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9c62

P400 subcomplex of the native human TIP60 complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 224.1 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RuvB-like 2

物种未注明

UniProt Q9Y230

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–463 链 D； UniProt 1–463 链 F； UniProt 1–463 未记录 RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） E1A-binding protein p400 × 1 （Q96L91） Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 （Q9H2F5） DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 （Q9NPF5） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 （Q15906） Actin-like protein 6A × 2 （O96019） Histone H2A.Z × 1 （P0C0S5） Histone H2B type 1-B × 1 （P33778） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 5.28 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9C62 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2CQA Solution structure of RSGI RUH-039, a fragment of C-terminal domain of RuvB-like 2 from human cDNA 提交 2005-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 131–212（82 aa） 片段：C-terminal domain (Residues 132-213)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成 1.3mM RSGI RUH-039 U-15,13C; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O | 90% D2O, 10% D2O
分辨率未提供
2XSZ The dodecameric human RuvBL1:RuvBL2 complex with truncated domains II 提交 2010-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 2–133（132 aa）
链 D 238–463（226 aa）
链 E 2–133（132 aa）
链 E 238–463（226 aa）
链 F 2–133（132 aa）
链 F 238–463（226 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；CRYSTALLIZATION DROPS WERE MIXED FROM EQUAL VOLUMES OF PROTEIN SOLUTION (12 MG/ML, 20MM TRIS-HCL PH 8.0, 200MM NACL, 10% GLYCEROL, 4MM MGCL2, 4MM ADP, 0.5MM TCEP) AND CRYSTALLIZATION SOLUTION (0.2M MGCL2, 30% PEG 400, 0.1M HEPES PH 7.5).
分辨率 3.00 Å R-free 0.205
3UK6 Crystal Structure of the Tip48 (Tip49b) hexamer 提交 2011-11-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–132（132 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 A 239–463（225 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 B 1–132（132 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 B 239–463（225 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 C 1–132（132 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 C 239–463（225 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 D 1–132（132 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 D 239–463（225 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 I 1–132（132 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 I 239–463（225 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 J 1–132（132 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 J 239–463（225 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris-HCL, pH 8.0, 20% PEG 3000, 5% glucose, galactose or trehalose, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.95 Å R-free 0.264
3UK6 Crystal Structure of the Tip48 (Tip49b) hexamer 提交 2011-11-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–132（132 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 E 239–463（225 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 F 1–132（132 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 F 239–463（225 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 G 1–132（132 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 G 239–463（225 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 H 1–132（132 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 H 239–463（225 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 K 1–132（132 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 K 239–463（225 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 L 1–132（132 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 L 239–463（225 aa） 片段：UNP residues 1-132, 239-463
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris-HCL, pH 8.0, 20% PEG 3000, 5% glucose, galactose or trehalose, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.95 Å R-free 0.264
5OAF Human Rvb1/Rvb2 heterohexamer in INO80 complex 提交 2017-06-21 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–463（463 aa）
链 D 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.06 Å
6FO1 Human R2TP subcomplex containing 1 RUVBL1-RUVBL2 hexamer bound to 1 RBD domain from RPAP3. 提交 2018-02-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–463（463 aa）
链 E 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.57 Å
6H7X First X-ray structure of full-length human RuvB-Like 2. 提交 2018-07-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–463（463 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 18 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 42 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；303.15 K；PEG 3350, Magnesium Chloride
分辨率 2.89 Å R-free 0.237
6HTS Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to nucleosome 提交 2018-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 B 1–463（463 aa）
链 D 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6IGM Cryo-EM Structure of Human SRCAP Complex 提交 2018-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 B 1–463（463 aa）
链 D 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6K0R Ruvbl1-Ruvbl2 with truncated domain II in complex with phosphorylated Cordycepin 提交 2019-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–133（133 aa）
链 D 238–463（226 aa）
链 E 1–133（133 aa）
链 E 238–463（226 aa）
链 F 1–133（133 aa）
链 F 238–463（226 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CUU [(2~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES-Na pH 7.5-7.6, 0.2 M MgCl2, 20-21 % PEG400
分辨率 2.50 Å R-free 0.269
6K0R Ruvbl1-Ruvbl2 with truncated domain II in complex with phosphorylated Cordycepin 提交 2019-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–133（133 aa）
链 J 238–463（226 aa）
链 K 1–133（133 aa）
链 K 238–463（226 aa）
链 L 1–133（133 aa）
链 L 238–463（226 aa）
未记录 CUU [(2~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CU0 [(2~{R},3~{S},4~{S})-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES-Na pH 7.5-7.6, 0.2 M MgCl2, 20-21 % PEG400
分辨率 2.50 Å R-free 0.269
6QI8 Truncated human R2TP complex, structure 3 (ADP-filled) 提交 2019-01-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–463（463 aa）
链 E 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
6QI9 Truncated human R2TP complex, structure 4 (ADP-empty) 提交 2019-01-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–463（463 aa）
链 E 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.63 Å
7AHO RUVBL1-RUVBL2 heterohexameric ring after binding of RNA helicase DHX34 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–463（463 aa）
链 E 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM Tris-HCl pH 7.4, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
7OLE Cryo-EM structure of the TELO2-TTI1-TTI2-RUVBL1-RUVBL2 complex 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 B 1–463（463 aa）
链 D 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions were made fresh for protein purification
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3sec
分辨率 3.41 Å
7P6X Cryo-Em structure of the hexameric RUVBL1-RUVBL2 in complex with ZNHIT2 提交 2021-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–463（463 aa）
链 E 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7ZI4 Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to a WT nucleosome 提交 2022-04-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–463（463 aa）
链 D 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4uL of sample applied to Quantifoil R2/2 Cu 300 mesh grids. blot parameters were wait time 30 sec, blot time 0.5 sec, blot force -8
分辨率 3.20 Å
8QR1 Cryo-EM structure of the human Tip60 complex 提交 2023-10-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 D 1–463（463 aa）
链 H 1–463（463 aa）
链 J 1–463（463 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 N 1–463（463 aa）
链 P 1–463（463 aa）
链 R 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 N 1–463（463 aa）
链 P 1–463（463 aa）
链 R 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 N 1–463（463 aa）
链 P 1–463（463 aa）
链 R 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8XVG Structure of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–463（463 aa）
链 D 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.40 Å
8XVT The core subcomplex of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–463（463 aa）
链 D 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9C57 Reconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex 提交 2024-06-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–463（463 aa）
链 D 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
9CA7 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the fully-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 F 1–463（463 aa）
链 H 1–463（463 aa）
链 J 1–463（463 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
9CA8 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the partially-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 F 1–463（463 aa）
链 H 1–463（463 aa）
链 J 1–463（463 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.92 Å
9CA9 Cryo-EM structure of the human SRCAP complex in the unbound state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 F 1–463（463 aa）
链 H 1–463（463 aa）
链 J 1–463（463 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9CAA Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the pre-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 F 1–463（463 aa）
链 H 1–463（463 aa）
链 J 1–463（463 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.04 Å
9CAB Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the encounter state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 F 1–463（463 aa）
链 H 1–463（463 aa）
链 J 1–463（463 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.94 Å
9CAC Cryo-EM structure of the RuvBL lobe of the native human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 F 1–463（463 aa）
链 H 1–463（463 aa）
链 J 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9CAE Cryo-EM structure of the reconstituted RuvBL lobe of the human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 F 1–463（463 aa）
链 H 1–463（463 aa）
链 J 1–463（463 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
9EMA RUVBL1/2 in complex with ATP and CB-6644 inhibitor 提交 2024-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–463（463 aa）
链 E 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 A1H5V 5-chloranyl-2-ethoxy-4-fluoranyl-~{N}-[4-[[3-(methoxymethyl)-1-oxidanylidene-6,7-dihydro-5~{H}-pyrazolo[1,2-a][1,2]benzodiazepin-2-yl]amino]-2,2-dimethyl-4-oxidanylidene-butyl]benzamide × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
9EMC RUVBL1/2 in complex with ATP 提交 2024-03-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–463（463 aa）
链 E 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9GCG CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 D 1–463（463 aa）
链 E 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9GE5 CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 D 15–453（439 aa）
链 E 15–453（439 aa）
链 F 15–453（439 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
9GEV CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 D 1–463（463 aa）
链 E 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
9GFB CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 D 1–463（463 aa）
链 E 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9HB4 Hexameric RuvBL1/RuvBL2 bound to SPAG1 C-ter 提交 2024-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–463（463 aa）
链 E 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES, 170 mM NaCL, 2mM MgCl2, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9HPO Docedameric RuvBL1/RuvBL2 提交 2024-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 D 1–463（463 aa）
链 E 1–463（463 aa）
链 F 1–463（463 aa）
链 J 1–463（463 aa）
链 K 1–463（463 aa）
链 L 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES, 170 mM NaCL, 2mM MgCl2, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å

共 37 个其他 PDB 条目、39 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RUVB2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463 作者链 D； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463 作者链 F； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463

RuvB-like 1

物种未注明

UniProt Q9Y265

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–456 链 C； UniProt 1–456 链 E； UniProt 1–456 未记录 RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） E1A-binding protein p400 × 1 （Q96L91） Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 （Q9H2F5） DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 （Q9NPF5） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 （Q15906） Actin-like protein 6A × 2 （O96019） Histone H2A.Z × 1 （P0C0S5） Histone H2B type 1-B × 1 （P33778） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 5.28 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9C62 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2C9O 3D Structure of the human RuvB-like helicase RuvBL1 提交 2005-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING THE VAPOR DIFFUSION METHOD (SITTING DROP). THE WELLS CONTAINED 500 MICROLITERS OF PRECIPITANT SOLUTION AND THE DROPS WERE COMPOSED OF 1.5 MICROLITERS OF PROTEIN SOLUTION (15 MG/ML) AND 1.5 MICROLITERS OF RESERVOIR SOLUTION. THE BEST CRYSTALS WERE OBTAINED FROM A SOLUTION CONTAINING 1.6 M SODIUM MALONATE PH 6 AT 293 K.
分辨率 2.20 Å R-free 0.257
2C9O 3D Structure of the human RuvB-like helicase RuvBL1 提交 2005-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING THE VAPOR DIFFUSION METHOD (SITTING DROP). THE WELLS CONTAINED 500 MICROLITERS OF PRECIPITANT SOLUTION AND THE DROPS WERE COMPOSED OF 1.5 MICROLITERS OF PROTEIN SOLUTION (15 MG/ML) AND 1.5 MICROLITERS OF RESERVOIR SOLUTION. THE BEST CRYSTALS WERE OBTAINED FROM A SOLUTION CONTAINING 1.6 M SODIUM MALONATE PH 6 AT 293 K.
分辨率 2.20 Å R-free 0.257
2XSZ The dodecameric human RuvBL1:RuvBL2 complex with truncated domains II 提交 2010-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–126（125 aa）
链 A 234–456（223 aa）
链 B 2–126（125 aa）
链 B 234–456（223 aa）
链 C 2–126（125 aa）
链 C 234–456（223 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；CRYSTALLIZATION DROPS WERE MIXED FROM EQUAL VOLUMES OF PROTEIN SOLUTION (12 MG/ML, 20MM TRIS-HCL PH 8.0, 200MM NACL, 10% GLYCEROL, 4MM MGCL2, 4MM ADP, 0.5MM TCEP) AND CRYSTALLIZATION SOLUTION (0.2M MGCL2, 30% PEG 400, 0.1M HEPES PH 7.5).
分辨率 3.00 Å R-free 0.205
5OAF Human Rvb1/Rvb2 heterohexamer in INO80 complex 提交 2017-06-21 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
链 E 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.06 Å
6FO1 Human R2TP subcomplex containing 1 RUVBL1-RUVBL2 hexamer bound to 1 RBD domain from RPAP3. 提交 2018-02-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–456（456 aa）
链 B 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.57 Å
6HTS Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to nucleosome 提交 2018-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 A 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
链 E 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6IGM Cryo-EM Structure of Human SRCAP Complex 提交 2018-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
链 E 1–456（456 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6K0R Ruvbl1-Ruvbl2 with truncated domain II in complex with phosphorylated Cordycepin 提交 2019-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–126（125 aa）
链 A 234–456（223 aa）
链 B 2–126（125 aa）
链 B 234–456（223 aa）
链 C 2–126（125 aa）
链 C 234–456（223 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CUU [(2~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES-Na pH 7.5-7.6, 0.2 M MgCl2, 20-21 % PEG400
分辨率 2.50 Å R-free 0.269
6K0R Ruvbl1-Ruvbl2 with truncated domain II in complex with phosphorylated Cordycepin 提交 2019-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 2–126（125 aa）
链 G 234–456（223 aa）
链 H 2–126（125 aa）
链 H 234–456（223 aa）
链 I 2–126（125 aa）
链 I 234–456（223 aa）
未记录 CUU [(2~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CU0 [(2~{R},3~{S},4~{S})-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES-Na pH 7.5-7.6, 0.2 M MgCl2, 20-21 % PEG400
分辨率 2.50 Å R-free 0.269
6QI8 Truncated human R2TP complex, structure 3 (ADP-filled) 提交 2019-01-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–456（456 aa）
链 B 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
6QI9 Truncated human R2TP complex, structure 4 (ADP-empty) 提交 2019-01-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–456（456 aa）
链 B 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.63 Å
7AHO RUVBL1-RUVBL2 heterohexameric ring after binding of RNA helicase DHX34 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–456（456 aa）
链 B 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM Tris-HCl pH 7.4, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
7OLE Cryo-EM structure of the TELO2-TTI1-TTI2-RUVBL1-RUVBL2 complex 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
链 E 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions were made fresh for protein purification
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3sec
分辨率 3.41 Å
7P6X Cryo-Em structure of the hexameric RUVBL1-RUVBL2 in complex with ZNHIT2 提交 2021-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–456（456 aa）
链 B 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7ZI4 Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to a WT nucleosome 提交 2022-04-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
链 E 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4uL of sample applied to Quantifoil R2/2 Cu 300 mesh grids. blot parameters were wait time 30 sec, blot time 0.5 sec, blot force -8
分辨率 3.20 Å
8QR1 Cryo-EM structure of the human Tip60 complex 提交 2023-10-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 E 1–456（456 aa）
链 I 1–456（456 aa）
链 L 1–456（456 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 M 1–456（456 aa）
链 O 1–456（456 aa）
链 Q 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 M 1–456（456 aa）
链 O 1–456（456 aa）
链 Q 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 M 1–456（456 aa）
链 O 1–456（456 aa）
链 Q 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8XVG Structure of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
链 E 1–456（456 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.40 Å
8XVT The core subcomplex of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 A 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
链 E 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9C57 Reconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex 提交 2024-06-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 A 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
链 E 1–456（456 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
9CA7 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the fully-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 E 1–456（456 aa）
链 G 1–456（456 aa）
链 I 1–456（456 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
9CA8 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the partially-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 E 1–456（456 aa）
链 G 1–456（456 aa）
链 I 1–456（456 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.92 Å
9CA9 Cryo-EM structure of the human SRCAP complex in the unbound state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–456（456 aa）
链 G 1–456（456 aa）
链 I 1–456（456 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9CAA Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the pre-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 E 1–456（456 aa）
链 G 1–456（456 aa）
链 I 1–456（456 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.04 Å
9CAB Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the encounter state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 E 1–456（456 aa）
链 G 1–456（456 aa）
链 I 1–456（456 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.94 Å
9CAC Cryo-EM structure of the RuvBL lobe of the native human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 E 1–456（456 aa）
链 G 1–456（456 aa）
链 I 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9CAE Cryo-EM structure of the reconstituted RuvBL lobe of the human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 E 1–456（456 aa）
链 G 1–456（456 aa）
链 I 1–456（456 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
9EMA RUVBL1/2 in complex with ATP and CB-6644 inhibitor 提交 2024-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–456（456 aa）
链 B 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 A1H5V 5-chloranyl-2-ethoxy-4-fluoranyl-~{N}-[4-[[3-(methoxymethyl)-1-oxidanylidene-6,7-dihydro-5~{H}-pyrazolo[1,2-a][1,2]benzodiazepin-2-yl]amino]-2,2-dimethyl-4-oxidanylidene-butyl]benzamide × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
9EMC RUVBL1/2 in complex with ATP 提交 2024-03-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–456（456 aa）
链 B 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9GCG CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 A 1–456（456 aa）
链 B 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9GE5 CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 A 2–454（453 aa）
链 B 2–454（453 aa）
链 C 2–454（453 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
9GEV CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 A 1–456（456 aa）
链 B 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
9GFB CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 A 1–456（456 aa）
链 B 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9HB4 Hexameric RuvBL1/RuvBL2 bound to SPAG1 C-ter 提交 2024-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–456（456 aa）
链 B 1–456（456 aa）
链 C 1–456（456 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES, 170 mM NaCL, 2mM MgCl2, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9HPO Docedameric RuvBL1/RuvBL2 提交 2024-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 1–451（451 aa）
链 B 1–451（451 aa）
链 C 1–451（451 aa）
链 G 1–451（451 aa）
链 H 1–451（451 aa）
链 I 1–451（451 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES, 170 mM NaCL, 2mM MgCl2, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å

共 35 个其他 PDB 条目、37 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RUVB1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–456； UniProt 1–456 作者链 C； PDB构建体 1–456； UniProt 1–456 作者链 E； PDB构建体 1–456； UniProt 1–456

E1A-binding protein p400

物种未注明

UniProt Q96L91

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 1–3159 未记录 RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 （Q9H2F5） DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 （Q9NPF5） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 （Q15906） Actin-like protein 6A × 2 （O96019） Histone H2A.Z × 1 （P0C0S5） Histone H2B type 1-B × 1 （P33778） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 5.28 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9C62 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8QR1 Cryo-EM structure of the human Tip60 complex 提交 2023-10-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 A 1–3159（3159 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8QRI TRRAP and EP400 in the human Tip60 complex 提交 2023-10-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–3159（3159 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8XVG Structure of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 H 1–3123（3123 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.40 Å
8XVT The core subcomplex of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–3123（3123 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8XVV The TRRAP module of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1–3123（3123 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9C47 TRRAP module of the human TIP60 complex 提交 2024-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–3159（3159 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9C57 Reconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex 提交 2024-06-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 G 1–3159（3159 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
9C6N ARP module of the human TIP60 complex 提交 2024-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 1–3159（3159 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9CAC Cryo-EM structure of the RuvBL lobe of the native human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 A 1–3159（3159 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9CAD Cryo-EM structure of the TRRAP lobe of the native human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–3159（3159 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9CAE Cryo-EM structure of the reconstituted RuvBL lobe of the human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 658–3159（2502 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
9CAF Cryo-EM structure of the reconstituted TRRAP lobe of the human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 513–913（401 aa）
链 A 2134–2529（396 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.35 Å

共 12 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EP400_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–3159； UniProt 1–3159

Enhancer of polycomb homolog 1

物种未注明

UniProt Q9H2F5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 1–836 未记录 RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） E1A-binding protein p400 × 1 （Q96L91） DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 （Q9NPF5） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 （Q15906） Actin-like protein 6A × 2 （O96019） Histone H2A.Z × 1 （P0C0S5） Histone H2B type 1-B × 1 （P33778） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 5.28 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9C62 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6NFX MBTD1 MBT repeats 提交 2018-12-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 644–671（28 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 38 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；297 K；10% PEG-6000, 0.1 M sodium citrate
分辨率 1.95 Å R-free 0.221
8QR1 Cryo-EM structure of the human Tip60 complex 提交 2023-10-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 C 1–836（836 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8XVG Structure of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 M 1–813（813 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.40 Å
8XVT The core subcomplex of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 M 1–813（813 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9C57 Reconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex 提交 2024-06-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–836（836 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
9C6N ARP module of the human TIP60 complex 提交 2024-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 1–836（836 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9CAC Cryo-EM structure of the RuvBL lobe of the native human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 C 1–836（836 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9CAE Cryo-EM structure of the reconstituted RuvBL lobe of the human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 C 359–620（262 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EPC1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–836； UniProt 1–836

DNA methyltransferase 1-associated protein 1

物种未注明

UniProt Q9NPF5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白拷贝数一致 链 I； UniProt 1–467 未记录 RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） E1A-binding protein p400 × 1 （Q96L91） Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 （Q9H2F5） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 （Q15906） Actin-like protein 6A × 2 （O96019） Histone H2A.Z × 1 （P0C0S5） Histone H2B type 1-B × 1 （P33778） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 5.28 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9C62 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3HM5 SANT domain of human DNA methyltransferase 1 associated protein 1 提交 2009-05-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 121–212（92 aa） 片段：SANT domain, UNP residues 121-212
未记录 CA CALCIUM ION × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% PEG3350, 0.2M calcium chloride, 0.1M HEPES, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.275
4IEJ Crystal structure of a DNA methyltransferase 1 associated protein 1 (DMAP1) from Homo sapiens at 1.45 A resolution 提交 2012-12-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 121–212（92 aa） 片段：SANT domain containing residues 121-212
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.20M calcium chloride 20.00% polyethylene glycol 3350, NANODROP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.45 Å R-free 0.226
8QR1 Cryo-EM structure of the human Tip60 complex 提交 2023-10-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 F 1–467（467 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 V 1–467（467 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 V 1–467（467 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 V 1–467（467 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8XVG Structure of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 G 1–467（467 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.40 Å
8XVT The core subcomplex of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 G 1–467（467 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9C57 Reconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex 提交 2024-06-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 I 1–467（467 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
9C6N ARP module of the human TIP60 complex 提交 2024-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 1–467（467 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9CAC Cryo-EM structure of the RuvBL lobe of the native human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 N 1–467（467 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9CAE Cryo-EM structure of the reconstituted RuvBL lobe of the human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 N 1–467（467 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å

共 12 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 DMAP1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–467； UniProt 1–467

Actin, cytoplasmic 1

物种未注明

UniProt P60709

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白拷贝数一致 链 J； UniProt 1–375 未记录 RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） E1A-binding protein p400 × 1 （Q96L91） Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 （Q9H2F5） DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 （Q9NPF5） Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 （Q15906） Actin-like protein 6A × 2 （O96019） Histone H2A.Z × 1 （P0C0S5） Histone H2B type 1-B × 1 （P33778） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 5.28 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9C62 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
21VV Cryo-EM structure of ncBAF bound to the nucleosome 提交 2025-12-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 J 1–375（375 aa）
未记录 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8.0, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.5 mM ADP, 8 mM NaF, 1 mM BeSO4.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
3D2U Structure of UL18, a Peptide-Binding Viral MHC Mimic, Bound to a Host Inhibitory Receptor 提交 2008-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 170–178（9 aa） 片段：sequence database residues 170-178
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.4 M Mg(NO3)2, and 16~22% (w/v) PEG 33500, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.21 Å R-free 0.259
3D2U Structure of UL18, a Peptide-Binding Viral MHC Mimic, Bound to a Host Inhibitory Receptor 提交 2008-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 170–178（9 aa） 片段：sequence database residues 170-178
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.4 M Mg(NO3)2, and 16~22% (w/v) PEG 33500, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.21 Å R-free 0.259
3J82 Electron cryo-microscopy of DNGR-1 in complex with F-actin 提交 2014-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
3LUE Model of alpha-actinin CH1 bound to F-actin 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
链 F 2–375（374 aa）
链 G 2–375（374 aa）
链 H 2–375（374 aa）
链 I 2–375（374 aa）
链 J 2–375（374 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 15.00 Å
6ANU Cryo-EM structure of F-actin complexed with the beta-III-spectrin actin-binding domain 提交 2017-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
链 C 1–375（375 aa）
链 D 1–375（375 aa）
链 E 1–375（375 aa）
链 F 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 66–88（23 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000
分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 66–88（23 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000
分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 66–88（23 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000
分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 66–88（23 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000
分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICV Structure of SETD3 bound to SAH and unmodified actin 提交 2018-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 66–88（23 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5 2% Polyethylene glycol 400 2.0M Ammonium sulfate
分辨率 2.15 Å R-free 0.205
6ICV Structure of SETD3 bound to SAH and unmodified actin 提交 2018-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 66–88（23 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5 2% Polyethylene glycol 400 2.0M Ammonium sulfate
分辨率 2.15 Å R-free 0.205
6LTJ Structure of nucleosome-bound human BAF complex 提交 2020-01-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–375（375 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6MBJ SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, P21 Crystal Form 提交 2018-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–80（15 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.78 Å R-free 0.223
6MBJ SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, P21 Crystal Form 提交 2018-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 66–80（15 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.78 Å R-free 0.223
6MBK SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, First P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.69 Å R-free 0.243
6MBK SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, First P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.69 Å R-free 0.243
6MBL SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, Second P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.20 Å R-free 0.227
6NBW Ternary Complex of Beta/Gamma-Actin with Profilin and AnCoA-NAA80 提交 2018-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–375（374 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 LAB LATRUNCULIN B × 1 GOL GLYCEROL × 2 SOP [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-4-HYDROXY-3-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL (3R)-3-HYDROXY-2,2-DIMETHYL-4-OXO-4-{[3-OXO-3-({2-[(2-OXOPROPYL)THIO]ETHYL}AMINO)PROPYL]AMINO}BUTYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290 K；15% PEG 3350, 50mM MES pH6.2, 50mM NH4NO3
分辨率 2.50 Å R-free 0.209
6OX0 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Sinefungin Replacing SAH as Cofactor 提交 2019-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
未记录 SFG SINEFUNGIN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 1.75 Å R-free 0.225
6OX0 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Sinefungin Replacing SAH as Cofactor 提交 2019-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
未记录 SFG SINEFUNGIN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 1.75 Å R-free 0.225
6OX1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Target Histidine Partially Methylated 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 1.95 Å R-free 0.201
6OX1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Target Histidine Partially Methylated 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 1.95 Å R-free 0.201
6OX2 SETD3in Complex with an Actin Peptide with the Target Histidine Fully Methylated 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 2.09 Å R-free 0.239
6OX2 SETD3in Complex with an Actin Peptide with the Target Histidine Fully Methylated 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 2.09 Å R-free 0.239
6OX4 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide 提交 2019-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 2.29 Å R-free 0.236
6OX4 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide 提交 2019-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 66–80（15 aa） 片段：residues 66-80
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 2.29 Å R-free 0.236
6OX5 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Lysine 提交 2019-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 66–83（18 aa）
突变：H73K SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 2.10 Å R-free 0.205
7AS4 Recombinant human gTuRC 提交 2020-10-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 7 2–375（374 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
7P1H Structure of the V. vulnificus ExoY-G-actin-profilin complex 提交 2021-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 4–375（372 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7VDV The overall structure of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 P 1–375（375 aa）
未记录 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7W28 Crystal Structure of SETD3-SAH in complex with betaA-4PyrAla73 peptide 提交 2021-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 66–81（16 aa） 片段：SAH
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；30%(w/v) PEG4000, 0.1 M Tris base/Hydrochloric acid 8.5, 0.2M Lithium sulfate.
分辨率 1.79 Å R-free 0.211
7W29 Crystal Structure of SETD3-SAH in complex with betaA-Orn73 peptide 提交 2021-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 66–81（16 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；289 K；20%(w/v) PEG6000, 0.1M Bicine/Sodium hydroxide 9.0
分辨率 2.90 Å R-free 0.279
8COG Human arginylated beta-actin 提交 2023-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 2–375（374 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Actin for EM was polymerized by mixing, 20 ul 20 uM G-actin, 8 ul 10x MKE and 52 ul 5 mM HEPES-KOH pH 7.4 containing 0.2 mM ATP and 0.5 mM DTT and incubating at RT for 1 hour.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
8DNH Cryo-EM structure of nonmuscle beta-actin 提交 2022-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.99 Å
8OI8 Cryo-EM structure of ADP-bound, filamentous beta-actin harboring the R183W mutation 提交 2023-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
链 C 1–375（375 aa）
链 D 1–375（375 aa）
链 E 1–375（375 aa）
突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1x KMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA) supplemented with 0.02% Tween20 (v/v)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.28 Å
8OID Cryo-EM structure of ADP-bound, filamentous beta-actin harboring the N111S mutation 提交 2023-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
链 C 1–375（375 aa）
链 D 1–375（375 aa）
链 E 1–375（375 aa）
突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1x KMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA) supplemented with 0.02% Tween20 (v/v)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.30 Å
8QR1 Cryo-EM structure of the human Tip60 complex 提交 2023-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 B 1–375（375 aa）
链 G 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8RTT Structure of the formin Cdc12 bound to the barbed end of phalloidin-stabilized F-actin. 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
链 C 1–375（375 aa）
链 D 1–375（375 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.
分辨率 3.56 Å
8RTY Structure of the F-actin barbed end bound by Cdc12 and profilin (ring complex) at a resolution of 6.3 Angstrom 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.
分辨率 6.25 Å
8RU2 Structure of the F-actin barbed end bound by formin mDia1 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.
分辨率 3.49 Å
8VRD Rigid body fitted model for free recombinant gamma tubulin ring complex. 提交 2024-01-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric
链 S 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
8VRJ Rigid body fitted model for gamma tubulin ring complex capped microtubule 提交 2024-01-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric
链 9 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
8VRK Rigid body fitted model for refined density map of gamma tubulin ring complex capped microtubule 提交 2024-01-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric
链 9 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.50 Å
8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 S 1–375（375 aa）
链 U 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 S 1–375（375 aa）
链 U 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 S 1–375（375 aa）
链 U 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8XVT The core subcomplex of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 K 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9B2Z Actin-bound Legionella pneumophila AMPylase LnaB with AMPylated catalytic histidine 提交 2024-03-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–375（375 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 LAB LATRUNCULIN B × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9B7J Cryo-EM structure of human dynactin complex bound to Chlamydia effector Dre1 提交 2024-03-27 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
9B85 Cryo-EM structure of human dynactin complex bound to Chlamydia effector Dre1 提交 2024-03-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
9C57 Reconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex 提交 2024-06-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–375（375 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
9C6N ARP module of the human TIP60 complex 提交 2024-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 J 1–375（375 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9CAC Cryo-EM structure of the RuvBL lobe of the native human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 K 1–375（375 aa）
链 L 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9CAE Cryo-EM structure of the reconstituted RuvBL lobe of the human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 L 1–375（375 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
9FJM Cryo-EM structure of the phalloidin-bound pointed end of the actin filament. 提交 2024-05-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.
分辨率 3.65 Å
9GXI Subtomogram average of fascin-actin complex 提交 2024-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–375（375 aa）
链 C 1–375（375 aa）
链 D 1–375（375 aa）
链 E 1–375（375 aa）
链 F 1–375（375 aa）
链 G 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.00 Å
9I8G Inwards conformation' of the human gamma-TuRC from purified centrosomes obtained by rigid body docking 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 U 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 22.40 Å
9I8H Outwards conformation' of the human gamma-TuRC from purified centrosomes obtained by rigid body docking 提交 2025-02-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 U 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 23.20 Å
9P1I Atomic structure of vibrio effector fragment VopV bound to Beta-cytoplasmic/gamma1-cytoplasmic F-actin 提交 2025-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 Q 1–375（375 aa）
链 R 1–375（375 aa）
链 S 1–375（375 aa）
链 T 1–375（375 aa）
链 U 1–375（375 aa）
链 V 1–375（375 aa）
链 W 1–375（375 aa）
链 X 1–375（375 aa）
链 Y 1–375（375 aa）
链 Z 1–375（375 aa）
链 a 1–375（375 aa）
链 b 1–375（375 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 12 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9QEW Cryo-EM structure of the undecorated actin filament in the ADP-Pi state. 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.18 Å
9QEY Cryo-EM structure of the actin filament bound by a single Coronin-1B molecule. 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.74 Å
9QF2 Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state. 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.42 Å
9QFB Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state. 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
链 F 2–375（374 aa）
链 G 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.74 Å
9QFD Cryo-EM structure of the fully cofilin-1-decorated actin filament (cofilactin) 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
链 F 2–375（374 aa）
链 G 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.61 Å
9QFE Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1 on separate actin strands 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
链 F 2–375（374 aa）
链 G 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.12 Å
9QFG Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1, strand boundary 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
链 F 2–375（374 aa）
链 G 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.49 Å
9QFJ Cryo-EM structure of the cofilactin filament core at 2.3 Angstrom resolution. 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.31 Å
9QFK Cryo-EM structure of the Coronin-1B-decorated actin filament bound by one Cofilin-1 molecule (crosslinked) 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
链 F 2–375（374 aa）
链 G 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.99 Å
9QFO Cryo-EM structure of the cofilactin filament pointed end 提交 2025-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
链 F 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.96 Å
9QFQ Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by AIP1 提交 2025-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.76 Å
9QFW Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by two AIP1 molecules 提交 2025-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 2–375（374 aa）
链 B 2–375（374 aa）
链 C 2–375（374 aa）
链 D 2–375（374 aa）
链 E 2–375（374 aa）
突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.16 Å
9QVM Cryo-EM reconstruction of the NEDD1 anchor protein and CDK5RAP2 bound to the gamma-tubulin ring complex 提交 2025-04-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 Z 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.80 Å
9QVN Cryo-EM reconstruction of the NEDD1 anchor protein bound to the gamma-tubulin ring complex 提交 2025-04-11 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric
链 Z 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 K 1–375（375 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 K 1–375（375 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 K 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 K 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9UXA local ARP-NCP structure of the ncBAF-nucleosome complex in the apo state 提交 2025-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 I 2–375（374 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9UXB The apo structure of BCL7B-containing ARP module of the human SWI/SNF complex 提交 2025-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–375（374 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
9UXC The ADP-bound structure of BCL7B-containing ARP module of the human SWI/SNF complex 提交 2025-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–375（374 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.74 Å
9WBZ The structure of NCP-motor-ARP module of ncBAF-nucleosome complex 提交 2025-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 L 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9WC1 The structure of ARP module in ncBAF complex 提交 2025-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–375（375 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 72 个其他 PDB 条目、83 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACTB_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375

Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog

物种未注明

UniProt Q15906

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白拷贝数一致 链 K； UniProt 1–364 未记录 RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） E1A-binding protein p400 × 1 （Q96L91） Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 （Q9H2F5） DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 （Q9NPF5） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Actin-like protein 6A × 2 （O96019） Histone H2A.Z × 1 （P0C0S5） Histone H2B type 1-B × 1 （P33778） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 5.28 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9C62 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5FUG Crystal structure of a human YL1-H2A.Z-H2B complex 提交 2016-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 6–69（64 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SUCCINIC ACID/PHOSPHATE/GLYCINE SYSTEM PH 6/7 ; 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
5FUG Crystal structure of a human YL1-H2A.Z-H2B complex 提交 2016-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 6–69（64 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SUCCINIC ACID/PHOSPHATE/GLYCINE SYSTEM PH 6/7 ; 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
5FUG Crystal structure of a human YL1-H2A.Z-H2B complex 提交 2016-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 6–69（64 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SUCCINIC ACID/PHOSPHATE/GLYCINE SYSTEM PH 6/7 ; 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
5FUG Crystal structure of a human YL1-H2A.Z-H2B complex 提交 2016-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 6–69（64 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SUCCINIC ACID/PHOSPHATE/GLYCINE SYSTEM PH 6/7 ; 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8QR1 Cryo-EM structure of the human Tip60 complex 提交 2023-10-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 S 1–364（364 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 J 1–364（364 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 J 1–364（364 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 J 1–364（364 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8XVG Structure of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 N 1–364（364 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.40 Å
8XVT The core subcomplex of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 N 1–364（364 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9C57 Reconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex 提交 2024-06-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 K 1–364（364 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
9CA7 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the fully-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 B 1–364（364 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
9CA8 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the partially-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 B 1–364（364 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.92 Å
9CA9 Cryo-EM structure of the human SRCAP complex in the unbound state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 B 1–364（364 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9CAA Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the pre-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 B 1–364（364 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.04 Å
9CAB Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the encounter state (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 B 1–364（364 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.94 Å
9CAC Cryo-EM structure of the RuvBL lobe of the native human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 B 1–364（364 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9CAE Cryo-EM structure of the reconstituted RuvBL lobe of the human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 B 1–364（364 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
9INC High resolutional Crystal Structure of human H2A.Z-H2B dimer in complex with human YL1-Z domain 提交 2024-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 8–73（66 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；45% PEG200 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 2.01 Å R-free 0.257
9INC High resolutional Crystal Structure of human H2A.Z-H2B dimer in complex with human YL1-Z domain 提交 2024-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 8–73（66 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；45% PEG200 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 2.01 Å R-free 0.257
9INC High resolutional Crystal Structure of human H2A.Z-H2B dimer in complex with human YL1-Z domain 提交 2024-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 8–73（66 aa）
链 F 8–73（66 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；45% PEG200 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 2.01 Å R-free 0.257

共 16 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VPS72_HUMAN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–364； UniProt 1–364

Actin-like protein 6A

物种未注明

UniProt O96019

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白拷贝数一致 链 L； UniProt 1–429 链 M； UniProt 1–429 未记录 RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） E1A-binding protein p400 × 1 （Q96L91） Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 （Q9H2F5） DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 （Q9NPF5） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 （Q15906） Histone H2A.Z × 1 （P0C0S5） Histone H2B type 1-B × 1 （P33778） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 5.28 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9C62 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
21VV Cryo-EM structure of ncBAF bound to the nucleosome 提交 2025-12-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 K 1–429（429 aa）
未记录 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8.0, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.5 mM ADP, 8 mM NaF, 1 mM BeSO4.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6LTJ Structure of nucleosome-bound human BAF complex 提交 2020-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 J 12–417（406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7VDV The overall structure of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 N 1–429（429 aa）
未记录 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7Y8R The nucleosome-bound human PBAF complex 提交 2022-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric
链 K 1–429（429 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8QR1 Cryo-EM structure of the human Tip60 complex 提交 2023-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 K 1–429（429 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 T 1–429（429 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 T 1–429（429 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 T 1–429（429 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8XVG Structure of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 I 1–429（429 aa）
链 J 1–429（429 aa）
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.40 Å
8XVT The core subcomplex of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 I 1–429（429 aa）
链 J 1–429（429 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9C4B Second BAF53a of the human TIP60 complex 提交 2024-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–429（429 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9C57 Reconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex 提交 2024-06-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–429（429 aa）
链 M 1–429（429 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
9C6N ARP module of the human TIP60 complex 提交 2024-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 L 1–429（429 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9CAC Cryo-EM structure of the RuvBL lobe of the native human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric
链 M 1–429（429 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9CAE Cryo-EM structure of the reconstituted RuvBL lobe of the human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 M 1–429（429 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 J 1–429（429 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 J 1–429（429 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 J 1–429（429 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 J 1–429（429 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9UXA local ARP-NCP structure of the ncBAF-nucleosome complex in the apo state 提交 2025-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 J 2–423（422 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9UXB The apo structure of BCL7B-containing ARP module of the human SWI/SNF complex 提交 2025-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–429（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
9UXC The ADP-bound structure of BCL7B-containing ARP module of the human SWI/SNF complex 提交 2025-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–429（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.74 Å
9WBZ The structure of NCP-motor-ARP module of ncBAF-nucleosome complex 提交 2025-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 N 1–429（429 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9WC1 The structure of ARP module in ncBAF complex 提交 2025-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–429（429 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 24 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACL6A_HUMAN
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–429； UniProt 1–429 作者链 M； PDB构建体 1–429； UniProt 1–429

Histone H2A.Z

物种未注明

UniProt P0C0S5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白拷贝数一致 链 N； UniProt 1–128 未记录 RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） E1A-binding protein p400 × 1 （Q96L91） Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 （Q9H2F5） DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 （Q9NPF5） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 （Q15906） Actin-like protein 6A × 2 （O96019） Histone H2B type 1-B × 1 （P33778） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 5.28 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9C62 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3WA9 The nucleosome containing human H2A.Z.1 提交 2013-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–128（128 aa）
链 G 1–128（128 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.07 Å R-free 0.271
4CAY Crystal structure of a human Anp32e-H2A.Z-H2B complex 提交 2013-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 19–128（110 aa） 片段：GLOBULAR DOMAIN, RESIDUES 19-128
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 7.0, 0.2 M NA FORMATE, 24% TO 30% PEG 3350
分辨率 1.48 Å R-free 0.195
4NFT Crystal structure of human lnkH2B-h2A.Z-Anp32e 提交 2013-11-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 16–114（99 aa） 片段：UNP residues 34-126, 16-114
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；0.2M Sodium thiocyanate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.61 Å R-free 0.273
4NFT Crystal structure of human lnkH2B-h2A.Z-Anp32e 提交 2013-11-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 16–114（99 aa） 片段：UNP residues 34-126, 16-114
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；0.2M Sodium thiocyanate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.61 Å R-free 0.273
4NFT Crystal structure of human lnkH2B-h2A.Z-Anp32e 提交 2013-11-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 16–114（99 aa） 片段：UNP residues 34-126, 16-114
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；0.2M Sodium thiocyanate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.61 Å R-free 0.273
4NFT Crystal structure of human lnkH2B-h2A.Z-Anp32e 提交 2013-11-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 16–114（99 aa） 片段：UNP residues 34-126, 16-114
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；0.2M Sodium thiocyanate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.61 Å R-free 0.273
5B31 The crystal structure of the heterotypic H2AZ/H2A nucleosome with H3.1. 提交 2016-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 G 1–128（128 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.271
5B32 The crystal structure of the heterotypic H2AZ/H2A nucleosome with H3.3. 提交 2016-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 G 1–128（128 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.35 Å R-free 0.259
5B33 The crystal structure of the H2AZ nucleosome with H3.3. 提交 2016-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–128（128 aa）
链 G 1–128（128 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.92 Å R-free 0.252
5CHL Structural basis of H2A.Z recognition by YL1 histone chaperone component of SRCAP/SWR1 chromatin remodeling complex 提交 2015-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 22–113（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.19 mM CYMAL-7, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 40% Polyethylene glycol 400
分辨率 1.89 Å R-free 0.231
5FUG Crystal structure of a human YL1-H2A.Z-H2B complex 提交 2016-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 19–128（110 aa） 片段：GLOBULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SUCCINIC ACID/PHOSPHATE/GLYCINE SYSTEM PH 6/7 ; 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
5FUG Crystal structure of a human YL1-H2A.Z-H2B complex 提交 2016-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 19–128（110 aa） 片段：GLOBULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SUCCINIC ACID/PHOSPHATE/GLYCINE SYSTEM PH 6/7 ; 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
5FUG Crystal structure of a human YL1-H2A.Z-H2B complex 提交 2016-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 19–128（110 aa） 片段：GLOBULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SUCCINIC ACID/PHOSPHATE/GLYCINE SYSTEM PH 6/7 ; 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
5FUG Crystal structure of a human YL1-H2A.Z-H2B complex 提交 2016-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 19–128（110 aa） 片段：GLOBULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SUCCINIC ACID/PHOSPHATE/GLYCINE SYSTEM PH 6/7 ; 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
5Z30 The crystal structure of the nucleosome containing a cancer-associated histone H2A.Z R80C mutant 提交 2018-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–128（128 aa）
链 G 1–128（128 aa）
突变：R80C 突变：R80C CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.45 Å R-free 0.243
6JOU Crystal structure of the human nucleosome containing H2A.Z.1 S42R 提交 2019-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–128（128 aa）
链 G 1–128（128 aa）
突变：S42R 突变：S42R MN MANGANESE (II) ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.17 Å R-free 0.250
7YRD histone methyltransferase 提交 2022-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 11–123（113 aa）
链 G 11–123（113 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7YRG histone methyltransferase 提交 2022-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 11–123（113 aa）
链 G 11–123（113 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8JHF Native SUV420H1 bound to 167-bp nucleosome 提交 2023-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 14–126（113 aa）
链 G 14–126（113 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane
分辨率 3.68 Å
8T9F Catalytic and non-catalytic mechanisms of histone H4 lysine 20 methyltransferase SUV420H1 提交 2023-06-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–128（128 aa）
链 G 1–128（128 aa）
未记录 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；50 mM HEPES pH 7.9, 100 mM NaCl, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8THU Catalytic and non-catalytic mechanisms of histone H4 lysine 20 methyltransferase SUV420H1 提交 2023-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–128（128 aa）
链 G 1–128（128 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；50 mM HEPES pH 7.9, 100 mM NaCl, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9GCG CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 O 2–128（127 aa）
链 S 2–128（127 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9GE4 CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 O 2–128（127 aa）
链 S 2–128（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
9INC High resolutional Crystal Structure of human H2A.Z-H2B dimer in complex with human YL1-Z domain 提交 2024-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 17–114（98 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；45% PEG200 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 2.01 Å R-free 0.257
9INC High resolutional Crystal Structure of human H2A.Z-H2B dimer in complex with human YL1-Z domain 提交 2024-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 17–114（98 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；45% PEG200 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 2.01 Å R-free 0.257
9INC High resolutional Crystal Structure of human H2A.Z-H2B dimer in complex with human YL1-Z domain 提交 2024-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 17–114（98 aa）
链 D 17–114（98 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；45% PEG200 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 2.01 Å R-free 0.257
9OGR Cryo-EM analysis of human H2A.Z on methylated Sat2R-P DNA (v1) 提交 2025-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–128（127 aa）
链 G 2–128（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
9OGS Cryo-EM analysis of human H2A.Z on Sat2R-P DNA (v1) 提交 2025-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–128（127 aa）
链 G 2–128（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9OGZ Cryo-EM analysis of human H2A.Z on Sat2R-P DNA (v2) 提交 2025-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–128（127 aa）
链 G 2–128（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9OH0 Cryo-EM analysis of human H2A.Z on methylated Sat2R-P DNA (v2) 提交 2025-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–128（127 aa）
链 G 2–128（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
9OH1 Cryo-EM analysis of human H2A.Z on 601L DNA 提交 2025-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–128（127 aa）
链 G 2–128（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
9OH2 Cryo-EM analysis of human H2A.Z on methylated 601L DNA 提交 2025-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–128（127 aa）
链 G 2–128（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
9UBD The Structural Basis of the Recognition of the Histone Variant H2A.Z by the SRCAP Catalytic Subunit 提交 2025-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 17–114（98 aa）
链 D 17–114（98 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.2 M Potassium thiocyanate 15 % w/v PEG 3,350 pH 7.0
分辨率 2.53 Å R-free 0.288

共 25 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2AZ_HUMAN
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 N； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128

Histone H2B type 1-B

物种未注明

UniProt P33778

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白拷贝数一致 链 O； UniProt 1–126 未记录 RuvB-like 2 × 3 （Q9Y230） RuvB-like 1 × 3 （Q9Y265） E1A-binding protein p400 × 1 （Q96L91） Enhancer of polycomb homolog 1 × 1 （Q9H2F5） DNA methyltransferase 1-associated protein 1 × 1 （Q9NPF5） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog × 1 （Q15906） Actin-like protein 6A × 2 （O96019） Histone H2A.Z × 1 （P0C0S5） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 5.28 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9C62 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3X1S Crystal structure of the nucleosome core particle 提交 2014-11-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70mM KCL, 70-90mM MnCl2, 24% MPD, 20mM Na-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.81 Å R-free 0.270
3X1U Crystal structure of nucleosome core particle in the presence of histone variants involved in reprogramming 提交 2014-11-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 3–126（124 aa）
链 H 3–126（124 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 CL CHLORIDE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70 mM KCl, 70-90 mM MnCl2, 24% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.25 Å R-free 0.270
9FGQ Structure of human APC3loop 375-381 bound to the NCP 提交 2024-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPEs pH8.0, 50 mM NaCl, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
9GE5 CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 T 33–124（92 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2B1B_HUMAN
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 O； PDB构建体 1–126； UniProt 1–126

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9c62

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9c62
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9c62
沉积日期 deposition_date2024-06-07
结构标题 titleP400 subcomplex of the native human TIP60 complex
关键词 keywordscomplex, chromatin regulator, GENE REGULATION; GENE REGULATION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier67.90 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron67.63 Å
零角强度 I(0) i04428340000.00
分子量 molecular_weight561900.0 kDa
排除体积 excluded_volume703910 ų
包络体积 envelope_volume1128300 ų
水化壳体积 shell_volume138990 ų
包络直径 envelope_diameter216.6 Å
壳层 Rg shell_rg68.76 Å
包络 Rg envelope_rg65.21 Å
形状 Rg shape_rg67.66 Å
总 Rg total_rg67.51 Å
总原子数 total_atoms79168
残基数 n_residues4997
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax224.1 Å
Rg (实空间) rg_real67.80 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.21 Å
I(0) (实空间) i0_real4.4280e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error9.5810e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal68.08 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal4430000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8714
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary68.2 Å
偏度 Skewness skewness0.150
峰度 Kurtosis kurtosis-0.734
角度范围 angular_range— – 0.1150 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha317600000.0000
实空间数据点数 n_real_points24
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.910; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.597
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)