7sx3

Human NALCN-FAM155A-UNC79-UNC80 channelosome with CaM bound, conformation 1/2

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 276.4 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Sodium leak channel non-selective protein,Enhanced green fluorescent protein

Homo sapiens

UniProt A0A7G8ZY66

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–241 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) Transmembrane protein FAM155A × 1 (B1AL88) Calmodulin-1 × 1 (P0DP23) UNC79,Protein unc-79 homolog,Protein unc-79 homolog × 1 (Q9P2D8) Protein unc-80 homolog × 1 (Q8N2C7) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 4 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;3.5 sec blotting 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A7G8ZY66_MUHV1
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1760–2000; UniProt 1–241

Sodium leak channel non-selective protein,Enhanced green fluorescent protein

Homo sapiens

UniProt Q8IZF0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–1738 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) Transmembrane protein FAM155A × 1 (B1AL88) Calmodulin-1 × 1 (P0DP23) UNC79,Protein unc-79 homolog,Protein unc-79 homolog × 1 (Q9P2D8) Protein unc-80 homolog × 1 (Q8N2C7) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 4 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;3.5 sec blotting 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NALCN_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–1738; UniProt 1–1738

Transmembrane protein FAM155A

Homo sapiens

UniProt B1AL88

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–458 未记录 Sodium leak channel non-selective protein,Enhanced green fluorescent protein × 1 (Q8IZF0,A0A7G8ZY66) Calmodulin-1 × 1 (P0DP23) UNC79,Protein unc-79 homolog,Protein unc-79 homolog × 1 (Q9P2D8) Protein unc-80 homolog × 1 (Q8N2C7) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 4 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;3.5 sec blotting 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F155A_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–458; UniProt 1–458

Calmodulin-1

Homo sapiens

UniProt P0DP23

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–149 未记录 Sodium leak channel non-selective protein,Enhanced green fluorescent protein × 1 (Q8IZF0,A0A7G8ZY66) Transmembrane protein FAM155A × 1 (B1AL88) UNC79,Protein unc-79 homolog,Protein unc-79 homolog × 1 (Q9P2D8) Protein unc-80 homolog × 1 (Q8N2C7) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 4 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;3.5 sec blotting 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 213 个其他 PDB 条目、279 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CALM1_HUMAN
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–149; UniProt 1–149

UNC79,Protein unc-79 homolog,Protein unc-79 homolog

Homo sapiens

UniProt Q9P2D8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 174–2635 未记录 Sodium leak channel non-selective protein,Enhanced green fluorescent protein × 1 (Q8IZF0,A0A7G8ZY66) Transmembrane protein FAM155A × 1 (B1AL88) Calmodulin-1 × 1 (P0DP23) Protein unc-80 homolog × 1 (Q8N2C7) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 4 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;3.5 sec blotting 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UNC79_HUMAN
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 75–2536; UniProt 174–2635

Protein unc-80 homolog

Homo sapiens

UniProt Q8N2C7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 1–3258 未记录 Sodium leak channel non-selective protein,Enhanced green fluorescent protein × 1 (Q8IZF0,A0A7G8ZY66) Transmembrane protein FAM155A × 1 (B1AL88) Calmodulin-1 × 1 (P0DP23) UNC79,Protein unc-79 homolog,Protein unc-79 homolog × 1 (Q9P2D8) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 4 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;3.5 sec blotting 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UNC80_HUMAN
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–3258; UniProt 1–3258

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7sx3

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7sx3
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7sx3
沉积日期 deposition_date2021-11-22
结构标题 titleHuman NALCN-FAM155A-UNC79-UNC80 channelosome with CaM bound, conformation 1/2
关键词 keywordsion channel, calmodulin, HEAT repeat protein, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier75.75
回转半径 Rg (电子) rg_electron75.96
零角强度 I(0) i03598070000.00
分子量 molecular_weight540120.0 kDa
排除体积 excluded_volume689100 ų
包络体积 envelope_volume1092900 ų
水化壳体积 shell_volume128370 ų
包络直径 envelope_diameter305.3
壳层 Rg shell_rg68.09
包络 Rg envelope_rg75.22
形状 Rg shape_rg75.98
总 Rg total_rg75.73
总原子数 total_atoms37959
残基数 n_residues4681
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax276.4
Rg (实空间) rg_real80.29
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.04
I(0) (实空间) i0_real3.6300e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.4620e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal74.25
I(0) (倒空间) i0_reciprocal3584000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8743
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary79.0
偏度 Skewness skewness0.613
峰度 Kurtosis kurtosis0.029
角度范围 angular_range— – 0.1050 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.0780
最高正则化参数 α highest_alpha199700000.0000
实空间数据点数 n_real_points22
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.830; Stabil: 0.838; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.425

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)