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5xzc

Cryo-EM structure of p300-p53 protein complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 132.2 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone acetyltransferase p300

Homo sapiens

UniProt Q09472

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1046–1664 片段：UNP residues 1046-1664 无其他共同聚合物 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 10.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5XZC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1L3E NMR Structures of the HIF-1alpha CTAD/p300 CH1 Complex 提交 2002-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 323–423（101 aa） 片段：cysteine/histidine-rich 1 domain (CH1)
未记录 ZN ZINC ION × 3 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N,13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 90% D2O, 10% H2O
NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N,13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 99.9% D2O
NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 90% D2O, 10% H2O
NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 99.9% D2O
NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex 10% U-13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 99.9% D2O
分辨率未提供
1P4Q Solution structure of the CITED2 transactivation domain in complex with the p300 CH1 domain 提交 2003-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 323–423（101 aa） 片段：cysteine/histidine-rich 1 (CH1) domain
未记录 ZN ZINC ION × 3 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成 1mM CITED/p300;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 | 99.9% D2O
NMR样品组成 1mM CITED/p300 U-15N;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM CITED/p300 U-15N;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 | 99.9% D2O
NMR样品组成 1mM CITED/p300 U-15N,13C;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM CITED/p300 U-15N,13C;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 | 99.9% D2O
NMR样品组成 1mM CITED/p300 10%13C;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 | 99.9% D2O
分辨率未提供
2K8F Structural Basis for the Regulation of p53 Function by p300 提交 2008-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1723–1812（90 aa） 片段：UNP residues 1723-1812
突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3；308 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient
NMR样品组成 1.1 mM TAZ2, 1.0 mM [U-100% 15N] TAD(1-39), 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 15N] TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2MH0 Solution NMR structure of the p300 Taz2:ETAD1 complex 提交 2013-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1723–1812（90 aa） 片段：TAZ-type 2 zinc finger residues 1723-1812
突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成 1.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] ETAD1, 2 mM Taz2, 20 mM MES, 1 mM sodium azide, 5 mM beta-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 3078 uM ETAD1, 1038 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Taz2, 20 mM MES, 1 mM sodium azide, 5 mM beta-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2MZD Characterization of the p300 Taz2-p53 TAD2 Complex and Comparison with the p300 Taz2-p53 TAD1 Complex 提交 2015-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1723–1812（90 aa） 片段：UNP residues 1723-1812
突变：C16A, C24A, C67A, C68A 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3；308 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient
NMR样品组成 1.1 mM Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 15N] Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
3BIY Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with a bisubstrate inhibitor, Lys-CoA 提交 2007-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1287–1666（380 aa） 片段：acetyltransferase domain
突变：K1637R, M1652G BR BROMIDE ION × 5 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES sodium pH 7.5, 20% w/v polyethylene glycol 4,000, 10% v/v 2-Propanol , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.213
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1040–1161（122 aa） 片段：UNP RESIDUES 1040-1161
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 J 1040–1161（122 aa） 片段：UNP RESIDUES 1040-1161
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 K 1040–1161（122 aa） 片段：UNP RESIDUES 1040-1161
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 L 1040–1161（122 aa） 片段：UNP RESIDUES 1040-1161
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1040–1161（122 aa） 片段：UNP RESIDUES 1040-1161
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1040–1161（122 aa） 片段：UNP RESIDUES 1040-1161
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1040–1161（122 aa） 片段：UNP RESIDUES 1040-1161
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1040–1161（122 aa） 片段：UNP RESIDUES 1040-1161
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1040–1161（122 aa） 片段：UNP RESIDUES 1040-1161
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 1040–1161（122 aa） 片段：UNP RESIDUES 1040-1161
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 1040–1161（122 aa） 片段：UNP RESIDUES 1040-1161
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 I 1040–1161（122 aa） 片段：UNP RESIDUES 1040-1161
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3IO2 Crystal structure of the Taz2 domain of p300 提交 2009-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1723–1836（114 aa） 片段：residues 1723-1836
突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.3；277 K；Protein solution: 30 mg/ml Taz2, 25 mM MES pH 6.3, 100 mM NaCl, 6% glycerol, 10% TCEP. Precipitating solution: 3.2 M AMS in MES buffer pH 6.0, 10 % ethylene glycol. Both solutions mixed 1:1 and kept under oil, Microbatch, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.236
3P57 Crystal structure of the p300 TAZ2 domain bound to MEF2 on DNA 提交 2010-10-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：tridecameric
链 P 1726–1835（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；288 K；16% PEG 1000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.19 Å R-free 0.272
3T92 Crystal structure of the Taz2:C/EBPepsilon-TAD chimera protein 提交 2011-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1723–1818（96 aa） 片段：unp residues 1723-1818; unp residues 37-61
突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A, ZN ZINC ION × 3 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 ACN ACETONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Micro batch under oil；pH 8.5；277 K；200mM NaCl, 5mM TCEP and 20% isopropanol, pH 8.5, Micro batch under oil, temperature 277K
分辨率 1.50 Å R-free 0.228
4BHW Structural basis for autoinhibition of the acetyltransferase activity of p300 提交 2013-04-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1043–1519（477 aa） 片段：P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666
链 A 1581–1666（86 aa） 片段：P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666
链 B 1043–1519（477 aa） 片段：P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666
链 B 1581–1666（86 aa） 片段：P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES ZN ZINC ION × 7 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；100 MM HEPES, PH 7.5, 20% PEG3350, 0.2M NACL
分辨率 2.80 Å R-free 0.244
4PZR Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with Coenzyme A 提交 2014-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1287–1664（378 aa） 片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1664)
突变：Y1467F PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 COA COENZYME A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 16% PEG3350, 3-10% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.219
4PZS Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with Acetyl-Coenzyme A 提交 2014-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1287–1664（378 aa） 片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1664)
突变：Y1467F ACO ACETYL COENZYME *A × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 16% PEG3350, 3-10% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.94 Å R-free 0.230
4PZT Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with an inhibitor, Acetonyl-Coenzyme A 提交 2014-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1287–1664（378 aa） 片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1664)
突变：Y1467F SOP [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-4-HYDROXY-3-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL (3R)-3-HYDROXY-2,2-DIMETHYL-4-OXO-4-{[3-OXO-3-({2-[(2-OXOPROPYL)THIO]ETHYL}AMINO)PROPYL]AMINO}BUTYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 16% PEG3350, 3-10% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
5BT3 Crystal structure of EP300 bromodomain in complex with SGC-CBP30 chemical probe 提交 2015-06-02 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1048–1161（114 aa） 片段：bromodomain, UNP residues 1048-1161
未记录 2LO 2-[2-(3-chloro-4-methoxyphenyl)ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(2S)-2-(morpholin-4-yl)propyl]-1H-benzimidazole × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.1 M tri-sodium citrate dihydrate pH 5.6, 20% iso-propanol, 20% PEG 4000
分辨率 1.05 Å R-free 0.178
5KJ2 The novel p300/CBP inhibitor A-485 uncovers a unique mechanism of action to target AR in castrate resistant prostate cancer 提交 2016-06-17 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1287–1666（380 aa）
未记录 6TF N-[(4-fluorophenyl)methyl]-2-{(1R)-5-[(methylcarbamoyl)amino]-2',4'-dioxo-2,3-dihydro-3'H-spiro[indene-1,5'-[1,3]oxazolidin]-3'-yl}-N-[(2S)-1,1,1-trifluoropropan-2-yl]acetamide × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；290 K；25% (w/v) PEG3350, 0.2M Sodium Chloride, 0.1M BIS-TRIS buffer pH5.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.260
5LKT Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with butyryl-coenzyme A. 提交 2016-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1043–1519（477 aa） 片段：UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666
链 A 1581–1666（86 aa） 片段：UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666
突变：Y1467F,Y1467F 突变：Y1467F,Y1467F ZN ZINC ION × 4 BCO Butyryl Coenzyme A × 1 GOL GLYCEROL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Tris, PEG MME 2000
分辨率 2.04 Å R-free 0.204
5LKU Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with coenzyme A. 提交 2016-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1043–1519（477 aa）
链 A 1581–1666（86 aa）
突变：Y1467F,Y1467F 突变：Y1467F,Y1467F ZN ZINC ION × 4 COA COENZYME A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Tris, PEG MME 2000
分辨率 3.50 Å R-free 0.242
5LKX Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with propionyl-coenzyme A. 提交 2016-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1043–1519（477 aa）
链 A 1581–1666（86 aa）
突变：Y1467F,Y1467F 突变：Y1467F,Y1467F ZN ZINC ION × 4 1VU propionyl Coenzyme A × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Tris, PEG MME 2000, DMSO
分辨率 2.52 Å R-free 0.239
5LKZ Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with crotonyl-coenzyme A. 提交 2016-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1043–1519（477 aa） 片段：UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666,UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666
链 A 1581–1666（86 aa） 片段：UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666,UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666
突变：Y1467F,Y1467F,Y1467F,Y1467F 突变：Y1467F,Y1467F,Y1467F,Y1467F ZN ZINC ION × 4 COO CROTONYL COENZYME A × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Tris, PEG MME 2000
分辨率 2.50 Å R-free 0.234
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1040–1161（122 aa） 片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161
未记录 XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl
分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1040–1161（122 aa） 片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161
未记录 XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl
分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1040–1161（122 aa） 片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161
未记录 XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl
分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1040–1161（122 aa） 片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161
未记录 XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl
分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1040–1161（122 aa） 片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161
未记录 XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 2 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl
分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1040–1161（122 aa） 片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161
未记录 XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl
分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 1040–1161（122 aa） 片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl
分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPM Crystal structure of the bromodomain of human Ep300 bound to the inhibitor XDM3d 提交 2016-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1048–1161（114 aa） 片段：bromodomain, UNP residues 1048-1161
未记录 71Y ~{N}-[(1~{S},2~{S})-7-chloranyl-2-oxidanyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole -2-carboxamide × 2 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；NaCl, PEG 3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.187
5LPM Crystal structure of the bromodomain of human Ep300 bound to the inhibitor XDM3d 提交 2016-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1048–1161（114 aa） 片段：bromodomain, UNP residues 1048-1161
未记录 71Y ~{N}-[(1~{S},2~{S})-7-chloranyl-2-oxidanyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole -2-carboxamide × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；NaCl, PEG 3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.187
5NU5 Crystal structure of the human bromodomain of EP300 bound to the inhibitor XDM-CBP 提交 2017-04-28 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1048–1161（114 aa） 片段：bromodomain
未记录 99E ~{N}-[[2,8-bis(oxidanyl)naphthalen-1-yl]methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；KSCN, NaBr, PEG 6000, PEG 8000, PEG 10000
分辨率 1.60 Å R-free 0.185
5NU5 Crystal structure of the human bromodomain of EP300 bound to the inhibitor XDM-CBP 提交 2017-04-28 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1048–1161（114 aa） 片段：bromodomain
未记录 99E ~{N}-[[2,8-bis(oxidanyl)naphthalen-1-yl]methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；KSCN, NaBr, PEG 6000, PEG 8000, PEG 10000
分辨率 1.60 Å R-free 0.185
6DS6 Crystal structure of p300 ZZ domain in complex with histone H3 peptide 提交 2018-06-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1663–1713（51 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M HEPES and 70% MPD (pH 7.5)
分辨率 1.95 Å R-free 0.253
6FGN Solution Structure of p300Taz2-p63TA 提交 2018-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1723–1812（90 aa） 片段：Taz2,transactivation domain
未记录 ZN ZINC ION × 3 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3；303 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 AMBIENT
NMR样品组成 1200 mM [U-13C; U-15N] Fusion construct of p300 Taz2 and the transactivation domain of p63, 25 mM MES, 200 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
6FGS Solution structure of p300Taz2-p73TA1 提交 2018-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1723–1812（90 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 AMBIENT
NMR样品组成 700 uM [U-13C; U-15N] Fusion construct of p300 Taz2 and the transactivation domain 1 of p73, 25 mM MES, 50 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
6GYR Transcription factor dimerization activates the p300 acetyltransferase 提交 2018-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1046–1664（619 aa）
链 C 1046–1664（619 aa）
突变：Y1467F 突变：Y1467F ZN ZINC ION × 7 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；100 mM HEPES, pH 7.5, 18-22% polyethylene glycol 3350, 0.2 M NaCl
分辨率 3.10 Å R-free 0.265
6GYR Transcription factor dimerization activates the p300 acetyltransferase 提交 2018-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1046–1664（619 aa）
链 D 1046–1664（619 aa）
突变：Y1467F 突变：Y1467F ZN ZINC ION × 7 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；100 mM HEPES, pH 7.5, 18-22% polyethylene glycol 3350, 0.2 M NaCl
分辨率 3.10 Å R-free 0.265
6GYT Transcription factor dimerization activates the p300 acetyltransferase 提交 2018-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1047–1168（122 aa）
链 B 1047–1168（122 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；294 K；1.6 M Ammonium Sulfate, 100 mM Bicine, pH 9.0
分辨率 2.50 Å R-free 0.288
6K4N Cryo-EM structure of p300 提交 2019-05-24 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1046–1664（619 aa） 片段：UNP RESIDUES 1046-1664
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.80 Å
6PF1 Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-090 and CoA 提交 2019-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1287–1513（227 aa）
链 A 1581–1663（83 aa）
突变：Y1467F 突变：Y1467F COA COENZYME A × 1 OJ7 3-[3-chloro-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-2-methyl-1H-indole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；0.1 M CHES pH 9.5, 30% w/v PEG 3000
分辨率 2.32 Å R-free 0.247
6PF1 Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-090 and CoA 提交 2019-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1287–1513（227 aa）
链 B 1581–1663（83 aa）
突变：Y1467F 突变：Y1467F COA COENZYME A × 1 OJ7 3-[3-chloro-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-2-methyl-1H-indole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；0.1 M CHES pH 9.5, 30% w/v PEG 3000
分辨率 2.32 Å R-free 0.247
6PGU Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-076 and CoA 提交 2019-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1287–1519（233 aa）
链 A 1582–1663（82 aa）
突变：Y1467F, loop deletion 突变：Y1467F, loop deletion COA COENZYME A × 1 OK7 N-(thiophen-2-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；20% MPD, 0.1 M Tris pH 8, 7.5% PEG-MME 5000
分辨率 1.72 Å R-free 0.206
6PGU Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-076 and CoA 提交 2019-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1287–1519（233 aa）
链 B 1582–1663（82 aa）
突变：Y1467F, loop deletion 突变：Y1467F, loop deletion COA COENZYME A × 1 OK7 N-(thiophen-2-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；20% MPD, 0.1 M Tris pH 8, 7.5% PEG-MME 5000
分辨率 1.72 Å R-free 0.206
6V8B Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with AcCoA competitive inhibitor 1 提交 2019-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1287–1666（380 aa）
突变：M1652G QRY 4-(2-{[(1R)-2-(1H-indol-3-yl)-2-oxo-1-phenylethyl]amino}ethyl)benzene-1-sulfonamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；INDEX F6. 25% PEG3350, 0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BisTris pH 5.5
分辨率 3.13 Å R-free 0.316
6V8K Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with peptide-competitive inhibitor 2 提交 2019-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1287–1519（233 aa）
链 A 1581–1663（83 aa）
突变：Y1467F 突变：Y1467F COA COENZYME A × 1 QS4 1-(2-methyl-1H-indol-3-yl)-2-[(2R)-2-methylpiperidin-1-yl]ethan-1-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.24 mM HAT, 0.12 mM CoA, 0.75 mM ligand. 200+150 (+20) nL sitting drops. Internal focus screen with microseeding. 17.5% MPD, 0.1 M Tris pH 8, 2.5 % PEG3350. Cryo 30% MPD, 5% PEG 3350, 1 mM ligand
分辨率 1.84 Å R-free 0.213
6V8N Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with AcCoA competitive inhibitor 17 提交 2019-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1287–1666（380 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 QS1 (2R)-2-{[(2S)-2-(4-cyanophenyl)propyl]amino}-N-[5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)pyridin-2-yl]-2-phenylacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M BisTris pH 5.5, 20% PEG 3350, streak-seed with loop
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
6V90 Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with AcCoA competitive inhibitor 12 提交 2019-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1287–1666（380 aa）
突变：M1652G QSD (2R)-2-{[2-(4-cyanophenyl)ethyl]amino}-N-[5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)pyridin-2-yl]-2-phenylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；INDEX F6. 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 0.2 M ammonium sulfate 25% w/v PEG 3350. The crystal was cryoprotected with MiTeGen Low Viscosity Cryo Oil
分辨率 2.04 Å R-free 0.241
7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1287–1666（380 aa） 片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)
未记录 Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；290 K；25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5
分辨率 2.61 Å R-free 0.265
7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1287–1666（380 aa） 片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)
未记录 Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；290 K；25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5
分辨率 2.61 Å R-free 0.265
7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1287–1666（380 aa） 片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)
未记录 Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；290 K；25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5
分辨率 2.61 Å R-free 0.265
7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1287–1666（380 aa） 片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)
未记录 Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；290 K；25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5
分辨率 2.61 Å R-free 0.265
7SS8 Human P300 complexed with a proline-based inhibitor 提交 2021-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1048–1519（472 aa）
链 A 1582–1664（83 aa）
突变：Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG 突变：Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 C0C 1-[1-(4-chlorophenyl)cyclopentane-1-carbonyl]-N-{[3-(methylcarbamoyl)phenyl]methyl}-D-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.1 M MES pH 6.5
分辨率 2.15 Å R-free 0.230
7SSK Human P300 complexed with a glycine-based inhibitor 提交 2021-11-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1048–1519（472 aa）
链 A 1582–1664（83 aa）
突变：Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG 突变：Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 C3I N-[2-(4-methoxyanilino)-2-oxoethyl]-N-methyl-1-phenylcyclopentane-1-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.1 M MES pH 6.5
分辨率 2.36 Å R-free 0.235
7SZQ Human P300 complexed with an azaindazole inhibitor 提交 2021-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1279–1666（388 aa）
突变：Y1467F ETL 1-[1-(4-chlorophenyl)cyclopentane-1-carbonyl]-N-1H-pyrazolo[4,3-b]pyridin-5-yl-D-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；277 K；30% PEG400, 0.1 M CHES pH 9.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.235
7UGI Bromodomain of EP300 liganded with BMS-536924 提交 2022-03-24 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1048–1161（114 aa）
未记录 N6I (3M)-4-{[(2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxyethyl]amino}-3-[4-methyl-6-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]pyridin-2(1H)-one × 1 PE5 3,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；0.05M Potassium phosphate monobasic 20% w/v Polyethylene glycol 8,000
分辨率 2.00 Å R-free 0.274
7UGI Bromodomain of EP300 liganded with BMS-536924 提交 2022-03-24 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1048–1161（114 aa）
未记录 N6I (3M)-4-{[(2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxyethyl]amino}-3-[4-methyl-6-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]pyridin-2(1H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；0.05M Potassium phosphate monobasic 20% w/v Polyethylene glycol 8,000
分辨率 2.00 Å R-free 0.274
7VHY Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound (+)-3 提交 2021-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1159–1519（361 aa） 片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
链 A 1581–1666（86 aa） 片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
突变：Y1467E 突变：Y1467E ZN ZINC ION × 3 6QI [(6R)-6-(1H-indazol-4-ylmethyl)-1,4-oxazepan-4-yl]-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]methanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；15% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH7.0)
分辨率 2.30 Å R-free 0.250
7VHY Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound (+)-3 提交 2021-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1159–1519（361 aa） 片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
链 B 1581–1666（86 aa） 片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
突变：Y1467E 突变：Y1467E ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；15% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH7.0)
分辨率 2.30 Å R-free 0.250
7VHZ Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 7 提交 2021-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1159–1519（361 aa） 片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
链 A 1581–1666（86 aa） 片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
突变：Y1467E 突变：Y1467E ZN ZINC ION × 3 6TI (2R)-N-(2H-indazol-4-yl)-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)
分辨率 2.00 Å R-free 0.219
7VHZ Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 7 提交 2021-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1159–1519（361 aa） 片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
链 B 1581–1666（86 aa） 片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
突变：Y1467E 突变：Y1467E ZN ZINC ION × 3 6TI (2R)-N-(2H-indazol-4-yl)-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)
分辨率 2.00 Å R-free 0.219
7VI0 Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 11 提交 2021-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1159–1519（361 aa） 片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
链 A 1581–1666（86 aa） 片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
突变：Y1467E 突变：Y1467E ZN ZINC ION × 3 6YI (4S)-N-(3H-indazol-4-yl)-3-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-1,1-bis(oxidanylidene)-1,3-thiazolidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；12% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)
分辨率 2.10 Å R-free 0.235
7VI0 Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 11 提交 2021-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1159–1519（361 aa） 片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
链 B 1581–1666（86 aa） 片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)
突变：Y1467E 突变：Y1467E ZN ZINC ION × 3 6YI (4S)-N-(3H-indazol-4-yl)-3-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-1,1-bis(oxidanylidene)-1,3-thiazolidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；12% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)
分辨率 2.10 Å R-free 0.235
7W9V Cryo-EM structure of nucleosome in complex with p300 acetyltransferase catalytic core (complex I) 提交 2021-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 K 1035–1519（485 aa）
链 K 1581–1720（140 aa）
突变：Y1467F 突变：Y1467F 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
7XEZ NMR solution structures of p300 TAZ2 domain in complex with BRD4-NUT F1c domain binding motif #2 提交 2022-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1723–1812（90 aa）
突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A ZN ZINC ION × 3 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3；298 K；压力 1
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain in fusion with BRD4-NUT F1c domain binding motif #2, 200 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain in fusion with BRD4-NUT F1c domain binding motif #2, 200 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
7XFG NMR solution structures of p300 TAZ2 domain in complex with BRD4-NUT F1c domain binding motif #1 提交 2022-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1723–1812（90 aa） 片段：TAZ2 domain
突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A ZN ZINC ION × 3 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）null；压力 1
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain, 1.5 mM BRD4-NUT fusion protein F1c domain binding motif #1, 200 mM sodium phosphate, 3.0 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain, 1.5 mM BRD4-NUT fusion protein F1c domain binding motif #1, 200 mM sodium phosphate, 3.0 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
8E1D NMR-derived ensemble of the TAZ2 domain of p300 bound to the microphthalmia-associated transcription factor 提交 2022-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1723–1812（90 aa）
突变：C1738A C1746A C1789A C1790A ZN ZINC ION × 3 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；308 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成 20 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES), 5 mM beta mercaptoethanol, 10 uM Zinc chloride, 1 mM [U-13C; U-15N] Microphthalmia-associated transcription factor, 1.2 mM TAZ2 domain of p300, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 20 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES), 5 mM beta mercaptoethanol, 10 mM Zinc chloride, 1.15 mM Microphthalmia-associated transcription factor, 0.95 mM [U-13C; U-15N] TAZ2 domain of p300, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
8FVF Bromodomain of EP300 liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1048–1161（114 aa） 片段：bromodomain
未记录 JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NI NICKEL (II) ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1M Sodium chloride, 0.1M HEPES pH7.5, 1.6M Ammonium sulfate
分辨率 2.10 Å R-free 0.239
8FVF Bromodomain of EP300 liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1048–1161（114 aa） 片段：bromodomain
未记录 JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NI NICKEL (II) ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1M Sodium chloride, 0.1M HEPES pH7.5, 1.6M Ammonium sulfate
分辨率 2.10 Å R-free 0.239
8GZC Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 10 提交 2022-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1159–1519（361 aa）
链 A 1581–1666（86 aa）
突变：Y1467E 突变：Y1467E ZN ZINC ION × 3 KQO (2~{R},4~{R})-4-fluoranyl-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclohexyl]carbonyl-~{N}-(1~{H}-pyrazolo[4,3-b]pyridin-5-yl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；15% PEG3350, 0.1 M HEPES
分辨率 2.00 Å R-free 0.227
8GZC Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 10 提交 2022-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1159–1519（361 aa）
链 B 1581–1666（86 aa）
突变：Y1467E 突变：Y1467E ZN ZINC ION × 3 KQO (2~{R},4~{R})-4-fluoranyl-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclohexyl]carbonyl-~{N}-(1~{H}-pyrazolo[4,3-b]pyridin-5-yl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；15% PEG3350, 0.1 M HEPES
分辨率 2.00 Å R-free 0.227
8HAG Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (3.2 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 K 1048–1836（789 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8HAH Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (3.9 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 K 1048–1836（789 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8HAI Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (4.7 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 K 1048–1836（789 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8HAJ Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (4.8 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 K 1048–1836（789 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8HAK Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 4 (4.5 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 N 1048–1836（789 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
9IT5 p300 KAT domain in complex with KB528 提交 2024-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1287–1666（380 aa） 片段：KAT domain
突变：K1637R/M1652G A1L3B 4-[(2~{S})-1-[[(~{R})-[(3~{S})-7-(1-methylpyrazol-4-yl)-2,3-dihydro-1~{H}-pyrido[2,3-b][1,4]oxazin-3-yl]-phenyl-methyl]amino]propan-2-yl]benzenecarbonitrile × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；HM(PEGs-E9)-D6 (0.18M NH4Cl, 24% PEG 3350)
分辨率 2.00 Å R-free 0.238
9IT5 p300 KAT domain in complex with KB528 提交 2024-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1287–1666（380 aa） 片段：KAT domain
突变：K1637R/M1652G A1L3B 4-[(2~{S})-1-[[(~{R})-[(3~{S})-7-(1-methylpyrazol-4-yl)-2,3-dihydro-1~{H}-pyrido[2,3-b][1,4]oxazin-3-yl]-phenyl-methyl]amino]propan-2-yl]benzenecarbonitrile × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；HM(PEGs-E9)-D6 (0.18M NH4Cl, 24% PEG 3350)
分辨率 2.00 Å R-free 0.238
9JEJ Crystal structure of human EP300 KIX domain (L644C mutant) 提交 2024-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 566–652（87 aa） 片段：KIX domain
突变：L644C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Citrate : Citric Acid pH5.5, 1 M Ammonium Phosphate Dibasic
分辨率 2.90 Å R-free 0.281
9JEJ Crystal structure of human EP300 KIX domain (L644C mutant) 提交 2024-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 566–652（87 aa） 片段：KIX domain
突变：L644C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Citrate : Citric Acid pH5.5, 1 M Ammonium Phosphate Dibasic
分辨率 2.90 Å R-free 0.281
9JEJ Crystal structure of human EP300 KIX domain (L644C mutant) 提交 2024-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 566–652（87 aa） 片段：KIX domain
突变：L644C ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Citrate : Citric Acid pH5.5, 1 M Ammonium Phosphate Dibasic
分辨率 2.90 Å R-free 0.281
9JUT X-ray crystal structure of Y16524 in EP300 提交 2024-10-08 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1040–1161（122 aa）
未记录 A1EDM (6~{S})-1-(3-chloranyl-4-methoxy-phenyl)-6-[4-(3-methyl-1,2-benzoxazol-5-yl)-1-[(2~{S})-2-morpholin-4-ylpropyl]imidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；60% v/v Tacsimate pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 2.13 Å R-free 0.234
9MZA Chemically Hijacked BCL6-TCIP3-p300 Complex 提交 2025-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1040–1161（122 aa）
链 D 1040–1161（122 aa）
未记录 A1BUC 1-{1-[5-({1-[5-chloro-4-({8-methoxy-1-methyl-3-[2-(methylamino)-2-oxoethoxy]-2-oxo-1,2-dihydroquinolin-6-yl}amino)pyrimidin-2-yl]piperidine-4-carbonyl}amino)pentanoyl]piperidin-4-yl}-3-[(6M)-7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-N-methyl-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, PEG 3,350 20%
分辨率 2.10 Å R-free 0.277

共 58 个其他 PDB 条目、92 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EP300_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–619； UniProt 1046–1664

Cellular tumor antigen p53

Homo sapiens

UniProt P04637

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 92–356 链 C； UniProt 92–356 链 D； UniProt 92–356 链 E； UniProt 92–356 未记录 无其他共同聚合物 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 10.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5XZC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1A1U SOLUTION STRUCTURE DETERMINATION OF A P53 MUTANT DIMERIZATION DOMAIN, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1997-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 324–358（35 aa） 片段：OLIGOMERIZATION
链 C 324–358（35 aa） 片段：OLIGOMERIZATION
突变：M40K, F41I, L44Y 突变：M40K, F41I, L44Y 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；313 K
分辨率未提供
1AIE P53 TETRAMERIZATION DOMAIN CRYSTAL STRUCTURE 提交 1997-04-17 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 326–356（31 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；1.4 M SODIUM CITRATE, 100 MM HEPES, PH 8.0
分辨率 1.50 Å R-free 0.252
1C26 CRYSTAL STRUCTURE OF P53 TETRAMERIZATION DOMAIN 提交 1999-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 325–356（32 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；298 K；3.0 M SODIUM FORMATE 0.5 M AMMONIUM SULFATE 50 MM TRIS-HCL PH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298 K
分辨率 1.70 Å
1DT7 SOLUTION STRUCTURE OF THE C-TERMINAL NEGATIVE REGULATORY DOMAIN OF P53 IN A COMPLEX WITH CA2+-BOUND S100B(BB) 提交 2000-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 X 367–388（22 aa） 片段：C-TERMINAL PEPTIDE
链 Y 367–388（22 aa） 片段：C-TERMINAL PEPTIDE
未记录 CA CALCIUM ION × 4 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；310 K；离子强度（mmCIF原始值）25 mM；压力 ambient
NMR样品组成 3-6 mM S100 (subunit concentration), 0.1 mM EDTA, 0.34 mM NaN3, 5 mM DTT, 17 mM NaCl, 10 mM d11-tris-HCl, 7% D2O, 6-13 mM CaCl2, 4.8-10 mM p53 peptide | 7% D2O, 93% H2O
分辨率未提供
1GZH Crystal structure of the BRCT domains of human 53BP1 bound to the p53 tumor supressor 提交 2002-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 95–292（198 aa） 片段：DNA BINDING REGION, RESIDUES 95-292
未记录 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.4；50 MM TRIS PH 7.4, 250 MM AMMONIUM SULFATE, 25% POLYETHYLENE GLYCOL 4000
分辨率 2.60 Å R-free 0.288
1GZH Crystal structure of the BRCT domains of human 53BP1 bound to the p53 tumor supressor 提交 2002-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 95–292（198 aa） 片段：DNA BINDING REGION, RESIDUES 95-292
未记录 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.4；50 MM TRIS PH 7.4, 250 MM AMMONIUM SULFATE, 25% POLYETHYLENE GLYCOL 4000
分辨率 2.60 Å R-free 0.288
1H26 CDK2/CyclinA in complex with an 11-residue recruitment peptide from p53 提交 2002-07-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 376–386（11 aa） 片段：RESIDUES 376-386
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；0.8M KCL, 1.2M (NH4)2SO4, 40MM HEPES PH 7.0. PROTEIN CONCENTRATION = 10MG/ML
分辨率 2.24 Å R-free 0.268
1HS5 NMR SOLUTION STRUCTURE OF DESIGNED P53 DIMER 提交 2000-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 324–357（34 aa） 片段：RESIDUES 324-357
链 B 324–357（34 aa） 片段：RESIDUES 324-357
突变：M340Q, L344R 突变：M340Q, L344R 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；300 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM；压力 ambient
NMR样品组成 2mM U-15N,13C; 25mM sodium phosphate; 150mM sodium chloride | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1JSP NMR Structure of CBP Bromodomain in complex with p53 peptide 提交 2001-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 367–386（20 aa） 片段：C-terminal fragment
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 0.5mM CBP bromodomain U-15N; 0.5mM P53 peptide; 100mM phosphate buffer; pH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5mM CBP bromodomain U-15N,13C; 0.5mM P53 peptide;100mM phosphate buffer; pH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5mM CBP bromodomain U-15N,13C; 0.5mM P53 peptide;100mM phosphate buffer; pH 6.5 | 99.9%D2O
NMR样品组成 0.5mM CBP bromodomain U-15N,13C,75% 2H; 0.5mM P53 peptide;100mM phosphate buffer; pH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1KZY Crystal Structure of the 53bp1 BRCT Region Complexed to Tumor Suppressor P53 提交 2002-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 95–289（195 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN
链 B 95–289（195 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；PEG4000, sodium citrate, ammonium acetate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
1MA3 Structure of a Sir2 enzyme bound to an acetylated p53 peptide 提交 2002-07-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 372–389（18 aa） 片段：Regulatory C-terminal tail (residues 372-389)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；PEG 8000, PEG 1000 and Sodium Chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.254
1OLG HIGH-RESOLUTION SOLUTION STRUCTURE OF THE OLIGOMERIZATION DOMAIN OF P53 BY MULTI-DIMENSIONAL NMR 提交 1994-06-13 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 319–360（42 aa）
链 B 319–360（42 aa）
链 C 319–360（42 aa）
链 D 319–360（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1OLH HIGH-RESOLUTION SOLUTION STRUCTURE OF THE OLIGOMERIZATION DOMAIN OF P53 BY MULTI-DIMENSIONAL NMR 提交 1994-06-13 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 319–360（42 aa）
链 B 319–360（42 aa）
链 C 319–360（42 aa）
链 D 319–360（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1PES NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE TETRAMERIC MINIMUM TRANSFORMING DOMAIN OF P53 提交 1994-11-24 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 325–355（31 aa）
链 B 325–355（31 aa）
链 C 325–355（31 aa）
链 D 325–355（31 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1PET NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE TETRAMERIC MINIMUM TRANSFORMING DOMAIN OF P53 提交 1994-11-24 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 325–355（31 aa）
链 B 325–355（31 aa）
链 C 325–355（31 aa）
链 D 325–355（31 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1SAE HIGH RESOLUTION SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE OLIGOMERIZATION DOMAIN OF P53 BY MULTI-DIMENSIONAL NMR (SAC STRUCTURES) 提交 1995-03-12 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 319–360（42 aa）
链 B 319–360（42 aa）
链 C 319–360（42 aa）
链 D 319–360（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1SAF HIGH RESOLUTION SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE OLIGOMERIZATION DOMAIN OF P53 BY MULTI-DIMENSIONAL NMR (SAD STRUCTURES) 提交 1995-03-12 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 319–360（42 aa）
链 B 319–360（42 aa）
链 C 319–360（42 aa）
链 D 319–360（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1SAK HIGH RESOLUTION SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE OLIGOMERIZATION DOMAIN OF P53 BY MULTI-DIMENSIONAL NMR (SAC STRUCTURES) 提交 1995-03-12 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 319–360（42 aa）
链 B 319–360（42 aa）
链 C 319–360（42 aa）
链 D 319–360（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1SAL HIGH RESOLUTION SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE OLIGOMERIZATION DOMAIN OF P53 BY MULTI-DIMENSIONAL NMR (SAD STRUCTURES) 提交 1995-03-12 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 319–360（42 aa）
链 B 319–360（42 aa）
链 C 319–360（42 aa）
链 D 319–360（42 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1TSR P53 CORE DOMAIN IN COMPLEX WITH DNA 提交 1995-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 A 94–312（219 aa）
链 B 94–312（219 aa）
链 C 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1TUP TUMOR SUPPRESSOR P53 COMPLEXED WITH DNA 提交 1995-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 A 94–312（219 aa）
链 B 94–312（219 aa）
链 C 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1UOL Crystal structure of the human p53 core domain mutant M133L/V203A/N239Y/N268D at 1.9 A resolution. 提交 2003-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA BINDING (CORE) DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2；pH 7.20
分辨率 1.90 Å R-free 0.230
1UOL Crystal structure of the human p53 core domain mutant M133L/V203A/N239Y/N268D at 1.9 A resolution. 提交 2003-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA BINDING (CORE) DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2；pH 7.20
分辨率 1.90 Å R-free 0.230
1XQH Crystal structure of a ternary complex of the methyltransferase SET9 (also known as SET7/9) with a P53 peptide and SAH 提交 2004-10-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 369–377（9 aa） 片段：mono-methylated p53 peptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；291 K；PEG3350, Tris-HCL, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 1.75 Å R-free 0.223
1XQH Crystal structure of a ternary complex of the methyltransferase SET9 (also known as SET7/9) with a P53 peptide and SAH 提交 2004-10-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 369–377（9 aa） 片段：mono-methylated p53 peptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；291 K；PEG3350, Tris-HCL, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 1.75 Å R-free 0.223
1YCQ XENOPUS LAEVIS MDM2 BOUND TO THE TRANSACTIVATION DOMAIN OF HUMAN P53 提交 1996-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 13–29（17 aa） 片段：RESIDUES 13 - 29
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å R-free 0.253
1YCR MDM2 BOUND TO THE TRANSACTIVATION DOMAIN OF P53 提交 1996-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 15–29（15 aa） 片段：RESIDUES 15 - 29
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å R-free 0.276
1YCS P53-53BP2 COMPLEX 提交 1996-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 94–292（199 aa） 片段：RESIDUES 97 - 287
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å R-free 0.286
2AC0 Structural Basis of DNA Recognition by p53 Tetramers (complex I) 提交 2005-07-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：residues 94-293
链 B 94–293（200 aa） 片段：residues 94-293
链 C 94–293（200 aa） 片段：residues 94-293
链 D 94–293（200 aa） 片段：residues 94-293
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；Ammonium Formate, PEG 3350, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.217
2ADY Structural Basis of DNA Recognition by p53 Tetramers (complex IV) 提交 2005-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：residues 94-293
链 B 94–293（200 aa） 片段：residues 94-293
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；Ammonium Fluoride, PEG 3350, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.251
2AHI Structural Basis of DNA Recognition by p53 Tetramers (complex III) 提交 2005-07-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：residues 94-293
链 B 94–293（200 aa） 片段：residues 94-293
链 C 94–293（200 aa） 片段：residues 94-293
链 D 94–293（200 aa） 片段：residues 94-293
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；Ammonium Chloride, PEG 3350, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.85 Å R-free 0.225
2ATA Structural Basis of DNA Recognition by p53 Tetramers (complex II) 提交 2005-08-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：residues 94-293
链 B 94–293（200 aa） 片段：residues 94-293
链 C 94–293（200 aa） 片段：residues 94-293
链 D 94–293（200 aa） 片段：residues 94-293
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；Lithium Chloride, PEG 3350, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.215
2B3G p53N (fragment 33-60) bound to RPA70N 提交 2005-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 33–60（28 aa） 片段：residues 33-60
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.9；298 K；Na3 Citrate, Hepes, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 7.90
分辨率 1.60 Å R-free 0.239
2BIM human p53 core domain mutant M133L-V203A-N239Y-N268D-R273H 提交 2005-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING (CORE) DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.98 Å R-free 0.223
2BIM human p53 core domain mutant M133L-V203A-N239Y-N268D-R273H 提交 2005-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING (CORE) DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.98 Å R-free 0.223
2BIN human p53 core domain mutant M133L-H168R-V203A-N239Y-N268D 提交 2005-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING (CORE) DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.236
2BIO human p53 core domain mutant M133L-V203A-N239Y-R249S-N268D 提交 2005-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING (CORE) DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.234
2BIP human p53 core domain mutant M133L-H168R-V203A-N239Y-R249S-N268D 提交 2005-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING (CORE) DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.235
2BIQ human p53 core domain mutant T123A-M133L-H168R-V203A-N239Y-R249S- N268D 提交 2005-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING (CORE) DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.255
2F1X Crystal structure of the TRAF-like domain of HAUSP/USP7 bound to a p53 peptide 提交 2005-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 360–368（9 aa） 片段：p53 peptide fusion with HAUSP N terminal
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG2000 monomethylether, calcium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.263
2F1X Crystal structure of the TRAF-like domain of HAUSP/USP7 bound to a p53 peptide 提交 2005-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 360–368（9 aa） 片段：p53 peptide fusion with HAUSP N terminal
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG2000 monomethylether, calcium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.263
2GS0 NMR structure of the complex between the PH domain of the Tfb1 subunit from TFIIH and the activation domain of p53 提交 2006-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 20–73（54 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM sodium phosphate；压力 ambient
NMR样品组成 1.0 mM Tfb1 U-15N, 1.0 mM p53 unlabeled, 1.00 mM EDTA, 20 mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM Tfb1 U-15N,13C, 1.0 mM p53 unlabeled, 1.00 mM EDTA, 20 mM phosphate buffer; 100% D20 | 100% D20
NMR样品组成 1.0 mM p53 U-15N, 1.0 mM Tfb1 unlabeled, 1.00 mM EDTA, 20 mM phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM p53 U-15N, 1.0 mM Tfb1 unlabeled, 1.00 mM EDTA, 20 mM phosphate buffer; 100% D20 | 100% D20
分辨率未提供
2H2D The Structural Basis for Sirtuin Substrate Affinity 提交 2006-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 372–389（18 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.6；298 K；20% PEG 3350, 0.1 M CHES pH 9.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 9.60
分辨率 1.70 Å R-free 0.237
2H2F The Structural basis for Sirtuin Substrate affinity 提交 2006-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 372–389（18 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.6；298 K；20% PEG, pH 9.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 9.60
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
2H4J Sir2-deacetylated peptide (from enzymatic turnover in crystal) 提交 2006-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 372–389（18 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 NCA NICOTINAMIDE × 1 OAD 2'-O-ACETYL ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.6；293 K；CHES, PEG3350, PH9.6, acetylated peptide. Crystals were soaked in cryo + 5mM NAD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.246
2J0Z p53 tetramerization domain wild type 提交 2006-08-08 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 326–356（31 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 326-356
链 B 326–356（31 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 326-356
链 C 326–356（31 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 326-356
链 D 326–356（31 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 326-356
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2；300 K；压力 1.0
NMR样品组成 5% D2O/95% WATER
分辨率未提供
2J10 p53 tetramerization domain mutant T329F Q331K 提交 2006-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 326–356（31 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 326-356
链 B 326–356（31 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 326-356
链 C 326–356（31 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 326-356
链 D 326–356（31 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 326-356
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2；300 K；压力 1.0
NMR样品组成 5% D2O/95% WATER
分辨率未提供
2J11 p53 tetramerization domain mutant Y327S T329G Q331G 提交 2006-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 326–356（31 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 326-356
链 B 326–356（31 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 326-356
链 C 326–356（31 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 326-356
链 D 326–356（31 aa） 片段：TETRAMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 326-356
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2；300 K；压力 1.0
NMR样品组成 5% D2O/95% WATER
分辨率未提供
2J1W Human p53 core domain mutant M133L-V143A-V203A-N239Y-N268D 提交 2006-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.206
2J1W Human p53 core domain mutant M133L-V143A-V203A-N239Y-N268D 提交 2006-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.206
2J1X Human p53 core domain mutant M133L-V203A-Y220C-N239Y-N268D 提交 2006-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.65 Å R-free 0.206
2J1X Human p53 core domain mutant M133L-V203A-Y220C-N239Y-N268D 提交 2006-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.65 Å R-free 0.206
2J1Y Human p53 core domain mutant M133L-V203A-N239Y-G245S-N268D 提交 2006-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN, RESIDUES 94-293
突变：YES ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.69 Å R-free 0.218
2J1Y Human p53 core domain mutant M133L-V203A-N239Y-G245S-N268D 提交 2006-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–293（200 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN, RESIDUES 94-293
突变：YES ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.69 Å R-free 0.218
2J1Y Human p53 core domain mutant M133L-V203A-N239Y-G245S-N268D 提交 2006-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 94–293（200 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN, RESIDUES 94-293
突变：YES ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.69 Å R-free 0.218
2J1Y Human p53 core domain mutant M133L-V203A-N239Y-G245S-N268D 提交 2006-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 94–293（200 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN, RESIDUES 94-293
突变：YES ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.69 Å R-free 0.218
2J1Z Human p53 core domain mutant M133L-V203A-N239Y-N268D-F270L 提交 2006-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.213
2J1Z Human p53 core domain mutant M133L-V203A-N239Y-N268D-F270L 提交 2006-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.213
2J20 Human p53 core domain mutant M133L-V203A-N239Y-N268D-R273C 提交 2006-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.206
2J20 Human p53 core domain mutant M133L-V203A-N239Y-N268D-R273C 提交 2006-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.206
2J21 Human p53 core domain mutant M133L-V203A-N239Y-N268D-R282W 提交 2006-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.60 Å R-free 0.224
2J21 Human p53 core domain mutant M133L-V203A-N239Y-N268D-R282W 提交 2006-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING CORE DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.60 Å R-free 0.224
2K8F Structural Basis for the Regulation of p53 Function by p300 提交 2008-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–39（39 aa） 片段：UNP residues 1-39
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3；308 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient
NMR样品组成 1.1 mM TAZ2, 1.0 mM [U-100% 15N] TAD(1-39), 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 15N] TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2L14 Structure of CBP nuclear coactivator binding domain in complex with p53 TAD 提交 2010-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 13–61（49 aa） 片段：p53 TAD
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 15N] CBP nuclear coactivator binding domain, 0.5 mM [U-99% 15N] p53 TAD, 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] CBP nuclear coactivator binding domain, 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] p53 TAD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2LY4 HMGB1-facilitated p53 DNA binding occurs via HMG-box/p53 transactivation domain interaction and is regulated by the acidic tail 提交 2012-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–93（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.01；压力 ambient
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.5 mM PMSF, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2MEJ Solution Structure of the Complex Between BCL-xL and the p53 Core Domain determined with PRE restraints 提交 2013-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 96–312（217 aa） 片段：UNP residues 96-312
未记录 ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient
NMR样品组成 0.6 mM [U-98% 13C; U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] BCL-xL, 0.1 mM p53, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.6 mM [U-98% 13C; U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 0.65 mM BCL-xL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 0.1 mM BCL-xL_C151MTSL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 0.1 mM BCL-xL_C151MTSL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 0.1 mM BCL-xL_C151S_S122C MTSL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 0.1 mM BCL-xL_C151S_S122C MTSL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 0.1 mM BCL-xL_C151S_S2C MTSL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 0.1 mM BCL-xL_C151S_S2C MTSL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] BCL-xL, 0.1 mM Co_p53, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
2MWO Solution structure of 53BP1 tandem Tudor domains in complex with a p53K370me2 peptide 提交 2014-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 363–377（15 aa） 片段：DNA-binding repression region residues 363-377
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 ambient
NMR样品组成 25 mM sodium phosphate, 1.5 mM sodium azide, 2.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] 53BP1-Tudor, 6.0 mM p53K370me2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 25 mM sodium phosphate, 1.5 mM sodium azide, 2.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] 53BP1-Tudor, 6.0 mM p53K370me2, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 25 mM sodium phosphate, 1.5 mM sodium azide, 5.0 mM 53BP1-Tudor, 2.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p53Kc370me2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 25 mM sodium phosphate, 1.5 mM sodium azide, 5.0 mM 53BP1-Tudor, 2.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p53Kc370me2, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 25 mM sodium phosphate, 1.5 mM sodium azide, 2.0 mM [U-100% 15N] 53BP1-Tudor, 6.0 mM p53K370me2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 35 mM sodium phosphate, 1.5 mM sodium azide, 2.0 mM p53K370me2, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 25 mM sodium phosphate, 1.5 mM sodium azide, 2.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p53Kc370me2, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2MWP Solution structure of 53BP1 tandem Tudor domains in complex with a p53K382me2 peptide 提交 2014-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 376–387（12 aa） 片段：DNA-binding repression region residues 376-387
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 ambient
NMR样品组成 25 mM sodium phosphate, 1.5 mM sodium azide, 2.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] 53BP1-Tudor, 6.0 mM p53K382me2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 25 mM sodium phosphate, 1.5 mM sodium azide, 2.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] 53BP1-Tudor, 6.0 mM p53K382me2, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 25 mM sodium phosphate, 1.5 mM sodium azide, 2.0 mM 53BP1-Tudor, 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p53Kc382me2, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 25 mM sodium phosphate, 1.5 mM sodium azide, 2.0 mM [U-100% 15N] 53BP1-Tudor, 6.0 mM p53K382me2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 25 mM sodium phosphate, 1.5 mM sodium azide, 2.0 mM p53K382me2, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 25 mM sodium phosphate, 1.5 mM sodium azide, 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p53Kc382me2, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2MWY Mdmx-p53 提交 2014-12-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 15–29（15 aa） 片段：residues 15-23
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient
NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein 1, 1.2 mM protein 2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2MZD Characterization of the p300 Taz2-p53 TAD2 Complex and Comparison with the p300 Taz2-p53 TAD1 Complex 提交 2015-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 35–59（25 aa） 片段：UNP residues 35-59
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3；308 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient
NMR样品组成 1.1 mM Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 15N] Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2OCJ Human p53 core domain in the absence of DNA 提交 2006-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：core domain (residues 94-312)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；293 K；2 ul protein solution (5 mg/ml protein in 20 mM Tris, pH 7.6, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 ul reservoir buffer consisting of 100 mM Hepes, pH 7.6, 10 mM DTT, and 14-21% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000 above 500 ul reservoir buffer. Colorless plate-shaped crystals were obtained within a few days. VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.05 Å R-free 0.246
2OCJ Human p53 core domain in the absence of DNA 提交 2006-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：core domain (residues 94-312)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；293 K；2 ul protein solution (5 mg/ml protein in 20 mM Tris, pH 7.6, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 ul reservoir buffer consisting of 100 mM Hepes, pH 7.6, 10 mM DTT, and 14-21% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000 above 500 ul reservoir buffer. Colorless plate-shaped crystals were obtained within a few days. VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.05 Å R-free 0.246
2OCJ Human p53 core domain in the absence of DNA 提交 2006-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 94–312（219 aa） 片段：core domain (residues 94-312)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；293 K；2 ul protein solution (5 mg/ml protein in 20 mM Tris, pH 7.6, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 ul reservoir buffer consisting of 100 mM Hepes, pH 7.6, 10 mM DTT, and 14-21% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000 above 500 ul reservoir buffer. Colorless plate-shaped crystals were obtained within a few days. VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.05 Å R-free 0.246
2OCJ Human p53 core domain in the absence of DNA 提交 2006-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 94–312（219 aa） 片段：core domain (residues 94-312)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；293 K；2 ul protein solution (5 mg/ml protein in 20 mM Tris, pH 7.6, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 ul reservoir buffer consisting of 100 mM Hepes, pH 7.6, 10 mM DTT, and 14-21% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000 above 500 ul reservoir buffer. Colorless plate-shaped crystals were obtained within a few days. VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.05 Å R-free 0.246
2PCX Crystal structure of p53DBD(R282Q) at 1.54-angstrom Resolution 提交 2007-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–292（199 aa） 片段：p53 DBD DOMAIN
突变：R282Q ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；300 K；0.1M ammonium acetate, 25% PEG 3350, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K
分辨率 1.54 Å R-free 0.232
2RUK Solution structure of the complex between p53 transactivation domain 2 and TFIIH p62 PH domain 提交 2014-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 41–62（22 aa） 片段：p53 transactivation domain, UNP residues 41-62
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient
NMR样品组成 0.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TFIIH p62 PH domain-1, 0.48 mM p53 TAD2-2, 20 mM potassium phosphate-3, 5 mM [U-2H] DTT-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TFIIH p62 PH domain-5, 0.48 mM p53 TAD2-6, 20 mM potassium phosphate-7, 5 mM [U-2H] DTT-8, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2VUK Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the stabilizing small-molecule drug PhiKan083 提交 2008-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；294 K；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES PH 7.2, 19 % PEG 4000, 5 MM DTT. CRYSTALS WERE SOAKED WITH 10 MM PHIKAN083 IN CRYO BUFFER CONTAINING 100 MM HEPES PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 19 % PEG 4000, 20 % GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.50 Å R-free 0.208
2VUK Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the stabilizing small-molecule drug PhiKan083 提交 2008-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 P83 1-(9-ethyl-9H-carbazol-3-yl)-N-methylmethanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；294 K；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES PH 7.2, 19 % PEG 4000, 5 MM DTT. CRYSTALS WERE SOAKED WITH 10 MM PHIKAN083 IN CRYO BUFFER CONTAINING 100 MM HEPES PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 19 % PEG 4000, 20 % GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.50 Å R-free 0.208
2WGX HUMAN P53 CORE DOMAIN MUTANT M133L-V203A-Y236F-N239Y-T253I-N268D 提交 2009-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；294 K；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES PH 7.2, 19 % PEG 4000, 5 MM DTT.
分辨率 1.75 Å R-free 0.199
2WGX HUMAN P53 CORE DOMAIN MUTANT M133L-V203A-Y236F-N239Y-T253I-N268D 提交 2009-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；294 K；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES PH 7.2, 19 % PEG 4000, 5 MM DTT.
分辨率 1.75 Å R-free 0.199
2X0U STRUCTURE OF THE P53 CORE DOMAIN MUTANT Y220C BOUND TO A 2-amino substituted benzothiazole scaffold 提交 2009-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；294 K；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES PH 7.2, 19% PEG 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: SATURATED SOLUTION OF SMALL MOLECULE LIGAND IN 100 MM HEPES PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 19% PEG 4000, 20% GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.60 Å R-free 0.193
2X0U STRUCTURE OF THE P53 CORE DOMAIN MUTANT Y220C BOUND TO A 2-amino substituted benzothiazole scaffold 提交 2009-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X0U 6,7-DIHYDRO[1,4]DIOXINO[2,3-F][1,3]BENZOTHIAZOL-2-AMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；294 K；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES PH 7.2, 19% PEG 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: SATURATED SOLUTION OF SMALL MOLECULE LIGAND IN 100 MM HEPES PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 19% PEG 4000, 20% GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.60 Å R-free 0.193
2X0V STRUCTURE OF THE P53 CORE DOMAIN MUTANT Y220C BOUND TO 4-(trifluoromethyl)benzene-1,2-diamine 提交 2009-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；294 K；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES PH 7.2, 19 % PEG 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: SATURATED SOLUTION OF SMALL MOLECULE LIGAND IN 100 MM HEPES PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 19 % PEG 4000, 20 % GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.80 Å R-free 0.189
2X0V STRUCTURE OF THE P53 CORE DOMAIN MUTANT Y220C BOUND TO 4-(trifluoromethyl)benzene-1,2-diamine 提交 2009-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X0V 4-(TRIFLUOROMETHYL)BENZENE-1,2-DIAMINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；294 K；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES PH 7.2, 19 % PEG 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: SATURATED SOLUTION OF SMALL MOLECULE LIGAND IN 100 MM HEPES PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 19 % PEG 4000, 20 % GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.80 Å R-free 0.189
2X0W STRUCTURE OF THE P53 CORE DOMAIN MUTANT Y220C BOUND TO 5,6-dimethoxy- 2-methylbenzothiazole 提交 2009-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES PH 7.2, 19% PEG 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: SATURATED SOLUTION OF SMALL MOLECULE LIGAND IN 100 MM HEPES PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 19% PEG 4000, 20% GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
2X0W STRUCTURE OF THE P53 CORE DOMAIN MUTANT Y220C BOUND TO 5,6-dimethoxy- 2-methylbenzothiazole 提交 2009-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X0W 5,6-DIMETHOXY-2-METHYL-1,3-BENZOTHIAZOLE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES PH 7.2, 19% PEG 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: SATURATED SOLUTION OF SMALL MOLECULE LIGAND IN 100 MM HEPES PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE PH 7.2, 19% PEG 4000, 20% GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
2XWR Crystal structure of the DNA-binding domain of human p53 with extended N terminus 提交 2010-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 89–293（205 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 89-293
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION AT 17 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 5.4 MG/ML IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 220 MM NACL, AND 5 MM DTT. RESERVOIR SOLUTION: 100 MM BIS-TRIS, PH 5.5, 23% PEG 3350, 200 MM AMMONIUM SULFATE.
分辨率 1.68 Å R-free 0.209
2XWR Crystal structure of the DNA-binding domain of human p53 with extended N terminus 提交 2010-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 89–293（205 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 89-293
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION AT 17 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 5.4 MG/ML IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 220 MM NACL, AND 5 MM DTT. RESERVOIR SOLUTION: 100 MM BIS-TRIS, PH 5.5, 23% PEG 3350, 200 MM AMMONIUM SULFATE.
分辨率 1.68 Å R-free 0.209
2YBG Structure of Lys120-acetylated p53 core domain 提交 2011-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-293
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 PROTEIN SOLUTION: 5 MG/ML PROTEIN IN 20 MM CITRATE BUFFER PH 6.1, 150 MM NACL, 10 MM DTT. CRYSTALLIZATION BUFFER: 26% (W/V) PEG 3350, 43 MM SODIUM ACETATE AND 100 MM HEPES, PH 7.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.226
2YBG Structure of Lys120-acetylated p53 core domain 提交 2011-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–293（200 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-293
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 PROTEIN SOLUTION: 5 MG/ML PROTEIN IN 20 MM CITRATE BUFFER PH 6.1, 150 MM NACL, 10 MM DTT. CRYSTALLIZATION BUFFER: 26% (W/V) PEG 3350, 43 MM SODIUM ACETATE AND 100 MM HEPES, PH 7.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.226
2YBG Structure of Lys120-acetylated p53 core domain 提交 2011-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 94–293（200 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-293
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 PROTEIN SOLUTION: 5 MG/ML PROTEIN IN 20 MM CITRATE BUFFER PH 6.1, 150 MM NACL, 10 MM DTT. CRYSTALLIZATION BUFFER: 26% (W/V) PEG 3350, 43 MM SODIUM ACETATE AND 100 MM HEPES, PH 7.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.226
2YBG Structure of Lys120-acetylated p53 core domain 提交 2011-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 94–293（200 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-293
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 PROTEIN SOLUTION: 5 MG/ML PROTEIN IN 20 MM CITRATE BUFFER PH 6.1, 150 MM NACL, 10 MM DTT. CRYSTALLIZATION BUFFER: 26% (W/V) PEG 3350, 43 MM SODIUM ACETATE AND 100 MM HEPES, PH 7.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.226
2YDR CpOGA D298N in complex with p53-derived O-GlcNAc peptide 提交 2011-03-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 144–154（11 aa） 片段：RESIDUES 144-154
未记录 CD CADMIUM ION × 18 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；0.6 M NAAC, 0.175 M CDSO4, 0.1 M HEPES PH 7.5
分辨率 2.75 Å R-free 0.219
2Z5S Molecular basis for the inhibition of p53 by Mdmx 提交 2007-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 15–29（15 aa） 片段：TRANSACTIVATION DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；280 K；30% PEG 300, 0.1M MES pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 280K
分辨率 2.30 Å R-free 0.310
2Z5S Molecular basis for the inhibition of p53 by Mdmx 提交 2007-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Q 15–29（15 aa） 片段：TRANSACTIVATION DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；280 K；30% PEG 300, 0.1M MES pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 280K
分辨率 2.30 Å R-free 0.310
2Z5S Molecular basis for the inhibition of p53 by Mdmx 提交 2007-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 R 15–29（15 aa） 片段：TRANSACTIVATION DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；280 K；30% PEG 300, 0.1M MES pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 280K
分辨率 2.30 Å R-free 0.310
2Z5T Molecular basis for the inhibition of p53 by Mdmx 提交 2007-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 15–29（15 aa） 片段：TRANSACTIVATION DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；280 K；30% PEG 300, 0.1M MES, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 280K
分辨率 2.30 Å R-free 0.264
2Z5T Molecular basis for the inhibition of p53 by Mdmx 提交 2007-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Q 15–29（15 aa） 片段：TRANSACTIVATION DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；280 K；30% PEG 300, 0.1M MES, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 280K
分辨率 2.30 Å R-free 0.264
2Z5T Molecular basis for the inhibition of p53 by Mdmx 提交 2007-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 R 15–29（15 aa） 片段：TRANSACTIVATION DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；280 K；30% PEG 300, 0.1M MES, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 280K
分辨率 2.30 Å R-free 0.264
3D05 Human p53 core domain with hot spot mutation R249S (II) 提交 2008-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 Core Domain, UNP residues 94-293
突变：R249S ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；0.2M Sodium Acetate, 20% PEG 3350, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.264
3D06 Human p53 core domain with hot spot mutation R249S (I) 提交 2008-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 Core Domain, UNP residues 94-293
突变：R249S ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；0.15M Sodium acetate, 20% PEG 3350, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.20 Å R-free 0.202
3D07 Human p53 core domain with hot spot mutation R249S (III) 提交 2008-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 Core Domain, UNP residues 94-293
突变：R249S ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；0.2M Sodium Acetate, 20% PEG 3350, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.256
3D07 Human p53 core domain with hot spot mutation R249S (III) 提交 2008-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–293（200 aa） 片段：p53 Core Domain, UNP residues 94-293
突变：R249S ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；0.2M Sodium Acetate, 20% PEG 3350, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.256
3D08 Human p53 core domain with hot spot mutation R249S and second-site suppressor mutation H168R 提交 2008-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 Core Domain, UNP residues 94-293
突变：R249S, H168R ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；0.2M Sodium acetate, 20% PEG3350, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.212
3D09 Human p53 core domain with hot spot mutation R249S and second-site suppressor mutations H168R and T123A 提交 2008-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 Core Domain, UNP residues 94-293
突变：R249S, H168R, T123A ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；0.2M Sodium Acetate, 20% PEG 3350, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.262
3D0A Human p53 core domain with hot spot mutation R249S and second site suppressor mutation H168R in sequence-specific complex with DNA 提交 2008-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：P53 core domain, UNP residues 94-293
链 B 94–293（200 aa） 片段：P53 core domain, UNP residues 94-293
突变：R249S, H168R 突变：R249S, H168R ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；0.2 M ammonium formate, 20% PEG 3350, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.241
3D0A Human p53 core domain with hot spot mutation R249S and second site suppressor mutation H168R in sequence-specific complex with DNA 提交 2008-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 94–293（200 aa） 片段：P53 core domain, UNP residues 94-293
链 D 94–293（200 aa） 片段：P53 core domain, UNP residues 94-293
突变：R249S, H168R 突变：R249S, H168R ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；0.2 M ammonium formate, 20% PEG 3350, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.241
3DAB Structure of the human Mdmx protein bound to the p53 tumor suppressor transactivation domain 提交 2008-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 15–29（15 aa） 片段：UNP residues 15-29
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；25% PEG3350, 0.1M MES, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K
分辨率 1.90 Å R-free 0.257
3DAB Structure of the human Mdmx protein bound to the p53 tumor suppressor transactivation domain 提交 2008-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 15–29（15 aa） 片段：UNP residues 15-29
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；25% PEG3350, 0.1M MES, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K
分辨率 1.90 Å R-free 0.257
3DAB Structure of the human Mdmx protein bound to the p53 tumor suppressor transactivation domain 提交 2008-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 15–29（15 aa） 片段：UNP residues 15-29
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；25% PEG3350, 0.1M MES, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K
分辨率 1.90 Å R-free 0.257
3DAB Structure of the human Mdmx protein bound to the p53 tumor suppressor transactivation domain 提交 2008-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 15–29（15 aa） 片段：UNP residues 15-29
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；25% PEG3350, 0.1M MES, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K
分辨率 1.90 Å R-free 0.257
3DAC Structure of the human Mdmx protein bound to the p53 tumor suppressor transactivation domain 提交 2008-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 17–37（21 aa） 片段：UNP residues 17-37
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；30% PEG300, 0.1M MES, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 1.80 Å R-free 0.243
3DAC Structure of the human Mdmx protein bound to the p53 tumor suppressor transactivation domain 提交 2008-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 17–37（21 aa） 片段：UNP residues 17-37
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；30% PEG300, 0.1M MES, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 1.80 Å R-free 0.243
3IGK Diversity in DNA recognition by p53 revealed by crystal structures with Hoogsteen base pairs (p53-DNA complex 2) 提交 2009-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：P53 core domain, unp residues 94-293
突变：H168R, R249S ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；0.16M SODIUM ACETATE, 16% PEG 3350, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.214
3IGL Diversity in DNA recognition by p53 revealed by crystal structures with Hoogsteen base pairs (p53-DNA complex 1) 提交 2009-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：P53 core domain, unp residues 94-293
未记录 ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；0.16M SODIUM ACETATE, 16% PEG 3350, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.212
3KMD Crystal structure of the p53 core domain bound to a full consensus site as a self-assembled tetramer 提交 2009-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 92–291（200 aa） 片段：UNP residues 92-291, DNA binding domain
链 B 92–291（200 aa） 片段：UNP residues 92-291, DNA binding domain
链 C 92–291（200 aa） 片段：UNP residues 92-291, DNA binding domain
链 D 92–291（200 aa） 片段：UNP residues 92-291, DNA binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 6.68；291 K；16% PEG 4000, 142mM Nacl, pH 6.68, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.15 Å R-free 0.239
3KZ8 Diversity in DNA recognition by p53 revealed by crystal structures with Hoogsteen base pairs (p53-DNA complex 3) 提交 2009-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：P53 core domain, UNP residues 94-293
链 B 94–293（200 aa） 片段：P53 core domain, UNP residues 94-293
未记录 ZN ZINC ION × 4 IOD IODIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；0.20M AMMONIUM IODIDE, 20% PEG 3350, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.91 Å R-free 0.266
3LW1 Binary complex of 14-3-3 sigma and p53 pT387-peptide 提交 2010-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 385–393（9 aa） 片段：UNP residues 385-393
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 28% PEG 400, 5% glycerol, 2mM DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.28 Å R-free 0.151
3PDH Structure of Sir2Tm bound to a propionylated peptide 提交 2010-10-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 372–389（18 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；Crystals were obtained from 1:1 mix of protein and the well solution (9.5% (w/v) PEG3350, 100 mM CHES buffer), pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.210
3Q01 An induced fit mechanism regulates p53 DNA binding kinetics to confer sequence specificity 提交 2010-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 94–291（198 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 94-291) and Oligomerization (Res 322-356) domains
链 A 322–356（35 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 94-291) and Oligomerization (Res 322-356) domains
链 B 94–291（198 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 94-291) and Oligomerization (Res 322-356) domains
链 B 322–356（35 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 94-291) and Oligomerization (Res 322-356) domains
突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322T, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322T, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322T, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322T, L323M, M340Q, L344R, G356T ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M HEPES, pH 7.5, 45% v/v 2-Methyl-2,4-pentanediol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.282
3Q05 An induced fit mechanism regulates p53 DNA binding kinetics to confer sequence specificity 提交 2010-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 94–291（198 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 94-291) and Oligomerization (Res 321-356) domains
链 A 321–356（36 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 94-291) and Oligomerization (Res 321-356) domains
链 B 94–291（198 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 94-291) and Oligomerization (Res 321-356) domains
链 B 321–356（36 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 94-291) and Oligomerization (Res 321-356) domains
链 C 94–291（198 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 94-291) and Oligomerization (Res 321-356) domains
链 C 321–356（36 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 94-291) and Oligomerization (Res 321-356) domains
链 D 94–291（198 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 94-291) and Oligomerization (Res 321-356) domains
链 D 321–356（36 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 94-291) and Oligomerization (Res 321-356) domains
突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322A, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322A, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322A, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322A, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322A, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322A, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322A, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322A, L323M, M340Q, L344R, G356T ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.15M DL-Malic Acid [pH 7.0], 20% Polyethylene Glycol 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.40 Å R-free 0.267
3Q06 An induced fit mechanism regulates p53 DNA binding kinetics to confer sequence specificity 提交 2010-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 96–292（197 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 96-292) and Oligomerization (Res 321-356) domains
链 A 321–354（34 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 96-292) and Oligomerization (Res 321-356) domains
链 B 96–292（197 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 96-292) and Oligomerization (Res 321-356) domains
链 B 321–354（34 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 96-292) and Oligomerization (Res 321-356) domains
链 C 96–292（197 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 96-292) and Oligomerization (Res 321-356) domains
链 C 321–354（34 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 96-292) and Oligomerization (Res 321-356) domains
链 D 96–292（197 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 96-292) and Oligomerization (Res 321-356) domains
链 D 321–354（34 aa） 片段：p53 DNA-binding (Res 96-292) and Oligomerization (Res 321-356) domains
突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, M340Q, L344R, G356T ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.15M DL-Malic Acid pH 7.0, 20% Polyethylene Glycol 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.314
3SAK HIGH RESOLUTION SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE OLIGOMERIZATION DOMAIN OF P53 BY MULTI-DIMENSIONAL NMR (SAC STRUCTURES) 提交 1999-04-30 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 319–360（42 aa） 片段：OLIGOMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 319 - 360
链 B 319–360（42 aa） 片段：OLIGOMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 319 - 360
链 C 319–360（42 aa） 片段：OLIGOMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 319 - 360
链 D 319–360（42 aa） 片段：OLIGOMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 319 - 360
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 308 K
分辨率未提供
3TG5 Structure of SMYD2 in complex with p53 and SAH 提交 2011-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 365–375（11 aa） 片段：UNP residues 365-375
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.1M Hepes (pH 7.5), 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.263
3TS8 Crystal structure of a multidomain human p53 tetramer bound to the natural CDKN1A(p21) p53-response element 提交 2011-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 94–291（198 aa） 片段：p53 DNA-binding (UNP residues 94-291) and Oligomerization (UNP residues 321-356) domains
链 A 321–356（36 aa） 片段：p53 DNA-binding (UNP residues 94-291) and Oligomerization (UNP residues 321-356) domains
链 B 94–291（198 aa） 片段：p53 DNA-binding (UNP residues 94-291) and Oligomerization (UNP residues 321-356) domains
链 B 321–356（36 aa） 片段：p53 DNA-binding (UNP residues 94-291) and Oligomerization (UNP residues 321-356) domains
链 C 94–291（198 aa） 片段：p53 DNA-binding (UNP residues 94-291) and Oligomerization (UNP residues 321-356) domains
链 C 321–356（36 aa） 片段：p53 DNA-binding (UNP residues 94-291) and Oligomerization (UNP residues 321-356) domains
链 D 94–291（198 aa） 片段：p53 DNA-binding (UNP residues 94-291) and Oligomerization (UNP residues 321-356) domains
链 D 321–356（36 aa） 片段：p53 DNA-binding (UNP residues 94-291) and Oligomerization (UNP residues 321-356) domains
突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322t, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322t, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322t, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322t, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322t, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322t, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322t, L323M, M340Q, L344R, G356T 突变：C135V, C141V, W146Y, C182S, V203A, R209P, C229Y, H233Y, Y234F, N235K, Y236F, T253V, N268D, P322t, L323M, M340Q, L344R, G356T ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.2 M potassium tartrate tetrahydrate, 20% Polyethylene Glycol 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.283
3ZME Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the small molecule PhiKan7242 提交 2013-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：Y220C ZN ZINC ION × 1 QC5 2-(4-(4-fluorophenyl)-5-(1H-pyrrol-1-yl)-1H-pyrazol-1-yl)-N,N-dimethylethanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；294 K；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 40 MM COMPOUND (PK7204) IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL. SOAKING TIME: 3 HOURS.
分辨率 1.35 Å R-free 0.175
3ZME Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the small molecule PhiKan7242 提交 2013-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：Y220C ZN ZINC ION × 1 QC5 2-(4-(4-fluorophenyl)-5-(1H-pyrrol-1-yl)-1H-pyrazol-1-yl)-N,N-dimethylethanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；294 K；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 40 MM COMPOUND (PK7204) IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL. SOAKING TIME: 3 HOURS.
分辨率 1.35 Å R-free 0.175
4AGL Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the stabilizing small molecule PhiKan784 提交 2012-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES P84 2,4-BIS(IODANYL)-6-[[METHYL-(1-METHYLPIPERIDIN-4-YL)AMINO]METHYL]PHENOL × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.70 Å R-free 0.193
4AGL Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the stabilizing small molecule PhiKan784 提交 2012-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES P84 2,4-BIS(IODANYL)-6-[[METHYL-(1-METHYLPIPERIDIN-4-YL)AMINO]METHYL]PHENOL × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.70 Å R-free 0.193
4AGM Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the stabilizing small molecule PhiKan5086 提交 2012-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES P86 2-{[4-(DIETHYLAMINO)PIPERIDIN-1-YL]METHYL}-4,6-DIIODOPHENOL × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.52 Å R-free 0.197
4AGM Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the stabilizing small molecule PhiKan5086 提交 2012-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES P86 2-{[4-(DIETHYLAMINO)PIPERIDIN-1-YL]METHYL}-4,6-DIIODOPHENOL × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.52 Å R-free 0.197
4AGN Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the stabilizing small molecule PhiKan5116 提交 2012-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 NXG 2-{[4-(DIETHYLAMINO)PIPERIDIN-1-YL]METHYL}-4-(3-HYDROXYPROP-1-YN-1-YL)-6-IODOPHENOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.60 Å R-free 0.194
4AGN Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the stabilizing small molecule PhiKan5116 提交 2012-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 NXG 2-{[4-(DIETHYLAMINO)PIPERIDIN-1-YL]METHYL}-4-(3-HYDROXYPROP-1-YN-1-YL)-6-IODOPHENOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.60 Å R-free 0.194
4AGO Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the stabilizing small molecule PhiKan5174 提交 2012-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES P74 TERT-BUTYL [3-(3-{[4-(DIETHYLAMINO)PIPERIDIN-1-YL]METHYL}-4-HYDROXY-5-IODOPHENYL)PROP-2-YN-1-YL]CARBAMATE × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.45 Å R-free 0.217
4AGO Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the stabilizing small molecule PhiKan5174 提交 2012-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES P74 TERT-BUTYL [3-(3-{[4-(DIETHYLAMINO)PIPERIDIN-1-YL]METHYL}-4-HYDROXY-5-IODOPHENYL)PROP-2-YN-1-YL]CARBAMATE × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.45 Å R-free 0.217
4AGP Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the stabilizing small molecule PhiKan5176 提交 2012-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES P51 2-{[4-(diethylamino)piperidin-1-yl]methyl}-6-iodo-4-(3-phenoxyprop-1-yn-1-yl)phenol × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.50 Å R-free 0.187
4AGP Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the stabilizing small molecule PhiKan5176 提交 2012-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES P51 2-{[4-(diethylamino)piperidin-1-yl]methyl}-6-iodo-4-(3-phenoxyprop-1-yn-1-yl)phenol × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.50 Å R-free 0.187
4AGQ Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the stabilizing small molecule PhiKan5196 提交 2012-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES P96 2-{[4-(diethylamino)piperidin-1-yl]methyl}-6-iodo-4-[3-(phenylamino)prop-1-yn-1-yl]phenol × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 13 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.42 Å R-free 0.192
4AGQ Structure of the p53 core domain mutant Y220C bound to the stabilizing small molecule PhiKan5196 提交 2012-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES P96 2-{[4-(diethylamino)piperidin-1-yl]methyl}-6-iodo-4-[3-(phenylamino)prop-1-yn-1-yl]phenol × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 13 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.42 Å R-free 0.192
4BUZ SIR2 COMPLEX STRUCTURE MIXTURE OF EX-527 INHIBITOR AND REACTION PRODUCTS OR OF REACTION SUBSTRATES P53 PEPTIDE AND NAD 提交 2013-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 379–386（8 aa） 片段：RESIDUES 379-386
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） OCZ (1S)-6-chloro-2,3,4,9-tetrahydro-1H-carbazole-1- carboxamide × 1 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 OAD 2'-O-ACETYL ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；8.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.194
4BV2 CRYSTAL STRUCTURE OF SIR2 IN COMPLEX WITH THE INHIBITOR EX-527, 2'-O-ACETYL-ADP-RIBOSE AND DEACETYLATED P53-PEPTIDE 提交 2013-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 376–388（13 aa） 片段：RESIDUES 380-384
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.9；20% PEG 6000, 0.1 M BIS-TRIS PH5.9
分辨率 3.30 Å R-free 0.318
4BV2 CRYSTAL STRUCTURE OF SIR2 IN COMPLEX WITH THE INHIBITOR EX-527, 2'-O-ACETYL-ADP-RIBOSE AND DEACETYLATED P53-PEPTIDE 提交 2013-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 376–388（13 aa） 片段：RESIDUES 380-384
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.9；20% PEG 6000, 0.1 M BIS-TRIS PH5.9
分辨率 3.30 Å R-free 0.318
4BV2 CRYSTAL STRUCTURE OF SIR2 IN COMPLEX WITH THE INHIBITOR EX-527, 2'-O-ACETYL-ADP-RIBOSE AND DEACETYLATED P53-PEPTIDE 提交 2013-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 376–388（13 aa） 片段：RESIDUES 380-384
未记录 ZN ZINC ION × 1 OCZ (1S)-6-chloro-2,3,4,9-tetrahydro-1H-carbazole-1- carboxamide × 1 OAD 2'-O-ACETYL ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.9；20% PEG 6000, 0.1 M BIS-TRIS PH5.9
分辨率 3.30 Å R-free 0.318
4BV2 CRYSTAL STRUCTURE OF SIR2 IN COMPLEX WITH THE INHIBITOR EX-527, 2'-O-ACETYL-ADP-RIBOSE AND DEACETYLATED P53-PEPTIDE 提交 2013-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 376–388（13 aa） 片段：RESIDUES 380-384
未记录 ZN ZINC ION × 1 OCZ (1S)-6-chloro-2,3,4,9-tetrahydro-1H-carbazole-1- carboxamide × 1 OAD 2'-O-ACETYL ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.9；20% PEG 6000, 0.1 M BIS-TRIS PH5.9
分辨率 3.30 Å R-free 0.318
4FZ3 Crystal structure of SIRT3 in complex with acetyl p53 peptide coupled with 4-amino-7-methylcoumarin 提交 2012-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 379–382（4 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；0.85M HEPES-NA, 8.5%(V/V) ISO-PROPANOL, 17%(W/V) PEG4000, 15%(V/V) GLYCEROL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.10 Å R-free 0.282
4HFZ Crystal Structure of an MDM2/P53 Peptide Complex 提交 2012-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 15–29（15 aa） 片段：residues 15-29
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；277 K；0.2 M (NH4)2SO4, pH 4.6 and 30% w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.69 Å R-free 0.247
4HFZ Crystal Structure of an MDM2/P53 Peptide Complex 提交 2012-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 15–29（15 aa） 片段：residues 15-29
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；277 K；0.2 M (NH4)2SO4, pH 4.6 and 30% w/v PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.69 Å R-free 0.247
4HJE Crystal structure of p53 core domain in complex with DNA 提交 2012-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 92–291（200 aa） 片段：UNP residues 92-291
链 B 92–291（200 aa） 片段：UNP residues 92-291
链 C 92–291（200 aa） 片段：UNP residues 92-291
链 D 92–291（200 aa） 片段：UNP residues 92-291
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.91 Å R-free 0.228
4IBQ Human p53 core domain with hot spot mutation R273C 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273C ZN ZINC ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；20% PEG 3350, 0.1M K-Acetate, 0.1M KF, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.163
4IBQ Human p53 core domain with hot spot mutation R273C 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273C ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；20% PEG 3350, 0.1M K-Acetate, 0.1M KF, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.163
4IBQ Human p53 core domain with hot spot mutation R273C 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273C ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；20% PEG 3350, 0.1M K-Acetate, 0.1M KF, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.163
4IBQ Human p53 core domain with hot spot mutation R273C 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273C ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；20% PEG 3350, 0.1M K-Acetate, 0.1M KF, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.163
4IBS Human p53 core domain with hot spot mutation R273H (form I) 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273H ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；12% PEG 3350, 0.12M Mg-Formate, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.78 Å R-free 0.181
4IBS Human p53 core domain with hot spot mutation R273H (form I) 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273H ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；12% PEG 3350, 0.12M Mg-Formate, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.78 Å R-free 0.181
4IBS Human p53 core domain with hot spot mutation R273H (form I) 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273H ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；12% PEG 3350, 0.12M Mg-Formate, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.78 Å R-free 0.181
4IBS Human p53 core domain with hot spot mutation R273H (form I) 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273H ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；12% PEG 3350, 0.12M Mg-Formate, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.78 Å R-free 0.181
4IBT Human p53 core domain with hot spot mutation R273H and second-site suppressor mutation T284R 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273H, T284R ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；20% PEG 3350, 0.2M NaF, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.182
4IBT Human p53 core domain with hot spot mutation R273H and second-site suppressor mutation T284R 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273H, T284R ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；20% PEG 3350, 0.2M NaF, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.182
4IBT Human p53 core domain with hot spot mutation R273H and second-site suppressor mutation T284R 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273H, T284R ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；20% PEG 3350, 0.2M NaF, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.182
4IBT Human p53 core domain with hot spot mutation R273H and second-site suppressor mutation T284R 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273H, T284R ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；20% PEG 3350, 0.2M NaF, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.182
4IBU Human p53 core domain with hot spot mutation R273C and second-site suppressor mutation T284R in sequence-specific complex with DNA 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
链 B 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
链 C 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
链 D 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273C, T284R 突变：R273C, T284R 突变：R273C, T284R 突变：R273C, T284R ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；1:2 PROTEIN/DNA RATIO, 14% PEG 3350, 0.14M Li-Acetate, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.197
4IBV Human p53 core domain with hot spot mutation R273C and second-site suppressor mutation S240R in sequence-specific complex with DNA 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273C, S240R EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；1:2.4 PROTEIN/DNA RATIO, 16% PEG 3350, 0.18M NH4F, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4IBW Human p53 core domain with hot spot mutation R273H and second-site suppressor mutation T284R in sequence-specific complex with DNA 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273H, T284R ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 34 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；1:2.4 PROTEIN/DNA RATIO, 14% PEG 3350, 0.14M NH4F, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.79 Å R-free 0.188
4IBY Human p53 core domain with hot spot mutation R273H and second-site suppressor mutation S240R 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273H, S240R ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Na2HPO4, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.45 Å R-free 0.200
4IBY Human p53 core domain with hot spot mutation R273H and second-site suppressor mutation S240R 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273H, S240R ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Na2HPO4, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.45 Å R-free 0.200
4IBZ Human p53 core domain with hot spot mutation R273C and second-site suppressor mutation T284R 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273C, T284R ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；12% PEG 3350, 0.12M NH4-Acetate, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.92 Å R-free 0.233
4IBZ Human p53 core domain with hot spot mutation R273C and second-site suppressor mutation T284R 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273C, T284R ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；12% PEG 3350, 0.12M NH4-Acetate, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.92 Å R-free 0.233
4IBZ Human p53 core domain with hot spot mutation R273C and second-site suppressor mutation T284R 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273C, T284R ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；12% PEG 3350, 0.12M NH4-Acetate, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.92 Å R-free 0.233
4IBZ Human p53 core domain with hot spot mutation R273C and second-site suppressor mutation T284R 提交 2012-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273C, T284R ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；12% PEG 3350, 0.12M NH4-Acetate, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.92 Å R-free 0.233
4IJT Human p53 core domain with hot spot mutation R273H (form II) 提交 2012-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa） 片段：DNA binding domain
突变：R273H ZN ZINC ION × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；293 K；1:1.5 PROTEIN/DNA RATIO, 20% PEG 3350, 0.2M KCl, pH 6.1, Vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.78 Å R-free 0.194
4KVP Human p53 Core Domain Mutant V157F 提交 2013-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：p53 Core Domain
突变：V157F ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；2 microliter protein solution (around 5.0-7.0 mg/ml protein in 20 mM Tris, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 microliter reservoir buffer (25% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 2000 monomethyl ether (MME)), pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.50 Å R-free 0.210
4KVP Human p53 Core Domain Mutant V157F 提交 2013-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：p53 Core Domain
突变：V157F ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；2 microliter protein solution (around 5.0-7.0 mg/ml protein in 20 mM Tris, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 microliter reservoir buffer (25% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 2000 monomethyl ether (MME)), pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.50 Å R-free 0.210
4KVP Human p53 Core Domain Mutant V157F 提交 2013-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 94–312（219 aa） 片段：p53 Core Domain
突变：V157F ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；2 microliter protein solution (around 5.0-7.0 mg/ml protein in 20 mM Tris, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 microliter reservoir buffer (25% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 2000 monomethyl ether (MME)), pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.50 Å R-free 0.210
4KVP Human p53 Core Domain Mutant V157F 提交 2013-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 94–312（219 aa） 片段：p53 Core Domain
突变：V157F ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；2 microliter protein solution (around 5.0-7.0 mg/ml protein in 20 mM Tris, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 microliter reservoir buffer (25% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 2000 monomethyl ether (MME)), pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.50 Å R-free 0.210
4LO9 Human p53 Core Domain Mutant N235K 提交 2013-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：p53 Core Domain (UNP residues 94-312)
突变：N235K ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；2 microliter protein solution (around 5.0-7.0 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.6, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 microliter reservoir buffer(100 mM HEPES, 30 % (w/v) polyethylene glycol (PEG) 6000, pH 7.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.247
4LO9 Human p53 Core Domain Mutant N235K 提交 2013-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：p53 Core Domain (UNP residues 94-312)
突变：N235K ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；2 microliter protein solution (around 5.0-7.0 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.6, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 microliter reservoir buffer(100 mM HEPES, 30 % (w/v) polyethylene glycol (PEG) 6000, pH 7.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.247
4LO9 Human p53 Core Domain Mutant N235K 提交 2013-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 94–312（219 aa） 片段：p53 Core Domain (UNP residues 94-312)
突变：N235K ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；2 microliter protein solution (around 5.0-7.0 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.6, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 microliter reservoir buffer(100 mM HEPES, 30 % (w/v) polyethylene glycol (PEG) 6000, pH 7.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.247
4LO9 Human p53 Core Domain Mutant N235K 提交 2013-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 94–312（219 aa） 片段：p53 Core Domain (UNP residues 94-312)
突变：N235K ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；2 microliter protein solution (around 5.0-7.0 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.6, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 microliter reservoir buffer(100 mM HEPES, 30 % (w/v) polyethylene glycol (PEG) 6000, pH 7.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.247
4LOE Human p53 Core Domain Mutant N239Y 提交 2013-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：p53 Core Domain (UNP residues 94-312)
突变：N239Y ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；277 K；2 microliter protein solution (around 5.0-7.0 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.6, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 microliter reservoir buffer(200 mM lithium acetate, 20% (w/v) PEG 3350), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.244
4LOE Human p53 Core Domain Mutant N239Y 提交 2013-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：p53 Core Domain (UNP residues 94-312)
突变：N239Y ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；277 K；2 microliter protein solution (around 5.0-7.0 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.6, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 microliter reservoir buffer(200 mM lithium acetate, 20% (w/v) PEG 3350), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.244
4LOE Human p53 Core Domain Mutant N239Y 提交 2013-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 94–312（219 aa） 片段：p53 Core Domain (UNP residues 94-312)
突变：N239Y ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；277 K；2 microliter protein solution (around 5.0-7.0 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.6, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 microliter reservoir buffer(200 mM lithium acetate, 20% (w/v) PEG 3350), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.244
4LOE Human p53 Core Domain Mutant N239Y 提交 2013-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 94–312（219 aa） 片段：p53 Core Domain (UNP residues 94-312)
突变：N239Y ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；277 K；2 microliter protein solution (around 5.0-7.0 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.6, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 microliter reservoir buffer(200 mM lithium acetate, 20% (w/v) PEG 3350), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.244
4LOF Human p53 Core Domain Mutant V157F/N235K/N239Y 提交 2013-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：p53 Core Domain (UNP residues 94-312)
突变：V157F, N235K, N239Y ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.6；2 microliters protein solution (around 5.0-7.0 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.6, 150 mM NaCl, 10 mM DTT) were mixed with 2 microliters reservoir buffer with 200 mM di-sodium hydrogen phosphate dehydrate (Na2HPO4), 20% (w/v) PEG 3350, VAPOR DIFFUSION
分辨率 2.00 Å R-free 0.256
4MZI Crystal structure of a human mutant p53 提交 2013-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–292（199 aa） 片段：UNP residues 94-292
突变：S121F, V122G ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；278 K；pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 1.25 Å R-free 0.201
4MZR Crystal structure of a polypeptide p53 mutant bound to DNA 提交 2013-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 94–358（265 aa） 片段：UNP residues 94-358
链 B 94–358（265 aa） 片段：UNP residues 94-358
链 C 94–358（265 aa） 片段：UNP residues 94-358
链 D 94–358（265 aa） 片段：UNP residues 94-358
突变：S121F, V122G 突变：S121F, V122G 突变：S121F, V122G 突变：S121F, V122G ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；278 K；0.2M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 20% PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.90 Å R-free 0.281
4QO1 p53 DNA binding domain in complex with Nb139 提交 2014-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 92–312（221 aa） 片段：p53DBD, unp residues 92-312
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Crystals of the complex were obtained at 293K using the hanging-drop vapour diffusion method after mixing 1:l protein solution with 1:l reservoir solution equilibrated against 125 ul 0.2 M potassium formate 20% w/v PEG 3350 reservoir solution, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.92 Å R-free 0.205
4RP6 Structure of the amyloid-forming segment LTIITLE from p53 (residues 252-258) 提交 2014-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 Z 252–258（7 aa） 片段：UNP residues 252-258
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；reservoir contained 0.1 M Tris buffer pH 8.5 and 20% ethanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.70 Å R-free 0.192
4RP7 Structure of the amyloid-forming segment TIITLE from p53 (residues 253-258) 提交 2014-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 Z 253–258（6 aa） 片段：UNP residues 253-258
未记录 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；reservoir contained 0.01 M zinc chloride, 0.1 M MES buffer pH 6, and 20% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.58 Å R-free 0.193
4XR8 Crystal structure of the HPV16 E6/E6AP/p53 ternary complex at 2.25 A resolution 提交 2015-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 55–253（199 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 ZN ZINC ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；290 K；7.5 % PEG 20K, 0.05 M MES pH 6.5
分辨率 2.25 Å R-free 0.246
4XR8 Crystal structure of the HPV16 E6/E6AP/p53 ternary complex at 2.25 A resolution 提交 2015-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 55–253（199 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；290 K；7.5 % PEG 20K, 0.05 M MES pH 6.5
分辨率 2.25 Å R-free 0.246
5A7B Structure of the p53 cancer Y220C bound to the stabilizing small molecule PhiKan5211 提交 2015-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 KMN 2-[[4-(diethylamino)piperidin-1-yl]methyl]-6-ethynyl-4-(3-phenoxyprop-1-ynyl)phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.40 Å R-free 0.192
5A7B Structure of the p53 cancer Y220C bound to the stabilizing small molecule PhiKan5211 提交 2015-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 KMN 2-[[4-(diethylamino)piperidin-1-yl]methyl]-6-ethynyl-4-(3-phenoxyprop-1-ynyl)phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.40 Å R-free 0.192
5AB9 Structure of the p53 cancer mutant Y220C with bound small molecule 7- ethyl-3-(piperidin-4-yl)-1H-indole 提交 2015-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 92O 7-ethyl-3-(piperidin-4-yl)-1H-indole × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 40 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.36 Å R-free 0.166
5AB9 Structure of the p53 cancer mutant Y220C with bound small molecule 7- ethyl-3-(piperidin-4-yl)-1H-indole 提交 2015-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 92O 7-ethyl-3-(piperidin-4-yl)-1H-indole × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 40 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.36 Å R-free 0.166
5ABA Structure of the p53 cancer mutant Y220C with bound small-molecule stabilizer PhiKan5149 提交 2015-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 UL7 1-{1-[(3-bromo-5-chloro-2-hydroxyphenyl)methyl piperidin-4-yl}piperidin-4-ol] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.62 Å R-free 0.203
5ABA Structure of the p53 cancer mutant Y220C with bound small-molecule stabilizer PhiKan5149 提交 2015-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 UL7 1-{1-[(3-bromo-5-chloro-2-hydroxyphenyl)methyl piperidin-4-yl}piperidin-4-ol] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.62 Å R-free 0.203
5AOI Structure of the p53 cancer mutant Y220C in complex with an indole- based small molecule 提交 2015-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.78 Å R-free 0.206
5AOI Structure of the p53 cancer mutant Y220C in complex with an indole- based small molecule 提交 2015-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 RZH 2-(5-BROMO-7-ETHYL-2-METHYL-1H-INDOLE-3-YL)ETHAN-1-AMIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.78 Å R-free 0.206
5AOJ Structure of the p53 cancer mutant Y220C in complex with 2-hydroxy-3, 5-diiodo-4-(1H-pyrrol-1-yl)benzoic acid 提交 2015-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES Y0V 2-hydroxy-3,5-diiodo-4-(1H-pyrrol-1-yl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 23 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.47 Å R-free 0.178
5AOJ Structure of the p53 cancer mutant Y220C in complex with 2-hydroxy-3, 5-diiodo-4-(1H-pyrrol-1-yl)benzoic acid 提交 2015-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES Y0V 2-hydroxy-3,5-diiodo-4-(1H-pyrrol-1-yl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 23 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.47 Å R-free 0.178
5AOK Structure of the p53 cancer mutant Y220C with bound small molecule PhiKan7099 提交 2015-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 GOH 5-[2-cyclopropyl-5-(1H-pyrrol-1-yl)-1,3-oxazol-4-yl]-1H-1,2,3,4-tetrazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 38 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.35 Å R-free 0.169
5AOK Structure of the p53 cancer mutant Y220C with bound small molecule PhiKan7099 提交 2015-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 GOH 5-[2-cyclopropyl-5-(1H-pyrrol-1-yl)-1,3-oxazol-4-yl]-1H-1,2,3,4-tetrazole × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 38 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.35 Å R-free 0.169
5AOL Structure of the p53 cancer mutant Y220C with bound 3-bromo-5-(trifluoromethyl)benzene-1,2-diamine 提交 2015-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES UFV 3-BROMO-5-(TRIFLUOROMETHYL)BENZENE-1,2-DIAMINE × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.50 Å R-free 0.169
5AOL Structure of the p53 cancer mutant Y220C with bound 3-bromo-5-(trifluoromethyl)benzene-1,2-diamine 提交 2015-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 MM COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.50 Å R-free 0.169
5AOM Structure of the p53 cancer mutant Y220C with bound small molecule PhiKan883 提交 2015-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES FY8 N-(5-chloranyl-2-oxidanyl-phenyl)piperidine-4-carboxamide × 2 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: SATURATED SOLUTION OF COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.74 Å R-free 0.191
5AOM Structure of the p53 cancer mutant Y220C with bound small molecule PhiKan883 提交 2015-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES FY8 N-(5-chloranyl-2-oxidanyl-phenyl)piperidine-4-carboxamide × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: SATURATED SOLUTION OF COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.74 Å R-free 0.191
5BUA Lysine 120-acetylated P53 DNA binding domain in a complex with DNA. 提交 2015-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：P53 DNA binding domain, UNP residues 94-293
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.1；286 K；0.2M Ammonium fluoride; 20% PEG 3350
分辨率 1.81 Å R-free 0.213
5ECG Crystal structure of the BRCT domains of 53BP1 in complex with p53 and H2AX-pSer139 (gammaH2AX) 提交 2015-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 95–312（218 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；200mM NaF, 100mM Bis-Tris Propane pH 6.5, 20% (w/v) PEG 3,350
分辨率 3.00 Å R-free 0.264
5ECG Crystal structure of the BRCT domains of 53BP1 in complex with p53 and H2AX-pSer139 (gammaH2AX) 提交 2015-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 95–312（218 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；200mM NaF, 100mM Bis-Tris Propane pH 6.5, 20% (w/v) PEG 3,350
分辨率 3.00 Å R-free 0.264
5G4M Crystal structure of the p53 cancer mutant Y220C in complex with a monofluorinated derivative of the small molecule stabilizer Phikan083 提交 2016-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 O82 1-[9-(2-fluoroethyl)-9H-carbazol-3-yl]-N-methylmethanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: SATURATED SOLUTION OF COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.38 Å R-free 0.170
5G4M Crystal structure of the p53 cancer mutant Y220C in complex with a monofluorinated derivative of the small molecule stabilizer Phikan083 提交 2016-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 O82 1-[9-(2-fluoroethyl)-9H-carbazol-3-yl]-N-methylmethanamine × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: SATURATED SOLUTION OF COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.38 Å R-free 0.170
5G4N Crystal structure of the p53 cancer mutant Y220C in complex with a difluorinated derivative of the small molecule stabilizer Phikan083 提交 2016-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 O83 1-[9-(2,2-difluoroethyl)-9H-carbazol-3-yl]-N-methylmethanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: SATURATED SOLUTION OF COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL
分辨率 1.35 Å R-free 0.168
5G4N Crystal structure of the p53 cancer mutant Y220C in complex with a difluorinated derivative of the small molecule stabilizer Phikan083 提交 2016-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 O83 1-[9-(2,2-difluoroethyl)-9H-carbazol-3-yl]-N-methylmethanamine × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: SATURATED SOLUTION OF COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL
分辨率 1.35 Å R-free 0.168
5G4O Crystal structure of the p53 cancer mutant Y220C in complex with a trifluorinated derivative of the small molecule stabilizer Phikan083 提交 2016-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 O80 N,N-dimethyl-1-[9-(2,2,2-trifluoroethyl)-9H-carbazol-3-yl]methanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: SATURATED SOLUTION OF COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.48 Å R-free 0.171
5G4O Crystal structure of the p53 cancer mutant Y220C in complex with a trifluorinated derivative of the small molecule stabilizer Phikan083 提交 2016-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 94-312
突变：YES ZN ZINC ION × 1 O80 N,N-dimethyl-1-[9-(2,2,2-trifluoroethyl)-9H-carbazol-3-yl]methanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；SITTING-DROP VAPOR DIFFUSION AT 21 DEGREE C. PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: SATURATED SOLUTION OF COMPOUND IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.48 Å R-free 0.171
5HOU Solution Structure of p53TAD-TAZ1 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–61（61 aa） 片段：p53TAD, TAZ1 domain of CBP
未记录 ZN ZINC ION × 3 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR测量条件 pH 6.4；308 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR样品组成 1.0 mM [U-15N] p53TAD - [NA] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1.0 mM [U-15N][U-13C] p53TAD - [NA] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成 1.0 mM [NA] p53TAD - [U-15N] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1.0 mM [NA] p53TAD - [U-15N][U-13C] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成 1.0 mM [U-15N][U-13C] p53TAD - [NA] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1 mM [NA] p53TAD - [U-15N][U-13C] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
5HP0 Solution Structure of TAZ2-p53AD2 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–61（25 aa） 片段：p53AD2, TAZ2 domain of CBP
未记录 ZN ZINC ION × 3 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR测量条件 pH 6.4；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53AD2, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53AD2, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53AD2, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-13C] TAZ2, 1 mM p53AD2(38-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 5 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成 1 mM [U-13C] p53AD2, 1 mM TAZ2, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
分辨率未提供
5HPD Solution Structure of TAZ2-p53TAD 提交 2016-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–61（60 aa） 片段：p53TAD, TAZ2 domain of CBP
未记录 ZN ZINC ION × 3 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR测量条件 pH 6.4；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR样品组成 1.75 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53TAD, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.75 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53TAD, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 1 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成 1 mM [U-13C] TAZ2, 1 mM p53(13-37, 1 mM p53(38-61), 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 20 mM [U-2H] TRIS, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成 1 mM TAZ2, 1 mM [U-13C] p53(13-37), 1 mM [U-13C] p53(38-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成 1 mM TAZ2, 1 mM [U-15N] p53(13-61), 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-15N] TAZ2, 1 mM p53(13-61), 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM TAZ2, 1 mM [U-13C] p53(13-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
NMR样品组成 1 mM [U-13C] TAZ2, 1 mM p53(13-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O | 99% D2O, 1% H2O
分辨率未提供
5LAP p53 cancer mutant Y220C with Cys182 alkylation 提交 2016-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 6SM 5-chloranylpyrimidine-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 mM Phikan11000 IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.42 Å R-free 0.193
5LAP p53 cancer mutant Y220C with Cys182 alkylation 提交 2016-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 6SM 5-chloranylpyrimidine-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PROTEIN SOLUTION: 6 MG/ML PROTEIN IN 25 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 150 MM KCL, 5 MM DTT. RESERVOIR BUFFER: 100 MM HEPES, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 5 MM DTT. SOAKING BUFFER: 30 mM Phikan11000 IN 100 MM HEPES, PH 7.2, 10 MM SODIUM PHOSPHATE, PH 7.2, 19% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000, 20 % (V/V) GLYCEROL, 150 MM KCL.
分辨率 1.42 Å R-free 0.193
5LGY Lysine 120-acetylated P53 DNA binding domain in a complex with the BAX response element. 提交 2016-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 94–291（198 aa） 片段：UNP residues 94-291
链 B 94–291（198 aa） 片段：UNP residues 94-291
链 C 94–291（198 aa） 片段：UNP residues 94-291
链 D 94–291（198 aa） 片段：UNP residues 94-291
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.1；286 K；0.22 M Ammonium acetate, 10% w/v PEG 3350, tri-Sodium citrate pH 6.1
分辨率 2.92 Å R-free 0.277
5MCT New Insights into the Role of DNA Shape on Its Recognition by p53 Proteins (complex p53DBD-LHG1) 提交 2016-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：P53 DNA BINDING DOMAIN
链 B 94–293（200 aa） 片段：P53 DNA BINDING DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 FOR FORMYL GROUP × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7；292 K；0.1 M Ammonium citrate, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.45 Å R-free 0.189
5MCU New Insights into the Role of DNA Shape on Its Recognition by p53 Proteins (complex p53DBD-LHG2) 提交 2016-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：P53 DNA BINDING DOMAIN
链 B 94–293（200 aa） 片段：P53 DNA BINDING DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7；292 K；0.05 M HEPES sodium salt, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.70 Å R-free 0.201
5MCV New Insights into the Role of DNA Shape on Its Recognition by p53 Proteins (complex p53DBD-LWC1) 提交 2016-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 55–254（200 aa） 片段：P53 DNA BINDING DOMAIN
链 B 55–254（200 aa） 片段：P53 DNA BINDING DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20 ACT ACETATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.8；292 K；0.02 M Citric acid, 0.08 M BIS-TRIS propane, 16% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.60 Å R-free 0.188
5MCW New Insights into the Role of DNA Shape on Its Recognition by p53 Proteins (complex p53DBD-LWC2) 提交 2016-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：P53 DNA BINDING DOMAIN
链 B 94–293（200 aa） 片段：P53 DNA BINDING DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 4 FOR FORMYL GROUP × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.8；292 K；0.02 M Citric acid, 0.08 M BIS-TRIS propane, 18% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.90 Å R-free 0.235
5MF7 New Insights into the Role of DNA Shape on Its Recognition by p53 Proteins (complex p53DBD-GADD45) 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 55–254（200 aa） 片段：P53 DNA BINDING DOMAIN
链 B 55–254（200 aa） 片段：P53 DNA BINDING DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；292 K；4% Tacsimate, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.59 Å R-free 0.233
5MG7 New Insights into the Role of DNA Shape on Its Recognition by p53 Proteins (complex p53DBD-p53R2) 提交 2016-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：P53 DNA Binding Domain, UNP Residues 94-293
链 B 94–293（200 aa） 片段：P53 DNA Binding Domain, UNP Residues 94-293
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7；292 K；0.07 M ammonium tartrate dibasic, 8.4% Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.45 Å R-free 0.202
5O1A p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB240 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9H5 [3,5-bis(iodanyl)-2-oxidanyl-4-pyrrol-1-yl-phenyl]-(4-methylpiperazin-1-yl)methanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.44 Å R-free 0.178
5O1A p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB240 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9H5 [3,5-bis(iodanyl)-2-oxidanyl-4-pyrrol-1-yl-phenyl]-(4-methylpiperazin-1-yl)methanone × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.44 Å R-free 0.178
5O1B p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB84 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9H2 6-(hydroxymethyl)-2,4-bis(iodanyl)-3-pyrrol-1-yl-phenol × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.43 Å R-free 0.174
5O1B p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB84 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9H2 6-(hydroxymethyl)-2,4-bis(iodanyl)-3-pyrrol-1-yl-phenol × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.43 Å R-free 0.174
5O1C p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB184 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9GZ 5-(4-fluorophenyl)-3-iodanyl-2-oxidanyl-4-pyrrol-1-yl-benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.32 Å R-free 0.172
5O1C p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB184 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9GZ 5-(4-fluorophenyl)-3-iodanyl-2-oxidanyl-4-pyrrol-1-yl-benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.32 Å R-free 0.172
5O1D p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB481 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9GW 3-iodanyl-2-oxidanyl-5-propoxy-4-pyrrol-1-yl-benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.36 Å R-free 0.164
5O1D p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB481 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9GW 3-iodanyl-2-oxidanyl-5-propoxy-4-pyrrol-1-yl-benzoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.36 Å R-free 0.164
5O1E p53 cancer mutant Y220C im complex with compound MB577 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9GT 3-iodanyl-2-oxidanyl-5-prop-2-enoxy-4-pyrrol-1-yl-benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.30 Å R-free 0.165
5O1E p53 cancer mutant Y220C im complex with compound MB577 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9GT 3-iodanyl-2-oxidanyl-5-prop-2-enoxy-4-pyrrol-1-yl-benzoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.30 Å R-free 0.165
5O1F p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB582 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9GQ 5-butoxy-3-iodanyl-2-oxidanyl-4-pyrrol-1-yl-benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.38 Å R-free 0.167
5O1F p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB582 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9GQ 5-butoxy-3-iodanyl-2-oxidanyl-4-pyrrol-1-yl-benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.38 Å R-free 0.167
5O1G p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB487 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9GK 3-iodanyl-2-oxidanyl-5-(2-phenylethoxy)-4-pyrrol-1-yl-benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.35 Å R-free 0.166
5O1G p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB487 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9GK 3-iodanyl-2-oxidanyl-5-(2-phenylethoxy)-4-pyrrol-1-yl-benzoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.35 Å R-free 0.166
5O1H p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB539 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9GN 3-iodanyl-2-oxidanyl-5-propylsulfanyl-4-pyrrol-1-yl-benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.32 Å R-free 0.160
5O1H p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB539 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9GN 3-iodanyl-2-oxidanyl-5-propylsulfanyl-4-pyrrol-1-yl-benzoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 30 mM compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.32 Å R-free 0.160
5O1I p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB710 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 9GH 2-(diethylamino)-6-iodanyl-5-oxidanyl-7-pyrrol-1-yl-1,3-benzothiazole-4-carboxylic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.40 Å R-free 0.187
5O1I p53 cancer mutant Y220C in complex with compound MB710 提交 2017-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：UNP residues 94-312
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.40 Å R-free 0.187
5OL0 Structure of Leishmania infantum Silent Information Regulator 2 related protein 1 (LiSIR2rp1) in complex with acetylated p53 peptide 提交 2017-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 372–389（18 aa） 片段：UNP residues 372-389
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；100mM Na Hepes pH7.5; 25% PEG2000 MME
分辨率 1.99 Å R-free 0.226
5OL0 Structure of Leishmania infantum Silent Information Regulator 2 related protein 1 (LiSIR2rp1) in complex with acetylated p53 peptide 提交 2017-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 372–389（18 aa） 片段：UNP residues 372-389
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；100mM Na Hepes pH7.5; 25% PEG2000 MME
分辨率 1.99 Å R-free 0.226
6FF9 Mutant R280K of human P53 提交 2018-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 58–250（193 aa）
突变：R280K ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；35% PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.226
6FF9 Mutant R280K of human P53 提交 2018-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 58–250（193 aa）
突变：R280K ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；35% PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.226
6FF9 Mutant R280K of human P53 提交 2018-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 58–250（193 aa）
突变：R280K ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；35% PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.226
6FF9 Mutant R280K of human P53 提交 2018-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 58–250（193 aa）
突变：R280K ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；35% PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.226
6FJ5 New Insights into the Role of DNA Shape on Its Recognition by p53 Proteins (complex p53DBD-AGG-HG) 提交 2018-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：P53 DNA BINDING DOMAIN, UNP residues 94-293
链 B 94–293（200 aa） 片段：P53 DNA BINDING DOMAIN, UNP residues 94-293
链 C 94–293（200 aa） 片段：P53 DNA BINDING DOMAIN, UNP residues 94-293
链 D 94–293（200 aa） 片段：P53 DNA BINDING DOMAIN, UNP residues 94-293
未记录 ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7；292 K；0.1 M Sodium formate pH 7.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.05 Å R-free 0.244
6GGA p53 cancer mutant Y220C in complex with small-molecule stabilizer PK9284 提交 2018-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D EY2 (7-bromanyl-9-ethyl-carbazol-3-yl)methyl-methyl-azanium × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.55 Å R-free 0.200
6GGA p53 cancer mutant Y220C in complex with small-molecule stabilizer PK9284 提交 2018-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D EY2 (7-bromanyl-9-ethyl-carbazol-3-yl)methyl-methyl-azanium × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.55 Å R-free 0.200
6GGB p53 cancer mutant Y220C in complex with small-molecule stabilizer PK9318 提交 2018-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 EXQ [9-ethyl-7-(4-methylthiophen-2-yl)carbazol-3-yl]methyl-methyl-azanium × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.32 Å R-free 0.161
6GGB p53 cancer mutant Y220C in complex with small-molecule stabilizer PK9318 提交 2018-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 EXQ [9-ethyl-7-(4-methylthiophen-2-yl)carbazol-3-yl]methyl-methyl-azanium × 1 GOL GLYCEROL × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.32 Å R-free 0.161
6GGC p53 cancer mutant Y220C in complex with small-molecule stabilizer PK9320 提交 2018-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 EXN [9-ethyl-7-(furan-2-yl)carbazol-3-yl]methyl-methyl-azanium × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.24 Å R-free 0.166
6GGC p53 cancer mutant Y220C in complex with small-molecule stabilizer PK9320 提交 2018-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 EXN [9-ethyl-7-(furan-2-yl)carbazol-3-yl]methyl-methyl-azanium × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.24 Å R-free 0.166
6GGD p53 cancer mutant Y220C in complex with small-molecule stabilizer PK9324 提交 2018-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D, ZN ZINC ION × 1 EYB [9-ethyl-7-(1,2-oxazol-4-yl)carbazol-3-yl]methyl-methyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.40 Å R-free 0.170
6GGD p53 cancer mutant Y220C in complex with small-molecule stabilizer PK9324 提交 2018-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D, ZN ZINC ION × 1 EYB [9-ethyl-7-(1,2-oxazol-4-yl)carbazol-3-yl]methyl-methyl-azanium × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.40 Å R-free 0.170
6GGE p53 cancer mutant Y220C in complex with small-molecule stabilizer PK9327 提交 2018-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, Y220S,N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 EYE [9-ethyl-7-(5-methylthiophen-2-yl)carbazol-3-yl]methyl-methyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.25 Å R-free 0.171
6GGE p53 cancer mutant Y220C in complex with small-molecule stabilizer PK9327 提交 2018-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, Y220S,N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 EYE [9-ethyl-7-(5-methylthiophen-2-yl)carbazol-3-yl]methyl-methyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.25 Å R-free 0.171
6GGF Structure of the p53 cancer mutant Y220C in complex with small-molecule stabilizer PK9328 提交 2018-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 EXQ [9-ethyl-7-(4-methylthiophen-2-yl)carbazol-3-yl]methyl-methyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm NaCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm NaCl.
分辨率 1.32 Å R-free 0.171
6GGF Structure of the p53 cancer mutant Y220C in complex with small-molecule stabilizer PK9328 提交 2018-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 EXQ [9-ethyl-7-(4-methylthiophen-2-yl)carbazol-3-yl]methyl-methyl-azanium × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm NaCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of compound in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm NaCl.
分辨率 1.32 Å R-free 0.171
6LHD Crystal structure of p53/BCL-xL fusion complex 提交 2019-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 57–253（197 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；0.2M sodium malonate pH 7.0, 20%(w/v) polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.50 Å R-free 0.260
6LHD Crystal structure of p53/BCL-xL fusion complex 提交 2019-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 57–253（197 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；0.2M sodium malonate pH 7.0, 20%(w/v) polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.50 Å R-free 0.260
6RJZ Fragment AZ-015 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 K6B 7-(6-azanylpyridin-2-yl)-1-benzothiophene-2-carboximidamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.58 Å R-free 0.218
6RK8 Fragment AZ-014 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 K6N 7-(3-azanyl-4-methyl-pyrazol-1-yl)-1-benzothiophene-2-carboximidamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.60 Å R-free 0.229
6RKI Fragment AZ-023 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 K6T 5-[(3-aminophenyl)amino]-4-phenyl-thiophene-2-carboximidamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.88 Å R-free 0.206
6RKK Fragment AZ-021 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 K6W 4-phenyl-5-(phenylmethyl)thiophene-2-carboximidamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.88 Å R-free 0.272
6RKM Fragment AZ-022 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 K6Z 4-phenyl-5-phenylazanyl-thiophene-2-carboximidamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.88 Å R-free 0.230
6RL3 Fragment AZ-003 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 K48 5-azanyl-4-phenyl-thiophene-2-carboximidamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.30 Å R-free 0.192
6RL4 Fragment AZ-025 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 K7N 5-[1-(2-azanylethyl)imidazol-4-yl]-4-phenyl-thiophene-2-carboximidamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.60 Å R-free 0.180
6RL6 Fragment AZ-024 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 K7Q ~{N}-(2-azanylethyl)-2-carbamimidoyl-7-methoxy-1-benzothiophene-4-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.60 Å R-free 0.183
6RM5 Fragment AZ-016 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 K8W 7-(6-azanyl-5-methyl-pyridin-2-yl)-1-benzothiophene-2-carboximidamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.88 Å R-free 0.207
6RM7 Fragment AZ-026 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 K92 5-[3-(2-azanylethyl)imidazol-4-yl]-4-phenyl-thiophene-2-carboximidamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.60 Å R-free 0.169
6RWH Fragment AZ-007 binding at a primary and secondary binding site of the the p53pT387/14-3-3 sigma complex 提交 2019-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） KLB 5-(1~{H}-imidazol-5-yl)-4-phenyl-thiophene-2-carboximidamide × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.68 Å R-free 0.227
6RWI Fragment AZ-002 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） KLE 5-phenylthiophene-2-carboximidamide × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.65 Å R-free 0.204
6RWS Fragment AZ-009 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） KLZ 4-chloranyl-6-(sulfanylmethyl)-1-benzothiophene-2-carboximidamide × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.53 Å R-free 0.200
6RWU Fragment AZ-010 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） KM8 ~{N}-[3-(5-carbamimidoylthiophen-3-yl)phenyl]propanamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.46 Å R-free 0.221
6RX2 Fragment AZ-005 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 6 CA CALCIUM ION × 2 KM2 7-[[(2~{S})-1-azanylpropan-2-yl]amino]-1-benzothiophene-2-carboximidamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.82 Å R-free 0.220
6RZ3 Crystal structure of a complex between the DNA-binding domain of p53 and the carboxyl-terminal conserved region of iASPP 提交 2019-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 62–292（231 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；18% (w/v) polyethylene glycol 3350, 0.18 M tri-sodium citrate
分辨率 4.23 Å R-free 0.292
6S39 Fragment AZ-018 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） K5Z 5-(3-azanylpropyl)-4-phenyl-thiophene-2-carboximidamide × 2 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.88 Å R-free 0.388
6S9Q Fragment AZ-004 binding at a primary and secondary site in a p53pT387/14-3-3 complex 提交 2019-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） L1T 4-methyl-5-phenyl-thiophene-2-carboximidamide × 6 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT.
分辨率 1.69 Å R-free 0.226
6SHZ p53 cancer mutant Y220C 提交 2019-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–311（218 aa） 片段：DNA-binding domain
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT.
分辨率 1.24 Å R-free 0.172
6SHZ p53 cancer mutant Y220C 提交 2019-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–311（218 aa） 片段：DNA-binding domain
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT.
分辨率 1.24 Å R-free 0.172
6SI0 p53 cancer mutant Y220C in complex with small-molecule stabilizer PK9323 提交 2019-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 LEK 1-[9-ethyl-7-(1,3-thiazol-4-yl)carbazol-3-yl]-~{N}-methyl-methanamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of PK9323 in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.53 Å R-free 0.171
6SI0 p53 cancer mutant Y220C in complex with small-molecule stabilizer PK9323 提交 2019-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
突变：M133L, V203A, Y220C, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 LEK 1-[9-ethyl-7-(1,3-thiazol-4-yl)carbazol-3-yl]-~{N}-methyl-methanamine × 1 GOL GLYCEROL × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of PK9323 in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.53 Å R-free 0.171
6SI1 p53 cancer mutant Y220H 提交 2019-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
突变：M133L, V203A, Y220H, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT.
分辨率 1.44 Å R-free 0.178
6SI1 p53 cancer mutant Y220H 提交 2019-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
突变：M133L, V203A, Y220H, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT.
分辨率 1.44 Å R-free 0.178
6SI2 p53 cancer mutant Y220S 提交 2019-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
突变：M133L, V203A, Y220S, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT.
分辨率 1.50 Å R-free 0.178
6SI2 p53 cancer mutant Y220S 提交 2019-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
突变：M133L, V203A, Y220S, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT.
分辨率 1.50 Å R-free 0.178
6SI3 p53 cancer mutant Y220S in complex with small-molecule stabilizer PK9301 提交 2019-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
突变：M133L, V203A, Y220S, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 LEB 1-[7-bromanyl-9-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]carbazol-3-yl]-~{N}-methyl-methanamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of PK9301 in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.40 Å R-free 0.176
6SI3 p53 cancer mutant Y220S in complex with small-molecule stabilizer PK9301 提交 2019-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
突变：M133L, V203A, Y220S, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 LEB 1-[7-bromanyl-9-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]carbazol-3-yl]-~{N}-methyl-methanamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: Saturated solution of PK9301 in 100 mm HEPES, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, ph 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm KCl.
分辨率 1.40 Å R-free 0.176
6SI4 p53 cancer mutant Y220S in complex with small-molecule stabilizer PK9323 提交 2019-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
突变：M133L, V203A, Y220S, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 LEK 1-[9-ethyl-7-(1,3-thiazol-4-yl)carbazol-3-yl]-~{N}-methyl-methanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT, 2 mM PK9323.
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
6SI4 p53 cancer mutant Y220S in complex with small-molecule stabilizer PK9323 提交 2019-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
突变：M133L, V203A, Y220S, N239Y, N268D ZN ZINC ION × 1 LEK 1-[9-ethyl-7-(1,3-thiazol-4-yl)carbazol-3-yl]-~{N}-methyl-methanamine × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, ph 7.2, 150 mm KCl, 5 mm DTT. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT, 2 mM PK9323.
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
6SIN Fragment AZ-020 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） K65 ~{N}-[2-(5-carbamimidoylthiophen-3-yl)phenyl]prop-2-enamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT
分辨率 1.64 Å R-free 0.211
6SIO Fragment AZ-017 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 LFQ 5-methyl-4-phenyl-thiophene-2-carboximidamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT
分辨率 1.60 Å R-free 0.195
6SIP Fragment AZ-011 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 LFB 7-methoxy-1-benzothiophene-2-carboximidamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT
分辨率 1.60 Å R-free 0.196
6SIQ Fragment AZ-012 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 LF5 4-chloranyl-7-propan-2-yloxy-1-benzothiophene-2-carboximidamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT
分辨率 1.60 Å R-free 0.217
6SL6 p53 charged core 提交 2019-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 89–311（223 aa）
突变：A138G, L252K, T256R, R267L, N268D GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.2 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.67 Å R-free 0.180
6SLV Fragment AZ-013 binding at the p53pT387/14-3-3 sigma interface 提交 2019-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 382–393（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 LJW 4-(methylamino)-7-propan-2-yloxy-1-benzothiophene-2-carboximidamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes, pH7.5, 27%PEG, 5% Glycerol, 0.2M Calcium Chloride, 2mM DTT
分辨率 1.90 Å R-free 0.218
6T58 Structure determination of the transactivation domain of p53 in complex with S100A4 using annexin A2 as a crystallization chaperone 提交 2019-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 17–56（40 aa）
突变：A280E,A280E,A280E,A280E GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.12 M Alcohols 0.1 M Sodium HEPES; MOPS (acid) pH7.5 20% v/v Ethylene glycol; 10 % w/v PEG 8000 Morpheus D6
分辨率 3.10 Å R-free 0.272
6T58 Structure determination of the transactivation domain of p53 in complex with S100A4 using annexin A2 as a crystallization chaperone 提交 2019-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 17–56（40 aa）
突变：A280E,A280E,A280E,A280E GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.12 M Alcohols 0.1 M Sodium HEPES; MOPS (acid) pH7.5 20% v/v Ethylene glycol; 10 % w/v PEG 8000 Morpheus D6
分辨率 3.10 Å R-free 0.272
6VR1 Complex of HLA-A2, a class I MHC, with a p53 peptide 提交 2020-02-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 168–176（9 aa） 片段：residues 168-176
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；296 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M magnesium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.274
6VR1 Complex of HLA-A2, a class I MHC, with a p53 peptide 提交 2020-02-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Q 168–176（9 aa） 片段：residues 168-176
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；296 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M magnesium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.274
6VR5 Complex of HLA-A2, a class I MHC, with a p53 peptide 提交 2020-02-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 168–176（9 aa） 片段：residues 168-176
突变：R175H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；295 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M magnesium chloride
分辨率 2.38 Å R-free 0.280
6VR5 Complex of HLA-A2, a class I MHC, with a p53 peptide 提交 2020-02-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Q 168–176（9 aa） 片段：residues 168-176
突变：R175H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；295 K；15% PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M magnesium chloride
分辨率 2.38 Å R-free 0.280
6VRM T cell receptor-p53-HLA-A2 complex 提交 2020-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 P 168–176（9 aa）
突变：R175H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；295 K；20% (w/v) polyacrylic acid 5100, 0.1 M HEPES, 20 mM MgCl2
分辨率 2.61 Å R-free 0.275
6VRN T cell receptor-p53-HLA-A2 complex 提交 2020-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 P 168–176（9 aa）
突变：R175H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.7；295 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2 M ammonium tartrate dibasic
分辨率 2.46 Å R-free 0.259
6W51 Structure of the antibody fragment H2 in complex with HLA-A*02:01/p53R175H 提交 2020-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 168–176（9 aa）
突变：R175H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.2 M Ammonium chloride, 20% w/v PEG 3350
分辨率 3.53 Å R-free 0.283
6W51 Structure of the antibody fragment H2 in complex with HLA-A*02:01/p53R175H 提交 2020-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 168–176（9 aa）
突变：R175H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.2 M Ammonium chloride, 20% w/v PEG 3350
分辨率 3.53 Å R-free 0.283
6W51 Structure of the antibody fragment H2 in complex with HLA-A*02:01/p53R175H 提交 2020-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 168–176（9 aa）
突变：R175H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.2 M Ammonium chloride, 20% w/v PEG 3350
分辨率 3.53 Å R-free 0.283
6W51 Structure of the antibody fragment H2 in complex with HLA-A*02:01/p53R175H 提交 2020-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 168–176（9 aa）
突变：R175H PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.2 M Ammonium chloride, 20% w/v PEG 3350
分辨率 3.53 Å R-free 0.283
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 M 1–393（393 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
6ZNC Structural basis of reactivation of oncogenic p53 mutants by a small molecule: methylene quinuclidinone (MQ). Human wild-type p53DBD bound to DNA and MQ: wt-DNA-MQ (I) 提交 2020-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 2 QNN (2~{S})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 6 QN8 (2~{R})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；292 K；Protein/DNA ratio 1:2.4, TRIS pH=8.5 100mM, 2.0% Tacsimate(tm) pH=8.0, 16% w/v PEG 3350
分辨率 1.64 Å R-free 0.190
7B46 Structural basis of reactivation of oncogenic p53 mutants by a small molecule: methylene quinuclidinone (MQ). Human wild-type p53DBD bound to DNA and MQ: wt-DNA-MQ (P1) 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 B 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 C 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 D 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
突变：' 突变：' 突变：' 突变：' ZN ZINC ION × 4 QN8 (2~{R})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 7 ACT ACETATE ION × 1 QNN (2~{S})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；292 K；Protein/DNA ratio 1:2.4, 0.1M DL-Malic acid pH=7.0, 19% w/v PEG 3350
分辨率 2.02 Å R-free 0.203
7B47 Structural basis of reactivation of oncogenic p53 mutants by a small molecule: methylene quinuclidinone (MQ). Human p53DBD-R273H mutant bound to MQ: R273H-MQ (I) 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 B 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 C 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 D 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
突变：R273H 突变：R273H 突变：R273H 突变：R273H ZN ZINC ION × 4 QN8 (2~{R})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 6 QNN (2~{S})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.1；292 K；0.1M Li Acetate, 16% w/v PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.202
7B48 Structural basis of reactivation of oncogenic p53 mutants by a small molecule: methylene quinuclidinone (MQ). Human p53DBD-R273H mutant bound to MQ: R273H-MQ (II) 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 B 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 C 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 D 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
突变：R273H 突变：R273H 突变：R273H 突变：R273H ZN ZINC ION × 4 QNN (2~{S})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 ACT ACETATE ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.1；292 K；0.2M Li Acetate, 2.0% w/v Agarose, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.228
7B49 Structural basis of reactivation of oncogenic p53 mutants by a small molecule: methylene quinuclidinone (MQ). Human p53DBD-R273H mutant bound to DNA and MQ: R273H-DNA-MQ 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 B 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
突变：R273H 突变：R273H ZN ZINC ION × 4 QN8 (2~{R})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 4 QNN (2~{S})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 4 FMT FORMIC ACID × 48 ACT ACETATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.1；292 K；Protein/DNA ratio 1:1.4, 0.075M Sodium formate, 7.5% w/v PEG 3350
分辨率 1.42 Å R-free 0.229
7B4A Structural basis of reactivation of oncogenic p53 mutants by a small molecule: methylene quinuclidinone (MQ). Human p53DBD-R273H mutant bound to DNA: R273H-DNA 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexamer
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 B 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
突变：R273H 突变：R273H ZN ZINC ION × 4 FMT FORMIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.1；292 K；Protein/DNA ratio 1:1.4, 0.075M Sodium formate, 7.5% w/v PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.254
7B4B Structural basis of reactivation of oncogenic p53 mutants by a small molecule: methylene quinuclidinone (MQ). Human p53DBD-R273C mutant bound to MQ: R273C-MQ (I) 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetramer
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 B 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 C 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 D 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
突变：R273C 突变：R273C 突变：R273C 突变：R273C ZN ZINC ION × 4 QN8 (2~{R})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 4 QNN (2~{S})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.1；292 K；PROTEIN/DNA RATIO 1:2.4, 0.2M Sodium Fluoride, 20% w/v PEG 3350
分辨率 1.76 Å R-free 0.218
7B4C Structural basis of reactivation of oncogenic p53 mutants by a small molecule: methylene quinuclidinone (MQ). Human p53DBD-R273C mutant bound to MQ: R273C-MQ (II) 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetramer
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 B 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 C 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
链 D 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
突变：R273C 突变：R273C 突变：R273C 突变：R273C ZN ZINC ION × 4 QNN (2~{S})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 QN8 (2~{R})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.1；292 K；0.2M Sodium Fluoride, 20% w/v PEG 3350
分辨率 1.71 Å R-free 0.182
7B4D Structural basis of reactivation of oncogenic p53 mutants by a small molecule: methylene quinuclidinone (MQ). Human p53DBD-R273C/S240R double mutant bound to DNA and MQ: R273C/S240R-DNA-MQ 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetramer
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
突变：R273C S240R ZN ZINC ION × 2 QNN (2~{S})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 6 QN8 (2~{R})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 2 FMT FORMIC ACID × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.1；292 K；Protein/DNA ratio 1:2.4, 0.2M Sodium formate, 20% w/v PEG 3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.204
7B4E Structural basis of reactivation of oncogenic p53 mutants by a small molecule: methylene quinuclidinone (MQ). Human p53DBD-R282W mutant bound to DNA and MQ: R282W-DNA-MQ 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetramer
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
突变：R282W ZN ZINC ION × 2 QN8 (2~{R})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 6 QNN (2~{S})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.1；292 K；Protein/DNA ratio 1:1.5, 0.1M Sodium Acetate, 20% w/v PEG 3350
分辨率 1.58 Å R-free 0.201
7B4F Structural basis of reactivation of oncogenic p53 mutants by a small molecule: methylene quinuclidinone (MQ). Human p53DBD-R282W mutant bound to DNA: R282W-MQ (I) 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetramer
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
突变：R282W ZN ZINC ION × 2 FMT FORMIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；292 K；Protein/DNA ratio 1:1.5, 0.03M Citric acid, 0.07M BIS-TRIS propane pH=7.6, 20% w/v PEG 3350
分辨率 1.78 Å R-free 0.195
7B4G Structural basis of reactivation of oncogenic p53 mutants by a small molecule: methylene quinuclidinone (MQ). Human p53DBD-R282W mutant bound to DNA: R282W-MQ (II) 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
突变：R282W ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；292 K；Protein/DNA ratio 1:1.5, 0.2M Sodium Acetate, 20% w/v PEG 3350
分辨率 1.86 Å R-free 0.205
7B4H Structural basis of reactivation of oncogenic p53 mutants by a small molecule: methylene quinuclidinone (MQ). Human wild-type p53DBD bound to DNA and MQ: wt-DNA-MQ (III) 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 QN8 (2~{R})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 4 QNN (2~{S})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 2 FMT FORMIC ACID × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；292 K；Protein/DNA ratio 1:2.4, 0.1M TRIS pH=8.5, 2% Tacsimate(TM) pH=8.0, 16% w/v PEG 3350
分辨率 1.39 Å R-free 0.200
7B4N Structural basis of reactivation of oncogenic p53 mutants by a small molecule: methylene quinuclidinone (MQ). Human wild-type p53DBD bound to DNA and MQ: wt-DNA-MQ (II) 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 94–293（200 aa） 片段：p53 human DNA binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 2 QN8 (2~{R})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 4 QNN (2~{S})-2-methyl-1-azabicyclo[2.2.2]octan-3-one × 2 FMT FORMIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；292 K；Protein/DNA ratio 1:2.4, 0.1M TRIS pH=8.5, 2% Tacsimate(TM) pH=8.0, 16% w/v PEG 3350
分辨率 1.32 Å R-free 0.166
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 326–356（31 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 326–356（31 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 326–356（31 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 326–356（31 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 326–356（31 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 326–356（31 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 N 326–356（31 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 326–356（31 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Bis-Tris, (NH4)2SO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.239
7DHY Arsenic-bound p53 DNA-binding domain mutant G245S 提交 2020-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa）
突变：G245S ARS ARSENIC × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Tris (pH 8.0-8.5), 20% (w/v) PEG 8000, 0.2 M Li2SO4, 2 mM EDTA, and 2 mM As2O3
分辨率 2.15 Å R-free 0.219
7DHY Arsenic-bound p53 DNA-binding domain mutant G245S 提交 2020-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–293（200 aa）
突变：G245S ARS ARSENIC × 1 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Tris (pH 8.0-8.5), 20% (w/v) PEG 8000, 0.2 M Li2SO4, 2 mM EDTA, and 2 mM As2O3
分辨率 2.15 Å R-free 0.219
7DHY Arsenic-bound p53 DNA-binding domain mutant G245S 提交 2020-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 94–293（200 aa）
突变：G245S ARS ARSENIC × 1 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Tris (pH 8.0-8.5), 20% (w/v) PEG 8000, 0.2 M Li2SO4, 2 mM EDTA, and 2 mM As2O3
分辨率 2.15 Å R-free 0.219
7DHY Arsenic-bound p53 DNA-binding domain mutant G245S 提交 2020-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 94–293（200 aa）
突变：G245S ARS ARSENIC × 1 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Tris (pH 8.0-8.5), 20% (w/v) PEG 8000, 0.2 M Li2SO4, 2 mM EDTA, and 2 mM As2O3
分辨率 2.15 Å R-free 0.219
7DHZ Arsenic-bound p53 DNA-binding domain mutant R249S 提交 2020-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa）
突变：R249S GOL GLYCEROL × 1 ARS ARSENIC × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Bis-Tris (pH 7) and 22% PEG5000-MME
分辨率 1.74 Å R-free 0.257
7DHZ Arsenic-bound p53 DNA-binding domain mutant R249S 提交 2020-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–293（200 aa）
突变：R249S GOL GLYCEROL × 2 ARS ARSENIC × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Bis-Tris (pH 7) and 22% PEG5000-MME
分辨率 1.74 Å R-free 0.257
7DVD The crystal structure of p53 DNA binding domain and PUMA complex 提交 2021-01-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 92–290（199 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；0.1 M Tris (pH 7.0) 20% (w/w) PEG-200 MME
分辨率 2.59 Å R-free 0.318
7DVD The crystal structure of p53 DNA binding domain and PUMA complex 提交 2021-01-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 92–290（199 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；0.1 M Tris (pH 7.0) 20% (w/w) PEG-200 MME
分辨率 2.59 Å R-free 0.318
7DVD The crystal structure of p53 DNA binding domain and PUMA complex 提交 2021-01-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 92–290（199 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；0.1 M Tris (pH 7.0) 20% (w/w) PEG-200 MME
分辨率 2.59 Å R-free 0.318
7DVD The crystal structure of p53 DNA binding domain and PUMA complex 提交 2021-01-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 92–290（199 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；0.1 M Tris (pH 7.0) 20% (w/w) PEG-200 MME
分辨率 2.59 Å R-free 0.318
7EAX Crystal complex of p53-V272M and antimony ion 提交 2021-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 96–289（194 aa）
突变：V272M ZN ZINC ION × 1 SB ANTIMONY (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1M Tris pH 8.5, 10% w/v PEG3350 and 0.2M Magnesium chloride
分辨率 2.55 Å R-free 0.235
7EAX Crystal complex of p53-V272M and antimony ion 提交 2021-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 96–289（194 aa）
突变：V272M ZN ZINC ION × 1 SB ANTIMONY (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1M Tris pH 8.5, 10% w/v PEG3350 and 0.2M Magnesium chloride
分辨率 2.55 Å R-free 0.235
7EAX Crystal complex of p53-V272M and antimony ion 提交 2021-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 96–289（194 aa）
突变：V272M ZN ZINC ION × 1 SB ANTIMONY (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1M Tris pH 8.5, 10% w/v PEG3350 and 0.2M Magnesium chloride
分辨率 2.55 Å R-free 0.235
7EAX Crystal complex of p53-V272M and antimony ion 提交 2021-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 96–289（194 aa）
突变：V272M ZN ZINC ION × 1 SB ANTIMONY (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1M Tris pH 8.5, 10% w/v PEG3350 and 0.2M Magnesium chloride
分辨率 2.55 Å R-free 0.235
7EDS Human p53 core domain with germline hot spot mutation M133T in complex with the natural PIG3 p53-response element and Arsenic 提交 2021-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 94–293（200 aa）
突变：M133T ARS ARSENIC × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Tris pH 8.5-9, 17-19% PEG20000, 0.1 M MgCl2, 2 mM EDTA, 2 mM As2O3
分辨率 1.77 Å R-free 0.227
7EEU Human p53 core domain with hot spot mutation R282W in complex with the natural CDKN1A(p21) p53-response element and Arsenic 提交 2021-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 94–293（200 aa）
链 B 94–293（200 aa）
链 C 94–293（200 aa）
链 D 94–293（200 aa）
突变：R282W 突变：R282W 突变：R282W 突变：R282W ARS ARSENIC × 4 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Sodium acetate, 0.1 M HEPES pH 8.0, 10% w/v PEG 4000, 2mM EDTA and 2mM As2O3
分辨率 2.90 Å R-free 0.264
7EEU Human p53 core domain with hot spot mutation R282W in complex with the natural CDKN1A(p21) p53-response element and Arsenic 提交 2021-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 E 94–293（200 aa）
链 F 94–293（200 aa）
链 G 94–293（200 aa）
链 H 94–293（200 aa）
突变：R282W 突变：R282W 突变：R282W 突变：R282W ARS ARSENIC × 4 ZN ZINC ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Sodium acetate, 0.1 M HEPES pH 8.0, 10% w/v PEG 4000, 2mM EDTA and 2mM As2O3
分辨率 2.90 Å R-free 0.264
7EL4 The crystal structure of p53p peptide fragment in complex with the N-terminal domain of MdmX 提交 2021-04-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 23–29（7 aa）
未记录 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.16；291 K；0.1 M MES pH 6.5, 2 M MgSO4
分辨率 2.11 Å R-free 0.225
7NMI Transactivation domain of p53 in complex with S100P, using annexin A2 as crystallization chaperone 提交 2021-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 17–56（40 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Morpheus screen (MD) H6 0.1 M Amino acids, 0.1 M Buffer System 2, pH 7.5, 30 % v/v Precipitant Mix 2
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
7RM4 Neoantigen p53R175H-specific TCR 6-11 binds to p53R175H-HLA-A2 提交 2021-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 168–176（9 aa）
突变：R175H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris propane (pH 8.5), and 0.2 M Potassium thiocyanate
分辨率 3.33 Å R-free 0.295
7RM4 Neoantigen p53R175H-specific TCR 6-11 binds to p53R175H-HLA-A2 提交 2021-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 168–176（9 aa）
突变：R175H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris propane (pH 8.5), and 0.2 M Potassium thiocyanate
分辨率 3.33 Å R-free 0.295
7RM4 Neoantigen p53R175H-specific TCR 6-11 binds to p53R175H-HLA-A2 提交 2021-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 M 168–176（9 aa）
突变：R175H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris propane (pH 8.5), and 0.2 M Potassium thiocyanate
分辨率 3.33 Å R-free 0.295
7RM4 Neoantigen p53R175H-specific TCR 6-11 binds to p53R175H-HLA-A2 提交 2021-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 168–176（9 aa）
突变：R175H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris propane (pH 8.5), and 0.2 M Potassium thiocyanate
分辨率 3.33 Å R-free 0.295
7V97 Arsenic-bound p53 DNA-binding domain mutant V272M 提交 2021-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–293（200 aa）
未记录 ARS ARSENIC × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1 M Tris pH 8.2, 0.2 M Magnesium chloride, 16% w/v PEG 8000
分辨率 2.02 Å R-free 0.251
7V97 Arsenic-bound p53 DNA-binding domain mutant V272M 提交 2021-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–293（200 aa）
未记录 ARS ARSENIC × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1 M Tris pH 8.2, 0.2 M Magnesium chloride, 16% w/v PEG 8000
分辨率 2.02 Å R-free 0.251
7V97 Arsenic-bound p53 DNA-binding domain mutant V272M 提交 2021-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 94–293（200 aa）
未记录 ARS ARSENIC × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1 M Tris pH 8.2, 0.2 M Magnesium chloride, 16% w/v PEG 8000
分辨率 2.02 Å R-free 0.251
7V97 Arsenic-bound p53 DNA-binding domain mutant V272M 提交 2021-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 94–293（200 aa）
未记录 ARS ARSENIC × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1 M Tris pH 8.2, 0.2 M Magnesium chloride, 16% w/v PEG 8000
分辨率 2.02 Å R-free 0.251
7XZX Cryo-EM structure of the nucleosome in complex with p53 DNA-binding domain 提交 2022-06-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 K 94–293（200 aa）
链 L 94–293（200 aa）
链 M 94–293（200 aa）
链 N 94–293（200 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.53 Å
7XZZ Cryo-EM structure of the nucleosome in complex with p53 提交 2022-06-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 K 1–393（393 aa）
链 L 1–393（393 aa）
链 M 1–393（393 aa）
链 N 1–393（393 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7YGI Crystal structure of p53 DBD domain in complex with azurin 提交 2022-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 92–289（198 aa）
链 B 92–289（198 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 K POTASSIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；0.05M Na2HPO4+19.5% PEG3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.270
8A31 p53 cancer mutant Y220C in complex with iodophenol-based small-molecule stabilizer JC694 提交 2022-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
未记录 KV0 4-(3-fluoranylpyrrol-1-yl)-3,5-bis(iodanyl)-2-oxidanyl-benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 5.7 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, pH 7.2, 150 mm NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 20 mM compound in 100 mm HEPES, pH 7.2, 10 mM sodium phosphate, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm NaCl.
分辨率 1.46 Å R-free 0.191
8A31 p53 cancer mutant Y220C in complex with iodophenol-based small-molecule stabilizer JC694 提交 2022-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
未记录 KV0 4-(3-fluoranylpyrrol-1-yl)-3,5-bis(iodanyl)-2-oxidanyl-benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 5.7 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, pH 7.2, 150 mm NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 20 mM compound in 100 mm HEPES, pH 7.2, 10 mM sodium phosphate, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm NaCl.
分辨率 1.46 Å R-free 0.191
8A32 p53 cancer mutant Y220C in complex with iodophenol-based small-molecule stabilizer JC769 提交 2022-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
未记录 KVA 4-[3,4-bis(fluoranyl)pyrrol-1-yl]-3,5-bis(iodanyl)-2-oxidanyl-benzoic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 5.7 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, pH 7.2, 150 mm NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 20 mM compound in 100 mm HEPES, pH 7.2, 10 mM sodium phosphate, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm NaCl.
分辨率 1.47 Å R-free 0.193
8A32 p53 cancer mutant Y220C in complex with iodophenol-based small-molecule stabilizer JC769 提交 2022-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
未记录 KVA 4-[3,4-bis(fluoranyl)pyrrol-1-yl]-3,5-bis(iodanyl)-2-oxidanyl-benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 5.7 mg/ml protein in 25 mM sodium phosphate, pH 7.2, 150 mm NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 100 mm HEPES, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mm DTT. Soaking buffer: 20 mM compound in 100 mm HEPES, pH 7.2, 10 mM sodium phosphate, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mm NaCl.
分辨率 1.47 Å R-free 0.193
8A92 p53-Y220C Core Domain in Complex with a Bromo-trifluoro-pyrazole-amine 提交 2022-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：Y220C,M133L,V203A,N239Y,N268D LE9 4-bromanyl-5-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-3-amine × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.15；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.15), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.37 Å R-free 0.183
8A92 p53-Y220C Core Domain in Complex with a Bromo-trifluoro-pyrazole-amine 提交 2022-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：Y220C,M133L,V203A,N239Y,N268D LE9 4-bromanyl-5-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-3-amine × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.15；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.15), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.37 Å R-free 0.183
8CG7 Structure of p53 cancer mutant Y220C with arylation at Cys182 and Cys277 提交 2023-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1IH3 5-iodanyl-2-methylsulfonyl-pyrimidine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml in 25 mM phosphate buffer, pH 7.2, 0.5 mM TCEP. Crystallization buffer: 19% polyethylene glycol 4000, 100 mM Hepes, pH 7.0. For covalent modification, crystals were soaked for 4 hours in crystallization buffer complemented with 20% glycerol and 30 mM compound before flash freezing in liquid nitrogen.
分辨率 1.53 Å R-free 0.187
8CG7 Structure of p53 cancer mutant Y220C with arylation at Cys182 and Cys277 提交 2023-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1IH3 5-iodanyl-2-methylsulfonyl-pyrimidine × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml in 25 mM phosphate buffer, pH 7.2, 0.5 mM TCEP. Crystallization buffer: 19% polyethylene glycol 4000, 100 mM Hepes, pH 7.0. For covalent modification, crystals were soaked for 4 hours in crystallization buffer complemented with 20% glycerol and 30 mM compound before flash freezing in liquid nitrogen.
分辨率 1.53 Å R-free 0.187
8DC4 Crystal structure of p53 Y220C covalently bound to carbazole KG3 提交 2022-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：Y220C ZN ZINC ION × 1 R3R 9-propanoyl-9H-carbazole-3-carbaldehyde, bound form × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；100 mM HEPES, 2.2M MgSO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.231
8DC4 Crystal structure of p53 Y220C covalently bound to carbazole KG3 提交 2022-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：Y220C ZN ZINC ION × 1 R3R 9-propanoyl-9H-carbazole-3-carbaldehyde, bound form × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；100 mM HEPES, 2.2M MgSO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.231
8DC4 Crystal structure of p53 Y220C covalently bound to carbazole KG3 提交 2022-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 94–312（219 aa）
突变：Y220C ZN ZINC ION × 1 R3R 9-propanoyl-9H-carbazole-3-carbaldehyde, bound form × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；100 mM HEPES, 2.2M MgSO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.231
8DC4 Crystal structure of p53 Y220C covalently bound to carbazole KG3 提交 2022-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 94–312（219 aa）
突变：Y220C ZN ZINC ION × 1 R3R 9-propanoyl-9H-carbazole-3-carbaldehyde, bound form × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；100 mM HEPES, 2.2M MgSO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.231
8DC6 Crystal structure of p53 Y220C covalently bound to indole KG6 提交 2022-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：Y220C ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5 R4F 1-(2-methylprop-2-enoyl)-1H-indole-3-carbaldehyde, bound form × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；100 mM HEPES, 2.2M MgSO4
分辨率 1.60 Å R-free 0.202
8DC6 Crystal structure of p53 Y220C covalently bound to indole KG6 提交 2022-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：Y220C ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 R4F 1-(2-methylprop-2-enoyl)-1H-indole-3-carbaldehyde, bound form × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；100 mM HEPES, 2.2M MgSO4
分辨率 1.60 Å R-free 0.202
8DC6 Crystal structure of p53 Y220C covalently bound to indole KG6 提交 2022-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 94–312（219 aa）
突变：Y220C ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 R4F 1-(2-methylprop-2-enoyl)-1H-indole-3-carbaldehyde, bound form × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；100 mM HEPES, 2.2M MgSO4
分辨率 1.60 Å R-free 0.202
8DC6 Crystal structure of p53 Y220C covalently bound to indole KG6 提交 2022-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 94–312（219 aa）
突变：Y220C ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 R4F 1-(2-methylprop-2-enoyl)-1H-indole-3-carbaldehyde, bound form × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；100 mM HEPES, 2.2M MgSO4
分辨率 1.60 Å R-free 0.202
8DC7 Crystal structure of p53 Y220C covalently bound to indole KG10 提交 2022-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 R4R 4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-1-(2-methylprop-2-enoyl)-1H-indole-3-carbaldehyde, bound form × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；100 mM HEPES, 2.2M MgSO4
分辨率 1.99 Å R-free 0.193
8DC8 Crystal structure of p53 Y220C covalently bound to azaindole KG13 提交 2022-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 R50 2-methyl-1-[(4P)-3-methyl-4-(2-methyl-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-6-yl)-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-1-yl]prop-2-en-1-one, bound form × 1 SO4 SULFATE ION × 2 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；100 mM HEPES, 2.2M MgSO4
分辨率 1.72 Å R-free 0.204
8E7A Crystal structure of the p53 (Y107H) core domain orthorhombic P form 提交 2022-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：S94-T312
突变：Y107H ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；30 % (w/v) PEG 2000 MME, 100 mM potassium thiocyanate
分辨率 1.30 Å R-free 0.174
8E7B Crystal structure of the p53 (Y107H) core domain monoclinic P form 提交 2022-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：S94-T312
突变：Y107H ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；28 % (w/v) PEG 2000 MME, 100 mM Bis-Tris
分辨率 2.50 Å R-free 0.279
8E7B Crystal structure of the p53 (Y107H) core domain monoclinic P form 提交 2022-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：S94-T312
突变：Y107H ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；28 % (w/v) PEG 2000 MME, 100 mM Bis-Tris
分辨率 2.50 Å R-free 0.279
8GCR HPV16 E6-E6AP-p53 complex 提交 2023-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
8HLL Crystal structure of p53/BCL2 fusion complex (complex 1) 提交 2022-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 95–290（196 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；PEG 8K 8%-13%, 0.1M HEPES, 0.8% ethylene glycol
分辨率 2.62 Å R-free 0.280
8HLM Crystal structure of p53/BCL2 fusion complex (complex 2) 提交 2022-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 95–290（196 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；0.1 M Imidazole, PEG8K 15-21%
分辨率 2.52 Å R-free 0.290
8HLN Crystal structure of p53/BCL2 fusion complex(complex3) 提交 2022-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 95–290（196 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；0.1 M HEPES, PEG8000 8%-13%, 0.8% ethylene glycol
分辨率 2.35 Å R-free 0.253
8J8N Structure of p53 DNA-binding domain and ZNF568 KRAB domain complex 提交 2023-05-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 92–292（201 aa） 片段：DNA binding domain
链 B 92–292（201 aa） 片段：DNA binding domain
链 C 92–292（201 aa） 片段：DNA binding domain
链 D 92–292（201 aa） 片段：DNA binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 9.02 Å
8OXM ATM(Q2971A) activated by oxidative stress in complex with Mg AMP-PNP and p53 peptide 提交 2023-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 11–22（12 aa）
链 F 11–22（12 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8OXO ATM(Q2971A) dimeric C-terminal region activated by oxidative stress in complex with Mg AMP-PNP and p53 peptide 提交 2023-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 11–22（12 aa）
链 F 11–22（12 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8QWK Structure of p53 cancer mutant Y126C 提交 2023-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 5.5-6.0 mg/ml in 25 mM HEPES (pH 7.5), 300 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 0.7 M sodium citrate and 0.1 M bis-tris-propane (pH 7.0).
分辨率 1.69 Å R-free 0.218
8QWL Structure of p53 cancer mutant Y163C 提交 2023-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 5.5-6.0 mg/ml in 25 mM HEPES (pH 7.5), 200 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 24% PEG 3350 (w/v), 10% ethylene glycol (v/v), 0.2 M sodium malonate (pH 7.0).
分辨率 1.65 Å R-free 0.189
8QWM Structure of p53 cancer mutant Y205C 提交 2023-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 5.5-6.0 mg/ml in 25 mM HEPES (pH 7.5), 200 mM NaCl, 0.5 mM TCEP Reservoir buffer: 18% PEG 3350 (w/v), 15% ethylene glycol (v/v), 0.2 M Na/K tartrate.
分辨率 1.54 Å R-free 0.221
8QWM Structure of p53 cancer mutant Y205C 提交 2023-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 5.5-6.0 mg/ml in 25 mM HEPES (pH 7.5), 200 mM NaCl, 0.5 mM TCEP Reservoir buffer: 18% PEG 3350 (w/v), 15% ethylene glycol (v/v), 0.2 M Na/K tartrate.
分辨率 1.54 Å R-free 0.221
8QWN Structure of p53 cancer mutant Y220C (hexagonal crystal form) 提交 2023-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 5.5-6.0 mg/ml in 25 mM HEPES (pH 7.5), 200 mM NaCl, 0.5 mM TCEP Reservoir buffer: 20% w/v PEG 8000 (w/v), 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M magnesium chloride hexahydrate.
分辨率 1.44 Å R-free 0.209
8QWO Structure of p53 cancer mutant Y234C 提交 2023-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 5.5-6.0 mg/ml in 25 mM phosphate (pH 7.5), 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP Reservoir buffer: 19% PEG 4000 (w/v), 0.1 M HEPES (pH 7.0), 5 mM DTT.
分辨率 1.38 Å R-free 0.178
8QWO Structure of p53 cancer mutant Y234C 提交 2023-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 5.5-6.0 mg/ml in 25 mM phosphate (pH 7.5), 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP Reservoir buffer: 19% PEG 4000 (w/v), 0.1 M HEPES (pH 7.0), 5 mM DTT.
分辨率 1.38 Å R-free 0.178
8QWP Structure of p53 cancer mutant Y236C 提交 2023-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 5.5-6.0 mg/ml in 25 mM HEPES (pH 7.5), 200 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 19% PEG 3350 (w/v), 5% ethylene glycol (v/v), 0.2 M Na/K tartrate.
分辨率 2.10 Å R-free 0.268
8QWP Structure of p53 cancer mutant Y236C 提交 2023-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 5.5-6.0 mg/ml in 25 mM HEPES (pH 7.5), 200 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 19% PEG 3350 (w/v), 5% ethylene glycol (v/v), 0.2 M Na/K tartrate.
分辨率 2.10 Å R-free 0.268
8R1F Monomeric E6AP-E6-p53 ternary complex 提交 2023-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.67 Å
8R1G Dimeric ternary structure of E6AP-E6-p53 提交 2023-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–393（393 aa）
链 F 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.99 Å
8RBA p53-Y220C Core Domain Covalently Bound to 2,5,6-trifluoropyridine-3-carbonitrile Soaked at 5 mM 提交 2023-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, N239Y, N268D, Y220C YLW 2,5-bis(fluoranyl)pyridine-3-carbonitrile × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.57 Å R-free 0.183
8RBA p53-Y220C Core Domain Covalently Bound to 2,5,6-trifluoropyridine-3-carbonitrile Soaked at 5 mM 提交 2023-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, N239Y, N268D, Y220C YLW 2,5-bis(fluoranyl)pyridine-3-carbonitrile × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.57 Å R-free 0.183
8RBB p53-Y220C Core Domain Covalently Bound to 2,5,6-trifluoropyridine-3-carbonitrile Soaked at 40 mM 提交 2023-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 YLW 2,5-bis(fluoranyl)pyridine-3-carbonitrile × 5 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.69 Å R-free 0.207
8RBB p53-Y220C Core Domain Covalently Bound to 2,5,6-trifluoropyridine-3-carbonitrile Soaked at 40 mM 提交 2023-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 YLW 2,5-bis(fluoranyl)pyridine-3-carbonitrile × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.69 Å R-free 0.207
8RBC p53-Y220C Core Domain Covalently Bound to 3-amino-5-chloropyrazine-2,6-dicarbonitrile Soaked at 5 mM 提交 2023-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 YM0 3-azanylpyrazine-2,6-dicarbonitrile × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 2.06 Å R-free 0.260
8RBC p53-Y220C Core Domain Covalently Bound to 3-amino-5-chloropyrazine-2,6-dicarbonitrile Soaked at 5 mM 提交 2023-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 YM0 3-azanylpyrazine-2,6-dicarbonitrile × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 2.06 Å R-free 0.260
8RCI Human p53 DNA-binding domain bound to DARPin C10 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 94–294（201 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 2.5 mg/ml of p53 DBD-DARPin C10 complex (1:1 ratio) in 50 mM Tris, pH 8, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP Crystallization buffer: 25 % w/v PEG 3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.197
8UQR Crystal structure of the human p53 tetramerization domain 提交 2023-10-24 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 326–356（31 aa）
链 B 326–356（31 aa）
链 C 326–356（31 aa）
链 D 326–356（31 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；15% PEG 1500
分辨率 1.22 Å R-free 0.177
8WD2 The Crystal Structure of p53 from Biortus. 提交 2023-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：M133L,V203A,Y220C,N239Y,N268D PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.04M Potassium phosphate monobasic, 16% w/v PEG 8000, 20% v/v Glycerol
分辨率 1.85 Å R-free 0.208
8WD2 The Crystal Structure of p53 from Biortus. 提交 2023-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：M133L,V203A,Y220C,N239Y,N268D PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.04M Potassium phosphate monobasic, 16% w/v PEG 8000, 20% v/v Glycerol
分辨率 1.85 Å R-free 0.208
8XCB Cocrystal structure of p53 in complex of B20 提交 2023-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 94–293（200 aa）
链 B 94–293（200 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 A1LUZ 2-[2,4-bis(oxidanylidene)-1,3-thiazolidin-5-ylidene]ethanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Tris pH 8.5, 10% w/v PEG3350 and 0.2M Magnesium chloride
分辨率 1.83 Å R-free 0.245
8XCB Cocrystal structure of p53 in complex of B20 提交 2023-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 94–293（200 aa）
链 D 94–293（200 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 A1LUZ 2-[2,4-bis(oxidanylidene)-1,3-thiazolidin-5-ylidene]ethanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Tris pH 8.5, 10% w/v PEG3350 and 0.2M Magnesium chloride
分辨率 1.83 Å R-free 0.245
8XCE cocrystal structure of p53 in complex of B23 提交 2023-12-08 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 94–293（200 aa）
链 B 94–293（200 aa）
链 C 94–293（200 aa）
链 D 94–293（200 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 A1LU0 2-[(2~{Z})-2-(3-ethynylphenyl)imino-4-oxidanylidene-1,3-thiazolidin-5-ylidene]ethanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.1M Tris pH 8.5, 10% w/v PEG3350 and 0.2M Magnesium chloride
分辨率 2.00 Å R-free 0.223
8XP5 The Crystal Structure of p53/BCL-xL fusion complex from Biortus. 提交 2024-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 95–292（198 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05M MgCl2, 0.1M MES pH6.5, 5% PEG 4000, 10% 2-Propanol, 30% w/v D-Sorbito
分辨率 2.55 Å R-free 0.328
8XP5 The Crystal Structure of p53/BCL-xL fusion complex from Biortus. 提交 2024-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 95–292（198 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05M MgCl2, 0.1M MES pH6.5, 5% PEG 4000, 10% 2-Propanol, 30% w/v D-Sorbito
分辨率 2.55 Å R-free 0.328
9BR3 Crystal structure of p53 Y220C mutant in complex with PC-10709 提交 2024-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：Y220C A1ARO 2-{3-[4-(methanesulfonyl)-2-methoxyanilino]prop-1-yn-1-yl}-N-(1-methylpiperidin-4-yl)-1-(2,2,2-trifluoroethyl)-1H-indol-4-amine × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；p53, CID 3799, at 6.93mg/ml; Optimization screen PMV1-opt1 e3: 16% PEG 8000, 20% glycerol, 20mM K2HPO4; protein + 1mM BSI 107743; cryo: direct; crystal tracking ID 285723e3, puck tai0-7
分辨率 1.90 Å R-free 0.191
9BR3 Crystal structure of p53 Y220C mutant in complex with PC-10709 提交 2024-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：Y220C A1ARO 2-{3-[4-(methanesulfonyl)-2-methoxyanilino]prop-1-yn-1-yl}-N-(1-methylpiperidin-4-yl)-1-(2,2,2-trifluoroethyl)-1H-indol-4-amine × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；p53, CID 3799, at 6.93mg/ml; Optimization screen PMV1-opt1 e3: 16% PEG 8000, 20% glycerol, 20mM K2HPO4; protein + 1mM BSI 107743; cryo: direct; crystal tracking ID 285723e3, puck tai0-7
分辨率 1.90 Å R-free 0.191
9BR4 Crystal structure of p53 Y220C mutant in complex with PC-9859 提交 2024-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：p53
未记录 A1ARZ 2-methyl-2-{5-[(3-{4-[(1-methylpiperidin-4-yl)amino]-1-(2,2,2-trifluoroethyl)-1H-indol-2-yl}prop-2-yn-1-yl)amino]pyridin-2-yl}propanenitrile × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；p53, at 6.93mg/ml; Optimization screen PMV1-opt1 e2: 18% PEG 8000, 20% glycerol, 20mM K2HPO4; protein + 1mM compound PC-8959; cryo: direct; crystal tracking ID 272674 e2, puck mqj6-10
分辨率 1.70 Å R-free 0.175
9BR4 Crystal structure of p53 Y220C mutant in complex with PC-9859 提交 2024-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：p53
未记录 A1ARZ 2-methyl-2-{5-[(3-{4-[(1-methylpiperidin-4-yl)amino]-1-(2,2,2-trifluoroethyl)-1H-indol-2-yl}prop-2-yn-1-yl)amino]pyridin-2-yl}propanenitrile × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；p53, at 6.93mg/ml; Optimization screen PMV1-opt1 e2: 18% PEG 8000, 20% glycerol, 20mM K2HPO4; protein + 1mM compound PC-8959; cryo: direct; crystal tracking ID 272674 e2, puck mqj6-10
分辨率 1.70 Å R-free 0.175
9C5S Disulfide-linked, antiparallel p53-derived peptide dimer (CV1) 提交 2024-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 17–30（14 aa）
链 B 17–30（14 aa）
链 C 17–30（14 aa）
链 D 17–30（14 aa）
突变：p53-derived 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：p53-derived 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：p53-derived 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：p53-derived 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；30 mM sodium nitrate, 30 mM dibasic sodium phosphate, 30 mM ammonium sulfate, 20% v/v glycerol, 10% w/v PEG4000, 100 mM imidazole/MES monohydrate buffer, pH 6.5
分辨率 1.01 Å R-free 0.202
9CHT Human E3 ligase E6AP in complex with HPV16-E6 and p53 提交 2024-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–312（312 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9FZB Human p53 DNA-binding domain bound to DARPin C10-H82R 提交 2024-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 94–294（201 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 2.6 mg/ml p53 DBD-DARPin C10-H82R complex in 50 mM HEPES, pH 7.5, 300 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir solution: 0.1 M Bis-Tris propane, pH 7.5, 0.02 M sodium potassium phosphate, pH 7.5, 20% (w/v) PEG 3350, 10% (v/v) ethylene glycol. Drop volume ratio: 2:1
分辨率 1.44 Å R-free 0.184
9G5H p53-Y220C Core Domain Covalently Bound to 2-chloro-5-cyanopyrazine Soaked at 5 mM 提交 2024-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：Y220C, M133L, V203A, N239Y, N268D A1IIO 5-chloranylpyrazine-2-carbonitrile × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.65 Å R-free 0.206
9G5H p53-Y220C Core Domain Covalently Bound to 2-chloro-5-cyanopyrazine Soaked at 5 mM 提交 2024-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：Y220C, M133L, V203A, N239Y, N268D A1IIO 5-chloranylpyrazine-2-carbonitrile × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.65 Å R-free 0.206
9G6T p53-Y220C Core Domain Covalently Bound to 5-Chloro-6-methylpyrazine-2-carbonitrile Soaked at 5 mM 提交 2024-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 94–312（219 aa）
链 B 94–312（219 aa）
突变：Y220C, M133L, V203A, N239Y, N268D 突变：Y220C, M133L, V203A, N239Y, N268D A1II4 5-chloranyl-6-methyl-pyrazine-2-carbonitrile × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.56 Å R-free 0.199
9G6U p53-Y220C Core Domain Covalently Bound to 3,5-Dichloro-6-Ethylpyrazine-2-carbonitirle Soaked at 5 mM 提交 2024-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：Y220C, M133L, V203A, N239Y, N268D A1II1 3,5-bis(chloranyl)-6-ethyl-pyrazine-2-carbonitrile × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.64 Å R-free 0.229
9G6U p53-Y220C Core Domain Covalently Bound to 3,5-Dichloro-6-Ethylpyrazine-2-carbonitirle Soaked at 5 mM 提交 2024-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：Y220C, M133L, V203A, N239Y, N268D A1II1 3,5-bis(chloranyl)-6-ethyl-pyrazine-2-carbonitrile × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.64 Å R-free 0.229
9R04 p53 bound to the nucleosome at position SHL-5.7 (crosslinked sample) 提交 2025-04-24 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 K 1–393（393 aa）
链 L 1–393（393 aa）
链 M 1–393（393 aa）
链 N 1–393（393 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9R2M p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (non-crosslinked sample, composite map) 提交 2025-04-30 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 K 1–393（393 aa）
链 L 1–393（393 aa）
链 M 1–393（393 aa）
链 N 1–393（393 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9R2P p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (crosslinked sample) 提交 2025-04-30 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 K 1–393（393 aa）
链 L 1–393（393 aa）
链 M 1–393（393 aa）
链 N 1–393（393 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
9R2Q p53 bound to nucleosome at position SHL-5.7 (non-crosslinked sample) 提交 2025-04-30 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 K 1–393（393 aa）
链 L 1–393（393 aa）
链 M 1–393（393 aa）
链 N 1–393（393 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9S9L Crystal structure of p53 cancer mutant Y220C in complex with rezatapopt precursor 提交 2025-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1JMS ~{N}-[3-[1-ethyl-5-(methylaminomethyl)indol-2-yl]prop-2-ynyl]aniline × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mm sodium phosphate, pH 7.2, 150 mM KCl, 5 mM DTT. Reservoir buffer: 100 mM Hepes, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mM DTT. Soaking buffer: 19 mM compound in 100 mM Hepes, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mM KCl.
分辨率 1.38 Å R-free 0.174
9S9L Crystal structure of p53 cancer mutant Y220C in complex with rezatapopt precursor 提交 2025-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1JMS ~{N}-[3-[1-ethyl-5-(methylaminomethyl)indol-2-yl]prop-2-ynyl]aniline × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mm sodium phosphate, pH 7.2, 150 mM KCl, 5 mM DTT. Reservoir buffer: 100 mM Hepes, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 5 mM DTT. Soaking buffer: 19 mM compound in 100 mM Hepes, ph 7.2, 10 mM sodium phosphate, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mM KCl.
分辨率 1.38 Å R-free 0.174
9S9M Crystal structure of p53 cancer mutant Y220C in complex with rezatapopt analog 7 提交 2025-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 A1JMO 2-[3-[(4-dimethylphosphorylphenyl)amino]prop-1-ynyl]-~{N}-(1-methylpiperidin-4-yl)-1-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]indol-4-amine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；mM Hepes, pH 7.0, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000. Soaking buffer: 19 mM compound in 100 mM Hepes, pH 7.2, 10 mM sodium phosphate, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mM KCl.
分辨率 1.83 Å R-free 0.226
9S9M Crystal structure of p53 cancer mutant Y220C in complex with rezatapopt analog 7 提交 2025-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 A1JMO 2-[3-[(4-dimethylphosphorylphenyl)amino]prop-1-ynyl]-~{N}-(1-methylpiperidin-4-yl)-1-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]indol-4-amine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；mM Hepes, pH 7.0, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000. Soaking buffer: 19 mM compound in 100 mM Hepes, pH 7.2, 10 mM sodium phosphate, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mM KCl.
分辨率 1.83 Å R-free 0.226
9S9N Crystal structure of p53 cancer mutant Y220C in complex with rezatapopt analog 8 提交 2025-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 A1JMP 1-~{tert}-butyl-~{N}-[[3-[4-[[(3~{S},4~{R})-3-fluoranyl-1-methyl-piperidin-4-yl]amino]-1-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]indol-2-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]methyl]pyrazole-4-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM Hepes, pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 100 mM Hepes, pH 7.0, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000. Soaking buffer: 17 mM compound in 100 mM Hepes, pH 7.2, 10 mM sodium phosphate, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mM KCl.
分辨率 1.72 Å R-free 0.207
9S9N Crystal structure of p53 cancer mutant Y220C in complex with rezatapopt analog 8 提交 2025-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 A1JMP 1-~{tert}-butyl-~{N}-[[3-[4-[[(3~{S},4~{R})-3-fluoranyl-1-methyl-piperidin-4-yl]amino]-1-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]indol-2-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]methyl]pyrazole-4-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM Hepes, pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 100 mM Hepes, pH 7.0, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000. Soaking buffer: 17 mM compound in 100 mM Hepes, pH 7.2, 10 mM sodium phosphate, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mM KCl.
分辨率 1.72 Å R-free 0.207
9S9O Crystal structure of p53 cancer mutant Y220C in complex with rezatapopt 提交 2025-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1JMR 4-[3-[4-[[(3~{S},4~{R})-3-fluoranyl-1-methyl-piperidin-4-yl]amino]-1-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]indol-2-yl]prop-2-ynylamino]-3-methoxy-~{N}-methyl-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM Hepes, pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 100 mM Hepes, pH 7.0, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000. Soaking buffer: 18 mM compound in 100 mM Hepes, pH 7.2, 10 mM sodium phosphate, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mM KCl
分辨率 1.49 Å R-free 0.186
9S9O Crystal structure of p53 cancer mutant Y220C in complex with rezatapopt 提交 2025-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1JMR 4-[3-[4-[[(3~{S},4~{R})-3-fluoranyl-1-methyl-piperidin-4-yl]amino]-1-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]indol-2-yl]prop-2-ynylamino]-3-methoxy-~{N}-methyl-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml protein in 25 mM Hepes, pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 100 mM Hepes, pH 7.0, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000. Soaking buffer: 18 mM compound in 100 mM Hepes, pH 7.2, 10 mM sodium phosphate, pH 7.2, 19% (w/v) polyethylene glycol 4000, 20 % (v/v) glycerol, 150 mM KCl
分辨率 1.49 Å R-free 0.186
9S9P Crystal structure of p53 cancer mutant Y220S in complex with rezatapopt 提交 2025-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1JMR 4-[3-[4-[[(3~{S},4~{R})-3-fluoranyl-1-methyl-piperidin-4-yl]amino]-1-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]indol-2-yl]prop-2-ynylamino]-3-methoxy-~{N}-methyl-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 NO3 NITRATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml in 25 mM Hepes, pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 1 mM Rezatapopt, 2% DMSO. Reservoir buffer: 0.2 M ammonium nitrate, 20% PEG 3350 (protein:buffer 2:1). Cryo: reservoir buffer supplemented with 23% ethylene glycol.
分辨率 1.40 Å R-free 0.188
9S9P Crystal structure of p53 cancer mutant Y220S in complex with rezatapopt 提交 2025-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa） 片段：DNA-binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1JMR 4-[3-[4-[[(3~{S},4~{R})-3-fluoranyl-1-methyl-piperidin-4-yl]amino]-1-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]indol-2-yl]prop-2-ynylamino]-3-methoxy-~{N}-methyl-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 NO3 NITRATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml in 25 mM Hepes, pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 1 mM Rezatapopt, 2% DMSO. Reservoir buffer: 0.2 M ammonium nitrate, 20% PEG 3350 (protein:buffer 2:1). Cryo: reservoir buffer supplemented with 23% ethylene glycol.
分辨率 1.40 Å R-free 0.188
9S9Q Crystal structure of p53 cancer mutant Y220N in complex with rezatapopt 提交 2025-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1JMR 4-[3-[4-[[(3~{S},4~{R})-3-fluoranyl-1-methyl-piperidin-4-yl]amino]-1-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]indol-2-yl]prop-2-ynylamino]-3-methoxy-~{N}-methyl-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml in 25 mM Hepes, pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 1 mM Rezatapopt, 2% DMSO. Reservoir buffer: 10% PEG 8000, 8% ethylene glycol, 0.1 M HEPES pH 7.5 (protein:buffer 1:1). Cryo: reservoir buffer supplemented with 23% ethylene glycol.
分辨率 1.87 Å R-free 0.243
9S9Q Crystal structure of p53 cancer mutant Y220N in complex with rezatapopt 提交 2025-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1JMR 4-[3-[4-[[(3~{S},4~{R})-3-fluoranyl-1-methyl-piperidin-4-yl]amino]-1-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]indol-2-yl]prop-2-ynylamino]-3-methoxy-~{N}-methyl-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 6 mg/ml in 25 mM Hepes, pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 1 mM Rezatapopt, 2% DMSO. Reservoir buffer: 10% PEG 8000, 8% ethylene glycol, 0.1 M HEPES pH 7.5 (protein:buffer 1:1). Cryo: reservoir buffer supplemented with 23% ethylene glycol.
分辨率 1.87 Å R-free 0.243
9S9R Crystal structure of p53 cancer mutant Y220N 提交 2025-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；22.5% (w/v) BMW PEG smear broad, 0.1 M potassium sodium tartrate, 10% (w/v) ethylene glycol, 0.1 M sodium cacodylate, pH 5.3-5.8
分辨率 1.70 Å R-free 0.229
9S9R Crystal structure of p53 cancer mutant Y220N 提交 2025-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；22.5% (w/v) BMW PEG smear broad, 0.1 M potassium sodium tartrate, 10% (w/v) ethylene glycol, 0.1 M sodium cacodylate, pH 5.3-5.8
分辨率 1.70 Å R-free 0.229
9SPM p53 cancer mutant V143A in complex with DARPin C10 提交 2025-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 94–294（201 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 0.75 mg/ml p53-DARPin complex in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 20% PEG smear broad, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M ammonium nitrate. Drop volume ratio 1:1.
分辨率 1.71 Å R-free 0.218
9SPN p53 cancer mutant V157F in complex with DARPin C10 提交 2025-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 94–294（201 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 0.6 mg/ml DARPin-p53 complex in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir solution: 20% PEG3350, 10% ethylene glycol, 0.2 M sodium/potassium phosphate. Drop volume ratio 2:1.
分辨率 1.93 Å R-free 0.223
9SPO p53 cancer mutant Y220C in complex with DARPin C10 提交 2025-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 94–294（201 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 2.3 mg/ml DARPin-p53 complex in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir solution: 20% PEG3350, 10% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris-propane pH 8.5, 0.2 M sodium formate. Drop volume ratio 2:1.
分辨率 1.48 Å R-free 0.182
9SPP p53 cancer mutant Y234C in complex with DARPin C10 提交 2025-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 94–294（201 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 1.5 mg/ml p53-DARPin complex in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 15% PEG3350, 0.1 M magnesium formate. Drop volume ratio 2:1.
分辨率 1.47 Å R-free 0.192
9SPQ p53 cancer mutant V272M in complex with DARPin C10 提交 2025-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 94–294（201 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein solution: 0.9 mg/ml p53-DARPin complex in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 2.4 M sodium malonate. Drop volume ratio 2:1.
分辨率 2.20 Å R-free 0.222
9SPR p53 cancer mutant R282W in complex with DARPin C10 提交 2025-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 94–294（201 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein concentration: 1.8 mg/ml in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 25% PEG3350, 0.1M HEPES pH 7.5, 0.2M lithium sulfate. Drop volume ratio 1:1.
分辨率 1.66 Å R-free 0.201
9SPS p53 cancer mutant E285K in complex with DARPin C10-H82R 提交 2025-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 94–294（201 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Protein concentration p53-DARPin complex: 0.54 mg/ml in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP. Reservoir buffer: 25% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris pH 8.5. Drop ratio protein vs reservoir buffer: 2:1.
分辨率 1.42 Å R-free 0.177
9SUK p53-R282W Core Domain Covalently Bound to a Vinyl-Sulfone Fragment 提交 2025-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, N239Y, N268D, R282W EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 A1JQW 3-bromanyl-1-benzothiophene 1,1-dioxide × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.56 Å R-free 0.206
9SUK p53-R282W Core Domain Covalently Bound to a Vinyl-Sulfone Fragment 提交 2025-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
突变：M133L, V203A, N239Y, N268D, R282W EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 A1JQW 3-bromanyl-1-benzothiophene 1,1-dioxide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.56 Å R-free 0.206
9SZZ p53-Y220C Core Domain Covalently Bound to a Vinyl-Sulfone Fragment 提交 2025-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 94–312（219 aa）
未记录 A1JQW 3-bromanyl-1-benzothiophene 1,1-dioxide × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.70 Å R-free 0.213
9SZZ p53-Y220C Core Domain Covalently Bound to a Vinyl-Sulfone Fragment 提交 2025-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 94–312（219 aa）
未记录 A1JQW 3-bromanyl-1-benzothiophene 1,1-dioxide × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM HEPES (pH = 7.2), 19 % PEG4000 and 10 mM DTT
分辨率 1.70 Å R-free 0.213

共 291 个其他 PDB 条目、462 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 P53_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–265； UniProt 92–356 作者链 C； PDB构建体 1–265； UniProt 92–356 作者链 D； PDB构建体 1–265； UniProt 92–356 作者链 E； PDB构建体 1–265； UniProt 92–356

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 5xzc

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 5xzc
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5xzc
沉积日期 deposition_date2017-07-12
结构标题 titleCryo-EM structure of p300-p53 protein complex
关键词 keywordstranscription factor, autoacetylation, allosteric interaction, catalytically active form, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier45.99 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron45.24 Å
零角强度 I(0) i0494383000.00
分子量 molecular_weight177190.0 kDa
排除体积 excluded_volume214570 ų
包络体积 envelope_volume231800 ų
水化壳体积 shell_volume45789 ų
包络直径 envelope_diameter134.3 Å
壳层 Rg shell_rg47.05 Å
包络 Rg envelope_rg41.55 Å
形状 Rg shape_rg45.47 Å
总 Rg total_rg45.31 Å
总原子数 total_atoms—
残基数 n_residues—
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax132.2 Å
Rg (实空间) rg_real45.69 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.64 Å
I(0) (实空间) i0_real4.9440e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.4770e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal45.99 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal494500000.0000
解质量估计 total_estimate0.8598
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary66.1 Å
偏度 Skewness skewness-0.052
峰度 Kurtosis kurtosis-0.720
角度范围 angular_range— – 0.1700 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha17450000.0000
实空间数据点数 n_real_points35
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.993; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.195
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)