12dk

structure of human KCNQ1-CaM-PIP2 intermediate state

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 124.5 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1

Homo sapiens

UniProt P51787

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 76–620 链 C; UniProt 76–620 链 E; UniProt 76–620 链 G; UniProt 76–620 突变:I145C, E160R, R231E Calmodulin-1 × 4 (P0DP23) PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 CA CALCIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 26 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KCNQ1_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–545; UniProt 76–620 作者链 C; PDB构建体 1–545; UniProt 76–620 作者链 E; PDB构建体 1–545; UniProt 76–620 作者链 G; PDB构建体 1–545; UniProt 76–620

Calmodulin-1

Homo sapiens

UniProt P0DP23

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–149 链 D; UniProt 1–149 链 F; UniProt 1–149 链 H; UniProt 1–149 未记录 Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1 × 4 (P51787) PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 CA CALCIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 213 个其他 PDB 条目、279 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CALM1_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–149; UniProt 1–149 作者链 D; PDB构建体 1–149; UniProt 1–149 作者链 F; PDB构建体 1–149; UniProt 1–149 作者链 H; PDB构建体 1–149; UniProt 1–149

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 12dk

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 12dk
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id12dk
沉积日期 deposition_date2026-03-28
结构标题 titlestructure of human KCNQ1-CaM-PIP2 intermediate state
关键词 keywordsKCNQ1, intermediate state, PIP2, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier40.78
回转半径 Rg (电子) rg_electron40.13
零角强度 I(0) i0677182000.00
分子量 molecular_weight219790.0 kDa
排除体积 excluded_volume277560 ų
包络体积 envelope_volume393550 ų
水化壳体积 shell_volume77753 ų
包络直径 envelope_diameter129.1
壳层 Rg shell_rg49.19
包络 Rg envelope_rg39.39
形状 Rg shape_rg40.11
总 Rg total_rg40.68
总原子数 total_atoms15464
残基数 n_residues1924
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax124.5
Rg (实空间) rg_real40.52
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.52
I(0) (实空间) i0_real6.7720e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error9.1660e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal40.78
I(0) (倒空间) i0_reciprocal677400000.0000
解质量估计 total_estimate0.8931
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary51.1
偏度 Skewness skewness0.036
峰度 Kurtosis kurtosis-0.508
角度范围 angular_range— – 0.1950 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha58680000.0000
实空间数据点数 n_real_points40
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.904; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.960; Smooth: 0.934

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)