|
5NUG
Motor domains from human cytoplasmic dynein-1 in the phi-particle conformation
提交 2017-04-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;20mM HEPES pH7.4, 150 mM KCl, 1mM MgCl2, 5 mM DTT, 0.1 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
5NUG
Motor domains from human cytoplasmic dynein-1 in the phi-particle conformation
提交 2017-04-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;20mM HEPES pH7.4, 150 mM KCl, 1mM MgCl2, 5 mM DTT, 0.1 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
5OWO
Human cytoplasmic Dynein N-Terminus dimerization domain at 1.8 Angstrom resolution
提交 2017-09-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–201(201 aa)
链 B
1–201(201 aa)
链 C
1–201(201 aa)
链 D
1–201(201 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
GOL GLYCEROL × 9
MG MAGNESIUM ION × 26
CA CALCIUM ION × 2
NA SODIUM ION × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;291.15 K;100mM Sodium acetate, pH 5.5, 10% Glycerol, 50mM Calcium acetate, 20% PEG 2,000 MME
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.229
|
|
6F1T
Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and BICDR1
提交 2017-11-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 45
PDB 声明:45-meric
|
链 e
1–983(983 aa)
链 f
1–983(983 aa)
链 m
1–983(983 aa)
链 n
1–983(983 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
6F1U
N terminal region of dynein tail domains in complex with dynactin filament and BICDR-1
提交 2017-11-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:tridecameric
|
链 f
1–1186(1186 aa)
链 m
1–1186(1186 aa)
链 n
1–1186(1186 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
6F1V
C terminal region of the dynein heavy chains in the dynein tail/dynactin/BICDR1 complex
提交 2017-11-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 f
1–1186(1186 aa)
链 m
1–1186(1186 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
6F1Y
Dynein light intermediate chain region of the dynein tail/dynactin/BICDR1 complex
提交 2017-11-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 f
780–927(148 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
6F38
Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and HOOK3
提交 2017-11-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 45
PDB 声明:45-meric
|
链 e
1–1455(1455 aa)
链 f
1–1455(1455 aa)
链 m
1–1455(1455 aa)
链 n
1–1455(1455 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.70 Å
|
|
6F3A
Cryo-EM structure of a single dynein tail domain bound to dynactin and BICD2N
提交 2017-11-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 36
PDB 声明:36-meric
|
链 e
1–1455(1455 aa)
链 f
1–1455(1455 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å
|
|
7Z8F
Composite structure of dynein-dynactin-BICDR on microtubules
提交 2022-03-17
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 43
PDB 声明:43-meric
|
链 e
1–4646(4646 aa)
链 f
1–4646(4646 aa)
链 m
1–4646(4646 aa)
链 n
1–4646(4646 aa)
|
突变:R1567E, K1610E
突变:R1567E, K1610E
突变:R1567E, K1610E
突变:R1567E, K1610E
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13
MG MAGNESIUM ION × 14
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5
ZN ZINC ION × 3
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 20.00 Å
|
|
7Z8G
Cytoplasmic dynein-1 motor domain
提交 2022-03-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
突变:R1567E, K1610E
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 3.52 Å
|
|
7Z8H
Cytoplasmic dynein-1 motor domain AAA1, AAA2, and AAA3 subunits
提交 2022-03-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 3.41 Å
|
|
7Z8I
The barbed end complex of dynactin bound to BICDR1 and the cytoplasmic dynein tails (A2, B1, B2)
提交 2022-03-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 17
PDB 声明:heptadecameric
|
链 f
1–4646(4646 aa)
链 m
1–4646(4646 aa)
链 n
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 3.30 Å
|
|
7Z8J
Cytoplasmic dynein (A2) bound to BICDR1
提交 2022-03-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 9
PDB 声明:nonameric
|
链 f
1–4646(4646 aa)
链 m
1–4646(4646 aa)
链 n
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 3.93 Å
|
|
7Z8K
Cytoplasmic dynein (A1) bound to BICDR1
提交 2022-03-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 9
PDB 声明:nonameric
|
链 e
1–4646(4646 aa)
链 f
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 4.37 Å
|
|
7Z8L
Cytoplasmic dynein light intermediate chain (B1) bound to the motor domain (A2).
提交 2022-03-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 f
1–4646(4646 aa)
|
突变:E1518K, R1567K
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 4.90 Å
|
|
8DYU
Structure of human cytoplasmic dynein-1 bound to two Lis1 proteins
提交 2022-08-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1320–4646(3327 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å
|
|
8DYV
Structure of human cytoplasmic dynein-1 bound to one Lis1
提交 2022-08-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1320–4646(3327 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.97 Å
|
|
8FCY
Engineered human dynein motor domain in microtubule-bound state
提交 2022-12-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1458–3281(1824 aa)
链 A
3412–4646(1235 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;50 mM Tris pH 7.4, 150 mM potassium acetate, 2 mM magnesium acetate, 1 mM EGTA, 1 mM DTT, and 0.1 mM Mg-ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
8FD6
Engineered human dynein motor domain in the microtubule-unbound state in the buffer containing ATP-Vi
提交 2022-12-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1458–3277(1820 aa)
链 A
3412–4646(1235 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
VO4 VANADATE ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;50 mM Tris pH 7.4, 150 mM potassium acetate, 2 mM magnesium acetate, 1 mM EGTA, 1 mM DTT, and 0.1 mM Mg-ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
8FDT
Engineered human dynein motor domain in the microtubule-unbound state with LIS1 complex in the buffer containing ATP-Vi
提交 2022-12-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1458–3277(1820 aa)
链 A
3412–4646(1235 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
VO4 VANADATE ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;50 mM Tris pH 7.4, 150 mM potassium acetate, 2 mM magnesium acetate, 1 mM EGTA, 1 mM DTT, and 0.1 mM Mg-ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
8FDU
Engineered human dynein motor domain in the microtubule-unbound state with LIS1 complex in the buffer containing ATP-Vi (local refined on AAA3-AAA5 and LIS1)
提交 2022-12-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1458–3277(1820 aa)
链 A
3412–4646(1235 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;50 mM Tris pH 7.4, 150 mM potassium acetate, 2 mM magnesium acetate, 1 mM EGTA, 1 mM DTT, and 0.1 mM Mg-ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
8PQV
Cytoplasmic dynein-1 motor domain in post-powerstroke state
提交 2023-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
突变:R1567E, K1610E
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å
|
|
8PQW
Cytoplasmic dynein-1 motor domain bound to dynactin-p150glued and LIS1
提交 2023-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 9
PDB 声明:nonameric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
突变:R1567E, K1610E
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å
|
|
8PQY
Cytoplasmic dynein-1 motor domain bound to LIS1
提交 2023-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
突变:R1567E, K1610E
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
8PQZ
Cytoplasmic dynein-1 A1/A2 motor domains bound to LIS1
提交 2023-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
链 J
1–4646(4646 aa)
|
突变:R1567E, K1610E
突变:R1567E, K1610E
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å
|
|
8PR0
Cytoplasmic dynein-A heavy chain bound to dynactin-p150glued and IC-LC tower
提交 2023-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 11
PDB 声明:undecameric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
链 B
1–4646(4646 aa)
|
突变:R1567E, K1610E
突变:R1567E, K1610E
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.40 Å
|
|
8PR1
Cytoplasmic dynein-B heavy chain bound to IC-LC tower
提交 2023-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
链 G
1–4646(4646 aa)
|
突变:R1567E, K1610E
突变:R1567E, K1610E
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å
|
|
8PR2
Cytoplasmic dynein-1 heavy chain bound to JIP3-LZI
提交 2023-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 f
1–4646(4646 aa)
链 m
1–4646(4646 aa)
|
突变:R1567E, K1610E
突变:R1567E, K1610E
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
8PR3
Cytoplasmic dynein-1 heavy chain bound to JIP3-RH1
提交 2023-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 9
PDB 声明:nonameric
|
链 f
1–4646(4646 aa)
链 m
1–4646(4646 aa)
|
突变:R1567E, K1610E
突变:R1567E, K1610E
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
8PTK
Composite structure of Dynein-Dynactin-JIP3-LIS1
提交 2023-07-14
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 53
PDB 声明:53-meric
|
链 e
1–4646(4646 aa)
链 f
1–4646(4646 aa)
链 m
1–4646(4646 aa)
链 n
1–4646(4646 aa)
|
突变:R1567E, K1610E
突变:R1567E, K1610E
突变:R1567E, K1610E
突变:R1567E, K1610E
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
ZN ZINC ION × 3
MG MAGNESIUM ION × 6
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.00 Å
|
|
9BLY
Composite structure of full-length human dynein-1 in phi-particle conformation
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
链 B
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
9BLZ
State-1(phi motor) of full-length human dynein-1 in 5mM ATP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å
|
|
9BM0
State-2 of motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM ATP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9BM1
State-3 of motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM ATP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.02 Å
|
|
9BM2
State-4 of motor domain from full-length human dynein-1 in 5 mM ATP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.82 Å
|
|
9BM3
State-5a of motor domain from full-length human dynein-1 in 5 mM ATP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.49 Å
|
|
9BM4
State-5b of motor domain from full-length human dynein-1 in 5 mM ATP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.48 Å
|
|
9BM5
State-6 of motor domain from full-length human dynein-1 in 5 mM ATP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
9BM6
State-7a of motor domain from full-length human dynein-1 in 5 mM ATP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å
|
|
9BM7
State-7b of motor domain from full-length human dynein-1 in 5 mM ATP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.58 Å
|
|
9BM8
State-7c of motor domain from full-length human dynein-1 in 5 mM ATP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å
|
|
9BMA
Motor domain from full-length human dynein-1 bound to microtubules in apo condition
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;30 mM HEPES pH 7.2, 60 mM KCl, 1 mM EGTA, 5 mM MgSO4, 1 mM DTT, 5 uM paclitaxel
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9BMB
Post-1 motor domain from full-length human dynein-1 bound to microtubules in 5mM ADP condition
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;30 mM HEPES pH 7.2, 60 mM KCl, 1 mM EGTA, 5 mM MgSO4, 1 mM DTT, 5 uM paclitaxel, 5mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
9BMC
Post-2 motor domain from full-length human dynein-1 bound to microtubules in 5mM ADP condition
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;30 mM HEPES pH 7.2, 60 mM KCl, 1 mM EGTA, 5 mM MgSO4, 1 mM DTT, 5 uM paclitaxel, 5mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
9BMD
Motor domain from full-length human dynein-1 bound to microtubules in 5mM AMPPNP condition
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;30 mM HEPES pH 7.2, 60 mM KCl, 1 mM EGTA, 5 mM MgSO4, 1 mM DTT, 5 uM paclitaxel, 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
9BMF
State-1(phi motor) of full-length human dynein-1 in 5mM ATPVi
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
AOV ADP ORTHOVANADATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATPVi
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9BMG
State-2 of full-length human dynein-1 in 5mM ATPVi
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
AOV ADP ORTHOVANADATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATPVi
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å
|
|
9BMH
State-4 of motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM ATPVi
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
AOV ADP ORTHOVANADATE × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATPVi
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9BMJ
State-1 of the motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM AMPPNP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9BML
State-2 of the motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM AMPPNP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
9BMM
State-4 of the motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM AMPPNP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9BMN
State-5 of motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM AMPPNP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
9BMO
State-6 of motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM AMPPNP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
9BMP
State-7 of the motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM AMPPNP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
9BMR
State-1 of motor domain from full-length human phi dynein-1 in 5 mM ADP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
|
9BMS
State-2 of motor domain from full-length human dynein-1 in 5 mM ADP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å
|
|
9BMT
State-5 of motor domain from full-length human dynein-1 in 5 mM ADP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
9BMU
State-6 of motor domain from full-length human dynein-1 in 5 mM ADP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
9BMV
State-7a-post1 of motor domain from full-length human dynein-1 in 5 mM ADP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
9BMW
State-7b-post2 of motor domain from full-length human dynein-1 in 5 mM ADP
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
9BMY
State-1 of motor domain from full-length human dynein-1 in apo condition
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å
|
|
9BMZ
State-2 of motor domain from full-length human dynein-1 in apo condition
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å
|
|
9BN0
State-7 of motor domain from full-length human dynein-1 in apo condition
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
9BN1
State-8 of motor domain from full-length human dynein-1 in apo condition
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
9BN3
The alpha registry-locked dynein motor domain mutant in 5mM ATP condition, class1
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9BN4
The alpha registry-locked dynein motor domain mutant in 5mM ATP condition, class2
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
9BN5
The alpha registry-locked dynein motor domain mutant in 5mM ATPVi condition, class1
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATPVi
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
9BN6
The alpha registry-locked dynein motor domain mutant in 5mM ATPVi condition, class2
提交 2024-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATPVi
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
9DH5
State-1 of the motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM AMPPNP with 5mM Mg2+
提交 2024-09-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
|
9DH6
State-2 of the motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM AMPPNP with 5mM Mg2+
提交 2024-09-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
9DH7
State-4 of the motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM AMPPNP with 5mM Mg2+
提交 2024-09-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
9DH8
State-5 of the motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM AMPPNP with 5mM Mg2+
提交 2024-09-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
9DH9
State-7-Post-2 of the motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM AMPPNP with 5mM Mg2+
提交 2024-09-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
9DHA
State-7-Post-1 of the motor domain from full-length human dynein-1 in 5mM AMPPNP with 5mM Mg2+
提交 2024-09-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
9DZY
Cryo-EM structure of Pre-Chi dynein bound to Lis1
提交 2024-10-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
2–4646(4645 aa)
链 B
2–4646(4645 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9E0K
Cryo-EM structure of human cytoplasmic dynein-1 in the presence of ATP
提交 2024-10-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–4646(4645 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9E0T
Cryo-EM structure of human cytoplasmic dynein-1 bound to LIS1 in the presence of ATP
提交 2024-10-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
2–4646(4645 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9E0U
Cryo-EM structure of human cytoplasmic dynein-1 in the presence of ATP
提交 2024-10-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–4646(4645 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
9E0W
Cryo-EM structure of human cytoplasmic dynein-1 bound to LIS1 in the presence of ATP
提交 2024-10-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
2–4646(4645 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9E0X
Cryo-EM structure of Phi dynein
提交 2024-10-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
2–4646(4645 aa)
链 B
2–4646(4645 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
9E0Y
Cryo-EM structure of human cytoplasmic dynein-1 in the presence of ATP
提交 2024-10-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2–4646(4645 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
9E0Z
Dimeric motor domains from phi-like dynein-1 bound to a Lis1 dimer under Nde1-Lis1 condition
提交 2024-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
链 B
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å
|
|
9E10
Dimeric motor domains from phi dynein-1 under Lis1 condition
提交 2024-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
链 B
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.71 Å
|
|
9E11
Dimeric motor domains from phi-like dynein-1 bound to a Lis1 dimer under Lis1 condition
提交 2024-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
链 B
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å
|
|
9E12
Full-length human dynein-1 in phi comformation under Lis1 condition
提交 2024-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–4646(4646 aa)
链 B
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.50 Å
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9E13
Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Lis1 condition
提交 2024-10-21
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
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链 A
1–4646(4646 aa)
链 B
1–4646(4646 aa)
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未记录
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ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.50 Å
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9E14
Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Nde1-Lis1 condition
提交 2024-10-21
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
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链 A
1–4646(4646 aa)
链 B
1–4646(4646 aa)
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未记录
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ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 5.00 Å
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9E22
Cryo-EM structure of human cytoplasmic dynein-1 bound to LIS1 in the presence of ATP
提交 2024-10-21
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
2–4646(4645 aa)
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未记录
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ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.30 Å
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9E23
Cryo-EM structure of Pre-Chi dynein tail
提交 2024-10-21
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:16-meric
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链 A
2–4646(4645 aa)
链 G
2–4646(4645 aa)
链 e
2–4646(4645 aa)
链 f
2–4646(4645 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 6.20 Å
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9E28
Cryo-EM structure of Phi dynein tail
提交 2024-10-21
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:16-meric
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链 A
2–4646(4645 aa)
链 G
2–4646(4645 aa)
链 e
2–4646(4645 aa)
链 f
2–4646(4645 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 4.40 Å
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9HHL
Structure of Dynein-Dynactin-NuMA-LIS1
提交 2024-11-21
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突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 41
PDB 声明:41-meric
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链 e
1–4646(4646 aa)
链 f
1–4646(4646 aa)
链 m
1–4646(4646 aa)
链 n
1–4646(4646 aa)
|
突变:R1567E, K1610E
突变:R1567E, K1610E
突变:R1567E, K1610E
突变:R1567E, K1610E
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 3
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 6.53 Å
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9YNC
Motor domains of phi-like human dynein-1 bound to dynactin-p150glued and LIS1
提交 2025-10-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 10
PDB 声明:decameric
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链 A
1–4646(4646 aa)
链 B
1–4646(4646 aa)
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未记录
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ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.93 Å
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9YND
Motor domain of human dynein-1 in pre-power stroke bound to dynactin-p150glued-CC1B and LIS1
提交 2025-10-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 9
PDB 声明:nonameric
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链 A
1–4646(4646 aa)
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未记录
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ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.26 Å
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9YNE
Motor domain of human dynein-1 in pre-power stroke bound to dynactin-p150glued-CC1B-ICD and LIS1
提交 2025-10-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
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链 A
1–4646(4646 aa)
|
未记录
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ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 8.46 Å
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9YNF
Motor domain of human dynein-1 in post1 state
提交 2025-10-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1–4646(4646 aa)
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未记录
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ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.92 Å
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9YNH
Full-length human cytoplasmic dynein-1 in phi-like state bound to dynactin-p150glued and LIS1
提交 2025-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:octadecameric
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链 A
1–4646(4646 aa)
链 B
1–4646(4646 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å
|