9zrq

Cryo-EM structure of KCa2.2/calmodulin channel in complex with SKA31.

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 133.0 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2

Homo sapiens

UniProt Q9H2S1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 117–477 链 B; UniProt 117–477 链 C; UniProt 117–477 链 D; UniProt 117–477 未记录 Calmodulin-1 × 4 (P0DP23) K POTASSIUM ION × 4 A1C3Q naphtho[1,2-d][1,3]thiazol-2-amine × 4 CA CALCIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.77 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KCNN2_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–361; UniProt 117–477 作者链 B; PDB构建体 1–361; UniProt 117–477 作者链 C; PDB构建体 1–361; UniProt 117–477 作者链 D; PDB构建体 1–361; UniProt 117–477

Calmodulin-1

Homo sapiens

UniProt P0DP23

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 3–148 链 F; UniProt 3–148 链 G; UniProt 3–148 链 H; UniProt 3–148 未记录 Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2 × 4 (Q9H2S1) K POTASSIUM ION × 4 A1C3Q naphtho[1,2-d][1,3]thiazol-2-amine × 4 CA CALCIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.77 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 213 个其他 PDB 条目、279 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CALM1_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–146; UniProt 3–148 作者链 F; PDB构建体 1–146; UniProt 3–148 作者链 G; PDB构建体 1–146; UniProt 3–148 作者链 H; PDB构建体 1–146; UniProt 3–148

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9zrq

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9zrq
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9zrq
沉积日期 deposition_date2025-12-20
结构标题 titleCryo-EM structure of KCa2.2/calmodulin channel in complex with SKA31.
关键词 keywords;Intermediate conductance calcium-activated potassium channel, Ion channel, Calmodulin binding protein, TRANSPORT PROTEIN, MEMBRANE PROTEIN ;; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier44.34
回转半径 Rg (电子) rg_electron43.62
零角强度 I(0) i01465840000.00
分子量 molecular_weight211470.0 kDa
排除体积 excluded_volume205280 ų
包络体积 envelope_volume438460 ų
水化壳体积 shell_volume81610 ų
包络直径 envelope_diameter142.6
壳层 Rg shell_rg51.42
包络 Rg envelope_rg41.88
形状 Rg shape_rg43.65
总 Rg total_rg43.84
总原子数 total_atoms15961
残基数 n_residues2028
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax133.0
Rg (实空间) rg_real43.97
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.78
I(0) (实空间) i0_real1.4660e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.3890e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal44.34
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1466000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8946
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary62.8
偏度 Skewness skewness-0.050
峰度 Kurtosis kurtosis-0.547
角度范围 angular_range— – 0.1800 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha78600000.0000
实空间数据点数 n_real_points37
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.913; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.953; Smooth: 0.933

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)