9tnz

SP100 CARD filament

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 226.7 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Nuclear autoantigen Sp-100

Homo sapiens

UniProt P0AEX9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric(26) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 27–361 链 AA; UniProt 27–361 链 B; UniProt 27–361 链 C; UniProt 27–361 链 D; UniProt 27–361 链 E; UniProt 27–361 链 F; UniProt 27–361 链 G; UniProt 27–361 链 H; UniProt 27–361 链 I; UniProt 27–361 链 J; UniProt 27–361 链 K; UniProt 27–361 链 L; UniProt 27–361 链 M; UniProt 27–361 链 N; UniProt 27–361 链 O; UniProt 27–361 链 P; UniProt 27–361 链 Q; UniProt 27–361 链 R; UniProt 27–361 链 S; UniProt 27–361 链 T; UniProt 27–361 链 V; UniProt 27–361 链 W; UniProt 27–361 链 X; UniProt 27–361 链 Y; UniProt 27–361 链 Z; UniProt 27–361 未记录 无其他共同聚合物 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.52 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 366 个其他 PDB 条目、491 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MALE_ECOLI
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 AA; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 B; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 C; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 D; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 E; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 F; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 G; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 H; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 I; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 J; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 K; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 L; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 M; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 N; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 O; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 P; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 Q; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 R; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 S; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 T; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 V; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 W; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 X; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 Y; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361 作者链 Z; PDB构建体 15–349; UniProt 27–361

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Nuclear autoantigen Sp-100

Homo sapiens

UniProt P23497

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric(26) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 33–149 链 AA; UniProt 33–149 链 B; UniProt 33–149 链 C; UniProt 33–149 链 D; UniProt 33–149 链 E; UniProt 33–149 链 F; UniProt 33–149 链 G; UniProt 33–149 链 H; UniProt 33–149 链 I; UniProt 33–149 链 J; UniProt 33–149 链 K; UniProt 33–149 链 L; UniProt 33–149 链 M; UniProt 33–149 链 N; UniProt 33–149 链 O; UniProt 33–149 链 P; UniProt 33–149 链 Q; UniProt 33–149 链 R; UniProt 33–149 链 S; UniProt 33–149 链 T; UniProt 33–149 链 V; UniProt 33–149 链 W; UniProt 33–149 链 X; UniProt 33–149 链 Y; UniProt 33–149 链 Z; UniProt 33–149 未记录 无其他共同聚合物 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.52 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 122 个其他 PDB 条目、242 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SP100_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 AA; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 B; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 C; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 D; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 E; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 F; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 G; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 H; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 I; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 J; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 K; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 L; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 M; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 N; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 O; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 P; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 Q; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 R; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 S; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 T; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 V; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 W; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 X; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 Y; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149 作者链 Z; PDB构建体 409–525; UniProt 33–149

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9tnz

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9tnz
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9tnz
沉积日期 deposition_date2025-12-16
结构标题 titleSP100 CARD filament
关键词 keywordsInnate immunity, interferon, DNA damage, cryo-EM, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier76.33
回转半径 Rg (电子) rg_electron78.23
零角强度 I(0) i01200440000.00
分子量 molecular_weight304450.0 kDa
排除体积 excluded_volume386620 ų
包络体积 envelope_volume672060 ų
水化壳体积 shell_volume83401 ų
包络直径 envelope_diameter279.1
壳层 Rg shell_rg57.09
包络 Rg envelope_rg77.56
形状 Rg shape_rg78.24
总 Rg total_rg77.70
总原子数 total_atoms21502
残基数 n_residues2574
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax226.7
Rg (实空间) rg_real73.79
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.70
I(0) (实空间) i0_real1.1780e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.2120e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal71.85
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1187000000.0000
解质量估计 total_estimate0.7778
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary45.4
偏度 Skewness skewness0.549
峰度 Kurtosis kurtosis-0.619
角度范围 angular_range— – 0.1000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.1630
最高正则化参数 α highest_alpha54580000.0000
实空间数据点数 n_real_points21
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.654; Stabil: 0.986; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.763; Smooth: 0.105

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)