Structure of transcribing complex 2 (TC2), the initially transcribing complex with Pol II positioned 2nt downstream of TSS.

CDK-activating kinase assembly factor MAT1

Homo sapiens

UniProt P51948

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 0； UniProt 1–309	未记录	General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1G25 SOLUTION STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF THE HUMAN TFIIH MAT1 SUBUNIT 提交 2000-10-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；298 K；压力 ambiant NMR测量条件 pH 7.5；290 K；压力 ambiant NMR测量条件 pH 7.5；283 K；压力 ambiant NMR样品组成 2 mM MAT1; 20 mM Tris-HCl pH 7.5; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
28JM Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH and XPC initial encounter complex 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.29 Å
28JS Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (composite map) 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.32 Å
28JV Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (consensus map) 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.91 Å
28KE Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC-XPA complex bound to bulky lesion-mimic DNA 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.60 Å
6NMI Cryo-EM structure of the human TFIIH core complex 提交 2019-01-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；A thin film of continuous carbon was floated onto Protochips C-flat CF-4/2 holey carbon grids and glow discharged or plasma cleaned before application of 4 uL of sample solution.	分辨率 3.70 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
6O9M Structure of the human apo TFIIH 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6TUN Helicase domain complex 提交 2020-01-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 66–141（76 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris pH 8.5 25% PEG8000	分辨率 2.07 Å R-free 0.227
6TUN Helicase domain complex 提交 2020-01-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 66–141（76 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris pH 8.5 25% PEG8000	分辨率 2.07 Å R-free 0.227
6XBZ Structure of the human CDK-activating kinase 提交 2020-06-07	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
6XD3 Structure of the human CAK in complex with THZ1 提交 2020-06-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa） 片段：residues 220-309	未记录	V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7B5O Cryo-EM structure of the human CAK bound to ICEC0942 at 2.5 Angstroms resolution 提交 2020-12-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.50 Å
7B5Q Cryo-EM structure of the human CAK bound to ICEC0942 (PHENIX-OPLS3e) 提交 2020-12-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.50 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 d 1–309（309 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVW TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7NVX TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 3 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 7 1–309（309 aa）	突变：0	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 7 1–309（309 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HD 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HD 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8ORM Cryo-EM structure of CAK-THZ1 提交 2023-04-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6V Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0942 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6W Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor BS-181 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X2H ~{N}5-(6-azanylhexyl)-~{N}7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6X Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor BS-194 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	NS9 (2S,3S)-3-{[7-(benzylamino)-3-(1-methylethyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino}butane-1,2,4-triol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6Y Cryo-EM structure of CAK in complex with nucleotide analogue ATPgS 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P6Z Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0510-R 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X4L N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-N5-[(3R)-pyrrolidin-3-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
8P70 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0510-S 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X4Q N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-N5-[(3S)-pyrrolidin-3-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P71 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0574 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X4F (3R,4S)-4-[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]pyrrolidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P72 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0768 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X2Z ~{N}7-(phenylmethyl)-~{N}5-[(3~{S})-piperidin-3-yl]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P73 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0829 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X50 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidine-3,4-diol × 1 X58 (3S,4S)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidine-3,4-diol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P74 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0880 (ring-up conformation) 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X3Z (2S,3S)-3-[[7-[(2-bromophenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]butane-1,2,4-triol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.20 Å
8P75 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0880 (ring-down conformation) 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X3Z (2S,3S)-3-[[7-[(2-bromophenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]butane-1,2,4-triol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P76 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0914 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	X1W N5-[(3S,4R)-4-phenylmethoxypyrrolidin-3-yl]-N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
8P77 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0943 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	I73 (3S,4S)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.80 Å
8P78 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor dinaciclib 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	1QK 3-[({3-ethyl-5-[(2S)-2-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl}amino)methyl]-1-hydroxypyridinium × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8P79 Cryo-EM structure of CAK with averaged inhibitor density 提交 2023-05-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；Structure obtained by combining data from six samples of CAK bound to different non-covalent inhibitors. Four samples contained 5 mM beta-mercaptoethanol and two samples did not. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.70 Å
8P7L Cryo-EM structure of CDK7 subunit of CAK in complex with inhibitor LDC4297 提交 2023-05-30	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	WD9 2-[(3S)-piperidin-3-yl]oxy-8-propan-2-yl-N-[(2-pyrazol-1-ylphenyl)methyl]pyrazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-4-amine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
8PLZ Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor CT7030 提交 2023-06-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	ZQ6 (3~{R},4~{R})-4-[[[7-[(2-methoxyphenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
8PYR Crystal structure of the dual T-loop phosphorylated Cdk7/CycH/Mat1 complex 提交 2023-07-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 230–309（80 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；0.1 M Hepes (pH 7.0), 12% (v/w) medium weight PEG mix of PEG6K and PEG4K, 10% ethylene-glycol, and 0.2 M NDSB	分辨率 2.15 Å R-free 0.241
8PYR Crystal structure of the dual T-loop phosphorylated Cdk7/CycH/Mat1 complex 提交 2023-07-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 230–309（80 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；0.1 M Hepes (pH 7.0), 12% (v/w) medium weight PEG mix of PEG6K and PEG4K, 10% ethylene-glycol, and 0.2 M NDSB	分辨率 2.15 Å R-free 0.241
8S0R Cryo-EM structure of CAK modified by covalent inhibitor SY-1365 提交 2024-02-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	A1H46 ~{N}-[(1~{S},3~{R})-3-[[5-chloranyl-4-(1~{H}-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]-1-methyl-cyclohexyl]-5-[4-(dimethylamino)butanoylamino]pyridine-2-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
8S0T Cryo-EM structure of CAK in complex with SY-5609 提交 2024-02-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	YNK 7-dimethylphosphoryl-3-[2-[[(3~{S})-6,6-dimethylpiperidin-3-yl]amino]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]-1~{H}-indole-6-carbonitrile × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；Buffer contained 54 uM inhibitor SY-5609. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 0 1–309（309 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
9HIX Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with THZ1 提交 2024-11-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9HIY Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with ATPgS 提交 2024-11-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
9HJ0 Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with Samuraciclib 提交 2024-11-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9I9I Cryo-EM structure of CAK-CDK11 提交 2025-02-06	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9I9J Cryo-EM structure of CAK-CDK2 (determined in the presence of ADP-nitrate) 提交 2025-02-06	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9I9K Cryo-EM structure of CAK-CDK2 (determined in the presence of ADP-AlFx) 提交 2025-02-06	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9QCV Cryo-EM structure of CAK-CDK2-cyclin A2 bound to AMP-PNP 提交 2025-03-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9QCX Cryo-EM structure of apo-CAK-CDK2-cyclin A2 提交 2025-03-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9QJN Cryo-EM structure of the human CAK bound to OTS964 提交 2025-03-19	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 220–309（90 aa）	未记录	NK3 OTS964 × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9SKQ Cryo-EM structure of CAK-CDK1-cyclin B1 提交 2025-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 1–309（309 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 66 个其他 PDB 条目、68 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MAT1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 0； PDB构建体 1–309； UniProt 1–309

General transcription factor IIH subunit 1

Homo sapiens

UniProt P32780

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 1； UniProt 1–548	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1PFJ Solution structure of the N-terminal PH/PTB domain of the TFIIH P62 subunit 提交 2003-05-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa） 片段：N-terminal PH/PTB domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；293 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM；压力 ambient NMR测量条件 pH 7.4；293 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM；压力 ambient NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM；压力 ambient NMR测量条件 pH 7.4；293 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM；压力 ambient NMR样品组成 1.5mM P62 U-15N,13C; 20mM deuterated TRIS; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.2mM P62 U-15N; 20mM deuterated TRIS; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.9mM P62 U-15N; 20mM deuterated TRIS + 26ug C12E6/hexanol; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O, 10% D2O; 26 ug C12E6/hexanol NMR样品组成 1.5mM P62; 20mM deuterated TRIS; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
28JM Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH and XPC initial encounter complex 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.29 Å
28JS Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (composite map) 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.32 Å
28JV Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (consensus map) 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.91 Å
28KE Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC-XPA complex bound to bulky lesion-mimic DNA 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.60 Å
2DII Solution structure of the BSD domain of human TFIIH basal transcription factor complex p62 subunit 提交 2006-03-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 103–150（48 aa） 片段：BSD domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；296 K；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 ambient NMR样品组成 1.07mM BSD domain U-15N,13C; 20mM d-Tris HCl (pH 7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2RNR Solution structure of the complex between TFIIE alpha C-terminal acidic domain and TFIIH p62 PH domain 提交 2008-01-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–108（108 aa） 片段：PH domain, UNP residues 1-108	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient NMR样品组成 0.5MM [U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 0.5MM TFIIH P62; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5MM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 0.5MM TFIIH P62; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5MM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 0.5MM TFIIH P62; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 0.5MM [U-100% 15N] TFIIH P62, 0.5mM TFIIE-ALPHA; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5MM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIH P62, 0.5MM TFIIE-ALPHA; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5MM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIH P62, 0.5MM TFIIE-ALPHA; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
2RUK Solution structure of the complex between p53 transactivation domain 2 and TFIIH p62 PH domain 提交 2014-09-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–108（108 aa） 片段：TFIIH p62 PH domain, UNP residues 1-108	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient NMR样品组成 0.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TFIIH p62 PH domain-1, 0.48 mM p53 TAD2-2, 20 mM potassium phosphate-3, 5 mM [U-2H] DTT-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TFIIH p62 PH domain-5, 0.48 mM p53 TAD2-6, 20 mM potassium phosphate-7, 5 mM [U-2H] DTT-8, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
2RVB Solution structure of the complex between XPC acidic domain and TFIIH p62 PH domain 提交 2015-07-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient NMR样品组成 0.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] XPC acidic domain-1, 0.48 mM TFIIH p62 PH domain-2, 20 mM potassium phosphate-3, 5 mM [U-2H] DTT-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] XPC acidic domain-5, 0.48 mM TFIIH p62 PH domain-6, 20 mM potassium phosphate-7, 5 mM [U-2H] DTT-8, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 0.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TFIIH p62 PH domain-9, 0.48 mM XPC acidic domain-10, 20 mM potassium phosphate-11, 5 mM [U-2H] DTT-12, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TFIIH p62 PH domain-13, 0.48 mM XPC acidic domain-14, 20 mM potassium phosphate-15, 5 mM [U-2H] DTT-16, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
5GOW Solution structure of the complex between DP1 acidic region and TFIIH p62 PH domain 提交 2016-07-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–108（108 aa） 片段：UNP residues 1-108	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 760 NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] DP1, 0.42 mM TFIIH p62, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] DP1, 0.42 mM TFIIH p62, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TFIIH p62, 0.42 mM DP1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.35 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TFIIH p62, 0.42 mM DP1, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
5XV8 Solution structure of the complex between UVSSA acidic region and TFIIH p62 PH domain 提交 2017-06-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–108（107 aa） 片段：UNP residues 2-108	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 760 NMR样品组成 0.40 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] UVSSA, 0.48 mM TFIIH p62, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.40 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] UVSSA, 0.48 mM TFIIH p62, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 0.40 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TFIIH p62, 0.48 mM UVSSA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.40 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TFIIH p62, 0.48 mM UVSSA, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
6O9M Structure of the human apo TFIIH 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7AD8 Core TFIIH-XPA-DNA complex with modelled p62 subunit 提交 2020-09-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 I 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7BUL Solution structure of the tandem PH and BSD1 domains of TFIIH p62 提交 2020-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–158（158 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；293 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1 NMR样品组成 1.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TFIIH p62, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.9 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] TFIIH p62, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 Y 1–548（548 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVW TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7NVX TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 2 1–548（548 aa）	突变：0	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 2 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8EBS Initial DNA-lesion (Cy5) binding by XPC and TFIIH 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8EBT XPA repositioning Core7 of TFIIH relative to XPC-DNA lesion (Cy5) 提交 2022-08-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 111–548（438 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8EBU XPC release from Core7-XPA-DNA (Cy5) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8EBV Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex 1 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.10 Å
8EBW Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex2 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
8EBX XPA repositioning Core7 of TFIIH relative to XPC-DNA lesion (AP) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8EBY XPC release from Core7-XPA-DNA (AP) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HB 1–548（548 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HB 1–548（548 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 1 1–548（548 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
9PCP NER dual incision complex - NoG 提交 2025-06-28	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9PD4 NER dual incision complex - DuIM 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9PD5 NER dual incision complex - NoF 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
9XYU NER complex - C7CAD.ATP 提交 2025-08-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 1–548（548 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 49 个其他 PDB 条目、49 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TF2H1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–548； UniProt 1–548

General transcription factor IIH subunit 2

Homo sapiens

UniProt Q13888

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 2； UniProt 1–395	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1Z60 Solution structure of the carboxy-terminal domain of human TFIIH P44 subunit 提交 2005-03-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 328–386（59 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN	突变：C381S	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；293 K；压力 ambient NMR测量条件 pH 7；303 K；压力 ambient NMR样品组成 1mM p44 U-15N; 20mM deuterated TrisHCl buffer, 20mM NaCl and 0.5mM DTT | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5mM p44; 20mM deuterated TrisHCl buffer, 20mM NaCl and 0.5mM DTT | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
28JM Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH and XPC initial encounter complex 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.29 Å
28JS Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (composite map) 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.32 Å
28JV Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (consensus map) 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.91 Å
28KE Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC-XPA complex bound to bulky lesion-mimic DNA 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.60 Å
5IVW Human core TFIIH bound to DNA within the PIC 提交 2016-03-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 0 1–395（395 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 10.00 Å
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 0 1–395（395 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 0 1–395（395 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 0 1–395（395 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 0 1–395（395 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 6.30 Å
5O85 p34-p44 complex 提交 2017-06-12	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–395（395 aa）	突变：C381S	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 mM Tris-HCl or Hepes (pH 7.0 to 8.5) and 20-40% PEG 4000	分辨率 3.40 Å R-free 0.290
5O85 p34-p44 complex 提交 2017-06-12	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–395（395 aa）	突变：C381S	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 mM Tris-HCl or Hepes (pH 7.0 to 8.5) and 20-40% PEG 4000	分辨率 3.40 Å R-free 0.290
5OF4 The cryo-EM structure of human TFIIH 提交 2017-07-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3-4 minute incubation, 2 second blot	分辨率 4.40 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 6 1–395（395 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
6O9M Structure of the human apo TFIIH 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 6 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6RO4 Structure of the core TFIIH-XPA-DNA complex 提交 2019-05-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 D 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4 ul of sample was applied to glow-discharged grids which were blotted for 5s and plunge-frozen in liquid ethane.	分辨率 3.50 Å
7AD8 Core TFIIH-XPA-DNA complex with modelled p62 subunit 提交 2020-09-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 2 1–395（395 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 2 1–395（395 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 2 1–395（395 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 2 1–395（395 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 a 1–395（395 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 6 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVW TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 6 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7NVX TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 6 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 6 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 6 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 6 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 4 1–395（395 aa）	突变：0	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 4 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8EBS Initial DNA-lesion (Cy5) binding by XPC and TFIIH 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8EBT XPA repositioning Core7 of TFIIH relative to XPC-DNA lesion (Cy5) 提交 2022-08-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 E 8–387（380 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8EBU XPC release from Core7-XPA-DNA (Cy5) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8EBV Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex 1 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.10 Å
8EBW Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex2 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
8EBX XPA repositioning Core7 of TFIIH relative to XPC-DNA lesion (AP) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8EBY XPC release from Core7-XPA-DNA (AP) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HG 1–395（395 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HG 1–395（395 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 2 1–395（395 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 2 1–395（395 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 2 1–395（395 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 2 1–395（395 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 2 1–395（395 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 2 1–395（395 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 2 1–395（395 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
9PCP NER dual incision complex - NoG 提交 2025-06-28	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9PD4 NER dual incision complex - DuIM 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9PD5 NER dual incision complex - NoF 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
9XYU NER complex - C7CAD.ATP 提交 2025-08-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 E 1–395（395 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 50 个其他 PDB 条目、51 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TF2H2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–395； UniProt 1–395

General transcription factor IIH subunit 3

Homo sapiens

UniProt Q13889

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 3； UniProt 1–308	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
28JM Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH and XPC initial encounter complex 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.29 Å
28JS Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (composite map) 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.32 Å
28JV Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (consensus map) 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.91 Å
28KE Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC-XPA complex bound to bulky lesion-mimic DNA 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.60 Å
5IVW Human core TFIIH bound to DNA within the PIC 提交 2016-03-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 10.00 Å
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 6.30 Å
5O85 p34-p44 complex 提交 2017-06-12	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 mM Tris-HCl or Hepes (pH 7.0 to 8.5) and 20-40% PEG 4000	分辨率 3.40 Å R-free 0.290
5O85 p34-p44 complex 提交 2017-06-12	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 mM Tris-HCl or Hepes (pH 7.0 to 8.5) and 20-40% PEG 4000	分辨率 3.40 Å R-free 0.290
5OF4 The cryo-EM structure of human TFIIH 提交 2017-07-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3-4 minute incubation, 2 second blot	分辨率 4.40 Å
6NMI Cryo-EM structure of the human TFIIH core complex 提交 2019-01-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；A thin film of continuous carbon was floated onto Protochips C-flat CF-4/2 holey carbon grids and glow discharged or plasma cleaned before application of 4 uL of sample solution.	分辨率 3.70 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 4 1–308（308 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
6O9M Structure of the human apo TFIIH 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 4 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6RO4 Structure of the core TFIIH-XPA-DNA complex 提交 2019-05-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 E 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4 ul of sample was applied to glow-discharged grids which were blotted for 5s and plunge-frozen in liquid ethane.	分辨率 3.50 Å
7AD8 Core TFIIH-XPA-DNA complex with modelled p62 subunit 提交 2020-09-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 E 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 b 1–308（308 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 4 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVW TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 4 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7NVX TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 4 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 4 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 4 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 4 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 5 1–308（308 aa）	突变：0	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 5 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8EBS Initial DNA-lesion (Cy5) binding by XPC and TFIIH 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8EBT XPA repositioning Core7 of TFIIH relative to XPC-DNA lesion (Cy5) 提交 2022-08-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 F 6–289（284 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8EBU XPC release from Core7-XPA-DNA (Cy5) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8EBV Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex 1 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.10 Å
8EBW Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex2 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
8EBX XPA repositioning Core7 of TFIIH relative to XPC-DNA lesion (AP) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8EBY XPC release from Core7-XPA-DNA (AP) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HE 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HE 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 3 1–308（308 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
9PCP NER dual incision complex - NoG 提交 2025-06-28	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9PD4 NER dual incision complex - DuIM 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9PD5 NER dual incision complex - NoF 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
9XYU NER complex - C7CAD.ATP 提交 2025-08-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 F 1–308（308 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	TF2H3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 1–308； UniProt 1–308

General transcription factor IIH subunit 4

Homo sapiens

UniProt Q92759

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 4； UniProt 1–462	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
28JM Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH and XPC initial encounter complex 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.29 Å
28JS Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (composite map) 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.32 Å
28JV Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (consensus map) 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.91 Å
28KE Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC-XPA complex bound to bulky lesion-mimic DNA 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.60 Å
5IVW Human core TFIIH bound to DNA within the PIC 提交 2016-03-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 2 1–462（462 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 10.00 Å
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 2 1–462（462 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 2 1–462（462 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 2 1–462（462 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 2 1–462（462 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 6.30 Å
5OF4 The cryo-EM structure of human TFIIH 提交 2017-07-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 D 384–462（79 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3-4 minute incubation, 2 second blot	分辨率 4.40 Å
6NMI Cryo-EM structure of the human TFIIH core complex 提交 2019-01-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；A thin film of continuous carbon was floated onto Protochips C-flat CF-4/2 holey carbon grids and glow discharged or plasma cleaned before application of 4 uL of sample solution.	分辨率 3.70 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 2 1–462（462 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
6O9M Structure of the human apo TFIIH 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 2 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6RO4 Structure of the core TFIIH-XPA-DNA complex 提交 2019-05-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 C 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4 ul of sample was applied to glow-discharged grids which were blotted for 5s and plunge-frozen in liquid ethane.	分辨率 3.50 Å
7AD8 Core TFIIH-XPA-DNA complex with modelled p62 subunit 提交 2020-09-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 4 1–462（462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 4 1–462（462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 4 1–462（462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 4 1–462（462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 Z 1–462（462 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 2 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVV XPB-containing part of TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 2 1–462（462 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NVW TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 2 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7NVX TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 2 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 2 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 2 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 2 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 3 1–462（462 aa）	突变：0	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 3 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8EBS Initial DNA-lesion (Cy5) binding by XPC and TFIIH 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8EBT XPA repositioning Core7 of TFIIH relative to XPC-DNA lesion (Cy5) 提交 2022-08-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 17–462（446 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8EBU XPC release from Core7-XPA-DNA (Cy5) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8EBV Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex 1 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.10 Å
8EBW Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex2 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
8EBX XPA repositioning Core7 of TFIIH relative to XPC-DNA lesion (AP) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8EBY XPC release from Core7-XPA-DNA (AP) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HC 1–462（462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HC 1–462（462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 4 1–462（462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 4 1–462（462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 4 1–462（462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 4 1–462（462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 4 1–462（462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 4 1–462（462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 4 1–462（462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
9PCP NER dual incision complex - NoG 提交 2025-06-28	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9PD4 NER dual incision complex - DuIM 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9PD5 NER dual incision complex - NoF 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
9XYU NER complex - C7CAD.ATP 提交 2025-08-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–462（462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 50 个其他 PDB 条目、50 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TF2H4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 4； PDB构建体 1–462； UniProt 1–462

General transcription factor IIH subunit 5

Homo sapiens

UniProt Q6ZYL4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 5； UniProt 1–71	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1YDL Crystal Structure of the Human TFIIH, Northeast Structural Genomics Target HR2045. 提交 2004-12-24	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–71（71 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；22% PEG 3350, 100 mM MgCl2, and 10 mM DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.297
28JM Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH and XPC initial encounter complex 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.29 Å
28JS Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (composite map) 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.32 Å
28JV Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (consensus map) 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.91 Å
28KE Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC-XPA complex bound to bulky lesion-mimic DNA 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.60 Å
2JNJ Solution structure of the p8 TFIIH subunit 提交 2007-01-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–71（71 aa） 链 B 1–71（71 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 300 uM [U-99% 13C, U-99% 15N] protein, 2.5 mM beta-mercaptoethanol, 50 mM sodium chloride, 10 mM TRIS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 uM protein, 2.5 mM beta-mercaptoethanol, 50 mM sodium chloride, 10 mM TRIS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 uM [U-99% 15N] protein, 2.5 mM beta-mercaptoethanol, 50 mM sodium chloride, 10 mM TRIS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5IVW Human core TFIIH bound to DNA within the PIC 提交 2016-03-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 1 1–71（71 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 10.00 Å
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 1 1–71（71 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 1 1–71（71 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 1 1–71（71 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 1 1–71（71 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 6.30 Å
5OF4 The cryo-EM structure of human TFIIH 提交 2017-07-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3-4 minute incubation, 2 second blot	分辨率 4.40 Å
6NMI Cryo-EM structure of the human TFIIH core complex 提交 2019-01-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；A thin film of continuous carbon was floated onto Protochips C-flat CF-4/2 holey carbon grids and glow discharged or plasma cleaned before application of 4 uL of sample solution.	分辨率 3.70 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
6O9M Structure of the human apo TFIIH 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6RO4 Structure of the core TFIIH-XPA-DNA complex 提交 2019-05-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 F 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4 ul of sample was applied to glow-discharged grids which were blotted for 5s and plunge-frozen in liquid ethane.	分辨率 3.50 Å
7AD8 Core TFIIH-XPA-DNA complex with modelled p62 subunit 提交 2020-09-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 F 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 c 1–71（71 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVV XPB-containing part of TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NVW TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7NVX TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 6 1–71（71 aa）	突变：0	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 6 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8EBS Initial DNA-lesion (Cy5) binding by XPC and TFIIH 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8EBT XPA repositioning Core7 of TFIIH relative to XPC-DNA lesion (Cy5) 提交 2022-08-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 G 4–69（66 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8EBU XPC release from Core7-XPA-DNA (Cy5) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8EBV Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex 1 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.10 Å
8EBW Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex2 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
8EBX XPA repositioning Core7 of TFIIH relative to XPC-DNA lesion (AP) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8EBY XPC release from Core7-XPA-DNA (AP) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HF 1–71（71 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HF 1–71（71 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 5 1–71（71 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
9PCP NER dual incision complex - NoG 提交 2025-06-28	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9PD4 NER dual incision complex - DuIM 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9PD5 NER dual incision complex - NoF 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
9XYU NER complex - C7CAD.ATP 提交 2025-08-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 G 1–71（71 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 52 个其他 PDB 条目、52 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TF2H5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 5； PDB构建体 1–71； UniProt 1–71

General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB

Homo sapiens

UniProt P19447

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 6； UniProt 1–782	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
28JM Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH and XPC initial encounter complex 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.29 Å
28JS Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (composite map) 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.32 Å
28JV Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (consensus map) 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.91 Å
28KE Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC-XPA complex bound to bulky lesion-mimic DNA 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.60 Å
4ERN Crystal structure of the C-terminal domain of human XPB/ERCC-3 excision repair protein at 1.80 A 提交 2012-04-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 494–782（289 aa） 片段：C-terminal domain (UNP residues 494-782)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.55；298 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.55, 0.2 M ammonium acetate, 27% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
5IVW Human core TFIIH bound to DNA within the PIC 提交 2016-03-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 V 1–782（782 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 10.00 Å
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 V 1–782（782 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 V 1–782（782 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 V 1–782（782 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 V 1–782（782 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 6.30 Å
5OF4 The cryo-EM structure of human TFIIH 提交 2017-07-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 266–782（517 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3-4 minute incubation, 2 second blot	分辨率 4.40 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 7 1–782（782 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
6O9M Structure of the human apo TFIIH 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 7 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6RO4 Structure of the core TFIIH-XPA-DNA complex 提交 2019-05-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4 ul of sample was applied to glow-discharged grids which were blotted for 5s and plunge-frozen in liquid ethane.	分辨率 3.50 Å
7AD8 Core TFIIH-XPA-DNA complex with modelled p62 subunit 提交 2020-09-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 6 1–782（782 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 6 1–782（782 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 6 1–782（782 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 6 1–782（782 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 W 1–782（782 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 7 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVV XPB-containing part of TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 7 1–782（782 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NVW TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 7 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7NVX TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 7 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 7 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 7 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 7 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 0 1–772（772 aa）	突变：0	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 0 1–782（782 aa）	突变：0	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8EBS Initial DNA-lesion (Cy5) binding by XPC and TFIIH 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8EBU XPC release from Core7-XPA-DNA (Cy5) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8EBV Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex 1 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.10 Å
8EBW Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex2 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
8EBX XPA repositioning Core7 of TFIIH relative to XPC-DNA lesion (AP) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8EBY XPC release from Core7-XPA-DNA (AP) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HH 1–782（782 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HH 1–782（782 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 6 1–782（782 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 6 1–782（782 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 6 1–782（782 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 6 1–782（782 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 6 1–782（782 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 6 1–782（782 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 6 1–782（782 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
9PCP NER dual incision complex - NoG 提交 2025-06-28	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9PD4 NER dual incision complex - DuIM 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9PD5 NER dual incision complex - NoF 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
9XYU NER complex - C7CAD.ATP 提交 2025-08-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 A 1–782（782 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 49 个其他 PDB 条目、49 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ERCC3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 6； PDB构建体 1–782； UniProt 1–782

General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD

Homo sapiens

UniProt P18074

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 7； UniProt 1–760	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
28JM Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH and XPC initial encounter complex 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.29 Å
28JS Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (composite map) 提交 2026-02-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.32 Å
28JV Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (consensus map) 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.91 Å
28KE Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC-XPA complex bound to bulky lesion-mimic DNA 提交 2026-02-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2	分辨率 3.60 Å
5IVW Human core TFIIH bound to DNA within the PIC 提交 2016-03-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 W 1–760（760 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 10.00 Å
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 W 1–760（760 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 W 1–760（760 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 W 1–760（760 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 W 1–760（760 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 6.30 Å
5OF4 The cryo-EM structure of human TFIIH 提交 2017-07-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3-4 minute incubation, 2 second blot	分辨率 4.40 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 0 1–760（760 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
6O9M Structure of the human apo TFIIH 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 0 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6RO4 Structure of the core TFIIH-XPA-DNA complex 提交 2019-05-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4 ul of sample was applied to glow-discharged grids which were blotted for 5s and plunge-frozen in liquid ethane.	分辨率 3.50 Å
6TUN Helicase domain complex 提交 2020-01-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 245–439（195 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris pH 8.5 25% PEG8000	分辨率 2.07 Å R-free 0.227
6TUN Helicase domain complex 提交 2020-01-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 245–439（195 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris pH 8.5 25% PEG8000	分辨率 2.07 Å R-free 0.227
7AD8 Core TFIIH-XPA-DNA complex with modelled p62 subunit 提交 2020-09-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 7 1–760（760 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 7 1–760（760 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 7 1–760（760 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 7 1–760（760 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 X 1–760（760 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 0 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVW TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 0 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7NVX TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 0 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 0 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 0 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 0 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 1 1–760（760 aa）	突变：0	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 1 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8EBS Initial DNA-lesion (Cy5) binding by XPC and TFIIH 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8EBT XPA repositioning Core7 of TFIIH relative to XPC-DNA lesion (Cy5) 提交 2022-08-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–730（730 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8EBU XPC release from Core7-XPA-DNA (Cy5) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8EBV Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex 1 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.10 Å
8EBW Initial DNA-lesion (AP) binding by XPC and TFIIH complex2 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
8EBX XPA repositioning Core7 of TFIIH relative to XPC-DNA lesion (AP) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8EBY XPC release from Core7-XPA-DNA (AP) 提交 2022-08-31	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HA 1–760（760 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 HA 1–760（760 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 7 1–760（760 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 7 1–760（760 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 7 1–760（760 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 7 1–760（760 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 7 1–760（760 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 7 1–760（760 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 7 1–760（760 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
9PCP NER dual incision complex - NoG 提交 2025-06-28	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9PD4 NER dual incision complex - DuIM 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9PD5 NER dual incision complex - NoF 提交 2025-06-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
9XYU NER complex - C7CAD.ATP 提交 2025-08-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–760（760 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 49 个其他 PDB 条目、50 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	ERCC2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 7； PDB构建体 1–760； UniProt 1–760

Alpha-amanitin

物种未注明

UniProt P85421

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 N； UniProt 1–8	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1K83 Crystal Structure of Yeast RNA Polymerase II Complexed with the Inhibitor Alpha Amanitin 提交 2001-10-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 M 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；PH 6.00	分辨率 2.80 Å R-free 0.280
2VUM Alpha-amanitin inhibited complete RNA polymerase II elongation complex 提交 2008-05-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 M 7–8（2 aa） 链 M 1–6（6 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；200 MM AMMONIUM ACETATE, 300 MM SODIUM ACETATE, 50 MM HEPES PH 7.0, 4-7% PEG 6000, 5 MM TCEP	分辨率 3.40 Å R-free 0.288
3CQZ Crystal structure of 10 subunit RNA polymerase II in complex with the inhibitor alpha-amanitin 提交 2008-04-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 M 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å R-free 0.273
6EXV Structure of mammalian RNA polymerase II elongation complex inhibited by Alpha-amanitin 提交 2017-11-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 M 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 N 1–8（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AAMAT_AMAPH
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–8； UniProt 1–8

Transcription initiation factor TFIID subunit 1

Homo sapiens

UniProt P21675

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 1–1872	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1EQF CRYSTAL STRUCTURE OF THE DOUBLE BROMODOMAIN MODULE FROM HUMAN TAFII250 提交 2000-04-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1359–1638（280 aa） 片段：DOUBLE BROMODOMAIN, RESIDUES 1359-1638	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；294 K；ammonium sulfate, TrisCl, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.10 Å R-free 0.246
3AAD Structure of the histone chaperone CIA/ASF1-double bromodomain complex linking histone modifications and site-specific histone eviction 提交 2009-11-16	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1342–1629（288 aa） 片段：Bromodomain	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.65；293 K；0.1M MES, 1.1M AMMONIUM SULFATE, 0.25M LITHIUM SULFATE, pH 5.65, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.30 Å R-free 0.293
3UV4 Crystal Structure of the second bromodomain of human Transcription initiation factor TFIID subunit 1 (TAF1) 提交 2011-11-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1501–1635（135 aa） 片段：unp residues 1501-1635	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.056M NaH2PO4 1.344M K2HPO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.89 Å
3UV4 Crystal Structure of the second bromodomain of human Transcription initiation factor TFIID subunit 1 (TAF1) 提交 2011-11-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1501–1635（135 aa） 片段：unp residues 1501-1635	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.056M NaH2PO4 1.344M K2HPO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.89 Å
3UV5 Crystal Structure of the tandem bromodomains of human Transcription initiation factor TFIID subunit 1 (TAF1) 提交 2011-11-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1373–1635（263 aa） 片段：unp residues 1373-1635	未记录	TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1M Tris-HCl, 1.1M (NH4)2SO4, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.03 Å R-free 0.230
4RGW Crystal Structure of a TAF1-TAF7 Complex in Human Transcription Factor IID 提交 2014-09-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 579–1215（637 aa） 片段：DUF3591 domain, UNP residues 579-1215	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate, pH 7.4, 20% w/v PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.234
4YYM Crystal structure of TAF1 BD2 Bromodomain bound to a butyryllysine peptide 提交 2015-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1497–1638（142 aa） 片段：bromodomain (UNP residues 1497-1638) 链 B 1497–1638（142 aa） 片段：bromodomain (UNP residues 1497-1638)	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M calcium chloride, 20 w/v PEG3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.261
4YYN Crystal structure of TAF1 BD2 Bromodomain bound to a crotonyllysine peptide 提交 2015-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1497–1638（142 aa） 片段：bromodomain (UNP residues 1497-1638) 链 B 1497–1638（142 aa） 片段：bromodomain (UNP residues 1497-1638)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M calcium acetate, 20% w/v PEG3350	分辨率 1.85 Å R-free 0.243
5FUR Structure of human TFIID-IIA bound to core promoter DNA 提交 2016-01-29	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–1872（1872 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40；pH 7.9；10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 8.50 Å
5I1Q Second bromodomain of TAF1 bound to a pyrrolopyridone compound 提交 2016-01-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1497–1638（142 aa） 片段：second bromodomain (UNP residues 1497-1638)	未记录	67C 3-[6-(but-3-en-1-yl)-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl]-N,N-dimethylbenzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M ammonium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.214
5I29 TAF1(2) bound to a pyrrolopyridone compound 提交 2016-02-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1497–1638（142 aa） 片段：second bromodomain (UNP residues 1497-1638)	未记录	67B N,N-dimethyl-3-(6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)benzamide × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M calcium chloride, 20% PEG3350	分辨率 1.21 Å R-free 0.216
5MG2 Crystal structure of the second bromodomain of human TAF1 in complex with BAY-299 chemical probe 提交 2016-11-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1501–1635（135 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 7M8 6-(3-oxidanylpropyl)-2-(1,3,6-trimethyl-2-oxidanylidene-benzimidazol-5-yl)benzo[de]isoquinoline-1,3-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；20%PEG 10K, 0.20 M NaCl, 0.1M citrate/phosphate pH 4.2	分辨率 1.75 Å R-free 0.220
6BQD TAF1-BD2 bromodomain in complex with (E)-3-(6-(but-2-en-1-yl)-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)-N,N-dimethylbenzamide 提交 2017-11-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1501–1630（130 aa） 片段：TAF1-BD2 bromodomain	未记录	69G 3-{6-[(2E)-but-2-en-1-yl]-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl}-N,N-dimethylbenzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；277 K；8% Tacsimate pH 5.0 and 20% PEG3350	分辨率 2.14 Å R-free 0.226
6BQD TAF1-BD2 bromodomain in complex with (E)-3-(6-(but-2-en-1-yl)-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)-N,N-dimethylbenzamide 提交 2017-11-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1501–1630（130 aa） 片段：TAF1-BD2 bromodomain	未记录	69G 3-{6-[(2E)-but-2-en-1-yl]-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl}-N,N-dimethylbenzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；277 K；8% Tacsimate pH 5.0 and 20% PEG3350	分辨率 2.14 Å R-free 0.226
6FIC Bivalent Inhibitor UNC4512 Bound to the TAF1 Bromodomain Tandem 提交 2018-01-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 T 1359–1638（280 aa）	未记录	DKH 3-azanyl-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[3-azanyl-1-[[2-[[3-methyl-6-[4-methyl-3-(methylsulfonyl-$l^{2}-azanyl)cyclohexa-1,3,5-trien-1-yl]-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-8-yl]-$l^{2}-azanyl]-2-oxidanylidene-ethyl]amino]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]-~{N}-[3-[[3-methyl-6-[4-methyl-3-(methylsulfonylamino)phenyl]-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-8-yl]amino]-3-oxidanylidene-propyl]propanamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 4.2 M NaCl	分辨率 2.18 Å R-free 0.236
6MZD Human TFIID Lobe A canonical 提交 2018-11-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 21–1893（1873 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 9.80 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 23.00 Å
6P38 Crystal Structure Analysis of TAF1 Bromodomain 提交 2019-05-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1522–1656（135 aa）	未记录	NQV 4-{[(3R)-4-cyclopentyl-1,3-dimethyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydropyrido[2,3-b]pyrazin-6-yl]amino}-N-(1-methylpiperidin-4-yl)-3-[(propan-2-yl)oxy]benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 2000, Trimethylamine N-oxide dihydrate, Tris pH 8.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.219
6P39 Crystal Structure Analysis of TAF1 Bromodomain 提交 2019-05-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1521–1656（136 aa）	未记录	NQY 3-methoxy-4-{[(6aR)-5-methyl-6-oxo-6,6a,7,8,9,10-hexahydro-5H-dipyrido[1,2-a:3',2'-e]pyrazin-2-yl]amino}-N-(1-methylpiperidin-4-yl)benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG1000, Tris pH 8.0	分辨率 2.94 Å R-free 0.212
6P3A Crystal Structure Analysis of TAF1 Bromodomain 提交 2019-05-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1522–1656（135 aa）	未记录	NQP 4-{[(3R)-1-(but-3-en-1-yl)-3-methyl-4-(oxan-4-yl)-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydropyrido[2,3-b]pyrazin-6-yl]amino}-3-methoxy-N-(1-methylpiperidin-4-yl)benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG8000, Tris pH 8.0	分辨率 2.99 Å R-free 0.286
6P3A Crystal Structure Analysis of TAF1 Bromodomain 提交 2019-05-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1522–1656（135 aa）	未记录	NQP 4-{[(3R)-1-(but-3-en-1-yl)-3-methyl-4-(oxan-4-yl)-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydropyrido[2,3-b]pyrazin-6-yl]amino}-3-methoxy-N-(1-methylpiperidin-4-yl)benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG8000, Tris pH 8.0	分辨率 2.99 Å R-free 0.286
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7EGH TFIID lobe C subcomplex 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DA 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DA 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7JJG Crystal structure of the second bromodomain (BD2) of human TAF1 bound to ATR kinase inhibitor AZ20 提交 2020-07-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1522–1656（135 aa）	未记录	VCD 4-{4-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-6-[1-(methylsulfonyl)cyclopropyl]pyrimidin-2-yl}-1H-indole × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.01 M Co(II) chloride, 0.1 M Sodium acetate trihydrate (pH 4.6), 1 M 1,6-Hexanediol	分辨率 1.60 Å R-free 0.195
7JJH Crystal structure of the unliganded tandem bromodomain (BD1, BD2) of human TAF1 提交 2020-07-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1373–1635（263 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.8 M Succinic Acid, pH 7.0	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
7JSP Crystal structure of the second bromodomain (BD2) of human TAF1 bound to ATR kinase inhibitor AZD6738 提交 2020-08-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1522–1656（135 aa）	未记录	VJM 4-(4-{1-[(R)-amino(hydroxy)methyl-lambda~4~-sulfanyl]cyclopropyl}-6-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]pyrimidin-2-yl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.01 M Co(II) chloride, 0.1 M Sodium acetate trihydrate (pH 4.6), 1 M 1,6-Hexanediol	分辨率 1.70 Å R-free 0.205
7JTC Crystal structure of the second bromodomain (BD2) of human TAF1 bound to ZS1-322 提交 2020-08-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1522–1656（135 aa）	未记录	VK1 1-{6-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-2-(methylsulfanyl)pyrimidin-4-yl}cyclopropane-1-sulfonimidoamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.01 M Co(II) chloride, 0.1 M Sodium acetate trihydrate (pH 4.6), 1 M 1,6-Hexanediol	分辨率 2.05 Å R-free 0.232
7K03 Crystal structure of the tandem bromodomain (BD1 and BD2) of human TAF1 bound to ATR kinase inhibitor AZD6738 提交 2020-09-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1373–1635（263 aa） 片段：Tandem bromodomains, residues 1373-1635	未记录	VJM 4-(4-{1-[(R)-amino(hydroxy)methyl-lambda~4~-sulfanyl]cyclopropyl}-6-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]pyrimidin-2-yl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.2 M Magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate, 20% Polyethylene glycol 8,000	分辨率 1.60 Å R-free 0.180
7K0D Crystal structure of the tandem bromodomain (BD1, BD2) of human TAF1 bound to mTORC1/2 inhibitor AZD3147 提交 2020-09-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1373–1635（263 aa） 片段：TANDEM BROMODOMAINS, RESIDUES 1373-1635	未记录	VQS N-(4-{4-[1-(cyclopropylsulfonyl)cyclopropyl]-6-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]pyrimidin-2-yl}phenyl)-N'-(2-hydroxyethyl)thiourea × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M MES monohydrate, 30% Polyethylene glycol monomethyl ether 5,000	分辨率 2.20 Å R-free 0.249
7K0U Crystal structure of the second bromodomain (BD2) of human TAF1 bound to PLK1 kinase inhibitor BI2536 提交 2020-09-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1501–1635（135 aa） 链 B 1501–1635（135 aa）	未记录	R78 4-{[(7R)-8-cyclopentyl-7-ethyl-5-methyl-6-oxo-5,6,7,8-tetrahydropteridin-2-yl]amino}-3-methoxy-N-(1-methylpiperidin-4-yl)benzamide × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 10% PEG 8,000, 8% Ethylene glycol	分辨率 2.52 Å R-free 0.245
7K1P Crystal structure of the second bromodomain (BD2) of human TAF1 bound to bromosporine 提交 2020-09-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1501–1635（135 aa）	未记录	BMF Bromosporine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 10% PEG 8,000, 8% Ethylene glycol	分辨率 2.45 Å R-free 0.220
7K27 Crystal structure of the tandem bromodomain (BD1, BD2) of human TAF1 bound to ATR inhibitor AZ20 提交 2020-09-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1373–1635（263 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 VCD 4-{4-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-6-[1-(methylsulfonyl)cyclopropyl]pyrimidin-2-yl}-1H-indole × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 1.50 Å R-free 0.175
7K3O Crystal structure of the unliganded second bromodomain (BD2) of human TAF1 提交 2020-09-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1501–1635（135 aa） 链 B 1501–1635（135 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 2.0 M Ammonium sulfate, 25% v/v Ethylene glycol	分辨率 1.70 Å R-free 0.202
7K42 Crystal structure of the second bromodomain (BD2) of human TAF1 bound to dioxane 提交 2020-09-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1501–1635（135 aa） 链 B 1501–1635（135 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 22	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Sodium acetate tribasic dihydrate pH 5.6, 2.0 M Ammonium sulfate, 25% v/v Ethylene glycol	分辨率 1.70 Å R-free 0.190
7K6F Crystal structure of the tandem bromodomain (BD1, BD2) of human TAF1 in complex with MES (2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid) 提交 2020-09-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1373–1635（263 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ACT ACETATE ION × 2 FMT FORMIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Carboxylic acid (0.02M Sodium formate; 0.02M Ammonium acetate; 0.02M Sodium citrate tribasic dihydrate; 0.02M Potassium sodium tartrate tetrahydrate; 0.02M Sodium oxamate), 0.1M Buffer system 1 pH 6.5 (Imidazole; MES monohydrate), 30% precipitant mix 3 (20% v/v Glycerol; 10% w/v PEG 4000)	分辨率 1.86 Å R-free 0.203
7L6X Crystal structure of the tandem bromodomain (BD1, BD2) of human TAF1 bound to GNE-371 提交 2020-12-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1373–1635（263 aa）	未记录	G9V 6-(but-3-en-1-yl)-4-[1-methyl-6-(morpholine-4-carbonyl)-1H-benzimidazol-4-yl]-1,6-dihydro-7H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-7-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Amino acids, 0.1M Buffer system 1 pH 6.5, 30% v/v precipitant mix 3 (morpheus screen 2-39)	分辨率 2.75 Å R-free 0.250
7LB0 Crystal structure of the tandem bromodomain (BD1, BD2) of human TAF1 bound to ZS1-295 提交 2021-01-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1373–1635（263 aa）	未记录	XXV 1-{6-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-2-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)pyrimidin-4-yl}cyclopropane-1-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 25% PEG 3350	分辨率 2.33 Å R-free 0.220
7LB1 Crystal structure of the tandem bromodomain (BD1, BD2) of human TAF1 bound to ZS1-585 提交 2021-01-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1373–1635（263 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 XWV 5-{4-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-6-[1-(S-methylsulfonimidoyl)cyclopropyl]pyrimidin-2-yl}isoquinoline × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M MgCl2, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 15% PEG 3350	分辨率 1.35 Å R-free 0.179
7LB2 Crystal structure of the tandem bromodomain (BD1, BD2) of human TAF1 bound to ZS1-589 提交 2021-01-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1373–1635（263 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 1 XWY (3R)-3-methyl-4-{6-[1-(S-methylsulfonimidoyl)cyclopropyl]-2-(naphthalen-1-yl)pyrimidin-4-yl}morpholine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M MgCl2, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 15% PEG 3350	分辨率 1.70 Å R-free 0.200
7LB3 Crystal structure of the second bromodomain (BD2) of human TAF1 bound to ZS1-580 提交 2021-01-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1501–1635（135 aa） 片段：second bromodomain	未记录	XXS 4-{4-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-6-[1-(S-methylsulfonimidoyl)cyclopropyl]pyrimidin-2-yl}-1H-indazole × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M MgCl2, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 15% PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.208
7N42 Crystal structure of the tandem bromodomain of human TAF1 (TAF1-T) bound to ZS1-681 提交 2021-06-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1373–1635（263 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 06M 6-(but-3-en-1-yl)-4-[6-{1-[(R)-S-methanesulfonimidoyl]cyclopropyl}-2-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)pyrimidin-4-yl]-1,6-dihydro-7H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-7-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.15 M MgCl2, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 15% PEG 3,350	分辨率 1.90 Å R-free 0.204
7P4S BROMODOMAIN OF HUMAN TAF1 (2) WITH naphthyridinone compound 提交 2021-07-13	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1501–1635（135 aa）	未记录	5LV 8-[[1-(3-azanylpropyl)piperidin-4-yl]amino]-5-[5-(hydroxymethyl)pyridin-3-yl]-3-methyl-1~{H}-1,7-naphthyridin-2-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；278 K；30% w/v EDO_P8K, 0.1M Morpheus buffer 2 and 10% morpheus alcohols	分辨率 2.17 Å R-free 0.274
7T2I Crystal structure of the tandem bromodomain (BD1, BD2) of human TAF1 bound to ZS1-588 提交 2021-12-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1373–1635（263 aa）	未记录	DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 E9F 4-(6-{1-[(R)-S-methanesulfonimidoyl]cyclopropyl}-2-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]pyrimidin-4-yl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.15 M MgCl2, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 15% PEG 3,350	分辨率 1.89 Å R-free 0.199
7T36 Crystal structure of the tandem bromodomain (BD1 and BD2) of human TAF1 bound to ZS1-322 提交 2021-12-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1373–1635（263 aa）	未记录	EIO (3R)-4-[6-{1-[diamino(hydroxy)-lambda~4~-sulfanyl]cyclopropyl}-2-(methylsulfanyl)pyrimidin-4-yl]-3-methylmorpholine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.15 M MgCl2, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 15% PEG 3,350	分辨率 1.65 Å R-free 0.203
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DA 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DA 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 A 1–1872（1872 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

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UniProt名称	TAF1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1872； UniProt 1–1872

Transcription initiation factor TFIID subunit 2

Homo sapiens

UniProt Q6P1X5

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 B； UniProt 1–1199	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5FUR Structure of human TFIID-IIA bound to core promoter DNA 提交 2016-01-29	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 I 1–1199（1199 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40；pH 7.9；10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 8.50 Å
6MZC Human TFIID BC core 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 4.50 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 23.00 Å
6MZM Human TFIID bound to promoter DNA and TFIIA 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 7.50 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7EGH TFIID lobe C subcomplex 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DB 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DB 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DB 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DB 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 B 1–1199（1199 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

共 27 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1199； UniProt 1–1199

Transcription initiation factor TFIID subunit 4

Homo sapiens

UniProt O00268

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 D； UniProt 1–1085 链 d； UniProt 1–1085	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1H3O Crystal Structure of the Human TAF4-TAF12 (TAFII135-TAFII20) Complex 提交 2002-09-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 870–943（74 aa） 片段：HISTONE FOLD DOMAIN, RESIDUES 870-943	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.25；pH 5.25	分辨率 2.30 Å R-free 0.272
1H3O Crystal Structure of the Human TAF4-TAF12 (TAFII135-TAFII20) Complex 提交 2002-09-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 870–943（74 aa） 片段：HISTONE FOLD DOMAIN, RESIDUES 870-943	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.25；pH 5.25	分辨率 2.30 Å R-free 0.272
2P6V Structure of TAFH domain of the human TAF4 subunit of TFIID 提交 2007-03-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 575–688（114 aa） 片段：TAFH domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；295 K；Crystals of methylated hTAF4-TAFH containing SeMet were grown by hanging drop vapor diffusion at 22 C by mixing equal volumes of protein solution and crystallization buffer (200 mM ammonium acetate, 2.2 M ammonium sulfate and 150 mM sodium bromide). , pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.00 Å R-free 0.248
6MZC Human TFIID BC core 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 E 1–1085（1085 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 4.50 Å
6MZD Human TFIID Lobe A canonical 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–1085（1085 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 9.80 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 E 1–1085（1085 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 23.00 Å
6MZM Human TFIID bound to promoter DNA and TFIIA 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 D 61–1085（1025 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 7.50 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7EGF TFIID lobe A subcomplex 提交 2021-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
7EGG TFIID lobe B subcomplex 提交 2021-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 D 1–1085（1085 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.77 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DD 1–1085（1085 aa） 链 Dd 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DD 1–1085（1085 aa） 链 Dd 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DD 1–1085（1085 aa） 链 Dd 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DD 1–1085（1085 aa） 链 Dd 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 D 1–1085（1085 aa） 链 d 1–1085（1085 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

共 30 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–1085； UniProt 1–1085 作者链 d； PDB构建体 1–1085； UniProt 1–1085

Transcription initiation factor TFIID subunit 5

Homo sapiens

UniProt Q15542

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 E； UniProt 1–800 链 e； UniProt 1–800	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2NXP Structure of NTD2 domain of the human TAF5 subunit of TFIID 提交 2006-11-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 188–343（156 aa） 片段：N-terminal conserved domain 2 (NTD2)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.1；295 K；0.1M Tris-HCl, 0.6M calcium chloride, 20% PEG 4000, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K	分辨率 2.17 Å R-free 0.263
2NXP Structure of NTD2 domain of the human TAF5 subunit of TFIID 提交 2006-11-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 188–343（156 aa） 片段：N-terminal conserved domain 2 (NTD2)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.1；295 K；0.1M Tris-HCl, 0.6M calcium chloride, 20% PEG 4000, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K	分辨率 2.17 Å R-free 0.263
2NXP Structure of NTD2 domain of the human TAF5 subunit of TFIID 提交 2006-11-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 188–343（156 aa） 片段：N-terminal conserved domain 2 (NTD2)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.1；295 K；0.1M Tris-HCl, 0.6M calcium chloride, 20% PEG 4000, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K	分辨率 2.17 Å R-free 0.263
2NXP Structure of NTD2 domain of the human TAF5 subunit of TFIID 提交 2006-11-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 188–343（156 aa） 片段：N-terminal conserved domain 2 (NTD2)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.1；295 K；0.1M Tris-HCl, 0.6M calcium chloride, 20% PEG 4000, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K	分辨率 2.17 Å R-free 0.263
2NXP Structure of NTD2 domain of the human TAF5 subunit of TFIID 提交 2006-11-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 188–343（156 aa） 片段：N-terminal conserved domain 2 (NTD2)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.1；295 K；0.1M Tris-HCl, 0.6M calcium chloride, 20% PEG 4000, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K	分辨率 2.17 Å R-free 0.263
2NXP Structure of NTD2 domain of the human TAF5 subunit of TFIID 提交 2006-11-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 188–343（156 aa） 片段：N-terminal conserved domain 2 (NTD2)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.1；295 K；0.1M Tris-HCl, 0.6M calcium chloride, 20% PEG 4000, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K	分辨率 2.17 Å R-free 0.263
2NXP Structure of NTD2 domain of the human TAF5 subunit of TFIID 提交 2006-11-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 188–343（156 aa） 片段：N-terminal conserved domain 2 (NTD2)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.1；295 K；0.1M Tris-HCl, 0.6M calcium chloride, 20% PEG 4000, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K	分辨率 2.17 Å R-free 0.263
2NXP Structure of NTD2 domain of the human TAF5 subunit of TFIID 提交 2006-11-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 H 188–343（156 aa） 片段：N-terminal conserved domain 2 (NTD2)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.1；295 K；0.1M Tris-HCl, 0.6M calcium chloride, 20% PEG 4000, pH 7.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K	分辨率 2.17 Å R-free 0.263
6F3T Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex 提交 2017-11-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 194–800（607 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.15 K；0.1 M Tris/HCl pH6.8, 0.8M Na-Citrate, 0.0-0.15M NaCl	分辨率 2.50 Å R-free 0.220
6F3T Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex 提交 2017-11-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 194–800（607 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.15 K；0.1 M Tris/HCl pH6.8, 0.8M Na-Citrate, 0.0-0.15M NaCl	分辨率 2.50 Å R-free 0.220
6F3T Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex 提交 2017-11-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 194–800（607 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.15 K；0.1 M Tris/HCl pH6.8, 0.8M Na-Citrate, 0.0-0.15M NaCl	分辨率 2.50 Å R-free 0.220
6F3T Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex 提交 2017-11-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 194–800（607 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.15 K；0.1 M Tris/HCl pH6.8, 0.8M Na-Citrate, 0.0-0.15M NaCl	分辨率 2.50 Å R-free 0.220
6MZC Human TFIID BC core 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 G 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 4.50 Å
6MZD Human TFIID Lobe A canonical 提交 2018-11-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 F 1–496（496 aa） 链 F 537–800（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 9.80 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 F 1–496（496 aa） 链 F 537–800（264 aa） 链 G 1–496（496 aa） 链 G 537–800（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 23.00 Å
6MZM Human TFIID bound to promoter DNA and TFIIA 提交 2018-11-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 G 1–496（496 aa） 链 G 537–800（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 7.50 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7EGF TFIID lobe A subcomplex 提交 2021-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 e 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
7EGG TFIID lobe B subcomplex 提交 2021-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 E 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.77 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DE 1–800（800 aa） 链 De 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DE 1–800（800 aa） 链 De 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DE 1–800（800 aa） 链 De 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DE 1–800（800 aa） 链 De 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 E 1–800（800 aa） 链 e 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

共 30 个其他 PDB 条目、40 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–800； UniProt 1–800 作者链 e； PDB构建体 1–800； UniProt 1–800

Transcription initiation factor TFIID subunit 6

Homo sapiens

UniProt P49848

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 F； UniProt 1–677 链 f； UniProt 1–677	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5FUR Structure of human TFIID-IIA bound to core promoter DNA 提交 2016-01-29	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 J 1–677（677 aa） 链 K 1–677（677 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40；pH 7.9；10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 8.50 Å
6F3T Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex 提交 2017-11-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 42–129（88 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.15 K；0.1 M Tris/HCl pH6.8, 0.8M Na-Citrate, 0.0-0.15M NaCl	分辨率 2.50 Å R-free 0.220
6F3T Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex 提交 2017-11-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 42–129（88 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.15 K；0.1 M Tris/HCl pH6.8, 0.8M Na-Citrate, 0.0-0.15M NaCl	分辨率 2.50 Å R-free 0.220
6F3T Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex 提交 2017-11-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 42–129（88 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.15 K；0.1 M Tris/HCl pH6.8, 0.8M Na-Citrate, 0.0-0.15M NaCl	分辨率 2.50 Å R-free 0.220
6F3T Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex 提交 2017-11-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 42–129（88 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.15 K；0.1 M Tris/HCl pH6.8, 0.8M Na-Citrate, 0.0-0.15M NaCl	分辨率 2.50 Å R-free 0.220
6MZC Human TFIID BC core 提交 2018-11-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 H 1–677（677 aa） 链 I 38–714（677 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 4.50 Å
6MZD Human TFIID Lobe A canonical 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 H 1–677（677 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 9.80 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 H 1–677（677 aa） 链 I 38–714（677 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 23.00 Å
6MZM Human TFIID bound to promoter DNA and TFIIA 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 H 1–677（677 aa） 链 I 38–243（206 aa） 链 I 207–667（461 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 7.50 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7EGF TFIID lobe A subcomplex 提交 2021-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 f 1–677（677 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
7EGG TFIID lobe B subcomplex 提交 2021-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 1–677（677 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.77 Å
7EGH TFIID lobe C subcomplex 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DF 1–677（677 aa） 链 Df 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DF 1–677（677 aa） 链 Df 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DF 1–677（677 aa） 链 Df 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DF 1–677（677 aa） 链 Df 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 F 1–677（677 aa） 链 f 1–677（677 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

共 31 个其他 PDB 条目、34 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–677； UniProt 1–677 作者链 f； PDB构建体 1–677； UniProt 1–677

Transcription initiation factor TFIID subunit 7

Homo sapiens

UniProt Q15545

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 G； UniProt 1–349	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4RGW Crystal Structure of a TAF1-TAF7 Complex in Human Transcription Factor IID 提交 2014-09-30	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–349（349 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate, pH 7.4, 20% w/v PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.234
5FUR Structure of human TFIID-IIA bound to core promoter DNA 提交 2016-01-29	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 H 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40；pH 7.9；10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 8.50 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 J 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 23.00 Å
6MZM Human TFIID bound to promoter DNA and TFIIA 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 J 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 7.50 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7EGH TFIID lobe C subcomplex 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DG 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DG 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DG 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DG 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 G 1–349（349 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

共 27 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–349； UniProt 1–349

Transcription initiation factor TFIID subunit 8

Homo sapiens

UniProt Q7Z7C8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 H； UniProt 1–310	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4WV4 Heterodimer of TAF8/TAF10 提交 2014-11-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 25–120（96 aa） 片段：UNP residues 25-120	未记录	GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；281.15 K；sodium/potassium phosphate	分辨率 1.91 Å R-free 0.237
4WV6 Heterodimer of Importin alpha 1 with nuclear localization signal of TAF8 提交 2014-11-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 297–310（14 aa） 片段：UNP residues 297-310 链 C 297–310（14 aa） 片段：UNP residues 297-310	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；281.15 K；HEPES-NaOH, polyethylene glycole 3350, L-proline	分辨率 1.75 Å R-free 0.180
5FUR Structure of human TFIID-IIA bound to core promoter DNA 提交 2016-01-29	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–310（310 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40；pH 7.9；10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 8.50 Å
6MZC Human TFIID BC core 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 K 1–120（120 aa） 链 K 172–310（139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 4.50 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 K 1–310（310 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 23.00 Å
6MZM Human TFIID bound to promoter DNA and TFIIA 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 K 1–310（310 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 7.50 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7EGG TFIID lobe B subcomplex 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.77 Å
7EGH TFIID lobe C subcomplex 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DH 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DH 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DH 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DH 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 H 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

共 30 个其他 PDB 条目、30 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–310； UniProt 1–310

Transcription initiation factor TFIID subunit 9

Homo sapiens

UniProt Q16594

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 I； UniProt 1–264 链 i； UniProt 1–264	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6F3T Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex 提交 2017-11-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 5–120（116 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.15 K；0.1 M Tris/HCl pH6.8, 0.8M Na-Citrate, 0.0-0.15M NaCl	分辨率 2.50 Å R-free 0.220
6F3T Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex 提交 2017-11-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 5–120（116 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.15 K；0.1 M Tris/HCl pH6.8, 0.8M Na-Citrate, 0.0-0.15M NaCl	分辨率 2.50 Å R-free 0.220
6F3T Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex 提交 2017-11-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 5–120（116 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.15 K；0.1 M Tris/HCl pH6.8, 0.8M Na-Citrate, 0.0-0.15M NaCl	分辨率 2.50 Å R-free 0.220
6F3T Crystal structure of the human TAF5-TAF6-TAF9 complex 提交 2017-11-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 5–120（116 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277.15 K；0.1 M Tris/HCl pH6.8, 0.8M Na-Citrate, 0.0-0.15M NaCl	分辨率 2.50 Å R-free 0.220
6MZC Human TFIID BC core 提交 2018-11-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 M 1–109（109 aa） 链 M 117–264（148 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 4.50 Å
6MZD Human TFIID Lobe A canonical 提交 2018-11-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–109（109 aa） 链 L 117–264（148 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 9.80 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 L 1–264（264 aa） 链 M 1–264（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 23.00 Å
6MZM Human TFIID bound to promoter DNA and TFIIA 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 L 1–264（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 7.50 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7EGF TFIID lobe A subcomplex 提交 2021-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 i 1–264（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
7EGG TFIID lobe B subcomplex 提交 2021-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 I 1–264（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.77 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DI 1–264（264 aa） 链 Di 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DI 1–264（264 aa） 链 Di 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DI 1–264（264 aa） 链 Di 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DI 1–264（264 aa） 链 Di 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8H7G Cryo-EM structure of the human SAGA complex 提交 2022-10-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 M 1–264（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 I 1–264（264 aa） 链 i 1–264（264 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

共 30 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF9_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–264； UniProt 1–264 作者链 i； PDB构建体 1–264； UniProt 1–264

Transcription initiation factor TFIID subunit 10

Homo sapiens

UniProt Q12962

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 J； UniProt 1–218 链 j； UniProt 1–218	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4J7F SET7/9Y335pAF in complex with TAF10 peptide and AdoHcy 提交 2013-02-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 186–195（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；Sodium citrate, imidazole, nickel chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.59 Å R-free 0.215
4J7F SET7/9Y335pAF in complex with TAF10 peptide and AdoHcy 提交 2013-02-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 186–195（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；Sodium citrate, imidazole, nickel chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.59 Å R-free 0.215
4J7I SET7/9Y335F in complex with TAF10 peptide and AdoHcy 提交 2013-02-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 186–195（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；Sodium citrate, imidazole, nickel chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.56 Å R-free 0.257
4J7I SET7/9Y335F in complex with TAF10 peptide and AdoHcy 提交 2013-02-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 186–195（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；Sodium citrate, imidazole, nickel chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.56 Å R-free 0.257
4J83 SET7/9 in complex with TAF10K189A peptide and AdoMet 提交 2013-02-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 186–195（10 aa）	突变：K189A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；Sodium citrate, imidazole, nickel chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.70 Å R-free 0.211
4J83 SET7/9 in complex with TAF10K189A peptide and AdoMet 提交 2013-02-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 186–195（10 aa）	突变：K189A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；Sodium citrate, imidazole, nickel chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.70 Å R-free 0.211
4J8O SET7/9 in complex with TAF10K189A peptide and AdoHcy 提交 2013-02-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 186–195（10 aa）	突变：K189A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；sodium citrate, imidazole, nickel chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.63 Å R-free 0.228
4WV4 Heterodimer of TAF8/TAF10 提交 2014-11-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 112–212（101 aa） 片段：UNP 112-212	未记录	GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；281.15 K；sodium/potassium phosphate	分辨率 1.91 Å R-free 0.237
5EG2 SET7/9 N265A in complex with AdoHcy and TAF10 peptide 提交 2015-10-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 186–195（10 aa） 片段：UNP residues 186-195	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293 K；1:1 ratio of protein solution to crystallization solution. Protein solution: 4.0-8.0 mg/mL protein, 2.5 mM AdoMet, 2.0 mM TAF10 peptide, and 2.0 mM TCEP Crystallant solution: 0.99 - 1.02 M sodium citrate, 12 - 22 mM nickel (II) chloride, and 100 mM imidazole pH 8.4	分辨率 1.55 Å R-free 0.171
6MZC Human TFIID BC core 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 O 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 4.50 Å
6MZD Human TFIID Lobe A canonical 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 N 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 9.80 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 N 1–218（218 aa） 链 O 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 23.00 Å
6MZM Human TFIID bound to promoter DNA and TFIIA 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 O 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 7.50 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7EGF TFIID lobe A subcomplex 提交 2021-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 j 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
7EGG TFIID lobe B subcomplex 提交 2021-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 J 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.77 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DJ 1–218（218 aa） 链 Dj 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DJ 1–218（218 aa） 链 Dj 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7KTR Cryo-EM structure of the human SAGA coactivator complex (TRRAP, core) 提交 2020-11-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 H 1–218（218 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8；Buffers were freshly prepared and 0.22 um filtered. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 0, blot time 3 sec	分辨率 2.93 Å
7KTS Negative stain EM structure of the human SAGA coactivator complex (TRRAP, core, splicing module) 提交 2020-11-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 H 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Buffers were freshly prepared and 0.22 um filtered.	分辨率 19.09 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DJ 1–218（218 aa） 链 Dj 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DJ 1–218（218 aa） 链 Dj 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8H7G Cryo-EM structure of the human SAGA complex 提交 2022-10-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 O 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 J 1–218（218 aa） 链 j 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
9RDK Cryo-EM structure of the human SAGA co-activator complex 提交 2025-06-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric	链 H 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.41 Å

共 38 个其他 PDB 条目、41 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF10_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–218； UniProt 1–218 作者链 j； PDB构建体 1–218； UniProt 1–218

Transcription initiation factor TFIID subunit 12

Homo sapiens

UniProt Q16514

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 L； UniProt 1–161 链 l； UniProt 1–161	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1H3O Crystal Structure of the Human TAF4-TAF12 (TAFII135-TAFII20) Complex 提交 2002-09-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 57–128（72 aa） 片段：HISTONE FOLD DOMAIN, RESIDUES 57-128	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.25；pH 5.25	分辨率 2.30 Å R-free 0.272
1H3O Crystal Structure of the Human TAF4-TAF12 (TAFII135-TAFII20) Complex 提交 2002-09-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 57–128（72 aa） 片段：HISTONE FOLD DOMAIN, RESIDUES 57-128	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.25；pH 5.25	分辨率 2.30 Å R-free 0.272
6MZC Human TFIID BC core 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 R 1–161（161 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 4.50 Å
6MZD Human TFIID Lobe A canonical 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 Q 1–161（161 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 9.80 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 Q 1–161（161 aa） 链 R 1–161（161 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 23.00 Å
6MZM Human TFIID bound to promoter DNA and TFIIA 提交 2018-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 R 1–161（161 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 7.50 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7EGF TFIID lobe A subcomplex 提交 2021-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 l 1–161（161 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
7EGG TFIID lobe B subcomplex 提交 2021-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 L 1–161（161 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.77 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DL 1–161（161 aa） 链 Dl 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DL 1–161（161 aa） 链 Dl 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7KTR Cryo-EM structure of the human SAGA coactivator complex (TRRAP, core) 提交 2020-11-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 G 1–161（161 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8；Buffers were freshly prepared and 0.22 um filtered. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 0, blot time 3 sec	分辨率 2.93 Å
7KTS Negative stain EM structure of the human SAGA coactivator complex (TRRAP, core, splicing module) 提交 2020-11-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 G 1–161（161 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Buffers were freshly prepared and 0.22 um filtered.	分辨率 19.09 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DL 1–161（161 aa） 链 Dl 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DL 1–161（161 aa） 链 Dl 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8H7G Cryo-EM structure of the human SAGA complex 提交 2022-10-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 R 1–161（161 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 L 1–161（161 aa） 链 l 1–161（161 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
9RDK Cryo-EM structure of the human SAGA co-activator complex 提交 2025-06-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric	链 G 1–161（161 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.41 Å

共 33 个其他 PDB 条目、34 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF12_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	20
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 l； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161

Transcription initiation factor IIA subunit 2

Homo sapiens

UniProt P52657

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 O； UniProt 1–109	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NVP HUMAN TFIIA/TBP/DNA COMPLEX 提交 2003-02-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 D 2–109（108 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；PEG6000, lithium nitrate, calcium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.10 Å R-free 0.247
5FUR Structure of human TFIID-IIA bound to core promoter DNA 提交 2016-01-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 3–99（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40；pH 7.9；10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 8.50 Å
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5M4S Transcription factor TFIIA as a single chain protein 提交 2016-10-19	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20mM Tris (8.0), 1mM DTT, 0.5mM EDTA and 25mM NaCl	分辨率 2.38 Å R-free 0.242
6MZM Human TFIID bound to promoter DNA and TFIIA 提交 2018-11-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 X 3–99（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 7.50 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DO 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DO 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 N 1–109（109 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
7ZWC Structure of SNAPc:TBP-TFIIA-TFIIB sub-complex bound to U5 snRNA promoter 提交 2022-05-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7ZXE Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DO 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DO 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 V 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 O 1–109（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

共 53 个其他 PDB 条目、53 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	T2AG_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	21
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–109； UniProt 1–109

TATA-box-binding protein

Homo sapiens

UniProt P20226

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 P； UniProt 1–339	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 158–337（180 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 F 158–337（180 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 J 158–337（180 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 N 158–337（180 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 R 158–337（180 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1CDW HUMAN TBP CORE DOMAIN COMPLEXED WITH DNA 提交 1996-04-11	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 159–337（179 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å R-free 0.258
1JFI Crystal Structure of the NC2-TBP-DNA Ternary Complex 提交 2001-06-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 159–339（181 aa） 片段：RESIDUES 359-539	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；PEG 4000, sodium citrate, potassium chloride, magnesium chloride, DTT, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.62 Å R-free 0.277
1NVP HUMAN TFIIA/TBP/DNA COMPLEX 提交 2003-02-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 A 159–339（181 aa） 片段：C-TERMINAL 181 AMINO ACIDS	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；PEG6000, lithium nitrate, calcium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.10 Å R-free 0.247
1TGH TATA BINDING PROTEIN (TBP)/DNA COMPLEX 提交 1996-02-13	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 113–297（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.00	分辨率 2.90 Å R-free 0.294
4ROC Human TFIIB-related factor 2 (Brf2) and TBP bound to U6#2 promoter 提交 2014-10-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 159–339（181 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；293 K；10-20% PEG 3350, 50-100 mM MgCl2, 2 mM DTT, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.215
4ROD Human TFIIB-related factor 2 (Brf2) and TBP bound to TRNAU1 promoter 提交 2014-10-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 159–339（181 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；293 K；10-20% PEG 3350, 50-100 mM MgCl2, 2 mM DTT, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.247
4ROE Human TFIIB-related factor 2 (Brf2) and TBP bound to RPPH1 promoter 提交 2014-10-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 159–339（181 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；293 K；10-20% PEG 3350, 50-100 mM MgCl2, 2 mM DTT, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.222
5FUR Structure of human TFIID-IIA bound to core promoter DNA 提交 2016-01-29	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–339（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40；pH 7.9；10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 8.50 Å
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5N9G TFIIIB -TBP/Brf2/DNA and SANT domain of Bdp1- 提交 2017-02-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 B 159–339（181 aa） 片段：UNP residues 159-339	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-16% PEG 8000, 150-200 mM KCl, 100 mM MES pH 6.5, 10-15 mM MgCl2, 1 mM TCEP	分辨率 2.70 Å R-free 0.234
5N9G TFIIIB -TBP/Brf2/DNA and SANT domain of Bdp1- 提交 2017-02-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 G 159–339（181 aa） 片段：UNP residues 159-339	未记录	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-16% PEG 8000, 150-200 mM KCl, 100 mM MES pH 6.5, 10-15 mM MgCl2, 1 mM TCEP	分辨率 2.70 Å R-free 0.234
6MZD Human TFIID Lobe A canonical 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 T 1–339（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 9.80 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 T 1–339（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 23.00 Å
6MZM Human TFIID bound to promoter DNA and TFIIA 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 T 1–339（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 7.50 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7EGF TFIID lobe A subcomplex 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DP 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 DP 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
7ZWC Structure of SNAPc:TBP-TFIIA-TFIIB sub-complex bound to U5 snRNA promoter 提交 2022-05-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7ZXE Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DP 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DP 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8ITY human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1 提交 2023-03-23	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 U 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8IUE RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1 提交 2023-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 U 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.10 Å
8IUH RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1 提交 2023-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 U 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 O 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 P 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
9FSO Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1) 提交 2024-06-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 R 159–339（181 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
9FSP RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2) 提交 2024-06-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 R 159–339（181 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.39 Å
9FSQ RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC) 提交 2024-06-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 R 159–339（181 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.51 Å
9FSR RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini) 提交 2024-06-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 R 159–339（181 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.76 Å
9FSS RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini) 提交 2024-06-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 R 159–339（181 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.14 Å
9K3B Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall) 提交 2024-10-18	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 U 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.80 Å
9K3U Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5) 提交 2024-10-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 U 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
9K3V Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4) 提交 2024-10-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 U 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
9LXN Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 U 1–339（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å

共 76 个其他 PDB 条目、81 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TBP_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	22
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–339； UniProt 1–339

Transcription initiation factor IIA beta chain

Homo sapiens

UniProt P52655

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 Q； UniProt 1–376	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1NVP HUMAN TFIIA/TBP/DNA COMPLEX 提交 2003-02-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 B 2–58（57 aa） 片段：N-terminal 58 amino acids 链 C 303–376（74 aa） 片段：c-terminal 76 amino acids	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；PEG6000, lithium nitrate, calcium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.10 Å R-free 0.247
5FUR Structure of human TFIID-IIA bound to core promoter DNA 提交 2016-01-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 9–51（43 aa） 链 C 330–376（47 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40；pH 7.9；10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 8.50 Å
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 N 1–376（376 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 N 1–376（376 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 N 1–376（376 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 N 1–376（376 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 N 1–376（376 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 N 1–376（376 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 N 1–376（376 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 N 1–376（376 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5M4S Transcription factor TFIIA as a single chain protein 提交 2016-10-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–58（57 aa） 链 A 328–376（49 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20mM Tris (8.0), 1mM DTT, 0.5mM EDTA and 25mM NaCl	分辨率 2.38 Å R-free 0.242
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 N 1–376（376 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 M 1–376（376 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
7ZWC Structure of SNAPc:TBP-TFIIA-TFIIB sub-complex bound to U5 snRNA promoter 提交 2022-05-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7ZXE Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DQ 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 DQ 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 U 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 Q 1–376（376 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	TF2AA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	23
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–376； UniProt 1–376

Transcription initiation factor IIB

Homo sapiens

UniProt Q00403

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 R； UniProt 1–316	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 110–316（207 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 E 110–316（207 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 I 110–316（207 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 M 110–316（207 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 Q 110–316（207 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1DL6 SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN TFIIB N-TERMINAL DOMAIN 提交 1999-12-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–59（58 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；压力 AMBIENT NMR样品组成 3MM HTFIIB N-TERMINAL DOMAIN U-15N; 50MM PHOSPHATE; 90% H2O, 10% D2O	分辨率未提供
1RLY RDC-derived models of the zinc ribbon domain of human general transcription TFIIB (zinc bound structures) 提交 2003-11-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–60（60 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient NMR样品组成 0.6mM TFIIB Uniform labeling with 15N: U-98% 15N, 20mM [2H4]-imidazole hydrochloride, 2.5mM ZnCl2, 5% glycerol, 20mM sodium sulfate at pH 6.5, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.6mM TFIIB Uniform labeling with 15N: U-98% 15N, 20mM [2H4]-imidazole hydrochloride, 2.5mM ZnCl2, 5% glycerol, 20mM sodium sulfate at pH 6.5, 12mg/mL of filamentous phage, Pf1, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
1RO4 RDC-derived models of the zinc ribbon domain of human general transcription factor TFIIB (zinc free structures) 提交 2003-12-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–60（60 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient NMR样品组成 0.6mM TFIIB Uniform labeling with 15N: U-98% 15N, 20mM [2H4]-imidazole hydrochloride, 5% glycerol and 20mM sodium sulfate at pH 6.5, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.6mM TFIIB Uniform labeling with 15N: U-98% 15N, 20mM [2H4]-imidazole hydrochloride, 5% glycerol and 20mM sodium sulfate at pH 6.5, 12mg/mL of filamentous phage, Pf1, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
1TFB NMR STUDIES OF HUMAN GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIB: DYNAMICS AND INTERACTION WITH VP16 ACTIVATION DOMAIN, 20 STRUCTURES 提交 1996-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 112–316（205 aa） 片段：CONSTRUCT COMPRISES RESIDUES 1 - 3 AND 112 - 316 OF FULL LENGTH HUMAN TFIIB	突变：DEL(4 - 111)	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1VOL TFIIB (HUMAN CORE DOMAIN)/TBP (A.THALIANA)/TATA ELEMENT TERNARY COMPLEX 提交 1996-04-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–316（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å R-free 0.318
2PHG Model for VP16 binding to TFIIB 提交 2007-04-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 112–316（205 aa） 片段：c-terminal core domain	突变：D111S	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM；压力 1 NMR样品组成 0.2 mM VP16ad U-15N, 0-0.2 mM TFIIBc, 50 mM KCl, 50 mM phosphate buffer pH 5.6, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5WH1 Apo form of the C-terminal region of human Transcription Factor IIB 提交 2017-07-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 107–316（210 aa） 片段：C-terminal residues 107-316	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；100 mM sodium acetate trihydrate pH 4.5, 2 M ammonium sulfate	分辨率 3.39 Å R-free 0.214
5WH1 Apo form of the C-terminal region of human Transcription Factor IIB 提交 2017-07-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 107–316（210 aa） 片段：C-terminal residues 107-316	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；100 mM sodium acetate trihydrate pH 4.5, 2 M ammonium sulfate	分辨率 3.39 Å R-free 0.214
5WH1 Apo form of the C-terminal region of human Transcription Factor IIB 提交 2017-07-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 107–316（210 aa） 片段：C-terminal residues 107-316	未记录	SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；100 mM sodium acetate trihydrate pH 4.5, 2 M ammonium sulfate	分辨率 3.39 Å R-free 0.214
5WH1 Apo form of the C-terminal region of human Transcription Factor IIB 提交 2017-07-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 107–316（210 aa） 片段：C-terminal residues 107-316	未记录	SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；100 mM sodium acetate trihydrate pH 4.5, 2 M ammonium sulfate	分辨率 3.39 Å R-free 0.214
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 R 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 R 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 R 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 R 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 R 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 R 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 R 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 BA 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 BA 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 O 1–316（316 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
7ZWC Structure of SNAPc:TBP-TFIIA-TFIIB sub-complex bound to U5 snRNA promoter 提交 2022-05-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7ZXE Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 BA 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 BA 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 M 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 R 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 R 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 R 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 R 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 R 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 R 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 R 1–316（316 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

共 54 个其他 PDB 条目、61 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TF2B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	24
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–316； UniProt 1–316

General transcription factor IIF subunit 1

Homo sapiens

UniProt P35269

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 S； UniProt 1–517	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–172（171 aa） 片段：RESIDUES 2-172	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 1.70 Å R-free 0.260
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–172（171 aa） 片段：RESIDUES 2-172	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 1.70 Å R-free 0.260
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 2–172（171 aa） 片段：RESIDUES 2-172	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 1.70 Å R-free 0.260
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 2–172（171 aa） 片段：RESIDUES 2-172	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 1.70 Å R-free 0.260
1I27 CRYSTAL STRUCTURE OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF THE RAP74 SUBUNIT OF HUMAN TRANSCRIPTION FACTOR IIF (TFIIF) 提交 2001-02-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 449–517（69 aa） 片段：RAP74 SUBUNIT, C-TERMINAL DOMAIN	突变：YES	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；282 K；Zinc Sulfate, Lithium chloride, PEG 2000 MME, polyvinylpyrrolidone 15K, glucosamine hydrochloride, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 282K	分辨率 1.02 Å R-free 0.146
1J2X Crystal structure of RAP74 C-terminal domain complexed with FCP1 C-terminal peptide 提交 2003-01-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 449–517（69 aa） 片段：C-terminal domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEGMME 550, zinc sulfate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.254
1NHA Solution Structure of the Carboxyl-Terminal Domain of RAP74 and NMR Characterization of the FCP-Binding Sites of RAP74 and CTD of RAP74, the subunit of Human TFIIF 提交 2002-12-19	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 436–517（82 aa） 片段：C-Terminal Domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM sodium phosphate buffer；压力 ambient NMR样品组成 1mM cterRAP74 unlabeled, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 100% D2O NMR样品组成 1mM cterRAP74 U-15N, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM cterRAP74 U-15N and U-13C, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM cterRAP74 U-15N and U-13C, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 100% D2O	分辨率未提供
1ONV NMR Structure of a Complex Containing the TFIIF Subunit RAP74 and the RNAP II CTD Phosphatase FCP1 提交 2003-03-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 436–517（82 aa） 片段：C-Terminal Domain of RAP74, sequence database residues 436-517	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM sodium phosphate buffer；压力 ambient NMR样品组成 1mM cterRAP74/cterFCP1, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 100% D2O NMR样品组成 1mM U-15N cterRAP74/cterFCP1, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM U-15N,13C cterRAP74/cterFCP1, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM cterRAP74/U-15N cterFCP1, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM cterRAP74/U-15N,13C cterFCP1, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM U-15N,C13 cterRAP74/cterFCP1, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA; | 100% D2O NMR样品组成 1mM cterRAP74/U-15N,13C cterFCP1, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 100% D2O	分辨率未提供
2K7L NMR structure of a complex formed by the C-terminal domain of human RAP74 and a phosphorylated peptide from the central domain of the FCP1 提交 2008-08-13	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 451–517（67 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10-40；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-98% 15N] cterRAP74, 1 mM centFCP1-T584PO4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] cterRAP74, 1 mM centFCP1-T584PO4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] cterRAP74, 1 mM centFCP1-T584PO4, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 FA 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 FA 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 FA 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 FA 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8S54 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state b (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 Q 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 S 1–517（517 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å

共 60 个其他 PDB 条目、63 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	T2FA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	25
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–517； UniProt 1–517

General transcription factor IIF subunit 2

Homo sapiens

UniProt P13984

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 T； UniProt 1–249	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BBY DNA-BINDING DOMAIN FROM HUMAN RAP30, NMR, MINIMIZED AVERAGE 提交 1998-04-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 175–243（69 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；297 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM PHOSPHATE, 50mM NACL；压力 1 NMR样品组成 AQUEOUS	分辨率未提供
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–119（118 aa） 片段：RESIDUES 2-119	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 1.70 Å R-free 0.260
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–119（118 aa） 片段：RESIDUES 2-119	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 1.70 Å R-free 0.260
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 2–119（118 aa） 片段：RESIDUES 2-119	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 1.70 Å R-free 0.260
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 2–119（118 aa） 片段：RESIDUES 2-119	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 1.70 Å R-free 0.260
2BBY DNA-BINDING DOMAIN FROM HUMAN RAP30, NMR, 30 STRUCTURES 提交 1998-04-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 175–243（69 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；297 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM PHOSPHATE, 50mM NACL；压力 1 NMR样品组成 AQUEOUS	分辨率未提供
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 FB 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 FB 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 FB 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 FB 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8S54 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state b (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 R 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 T 1–249（249 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	T2FB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	26
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249

General transcription factor IIE subunit 1

Homo sapiens

UniProt P29083

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 U； UniProt 1–439	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1VD4 Solution structure of the zinc finger domain of TFIIE alpha 提交 2004-03-18	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 113–174（62 aa） 片段：Zinc Finger Domain	未记录	ZN ZINC ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 3-4mM TFIIE alpha Zinc finger domain, U-15N, U-15N, 13C; 20mM potassium phosphate beffer, 0.03mM ZnCl2, 5mM d-DTT | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 3-4mM TFIIE alpha Zinc finger domain, U-15N, U-15N, 13C; 20mM potassium phosphate beffer, 0.03mM ZnCl2, 5mM d-DTT | 99.9% D2O	分辨率未提供
2JTX NMR structure of the TFIIE-alpha carboxyl terminus 提交 2007-08-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 336–439（104 aa） 片段：carboxyl terminus, residues 336-439	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2；压力 ambient NMR样品组成 1 mM TFIIE-alpha;, 20 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] TFIIE-alpha;, 20 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIE-alpha;, 20 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIE-alpha;, 20 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
2RNQ Solution structure of the C-terminal acidic domain of TFIIE alpha 提交 2008-01-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 378–439（62 aa） 片段：C-terminal acidic doman, UNP residues 378-439	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；295 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient NMR样品组成 1-2mM TFIIE-ALPHA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1-2mM TFIIE-ALPHA, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 1-2mM [U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1-2mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1-2mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
2RNR Solution structure of the complex between TFIIE alpha C-terminal acidic domain and TFIIH p62 PH domain 提交 2008-01-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 378–439（62 aa） 片段：C-terminal acidic domain, UNP residues 378-439	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient NMR样品组成 0.5MM [U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 0.5MM TFIIH P62; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5MM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 0.5MM TFIIH P62; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5MM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 0.5MM TFIIH P62; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 0.5MM [U-100% 15N] TFIIH P62, 0.5mM TFIIE-ALPHA; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5MM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIH P62, 0.5MM TFIIE-ALPHA; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5MM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIH P62, 0.5MM TFIIE-ALPHA; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
5GPY Crystal structure of the human TFIIE complex 提交 2016-08-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–217（217 aa） 片段：UNP residues 1-217	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.9；293 K；12% PEG3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.237
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 Q 1–439（439 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 Q 1–439（439 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 Q 1–439（439 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 Q 1–439（439 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 Q 1–439（439 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 Q 1–439（439 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 Q 1–439（439 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 Q 1–439（439 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 Q 1–439（439 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 U 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 U 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 U 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 U 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 EA 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 EA 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 Q 1–439（439 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7NVV XPB-containing part of TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NVW TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7NVX TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 W 1–273（273 aa） 链 W 274–439（166 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 W 1–196（196 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 EA 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 EA 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8S54 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state b (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 W 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 U 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 U 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 U 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 U 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 U 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 U 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 U 1–439（439 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

共 47 个其他 PDB 条目、47 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	T2EA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	27
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–439； UniProt 1–439

Transcription initiation factor IIE subunit beta

Homo sapiens

UniProt P29084

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 V； UniProt 1–291	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1D8J SOLUTION STRUCTURE OF THE CENTRAL CORE DOMAIN OF TFIIE BETA 提交 1999-10-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–146（81 aa） 片段：CENTRAL CORE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；300 K；离子强度（mmCIF原始值）500mM NACL；压力 AMBIENT NMR样品组成 1-2MM PROTEIN U-15N,13C; 20MM PHOSPHATE BUFFER, 500MM NACL NMR样品组成 1-2MM PROTEIN ; 20MM PHOSPHATE BUFFER, 500MM NACL	分辨率未提供
1D8K SOLUTION STRUCTURE OF THE CENTRAL CORE DOMAIN OF TFIIE BETA 提交 1999-10-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–146（81 aa） 片段：CENTRAL CORE DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；300 K；离子强度（mmCIF原始值）500mM NACL；压力 AMBIENT NMR样品组成 1-2MM PROTEIN U-15N,13C; 20MM PHOSPHATE BUFFER, 500MM NACL NMR样品组成 1-2MM PROTEIN U-15N; 20MM PHOSPHATE BUFFER, 500MM NACL NMR样品组成 1-2MM PROTEIN ; 20MM PHOSPHATE BUFFER, 500MM NACL	分辨率未提供
5GPY Crystal structure of the human TFIIE complex 提交 2016-08-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 141–244（104 aa） 片段：UNP residues 141-244	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.9；293 K；12% PEG3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.237
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 R 1–291（291 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 R 1–291（291 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 R 1–291（291 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 R 1–291（291 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 R 1–291（291 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 R 1–291（291 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 R 1–291（291 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 R 1–291（291 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric	链 R 1–291（291 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 V 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 V 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 V 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 V 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 EB 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 EB 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric	链 R 1–291（291 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 X 1–291（291 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 X 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 X 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 X 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 X 1–291（291 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 X 1–291（291 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 X 1–291（291 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 X 1–291（291 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 X 1–291（291 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 EB 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 EB 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 X 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 X 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric	链 X 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 X 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 V 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 V 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 V 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 V 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 V 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 V 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 V 1–291（291 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

共 41 个其他 PDB 条目、41 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	T2EB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	28
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–291； UniProt 1–291

Transcription initiation factor TFIID subunit 3

Homo sapiens

UniProt Q5VWG9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 c； UniProt 1–929	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5C13 Crystal Structure of TAF3 PHD finger bound to histone H3C4me3 peptide 提交 2015-06-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 855–915（61 aa） 片段：PHD finger domain, UNP residues 853-915 链 E 855–915（61 aa） 片段：PHD finger domain, UNP residues 853-915	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.03M magnesium chloride, 0.03M calcium chloride, 0.1M MES, 0.1M imidazole, PH6.5, 15% PEGMME 550, 15% PEG 20K	分辨率 2.10 Å R-free 0.280
5C13 Crystal Structure of TAF3 PHD finger bound to histone H3C4me3 peptide 提交 2015-06-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 855–915（61 aa） 片段：PHD finger domain, UNP residues 853-915 链 G 855–915（61 aa） 片段：PHD finger domain, UNP residues 853-915	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.03M magnesium chloride, 0.03M calcium chloride, 0.1M MES, 0.1M imidazole, PH6.5, 15% PEGMME 550, 15% PEG 20K	分辨率 2.10 Å R-free 0.280
5WXG Structure of TAF PHD finger domain binds to H3(1-15)K4ac 提交 2017-01-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 853–915（63 aa） 片段：UNP residues 853-915	未记录	ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；0.03M magnesium chloride, 0.03M calcium chloride, 0.1M MES, 0.1M imidazole, PH6.5, 15% PEGMME 550, 15% PEG 20K	分辨率 1.70 Å R-free 0.195
5WXH Crystal structure of TAF3 PHD finger bound to H3K4me3 提交 2017-01-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 853–915（63 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；0.03 M magnesium chloride, 0.03 M calcium chloride, 0.1 M MES, 0.1 M imidazole, PH6.5, 15% PEGMME 550, 15% PEG 20K	分辨率 1.30 Å R-free 0.175
5WXH Crystal structure of TAF3 PHD finger bound to H3K4me3 提交 2017-01-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 853–915（63 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；0.03 M magnesium chloride, 0.03 M calcium chloride, 0.1 M MES, 0.1 M imidazole, PH6.5, 15% PEGMME 550, 15% PEG 20K	分辨率 1.30 Å R-free 0.175
5XMY Crystal structure of TAF3 PHD finger bound to H3K4me3Q5ser 提交 2017-05-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 853–915（63 aa） 片段：PHD finger, UNP residues 853-915	突变：Y856M	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；0.03 M magnesium chloride, 0.03 M calcium chloride, 0.1 M MES, 0.1 M imidazole, PH6.5, 15% PEGMME 550, 15% PEG 20K	分辨率 1.70 Å R-free 0.221
5XMY Crystal structure of TAF3 PHD finger bound to H3K4me3Q5ser 提交 2017-05-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 853–915（63 aa） 片段：PHD finger, UNP residues 853-915	突变：Y856M	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；0.03 M magnesium chloride, 0.03 M calcium chloride, 0.1 M MES, 0.1 M imidazole, PH6.5, 15% PEGMME 550, 15% PEG 20K	分辨率 1.70 Å R-free 0.221
6MZD Human TFIID Lobe A canonical 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–929（929 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 9.80 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 C 1–929（929 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 23.00 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7EGF TFIID lobe A subcomplex 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 Dc 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 Dc 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 Dc 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 Dc 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 c 1–929（929 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

共 29 个其他 PDB 条目、32 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	31
链与序列区间	作者链 c； PDB构建体 1–929； UniProt 1–929

Transcription initiation factor TFIID subunit 11

Homo sapiens

UniProt Q15544

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 k； UniProt 1–211	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BH8 HTAFII18/HTAFII28 HETERODIMER CRYSTAL STRUCTURE 提交 1998-06-16	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 113–201（89 aa） 片段：RESIDUES 113 - 201	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.282
1BH9 HTAFII18/HTAFII28 HETERODIMER CRYSTAL STRUCTURE WITH BOUND PCMBS 提交 1998-06-16	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 113–201（89 aa） 片段：RESIDUES 113 - 201	未记录	PMB PARA-MERCURY-BENZENESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.257
6MZD Human TFIID Lobe A canonical 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 P 1–211（211 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 9.80 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 P 1–211（211 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 23.00 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7EGF TFIID lobe A subcomplex 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 Dk 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 Dk 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 Dk 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 Dk 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 k 1–211（211 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

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UniProt名称	TAF11_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	32
链与序列区间	作者链 k； PDB构建体 1–211； UniProt 1–211

Transcription initiation factor TFIID subunit 13

Homo sapiens

UniProt Q15543

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 m； UniProt 1–124	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BH8 HTAFII18/HTAFII28 HETERODIMER CRYSTAL STRUCTURE 提交 1998-06-16	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 31–75（45 aa） 片段：RESIDUES 31 - 75	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.282
1BH9 HTAFII18/HTAFII28 HETERODIMER CRYSTAL STRUCTURE WITH BOUND PCMBS 提交 1998-06-16	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 31–75（45 aa） 片段：RESIDUES 31 - 75	未记录	PMB PARA-MERCURY-BENZENESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.257
6MZD Human TFIID Lobe A canonical 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 S 1–124（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 9.80 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 S 1–124（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N	分辨率 23.00 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
7EGF TFIID lobe A subcomplex 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 Dm 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 Dm 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 Dm 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 Dm 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 m 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF13_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	33
链与序列区间	作者链 m； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124

DNA-directed RNA polymerase subunit

物种未注明

UniProt A0A8D1DPV6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 o； UniProt 1–1970	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PA 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PA 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8QEP RNA polymerase II bound to Alu RNA right arm 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8QEQ RNA polymerase II bound to minimal Alu RNA right arm in the alternative conformation 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：11-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8UHA Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - tilted 提交 2023-10-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8UHD Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - post-translocated 提交 2023-10-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8UHG Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - poised post-translocated 提交 2023-10-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UI0 Structure of poised transcription complex Pol II-DSIF-NELF - pre-translocated 提交 2023-10-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UIS Structure of transcription complex Pol II-DSIF-NELF-TFIIS 提交 2023-10-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
8W8E human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8W8F human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT-CMTR1 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 o 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9FD2 Structure of Pol II-TC-NER-STK19 complex 提交 2024-05-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9HVO Structure of the transcribing Pol II-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9HVQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-PAF-SPT6-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
9HWG Structure of the transcribing Pol II-TCR-RECQL5 complex 提交 2025-01-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9QEQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-SPT6-U1 snRNP complex 提交 2025-03-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9RTT Activated Elongation Complex with IWS1 and ELOF1 提交 2025-07-03	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.01 Å
9RZE State 2 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to proximal upstream H3 提交 2025-07-15	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.53 Å
9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.72 Å
9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 A 1–1970（1970 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å

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UniProt名称	A0A8D1DPV6_PIG
Isoform	—
PDB实体	34
链与序列区间	作者链 o； PDB构建体 1–1970； UniProt 1–1970

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

物种未注明

UniProt A0A4X1TVZ5

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 p； UniProt 78–1251	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PB 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PB 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7F4G Structure of RPAP2-bound RNA polymerase II 提交 2021-06-18	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 B 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
7UNC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS complex with rewrapped nucleosome 提交 2022-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 B 1–1251（1251 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7UND Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-nucleosome complex (stalled at +38) 提交 2022-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 B 1–1251（1251 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 2 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PB 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PB 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8UHA Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - tilted 提交 2023-10-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 B 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8UHD Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - post-translocated 提交 2023-10-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 B 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8UHG Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - poised post-translocated 提交 2023-10-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 B 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UI0 Structure of poised transcription complex Pol II-DSIF-NELF - pre-translocated 提交 2023-10-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 B 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UIS Structure of transcription complex Pol II-DSIF-NELF-TFIIS 提交 2023-10-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 B 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
8W8E human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 B 78–1251（1174 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8W8F human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT-CMTR1 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 B 78–1251（1174 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 p 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9BZ0 Structure of an STK19-containing TC-NER complex 提交 2024-05-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 B 1–1251（1251 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
9EGX RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-hexasome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 B 1–1251（1251 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGY RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 B 1–1251（1251 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGZ RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 B 1–1251（1251 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EH0 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 30 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 B 1–1251（1251 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9EH1 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 20 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 B 93–1251（1159 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9EH2 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-FACT nucleosome upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 B 1–1251（1251 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 B 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 B 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 B 78–1251（1174 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

共 47 个其他 PDB 条目、47 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A4X1TVZ5_PIG
Isoform	—
PDB实体	35
链与序列区间	作者链 p； PDB构建体 1–1174； UniProt 78–1251

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

物种未注明

UniProt I3LCH3

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 q； UniProt 1–275	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6EXV Structure of mammalian RNA polymerase II elongation complex inhibited by Alpha-amanitin 提交 2017-11-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
6GMH Structure of activated transcription complex Pol II-DSIF-PAF-SPT6 提交 2018-05-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：heptadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10s wait prior to blotting, blotting 8.5s	分辨率 3.10 Å
6GML Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF 提交 2018-05-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 C 1–271（271 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6TED Structure of complete, activated transcription complex Pol II-DSIF-PAF-SPT6 uncovers allosteric elongation activation by RTF1 提交 2019-11-11	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2 microliters applied to both sides of grid. Sample incubated on grid for 10s prior to blotting. Blotting for 8.5s.	分辨率 3.10 Å
7B0Y Structure of a transcribing RNA polymerase II-U1 snRNP complex 提交 2020-11-23	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：25-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7B7U Cryo-EM structure of mammalian RNA polymerase II in complex with human RPAP2 提交 2020-12-11	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–271（271 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PC 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PC 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7F4G Structure of RPAP2-bound RNA polymerase II 提交 2021-06-18	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
7OKX Structure of active transcription elongation complex Pol II-DSIF (SPT5-KOW5)-ELL2-EAF1 (composite structure) 提交 2021-05-18	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7OKY Structure of active transcription elongation complex Pol II-DSIF-ELL2-EAF1(composite structure) 提交 2021-05-18	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.14 Å
7OL0 Structure of active transcription elongation complex Pol II-DSIF (SPT5-KOW5) 提交 2021-05-18	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7OO3 Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA (Structure1) 提交 2021-05-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7OOB Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA-ADPBeF3 (Structure2) 提交 2021-05-27	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7OOP Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA-PAF-SPT6 (Structure 3) 提交 2021-05-28	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7OPC Pol II-CSB-CRL4CSA-UVSSA-SPT6-PAF (Structure 4) 提交 2021-05-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：28-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7OPD Pol II-CSB-CRL4CSA-UVSSA-SPT6-PAF (Structure 5) 提交 2021-05-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：28-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8A3Y Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex 提交 2022-06-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 C 1–270（270 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8A40 Structure of mammalian Pol II-TFIIS elongation complex 提交 2022-06-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PC 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PC 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8OEU Structure of the mammalian Pol II-SPT6 complex (composite structure, Structure 4) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
8OEV Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, lacking ELOA latch (composite structure, structure 3) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.86 Å
8OEW Structure of the mammalian Pol II-Elongin complex, lacking the ELOA latch (composite structure, structure 2) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8OF0 Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, Structure 1 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
8P4A Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 1 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8P4B Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 2 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8P4C Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 3 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8P4D Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 4 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8P4E Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 5 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8P4F Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 6 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	MGT 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8QEP RNA polymerase II bound to Alu RNA right arm 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8QEQ RNA polymerase II bound to minimal Alu RNA right arm in the alternative conformation 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：11-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8S54 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state b (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 q 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9ER2 PolII-TCR-STK19 structure. 提交 2024-03-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9FD2 Structure of Pol II-TC-NER-STK19 complex 提交 2024-05-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9FYX Influenza A/H7N9 polymerase pre-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：23-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 0.1 mM MgCl2 4% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9G0A Influenza A/H7N9 polymerase post-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：23-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 3 mM MgCl2 4% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9HVO Structure of the transcribing Pol II-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9HVQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-PAF-SPT6-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
9HWG Structure of the transcribing Pol II-TCR-RECQL5 complex 提交 2025-01-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9QEQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-SPT6-U1 snRNP complex 提交 2025-03-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9RTT Activated Elongation Complex with IWS1 and ELOF1 提交 2025-07-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.01 Å
9RZE State 2 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to proximal upstream H3 提交 2025-07-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.53 Å
9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.72 Å
9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 C 1–275（275 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å

共 85 个其他 PDB 条目、85 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I3LCH3_PIG
Isoform	—
PDB实体	36
链与序列区间	作者链 q； PDB构建体 1–275； UniProt 1–275

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4

物种未注明

UniProt A0A481BYI6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 r； UniProt 1–142	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PD 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PD 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7F4G Structure of RPAP2-bound RNA polymerase II 提交 2021-06-18	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 l 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PD 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PD 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8W8E human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8W8F human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT-CMTR1 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 r 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A481BYI6_PIG
Isoform	—
PDB实体	37
链与序列区间	作者链 r； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

DNA-directed RNA polymerase II subunit E

物种未注明

UniProt A0A4X1VTX4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 s； UniProt 1–210	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PE 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PE 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7F4G Structure of RPAP2-bound RNA polymerase II 提交 2021-06-18	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
7UNC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS complex with rewrapped nucleosome 提交 2022-04-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7UND Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-nucleosome complex (stalled at +38) 提交 2022-04-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 4 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
8A40 Structure of mammalian Pol II-TFIIS elongation complex 提交 2022-06-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PE 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PE 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8UHA Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - tilted 提交 2023-10-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8UHD Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - post-translocated 提交 2023-10-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8UHG Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - poised post-translocated 提交 2023-10-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UI0 Structure of poised transcription complex Pol II-DSIF-NELF - pre-translocated 提交 2023-10-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UIS Structure of transcription complex Pol II-DSIF-NELF-TFIIS 提交 2023-10-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
8W8E human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8W8F human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT-CMTR1 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 s 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9BZ0 Structure of an STK19-containing TC-NER complex 提交 2024-05-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
9EGX RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-hexasome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGY RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGZ RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EH0 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 30 bp upstream 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9EH1 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 20 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 E 2–210（209 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9EH2 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-FACT nucleosome upstream 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9MLC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-ELOF1-LEDGF-nucleosome activated elongation complex Composite map T 提交 2024-12-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric	链 E 1–210（210 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å

共 46 个其他 PDB 条目、46 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A4X1VTX4_PIG
Isoform	—
PDB实体	38
链与序列区间	作者链 s； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210

DNA-directed RNA polymerase II subunit F

物种未注明

UniProt A0A4X1VEK9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 t； UniProt 1–127	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PF 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PF 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7F4G Structure of RPAP2-bound RNA polymerase II 提交 2021-06-18	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
7UNC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS complex with rewrapped nucleosome 提交 2022-04-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7UND Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-nucleosome complex (stalled at +38) 提交 2022-04-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 5 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
8A40 Structure of mammalian Pol II-TFIIS elongation complex 提交 2022-06-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PF 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PF 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8QEP RNA polymerase II bound to Alu RNA right arm 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8QEQ RNA polymerase II bound to minimal Alu RNA right arm in the alternative conformation 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：11-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8UHA Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - tilted 提交 2023-10-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8UHD Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - post-translocated 提交 2023-10-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8UHG Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - poised post-translocated 提交 2023-10-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UI0 Structure of poised transcription complex Pol II-DSIF-NELF - pre-translocated 提交 2023-10-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UIS Structure of transcription complex Pol II-DSIF-NELF-TFIIS 提交 2023-10-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
8W8E human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8W8F human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT-CMTR1 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 t 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9BZ0 Structure of an STK19-containing TC-NER complex 提交 2024-05-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
9EGX RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-hexasome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGY RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGZ RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EH0 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 30 bp upstream 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9EH2 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-FACT nucleosome upstream 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9FD2 Structure of Pol II-TC-NER-STK19 complex 提交 2024-05-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9FYX Influenza A/H7N9 polymerase pre-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：23-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 0.1 mM MgCl2 4% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9G0A Influenza A/H7N9 polymerase post-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：23-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 3 mM MgCl2 4% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9HVO Structure of the transcribing Pol II-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9HVQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-PAF-SPT6-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
9HWG Structure of the transcribing Pol II-TCR-RECQL5 complex 提交 2025-01-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9MLC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-ELOF1-LEDGF-nucleosome activated elongation complex Composite map T 提交 2024-12-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9QEQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-SPT6-U1 snRNP complex 提交 2025-03-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric	链 F 1–127（127 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 57 个其他 PDB 条目、57 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	A0A4X1VEK9_PIG
Isoform	—
PDB实体	39
链与序列区间	作者链 t； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

物种未注明

UniProt A0A4X1VKG7

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 u； UniProt 1–172	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PG 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PG 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7F4G Structure of RPAP2-bound RNA polymerase II 提交 2021-06-18	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
7UNC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS complex with rewrapped nucleosome 提交 2022-04-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7UND Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-nucleosome complex (stalled at +38) 提交 2022-04-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 k 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
8A3Y Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex 提交 2022-06-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8A40 Structure of mammalian Pol II-TFIIS elongation complex 提交 2022-06-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PG 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PG 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8OEU Structure of the mammalian Pol II-SPT6 complex (composite structure, Structure 4) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
8OEV Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, lacking ELOA latch (composite structure, structure 3) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.86 Å
8OEW Structure of the mammalian Pol II-Elongin complex, lacking the ELOA latch (composite structure, structure 2) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8OF0 Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, Structure 1 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
8P4A Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 1 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8P4B Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 2 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8P4C Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 3 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8P4D Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 4 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8P4E Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 5 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8P4F Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 6 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	MGT 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8QEP RNA polymerase II bound to Alu RNA right arm 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8S54 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state b (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8UHA Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - tilted 提交 2023-10-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8UHD Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - post-translocated 提交 2023-10-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8UHG Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - poised post-translocated 提交 2023-10-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 G 1–171（171 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UI0 Structure of poised transcription complex Pol II-DSIF-NELF - pre-translocated 提交 2023-10-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 G 1–171（171 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UIS Structure of transcription complex Pol II-DSIF-NELF-TFIIS 提交 2023-10-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
8W8E human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8W8F human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT-CMTR1 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 u 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9BZ0 Structure of an STK19-containing TC-NER complex 提交 2024-05-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
9EGX RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-hexasome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGY RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGZ RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EH0 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 30 bp upstream 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9EH1 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 20 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 G 1–171（171 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9EH2 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-FACT nucleosome upstream 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9ER2 PolII-TCR-STK19 structure. 提交 2024-03-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9FD2 Structure of Pol II-TC-NER-STK19 complex 提交 2024-05-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9FYX Influenza A/H7N9 polymerase pre-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：23-meric	链 G 1–171（171 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 0.1 mM MgCl2 4% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9G0A Influenza A/H7N9 polymerase post-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：23-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 3 mM MgCl2 4% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9HVO Structure of the transcribing Pol II-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9HVQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-PAF-SPT6-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
9HWG Structure of the transcribing Pol II-TCR-RECQL5 complex 提交 2025-01-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9MLC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-ELOF1-LEDGF-nucleosome activated elongation complex Composite map T 提交 2024-12-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9QEQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-SPT6-U1 snRNP complex 提交 2025-03-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9RTN State 2 MAP 2 SPT6 with SETD2 提交 2025-07-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.82 Å
9RTT Activated Elongation Complex with IWS1 and ELOF1 提交 2025-07-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.01 Å
9RZD State 3 MAP 2 SPT6 with SETD2 提交 2025-07-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.69 Å
9RZE State 2 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to proximal upstream H3 提交 2025-07-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.53 Å
9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.72 Å
9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 G 1–172（172 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å

共 83 个其他 PDB 条目、83 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	A0A4X1VKG7_PIG
Isoform	—
PDB实体	40
链与序列区间	作者链 u； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

物种未注明

UniProt I3LCB2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 v； UniProt 1–150	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6EXV Structure of mammalian RNA polymerase II elongation complex inhibited by Alpha-amanitin 提交 2017-11-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
6GMH Structure of activated transcription complex Pol II-DSIF-PAF-SPT6 提交 2018-05-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：heptadecameric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10s wait prior to blotting, blotting 8.5s	分辨率 3.10 Å
6GML Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF 提交 2018-05-27	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6TED Structure of complete, activated transcription complex Pol II-DSIF-PAF-SPT6 uncovers allosteric elongation activation by RTF1 提交 2019-11-11	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2 microliters applied to both sides of grid. Sample incubated on grid for 10s prior to blotting. Blotting for 8.5s.	分辨率 3.10 Å
7B0Y Structure of a transcribing RNA polymerase II-U1 snRNP complex 提交 2020-11-23	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：25-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8A3Y Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex 提交 2022-06-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8A40 Structure of mammalian Pol II-TFIIS elongation complex 提交 2022-06-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8OEU Structure of the mammalian Pol II-SPT6 complex (composite structure, Structure 4) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
8OEV Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, lacking ELOA latch (composite structure, structure 3) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.86 Å
8OEW Structure of the mammalian Pol II-Elongin complex, lacking the ELOA latch (composite structure, structure 2) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8OF0 Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, Structure 1 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
8P4A Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 1 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8P4B Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 2 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8P4C Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 3 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8P4D Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 4 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8P4E Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 5 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8P4F Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 6 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	MGT 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8QEP RNA polymerase II bound to Alu RNA right arm 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8QEQ RNA polymerase II bound to minimal Alu RNA right arm in the alternative conformation 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：11-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8S54 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state b (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8W8E human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8W8F human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT-CMTR1 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 v 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9EH1 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 20 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 H 2–150（149 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9ER2 PolII-TCR-STK19 structure. 提交 2024-03-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9FD2 Structure of Pol II-TC-NER-STK19 complex 提交 2024-05-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9FYX Influenza A/H7N9 polymerase pre-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：23-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 0.1 mM MgCl2 4% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9G0A Influenza A/H7N9 polymerase post-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：23-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 3 mM MgCl2 4% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9HVO Structure of the transcribing Pol II-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9HVQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-PAF-SPT6-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
9HWG Structure of the transcribing Pol II-TCR-RECQL5 complex 提交 2025-01-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9QEQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-SPT6-U1 snRNP complex 提交 2025-03-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9RTT Activated Elongation Complex with IWS1 and ELOF1 提交 2025-07-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.01 Å
9RZE State 2 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to proximal upstream H3 提交 2025-07-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.53 Å
9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.72 Å
9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 H 1–150（150 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å

共 61 个其他 PDB 条目、61 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I3LCB2_PIG
Isoform	—
PDB实体	41
链与序列区间	作者链 v； PDB构建体 1–150； UniProt 1–150

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

物种未注明

UniProt P60899

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 w； UniProt 1–125	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6EXV Structure of mammalian RNA polymerase II elongation complex inhibited by Alpha-amanitin 提交 2017-11-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
6GMH Structure of activated transcription complex Pol II-DSIF-PAF-SPT6 提交 2018-05-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：heptadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10s wait prior to blotting, blotting 8.5s	分辨率 3.10 Å
6GML Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF 提交 2018-05-27	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6TED Structure of complete, activated transcription complex Pol II-DSIF-PAF-SPT6 uncovers allosteric elongation activation by RTF1 提交 2019-11-11	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2 microliters applied to both sides of grid. Sample incubated on grid for 10s prior to blotting. Blotting for 8.5s.	分辨率 3.10 Å
7B0Y Structure of a transcribing RNA polymerase II-U1 snRNP complex 提交 2020-11-23	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：25-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7B7U Cryo-EM structure of mammalian RNA polymerase II in complex with human RPAP2 提交 2020-12-11	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PI 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PI 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7F4G Structure of RPAP2-bound RNA polymerase II 提交 2021-06-18	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
7OKX Structure of active transcription elongation complex Pol II-DSIF (SPT5-KOW5)-ELL2-EAF1 (composite structure) 提交 2021-05-18	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7OKY Structure of active transcription elongation complex Pol II-DSIF-ELL2-EAF1(composite structure) 提交 2021-05-18	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.14 Å
7OL0 Structure of active transcription elongation complex Pol II-DSIF (SPT5-KOW5) 提交 2021-05-18	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7OO3 Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA (Structure1) 提交 2021-05-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7OOB Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA-ADPBeF3 (Structure2) 提交 2021-05-27	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7OOP Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA-PAF-SPT6 (Structure 3) 提交 2021-05-28	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7OPC Pol II-CSB-CRL4CSA-UVSSA-SPT6-PAF (Structure 4) 提交 2021-05-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：28-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7OPD Pol II-CSB-CRL4CSA-UVSSA-SPT6-PAF (Structure 5) 提交 2021-05-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：28-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7OZN RNA Polymerase II dimer (Class 1) 提交 2021-06-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 I 1–125（125 aa） 链 U 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7OZO RNA Polymerase II dimer (Class 2) 提交 2021-06-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 I 1–125（125 aa） 链 U 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7OZP RNA Polymerase II dimer (Class 3) 提交 2021-06-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 I 1–125（125 aa） 链 U 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7PKS Structural basis of Integrator-mediated transcription regulation 提交 2021-08-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：31-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 7 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8A3Y Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex 提交 2022-06-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8A40 Structure of mammalian Pol II-TFIIS elongation complex 提交 2022-06-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8B3D Structure of the Pol II-TCR-ELOF1 complex. 提交 2022-09-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8B3F Pol II-CSB-CSA-DDB1-ELOF1 提交 2022-09-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PI 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PI 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8OEU Structure of the mammalian Pol II-SPT6 complex (composite structure, Structure 4) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
8OEV Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, lacking ELOA latch (composite structure, structure 3) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.86 Å
8OEW Structure of the mammalian Pol II-Elongin complex, lacking the ELOA latch (composite structure, structure 2) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8OF0 Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, Structure 1 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
8P4A Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 1 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8P4B Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 2 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8P4C Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 3 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8P4D Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 4 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8P4E Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 5 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8P4F Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 6 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	MGT 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8QEP RNA polymerase II bound to Alu RNA right arm 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8QEQ RNA polymerase II bound to minimal Alu RNA right arm in the alternative conformation 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：11-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8S54 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state b (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8UHA Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - tilted 提交 2023-10-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8UHD Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - post-translocated 提交 2023-10-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8UHG Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - poised post-translocated 提交 2023-10-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UI0 Structure of poised transcription complex Pol II-DSIF-NELF - pre-translocated 提交 2023-10-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UIS Structure of transcription complex Pol II-DSIF-NELF-TFIIS 提交 2023-10-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
8W8E human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8W8F human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT-CMTR1 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 w 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9BZ0 Structure of an STK19-containing TC-NER complex 提交 2024-05-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
9EGX RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-hexasome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGY RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGZ RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EH0 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 30 bp upstream 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9EH1 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 20 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 I 10–125（116 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9EH2 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-FACT nucleosome upstream 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9ER2 PolII-TCR-STK19 structure. 提交 2024-03-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9FD2 Structure of Pol II-TC-NER-STK19 complex 提交 2024-05-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9FYX Influenza A/H7N9 polymerase pre-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：23-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 0.1 mM MgCl2 4% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9G0A Influenza A/H7N9 polymerase post-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：23-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 3 mM MgCl2 4% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9HVO Structure of the transcribing Pol II-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9HVQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-PAF-SPT6-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
9HWG Structure of the transcribing Pol II-TCR-RECQL5 complex 提交 2025-01-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9MLC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-ELOF1-LEDGF-nucleosome activated elongation complex Composite map T 提交 2024-12-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9QEQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-SPT6-U1 snRNP complex 提交 2025-03-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9RTT Activated Elongation Complex with IWS1 and ELOF1 提交 2025-07-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.01 Å
9RZE State 2 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to proximal upstream H3 提交 2025-07-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.53 Å
9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.72 Å
9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 I 1–125（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å

共 111 个其他 PDB 条目、111 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPB9_PIG
Isoform	—
PDB实体	42
链与序列区间	作者链 w； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

物种未注明

UniProt A0A493TD97

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 x； UniProt 1–67	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 8 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PJ 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PJ 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8W8E human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 J 1–67（67 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8W8F human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT-CMTR1 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 J 1–67（67 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 x 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 J 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 J 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 J 1–67（67 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A493TD97_ANAPP
Isoform	—
PDB实体	43
链与序列区间	作者链 x； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a

物种未注明

UniProt F1RKE4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 y； UniProt 1–117	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6EXV Structure of mammalian RNA polymerase II elongation complex inhibited by Alpha-amanitin 提交 2017-11-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
6GMH Structure of activated transcription complex Pol II-DSIF-PAF-SPT6 提交 2018-05-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：heptadecameric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10s wait prior to blotting, blotting 8.5s	分辨率 3.10 Å
6GML Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF 提交 2018-05-27	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6TED Structure of complete, activated transcription complex Pol II-DSIF-PAF-SPT6 uncovers allosteric elongation activation by RTF1 提交 2019-11-11	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2 microliters applied to both sides of grid. Sample incubated on grid for 10s prior to blotting. Blotting for 8.5s.	分辨率 3.10 Å
7B0Y Structure of a transcribing RNA polymerase II-U1 snRNP complex 提交 2020-11-23	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：25-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8A3Y Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex 提交 2022-06-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8A40 Structure of mammalian Pol II-TFIIS elongation complex 提交 2022-06-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8OEU Structure of the mammalian Pol II-SPT6 complex (composite structure, Structure 4) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
8OEV Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, lacking ELOA latch (composite structure, structure 3) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.86 Å
8OEW Structure of the mammalian Pol II-Elongin complex, lacking the ELOA latch (composite structure, structure 2) 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8OF0 Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, Structure 1 提交 2023-03-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
8P4A Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 1 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8P4B Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 2 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8P4C Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 3 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8P4D Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 4 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8P4E Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 5 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8P4F Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 6 提交 2023-05-20	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	MGT 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8QEP RNA polymerase II bound to Alu RNA right arm 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8QEQ RNA polymerase II bound to minimal Alu RNA right arm in the alternative conformation 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：11-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8S54 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state b (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8UHG Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - poised post-translocated 提交 2023-10-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 K 1–115（115 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UI0 Structure of poised transcription complex Pol II-DSIF-NELF - pre-translocated 提交 2023-10-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 K 1–115（115 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8W8E human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8W8F human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT-CMTR1 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 y 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9EH1 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 20 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 K 1–115（115 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9ER2 PolII-TCR-STK19 structure. 提交 2024-03-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9FD2 Structure of Pol II-TC-NER-STK19 complex 提交 2024-05-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9FYX Influenza A/H7N9 polymerase pre-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：23-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 0.1 mM MgCl2 4% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9G0A Influenza A/H7N9 polymerase post-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：23-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 3 mM MgCl2 4% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9HVO Structure of the transcribing Pol II-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9HVQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-PAF-SPT6-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
9HWG Structure of the transcribing Pol II-TCR-RECQL5 complex 提交 2025-01-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9QEQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-SPT6-U1 snRNP complex 提交 2025-03-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9RTT Activated Elongation Complex with IWS1 and ELOF1 提交 2025-07-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.01 Å
9RZE State 2 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to proximal upstream H3 提交 2025-07-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.53 Å
9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.72 Å
9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 K 1–117（117 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å

共 63 个其他 PDB 条目、63 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F1RKE4_PIG
Isoform	—
PDB实体	44
链与序列区间	作者链 y； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117

RPB12

物种未注明

UniProt A0A4X1TRS6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合 异源复合物 蛋白 × 48 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物数一致	链 z； UniProt 1–58	未记录	CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） Alpha-amanitin × 1 （P85421） RNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 （P21675） Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 （Q6P1X5） Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 （O00268） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 （Q15542） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 （P49848） Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 （Q15545） Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 （Q7Z7C8） Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 （Q16594） Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 （Q12962） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 （Q16514） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIA beta chain × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） non-template DNA × 1 template DNA × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 （Q5VWG9） Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 （Q15544） Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 （Q15543） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8WAK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PL 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric	链 PL 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7F4G Structure of RPAP2-bound RNA polymerase II 提交 2021-06-18	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
7UNC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS complex with rewrapped nucleosome 提交 2022-04-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7UND Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-nucleosome complex (stalled at +38) 提交 2022-04-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 a 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PL 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 PL 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8QEP RNA polymerase II bound to Alu RNA right arm 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8QEQ RNA polymerase II bound to minimal Alu RNA right arm in the alternative conformation 提交 2023-09-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：11-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8UHA Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - tilted 提交 2023-10-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8UHD Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - post-translocated 提交 2023-10-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8UHG Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - poised post-translocated 提交 2023-10-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UI0 Structure of poised transcription complex Pol II-DSIF-NELF - pre-translocated 提交 2023-10-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8UIS Structure of transcription complex Pol II-DSIF-NELF-TFIIS 提交 2023-10-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
8W8E human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
8W8F human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT-CMTR1 提交 2023-09-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08	结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric	链 z 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9BZ0 Structure of an STK19-containing TC-NER complex 提交 2024-05-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.90 Å
9EGX RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-hexasome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGY RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGZ RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EH0 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 30 bp upstream 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9EH2 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-FACT nucleosome upstream 提交 2024-11-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9FD2 Structure of Pol II-TC-NER-STK19 complex 提交 2024-05-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9FYX Influenza A/H7N9 polymerase pre-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：23-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 0.1 mM MgCl2 4% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9G0A Influenza A/H7N9 polymerase post-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：23-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 3 mM MgCl2 4% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9HVO Structure of the transcribing Pol II-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9HVQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-PAF-SPT6-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
9HWG Structure of the transcribing Pol II-TCR-RECQL5 complex 提交 2025-01-03	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9MLC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-ELOF1-LEDGF-nucleosome activated elongation complex Composite map T 提交 2024-12-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9QEQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-SPT6-U1 snRNP complex 提交 2025-03-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric	链 L 1–58（58 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

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UniProt名称	A0A4X1TRS6_PIG
Isoform	—
PDB实体	45
链与序列区间	作者链 z； PDB构建体 1–58； UniProt 1–58

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