8t0m

Proteasome 20S core particle from Pre1-1 Pre4-1 Double mutant

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 171.6 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome subunit alpha type-1

物种未注明

UniProt P21243

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–252 链 O; UniProt 1–252 未记录 Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (P40302) Proteasome subunit alpha type-7 × 2 (P21242) Proteasome subunit beta type-1 × 2 (P38624) Proteasome subunit beta type-2 × 2 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 2 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 2 (P22141) Proteasome subunit beta type-5 × 2 (P30656) Proteasome subunit beta type-6 × 2 (P23724) Proteasome subunit beta type-7 × 2 (P30657) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;Fluorinated Fos-Choline was added to the sample immediately prior to deposition on a grid for plunge freezing. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 374 个其他 PDB 条目、375 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSA1_YEAST
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252 作者链 O; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252

Proteasome subunit alpha type-2

物种未注明

UniProt P23639

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–250 链 P; UniProt 1–250 未记录 Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (P21243) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (P40302) Proteasome subunit alpha type-7 × 2 (P21242) Proteasome subunit beta type-1 × 2 (P38624) Proteasome subunit beta type-2 × 2 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 2 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 2 (P22141) Proteasome subunit beta type-5 × 2 (P30656) Proteasome subunit beta type-6 × 2 (P23724) Proteasome subunit beta type-7 × 2 (P30657) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;Fluorinated Fos-Choline was added to the sample immediately prior to deposition on a grid for plunge freezing. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 373 个其他 PDB 条目、374 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSA2_YEAST
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–250; UniProt 1–250 作者链 P; PDB构建体 1–250; UniProt 1–250

Proteasome subunit alpha type-3

物种未注明

UniProt P23638

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–258 链 Q; UniProt 1–258 未记录 Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (P23639) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (P40302) Proteasome subunit alpha type-7 × 2 (P21242) Proteasome subunit beta type-1 × 2 (P38624) Proteasome subunit beta type-2 × 2 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 2 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 2 (P22141) Proteasome subunit beta type-5 × 2 (P30656) Proteasome subunit beta type-6 × 2 (P23724) Proteasome subunit beta type-7 × 2 (P30657) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;Fluorinated Fos-Choline was added to the sample immediately prior to deposition on a grid for plunge freezing. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 371 个其他 PDB 条目、372 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSA3_YEAST
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–258; UniProt 1–258 作者链 Q; PDB构建体 1–258; UniProt 1–258

Proteasome subunit alpha type-4

物种未注明

UniProt P40303

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 1–254 链 R; UniProt 1–254 未记录 Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (P23638) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (P40302) Proteasome subunit alpha type-7 × 2 (P21242) Proteasome subunit beta type-1 × 2 (P38624) Proteasome subunit beta type-2 × 2 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 2 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 2 (P22141) Proteasome subunit beta type-5 × 2 (P30656) Proteasome subunit beta type-6 × 2 (P23724) Proteasome subunit beta type-7 × 2 (P30657) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;Fluorinated Fos-Choline was added to the sample immediately prior to deposition on a grid for plunge freezing. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 373 个其他 PDB 条目、374 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSA4_YEAST
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–254; UniProt 1–254 作者链 R; PDB构建体 1–254; UniProt 1–254

Proteasome subunit alpha type-5

物种未注明

UniProt P32379

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 1–260 链 S; UniProt 1–260 未记录 Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (P40303) Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (P40302) Proteasome subunit alpha type-7 × 2 (P21242) Proteasome subunit beta type-1 × 2 (P38624) Proteasome subunit beta type-2 × 2 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 2 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 2 (P22141) Proteasome subunit beta type-5 × 2 (P30656) Proteasome subunit beta type-6 × 2 (P23724) Proteasome subunit beta type-7 × 2 (P30657) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;Fluorinated Fos-Choline was added to the sample immediately prior to deposition on a grid for plunge freezing. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 373 个其他 PDB 条目、375 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSA5_YEAST
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 S; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260

Proteasome subunit alpha type-6

物种未注明

UniProt P40302

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 F; UniProt 1–234 链 T; UniProt 1–234 未记录 Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (P32379) Proteasome subunit alpha type-7 × 2 (P21242) Proteasome subunit beta type-1 × 2 (P38624) Proteasome subunit beta type-2 × 2 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 2 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 2 (P22141) Proteasome subunit beta type-5 × 2 (P30656) Proteasome subunit beta type-6 × 2 (P23724) Proteasome subunit beta type-7 × 2 (P30657) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;Fluorinated Fos-Choline was added to the sample immediately prior to deposition on a grid for plunge freezing. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 371 个其他 PDB 条目、372 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSA6_YEAST
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–234; UniProt 1–234 作者链 T; PDB构建体 1–234; UniProt 1–234

Proteasome subunit alpha type-7

物种未注明

UniProt P21242

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 1–288 链 U; UniProt 1–288 未记录 Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (P40302) Proteasome subunit beta type-1 × 2 (P38624) Proteasome subunit beta type-2 × 2 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 2 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 2 (P22141) Proteasome subunit beta type-5 × 2 (P30656) Proteasome subunit beta type-6 × 2 (P23724) Proteasome subunit beta type-7 × 2 (P30657) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;Fluorinated Fos-Choline was added to the sample immediately prior to deposition on a grid for plunge freezing. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 372 个其他 PDB 条目、373 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSA7_YEAST
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288 作者链 U; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288

Proteasome subunit beta type-1

物种未注明

UniProt P38624

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 1–215 链 V; UniProt 1–215 未记录 Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (P40302) Proteasome subunit alpha type-7 × 2 (P21242) Proteasome subunit beta type-2 × 2 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 2 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 2 (P22141) Proteasome subunit beta type-5 × 2 (P30656) Proteasome subunit beta type-6 × 2 (P23724) Proteasome subunit beta type-7 × 2 (P30657) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;Fluorinated Fos-Choline was added to the sample immediately prior to deposition on a grid for plunge freezing. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 365 个其他 PDB 条目、366 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSB1_YEAST
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–215; UniProt 1–215 作者链 V; PDB构建体 1–215; UniProt 1–215

Proteasome subunit beta type-2

物种未注明

UniProt P25043

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 I; UniProt 1–261 链 W; UniProt 1–261 未记录 Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (P40302) Proteasome subunit alpha type-7 × 2 (P21242) Proteasome subunit beta type-1 × 2 (P38624) Proteasome subunit beta type-3 × 2 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 2 (P22141) Proteasome subunit beta type-5 × 2 (P30656) Proteasome subunit beta type-6 × 2 (P23724) Proteasome subunit beta type-7 × 2 (P30657) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;Fluorinated Fos-Choline was added to the sample immediately prior to deposition on a grid for plunge freezing. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 358 个其他 PDB 条目、359 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSB2_YEAST
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–261; UniProt 1–261 作者链 W; PDB构建体 1–261; UniProt 1–261

Proteasome subunit beta type-3

物种未注明

UniProt P25451

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 1–205 链 X; UniProt 1–205 未记录 Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (P40302) Proteasome subunit alpha type-7 × 2 (P21242) Proteasome subunit beta type-1 × 2 (P38624) Proteasome subunit beta type-2 × 2 (P25043) Proteasome subunit beta type-4 × 2 (P22141) Proteasome subunit beta type-5 × 2 (P30656) Proteasome subunit beta type-6 × 2 (P23724) Proteasome subunit beta type-7 × 2 (P30657) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;Fluorinated Fos-Choline was added to the sample immediately prior to deposition on a grid for plunge freezing. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 369 个其他 PDB 条目、370 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSB3_YEAST
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–205; UniProt 1–205 作者链 X; PDB构建体 1–205; UniProt 1–205

Proteasome subunit beta type-4

物种未注明

UniProt P22141

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 K; UniProt 1–198 链 Y; UniProt 1–198 未记录 Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (P40302) Proteasome subunit alpha type-7 × 2 (P21242) Proteasome subunit beta type-1 × 2 (P38624) Proteasome subunit beta type-2 × 2 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 2 (P25451) Proteasome subunit beta type-5 × 2 (P30656) Proteasome subunit beta type-6 × 2 (P23724) Proteasome subunit beta type-7 × 2 (P30657) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;Fluorinated Fos-Choline was added to the sample immediately prior to deposition on a grid for plunge freezing. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 369 个其他 PDB 条目、370 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSB4_YEAST
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–198; UniProt 1–198 作者链 Y; PDB构建体 1–198; UniProt 1–198

Proteasome subunit beta type-5

物种未注明

UniProt P30656

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 L; UniProt 1–287 链 Z; UniProt 1–287 未记录 Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (P40302) Proteasome subunit alpha type-7 × 2 (P21242) Proteasome subunit beta type-1 × 2 (P38624) Proteasome subunit beta type-2 × 2 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 2 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 2 (P22141) Proteasome subunit beta type-6 × 2 (P23724) Proteasome subunit beta type-7 × 2 (P30657) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;Fluorinated Fos-Choline was added to the sample immediately prior to deposition on a grid for plunge freezing. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 360 个其他 PDB 条目、361 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSB5_YEAST
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–287; UniProt 1–287 作者链 Z; PDB构建体 1–287; UniProt 1–287

Proteasome subunit beta type-6

物种未注明

UniProt P23724

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 M; UniProt 1–241 链 a; UniProt 1–241 未记录 Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (P40302) Proteasome subunit alpha type-7 × 2 (P21242) Proteasome subunit beta type-1 × 2 (P38624) Proteasome subunit beta type-2 × 2 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 2 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 2 (P22141) Proteasome subunit beta type-5 × 2 (P30656) Proteasome subunit beta type-7 × 2 (P30657) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;Fluorinated Fos-Choline was added to the sample immediately prior to deposition on a grid for plunge freezing. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 359 个其他 PDB 条目、360 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSB6_YEAST
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–241; UniProt 1–241 作者链 a; PDB构建体 1–241; UniProt 1–241

Proteasome subunit beta type-7

物种未注明

UniProt P30657

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric(28) 与蛋白拷贝数一致 链 N; UniProt 1–251 链 b; UniProt 1–251 突变:Deletion of 15 C-terminal Residues WDFAKDIKGYGTQKI Proteasome subunit alpha type-1 × 2 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 2 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 2 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 2 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 2 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 2 (P40302) Proteasome subunit alpha type-7 × 2 (P21242) Proteasome subunit beta type-1 × 2 (P38624) Proteasome subunit beta type-2 × 2 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 2 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 2 (P22141) Proteasome subunit beta type-5 × 2 (P30656) Proteasome subunit beta type-6 × 2 (P23724) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;Fluorinated Fos-Choline was added to the sample immediately prior to deposition on a grid for plunge freezing. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 358 个其他 PDB 条目、359 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSB7_YEAST
Isoform
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–251; UniProt 1–251 作者链 b; PDB构建体 1–251; UniProt 1–251

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8t0m

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8t0m
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8t0m
沉积日期 deposition_date2023-06-01
结构标题 titleProteasome 20S core particle from Pre1-1 Pre4-1 Double mutant
关键词 keywordsProteasome, core particle, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier60.19
回转半径 Rg (电子) rg_electron59.72
零角强度 I(0) i06242530000.00
分子量 molecular_weight674520.0 kDa
排除体积 excluded_volume847190 ų
包络体积 envelope_volume1211800 ų
水化壳体积 shell_volume164500 ų
包络直径 envelope_diameter187.2
壳层 Rg shell_rg67.04
包络 Rg envelope_rg57.06
形状 Rg shape_rg59.70
总 Rg total_rg59.91
总原子数 total_atoms47538
残基数 n_residues6102
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax171.6
Rg (实空间) rg_real59.88
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.93
I(0) (实空间) i0_real6.2430e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2930e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal60.42
I(0) (倒空间) i0_reciprocal6248000000.0000
解质量估计 total_estimate0.6112
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary79.2
偏度 Skewness skewness0.184
峰度 Kurtosis kurtosis-0.442
角度范围 angular_range— – 0.1300 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha718400000.0000
实空间数据点数 n_real_points27
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.958; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.025; Positv: 1.000; Valcen: 0.992; Smooth: 0.002

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id8t0mB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0mC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0mD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0mE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0mG01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0mH01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0mI01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0mM01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0mP01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0mQ01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0mR01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0mS01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0mU01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0mV01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0mW01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain
结构域编号 domain_id8t0ma01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)