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RNA Polymerase I-tWH-Rrn3-DNA

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 177.7 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P10964

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 1–1664 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135 × 1 （P22138） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 （P07703） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14 × 1 （P50106） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 × 1 （P46669） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12 × 1 （P32529） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 （P28000） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 × 1 （Q01080） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34 × 1 （P47006） RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3 × 1 （P36070） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 P 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C3H Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.27 A resolution, crystal form C2-93 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 24% ETHYLENGLYCOL, 0.1M MES PH 6.8
分辨率 3.27 Å R-free 0.226
4C3I Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.0 A resolution, crystal form C2-100 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL PH 7.4
分辨率 3.00 Å R-free 0.231
4C3J Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.35 A resolution, crystal form C2-90 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL, PH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.220
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 AA 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 BA 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 CA 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 DA 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 EA 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 FA 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5LMX Monomeric RNA polymerase I at 4.9 A resolution 提交 2016-08-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
5M3F Yeast RNA polymerase I elongation complex at 3.8A 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 3.80 Å
5M3M Free monomeric RNA polymerase I at 4.0A resolution 提交 2016-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 4.00 Å
5M5W RNA Polymerase I open complex 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 3.80 Å
5M5X RNA Polymerase I elongation complex 1 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot time for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M5Y RNA Polymerase I elongation complex 2 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M64 RNA Polymerase I elongation complex with A49 tandem winged helix domain 提交 2016-10-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.60 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6H67 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) 提交 2018-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6H68 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) with fully-ordered A49 提交 2018-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6HKO Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.42 Å
6HLQ Yeast RNA polymerase I* elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLR Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP (core focused) 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLS Yeast apo RNA polymerase I* 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.21 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9G1V Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.70 Å
9G1X Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 11-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：14-meric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G23 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at A-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G24 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at E-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G26 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, closed state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G27 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, pre-translocation state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.80 Å
9G29 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site with the C-terminal of A12 in the funnel 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.30 Å
9G2B Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 12-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.20 Å
9G2C Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, open state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 A 1–1664（1664 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å

共 44 个其他 PDB 条目、50 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RPA1_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–1664； UniProt 1–1664

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P22138

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 B； UniProt 1–1203 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190 × 1 （P10964） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 （P07703） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14 × 1 （P50106） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 × 1 （P46669） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12 × 1 （P32529） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 （P28000） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 × 1 （Q01080） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34 × 1 （P47006） RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3 × 1 （P36070） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 Q 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C3H Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.27 A resolution, crystal form C2-93 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 24% ETHYLENGLYCOL, 0.1M MES PH 6.8
分辨率 3.27 Å R-free 0.226
4C3I Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.0 A resolution, crystal form C2-100 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL PH 7.4
分辨率 3.00 Å R-free 0.231
4C3J Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.35 A resolution, crystal form C2-90 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL, PH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.220
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 AB 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 BB 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 CB 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 DB 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 EB 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 FB 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5LMX Monomeric RNA polymerase I at 4.9 A resolution 提交 2016-08-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
5M3F Yeast RNA polymerase I elongation complex at 3.8A 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 3.80 Å
5M3M Free monomeric RNA polymerase I at 4.0A resolution 提交 2016-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 4.00 Å
5M5W RNA Polymerase I open complex 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 3.80 Å
5M5X RNA Polymerase I elongation complex 1 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot time for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M5Y RNA Polymerase I elongation complex 2 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M64 RNA Polymerase I elongation complex with A49 tandem winged helix domain 提交 2016-10-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.60 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6H67 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) 提交 2018-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6H68 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) with fully-ordered A49 提交 2018-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6HKO Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.42 Å
6HLQ Yeast RNA polymerase I* elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLR Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP (core focused) 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLS Yeast apo RNA polymerase I* 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.21 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9G1V Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.70 Å
9G1X Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 11-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：14-meric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G23 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at A-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G24 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at E-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G26 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, closed state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G27 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, pre-translocation state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.80 Å
9G29 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site with the C-terminal of A12 in the funnel 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.30 Å
9G2B Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 12-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.20 Å
9G2C Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, open state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 B 1–1203（1203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å

共 44 个其他 PDB 条目、50 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPA2_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–1203； UniProt 1–1203

DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P07703

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 1–335 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190 × 1 （P10964） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135 × 1 （P22138） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14 × 1 （P50106） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 × 1 （P46669） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12 × 1 （P32529） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 （P28000） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 × 1 （Q01080） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34 × 1 （P47006） RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3 × 1 （P36070） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 R 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C3H Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.27 A resolution, crystal form C2-93 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 24% ETHYLENGLYCOL, 0.1M MES PH 6.8
分辨率 3.27 Å R-free 0.226
4C3I Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.0 A resolution, crystal form C2-100 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL PH 7.4
分辨率 3.00 Å R-free 0.231
4C3J Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.35 A resolution, crystal form C2-90 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL, PH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.220
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 AC 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 BC 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 CC 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 DC 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 EC 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 FC 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
5FJ8 Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III elongation complex at 3. 9 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 3.90 Å
5FJ9 Cryo-EM structure of yeast apo RNA polymerase III at 4.6 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 4.60 Å
5FJA Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III at 4.7 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT - FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 4.65 Å
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5LMX Monomeric RNA polymerase I at 4.9 A resolution 提交 2016-08-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
5M3F Yeast RNA polymerase I elongation complex at 3.8A 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 3.80 Å
5M3M Free monomeric RNA polymerase I at 4.0A resolution 提交 2016-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 4.00 Å
5M5W RNA Polymerase I open complex 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 3.80 Å
5M5X RNA Polymerase I elongation complex 1 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot time for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M5Y RNA Polymerase I elongation complex 2 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M64 RNA Polymerase I elongation complex with A49 tandem winged helix domain 提交 2016-10-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.60 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6CNB Yeast RNA polymerase III initial transcribing complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6CNC Yeast RNA polymerase III open complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6CND Yeast RNA polymerase III natural open complex (nOC) 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6CNF Yeast RNA polymerase III elongation complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6EU0 RNA Polymerase III open pre-initiation complex (OC-PIC) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6EU1 RNA Polymerase III - open DNA complex (OC-POL3). 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6EU2 Apo RNA Polymerase III - open conformation (oPOL3) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6EU3 Apo RNA Polymerase III - closed conformation (cPOL3) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6F40 RNA Polymerase III open complex 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6F41 RNA Polymerase III initially transcribing complex 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6F42 RNA Polymerase III closed complex CC1. 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6F44 RNA Polymerase III closed complex CC2. 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6H67 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) 提交 2018-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6H68 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) with fully-ordered A49 提交 2018-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6HKO Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.42 Å
6HLQ Yeast RNA polymerase I* elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLR Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP (core focused) 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLS Yeast apo RNA polymerase I* 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.21 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
6TUT Cryo-EM structure of the RNA Polymerase III-Maf1 complex 提交 2020-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES, 150 mM (NH4)2SO4, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 6, blot force 2
分辨率 3.25 Å
7Z0H Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.6 A (focus subunit AC40). 提交 2022-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7Z1L Structure of yeast RNA Polymerase III Pre-Termination Complex (PTC) 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7Z1M Structure of yeast RNA Polymerase III Elongation Complex (EC) 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7Z1N Structure of yeast RNA Polymerase III Delta C53-C37-C11 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7Z1O Structure of yeast RNA Polymerase III PTC + NTPs 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7Z2Z Structure of yeast RNA Polymerase III-DNA-Ty1 integrase complex (Pol III-DNA-IN1) at 3.1 A 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
7Z30 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.9 A (focus subunit C11 terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7Z31 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.7 A (focus subunit C11, no C11 C-terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
8BWS Structure of yeast RNA Polymerase III elongation complex at 3.3 A 提交 2022-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9G1V Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.70 Å
9G1X Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 11-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：14-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G23 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at A-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G24 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at E-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G26 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, closed state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G27 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, pre-translocation state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.80 Å
9G29 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site with the C-terminal of A12 in the funnel 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.30 Å
9G2B Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 12-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.20 Å
9G2C Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, open state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 C 1–335（335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å

共 69 个其他 PDB 条目、75 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAC1_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–335； UniProt 1–335

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P50106

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 D； UniProt 1–137 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190 × 1 （P10964） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135 × 1 （P22138） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 （P07703） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 × 1 （P46669） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12 × 1 （P32529） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 （P28000） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 × 1 （Q01080） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34 × 1 （P47006） RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3 × 1 （P36070） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2RF4 Crystal structure of the RNA Polymerase I subcomplex A14/43 提交 2007-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–52（52 aa）
链 B 78–112（35 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；295 K；18 % (w/v) PEG 3350, 350 mM potassium acetate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.285
2RF4 Crystal structure of the RNA Polymerase I subcomplex A14/43 提交 2007-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–52（52 aa）
链 D 78–112（35 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；295 K；18 % (w/v) PEG 3350, 350 mM potassium acetate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.285
2RF4 Crystal structure of the RNA Polymerase I subcomplex A14/43 提交 2007-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–52（52 aa）
链 F 78–112（35 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；295 K；18 % (w/v) PEG 3350, 350 mM potassium acetate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.285
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 S 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C3H Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.27 A resolution, crystal form C2-93 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 24% ETHYLENGLYCOL, 0.1M MES PH 6.8
分辨率 3.27 Å R-free 0.226
4C3I Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.0 A resolution, crystal form C2-100 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL PH 7.4
分辨率 3.00 Å R-free 0.231
4C3J Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.35 A resolution, crystal form C2-90 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL, PH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.220
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 AD 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 BD 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 CD 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 DD 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 ED 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 FD 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5LMX Monomeric RNA polymerase I at 4.9 A resolution 提交 2016-08-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
5M3F Yeast RNA polymerase I elongation complex at 3.8A 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 3.80 Å
5M3M Free monomeric RNA polymerase I at 4.0A resolution 提交 2016-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 4.00 Å
5M5W RNA Polymerase I open complex 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 3.80 Å
5M5X RNA Polymerase I elongation complex 1 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot time for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M5Y RNA Polymerase I elongation complex 2 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M64 RNA Polymerase I elongation complex with A49 tandem winged helix domain 提交 2016-10-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.60 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6H67 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) 提交 2018-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6H68 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) with fully-ordered A49 提交 2018-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6HKO Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.42 Å
6HLQ Yeast RNA polymerase I* elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLR Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP (core focused) 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLS Yeast apo RNA polymerase I* 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.21 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9G1V Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.70 Å
9G1X Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 11-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：14-meric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G23 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at A-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G24 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at E-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G26 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, closed state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G27 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, pre-translocation state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.80 Å
9G29 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site with the C-terminal of A12 in the funnel 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.30 Å
9G2B Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 12-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 D 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.20 Å

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UniProt名称 RPA14_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P20434

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 E； UniProt 1–215 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190 × 1 （P10964） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135 × 1 （P22138） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 （P07703） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14 × 1 （P50106） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 × 1 （P46669） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12 × 1 （P32529） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 （P28000） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 × 1 （Q01080） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34 × 1 （P47006） RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3 × 1 （P36070） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1DZF RPB5 from S.cerevisiae 提交 2000-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–215（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 20% PEG 800, 200 MM AMMONIUM SA SULPHATE, 100 MM SODIUM CACODYLATE, PH 6.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.271
1I3Q RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM I AT 3.1 A RESOLUTION 提交 2001-02-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammoniumhydrogenphosphate, Sodiumdihydrogenphosphate, dioxane, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
1I50 RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM II AT 2.8 A RESOLUTION 提交 2001-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUMHYDROGENPHOSPHATE, SODIUMDIHYDROGENPHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1I50 RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM II AT 2.8 A RESOLUTION 提交 2001-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUMHYDROGENPHOSPHATE, SODIUMDIHYDROGENPHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1I6H RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX 提交 2001-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 100K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
1K83 Crystal Structure of Yeast RNA Polymerase II Complexed with the Inhibitor Alpha Amanitin 提交 2001-10-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PH 6.00
分辨率 2.80 Å R-free 0.280
1NIK Wild Type RNA Polymerase II 提交 2002-12-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.3；291 K；peg400, peg 6K, NaCl, Dioaxne, ZnCl2, Ammonium phosphate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 6.30
分辨率 4.10 Å R-free 0.360
1NT9 Complete 12-subunit RNA polymerase II 提交 2003-01-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；PEG 20000, ammonium sodium phosphate, sodium chloride, dioxane, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 4.20 Å
1PQV RNA polymerase II-TFIIS complex 提交 2003-06-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；sodium-ammonium tartrate, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.80 Å
1R5U RNA POLYMERASE II TFIIB COMPLEX 提交 2003-10-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；ammonium sulfate, MES, NaCl, CdCl2, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.50 Å R-free 0.373
1R9S RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX, MATCHED NUCLEOTIDE 提交 2003-10-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammonium hydrogen phosphate, sodium dihydrogen phosphate, dioxane, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.25 Å R-free 0.398
1R9T RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX, MISMATCHED NUCLEOTIDE 提交 2003-10-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammonium hydrogen phosphate, sodium dihydrogen phosphate, dioxane, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.317
1SFO RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX 提交 2004-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, ammonium sodium phosphate, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.61 Å R-free 0.343
1TWA RNA polymerase II complexed with ATP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.246
1TWC RNA polymerase II complexed with GTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
1TWF RNA polymerase II complexed with UTP at 2.3 A resolution 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1TWF RNA polymerase II complexed with UTP at 2.3 A resolution 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 4 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 8 ZN ZINC ION × 32 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 ZN ZINC ION × 16 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWH RNA polymerase II complexed with 2'dATP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.262
1WCM Complete 12-Subunit RNA Polymerase II at 3.8 Angstrom 提交 2004-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.80 Å R-free 0.285
1Y1V Refined RNA Polymerase II-TFIIS complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.80 Å R-free 0.294
1Y1W Complete RNA Polymerase II elongation complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.00 Å R-free 0.276
1Y1Y RNA Polymerase II-TFIIS-DNA/RNA complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.00 Å
1Y77 Complete RNA Polymerase II elongation complex with substrate analogue GMPCPP 提交 2004-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.50 Å
2B63 Complete RNA Polymerase II-RNA inhibitor complex 提交 2005-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes (pH 7.0), 5% PEG 6000, and 5 mM TCEP
分辨率 3.80 Å R-free 0.273
2B8K 12-subunit RNA Polymerase II 提交 2005-10-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 4.15 Å
2E2H RNA polymerase II elongation complex at 5 mM Mg2+ with GTP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.95 Å R-free 0.368
2E2I RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with 2'-dGTP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.41 Å R-free 0.316
2E2J RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with GMPCPP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.306
2JA5 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex A 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.00
分辨率 3.80 Å R-free 0.280
2JA6 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex B 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 4.00 Å R-free 0.301
2JA7 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex C 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.275
2JA7 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex C 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 Q 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.275
2JA8 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex D 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.288
2NVQ RNA Polymerase II Elongation Complex in 150 mM Mg+2 with 2'dUTP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 DUT DEOXYURIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200mM NH4OAc, 150mM Mg(OAc)2, 50mM Hepes, pH 7.0, 5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.283
2NVT RNA Polymerase II Elongation Complex in 150 mM Mg+2 with GMPCPP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200mM NH4OAc, 150mM Mg(OAc)2, 50mM Hepes, pH 7.0, 5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.36 Å R-free 0.283
2NVX RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with 2'-dUTP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 DUT DEOXYURIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.60 Å R-free 0.304
2NVY RNA Polymerase II form II in 150 mM Mn+2 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.323
2NVY RNA Polymerase II form II in 150 mM Mn+2 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.323
2NVZ RNA Polymerase II elongation complex with UTP, updated 11/2006 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.30 Å R-free 0.332
2R7Z Cisplatin lesion containing RNA polymerase II elongation complex 提交 2007-09-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 CPT Cisplatin × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5% (v/v) PEG 6000, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.80 Å R-free 0.240
2R92 Elongation complex of RNA polymerase II with artificial RdRP scaffold 提交 2007-09-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；5% (w/v) PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K, pH 7.00
分辨率 3.80 Å R-free 0.246
2R93 Elongation complex of RNA polymerase II with a hepatitis delta virus-derived RNA stem loop 提交 2007-09-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；5% (w/v) PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 4.00 Å R-free 0.241
2VUM Alpha-amanitin inhibited complete RNA polymerase II elongation complex 提交 2008-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 50 MM HEPES PH 7.0, 4-7% PEG 6000, 5 MM TCEP
分辨率 3.40 Å R-free 0.288
2YU9 RNA polymerase II elongation complex in 150 mm MG+2 with UTP 提交 2007-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200MM NH4OAC, 150MM MG(OAC)2, 50MM HEPES, PH 7.0, 5% PEG6000, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.344
3CQZ Crystal structure of 10 subunit RNA polymerase II in complex with the inhibitor alpha-amanitin 提交 2008-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3FKI 12-Subunit RNA Polymerase II Refined with Zn-SAD data 提交 2008-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；5-7% PEG 4000, 50 mM HEPES pH 7.0, 10 mM DTT, 70 mM glucosamine, 50 mM dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.88 Å R-free 0.301
3GTG Backtracked RNA polymerase II complex with 12mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 27 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.78 Å R-free 0.300
3GTJ Backtracked RNA polymerase II complex with 13mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 27 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.42 Å R-free 0.292
3GTK Backtracked RNA polymerase II complex with 18mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 27 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.278
3GTL Backtracked RNA polymerase II complex with 13mer with G<>U mismatch 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 27 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.38 Å R-free 0.322
3GTM Co-complex of Backtracked RNA polymerase II with TFIIS 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–215（215 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 27 kDa polypeptide
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.289
3GTO Backtracked RNA polymerase II complex with 15mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 27 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.00 Å R-free 0.290
3GTP Backtracked RNA polymerase II complex with 24mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 27 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.90 Å R-free 0.299
3GTQ Backtracked RNA polymerase II complex induced by damage 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 27 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.335
3H3V Yeast RNAP II containing poly(A)-signal sequence in the active site 提交 2009-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；200 mM ammonium acetate, 50mM HEPES pH 7.0, 4% polyethylene glycol 6000, 5mM TCEP (tris (2-carboxyethyl) phosphine hydrochloride), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0 K
分辨率 4.00 Å R-free 0.241
3HOU Complete RNA polymerase II elongation complex I with a T-U mismatch 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.252
3HOU Complete RNA polymerase II elongation complex I with a T-U mismatch 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 Q 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.252
3HOV Complete RNA polymerase II elongation complex II 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE,, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.50 Å R-free 0.226
3HOW Complete RNA polymerase II elongation complex III with a T-U mismatch and a frayed RNA 3'-uridine 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.60 Å R-free 0.254
3HOX Complete RNA polymerase II elongation complex V 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.65 Å R-free 0.250
3HOY Complete RNA polymerase II elongation complex VI 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.40 Å R-free 0.254
3HOZ Complete RNA polymerase II elongation complex IV with a T-U mismatch and a frayed RNA 3'-guanine 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；20mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.65 Å R-free 0.253
3I4M 8-oxoguanine containing RNA polymerase II elongation complex D 提交 2009-07-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 50mM Hepes, 4%(w/v) PEG 6000, 5mM TCEP, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.70 Å R-free 0.258
3I4N 8-oxoguanine containing RNA polymerase II elongation complex E 提交 2009-07-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；5%(w/v) PEG 6000, 200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 50mM Hepes, 5mM TCEP , pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.90 Å R-free 0.266
3J1N Cryo-EM map of a yeast minimal preinitiation complex interacting with the Mediator Head module 提交 2012-03-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 mM KCl, 25 mM Tris-HCl, 10 mM DTT；pH 8；25 mM KCl, 25 mM Tris-HCl, 10 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for ~2 sec before plunging；77 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for approximately 2 seconds before plunging into liquid ethane.
分辨率 16.00 Å
3K1F Crystal structure of RNA Polymerase II in complex with TFIIB 提交 2009-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；800 mM sodium ammonium tartrate, 100 mM HEPES pH 7.5, 5 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.30 Å R-free 0.255
3K7A Crystal Structure of an RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2009-10-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；295 K；1.2 M sodium/potassium phosphate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.80 Å R-free 0.313
3M3Y RNA polymerase II elongation complex C 提交 2010-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 C7P cis-diammine(pyridine)chloroplatinum(II) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6,000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.18 Å R-free 0.255
3M4O RNA polymerase II elongation complex B 提交 2010-03-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 C7P cis-diammine(pyridine)chloroplatinum(II) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6,000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.57 Å R-free 0.292
3PO2 Arrested RNA Polymerase II elongation complex 提交 2010-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG6000, 50mM HEPES pH 7.0, 200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.178
3PO3 Arrested RNA Polymerase II reactivation intermediate 提交 2010-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG6000, 50mM HEPES pH 7.0, 200mM AMMONIUM ACETATE, 300mM SODIUM ACETATE, 5mM TCEP , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.189
3QT1 RNA polymerase II variant containing A Chimeric RPB9-C11 subunit 提交 2011-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 5-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 4.30 Å R-free 0.281
3RZD RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA 提交 2011-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.30 Å R-free 0.230
3RZO RNA Polymerase II Initiation Complex with a 4-nt RNA 提交 2011-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.00 Å R-free 0.236
3S14 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 6-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 2.85 Å R-free 0.227
3S15 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 7-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.228
3S16 RNA Polymerase II Initiation Complex with an 8-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.24 Å R-free 0.227
3S17 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 9-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.9, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.20 Å R-free 0.236
3S1M RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA (variant 1) 提交 2011-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.13 Å R-free 0.233
3S1N RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA (variant 2) 提交 2011-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.232
3S1Q RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt 3'-deoxy RNA soaked with ATP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.30 Å R-free 0.229
3S1R RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt 3'-deoxy RNA soaked with GTP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.226
3S2D RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA containing a 5Br-U 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.231
3S2H RNA Polymerase II Initiation Complex with a 6-nt RNA containing a 2[prime]-iodo ATP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 5.9-6.1, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.240
4A3B RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 4nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.197
4A3C RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 5nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.184
4A3D RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 6nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.40 Å R-free 0.186
4A3E RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 5nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.40 Å R-free 0.188
4A3F RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 6nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.185
4A3G RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 2nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.194
4A3I RNA Polymerase II binary complex with DNA 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.80 Å R-free 0.191
4A3J RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 2nt DNA-RNA hybrid and soaked with GMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 3.70 Å R-free 0.194
4A3K RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 7nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.50 Å R-free 0.185
4A3L RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 7nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.187
4A3M RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 4nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.90 Å R-free 0.190
4A93 RNA Polymerase II elongation complex containing a CPD Lesion 提交 2011-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；4-7% PEG 6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP.
分辨率 3.40 Å R-free 0.199
4BBR Structure of RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2012-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.40 Å R-free 0.211
4BBS Structure of an initially transcribing RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2012-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.60 Å R-free 0.225
4BXX Arrested RNA polymerase II-Bye1 complex 提交 2013-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.28 Å R-free 0.208
4BXZ RNA Polymerase II-Bye1 complex 提交 2013-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；750 MM TRI-SODIUM CITRATE, 100 MM HEPES PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 4.80 Å R-free 0.253
4BY1 elongating RNA Polymerase II-Bye1 TLD complex soaked with AMPCPP 提交 2013-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.60 Å R-free 0.206
4BY7 elongating RNA Polymerase II-Bye1 TLD complex 提交 2013-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.15 Å R-free 0.212
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 T 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C3H Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.27 A resolution, crystal form C2-93 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 24% ETHYLENGLYCOL, 0.1M MES PH 6.8
分辨率 3.27 Å R-free 0.226
4C3I Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.0 A resolution, crystal form C2-100 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL PH 7.4
分辨率 3.00 Å R-free 0.231
4C3J Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.35 A resolution, crystal form C2-90 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL, PH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.220
4V1M Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 6.60 Å
4V1N Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 7.80 Å
4V1O Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 9.70 Å
4X67 Crystal structure of elongating yeast RNA polymerase II stalled at oxidative Cyclopurine DNA lesions. 提交 2014-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, PH 5.9-6.3, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7% - 11.6% PEG6000
分辨率 4.10 Å R-free 0.289
4X6A Crystal structure of yeast RNA polymerase II encountering oxidative Cyclopurine DNA lesions 提交 2014-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, PH 5.9-6.3, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7% - 11.6% PEG6000
分辨率 3.96 Å R-free 0.296
4Y52 Crystal structure of 5-Carboxycytosine Recognition by RNA Polymerase II during Transcription Elongation. 提交 2015-02-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7-11.6%(w/v) PEG6000
分辨率 3.50 Å R-free 0.232
4Y7N The Structure Insight into 5-Carboxycytosine Recognition by RNA Polymerase II during Transcription Elongation. 提交 2015-02-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7-11.6%(w/v) PEG6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.250
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 AE 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 BE 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 CE 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 DE 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 EE 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 FE 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
5C3E Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 6000, Ammonium Acetate, Sodium Acetate, DTT
分辨率 3.70 Å R-free 0.220
5C44 Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 6000, Ammonium Acetate, Sodium Acetate, DTT
分辨率 3.95 Å R-free 0.236
5C4A Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；PEG 4000, POTASSIUM THIOCYANATE, MES, DTT
分辨率 4.20 Å R-free 0.242
5C4J Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 4000, SODIUM MALONATE, HEPES, DTT
分辨率 4.00 Å R-free 0.271
5C4X Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；PEG 4000, SODIUM CITRATE, MES, DTT
分辨率 4.00 Å R-free 0.227
5FJ8 Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III elongation complex at 3. 9 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 3.90 Å
5FJ9 Cryo-EM structure of yeast apo RNA polymerase III at 4.6 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 4.60 Å
5FJA Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III at 4.7 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT - FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 4.65 Å
5FMF the P-lobe of RNA polymerase II pre-initiation complex 提交 2015-11-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric
链 E 2–215（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES (PH7.6), 5 MM DTT, 2 MM MG(OAC)2,AND 40 MM KOAC；pH 7.6；20 MM HEPES (PH7.6), 5 MM DTT, 2 MM MG(OAC)2,AND 40 MM KOAC
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III,
分辨率 6.00 Å
5FYW Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening (OC) 提交 2016-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN - ETHANE. INSTRUMENT - FEI VITROBOT MARK IV. QUANTIFOIL R 3.5- 1 HOLEY CARBON GRIDS WERE GLOW-DISCHARGED BEFORE DEPOSITION OF 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE. GRIDS WERE THEN BLOTTED FOR 8.5 S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.35 Å
5FZ5 Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening (CC) 提交 2016-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 8.80 Å
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5IP7 Structure of RNA Polymerase II-Tfg1 peptide complex 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 E 2–215（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 6000, sodium acetate, ammonium acetate, hepes, tcep
分辨率 3.52 Å R-free 0.180
5IP9 Structure of RNA Polymerase II-TFIIF complex 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 E 2–215（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；peg 6000, sodium acetate, ammonium acetate, hepes, tcep
分辨率 3.90 Å R-free 0.194
5LMX Monomeric RNA polymerase I at 4.9 A resolution 提交 2016-08-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
5M3F Yeast RNA polymerase I elongation complex at 3.8A 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 3.80 Å
5M3M Free monomeric RNA polymerase I at 4.0A resolution 提交 2016-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 4.00 Å
5M5W RNA Polymerase I open complex 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 3.80 Å
5M5X RNA Polymerase I elongation complex 1 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot time for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M5Y RNA Polymerase I elongation complex 2 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M64 RNA Polymerase I elongation complex with A49 tandem winged helix domain 提交 2016-10-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.60 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5OQJ STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH 提交 2017-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE BLOTTED FOR 8 S AND PLUNGE-FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.70 Å
5OQM STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH AND CORE MEDIATOR 提交 2017-08-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：46-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 8 s and plunge-frozen in liquid ethane.
分辨率 5.80 Å
5OT2 RNA polymerase II elongation complex in the presence of 3d-Napht-A 提交 2017-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 AHW 2-ethyl-7-methoxy-naphthalene × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 300 mM sodium acetate, 50 mM HEPES pH 7.0, 5 mM TCEP
分辨率 3.20 Å R-free 0.222
5SVA Mediator-RNA Polymerase II Pre-Initiation Complex 提交 2016-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 15.30 Å
5U5Q 12 Subunit RNA Polymerase II at Room Temperature collected using SFX 提交 2016-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 6.3；289.65 K；21-22% PEG 400, 5% PEG 5%, 100 mM Ammonium Phosphate pH 6.3, 100 mM NaCl, 1 mM ZnCl2 and 10 mM DTT
分辨率 3.80 Å R-free 0.271
5VVR Ternary complex of RNA Pol II, transcription scaffold and Rad26 提交 2017-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5VVS RNA pol II elongation complex 提交 2017-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
5W4U Pol II elongation complex with an N6-methyladenine-containing template 提交 2017-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 10-12.5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.60 Å R-free 0.259
5W51 Pol II elongation complex with an N6-methyladenine-containing template and a matched UMPNPP 提交 2017-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 2KH 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]uridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 10-12.5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.254
5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6BLO Pol II elongation complex with an abasic lesion at i+1 position 提交 2017-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.227
6BLP Pol II elongation complex with an abasic lesion at i+1 position, soaking AMPCPP 提交 2017-11-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.257
6BM2 Pol II elongation complex with an abasic lesion at i-1 position 提交 2017-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.244
6BM4 Pol II elongation complex with an abasic lesion at i-1 position,soaking UMPNPP 提交 2017-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 2KH 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]uridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 2.95 Å R-free 0.260
6BQF Pol II elongation complex with 'dT-AP' at i+1, i-1 position 提交 2017-11-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.35 Å R-free 0.245
6CNB Yeast RNA polymerase III initial transcribing complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6CNC Yeast RNA polymerase III open complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6CND Yeast RNA polymerase III natural open complex (nOC) 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6CNF Yeast RNA polymerase III elongation complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6EU0 RNA Polymerase III open pre-initiation complex (OC-PIC) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6EU1 RNA Polymerase III - open DNA complex (OC-POL3). 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6EU2 Apo RNA Polymerase III - open conformation (oPOL3) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6EU3 Apo RNA Polymerase III - closed conformation (cPOL3) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6F40 RNA Polymerase III open complex 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6F41 RNA Polymerase III initially transcribing complex 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6F42 RNA Polymerase III closed complex CC1. 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6F44 RNA Polymerase III closed complex CC2. 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6GYK Structure of a yeast closed complex (core CC1) 提交 2018-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
6GYL Structure of a yeast closed complex with distorted DNA (core CCdist) 提交 2018-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6GYM Structure of a yeast closed complex with distorted DNA (CCdist) 提交 2018-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6H67 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) 提交 2018-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6H68 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) with fully-ordered A49 提交 2018-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6HKO Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.42 Å
6HLQ Yeast RNA polymerase I* elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLR Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP (core focused) 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLS Yeast apo RNA polymerase I* 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.21 Å
6I84 Structure of transcribing RNA polymerase II-nucleosome complex 提交 2018-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6O6C RNA polymerase II elongation complex arrested at a CPD lesion 提交 2019-03-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was manually wicked from the grid. 1.2 uL sample buffer was then applied to the streptavidin side. The grid was then blotted.
分辨率 3.10 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
6TUT Cryo-EM structure of the RNA Polymerase III-Maf1 complex 提交 2020-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES, 150 mM (NH4)2SO4, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 6, blot force 2
分辨率 3.25 Å
6UPX RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 1 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.266
6UPY RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 2E 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.282
6UPZ RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 3 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.269
6UQ0 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 4 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.56 Å R-free 0.278
6UQ1 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 6 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.287
6UQ2 RNA polymerase II elongation complex with dG in state 1 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.280
6UQ3 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 5 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.47 Å R-free 0.286
7KED RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.305
7KEE RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3, rNaMTP bound to E-site 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 WCG (1S)-1,4-anhydro-5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-1-(3-methoxynaphthalen-2-yl)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.45 Å R-free 0.302
7KEF RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3, rNaM in swing state 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 WC4 (1S)-1,4-anhydro-1-(3-methoxynaphthalen-2-yl)-5-O-phosphono-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.89 Å R-free 0.326
7NKX RNA polymerase II-Spt4/5-nucleosome-Chd1 structure 提交 2021-02-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NKY RNA Polymerase II-Spt4/5-nucleosome-FACT structure 提交 2021-02-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7O4I Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with initial transcription bubble 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7O4J Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex (consensus) 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7O72 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with closed promoter DNA 提交 2021-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7O73 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with closed distorted promoter DNA 提交 2021-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7O75 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7RIM RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 1 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 2.90 Å R-free 0.251
7RIP RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 1 soaked with CTP 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.261
7RIQ RNA polymerase II elongation complex scaffold 1 without polyamide 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.00 Å R-free 0.264
7RIW RNA polymerase II elongation complex scaffold 2, without polyamide 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.265
7RIX RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 2 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.268
7RIY RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 2 soaked with UTP 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.70 Å R-free 0.281
7UI9 Core Mediator-PICearly (Copy A) 提交 2022-03-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7UIF Mediator-PIC Early (Core B) 提交 2022-03-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
7UIO Mediator-PIC Early (Composite Model) 提交 2022-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：80-meric
链 AE 1–215（215 aa）
链 BE 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 THR THREONINE × 1 ALA ALANINE × 1 ASP ASPARTIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z0H Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.6 A (focus subunit AC40). 提交 2022-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7Z1L Structure of yeast RNA Polymerase III Pre-Termination Complex (PTC) 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7Z1M Structure of yeast RNA Polymerase III Elongation Complex (EC) 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7Z1N Structure of yeast RNA Polymerase III Delta C53-C37-C11 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7Z1O Structure of yeast RNA Polymerase III PTC + NTPs 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7Z2Z Structure of yeast RNA Polymerase III-DNA-Ty1 integrase complex (Pol III-DNA-IN1) at 3.1 A 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
7Z30 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.9 A (focus subunit C11 terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7Z31 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.7 A (focus subunit C11, no C11 C-terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
7ZS9 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome (complex A) 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7ZSA Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP (complex B) 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7ZSB Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP, complex C 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
8BWS Structure of yeast RNA Polymerase III elongation complex at 3.3 A 提交 2022-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8CEN Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator 提交 2023-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：46-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8CEO Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator and the +1 nucleosome 提交 2023-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：54-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8JCH Cryo-EM structure of yeast Rat1-bound Pol II pre-termination transcription complex 1 (Pol II Rat1-PTTC1) 提交 2023-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8K5P Cryo-EM structure of yeast Rat1-bound Pol II pre-termination transcription complex 2 (Pol II Rat1-PTTC2) 提交 2023-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8RAM Structure of Sen1 bound RNA Polymerase II pre-termination complex 提交 2023-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8RAP Structure of Sen1-ADP.BeF3 bound RNA Polymerase II pre-termination complex 提交 2023-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8UKQ RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion in apo state 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：13-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13 % (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.50 Å R-free 0.302
8UKR RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion soaking with ATP before chemistry 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.78 Å R-free 0.310
8UKS RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion soaking with CTP before chemistry 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 8 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.40 Å R-free 0.301
8UKT RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion with AMP added 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：13-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.60 Å R-free 0.289
8UKU RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion with CMP added 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.60 Å R-free 0.301
8UOQ Composite map of PIC_delta_TFIIK form2 提交 2023-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8UOT Composite map of PICdeltaTFIIK form1 提交 2023-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES PH 7.6 50 mM KOAc 5 mM DTT 2 mM MgOAc
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9G1V Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.70 Å
9G1X Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 11-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：14-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G23 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at A-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G24 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at E-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G26 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, closed state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G27 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, pre-translocation state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.80 Å
9G29 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site with the C-terminal of A12 in the funnel 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.30 Å
9G2B Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 12-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.20 Å
9G2C Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, open state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9JA1 The RNA polymerase II elongation complex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-08-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
9K7F RNA polymerase II elongation complex apo structure. 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
9KD7 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-1 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
9KD8 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-2 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.46 Å
9KD9 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-5 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9KDN The structure of 1 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 2 CTG repeats. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
9KDO The structure of 2 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 3 CTG repeats 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
9KDQ The structure of 3 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 4 CTG repeats. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
9N5B RNA polymerase II elongation complex containing 8-oxoG at +1 site, apo form 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.256
9N5C RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, CMPCPP-bound 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.297
9N5D RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, CMP added 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.35 Å R-free 0.300
9N5E RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, AMPCPP in E-site 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.75 Å R-free 0.291
9N5F RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG in syn-conformation with added AMP 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.281
9N5G RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, ATP in both A- and E-site 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.15 Å R-free 0.254
9PVV RNA polymerase II elongation complex with dC at +1 site, 8-oxo-GTP bound in A-site. 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.48 Å R-free 0.258
9PVW RNA polymerase II elongation complex with dA at +1 site, 8-oxo-GMP added in Syn-conformation 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.56 Å R-free 0.288
9PVX RNA polymerase II elongation complex with dA at +1 site, 8-oxo-GTP bound in E-site. 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.39 Å R-free 0.236
9QEB CryoEM structure of transcribing RNA polymerase II elongation complex 提交 2025-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.26 Å
9RYB CryoEM structure of transcribing RNA polymerase II elongation complex in post-catalysis state 提交 2025-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–215（215 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 1 DPO DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.33 Å

共 264 个其他 PDB 条目、277 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAB1_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–215； UniProt 1–215

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P20435

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 F； UniProt 1–155 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190 × 1 （P10964） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135 × 1 （P22138） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 （P07703） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14 × 1 （P50106） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 × 1 （P46669） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12 × 1 （P32529） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 （P28000） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 × 1 （Q01080） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34 × 1 （P47006） RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3 × 1 （P36070） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1I3Q RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM I AT 3.1 A RESOLUTION 提交 2001-02-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammoniumhydrogenphosphate, Sodiumdihydrogenphosphate, dioxane, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
1I50 RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM II AT 2.8 A RESOLUTION 提交 2001-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUMHYDROGENPHOSPHATE, SODIUMDIHYDROGENPHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1I50 RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM II AT 2.8 A RESOLUTION 提交 2001-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUMHYDROGENPHOSPHATE, SODIUMDIHYDROGENPHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1I6H RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX 提交 2001-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 100K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
1K83 Crystal Structure of Yeast RNA Polymerase II Complexed with the Inhibitor Alpha Amanitin 提交 2001-10-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PH 6.00
分辨率 2.80 Å R-free 0.280
1NIK Wild Type RNA Polymerase II 提交 2002-12-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.3；291 K；peg400, peg 6K, NaCl, Dioaxne, ZnCl2, Ammonium phosphate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 6.30
分辨率 4.10 Å R-free 0.360
1NT9 Complete 12-subunit RNA polymerase II 提交 2003-01-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；PEG 20000, ammonium sodium phosphate, sodium chloride, dioxane, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 4.20 Å
1PQV RNA polymerase II-TFIIS complex 提交 2003-06-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；sodium-ammonium tartrate, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.80 Å
1R5U RNA POLYMERASE II TFIIB COMPLEX 提交 2003-10-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；ammonium sulfate, MES, NaCl, CdCl2, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.50 Å R-free 0.373
1R9S RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX, MATCHED NUCLEOTIDE 提交 2003-10-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammonium hydrogen phosphate, sodium dihydrogen phosphate, dioxane, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.25 Å R-free 0.398
1R9T RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX, MISMATCHED NUCLEOTIDE 提交 2003-10-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammonium hydrogen phosphate, sodium dihydrogen phosphate, dioxane, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.317
1SFO RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX 提交 2004-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, ammonium sodium phosphate, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.61 Å R-free 0.343
1TWA RNA polymerase II complexed with ATP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.246
1TWC RNA polymerase II complexed with GTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
1TWF RNA polymerase II complexed with UTP at 2.3 A resolution 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1TWF RNA polymerase II complexed with UTP at 2.3 A resolution 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 4 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 8 ZN ZINC ION × 32 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 ZN ZINC ION × 16 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWH RNA polymerase II complexed with 2'dATP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.262
1WCM Complete 12-Subunit RNA Polymerase II at 3.8 Angstrom 提交 2004-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.80 Å R-free 0.285
1Y1V Refined RNA Polymerase II-TFIIS complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.80 Å R-free 0.294
1Y1W Complete RNA Polymerase II elongation complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.00 Å R-free 0.276
1Y1Y RNA Polymerase II-TFIIS-DNA/RNA complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.00 Å
1Y77 Complete RNA Polymerase II elongation complex with substrate analogue GMPCPP 提交 2004-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.50 Å
2B63 Complete RNA Polymerase II-RNA inhibitor complex 提交 2005-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes (pH 7.0), 5% PEG 6000, and 5 mM TCEP
分辨率 3.80 Å R-free 0.273
2B8K 12-subunit RNA Polymerase II 提交 2005-10-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 4.15 Å
2E2H RNA polymerase II elongation complex at 5 mM Mg2+ with GTP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.95 Å R-free 0.368
2E2I RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with 2'-dGTP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.41 Å R-free 0.316
2E2J RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with GMPCPP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.306
2JA5 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex A 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.00
分辨率 3.80 Å R-free 0.280
2JA6 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex B 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 4.00 Å R-free 0.301
2JA7 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex C 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.275
2JA7 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex C 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 R 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.275
2JA8 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex D 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.288
2NVQ RNA Polymerase II Elongation Complex in 150 mM Mg+2 with 2'dUTP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 DUT DEOXYURIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200mM NH4OAc, 150mM Mg(OAc)2, 50mM Hepes, pH 7.0, 5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.283
2NVT RNA Polymerase II Elongation Complex in 150 mM Mg+2 with GMPCPP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200mM NH4OAc, 150mM Mg(OAc)2, 50mM Hepes, pH 7.0, 5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.36 Å R-free 0.283
2NVX RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with 2'-dUTP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 DUT DEOXYURIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.60 Å R-free 0.304
2NVY RNA Polymerase II form II in 150 mM Mn+2 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.323
2NVY RNA Polymerase II form II in 150 mM Mn+2 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.323
2NVZ RNA Polymerase II elongation complex with UTP, updated 11/2006 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.30 Å R-free 0.332
2R7Z Cisplatin lesion containing RNA polymerase II elongation complex 提交 2007-09-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 CPT Cisplatin × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5% (v/v) PEG 6000, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.80 Å R-free 0.240
2R92 Elongation complex of RNA polymerase II with artificial RdRP scaffold 提交 2007-09-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；5% (w/v) PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K, pH 7.00
分辨率 3.80 Å R-free 0.246
2R93 Elongation complex of RNA polymerase II with a hepatitis delta virus-derived RNA stem loop 提交 2007-09-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；5% (w/v) PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 4.00 Å R-free 0.241
2VUM Alpha-amanitin inhibited complete RNA polymerase II elongation complex 提交 2008-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 50 MM HEPES PH 7.0, 4-7% PEG 6000, 5 MM TCEP
分辨率 3.40 Å R-free 0.288
2YU9 RNA polymerase II elongation complex in 150 mm MG+2 with UTP 提交 2007-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200MM NH4OAC, 150MM MG(OAC)2, 50MM HEPES, PH 7.0, 5% PEG6000, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.344
3CQZ Crystal structure of 10 subunit RNA polymerase II in complex with the inhibitor alpha-amanitin 提交 2008-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3FKI 12-Subunit RNA Polymerase II Refined with Zn-SAD data 提交 2008-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；5-7% PEG 4000, 50 mM HEPES pH 7.0, 10 mM DTT, 70 mM glucosamine, 50 mM dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.88 Å R-free 0.301
3GTG Backtracked RNA polymerase II complex with 12mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 23 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.78 Å R-free 0.300
3GTJ Backtracked RNA polymerase II complex with 13mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 23 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.42 Å R-free 0.292
3GTK Backtracked RNA polymerase II complex with 18mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 23 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.278
3GTL Backtracked RNA polymerase II complex with 13mer with G<>U mismatch 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 23 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.38 Å R-free 0.322
3GTM Co-complex of Backtracked RNA polymerase II with TFIIS 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–155（155 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 23 kDa polypeptide
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.289
3GTO Backtracked RNA polymerase II complex with 15mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 23 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.00 Å R-free 0.290
3GTP Backtracked RNA polymerase II complex with 24mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 23 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.90 Å R-free 0.299
3GTQ Backtracked RNA polymerase II complex induced by damage 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 23 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.335
3H3V Yeast RNAP II containing poly(A)-signal sequence in the active site 提交 2009-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 G 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；200 mM ammonium acetate, 50mM HEPES pH 7.0, 4% polyethylene glycol 6000, 5mM TCEP (tris (2-carboxyethyl) phosphine hydrochloride), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0 K
分辨率 4.00 Å R-free 0.241
3HOU Complete RNA polymerase II elongation complex I with a T-U mismatch 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.252
3HOU Complete RNA polymerase II elongation complex I with a T-U mismatch 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 R 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.252
3HOV Complete RNA polymerase II elongation complex II 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE,, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.50 Å R-free 0.226
3HOW Complete RNA polymerase II elongation complex III with a T-U mismatch and a frayed RNA 3'-uridine 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.60 Å R-free 0.254
3HOX Complete RNA polymerase II elongation complex V 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.65 Å R-free 0.250
3HOY Complete RNA polymerase II elongation complex VI 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.40 Å R-free 0.254
3HOZ Complete RNA polymerase II elongation complex IV with a T-U mismatch and a frayed RNA 3'-guanine 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；20mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.65 Å R-free 0.253
3I4M 8-oxoguanine containing RNA polymerase II elongation complex D 提交 2009-07-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 50mM Hepes, 4%(w/v) PEG 6000, 5mM TCEP, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.70 Å R-free 0.258
3I4N 8-oxoguanine containing RNA polymerase II elongation complex E 提交 2009-07-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；5%(w/v) PEG 6000, 200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 50mM Hepes, 5mM TCEP , pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.90 Å R-free 0.266
3J1N Cryo-EM map of a yeast minimal preinitiation complex interacting with the Mediator Head module 提交 2012-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 72–155（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 mM KCl, 25 mM Tris-HCl, 10 mM DTT；pH 8；25 mM KCl, 25 mM Tris-HCl, 10 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for ~2 sec before plunging；77 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for approximately 2 seconds before plunging into liquid ethane.
分辨率 16.00 Å
3K1F Crystal structure of RNA Polymerase II in complex with TFIIB 提交 2009-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；800 mM sodium ammonium tartrate, 100 mM HEPES pH 7.5, 5 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.30 Å R-free 0.255
3K7A Crystal Structure of an RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2009-10-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；295 K；1.2 M sodium/potassium phosphate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.80 Å R-free 0.313
3M3Y RNA polymerase II elongation complex C 提交 2010-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 C7P cis-diammine(pyridine)chloroplatinum(II) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6,000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.18 Å R-free 0.255
3M4O RNA polymerase II elongation complex B 提交 2010-03-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 C7P cis-diammine(pyridine)chloroplatinum(II) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6,000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.57 Å R-free 0.292
3PO2 Arrested RNA Polymerase II elongation complex 提交 2010-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG6000, 50mM HEPES pH 7.0, 200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.178
3PO3 Arrested RNA Polymerase II reactivation intermediate 提交 2010-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG6000, 50mM HEPES pH 7.0, 200mM AMMONIUM ACETATE, 300mM SODIUM ACETATE, 5mM TCEP , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.189
3QT1 RNA polymerase II variant containing A Chimeric RPB9-C11 subunit 提交 2011-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 5-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 4.30 Å R-free 0.281
3RZD RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA 提交 2011-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.30 Å R-free 0.230
3RZO RNA Polymerase II Initiation Complex with a 4-nt RNA 提交 2011-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.00 Å R-free 0.236
3S14 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 6-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 2.85 Å R-free 0.227
3S15 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 7-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.228
3S16 RNA Polymerase II Initiation Complex with an 8-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.24 Å R-free 0.227
3S17 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 9-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.9, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.20 Å R-free 0.236
3S1M RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA (variant 1) 提交 2011-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.13 Å R-free 0.233
3S1N RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA (variant 2) 提交 2011-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.232
3S1Q RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt 3'-deoxy RNA soaked with ATP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.30 Å R-free 0.229
3S1R RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt 3'-deoxy RNA soaked with GTP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.226
3S2D RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA containing a 5Br-U 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.231
3S2H RNA Polymerase II Initiation Complex with a 6-nt RNA containing a 2[prime]-iodo ATP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 5.9-6.1, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.240
4A3B RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 4nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.197
4A3C RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 5nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.184
4A3D RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 6nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.40 Å R-free 0.186
4A3E RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 5nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.40 Å R-free 0.188
4A3F RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 6nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.185
4A3G RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 2nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.194
4A3I RNA Polymerase II binary complex with DNA 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.80 Å R-free 0.191
4A3J RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 2nt DNA-RNA hybrid and soaked with GMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 3.70 Å R-free 0.194
4A3K RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 7nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.50 Å R-free 0.185
4A3L RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 7nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.187
4A3M RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 4nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.90 Å R-free 0.190
4A93 RNA Polymerase II elongation complex containing a CPD Lesion 提交 2011-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；4-7% PEG 6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP.
分辨率 3.40 Å R-free 0.199
4BBR Structure of RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2012-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.40 Å R-free 0.211
4BBS Structure of an initially transcribing RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2012-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.60 Å R-free 0.225
4BXX Arrested RNA polymerase II-Bye1 complex 提交 2013-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.28 Å R-free 0.208
4BXZ RNA Polymerase II-Bye1 complex 提交 2013-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；750 MM TRI-SODIUM CITRATE, 100 MM HEPES PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 4.80 Å R-free 0.253
4BY1 elongating RNA Polymerase II-Bye1 TLD complex soaked with AMPCPP 提交 2013-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.60 Å R-free 0.206
4BY7 elongating RNA Polymerase II-Bye1 TLD complex 提交 2013-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.15 Å R-free 0.212
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 U 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C3H Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.27 A resolution, crystal form C2-93 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 24% ETHYLENGLYCOL, 0.1M MES PH 6.8
分辨率 3.27 Å R-free 0.226
4C3I Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.0 A resolution, crystal form C2-100 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL PH 7.4
分辨率 3.00 Å R-free 0.231
4C3J Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.35 A resolution, crystal form C2-90 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL, PH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.220
4V1M Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 6.60 Å
4V1N Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 7.80 Å
4V1O Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 9.70 Å
4X67 Crystal structure of elongating yeast RNA polymerase II stalled at oxidative Cyclopurine DNA lesions. 提交 2014-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, PH 5.9-6.3, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7% - 11.6% PEG6000
分辨率 4.10 Å R-free 0.289
4X6A Crystal structure of yeast RNA polymerase II encountering oxidative Cyclopurine DNA lesions 提交 2014-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, PH 5.9-6.3, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7% - 11.6% PEG6000
分辨率 3.96 Å R-free 0.296
4Y52 Crystal structure of 5-Carboxycytosine Recognition by RNA Polymerase II during Transcription Elongation. 提交 2015-02-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7-11.6%(w/v) PEG6000
分辨率 3.50 Å R-free 0.232
4Y7N The Structure Insight into 5-Carboxycytosine Recognition by RNA Polymerase II during Transcription Elongation. 提交 2015-02-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7-11.6%(w/v) PEG6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.250
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 AF 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 BF 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 CF 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 DF 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 EF 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 FF 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
5C3E Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 6000, Ammonium Acetate, Sodium Acetate, DTT
分辨率 3.70 Å R-free 0.220
5C44 Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 6000, Ammonium Acetate, Sodium Acetate, DTT
分辨率 3.95 Å R-free 0.236
5C4A Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；PEG 4000, POTASSIUM THIOCYANATE, MES, DTT
分辨率 4.20 Å R-free 0.242
5C4J Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 4000, SODIUM MALONATE, HEPES, DTT
分辨率 4.00 Å R-free 0.271
5C4X Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；PEG 4000, SODIUM CITRATE, MES, DTT
分辨率 4.00 Å R-free 0.227
5FJ8 Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III elongation complex at 3. 9 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 3.90 Å
5FJ9 Cryo-EM structure of yeast apo RNA polymerase III at 4.6 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 4.60 Å
5FJA Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III at 4.7 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT - FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 4.65 Å
5FMF the P-lobe of RNA polymerase II pre-initiation complex 提交 2015-11-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric
链 F 72–155（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES (PH7.6), 5 MM DTT, 2 MM MG(OAC)2,AND 40 MM KOAC；pH 7.6；20 MM HEPES (PH7.6), 5 MM DTT, 2 MM MG(OAC)2,AND 40 MM KOAC
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III,
分辨率 6.00 Å
5FYW Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening (OC) 提交 2016-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN - ETHANE. INSTRUMENT - FEI VITROBOT MARK IV. QUANTIFOIL R 3.5- 1 HOLEY CARBON GRIDS WERE GLOW-DISCHARGED BEFORE DEPOSITION OF 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE. GRIDS WERE THEN BLOTTED FOR 8.5 S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.35 Å
5FZ5 Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening (CC) 提交 2016-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 8.80 Å
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5IP7 Structure of RNA Polymerase II-Tfg1 peptide complex 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 F 69–155（87 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 6000, sodium acetate, ammonium acetate, hepes, tcep
分辨率 3.52 Å R-free 0.180
5IP9 Structure of RNA Polymerase II-TFIIF complex 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 F 69–155（87 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；peg 6000, sodium acetate, ammonium acetate, hepes, tcep
分辨率 3.90 Å R-free 0.194
5LMX Monomeric RNA polymerase I at 4.9 A resolution 提交 2016-08-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
5M3F Yeast RNA polymerase I elongation complex at 3.8A 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 3.80 Å
5M3M Free monomeric RNA polymerase I at 4.0A resolution 提交 2016-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 4.00 Å
5M5W RNA Polymerase I open complex 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 3.80 Å
5M5X RNA Polymerase I elongation complex 1 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot time for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M5Y RNA Polymerase I elongation complex 2 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M64 RNA Polymerase I elongation complex with A49 tandem winged helix domain 提交 2016-10-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.60 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5OQJ STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH 提交 2017-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE BLOTTED FOR 8 S AND PLUNGE-FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.70 Å
5OQM STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH AND CORE MEDIATOR 提交 2017-08-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：46-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 8 s and plunge-frozen in liquid ethane.
分辨率 5.80 Å
5OT2 RNA polymerase II elongation complex in the presence of 3d-Napht-A 提交 2017-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 AHW 2-ethyl-7-methoxy-naphthalene × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 300 mM sodium acetate, 50 mM HEPES pH 7.0, 5 mM TCEP
分辨率 3.20 Å R-free 0.222
5SVA Mediator-RNA Polymerase II Pre-Initiation Complex 提交 2016-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 15.30 Å
5U5Q 12 Subunit RNA Polymerase II at Room Temperature collected using SFX 提交 2016-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 6.3；289.65 K；21-22% PEG 400, 5% PEG 5%, 100 mM Ammonium Phosphate pH 6.3, 100 mM NaCl, 1 mM ZnCl2 and 10 mM DTT
分辨率 3.80 Å R-free 0.271
5VVR Ternary complex of RNA Pol II, transcription scaffold and Rad26 提交 2017-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5VVS RNA pol II elongation complex 提交 2017-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
5W4U Pol II elongation complex with an N6-methyladenine-containing template 提交 2017-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 10-12.5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.60 Å R-free 0.259
5W51 Pol II elongation complex with an N6-methyladenine-containing template and a matched UMPNPP 提交 2017-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 2KH 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]uridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 10-12.5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.254
5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6BLO Pol II elongation complex with an abasic lesion at i+1 position 提交 2017-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.227
6BLP Pol II elongation complex with an abasic lesion at i+1 position, soaking AMPCPP 提交 2017-11-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.257
6BM2 Pol II elongation complex with an abasic lesion at i-1 position 提交 2017-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.244
6BM4 Pol II elongation complex with an abasic lesion at i-1 position,soaking UMPNPP 提交 2017-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 2KH 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]uridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 2.95 Å R-free 0.260
6BQF Pol II elongation complex with 'dT-AP' at i+1, i-1 position 提交 2017-11-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.35 Å R-free 0.245
6CNB Yeast RNA polymerase III initial transcribing complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6CNC Yeast RNA polymerase III open complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6CND Yeast RNA polymerase III natural open complex (nOC) 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6CNF Yeast RNA polymerase III elongation complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6EU0 RNA Polymerase III open pre-initiation complex (OC-PIC) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6EU1 RNA Polymerase III - open DNA complex (OC-POL3). 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6EU2 Apo RNA Polymerase III - open conformation (oPOL3) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6EU3 Apo RNA Polymerase III - closed conformation (cPOL3) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6F40 RNA Polymerase III open complex 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6F41 RNA Polymerase III initially transcribing complex 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6F42 RNA Polymerase III closed complex CC1. 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6F44 RNA Polymerase III closed complex CC2. 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6GYK Structure of a yeast closed complex (core CC1) 提交 2018-06-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 F 2–155（154 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
6GYL Structure of a yeast closed complex with distorted DNA (core CCdist) 提交 2018-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6GYM Structure of a yeast closed complex with distorted DNA (CCdist) 提交 2018-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6H67 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) 提交 2018-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6H68 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) with fully-ordered A49 提交 2018-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6HKO Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.42 Å
6HLQ Yeast RNA polymerase I* elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLR Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP (core focused) 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLS Yeast apo RNA polymerase I* 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.21 Å
6I84 Structure of transcribing RNA polymerase II-nucleosome complex 提交 2018-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6O6C RNA polymerase II elongation complex arrested at a CPD lesion 提交 2019-03-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was manually wicked from the grid. 1.2 uL sample buffer was then applied to the streptavidin side. The grid was then blotted.
分辨率 3.10 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
6TUT Cryo-EM structure of the RNA Polymerase III-Maf1 complex 提交 2020-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES, 150 mM (NH4)2SO4, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 6, blot force 2
分辨率 3.25 Å
6UPX RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 1 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.266
6UPY RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 2E 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.282
6UPZ RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 3 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.269
6UQ0 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 4 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.56 Å R-free 0.278
6UQ1 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 6 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.287
6UQ2 RNA polymerase II elongation complex with dG in state 1 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.280
6UQ3 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 5 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.47 Å R-free 0.286
7KED RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.305
7KEE RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3, rNaMTP bound to E-site 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 WCG (1S)-1,4-anhydro-5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-1-(3-methoxynaphthalen-2-yl)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.45 Å R-free 0.302
7KEF RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3, rNaM in swing state 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 WC4 (1S)-1,4-anhydro-1-(3-methoxynaphthalen-2-yl)-5-O-phosphono-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.89 Å R-free 0.326
7MEI Composite structure of EC+EC 提交 2021-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：30-meric
链 F 1–155（155 aa）
链 f 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES PH 7.6 50 mM KoAc 5 mM DTT 2 mM MgoAc
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
7NKX RNA polymerase II-Spt4/5-nucleosome-Chd1 structure 提交 2021-02-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NKY RNA Polymerase II-Spt4/5-nucleosome-FACT structure 提交 2021-02-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7O4I Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with initial transcription bubble 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7O4J Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex (consensus) 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7O4K Yeast TFIIH in the contracted state within the pre-initiation complex 提交 2021-04-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 10 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7O4L Yeast TFIIH in the expanded state within the pre-initiation complex 提交 2021-04-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 11 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7O72 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with closed promoter DNA 提交 2021-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7O73 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with closed distorted promoter DNA 提交 2021-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7O75 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7RIM RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 1 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 2.90 Å R-free 0.251
7RIP RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 1 soaked with CTP 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.261
7RIQ RNA polymerase II elongation complex scaffold 1 without polyamide 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.00 Å R-free 0.264
7RIW RNA polymerase II elongation complex scaffold 2, without polyamide 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.265
7RIX RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 2 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.268
7RIY RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 2 soaked with UTP 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.70 Å R-free 0.281
7UI9 Core Mediator-PICearly (Copy A) 提交 2022-03-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7UIF Mediator-PIC Early (Core B) 提交 2022-03-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
7UIO Mediator-PIC Early (Composite Model) 提交 2022-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：80-meric
链 AF 1–155（155 aa）
链 BF 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 THR THREONINE × 1 ALA ALANINE × 1 ASP ASPARTIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z0H Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.6 A (focus subunit AC40). 提交 2022-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7Z1L Structure of yeast RNA Polymerase III Pre-Termination Complex (PTC) 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7Z1M Structure of yeast RNA Polymerase III Elongation Complex (EC) 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7Z1N Structure of yeast RNA Polymerase III Delta C53-C37-C11 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7Z1O Structure of yeast RNA Polymerase III PTC + NTPs 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7Z2Z Structure of yeast RNA Polymerase III-DNA-Ty1 integrase complex (Pol III-DNA-IN1) at 3.1 A 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
7Z30 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.9 A (focus subunit C11 terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7Z31 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.7 A (focus subunit C11, no C11 C-terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
7ZS9 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome (complex A) 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7ZSA Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP (complex B) 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7ZSB Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP, complex C 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
8BWS Structure of yeast RNA Polymerase III elongation complex at 3.3 A 提交 2022-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8CEN Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator 提交 2023-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：46-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8CEO Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator and the +1 nucleosome 提交 2023-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：54-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8JCH Cryo-EM structure of yeast Rat1-bound Pol II pre-termination transcription complex 1 (Pol II Rat1-PTTC1) 提交 2023-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8K5P Cryo-EM structure of yeast Rat1-bound Pol II pre-termination transcription complex 2 (Pol II Rat1-PTTC2) 提交 2023-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8RAM Structure of Sen1 bound RNA Polymerase II pre-termination complex 提交 2023-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8RAP Structure of Sen1-ADP.BeF3 bound RNA Polymerase II pre-termination complex 提交 2023-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8TUG Cryo-EM structure of CPD-stalled Pol II in complex with Rad26 (engaged state) 提交 2023-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8TVP Cryo-EM structure of CPD-stalled Pol II in complex with Rad26 (open state) 提交 2023-08-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8TVQ Cryo-EM structure of CPD stalled 10-subunit Pol II in complex with Rad26 提交 2023-08-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：14-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8TVS Cryo-EM structure of backtracked Pol II in complex with Rad26 提交 2023-08-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8TVV Cryo-EM structure of backtracked Pol II 提交 2023-08-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8TVW Cryo-EM structure of CPD-stalled Pol II (conformation 1) 提交 2023-08-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8TVX Cryo-EM structure of CPD-stalled Pol II (Conformation 2) 提交 2023-08-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8TVY Cryo-EM structure of CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex with Rad26 and Elf1 (closed state) 提交 2023-08-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8U9R STRUCTURAL BASIS OF TRANSCRIPTION: RNA POLYMERASE II SUBSTRATE BINDING AND METAL COORDINATION USING A FREE-ELECTRON LASER 提交 2023-09-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 GOL GLYCEROL × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10-15 % tacsimate 100mM Hepes pH 7.5
分辨率 3.34 Å R-free 0.261
8U9X STRUCTURAL BASIS OF TRANSCRIPTION: RNA POLYMERASE II SUBSTRATE BINDING AND METAL COORDINATION AT 3.0 A OF T834P MUTANT USING A FREE-ELECTRON LASER 提交 2023-09-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；289 K；10-15 % tacsimate 100mM Hepes
分辨率 3.05 Å R-free 0.307
8UKQ RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion in apo state 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：13-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13 % (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.50 Å R-free 0.302
8UKR RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion soaking with ATP before chemistry 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.78 Å R-free 0.310
8UKS RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion soaking with CTP before chemistry 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 8 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.40 Å R-free 0.301
8UKT RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion with AMP added 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：13-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.60 Å R-free 0.289
8UKU RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion with CMP added 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.60 Å R-free 0.301
8UMH Consensus map of PICdeltaTFIIK form2 提交 2023-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES PH 7.6 50 mM KOAc 5 mM DTT 2 mM MgOAc
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8UMI consensus map of PICdeltaTFIIK form1 提交 2023-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES PH 7.6 50 mM KOAc 5 mM DTT 2 mM MgOAc
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8UOQ Composite map of PIC_delta_TFIIK form2 提交 2023-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8UOT Composite map of PICdeltaTFIIK form1 提交 2023-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES PH 7.6 50 mM KOAc 5 mM DTT 2 mM MgOAc
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9BVT RNA Pol II - High Mn(+2) concentration 提交 2024-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；Tacsimate Hepes
分辨率 3.40 Å R-free 0.249
9BW0 RNA Polymerase II - No ATP 提交 2024-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；Tacsimate, Hepes pH 7.0
分辨率 3.51 Å R-free 0.246
9G1V Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.70 Å
9G1X Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 11-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：14-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G23 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at A-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G24 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at E-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G26 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, closed state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G27 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, pre-translocation state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.80 Å
9G29 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site with the C-terminal of A12 in the funnel 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.30 Å
9G2B Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 12-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.20 Å
9G2C Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, open state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9JA1 The RNA polymerase II elongation complex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-08-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
9K7F RNA polymerase II elongation complex apo structure. 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
9KD7 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-1 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
9KD8 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-2 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.46 Å
9KD9 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-5 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9KDN The structure of 1 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 2 CTG repeats. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
9KDO The structure of 2 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 3 CTG repeats 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
9KDQ The structure of 3 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 4 CTG repeats. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
9N5B RNA polymerase II elongation complex containing 8-oxoG at +1 site, apo form 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.256
9N5C RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, CMPCPP-bound 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.297
9N5D RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, CMP added 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.35 Å R-free 0.300
9N5E RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, AMPCPP in E-site 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.75 Å R-free 0.291
9N5F RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG in syn-conformation with added AMP 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.281
9N5G RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, ATP in both A- and E-site 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.15 Å R-free 0.254
9PVV RNA polymerase II elongation complex with dC at +1 site, 8-oxo-GTP bound in A-site. 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.48 Å R-free 0.258
9PVW RNA polymerase II elongation complex with dA at +1 site, 8-oxo-GMP added in Syn-conformation 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.56 Å R-free 0.288
9PVX RNA polymerase II elongation complex with dA at +1 site, 8-oxo-GTP bound in E-site. 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.39 Å R-free 0.236
9QEB CryoEM structure of transcribing RNA polymerase II elongation complex 提交 2025-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.26 Å
9RYB CryoEM structure of transcribing RNA polymerase II elongation complex in post-catalysis state 提交 2025-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 1 DPO DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.33 Å

共 280 个其他 PDB 条目、293 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RPAB2_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P46669

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 G； UniProt 1–326 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190 × 1 （P10964） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135 × 1 （P22138） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 （P07703） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14 × 1 （P50106） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12 × 1 （P32529） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 （P28000） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 × 1 （Q01080） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34 × 1 （P47006） RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3 × 1 （P36070） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2RF4 Crystal structure of the RNA Polymerase I subcomplex A14/43 提交 2007-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–172（171 aa）
链 A 210–251（42 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；295 K；18 % (w/v) PEG 3350, 350 mM potassium acetate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.285
2RF4 Crystal structure of the RNA Polymerase I subcomplex A14/43 提交 2007-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–172（171 aa）
链 C 210–251（42 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；295 K；18 % (w/v) PEG 3350, 350 mM potassium acetate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.285
2RF4 Crystal structure of the RNA Polymerase I subcomplex A14/43 提交 2007-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2–172（171 aa）
链 E 210–251（42 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；295 K；18 % (w/v) PEG 3350, 350 mM potassium acetate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.285
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 G 1–326（326 aa）
链 O 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 4 1–326（326 aa）
链 V 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C3H Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.27 A resolution, crystal form C2-93 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 24% ETHYLENGLYCOL, 0.1M MES PH 6.8
分辨率 3.27 Å R-free 0.226
4C3I Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.0 A resolution, crystal form C2-100 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL PH 7.4
分辨率 3.00 Å R-free 0.231
4C3J Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.35 A resolution, crystal form C2-90 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL, PH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.220
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 AG 1–326（326 aa）
链 AO 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 BG 1–326（326 aa）
链 BO 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 CG 1–326（326 aa）
链 CO 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 DG 1–326（326 aa）
链 DO 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 EG 1–326（326 aa）
链 EO 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 FG 1–326（326 aa）
链 FO 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5LMX Monomeric RNA polymerase I at 4.9 A resolution 提交 2016-08-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
5M3F Yeast RNA polymerase I elongation complex at 3.8A 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 3.80 Å
5M3M Free monomeric RNA polymerase I at 4.0A resolution 提交 2016-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 4.00 Å
5M5W RNA Polymerase I open complex 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 3.80 Å
5M5X RNA Polymerase I elongation complex 1 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot time for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M5Y RNA Polymerase I elongation complex 2 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M64 RNA Polymerase I elongation complex with A49 tandem winged helix domain 提交 2016-10-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.60 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6H67 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) 提交 2018-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6H68 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) with fully-ordered A49 提交 2018-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6HKO Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.42 Å
6HLQ Yeast RNA polymerase I* elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLR Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP (core focused) 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLS Yeast apo RNA polymerase I* 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.21 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9G1V Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.70 Å
9G1X Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 11-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：14-meric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G23 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at A-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G24 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at E-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G26 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, closed state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G27 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, pre-translocation state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.80 Å
9G29 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site with the C-terminal of A12 in the funnel 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.30 Å
9G2B Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 12-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.20 Å
9G2C Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, open state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 G 1–326（326 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å

共 45 个其他 PDB 条目、53 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPA43_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–326； UniProt 1–326

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P20436

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 H； UniProt 1–146 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190 × 1 （P10964） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135 × 1 （P22138） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 （P07703） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14 × 1 （P50106） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 × 1 （P46669） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12 × 1 （P32529） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 （P28000） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 × 1 （Q01080） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34 × 1 （P47006） RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3 × 1 （P36070） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1A1D YEAST RNA POLYMERASE SUBUNIT RPB8, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE, ALPHA CARBONS ONLY 提交 1997-12-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–146（146 aa） 片段：SUBUNIT RPB8
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3；298 K
NMR样品组成 D2O
分辨率未提供
1I3Q RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM I AT 3.1 A RESOLUTION 提交 2001-02-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammoniumhydrogenphosphate, Sodiumdihydrogenphosphate, dioxane, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
1I50 RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM II AT 2.8 A RESOLUTION 提交 2001-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUMHYDROGENPHOSPHATE, SODIUMDIHYDROGENPHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1I50 RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM II AT 2.8 A RESOLUTION 提交 2001-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUMHYDROGENPHOSPHATE, SODIUMDIHYDROGENPHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1I6H RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX 提交 2001-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 100K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
1K83 Crystal Structure of Yeast RNA Polymerase II Complexed with the Inhibitor Alpha Amanitin 提交 2001-10-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PH 6.00
分辨率 2.80 Å R-free 0.280
1NIK Wild Type RNA Polymerase II 提交 2002-12-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.3；291 K；peg400, peg 6K, NaCl, Dioaxne, ZnCl2, Ammonium phosphate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 6.30
分辨率 4.10 Å R-free 0.360
1NT9 Complete 12-subunit RNA polymerase II 提交 2003-01-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；PEG 20000, ammonium sodium phosphate, sodium chloride, dioxane, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 4.20 Å
1PQV RNA polymerase II-TFIIS complex 提交 2003-06-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；sodium-ammonium tartrate, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.80 Å
1R5U RNA POLYMERASE II TFIIB COMPLEX 提交 2003-10-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；ammonium sulfate, MES, NaCl, CdCl2, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.50 Å R-free 0.373
1R9S RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX, MATCHED NUCLEOTIDE 提交 2003-10-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammonium hydrogen phosphate, sodium dihydrogen phosphate, dioxane, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.25 Å R-free 0.398
1R9T RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX, MISMATCHED NUCLEOTIDE 提交 2003-10-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammonium hydrogen phosphate, sodium dihydrogen phosphate, dioxane, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.317
1SFO RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX 提交 2004-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, ammonium sodium phosphate, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.61 Å R-free 0.343
1TWA RNA polymerase II complexed with ATP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.246
1TWC RNA polymerase II complexed with GTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
1TWF RNA polymerase II complexed with UTP at 2.3 A resolution 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1TWF RNA polymerase II complexed with UTP at 2.3 A resolution 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 4 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 8 ZN ZINC ION × 32 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 ZN ZINC ION × 16 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWH RNA polymerase II complexed with 2'dATP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.262
1WCM Complete 12-Subunit RNA Polymerase II at 3.8 Angstrom 提交 2004-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.80 Å R-free 0.285
1Y1V Refined RNA Polymerase II-TFIIS complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.80 Å R-free 0.294
1Y1W Complete RNA Polymerase II elongation complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.00 Å R-free 0.276
1Y1Y RNA Polymerase II-TFIIS-DNA/RNA complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.00 Å
1Y77 Complete RNA Polymerase II elongation complex with substrate analogue GMPCPP 提交 2004-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.50 Å
2B63 Complete RNA Polymerase II-RNA inhibitor complex 提交 2005-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes (pH 7.0), 5% PEG 6000, and 5 mM TCEP
分辨率 3.80 Å R-free 0.273
2B8K 12-subunit RNA Polymerase II 提交 2005-10-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 4.15 Å
2E2H RNA polymerase II elongation complex at 5 mM Mg2+ with GTP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.95 Å R-free 0.368
2E2I RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with 2'-dGTP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.41 Å R-free 0.316
2E2J RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with GMPCPP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.306
2JA5 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex A 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.00
分辨率 3.80 Å R-free 0.280
2JA6 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex B 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 4.00 Å R-free 0.301
2JA7 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex C 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.275
2JA7 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex C 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 T 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.275
2JA8 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex D 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.288
2NVQ RNA Polymerase II Elongation Complex in 150 mM Mg+2 with 2'dUTP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 DUT DEOXYURIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200mM NH4OAc, 150mM Mg(OAc)2, 50mM Hepes, pH 7.0, 5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.283
2NVT RNA Polymerase II Elongation Complex in 150 mM Mg+2 with GMPCPP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200mM NH4OAc, 150mM Mg(OAc)2, 50mM Hepes, pH 7.0, 5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.36 Å R-free 0.283
2NVX RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with 2'-dUTP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 DUT DEOXYURIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.60 Å R-free 0.304
2NVY RNA Polymerase II form II in 150 mM Mn+2 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.323
2NVY RNA Polymerase II form II in 150 mM Mn+2 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.323
2NVZ RNA Polymerase II elongation complex with UTP, updated 11/2006 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.30 Å R-free 0.332
2R7Z Cisplatin lesion containing RNA polymerase II elongation complex 提交 2007-09-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 CPT Cisplatin × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5% (v/v) PEG 6000, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.80 Å R-free 0.240
2R92 Elongation complex of RNA polymerase II with artificial RdRP scaffold 提交 2007-09-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；5% (w/v) PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K, pH 7.00
分辨率 3.80 Å R-free 0.246
2R93 Elongation complex of RNA polymerase II with a hepatitis delta virus-derived RNA stem loop 提交 2007-09-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；5% (w/v) PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 4.00 Å R-free 0.241
2VUM Alpha-amanitin inhibited complete RNA polymerase II elongation complex 提交 2008-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 50 MM HEPES PH 7.0, 4-7% PEG 6000, 5 MM TCEP
分辨率 3.40 Å R-free 0.288
2YU9 RNA polymerase II elongation complex in 150 mm MG+2 with UTP 提交 2007-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200MM NH4OAC, 150MM MG(OAC)2, 50MM HEPES, PH 7.0, 5% PEG6000, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.344
3CQZ Crystal structure of 10 subunit RNA polymerase II in complex with the inhibitor alpha-amanitin 提交 2008-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3FKI 12-Subunit RNA Polymerase II Refined with Zn-SAD data 提交 2008-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；5-7% PEG 4000, 50 mM HEPES pH 7.0, 10 mM DTT, 70 mM glucosamine, 50 mM dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.88 Å R-free 0.301
3GTG Backtracked RNA polymerase II complex with 12mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 14.5 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.78 Å R-free 0.300
3GTJ Backtracked RNA polymerase II complex with 13mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 14.5 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.42 Å R-free 0.292
3GTK Backtracked RNA polymerase II complex with 18mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 14.5 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.278
3GTL Backtracked RNA polymerase II complex with 13mer with G<>U mismatch 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 14.5 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.38 Å R-free 0.322
3GTM Co-complex of Backtracked RNA polymerase II with TFIIS 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tetradecameric
链 H 1–146（146 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 14.5 kDa polypeptide
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.289
3GTO Backtracked RNA polymerase II complex with 15mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 14.5 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.00 Å R-free 0.290
3GTP Backtracked RNA polymerase II complex with 24mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 14.5 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.90 Å R-free 0.299
3GTQ Backtracked RNA polymerase II complex induced by damage 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 14.5 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.335
3H3V Yeast RNAP II containing poly(A)-signal sequence in the active site 提交 2009-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 I 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；200 mM ammonium acetate, 50mM HEPES pH 7.0, 4% polyethylene glycol 6000, 5mM TCEP (tris (2-carboxyethyl) phosphine hydrochloride), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0 K
分辨率 4.00 Å R-free 0.241
3HOU Complete RNA polymerase II elongation complex I with a T-U mismatch 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.252
3HOU Complete RNA polymerase II elongation complex I with a T-U mismatch 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 T 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.252
3HOV Complete RNA polymerase II elongation complex II 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE,, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.50 Å R-free 0.226
3HOW Complete RNA polymerase II elongation complex III with a T-U mismatch and a frayed RNA 3'-uridine 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.60 Å R-free 0.254
3HOX Complete RNA polymerase II elongation complex V 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.65 Å R-free 0.250
3HOY Complete RNA polymerase II elongation complex VI 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.40 Å R-free 0.254
3HOZ Complete RNA polymerase II elongation complex IV with a T-U mismatch and a frayed RNA 3'-guanine 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；20mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.65 Å R-free 0.253
3I4M 8-oxoguanine containing RNA polymerase II elongation complex D 提交 2009-07-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 50mM Hepes, 4%(w/v) PEG 6000, 5mM TCEP, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.70 Å R-free 0.258
3I4N 8-oxoguanine containing RNA polymerase II elongation complex E 提交 2009-07-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；5%(w/v) PEG 6000, 200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 50mM Hepes, 5mM TCEP , pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.90 Å R-free 0.266
3J1N Cryo-EM map of a yeast minimal preinitiation complex interacting with the Mediator Head module 提交 2012-03-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 mM KCl, 25 mM Tris-HCl, 10 mM DTT；pH 8；25 mM KCl, 25 mM Tris-HCl, 10 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for ~2 sec before plunging；77 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for approximately 2 seconds before plunging into liquid ethane.
分辨率 16.00 Å
3K1F Crystal structure of RNA Polymerase II in complex with TFIIB 提交 2009-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；800 mM sodium ammonium tartrate, 100 mM HEPES pH 7.5, 5 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.30 Å R-free 0.255
3K7A Crystal Structure of an RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2009-10-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；295 K；1.2 M sodium/potassium phosphate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.80 Å R-free 0.313
3M3Y RNA polymerase II elongation complex C 提交 2010-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 C7P cis-diammine(pyridine)chloroplatinum(II) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6,000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.18 Å R-free 0.255
3M4O RNA polymerase II elongation complex B 提交 2010-03-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 C7P cis-diammine(pyridine)chloroplatinum(II) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6,000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.57 Å R-free 0.292
3PO2 Arrested RNA Polymerase II elongation complex 提交 2010-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG6000, 50mM HEPES pH 7.0, 200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.178
3PO3 Arrested RNA Polymerase II reactivation intermediate 提交 2010-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG6000, 50mM HEPES pH 7.0, 200mM AMMONIUM ACETATE, 300mM SODIUM ACETATE, 5mM TCEP , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.189
3QT1 RNA polymerase II variant containing A Chimeric RPB9-C11 subunit 提交 2011-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 5-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 4.30 Å R-free 0.281
3RZD RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA 提交 2011-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.30 Å R-free 0.230
3RZO RNA Polymerase II Initiation Complex with a 4-nt RNA 提交 2011-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.00 Å R-free 0.236
3S14 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 6-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 2.85 Å R-free 0.227
3S15 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 7-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.228
3S16 RNA Polymerase II Initiation Complex with an 8-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.24 Å R-free 0.227
3S17 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 9-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.9, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.20 Å R-free 0.236
3S1M RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA (variant 1) 提交 2011-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.13 Å R-free 0.233
3S1N RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA (variant 2) 提交 2011-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.232
3S1Q RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt 3'-deoxy RNA soaked with ATP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.30 Å R-free 0.229
3S1R RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt 3'-deoxy RNA soaked with GTP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.226
3S2D RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA containing a 5Br-U 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.231
3S2H RNA Polymerase II Initiation Complex with a 6-nt RNA containing a 2[prime]-iodo ATP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 5.9-6.1, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.240
4A3B RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 4nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.197
4A3C RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 5nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.184
4A3D RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 6nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.40 Å R-free 0.186
4A3E RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 5nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.40 Å R-free 0.188
4A3F RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 6nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.185
4A3G RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 2nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.194
4A3I RNA Polymerase II binary complex with DNA 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.80 Å R-free 0.191
4A3J RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 2nt DNA-RNA hybrid and soaked with GMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 3.70 Å R-free 0.194
4A3K RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 7nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.50 Å R-free 0.185
4A3L RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 7nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.187
4A3M RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 4nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.90 Å R-free 0.190
4A93 RNA Polymerase II elongation complex containing a CPD Lesion 提交 2011-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；4-7% PEG 6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP.
分辨率 3.40 Å R-free 0.199
4BBR Structure of RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2012-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.40 Å R-free 0.211
4BBS Structure of an initially transcribing RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2012-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.60 Å R-free 0.225
4BXX Arrested RNA polymerase II-Bye1 complex 提交 2013-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.28 Å R-free 0.208
4BXZ RNA Polymerase II-Bye1 complex 提交 2013-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；750 MM TRI-SODIUM CITRATE, 100 MM HEPES PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 4.80 Å R-free 0.253
4BY1 elongating RNA Polymerase II-Bye1 TLD complex soaked with AMPCPP 提交 2013-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.60 Å R-free 0.206
4BY7 elongating RNA Polymerase II-Bye1 TLD complex 提交 2013-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.15 Å R-free 0.212
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 W 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C3H Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.27 A resolution, crystal form C2-93 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 24% ETHYLENGLYCOL, 0.1M MES PH 6.8
分辨率 3.27 Å R-free 0.226
4C3I Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.0 A resolution, crystal form C2-100 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL PH 7.4
分辨率 3.00 Å R-free 0.231
4C3J Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.35 A resolution, crystal form C2-90 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL, PH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.220
4V1M Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 6.60 Å
4V1N Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 7.80 Å
4V1O Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 9.70 Å
4X67 Crystal structure of elongating yeast RNA polymerase II stalled at oxidative Cyclopurine DNA lesions. 提交 2014-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, PH 5.9-6.3, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7% - 11.6% PEG6000
分辨率 4.10 Å R-free 0.289
4X6A Crystal structure of yeast RNA polymerase II encountering oxidative Cyclopurine DNA lesions 提交 2014-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, PH 5.9-6.3, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7% - 11.6% PEG6000
分辨率 3.96 Å R-free 0.296
4Y52 Crystal structure of 5-Carboxycytosine Recognition by RNA Polymerase II during Transcription Elongation. 提交 2015-02-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7-11.6%(w/v) PEG6000
分辨率 3.50 Å R-free 0.232
4Y7N The Structure Insight into 5-Carboxycytosine Recognition by RNA Polymerase II during Transcription Elongation. 提交 2015-02-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7-11.6%(w/v) PEG6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.250
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 AH 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 BH 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 CH 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 DH 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 EH 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 FH 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
5C3E Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 6000, Ammonium Acetate, Sodium Acetate, DTT
分辨率 3.70 Å R-free 0.220
5C44 Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 6000, Ammonium Acetate, Sodium Acetate, DTT
分辨率 3.95 Å R-free 0.236
5C4A Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；PEG 4000, POTASSIUM THIOCYANATE, MES, DTT
分辨率 4.20 Å R-free 0.242
5C4J Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 4000, SODIUM MALONATE, HEPES, DTT
分辨率 4.00 Å R-free 0.271
5C4X Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；PEG 4000, SODIUM CITRATE, MES, DTT
分辨率 4.00 Å R-free 0.227
5FJ8 Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III elongation complex at 3. 9 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 3.90 Å
5FJ9 Cryo-EM structure of yeast apo RNA polymerase III at 4.6 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 4.60 Å
5FJA Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III at 4.7 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT - FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 4.65 Å
5FMF the P-lobe of RNA polymerase II pre-initiation complex 提交 2015-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES (PH7.6), 5 MM DTT, 2 MM MG(OAC)2,AND 40 MM KOAC；pH 7.6；20 MM HEPES (PH7.6), 5 MM DTT, 2 MM MG(OAC)2,AND 40 MM KOAC
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III,
分辨率 6.00 Å
5FYW Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening (OC) 提交 2016-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN - ETHANE. INSTRUMENT - FEI VITROBOT MARK IV. QUANTIFOIL R 3.5- 1 HOLEY CARBON GRIDS WERE GLOW-DISCHARGED BEFORE DEPOSITION OF 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE. GRIDS WERE THEN BLOTTED FOR 8.5 S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.35 Å
5FZ5 Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening (CC) 提交 2016-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 8.80 Å
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5IP7 Structure of RNA Polymerase II-Tfg1 peptide complex 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 2–146（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 6000, sodium acetate, ammonium acetate, hepes, tcep
分辨率 3.52 Å R-free 0.180
5IP9 Structure of RNA Polymerase II-TFIIF complex 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 2–146（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；peg 6000, sodium acetate, ammonium acetate, hepes, tcep
分辨率 3.90 Å R-free 0.194
5LMX Monomeric RNA polymerase I at 4.9 A resolution 提交 2016-08-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
5M3F Yeast RNA polymerase I elongation complex at 3.8A 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 3.80 Å
5M3M Free monomeric RNA polymerase I at 4.0A resolution 提交 2016-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 4.00 Å
5M5W RNA Polymerase I open complex 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 3.80 Å
5M5X RNA Polymerase I elongation complex 1 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot time for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M5Y RNA Polymerase I elongation complex 2 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M64 RNA Polymerase I elongation complex with A49 tandem winged helix domain 提交 2016-10-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.60 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5OQJ STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH 提交 2017-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE BLOTTED FOR 8 S AND PLUNGE-FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.70 Å
5OQM STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH AND CORE MEDIATOR 提交 2017-08-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：46-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 8 s and plunge-frozen in liquid ethane.
分辨率 5.80 Å
5OT2 RNA polymerase II elongation complex in the presence of 3d-Napht-A 提交 2017-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 AHW 2-ethyl-7-methoxy-naphthalene × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 300 mM sodium acetate, 50 mM HEPES pH 7.0, 5 mM TCEP
分辨率 3.20 Å R-free 0.222
5SVA Mediator-RNA Polymerase II Pre-Initiation Complex 提交 2016-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 15.30 Å
5U5Q 12 Subunit RNA Polymerase II at Room Temperature collected using SFX 提交 2016-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 6.3；289.65 K；21-22% PEG 400, 5% PEG 5%, 100 mM Ammonium Phosphate pH 6.3, 100 mM NaCl, 1 mM ZnCl2 and 10 mM DTT
分辨率 3.80 Å R-free 0.271
5VVR Ternary complex of RNA Pol II, transcription scaffold and Rad26 提交 2017-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5VVS RNA pol II elongation complex 提交 2017-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
5W4U Pol II elongation complex with an N6-methyladenine-containing template 提交 2017-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 10-12.5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.60 Å R-free 0.259
5W51 Pol II elongation complex with an N6-methyladenine-containing template and a matched UMPNPP 提交 2017-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 2KH 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]uridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 10-12.5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.254
5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6BLO Pol II elongation complex with an abasic lesion at i+1 position 提交 2017-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.227
6BLP Pol II elongation complex with an abasic lesion at i+1 position, soaking AMPCPP 提交 2017-11-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.257
6BM2 Pol II elongation complex with an abasic lesion at i-1 position 提交 2017-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.244
6BM4 Pol II elongation complex with an abasic lesion at i-1 position,soaking UMPNPP 提交 2017-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 2KH 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]uridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 2.95 Å R-free 0.260
6BQF Pol II elongation complex with 'dT-AP' at i+1, i-1 position 提交 2017-11-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.35 Å R-free 0.245
6CNB Yeast RNA polymerase III initial transcribing complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6CNC Yeast RNA polymerase III open complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6CND Yeast RNA polymerase III natural open complex (nOC) 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6CNF Yeast RNA polymerase III elongation complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6EU0 RNA Polymerase III open pre-initiation complex (OC-PIC) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6EU1 RNA Polymerase III - open DNA complex (OC-POL3). 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6EU2 Apo RNA Polymerase III - open conformation (oPOL3) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6EU3 Apo RNA Polymerase III - closed conformation (cPOL3) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6F40 RNA Polymerase III open complex 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6F41 RNA Polymerase III initially transcribing complex 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6F42 RNA Polymerase III closed complex CC1. 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6F44 RNA Polymerase III closed complex CC2. 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6GYK Structure of a yeast closed complex (core CC1) 提交 2018-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
6GYL Structure of a yeast closed complex with distorted DNA (core CCdist) 提交 2018-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6GYM Structure of a yeast closed complex with distorted DNA (CCdist) 提交 2018-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6H67 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) 提交 2018-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6H68 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) with fully-ordered A49 提交 2018-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6HKO Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.42 Å
6HLQ Yeast RNA polymerase I* elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLR Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP (core focused) 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLS Yeast apo RNA polymerase I* 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.21 Å
6I84 Structure of transcribing RNA polymerase II-nucleosome complex 提交 2018-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6O6C RNA polymerase II elongation complex arrested at a CPD lesion 提交 2019-03-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was manually wicked from the grid. 1.2 uL sample buffer was then applied to the streptavidin side. The grid was then blotted.
分辨率 3.10 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
6TUT Cryo-EM structure of the RNA Polymerase III-Maf1 complex 提交 2020-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES, 150 mM (NH4)2SO4, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 6, blot force 2
分辨率 3.25 Å
6UPX RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 1 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.266
6UPY RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 2E 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.282
6UPZ RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 3 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.269
6UQ0 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 4 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.56 Å R-free 0.278
6UQ1 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 6 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.287
6UQ2 RNA polymerase II elongation complex with dG in state 1 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.280
6UQ3 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 5 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.47 Å R-free 0.286
7KED RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.305
7KEE RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3, rNaMTP bound to E-site 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 WCG (1S)-1,4-anhydro-5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-1-(3-methoxynaphthalen-2-yl)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.45 Å R-free 0.302
7KEF RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3, rNaM in swing state 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 WC4 (1S)-1,4-anhydro-1-(3-methoxynaphthalen-2-yl)-5-O-phosphono-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.89 Å R-free 0.326
7NKX RNA polymerase II-Spt4/5-nucleosome-Chd1 structure 提交 2021-02-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NKY RNA Polymerase II-Spt4/5-nucleosome-FACT structure 提交 2021-02-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7O4I Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with initial transcription bubble 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7O4J Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex (consensus) 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7O72 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with closed promoter DNA 提交 2021-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7O73 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with closed distorted promoter DNA 提交 2021-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7O75 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7RIM RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 1 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 2.90 Å R-free 0.251
7RIP RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 1 soaked with CTP 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.261
7RIQ RNA polymerase II elongation complex scaffold 1 without polyamide 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.00 Å R-free 0.264
7RIW RNA polymerase II elongation complex scaffold 2, without polyamide 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.265
7RIX RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 2 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.268
7RIY RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 2 soaked with UTP 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.70 Å R-free 0.281
7UI9 Core Mediator-PICearly (Copy A) 提交 2022-03-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7UIF Mediator-PIC Early (Core B) 提交 2022-03-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
7UIO Mediator-PIC Early (Composite Model) 提交 2022-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：80-meric
链 AH 1–146（146 aa）
链 BH 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 THR THREONINE × 1 ALA ALANINE × 1 ASP ASPARTIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z0H Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.6 A (focus subunit AC40). 提交 2022-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7Z1L Structure of yeast RNA Polymerase III Pre-Termination Complex (PTC) 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7Z1M Structure of yeast RNA Polymerase III Elongation Complex (EC) 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7Z1N Structure of yeast RNA Polymerase III Delta C53-C37-C11 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7Z1O Structure of yeast RNA Polymerase III PTC + NTPs 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7Z2Z Structure of yeast RNA Polymerase III-DNA-Ty1 integrase complex (Pol III-DNA-IN1) at 3.1 A 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
7Z30 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.9 A (focus subunit C11 terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7Z31 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.7 A (focus subunit C11, no C11 C-terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
7ZS9 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome (complex A) 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7ZSA Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP (complex B) 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7ZSB Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP, complex C 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
8BWS Structure of yeast RNA Polymerase III elongation complex at 3.3 A 提交 2022-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8CEN Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator 提交 2023-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：46-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8CEO Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator and the +1 nucleosome 提交 2023-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：54-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8JCH Cryo-EM structure of yeast Rat1-bound Pol II pre-termination transcription complex 1 (Pol II Rat1-PTTC1) 提交 2023-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8K5P Cryo-EM structure of yeast Rat1-bound Pol II pre-termination transcription complex 2 (Pol II Rat1-PTTC2) 提交 2023-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8RAM Structure of Sen1 bound RNA Polymerase II pre-termination complex 提交 2023-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8RAP Structure of Sen1-ADP.BeF3 bound RNA Polymerase II pre-termination complex 提交 2023-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8UKQ RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion in apo state 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：13-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13 % (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.50 Å R-free 0.302
8UKR RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion soaking with ATP before chemistry 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.78 Å R-free 0.310
8UKS RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion soaking with CTP before chemistry 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 8 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.40 Å R-free 0.301
8UKT RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion with AMP added 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：13-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.60 Å R-free 0.289
8UKU RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion with CMP added 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.60 Å R-free 0.301
8UOQ Composite map of PIC_delta_TFIIK form2 提交 2023-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8UOT Composite map of PICdeltaTFIIK form1 提交 2023-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES PH 7.6 50 mM KOAc 5 mM DTT 2 mM MgOAc
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9G1V Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.70 Å
9G1X Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 11-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：14-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G23 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at A-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G24 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at E-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G26 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, closed state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G27 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, pre-translocation state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.80 Å
9G29 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site with the C-terminal of A12 in the funnel 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.30 Å
9G2B Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 12-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.20 Å
9G2C Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, open state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9JA1 The RNA polymerase II elongation complex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-08-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tetradecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
9K7F RNA polymerase II elongation complex apo structure. 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
9KD7 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-1 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
9KD8 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-2 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.46 Å
9KD9 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-5 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9KDN The structure of 1 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 2 CTG repeats. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
9KDO The structure of 2 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 3 CTG repeats 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
9KDQ The structure of 3 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 4 CTG repeats. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
9N5B RNA polymerase II elongation complex containing 8-oxoG at +1 site, apo form 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.256
9N5C RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, CMPCPP-bound 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.297
9N5D RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, CMP added 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.35 Å R-free 0.300
9N5E RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, AMPCPP in E-site 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.75 Å R-free 0.291
9N5F RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG in syn-conformation with added AMP 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.281
9N5G RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, ATP in both A- and E-site 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.15 Å R-free 0.254
9PVV RNA polymerase II elongation complex with dC at +1 site, 8-oxo-GTP bound in A-site. 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.48 Å R-free 0.258
9PVW RNA polymerase II elongation complex with dA at +1 site, 8-oxo-GMP added in Syn-conformation 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.56 Å R-free 0.288
9PVX RNA polymerase II elongation complex with dA at +1 site, 8-oxo-GTP bound in E-site. 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.39 Å R-free 0.236
9QEB CryoEM structure of transcribing RNA polymerase II elongation complex 提交 2025-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.26 Å
9RYB CryoEM structure of transcribing RNA polymerase II elongation complex in post-catalysis state 提交 2025-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–146（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 1 DPO DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.33 Å

共 264 个其他 PDB 条目、277 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAB3_YEAST
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–146； UniProt 1–146

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32529

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 I； UniProt 1–125 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190 × 1 （P10964） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135 × 1 （P22138） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 （P07703） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14 × 1 （P50106） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 × 1 （P46669） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 （P28000） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 × 1 （Q01080） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34 × 1 （P47006） RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3 × 1 （P36070） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 X 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C3H Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.27 A resolution, crystal form C2-93 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 24% ETHYLENGLYCOL, 0.1M MES PH 6.8
分辨率 3.27 Å R-free 0.226
4C3I Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.0 A resolution, crystal form C2-100 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL PH 7.4
分辨率 3.00 Å R-free 0.231
4C3J Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.35 A resolution, crystal form C2-90 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL, PH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.220
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 AI 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 BI 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 CI 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 DI 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 EI 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 FI 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5LMX Monomeric RNA polymerase I at 4.9 A resolution 提交 2016-08-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
5M3F Yeast RNA polymerase I elongation complex at 3.8A 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 3.80 Å
5M3M Free monomeric RNA polymerase I at 4.0A resolution 提交 2016-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 4.00 Å
5M5W RNA Polymerase I open complex 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 3.80 Å
5M5X RNA Polymerase I elongation complex 1 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot time for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M5Y RNA Polymerase I elongation complex 2 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M64 RNA Polymerase I elongation complex with A49 tandem winged helix domain 提交 2016-10-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.60 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6H67 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) 提交 2018-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6H68 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) with fully-ordered A49 提交 2018-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6HKO Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.42 Å
6HLQ Yeast RNA polymerase I* elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLR Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP (core focused) 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLS Yeast apo RNA polymerase I* 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.21 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9G1V Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.70 Å
9G23 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at A-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G24 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at E-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G26 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, closed state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G27 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, pre-translocation state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.80 Å
9G29 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site with the C-terminal of A12 in the funnel 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.30 Å
9G2B Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 12-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.20 Å
9G2C Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, open state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å

共 43 个其他 PDB 条目、49 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPA12_YEAST
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P22139

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 J； UniProt 1–70 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190 × 1 （P10964） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135 × 1 （P22138） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 （P07703） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14 × 1 （P50106） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 × 1 （P46669） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12 × 1 （P32529） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 （P28000） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 × 1 （Q01080） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34 × 1 （P47006） RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3 × 1 （P36070） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1I3Q RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM I AT 3.1 A RESOLUTION 提交 2001-02-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammoniumhydrogenphosphate, Sodiumdihydrogenphosphate, dioxane, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
1I50 RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM II AT 2.8 A RESOLUTION 提交 2001-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUMHYDROGENPHOSPHATE, SODIUMDIHYDROGENPHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1I50 RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM II AT 2.8 A RESOLUTION 提交 2001-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUMHYDROGENPHOSPHATE, SODIUMDIHYDROGENPHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1I6H RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX 提交 2001-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 100K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
1K83 Crystal Structure of Yeast RNA Polymerase II Complexed with the Inhibitor Alpha Amanitin 提交 2001-10-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PH 6.00
分辨率 2.80 Å R-free 0.280
1NIK Wild Type RNA Polymerase II 提交 2002-12-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.3；291 K；peg400, peg 6K, NaCl, Dioaxne, ZnCl2, Ammonium phosphate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 6.30
分辨率 4.10 Å R-free 0.360
1NT9 Complete 12-subunit RNA polymerase II 提交 2003-01-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；PEG 20000, ammonium sodium phosphate, sodium chloride, dioxane, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 4.20 Å
1PQV RNA polymerase II-TFIIS complex 提交 2003-06-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；sodium-ammonium tartrate, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.80 Å
1R5U RNA POLYMERASE II TFIIB COMPLEX 提交 2003-10-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；ammonium sulfate, MES, NaCl, CdCl2, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.50 Å R-free 0.373
1R9S RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX, MATCHED NUCLEOTIDE 提交 2003-10-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammonium hydrogen phosphate, sodium dihydrogen phosphate, dioxane, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.25 Å R-free 0.398
1R9T RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX, MISMATCHED NUCLEOTIDE 提交 2003-10-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammonium hydrogen phosphate, sodium dihydrogen phosphate, dioxane, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.317
1SFO RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX 提交 2004-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, ammonium sodium phosphate, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.61 Å R-free 0.343
1TWA RNA polymerase II complexed with ATP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.246
1TWC RNA polymerase II complexed with GTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
1TWF RNA polymerase II complexed with UTP at 2.3 A resolution 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1TWF RNA polymerase II complexed with UTP at 2.3 A resolution 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 4 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 8 ZN ZINC ION × 32 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 ZN ZINC ION × 16 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWH RNA polymerase II complexed with 2'dATP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.262
1WCM Complete 12-Subunit RNA Polymerase II at 3.8 Angstrom 提交 2004-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.80 Å R-free 0.285
1Y1V Refined RNA Polymerase II-TFIIS complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.80 Å R-free 0.294
1Y1W Complete RNA Polymerase II elongation complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.00 Å R-free 0.276
1Y1Y RNA Polymerase II-TFIIS-DNA/RNA complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.00 Å
1Y77 Complete RNA Polymerase II elongation complex with substrate analogue GMPCPP 提交 2004-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.50 Å
2B63 Complete RNA Polymerase II-RNA inhibitor complex 提交 2005-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes (pH 7.0), 5% PEG 6000, and 5 mM TCEP
分辨率 3.80 Å R-free 0.273
2B8K 12-subunit RNA Polymerase II 提交 2005-10-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 4.15 Å
2E2H RNA polymerase II elongation complex at 5 mM Mg2+ with GTP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.95 Å R-free 0.368
2E2I RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with 2'-dGTP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.41 Å R-free 0.316
2E2J RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with GMPCPP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.306
2JA5 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex A 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.00
分辨率 3.80 Å R-free 0.280
2JA6 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex B 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 4.00 Å R-free 0.301
2JA7 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex C 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.275
2JA7 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex C 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 V 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.275
2JA8 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex D 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.288
2NVQ RNA Polymerase II Elongation Complex in 150 mM Mg+2 with 2'dUTP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 DUT DEOXYURIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200mM NH4OAc, 150mM Mg(OAc)2, 50mM Hepes, pH 7.0, 5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.283
2NVT RNA Polymerase II Elongation Complex in 150 mM Mg+2 with GMPCPP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200mM NH4OAc, 150mM Mg(OAc)2, 50mM Hepes, pH 7.0, 5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.36 Å R-free 0.283
2NVX RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with 2'-dUTP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 DUT DEOXYURIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.60 Å R-free 0.304
2NVY RNA Polymerase II form II in 150 mM Mn+2 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.323
2NVY RNA Polymerase II form II in 150 mM Mn+2 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.323
2NVZ RNA Polymerase II elongation complex with UTP, updated 11/2006 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.30 Å R-free 0.332
2R7Z Cisplatin lesion containing RNA polymerase II elongation complex 提交 2007-09-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 CPT Cisplatin × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5% (v/v) PEG 6000, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.80 Å R-free 0.240
2R92 Elongation complex of RNA polymerase II with artificial RdRP scaffold 提交 2007-09-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；5% (w/v) PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K, pH 7.00
分辨率 3.80 Å R-free 0.246
2R93 Elongation complex of RNA polymerase II with a hepatitis delta virus-derived RNA stem loop 提交 2007-09-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；5% (w/v) PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 4.00 Å R-free 0.241
2VUM Alpha-amanitin inhibited complete RNA polymerase II elongation complex 提交 2008-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 50 MM HEPES PH 7.0, 4-7% PEG 6000, 5 MM TCEP
分辨率 3.40 Å R-free 0.288
2YU9 RNA polymerase II elongation complex in 150 mm MG+2 with UTP 提交 2007-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200MM NH4OAC, 150MM MG(OAC)2, 50MM HEPES, PH 7.0, 5% PEG6000, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.344
3CQZ Crystal structure of 10 subunit RNA polymerase II in complex with the inhibitor alpha-amanitin 提交 2008-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3FKI 12-Subunit RNA Polymerase II Refined with Zn-SAD data 提交 2008-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；5-7% PEG 4000, 50 mM HEPES pH 7.0, 10 mM DTT, 70 mM glucosamine, 50 mM dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.88 Å R-free 0.301
3GTG Backtracked RNA polymerase II complex with 12mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I/II/III subunit 10
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.78 Å R-free 0.300
3GTJ Backtracked RNA polymerase II complex with 13mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I/II/III subunit 10
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.42 Å R-free 0.292
3GTK Backtracked RNA polymerase II complex with 18mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I/II/III subunit 10
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.278
3GTL Backtracked RNA polymerase II complex with 13mer with G<>U mismatch 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I/II/III subunit 10
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.38 Å R-free 0.322
3GTM Co-complex of Backtracked RNA polymerase II with TFIIS 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tetradecameric
链 J 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I/II/III subunit 10
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.289
3GTO Backtracked RNA polymerase II complex with 15mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I/II/III subunit 10
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.00 Å R-free 0.290
3GTP Backtracked RNA polymerase II complex with 24mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I/II/III subunit 10
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.90 Å R-free 0.299
3GTQ Backtracked RNA polymerase II complex induced by damage 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I/II/III subunit 10
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.335
3H3V Yeast RNAP II containing poly(A)-signal sequence in the active site 提交 2009-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 K 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；200 mM ammonium acetate, 50mM HEPES pH 7.0, 4% polyethylene glycol 6000, 5mM TCEP (tris (2-carboxyethyl) phosphine hydrochloride), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0 K
分辨率 4.00 Å R-free 0.241
3HOU Complete RNA polymerase II elongation complex I with a T-U mismatch 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.252
3HOU Complete RNA polymerase II elongation complex I with a T-U mismatch 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 V 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.252
3HOV Complete RNA polymerase II elongation complex II 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE,, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.50 Å R-free 0.226
3HOW Complete RNA polymerase II elongation complex III with a T-U mismatch and a frayed RNA 3'-uridine 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.60 Å R-free 0.254
3HOX Complete RNA polymerase II elongation complex V 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.65 Å R-free 0.250
3HOY Complete RNA polymerase II elongation complex VI 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.40 Å R-free 0.254
3HOZ Complete RNA polymerase II elongation complex IV with a T-U mismatch and a frayed RNA 3'-guanine 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；20mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.65 Å R-free 0.253
3I4M 8-oxoguanine containing RNA polymerase II elongation complex D 提交 2009-07-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 50mM Hepes, 4%(w/v) PEG 6000, 5mM TCEP, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.70 Å R-free 0.258
3I4N 8-oxoguanine containing RNA polymerase II elongation complex E 提交 2009-07-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；5%(w/v) PEG 6000, 200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 50mM Hepes, 5mM TCEP , pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.90 Å R-free 0.266
3J1N Cryo-EM map of a yeast minimal preinitiation complex interacting with the Mediator Head module 提交 2012-03-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 mM KCl, 25 mM Tris-HCl, 10 mM DTT；pH 8；25 mM KCl, 25 mM Tris-HCl, 10 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for ~2 sec before plunging；77 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for approximately 2 seconds before plunging into liquid ethane.
分辨率 16.00 Å
3K1F Crystal structure of RNA Polymerase II in complex with TFIIB 提交 2009-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；800 mM sodium ammonium tartrate, 100 mM HEPES pH 7.5, 5 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.30 Å R-free 0.255
3K7A Crystal Structure of an RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2009-10-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；295 K；1.2 M sodium/potassium phosphate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.80 Å R-free 0.313
3M3Y RNA polymerase II elongation complex C 提交 2010-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 C7P cis-diammine(pyridine)chloroplatinum(II) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6,000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.18 Å R-free 0.255
3M4O RNA polymerase II elongation complex B 提交 2010-03-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 C7P cis-diammine(pyridine)chloroplatinum(II) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6,000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.57 Å R-free 0.292
3PO2 Arrested RNA Polymerase II elongation complex 提交 2010-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG6000, 50mM HEPES pH 7.0, 200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.178
3PO3 Arrested RNA Polymerase II reactivation intermediate 提交 2010-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG6000, 50mM HEPES pH 7.0, 200mM AMMONIUM ACETATE, 300mM SODIUM ACETATE, 5mM TCEP , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.189
3QT1 RNA polymerase II variant containing A Chimeric RPB9-C11 subunit 提交 2011-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 5-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 4.30 Å R-free 0.281
3RZD RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA 提交 2011-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.30 Å R-free 0.230
3RZO RNA Polymerase II Initiation Complex with a 4-nt RNA 提交 2011-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.00 Å R-free 0.236
3S14 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 6-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 2.85 Å R-free 0.227
3S15 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 7-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.228
3S16 RNA Polymerase II Initiation Complex with an 8-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.24 Å R-free 0.227
3S17 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 9-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.9, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.20 Å R-free 0.236
3S1M RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA (variant 1) 提交 2011-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.13 Å R-free 0.233
3S1N RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA (variant 2) 提交 2011-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.232
3S1Q RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt 3'-deoxy RNA soaked with ATP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.30 Å R-free 0.229
3S1R RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt 3'-deoxy RNA soaked with GTP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.226
3S2D RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA containing a 5Br-U 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.231
3S2H RNA Polymerase II Initiation Complex with a 6-nt RNA containing a 2[prime]-iodo ATP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 5.9-6.1, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.240
4A3B RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 4nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.197
4A3C RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 5nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.184
4A3D RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 6nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.40 Å R-free 0.186
4A3E RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 5nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.40 Å R-free 0.188
4A3F RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 6nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.185
4A3G RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 2nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.194
4A3I RNA Polymerase II binary complex with DNA 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.80 Å R-free 0.191
4A3J RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 2nt DNA-RNA hybrid and soaked with GMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 3.70 Å R-free 0.194
4A3K RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 7nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.50 Å R-free 0.185
4A3L RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 7nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.187
4A3M RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 4nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.90 Å R-free 0.190
4A93 RNA Polymerase II elongation complex containing a CPD Lesion 提交 2011-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；4-7% PEG 6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP.
分辨率 3.40 Å R-free 0.199
4BBR Structure of RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2012-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.40 Å R-free 0.211
4BBS Structure of an initially transcribing RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2012-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.60 Å R-free 0.225
4BXX Arrested RNA polymerase II-Bye1 complex 提交 2013-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.28 Å R-free 0.208
4BXZ RNA Polymerase II-Bye1 complex 提交 2013-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；750 MM TRI-SODIUM CITRATE, 100 MM HEPES PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 4.80 Å R-free 0.253
4BY1 elongating RNA Polymerase II-Bye1 TLD complex soaked with AMPCPP 提交 2013-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.60 Å R-free 0.206
4BY7 elongating RNA Polymerase II-Bye1 TLD complex 提交 2013-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.15 Å R-free 0.212
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 Y 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C3H Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.27 A resolution, crystal form C2-93 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 24% ETHYLENGLYCOL, 0.1M MES PH 6.8
分辨率 3.27 Å R-free 0.226
4C3I Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.0 A resolution, crystal form C2-100 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL PH 7.4
分辨率 3.00 Å R-free 0.231
4C3J Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.35 A resolution, crystal form C2-90 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL, PH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.220
4V1M Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 6.60 Å
4V1N Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 7.80 Å
4V1O Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 9.70 Å
4X67 Crystal structure of elongating yeast RNA polymerase II stalled at oxidative Cyclopurine DNA lesions. 提交 2014-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, PH 5.9-6.3, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7% - 11.6% PEG6000
分辨率 4.10 Å R-free 0.289
4X6A Crystal structure of yeast RNA polymerase II encountering oxidative Cyclopurine DNA lesions 提交 2014-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, PH 5.9-6.3, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7% - 11.6% PEG6000
分辨率 3.96 Å R-free 0.296
4Y52 Crystal structure of 5-Carboxycytosine Recognition by RNA Polymerase II during Transcription Elongation. 提交 2015-02-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7-11.6%(w/v) PEG6000
分辨率 3.50 Å R-free 0.232
4Y7N The Structure Insight into 5-Carboxycytosine Recognition by RNA Polymerase II during Transcription Elongation. 提交 2015-02-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7-11.6%(w/v) PEG6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.250
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 AJ 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 BJ 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 CJ 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 DJ 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 EJ 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 FJ 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
5C3E Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 6000, Ammonium Acetate, Sodium Acetate, DTT
分辨率 3.70 Å R-free 0.220
5C44 Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 6000, Ammonium Acetate, Sodium Acetate, DTT
分辨率 3.95 Å R-free 0.236
5C4A Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；PEG 4000, POTASSIUM THIOCYANATE, MES, DTT
分辨率 4.20 Å R-free 0.242
5C4J Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 4000, SODIUM MALONATE, HEPES, DTT
分辨率 4.00 Å R-free 0.271
5C4X Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；PEG 4000, SODIUM CITRATE, MES, DTT
分辨率 4.00 Å R-free 0.227
5FJ8 Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III elongation complex at 3. 9 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 3.90 Å
5FJ9 Cryo-EM structure of yeast apo RNA polymerase III at 4.6 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 4.60 Å
5FJA Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III at 4.7 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT - FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 4.65 Å
5FMF the P-lobe of RNA polymerase II pre-initiation complex 提交 2015-11-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric
链 J 1–65（65 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES (PH7.6), 5 MM DTT, 2 MM MG(OAC)2,AND 40 MM KOAC；pH 7.6；20 MM HEPES (PH7.6), 5 MM DTT, 2 MM MG(OAC)2,AND 40 MM KOAC
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III,
分辨率 6.00 Å
5FYW Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening (OC) 提交 2016-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN - ETHANE. INSTRUMENT - FEI VITROBOT MARK IV. QUANTIFOIL R 3.5- 1 HOLEY CARBON GRIDS WERE GLOW-DISCHARGED BEFORE DEPOSITION OF 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE. GRIDS WERE THEN BLOTTED FOR 8.5 S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.35 Å
5FZ5 Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening (CC) 提交 2016-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 8.80 Å
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5IP7 Structure of RNA Polymerase II-Tfg1 peptide complex 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–65（65 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 6000, sodium acetate, ammonium acetate, hepes, tcep
分辨率 3.52 Å R-free 0.180
5IP9 Structure of RNA Polymerase II-TFIIF complex 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–65（65 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；peg 6000, sodium acetate, ammonium acetate, hepes, tcep
分辨率 3.90 Å R-free 0.194
5LMX Monomeric RNA polymerase I at 4.9 A resolution 提交 2016-08-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
5M3F Yeast RNA polymerase I elongation complex at 3.8A 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 3.80 Å
5M3M Free monomeric RNA polymerase I at 4.0A resolution 提交 2016-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 4.00 Å
5M5W RNA Polymerase I open complex 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 3.80 Å
5M5X RNA Polymerase I elongation complex 1 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot time for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M5Y RNA Polymerase I elongation complex 2 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M64 RNA Polymerase I elongation complex with A49 tandem winged helix domain 提交 2016-10-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.60 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5OQJ STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH 提交 2017-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE BLOTTED FOR 8 S AND PLUNGE-FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.70 Å
5OQM STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH AND CORE MEDIATOR 提交 2017-08-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：46-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 8 s and plunge-frozen in liquid ethane.
分辨率 5.80 Å
5OT2 RNA polymerase II elongation complex in the presence of 3d-Napht-A 提交 2017-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 AHW 2-ethyl-7-methoxy-naphthalene × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 300 mM sodium acetate, 50 mM HEPES pH 7.0, 5 mM TCEP
分辨率 3.20 Å R-free 0.222
5SVA Mediator-RNA Polymerase II Pre-Initiation Complex 提交 2016-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 15.30 Å
5U5Q 12 Subunit RNA Polymerase II at Room Temperature collected using SFX 提交 2016-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 6.3；289.65 K；21-22% PEG 400, 5% PEG 5%, 100 mM Ammonium Phosphate pH 6.3, 100 mM NaCl, 1 mM ZnCl2 and 10 mM DTT
分辨率 3.80 Å R-free 0.271
5VVR Ternary complex of RNA Pol II, transcription scaffold and Rad26 提交 2017-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5VVS RNA pol II elongation complex 提交 2017-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
5W4U Pol II elongation complex with an N6-methyladenine-containing template 提交 2017-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 10-12.5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.60 Å R-free 0.259
5W51 Pol II elongation complex with an N6-methyladenine-containing template and a matched UMPNPP 提交 2017-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 2KH 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]uridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 10-12.5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.254
5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6BLO Pol II elongation complex with an abasic lesion at i+1 position 提交 2017-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.227
6BLP Pol II elongation complex with an abasic lesion at i+1 position, soaking AMPCPP 提交 2017-11-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.257
6BM2 Pol II elongation complex with an abasic lesion at i-1 position 提交 2017-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.244
6BM4 Pol II elongation complex with an abasic lesion at i-1 position,soaking UMPNPP 提交 2017-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 2KH 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]uridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 2.95 Å R-free 0.260
6BQF Pol II elongation complex with 'dT-AP' at i+1, i-1 position 提交 2017-11-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.35 Å R-free 0.245
6CNB Yeast RNA polymerase III initial transcribing complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6CNC Yeast RNA polymerase III open complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6CND Yeast RNA polymerase III natural open complex (nOC) 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6CNF Yeast RNA polymerase III elongation complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6EU0 RNA Polymerase III open pre-initiation complex (OC-PIC) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6EU1 RNA Polymerase III - open DNA complex (OC-POL3). 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6EU2 Apo RNA Polymerase III - open conformation (oPOL3) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6EU3 Apo RNA Polymerase III - closed conformation (cPOL3) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6F40 RNA Polymerase III open complex 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6F41 RNA Polymerase III initially transcribing complex 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6F42 RNA Polymerase III closed complex CC1. 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6F44 RNA Polymerase III closed complex CC2. 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6GYK Structure of a yeast closed complex (core CC1) 提交 2018-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
6GYL Structure of a yeast closed complex with distorted DNA (core CCdist) 提交 2018-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6GYM Structure of a yeast closed complex with distorted DNA (CCdist) 提交 2018-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6H67 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) 提交 2018-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6H68 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) with fully-ordered A49 提交 2018-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6HKO Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.42 Å
6HLQ Yeast RNA polymerase I* elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLR Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP (core focused) 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLS Yeast apo RNA polymerase I* 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.21 Å
6I84 Structure of transcribing RNA polymerase II-nucleosome complex 提交 2018-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6O6C RNA polymerase II elongation complex arrested at a CPD lesion 提交 2019-03-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was manually wicked from the grid. 1.2 uL sample buffer was then applied to the streptavidin side. The grid was then blotted.
分辨率 3.10 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
6TUT Cryo-EM structure of the RNA Polymerase III-Maf1 complex 提交 2020-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES, 150 mM (NH4)2SO4, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 6, blot force 2
分辨率 3.25 Å
6UPX RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 1 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.266
6UPY RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 2E 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.282
6UPZ RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 3 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.269
6UQ0 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 4 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.56 Å R-free 0.278
6UQ1 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 6 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.287
6UQ2 RNA polymerase II elongation complex with dG in state 1 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.280
6UQ3 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 5 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.47 Å R-free 0.286
7KED RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.305
7KEE RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3, rNaMTP bound to E-site 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 WCG (1S)-1,4-anhydro-5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-1-(3-methoxynaphthalen-2-yl)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.45 Å R-free 0.302
7KEF RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3, rNaM in swing state 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 WC4 (1S)-1,4-anhydro-1-(3-methoxynaphthalen-2-yl)-5-O-phosphono-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.89 Å R-free 0.326
7NKX RNA polymerase II-Spt4/5-nucleosome-Chd1 structure 提交 2021-02-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NKY RNA Polymerase II-Spt4/5-nucleosome-FACT structure 提交 2021-02-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7O4I Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with initial transcription bubble 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7O4J Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex (consensus) 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7O72 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with closed promoter DNA 提交 2021-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7O73 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with closed distorted promoter DNA 提交 2021-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7O75 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7RIM RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 1 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 2.90 Å R-free 0.251
7RIP RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 1 soaked with CTP 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.261
7RIQ RNA polymerase II elongation complex scaffold 1 without polyamide 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.00 Å R-free 0.264
7RIW RNA polymerase II elongation complex scaffold 2, without polyamide 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.265
7RIX RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 2 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.268
7RIY RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 2 soaked with UTP 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.70 Å R-free 0.281
7UI9 Core Mediator-PICearly (Copy A) 提交 2022-03-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7UIF Mediator-PIC Early (Core B) 提交 2022-03-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
7UIO Mediator-PIC Early (Composite Model) 提交 2022-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：80-meric
链 AJ 1–70（70 aa）
链 BJ 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 THR THREONINE × 1 ALA ALANINE × 1 ASP ASPARTIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z0H Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.6 A (focus subunit AC40). 提交 2022-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7Z1L Structure of yeast RNA Polymerase III Pre-Termination Complex (PTC) 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7Z1M Structure of yeast RNA Polymerase III Elongation Complex (EC) 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7Z1N Structure of yeast RNA Polymerase III Delta C53-C37-C11 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7Z1O Structure of yeast RNA Polymerase III PTC + NTPs 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7Z2Z Structure of yeast RNA Polymerase III-DNA-Ty1 integrase complex (Pol III-DNA-IN1) at 3.1 A 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
7Z30 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.9 A (focus subunit C11 terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7Z31 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.7 A (focus subunit C11, no C11 C-terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
7ZS9 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome (complex A) 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7ZSA Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP (complex B) 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7ZSB Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP, complex C 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
8BWS Structure of yeast RNA Polymerase III elongation complex at 3.3 A 提交 2022-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8CEN Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator 提交 2023-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：46-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8CEO Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator and the +1 nucleosome 提交 2023-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：54-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8JCH Cryo-EM structure of yeast Rat1-bound Pol II pre-termination transcription complex 1 (Pol II Rat1-PTTC1) 提交 2023-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8K5P Cryo-EM structure of yeast Rat1-bound Pol II pre-termination transcription complex 2 (Pol II Rat1-PTTC2) 提交 2023-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8RAM Structure of Sen1 bound RNA Polymerase II pre-termination complex 提交 2023-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8RAP Structure of Sen1-ADP.BeF3 bound RNA Polymerase II pre-termination complex 提交 2023-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8UKQ RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion in apo state 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：13-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13 % (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.50 Å R-free 0.302
8UKR RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion soaking with ATP before chemistry 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.78 Å R-free 0.310
8UKS RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion soaking with CTP before chemistry 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 8 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.40 Å R-free 0.301
8UKT RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion with AMP added 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：13-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.60 Å R-free 0.289
8UKU RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion with CMP added 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.60 Å R-free 0.301
8UOQ Composite map of PIC_delta_TFIIK form2 提交 2023-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8UOT Composite map of PICdeltaTFIIK form1 提交 2023-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES PH 7.6 50 mM KOAc 5 mM DTT 2 mM MgOAc
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9G1V Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.70 Å
9G1X Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 11-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：14-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G23 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at A-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G24 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at E-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G26 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, closed state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G27 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, pre-translocation state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.80 Å
9G29 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site with the C-terminal of A12 in the funnel 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.30 Å
9G2B Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 12-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.20 Å
9G2C Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, open state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9JA1 The RNA polymerase II elongation complex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-08-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tetradecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
9K7F RNA polymerase II elongation complex apo structure. 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
9KD7 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-1 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
9KD8 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-2 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.46 Å
9KD9 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-5 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9KDN The structure of 1 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 2 CTG repeats. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
9KDO The structure of 2 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 3 CTG repeats 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
9KDQ The structure of 3 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 4 CTG repeats. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
9N5B RNA polymerase II elongation complex containing 8-oxoG at +1 site, apo form 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.256
9N5C RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, CMPCPP-bound 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.297
9N5D RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, CMP added 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.35 Å R-free 0.300
9N5E RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, AMPCPP in E-site 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.75 Å R-free 0.291
9N5F RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG in syn-conformation with added AMP 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.281
9N5G RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, ATP in both A- and E-site 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.15 Å R-free 0.254
9PVV RNA polymerase II elongation complex with dC at +1 site, 8-oxo-GTP bound in A-site. 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.48 Å R-free 0.258
9PVW RNA polymerase II elongation complex with dA at +1 site, 8-oxo-GMP added in Syn-conformation 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.56 Å R-free 0.288
9PVX RNA polymerase II elongation complex with dA at +1 site, 8-oxo-GTP bound in E-site. 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.39 Å R-free 0.236
9QEB CryoEM structure of transcribing RNA polymerase II elongation complex 提交 2025-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.26 Å
9RYB CryoEM structure of transcribing RNA polymerase II elongation complex in post-catalysis state 提交 2025-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 1 DPO DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.33 Å

共 263 个其他 PDB 条目、276 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RPAB5_YEAST
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–70； UniProt 1–70

DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P28000

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 K； UniProt 1–142 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190 × 1 （P10964） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135 × 1 （P22138） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 （P07703） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14 × 1 （P50106） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 × 1 （P46669） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12 × 1 （P32529） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 × 1 （Q01080） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34 × 1 （P47006） RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3 × 1 （P36070） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 Z 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C3H Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.27 A resolution, crystal form C2-93 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 24% ETHYLENGLYCOL, 0.1M MES PH 6.8
分辨率 3.27 Å R-free 0.226
4C3I Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.0 A resolution, crystal form C2-100 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL PH 7.4
分辨率 3.00 Å R-free 0.231
4C3J Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.35 A resolution, crystal form C2-90 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL, PH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.220
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 AK 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 BK 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 CK 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 DK 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 EK 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 FK 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
5FJ8 Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III elongation complex at 3. 9 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 3.90 Å
5FJ9 Cryo-EM structure of yeast apo RNA polymerase III at 4.6 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 4.60 Å
5FJA Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III at 4.7 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT - FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 4.65 Å
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5LMX Monomeric RNA polymerase I at 4.9 A resolution 提交 2016-08-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
5M3F Yeast RNA polymerase I elongation complex at 3.8A 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 3.80 Å
5M3M Free monomeric RNA polymerase I at 4.0A resolution 提交 2016-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 4.00 Å
5M5W RNA Polymerase I open complex 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 3.80 Å
5M5X RNA Polymerase I elongation complex 1 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot time for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M5Y RNA Polymerase I elongation complex 2 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M64 RNA Polymerase I elongation complex with A49 tandem winged helix domain 提交 2016-10-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.60 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6CNB Yeast RNA polymerase III initial transcribing complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6CNC Yeast RNA polymerase III open complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6CND Yeast RNA polymerase III natural open complex (nOC) 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6CNF Yeast RNA polymerase III elongation complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6EU0 RNA Polymerase III open pre-initiation complex (OC-PIC) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6EU1 RNA Polymerase III - open DNA complex (OC-POL3). 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6EU2 Apo RNA Polymerase III - open conformation (oPOL3) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6EU3 Apo RNA Polymerase III - closed conformation (cPOL3) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6F40 RNA Polymerase III open complex 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6F41 RNA Polymerase III initially transcribing complex 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6F42 RNA Polymerase III closed complex CC1. 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6F44 RNA Polymerase III closed complex CC2. 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6H67 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) 提交 2018-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6H68 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) with fully-ordered A49 提交 2018-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6HKO Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.42 Å
6HLQ Yeast RNA polymerase I* elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLR Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP (core focused) 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLS Yeast apo RNA polymerase I* 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.21 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
6TUT Cryo-EM structure of the RNA Polymerase III-Maf1 complex 提交 2020-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES, 150 mM (NH4)2SO4, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 6, blot force 2
分辨率 3.25 Å
7Z0H Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.6 A (focus subunit AC40). 提交 2022-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7Z1L Structure of yeast RNA Polymerase III Pre-Termination Complex (PTC) 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7Z1M Structure of yeast RNA Polymerase III Elongation Complex (EC) 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7Z1N Structure of yeast RNA Polymerase III Delta C53-C37-C11 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7Z1O Structure of yeast RNA Polymerase III PTC + NTPs 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7Z2Z Structure of yeast RNA Polymerase III-DNA-Ty1 integrase complex (Pol III-DNA-IN1) at 3.1 A 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
7Z30 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.9 A (focus subunit C11 terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7Z31 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.7 A (focus subunit C11, no C11 C-terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
8BWS Structure of yeast RNA Polymerase III elongation complex at 3.3 A 提交 2022-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9G1V Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.70 Å
9G1X Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 11-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：14-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G23 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at A-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G24 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at E-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G26 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, closed state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G27 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, pre-translocation state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.80 Å
9G29 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site with the C-terminal of A12 in the funnel 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.30 Å
9G2B Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 12-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.20 Å
9G2C Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, open state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 K 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å

共 69 个其他 PDB 条目、75 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAC2_YEAST
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P40422

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 L； UniProt 1–70 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190 × 1 （P10964） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135 × 1 （P22138） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 （P07703） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14 × 1 （P50106） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 × 1 （P46669） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12 × 1 （P32529） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 （P28000） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 × 1 （Q01080） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34 × 1 （P47006） RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3 × 1 （P36070） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1I3Q RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM I AT 3.1 A RESOLUTION 提交 2001-02-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammoniumhydrogenphosphate, Sodiumdihydrogenphosphate, dioxane, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
1I50 RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM II AT 2.8 A RESOLUTION 提交 2001-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUMHYDROGENPHOSPHATE, SODIUMDIHYDROGENPHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1I50 RNA POLYMERASE II CRYSTAL FORM II AT 2.8 A RESOLUTION 提交 2001-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUMHYDROGENPHOSPHATE, SODIUMDIHYDROGENPHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1I6H RNA POLYMERASE II ELONGATION COMPLEX 提交 2001-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 100K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
1K83 Crystal Structure of Yeast RNA Polymerase II Complexed with the Inhibitor Alpha Amanitin 提交 2001-10-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PH 6.00
分辨率 2.80 Å R-free 0.280
1NIK Wild Type RNA Polymerase II 提交 2002-12-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.3；291 K；peg400, peg 6K, NaCl, Dioaxne, ZnCl2, Ammonium phosphate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 6.30
分辨率 4.10 Å R-free 0.360
1NT9 Complete 12-subunit RNA polymerase II 提交 2003-01-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；PEG 20000, ammonium sodium phosphate, sodium chloride, dioxane, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 4.20 Å
1PQV RNA polymerase II-TFIIS complex 提交 2003-06-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；sodium-ammonium tartrate, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.80 Å
1R5U RNA POLYMERASE II TFIIB COMPLEX 提交 2003-10-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；ammonium sulfate, MES, NaCl, CdCl2, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.50 Å R-free 0.373
1R9S RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX, MATCHED NUCLEOTIDE 提交 2003-10-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammonium hydrogen phosphate, sodium dihydrogen phosphate, dioxane, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.25 Å R-free 0.398
1R9T RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX, MISMATCHED NUCLEOTIDE 提交 2003-10-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, Ammonium hydrogen phosphate, sodium dihydrogen phosphate, dioxane, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.317
1SFO RNA POLYMERASE II STRAND SEPARATED ELONGATION COMPLEX 提交 2004-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, ammonium sodium phosphate, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.61 Å R-free 0.343
1TWA RNA polymerase II complexed with ATP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.246
1TWC RNA polymerase II complexed with GTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
1TWF RNA polymerase II complexed with UTP at 2.3 A resolution 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1TWF RNA polymerase II complexed with UTP at 2.3 A resolution 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 4 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 8 ZN ZINC ION × 32 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWG RNA polymerase II complexed with CTP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 ZN ZINC ION × 16 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.281
1TWH RNA polymerase II complexed with 2'dATP 提交 2004-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 6000, AMMONIUM HYDROGEN PHOSPHATE, SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE, DIOXANE, DTT, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.262
1WCM Complete 12-Subunit RNA Polymerase II at 3.8 Angstrom 提交 2004-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.80 Å R-free 0.285
1Y1V Refined RNA Polymerase II-TFIIS complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.80 Å R-free 0.294
1Y1W Complete RNA Polymerase II elongation complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.00 Å R-free 0.276
1Y1Y RNA Polymerase II-TFIIS-DNA/RNA complex 提交 2004-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.00 Å
1Y77 Complete RNA Polymerase II elongation complex with substrate analogue GMPCPP 提交 2004-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.50 Å
2B63 Complete RNA Polymerase II-RNA inhibitor complex 提交 2005-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes (pH 7.0), 5% PEG 6000, and 5 mM TCEP
分辨率 3.80 Å R-free 0.273
2B8K 12-subunit RNA Polymerase II 提交 2005-10-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 4.15 Å
2E2H RNA polymerase II elongation complex at 5 mM Mg2+ with GTP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.95 Å R-free 0.368
2E2I RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with 2'-dGTP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.41 Å R-free 0.316
2E2J RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with GMPCPP 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.306
2JA5 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex A 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.00
分辨率 3.80 Å R-free 0.280
2JA6 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex B 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 4.00 Å R-free 0.301
2JA7 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex C 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.275
2JA7 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex C 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 X 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.275
2JA8 CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex D 提交 2006-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.288
2NVQ RNA Polymerase II Elongation Complex in 150 mM Mg+2 with 2'dUTP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 DUT DEOXYURIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200mM NH4OAc, 150mM Mg(OAc)2, 50mM Hepes, pH 7.0, 5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.283
2NVT RNA Polymerase II Elongation Complex in 150 mM Mg+2 with GMPCPP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200mM NH4OAc, 150mM Mg(OAc)2, 50mM Hepes, pH 7.0, 5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.36 Å R-free 0.283
2NVX RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with 2'-dUTP 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 DUT DEOXYURIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.60 Å R-free 0.304
2NVY RNA Polymerase II form II in 150 mM Mn+2 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.323
2NVY RNA Polymerase II form II in 150 mM Mn+2 提交 2006-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.323
2NVZ RNA Polymerase II elongation complex with UTP, updated 11/2006 提交 2006-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.30 Å R-free 0.332
2R7Z Cisplatin lesion containing RNA polymerase II elongation complex 提交 2007-09-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 CPT Cisplatin × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5% (v/v) PEG 6000, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.80 Å R-free 0.240
2R92 Elongation complex of RNA polymerase II with artificial RdRP scaffold 提交 2007-09-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；5% (w/v) PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K, pH 7.00
分辨率 3.80 Å R-free 0.246
2R93 Elongation complex of RNA polymerase II with a hepatitis delta virus-derived RNA stem loop 提交 2007-09-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；5% (w/v) PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 150 mM magnesium acetate, 50 mM Hepes pH 7.0, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 4.00 Å R-free 0.241
2VUM Alpha-amanitin inhibited complete RNA polymerase II elongation complex 提交 2008-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 50 MM HEPES PH 7.0, 4-7% PEG 6000, 5 MM TCEP
分辨率 3.40 Å R-free 0.288
2YU9 RNA polymerase II elongation complex in 150 mm MG+2 with UTP 提交 2007-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；200MM NH4OAC, 150MM MG(OAC)2, 50MM HEPES, PH 7.0, 5% PEG6000, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.344
3CQZ Crystal structure of 10 subunit RNA polymerase II in complex with the inhibitor alpha-amanitin 提交 2008-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.273
3FKI 12-Subunit RNA Polymerase II Refined with Zn-SAD data 提交 2008-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；5-7% PEG 4000, 50 mM HEPES pH 7.0, 10 mM DTT, 70 mM glucosamine, 50 mM dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.88 Å R-free 0.301
3GTG Backtracked RNA polymerase II complex with 12mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 7.7 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.78 Å R-free 0.300
3GTJ Backtracked RNA polymerase II complex with 13mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 7.7 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.42 Å R-free 0.292
3GTK Backtracked RNA polymerase II complex with 18mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 7.7 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.278
3GTL Backtracked RNA polymerase II complex with 13mer with G<>U mismatch 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 7.7 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.38 Å R-free 0.322
3GTM Co-complex of Backtracked RNA polymerase II with TFIIS 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tetradecameric
链 L 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 7.7 kDa polypeptide
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.289
3GTO Backtracked RNA polymerase II complex with 15mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 7.7 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.00 Å R-free 0.290
3GTP Backtracked RNA polymerase II complex with 24mer RNA 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 7.7 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.90 Å R-free 0.299
3GTQ Backtracked RNA polymerase II complex induced by damage 提交 2009-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa） 片段：DNA-directed RNA polymerases I, II, and III 7.7 kDa polypeptide
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM Dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.80 Å R-free 0.335
3H3V Yeast RNAP II containing poly(A)-signal sequence in the active site 提交 2009-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 M 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；200 mM ammonium acetate, 50mM HEPES pH 7.0, 4% polyethylene glycol 6000, 5mM TCEP (tris (2-carboxyethyl) phosphine hydrochloride), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0 K
分辨率 4.00 Å R-free 0.241
3HOU Complete RNA polymerase II elongation complex I with a T-U mismatch 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.252
3HOU Complete RNA polymerase II elongation complex I with a T-U mismatch 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 X 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.252
3HOV Complete RNA polymerase II elongation complex II 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE,, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.50 Å R-free 0.226
3HOW Complete RNA polymerase II elongation complex III with a T-U mismatch and a frayed RNA 3'-uridine 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.60 Å R-free 0.254
3HOX Complete RNA polymerase II elongation complex V 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.65 Å R-free 0.250
3HOY Complete RNA polymerase II elongation complex VI 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.40 Å R-free 0.254
3HOZ Complete RNA polymerase II elongation complex IV with a T-U mismatch and a frayed RNA 3'-guanine 提交 2009-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；20mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 4-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.65 Å R-free 0.253
3I4M 8-oxoguanine containing RNA polymerase II elongation complex D 提交 2009-07-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 50mM Hepes, 4%(w/v) PEG 6000, 5mM TCEP, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.70 Å R-free 0.258
3I4N 8-oxoguanine containing RNA polymerase II elongation complex E 提交 2009-07-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；5%(w/v) PEG 6000, 200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 50mM Hepes, 5mM TCEP , pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.90 Å R-free 0.266
3J1N Cryo-EM map of a yeast minimal preinitiation complex interacting with the Mediator Head module 提交 2012-03-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 mM KCl, 25 mM Tris-HCl, 10 mM DTT；pH 8；25 mM KCl, 25 mM Tris-HCl, 10 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 Blot for ~2 sec before plunging；77 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for approximately 2 seconds before plunging into liquid ethane.
分辨率 16.00 Å
3K1F Crystal structure of RNA Polymerase II in complex with TFIIB 提交 2009-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；800 mM sodium ammonium tartrate, 100 mM HEPES pH 7.5, 5 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.30 Å R-free 0.255
3K7A Crystal Structure of an RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2009-10-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；295 K；1.2 M sodium/potassium phosphate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.80 Å R-free 0.313
3M3Y RNA polymerase II elongation complex C 提交 2010-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 C7P cis-diammine(pyridine)chloroplatinum(II) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6,000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.18 Å R-free 0.255
3M4O RNA polymerase II elongation complex B 提交 2010-03-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 C7P cis-diammine(pyridine)chloroplatinum(II) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-11% PEG6,000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.57 Å R-free 0.292
3PO2 Arrested RNA Polymerase II elongation complex 提交 2010-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG6000, 50mM HEPES pH 7.0, 200mM ammonium acetate, 300mM sodium acetate, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.178
3PO3 Arrested RNA Polymerase II reactivation intermediate 提交 2010-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG6000, 50mM HEPES pH 7.0, 200mM AMMONIUM ACETATE, 300mM SODIUM ACETATE, 5mM TCEP , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.189
3QT1 RNA polymerase II variant containing A Chimeric RPB9-C11 subunit 提交 2011-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；200mM ammonium acetate, 300mM SODIUM ACETATE, 50mM Hepes pH 7.0, 5-6% PEG 6000, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 4.30 Å R-free 0.281
3RZD RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA 提交 2011-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.30 Å R-free 0.230
3RZO RNA Polymerase II Initiation Complex with a 4-nt RNA 提交 2011-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.00 Å R-free 0.236
3S14 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 6-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 2.85 Å R-free 0.227
3S15 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 7-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.228
3S16 RNA Polymerase II Initiation Complex with an 8-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.24 Å R-free 0.227
3S17 RNA Polymerase II Initiation Complex with a 9-nt RNA 提交 2011-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.9, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.20 Å R-free 0.236
3S1M RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA (variant 1) 提交 2011-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.13 Å R-free 0.233
3S1N RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA (variant 2) 提交 2011-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.232
3S1Q RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt 3'-deoxy RNA soaked with ATP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION
分辨率 3.30 Å R-free 0.229
3S1R RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt 3'-deoxy RNA soaked with GTP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6.000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.226
3S2D RNA Polymerase II Initiation Complex with a 5-nt RNA containing a 5Br-U 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.231
3S2H RNA Polymerase II Initiation Complex with a 6-nt RNA containing a 2[prime]-iodo ATP 提交 2011-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 5.9-6.1, 50mM dioxane, 9-11% PEG 6,000, 15mM DTT, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.240
4A3B RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 4nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.197
4A3C RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 5nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.184
4A3D RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 6nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.40 Å R-free 0.186
4A3E RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 5nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.40 Å R-free 0.188
4A3F RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 6nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.185
4A3G RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 2nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.194
4A3I RNA Polymerase II binary complex with DNA 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.80 Å R-free 0.191
4A3J RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 2nt DNA-RNA hybrid and soaked with GMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7
分辨率 3.70 Å R-free 0.194
4A3K RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 7nt DNA-RNA hybrid 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.50 Å R-free 0.185
4A3L RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 7nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.50 Å R-free 0.187
4A3M RNA Polymerase II initial transcribing complex with a 4nt DNA-RNA hybrid and soaked with AMPCPP 提交 2011-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7
分辨率 3.90 Å R-free 0.190
4A93 RNA Polymerase II elongation complex containing a CPD Lesion 提交 2011-11-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；4-7% PEG 6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP.
分辨率 3.40 Å R-free 0.199
4BBR Structure of RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2012-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.40 Å R-free 0.211
4BBS Structure of an initially transcribing RNA polymerase II-TFIIB complex 提交 2012-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.60 Å R-free 0.225
4BXX Arrested RNA polymerase II-Bye1 complex 提交 2013-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.28 Å R-free 0.208
4BXZ RNA Polymerase II-Bye1 complex 提交 2013-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；750 MM TRI-SODIUM CITRATE, 100 MM HEPES PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 4.80 Å R-free 0.253
4BY1 elongating RNA Polymerase II-Bye1 TLD complex soaked with AMPCPP 提交 2013-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.60 Å R-free 0.206
4BY7 elongating RNA Polymerase II-Bye1 TLD complex 提交 2013-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；5-7% PEG6000, 50 MM HEPES PH 7.0, 200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 5 MM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293 K
分辨率 3.15 Å R-free 0.212
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 1 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C3H Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.27 A resolution, crystal form C2-93 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 24% ETHYLENGLYCOL, 0.1M MES PH 6.8
分辨率 3.27 Å R-free 0.226
4C3I Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.0 A resolution, crystal form C2-100 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL PH 7.4
分辨率 3.00 Å R-free 0.231
4C3J Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.35 A resolution, crystal form C2-90 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL, PH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.220
4V1M Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 6.60 Å
4V1N Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 7.80 Å
4V1O Architecture of the RNA polymerase II-Mediator core transcription initiation complex 提交 2014-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 180 MM POTASSIUM ACETATE, 5 % GLYCEROL, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE GLOW- DISCHARGED FOR 20 S BEFORE DEPOSITION OF 4 MICROLITERS SAMPLE AND INCUBATED FOR 30 S. GRIDS WERE WASHED TWICE WITH 4 MICROLITERS DISTILLED WATER, BLOTTED, AND VITRIFIED BY PLUNGING INTO LIQUID ETHANE WITH A MANUAL PLUNGER.
分辨率 9.70 Å
4X67 Crystal structure of elongating yeast RNA polymerase II stalled at oxidative Cyclopurine DNA lesions. 提交 2014-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, PH 5.9-6.3, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7% - 11.6% PEG6000
分辨率 4.10 Å R-free 0.289
4X6A Crystal structure of yeast RNA polymerase II encountering oxidative Cyclopurine DNA lesions 提交 2014-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, PH 5.9-6.3, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7% - 11.6% PEG6000
分辨率 3.96 Å R-free 0.296
4Y52 Crystal structure of 5-Carboxycytosine Recognition by RNA Polymerase II during Transcription Elongation. 提交 2015-02-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7-11.6%(w/v) PEG6000
分辨率 3.50 Å R-free 0.232
4Y7N The Structure Insight into 5-Carboxycytosine Recognition by RNA Polymerase II during Transcription Elongation. 提交 2015-02-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；390 mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.0, 50 mM dioxane, 10 mM DTT, and 10.7-11.6%(w/v) PEG6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.250
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 AL 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 BL 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 CL 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 DL 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 EL 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 FL 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
5C3E Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 6000, Ammonium Acetate, Sodium Acetate, DTT
分辨率 3.70 Å R-free 0.220
5C44 Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 6000, Ammonium Acetate, Sodium Acetate, DTT
分辨率 3.95 Å R-free 0.236
5C4A Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；PEG 4000, POTASSIUM THIOCYANATE, MES, DTT
分辨率 4.20 Å R-free 0.242
5C4J Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；PEG 4000, SODIUM MALONATE, HEPES, DTT
分辨率 4.00 Å R-free 0.271
5C4X Crystal structure of a transcribing RNA Polymerase II complex reveals a complete transcription bubble 提交 2015-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；PEG 4000, SODIUM CITRATE, MES, DTT
分辨率 4.00 Å R-free 0.227
5FJ8 Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III elongation complex at 3. 9 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT, 5MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 3.90 Å
5FJ9 Cryo-EM structure of yeast apo RNA polymerase III at 4.6 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 4.60 Å
5FJA Cryo-EM structure of yeast RNA polymerase III at 4.7 A 提交 2015-10-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT；pH 7.5；150MM (NH4)2SO4, 15MM TRIS, 10MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT - FEI VITROBOT MARK III, METHOD- 2.5 UL OF SAMPLE WAS APPLIED 15 SECONDS WAIT TIME BLOT FOR 9 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 4.65 Å
5FMF the P-lobe of RNA polymerase II pre-initiation complex 提交 2015-11-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric
链 L 25–70（46 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM HEPES (PH7.6), 5 MM DTT, 2 MM MG(OAC)2,AND 40 MM KOAC；pH 7.6；20 MM HEPES (PH7.6), 5 MM DTT, 2 MM MG(OAC)2,AND 40 MM KOAC
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III,
分辨率 6.00 Å
5FYW Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening (OC) 提交 2016-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN - ETHANE. INSTRUMENT - FEI VITROBOT MARK IV. QUANTIFOIL R 3.5- 1 HOLEY CARBON GRIDS WERE GLOW-DISCHARGED BEFORE DEPOSITION OF 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE. GRIDS WERE THEN BLOTTED FOR 8.5 S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.35 Å
5FZ5 Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening (CC) 提交 2016-03-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT；pH 7.5；25 MM HEPES-KOH PH 7.5, 150 MM POTASSIUM ACETATE, 2 MM MGCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 8.80 Å
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5IP7 Structure of RNA Polymerase II-Tfg1 peptide complex 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 L 25–70（46 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 6000, sodium acetate, ammonium acetate, hepes, tcep
分辨率 3.52 Å R-free 0.180
5IP9 Structure of RNA Polymerase II-TFIIF complex 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 L 25–70（46 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；peg 6000, sodium acetate, ammonium acetate, hepes, tcep
分辨率 3.90 Å R-free 0.194
5LMX Monomeric RNA polymerase I at 4.9 A resolution 提交 2016-08-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
5M3F Yeast RNA polymerase I elongation complex at 3.8A 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 3.80 Å
5M3M Free monomeric RNA polymerase I at 4.0A resolution 提交 2016-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 4.00 Å
5M5W RNA Polymerase I open complex 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 3.80 Å
5M5X RNA Polymerase I elongation complex 1 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot time for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M5Y RNA Polymerase I elongation complex 2 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M64 RNA Polymerase I elongation complex with A49 tandem winged helix domain 提交 2016-10-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.60 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5OQJ STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH 提交 2017-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；GRIDS WERE BLOTTED FOR 8 S AND PLUNGE-FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.70 Å
5OQM STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH AND CORE MEDIATOR 提交 2017-08-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：46-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 8 s and plunge-frozen in liquid ethane.
分辨率 5.80 Å
5OT2 RNA polymerase II elongation complex in the presence of 3d-Napht-A 提交 2017-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 AHW 2-ethyl-7-methoxy-naphthalene × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；4-7% PEG 6000, 200 mM ammonium acetate, 300 mM sodium acetate, 50 mM HEPES pH 7.0, 5 mM TCEP
分辨率 3.20 Å R-free 0.222
5SVA Mediator-RNA Polymerase II Pre-Initiation Complex 提交 2016-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 15.30 Å
5U5Q 12 Subunit RNA Polymerase II at Room Temperature collected using SFX 提交 2016-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 6.3；289.65 K；21-22% PEG 400, 5% PEG 5%, 100 mM Ammonium Phosphate pH 6.3, 100 mM NaCl, 1 mM ZnCl2 and 10 mM DTT
分辨率 3.80 Å R-free 0.271
5VVR Ternary complex of RNA Pol II, transcription scaffold and Rad26 提交 2017-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5VVS RNA pol II elongation complex 提交 2017-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
5W4U Pol II elongation complex with an N6-methyladenine-containing template 提交 2017-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 10-12.5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.60 Å R-free 0.259
5W51 Pol II elongation complex with an N6-methyladenine-containing template and a matched UMPNPP 提交 2017-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 2KH 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]uridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 10-12.5% PEG6000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.254
5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6BLO Pol II elongation complex with an abasic lesion at i+1 position 提交 2017-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.227
6BLP Pol II elongation complex with an abasic lesion at i+1 position, soaking AMPCPP 提交 2017-11-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.257
6BM2 Pol II elongation complex with an abasic lesion at i-1 position 提交 2017-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.244
6BM4 Pol II elongation complex with an abasic lesion at i-1 position,soaking UMPNPP 提交 2017-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 2KH 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]uridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 2.95 Å R-free 0.260
6BQF Pol II elongation complex with 'dT-AP' at i+1, i-1 position 提交 2017-11-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 50mM dioxane, 10mM DTT, 9-12% PEG6000
分辨率 3.35 Å R-free 0.245
6CNB Yeast RNA polymerase III initial transcribing complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6CNC Yeast RNA polymerase III open complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6CND Yeast RNA polymerase III natural open complex (nOC) 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6CNF Yeast RNA polymerase III elongation complex 提交 2018-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6EU0 RNA Polymerase III open pre-initiation complex (OC-PIC) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6EU1 RNA Polymerase III - open DNA complex (OC-POL3). 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6EU2 Apo RNA Polymerase III - open conformation (oPOL3) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6EU3 Apo RNA Polymerase III - closed conformation (cPOL3) 提交 2017-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6F40 RNA Polymerase III open complex 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6F41 RNA Polymerase III initially transcribing complex 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6F42 RNA Polymerase III closed complex CC1. 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6F44 RNA Polymerase III closed complex CC2. 提交 2017-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6GYK Structure of a yeast closed complex (core CC1) 提交 2018-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
6GYL Structure of a yeast closed complex with distorted DNA (core CCdist) 提交 2018-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6GYM Structure of a yeast closed complex with distorted DNA (CCdist) 提交 2018-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：31-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6H67 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) 提交 2018-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6H68 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) with fully-ordered A49 提交 2018-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6HKO Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.42 Å
6HLQ Yeast RNA polymerase I* elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLR Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP (core focused) 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.18 Å
6HLS Yeast apo RNA polymerase I* 提交 2018-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.21 Å
6I84 Structure of transcribing RNA polymerase II-nucleosome complex 提交 2018-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6O6C RNA polymerase II elongation complex arrested at a CPD lesion 提交 2019-03-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was manually wicked from the grid. 1.2 uL sample buffer was then applied to the streptavidin side. The grid was then blotted.
分辨率 3.10 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
6TUT Cryo-EM structure of the RNA Polymerase III-Maf1 complex 提交 2020-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES, 150 mM (NH4)2SO4, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 6, blot force 2
分辨率 3.25 Å
6UPX RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 1 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.266
6UPY RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 2E 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.282
6UPZ RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 3 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.269
6UQ0 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 4 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.56 Å R-free 0.278
6UQ1 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 6 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.287
6UQ2 RNA polymerase II elongation complex with dG in state 1 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.280
6UQ3 RNA polymerase II elongation complex with 5-guanidinohydantoin lesion in state 5 提交 2019-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.47 Å R-free 0.286
7KED RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.305
7KEE RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3, rNaMTP bound to E-site 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 WCG (1S)-1,4-anhydro-5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-1-(3-methoxynaphthalen-2-yl)-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.45 Å R-free 0.302
7KEF RNA polymerase II elongation complex with unnatural base dTPT3, rNaM in swing state 提交 2020-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 WC4 (1S)-1,4-anhydro-1-(3-methoxynaphthalen-2-yl)-5-O-phosphono-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.89 Å R-free 0.326
7NKX RNA polymerase II-Spt4/5-nucleosome-Chd1 structure 提交 2021-02-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NKY RNA Polymerase II-Spt4/5-nucleosome-FACT structure 提交 2021-02-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7O4I Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with initial transcription bubble 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7O4J Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex (consensus) 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7O72 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with closed promoter DNA 提交 2021-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7O73 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with closed distorted promoter DNA 提交 2021-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7O75 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-04-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7RIM RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 1 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 2.90 Å R-free 0.251
7RIP RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 1 soaked with CTP 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.261
7RIQ RNA polymerase II elongation complex scaffold 1 without polyamide 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.00 Å R-free 0.264
7RIW RNA polymerase II elongation complex scaffold 2, without polyamide 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.20 Å R-free 0.265
7RIX RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 2 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.40 Å R-free 0.268
7RIY RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 2 soaked with UTP 提交 2021-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 5N0 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.70 Å R-free 0.281
7UI9 Core Mediator-PICearly (Copy A) 提交 2022-03-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7UIF Mediator-PIC Early (Core B) 提交 2022-03-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
7UIO Mediator-PIC Early (Composite Model) 提交 2022-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：80-meric
链 AL 1–70（70 aa）
链 BL 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 THR THREONINE × 1 ALA ALANINE × 1 ASP ASPARTIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z0H Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.6 A (focus subunit AC40). 提交 2022-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 L 27–70（44 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7Z1L Structure of yeast RNA Polymerase III Pre-Termination Complex (PTC) 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7Z1M Structure of yeast RNA Polymerase III Elongation Complex (EC) 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7Z1N Structure of yeast RNA Polymerase III Delta C53-C37-C11 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7Z1O Structure of yeast RNA Polymerase III PTC + NTPs 提交 2022-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 1N7 CHAPSO × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7Z2Z Structure of yeast RNA Polymerase III-DNA-Ty1 integrase complex (Pol III-DNA-IN1) at 3.1 A 提交 2022-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric
链 L 27–70（44 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
7Z30 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.9 A (focus subunit C11 terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 L 27–70（44 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7Z31 Structure of yeast RNA Polymerase III-Ty1 integrase complex at 2.7 A (focus subunit C11, no C11 C-terminal Zn-ribbon in the funnel pore). 提交 2022-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric
链 L 27–70（44 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
7ZS9 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome (complex A) 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7ZSA Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP (complex B) 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7ZSB Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP, complex C 提交 2022-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
8BWS Structure of yeast RNA Polymerase III elongation complex at 3.3 A 提交 2022-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8CEN Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator 提交 2023-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：46-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8CEO Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator and the +1 nucleosome 提交 2023-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：54-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8JCH Cryo-EM structure of yeast Rat1-bound Pol II pre-termination transcription complex 1 (Pol II Rat1-PTTC1) 提交 2023-05-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8K5P Cryo-EM structure of yeast Rat1-bound Pol II pre-termination transcription complex 2 (Pol II Rat1-PTTC2) 提交 2023-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8RAM Structure of Sen1 bound RNA Polymerase II pre-termination complex 提交 2023-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8RAP Structure of Sen1-ADP.BeF3 bound RNA Polymerase II pre-termination complex 提交 2023-12-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8UKQ RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion in apo state 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：13-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13 % (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.50 Å R-free 0.302
8UKR RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion soaking with ATP before chemistry 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.78 Å R-free 0.310
8UKS RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion soaking with CTP before chemistry 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 8 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.40 Å R-free 0.301
8UKT RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion with AMP added 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：13-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.60 Å R-free 0.289
8UKU RNA polymerase II elongation complex with Fapy-dG lesion with CMP added 提交 2023-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；390 mM ammonium phosphate (pH 6.0), 5 mM DTT, 5 mM dioxane, and 9-13% (w/v) PEG 6,000
分辨率 3.60 Å R-free 0.301
8UOQ Composite map of PIC_delta_TFIIK form2 提交 2023-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8UOT Composite map of PICdeltaTFIIK form1 提交 2023-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：30-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES PH 7.6 50 mM KOAc 5 mM DTT 2 mM MgOAc
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9G1V Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.70 Å
9G1X Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 11-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：14-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G23 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at A-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G24 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at E-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G26 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, closed state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G27 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, pre-translocation state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.80 Å
9G29 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site with the C-terminal of A12 in the funnel 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.30 Å
9G2B Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, 12-subunit 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.20 Å
9G2C Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, open state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9JA1 The RNA polymerase II elongation complex from Saccharomyces cerevisiae 提交 2024-08-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tetradecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
9K7F RNA polymerase II elongation complex apo structure. 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
9KD7 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-1 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
9KD8 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-2 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.46 Å
9KD9 The structure of RNA polymerase II elongation complex paused at N-5 state by actinomycin D. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9KDN The structure of 1 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 2 CTG repeats. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
9KDO The structure of 2 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 3 CTG repeats 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
9KDQ The structure of 3 ACTD bound to RNA polymerase II elongation complex with 4 CTG repeats. 提交 2024-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
9N5B RNA polymerase II elongation complex containing 8-oxoG at +1 site, apo form 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.10 Å R-free 0.256
9N5C RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, CMPCPP-bound 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.297
9N5D RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, CMP added 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 PPV PYROPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.35 Å R-free 0.300
9N5E RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, AMPCPP in E-site 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.75 Å R-free 0.291
9N5F RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG in syn-conformation with added AMP 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.60 Å R-free 0.281
9N5G RNA polymerase II elongation complex with 8-oxoG at +1 site, ATP in both A- and E-site 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；390mM (NH4)2HPO4/NaH2PO4, pH 6.5, 5mM dioxane, 5mM DTT, 10-12% PEG6000
分辨率 3.15 Å R-free 0.254
9PVV RNA polymerase II elongation complex with dC at +1 site, 8-oxo-GTP bound in A-site. 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.48 Å R-free 0.258
9PVW RNA polymerase II elongation complex with dA at +1 site, 8-oxo-GMP added in Syn-conformation 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.56 Å R-free 0.288
9PVX RNA polymerase II elongation complex with dA at +1 site, 8-oxo-GTP bound in E-site. 提交 2025-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.39 Å R-free 0.236
9QEB CryoEM structure of transcribing RNA polymerase II elongation complex 提交 2025-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.26 Å
9RYB CryoEM structure of transcribing RNA polymerase II elongation complex in post-catalysis state 提交 2025-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 1 DPO DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.33 Å

共 263 个其他 PDB 条目、276 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAB4_YEAST
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–70； UniProt 1–70

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q01080

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 M； UniProt 1–415 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190 × 1 （P10964） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135 × 1 （P22138） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 （P07703） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14 × 1 （P50106） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 × 1 （P46669） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12 × 1 （P32529） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 （P28000） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34 × 1 （P47006） RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3 × 1 （P36070） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3NFH Crystal structure of tandem winged helix domain of RNA polymerase I subunit A49 (P4) 提交 2010-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 154–399（246 aa） 片段：UNP residues 154-399
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；26% PEG 4000, 200 mM lithium sulfate monohydrate, 100 mM Tris pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.17 Å R-free 0.225
3NFH Crystal structure of tandem winged helix domain of RNA polymerase I subunit A49 (P4) 提交 2010-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 154–399（246 aa） 片段：UNP residues 154-399
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；26% PEG 4000, 200 mM lithium sulfate monohydrate, 100 mM Tris pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.17 Å R-free 0.225
3NFI Crystal structure of tandem winged helix domain of RNA polymerase I subunit A49 提交 2010-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 171–403（233 aa） 片段：UNP residues 171-403
突变：L178M, L261M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；24% PEG 3350, 50 mM Tris pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
3NFI Crystal structure of tandem winged helix domain of RNA polymerase I subunit A49 提交 2010-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 171–403（233 aa） 片段：UNP residues 171-403
突变：L178M, L261M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；24% PEG 3350, 50 mM Tris pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
3NFI Crystal structure of tandem winged helix domain of RNA polymerase I subunit A49 提交 2010-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 171–403（233 aa） 片段：UNP residues 171-403
突变：L178M, L261M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；24% PEG 3350, 50 mM Tris pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
3NFI Crystal structure of tandem winged helix domain of RNA polymerase I subunit A49 提交 2010-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 171–403（233 aa） 片段：UNP residues 171-403
突变：L178M, L261M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；24% PEG 3350, 50 mM Tris pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
3NFI Crystal structure of tandem winged helix domain of RNA polymerase I subunit A49 提交 2010-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 171–403（233 aa） 片段：UNP residues 171-403
突变：L178M, L261M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） PE4 2-{2-[2-(2-{2-[2-(2-ETHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；24% PEG 3350, 50 mM Tris pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 2 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C3H Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.27 A resolution, crystal form C2-93 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 24% ETHYLENGLYCOL, 0.1M MES PH 6.8
分辨率 3.27 Å R-free 0.226
4C3I Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.0 A resolution, crystal form C2-100 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL PH 7.4
分辨率 3.00 Å R-free 0.231
4C3J Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.35 A resolution, crystal form C2-90 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL, PH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.220
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 AM 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 BM 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 CM 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 DM 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 EM 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 FM 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5LMX Monomeric RNA polymerase I at 4.9 A resolution 提交 2016-08-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
5M3F Yeast RNA polymerase I elongation complex at 3.8A 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 3.80 Å
5M3M Free monomeric RNA polymerase I at 4.0A resolution 提交 2016-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 4.00 Å
5M5W RNA Polymerase I open complex 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 3.80 Å
5M5X RNA Polymerase I elongation complex 1 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot time for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M5Y RNA Polymerase I elongation complex 2 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M64 RNA Polymerase I elongation complex with A49 tandem winged helix domain 提交 2016-10-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.60 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6H67 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) 提交 2018-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6H68 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) with fully-ordered A49 提交 2018-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6HKO Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.42 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9G1V Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.70 Å
9G23 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at A-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G24 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at E-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G26 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, closed state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G29 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site with the C-terminal of A12 in the funnel 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.30 Å
9G2C Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, open state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 M 1–415（415 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å

共 40 个其他 PDB 条目、51 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPA49_YEAST
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 1–415； UniProt 1–415

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P47006

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 N； UniProt 1–233 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190 × 1 （P10964） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135 × 1 （P22138） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 （P07703） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14 × 1 （P50106） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 × 1 （P46669） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12 × 1 （P32529） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 （P28000） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 × 1 （Q01080） RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3 × 1 （P36070） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C2M Structure of RNA polymerase I at 2.8 A resolution 提交 2013-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 3 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10% PEG4000, 300MM AMMONIUM ACETATE, 50MM HEPES PH 7.5, 5MM TCEP
分辨率 2.80 Å R-free 0.210
4C3H Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.27 A resolution, crystal form C2-93 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 24% ETHYLENGLYCOL, 0.1M MES PH 6.8
分辨率 3.27 Å R-free 0.226
4C3I Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.0 A resolution, crystal form C2-100 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL PH 7.4
分辨率 3.00 Å R-free 0.231
4C3J Structure of 14-subunit RNA polymerase I at 3.35 A resolution, crystal form C2-90 提交 2013-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% MPD, 0.1M TRIS HCL, PH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.220
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 AN 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 BN 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 CN 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 DN 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 EN 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
4YM7 RNA polymerase I structure with an alternative dimer hinge 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 FN 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG 6000, 3% MPD, 100 mM Hepes, 300 mM di-ammonium-tartrate, 3 mM TCEP
分辨率 5.50 Å R-free 0.235
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5LMX Monomeric RNA polymerase I at 4.9 A resolution 提交 2016-08-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
5M3F Yeast RNA polymerase I elongation complex at 3.8A 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 3.80 Å
5M3M Free monomeric RNA polymerase I at 4.0A resolution 提交 2016-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 13, blotting time 8.5s
分辨率 4.00 Å
5M5W RNA Polymerase I open complex 提交 2016-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 3.80 Å
5M5X RNA Polymerase I elongation complex 1 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot time for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M5Y RNA Polymerase I elongation complex 2 提交 2016-10-23 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.00 Å
5M64 RNA Polymerase I elongation complex with A49 tandem winged helix domain 提交 2016-10-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of sample 15 seconds wait time Blot for 8 seconds
分辨率 4.60 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
5W5Y RNA polymerase I Initial Transcribing Complex 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5W64 RNA Polymerase I Initial Transcribing Complex State 1 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5W65 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 2 提交 2017-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
5W66 RNA polymerase I Initial Transcribing Complex State 3 提交 2017-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6H67 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) 提交 2018-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6H68 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) with fully-ordered A49 提交 2018-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6HKO Yeast RNA polymerase I elongation complex bound to nucleotide analog GMPCPP 提交 2018-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30 seconds incubation 3 seconds blotting blotting force 3
分辨率 3.42 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9G1V Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 2.70 Å
9G23 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at A-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G24 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site bound to nucleotide analog AMPCPP at E-site 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å
9G26 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, closed state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.40 Å
9G29 Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site with the C-terminal of A12 in the funnel 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.30 Å
9G2C Yeast RNA polymerase I elongation complex stalled by an apurinic site, open state 提交 2024-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 N 1–233（233 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 METHANE
分辨率 3.50 Å

共 38 个其他 PDB 条目、44 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPA34_YEAST
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 N； PDB构建体 1–233； UniProt 1–233

RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P36070

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 15 DNA 2 PDB 声明：heptadecameric（17） 与全部聚合物数一致 链 O； UniProt 1–627 未记录 Template strand × 1 Nontemplate strand × 1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA190 × 1 （P10964） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA135 × 1 （P22138） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 × 1 （P07703） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA14 × 1 （P50106） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43 × 1 （P46669） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12 × 1 （P32529） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 × 1 （P28000） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 × 1 （Q01080） DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34 × 1 （P47006） ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6RQT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3TJ1 Crystal Structure of RNA Polymerase I Transcription Initiation Factor Rrn3 提交 2011-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–627（627 aa）
链 B 1–627（627 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；14% PEG 3350, 250 mM sodium-potassium-tartrate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.85 Å R-free 0.242
5G5L RNA polymerase I-Rrn3 complex at 4.8 A resolution 提交 2016-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 O 1–627（627 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT；pH 7.8；150MM NACL, 5MM HEPES, 1MM MGCL2, 0.01 MM ZNCL2, 5 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITROBOT MARK IV, METHOD- 4.5 MICROLITERS OF SAMPLE WAS APPLIED TO GLOW- DISCHARGED QUANTIFOIL R 2- 1 HOLEY CARBON GRIDS, WHICH WERE THEN BLOTTED FOR 8.5S AND PLUNGE- FROZEN IN LIQUID ETHANE.
分辨率 4.80 Å
5N5Y Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation III) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 O 1–627（627 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N5Z Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation II) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 O 1–627（627 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N60 Cryo-EM structure of RNA polymerase I in complex with Rrn3 and Core Factor (Orientation I) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 O 1–627（627 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
5N61 RNA polymerase I initially transcribing complex 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 O 1–627（627 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
5OA1 RNA polymerase I pre-initiation complex 提交 2017-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 O 1–627（627 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6RQH RNA Polymerase I Closed Conformation 1 (CC1) 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 O 1–627（627 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RQL RNA Polymerase I Closed Conformation 2 (CC2) 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 O 1–627（627 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6RRD RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 1 提交 2019-05-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 O 1–627（627 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6RUI RNA Polymerase I Pre-initiation complex DNA opening intermediate 2 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 O 1–627（627 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6RUO RNA Polymerase I Open Complex conformation 1 提交 2019-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 O 1–627（627 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RWE RNA Polymerase I Open Complex conformation 2 提交 2019-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 O 1–627（627 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6TPS early intermediate RNA Polymerase I Pre-initiation complex - eiPIC 提交 2019-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 O 1–627（627 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å

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查看构建体与数据证据
UniProt名称 RRN3_YEAST
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 O； PDB构建体 1–627； UniProt 1–627

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6rqt

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6rqt
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6rqt
沉积日期 deposition_date2019-05-16
结构标题 titleRNA Polymerase I-tWH-Rrn3-DNA
关键词 keywordsRNA Polymerase I, POL1, tandem winged helix, tWH, Rrn3, Transcription, Promoter escape; TRANSCRIPTION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier55.09 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron54.98 Å
零角强度 I(0) i04550330000.00
分子量 molecular_weight566990.0 kDa
排除体积 excluded_volume709420 ų
包络体积 envelope_volume1043400 ų
水化壳体积 shell_volume148410 ų
包络直径 envelope_diameter191.9 Å
壳层 Rg shell_rg64.55 Å
包络 Rg envelope_rg54.43 Å
形状 Rg shape_rg55.00 Å
总 Rg total_rg55.12 Å
总原子数 total_atoms39820
残基数 n_residues4947
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax177.7 Å
Rg (实空间) rg_real54.84 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.12 Å
I(0) (实空间) i0_real4.5500e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.3160e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal55.28 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal4553000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8744
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary67.4 Å
偏度 Skewness skewness0.194
峰度 Kurtosis kurtosis-0.360
角度范围 angular_range— – 0.1450 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha869800000.0000
实空间数据点数 n_real_points30
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.860; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.950; Smooth: 0.833
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 15 domains

CATH v4.4 (15 domains)

结构域编号 domain_id6rqtB04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1110 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase Rpb2, domain 2
结构域编号 domain_id6rqtB05
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1070 — Hypothetical Protein Ta0175; Chain: A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id6rqtB06
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology270 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; Domain 6
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — DNA-directed RNA polymerase, subunit 2, domain 6
结构域编号 domain_id6rqtB07
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — RNA polymerase II, Rpb2 subunit, wall domain
结构域编号 domain_id6rqtB08
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1800 — DCoH-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase alpha subunit dimerisation domain
结构域编号 domain_id6rqtC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit
结构域编号 domain_id6rqtC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12 — DNA-directed RNA polymerase, insert domain
结构域编号 domain_id6rqtE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1340 — Dna-directed Rna Polymerases I, Ii, And Iii 27 Kd Polypeptide; Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase, Rpb5, N-terminal domain
结构域编号 domain_id6rqtE02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — RPB5-like RNA polymerase subunit
结构域编号 domain_id6rqtF00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase subunit, RPB6/omega
结构域编号 domain_id6rqtG01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily120 — RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain
结构域编号 domain_id6rqtH00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 — Nucleic acid-binding proteins
结构域编号 domain_id6rqtJ00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Homeodomain-like
结构域编号 domain_id6rqtK00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit
结构域编号 domain_id6rqtL00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — RNA polymerase ii, chain L
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)