7cgo

Cryo-EM structure of the flagellar motor-hook complex from Salmonella

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 397.7 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar basal-body rod protein FlgG

物种未注明

UniProt P0A1J3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 219 PDB 声明:219-meric(219) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–260 链 B; UniProt 1–260 链 C; UniProt 1–260 链 D; UniProt 1–260 链 E; UniProt 1–260 链 F; UniProt 1–260 链 G; UniProt 1–260 链 H; UniProt 1–260 链 I; UniProt 1–260 链 J; UniProt 1–260 链 K; UniProt 1–260 链 L; UniProt 1–260 链 M; UniProt 1–260 链 N; UniProt 1–260 链 O; UniProt 1–260 链 P; UniProt 1–260 链 Q; UniProt 1–260 链 R; UniProt 1–260 链 S; UniProt 1–260 链 T; UniProt 1–260 链 U; UniProt 1–260 链 V; UniProt 1–260 链 W; UniProt 1–260 链 X; UniProt 1–260 未记录 Flagellar basal-body rod protein FlgF × 5 (P16323) Flagellar MS ring L2 × 5 Flagellar MS ring L1 × 5 (P15928) Flagellar basal-body rod protein FlgC × 6 (P0A1I7) Flagellar basal body rod protein FlgB × 5 (P16437) Flagellar hook-basal body complex protein FliE × 6 (P26462) Flagellar hook protein FlgE × 33 (P0A1J1) Flagellar biosynthetic protein FliR × 1 (P54702) Flagellar biosynthetic protein FliQ × 4 (P0A1L5) Flagellar biosynthetic protein FliP × 5 (P54700) Flagellar M-ring protein × 57 (P15928) FlgB-Dc loop × 5 FliE helix 1 × 6 Flagellar L-ring protein × 26 (P0A1N8) Flagellar P-ring protein × 26 (P15930) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;blot for 6 seconds before plunging 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 14 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLGG_SALTY
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 B; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 C; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 D; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 E; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 F; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 G; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 H; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 I; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 J; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 K; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 L; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 M; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 N; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 O; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 P; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 Q; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 R; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 S; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 T; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 U; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 V; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 W; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260 作者链 X; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260

Flagellar basal-body rod protein FlgF

物种未注明

UniProt P16323

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 219 PDB 声明:219-meric(219) 与蛋白拷贝数一致 链 a; UniProt 1–251 链 b; UniProt 1–251 链 c; UniProt 1–251 链 d; UniProt 1–251 链 e; UniProt 1–251 未记录 Flagellar basal-body rod protein FlgG × 24 (P0A1J3) Flagellar MS ring L2 × 5 Flagellar MS ring L1 × 5 (P15928) Flagellar basal-body rod protein FlgC × 6 (P0A1I7) Flagellar basal body rod protein FlgB × 5 (P16437) Flagellar hook-basal body complex protein FliE × 6 (P26462) Flagellar hook protein FlgE × 33 (P0A1J1) Flagellar biosynthetic protein FliR × 1 (P54702) Flagellar biosynthetic protein FliQ × 4 (P0A1L5) Flagellar biosynthetic protein FliP × 5 (P54700) Flagellar M-ring protein × 57 (P15928) FlgB-Dc loop × 5 FliE helix 1 × 6 Flagellar L-ring protein × 26 (P0A1N8) Flagellar P-ring protein × 26 (P15930) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;blot for 6 seconds before plunging 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 12 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLGF_SALTY
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 a; PDB构建体 1–251; UniProt 1–251 作者链 b; PDB构建体 1–251; UniProt 1–251 作者链 c; PDB构建体 1–251; UniProt 1–251 作者链 d; PDB构建体 1–251; UniProt 1–251 作者链 e; PDB构建体 1–251; UniProt 1–251

Flagellar MS ring L1

物种未注明

UniProt P15928

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 219 PDB 声明:219-meric(219) 与蛋白拷贝数一致 链 5; UniProt 311–331 链 6; UniProt 311–331 链 7; UniProt 311–331 链 8; UniProt 311–331 链 9; UniProt 311–331 链 Ca; UniProt 1–560 链 Cb; UniProt 1–560 链 Cc; UniProt 1–560 链 Cd; UniProt 1–560 链 Ce; UniProt 1–560 链 Cf; UniProt 1–560 链 Cg; UniProt 1–560 链 Ch; UniProt 1–560 链 Ci; UniProt 1–560 链 Cj; UniProt 1–560 链 Ck; UniProt 1–560 链 Cl; UniProt 1–560 链 Cm; UniProt 1–560 链 Cn; UniProt 1–560 链 Co; UniProt 1–560 链 Cp; UniProt 1–560 链 Cq; UniProt 1–560 链 Cr; UniProt 1–560 链 Cs; UniProt 1–560 链 Ct; UniProt 1–560 链 Cu; UniProt 1–560 链 Cv; UniProt 1–560 链 Cw; UniProt 1–560 链 Cx; UniProt 1–560 链 Cy; UniProt 1–560 链 Cz; UniProt 1–560 链 Da; UniProt 1–560 链 Db; UniProt 1–560 链 Dc; UniProt 1–560 链 Dd; UniProt 1–560 链 De; UniProt 1–560 链 Df; UniProt 1–560 链 Dg; UniProt 1–560 链 Dh; UniProt 1–560 链 Di; UniProt 1–560 链 Dj; UniProt 1–560 链 Dk; UniProt 1–560 链 Dl; UniProt 1–560 链 Dm; UniProt 1–560 链 Dn; UniProt 1–560 链 Do; UniProt 1–560 链 Dp; UniProt 1–560 链 Dq; UniProt 1–560 链 Dr; UniProt 1–560 链 Ds; UniProt 1–560 链 Dt; UniProt 1–560 链 Du; UniProt 1–560 链 Dv; UniProt 1–560 链 Dw; UniProt 1–560 链 Ea; UniProt 1–560 链 Eb; UniProt 1–560 链 Ec; UniProt 1–560 链 Ed; UniProt 1–560 链 Ee; UniProt 1–560 链 Ef; UniProt 1–560 链 Eg; UniProt 1–560 链 Eh; UniProt 1–560 未记录 Flagellar basal-body rod protein FlgG × 24 (P0A1J3) Flagellar basal-body rod protein FlgF × 5 (P16323) Flagellar MS ring L2 × 5 Flagellar basal-body rod protein FlgC × 6 (P0A1I7) Flagellar basal body rod protein FlgB × 5 (P16437) Flagellar hook-basal body complex protein FliE × 6 (P26462) Flagellar hook protein FlgE × 33 (P0A1J1) Flagellar biosynthetic protein FliR × 1 (P54702) Flagellar biosynthetic protein FliQ × 4 (P0A1L5) Flagellar biosynthetic protein FliP × 5 (P54700) FlgB-Dc loop × 5 FliE helix 1 × 6 Flagellar L-ring protein × 26 (P0A1N8) Flagellar P-ring protein × 26 (P15930) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;blot for 6 seconds before plunging 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 47 个其他 PDB 条目、47 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLIF_SALTY
Isoform
PDB实体 4, 12
链与序列区间 作者链 5; PDB构建体 1–21; UniProt 311–331 作者链 6; PDB构建体 1–21; UniProt 311–331 作者链 7; PDB构建体 1–21; UniProt 311–331 作者链 8; PDB构建体 1–21; UniProt 311–331 作者链 9; PDB构建体 1–21; UniProt 311–331 作者链 Ca; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cb; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cc; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cd; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Ce; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cf; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cg; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Ch; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Ci; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cj; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Ck; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cl; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cm; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cn; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Co; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cp; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cq; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cr; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cs; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Ct; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cu; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cv; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cw; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cx; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cy; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Cz; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Da; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Db; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dc; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dd; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 De; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Df; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dg; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dh; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Di; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dj; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dk; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dl; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dm; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dn; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Do; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dp; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dq; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dr; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Ds; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dt; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Du; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dv; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Dw; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Ea; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Eb; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Ec; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Ed; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Ee; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Ef; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Eg; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560 作者链 Eh; PDB构建体 1–560; UniProt 1–560

Flagellar basal-body rod protein FlgC

物种未注明

UniProt P0A1I7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 219 PDB 声明:219-meric(219) 与蛋白拷贝数一致 链 f; UniProt 1–134 链 g; UniProt 1–134 链 h; UniProt 1–134 链 i; UniProt 1–134 链 j; UniProt 1–134 链 p; UniProt 1–134 未记录 Flagellar basal-body rod protein FlgG × 24 (P0A1J3) Flagellar basal-body rod protein FlgF × 5 (P16323) Flagellar MS ring L2 × 5 Flagellar MS ring L1 × 5 (P15928) Flagellar basal body rod protein FlgB × 5 (P16437) Flagellar hook-basal body complex protein FliE × 6 (P26462) Flagellar hook protein FlgE × 33 (P0A1J1) Flagellar biosynthetic protein FliR × 1 (P54702) Flagellar biosynthetic protein FliQ × 4 (P0A1L5) Flagellar biosynthetic protein FliP × 5 (P54700) Flagellar M-ring protein × 57 (P15928) FlgB-Dc loop × 5 FliE helix 1 × 6 Flagellar L-ring protein × 26 (P0A1N8) Flagellar P-ring protein × 26 (P15930) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;blot for 6 seconds before plunging 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLGC_SALTY
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 f; PDB构建体 1–134; UniProt 1–134 作者链 g; PDB构建体 1–134; UniProt 1–134 作者链 h; PDB构建体 1–134; UniProt 1–134 作者链 i; PDB构建体 1–134; UniProt 1–134 作者链 j; PDB构建体 1–134; UniProt 1–134 作者链 p; PDB构建体 1–134; UniProt 1–134

Flagellar basal body rod protein FlgB

物种未注明

UniProt P16437

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 219 PDB 声明:219-meric(219) 与蛋白拷贝数一致 链 k; UniProt 1–138 链 l; UniProt 1–138 链 m; UniProt 1–138 链 n; UniProt 1–138 链 o; UniProt 1–138 未记录 Flagellar basal-body rod protein FlgG × 24 (P0A1J3) Flagellar basal-body rod protein FlgF × 5 (P16323) Flagellar MS ring L2 × 5 Flagellar MS ring L1 × 5 (P15928) Flagellar basal-body rod protein FlgC × 6 (P0A1I7) Flagellar hook-basal body complex protein FliE × 6 (P26462) Flagellar hook protein FlgE × 33 (P0A1J1) Flagellar biosynthetic protein FliR × 1 (P54702) Flagellar biosynthetic protein FliQ × 4 (P0A1L5) Flagellar biosynthetic protein FliP × 5 (P54700) Flagellar M-ring protein × 57 (P15928) FlgB-Dc loop × 5 FliE helix 1 × 6 Flagellar L-ring protein × 26 (P0A1N8) Flagellar P-ring protein × 26 (P15930) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;blot for 6 seconds before plunging 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLGB_SALTY
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 k; PDB构建体 1–138; UniProt 1–138 作者链 l; PDB构建体 1–138; UniProt 1–138 作者链 m; PDB构建体 1–138; UniProt 1–138 作者链 n; PDB构建体 1–138; UniProt 1–138 作者链 o; PDB构建体 1–138; UniProt 1–138

Flagellar hook-basal body complex protein FliE

物种未注明

UniProt P26462

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 219 PDB 声明:219-meric(219) 与蛋白拷贝数一致 链 q; UniProt 1–104 链 r; UniProt 1–104 链 s; UniProt 1–104 链 t; UniProt 1–104 链 u; UniProt 1–104 链 v; UniProt 1–104 未记录 Flagellar basal-body rod protein FlgG × 24 (P0A1J3) Flagellar basal-body rod protein FlgF × 5 (P16323) Flagellar MS ring L2 × 5 Flagellar MS ring L1 × 5 (P15928) Flagellar basal-body rod protein FlgC × 6 (P0A1I7) Flagellar basal body rod protein FlgB × 5 (P16437) Flagellar hook protein FlgE × 33 (P0A1J1) Flagellar biosynthetic protein FliR × 1 (P54702) Flagellar biosynthetic protein FliQ × 4 (P0A1L5) Flagellar biosynthetic protein FliP × 5 (P54700) Flagellar M-ring protein × 57 (P15928) FlgB-Dc loop × 5 FliE helix 1 × 6 Flagellar L-ring protein × 26 (P0A1N8) Flagellar P-ring protein × 26 (P15930) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;blot for 6 seconds before plunging 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLIE_SALTY
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 q; PDB构建体 1–104; UniProt 1–104 作者链 r; PDB构建体 1–104; UniProt 1–104 作者链 s; PDB构建体 1–104; UniProt 1–104 作者链 t; PDB构建体 1–104; UniProt 1–104 作者链 u; PDB构建体 1–104; UniProt 1–104 作者链 v; PDB构建体 1–104; UniProt 1–104

Flagellar hook protein FlgE

物种未注明

UniProt P0A1J1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 219 PDB 声明:219-meric(219) 与蛋白拷贝数一致 链 DA; UniProt 1–403 链 DB; UniProt 1–403 链 DC; UniProt 1–403 链 DD; UniProt 1–403 链 DE; UniProt 1–403 链 DF; UniProt 1–403 链 DG; UniProt 1–403 链 DH; UniProt 1–403 链 DI; UniProt 1–403 链 DJ; UniProt 1–403 链 DK; UniProt 1–403 链 DL; UniProt 1–403 链 DM; UniProt 1–403 链 DN; UniProt 1–403 链 DO; UniProt 1–403 链 DP; UniProt 1–403 链 DQ; UniProt 1–403 链 DR; UniProt 1–403 链 DS; UniProt 1–403 链 DT; UniProt 1–403 链 DU; UniProt 1–403 链 DV; UniProt 1–403 链 DW; UniProt 1–403 链 DX; UniProt 1–403 链 DY; UniProt 1–403 链 DZ; UniProt 1–403 链 EA; UniProt 1–403 链 EB; UniProt 1–403 链 EC; UniProt 1–403 链 ED; UniProt 1–403 链 EE; UniProt 1–403 链 EF; UniProt 1–403 链 EG; UniProt 1–403 未记录 Flagellar basal-body rod protein FlgG × 24 (P0A1J3) Flagellar basal-body rod protein FlgF × 5 (P16323) Flagellar MS ring L2 × 5 Flagellar MS ring L1 × 5 (P15928) Flagellar basal-body rod protein FlgC × 6 (P0A1I7) Flagellar basal body rod protein FlgB × 5 (P16437) Flagellar hook-basal body complex protein FliE × 6 (P26462) Flagellar biosynthetic protein FliR × 1 (P54702) Flagellar biosynthetic protein FliQ × 4 (P0A1L5) Flagellar biosynthetic protein FliP × 5 (P54700) Flagellar M-ring protein × 57 (P15928) FlgB-Dc loop × 5 FliE helix 1 × 6 Flagellar L-ring protein × 26 (P0A1N8) Flagellar P-ring protein × 26 (P15930) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;blot for 6 seconds before plunging 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 20 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLGE_SALTY
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 DA; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DB; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DC; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DD; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DE; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DF; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DG; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DH; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DI; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DJ; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DK; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DL; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DM; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DN; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DO; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DP; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DQ; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DR; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DS; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DT; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DU; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DV; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DW; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DX; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DY; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 DZ; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 EA; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 EB; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 EC; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 ED; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 EE; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 EF; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403 作者链 EG; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403

Flagellar biosynthetic protein FliR

物种未注明

UniProt P54702

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 219 PDB 声明:219-meric(219) 与蛋白拷贝数一致 链 CE; UniProt 1–264 未记录 Flagellar basal-body rod protein FlgG × 24 (P0A1J3) Flagellar basal-body rod protein FlgF × 5 (P16323) Flagellar MS ring L2 × 5 Flagellar MS ring L1 × 5 (P15928) Flagellar basal-body rod protein FlgC × 6 (P0A1I7) Flagellar basal body rod protein FlgB × 5 (P16437) Flagellar hook-basal body complex protein FliE × 6 (P26462) Flagellar hook protein FlgE × 33 (P0A1J1) Flagellar biosynthetic protein FliQ × 4 (P0A1L5) Flagellar biosynthetic protein FliP × 5 (P54700) Flagellar M-ring protein × 57 (P15928) FlgB-Dc loop × 5 FliE helix 1 × 6 Flagellar L-ring protein × 26 (P0A1N8) Flagellar P-ring protein × 26 (P15930) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;blot for 6 seconds before plunging 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 FLIR_SALTY
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 CE; PDB构建体 1–264; UniProt 1–264

Flagellar biosynthetic protein FliQ

物种未注明

UniProt P0A1L5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 219 PDB 声明:219-meric(219) 与蛋白拷贝数一致 链 CA; UniProt 1–89 链 CB; UniProt 1–89 链 CC; UniProt 1–89 链 CD; UniProt 1–89 未记录 Flagellar basal-body rod protein FlgG × 24 (P0A1J3) Flagellar basal-body rod protein FlgF × 5 (P16323) Flagellar MS ring L2 × 5 Flagellar MS ring L1 × 5 (P15928) Flagellar basal-body rod protein FlgC × 6 (P0A1I7) Flagellar basal body rod protein FlgB × 5 (P16437) Flagellar hook-basal body complex protein FliE × 6 (P26462) Flagellar hook protein FlgE × 33 (P0A1J1) Flagellar biosynthetic protein FliR × 1 (P54702) Flagellar biosynthetic protein FliP × 5 (P54700) Flagellar M-ring protein × 57 (P15928) FlgB-Dc loop × 5 FliE helix 1 × 6 Flagellar L-ring protein × 26 (P0A1N8) Flagellar P-ring protein × 26 (P15930) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;blot for 6 seconds before plunging 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 12 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 FLIQ_SALTY
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 CA; PDB构建体 1–89; UniProt 1–89 作者链 CB; PDB构建体 1–89; UniProt 1–89 作者链 CC; PDB构建体 1–89; UniProt 1–89 作者链 CD; PDB构建体 1–89; UniProt 1–89

Flagellar biosynthetic protein FliP

物种未注明

UniProt P54700

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 219 PDB 声明:219-meric(219) 与蛋白拷贝数一致 链 CF; UniProt 1–245 链 w; UniProt 1–245 链 x; UniProt 1–245 链 y; UniProt 1–245 链 z; UniProt 1–245 未记录 Flagellar basal-body rod protein FlgG × 24 (P0A1J3) Flagellar basal-body rod protein FlgF × 5 (P16323) Flagellar MS ring L2 × 5 Flagellar MS ring L1 × 5 (P15928) Flagellar basal-body rod protein FlgC × 6 (P0A1I7) Flagellar basal body rod protein FlgB × 5 (P16437) Flagellar hook-basal body complex protein FliE × 6 (P26462) Flagellar hook protein FlgE × 33 (P0A1J1) Flagellar biosynthetic protein FliR × 1 (P54702) Flagellar biosynthetic protein FliQ × 4 (P0A1L5) Flagellar M-ring protein × 57 (P15928) FlgB-Dc loop × 5 FliE helix 1 × 6 Flagellar L-ring protein × 26 (P0A1N8) Flagellar P-ring protein × 26 (P15930) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;blot for 6 seconds before plunging 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 FLIP_SALTY
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 CF; PDB构建体 1–245; UniProt 1–245 作者链 w; PDB构建体 1–245; UniProt 1–245 作者链 x; PDB构建体 1–245; UniProt 1–245 作者链 y; PDB构建体 1–245; UniProt 1–245 作者链 z; PDB构建体 1–245; UniProt 1–245

Flagellar L-ring protein

物种未注明

UniProt P0A1N8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 219 PDB 声明:219-meric(219) 与蛋白拷贝数一致 链 AA; UniProt 1–232 链 AB; UniProt 1–232 链 AC; UniProt 1–232 链 AD; UniProt 1–232 链 AE; UniProt 1–232 链 AF; UniProt 1–232 链 AG; UniProt 1–232 链 AH; UniProt 1–232 链 AI; UniProt 1–232 链 AJ; UniProt 1–232 链 AK; UniProt 1–232 链 AL; UniProt 1–232 链 AM; UniProt 1–232 链 AN; UniProt 1–232 链 AO; UniProt 1–232 链 AP; UniProt 1–232 链 AQ; UniProt 1–232 链 AR; UniProt 1–232 链 AS; UniProt 1–232 链 AT; UniProt 1–232 链 AU; UniProt 1–232 链 AV; UniProt 1–232 链 AW; UniProt 1–232 链 AX; UniProt 1–232 链 AY; UniProt 1–232 链 AZ; UniProt 1–232 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) Flagellar basal-body rod protein FlgG × 24 (P0A1J3) Flagellar basal-body rod protein FlgF × 5 (P16323) Flagellar MS ring L2 × 5 Flagellar MS ring L1 × 5 (P15928) Flagellar basal-body rod protein FlgC × 6 (P0A1I7) Flagellar basal body rod protein FlgB × 5 (P16437) Flagellar hook-basal body complex protein FliE × 6 (P26462) Flagellar hook protein FlgE × 33 (P0A1J1) Flagellar biosynthetic protein FliR × 1 (P54702) Flagellar biosynthetic protein FliQ × 4 (P0A1L5) Flagellar biosynthetic protein FliP × 5 (P54700) Flagellar M-ring protein × 57 (P15928) FlgB-Dc loop × 5 FliE helix 1 × 6 Flagellar P-ring protein × 26 (P15930) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;blot for 6 seconds before plunging 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 FLGH_SALTY
Isoform
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 AA; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AB; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AC; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AD; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AE; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AF; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AG; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AH; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AI; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AJ; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AK; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AL; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AM; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AN; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AO; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AP; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AQ; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AR; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AS; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AT; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AU; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AV; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AW; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AX; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AY; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232 作者链 AZ; PDB构建体 1–232; UniProt 1–232

Flagellar P-ring protein

物种未注明

UniProt P15930

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 219 PDB 声明:219-meric(219) 与蛋白拷贝数一致 链 BA; UniProt 1–365 链 BB; UniProt 1–365 链 BC; UniProt 1–365 链 BD; UniProt 1–365 链 BE; UniProt 1–365 链 BF; UniProt 1–365 链 BG; UniProt 1–365 链 BH; UniProt 1–365 链 BI; UniProt 1–365 链 BJ; UniProt 1–365 链 BK; UniProt 1–365 链 BL; UniProt 1–365 链 BM; UniProt 1–365 链 BN; UniProt 1–365 链 BO; UniProt 1–365 链 BP; UniProt 1–365 链 BQ; UniProt 1–365 链 BR; UniProt 1–365 链 BS; UniProt 1–365 链 BT; UniProt 1–365 链 BU; UniProt 1–365 链 BV; UniProt 1–365 链 BW; UniProt 1–365 链 BX; UniProt 1–365 链 BY; UniProt 1–365 链 BZ; UniProt 1–365 未记录 Flagellar basal-body rod protein FlgG × 24 (P0A1J3) Flagellar basal-body rod protein FlgF × 5 (P16323) Flagellar MS ring L2 × 5 Flagellar MS ring L1 × 5 (P15928) Flagellar basal-body rod protein FlgC × 6 (P0A1I7) Flagellar basal body rod protein FlgB × 5 (P16437) Flagellar hook-basal body complex protein FliE × 6 (P26462) Flagellar hook protein FlgE × 33 (P0A1J1) Flagellar biosynthetic protein FliR × 1 (P54702) Flagellar biosynthetic protein FliQ × 4 (P0A1L5) Flagellar biosynthetic protein FliP × 5 (P54700) Flagellar M-ring protein × 57 (P15928) FlgB-Dc loop × 5 FliE helix 1 × 6 Flagellar L-ring protein × 26 (P0A1N8) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;blot for 6 seconds before plunging 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLGI_SALTY
Isoform
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 BA; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BB; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BC; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BD; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BE; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BF; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BG; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BH; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BI; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BJ; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BK; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BL; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BM; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BN; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BO; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BP; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BQ; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BR; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BS; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BT; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BU; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BV; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BW; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BX; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BY; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365 作者链 BZ; PDB构建体 1–365; UniProt 1–365

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7cgo

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7cgo
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7cgo
沉积日期 deposition_date2020-07-01
结构标题 titleCryo-EM structure of the flagellar motor-hook complex from Salmonella
关键词 keywordsFlagella, Hook-basal body, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron137.40
零角强度 I(0) i0334285000000.00
分子量 molecular_weight4779500.0 kDa
排除体积 excluded_volume5915500 ų
包络体积 envelope_volume10567000 ų
水化壳体积 shell_volume629250 ų
包络直径 envelope_diameter514.8
壳层 Rg shell_rg130.10
包络 Rg envelope_rg141.10
形状 Rg shape_rg137.40
总 Rg total_rg137.20
总原子数 total_atoms335722
残基数 n_residues45082
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax397.7
Rg (实空间) rg_real129.60
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.07
I(0) (实空间) i0_real3.2080e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.8560e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal122.40
I(0) (倒空间) i0_reciprocal318500000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8946
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary144.6
偏度 Skewness skewness0.507
峰度 Kurtosis kurtosis-0.187
角度范围 angular_range— – 0.0550 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.9484
最高正则化参数 α highest_alpha25410000000.0000
实空间数据点数 n_real_points12
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.009; Oscil: 0.931; Stabil: 0.979; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.899; Smooth: 0.002

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)