当前蛋白身份：P60709
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21VV Cryo-EM structure of ncBAF bound to the nucleosome 提交 2025-12-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–375（375 aa）
|
未记录 | BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM HEPES pH 8.0, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.5 mM ADP, 8 mM NaF, 1 mM BeSO4.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 3D2U Structure of UL18, a Peptide-Binding Viral MHC Mimic, Bound to a Host Inhibitory Receptor 提交 2008-05-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
170–178（9 aa）
片段：sequence database residues 170-178
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.4 M Mg(NO3)2, and 16~22% (w/v) PEG 33500, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.259 |
| 3D2U Structure of UL18, a Peptide-Binding Viral MHC Mimic, Bound to a Host Inhibitory Receptor 提交 2008-05-08 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
170–178（9 aa）
片段：sequence database residues 170-178
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.4 M Mg(NO3)2, and 16~22% (w/v) PEG 33500, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.259 |
| 3J82 Electron cryo-microscopy of DNGR-1 in complex with F-actin 提交 2014-09-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 3LUE Model of alpha-actinin CH1 bound to F-actin 提交 2010-02-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
链 E
2–375（374 aa）
链 F
2–375（374 aa）
链 G
2–375（374 aa）
链 H
2–375（374 aa）
链 I
2–375（374 aa）
链 J
2–375（374 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 15.00 Å |
| 6ANU Cryo-EM structure of F-actin complexed with the beta-III-spectrin actin-binding domain 提交 2017-08-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–375（375 aa）
链 B
1–375（375 aa）
链 C
1–375（375 aa）
链 D
1–375（375 aa）
链 E
1–375（375 aa）
链 F
1–375（375 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
66–88（23 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate
0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5
20% Polyethylene glycol 8000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.214 |
| 6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
66–88（23 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate
0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5
20% Polyethylene glycol 8000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.214 |
| 6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
66–88（23 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate
0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5
20% Polyethylene glycol 8000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.214 |
| 6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
66–88（23 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate
0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5
20% Polyethylene glycol 8000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.214 |
| 6ICV Structure of SETD3 bound to SAH and unmodified actin 提交 2018-09-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
66–88（23 aa）
|
未记录 | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5
2% Polyethylene glycol 400
2.0M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.205 |
| 6ICV Structure of SETD3 bound to SAH and unmodified actin 提交 2018-09-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
66–88（23 aa）
|
未记录 | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5
2% Polyethylene glycol 400
2.0M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.205 |
| 6LTJ Structure of nucleosome-bound human BAF complex 提交 2020-01-22 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–375（375 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6MBJ SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, P21 Crystal Form 提交 2018-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Y
66–80（15 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.223 |
| 6MBJ SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, P21 Crystal Form 提交 2018-08-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Z
66–80（15 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.223 |
| 6MBK SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, First P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Y
66–80（15 aa）
片段：residues 66-80
|
未记录 | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.243 |
| 6MBK SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, First P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Z
66–80（15 aa）
片段：residues 66-80
|
未记录 | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.243 |
| 6MBL SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, Second P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Y
66–80（15 aa）
片段：residues 66-80
|
未记录 | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.227 |
| 6NBW Ternary Complex of Beta/Gamma-Actin with Profilin and AnCoA-NAA80 提交 2018-12-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 LAB LATRUNCULIN B × 1 GOL GLYCEROL × 2 SOP [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-4-HYDROXY-3-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL (3R)-3-HYDROXY-2,2-DIMETHYL-4-OXO-4-{[3-OXO-3-({2-[(2-OXOPROPYL)THIO]ETHYL}AMINO)PROPYL]AMINO}BUTYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290 K；15% PEG 3350, 50mM MES pH6.2, 50mM NH4NO3
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.209 |
| 6OX0 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Sinefungin Replacing SAH as Cofactor 提交 2019-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Y
66–80（15 aa）
片段：residues 66-80
|
未记录 | SFG SINEFUNGIN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.225 |
| 6OX0 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Sinefungin Replacing SAH as Cofactor 提交 2019-05-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Z
66–80（15 aa）
片段：residues 66-80
|
未记录 | SFG SINEFUNGIN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.225 |
| 6OX1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Target Histidine Partially Methylated 提交 2019-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Y
66–80（15 aa）
片段：residues 66-80
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.201 |
| 6OX1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Target Histidine Partially Methylated 提交 2019-05-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Z
66–80（15 aa）
片段：residues 66-80
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.201 |
| 6OX2 SETD3in Complex with an Actin Peptide with the Target Histidine Fully Methylated 提交 2019-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Y
66–80（15 aa）
片段：residues 66-80
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.239 |
| 6OX2 SETD3in Complex with an Actin Peptide with the Target Histidine Fully Methylated 提交 2019-05-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Z
66–80（15 aa）
片段：residues 66-80
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.239 |
| 6OX4 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide 提交 2019-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Y
66–80（15 aa）
片段：residues 66-80
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.236 |
| 6OX4 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide 提交 2019-05-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Z
66–80（15 aa）
片段：residues 66-80
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.236 |
| 6OX5 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Lysine 提交 2019-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Y
66–83（18 aa）
|
突变：H73K | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.205 |
| 7AS4 Recombinant human gTuRC 提交 2020-10-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric（33） 与蛋白数一致 |
链 7
2–375（374 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.13 Å |
| 7P1H Structure of the V. vulnificus ExoY-G-actin-profilin complex 提交 2021-07-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
4–375（372 aa）
|
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7VDV The overall structure of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 P
1–375（375 aa）
|
未记录 | BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7W28 Crystal Structure of SETD3-SAH in complex with betaA-4PyrAla73 peptide 提交 2021-11-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
66–81（16 aa）
片段：SAH
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；30%(w/v) PEG4000, 0.1 M Tris base/Hydrochloric acid 8.5, 0.2M Lithium sulfate.
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.211 |
| 7W29 Crystal Structure of SETD3-SAH in complex with betaA-Orn73 peptide 提交 2021-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
66–81（16 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；289 K；20%(w/v) PEG6000, 0.1M Bicine/Sodium hydroxide 9.0
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.279 |
| 8COG Human arginylated beta-actin 提交 2023-02-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
2–375（374 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Actin for EM was polymerized by mixing, 20 ul 20 uM G-actin, 8 ul 10x MKE and 52 ul 5 mM HEPES-KOH pH 7.4 containing 0.2 mM ATP and 0.5 mM DTT and incubating at RT for 1 hour.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8DNH Cryo-EM structure of nonmuscle beta-actin 提交 2022-07-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.99 Å |
| 8OI8 Cryo-EM structure of ADP-bound, filamentous beta-actin harboring the R183W mutation 提交 2023-03-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–375（375 aa）
链 B
1–375（375 aa）
链 C
1–375（375 aa）
链 D
1–375（375 aa）
链 E
1–375（375 aa）
|
突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1x KMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA) supplemented with 0.02% Tween20 (v/v)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.28 Å |
| 8OID Cryo-EM structure of ADP-bound, filamentous beta-actin harboring the N111S mutation 提交 2023-03-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–375（375 aa）
链 B
1–375（375 aa）
链 C
1–375（375 aa）
链 D
1–375（375 aa）
链 E
1–375（375 aa）
|
突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1x KMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA) supplemented with 0.02% Tween20 (v/v)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 8QR1 Cryo-EM structure of the human Tip60 complex 提交 2023-10-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric（13） 与蛋白数一致 |
链 B
1–375（375 aa）
链 G
1–375（375 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 8RTT Structure of the formin Cdc12 bound to the barbed end of phalloidin-stabilized F-actin. 提交 2024-01-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1–375（375 aa）
链 B
1–375（375 aa）
链 C
1–375（375 aa）
链 D
1–375（375 aa）
|
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.
|
分辨率 3.56 Å |
| 8RTY Structure of the F-actin barbed end bound by Cdc12 and profilin (ring complex) at a resolution of 6.3 Angstrom 提交 2024-01-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
|
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.
|
分辨率 6.25 Å |
| 8RU2 Structure of the F-actin barbed end bound by formin mDia1 提交 2024-01-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.
|
分辨率 3.49 Å |
| 8VRD Rigid body fitted model for free recombinant gamma tubulin ring complex. 提交 2024-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric（34） 与蛋白数一致 |
链 S
1–375（375 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 8VRJ Rigid body fitted model for gamma tubulin ring complex capped microtubule 提交 2024-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白数一致 |
链 9
1–375（375 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 8VRK Rigid body fitted model for refined density map of gamma tubulin ring complex capped microtubule 提交 2024-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白数一致 |
链 9
1–375（375 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.50 Å |
| 8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 S
1–375（375 aa）
链 U
1–375（375 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 S
1–375（375 aa）
链 U
1–375（375 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 S
1–375（375 aa）
链 U
1–375（375 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8XVT The core subcomplex of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 K
1–375（375 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9B2Z Actin-bound Legionella pneumophila AMPylase LnaB with AMPylated catalytic histidine 提交 2024-03-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–375（375 aa）
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 LAB LATRUNCULIN B × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 9B7J Cryo-EM structure of human dynactin complex bound to Chlamydia effector Dre1 提交 2024-03-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric（25） 与蛋白数一致 |
链 H
1–375（375 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.49 Å |
| 9B85 Cryo-EM structure of human dynactin complex bound to Chlamydia effector Dre1 提交 2024-03-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric（19） 与蛋白数一致 |
链 H
1–375（375 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 9C57 Reconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex 提交 2024-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 J
1–375（375 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 9C62 P400 subcomplex of the native human TIP60 complex 提交 2024-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 J
1–375（375 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.28 Å |
| 9C6N ARP module of the human TIP60 complex 提交 2024-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 J
1–375（375 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 9CAC Cryo-EM structure of the RuvBL lobe of the native human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric（13） 与蛋白数一致 |
链 K
1–375（375 aa）
链 L
1–375（375 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 9CAE Cryo-EM structure of the reconstituted RuvBL lobe of the human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 L
1–375（375 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
| 9FJM Cryo-EM structure of the phalloidin-bound pointed end of the actin filament. 提交 2024-05-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.
|
分辨率 3.65 Å |
| 9GXI Subtomogram average of fascin-actin complex 提交 2024-09-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 B
1–375（375 aa）
链 C
1–375（375 aa）
链 D
1–375（375 aa）
链 E
1–375（375 aa）
链 F
1–375（375 aa）
链 G
1–375（375 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.00 Å |
| 9I8G Inwards conformation' of the human gamma-TuRC from purified centrosomes obtained by rigid body docking 提交 2025-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric（33） 与蛋白数一致 |
链 U
1–375（375 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 22.40 Å |
| 9I8H Outwards conformation' of the human gamma-TuRC from purified centrosomes obtained by rigid body docking 提交 2025-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric（33） 与蛋白数一致 |
链 U
1–375（375 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 23.20 Å |
| 9P1I Atomic structure of vibrio effector fragment VopV bound to Beta-cytoplasmic/gamma1-cytoplasmic F-actin 提交 2025-06-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–375（375 aa）
链 R
1–375（375 aa）
链 S
1–375（375 aa）
链 T
1–375（375 aa）
链 U
1–375（375 aa）
链 V
1–375（375 aa）
链 W
1–375（375 aa）
链 X
1–375（375 aa）
链 Y
1–375（375 aa）
链 Z
1–375（375 aa）
链 a
1–375（375 aa）
链 b
1–375（375 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 12 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9QEW Cryo-EM structure of the undecorated actin filament in the ADP-Pi state. 提交 2025-03-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
链 E
2–375（374 aa）
|
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.18 Å |
| 9QEY Cryo-EM structure of the actin filament bound by a single Coronin-1B molecule. 提交 2025-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
链 E
2–375（374 aa）
|
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.74 Å |
| 9QF2 Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state. 提交 2025-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
链 E
2–375（374 aa）
|
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.42 Å |
| 9QFB Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state. 提交 2025-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
链 E
2–375（374 aa）
链 F
2–375（374 aa）
链 G
2–375（374 aa）
|
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.74 Å |
| 9QFD Cryo-EM structure of the fully cofilin-1-decorated actin filament (cofilactin) 提交 2025-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
链 E
2–375（374 aa）
链 F
2–375（374 aa）
链 G
2–375（374 aa）
|
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.61 Å |
| 9QFE Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1 on separate actin strands 提交 2025-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
链 E
2–375（374 aa）
链 F
2–375（374 aa）
链 G
2–375（374 aa）
|
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.12 Å |
| 9QFG Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1, strand boundary 提交 2025-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
链 E
2–375（374 aa）
链 F
2–375（374 aa）
链 G
2–375（374 aa）
|
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.49 Å |
| 9QFJ Cryo-EM structure of the cofilactin filament core at 2.3 Angstrom resolution. 提交 2025-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
链 E
2–375（374 aa）
|
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.31 Å |
| 9QFK Cryo-EM structure of the Coronin-1B-decorated actin filament bound by one Cofilin-1 molecule (crosslinked) 提交 2025-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
链 E
2–375（374 aa）
链 F
2–375（374 aa）
链 G
2–375（374 aa）
|
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.99 Å |
| 9QFO Cryo-EM structure of the cofilactin filament pointed end 提交 2025-03-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
链 E
2–375（374 aa）
链 F
2–375（374 aa）
|
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.96 Å |
| 9QFQ Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by AIP1 提交 2025-03-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric（11） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
链 E
2–375（374 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.76 Å |
| 9QFW Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by two AIP1 molecules 提交 2025-03-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
2–375（374 aa）
链 B
2–375（374 aa）
链 C
2–375（374 aa）
链 D
2–375（374 aa）
链 E
2–375（374 aa）
|
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 9QVM Cryo-EM reconstruction of the NEDD1 anchor protein and CDK5RAP2 bound to the gamma-tubulin ring complex 提交 2025-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 Z
1–375（375 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.80 Å |
| 9QVN Cryo-EM reconstruction of the NEDD1 anchor protein bound to the gamma-tubulin ring complex 提交 2025-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric（45） 与蛋白数一致 |
链 Z
1–375（375 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–375（375 aa）
|
未记录 | PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–375（375 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–375（375 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.90 Å |
| 9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–375（375 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 9UXA local ARP-NCP structure of the ncBAF-nucleosome complex in the apo state 提交 2025-05-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 I
2–375（374 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.28 Å |
| 9UXB The apo structure of BCL7B-containing ARP module of the human SWI/SNF complex 提交 2025-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
2–375（374 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.92 Å |
| 9UXC The ADP-bound structure of BCL7B-containing ARP module of the human SWI/SNF complex 提交 2025-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
2–375（374 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.74 Å |
| 9WBZ The structure of NCP-motor-ARP module of ncBAF-nucleosome complex 提交 2025-08-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 L
1–375（375 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9WC1 The structure of ARP module in ncBAF complex 提交 2025-08-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–375（375 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |