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9gxi

Subtomogram average of fascin-actin complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 187.5 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed

物种未注明

UniProt P60709

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–375 链 C； UniProt 1–375 链 D； UniProt 1–375 链 E； UniProt 1–375 链 F； UniProt 1–375 链 G； UniProt 1–375 未记录 Fascin × 1 （Q16658） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 9.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9GXI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
21VV Cryo-EM structure of ncBAF bound to the nucleosome 提交 2025-12-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 J 1–375（375 aa）
未记录 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8.0, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.5 mM ADP, 8 mM NaF, 1 mM BeSO4.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
3D2U Structure of UL18, a Peptide-Binding Viral MHC Mimic, Bound to a Host Inhibitory Receptor 提交 2008-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 170–178（9 aa） 片段：sequence database residues 170-178
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.4 M Mg(NO3)2, and 16~22% (w/v) PEG 33500, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.21 Å R-free 0.259
3D2U Structure of UL18, a Peptide-Binding Viral MHC Mimic, Bound to a Host Inhibitory Receptor 提交 2008-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 170–178（9 aa） 片段：sequence database residues 170-178
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.4 M Mg(NO3)2, and 16~22% (w/v) PEG 33500, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.21 Å R-free 0.259
3J82 Electron cryo-microscopy of DNGR-1 in complex with F-actin 提交 2014-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
3LUE Model of alpha-actinin CH1 bound to F-actin 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
链 F 2–375（374 aa）
链 G 2–375（374 aa）
链 H 2–375（374 aa）
链 I 2–375（374 aa）
链 J 2–375（374 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 15.00 Å
6ANU Cryo-EM structure of F-actin complexed with the beta-III-spectrin actin-binding domain 提交 2017-08-14 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
链 C 1–375（375 aa）
链 D 1–375（375 aa）
链 E 1–375（375 aa）
链 F 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 66–88（23 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000
分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 66–88（23 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000
分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 66–88（23 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000
分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 66–88（23 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000
分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICV Structure of SETD3 bound to SAH and unmodified actin 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 66–88（23 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5 2% Polyethylene glycol 400 2.0M Ammonium sulfate
分辨率 2.15 Å R-free 0.205
6ICV Structure of SETD3 bound to SAH and unmodified actin 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 66–88（23 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5 2% Polyethylene glycol 400 2.0M Ammonium sulfate
分辨率 2.15 Å R-free 0.205
6LTJ Structure of nucleosome-bound human BAF complex 提交 2020-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–375（375 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6MBJ SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, P21 Crystal Form 提交 2018-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–80（15 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.78 Å R-free 0.223
6MBJ SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, P21 Crystal Form 提交 2018-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 66–80（15 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.78 Å R-free 0.223
6MBK SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, First P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.69 Å R-free 0.243
6MBK SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, First P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.69 Å R-free 0.243
6MBL SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, Second P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.20 Å R-free 0.227
6NBW Ternary Complex of Beta/Gamma-Actin with Profilin and AnCoA-NAA80 提交 2018-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–375（374 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 LAB LATRUNCULIN B × 1 GOL GLYCEROL × 2 SOP [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-4-HYDROXY-3-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL (3R)-3-HYDROXY-2,2-DIMETHYL-4-OXO-4-{[3-OXO-3-({2-[(2-OXOPROPYL)THIO]ETHYL}AMINO)PROPYL]AMINO}BUTYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290 K；15% PEG 3350, 50mM MES pH6.2, 50mM NH4NO3
分辨率 2.50 Å R-free 0.209
6OX0 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Sinefungin Replacing SAH as Cofactor 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
未记录 SFG SINEFUNGIN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 1.75 Å R-free 0.225
6OX0 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Sinefungin Replacing SAH as Cofactor 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
未记录 SFG SINEFUNGIN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 1.75 Å R-free 0.225
6OX1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Target Histidine Partially Methylated 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 1.95 Å R-free 0.201
6OX1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Target Histidine Partially Methylated 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 1.95 Å R-free 0.201
6OX2 SETD3in Complex with an Actin Peptide with the Target Histidine Fully Methylated 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 2.09 Å R-free 0.239
6OX2 SETD3in Complex with an Actin Peptide with the Target Histidine Fully Methylated 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 2.09 Å R-free 0.239
6OX4 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 2.29 Å R-free 0.236
6OX4 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 2.29 Å R-free 0.236
6OX5 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Lysine 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–83（18 aa）
突变：H73K SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 2.10 Å R-free 0.205
7AS4 Recombinant human gTuRC 提交 2020-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 7 2–375（374 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
7P1H Structure of the V. vulnificus ExoY-G-actin-profilin complex 提交 2021-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 4–375（372 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7VDV The overall structure of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 P 1–375（375 aa）
未记录 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7W28 Crystal Structure of SETD3-SAH in complex with betaA-4PyrAla73 peptide 提交 2021-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 66–81（16 aa） 片段：SAH
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；30%(w/v) PEG4000, 0.1 M Tris base/Hydrochloric acid 8.5, 0.2M Lithium sulfate.
分辨率 1.79 Å R-free 0.211
7W29 Crystal Structure of SETD3-SAH in complex with betaA-Orn73 peptide 提交 2021-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 66–81（16 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；289 K；20%(w/v) PEG6000, 0.1M Bicine/Sodium hydroxide 9.0
分辨率 2.90 Å R-free 0.279
8COG Human arginylated beta-actin 提交 2023-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 2–375（374 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Actin for EM was polymerized by mixing, 20 ul 20 uM G-actin, 8 ul 10x MKE and 52 ul 5 mM HEPES-KOH pH 7.4 containing 0.2 mM ATP and 0.5 mM DTT and incubating at RT for 1 hour.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
8DNH Cryo-EM structure of nonmuscle beta-actin 提交 2022-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.99 Å
8OI8 Cryo-EM structure of ADP-bound, filamentous beta-actin harboring the R183W mutation 提交 2023-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
链 C 1–375（375 aa）
链 D 1–375（375 aa）
链 E 1–375（375 aa）
突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1x KMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA) supplemented with 0.02% Tween20 (v/v)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.28 Å
8OID Cryo-EM structure of ADP-bound, filamentous beta-actin harboring the N111S mutation 提交 2023-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
链 C 1–375（375 aa）
链 D 1–375（375 aa）
链 E 1–375（375 aa）
突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1x KMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA) supplemented with 0.02% Tween20 (v/v)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.30 Å
8QR1 Cryo-EM structure of the human Tip60 complex 提交 2023-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 B 1–375（375 aa）
链 G 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8RTT Structure of the formin Cdc12 bound to the barbed end of phalloidin-stabilized F-actin. 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
链 C 1–375（375 aa）
链 D 1–375（375 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.
分辨率 3.56 Å
8RTY Structure of the F-actin barbed end bound by Cdc12 and profilin (ring complex) at a resolution of 6.3 Angstrom 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.
分辨率 6.25 Å
8RU2 Structure of the F-actin barbed end bound by formin mDia1 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.
分辨率 3.49 Å
8VRD Rigid body fitted model for free recombinant gamma tubulin ring complex. 提交 2024-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric
链 S 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
8VRJ Rigid body fitted model for gamma tubulin ring complex capped microtubule 提交 2024-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric
链 9 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
8VRK Rigid body fitted model for refined density map of gamma tubulin ring complex capped microtubule 提交 2024-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric
链 9 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.50 Å
8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 S 1–375（375 aa）
链 U 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 S 1–375（375 aa）
链 U 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 S 1–375（375 aa）
链 U 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8XVT The core subcomplex of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 K 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9B2Z Actin-bound Legionella pneumophila AMPylase LnaB with AMPylated catalytic histidine 提交 2024-03-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–375（375 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 LAB LATRUNCULIN B × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9B7J Cryo-EM structure of human dynactin complex bound to Chlamydia effector Dre1 提交 2024-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
9B85 Cryo-EM structure of human dynactin complex bound to Chlamydia effector Dre1 提交 2024-03-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
9C57 Reconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex 提交 2024-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–375（375 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
9C62 P400 subcomplex of the native human TIP60 complex 提交 2024-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.28 Å
9C6N ARP module of the human TIP60 complex 提交 2024-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 J 1–375（375 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9CAC Cryo-EM structure of the RuvBL lobe of the native human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 K 1–375（375 aa）
链 L 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9CAE Cryo-EM structure of the reconstituted RuvBL lobe of the human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 L 1–375（375 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
9FJM Cryo-EM structure of the phalloidin-bound pointed end of the actin filament. 提交 2024-05-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.
分辨率 3.65 Å
9I8G Inwards conformation' of the human gamma-TuRC from purified centrosomes obtained by rigid body docking 提交 2025-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 U 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 22.40 Å
9I8H Outwards conformation' of the human gamma-TuRC from purified centrosomes obtained by rigid body docking 提交 2025-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 U 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 23.20 Å
9P1I Atomic structure of vibrio effector fragment VopV bound to Beta-cytoplasmic/gamma1-cytoplasmic F-actin 提交 2025-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 Q 1–375（375 aa）
链 R 1–375（375 aa）
链 S 1–375（375 aa）
链 T 1–375（375 aa）
链 U 1–375（375 aa）
链 V 1–375（375 aa）
链 W 1–375（375 aa）
链 X 1–375（375 aa）
链 Y 1–375（375 aa）
链 Z 1–375（375 aa）
链 a 1–375（375 aa）
链 b 1–375（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 12 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9QEW Cryo-EM structure of the undecorated actin filament in the ADP-Pi state. 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.18 Å
9QEY Cryo-EM structure of the actin filament bound by a single Coronin-1B molecule. 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.74 Å
9QF2 Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state. 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.42 Å
9QFB Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state. 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
链 F 2–375（374 aa）
链 G 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.74 Å
9QFD Cryo-EM structure of the fully cofilin-1-decorated actin filament (cofilactin) 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
链 F 2–375（374 aa）
链 G 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.61 Å
9QFE Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1 on separate actin strands 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
链 F 2–375（374 aa）
链 G 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.12 Å
9QFG Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1, strand boundary 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
链 F 2–375（374 aa）
链 G 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.49 Å
9QFJ Cryo-EM structure of the cofilactin filament core at 2.3 Angstrom resolution. 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.31 Å
9QFK Cryo-EM structure of the Coronin-1B-decorated actin filament bound by one Cofilin-1 molecule (crosslinked) 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
链 F 2–375（374 aa）
链 G 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.99 Å
9QFO Cryo-EM structure of the cofilactin filament pointed end 提交 2025-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
链 F 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.96 Å
9QFQ Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by AIP1 提交 2025-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.76 Å
9QFW Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by two AIP1 molecules 提交 2025-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.16 Å
9QVM Cryo-EM reconstruction of the NEDD1 anchor protein and CDK5RAP2 bound to the gamma-tubulin ring complex 提交 2025-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 Z 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.80 Å
9QVN Cryo-EM reconstruction of the NEDD1 anchor protein bound to the gamma-tubulin ring complex 提交 2025-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric
链 Z 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 K 1–375（375 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 K 1–375（375 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 K 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 K 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9UXA local ARP-NCP structure of the ncBAF-nucleosome complex in the apo state 提交 2025-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 I 2–375（374 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9UXB The apo structure of BCL7B-containing ARP module of the human SWI/SNF complex 提交 2025-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–375（374 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
9UXC The ADP-bound structure of BCL7B-containing ARP module of the human SWI/SNF complex 提交 2025-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–375（374 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.74 Å
9WBZ The structure of NCP-motor-ARP module of ncBAF-nucleosome complex 提交 2025-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 L 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9WC1 The structure of ARP module in ncBAF complex 提交 2025-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 72 个其他 PDB 条目、83 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACTB_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 C； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 D； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 E； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 F； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 G； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375

Fascin

Homo sapiens

UniProt Q16658

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–493 未记录 Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed × 6 （P60709） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 9.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9GXI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1DFC CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN FASCIN, AN ACTIN-CROSSLINKING PROTEIN 提交 1999-11-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa） 片段：FULL-LENGTH PROTEIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 4000, hepes, dtt, sodium azide , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.90 Å R-free 0.268
1DFC CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN FASCIN, AN ACTIN-CROSSLINKING PROTEIN 提交 1999-11-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–493（493 aa） 片段：FULL-LENGTH PROTEIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 4000, hepes, dtt, sodium azide , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.90 Å R-free 0.268
3LLP 1.8 Angstrom human fascin 1 crystal structure 提交 2010-01-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 K POTASSIUM ION × 1 BR BROMIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；100mM Hepes, pH 7.5, 20% PEG 4000, 2% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.220
3LLP 1.8 Angstrom human fascin 1 crystal structure 提交 2010-01-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–493（493 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 K POTASSIUM ION × 1 BR BROMIDE ION × 4 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；100mM Hepes, pH 7.5, 20% PEG 4000, 2% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.220
3P53 Structure of fascin 提交 2010-10-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 12P DODECAETHYLENE GLYCOL × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；24% PEG 3350, 0.2 M Lithium Acetate, 1mM DTT, 4% glycerol, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
3P53 Structure of fascin 提交 2010-10-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–493（493 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；24% PEG 3350, 0.2 M Lithium Acetate, 1mM DTT, 4% glycerol, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4GOV The crystal structure of human fascin 1 S39D mutant 提交 2012-08-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
突变：S39D BR BROMIDE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 5 GOL GLYCEROL × 3 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.234
4GOV The crystal structure of human fascin 1 S39D mutant 提交 2012-08-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–493（493 aa）
突变：S39D BR BROMIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 8 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.234
4GOV The crystal structure of human fascin 1 S39D mutant 提交 2012-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–493（493 aa）
链 B 1–493（493 aa）
突变：S39D 突变：S39D BR BROMIDE ION × 12 CL CHLORIDE ION × 26 GOL GLYCEROL × 20 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.234
4GOY The crystal structure of human fascin 1 K41A mutant 提交 2012-08-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
突变：K41A BR BROMIDE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
4GOY The crystal structure of human fascin 1 K41A mutant 提交 2012-08-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–493（493 aa）
突变：K41A BR BROMIDE ION × 5 CL CHLORIDE ION × 6 GOL GLYCEROL × 3 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
4GOY The crystal structure of human fascin 1 K41A mutant 提交 2012-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–493（493 aa）
链 B 1–493（493 aa）
突变：K41A 突变：K41A BR BROMIDE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 10 GOL GLYCEROL × 6 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
4GOY The crystal structure of human fascin 1 K41A mutant 提交 2012-08-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–493（493 aa）
突变：K41A BR BROMIDE ION × 10 CL CHLORIDE ION × 12 GOL GLYCEROL × 6 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
4GP0 The crystal structure of human fascin 1 R149A K150A R151A mutant 提交 2012-08-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
突变：R149A K150A R151A BR BROMIDE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 11 GOL GLYCEROL × 4 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.249
4GP0 The crystal structure of human fascin 1 R149A K150A R151A mutant 提交 2012-08-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–493（493 aa）
突变：R149A K150A R151A BR BROMIDE ION × 6 CL CHLORIDE ION × 18 GOL GLYCEROL × 6 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.249
4GP0 The crystal structure of human fascin 1 R149A K150A R151A mutant 提交 2012-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–493（493 aa）
链 B 1–493（493 aa）
突变：R149A K150A R151A 突变：R149A K150A R151A BR BROMIDE ION × 14 CL CHLORIDE ION × 58 GOL GLYCEROL × 20 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 6 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.249
4GP3 The crystal structure of human fascin 1 K358A mutant 提交 2012-08-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
突变：K358A BR BROMIDE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 5 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.25 Å R-free 0.252
4GP3 The crystal structure of human fascin 1 K358A mutant 提交 2012-08-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–493（493 aa）
突变：K358A BR BROMIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 13 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.25 Å R-free 0.252
4GP3 The crystal structure of human fascin 1 K358A mutant 提交 2012-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–493（493 aa）
链 B 1–493（493 aa）
突变：K358A 突变：K358A BR BROMIDE ION × 7 CL CHLORIDE ION × 18 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.25 Å R-free 0.252
4GP3 The crystal structure of human fascin 1 K358A mutant 提交 2012-08-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–493（493 aa）
突变：K358A BR BROMIDE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 26 GOL GLYCEROL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100mM Hepes, 16% PEG 4000, 1% isopropanol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.25 Å R-free 0.252
6B0T Structural Insights into the Induced-fit Inhibition of Fascin by a Small Molecule 提交 2017-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 7–493（487 aa） 片段：residues 7-493
未记录 C7V 4-methyl-N-(1-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-1H-indazol-3-yl)-1,2-oxazole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；24% PEG 4000, 50mM Tris HCL (pH 8), 3.3% glycerol, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2 and 0.004% NaN3
分辨率 2.80 Å R-free 0.303
6B0T Structural Insights into the Induced-fit Inhibition of Fascin by a Small Molecule 提交 2017-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 7–493（487 aa） 片段：residues 7-493
未记录 C7V 4-methyl-N-(1-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-1H-indazol-3-yl)-1,2-oxazole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；24% PEG 4000, 50mM Tris HCL (pH 8), 3.3% glycerol, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2 and 0.004% NaN3
分辨率 2.80 Å R-free 0.303
6B0T Structural Insights into the Induced-fit Inhibition of Fascin by a Small Molecule 提交 2017-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 7–493（487 aa） 片段：residues 7-493
未记录 C7V 4-methyl-N-(1-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-1H-indazol-3-yl)-1,2-oxazole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；24% PEG 4000, 50mM Tris HCL (pH 8), 3.3% glycerol, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2 and 0.004% NaN3
分辨率 2.80 Å R-free 0.303
6B0T Structural Insights into the Induced-fit Inhibition of Fascin by a Small Molecule 提交 2017-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 7–493（487 aa） 片段：residues 7-493
未记录 C7V 4-methyl-N-(1-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-1H-indazol-3-yl)-1,2-oxazole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；24% PEG 4000, 50mM Tris HCL (pH 8), 3.3% glycerol, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2 and 0.004% NaN3
分辨率 2.80 Å R-free 0.303
6B0T Structural Insights into the Induced-fit Inhibition of Fascin by a Small Molecule 提交 2017-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 7–493（487 aa） 片段：residues 7-493
未记录 C7V 4-methyl-N-(1-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-1H-indazol-3-yl)-1,2-oxazole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；24% PEG 4000, 50mM Tris HCL (pH 8), 3.3% glycerol, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2 and 0.004% NaN3
分辨率 2.80 Å R-free 0.303
6B0T Structural Insights into the Induced-fit Inhibition of Fascin by a Small Molecule 提交 2017-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 7–493（487 aa） 片段：residues 7-493
未记录 C7V 4-methyl-N-(1-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-1H-indazol-3-yl)-1,2-oxazole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；24% PEG 4000, 50mM Tris HCL (pH 8), 3.3% glycerol, 142mM NaCl, 5mM MgCl2, 10mM CaCl2 and 0.004% NaN3
分辨率 2.80 Å R-free 0.303
6I0Z CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 1 提交 2018-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 GZQ ~{N}-(2,4-dichlorophenyl)-~{N}-methyl-ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；16-20% PEG 3350, 200 mM LiAc, 4% glycerol
分辨率 1.77 Å R-free 0.227
6I0Z CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 1 提交 2018-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–493（493 aa）
未记录 GZQ ~{N}-(2,4-dichlorophenyl)-~{N}-methyl-ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；16-20% PEG 3350, 200 mM LiAc, 4% glycerol
分辨率 1.77 Å R-free 0.227
6I10 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 2 提交 2018-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 GZK 1-[(3~{R})-1,1-bis(oxidanylidene)thiolan-3-yl]-5-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one × 1 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；292 K；18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.287
6I11 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 3 提交 2018-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 H0H ~{N}-(1-methylpyrazol-4-yl)-1-oxidanylidene-2-(phenylmethyl)isoquinoline-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；292 K；18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
分辨率 1.67 Å R-free 0.247
6I12 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 5 提交 2018-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 H08 2-[(4-chlorophenyl)methyl]-~{N}-(1-methylpyrazol-4-yl)-1-oxidanylidene-isoquinoline-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；292 K；18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
分辨率 1.65 Å R-free 0.208
6I13 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 7 提交 2018-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 H0Q 2-[(3-chlorophenyl)methyl]-~{N}-(1-methylpyrazol-4-yl)-1-oxidanylidene-isoquinoline-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；292 K；18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
分辨率 1.79 Å R-free 0.227
6I14 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 9 提交 2018-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 GZN 2-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-~{N}-(1-methylpyrazol-4-yl)-1-oxidanylidene-isoquinoline-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；292 K；18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
分辨率 1.73 Å R-free 0.216
6I15 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 11 提交 2018-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACT ACETATE ION × 1 GZT 1-[[2,2-bis(fluoranyl)-1,3-benzodioxol-5-yl]methyl]-~{N}-methyl-2-oxidanylidene-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；292 K；18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
分辨率 1.91 Å R-free 0.243
6I16 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 15 提交 2018-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 H0B 6-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-~{N}-(1-methylpyrazol-4-yl)-5-oxidanylidene-1,6-naphthyridine-8-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；292 K；18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.239
6I17 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH COMPOUND 24 提交 2018-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GZW 2-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-~{N}-(1-methylpyrazol-4-yl)-1-oxidanylidene-6-piperidin-4-yl-2,7-naphthyridine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；292 K；18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
分辨率 1.56 Å R-free 0.240
6I18 CRYSTAL STRUCTURE OF FASCIN IN COMPLEX WITH BDP-13176 提交 2018-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 H0N 5-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-4-oxidanylidene-1-piperidin-4-yl-~{N}-pyridin-4-yl-pyrazolo[4,3-c]pyridine-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；292 K；18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
分辨率 1.49 Å R-free 0.195
7ZAU Fascin-1 in complex with Nb 3E11 提交 2022-03-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.02 M D-glucose, D-mannose, D-galactose, L-fucose, D-xylose, N-acetyl-D-glucosamine; 0.1 M MES/imidazole pH 6.5, 10% PEG 8000, 20% ethylene glycol
分辨率 2.20 Å R-free 0.290
7ZAU Fascin-1 in complex with Nb 3E11 提交 2022-03-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–493（493 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.02 M D-glucose, D-mannose, D-galactose, L-fucose, D-xylose, N-acetyl-D-glucosamine; 0.1 M MES/imidazole pH 6.5, 10% PEG 8000, 20% ethylene glycol
分辨率 2.20 Å R-free 0.290
7ZAU Fascin-1 in complex with Nb 3E11 提交 2022-03-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–493（493 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.02 M D-glucose, D-mannose, D-galactose, L-fucose, D-xylose, N-acetyl-D-glucosamine; 0.1 M MES/imidazole pH 6.5, 10% PEG 8000, 20% ethylene glycol
分辨率 2.20 Å R-free 0.290
7ZAU Fascin-1 in complex with Nb 3E11 提交 2022-03-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–493（493 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.02 M D-glucose, D-mannose, D-galactose, L-fucose, D-xylose, N-acetyl-D-glucosamine; 0.1 M MES/imidazole pH 6.5, 10% PEG 8000, 20% ethylene glycol
分辨率 2.20 Å R-free 0.290
8VO5 Cryo-EM structure of fascin bound to F-actin (actin binding site 1) 提交 2024-01-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8VO6 Cryo-EM structure of fascin bound to F-actin (actin binding site 2) 提交 2024-01-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VO7 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin 提交 2024-01-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VO8 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_left) 提交 2024-01-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8VO9 Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_middle) 提交 2024-01-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8VOA Cryo-EM structure of fascin crosslinked F-actin (Eigen_right) 提交 2024-01-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9FN6 Full-length crystal structure of human Fascin 1 提交 2024-06-09 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0,1M HEPES pH 7.5, 20% polyethylene glycol (PEG) 4000, 2% propanol
分辨率 2.20 Å R-free 0.304
9FN6 Full-length crystal structure of human Fascin 1 提交 2024-06-09 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–493（493 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0,1M HEPES pH 7.5, 20% polyethylene glycol (PEG) 4000, 2% propanol
分辨率 2.20 Å R-free 0.304
9GS6 Crystal structure of fascin in complex with compound 4 提交 2024-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–493（493 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 A1IPD N-(1-(3,4-dichlorobenzyl)-6-oxo-1,6-dihydropyridin-3-yl)-5-oxopyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；292 K；18-22% PEG 8000, 100-130 mM MgAc2, 100 mM citric acid pH 5.0
分辨率 1.97 Å R-free 0.268

共 27 个其他 PDB 条目、50 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FSCN1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–493； UniProt 1–493

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9gxi

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9gxi
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9gxi
沉积日期 deposition_date2024-09-30
最后修订 last_revision2025-06-11
结构标题 titleSubtomogram average of fascin-actin complex
关键词 keywordsfascin, actin filament, bundling, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier61.04 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron61.82 Å
零角强度 I(0) i01254910000.00
分子量 molecular_weight295280.0 kDa
排除体积 excluded_volume368590 ų
包络体积 envelope_volume567000 ų
水化壳体积 shell_volume80233 ų
包络直径 envelope_diameter200.9 Å
壳层 Rg shell_rg57.57 Å
包络 Rg envelope_rg60.25 Å
形状 Rg shape_rg61.78 Å
总 Rg total_rg61.84 Å
总原子数 total_atoms20732
残基数 n_residues2662
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax187.5 Å
Rg (实空间) rg_real61.60 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.08 Å
I(0) (实空间) i0_real1.2550e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.5890e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal60.50 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1253000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8119
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary50.5 Å
偏度 Skewness skewness0.418
峰度 Kurtosis kurtosis-0.715
角度范围 angular_range— – 0.1300 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha66370000.0000
实空间数据点数 n_real_points27
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.877; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.921; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)