7o2l

Yeast 20S proteasome in complex with the covalently bound inhibitor b-lactone (2R,3S)-3-isopropyl-4-oxo-2-oxetane-carboxylate (IOC)

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PXC6） HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5Q273） 20S proteasome × 2 （P32379） BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PTH4） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （A0A6A5Q4M4） BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PYC9） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q449） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0YA22） Proteasome subunit beta × 2 （A0A6A5Q0W2） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （A0A6V8RU78） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q0P3） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0ZSP2） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 2 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 water × 27	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6L1BIF8_YEASX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250 作者链 O； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250

BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1

物种未注明

UniProt A0A6A5PXC6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6L1BIF8） HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5Q273） 20S proteasome × 2 （P32379） BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PTH4） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （A0A6A5Q4M4） BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PYC9） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q449） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0YA22） Proteasome subunit beta × 2 （A0A6A5Q0W2） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （A0A6V8RU78） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q0P3） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0ZSP2） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 2 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 water × 27	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6A5PXC6_YEASX
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–258； UniProt 1–258 作者链 P； PDB构建体 1–258； UniProt 1–258

HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1

物种未注明

UniProt A0A6A5Q273

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6L1BIF8） BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PXC6） 20S proteasome × 2 （P32379） BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PTH4） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （A0A6A5Q4M4） BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PYC9） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q449） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0YA22） Proteasome subunit beta × 2 （A0A6A5Q0W2） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （A0A6V8RU78） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q0P3） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0ZSP2） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 2 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 water × 27	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6A5Q273_YEASX
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–254； UniProt 1–254 作者链 Q； PDB构建体 1–254； UniProt 1–254

20S proteasome

物种未注明

UniProt P32379

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6L1BIF8） BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PXC6） HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5Q273） BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PTH4） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （A0A6A5Q4M4） BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PYC9） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q449） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0YA22） Proteasome subunit beta × 2 （A0A6A5Q0W2） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （A0A6V8RU78） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q0P3） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0ZSP2） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 2 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 water × 27	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–260； UniProt 1–260 作者链 R； PDB构建体 1–260； UniProt 1–260

BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1

物种未注明

UniProt A0A6A5PTH4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6L1BIF8） BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PXC6） HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5Q273） 20S proteasome × 2 （P32379） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （A0A6A5Q4M4） BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PYC9） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q449） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0YA22） Proteasome subunit beta × 2 （A0A6A5Q0W2） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （A0A6V8RU78） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q0P3） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0ZSP2） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 2 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 water × 27	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6A5PTH4_YEASX
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234 作者链 S； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234

Probable proteasome subunit alpha type-7

物种未注明

UniProt A0A6A5Q4M4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6L1BIF8） BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PXC6） HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5Q273） 20S proteasome × 2 （P32379） BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PTH4） BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PYC9） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q449） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0YA22） Proteasome subunit beta × 2 （A0A6A5Q0W2） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （A0A6V8RU78） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q0P3） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0ZSP2） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 2 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 water × 27	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6A5Q4M4_YEASX
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 T； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288

BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1

物种未注明

UniProt A0A6A5PYC9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6L1BIF8） BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PXC6） HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5Q273） 20S proteasome × 2 （P32379） BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PTH4） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （A0A6A5Q4M4） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q449） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0YA22） Proteasome subunit beta × 2 （A0A6A5Q0W2） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （A0A6V8RU78） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q0P3） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0ZSP2） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 2 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 water × 27	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6A5PYC9_YEASX
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 U； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252

Proteasome endopeptidase complex

物种未注明

UniProt A0A6A5Q449

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6L1BIF8） BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PXC6） HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5Q273） 20S proteasome × 2 （P32379） BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PTH4） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （A0A6A5Q4M4） BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PYC9） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0YA22） Proteasome subunit beta × 2 （A0A6A5Q0W2） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （A0A6V8RU78） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q0P3） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0ZSP2） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 2 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 water × 27	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6A5Q449_YEASX
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–232； UniProt 30–261 作者链 V； PDB构建体 1–232； UniProt 30–261

Proteasome endopeptidase complex

物种未注明

UniProt A0A6L0YA22

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6L1BIF8） BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PXC6） HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5Q273） 20S proteasome × 2 （P32379） BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PTH4） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （A0A6A5Q4M4） BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PYC9） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q449） Proteasome subunit beta × 2 （A0A6A5Q0W2） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （A0A6V8RU78） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q0P3） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0ZSP2） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 2 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 water × 27	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6L0YA22_YEASX
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–205； UniProt 1–205 作者链 W； PDB构建体 1–205； UniProt 1–205

Proteasome subunit beta

物种未注明

UniProt A0A6A5Q0W2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6L1BIF8） BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PXC6） HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5Q273） 20S proteasome × 2 （P32379） BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PTH4） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （A0A6A5Q4M4） BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PYC9） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q449） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0YA22） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （A0A6V8RU78） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q0P3） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0ZSP2） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 2 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 water × 27	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A6A5Q0W2_YEASX
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–198； UniProt 1–198 作者链 X； PDB构建体 1–198； UniProt 1–198

Proteasome subunit beta type-5

物种未注明

UniProt A0A6V8RU78

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6L1BIF8） BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PXC6） HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5Q273） 20S proteasome × 2 （P32379） BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PTH4） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （A0A6A5Q4M4） BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PYC9） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q449） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0YA22） Proteasome subunit beta × 2 （A0A6A5Q0W2） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q0P3） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0ZSP2） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 2 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 water × 27	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6V8RU78_YEASX
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–212； UniProt 76–287 作者链 Y； PDB构建体 1–212； UniProt 76–287

Proteasome endopeptidase complex

物种未注明

UniProt A0A6A5Q0P3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6L1BIF8） BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PXC6） HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5Q273） 20S proteasome × 2 （P32379） BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PTH4） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （A0A6A5Q4M4） BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PYC9） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q449） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0YA22） Proteasome subunit beta × 2 （A0A6A5Q0W2） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （A0A6V8RU78） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0ZSP2） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 2 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 water × 27	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A6A5Q0P3_YEASX
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–222； UniProt 20–241 作者链 Z； PDB构建体 1–222； UniProt 20–241

Proteasome subunit beta type-7

物种未注明

UniProt P30657

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6L1BIF8） BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PXC6） HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5Q273） 20S proteasome × 2 （P32379） BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PTH4） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （A0A6A5Q4M4） BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PYC9） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q449） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0YA22） Proteasome subunit beta × 2 （A0A6A5Q0W2） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （A0A6V8RU78） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q0P3） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0ZSP2） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 2 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 water × 27	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB7_YEAST
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–246； UniProt 21–266 作者链 a； PDB构建体 1–246； UniProt 21–266

Proteasome endopeptidase complex

物种未注明

UniProt A0A6L0ZSP2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6L1BIF8） BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PXC6） HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5Q273） 20S proteasome × 2 （P32379） BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PTH4） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （A0A6A5Q4M4） BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PYC9） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q449） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6L0YA22） Proteasome subunit beta × 2 （A0A6A5Q0W2） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （A0A6V8RU78） Proteasome endopeptidase complex × 2 （A0A6A5Q0P3） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 2 (2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid × 6 water × 27	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6L0ZSP2_YEASX
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–196； UniProt 20–215 作者链 b； PDB构建体 1–196； UniProt 20–215

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7o2l
沉积日期 deposition_date	2021-03-30
结构标题 title	Yeast 20S proteasome in complex with the covalently bound inhibitor b-lactone (2R,3S)-3-isopropyl-4-oxo-2-oxetane-carboxylate (IOC)
关键词 keywords	HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex, Proteasome, b-lactone, Binding Analysis, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7o2l__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7o2l__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7o2l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	60.42 Å
Rg（电子密度）	59.96 Å
总 Rg	60.17 Å
原子数	49366
残基数	6334
排除体积	878950 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7o2l__assembly_1__model_1`	28-meric （28）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1
分子量 formula_weight	27191.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,O
原子数 atom_count	49492

MTDRYSFSLTTFSPSGKLGQIDYALTAVKQGVTSLGIKATNGVVIATEKKSSSPLAMSETLSKVSLLTPDIGAVYSGMGPDYRVLVDKSRKVAHTSYKRIYGEYPPTKLLVSEVAKIMQEATQSGGVRPFGVSLLIAGHDEFNGFSLYQVDPSGSYFPWKATAIGKGSVAAKTFLEKRWNDELELEDAIHIALLTLKESVEGEFNGDTIELAIIGDENPDLLGYTGIPTDKGPRFRKLTSQEINDRLEAL

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1
分子量 formula_weight	28748.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,P

MGSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYALESISHAGTAIGIMASDGIVLAAERKVTSTLLEQDTSTEKLYKLNDKIAVAVAGLTADAEILINTARIHAQNYLKTYNEDIPVEILVRRLSDIKQGYTQHGGLRPFGVSFIYAGYDDRYGYQLYTSNPSGNYTGWKAISVGANTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILVKTGITKKDEDEEADEDMK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1
分子量 formula_weight	28478.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,Q

MSGYDRALSIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNADSRILIEKARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWSAQTIGRNSKTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEKQEQQEQDKKKKSNH

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	20S proteasome
分子量 formula_weight	28649.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,R

MFLTRSEYDRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSGLTADARSMIEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEPSGTFYRYNAKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELIKELKEKEAAESPEEADVEMS

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1
分子量 formula_weight	25634.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,S

MFRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPDARVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTAIGARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Probable proteasome subunit alpha type-7
分子量 formula_weight	31575.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,T

MTSIGTGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSGLIPDGRHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGYKGAATGKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAIDFAQKEINGDDDEDEDDSDNVMSSDDENAPVATNANATTDQEGDIHLE

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1
分子量 formula_weight	28033.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,U

MSGAAAASAAGYDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKATNQTNINSLAVRGKDCTVVISQKKVPDKLLDPTTVSYIFCISRTIGMVVNGPIPDARNAALRAKAEAAEFRYKYGYDMPCDVLAKRMANLSQIYTQRAYMRPLGVILTFVSVDEELGPSIYKTDPAGYYVGYKATATGPKQQEITTNLENHFKKSKIDHINEESWEKVVEFAITHMIDALGTEFSKNDLEVGVATKDKFFTLSAENIEERLVAIAEQD

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Proteasome endopeptidase complex
分子量 formula_weight	25114.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,V

TTIVGVKFNNGVVIAADTRSTQGPIVADKNCAKLHRISPKIWCAGAGTAADTEAVTQLIGSNIELHSLYTSREPRVVSALQMLKQHLFKYQGHIGAYLIVAGVDPTGSHLFSIHAHGSTDVGYYLSLGSGSLAAMAVLESHWKQDLTKEEAIKLASDAIQAGIWNDLGSGSNVDVCVMEIGKDAEYLRNYLTPNVREEKQKSYKFPRGTTAVLKESIVNICDIQEEQVDITA

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Proteasome endopeptidase complex
分子量 formula_weight	22627.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,W

MSDPSSINGGIVVAMTGKDCVAIACDLRLGSQSLGVSNKFEKIFHYGHVFLGITGLATDVTTLNEMFRYKTNLYKLKEERAIEPETFTQLVSSSLYERRFGPYFVGPVVAGINSKSGKPFIAGFDLIGCIDEAKDFIVSGTASDQLFGMCESLYEPNLEPEDLFETISQALLNAADRDALSGWGAVVYIIKKDEVVKRYLKMRQD

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta
分子量 formula_weight	22545.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,X

MDIILGIRVQDSVILASSKAVTRGISVLKDSDDKTRQLSPHTLMSFAGEAGDTVQFAEYIQANIQLYSIREDYELSPQAVSSFVRQELAKSIRSRRPYQVNVLIGGYDKKKNKPELYQIDYLGTKVELPYGAHGYSGFYTFSLLDHHYRPDMTTEEGLDLLKLCVQELEKRMPMDFKGVIVKIVDKDGIRQVDDFQAQ

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-5
分子量 formula_weight	23325.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,Y

TTTLAFRFQGGIIVAVDSRATAGNWVASQTVKKVIEINPFLLGTMAGGAADCQFWETWLGSQCRLHELREKERISVAAASKILSNLVYQYKGAGLSMGTMICGYTRKEGPTIYYVDSDGTRLKGDIFCVGSGQTFAYGVLDSNYKWDLSVEDALYLGKRSILAAAHRDAYSGGSVNLYHVTEDGWIYHGNHDVGELFWKVKEEEGSFNNVIG

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Proteasome endopeptidase complex
分子量 formula_weight	24883.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,Z

QFNPYGDNGGTILGIAGEDFAVLAGDTRNITDYSINSRYEPKVFDCGDNIVMSANGFAADGDALVKRFKNSVKWYHFDHNDKKLSINSAARNIQHLLYGKRFFPYYVHTIIAGLDEDGKGAVYSFDPVGSYEREQCRAGGAAASLIMPFLDNQVNFKNQYEPGTNGKVKKPLKYLSVEEVIKLVRDSFTSATERHIQVGDGLEILIVTKDGVRKEFYELKRD

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-7
分子量 formula_weight	27200.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,a

TQIANAGASPMVNTQQPIVTGTSVISMKYDNGVIIAADNLGSYGSLLRFNGVERLIPVGDNTVVGISGDISDMQHIERLLKDLVTENAYDNPLADAEEALEPSYIFEYLATVMYQRRSKMNPLWNAIIVAGVQSNGDQFLRYVNLLGVTYSSPTLATGFGAHMANPLLRKVVDRESDIPKTTVQVAEEAIVNAMRVLYYRDARSSRNFSLAIIDKNTGLTFKKNLQVENMKWDFAKDIKGYGTQKI

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Proteasome endopeptidase complex
分子量 formula_weight	21517.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N,b

TSIMAVTFKDGVILGADSRTTTGAYIANRVTDKLTRVHDKIWCCRSGSAADTQAIADIVQYHLELYTSQYGTPSTETAASVFKELCYENKDNLTAGIIVAGYDDKNKGEVYTIPLGGSVHKLPYAIAGSGSTFIYGYCDKNFRENMSKEETVDFIKHSLSQAIKWDGSSGGVIRMVVLTAAGVERLIFYPDEYEQL

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	(2 {R},3 {S})-3-methanoyl-4-methyl-2-hydroxy-pentanoic acid
分子量 formula_weight	160.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 18 Entity 18 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	126

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id	7o2lA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lK01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lL01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lO01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lP01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lQ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lR01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lT01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lV01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lY01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	7o2lZ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

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晶胞边长 a length_a	135.120 Å
晶胞边长 b length_b	301.500 Å
晶胞边长 c length_c	144.250 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	112.93 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.1798
R_work r_work	0.1779
R_free r_free	0.2158

Yeast 20S proteasome in complex with the covalently bound inhibitor b-lactone (2R,3S)-3-isopropyl-4-oxo-2-oxetane-carboxylate (IOC)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HLJ1_G0039880.mRNA.1.CDS.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

BJ4_G0021480.mRNA.1.CDS.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

HLJ1_G0048980.mRNA.1.CDS.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

20S proteasome

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

BJ4_G0043800.mRNA.1.CDS.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Probable proteasome subunit alpha type-7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

BJ4_G0020160.mRNA.1.CDS.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome endopeptidase complex

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome endopeptidase complex

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体