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8bcf

Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 78

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 140.8 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase

Homo sapiens

UniProt O75643

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 394–2136 未记录 Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 Q8Z ~{N}-methoxy-~{N}-methyl-benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350 分辨率 2.42 Å R-free 0.275

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8BCF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JCR 3D structure determination of the human*U4/U6.U5* tri-snRNP complex 提交 2016-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 C 1–2136（2136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA；pH 7.9；20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.00 Å
4F91 Brr2 Helicase Region 提交 2012-05-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 402–2125（1724 aa） 片段：Brr2 Helicase Region
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293.15 K；0.1 M sodium citrate, 1.2 M sodium Malonate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.272
4F92 Brr2 Helicase Region S1087L 提交 2012-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 402–2125（1724 aa） 片段：Brr2 Helicase Region
突变：S1087L SAN SULFANILAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293.15 K；0.1 M sodium citrate, 1.2 M sodium Malonate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.66 Å R-free 0.259
4F93 Brr2 Helicase Region S1087L, Mg-ATP 提交 2012-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 402–2125（1724 aa） 片段：Brr2 Helicase Region
突变：S1087L ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SAN SULFANILAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293.15 K；0.1 M sodium citrate, 1.2 M sodium Malonate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.92 Å R-free 0.248
4KIT Crystal structure of human Brr2 in complex with the Prp8 Jab1/MPN domain 提交 2013-05-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 395–2129（1735 aa） 片段：helicase region (UNP residues 395-2129)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；277 K；0.1 M HEPES-NaOH, pH 7.9, 0.2 M magnesium chloride, 12% ethanol, Silver Bullets Bio condition 91 (Hampton Research) as additive, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric
链 C 1–2136（2136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
5URJ Crystal structure of human BRR2 in complex with T-3905516 提交 2017-02-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 395–2129（1735 aa） 片段：UNP residues 395-2129
未记录 GOL GLYCEROL × 1 8LS 6-benzyl-3-[(2R)-2-(3-fluoropyridin-2-yl)-6-methyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-7-yl]-4,6-dihydropyrido[4,3-d]pyrimidine-2,7(3H,8H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.25-1.5M sodium malonate, 100mM sodium citrate pH 5.0-5.3, 10mg/ml BRR2
分辨率 2.75 Å R-free 0.286
5URK Crystal structure of human BRR2 in complex with T-3935799 提交 2017-02-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 395–2129（1735 aa） 片段：UNP residues 395-2129
未记录 GOL GLYCEROL × 1 8LP 6-benzyl-3-[3-(benzyloxy)phenyl]-4,6-dihydropyrido[4,3-d]pyrimidine-2,7(1H,3H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.25-1.5 M sodium malonate, 100 mM sodium citrate pH 5.0-5.3, 10mg/ml BRR2
分辨率 2.95 Å R-free 0.277
5URM Crystal structure of human BRR2 in complex with T-1206548 提交 2017-02-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 395–2129（1735 aa） 片段：UNP residues 395-2129
未记录 8LV 3-(5-{[(2R)-5-amino-2-cyclohexyl-7-oxo-2,3-dihydro-7H-[1,3,4]thiadiazolo[3,2-a]pyrimidin-6-yl]methyl}furan-2-yl)benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.25-1.5M sodium malonate, 100mM sodium citrate pH 5.0-5.3, 10mg/ml BRR2
分辨率 2.80 Å R-free 0.260
5URM Crystal structure of human BRR2 in complex with T-1206548 提交 2017-02-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 395–2129（1735 aa） 片段：UNP residues 395-2129
未记录 8LV 3-(5-{[(2R)-5-amino-2-cyclohexyl-7-oxo-2,3-dihydro-7H-[1,3,4]thiadiazolo[3,2-a]pyrimidin-6-yl]methyl}furan-2-yl)benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.25-1.5M sodium malonate, 100mM sodium citrate pH 5.0-5.3, 10mg/ml BRR2
分辨率 2.80 Å R-free 0.260
5XJC Cryo-EM structure of the human spliceosome just prior to exon ligation at 3.6 angstrom 提交 2017-04-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5YZG The Cryo-EM Structure of Human Catalytic Step I Spliceosome (C complex) at 4.1 angstrom resolution 提交 2017-12-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
5Z56 cryo-EM structure of a human activated spliceosome (mature Bact) at 5.1 angstrom. 提交 2018-01-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
5Z57 Cryo-EM structure of the human activated spliceosome (late Bact) at 6.5 angstrom 提交 2018-01-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：57-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ALA ALANINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
5Z58 Cryo-EM structure of a human activated spliceosome (early Bact) at 4.9 angstrom. 提交 2018-01-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：46-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FF7 human Bact spliceosome core structure 提交 2018-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：61-meric
链 r 1–2136（2136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6ICZ Cryo-EM structure of a human post-catalytic spliceosome (P complex) at 3.0 angstrom 提交 2018-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6QDV Human post-catalytic P complex spliceosome 提交 2019-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric
链 B 404–2125（1722 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was applied to the grid, left for 25s, then blotted for 2.5-3.5s and immediately plunged into liquid ethane.
分辨率 3.30 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 5B 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.
分辨率 2.92 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric
链 5B 1–2136（2136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
6S8O Human Brr2 Helicase Region M641C/A1582C 提交 2019-07-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 394–2136（1743 aa）
突变：M641C, A1582C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291.15 K；0.1M sodium citrate, 1.5M sodium malonate
分辨率 3.17 Å R-free 0.318
6S8Q Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 提交 2019-07-10 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.39 Å R-free 0.253
6S9I Human Brr2 Helicase Region D534C/N1866C in complex with C-tail deleted Jab1 提交 2019-07-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
突变：D534C, N1866C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.278
7A5P Human C Complex Spliceosome - Medium-resolution PERIPHERY 提交 2020-08-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：48-meric
链 q 1–2136（2136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
7ABG Human pre-Bact-1 spliceosome 提交 2020-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 s 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.80 Å
7ABI Human pre-Bact-2 spliceosome 提交 2020-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 s 1–2136（2136 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.00 Å
7BDI Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and ATPgammaS 提交 2020-12-21 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.297
7BDJ Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and mant-ATPgammaS 提交 2020-12-21 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 TGB [[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-[2-(methylamino)phenyl]carbonyloxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-sulfanyl-phosphinic acid × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.59 Å R-free 0.289
7BDK Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and ADP 提交 2020-12-21 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.52 Å R-free 0.284
7BDL Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and mant-ADP 提交 2020-12-21 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 TG8 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-[[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]oxymethyl]oxolan-3-yl] 2-(methylamino)benzoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.69 Å R-free 0.292
7DVQ Cryo-EM Structure of the Activated Human Minor Spliceosome (minor Bact Complex) 提交 2021-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：49-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 2 G5J 5'-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(methoxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]oxy}phosphoryl]guanosine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7OS1 Cryo-EM structure of Brr2 in complex with Fbp21 提交 2021-06-07 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 395–2129（1735 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7OS2 Cryo-EM structure of Brr2 in complex with Jab1/MPN and C9ORF78 提交 2021-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 394–2129（1736 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
7PX3 Structure of U5 snRNP assembly and recycling factor TSSC4 in complex with BRR2 and Jab1 domain of PRPF8 提交 2021-10-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
7W5B The cryo-EM structure of human C* complex 提交 2021-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8BC8 Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 18 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 QB6 3-azanyl-4-oxidanyl-benzenesulfonamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.39 Å R-free 0.245
8BC9 Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 24 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 A09 N-hydroxybenzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
8BCA Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 26 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 Q96 3-azanyl-~{N}-methyl-4-(methylamino)benzenesulfonamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.258
8BCB Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 34 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 SAN SULFANILAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.38 Å R-free 0.258
8BCC Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 39 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 QAU 3-oxidanylbenzenesulfonamide × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.258
8BCD Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 50 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 QB0 phenylsulfonylcarbamodithioic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.279
8BCE Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 76 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 B09 N-methoxybenzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.267
8BCG Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 86 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 Q9I 4-chloranyl-~{N}-methoxy-~{N}-methyl-benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.39 Å R-free 0.269
8BCH Human Brr2 Helicase Region in complex with Sulfaguanidine 提交 2022-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 394–2136（1743 aa）
未记录 QA9 1-(4-aminophenyl)sulfonylguanidine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291.15 K；0.1M sodium citrate, 1.5M sodium malonate
分辨率 2.87 Å R-free 0.337
8C6J Human spliceosomal PM5 C* complex 提交 2023-01-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8CH6 Structure of a late-stage activated spliceosome (BAqr) arrested with a dominant-negative Aquarius mutant (state B complex). 提交 2023-02-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 c 1–2136（2136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 12 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；All solutions were sterile-filtered using a 0.22um vacuum filtration unit.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Volumes of 4 ul of the concentrated sample were applied to one side of glow-discharged UltrAuFoil 200 2/2 grids (Quantifoil) in a Vitrobot Mark IV (FEI), operated at 4 degrees Celsius and 100% humidity. The grids were blotted for 2s with blotting force 5 and immediately frozen by plunging into liquid ethane.
分辨率 5.90 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric
链 5D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric
链 5D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric
链 5D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric
链 5D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8I0P The cryo-EM structure of human pre-Bact complex 提交 2023-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8I0R The cryo-EM structure of human Bact-I complex 提交 2023-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I0S The cryo-EM structure of human Bact-II complex 提交 2023-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8I0T The cryo-EM structure of human Bact-III complex 提交 2023-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I0W The cryo-EM structure of human C complex 提交 2023-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：58-meric
链 D 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8Q7Q Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperones CD2BP2 and TSSC4 (State 2) 提交 2023-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8Q7V Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperones CD2BP2 and TSSC4 (State 1) 提交 2023-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8Q7W Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 3) 提交 2023-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8Q7X Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 4) 提交 2023-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8Q91 Structure of the human 20S U5 snRNP core 提交 2023-08-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.29 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8QP9 Cryo-EM Structure of Pre-B+AMPPNP Complex (core part) 提交 2023-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8QPA Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ssLNG Complex (core part) 提交 2023-10-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：heptadecameric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8QPK Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss Complex (core part) 提交 2023-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8RC0 Structure of the human 20S U5 snRNP 提交 2023-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric
链 B 1–60（60 aa）
链 B 61–2136（2076 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
8Y6O Cryo-EM Structure of the human minor pre-B complex (pre-precatalytic spliceosome) U11 and tri-snRNP part 提交 2024-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：46-meric
链 E 1–2136（2136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.38 Å
9FMD Integrative model of the human post-catalytic spliceosome (P-complex) 提交 2024-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9R3D Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
9R8V Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：63-meric
链 B 1–2136（2136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.50 Å

共 79 个其他 PDB 条目、80 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 U520_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 5–1747； UniProt 394–2136

Pre-mRNA-processing-splicing factor 8

Homo sapiens

UniProt Q6P2Q9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 J； UniProt 2064–2320 未记录 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 Q8Z ~{N}-methoxy-~{N}-methyl-benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350 分辨率 2.42 Å R-free 0.275

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8BCF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3E9L Crystal Structure of Human Prp8, Residues 1755-2016 提交 2008-08-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1760–2016（257 aa） 片段：endonuclease domain
未记录 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.95 Å R-free 0.248
3ENB Crystal Structure of PRP8 core domain IV 提交 2008-09-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1769–1990（222 aa） 片段：UNP residues 1769-1990
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；296 K；2.5 M NaCl, 100 mM Tris-HCl pH 7.0, 100 mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.85 Å R-free 0.243
3ENB Crystal Structure of PRP8 core domain IV 提交 2008-09-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1769–1990（222 aa） 片段：UNP residues 1769-1990
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；296 K；2.5 M NaCl, 100 mM Tris-HCl pH 7.0, 100 mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.85 Å R-free 0.243
3JCR 3D structure determination of the human*U4/U6.U5* tri-snRNP complex 提交 2016-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA；pH 7.9；20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.00 Å
3LRU hPRP8 Non-Native Subdomain 提交 2010-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1831–1990（160 aa） 片段：UNP residues 1831-1990
链 B 1831–1990（160 aa） 片段：UNP residues 1831-1990
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 vapour diffusion；pH 6；298 K；12% PEG4000, Tris Ph8, 1,3 diamino-propane, pH 6, vapour diffusion, temperature 298K
分辨率 1.85 Å R-free 0.254
4JK7 Open and closed forms of wild-type human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1769–1990（222 aa） 片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990
未记录 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 1.40 Å R-free 0.177
4JK7 Open and closed forms of wild-type human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1769–1990（222 aa） 片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 1.40 Å R-free 0.177
4JK8 Open and closed forms of R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1769–1990（222 aa） 片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990
突变：R1865A GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.15 Å R-free 0.160
4JK8 Open and closed forms of R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1769–1990（222 aa） 片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990
突变：R1865A CL CHLORIDE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.15 Å R-free 0.160
4JK9 Open and closed forms of wild-type human PRP8 RNase H-like domain with bound Co ion 提交 2013-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1769–1990（222 aa） 片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990
未记录 CO COBALT (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.205
4JK9 Open and closed forms of wild-type human PRP8 RNase H-like domain with bound Co ion 提交 2013-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1769–1990（222 aa） 片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990
未记录 CO COBALT (II) ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.205
4JKA Open and closed forms of R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Co ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1769–1990（222 aa） 片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990
突变：R1865A CO COBALT (II) ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.32 Å R-free 0.166
4JKA Open and closed forms of R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Co ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1769–1990（222 aa） 片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990
突变：R1865A CO COBALT (II) ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.32 Å R-free 0.166
4JKB Open and closed forms of V1788D human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1769–1990（222 aa） 片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990
突变：V1788D GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.30 Å R-free 0.145
4JKB Open and closed forms of V1788D human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1769–1990（222 aa） 片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990
突变：V1788D GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.30 Å R-free 0.145
4JKC Open and closed forms of T1800E human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1769–1990（222 aa） 片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;
突变：T1800E CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.164
4JKC Open and closed forms of T1800E human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1769–1990（222 aa） 片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;
突变：T1800E CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.164
4JKD Open and closed forms of I1790Y human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1769–1990（222 aa） 片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;
突变：I1790Y MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.55 Å R-free 0.188
4JKD Open and closed forms of I1790Y human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1769–1990（222 aa） 片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;
突变：I1790Y MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.55 Å R-free 0.188
4JKE Open and closed forms of T1789P human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1769–1990（222 aa） 片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;
突变：T1789P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.65 Å R-free 0.203
4JKE Open and closed forms of T1789P human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1769–1990（222 aa） 片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;
突变：T1789P MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.65 Å R-free 0.203
4JKF Open and closed forms of T1791P+R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1769–1990（222 aa） 片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;
突变：T1791P R1865A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.95 Å R-free 0.226
4JKF Open and closed forms of T1791P+R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1769–1990（222 aa） 片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;
突变：T1791P R1865A MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.95 Å R-free 0.226
4JKG Open and closed forms of mixed T1789P+R1865A and R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1769–1990（222 aa） 片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990
突变：R1865A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.234
4JKG Open and closed forms of mixed T1789P+R1865A and R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1769–1990（222 aa） 片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990
突变：T1789P, R1865A MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.234
4JKH Open and closed forms of D1781E human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1769–1990（222 aa） 片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;
突变：D1781E CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.219
4JKH Open and closed forms of D1781E human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1769–1990（222 aa） 片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;
突变：D1781E CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.219
4KIT Crystal structure of human Brr2 in complex with the Prp8 Jab1/MPN domain 提交 2013-05-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2064–2335（272 aa） 片段：Jab1/MPN domain (UNP residues 2064-2335)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；277 K；0.1 M HEPES-NaOH, pH 7.9, 0.2 M magnesium chloride, 12% ethanol, Silver Bullets Bio condition 91 (Hampton Research) as additive, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
5MQF Cryo-EM structure of a human spliceosome activated for step 2 of splicing (C* complex) 提交 2016-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：41-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
5XJC Cryo-EM structure of the human spliceosome just prior to exon ligation at 3.6 angstrom 提交 2017-04-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
5YZG The Cryo-EM Structure of Human Catalytic Step I Spliceosome (C complex) at 4.1 angstrom resolution 提交 2017-12-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
5Z56 cryo-EM structure of a human activated spliceosome (mature Bact) at 5.1 angstrom. 提交 2018-01-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
5Z57 Cryo-EM structure of the human activated spliceosome (late Bact) at 6.5 angstrom 提交 2018-01-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：57-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ALA ALANINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
5Z58 Cryo-EM structure of a human activated spliceosome (early Bact) at 4.9 angstrom. 提交 2018-01-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：46-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6FF4 human Bact spliceosome core structure 提交 2018-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with blotting sensor
分辨率 3.40 Å
6FF7 human Bact spliceosome core structure 提交 2018-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：61-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6ICZ Cryo-EM structure of a human post-catalytic spliceosome (P complex) at 3.0 angstrom 提交 2018-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6ID0 Cryo-EM structure of a human intron lariat spliceosome prior to Prp43 loaded (ILS1 complex) at 2.9 angstrom resolution 提交 2018-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：42-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6ID1 Cryo-EM structure of a human intron lariat spliceosome after Prp43 loaded (ILS2 complex) at 2.9 angstrom resolution 提交 2018-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：43-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
6QDV Human post-catalytic P complex spliceosome 提交 2019-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was applied to the grid, left for 25s, then blotted for 2.5-3.5s and immediately plunged into liquid ethane.
分辨率 3.30 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 5A 25–2335（2311 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.
分辨率 2.92 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric
链 5A 25–2335（2311 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
6S8Q Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 提交 2019-07-10 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.39 Å R-free 0.253
6S9I Human Brr2 Helicase Region D534C/N1866C in complex with C-tail deleted Jab1 提交 2019-07-13 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.278
6ZYM Human C Complex Spliceosome - High-resolution CORE 提交 2020-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：26-meric
链 A 1–1755（1755 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7A5P Human C Complex Spliceosome - Medium-resolution PERIPHERY 提交 2020-08-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：48-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
7AAV Human pre-Bact-2 spliceosome core structure 提交 2020-09-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：heptadecameric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 KGN D-chiro inositol hexakisphosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7ABF Human pre-Bact-1 spliceosome core structure 提交 2020-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7ABG Human pre-Bact-1 spliceosome 提交 2020-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.80 Å
7ABI Human pre-Bact-2 spliceosome 提交 2020-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.00 Å
7BDI Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and ATPgammaS 提交 2020-12-21 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.297
7BDJ Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and mant-ATPgammaS 提交 2020-12-21 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 TGB [[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-[2-(methylamino)phenyl]carbonyloxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-sulfanyl-phosphinic acid × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.59 Å R-free 0.289
7BDK Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and ADP 提交 2020-12-21 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.52 Å R-free 0.284
7BDL Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and mant-ADP 提交 2020-12-21 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 TG8 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-[[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]oxymethyl]oxolan-3-yl] 2-(methylamino)benzoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.69 Å R-free 0.292
7DVQ Cryo-EM Structure of the Activated Human Minor Spliceosome (minor Bact Complex) 提交 2021-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：49-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 2 G5J 5'-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(methoxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]oxy}phosphoryl]guanosine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7OS2 Cryo-EM structure of Brr2 in complex with Jab1/MPN and C9ORF78 提交 2021-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 2064–2335（272 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
7PJH Crystal structure of the human spliceosomal maturation factor AAR2 bound to the RNAse H domain of PRPF8 提交 2021-08-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1758–2016（259 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 10% PEG 6000, 5%(v/v) 2-methyl-2,4- pentanediol
分辨率 2.35 Å R-free 0.235
7PX3 Structure of U5 snRNP assembly and recycling factor TSSC4 in complex with BRR2 and Jab1 domain of PRPF8 提交 2021-10-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
7QTT Structural organization of a late activated human spliceosome (Baqr, core region) 提交 2022-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric
链 a 1–2335（2335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 12 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；All solutions were sterile filtered using a 0.22um vacuum filtration unit.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Volumes of 4 ul of the concentrated sample were applied to one side of glow-discharged UltrAuFoil 200 2/2 grids (Quantifoil) in a Vitrobot Mark IV (FEI) operating at 4 degrees Celsius and 100% humidity. The grids were blotted for 2s with blotting force 5 and immediately frozen by plunging into liquid ethane.
分辨率 3.10 Å
7W59 The cryo-EM structure of human pre-C*-I complex 提交 2021-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：50-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7W5A The cryo-EM structure of human pre-C*-II complex 提交 2021-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7W5B The cryo-EM structure of human C* complex 提交 2021-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8BC8 Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 18 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 QB6 3-azanyl-4-oxidanyl-benzenesulfonamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.39 Å R-free 0.245
8BC9 Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 24 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 A09 N-hydroxybenzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
8BCA Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 26 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 Q96 3-azanyl-~{N}-methyl-4-(methylamino)benzenesulfonamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.258
8BCB Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 34 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 SAN SULFANILAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.38 Å R-free 0.258
8BCC Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 39 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 QAU 3-oxidanylbenzenesulfonamide × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.258
8BCD Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 50 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 QB0 phenylsulfonylcarbamodithioic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.279
8BCE Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 76 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 B09 N-methoxybenzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.267
8BCG Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 86 提交 2022-10-15 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 2064–2320（257 aa）
未记录 Q9I 4-chloranyl-~{N}-methoxy-~{N}-methyl-benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350
分辨率 2.39 Å R-free 0.269
8C6J Human spliceosomal PM5 C* complex 提交 2023-01-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8CH6 Structure of a late-stage activated spliceosome (BAqr) arrested with a dominant-negative Aquarius mutant (state B complex). 提交 2023-02-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 a 1–2335（2335 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 12 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；All solutions were sterile-filtered using a 0.22um vacuum filtration unit.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Volumes of 4 ul of the concentrated sample were applied to one side of glow-discharged UltrAuFoil 200 2/2 grids (Quantifoil) in a Vitrobot Mark IV (FEI), operated at 4 degrees Celsius and 100% humidity. The grids were blotted for 2s with blotting force 5 and immediately frozen by plunging into liquid ethane.
分辨率 5.90 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric
链 5B 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric
链 5B 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric
链 5B 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric
链 5B 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8I0P The cryo-EM structure of human pre-Bact complex 提交 2023-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8I0R The cryo-EM structure of human Bact-I complex 提交 2023-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I0S The cryo-EM structure of human Bact-II complex 提交 2023-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8I0T The cryo-EM structure of human Bact-III complex 提交 2023-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I0U The cryo-EM structure of human Bact-IV complex 提交 2023-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I0V The cryo-EM structure of human post-Bact complex 提交 2023-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I0W The cryo-EM structure of human C complex 提交 2023-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：58-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8Q7N cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region) 提交 2023-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8Q7Q Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperones CD2BP2 and TSSC4 (State 2) 提交 2023-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8Q7V Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperones CD2BP2 and TSSC4 (State 1) 提交 2023-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8Q7W Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 3) 提交 2023-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8Q7X Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 4) 提交 2023-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8Q91 Structure of the human 20S U5 snRNP core 提交 2023-08-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.29 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8QP8 Cryo-EM Structure of Pre-B Complex (core part) 提交 2023-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QP9 Cryo-EM Structure of Pre-B+AMPPNP Complex (core part) 提交 2023-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8QPA Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ssLNG Complex (core part) 提交 2023-10-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：heptadecameric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8QPE Cryo-EM Structure of Pre-B-like Complex (core part) 提交 2023-10-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：20-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8QPK Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss Complex (core part) 提交 2023-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8RC0 Structure of the human 20S U5 snRNP 提交 2023-12-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
8RO2 Integrative Structure of the human intron lariat Spliceosome (ILS'') 提交 2024-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：40-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8Y6O Cryo-EM Structure of the human minor pre-B complex (pre-precatalytic spliceosome) U11 and tri-snRNP part 提交 2024-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：46-meric
链 C 1–2335（2335 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.38 Å
9FMD Integrative model of the human post-catalytic spliceosome (P-complex) 提交 2024-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9R3D Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric
链 A 1–2335（2335 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å

共 100 个其他 PDB 条目、112 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRP8_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 7–263； UniProt 2064–2320

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8bcf

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8bcf
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8bcf
沉积日期 deposition_date2022-10-15
结构标题 titleHuman Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 78
关键词 keywordshelicase, complex, ligand, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier43.29 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron42.68 Å
零角强度 I(0) i0733659000.00
分子量 molecular_weight227910.0 kDa
排除体积 excluded_volume287390 ų
包络体积 envelope_volume383880 ų
水化壳体积 shell_volume73786 ų
包络直径 envelope_diameter152.3 Å
壳层 Rg shell_rg48.56 Å
包络 Rg envelope_rg42.35 Å
形状 Rg shape_rg42.68 Å
总 Rg total_rg42.96 Å
总原子数 total_atoms16037
残基数 n_residues1987
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax140.8 Å
Rg (实空间) rg_real43.18 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.03 Å
I(0) (实空间) i0_real7.3370e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.3450e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal43.29 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal733800000.0000
解质量估计 total_estimate0.8972
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary50.8 Å
偏度 Skewness skewness0.214
峰度 Kurtosis kurtosis-0.525
角度范围 angular_range— – 0.1800 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha79330000.0000
实空间数据点数 n_real_points37
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.914; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.919
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id8bcfB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id8bcfB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id8bcfB03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id8bcfB04
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — C2 domain
结构域编号 domain_id8bcfB05
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id8bcfB06
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)