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9c15

Crystal structure of the KRAS-p110alpha complex with molecular glue D927

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 119.8 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform

Homo sapiens

UniProt P42336

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 105–1068 突变：W1057A, I1058A, F1059A GTPase KRas × 1 （P01116） A1ATF 2-[3-fluoro-4-({(7P)-7-[2-(2-methoxyethoxy)phenyl]thieno[2,3-d]pyridazin-4-yl}amino)phenyl]acetamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Tris, 0.1 M NaCl, 15% PEG 20K 分辨率 2.81 Å R-free 0.234

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9C15 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2ENQ Solution structure of the C2 domain from human PI3-kinase p110 subunit alpha 提交 2007-03-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 331–481（151 aa） 片段：C2 domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成 0.77mM 13C, 15N-labeled protein; 20mM d-Tris-HCl(pH7.0), 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O; 90% H2O | 10% D2O; 90% H2O
分辨率未提供
2RD0 Structure of a human p110alpha/p85alpha complex 提交 2007-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；Sodium Formate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 3.05 Å R-free 0.323
3HHM Crystal structure of p110alpha H1047R mutant in complex with niSH2 of p85alpha and the drug wortmannin 提交 2009-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R KWT (1S,6BR,9AS,11R,11BR)-9A,11B-DIMETHYL-1-[(METHYLOXY)METHYL]-3,6,9-TRIOXO-1,6,6B,7,8,9,9A,10,11,11B-DECAHYDRO-3H-FURO[4, 3,2-DE]INDENO[4,5-H][2]BENZOPYRAN-11-YL ACETATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Na formate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.307
3HIZ Crystal structure of p110alpha H1047R mutant in complex with niSH2 of p85alpha 提交 2009-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Na formate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.333
3ZIM Discovery of a potent and isoform-selective targeted covalent inhibitor of the lipid kinase PI3Kalpha 提交 2013-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1046（940 aa） 片段：N-TERMINAL TRUNCATED, RESIDUES 107-1046
未记录 KKR 1-[4-[[2-(1H-indazol-4-yl)-4-morpholin-4-yl-thieno[3,2-d]pyrimidin-6-yl]methyl]piperazin-1-yl]-6-methyl-hept-5-ene-1,4- dione × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.85 Å R-free 0.278
4JPS Co-crystal Structures of the Lipid Kinase PI3K alpha with Pan and Isoform Selective Inhibitors 提交 2013-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K SCN THIOCYANATE ION × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；303 K；12% PEG 3350, 120MM KSCN, 6uL protein to 4uL well with streak seeding at 18C , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 303K
分辨率 2.20 Å R-free 0.228
4L1B Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha 提交 2013-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.59 Å R-free 0.274
4L23 Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha and PI-103 提交 2013-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
4L2Y Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha and compound 9d 提交 2013-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 XXK 3-amino-5-[4-(morpholin-4-yl)pyrido[3',2':4,5]furo[3,2-d]pyrimidin-2-yl]phenol × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.271
4OVU Crystal Structure of p110alpha in complex with niSH2 of p85alpha 提交 2014-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；NaFormate
分辨率 2.96 Å R-free 0.272
4OVV Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with diC4-PIP2 提交 2014-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.339
4TUU Isolated p110a subunit of PI3Ka provides a platform for structure-based drug design 提交 2014-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa） 片段：UNP residues 105-1048
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；PEG 6K, 0.6 M Na Formate, 0.1M CHES, pH 9.0-10 and 5 mM TCEP, pH 7.0 at a temperature of 20 degC.
分辨率 2.64 Å R-free 0.245
4TV3 Isolated p110a subunit of PI3Ka provides a platform for structure-based drug design 提交 2014-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa） 片段：UNP residues 105-1048
未记录 ML9 2-amino-8-[trans-4-(2-hydroxyethoxy)cyclohexyl]-6-(6-methoxypyridin-3-yl)-4-methylpyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；PEG 6K, 0.6 M Na Formate, 0.1M CHES, pH 9.0-10 and 5 mM TCEP, pH 7.0 at a temperature of 20 degC.
分辨率 2.85 Å R-free 0.250
4WAF Crystal Structure of a novel tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazine in an engineered PI3K alpha 提交 2014-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1068（1067 aa）
突变：M232K, L233K, I800M, F930V 3K6 N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；12% PEG 3350, 120mM potassium thiocyanate
分辨率 2.39 Å R-free 0.247
4YKN Pi3K alpha lipid kinase with Active Site Inhibitor 提交 2015-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–1068（1067 aa） 片段：UNP P27986 residues 318-615, LINKER (GSPGISGGGGG), P42336 residues 2-1068
未记录 4EL 3-(6-methoxypyridin-3-yl)-5-[({4-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)sulfamoyl]phenyl}amino)methyl]benzoic acid × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；ethylenene glycol, PIP2
分辨率 2.90 Å R-free 0.247
4ZOP Co-crystal Structure of Lipid Kinase PI3K alpha with a selective phosphatidylinositol-3 kinase alpha inhibitor 提交 2015-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K 4Q2 (2S,3R)-N~1~-(8-tert-butyl-4,5-dihydro[1,3]thiazolo[4,5-h]quinazolin-2-yl)-3-methylpyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；303 K；12% PEG 3350, 120MM KSCN, 6UL PROTEIN TO 4UL WELL WITH STREAK SEEDING AT 18C , PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.62 Å R-free 0.258
5DXH p110alpha/p85alpha with compound 5 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1068（1067 aa）
未记录 5H2 methyl {2-[4-(2-chlorophenyl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]-4,5-dihydrothieno[3,2-d][1]benzoxepin-8-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.218
5DXH p110alpha/p85alpha with compound 5 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–1068（1067 aa）
未记录 5H2 methyl {2-[4-(2-chlorophenyl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]-4,5-dihydrothieno[3,2-d][1]benzoxepin-8-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.218
5DXT p110alpha with GDC-0326 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1068（962 aa） 片段：PI3-KINASE P110 ALPHA, UNP residues 107-1068
未记录 5H5 (2S)-2-({2-[1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}oxy)propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 20000
分辨率 2.25 Å R-free 0.262
5FI4 Discovery of imidazo[1,2-a]-pyridine inhibitors of pan-PI3 kinases that are efficacious in a mouse xenograft model 提交 2015-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K L233K GOL GLYCEROL × 1 5XV ~{N}-[6-[5-azanyl-6-[(2~{S})-1,1,1-tris(fluoranyl)propan-2-yl]oxy-pyrazin-2-yl]imidazo[1,2-a]pyridin-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；12.5% PEG 3350, 125 mM KSCN Drops were 5uL protein: 3uL well solutions and streak seeded.
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
5ITD Crystal structure of PI3K alpha with PI3K delta inhibitor 提交 2016-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K 6CY 5-{4-[3-(4-acetylpiperazine-1-carbonyl)phenyl]quinazolin-6-yl}-2-methoxypyridine-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 uL of protein was mixed with 5 uL of well solution containing 12% PEG 3350 and 120 mM potassium thiocyanate
分辨率 3.02 Å R-free 0.241
5SW8 Crystal structure of PI3Kalpha in complex with fragments 7 and 11 提交 2016-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 70S 2H-indazol-5-amine × 1 FB1 2-CHLOROBENZENESULFONAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
5SWG Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 5 and 21 提交 2016-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） AX7 1H-benzimidazol-2-amine × 1 CAQ CATECHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.11 Å R-free 0.262
5SWO Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 4 and 19 提交 2016-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 1 70T 2-methyl-5-nitro-1H-indole × 1 2ZV 4-methyl-3-nitropyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.274
5SWP Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 6 and 24 提交 2016-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 70W tert-butyl 4-aminopiperidine-1-carboxylate × 2 70V 2-methylcyclohexane-1,3-dione × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.41 Å R-free 0.296
5SWR Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 20 and 26 提交 2016-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 718 6-hydroxy-3,4-dihydronaphthalen-1(2H)-one × 1 CL CHLORIDE ION × 2 SAL 2-HYDROXYBENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.31 Å R-free 0.273
5SWT Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 17 and 27 提交 2016-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71A pyridin-3-ol × 1 71B 3-fluoro-4-methoxyaniline × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
5SX8 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 12 and 15 提交 2016-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71M 6-methylpyridin-2-amine × 2 LUZ pteridine-2,4(1H,3H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.47 Å R-free 0.276
5SX9 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 14 提交 2016-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71L 4,6-dimethylpyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.52 Å R-free 0.277
5SXA Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 10 提交 2016-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71N 2-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazol-5-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.35 Å R-free 0.275
5SXB Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 23 提交 2016-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SOA ISATOIC ANHYDRIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.30 Å R-free 0.278
5SXC Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 8 提交 2016-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） URF 5-FLUOROURACIL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.55 Å R-free 0.268
5SXD Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 22 提交 2016-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71F 2-methoxybenzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.276
5SXE Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 19 and 28 提交 2016-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71G 3-aminobenzonitrile × 1 ES3 4-bromo-1H-imidazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.51 Å R-free 0.271
5SXF Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 9 提交 2016-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HPP HYDROXYPHENYL PROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.46 Å R-free 0.267
5SXI Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 13 提交 2016-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71J trans-cyclohexane-1,4-diol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.40 Å R-free 0.279
5SXJ Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 29 提交 2016-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） BHO BENZHYDROXAMIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.42 Å R-free 0.279
5SXK Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 18 提交 2016-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71K 2-methylbenzene-1,3-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.55 Å R-free 0.278
5UBR CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K ALPHA IN COMPLEX WITH A 7-(3-(PIPERAZIN-1-YL)PHENYL)PYRROLO[2,1-F][1,2,4] TRIAZIN-4-AMINE DERIVIATINE 提交 2016-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1050（944 aa）
未记录 85S 1-[4-(3-{4-amino-5-[1-(oxan-4-yl)-1H-pyrazol-5-yl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl}phenyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；NULL
分辨率 2.40 Å R-free 0.246
5UK8 The co-structure of (R)-4-(6-(1-(cyclopropylsulfonyl)cyclopropyl)-2-(1H-indol-4-yl)pyrimidin-4-yl)-3-methylmorpholine and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K,L233K, I800M, F930V, R770E, W780K, E798I, V850W 8DV (R)-4-(6-(1-(cyclopropylsulfonyl)cyclopropyl)-2-(1H-indol-4-yl)pyrimidin-4-yl)-3-methylmorpholine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 303.15K
分辨率 2.50 Å R-free 0.240
5UKJ The co-structure of N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3- b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5- a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa） 片段：UNP residues
突变：M232K L233K I800M F930V W780K V850W R770E E798I 3K6 N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP,
分辨率 2.80 Å R-free 0.252
5UL1 The co-structure of 3-amino-6-(4-((1-(dimethylamino)propan-2-yl)sulfonyl)phenyl)-N-phenylpyrazine-2-carboxamide and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K L233K I800M F930V W780K V850W R770E E798I 8DY 3-amino-6-(4-{[(2S)-1-(dimethylamino)propan-2-yl]sulfonyl}phenyl)-N-phenylpyrazine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.00 Å R-free 0.260
5XGH Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 8–1055（1048 aa） 片段：UNP residues 8-1055
未记录 84U 3-[(4-fluorophenyl)methylamino]-5-(4-morpholin-4-ylthieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)phenol × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.97 Å R-free 0.280
5XGI Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 8–1059（1052 aa） 片段：UNP residues 8-1059
未记录 84R 3-azanyl-5-(4-morpholin-4-ylthieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)phenol × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.56 Å R-free 0.290
5XGJ Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 8–1055（1048 aa） 片段：UNP residues 8-1055
未记录 84X 3-(4-morpholin-4-ylfuro[3,2-d]pyrimidin-2-yl)-5-[(phenylmethyl)amino]phenol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.97 Å R-free 0.279
6GVF Crystal structure of PI3K alpha in complex with 3-(2-Amino-benzooxazol-5-yl)-1-isopropyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-ylamine 提交 2018-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1051（945 aa）
未记录 FE5 5-(4-azanyl-1-propan-2-yl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl)-1,3-benzoxazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；NULL
分辨率 2.50 Å R-free 0.244
6GVG Crystal structure of PI3K alpha in complex with 3-(2-Amino-benzooxazol-5-yl)-1-isopropyl-4-methyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-ylamine 提交 2018-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1068（962 aa）
未记录 FCZ 5-(6-azanyl-4-methyl-1-propan-2-yl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl)-1,3-benzoxazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；none
分辨率 3.00 Å R-free 0.229
6GVH Crystal structure of PI3K alpha in complex with 3-(2-Amino-benzooxazol-5-yl)-4-chloro-1-isopropyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-ylamine 提交 2018-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1068（962 aa）
未记录 FDH 5-(6-azanyl-4-chloranyl-1-propan-2-yl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl)-1,3-benzoxazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；none
分辨率 2.74 Å R-free 0.246
6GVI Crystal structure of PI3K alpha in complex with 3-(2-Amino-benzooxazol-5-yl)-1-isopropyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidine-4,6-diamine 提交 2018-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1068（962 aa）
未记录 FDW 3-(2-azanyl-1,3-benzoxazol-5-yl)-1-propan-2-yl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidine-4,6-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；none
分辨率 2.90 Å R-free 0.232
6NCT Structure of p110alpha/niSH2 - vector data collection 提交 2018-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 2 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes, 1.4-1.6 M sodium formate
分辨率 3.35 Å R-free 0.271
6OAC PQR530 [(S)-4-(Difluoromethyl)-5-(4-(3-methylmorpholino)-6-morpholino-1,3,5-triazin-2-yl)pyridin-2-amine] bound to the PI3Ka catalytic subunit p110alpha 提交 2019-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 M1J 4-(difluoromethyl)-5-{4-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-6-(morpholin-4-yl)-1,3,5-triazin-2-yl}pyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；290 K；8% PEG6000, 0.6M Na Formate, 0.1M CHES pH 9.5, 5mM TCEP
分辨率 3.15 Å R-free 0.287
6PYS Human PI3Kalpha in complex with Compound 2-10 ((3S)-3-benzyl-3-methyl-5-[5-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one) 提交 2019-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1051（945 aa） 片段：UNP residues 107-1051
未记录 P5J (3S)-3-benzyl-3-methyl-5-[5-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；not available
分辨率 2.19 Å R-free 0.259
6VO7 Crystal structure of PI3K-alpha Ras Binding Domain (RBD) 提交 2020-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCL, 0.7 M Na Citrate, pH 8.5
分辨率 2.31 Å R-free 0.255
7JIU HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 2F 提交 2020-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1052（946 aa） 片段：TRUNCATED PI3-KINASE ALPHA, residues 107-1052
未记录 VBS (3S)-3-benzyl-5-[9-ethyl-8-(2-methylpyrimidin-5-yl)-9H-purin-6-yl]-3-methyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；NOT AVAILABLE
分辨率 2.12 Å R-free 0.246
7K6M Crystal structure of PI3Kalpha selective Inhibitor PF-06843195 提交 2020-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 VXY 2,2-difluoroethyl (3S)-3-{[2'-amino-5-fluoro-2-(morpholin-4-yl)[4,5'-bipyrimidin]-6-yl]amino}-3-(hydroxymethyl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M sodium formate, 5 mM TCEP pH 7, 50 mM Tris pH 8.0, 100 mM NaCl, 2% Ethylene Glycol
分辨率 2.41 Å R-free 0.232
7K6N Crystal structure of PI3Kalpha selective Inhibitor 11-1575 提交 2020-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 VY4 tert-butyl (3S)-3-[4-(2-aminopyrimidin-5-yl)-2-(morpholin-4-yl)-5,6-dihydro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-3-methylpyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M sodium formate, 5 mM TCEP pH 7
分辨率 2.77 Å R-free 0.235
7K6O Crystal structure of PI3Kalpha inhibitor 10-5429 提交 2020-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 VY1 (3S)-3-[4-(2-aminopyrimidin-5-yl)-2-(morpholin-4-yl)-5,6-dihydro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-N-methylpyrrolidine-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M sodium formate, 5 mM TCEP pH 7
分辨率 2.74 Å R-free 0.262
7K71 Crystal structure of PI3Kalpha inhibitor 4-0686 提交 2020-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 VYP 2-(morpholin-4-yl)[4,5'-bipyrimidin]-2'-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M sodium formate, 5 mM TCEP pH 7
分辨率 2.90 Å R-free 0.259
7L1B Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a wild-type PIK3CA peptide 提交 2020-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；10.00 % w/v Polyethylene glycol 8,000, 200 mM Calcium acetate, 100 mM HEPES; pH 7.5
分辨率 2.04 Å R-free 0.221
7L1C Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2020-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 FMT FORMIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277.15 K；20% w/v Polyethylene glycol 3,350, 200 mM Ammonium formate, pH 6.6
分辨率 1.96 Å R-free 0.205
7L1D Crystal structure of human 21LT2-2 TCR bound to HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2020-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1046–1054（9 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；10% w/v Polyethylene glycol 8,000, 200mM Magnesium acetate
分辨率 3.11 Å R-free 0.250
7MLK Crystal structure of human PI3Ka (p110a subunit) with MMV085400 bound to the active site determined at 2.9 angstroms resolution 提交 2021-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa） 片段：UNP residues 105-1048
未记录 ZHY 4-[6-(3,4,5-trimethoxyanilino)pyrazin-2-yl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M Sodium Formate and AMP, 5 mM TCEP pH 7
分辨率 2.91 Å R-free 0.242
7MYN Cryo-EM Structure of p110alpha in complex with p85alpha 提交 2021-05-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7MYO Cryo-EM structure of p110alpha in complex with p85alpha inhibited by BYL-719 提交 2021-05-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
7PG5 Crystal Structure of PI3Kalpha 提交 2021-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；10% PEG 5K MME (w/v), 160 nM KSCN, 100 mM sodium cacodylate pH 6.5.
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
7PG6 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with the inhibitor NVP-BYL719 提交 2021-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% PEG 5000, 160 mM KSCN and 100 mM sodium cacodylate pH 6.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.240
7R9V Structure of PIK3CA with covalent inhibitor 19 提交 2021-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 2Q7 N-[2-(4-{4-[2-amino-4-(difluoromethyl)pyrimidin-5-yl]-6-(morpholin-4-yl)-1,3,5-triazin-2-yl}piperazin-1-yl)-2-oxoethyl]-1-(prop-2-enoyl)piperidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG6000 8%, 0.6 M sodium formate, 0.1 M CHES pH 9.4, 5 mM TCEP
分辨率 2.69 Å R-free 0.292
7R9Y Structure of PIK3CA with covalent inhibitor 22 提交 2021-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 2IX N-[2-(4-{4-[2-amino-4-(difluoromethyl)pyrimidin-5-yl]-6-(morpholin-4-yl)-1,3,5-triazin-2-yl}piperazin-1-yl)-2-oxoethyl]-N-methyl-1-(prop-2-enoyl)piperidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG6000 8%, 0.6 M sodium formate, 0.1 M CHES pH 9.4, 5 mM TCEP
分辨率 2.85 Å R-free 0.287
7RRG Crystal structure of human 0606T1-2 TCR bound to HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H1047L GOL GLYCEROL × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；12% w/v Polyethylene glycol 3,350, 100 mM Succinic acid
分辨率 2.12 Å R-free 0.221
7TZ7 PI3K alpha in complex with an inhibitor 提交 2022-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K KVJ (4S,5R)-3-[2'-amino-2-(morpholin-4-yl)-4'-(trifluoromethyl)[4,5'-bipyrimidin]-6-yl]-4-(hydroxymethyl)-5-methyl-1,3-oxazolidin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；0.15M Potassium Thiocyanate, 20% PEG 3350
分辨率 2.41 Å R-free 0.277
8AM0 Crystal structure of human T1061E PI3Kalpha in complex with its regulatory subunit and the inhibitor GDC-0077 (Inavolisib) 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：T1061E MWF (2R)-2-[[2-[(4S)-4-[bis(fluoranyl)methyl]-2-oxidanylidene-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl]amino]propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；293 K；0.10 M Bis-Tris-Propane pH 8.10, 0.20 M Na 3 -citrate, 10.00 %(w/v) PEG 3350
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；293 K；0.10 M Bis-Tris-Propane pH 8.10, 0.20 M Na 3 -citrate, 10.00 %(w/v) PEG 3350
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；293 K；0.10 M Bis-Tris-Propane pH 8.10, 0.20 M Na 3 -citrate, 10.00 %(w/v) PEG 3350
分辨率 2.82 Å R-free 0.300
8BFU Crystal structure of the apo p110alpha catalytic subunit from homo sapiens 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；12.5% (w/v) PEG 4K, 20% (v/v) 1,2,6-hexanetriol, 90 mM LiNaK, 0.1 M MOPSO/bis-tris pH 6.5
分辨率 2.41 Å R-free 0.279
8DCP PI 3-kinase alpha with nanobody 3-126 提交 2022-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.41 Å
8DCX PI 3-kinase alpha with nanobody 3-159 提交 2022-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8DD4 PI 3-kinase alpha with nanobody 3-142 提交 2022-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8DD8 PI 3-kinase alpha with nanobody 3-142, crosslinked with DSG 提交 2022-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8EXL Crystal structure of PI3K-alpha in complex with taselisib 提交 2022-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 7–1052（1046 aa）
未记录 799 2-methyl-2-(4-{2-[3-methyl-1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-1H-pyrazol-1-yl)propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；0.1M MES buffer pH 6.2, 16% PEG 20,000, 0.1M KCl
分辨率 1.99 Å R-free 0.225
8EXO Crystal structure of PI3K-alpha in complex with compound 19 提交 2022-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 7–1052（1046 aa）
未记录 X3W 1-{(4S,11aM)-2-[(4R)-2-oxo-4-(propan-2-yl)-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；0.1M MES buffer pH 6.2, 16% PEG 20,000, 0.1M KCl
分辨率 2.46 Å R-free 0.242
8EXU Crystal structure of PI3K-alpha in complex with compound 30 提交 2022-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 7–1052（1046 aa）
未记录 X3R (2S)-2-cyclopropyl-2-({(4S,11aM)-2-[(4S)-2-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}amino)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；0.1M MES buffer pH 6.2, 16% PEG 20,000, 0.1M KCl
分辨率 2.68 Å R-free 0.241
8EXV Crystal structure of PI3K-alpha in complex with compound 32 提交 2022-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 7–1052（1046 aa）
未记录 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；0.1M MES buffer pH 6.2, 16% PEG 20,000, 0.1M KCl
分辨率 2.48 Å R-free 0.258
8GUA Cryo-EM structure of cancer-specific PI3Kalpha mutant E542K in complex with BYL-719 提交 2022-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
8GUB Cryo-EM structure of cancer-specific PI3Kalpha mutant H1047R in complex with BYL-719 提交 2022-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8GUD Cryo-EM structure of cancer-specific PI3Kalpha mutant E545K in complex with BYL-719 提交 2022-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.62 Å
8ILR Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 16 提交 2023-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 7TZ N-[(2S)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[4-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8ILS Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 17 提交 2023-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 7U5 N-[(2R)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[4-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8ILV Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 18 提交 2023-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 L2V N-[(2R)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[3-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.19 Å
8OW2 Crystal structure of the p110alpha catalytic subunit from homo sapiens in complex with activator 1938 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 QIH 1-[7-[[2-[[4-(4-ethylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]pyridin-4-yl]amino]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；12.5% (w/v) PEG 4K, 20% (v/v) 1,2,6-hexanetriol, 50 mM Polyamines, 0.1 M MOPSO/bis-tris pH 6.5
分辨率 2.57 Å R-free 0.271
8SBC Co-structure of Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform and brain penetrant inhibitors 提交 2023-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K, W780K, I800M, V850W, F930V ZTV (2M)-7-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-5-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-2-(pyridin-2-yl)-1H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303 K；RESERVOIR SOLUTION : 12%-20% PEG 3350, 0.125M-0.20M KSCN PROTEIN SOLUTION : 20MM TRIS PH 7.2, 200MM NACL, 1% BETAINE, 1% ETHYLENE GLYCOL, 0.02% CHAPS, 5MM DTT, PROTEIN IS 7.4 MG/ML FORMATION METHOD : SOAKING PROTOCOL : SET UP APO XTALS DROPS IN 1:1 RATIO IN 30C, REMARK 280 XTALS GROW OVERNIGHT, THEN ADD 2MM OF STOCK CPD AND INCUBATE FOR A FEW HOURS METHOD : VAPOR DIFFUSION - HANGING DROP TEMPERATURE : 303.0 CRYO PROTOCOL : 20% ETHYLENE GLYCOL PLUS WELL SOLUTION
分辨率 2.30 Å R-free 0.271
8SBJ Co-structure Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform complexed with brain penetrant inhibitors 提交 2023-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 ZUO (2M)-7-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-5-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-2-(1H-pyrazol-3-yl)-3H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303 K；RESERVOIR SOLUTION : 12%-20% PEG 3350, 0.125M-0.20M KSCN; PROTEIN SOLUTION: 20MM TRIS PH 7.2, 200MM NACL, 1% BETAINE, 1% ETHYLENE GLYCOL, 0.02% CHAPS, 5MM DTT, PROTEIN IS 7.4 MG/ML, FORMATION METHOD : SOAKING, PROTOCOL: SET UP APO XTALS DROPS IN 1:1 RATIO IN 30C, XTALS GROW OVERNIGHT, THEN ADD 2MM OF STOCK CPD AND INCUBATE FOR A FEW HOURS; CRYO PROTOCOL: 20% ETHYLENE GLYCOL PLUS WELL SOLUTION
分辨率 3.10 Å R-free 0.257
8TDU STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to PI3Kalpha 提交 2023-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1 M MES pH 6.8, 500mM NaCl, 8% w/v PEG 3350
分辨率 3.11 Å R-free 0.267
8TDU STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to PI3Kalpha 提交 2023-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
未记录 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1 M MES pH 6.8, 500mM NaCl, 8% w/v PEG 3350
分辨率 3.11 Å R-free 0.267
8TGD STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to H1047R PI3Kalpha 提交 2023-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；0.5 M NaCl, 0.1 M MES-NaOH pH 6.8, 5% w/v PEG 3350
分辨率 2.93 Å R-free 0.252
8TGD STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to H1047R PI3Kalpha 提交 2023-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；0.5 M NaCl, 0.1 M MES-NaOH pH 6.8, 5% w/v PEG 3350
分辨率 2.93 Å R-free 0.252
8TS7 Human PI3K p85alpha/p110alpha 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1053（1052 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.71 Å R-free 0.288
8TS8 p85alpha/p110alpha heterodimer H1047R mutant 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1053（1052 aa）
突变：H1047R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.72 Å R-free 0.265
8TS9 Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 1 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1050（1049 aa）
突变：H1047R UE9 5-[3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamido]-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.252
8TSA Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 2 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1050（1049 aa）
突变：H1047R UIW 5-(3-bromo-5-fluorobenzamido)-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.51 Å R-free 0.276
8TSB Human PI3K p85alpha/p110alpha bound to compound 2 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1053（1052 aa）
未记录 UIW 5-(3-bromo-5-fluorobenzamido)-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 3.53 Å R-free 0.256
8TSC Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 3 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1050（1049 aa）
突变：H1047R UJC (1S)-7-[3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamido]-N-methyl-1-(2-methylphenyl)-3-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 3.62 Å R-free 0.255
8TSD Human PI3K p85alpha/p110alpha bound to RLY-2608 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1053（1052 aa）
未记录 XUZ N-{(3R,6M)-3-(2-chloro-5-fluorophenyl)-6-[(4S)-5-cyano[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyridin-6-yl]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.277
8TU6 CryoEM structure of PI3Kalpha 提交 2023-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1068（1067 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
8TWY Structure of p110 alpha bound to (S)-1-(4-((2-(4-(4-(2-amino-4-(difluoromethyl)pyrimidin-5-yl)-6-(3-methylmorpholino)-1,3,5- triazin-2-yl)piperazin-1-yl)-2-oxoethoxy)methyl)piperidin-1-yl)prop-2-en-1-one (compound 9) 提交 2023-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 RNX 1-(4-{[2-(4-{(4P)-4-[2-amino-4-(difluoromethyl)pyrimidin-5-yl]-6-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-1,3,5-triazin-2-yl}piperazin-1-yl)-2-oxoethoxy]methyl}piperidin-1-yl)prop-2-en-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG6000 10-15%, 0.6 M sodium formate, 0.1 M CHES pH 9.5-10.5, 5 mM TCEP
分辨率 2.67 Å R-free 0.261
8V8H PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 4). 提交 2023-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium acetate, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5, 4% w/v PEG 4000.
分辨率 3.58 Å R-free 0.272
8V8H PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 4). 提交 2023-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium acetate, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5, 4% w/v PEG 4000.
分辨率 3.58 Å R-free 0.272
8V8I PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket (compound 5). 提交 2023-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M Sodium Malonate pH 5.0, 10% w/v PEG 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8V8I PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket (compound 5). 提交 2023-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
未记录 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M Sodium Malonate pH 5.0, 10% w/v PEG 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8V8J PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitors in two cryptic pockets (compounds 4 and 5). 提交 2023-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；0.4M Sodium Formate, 0.1 M Sodium Citrate, pH 5.2
分辨率 3.35 Å R-free 0.251
8V8J PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitors in two cryptic pockets (compounds 4 and 5). 提交 2023-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
未记录 YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；0.4M Sodium Formate, 0.1 M Sodium Citrate, pH 5.2
分辨率 3.35 Å R-free 0.251
8V8U PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 12). 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 YQB (3S)-9-[(1R)-1-(2-carboxyanilino)ethyl]-3-cyano-7-methyl-4-oxo-2-(piperidin-1-yl)-3,4-dihydropyrido[1,2-a]pyrimidin-5-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3-0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.93 Å R-free 0.255
8V8U PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 12). 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 YQB (3S)-9-[(1R)-1-(2-carboxyanilino)ethyl]-3-cyano-7-methyl-4-oxo-2-(piperidin-1-yl)-3,4-dihydropyrido[1,2-a]pyrimidin-5-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3-0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.93 Å R-free 0.255
8V8V PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 7). 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R YQ2 2-[[(1~{R})-1-(7-methyl-4-oxidanylidene-2-piperidin-1-yl-3~{H}-pyrido[1,2-a]pyrimidin-9-yl)ethyl]amino]benzoic acid × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.61 Å R-free 0.288
8V8V PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 7). 提交 2023-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R YQ2 2-[[(1~{R})-1-(7-methyl-4-oxidanylidene-2-piperidin-1-yl-3~{H}-pyrido[1,2-a]pyrimidin-9-yl)ethyl]amino]benzoic acid × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.61 Å R-free 0.288
8VCL Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2023-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L FMT FORMIC ACID × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；12% w/v Polyethylene glycol 3,350, 4% v/v TacsimateTM, pH 6.0
分辨率 2.40 Å R-free 0.230
8W9A CryoEM structure of human PI3K-alpha (P85/P110-H1047R) with QR-7909 binding at an allosteric site 提交 2023-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 UEX 6-chloranyl-3-[[(1R)-1-[2-(1,3-dihydropyrrolo[3,4-c]pyridin-2-yl)-3,6-dimethyl-4-oxidanylidene-quinazolin-8-yl]ethyl]amino]pyridine-2-carboxylic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8W9B CryoEM structure of human PI3K-alpha (P85/P110-H1047R) with QR-8557 binding at an allosteric site 提交 2023-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 UJ3 1-[(1S)-1-(5-fluoranyl-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2-methyl-propyl]-3-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-5-yl)urea × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9ASF Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a wild-type PIK3CA peptide analogue (Trp-6 Bta) 提交 2024-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa） 片段：residues 1046-1054 (Uniprot numbering)
突变：W6Bta 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；15% w/v Polyethylene glycol 6,000, 50 mM Potassium chloride; 10 mM Magnesium chloride
分辨率 1.77 Å R-free 0.237
9ASG Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide analogue (Trp-6 Bta) 提交 2024-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa） 片段：residues 1046-1054 (Uniprot numbering)
突变：H2L, W6Bta 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；15% w/v Polyethylene glycol 3,350, 150mM Cesium chloride
分辨率 2.03 Å R-free 0.238
9B4S Crystal structure of the RRAS2-p110alpha complex 提交 2024-03-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 105–1068（964 aa）
突变：W1057A, I1058A, F1059A 5H5 (2S)-2-({2-[1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}oxy)propanamide × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M (Bicine/Tris), 0.06 M Divalent mix, 30% (40%v/v PEG MME 500, 20%w/v PEG 20000)
分辨率 3.10 Å R-free 0.272
9B4T Crystal structure of the MRAS-p110alpha complex 提交 2024-03-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 105–1068（964 aa）
突变：W1057A, I1058A, F1059A 5H5 (2S)-2-({2-[1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}oxy)propanamide × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M (Tris/Bicine) 1.2%w/v cholic acid mix, 50%v/v (40%v/v ethylene glycol, 20%w/v PEG 8000)
分辨率 2.75 Å R-free 0.262
9B4U Crystal structure of p110alpha-RBD covalently bound to a breaker compound BBO-10203 via Cys242 提交 2024-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
链 B 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
未记录 A1AIR 1-[(4R,8R)-2-[(4M,7P)-7-[2,4-difluoro-6-(2-methoxyethoxy)phenyl]-4-(1-methyl-1H-indazol-5-yl)thieno[3,2-c]pyridin-6-yl]-4-methyl-6,7-dihydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-5(4H)-yl]propan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；277 K；0.1 M Tris, 0.2 M CaCl2, 24 % PEG 6000
分辨率 2.21 Å R-free 0.269
9CMK Crystal structure of p110alpha-RAS binding domain (RBD) in complex with molecular glue D927 提交 2024-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 160–300（141 aa）
未记录 A1ATF 2-[3-fluoro-4-({(7P)-7-[2-(2-methoxyethoxy)phenyl]thieno[2,3-d]pyridazin-4-yl}amino)phenyl]acetamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；277 K；0.1 M (MES/Imidazole), 0.06 M Divalent mix, 40 %v/v (MPD, PEG 1000, PEG 3350)
分辨率 1.75 Å R-free 0.221
9CMK Crystal structure of p110alpha-RAS binding domain (RBD) in complex with molecular glue D927 提交 2024-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 160–300（141 aa）
未记录 A1ATF 2-[3-fluoro-4-({(7P)-7-[2-(2-methoxyethoxy)phenyl]thieno[2,3-d]pyridazin-4-yl}amino)phenyl]acetamide × 1 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；277 K；0.1 M (MES/Imidazole), 0.06 M Divalent mix, 40 %v/v (MPD, PEG 1000, PEG 3350)
分辨率 1.75 Å R-free 0.221
9CML Crystal structure of p110alpha-RAS binding domain (RBD) in complex with molecular glue D223 提交 2024-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 160–300（141 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M (TRIS/Bicine), 0.1 M amino acid mix, 50 %v/v (MPD, PEG 1000, PEG 3350)
分辨率 2.01 Å R-free 0.278
9CML Crystal structure of p110alpha-RAS binding domain (RBD) in complex with molecular glue D223 提交 2024-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 160–300（141 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M (TRIS/Bicine), 0.1 M amino acid mix, 50 %v/v (MPD, PEG 1000, PEG 3350)
分辨率 2.01 Å R-free 0.278
9CMV Crystal structure of the KRAS-p110alpha complex in the presence of molecular glue D223 提交 2024-07-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 105–1068（964 aa）
突变：W1057A/I1058A/F1059A A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Tris, 0.1 M NaCl, 10 % PEG 20K
分辨率 3.01 Å R-free 0.268
9CWY Crystal structure of HLA-A*03:02 in complex with a wild-type PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 FMT FORMIC ACID × 7 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277.15 K；12% w/v polyethylene glycol 3,350, 4% v/v Tacsimate (Hampton Research)
分辨率 1.98 Å R-free 0.224
9CWZ Crystal structure of HLA-A*03:02 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L GOL GLYCEROL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；277.15 K；20% w/v polyethylene glycol 3,350, 200 mM lithium nitrate
分辨率 2.05 Å R-free 0.238
9CX0 Crystal structure of HLA-A*03:01 E152V mutant in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；12% w/v polyethylene glycol 3,350, 100 mM sodium malonate
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
9CX1 Crystal structure of HLA-A*03:01 L156Q mutant in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；20% w/v polyethylene glycol 3,350, 200 mM sodium malonate
分辨率 2.00 Å R-free 0.221
9CX2 Crystal structure of HLA-A*03:01 L156Q mutant in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；10% w/v polyethylene glycol 20,000, 100 mM MES
分辨率 2.30 Å R-free 0.219
9E8M Covalent inhibitor VVD-442 bound to the RAS binding domain (RBD) of PI3Ka 提交 2024-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
未记录 A1BF9 1-[(1P)-5-bromo-2'-chloro[1,1'-biphenyl]-2-sulfonyl]-4-fluoro-N-[(2S)-4-(methanesulfonyl)butan-2-yl]piperidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；4.8 M ammonium acetate, 0.1 M MES pH 5.5
分辨率 2.83 Å R-free 0.268
9E8M Covalent inhibitor VVD-442 bound to the RAS binding domain (RBD) of PI3Ka 提交 2024-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
未记录 A1BF9 1-[(1P)-5-bromo-2'-chloro[1,1'-biphenyl]-2-sulfonyl]-4-fluoro-N-[(2S)-4-(methanesulfonyl)butan-2-yl]piperidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；4.8 M ammonium acetate, 0.1 M MES pH 5.5
分辨率 2.83 Å R-free 0.268
9LWQ Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 QIH 1-[7-[[2-[[4-(4-ethylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]pyridin-4-yl]amino]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
9LWR Cryo-EM structure of PI3Kalpha H1047R in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9LWS Cryo-EM structure of PI3Kalpha H1047R in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
9NI3 Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 1 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9NI4 Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex dimer on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1068（1068 aa）
链 B 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.61 Å
9NI5 Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
9NI6 Cryo-EM structure of the Class 1 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
9NI7 Cryo-EM structure of the Class 3 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9NI8 Cryo-EM structure of the Class 2 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9NID Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex dimer on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs low-pass filtered to 5 angstroms 提交 2025-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1068（1068 aa）
链 B 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9NIE Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs low-pass filtered to 5 angstroms 提交 2025-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9NIF Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs low-pass filtered to 5 angstroms 提交 2025-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 1 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9NLC Cryo-EM structure of the Class 1 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs low-pass filtered to 10 angstroms 提交 2025-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å

共 134 个其他 PDB 条目、145 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PK3CA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–965； UniProt 105–1068

GTPase KRas

Homo sapiens

UniProt P01116

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–169 未记录 Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform × 1 （P42336） A1ATF 2-[3-fluoro-4-({(7P)-7-[2-(2-methoxyethoxy)phenyl]thieno[2,3-d]pyridazin-4-yl}amino)phenyl]acetamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Tris, 0.1 M NaCl, 15% PEG 20K 分辨率 2.81 Å R-free 0.234

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9C15 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
10JT CRYSTAL STRUCTURE OF KIRSTEN RAT SARCOMA G12C COMPLEXED WITH GMPPNP AND COVALENTLY BOUND TO 1-[(2R,3R)-3-{[(7P)-7-(8-ethynyl-7-fluoronaphthalen-1-yl)-8-fluoro-2-{ [(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d] pyrimidin-4-yl](methyl)amino}-2-methylpyrrolidin-1-yl]-3-(pyrazin-2-yl)propan-1-one 提交 2026-01-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1C5K 1-[(2R,3R)-3-{[(7P)-7-(8-ethynyl-7-fluoronaphthalen-1-yl)-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl](methyl)amino}-2-methylpyrrolidin-1-yl]-3-(pyrazin-2-yl)propan-1-one × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；100 MM HEPES, pH 7.5, 30% (w/v) PEG 4000, 200 MM calcium chloride dihyrate
分辨率 1.49 Å R-free 0.227
10JT CRYSTAL STRUCTURE OF KIRSTEN RAT SARCOMA G12C COMPLEXED WITH GMPPNP AND COVALENTLY BOUND TO 1-[(2R,3R)-3-{[(7P)-7-(8-ethynyl-7-fluoronaphthalen-1-yl)-8-fluoro-2-{ [(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d] pyrimidin-4-yl](methyl)amino}-2-methylpyrrolidin-1-yl]-3-(pyrazin-2-yl)propan-1-one 提交 2026-01-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1C5K 1-[(2R,3R)-3-{[(7P)-7-(8-ethynyl-7-fluoronaphthalen-1-yl)-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl](methyl)amino}-2-methylpyrrolidin-1-yl]-3-(pyrazin-2-yl)propan-1-one × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；100 MM HEPES, pH 7.5, 30% (w/v) PEG 4000, 200 MM calcium chloride dihyrate
分辨率 1.49 Å R-free 0.227
10NU Structure of kRas G12C bound to Inhibitor 13ab 提交 2026-01-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C; C51S; C80L; C118S CA CALCIUM ION × 2 A1C6Y 1-((2R,5S)-4-((S)-6-chloro-7-(1,6-dimethyl-1H-indazol-7-yl)-8-fluoro-2-(((S)-1-methylpyrrolidin-2-yl)methoxy)quinazolin-4-yl)-2,5-dimethylpiperazin-1-yl)prop-2-en-1-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；25-29% PEG4000, 0.2 M CaCl2, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.50 Å R-free 0.269
10NU Structure of kRas G12C bound to Inhibitor 13ab 提交 2026-01-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C; C51S; C80L; C118S CA CALCIUM ION × 2 A1C6Y 1-((2R,5S)-4-((S)-6-chloro-7-(1,6-dimethyl-1H-indazol-7-yl)-8-fluoro-2-(((S)-1-methylpyrrolidin-2-yl)methoxy)quinazolin-4-yl)-2,5-dimethylpiperazin-1-yl)prop-2-en-1-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；25-29% PEG4000, 0.2 M CaCl2, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.50 Å R-free 0.269
10NV Structure of kRas G12C Bound to Inhibitor 13ba 提交 2026-01-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C; C51S; C80L; C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1C60 4-((2S,5R)-4-Acryloyl-2,5-dimethylpiperazin-1-yl)-7-(1,6-dimethyl-1H-indazol-7-yl)-8-fluoro-2-(((S)-1-methylpyrrolidin-2-yl)methoxy)quinazoline-6-carbonitrile × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；25-29% PEG4000, 0.2 M CaCl2, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.52 Å R-free 0.203
10NV Structure of kRas G12C Bound to Inhibitor 13ba 提交 2026-01-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C; C51S; C80L; C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1C60 4-((2S,5R)-4-Acryloyl-2,5-dimethylpiperazin-1-yl)-7-(1,6-dimethyl-1H-indazol-7-yl)-8-fluoro-2-(((S)-1-methylpyrrolidin-2-yl)methoxy)quinazoline-6-carbonitrile × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；25-29% PEG4000, 0.2 M CaCl2, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.52 Å R-free 0.203
11QE Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/I55E: Suppressing G12D oncogenicity via second-site I55E mutation 提交 2026-03-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, I55E GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.2 M (NH4)2SO4; 0.2 K Acetate
分辨率 1.23 Å R-free 0.203
1D8D CO-CRYSTAL STRUCTURE OF RAT PROTEIN FARNESYLTRANSFERASE COMPLEXED WITH A K-RAS4B PEPTIDE SUBSTRATE AND FPP ANALOG AT 2.0A RESOLUTION 提交 1999-10-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 178–188（11 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ACT ACETATE ION × 4 FII [(3,7,11-TRIMETHYL-DODECA-2,6,10-TRIENYLOXYCARBAMOYL)-METHYL]-PHOSPHONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；290 K；Peg 8000, ammonium acetate, DTT, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.00 Å R-free 0.200
1D8E Zinc-depleted FTase complexed with K-RAS4B peptide substrate and FPP analog. 提交 1999-10-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 178–188（11 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 FII [(3,7,11-TRIMETHYL-DODECA-2,6,10-TRIENYLOXYCARBAMOYL)-METHYL]-PHOSPHONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；290 K；Peg 8000, ammonium acetate, DTT , pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 3.00 Å R-free 0.249
24HR Human KRAS G12D (GDP-bound) in complex with macrocyclic peptide inhibitor AP6252 提交 2026-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 FMT FORMIC ACID × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；4.0M Sodium formate
分辨率 2.07 Å R-free 0.270
24HR Human KRAS G12D (GDP-bound) in complex with macrocyclic peptide inhibitor AP6252 提交 2026-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 FMT FORMIC ACID × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；4.0M Sodium formate
分辨率 2.07 Å R-free 0.270
24HR Human KRAS G12D (GDP-bound) in complex with macrocyclic peptide inhibitor AP6252 提交 2026-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FMT FORMIC ACID × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；4.0M Sodium formate
分辨率 2.07 Å R-free 0.270
24HR Human KRAS G12D (GDP-bound) in complex with macrocyclic peptide inhibitor AP6252 提交 2026-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；4.0M Sodium formate
分辨率 2.07 Å R-free 0.270
24HS Human KRAS G12D (GDP-bound) in complex with macrocyclic peptide inhibitor AP4959 提交 2026-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；60.0% v/v Tacsimate
分辨率 2.53 Å R-free 0.290
24HS Human KRAS G12D (GDP-bound) in complex with macrocyclic peptide inhibitor AP4959 提交 2026-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；60.0% v/v Tacsimate
分辨率 2.53 Å R-free 0.290
24HS Human KRAS G12D (GDP-bound) in complex with macrocyclic peptide inhibitor AP4959 提交 2026-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；60.0% v/v Tacsimate
分辨率 2.53 Å R-free 0.290
24HS Human KRAS G12D (GDP-bound) in complex with macrocyclic peptide inhibitor AP4959 提交 2026-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；60.0% v/v Tacsimate
分辨率 2.53 Å R-free 0.290
24HS Human KRAS G12D (GDP-bound) in complex with macrocyclic peptide inhibitor AP4959 提交 2026-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；60.0% v/v Tacsimate
分辨率 2.53 Å R-free 0.290
24HS Human KRAS G12D (GDP-bound) in complex with macrocyclic peptide inhibitor AP4959 提交 2026-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；60.0% v/v Tacsimate
分辨率 2.53 Å R-free 0.290
24HS Human KRAS G12D (GDP-bound) in complex with macrocyclic peptide inhibitor AP4959 提交 2026-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；60.0% v/v Tacsimate
分辨率 2.53 Å R-free 0.290
24HS Human KRAS G12D (GDP-bound) in complex with macrocyclic peptide inhibitor AP4959 提交 2026-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；60.0% v/v Tacsimate
分辨率 2.53 Å R-free 0.290
24HT Human KRAS G12D (GDP-bound) in complex with macrocyclic peptide inhibitor AP2527 提交 2026-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 ACY ACETIC ACID × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.1M Sodium acetate trihydrate (pH 4.6), 8.0 %w/v Polyethylene glycol 4000
分辨率 1.70 Å R-free 0.239
2MSC NMR data-driven model of GTPase KRas-GDP tethered to a lipid-bilayer nanodisc 提交 2014-07-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–185（185 aa） 片段：UNP residues 1-185
未记录 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.105；压力 ambient
NMR样品组成 20 mM TRIS-1, 100 mM sodium chloride-2, 2 mM TCEP-3, 5 mM MgCl2-4, 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C K-Ras-5, 0.6 mM membrane scaffold protein-6, 0.6 mM GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE-7, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-8, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-9, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 20 mM TRIS-11, 100 mM sodium chloride-12, 2 mM TCEP-13, 5 mM Magnesium-14, 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C K-Ras-15, 0.6 mM membrane scaffold protein-16, 0.6 mM GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE-17, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-18, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-19, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-20, 0.65 mM 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-diethylenetriaminepentaacetic acid (gadolinium salt)-21, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2MSD NMR data-driven model of GTPase KRas-GNP tethered to a lipid-bilayer nanodisc 提交 2014-07-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–185（185 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-185
未记录 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.105；压力 ambient
NMR样品组成 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C K-Ras-1, 0.6 mM membrane scaffold protein-2, 20 mM TRIS-3, 100 mM sodium chloride-4, 2 mM TCEP-5, 0.6 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-6, 5 mM Magnesium-7, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-8, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-9, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C K-Ras-11, 0.6 mM membrane scaffold protein-12, 20 mM TRIS-13, 100 mM sodium chloride-14, 5 mM Magnesium-15, 0.6 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-16, 2 mM TCEP-17, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-18, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-19, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-20, 0.65 mM 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-diethylenetriaminepentaacetic acid (gadolinium salt)-21, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2MSE NMR data-driven model of GTPase KRas-GNP:ARafRBD complex tethered to a lipid-bilayer nanodisc 提交 2014-07-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–185（185 aa） 片段：UNP residues 1-185
未记录 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.105；压力 ambient
NMR样品组成 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C K-Ras-1, 0.6 mM membrane scaffold protein-2, 0.7 mM A-RafRBD-3, 100 mM sodium chloride-4, 5 mM Magnesium-5, 20 mM TRIS-6, 2 mM TCEP-7, 0.6 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-8, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-9, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-10, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-11, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.7 mM K-Ras-12, 0.7 mM membrane scaffold protein-13, 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C A-RafRBD-14, 5 mM Magnesium-15, 20 mM TRIS-16, 100 mM sodium chloride-17, 2 mM TCEP-18, 0.7 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-19, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-20, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-21, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-22, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C K-Ras-23, 0.7 mM A-RafRBD-24, 0.6 mM membrane scaffold protein-25, 20 mM TRIS-26, 100 mM sodium chloride-27, 5 mM Magnesium-28, 2 mM TCEP-29, 0.6 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-30, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-31, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-32, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-33, 0.65 mM 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-diethylenetriaminepentaacetic acid (gadolinium salt)-34, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.7 mM K-Ras-35, 0.6 mM U-15N, Ile C-delta-13C A-RafRBD-36, 0.7 mM membrane scaffold protein-37, 20 mM TRIS-38, 100 mM sodium chloride-39, 5 mM Magnesium-40, 2 mM TCEP-41, 0.7 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-42, 18.75 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine-43, 5 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine-44, 1.25 mM 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[4-(p-maleimidomethyl)cyclohexane-carboxamide]-45, 0.65 mM 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-diethylenetriaminepentaacetic acid (gadolinium salt)-46, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3GFT Human K-Ras (Q61H) in complex with a GTP analogue 提交 2009-02-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：Isoform 2, residues 1-169
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2M Lithium citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 2.27 Å R-free 0.267
3GFT Human K-Ras (Q61H) in complex with a GTP analogue 提交 2009-02-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：Isoform 2, residues 1-169
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2M Lithium citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 2.27 Å R-free 0.267
3GFT Human K-Ras (Q61H) in complex with a GTP analogue 提交 2009-02-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa） 片段：Isoform 2, residues 1-169
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2M Lithium citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 2.27 Å R-free 0.267
3GFT Human K-Ras (Q61H) in complex with a GTP analogue 提交 2009-02-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa） 片段：Isoform 2, residues 1-169
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2M Lithium citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 2.27 Å R-free 0.267
3GFT Human K-Ras (Q61H) in complex with a GTP analogue 提交 2009-02-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–169（169 aa） 片段：Isoform 2, residues 1-169
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2M Lithium citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 2.27 Å R-free 0.267
3GFT Human K-Ras (Q61H) in complex with a GTP analogue 提交 2009-02-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–169（169 aa） 片段：Isoform 2, residues 1-169
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2M Lithium citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 2.27 Å R-free 0.267
4DSN Small-molecule ligands bind to a distinct pocket in Ras and inhibit SOS-mediated nucleotide exchange activity 提交 2012-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–188（187 aa）
突变：G12D GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2 uL + 0.2 uL drops containing 40 mg/mL KRas, 0.1 M TrisCl, 25% polyethylene glycol 4000, 0.2 M NaOAc, 2% benzamidine-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.03 Å R-free 0.206
4DSO Small-molecule ligands bind to a distinct pocket in Ras and inhibit SOS-mediated nucleotide exchange activity 提交 2012-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–188（187 aa）
突变：G12D GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEN BENZAMIDINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2 uL + 0.2 uL drops containing 40 mg/mL KRas, 0.1 M TrisCl, 25% polyethylene glycol 4000, 0.2 M NaOAc, 2% benzamidine-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.207
4DST Small-molecule ligands bind to a distinct pocket in Ras and inhibit SOS-mediated nucleotide exchange activity 提交 2012-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–188（187 aa）
突变：G12D 9LI 2-(4,6-dichloro-2-methyl-1H-indol-3-yl)ethanamine × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2 uL + 0.2 uL drops containing 40 mg/mL KRas, 0.1 M TrisCl, 25% polyethylene glycol 4000, 0.2 M NaOAc, 2% benzamidine-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.209
4DSU Small-molecule ligands bind to a distinct pocket in Ras and inhibit SOS-mediated nucleotide exchange activity 提交 2012-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–188（187 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BZI BENZIMIDAZOLE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2 uL + 0.2 uL drops containing 40 mg/mL KRas, 0.1 M TrisCl, 25% polyethylene glycol 4000, 0.2 M NaOAc, 2% benzamidine-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
4EPR Discovery of Small Molecules that Bind to K-Ras and Inhibit Sos-Mediated Activation. 提交 2012-04-17 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；291 K；30% PEG4000, 0.1 M sodium phosphate, 0.2 M Li2SO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
4EPT Discovery of Small Molecules that Bind to K-Ras and Inhibit Sos-mediated Activation 提交 2012-04-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：Catalytic
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 0QW (2-hydroxyphenyl)(pyrrolidin-1-yl)methanethione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；30% PEG8000, 0.1 M MES, 0.2 M sodium acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.274
4EPV Discovery of Small Molecules that Bind to K-Ras and Inhibit Sos-mediated Activation 提交 2012-04-17 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 0QX 2-(1H-indol-3-ylmethyl)-1H-imidazo[4,5-c]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；291 K；25% PEG1500, 0.1 M MMT, pH 4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.35 Å R-free 0.194
4EPW Discovery of Small Molecules that Bind to K-Ras and Inhibit Sos-mediated Activation 提交 2012-04-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：Catalytic
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 0QV (4-hydroxypiperidin-1-yl)(1H-indol-3-yl)methanethione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；32% PEG1500, 0.7% 1-Butanol, pH 6.1-8.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.70 Å R-free 0.240
4EPX Discovery of Small Molecules that Bind to K-Ras and Inhibit Sos-mediated Activation 提交 2012-04-17 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 0QR N-(6-aminopyridin-2-yl)-4-fluorobenzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；291 K；28% PEG8000, 0.1 M sodium acetate, 5% DMSO, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.76 Å R-free 0.201
4EPY Discovery of Small Molecules that Bind to K-Ras and Inhibit Sos-mediated Activation 提交 2012-04-17 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 0QY N-[2-(1H-indol-3-ylmethyl)-1H-benzimidazol-5-yl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；291 K；28% PEG4000, 0.1 M MMT, 0.2 M ammonium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.199
4L8G Crystal Structure of K-Ras G12C, GDP-bound 提交 2013-06-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；21% PEG3350, 0.2M CaCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.52 Å R-free 0.180
4LDJ Crystal Structure of a GDP-bound G12C Oncogenic Mutant of Human GTPase KRas 提交 2013-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M Sodium Acetate pH4.5, 0.1M Tris pH 8.5, 28% PEG 3350, Vapor Diffusion, Hanging Drop, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.15 Å R-free 0.162
4LPK Crystal Structure of K-Ras WT, GDP-bound 提交 2013-07-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；19% PEG3350, 0.2M CaCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.192
4LPK Crystal Structure of K-Ras WT, GDP-bound 提交 2013-07-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；19% PEG3350, 0.2M CaCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.192
4LRW Crystal Structure of K-Ras G12C (cysteine-light), GDP-bound 提交 2013-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；30% PEG4000, 0.2M MgSO4, 0.1M TRIS, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.15 Å R-free 0.204
4LRW Crystal Structure of K-Ras G12C (cysteine-light), GDP-bound 提交 2013-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；30% PEG4000, 0.2M MgSO4, 0.1M TRIS, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.15 Å R-free 0.204
4LRW Crystal Structure of K-Ras G12C (cysteine-light), GDP-bound 提交 2013-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；30% PEG4000, 0.2M MgSO4, 0.1M TRIS, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.15 Å R-free 0.204
4LUC Crystal Structure of small molecule disulfide 6 bound to K-Ras G12C 提交 2013-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 CA CALCIUM ION × 4 20G N-{1-[(2,4-dichlorophenoxy)acetyl]piperidin-4-yl}-4-sulfanylbutanamide × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG8000, 0.1M CaCl2, 0.1M TRIS, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.29 Å R-free 0.169
4LV6 Crystal Structure of small molecule disulfide 4 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 CA CALCIUM ION × 4 20H 1-[(2,4-dichlorophenoxy)acetyl]-N-(2-sulfanylethyl)piperidine-4-carboxamide × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；22% PEG8000, 0.1M CaCl2, 0.1M TRIS, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.187
4LV6 Crystal Structure of small molecule disulfide 4 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-07-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 CA CALCIUM ION × 2 20H 1-[(2,4-dichlorophenoxy)acetyl]-N-(2-sulfanylethyl)piperidine-4-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；22% PEG8000, 0.1M CaCl2, 0.1M TRIS, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.187
4LV6 Crystal Structure of small molecule disulfide 4 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-07-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 CA CALCIUM ION × 2 20H 1-[(2,4-dichlorophenoxy)acetyl]-N-(2-sulfanylethyl)piperidine-4-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；22% PEG8000, 0.1M CaCl2, 0.1M TRIS, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.187
4LYF Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 8 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-07-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
链 C 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 21C N-{1-[N-(4,5-dichloro-2-hydroxyphenyl)glycyl]piperidin-4-yl}ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；31% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.57 Å R-free 0.192
4LYH Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 9 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-07-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
链 C 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 21F N-{1-[N-(4-chloro-5-iodo-2-methoxyphenyl)glycyl]piperidin-4-yl}ethanesulfonamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.9M (NH4)2SO4, 0.2M NaCl, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.37 Å R-free 0.188
4LYH Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 9 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-07-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.9M (NH4)2SO4, 0.2M NaCl, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.37 Å R-free 0.188
4LYH Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 9 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-07-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 21F N-{1-[N-(4-chloro-5-iodo-2-methoxyphenyl)glycyl]piperidin-4-yl}ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.9M (NH4)2SO4, 0.2M NaCl, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.37 Å R-free 0.188
4LYH Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 9 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-07-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 21F N-{1-[N-(4-chloro-5-iodo-2-methoxyphenyl)glycyl]piperidin-4-yl}ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.9M (NH4)2SO4, 0.2M NaCl, 0.1M Na-cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.37 Å R-free 0.188
4LYJ Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 9 covalently bound to K-Ras G12C, alternative space group 提交 2013-07-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 21F N-{1-[N-(4-chloro-5-iodo-2-methoxyphenyl)glycyl]piperidin-4-yl}ethanesulfonamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；30% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.93 Å R-free 0.207
4M1O Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 7 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；31% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.57 Å R-free 0.202
4M1O Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 7 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 21J N-(1-{[(5,7-dichloro-2,2-dimethyl-1,3-benzodioxol-4-yl)oxy]acetyl}piperidin-4-yl)ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；31% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.57 Å R-free 0.202
4M1O Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 7 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；31% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.57 Å R-free 0.202
4M1S Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 13 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；32% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.55 Å R-free 0.197
4M1S Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 13 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 21K N-{1-[N-(2,4-dichlorophenyl)glycyl]piperidin-4-yl}ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；32% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.55 Å R-free 0.197
4M1S Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 13 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；32% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.55 Å R-free 0.197
4M1T Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 14 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；30% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.202
4M1T Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 14 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 21M N-{1-[(2,4-dichlorophenoxy)acetyl]piperidin-4-yl}ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；30% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.202
4M1T Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 14 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；30% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.202
4M1W Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 21R N-{1-[N-(4,5-dichloro-2-ethylphenyl)glycyl]piperidin-4-yl}ethanesulfonamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；31% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.58 Å R-free 0.190
4M1W Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 21R N-{1-[N-(4,5-dichloro-2-ethylphenyl)glycyl]piperidin-4-yl}ethanesulfonamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；31% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.58 Å R-free 0.190
4M1W Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 21R N-{1-[N-(4,5-dichloro-2-ethylphenyl)glycyl]piperidin-4-yl}ethanesulfonamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；31% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.58 Å R-free 0.190
4M1Y Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 15 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；31% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.49 Å R-free 0.191
4M1Y Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 15 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 21S N-{1-[N-(5,7-dichloro-2,1,3-benzothiadiazol-4-yl)glycyl]piperidin-4-yl}ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；31% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.49 Å R-free 0.191
4M1Y Crystal Structure of small molecule vinylsulfonamide 15 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；31% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.49 Å R-free 0.191
4M21 Crystal Structure of small molecule acrylamide 11 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；29% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.94 Å R-free 0.226
4M21 Crystal Structure of small molecule acrylamide 11 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 21Y 1-(4-{[(4,5-dichloro-2-methoxyphenyl)amino]acetyl}piperazin-1-yl)propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；29% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.94 Å R-free 0.226
4M21 Crystal Structure of small molecule acrylamide 11 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；29% PEG4000, 0.2M NH4CH3COO, 0.1M Na-citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.94 Å R-free 0.226
4M22 Crystal Structure of small molecule acrylamide 16 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；31% PEG3000, 0.2M NaCl, 0.1M TRIS, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.09 Å R-free 0.216
4M22 Crystal Structure of small molecule acrylamide 16 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 22C 1-{4-[(2,4-dichlorophenoxy)acetyl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；31% PEG3000, 0.2M NaCl, 0.1M TRIS, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.09 Å R-free 0.216
4M22 Crystal Structure of small molecule acrylamide 16 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2013-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 22C 1-{4-[(2,4-dichlorophenoxy)acetyl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；31% PEG3000, 0.2M NaCl, 0.1M TRIS, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.09 Å R-free 0.216
4NMM Crystal Structure of a G12C Oncogenic Variant of Human KRas Bound to a Novel GDP Competitive Covalent Inhibitor 提交 2013-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
突变：G12C MG MAGNESIUM ION × 1 Y9Z 5'-O-[(S)-{[(S)-[2-(acetylamino)ethoxy](hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]guanosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4；277 K；0.2M MMT pH4.0, 28% PEG 6,000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.89 Å R-free 0.237
4OBE Crystal Structure of GDP-bound Human KRas 提交 2014-01-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M Sodium Acetate pH4.5, 0.1M Tris pH 8.5, 26% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.24 Å R-free 0.169
4OBE Crystal Structure of GDP-bound Human KRas 提交 2014-01-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M Sodium Acetate pH4.5, 0.1M Tris pH 8.5, 26% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.24 Å R-free 0.169
4PZY Second-site screening of K-Ras in the presence of covalently attached first-site ligands 提交 2014-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12V, Q70C, C118S 突变：G12V, Q70C, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 2XR 2-chloro-1-(1H-indol-3-yl)ethanone × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；30% PEG MME 2000, 0.1M KSCN, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.88 Å R-free 0.238
4PZY Second-site screening of K-Ras in the presence of covalently attached first-site ligands 提交 2014-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V, Q70C, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；30% PEG MME 2000, 0.1M KSCN, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.88 Å R-free 0.238
4PZY Second-site screening of K-Ras in the presence of covalently attached first-site ligands 提交 2014-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12V, Q70C, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 2XR 2-chloro-1-(1H-indol-3-yl)ethanone × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；30% PEG MME 2000, 0.1M KSCN, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.88 Å R-free 0.238
4PZZ Second-site screening of K-Ras in the presence of covalently attached first-site ligands 提交 2014-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V, S39C, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 2XO 1H-benzimidazol-2-ylmethanethiol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；24% PEG 4000, 0.1 M MMT pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.156
4Q01 Second-site screening of K-Ras in the presence of covalently attached first-site ligands 提交 2014-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V, S39C, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 2XH naphthalene-1-thiol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；22% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.29 Å R-free 0.213
4Q01 Second-site screening of K-Ras in the presence of covalently attached first-site ligands 提交 2014-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12V, S39C, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 2XH naphthalene-1-thiol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；22% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.29 Å R-free 0.213
4Q02 Second-site screening of K-Ras in the presence of covalently attached first-site ligands 提交 2014-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V, S39C, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 2XG 3,4-difluorobenzenethiol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；28% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.196
4Q03 Second-site screening of K-Ras in the presence of covalently attached first-site ligands 提交 2014-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V, S39C, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 2XE 4-bromobenzenethiol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；24% PEG 4000, 0.1 M MMT, pH4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.20 Å R-free 0.188
4QL3 Crystal Structure of a GDP-bound G12R Oncogenic Mutant of Human GTPase KRas 提交 2014-06-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12R GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M Sodium Acetate pH4.5, 0.1M Tris pH 8.5, 28% PEG 3,350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.04 Å R-free 0.162
4TQ9 Crystal Structure of a GDP-bound G12V Oncogenic Mutant of Human GTPase KRas 提交 2014-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–168（168 aa） 片段：UNP residues 1-168
突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M Sodium Acetate pH4.5, 0.1M Tris pH 8.5, 24% PEG 3,350
分辨率 1.49 Å R-free 0.194
4TQ9 Crystal Structure of a GDP-bound G12V Oncogenic Mutant of Human GTPase KRas 提交 2014-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–168（168 aa） 片段：UNP residues 1-168
突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M Sodium Acetate pH4.5, 0.1M Tris pH 8.5, 24% PEG 3,350
分辨率 1.49 Å R-free 0.194
4TQA Crystal Structure of a GDP-bound G13D Oncogenic Mutant of Human GTPase KRas 提交 2014-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–168（168 aa） 片段：UNP residues 1-168
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M Sodium Acetate pH4.5, 0.1M Tris pH 8.5, 26% PEG 3,350
分辨率 1.13 Å R-free 0.169
4TQA Crystal Structure of a GDP-bound G13D Oncogenic Mutant of Human GTPase KRas 提交 2014-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–168（168 aa） 片段：UNP residues 1-168
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M Sodium Acetate pH4.5, 0.1M Tris pH 8.5, 26% PEG 3,350
分辨率 1.13 Å R-free 0.169
4WA7 Crystal Structure of a GDP-bound Q61L Oncogenic Mutant of Human GT- Pase KRas 提交 2014-08-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：Q61L GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1M MMT pH 4.0, 24% PEG6000
分辨率 1.99 Å R-free 0.233
5F2E Crystal Structure of small molecule ARS-853 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2015-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：GTPase domain
突变：G12C, C51S, C80L, C118S, R151G, E153D, Q165K, Y166H, R167K, L168E MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 5UT 1-[3-[4-[2-[[4-chloranyl-5-(1-methylcyclopropyl)-2-oxidanyl-phenyl]amino]ethanoyl]piperazin-1-yl]azetidin-1-yl]prop-2-en-1-one × 1 GLY GLYCINE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；293 K；2.2 M 3:2 NaH2PO4/K2HPO4, 0.2 M Li2SO4, 0.1 M glycine pH=10.5
分辨率 1.40 Å R-free 0.176
5KYK Covalent GTP-competitive inhibitors of KRAS G12C: Guanosine bisphosphonate Analogs 提交 2016-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–168（168 aa） 片段：UNP residues 1-168
未记录 6ZD 5'-O-[(R)-[({2-[(chloroacetyl)amino]ethyl}sulfamoyl)methyl](hydroxy)phosphoryl]guanosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；Protein was purified in buffer: 20 mM Hepes pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM MgCl2 and 0.5 mM DTT. Crystals grew in five days at room temperature from hanging vapor diffusion drops with following condition: 0.1 M Citric acid pH 4.0, 20% PEG 3350. Crystals were cryoprotected in mother liquid with 40% PEG 3350 and flash frozen in liquid nitrogen.
分辨率 2.70 Å R-free 0.314
5KYK Covalent GTP-competitive inhibitors of KRAS G12C: Guanosine bisphosphonate Analogs 提交 2016-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–168（168 aa） 片段：UNP residues 1-168
未记录 6ZD 5'-O-[(R)-[({2-[(chloroacetyl)amino]ethyl}sulfamoyl)methyl](hydroxy)phosphoryl]guanosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；Protein was purified in buffer: 20 mM Hepes pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM MgCl2 and 0.5 mM DTT. Crystals grew in five days at room temperature from hanging vapor diffusion drops with following condition: 0.1 M Citric acid pH 4.0, 20% PEG 3350. Crystals were cryoprotected in mother liquid with 40% PEG 3350 and flash frozen in liquid nitrogen.
分辨率 2.70 Å R-free 0.314
5KYK Covalent GTP-competitive inhibitors of KRAS G12C: Guanosine bisphosphonate Analogs 提交 2016-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–168（168 aa） 片段：UNP residues 1-168
未记录 6ZD 5'-O-[(R)-[({2-[(chloroacetyl)amino]ethyl}sulfamoyl)methyl](hydroxy)phosphoryl]guanosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；Protein was purified in buffer: 20 mM Hepes pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM MgCl2 and 0.5 mM DTT. Crystals grew in five days at room temperature from hanging vapor diffusion drops with following condition: 0.1 M Citric acid pH 4.0, 20% PEG 3350. Crystals were cryoprotected in mother liquid with 40% PEG 3350 and flash frozen in liquid nitrogen.
分辨率 2.70 Å R-free 0.314
5MLA Crystal structure of human RAS in complex with darpin K55 提交 2016-12-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–166（166 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；18% PEG8000, 200mM Calcium Acetate, 100mM Sodium Cacodylate pH6.5
分辨率 2.19 Å R-free 0.229
5MLB Crystal structure of human RAS in complex with darpin K27 提交 2016-12-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；30% PEGMME 2000, 299mM Calcium Acetate, 100mM Sodium Cacodylate pH 6.5
分辨率 3.22 Å R-free 0.235
5MLB Crystal structure of human RAS in complex with darpin K27 提交 2016-12-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；30% PEGMME 2000, 299mM Calcium Acetate, 100mM Sodium Cacodylate pH 6.5
分辨率 3.22 Å R-free 0.235
5MLB Crystal structure of human RAS in complex with darpin K27 提交 2016-12-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；30% PEGMME 2000, 299mM Calcium Acetate, 100mM Sodium Cacodylate pH 6.5
分辨率 3.22 Å R-free 0.235
5MLB Crystal structure of human RAS in complex with darpin K27 提交 2016-12-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；30% PEGMME 2000, 299mM Calcium Acetate, 100mM Sodium Cacodylate pH 6.5
分辨率 3.22 Å R-free 0.235
5O2S Human KRAS in complex with darpin K27 提交 2017-05-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% (w/v) PEG-MME 2000, 200mM ammonium sulphate, 100mM sodium citrate pH 5.6
分辨率 3.22 Å R-free 0.235
5O2S Human KRAS in complex with darpin K27 提交 2017-05-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% (w/v) PEG-MME 2000, 200mM ammonium sulphate, 100mM sodium citrate pH 5.6
分辨率 3.22 Å R-free 0.235
5O2S Human KRAS in complex with darpin K27 提交 2017-05-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% (w/v) PEG-MME 2000, 200mM ammonium sulphate, 100mM sodium citrate pH 5.6
分辨率 3.22 Å R-free 0.235
5O2S Human KRAS in complex with darpin K27 提交 2017-05-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% (w/v) PEG-MME 2000, 200mM ammonium sulphate, 100mM sodium citrate pH 5.6
分辨率 3.22 Å R-free 0.235
5O2T Human KRAS in complex with darpin K27 提交 2017-05-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–166（166 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；18% (w/v) PEG8000, 200mM calcium acetate, 100mM sodium cacodylate pH 6.5
分辨率 2.19 Å R-free 0.229
5OCG Discovery of small molecules binding to KRAS via high affinity antibody fragment competition method. 提交 2017-06-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–188（187 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 9R5 [(2~{R})-6-chloranyl-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-2-yl]methanamine × 1 GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M TrisCl pH 8.0, 0.2 M NaOAc and 30-36 % PEG 4000
分辨率 1.48 Å R-free 0.204
5OCO Discovery of small molecules binding to KRAS via high affinity antibody fragment competition method. 提交 2017-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
链 C 1–169（169 aa）
链 D 1–169（169 aa）
链 E 1–169（169 aa）
链 F 1–169（169 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 6 9RK ~{N}-[[(3~{R})-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-3-yl]methyl]furan-2-carboxamide × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 CIT CITRIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；8-15% w/v Polyethylene Glycol 3350 and 0.2 M lithium citrate
分辨率 1.66 Å R-free 0.205
5OCT Discovery of small molecules binding to KRAS via high affinity antibody fragment competition method. 提交 2017-07-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
链 C 1–169（169 aa）
链 D 1–169（169 aa）
链 E 1–169（169 aa）
链 F 1–169（169 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 6 9R5 [(2~{R})-6-chloranyl-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-2-yl]methanamine × 9 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；8-15% w/v PEG 3350 and 0.2 M lithium citrate
分辨率 2.07 Å R-free 0.218
5TAR Crystal structure of farnesylated and methylated kras4b in complex with PDE-delta (crystal form II - with ordered hypervariable region) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–185（184 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） FAR FARNESYL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES:NaOH pH 7.5 and 2 M ammonium sulfate
分辨率 1.90 Å R-free 0.266
5TB5 Crystal structure of full-length farnesylated and methylated KRAS4b in complex with PDE-delta (crystal form I - with partially disordered hypervariable region) 提交 2016-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–185（184 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） FAR FARNESYL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M citrate pH 5.0 and 20% w/v PEG 6000
分辨率 2.00 Å R-free 0.248
5TB5 Crystal structure of full-length farnesylated and methylated KRAS4b in complex with PDE-delta (crystal form I - with partially disordered hypervariable region) 提交 2016-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–185（184 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） FAR FARNESYL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M citrate pH 5.0 and 20% w/v PEG 6000
分辨率 2.00 Å R-free 0.248
5UFE Wild-type K-Ras(GNP)/R11.1.6 complex 提交 2017-01-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–166（166 aa） 片段：UNP residues 1-166
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 3 CD CADMIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 CO COBALT (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；calcium chloride, cadmium chloride, cobalt(II)chloride, PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.241
5UFQ K-RasG12D(GNP)/R11.1.6 complex 提交 2017-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–166（166 aa） 片段：UNP residues 1-166
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 CD CADMIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；calcium chloride, cadmium chloride, cobalt(II) chloride hexahydrate, PEG 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.263
5UFQ K-RasG12D(GNP)/R11.1.6 complex 提交 2017-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–166（166 aa） 片段：UNP residues 1-166
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 CD CADMIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；calcium chloride, cadmium chloride, cobalt(II) chloride hexahydrate, PEG 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.263
5UFQ K-RasG12D(GNP)/R11.1.6 complex 提交 2017-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–166（166 aa） 片段：UNP residues 1-166
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 CD CADMIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；calcium chloride, cadmium chloride, cobalt(II) chloride hexahydrate, PEG 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.263
5UK9 Wild-type K-Ras(GCP) pH 6.5 提交 2017-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；ammonium sulfate, sodium cacodylate, PEG 8000
分辨率 1.89 Å R-free 0.206
5UK9 Wild-type K-Ras(GCP) pH 6.5 提交 2017-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–166（166 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；ammonium sulfate, sodium cacodylate, PEG 8000
分辨率 1.89 Å R-free 0.206
5UQW Crystal structure of human KRAS G12V mutant in complex with GDP 提交 2017-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
突变：G12V MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 25% w/v PEG3350, pH 6.5
分辨率 1.50 Å R-free 0.153
5UQW Crystal structure of human KRAS G12V mutant in complex with GDP 提交 2017-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
突变：G12V MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 25% w/v PEG3350, pH 6.5
分辨率 1.50 Å R-free 0.153
5US4 Crystal structure of human KRAS G12D mutant in complex with GDP 提交 2017-02-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.1；293 K；0.2 M sodium phosphate dibasic, 20% w/v PEG3350, pH 9.1
分辨率 1.83 Å R-free 0.201
5US4 Crystal structure of human KRAS G12D mutant in complex with GDP 提交 2017-02-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.1；293 K；0.2 M sodium phosphate dibasic, 20% w/v PEG3350, pH 9.1
分辨率 1.83 Å R-free 0.201
5USJ Crystal Structure of human KRAS G12D mutant in complex with GDPNP 提交 2017-02-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 25% w/v PEG3350, pH 5.5
分辨率 1.94 Å R-free 0.238
5USJ Crystal Structure of human KRAS G12D mutant in complex with GDPNP 提交 2017-02-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 25% w/v PEG3350, pH 5.5
分辨率 1.94 Å R-free 0.238
5USJ Crystal Structure of human KRAS G12D mutant in complex with GDPNP 提交 2017-02-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 25% w/v PEG3350, pH 5.5
分辨率 1.94 Å R-free 0.238
5USJ Crystal Structure of human KRAS G12D mutant in complex with GDPNP 提交 2017-02-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 25% w/v PEG3350, pH 5.5
分辨率 1.94 Å R-free 0.238
5USJ Crystal Structure of human KRAS G12D mutant in complex with GDPNP 提交 2017-02-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 25% w/v PEG3350, pH 5.5
分辨率 1.94 Å R-free 0.238
5USJ Crystal Structure of human KRAS G12D mutant in complex with GDPNP 提交 2017-02-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 25% w/v PEG3350, pH 5.5
分辨率 1.94 Å R-free 0.238
5V6S Crystal structure of small molecule acrylamide 1 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2017-03-17 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C/C51S/C80L/C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 8YD 1-{4-[6-chloro-8-fluoro-7-(5-methyl-1H-indazol-4-yl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 8000, 0.1M Hepes pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
5V6V Crystal structure of small molecule aziridine 3 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2017-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C/C51S/C80L/C118S 突变：G12C/C51S/C80L/C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 6 8YA 3-amino-1-{4-[6-chloro-8-fluoro-7-(5-methyl-1H-indazol-4-yl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；28% PEG 4000, 0.1M Tris pH 8, 0.2M CaCl2, vapor diffusion, hanging drop, 293K
分辨率 1.72 Å R-free 0.202
5V71 KRAS G12C in bound to quinazoline based switch II pocket (SWIIP) binder 提交 2017-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–168（168 aa） 片段：UNP residues 1-168
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 8ZG 1-{4-[6-chloro-7-(2-fluorophenyl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.9；277 K；1.8M sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic pH6.9
分辨率 2.23 Å R-free 0.228
5V71 KRAS G12C in bound to quinazoline based switch II pocket (SWIIP) binder 提交 2017-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–168（168 aa） 片段：UNP residues 1-168
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 8ZG 1-{4-[6-chloro-7-(2-fluorophenyl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.9；277 K；1.8M sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic pH6.9
分辨率 2.23 Å R-free 0.228
5V71 KRAS G12C in bound to quinazoline based switch II pocket (SWIIP) binder 提交 2017-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–168（168 aa） 片段：UNP residues 1-168
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 8ZG 1-{4-[6-chloro-7-(2-fluorophenyl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.9；277 K；1.8M sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic pH6.9
分辨率 2.23 Å R-free 0.228
5V71 KRAS G12C in bound to quinazoline based switch II pocket (SWIIP) binder 提交 2017-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–168（168 aa） 片段：UNP residues 1-168
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 8ZG 1-{4-[6-chloro-7-(2-fluorophenyl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.9；277 K；1.8M sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic pH6.9
分辨率 2.23 Å R-free 0.228
5V71 KRAS G12C in bound to quinazoline based switch II pocket (SWIIP) binder 提交 2017-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–168（168 aa） 片段：UNP residues 1-168
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 8ZG 1-{4-[6-chloro-7-(2-fluorophenyl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.9；277 K；1.8M sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic pH6.9
分辨率 2.23 Å R-free 0.228
5V71 KRAS G12C in bound to quinazoline based switch II pocket (SWIIP) binder 提交 2017-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–168（168 aa） 片段：UNP residues 1-168
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 8ZG 1-{4-[6-chloro-7-(2-fluorophenyl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.9；277 K；1.8M sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic pH6.9
分辨率 2.23 Å R-free 0.228
5V9L KRAS G12C in bound to quinazoline based switch II pocket (SWIIP) binder 提交 2017-03-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–168（168 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 91D N~3~-[6-chloro-7-(2-fluorophenyl)-4-(4-propanoylpiperazin-1-yl)quinazolin-2-yl]-N,N-dimethyl-beta-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.1；277 K；1.6M sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic pH7.1
分辨率 1.98 Å R-free 0.226
5V9L KRAS G12C in bound to quinazoline based switch II pocket (SWIIP) binder 提交 2017-03-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–168（168 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 91D N~3~-[6-chloro-7-(2-fluorophenyl)-4-(4-propanoylpiperazin-1-yl)quinazolin-2-yl]-N,N-dimethyl-beta-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.1；277 K；1.6M sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic pH7.1
分辨率 1.98 Å R-free 0.226
5V9L KRAS G12C in bound to quinazoline based switch II pocket (SWIIP) binder 提交 2017-03-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–168（168 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 91D N~3~-[6-chloro-7-(2-fluorophenyl)-4-(4-propanoylpiperazin-1-yl)quinazolin-2-yl]-N,N-dimethyl-beta-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.1；277 K；1.6M sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic pH7.1
分辨率 1.98 Å R-free 0.226
5V9O KRAS G12C inhibitor 提交 2017-03-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–168（168 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 91G N~3~-[6-chloro-7-(3-hydroxynaphthalen-1-yl)-4-(4-propanoylpiperazin-1-yl)quinazolin-2-yl]-N,N-dimethyl-beta-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 9；277 K；0.1M Tris pH9.0, ammonium sulfate 1.6M
分辨率 1.56 Å R-free 0.199
5V9U Crystal Structure of small molecule ARS-1620 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2017-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：GTPase domain
突变：G12C, C51S, C80L, C118S, R151G, E153D, Q165K, Y166H, R167K, L168E CA CALCIUM ION × 4 91S (S)-1-{4-[6-chloro-8-fluoro-7-(2-fluoro-6-hydroxyphenyl)quinazolin-4-yl] piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；29% PEG 4000, 0.2 M CaCl2, 0.1 M Tris pH=8.5
分辨率 1.38 Å R-free 0.189
5V9U Crystal Structure of small molecule ARS-1620 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2017-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：GTPase domain
突变：G12C, C51S, C80L, C118S, R151G, E153D, Q165K, Y166H, R167K, L168E CA CALCIUM ION × 2 91S (S)-1-{4-[6-chloro-8-fluoro-7-(2-fluoro-6-hydroxyphenyl)quinazolin-4-yl] piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 GOL GLYCEROL × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；29% PEG 4000, 0.2 M CaCl2, 0.1 M Tris pH=8.5
分辨率 1.38 Å R-free 0.189
5VBM Crystal Structure of Small Molecule Disulfide 2C07 Bound to K-Ras Cys Light M72C GDP 提交 2017-03-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：M72C, C51S, C80L, C118S MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 92V 1-(4-methoxyphenyl)-N-(3-sulfanylpropyl)-5-(trifluoromethyl)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；33% PEG4000 .1 M Na Citrate (pH 4.6) .2 M Ammonium Acetate .22 M KCl (10% Additive of 2.2 M KCL)
分辨率 1.49 Å R-free 0.196
5VP7 Crystal structure of human KRAS G12A mutant in complex with GDP 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12A, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol L-1 sodium acetate, 0.1 mol L-1 Tris pH 8.5, 26% PEG 3,350
分辨率 1.70 Å R-free 0.207
5VP7 Crystal structure of human KRAS G12A mutant in complex with GDP 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12A, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol L-1 sodium acetate, 0.1 mol L-1 Tris pH 8.5, 26% PEG 3,350
分辨率 1.70 Å R-free 0.207
5VPI Crystal structure of human KRAS G12A mutant in complex with GTP 提交 2017-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12A, C118S GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 24% PEG 3,350
分辨率 1.62 Å R-free 0.216
5VPI Crystal structure of human KRAS G12A mutant in complex with GTP 提交 2017-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12A, C118S GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 24% PEG 3,350
分辨率 1.62 Å R-free 0.216
5VPY Crystal structure of human KRAS G12A mutant in complex with GppNHp 提交 2017-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12A, C118S MG MAGNESIUM ION × 1 9GM 2-amino-9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonoamino)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-xylofuranosyl}-1,9-dihydro-6H-purin-6-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 24% PEG 3,350
分辨率 2.00 Å R-free 0.233
5VPY Crystal structure of human KRAS G12A mutant in complex with GppNHp 提交 2017-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12A, C118S MG MAGNESIUM ION × 1 9GM 2-amino-9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonoamino)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-xylofuranosyl}-1,9-dihydro-6H-purin-6-one × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 24% PEG 3,350
分辨率 2.00 Å R-free 0.233
5VPZ Crystal structure of human KRAS G12A mutant in complex with GTP-gamma-S 提交 2017-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12A, C118S MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 24% PEG 3,350
分辨率 1.85 Å R-free 0.234
5VPZ Crystal structure of human KRAS G12A mutant in complex with GTP-gamma-S 提交 2017-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12A, C118S MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 24% PEG 3,350
分辨率 1.85 Å R-free 0.234
5VQ0 Crystal structure of human KRAS G12A mutant in complex with GDP (EDTA soaked) 提交 2017-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12A, C118S MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 26% PEG 3,350
分辨率 2.30 Å R-free 0.273
5VQ0 Crystal structure of human KRAS G12A mutant in complex with GDP (EDTA soaked) 提交 2017-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12A, C118S MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 26% PEG 3,350
分辨率 2.30 Å R-free 0.273
5VQ1 Crystal structure of human KRAS Q61A mutant in complex with GDP 提交 2017-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：Q61A, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 28% PEG 3,350
分辨率 1.78 Å R-free 0.214
5VQ1 Crystal structure of human KRAS Q61A mutant in complex with GDP 提交 2017-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：Q61A, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 28% PEG 3,350
分辨率 1.78 Å R-free 0.214
5VQ2 Crystal structure of human WT-KRAS in complex with GTP 提交 2017-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 28% PEG 3,350
分辨率 1.96 Å R-free 0.231
5VQ2 Crystal structure of human WT-KRAS in complex with GTP 提交 2017-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 28% PEG 3,350
分辨率 1.96 Å R-free 0.231
5VQ6 Crystal structure of human WT-KRAS in complex with GTP-gamma-S 提交 2017-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：C118S GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 24% PEG 3,350
分辨率 1.99 Å R-free 0.221
5VQ6 Crystal structure of human WT-KRAS in complex with GTP-gamma-S 提交 2017-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：C118S GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 24% PEG 3,350
分辨率 1.99 Å R-free 0.221
5VQ8 Crystal structure of human WT-KRAS in complex with GDP (EDTA soaked) 提交 2017-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 24% PEG 3,350
分辨率 2.30 Å R-free 0.266
5VQ8 Crystal structure of human WT-KRAS in complex with GDP (EDTA soaked) 提交 2017-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 24% PEG 3,350
分辨率 2.30 Å R-free 0.266
5W22 Crystal structure of human WT-KRAS in complex with GDP 提交 2017-06-05 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 24% PEG 4,000
分辨率 1.76 Å R-free 0.204
5W22 Crystal structure of human WT-KRAS in complex with GDP 提交 2017-06-05 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 mol/L sodium acetate, 0.1 mol/L Tris pH 8.5, 24% PEG 4,000
分辨率 1.76 Å R-free 0.204
5WHA KRas G12V, bound to GDP and miniprotein 225-11 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.25 M CALCIUM CHLORIDE, 24% PEG 3350
分辨率 2.04 Å R-free 0.277
5WHA KRas G12V, bound to GDP and miniprotein 225-11 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.25 M CALCIUM CHLORIDE, 24% PEG 3350
分辨率 2.04 Å R-free 0.277
5WHA KRas G12V, bound to GDP and miniprotein 225-11 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.25 M CALCIUM CHLORIDE, 24% PEG 3350
分辨率 2.04 Å R-free 0.277
5WHA KRas G12V, bound to GDP and miniprotein 225-11 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.25 M CALCIUM CHLORIDE, 24% PEG 3350
分辨率 2.04 Å R-free 0.277
5WHB KRas G12V, bound to GDP and miniprotein 225-11(A30R) 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.25M CALCIUM CHLORIDE, 24% PEG 3350
分辨率 2.18 Å R-free 0.252
5WHB KRas G12V, bound to GDP and miniprotein 225-11(A30R) 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.25M CALCIUM CHLORIDE, 24% PEG 3350
分辨率 2.18 Å R-free 0.252
5WHB KRas G12V, bound to GDP and miniprotein 225-11(A30R) 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.25M CALCIUM CHLORIDE, 24% PEG 3350
分辨率 2.18 Å R-free 0.252
5WHB KRas G12V, bound to GDP and miniprotein 225-11(A30R) 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.25M CALCIUM CHLORIDE, 24% PEG 3350
分辨率 2.18 Å R-free 0.252
5WHB KRas G12V, bound to GDP and miniprotein 225-11(A30R) 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
链 J 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V 突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.25M CALCIUM CHLORIDE, 24% PEG 3350
分辨率 2.18 Å R-free 0.252
5WHB KRas G12V, bound to GDP and miniprotein 225-11(A30R) 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
链 G 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V 突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.25M CALCIUM CHLORIDE, 24% PEG 3350
分辨率 2.18 Å R-free 0.252
5WHD Crystal structure of KRas G12V/D38P, bound to GDP 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V D38P GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M SODIUM FLUORIDE, 23% PEG 3350,
分辨率 1.64 Å R-free 0.225
5WHD Crystal structure of KRas G12V/D38P, bound to GDP 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V D38P GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M SODIUM FLUORIDE, 23% PEG 3350,
分辨率 1.64 Å R-free 0.225
5WHD Crystal structure of KRas G12V/D38P, bound to GDP 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V D38P GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M SODIUM FLUORIDE, 23% PEG 3350,
分辨率 1.64 Å R-free 0.225
5WHD Crystal structure of KRas G12V/D38P, bound to GDP 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V D38P GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M SODIUM FLUORIDE, 23% PEG 3350,
分辨率 1.64 Å R-free 0.225
5WHD Crystal structure of KRas G12V/D38P, bound to GDP 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
链 C 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V D38P 突变：G12V D38P GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M SODIUM FLUORIDE, 23% PEG 3350,
分辨率 1.64 Å R-free 0.225
5WHD Crystal structure of KRas G12V/D38P, bound to GDP 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
链 D 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V D38P 突变：G12V D38P GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M SODIUM FLUORIDE, 23% PEG 3350,
分辨率 1.64 Å R-free 0.225
5WHE KRas G12V/D38P, bound to GppNHp and miniprotein 225-11 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V, D38P GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.25 M CALCIUM CHLORIDE, 21% PEG 3350,
分辨率 1.91 Å R-free 0.227
5WHE KRas G12V/D38P, bound to GppNHp and miniprotein 225-11 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V, D38P GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.25 M CALCIUM CHLORIDE, 21% PEG 3350,
分辨率 1.91 Å R-free 0.227
5WHE KRas G12V/D38P, bound to GppNHp and miniprotein 225-11 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V, D38P GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.25 M CALCIUM CHLORIDE, 21% PEG 3350,
分辨率 1.91 Å R-free 0.227
5WHE KRas G12V/D38P, bound to GppNHp and miniprotein 225-11 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
突变：G12V, D38P GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.25 M CALCIUM CHLORIDE, 21% PEG 3350,
分辨率 1.91 Å R-free 0.227
5WLB KRas G12V, bound to GppNHp and miniprotein 225-15a/b 提交 2017-07-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M AMMONIUM SULFATE, 26% PEG 3350, 0.1M HEPES PH 7.5
分辨率 1.72 Å R-free 0.233
5WLB KRas G12V, bound to GppNHp and miniprotein 225-15a/b 提交 2017-07-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–166（166 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-166
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M AMMONIUM SULFATE, 26% PEG 3350, 0.1M HEPES PH 7.5
分辨率 1.72 Å R-free 0.233
5WPM KRas G12V, bound to GppNHp and miniprotein 225-11(A30R) 提交 2017-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–166（166 aa） 片段：residues 1-166
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M calcium chloride and 20% PEG3350
分辨率 1.72 Å R-free 0.285
5XCO Crystal structure of human K-Ras G12D Mutant in complex with GDP and Cyclic Inhibitory Peptide 提交 2017-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Hepes, 50% PEG 200
分辨率 1.25 Å R-free 0.194
5YXZ Co-crystal Structure of KRAS (G12C) covalently bound with Quinazoline based inhibitor JBI484 提交 2017-12-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 94C 1-[4-[6-chloranyl-8-fluoranyl-7-(2-fluorophenyl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl]propan-1-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.15M K Bromide, 30% w/v PEG MME 2000
分辨率 1.70 Å R-free 0.237
5YY1 Co-crystal Structure of KRAS (G12C) covalently bound with Quinazoline based inhibitor JBI739 提交 2017-12-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 94F 1-[4-[6-chloranyl-8-fluoranyl-7-[2-(trifluoromethyl)phenyl]quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl]propan-1-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.01M tri-Sodium citrate, 33% (w/v) PEG 6000
分辨率 1.69 Å R-free 0.235
6ARK Crystal Structure of compound 10 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2017-08-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C, C51S, C80L, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BQD (3R)-N-(6-bromonaphthalen-2-yl)-3-hydroxy-1-propanoyl-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；5% PEG 400, 2M (NH4)2SO4, 0.1M HEPES
分辨率 1.75 Å R-free 0.231
6ASA KRAS mutant-D33E in GDP-bound 提交 2017-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–168（168 aa） 片段：UNP residues 1-168
突变：D33E GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；0.1 M Tris pH 8.5, 200 mM MgCl2, 25 % PEG 3350
分辨率 2.54 Å R-free 0.264
6ASE KRAS mutant-A59G in GDP-bound 提交 2017-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
突变：A59G MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；0.15 M Cesium chloride, 15 % PEG 3350, 40 mM MgCl2
分辨率 1.55 Å R-free 0.226
6B0V Crystal Structure of small molecule ARS-107 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2017-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
突变：G12C, C51S, C80L, C118S CA CALCIUM ION × 2 C8G 1-[3-(4-{[(4,5-dichloro-2-hydroxyphenyl)amino]acetyl}piperazin-1-yl)azetidin-1-yl]propan-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；29% PEG 4000, 0.2 M CaCl2, 0.1 M Tris pH=8.5
分辨率 1.29 Å R-free 0.218
6B0V Crystal Structure of small molecule ARS-107 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2017-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
突变：G12C, C51S, C80L, C118S CA CALCIUM ION × 2 C8G 1-[3-(4-{[(4,5-dichloro-2-hydroxyphenyl)amino]acetyl}piperazin-1-yl)azetidin-1-yl]propan-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；29% PEG 4000, 0.2 M CaCl2, 0.1 M Tris pH=8.5
分辨率 1.29 Å R-free 0.218
6B0Y Crystal Structure of small molecule ARS-917 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2017-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
突变：G12C, C51S, C80L, C118S CA CALCIUM ION × 2 8ZG 1-{4-[6-chloro-7-(2-fluorophenyl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；27% PEG 4000, 0.2 M CaCl2, 0.1 M Tris pH=8.5
分辨率 1.43 Å R-free 0.207
6B0Y Crystal Structure of small molecule ARS-917 covalently bound to K-Ras G12C 提交 2017-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：UNP residues 1-169
突变：G12C, C51S, C80L, C118S CA CALCIUM ION × 2 8ZG 1-{4-[6-chloro-7-(2-fluorophenyl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 GOL GLYCEROL × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；27% PEG 4000, 0.2 M CaCl2, 0.1 M Tris pH=8.5
分辨率 1.43 Å R-free 0.207
6BOF Crystal structure of KRAS A146T-GDP demonstrating open switch 1 conformation 提交 2017-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–169（168 aa）
链 B 2–169（168 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.4 M sodium malonate, pH 7.0, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 7.0
分辨率 1.40 Å R-free 0.145
6BP1 Crystal structure of human KRAS A59G mutant in complex with GCP 提交 2017-11-21 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：A59G GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；293 K；4% MPD, 0.1 M citric acid, pH 3.5, 20% PEG1500
分辨率 2.00 Å R-free 0.223
6CC9 NMR data-driven model of GTPase KRas-GMPPNP:Cmpd2 complex tethered to a nanodisc 提交 2018-02-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–185（185 aa）
突变：G12V PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EWS (2R,4S)-4-[(5-bromo-1H-indole-3-carbonyl)amino]-2-[(4-chlorophenyl)methyl]piperidin-1-ium × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成 0.2 mM U-15N, Ile, Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C GTPase KRas isoform b, 0.4 mM Membrane Scaffold Protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM TRIS, 5 mM magnesium chloride, 2 mM TCEP, 0.2 mM GMPPNP, 12 mM DOPC, 3.2 mM DOPS, 0.8 mM PE-MCC, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM U-15N, Ile, Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C GTPase KRas isoform b, 0.4 mM Membrane Scaffold Protein, 1 mM Cmpd2, 100 mM sodium chloride, 20 mM TRIS, 5 mM magnesium chloride, 2 mM TCEP, 0.2 mM GMPPNP, 12 mM DOPC, 3.2 mM DOPS, 0.8 mM PE-MCC, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-15N] GTPase KRas isoform b, 1 mM Cmpd2, 100 mM sodium chloride, 20 mM TRIS, 5 mM magnesium chloride, 2 mM TCEP, 0.2 mM GMPPNP, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6CCH NMR data-driven model of GTPase KRas-GMPPNP tethered to a nanodisc (E3 state) 提交 2018-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–185（185 aa）
突变：G12V PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）105；压力 1
NMR样品组成 0.2 mM U-15N, Ile, Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C GTPase KRas isoform b, 0.4 mM Membrane Scaffold Protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM TRIS, 5 mM magnesium chloride, 2 mM TCEP, 0.2 mM GMPPNP, 12 mM DOPC, 3.2 mM DOPS, 0.8 mM PE-MCC, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM U-15N, Ile, Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C GTPase KRas isoform b, 0.4 mM Membrane Scaffold Protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM TRIS, 5 mM magnesium chloride, 2 mM TCEP, 0.2 mM GMPPNP, 12 mM DOPC, 3.2 mM DOPS, 0.8 mM PE-MCC, 0.4 mM PE-DTPA-Gd, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6CCX NMR data-driven model of GTPase KRas-GMPPNP:Cmpd2 complex tethered to a nanodisc 提交 2018-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–185（185 aa）
突变：G12V PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EWS (2R,4S)-4-[(5-bromo-1H-indole-3-carbonyl)amino]-2-[(4-chlorophenyl)methyl]piperidin-1-ium × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）105；压力 1
NMR样品组成 0.2 mM U-15N, Ile, Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C GTPase KRas isoform b, 0.4 mM Membrane Scaffold Protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM TRIS, 5 mM magnesium chloride, 2 mM TCEP, 0.2 mM GMPPNP, 12 mM DOPC, 3.2 mM DOPS, 0.8 mM PE-MCC, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM GTPase KRas isoform b, 0.4 mM Membrane Scaffold Protein, 100 mM sodium chloride, 20 mM TRIS, 5 mM magnesium chloride, 2 mM TCEP, 0.2 mM GMPPNP, 12 mM DOPC, 3.2 mM DOPS, 0.8 mM PE-MCC, 0.4 mM PE-DTPA-Gd, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6CU6 Crystal structure of GMPPNP-bound G12R mutant of human KRAS4b 提交 2018-03-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12R MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；2.1 M Sodium Malonate pH 7.5, 40 mM Dimethyloctylphosphine oxide
分辨率 1.50 Å R-free 0.230
6CU6 Crystal structure of GMPPNP-bound G12R mutant of human KRAS4b 提交 2018-03-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12R MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；2.1 M Sodium Malonate pH 7.5, 40 mM Dimethyloctylphosphine oxide
分辨率 1.50 Å R-free 0.230
6CU6 Crystal structure of GMPPNP-bound G12R mutant of human KRAS4b 提交 2018-03-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12R MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；2.1 M Sodium Malonate pH 7.5, 40 mM Dimethyloctylphosphine oxide
分辨率 1.50 Å R-free 0.230
6E6F KRAS G13D bound to GppNHp (K13GNP) 提交 2018-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–166（166 aa） 片段：residues 1-166
突变：G13D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291.15 K；5 mM Sodium acetate, 91 mM sodium citrate tribasic, 183 mM Ammonium acetate, 27.2% PEG 4000, 4.3% stabilization buffer (20 mM HEPES, 50 mM NaCl, 20 mM MgCl2, at pH 7.5), crystals grown 1uL by 1uL mother liquor to protein (22mg/mL), No cryoprotectant was used for diffraction
分辨率 3.40 Å R-free 0.258
6E6F KRAS G13D bound to GppNHp (K13GNP) 提交 2018-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–166（166 aa） 片段：residues 1-166
突变：G13D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291.15 K；5 mM Sodium acetate, 91 mM sodium citrate tribasic, 183 mM Ammonium acetate, 27.2% PEG 4000, 4.3% stabilization buffer (20 mM HEPES, 50 mM NaCl, 20 mM MgCl2, at pH 7.5), crystals grown 1uL by 1uL mother liquor to protein (22mg/mL), No cryoprotectant was used for diffraction
分辨率 3.40 Å R-free 0.258
6E6G KRAS G13D bound to GDP (K13GDP) 提交 2018-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–166（166 aa） 片段：residues 1-166
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291.15 K；27.5% PEG 3350, 125 mM Na(OAc), 122 mM sodium citrate, 4.0% stabilization buffer (20 mM HEPES, 50 mM NaCl, 20 mM MgCl2, at pH 7.5), Crystals grown in 1uL by 1uL drops of mother liquor to protein (18 mg/mL), No cryoprotectant used for diffraction
分辨率 1.93 Å R-free 0.225
6EPL Ras guanine exchange factor SOS1 (Rem-cdc25) in complex with KRAS(G12C) 提交 2017-10-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 R 1–169（169 aa）
突变：G12C, C118S, D126E, T127S, K128R GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；Drops made from KRAS SOS1 complex (11.3 mg/ml in 5 mM Tris pH 7.5, 100 mM NaCl) and reservoir solution (3.65 M sodium Formate). No cryo protectant added.
分辨率 2.55 Å R-free 0.224
6EPM Ras guanine nucleotide exchange factor SOS1 (Rem-cdc25) in complex with KRAS(G12C) and fragment screening hit F1 提交 2017-10-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 R 1–169（169 aa）
突变：G12C, C118S, D126E, T127S, K128R GOL GLYCEROL × 1 BQ5 (1-phenyl-5,6-dihydro-4~{H}-cyclopenta[c]pyrazol-3-yl)methanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；Drops made from KRAS SOS1 complex (14.4 mg/ml in 5 mM Tris pH 7.5, 100mM NaCl) and reservoir solution (2.9 to 3.4 M sodium formate, 100 mM MES pH 6.5). Fragment soaked at 25 mM for one day using a 500 mM fragment stock solution in DMSO. Cryo buffer 0.1 M MES pH 6.5, 3.5 M sodium formate, 20 glycerol, 25 mM fragment
分辨率 2.50 Å R-free 0.211
6EPN Ras guanine exchange factor SOS1 (Rem-cdc25) in complex with KRAS(G12C) and fragment screening hit F2 提交 2017-10-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 R 1–169（169 aa）
突变：G12C, C118S, D126E, T127S, K128R GOL GLYCEROL × 1 BQ2 1-(3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl)-2-oxidanyl-ethanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；Drops made from KRAS SOS1 complex (14.4 mg/ml in 5 mM Tris pH 7.5, 100mM NaCl) and reservoir solution (2.9 to 3.4 M sodium formate, 100 mM MES pH 6.5). Fragment soaked at 25 mM for 2.5 days using a 500 mM fragment stock solution in DMSO. Cryo buffer 0.1 M MES pH 6.5, 3.5 M sodium formate, 20 glycerol, 25 mM fragment.
分辨率 2.50 Å R-free 0.218
6EPO RAS GUANINE EXCHANGE FACTOR SOS1 (REM-CDC25) IN COMPLEX WITH KRAS(G12C) AND FRAGMENT SCREENING HIT F3 提交 2017-10-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 R 1–169（169 aa）
突变：G12C, C118S, D126E, T127S, K128R GOL GLYCEROL × 1 BPW 3-(4-chlorophenyl)propan-1-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；Drops made from KRAS SOS1 complex (14.4 mg/ml in 5 mM Tris pH 7.5, 100mM NaCl) and reservoir solution (2.9 to 3.4 M sodium formate, 100 mM MES pH 6.5). Fragment soaked at 25 mM for two days using a 500 mM fragment stock solution in DMSO. Cryo buffer 0.1 M MES pH 6.5, 3.5 M sodium formate, 20 glycerol, 25 mM fragment
分辨率 2.40 Å R-free 0.214
6EPP RAS GUANINE EXCHANGE FACTOR SOS1 (REM-CDC25) IN COMPLEX WITH KRAS(G12C) AND FRAGMENT SCREENING HIT F4 提交 2017-10-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 R 1–169（169 aa）
突变：G12C, C118S, D126E, T127S, K128R GOL GLYCEROL × 1 BOQ ethyl 2-(aminomethyl)-5-~{tert}-butyl-furan-3-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；Drops made from KRAS SOS1 complex (14.4 mg/ml in 5 mM Tris pH 7.5, 100mM NaCl) and reservoir solution (2.9 to 3.4 M sodium formate, 100 mM MES pH 6.5). Fragment soaked at 25 mM for three days at 277 K using a 500 mM fragment stock solution in DMSO. Cryo buffer 0.1 M MES pH 6.5, 3.5 M sodium formate, 20 glycerol, 25 mM fragment
分辨率 2.40 Å R-free 0.201
6F76 Antibody derived (Abd-8) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
链 C 1–169（169 aa）
链 D 1–169（169 aa）
链 E 1–169（169 aa）
链 F 1–169（169 aa）
突变：Q61H 突变：Q61H 突变：Q61H 突变：Q61H 突变：Q61H 突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 6 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 6 CVK 4-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-5-yl)-~{N}-[3-[(dimethylamino)methyl]phenyl]-2-methoxy-aniline × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M lithium citrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
6FA1 Antibody derived (Abd-4) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–168（168 aa）
链 B 1–169（169 aa）
链 C 1–168（168 aa）
链 D 1–168（168 aa）
链 E 1–169（169 aa）
链 F 1–168（168 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q61H 突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 6 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 6 D2Z 2-[4-[[(3~{R})-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-3-yl]methylcarbamoyl]phenoxy]ethyl-dimethyl-azanium × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M lithium citrate
分辨率 1.97 Å R-free 0.207
6FA2 Antibody derived (Abd-5) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 D2W 4-[2-(dimethylamino)ethoxy]-~{N}-[[(3~{R})-5-(6-methoxypyridin-2-yl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-3-yl]methyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M lithium citrate
分辨率 2.60 Å R-free 0.233
6FA2 Antibody derived (Abd-5) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 D2W 4-[2-(dimethylamino)ethoxy]-~{N}-[[(3~{R})-5-(6-methoxypyridin-2-yl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-3-yl]methyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M lithium citrate
分辨率 2.60 Å R-free 0.233
6FA2 Antibody derived (Abd-5) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 D2W 4-[2-(dimethylamino)ethoxy]-~{N}-[[(3~{R})-5-(6-methoxypyridin-2-yl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-3-yl]methyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M lithium citrate
分辨率 2.60 Å R-free 0.233
6FA2 Antibody derived (Abd-5) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 D2W 4-[2-(dimethylamino)ethoxy]-~{N}-[[(3~{R})-5-(6-methoxypyridin-2-yl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-3-yl]methyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M lithium citrate
分辨率 2.60 Å R-free 0.233
6FA2 Antibody derived (Abd-5) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 D2W 4-[2-(dimethylamino)ethoxy]-~{N}-[[(3~{R})-5-(6-methoxypyridin-2-yl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-3-yl]methyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M lithium citrate
分辨率 2.60 Å R-free 0.233
6FA2 Antibody derived (Abd-5) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 D2W 4-[2-(dimethylamino)ethoxy]-~{N}-[[(3~{R})-5-(6-methoxypyridin-2-yl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-3-yl]methyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M lithium citrate
分辨率 2.60 Å R-free 0.233
6FA3 Antibody derived (Abd-6) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–168（168 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 D1Z ~{N}-[[(3~{R})-5-[5-[[3-[(dimethylamino)methyl]phenyl]amino]-6-methoxy-pyridin-2-yl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-3-yl]methyl]oxane-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M lithium citrate
分辨率 1.82 Å R-free 0.207
6FA3 Antibody derived (Abd-6) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–168（168 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 D1Z ~{N}-[[(3~{R})-5-[5-[[3-[(dimethylamino)methyl]phenyl]amino]-6-methoxy-pyridin-2-yl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-3-yl]methyl]oxane-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M lithium citrate
分辨率 1.82 Å R-free 0.207
6FA3 Antibody derived (Abd-6) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–168（168 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 D1Z ~{N}-[[(3~{R})-5-[5-[[3-[(dimethylamino)methyl]phenyl]amino]-6-methoxy-pyridin-2-yl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-3-yl]methyl]oxane-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M lithium citrate
分辨率 1.82 Å R-free 0.207
6FA3 Antibody derived (Abd-6) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–168（168 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M lithium citrate
分辨率 1.82 Å R-free 0.207
6FA3 Antibody derived (Abd-6) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–168（168 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M lithium citrate
分辨率 1.82 Å R-free 0.207
6FA3 Antibody derived (Abd-6) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–168（168 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 D1Z ~{N}-[[(3~{R})-5-[5-[[3-[(dimethylamino)methyl]phenyl]amino]-6-methoxy-pyridin-2-yl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-3-yl]methyl]oxane-4-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M lithium citrate
分辨率 1.82 Å R-free 0.207
6FA4 Antibody derived (Abd-7) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 D1W 6-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-5-yl)-~{N}-[4-[(dimethylamino)methyl]phenyl]-2-methoxy-pyridin-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.02 Å R-free 0.232
6FA4 Antibody derived (Abd-7) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 D1W 6-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-5-yl)-~{N}-[4-[(dimethylamino)methyl]phenyl]-2-methoxy-pyridin-3-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.02 Å R-free 0.232
6FA4 Antibody derived (Abd-7) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.02 Å R-free 0.232
6FA4 Antibody derived (Abd-7) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 D1W 6-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-5-yl)-~{N}-[4-[(dimethylamino)methyl]phenyl]-2-methoxy-pyridin-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.02 Å R-free 0.232
6FA4 Antibody derived (Abd-7) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.02 Å R-free 0.232
6FA4 Antibody derived (Abd-7) small molecule binding to KRAS. 提交 2017-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 D1W 6-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-5-yl)-~{N}-[4-[(dimethylamino)methyl]phenyl]-2-methoxy-pyridin-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.02 Å R-free 0.232
6GJ5 CRYSTAL STRUCTURE OF KRAS G12D (GPPCP) IN COMPLEX WITH 15 提交 2018-05-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 F0N (3~{S})-3-[2-[(2~{R})-pyrrolidin-2-yl]-1~{H}-indol-3-yl]-2,3-dihydroisoindol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；30% PEG3350, 0.2 M potassium acetate
分辨率 1.50 Å R-free 0.203
6GJ5 CRYSTAL STRUCTURE OF KRAS G12D (GPPCP) IN COMPLEX WITH 15 提交 2018-05-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：C118S GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 F0N (3~{S})-3-[2-[(2~{R})-pyrrolidin-2-yl]-1~{H}-indol-3-yl]-2,3-dihydroisoindol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；30% PEG3350, 0.2 M potassium acetate
分辨率 1.50 Å R-free 0.203
6GJ6 CRYSTAL STRUCTURE OF KRAS G12D (GPPCP) IN COMPLEX WITH 18 提交 2018-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 NO3 NITRATE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 EZZ (3~{S})-3-[2-[(dimethylamino)methyl]-1~{H}-indol-3-yl]-5-oxidanyl-2,3-dihydroisoindol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% PEG3350, 0.2M ammonium nitrate
分辨率 1.76 Å R-free 0.211
6GJ7 CRYSTAL STRUCTURE OF KRAS G12D (GPPCP) IN COMPLEX WITH 22 提交 2018-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 F0B (3~{S})-5-oxidanyl-3-[2-[[[1-(phenylmethyl)indol-6-yl]methylamino]methyl]-1~{H}-indol-3-yl]-2,3-dihydroisoindol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；Molecular Dimensions Morpheus Screen with 30% Precipitant Mix1, 0.1M Morpheus buffer system 2 pH 7.5 and 10% nitrate phosphate sulfate mix
分辨率 1.67 Å R-free 0.257
6GJ8 CRYSTAL STRUCTURE OF KRAS G12D (GPPCP) IN COMPLEX WITH BI 2852 提交 2018-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–168（168 aa）
未记录 F0K (3~{S})-3-[2-[[[1-[(1-methylimidazol-4-yl)methyl]indol-6-yl]methylamino]methyl]-1~{H}-indol-3-yl]-5-oxidanyl-2,3-dihydroisoindol-1-one × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；25% PEG3350, 0.2M ammonium sulfate and 0.1M bis-TRIS buffer at pH 6
分辨率 1.65 Å R-free 0.198
6GOD KRAS full length wild-type GPPNHP 提交 2018-06-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–172（171 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1 M TrisCl, 0.2 M NaOAc and 30-35 % PEG 4000
分辨率 1.71 Å R-free 0.231
6GOE KRAS full length G12V GPPNHP 提交 2018-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–171（170 aa）
突变：G12V MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1 M TrisCl, 0.2 M NaOAc and 30-35 % PEG 4000
分辨率 1.60 Å R-free 0.220
6GOF KRAS full length G12D GPPNHP 提交 2018-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–172（171 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M, TrisCl, 0.2 M NaOAc and 30-35 % PEG 4000
分辨率 1.98 Å R-free 0.252
6GOG KRAS-169 Q61H GPPNHP 提交 2018-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
链 C 1–169（169 aa）
链 D 1–169（169 aa）
链 E 1–169（169 aa）
链 F 1–169（169 aa）
突变：Q61H 突变：Q61H 突变：Q61H 突变：Q61H 突变：Q61H 突变：Q61H GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 CIT CITRIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 2.05 Å R-free 0.191
6GOM KRAS-169 Q61H GPPNHP + PPIN-1 提交 2018-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–168（168 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CIT CITRIC ACID × 2 F6E (6~{S})-1-(1~{H}-imidazol-4-ylcarbonyl)-6-[(4-phenylphenyl)methyl]-4-propyl-1,4-diazepan-5-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 1.63 Å R-free 0.207
6GOM KRAS-169 Q61H GPPNHP + PPIN-1 提交 2018-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–168（168 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 1.63 Å R-free 0.207
6GOM KRAS-169 Q61H GPPNHP + PPIN-1 提交 2018-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–168（168 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 1.63 Å R-free 0.207
6GOM KRAS-169 Q61H GPPNHP + PPIN-1 提交 2018-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–168（168 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 1.63 Å R-free 0.207
6GOM KRAS-169 Q61H GPPNHP + PPIN-1 提交 2018-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–168（168 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 1.63 Å R-free 0.207
6GOM KRAS-169 Q61H GPPNHP + PPIN-1 提交 2018-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–168（168 aa）
突变：Q61H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 1.63 Å R-free 0.207
6GQT KRAS-169 Q61H GPPNHP + PPIN-2 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–168（168 aa）
突变：Q61H GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CIT CITRIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 1.69 Å R-free 0.214
6GQT KRAS-169 Q61H GPPNHP + PPIN-2 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–168（168 aa）
突变：Q61H GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 F8N ~{N}-(3-imidazol-1-ylpropyl)-4-[[3-(3-methoxyphenyl)phenyl]methyl]oxane-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 1.69 Å R-free 0.214
6GQT KRAS-169 Q61H GPPNHP + PPIN-2 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–168（168 aa）
突变：Q61H GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 F8N ~{N}-(3-imidazol-1-ylpropyl)-4-[[3-(3-methoxyphenyl)phenyl]methyl]oxane-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 1.69 Å R-free 0.214
6GQT KRAS-169 Q61H GPPNHP + PPIN-2 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–168（168 aa）
突变：Q61H GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CIT CITRIC ACID × 1 F8N ~{N}-(3-imidazol-1-ylpropyl)-4-[[3-(3-methoxyphenyl)phenyl]methyl]oxane-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 1.69 Å R-free 0.214
6GQT KRAS-169 Q61H GPPNHP + PPIN-2 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–168（168 aa）
突变：Q61H GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 1.69 Å R-free 0.214
6GQT KRAS-169 Q61H GPPNHP + PPIN-2 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–168（168 aa）
突变：Q61H GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 F8N ~{N}-(3-imidazol-1-ylpropyl)-4-[[3-(3-methoxyphenyl)phenyl]methyl]oxane-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 1.69 Å R-free 0.214
6GQW KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-1 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 F8T [4-[[4-(3-methoxyphenyl)phenyl]amino]phenyl]methyl-dimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.80 Å R-free 0.224
6GQW KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-1 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 F8T [4-[[4-(3-methoxyphenyl)phenyl]amino]phenyl]methyl-dimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.80 Å R-free 0.224
6GQW KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-1 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 F8T [4-[[4-(3-methoxyphenyl)phenyl]amino]phenyl]methyl-dimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.80 Å R-free 0.224
6GQW KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-1 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.80 Å R-free 0.224
6GQW KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-1 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.80 Å R-free 0.224
6GQW KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-1 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 F8T [4-[[4-(3-methoxyphenyl)phenyl]amino]phenyl]methyl-dimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.80 Å R-free 0.224
6GQX KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-2 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 F8K [4-[[2-methoxy-4-(3-methoxyphenyl)phenyl]amino]phenyl]methyl-dimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.230
6GQX KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-2 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 F8K [4-[[2-methoxy-4-(3-methoxyphenyl)phenyl]amino]phenyl]methyl-dimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.230
6GQX KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-2 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 F8K [4-[[2-methoxy-4-(3-methoxyphenyl)phenyl]amino]phenyl]methyl-dimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.230
6GQX KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-2 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–167（167 aa）
突变：Q61H GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.230
6GQX KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-2 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–167（167 aa）
突变：Q61H GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.230
6GQX KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-2 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–167（167 aa）
突变：Q61H GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v polyethylene glycol 3350 and 0.2 M Lithium citrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.230
6GQY KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-3 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 F8Q [4-[[3-fluoranyl-2-methoxy-4-(3-methoxyphenyl)phenyl]amino]phenyl]methyl-dimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.75 Å R-free 0.247
6GQY KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-3 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 F8Q [4-[[3-fluoranyl-2-methoxy-4-(3-methoxyphenyl)phenyl]amino]phenyl]methyl-dimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.75 Å R-free 0.247
6GQY KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-3 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 F8Q [4-[[3-fluoranyl-2-methoxy-4-(3-methoxyphenyl)phenyl]amino]phenyl]methyl-dimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.75 Å R-free 0.247
6GQY KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-3 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 F8Q [4-[[3-fluoranyl-2-methoxy-4-(3-methoxyphenyl)phenyl]amino]phenyl]methyl-dimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.75 Å R-free 0.247
6GQY KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-3 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.75 Å R-free 0.247
6GQY KRAS-169 Q61H GPPNHP + CH-3 提交 2018-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–167（167 aa）
突变：Q61H MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8-15% w/v polyethylene glycol 3350 and 0.2M Lithium citrate
分辨率 2.75 Å R-free 0.247
6H46 Human KRAS in complex with darpin K13 提交 2018-07-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.5-1.0M lithium sulfate 0.5-1.0M ammonium sulfate 100mM tri-sodium citrate pH5.5
分辨率 2.22 Å R-free 0.230
6H47 Human KRAS in complex with darpin K19 提交 2018-07-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–166（166 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.5-1.0M lithium sulfate 0.5-1.0M ammonium sulfate 100mM tri-solium citrate pH 5.5
分辨率 1.70 Å R-free 0.208
6M9W Structure of Mg-free KRAS4b (2-169) bound to GDP with the switch-I in fully open conformation 提交 2018-08-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–169（168 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056 M NaPO4.H2O, 1.344 M K2PO4, pH 8.2
分辨率 1.50 Å R-free 0.181
6M9W Structure of Mg-free KRAS4b (2-169) bound to GDP with the switch-I in fully open conformation 提交 2018-08-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–169（168 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；0.056 M NaPO4.H2O, 1.344 M K2PO4, pH 8.2
分辨率 1.50 Å R-free 0.181
6MBQ Crystal structure of Mg-free wild-type KRAS (2-166) bound to GMPPNP in the state 1 conformation 提交 2018-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–166（165 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；200 mM Ammonium Fluoride, 20% PEG 3350
分辨率 1.35 Å R-free 0.179
6MBT Crystal structure of wild-type KRAS bound to GDP and Mg (Space group C2) 提交 2018-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；6% 2-Propanol, 0.1 M Na acetate pH 4.5, 26% PEG MME 550
分辨率 1.45 Å R-free 0.215
6MBT Crystal structure of wild-type KRAS bound to GDP and Mg (Space group C2) 提交 2018-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；6% 2-Propanol, 0.1 M Na acetate pH 4.5, 26% PEG MME 550
分辨率 1.45 Å R-free 0.215
6MBU Crystal structure of wild-type KRAS (1-169) bound to GDP and Mg (Space group P3) 提交 2018-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M TRIS HCl pH 8.5, 30% PEG 4K
分辨率 1.45 Å R-free 0.181
6MBU Crystal structure of wild-type KRAS (1-169) bound to GDP and Mg (Space group P3) 提交 2018-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M TRIS HCl pH 8.5, 30% PEG 4K
分辨率 1.45 Å R-free 0.181
6MNX Structural basis of impaired hydrolysis in KRAS Q61H mutant 提交 2018-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MMT, 24% PEG 6000 and 1% 1,2-butanediol, pH 6.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
6MNX Structural basis of impaired hydrolysis in KRAS Q61H mutant 提交 2018-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MMT, 24% PEG 6000 and 1% 1,2-butanediol, pH 6.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
6MNX Structural basis of impaired hydrolysis in KRAS Q61H mutant 提交 2018-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MMT, 24% PEG 6000 and 1% 1,2-butanediol, pH 6.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
6MNX Structural basis of impaired hydrolysis in KRAS Q61H mutant 提交 2018-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MMT, 24% PEG 6000 and 1% 1,2-butanediol, pH 6.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
6MNX Structural basis of impaired hydrolysis in KRAS Q61H mutant 提交 2018-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–169（169 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MMT, 24% PEG 6000 and 1% 1,2-butanediol, pH 6.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
6MNX Structural basis of impaired hydrolysis in KRAS Q61H mutant 提交 2018-10-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–169（169 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MMT, 24% PEG 6000 and 1% 1,2-butanediol, pH 6.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
6MQG Crystal structure of KRAS V14I-GDP demonstrating open switch 1 conformation - Form 1 提交 2018-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 3–169（167 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；1.8 M Na/K Phosphate, pH 8.2
分辨率 1.50 Å R-free 0.195
6MQN Crystal structure of KRAS V14I-GDP demonstrating disorder switch 1 conformation - Form 2 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；1.8M Na/K Phosphate pH 8.2
分辨率 1.60 Å R-free 0.227
6MQN Crystal structure of KRAS V14I-GDP demonstrating disorder switch 1 conformation - Form 2 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；1.8M Na/K Phosphate pH 8.2
分辨率 1.60 Å R-free 0.227
6MQN Crystal structure of KRAS V14I-GDP demonstrating disorder switch 1 conformation - Form 2 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；1.8M Na/K Phosphate pH 8.2
分辨率 1.60 Å R-free 0.227
6MS9 GDP-bound KRAS P34R mutant 提交 2018-10-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；1.8 M Na/K-phosphate pH 8.3
分辨率 1.49 Å R-free 0.232
6MS9 GDP-bound KRAS P34R mutant 提交 2018-10-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；1.8 M Na/K-phosphate pH 8.3
分辨率 1.49 Å R-free 0.232
6MS9 GDP-bound KRAS P34R mutant 提交 2018-10-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；1.8 M Na/K-phosphate pH 8.3
分辨率 1.49 Å R-free 0.232
6MTA KRAS P34R mutant structure in complex with GTP analogue 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；1.8 M Na/K-phosphate pH 8.2-8.5
分辨率 2.15 Å R-free 0.243
6MTA KRAS P34R mutant structure in complex with GTP analogue 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；1.8 M Na/K-phosphate pH 8.2-8.5
分辨率 2.15 Å R-free 0.243
6MTA KRAS P34R mutant structure in complex with GTP analogue 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；1.8 M Na/K-phosphate pH 8.2-8.5
分辨率 2.15 Å R-free 0.243
6N2J Tetrahydropyridopyrimidines as Covalent Inhibitors of KRAS-G12C 提交 2018-11-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C,C51S,C80L,C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K9M 1-{4-[7-(naphthalen-1-yl)-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；0.1M Na Citrate, pH 5.0 29% PEG8000 0.2M Amm Acetate
分辨率 1.80 Å R-free 0.204
6N2K Tetrahydropyridopyrimidines as Covalent Inhibitors of KRAS-G12C 提交 2018-11-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C,C51S,C80L,C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K9J 1-{4-[2-{[(2R)-1-(dimethylamino)propan-2-yl]oxy}-7-(3-hydroxynaphthalen-1-yl)-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；0.1M Na Citrate, pH 4.2 25% PEG 8000 0.2M Amm Acetate
分辨率 1.72 Å R-free 0.172
6O36 Crystal structure of human KRAS P34R mutant in complex with GNP 提交 2019-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–168（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；1.6-1.8 M sodium/potassium phosphate, pH 8.2
分辨率 2.00 Å R-free 0.222
6O36 Crystal structure of human KRAS P34R mutant in complex with GNP 提交 2019-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–168（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；1.6-1.8 M sodium/potassium phosphate, pH 8.2
分辨率 2.00 Å R-free 0.222
6O36 Crystal structure of human KRAS P34R mutant in complex with GNP 提交 2019-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–168（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；1.6-1.8 M sodium/potassium phosphate, pH 8.2
分辨率 2.00 Å R-free 0.222
6O46 Crystal structure of human KRAS P34R mutant in complex with GNP and Phosphate 提交 2019-02-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–168（168 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.8-2.0 M sodium/potassium phosphate, pH 8.0-8.4
分辨率 1.90 Å R-free 0.210
6O46 Crystal structure of human KRAS P34R mutant in complex with GNP and Phosphate 提交 2019-02-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–168（168 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.8-2.0 M sodium/potassium phosphate, pH 8.0-8.4
分辨率 1.90 Å R-free 0.210
6O46 Crystal structure of human KRAS P34R mutant in complex with GNP and Phosphate 提交 2019-02-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–168（168 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.8-2.0 M sodium/potassium phosphate, pH 8.0-8.4
分辨率 1.90 Å R-free 0.210
6OB2 Crystal structure of wild-type KRAS (GMPPNP-bound) in complex with GAP-related domain (GRD) of neurofibromin (NF1) 提交 2019-03-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IMD IMIDAZOLE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8.0 and 19% PAA-co-maleic acid
分辨率 2.85 Å R-free 0.247
6OB2 Crystal structure of wild-type KRAS (GMPPNP-bound) in complex with GAP-related domain (GRD) of neurofibromin (NF1) 提交 2019-03-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8.0 and 19% PAA-co-maleic acid
分辨率 2.85 Å R-free 0.247
6OB3 Crystal structure of G13D-KRAS (GMPPNP-bound) in complex with GAP-related domain (GRD) of neurofibromin (NF1) 提交 2019-03-19 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G13D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES pH 6.0 and 25% Pentaerythritol propoxylate (5/4 PO/OH)
分辨率 2.10 Å R-free 0.226
6OB3 Crystal structure of G13D-KRAS (GMPPNP-bound) in complex with GAP-related domain (GRD) of neurofibromin (NF1) 提交 2019-03-19 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：G13D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES pH 6.0 and 25% Pentaerythritol propoxylate (5/4 PO/OH)
分辨率 2.10 Å R-free 0.226
6OIM Crystal Structure of human KRAS G12C covalently bound to AMG 510 提交 2019-04-09 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MOV AMG 510 (bound form) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1mM MgCl2, 0.1M MES pH6.5, 30% PEG4000
分辨率 1.65 Å R-free 0.215
6P0Z Crystal structure of N-acetylated KRAS (2-169) bound to GDP and Mg 提交 2019-05-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–169（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；100mM BS1 pH 6.5, 100mM AminoAcids, 30% PEG500MME_P20K
分辨率 1.01 Å R-free 0.166
6P0Z Crystal structure of N-acetylated KRAS (2-169) bound to GDP and Mg 提交 2019-05-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–169（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；100mM BS1 pH 6.5, 100mM AminoAcids, 30% PEG500MME_P20K
分辨率 1.01 Å R-free 0.166
6P8W Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to an acryloylazetidine acetamide inhibitor. 提交 2019-06-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 O67 N-(5-bromo-2-{2-oxo-2-[(1-propanoylazetidin-3-yl)amino]ethoxy}phenyl)-3-methyl-1,2-oxazole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M Calcium chloride, 0.1M MES pH6.5, 30% PEG4000
分辨率 2.10 Å R-free 0.277
6P8W Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to an acryloylazetidine acetamide inhibitor. 提交 2019-06-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 O67 N-(5-bromo-2-{2-oxo-2-[(1-propanoylazetidin-3-yl)amino]ethoxy}phenyl)-3-methyl-1,2-oxazole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M Calcium chloride, 0.1M MES pH6.5, 30% PEG4000
分辨率 2.10 Å R-free 0.277
6P8X Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to an acryloylazetidine acetamide inhibitor. 提交 2019-06-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S CA CALCIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 O5V 2-[4-bromo-2-(3-phenyl-2,5-dihydro-1H-pyrrole-1-carbonyl)phenoxy]-N-(1-propanoylazetidin-3-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Calcium chloride, 20% PEG3350
分辨率 2.11 Å R-free 0.313
6P8X Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to an acryloylazetidine acetamide inhibitor. 提交 2019-06-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S CA CALCIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 O5V 2-[4-bromo-2-(3-phenyl-2,5-dihydro-1H-pyrrole-1-carbonyl)phenoxy]-N-(1-propanoylazetidin-3-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Calcium chloride, 20% PEG3350
分辨率 2.11 Å R-free 0.313
6P8X Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to an acryloylazetidine acetamide inhibitor. 提交 2019-06-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 O5V 2-[4-bromo-2-(3-phenyl-2,5-dihydro-1H-pyrrole-1-carbonyl)phenoxy]-N-(1-propanoylazetidin-3-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Calcium chloride, 20% PEG3350
分辨率 2.11 Å R-free 0.313
6P8X Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to an acryloylazetidine acetamide inhibitor. 提交 2019-06-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 O5V 2-[4-bromo-2-(3-phenyl-2,5-dihydro-1H-pyrrole-1-carbonyl)phenoxy]-N-(1-propanoylazetidin-3-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Calcium chloride, 20% PEG3350
分辨率 2.11 Å R-free 0.313
6P8Y Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to an acryloylazetidine acetamide inhibitor. 提交 2019-06-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 O5Y 2-[5-bromo-3-(5-methoxy-3,4-dihydroisoquinoline-2(1H)-carbonyl)-1H-indol-1-yl]-N-(1-propanoylazetidin-3-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Sodium citrate pH5.6, 32% PEG4000, 0.005M Magnesium chloride
分辨率 2.31 Å R-free 0.269
6P8Y Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to an acryloylazetidine acetamide inhibitor. 提交 2019-06-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 O5Y 2-[5-bromo-3-(5-methoxy-3,4-dihydroisoquinoline-2(1H)-carbonyl)-1H-indol-1-yl]-N-(1-propanoylazetidin-3-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Sodium citrate pH5.6, 32% PEG4000, 0.005M Magnesium chloride
分辨率 2.31 Å R-free 0.269
6P8Z Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to an acryloylazetidine acetamide inhibitor 提交 2019-06-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 O5S 2-[5-chloro-2-cyclopropyl-3-(5-methoxy-3,4-dihydroisoquinoline-2(1H)-carbonyl)-7-methyl-1H-indol-1-yl]-N-(1-propanoylazetidin-3-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M Calcium chloride, 0.1M TRIS pH8.5, 20% PEG 4000
分辨率 1.65 Å R-free 0.269
6P8Z Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to an acryloylazetidine acetamide inhibitor 提交 2019-06-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S CA CALCIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 O5S 2-[5-chloro-2-cyclopropyl-3-(5-methoxy-3,4-dihydroisoquinoline-2(1H)-carbonyl)-7-methyl-1H-indol-1-yl]-N-(1-propanoylazetidin-3-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M Calcium chloride, 0.1M TRIS pH8.5, 20% PEG 4000
分辨率 1.65 Å R-free 0.269
6PGO Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to a phthalazine inhibitor 提交 2019-06-24 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 OJ1 1-{4-[7-chloro-6-(2-fluoro-6-hydroxyphenyl)-4-phenylphthalazin-1-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium citrate pH5.6, 32% PEG 400, 5mM magnesium chloride
分辨率 1.60 Å R-free 0.231
6PGO Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to a phthalazine inhibitor 提交 2019-06-24 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 OJ1 1-{4-[7-chloro-6-(2-fluoro-6-hydroxyphenyl)-4-phenylphthalazin-1-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium citrate pH5.6, 32% PEG 400, 5mM magnesium chloride
分辨率 1.60 Å R-free 0.231
6PGP Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to a quinazolinone inhibitor 提交 2019-06-24 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 OHY 6-chloro-7-(2-fluoro-6-hydroxyphenyl)-4-(4-propanoylpiperazin-1-yl)-1-[2-(propan-2-yl)phenyl]quinazolin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M calcium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.216
6PGP Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to a quinazolinone inhibitor 提交 2019-06-24 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 OHY 6-chloro-7-(2-fluoro-6-hydroxyphenyl)-4-(4-propanoylpiperazin-1-yl)-1-[2-(propan-2-yl)phenyl]quinazolin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M calcium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.216
6PQ3 Crystal structure of GDP-bound KRAS with ten residues long internal tandem duplication in the switch II region 提交 2019-07-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：Internal tandem duplication of 10 amino acid (55-64) GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM lithium acetate and 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.75 Å R-free 0.217
6PTS NMR data-driven model of KRas-GMPPNP:RBD-CRD complex tethered to a nanodisc (state A) 提交 2019-07-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–185（185 aa）
未记录 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）450；压力 1
NMR测量条件 pH 5.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C KRAS, 0.2 mM U-12C, 14N, 1H RBD-CRD, 0.4 mM U-12C, 14N, 1H MSP, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM U-12C, 14N, 1H KRAS, 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C RBD-CRD, 0.4 mM U-12C, 14N, 1H MSP, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM U-12C, 14N, 1H KRAS, 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM U-12C, 14N, 1H KRAS, 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM U-15N; Ile C-delta-13C, Met methyl-13C KRAS, 0.5 mM Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C, RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 15N]; [U-13C]; RBD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.3 mM [U-99% 15N]; [U-13C]; CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6PTW NMR data-driven model of KRas-GMPPNP:RBD-CRD complex tethered to a nanodisc (state B) 提交 2019-07-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–185（185 aa）
未记录 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）450；压力 1
NMR测量条件 pH 5.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N; U-2H] KRAS, 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] RBD-CRD, 0.4 mM [U-12C; U-14N; U-1H] MSP, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] KRAS, 0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N; U-2H] RBD-CRD, 0.4 mM [U-12C; U-14N; U-1H] MSP, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N] RBD-CRD, 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] KRAS Q43C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N] RBD-CRD, 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] KRAS N-term C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-15N; Ile C-delta-13C; Met methyl-13C] KRAS, 0.5 mM [Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C] RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] RBD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6QUU Crystal Structure of KRAS-G12D in complex with GMP-PCP 提交 2019-02-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.4；277 K；52% MPD, 0.06M MES
分辨率 1.48 Å R-free 0.204
6QUU Crystal Structure of KRAS-G12D in complex with GMP-PCP 提交 2019-02-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.4；277 K；52% MPD, 0.06M MES
分辨率 1.48 Å R-free 0.204
6QUV Crystal Structure of KRAS-G12D in complex with GMP-PCP and compound 15R 提交 2019-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 JJN (6~{a}~{R},11~{b}~{S})-6~{a}-(1,4-dimethylpiperidin-4-yl)-7,11~{b}-dihydro-6~{H}-indolo[2,3-c]isoquinolin-5-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.4；277 K；52% MPD, 0.06 M MES
分辨率 1.48 Å R-free 0.208
6QUW Crystal Structure of KRAS-G12D in Complex with Natural Product-Like Compound 9b 提交 2019-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 JJQ (3~{a}~{R},8~{b}~{S})-2,2,3~{a},8~{b}-tetramethyl-3,4-dihydro-1~{H}-pyrrolo[2,3-b]indole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.4；277 K；52% MPD, 0.06 M MES
分辨率 1.24 Å R-free 0.210
6QUX Crystal Structure of KRAS-G12D in Complex with Natural Product-Like Compound 15 提交 2019-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 JJN (6~{a}~{R},11~{b}~{S})-6~{a}-(1,4-dimethylpiperidin-4-yl)-7,11~{b}-dihydro-6~{H}-indolo[2,3-c]isoquinolin-5-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.4；277 K；52% MPD, 0.06 M MES
分辨率 1.62 Å R-free 0.223
6T5B KRasG12C ligand complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 O7K pyrazinoquinolinone × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50mM HEPES pH 7.4, 100mM NaCl, 2mM MgSO4
分辨率 1.37 Å R-free 0.231
6T5V KRasG12C ligand complex 提交 2019-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MKZ 1-[4-[6-chloranyl-7-(5-methyl-1~{H}-indazol-4-yl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl]propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50mM HEPES 100mM NaCl 2mM MgSO4
分辨率 1.31 Å R-free 0.205
6TAM X-RAY STRUCTURE OF HUMAN K-RAS G12C IN COMPLEX WITH COVALENT ISOQUINOLINONE INHIBITOR (COMPOUND 3) 提交 2019-10-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C, C51S, C80L, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MZQ 7-[2,4-bis(fluoranyl)phenyl]-3-[(3~{R})-1-propanoylpyrrolidin-3-yl]-4~{H}-isoquinolin-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；293 K；100 mM MES pH 6.9 and 34% PEG 4000
分辨率 1.64 Å R-free 0.201
6TAN X-RAY STRUCTURE OF HUMAN K-RAS G12C IN COMPLEX WITH COVALENT ISOQUINOLINONE INHIBITOR (COMPOUND 17) 提交 2019-10-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C, C51S, C80L, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MZN 7-(2-fluoranyl-6-oxidanyl-phenyl)-3-[(3~{R})-1-propanoylpyrrolidin-3-yl]-4~{H}-2,6-naphthyridin-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；293 K；100 NANOLITER COVALENTLY MODIFIED KRAS (CONCENTRATION 18.8 MG/ML, IN 0.02 M HEPES PH 7.5, 0.15 M NACL, 0.001 M MGCL2) ADDED TO 100 NANOLITER RESERVOIR (0.1 M NA-MES PH 6.3, 31 % PEG 4000)
分辨率 1.16 Å R-free 0.183
6USX Identification of the Clinical Development Candidate MRTX849, a Covalent KRASG12C Inhibitor for the Treatment of Cancer 提交 2019-10-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C, C51S, C80L, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 M1R 1-{4-[2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-7-(naphthalen-1-yl)-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；293 K；29% PEG8K 0.1M NaCitrate pH 5.4 0.2M Amm Acetate
分辨率 2.27 Å R-free 0.250
6USX Identification of the Clinical Development Candidate MRTX849, a Covalent KRASG12C Inhibitor for the Treatment of Cancer 提交 2019-10-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C, C51S, C80L, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 M1R 1-{4-[2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-7-(naphthalen-1-yl)-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；293 K；29% PEG8K 0.1M NaCitrate pH 5.4 0.2M Amm Acetate
分辨率 2.27 Å R-free 0.250
6USZ Identification of the Clinical Development Candidate MRTX849, a Covalent KRASG12C Inhibitor for the Treatment of Cancer 提交 2019-10-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C, C51S, C80L, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 QH4 {(2S)-4-[2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-7-(naphthalen-1-yl)-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-1-propanoylpiperazin-2-yl}acetonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；23% PEG8K 0.1M NaCitrate pH 4.6 0.2M Amm Acetate
分辨率 2.03 Å R-free 0.226
6UT0 Identification of the Clinical Development Candidate MRTX849, a Covalent KRASG12C Inhibitor for the Treatment of Cancer 提交 2019-10-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C, C51S, C80L, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 M1X {(2S)-4-[7-(8-chloronaphthalen-1-yl)-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-1-[(2S)-2-fluoropropanoyl]piperazin-2-yl}acetonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；32% PEG 4K 0.1M NaOAc (unbuffered) 8% 2-Propanol
分辨率 1.94 Å R-free 0.222
6UT0 Identification of the Clinical Development Candidate MRTX849, a Covalent KRASG12C Inhibitor for the Treatment of Cancer 提交 2019-10-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C, C51S, C80L, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 M1X {(2S)-4-[7-(8-chloronaphthalen-1-yl)-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-1-[(2S)-2-fluoropropanoyl]piperazin-2-yl}acetonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；32% PEG 4K 0.1M NaOAc (unbuffered) 8% 2-Propanol
分辨率 1.94 Å R-free 0.222
6UT0 Identification of the Clinical Development Candidate MRTX849, a Covalent KRASG12C Inhibitor for the Treatment of Cancer 提交 2019-10-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12C, C51S, C80L, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 M1X {(2S)-4-[7-(8-chloronaphthalen-1-yl)-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-1-[(2S)-2-fluoropropanoyl]piperazin-2-yl}acetonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；32% PEG 4K 0.1M NaOAc (unbuffered) 8% 2-Propanol
分辨率 1.94 Å R-free 0.222
6UT0 Identification of the Clinical Development Candidate MRTX849, a Covalent KRASG12C Inhibitor for the Treatment of Cancer 提交 2019-10-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
突变：G12C, C51S, C80L, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 M1X {(2S)-4-[7-(8-chloronaphthalen-1-yl)-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-1-[(2S)-2-fluoropropanoyl]piperazin-2-yl}acetonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；32% PEG 4K 0.1M NaOAc (unbuffered) 8% 2-Propanol
分辨率 1.94 Å R-free 0.222
6V5L The HADDOCK structure model of GDP KRas in complex with its allosteric inhibitor E22 提交 2019-12-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 QPD (2R)-2-[2-(1H-indole-3-carbonyl)hydrazinyl]-2-phenylacetamide × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）115；压力 1
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）115；压力 1
NMR样品组成 0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] KRAS, 1.0 mM E22, 5 mM [U-99% 2H] DTT, 10 uM [U-99% 2H] DSS, 25 mM nature abundance sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 5 mM MAGNESIUM ION, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] KRas, 1.0 mM E22, 5 mM [U-99% 2H] DTT, 10 uM [U-99% 2H] DSS, 25 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 5 mM MAGNESIUM ION, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
6V65 Crystal structure of KRAS(GMPPNP)-NF1(GRD)-SPRED1 complex 提交 2019-12-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–169（169 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 FMT FORMIC ACID × 4 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；100 mM Tris pH7.8 100 mM ammonium sulfate 300 mM sodium formate 3% PEG3350, 3.5% PGA-LM 10% detergent ANAPOE-80
分辨率 2.76 Å R-free 0.241
6V6F Crystal structure of Q61L KRAS(GMPPNP)-NF1(GRD)-SPRED1(EVH1) complex 提交 2019-12-05 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：Q61L ZN ZINC ION × 1 FMT FORMIC ACID × 4 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；100 mM Tris pH 7.8, 100 mM ammonium sulfate, 300 mM sodium formate, 3% PEG3350, 3.5% PGA-LM 10% detergent ANAPOE-80
分辨率 2.54 Å R-free 0.265
6VC8 Crystal structure of wild-type KRAS4b(1-169) in complex with GMPPNP and Mg ion 提交 2019-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；32% PEG 4000, 800 mM LiCl, 100 mM Magnesium Chloride and 100 mM Tris pH 8.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.277
6VC8 Crystal structure of wild-type KRAS4b(1-169) in complex with GMPPNP and Mg ion 提交 2019-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；32% PEG 4000, 800 mM LiCl, 100 mM Magnesium Chloride and 100 mM Tris pH 8.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.277
6VC8 Crystal structure of wild-type KRAS4b(1-169) in complex with GMPPNP and Mg ion 提交 2019-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；32% PEG 4000, 800 mM LiCl, 100 mM Magnesium Chloride and 100 mM Tris pH 8.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.277
6VJJ Crystal Structure of wild-type KRAS4b (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) of RAF1/CRAF 提交 2020-01-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CL CHLORIDE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.09M Halogens, 0.1M Imidazole.MES pH 6.5, 37.5% MPD, PEG 1000 and PEG 3350
分辨率 1.40 Å R-free 0.195
6W4E NMR-driven structure of KRAS4B-GTP homodimer on a lipid bilayer nanodisc 提交 2020-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–185（184 aa）
链 C 2–185（184 aa）
未记录 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 80 uM ILV 13C-methyl; Lys 15N-amide KRAS4B, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6W4F NMR-driven structure of KRAS4B-GDP homodimer on a lipid bilayer nanodisc 提交 2020-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–185（184 aa）
链 C 2–185（184 aa）
未记录 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 80 uM ILV 13C-methyl; Lys 15N-amide KRAS4B, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6WGN Crystal structure of K-Ras(G12D) GppNHp bound to cyclic peptide ligand KD2 提交 2020-04-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, C51S, C80L, C118S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；PEG 4000, Tris, Lithium sulfate
分辨率 1.60 Å R-free 0.214
6WGN Crystal structure of K-Ras(G12D) GppNHp bound to cyclic peptide ligand KD2 提交 2020-04-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, C51S, C80L, C118S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；PEG 4000, Tris, Lithium sulfate
分辨率 1.60 Å R-free 0.214
6WGN Crystal structure of K-Ras(G12D) GppNHp bound to cyclic peptide ligand KD2 提交 2020-04-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12D, C51S, C80L, C118S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；PEG 4000, Tris, Lithium sulfate
分辨率 1.60 Å R-free 0.214
6WS2 Crystal structure of KRAS-K104Q mutant, GDP-bound 提交 2020-04-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：K104Q GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8.5 and 2 M ammonium sulfate
分辨率 1.59 Å R-free 0.195
6WS2 Crystal structure of KRAS-K104Q mutant, GDP-bound 提交 2020-04-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：K104Q GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8.5 and 2 M ammonium sulfate
分辨率 1.59 Å R-free 0.195
6WS2 Crystal structure of KRAS-K104Q mutant, GDP-bound 提交 2020-04-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：K104Q GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8.5 and 2 M ammonium sulfate
分辨率 1.59 Å R-free 0.195
6WS2 Crystal structure of KRAS-K104Q mutant, GDP-bound 提交 2020-04-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
突变：K104Q GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8.5 and 2 M ammonium sulfate
分辨率 1.59 Å R-free 0.195
6WS4 Crystal structure of KRAS-G12D/K104Q mutant, GDP-bound 提交 2020-04-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, K104Q GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；3.0 % Xylitol, 0.2 M ammonium acetate and 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.84 Å R-free 0.158
6WS4 Crystal structure of KRAS-G12D/K104Q mutant, GDP-bound 提交 2020-04-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, K104Q GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；3.0 % Xylitol, 0.2 M ammonium acetate and 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.84 Å R-free 0.158
6WS4 Crystal structure of KRAS-G12D/K104Q mutant, GDP-bound 提交 2020-04-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12D, K104Q GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；3.0 % Xylitol, 0.2 M ammonium acetate and 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.84 Å R-free 0.158
6WS4 Crystal structure of KRAS-G12D/K104Q mutant, GDP-bound 提交 2020-04-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
突变：G12D, K104Q GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；3.0 % Xylitol, 0.2 M ammonium acetate and 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.84 Å R-free 0.158
6XGU Crystal Structure of KRAS-Q61R (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) and cysteine-rich domain (CRD) of RAF1/CRAF 提交 2020-06-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：Q61R GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；100 mM Tris 7.8, 200 mM KBr, 200 mM KSCN, 3% PGA, 0.35 mM D-myo-phosphatidylinositol 3,4,5-triphosphate
分辨率 2.70 Å R-free 0.236
6XGV Crystal Structure of KRAS-G13D (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) and cysteine-rich domain (CRD) of RAF1/CRAF 提交 2020-06-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G13D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；100 mM sodium cacodylate pH 6.5, 700 mM sodium acetate, 0.35 mM D-myo-phosphatidylinositol 3,4,5-triphosphate
分辨率 2.11 Å R-free 0.204
6XHB Crystal Structure of wild-type KRAS (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) and cysteine-rich domain (CRD) of RAF1/CRAF (crystal form II) 提交 2020-06-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；100 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM sodium citrate, 15% 2-propanol, 0.25% (w/v) n-octyl-beta-D-glucoside, 0.35 mM D-myo-phosphatidylinositol 3,4,5-triphosphate, and 0.25% (w/v) n-dodecyl-beta-D-maltoside
分辨率 2.50 Å R-free 0.221
6YR8 Affimer K6 - KRAS protein complex 提交 2020-04-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；0.1M sodium acetate, 25% w/v PEG 4000, 0.2M ammonium sulfate, 5% MPD
分辨率 1.90 Å R-free 0.246
6YXW Affimer K3 - KRAS protein complex 提交 2020-05-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–167（167 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；291 K；2M ammonium sulfate, 0.2M potassium sodium tartrate, 0.1M tri-sodium citrate
分辨率 2.06 Å R-free 0.278
6YXW Affimer K3 - KRAS protein complex 提交 2020-05-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–167（167 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；291 K；2M ammonium sulfate, 0.2M potassium sodium tartrate, 0.1M tri-sodium citrate
分辨率 2.06 Å R-free 0.278
6ZL5 CRYSTAL STRUCTURE OF KRAS-G12D(C118S) IN COMPLEX WITH BI-2852 AND GDP 提交 2020-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 F0K (3~{S})-3-[2-[[[1-[(1-methylimidazol-4-yl)methyl]indol-6-yl]methylamino]methyl]-1~{H}-indol-3-yl]-5-oxidanyl-2,3-dihydroisoindol-1-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；278 K；2M Ammonium sulfate 100mM Sodium cacodylate 200mM Sodium cloride
分辨率 1.65 Å R-free 0.209
6ZLI CRYSTAL STRUCTURE OF KRAS-G12D IN COMPLEX WITH COMPOUND 13 AND GCP 提交 2020-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；278 K；51.8% MPD 50mM MES PH= 6.4
分辨率 1.73 Å R-free 0.220
6ZLI CRYSTAL STRUCTURE OF KRAS-G12D IN COMPLEX WITH COMPOUND 13 AND GCP 提交 2020-06-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 QME 2-[(2~{R})-piperidin-2-yl]-1~{H}-indole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；278 K；51.8% MPD 50mM MES PH= 6.4
分辨率 1.73 Å R-free 0.220
7A1X KRASG12C GDP form in complex with Cpd1 提交 2020-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 QWB 3-(imidazol-1-ylmethyl)-1~{H}-indole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；TRIS 100mM - PEG 4K 23% - Na Acet 100mM - pH8.5
分辨率 1.32 Å R-free 0.174
7A1Y KRASG12C GDP form in complex with Cpd2 提交 2020-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
突变：G12C QWH ~{N}-(3-bromanyl-2,6-dimethyl-pyridin-4-yl)propanamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；HEPES 100mM - (NH4)2SO4 2.25M - pH7.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.210
7ACA CRYSTAL STRUCTURE OF AN ACTIVE KRAS G12D (GPPCP) DIMER IN COMPLEX WITH BI-5747 提交 2020-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
链 D 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 R6W (3~{S})-5-oxidanyl-3-[2-[[6-[[3-[(1~{S})-6-oxidanyl-3-oxidanylidene-1,2-dihydroisoindol-1-yl]-1~{H}-indol-2-yl]methylamino]hexylamino]methyl]-1~{H}-indol-3-yl]-2,3-dihydroisoindol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；Morpheus Screen D12 Morpheus Alcohol 10% Morpheus Buffer 3 MPD_P1K_P3350 37.5% w/v
分辨率 1.57 Å R-free 0.205
7ACA CRYSTAL STRUCTURE OF AN ACTIVE KRAS G12D (GPPCP) DIMER IN COMPLEX WITH BI-5747 提交 2020-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
链 C 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 R6W (3~{S})-5-oxidanyl-3-[2-[[6-[[3-[(1~{S})-6-oxidanyl-3-oxidanylidene-1,2-dihydroisoindol-1-yl]-1~{H}-indol-2-yl]methylamino]hexylamino]methyl]-1~{H}-indol-3-yl]-2,3-dihydroisoindol-1-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；Morpheus Screen D12 Morpheus Alcohol 10% Morpheus Buffer 3 MPD_P1K_P3350 37.5% w/v
分辨率 1.57 Å R-free 0.205
7ACF CRYSTAL STRUCTURE OF CRYSTAL FORM 2 OF AN ACTIVE KRAS G12D (GPPCP) DIMER IN COMPLEX WITH BI-5747 提交 2020-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 R6W (3~{S})-5-oxidanyl-3-[2-[[6-[[3-[(1~{S})-6-oxidanyl-3-oxidanylidene-1,2-dihydroisoindol-1-yl]-1~{H}-indol-2-yl]methylamino]hexylamino]methyl]-1~{H}-indol-3-yl]-2,3-dihydroisoindol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；278 K；Morpheus Screen E9
分辨率 1.91 Å R-free 0.198
7ACF CRYSTAL STRUCTURE OF CRYSTAL FORM 2 OF AN ACTIVE KRAS G12D (GPPCP) DIMER IN COMPLEX WITH BI-5747 提交 2020-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–169（169 aa）
链 D 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 R6W (3~{S})-5-oxidanyl-3-[2-[[6-[[3-[(1~{S})-6-oxidanyl-3-oxidanylidene-1,2-dihydroisoindol-1-yl]-1~{H}-indol-2-yl]methylamino]hexylamino]methyl]-1~{H}-indol-3-yl]-2,3-dihydroisoindol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；278 K；Morpheus Screen E9
分辨率 1.91 Å R-free 0.198
7ACH CRYSTAL STRUCTURE OF ACTIVE KRAS G12D (GPPCP) IN COMPLEX WITH THE SOAKED DIMERIC INHIBITOR BI-5747 提交 2020-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
未记录 R6W (3~{S})-5-oxidanyl-3-[2-[[6-[[3-[(1~{S})-6-oxidanyl-3-oxidanylidene-1,2-dihydroisoindol-1-yl]-1~{H}-indol-2-yl]methylamino]hexylamino]methyl]-1~{H}-indol-3-yl]-2,3-dihydroisoindol-1-one × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；278 K；MPD 51% v/v 50mM MES pH 6.4
分辨率 1.90 Å R-free 0.214
7ACQ CRYSTAL STRUCTURE OF INACTIVE KRAS G12D (GDP) IN COMPLEX WITH THE SOAKED DIMERIC INHIBITOR BI-5747 提交 2020-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
链 C 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 R6W (3~{S})-5-oxidanyl-3-[2-[[6-[[3-[(1~{S})-6-oxidanyl-3-oxidanylidene-1,2-dihydroisoindol-1-yl]-1~{H}-indol-2-yl]methylamino]hexylamino]methyl]-1~{H}-indol-3-yl]-2,3-dihydroisoindol-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；278 K；200 mM CaCl2 100 mM MES pH6 PEG6000 20% W/v
分辨率 1.86 Å R-free 0.210
7C40 MgGDP bound KRAS G12V 提交 2020-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–168（168 aa）
突变：G12V MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Polyethylene glycol 3,350, 0.2M potassium nitrate (pH 6.8)
分辨率 2.52 Å R-free 0.226
7C41 KRAS G12V and H-REV107 peptide complex 提交 2020-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–168（168 aa）
突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；polyethylene glycol 3350, 0.2 M potassium nitrate at pH 6.8
分辨率 2.28 Å R-free 0.283
7C41 KRAS G12V and H-REV107 peptide complex 提交 2020-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 J 1–168（168 aa）
突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；polyethylene glycol 3350, 0.2 M potassium nitrate at pH 6.8
分辨率 2.28 Å R-free 0.283
7C41 KRAS G12V and H-REV107 peptide complex 提交 2020-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 M 1–168（168 aa）
突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；polyethylene glycol 3350, 0.2 M potassium nitrate at pH 6.8
分辨率 2.28 Å R-free 0.283
7C41 KRAS G12V and H-REV107 peptide complex 提交 2020-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 1–168（168 aa）
突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；polyethylene glycol 3350, 0.2 M potassium nitrate at pH 6.8
分辨率 2.28 Å R-free 0.283
7EW9 GDP-bound KRAS G12D in complex with TH-Z816 提交 2021-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 05C 7-(8-methylnaphthalen-1-yl)-4-[(2~{R})-2-methylpiperazin-1-yl]-2-[[(2~{S})-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy]-6,8-dihydro-5~{H}-pyrido[3,4-d]pyrimidine × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.5；293.15 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.13 Å R-free 0.257
7EW9 GDP-bound KRAS G12D in complex with TH-Z816 提交 2021-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 05C 7-(8-methylnaphthalen-1-yl)-4-[(2~{R})-2-methylpiperazin-1-yl]-2-[[(2~{S})-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy]-6,8-dihydro-5~{H}-pyrido[3,4-d]pyrimidine × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.5；293.15 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.13 Å R-free 0.257
7EW9 GDP-bound KRAS G12D in complex with TH-Z816 提交 2021-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.5；293.15 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.13 Å R-free 0.257
7EWA GDP-bound KRAS G12D in complex with TH-Z827 提交 2021-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 05F 4-[(1~{R},5~{S})-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]-7-(8-methylnaphthalen-1-yl)-2-[[(2~{S})-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy]-6,8-dihydro-5~{H}-pyrido[3,4-d]pyrimidine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.5；297 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.25 Å R-free 0.258
7EWA GDP-bound KRAS G12D in complex with TH-Z827 提交 2021-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 05F 4-[(1~{R},5~{S})-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]-7-(8-methylnaphthalen-1-yl)-2-[[(2~{S})-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy]-6,8-dihydro-5~{H}-pyrido[3,4-d]pyrimidine × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.5；297 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.25 Å R-free 0.258
7EWA GDP-bound KRAS G12D in complex with TH-Z827 提交 2021-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.5；297 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.25 Å R-free 0.258
7EWB GDP-bound KRAS G12D in complex with TH-Z835 提交 2021-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 05I 4-[(1~{S},5~{R})-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-7-(8-methylnaphthalen-1-yl)-2-[[(2~{S})-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy]-6,8-dihydro-5~{H}-pyrido[3,4-d]pyrimidine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；297 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26 % (w/v) PEG 3350
分辨率 1.99 Å R-free 0.246
7EWB GDP-bound KRAS G12D in complex with TH-Z835 提交 2021-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 05I 4-[(1~{S},5~{R})-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-7-(8-methylnaphthalen-1-yl)-2-[[(2~{S})-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy]-6,8-dihydro-5~{H}-pyrido[3,4-d]pyrimidine × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；297 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26 % (w/v) PEG 3350
分辨率 1.99 Å R-free 0.246
7EWB GDP-bound KRAS G12D in complex with TH-Z835 提交 2021-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 05I 4-[(1~{S},5~{R})-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-7-(8-methylnaphthalen-1-yl)-2-[[(2~{S})-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy]-6,8-dihydro-5~{H}-pyrido[3,4-d]pyrimidine × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；297 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26 % (w/v) PEG 3350
分辨率 1.99 Å R-free 0.246
7KFZ Structure of a ternary KRas(G13D)-SOS complex 提交 2020-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–169（169 aa）
链 C 1–169（169 aa）
突变：G13D 突变：G13D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
7KMR Crystal structure analysis of human KRAS mutant 提交 2020-11-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–185（185 aa）
突变：A59E GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；300 K；1.5 M sodium malonate, 0.1 M HEPES, pH 7.5
分辨率 1.51 Å R-free 0.197
7KYZ Solution structures of full-length K-RAS bound to GDP 提交 2020-12-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–188（188 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 1
NMR样品组成 0.7-0.9 mM [U-100% 15N] GTPase KRas, 20 mM [U-2H] MES, 100 mM potassium chloride, 50 mM sodium chloride, 2 mM MgCl2, 1 mM [U-2H] TCEP, 7 mM [U-2H] D2O, 0.05 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.7-0.9 mM [U-13C; U-15N] GTPase KRas, 20 mM [U-2H] MES, 100 mM potassium chloride, 50 mM sodium chloride, 2 mM MgCl2, 1 mM [U-2H] TCEP, 7 mM [U-2H] D2O, 0.05 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7LC1 Crystal Structure of KRAS4b (GMPPNP-bound) in complex with the RBD-PH domains of SIN1 提交 2021-01-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：Q25A MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；200 mM ammonium sulfate, 100 mM HEPES (N-2-hydroxyethyl piperazine-N-ethane sulfonic acid) pH 7.5, 25% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.279
7LC1 Crystal Structure of KRAS4b (GMPPNP-bound) in complex with the RBD-PH domains of SIN1 提交 2021-01-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：Q25A MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；200 mM ammonium sulfate, 100 mM HEPES (N-2-hydroxyethyl piperazine-N-ethane sulfonic acid) pH 7.5, 25% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.279
7LC2 Crystal Structure of KRAS4b-Q61R (GMPPNP-bound) in complex with the RAS-binding domain (RBD) of SIN1 提交 2021-01-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：Q61R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；100mM MMT buffer (DL-malic acid, MES and Tris base in 1:2:2 ratio) pH 5, 25% PEG (polyethylene glycol) 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.287
7LC2 Crystal Structure of KRAS4b-Q61R (GMPPNP-bound) in complex with the RAS-binding domain (RBD) of SIN1 提交 2021-01-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：Q61R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；100mM MMT buffer (DL-malic acid, MES and Tris base in 1:2:2 ratio) pH 5, 25% PEG (polyethylene glycol) 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.287
7LGI The haddock model of GDP KRas in complex with promazine using chemical shift perturbations and intermolecular NOEs 提交 2021-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 P2Z Promazine × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）115；压力 1 PA
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）115；压力 1 PA
NMR样品组成 0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] KRAS, 1.0 mM P2Z, 5 mM [U-99% 2H] DTT, 10 uM [U-99% 2H] DSS, 25 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] KRAS, 1.0 mM P2Z, 5 mM [U-99% 2H] DTT, 10 uM [U-99% 2H] DSS, 25 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
7MQU The haddock model of GDP KRas in complex with promethazine using NMR chemical shift perturbations 提交 2021-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZM7 (2R)-N,N-dimethyl-1-(10H-phenothiazin-10-yl)propan-2-amine × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）115；压力 1
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）115；压力 1
NMR样品组成 0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] GTPase KRas, 1.0 mM PMZ, 5 mM [U-99% 2H] DTT, 25 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 10 uM [U-99% 2H] DSS, 5 mM MAGNESIUM ION, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] GTPase KRas, 1.0 mM PMZ, 5 mM [U-99% 2H] DTT, 25 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 5 mM MAGNESIUM ION, 10 uM [U-99% 2H] DSS, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
7NY8 Affimer K69 - KRAS protein complex 提交 2021-03-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–167（167 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M imidazole, 0.1M MES monohydrate, 20% w/v PEG 500 MME, 10% w/v PEG 20000, 0.12M 1,6-hexanediol, 0.12M 1,2-propanediol, 0.12M 1,4-butanediol, 0.12M 1-butanol, 0.12M 2-propanol, 0.12M 1,3-propanediol
分辨率 1.80 Å R-free 0.210
7NY8 Affimer K69 - KRAS protein complex 提交 2021-03-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–167（167 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M imidazole, 0.1M MES monohydrate, 20% w/v PEG 500 MME, 10% w/v PEG 20000, 0.12M 1,6-hexanediol, 0.12M 1,2-propanediol, 0.12M 1,4-butanediol, 0.12M 1-butanol, 0.12M 2-propanol, 0.12M 1,3-propanediol
分辨率 1.80 Å R-free 0.210
7O70 KRasG12C ligand complex 提交 2021-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 V4T 1-[(4R,7S)-12-chloro-14-fluoro-13-(2-fluoro-6-hydroxyphenyl)-4-methyl-10-oxa-2,5,16,18-tetrazatetracyclo[9.7.1.0^(2,7).0^(15,19)]nonadeca-1(18),11,13,15(19),16-pentaen-5-en-1-one-yl]prop-2 × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50mM HEPES pH 7.4, 100mM NaCl, 2mM MgSO4
分辨率 1.18 Å R-free 0.257
7O70 KRasG12C ligand complex 提交 2021-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
未记录 V4T 1-[(4R,7S)-12-chloro-14-fluoro-13-(2-fluoro-6-hydroxyphenyl)-4-methyl-10-oxa-2,5,16,18-tetrazatetracyclo[9.7.1.0^(2,7).0^(15,19)]nonadeca-1(18),11,13,15(19),16-pentaen-5-en-1-one-yl]prop-2 × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50mM HEPES pH 7.4, 100mM NaCl, 2mM MgSO4
分辨率 1.18 Å R-free 0.257
7OO7 KRasG12C ligand complex 提交 2021-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
突变：G12C MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 VLE 1-[(6aS)-3-chloro-2-(5-methyl-1H-indazol-4-yl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':5,6][1,5]oxazocino[4,3,2-de]quinazolin-8-yl]-2-propen-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；50mM HEPES 100mM NaCl 2mM MgSO4
分辨率 1.48 Å R-free 0.226
7OO7 KRasG12C ligand complex 提交 2021-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–164（164 aa）
突变：G12C MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 VLE 1-[(6aS)-3-chloro-2-(5-methyl-1H-indazol-4-yl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':5,6][1,5]oxazocino[4,3,2-de]quinazolin-8-yl]-2-propen-1-one × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；50mM HEPES 100mM NaCl 2mM MgSO4
分辨率 1.48 Å R-free 0.226
7Q9U Crystal structure of the high affinity KRas mutant PDE6D complex 提交 2021-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 1–185（185 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FAR FARNESYL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Ammonium sulphate, 0.1 M tri sodium citrate pH 5.6, 15 % w/v PEG 4000
分辨率 2.24 Å R-free 0.255
7Q9U Crystal structure of the high affinity KRas mutant PDE6D complex 提交 2021-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 BBB 1–185（185 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FAR FARNESYL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Ammonium sulphate, 0.1 M tri sodium citrate pH 5.6, 15 % w/v PEG 4000
分辨率 2.24 Å R-free 0.255
7R0M KRasG12C in complex with GDP and JDQ443 提交 2022-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 H2T 1-[6-[4-(5-chloranyl-6-methyl-1~{H}-indazol-4-yl)-5-methyl-3-(1-methylindazol-5-yl)pyrazol-1-yl]-2-azaspiro[3.3]heptan-2-yl]propan-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 4000, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M CaCl2
分辨率 1.61 Å R-free 0.249
7R0M KRasG12C in complex with GDP and JDQ443 提交 2022-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 H2T 1-[6-[4-(5-chloranyl-6-methyl-1~{H}-indazol-4-yl)-5-methyl-3-(1-methylindazol-5-yl)pyrazol-1-yl]-2-azaspiro[3.3]heptan-2-yl]propan-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG 4000, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M CaCl2
分辨率 1.61 Å R-free 0.249
7R0N KRasG12C in complex with GDP and compound 2 提交 2022-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 H40 ~{N}-[4-[2-bromanyl-6-(2-hydroxyethylamino)pyridin-4-yl]sulfanylphenyl]propanamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；33% PEG 6000, 0.01 M NaCitrate
分辨率 1.20 Å R-free 0.222
7R0Q KRasG12C in complex with GDP and compound 3 提交 2022-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 H0O ~{N}-[4-[3,5-dimethyl-4-(5-methyl-2~{H}-indazol-4-yl)pyrazol-1-yl]phenyl]propanamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG 4000, 0.1 M TRIS HCl pH 8.5, 0.2 M CaCl2
分辨率 1.95 Å R-free 0.292
7R0Q KRasG12C in complex with GDP and compound 3 提交 2022-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 H0O ~{N}-[4-[3,5-dimethyl-4-(5-methyl-2~{H}-indazol-4-yl)pyrazol-1-yl]phenyl]propanamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG 4000, 0.1 M TRIS HCl pH 8.5, 0.2 M CaCl2
分辨率 1.95 Å R-free 0.292
7ROV KRAS G12D Mutant in complex with GMPPCP and cyclic peptide MP-9903 提交 2021-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–188（188 aa）
突变：G12D GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；100mM Bis-Tris and 25% PEG 4000
分辨率 1.32 Å R-free 0.216
7ROV KRAS G12D Mutant in complex with GMPPCP and cyclic peptide MP-9903 提交 2021-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–188（188 aa）
突变：G12D GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；100mM Bis-Tris and 25% PEG 4000
分辨率 1.32 Å R-free 0.216
7RP2 Crystal structure of Kas G12C in complex with 2H11 CLAMP 提交 2021-08-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CAC CACODYLATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 40% 2-methyl 2,4-pentanediol (MPD), 7% PEG 8000, 0.5% ethyl acetate, 10 mM spermine tetrahydrochloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
7RP4 Crystal structure of KRAS G12C in complex with GNE-1952 提交 2021-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–169（168 aa）
突变：G12C MKZ 1-[4-[6-chloranyl-7-(5-methyl-1~{H}-indazol-4-yl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl]propan-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.10% n-Octyl-B-D-glucoside, 0.1 M sodium citrate pH 5.5, 22% PEG 3350
分辨率 2.15 Å R-free 0.253
7RP4 Crystal structure of KRAS G12C in complex with GNE-1952 提交 2021-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–169（168 aa）
突变：G12C MKZ 1-[4-[6-chloranyl-7-(5-methyl-1~{H}-indazol-4-yl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl]propan-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.10% n-Octyl-B-D-glucoside, 0.1 M sodium citrate pH 5.5, 22% PEG 3350
分辨率 2.15 Å R-free 0.253
7RSC NMR-driven structure of the KRAS4B-G12D "alpha-alpha" dimer on a lipid bilayer nanodisc 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–185（184 aa）
链 B 2–185（184 aa）
突变：G12D 突变：G12D GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 7Q9 [(2~{R})-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-2-propanoyloxy-propyl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 128 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 32 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 80 uM ILV 13C-methyl; Lys 15N-amide KRAS4B, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7RSE NMR-driven structure of the KRAS4B-G12D "alpha-beta" dimer on a lipid bilayer nanodisc 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–185（184 aa）
链 B 2–185（184 aa）
突变：G12D 突变：G12D GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 7Q9 [(2~{R})-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-2-propanoyloxy-propyl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 128 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 32 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 80 uM ILV 13C-methyl; Lys 15N-amide KRAS4B, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7SCW KRAS full length wild-type in complex with RGL1 Ras association domain 提交 2021-09-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.05M Magnesium acetate tetrahydrate, 0.1M MES (pH 6.5), 26% v/v PEG 400
分辨率 1.98 Å R-free 0.192
7SCX KRAS full-length G12V in complex with RGL1 Ras association domain 提交 2021-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–188（188 aa）
突变：G12V MG MAGNESIUM ION × 2 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M BIS-TRIS (pH 5.5), 25% w/v PEG 3350
分辨率 1.96 Å R-free 0.214
7T47 KRAS G12D (GppCp) with MRTX-1133 提交 2021-12-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa） 片段：UNP residues 1-164
突变：G12D, C51S, C80L, C118S 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.1 M sodium acetate, 8% v/v isopropanol, 22% PEG4000
分辨率 1.27 Å R-free 0.172
7TLE Crystal Structure of small molecule beta-lactone 1 covalently bound to K-Ras(G12S) 提交 2022-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
突变：G12S MG MAGNESIUM ION × 1 I6T (3R,4R)-1-[7-(8-chloronaphthalen-1-yl)-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-3-hydroxypiperidine-4-carbaldehyde × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.1 M sodium acetate, 30% w/v PEG MME 2K, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.99 Å R-free 0.234
7TLG Crystal Structure of small molecule beta-lactone 5 covalently bound to K-Ras(G12S) 提交 2022-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
突变：G12S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 I7H (3R,4R)-1-[7-(8-chloronaphthalen-1-yl)-8-fluoro-2-{[(4S,7as)-tetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]-3-hydroxypiperidine-4-carbaldehyde × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES, 30% PEG 4K
分辨率 1.80 Å R-free 0.233
7TLG Crystal Structure of small molecule beta-lactone 5 covalently bound to K-Ras(G12S) 提交 2022-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–164（164 aa）
突变：G12S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 I7H (3R,4R)-1-[7-(8-chloronaphthalen-1-yl)-8-fluoro-2-{[(4S,7as)-tetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]-3-hydroxypiperidine-4-carbaldehyde × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES, 30% PEG 4K
分辨率 1.80 Å R-free 0.233
7TLK Crystal Structure of K-Ras(G12S) 提交 2022-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
突变：G12S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.7；293 K；0.1 M Tris, 0.2 M CaCl2, 25% PEG 4K
分辨率 1.71 Å R-free 0.205
7TLK Crystal Structure of K-Ras(G12S) 提交 2022-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–164（164 aa）
突变：G12S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.7；293 K；0.1 M Tris, 0.2 M CaCl2, 25% PEG 4K
分辨率 1.71 Å R-free 0.205
7U8H Discovery of a KRAS G12V Inhibitor in vivo Tool Compound starting from an HSQC-NMR based Fragment Hit 提交 2022-03-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V 2XO 1H-benzimidazol-2-ylmethanethiol × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 LX6 2-amino-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291.15 K；30% PEG3350, 0.1 M bicine pH 8.5, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.70 Å R-free 0.199
7U8H Discovery of a KRAS G12V Inhibitor in vivo Tool Compound starting from an HSQC-NMR based Fragment Hit 提交 2022-03-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12V 2XO 1H-benzimidazol-2-ylmethanethiol × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 LX6 2-amino-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291.15 K；30% PEG3350, 0.1 M bicine pH 8.5, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.70 Å R-free 0.199
7U8H Discovery of a KRAS G12V Inhibitor in vivo Tool Compound starting from an HSQC-NMR based Fragment Hit 提交 2022-03-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12V 2XO 1H-benzimidazol-2-ylmethanethiol × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291.15 K；30% PEG3350, 0.1 M bicine pH 8.5, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.70 Å R-free 0.199
7U8H Discovery of a KRAS G12V Inhibitor in vivo Tool Compound starting from an HSQC-NMR based Fragment Hit 提交 2022-03-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
突变：G12V 2XO 1H-benzimidazol-2-ylmethanethiol × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291.15 K；30% PEG3350, 0.1 M bicine pH 8.5, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.70 Å R-free 0.199
7VVB Crystal Structure of KRas4A(GMPPNP-bound) in complex with the Ras-binding domain(RBD) of SIN1 提交 2021-11-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–189（189 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；278 K；PEG 5000 MME
分辨率 1.70 Å R-free 0.197
7YUZ Human K-Ras G12D (GDP-bound) in complex with cyclic peptide inhibitor AP8784 提交 2022-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IOD IODIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium iodide, 20.0 %w/v Polyethylene glycol 3,350, and 25%v/v Ethylene glycol as a cryoprotectant
分辨率 1.88 Å R-free 0.298
7YV1 Human K-Ras G12D (GDP-bound) in complex with cyclic peptide inhibitor LUNA18 and KA30L Fab 提交 2022-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.0 %v/v Tacsimate (pH 5.0), 0.1 M tri-Sodium citrate (pH 5.6), 16.0 %w/v Polyethylene glycol 3,350, and 25 %v/v Ethylene glycerol as a cryoprotectant
分辨率 1.45 Å R-free 0.277
8AFB CRYSTAL STRUCTURE OF KRAS-G12C IN COMPLEX WITH COMPOUND 23 (BI-0474) 提交 2022-07-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 LXD (4~{S})-2-azanyl-4-[3-[6-[(2~{S})-2,4-dimethylpiperazin-1-yl]-4-(4-prop-2-enoylpiperazin-1-yl)pyridin-2-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；10% PEG8000, 10% PEG1000
分辨率 1.12 Å R-free 0.222
8AFC CRYSTAL STRUCTURE OF KRAS-G12C IN COMPLEX WITH COMPOUND 12 提交 2022-07-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 LXK 2-azanyl-4,4-dimethyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；100mM NaAc pH 5, 1.5M Ammoniumsulfate
分辨率 2.41 Å R-free 0.266
8AFC CRYSTAL STRUCTURE OF KRAS-G12C IN COMPLEX WITH COMPOUND 12 提交 2022-07-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；100mM NaAc pH 5, 1.5M Ammoniumsulfate
分辨率 2.41 Å R-free 0.266
8AFD CRYSTAL STRUCTURE OF BIT-BLOCKED KRAS-G12V-S39C IN COMPLEX WITH COMPOUND 20a 提交 2022-07-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 2XO 1H-benzimidazol-2-ylmethanethiol × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 LXU (4~{S})-4-[3-(4-aminophenyl)-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-2-azanyl-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；297 K；100mM PCB pH 5.9, 20% PEG 1500
分辨率 1.63 Å R-free 0.265
8AFD CRYSTAL STRUCTURE OF BIT-BLOCKED KRAS-G12V-S39C IN COMPLEX WITH COMPOUND 20a 提交 2022-07-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 2XO 1H-benzimidazol-2-ylmethanethiol × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 LXU (4~{S})-4-[3-(4-aminophenyl)-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-2-azanyl-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；297 K；100mM PCB pH 5.9, 20% PEG 1500
分辨率 1.63 Å R-free 0.265
8AFD CRYSTAL STRUCTURE OF BIT-BLOCKED KRAS-G12V-S39C IN COMPLEX WITH COMPOUND 20a 提交 2022-07-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 2XO 1H-benzimidazol-2-ylmethanethiol × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；297 K；100mM PCB pH 5.9, 20% PEG 1500
分辨率 1.63 Å R-free 0.265
8AFD CRYSTAL STRUCTURE OF BIT-BLOCKED KRAS-G12V-S39C IN COMPLEX WITH COMPOUND 20a 提交 2022-07-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 2XO 1H-benzimidazol-2-ylmethanethiol × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；297 K；100mM PCB pH 5.9, 20% PEG 1500
分辨率 1.63 Å R-free 0.265
8AQ5 KRAS G12C IN COMPLEX WITH GDP AND COMPOUND 16 提交 2022-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 NZ6 1-[6-[4-(5-chloranyl-6-methyl-1~{H}-indazol-4-yl)-5-methyl-3-phenyl-pyrazol-1-yl]-2-azaspiro[3.3]heptan-2-yl]propan-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG 3350, 0.1 M sodium acetate
分辨率 1.80 Å R-free 0.215
8AQ7 KRAS G12C IN COMPLEX WITH GDP AND COMPOUND 9 提交 2022-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 NZX 1-[6-[3-cyclohexyl-5-methyl-4-(5-methyl-1~{H}-indazol-4-yl)pyrazol-1-yl]-2-azaspiro[3.3]heptan-2-yl]propan-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30 % PEG 4000, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M MgCl2
分辨率 1.65 Å R-free 0.253
8AQ7 KRAS G12C IN COMPLEX WITH GDP AND COMPOUND 9 提交 2022-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 NZX 1-[6-[3-cyclohexyl-5-methyl-4-(5-methyl-1~{H}-indazol-4-yl)pyrazol-1-yl]-2-azaspiro[3.3]heptan-2-yl]propan-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30 % PEG 4000, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M MgCl2
分辨率 1.65 Å R-free 0.253
8AZR KRAS in complex with precursor 1 提交 2022-09-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 LR4 (4~{S})-2-azanyl-4-[3-[6-[(2~{S})-2,4-dimethylpiperazin-1-yl]pyridin-2-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2mM Magnesiumchloride, 20% PEG 2000, 100mM sodium acetate pH 4.4
分辨率 1.60 Å R-free 0.232
8AZV KRAS in complex with BI-2865 提交 2022-09-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 OFU (4S)-2-azanyl-4-methyl-4-[3-[4-[(1S)-1-[(2S)-1-methylpyrrolidin-1-ium-2-yl]ethoxy]pyrimidin-2-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2mM Magnesium Chloride, 20% PEG 2000, 100mM sodium acetate pH 4.4
分辨率 1.05 Å R-free 0.173
8AZX KRAS-G12C in complex with BI-2865 提交 2022-09-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 OFU (4S)-2-azanyl-4-methyl-4-[3-[4-[(1S)-1-[(2S)-1-methylpyrrolidin-1-ium-2-yl]ethoxy]pyrimidin-2-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2mM Magnesium Chloride, 20% PEG 2000, 100mM sodium acetate pH 4.4
分辨率 1.04 Å R-free 0.197
8AZY KRAS-G12D in complex with BI-2865 提交 2022-09-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 OFU (4S)-2-azanyl-4-methyl-4-[3-[4-[(1S)-1-[(2S)-1-methylpyrrolidin-1-ium-2-yl]ethoxy]pyrimidin-2-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2mM Magnesium Chloride, 20% PEG 2000, 100mM sodium acetate pH 4.4
分辨率 1.09 Å R-free 0.197
8AZZ KRAS-G12V in complex with BI-2865 提交 2022-09-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 OFU (4S)-2-azanyl-4-methyl-4-[3-[4-[(1S)-1-[(2S)-1-methylpyrrolidin-1-ium-2-yl]ethoxy]pyrimidin-2-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2mM Magnesium Chloride, 20% PEG 2000, 100mM sodium acetate pH 4.4
分辨率 1.02 Å R-free 0.167
8B00 KRAS-G13D in complex with BI-2865 提交 2022-09-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 OFU (4S)-2-azanyl-4-methyl-4-[3-[4-[(1S)-1-[(2S)-1-methylpyrrolidin-1-ium-2-yl]ethoxy]pyrimidin-2-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2mM Magnesium Chloride, 20% PEG 2000, 100mM sodium acetate pH 4.4
分辨率 1.04 Å R-free 0.161
8B6I KRasG12C ligand complex 提交 2022-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PQI 1-[(4~{a}~{S})-7-chloranyl-8-(5-methyl-2~{H}-indazol-4-yl)-1,2,4,4~{a},5,11-hexahydropyrazino[2,1-c][1,4]benzoxazepin-3-yl]propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350 LITHIUM SULFATE
分辨率 1.70 Å R-free 0.241
8B6I KRasG12C ligand complex 提交 2022-09-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PQI 1-[(4~{a}~{S})-7-chloranyl-8-(5-methyl-2~{H}-indazol-4-yl)-1,2,4,4~{a},5,11-hexahydropyrazino[2,1-c][1,4]benzoxazepin-3-yl]propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350 LITHIUM SULFATE
分辨率 1.70 Å R-free 0.241
8B78 KRasG12C ligand complex 提交 2022-09-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PUO 1-[(4~{a}~{R})-8-(2-chloranyl-6-oxidanyl-phenyl)-7-fluoranyl-9-prop-1-ynyl-1,2,4,4~{a},5,11-hexahydropyrazino[2,1-c][1,4]benzoxazepin-3-yl]propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350 LITHIUM SULFATE
分辨率 1.11 Å R-free 0.236
8BLR G13D mutant of KRAS4b (2-169) bound to GDP with the switch-I in fully open conformation 提交 2022-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–169（168 aa）
突变：G13D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；2.4M sodium malonate pH 7
分辨率 1.40 Å R-free 0.144
8CPR G13D mutant of KRAS4b (2-169) bound to GDP with the switch-I in fully open conformation crystallized in sodium potassium phosphate buffer 提交 2023-03-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–169（168 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.4 M Na/K Phosphate pH around 8.8 OR 0.9 M Na/K Phosphate pH 9.1 (sodium potassium phosphate), 0.5 M Na/K Phosphate pH 8.3
分辨率 2.00 Å R-free 0.248
8DNI Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound with Araxes WO2020/028706A1 compound I-1 提交 2022-07-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 U4L (4P)-4-(5-methyl-1H-indazol-4-yl)-6-(2-propanoyl-2,6-diazaspiro[3.4]octan-6-yl)-2-(pyrrolidin-1-yl)pyrimidine-5-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.001M MgCl2, 0.1M MES pH6.5, 30% PEG4000
分辨率 1.50 Å R-free 0.254
8ECR KRAS4B 1-185 (C185S) bound to GDP-Mg2+ 提交 2022-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–185（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；20% PEG8000, 200 mM Magnesium chloride, 100 mM Tris-HCl pH 8.5
分辨率 1.42 Å R-free 0.169
8ECR KRAS4B 1-185 (C185S) bound to GDP-Mg2+ 提交 2022-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–185（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；20% PEG8000, 200 mM Magnesium chloride, 100 mM Tris-HCl pH 8.5
分辨率 1.42 Å R-free 0.169
8EDY KRAS4b A146T 1-185 bound to GDP 提交 2022-09-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–185（185 aa）
突变：A146T GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；22% PEG3350, 200 mM lithium citrate, 10 uM GDP, 1 mM magnesium chloride, 2 mM DTT, 20 mM sodium chloride, 10 mM Tris-HCl, pH 8
分辨率 1.18 Å R-free 0.172
8EER KRAS4B A146V 1-185 bound to GDP 提交 2022-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–185（185 aa）
突变：A146V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；22% PEG3350, 200 mM lithium citrate, 10 mM Tris-HCl pH 8, 20 mM NaCl, 2 mM DTT, 1 mM magnesium chloride, 10 uM GDP, 12.8 mg/mL KRAS4B A146V
分辨率 1.18 Å R-free 0.172
8EIE KRAS4b K117N 1-185 bound to GNP-Mg2+ 提交 2022-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–185（185 aa）
突变：K117N GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；30% PEG4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 20 mM sodium chloride, 1 mM magnesium chloride, 2 mM DTT, 2 mM GNP, 15 mg/ml KRAS K117N
分辨率 1.41 Å R-free 0.205
8EPW Crystal Structure of KRAS4b-G13D (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) of RAF1/CRAF 提交 2022-10-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G13D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M potassium bromide, 30% PEG 2000 MME
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
8EZG Monobody 12D1 bound to KRAS(G12D) 提交 2022-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–168（168 aa）
突变：G12D, C51S, C80L, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；2.8 M sodium acetate trihydrate
分辨率 2.52 Å R-free 0.213
8FMJ Crystal structure of human KRAS in space group R32 提交 2022-12-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Tris 0.1 M pH 7.8 - 8.0 NaAc 0.2 M PEG3350 30-34%
分辨率 1.33 Å R-free 0.167
8FMK Crystal structure of human KRAS with extended switch I loop 提交 2022-12-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；(NH)4Cl 0.2 M PEG3350 20-24%
分辨率 1.48 Å R-free 0.237
8G42 KRAS G12C complex with GDP imaged on a cryo-EM imaging scaffold 提交 2023-02-08 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
8G47 KRAS G12C complex with GDP and AMG 510 imaged on a cryo-EM imaging scaffold 提交 2023-02-08 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MOV AMG 510 (bound form) × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.19 Å
8G4F KRAS G12V complex with GDP imaged on a cryo-EM imaging scaffold 提交 2023-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–166（166 aa）
突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8G4H KRAS G13C complex with GDP imaged on a cryo-EM imaging scaffold 提交 2023-02-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G13C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
8G9P Tricomplex of RMC-4998, KRAS G12C, and CypA 提交 2023-02-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 YV2 (2S)-2-{(5S)-7-[(2E)-4-(dimethylamino)-4-methylpent-2-enoyl]-1-oxo-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(1P,8S,10R,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]-3-methylbutanamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；22% PEG 3350, 100 mM NaCl
分辨率 1.50 Å R-free 0.188
8G9P Tricomplex of RMC-4998, KRAS G12C, and CypA 提交 2023-02-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 YV2 (2S)-2-{(5S)-7-[(2E)-4-(dimethylamino)-4-methylpent-2-enoyl]-1-oxo-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(1P,8S,10R,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]-3-methylbutanamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；22% PEG 3350, 100 mM NaCl
分辨率 1.50 Å R-free 0.188
8G9Q Tricomplex of Compound-1, KRAS G12C, and CypA 提交 2023-02-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 YV6 methyl (3S)-1-[N-(4-sulfanylbutanoyl)-L-valyl-3-hydroxy-L-phenylalanyl]-1,2-diazinane-3-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；22% PEG 3350, 100 mM NaCl, 100 mM Bis-Tris pH 5.5
分辨率 1.40 Å R-free 0.214
8I5E Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS peptide (VVGAGGVGK) 提交 2023-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 8–16（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1 M Tris. 8.0. 25% v/v PEG 350 MME.
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
8JGD GDP-bound KRAS G12C in complex with YK-8S 提交 2023-05-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DWI (2~{S})-1-[4-[7-(8-ethynyl-7-fluoranyl-naphthalen-1-yl)-8-fluoranyl-2-[[(2~{R},8~{S})-2-fluoranyl-1,2,3,5,6,7-hexahydropyrrolizin-8-yl]methoxy]pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]piperazin-1-yl]-2-oxidanyl-propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；200mM calcium acetate,100mM MES(PH 5.5-6.5),PEG 8000 16%-24%
分辨率 1.60 Å R-free 0.201
8JHL GDP-bound KRAS G12D in complex with YK-8S 提交 2023-05-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DNU 1-[4-[7-(8-ethynyl-7-fluoranyl-naphthalen-1-yl)-8-fluoranyl-2-[[(2~{R},8~{S})-2-fluoranyl-1,2,3,5,6,7-hexahydropyrrolizin-8-yl]methoxy]pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]piperazin-1-yl]-3-oxidanyl-propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；200mM calcium acetate,100mM MES(PH 5.5-6.5),PEG 8000 16%-24%
分辨率 2.10 Å R-free 0.208
8JJS Human K-Ras G12D (GDP-bound) in complex with cyclic peptide inhibitor AP10343 提交 2023-05-31 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–174（173 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.0 M Ammonium sulfate, 25 %(v/v) Ethylene glycol as cryoprotectant
分辨率 1.53 Å R-free 0.242
8K4T Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12C peptide (VVVGACGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 7–16（10 aa）
突变：G12C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate,Sodium cacodylate pH 6.0, PEG 4000
分辨率 2.30 Å R-free 0.316
8K4T Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12C peptide (VVVGACGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 7–16（10 aa）
突变：G12C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate,Sodium cacodylate pH 6.0, PEG 4000
分辨率 2.30 Å R-free 0.316
8K4V Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12R peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 7–16（10 aa）
突变：G12R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 3.10 Å R-free 0.347
8K4V Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12R peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 7–16（10 aa）
突变：G12R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 3.10 Å R-free 0.347
8K4V Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12R peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 7–16（10 aa）
突变：G12R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 3.10 Å R-free 0.347
8K4V Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12R peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 7–16（10 aa）
突变：G12R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 3.10 Å R-free 0.347
8K50 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12V peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 7–16（10 aa）
突变：G12V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
8K50 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12V peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 7–16（10 aa）
突变：G12V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
8K50 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12V peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 7–16（10 aa）
突变：G12V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
8K50 Crystal structure of HLA-A*11:01 in complex with KRAS G12V peptide (VVVGARGVGK) 提交 2023-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 7–16（10 aa）
突变：G12V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Ammonium sulfate, Sodium cacodylate, PEG 4000
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
8ONV KRAS-G13D in complex with BI-2493 提交 2023-04-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 VU6 (7~{S})-2'-azanyl-3-[2-[(2~{S})-2-methylpiperazin-1-yl]pyrimidin-4-yl]spiro[5,6-dihydro-4~{H}-1,2-benzoxazole-7,4'-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophene]-3'-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；278 K；0.2mM MgCl2, 15-27% PEG 2000, 100mM sodium acetate pH=4.4
分辨率 1.01 Å R-free 0.157
8QU8 PROTAC-mediated complex of KRAS with VHL/Elongin-B/Elongin-C/Cullin-2/Rbx1 提交 2023-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 1–164（164 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QUG KRAS-G12C in Complex with Compound 1 提交 2023-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 WYU (4S)-2-azanyl-4-methyl-4-[3-[2-[(2S)-2-methyl-1,4-diazepan-1-yl]pyrimidin-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；25% PEG3350, 0.1 M BisTris, 0.27M NH4Ac
分辨率 1.56 Å R-free 0.222
8QVU Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2023-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–188（188 aa）
未记录 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 8000, 0.2 M lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.287
8QVU Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2023-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–188（188 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 8000, 0.2 M lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.287
8QW6 Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–169（169 aa）
突变：G12V, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X4R (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM sodium citrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.295
8QW6 Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X4R (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM sodium citrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.295
8QW7 Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V, C118S X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM Lithium sulfate monohydrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
8QW7 Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–169（169 aa）
突变：G12V, C118S X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM Lithium sulfate monohydrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
8R7W Kras G12D in complex with compound 3 提交 2023-11-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 YLE 8-(furan-3-yl)-2,3,4,9-tetrahydropyrido[3,4-b]indol-1-one × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；53.4 % (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol and 0.05 M MES pH 6.4
分辨率 1.16 Å R-free 0.202
8R7W Kras G12D in complex with compound 3 提交 2023-11-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 YLE 8-(furan-3-yl)-2,3,4,9-tetrahydropyrido[3,4-b]indol-1-one × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；53.4 % (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol and 0.05 M MES pH 6.4
分辨率 1.16 Å R-free 0.202
8R7X Kras G12D in complex with compound 4 提交 2023-11-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；53.4 % (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol and 0.05 M MES pH 6.4
分辨率 1.31 Å R-free 0.192
8R7X Kras G12D in complex with compound 4 提交 2023-11-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 YFJ 8-pyridin-4-yl-2,3,4,9-tetrahydropyrido[3,4-b]indol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；53.4 % (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol and 0.05 M MES pH 6.4
分辨率 1.31 Å R-free 0.192
8RNI HLA-A*03:01 with KRAS-G12V-10mer 提交 2024-01-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 7–16（10 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1M ammonium citrate tribasic pH7, 12% PEG 3350
分辨率 2.49 Å R-free 0.276
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 7–16（10 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 J 7–16（10 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 O 7–16（10 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 T 7–16（10 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Y 7–16（10 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 d 7–16（10 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 i 7–16（10 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8RRO G12V-TCR complex with HLA-A3 提交 2024-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 n 7–16（10 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M Bis-Tris Propane (pH 6.5), 0.2M Na2SO4, 14-20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.286
8S8C Structure of Kras in complex with inhibitor MK-1084 提交 2024-03-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1H5U (5aSa,17aRa)- 20-Chloro-2-[(2S,5R)-2,5-dimethyl-4-(prop-2-enoyl)piperazin-1-yl]-14,17-difluoro-6-(propan-2-yl)-11,12-dihydro-4H-1,18-(ethanediylidene)pyrido[4,3-e]pyrimido[1,6-g][1,4,7,9]benzodioxadiazacyclododecin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；30% PEG 3350 0.1M pH=9 NaH2PO4/Na2HPO4
分辨率 1.90 Å R-free 0.225
8STM Crystal structure of KRAS-G75A mutant, GDP-bound 提交 2023-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
链 C 1–169（169 aa）
链 D 1–169（169 aa）
突变：G75A 突变：G75A 突变：G75A 突变：G75A GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.00 Å R-free 0.192
8STN Crystal structure of KRAS-G12D/G75A mutant, GDP-bound 提交 2023-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, G75A 突变：G12D, G75A GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.03 Å R-free 0.183
8STN Crystal structure of KRAS-G12D/G75A mutant, GDP-bound 提交 2023-05-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, G75A GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.03 Å R-free 0.183
8T4V Crystal structure of compound 1 bound to K-Ras(G12D) 提交 2023-06-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 Y63 4-{(1R,5S)-3-[(7P)-7-(8-ethynylnaphthalen-1-yl)-8-fluoro-2-{[(4s,7as)-tetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl}-4-oxobutanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES 6.5, 25% PEG4K
分辨率 1.47 Å R-free 0.211
8T4V Crystal structure of compound 1 bound to K-Ras(G12D) 提交 2023-06-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 Y63 4-{(1R,5S)-3-[(7P)-7-(8-ethynylnaphthalen-1-yl)-8-fluoro-2-{[(4s,7as)-tetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl}-4-oxobutanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES 6.5, 25% PEG4K
分辨率 1.47 Å R-free 0.211
8T71 Crystal Structure of WT KRAS4a with bound GDP and Mg ion 提交 2023-06-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–177（177 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M ammonium iodide, 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.80 Å R-free 0.211
8T71 Crystal Structure of WT KRAS4a with bound GDP and Mg ion 提交 2023-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–177（177 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M ammonium iodide, 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.80 Å R-free 0.211
8T72 Crystal structure of WT KRAS4a with bound GMPPNP and Mg ion 提交 2023-06-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–177（177 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaBr, 20% PEG 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.236
8T72 Crystal structure of WT KRAS4a with bound GMPPNP and Mg ion 提交 2023-06-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–177（177 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaBr, 20% PEG 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.236
8T72 Crystal structure of WT KRAS4a with bound GMPPNP and Mg ion 提交 2023-06-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–177（177 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaBr, 20% PEG 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.236
8T73 Crystal structure of KRAS4a-R151G with bound GDP and Mg ion 提交 2023-06-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：R151G GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM HEPES pH 7.4, 2 M ammonium sulfate , 0.1 M MgCl2.6H2O
分辨率 1.50 Å R-free 0.188
8T73 Crystal structure of KRAS4a-R151G with bound GDP and Mg ion 提交 2023-06-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：R151G GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM HEPES pH 7.4, 2 M ammonium sulfate , 0.1 M MgCl2.6H2O
分辨率 1.50 Å R-free 0.188
8T74 Crystal structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD) 提交 2023-06-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–177（177 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M DL-malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
分辨率 1.65 Å R-free 0.196
8T75 Crystal Structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD-CRD) 提交 2023-06-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–177（177 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 2 M sodium formate
分辨率 2.65 Å R-free 0.219
8T75 Crystal Structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD-CRD) 提交 2023-06-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–177（177 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 2 M sodium formate
分辨率 2.65 Å R-free 0.219
8T75 Crystal Structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD-CRD) 提交 2023-06-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–177（177 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 2 M sodium formate
分辨率 2.65 Å R-free 0.219
8T75 Crystal Structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD-CRD) 提交 2023-06-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–177（177 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 2 M sodium formate
分辨率 2.65 Å R-free 0.219
8TBF Tricomplex of RMC-7977, KRAS WT, and CypA 提交 2023-06-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；24% PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0
分辨率 1.50 Å R-free 0.210
8TBF Tricomplex of RMC-7977, KRAS WT, and CypA 提交 2023-06-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；24% PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0
分辨率 1.50 Å R-free 0.210
8TBH Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12R, and CypA 提交 2023-06-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12R GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；17% PEG4000, 0.1 M imidazole, pH 8.0
分辨率 1.50 Å R-free 0.225
8TBH Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12R, and CypA 提交 2023-06-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12R GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；17% PEG4000, 0.1 M imidazole, pH 8.0
分辨率 1.50 Å R-free 0.225
8TBJ Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12A, and CypA 提交 2023-06-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12A GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；24% PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0
分辨率 1.45 Å R-free 0.215
8TBJ Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12A, and CypA 提交 2023-06-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12A GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；24% PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0
分辨率 1.45 Å R-free 0.215
8TBK Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12C, and CypA 提交 2023-06-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；27% PEG4000, 0.1 M imidazole, pH 7.0
分辨率 1.26 Å R-free 0.184
8TBK Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12C, and CypA 提交 2023-06-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；27% PEG4000, 0.1 M imidazole, pH 7.0
分辨率 1.26 Å R-free 0.184
8TBL Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12D, and CypA 提交 2023-06-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；25% PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0
分辨率 1.88 Å R-free 0.227
8TBL Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12D, and CypA 提交 2023-06-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；25% PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0
分辨率 1.88 Å R-free 0.227
8TBM Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12V, and CypA 提交 2023-06-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；24% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.57 Å R-free 0.211
8TBM Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12V, and CypA 提交 2023-06-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12V GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；24% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.57 Å R-free 0.211
8TBN Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12S, and CypA 提交 2023-06-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；22% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.46 Å R-free 0.197
8TBN Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12S, and CypA 提交 2023-06-28 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；22% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.46 Å R-free 0.197
8TXE Crystal structure of KRAS G12D in complex with GDP and compound 5 提交 2023-08-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 VM9 (6M)-6-(6-chloro-4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}quinazolin-7-yl)-4-methyl-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；286.15 K；0.1 M Sodium Acetate pH 4.5, 40% PEG 400
分辨率 1.35 Å R-free 0.215
8TXE Crystal structure of KRAS G12D in complex with GDP and compound 5 提交 2023-08-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 VM9 (6M)-6-(6-chloro-4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}quinazolin-7-yl)-4-methyl-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；286.15 K；0.1 M Sodium Acetate pH 4.5, 40% PEG 400
分辨率 1.35 Å R-free 0.215
8TXG Crystal structure of KRAS G12D in complex with GDP and compound 8 提交 2023-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 VQT (4M)-4-(6-chloro-4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}quinazolin-7-yl)-7-fluoro-1,3-benzothiazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；286.15 K；2.0 M Ammonium Sulfate, 15% ethylene glycol, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.50 Å R-free 0.223
8TXH Crystal structure of KRAS G12D in complex with GDP and compound 14 提交 2023-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 VR5 (4P)-2-amino-4-{4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}-6-(trifluoromethyl)quinazolin-7-yl}-7-fluoro-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；286.15 K；0.1 M Sodium Acetate pH 4.5, 40% PEG 400
分辨率 1.20 Å R-free 0.203
8TXH Crystal structure of KRAS G12D in complex with GDP and compound 14 提交 2023-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 VR5 (4P)-2-amino-4-{4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}-6-(trifluoromethyl)quinazolin-7-yl}-7-fluoro-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；286.15 K；0.1 M Sodium Acetate pH 4.5, 40% PEG 400
分辨率 1.20 Å R-free 0.203
8UDR Structure of the P1B7 antibody bound to the Sotorasib-modified KRas G12C peptide presented by the A*03:01 MHC I complex 提交 2023-09-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 7–16（10 aa）
未记录 MOV AMG 510 (bound form) × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES ph 7.5, 100 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8UN3 KRAS-G13D-GDP in complex with Cpd5 (1-((S)-10-(6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)-11-chloro-7-(((2S,4R)-4-fluoro-1-methylpyrrolidin-2-yl)methoxy)-3,4,13,13a-tetrahydropyrazino[2',1':3,4][1,4]oxazepino[5,6,7-de]quinazolin-2(1H)-yl)prop-2-en-1-one) 提交 2023-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–168（167 aa） 片段：GTPase, residues 2-168
突变：G13D XOI 1-[(5M,8aS,13R)-5-[6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloro-2-{[(2S,4R)-4-fluoro-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-8a,9,11,12-tetrahydropyrazino[2',1':3,4][1,4]oxazepino[5,6,7-de]quinazolin-10(8H)-yl]prop-2-en-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CL CHLORIDE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；277 K；0.2M Sodium Chloride, 0.1M Imidazole pH8.0, 0.4M Sodium di-hydrogen Phosphate, 1.6M Di-potassium Hydrogen Phosphate
分辨率 2.07 Å R-free 0.191
8UN3 KRAS-G13D-GDP in complex with Cpd5 (1-((S)-10-(6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)-11-chloro-7-(((2S,4R)-4-fluoro-1-methylpyrrolidin-2-yl)methoxy)-3,4,13,13a-tetrahydropyrazino[2',1':3,4][1,4]oxazepino[5,6,7-de]quinazolin-2(1H)-yl)prop-2-en-1-one) 提交 2023-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–168（167 aa） 片段：GTPase, residues 2-168
突变：G13D XOI 1-[(5M,8aS,13R)-5-[6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloro-2-{[(2S,4R)-4-fluoro-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-8a,9,11,12-tetrahydropyrazino[2',1':3,4][1,4]oxazepino[5,6,7-de]quinazolin-10(8H)-yl]prop-2-en-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；277 K；0.2M Sodium Chloride, 0.1M Imidazole pH8.0, 0.4M Sodium di-hydrogen Phosphate, 1.6M Di-potassium Hydrogen Phosphate
分辨率 2.07 Å R-free 0.191
8UN3 KRAS-G13D-GDP in complex with Cpd5 (1-((S)-10-(6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)-11-chloro-7-(((2S,4R)-4-fluoro-1-methylpyrrolidin-2-yl)methoxy)-3,4,13,13a-tetrahydropyrazino[2',1':3,4][1,4]oxazepino[5,6,7-de]quinazolin-2(1H)-yl)prop-2-en-1-one) 提交 2023-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 2–168（167 aa） 片段：GTPase, residues 2-168
突变：G13D XOI 1-[(5M,8aS,13R)-5-[6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloro-2-{[(2S,4R)-4-fluoro-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-8a,9,11,12-tetrahydropyrazino[2',1':3,4][1,4]oxazepino[5,6,7-de]quinazolin-10(8H)-yl]prop-2-en-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；277 K；0.2M Sodium Chloride, 0.1M Imidazole pH8.0, 0.4M Sodium di-hydrogen Phosphate, 1.6M Di-potassium Hydrogen Phosphate
分辨率 2.07 Å R-free 0.191
8UN3 KRAS-G13D-GDP in complex with Cpd5 (1-((S)-10-(6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)-11-chloro-7-(((2S,4R)-4-fluoro-1-methylpyrrolidin-2-yl)methoxy)-3,4,13,13a-tetrahydropyrazino[2',1':3,4][1,4]oxazepino[5,6,7-de]quinazolin-2(1H)-yl)prop-2-en-1-one) 提交 2023-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 2–168（167 aa） 片段：GTPase, residues 2-168
突变：G13D XOI 1-[(5M,8aS,13R)-5-[6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloro-2-{[(2S,4R)-4-fluoro-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-8a,9,11,12-tetrahydropyrazino[2',1':3,4][1,4]oxazepino[5,6,7-de]quinazolin-10(8H)-yl]prop-2-en-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；277 K；0.2M Sodium Chloride, 0.1M Imidazole pH8.0, 0.4M Sodium di-hydrogen Phosphate, 1.6M Di-potassium Hydrogen Phosphate
分辨率 2.07 Å R-free 0.191
8UN4 KRAS-G13D-GDP in complex with Cpd36 ((E)-1-((3S)-4-(7-(6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)-6-chloro-8-fluoro-2-(((S)-2-methylenetetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl)methoxy)quinazolin-4-yl)-3-methylpiperazin-1-yl)-3-(4-((dimethylamino)methyl)-5-methylpyridin-2-yl)prop-2-en-1-one) 提交 2023-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–169（168 aa） 片段：residues 2-169
突变：G13D MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 XV3 (2E)-1-{(3S)-4-[(7M)-7-[6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloro-8-fluoro-2-{[(4R,7aS)-2-methylidenetetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}quinazolin-4-yl]-3-methylpiperazin-1-yl}-3-{4-[(dimethylamino)methyl]-5-methylpyridin-2-yl}prop-2-en-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；291 K；0.1M MMT pH 5.0, 25 % w/v Polyethylene glycol 1,500
分辨率 1.57 Å R-free 0.215
8UN5 KRAS-G13D-GDP in complex with Cpd38 ((E)-1-((3S)-4-(7-(6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)-6-chloro-8-fluoro-2-(((S)-2-methylenetetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl)methoxy)quinazolin-4-yl)-3-methylpiperazin-1-yl)-3-(1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-8-yl)prop-2-en-1-one) 提交 2023-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–168（167 aa） 片段：GTPase, residues 2-168
未记录 GOL GLYCEROL × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 XQ6 (2E)-1-{(3S)-4-[(7M)-7-[6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloro-8-fluoro-2-{[(4R,7aS)-2-methylidenetetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}quinazolin-4-yl]-3-methylpiperazin-1-yl}-3-(1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-8-yl)prop-2-en-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 4.5；277 K；0.1 M Sodium acetate pH 4.5, 30% w/v PEG 5,000MME
分辨率 1.31 Å R-free 0.212
8UN5 KRAS-G13D-GDP in complex with Cpd38 ((E)-1-((3S)-4-(7-(6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)-6-chloro-8-fluoro-2-(((S)-2-methylenetetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl)methoxy)quinazolin-4-yl)-3-methylpiperazin-1-yl)-3-(1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-8-yl)prop-2-en-1-one) 提交 2023-10-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–168（167 aa） 片段：GTPase, residues 2-168
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 XQ6 (2E)-1-{(3S)-4-[(7M)-7-[6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloro-8-fluoro-2-{[(4R,7aS)-2-methylidenetetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}quinazolin-4-yl]-3-methylpiperazin-1-yl}-3-(1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-8-yl)prop-2-en-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 4.5；277 K；0.1 M Sodium acetate pH 4.5, 30% w/v PEG 5,000MME
分辨率 1.31 Å R-free 0.212
8V39 Crystal structure of active KRAS-G12C (GMPPNP-bound) in complex with BBO-8520 提交 2023-11-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C C118S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 Y8N BBO-8520 (bound form) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；56.36 mM NaH2PO4, 1343 mM K2HPO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.312
8V39 Crystal structure of active KRAS-G12C (GMPPNP-bound) in complex with BBO-8520 提交 2023-11-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C C118S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 Y8N BBO-8520 (bound form) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；56.36 mM NaH2PO4, 1343 mM K2HPO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.312
8V39 Crystal structure of active KRAS-G12C (GMPPNP-bound) in complex with BBO-8520 提交 2023-11-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12C C118S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 Y8N BBO-8520 (bound form) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；56.36 mM NaH2PO4, 1343 mM K2HPO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.312
8V3A Crystal structure of KRAS-G12C (GDP-bound) in complex with BBO-8520 提交 2023-11-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 Y8N BBO-8520 (bound form) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Na3 citrate pH 5.5, 20% PEG 4000, 10% isopropanol
分辨率 1.67 Å R-free 0.186
8V3A Crystal structure of KRAS-G12C (GDP-bound) in complex with BBO-8520 提交 2023-11-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 Y8N BBO-8520 (bound form) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Na3 citrate pH 5.5, 20% PEG 4000, 10% isopropanol
分辨率 1.67 Å R-free 0.186
8VGQ CryoEM structure of GNE-1952-alkylated KRAS G12C in complex with engineered conformationally rigid Fab 2H11.4DS 提交 2023-12-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C, C51S, C80L, C118S A1AAW 1-{4-[(7M)-6-methyl-7-(5-methyl-2H-indazol-4-yl)quinazolin-4-yl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8VJZ HLA-A*03:01 with WT KRAS-10mer 提交 2024-01-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 7–16（10 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1M ammonium citrate tribasic pH7, 12% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.214
8VR9 Structure of a synthetic antibody in complex with a class I MHC presenting a hapten-peptide conjugate 提交 2024-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 8–16（9 aa） 片段：residues 8-16
突变：G12C MOV AMG 510 (bound form) × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
8VRA Structure of a synthetic antibody in complex with a class I MHC presenting a hapten-peptide conjugate 提交 2024-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 7–16（10 aa）
突变：G12C MOV AMG 510 (bound form) × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
8VRB Structure of a synthetic antibody in complex with a class I MHC presenting a hapten-peptide conjugate 提交 2024-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 7–16（10 aa） 片段：residues 7-16
突变：G12C MOV AMG 510 (bound form) × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
9AX6 Tricomplex of RMC-6236, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-03-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, C51S, C80L, C118S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Tris, pH 8.0, 25% PEG4000
分辨率 1.65 Å R-free 0.227
9AX6 Tricomplex of RMC-6236, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-03-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, C51S, C80L, C118S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Tris, pH 8.0, 25% PEG4000
分辨率 1.65 Å R-free 0.227
9BAI Crystal structure of GDP-bound human K-RAS in a covalent complex with aryl sulfonyl fluoride compounds. 提交 2024-04-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S MG MAGNESIUM ION × 1 WMU 3-[bis(oxidanylidene)-$l^{5}-sulfanyl]-~{N}-pyridin-4-yl-benzenesulfonamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Ammonium chloride 0.2 M and PEG 3350 20%.
分辨率 1.49 Å R-free 0.225
9BAI Crystal structure of GDP-bound human K-RAS in a covalent complex with aryl sulfonyl fluoride compounds. 提交 2024-04-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：C118S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 WMU 3-[bis(oxidanylidene)-$l^{5}-sulfanyl]-~{N}-pyridin-4-yl-benzenesulfonamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Ammonium chloride 0.2 M and PEG 3350 20%.
分辨率 1.49 Å R-free 0.225
9BAI Crystal structure of GDP-bound human K-RAS in a covalent complex with aryl sulfonyl fluoride compounds. 提交 2024-04-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：C118S MG MAGNESIUM ION × 1 WMU 3-[bis(oxidanylidene)-$l^{5}-sulfanyl]-~{N}-pyridin-4-yl-benzenesulfonamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Ammonium chloride 0.2 M and PEG 3350 20%.
分辨率 1.49 Å R-free 0.225
9BAI Crystal structure of GDP-bound human K-RAS in a covalent complex with aryl sulfonyl fluoride compounds. 提交 2024-04-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
突变：C118S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 WMU 3-[bis(oxidanylidene)-$l^{5}-sulfanyl]-~{N}-pyridin-4-yl-benzenesulfonamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Ammonium chloride 0.2 M and PEG 3350 20%.
分辨率 1.49 Å R-free 0.225
9BAJ Crystal structure of GDP-bound human K-RAS in a covalent complex with aryl sulfonyl fluoride compounds. 提交 2024-04-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S MG MAGNESIUM ION × 1 A1AK8 3-(dioxo-lambda~6~-sulfanyl)-N-phenylbenzene-1-sulfonamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Ammonium chloride 0.2 M and PEG 3350 20%
分辨率 1.49 Å R-free 0.270
9BAJ Crystal structure of GDP-bound human K-RAS in a covalent complex with aryl sulfonyl fluoride compounds. 提交 2024-04-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：C118S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 A1AK8 3-(dioxo-lambda~6~-sulfanyl)-N-phenylbenzene-1-sulfonamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Ammonium chloride 0.2 M and PEG 3350 20%
分辨率 1.49 Å R-free 0.270
9BAJ Crystal structure of GDP-bound human K-RAS in a covalent complex with aryl sulfonyl fluoride compounds. 提交 2024-04-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：C118S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 A1AK8 3-(dioxo-lambda~6~-sulfanyl)-N-phenylbenzene-1-sulfonamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Ammonium chloride 0.2 M and PEG 3350 20%
分辨率 1.49 Å R-free 0.270
9BAJ Crystal structure of GDP-bound human K-RAS in a covalent complex with aryl sulfonyl fluoride compounds. 提交 2024-04-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
突变：C118S MG MAGNESIUM ION × 1 A1AK8 3-(dioxo-lambda~6~-sulfanyl)-N-phenylbenzene-1-sulfonamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Ammonium chloride 0.2 M and PEG 3350 20%
分辨率 1.49 Å R-free 0.270
9BAK Crystal structure of GDP-bound human K-RAS in a covalent complex with aryl sulfonyl fluoride compounds. 提交 2024-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WN3 3-[bis(oxidanylidene)-$l^{5}-sulfanyl]-~{N}-pyridazin-3-yl-benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Ammonium chloride 0.2 M and PEG 3350 20%
分辨率 1.67 Å R-free 0.289
9BAK Crystal structure of GDP-bound human K-RAS in a covalent complex with aryl sulfonyl fluoride compounds. 提交 2024-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WN3 3-[bis(oxidanylidene)-$l^{5}-sulfanyl]-~{N}-pyridazin-3-yl-benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Ammonium chloride 0.2 M and PEG 3350 20%
分辨率 1.67 Å R-free 0.289
9BAK Crystal structure of GDP-bound human K-RAS in a covalent complex with aryl sulfonyl fluoride compounds. 提交 2024-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WN3 3-[bis(oxidanylidene)-$l^{5}-sulfanyl]-~{N}-pyridazin-3-yl-benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Ammonium chloride 0.2 M and PEG 3350 20%
分辨率 1.67 Å R-free 0.289
9BAK Crystal structure of GDP-bound human K-RAS in a covalent complex with aryl sulfonyl fluoride compounds. 提交 2024-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WN3 3-[bis(oxidanylidene)-$l^{5}-sulfanyl]-~{N}-pyridazin-3-yl-benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Ammonium chloride 0.2 M and PEG 3350 20%
分辨率 1.67 Å R-free 0.289
9BFV Tri-complex of Compound-23, KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 A1AOV (3R)-1-[(2E)-4-(dimethylamino)-4-methylpent-2-enoyl]-N-[(2S)-1-{[(1P,8R,10R,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methylpyrrolidine-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.20 Å R-free 0.189
9BFV Tri-complex of Compound-23, KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 A1AOV (3R)-1-[(2E)-4-(dimethylamino)-4-methylpent-2-enoyl]-N-[(2S)-1-{[(1P,8R,10R,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methylpyrrolidine-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.20 Å R-free 0.189
9BFW Tri-complex of Compound-4, KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 A1AOM 1-acetyl-N-[(2S)-1-{[(1M,8S,10R,14S,20S)-22-cyano-4-hydroxy-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,20,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,21,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methylazetidine-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5
分辨率 1.20 Å R-free 0.147
9BFX Tri-complex of Elironrasib (RMC-6291), KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOD 1-[(2E)-4-(dimethylamino)-4-methylpent-2-enoyl]-N-[(2R)-1-{[(2S,6S,8S,10R,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-5,16-dioxa-2,10,22,28-tetraazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),20,23,26-tetraen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-4-fluoro-N-methylpiperidine-4-carboxamide (non-preferred name) × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 150 mM sodium chloride
分辨率 1.40 Å R-free 0.209
9BFX Tri-complex of Elironrasib (RMC-6291), KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOD 1-[(2E)-4-(dimethylamino)-4-methylpent-2-enoyl]-N-[(2R)-1-{[(2S,6S,8S,10R,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-5,16-dioxa-2,10,22,28-tetraazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),20,23,26-tetraen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-4-fluoro-N-methylpiperidine-4-carboxamide (non-preferred name) × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 150 mM sodium chloride
分辨率 1.40 Å R-free 0.209
9BFY Tri-complex of Compound-14, KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 A1AOL (3R)-N-[(2S)-1-{[(1M,8R,10R,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methyl-1-propanoylpyrrolidine-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.26 Å R-free 0.189
9BFY Tri-complex of Compound-14, KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 A1AOL (3R)-N-[(2S)-1-{[(1M,8R,10R,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methyl-1-propanoylpyrrolidine-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 CL CHLORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.26 Å R-free 0.189
9BFZ Tri-complex of Compound-5, KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOK (3R)-N-[(2S)-1-{[(1M,8R,10S,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-[2-(2-methoxyethyl)phenyl]-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methyl-1-propanoylpyrrolidine-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.80 Å R-free 0.222
9BFZ Tri-complex of Compound-5, KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOK (3R)-N-[(2S)-1-{[(1M,8R,10S,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-[2-(2-methoxyethyl)phenyl]-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methyl-1-propanoylpyrrolidine-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.80 Å R-free 0.222
9BG1 Tri-complex of Compound-3, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOH (2R)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-methyl-2-(N-methylacetamido)butanamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.51 Å R-free 0.226
9BG1 Tri-complex of Compound-3, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOH (2R)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-methyl-2-(N-methylacetamido)butanamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.51 Å R-free 0.226
9BG2 Tri-complex of Compound-10, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOJ (1S,2R)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.64 Å R-free 0.228
9BG2 Tri-complex of Compound-10, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOJ (1S,2R)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.64 Å R-free 0.228
9BG4 Tri-complex of Compound-2, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 A1AOG (2R)-N-[(1P,8S,10S,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]-3-methyl-2-(N-methylacetamido)butanamide (non-preferred name) × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 nM NaCl
分辨率 1.14 Å R-free 0.177
9BG4 Tri-complex of Compound-2, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 A1AOG (2R)-N-[(1P,8S,10S,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]-3-methyl-2-(N-methylacetamido)butanamide (non-preferred name) × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 nM NaCl
分辨率 1.14 Å R-free 0.177
9BG5 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G13D, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
突变：G13D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；24% PEG4000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.67 Å R-free 0.266
9BG5 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G13D, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–164（164 aa）
突变：G13D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；24% PEG4000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.67 Å R-free 0.266
9BG6 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；25% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.66 Å R-free 0.240
9BG6 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12V GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；25% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.66 Å R-free 0.240
9BG7 Tri-complex of Compound-6, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOI N-[(2R)-1-{[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-3-methoxy-N-methylazetidine-1-carboxamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.60 Å R-free 0.203
9BG7 Tri-complex of Compound-6, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12V GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOI N-[(2R)-1-{[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-3-methoxy-N-methylazetidine-1-carboxamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.60 Å R-free 0.203
9BG9 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS WT, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；25% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.58 Å R-free 0.231
9BG9 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS WT, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–164（164 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；25% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.58 Å R-free 0.231
9BGA Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；28% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
分辨率 1.41 Å R-free 0.229
9BGA Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；28% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
分辨率 1.41 Å R-free 0.229
9BGB Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS Q61H, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
突变：Q61H GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；29% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
分辨率 1.68 Å R-free 0.230
9BGB Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS Q61H, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–164（164 aa）
突变：Q61H GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；29% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
分辨率 1.68 Å R-free 0.230
9BGC Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G12R, and CypA 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12R GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；22% PEG2000 MME, 0.10 M Tris, pH 8
分辨率 1.87 Å R-free 0.272
9BGC Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G12R, and CypA 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12R GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；22% PEG2000 MME, 0.10 M Tris, pH 8
分辨率 1.87 Å R-free 0.272
9BHO Crystal structure of KRAS G12S in a transition state mimetic complex with CYPA and RMC-7977 提交 2024-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–169（169 aa）
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12S 突变：G12S ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；100 mM Tris pH 8.5, 15% PEG 20000
分辨率 1.89 Å R-free 0.218
9BHP Crystal structure of KRAS G12C in a transition state mimetic complex with CYPA and RMC-7977 提交 2024-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–169（169 aa）
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12C 突变：G12C ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；100 mM Tris-HCl pH 8.5, 20% PEG 10000
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
9BHQ Crystal structure of KRAS G12A in a transition state mimetic complex with CYPA and RMC-7977 提交 2024-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–169（169 aa）
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12A 突变：G12A ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；100 mM Tris pH 8.5, 15% PEG 10000
分辨率 1.90 Å R-free 0.232
9BI1 Crystal structure of GMPPNP bound KRAS G12D in complex with CYPA and RMC-7977 提交 2024-04-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–169（169 aa）
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12D 突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；100 mM Tris-HCl pH 8.5, 24% PEG 10000
分辨率 1.65 Å R-free 0.260
9BI2 Crystal structure of GMPPNP bound KRAS G12C in complex with CYPA and RMC-7977 提交 2024-04-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–169（169 aa）
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12C 突变：G12C GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；100 mM Tris-HCl pH 8.5, 24% PEG 10000
分辨率 2.15 Å R-free 0.236
9BL0 KRAS G12D Mutant KRAS 1-169 at 298 K bound to MRTX-1133 提交 2024-04-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, C51S, C80L, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；24% PEG 8000,100 mM Sodium Citrate, 100 mM Ammonium Acetate pH 5.0
分辨率 1.66 Å R-free 0.195
9BL0 KRAS G12D Mutant KRAS 1-169 at 298 K bound to MRTX-1133 提交 2024-04-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, C51S, C80L, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；24% PEG 8000,100 mM Sodium Citrate, 100 mM Ammonium Acetate pH 5.0
分辨率 1.66 Å R-free 0.195
9C3K Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/M67R: Suppressing G12D oncogenicity via second-site M67R mutation 提交 2024-06-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, M67R GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NH4 Acetate; 2.2 M (NH4)2SO4
分辨率 1.70 Å R-free 0.209
9C3K Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/M67R: Suppressing G12D oncogenicity via second-site M67R mutation 提交 2024-06-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, M67R GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NH4 Acetate; 2.2 M (NH4)2SO4
分辨率 1.70 Å R-free 0.209
9C3M Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/F28K: Suppressing G12D oncogenicity via second-site F28K mutation 提交 2024-06-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, F28K GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；3.2 M (NH4)2SO4; 0.1 M Na3Cit pH 5
分辨率 1.74 Å R-free 0.222
9C3M Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/F28K: Suppressing G12D oncogenicity via second-site F28K mutation 提交 2024-06-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, F28K GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；3.2 M (NH4)2SO4; 0.1 M Na3Cit pH 5
分辨率 1.74 Å R-free 0.222
9C3N Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/P34R: Suppressing G12D oncogenicity via second-site P34R mutation 提交 2024-06-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, P34R MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Malonate, 2.2 M (NH4)2SO4
分辨率 1.50 Å R-free 0.217
9C3N Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/P34R: Suppressing G12D oncogenicity via second-site P34R mutation 提交 2024-06-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, P34R MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Malonate, 2.2 M (NH4)2SO4
分辨率 1.50 Å R-free 0.217
9C3Q Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/R41Q: Suppressing G12D oncogenicity via second-site R41Q mutation 提交 2024-06-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, R41Q GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG MME 2K; 0.1 M KSCN
分辨率 1.22 Å R-free 0.190
9C3R Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/V45E: Suppressing G12D oncogenicity via second-site V45E mutation 提交 2024-06-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, V45E GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Potassium Iodide, 2.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.20 Å R-free 0.209
9C3R Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/V45E: Suppressing G12D oncogenicity via second-site V45E mutation 提交 2024-06-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, V45E GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Potassium Iodide, 2.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.20 Å R-free 0.209
9C3V Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/D54R: Suppressing G12D oncogenicity via second-site D54R mutation 提交 2024-06-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, D54R GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Di-sodium Phosphate, 2.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.51 Å R-free 0.268
9C3V Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/D54R: Suppressing G12D oncogenicity via second-site D54R mutation 提交 2024-06-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, D54R GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Di-sodium Phosphate, 2.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.51 Å R-free 0.268
9C3Z Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/G60R: Suppressing G12D oncogenicity via second-site G60R mutation 提交 2024-06-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, G60R MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Lithium acetate, 2.2 M Ammonium sulfate
分辨率 1.80 Å R-free 0.174
9C3Z Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/G60R: Suppressing G12D oncogenicity via second-site G60R mutation 提交 2024-06-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, G60R MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Lithium acetate, 2.2 M Ammonium sulfate
分辨率 1.80 Å R-free 0.174
9C40 Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/V103Y: Suppressing G12D oncogenicity via second-site V103Y mutation 提交 2024-06-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, V103Y MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Potassium Nitrate, 2.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 1.80 Å R-free 0.208
9C40 Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/V103Y: Suppressing G12D oncogenicity via second-site V103Y mutation 提交 2024-06-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, V103Y MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Potassium Nitrate, 2.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 1.80 Å R-free 0.208
9C41 Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/E62Q: Suppressing G12D oncogenicity via second-site E62Q mutation 提交 2024-06-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, E62Q MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Formate, 2.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 1.94 Å R-free 0.161
9C41 Crystal structure of GDP-bound KRAS G12D/E62Q: Suppressing G12D oncogenicity via second-site E62Q mutation 提交 2024-06-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, E62Q MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Formate, 2.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 1.94 Å R-free 0.161
9C43 Crystal structure of GDP-bound KRAS E3K/G12D: Suppressing G12D oncogenicity via second-site E3K mutation 提交 2024-06-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, E3K MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.2 M (NH4)2SO4; 0.2 NH4NO3
分辨率 1.87 Å R-free 0.160
9C43 Crystal structure of GDP-bound KRAS E3K/G12D: Suppressing G12D oncogenicity via second-site E3K mutation 提交 2024-06-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, E3K GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.2 M (NH4)2SO4; 0.2 NH4NO3
分辨率 1.87 Å R-free 0.160
9CMV Crystal structure of the KRAS-p110alpha complex in the presence of molecular glue D223 提交 2024-07-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Tris, 0.1 M NaCl, 10 % PEG 20K
分辨率 3.01 Å R-free 0.268
9CT7 Tricomplex of Compound 1, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1AZV (2R)-2-cyclopentyl-N-[(1M,8S,10R,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]-2-(N-methylacetamido)acetamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；18-23% PEG3350 + 0.11-0.2M NaCl + 0.10M Bis Tris pH 5.5
分辨率 1.42 Å R-free 0.204
9CT7 Tricomplex of Compound 1, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1AZV (2R)-2-cyclopentyl-N-[(1M,8S,10R,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]-2-(N-methylacetamido)acetamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；18-23% PEG3350 + 0.11-0.2M NaCl + 0.10M Bis Tris pH 5.5
分辨率 1.42 Å R-free 0.204
9CT8 Tricomplex of Compound 2, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AZX (2R)-2-amino-N-(2-{[(1R)-1-cyclopentyl-2-{[(1M,8S,10S,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-2-oxoethyl](methyl)amino}-2-oxoethyl)-N-methylpropanamide (non-preferred name) × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；22-27% PEG3350 + 0.11-0.20M NaCl + 0.10M MES pH 5.5
分辨率 1.28 Å R-free 0.190
9CT8 Tricomplex of Compound 2, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AZX (2R)-2-amino-N-(2-{[(1R)-1-cyclopentyl-2-{[(1M,8S,10S,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-2-oxoethyl](methyl)amino}-2-oxoethyl)-N-methylpropanamide (non-preferred name) × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；22-27% PEG3350 + 0.11-0.20M NaCl + 0.10M MES pH 5.5
分辨率 1.28 Å R-free 0.190
9CT9 Tricomplex of Compound 3, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1AZY (2R)-2-{(5S)-7-[(2R)-2-aminopropanoyl]-1-oxo-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-2-cyclopentyl-N-[(1M,8S,10S,14R,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]acetamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 3350 + 0.20M Sodium chloride + 0.10M MES pH 5.5 + 1.25% Glycerol
分辨率 1.35 Å R-free 0.185
9CT9 Tricomplex of Compound 3, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1AZY (2R)-2-{(5S)-7-[(2R)-2-aminopropanoyl]-1-oxo-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-2-cyclopentyl-N-[(1M,8S,10S,14R,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]acetamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 3350 + 0.20M Sodium chloride + 0.10M MES pH 5.5 + 1.25% Glycerol
分辨率 1.35 Å R-free 0.185
9CTA Tricomplex of RMC-9945, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AZW (2R)-2-{(5S)-7-[(2R)-3-cyclopropyl-2-(methylamino)propanoyl]-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-21-(2,2,2-trifluoroethyl)-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-methylbutanamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；MES 5.5, NaCl, PEG3350
分辨率 1.29 Å R-free 0.194
9CTA Tricomplex of RMC-9945, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AZW (2R)-2-{(5S)-7-[(2R)-3-cyclopropyl-2-(methylamino)propanoyl]-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-21-(2,2,2-trifluoroethyl)-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-methylbutanamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；MES 5.5, NaCl, PEG3350
分辨率 1.29 Å R-free 0.194
9CTB Tri-complex of zoldonrasib (RMC-9805), KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1AZZ (2R)-2-cyclopentyl-2-{(5S)-7-[(2R)-3-cyclopropyl-2-(methylamino)propanoyl]-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(2S,6R,8S,10R,14S,21M)-21-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-22-(2,2,2-trifluoroethyl)-5,16-dioxa-2,10,22,28-tetraazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),20,23,26-tetraen-8-yl]acetamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES 5.5, 20% PEG3350, 0.1 M NaCl
分辨率 1.29 Å R-free 0.194
9CTB Tri-complex of zoldonrasib (RMC-9805), KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1AZZ (2R)-2-cyclopentyl-2-{(5S)-7-[(2R)-3-cyclopropyl-2-(methylamino)propanoyl]-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(2S,6R,8S,10R,14S,21M)-21-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-22-(2,2,2-trifluoroethyl)-5,16-dioxa-2,10,22,28-tetraazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),20,23,26-tetraen-8-yl]acetamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES 5.5, 20% PEG3350, 0.1 M NaCl
分辨率 1.29 Å R-free 0.194
9DMM Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to Divarasib (GDC6036) 提交 2024-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：C-terminus (residues 170-188) deleted
突变：G12C, C51S, C80S, C118S A1AWR 1-{(3S)-4-[(7M)-7-[6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloro-8-fluoro-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}quinazolin-4-yl]-3-methylpiperazin-1-yl}propan-1-one × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1mM MgCl2, 0.1M MES, 30% PEG4000
分辨率 1.90 Å R-free 0.228
9E3S Tricomplex of RMC-9945, KRAS G12N, and CypA 提交 2024-10-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1BEA (2R)-2-{(5S)-7-[(2R,3R)-3-cyclopropyl-1-methylaziridine-2-carbonyl]-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-21-(2,2,2-trifluoroethyl)-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-methylbutanamide (non-preferred name) × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES 6 pH, 0.1-0.2 M NaCl, 21-26 %w/v PEG 3350
分辨率 1.08 Å R-free 0.178
9E3S Tricomplex of RMC-9945, KRAS G12N, and CypA 提交 2024-10-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1BEA (2R)-2-{(5S)-7-[(2R,3R)-3-cyclopropyl-1-methylaziridine-2-carbonyl]-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-21-(2,2,2-trifluoroethyl)-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-methylbutanamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES 6 pH, 0.1-0.2 M NaCl, 21-26 %w/v PEG 3350
分辨率 1.08 Å R-free 0.178
9E5D Discovery of an Orally Biovailable KRAS G12D Inhibitor 提交 2024-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1BEI methyl 3-[(7M)-1-[(1R,4R,5S)-2-azabicyclo[2.1.1]hexan-5-yl]-8-(2-cyanoethyl)-4-[3-(dimethylamino)azetidin-1-yl]-6-fluoro-7-(3-hydroxynaphthalen-1-yl)-1H-imidazo[4,5-c]quinolin-2-yl]propanoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M (NH4)3 Citrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.36 Å R-free 0.193
9E5F Discovery of an Orally Bioavailable KRAS G12D Inhibitor 提交 2024-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa） 片段：residues 1-169
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1BEJ (4P)-4-{1-[(1R,4R,5S)-2-azabicyclo[2.1.1]hexan-5-yl]-8-chloro-4-[3-(dimethylamino)azetidin-1-yl]-6-fluoro-1H-imidazo[4,5-c]quinolin-7-yl}naphthalen-2-ol × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium acetate, pH 4.6,30% PEG 4000 and 0.2M ammonium acetate
分辨率 1.35 Å R-free 0.178
9E9H Crystal structure of human KRAS G12C covalently bound to DEL triazine compound 5 提交 2024-11-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C51S,C80L,C118S CA CALCIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1BH6 (3S)-N,5-dimethyl-3-({4-[3-(morpholin-4-yl)phenyl]-6-(2-propanoyl-2,6-diazaspiro[3.4]octan-6-yl)-1,3,5-triazin-2-yl}amino)hexanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.001M calcium chloride, 0.1M MES pH6.5, 30% PEG 4000
分辨率 1.65 Å R-free 0.250
9E9I Crystal Structure of human KRAS G12C covalently bound to nopinone-derived naphthol compound 21 提交 2024-11-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118A MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1BH5 1-{6-[(4P,6R,8R)-3-fluoro-4-(3-hydroxynaphthalen-1-yl)-7,7-dimethyl-5,6,7,8-tetrahydro-6,8-methanoquinolin-2-yl]-2,6-diazaspiro[3.4]octan-2-yl}propan-1-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium citrate pH5.6, 32% PEG4000, 0.005M magnesium chloride
分辨率 1.18 Å R-free 0.199
9G0Y Human KRas4A (GDP) in complex with compound 11 提交 2024-07-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1IH1 N-(7-chloro-4-hydroxybenzo[d]thiazol-2-yl)-4-hydroxybenzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；27.5% PEG 8000, 400 mM LiCl
分辨率 1.31 Å R-free 0.169
9G4B Human KRas4A (GDP) in complex with compound 15 提交 2024-07-15 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 A1IIU (3Z)-7-chloro-10,21-dihydroxy-2,2-dioxo-18-(4-piperidyl)-2-lambda-6,5-dithia-3,12,18-triazatetracyclo[18.3.1.04,12.06,11]tetracosa-1(23),3,6,8,10,20(24),21-heptaen-19-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.7；292 K；25% PEG 8000, 500 mM LiCl, 100 mM bis-tris propane
分辨率 1.14 Å R-free 0.193
9GBJ KRAS G12D in complex with covalent inhibitor 提交 2024-07-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1IJ7 1-[(3S)-1-[2-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-6-[(1S)-1-[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]ethoxy]pyrimidin-4-yl]pyrrolidin-3-yl]-3-[1-(methoxymethyl)cyclopropyl]urea × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.2 mM MgCl2, 15% PEG 2000, 100 mM sodium acetate pH 4.4
分辨率 1.71 Å R-free 0.223
9GGT Human KRas4A (GDP) in complex with compound 8 提交 2024-08-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1IK7 N-(7-chloro-1,3-benzothiazol-2-yl)-3-hydroxy-benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；292 K；25% PEG 8000, 300 mM LiCl, 100 mM bis-tris propane
分辨率 1.71 Å R-free 0.263
9GGU Human KRas4A (GDP) in complex with compound 9 提交 2024-08-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1IMC N-(7-chloro-1,3-benzothiazol-2-yl)-2-hydroxy-benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；292 K；25% PEG 8000, 300 mM LiCl, 100 mM bis-tris propane
分辨率 1.60 Å R-free 0.208
9GGV Human KRas4A (GDP) in complex with compound 14 提交 2024-08-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 A1IK9 5-[(7-chloranyl-3-ethyl-4-oxidanyl-1,3-benzothiazol-2-yl)sulfamoyl]-~{N}-(2-hydroxyethyl)-2-oxidanyl-~{N}-piperidin-4-yl-benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；27.5% PEG 8000, 400 mM LiCl
分辨率 1.19 Å R-free 0.178
9GGW Human KRas4A (GDP) in complex with compound 16 提交 2024-08-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1ILA 11-(4-aminocyclohexyl)-16-chloro-1,15-dihydroxy-10,10-dioxo-10lambda6-thia-2,11lambda6-diaza-1lambda6,15lambda6-diphospha-3-phosphoniapentacyclo[7.5.1.01,15.03,15.013,15]hexadecan-12-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；292 K；25% PEG 8000, 300 mM LiCl, 100 mM bis-tris propane
分辨率 1.82 Å R-free 0.268
9GGW Human KRas4A (GDP) in complex with compound 16 提交 2024-08-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1ILA 11-(4-aminocyclohexyl)-16-chloro-1,15-dihydroxy-10,10-dioxo-10lambda6-thia-2,11lambda6-diaza-1lambda6,15lambda6-diphospha-3-phosphoniapentacyclo[7.5.1.01,15.03,15.013,15]hexadecan-12-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；292 K；25% PEG 8000, 300 mM LiCl, 100 mM bis-tris propane
分辨率 1.82 Å R-free 0.268
9GGX Human KRas4A (GMPPNP) in complex with compound 19 提交 2024-08-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CO COBALT (II) ION × 1 A1IMB (3E,15S)-17-(cis-4-aminocyclohexyl)-7-chloro-10,15,20-trihydroxy-2,2-dioxo-2-lambda-6,5-dithia-3,12,17-triazatetracyclo[17.3.1.04,12.06,11]tricosa-1(22),3,6(11),7,9,19(23),20-heptaen-18-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；24% PEG 3350, 150 mM MgCl2, 10 mM CoCl2, 100 mM HEPES
分辨率 1.30 Å R-free 0.224
9GGY Human KRas4A (GDP) in complex with compound 29 提交 2024-08-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 A1IK3 12-(1-aza-5-azanidaspiro[4.5]decan-8-yl)-18-[(1-chloro-3-hydroxy-1,2,3-benzothiadiazol-5-yl)-lambda4-sulfanylidene]-4-hydroxy-3,3-dioxo-3lambda6-thia-1,4,12,17-tetraza-2lambda6-thia-6,10,19-triaza-3 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；25% PEG 8000, 300 mM LiCl, 100 mM bis-tris propane
分辨率 1.27 Å R-free 0.194
9GGZ Human KRas4A (GMPPNP) in complex with compound 31 提交 2024-08-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CO COBALT (II) ION × 2 A1IK8 (3Z)-18-(4-aminocyclohexyl)-7-chloro-10-hydroxy-2,2-dioxo-21-[[(3S)-pyrrolidin-3-yl]amino]-2-lambda-6,5-dithia-3,12,18,22-tetrazatetracyclo[18.3.1.04,12.06,11]tetracosa-1(23),3,6,8,10,20(24),21-heptaen-19-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；24% PEG 3350, 100 mM MgCl2, 10 mM CoCl2, 100 mM HEPES
分辨率 1.37 Å R-free 0.231
9GH0 Human KRas4A (GMPPNP) in complex with compound 32 提交 2024-08-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CO COBALT (II) ION × 2 A1IMA (3Z)-18-(4-aminocyclohexyl)-7-chloro-10-hydroxy-2,2-dioxo-21-piperazin-1-yl-2-lambda-6,5-dithia-3,12,18,22-tetrazatetracyclo[18.3.1.04,12.06,11]tetracosa-1(23),3,6,8,10,20(24),21-heptaen-19-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；24% PEG 3350, 100 mM MgCl2, 10 mM CoCl2, 100 mM HEPES
分辨率 1.57 Å R-free 0.240
9GH1 Human KRas4A (GMPPNP) in complex with compound 34 提交 2024-08-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CO COBALT (II) ION × 1 A1IK5 (3Z)-18-(4-aminocyclohexyl)-21-[[4-(2-aminoethylamino)cyclohexyl]amino]-7-chloro-10-hydroxy-2,2-dioxo-2lambda6,5-dithia-3,12,18,22-tetrazatetracyclo[18.3.1.04,12.06,11]tetracosa-1(23),3,6,8,10,20(24),21-heptaen-19-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；20% PEG 3350, 150 mM MgCl2, 10 mM CoCl2, 100 mM HEPES
分辨率 1.33 Å R-free 0.247
9GH2 Human KRas4A (GMPPNP) in complex with compound 36 提交 2024-08-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：C118S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CO COBALT (II) ION × 2 A1ILF (3Z)-18-(4-aminocyclohexyl)-21-[4-(4-amino-1-piperidyl)-1-piperidyl]-7-chloro-10-hydroxy-2,2-dioxo-2-lambda-6,5-dithia-3,12,18,22-tetrazatetracyclo[18.3.1.04,12.06,11]tetracosa-1(23),3,6,8,10,20(24),21-heptaen-19-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；24% PEG 3350, 150 mM MgCl2, 10 mM CoCl2, 100 mM HEPES
分辨率 1.35 Å R-free 0.217
9GLU Crystal structure of KRasG12D-GDP in complex with the peptide MPB1 提交 2024-08-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；25% PEG 3350, 0.1 mM BisTris pH 5.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.215
9GLU Crystal structure of KRasG12D-GDP in complex with the peptide MPB1 提交 2024-08-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；25% PEG 3350, 0.1 mM BisTris pH 5.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.215
9GTK KRAS in complex with DARPin 784_F5 提交 2024-09-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–186（186 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；Crystals grew within 25 days in 0.2 M potassium sodium tartrate, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.201
9GTK KRAS in complex with DARPin 784_F5 提交 2024-09-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–186（186 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 SRT S,R MESO-TARTARIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；Crystals grew within 25 days in 0.2 M potassium sodium tartrate, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.201
9GTK KRAS in complex with DARPin 784_F5 提交 2024-09-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；Crystals grew within 25 days in 0.2 M potassium sodium tartrate, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.201
9HMR KRAS-G12V-D92C covalently bound to BI-1830 提交 2024-12-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1IWE 1-[4-[2-[(4-bromanyl-2-methyl-phenyl)amino]ethanoyl]piperazin-1-yl]propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.5, 10% ethylene glycol, 20% PEG 3350, 0.2 M sodium fluoride
分辨率 1.50 Å R-free 0.239
9HMR KRAS-G12V-D92C covalently bound to BI-1830 提交 2024-12-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1IWE 1-[4-[2-[(4-bromanyl-2-methyl-phenyl)amino]ethanoyl]piperazin-1-yl]propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.5, 10% ethylene glycol, 20% PEG 3350, 0.2 M sodium fluoride
分辨率 1.50 Å R-free 0.239
9HMR KRAS-G12V-D92C covalently bound to BI-1830 提交 2024-12-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1IWE 1-[4-[2-[(4-bromanyl-2-methyl-phenyl)amino]ethanoyl]piperazin-1-yl]propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.5, 10% ethylene glycol, 20% PEG 3350, 0.2 M sodium fluoride
分辨率 1.50 Å R-free 0.239
9HMR KRAS-G12V-D92C covalently bound to BI-1830 提交 2024-12-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1IWE 1-[4-[2-[(4-bromanyl-2-methyl-phenyl)amino]ethanoyl]piperazin-1-yl]propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.5, 10% ethylene glycol, 20% PEG 3350, 0.2 M sodium fluoride
分辨率 1.50 Å R-free 0.239
9I5E A Coiled Coil Module Strategy for High-Resolution Cryo-EM Structures of Small Proteins for Drug Discovery 提交 2025-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–164（164 aa）
链 B 1–164（164 aa）
未记录 M1X {(2S)-4-[7-(8-chloronaphthalen-1-yl)-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-1-[(2S)-2-fluoropropanoyl]piperazin-2-yl}acetonitrile × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.77 Å
9I7Y Crystal Structure of KRasG13C in Complex with Nucleotide-based Covalent Inhibitor 7b 提交 2025-02-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 A1I08 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-oxidanyl-2-[[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]oxymethyl]oxolan-3-yl] (3~{S})-3-(propanoylamino)piperidine-1-carboxylate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；30 % PEG4000, 100 mM NaAc pH 9.0, 200 mM Tris pH 9.0 followed by shrinking of the crystal in new drop with crytallization condition, SEC buffer and 20 % glycerol for 24 h.
分辨率 1.85 Å R-free 0.228
9I7Y Crystal Structure of KRasG13C in Complex with Nucleotide-based Covalent Inhibitor 7b 提交 2025-02-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 A1I08 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-oxidanyl-2-[[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]oxymethyl]oxolan-3-yl] (3~{S})-3-(propanoylamino)piperidine-1-carboxylate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；30 % PEG4000, 100 mM NaAc pH 9.0, 200 mM Tris pH 9.0 followed by shrinking of the crystal in new drop with crytallization condition, SEC buffer and 20 % glycerol for 24 h.
分辨率 1.85 Å R-free 0.228
9I7Y Crystal Structure of KRasG13C in Complex with Nucleotide-based Covalent Inhibitor 7b 提交 2025-02-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
未记录 A1I08 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-oxidanyl-2-[[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]oxymethyl]oxolan-3-yl] (3~{S})-3-(propanoylamino)piperidine-1-carboxylate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；30 % PEG4000, 100 mM NaAc pH 9.0, 200 mM Tris pH 9.0 followed by shrinking of the crystal in new drop with crytallization condition, SEC buffer and 20 % glycerol for 24 h.
分辨率 1.85 Å R-free 0.228
9IAP Structure of 1 in complex with GDP-KRAS 提交 2025-02-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1I1P (4~{S})-2-azanyl-4-methyl-4-[3-(3-piperazin-1-ylphenyl)-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2mM Magnesium Chloride, 20% PEG 2000, 100mM sodium acetate pH 4.4
分辨率 1.18 Å R-free 0.232
9IAW Structure of 5 in complex with GDP-KRAS 提交 2025-02-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1I1R (4~{S})-2-azanyl-4-methyl-4-[3-[2-[(2~{S})-2-methylpiperazin-1-yl]pyrimidin-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2mM Magnesium Chloride, 20% PEG 2000, 100mM sodium acetate pH 4.4
分辨率 1.00 Å R-free 0.200
9IAY Structure of 10 in complex with GDP-KRAS 提交 2025-02-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 WYU (4S)-2-azanyl-4-methyl-4-[3-[2-[(2S)-2-methyl-1,4-diazepan-1-yl]pyrimidin-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2mM Magnesium Chloride, 20% PEG 2000, 100mM sodium acetate pH 4.4
分辨率 0.95 Å R-free 0.191
9IB4 Structure of 12 in complex with GDP-KRAS 提交 2025-02-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 A1I1Z (4~{S})-2-azanyl-4-methyl-4-[3-[2-[[(2~{S})-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy]pyrimidin-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-5-yl]-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophene-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2mM Magnesium Chloride, 20% PEG 2000, 100mM sodium acetate pH 4.4
分辨率 1.06 Å R-free 0.239
9IB5 Structure of 18 (BI-2493) in complex with GDP-KRAS 提交 2025-02-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 VU6 (7~{S})-2'-azanyl-3-[2-[(2~{S})-2-methylpiperazin-1-yl]pyrimidin-4-yl]spiro[5,6-dihydro-4~{H}-1,2-benzoxazole-7,4'-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophene]-3'-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2mM Magnesium Chloride, 20% PEG 2000, 100mM sodium acetate pH 4.4
分辨率 1.01 Å R-free 0.191
9KFL KRAS G12V and peptide complex 提交 2024-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–168（168 aa）
链 D 1–168（168 aa）
链 E 1–168（168 aa）
链 H 1–168（168 aa）
链 K 1–168（168 aa）
突变：G12V 突变：G12V 突变：G12V 突变：G12V 突变：G12V MG MAGNESIUM ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Polyethylene glycol 3350, 0.2M potassium nitrate (pH 6.8)
分辨率 3.45 Å R-free 0.233
9KPM Crystal structure of KRAS-G12C in complex with compound 16 (JAB-16) 提交 2024-11-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1L6C 7-[2-azanyl-3,5-bis(chloranyl)-6-fluoranyl-phenyl]-6-chloranyl-1-(4-methyl-2-propan-2-yl-pyridin-3-yl)-2-oxidanylidene-4-(4-prop-2-enoylpiperazin-1-yl)-1,8-naphthyridine-3-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；277 K；0.2 M Magnesium Chloride, 0.1 M Tris pH 8.3, 25% w/v PEG 3350
分辨率 1.41 Å R-free 0.194
9KPN Crystal structure of KRAS-G12C in complex with Compound 20 (JAB-20) 提交 2024-11-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1L6B Glecirasib bound form × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；277 K；0.1 M Sodium cacodylate, pH 5.3, 25% w/v PEG 4000
分辨率 1.29 Å R-free 0.193
9KPN Crystal structure of KRAS-G12C in complex with Compound 20 (JAB-20) 提交 2024-11-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1L6B Glecirasib bound form × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；277 K；0.1 M Sodium cacodylate, pH 5.3, 25% w/v PEG 4000
分辨率 1.29 Å R-free 0.193
9L6A Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with compound 1 提交 2024-12-24 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1L65 6-cyclopropyl-4-[(1~{S},4~{S})-2,5-diazabicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]-7-(6-fluoranyl-5-methyl-1~{H}-indazol-4-yl)-2-(oxan-4-yloxy)-8-phenylmethoxy-quinazoline × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；Tris, magnesium chloride, NaCl, PEG3350
分辨率 1.36 Å R-free 0.245
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 1–169（169 aa）
突变：G12D A1L66 ASP3082 × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 L 1–169（169 aa）
突变：G12D A1L66 ASP3082 × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 1–169（169 aa）
突变：G12D A1L66 ASP3082 × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9MF0 Crystal structure of KRAS(GDP) bound to LZTR1(Kelch domain) 提交 2024-12-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：T35A, E62A MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；8% w/v PGA-LM. 0.3M sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M sodium acetate pH 5.0.
分辨率 3.30 Å R-free 0.233
9MF0 Crystal structure of KRAS(GDP) bound to LZTR1(Kelch domain) 提交 2024-12-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：T35A, E62A MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；8% w/v PGA-LM. 0.3M sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M sodium acetate pH 5.0.
分辨率 3.30 Å R-free 0.233
9MF0 Crystal structure of KRAS(GDP) bound to LZTR1(Kelch domain) 提交 2024-12-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–169（169 aa）
突变：T35A, E62A MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；8% w/v PGA-LM. 0.3M sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M sodium acetate pH 5.0.
分辨率 3.30 Å R-free 0.233
9MF0 Crystal structure of KRAS(GDP) bound to LZTR1(Kelch domain) 提交 2024-12-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–169（169 aa）
突变：T35A, E62A MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；8% w/v PGA-LM. 0.3M sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M sodium acetate pH 5.0.
分辨率 3.30 Å R-free 0.233
9MF0 Crystal structure of KRAS(GDP) bound to LZTR1(Kelch domain) 提交 2024-12-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 1–169（169 aa）
突变：T35A, E62A MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；8% w/v PGA-LM. 0.3M sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M sodium acetate pH 5.0.
分辨率 3.30 Å R-free 0.233
9N44 Crystal structure of human KRAS-G12C covalent bound to Olomorasib 提交 2025-02-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 A1BV7 Olomorasib Bound Form × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；100mM Tris HCl pH 7.5 + 26.7% PEG 4K + 200mM Calcium Chloride
分辨率 1.11 Å R-free 0.189
9N9N Crystal structure of KRAS(G12C) bound to the cyclic peptide UNC10415730A 提交 2025-02-11 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.15 M Potassium Bromide, 30 % (w/v) PEG 2000 MME
分辨率 1.24 Å R-free 0.198
9N9N Crystal structure of KRAS(G12C) bound to the cyclic peptide UNC10415730A 提交 2025-02-11 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.15 M Potassium Bromide, 30 % (w/v) PEG 2000 MME
分辨率 1.24 Å R-free 0.198
9NF2 KRAS G12D Mutant KRAS 1-169 at 298 K bound to MRTX-1133 and GMPPNP 提交 2025-02-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, C51S, C80L, C118S 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG4000, Bis-Tris, pH 5.5, sodium acetate, 2-propanol
分辨率 1.70 Å R-free 0.213
9NFB Structure of the cross-HLA supertype antibody R302 bound to a class I MHC presenting a divarasib-modified KRAS-G12C peptide on HLA-A*02 提交 2025-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 5–14（10 aa）
突变：G12C A1AWR 1-{(3S)-4-[(7M)-7-[6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloro-8-fluoro-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}quinazolin-4-yl]-3-methylpiperazin-1-yl}propan-1-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot time 4 s blot force 5
分辨率 3.23 Å
9NFC Structure of the cross-HLA supertype antibody R302 bound to a class I MHC presenting a divarasib-modified KRAS-G12C peptide on HLA-A*03 提交 2025-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 7–16（10 aa）
突变：G12C A1AWR 1-{(3S)-4-[(7M)-7-[6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloro-8-fluoro-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}quinazolin-4-yl]-3-methylpiperazin-1-yl}propan-1-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot time 4 s blot force 5
分辨率 2.58 Å
9NI3 Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–188（188 aa）
未记录 PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 1 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9NI4 Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex dimer on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–188（188 aa）
链 D 1–188（188 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.61 Å
9NI5 Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–188（188 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
9NI6 Cryo-EM structure of the Class 1 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–188（188 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
9NI7 Cryo-EM structure of the Class 3 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–188（188 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9NI8 Cryo-EM structure of the Class 2 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–188（188 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9NID Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex dimer on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs low-pass filtered to 5 angstroms 提交 2025-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–188（188 aa）
链 D 1–188（188 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9NIE Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs low-pass filtered to 5 angstroms 提交 2025-02-26 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–188（188 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9NIF Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs low-pass filtered to 5 angstroms 提交 2025-02-26 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–188（188 aa）
未记录 PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 1 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9NLC Cryo-EM structure of the Class 1 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs low-pass filtered to 10 angstroms 提交 2025-03-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–188（188 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
9NZM Crystal Structure of Kirsten Rat Sarcoma G12C Complexed with GMPPNP and Covalently Bound to an Adduct of {(2S)-4-[7-(8-chloronaphthalen-1-yl)-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-1-[(2Z)-2-fluoro-3-(pyridin-2-yl)prop-2-enoyl]piperazin-2-yl}acetonitrile 提交 2025-04-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C, C51S, C80L, C121S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 A1B7P {(2S)-4-[7-(8-chloronaphthalen-1-yl)-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-1-[(3R)-3-fluoro-3-(pyridin-2-yl)propanoyl]piperazin-2-yl}acetonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 MM Sodium cacodylate, pH 6.5, 1 M tri-sodium citrate dihydrate
分辨率 1.59 Å R-free 0.229
9NZM Crystal Structure of Kirsten Rat Sarcoma G12C Complexed with GMPPNP and Covalently Bound to an Adduct of {(2S)-4-[7-(8-chloronaphthalen-1-yl)-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-1-[(2Z)-2-fluoro-3-(pyridin-2-yl)prop-2-enoyl]piperazin-2-yl}acetonitrile 提交 2025-04-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12C, C51S, C80L, C121S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 A1B7P {(2S)-4-[7-(8-chloronaphthalen-1-yl)-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-1-[(3R)-3-fluoro-3-(pyridin-2-yl)propanoyl]piperazin-2-yl}acetonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 MM Sodium cacodylate, pH 6.5, 1 M tri-sodium citrate dihydrate
分辨率 1.59 Å R-free 0.229
9NZN Crystal Structure of Kirsten Rat Sarcoma G12C Complexed with GDP and Covalently Bound to an Adduct of (2S)-1-{4-[(7P)-7-(8-ethynyl-7-fluoro-3-hydroxynaphthalen-1-yl)-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]piperazin-1-yl}-2-fluoro-3-(1,3-thiazol-2-yl)propan-1-one 提交 2025-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1B7Q (2S)-1-{4-[(7P)-7-(8-ethynyl-7-fluoro-3-hydroxynaphthalen-1-yl)-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]piperazin-1-yl}-2-fluoro-3-(1,3-thiazol-2-yl)propan-1-one × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；100 MM Sodium acetate anhydrous, pH 4.6, 200 MM ammonium sulfate, 25% (w/v) PEG 4000
分辨率 1.50 Å R-free 0.224
9O0N Crystal structure of GDP-bound wild type KRAS in complex with MRTX1133 提交 2025-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；25% PEG 1500, 30% MPD, 0.1M sodium acetate, pH 4.5
分辨率 1.40 Å R-free 0.198
9O0O Crystal structure of GMPPNP-bound wild type KRAS in complex with MRTX1133 提交 2025-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；2M lithium sulfate, 15mM magnesium chloride, 5mM spermidine, 50mM sodium cacodylate pH 6.0
分辨率 1.90 Å R-free 0.207
9O0R Crystal structure of wild-type KRAS (GDP-bound) in complex with MRTX849 (adagrasib) 提交 2025-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 A1B7W Adagrasib × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；45 mM zinc acetate, 18% PEG 3350, 40 mM trans-4-hydroxy-L-proline
分辨率 1.81 Å R-free 0.247
9O0R Crystal structure of wild-type KRAS (GDP-bound) in complex with MRTX849 (adagrasib) 提交 2025-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 A1B7W Adagrasib × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；45 mM zinc acetate, 18% PEG 3350, 40 mM trans-4-hydroxy-L-proline
分辨率 1.81 Å R-free 0.247
9O0S Crystal structure of KRAS-Q61R mutant, GMPPNP-bound 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：Q61R GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 8000, 20% PEG 400, 100 mM magnesium chloride, 100 mM Tris pH 8.5
分辨率 1.89 Å R-free 0.229
9O55 Structure of a synthetic antibody (RM010) in complex with a class I MHC presenting a hapten-peptide conjugate 提交 2025-04-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 7–16（10 aa）
未记录 A1B8E [(2S)-4-[7-(8-chloronaphthalen-1-yl)-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-4-yl]-1-(2-fluoroprop-2-enoyl)piperazin-2-yl]acetonitrile × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9O65 Cryo-EM structure of SHOC2-KRAS-PP1CA (SKP) complex 提交 2025-04-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：Q61R GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9OEL KRAS Wild Type 1-169 at 293 K 提交 2025-04-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM sodium acetate, pH 3.6-5.6, 100 mM Tris, pH 8.5, 22-28% PEG3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.212
9OEL KRAS Wild Type 1-169 at 293 K 提交 2025-04-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM sodium acetate, pH 3.6-5.6, 100 mM Tris, pH 8.5, 22-28% PEG3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.212
9OEX K-Ras G12V at 293 K 提交 2025-04-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM sodium acetate, pH 4.5-4.7, 100 mM Tris, pH 8.5, 20% PEG3350, 1 mM DTT
分辨率 1.50 Å R-free 0.221
9OEX K-Ras G12V at 293 K 提交 2025-04-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；200 mM sodium acetate, pH 4.5-4.7, 100 mM Tris, pH 8.5, 20% PEG3350, 1 mM DTT
分辨率 1.50 Å R-free 0.221
9P44 Crystal structure of KRAS-G12D (GDP-bound) in complex with BBO-11818 提交 2025-06-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1CG4 methyl (3S)-3-{[(7P)-7-(2-amino-3-cyano-7-fluoro-1-benzothiophen-4-yl)-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}-6-(trifluoromethyl)quinazolin-4-yl](ethyl)amino}pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M CHES pH 9.5, 1 M tri-sodium citrate
分辨率 1.70 Å R-free 0.213
9P44 Crystal structure of KRAS-G12D (GDP-bound) in complex with BBO-11818 提交 2025-06-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D, C118S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1CG4 methyl (3S)-3-{[(7P)-7-(2-amino-3-cyano-7-fluoro-1-benzothiophen-4-yl)-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}-6-(trifluoromethyl)quinazolin-4-yl](ethyl)amino}pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M CHES pH 9.5, 1 M tri-sodium citrate
分辨率 1.70 Å R-free 0.213
9P45 Crystal structure of KRAS-G12D (GMPPNP-bound) in complex with BBO-11818 提交 2025-06-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D, C118S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 A1CG4 methyl (3S)-3-{[(7P)-7-(2-amino-3-cyano-7-fluoro-1-benzothiophen-4-yl)-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}-6-(trifluoromethyl)quinazolin-4-yl](ethyl)amino}pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6, 45% PEG 200, 0.05 M CaCl2
分辨率 1.35 Å R-free 0.194
9PIZ Structure of KRAS-G12C bound to 1-[(4aR,10P,13R)-10-[5-amino-4-fluoro-3-methyl-2-(trifluoromethyl)phenyl]-11-chloro-9-fluoro-1,2,4a,5-tetrahydropyrazino[1',2':4,5][1,4]oxazino[2,3-c]quinolin-3(4H)-yl]prop-2-en-1-one (compound 15) 提交 2025-07-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1CII 1-[(4aR,10P,13R)-10-[5-amino-4-fluoro-3-methyl-2-(trifluoromethyl)phenyl]-11-chloro-9-fluoro-1,2,4a,5-tetrahydropyrazino[1',2':4,5][1,4]oxazino[2,3-c]quinolin-3(4H)-yl]prop-2-en-1-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 7 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.4, 37% PEG300, 0.2 M calcium acetate, 0.4 mM TCEP
分辨率 1.94 Å R-free 0.218
9PVF KRAS complex with UM0152533 compound 提交 2025-08-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；293.15 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M MgCl2, 25 % PEG 3,350
分辨率 2.00 Å R-free 0.215
9PVF KRAS complex with UM0152533 compound 提交 2025-08-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；293.15 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M MgCl2, 25 % PEG 3,350
分辨率 2.00 Å R-free 0.215
9PVF KRAS complex with UM0152533 compound 提交 2025-08-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；293.15 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M MgCl2, 25 % PEG 3,350
分辨率 2.00 Å R-free 0.215
9PVF KRAS complex with UM0152533 compound 提交 2025-08-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；293.15 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M MgCl2, 25 % PEG 3,350
分辨率 2.00 Å R-free 0.215
9PVF KRAS complex with UM0152533 compound 提交 2025-08-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；293.15 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M MgCl2, 25 % PEG 3,350
分辨率 2.00 Å R-free 0.215
9PVF KRAS complex with UM0152533 compound 提交 2025-08-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–166（166 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；293.15 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M MgCl2, 25 % PEG 3,350
分辨率 2.00 Å R-free 0.215
9PZF Structure of KRAS G12C bound to Compound 4 提交 2025-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–169（168 aa）
突变：G12C variant, C51S, C80L, C118S A1CQ2 1-(4-{(7M)-7-[6-amino-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloroquinazolin-4-yl}piperazin-1-yl)propan-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100mM Tris pH 8.3-8.7, 28%-32% PEG 3350, and 200mM MgCl2
分辨率 1.84 Å R-free 0.204
9PZF Structure of KRAS G12C bound to Compound 4 提交 2025-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–169（168 aa）
突变：G12C variant, C51S, C80L, C118S A1CQ2 1-(4-{(7M)-7-[6-amino-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloroquinazolin-4-yl}piperazin-1-yl)propan-1-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100mM Tris pH 8.3-8.7, 28%-32% PEG 3350, and 200mM MgCl2
分辨率 1.84 Å R-free 0.204
9PZY Structure of KRAS G12C bound to Divarasib (GDC6036) 提交 2025-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–169（168 aa）
突变：G12C variant GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 A1AWR 1-{(3S)-4-[(7M)-7-[6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloro-8-fluoro-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}quinazolin-4-yl]-3-methylpiperazin-1-yl}propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100mM Tris pH 8.3-8.7, 28%-32% PEG 3350, 200mM MgCl2
分辨率 2.17 Å R-free 0.212
9PZY Structure of KRAS G12C bound to Divarasib (GDC6036) 提交 2025-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–169（168 aa）
突变：G12C variant GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 A1AWR 1-{(3S)-4-[(7M)-7-[6-amino-4-methyl-3-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-6-chloro-8-fluoro-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}quinazolin-4-yl]-3-methylpiperazin-1-yl}propan-1-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100mM Tris pH 8.3-8.7, 28%-32% PEG 3350, 200mM MgCl2
分辨率 2.17 Å R-free 0.212
9QPZ KRAS-WT(1-169) - GDP IN COMPLEX WITH compound (R)-1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 A1I89 (4~{R})-4-[[(1~{S},5~{R})-3-[7-(8-ethynyl-7-fluoranyl-3-oxidanyl-naphthalen-1-yl)-8-fluoranyl-2-[[(2~{R},8~{S})-2-fluoranyl-1,2,3,5,6,7-hexahydropyrrolizin-8-yl]methoxy]pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]carbonyl]-3,3-dimethyl-oxetan-2-one × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 % PEG 4000, 0.2 M (NH4)2SO4
分辨率 1.31 Å R-free 0.219
9QQ0 KRAS-G12D(1-169) - GDP IN covalent COMPLEX WITH compound (3R,4R)-3 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 A1I9E (2~{R})-2-ethyl-4-[(1~{R},5~{S})-3-[7-(8-ethynyl-7-fluoranyl-3-oxidanyl-naphthalen-1-yl)-8-fluoranyl-2-[[(2~{R},8~{S})-2-fluoranyl-1,2,3,5,6,7-hexahydropyrrolizin-8-yl]methoxy]pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]-2-methyl-4-oxidanylidene-butanoic acid × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30 % PEG 1000, 0.2 M MgSO4
分辨率 1.55 Å R-free 0.213
9QQ1 KRAS-G12D(1-169) - GDP IN covalent COMPLEX with compound (3S,4R)-8 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 A1I9F (2~{S})-4-[(1~{R},5~{S})-3-[7-(8-ethynyl-7-fluoranyl-3-oxidanyl-naphthalen-1-yl)-8-fluoranyl-2-[[(2~{R},8~{S})-2-fluoranyl-1,2,3,5,6,7-hexahydropyrrolizin-8-yl]methoxy]pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]-2-methyl-2-(oxan-4-ylmethyl)-4-oxidanylidene-butanoic acid × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30 % PEG 1000 0.2 M NaH2PO4
分辨率 1.30 Å R-free 0.207
9RK8 Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12V C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–169（169 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10%w/v PEG 8000
分辨率 2.63 Å R-free 0.263
9RK8 Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12V C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–169（169 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10%w/v PEG 8000
分辨率 2.63 Å R-free 0.263
9RKC Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12D C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–169（169 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Na2SO4, 15% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.79
分辨率 2.19 Å R-free 0.275
9RKC Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12D C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–169（169 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Na2SO4, 15% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.79
分辨率 2.19 Å R-free 0.275
9RKE Crystal Structure of compound 1-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–169（169 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.3 M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.286
9RKE Crystal Structure of compound 1-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–169（169 aa）
未记录 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.3 M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.286
9RKJ Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–169（169 aa）
未记录 FLC CITRATE ANION × 2 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.167 M trisodium citrate, 17%(w/v) PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.288
9RKJ Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–169（169 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.167 M trisodium citrate, 17%(w/v) PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.288
9RKN Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–169（169 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.14 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1M BIS-TRIS pH 5.8
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
9RKN Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–169（169 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.14 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1M BIS-TRIS pH 5.8
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
9TBM From KRASG12D to pan-KRAS inhibitors 提交 2025-11-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；containing 0.1M NaH2PO4/Na2HPO4 pH 9, 30.0% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.254
9TBM From KRASG12D to pan-KRAS inhibitors 提交 2025-11-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1JU5 4-[4-[(1~{S},5~{R})-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-2-[[1-[(dimethylamino)methyl]cyclopropyl]methoxy]-6,8-bis(fluoranyl)quinazolin-7-yl]naphthalen-2-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；containing 0.1M NaH2PO4/Na2HPO4 pH 9, 30.0% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.254
9TBM From KRASG12D to pan-KRAS inhibitors 提交 2025-11-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；containing 0.1M NaH2PO4/Na2HPO4 pH 9, 30.0% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.254
9TBR From KRASG12D to pan-KRAS inhibitors 提交 2025-11-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–169（168 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1JU6 4-[6,8-bis(fluoranyl)-2-[[(2~{R},8~{S})-2-fluoranyl-1,2,3,5,6,7-hexahydropyrrolizin-8-yl]methoxy]-4-[(1~{S},5~{R})-1-methyl-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]quinazolin-7-yl]naphthalen-2-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1M NaH2PO4/Na2HPO4 pH 9, 30.0% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.65 Å R-free 0.212
9TBW From KRASG12D to pan-KRAS inhibitors 提交 2025-11-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 A1JU7 4-[6,8-bis(fluoranyl)-2-[[(2~{R},8~{S})-2-fluoranyl-1,2,3,5,6,7-hexahydropyrrolizin-8-yl]methoxy]-4-(1,4-oxazepan-4-yl)quinazolin-7-yl]-5-chloranyl-naphthalen-2-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1M sodium acetate pH 5.5, 30-35% PEG3350
分辨率 1.54 Å R-free 0.229
9TC0 From KRASG12D to pan-KRAS inhibitors 提交 2025-11-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1JU8 (6~{S})-4-[7-(8-ethynyl-3-oxidanyl-naphthalen-1-yl)-6,8-bis(fluoranyl)-2-[[(2~{R},8~{S})-2-fluoranyl-1,2,3,5,6,7-hexahydropyrrolizin-8-yl]methoxy]quinazolin-4-yl]-6-methyl-1,4-oxazepan-6-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M sodium acetate pH 5.5, 30-35% PEG3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.227
9TC2 From KRASG12D to pan-KRAS inhibitors 提交 2025-11-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 A1JU3 (6~{R})-1-[7-(8-chloranyl-3-oxidanyl-naphthalen-1-yl)-6,8-bis(fluoranyl)-2-[[(2~{R},8~{S})-2-fluoranyl-2,3,4,5,6,7-hexahydro-1~{H}-pyrrolizin-4-ium-8-yl]methoxy]quinazolin-4-yl]-6-methyl-1,4-diazepan-4-ium-6-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M sodium acetate pH 5.5, 30-35% PEG3350
分辨率 1.30 Å R-free 0.198
9TC5 From KRASG12D to pan-KRAS inhibitors 提交 2025-11-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1JU9 (1~{S},5~{S},6~{R})-3-[7-(8-ethynyl-3-oxidanyl-naphthalen-1-yl)-6,8-bis(fluoranyl)-2-[[(2~{R},8~{S})-2-fluoranyl-1,2,3,5,6,7-hexahydropyrrolizin-8-yl]methoxy]quinazolin-4-yl]-1,5-dimethyl-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-6-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M sodium acetate pH 5.5, 30-35% PEG3350
分辨率 1.35 Å R-free 0.212
9TC6 From KRASG12D to pan-KRAS inhibitors 提交 2025-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–169（168 aa）
突变：G12D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1JU2 4-[6,8-bis(fluoranyl)-2-[[(2~{R},8~{S})-2-fluoranyl-1,2,3,5,6,7-hexahydropyrrolizin-8-yl]methoxy]-4-[(1~{S},5~{S},6~{R})-6-methoxy-1,5-dimethyl-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]quinazolin-7-yl]-5-ethynyl-naphthalen-2-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1M NaH2PO4/Na2HPO4 pH 9, 30.0-35% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.63 Å R-free 0.222
9U50 GDP-bound KRAS G12V in complex with MCB-294 提交 2025-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 A1EN3 (3~{R})-1-[2-[[(8~{S})-6-[bis(fluoranyl)methylidene]-2,3,5,7-tetrahydro-1~{H}-pyrrolizin-8-yl]methoxy]-7-(8-ethynyl-7-fluoranyl-3-oxidanyl-naphthalen-1-yl)-8-fluoranyl-pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]-3-methyl-piperidin-3-ol × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26% (w/v) PEG 3350.
分辨率 1.87 Å R-free 0.228
9U50 GDP-bound KRAS G12V in complex with MCB-294 提交 2025-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 A1EN3 (3~{R})-1-[2-[[(8~{S})-6-[bis(fluoranyl)methylidene]-2,3,5,7-tetrahydro-1~{H}-pyrrolizin-8-yl]methoxy]-7-(8-ethynyl-7-fluoranyl-3-oxidanyl-naphthalen-1-yl)-8-fluoranyl-pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]-3-methyl-piperidin-3-ol × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26% (w/v) PEG 3350.
分辨率 1.87 Å R-free 0.228
9U50 GDP-bound KRAS G12V in complex with MCB-294 提交 2025-03-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 A1EN3 (3~{R})-1-[2-[[(8~{S})-6-[bis(fluoranyl)methylidene]-2,3,5,7-tetrahydro-1~{H}-pyrrolizin-8-yl]methoxy]-7-(8-ethynyl-7-fluoranyl-3-oxidanyl-naphthalen-1-yl)-8-fluoranyl-pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]-3-methyl-piperidin-3-ol × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26% (w/v) PEG 3350.
分辨率 1.87 Å R-free 0.228
9U5T GDP-bound KRAS G12D in complex with MCB-294 提交 2025-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 A1EN3 (3~{R})-1-[2-[[(8~{S})-6-[bis(fluoranyl)methylidene]-2,3,5,7-tetrahydro-1~{H}-pyrrolizin-8-yl]methoxy]-7-(8-ethynyl-7-fluoranyl-3-oxidanyl-naphthalen-1-yl)-8-fluoranyl-pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]-3-methyl-piperidin-3-ol × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 26% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium acetate
分辨率 1.80 Å R-free 0.211
9U8L Crystal structure of KRAS-G12D/Y96S mutant in complex with MRTX-1133 提交 2025-03-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D,Y96S MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M SPG buffer pH 5.0, 25% (w/v) PEG 1500
分辨率 1.23 Å R-free 0.176
9U8T Crystal structure of KRAS-G12D/R68M mutant in complex with MRTX-1133 提交 2025-03-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D,R68M GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Sodium acetate, pH5.0, 20% (w/v) PEG 6000
分辨率 1.40 Å R-free 0.183
9U8U Crystal structure of KRAS-G12D/Q61H mutant in complex with MRTX-1133 提交 2025-03-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D,Q61H GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Ammonium chloride, 0.1 M Sodium acetate pH 5.0, 20% (w/v) PEG 6000
分辨率 1.32 Å R-free 0.180
9U8V Crystal structure of KRAS-G12D/Y96S mutant in complex with GDP 提交 2025-03-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D,Y96S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M SPG buffer pH 7.0, 25% (w/v) PEG 1500
分辨率 1.57 Å R-free 0.195
9U8W Crystal structure of KRAS-G12D/Q99L mutant in complex with GDP 提交 2025-03-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D,Q99L GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.01 M Zinc chloride, 0.1 M Sodium acetate pH 5.0, 20% (w/v) PEG 6000
分辨率 1.50 Å R-free 0.210
9U8W Crystal structure of KRAS-G12D/Q99L mutant in complex with GDP 提交 2025-03-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D,Q99L GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.01 M Zinc chloride, 0.1 M Sodium acetate pH 5.0, 20% (w/v) PEG 6000
分辨率 1.50 Å R-free 0.210
9U8X Crystal structure of KRAS-G12D/R68M mutant in complex with GDP 提交 2025-03-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D,R68M GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Sodium fluoride, 0.1 M Bis tris propane pH 6.5, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.65 Å R-free 0.256
9U8Y Crystal structure of KRAS-G12D/G13D mutant in complex with GDP 提交 2025-03-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D,G13D GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M MMT buffer pH 5.0, 25% (w/v) PEG 1500
分辨率 1.73 Å R-free 0.266
9U8Z Crystal structure of KRAS-G12D/Q61H mutant in complex with GDP 提交 2025-03-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D,Q61H GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M MIB buffer pH 4.0, 25% (w/v) PEG 1500
分辨率 1.20 Å R-free 0.196
9U90 Crystal structure of KRAS-G12D/E62K mutant in complex with GDP 提交 2025-03-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D,E62K GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M SPG buffer pH 7.0, 25% (w/v) PEG 1500
分辨率 1.20 Å R-free 0.202
9U95 Crystal structure of KRAS-G12D/Q99L mutant in complex with MRTX-1133 提交 2025-03-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D,Q99L 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M SPG buffer pH 4.0, 25% (w/v) PEG 1500
分辨率 1.75 Å R-free 0.201
9U95 Crystal structure of KRAS-G12D/Q99L mutant in complex with MRTX-1133 提交 2025-03-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D,Q99L 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M SPG buffer pH 4.0, 25% (w/v) PEG 1500
分辨率 1.75 Å R-free 0.201
9U97 Crystal structure of KRAS-G12D/G13D mutant in complex with MRTX-1133 提交 2025-03-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D,G13D 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M SPG buffer pH 5.0, 25% (w/v) PEG 1500
分辨率 1.79 Å R-free 0.235
9U99 Crystal structure of KRAS-G12D/E62K mutant in complex with MRTX-1133 提交 2025-03-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12D,E62K 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Sodium acetate pH5.0, 20% (w/v) PEG 6000
分辨率 2.50 Å R-free 0.250
9U99 Crystal structure of KRAS-G12D/E62K mutant in complex with MRTX-1133 提交 2025-03-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12D,E62K 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Sodium acetate pH5.0, 20% (w/v) PEG 6000
分辨率 2.50 Å R-free 0.250
9U99 Crystal structure of KRAS-G12D/E62K mutant in complex with MRTX-1133 提交 2025-03-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12D,E62K 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Sodium acetate pH5.0, 20% (w/v) PEG 6000
分辨率 2.50 Å R-free 0.250
9U99 Crystal structure of KRAS-G12D/E62K mutant in complex with MRTX-1133 提交 2025-03-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–169（169 aa）
突变：G12D,E62K 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Sodium acetate pH5.0, 20% (w/v) PEG 6000
分辨率 2.50 Å R-free 0.250
9USB GppNHp-bound KRAS G12D in complex with MCB-294 提交 2025-05-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 A1EN3 (3~{R})-1-[2-[[(8~{S})-6-[bis(fluoranyl)methylidene]-2,3,5,7-tetrahydro-1~{H}-pyrrolizin-8-yl]methoxy]-7-(8-ethynyl-7-fluoranyl-3-oxidanyl-naphthalen-1-yl)-8-fluoranyl-pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]-3-methyl-piperidin-3-ol × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26% (w/v) PEG 3350.
分辨率 2.35 Å R-free 0.242
9USB GppNHp-bound KRAS G12D in complex with MCB-294 提交 2025-05-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 A1EN3 (3~{R})-1-[2-[[(8~{S})-6-[bis(fluoranyl)methylidene]-2,3,5,7-tetrahydro-1~{H}-pyrrolizin-8-yl]methoxy]-7-(8-ethynyl-7-fluoranyl-3-oxidanyl-naphthalen-1-yl)-8-fluoranyl-pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]-3-methyl-piperidin-3-ol × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26% (w/v) PEG 3350.
分辨率 2.35 Å R-free 0.242
9USB GppNHp-bound KRAS G12D in complex with MCB-294 提交 2025-05-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–169（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 A1EN3 (3~{R})-1-[2-[[(8~{S})-6-[bis(fluoranyl)methylidene]-2,3,5,7-tetrahydro-1~{H}-pyrrolizin-8-yl]methoxy]-7-(8-ethynyl-7-fluoranyl-3-oxidanyl-naphthalen-1-yl)-8-fluoranyl-pyrido[4,3-d]pyrimidin-4-yl]-3-methyl-piperidin-3-ol × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 26% (w/v) PEG 3350.
分辨率 2.35 Å R-free 0.242
9XZ1 KRAS(G12C)-RNK07311-HSP90(N-terminus) 提交 2025-08-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 CA CALCIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1CRY (5M)-4-{4-[(4-{4-[2-({7-(8-chloronaphthalen-1-yl)-4-[(3S)-3-(cyanomethyl)-4-propanoylpiperazin-1-yl]-5,6,7,8-tetrahydropyrido[3,4-d]pyrimidin-2-yl}oxy)ethyl]piperazine-1-carbonyl}piperidin-1-yl)methyl]phenyl}-5-[2,4-dihydroxy-5-(propan-2-yl)phenyl]-4H-1,2,4-triazole-3-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；KRAS(G/C)-RNK07311-HSP90a complex was crystallized by sitting drop with vapor diffusion against 0.05M CaCl2, 0.1M Bis-Tris pH6.5, 30% PEGMME550 (drop size: 200 nl protein + 180nl reservoir + 20nl lysozyme seed).
分辨率 1.96 Å R-free 0.249
9YGS Crystal structure of GMPPNP bound KRAS-Y71H in complex with RBD domain of CRAF(RAF1) 提交 2025-09-29 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：Y71H GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；100 mM Potassium thiocyanate, 30% PEG monomethyl ether 2000.
分辨率 1.68 Å R-free 0.233
9YOW Crystal structure of GMPPNP bound KRAS G12C in complex with CYPA and RMC-4791 提交 2025-10-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12C MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 A1CYT 1-cyano-N-[(2S)-1-{[(1M,8S,10S,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.1 M Tris pH 8.0, 0.2 M NaCl, 20% PEG 6000
分辨率 1.57 Å R-free 0.245
9YOW Crystal structure of GMPPNP bound KRAS G12C in complex with CYPA and RMC-4791 提交 2025-10-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–169（169 aa）
突变：G12C MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 A1CYT 1-cyano-N-[(2S)-1-{[(1M,8S,10S,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.1 M Tris pH 8.0, 0.2 M NaCl, 20% PEG 6000
分辨率 1.57 Å R-free 0.245
9ZO9 KRAS G13D Mutant in Complex with GDP and Compound 6. 提交 2025-12-15 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G13D, C51S, C80L, C118S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.70 Å R-free 0.197
9ZPA KRAS G12V Mutant in Complex with GDP and Compound 12. 提交 2025-12-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V, C51S, C80L, C118S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.68 Å R-free 0.255
9ZPA KRAS G12V Mutant in Complex with GDP and Compound 12. 提交 2025-12-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12V, C51S, C80L, C118S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.68 Å R-free 0.255
9ZPE KRAS G12V Mutant in Complex with GDP and Compound 8. 提交 2025-12-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–169（169 aa）
突变：G12V, C51S, C80L, C118S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.91 Å R-free 0.244
9ZPE KRAS G12V Mutant in Complex with GDP and Compound 8. 提交 2025-12-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–169（169 aa）
突变：G12V, C51S, C80L, C118S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.91 Å R-free 0.244

共 445 个其他 PDB 条目、804 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RASK_HUMAN
Isoform P01116-2
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 2–170； UniProt 1–169

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9c15

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9c15
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9c15
沉积日期 deposition_date2024-05-28
最后修订 last_revision2025-01-22
结构标题 titleCrystal structure of the KRAS-p110alpha complex with molecular glue D927
关键词 keywordsRAS, KRAS, PI3Kalpha, p110alpha, PIK3CA, glue, ONCOPROTEIN; ONCOPROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier35.24 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron34.84 Å
零角强度 I(0) i0430814000.00
分子量 molecular_weight111690.0 kDa
排除体积 excluded_volume107900 ų
包络体积 envelope_volume195690 ų
水化壳体积 shell_volume47896 ų
包络直径 envelope_diameter127.9 Å
壳层 Rg shell_rg40.30 Å
包络 Rg envelope_rg34.90 Å
形状 Rg shape_rg34.83 Å
总 Rg total_rg35.15 Å
总原子数 total_atoms8419
残基数 n_residues1055
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax119.8 Å
Rg (实空间) rg_real35.36 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.03 Å
I(0) (实空间) i0_real4.3080e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error6.8540e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal35.28 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal430800000.0000
解质量估计 total_estimate0.6707
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary39.9 Å
偏度 Skewness skewness0.510
峰度 Kurtosis kurtosis-0.010
角度范围 angular_range— – 0.2250 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha45080000.0000
实空间数据点数 n_real_points46
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.801; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.186; Positv: 1.000; Valcen: 0.984; Smooth: 0.768
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)