8a3y

Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase subunit

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A7M4DUC2_PIG
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1984； UniProt 1–1984

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

物种未注明

UniProt I3LGP4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I3LGP4_PIG
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1251； UniProt 50–1300

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

Sus scrofa

UniProt I3LCH3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I3LCH3_PIG
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–270； UniProt 1–270

RNA polymerase II subunit D

物种未注明

UniProt A0A287ADR4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A287ADR4_PIG
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–142； UniProt 43–184

DNA-directed RNA polymerase II subunit E

物种未注明

UniProt I3LSI7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I3LSI7_PIG
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

物种未注明

UniProt A0A8D1KNW4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A8D1KNW4_PIG
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

物种未注明

UniProt A0A4X1VKG7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A4X1VKG7_PIG
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

物种未注明

UniProt I3LCB2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I3LCB2_PIG
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–150； UniProt 1–150

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

物种未注明

UniProt P60899

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB9_PIG
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

物种未注明

UniProt A0A4X1VYD0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A4X1VYD0_PIG
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a

物种未注明

UniProt F1RKE4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	F1RKE4_PIG
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117

RNA polymerase II subunit K

物种未注明

UniProt A0A8D0JYF1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A8D0JYF1_PIG
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–58； UniProt 1–58

RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1

Homo sapiens

UniProt Q6PD62

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CTR9_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–1173； UniProt 1–1173 作者链 U； PDB构建体 1–1173； UniProt 1–1173

RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1

Homo sapiens

UniProt Q8WVC0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	LEO1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1180–1845； UniProt 1–666 作者链 U； PDB构建体 1180–1845； UniProt 1–666

RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog

Homo sapiens

UniProt Q92541

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RTF1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–248； UniProt 353–600

RNA polymerase II-associated factor 1 homolog

Homo sapiens

UniProt Q8N7H5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PAF1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–311； UniProt 25–335

WD repeat-containing protein 61

Homo sapiens

UniProt Q9GZS3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	WDR61_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	20
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–305； UniProt 1–305

Parafibromin

Homo sapiens

UniProt Q6P1J9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CDC73_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	21
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–531； UniProt 1–531

Transcription elongation factor SPT4

Homo sapiens

UniProt Q4R941

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SPT4H_MACFA
Isoform	—
PDB实体	22
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 5–121； UniProt 1–117

Transcription elongation factor SPT5

Homo sapiens

UniProt O00267

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SPT5H_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	23
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–1087； UniProt 1–1087

Histone H3.2

Xenopus laevis

UniProt P84233

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H32_XENLA
Isoform	—
PDB实体	24
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 e； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

Histone H4

Xenopus laevis

UniProt P62799

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H4_XENLA
Isoform	—
PDB实体	25
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 f； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103

Histone H2A

Xenopus laevis

UniProt Q6AZJ8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2B × 1 （A0A8J1LZU9） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q6AZJ8_XENLA
Isoform	—
PDB实体	26
链与序列区间	作者链 c； PDB构建体 1–103； UniProt 17–119

Histone H2B

Xenopus laevis

UniProt A0A8J1LZU9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 27 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A7M4DUC2） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （I3LGP4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） RNA polymerase II subunit D × 1 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （A0A8D1KNW4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A4X1VYD0） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RNA polymerase II subunit K × 1 （A0A8D0JYF1） SPT6 × 1 Non-template DNA × 1 RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1 × 2 （Q6PD62,Q8WVC0） RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 （Q92541） RNA, Template DNA × 1 RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 （Q8N7H5） WD repeat-containing protein 61 × 1 （Q9GZS3） Parafibromin × 1 （Q6P1J9） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （Q4R941） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A8J1LZU9_XENLA
Isoform	—
PDB实体	27
链与序列区间	作者链 d； PDB构建体 1–95； UniProt 32–126

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8a3y
沉积日期 deposition_date	2022-06-09
结构标题 title	Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex
关键词 keywords	chromatin, rna polymerase II, nucleosome, TFIIS, transcription, elongation; TRANSCRIPTION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8a3y__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8a3y__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8a3y__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	78.68 Å
Rg（电子密度）	76.61 Å
总 Rg	76.43 Å
原子数	125225
残基数	8200
排除体积	1130700 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8a3y__assembly_1__model_1`	30-meric （30）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (29)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit
分子量 formula_weight	219049.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	125225

MHGGGPPSGDSACPLRTIKRVQFGVLSPDELKRMSVTEGGIKYPETTEGGRPKLGGLMDPRQGVIERTGRCQTCAGNMTECPGHFGHIELAKPVFHVGFLVKTMKVLRCVCFFCSKLLVDSNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKGKNICEGGEEMDNKFGVEQPEGDEDLTKEKGHGGCGRYQPRIRRSGLELYAEWKHVNEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVLGMEPRYARPEWMIVTVLPVPPLSVRPAVVMQGSARNQDDLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAAHVIAEDVKLLQFHVATMVDNELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGKEGRVRGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNIDRLQELVRRGNSQYPGAKYIIRDNGDRIDLRFHPKPSDLHLQTGYKVERHMCDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPWSTFRLNLSVTTPYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIQELAMVPRMIVTPQSNRPVMGIVQDTLTAVRKFTKRDVFLERGEVMNLLMFLSTWDGKVPQPAILKPRPLWTGKQIFSLIIPGHINCIRTHSTHPDDEDSGPYKHISPGDTKVVVENGELIMGILCKKSLGTSAGSLVHISYLEMGHDITRLFYSNIQTVINNWLLIEGHTIGIGDSIADSKTYQDIQNTIKKAKQDVIEVIEKAHNNELEPTPGNTLRQTFENQVNRILNDARDKTGSSAQKSLSEYNNFKSMVVSGAKGSKINISQVIAVVGQQNVEGKRIPFGFKHRTLPHFIKDDYGPESRGFVENSYLAGLTPTEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLIKSMESVMVKYDATVRNSINQVVQLRYGEDGLAGESVEFQNLATLKPSNKAFEKKFRFDYTNERALRRTLQEDLVKDVLSNAHIQNELEREFERMREDREVLRVIFPTGDSKVVLPCNLLRMIWNAQKIFHINPRLPSDLHPIKVVEGVKELSKKLVIVNGDDPLSRQAQENATLLFNIHLRSTLCSRRMAEEFRLSGEAFDWLLGEIESKFNQAIAHPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLKELINISKKPKTPSLTVFLLGQSARDAERAKDILCRLEHTTLRKVTANTAIYYDPNPQSTVVAEDQEWVNVYYEMPDFDVARISPWLLRVELDRKHMTDRKLTMEQIAEKINAGFGDDLNCIFNDDNAEKLVLRIRIMNSDENKMQEEEEVVDKMDDDVFLRCIESNMLTDMTLQGIEQISKVYMHLPQTDNKKKIIITEDGEFKALQEWILETDGVSLMRVLSEKDVDPVRTTSNDIVEIFTVLGIEAVRKALERELYHVISFDGSYVNYRHLALLCDTMTCRGHLMAITRHGVNRQDTGPLMKCSFEETVDVLMEAAAHGESDPMKGVSENIMLGQLAPAGTGCFDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTGMFFGSAPSPMGGISPAMTPWNQGATPAYGAWSPSVGSGMTPGAAGFSPSAASDASGFSPGYSPAWSPTPGSPGSPGPSSPYIPSPGGAMSPSYSPTSPAYEPRSPGGYTPQSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit beta
分子量 formula_weight	142426.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MCSTNLSQALAYFRAGANLTAASLWAGFRGSRRIFWERRKRKSLCLALRPGGACWRWLLAVSCVSLRGLGAPGSCANMYDADEDMQYDEDDDEITPDLWQEACWIVISSYFDEKGLVRQQLDSFDEFIQMSVQRIVEDAPPIDLQAEAQHASGEVEEPPRYLLKFEQIYLSKPTHWERDGAPSPMMPNEARLRNLTYSAPLYVDITKTVIKEGEEQLQTQHQKTFIGKIPIMLRSTYCLLNGLTDRDLCELNECPLDPGGYFIINGSEKVLIAQEKMATNTVYVFAKKDSKYAYTGECRSCLENSSRPTSTIWVSMLARGGQGAKKSAIGQRIVATLPYIKQEVPIIIVFRALGFVSDRDILEHIIYDFEDPEMMEMVKPSLDEAFVIQEQNVALNFIGSRGAKPGVTKEKRIKYAKEVLQKEMLPHVGVSDFCETKKAYFLGYMVHRLLLAALGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLLAFLFRGMFKNLLKEVRIYAQKFIDRGKDFNLELAIKTRIISDGLKYSLATGNWGDQKKAHQARAGVSQVLNRLTFASTLSHLRRLNSPIGRDGKLAKPRQLHNTLWGMVCPAETPEGHAVGLVKNLALMAYISVGSQPSPILEFLEEWSMENLEEISPAAIADATKIFVNGCWVGIHKDPEQLMNTLRKLRRQMDIIVSEVSMIRDIREREIRIYTDAGRICRPLLIVEKQKLLLKKRHIDQLKEREYNNYSWQDLVASGVVEYIDTLEEETVMLAMTPDDLQEKEVAYCSTYTHCEIHPSMILGVCASIIPFPDHNQSPRNTYQSAMGKQAMGVYITNFHVRMDTLAHVLYYPQKPLVTTRSMEYLRFRELPAGINSIVAIASYTGYNQEDSVIMNRSAVDRGFFRSVFYRSYKEQESKKGFDQEEVFEKPTRETCQGMRHAIYDKLDDDGLIAPGVRVSGDDVIIGKTVTLPENEDELEGTNRRYTKRDCSTFLRTSETGIVDQVMVTLNQEGYKFCKIRVRSVRIPQIGDKFASRHGQKGTCGIQYRQEDMPFTCEGITPDIIINPHAIPSRMTIGHLIECLQGKVSANKGEIGDATPFNDAVNVQKISNLLSDYGYHLRGNEVLYNGFTGRKITSQIFIGPTYYQRLKHMVDDKIHSRARGPIQILNRQPMEGRSRDGGLRFGEMERDCQIAHGAAQFLRERLFEASDPYQVHVCNLCGIMAIANTRTHTYECRGCRNKTQISLVRMPYACKLLFQELMSMSIAPRMMSV

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3
分子量 formula_weight	30898.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MPYANQPTVRITELTDENVKFIIENTDLAVANSIRRVFIAEVPIIAIDWVQIDANSSVLHDEFIAHRLGLIPLTSDDIVDKLQYSRDCTCEEFCPECSVEFTLDVRCNEDQTRHVTSRDLISNSPRVIPVTSRNRDNDPSDYVEQDDILIVKLRKGQELRLRAYAKKGFGKEHAKWNPTAGVAFEYDPDNALRHTVYPKPEEWPKSEYSELDEDESQAPYDPNGKPERFYYNVESCGSLRPETIVLSALSGLKKKLSDLQTQLSHEIQSD

来源 Source

来源生物 organism	Sus scrofa
通用名 common_name	pig
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9823
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	RNA polymerase II subunit D
分子量 formula_weight	16331.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MAAGGSDPRAGDVEEDASQLIFPKEFETAETLLNSEVHMLLEHRKQQNESAEDEQELSEVFMKTLNYTARFSRFKNRETIASVRSLLLQKKLHKFELACLANLCPETAEESKALIPSLEGRFEDEELQQILDDIQTKRSFQY

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit E
分子量 formula_weight	24644.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MDDEEETYRLWKIRKTIMQLCHDRGYLVTQDELDQTLEEFKAQFGDKPSEGRPRRTDLTVLVAHNDDPTDQMFVFFPEEPKVGIKTIKVYCQRMQEENITRALIVVQQGMTPSAKQSLVDMAPKYILEQFLQQELLINITEHELVPEHVVMTKEEVTELLARYKLRENQLPRIQAGDPVARYFGIKRGQVVKIIRPSETAGRYITYRLVQ

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2
分子量 formula_weight	14477.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSDNEDNFDGDDFDDVEEDEGLDDLENAEEEGQENVEILPSGERPQANQKRITTPYMTKYERARVLGTRALQIAMCAPVMVELEGETDPLLIAMKELKARKIPIIIRRYLPDGSYEDWGVDELIISD

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7
分子量 formula_weight	19314.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MFYHISLEHEILLHPRYFGPNLLNTVKQKLFTEVEGTCTGKYGFVIAVTTIDNIGAGVIQPGRGFVLYPVKYKAIVFRPFKGEVVDAVVTQVNKVGLFTEIGPMSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTMDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIFAIGSLMDDYLGLVS

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
分子量 formula_weight	17162.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MAGILFEDIFDVKDIDPEGKKFDRVSRLHCESESFKMDLILDVNIQIYPVDLGDKFRLVIASTLYEDGTLDDGEYNPTDDRPSRADQFEYVMYGKVYRIEGDETSTEAATRLSAYVSYGGLLMRLQGDANNLHGFEVDSRVYLLMKKLAF

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
分子量 formula_weight	14541.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MEPDGTYEPGFVGIRFCQECNNMLYPKEDKENRILLYACRNCDYQQEADNSCIYVNKITHEVDELTQIIADVSQDPTLPRTEDHPCQKCGHKEAVFFQSHSARAEDAMRLYYVCTAPHCGHRWTE

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
分子量 formula_weight	7655.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MIIPVRCFTCGKIVGNKWEAYLGLLQAEYTEGDALDALGLKRYCCRRMLLAHVDLIEKLLNYAPLEK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a
分子量 formula_weight	13310.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MNAPPAFESFLLFEGEKKITINKDTKVPNACLFTINKEDHTLGNIIKSQLLKDPQVLFAGYKVPHPLEHKIIIRVQTTPDYSPQEAFTNAITDLISELSLLEERFRVAIKDKQEGIE

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	RNA polymerase II subunit K
分子量 formula_weight	7018.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MDTQKDVQPPKQQPMIYICGECHTENEIKSRDPIRCRECGYRIMYKKRTKRLVVFDAR

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	SPT6
分子量 formula_weight	117027.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

DQDNEIRATDLPERFQLRSIPVKGAEDDELEEEADWIYRNAFATPTISLSRKGPSTIQKIKEALGFMRNQHFEVPFIAFYRKEYVEPELHINDLWRVWQWDEKWTQLRIRKENLTRLFEKMQAYQYEQISAIRALDTTDMERLKDVQSMDELKDVYNHFLLYYGRDIPKKFGLTPEQFGENLRDSYQRHETEQFPAEPLELAKDTPEAVLEGARYMVALQIAREPLVRQVLRQTFQERAKLNITPTKKGRKDVDEAHYAYSFKYLKNKPVKELRDDQFLKICLAEDEGLLTTDISIDLKGTYFEEIKQFYYRDEFSHQVQEWNRQRTMAIERALQQFLYVQMAKELKNKLLAEAKEYVIKACSRKLYNWLRVAPYRPDQQQGKGIRVLGIAFSSARDHPVFCALVNGEGEVTDFLRLPHFTEEREKKAQDIETLKKFLLNKKPHVVTVAGENRDAQMLIEDVKRIVHELDQGQQLSSIGVELVDNELAILYMNSKKSEAEFRDYPPVLRQAVSLARRIQDPLIEFAQVCSEDILCLKFHPLQEHVVKEELLNALYCEFINRVNEVGVDVNRAIAHPYSQALIQYVCGLGPRKGTHLLKILKQNNTRLESRTQLVTMCHMGPKVFMNCAGFLKIDTEVLDGSRVHPETYEWARKMAVDALEYDESAEDANPAGALEEILENPERLKDLDLDAFAEELERQGYGDKHITLYDIRAELSCRYKDLRTAYRSPNTEEIFNMLTKETPETFYIGKLIICNVTGIAHIGVKTRLDNGVTGFIPTKFLSDKVVKRPEERVKVGMTVHCRIMKIDIEKFSADLTCRTSDLMIAHPSFHNINFKQAEKMMETMDQGDVIIRPSSKGENHLTVTWKVSDGIYQHVDVRATLWINSEEFEDLDEIVARYVQPMASFARDLLNHKYYQDCSGGDRKKLEELLIKTKKEKPTFIPYFICACKELPGKFLLGYQPRGKPRIEYVTVTPEGFRYRGQIFPTVNGLFRWFKDHYQDPV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Non-template DNA
分子量 formula_weight	39557.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	N

CCATTGAGAGCGGCGGAGCCAGCAGGGAGCTGGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTGAT

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	RNA, Template DNA
分子量 formula_weight	9054.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	P

UAACCGGAGAGGGAACCCACUCAAAAAA

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog,RNA polymerase-associated protein LEO1
分子量 formula_weight	210005.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q,U

MSRGSIEIPLRDTDEVIELDFDQLPEGDEVISILKQEHTQLHIWIALALEYYKQGKTEEFVKLLEAARIDGNLDYRDHEKDQMTCLDTLAAYYVQQARKEKNKDNKKDLITQATLLYTMADKIIMYDQNHLLGRACFCLLEGDKMDQADAQFHFVLNQSPNNIPALLGKACISFNKKDYRGALAYYKKALRTNPGCPAEVRLGMGHCFVKLNKLEKARLAFSRALELNSKCVGALVGLAVLELNNKEADSIKNGVQLLSRAYTIDPSNPMVLNHLANHFFFKKDYSKVQHLALHAFHNTEVEAMQAESCYQLARSFHVQEDYDQAFQYYYQATQFASSSFVLPFFGLGQMYIYRGDKENASQCFEKVLKAYPNNYETMKILGSLYAASEDQEKRDIAKGHLKKVTEQYPDDVEAWIELAQILEQTDIQGALSAYGTATRILQEKVQADVPPEILNNVGALHFRLGNLGEAKKYFLASLDRAKAEAEHDEHYYNAISVTTSYNLARLYEAMCEFHEAEKLYKNILREHPNYVDCYLRLGAMARDKGNFYEASDWFKEALQINQDHPDAWSLIGNLHLAKQEWGPGQKKFERILKQPSTQSDTYSMLALGNVWLQTLHQPTRDREKEKRHQDRALAIYKQVLRNDAKNLYAANGIGAVLAHKGYFREARDVFAQVREATADISDVWLNLAHIYVEQKQYISAVQMYENCLRKFYKHQNTEVVLYLARALFKCGKLQECKQTLLKARHVAPSDTVLMFNVALVLQRLATSVLKDEKSNLKEVLNAVKELELAHRYFSYLSKVGDKMRFDLALAATEARQCSDLLSQAQYHVARARKQDEEERELRAKQEQEKELLRQKLLKEQEEKRLREKEEQKKLLEQRAQYVEKTKNILMFTGETEATKEKKRGGGGGRRSKKGGEFDEFVNDDTDDDLPISKKKKRRKGSGSEQEGEDEEGGERKKKKRRRHPKGEEGSDDDETENGPKPKKRRPPKAEKKKAPKPERLPPSMKGKIKSKAIISSSDDSSDEDKLKIADEGHPRNSNSNSDSDEDEQRKKCASSESDSDENQNKSGSEAGSPRRPRRQRSDQDSDSDQPSRKRRPSGSEQSDNESVQSGRSHSGVSENDSRPASPSAESDHESERGSDNEGSGQGSGNESEPEGSNNEASDRGSEHGSDDSDENLYFQMADMEDLFGSDADSEAERKDSDSGSDSDSDQENAASGSNASGSESDQDERGDSGQPSNKELFGDDSEDEGASHHSGSDNHSERSDNRSEASERSDHEDNDPSDVDQHSGSEAPNDDEDEGHRSDGGSHHSEAEGSEKAHSDDEKWGREDKSDQSDDEKIQNSDDEERAQGSDEDKLQNSDDDEKMQNTDDEERPQLSDDERQQLSEEEKANSDDERPVASDNDDEKQNSDDEEQPQLSDEEKMQNSDDERPQASDEEHRHSDDEEEQDHKSESARGSDSEDEVLRMKRKNAIASDSEADSDTEVPKDNSGTMDLFGGADDISSGSDGEDKPPTPGQPVDENGLPQDQQEEEPIPETRIEVEIPKVNTDLGNDLYFVKLPNFLSVEPRPFDPQYYEDEFEDEEMLDEEGRTRLKLKVENTIRWRIRRDEEGNEIKESNARIVKWSDGSMSLHLGNEVFDVYKAPLQGDHNHLFIRQGTGLQGQAVFKTKLTFRPHSTDSATHRKMTLSLADRCSKTQKIRILPMAGRDPECQRTEMIKKEEERLRASIRRESQQRRMREKQHQRGLSASYLEPDRYDEEEEGEESISLAAIKNRYKGGIREERARIYSSDSDEGSEEDKAQRLLKAKKLTSDEEGEPSGKRKAEDDDKANKKHKKYVISDEEEEDDD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog
分子量 formula_weight	29128.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

VSLPEELNRVRLSRHKLERWCHMPFFAKTVTGCFVRIGIGNHNSKPVYRVAEITGVVETAKVYQLGGTRTNKGLQLRHGNDQRVFRLEFVSNQEFTESEFMKWKEAMFSAGMQLPTLDEINKKELSIKEALNYKFNDQDIEEIVKEKERFRKAPPNYAMKKTQLLKEKAMAEDLGDQDKAKQIQDQLNELEERAEALDRQRTKNISAISYINQRNREWNIVESEKALVAESHNMKNQQMDPFTRRQCK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	RNA, Template DNA
分子量 formula_weight	42305.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	T

ATCAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCCAGCTCCCTGCTGGCTCCGAGTGGGTTCTGCCGCTCTCAATGG

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	RNA polymerase II-associated factor 1 homolog
分子量 formula_weight	36451.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

ERSGVVCRVKYCNSLPDIPFDPKFITYPFDQNRFVQYKATSLEKQHKHDLLTEPDLGVTIDLINPDTYRIDPNVLLDPADEKLLEEEIQAPTSSKRSQQHAKVVPWMRKTEYISTEFNRYGISNEKPEVKIGVSVKQQFTEEEIYKDRDSQITAIEKTFEDAQKSISQHYSKPRVTPVEVMPVFPDFKMWINPCAQVIFDSDPAPKDTSGAAALEMMSQAMIRGMMDEEGNQFVAYFLPVEETLKKRKRDQEEEMDYAPDDVYDYKIAREYNWNVKNKASKGYEENYFFIFREGDGVYYNELETRVRLSKR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	WD repeat-containing protein 61
分子量 formula_weight	33617.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

MTNQYGILFKQEQAHDDAIWSVAWGTNKKENSETVVTGSLDDLVKVWKWRDERLDLQWSLEGHQLGVVSVDISHTLPIAASSSLDAHIRLWDLENGKQIKSIDAGPVDAWTLAFSPDSQYLATGTHVGKVNIFGVESGKKEYSLDTRGKFILSIAYSPDGKYLASGAIDGIINIFDIATGKLLHTLEGHAMPIRSLTFSPDSQLLVTASDDGYIKIYDVQHANLAGTLSGHASWVLNVAFCPDDTHFVSSSSDKSVKVWDVGTRTCVHTFFDHQDQVWGVKYNGNGSKIVSVGDDQEIHIYDCPI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 21 Entity 21 polymer

描述 description	Parafibromin
分子量 formula_weight	60673.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MADVLSVLRQYNIQKKEIVVKGDEVIFGEFSWPKNVKTNYVVWGTGKEGQPREYYTLDSILFLLNNVHLSHPVYVRRAATENIPVVRRPDRKDLLGYLNGEASTSASIDRSAPLEIGLQRSTQVKRAADEVLAEAKKPRIEDEECVRLDKERLAARLEGHKEGIVQTEQIRSLSEAMSVEKIAAIKAKIMAKKRSTIKTDLDDDITALKQRSFVDAEVDVTRDIVSRERVWRTRTTILQSTGKNFSKNIFAILQSVKAREEGRAPEQRPAPNAAPVDPTLRTKQPIPAAYNRYDQERFKGKEETEGFKIDTMGTYHGMTLKSVTEGASARKTQTPAAQPVPRPVSQARPPPNQKKGSRTPIIIIPAATTSLITMLNAKDLLQDLKFVPSDEKKKQGCQRENETLIQRRKDQMQPGGTAISVTVPYRVVDQPLKLMPQDWDRVVAVFVQGPAWQFKGWPWLLPDGSPVDIFAKIKAFHLKYDEVRLDPNVQKWDVTVLELSYHKRHLDRPVFLRFWETLDRYMVKHKSHLRF

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 22 Entity 22 polymer

描述 description	Transcription elongation factor SPT4
分子量 formula_weight	13508.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

GPGSMALETVPKDLRHLRACLLCSLVKTIDQFEYDGCDNCDAYLQMKGNREMVYDCTSSSFDGIIAMMSPEDSWVSKWQRVSNFKPGVYAVSVTGRLPQGIVRELKSRGVAYKSRDTAIKT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 23 Entity 23 polymer

描述 description	Transcription elongation factor SPT5
分子量 formula_weight	121225.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MSDSEDSNFSEEEDSERSSDGEEAEVDEERRSAAGSEKEEEPEDEEEEEEEEEYDEEEEEEDDDRPPKKPRHGGFILDEADVDDEYEDEDQWEDGAEDILEKEEIEASNIDNVVLDEDRSGARRLQNLWRDQREEELGEYYMKKYAKSSVGETVYGGSDELSDDITQQQLLPGVKDPNLWTVKCKIGEERATAISLMRKFIAYQFTDTPLQIKSVVAPEHVKGYIYVEAYKQTHVKQAIEGVGNLRLGYWNQQMVPIKEMTDVLKVVKEVANLKPKSWVRLKRGIYKDDIAQVDYVEPSQNTISLKMIPRIDYDRIKARMSLKDWFAKRKKFKRPPQRLFDAEKIRSLGGDVASDGDFLIFEGNRYSRKGFLFKSFAMSAVITEGVKPTLSELEKFEDQPEGIDLEVVTESTGKEREHNFQPGDNVEVCEGELINLQGKILSVDGNKITIMPKHEDLKDMLEFPAQELRKYFKMGDHVKVIAGRFEGDTGLIVRVEENFVILFSDLTMHELKVLPRDLQLCSETASGVDVGGQHEWGELVQLDPQTVGVIVRLERETFQVLNMYGKVVTVRHQAVTRKKDNRFAVALDSEQNNIHVKDIVKVIDGPHSGREGEIRHLFRSFAFLHCKKLVENGGMFVCKTRHLVLAGGSKPRDVTNFTVGGFAPMSPRISSPMHPSAGGQRGGFGSPGGGSGGMSRGRGRRDNELIGQTVRISQGPYKGYIGVVKDATESTARVELHSTCQTISVDRQRLTTVGSRRPGGMTSTYGRTPMYGSQTPMYGSGSRTPMYGSQTPLQDGSRTPHYGSQTPLHDGSRTPAQSGAWDPNNPNTPSRAEEEYEYAFDDEPTPSPQAYGGTPNPQTPGYPDPSSPQVNPQYNPQTPGTPAMYNTDQFSPYAAPSPQGSYQPSPSPQSYHQVAPSPAGYQNTHSPASYHPTPSPMAYQASPSPSPVGYSPMTPGAPSPGGYNPHTPGSGIEQNSSDWVTTDIQVKVRDTYLDTQVVGQTGVIRSVTGGMCSVYLKDSEKVVSISSEHLEPITPTKNNKVKVILGEDREATGVLLSIDGEDGIVRMDLDEQLKILNLRFLGKLLEA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 24 Entity 24 polymer

描述 description	Histone H3.2
分子量 formula_weight	15435.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,e

MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 25 Entity 25 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	11394.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b,f

MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 26 Entity 26 polymer

描述 description	Histone H2A
分子量 formula_weight	11294.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

TRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPK

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 27 Entity 27 polymer

描述 description	Histone H2B
分子量 formula_weight	10607.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

KTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	9

实体 29 Entity 29 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▶

分辨率 resolution	3.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	30000

Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA polymerase II subunit D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体