8qpa

Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ssLNG Complex (core part)

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 204.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 13 RNA 4 PDB 声明：heptadecameric（17）与全部聚合物数一致	链 B； UniProt 1–2136	未记录	Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 × 1 （Q9BUQ8） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39 × 1 （Q53GS9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） U5 snRNA × 1 ;5'ss oligo ; × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） U4 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8QPA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3JCR 3D structure determination of the humanU4/U6.U5 tri-snRNP complex 提交 2016-01-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 C 1–2136（2136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA；pH 7.9；20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.00 Å
4F91 Brr2 Helicase Region 提交 2012-05-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 402–2125（1724 aa）片段：Brr2 Helicase Region	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293.15 K；0.1 M sodium citrate, 1.2 M sodium Malonate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K	分辨率 2.70 Å R-free 0.272
4F92 Brr2 Helicase Region S1087L 提交 2012-05-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 402–2125（1724 aa）片段：Brr2 Helicase Region	突变：S1087L	SAN SULFANILAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293.15 K；0.1 M sodium citrate, 1.2 M sodium Malonate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K	分辨率 2.66 Å R-free 0.259
4F93 Brr2 Helicase Region S1087L, Mg-ATP 提交 2012-05-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 402–2125（1724 aa）片段：Brr2 Helicase Region	突变：S1087L	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SAN SULFANILAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293.15 K；0.1 M sodium citrate, 1.2 M sodium Malonate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K	分辨率 2.92 Å R-free 0.248
4KIT Crystal structure of human Brr2 in complex with the Prp8 Jab1/MPN domain 提交 2013-05-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 395–2129（1735 aa）片段：helicase region (UNP residues 395-2129)	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；277 K；0.1 M HEPES-NaOH, pH 7.9, 0.2 M magnesium chloride, 12% ethanol, Silver Bullets Bio condition 91 (Hampton Research) as additive, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.235
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 C 1–2136（2136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
5URJ Crystal structure of human BRR2 in complex with T-3905516 提交 2017-02-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 395–2129（1735 aa）片段：UNP residues 395-2129	未记录	GOL GLYCEROL × 1 8LS 6-benzyl-3-[(2R)-2-(3-fluoropyridin-2-yl)-6-methyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-7-yl]-4,6-dihydropyrido[4,3-d]pyrimidine-2,7(3H,8H)-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.25-1.5M sodium malonate, 100mM sodium citrate pH 5.0-5.3, 10mg/ml BRR2	分辨率 2.75 Å R-free 0.286
5URK Crystal structure of human BRR2 in complex with T-3935799 提交 2017-02-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 395–2129（1735 aa）片段：UNP residues 395-2129	未记录	GOL GLYCEROL × 1 8LP 6-benzyl-3-[3-(benzyloxy)phenyl]-4,6-dihydropyrido[4,3-d]pyrimidine-2,7(1H,3H)-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.25-1.5 M sodium malonate, 100 mM sodium citrate pH 5.0-5.3, 10mg/ml BRR2	分辨率 2.95 Å R-free 0.277
5URM Crystal structure of human BRR2 in complex with T-1206548 提交 2017-02-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 395–2129（1735 aa）片段：UNP residues 395-2129	未记录	8LV 3-(5-{[(2R)-5-amino-2-cyclohexyl-7-oxo-2,3-dihydro-7H-[1,3,4]thiadiazolo[3,2-a]pyrimidin-6-yl]methyl}furan-2-yl)benzoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.25-1.5M sodium malonate, 100mM sodium citrate pH 5.0-5.3, 10mg/ml BRR2	分辨率 2.80 Å R-free 0.260
5URM Crystal structure of human BRR2 in complex with T-1206548 提交 2017-02-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 395–2129（1735 aa）片段：UNP residues 395-2129	未记录	8LV 3-(5-{[(2R)-5-amino-2-cyclohexyl-7-oxo-2,3-dihydro-7H-[1,3,4]thiadiazolo[3,2-a]pyrimidin-6-yl]methyl}furan-2-yl)benzoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.25-1.5M sodium malonate, 100mM sodium citrate pH 5.0-5.3, 10mg/ml BRR2	分辨率 2.80 Å R-free 0.260
5XJC Cryo-EM structure of the human spliceosome just prior to exon ligation at 3.6 angstrom 提交 2017-04-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
5YZG The Cryo-EM Structure of Human Catalytic Step I Spliceosome (C complex) at 4.1 angstrom resolution 提交 2017-12-14	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
5Z56 cryo-EM structure of a human activated spliceosome (mature Bact) at 5.1 angstrom. 提交 2018-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 13	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
5Z57 Cryo-EM structure of the human activated spliceosome (late Bact) at 6.5 angstrom 提交 2018-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：57-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ALA ALANINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.50 Å
5Z58 Cryo-EM structure of a human activated spliceosome (early Bact) at 4.9 angstrom. 提交 2018-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：46-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6FF7 human Bact spliceosome core structure 提交 2018-01-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：61-meric	链 r 1–2136（2136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6ICZ Cryo-EM structure of a human post-catalytic spliceosome (P complex) at 3.0 angstrom 提交 2018-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6QDV Human post-catalytic P complex spliceosome 提交 2019-01-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric	链 B 404–2125（1722 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was applied to the grid, left for 25s, then blotted for 2.5-3.5s and immediately plunged into liquid ethane.	分辨率 3.30 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric	链 5B 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.	分辨率 2.92 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric	链 5B 1–2136（2136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
6S8O Human Brr2 Helicase Region M641C/A1582C 提交 2019-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 394–2136（1743 aa）	突变：M641C, A1582C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291.15 K；0.1M sodium citrate, 1.5M sodium malonate	分辨率 3.17 Å R-free 0.318
6S8Q Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 提交 2019-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.39 Å R-free 0.253
6S9I Human Brr2 Helicase Region D534C/N1866C in complex with C-tail deleted Jab1 提交 2019-07-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	突变：D534C, N1866C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.60 Å R-free 0.278
7A5P Human C Complex Spliceosome - Medium-resolution PERIPHERY 提交 2020-08-21	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：48-meric	链 q 1–2136（2136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.00 Å
7ABG Human pre-Bact-1 spliceosome 提交 2020-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric	链 s 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.80 Å
7ABI Human pre-Bact-2 spliceosome 提交 2020-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric	链 s 1–2136（2136 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.00 Å
7BDI Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and ATPgammaS 提交 2020-12-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.80 Å R-free 0.297
7BDJ Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and mant-ATPgammaS 提交 2020-12-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	TGB [[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-[2-(methylamino)phenyl]carbonyloxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-sulfanyl-phosphinic acid × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.59 Å R-free 0.289
7BDK Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and ADP 提交 2020-12-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.52 Å R-free 0.284
7BDL Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and mant-ADP 提交 2020-12-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	TG8 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-[[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]oxymethyl]oxolan-3-yl] 2-(methylamino)benzoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.69 Å R-free 0.292
7DVQ Cryo-EM Structure of the Activated Human Minor Spliceosome (minor Bact Complex) 提交 2021-01-14	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：49-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 2 G5J 5'-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(methoxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]oxy}phosphoryl]guanosine × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.89 Å
7OS1 Cryo-EM structure of Brr2 in complex with Fbp21 提交 2021-06-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 395–2129（1735 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7OS2 Cryo-EM structure of Brr2 in complex with Jab1/MPN and C9ORF78 提交 2021-06-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 394–2129（1736 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
7PX3 Structure of U5 snRNP assembly and recycling factor TSSC4 in complex with BRR2 and Jab1 domain of PRPF8 提交 2021-10-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
7W5B The cryo-EM structure of human C* complex 提交 2021-11-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8BC8 Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 18 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	QB6 3-azanyl-4-oxidanyl-benzenesulfonamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.39 Å R-free 0.245
8BC9 Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 24 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	A09 N-hydroxybenzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.30 Å R-free 0.249
8BCA Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 26 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	Q96 3-azanyl-~{N}-methyl-4-(methylamino)benzenesulfonamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.80 Å R-free 0.258
8BCB Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 34 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 SAN SULFANILAMIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.38 Å R-free 0.258
8BCC Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 39 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	QAU 3-oxidanylbenzenesulfonamide × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.35 Å R-free 0.258
8BCD Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 50 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	QB0 phenylsulfonylcarbamodithioic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 3.50 Å R-free 0.279
8BCE Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 76 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	B09 N-methoxybenzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.267
8BCF Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 78 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 Q8Z ~{N}-methoxy-~{N}-methyl-benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.42 Å R-free 0.275
8BCG Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 86 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	Q9I 4-chloranyl-~{N}-methoxy-~{N}-methyl-benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.39 Å R-free 0.269
8BCH Human Brr2 Helicase Region in complex with Sulfaguanidine 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 394–2136（1743 aa）	未记录	QA9 1-(4-aminophenyl)sulfonylguanidine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291.15 K；0.1M sodium citrate, 1.5M sodium malonate	分辨率 2.87 Å R-free 0.337
8C6J Human spliceosomal PM5 C* complex 提交 2023-01-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8CH6 Structure of a late-stage activated spliceosome (BAqr) arrested with a dominant-negative Aquarius mutant (state B complex). 提交 2023-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric	链 c 1–2136（2136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；All solutions were sterile-filtered using a 0.22um vacuum filtration unit. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Volumes of 4 ul of the concentrated sample were applied to one side of glow-discharged UltrAuFoil 200 2/2 grids (Quantifoil) in a Vitrobot Mark IV (FEI), operated at 4 degrees Celsius and 100% humidity. The grids were blotted for 2s with blotting force 5 and immediately frozen by plunging into liquid ethane.	分辨率 5.90 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 5D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 5D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 5D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric	链 5D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8I0P The cryo-EM structure of human pre-Bact complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8I0R The cryo-EM structure of human Bact-I complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8I0S The cryo-EM structure of human Bact-II complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8I0T The cryo-EM structure of human Bact-III complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8I0W The cryo-EM structure of human C complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：58-meric	链 D 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8Q7Q Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperones CD2BP2 and TSSC4 (State 2) 提交 2023-08-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8Q7V Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperones CD2BP2 and TSSC4 (State 1) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8Q7W Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 3) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8Q7X Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 4) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
8Q91 Structure of the human 20S U5 snRNP core 提交 2023-08-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.29 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 B 1–160（160 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QP9 Cryo-EM Structure of Pre-B+AMPPNP Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01	当前字段一致	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8QPK Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss Complex (core part) 提交 2023-10-02	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RC0 Structure of the human 20S U5 snRNP 提交 2023-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 B 1–60（60 aa）链 B 61–2136（2076 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
8Y6O Cryo-EM Structure of the human minor pre-B complex (pre-precatalytic spliceosome) U11 and tri-snRNP part 提交 2024-02-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：46-meric	链 E 1–2136（2136 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.38 Å
9FMD Integrative model of the human post-catalytic spliceosome (P-complex) 提交 2024-06-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9R3D Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
9R8V Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：63-meric	链 B 1–2136（2136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.50 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	U520_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–2136； UniProt 1–2136

Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23

物种未注明

UniProt Q9BUQ8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 13 RNA 4 PDB 声明：heptadecameric（17）与全部聚合物数一致	链 G； UniProt 1–820	未记录	U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39 × 1 （Q53GS9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） U5 snRNA × 1 ;5'ss oligo ; × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） U4 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8QPA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3JCR 3D structure determination of the humanU4/U6.U5 tri-snRNP complex 提交 2016-01-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 F 1–820（820 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA；pH 7.9；20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.00 Å
4NHO Structure of the spliceosomal DEAD-box protein Prp28 提交 2013-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 338–820（483 aa）片段：RecA domains (UNP residues 338-820)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 CXS 3-CYCLOHEXYL-1-PROPYLSULFONIC ACID × 1 HG MERCURY (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；298 K；2.2 M ammonium sulfate, 20 % (v/v) glycerol, 0.1 M CAPS, mixing 1 ul of protein with 1 ul of reservoir solution, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.218
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 X 1–820（820 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric	链 5X 1–820（820 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.	分辨率 2.92 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric	链 5X 1–820（820 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4U 1–820（820 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4U 1–820（820 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8Q7W Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 3) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 E 1–820（820 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8Q7X Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 4) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 E 1–820（820 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
8Q91 Structure of the human 20S U5 snRNP core 提交 2023-08-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric	链 D 1–820（820 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 G 1–820（820 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QP8 Cryo-EM Structure of Pre-B Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric	链 G 1–820（820 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8QP9 Cryo-EM Structure of Pre-B+AMPPNP Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 G 1–820（820 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01	当前字段一致	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 G 1–820（820 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8QPK Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss Complex (core part) 提交 2023-10-02	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric	链 G 1–820（820 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 G 1–820（820 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.60 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric	链 G 1–820（820 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 G 1–820（820 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric	链 G 1–820（820 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 G 1–820（820 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RC0 Structure of the human 20S U5 snRNP 提交 2023-12-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 D 1–820（820 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 G 1–820（820 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
8Y6O Cryo-EM Structure of the human minor pre-B complex (pre-precatalytic spliceosome) U11 and tri-snRNP part 提交 2024-02-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：46-meric	链 I 1–820（820 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.38 Å

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	DDX23_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–820； UniProt 1–820

U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3

物种未注明

UniProt O43395

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 13 RNA 4 PDB 声明：heptadecameric（17）与全部聚合物数一致	链 J； UniProt 1–683	未记录	U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 × 1 （Q9BUQ8） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39 × 1 （Q53GS9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） U5 snRNA × 1 ;5'ss oligo ; × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） U4 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8QPA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1X4Q Solution structure of PWI domain in U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3(hPrp3) 提交 2005-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–79（79 aa）片段：PWI domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient NMR样品组成 0.8mM U-15, 13C; 20mM phosphate buffer NA; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O,10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3JCR 3D structure determination of the humanU4/U6.U5 tri-snRNP complex 提交 2016-01-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 K 1–683（683 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA；pH 7.9；20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.00 Å
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 E 1–683（683 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric	链 4A 1–683（683 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.	分辨率 2.92 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric	链 4A 1–683（683 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4B 1–683（683 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4B 1–683（683 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 4B 1–683（683 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric	链 4B 1–683（683 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8Q7N cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region) 提交 2023-08-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.29 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QP8 Cryo-EM Structure of Pre-B Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8QP9 Cryo-EM Structure of Pre-B+AMPPNP Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01	当前字段一致	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8QPE Cryo-EM Structure of Pre-B-like Complex (core part) 提交 2023-10-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：20-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 J 1–683（683 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
8Y6O Cryo-EM Structure of the human minor pre-B complex (pre-precatalytic spliceosome) U11 and tri-snRNP part 提交 2024-02-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：46-meric	链 N 1–683（683 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.38 Å

共 26 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PRPF3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–683； UniProt 1–683

U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31

物种未注明

UniProt Q8WWY3

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 13 RNA 4 PDB 声明：heptadecameric（17）与全部聚合物数一致	链 L； UniProt 1–499	未记录	U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 × 1 （Q9BUQ8） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39 × 1 （Q53GS9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） U5 snRNA × 1 ;5'ss oligo ; × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） U4 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8QPA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2OZB Structure of a human Prp31-15.5K-U4 snRNA complex 提交 2007-02-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 B 78–333（256 aa）片段：Prp31, residues 78-333	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M calcium acetate, 0.1 M HEPES-NaOH, pH 7.0, 6 % PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.248
2OZB Structure of a human Prp31-15.5K-U4 snRNA complex 提交 2007-02-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 E 78–333（256 aa）片段：Prp31, residues 78-333	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M calcium acetate, 0.1 M HEPES-NaOH, pH 7.0, 6 % PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.248
3JCR 3D structure determination of the humanU4/U6.U5 tri-snRNP complex 提交 2016-01-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 J 1–499（499 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA；pH 7.9；20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.00 Å
3SIU Structure of a hPrp31-15.5K-U4atac 5' stem loop complex, monomeric form 提交 2011-06-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 B 85–333（249 aa）片段：UNP residues 85-333	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-Tris, pH 7.0, 20% w/v PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 393K	分辨率 2.63 Å R-free 0.241
3SIU Structure of a hPrp31-15.5K-U4atac 5' stem loop complex, monomeric form 提交 2011-06-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 E 85–333（249 aa）片段：UNP residues 85-333	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-Tris, pH 7.0, 20% w/v PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 393K	分辨率 2.63 Å R-free 0.241
3SIV Structure of a hPrp31-15.5K-U4atac 5' stem loop complex, dimeric form 提交 2011-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 B 85–333（249 aa）片段：UNP residues 85-333 链 E 85–333（249 aa）片段：UNP residues 85-333	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.4, 20% v/v PEG550 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 393K	分辨率 3.30 Å R-free 0.239
3SIV Structure of a hPrp31-15.5K-U4atac 5' stem loop complex, dimeric form 提交 2011-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 H 85–333（249 aa）片段：UNP residues 85-333 链 K 85–333（249 aa）片段：UNP residues 85-333	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.4, 20% v/v PEG550 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 393K	分辨率 3.30 Å R-free 0.239
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 H 1–499（499 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric	链 4C 1–499（499 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.	分辨率 2.92 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric	链 4C 1–499（499 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4D 1–499（499 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4D 1–499（499 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 4D 1–499（499 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric	链 4D 1–499（499 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8Q7N cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region) 提交 2023-08-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.29 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QP8 Cryo-EM Structure of Pre-B Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8QP9 Cryo-EM Structure of Pre-B+AMPPNP Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01	当前字段一致	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8QPE Cryo-EM Structure of Pre-B-like Complex (core part) 提交 2023-10-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：20-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QPK Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss Complex (core part) 提交 2023-10-02	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
8Y6O Cryo-EM Structure of the human minor pre-B complex (pre-precatalytic spliceosome) U11 and tri-snRNP part 提交 2024-02-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：46-meric	链 L 1–499（499 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.38 Å

共 29 个其他 PDB 条目、32 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PRP31_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–499； UniProt 1–499

U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4

物种未注明

UniProt O43172

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 13 RNA 4 PDB 声明：heptadecameric（17）与全部聚合物数一致	链 F； UniProt 1–522	未记录	U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 × 1 （Q9BUQ8） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39 × 1 （Q53GS9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） U5 snRNA × 1 ;5'ss oligo ; × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） U4 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8QPA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1MZW Crystal structure of a U4/U6 snRNP complex between human spliceosomal cyclophilin H and a U4/U6-60K peptide 提交 2002-10-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 107–137（31 aa）片段：residues 107-137, internal domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；PEG 8000, magnesium acetate, HEPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.212
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 F 1–521（521 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 K 1–522（522 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 K 1–522（522 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric	链 4B 1–522（522 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.	分辨率 2.92 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric	链 4B 1–522（522 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4C 1–522（522 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4C 1–522（522 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 4C 1–522（522 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric	链 4C 1–522（522 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8Q7N cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region) 提交 2023-08-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 F 1–522（522 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric	链 F 1–522（522 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.29 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 F 1–522（522 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01	当前字段一致	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 F 1–522（522 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8QPE Cryo-EM Structure of Pre-B-like Complex (core part) 提交 2023-10-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：20-meric	链 F 1–522（522 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 F 1–522（522 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric	链 F 1–522（522 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric	链 4B 1–522（522 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 F 1–522（522 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric	链 F 1–522（522 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 F 1–522（522 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 F 1–522（522 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
8Y6O Cryo-EM Structure of the human minor pre-B complex (pre-precatalytic spliceosome) U11 and tri-snRNP part 提交 2024-02-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：46-meric	链 M 1–522（522 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.38 Å

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PRP4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–522； UniProt 1–522

Pre-mRNA-processing factor 6

物种未注明

UniProt O94906

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 13 RNA 4 PDB 声明：heptadecameric（17）与全部聚合物数一致	链 N； UniProt 1–941	未记录	U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 × 1 （Q9BUQ8） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39 × 1 （Q53GS9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） U5 snRNA × 1 ;5'ss oligo ; × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） U4 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8QPA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3JCR 3D structure determination of the humanU4/U6.U5 tri-snRNP complex 提交 2016-01-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 G 1–941（941 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA；pH 7.9；20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.00 Å
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 G 1–941（941 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric	链 5J 1–941（941 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.	分辨率 2.92 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4G 1–941（941 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4G 1–941（941 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 4G 1–941（941 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric	链 4G 1–941（941 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8Q7N cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region) 提交 2023-08-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8Q7Q Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperones CD2BP2 and TSSC4 (State 2) 提交 2023-08-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 F 1–941（941 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8Q7V Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperones CD2BP2 and TSSC4 (State 1) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 F 1–941（941 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8Q7W Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 3) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 F 1–941（941 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8Q7X Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 4) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 F 1–941（941 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
8Q91 Structure of the human 20S U5 snRNP core 提交 2023-08-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric	链 E 1–941（941 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.29 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QP8 Cryo-EM Structure of Pre-B Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8QP9 Cryo-EM Structure of Pre-B+AMPPNP Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01	当前字段一致	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8QPE Cryo-EM Structure of Pre-B-like Complex (core part) 提交 2023-10-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：20-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QPK Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss Complex (core part) 提交 2023-10-02	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RC0 Structure of the human 20S U5 snRNP 提交 2023-12-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 E 1–941（941 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 N 1–941（941 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
8Y6O Cryo-EM Structure of the human minor pre-B complex (pre-precatalytic spliceosome) U11 and tri-snRNP part 提交 2024-02-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：46-meric	链 G 1–941（941 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.38 Å

共 31 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	PRP6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–941； UniProt 1–941

Pre-mRNA-processing-splicing factor 8

物种未注明

UniProt Q6P2Q9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 13 RNA 4 PDB 声明：heptadecameric（17）与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 1–2335	未记录	U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 × 1 （Q9BUQ8） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39 × 1 （Q53GS9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） U5 snRNA × 1 ;5'ss oligo ; × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） U4 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8QPA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3E9L Crystal Structure of Human Prp8, Residues 1755-2016 提交 2008-08-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1760–2016（257 aa）片段：endonuclease domain	未记录	NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.95 Å R-free 0.248
3ENB Crystal Structure of PRP8 core domain IV 提交 2008-09-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1769–1990（222 aa）片段：UNP residues 1769-1990	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；296 K；2.5 M NaCl, 100 mM Tris-HCl pH 7.0, 100 mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 1.85 Å R-free 0.243
3ENB Crystal Structure of PRP8 core domain IV 提交 2008-09-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1769–1990（222 aa）片段：UNP residues 1769-1990	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；296 K；2.5 M NaCl, 100 mM Tris-HCl pH 7.0, 100 mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 1.85 Å R-free 0.243
3JCR 3D structure determination of the humanU4/U6.U5 tri-snRNP complex 提交 2016-01-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA；pH 7.9；20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.00 Å
3LRU hPRP8 Non-Native Subdomain 提交 2010-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1831–1990（160 aa）片段：UNP residues 1831-1990 链 B 1831–1990（160 aa）片段：UNP residues 1831-1990	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 vapour diffusion；pH 6；298 K；12% PEG4000, Tris Ph8, 1,3 diamino-propane, pH 6, vapour diffusion, temperature 298K	分辨率 1.85 Å R-free 0.254
4JK7 Open and closed forms of wild-type human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1769–1990（222 aa）片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990	未记录	GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 1.40 Å R-free 0.177
4JK7 Open and closed forms of wild-type human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1769–1990（222 aa）片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 1.40 Å R-free 0.177
4JK8 Open and closed forms of R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1769–1990（222 aa）片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990	突变：R1865A	GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.15 Å R-free 0.160
4JK8 Open and closed forms of R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1769–1990（222 aa）片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990	突变：R1865A	CL CHLORIDE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.15 Å R-free 0.160
4JK9 Open and closed forms of wild-type human PRP8 RNase H-like domain with bound Co ion 提交 2013-03-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1769–1990（222 aa）片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990	未记录	CO COBALT (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.205
4JK9 Open and closed forms of wild-type human PRP8 RNase H-like domain with bound Co ion 提交 2013-03-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1769–1990（222 aa）片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990	未记录	CO COBALT (II) ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.205
4JKA Open and closed forms of R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Co ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1769–1990（222 aa）片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990	突变：R1865A	CO COBALT (II) ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.32 Å R-free 0.166
4JKA Open and closed forms of R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Co ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1769–1990（222 aa）片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990	突变：R1865A	CO COBALT (II) ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.32 Å R-free 0.166
4JKB Open and closed forms of V1788D human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1769–1990（222 aa）片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990	突变：V1788D	GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.30 Å R-free 0.145
4JKB Open and closed forms of V1788D human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1769–1990（222 aa）片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990	突变：V1788D	GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.30 Å R-free 0.145
4JKC Open and closed forms of T1800E human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1769–1990（222 aa）片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;	突变：T1800E	CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.164
4JKC Open and closed forms of T1800E human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1769–1990（222 aa）片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;	突变：T1800E	CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.164
4JKD Open and closed forms of I1790Y human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1769–1990（222 aa）片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;	突变：I1790Y	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.55 Å R-free 0.188
4JKD Open and closed forms of I1790Y human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1769–1990（222 aa）片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;	突变：I1790Y	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.55 Å R-free 0.188
4JKE Open and closed forms of T1789P human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1769–1990（222 aa）片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;	突变：T1789P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.65 Å R-free 0.203
4JKE Open and closed forms of T1789P human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1769–1990（222 aa）片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;	突变：T1789P	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.65 Å R-free 0.203
4JKF Open and closed forms of T1791P+R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1769–1990（222 aa）片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;	突变：T1791P R1865A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.95 Å R-free 0.226
4JKF Open and closed forms of T1791P+R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1769–1990（222 aa）片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;	突变：T1791P R1865A	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.95 Å R-free 0.226
4JKG Open and closed forms of mixed T1789P+R1865A and R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1769–1990（222 aa）片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990	突变：R1865A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.234
4JKG Open and closed forms of mixed T1789P+R1865A and R1865A human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1769–1990（222 aa）片段：PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990	突变：T1789P, R1865A	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.234
4JKH Open and closed forms of D1781E human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1769–1990（222 aa）片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;	突变：D1781E	CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.219
4JKH Open and closed forms of D1781E human PRP8 RNase H-like domain with bound Mg ion 提交 2013-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1769–1990（222 aa）片段：;PRP8 RNase H-like domain, UNP residues 1769-1990' ;	突变：D1781E	CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；15% PEG 4000, 300mM MgCl2, 100mM Tris, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.219
4KIT Crystal structure of human Brr2 in complex with the Prp8 Jab1/MPN domain 提交 2013-05-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2064–2335（272 aa）片段：Jab1/MPN domain (UNP residues 2064-2335)	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；277 K；0.1 M HEPES-NaOH, pH 7.9, 0.2 M magnesium chloride, 12% ethanol, Silver Bullets Bio condition 91 (Hampton Research) as additive, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.235
5MQF Cryo-EM structure of a human spliceosome activated for step 2 of splicing (C* complex) 提交 2016-12-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：41-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.90 Å
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
5XJC Cryo-EM structure of the human spliceosome just prior to exon ligation at 3.6 angstrom 提交 2017-04-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
5YZG The Cryo-EM Structure of Human Catalytic Step I Spliceosome (C complex) at 4.1 angstrom resolution 提交 2017-12-14	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
5Z56 cryo-EM structure of a human activated spliceosome (mature Bact) at 5.1 angstrom. 提交 2018-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 13	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
5Z57 Cryo-EM structure of the human activated spliceosome (late Bact) at 6.5 angstrom 提交 2018-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：57-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ALA ALANINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.50 Å
5Z58 Cryo-EM structure of a human activated spliceosome (early Bact) at 4.9 angstrom. 提交 2018-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：46-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6FF4 human Bact spliceosome core structure 提交 2018-01-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot with blotting sensor	分辨率 3.40 Å
6FF7 human Bact spliceosome core structure 提交 2018-01-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：61-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6ICZ Cryo-EM structure of a human post-catalytic spliceosome (P complex) at 3.0 angstrom 提交 2018-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6ID0 Cryo-EM structure of a human intron lariat spliceosome prior to Prp43 loaded (ILS1 complex) at 2.9 angstrom resolution 提交 2018-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：42-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
6ID1 Cryo-EM structure of a human intron lariat spliceosome after Prp43 loaded (ILS2 complex) at 2.9 angstrom resolution 提交 2018-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：43-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.86 Å
6QDV Human post-catalytic P complex spliceosome 提交 2019-01-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was applied to the grid, left for 25s, then blotted for 2.5-3.5s and immediately plunged into liquid ethane.	分辨率 3.30 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric	链 5A 25–2335（2311 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.	分辨率 2.92 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric	链 5A 25–2335（2311 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
6S8Q Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 提交 2019-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.39 Å R-free 0.253
6S9I Human Brr2 Helicase Region D534C/N1866C in complex with C-tail deleted Jab1 提交 2019-07-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.60 Å R-free 0.278
6ZYM Human C Complex Spliceosome - High-resolution CORE 提交 2020-08-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：26-meric	链 A 1–1755（1755 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7A5P Human C Complex Spliceosome - Medium-resolution PERIPHERY 提交 2020-08-21	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：48-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.00 Å
7AAV Human pre-Bact-2 spliceosome core structure 提交 2020-09-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：heptadecameric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 KGN D-chiro inositol hexakisphosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
7ABF Human pre-Bact-1 spliceosome core structure 提交 2020-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ABG Human pre-Bact-1 spliceosome 提交 2020-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.80 Å
7ABI Human pre-Bact-2 spliceosome 提交 2020-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.00 Å
7BDI Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and ATPgammaS 提交 2020-12-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.80 Å R-free 0.297
7BDJ Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and mant-ATPgammaS 提交 2020-12-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	TGB [[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-[2-(methylamino)phenyl]carbonyloxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-sulfanyl-phosphinic acid × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.59 Å R-free 0.289
7BDK Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and ADP 提交 2020-12-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.52 Å R-free 0.284
7BDL Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and mant-ADP 提交 2020-12-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	TG8 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-2-[[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]oxymethyl]oxolan-3-yl] 2-(methylamino)benzoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.69 Å R-free 0.292
7DVQ Cryo-EM Structure of the Activated Human Minor Spliceosome (minor Bact Complex) 提交 2021-01-14	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：49-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 2 G5J 5'-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(methoxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]oxy}phosphoryl]guanosine × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.89 Å
7OS2 Cryo-EM structure of Brr2 in complex with Jab1/MPN and C9ORF78 提交 2021-06-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 2064–2335（272 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
7PJH Crystal structure of the human spliceosomal maturation factor AAR2 bound to the RNAse H domain of PRPF8 提交 2021-08-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1758–2016（259 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 10% PEG 6000, 5%(v/v) 2-methyl-2,4- pentanediol	分辨率 2.35 Å R-free 0.235
7PX3 Structure of U5 snRNP assembly and recycling factor TSSC4 in complex with BRR2 and Jab1 domain of PRPF8 提交 2021-10-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
7QTT Structural organization of a late activated human spliceosome (Baqr, core region) 提交 2022-01-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric	链 a 1–2335（2335 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；All solutions were sterile filtered using a 0.22um vacuum filtration unit. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Volumes of 4 ul of the concentrated sample were applied to one side of glow-discharged UltrAuFoil 200 2/2 grids (Quantifoil) in a Vitrobot Mark IV (FEI) operating at 4 degrees Celsius and 100% humidity. The grids were blotted for 2s with blotting force 5 and immediately frozen by plunging into liquid ethane.	分辨率 3.10 Å
7W59 The cryo-EM structure of human pre-C*-I complex 提交 2021-11-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：50-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7W5A The cryo-EM structure of human pre-C*-II complex 提交 2021-11-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7W5B The cryo-EM structure of human C* complex 提交 2021-11-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8BC8 Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 18 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	QB6 3-azanyl-4-oxidanyl-benzenesulfonamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.39 Å R-free 0.245
8BC9 Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 24 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	A09 N-hydroxybenzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.30 Å R-free 0.249
8BCA Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 26 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	Q96 3-azanyl-~{N}-methyl-4-(methylamino)benzenesulfonamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.80 Å R-free 0.258
8BCB Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 34 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 SAN SULFANILAMIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.38 Å R-free 0.258
8BCC Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 39 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	QAU 3-oxidanylbenzenesulfonamide × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.35 Å R-free 0.258
8BCD Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 50 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	QB0 phenylsulfonylcarbamodithioic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 3.50 Å R-free 0.279
8BCE Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 76 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	B09 N-methoxybenzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.267
8BCF Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 78 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 Q8Z ~{N}-methoxy-~{N}-methyl-benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.42 Å R-free 0.275
8BCG Human Brr2 Helicase Region in complex with C-tail deleted Jab1 and compound 86 提交 2022-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2064–2320（257 aa）	未记录	Q9I 4-chloranyl-~{N}-methoxy-~{N}-methyl-benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；291.15 K；0.1M Hepes-NaOH, 0.1M MgCl2, 8% PEG 3350	分辨率 2.39 Å R-free 0.269
8C6J Human spliceosomal PM5 C* complex 提交 2023-01-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8CH6 Structure of a late-stage activated spliceosome (BAqr) arrested with a dominant-negative Aquarius mutant (state B complex). 提交 2023-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric	链 a 1–2335（2335 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；All solutions were sterile-filtered using a 0.22um vacuum filtration unit. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Volumes of 4 ul of the concentrated sample were applied to one side of glow-discharged UltrAuFoil 200 2/2 grids (Quantifoil) in a Vitrobot Mark IV (FEI), operated at 4 degrees Celsius and 100% humidity. The grids were blotted for 2s with blotting force 5 and immediately frozen by plunging into liquid ethane.	分辨率 5.90 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 5B 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 5B 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 5B 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric	链 5B 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8I0P The cryo-EM structure of human pre-Bact complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8I0R The cryo-EM structure of human Bact-I complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8I0S The cryo-EM structure of human Bact-II complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8I0T The cryo-EM structure of human Bact-III complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8I0U The cryo-EM structure of human Bact-IV complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8I0V The cryo-EM structure of human post-Bact complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8I0W The cryo-EM structure of human C complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：58-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8Q7N cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region) 提交 2023-08-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8Q7Q Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperones CD2BP2 and TSSC4 (State 2) 提交 2023-08-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8Q7V Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperones CD2BP2 and TSSC4 (State 1) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8Q7W Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 3) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8Q7X Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 4) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
8Q91 Structure of the human 20S U5 snRNP core 提交 2023-08-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.29 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QP8 Cryo-EM Structure of Pre-B Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8QP9 Cryo-EM Structure of Pre-B+AMPPNP Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01	当前字段一致	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8QPE Cryo-EM Structure of Pre-B-like Complex (core part) 提交 2023-10-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：20-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QPK Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss Complex (core part) 提交 2023-10-02	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RC0 Structure of the human 20S U5 snRNP 提交 2023-12-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
8RO2 Integrative Structure of the human intron lariat Spliceosome (ILS'') 提交 2024-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：40-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8Y6O Cryo-EM Structure of the human minor pre-B complex (pre-precatalytic spliceosome) U11 and tri-snRNP part 提交 2024-02-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：46-meric	链 C 1–2335（2335 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.38 Å
9FMD Integrative model of the human post-catalytic spliceosome (P-complex) 提交 2024-06-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9R3D Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric	链 A 1–2335（2335 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å

共 100 个其他 PDB 条目、112 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PRP8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–2335； UniProt 1–2335

Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39

物种未注明

UniProt Q53GS9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 13 RNA 4 PDB 声明：heptadecameric（17）与全部聚合物数一致	链 U； UniProt 1–565	未记录	U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 × 1 （Q9BUQ8） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） U5 snRNA × 1 ;5'ss oligo ; × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） U4 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8QPA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3JCR 3D structure determination of the humanU4/U6.U5 tri-snRNP complex 提交 2016-01-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 V 1–565（565 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA；pH 7.9；20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.00 Å
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 W 1–565（565 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric	链 U 1–555（555 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.	分辨率 2.92 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric	链 U 1–555（555 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4T 1–565（565 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4T 1–565（565 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 U 1–565（565 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QP8 Cryo-EM Structure of Pre-B Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric	链 U 1–565（565 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8QP9 Cryo-EM Structure of Pre-B+AMPPNP Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 U 1–565（565 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01	当前字段一致	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 U 1–565（565 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8QPE Cryo-EM Structure of Pre-B-like Complex (core part) 提交 2023-10-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：20-meric	链 U 1–565（565 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QPK Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss Complex (core part) 提交 2023-10-02	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric	链 U 1–565（565 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 U 1–565（565 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric	链 U 1–565（565 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric	链 U 1–565（565 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 U 1–565（565 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric	链 U 1–565（565 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 U 1–565（565 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 U 1–565（565 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
8Y6O Cryo-EM Structure of the human minor pre-B complex (pre-precatalytic spliceosome) U11 and tri-snRNP part 提交 2024-02-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：46-meric	链 U 1–565（565 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.38 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	UBP39_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–565； UniProt 1–565

U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1

物种未注明

UniProt O43290

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 13 RNA 4 PDB 声明：heptadecameric（17）与全部聚合物数一致	链 S； UniProt 1–800	未记录	U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 × 1 （Q9BUQ8） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39 × 1 （Q53GS9） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） U5 snRNA × 1 ;5'ss oligo ; × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） U4 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8QPA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4PYU The conserved ubiquitin-like protein hub1 plays a critical role in splicing in human cells 提交 2014-03-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 117–135（19 aa）片段：UBL5 BINDING MOTIF (UNP RESIDUES 117-135)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.15 M SODIUM ACETATE, 20% W/V PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
4PYU The conserved ubiquitin-like protein hub1 plays a critical role in splicing in human cells 提交 2014-03-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 117–135（19 aa）片段：UBL5 BINDING MOTIF (UNP RESIDUES 117-135)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.15 M SODIUM ACETATE, 20% W/V PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
4PYU The conserved ubiquitin-like protein hub1 plays a critical role in splicing in human cells 提交 2014-03-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 117–135（19 aa）片段：UBL5 BINDING MOTIF (UNP RESIDUES 117-135)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.15 M SODIUM ACETATE, 20% W/V PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
4PYU The conserved ubiquitin-like protein hub1 plays a critical role in splicing in human cells 提交 2014-03-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 117–135（19 aa）片段：UBL5 BINDING MOTIF (UNP RESIDUES 117-135)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.15 M SODIUM ACETATE, 20% W/V PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
4PYU The conserved ubiquitin-like protein hub1 plays a critical role in splicing in human cells 提交 2014-03-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 117–135（19 aa）片段：UBL5 BINDING MOTIF (UNP RESIDUES 117-135)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.15 M SODIUM ACETATE, 20% W/V PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
4PYU The conserved ubiquitin-like protein hub1 plays a critical role in splicing in human cells 提交 2014-03-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 117–135（19 aa）片段：UBL5 BINDING MOTIF (UNP RESIDUES 117-135)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；0.1 M TRIS-HCL, 0.15 M SODIUM ACETATE, 20% W/V PEG4000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 P 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 9 1–800（800 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.	分辨率 2.92 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4S 1–800（800 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4S 1–800（800 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 4J 1–800（800 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric	链 4J 1–800（800 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8Q7N cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region) 提交 2023-08-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.29 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QP8 Cryo-EM Structure of Pre-B Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8QP9 Cryo-EM Structure of Pre-B+AMPPNP Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01	当前字段一致	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8QPE Cryo-EM Structure of Pre-B-like Complex (core part) 提交 2023-10-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：20-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QPK Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss Complex (core part) 提交 2023-10-02	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
8Y6O Cryo-EM Structure of the human minor pre-B complex (pre-precatalytic spliceosome) U11 and tri-snRNP part 提交 2024-02-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：46-meric	链 S 1–800（800 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.38 Å

共 25 个其他 PDB 条目、30 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	SNUT1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–800； UniProt 1–800

116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component

物种未注明

UniProt Q15029

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 13 RNA 4 PDB 声明：heptadecameric（17）与全部聚合物数一致	链 C； UniProt 1–972	未记录	U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 × 1 （Q9BUQ8） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39 × 1 （Q53GS9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） U5 snRNA × 1 ;5'ss oligo ; × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） U4 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8QPA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3JCR 3D structure determination of the humanU4/U6.U5 tri-snRNP complex 提交 2016-01-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 B 1–972（972 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA；pH 7.9；20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.00 Å
5MQF Cryo-EM structure of a human spliceosome activated for step 2 of splicing (C* complex) 提交 2016-12-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：41-meric	链 B 1–972（972 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.90 Å
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 B 1–972（972 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
5XJC Cryo-EM structure of the human spliceosome just prior to exon ligation at 3.6 angstrom 提交 2017-04-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
5YZG The Cryo-EM Structure of Human Catalytic Step I Spliceosome (C complex) at 4.1 angstrom resolution 提交 2017-12-14	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
5Z56 cryo-EM structure of a human activated spliceosome (mature Bact) at 5.1 angstrom. 提交 2018-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 13	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
5Z57 Cryo-EM structure of the human activated spliceosome (late Bact) at 6.5 angstrom 提交 2018-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：57-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ALA ALANINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.50 Å
5Z58 Cryo-EM structure of a human activated spliceosome (early Bact) at 4.9 angstrom. 提交 2018-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：46-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6FF4 human Bact spliceosome core structure 提交 2018-01-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric	链 B 1–972（972 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot with blotting sensor	分辨率 3.40 Å
6FF7 human Bact spliceosome core structure 提交 2018-01-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：61-meric	链 B 1–972（972 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6ICZ Cryo-EM structure of a human post-catalytic spliceosome (P complex) at 3.0 angstrom 提交 2018-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6ID0 Cryo-EM structure of a human intron lariat spliceosome prior to Prp43 loaded (ILS1 complex) at 2.9 angstrom resolution 提交 2018-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：42-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
6ID1 Cryo-EM structure of a human intron lariat spliceosome after Prp43 loaded (ILS2 complex) at 2.9 angstrom resolution 提交 2018-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：43-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.86 Å
6QDV Human post-catalytic P complex spliceosome 提交 2019-01-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric	链 C 56–955（900 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was applied to the grid, left for 25s, then blotted for 2.5-3.5s and immediately plunged into liquid ethane.	分辨率 3.30 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric	链 5C 104–956（853 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.	分辨率 2.92 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric	链 5C 104–957（854 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
6ZYM Human C Complex Spliceosome - High-resolution CORE 提交 2020-08-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：26-meric	链 B 1–952（952 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7AAV Human pre-Bact-2 spliceosome core structure 提交 2020-09-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：heptadecameric	链 r 1–972（972 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 KGN D-chiro inositol hexakisphosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
7ABF Human pre-Bact-1 spliceosome core structure 提交 2020-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric	链 r 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7ABG Human pre-Bact-1 spliceosome 提交 2020-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric	链 r 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.80 Å
7ABI Human pre-Bact-2 spliceosome 提交 2020-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric	链 r 1–972（972 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.00 Å
7DVQ Cryo-EM Structure of the Activated Human Minor Spliceosome (minor Bact Complex) 提交 2021-01-14	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：49-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 K POTASSIUM ION × 2 G5J 5'-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(methoxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]oxy}phosphoryl]guanosine × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.89 Å
7QTT Structural organization of a late activated human spliceosome (Baqr, core region) 提交 2022-01-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：37-meric	链 b 1–972（972 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；All solutions were sterile filtered using a 0.22um vacuum filtration unit. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Volumes of 4 ul of the concentrated sample were applied to one side of glow-discharged UltrAuFoil 200 2/2 grids (Quantifoil) in a Vitrobot Mark IV (FEI) operating at 4 degrees Celsius and 100% humidity. The grids were blotted for 2s with blotting force 5 and immediately frozen by plunging into liquid ethane.	分辨率 3.10 Å
7W59 The cryo-EM structure of human pre-C*-I complex 提交 2021-11-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：50-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7W5A The cryo-EM structure of human pre-C*-II complex 提交 2021-11-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7W5B The cryo-EM structure of human C* complex 提交 2021-11-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8C6J Human spliceosomal PM5 C* complex 提交 2023-01-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8CH6 Structure of a late-stage activated spliceosome (BAqr) arrested with a dominant-negative Aquarius mutant (state B complex). 提交 2023-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric	链 b 1–972（972 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；All solutions were sterile-filtered using a 0.22um vacuum filtration unit. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Volumes of 4 ul of the concentrated sample were applied to one side of glow-discharged UltrAuFoil 200 2/2 grids (Quantifoil) in a Vitrobot Mark IV (FEI), operated at 4 degrees Celsius and 100% humidity. The grids were blotted for 2s with blotting force 5 and immediately frozen by plunging into liquid ethane.	分辨率 5.90 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 5C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 5C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 5C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric	链 5C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8I0P The cryo-EM structure of human pre-Bact complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8I0R The cryo-EM structure of human Bact-I complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8I0S The cryo-EM structure of human Bact-II complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8I0T The cryo-EM structure of human Bact-III complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8I0U The cryo-EM structure of human Bact-IV complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8I0V The cryo-EM structure of human post-Bact complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8I0W The cryo-EM structure of human C complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：58-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8Q7N cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region) 提交 2023-08-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8Q7Q Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperones CD2BP2 and TSSC4 (State 2) 提交 2023-08-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8Q7V Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperones CD2BP2 and TSSC4 (State 1) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8Q7W Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 3) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8Q7X Structure of the recycling U5 snRNP bound to chaperone CD2BP2 (State 4) 提交 2023-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
8Q91 Structure of the human 20S U5 snRNP core 提交 2023-08-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.29 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QP8 Cryo-EM Structure of Pre-B Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8QP9 Cryo-EM Structure of Pre-B+AMPPNP Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01	当前字段一致	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8QPE Cryo-EM Structure of Pre-B-like Complex (core part) 提交 2023-10-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：20-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QPK Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss Complex (core part) 提交 2023-10-02	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RC0 Structure of the human 20S U5 snRNP 提交 2023-12-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：15-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
8RO2 Integrative Structure of the human intron lariat Spliceosome (ILS'') 提交 2024-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：40-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8Y6O Cryo-EM Structure of the human minor pre-B complex (pre-precatalytic spliceosome) U11 and tri-snRNP part 提交 2024-02-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：46-meric	链 D 1–972（972 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.38 Å
9FMD Integrative model of the human post-catalytic spliceosome (P-complex) 提交 2024-06-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9R3D Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-04	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：17-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
9R8V Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：63-meric	链 C 1–972（972 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.50 Å

共 67 个其他 PDB 条目、67 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	U5S1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–972； UniProt 1–972

NHP2-like protein 1, N-terminally processed

物种未注明

UniProt P55769

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 13 RNA 4 PDB 声明：heptadecameric（17）与全部聚合物数一致	链 M； UniProt 1–128	未记录	U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 × 1 （Q9BUQ8） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39 × 1 （Q53GS9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） U5 snRNA × 1 ;5'ss oligo ; × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） U4 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8QPA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1E7K Crystal structure of the spliceosomal 15.5kD protein bound to a U4 snRNA fragment 提交 2000-08-29	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.6；pH 7.60	分辨率 2.90 Å R-free 0.302
1E7K Crystal structure of the spliceosomal 15.5kD protein bound to a U4 snRNA fragment 提交 2000-08-29	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 B 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.6；pH 7.60	分辨率 2.90 Å R-free 0.302
2JNB Solution Structure of RNA-binding protein 15.5K 提交 2007-01-04	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；293 K；离子强度（mmCIF原始值）250；压力 ambient NMR测量条件 pH 6；293 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient NMR样品组成 0.1 % sodium azide, 100 mM sodium chloride, 100 mM sodium phosphate, 1.6 mM protein, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.1 % sodium azide, 200 mM sodium chloride, 50 mM sodium phosphate, 0.9 mM [U-98% 13C, U-98% 15N] protein, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2OZB Structure of a human Prp31-15.5K-U4 snRNA complex 提交 2007-02-26	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 A 1–128（128 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M calcium acetate, 0.1 M HEPES-NaOH, pH 7.0, 6 % PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.248
2OZB Structure of a human Prp31-15.5K-U4 snRNA complex 提交 2007-02-26	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 D 1–128（128 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M calcium acetate, 0.1 M HEPES-NaOH, pH 7.0, 6 % PEG 6000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.248
3JCR 3D structure determination of the humanU4/U6.U5 tri-snRNP complex 提交 2016-01-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 I 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA；pH 7.9；20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.00 Å
3SIU Structure of a hPrp31-15.5K-U4atac 5' stem loop complex, monomeric form 提交 2011-06-20	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 A 1–128（128 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-Tris, pH 7.0, 20% w/v PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 393K	分辨率 2.63 Å R-free 0.241
3SIU Structure of a hPrp31-15.5K-U4atac 5' stem loop complex, monomeric form 提交 2011-06-20	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 D 1–128（128 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-Tris, pH 7.0, 20% w/v PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 393K	分辨率 2.63 Å R-free 0.241
3SIV Structure of a hPrp31-15.5K-U4atac 5' stem loop complex, dimeric form 提交 2011-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 A 1–128（128 aa）链 D 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.4, 20% v/v PEG550 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 393K	分辨率 3.30 Å R-free 0.239
3SIV Structure of a hPrp31-15.5K-U4atac 5' stem loop complex, dimeric form 提交 2011-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 G 1–128（128 aa）链 J 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.4, 20% v/v PEG550 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 393K	分辨率 3.30 Å R-free 0.239
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 O 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 M 1–128（128 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 M 1–128（128 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric	链 4D 1–128（128 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.	分辨率 2.92 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric	链 4D 1–128（128 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
7MQ8 Cryo-EM structure of the human SSU processome, state pre-A1 提交 2021-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 71 PDB 声明：75-meric	链 SE 1–128（128 aa）链 SF 1–128（128 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 22 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7MQ9 Cryo-EM structure of the human SSU processome, state pre-A1* 提交 2021-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 70 PDB 声明：74-meric	链 SE 1–128（128 aa）链 SF 1–128（128 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 22 ZN ZINC ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.87 Å
7MQA Cryo-EM structure of the human SSU processome, state post-A1 提交 2021-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 69 PDB 声明：72-meric	链 SE 1–128（128 aa）链 SF 1–128（128 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 64 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4E 1–128（128 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4E 1–128（128 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 4E 1–128（128 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric	链 4E 1–128（128 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8Q7N cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region) 提交 2023-08-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 M 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric	链 M 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.29 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 M 1–128（128 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01	当前字段一致	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 M 1–128（128 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8QPE Cryo-EM Structure of Pre-B-like Complex (core part) 提交 2023-10-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：20-meric	链 M 1–128（128 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 M 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric	链 M 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric	链 M 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 M 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric	链 M 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 M 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 M 1–128（128 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
8Y6O Cryo-EM Structure of the human minor pre-B complex (pre-precatalytic spliceosome) U11 and tri-snRNP part 提交 2024-02-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：46-meric	链 O 1–128（128 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.38 Å

共 31 个其他 PDB 条目、35 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NH2L1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128

Thioredoxin-like protein 4A

物种未注明

UniProt P83876

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 13 RNA 4 PDB 声明：heptadecameric（17）与全部聚合物数一致	链 D； UniProt 1–142	未记录	U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 × 1 （Q9BUQ8） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39 × 1 （Q53GS9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） U5 snRNA × 1 ;5'ss oligo ; × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） U4 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8QPA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1PQN dominant negative human hDim1 (hDim1 1-128) 提交 2003-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–128（127 aa）片段：dominant negative human hDim1	突变：deltaC14	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.65；310 K；压力 ambient NMR样品组成 1mM hDim1 1-128,U-15N; 10mM phosphate buffer; 95% H2O, 5% D2O, 0.2% 2,2-dimethyl-2-silapentane-5-sulfonate (DSS), 0.04% NaN3 \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1mM hDim1 1-128,U-15N,13C; 10mM phosphate buffer; 95% H2O, 5% D2O, 0.2% 2,2-dimethyl-2-silapentane-5-sulfonate (DSS), 0.04% NaN3 \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1mM hDim1 1-128,U-13C; 10mM phosphate buffer; 100% D2O, 0.2% 2,2-dimethyl-2-silapentane-5-sulfonate (DSS), 0.04% NaN3 \| 100% D2O	分辨率未提供
1QGV HUMAN SPLICEOSOMAL PROTEIN U5-15KD 提交 1999-05-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–142（142 aa）片段：FULL-LENGTH	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；294 K；1.0 M AMMONIUM SULPHATE 0.2 M HEPES/NAOH, PH 7.6 AT 294 K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.40 Å R-free 0.269
1SYX The crystal structure of a binary U5 snRNP complex 提交 2004-04-02	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–142（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 2000mme, MES, calcium acetate, 1,4-butanediol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.35 Å R-free 0.262
1SYX The crystal structure of a binary U5 snRNP complex 提交 2004-04-02	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–142（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 2000mme, MES, calcium acetate, 1,4-butanediol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.35 Å R-free 0.262
1SYX The crystal structure of a binary U5 snRNP complex 提交 2004-04-02	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–142（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 2000mme, MES, calcium acetate, 1,4-butanediol, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.35 Å R-free 0.262
3JCR 3D structure determination of the humanU4/U6.U5 tri-snRNP complex 提交 2016-01-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric	链 E 1–142（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA；pH 7.9；20 mM HEPES, pH 7.9, 100 mM KCl, 5 mM MgCl2, 0.1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).	分辨率 7.00 Å
4BWQ Crystal structure of U5-15kD in a complex with PQBP1 提交 2013-07-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 4–137（134 aa）片段：RESIDUES 4-137	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.252
4BWQ Crystal structure of U5-15kD in a complex with PQBP1 提交 2013-07-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 4–137（134 aa）片段：RESIDUES 4-137	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.252
4BWQ Crystal structure of U5-15kD in a complex with PQBP1 提交 2013-07-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 4–137（134 aa）片段：RESIDUES 4-137	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.252
4BWQ Crystal structure of U5-15kD in a complex with PQBP1 提交 2013-07-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 4–137（134 aa）片段：RESIDUES 4-137	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.252
4BWS Crystal structure of the heterotrimer of PQBP1, U5-15kD and U5-52kD. 提交 2013-07-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 4–137（134 aa）片段：RESIDUES 4-137	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.277
4BWS Crystal structure of the heterotrimer of PQBP1, U5-15kD and U5-52kD. 提交 2013-07-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 4–137（134 aa）片段：RESIDUES 4-137	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.277
4CDO Crystal structure of PQBP1 bound to spliceosomal U5-15kD 提交 2013-11-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 4–137（134 aa）片段：RESIDUES 4-137,223-265	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.238
4CDO Crystal structure of PQBP1 bound to spliceosomal U5-15kD 提交 2013-11-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 4–137（134 aa）片段：RESIDUES 4-137,223-265	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.238
5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 J 1–142（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 O 1–142（142 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 O 1–142（142 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6QW6 Structure of the human U5.U4/U6 tri-snRNP at 2.9A resolution. 提交 2019-03-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric	链 5D 1–142（142 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Wait 30s, blot for 2s to 3s.	分辨率 2.92 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric	链 5D 1–142（142 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4F 1–142（142 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 4F 1–142（142 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 4F 1–142（142 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric	链 4F 1–142（142 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8Q7N cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region) 提交 2023-08-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.29 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QP8 Cryo-EM Structure of Pre-B Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8QP9 Cryo-EM Structure of Pre-B+AMPPNP Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01	当前字段一致	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8QPE Cryo-EM Structure of Pre-B-like Complex (core part) 提交 2023-10-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：20-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QPK Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss Complex (core part) 提交 2023-10-02	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 D 1–142（142 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å

共 31 个其他 PDB 条目、38 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TXN4A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

Splicing factor 3A subunit 1

物种未注明

UniProt Q15459

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 异源复合物蛋白 × 13 RNA 4 PDB 声明：heptadecameric（17）与全部聚合物数一致	链 7； UniProt 1–793	未记录	U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23 × 1 （Q9BUQ8） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39 × 1 （Q53GS9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） U5 snRNA × 1 ;5'ss oligo ; × 1 U4 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8QPA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1ZKH Solution structure of a human ubiquitin-like domain in SF3A1 提交 2005-05-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 704–789（86 aa）片段：Ubiquitin-like domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300 mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 2mM protein, U-15N, U-13C; 300 mM NaCl, 1mM benzamidine, 10mM DTT, 0.01% NaN3, 10mM Sodium Acetate, 0.01mM ZnSO4, 90%H2O, 10%D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 2mM protein, U-15N, U-13C; 300 mM NaCl, 1mM benzamidine, 10mM DTT, 0.01% NaN3, 10mM Sodium Acetate, 0.01mM ZnSO4, 99.9% D2O \| 99.9% D2O	分辨率未提供
2DT6 Solution structure of the first SURP domain of human splicing factor SF3a120 提交 2006-07-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 48–110（63 aa）片段：SURP domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；278 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM；压力 AMBIENT NMR样品组成 2.0mM U-15N, 13C PROTEIN; 20mM soldium phosphate; 1mM d-DTT; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2DT7 Solution structure of the second SURP domain of human splicing factor SF3a120 in complex with a fragment of human splicing factor SF3a60 提交 2006-07-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 134–217（84 aa）片段：SURP domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；308 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM；压力 AMBIENT NMR样品组成 2.0mM U-15N, 13C PROTEIN; 20mM sodium phosphate; 1mM d-DTT; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5Z56 cryo-EM structure of a human activated spliceosome (mature Bact) at 5.1 angstrom. 提交 2018-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric	链 u 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 13	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
5Z57 Cryo-EM structure of the human activated spliceosome (late Bact) at 6.5 angstrom 提交 2018-01-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：57-meric	链 v 1–464（464 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ALA ALANINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.50 Å
5Z58 Cryo-EM structure of a human activated spliceosome (early Bact) at 4.9 angstrom. 提交 2018-01-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：46-meric	链 v 1–464（464 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric	链 u 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 u 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6FF7 human Bact spliceosome core structure 提交 2018-01-03	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：61-meric	链 p 1–793（793 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric	链 A1 1–282（282 aa）链 A1 455–793（339 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
6Y53 human 17S U2 snRNP low resolution part 提交 2020-02-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：nonadecameric	链 6 1–793（793 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.10 Å
6Y5Q human 17S U2 snRNP 提交 2020-02-25	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：22-meric	链 6 1–793（793 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.10 Å
7ABG Human pre-Bact-1 spliceosome 提交 2020-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric	链 p 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.80 Å
7ABI Human pre-Bact-2 spliceosome 提交 2020-09-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric	链 p 1–793（793 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.00 Å
7EVO The cryo-EM structure of the human 17S U2 snRNP 提交 2021-05-21	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric	链 A 1–793（793 aa）	未记录	9B0 [(2~{S},3~{S},4~{E},6~{S},7~{R},10~{R})-3,7-dimethyl-2-[(2~{E},4~{E},6~{R})-6-methyl-6-oxidanyl-7-[(2~{R},3~{R})-3-[(2~{R},3~{S})-3-oxidanylpentan-2-yl]oxiran-2-yl]hepta-2,4-dien-2-yl]-7,10-bis(oxidanyl)-12-oxidanylidene-1-oxacyclododec-4-en-6-yl] 4-cycloheptylpiperazine-1-carboxylate × 1 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7P0V Crystal structure of human SF3A1 ubiquitin-like domain in complex with U1 snRNA stem-loop 4 提交 2021-06-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 639–728（90 aa）	未记录	1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；100 mM Tris-HCl pH 8.5, 200 mM Li2SO4 and 40 % PEG400	分辨率 1.56 Å R-free 0.258
7VH9 Solution structure of the chimeric peptide of the first SURP domain of Human SF3A1 and the interacting region of SF1. 提交 2021-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 48–110（63 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1 NMR样品组成 1.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
7VPX The cryo-EM structure of the human pre-A complex 提交 2021-10-18	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：35-meric	链 A 1–793（793 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 SJT spliceostatin A (form II) × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8CH6 Structure of a late-stage activated spliceosome (BAqr) arrested with a dominant-negative Aquarius mutant (state B complex). 提交 2023-02-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric	链 H 1–793（793 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；All solutions were sterile-filtered using a 0.22um vacuum filtration unit. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Volumes of 4 ul of the concentrated sample were applied to one side of glow-discharged UltrAuFoil 200 2/2 grids (Quantifoil) in a Vitrobot Mark IV (FEI), operated at 4 degrees Celsius and 100% humidity. The grids were blotted for 2s with blotting force 5 and immediately frozen by plunging into liquid ethane.	分辨率 5.90 Å
8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 2D 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 2D 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric	链 2D 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric	链 2D 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8HK1 The cryo-EM structure of human pre-17S U2 snRNP 提交 2022-11-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric	链 A 1–793（793 aa）	未记录	9B0 [(2~{S},3~{S},4~{E},6~{S},7~{R},10~{R})-3,7-dimethyl-2-[(2~{E},4~{E},6~{R})-6-methyl-6-oxidanyl-7-[(2~{R},3~{R})-3-[(2~{R},3~{S})-3-oxidanylpentan-2-yl]oxiran-2-yl]hepta-2,4-dien-2-yl]-7,10-bis(oxidanyl)-12-oxidanylidene-1-oxacyclododec-4-en-6-yl] 4-cycloheptylpiperazine-1-carboxylate × 1 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8I0P The cryo-EM structure of human pre-Bact complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric	链 u 1–793（793 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8I0R The cryo-EM structure of human Bact-I complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric	链 u 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8I0S The cryo-EM structure of human Bact-II complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric	链 u 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8I0T The cryo-EM structure of human Bact-III complex 提交 2023-01-11	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric	链 u 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8ID2 Crystal structure of the ubiquitin-like domain in the SF3A1 subunit of human U2 snRNP complexed with the stem-loop 4 of U1 snRNA 提交 2023-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 703–793（91 aa）链 B 703–793（91 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100 mM MIB buffer (pH 5.0), 25% PEG 1500	分辨率 1.80 Å R-free 0.237
8Q7N cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region) 提交 2023-08-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.29 Å
8QOZ Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss+ATPgammaS Complex (core part) 提交 2023-09-29	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QP8 Cryo-EM Structure of Pre-B Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8QP9 Cryo-EM Structure of Pre-B+AMPPNP Complex (core part) 提交 2023-09-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8QPB Cryo-EM Structure of Pre-B+ATP Complex (core part) 提交 2023-10-01	当前字段一致	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：17-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8QPE Cryo-EM Structure of Pre-B-like Complex (core part) 提交 2023-10-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：20-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8QPK Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ss Complex (core part) 提交 2023-10-02	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.60 Å
8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
9R8V Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-17	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：63-meric	链 7 1–793（793 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.50 Å
9ZE0 Cryo-EM structure of the endogenous U2/branchpoint spliceosomal complex (Proximal DHX15 state) 提交 2025-11-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 A1 1–793（793 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2, 10 mM DTT, 4.5% glycerol cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.43 Å
9ZE3 Cryo-EM structure of the endogenous U2/branchpoint spliceosomal complex (Distal DHX15 state) 提交 2025-11-27	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 A1 1–793（793 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2, 10 mM DTT, 4.5% glycerol cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.93 Å
9ZEC Cryo-EM structure of the endogenous U2/branchpoint spliceosomal complex (SF3A state 1) 提交 2025-11-29	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A1 1–793（793 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2, 10 mM DTT, 4.5% glycerol cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.61 Å
9ZED Cryo-EM structure of the endogenous U2/branchpoint spliceosomal complex (SF3A state 2) 提交 2025-11-29	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A1 1–793（793 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；20 mM HEPES-KOH pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2, 10 mM DTT, 4.5% glycerol cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.94 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	SF3A1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 7； PDB构建体 1–793； UniProt 1–793

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8qpa
沉积日期 deposition_date	2023-10-01
结构标题 title	Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ssLNG Complex (core part)
关键词 keywords	spliceosome, SPLICING; SPLICING
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	60.20 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	59.76 Å
零角强度 I(0) i0	6234900000.00
分子量 molecular_weight	620750.0 kDa
排除体积 excluded_volume	757910 Å³
包络体积 envelope_volume	1128100 Å³
水化壳体积 shell_volume	150980 Å³
包络直径 envelope_diameter	221.3 Å
壳层 Rg shell_rg	65.35 Å
包络 Rg envelope_rg	59.26 Å
形状 Rg shape_rg	59.76 Å
总 Rg total_rg	59.85 Å
总原子数 total_atoms	43455
残基数 n_residues	5086
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	204.1 Å
Rg (实空间) rg_real	60.07 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.22 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.2350e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.2610e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	60.28 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	6237000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8636
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	70.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.308
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.333
角度范围 angular_range	— – 0.1300 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	548700000.0000
实空间数据点数 n_real_points	27
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.818; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.963; Smooth: 0.805

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase
分子量 formula_weight	244823.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.13
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	43455

MADVTARSLQYEYKANSNLVLQADRSLIDRTRRDEPTGEVLSLVGKLEGTRMGDKAQRTKPQMQEERRAKRRKRDEDRHDINKMKGYTLLSEGIDEMVGIIYKPKTKETRETYEVLLSFIQAALGDQPRDILCGAADEVLAVLKNEKLRDKERRKEIDLLLGQTDDTRYHVLVNLGKKITDYGGDKEIQNMDDNIDETYGVNVQFESDEEEGDEDVYGEVREEASDDDMEGDEAVVRCTLSANLVASGELMSSKKKDLHPRDIDAFWLQRQLSRFYDDAIVSQKKADEVLEILKTASDDRECENQLVLLLGFNTFDFIKVLRQHRMMILYCTLLASAQSEAEKERIMGKMEADPELSKFLYQLHETEKEDLIREERSRRERVRQSRMDTDLETMDLDQGGEALAPRQVLDLEDLVFTQGSHFMANKRCQLPDGSFRRQRKGYEEVHVPALKPKPFGSEEQLLPVEKLPKYAQAGFEGFKTLNRIQSKLYRAALETDENLLLCAPTGAGKTNVALMCMLREIGKHINMDGTINVDDFKIIYIAPMRSLVQEMVGSFGKRLATYGITVAELTGDHQLCKEEISATQIIVCTPEKWDIITRKGGERTYTQLVRLIILDEIHLLHDDRGPVLEALVARAIRNIEMTQEDVRLIGLSATLPNYEDVATFLRVDPAKGLFYFDNSFRPVPLEQTYVGITEKKAIKRFQIMNEIVYEKIMEHAGKNQVLVFVHSRKETGKTARAIRDMCLEKDTLGLFLREGSASTEVLRTEAEQCKNLELKDLLPYGFAIHHAGMTRVDRTLVEDLFADKHIQVLVSTATLAWGVNLPAHTVIIKGTQVYSPEKGRWTELGALDILQMLGRAGRPQYDTKGEGILITSHGELQYYLSLLNQQLPIESQMVSKLPDMLNAEIVLGNVQNAKDAVNWLGYAYLYIRMLRSPTLYGISHDDLKGDPLLDQRRLDLVHTAALMLDKNNLVKYDKKTGNFQVTELGRIASHYYITNDTVQTYNQLLKPTLSEIELFRVFSLSSEFKNITVREEEKLELQKLLERVPIPVKESIEEPSAKINVLLQAFISQLKLEGFALMADMVYVTQSAGRLMRAIFEIVLNRGWAQLTDKTLNLCKMIDKRMWQSMCPLRQFRKLPEEVVKKIEKKNFPFERLYDLNHNEIGELIRMPKMGKTIHKYVHLFPKLELSVHLQPITRSTLKVELTITPDFQWDEKVHGSSEAFWILVEDVDSEVILHHEYFLLKAKYAQDEHLITFFVPVFEPLPPQYFIRVVSDRWLSCETQLPVSFRHLILPEKYPPPTELLDLQPLPVSALRNSAFESLYQDKFPFFNPIQTQVFNTVYNSDDNVFVGAPTGSGKTICAEFAILRMLLQSSEGRCVYITPMEALAEQVYMDWYEKFQDRLNKKVVLLTGETSTDLKLLGKGNIIISTPEKWDILSRRWKQRKNVQNINLFVVDEVHLIGGENGPVLEVICSRMRYISSQIERPIRIVALSSSLSNAKDVAHWLGCSATSTFNFHPNVRPVPLELHIQGFNISHTQTRLLSMAKPVYHAITKHSPKKPVIVFVPSRKQTRLTAIDILTTCAADIQRQRFLHCTEKDLIPYLEKLSDSTLKETLLNGVGYLHEGLSPMERRLVEQLFSSGAIQVVVASRSLCWGMNVAAHLVIIMDTQYYNGKIHAYVDYPIYDVLQMVGHANRPLQDDEGRCVIMCQGSKKDFFKKFLYEPLPVESHLDHCMHDHFNAEIVTKTIENKQDAVDYLTWTFLYRRMTQNPNYYNLQGISHRHLSDHLSELVEQTLSDLEQSKCISIEDEMDVAPLNLGMIAAYYYINYTTIELFSMSLNAKTKVRGLIEIISNAAEYENIPIRHHEDNLLRQLAQKVPHKLNNPKFNDPHVKTNLLLQAHLSRMQLSAELQSDTEEILSKAIRLIQACVDVLSSNGWLSPALAAMELAQMVTQAMWSKDSYLKQLPHFTSEHIKRCTDKGVESVFDIMEMEDEERNALLQLTDSQIADVARFCNRYPNIELSYEVVDKDSIRSGGPVVVLVQLEREEEVTGPVIAPLFPQKREEGWWVVIGDAKSNSLISIKRLTLQQKAKVKLDFVAPATGAHNYTLYFMSDAYMGCDQEYKFSVDVKEAETDSDSD

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23
分子量 formula_weight	95785.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MAGELADKKDRDASPSKEERKRSRTPDRERDRDRDRKSSPSKDRKRHRSRDRRRGGSRSRSRSRSKSAERERRHKERERDKERDRNKKDRDRDKDGHRRDKDRKRSSLSPGRGKDFKSRKDRDSKKDEEDEHGDKKPKAQPLSLEELLAKKKAEEEAEAKPKFLSKAEREAEALKRRQQEVEERQRMLEEERKKRKQFQDLGRKMLEDPQERERRERRERMERETNGNEDEEGRQKIREEKDKSKELHAIKERYLGGIKKRRRTRHLNDRKFVFEWDASEDTSIDYNPLYKERHQVQLLGRGFIAGIDLKQQKREQSRFYGDLMEKRRTLEEKEQEEARLRKLRKKEAKQRWDDRHWSQKKLDEMTDRDWRIFREDYSITTKGGKIPNPIRSWKDSSLPPHILEVIDKCGYKEPTPIQRQAIPIGLQNRDIIGVAETGSGKTAAFLIPLLVWITTLPKIDRIEESDQGPYAIILAPTRELAQQIEEETIKFGKPLGIRTVAVIGGISREDQGFRLRMGCEIVIATPGRLIDVLENRYLVLSRCTYVVLDEADRMIDMGFEPDVQKILEHMPVSNQKPDTDEAEDPEKMLANFESGKHKYRQTVMFTATMPPAVERLARSYLRRPAVVYIGSAGKPHERVEQKVFLMSESEKRKKLLAILEQGFDPPIIIFVNQKKGCDVLAKSLEKMGYNACTLHGGKGQEQREFALSNLKAGAKDILVATDVAGRGIDIQDVSMVVNYDMAKNIEDYIHRIGRTGRAGKSGVAITFLTKEDSAVFYELKQAILESPVSSCPPELANHPDAQHKPGTILTKKRREETIFA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3
分子量 formula_weight	77669.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MALSKRELDELKPWIEKTVKRVLGFSEPTVVTAALNCVGKGMDKKKAADHLKPFLDDSTLRFVDKLFEAVEEGRSSRHSKSSSDRSRKRELKEVFGDDSEISKESSGVKKRRIPRFEEVEEEPEVIPGPPSESPGMLTKLQIKQMMEAATRQIEERKKQLSFISPPTPQPKTPSSSQPERLPIGNTIQPSQAATFMNDAIEKARKAAELQARIQAQLALKPGLIGNANMVGLANLHAMGIAPPKVELKDQTKPTPLILDEQGRTVDATGKEIELTHRMPTLKANIRAVKREQFKQQLKEKPSEDMESNTFFDPRVSIAPSQRQRRTFKFHDKGKFEKIAQRLRTKAQLEKLQAEISQAARKTGIHTSTRLALIAPKKELKEGDIPEIEWWDSYIIPNGFDLTEENPKREDYFGITNLVEHPAQLNPPVDNDTPVTLGVYLTKKEQKKLRRQTRREAQKELQEKVRLGLMPPPEPKVRISNLMRVLGTEAVQDPTKVEAHVRAQMAKRQKAHEEANAARKLTAEQRKVKKIKKLKEDISQGVHISVYRVRNLSNPAKKFKIEANAGQLYLTGVVVLHKDVNVVVVEGGPKAQKKFKRLMLHRIKWDEQTSNTKGDDDEESDEEAVKKTNKCVLVWEGTAKDRSFGEMKFKQCPTENMAREHFKKHGAEHYWDLALSESVLESTD

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31
分子量 formula_weight	55529.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MSLADELLADLEEAAEEEEGGSYGEEEEEPAIEDVQEETQLDLSGDSVKTIAKLWDSKMFAEIMMKIEEYISKQAKASEVMGPVEAAPEYRVIVDANNLTVEIENELNIIHKFIRDKYSKRFPELESLVPNALDYIRTVKELGNSLDKCKNNENLQQILTNATIMVVSVTASTTQGQQLSEEELERLEEACDMALELNASKHRIYEYVESRMSFIAPNLSIIIGASTAAKIMGVAGGLTNLSKMPACNIMLLGAQRKTLSGFSSTSVLPHTGYIYHSDIVQSLPPDLRRKAARLVAAKCTLAARVDSFHESTEGKVGYELKDEIERKFDKWQEPPPVKQVKPLPAPLDGQRKKRGGRRYRKMKERLGLTEIRKQANRMSFGEIEEDAYQEDLGFSLGHLGKSGSGRVRQTQVNEATKARISKTLQRTLQKQSVVYGGKSTIRDRSSGTASSVAFTPLQGLEIVNPQAAEKKVAEANQKYFSSMAEFLKVKGEKSGLMST

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4
分子量 formula_weight	58536.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MASSRASSTQATKTKAPDDLVAPVVKKPHIYYGSLEEKERERLAKGESGILGKDGLKAGIEAGNINITSGEVFEIEEHISERQAEVLAEFERRKRARQINVSTDDSEVKACLRALGEPITLFGEGPAERRERLRNILSVVGTDALKKTKKDDEKSKKSKEEYQQTWYHEGPNSLKVARLWIANYSLPRAMKRLEEARLHKEIPETTRTSQMQELHKSLRSLNNFCSQIGDDRPISYCHFSPNSKMLATACWSGLCKLWSVPDCNLLHTLRGHNTNVGAIVFHPKSTVSLDPKDVNLASCAADGSVKLWSLDSDEPVADIEGHTVRVARVMWHPSGRFLGTTCYDRSWRLWDLEAQEEILHQEGHSMGVYDIAFHQDGSLAGTGGLDAFGRVWDLRTGRCIMFLEGHLKEIYGINFSPNGYHIATGSGDNTCKVWDLRQRRCVYTIPAHQNLVTGVKFEPIHGNFLLTGAYDNTAKIWTHPGWSPLKTLAGHEGKVMGLDISSDGQLIATCSYDRTFKLWMAE

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Pre-mRNA-processing factor 6
分子量 formula_weight	107092.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MNKKKKPFLGMPAPLGYVPGLGRGATGFTTRSDIGPARDANDPVDDRHAPPGKRTVGDQMKKNQAADDDDEDLNDTNYDEFNGYAGSLFSSGPYEKDDEEADAIYAALDKRMDERRKERREQREKEEIEKYRMERPKIQQQFSDLKRKLAEVTEEEWLSIPEVGDARNKRQRNPRYEKLTPVPDSFFAKHLQTGENHTSVDPRQTQFGGLNTPYPGGLNTPYPGGMTPGLMTPGTGELDMRKIGQARNTLMDMRLSQVSDSVSGQTVVDPKGYLTDLNSMIPTHGGDINDIKKARLLLKSVRETNPHHPPAWIASARLEEVTGKLQVARNLIMKGTEMCPKSEDVWLEAARLQPGDTAKAVVAQAVRHLPQSVRIYIRAAELETDIRAKKRVLRKALEHVPNSVRLWKAAVELEEPEDARIMLSRAVECCPTSVELWLALARLETYENARKVLNKARENIPTDRHIWITAAKLEEANGNTQMVEKIIDRAITSLRANGVEINREQWIQDAEECDRAGSVATCQAVMRAVIGIGIEEEDRKHTWMEDADSCVAHNALECARAIYAYALQVFPSKKSVWLRAAYFEKNHGTRESLEALLQRAVAHCPKAEVLWLMGAKSKWLAGDVPAARSILALAFQANPNSEEIWLAAVKLESENDEYERARRLLAKARSSAPTARVFMKSVKLEWVQDNIRAAQDLCEEALRHYEDFPKLWMMKGQIEEQKEMMEKAREAYNQGLKKCPHSTPLWLLLSRLEEKIGQLTRARAILEKSRLKNPKNPGLWLESVRLEYRAGLKNIANTLMAKALQECPNSGILWSEAIFLEARPQRRTKSVDALKKCEHDPHVLLAVAKLFWSQRKITKAREWFHRTVKIDSDLGDAWAFFYKFELQHGTEEQQEEVRKRCESAEPRHGELWCAVSKDIANWQKKIGDILRLVAGRIKNTF

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Pre-mRNA-processing-splicing factor 8
分子量 formula_weight	273974.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MAGVFPYRGPGNPVPGPLAPLPDYMSEEKLQEKARKWQQLQAKRYAEKRKFGFVDAQKEDMPPEHVRKIIRDHGDMTNRKFRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVPVLYHITGAISFVNEIPWVIEPVYISQWGSMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNILDVEPLEAIQLELDPEEDAPVLDWFYDHQPLRDSRKYVNGSTYQRWQFTLPMMSTLYRLANQLLTDLVDDNYFYLFDLKAFFTSKALNMAIPGGPKFEPLVRDINLQDEDWNEFNDINKIIIRQPIRTEYKIAFPYLYNNLPHHVHLTWYHTPNVVFIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRHSVKSQEPLPDDDEEFELPEFVEPFLKDTPLYTDNTANGIALLWAPRPFNLRSGRTRRALDIPLVKNWYREHCPAGQPVKVRVSYQKLLKYYVLNALKHRPPKAQKKRYLFRSFKATKFFQSTKLDWVEVGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREVLRLTKLVVDSHVQYRLGNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAAGWRVWLFFMRGITPLLERWLGNLLARQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRAAVMHDILDMMPEGIKQNKARTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPTPIENMILRYVKAKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKDGPYITAEEAVAVYTTTVHWLESRRFSPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEAYSVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMDLYSHLVPVYDVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPADTEPPPLLVYKWCQGINNLQDVWETSEGECNVMLESRFEKMYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFASFIVQYYGLVMDLLVLGLHRASEMAGPPQMPNDFLSFQDIATEAAHPIRLFCRYIDRIHIFFRFTADEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTVQWENSFVSVYSKDNPNLLFNMCGFECRILPKCRTSYEEFTHKDGVWNLQNEVTKERTAQCFLRVDDESMQRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHEEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEAIAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTDFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEGLFWEKASGFEESMKWKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFASYKWNVSRPSLLADSKDVMDSTTTQKYWIDIQLRWGDYDSHDIERYARAKFLDYTTDNMSIYPSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGSKPLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKGLQLYSSEPTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSELQLPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLILILRALHVNNDRAKVILKPDKTTITEPHHIWPTLTDEEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVASLTQSEIRDIILGMEISAPSQQRQQIAEIEKQTKEQSQLTATQTRTVNKHGDEIITSTTSNYETQTFSSKTEWRVRAISAANLHLRTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNVLKKFICISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQVKEIRCIVMVPQWGTHQTVHLPGQLPQHEYLKEMEPLGWIHTQPNESPQLSPQDVTTHAKIMADNPSWDGEKTIIITCSFTPGSCTLTAYKLTPSGYEWGRQNTDKGNNPKGYLPSHYERVQMLLSDRFLGFFMVPAQSSWNYNFMGVRHDPNMKYELQLANPKEFYHEVHRPSHFLNFALLQEGEVYSADREDLYA

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39
分子量 formula_weight	65481.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MSGRSKRESRGSTRGKRESESRGSSGRVKRERDREREPEAASSRGSPVRVKREFEPASAREAPASVVPFVRVKREREVDEDSEPEREVRAKNGRVDSEDRRSRHCPYLDTINRSVLDFDFEKLCSISLSHINAYACLVCGKYFQGRGLKSHAYIHSVQFSHHVFLNLHTLKFYCLPDNYEIIDSSLEDITYVLKPTFTKQQIANLDKQAKLSRAYDGTTYLPGIVGLNNIKANDYANAVLQALSNVPPLRNYFLEEDNYKNIKRPPGDIMFLLVQRFGELMRKLWNPRNFKAHVSPHEMLQAVVLCSKKTFQITKQGDGVDFLSWFLNALHSALGGTKKKKKTIVTDVFQGSMRIFTKKLPHPDLPAEEKEQLLHNDEYQETMVESTFMYLTLDLPTAPLYKDEKEQLIIPQVPLFNILAKFNGITEKEYKTYKENFLKRFQLTKLPPYLIFCIKRFTKNNFFVEKNPTIVNFPITNVDLREYLSEEVQAVHKNTTYDLIANIVHDGKPSEGSYRIHVLHHGTGKWYELQDLQVTDILPQMITLSEAYIQIWKRRDNDETNQQGA

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1
分子量 formula_weight	90414.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MGSSKKHRGEKEAAGTTAAAGTGGATEQPPRHREHKKHKHRSGGSGGSGGERRKRSRERGGERGSGRRGAEAEARSSTHGRERSQAEPSERRVKREKRDDGYEAAASSKTSSGDASSLSIEETNKLRAKLGLKPLEVNAIKKEAGTKEEPVTADVINPMALRQREELREKLAAAKEKRLLNQKLGKIKTLGEDDPWLDDTAAWIERSRQLQKEKDLAEKRAKLLEEMDQEFGVSTLVEEEFGQRRQDLYSARDLQGLTVEHAIDSFREGETMILTLKDKGVLQEEEDVLVNVNLVDKERAEKNVELRKKKPDYLPYAEDESVDDLAQQKPRSILSKYDEELEGERPHSFRLEQGGTADGLRERELEEIRAKLRLQAQSLSTVGPRLASEYLTPEEMVTFKKTKRRVKKIRKKEKEVVVRADDLLPLGDQTQDGDFGSRLRGRGRRRVSEVEEEKEPVPQPLPSDDTRVENMDISDEEEGGAPPPGSPQVLEEDEAELELQKQLEKGRRLRQLQQLQQLRDSGEKVVEIVKKLESRQRGWEEDEDPERKGAIVFNATSEFCRTLGEIPTYGLAGNREEQEELMDFERDEERSANGGSESDGEENIGWSTVNLDEEKQQQDFSASSTTILDEEPIVNRGLAAALLLCQNKGLLETTVQKVARVKAPNKSLPSAVYCIEDKMAIDDKYSRREEYRGFTQDFKEKDGYKPDVKIEYVDETGRKLTPKEAFRQLSHRFHGKGSGKMKTERRMKKLDEEALLKKMSSSDTPLGTVALLQEKQKAQKTPYIVLSGSGKSMNANTITK

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component
分子量 formula_weight	109560.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MDTDLYDEFGNYIGPELDSDEDDDELGRETKDLDEMDDDDDDDDVGDHDDDHPGMEVVLHEDKKYYPTAEEVYGPEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDENLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKAPTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGPLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWISVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLELAKQDVVLNYPM

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	NHP2-like protein 1, N-terminally processed
分子量 formula_weight	14191.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MTEADVNPKAYPLADAHLTKKLLDLVQQSCNYKQLRKGANEATKTLNRGISEFIVMAADAEPLEIILHLPLLCEDKNVPYVFVRSKQALGRACGVSRPVIACSVTIKEGSQLKQQIQSIQQSIERLLV

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Thioredoxin-like protein 4A
分子量 formula_weight	16807.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MSYMLPHLHNGWQVDQAILSEEDRVVVIRFGHDWDPTCMKMDEVLYSIAEKVKNFAVIYLVDITEVPDFNKMYELYDPCTVMFFFRNKHIMIDLGTGNNNKINWAMEDKQEMVDIIETVYRGARKGRGLVVSPKDYSTKYRY

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	U5 snRNA
分子量 formula_weight	37254.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	5

AUACUCUGGUUUCUCUUCAGAUCGCAUAAAUCUUUCGCCUUUUACUAAAGAUUUCCGUGGAGAGGAACAACUCUGAGUCUUAACCCAAUUUUUUGAGGCCUUGCUUUGGCAAGGCUA

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	;5'ss oligo ;
分子量 formula_weight	5757.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	z

AAGGUAAGUAUCGUUCCA

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Splicing factor 3A subunit 1
分子量 formula_weight	88991.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	7

MPAGPVQAVPPPPPVPTEPKQPTEEEASSKEDSAPSKPVVGIIYPPPEVRNIVDKTASFVARNGPEFEARIRQNEINNPKFNFLNPNDPYHAYYRHKVSEFKEGKAQEPSAAIPKVMQQQQQTTQQQLPQKVQAQVIQETIVPKEPPPEFEFIADPPSISAFDLDVVKLTAQFVARNGRQFLTQLMQKEQRNYQFDFLRPQHSLFNYFTKLVEQYTKILIPPKGLFSKLKKEAENPREVLDQVCYRVEWAKFQERERKKEEEEKEKERVAYAQIDWHDFVVVETVDFQPNEQGNFPPPTTPEELGARILIQERYEKFGESEEVEMEVESDEEDDKQEKAEEPPSQLDQDTQVQDMDEGSDDEEEGQKVPPPPETPMPPPLPPTPDQVIVRKDYDPKASKPLPPAPAPDEYLVSPITGEKIPASKMQEHMRIGLLDPRWLEQRDRSIREKQSDDEVYAPGLDIESSLKQLAERRTDIFGVEETAIGKKIGEEEIQKPEEKVTWDGHSGSMARTQQAAQANITLQEQIEAIHKAKGLVPEDDTKEKIGPSKPNEIPQQPPPPSSATNIPSSAPPITSVPRPPTMPPPVRTTVVSAVPVMPRPPMASVVRLPPGSVIAPMPPIIHAPRINVVPMPPSAPPIMAPRPPPMIVPTAFVPAPPVAPVPAPAPMPPVHPPPPMEDEPTSKKLKTEDSLMPEEEFLRRNKGPVSIKVQVPNMQDKTEWKLNGQVLVFTLPLTDQVSVIKVKIHEATGMPAGKQKLQYEGIFIKDSNSLAYYNMANGAVIHLALKERGGRKK

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	U4 snRNA
分子量 formula_weight	46181.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	4

AGCUUUGCGCAGUGGCAGUAUCGUAGCCAAUGAGGUCUAUCCGAGGCGCGAUUAUUGCUAAUUGAAAACUUUUCCCAAUACCCCGCCGUGACGACUUGCAAUAUAGUCGGCACUGGCAAUUUUUGACAGUCUCUACGGAGACUG

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	U6 snRNA
分子量 formula_weight	34098.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	6

GUGCUCGCUUCGGCAGCACAUAUACUAAAAUUGGAACGAUACAGAGAAGAUUAGCAUGGCCCCUGCGCAAGGAUGACACGCAAAUUCGUGAAGCGUUCCAUAUUUU

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE
分子量 formula_weight	660.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.70 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	136333

fit	/app/data/saxs_computation/qp/8qpa/8qpa.fit
pddf	/app/data/pr_computation/qp/8qpa/8qpa.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/qp/8qpa/8qpa.dat

Cryo-EM Structure of Pre-B+5'ssLNG Complex (core part)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Pre-mRNA-processing factor 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Pre-mRNA-processing-splicing factor 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 39

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

NHP2-like protein 1, N-terminally processed

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Thioredoxin-like protein 4A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Splicing factor 3A subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

实体 10 Entity 10 polymer

聚合物 Polymer

实体 11 Entity 11 polymer

聚合物 Polymer

实体 12 Entity 12 polymer

聚合物 Polymer

实体 13 Entity 13 polymer

聚合物 Polymer

实体 14 Entity 14 polymer

聚合物 Polymer

实体 15 Entity 15 polymer