当前蛋白身份：P0DTD1
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10DV Room Temperature X-Ray Structure of SARS CoV-2 Main Protease Intermediate Precursor with Ensitrelvir (ESV) 提交 2026-01-14 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3572（309 aa）
链 B
3264–3572（309 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5 or 7.0
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.234 |
| 11RO Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro with UM-005 提交 2026-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1DAK N-(trifluoroacetyl)-D-phenylalanyl-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.239 |
| 12AF Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro with UM-067 提交 2026-03-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 A1DA8 N-(trifluoroacetyl)-D-phenylalanyl-3-cyclopropyl-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.266 |
| 13MI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12860 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1AY5 (furan-2-yl)(thiomorpholin-4-yl)methanone × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.194 |
| 13MJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13647 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CT0 2-fluorobenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.202 |
| 13MK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12961 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1AYD N-(2,4-difluorophenyl)-N'-methylthiourea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.196 |
| 13ML PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13431 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CT1 N-[(pyridin-3-yl)methyl]benzenecarbothioamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.213 |
| 13MM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13408 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 6OT 3,5-dichlorobenzene-1-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.193 |
| 13MN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12338 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CT2 4-(piperazin-1-yl)phenol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.229 |
| 13MO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with TD1471 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CUB 4-acetylbenzene-1-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.205 |
| 13MP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with TD1452 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CUC 3-chlorobenzene-1-sulfonamide × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.245 |
| 13MQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13639 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 VN9 3,4-dihydro-1~{H}-quinolin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.196 |
| 13MR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13275 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CUD N-(2-fluorophenyl)pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.204 |
| 13MS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13952 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CUE 3-oxo-3-(piperidin-1-yl)propanenitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.198 |
| 13MT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14022 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 X4P 2-chloropyridine-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.190 |
| 13MU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with FL0184 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1AY2 2-methoxy-7,7-dimethyl-6,7-dihydro-5H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-5-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.190 |
| 13MV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12895 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CUK 1,3-dihydro-2-benzofuran-5-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.47 Å R-free 0.222 |
| 13MW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PDK0219 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CUL (7S)-6-(5-chloropyridin-2-yl)-7-hydroxy-6,7-dihydro-5H-pyrrolo[3,4-b]pyrazin-5-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.194 |
| 13MX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13509 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CUM N-(2-methylphenyl)morpholine-4-carbothioamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.190 |
| 13MY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12362 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CUO 2,2-dimethyl-N-(pyridin-4-yl)propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.195 |
| 13MZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14473 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CUP N-(2,4-dimethylphenyl)-N'-[(pyridin-4-yl)methyl]thiourea × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.204 |
| 13NA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12973 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CUQ 3-(1H-pyrrol-1-yl)benzene-1-carbothioamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.209 |
| 13NB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14425 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CUR N-(2-{[(furan-2-yl)methyl]sulfanyl}ethyl)benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.230 |
| 13NC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12597 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CUS 6-methyl-2-phenyl-4,5-dihydropyridazin-3(2H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.174 |
| 13ND PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13652 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CUU 5-tert-butyl-2,4-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.188 |
| 13NE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PDK0362 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 0OL phenyl(piperidin-1-yl)methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.189 |
| 13NF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14399 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CUV (4S)-4-(prop-2-en-1-yl)-5-propyl-2,4-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.208 |
| 13NG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12572 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 60Q 2-pyrrol-1-ylbenzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.200 |
| 13NH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13189 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1EE6 N-[(4-fluorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-butanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.222 |
| 13NI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12139 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 F2L ~{N}-[2,6-bis(fluoranyl)phenyl]ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.181 |
| 13NJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13190 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 XZT 1-(2,4-difluorophenyl)pyrrolidine-2,5-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.199 |
| 13NK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13409 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1JBC 3,4-dichlorobenzenesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.238 |
| 13NL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14367 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CUW 2-(2-fluorophenyl)-N-[(1R,3s,5S)-8-methyl-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.212 |
| 13NM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12910 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CUX 3-(phenoxymethyl)aniline × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.211 |
| 13NN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with T0407 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 W1P 5-methyl-2-phenyl-2,4-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.223 |
| 13NO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13239 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CUY [2-(phenoxymethyl)phenyl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.214 |
| 13NP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13464 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1AYN 2,5-dichlorothiophene-3-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.214 |
| 13NQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13430 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1AY4 3-methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1,3-benzoxazole-6-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.220 |
| 13NR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr16749 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CU2 N-methyl-N-phenylthiourea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.207 |
| 13NS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14426 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CU4 N-(2,6-dimethylphenyl)-N'-[(pyridin-3-yl)methyl]thiourea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.207 |
| 13NT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12169 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CU5 1-[2-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl]methanamine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.203 |
| 13NU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13806 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CU6 1,1'-(piperidine-1,4-diyl)di(ethan-1-one) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.188 |
| 13NV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12938 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1AY6 {3-[(pyridin-2-yl)oxy]phenyl}methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.86 Å R-free 0.226 |
| 13NW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13256 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CU9 4-(4-methyl-1,4-diazepan-1-yl)benzonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.215 |
| 13NX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13501 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CVA N-[3-(trifluoromethyl)phenyl]hydrazinecarbothioamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.225 |
| 13NY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13835 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1AA8 2-(methylsulfanyl)pyridine-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.197 |
| 13NZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14215 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 W77 2,4-dichloro-N-(pyridin-3-yl)benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.185 |
| 13OA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13232 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1AYG 6-(2,3-dimethylphenoxy)pyridin-3-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.194 |
| 13OB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12754 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CVB 1-[2-(morpholin-4-yl)phenyl]methanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.213 |
| 13OC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13508 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 SNJ 2,5-diphenyl-4~{H}-pyrazol-3-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.186 |
| 13OD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12214 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 9TW 3-chloranyl-4-fluoranyl-benzamide × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.207 |
| 13OE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12542 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CVC 1-[4-(1H-imidazol-1-yl)phenyl]ethan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.183 |
| 13OF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13009 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CVD 6-(2-fluorophenoxy)pyridin-3-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.215 |
| 13OG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12109 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 V4X 3-oxo-3-(thiomorpholin-4-yl)propanenitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.212 |
| 13OH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12970 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CVE N-cyclohexyl-N'-(2-hydroxyethyl)thiourea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.209 |
| 13OI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13020 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CVH N-methyl-1-[3-(piperidin-1-yl)phenyl]methanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.86 Å R-free 0.224 |
| 13OJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13319 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1EM9 [4-(4-methyl-1,4-diazepan-1-yl)phenyl]methanamine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.209 |
| 13OK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13487 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CVF N-methyl-1-[4-(4-methyl-1,4-diazepan-1-yl)phenyl]methanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.190 |
| 13OL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14108 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CVI thiophene-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.190 |
| 13OM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13521 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CVJ (4S)-4-methyl-N-(propan-2-yl)-6,7-dihydrothieno[3,2-c]pyridine-5(4H)-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.190 |
| 13ON PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12648 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CVK 2,4-dichlorobenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.217 |
| 13OO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12829 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CVP N-(2-cyano-4,6-difluorophenyl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.197 |
| 13OP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14494 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CVL N-(1-benzylpiperidin-4-yl)cyclobutanecarboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.229 |
| 13OQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13577 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CVM 2-chloro-N-[(pyridin-2-yl)methyl]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.227 |
| 13OR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13474 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CVN N'-(2,3-dichlorophenyl)-N,N-dimethylurea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.233 |
| 13OS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13576 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CVO (2S)-N-(2,6-dimethylphenyl)-2-(pyrrolidin-1-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.207 |
| 13OT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12204 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1EHY 2-(2-methylimidazol-1-yl)aniline × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.230 |
| 13OU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13389 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CVV N-(2,6-dimethylphenyl)-N'-(2-hydroxyethyl)thiourea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.225 |
| 13OV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12354 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CVX 3-(morpholin-4-yl)aniline × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.237 |
| 13OW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12808 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CVW (5R)-5-methyl-6-(thiophen-2-yl)-4,5-dihydropyridazin-3(2H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.255 |
| 13OX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13347 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1AXZ 3-(2-phenylethyl)-2-sulfanylideneimidazolidin-4-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.239 |
| 13OY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13146 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1AXA {4-[(oxan-4-yl)oxy]phenyl}methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.233 |
| 13OZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12541 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 HX8 4-phenoxyphenol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.218 |
| 13PA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-4461 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CVZ 1-(7-amino-1H-indol-1-yl)ethan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.246 |
| 13PB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13944 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1AX0 5-fluoro-2-methylbenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.214 |
| 13PC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12861 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CV0 (oxan-4-yl)(piperidin-1-yl)methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.217 |
| 13PD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr16677 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 SNU 4-(1H-pyrrol-1-yl)aniline × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.253 |
| 13PE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with FS-3319 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CV1 5-(morpholin-4-yl)-1H-indole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.221 |
| 13PF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12776 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CV2 [4-(morpholin-4-yl)phenyl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.226 |
| 13PG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr16736 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CV3 cyclobutyl(morpholin-4-yl)methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.218 |
| 13PH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12864 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 8K2 5-chloranylthiophene-2-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.84 Å R-free 0.242 |
| 13PI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12314 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 SLS 3,4-dihydro-2~{H}-chromene-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.223 |
| 13PJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13351 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 2O8 4-[(trifluoromethyl)sulfanyl]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.225 |
| 13PL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12992 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CV4 N-(2,4-difluorophenyl)hydrazinecarbothioamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.228 |
| 13PM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12188 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CV5 [3-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.234 |
| 13PN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr16619 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CV6 1,3-diazepane-2-thione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.222 |
| 13PO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 5T-0834 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CV7 1-[5-(4-methylpiperazin-1-yl)thiophen-2-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.216 |
| 13PP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-5144 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 3C5 N-methyl-1-[3-(pyridin-3-yl)phenyl]methanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.223 |
| 13PQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12920 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 RZN (4-phenoxyphenyl)methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.212 |
| 13PR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12546 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 54F 3-(pyridin-2-yloxy)aniline × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.229 |
| 13PS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14256 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1AX8 3-amino-4-methylbenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.232 |
| 13PT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13240 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CWC [3-(phenoxymethyl)phenyl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.214 |
| 13PU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14262 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CWD N-(2-methylphenyl)-N'-[2-(pyridin-2-yl)ethyl]thiourea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.202 |
| 13PV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14220 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 UTG N-(2-chlorophenyl)-N'-[(furan-2-yl)methyl]thiourea × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.202 |
| 13PW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13277 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CWE N'-(2,4-difluorophenyl)-N,N-dimethylthiourea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.216 |
| 13PX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13634 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CWF 4-aminobenzamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.47 Å R-free 0.230 |
| 13PY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14240 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1AW1 2-chloro-4-(trifluoromethyl)benzene-1-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.211 |
| 13PZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12779 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CWG [3-(morpholin-4-yl)phenyl]methanol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.235 |
| 13QA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12206 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CWH 4-(2-methyl-1H-imidazol-1-yl)aniline × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.201 |
| 13QB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13881 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1ENG 3-(trifluoromethyl)-1,4-dihydropyrazol-5-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.228 |
| 13QC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with FS-2015 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CWI 4-methyl-N-[(pyridin-3-yl)methyl]pyridin-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.231 |
| 13QD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13673 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1EHF 4-methylthiophene-2-carboxamide × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.183 |
| 13QE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with DH-0718 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1AW5 6-bromo-1-methyl-3,4-dihydroquinolin-2(1H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.192 |
| 13QF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-5947 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1AW7 4-bromo-3-[(dimethylamino)methyl]phenol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.207 |
| 13QG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12321 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CWJ (2S)-2-methyl-2,3-dihydro-1,5-benzoxazepin-4(5H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.232 |
| 13QH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13551 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1AW9 N-[(1R,2S,4R)-bicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]-N'-[(2S)-1-hydroxybutan-2-yl]thiourea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.84 Å R-free 0.224 |
| 13QI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12593 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CWN N-[(thiophen-2-yl)methyl]hydrazinecarbothioamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.220 |
| 13QJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 7T-0223 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CWO N-ethyl-1H-1,3-benzimidazol-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.225 |
| 13QK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-3475 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CWP 5-bromo-N-methylpyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.227 |
| 13QL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PDK0169 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CWT 4-phenylmorpholin-3-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.208 |
| 13QM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12588 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CWU 4-(piperazin-1-yl)benzonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.205 |
| 13QN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-6504 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 Y1H (6-fluoro-2H,4H-1,3-benzodioxin-8-yl)methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.237 |
| 13QO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-3142 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CWV 1,3-diazaspiro[4.5]decane-2,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.198 |
| 13QP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12207 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1EE3 4-prop-2-ynyl-1,4-thiazinane 1,1-dioxide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.219 |
| 13QQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 10W-0336 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CWW (6aS,10R)-6a,7,8,9-tetrahydropyrido[3,2-e]pyrrolo[1,2-a]pyrazin-6(5H)-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.264 |
| 13QR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 5D-043 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CWZ 3-(4-methoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.202 |
| 13QS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-5351 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CW0 2-bromo-5-chloropyridin-4(1H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.229 |
| 13QT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 7J-015 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CW1 (4R)-8-chloro-6-(trifluoromethyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.189 |
| 13QU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-4774 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1AY3 3-bromo-1H-pyrazolo[3,4-c]pyridine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.216 |
| 13QV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 6R-0620 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CW2 (3R)-1-[(2-chloro-1,3-thiazol-5-yl)methyl]-3-methylpiperidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.193 |
| 13QW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 8B-017 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CW3 (2P)-2-(1H-imidazol-1-yl)-5-(trifluoromethyl)pyridine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.205 |
| 13QX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 1X-0873 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CW5 1-[(6-chloropyridin-3-yl)methyl]piperidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.205 |
| 13QY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 2T-1515 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CW6 4-acetyl-2-(1H-pyrrol-1-yl)benzonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.214 |
| 13QZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 3R-1315 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CW7 5,6,7,8-tetrahydro-4H-furo[3,2-c]azepin-4-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.186 |
| 13RA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 5X-0942 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CW8 (2E)-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-2(3H)-imine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.196 |
| 13RB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 9R-0337 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 A1CW9 N-{[(2R)-oxolan-2-yl]methyl}-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.194 |
| 13RC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 12P-613 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CXA 4-(cyclopentylmethyl)-1lambda~6~-thiomorpholine-1,1-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.217 |
| 13RD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 3T-0366 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CXB 4-(4-methoxyphenyl)-1H-imidazole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.198 |
| 13RE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with AS-5711 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CXC methyl [(1S)-3-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-1-yl]acetate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.198 |
| 13RF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 11G-454S 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CXD N-[2-(morpholin-4-yl)phenyl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.268 |
| 13RG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 6D-023 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CXE (1R)-3-(3,4-dichlorophenyl)-1lambda~4~,3-thiazolidine-1,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.199 |
| 13RH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with FS-2990 提交 2025-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1561–1880（320 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 A1CXG 1-phenyl-1H-imidazole-4-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.201 |
| 13RI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004094 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CXR (2R)-3-methyl-2-{[(6P)-6-(thiophen-2-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}butan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.155 |
| 13RI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004094 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.155 |
| 13RJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004097 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CXS (2R)-3-methyl-2-{[(6M)-6-(1H-pyrrol-2-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}butan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.169 |
| 13RJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004097 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.169 |
| 13RK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004052 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CXT (4M)-4-{4-[(2,2-dimethyl-5-oxopyrrolidin-1-yl)amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl}-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.186 |
| 13RK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004052 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.186 |
| 13RL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004054 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CXU (4P)-4-(4-{[(2R)-1-hydroxy-3-methylbutan-2-yl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.161 |
| 13RL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004054 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.161 |
| 13RM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004100 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CXV (2R)-3-methyl-2-{[(6P)-6-(1,2-thiazol-5-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}butan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.149 |
| 13RM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004100 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.149 |
| 13RN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004214 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CXW (2R)-3-methyl-2-{[(6P)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}butan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.155 |
| 13RN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004214 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.155 |
| 13RO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004268 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CXX (2R)-3-methyl-2-{[(6P)-6-(1H-pyrazol-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}butan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.95 Å R-free 0.162 |
| 13RO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004268 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.95 Å R-free 0.162 |
| 13RP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004272 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CXY (2R)-3-methyl-2-{[6-(pyrimidin-5-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}butan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.95 Å R-free 0.155 |
| 13RP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004272 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.95 Å R-free 0.155 |
| 13RQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004683 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CXZ (3P)-3-(4-{[(2R)-1-hydroxy-3-methylbutan-2-yl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)thiophene-2-carbonitrile × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.161 |
| 13RQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004683 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.161 |
| 13RR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004678 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CX0 (2R)-2-{[(6P)-6-(2-fluorophenyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-3-methylbutan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.165 |
| 13RR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004678 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.165 |
| 13RS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005707 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CX1 (4P)-4-(4-{[(2R)-1-hydroxy-3-methylbutan-2-yl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1-methyl-1H-pyrazole-3-carbonitrile × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.94 Å R-free 0.159 |
| 13RS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005707 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.94 Å R-free 0.159 |
| 13RT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006249 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CX2 N-{4-[(4,4-dimethyl-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl)amino]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-8-yl}-2,2-difluoroacetamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.174 |
| 13RT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006249 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.174 |
| 13RU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006318 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CX3 (4M)-4-{4-[(4,4-dimethyl-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl)amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl}-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.201 |
| 13RU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006318 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.201 |
| 13RV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006319 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CX4 (4M)-1-methyl-4-{4-[(2-oxo-3,8-dioxa-1-azaspiro[4.5]decan-1-yl)amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl}-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.172 |
| 13RV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006319 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.172 |
| 13RW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006354 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CX5 1-[(8-cyclopropyl-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-5,5-dimethylpyrrolidin-2-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.182 |
| 13RW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006354 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.182 |
| 13RX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006344 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CX6 (4M)-4-(4-{[8-(methanesulfonyl)-2-oxo-3-oxa-1,8-diazaspiro[4.5]decan-1-yl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.182 |
| 13RX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006344 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.182 |
| 13RY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006372 提交 2025-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CX7 4,4-dimethyl-3-{[8-(trifluoromethyl)-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl]amino}-1,3-oxazolidin-2-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.178 |
| 13RY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006372 提交 2025-10-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.178 |
| 23LW Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease A173V mutant in complex with leritrelvir 提交 2026-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：A173V 突变：A173V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.65 Å R-free 0.238 |
| 23LX Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease P168 deletion mutant in complex with leritrelvir 提交 2026-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å R-free 0.231 |
| 23LZ Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease G143S mutant in complex with leritrelvir 提交 2026-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
3264–3569（306 aa）
|
突变：G143S 突变：G143S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.97 Å R-free 0.247 |
| 23LZ Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease G143S mutant in complex with leritrelvir 提交 2026-02-11 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
突变：G143S 突变：G143S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.97 Å R-free 0.247 |
| 23MA Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease H172Y mutant in complex with leritrelvir 提交 2026-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：H172Y 突变：H172Y | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.27 Å R-free 0.240 |
| 23MC Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease M49I mutant in complex with leritrelvir 提交 2026-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：M49I 突变：M49I | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.87 Å R-free 0.215 |
| 23MD Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease M49I/M165I mutant in complex with leritrelvir 提交 2026-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：M49I/M165I 突变：M49I/M165I | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å R-free 0.219 |
| 23ME Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease M49I/M165T mutant in complex with leritrelvir 提交 2026-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：M49I/M165T 突变：M49I/M165T | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 23MF Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease M165T mutant in complex with leritrelvir 提交 2026-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：M165T 突变：M165T | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.78 Å R-free 0.205 |
| 23MG Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease S144A mutant in complex with leritrelvir 提交 2026-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：S144A 突变：S144A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.239 |
| 23MI Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease M49T mutant in complex with leritrelvir 提交 2026-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：M49T 突变：M49T | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å R-free 0.216 |
| 23MJ Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease Q192L mutant in complex with leritrelvir 提交 2026-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：Q192L 突变：Q192L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å R-free 0.200 |
| 23MK Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease P168 deletion and A173V mutant in complex with leritrelvir 提交 2026-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：A173V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.238 |
| 23ML Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease Q189K mutant in complex with leritrelvir 提交 2026-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：Q189K 突变：Q189K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.16 Å R-free 0.253 |
| 24EW SARS-CoV-2 polymerase with incorporated and pre-incorporated AT-9052-Sp 提交 2026-03-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.39 Å |
| 28WF SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative ligand AD1 提交 2026-02-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1J0V [(2~{S},6~{R})-6-(6-aminopurin-9-yl)morpholin-2-yl]methanol × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M MES (pH 5.6), 12% PEG 3350, 60 mM magnesium chloride
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.278 |
| 5R7Y PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of COVID-19 main protease in complex with Z45617795 提交 2020-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | JFM N-(2-phenylethyl)methanesulfonamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.237 |
| 5R7Z PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1220452176 提交 2020-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 HWH ~{N}-[2-(5-fluoranyl-1~{H}-indol-3-yl)ethyl]ethanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.233 |
| 5R80 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z18197050 提交 2020-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 RZG methyl 4-sulfamoylbenzoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.235 |
| 5R81 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of COVID-19 main protease in complex with Z1367324110 提交 2020-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | RZJ 1-methyl-3,4-dihydro-2~{H}-quinoline-7-sulfonamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.249 |
| 5R82 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of COVID-19 main protease in complex with Z219104216 提交 2020-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | RZS 6-(ethylamino)pyridine-3-carbonitrile × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.212 |
| 5R83 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z44592329 提交 2020-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 K0G N-phenyl-N'-pyridin-3-ylurea × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.215 |
| 5R84 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of COVID-19 main protease in complex with Z31792168 提交 2020-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | GWS 2-cyclohexyl-~{N}-pyridin-3-yl-ethanamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.293 |
| 5R8T PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 main protease screened against DSI poised (Enamine), Fraglites and Peplites (Newcastle university), Mini Frags (Astex), York 3D (York university), electrophile cysteine covalent (Weizman institute) fragment libraries 提交 2020-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.208 |
| 5RE4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1129283193 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 SZY N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.266 |
| 5RE5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z33545544 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T0J N~1~-phenylpiperidine-1,4-dicarboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.265 |
| 5RE6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z54571979 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O0S N-{4-[(pyrimidin-2-yl)oxy]phenyl}acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.251 |
| 5RE7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z30932204 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T0S N-[(4-sulfamoylphenyl)methyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.225 |
| 5RE8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2737076969 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T0V 1-(3-fluorophenyl)-N-[(furan-2-yl)methyl]methanamine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.248 |
| 5RE9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2856434836 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 LPZ 2-(4-methylphenoxy)-1-(4-methylpiperazin-4-ium-1-yl)ethanone × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.225 |
| 5REA PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z31432226 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 JGP (azepan-1-yl)(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methanone × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.228 |
| 5REB PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2856434899 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T0Y 1-[(thiophen-3-yl)methyl]piperidin-4-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.224 |
| 5REC PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1587220559 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T1J 2-{[(1H-benzimidazol-2-yl)amino]methyl}phenol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.237 |
| 5RED PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2856434865 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 JJG 4-[2-(phenylsulfanyl)ethyl]morpholine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.211 |
| 5REE PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2217052426 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T1M (2R,3R)-1-benzyl-2-methylpiperidin-3-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.242 |
| 5REF PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z24758179 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 6SU methyl 3-(methylsulfonylamino)benzoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.246 |
| 5REG PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1545313172 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 LWA (2~{S})-~{N}-(4-aminocarbonylphenyl)oxolane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.227 |
| 5REH PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z111507846 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 AWP 1-cyclohexyl-3-(2-pyridin-4-ylethyl)urea × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.257 |
| 5REI PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2856434856 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T1S 4-[(3-chlorophenyl)methyl]morpholine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.240 |
| 5REJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102241 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T1V 1-{4-[(thiophen-2-yl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.240 |
| 5REK PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102327 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T1Y 1-{4-[(3-fluorophenyl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.230 |
| 5REL PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102340 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T2G 1-{4-[(3-methylphenyl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.220 |
| 5REM PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0103016 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T2J 1 1-(4-(2-nitrophenyl)piperazin-1-yl)ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.246 |
| 5REN PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102425 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T2V 1-[(3R)-3-(1,3-benzothiazol-2-yl)piperidin-1-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.278 |
| 5REO PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102578 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T2Y N-[(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.227 |
| 5REP PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102201 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T3G 1-{4-[(2,6-difluorophenyl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.231 |
| 5RER PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102615 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T3J 1-[(2R)-2-(4-fluorophenyl)morpholin-4-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.253 |
| 5RES PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102281 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T3V 1-{4-[(2-fluorophenyl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.226 |
| 5RET PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102269 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T47 1-{4-[(3-chlorophenyl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.222 |
| 5REU PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102395 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T4D 2-[(4-acetylpiperazin-1-yl)sulfonyl]benzonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.232 |
| 5REV PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0103072 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T4J N-[3-(thiomorpholine-4-carbonyl)phenyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.222 |
| 5REW PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102275 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T4M N-[(1R)-1-(naphthalen-1-yl)ethyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.224 |
| 5REX PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102287 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T4V 1-{4-[(naphthalen-1-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.251 |
| 5REY PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102911 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T4Y 1-{4-[(2-methylphenyl)methyl]-1,4-diazepan-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.274 |
| 5REZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with POB0129 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T54 (1R,2S)-2-(thiophen-3-yl)cyclopentane-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.272 |
| 5RF0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with POB0073 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T5D [1-(pyridin-2-yl)cyclopentyl]methanol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.226 |
| 5RF1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NCL-00023830 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T5G 4-bromobenzene-1-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.236 |
| 5RF2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1741969146 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 HVB 1-azanylpropylideneazanium × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.222 |
| 5RF3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1741970824 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T5V pyrimidin-5-amine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.221 |
| 5RF4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1741982125 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T5Y pyridin-2-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.225 |
| 5RF5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z3241250482 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 HV2 1,1-bis(oxidanylidene)thietan-3-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.231 |
| 5RF6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1348371854 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 NTG 5-(1,4-oxazepan-4-yl)pyridine-2-carbonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.217 |
| 5RF7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z316425948_minor 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T67 1-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.217 |
| 5RF8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z271004858 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 SFY 4-amino-N-(pyridin-2-yl)benzenesulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.213 |
| 5RF9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z217038356 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 S7D 1-[(2~{S})-2-methylmorpholin-4-yl]-2-pyrazol-1-yl-ethanone × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.215 |
| 5RFA PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2643472210 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 JGY 1-methyl-N-{[(2S)-oxolan-2-yl]methyl}-1H-pyrazole-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.215 |
| 5RFB PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1271660837 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 K3S N-[(1-methyl-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methyl]ethanamine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.224 |
| 5RFC PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z979145504 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 K1Y methyl (2-methyl-4-phenyl-1,3-thiazol-5-yl)carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.213 |
| 5RFD PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z126932614 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T6J 2-[(methylsulfonyl)methyl]-1H-benzimidazole × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.211 |
| 5RFE PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z509756472 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 JGG N-[(4-cyanophenyl)methyl]morpholine-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.214 |
| 5RFF PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102704 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T6M 1-{4-[(4-chlorophenyl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.247 |
| 5RFG PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102372 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T6V N-[(3S)-1,1-dioxo-2,3-dihydro-1H-1lambda~6~-thiophen-3-yl]-N-phenylacetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.306 |
| 5RFH PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102277 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T6Y 1-{4-[(5-chlorothiophen-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.237 |
| 5RFI PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102353 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T71 1-{4-[(2,5-dimethylphenyl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.242 |
| 5RFJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0103067 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T7A N-(4-methoxy-1,3-benzothiazol-2-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.241 |
| 5RFK PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102575 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T7D N-(1-acetylpiperidin-4-yl)benzamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.235 |
| 5RFL PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102389 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T7G 1-acetyl-N-(2-hydroxyphenyl)piperidine-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.225 |
| 5RFM PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102539 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T7J N-[(3R)-1,1-dioxo-2,3-dihydro-1H-1lambda~6~-thiophen-3-yl]-N-(4-methylphenyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.257 |
| 5RFN PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102868 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T7P N-[(3R)-1,1-dioxo-2,3-dihydro-1H-1lambda~6~-thiophen-3-yl]-N-(4-fluorophenyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 5RFO PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102972 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T7S 1-[4-(piperidine-1-carbonyl)piperidin-1-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.278 |
| 5RFP PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102190 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T7V N-[(1S)-1-(3-chlorophenyl)ethyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.297 |
| 5RFQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102179 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T7Y N-[3-(2-oxopyrrolidin-1-yl)phenyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.227 |
| 5RFR PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102169 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T81 1-{4-[(5-bromothiophen-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.238 |
| 5RFS PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102739 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T84 1-{4-[(thiophen-3-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.233 |
| 5RFT PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102432 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T8A 1-[(4S)-4-phenyl-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.237 |
| 5RFU PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102121 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T8D 1-{4-[(5-chlorothiophen-2-yl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.210 |
| 5RFV PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102306 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T8J 1-[4-(thiophene-2-carbonyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.224 |
| 5RFW PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102243 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T8M 1-{4-[(thiophen-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.223 |
| 5RFX PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102254 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T8P 1-[4-(4-methoxyphenyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.216 |
| 5RFY PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102974 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T8S 1-acetyl-N-methyl-N-(propan-2-yl)piperidine-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.277 |
| 5RFZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102274 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 T8V N-(2-chloropyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.227 |
| 5RG0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102535 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T8Y 1,1'-(piperazine-1,4-diyl)di(ethan-1-one) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.236 |
| 5RG1 PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NCL-00024905 提交 2020-03-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 T9J Nalpha-acetyl-N-(3-bromoprop-2-yn-1-yl)-L-tyrosinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.215 |
| 5RG2 PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NCL-00025058 提交 2020-03-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 T9M N~2~-acetyl-N-prop-2-en-1-yl-D-allothreoninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.228 |
| 5RG3 PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NCL-00025412 提交 2020-03-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 T9P N~2~-acetyl-N~1~-prop-2-en-1-yl-L-aspartamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.215 |
| 5RGG PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2856434890 (Mpro-x0165) 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NZD 4-methyl-N-phenylpiperazine-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.216 |
| 5RGH PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1619978933 (Mpro-x0395) 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 U0M 5-fluoro-1-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)methyl]-1,2,3,6-tetrahydropyridine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.208 |
| 5RGI PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z369936976 (Mpro-x0397) 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 U0P N'-cyclopropyl-N-methyl-N-[(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)methyl]urea × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.212 |
| 5RGJ PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1401276297 (Mpro-x0425) 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 U0S (5S)-7-(pyrazin-2-yl)-2-oxa-7-azaspiro[4.4]nonane × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.206 |
| 5RGK PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1310876699 (Mpro-x0426) 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 U0V 2-fluoro-N-[2-(pyridin-4-yl)ethyl]benzamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.210 |
| 5RGL PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102962 (Mpro-x0705) 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 U0Y 1-[4-(4-methylbenzene-1-carbonyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.229 |
| 5RGM PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102142 (Mpro-x0708) 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 U1D N'-acetyl-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophene-2-carbohydrazide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.224 |
| 5RGN PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102759 (Mpro-x0731) 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 U1A 1-{4-[(4-methylphenyl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.233 |
| 5RGO PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102248 (Mpro-x0736) 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 U1G 1-[4-(furan-2-carbonyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.217 |
| 5RGP PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102628 (Mpro-x0771) 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 U1M 1-{4-[(2,4-dimethylphenyl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.202 |
| 5RGQ PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1849009686 (Mpro-x1086) 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 U1V 1-(4-fluoro-2-methylphenyl)methanesulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.225 |
| 5RGR PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z328695024 (Mpro-x1101) 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 K1G N,1-dimethyl-N-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.200 |
| 5RGS PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1259086950 (Mpro-x1163) 提交 2020-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 S7V [(2~{R})-4-(phenylmethyl)morpholin-2-yl]methanol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.231 |
| 5RGT PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4439011607 (Mpro-x2540) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 UHS N-[(1R)-2-(tert-butylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-(5-tert-butyl-1,2-oxazol-3-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.271 |
| 5RGU PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4444622180 (Mpro-x2562) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UGD N-(3-{[(2R)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)-2-(pyrimidin-5-yl)acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.238 |
| 5RGV PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4444622066 (Mpro-x2563) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UGG 2-(isoquinolin-4-yl)-N-phenylacetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.232 |
| 5RGW PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4444621910 (Mpro-x2569) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UGM 2-(5-cyanopyridin-3-yl)-N-(pyridin-3-yl)acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.203 |
| 5RGX PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1344037997 (Mpro-x2572) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UGP 2-(3-cyanophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.218 |
| 5RGY PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1535580916 (Mpro-x2581) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UGS N-(4-methoxypyridin-2-yl)-2-(naphthalen-2-yl)acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.246 |
| 5RGZ PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1343543528 (Mpro-x2600) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UH1 2-(3-cyanophenyl)-N-(pyridin-3-yl)acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.209 |
| 5RH0 PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1286870272 (Mpro-x2608) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UH4 N-(5-methylthiophen-2-yl)-N'-pyridin-3-ylurea × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.240 |
| 5RH1 PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2010253653 (Mpro-x2643) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UGV 2-(5-chlorothiophen-2-yl)-N-(pyridin-3-yl)acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.243 |
| 5RH2 PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1129289650 (Mpro-x2646) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UH7 2-(3-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.230 |
| 5RH3 PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1264525706 (Mpro-x2649) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UHA (2R)-2-(3-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.232 |
| 5RH4 PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1530425063 (Mpro-x2659) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UHG (2R)-2-(6-chloro-9H-carbazol-2-yl)propanoic acid × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.205 |
| 5RH5 PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4439011520 (Mpro-x2694) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UHV N-(5-tert-butyl-1,2-oxazol-3-yl)-N-[(1R)-2-[(4-methoxy-2-methylphenyl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.223 |
| 5RH6 PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4439011588 (Mpro-x2703) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 UHY N-[(1R)-2-[(2-ethyl-6-methylphenyl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-[6-(propan-2-yl)pyridin-3-yl]propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.217 |
| 5RH7 PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4439011584 (Mpro-x2705) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 UJ1 N-(5-tert-butyl-1H-pyrazol-3-yl)-N-[(1R)-2-[(2-ethyl-6-methylphenyl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.220 |
| 5RH8 PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4444621965 (Mpro-x2764) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 UHM 2-(cyanomethoxy)-N-[(1,2-thiazol-4-yl)methyl]benzamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.221 |
| 5RH9 PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4438424255 (Mpro-x2776) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 UJ4 N-{4-[(1S)-1-methoxyethyl]phenyl}-N-[(1R)-2-[(4-methoxy-2-methylphenyl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.225 |
| 5RHA PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z147647874 (Mpro-x2779) 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | T8M 1-{4-[(thiophen-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.209 |
| 5RHB PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Cov_HetLib030 (Mpro-x2097) 提交 2020-05-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 USD (E)-1-(pyrimidin-2-yl)methanimine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.207 |
| 5RHC PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Cov_HetLib053 (Mpro-x2119) 提交 2020-05-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | USA (E)-1-(1H-imidazol-2-yl)methanimine × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.217 |
| 5RHD PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with SF013 (Mpro-x2193) 提交 2020-05-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14 US7 1-[4-(methylsulfonyl)phenyl]piperazine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.206 |
| 5RHE PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PG-COV-42 (Mpro-x2052) 提交 2020-05-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UPD 1-acetyl-N-(6-methoxypyridin-3-yl)piperidine-4-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.216 |
| 5RHF PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PG-COV-34 (Mpro-x2754) 提交 2020-05-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 UPJ 1-acetyl-N-methyl-N-phenylpiperidine-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.228 |
| 5RL0 PanDDA analysis group deposition of computational designs of SARS-CoV-2 main protease covalent inhibitors -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-adc59df6-2 (Mpro-x3110) 提交 2020-08-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | VEG ethyl N-[(2R)-2-[(4-tert-butylphenyl)(propanoyl)amino]-2-(pyridin-3-yl)acetyl]-beta-alaninate × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.214 |
| 5RL1 PanDDA analysis group deposition of computational designs of SARS-CoV-2 main protease covalent inhibitors -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-adc59df6-27 (Mpro-x3113) 提交 2020-08-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | VEJ N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-[(3-methoxypropyl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.210 |
| 5RL2 PanDDA analysis group deposition of computational designs of SARS-CoV-2 main protease covalent inhibitors -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-adc59df6-26 (Mpro-x3115) 提交 2020-08-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | VEM N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-[(2-methoxyethyl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.200 |
| 5RL3 PanDDA analysis group deposition of computational designs of SARS-CoV-2 main protease covalent inhibitors -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-adc59df6-39 (Mpro-x3117) 提交 2020-08-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 VEP N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-[(oxan-4-yl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.205 |
| 5RL4 PanDDA analysis group deposition of computational designs of SARS-CoV-2 main protease covalent inhibitors -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-adc59df6-3 (Mpro-x3124) 提交 2020-08-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 VEV N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(methylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.205 |
| 5RL5 PanDDA analysis group deposition of computational designs of SARS-CoV-2 main protease covalent inhibitors -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-adc59df6-30 (Mpro-x3359) 提交 2020-08-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 VEY N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(ethylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.217 |
| 5RL6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z198195770 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.249 |
| 5RL6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z198195770 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LJA N-[3-(carbamoylamino)phenyl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.249 |
| 5RL7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z364321922 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | VVD 5-(acetylamino)-2-fluorobenzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.269 |
| 5RL7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z364321922 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | VVD 5-(acetylamino)-2-fluorobenzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.269 |
| 5RL8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z53825177 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | VVG N-(2-fluorophenyl)ethanesulfonamide × 2 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.270 |
| 5RL8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z53825177 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.270 |
| 5RL9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1703168683 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.231 |
| 5RL9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1703168683 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 UR7 1-(3-fluoro-4-methylphenyl)methanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.231 |
| 5RLB PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z216450634 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | VVJ N-cycloheptyl-N-methylmethanesulfonamide × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.262 |
| 5RLB PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z216450634 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.262 |
| 5RLC PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z56923284 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.252 |
| 5RLC PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z56923284 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VVM 4-amino-N-phenylbenzene-1-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.252 |
| 5RLD PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z19735981 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.270 |
| 5RLD PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z19735981 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VVY 2-phenoxy-1-(pyrrolidin-1-yl)ethan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.270 |
| 5RLE PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1429867185 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.262 |
| 5RLE PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1429867185 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VVP 4-methoxy-1H-indole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.262 |
| 5RLF PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z235341991 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | NY7 N-(2-methoxy-5-methylphenyl)glycinamide × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.254 |
| 5RLF PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z235341991 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.254 |
| 5RLG PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z19739650 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | VW1 (2S)-2-(4-cyanophenoxy)propanamide × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.286 |
| 5RLG PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z19739650 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.286 |
| 5RLH PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2856434778 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.251 |
| 5RLH PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2856434778 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 K2P 2-(trifluoromethoxy)benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.251 |
| 5RLI PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z45617795 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | JFM N-(2-phenylethyl)methanesulfonamide × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.268 |
| 5RLI PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z45617795 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | JFM N-(2-phenylethyl)methanesulfonamide × 2 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.268 |
| 5RLJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1407673036 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.228 |
| 5RLJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1407673036 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VW4 (2S)-2-phenylpropane-1-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.228 |
| 5RLK PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1509882419 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.240 |
| 5RLK PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1509882419 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 NYV 1-(propan-2-yl)-1H-imidazole-4-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.240 |
| 5RLL PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z425387594 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.267 |
| 5RLL PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z425387594 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 H04 1-(2-ethoxyphenyl)piperazine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.267 |
| 5RLM PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1650168321 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.237 |
| 5RLM PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1650168321 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VW7 N-(8-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinolin-5-yl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.237 |
| 5RLN PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z364328788 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | NZG 3-(acetylamino)-4-fluorobenzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.258 |
| 5RLN PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z364328788 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.258 |
| 5RLO PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1454310449 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.243 |
| 5RLO PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1454310449 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 UQS N-[(2-fluorophenyl)methyl]-1H-pyrazol-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.243 |
| 5RLP PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z166605480 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.253 |
| 5RLP PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z166605480 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VWA (1S)-1-(4-fluorophenyl)-N-methylethan-1-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.253 |
| 5RLQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z285782452 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | UVA N-methyl-2-(methylsulfonyl)aniline × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.254 |
| 5RLQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z285782452 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.254 |
| 5RLR PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z822382694 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.283 |
| 5RLR PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z822382694 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VWD (1R)-2-(methylsulfonyl)-1-phenylethan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.283 |
| 5RLS PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z59181945 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | VWG N-hydroxyquinoline-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.254 |
| 5RLS PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z59181945 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.254 |
| 5RLT PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z53116498 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.264 |
| 5RLT PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z53116498 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 UVJ 3-(2-methyl-1H-benzimidazol-1-yl)propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.264 |
| 5RLU PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z744754722 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | JG4 2-(thiophen-2-yl)-1H-imidazole × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.273 |
| 5RLU PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z744754722 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | JG4 2-(thiophen-2-yl)-1H-imidazole × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.273 |
| 5RLV PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2467208649 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | VWJ N-(propan-2-yl)-1H-benzimidazol-2-amine × 2 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.260 |
| 5RLV PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2467208649 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | VWJ N-(propan-2-yl)-1H-benzimidazol-2-amine × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.260 |
| 5RLW PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z45705015 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | S9S ~{N}-[2-(4-fluorophenyl)ethyl]methanesulfonamide × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.237 |
| 5RLW PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z45705015 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | S9S ~{N}-[2-(4-fluorophenyl)ethyl]methanesulfonamide × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.237 |
| 5RLY PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2027049478 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | K34 5-(1,3-thiazol-2-yl)-1H-1,2,4-triazole × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.261 |
| 5RLY PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2027049478 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | K34 5-(1,3-thiazol-2-yl)-1H-1,2,4-triazole × 2 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.261 |
| 5RLZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2293643386 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | VWM (3R)-1-acetyl-3-hydroxypiperidine-3-carboxylic acid × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.273 |
| 5RLZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2293643386 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.273 |
| 5RM0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1492796719 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.238 |
| 5RM0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1492796719 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 S7G ~{N}-[(3~{R})-1,2,3,4-tetrahydroquinolin-3-yl]ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.238 |
| 5RM1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z426041412 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.234 |
| 5RM1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z426041412 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 RY4 N-[4-(aminomethyl)phenyl]methanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.234 |
| 5RM2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1741964527 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.273 |
| 5RM2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1741964527 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 UXG 1-(diphenylmethyl)azetidin-3-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.273 |
| 5RM3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1745658474 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | S7J 2-(trifluoromethyl)pyrimidine-5-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.274 |
| 5RM3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1745658474 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.274 |
| 5RM4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1639162606 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.253 |
| 5RM4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1639162606 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 PK4 2-fluoro-N,3-dimethylbenzene-1-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.253 |
| 5RM5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z373768900 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.262 |
| 5RM5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z373768900 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 NUA N-(1-ethyl-1H-pyrazol-4-yl)cyclobutanecarboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.262 |
| 5RM6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z396380540 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.251 |
| 5RM6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z396380540 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 HR5 ~{N}-(cyclobutylmethyl)-1,5-dimethyl-pyrazole-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.251 |
| 5RM7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z69118333 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.269 |
| 5RM7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z69118333 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 N0E ~{N}-(4-hydroxyphenyl)-3-phenyl-propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.269 |
| 5RM8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1614545742 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | GQJ methyl (2~{S},4~{R})-1-(furan-2-ylcarbonyl)-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxylate × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.248 |
| 5RM8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1614545742 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.248 |
| 5RM9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2856434942 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.254 |
| 5RM9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2856434942 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 EJQ ~{N}-(4-fluorophenyl)-2-pyrrolidin-1-yl-ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.254 |
| 5RMA PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z321318226 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.236 |
| 5RMA PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z321318226 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 JHJ N-(4-methoxyphenyl)-N'-pyridin-4-ylurea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.236 |
| 5RMB PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2856434920 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | VWV ethyl (1,1-dioxo-1lambda~6~,4-thiazinan-4-yl)acetate × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.249 |
| 5RMB PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2856434920 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.249 |
| 5RMC PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z24758179 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.258 |
| 5RMC PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z24758179 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 6SU methyl 3-(methylsulfonylamino)benzoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.258 |
| 5RMD PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z57614330 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | VWY N-ethyl-4-[(methylsulfonyl)amino]benzamide × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.261 |
| 5RMD PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z57614330 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | VWY N-ethyl-4-[(methylsulfonyl)amino]benzamide × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.261 |
| 5RME PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z26333434 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | RYM 4-(benzimidazol-1-ylmethyl)benzenecarbonitrile × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.284 |
| 5RME PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z26333434 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.284 |
| 5RMF PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z54226006 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | NX7 (2,6-difluorophenyl)(pyrrolidin-1-yl)methanone × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.270 |
| 5RMF PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z54226006 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.270 |
| 5RMG PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z285675722 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.256 |
| 5RMG PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z285675722 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MUK 4,6-dimethyl-~{N}-phenyl-pyrimidin-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.256 |
| 5RMH PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1101755952 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | VX4 [(4S)-4-methylazepan-1-yl](1,3-thiazol-4-yl)methanone × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.243 |
| 5RMH PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1101755952 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.243 |
| 5RMI PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z53860899 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | STV ~{N}-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)ethanesulfonamide × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.251 |
| 5RMI PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z53860899 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.251 |
| 5RMJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z68299550 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | JOV 3-chloro-N-(1-hydroxy-2-methylpropan-2-yl)benzamide × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.296 |
| 5RMJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z68299550 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.296 |
| 5RMK PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1273312153 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.274 |
| 5RMK PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1273312153 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 O2A N-methyl-1H-indole-7-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.274 |
| 5RML PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z85956652 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.288 |
| 5RML PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z85956652 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VXD N-(3-chloro-2-methylphenyl)glycinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.288 |
| 5RMM PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with POB0066 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.281 |
| 5RMM PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with POB0066 提交 2020-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VXG (3S,4R)-1-acetyl-4-phenylpyrrolidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.281 |
| 5ROB PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 helicase 提交 2020-09-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.254 |
| 5ROB PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 helicase 提交 2020-09-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.254 |
| 5RS7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000034618676 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W4Y 1-{2-[(propan-2-yl)oxy]ethyl}-2-sulfanylidene-1,2,3,5-tetrahydro-4H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-4-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.190 |
| 5RS7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000034618676 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.190 |
| 5RS8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000001601 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | H35 N-(FURAN-2-YLMETHYL)-7H-PURIN-6-AMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.179 |
| 5RS8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000001601 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.179 |
| 5RS9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000007636250 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W4V 6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d][1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-8-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.178 |
| 5RS9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000007636250 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.178 |
| 5RSB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001674697 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W4S 7-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.184 |
| 5RSB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001674697 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.184 |
| 5RSC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000003888754 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W5S 7-[(furan-2-yl)methyl]-5,6-dimethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.201 |
| 5RSC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000003888754 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.201 |
| 5RSD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000331945 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 1LQ quinazolin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.189 |
| 5RSD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000331945 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.189 |
| 5RSE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000336438345 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W5P 4-[(3R)-3-fluoropiperidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.208 |
| 5RSE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000336438345 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.208 |
| 5RSF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000026180281 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W5M 9-methyl-9H-purine-2,6-diamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.173 |
| 5RSF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000026180281 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.173 |
| 5RSG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000263392672 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W5J N-methyl-N-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl-beta-alanine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.183 |
| 5RSG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000263392672 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.183 |
| 5RSH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000274438208 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W5G 4-(5-azaspiro[2.5]octan-5-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.179 |
| 5RSH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000274438208 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.179 |
| 5RSI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000374420934 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W5D 4-(1,4-oxazonan-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.217 |
| 5RSI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000374420934 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.217 |
| 5RSJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000089254160_N3 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W5A 3-[(2-methyl-1,3-thiazol-4-yl)methyl]-3H-purin-6-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.193 |
| 5RSJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000089254160_N3 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.193 |
| 5RSK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000901381520_N3 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W57 3-[(3-methoxy-1,2-oxazol-5-yl)methyl]-3H-purin-6-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.164 |
| 5RSK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000901381520_N3 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.164 |
| 5RSL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000365052868 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W51 6-[(1s,4s)-2-azabicyclo[2.2.2]octan-2-yl]-5-chloropyrimidin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.189 |
| 5RSL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000365052868 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.189 |
| 5RSM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000001099 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 4SO 4-sulfamoylbenzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.185 |
| 5RSM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000001099 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.185 |
| 5RSN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000064576 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 51X (1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.181 |
| 5RSN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000064576 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.181 |
| 5RSO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000000226 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TYZ PARA ACETAMIDO BENZOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.187 |
| 5RSO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000000226 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.187 |
| 5RSP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002560357 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | LSA 1,2-BENZISOTHIAZOL-3(2H)-ONE 1,1-DIOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.172 |
| 5RSP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002560357 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.172 |
| 5RSQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000158490 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | MOK 5-methyl-3-phenyl-1,2-oxazole-4-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.170 |
| 5RSQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000158490 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.170 |
| 5RSR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000158650 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | XIY 2-HYDROXYMETHYL-BENZOIMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.191 |
| 5RSR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000158650 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.191 |
| 5RSS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000006691828 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | NC3 N-[(CYCLOHEXYLAMINO)CARBONYL]GLYCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.167 |
| 5RSS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000006691828 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.167 |
| 5RST PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332673 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 5HN 5-hydroxypyridine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.169 |
| 5RST PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332673 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.169 |
| 5RSU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000002055 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | OHB salicylamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 5RSU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000002055 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 5RSV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000340465 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 4MB 4-[(METHYLSULFONYL)AMINO]BENZOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.179 |
| 5RSV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000340465 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.179 |
| 5RSW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000337835 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 6FZ 2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.177 |
| 5RSW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000337835 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.177 |
| 5RSX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388262 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | YTX 2-(3-methoxy-4-oxidanyl-phenyl)ethanoic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.176 |
| 5RSX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388262 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.176 |
| 5RSY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004787230 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 3R6 2-hydroxy-5-(methylsulfanyl)benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.192 |
| 5RSY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004787230 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.192 |
| 5RSZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004218283 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | ZZA 1-PHENYL-1H-PYRAZOLE-4-CARBOXYLIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.182 |
| 5RSZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004218283 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.182 |
| 5RT0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002582714 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 4BL 6-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.157 |
| 5RT0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002582714 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.157 |
| 5RT1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039810 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 3A9 2,3-dihydro-1-benzofuran-5-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 5RT1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039810 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 5RT2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008652361 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 5OF 2-(4-oxidanylidene-3~{H}-phthalazin-1-yl)ethanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.174 |
| 5RT2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008652361 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.174 |
| 5RT3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000039281982 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 2FX 1-benzothiophen-2-ylacetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.219 |
| 5RT3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000039281982 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.219 |
| 5RT4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000051581 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 4BX 3-(1H-benzimidazol-2-yl)propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.175 |
| 5RT4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000051581 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.175 |
| 5RT5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000058111 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 07L 7-hydroxy-2H-chromen-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.172 |
| 5RT5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000058111 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.172 |
| 5RT6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000156509 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 05R 2-(3,4-dichlorophenyl)ethanoic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.182 |
| 5RT6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000156509 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.182 |
| 5RT7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000015442276 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | GVH 1H-PYRROLO[2,3-B]PYRIDINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.173 |
| 5RT7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000015442276 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.173 |
| 5RT8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161908 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | HLR 1,2-benzoxazol-3-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.160 |
| 5RT8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161908 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.160 |
| 5RT9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388280 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 54G 2-hydroxy-5-methylbenzoic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.185 |
| 5RT9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388280 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.185 |
| 5RTA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332540 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | Q6T 1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 5RTA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332540 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 5RTB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000006534965 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 3XH 3-Hydroxyhippuric acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.186 |
| 5RTB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000006534965 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.186 |
| 5RTC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000006490906 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | EVE 1H-benzimidazole-2-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.201 |
| 5RTC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000006490906 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.201 |
| 5RTD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000157108 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | MHW 3-HYDROXYPICOLINIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.178 |
| 5RTD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000157108 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.178 |
| 5RTE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000013283576 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 4FL 4-(1H-imidazol-2-yl)pyridine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.193 |
| 5RTE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000013283576 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.193 |
| 5RTF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002047514 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.166 |
| 5RTF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002047514 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | ISN ISATIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.166 |
| 5RTG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000395673 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 3HP 3-HYDROXYPHENYLACETATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.180 |
| 5RTG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000395673 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.180 |
| 5RTH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000156863 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 3BZ 3-chlorobenzoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.172 |
| 5RTH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000156863 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.172 |
| 5RTI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004219237 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 6U6 3-(5-chloranyl-1,3-benzothiazol-2-yl)propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.185 |
| 5RTI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004219237 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.185 |
| 5RTJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332752 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | PHB P-HYDROXYBENZOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.176 |
| 5RTJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332752 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.176 |
| 5RTK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000164504 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | BZX 1,3-benzodioxol-5-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.164 |
| 5RTK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000164504 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.164 |
| 5RTL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388056 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 4J8 4-methylbenzenesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 5RTL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388056 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 5RTM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000002005 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | PZA PYRAZINE-2-CARBOXAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.168 |
| 5RTM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000002005 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.168 |
| 5RTN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000013514509 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | AQO 2-AMINOQUINAZOLIN-4(3H)-ONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.174 |
| 5RTN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000013514509 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.174 |
| 5RTO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388302 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 5RTO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388302 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 4PN 4-PIPERIDINO-PIPERIDINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 5RTP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001679336 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | AOT 2-oxidanylidene-2-phenylazanyl-ethanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.168 |
| 5RTP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001679336 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.168 |
| 5RTQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000019015078 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 4JO 5-bromo-6-methylpyridin-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.172 |
| 5RTQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000019015078 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.172 |
| 5RTR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000018169763 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | SHA SALICYLHYDROXAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.168 |
| 5RTR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000018169763 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.168 |
| 5RTS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000159004 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 0LO 5-phenylpyridine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 5RTS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000159004 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 5RTT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000873830 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | NMI 3-(1-methyl-1H-indol-3-yl)propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.182 |
| 5RTT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000873830 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.182 |
| 5RTU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000159056 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 1FF 1-methyl-5-phenyl-1H-pyrazole-4-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 5RTU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000159056 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 5RTV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001698894 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | PF0 3-hydroxy-2-methylbenzoic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.172 |
| 5RTV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001698894 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.172 |
| 5RTW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000164777 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | OHP (2-HYDROXYPHENYL)ACETIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.175 |
| 5RTW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000164777 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.175 |
| 5RTX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000090873 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 6OT 3,5-dichlorobenzene-1-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.161 |
| 5RTX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000090873 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.161 |
| 5RTY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000157088 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | HBD 4-HYDROXYBENZAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.181 |
| 5RTY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000157088 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.181 |
| 5RTZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000404062 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | FHB 3-FLUORO-4-HYDROXYBENZOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.178 |
| 5RTZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000404062 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.178 |
| 5RU0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388514 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 2CL (2,6-DICHLOROPHENYL)ACETIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.166 |
| 5RU0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388514 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 2CL (2,6-DICHLOROPHENYL)ACETIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.166 |
| 5RU1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000034687 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DFA DIPHENYLACETIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.180 |
| 5RU1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000034687 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.180 |
| 5RU2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000331715 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 06Y 2-phenoxyethanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.194 |
| 5RU2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000331715 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.194 |
| 5RU3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161696 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.160 |
| 5RU3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161696 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 8H8 2-fluoro-4-hydroxybenzonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.160 |
| 5RU4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001688638 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 6V9 2-methyl-1,3-thiazole-5-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.168 |
| 5RU4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001688638 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.168 |
| 5RU5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000098208711 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | BXW 3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzothiazine-7-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 5RU5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000098208711 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 5RU6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001442764 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 5RU6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001442764 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 2UP naphthalene-2-carboximidamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 5RU7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000003591110 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | PYD 2,5-DIMETHYL-PYRIMIDIN-4-YLAMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.162 |
| 5RU7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000003591110 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.162 |
| 5RU8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000154817 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 1SQ ISOQUINOLIN-1-AMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.156 |
| 5RU8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000154817 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.156 |
| 5RU9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000165882 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 4SV 3-AMINOPYRIDINE-4-CARBOXYLIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.189 |
| 5RU9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000165882 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.189 |
| 5RUA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000033986325 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 3EU (3,5-dichlorophenyl)acetic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.174 |
| 5RUA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000033986325 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.174 |
| 5RUC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000005878 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | NCA NICOTINAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.170 |
| 5RUC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000005878 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.170 |
| 5RUD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008615114 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 2D0 4-chloro-1,3-benzothiazol-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.171 |
| 5RUD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008615114 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.171 |
| 5RUE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000000922 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | BHA 2-HYDROXY-4-AMINOBENZOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.183 |
| 5RUE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000000922 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.183 |
| 5RUF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000016989831 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 54T 6-chloro-1,3-benzothiazol-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.167 |
| 5RUF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000016989831 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.167 |
| 5RUG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000038389 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | NOA NAPHTHYLOXYACETIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.189 |
| 5RUG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000038389 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.189 |
| 5RUH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000123600 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | KNL (2,6-dichlorophenoxy)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.172 |
| 5RUH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000123600 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.172 |
| 5RUI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332651 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 4YS isoquinolin-1(2H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.166 |
| 5RUI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332651 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.166 |
| 5RUJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000404314 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 2SX (5-bromo-1H-indol-3-yl)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.185 |
| 5RUJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000404314 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.185 |
| 5RUK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161692 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | NVU 2-(1,2-benzoxazol-3-yl)ethanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.183 |
| 5RUK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161692 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.183 |
| 5RUL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000163774 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 5ZE 4,6-dimethylpyrimidin-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.172 |
| 5RUL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000163774 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.172 |
| 5RUM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008861082 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 52F 3-(3-oxo-3,4-dihydroquinoxalin-2-yl)propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.176 |
| 5RUM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008861082 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.176 |
| 5RUN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000194295 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | EXB 3-(1H-benzimidazol-1-yl)propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.171 |
| 5RUN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000194295 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.171 |
| 5RUO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001683100 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W6A 4-chloro-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.179 |
| 5RUO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001683100 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.179 |
| 5RUP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004976927 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 04R [3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-indazol-1-yl]acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.174 |
| 5RUP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004976927 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.174 |
| 5RUQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000032199226 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W6D 1H-indole-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 5RUQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000032199226 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 5RUR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000017744334 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | FBB 6-fluoro-1,3-benzothiazol-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.168 |
| 5RUR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000017744334 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.168 |
| 5RUS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388081 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | HSM HISTAMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.161 |
| 5RUS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388081 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.161 |
| 5RUT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161958 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | APG ATROLACTIC ACID (2-PHENYL-LACTIC ACID) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.178 |
| 5RUT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161958 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.178 |
| 5RUU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000438614 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W6G N-(1,3,4-thiadiazol-2-yl)benzenesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.191 |
| 5RUU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000438614 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.191 |
| 5RUV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000019015194 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 5RUV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000019015194 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W6J 1-(pyridin-2-yl)-1,4-diazepane × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 5RUW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000045014941 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W6M 3-{[(3-methyl-1,2,4-oxadiazol-5-yl)methyl]carbamoyl}benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.171 |
| 5RUW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000045014941 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.171 |
| 5RUX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002020050 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W6P 1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 5RUX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002020050 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 5RUY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000013517187 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | XAN XANTHINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.189 |
| 5RUY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000013517187 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.189 |
| 5RUZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000019685960 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W6S 4-(1H-pyrazol-3-yl)piperidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.167 |
| 5RUZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000019685960 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.167 |
| 5RV0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039994 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W6V N-(1,3-thiazol-2-yl)benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 5RV0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039994 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 5RV1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000251609 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.180 |
| 5RV1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000251609 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.180 |
| 5RV2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000311783 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W7S N-benzylpyrazine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.197 |
| 5RV2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000311783 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.197 |
| 5RV3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000057162 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | MYI (5-methoxy-1H-indol-3-yl)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.190 |
| 5RV3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000057162 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.190 |
| 5RV4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039224 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 4FS quinolin-3-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.176 |
| 5RV4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039224 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.176 |
| 5RV5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008578948 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | JG8 BENZOFURO[3,2-D]PYRIMIDIN-4(3H)-ONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.182 |
| 5RV5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008578948 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.182 |
| 5RV6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000158540 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 0HN 1,3-benzodioxole-5-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.160 |
| 5RV6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000158540 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.160 |
| 5RV7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000003954002 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | JNZ 1H-indazol-3-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.160 |
| 5RV7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000003954002 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.160 |
| 5RV8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039575 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 8EJ 6-methylpyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.177 |
| 5RV8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039575 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.177 |
| 5RV9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388150 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | EKZ 4-tert-butylbenzene-1,2-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.182 |
| 5RV9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388150 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | EKZ 4-tert-butylbenzene-1,2-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.182 |
| 5RVA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000016343276 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | HQD 3-HYDROXY-2-METHYLQUINOLIN-4(1H)-ONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 5RVA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000016343276 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 5RVB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000014419577 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 7PD 2-aminopteridine-4,7(3H,8H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.164 |
| 5RVB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000014419577 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.164 |
| 5RVC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000933940912 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W7V (1R,5R)-N-methyl-N-(1H-pyrazol-4-yl)bicyclo[3.1.0]hexane-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.156 |
| 5RVC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000933940912 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.156 |
| 5RVD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000263980802 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W7Y 4-[(2R)-2-cyclobutylpyrrolidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.198 |
| 5RVD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000263980802 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.198 |
| 5RVE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000736709772 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W8A {[(2S)-1-oxo-1-(2-oxoimidazolidin-1-yl)propan-2-yl]sulfanyl}acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.170 |
| 5RVE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000736709772 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.170 |
| 5RVF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000082473428_N3 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W8D 3-{[(2R)-oxolan-2-yl]methyl}-3H-purin-6-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.173 |
| 5RVF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000082473428_N3 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.173 |
| 5RVG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000400552187_N3 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | W8J 3-{3-[(3S)-oxolan-3-yl]propyl}-3H-purin-6-amine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.179 |
| 5RVG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000400552187_N3 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.179 |
| 5RVH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000265642 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | Q3C quinoline-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.184 |
| 5RVH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000265642 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.184 |
| 5RVI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000084843283 提交 2020-09-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | CLW CHLORZOXAZONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.94 Å R-free 0.181 |
| 5RVI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000084843283 提交 2020-09-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | CLW CHLORZOXAZONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.94 Å R-free 0.181 |
| 5RVJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001612349 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 4JQ 6-amino-2H-chromen-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.158 |
| 5RVK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002977810 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 2AK 7-bromo-5-methyl-1H-indole-2,3-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.195 |
| 5RVL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000149580 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | BVF 4-METHYLPYRIDIN-2-AMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.195 |
| 5RVM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000157088 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | HBD 4-HYDROXYBENZAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.155 |
| 5RVN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332748 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | ANN 4-METHOXYBENZOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.187 |
| 5RVO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000013514509 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | AQO 2-AMINOQUINAZOLIN-4(3H)-ONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.212 |
| 5RVP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000154817 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 1SQ ISOQUINOLIN-1-AMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.142 |
| 5RVQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002508153 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 4BY 5-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.183 |
| 5RVR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000016052862 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | LZ1 1H-indazole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.157 |
| 5RVS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000159004 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 0LO 5-phenylpyridine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.223 |
| 5RVT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002582714 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 4BL 6-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.170 |
| 5RVU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002506130 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 6P3 6-phenylpyridine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.188 |
| 5RVV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000020269197 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | WB1 6-methyl-1H-indole-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.215 |
| 5S18 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-321461 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | WOY 6,7-dihydro-5H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.211 |
| 5S18 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-321461 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.211 |
| 5S1A PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-43406 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WPS 5-amino-3-methyl-1H-pyrazole-4-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.211 |
| 5S1A PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-43406 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WPS 5-amino-3-methyl-1H-pyrazole-4-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.211 |
| 5S1C PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z3034471507 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WPV 1-(5-bromopyridin-3-yl)methanamine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.202 |
| 5S1C PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z3034471507 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.202 |
| 5S1E PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with AB-601_30915014 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WPY N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.215 |
| 5S1E PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with AB-601_30915014 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.215 |
| 5S1G PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-108952 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WQ1 (4-methylpyridin-3-yl)methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.197 |
| 5S1G PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-108952 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.197 |
| 5S1I PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-301084 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WQ4 5-amino-2-methyl-1,3-oxazole-4-carbonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.194 |
| 5S1I PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-301084 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.194 |
| 5S1K PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-105873 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WQ7 1-(2-aminoethyl)pyridin-2(1H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.205 |
| 5S1K PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-105873 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.205 |
| 5S1M PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with STK497968 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DE5 2-azanyl-~{N}-(1,3-thiazol-2-yl)ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.204 |
| 5S1M PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with STK497968 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.204 |
| 5S1O PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with STL414928 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WQA 2H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-amine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.209 |
| 5S1O PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with STL414928 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.209 |
| 5S1Q PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-17035 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WQG quinazolin-4(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.210 |
| 5S1Q PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-17035 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.210 |
| 5S1S PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1613477500 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WQJ 7,8-dihydro-5H-pyrano[4,3-b]pyridin-3-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.202 |
| 5S1S PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1613477500 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.202 |
| 5S1U PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-52144 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WQM (3S)-N-methyl-6-oxo-3,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.197 |
| 5S1U PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-52144 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.197 |
| 5S1W PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z838838708 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WQV N-(5-bromo-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.204 |
| 5S1W PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z838838708 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.204 |
| 5S1Y PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with STK346965 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WQY 1-(quinolin-3-yl)methanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.200 |
| 5S1Y PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with STK346965 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.200 |
| 5S20 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with PB1827975385 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WRD (5R)-5-amino-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.196 |
| 5S20 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with PB1827975385 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.196 |
| 5S22 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z145120524 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WRJ 2H-1-benzopyran-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.218 |
| 5S22 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z145120524 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.218 |
| 5S24 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-697611 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WRM 2-(1H-benzimidazol-1-yl)-N-methylacetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.222 |
| 5S24 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-697611 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.222 |
| 5S26 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z605596346 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | L46 4-acetyl-3-ethyl-N,5-dimethyl-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.208 |
| 5S26 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z605596346 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.208 |
| 5S27 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1262398530 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.217 |
| 5S27 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1262398530 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WSM 4-(3-aminopropyl)-2H-1,4-benzoxazin-3(4H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.217 |
| 5S28 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z409974522 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WRV N-(3-fluoro-4-methylphenyl)-N'-[(2S)-1-hydroxypropan-2-yl]urea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.215 |
| 5S28 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z409974522 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.215 |
| 5S29 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z199959602 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WRY 7-fluoro-N,2-dimethylquinoline-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.222 |
| 5S29 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z199959602 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.222 |
| 5S2A PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1263529624 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WS4 N-(4-hydroxyphenyl)-1-methyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.211 |
| 5S2A PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1263529624 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.211 |
| 5S2B PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z373769142 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WSG N-(1-ethyl-1H-pyrazol-4-yl)-4-fluorobenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.208 |
| 5S2B PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z373769142 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.208 |
| 5S2C PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z45612755 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WSJ N-(1,5-dimethyl-3-oxo-2-phenyl-2,3-dihydro-1H-pyrazol-4-yl)methanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.207 |
| 5S2C PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z45612755 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.207 |
| 5S2D PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z369936976 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.193 |
| 5S2D PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z369936976 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | U0P N'-cyclopropyl-N-methyl-N-[(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)methyl]urea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.193 |
| 5S2E PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1152242726 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | VZM N-(6-methoxypyridin-3-yl)-N'-thiophen-2-ylurea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.209 |
| 5S2E PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1152242726 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.209 |
| 5S2F PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z44592329 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | K0G N-phenyl-N'-pyridin-3-ylurea × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.215 |
| 5S2F PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z44592329 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.215 |
| 5S2G PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z321318226 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | JHJ N-(4-methoxyphenyl)-N'-pyridin-4-ylurea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.212 |
| 5S2G PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z321318226 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.212 |
| 5S2H PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434920 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.206 |
| 5S2H PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434920 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | VWV ethyl (1,1-dioxo-1lambda~6~,4-thiazinan-4-yl)acetate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.206 |
| 5S2I PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57299529 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.208 |
| 5S2I PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57299529 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | LUY ~{N}-(2-phenylethyl)-1~{H}-benzimidazol-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.208 |
| 5S2J PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z509756472 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.205 |
| 5S2J PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z509756472 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | JGG N-[(4-cyanophenyl)methyl]morpholine-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.205 |
| 5S2K PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z445856640 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | VZP N-[(3R)-1,1-dioxo-1lambda~6~-thiolan-3-yl]-N-methyl-N'-propan-2-ylurea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.193 |
| 5S2K PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z445856640 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.193 |
| 5S2L PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2234920345 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | VZS N-(2-methoxy-5-methylphenyl)-N'-4H-1,2,4-triazol-4-ylurea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.198 |
| 5S2L PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2234920345 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | VZS N-(2-methoxy-5-methylphenyl)-N'-4H-1,2,4-triazol-4-ylurea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.198 |
| 5S2M PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z56827661 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | VZY N-(3-methylbenzene-1-carbonyl)glycine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.197 |
| 5S2M PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z56827661 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.197 |
| 5S2N PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1787627869 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | GWY 5-chloranyl-~{N}-methyl-~{N}-[[(3~{S})-oxolan-3-yl]methyl]pyrimidin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.204 |
| 5S2N PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1787627869 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.204 |
| 5S2O PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z645232558 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | NXS [1-(pyrimidin-2-yl)piperidin-4-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.195 |
| 5S2O PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z645232558 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.195 |
| 5S2P PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z927746322 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W04 N~2~-methyl-N-(4-methylpyridin-2-yl)glycinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.192 |
| 5S2P PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z927746322 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.192 |
| 5S2Q PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z26781952 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W0A N-[(1H-benzimidazol-2-yl)methyl]butanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.28 Å R-free 0.195 |
| 5S2Q PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z26781952 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.28 Å R-free 0.195 |
| 5S2R PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57292369 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | K41 2-methyl-N-(2-methyl-2H-tetrazol-5-yl)propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.202 |
| 5S2R PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57292369 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.202 |
| 5S2S PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434894 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | GWV ~{N},~{N}-dimethyl-4-[(propan-2-ylamino)methyl]aniline × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.194 |
| 5S2S PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434894 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.194 |
| 5S2T PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z26781964 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W0D N-[(1H-benzimidazol-2-yl)methyl]furan-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.213 |
| 5S2T PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z26781964 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.213 |
| 5S2U PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z85956652 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.193 |
| 5S2U PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z85956652 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | VXD N-(3-chloro-2-methylphenyl)glycinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.193 |
| 5S2V PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1186029914 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.196 |
| 5S2V PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1186029914 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W0G (3R)-1-(2-fluorophenyl)-3-(methylamino)pyrrolidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.196 |
| 5S2W PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1407672867 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | GWP 2-cyclopropyl-1~{H}-imidazole-4-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.201 |
| 5S2W PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1407672867 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.201 |
| 5S2X PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1139246057 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.193 |
| 5S2X PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1139246057 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W0J (3R)-N-methyl-1-(pyridazin-3-yl)piperidin-3-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.193 |
| 5S2Y PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z19727416 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.203 |
| 5S2Y PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z19727416 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W0M (2R)-2-(4-chlorophenoxy)propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.203 |
| 5S2Z PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z126932614 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | T6J 2-[(methylsulfonyl)methyl]-1H-benzimidazole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.201 |
| 5S2Z PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z126932614 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.201 |
| 5S30 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z65532537 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W0P (2R)-2-(2-fluorophenoxy)propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.207 |
| 5S30 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z65532537 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.207 |
| 5S31 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741959530 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.222 |
| 5S31 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741959530 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W0S 1-(3,4,5-trimethoxyphenyl)methanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.222 |
| 5S32 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z26781943 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W0V N-[(1H-benzimidazol-2-yl)methyl]-2-methylpropanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.236 |
| 5S32 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z26781943 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.236 |
| 5S33 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z906021418 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | K2G 5-chloro-2-(propan-2-yl)pyrimidine-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.206 |
| 5S33 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z906021418 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.206 |
| 5S34 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434941 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | GOV (2S)-1-{[(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl]amino}propan-2-ol × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.194 |
| 5S34 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434941 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.194 |
| 5S35 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z68404778 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | B1A ~{N}-(4-phenylazanylphenyl)ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.213 |
| 5S35 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z68404778 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.213 |
| 5S36 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434938 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 7ZC 1-(5-methoxy-1H-indol-3-yl)-N,N-dimethyl-methanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.209 |
| 5S36 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434938 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 7ZC 1-(5-methoxy-1H-indol-3-yl)-N,N-dimethyl-methanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.209 |
| 5S37 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1954800564 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | NZ1 5-methoxy-1,3-benzothiazol-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.205 |
| 5S37 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1954800564 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.205 |
| 5S38 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1745658474 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | S7J 2-(trifluoromethyl)pyrimidine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.203 |
| 5S38 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1745658474 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.203 |
| 5S39 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z165170770 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W0Y N-methyl-4-sulfamoylbenzamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.206 |
| 5S39 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z165170770 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.206 |
| 5S3A PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1562205518 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W17 1-(2-hydroxyethyl)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.209 |
| 5S3A PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1562205518 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.209 |
| 5S3B PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741966151 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W1A N-[(piperidin-4-yl)methyl]methanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.193 |
| 5S3B PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741966151 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.193 |
| 5S3C PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434937 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W1D (4-acetylphenoxy)acetic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.227 |
| 5S3C PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434937 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.227 |
| 5S3D PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z30820160 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | JFP N-(4-methyl-1,3-thiazol-2-yl)propanamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.213 |
| 5S3D PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z30820160 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.213 |
| 5S3E PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z274553586 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | WSY 3-(3,5-dimethyl-1H-1,2,4-triazol-1-yl)propanoic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.207 |
| 5S3E PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z274553586 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.207 |
| 5S3F PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57446103 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W1J N-(2-propyl-2H-tetrazol-5-yl)furan-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.194 |
| 5S3F PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57446103 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.194 |
| 5S3G PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z384468096 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | JHS N-[(4-phenyloxan-4-yl)methyl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.197 |
| 5S3G PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z384468096 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.197 |
| 5S3H PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434892 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W1M 3-[(1-methyl-1H-pyrazole-3-carbonyl)amino]benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.210 |
| 5S3H PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434892 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.210 |
| 5S3I PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z50145861 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.201 |
| 5S3I PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z50145861 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W1P 5-methyl-2-phenyl-2,4-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.201 |
| 5S3J PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1324853681 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W1S (8S)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridine-8-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.197 |
| 5S3J PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1324853681 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.197 |
| 5S3K PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z219104216 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | RZS 6-(ethylamino)pyridine-3-carbonitrile × 1 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.196 |
| 5S3K PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z219104216 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.196 |
| 5S3L PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z54628578 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | JH4 N-methylpyrimidin-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.196 |
| 5S3L PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z54628578 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.196 |
| 5S3M PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z45656995 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | S2S 4-(methylsulfonylamino)benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.207 |
| 5S3M PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z45656995 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.207 |
| 5S3N PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z287484230 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W1V 2-(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.200 |
| 5S3N PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z287484230 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.200 |
| 5S3O PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z102768020 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W1Y N-methyl-1-(1-phenyl-1H-pyrazol-4-yl)methanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.196 |
| 5S3O PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z102768020 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.196 |
| 5S3P PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1238477790 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W21 N-(cyclopentanecarbonyl)-L-alanine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.194 |
| 5S3P PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1238477790 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.194 |
| 5S3Q PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0013 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W2A (2R,3R)-2-methyl-1-(methylsulfonyl)piperidine-3-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.196 |
| 5S3Q PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0013 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W2A (2R,3R)-2-methyl-1-(methylsulfonyl)piperidine-3-carbonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.196 |
| 5S3R PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0014 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.201 |
| 5S3R PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0014 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W24 (2S,3S)-N,2-dimethyl-1-(methylsulfonyl)piperidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.201 |
| 5S3S PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0103 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W27 1-[(5S,8R)-6,7,8,9-tetrahydro-5H-5,8-epiminocyclohepta[b]pyridin-10-yl]ethan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.209 |
| 5S3S PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0103 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.209 |
| 5S3T PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0128 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W2G (1R,2S)-2-(thiophen-3-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.188 |
| 5S3T PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0128 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W2G (1R,2S)-2-(thiophen-3-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.188 |
| 5S3U PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0041 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W2J [(3R,5R)-5-methylpiperidin-3-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.193 |
| 5S3U PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0041 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.193 |
| 5S3V PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0120 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.195 |
| 5S3V PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0120 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W2M (2R)-1',4'-dihydro-2'H-spiro[pyrrolidine-2,3'-quinolin]-2'-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.195 |
| 5S3W PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0135 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.186 |
| 5S3W PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0135 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W2S (3R,4R)-4-(2-methylphenyl)oxolane-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.186 |
| 5S3X PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0136 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W2V (3S,4S)-4-(3-methoxyphenyl)oxane-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.197 |
| 5S3X PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0136 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.197 |
| 5S3Y PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0012 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.198 |
| 5S3Y PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0012 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W2Y (2S,3S)-2-methyl-1-(methylsulfonyl)piperidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.198 |
| 5S3Z PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0140 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W34 (3R,4S)-4-(3-methoxyphenyl)oxan-3-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.186 |
| 5S3Z PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0140 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.186 |
| 5S40 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00023824 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | HHQ 4-iodanyl-3~{H}-pyridin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.204 |
| 5S40 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00023824 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.204 |
| 5S41 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00023825 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | HGQ 4-bromanyl-1~{H}-pyridin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.213 |
| 5S41 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00023825 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.213 |
| 5S42 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00023833 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.195 |
| 5S42 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00023833 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | HH8 4-bromanyl-1,8-naphthyridine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.195 |
| 5S43 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00024661 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.201 |
| 5S43 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00024661 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | UUJ 5-bromo-2-hydroxybenzonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.201 |
| 5S44 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00024890 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W3A (4-bromo-1H-pyrazol-1-yl)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.201 |
| 5S44 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00024890 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.201 |
| 5S45 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00024773 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W3D (4-bromo-2-oxopyridin-1(2H)-yl)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.208 |
| 5S45 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00024773 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.208 |
| 5S46 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57131035 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | HYN imidazolidine-2,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.205 |
| 5S46 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57131035 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.205 |
| 5S47 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z940713508 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | BAQ pyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.197 |
| 5S47 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z940713508 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.197 |
| 5S48 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741982125 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | HRZ 1~{H}-pyridin-2-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.199 |
| 5S48 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741982125 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | HRZ 1~{H}-pyridin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.199 |
| 5S49 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z56866006 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 3TR 3-AMINO-1,2,4-TRIAZOLE × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.197 |
| 5S49 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z56866006 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 3TR 3-AMINO-1,2,4-TRIAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.197 |
| 5S4A PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z955123498 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 4AP 4-AMINOPYRIDINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.192 |
| 5S4A PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z955123498 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 4AP 4-AMINOPYRIDINE × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.192 |
| 5S4B PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z3219959731 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W3G pyridazin-3(2H)-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.208 |
| 5S4B PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z3219959731 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.208 |
| 5S4C PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1954800348 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W3J 1,4,5,6-tetrahydropyrimidin-2-amine × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.183 |
| 5S4C PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1954800348 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W3J 1,4,5,6-tetrahydropyrimidin-2-amine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.183 |
| 5S4D PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741982441 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 2OP (2S)-2-HYDROXYPROPANOIC ACID × 1 LAC LACTIC ACID × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.206 |
| 5S4D PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741982441 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.206 |
| 5S4E PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2301685688 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 W3M 1H-imidazole-5-carbonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.196 |
| 5S4E PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2301685688 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W3M 1H-imidazole-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.196 |
| 5S4F PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF003 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W3P 1,8-naphthyridine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.213 |
| 5S4F PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF003 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.213 |
| 5S4G PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF005 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W3S [1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-3-amine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.224 |
| 5S4G PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF005 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.224 |
| 5S4H PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF048 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W3V 1-carbamoylpiperidine-4-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.223 |
| 5S4H PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF048 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.223 |
| 5S4I PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF051 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W3Y (5S)-1-(4-chlorophenyl)-5-methylimidazolidine-2,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.204 |
| 5S4I PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF051 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.204 |
| 5S4J PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF054 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W41 6-chlorotetrazolo[1,5-b]pyridazine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.202 |
| 5S4J PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF054 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.202 |
| 5S4K PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with FMOOA000509a 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.209 |
| 5S4K PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with FMOOA000509a 提交 2020-11-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | W44 (2S,5R,6R)-7-methyl-2,3,4,5,6,7-hexahydro-1H-2,6-methanoazocino[5,4-b]indol-5-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.209 |
| 5S6X PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z2889976755 提交 2020-11-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 WUG 1-(2,4-dimethyl-1H-imidazol-5-yl)methanamine × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.222 |
| 5S6Y PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z56900771 提交 2020-11-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 WUJ N-[(furan-2-yl)methyl]urea × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.254 |
| 5S6Z PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with PB2255187532 提交 2020-11-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 WUM 4-[(dimethylamino)methyl]-1,3-thiazol-2-amine × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.222 |
| 5S70 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with EN300-181428 提交 2020-11-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 WUS (5R)-2-methyl-4,5,6,7-tetrahydro-1H-benzimidazol-5-amine × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.228 |
| 5S71 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with FUZS-5 提交 2020-11-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 WUV 5'-thiothymidine × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.215 |
| 5S72 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with BBL029427 提交 2020-11-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 WUY N-(2-aminoethyl)-N'-phenylurea × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.277 |
| 5S73 PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain 提交 2020-11-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.223 |
| 5S73 PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain 提交 2020-11-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.223 |
| 5S74 PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain 提交 2020-11-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 0.96 Å R-free 0.185 |
| 5S74 PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain 提交 2020-11-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 0.1；293.15 K；30% PEG 3K
|
分辨率 0.96 Å R-free 0.185 |
| 5SA4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z239136710 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | K3A N-(5-methyl-1H-pyrazol-3-yl)acetamide × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.225 |
| 5SA5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z1530301542 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 ZQA 4-ethyl-2-(1H-imidazol-5-yl)-1,3-thiazole × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.219 |
| 5SA6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z2856434783 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | O3G N-benzyl-1-(4-fluorophenyl)methanamine × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.222 |
| 5SA7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z1673618163 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | WL7 4-amino-N-(2-hydroxyethyl)-N-methylbenzene-1-sulfonamide × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.225 |
| 5SA8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z68299550 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | JOV 3-chloro-N-(1-hydroxy-2-methylpropan-2-yl)benzamide × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.222 |
| 5SA9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z2697514548 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | GWG 1-methylindazole-3-carboxamide × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.223 |
| 5SAA PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z319891284 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 ZQD 3-[(2S)-1-(methanesulfonyl)pyrrolidin-2-yl]-5-methyl-1,2-oxazole × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.227 |
| 5SAB PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z31504642 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 WJD 2-methoxy-N-phenylacetamide × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.231 |
| 5SAC PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z59181945 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 VWG N-hydroxyquinoline-2-carboxamide × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.217 |
| 5SAD PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z425449682 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | EJW (3-phenyl-1,2-oxazol-5-yl)methylazanium × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.223 |
| 5SAE PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z3219959731 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 W3G pyridazin-3(2H)-one × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.223 |
| 5SAF PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with EN300-321461 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 WOY 6,7-dihydro-5H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.222 |
| 5SAG PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with EN300-1605072 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | ZQG 3-(1H-imidazol-2-yl)propan-1-amine × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.230 |
| 5SAH PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with EN300-100112 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | ZQJ 2-methyl-5,6,7,8-tetrahydropyrido[4,3-c]pyridazin-3(2H)-one × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.256 |
| 5SAI PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z1424343998 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | ZQM N-{2-[(propan-2-yl)sulfanyl]phenyl}urea × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.222 |
| 5SBF PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 NendoU 提交 2021-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.211 |
| 5SKW PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1272494722 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | LF6 {(1R,2R)-2-[(Z)-(3-methyl-1,2,4-thiadiazol-5(2H)-ylidene)amino]cyclopentyl}methanol × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.267 |
| 5SKX PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z126932614 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | T6J 2-[(methylsulfonyl)methyl]-1H-benzimidazole × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.275 |
| 5SKY PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z466628048 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 O2M N-[(4-methyl-1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1H-pyrazole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.248 |
| 5SKZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z57258487 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 NVD N-{[4-(dimethylamino)phenyl]methyl}-4H-1,2,4-triazol-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.244 |
| 5SL0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z57260516 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 B0V 2-methoxy-~{N}-(2,4,6-trimethylphenyl)ethanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.260 |
| 5SL1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1273312153 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 O2A N-methyl-1H-indole-7-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.267 |
| 5SL2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z100643660 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LFO N,1-dimethyl-1H-indole-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.256 |
| 5SL3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z223688272 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LGR 2-[acetyl(methyl)amino]benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.269 |
| 5SL4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z383202616 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LHR N-(1H-indazol-6-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.281 |
| 5SL5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z32014663 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 WNV N,N,2,3-tetramethylbenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.281 |
| 5SL6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z256709556 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 60P 3-methylthiophene-2-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.293 |
| 5SL7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1186029914 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 W0G (3R)-1-(2-fluorophenyl)-3-(methylamino)pyrrolidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.251 |
| 5SL8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2856434762 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 JGD N,N-dimethylpyridin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.261 |
| 5SL9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z54571979 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 O0S N-{4-[(pyrimidin-2-yl)oxy]phenyl}acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.295 |
| 5SLA PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1003207278 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LJR 1-cyclohexyl-N-methylmethanesulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.271 |
| 5SLB PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z744930860 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LJK 3-methyl-N-(2-methylbutan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.242 |
| 5SLC PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1849009686 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 U1V 1-(4-fluoro-2-methylphenyl)methanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.260 |
| 5SLD PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1246465616 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LJ6 (2R)-3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-N,N,2-trimethylpropanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.258 |
| 5SLE PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z56880342 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 JGA N-ethyl-N'-(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)urea × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.261 |
| 5SLF PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z198195770 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LJA N-[3-(carbamoylamino)phenyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.245 |
| 5SLG PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z32400357 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 NZJ 1-(3-methylbenzene-1-carbonyl)piperidine-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.323 |
| 5SLH PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z65532537 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LLU (2S)-2-(2-fluorophenoxy)propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.264 |
| 5SLI PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1003146540 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LL0 2-(difluoromethoxy)benzene-1-sulfonamide × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.271 |
| 5SLJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1430613393 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LKU 3-fluoro-N-(3-hydroxy-4-methylphenyl)benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.247 |
| 5SLK PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1354370680 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LKL 2-[(5-chloro-3-fluoropyridin-2-yl)(methyl)amino]ethan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.285 |
| 5SLL PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z54615640 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LK6 N-[(3R)-3-methyl-1,1-dioxo-1lambda~6~-thiolan-3-yl]cyclopropanecarboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.251 |
| 5SLM PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z28290384 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 WN1 N-(2-fluorophenyl)-3-methoxybenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.307 |
| 5SLN PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z57299529 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LUY ~{N}-(2-phenylethyl)-1~{H}-benzimidazol-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.298 |
| 5SLO PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z56983806 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 JJM 1-methyl-N-(3-methylphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.281 |
| 5SLP PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z373768898 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 UWY N-(1-ethyl-1H-pyrazol-4-yl)cyclopentanecarboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.260 |
| 5SLQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2856434829 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ELQ [3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-(4-methylpiperazin-1-yl)methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.274 |
| 5SLR PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2073741691 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LO6 2-(difluoromethoxy)-1-[(2R,6S)-2,6-dimethylmorpholin-4-yl]ethan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.267 |
| 5SLS PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1373445602 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 SZE 4-(3-fluoranylpyridin-2-yl)-1-methyl-piperazin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.292 |
| 5SLT PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1816233707 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LNS 6-(methylcarbamoyl)pyridine-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.257 |
| 5SLU PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1796014543 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 UX1 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-N-methylcyclopropane-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.283 |
| 5SLV PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2856434942 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 EJQ ~{N}-(4-fluorophenyl)-2-pyrrolidin-1-yl-ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.280 |
| 5SLW PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1310876699 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 U0V 2-fluoro-N-[2-(pyridin-4-yl)ethyl]benzamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.273 |
| 5SLX PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z752989138 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LMW 2-[(4-aminophenyl)(ethyl)amino]ethan-1-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.259 |
| 5SLY PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1526504764 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LM6 1-(1-ethyl-1H-pyrazol-5-yl)-N-methylmethanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.292 |
| 5SLZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2072621991 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LQP 2-(difluoromethoxy)-1-[(3aR,6aS)-hexahydrocyclopenta[c]pyrrol-2(1H)-yl]ethan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.294 |
| 5SM0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z32665176 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LQI (1-benzofuran-2-yl)(4-methylpiperidin-1-yl)methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.273 |
| 5SM1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z68277692 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 WH1 N-methyl-N-[2-(pyridin-2-yl)ethyl]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.260 |
| 5SM2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z3006151474 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LQ3 (5S)-5-(difluoromethoxy)pyridin-2(5H)-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.270 |
| 5SM3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z943693514 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 GT4 ~{N}-(4-hydroxyphenyl)-2-methoxy-ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.306 |
| 5SM4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2856434944 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 AWD ~{N}-(4-fluorophenyl)-4-methyl-piperazine-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.271 |
| 5SM5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2856434807 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 S5J 2-[4-(2-methoxyphenyl)piperazin-1-yl]ethanenitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.249 |
| 5SM6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1899842917 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 K1A 3-[(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)methyl]-5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.278 |
| 5SM7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1247413608 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LPU 1-(methanesulfonyl)piperidin-4-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.268 |
| 5SM8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2027158783 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 WKA N-(2,1,3-benzoxadiazol-4-yl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.267 |
| 5SM9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2234920345 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VZS N-(2-methoxy-5-methylphenyl)-N'-4H-1,2,4-triazol-4-ylurea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.271 |
| 5SMA PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2856434890 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 NZD 4-methyl-N-phenylpiperazine-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.259 |
| 5SMB PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z419995480 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LRR 1-(morpholin-4-yl)-4-phenylbutan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.280 |
| 5SMC PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2033637875 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LRF N~2~-(4-cyano-3-methyl-1,2-thiazol-5-yl)-N~2~-methylglycinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.263 |
| 5SMD PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z274575916 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 WKS 2,4-dimethyl-6-(piperazin-1-yl)pyrimidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.263 |
| 5SME PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z437584380 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 I8D (4-chlorophenyl)(thiomorpholin-4-yl)methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.255 |
| 5SMF PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z56791867 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 K1S N,N-diethyl-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.319 |
| 5SMG PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2092370954 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LR9 3-amino-N-ethyl-N-methylbenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.253 |
| 5SMH PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2856434938 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 7ZC 1-(5-methoxy-1H-indol-3-yl)-N,N-dimethyl-methanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.280 |
| 5SMI PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z71580604 提交 2022-03-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 LQV (2S)-N-(5-methylpyridin-2-yl)oxolane-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.329 |
| 5SMK PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 NSP14 提交 2022-03-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；278 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.217 |
| 5SML PanDDA analysis group deposition of SARS-CoV-2 main protease ligands identified from single sequence-guideddeep generative framework -- Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z68337194 (Mpro-IBM0045) 提交 2022-04-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O3R 6-{[(3,4-dichlorophenyl)methyl](methyl)amino}pyridine-3-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.227 |
| 5SMM PanDDA analysis group deposition of SARS-CoV-2 main protease ligands identified from single sequence-guideddeep generative framework -- Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1633315555 (Mpro-IBM0058) 提交 2022-04-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 O46 N-[4-(3-fluorophenyl)oxan-4-yl]-2-(3-hydroxyphenyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.231 |
| 5SMN PanDDA analysis group deposition of SARS-CoV-2 main protease ligands identified from single sequence-guideddeep generative framework -- Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1365651030 (Mpro-IBM0078) 提交 2022-04-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O4F N-(1-cyanocyclopropyl)-1-(3-methylpyridin-4-yl)piperidine-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.212 |
| 5SOI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000078036511 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WVG 3-[(3R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]propanoic acid × 1 WYY 3-[(3S)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SOI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000078036511 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SOJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000642067873 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RWQ [(3R)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)piperidin-3-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.150 |
| 5SOJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000642067873 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.150 |
| 5SOK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000302059710 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RVO 5-chloro-6-{(3R)-3-[(pyridin-4-yl)oxy]pyrrolidin-1-yl}pyrimidin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.159 |
| 5SOK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000302059710 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.159 |
| 5SOL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000910475722 - (S,R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WVM (8S)-8-fluoro-6-(6-{[(2R)-2-hydroxypropyl]amino}pyrimidin-4-yl)-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.163 |
| 5SOL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000910475722 - (S,R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.163 |
| 5SOM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000835985505 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WVY [(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]methyl [4-(1H-pyrazol-1-yl)phenyl]acetate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SOM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000835985505 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SON PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000920153280 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WW1 3-{[(2R)-2-phenylpropyl]sulfanyl}-7H-[1,2,4]triazolo[4,3-b][1,2,4]triazole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.178 |
| 5SON PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000920153280 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.178 |
| 5SOO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000897286891 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WW4 4-{(3R)-3-[(1,3-thiazol-2-yl)methyl]pyrrolidin-1-yl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.157 |
| 5SOO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000897286891 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.157 |
| 5SOP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001364194305 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RYI (5R)-7-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2lambda~6~-thia-7-azaspiro[4.5]decane-2,2-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.174 |
| 5SOP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001364194305 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.174 |
| 5SOQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000896845531 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WWJ 5-ethyl-4-{(3R)-3-[(3-methyl-1,2,4-oxadiazol-5-yl)methyl]piperidin-1-yl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SOQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000896845531 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SOR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000110510893 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WWP 3-{[3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-3H-purin-6-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SOR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000110510893 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SOS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000559260078 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WWS 3-[(5-chloropyridin-2-yl)methyl]-3H-purin-6-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.151 |
| 5SOS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000559260078 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.151 |
| 5SOT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000292637864 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WX4 {1-[(3R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]-1H-1,2,3-triazol-4-yl}methanol × 1 S1O {1-[(3S)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]-1H-1,2,3-triazol-4-yl}methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.154 |
| 5SOT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000292637864 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.154 |
| 5SOU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000285507655 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WX7 5-[(3R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]-1,3,4-oxadiazol-2(3H)-one × 1 RZ9 5-[(3S)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]-1,3,4-oxadiazol-2(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.152 |
| 5SOU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000285507655 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.152 |
| 5SOV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000893191027 - (S) and (R) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WXD 5-ethyl-4-[(3S)-3-(methylsulfonyl)piperidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 WXA 5-ethyl-4-[(3R)-3-(methylsulfonyl)piperidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.157 |
| 5SOV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000893191027 - (S) and (R) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.157 |
| 5SOW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000118179920 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WXG 1-{2-[(9H-purin-6-yl)sulfanyl]ethyl}pyrrolidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.177 |
| 5SOW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000118179920 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.177 |
| 5SOX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000043461211 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WXJ 4-[2-(6-amino-3H-purin-3-yl)ethoxy]benzonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.136 |
| 5SOX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000043461211 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.136 |
| 5SOY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000222377450 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WXS 4-methyl-5-{[(9H-purin-6-yl)sulfanyl]methyl}-2H-1,3-dioxol-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.183 |
| 5SOY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000222377450 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.183 |
| 5SOZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000827900828 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WXY (1-azaspiro[4.5]decan-1-yl)(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.162 |
| 5SOZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000827900828 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.162 |
| 5SP0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000681764827 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WY7 3-{[5-(furan-2-yl)-1,2-oxazol-3-yl]methyl}-3H-purin-6-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.146 |
| 5SP0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000681764827 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.146 |
| 5SP1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001472868186 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WYA 3-{[methyl(pyrido[2,3-b]pyrazin-6-yl)amino]methyl}[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazin-8(7H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.173 |
| 5SP1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001472868186 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.173 |
| 5SP2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000579359572 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WYG [(2R)-4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)morpholin-2-yl]acetic acid × 1 S3E [(2S)-4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)morpholin-2-yl]acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.154 |
| 5SP2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000579359572 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.154 |
| 5SP3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000450476923 - (S,R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WYJ [(2S,6R)-6-methyl-4-(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholin-2-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.160 |
| 5SP3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000450476923 - (S,R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.160 |
| 5SP4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398572 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RWL 9-[(2-chloro-1,3-thiazol-4-yl)methyl]-9H-purine-2,6-diamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.178 |
| 5SP4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398572 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.178 |
| 5SP6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398580 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RXX 9-{[(2P)-2-(5-methylfuran-2-yl)-1,3-thiazol-4-yl]methyl}-9H-purine-2,6-diamine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.204 |
| 5SP6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398580 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.204 |
| 5SP7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010903509 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RVS (1S,2S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-1,2,3,4-tetrahydronaphthalene-2-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.152 |
| 5SP7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010903509 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.152 |
| 5SP8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894415 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RXI (6~{S})-7-[4-(cyclopropylcarbamoylamino)phenyl]carbonyl-3-methyl-6,8-dihydro-5~{H}-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazine-6-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.162 |
| 5SP8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894415 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.162 |
| 5SP9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3508769536 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.146 |
| 5SP9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3508769536 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RWC (3S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzoyl]-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.146 |
| 5SPA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894417 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RY6 (1S,2S)-1-(4-carbamamidobenzamido)-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 2 RYC (1R,2R)-1-(4-carbamamidobenzamido)-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.155 |
| 5SPA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894417 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.155 |
| 5SPB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894404 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S09 (1R,2R)-4-hydroxy-1-[4-(phenylcarbamamido)benzamido]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 S0T (1S,2S)-4-hydroxy-1-[4-(phenylcarbamamido)benzamido]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.165 |
| 5SPB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894404 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.165 |
| 5SPC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894387 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QLF (1S,2S)-4-hydroxy-1-[(5,6,7,8-tetrahydro-1,8-naphthyridine-3-carbonyl)amino]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 QLU (1R,2R)-4-hydroxy-1-[(5,6,7,8-tetrahydro-1,8-naphthyridine-3-carbonyl)amino]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.153 |
| 5SPC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894387 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.153 |
| 5SPD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398539 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QYJ (1S,2S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 2 QRU (1R,2R)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.162 |
| 5SPD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398539 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.162 |
| 5SPE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398531 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S1F (1S,2S)-1-{4-[(methoxycarbonyl)amino]benzamido}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.144 |
| 5SPE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398531 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.144 |
| 5SPF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398569 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RYQ 9-[(2-methyl-1,3-thiazol-4-yl)methyl]-9H-purine-2,6-diamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.160 |
| 5SPF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398569 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.160 |
| 5SPG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398585 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RZI 9-[(2-cyclopropyl-1,3-thiazol-4-yl)methyl]-9H-purine-2,6-diamine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.158 |
| 5SPG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398585 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.158 |
| 5SPH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398515 - (R,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RZR (1R,2S)-1-[4-(methylcarbamamido)benzamido]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.151 |
| 5SPH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398515 - (R,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.151 |
| 5SPI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4574659604 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S1X (1S,2S)-1-{4-[(cyclopropanecarbonyl)amino]benzamido}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 S2R (1R,2R)-1-{4-[(cyclopropanecarbonyl)amino]benzamido}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.145 |
| 5SPI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4574659604 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.145 |
| 5SPJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000893101964 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S3R 5-chloro-N~3~-[(4-cyclopropyl-5-methyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]pyrazine-2,3-diamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.146 |
| 5SPJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000893101964 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.146 |
| 5SPK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250003296134 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S4F 3-[(3R)-1-(6-amino-5-chloropyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.160 |
| 5SPK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250003296134 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.160 |
| 5SPL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000611664196 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RW5 [(2S,4S)-4-methyl-2-(5-methylfuran-2-yl)piperidin-1-yl](7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.144 |
| 5SPL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000611664196 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.144 |
| 5SPM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00002410346 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S4O 4-hydroxy-6-(3-hydroxy-1-methyl-1,4,5,7-tetrahydro-6H-pyrazolo[3,4-c]pyridine-6-carbonyl)-2H-pyran-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.146 |
| 5SPM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00002410346 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.146 |
| 5SPN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00010608284 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S50 1-cyclopentyl-3-methyl-N-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)-1H-pyrazole-5-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.155 |
| 5SPN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00010608284 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.155 |
| 5SPO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00020289192 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.152 |
| 5SPO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00020289192 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S5F 6-chloro-4-{(8S)-8-[(4H-1,2,4-triazol-4-yl)methyl]-6-azaspiro[3.4]octan-6-yl}pyrimidin-2(1H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.152 |
| 5SPP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250002155324 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S5U 4-[methyl(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]butanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SPP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250002155324 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SPQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00014134848 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S63 (3R)-1-[(4-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)acetyl]-3-methylpyrrolidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.164 |
| 5SPQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00014134848 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.164 |
| 5SPR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250002852032 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S6C [(3S)-1-(7H-purin-6-yl)piperidin-3-yl]acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.159 |
| 5SPR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250002852032 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.159 |
| 5SPS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00012962804 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S6N (3S)-6,6-dimethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)piperidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.167 |
| 5SPS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00012962804 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.167 |
| 5SPT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000850008207 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 S6U 2-(2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl)ethyl 7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5SPT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000850008207 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5SPU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001364774273 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S7F (3S)-1-(6-amino-5-methylpyridine-3-sulfonyl)piperidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.155 |
| 5SPU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001364774273 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.155 |
| 5SPV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250003774401 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S7O 2-[methyl-[(9-oxidanylidene-1$l^{4},7,8-triazabicyclo[4.3.0]nona-1(6),2,4-trien-3-yl)carbonyl]amino]ethanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.167 |
| 5SPV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250003774401 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.167 |
| 5SPW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00004674769 - (R,S,R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | S5O (1R,5S,6R)-3-(7H-purin-6-yl)-3-azabicyclo[3.2.2]nonane-6-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.152 |
| 5SPW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00004674769 - (R,S,R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.152 |
| 5SPX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250003958539 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QIW (5M)-5-(3-ethyl-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)-1,3-dimethyl-1H-pyrazole-4-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.159 |
| 5SPX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250003958539 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.159 |
| 5SPY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL300019621104 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QJ0 1-(5-bromo-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)-2-[(1H-tetrazol-5-yl)sulfanyl]ethan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.169 |
| 5SPY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL300019621104 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.169 |
| 5SPZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250001448407 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QJC (3S)-3-(fluoromethyl)-1-(6-oxo-1,6-dihydropyridazine-4-carbonyl)pyrrolidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.160 |
| 5SPZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250001448407 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.160 |
| 5SQ0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL300007260658 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QJG (2S,4S)-1-(6-fluoro-2-hydroxyquinoline-4-carbonyl)-4-methylazetidine-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SQ0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL300007260658 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SQ1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001601221314 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QJO 1-(2-aminopyrimidine-5-sulfonyl)-4,4-difluoro-L-proline × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.165 |
| 5SQ1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001601221314 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.165 |
| 5SQ2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2976440814 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QJU 7-fluoro-4-{(3R)-3-[(3-methyl-1,2,4-oxadiazol-5-yl)methyl]piperidin-1-yl}-9H-pyrimido[4,5-b]indole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.158 |
| 5SQ2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2976440814 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.158 |
| 5SQ3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5028367848 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QK6 [(2R)-4-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholin-2-yl]acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.152 |
| 5SQ3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5028367848 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.152 |
| 5SQ4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2364980062 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QKC 7-fluoro-4-[(3R)-3-(methanesulfonyl)piperidin-1-yl]-9H-pyrimido[4,5-b]indole × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.147 |
| 5SQ4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2364980062 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.147 |
| 5SQ5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894407 - (R,S) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QKL (1R,2S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 QKX (1S,2S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.155 |
| 5SQ5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894407 - (R,S) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.155 |
| 5SQ6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894406 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QL6 3-{[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]methyl}-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.170 |
| 5SQ6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894406 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.170 |
| 5SQ7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1445235880 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QM6 3-{[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]methyl}-1-benzofuran-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.199 |
| 5SQ7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1445235880 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.199 |
| 5SQ8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1445261766 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QMF 3-{[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]methyl}-1-benzothiophene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.184 |
| 5SQ8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1445261766 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.184 |
| 5SQ9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894420 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QMO (1R,2R)-4-hydroxy-1-{4-[(propan-2-yl)carbamamido]benzamido}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 QN0 (1S,2S)-4-hydroxy-1-{4-[(propan-2-yl)carbamamido]benzamido}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5SQ9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894420 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5SQA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894395 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QNF (1R,2R)-4-hydroxy-1-[(3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazine-7-carbonyl)amino]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 QNV (1S,2S)-4-hydroxy-1-[(3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazine-7-carbonyl)amino]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.158 |
| 5SQA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894395 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.158 |
| 5SQB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894390 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QO3 (1R,2R)-1-({6-[(cyclopropylmethyl)amino]pyridine-3-carbonyl}amino)-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 QOF (1S,2S)-1-({6-[(cyclopropylmethyl)amino]pyridine-3-carbonyl}amino)-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.138 |
| 5SQB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894390 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.138 |
| 5SQC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894388 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QOR (1R,2R)-4-hydroxy-1-({5-[(oxan-4-yl)amino]pyrazine-2-carbonyl}amino)-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 QP9 (1S,2S)-4-hydroxy-1-({5-[(oxan-4-yl)amino]pyrazine-2-carbonyl}amino)-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.152 |
| 5SQC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894388 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.152 |
| 5SQD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894382 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QPL (1R,2R)-4-hydroxy-1-{[2-(hydroxymethyl)-1H-benzimidazole-5-carbonyl]amino}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 QPX (1S,2S)-4-hydroxy-1-{[2-(hydroxymethyl)-1H-benzimidazole-5-carbonyl]amino}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SQD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894382 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SQE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894392- (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QR0 (1S,2S)-4-hydroxy-1-{4-[(1H-imidazol-1-yl)amino]benzamido}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.153 |
| 5SQE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894392- (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.153 |
| 5SQF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250000548538 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QQ9 (3R)-1-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-4-carbonyl)piperidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.153 |
| 5SQF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250000548538 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.153 |
| 5SQG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894430 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QQI (1R,2R)-1-{[6-(cyclopropylcarbamamido)pyridine-3-carbonyl]amino}-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 QQR (1S,2S)-1-{[6-(cyclopropylcarbamamido)pyridine-3-carbonyl]amino}-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.159 |
| 5SQG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894430 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.159 |
| 5SQH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894431- (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QR6 (1S,2S)-1-[2-chloro-4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.151 |
| 5SQH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894431- (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.151 |
| 5SQI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5016127255 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QRC (1S,2S)-4-hydroxy-1-[4-(methylcarbamamido)benzamido]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 2 QRI (1R,2R)-4-hydroxy-1-[4-(methylcarbamamido)benzamido]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.158 |
| 5SQI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5016127255 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.158 |
| 5SQJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5021668601 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 QRU (1R,2R)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.153 |
| 5SQJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5021668601 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.153 |
| 5SQK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2479782408 - (R,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QS6 (1R,3S)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclopentan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SQK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2479782408 - (R,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SQL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2689779890 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QSL 3-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}-1lambda~6~-thietane-1,1-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SQL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2689779890 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QSL 3-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}-1lambda~6~-thietane-1,1-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SQM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5028367849 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QT0 5-[(3R)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)piperidin-3-yl]-1,3,4-oxadiazol-2(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.157 |
| 5SQM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5028367849 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.157 |
| 5SQN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4914649780 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QT6 3-[(3S)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)piperidin-3-yl]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5SQN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4914649780 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5SQO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5030903496 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QTF (8R)-8-fluoro-6-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.162 |
| 5SQO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5030903496 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.162 |
| 5SQP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5028367859 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QTO (8S)-6-(6-anilinopyrimidin-4-yl)-8-fluoro-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.159 |
| 5SQP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5028367859 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.159 |
| 5SQQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00014649046 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QU3 4-(2-amino-7,8-dihydropyrido[4,3-d]pyrimidine-6(5H)-carbonyl)-N-methylfuran-2-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.146 |
| 5SQQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00014649046 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.146 |
| 5SQR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL300016493575 - (R,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QUC (2R,3S)-1-(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-3-sulfonyl)-2-methylpiperidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SQR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL300016493575 - (R,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SQS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001240411747 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QVC (4P)-4-[(4M)-4-(3-methyl-1,2,4-oxadiazol-5-yl)pyridin-2-yl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.150 |
| 5SQS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001240411747 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.150 |
| 5SQT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000833624464 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QUR (3R,4R)-4-methyl-1-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-benzoxazole-7-carbonyl)pyrrolidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.157 |
| 5SQT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000833624464 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QV1 (3S,4S)-4-methyl-1-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-benzoxazole-7-carbonyl)pyrrolidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.157 |
| 5SQU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250004627335 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 QVL N,3-dimethyl-N-(1H-tetrazol-5-yl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SQU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250004627335 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SQV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894399 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QVX (1S,2S)-4-hydroxy-1-{4-[(pyridin-3-yl)amino]benzamido}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5SQV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894399 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5SQW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5014193706 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QW3 (1R,2R)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)-2-hydroxybenzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 QWC (1S,2S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)-2-hydroxybenzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SQW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5014193706 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SQX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5183357278 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QWX (1R,2R)-1-[2-amino-4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 QX5 (1S,2S)-1-[2-amino-4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.174 |
| 5SQX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5183357278 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.174 |
| 5SQY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5211314110 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QWO (1S,2S)-1-{[4-(cyclopropylcarbamamido)-1,3-benzothiazole-7-carbonyl]amino}-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.158 |
| 5SQY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5211314110 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.158 |
| 5SQZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1039058598 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QXC N-[(pyridin-2-yl)methyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.154 |
| 5SQZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1039058598 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.154 |
| 5SR0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3649721459 - (R,S) and (S,R) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QXS (1S,2R)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclohexan-1-ol × 1 QY0 (1R,2S)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclohexan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.160 |
| 5SR0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3649721459 - (R,S) and (S,R) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.160 |
| 5SR1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1272415642 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QXL (3R)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-1lambda~6~-thiane-1,1-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SR1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1272415642 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QXL (3R)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-1lambda~6~-thiane-1,1-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SR2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with EN300-36602160 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QYC (1R,2S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.155 |
| 5SR2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with EN300-36602160 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.155 |
| 5SR3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5021669050 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QYJ (1S,2S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.154 |
| 5SR3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5021669050 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.154 |
| 5SR4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2479779298 - (R,S) and (S,R) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QYO (1S,3R)-3-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]cyclopentan-1-ol × 1 QYU (1R,3S)-3-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]cyclopentan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SR4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2479779298 - (R,S) and (S,R) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SR5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265454473 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QZ6 (2R)-2-{[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]methyl}-1lambda~6~-thietane-1,1-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.147 |
| 5SR5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265454473 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.147 |
| 5SR6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3011799020 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QZF (8R)-8-fluoro-6-(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.153 |
| 5SR6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3011799020 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.153 |
| 5SR7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4914649782 - (R,R,S) and (S,S,R) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QZO (1S,6R,7S)-3-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-3-azabicyclo[4.1.0]heptane-7-carboxylic acid × 1 QZX (1R,6S,7R)-3-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-3-azabicyclo[4.1.0]heptane-7-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.174 |
| 5SR7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4914649782 - (R,R,S) and (S,S,R) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.174 |
| 5SR8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4914650235 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | R0A [(6S)-8-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-5-oxa-8-azaspiro[3.5]nonan-6-yl]acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.171 |
| 5SR8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4914650235 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.171 |
| 5SR9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3562259556 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | R0H methyl (3R)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-3-(hydroxymethyl)pyrrolidine-3-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.153 |
| 5SR9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3562259556 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.153 |
| 5SRA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5372052920 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | R0L (2R)-4-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholine-2-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.157 |
| 5SRA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5372052920 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.157 |
| 5SRB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562532 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | R0R (8R)-8-fluoro-6-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-2-oxa-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1 R0W (8S)-8-fluoro-6-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-2-oxa-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.158 |
| 5SRB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562532 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.158 |
| 5SRC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562500 - (R,R) and (R,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QIO (2R)-[(3R)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)piperidin-3-yl](hydroxy)acetic acid × 1 QIR (2S)-[(3R)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)piperidin-3-yl](hydroxy)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.175 |
| 5SRC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562500 - (R,R) and (R,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.175 |
| 5SRD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5373433723 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | R8K (8S)-8-fluoro-6-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-N-(methanesulfonyl)-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.165 |
| 5SRD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5373433723 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.165 |
| 5SRE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562530 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | R8R (5R)-7-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-7-azaspiro[3.5]nonane-5-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.152 |
| 5SRE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562530 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.152 |
| 5SRF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4175156780 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | R8Z (3R)-3-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)(methyl)amino]-1lambda~6~-thiane-1,1-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SRF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4175156780 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.156 |
| 5SRG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265428403 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | R98 7-fluoro-N-methyl-N-[(pyridin-2-yl)methyl]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-amine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.151 |
| 5SRG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265428403 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.151 |
| 5SRH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265470867 - pyrimido-indole core only 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 R9F 7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5SRH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265470867 - pyrimido-indole core only 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5SRI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5278734565 - pyrimido-indole core only 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | R9F 7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.158 |
| 5SRI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5278734565 - pyrimido-indole core only 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.158 |
| 5SRJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265428226 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | R9L 3-{[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]methyl}-1lambda~6~-thietane-1,1-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SRJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265428226 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SRK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5373433775 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | R9U (2R)-4-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-N-(methanesulfonyl)morpholine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.146 |
| 5SRK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5373433775 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.146 |
| 5SRL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5352447655 - (R,R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RA3 [(2R,6R)-4-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-6-(hydroxymethyl)morpholin-2-yl]acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.148 |
| 5SRL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5352447655 - (R,R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.148 |
| 5SRM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3860662215 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RBB [(2R)-6,6-dimethyl-4-(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholin-2-yl]acetic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.151 |
| 5SRM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3860662215 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.151 |
| 5SRN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2466029596 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RBO [(2R)-4-(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholin-2-yl]acetic acid × 1 RC3 [(2S)-4-(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholin-2-yl]acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SRN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2466029596 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SRO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562509 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RCR (8R)-6-(7-bromo-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-8-fluoro-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1 RD6 (8S)-6-(7-bromo-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-8-fluoro-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.153 |
| 5SRO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562509 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.153 |
| 5SRP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5340019182 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RDN (8R)-6-(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1 TFA trifluoroacetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.150 |
| 5SRP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5340019182 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.150 |
| 5SRQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3831836449 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RDU [(6R)-8-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-5-oxa-8-azaspiro[3.5]nonan-6-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.147 |
| 5SRQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3831836449 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.147 |
| 5SRR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4158218973 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RF0 [(2S,6S)-4-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-6-methoxymorpholin-2-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SRR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4158218973 - (S,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.149 |
| 5SRS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2614735107 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RFI 3-[(3S)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)pyrrolidin-3-yl]-1,3-oxazolidin-2-one × 1 RFU 3-[(3R)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)pyrrolidin-3-yl]-1,3-oxazolidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.143 |
| 5SRS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2614735107 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.143 |
| 5SRT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562791 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RG5 7-fluoro-4-[(2R)-2-(1H-tetrazol-5-yl)morpholin-4-yl]-9H-pyrimido[4,5-b]indole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.167 |
| 5SRT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562791 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.167 |
| 5SRU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562523 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RGF (8S)-6-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.168 |
| 5SRU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562523 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.168 |
| 5SRV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562533 - (R,R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RI3 (3R,4R)-4-cyclopropyl-3-fluoro-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)pyrrolidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.165 |
| 5SRV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562533 - (R,R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.165 |
| 5SRW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2364914118 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RI7 methyl [(2S)-4-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholin-2-yl]acetate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.146 |
| 5SRW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2364914118 - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.146 |
| 5SRX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562503 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RIK 3-[(2R)-4-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholin-2-yl]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.151 |
| 5SRX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562503 - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.151 |
| 5SRY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265428218 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RIW 1-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]pyrrolidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.150 |
| 5SRY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265428218 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.150 |
| 5SRZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5281440906 - (R,S) and (S,R) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RIZ (1R,2S)-2-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]cyclohexane-1-carboxylic acid × 1 RJ9 (1S,2R)-2-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]cyclohexane-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5SRZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5281440906 - (R,S) and (S,R) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.161 |
| 5SS0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCn9000000uj1v 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RJL 3-hydroxy-N-{2-[(5-methoxypyridine-3-carbonyl)amino]ethyl}pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.151 |
| 5SS0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCn9000000uj1v 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.151 |
| 5SS1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCou000000a2Hm 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RJS (8S)-N-[(4-bromo-3-fluorophenyl)methanesulfonyl]pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.187 |
| 5SS1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCou000000a2Hm 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.187 |
| 5SS2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCnt000006kx7L 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RK0 N-{5-[(3-cyano-4-methylphenyl)sulfamoyl]-4-methyl-1,3-thiazol-2-yl}acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.160 |
| 5SS2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCnt000006kx7L 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.160 |
| 5SS3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCnu000001eLaQ 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RK9 N-{5-[(3-cyanophenyl)sulfamoyl]-4-methyl-1,3-thiazol-2-yl}propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.180 |
| 5SS3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCnu000001eLaQ 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.180 |
| 5SS4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCns000000RJoU 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RKI (3-{[(thieno[3,2-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]methyl}phenyl)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.159 |
| 5SS4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCns000000RJoU 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.159 |
| 5SS5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCpE000000mAwk - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RKU (3S)-3-(4-bromophenyl)-3-[(6-fluoro-1H-benzimidazole-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.161 |
| 5SS5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCpE000000mAwk - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.161 |
| 5SS6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINClf00000cdzal 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RL5 1-(2-{[2-(ethylamino)-1,3-thiazole-5-carbonyl]amino}ethyl)-1H-imidazole-4-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.158 |
| 5SS6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINClf00000cdzal 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.158 |
| 5SS7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCnz000004Qo8S 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.146 |
| 5SS7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCnz000004Qo8S 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RL9 4-fluoro-3-{[(1H-indole-5-carbonyl)amino]methyl}benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.146 |
| 5SS8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCny000002NPIr 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RLN (4-{[(thieno[3,2-b]pyridine-7-carbonyl)amino]methyl}phenyl)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.150 |
| 5SS8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCny000002NPIr 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.150 |
| 5SS9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCow000000AiWv - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RLU (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.167 |
| 5SS9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCow000000AiWv - (R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.167 |
| 5SSA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINClv000001jcNa - (r,r) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RM6 [(1r,3r)-3-{[(thieno[2,3-c]pyridine-5-carbonyl)amino]methyl}cyclobutyl]acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.172 |
| 5SSA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINClv000001jcNa - (r,r) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.172 |
| 5SSB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCmk000007RhkC 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RMU 4-[(6-chloro-5-cyanopyridin-3-yl)sulfamoyl]-5-methylfuran-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.157 |
| 5SSB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCmk000007RhkC 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.157 |
| 5SSC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCk500000doQ8X 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RNC [3-(5-hydroxy-1,2,4-oxadiazol-3-yl)azetidin-1-yl][5-(methylamino)pyrazin-2-yl]methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.167 |
| 5SSC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCk500000doQ8X 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.167 |
| 5SSD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCm4000007vvRA - (R,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RNL (1R,2S)-2-({2-[(4S)-7-methyl-8-oxo-7,8-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazin-3-yl]ethyl}carbamoyl)cyclopropane-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.158 |
| 5SSD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCm4000007vvRA - (R,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.158 |
| 5SSE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCoD000001aHBe 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | ROO 2-methyl-5-{[(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]methyl}furan-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.149 |
| 5SSE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCoD000001aHBe 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.149 |
| 5SSF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCmr000000sTGN 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RP0 4-[(4-bromo-3-cyanophenyl)sulfamoyl]-5-methylfuran-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.165 |
| 5SSF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCmr000000sTGN 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.165 |
| 5SSG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCpv000006Li5M - (R,R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RPU (3R)-3-(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)-3-[(2R)-3-(furan-2-yl)-2-methylpropanamido]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.163 |
| 5SSG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCpv000006Li5M - (R,R) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.163 |
| 5SSH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCpx000006Mh4L - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RQ8 3-(5-bromopyridin-3-yl)-N-[5-(1,1-difluoroethyl)pyridine-3-carbonyl]-L-alanine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.149 |
| 5SSH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCpx000006Mh4L - (S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.149 |
| 5SSI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCn500000bifGU 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RQC (3R)-1-[3-(1-methyl-4-oxo-4,5-dihydro-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-yl)propanoyl]pyrrolidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.152 |
| 5SSI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCn500000bifGU 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.152 |
| 5SSJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCno00000broQT 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RQI 2-{2-[(6-fluoro-1H-benzimidazole-5-carbonyl)amino]ethyl}-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.146 |
| 5SSJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCno00000broQT 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.146 |
| 5SSK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCkk00000cjQyM - (R,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RQR (1S,4R)-4-[(thieno[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]cyclopent-2-ene-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.145 |
| 5SSK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCkk00000cjQyM - (R,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.145 |
| 5SSL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCoj00000doMWF 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RR3 1-[4-(cyanomethyl)phenyl]-N-(1-methyl-1H-pyrazolo[4,3-d]pyrimidin-7-yl)methanesulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.163 |
| 5SSL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCoj00000doMWF 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.163 |
| 5SSM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166256 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RRF (1R,2R)-1-[(1H-benzimidazole-5-carbonyl)amino]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 RS0 (1S,2S)-1-[(1H-benzimidazole-5-carbonyl)amino]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.156 |
| 5SSM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166256 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.156 |
| 5SSN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894382 - (R,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RS9 (1R,2S)-4-hydroxy-1-{[2-(hydroxymethyl)-1H-benzimidazole-5-carbonyl]amino}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.152 |
| 5SSN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894382 - (R,S) isomer 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.152 |
| 5SSO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562519 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RSR (8R)-6-(2-amino-7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-8-fluoro-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1 RT5 (8S)-6-(2-amino-7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-8-fluoro-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.157 |
| 5SSO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562519 - (R) and (S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.157 |
| 5SSP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166285 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RTI (1S,2S)-4-hydroxy-1-[(1H-indole-5-carbonyl)amino]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 RTU (1R,2R)-4-hydroxy-1-[(1H-indole-5-carbonyl)amino]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.149 |
| 5SSP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166285 - (R,R) and (S,S) isomers 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.149 |
| 5SSQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166291 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RV3 3-{[(1H-benzimidazole-5-carbonyl)amino]methyl}-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.150 |
| 5SSQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166291 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.150 |
| 5SSR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166300 提交 2022-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | RVF 3-{[(2-hydroxy-1H-benzimidazole-5-carbonyl)amino]methyl}-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.147 |
| 5SSR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166300 提交 2022-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.147 |
| 6LU7 The crystal structure of COVID-19 main protease in complex with an inhibitor N3 提交 2020-01-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：3C-like proteinase
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；293 K；2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.235 |
| 6LZE The crystal structure of COVID-19 main protease in complex with an inhibitor 11a 提交 2020-02-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3566（303 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；293 K；2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.199 |
| 6M03 The crystal structure of COVID-19 main protease in apo form 提交 2020-02-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.1；293 K；10% polyethylene glycol (PEG) 3000, 0.2M LiSO4, 1mM DTT, 0.1M imidazole buffer (pH 8.1), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 6M0K The crystal structure of COVID-19 main protease in complex with an inhibitor 11b 提交 2020-02-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 FJC ~{N}-[(2~{S})-3-(3-fluorophenyl)-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；293 K；2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.193 |
| 6M2N SARS-CoV-2 3CL protease (3CL pro) in complex with a novel inhibitor 提交 2020-02-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 3WL 5,6,7-trihydroxy-2-phenyl-4H-chromen-4-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM MES, pH5.8, 2% PEG6000, 3% DMSO, 1mM DTT
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.254 |
| 6M2N SARS-CoV-2 3CL protease (3CL pro) in complex with a novel inhibitor 提交 2020-02-28 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 3WL 5,6,7-trihydroxy-2-phenyl-4H-chromen-4-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM MES, pH5.8, 2% PEG6000, 3% DMSO, 1mM DTT
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.254 |
| 6M2Q SARS-CoV-2 3CL protease (3CL pro) apo structure (space group C21) 提交 2020-02-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100mM MES, pH5.8, 10% PEG6000, 3% DMSO, 1mM DTT
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.204 |
| 6M71 SARS-Cov-2 RNA-dependent RNA polymerase in complex with cofactors 提交 2020-03-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；Solutions were made fresh from concentrated to avoid microbial contamination.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging.
|
分辨率 2.90 Å |
| 6VWW Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2. 提交 2020-02-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 27 MG MAGNESIUM ION × 3 ACY ACETIC ACID × 9 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.2 M Calcium Acetate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 10 %(w/v) PEG8000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.178 |
| 6VXS Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS CoV-2 提交 2020-02-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；289 K；0.1 M CHES pH 9.5, 30 %(w/v) PEG3000
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.234 |
| 6VXS Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS CoV-2 提交 2020-02-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；289 K；0.1 M CHES pH 9.5, 30 %(w/v) PEG3000
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.234 |
| 6W01 The 1.9 A Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 in the Complex with a Citrate 提交 2020-02-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 66 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9 CIT CITRIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；289 K；0.1 M sodium citrate pH 5.6, 10 %(w/v) PEG4000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.185 |
| 6W02 Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS CoV-2 in the complex with ADP ribose 提交 2020-02-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.01 M sodium citrate, 33 %(w/v) PEG6000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.173 |
| 6W02 Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS CoV-2 in the complex with ADP ribose 提交 2020-02-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.01 M sodium citrate, 33 %(w/v) PEG6000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.173 |
| 6W4B The crystal structure of Nsp9 RNA binding protein of SARS CoV-2 提交 2020-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4141–4253（113 aa）
链 B
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；289 K；1.8 M di-Ammonium hydrogen citrate,
0.1 M Sodium acetate
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.276 |
| 6W4H 1.80 Angstrom Resolution Crystal Structure of NSP16 - NSP10 Complex from SARS-CoV-2 提交 2020-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
片段：UNP residues 6799-7096
链 B
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
|
未记录 | SO3 SULFITE ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ACT ACETATE ION × 2 BDF beta-D-fructopyranose × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；5.3 mg/mL 1:1 nsp16/nsp10 in 0.15 M sodium chloride, 0.01 M Tris, pH 7.5, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% glycerol against ComPAS screen A7 (0.2 M calcium acetate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 18% w/v PEG 8000), cryoprotectant: 1:1 screen + 50% sucrose
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.163 |
| 6W61 Crystal Structure of the methyltransferase-stimulatory factor complex of NSP16 and NSP10 from SARS CoV-2. 提交 2020-03-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；289 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.6, 10 5(w/v) PEG4000, 10 %(w/v) isopropanol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.193 |
| 6W63 Structure of COVID-19 main protease bound to potent broad-spectrum non-covalent inhibitor X77 提交 2020-03-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；3 mM DTT, 1% MPD, 80mM KCl, 50 mM MES pH 6.0, 16% PEG 10k
2uL protein ( 125 uM 3CLpro, 25 mM HEPES pH 7.5, 2.5 mM DTT, 1% DMSO, 400 uM 077) + 1 uL reservoir
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.221 |
| 6W6Y Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS CoV-2 in complex with AMP 提交 2020-03-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：ADP ribose phosphatase (ADRP) domain (UNP residues 1024-1192)
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；0.1 M MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.189 |
| 6W6Y Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS CoV-2 in complex with AMP 提交 2020-03-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
片段：ADP ribose phosphatase (ADRP) domain (UNP residues 1024-1192)
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；0.1 M MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.189 |
| 6W75 1.95 Angstrom Resolution Crystal Structure of NSP10 - NSP16 Complex from SARS-CoV-2 提交 2020-03-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
片段：UNP residues 6799-7096
链 B
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 FMT FORMIC ACID × 9 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；292 K；9.7 mg/mL 1:1 nsp10/nsp16 in 0.5 M sodium chloride, 0.01 M Tris, pH 7.5, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% glycerol against ComPAS screen F10 (0.4 M potassium/sodium tartrate), cryoprotectant: 4 M sodium formate
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.174 |
| 6W75 1.95 Angstrom Resolution Crystal Structure of NSP10 - NSP16 Complex from SARS-CoV-2 提交 2020-03-18 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
6799–7096（298 aa）
片段：UNP residues 6799-7096
链 D
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
|
未记录 | NA SODIUM ION × 5 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 FMT FORMIC ACID × 11 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；292 K；9.7 mg/mL 1:1 nsp10/nsp16 in 0.5 M sodium chloride, 0.01 M Tris, pH 7.5, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% glycerol against ComPAS screen F10 (0.4 M potassium/sodium tartrate), cryoprotectant: 4 M sodium formate
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.174 |
| 6W9Q Peptide-bound SARS-CoV-2 Nsp9 RNA-replicase 提交 2020-03-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；2.2M AmSO4, 0.1M Citrate-phosphate pH4
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.246 |
| 6WCF Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS-CoV-2 in complex with MES 提交 2020-03-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；0.1 M MES, PH 6.5, 30% W/V PEG4000
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.154 |
| 6WEN Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS-CoV-2 in the apo form 提交 2020-04-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；289 K；34.3% PEG 5000 MME, 150 mM AMPD/Tris, pH 9.0, 30 mM K/NA tartrate
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.144 |
| 6WEY High-resolution structure of the SARS-CoV-2 NSP3 Macro X domain 提交 2020-04-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1195（171 aa）
片段：Macro X domain (residues 207-377)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；Morpheus Screen D9 (0.12M Alcohols, 0.1M buffer system 3, pH 8.5, 30% PPT mix 1 [40% PEG 500 MME/20% PEG 20K])
|
分辨率 0.95 Å R-free 0.136 |
| 6WIQ Crystal structure of the co-factor complex of NSP7 and the C-terminal domain of NSP8 from SARS CoV-2 提交 2020-04-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 B
4019–4140（122 aa）
片段：C-terminal domain (UNP residues 4019-4140)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 1.5 M ammonium phosphate dibasic
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.252 |
| 6WJT 2.0 Angstrom Resolution Crystal Structure of Nsp16-Nsp10 Heterodimer from SARS-CoV-2 in Complex with S-Adenosyl-L-Homocysteine 提交 2020-04-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 FMT FORMIC ACID × 8 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: ComPAS (F10), 0.4M Potassium/Sodium tartrate;
Soak and Cryo: 5mM SAH, 4M Sodium formate, 3 hrs.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.191 |
| 6WJT 2.0 Angstrom Resolution Crystal Structure of Nsp16-Nsp10 Heterodimer from SARS-CoV-2 in Complex with S-Adenosyl-L-Homocysteine 提交 2020-04-14 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
6799–7096（298 aa）
链 D
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 FMT FORMIC ACID × 5 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: ComPAS (F10), 0.4M Potassium/Sodium tartrate;
Soak and Cryo: 5mM SAH, 4M Sodium formate, 3 hrs.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.191 |
| 6WKQ 1.98 Angstrom Resolution Crystal Structure of NSP16-NSP10 Heterodimer from SARS-CoV-2 in Complex with Sinefungin 提交 2020-04-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
片段：UNP residues 6799-7096
链 B
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 SFG SINEFUNGIN × 1 FMT FORMIC ACID × 6 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；5.3 mg/mL 1:1 nsp10/nsp16 in 0.15 M sodium chloride, 0.01 M Tris, pH 7.5, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% glycerol against ComPAS screen F10 (0.4 M potassium/sodium tartrate), soak and cryoprotection: 5 mM SFG, 4 M sodium formate, 3 hrs
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.180 |
| 6WKQ 1.98 Angstrom Resolution Crystal Structure of NSP16-NSP10 Heterodimer from SARS-CoV-2 in Complex with Sinefungin 提交 2020-04-16 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
6799–7096（298 aa）
片段：UNP residues 6799-7096
链 D
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 SFG SINEFUNGIN × 1 FMT FORMIC ACID × 9 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；5.3 mg/mL 1:1 nsp10/nsp16 in 0.15 M sodium chloride, 0.01 M Tris, pH 7.5, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% glycerol against ComPAS screen F10 (0.4 M potassium/sodium tartrate), soak and cryoprotection: 5 mM SFG, 4 M sodium formate, 3 hrs
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.180 |
| 6WKS Structure of SARS-CoV-2 nsp16/nsp10 in complex with RNA cap analogue (m7GpppA) and S-adenosylmethionine 提交 2020-04-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
6799–7096（298 aa）
链 BBB
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ADN ADENOSINE × 1 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；10% (v/v) MPD, 0.1M HEPES pH 7.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.188 |
| 6WLC Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 in the Complex with Uridine-5'-Monophosphate 提交 2020-04-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 6 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 30 ACT ACETATE ION × 12 SO4 SULFATE ION × 3 FMT FORMIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；16 %(w/v) PEG400, 100 mM Tris pH 8.5, 200 mM sodium acetate
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.195 |
| 6WNP X-ray Structure of SARS-CoV-2 main protease bound to Boceprevir at 1.45 A 提交 2020-04-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | U5G boceprevir (bound form) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；2.67 mM DTT, 0.33% MPD, 16.7 mM MES pH 6.0, 26.7 mM KCl, 5% PEG-10,000, 16.7 mM HEPES pH 7.5, 0.67% DMSO and 200 uM Boceprevir
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.196 |
| 6WOJ Structure of the SARS-CoV-2 macrodomain (NSP3) in complex with ADP-ribose 提交 2020-04-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1023–1197（175 aa）
片段：UNP Residues 1023-1197
|
未记录 | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；291 K；1.8 M NaH2PO4/K2HPO4, 0.1 M NDSB-256
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.252 |
| 6WOJ Structure of the SARS-CoV-2 macrodomain (NSP3) in complex with ADP-ribose 提交 2020-04-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1023–1197（175 aa）
片段：UNP Residues 1023-1197
|
未记录 | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；291 K；1.8 M NaH2PO4/K2HPO4, 0.1 M NDSB-256
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.252 |
| 6WOJ Structure of the SARS-CoV-2 macrodomain (NSP3) in complex with ADP-ribose 提交 2020-04-24 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1023–1197（175 aa）
片段：UNP Residues 1023-1197
|
未记录 | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；291 K；1.8 M NaH2PO4/K2HPO4, 0.1 M NDSB-256
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.252 |
| 6WOJ Structure of the SARS-CoV-2 macrodomain (NSP3) in complex with ADP-ribose 提交 2020-04-24 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1023–1197（175 aa）
片段：UNP Residues 1023-1197
|
未记录 | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；291 K；1.8 M NaH2PO4/K2HPO4, 0.1 M NDSB-256
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.252 |
| 6WQ3 Crystal Structure of Nsp16-Nsp10 Heterodimer from SARS-CoV-2 in Complex with 7-methyl-GpppA and S-adenosyl-L-homocysteine. 提交 2020-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 M7G 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 8 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: Anions (A10), 0.1M MES pH 6.5, 0.6M tri-Sodium citrate;
Soak and Cryo: 1mM SAH, 0.5mM GpppA, 2M Lithium sulfate.
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.186 |
| 6WQD The 1.95 A Crystal Structure of the Co-factor Complex of NSP7 and the C-terminal Domain of NSP8 from SARS-CoV-2 提交 2020-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 B
4019–4140（122 aa）
片段：C-terminal domain (UNP residues 4019-4140)
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
4019–4140（122 aa）
片段：C-terminal domain (UNP residues 4019-4140)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Tris, pH 8.5, 20% w/v PEG8000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.229 |
| 6WQF Structural Plasticity of the SARS-CoV-2 3CL Mpro Active Site Cavity Revealed by Room Temperature X-ray Crystallography 提交 2020-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；BIS-TRIS pH=6.5, 20% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.230 |
| 6WRH The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2 , C111S mutant 提交 2020-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；277 K；0.1 M Acetate buffer, 0.8 M NaH2PO4 / 1.2 M K2HPO4
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.164 |
| 6WRZ Crystal Structure of Nsp16-Nsp10 Heterodimer from SARS-CoV-2 with 7-methyl-GpppA and S-adenosyl-L-homocysteine in the Active Site and Sulfates in the mRNA Binding Groove. 提交 2020-04-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 10 CL CHLORIDE ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: Anions (F3), 0.1M HEPES pH 7.5, 0.9M Sodium phosphate, 0.9M Potassium phosphate;
Soak and Cryo: 1mM SAH, 0.5mM GpppA, 2M Lithium sulfate.
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.190 |
| 6WTC Crystal Structure of the Second Form of the Co-factor Complex of NSP7 and the C-terminal Domain of NSP8 from SARS CoV-2 提交 2020-05-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 B
4019–4140（122 aa）
片段：C-terminal domain (UNP residues 4019-4140)
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
4019–4140（122 aa）
片段：C-terminal domain (UNP residues 4019-4140)
|
未记录 | ACY ACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 25% w/v PEG3350
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.214 |
| 6WTJ Feline coronavirus drug inhibits the main protease of SARS-CoV-2 and blocks virus replication 提交 2020-05-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；295 K；0.2 M Sodium chloride 0.1 M HEPES pH 7.0 20 % w/v PEG 6000.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.235 |
| 6WTK Feline coronavirus drug inhibits the main protease of SARS-CoV-2 and blocks virus replication 提交 2020-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.2 M Sodium chloride 0.1 M HEPES pH 7.0 20 % w/v PEG 6000.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.255 |
| 6WTM Feline coronavirus drug inhibits the main protease of SARS-CoV-2 and blocks virus replication 提交 2020-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；0.2 M Sodium sulfate, 0.1 M Bis-Tris propane pH 6.5, 20 % w/v PEG 3350.
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.252 |
| 6WTT Crystals Structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease with inhibitor GC-376 提交 2020-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
|
未记录 | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；15 % PEG 2k, 10 % 1,6-HexD, 0.2 M NaCl
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.300 |
| 6WTT Crystals Structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease with inhibitor GC-376 提交 2020-05-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3567（304 aa）
链 C
3264–3567（304 aa）
|
未记录 | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 B1S (1R,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；15 % PEG 2k, 10 % 1,6-HexD, 0.2 M NaCl
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.300 |
| 6WUU Crystal structure of the SARS CoV-2 Papain-like protease in complex with peptide inhibitor VIR250 提交 2020-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1563–1879（317 aa）
片段：UNP Residues 1563-1879
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.230 |
| 6WUU Crystal structure of the SARS CoV-2 Papain-like protease in complex with peptide inhibitor VIR250 提交 2020-05-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1563–1879（317 aa）
片段：UNP Residues 1563-1879
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.230 |
| 6WUU Crystal structure of the SARS CoV-2 Papain-like protease in complex with peptide inhibitor VIR250 提交 2020-05-05 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1563–1879（317 aa）
片段：UNP Residues 1563-1879
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.230 |
| 6WUU Crystal structure of the SARS CoV-2 Papain-like protease in complex with peptide inhibitor VIR250 提交 2020-05-05 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1563–1879（317 aa）
片段：UNP Residues 1563-1879
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.230 |
| 6WVN Crystal Structure of Nsp16-Nsp10 from SARS-CoV-2 in Complex with 7-methyl-GpppA and S-Adenosylmethionine. 提交 2020-05-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 14 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADE ADENINE × 2 SO4 SULFATE ION × 10 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: Anions (F3), 0.1M HEPES pH 7.5, 0.9M Sodium phosphate, 0.9M Potassium phosphate;
Soak and Cryo: 5mM SAM, 0.5mM GpppA, 2M Lithium sulfate.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.178 |
| 6WX4 Crystal structure of the SARS CoV-2 Papain-like protease in complex with peptide inhibitor VIR251 提交 2020-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1563–1879（317 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.8 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Tris HCl pH 8.5 and 0.5% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 5,000
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.196 |
| 6WXC Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 in the Complex with potential repurposing drug Tipiracil 提交 2020-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CMU 5-CHLORO-6-(1-(2-IMINOPYRROLIDINYL) METHYL) URACIL × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 27 FMT FORMIC ACID × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；289 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M sodium/potassium phosphate pH 6.2 10 %(w/v) PEG8000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.194 |
| 6WXD SARS-CoV-2 Nsp9 RNA-replicase 提交 2020-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4141–4253（113 aa）
链 B
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；2.2M Ammonium Sulfate, 0.1M phosphate-citrate buffer pH 4
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 6WZU The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2 , P3221 space group 提交 2020-05-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；0.1 M acetate buffer, 0.8 NaH2PO4/1.2 M K2HPO4, seeds from PLprotease C111S mutant crystals
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.174 |
| 6X1B Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 in the Complex with the Product Nucleotide GpU. 提交 2020-05-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；289 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M sodium/potassium phosphate pH 6.2 10 %(w/v) PEG8000
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.185 |
| 6X4I Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 in the Complex with 3'-uridinemonophosphate 提交 2020-05-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | U3P 3'-URIDINEMONOPHOSPHATE × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 60 NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；289 K；0.2M Sodium Chloride, 0.1M Sodium Potassium phosphate, 10% PEG8000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.189 |
| 6XA4 Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with UAW241 提交 2020-06-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.239 |
| 6XA9 SARS CoV-2 PLpro in complex with ISG15 C-terminal domain propargylamide 提交 2020-06-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1563–1878（316 aa）
片段：UNP residues 1563-1878
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M lithium sulfate, 25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.5
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.231 |
| 6XA9 SARS CoV-2 PLpro in complex with ISG15 C-terminal domain propargylamide 提交 2020-06-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1563–1878（316 aa）
片段：UNP residues 1563-1878
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M lithium sulfate, 25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.5
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.231 |
| 6XA9 SARS CoV-2 PLpro in complex with ISG15 C-terminal domain propargylamide 提交 2020-06-04 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1563–1878（316 aa）
片段：UNP residues 1563-1878
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M lithium sulfate, 25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.5
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.231 |
| 6XAA SARS CoV-2 PLpro in complex with ubiquitin propargylamide 提交 2020-06-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1563–1878（316 aa）
片段：UNP residues 1563-1878
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；30% PEG4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris chloride, pH 8.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.260 |
| 6XB0 Room temperature X-ray crystallography reveals catalytic cysteine in the SARS-CoV-2 3CL Mpro is highly reactive: Insights for enzyme mechanism and drug design 提交 2020-06-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；BIS-TRIS pH=6.5, 20% PEG3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.201 |
| 6XB1 Room temperature X-ray crystallography reveals catalytic cysteine in the SARS-CoV-2 3CL Mpro is highly reactive: Insights for enzyme mechanism and drug design 提交 2020-06-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NEN 1-ETHYL-PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；BIS-TRIS pH=6.5, 20% PEG3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.202 |
| 6XB2 Room temperature X-ray crystallography reveals catalytic cysteine in the SARS-CoV-2 3CL Mpro is highly reactive: Insights for enzyme mechanism and drug design 提交 2020-06-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | NEN 1-ETHYL-PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；BIS-TRIS pH=6.5, 20% PEG3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.257 |
| 6XBG Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor UAW246 提交 2020-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.206 |
| 6XBH Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor UAW247 提交 2020-06-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.221 |
| 6XBI Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor UAW248 提交 2020-06-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.217 |
| 6XCH Room-temperature X-ray Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Leupeptin 提交 2020-06-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；BIS-TRIS pH=6.5, 20% PEG3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.237 |
| 6XDH Crystal Structure of NendoU (Uridylate-specific endoribonuclease, nsp15) from Betacoronavirus SARS-CoV-2 提交 2020-06-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
片段：BewuA.18928.a.MX151
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 3 CIT CITRIC ACID × 3 FMT FORMIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；BewuA.18928.a.MX151.PW38806 at 36 mg/ml mixed 1:1 with Morpheus(G3): 10% (w/v) PEG 4000, 20% (v/v) glycerol, 0.1 M MES/imidazole, pH=6.5, 0.02 M of each sodium formate, ammonium acetate, trisodium citrate, sodium potassium l-tartrate, sodium oxamate. Tray: 315968g8, puck: teq6-3.
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.182 |
| 6XDH Crystal Structure of NendoU (Uridylate-specific endoribonuclease, nsp15) from Betacoronavirus SARS-CoV-2 提交 2020-06-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
6453–6798（346 aa）
片段：BewuA.18928.a.MX151
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 6 CIT CITRIC ACID × 3 FMT FORMIC ACID × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；BewuA.18928.a.MX151.PW38806 at 36 mg/ml mixed 1:1 with Morpheus(G3): 10% (w/v) PEG 4000, 20% (v/v) glycerol, 0.1 M MES/imidazole, pH=6.5, 0.02 M of each sodium formate, ammonium acetate, trisodium citrate, sodium potassium l-tartrate, sodium oxamate. Tray: 315968g8, puck: teq6-3.
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.182 |
| 6XEZ Structure of SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-RTC 提交 2020-06-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 1N7 CHAPSO × 3 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6XFN Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with UAW243 提交 2020-06-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.228 |
| 6XG3 The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2 , C111S mutant, at room temperature 提交 2020-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；0.1 M acetate buffer, 0.8 NaH2PO4/1.2 M K2HPO4
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.193 |
| 6XG3 The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2 , C111S mutant, at room temperature 提交 2020-06-16 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；0.1 M acetate buffer, 0.8 NaH2PO4/1.2 M K2HPO4
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.193 |
| 6XHM Covalent complex of SARS-CoV-2 main protease with N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide 提交 2020-06-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；294 K；Precipitant: 25.0 %w/v (25.0 uL of stock 50.0 %w/v) PEG 1500, Buffer: 0.1 M (5.0 uL of stock 1.0 M) MMT (pH 4.00)
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.210 |
| 6XHU Room temperature X-ray crystallography reveals oxidation and reactivity of cysteine residues in SARS-CoV-2 3CL Mpro: Insights for enzyme mechanism and drug design 提交 2020-06-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；18% PEG 3350, 0.1 M BisTris pH 6.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.246 |
| 6XIP The 1.5 A Crystal Structure of the Co-factor Complex of NSP7 and the C-terminal Domain of NSP8 from SARS CoV-2 提交 2020-06-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3860–3942（83 aa）
链 B
4019–4140（122 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
4019–4140（122 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.199 |
| 6XKF The crystal structure of 3CL MainPro of SARS-CoV-2 with oxidized Cys145 (Sulfenic acid cysteine). 提交 2020-06-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；0.15M ammonium sulfate,0.1M Tris,15% PEG4000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 6XKH THE 1.28A CRYSTAL STRUCTURE OF 3CL MAINPRO OF SARS-COV-2 WITH OXIDIZED C145 (sulfinic acid cysteine) 提交 2020-06-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 FMT FORMIC ACID × 8 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；0.1 M Tris,
15% (w/v) PEG6000
|
分辨率 1.28 Å R-free 0.175 |
| 6XKM Room Temperature Structure of SARS-CoV-2 NSP10/NSP16 Methyltransferase in a Complex with SAM Determined by Fixed-Target Serial Crystallography 提交 2020-06-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 6.5；295 K；Protein: 4.0 mg/ml (NSP10/NSP16 1:1), 0.15 M NaCl, 0.01 M Tris-HCl, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, pH 7.5.
Precipitation buffer: 0.1 M MES pH 6.5, 0.9 M NaF. Batch crystallization: 100 ul of protein mixed with 100 ul of precipitation buffer in 500 ul polypropylene tube.
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.213 |
| 6XMK 1.70 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 7j 提交 2020-06-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
链 B
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | QYS (1S,2S)-2-[(N-{[(4,4-difluorocyclohexyl)methoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；20% (w/v) PEG 6000, 100 mM Tris, 200 mM NaCl
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.212 |
| 6XOA The crystal structure of 3CL MainPro of SARS-CoV-2 with C145S mutation 提交 2020-07-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145S 突变：C145S | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.02 M sodium/potassium phosphate,
20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.251 |
| 6XOA The crystal structure of 3CL MainPro of SARS-CoV-2 with C145S mutation 提交 2020-07-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145S 突变：C145S | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.02 M sodium/potassium phosphate,
20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.251 |
| 6XQB SARS-CoV-2 RdRp/RNA complex 提交 2020-07-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6XQS Room-temperature X-ray Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Telaprevir 提交 2020-07-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | SV6 (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287.15 K；18-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.204 |
| 6XQT Room-temperature X-ray Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Narlaprevir 提交 2020-07-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | NNA (1R,2S,5S)-3-[N-({1-[(tert-butylsulfonyl)methyl]cyclohexyl}carbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(1S)-1-[(1R)-2-(cyclopropylamino)-1-hydroxy-2-oxoethyl]pentyl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287.15 K；18-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 6XQU Room-temperature X-ray Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Boceprevir 提交 2020-07-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | U5G boceprevir (bound form) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287.15 K；18-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.234 |
| 6XR3 X-ray Structure of SARS-CoV-2 main protease bound to GRL-024-20 at 1.45 A 提交 2020-07-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | V7G N-[(2S)-1-({(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.7 mM DTT, 0.7% MPD, 33 mM MES pH 6.0, 80 mM KCl, 15% PEG 10,000, 17 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.187 |
| 6Y2E Crystal structure of the free enzyme of the SARS-CoV-2 (2019-nCoV) main protease 提交 2020-02-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M MMT (DL-malic acid, MES and Tris base in the molar ratios 1:2:2), pH 7.0, 25% PEG 1,500
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.222 |
| 6Y2F Crystal structure (monoclinic form) of the complex resulting from the reaction between SARS-CoV-2 (2019-nCoV) main protease and tert-butyl (1-((S)-1-(((S)-4-(benzylamino)-3,4-dioxo-1-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)butan-2-yl)amino)-3-cyclopropyl-1-oxopropan-2-yl)-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)carbamate (alpha-ketoamide 13b) 提交 2020-02-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 O6K ~{tert}-butyl ~{N}-[1-[(2~{S})-3-cyclopropyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S},3~{R})-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]-4-[(phenylmethyl)amino]butan-2-yl]amino]propan-2-yl]-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；10% PEG 200, 0.1 M bis-tris propane, pH 9.0, 18% PEG 8,000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.219 |
| 6Y84 SARS-CoV-2 main protease with unliganded active site (2019-nCoV, coronavirus disease 2019, COVID-19) 提交 2020-03-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；15% PEG 4000, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5.
0.15 microlitre protein + 0.3 microlitre reservoir + 0.05 microlitre seed stock
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.200 |
| 6YB7 SARS-CoV-2 main protease with unliganded active site (2019-nCoV, coronavirus disease 2019, COVID-19). 提交 2020-03-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；5% PEG 4000, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5. 0.15 microlitre protein + 0.3 microlitre reservoir + 0.05 microlitre seed stock
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.180 |
| 6YNQ Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to 2-Methyl-1-tetralone. 提交 2020-04-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | P6N (2~{S})-2-methyl-3,4-dihydro-2~{H}-naphthalen-1-one × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.226 |
| 6YVF Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to AZD6482. 提交 2020-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A82 2-[[(1R)-1-(7-methyl-2-morpholin-4-yl-4-oxidanylidene-pyrido[1,2-a]pyrimidin-9-yl)ethyl]amino]benzoic acid × 2 CL CHLORIDE ION × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION；291 K；Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.208 |
| 6YWK Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with HEPES 提交 2020-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；33% BMW PgSmear, 0.1M MgCl2 and 0.1M HEPES 7.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.214 |
| 6YWK Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with HEPES 提交 2020-04-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；33% BMW PgSmear, 0.1M MgCl2 and 0.1M HEPES 7.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.214 |
| 6YWK Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with HEPES 提交 2020-04-29 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；33% BMW PgSmear, 0.1M MgCl2 and 0.1M HEPES 7.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.214 |
| 6YWK Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with HEPES 提交 2020-04-29 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；33% BMW PgSmear, 0.1M MgCl2 and 0.1M HEPES 7.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.214 |
| 6YWK Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with HEPES 提交 2020-04-29 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；33% BMW PgSmear, 0.1M MgCl2 and 0.1M HEPES 7.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.214 |
| 6YWL Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose 提交 2020-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；27% PEG 4000, 0.2M sodium acetate pH 7, 0.1M tris 8.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.223 |
| 6YWL Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose 提交 2020-04-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；27% PEG 4000, 0.2M sodium acetate pH 7, 0.1M tris 8.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.223 |
| 6YWL Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose 提交 2020-04-29 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；27% PEG 4000, 0.2M sodium acetate pH 7, 0.1M tris 8.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.223 |
| 6YWL Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose 提交 2020-04-29 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；27% PEG 4000, 0.2M sodium acetate pH 7, 0.1M tris 8.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.223 |
| 6YWL Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose 提交 2020-04-29 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；27% PEG 4000, 0.2M sodium acetate pH 7, 0.1M tris 8.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.223 |
| 6YWM Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with MES 提交 2020-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.15 K；23% PEG 6000, 0.1M MgCl2, 5% Ethylene Glycol, 0.1M MES 6.0
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.229 |
| 6YWM Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with MES 提交 2020-04-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.15 K；23% PEG 6000, 0.1M MgCl2, 5% Ethylene Glycol, 0.1M MES 6.0
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.229 |
| 6YWM Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with MES 提交 2020-04-29 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.15 K；23% PEG 6000, 0.1M MgCl2, 5% Ethylene Glycol, 0.1M MES 6.0
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.229 |
| 6YYT Structure of replicating SARS-CoV-2 polymerase 提交 2020-05-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 6YZ1 The crystal structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp16 methyltransferase complex with Sinefungin 提交 2020-05-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4263–4384（122 aa）
|
未记录 | SFG SINEFUNGIN × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；300 nl protein: 150 nl well solution
100 mM MES pH 6.5,
200 mM NaCl,
10% w/v PEG 4000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.226 |
| 6Z2E Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with the activity-based probe, biotin-PEG(4)-Abu-Tle-Leu-Gln-vinylsulfone 提交 2020-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q5T (4~{S})-4-[[(2~{S})-2-[[(2~{S})-2-[[(2~{S})-2-[3-[2-[2-[2-[2-[5-[(3~{a}~{S},4~{R},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-3,3~{a},4,6~{a}-tetrahydro-1~{H}-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]butanoyl]amino]-3,3-dimethyl-butanoyl]amino]-4-methyl-pentanoyl]amino]-6-methylsulfonyl-hexanamide × 2 CL CHLORIDE ION × 4 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.12 M Ethylene glycols (0.3 M Diethylene glycol, 0.3 M Triethylene glycol, 0.3 M Tetraethylene glycol, 0.3 M Pentaethylene glycol), 0.1 M buffer system 2 (1.0 M Sodium HEPES, MOPS (acid), pH 7.5), pH 7.5, 30% Precipitant mix 3 (20% glycerol, 10% PEG 4000)
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.243 |
| 6Z5T SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-ribose 提交 2020-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1197（174 aa）
|
突变：0 | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.775 M DL-Malic Acid pH 7.0
10 mM TCEP
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.249 |
| 6Z5T SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-ribose 提交 2020-05-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1197（174 aa）
|
突变：0 | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.775 M DL-Malic Acid pH 7.0
10 mM TCEP
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.249 |
| 6Z6I SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPD 提交 2020-05-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1197（174 aa）
|
未记录 | A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M DL-Malic Acid
5% (v/v) glycerol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.279 |
| 6Z6I SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPD 提交 2020-05-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1197（174 aa）
|
未记录 | A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M DL-Malic Acid
5% (v/v) glycerol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.279 |
| 6Z6I SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPD 提交 2020-05-28 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1024–1197（174 aa）
|
未记录 | A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M DL-Malic Acid
5% (v/v) glycerol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.279 |
| 6Z6I SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPD 提交 2020-05-28 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1024–1197（174 aa）
|
未记录 | A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.9 M DL-Malic Acid
5% (v/v) glycerol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.279 |
| 6Z72 SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPM 提交 2020-05-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1197（174 aa）
|
未记录 | A3R Adenosine Diphosphate (Hydroxymethyl)pyrrolidine monoalcohol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.775 M DL-Malic Acid pH 7.0
4.5% (v/v) ethylene glycol
200 mM potassium cyanate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.263 |
| 6Z72 SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPM 提交 2020-05-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1197（174 aa）
|
未记录 | A3R Adenosine Diphosphate (Hydroxymethyl)pyrrolidine monoalcohol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.775 M DL-Malic Acid pH 7.0
4.5% (v/v) ethylene glycol
200 mM potassium cyanate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.263 |
| 6Z72 SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPM 提交 2020-05-29 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1024–1197（174 aa）
|
未记录 | A3R Adenosine Diphosphate (Hydroxymethyl)pyrrolidine monoalcohol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.775 M DL-Malic Acid pH 7.0
4.5% (v/v) ethylene glycol
200 mM potassium cyanate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.263 |
| 6Z72 SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPM 提交 2020-05-29 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1024–1197（174 aa）
|
未记录 | A3R Adenosine Diphosphate (Hydroxymethyl)pyrrolidine monoalcohol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 MLT D-MALATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.775 M DL-Malic Acid pH 7.0
4.5% (v/v) ethylene glycol
200 mM potassium cyanate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.263 |
| 6ZLW SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human 40S ribosomal subunit 提交 2020-07-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物一致 |
链 i
1–180（180 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 6ZM7 SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human CCDC124-80S-EBP1 ribosome complex 提交 2020-07-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致 |
链 CF
1–180（180 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 256 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 6ZME SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human CCDC124-80S-eERF1 ribosome complex 提交 2020-07-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致 |
链 CF
1–180（180 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 256 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 6ZMI SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human LYAR-80S ribosome complex 提交 2020-07-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致 |
链 i
1–180（180 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 256 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 6ZMO SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human LYAR-80S-eEF1a ribosome complex 提交 2020-07-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致 |
链 i
1–180（180 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 256 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 6ZMT SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a pre-40S-like ribosome complex 提交 2020-07-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric（35） 与全部聚合物一致 |
链 i
1–180（180 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 6ZN5 SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a pre-40S-like ribosome complex - state 2 提交 2020-07-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物一致 |
链 i
1–180（180 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6ZOJ SARS-CoV-2-Nsp1-40S complex, composite map 提交 2020-07-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物一致 |
链 j
1–180（180 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 6ZOK SARS-CoV-2-Nsp1-40S complex, focused on body 提交 2020-07-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 j
1–180（180 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 109 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 6ZON SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a human 43S preinitiation ribosome complex - state 1 提交 2020-07-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–180（180 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 6ZP4 SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a human 43S preinitiation ribosome complex - state 2 提交 2020-07-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–180（180 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 6ZPE Nonstructural protein 10 (nsp10) from SARS CoV-2 提交 2020-07-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4263–4384（122 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 2.17 M NaCl
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.160 |
| 6ZRT Crystal structure of SARS CoV2 main protease in complex with inhibitor Telaprevir 提交 2020-07-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 SV6 (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.75；291 K；100 mM MES pH 6.75
5% DMSO (V/V)
18% PEG 6000 (W/V)
300 uM Telaprevir
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.237 |
| 6ZRU Crystal structure of SARS CoV2 main protease in complex with inhibitor Boceprevir 提交 2020-07-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 U5G boceprevir (bound form) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.75；291 K；100 mM MES pH 6.75
5% DMSO (V/V)
16% PEG 6000 (W/V)
300 uM Boceprevir
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.215 |
| 6ZSL Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase at 1.94 Angstrom resolution 提交 2020-07-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.03M Sodium nitrate, 0.03 Sodium phosphate
dibasic, 0.03M Ammonium sulfate, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.253 |
| 6ZSL Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase at 1.94 Angstrom resolution 提交 2020-07-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.03M Sodium nitrate, 0.03 Sodium phosphate
dibasic, 0.03M Ammonium sulfate, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.253 |
| 7A1U Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Fusidic Acid. 提交 2020-08-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | FUA FUSIDIC ACID × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 IMD IMIDAZOLE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.204 |
| 7AAP Nsp7-Nsp8-Nsp12 SARS-CoV2 RNA-dependent RNA polymerase in complex with template:primer dsRNA and favipiravir-RTP 提交 2020-09-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 GE6 [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(3-aminocarbonyl-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyrazin-1-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 7ABU Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to RS102895 提交 2020-09-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | R6Q 1'-[2-[4-(trifluoromethyl)phenyl]ethyl]spiro[1~{H}-3,1-benzoxazine-4,4'-piperidine]-2-one × 2 IMD IMIDAZOLE × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M MIB
25% PEG 1500
5% DMSO
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.215 |
| 7ADW Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to 2,4'-Dimethylpropiophenone. 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 R7Q 2-methyl-1-(4-methylphenyl)propan-1-one × 2 IMD IMIDAZOLE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.229 |
| 7AEG SARS-CoV-2 main protease in a covalent complex with SDZ 224015 derivative, compound 5 提交 2020-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；Mpro was thawed and diluted to 6 mg/ml using 20 mM Hepes pH 7.5, 50 mM NaCl. The ligand of interest was dissolved in DMSO to 10 mM and then diluted into the protein solution to a final concentration of 1 mM. The ligand was then allowed to incubate with the protein for two hours at room temperature prior to dispensing plates. The drop composition was 0.15 ul protein ligand solution, 0.3 ul 11% (v/v) PEG 4K, 0.1 M MES pH 6.5, and 0.05 ul Mpro crystal seed stock. The Mpro crystal seed stock was prepared by crushing Mpro crystals with a pipette tip, suspending them in 30% PEG 4K, 5% (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5, and vortexing for 60 s with approximately 10 glass beads (1.0 mm diameter, BioSpec products). Reservoir solution was 11pc (v/v) PEG 4K, 5pc (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5. Crystals were grown using the sitting drop vapor diffusion method at 20 degrees C and appeared within 24 hours, reaching full size within 36 hours.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.202 |
| 7AEH SARS-CoV-2 main protease in a covalent complex with a pyridine derivative of ABT-957, compound 1 提交 2020-09-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 R8H (2~{R})-5-oxidanylidene-~{N}-[(2~{R},3~{S})-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-phenyl-4-(pyridin-2-ylmethylamino)butan-2-yl]-1-(phenylmethyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；Mpro was thawed and diluted to 6 mg/ml using 20 mM Hepes pH 7.5, 50 mM NaCl. The ligand of interest was dissolved in DMSO to 10 mM and then diluted into the protein solution to a final concentration of 1 mM. The ligand was then allowed to incubate with the protein for two hours at room temperature prior to dispensing plates. The drop composition was 0.15 ul protein ligand solution, 0.3 ul 11% (v/v) PEG 4K, 0.1 M MES pH 6.5, and 0.05 ul Mpro crystal seed stock. The Mpro crystal seed stock was prepared by crushing Mpro crystals with a pipette tip, suspending them in 30% PEG 4K, 5% (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5, and vortexing for 60 s with approximately 10 glass beads (1.0 mm diameter, BioSpec products). Reservoir solution was 11pc (v/v) PEG 4K, 5pc (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5. Crystals were grown using the sitting drop vapor diffusion method at 20 degrees C and appeared within 24 hours, reaching full size within 36 hours.
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.173 |
| 7AF0 Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Ipidacrine. 提交 2020-09-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 CL CHLORIDE ION × 2 R9W 2,3,5,6,7,8-hexahydro-1~{H}-cyclopenta[b]quinolin-9-amine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION；291 K；Co-crystallization with the compounds was achieved by equilibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1 mMEDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB, pH 7.5, containing 25% w/w PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To obtain well-diffracting crystals in a reproducible way seeding was applied for crystal growth. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 - 3 days. Crystals were manually harvested and flash-frozen in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.225 |
| 7AGA Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to AT7519 提交 2020-09-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | LZE 4-{[(2,6-dichlorophenyl)carbonyl]amino}-N-piperidin-4-yl-1H-pyrazole-3-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.223 |
| 7AHA Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Maleate. 提交 2020-09-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 SIN SUCCINIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.201 |
| 7AK4 Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Tretazicar. 提交 2020-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AA
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CB1 5-(AZIRIDIN-1-YL)-2,4-DINITROBENZAMIDE × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；282 K；25% PEG 1.500, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.221 |
| 7AKU Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Calpeptin. 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION；291 K；Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.235 |
| 7ALH Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 at 1.65A resolution (spacegroup C2). 提交 2020-10-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Na Acetate, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.189 |
| 7ALI Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 at 1.65A resolution (spacegroup P2(1)). 提交 2020-10-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Na Acetate, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.217 |
| 7AMJ Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to PD 168568. 提交 2020-10-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14 RMZ (3~{S})-3-[2-[4-(3,4-dimethylphenyl)piperazin-1-yl]ethyl]-2,3-dihydroisoindol-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.210 |
| 7ANS Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Adrafinil. 提交 2020-10-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 RNW 2-[(diphenylmethyl)-oxidanyl-$l^{3}-sulfanyl]-~{N}-oxidanyl-ethanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.211 |
| 7AOL Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Climbazole 提交 2020-10-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 IMD IMIDAZOLE × 2 RQH (1~{S})-1-(4-chloranylphenoxy)-1-imidazol-1-yl-3,3-dimethyl-butan-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；25% PEG 1500
5% DMSO
0.1 M MIB pH 7.5
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.192 |
| 7AP6 Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to MUT056399. 提交 2020-10-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | RQN 4-(4-ethyl-5-fluoranyl-2-oxidanyl-phenoxy)-3-fluoranyl-benzamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.237 |
| 7APH Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Tofogliflozin. 提交 2020-10-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AA
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | RT2 Tofogliflozin × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；282 K；25% PEG 1500, 0.1M MIB, 5% DMSO
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.266 |
| 7AQE Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to UNC-2327 提交 2020-10-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 RV5 N-1,2,3-Benzothiadiazol-6-yl-N'-[2-oxo-2-(1-piperidinyl)ethyl]urea also called unc-2327 × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；25% PEG1500, 5% DMSO, 0.1 M MIB Buffer
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.223 |
| 7AQI Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Ifenprodil 提交 2020-10-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | QEL 4-[(1R,2S)-2-(4-benzylpiperidin-1-yl)-1-hydroxypropyl]phenol × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 IMD IMIDAZOLE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.266 |
| 7AQJ Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Triglycidyl isocyanurate. 提交 2020-10-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | S7H 1-[(2~{R})-2-oxidanylpropyl]-3-[[(2~{R})-oxiran-2-yl]methyl]-5-[[(2~{S})-oxiran-2-yl]methyl]-1,3,5-triazinane-2,4,6-trione × 2 RV8 Triglycidyl isocyanurate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.260 |
| 7AR5 Structure of apo SARS-CoV-2 Main Protease with small beta angle, space group C2. 提交 2020-10-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MMT buffer (1:2:2 molar ratio of malic acid, MES, and Tris), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.214 |
| 7AR6 Structure of apo SARS-CoV-2 Main Protease with large beta angle, space group C2. 提交 2020-10-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.190 |
| 7ARF Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to thioglucose. 提交 2020-10-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | RVW (2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{S})-2-(hydroxymethyl)-6-sulfanyl-oxane-3,4,5-triol × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 7AU4 Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 3 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 RY5 (3~{S})-6-chloranyl-3'-(1,2-oxazol-3-ylmethyl)spiro[1,2-dihydroindene-3,5'-imidazolidine]-2',4'-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.25；293 K；100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (100 mM Tris pH 8.25, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 100 mM Tris pH 8.25, 10 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.214 |
| 7AVD Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to SEN1269 ligand 提交 2020-11-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 S1W 3-[[5-[3-(dimethylamino)phenoxy]pyrimidin-2-yl]amino]phenol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 7AWR Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Tegafur 提交 2020-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | S7W TEGAFUR × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；PEG 1500 25%, 0.1 M MIB Buffer pH 7.5, 5% DMSO
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.192 |
| 7AWS Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to TH-302. 提交 2020-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | S8E (1-methyl-2-nitro-1H-imidazol-5-yl)methyl (R)-N-(2-bromoethyl)-N'-ethylphosphorodiamidate × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.238 |
| 7AWU Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to LSN2463359. 提交 2020-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | S8B ~{N}-propan-2-yl-5-(2-pyridin-4-ylethynyl)pyridine-2-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
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分辨率 2.07 Å R-free 0.258 |
| 7AWW Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Clonidine 提交 2020-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CLU 2,6-DICHLORO-N-IMIDAZOLIDIN-2-YLIDENEANILINE × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；PEG 1500 25%, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.220 |
| 7AX6 Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Glutathione isopropyl ester 提交 2020-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | S8H (2~{S})-2-azanyl-5-oxidanylidene-5-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-1-[(2-oxidanylidene-2-propan-2-yloxy-ethyl)amino]-3-sulfanyl-propan-2-yl]amino]pentanoic acid × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 IMD IMIDAZOLE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；25% peg 1500, 5% dmso, 0.1 M MIB
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.248 |
| 7AXM Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Pelitinib 提交 2020-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 93J (2E)-N-{4-[(3-chloro-4-fluorophenyl)amino]-3-cyano-7-ethoxyquinolin-6-yl}-4-(dimethylamino)but-2-enamide × 2 IMD IMIDAZOLE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；0.1 M MIB pH 7.5, 25% PEG1500, 5% DMSO
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.209 |
| 7AXO Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to AR-42. 提交 2020-11-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 QCP AR-42 × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.201 |
| 7AY7 Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Isofloxythepin 提交 2020-11-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | S8T 9-fluoranyl-3-propan-2-yl-5,6-dihydrobenzo[b][1]benzothiepine × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 IMD IMIDAZOLE × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；25% PEG1500, 5% DMSO, 0.1 M MIB pH 7.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.195 |
| 7B2J Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 5 提交 2020-11-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimer（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | SQ2 2-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-yl)-1-(4-methylpiperidin-1-yl)ethan-1-one × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.75；293 K；100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 15 mM compound, 7.5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.203 |
| 7B2U Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 1 提交 2020-11-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimer（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | SQ5 (5S)-5-(cyclohexylmethyl)-3-(5-fluoropyridin-3-yl)imidazolidine-2,4-dione × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.75；293 K；100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 10 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.246 |
| 7B3B Structure of elongating SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase with Remdesivir at position -3 (structure 1) 提交 2020-11-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7B3C Structure of elongating SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase with Remdesivir at position -4 (structure 2) 提交 2020-11-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7B3D Structure of elongating SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase with AMP at position -4 (structure 3) 提交 2020-11-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7B3E Crystal structure of myricetin covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 提交 2020-11-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimer（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 CL CHLORIDE ION × 1 MYC 3,5,7-TRIHYDROXY-2-(3,4,5-TRIHYDROXYPHENYL)-4H-CHROMEN-4-ONE × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M DL-Glutamic acid monohydrate, 0.1M DL-Alanine, 0.1M Glycine, 0.1M DL-Lysine monohydrochloride, 0.1M DL-Serine, 0.1M HEPES/MOPS pH 7.5, 20% v/v Ethylene glycol; 10 % w/v PEG 8000
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.204 |
| 7B5Z Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 6 提交 2020-12-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 SYH 2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-yl)-1-(4-methylenepiperidin-1-yl)ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.75；293 K；100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 12.5 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.196 |
| 7B77 Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 8 提交 2020-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 T0W 2-(benzotriazol-1-yl)-~{N}-ethyl-~{N}-(furan-3-ylmethyl)ethanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.75；293 K；100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 12.5 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.214 |
| 7B83 Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to pyrithione zinc 提交 2020-12-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | PK8 9-oxa-7-thia-1-azonia-8$l^{2}-zincabicyclo[4.3.0]nona-1,3,5-triene × 2 IMD IMIDAZOLE × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION；291 K；Co-crystallization with the compounds was achieved mixing 0.23 uL of protein solution (6.25 mg/mL) in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT/TCEP (respectively), 1 mM EDTA, and 150 mM NaCl with 0.22 uL of reservoir solution consisting of 100 mM MIB, pH 7.5, containing 25% w/w PEG 1500 and 5% (v/v) DMSO, and 0.05 uL of a micro-seed crystal suspension. This growth solution was equilibrated by sitting drop vapor diffusion against 40 uL reservoir solution.
Prior to crystallization 125 nL droplets of 10 mM compound solutions from the two libraries in DMSO were applied to the wells of SwissCI 96-well plates (2-well or 3-well low profile, respectively) and subsequently dried in vacuum. Taking the crystallization drop volume into account this resulted in a final compound concentration of 2.5 mM and a molar ratio of 13.6 of compound to protein. To obtain well-diffracting crystals in a reproducible way micro-seeding was applied for crystal growth. Crystals appeared within a few hours and reached their final size (200x100x10 um3) after 2 - 3 days. Crystals were manually harvested and flash-frozen in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.207 |
| 7BAJ Crystal structure of ligand-free SARS-CoV-2 main protease 提交 2020-12-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；200mM ammonium chloride, 5%glycerol and 18% polyethylene glycol mw. 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.207 |
| 7BAK Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease treated with ebselen 提交 2020-12-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | SE SELENIUM ATOM × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；200mM ammonium chloride, 5%glycerol and 16% polyethylene glycol mw.3350
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.219 |
| 7BAL Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease treated with ebselen derivative of MR6-31-2 提交 2020-12-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | SE SELENIUM ATOM × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；200mM ammonium chloride, 5%glycerol and 20% polyethylene glycol mw. 3350
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.249 |
| 7BB2 Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 at 1.6A resolution (spacegroup P2(1)2(1)2(1)) 提交 2020-12-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M D-Glucose, 0.1M D-Mannose, 0.1M D-Galactose, 0.1M L-Fucose, 0.1M D-Xylose, 0.1M N-Acetyl-D-Glucosamine, 0.1 M Imidazole/MES monohydrate (acid) pH 6.5, 20% v/v Ethylene glycol, 10 % w/v PEG 8000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.189 |
| 7BE7 Crystal structure of MG-132 covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2. 提交 2020-12-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.12M Ethylene glycols (Diethylene glycol; Triethylene glycol; Tetraethylene glycol; Pentaethylene glycol) 0.1M Tris/BICINE pH 8.5, 20% v/v PEG 500 MME; 10 % w/v PEG 20000
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.201 |
| 7BF3 Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with adenosine 提交 2020-12-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ADN ADENOSINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；33% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.217 |
| 7BF3 Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with adenosine 提交 2020-12-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ADN ADENOSINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；33% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.217 |
| 7BF3 Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with adenosine 提交 2020-12-31 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；33% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.217 |
| 7BF3 Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with adenosine 提交 2020-12-31 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；33% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.217 |
| 7BF3 Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with adenosine 提交 2020-12-31 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；33% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.217 |
| 7BF4 Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with GMP 提交 2020-12-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；293.15 K；30% PEG 4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 MgCl2, 0.1 M tris, pH 8.3
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.174 |
| 7BF5 Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with ADP-ribose-phosphate (ADP-ribose-2'-phosphate, ADPRP) 提交 2020-12-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 A2R [(2R,3R,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-3-HYDROXY-4-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-TRIHYDROXYTETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；30% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.217 |
| 7BF5 Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with ADP-ribose-phosphate (ADP-ribose-2'-phosphate, ADPRP) 提交 2020-12-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | A2R [(2R,3R,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-3-HYDROXY-4-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-TRIHYDROXYTETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；30% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.217 |
| 7BF5 Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with ADP-ribose-phosphate (ADP-ribose-2'-phosphate, ADPRP) 提交 2020-12-31 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 A2R [(2R,3R,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-3-HYDROXY-4-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-TRIHYDROXYTETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；30% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.217 |
| 7BF5 Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with ADP-ribose-phosphate (ADP-ribose-2'-phosphate, ADPRP) 提交 2020-12-31 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；30% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.217 |
| 7BF5 Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with ADP-ribose-phosphate (ADP-ribose-2'-phosphate, ADPRP) 提交 2020-12-31 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 A2R [(2R,3R,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-3-HYDROXY-4-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-TRIHYDROXYTETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；30% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.217 |
| 7BF6 Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with remdesivir metabolite GS-441524 提交 2020-12-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | U08 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolane-2-carbonitrile × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；293.15 K；30% PEG 4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M tris, pH 8.3
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.226 |
| 7BF6 Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with remdesivir metabolite GS-441524 提交 2020-12-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | U08 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolane-2-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；293.15 K；30% PEG 4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M tris, pH 8.3
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.226 |
| 7BF6 Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with remdesivir metabolite GS-441524 提交 2020-12-31 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | U08 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolane-2-carbonitrile × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；293.15 K；30% PEG 4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M tris, pH 8.3
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.226 |
| 7BFB Crystal structure of ebselen covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2. 提交 2021-01-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 9JT N-phenyl-2-selanylbenzamide × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.12M alcohols (1,6-Hexanediol; 1-Butanol; 1,2-Propanediol; 2-Propanol; 1,4-Butanediol; 1,3-Propanediol), 0.1M Hepes/MOPS pH 7.5, 20% v/v PEG 500 MME, 10 % w/v PEG 20000
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.199 |
| 7BGP Crystal structure of MG-132 covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 in absence of DTT. 提交 2021-01-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.12M Ethylene glycols (Diethylene glycol; Triethylene glycol; Tetraethylene glycol; Pentaethylene glycol) 0.1M Tris/BICINE pH 8.5, 20% v/v PEG 500 MME; 10 % w/v PEG 20000
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.201 |
| 7BIJ Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 13 提交 2021-01-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 TU8 (3~{S})-3'-(5-fluoranylpyridin-3-yl)spiro[1,2-dihydroindene-3,5'-imidazolidine]-2',4'-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.75；293 K；100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 12.5 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.212 |
| 7BQ7 Crystal structure of 2019-nCoV nsp16-nsp10 complex 提交 2020-03-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.4 M Magnesium formate dihydrate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.208 |
| 7BQY THE CRYSTAL STRUCTURE OF COVID-19 MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH AN INHIBITOR N3 at 1.7 angstrom 提交 2020-03-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；293 K；2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.226 |
| 7BTF SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase in complex with cofactors in reduced condition 提交 2020-04-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 7BUY The crystal structure of COVID-19 main protease in complex with carmofur 提交 2020-04-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | JRY hexylcarbamic acid × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293.15 K；5% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.201 |
| 7BV1 Cryo-EM structure of the apo nsp12-nsp7-nsp8 complex 提交 2020-04-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7BV2 The nsp12-nsp7-nsp8 complex bound to the template-primer RNA and triphosphate form of Remdesivir(RTP) 提交 2020-04-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 F86 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-cyano-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 7BW4 Structure of the RNA-dependent RNA polymerase from SARS-CoV-2 提交 2020-04-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
4402–5324（923 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 7BZF COVID-19 RNA-dependent RNA polymerase post-translocated catalytic complex 提交 2020-04-27 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 7C2I Crystal structure of nsp16-nsp10 heterodimer from SARS-CoV-2 in complex with SAM (with additional SAM during crystallization) 提交 2020-05-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
片段：nsp16
链 B
4254–4392（139 aa）
片段：nsp10
|
未记录 | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.4 M Sodium malonate, 0.1 M MES, and 0.5% w/v PEG 10000.
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.209 |
| 7C2J Crystal structure of nsp16-nsp10 heterodimer from SARS-CoV-2 in complex with SAM (without additional SAM during crystallization) 提交 2020-05-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
片段：nsp16
链 B
4254–4392（139 aa）
片段：nsp10
|
未记录 | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M MES and 12 % w/v PEG 20000.
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.235 |
| 7C2K COVID-19 RNA-dependent RNA polymerase pre-translocated catalytic complex 提交 2020-05-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.93 Å |
| 7C2Q The crystal structure of COVID-19 main protease in the apo state 提交 2020-05-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3561（296 aa）
链 B
3266–3561（296 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES pH 7.5, 4% PEG 8000
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.265 |
| 7C2Y The crystal structure of COVID-2019 main protease in the apo state 提交 2020-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3561（298 aa）
链 B
3264–3561（298 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5, 10% Propanol ,20% PEG 4000
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.262 |
| 7C6S Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease complexed with Boceprevir 提交 2020-05-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | U5G boceprevir (bound form) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；20% PEG5000,0.1 M BIS-TRIS
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.222 |
| 7C6U Crystal structure of SARS-CoV-2 complexed with GC376 提交 2020-05-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 7C7P Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with Telaprevir 提交 2020-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | SV6 (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；13% PEG4000, 0.1 M MES pH6.0
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.216 |
| 7C8B Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with Z-VAD(OMe)-FMK 提交 2020-05-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；11% PEG 4000, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.230 |
| 7C8R Complex Structure of SARS-CoV-2 3CL Protease with TG-0203770 提交 2020-06-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | TG3 ethyl (4R)-4-[[(2S)-4-methyl-2-[[(2S,3R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoyl]amino]pentanoyl]amino]-5-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pentanoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；10% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate trihydrate, pH 4.0.
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.248 |
| 7C8T Complex Structure of SARS-CoV-2 3CL Protease with TG-0205221 提交 2020-06-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | NOL N-[(BENZYLOXY)CARBONYL]-O-(TERT-BUTYL)-L-THREONYL-3-CYCLOHEXYL-N-[(1S)-2-HYDROXY-1-{[(3S)-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL]METHYL}ETHYL]-L-ALANINAMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；293 K；14% PEG 1,000, 0.1 M citric acid, pH 3.5.
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.233 |
| 7C8U The crystal structure of COVID-19 main protease in complex with GC376 提交 2020-06-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2M Lithium chloride, 0.1M Hepes pH 7, 20% w/v PEG 6000
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.273 |
| 7CA8 The crystal structure of COVID-19 main protease in complex with an inhibitor Shikonin 提交 2020-06-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3561（298 aa）
链 B
3264–3561（298 aa）
|
未记录 | FNO 2-[(1R)-4-methyl-1-oxidanyl-pent-3-enyl]-5,8-bis(oxidanyl)naphthalene-1,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1M HEPES 7.5, 20% PEG 10000
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.279 |
| 7CAM SARS-CoV-2 main protease (Mpro) apo structure (space group P212121) 提交 2020-06-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M BICINE, 20% w/v Polyethylene glycol 10,000
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.309 |
| 7CB7 1.7A resolution structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with broad-spectrum coronavirus protease inhibitor GC376 提交 2020-06-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 B1S (1R,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 0.02 M sodium/potassium phosphate, 20% (w/v) PEG3350
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.192 |
| 7CBT The crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with GC376 提交 2020-06-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Sodium malonate pH 6.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.292 |
| 7CJD Crystal structure of the SARS-CoV-2 PLpro C111S mutant 提交 2020-07-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1881（318 aa）
链 B
1564–1881（318 aa）
链 C
1564–1881（318 aa）
链 D
1564–1881（318 aa）
|
突变：C111S 突变：C111S 突变：C111S 突变：C111S | ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；296 K；3%dextran sulfate sodium salt,0.1m Bicine ph8.5,15%PEG20000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.282 |
| 7CJM SARS CoV-2 PLpro in complex with GRL0617 提交 2020-07-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1564–1878（315 aa）
|
突变：C1674S | TTT 5-amino-2-methyl-N-[(1R)-1-naphthalen-1-ylethyl]benzamide × 1 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；283 K；12% PEG 3350, 0.1M Tris pH 7.5, 0.005M Cobalt(II) chloride hexahydrate, 0.005M Cadmium chloride hemi(pentahydrate), 0.005M Magnesium chloride hexahydrate, 0.005M Nickel(II) chloride hexahydrate
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.286 |
| 7CMD Crystal structure of the SARS-CoV-2 PLpro with GRL0617 提交 2020-07-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1881（318 aa）
|
未记录 | TTT 5-amino-2-methyl-N-[(1R)-1-naphthalen-1-ylethyl]benzamide × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.24M ammonium acetate,0.1M sodium citrate pH5.6,24% PEG4000
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.298 |
| 7CMD Crystal structure of the SARS-CoV-2 PLpro with GRL0617 提交 2020-07-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1564–1881（318 aa）
|
未记录 | TTT 5-amino-2-methyl-N-[(1R)-1-naphthalen-1-ylethyl]benzamide × 1 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.24M ammonium acetate,0.1M sodium citrate pH5.6,24% PEG4000
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.298 |
| 7CMD Crystal structure of the SARS-CoV-2 PLpro with GRL0617 提交 2020-07-27 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1564–1881（318 aa）
|
未记录 | TTT 5-amino-2-methyl-N-[(1R)-1-naphthalen-1-ylethyl]benzamide × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.24M ammonium acetate,0.1M sodium citrate pH5.6,24% PEG4000
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.298 |
| 7CMD Crystal structure of the SARS-CoV-2 PLpro with GRL0617 提交 2020-07-27 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1564–1881（318 aa）
|
未记录 | TTT 5-amino-2-methyl-N-[(1R)-1-naphthalen-1-ylethyl]benzamide × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.24M ammonium acetate,0.1M sodium citrate pH5.6,24% PEG4000
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.298 |
| 7COM Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with Boceprevir (space group P212121) 提交 2020-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | U5G boceprevir (bound form) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；21% (v/v) PEG 4000; 20% (v/v) PEG400; 0.1 M MES pH6.5;
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.246 |
| 7CTT Cryo-EM structure of Favipiravir bound to replicating polymerase complex of SARS-CoV-2 in the pre-catalytic state. 提交 2020-08-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GE6 [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(3-aminocarbonyl-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyrazin-1-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7CUT Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with Z-VAD-FMK 提交 2020-08-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 10% w/v PEG6000, 5% v/v MPD
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.223 |
| 7CUU Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with MG132 提交 2020-08-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 2 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 10% w/v PEG4000, 5% v/v Isopropanol
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.196 |
| 7CWB Ambient-Temperature Serial Femtosecond X-ray Crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease at 1.9 A Resolution (C121) 提交 2020-08-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；294 K；0.1 M MMT 6.0, 25% w/v PEG 1500
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.257 |
| 7CWC Ambient-Temperature Serial Femtosecond X-ray Crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease at 2.1 A Resolution (P212121) 提交 2020-08-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；294 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate,
0.1 M Tris 8.5,
30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.259 |
| 7CX9 Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with INZ-1 提交 2020-09-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | GKF 3-iodanyl-1~{H}-indazole-7-carbaldehyde × 2 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M MES pH5.0; 11% PEG 4000.
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.209 |
| 7CXM Architecture of a SARS-CoV-2 mini replication and transcription complex 提交 2020-09-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
|
突变：D910N | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 2.90 Å |
| 7CXN Architecture of a SARS-CoV-2 mini replication and transcription complex 提交 2020-09-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
|
突变：D910N | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å |
| 7CYQ Cryo-EM structure of an extended SARS-CoV-2 replication and transcription complex reveals an intermediate state in cap synthesis 提交 2020-09-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253（113 aa）
片段：UNP residues 4141-4253
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 7D1M CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-CoV-2 MAIN PROTEASE COMPLEXED WITH GC376 提交 2020-09-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；291 K；10mM Tris, 1mM EDTA, 1mM DTT
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.157 |
| 7D4F Structure of COVID-19 RNA-dependent RNA polymerase bound to suramin 提交 2020-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 G
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 H3U 8-(3-(3-aminobenzamido)-4-methylbenzamido)naphthalene-1,3,5-trisulfonic acid × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å |
| 7D7K The crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease in apo form 提交 2020-10-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1567–1878（312 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 CFF CAFFEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；293 K；0.1M Tris pH 8.0, 2.0M Ammonium sulfate, 0.033% w/v Caffeine, 0.033% w/v Dithioerythritol, 0.033% w/v L-Methionine
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.207 |
| 7D7K The crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease in apo form 提交 2020-10-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1567–1878（312 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 CFF CAFFEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；293 K；0.1M Tris pH 8.0, 2.0M Ammonium sulfate, 0.033% w/v Caffeine, 0.033% w/v Dithioerythritol, 0.033% w/v L-Methionine
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.207 |
| 7D7L The crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease in complex with YM155 提交 2020-10-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1567–1878（312 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 CFF CAFFEINE × 1 GXU 1-(2-methoxyethyl)-2-methyl-3-(pyrazin-2-ylmethyl)benzo[f]benzimidazol-3-ium-4,9-dione × 2 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；293 K；0.1M Tris pH 8.0, 2.0M Ammonium sulfate, 0.033% w/v Caffeine, 0.033% w/v Dithioerythritol, 0.033% w/v L-Methionine
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.218 |
| 7D7L The crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease in complex with YM155 提交 2020-10-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1567–1878（312 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 CFF CAFFEINE × 1 GXU 1-(2-methoxyethyl)-2-methyl-3-(pyrazin-2-ylmethyl)benzo[f]benzimidazol-3-ium-4,9-dione × 3 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；293 K；0.1M Tris pH 8.0, 2.0M Ammonium sulfate, 0.033% w/v Caffeine, 0.033% w/v Dithioerythritol, 0.033% w/v L-Methionine
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.218 |
| 7DDC Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Tafenoquine 提交 2020-10-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | H3F Tafenoquine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Ammonium acetate,0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% w/v Polyethylene glycol 10000
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.234 |
| 7DFG Structure of COVID-19 RNA-dependent RNA polymerase bound to favipiravir 提交 2020-11-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 G
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | 1RP 6-fluoro-3-oxo-4-(5-O-phosphono-beta-D-ribofuranosyl)-3,4-dihydropyrazine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 2 POP PYROPHOSPHATE 2- × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 7DFH Structure of COVID-19 RNA-dependent RNA polymerase bound to ribavirin 提交 2020-11-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 G
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 POP PYROPHOSPHATE 2- × 2 RVP RIBAVIRIN MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 7DG6 Structure of SARS-Cov2-Mpro-1-302 提交 2020-11-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3565（302 aa）
片段：UNP residues 3264-3565
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M bicine, pH=9.0, 10% PEG20000, 2% 1,4-dioxane
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.233 |
| 7DIY Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp10 bound to nsp14-exoribonuclease domain 提交 2020-11-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 B
5926–6214（289 aa）
片段：UNP residues 5926-6214
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M MOPS, 0.1 M Magnesium acetate tetrahydrate and 12 % w/v PEG 8000
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.264 |
| 7DOI Structure of COVID-19 RNA-dependent RNA polymerase bound to penciclovir. 提交 2020-12-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 G
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 POP PYROPHOSPHATE 2- × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 HCU [(2R)-4-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3H-purin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)butyl] dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7DOK Structure of COVID-19 RNA-dependent RNA polymerase (extended conformation) bound to penciclovir 提交 2020-12-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 G
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | HCU [(2R)-4-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3H-purin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)butyl] dihydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 POP PYROPHOSPHATE 2- × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.73 Å |
| 7DTE SARS-CoV-2 RdRP catalytic complex with T33-1 RNA 提交 2021-01-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7DVP SARS-CoV-2 Mpro mutant (H41A) in complex with nsp4|5 peptidyl substrate 提交 2021-01-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
3254–3273（20 aa）
|
突变：H41A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；293 K；2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.219 |
| 7DVW SARS-CoV-2 Mpro mutant (H41A) in complex with nsp5|6 peptidyl substrate 提交 2021-01-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
3560–3579（20 aa）
|
突变：H41A | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；293 K；2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.173 |
| 7DVX SARS-CoV-2 Mpro mutant (H41A) in complex with nsp6|7 peptidyl substrate 提交 2021-01-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
3850–3869（20 aa）
|
突变：H41A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；293 K；2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.247 |
| 7DVY SARS-CoV-2 Mpro mutant (H41A) in complex with nsp9|10 peptidyl substrate 提交 2021-01-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
4244–4263（20 aa）
|
突变：H41A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；293 K；2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.216 |
| 7DW0 SARS-CoV-2 Mpro mutant (H41A) in complex with nsp14|15 peptidyl substrate 提交 2021-01-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
6443–6462（20 aa）
|
突变：H41A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；293 K；2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.208 |
| 7DW6 SARS-CoV-2 Mpro mutant (H41A) in complex with nsp15|16 peptidyl substrate 提交 2021-01-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
6789–6808（20 aa）
|
突变：H41A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；293 K；2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.221 |
| 7E18 Crystal structure of SAR-CoV-2 3CL protease complex with inhibitor YH-53 提交 2021-02-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | HUR N-[(2S)-1-[[(2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-oxidanylidene-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；30%(w/v) PEG4000, 0.1 M sodium acetate pH 4.6, 0.2 M ammonium acetate
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.199 |
| 7E19 Crystal structure of SAR-CoV-2 3CL protease complex with inhibitor SH-5 提交 2021-02-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | HUO (phenylmethyl) N-[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-oxidanylidene-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；17.5% PEG4000
0.1M sodium acetate pH 4.6
0.2 M ammonium acetate
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.235 |
| 7E35 Crystal structure of the SARS-CoV-2 papain-like protease (PLPro) C112S mutant bound to compound S43 提交 2021-02-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
片段：papain-like protease (PLPro)
链 B
1564–1878（315 aa）
片段：papain-like protease (PLPro)
|
突变：C112S 突变：C112S | ZN ZINC ION × 2 GYX N-[(3-acetamidophenyl)methyl]-1-[(1R)-1-naphthalen-1-ylethyl]piperidine-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289 K；0.1M sodium citrate tribasic dihydrate at pH 5.5, 16%(v/v) PEG 8000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.317 |
| 7E5X THE CRYSTAL STRUCTURE OF COVID-19 MAIN PROTEASE apo form at 2.2 angstrom 提交 2021-02-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；293 K；2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.266 |
| 7E6K Viral protease 提交 2021-02-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | HYR N-(2-phenoxyethyl)methanethioamide × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7.5；293 K；0.03M Sodium nitrate, 0.03M Sodium phosphate dibasic, 0.03M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium HEPES (PH7.5), 0.1M MOPS (PH7.5), 20% PEG 500MME, 10% PEG 20000, protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.202 |
| 7ED5 A dual mechanism of action of AT-527 against SARS-CoV-2 polymerase 提交 2021-03-15 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 AT9 [[(2R,3R,4R,5R)-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1H-purin-9-yl)-4-fluoranyl-4-methyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 7EGQ Co-transcriptional capping machineries in SARS-CoV-2 RTC: Coupling of N7-methyltransferase and 3'-5' exoribonuclease with polymerase reveals mechanisms for capping and proofreading 提交 2021-03-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253（113 aa）
片段：UNP residues 4141-4253
链 H
4254–4392（139 aa）
链 K
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
链 N
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 O
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 P
3860–3942（83 aa）
链 Q
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 R
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 S
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 T
4141–4253（113 aa）
片段：UNP residues 4141-4253
链 U
4254–4392（139 aa）
链 X
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
|
未记录 | ZN ZINC ION × 26 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 7EIZ Coupling of N7-methyltransferase and 3'-5' exoribonuclease with SARS-CoV-2 polymerase reveals mechanisms for capping and proofreading 提交 2021-04-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5321（929 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253（113 aa）
链 H
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 K
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
|
未记录 | ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 7EQ4 Crystal Structure of the N-terminus of Nonstructural protein 1 from SARS-CoV-2 提交 2021-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
11–125（115 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Glycine pH 9.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.197 |
| 7FR0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890182452 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WW0 2-hydroxy-N-(pentan-3-yl)-3H-imidazo[4,5-b]pyridine-7-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.145 |
| 7FR0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890182452 提交 2022-10-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.145 |
| 7FR1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1423250928 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WWC 1-methyl-N'-(7H-purin-6-yl)cyclopropane-1-carbohydrazide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.152 |
| 7FR1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1423250928 提交 2022-10-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.152 |
| 7FR2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5551425673 - (S) isomer 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WWH 3-cyclohexyl-N-{(2S)-1-[(9H-purin-6-yl)amino]butan-2-yl}propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.153 |
| 7FR2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5551425673 - (S) isomer 提交 2022-10-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.153 |
| 7FR3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A01A - (S) isomer 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WWH 3-cyclohexyl-N-{(2S)-1-[(9H-purin-6-yl)amino]butan-2-yl}propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.166 |
| 7FR3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A01A - (S) isomer 提交 2022-10-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.166 |
| 7FR4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A26A - (S) isomer 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 WWN 2-cyclohexyl-N-{(2S)-1-[(7H-purin-6-yl)amino]butan-2-yl}acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7FR4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A26A - (S) isomer 提交 2022-10-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7FR5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890189003 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WWT 2-hydroxy-N-propyl-3H-imidazo[4,5-b]pyridine-7-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.156 |
| 7FR5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890189003 提交 2022-10-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.156 |
| 7FR6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890147894 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 7FR6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890147894 提交 2022-10-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WX6 (azepan-1-yl)(2-hydroxy-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-7-yl)methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 7FR7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z431872694 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WXB 6-(azepane-1-carbonyl)pyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.173 |
| 7FR7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z431872694 提交 2022-10-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.173 |
| 7FR8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890408258 - (R) isomer 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.156 |
| 7FR8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890408258 - (R) isomer 提交 2022-10-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WXF (2-hydroxy-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-7-yl)[(2R)-2-methylmorpholin-4-yl]methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.156 |
| 7FR9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1367095370 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WXK N-(1-methylcyclopropyl)-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrido[2,3-d]pyrimidine-6-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.166 |
| 7FR9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1367095370 提交 2022-10-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.166 |
| 7FRA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1343520564 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WXO 6-(azepane-1-sulfonyl)pyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7FRA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1343520564 提交 2022-10-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7FRB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5551426009 - (S) isomer 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WXT 1-methyl-N-{(2S)-3-methyl-2-[(9H-purin-6-yl)amino]butyl}cyclobutane-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7FRB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5551426009 - (S) isomer 提交 2022-10-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7FRC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A05 - (R) isomer 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WXX 3-cyclohexyl-N-{(2R)-2-[(1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-yl)amino]butyl}propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7FRC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A05 - (R) isomer 提交 2022-10-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7FRD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A25A - (S) isomer 提交 2022-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | WY6 3-phenyl-N-{(2S)-1-[(7H-purin-6-yl)amino]butan-2-yl}propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.162 |
| 7FRD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A25A - (S) isomer 提交 2022-10-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.162 |
| 7GAV Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-f7918075-2 (SARS2_MproA-x0854) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13 CL CHLORIDE ION × 2 KFU (3S)-5-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.236 |
| 7GAW Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e194df51-1 (SARS2_MproA-x0862) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 KG9 (4S)-6-chloro-2-[(1-cyanocyclopropyl)methanesulfonyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.252 |
| 7GAX Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with GAB-REV-70cc3ca5-4 (Mpro-x10019) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | KJI N-(4-methylpyridin-3-yl)-N~2~-(quinolin-4-yl)glycinamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.220 |
| 7GAY Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-031a96cc-8 (Mpro-x10022) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | KJO N-phenyl-2-(pyridin-3-yl)prop-2-enamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.197 |
| 7GAZ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DUN-NEW-f8ce3686-14 (Mpro-x10049) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | KL6 1-{2-[(methanesulfonyl)amino]ethyl}-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-7-sulfonamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.214 |
| 7GB0 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-c0143b99-1 (Mpro-x10082) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | KLR (2S)-N-tert-butyl-2-[4-(2-cyanoethyl)anilino]-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.199 |
| 7GB1 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with STE-KUL-2e0d2e88-2 (Mpro-x10150) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 KMF N-[2-(4-acetylpiperazin-1-yl)ethyl]naphthalene-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.197 |
| 7GB2 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MED-COV-4280ac29-25 (Mpro-x10155) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 KMX 1-{4-[(2-benzyl-1,3-thiazol-5-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.203 |
| 7GB3 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAV-CRI-3edb475e-6 (Mpro-x10172) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 KNU N-[(1S)-1-(3-chloro-5-fluorophenyl)ethyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.206 |
| 7GB4 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAR-DIA-23aa0b97-6 (Mpro-x10178) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 KO9 N-(5-cyanopyridin-3-yl)-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.230 |
| 7GB5 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-2 (Mpro-x10201) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | KOI 2-(3-chlorophenyl)-N-(pyridin-3-yl)acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.195 |
| 7GB6 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JOR-UNI-2fc98d0b-12 (Mpro-x10236) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 KP0 N-(3-chlorophenyl)-N-(2-cyclohexylethyl)-N'-(pyridin-3-yl)urea × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.217 |
| 7GB7 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JOR-UNI-2fc98d0b-6 (Mpro-x10237) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | KQ3 N-(3-chlorophenyl)-N-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-N'-(pyridin-3-yl)urea × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.205 |
| 7GB8 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-14 (Mpro-x10247) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 KQL N-(4-methylpyridin-3-yl)-2-[3-(trifluoromethyl)phenyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.233 |
| 7GB9 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-11 (Mpro-x10248) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 KQX 2-(4-methylphenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.210 |
| 7GBA Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ANT-OPE-d972fbad-1 (Mpro-x10296) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 KS0 1-{4-[(4-fluorophenyl)methyl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.255 |
| 7GBB Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAN-LON-a5fc619e-3 (Mpro-x10306) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | KSI 1-[(3S)-4-[(3-chlorophenyl)methyl]-3-(2-methylpropyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.234 |
| 7GBC Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-2eddb1ff-1 (Mpro-x10314) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 KSX 2-(5-cyanopyridin-3-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.225 |
| 7GBD Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-MED-2de63afb-2 (Mpro-x10322) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 KT9 N-(3-methyl-5-{[(2S)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)-2-(pyrimidin-5-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.222 |
| 7GBE Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-a3ef7265-20 (Mpro-x10324) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | KU6 (4R)-6-chloro-N-(4-cyclopropyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.221 |
| 7GBF Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-9 (Mpro-x10327) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 KUU (2R)-2-(3-chlorophenyl)-3-methyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)butanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.213 |
| 7GBG Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-1 (Mpro-x10329) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 KVF (2S)-2-(3-chlorophenyl)-N-(5-methylpyridazin-4-yl)butanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.212 |
| 7GBH Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-49816e9b-2 (Mpro-x10334) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 KVO 2-(3-chlorophenyl)-N-(2,4-dimethylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.209 |
| 7GBI Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-a3ef7265-3 (Mpro-x10338) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 KVX (3S)-5-chloro-N-[4-(hydroxymethyl)pyridin-3-yl]-2,3-dihydro-1-benzofuran-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.192 |
| 7GBJ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-32 (Mpro-x10355) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 KW9 7-fluoro-N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.229 |
| 7GBK Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-95b75b4d-2 (Mpro-x10359) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | KXF 2-(3-hydroxyphenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.216 |
| 7GBL Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-MED-2de63afb-1 (Mpro-x10371) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 KWR N-(3-{[(2S)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.245 |
| 7GBM Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-3 (Mpro-x10377) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 KX9 (2R)-2-(3-chlorophenyl)-N-[(4M)-4-(1H-pyrazol-1-yl)pyridin-3-yl]propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.215 |
| 7GBN Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-MED-2de63afb-14 (Mpro-x10387) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 KXR N-(3-fluoro-5-{[(2S)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)-2-(pyrimidin-5-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.235 |
| 7GBO Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-20 (Mpro-x10392) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 KY0 1-(3-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)cyclopropane-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.217 |
| 7GBP Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-10 (Mpro-x10395) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 KYC (2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-(dimethylamino)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.223 |
| 7GBQ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-23 (Mpro-x10396) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 KYU 2-(3-chlorophenyl)-2,2-difluoro-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.226 |
| 7GBR Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-7e92b6ca-4 (Mpro-x10403) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 KZC N-(2-anilinoethyl)-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.259 |
| 7GBS Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-95b75b4d-1 (Mpro-x10417) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 KZX 2-(3-fluorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.211 |
| 7GBT Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-7e92b6ca-2 (Mpro-x10419) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | L1F N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]-N-methyl-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.195 |
| 7GBU Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ADA-UNI-f8e79267-5 (Mpro-x10421) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | L2I (2S)-4-(methylamino)-2-phenyl-N-(pyridin-3-yl)butanamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.230 |
| 7GBV Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-22 (Mpro-x10422) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 L3I 2-(3-chlorophenyl)-2-methyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.225 |
| 7GBW Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-8 (Mpro-x10423) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 L6R (2R)-2-(3-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)pentanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.240 |
| 7GBX Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-5a013bed-2 (Mpro-x10466) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 L6D N-(1H-benzimidazol-1-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.228 |
| 7GBY Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-5 (Mpro-x10473) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 L5I (2R)-3-cyclopropyl-2-methyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.222 |
| 7GBZ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-11 (Mpro-x10474) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 L4U (3S)-3,4-dimethyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)pentanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.227 |
| 7GC0 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-21 (Mpro-x10476) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 L4N (5R)-N-(4-methylpyridin-3-yl)spiro[2.4]heptane-5-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.215 |
| 7GC1 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-25 (Mpro-x10478) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 L7F 2-[(1S,5R)-bicyclo[3.1.0]hexan-1-yl]-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.239 |
| 7GC2 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-93268d01-13 (Mpro-x10484) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 L7Q 3-methyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)-3-phenylbutanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.231 |
| 7GC3 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-cedd89ab-4 (Mpro-x10488) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 L7V 1-[(2S)-2-(5-cyclopropyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)pyrrolidin-1-yl]-2-(pyridin-3-yl)ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.214 |
| 7GC4 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-18 (Mpro-x10494) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 L83 N-(2-amino-4-methylpyridin-3-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.219 |
| 7GC5 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DUN-NEW-f8ce3686-24 (Mpro-x10506) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 L8F N-(2-{7-[(4-acetylpiperazin-1-yl)methyl]-1H-indol-3-yl}ethyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.227 |
| 7GC6 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-THE-c331be7a-6 (Mpro-x10513) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 L8O 1-[(4R)-4-(3-methylphenyl)-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.216 |
| 7GC7 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-39 (Mpro-x10525) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 L93 6-fluoro-N-[(2R)-2-(2-methoxyphenoxy)propyl]-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.211 |
| 7GC8 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-18 (Mpro-x10535) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 L9F (3P,5R)-3-(3-chlorophenyl)-5-(pyridin-3-yl)imidazolidine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.228 |
| 7GC9 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-22 (Mpro-x10555) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 L9O (1S)-N-(4-methylpyridin-3-yl)spiro[3.3]heptane-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.230 |
| 7GCA Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-18 (Mpro-x10559) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 LB0 (1r,3r)-3-cyclopropyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)cyclobutane-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.215 |
| 7GCB Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-13 (Mpro-x10565) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 LBC 2-(3-iodophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.222 |
| 7GCC Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-95b75b4d-4 (Mpro-x10566) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 LBO 2-(3-cyclopropylphenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.227 |
| 7GCD Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-23 (Mpro-x10575) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 LCU 2-[(1R,3s,5S)-bicyclo[3.1.0]hexan-3-yl]-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.215 |
| 7GCE Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-93268d01-7 (Mpro-x10598) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 LDX 3-(2-fluorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.204 |
| 7GCF Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-5a013bed-4 (Mpro-x10604) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 LKX 2-(3-chlorophenyl)-N-(5-oxo-1,5-dihydro-4H-1,2,4-triazol-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.212 |
| 7GCG Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-21 (Mpro-x10606) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 LKI 3-chloro-N-(4-methylpyridin-3-yl)benzene-1-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.246 |
| 7GCI Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-27 (Mpro-x10610) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 LJO (3R)-3-cyano-N-(4-methylpyridin-3-yl)oxolane-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.216 |
| 7GCJ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-19 (Mpro-x10626) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 LJ0 (1R,6S,7r)-N-(4-methylpyridin-3-yl)bicyclo[4.1.0]heptane-7-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.204 |
| 7GCK Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-48 (Mpro-x10638) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 LF3 2-(6-chloro-3-oxo-2,3-dihydro-4H-1,4-benzoxazin-4-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.217 |
| 7GCL Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-59 (Mpro-x10645) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 LR0 (7R)-N-(4-acetamidopyridin-3-yl)-4-fluorobicyclo[4.2.0]octa-1,3,5-triene-7-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.229 |
| 7GCM Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-THE-c331be7a-2 (Mpro-x10678) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 LQU 3-[(4R)-2-acetyl-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-4-yl]benzonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.227 |
| 7GCN Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-41 (Mpro-x10679) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 LQ0 2-(6-chloro-1H-indol-1-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.216 |
| 7GCO Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-7e92b6ca-1 (Mpro-x10700) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 LO0 N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]-2-oxo-2,3-dihydropyridine-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.217 |
| 7GCP Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NAU-LAT-64f4b287-5 (Mpro-x10710) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 LM0 (3S)-N',2-diacetyl-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carbohydrazide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.214 |
| 7GCQ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-2eddb1ff-2 (Mpro-x10723) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 LRC 2-(5-chloropyridin-3-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.239 |
| 7GCR Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with WAR-XCH-72a8c209-5 (Mpro-x10728) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 LRN 1-[(3R)-3-{(cyclohexylmethyl)[(1r,4R)-4-hydroxycyclohexyl]amino}piperidin-1-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.224 |
| 7GCS Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-18 (Mpro-x10733) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 LS0 2-(6-fluoro-1H-indol-1-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.223 |
| 7GCT Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BRU-LEF-c49414a7-1 (Mpro-x10756) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 LSF N-(4-methylpyridin-3-yl)-2-(3-{[(2R)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.235 |
| 7GCU Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-25 (Mpro-x10787) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 LT9 1-(3-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)-3-oxocyclobutane-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.208 |
| 7GCV Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-2eddb1ff-7 (Mpro-x10789) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 LUC 2-(3-chloro-5-{[(2R)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.229 |
| 7GCW Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NAU-LAT-445f63e5-6 (Mpro-x10800) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 LV9 N-(4-benzyloxan-4-yl)-N'-(pyridin-3-yl)urea × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.211 |
| 7GCX Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-24 (Mpro-x10801) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 LVM N-(4-methylpyridin-3-yl)-2-(spiro[2.3]hexan-5-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.225 |
| 7GCY Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-c59291d4-5 (Mpro-x10812) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 LW6 1H-indole-4-carbaldehyde × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.217 |
| 7GCZ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-c59291d4-4 (Mpro-x10820) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 LWO 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[4-(methylamino)phenyl]-N-[(thiophen-3-yl)methyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.228 |
| 7GD0 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-23 (Mpro-x10834) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 M4L (2S)-2-(3-bromophenyl)-2-hydroxy-N-(4-methoxypyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.230 |
| 7GD1 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-58 (Mpro-x10856) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 M2X (2R)-2-amino-2-(5-bromo-2-methoxyphenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.208 |
| 7GD2 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-3 (Mpro-x10862) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 M26 N-[(1R)-1-(3-bromophenyl)-2-methoxyethyl]-2-[(3S)-5-fluoro-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-3-yl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.212 |
| 7GD3 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-c59291d4-3 (Mpro-x10870) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 Y6J ~{N}-[4-[2-(benzotriazol-1-yl)ethanoyl-(thiophen-3-ylmethyl)amino]phenyl]cyclopropanecarboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.222 |
| 7GD4 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-c59291d4-2 (Mpro-x10871) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 R30 N-{4-[(1H-benzotriazol-1-ylacetyl)(thiophen-3-ylmethyl)amino]phenyl}propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.222 |
| 7GD5 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-d2866bdf-1 (Mpro-x10876) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 M0X 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[4-(dimethylamino)phenyl]-N-[(thiophen-3-yl)methyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.220 |
| 7GD6 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-38 (Mpro-x10888) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 M0G (2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxy-N-(4-methylpyridin-3-yl)butanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.210 |
| 7GD7 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ADA-UNI-f8e79267-2 (Mpro-x10889) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 LZX (2R)-4-[(methanesulfonyl)amino]-2-phenyl-N-(pyridin-3-yl)butanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.211 |
| 7GD8 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-119787ef-1 (Mpro-x10898) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 KU6 (4R)-6-chloro-N-(4-cyclopropyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.218 |
| 7GD9 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DUN-NEW-f8ce3686-23 (Mpro-x10899) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 LXF N-{4-[(2-phenylethyl)sulfamoyl]-1,3-benzothiazol-2-yl}acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.212 |
| 7GDA Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-2eddb1ff-3 (Mpro-x10900) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 MF0 (2R)-2-(5-chloropyridin-3-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.215 |
| 7GDB Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-968e8d9c-1 (Mpro-x10906) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 M9U (4S)-6-chloro-N-(4-cyclopropyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.216 |
| 7GDC Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-0a73fcb8-7 (Mpro-x10942) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 M93 (4R)-6-chloro-N-[4-(hydroxymethyl)pyridin-3-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.217 |
| 7GDD Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ADA-UCB-6c2cb422-1 (Mpro-x10959) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 860 2-(3-chlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.201 |
| 7GDE Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-12 (Mpro-x10976) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 M7X 2-(3-chlorophenyl)-N-(5-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.224 |
| 7GDF Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-a3ef7265-23 (Mpro-x10995) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 M6U N-(4-ethylpyridin-3-yl)-2-[6-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.231 |
| 7GDG Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAR-DIA-23aa0b97-14 (Mpro-x10996) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 M6I N-(3-chlorophenyl)-N'-(pyridin-3-yl)urea × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.226 |
| 7GDH Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LOR-NEU-c8f11034-6 (Mpro-x11001) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 M5X (3S)-3-hydroxy-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indole-5-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.238 |
| 7GDI Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-49816e9b-1 (Mpro-x11011) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 M5I N-(3-chlorophenyl)-2-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.242 |
| 7GDJ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-16 (Mpro-x11013) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 M50 2-(3-chlorophenyl)-N-(5-methylpyridazin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.268 |
| 7GDK Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-21 (Mpro-x11025) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 MJR 2-(3-chlorophenyl)-N-(3-methyl-1H-pyrazol-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.232 |
| 7GDL Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-15 (Mpro-x11041) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 MKI 2-(3-chlorophenyl)-N-methyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.231 |
| 7GDM Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-714a760b-16 (Mpro-x11044) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 MQ3 (2R)-2-cyclohexyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.216 |
| 7GDN Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-0e996074-1 (Mpro-x11159) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 MU3 (4R)-N-(4-cyclopropyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.197 |
| 7GDO Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-c0c213c9-14 (Mpro-x11164) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 MVR N-[(1-methyl-1H-pyrazol-3-yl)methyl]-2-(pyridin-3-yl)-N-[4-(pyridin-2-yl)phenyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.267 |
| 7GDP Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NAU-LAT-8502cac5-2 (Mpro-x11186) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 MVX (3S)-5-chloro-N-(4-cyclopropyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.239 |
| 7GDQ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LOR-NOR-30067bb9-15 (Mpro-x11204) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 MWN methyl (3R)-5-bromo-3-hydroxy-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indole-7-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.212 |
| 7GDR Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LOR-NOR-30067bb9-2 (Mpro-x11208) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 MX9 (3-methylphenyl)methyl (3R)-3-hydroxy-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indole-7-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.233 |
| 7GDS Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LOR-NOR-30067bb9-18 (Mpro-x11212) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 MZF (3R)-5-bromo-3-hydroxy-1-[(1,2,4-oxadiazol-3-yl)methyl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.204 |
| 7GDT Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAK-UNK-0d6072ac-20 (Mpro-x11223) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 N00 (2R)-2-(6-chloro-1-methyl-9H-carbazol-2-yl)propanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.216 |
| 7GDU Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-SGC-a8a902d9-1 (Mpro-x11225) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 N0F (3R)-3-(4-hydroxypiperidin-1-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)-3-(thiophen-3-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.214 |
| 7GDV Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NAU-LAT-8502cac5-6 (Mpro-x11231) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 N0O (3S)-5-chloro-N-(4-phenyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.241 |
| 7GDW Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BRU-THA-a358fbdd-2 (Mpro-x11233) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 N0X (4R)-N-(4-cyclopropyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)-4-methyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.221 |
| 7GDX Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LOR-NOR-30067bb9-7 (Mpro-x11254) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 N1U (3S)-5-bromo-1-[(3,4-dimethoxyphenyl)methyl]-3-hydroxy-7-methyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.229 |
| 7GDY Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LOR-NOR-30067bb9-6 (Mpro-x11258) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 N2X (3S)-5-bromo-1-[(2-ethoxyphenyl)methyl]-3-hydroxy-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.259 |
| 7GDZ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-c9973a83-1 (Mpro-x11271) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 N3I 2-(3-chloro-5-methoxyphenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.246 |
| 7GE0 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-6af13d92-2 (Mpro-x11276) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 N3R 5-fluoro-N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.248 |
| 7GE1 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-6af13d92-3 (Mpro-x11294) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 N43 5-methoxy-N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.252 |
| 7GE2 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-6af13d92-1 (Mpro-x11313) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 N4L N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]-5-methyl-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.240 |
| 7GE3 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-714a760b-3 (Mpro-x11317) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 N5L N-(5-amino-4-methylpyridin-3-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.192 |
| 7GE4 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-714a760b-19 (Mpro-x11318) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 N6X N-(5-amino-4-methylpyridin-3-yl)-2-(3-cyanophenyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.200 |
| 7GE5 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-5b47150d-6 (Mpro-x11339) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 N7L (1R,2R)-2-(fluoromethyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)cyclopropane-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.225 |
| 7GE6 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-a3ef7265-18 (Mpro-x11346) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 N8X 2-(3,5-dimethylphenyl)-N-(4-methyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.218 |
| 7GE7 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ADA-UCB-6c2cb422-3 (Mpro-x11354) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 N9I 2-(4-methylpyridin-3-yl)-N-(1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-8-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.207 |
| 7GE8 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-7e92b6ca-16 (Mpro-x11366) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NB0 4-[4-(2-fluorophenyl)piperazine-1-carbonyl]quinolin-2(1H)-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.225 |
| 7GE9 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-12 (Mpro-x11368) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NB6 2-(3-bromophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.206 |
| 7GEA Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-2 (Mpro-x11372) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 N6F (2S)-N-(4-acetamidopyridin-3-yl)-2-(3-chlorophenyl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.229 |
| 7GEB Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-93268d01-8 (Mpro-x11417) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NDI 2-(4-acetylpiperazin-1-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.219 |
| 7GEC Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UCB-00f2c2b3-7 (Mpro-x11424) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NEL 2-(3-chlorophenyl)-N-(1H-indazol-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.197 |
| 7GED Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-cedd89ab-2 (Mpro-x11426) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NGX (2S)-1-(3-chlorophenyl)-3-(1H-1,2,4-triazol-1-yl)propan-2-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.223 |
| 7GEE Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-93268d01-5 (Mpro-x11427) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NIJ 3-(3-fluorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.198 |
| 7GEF Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-93268d01-11 (Mpro-x11428) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 NJE N-(4-methylpyridin-3-yl)-2-(piperidin-1-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.186 |
| 7GEG Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-a364e151-1 (Mpro-x11431) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NJU 2-(3-chlorophenyl)-N-(5,6,7,8-tetrahydroisoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.222 |
| 7GEH Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-06d94977-2 (Mpro-x11432) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NKU 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[(3-chlorophenyl)methyl]-N-methylacetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.197 |
| 7GEI Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-8df914d1-2 (Mpro-x11454) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NM0 2-(3-chlorophenyl)-N-[(4R)-imidazo[1,2-a]pyridin-3-yl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.232 |
| 7GEJ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-c9c1e0d8-2 (Mpro-x11458) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NO0 2-(3-ethynylphenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.251 |
| 7GEK Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-8df914d1-4 (Mpro-x11473) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NOI 2-(3-chlorophenyl)-N-(1-methyl-1H-imidazol-5-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.214 |
| 7GEL Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-cedd89ab-1 (Mpro-x11475) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NQ3 (1M,3P)-1-(3-chlorophenyl)-3-(4-methylpyridin-3-yl)-1,3-dihydro-2H-imidazol-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.217 |
| 7GEM Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-15 (Mpro-x11485) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 NQO 2-(3-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridazin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.32 Å R-free 0.206 |
| 7GEN Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-1e5f28a7-1 (Mpro-x11488) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NRC methyl (2R)-2-(3-chlorophenyl)-3-[(4-methylpyridin-3-yl)amino]-3-oxopropanoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.210 |
| 7GEO Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-50fe53e8-3 (Mpro-x11493) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NRX 2-(3-chlorophenyl)-N-[(4S)-imidazo[1,5-a]pyridin-1-yl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.224 |
| 7GEQ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UCB-1dbca3b4-15 (Mpro-x11498) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 NSR (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.257 |
| 7GER Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-f7918075-5 (Mpro-x11499) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NU0 2-(3-chlorophenyl)-N-(2,6-naphthyridin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.280 |
| 7GES Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-bb423b95-7 (Mpro-x11501) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NUR 2-(3-chlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-N-methylacetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.213 |
| 7GET Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-0c2c77e1-1 (Mpro-x11507) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NV9 2-(3-chlorophenyl)-N-(4-phenylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.254 |
| 7GEU Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-50fe53e8-1 (Mpro-x11508) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NVO 2-(3-chlorophenyl)-N-(phthalazin-1-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.211 |
| 7GEV Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-f13221e1-4 (Mpro-x11513) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NW0 3-(3-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.215 |
| 7GEW Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-bb423b95-2 (Mpro-x11530) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NWI 2-(3-chlorophenyl)-N-(1,6-naphthyridin-8-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.219 |
| 7GEX Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIC-UNK-66895286-1 (Mpro-x11532) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NX9 2-(3-chlorophenyl)-N-(1H-pyrazol-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.216 |
| 7GEY Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIC-UNK-66895286-3 (Mpro-x11540) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NYR N-(3-chlorophenyl)-2-(3-methyl-1H-pyrazol-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.216 |
| 7GEZ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-6747fa38-1 (Mpro-x11541) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 NZK 2-(4-acetylpiperazin-1-yl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.204 |
| 7GF0 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-bb423b95-1 (Mpro-x11542) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O0C 2-(3-chlorophenyl)-N-(2,7-naphthyridin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.242 |
| 7GF1 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-95b75b4d-5 (Mpro-x11543) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O0R 2-(3-chlorophenyl)-N-(4-cyclopropylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.255 |
| 7GF2 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIC-UNK-08cd9c58-1 (Mpro-x11548) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O0X 2-(3-chlorophenyl)-N-(1,7-naphthyridin-5-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.219 |
| 7GF3 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-5 (Mpro-x11557) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O1I (2S)-2-(3-chlorophenyl)-3-hydroxy-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.260 |
| 7GF4 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-17 (Mpro-x11560) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O1X (2S)-2-(difluoromethoxy)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.230 |
| 7GF5 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-7 (Mpro-x11562) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O2R 2-(2-butoxy-5-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.213 |
| 7GF6 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-f42f3716-6 (Mpro-x11564) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O3I 2-[(1M)-5-chloro-2',3'-difluoro-4'-methyl[1,1'-biphenyl]-3-yl]-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.219 |
| 7GF7 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TAT-ENA-80bfd3e5-7 (Mpro-x11579) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O3U N-[(1R)-1,5-dicyano-4-(methylsulfanyl)-3-azaspiro[5.5]undeca-2,4-dien-2-yl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.241 |
| 7GF8 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TAT-ENA-80bfd3e5-37 (Mpro-x11587) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O4L N-(3-acetyl-2,5-dimethyl-1H-pyrrol-1-yl)-4-oxo-3,4-dihydrophthalazine-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.210 |
| 7GF9 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TAT-ENA-80bfd3e5-4 (Mpro-x11590) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O5C 1-[(4S)-3-(4-fluorobenzoyl)-2-methylindolizin-1-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.240 |
| 7GFA Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-3b92565d-1 (Mpro-x11609) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 Z26 2-(5-chloro-2-methoxyphenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.263 |
| 7GFB Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-b3e365b9-1 (Mpro-x11612) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NSR (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.224 |
| 7GFC Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-a0b0dbcb-4 (Mpro-x11616) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O87 4-{4-[3-(trifluoromethyl)phenyl]piperazine-1-carbonyl}quinolin-2(1H)-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.253 |
| 7GFD Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-2eddb1ff-8 (Mpro-x11641) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O8L (2S)-2-(3-chloro-5-{[(2R)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.236 |
| 7GFE Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-6344a35d-1 (Mpro-x11642) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 O9O N-{3-chloro-5-[(6-methoxypyridin-2-yl)oxy]phenyl}-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.218 |
| 7GFF Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5d20d11c-1 (Mpro-x11708) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 O9X (2R)-2-(difluoromethoxy)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.223 |
| 7GFG Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with CHO-MSK-6e55470f-5 (Mpro-x11723) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OAO 2-{3-chloro-5-[(3-methyl-1,2,4-oxadiazol-5-yl)methoxy]phenyl}-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.250 |
| 7GFH Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-f7918075-8 (Mpro-x11742) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OBO 2-(3-chlorophenyl)-N-(1H-imidazo[4,5-c]pyridin-7-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.223 |
| 7GFI Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with WIL-MOD-03b86a88-6 (Mpro-x11743) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OCI 2-(3-chloro-5-sulfamamidophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.233 |
| 7GFJ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-c0c213c9-1 (Mpro-x11757) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OD7 2-(6-methoxy-1H-benzotriazol-1-yl)-N-[4-(piperidin-4-yl)phenyl]-N-[(pyridin-2-yl)methyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.222 |
| 7GFK Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-044491d2-1 (Mpro-x11764) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 ODX 2-(3-chloro-5-{[(1S,2S)-2-hydroxycyclopentyl]amino}phenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.217 |
| 7GFL Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-bfb445d4-2 (Mpro-x11789) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OE6 N-(1H-benzotriazol-1-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.244 |
| 7GFM Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-1901c25b-1 (Mpro-x11790) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OEO N-[4-(dimethylamino)phenyl]-2-(isoquinolin-4-yl)-N-[(thiophen-3-yl)methyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.251 |
| 7GFN Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-7374c256-2 (Mpro-x11797) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OFX 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[4-(dimethylamino)phenyl]-N-[(1H-pyrazol-5-yl)methyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.236 |
| 7GFO Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ROB-IMP-e811baff-1 (Mpro-x11798) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OGF 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[4-(methylcarbamamido)phenyl]-N-[(thiophen-3-yl)methyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.223 |
| 7GFP Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-6b94ceba-5 (Mpro-x11801) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OHC 2-[3-(acetamidomethyl)-5-chlorophenyl]-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.243 |
| 7GFQ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-b3e365b9-3 (Mpro-x11809) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OI4 (4R)-6-chloro-N-(4-methylpyridin-3-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.228 |
| 7GFR Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-3c72d439-1 (Mpro-x11810) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OIE 2-(4-chloropyridin-2-yl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.221 |
| 7GFS Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAR-UCB-f313ec4d-6 (Mpro-x11812) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OIK (isoquinolin-4-yl)(4-phenylpiperazin-1-yl)methanone × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.234 |
| 7GFT Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAR-UCB-f313ec4d-2 (Mpro-x11813) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OIX N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]isoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.236 |
| 7GFU Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-bbbbc21a-3 (Mpro-x11831) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OJ9 2-(5-chloro-1-benzofuran-7-yl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.228 |
| 7GFV Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-2db6411e-2 (Mpro-x11852) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OJO 1-{4-[(3-chloro-5-hydroxyphenyl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.235 |
| 7GFW Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-fa06b69f-6 (Mpro-x11894) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OK9 N-{(1Z)-1-[5-(morpholin-4-yl)thiophen-2-yl]-3-oxoprop-1-en-2-yl}thiophene-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.214 |
| 7GFX Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-199e2e7c-1 (Mpro-x12000) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OKW 2-(3-chlorophenyl)-N-(6,7-dihydro-5H-cyclopenta[c]pyridin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.258 |
| 7GFY Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LOR-NOR-c954e7ad-4 (Mpro-x12010) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14 OLX [(3R)-5-ethyl-3-hydroxy-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-1-yl]acetic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.214 |
| 7GFZ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-a0b0dbcb-8 (Mpro-x12025) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 ONU 4-[3-(2-methoxyanilino)azetidine-1-carbonyl]quinolin-2(1H)-one × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.215 |
| 7GG0 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-e44ffd04-1 (Mpro-x12026) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OGV 2-(3-chlorophenyl)-N-[(4S)-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-3-yl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.228 |
| 7GG1 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-a0b0dbcb-9 (Mpro-x12064) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OGO 4-[3-(2-methoxyphenoxy)azetidine-1-carbonyl]quinolin-2(1H)-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.209 |
| 7GG2 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-8a69d52e-7 (Mpro-x12073) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OO6 (3S,4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3-methyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.275 |
| 7GG3 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with AAR-RCN-748c104b-1 (Mpro-x12080) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 OOL (E)-1-(4,6-dimethoxypyrimidin-2-yl)methanimine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.215 |
| 7GG4 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-52b62a6f-11 (Mpro-x12136) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OPU (4R)-6-chloro-N-[(4S)-7-methyl[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-8-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.259 |
| 7GG5 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-87c86d55-1 (Mpro-x12143) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OQF 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[4-(dimethylamino)phenyl]-N-[(1,3-thiazol-4-yl)methyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.214 |
| 7GG6 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-477dc5b7-2 (Mpro-x12171) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OQL (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.245 |
| 7GG7 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with CHO-MSK-00c5269a-2 (Mpro-x12177) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OQX 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[(3-chlorophenyl)methyl]-N-(4-methoxyphenyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.207 |
| 7GG8 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-cd485364-2 (Mpro-x12202) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 ORR 1-(5-amino-3,4-dihydro-1,7-naphthyridin-1(2H)-yl)-2-(3-chlorophenyl)ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.218 |
| 7GG9 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ANT-DIA-62e4526e-1 (Mpro-x12204) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 SQ2 2-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-yl)-1-(4-methylpiperidin-1-yl)ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.230 |
| 7GGA Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-e4b030d8-13 (Mpro-x12207) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 OSI (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.204 |
| 7GGB Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-044491d2-7 (Mpro-x12300) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OT6 2-{3-chloro-5-[(2-cyano-2-methylpropyl)amino]phenyl}-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.199 |
| 7GGC Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-044491d2-3 (Mpro-x12321) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OTV 2-(3-chloro-5-{[(1S,2R)-2-(trifluoromethyl)cyclopropyl]amino}phenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.286 |
| 7GGD Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-b5746674-38 (Mpro-x12350) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OUF N-[(furan-2-yl)methyl]-N'-(2-methyl-1-oxo-1,2-dihydroisoquinolin-4-yl)-N-{3-[(propan-2-yl)oxy]propyl}urea × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.204 |
| 7GGE Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-6d04362c-1 (Mpro-x12419) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 OV4 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-benzyl-N-[4-(dimethylamino)phenyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.248 |
| 7GGF Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-6d04362c-2 (Mpro-x12423) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 OVF 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[(3-chlorophenyl)methyl]-N-[4-(dimethylamino)phenyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.282 |
| 7GGG Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-d6de1f3c-2 (Mpro-x12582) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OVX 1-(3-chlorophenyl)-4-(isoquinoline-4-carbonyl)piperazin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.228 |
| 7GGH Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-c9c1e0d8-3 (Mpro-x12587) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 OWC (3S)-3-(3-chlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)piperidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.246 |
| 7GGI Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-14ad9fe9-1 (Mpro-x12640) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OWX 2-(3-chlorophenyl)-N-(1,2,3,4-tetrahydro-1,7-naphthyridin-5-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.210 |
| 7GGJ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-4f474d93-1 (Mpro-x12659) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OYF (4R)-6-chloro-N-(2,7-naphthyridin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.234 |
| 7GGK Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-64a710fa-1 (Mpro-x12661) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OYX N-(2-cyclohexylethyl)-2-(isoquinolin-4-yl)-N-[(thiophen-2-yl)methyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.225 |
| 7GGL Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-ce760d3f-8 (Mpro-x12674) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OZC (3S)-3-(4-chlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)piperidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.272 |
| 7GGM Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-afd4d4fd-2 (Mpro-x12677) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 OZX 2-(6-chloropyridin-2-yl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.235 |
| 7GGN Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-d6de1f3c-1 (Mpro-x12679) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 P0X 4-[4-(3-chlorophenyl)-3-oxopiperazine-1-carbonyl]quinolin-2(1H)-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.239 |
| 7GGO Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-8b8a49e1-4 (Mpro-x12682) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 P3L (4R)-6-chloro-N-[(4R)-2-oxopiperidin-4-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.229 |
| 7GGP Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UCB-29506327-1 (Mpro-x12686) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 P4R (1'M,4S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,4'-imidazolidine]-2',5'-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.218 |
| 7GGQ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-92e193ae-1 (Mpro-x12692) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 OQL (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.227 |
| 7GGR Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-c7771779-1 (Mpro-x12695) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 P6O (4S)-6-chloro-4-hydroxy-N-(isoquinolin-4-yl)-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.228 |
| 7GGS Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0e5afe9d-1 (Mpro-x12696) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 P7R (4R)-6-chloro-N-(1-methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-7-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.220 |
| 7GGT Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-c852c98b-10 (Mpro-x12698) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 P9O (4R)-6-chloro-N-(5,6,7,8-tetrahydro-2,6-naphthyridin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.225 |
| 7GGU Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0e5afe9d-3 (Mpro-x12699) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 PJ6 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.237 |
| 7GGV Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIC-UNK-91acba05-6 (Mpro-x12710) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 PJX (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.235 |
| 7GGW Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-2bb0cf2b-2 (Mpro-x12715) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 PKW (4R)-6-chloro-N-(1-methyl-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-7-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.240 |
| 7GGX Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-971238d3-5 (Mpro-x12716) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 PQ6 (4R)-4-(aminomethyl)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.228 |
| 7GGY Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-966f8da6-2 (Mpro-x12717) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 PUU (4R)-1-acetyl-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.278 |
| 7GGZ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-3c65e9ce-2 (Mpro-x12719) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 PVR 2-(4-acetylpiperazin-1-yl)-N-(4-cyclopropylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.209 |
| 7GH0 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-ce760d3f-4 (Mpro-x12723) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 PWR (4R)-6-chloro-N-(2-oxo-2lambda~5~-isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.220 |
| 7GH1 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-2bb0cf2b-1 (Mpro-x12731) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 PZ6 (4S)-4-(aminomethyl)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.214 |
| 7GH2 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-090737b9-1 (Mpro-x12735) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 Q0I (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-N-propanoyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.218 |
| 7GH3 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-3c65e9ce-4 (Mpro-x12740) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 Q1C 2-(4-methylpiperidin-1-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.237 |
| 7GH4 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-00c1612e-1 (Mpro-x12777) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 Q1U 2-(3-chlorophenyl)-N-(6-methoxyisoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.248 |
| 7GH5 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-714-12 (Mpro-x2908) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q2G N-(3-chlorophenyl)-N'-(4-methylpyridin-3-yl)urea × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.213 |
| 7GH6 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-916-2 (Mpro-x2910) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q2U N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.216 |
| 7GH7 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-714-22 (Mpro-x2912) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q36 (2R)-2-(3-cyanophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.204 |
| 7GH8 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAR-DIA-23aa0b97-13 (Mpro-x2964) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q3U N-(5-aminopyridin-3-yl)-N'-(3-chlorophenyl)urea × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.207 |
| 7GH9 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-362d364a-10 (Mpro-x2971) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q45 2-[(2S)-2-{2-[(methanesulfonyl)amino]ethyl}piperidin-1-yl]-N-(pyridin-3-yl)acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.211 |
| 7GHA Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAN-LON-a5fc619e-8 (Mpro-x3077) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q4F 1-{(1S,4S)-5-[(3-chlorophenyl)methyl]-2,5-diazabicyclo[2.2.1]heptan-2-yl}ethan-1-one × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.225 |
| 7GHB Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with GAB-REV-70cc3ca5-8 (Mpro-x3080) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q4R N~2~-methyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)-N~2~-(quinoline-8-sulfonyl)glycinamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.225 |
| 7GHC Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with GAB-REV-70cc3ca5-13 (Mpro-x3108) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q5C N-(4-methylpyridin-3-yl)-N~2~-[(pyridin-3-yl)acetyl]glycinamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.210 |
| 7GHD Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-4e090d3a-57 (Mpro-x3298) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q5K (2S)-N-{2-[(4-fluorobenzene-1-sulfonyl)amino]phenyl}-2-hydroxy-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.234 |
| 7GHE Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-916a2c5a-4 (Mpro-x3303) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q5R 4-(4-phenylpiperazine-1-carbonyl)quinolin-2(1H)-one × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.256 |
| 7GHF Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-4e090d3a-47 (Mpro-x3305) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q60 N'-[(1-methyl-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methyl]-N-(2-phenylethyl)-N-[(pyridin-3-yl)methyl]urea × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.223 |
| 7GHG Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAV-CRI-3edb475e-4 (Mpro-x3324) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q69 N-[(1R)-1-(3-chlorophenyl)-2-hydroxyethyl]acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.209 |
| 7GHH Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TOB-UNK-c2aba166-1 (Mpro-x3325) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q6U 1-[4-(prop-2-yn-1-yl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.223 |
| 7GHI Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAN-PUR-6788a628-2 (Mpro-x3333) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 Q7C N~3~-acetyl-N~3~-[(3S)-1,1-dioxo-1lambda~6~-thiolan-3-yl]-beta-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.219 |
| 7GHJ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with SIM-SYN-f15aaa3a-1 (Mpro-x3348) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 Q7R 1-[4-(diphenylmethyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.209 |
| 7GHK Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAR-DIA-eace69ff-36 (Mpro-x3351) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q8I 1-(5-fluoro-1H-indol-3-yl)-N-methylmethanamine × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.208 |
| 7GHL Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with GAB-REV-70cc3ca5-18 (Mpro-x3366) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Q8O 2-(1H-benzimidazol-6-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.205 |
| 7GHM Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-ce40166b-17 (Mpro-P0008) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13 Q99 N-[2-(3-chloro-5-{[(2S)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenoxy)ethyl]-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.234 |
| 7GHN Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-f2460aef-1 (Mpro-P0009) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13 QBR N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-{[2-(3-fluorophenyl)ethyl]amino}-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]furan-2-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.252 |
| 7GHO Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-c9c1e0d8-4 (Mpro-P0010) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 QC3 (3S)-3-(3-chlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)pyrrolidin-2-one × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.279 |
| 7GHP Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-4f474d93-1 (Mpro-P0012) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13 OYF (4R)-6-chloro-N-(2,7-naphthyridin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.247 |
| 7GHQ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-64a710fa-1 (Mpro-P0016) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14 OYX N-(2-cyclohexylethyl)-2-(isoquinolin-4-yl)-N-[(thiophen-2-yl)methyl]acetamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.251 |
| 7GHR Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-ce760d3f-8 (Mpro-P0017) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 OZC (3S)-3-(4-chlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)piperidin-2-one × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.260 |
| 7GHS Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-d6de1f3c-2 (Mpro-P0018) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14 OVX 1-(3-chlorophenyl)-4-(isoquinoline-4-carbonyl)piperazin-2-one × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.248 |
| 7GHT Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-c9c1e0d8-3 (Mpro-P0019) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 OWC (3S)-3-(3-chlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)piperidin-2-one × 2 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.257 |
| 7GHU Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UCB-29506327-1 (Mpro-P0022) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 P4R (1'M,4S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,4'-imidazolidine]-2',5'-dione × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.256 |
| 7GHV Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-afd4d4fd-2 (Mpro-P0025) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 OZX 2-(6-chloropyridin-2-yl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.255 |
| 7GHW Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-8b8a49e1-4 (Mpro-P0026) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 19 P3L (4R)-6-chloro-N-[(4R)-2-oxopiperidin-4-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.246 |
| 7GHX Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0e5afe9d-1 (Mpro-P0030) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14 P7R (4R)-6-chloro-N-(1-methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-7-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.241 |
| 7GHY Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-c852c98b-10 (Mpro-P0031) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16 P9O (4R)-6-chloro-N-(5,6,7,8-tetrahydro-2,6-naphthyridin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.244 |
| 7GHZ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIC-UNK-91acba05-6 (Mpro-P0033) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 20 PJX (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.254 |
| 7GI0 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-92e193ae-1 (Mpro-P0034) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 20 OQL (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.251 |
| 7GI1 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0e5afe9d-3 (Mpro-P0038) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 PJ6 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.257 |
| 7GI2 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-971238d3-5 (Mpro-P0039) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16 PQ6 (4R)-4-(aminomethyl)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.243 |
| 7GI3 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-090737b9-1 (Mpro-P0041) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 18 Q0I (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-N-propanoyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.262 |
| 7GI4 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-2eddb1ff-7 (Mpro-P0045) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 QCC 2-(3-chloro-5-{[(2S)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.254 |
| 7GI5 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BRU-THA-92256091-17 (Mpro-P0053) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 QCO N-[(1R)-2-{[2-(3-fluorophenyl)ethyl]amino}-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-{4-[(propan-2-yl)oxy]phenyl}-1H-imidazole-4-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.293 |
| 7GI6 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-4aa06b95-1 (Mpro-P0056) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 QD4 (4R)-6-chloro-N~4~-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydroquinoline-1,4(2H)-dicarboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.265 |
| 7GI7 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-6c284e65-1 (Mpro-P0057) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 QD9 N-[(3-chlorophenyl)methyl]-N-[5-(dimethylamino)pyridin-2-yl]-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.256 |
| 7GI8 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIC-UNK-45817b9b-1 (Mpro-P0060) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 17 QDF (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.256 |
| 7GI9 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-26 (Mpro-P0061) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 QDU 2-(2,5-difluorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.282 |
| 7GIA Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-33 (Mpro-P0063) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 QE3 2-(5-chloropyridin-2-yl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.269 |
| 7GIB Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-10 (Mpro-P0064) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 QER 2-(3-fluorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.257 |
| 7GIC Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-13 (Mpro-P0065) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 QEX N-(isoquinolin-4-yl)-2-(3-methylphenyl)acetamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.329 |
| 7GID Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-1 (Mpro-P0066) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 QF5 N-(isoquinolin-4-yl)-2-phenylacetamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.266 |
| 7GIE Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-17 (Mpro-P0068) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 QF9 2-(3-chloro-5-cyanophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.292 |
| 7GIF Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-7 (Mpro-P0069) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13 QFL 2-(4-fluorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.256 |
| 7GIG Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-12 (Mpro-P0074) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 QFU 2-(3-cyanophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.280 |
| 7GIH Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-16 (Mpro-P0075) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 QG3 2-(3,5-difluorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.253 |
| 7GII Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-8416115c-13 (Mpro-P0091) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 QGC (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1-[(4H-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.282 |
| 7GIJ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5d65ec79-1 (Mpro-P0097) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 QGO (4S)-6-chloro-4-[2-(dimethylamino)-2-oxoethyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.281 |
| 7GIK Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-1f3f1a6f-1 (Mpro-P0098) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 QGX (2R)-2-amino-2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.286 |
| 7GIL Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-6 (Mpro-P0108) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 QH6 2-(3-chloro-4-fluorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.287 |
| 7GIM Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-UNI-3735e77e-2 (Mpro-P0111) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 QHI (4R)-6,8-dichloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.279 |
| 7GIN Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-869ac754-1 (Mpro-P0114) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 QHU (4R)-6,7-dichloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.254 |
| 7GIO Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-fce787c2-3 (Mpro-P0121) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 QI4 (2S)-2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)propanamide × 2 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.262 |
| 7GIP Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-8416115c-5 (Mpro-P0122) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 QI7 (4R)-6-chloro-1-[(1H-imidazol-2-yl)methyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.262 |
| 7GIQ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-c852c98b-5 (Mpro-P0124) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 QIM (4R)-6-chloro-N-[6-(methanesulfonyl)isoquinolin-4-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.260 |
| 7GIR Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-971238d3-1 (Mpro-P0125) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 QIB (4S)-6-chloro-4-hydroxy-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.267 |
| 7GIS Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-30 (Mpro-P0126) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 QIQ 2-(5-chloropyridin-3-yl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.260 |
| 7GIT Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-fce787c2-5 (Mpro-P0129) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 QIT (2S)-2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-2-(methylamino)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.269 |
| 7GIU Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-05e671eb-10 (Mpro-P0130) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 QIZ (4R)-6-chloro-7-fluoro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.270 |
| 7GIV Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-de59a476-2 (Mpro-P0135) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 QJ6 (2R)-2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-2-methoxyacetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.299 |
| 7GIW Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-f9802937-7 (Mpro-P0141) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 QJF (4R)-6-chloro-N-(6-methoxyisoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.283 |
| 7GIX Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UNK-cf7facf1-1 (Mpro-P0143) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 P4R (1'M,4S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,4'-imidazolidine]-2',5'-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.275 |
| 7GIY Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BRU-CON-c4e3408a-1 (Mpro-P0145) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 OI4 (4R)-6-chloro-N-(4-methylpyridin-3-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.293 |
| 7GIZ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-5d232de5-4 (Mpro-P0148) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 PUU (4R)-1-acetyl-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.275 |
| 7GJ0 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-70ae9412-2 (Mpro-P0151) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13 QJL (4R)-6-chloro-4-{[(N,N-dimethylglycyl)amino]methyl}-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.267 |
| 7GJ1 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UNK-82501c2c-1 (Mpro-P0153) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 QJR 2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(2,7-naphthyridin-4-yl)acetamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.271 |
| 7GJ2 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-70ae9412-1 (Mpro-P0154) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 QK3 (4R)-6-chloro-4-{[2-(1H-imidazol-1-yl)acetamido]methyl}-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.264 |
| 7GJ3 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-29afea89-2 (Mpro-P0157) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13 PJ6 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.260 |
| 7GJ4 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-5d232de5-1 (Mpro-P0160) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 QKB (4R)-6-chloro-N-(6-fluoroisoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.283 |
| 7GJ5 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-5d232de5-5 (Mpro-P0171) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 PJX (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.275 |
| 7GJ6 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-fce787c2-4 (Mpro-P0178) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 QKI (2S)-2-(3,4-dichlorophenyl)-2-hydroxy-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.267 |
| 7GJ7 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UCB-50c39ae8-7 (Mpro-P0179) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13 Q0I (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-N-propanoyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.249 |
| 7GJ8 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-fce787c2-6 (Mpro-P0185) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 QKR 2-(3,4-dichlorophenyl)-2,2-difluoro-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.267 |
| 7GJ9 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-c3a96089-4 (Mpro-P0186) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 QL3 N-(6-acetamidopyridin-3-yl)-N-[(3-chlorophenyl)methyl]-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.299 |
| 7GJA Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-de59a476-4 (Mpro-P0187) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 QLC (2R)-2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-2-(2-methoxyethoxy)acetamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.289 |
| 7GJB Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5d65ec79-2 (Mpro-P0188) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 QLO (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.274 |
| 7GJC Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-BAS-c2bc0d80-6 (Mpro-P0207) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 QM3 (1'P,3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,3'-pyrrolidine]-2',5'-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.286 |
| 7GJD Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-3b97339c-2 (Mpro-P0208) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 QM9 (4S)-4-amino-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.262 |
| 7GJE Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e69ad64a-2 (Mpro-P0213) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 QML (3S)-5-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-N-propanoyl-2,3-dihydro-1-benzofuran-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.267 |
| 7GJF Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-8c98ee63-2 (Mpro-P0224) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 QMX (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-({[(1-methyl-1H-pyrazol-3-yl)methyl]amino}methyl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.274 |
| 7GJG Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-UNI-8e43a71e-8 (Mpro-P0238) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 QN9 (4S)-6-chloro-4-{2-[4-(3-hydroxypropyl)piperazin-1-yl]-2-oxoethyl}-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.280 |
| 7GJH Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-f2e727cd-5 (Mpro-P0240) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 QNU (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.269 |
| 7GJI Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-d08626de-3 (Mpro-P0243) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 QO0 (4S)-6,7-dichloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.249 |
| 7GJJ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-9739a092-9 (Mpro-P0394) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 QOO 2-{3-chloro-5-[4-(ethanesulfonyl)piperazin-1-yl]phenyl}-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.267 |
| 7GJK Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-4aa06b95-7 (Mpro-P0578) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 QOU (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-(2-methoxyethyl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.290 |
| 7GJL Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-UNI-3735e77e-1 (Mpro-P0600) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 QOC (3R)-3-(3,4-dichlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)piperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.281 |
| 7GJM Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-e4b030d8-11 (Mpro-P0601) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 QP0 (3R,4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3-methyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.276 |
| 7GJN Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-37aac4bd-4 (Mpro-P0602) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 QP6 (4S)-6,8-difluoro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.279 |
| 7GJO Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-a13804f0-3 (Mpro-P0607) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 QIZ (4R)-6-chloro-7-fluoro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.283 |
| 7GJP Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-fe871b40-11 (Mpro-P0626) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 QPQ (4S)-6-chloro-7-fluoro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.281 |
| 7GJQ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-78e1d523-1 (Mpro-P0627) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 QQ6 (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzothiopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.271 |
| 7GJR Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e9e99895-11 (Mpro-P0630) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 QQF 2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-N~2~-(methoxyacetyl)-L-alaninamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.303 |
| 7GJS Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e9e99895-2 (Mpro-P0640) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 QQO (2R)-N-{(2R)-2-(3,4-dichlorophenyl)-1-[(isoquinolin-4-yl)amino]-1-oxopropan-2-yl}-4-(propan-2-yl)morpholine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.279 |
| 7GJT Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-ba1ac7b9-11 (Mpro-P0642) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 QQU (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-{2-oxo-2-[(2R)-2-(1H-pyrazol-4-yl)piperidin-1-yl]ethyl}-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.286 |
| 7GJU Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e9e99895-6 (Mpro-P0655) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 QR5 (2R)-2-[2-(3-cyclopropyl-2-oxoimidazolidin-1-yl)acetamido]-2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.273 |
| 7GJV Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-932d1078-3 (Mpro-P0661) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 QP6 (4S)-6,8-difluoro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.275 |
| 7GJW Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with KAD-UNI-80f122c8-2 (Mpro-P0743) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 QR9 (4S)-4-{2-[(1R,4R)-5-acetyl-2,5-diazabicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]-2-oxoethyl}-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.303 |
| 7GJX Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-3ccb8ef6-1 (Mpro-P0744) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 QNU (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.291 |
| 7GJY Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e9e99895-13 (Mpro-P0747) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 QRS (3S)-N-{(2R)-2-(3,4-dichlorophenyl)-1-[(isoquinolin-4-yl)amino]-1-oxopropan-2-yl}-1-methylpyrrolidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.284 |
| 7GJZ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-9739a092-6 (Mpro-P0764) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13 CL CHLORIDE ION × 1 QRF 2-{3-chloro-5-[4-(furan-2-carbonyl)piperazin-1-yl]phenyl}-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.259 |
| 7GK0 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-BAS-c2bc0d80-7 (Mpro-P0765) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 QS3 (1'M,4S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-3'-methyl-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,4'-imidazolidine]-2',5'-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.287 |
| 7GK1 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-9e38fd34-1 (Mpro-P0766) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 QSF (3S)-5-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3-methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indole-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.269 |
| 7GK2 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-ba1ac7b9-13 (Mpro-P0772) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 QSX (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-{2-[(1S,4S)-5-methyl-2,5-diazabicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]-2-oxoethyl}-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.287 |
| 7GK3 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-fb82b63d-3 (Mpro-P0776) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 QT3 (1R)-7-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-methyl-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.283 |
| 7GK4 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-bb7ffe78-1 (Mpro-P0777) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 QTC 2-(3-chloro-5-ethylphenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.284 |
| 7GK5 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-5d232de5-7 (Mpro-P0793) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 CL CHLORIDE ION × 1 QC3 (3S)-3-(3-chlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)pyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.268 |
| 7GK6 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-fb82b63d-1 (Mpro-P0800) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 QTL (1R)-7-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.288 |
| 7GK7 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-ba1ac7b9-21 (Mpro-P0805) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 QU9 (4S)-6-chloro-4-(2-{(2R)-2-[(1H-imidazol-1-yl)methyl]pyrrolidin-1-yl}-2-oxoethyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.292 |
| 7GK8 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-dd3ad2b5-2 (Mpro-P0808) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 CL CHLORIDE ION × 1 QUQ (4S)-2-acetyl-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.289 |
| 7GK9 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-477dc5b7-5 (Mpro-P0811) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 2 QV0 (3'R)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,3'-piperidin]-2'-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.278 |
| 7GKA Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-5d232de5-8 (Mpro-P0816) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 QV9 (3R)-3-(3-chlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)pyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.283 |
| 7GKB Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-96f51285-5 (Mpro-P0831) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 1 QVG (4R)-6-chloro-7-fluoro-N-(6-fluoroisoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.284 |
| 7GKC Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-9c80c481-1 (Mpro-P0845) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 QVJ (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-{[2-(methylamino)-2-oxoethoxy]methyl}-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.268 |
| 7GKD Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-UNI-8d415491-3 (Mpro-P0850) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 QVU (4R)-6,7-dichloro-N-(2,7-naphthyridin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.299 |
| 7GKE Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-dd3ad2b5-3 (Mpro-P0851) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 QW1 (4S)-6-chloro-N~4~-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydroisoquinoline-2,4(1H)-dicarboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.281 |
| 7GKF Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-UNI-8d415491-6 (Mpro-P0872) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 QWL (4R)-6,7-dichloro-N-(6-fluoroisoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.263 |
| 7GKG Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-2f867453-1 (Mpro-P0878) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 2 QWU (3S)-5-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3-methyl-2,3-dihydro-1H-indole-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.279 |
| 7GKH Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-UNI-8d415491-1 (Mpro-P0884) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 QX3 (4R)-6,7-dichloro-N-(4-cyclopropylpyridin-3-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.282 |
| 7GKI Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RUB-POS-1325a9ea-4 (Mpro-P0887) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 QX9 2-(3-chlorophenyl)-N-(6-methylisoquinolin-4-yl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.291 |
| 7GKJ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-ba1ac7b9-19 (Mpro-P0904) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 1 QXI (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-{2-[(4R,8S)-8-methyl-5,6-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazin-7(8H)-yl]-2-oxoethyl}-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.274 |
| 7GKK Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JIN-POS-6dc588a4-6 (Mpro-P0906) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 CL CHLORIDE ION × 1 QXR N-(4-tert-butoxypyridin-3-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.277 |
| 7GKL Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with SAM-UNK-2684b532-12 (Mpro-P0925) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 QXX 2-(3-chlorophenyl)-N-[4-(trifluoromethyl)pyridin-3-yl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.277 |
| 7GKM Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-e0fe77e5-13 (Mpro-P0950) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 1 QY6 (3R)-6'-chloro-1-(isoquinolin-4-yl)-2',3'-dihydro-1'H-spiro[piperidine-3,4'-quinolin]-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.280 |
| 7GKN Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-611d11e7-4 (Mpro-P0978) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16 CL CHLORIDE ION × 1 QYI (4S)-6-chloro-N-(6-fluoroisoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.274 |
| 7GKO Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-30 (Mpro-P0996) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 1 QYN (4S)-6-chloro-2-(1H-imidazole-2-sulfonyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.274 |
| 7GKP Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-3 (Mpro-P1007) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 QYR (4S)-6-chloro-2-(cyclopropanesulfonyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.263 |
| 7GKQ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-18 (Mpro-P1010) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 QZ0 (4S)-6-chloro-N~4~-(isoquinolin-4-yl)-N~2~,N~2~-dimethyl-3,4-dihydroisoquinoline-2,4(1H)-dicarboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.272 |
| 7GKR Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-2 (Mpro-P1015) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 CL CHLORIDE ION × 1 QZC (4S)-6-chloro-2-(dimethylsulfamoyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.265 |
| 7GKS Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-11 (Mpro-P1062) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 QZL (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(3R)-3-methylpyrrolidine-1-sulfonyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.250 |
| 7GKT Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e6dd326d-8 (Mpro-P1073) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 QZU (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-[(prop-2-enamido)methyl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.260 |
| 7GKU Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-40 (Mpro-P1079) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 CL CHLORIDE ION × 1 R08 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-(1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.258 |
| 7GKV Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-23 (Mpro-P1090) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 R0F (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.264 |
| 7GKW Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e6dd326d-6 (Mpro-P1200) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 R0Q methyl ({(4R)-6-chloro-4-[(isoquinolin-4-yl)carbamoyl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-yl}methyl)carbamate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.258 |
| 7GKX Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-28 (Mpro-P1202) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 CL CHLORIDE ION × 1 R1I (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-(2-methoxyethyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.282 |
| 7GKY Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RUB-POS-1325a9ea-14 (Mpro-P1470) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 R1U 2-(3-chlorophenyl)-N-(1-methyl-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-7-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.263 |
| 7GKZ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-afb6844f-1 (Mpro-P1474) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 R2L (4R)-6-chloro-N-[4-methyl-5-(methylamino)pyridin-3-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.258 |
| 7GL0 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-a13804f0-4 (Mpro-P1477) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 R2X (2S,5R)-N-{(1R)-1-(3-chlorophenyl)-2-[(isoquinolin-4-yl)amino]-2-oxoethyl}-5-(pyrrolidine-1-carbonyl)oxolane-2-carboxamide (non-preferred name) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.257 |
| 7GL1 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-8293a91a-8 (Mpro-P1507) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 1 R3I (3S)-5-chloro-1'-(6-fluoroisoquinolin-4-yl)-2H-spiro[[1]benzofuran-3,3'-pyrrolidin]-2'-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.239 |
| 7GL2 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-1981ceba-4 (Mpro-P1623) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 2 R43 (4S)-6-chloro-2-(3-cyanoazetidine-1-sulfonyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.259 |
| 7GL3 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-1981ceba-2 (Mpro-P1624) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 2 R4X (4S)-2-(azetidine-1-sulfonyl)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.242 |
| 7GL4 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-1981ceba-3 (Mpro-P1638) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 R5H (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-(3-methoxyazetidine-1-sulfonyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.254 |
| 7GL5 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-10fcb19e-1 (Mpro-P1661) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 2 R5O (4S)-6-chloro-N-{6-[(methanesulfonyl)amino]isoquinolin-4-yl}-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.257 |
| 7GL6 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-8695a11f-1 (Mpro-P1701) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 CL CHLORIDE ION × 3 R66 (3R)-3-(3-chlorophenyl)-3-hydroxy-1-(isoquinolin-4-yl)pyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.242 |
| 7GL7 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-6bf93aa8-1 (Mpro-P1783) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13 CL CHLORIDE ION × 1 R6L (4S)-6-chloro-4-methoxy-N-[7-(methylsulfamoyl)isoquinolin-4-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.248 |
| 7GL8 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-dc2604c4-1 (Mpro-P1788) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 KG9 (4S)-6-chloro-2-[(1-cyanocyclopropyl)methanesulfonyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.242 |
| 7GL9 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UCB-50c39ae8-2 (Mpro-P1800) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 QM3 (1'P,3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,3'-pyrrolidine]-2',5'-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.289 |
| 7GLA Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-86c60949-2 (Mpro-P1812) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 R7F (4R)-6-chloro-N-[6-(2-hydroxypropan-2-yl)isoquinolin-4-yl]-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.245 |
| 7GLB Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-015fb6b4-2 (Mpro-P1835) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 2 R76 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.249 |
| 7GLC Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-6f6ae286-3 (Mpro-P1858) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 R87 (4S)-6-chloro-N-(7-fluoroisoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.271 |
| 7GLD Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-15 (Mpro-P1879) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 CL CHLORIDE ION × 1 R8I (4S)-6-chloro-2-{2-[(cyanomethyl)amino]-2-oxoethyl}-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.248 |
| 7GLE Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-13 (Mpro-P1889) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 R8O (4S)-6-chloro-2-[2-(cyclopropylamino)-2-oxoethyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.259 |
| 7GLF Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-22 (Mpro-P1978) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 R8X (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(2-methoxyethyl)(methyl)sulfamoyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.240 |
| 7GLG Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-18 (Mpro-P1980) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 CL CHLORIDE ION × 1 R95 (4S)-6-chloro-2-[(cyanomethyl)(methyl)sulfamoyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.238 |
| 7GLH Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-b38839dc-1 (Mpro-P1981) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 R9E 2-(3-chlorophenyl)-N-(7-fluoro-6-methoxyisoquinolin-4-yl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.257 |
| 7GLI Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-af1eef35-2 (Mpro-P1982) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 CL CHLORIDE ION × 1 R9I methyl N-[(4S)-6-chloro-4-[(isoquinolin-4-yl)carbamoyl]-3,4-dihydroisoquinoline-2(1H)-sulfonyl]-N-methylglycinate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.256 |
| 7GLJ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-4fff0a85-3 (Mpro-P1983) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 R9R (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(3-methyl-1,1-dioxo-1lambda~6~-thietan-3-yl)methanesulfonyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.247 |
| 7GLK Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-76744c27-4 (Mpro-P1986) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 CL CHLORIDE ION × 1 R9Z (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(1-methoxycyclopropyl)methanesulfonyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.240 |
| 7GLL Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-4fff0a85-1 (Mpro-P1988) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 RAQ (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(oxan-4-yl)methanesulfonyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.245 |
| 7GLM Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-21 (Mpro-P1990) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RBM (4S)-6-chloro-2-[(2-cyanoethyl)(methyl)sulfamoyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.260 |
| 7GLN Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-16 (Mpro-P1991) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RBX (4S)-6-chloro-2-[ethyl(methyl)sulfamoyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.240 |
| 7GLO Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-5a013bed-2 (Mpro-P2001) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 L6D N-(1H-benzimidazol-1-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.246 |
| 7GLP Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ADA-UCB-6c2cb422-1 (Mpro-P2005) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 860 2-(3-chlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.250 |
| 7GLQ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-8df914d1-2 (Mpro-P2007) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 NM0 2-(3-chlorophenyl)-N-[(4R)-imidazo[1,2-a]pyridin-3-yl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.244 |
| 7GLR Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIC-UNK-08cd9c58-1 (Mpro-P2010) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 O0X 2-(3-chlorophenyl)-N-(1,7-naphthyridin-5-yl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.245 |
| 7GLS Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-bfb445d4-2 (Mpro-P2011) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 OE6 N-(1H-benzotriazol-1-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.261 |
| 7GLT Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-12 (Mpro-P2017) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RC9 (4S)-6-chloro-2-[(1-cyanocyclobutyl)methanesulfonyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.241 |
| 7GLU Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-6479a3a9-2 (Mpro-P2028) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 1 RD5 2-(5-chloro-2-{[(methanesulfonyl)amino]methyl}phenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.245 |
| 7GLV Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-a54ce14d-2 (Mpro-P2031) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 R76 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.248 |
| 7GLW Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-1cbc2fae-1 (Mpro-P2036) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 CL CHLORIDE ION × 1 RDK (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methyl-1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.237 |
| 7GLX Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-2e8b2191-11 (Mpro-P2039) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RDQ (4S)-6-chloro-N-{6-[(methanesulfonyl)amino]isoquinolin-4-yl}-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.241 |
| 7GLY Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-23 (Mpro-P2057) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RDX (4S)-6-chloro-2-[(2-hydroxyethyl)(methyl)sulfamoyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.243 |
| 7GLZ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-14 (Mpro-P2067) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 REU (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(2S)-1-(methylamino)-1-oxopropan-2-yl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.254 |
| 7GM0 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-bfd29aac-1 (Mpro-P2070) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RFF (4S)-6-chloro-2-[(1-cyanocyclopropyl)methanesulfonyl]-N-(1-methyl-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-7-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.251 |
| 7GM1 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-2e8b2191-10 (Mpro-P2072) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RFR (4S)-6-chloro-N-{6-[(methanesulfonyl)amino]isoquinolin-4-yl}-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.261 |
| 7GM2 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-2e8b2191-12 (Mpro-P2074) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RG3 (4S)-6-chloro-N-[7-(methanesulfonyl)isoquinolin-4-yl]-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.244 |
| 7GM3 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-c20a539d-4 (Mpro-P2075) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RG9 2-(3-chlorophenyl)-N-[7-(2-hydroxypropan-2-yl)isoquinolin-4-yl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.254 |
| 7GM4 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-6f6ae286-5 (Mpro-P2080) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RGQ (4S)-6-chloro-N-(7-fluoroisoquinolin-4-yl)-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.264 |
| 7GM5 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-2 (Mpro-P2089) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 RGX (4S)-6-chloro-2-(cyclopropylsulfamoyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.247 |
| 7GM6 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-7889e8da-5 (Mpro-P2090) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RHI (4S)-6-chloro-N-[7-(methanesulfonyl)isoquinolin-4-yl]-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.255 |
| 7GM7 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-a577c8a2-1 (Mpro-P2099) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RI1 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.256 |
| 7GM8 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-7889e8da-3 (Mpro-P2101) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RI6 (4S)-6-chloro-N-(7-chloroisoquinolin-4-yl)-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.244 |
| 7GM9 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-1bed62cf-3 (Mpro-P2113) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RIJ 2-[(1'P,3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2',5'-dioxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylacetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.251 |
| 7GMA Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-7174c657-5 (Mpro-P2141) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 R2X (2S,5R)-N-{(1R)-1-(3-chlorophenyl)-2-[(isoquinolin-4-yl)amino]-2-oxoethyl}-5-(pyrrolidine-1-carbonyl)oxolane-2-carboxamide (non-preferred name) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.248 |
| 7GMB Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-31 (Mpro-P2144) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RIU 2-(3-chlorophenyl)-N-{6-[2-(dimethylamino)ethoxy]isoquinolin-4-yl}acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.246 |
| 7GMC Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-17 (Mpro-P2147) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 RIY (4S)-6-chloro-2-(ethylsulfamoyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.238 |
| 7GMD Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-7174c657-6 (Mpro-P2176) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 R2X (2S,5R)-N-{(1R)-1-(3-chlorophenyl)-2-[(isoquinolin-4-yl)amino]-2-oxoethyl}-5-(pyrrolidine-1-carbonyl)oxolane-2-carboxamide (non-preferred name) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.243 |
| 7GME Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-38 (Mpro-P2177) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RJ3 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]isoquinoline-7-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.244 |
| 7GMF Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e119ab4f-3 (Mpro-P2178) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RJF (4S)-6-chloro-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-N-(5-methylisoquinolin-4-yl)-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.237 |
| 7GMG Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e119ab4f-2 (Mpro-P2182) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 RJO (4S)-6-chloro-N-(6-fluoroisoquinolin-4-yl)-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.238 |
| 7GMH Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-37 (Mpro-P2183) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RJX 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]isoquinoline-6-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.236 |
| 7GMI Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-2 (Mpro-P2185) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RK6 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]-N-methylisoquinoline-7-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.245 |
| 7GMJ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-477dc5b7-4 (Mpro-P2197) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RKC (3'R)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,3'-pyrrolidin]-2'-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.237 |
| 7GMK Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-d899bab6-1 (Mpro-P2201) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RKR 2-(3-chlorophenyl)-N-[6-(dimethylamino)isoquinolin-4-yl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.240 |
| 7GML Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-28 (Mpro-P2203) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RL0 2-(3-chlorophenyl)-N-{6-[(methanesulfonyl)(methyl)amino]isoquinolin-4-yl}acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.244 |
| 7GMM Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-20 (Mpro-P2204) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RL8 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]-N-methylisoquinoline-6-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.238 |
| 7GMN Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-14 (Mpro-P2205) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RLH 2-(3-chlorophenyl)-N-{7-[2-(pyrrolidin-1-yl)ethoxy]isoquinolin-4-yl}acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.268 |
| 7GMO Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-12c4873b-5 (Mpro-P2206) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RLR (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.245 |
| 7GMP Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-7 (Mpro-P2207) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RM3 2-(3-chlorophenyl)-N-[7-(dimethylamino)isoquinolin-4-yl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.259 |
| 7GMQ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-13 (Mpro-P2210) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RMI 2-(3-chlorophenyl)-N-{7-[2-(dimethylamino)ethoxy]isoquinolin-4-yl}acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.244 |
| 7GMR Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-7fb4f80a-2 (Mpro-P2214) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RN0 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]isoquinolin-6-yl methanesulfonate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.249 |
| 7GMS Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-be9e6f63-3 (Mpro-P2215) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 RNI (4S)-6-chloro-2-[(1-cyanocyclopropyl)methanesulfonyl]-N-{7-[(methanesulfonyl)amino]isoquinolin-4-yl}-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.257 |
| 7GMT Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-19 (Mpro-P2218) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 ROZ 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]isoquinoline-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.247 |
| 7GMU Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-22 (Mpro-P2219) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 RPK N-(6-acetamidoisoquinolin-4-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.259 |
| 7GMV Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-8bb691af-4 (Mpro-P2222) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 1 RPZ 2-[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylacetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.252 |
| 7GMW Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e119ab4f-1 (Mpro-P2224) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RQ6 (4S)-6-chloro-N-(7-fluoroisoquinolin-4-yl)-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.256 |
| 7GMX Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-21 (Mpro-P2229) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RQO 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]-N,N-dimethylisoquinoline-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.268 |
| 7GMY Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-e69ed63d-13 (Mpro-P2242) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RQF (4S)-6-chloro-N-(7-fluoroisoquinolin-4-yl)-1-oxo-2-[2-oxo-2-(propylamino)ethyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.255 |
| 7GMZ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-c3ea9889-6 (Mpro-P2243) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 RR0 (2r,4r)-6-chloro-N-(7-fluoroisoquinolin-4-yl)-2,3-dihydro-4H-2,4-methano-1-benzopyran-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.248 |
| 7GN0 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-43f8f7d6-6 (Mpro-P2256) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 RRD (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-{2-[(oxetan-3-yl)amino]-2-oxoethyl}-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.247 |
| 7GN1 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-8bb691af-6 (Mpro-P2263) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RRU 1-{[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidine]-2(3H)-sulfonyl]methyl}cyclopropane-1-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.261 |
| 7GN2 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-e69ed63d-1 (Mpro-P2273) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RS6 (4S)-6-chloro-N-(7-fluoroisoquinolin-4-yl)-1-oxo-2-{2-oxo-2-[(propan-2-yl)amino]ethyl}-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.242 |
| 7GN3 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-7fb4f80a-1 (Mpro-P2284) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RSL 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]isoquinolin-7-yl methanesulfonate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.261 |
| 7GN4 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-43f8f7d6-4 (Mpro-P2291) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 1 RT4 (4S)-6-chloro-2-[2-(cyclopropylamino)-2-oxoethyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.241 |
| 7GN5 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-968bafd9-1 (Mpro-P2295) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RT9 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(1-methoxycyclopropyl)methanesulfonyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.254 |
| 7GN6 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e119ab4f-5 (Mpro-P2358) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RTS (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methyl-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.274 |
| 7GN7 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-1cbc2fae-2 (Mpro-P2381) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RV0 (4S)-6-chloro-4-ethyl-N-(isoquinolin-4-yl)-1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.264 |
| 7GN8 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-c7726e07-5 (Mpro-P2385) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 1 RPZ 2-[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylacetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 7GN9 Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-12c4873b-2 (Mpro-P2402) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RVL (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[1-(methylcarbamoyl)cyclopropyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.253 |
| 7GNA Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-4483ae88-4 (Mpro-P2415) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 RVR (4S)-6-chloro-1,1-dioxo-N-(5,6,7,8-tetrahydroisoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.266 |
| 7GNB Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-ee636701-1 (Mpro-P2468) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 1 RW0 (3R,4S)-6-chloro-N-[7-(methanesulfonyl)isoquinolin-4-yl]-3-methyl-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.239 |
| 7GNC Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-8bb691af-8 (Mpro-P2487) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 CL CHLORIDE ION × 1 RW9 2-[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-1,2'-dioxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylacetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.238 |
| 7GND Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIK-UNK-78dbf1b8-1 (Mpro-P2601) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RVR (4S)-6-chloro-1,1-dioxo-N-(5,6,7,8-tetrahydroisoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.238 |
| 7GNE Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIK-ENA-5d9157e9-6 (Mpro-P2605) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 CL CHLORIDE ION × 1 RWO (4R)-6-chloro-4-methyl-1,1-dioxo-N-(5,6,7,8-tetrahydroisoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.251 |
| 7GNF Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIK-ENA-5d9157e9-5 (Mpro-P2606) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13 CL CHLORIDE ION × 1 RWT (4S)-6-chloro-4-methyl-1,1-dioxo-N-(5,6,7,8-tetrahydroisoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.251 |
| 7GNG Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-705e09b8-1 (Mpro-P2607) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13 CL CHLORIDE ION × 1 RXU 2-[(3'S)-6-chloro-2'-oxo-1'-(5,6,7,8-tetrahydroisoquinolin-4-yl)-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylacetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.250 |
| 7GNH Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-853c0ffa-9 (Mpro-P2649) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 RYB 1-{[(3'S)-6-chloro-1'-{6-[2-(dimethylamino)ethoxy]isoquinolin-4-yl}-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidine]-2(3H)-sulfonyl]methyl}cyclopropane-1-carbonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.242 |
| 7GNI Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-b1ef7fe3-1 (Mpro-P2660) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 1 RZF 2-[(3'S)-6-chloro-1'-(6-chloroisoquinolin-4-yl)-1,2'-dioxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylacetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.241 |
| 7GNJ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-976a33d5-1 (Mpro-P2724) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16 CL CHLORIDE ION × 1 RZU 1-[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-1,2'-dioxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylcyclopropane-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.229 |
| 7GNK Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-ecbed2ba-12 (Mpro-P2730) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 18 CL CHLORIDE ION × 1 S0X 2-[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-(cyclopropylmethyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.253 |
| 7GNL Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-WEI-dcc3321b-1 (Mpro-P2757) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 1 S1U (4S)-6-chloro-2-{2-[4-(4-ethylpiperazin-1-yl)anilino]-2-oxoethyl}-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.239 |
| 7GNM Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-WEI-dcc3321b-2 (Mpro-P2761) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 15 CL CHLORIDE ION × 1 S1L (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-{2-[3-(morpholin-4-yl)anilino]-2-oxoethyl}-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.254 |
| 7GNN Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-WEI-dcc3321b-3 (Mpro-P2775) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 S39 (4S)-2-{2-[(1,3-benzothiazol-5-yl)amino]-2-oxoethyl}-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.252 |
| 7GNO Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-WEI-dcc3321b-4 (Mpro-P2838) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14 CL CHLORIDE ION × 1 S3X (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-(2-{[(1S)-1-(4-nitrophenyl)ethyl]amino}-2-oxoethyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.232 |
| 7GNP Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-WEI-dcc3321b-5 (Mpro-P2889) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 19 CL CHLORIDE ION × 2 S4X (4S)-6-chloro-2-(2-{[(1r,3R,5R,7S)-3-hydroxyadamantan-1-yl]amino}-2-oxoethyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.260 |
| 7GNQ Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-WEI-dcc3321b-6 (Mpro-P2916) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 18 CL CHLORIDE ION × 3 S5L (4S)-2-[2-(4-acetamidoanilino)-2-oxoethyl]-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.224 |
| 7GNR Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e48723dc-2 (Mpro-P3038) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 17 CL CHLORIDE ION × 1 RZU 1-[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-1,2'-dioxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylcyclopropane-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.257 |
| 7GNS Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-50a80394-1 (Mpro-P3050) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 1 S6K 1-{[(3'S,4'R)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-4'-methyl-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidine]-2(3H)-sulfonyl]methyl}cyclopropane-1-carbonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.265 |
| 7GNT Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-50a80394-2 (Mpro-P3054) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 CL CHLORIDE ION × 1 S7C 1-{[(3'S,4'R)-6-chloro-4'-ethyl-1'-(isoquinolin-4-yl)-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidine]-2(3H)-sulfonyl]methyl}cyclopropane-1-carbonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.251 |
| 7GNU Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-133e7cd9-2 (Mpro-P3074) 提交 2023-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 CL CHLORIDE ION × 1 S7U 1-{[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-piperidine]-2(3H)-sulfonyl]methyl}cyclopropane-1-carbonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.245 |
| 7GRE Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-1 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XWH 4-[3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-5-yl]pyridine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.249 |
| 7GRF Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-2 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XWZ 5-bromopyridin-3-amine × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.239 |
| 7GRG Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-3 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Y2C 3,5-dichloropyridin-4-amine × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.236 |
| 7GRH Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-4 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 18 Y25 5-chloropyridin-3-ol × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.253 |
| 7GRI Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-5 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 Y1R (1S)-1-(1H-pyrazol-5-yl)ethan-1-ol × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.258 |
| 7GRJ Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-6 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 Y1L (5-chloro-1-benzothiophen-3-yl)methanol × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.268 |
| 7GRK Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-7 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 Y1H (6-fluoro-2H,4H-1,3-benzodioxin-8-yl)methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.236 |
| 7GRL Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-8 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Y1C 4-(4,5-dibromo-2H-1,2,3-triazol-2-yl)butan-2-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.229 |
| 7GRM Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-9 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 NA SODIUM ION × 2 ZHA ~{N}-(5-oxidanylidene-7,8-dihydro-6~{H}-naphthalen-2-yl)ethanamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.231 |
| 7GRN Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-10 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 Y0W 2-[(3S)-pyrrolidin-3-yl]-5-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazole × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.301 |
| 7GRO Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-11 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Y3N N-[4-cyano-2-(trifluoromethyl)phenyl]acetamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.232 |
| 7GRP Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-12 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | VXQ 1-(2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl)methanamine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.230 |
| 7GRQ Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-13 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 Y0S N-[(3-methylthiophen-2-yl)methyl]benzamide × 1 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.234 |
| 7GRR Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-14 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 Y0O 5-(3-cyclohexylprop-1-yn-1-yl)pyridine-3-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.248 |
| 7GRS Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-15 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 25 NT9 ~{N}-methyl-1-(4-thiophen-2-ylphenyl)methanamine × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.224 |
| 7GRT Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-16 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Y0L N-[(2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl)methyl]benzamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.257 |
| 7GRU Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-17 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 1 Y0H 3-(4-chlorophenyl)-1-methyl-1H-pyrazol-5-amine × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.241 |
| 7GRV Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-18 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Y0C (2S)-2-(2-fluorophenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.236 |
| 7GRW Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-19 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 XZX (2S)-N-(3,5-dichlorophenyl)-2-hydroxypropanamide × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.239 |
| 7GRX Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-20 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 XZT 1-(2,4-difluorophenyl)pyrrolidine-2,5-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.219 |
| 7GRY Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-21 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CL CHLORIDE ION × 2 XZO 1-(3,5-dichlorophenyl)pyrrolidine-2,5-dione × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.217 |
| 7GRZ Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-22 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 NA SODIUM ION × 1 XZI N,N-dimethyl-2-[(naphthalen-2-yl)oxy]acetamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.254 |
| 7GS0 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-23 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 XZE (pyridin-2-yl)(quinolin-2-yl)methanone × 1 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.221 |
| 7GS1 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-24 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 GT7 2-cyano-~{N}-cyclohexyl-ethanamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.245 |
| 7GS2 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-25 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 5F8 3-(pyridin-3-yl)benzoic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.240 |
| 7GS3 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-26 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 JAH (6-phenylpyridin-3-yl)methanamine × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.279 |
| 7GS4 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-27 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 XZ6 7-(hydroxymethyl)-3-methyl-6~{H}-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidin-5-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.278 |
| 7GS5 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-28 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 0TI (3R)-5-fluoro-3-hydroxy-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.247 |
| 7GS6 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-29 提交 2023-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 XXN (3S)-4,7-dichloro-3-hydroxy-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 3 SO4 SULFATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.228 |
| 7GYY Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000006-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AJF 4-[(3S)-3-(1H-1,2,4-triazol-1-yl)pyrrolidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.252 |
| 7GYY Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000006-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.252 |
| 7GYZ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000035-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AI6 N-(4-methyl-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-5-yl)-N'-(1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-yl)urea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.235 |
| 7GYZ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000035-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.235 |
| 7GZ0 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000051-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AI7 (3S)-3-{[(1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}-1lambda~6~-thiane-1,1-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.235 |
| 7GZ0 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000051-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.235 |
| 7GZ1 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000061-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AJG 3-chloro-N-(1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-yl)pyridine-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.208 |
| 7GZ1 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000061-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.208 |
| 7GZ2 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000072-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AJH (2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)azepane-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.231 |
| 7GZ2 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000072-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.231 |
| 7GZ3 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000090-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AJI (2S,3S)-N-(5,6-dimethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2-methyloxolane-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.197 |
| 7GZ3 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000090-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.197 |
| 7GZ4 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000018-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AJJ 5-[(2-fluorophenyl)sulfamoyl]-2-methyl-N-(1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-yl)benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.240 |
| 7GZ4 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000018-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.240 |
| 7GZ5 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000050-002 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AJK 4-[4-(4-methylpyrimidin-2-yl)piperidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.180 |
| 7GZ5 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000050-002 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.180 |
| 7GZ6 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000243-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AJL (3R)-3-methoxy-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)pyrrolidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.198 |
| 7GZ6 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000243-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.198 |
| 7GZ7 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000131-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | QL6 3-{[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]methyl}-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.202 |
| 7GZ7 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000131-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.202 |
| 7GZ8 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000453-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AJW (2R)-3-methyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.183 |
| 7GZ8 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000453-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.183 |
| 7GZ9 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000462-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AJX N~2~-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-D-valinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.180 |
| 7GZ9 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000462-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.180 |
| 7GZA Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000479-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKD (3R)-3-(propan-2-yl)-4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperazin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.194 |
| 7GZA Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000479-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.194 |
| 7GZB Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000495-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKE (2R)-(2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl)[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.193 |
| 7GZB Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000495-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.193 |
| 7GZC Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000588-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKF (3R)-3-(4-fluorophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.212 |
| 7GZC Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000588-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.212 |
| 7GZD Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000593-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKG (3R)-3-(pyridin-4-yl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.190 |
| 7GZD Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000593-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.190 |
| 7GZE Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000601-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKH (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-{[5-(dimethylamino)pyridine-2-carbonyl]amino}propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.200 |
| 7GZE Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000601-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.200 |
| 7GZF Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000605-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKI (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(1-methyl-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.204 |
| 7GZF Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000605-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.204 |
| 7GZG Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000620-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKP (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine-5-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.203 |
| 7GZG Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000620-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.203 |
| 7GZH Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000670-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKQ (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.255 |
| 7GZH Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000670-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.255 |
| 7GZI Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000753-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKR 3-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-1-methyl-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.233 |
| 7GZI Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000753-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.233 |
| 7GZJ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000789-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKS (2R)-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.277 |
| 7GZJ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000789-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.277 |
| 7GZK Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000877-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AI8 N-{(1R)-1-[(3R)-oxolan-3-yl]ethyl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.221 |
| 7GZK Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000877-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.221 |
| 7GZL Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008304-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AI9 (3R)-3-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-3-[3-(difluoromethyl)phenyl]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.214 |
| 7GZL Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008304-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.214 |
| 7GZM Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008324-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKT N-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-D-valine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.210 |
| 7GZM Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008324-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.210 |
| 7GZN Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008351-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKU (4S)-4-hydroxy-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-D-proline × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.213 |
| 7GZN Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008351-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.213 |
| 7GZO Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008338-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKV 3-cyclopropyl-N-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-L-alanine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.195 |
| 7GZO Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008338-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.195 |
| 7GZQ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008379-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKV 3-cyclopropyl-N-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-L-alanine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.242 |
| 7GZQ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008379-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.242 |
| 7GZR Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008273-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AKZ (3S)-3-[3-(methanesulfonamido)phenyl]-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.237 |
| 7GZR Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008273-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.237 |
| 7GZS Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008340-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AK0 N-[(1R)-1-(4-methoxyphenyl)-2-(1H-tetrazol-5-yl)ethyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.246 |
| 7GZS Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008340-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.246 |
| 7GZT Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008348-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AK1 4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.268 |
| 7GZT Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008348-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.268 |
| 7GZU Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008674-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1AK2 7-{(1S)-2-methyl-1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propyl}-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.210 |
| 7GZU Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008674-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.210 |
| 7GZV Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012336-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AK3 4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-[(3R)-1-methylpyrrolidin-3-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.229 |
| 7GZW Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012338-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AK4 (3M)-3-(4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-N-methylbenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.147 |
| 7GZX Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011176-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AK5 7-[(1S)-2-methyl-1-{[(6M)-6-{5-[(methylamino)methyl]furan-3-yl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}propyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.194 |
| 7GZY Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011144-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AK6 (4M)-4-(4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.157 |
| 7GZZ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011184-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AK7 2-[(4M)-4-(4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazol-1-yl]-N-methylacetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.192 |
| 7H00 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011221-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ALQ (4M)-4-(4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro[1,4]dioxino[2,3-b]pyridin-6-yl)-2,2-dimethylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.171 |
| 7H01 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011192-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ALR 7-[(1S)-2-methyl-1-{[(6M)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}propyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.202 |
| 7H02 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000455-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ALS N-[(1S)-1-(3,4-dihydro-2H-1lambda~4~-thiophen-5-yl)-2-methylpropyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.188 |
| 7H03 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000452-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ALY N-[(2R)-1,1-difluoro-3-methylbutan-2-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.236 |
| 7H04 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000453-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AJW (2R)-3-methyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.195 |
| 7H05 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008287-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AL0 N-[(1S)-2-methyl-1-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)propyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.192 |
| 7H06 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0010739-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AL1 7-{(1S)-1-[(6-amino-5-chloropyrimidin-4-yl)amino]-2-methylpropyl}-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.186 |
| 7H07 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0010744-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AL4 N-[(1S,2S)-1-(4-methoxyphenyl)-2-(1H-tetrazol-5-yl)propyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.236 |
| 7H08 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012346-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AL5 4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.220 |
| 7H09 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011177-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AL6 (4M)-1-methyl-4-(4-{[(1R)-2-methyl-1-(3-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrido[3,2-b][1,4]oxazin-6-yl)propyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.253 |
| 7H09 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011177-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AL6 (4M)-1-methyl-4-(4-{[(1R)-2-methyl-1-(3-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrido[3,2-b][1,4]oxazin-6-yl)propyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.253 |
| 7H0A Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008485-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AL7 2-[(4P)-4-(4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazol-1-yl]-N,N-dimethylacetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.204 |
| 7H0A Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008485-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AL7 2-[(4P)-4-(4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazol-1-yl]-N,N-dimethylacetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.204 |
| 7H0B Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0010716-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMD (4M)-4-(4-{[(1R)-1-(2,3-dihydro[1,4]dioxino[2,3-b]pyridin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.227 |
| 7H0B Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0010716-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMD (4M)-4-(4-{[(1R)-1-(2,3-dihydro[1,4]dioxino[2,3-b]pyridin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.227 |
| 7H0C Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012349-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AME 4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.212 |
| 7H0C Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012349-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AME 4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.212 |
| 7H0D Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011446-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AIP 7-[(1S)-1-{[(6P)-6-(1,3-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.255 |
| 7H0E Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011153-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMF 4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.223 |
| 7H0E Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011153-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMF 4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.223 |
| 7H0F Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011207-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMG N-cyclopropyl-4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.226 |
| 7H0F Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011207-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMG N-cyclopropyl-4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.226 |
| 7H0G Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011210-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMI (4S)-6-{(1S)-1-[(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-2-methylpropyl}-2,3-dihydro-4H-1,4lambda~4~-benzoxathiin-4-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.185 |
| 7H0G Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011210-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMI (4S)-6-{(1S)-1-[(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-2-methylpropyl}-2,3-dihydro-4H-1,4lambda~4~-benzoxathiin-4-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.185 |
| 7H0H Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011204-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMJ N-ethyl-4-{[(1S)-2-methyl-1-(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)propyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.213 |
| 7H0H Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011204-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMJ N-ethyl-4-{[(1S)-2-methyl-1-(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)propyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.213 |
| 7H0I Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012317-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMK 4-{[(1R)-1-(4,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-1,4lambda~6~-benzoxathiin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.186 |
| 7H0J Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012318-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AML 6-{(1S)-2-methyl-1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propyl}-2,3-dihydro-4H-1,4lambda~6~-benzoxathiine-4,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.230 |
| 7H0J Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012318-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AML 6-{(1S)-2-methyl-1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propyl}-2,3-dihydro-4H-1,4lambda~6~-benzoxathiine-4,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.230 |
| 7H0K Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011076-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMP 4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazin-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.282 |
| 7H0L Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011436-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMQ 4-{[(S)-cyclopropyl(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)methyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.245 |
| 7H0L Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011436-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMQ 4-{[(S)-cyclopropyl(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)methyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.245 |
| 7H0M Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011428-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMR 2-[(4P)-4-(4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazol-1-yl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.317 |
| 7H0M Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011428-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMR 2-[(4P)-4-(4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazol-1-yl]acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.317 |
| 7H0N Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011215-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMS 7-[(1R)-1-({(6M)-6-[(4R)-imidazo[1,5-a]pyridin-6-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}amino)-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.199 |
| 7H0N Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011215-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMS 7-[(1R)-1-({(6M)-6-[(4R)-imidazo[1,5-a]pyridin-6-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}amino)-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.199 |
| 7H0O Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012310-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMT 7-{(1S)-2-methyl-1-[(9H-purin-6-yl)amino]propyl}-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.198 |
| 7H0P Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008445-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMU (2S,3S)-3-(4-bromophenyl)-2-methyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.240 |
| 7H0Q Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013821-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMV 4-{[(1S)-1-(2-aminopyridin-4-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.199 |
| 7H0Q Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013821-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMV 4-{[(1S)-1-(2-aminopyridin-4-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.199 |
| 7H0R Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013730-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AMW 7-[(1R)-2-methyl-1-{[(6M)-6-(1-methyl-2-oxo-1,2-dihydropyridin-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}propyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.21 Å R-free 0.216 |
| 7H0S Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013769-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANI 4-{[(1S)-1-(2-acetamido-1,3-benzothiazol-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.196 |
| 7H0S Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013769-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANI 4-{[(1S)-1-(2-acetamido-1,3-benzothiazol-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.196 |
| 7H0T Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013772-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANJ 7-[(1S)-1-{[(6M)-6-{3-[(4-acetylpiperazin-1-yl)methyl]phenyl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.293 |
| 7H0U Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013775-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANK 7-[(1S)-2-methyl-1-({(6M)-6-[(4R)-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-7-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}amino)propyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.247 |
| 7H0V Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013318-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANL 4-(4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-N-(2-hydroxyethyl)benzene-1-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.28 Å R-free 0.218 |
| 7H0W Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013738-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANP 7-{(1R)-2-methyl-1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propyl}-3,4-dihydro-1lambda~6~-thiopyrano[2,3-b]pyridine-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.204 |
| 7H0X Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013255-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANQ (4M)-1-methyl-4-(4-{[(1S)-2-methyl-1-(3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-6-yl)propyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.218 |
| 7H0X Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013255-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANQ (4M)-1-methyl-4-(4-{[(1S)-2-methyl-1-(3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-6-yl)propyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.218 |
| 7H0Y Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013258-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANR 4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-(1-methylazetidin-3-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.283 |
| 7H0Y Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013258-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANR 4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-(1-methylazetidin-3-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.283 |
| 7H0Z Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013269-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANS 4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.193 |
| 7H10 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013259-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANV 7-[(1R)-1-{[6-(methanesulfonyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.206 |
| 7H11 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013392-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANW 7-[(1R)-1-{[(6M)-6-(2,5-dihydrofuran-3-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.233 |
| 7H12 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013388-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANX 7-[(1R)-2-methyl-1-{[(6M)-6-(1H-pyrazol-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}propyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.192 |
| 7H13 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013385-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANU 7-[(1R)-1-{[(6M)-6-(3,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-5-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.213 |
| 7H14 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013383-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANY 7-[(1R)-2-methyl-1-{[(6M)-6-(1-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyridin-3-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}propyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.189 |
| 7H15 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013387-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1ANZ 7-[(1R)-1-{[(6M)-6-{2-[2-(dimethylamino)ethoxy]pyridin-4-yl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.185 |
| 7H16 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0015776-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AN0 7-{(1R)-1-[(6-bromo-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-2-methylpropyl}-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.201 |
| 7H17 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013389-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AN2 7-[(1R)-1-{[6-(2-aminopyrimidin-5-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.184 |
| 7H18 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013390-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AN3 7-[(1R)-1-({6-[2-(3-hydroxyazetidin-1-yl)pyrimidin-5-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}amino)-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.182 |
| 7H19 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013827-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AN4 4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.173 |
| 7H19 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013827-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AN4 4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.173 |
| 7H1A Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013833-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AL7 2-[(4P)-4-(4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazol-1-yl]-N,N-dimethylacetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.179 |
| 7H1A Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013833-001 提交 2024-01-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AL7 2-[(4P)-4-(4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazol-1-yl]-N,N-dimethylacetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.179 |
| 7H1B Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013839-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AN5 7-{(1S)-1-[(6,7-dihydro[1,4]dioxino[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-2-methylpropyl}-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.247 |
| 7H1C Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0014597-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AOA 7-[(1S)-1-{[(5R,8S)-10-acetyl-6,7,8,9-tetrahydro-5H-5,8-epiminocyclohepta[d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.254 |
| 7H1D Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011198-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AOB 4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-[(3R)-1-methylpyrrolidin-3-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.186 |
| 7H1E Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008674-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AK2 7-{(1S)-2-methyl-1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propyl}-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.192 |
| 7H1F Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0015381-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AK0 N-[(1R)-1-(4-methoxyphenyl)-2-(1H-tetrazol-5-yl)ethyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.205 |
| 7H1G Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012329-001 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1AOC 7-[(1S)-2-methyl-1-{[(6M)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}propyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.203 |
| 7HC4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3367 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A03 ethyl {4-[(2-oxopyrrolidin-1-yl)amino]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-8-yl}carbamate × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7HC4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3367 提交 2024-08-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7HC5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3765 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A02 (5R)-1-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-5-methylpyrrolidin-2-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.159 |
| 7HC5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3765 提交 2024-08-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.159 |
| 7HC6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3764 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A01 (5S)-1-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-5-methylpyrrolidin-2-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.160 |
| 7HC6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3764 提交 2024-08-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.160 |
| 7HC7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-4051 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A00 N-cyclopropyl-N'-{4-[(2-oxopyrrolidin-1-yl)amino]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-8-yl}urea × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.158 |
| 7HC7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-4051 提交 2024-08-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.158 |
| 7HC8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3763 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A0Z (5S)-1-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-5-phenylpyrrolidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.169 |
| 7HC8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3763 提交 2024-08-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.169 |
| 7HC9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3762 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A0R (5R)-1-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-5-phenylpyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.177 |
| 7HC9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3762 提交 2024-08-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.177 |
| 7HCA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-4636 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A0Q 1-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-5,5-dimethylpyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.173 |
| 7HCA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-4636 提交 2024-08-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.173 |
| 7HCB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000286 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7HCB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000286 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A2H N-cyclopropyl-5-{[(1-phenyl-1H-tetrazol-5-yl)methyl]sulfanyl}-1,3,4-thiadiazol-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7HCC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000296 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A41 3-{2-[(5-amino-1,3,4-thiadiazol-2-yl)sulfanyl]ethyl}-1,3-benzoxazol-2(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.150 |
| 7HCC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000296 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.150 |
| 7HCD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000303 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A42 (3R,6S)-6-methyl-1-(3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazine-7-carbonyl)piperidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7HCD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000303 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7HCE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000002 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1A47 1-[(1R,6S,8R)-8lambda~4~-thia-7,9-diazatetracyclo[4.3.0.0~1,8~.0~6,8~]nona-2,4-diene-2-sulfonyl]-L-proline × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.148 |
| 7HCE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000002 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.148 |
| 7HCF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000313 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A49 (2S)-3-phenyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 A1A5A (2R)-3-phenyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.150 |
| 7HCF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000313 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.150 |
| 7HCG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000316 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A5B 3-[(2H-1,3-benzodioxole-5-carbonyl)amino]thiophene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.149 |
| 7HCG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000316 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.149 |
| 7HCH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000317 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A5C 2-[(5,6-dimethylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)sulfanyl]benzoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.159 |
| 7HCH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000317 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.159 |
| 7HCI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000321 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A19 7-benzyl-5,6-dimethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.149 |
| 7HCI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000321 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.149 |
| 7HCJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000328 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A5D (2R)-2-methyl-3-[(2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-6-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 A1A5E (2S)-2-methyl-3-[(2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-6-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.153 |
| 7HCJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000328 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.153 |
| 7HCK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000329 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A5F (2S)-6-methyl-N-[(4S)-5,6,7,8-tetrahydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-3-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.156 |
| 7HCK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000329 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.156 |
| 7HCL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000341 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A5J 2-[2-(6-methyl-4-oxothieno[2,3-d][1,2,3]triazin-3(4H)-yl)ethyl]-1H-1lambda~6~,2-benzothiazole-1,1,3(2H)-trione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.155 |
| 7HCL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000341 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.155 |
| 7HCM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000348 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A5K (3R,4R)-1-[2-(hydroxymethyl)-1-methyl-1H-1,3-benzimidazole-5-carbonyl]-4-methylpiperidine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.156 |
| 7HCM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000348 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.156 |
| 7HCN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000288 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A5W (2S)-(3-oxo-1,2-benzothiazol-2(3H)-yl)(phenyl)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.173 |
| 7HCN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000288 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.173 |
| 7HCO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000291 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1A5X 4-fluoro-3-({[1-(propan-2-yl)-1H-tetrazol-5-yl]sulfanyl}methyl)-1-benzothiophene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.87 Å R-free 0.153 |
| 7HCO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000291 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.87 Å R-free 0.153 |
| 7HCP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000338 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A5Y (8R)-6-(7-fluoro-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-6-carbonyl)-6-azaspiro[4.5]decane-8-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.96 Å R-free 0.166 |
| 7HCP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000338 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.96 Å R-free 0.166 |
| 7HCQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000345 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A50 7-methyl-N-[6-(methylamino)pyridin-3-yl]-1-benzothiophene-2-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.169 |
| 7HCQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000345 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.169 |
| 7HCR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000611 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1A56 (3S)-3-hydroxy-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidine-3-carboxamide × 1 A1A57 (3R)-3-hydroxy-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidine-3-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 7HCR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000611 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 7HCS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000609 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1A58 [(2S,4S)-4-fluoro-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.165 |
| 7HCS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000609 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.165 |
| 7HCT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000612 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A6N (3R)-3-ethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-3-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.175 |
| 7HCT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000612 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.175 |
| 7HCU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000616 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A6O (3R,4R)-4-fluoro-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-3-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.170 |
| 7HCU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000616 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.170 |
| 7HCV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000610 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1A6P (3R,5R)-5-(hydroxymethyl)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-3-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.161 |
| 7HCV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000610 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.161 |
| 7HCW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0001444 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A6Q (3R,4S)-4-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]oxolan-3-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7HCW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0001444 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7HCX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003571 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A6V 1-{[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclobutan-1-ol × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.164 |
| 7HCX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003571 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.164 |
| 7HCY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003701 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A6U (1R)-1-[(2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]ethane-1,2-diol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.171 |
| 7HCY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003701 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.171 |
| 7HCZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003702 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A6X [(8R)-7-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-1,4-dioxa-7-azaspiro[4.4]nonan-8-yl]methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.155 |
| 7HCZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003702 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.155 |
| 7HD0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003703 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A6Y (2S)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-3-(1,3-thiazol-5-yl)propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.158 |
| 7HD0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003703 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.158 |
| 7HD1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003704 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A6Z [(2S)-4,4-dimethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.159 |
| 7HD1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003704 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.159 |
| 7HD2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003705 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1A60 (2S)-3-(furan-3-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.167 |
| 7HD2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003705 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.167 |
| 7HD3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003707 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A61 [(3S)-2-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-8-oxa-2-azaspiro[4.5]decan-3-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.169 |
| 7HD3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003707 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.169 |
| 7HD4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003708 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A62 [(3S)-2-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2-azaspiro[4.4]nonan-3-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.162 |
| 7HD4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003708 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.162 |
| 7HD5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003709 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A63 (2S)-3-(benzyloxy)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 A1A64 (2R)-3-(benzyloxy)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.168 |
| 7HD5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003709 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.168 |
| 7HD6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0001445 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A65 2-[(2S)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]propan-2-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.164 |
| 7HD6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0001445 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.164 |
| 7HD7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003710 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A66 [(6S)-5-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-5-azaspiro[2.4]heptan-6-yl]methanol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.157 |
| 7HD7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003710 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.157 |
| 7HD8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003711 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A68 (2S)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-3-(thiophen-2-yl)propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.163 |
| 7HD8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003711 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.163 |
| 7HD9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003713 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A7W [(1S,3S,4R)-2-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2-azabicyclo[2.2.1]heptan-3-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.163 |
| 7HD9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003713 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.163 |
| 7HDA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003715 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A7Z (2S)-2-phenyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.161 |
| 7HDA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003715 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.161 |
| 7HDB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003717 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1A70 [(3R)-4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)morpholin-3-yl]methanol × 1 A1A71 [(3S)-4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)morpholin-3-yl]methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.160 |
| 7HDB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003717 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.160 |
| 7HDC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003718 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A72 (1R,2R)-1-(4-chlorophenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propane-1,3-diol × 2 A1A73 (1R,2S)-1-(4-chlorophenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propane-1,3-diol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7HDC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003718 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7HDD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003719 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A75 [(2R,5S)-5-tert-butyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.160 |
| 7HDD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003719 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.160 |
| 7HDE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003720 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A76 [(2S,3aS,6aS)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)octahydrocyclopenta[b]pyrrol-2-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.153 |
| 7HDE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003720 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.153 |
| 7HDF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003721 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1A77 [(2R)-4-methyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperazin-2-yl]methanol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7HDF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003721 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7HDG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003722 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A78 [(2S,4R)-4-tert-butyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.160 |
| 7HDG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003722 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.160 |
| 7HDH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003726 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A8F [(2R)-5,5-dimethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 2 A1A8E [(2S)-5,5-dimethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7HDH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003726 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7HDI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003727 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A8G [(3S)-2-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2-azaspiro[4.5]decan-3-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.166 |
| 7HDI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003727 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.166 |
| 7HDJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003728 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A8H [(7S)-6-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-6-azaspiro[3.4]octan-7-yl]methanol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.176 |
| 7HDJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003728 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.176 |
| 7HDK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003730 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A8D (2S,3R)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butane-1,3-diol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7HDK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003730 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7HDL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003731 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A8J 2-[(2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]-2,3-dihydro-1H-inden-2-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.169 |
| 7HDL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003731 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.169 |
| 7HDM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003732 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A8K (4S)-4-hydroxy-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-D-proline × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.164 |
| 7HDM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003732 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.164 |
| 7HDN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003734 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1A8L (2R)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butane-1,4-diol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.172 |
| 7HDN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003734 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.172 |
| 7HDO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003637 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A8M (2S)-4,4,4-trifluoro-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.181 |
| 7HDO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003637 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.181 |
| 7HDP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003638 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A8W (2S)-2-cyclobutyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7HDP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003638 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7HDQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003639 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1A8X (1S,2S)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclopentan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.158 |
| 7HDQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003639 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.158 |
| 7HDR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003640 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A80 (2S)-3-(4-fluorophenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 A1A8Z (2R)-3-(4-fluorophenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7HDR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003640 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7HDS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003641 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A81 (2S)-3-cyclobutyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.162 |
| 7HDS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003641 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.162 |
| 7HDT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003642 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A82 (1S,3S)-1-phenyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butane-1,4-diol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.154 |
| 7HDT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003642 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.154 |
| 7HDU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003643 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A83 (2R)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.167 |
| 7HDU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003643 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.167 |
| 7HDV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003644 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A84 (2S)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]pent-4-yn-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.158 |
| 7HDV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003644 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.158 |
| 7HDW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003646 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A85 (3S)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.171 |
| 7HDW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003646 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.171 |
| 7HDX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003648 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A86 (2S)-4,4-dimethyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]pentan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.175 |
| 7HDX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003648 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.175 |
| 7HDY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003650 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A87 (2R)-3-(1H-indol-3-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 A1A88 (2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.159 |
| 7HDY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003650 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.159 |
| 7HDZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003651 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A89 (2S)-2-cyclopropyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.170 |
| 7HDZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003651 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.170 |
| 7HE0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003652 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9A (R)-phenyl[(2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.160 |
| 7HE0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003652 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.160 |
| 7HE1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003655 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9D [(2S,3S)-3-methyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.171 |
| 7HE1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003655 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.171 |
| 7HE2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003656 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1A9E [(2R,4R)-4-methoxy-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.160 |
| 7HE2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003656 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.160 |
| 7HE3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003657 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9F (2S)-3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.162 |
| 7HE3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003657 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.162 |
| 7HE4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003658 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A9G (2S)-3-(1,3-dioxolan-2-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.155 |
| 7HE4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003658 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.155 |
| 7HE5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003659 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9H (2R)-2-(furan-2-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.161 |
| 7HE5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003659 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.161 |
| 7HE6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003660 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9I (2S)-3-[(2R)-oxolan-2-yl]-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.181 |
| 7HE6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003660 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.181 |
| 7HE7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003662 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9J (2S)-3-cyclopropyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 7HE7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003662 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 7HE8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003664 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9K (3aR,6S,6aS)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)octahydrocyclopenta[b]pyrrol-6-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.167 |
| 7HE8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003664 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.167 |
| 7HE9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003665 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 2 A1A9L (2S)-3-[(3S)-oxolan-3-yl]-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.161 |
| 7HE9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003665 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.161 |
| 7HEA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003666 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A9M (1R)-1-[(2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.155 |
| 7HEA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003666 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.155 |
| 7HEB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003667 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9N (3R)-2-methyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]pentan-2-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.161 |
| 7HEB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003667 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.161 |
| 7HEC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003669 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9O (2S,3R)-3-phenyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7HEC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003669 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7HED PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003670 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9T {1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclobutyl}methanol × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.159 |
| 7HED PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003670 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.159 |
| 7HEE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003671 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9Q (2S)-3-(dimethylamino)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.161 |
| 7HEE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003671 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.161 |
| 7HEF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003673 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9R (2S)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-3-(1,3-thiazol-2-yl)propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.153 |
| 7HEF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003673 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.153 |
| 7HEG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003674 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9S (2R)-3-(2-methylphenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.158 |
| 7HEG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003674 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.158 |
| 7HEH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003675 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1A9U (2R)-3-(3-methylphenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.154 |
| 7HEH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003675 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.154 |
| 7HEI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003677 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9V (2S)-3-(piperidin-1-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.155 |
| 7HEI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003677 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.155 |
| 7HEJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003679 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9W (2S)-2-[(3R)-oxolan-3-yl]-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.155 |
| 7HEJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003679 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.155 |
| 7HEK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003681 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A9X [(1s,4s)-2-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2-azabicyclo[2.1.1]hexan-1-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.160 |
| 7HEK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003681 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.160 |
| 7HEL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003683 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A9Z (2S)-3-(4-methylphenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 A1A9Y (2R)-3-(4-methylphenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.158 |
| 7HEL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003683 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.158 |
| 7HEM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003684 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A91 (2R)-3-(3,4-dimethylphenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 A1A90 (2S)-3-(3,4-dimethylphenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7HEM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003684 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7HEN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003685 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A92 [(2S)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.155 |
| 7HEN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003685 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.155 |
| 7HEO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003686 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A94 (2S)-3-(4-iodophenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 A1A93 (2R)-3-(4-iodophenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.153 |
| 7HEO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003686 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.153 |
| 7HEP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003688 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A95 {1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclopropyl}methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.152 |
| 7HEP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003688 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.152 |
| 7HEQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003690 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A96 (2R)-3-cyclohexyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 7HEQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003690 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 7HER PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003691 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 2 A1A97 (2S)-3-cyclopentyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.160 |
| 7HER PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003691 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.160 |
| 7HES PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003692 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1A98 {1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclopentyl}methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.170 |
| 7HES PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003692 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.170 |
| 7HET PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003693 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BAB (2R)-2-[(1R)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1 A1BAC (2S)-2-[(1R)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.155 |
| 7HET PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003693 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.155 |
| 7HEU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003695 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BAA 2-ethyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7HEU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003695 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7HEV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003696 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BAD (2R)-3-(pyridin-2-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 A1BAE (2S)-3-(pyridin-2-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.156 |
| 7HEV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003696 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.156 |
| 7HEW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003697 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A99 (2R)-2-methyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.157 |
| 7HEW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003697 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.157 |
| 7HEX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003733 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1BAG [(2S,5R)-5-(1,3-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.160 |
| 7HEX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003733 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.160 |
| 7HEY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003635 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1BAI (2S,3R)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]pentan-2-ol × 1 A1BAJ (2R,3S)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]pentan-2-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.158 |
| 7HEY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003635 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.158 |
| 7HEZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003649 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1BAH (2S)-2-cyclopentyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7HEZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003649 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7HF0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003661 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 A1BAK (3R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-3-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 7HF0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003661 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 7HF1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003761 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BAM 1-{[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.162 |
| 7HF1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003761 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.162 |
| 7HF2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004062 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BAN (1R)-1-[(2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]ethan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.160 |
| 7HF2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004062 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.160 |
| 7HF3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004064 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BAP [(2S,4R)-4-methyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1 A1BAQ [(2R,4S)-4-methyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.165 |
| 7HF3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004064 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.165 |
| 7HF4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004066 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | TFA trifluoroacetic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1BAO 4-{(2S)-3-hydroxy-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propyl}phenol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.154 |
| 7HF4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004066 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.154 |
| 7HF5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003758 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BAS 2-methyl-1-[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-2-ol × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.166 |
| 7HF5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003758 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.166 |
| 7HF6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003760 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1BAT 1-{[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclopentan-1-ol × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.165 |
| 7HF6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003760 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.165 |
| 7HF7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004063 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1BAR [(2R,5S)-5-methyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.151 |
| 7HF7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004063 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.151 |
| 7HF8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004329 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BAU (1r,4r)-1-{[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexane-1,4-diol × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.167 |
| 7HF8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004329 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.167 |
| 7HF9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004194 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BAV 4-{[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}oxan-4-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.162 |
| 7HF9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004194 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.162 |
| 7HFA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004195 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BAW 4-{[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}thian-4-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.161 |
| 7HFA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004195 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.161 |
| 7HFB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004331 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BAX (1r,4r)-4-methyl-1-{[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexan-1-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.179 |
| 7HFB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004331 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.179 |
| 7HFC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004126 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BAY 2-[(2R)-3,3-dimethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]propan-2-ol × 1 A1BAZ 2-[(2S)-3,3-dimethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]propan-2-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.165 |
| 7HFC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004126 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.165 |
| 7HFD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004127 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BA8 2-[(1S,3aR,7aS)-2-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)octahydro-1H-isoindol-1-yl]propan-2-ol × 1 A1BA9 2-[(1S,3aS,7aR)-2-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)octahydro-1H-isoindol-1-yl]propan-2-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.171 |
| 7HFD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004127 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.171 |
| 7HFE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004128 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BA5 2-[(1S,2R,5R)-3-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-3-azabicyclo[3.2.0]heptan-2-yl]propan-2-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.167 |
| 7HFE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004128 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.167 |
| 7HFF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004307 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BA6 (1S,3R)-3-methyl-1-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.166 |
| 7HFF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004307 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.166 |
| 7HFG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004308 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BA7 4,4-difluoro-1-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.166 |
| 7HFG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004308 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.166 |
| 7HFH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004311 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1BBI (3R)-3-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}oxan-3-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.160 |
| 7HFH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004311 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.160 |
| 7HFI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004312 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1BBJ (1r,4r)-4-methyl-1-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.163 |
| 7HFI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004312 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.163 |
| 7HFJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004313 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BBK (1R,4S,5R)-4-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}-2-oxabicyclo[3.1.1]heptan-4-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.160 |
| 7HFJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004313 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.160 |
| 7HFK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004314 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BBL 4-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}oxan-4-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.170 |
| 7HFK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004314 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.170 |
| 7HFL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004319 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BBM 4-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}thian-4-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7HFL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004319 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7HFM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004320 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BBN (1R,2R,4S)-2-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}bicyclo[2.2.2]octan-2-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.163 |
| 7HFM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004320 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.163 |
| 7HFN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004322 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BBO (3R)-3-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}thian-3-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.158 |
| 7HFN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004322 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.158 |
| 7HFO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004309 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BBP (1S,3R)-1-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}-3-(trifluoromethyl)cyclohexan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.160 |
| 7HFO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004309 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.160 |
| 7HFP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004318 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1BBQ 4-{[methyl(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}oxan-4-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.156 |
| 7HFP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004318 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.156 |
| 7HFQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005994 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BBR [(2S)-4,4-dimethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.168 |
| 7HFQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005994 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.168 |
| 7HFR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005997 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1BBS (3aS,6S,6aR)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)octahydrocyclopenta[b]pyrrol-6-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.157 |
| 7HFR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005997 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.157 |
| 7HFS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005998 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BBT [(2S)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-1,2,5,6-tetrahydropyridin-2-yl]methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.152 |
| 7HFS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005998 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.152 |
| 7HFT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006000 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BBU 4-[(2R)-2-tert-butylpyrrolidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.169 |
| 7HFT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006000 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.169 |
| 7HFU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006002 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BBX [(2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7HFU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006002 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7HFV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005158 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BBY (2S,3R)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-2-ol × 1 A1BBZ (2R,3R)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-2-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.189 |
| 7HFV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005158 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.189 |
| 7HFW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005216 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BB0 4-[(2R)-2-(propan-2-yl)pyrrolidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.161 |
| 7HFW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005216 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.161 |
| 7HFX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005266 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BCC 2-methyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.151 |
| 7HFX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005266 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.151 |
| 7HFY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006217 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BCD 1-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7HFY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006217 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.154 |
| 7HFZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006220 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BCE (1r,4r)-1-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexane-1,4-diol × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.164 |
| 7HFZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006220 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.164 |
| 7HHS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000411 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A7O 1-({6-[(1H-indazol-5-yl)amino]pyrimidin-4-yl}amino)pyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.148 |
| 7HHS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000411 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.148 |
| 7HHT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000372 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1A7P 1-{[(5P)-5-(3-fluoropyridin-2-yl)pyrimidin-4-yl]amino}pyrrolidin-2-one × 2 BR BROMIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.157 |
| 7HHT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000372 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.157 |
| 7HHU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000528 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A7M (3R)-3-(2,4-difluorophenyl)-3-[(6,7-dihydro-5H-cyclopenta[c]pyridine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.179 |
| 7HHU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000528 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.179 |
| 7HHV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000527 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 A1A7L (3R)-3-(2,4-difluorophenyl)-3-{[(4R)-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyridine-5-carbonyl]amino}propanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.166 |
| 7HHV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000527 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.166 |
| 7HHW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000724 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A7K (5S)-1-[(5-iodo-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-(thiophen-2-yl)pyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.168 |
| 7HHW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000724 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.168 |
| 7HHX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000729 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1A7J 4-{[(5S)-2-oxo-5-(thiophen-2-yl)pyrrolidin-1-yl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.182 |
| 7HHX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000729 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.182 |
| 7HHY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000700 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A7I (5S)-1-[(5-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-phenylpyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.172 |
| 7HHY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000700 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.172 |
| 7HHZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000703 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A7H (5S)-1-[(5-bromo-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-phenylpyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.170 |
| 7HHZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000703 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.170 |
| 7HI0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000708 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A7G (5S)-1-[(5-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-methylpyrrolidin-2-one × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.162 |
| 7HI0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000708 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.162 |
| 7HI1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000712 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A7F (5S)-1-[(6-bromo-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-phenylpyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.168 |
| 7HI1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000712 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.168 |
| 7HI2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000682 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A7E (5S)-1-[(6-chloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-phenylpyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.171 |
| 7HI2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000682 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.171 |
| 7HI3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000688 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A7D (5S)-1-[(6-chloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-(thiophen-2-yl)pyrrolidin-2-one × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.162 |
| 7HI3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000688 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.162 |
| 7HI4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000689 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A7C (5S)-1-[(5-chloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-phenylpyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.178 |
| 7HI4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000689 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.178 |
| 7HI5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000737 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A7B (5S)-1-[(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-5-(thiophen-2-yl)pyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.174 |
| 7HI5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000737 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.174 |
| 7HI6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004099 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A69 (2R)-3-methyl-2-{[(6P)-6-(1H-pyrazol-3-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}butan-1-ol × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.162 |
| 7HI6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004099 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.162 |
| 7HI7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004197 提交 2024-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1A7A (2R)-2-[(8-amino-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-3-methylbutan-1-ol × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.173 |
| 7HI7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004197 提交 2024-09-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.173 |
| 7HPI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_6 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJ2 6-{[(3-fluorophenyl)methyl]sulfanyl}-9H-purine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.166 |
| 7HPI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_6 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.166 |
| 7HPJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_28 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJ3 (1R,2S)-2-[(thieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclohexane-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.168 |
| 7HPJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_28 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.168 |
| 7HPK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_79 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJ4 (6-bromo-1H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-yl)methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.183 |
| 7HPK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_79 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.183 |
| 7HPL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_8 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJI 4-[3-(1H-pyrazol-1-yl)azetidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.162 |
| 7HPL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_8 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.162 |
| 7HPM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_42 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1BJ5 (2S)-1-[(5-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-2,3-dimethylbutan-2-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.181 |
| 7HPM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_42 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.181 |
| 7HPN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_87 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJ6 [(3R)-3-(propan-2-yl)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.159 |
| 7HPN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_87 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.159 |
| 7HPO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1695_15 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJ7 (3R)-1-(5-cyanopyridin-2-yl)-N-(1,3-thiazol-2-yl)piperidine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.162 |
| 7HPO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1695_15 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.162 |
| 7HPP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1695_54 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BKE (1S,2S)-N-[3,5-difluoro-4-(methanesulfonyl)phenyl]-2-(pyridin-3-yl)cyclopropane-1-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.157 |
| 7HPP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1695_54 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.157 |
| 7HPQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_25 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BKD 4-[(2,4,6-trifluorophenyl)sulfanyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.188 |
| 7HPQ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_25 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.188 |
| 7HPR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_50 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BKC (1S,6R)-10-(6-chloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-4-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.170 |
| 7HPR PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_50 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.170 |
| 7HPS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_83 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BKB 1-{[(7-bromo-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]methyl}cyclopropane-1-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.154 |
| 7HPS PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_83 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.154 |
| 7HPT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_72 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1BKA 9-fluoro-4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2,3,4,5-tetrahydro-1,4-benzoxazepine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.168 |
| 7HPT PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_72 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.168 |
| 7HPU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1718_59 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJO (3S)-3-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]piperidine-2,6-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.161 |
| 7HPU PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1718_59 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.161 |
| 7HPV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1879_22 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJN N-(2-acetamido-1,3-thiazole-5-sulfonyl)-1-(3,4-dichlorophenyl)cyclobutane-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.142 |
| 7HPV PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1879_22 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.142 |
| 7HPW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1706_56 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BKQ 4-{[(1S)-2-bromocyclohex-2-en-1-yl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 1 A1CM4 4-{[(1R)-2-bromocyclohex-2-en-1-yl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.165 |
| 7HPW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1706_56 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.165 |
| 7HPX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_92 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BKP 7-fluoro-N-[(1R)-1-(1,3-thiazol-2-yl)propyl]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.157 |
| 7HPX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_92 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.157 |
| 7HPY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_91 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BKO (1s,3s)-3-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-3-methylcyclobutan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.166 |
| 7HPY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_91 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.166 |
| 7HPZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1705_34 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BKN 6-cyclopropyl-N-{[(3S)-3-hydroxy-1-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5-carbonyl)pyrrolidin-3-yl]methyl}pyridine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.164 |
| 7HPZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1705_34 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.164 |
| 7HQ0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1706_49 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJM 2-(5-bromo-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-3-carbonyl)-6-cyclopropyl-1lambda~6~,2,6-thiadiazinane-1,1-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.163 |
| 7HQ0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1706_49 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.163 |
| 7HQ1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_67 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BKM 4-bromo-N-(5,6-dimethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pent-4-enamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.166 |
| 7HQ1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_67 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.166 |
| 7HQ2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_92 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BKL N-(5,6-dimethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-3,3-dimethylbutanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.171 |
| 7HQ2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_92 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.171 |
| 7HQ3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1709_75 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1BKK 2-bromo-3-fluoro-4-[(propan-2-yl)oxy]-N-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.159 |
| 7HQ3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1709_75 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.159 |
| 7HQ4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_78 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1BKI 3-{(3R)-3-[(5-bromo-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butyl}-1,3-oxazolidin-2-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 7HQ4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_78 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 7HQ5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_85 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BKH (1R,2S)-2-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-N-methylcyclohexane-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.187 |
| 7HQ5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_85 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.187 |
| 7HQ6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1702_11 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJJ (4R)-N-[(1s,4S)-4-(3-hydroxy-2-methylbenzamido)cyclohexyl]imidazo[1,2-a]pyrimidine-7-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.170 |
| 7HQ6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1702_11 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.170 |
| 7HQ7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_26 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BKF 6-{[(3-ethylphenyl)methyl]sulfanyl}-9H-purine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.151 |
| 7HQ7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_26 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.151 |
| 7HQ8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_95 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BKG (3R)-1-(2-fluoroethyl)-3-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]pyrrolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.152 |
| 7HQ8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_95 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.152 |
| 7HQ9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_45 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJ8 (5S)-5-{[(5,6-dimethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}-4,4-dimethylpyrrolidin-2-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.183 |
| 7HQ9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_45 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.183 |
| 7HQA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1716_34 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1BJ9 4-{[(2-fluoro-5-hydroxyphenyl)methyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.171 |
| 7HQA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1716_34 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.171 |
| 7HQB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1705_4 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJL [(5S)-7-(2-amino-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-7-azaspiro[3.5]nonan-5-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.170 |
| 7HQB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1705_4 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.170 |
| 7HQC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_6 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1BJQ 5-ethyl-N-(4,4,4-trifluoro-2,2-dimethylbutyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.153 |
| 7HQC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_6 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.153 |
| 7HQD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_48 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJK phenyl(4-{[(9H-purin-6-yl)sulfanyl]methyl}phenyl)methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.164 |
| 7HQD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_48 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.164 |
| 7HQE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_79 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJR 7-fluoro-N-[(3R)-oxolan-3-yl]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-amine × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 7HQE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_79 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 7HQF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_16 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJS 6-({[3-(difluoromethyl)phenyl]methyl}sulfanyl)-9H-purine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.159 |
| 7HQF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_16 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.159 |
| 7HQG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_97 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJ1 6-{[(3-chloro-4-fluorophenyl)methyl]sulfanyl}-9H-purine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7HQG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_97 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7HQH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_71 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJ0 (3R)-3-[(7-bromo-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-N-methylbutanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.157 |
| 7HQH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_71 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.157 |
| 7HQI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_88 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJZ 3-(6-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)but-3-en-1-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7HQI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_88 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7HQJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_48 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJY N-[(1R)-2,2-dimethylcyclopentyl]-5,6-dimethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.165 |
| 7HQJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_48 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.165 |
| 7HQK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1702_58 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJX N'-(3,5-dichloro-4-methylbenzene-1-sulfonyl)-2-hydroxybenzohydrazide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.166 |
| 7HQK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1702_58 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.166 |
| 7HQL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_78 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJW 3-{2-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]ethyl}-1,3-oxazolidin-2-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.160 |
| 7HQL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_78 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.160 |
| 7HQM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_76 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJV (4R)-4-{[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]methyl}-1-propylpyrrolidin-2-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.147 |
| 7HQM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_76 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.147 |
| 7HQN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1706_32 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1BJU 1-(3-bromo-4-chlorophenyl)cyclopropane-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.156 |
| 7HQN PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1706_32 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.156 |
| 7HQO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_89 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJT (1R)-1-{1-[(7-bromo-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]cyclopropyl}-2-methoxyethan-1-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.169 |
| 7HQO PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_89 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.169 |
| 7HQP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_9 提交 2024-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1BJP 4-[(3R)-3-(2-fluorophenyl)pyrrolidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.156 |
| 7HQP PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_9 提交 2024-12-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.156 |
| 7HUC PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment B07 from the F2X-Entry Screen in monoclinic space group 提交 2025-01-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UIS N-[3-(diethylamino)phenyl]ethanamide × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.235 |
| 7HUD PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment B08 from the F2X-Entry Screen in monoclinic space group 提交 2025-01-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | T9S ethyl 1,3-dihydro-2H-pyrrolo[3,4-c]pyridine-2-carboxylate × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.229 |
| 7HUE PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment D08 from the F2X-Entry Screen in monoclinic space group 提交 2025-01-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1BNP N-[(3R)-1,1-dioxo-1lambda~6~-thiolan-3-yl]-N,N',N'-trimethylurea × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.233 |
| 7I13 PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment B05 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 A1BVZ 2-acetylbenzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.262 |
| 7I14 PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment B08 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 T9S ethyl 1,3-dihydro-2H-pyrrolo[3,4-c]pyridine-2-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.269 |
| 7I15 PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment C02 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 SYA 2,4,5-tris(fluoranyl)-3-methoxy-benzoic acid × 2 NA SODIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.282 |
| 7I16 PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment C07 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 VN9 3,4-dihydro-1~{H}-quinolin-2-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.273 |
| 7I17 PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment C10 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 TJV 1,3-benzodioxole-5-carbothioamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.260 |
| 7I18 PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment D04 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | R9D methyl 4-fluoro-D-phenylalaninate × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.255 |
| 7I19 PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment D08 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 A1BVW N-[(3S)-1,1-dioxo-1lambda~6~-thiolan-3-yl]-N,N',N'-trimethylurea × 2 NA SODIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.268 |
| 7I1A PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment D11 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 R9M 3-(1,3-thiazol-2-yl)propanoic acid × 3 NA SODIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.243 |
| 7I1C PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment E11 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 RA7 [2-(morpholin-4-yl)-1,3-thiazol-5-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.254 |
| 7I1D PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment F04 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 RB7 N-[(4-bromo-3-methylphenyl)methyl]-2-(methylsulfonyl)ethan-1-amine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.268 |
| 7I1E PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment G03 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 RD4 3-ethoxybenzene-1-carboximidamide × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.246 |
| 7I1F PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment G04 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 NA SODIUM ION × 1 T9V N-(4-methoxyphenyl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.260 |
| 7I1G PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment G09 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 RDM (2R)-2-(acetylamino)-4-phenylbutanoic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.242 |
| 7I1H PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment G10 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 A1BVY 1-phenyl-1H-tetrazole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.256 |
| 7I1I PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment H03 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | RDY N-[(benzyloxy)carbonyl]-N-methyl-L-alanine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.255 |
| 7I1J PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment H11 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group 提交 2025-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 TBJ N-cyclopentyl-N'-{[(2R)-oxolan-2-yl]methyl}urea × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；291 K；0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.248 |
| 7IB8 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X10590 (well A03) from the KIT library 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | A1CEI 5-(4-bromophenyl)-1H-tetrazole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.231 |
| 7IB9 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X11415 (well A09) from the KIT library 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | A1CEJ 3-methylnaphthalen-2-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.222 |
| 7IBA PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X13162 (well B06) from the KIT library 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | A1CRA 4-(2-aminoethyl)-2-iodophenol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.242 |
| 7IBB PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X13458 (well B08) from the KIT library 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | A1CS0 (2-bromo-1,4-phenylene)dimethanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.236 |
| 7IBC PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X15604 (well C08) from the KIT library 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | A1CS2 2-[(1-methylcyclobutyl)sulfanyl]benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.295 |
| 7IBD PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X2317 (well E01) from the KIT library 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | RMN (R)-MANDELIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.223 |
| 7IBE PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X4071 (well F06) from the KIT library 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | A1CRB 2,2,2-trifluoro-1-(1-methyl-1H-imidazol-2-yl)ethan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.226 |
| 7IBF PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X4161 (well F07) from the KIT library 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | A1CS1 (3S)-3-(4-hydroxyphenyl)piperazin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.251 |
| 7IBG PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X5449 (well G01) from the KIT library 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | A1CS3 methyl (1S)-2-oxocyclopentane-1-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.231 |
| 7IBH PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X6553 (well G10) from the KIT library 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | A1CS4 (4-bromanyl-5-methyl-thiophen-2-yl)-oxidanyl-oxidanylidene-boron × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.294 |
| 7IBI PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X7214 (well H02) from the KIT library 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | A1CS5 N,N'-(pyridine-2,6-diyl)diacetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.254 |
| 7IBJ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A01 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.227 |
| 7IBK PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.231 |
| 7IBL PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A04 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.240 |
| 7IBM PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.225 |
| 7IBN PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A06 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.241 |
| 7IBO PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.233 |
| 7IBP PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A08 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.227 |
| 7IBQ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A10 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.230 |
| 7IBR PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A11 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.225 |
| 7IBS PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.233 |
| 7IBT PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo01 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.239 |
| 7IBU PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.240 |
| 7IBV PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo03 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.249 |
| 7IBW PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo04 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.244 |
| 7IBX PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.235 |
| 7IBY PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo06 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.244 |
| 7IBZ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.240 |
| 7IC0 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo08 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.239 |
| 7IC1 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.245 |
| 7IC2 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.244 |
| 7IC3 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo13 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.250 |
| 7IC4 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B01 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.242 |
| 7IC5 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.229 |
| 7IC6 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B03 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.235 |
| 7IC7 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B04 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.254 |
| 7IC8 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.232 |
| 7IC9 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.66 Å R-free 0.242 |
| 7ICA PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B07 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.64 Å R-free 0.238 |
| 7ICB PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.61 Å R-free 0.237 |
| 7ICC PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B10 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.73 Å R-free 0.231 |
| 7ICW PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B11 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.238 |
| 7ICX PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.232 |
| 7ICY PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C01 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.242 |
| 7ICZ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.242 |
| 7ID0 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C02 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.245 |
| 7ID1 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C03 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.241 |
| 7ID2 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C04 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.237 |
| 7ID3 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.240 |
| 7ID4 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C06 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.240 |
| 7ID5 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.238 |
| 7ID6 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.245 |
| 7ID7 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C10 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.260 |
| 7ID8 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C11 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.247 |
| 7ID9 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.246 |
| 7IDA PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.242 |
| 7IDB PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D03 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.242 |
| 7IDC PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D04 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.242 |
| 7IDD PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D04 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.248 |
| 7IDE PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.238 |
| 7IDF PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D06 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.235 |
| 7IDG PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.241 |
| 7IDH PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D08 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.239 |
| 7IDI PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.238 |
| 7IDJ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D10 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.238 |
| 7IDK PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D11 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.242 |
| 7IDL PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.381 |
| 7IDM PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D01 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.258 |
| 7IDN PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.242 |
| 7IDO PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E03 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.240 |
| 7IDP PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E04 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.251 |
| 7IDQ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.237 |
| 7IDR PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E06 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.245 |
| 7IDS PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.249 |
| 7IDT PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E08 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 2.01 Å R-free 0.258 |
| 7IDU PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.89 Å R-free 0.245 |
| 7IDV PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E10 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.73 Å R-free 0.234 |
| 7IDW PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E11 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.236 |
| 7IDX PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.279 |
| 7IDY PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F01 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.248 |
| 7IDZ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.413 |
| 7IE0 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F03 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.241 |
| 7IE1 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F04 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.245 |
| 7IE2 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.265 |
| 7IE3 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F08 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.252 |
| 7IE4 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.242 |
| 7IE5 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F10 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.242 |
| 7IE6 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.337 |
| 7IE7 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F12 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.237 |
| 7IE8 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.239 |
| 7IE9 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G03 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.248 |
| 7IEA PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G04 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.242 |
| 7IEB PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.235 |
| 7IEC PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G06 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.235 |
| 7IED PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G08 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.241 |
| 7IEE PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.247 |
| 7IEF PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.249 |
| 7IEG PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H01 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.249 |
| 7IEH PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H03 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.246 |
| 7IEI PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.251 |
| 7IEJ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H06 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.254 |
| 7IEK PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H08 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.252 |
| 7IEL PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.253 |
| 7IEM PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H10 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.227 |
| 7IEN PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H11 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.248 |
| 7IEO PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.252 |
| 7IIW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5398393122 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
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未记录 | RLU (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 A1CJB (3S)-3-(4-bromophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.167 |
| 7IIW PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5398393122 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.167 |
| 7IIX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7691912366 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CJC (3S)-3-(4-bromophenyl)-3-[(2-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 A1CJD (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(2-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.177 |
| 7IIX PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7691912366 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.177 |
| 7IIY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075283 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
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未记录 | A1CJE (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 A1CJF (3S)-3-(4-bromophenyl)-3-[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.170 |
| 7IIY PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075283 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
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分辨率 1.01 Å R-free 0.170 |
| 7IIZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075280 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CJR (3S)-3-(4-bromophenyl)-3-[(9H-purine-6-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 A1CJS (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(9H-purine-6-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.158 |
| 7IIZ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075280 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.158 |
| 7IJ0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075284 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CJT (3R)-3-(4-bromo-2-methylphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.178 |
| 7IJ0 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075284 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.178 |
| 7IJ1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075302 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
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未记录 | A1CJV (3R)-3-(4-hydroxyphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 A1CJW (3S)-3-(4-hydroxyphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.165 |
| 7IJ1 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075302 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.165 |
| 7IJ2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8727396638 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CJX (2R,3S)-2-methyl-3-phenyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 A1CJY (2S,3R)-2-methyl-3-phenyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.164 |
| 7IJ2 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8727396638 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.164 |
| 7IJ3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8727396582 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CJZ (3R)-3-(3-methylphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.166 |
| 7IJ3 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8727396582 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.166 |
| 7IJ4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7692046343 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CJ0 (3S)-3-(4-chlorophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.176 |
| 7IJ4 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7692046343 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.176 |
| 7IJ5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7692056627 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CJ1 (3S)-3-(pyridin-2-yl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.166 |
| 7IJ5 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7692056627 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.166 |
| 7IJ6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7140729870 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CJ3 (3S)-3-(4-methylphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.177 |
| 7IJ6 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7140729870 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.177 |
| 7IJ7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7691912473 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1AKG (3R)-3-(pyridin-4-yl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.162 |
| 7IJ7 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7691912473 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.162 |
| 7IJ8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8928826043 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CJ4 (3R)-3-phenyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]butanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.173 |
| 7IJ8 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8928826043 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.173 |
| 7IJ9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8928826033 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CJ5 (3R)-3-(3-fluorophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.173 |
| 7IJ9 PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8928826033 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.173 |
| 7IJA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8929429249 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CJ6 (3S)-3-(2-methylphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7IJA PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8929429249 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.159 |
| 7IJB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8768700676 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CJ7 (3S)-3-(2-chlorophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.157 |
| 7IJB PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8768700676 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.157 |
| 7IJC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8929428675 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CJ8 (3S)-3-(pyridin-3-yl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.182 |
| 7IJC PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8929428675 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.182 |
| 7IJD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7692056404 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CKA (3S)-3-(4-fluorophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 7IJD PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7692056404 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 7IJE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523169 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CKB (3S)-3-phenyl-3-[(9H-purine-6-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 7IJE PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523169 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.165 |
| 7IJF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8727401304 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CKC (3S)-3-(3-chlorophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.177 |
| 7IJF PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8727401304 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.177 |
| 7IJG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990527720 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CKD (3R)-3-(2-fluorophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.153 |
| 7IJG PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990527720 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.153 |
| 7IJH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523176 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CKE (3S)-3-[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]-3-phenylpropanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.164 |
| 7IJH PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523176 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.164 |
| 7IJI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523172 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CKF (3S)-3-[(2-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]-3-phenylpropanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.182 |
| 7IJI PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523172 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.182 |
| 7IJJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990919037 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CKH (3R)-3-(3-hydroxyphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 A1CKI (3S)-3-(3-hydroxyphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.172 |
| 7IJJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990919037 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.172 |
| 7IJK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990919048 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CKJ (2R,3S)-2-hydroxy-3-phenyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.153 |
| 7IJK PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990919048 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.153 |
| 7IJL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523194 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CKK (3S)-3-[(2-chloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]-3-phenylpropanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.184 |
| 7IJL PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523194 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.184 |
| 7IJM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7534253453 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CKL (3S)-3-phenyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.179 |
| 7IJM PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7534253453 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.179 |
| 7IJN Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB175 (Mac1-x10181) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CLR (1R,2S)-2-(1H-indazol-4-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.169 |
| 7IJN Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB175 (Mac1-x10181) 提交 2025-08-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CLR (1R,2S)-2-(1H-indazol-4-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.169 |
| 7IJO Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB177 (Mac1-x10183) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CLS (1R,2S)-2-(isoquinolin-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.169 |
| 7IJO Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB177 (Mac1-x10183) 提交 2025-08-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.169 |
| 7IJP Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB179 (Mac1-x10184) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CLT (1R,2S)-2-(1-methyl-1H-1,3-benzimidazol-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.206 |
| 7IJP Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB179 (Mac1-x10184) 提交 2025-08-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.206 |
| 7IJQ Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with POB176 (Mac1-x10199) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CLU (1R,2S)-2-(1,3-benzoxazol-5-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.21 Å R-free 0.174 |
| 7IJQ Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with POB176 (Mac1-x10199) 提交 2025-08-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.21 Å R-free 0.174 |
| 7IJR Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0208 (Mac1-x10313) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CLV (1R,2R)-2-(isoquinolin-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.21 Å R-free 0.219 |
| 7IJR Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0208 (Mac1-x10313) 提交 2025-08-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.21 Å R-free 0.219 |
| 7IJS Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0209 (Mac1-x10314) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CLW (1R,2R)-2-(1,3-benzothiazol-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.164 |
| 7IJS Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0209 (Mac1-x10314) 提交 2025-08-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.164 |
| 7IJT Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0185 (Mac1-x10331) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | A1CLX (2P)-2-(1,3-benzothiazol-6-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.172 |
| 7IJT Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0185 (Mac1-x10331) 提交 2025-08-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.172 |
| 7IJU Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0206 (Mac1-x10390) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1CLZ (2P)-2-(isoquinolin-6-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.259 |
| 7IJV Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0207 (Mac1-x10395) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CL0 (2M)-2-(quinoxalin-6-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.251 |
| 7IJW Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0208 (Mac1-x10399) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1CLV (1R,2R)-2-(isoquinolin-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.285 |
| 7IJX Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0209 (Mac1-x10400) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1CLW (1R,2R)-2-(1,3-benzothiazol-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.268 |
| 7IJY Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0185 (Mac1-x10407) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1CLX (2P)-2-(1,3-benzothiazol-6-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.251 |
| 7IJZ Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0221 (Mac1-x10516) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1CL4 (2P)-2-(quinolin-6-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.32 Å R-free 0.235 |
| 7IK0 Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0211 (Mac1-x10525) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1CL5 (1R,2R)-2-(quinoxalin-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.244 |
| 7IK1 Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0215 (Mac1-x10529) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1CL7 (1R,2R)-2-(2-amino-1,3-benzothiazol-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.235 |
| 7IK2 Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0228 (Mac1-x10558) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1CL8 (2P)-2-(2-carbamamido-1,3-benzothiazol-6-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.206 |
| 7IK3 Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0212 (Mac1-x10580) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1CL9 (1R,2R)-2-(quinolin-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.254 |
| 7IK4 Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0213 (Mac1-x10581) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1CMA (1R,2R)-2-(quinolin-7-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.210 |
| 7IK5 Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0216 (Mac1-x10584) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1CMB (2P)-2-(2-amino-1,3-benzothiazol-6-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.224 |
| 7IK6 Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0217 (Mac1-x10585) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1CMC (2P)-2-[2-(methylamino)-1,3-benzothiazol-6-yl]cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.251 |
| 7IK7 Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0218 (Mac1-x10586) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1CMD (2P)-2-[2-(ethylamino)-1,3-benzothiazol-6-yl]cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.233 |
| 7IK8 Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0222 (Mac1-x10590) 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1CME (2P)-2-(quinolin-7-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.192 |
| 7IPH PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo11 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-08-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.285 |
| 7IPI PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-08-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.256 |
| 7IPJ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G11 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-08-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.268 |
| 7IPK PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-08-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.269 |
| 7IPL PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment B03 from the F2X-Entry library 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | SYG 2-[(1~{S})-1-azanylpropyl]phenol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.33 Å R-free 0.228 |
| 7IPM PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment B08 from the F2X-Entry library 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | T9S ethyl 1,3-dihydro-2H-pyrrolo[3,4-c]pyridine-2-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.229 |
| 7IPN PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment C02 from the F2X-Entry library 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | SYA 2,4,5-tris(fluoranyl)-3-methoxy-benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.255 |
| 7IPO PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment C06 from the F2X-Entry library 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | A1I4V ~{N}-(3-chloranyl-4-methyl-phenyl)ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.242 |
| 7IPP PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment D10 from the F2X-Entry library 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | R9J 2-methyl-N-(4-methylphenyl)-L-alanine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.227 |
| 7IPQ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment E01 from the F2X-Entry library 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | A1CSC methyl 3-amino-2-hydroxybenzoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.227 |
| 7IPR PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment E04 from the F2X-Entry library 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | VNV 3-phenyl-1,2-oxazol-5-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.215 |
| 7IPS PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment E12 from the F2X-Entry library 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | SYV 6-azanyl-3-methyl-1,3-benzoxazol-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.231 |
| 7IPT PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment F02 from the F2X-Entry library 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | T9Y ethyl 5-(trifluoromethyl)-1H-pyrazole-4-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.235 |
| 7IPU PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment F09 from the F2X-Entry library 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | UI4 4-pyridin-2-ylphenol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.239 |
| 7IPV PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A01a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.240 |
| 7IPW PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A02a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.236 |
| 7IPX PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A03a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.254 |
| 7IPY PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A04a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.243 |
| 7IPZ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A05a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.243 |
| 7IQ0 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A06a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.312 |
| 7IQ1 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A07a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.243 |
| 7IQ2 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A08a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.254 |
| 7IQ3 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A09a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.252 |
| 7IQ4 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A10a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.249 |
| 7IQ5 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A11b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.250 |
| 7IQ6 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A12a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.239 |
| 7IQ7 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo01 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.245 |
| 7IQ8 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo02 (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.245 |
| 7IQ9 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo03 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.254 |
| 7IQA PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo04 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.246 |
| 7IQB PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo05 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.64 Å R-free 0.246 |
| 7IQC PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo06 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.256 |
| 7IQD PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo07 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.251 |
| 7IQE PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo08 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.375 |
| 7IQF PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo09 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.247 |
| 7IQG PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo11 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.338 |
| 7IQH PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo12 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.288 |
| 7IQI PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo13 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.244 |
| 7IQJ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo14 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.263 |
| 7IQK PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo15 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.256 |
| 7IQL PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo15 (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.257 |
| 7IQM PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo16 (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.257 |
| 7IQN PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo17 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.246 |
| 7IQO PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo18 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.241 |
| 7IQP PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo19 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.238 |
| 7IQQ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo20 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.250 |
| 7IQR PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo21 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.273 |
| 7IQS PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo22 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.247 |
| 7IQT PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo23 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.246 |
| 7IQU PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo25 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.248 |
| 7IQV PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo26 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.243 |
| 7IQW PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo27 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.247 |
| 7IQX PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo28 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.245 |
| 7IQY PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo29 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.244 |
| 7IQZ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo30 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.253 |
| 7IR0 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo31 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.250 |
| 7IR1 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo32 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.252 |
| 7IR2 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo33 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.246 |
| 7IR3 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo34 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.254 |
| 7IR4 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo35 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.250 |
| 7IR5 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo36 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.254 |
| 7IR6 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B01a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.247 |
| 7IR7 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B02a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.239 |
| 7IR8 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B03b (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.280 |
| 7IR9 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B04a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.234 |
| 7IRA PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B05a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.267 |
| 7IRB PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B05b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.292 |
| 7IRC PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B06a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.261 |
| 7IRD PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B07a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.249 |
| 7IRE PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B08b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.21 Å R-free 0.248 |
| 7IRF PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B09b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.289 |
| 7IRG PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B10a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.263 |
| 7IRH PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B11a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.252 |
| 7IRI PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B12a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.252 |
| 7IRJ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C01a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.247 |
| 7IRK PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C02b (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.265 |
| 7IRL PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C03a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.252 |
| 7IRM PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C04a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.298 |
| 7IRN PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C05a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.257 |
| 7IRO PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C06b (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.263 |
| 7IRP PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C07a (dataset 4) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.247 |
| 7IRQ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C08a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.259 |
| 7IRR PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C09a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.250 |
| 7IRS PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C10a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.249 |
| 7IRT PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C11a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.234 |
| 7IRU PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C12a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.250 |
| 7IRV PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D01a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.236 |
| 7IRW PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D02a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.258 |
| 7IRX PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D03a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.244 |
| 7IRY PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D04a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.242 |
| 7IRZ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D05a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.244 |
| 7IS0 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D06a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.247 |
| 7IS1 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D07a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.285 |
| 7IS2 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D08a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.245 |
| 7IS3 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D09a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.254 |
| 7IS4 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D10b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.244 |
| 7IS5 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D11a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.265 |
| 7IS6 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D11b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.264 |
| 7IS7 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D12a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.246 |
| 7IS8 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E01a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.291 |
| 7IS9 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E01a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.246 |
| 7ISA PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E01b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.251 |
| 7ISB PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E02a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.246 |
| 7ISC PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E03a (dataset 3) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.235 |
| 7ISD PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E03b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.21 Å R-free 0.271 |
| 7ISE PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E04b (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.260 |
| 7ISF PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E05a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.251 |
| 7ISG PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E06a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.244 |
| 7ISH PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E07a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.240 |
| 7ISI PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E08a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.260 |
| 7ISJ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E09a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.251 |
| 7ISK PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E10a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.259 |
| 7ISL PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E11a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.255 |
| 7ISM PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F01a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.263 |
| 7ISN PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F03a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.242 |
| 7ISO PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F04a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.247 |
| 7ISP PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F05a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.241 |
| 7ISQ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F06a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.262 |
| 7ISR PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F07a (dataset 3) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.254 |
| 7ISS PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F08a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.245 |
| 7IST PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F10a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.257 |
| 7ISU PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F11a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.246 |
| 7ISV PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F12a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.257 |
| 7ISW PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G01a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.269 |
| 7ISX PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G02a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.252 |
| 7ISY PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G03a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.352 |
| 7ISZ PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G04a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.244 |
| 7IT0 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G05a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.245 |
| 7IT1 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G07a (dataset 4) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.245 |
| 7IT2 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G08a (dataset 3) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.255 |
| 7IT3 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G09a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.253 |
| 7IT4 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G10a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.252 |
| 7IT5 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G11a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.251 |
| 7IT6 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G12a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.256 |
| 7IT7 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H01a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.236 |
| 7IT8 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H02a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.265 |
| 7IT9 PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H03a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.230 |
| 7ITA PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H04a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.260 |
| 7ITB PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H05a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.270 |
| 7ITC PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H06a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.250 |
| 7ITD PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H07a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.255 |
| 7ITE PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H08a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.261 |
| 7ITF PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H09a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.251 |
| 7ITG PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H10a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.246 |
| 7ITH PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H11a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.259 |
| 7ITI PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H12a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–125（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.253 |
| 7JFQ The crystal structure of 3CL MainPro of SARS-CoV-2 with de-oxidized C145 提交 2020-07-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 FMT FORMIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；0.1 M TRIS pH 8.5 and 15% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.198 |
| 7JHE Room Temperature Structure of SARS-CoV-2 Nsp10/Nsp16 Methyltransferase in a Complex with 2'-O-methylated m7GpppA Cap-1 and SAH Determined by Fixed-Target Serial Crystallography 提交 2020-07-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 V9G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-ADENOSINE × 1 MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 6.5；295 K；Protein: 4.0 mg/ml (NSP10/NSP16 1:1), 0.15 M NaCl, 0.01 M Tris-HCl, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, pH 7.5. Precipitation buffer: 0.1 M MES pH 6.5, 0.9 M NaF. Batch crystallization: 100 ul of protein mixed with 100 ul of precipitation buffer in 500 ul polypropylene tube. Crystals were soaked with m7GpppA (0.5 mM) for 10 minutes before data collection.
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.248 |
| 7JIB Room Temperature Crystal Structure of Nsp10/Nsp16 from SARS-CoV-2 with Substrates and Products of 2'-O-methylation of the Cap-1 提交 2020-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 V9G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-ADENOSINE × 1 MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Protein: 4.0 mg/ml (Nsp10/Nsp16 1:1), 0.15 M NaCl, 0.01 M Tris-HCl, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, pH 7.5. Precipitation buffer: 0.1 M MES pH 6.5, 0.9 M NaF. Sitting drops made using 0.4 ul of protein mixed with 0.4 ul of precipitation buffer.
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分辨率 2.65 Å R-free 0.181 |
| 7JKV Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with an inhibitor GRL-2420 提交 2020-07-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | V7G N-[(2S)-1-({(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M MES pH 5.8, 15% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.177 |
| 7JLT Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP7-NSP8 complex. 提交 2020-07-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3860–3942（83 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Magnesium Chloride Hexahydrate, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 25% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.283 |
| 7JME Structure of the SARS-CoV-2 NSP3 Macro X domain in complex with cyclic AMP 提交 2020-07-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1195（171 aa）
|
未记录 | CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289.15 K；30% PEG 4K, 0.1M MES pH 6.5, crystals then soaked in 35% PEG 4K, 20mM cAMP
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.182 |
| 7JOY Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with its C-terminal autoprocessing sequence. 提交 2020-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES pH 6, 16-22% PEG 3350, 5% MPD
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 7JP0 Crystal structure of Mpro with inhibitor r1 提交 2020-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VJA N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 20% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.226 |
| 7JP1 Structure of wild-type substrate free SARS-CoV-2 Mpro. 提交 2020-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 15-20% PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.233 |
| 7JPE Room Temperature Structure of SARS-CoV-2 Nsp10/Nsp16 Methyltransferase in a Complex with m7GpppA Cap-0 and SAM Determined by Fixed-Target Serial Crystallography 提交 2020-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 M7G 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 6.5；297 K；Protein: 4.0 mg/ml (NSP10/NSP16 1:1), 0.15 M CaCl, 0.01 M Tris-HCl, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, pH 7.5.
Precipitation buffer: 0.1M MES pH 6.5, 0.9 M NaF. Batch crystallization: 100 ul of protein mixed with 100 ul of precipitation buffer in 500 ul polypropylane tube. Two days before data collection 1 mM EDTA was added to batch crystallization. Crystal were soaked with m7GpppA (0.5 mM) for 10 minutes before data collection.
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分辨率 2.18 Å R-free 0.237 |
| 7JPY Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in its apo-form 提交 2020-08-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.205 |
| 7JPZ Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI1 提交 2020-08-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GHX (phenylmethyl) N-[(2S)-1-oxidanylidene-1-[[(2S)-1-oxidanyl-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-3-phenyl-propan-2-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.241 |
| 7JQ0 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI3 提交 2020-08-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VHV N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.227 |
| 7JQ1 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI4 提交 2020-08-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VHJ N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl]propan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.298 |
| 7JQ2 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI5 提交 2020-08-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VHM N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-3-cyclohexyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.214 |
| 7JQ3 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI6 提交 2020-08-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VHP N-[(benzyloxy)carbonyl]-O-tert-butyl-L-threonyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.254 |
| 7JQ4 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI7 提交 2020-08-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | XM2 N-[(benzyloxy)carbonyl]-O-tert-butyl-L-threonyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.238 |
| 7JQ5 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI8 提交 2020-08-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NOL N-[(BENZYLOXY)CARBONYL]-O-(TERT-BUTYL)-L-THREONYL-3-CYCLOHEXYL-N-[(1S)-2-HYDROXY-1-{[(3S)-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL]METHYL}ETHYL]-L-ALANINAMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.329 |
| 7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric（34） 与全部聚合物一致 |
链 F
145–180（36 aa）
片段：UNP residues 145-180
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric（35） 与全部聚合物一致 |
链 F
145–180（36 aa）
片段：UNP residues 145-180
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7JR3 SARS-CoV-2 3CL protease crystallized under reducing conditions 提交 2020-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M MES, 15% PEG4000, 1 mM TCEP
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.183 |
| 7JR4 SARS-CoV-2 3CL protease with alternative conformation of the active site promoted by methylene-bridged cysteine and lysine residues 提交 2020-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M MES, 15% PEG4000, 5% DMSO
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.180 |
| 7JST Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL in apo form 提交 2020-08-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6；277 K；0.1 M sodium phosphate-monobasic, 0.1 MES, and 20% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.196 |
| 7JSU Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with GC376 提交 2020-08-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6；277 K；0.1 M sodium phosphate-monobasic, 0.1 M MES (pH 6), and 20% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.203 |
| 7JT0 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with MAC5576 提交 2020-08-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | LW1 thiophene-2-carbaldehyde × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6；277 K；0.1 M sodium phosphate-monobasic, 0.1 M MES (pH 6), and 20% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.192 |
| 7JT7 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with compound 4 提交 2020-08-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | TG3 ethyl (4R)-4-[[(2S)-4-methyl-2-[[(2S,3R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoyl]amino]pentanoyl]amino]-5-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pentanoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5；277 K；0.1 M potassium nitrate, 0.1 M sodium acetate, and 20% (w/v) PEG 1000
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.225 |
| 7JU7 The crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease in complex with masitinib 提交 2020-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | G65 Masitinib × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；0.2 M NaCl,
0.1 M MES,
20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.192 |
| 7JUN Joint neutron/X-ray structure of SARS-CoV-2 3CL Mpro at room temperature 提交 2020-08-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | 未声明 |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.6, 3% DMSO
|
分辨率未提供 |
| 7JVZ SARS CoV-2 MAIN PROTEASE 3CLpro, ROOM TEMPERATURE, DAMAGE FREE XFEL MONOCLINIC STRUCTURE 提交 2020-08-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 6.5；293 K；12.5 % PEG 3350, 100 mmol/L bistris
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.217 |
| 7JW8 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with compound 4 in space group P1 提交 2020-08-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | TG3 ethyl (4R)-4-[[(2S)-4-methyl-2-[[(2S,3R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoyl]amino]pentanoyl]amino]-5-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pentanoate × 2 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6.5；277 K；0.1 M BIS-TRIS and 20% (w/v) PEG MME 5000
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.227 |
| 7JW8 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with compound 4 in space group P1 提交 2020-08-25 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | TG3 ethyl (4R)-4-[[(2S)-4-methyl-2-[[(2S,3R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoyl]amino]pentanoyl]amino]-5-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pentanoate × 2 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6.5；277 K；0.1 M BIS-TRIS and 20% (w/v) PEG MME 5000
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.227 |
| 7JYC Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (3CLpro/Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor Narlaprevir 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | NNA (1R,2S,5S)-3-[N-({1-[(tert-butylsulfonyl)methyl]cyclohexyl}carbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(1S)-1-[(1R)-2-(cyclopropylamino)-1-hydroxy-2-oxoethyl]pentyl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3% DMSO
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.212 |
| 7JYY Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer in Complex with (m7GpppA)pUpUpApApA (Cap-0) and S-Adenosylmethionine (SAM). 提交 2020-09-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 FMT FORMIC ACID × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: ComPAS (G5), 0.1M Sodium citrate pH 5.6, 1.0M Ammonium dihydrogen phosphate;
Soak: 1.5 hours, 0.2mM [M7Gppp]rArUrUrArArA, 5mM SAM, 5mM Manganese chloride;
Cryo: 4M Sodium formate.
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.185 |
| 7JYY Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer in Complex with (m7GpppA)pUpUpApApA (Cap-0) and S-Adenosylmethionine (SAM). 提交 2020-09-01 | Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
6799–7096（298 aa）
链 D
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 2 FMT FORMIC ACID × 3 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: ComPAS (G5), 0.1M Sodium citrate pH 5.6, 1.0M Ammonium dihydrogen phosphate;
Soak: 1.5 hours, 0.2mM [M7Gppp]rArUrUrArArA, 5mM SAM, 5mM Manganese chloride;
Cryo: 4M Sodium formate.
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.185 |
| 7JZ0 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer in Complex with (m7GpppA2m)pUpUpApApA (Cap-1) and S-Adenosyl-L-homocysteine (SAH). 提交 2020-09-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 FMT FORMIC ACID × 6 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；292 K；Protein: 4.7mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: Anions (E6), 0.1M Sodium acetate pH 4.6, 0.5M Sodium succinate;
Soak: 17 hours, 0.2mM [M7Gppp]rArUrUrArArA, 5mM SAM, 5mM Manganese chloride,
Cryo: 4M Sodium formate.
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.198 |
| 7JZ0 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer in Complex with (m7GpppA2m)pUpUpApApA (Cap-1) and S-Adenosyl-L-homocysteine (SAH). 提交 2020-09-01 | Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
6799–7096（298 aa）
链 D
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 5 FMT FORMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；292 K；Protein: 4.7mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: Anions (E6), 0.1M Sodium acetate pH 4.6, 0.5M Sodium succinate;
Soak: 17 hours, 0.2mM [M7Gppp]rArUrUrArArA, 5mM SAM, 5mM Manganese chloride,
Cryo: 4M Sodium formate.
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.198 |
| 7K0E 1.90 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with deuterated GC376 提交 2020-09-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
链 B
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Hepes, 0.2 M ammonium acetate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.230 |
| 7K0F 1.65 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a deuterated GC376 alpha-ketoamide analog (compound 5) 提交 2020-09-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | VR4 N-{(2S,3R)-4-(benzylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucinamide × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；28% PEG 2000 MME, 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.225 |
| 7K0R Nucleotide bound SARS-CoV-2 Nsp15 提交 2020-09-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
链 D
6453–6798（346 aa）
链 E
6453–6798（346 aa）
链 F
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7K1L Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 in the Complex with Uridine-2',3'-Vanadate 提交 2020-09-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | UVC URIDINE-2',3'-VANADATE × 6 ACT ACETATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；16 % w/v Polyethylene glycol 4,000, 100 mM TRIS; pH 8.5, 200 mM Sodium acetate
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.192 |
| 7K1O Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 in the Complex with Uridine-3',5'-Diphosphate 提交 2020-09-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | VQV 1-(3,5-di-O-phosphono-alpha-L-xylofuranosyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；289 K；8 % w/v Polyethylene glycol 4,000, 100 mM Sodium acetate; pH 4.6
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 7K3N Crystal Structure of NSP1 from SARS-CoV-2 提交 2020-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–180（180 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292.15 K；0.2 M sodium formate, 20% PEG3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.248 |
| 7K3T Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (3CLpro/Mpro) at 1.2 A Resolution and a Possible Capture of Zinc Binding Intermediate 提交 2020-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 22 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；20% PEG 3350, 0.1 M MES pH 6.5, 5% DMSO
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.167 |
| 7K40 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (3CLpro/Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor Boceprevir at 1.35 A Resolution 提交 2020-09-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | U5G boceprevir (bound form) × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；298 K；20% PEG4000, 0.1 M HEPES, pH 7.2, 0.1 M sodium chloride, 4% DMSO
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.192 |
| 7K5I SARS-COV-2 nsp1 in complex with human 40S ribosome 提交 2020-09-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–180（180 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7K6D SARS-CoV-2 Main Protease Co-Crystal Structure with Telaprevir Determined from Crystals Grown with 40 nL Acoustically Ejected Mpro Droplets at 1.48 A Resolution (Cryo-protected) 提交 2020-09-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 SV6 (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3% DMSO, 1 mM telaprevir
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.215 |
| 7K6E SARS-CoV-2 Main Protease Co-Crystal Structure with Telaprevir Determined from Crystals Grown with 40 nL Acoustically Ejected Mpro Droplets at 1.63 A Resolution (Direct Vitrification) 提交 2020-09-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 SV6 (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3% DMSO
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.245 |
| 7K7P Structure of SARS-CoV-2 nonstuctural protein 1 提交 2020-09-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
10–127（118 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5, 30 % w/v Polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.216 |
| 7K9P Room temperature structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 solved using SFX. 提交 2020-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 5.5；295 K；NendoU protein 75 mg/ml (20 mM HEPES pH 7.5, 150mM NaCl, 1mM TCEP) is added to the precipitant solution (100mM Na Citrate pH 5.5, 20% PEG 1000, 20% 2-Methyl-2,4-pentanediol (MPD)) in a 1:7 protein:precipitant ratio with agitation at 295K overnight.
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.209 |
| 7KAG Crystal structure of the ubiquitin-like domain 1 (Ubl1) of Nsp3 from SARS-CoV-2 提交 2020-09-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
819–929（111 aa）
片段：ubiquitin-like domain
链 B
819–929（111 aa）
片段：ubiquitin-like domain
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes pH 7.5, 2% hexanediol
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.248 |
| 7KEG Crystal structure from SARS-COV2 NendoU NSP15 提交 2020-10-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.2；293 K；15% PEG 8000, 0.1 M Sodium/Potassium Phosphate pH 6.2.
Cryo-condition by adding 20% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.218 |
| 7KEH Crystal structure from SARS-CoV-2 NendoU NSP15 提交 2020-10-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 6 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；20 % w/v Polyethylene glycol 3350, 100 mM BIS-TRIS propane, pH 6.5, 200 mM Sodium sulfate
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.220 |
| 7KF4 Crystal structure from SARS-CoV-2 NendoU NSP15 提交 2020-10-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
链 D
6453–6798（346 aa）
链 E
6453–6798（346 aa）
链 F
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5；293 K；0.1 M trisodium citrate pH 5, 14 % w/v PEG6000
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.246 |
| 7KFI SARS-CoV-2 Main protease immature form - apo structure 提交 2020-10-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG4000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.218 |
| 7KG3 Crystal structure of CoV-2 Nsp3 Macrodomain 提交 2020-10-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | MLI MALONATE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；308 K；70% saturated ammonium sulfate, 0.4% BME, 200 mM Imidazole / Malate pH 7.4,
50 mM MES pH 6.0
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.177 |
| 7KHP Acyl-enzyme intermediate structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with its C-terminal autoprocessing sequence. 提交 2020-10-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1M MES pH 6, 16-22% PEG 3350, 5% MPD
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.248 |
| 7KOA Room Temperature Structure of SARS-CoV-2 Nsp10/16 Methyltransferase in a Complex with Cap-0 and SAM Determined by Pink-Beam Serial Crystallography 提交 2020-11-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 2 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 6.5；298 K；Protein: 4.0 mg/ml (NSP10/NSP16 1:1), 0.15 M NaCl, 0.01 M Tris-HCl, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% glycerol, pH 7.5.; Precipitation buffer: 0.1 M MES pH 6.5, 0.9 M NaF. Batch crystallization: 100 ul of protein mixed with 100 ul of precipitation buffer in 500 ul polypropylane tube. Crystals were soaked with m7GpppA (0.5 mM) for 10 minutes before data collection.
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.277 |
| 7KPH SARS-CoV-2 Main Protease in mature form 提交 2020-11-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 25% PEG 3350
cryo 30% PEG 400
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.181 |
| 7KQO Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain (P43 crystal form) 提交 2020-11-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.85 Å R-free 0.138 |
| 7KQO Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain (P43 crystal form) 提交 2020-11-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.85 Å R-free 0.138 |
| 7KQP Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose (P43 crystal form) 提交 2020-11-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.88 Å R-free 0.123 |
| 7KQP Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose (P43 crystal form) 提交 2020-11-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.88 Å R-free 0.123 |
| 7KQW Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain (C2 crystal form, methylated) 提交 2020-11-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain (UNP residues 1024-1192)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, pH 8.5, 100 mM sodium acetate, 28% PEG4000
|
分辨率 0.93 Å R-free 0.147 |
| 7KR0 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain (C2 crystal form, 100 K) 提交 2020-11-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain (UNP residues 1024-1192)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, pH 8.5, 100 mM sodium acetate, 28% PEG4000
|
分辨率 0.77 Å R-free 0.117 |
| 7KR1 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain (C2 crystal form, 310 K) 提交 2020-11-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain (UNP residues 1024-1192)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, pH 8.5, 100 mM sodium acetate, 28% PEG4000
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.221 |
| 7KRI FR6-bound SARS-CoV-2 Nsp9 RNA-replicase 提交 2020-11-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
4141–4253（113 aa）
链 B
4141–4253（113 aa）
链 C
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 X0Y 1,3-dimethyl-1H-pyrrolo[3,4-d]pyrimidine-2,4(3H,6H)-dione × 12 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4；293 K；0.1M Sodium Citrate pH 4.0
2.2-2.4M Sodium Malonate
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.195 |
| 7KRN Structure of SARS-CoV-2 backtracked complex bound to nsp13 helicase - nsp13(1)-BTC 提交 2020-11-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 1N7 CHAPSO × 3 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7KRO Structure of SARS-CoV-2 backtracked complex complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-BTC 提交 2020-11-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 1N7 CHAPSO × 3 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7KRP Structure of SARS-CoV-2 backtracked complex complex bound to nsp13 helicase - BTC (local refinement) 提交 2020-11-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 1N7 CHAPSO × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7KVL SARS-CoV-2 Main protease immature form - FMAX Library E01 fragment 提交 2020-11-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 11 X4P 2-chloropyridine-4-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 SER SERINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG4000
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.227 |
| 7KVR SARS-CoV-2 Main protease immature form - FMAX Library E09 fragment 提交 2020-11-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 X4V N~4~,N~4~-dimethylpyridine-2,4-diamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG4000
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.225 |
| 7KX5 Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with noncovalent inhibitor Jun8-76-3A 提交 2020-12-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | X7V N-([1,1'-biphenyl]-4-yl)-N-[(1R)-2-oxo-2-{[(1S)-1-phenylethyl]amino}-1-(pyridin-3-yl)ethyl]furan-2-carboxamide × 2 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% PEG 3000, 0.2 M NaF
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.279 |
| 7KXB Crystal structure of SARS-CoV-2 Nsp3 Macrodomain complex with PARG329 提交 2020-12-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | XB1 N-{3-[(1,3-dimethyl-2,6-dioxo-2,3,6,9-tetrahydro-1H-purin-8-yl)sulfanyl]propyl}-N'-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]thiourea × 1 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；60% ASO4
0.4% BME
50 mM MES pH 6.0
200 mM Imidazole /Malate pH 8.6
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.188 |
| 7KYU The crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease with the formation of Cys145-1H-indole-5-carboxylate 提交 2020-12-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XC4 1-[(1H-indole-5-carbonyl)oxy]-1H-benzotriazole × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；289 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1M MES, 20% (w/v) PEG6000
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.187 |
| 7L0D SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML188 提交 2020-12-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 0EN N-[(1R)-2-(tert-butylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-(4-tert-butylphenyl)furan-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；23% (w/v) PEG 3350, Potassium Sodium Tartrate Tetrahydrate
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.261 |
| 7L10 CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2 (2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 4 提交 2020-12-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XEY 2-[3-(3,5-dichlorophenyl)-2-oxo[2H-[1,3'-bipyridine]]-5-yl]benzonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 6,000
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.251 |
| 7L11 CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 5 提交 2020-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XF1 2-[3-(3-chloro-5-propoxyphenyl)-2-oxo[2H-[1,3'-bipyridine]]-5-yl]benzonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 22% v/v Polyethylene glycol 400
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.232 |
| 7L12 CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 14 提交 2020-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XF4 (5S)-5-{3-[3-(benzyloxy)-5-chlorophenyl]-2-oxo[2H-[1,3'-bipyridine]]-5-yl}pyrimidine-2,4(3H,5H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.10% w/v n-Octyl-b-D-glucoside, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 22% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.249 |
| 7L13 CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 21 提交 2020-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XF7 (5S)-5-(3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]phenyl}-2-oxo[2H-[1,3'-bipyridine]]-5-yl)pyrimidine-2,4(3H,5H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M BIS-TRIS propane pH 9.0, 20% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.248 |
| 7L14 CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 26 提交 2020-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XFD 2-{3-[3-chloro-5-(cyclopropylmethoxy)phenyl]-2-oxo[2H-[1,3'-bipyridine]]-5-yl}benzonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M BIS-TRIS propane pH 9.0, 8% w/v Polyethylene glycol 20,000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.204 |
| 7L1F SARS-CoV-2 RdRp in complex with 4 Remdesivir monophosphate 提交 2020-12-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
4424–5321（898 aa）
链 C
4020–4133（114 aa）
链 D
3861–3923（63 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.89 Å |
| 7L5D The crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease in complex with demethylated analog of masitinib 提交 2020-12-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XNJ N-(4-methyl-3-{[4-(pyridin-3-yl)-1,3-thiazol-2-yl]amino}phenyl)-4-[(piperazin-1-yl)methyl]benzamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 GOL GLYCEROL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2M NACL, 0.1M MES, 20% (W/V) PEG6000
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.201 |
| 7L6R Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer in Complex with (m7GpppA2m)pUpUpApApA (Cap-1), S-Adenosyl-L-homocysteine (SAH) and Manganese (Mn). 提交 2020-12-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GLC alpha-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 1 BDF beta-D-fructopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；292 K；Protein: 3.0 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol; Screen: Ammonium sulfate (E2), 0.1M Citric acid pH 5.0, 0.8M Ammonium sulfate; Soak: 6hours, 0.2mM m7GpppAUUAAA, 5mM SAM, 20mM Manganese chloride in screen solution; Cryo: 25% Sucrose in screen solution.
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.166 |
| 7L6T Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer in Complex with (m7GpppA2m)pUpUpApApA (Cap-1), S-Adenosyl-L-homocysteine (SAH) and two Magnesium (Mg) ions. 提交 2020-12-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 FMT FORMIC ACID × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GLC alpha-D-glucopyranose × 2 ZN ZINC ION × 2 BDF beta-D-fructopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；Protein: 3.8 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;Screen: Classics II (B3), 0.5M Magnesium formate, 0.1M HEPES pH 7.5;Soak: 6hours, 0.2mM m7GpppAUUAAA, 5mM SAM, in screen solution;Cryo: 25% Sucrose in screen solution.
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.162 |
| 7L8I SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Rupintrivir (P21) 提交 2020-12-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | AG7 4-{2-(4-FLUORO-BENZYL)-6-METHYL-5-[(5-METHYL-ISOXAZOLE-3-CARBONYL)-AMINO]-4-OXO-HEPTANOYLAMINO}-5-(2-OXO-PYRROLIDIN-3-YL)-PENTANOIC ACID ETHYL ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris-Methane pH 5.5 and 0.2 M NaCl
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.263 |
| 7L8J SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Rupintrivir (P21212) 提交 2020-12-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | AG7 4-{2-(4-FLUORO-BENZYL)-6-METHYL-5-[(5-METHYL-ISOXAZOLE-3-CARBONYL)-AMINO]-4-OXO-HEPTANOYLAMINO}-5-(2-OXO-PYRROLIDIN-3-YL)-PENTANOIC ACID ETHYL ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris-Methane pH 5.5 and 0.2 M NaCl
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.281 |
| 7LB7 Joint X-ray/neutron structure of SARS-CoV-2 main protease (3CL Mpro) in complex with Telaprevir 提交 2021-01-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | SV6 (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2 | 未声明 |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；287 K；18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.6
|
分辨率未提供 |
| 7LBN X-ray crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease with Calpain I Inhibitor 提交 2021-01-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M sodium citrate, 15% PEG3350, 20mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.185 |
| 7LCO Improved Feline Drugs as SARS-CoV-2 Mpro Inhibitors: Structure-Activity Studies & Micellar Solubilization for Enhanced Bioavailability 提交 2021-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XTJ (3-fluorophenyl)methyl [(2S)-3-cyclopropyl-1-oxo-1-({(2S)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)propan-2-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.249 |
| 7LCR Improved Feline Drugs as SARS-CoV-2 Mpro Inhibitors: Structure-Activity Studies & Micellar Solubilization for Enhanced Bioavailability 提交 2021-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XTM N~2~-{[(3-fluorophenyl)methoxy]carbonyl}-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.277 |
| 7LCS Improved Feline Drugs as SARS-CoV-2 Mpro Inhibitors: Structure-Activity Studies & Micellar Solubilization for Enhanced Bioavailability 提交 2021-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XTP benzyl [(2S)-3-cyclopropyl-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.2 M Lithium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.255 |
| 7LCT Improved Feline Drugs as SARS-CoV-2 Mpro Inhibitors: Structure-Activity Studies & Micellar Solubilization for Enhanced Bioavailability 提交 2021-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XU4 N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-N~2~-{[(1S)-1-phenylethoxy]carbonyl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；295 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.233 |
| 7LDL Improved Feline Drugs as SARS-CoV-2 Mpro Inhibitors: Structure-Activity Studies & Micellar Solubilization for Enhanced Bioavailability 提交 2021-01-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XV4 N-[(2S)-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.261 |
| 7LDX SARS-CoV-2 Main protease immature form - F2X Entry Library E06 fragment 提交 2021-01-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 R9V (3-endo)-8-benzyl-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG4000
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.273 |
| 7LFE SARS-CoV-2 Main protease immature form - F2X Entry Library E03 fragment 提交 2021-01-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 XWS (2R,4R)-1-phenylhexahydropyrimidine-2,4-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG4000
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.253 |
| 7LFP SARS-CoV-2 Main protease immature form - F2X Entry Library G05 fragment 提交 2021-01-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 XY4 N-phenyl-N'-propan-2-ylurea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG4000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.261 |
| 7LFZ Human leukocyte antigen B*07:02 in complex with SARS-CoV2 epitope IPRRNVATL 提交 2021-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
5916–5924（9 aa）
片段：UNP residues 5916-5924
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；0.1 M sodium citrate, pH 8.0, 20% PEG4000, 20% isopropanol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 7LG2 Human leukocyte antigen A*0201 in complex with SARS-CoV2 epitope ALWEIQQVV 提交 2021-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
4094–4102（9 aa）
片段：UNP residues 4094-4102
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；290 K；25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.2 M magnesium chloride
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.254 |
| 7LG3 Human leukocyte antigen A*0201 in complex with SARS-CoV2 epitope KLWAQCVQL 提交 2021-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
3886–3894（9 aa）
片段：UNP residues 3896-3894
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；290 K；20% PEG4000, 0.1 M sodium acetate, pH 5.6, 20% isopropanol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.248 |
| 7LG7 Crystal structure of CoV-2 Nsp3 Macrodomain complex with PARG345 提交 2021-01-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：Macrodomain
|
未记录 | XYJ 3-[(1,3-dimethyl-2,6-dioxo-2,3,6,9-tetrahydro-1H-purin-8-yl)sulfanyl]-N-{[2-(morpholin-4-yl)ethyl]sulfonyl}propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；60% ASO4,0.4% BME,50 mM MES 6.0,200 mM Imidazole /Malate 8.2
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.206 |
| 7LGO Crystal structure of the nucleic acid binding domain (NAB) of Nsp3 from SARS-CoV-2 提交 2021-01-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1907–2021（115 aa）
片段：nucleic acid binding domain (NAB)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；2 M ammonium sulfate, 2% hexanediol. Cryoprotectant paratone.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.318 |
| 7LGO Crystal structure of the nucleic acid binding domain (NAB) of Nsp3 from SARS-CoV-2 提交 2021-01-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1907–2021（115 aa）
片段：nucleic acid binding domain (NAB)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；2 M ammonium sulfate, 2% hexanediol. Cryoprotectant paratone.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.318 |
| 7LHQ Solution structure of SARS-CoV-2 nonstructural protein 7 at pH 7.0 提交 2021-01-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3860–3942（83 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成
1.7 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] SARS-CoV-2 nsp7, 10 mM MOPS, 150 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 0.025 % sodium azide, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7LKD X-ray crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in space group P21. 提交 2021-02-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M sodium sulphate, 10% PEG 3350, 20 mM HEPES pH 7.5, 15% glycerol
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.226 |
| 7LKE X-ray crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in space group C2 提交 2021-02-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M sodium sulphate, 10% PEG 3350, 20 mM HEPES pH 7.5, 15% glycerol
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.294 |
| 7LKR 1.65 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 2a 提交 2021-02-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | Y4D (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3s,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1 Y5S (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3s,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1 Y8Y (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3r,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1 Y91 (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3r,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris, 100 mM ammonium phosphate dibasic, 5% v/v 2-propanol
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.219 |
| 7LKS 1.70 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 2f 提交 2021-02-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | Y7G (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,2S,4S)-bicyclo[2.2.1]heptan-2-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 Y4P (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,2S,4S)-bicyclo[2.2.1]heptan-2-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% w/v PEG3350, 200 mM sodium formate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.221 |
| 7LKT 1.50 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 2k 提交 2021-02-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | Y7M (1S,2S)-2-((S)-2-(((adamantan-1-ylmethoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 Y4V (1R,2S)-2-((S)-2-(((adamantan-1-ylmethoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 FLC CITRATE ANION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；15% w/v PEG6000, 100 mM sodium citrate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.205 |
| 7LKU 1.65 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 3b (deuterated analog of inhibitor 2a) 提交 2021-02-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | Y4D (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3s,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1 Y5S (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3s,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1 Y8Y (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3r,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1 Y91 (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3r,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；20% w/v PEG4000, 100 mM Tris
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.211 |
| 7LKV 1.55 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 3c 提交 2021-02-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | Y4J (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3R,5S)-bicyclo[3.3.1]non-6-en-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 Y64 (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3R,5S)-bicyclo[3.3.1]non-6-en-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris, 100 mM ammonium phosphate dibasic, 5% v/v 2-propanol
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.208 |
| 7LKW 1.65 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 3d (deuterated analog of inhibitor 3c) 提交 2021-02-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | Y8S (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3S,5S)-bicyclo[3.3.1]non-6-en-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 Y8V (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3S,5S)-bicyclo[3.3.1]non-6-en-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 CL CHLORIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris, 100 mM ammonium phosphate dibasic, 5% v/v 2-propanol
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.227 |
| 7LKX 1.60 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 3e 提交 2021-02-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | Y51 (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1S,2S,4S)-bicyclo[2.2.1]hept-5-en-2-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 Y71 (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1S,2S,4S)-bicyclo[2.2.1]hept-5-en-2-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；15% w/v PEG3350, 100 mM succinic acid
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.212 |
| 7LMC Structure of SARS CoV-2 main protease shows simultaneous processing of its N- and C-terminii 提交 2021-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
链 E
3258–3263（6 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；286 K；0.1 M MES, pH 6, 20 % PEG 6000, 0.2 M ammonium chloride
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.288 |
| 7LMC Structure of SARS CoV-2 main protease shows simultaneous processing of its N- and C-terminii 提交 2021-02-05 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
链 F
3258–3263（6 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；286 K；0.1 M MES, pH 6, 20 % PEG 6000, 0.2 M ammonium chloride
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.288 |
| 7LMD SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 2-(benzotriazol-1-yl)-N-[4-(1H-pyrazol-4-yl)phenyl]-N-(3-thienylmethyl)acetamide 提交 2021-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Y6A 2-(benzotriazol-1-yl)-~{N}-[4-(1~{H}-pyrazol-4-yl)phenyl]-~{N}-(thiophen-3-ylmethyl)ethanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289.15 K；0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.234 |
| 7LME SARS-CoV-2 3CLPro in complex with N-[4-[[2-(benzotriazol-1-yl)acetyl]-(3-thienylmethyl)amino]phenyl]cyclopropanecarboxamide 提交 2021-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Y6J ~{N}-[4-[2-(benzotriazol-1-yl)ethanoyl-(thiophen-3-ylmethyl)amino]phenyl]cyclopropanecarboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289.15 K；0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.240 |
| 7LMF SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 2-(benzotriazol-1-yl)-N-[4-(1H-imidazol-4-yl)phenyl]-N-(3-thienylmethyl)acetamide 提交 2021-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Y6G 2-(benzotriazol-1-yl)-~{N}-[4-(1~{H}-imidazol-4-yl)phenyl]-~{N}-(thiophen-3-ylmethyl)ethanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289.15 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.254 |
| 7LTJ Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (3CL Mpro) in complex with a non-covalent inhibitor Mcule-5948770040 提交 2021-02-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YD1 6-[4-(3,4-dichlorophenyl)piperazin-1-yl]carbonyl-1~{H}-pyrimidine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0 with 0.2 microL of 1 to 200 dilution microseeds and incubated at 14degC
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.192 |
| 7LTN Crystal structure of Mpro in complex with inhibitor CDD-1713 提交 2021-02-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YCV 2-[4-(1~{H}-indazol-4-yl)-2-methanoyl-6-methoxy-phenoxy]-~{N},~{N}-dimethyl-ethanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% PEG3350, 0.2 M sodium acetate
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.245 |
| 7LW3 Structure of SARS-CoV-2 nsp16/nsp10 complex in presence of Cap-1 analog (m7GpppAmU) and SAH 提交 2021-02-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 YG4 [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(6-azanyl-7,8-dihydropurin-9-yl)-2-[[[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-7-methyl-6-oxidanylidene-1,8-dihydropurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxymethyl]-4-methoxy-oxolan-3-yl] [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{S})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；10% (v/v) propanol, 0.01 M MES/NaOH pH 6.0, 0.2 M calcium acetate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.251 |
| 7LW4 Structure of SARS-CoV-2 nsp16/nsp10 complex in presence of S-adenosyl-L-homocysteine (SAH) 提交 2021-02-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ACT ACETATE ION × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；10% (v/v) propanol-2, 0.1 M MES/NaOH pH 6.0, 0.2 M Calccium acetate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.240 |
| 7LYH Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor UAWJ9-36-1 提交 2021-03-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YHJ benzyl (1S,3aR,6aS)-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)hexahydrocyclopenta[c]pyrrole-2(1H)-carboxylate × 2 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M NaF
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 7LYI Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor UAWJ9-36-3 提交 2021-03-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 2 YHI benzyl (1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-3-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M NaF
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.217 |
| 7LZT Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 8b 提交 2021-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 YMY (1R,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-(((((1s,4S)-4-propylcyclohexyl)methoxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 YN1 (1S,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-(((((1s,4S)-4-propylcyclohexyl)methoxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.5 M ammonium sulfate, 100 mM MES
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.197 |
| 7LZU Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 12b 提交 2021-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | YKM (1R,2S)-2-((S)-2-((((S)-1-(4,4-difluorocyclohexyl)ethoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 YKP (1S,2S)-2-((S)-2-((((S)-1-(4,4-difluorocyclohexyl)ethoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；20% w/v PEG5000 MME, 100 mM Bis-Tris
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.201 |
| 7LZV Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 19b 提交 2021-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | YLM (1R,2S)-2-((S)-2-((((4-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 YLS (1S,2S)-2-((S)-2-((((4-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；20% w/v PEG4000, 100 mM Tris
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.212 |
| 7LZW Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 20b (deuterated analog of 19b) 提交 2021-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | YLM (1R,2S)-2-((S)-2-((((4-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 YLS (1S,2S)-2-((S)-2-((((4-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；20% w/v PEG4000, 100 mM Tris
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.258 |
| 7LZX Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 1c 提交 2021-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | YMG (1S,2S)-2-((S)-2-((((4,4-dimethylcyclohexyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 YMD (1R,2S)-2-((S)-2-((((4,4-dimethylcyclohexyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；20% w/v PEG2000 MME, 100 mM Tris, 200 mM Trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.214 |
| 7LZY Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 3c 提交 2021-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | YMJ (1R,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-(((((1s,4S)-4-propylcyclohexyl)oxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 YMM (1S,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-(((((1s,4S)-4-propylcyclohexyl)oxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；17% w/v PEG10000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM ammonium acetate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.223 |
| 7LZZ Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 5c 提交 2021-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | YMS (1R,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-(((((1r,4S)-4-phenylcyclohexyl)oxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 YMV (1S,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-(((((1r,4S)-4-phenylcyclohexyl)oxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% w/v PEG3350, 100 mM HEPES, 200 L-proline
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 7M00 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 13c 提交 2021-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | YKA (1R,2S)-2-((S)-2-((((2-(4,4-difluorocyclohexyl)propan-2-yl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 YKD (1S,2S)-2-((S)-2-((((2-(4,4-difluorocyclohexyl)propan-2-yl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；20% w/v PEG5000 MME, 100 mM Bis-Tris
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.265 |
| 7M01 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 14c 提交 2021-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | YKV (1S,2S)-2-((S)-2-((((S)-1-(4,4-difluorocyclohexyl)-2-phenylethoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 YKS (1R,2S)-2-((S)-2-((((S)-1-(4,4-difluorocyclohexyl)-2-phenylethoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；20% w/v PEG5000 MME, 100 mM Bis-Tris
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.224 |
| 7M02 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 17c 提交 2021-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | YL7 (1S,2S)-2-((S)-2-((((2-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 YKY (1R,2S)-2-((S)-2-((((2-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% w/v PEG2000 MME, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.241 |
| 7M03 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 18c 提交 2021-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | YLD (1R,2S)-2-((S)-2-((((3-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 YLJ (1S,2S)-2-((S)-2-((((3-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% w/v PEG2000 MME, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.249 |
| 7M04 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 21c 提交 2021-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | YLV (1R,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-((((perfluorophenyl)methoxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((R)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 YM1 (1S,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-((((perfluorophenyl)methoxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((R)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；20% w/v PEG5000 MME, 100 mM Bis-Tris
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.223 |
| 7M2P Structure of the SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 18 提交 2021-03-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.206 |
| 7M8M CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 11 提交 2021-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YSG 5-[3-(3-chloro-5-propoxyphenyl)-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M Sodium malonate pH 8.0, 0.1 M Tris pH 8.0, 30% w/v Polyethylene glycol 1,000
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.234 |
| 7M8N CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 16 提交 2021-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YSP 5-(3-{3-chloro-5-[(2-methylphenyl)methoxy]phenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 25% v/v Polyethylene glycol 300
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.229 |
| 7M8O CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 19 提交 2021-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YSM 5-(3-{3-chloro-5-[(3-fluorophenyl)methoxy]phenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 22% v/v Polyethylene glycol 400
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.288 |
| 7M8P CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 23 提交 2021-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YSJ 5-(3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M Succinic acid pH 7.0, 0.1 M BICINE pH 8.5, 30% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.231 |
| 7M8X CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 6 提交 2021-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YTJ 2-{3-[3-chloro-5-(2-methoxyethoxy)phenyl]-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl}benzonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 6,000
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.273 |
| 7M8Y CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 15 提交 2021-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YTM 5-{3-[3-chloro-5-(2-phenylethoxy)phenyl]-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl}pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M Imidazole pH 7.0, 20% v/v Jeffamine ED-2001 pH 7.0
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.228 |
| 7M8Z CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 29 提交 2021-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YTV 5-{3-[3-chloro-5-(3-hydroxy-3-methylbutoxy)phenyl]-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl}pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 6,000
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.240 |
| 7M90 CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 50 提交 2021-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YTS 5-(3-{3-chloro-5-[2-(3-oxopiperazin-1-yl)ethoxy]phenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 20% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.273 |
| 7M91 CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 25 提交 2021-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YU4 5-{3-[3-chloro-5-(3,3,3-trifluoropropoxy)phenyl]-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl}pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 6,000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.233 |
| 7MAT SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor dFFR 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | H37 D-phenylalanyl-N-[(3S)-6-carbamimidamido-1-chloro-2-oxohexan-3-yl]-L-phenylalaninamide × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.8M AmSO4 + 0.1M MES pH 6.5 + 3% Dioxane
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.260 |
| 7MAU SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor dFFR-yne 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 YVP N-{3-[(prop-2-yn-1-yl)oxy]propanoyl}-D-phenylalanyl-N-[(3S)-6-carbamimidamido-2-oxohexan-3-yl]-L-phenylalaninamide × 2 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.7M AmSO4 + 0.1M MES pH 6.5 + 3% Dioxane
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.214 |
| 7MAV SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor dFFCit-yne 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YVY N-{3-[(prop-2-yn-1-yl)oxy]propanoyl}-D-phenylalanyl-N-[(3S)-6-(carbamoylamino)-2-oxohexan-3-yl]-L-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.6M AmSO4 + 0.1M MES pH 6.5 + 3% Dioxane
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.244 |
| 7MAW SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM129 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YVA ethyl (4R)-4-({3-cyclopropyl-N-[(2E)-3-(4-ethynylphenyl)prop-2-enoyl]-L-alanyl}amino)-5-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentanoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.229 |
| 7MAX SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM137 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YV7 D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-4-fluoro-L-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；14% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.243 |
| 7MAZ SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM139 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YVD 4-fluoro-D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-4-fluoro-L-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.207 |
| 7MB0 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM141 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YVG D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.199 |
| 7MB1 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM143 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YVJ 4-fluoro-D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；12% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.214 |
| 7MB2 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM144 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YVM 4-fluoro-N-{3-[(prop-2-yn-1-yl)oxy]propanoyl}-D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.210 |
| 7MB3 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM145 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YVV N-{3-[(prop-2-yn-1-yl)oxy]propanoyl}-D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.233 |
| 7MB3 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM145 提交 2021-03-31 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YVV N-{3-[(prop-2-yn-1-yl)oxy]propanoyl}-D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.233 |
| 7MB3 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM145 提交 2021-03-31 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
3264–3569（306 aa）
链 F
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YVV N-{3-[(prop-2-yn-1-yl)oxy]propanoyl}-D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.233 |
| 7MB4 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp4/5 (P6-P1) 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
链 E
3258–3263（6 aa）
链 F
3258–3263（6 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；14% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.220 |
| 7MB4 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp4/5 (P6-P1) 提交 2021-03-31 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
链 G
3258–3263（6 aa）
链 H
3258–3263（6 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；14% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.220 |
| 7MB5 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp5/6 (P6-P1) 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
链 C
3564–3569（6 aa）
链 D
3564–3569（6 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.184 |
| 7MB6 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp6/7 (P6-P1) 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
链 C
3854–3859（6 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.272 |
| 7MB7 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp7/8 (P6-P1) 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3937–3942（6 aa）
|
突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.224 |
| 7MB8 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp8/9 (P6-P1) 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
链 E
4135–4140（6 aa）
链 F
4135–4140（6 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.195 |
| 7MB8 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp8/9 (P6-P1) 提交 2021-03-31 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
链 G
4135–4140（6 aa）
链 H
4135–4140（6 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.195 |
| 7MB9 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp10/11 (P6-P1) 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
链 C
4387–4392（6 aa）
链 D
4387–4392（6 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；13% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.228 |
| 7MBG SARS-CoV-2 Main protease in orthorhombic space group 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.222 |
| 7MBI Structure of SARS-CoV2 3CL protease covalently bound to peptidomimetic inhibitor 提交 2021-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YWJ 4-methoxy-N-[(2S)-4-methyl-1-oxo-1-({(2S)-3-oxo-1-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]butan-2-yl}amino)pentan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；2 M Sodium citrate tribasic dihydrate 0.1 M Bis-Tris propane 8.5 20 % w/v PEG 3350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.261 |
| 7MBI Structure of SARS-CoV2 3CL protease covalently bound to peptidomimetic inhibitor 提交 2021-03-31 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3569（306 aa）
链 C
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YWJ 4-methoxy-N-[(2S)-4-methyl-1-oxo-1-({(2S)-3-oxo-1-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]butan-2-yl}amino)pentan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide × 2 FN7 2,4,6-trimethylpyridine-3-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；2 M Sodium citrate tribasic dihydrate 0.1 M Bis-Tris propane 8.5 20 % w/v PEG 3350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.261 |
| 7MC5 Crystal structure of the SARS-CoV-2 ExoN-nsp10 complex 提交 2021-04-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
5928–6214（287 aa）
片段：UNP residues 5926-6214
链 M
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 23 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；di-ammonium tartrate, pH 7.0, PEG 3350
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.197 |
| 7MC6 Crystal structure of the SARS-CoV-2 ExoN-nsp10 complex containing Mg2+ ion 提交 2021-04-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
5926–6214（289 aa）
片段：UNP residues 5926-6214
链 M
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 CL CHLORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；MgCl2 , Tris-HCl pH 8.5, PEG 4000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.219 |
| 7ME0 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 NSP15 NendoU at pH 6.0 提交 2021-04-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
链 D
6453–6798（346 aa）
链 E
6453–6798（346 aa）
链 F
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.48 Å |
| 7MGR SARS-CoV-2 main protease in complex with nsp8/9 substrate peptide 提交 2021-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；5% PEG 4000; 0.1 M Tris, pH 8; 5% Dimethyl Sulfoxide (DMSO)
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.229 |
| 7MGS SARS-CoV-2 main protease in complex with N-terminal autoprocessing substrate 提交 2021-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145A | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；9% Polyethylene Glycol (PEG) 6000; 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.227 |
| 7MHF Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) at 100 K 提交 2021-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；22% PEG4000, 100 mM HEPES, pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.224 |
| 7MHG Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) at 240 K 提交 2021-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；22% PEG4000, 100 mM HEPES, pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.205 |
| 7MHH Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) at 277 K 提交 2021-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.253 |
| 7MHI Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) at 298 K 提交 2021-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.228 |
| 7MHJ Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) at 298 K and High Humidity 提交 2021-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 7MHK Crystal Structure of Apo/Unliganded SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) at 310 K 提交 2021-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.247 |
| 7MHL Ensemble refinement structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) at 100 K 提交 2021-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；22% PEG4000, 100 mM HEPES, pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.227 |
| 7MHM Ensemble refinement structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) at 240 K 提交 2021-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；22% PEG4000, 100 mM HEPES, pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.197 |
| 7MHN Ensemble refinement structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) at 277 K 提交 2021-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3--5% DMSO
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.215 |
| 7MHO Ensemble refinement structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) at 298 K 提交 2021-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3--5% DMSO
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.208 |
| 7MHP Ensemble refinement structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) at 298 K at high humidity 提交 2021-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3--5% DMSO
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.221 |
| 7MHQ Ensemble refinement structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) at 310 K 提交 2021-04-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3--5% DMSO
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.235 |
| 7MLF Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (3CLpro/Mpro) Covalently Bound to Compound C7 提交 2021-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
|
未记录 | C7A N-(4-tert-butylphenyl)-2-chloro-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；30% PEG2000 MME, 0.1 M potassium thiocyanate
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.279 |
| 7MLG Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (3CLpro/Mpro) Covalently Bound to Compound C63 提交 2021-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | ZJ1 (2R)-2-[(4-tert-butylphenyl)(ethanesulfonyl)amino]-N-cyclohexyl-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；0.1 M BTP, pH 6.5, 20% PEG3350, 0.2 M potassium thiocyanate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.268 |
| 7MNG Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (3CLpro/Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor VBY-825 (Partial Occupancy) 提交 2021-04-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | ZL7 (2R,3S)-N-cyclopropyl-3-{[(2R)-3-(cyclopropylmethanesulfonyl)-2-{[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-(4-fluorophenyl)ethyl]amino}propanoyl]amino}-2-hydroxypentanamide (non-preferred name) × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 4000, HEPES pH 7.0, 1 mM VBY-825 (in final drop), 4% DMSO (in final drop)
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.218 |
| 7MPB SARS Coronavirus-2 Main Protease 3CL-pro binding Ascorbate 提交 2021-05-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | ASC ASCORBIC ACID × 2 ETF TRIFLUOROETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；15 % PEG 3350, 5 mmol/L ascorbate, and trifluoroethanol (4 %)
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.244 |
| 7MRR Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (3CLpro/Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor Leupeptin 提交 2021-05-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 4000, HEPES pH 7.0, 3% DMSO
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.245 |
| 7MSW Full length SARS-CoV-2 Nsp2 提交 2021-05-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
181–818（638 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；Filtered and degassed before running FPLC
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 5 seconds before plunging into liquid ethane
|
分辨率 3.76 Å |
| 7MSX SARS-CoV-2 Nsp2 提交 2021-05-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
181–818（638 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；Filtered and degassed before running FPLC
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane
|
分辨率 3.15 Å |
| 7N06 SARS-CoV-2 Nsp15 endoribonuclease post-cleavage state 提交 2021-05-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 A
6453–6797（345 aa）
链 B
6453–6797（345 aa）
链 C
6453–6797（345 aa）
链 D
6453–6797（345 aa）
链 E
6453–6797（345 aa）
链 F
6453–6797（345 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å |
| 7N0B Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 (WT)-RNA complex 提交 2021-05-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 B
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7N0C Cryo-EM structure of the monomeric form of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 (E191A)-RNA complex 提交 2021-05-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 B
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
|
突变：E191A | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7N0D Cryo-EM structure of the tetrameric form of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 (E191A)-RNA complex 提交 2021-05-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 A
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 B
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
链 C
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 D
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
链 E
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 F
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
链 G
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 H
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
|
突变：E191A 突变：E191A 突变：E191A 突变：E191A | ZN ZINC ION × 20 MG MAGNESIUM ION × 6 1N7 CHAPSO × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 7N33 SARS-CoV-2 Nsp15 endoribonuclease pre-cleavage state 提交 2021-05-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 A
6453–6796（344 aa）
链 B
6453–6796（344 aa）
链 C
6453–6796（344 aa）
链 D
6453–6796（344 aa）
链 E
6453–6796（344 aa）
链 F
6453–6796（344 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 7N3K Oridonin-bound SARS-CoV-2 Nsp9 提交 2021-06-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4141–4253（113 aa）
链 B
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | ODN (1beta,6beta,7beta,8alpha,9beta,10alpha,13alpha,14R,16beta)-1,6,7,14-tetrahydroxy-7,20-epoxykauran-15-one × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；295 K；20% PEG 4000, 0.17M NH4SO4, 0.1M NaCitrate Phosphate pH 4.0
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.285 |
| 7N3K Oridonin-bound SARS-CoV-2 Nsp9 提交 2021-06-01 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
4141–4253（113 aa）
链 D
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | ODN (1beta,6beta,7beta,8alpha,9beta,10alpha,13alpha,14R,16beta)-1,6,7,14-tetrahydroxy-7,20-epoxykauran-15-one × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；295 K；20% PEG 4000, 0.17M NH4SO4, 0.1M NaCitrate Phosphate pH 4.0
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.285 |
| 7N3K Oridonin-bound SARS-CoV-2 Nsp9 提交 2021-06-01 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
4141–4253（113 aa）
链 F
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | ODN (1beta,6beta,7beta,8alpha,9beta,10alpha,13alpha,14R,16beta)-1,6,7,14-tetrahydroxy-7,20-epoxykauran-15-one × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；295 K；20% PEG 4000, 0.17M NH4SO4, 0.1M NaCitrate Phosphate pH 4.0
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.285 |
| 7N3K Oridonin-bound SARS-CoV-2 Nsp9 提交 2021-06-01 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
4141–4253（113 aa）
链 H
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | ODN (1beta,6beta,7beta,8alpha,9beta,10alpha,13alpha,14R,16beta)-1,6,7,14-tetrahydroxy-7,20-epoxykauran-15-one × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；295 K；20% PEG 4000, 0.17M NH4SO4, 0.1M NaCitrate Phosphate pH 4.0
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.285 |
| 7N44 Crystal structure of the SARS-CoV-2 (2019-NCoV) main protease in complex with 5-(3-{3-chloro-5-[(5-methyl-1,3-thiazol-4-yl)methoxy]phenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione (compound 13) 提交 2021-06-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 06I 5-(3-{3-chloro-5-[(5-methyl-1,3-thiazol-4-yl)methoxy]phenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.15 M DL-malic acid, pH 7.0, 0.1 M imidazole, pH 7.0, 22% v/v PEG550 MME
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.218 |
| 7N5Z SARS-CoV-2 Main protease C145S mutant 提交 2021-06-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 25% w/v PEG3350
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.197 |
| 7N6N SARS-CoV-2 Main protease C145S mutant in complex with N and C-terminal residues 提交 2021-06-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
3259–3569（311 aa）
片段：UNP residues 3259-3569
链 B
3259–3569（311 aa）
片段：UNP residues 3259-3569
链 C
3259–3263（5 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 3259-3263)
|
突变：C145S 突变：C145S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M phosphate/citrate, pH 5.5, 20% v/v PEG Smear High (BCS Screen A08)
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.255 |
| 7N7R Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z2472938267 提交 2021-06-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | S6V 1-[2-(2-oxidanylidenepyrrolidin-1-yl)ethyl]-3-phenyl-urea × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.240 |
| 7N7U Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with LIZA-7 提交 2021-06-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | 0MI 1-[(2~{R},4~{S},5~{R})-5-[[(azanylidene-$l^{4}-azanylidene)amino]methyl]-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]-5-methyl-pyrimidine-2,4-dione × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；'0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.254 |
| 7N7W Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with CSC000178569 提交 2021-06-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | 0OI N-(2-fluorophenyl)-N'-methylurea × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.228 |
| 7N7Y Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z18197050 提交 2021-06-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | RZG methyl 4-sulfamoylbenzoate × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.241 |
| 7N83 Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z2443429438 提交 2021-06-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 6 WNM (3S)-1-(phenylsulfonyl)pyrrolidin-3-amine × 21 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.232 |
| 7N89 Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease C145A mutant in complex with substrate Ac-SAVLQSGF-CONH2 提交 2021-06-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.218 |
| 7N8C Joint X-ray/neutron structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with Mcule5948770040 提交 2021-06-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YD1 6-[4-(3,4-dichlorophenyl)piperazin-1-yl]carbonyl-1~{H}-pyrimidine-2,4-dione × 2 | 未声明 |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0 reservoir solution and 0.2 microL microseeds at 1:200 dilution
|
分辨率未提供 |
| 7NBR Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with the HCV NS3/4A inhibitor boceprevir 提交 2021-01-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | U5G boceprevir (bound form) × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 30% PEG 8000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.269 |
| 7NBS Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with the HCV NS3/4A inhibitor telaprevir 提交 2021-01-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 SV6 (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.2 M Sodium bromide, 0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5, 20% PEG3350
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.256 |
| 7NBT Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 21 提交 2021-01-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 U7W 2-(benzotriazol-1-yl)-1-[(4~{S})-4-methyl-6,7-dihydro-4~{H}-thieno[3,2-c]pyridin-5-yl]ethanone × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.75；293 K；100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 12.5 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.230 |
| 7NBY Crystal structure of SU3327 (halicin) covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2. 提交 2021-01-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | U88 5-nitro-1,3-thiazole × 8 NO3 NITRATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.09M NPS (Sodium nitrate, Sodium phosphate dibasic, Ammonium sulfate), 0.1M Hepes/Mops pH 7.5, 20% v/v PEG 500 MME, 10 % w/v PEG 20000
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.198 |
| 7NEO Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 15 提交 2021-02-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
3264–3569（306 aa）
链 BBB
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | U9H 2-cyclobutyl-7-(5-fluoropyridin-3-yl)-5,7-diazaspiro[3.4]octane-6,8-dione × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.75；293 K；100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 12 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.239 |
| 7NEV Structure of the hemiacetal complex between the SARS-CoV-2 Main Protease and Leupeptin 提交 2021-02-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 IMD IMIDAZOLE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；Co-crystallization with the compounds was achieved by equilibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1 mMEDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB, pH 7.5, containing 25% w/w PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To obtain well-diffracting crystals in a reproducible way seeding was applied for crystal growth. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 - 3 days. Crystals were manually harvested and flash-frozen in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.234 |
| 7NF5 Crystal structure of MG-132 covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 in spacegroup C2. 提交 2021-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 6 CL CHLORIDE ION × 4 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.05M Magnesium chloride hexahydrate , 0.1M MES pH 6.5, 5 % w/vPEG 4000, 10% v/v 2-Propanol
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.225 |
| 7NG3 Crystal structure of MG-132 covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 in spacegroup P1. 提交 2021-02-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05M Magnesium chloride hexahydrate , 0.1M MES pH 6.5, 5 % w/vPEG 4000, 10% v/v 2-Propanol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.215 |
| 7NG6 Crystal structure of MG-132 covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 in spacegroup P1 in absence of DTT. 提交 2021-02-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 2 ACT ACETATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Magnesium acetate tetrahydrate, 0.1M MES pH 6.5, 10% w/vPEG 10,000
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.208 |
| 7NIJ SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in a novel conformational state. 提交 2021-02-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M MMT (DL-malic acid, MES, and Tris base in molar ratio 1:2:2), pH 7.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.203 |
| 7NIO Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase APO form 提交 2021-02-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
链 E
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；containing 20 % Ethylene Glycol, 10 % PEG 8K, 0.05 M MES pH 6.5, 0.05 M Imidazole pH 6.5, 10% v/v Ethylene glycols mix
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.286 |
| 7NN0 Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase in complex with AMP-PNP 提交 2021-02-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 % Ethylene Glycol, 10 % PEG 8K, 0.05 M MES pH 6.5, 0.05 M Imidazole pH 6.5, 10% v/v Alcohols mix
|
分辨率 3.04 Å R-free 0.284 |
| 7NN0 Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase in complex with AMP-PNP 提交 2021-02-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 % Ethylene Glycol, 10 % PEG 8K, 0.05 M MES pH 6.5, 0.05 M Imidazole pH 6.5, 10% v/v Alcohols mix
|
分辨率 3.04 Å R-free 0.284 |
| 7NN0 Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase in complex with AMP-PNP 提交 2021-02-23 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 % Ethylene Glycol, 10 % PEG 8K, 0.05 M MES pH 6.5, 0.05 M Imidazole pH 6.5, 10% v/v Alcohols mix
|
分辨率 3.04 Å R-free 0.284 |
| 7NN0 Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase in complex with AMP-PNP 提交 2021-02-23 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 % Ethylene Glycol, 10 % PEG 8K, 0.05 M MES pH 6.5, 0.05 M Imidazole pH 6.5, 10% v/v Alcohols mix
|
分辨率 3.04 Å R-free 0.284 |
| 7NNG Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2327226104 提交 2021-02-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | UJK 1-(2-methylphenyl)-1,2,3-triazole-4-carboxylic acid × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.295 |
| 7NNG Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2327226104 提交 2021-02-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | UJK 1-(2-methylphenyl)-1,2,3-triazole-4-carboxylic acid × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.295 |
| 7NT4 X-ray structure of SCoV2-PLpro in complex with small molecule inhibitor 提交 2021-03-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | PRL PROFLAVIN × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.05 M Sodium cacodylate pH 6.5
0.2 M Potassium chloride,
0.1 M Magnesium acetate
10 %(w/v) PEG 8000
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.264 |
| 7NT4 X-ray structure of SCoV2-PLpro in complex with small molecule inhibitor 提交 2021-03-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | PRL PROFLAVIN × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.05 M Sodium cacodylate pH 6.5
0.2 M Potassium chloride,
0.1 M Magnesium acetate
10 %(w/v) PEG 8000
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.264 |
| 7NTS Crystal structure of the SARS-CoV-2 Main Protease with oxidized C145 提交 2021-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 GOL GLYCEROL × 2 FMT FORMIC ACID × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M NaFormate, 20% PEG 3350, 10% DMSO, 10% Glycerol
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.207 |
| 7O46 Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 17 提交 2021-04-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | V18 2-cyclobutyl-7-isoquinolin-4-yl-5,7-diazaspiro[3.4]octane-6,8-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.75；293 K；100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 6.25 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.249 |
| 7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致 |
链 BK
4254–5324（1071 aa）
|
未记录 | SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.20 Å |
| 7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致 |
链 BK
4254–5324（1071 aa）
|
未记录 | SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致 |
链 BK
4254–5324（1071 aa）
|
未记录 | SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric（87） 与全部聚合物一致 |
链 BK
4254–5324（1071 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7ORR Non-structural protein 10 (nsp10) from SARS CoV-2 in complex with fragment VT00022 提交 2021-06-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4263–4384（122 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 PIM 4-PHENYL-1H-IMIDAZOLE × 2 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；Protein - 63 mg/mL in 50 mM Tris/HCl pH 8.0, 150 mM NaCl; precipitant (reservoir) - 0.1 M Bis-Tris/HCl pH 6.7, 2.4 M NaCl; 1:1, 1:2, 2:1 protein-to-precipitant ratios, 300 nL total drop volume. Soaking: reservoir solution, supplemented to 50 mM ligand, 5% (v/v) DMSO, 15% (v/v) glycerol; 2 h, 293K.
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.184 |
| 7ORU Non-structural protein 10 (nsp10) from SARS CoV-2 in complex with fragment VT00221 提交 2021-06-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4263–4384（122 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 2AQ QUINOLIN-2-AMINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；Protein - 63 mg/mL in 50 mM Tris/HCl pH 8.0, 150 mM NaCl; precipitant (reservoir) - 0.1 M Bis-Tris/HCl pH 6.7, 2.4 M NaCl; 1:1, 1:2, 2:1 protein-to-precipitant ratios, 300 nL total drop volume. Soaking: reservoir solution, supplemented to 50 mM ligand, 5% (v/v) DMSO, 15% (v/v) glycerol; 2 h, 293K.
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.172 |
| 7ORV Non-structural protein 10 (nsp10) from SARS CoV-2 in complex with fragment VT00239 提交 2021-06-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4263–4384（122 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X4V N~4~,N~4~-dimethylpyridine-2,4-diamine × 1 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；Protein - 63 mg/mL in 50 mM Tris/HCl pH 8.0, 150 mM NaCl; precipitant (reservoir) - 0.1 M Bis-Tris/HCl pH 6.7, 2.4 M NaCl; 1:1, 1:2, 2:1 protein-to-precipitant ratios, 300 nL total drop volume. Soaking: reservoir solution, supplemented to 50 mM ligand, 5% (v/v) DMSO, 15% (v/v) glycerol; 2 h, 293K.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.202 |
| 7ORW Non-structural protein 10 (nsp10) from SARS CoV-2 in complex with fragment VT00265 提交 2021-06-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4263–4384（122 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 7WA 1H-benzimidazol-4-amine × 1 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；Protein - 63 mg/mL in 50 mM Tris/HCl pH 8.0, 150 mM NaCl; precipitant (reservoir) - 0.1 M Bis-Tris/HCl pH 6.7, 2.4 M NaCl; 1:1, 1:2, 2:1 protein-to-precipitant ratios, 300 nL total drop volume. Soaking: reservoir solution, supplemented to 50 mM ligand, 5% (v/v) DMSO, 15% (v/v) glycerol; 2 h, 293K.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.209 |
| 7OYG Dimeric form of SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase 提交 2021-06-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
4393–5324（932 aa）
链 E
3943–4140（198 aa）
链 F
3860–3942（83 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å |
| 7OZU SARS-CoV-2 RdRp with Molnupiravir/ NHC in the template strand base-paired with A 提交 2021-06-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3940（81 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7OZV SARS-CoV-2 RdRp with Molnupiravir/ NHC in the template strand base-paired with G 提交 2021-06-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3940（81 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7P2O NMR solution structure of SUD-C domain of SARS-CoV-2 提交 2021-07-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1498–1561（64 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成
0.7 mM [U-99% 15N] SUD-C domain of SARS-CoV-2, 50 mM no sodium phosphate, 50 mM no sodium chloride, 2 mM no DTT, 2 mM no EDTA, 0.25 mM no DSS, 10 % no D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.7 mM [U-99% 15N] SUD-C domain of SARS-CoV-2, 50 mM no sodium phosphate, 50 mM no sodium chloride, 2 mM no DTT, 2 mM no EDTA, 0.25 mM no DSS, 10 % no D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7PFL The SARS-CoV2 major protease (Mpro) apo structure to 1.8 A resolution 提交 2021-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% w/v PEG 6000
100 mM HEPES pH 7
200 mM ammonium-sulfate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.219 |
| 7PFM A SARS-CoV2 major protease non-covalent ligand structure determined to 2.0 A resolution 提交 2021-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7IL N-[(1R)-2-(tert-butylamino)-2-oxidanylidene-1-pyridin-3-yl-ethyl]-N-(4-tert-butylphenyl)-1H-imidazole-5-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% w/v PEG 3350
200 mM Potassiumthiocyanate
100 mM Bis-Tris Propane pH 8.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 7PHZ Crystal structure of X77 bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 in spacegroup P2(1)2(1)2(1). 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 CL CHLORIDE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris/BICINE pH 8.5; 0.12M D-Glucose; 0.12M D-Mannose; 0.12M D-Galactose; 0.12M L-Fucose; 0.12M D-Xylose; 0.12M N-Acetyl-D-Glucosamine; 20% v/v Ethylene glycol; 10 % w/v PEG 8000
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.181 |
| 7PXZ Reduced form of SARS-CoV-2 Main Protease determined by XFEL radiation 提交 2021-10-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；291 K；Vapor diffusion was set up with 2 uL MPro (35 mg/mL) and 2 uL 25% PEG1500, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO. Seedstock was prepared by 100 uL 25% PEG1500, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO and 4 uL seeds from plate, vortex 5 times for 5 seconds, add 12.5 uL of MPro (35 mg/mL) and incubate at 18 deg overnight. Final sample was prepared in batch mode by adding 900 uL 25% PEG1500, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO and 100 uL seedstock and 100 uL MPro (35 mg per mL). Add seedbeads (250 uL volume in 1.5 mL Eppi) and incubate overnight at 900 rpm and 18 deg.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.212 |
| 7PZQ Oxidized form of SARS-CoV-2 Main Protease determined by XFEL radiation 提交 2021-10-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；291 K；Vapor diffusion was set up with 2 uL MPro (35 mg/mL) and 2 uL 25% PEG1500, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO. Seedstock was prepared by 100 uL 25% PEG1500, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO and 4 uL seeds from plate, vortex 5 times for 5 seconds, add 12.5 uL of MPro (35 mg/mL) and incubate at 18 deg overnight. Final sample was prepared in batch mode by adding 900 uL 25% PEG1500, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO and 100 uL seedstock and 100 uL MPro (35 mg per mL). Add seedbeads (250 uL volume in 1.5 mL Eppi) and incubate overnight at 900 rpm and 18 deg. Crystals were soaked with crystallization buffer containing containing 4 mM Calpeptin.
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.243 |
| 7Q5E Crystal structure of F2F-2020209-00X bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2. 提交 2021-11-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 90I benzyl (S)-2-(((S)-3,4-dioxo-1-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)-4-(phenethylamino)butan-2-yl)carbamoyl)pyrrolidine-1-carboxylate × 2 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.12M 1,6-Hexanediol 0.12M 1-Butanol
0.12M 1,2-Propanediol 0.12M 2-Propanol
0.12M 1,4-Butanediol 0.12M 1,3-Propanediol, 0.1M Tris/bicine pH 8.5, 20% v/v PEG 500 MME 10 % w/v PEG 20000
0.1 M Buffer System 3 8.5 30 % v/v Precipitant Mix 1
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.194 |
| 7Q5F Crystal structure of F2F-2020216-01X bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2. 提交 2021-11-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 90X (S)-1-(2-(2,4-dichlorophenoxy)acetyl)-N-((S)-3,4-dioxo-1-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)-4-(phenethylamino)butan-2-yl)pyrrolidine-2-carboxamide × 2 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 2 NO3 NITRATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.09M Sodium nitrate 0.09 Sodium phosphate dibasic 0.09M Ammonium sulfate, 0.1M Hepes/MOPS pH 7.5, 20% v/v PEG 500 MME 10 % w/v PEG 20000
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.196 |
| 7QBB Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 18 提交 2021-11-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 V1B 7-isoquinolin-4-yl-2-phenyl-5,7-diazaspiro[3.4]octane-6,8-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.75；293 K；100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 6.25 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG4K, RT, 2 h.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.258 |
| 7QG7 SARS-CoV-2 macrodomain Nsp3b bound to the remdesivir nucleoside GS-441524 提交 2021-12-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | U08 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolane-2-carbonitrile × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289.15 K；0.1 M Bis-Tris Propane/HCl pH 7.0, 2.2 M DL-Malic Acid pH 7.0, EG as cryoprotectant
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.226 |
| 7QG7 SARS-CoV-2 macrodomain Nsp3b bound to the remdesivir nucleoside GS-441524 提交 2021-12-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1194（170 aa）
|
未记录 | U08 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolane-2-carbonitrile × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289.15 K；0.1 M Bis-Tris Propane/HCl pH 7.0, 2.2 M DL-Malic Acid pH 7.0, EG as cryoprotectant
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.226 |
| 7QGI Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in the absence of NSP10 提交 2021-12-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.221 |
| 7QIF Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with 7MeGpppG. 提交 2021-12-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.26M sodium phosphate monobasic, 0.14M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.246 |
| 7QKA Crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease in complex with covalently bound GC376 提交 2021-12-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.207 |
| 7QT5 Room temperature In-situ SARS-CoV-2 MPRO with bound Z31792168 提交 2022-01-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | GWS 2-cyclohexyl-~{N}-pyridin-3-yl-ethanamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；11% (v/v) PEG 4K, 5% (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.231 |
| 7QT6 Room temperature In-situ SARS-CoV-2 MPRO with bound Z1367324110 提交 2022-01-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | RZJ 1-methyl-3,4-dihydro-2~{H}-quinoline-7-sulfonamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；11% (v/v) PEG 4K, 5% (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.222 |
| 7QT7 Room temperature In-situ SARS-CoV-2 MPRO with bound Z4439011520 提交 2022-01-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | UHV N-(5-tert-butyl-1,2-oxazol-3-yl)-N-[(1R)-2-[(4-methoxy-2-methylphenyl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；11% (v/v) PEG 4K, 5% (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.216 |
| 7QT8 Room temperature In-situ SARS-CoV-2 MPRO with bound ABT-957 提交 2022-01-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | R8H (2~{R})-5-oxidanylidene-~{N}-[(2~{R},3~{S})-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-phenyl-4-(pyridin-2-ylmethylamino)butan-2-yl]-1-(phenylmethyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；11% (v/v) PEG 4K, 5% (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.236 |
| 7R1T Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp10/nsp16 in complex with the SS148 inhibitor 提交 2022-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4263–4384（122 aa）
|
未记录 | 6NR (2~{S})-2-azanyl-4-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanyl-5-cyano-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanyl]butanoic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；10% w/v PEG 20,000, 20% v/v PEG MME 550;
0.03 M sodium nitrate, 0.03 M disodium hydrogen phosphate, 0.03 M ammonium sulfate;
0.1 M MES/imidazole pH 6.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.247 |
| 7R1U Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp10/nsp16 in complex with the WZ16 inhibitor 提交 2022-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4263–4384（122 aa）
|
未记录 | 4IK (2S,5S)-2,6-diamino-5-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl}hexanoic acid × 1 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；8% w/v PEG 8,000;
0.2 M NaCl;
0.1 M MES pH 6
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.252 |
| 7R2V Structure of nsp14 from SARS-CoV-2 in complex with SAH 提交 2022-02-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5926–6449（524 aa）
|
突变：D90A, E92A | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 ZN ZINC ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；278 K；PEG/Imidazole
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.254 |
| 7R2V Structure of nsp14 from SARS-CoV-2 in complex with SAH 提交 2022-02-06 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6449（524 aa）
|
突变：D90A, E92A | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；278 K；PEG/Imidazole
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.254 |
| 7R7H Peptidomimetic nitrile warheads as SARS-CoV-2 3CL protease inhibitors 提交 2021-06-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4IT N-[(2S)-1-({(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.2 M Ammonium chloride 0.1 M HEPES 7.0 20 % w/v PEG 6000
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.259 |
| 7RB0 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 NSP15 NendoU at pH 7.5 提交 2021-07-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
链 D
6453–6798（346 aa）
链 E
6453–6798（346 aa）
链 F
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；Hepes pH 7.5, 200 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 7RB2 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 NSP15 NendoU in BIS-Tris pH 6.0 提交 2021-07-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
链 D
6453–6798（346 aa）
链 E
6453–6798（346 aa）
链 F
6453–6798（346 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6；100 mM BIS-Tris 6.0, 200 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.27 Å |
| 7RBZ X-ray Structure of SARS-CoV-2 main protease covalently modified by compound GRL-017-20 提交 2021-07-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4IJ 5-chloropyridin-3-yl 2,3-dihydro-1H-indole-4-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；278 K；2.67 mM DTT, 0.33% MPD, 16.7 mM MES pH 6.0, 26.7 mM KCl, 5% PEG-10,000, 16.7 mM HEPES pH 7.5, 0.67% DMSO and 200 uM inhibitor
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.189 |
| 7RC0 X-ray Structure of SARS-CoV-2 main protease covalently modified by compound GRL-091-20 提交 2021-07-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4I9 5-chloro-4-methylpyridin-3-yl 1H-indole-4-carboxylate × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；2.67 mM DTT, 0.33% MPD, 16.7 mM MES pH 6.0, 26.7 mM KCl, 5% PEG-10,000, 16.7 mM HEPES pH 7.5, 0.67% DMSO and 200 uM inhibitor
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.174 |
| 7RDX SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-RTC - open class 提交 2021-07-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 1N7 CHAPSO × 3 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7RDY SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-RTC - engaged class 提交 2021-07-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
链 F
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 1N7 CHAPSO × 3 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7RDZ SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-RTC - apo class 提交 2021-07-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7RE0 SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-RTC - swiveled class 提交 2021-07-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7RE1 SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-RTC (composite) 提交 2021-07-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
链 F
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 1N7 CHAPSO × 3 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.91 Å |
| 7RE2 SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(1)-RTC 提交 2021-07-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 1N7 CHAPSO × 3 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 7RE3 SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-RTC dimer 提交 2021-07-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 G
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 H
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 I
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 J
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 K
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 L
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
|
未记录 | ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 4 1N7 CHAPSO × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.33 Å |
| 7RFR Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with a covalent inhibitor 提交 2021-07-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4W8 (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-3-(4-methoxy-1H-indole-2-carbonyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；294 K；0.1 M MES, pH 6.0, 20.0% w/v PEG6000, 0.2 M sodium chloride
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.228 |
| 7RFS Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with a covalent inhibitor 提交 2021-07-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；25.0% w/v PEG1500, 0.1 M MIB, pH 6.0
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.260 |
| 7RFU Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with a covalent inhibitor 提交 2021-07-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4YG (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-3-[N-(methanesulfonyl)-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；25.0% w/v PEG1500, 0.1 M MMT, pH 8.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.276 |
| 7RFW Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with a covalent inhibitor 提交 2021-07-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；25.0% w/v PEG1500, 0.1 M MMT, pH 6.0
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.227 |
| 7RLS Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-68 提交 2021-07-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 5YN 6-[4-(3,4,5-trichlorophenyl)piperazine-1-carbonyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.201 |
| 7RM2 Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with Mcule-CSR-494190-S1 提交 2021-07-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 5YJ 6-[4-(3,5-dichloro-4-methylphenyl)piperazine-1-carbonyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.190 |
| 7RMB Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-78 提交 2021-07-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 5Z7 6-[4-(4-bromo-3-chlorophenyl)piperazine-1-carbonyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.194 |
| 7RME Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-52 提交 2021-07-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 5Z3 6-{4-[4-chloro-3-(trifluoromethyl)phenyl]piperazine-1-carbonyl}pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.203 |
| 7RMT Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-70 提交 2021-07-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 5ZN 2-chloro-4-[4-(2,6-dioxo-1,2,5,6-tetrahydropyrimidine-4-carbonyl)piperazin-1-yl]benzaldehyde × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.196 |
| 7RMZ Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-63 提交 2021-07-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 5ZJ 6-{4-[3-chloro-4-(trifluoromethyl)phenyl]piperazine-1-carbonyl}pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.189 |
| 7RN0 Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor Jun9-57-3R 提交 2021-07-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 5ZB (2R)-2-{acetyl[4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl]amino}-N-[(1S)-1-phenylethyl]-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25 % 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M HEPES 7.5
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.241 |
| 7RN1 Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor Jun9-62-2R 提交 2021-07-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 2 5ZF N-([1,1'-biphenyl]-4-yl)-2-chloro-N-[(1R)-2-oxo-2-{[(1S)-1-phenylethyl]amino}-1-(pyridin-3-yl)ethyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M HEPES 7.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.223 |
| 7RN4 Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-69 提交 2021-07-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | H69 6-[4-(3,4-dichlorophenyl)piperidine-1-carbonyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.190 |
| 7RNH Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-45 提交 2021-07-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 5ZW 6-[4-(4-chlorophenyl)piperazine-1-carbonyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.201 |
| 7RNK Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-71 提交 2021-07-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 5ZT 6-{4-[3-chloro-4-(hydroxymethyl)phenyl]piperazine-1-carbonyl}pyrimidine-2,4(3H,5H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.206 |
| 7RNW SARS-CoV-2 Main Protease in complex with a cyclic peptide inhibitor 提交 2021-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；22% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris pH 6.0, 0.3M NaCl
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.231 |
| 7RNW SARS-CoV-2 Main Protease in complex with a cyclic peptide inhibitor 提交 2021-07-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；22% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris pH 6.0, 0.3M NaCl
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.231 |
| 7RQG Crystal structure of the Nsp3 Y3 domain from SARS-CoV-2 提交 2021-08-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2662–2763（102 aa）
片段：Y3 domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；1.1 sodium citrate, M, 0.1 M Hepes pH 7.5; Cryoprotectant paratone
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.242 |
| 7RQG Crystal structure of the Nsp3 Y3 domain from SARS-CoV-2 提交 2021-08-06 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2662–2763（102 aa）
片段：Y3 domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；1.1 sodium citrate, M, 0.1 M Hepes pH 7.5; Cryoprotectant paratone
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.242 |
| 7RQG Crystal structure of the Nsp3 Y3 domain from SARS-CoV-2 提交 2021-08-06 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2662–2763（102 aa）
片段：Y3 domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；1.1 sodium citrate, M, 0.1 M Hepes pH 7.5; Cryoprotectant paratone
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.242 |
| 7RQG Crystal structure of the Nsp3 Y3 domain from SARS-CoV-2 提交 2021-08-06 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
2662–2763（102 aa）
片段：Y3 domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；1.1 sodium citrate, M, 0.1 M Hepes pH 7.5; Cryoprotectant paratone
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.242 |
| 7RVM Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI11 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7V2 N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.238 |
| 7RVN Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI12 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 7VB N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methylidene-L-norvalinamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.212 |
| 7RVO Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI13 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7VI N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-3-cyclopropyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.275 |
| 7RVP Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI14 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7VQ N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-3-furan-2-yl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.274 |
| 7RVQ Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI16 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 7VW N-[(benzyloxy)carbonyl]-O-tert-butyl-L-threonyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.322 |
| 7RVR Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI18 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7W5 N-[(benzyloxy)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.323 |
| 7RVS Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI19 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 81L N-[(benzyloxy)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-3-cyclopropyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.227 |
| 7RVT Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI20 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7XK N~2~-[(2S)-2-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-cyclopropylacetyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.308 |
| 7RVU Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI21 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7XT N-[(benzyloxy)carbonyl]-3-methyl-L-isovalyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.329 |
| 7RVV Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI22 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7Y2 N-[(benzyloxy)carbonyl]-2-methyl-L-alanyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.428 |
| 7RVW Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI23 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7YB benzyl (1-{[(2S)-3-cyclohexyl-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]carbamoyl}cyclopropyl)carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.217 |
| 7RVX Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI24 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 7YI benzyl [(1S)-1-cyclopropyl-2-{[(2S)-3-cyclopropyl-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]amino}-2-oxoethyl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.265 |
| 7RVY Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI25 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7YQ O-tert-butyl-N-{[(3-chlorophenyl)methoxy]carbonyl}-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.268 |
| 7RVZ Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI26 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7YW O-tert-butyl-N-{[(3-chlorophenyl)methoxy]carbonyl}-L-threonyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.220 |
| 7RW0 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI27 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7YZ N-{[(3-chlorophenyl)methoxy]carbonyl}-L-valyl-3-cyclohexyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.253 |
| 7RW1 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI28 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 800 N-(1H-indole-2-carbonyl)-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.316 |
| 7S3K Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound Z1530718726 提交 2021-09-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Z26 2-(5-chloro-2-methoxyphenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；18-20% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.204 |
| 7S3S Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound Z1530724813 提交 2021-09-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 860 2-(3-chlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；18-20% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.222 |
| 7S4B Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound Z1530724963 提交 2021-09-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 87H (2R)-2-(3-fluorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；18-20% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.210 |
| 7S6W Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI29 提交 2021-09-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 8G9 (1R,2S,5S)-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.242 |
| 7S6X Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI30 提交 2021-09-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | I70 (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.207 |
| 7S6Y Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI32 提交 2021-09-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 8GW (1R,2S,5S)-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(2S,3R)-4-[(cyclopropylmethyl)amino]-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.258 |
| 7S6Z Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI33 提交 2021-09-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | I71 (1R,2S,5S)-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(2S,3R)-4-(ethylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.222 |
| 7S70 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI34 提交 2021-09-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 8H3 (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-(butylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.322 |
| 7S71 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI35 提交 2021-09-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 8H9 (1R,2S,5S)-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(2S,3R)-4-(hexylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.219 |
| 7S72 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI36 提交 2021-09-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 8I0 (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-(benzylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.296 |
| 7S73 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI37 提交 2021-09-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | I69 (6S)-5-{(2S)-2-[(tert-butylcarbamoyl)amino]-3,3-dimethylbutanoyl}-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-5-azaspiro[2.4]heptane-6-carboxamide (non-preferred name) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.238 |
| 7S74 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI38 提交 2021-09-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | I68 N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.272 |
| 7S75 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI42 提交 2021-09-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 8I7 (1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(3-methylbutanoyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.309 |
| 7S82 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Main protease C145S in complex with N-terminal peptide 提交 2021-09-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3259–3569（311 aa）
片段：UNP residues 3259-3569
链 B
3259–3569（311 aa）
片段：UNP residues 3259-3569
链 C
3259–3569（311 aa）
片段：UNP residues 3259-3569
链 D
3259–3569（311 aa）
片段：UNP residues 3259-3569
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8；20 mM Tris pH 7.8, 150 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7SD9 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI48 提交 2021-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 8T6 N-[(2S)-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4,4-dimethyl-1-oxopentan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.249 |
| 7SDA Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI49 提交 2021-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 8UI N-[(2S)-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4,4-dimethyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.244 |
| 7SDC Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MI-09 提交 2021-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | I80 (1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-{[4-(trifluoromethoxy)phenoxy]acetyl}-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.300 |
| 7SET SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML1000 提交 2021-10-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | I70 (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；Sitting drops consisted of 0.25 uL A:0.25 uL B:
A) 9 mg/mL Mpro + 0.5 mM ML1000 in 50 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 5 % DMSO
B) 0.1 M MES pH 6.5 + 15 % w/v PEG 6000 + 5% v/v 2-methyl-2,4-petanediol
cryoprotectant was 25% glycerol
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.206 |
| 7SF1 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML1001 提交 2021-10-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 8ZI (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-[N-(3,3-dimethylbutanoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；Sitting drops consisted of 0.16 uL A:0.16 uL B:
A) 5 mg/mL Mpro + 1.5 mM ML1001 in in 20 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 5 % DMSO
B) 0.1 M HEPES pH 7.5 + 0.2 M L-Proline + 24 % w/v PEG 1500
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.208 |
| 7SF3 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML1006m 提交 2021-10-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 90H (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-3-hydroxy-4-(methylamino)-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；Sitting drops consisted of 0.18 uL A:0.18 uL B:
A) 7 mg/mL Mpro + 1 mM ML1006m in in 20 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 3 % DMSO
B) 0.1 M HEPES pH 7.5 + 10% w/v PEG8000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.195 |
| 7SFB SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML101 提交 2021-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 90U benzyl (1R,2S,5S)-2-({(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}carbamoyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-3-carboxylate × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；Sitting drops consisted of 0.19 uL A:0.19 uL B:
A) 5.5 mg/mL Mpro + 0.5 mM ML101 in in 20 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 5 % DMSO
B) 0.1 M di-sodium malonate + 12 % w/v PEG 3350
The cryoprotectant was 30% v/v PEG200
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.232 |
| 7SFH SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML102 提交 2021-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 91I (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-(3-phenylpropanoyl)-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；Sitting drops consisted of 0.19 uL A:0.19 uL B:
A) 5.5 mg/mL Mpro + 0.5 mM ML102 in in 20 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 5 % DMSO
B) 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 +16 % w/v PEG 10000
Cryoprotectant was 30% v/v glycerol
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.193 |
| 7SFI SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML104 提交 2021-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 91Z (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[N-(2,4,6-trifluorophenyl)glycyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；Sitting drops consisted of 0.19 uL A:0.19 uL B:
A) 5.5 mg/mL Mpro + 0.5 mM ML104 in in 20 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 5 % DMSO
B) 0.1 M MES pH 6 + 14 % w/v PEG 4000
Cryoprotectant was 30% v/v glycerol.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.239 |
| 7SGH SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML124N 提交 2021-10-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 99W (S)-N-((S)-1-imino-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propan-2-yl)-4-methyl-2-(2-((2,4,6-trifluorophenyl)amino)acetamido)pentanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；Sitting drops consisted of 0.16 uL A:0.16 uL B:
A) 7 mg/mL Mpro + 1 mM ML124N in 20 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 3 % DMSO
B) Morpheus HT-96 well D1: 0.1 M MES pH 6.5 + 0.12 M Alcohols + 30 % v/v Precipitant Mix 1
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.232 |
| 7SGH SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML124N 提交 2021-10-05 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 99W (S)-N-((S)-1-imino-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propan-2-yl)-4-methyl-2-(2-((2,4,6-trifluorophenyl)amino)acetamido)pentanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；Sitting drops consisted of 0.16 uL A:0.16 uL B:
A) 7 mg/mL Mpro + 1 mM ML124N in 20 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 3 % DMSO
B) Morpheus HT-96 well D1: 0.1 M MES pH 6.5 + 0.12 M Alcohols + 30 % v/v Precipitant Mix 1
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.232 |
| 7SH7 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI87 提交 2021-10-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 9GI benzyl [(2S,3R)-3-tert-butoxy-1-{[(2S)-3-cyclohexyl-1-oxo-1-(2-{[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]methyl}-2-propanoylhydrazinyl)propan-2-yl]amino}-1-oxobutan-2-yl]carbamate (non-preferred name) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.297 |
| 7SH8 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI88 提交 2021-10-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GJ3 benzyl [(2S,3R)-1-{[(2S)-1-(2-acetyl-2-{[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]methyl}hydrazinyl)-3-cyclohexyl-1-oxopropan-2-yl]amino}-3-tert-butoxy-1-oxobutan-2-yl]carbamate (non-preferred name) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.272 |
| 7SH9 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI86 提交 2021-10-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 9HA benzyl [(2S,3R)-1-({(2S)-1-[2-acetyl-2-(3-amino-3-oxopropyl)hydrazinyl]-3-cyclohexyl-1-oxopropan-2-yl}amino)-3-tert-butoxy-1-oxobutan-2-yl]carbamate (non-preferred name) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.263 |
| 7SHB Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI79 提交 2021-10-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | I64 benzyl [(2S)-1-({(2S)-1-[2-(3-amino-3-oxopropyl)-2-propanoylhydrazinyl]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl}amino)-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate (non-preferred name) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.309 |
| 7SI9 Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with PF-07321332 提交 2021-10-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, compound soaked into apo-protease crystals
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.207 |
| 7T2T SARS-CoV2 Mpro native form 提交 2021-12-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；30% PEG 3350, 0.1 M Bis-tris propane pH 7.0
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.200 |
| 7T2U SARS-CoV2 3C-Like protease complexed with Nemo peptide 提交 2021-12-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
3263–3569（307 aa）
链 B
3263–3569（307 aa）
|
突变：C145S 突变：C145S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；20% PEG3350, 0.1M Bis-Tris (pH 6.5)
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.300 |
| 7T2U SARS-CoV2 3C-Like protease complexed with Nemo peptide 提交 2021-12-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
3263–3569（307 aa）
链 D
3263–3569（307 aa）
|
突变：C145S 突变：C145S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；20% PEG3350, 0.1M Bis-Tris (pH 6.5)
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.300 |
| 7T2V SARS CoV2 Mpro C145S mutant 提交 2021-12-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3263–3569（307 aa）
链 B
3263–3569（307 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；0.1MMESpH6.5,20%v/vPEGSmear High
|
分辨率 2.47 Å R-free 0.237 |
| 7T2V SARS CoV2 Mpro C145S mutant 提交 2021-12-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3263–3569（307 aa）
链 D
3263–3569（307 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；0.1MMESpH6.5,20%v/vPEGSmear High
|
分辨率 2.47 Å R-free 0.237 |
| 7T42 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 2c 提交 2021-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | FIK (1S,2S)-2-[(N-{[(2-acetyl-2-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)oxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 FIW (1R,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[2-(2-methylpropanoyl)-2-azaspiro[3.3]heptan-6-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；25% (w/v) PEG 1500, 100 mM PCTP
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.212 |
| 7T43 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 3c 提交 2021-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | FN2 (1S,2S)-1-hydroxy-2-[(N-{[(2-methyl-2-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)oxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 FP8 (1R,2S)-1-hydroxy-2-[(N-{[(2-methyl-2-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)oxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；25% (w/v) PEG 1500, 100 mM PCTP
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.213 |
| 7T44 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 4c 提交 2021-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | ESS (1R,2S)-2-[(N-{[(2-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)oxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 ET6 (1S,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[2-(methanesulfonyl)-2-azaspiro[3.3]heptan-6-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；17% (w/v) PEG 10000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM ammonium acetate
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.226 |
| 7T45 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 7c 提交 2021-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | EW9 (1S,2S)-2-{[N-({[7-(tert-butoxycarbonyl)-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 200 mM sodium fluoride
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.221 |
| 7T46 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 8c 提交 2021-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
链 B
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | F8C (1S,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[7-(2-methylpropanoyl)-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 F5L (1R,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[7-(2-methylpropanoyl)-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；25 % (w/v) PEG 3350, 100 mM Bis-Tris, 200 mM NaCl
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.193 |
| 7T48 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 9c 提交 2021-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 FHS (1S,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-2-{[N-({[7-(phenylacetyl)-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}propane-1-sulfonic acid × 2 FEY (1R,2S)-2-{[N-({[(2r,4R)-7-acetyl-7-azaspiro[3.5]non-5-en-2-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 100 mM Hepes, 200 mM lithium sulfate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.242 |
| 7T49 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 10c 提交 2021-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
链 B
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | FV5 (1R,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[7-(methanesulfonyl)-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 FVE (1S,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[7-(methanesulfonyl)-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；25 % (w/v) PEG 1500, 100 MMT
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.241 |
| 7T4A Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 11c 提交 2021-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | EQS (1S,2S)-2-[(N-{[(7-cyano-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl)oxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 EO6 (1R,2S)-2-[(N-{[(7-cyano-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl)oxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 % (w/v) PEG 3350, 20 mM sodium/postassium phosphate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.225 |
| 7T4B Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 14c 提交 2021-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
链 B
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | FWI (1R,2S)-2-{[N-({[1-(tert-butoxycarbonyl)azetidin-3-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3R)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-pyrrol-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 FZI (1S,2S)-2-{[N-({[1-(tert-butoxycarbonyl)azetidin-3-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3R)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-pyrrol-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 100 mM Bis-Tris, 200 mM sodium chloride
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.216 |
| 7T70 Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 4/5 提交 2021-12-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 18 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.220 |
| 7T8M Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 5/6 提交 2021-12-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | GOL GLYCEROL × 9 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.197 |
| 7T8R Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 7/8 提交 2021-12-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145A | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.228 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 J
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 11 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 K
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 12 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 L
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 13 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 M
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 14 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 N
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 15 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 O
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 16 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 P
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9W Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2 提交 2021-12-20 | Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 I
2048–2152（105 aa）
片段：BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.316 |
| 7T9Y Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 8/9 提交 2021-12-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.236 |
| 7TA4 Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 9/10 提交 2021-12-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.216 |
| 7TA7 Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 10/11 提交 2021-12-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.255 |
| 7TB2 Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 12/13 提交 2021-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.218 |
| 7TBT Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 13/14 提交 2021-12-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.266 |
| 7TC4 Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 15/16 提交 2021-12-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.227 |
| 7TDU Joint X-ray/neutron structure of SARS-CoV-2 main protease (3CL Mpro) in complex with BBH-1 提交 2022-01-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | I1W (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxo(1-~2~H)pyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-3-{N-[tert-butyl(~2~H)carbamoyl]-3-methyl-L-(N-~2~H)valyl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-(~2~H)carboxamide × 2 | 未声明 |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；287 K；20% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率未提供 |
| 7TE0 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor PF-07321332 提交 2022-01-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.248 |
| 7TEH Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (3CL Mpro) in complex with BBH-2 提交 2022-01-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | I1Z (1R,2S,5S)-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；293 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.186 |
| 7TEK SARS-CoV-2 3CLPro in complex with N-(4-(1H-pyrazol-4-yl)phenyl)-N-(3-chlorobenzyl)-2-(pyridin-3-yl)acetamide 提交 2022-01-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | I2D N-[(3-chlorophenyl)methyl]-N-[4-(1H-pyrazol-4-yl)phenyl]-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.274 |
| 7TEL SARS-CoV-2 3CLPro in complex with N-(4-(1H-imidazol-4-yl)phenyl)-N-(3-chloro-5-fluorobenzyl)-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide 提交 2022-01-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | I2N N-[(3-chloro-5-fluorophenyl)methyl]-N-[4-(1H-imidazol-4-yl)phenyl]-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 7TFR Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (3CL Mpro) in complex with NBH-2 提交 2022-01-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | NB2 (1R,2S,5S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-({1-[(2-methylpropane-2-sulfonyl)methyl]cyclohexyl}carbamoyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.181 |
| 7TGR Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with GC376 提交 2022-01-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
|
未记录 | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 B1S (1R,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 4 K POTASSIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M potassium thiocyanate, 20 % PEG 3350, and 0.1 M Bis-Tris propane buffer pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.225 |
| 7THH SUD-C and Ubl2 domains of SARS CoV-2 Nsp3 protein 提交 2022-01-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1496–1623（128 aa）
片段：SUD-C and Ubl2 domains, residues 1496-1623
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；289 K；0.2 M ammonium iodide, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.32 Å R-free 0.191 |
| 7THH SUD-C and Ubl2 domains of SARS CoV-2 Nsp3 protein 提交 2022-01-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1496–1623（128 aa）
片段：SUD-C and Ubl2 domains, residues 1496-1623
|
未记录 | P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 IOD IODIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；289 K；0.2 M ammonium iodide, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.32 Å R-free 0.191 |
| 7THH SUD-C and Ubl2 domains of SARS CoV-2 Nsp3 protein 提交 2022-01-11 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1496–1623（128 aa）
片段：SUD-C and Ubl2 domains, residues 1496-1623
|
未记录 | P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 IOD IODIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；289 K；0.2 M ammonium iodide, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.32 Å R-free 0.191 |
| 7THH SUD-C and Ubl2 domains of SARS CoV-2 Nsp3 protein 提交 2022-01-11 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1496–1623（128 aa）
片段：SUD-C and Ubl2 domains, residues 1496-1623
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；289 K；0.2 M ammonium iodide, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.32 Å R-free 0.191 |
| 7THH SUD-C and Ubl2 domains of SARS CoV-2 Nsp3 protein 提交 2022-01-11 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1496–1623（128 aa）
片段：SUD-C and Ubl2 domains, residues 1496-1623
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；289 K；0.2 M ammonium iodide, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.32 Å R-free 0.191 |
| 7THH SUD-C and Ubl2 domains of SARS CoV-2 Nsp3 protein 提交 2022-01-11 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1496–1623（128 aa）
片段：SUD-C and Ubl2 domains, residues 1496-1623
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；289 K；0.2 M ammonium iodide, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.32 Å R-free 0.191 |
| 7THM SARS-CoV-2 nsp12/7/8 complex with a native N-terminus nsp9 提交 2022-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
链 G
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 7TI9 Crystal structure of the ubiquitin-like domain 1 (Ubl1) of Nsp3 from SARS-CoV-2, form 2 提交 2022-01-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
818–929（112 aa）
片段：ubiquitin-like domain 1 (Ubl1)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；1.6 M ammonium sulfate, 2% hexanediol, 0.1M Hepes pH 7.5, 1.25% 1-Butyl-3-methylimidazolium dicyanamide
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.249 |
| 7TJ2 SARS-CoV-2 endoribonuclease Nsp15 bound to dsRNA 提交 2022-01-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
链 D
6453–6798（346 aa）
链 E
6453–6798（346 aa）
链 F
6453–6798（346 aa）
|
突变：H235A 突变：H235A 突变：H235A 突变：H235A 突变：H235A 突变：H235A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7TQ2 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with the cyclopropane based inhibitor 1c 提交 2022-01-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | ISG N-{(2S)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-N~2~-({[(1R,2R)-2-phenylcyclopropyl]methoxy}carbonyl)-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；8% (w/v) PEG 8000, 100 mM sodium citrate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.263 |
| 7TQ3 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with the cyclopropane based inhibitor 5c 提交 2022-01-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | IS5 N~2~-({[(1R,2R)-2-(3-fluorophenyl)cyclopropyl]methoxy}carbonyl)-N-{(2S)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；20% (w/v) PEG 6000, 100 mM Hepes, 200 mM lithium chloride
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.247 |
| 7TQ4 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with the cyclopropane based inhibitor 6c 提交 2022-01-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | IRZ N~2~-({[(1R,2R)-2-(3-chlorophenyl)cyclopropyl]methoxy}carbonyl)-N-{(2S)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；25 % (w/v) PEG 1500, 100 MMT
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.296 |
| 7TQ5 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with the cyclopropane based inhibitor 10d 提交 2022-01-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | IRW (1S,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[(1R,2R)-2-(4-methoxyphenyl)cyclopropyl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 ITX (1R,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[(1R,2R)-2-(4-methoxyphenyl)cyclopropyl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 CL CHLORIDE ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20 % (w/v) PEG 3350, 100 Bis-Tris propane, 200 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.217 |
| 7TQ6 Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with the cyclopropane based inhibitor 13d 提交 2022-01-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
链 B
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | IT3 (1S,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-2-{[N-({[(1R,2R)-2-propylcyclopropyl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}propane-1-sulfonic acid × 2 ITG (1R,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-2-{[N-({[(1R,2R)-2-propylcyclopropyl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；20 % (w/v) PEG 5000 MME, 100 Bis-Tris
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.216 |
| 7TQV SARS-CoV-2 endoribonuclease Nsp15 bound to dsRNA 提交 2022-01-27 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
链 D
6453–6798（346 aa）
链 E
6453–6798（346 aa）
链 F
6453–6798（346 aa）
|
突变：H235A 突变：H235A 突变：H235A 突变：H235A 突变：H235A 突变：H235A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 7TW7 Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SAM 提交 2022-02-06 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
6225–6452（228 aa）
|
突变：A4R, E67V, A77K | ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate, and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.218 |
| 7TW8 Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SAH 提交 2022-02-06 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
6225–6452（228 aa）
|
突变：A4R, E67V, A77K | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.206 |
| 7TW9 Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to Sinefungin 提交 2022-02-06 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
6225–6452（228 aa）
|
突变：A4R, E67V, A77K | SFG SINEFUNGIN × 1 ZN ZINC ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EOH ETHANOL × 1 MOH METHANOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate, and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.232 |
| 7TWF Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 73 kGy) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG3000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.135 |
| 7TWF Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 73 kGy) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG3000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.135 |
| 7TWG Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 153 kGy) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG 3000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.126 |
| 7TWG Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 153 kGy) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG 3000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.126 |
| 7TWH Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 290 kGy) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG3000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.115 |
| 7TWH Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 290 kGy) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG3000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.115 |
| 7TWI Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 539 kGy) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG3000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.113 |
| 7TWI Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 539 kGy) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG3000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.113 |
| 7TWJ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 4 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.109 |
| 7TWJ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 4 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.109 |
| 7TWN Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 5 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 1 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.114 |
| 7TWN Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 5 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.114 |
| 7TWO Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 6 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 1 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.119 |
| 7TWO Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 6 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.119 |
| 7TWP Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 7 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.124 |
| 7TWP Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 7 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.124 |
| 7TWQ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 9 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.126 |
| 7TWQ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 9 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.126 |
| 7TWR Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 8 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.121 |
| 7TWR Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 8 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.121 |
| 7TWS Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 10 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 32% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.127 |
| 7TWS Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 10 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 32% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.127 |
| 7TWT Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 4 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.120 |
| 7TWT Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 4 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.120 |
| 7TWV Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 5 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.107 |
| 7TWV Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 5 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.107 |
| 7TWW Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 6 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.107 |
| 7TWW Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 6 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.107 |
| 7TWX Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 7 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.109 |
| 7TWX Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 7 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.109 |
| 7TWY Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 8 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.107 |
| 7TWY Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 8 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.107 |
| 7TX0 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 9 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.84 Å R-free 0.111 |
| 7TX0 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 9 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.84 Å R-free 0.111 |
| 7TX1 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 10 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.108 |
| 7TX1 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 10 (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.108 |
| 7TX3 Neutron crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 | 未声明 |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 34% PEG 3000
|
分辨率未提供 |
| 7TX3 Neutron crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | 未声明 |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 34% PEG 3000
|
分辨率未提供 |
| 7TX4 Neutron crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P21 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | 未声明 |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；100 mM MES pH 6.5, 28% PEG 4000
|
分辨率未提供 |
| 7TX5 Neutron crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at 293 K (C2 crystal form) 提交 2022-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 | 未声明 |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；100 mM MES pH 6.5, 25% PEG 4000
|
分辨率未提供 |
| 7U92 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML1006a 提交 2022-03-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | M0C (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-(azetidin-1-yl)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289.15 K；Sitting drops consisted of 0.2 uL A:0.2 uL B: A) 5.2 mg/mL + 0.9 mM ML1006a in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO, B) MES pH 6.5, 8 % PEG20000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.207 |
| 7UKK Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with GC-376 提交 2022-04-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.181 |
| 7ULT Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer Apo-Form. 提交 2022-04-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 4 FMT FORMIC ACID × 7 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 5% Glycerol; Screen: ComPAS (F10), 0.4M Potassium/Sodium tartrate.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.188 |
| 7ULT Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer Apo-Form. 提交 2022-04-05 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
6799–7096（298 aa）
链 D
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 4 FMT FORMIC ACID × 10 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 5% Glycerol; Screen: ComPAS (F10), 0.4M Potassium/Sodium tartrate.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.188 |
| 7UO4 SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to Remdesivir triphosphate, in a pre-catalytic state 提交 2022-04-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | NWX [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-cyano-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å |
| 7UO7 SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to ATP, in a pre-catalytic state 提交 2022-04-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 7UO9 SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to UTP, in a pre-catalytic state 提交 2022-04-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |
| 7UOB SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to GTP, in a pre-catalytic state 提交 2022-04-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 L2B 3'-DEOXYURIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.68 Å |
| 7UOE SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to CTP, in a pre-catalytic state 提交 2022-04-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 L2B 3'-DEOXYURIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.67 Å |
| 7UR9 SARS-Cov2 Main protease in complex with inhibitor CDD-1845 提交 2022-04-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | O5F (2P)-2-(isoquinolin-4-yl)-1-[4-(methylamino)-4-oxobutyl]-N-[(1S)-1-(naphthalen-2-yl)ethyl]-1H-benzimidazole-7-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2 M Sodium chloride, 20%(w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.200 |
| 7URB Sars-Cov2 Main Protease in complex with CDD-1733 提交 2022-04-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | O5O (2P)-2-(isoquinolin-4-yl)-1-[(1s,3R)-3-(methylcarbamoyl)cyclobutyl]-N-{(1S)-1-[4-(trifluoromethyl)phenyl]butyl}-1H-benzimidazole-7-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M Sodium HEPES pH 7.5, 15% (w/v) PEG 20000
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.254 |
| 7US4 Sars-Cov2 Main Protease in complex with CDD-1819 提交 2022-04-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | O69 (2P)-2-(isoquinolin-4-yl)-1-[(1s,3R)-3-(methylcarbamoyl)cyclobutyl]-N-[(1S)-1-(naphthalen-2-yl)ethyl]-1H-benzimidazole-7-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M MES pH 6.5, 15% (w/v) PEG 20000
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.235 |
| 7UU6 Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in its apo-form 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.252 |
| 7UU7 Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in its apo-form 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.245 |
| 7UU8 Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in its apo-form 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.257 |
| 7UU9 Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in its apo-form 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 2.47 Å R-free 0.253 |
| 7UUA Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI8 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NOL N-[(BENZYLOXY)CARBONYL]-O-(TERT-BUTYL)-L-THREONYL-3-CYCLOHEXYL-N-[(1S)-2-HYDROXY-1-{[(3S)-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL]METHYL}ETHYL]-L-ALANINAMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.273 |
| 7UUB Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI12 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 7VB N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methylidene-L-norvalinamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.230 |
| 7UUC Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI19 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 81L N-[(benzyloxy)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-3-cyclopropyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.229 |
| 7UUD Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI33 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | I71 (1R,2S,5S)-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(2S,3R)-4-(ethylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.237 |
| 7UUE Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI85 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | I65 benzyl [(2S,3R)-1-({(2S)-1-[2-(3-amino-3-oxopropyl)-2-propanoylhydrazinyl]-3-cyclohexyl-1-oxopropan-2-yl}amino)-3-tert-butoxy-1-oxobutan-2-yl]carbamate (non-preferred name) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.232 |
| 7UUG SARS-CoV-2 Main Protease S144A (Mpro S144A) in Complex with ML1006a 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：S144A | M0C (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-(azetidin-1-yl)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289.15 K；Sitting drops consisted of 0.19 uL A:0.19 uL B:
A) 5.1 mg/mL Mpro S144A + 0.9 mM ML1006a in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO
B) 0.1 M MES pH 6.5, 10% PEG20000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 7UUP SARS-CoV-2 Main Protease S144A (Mpro S144A) in Complex with Nirmatrelvir (PF-07321332) 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：S144A | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289.15 K；Sitting drops consisted of 0.19 uL A:0.19 uL B:
A) 5.1 mg/mL Mpro S144A + 0.9 mM ML1001 in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO
B) 0.1 M MES pH 6.5, 10% PEG20000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.237 |
| 7VAH The crystal structure of COVID-19 main protease in H41A mutation 提交 2021-08-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：H41A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；293 K；2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.217 |
| 7VVP Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease in complex with PF07304814 提交 2021-11-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3561（296 aa）
链 B
3266–3561（296 aa）
|
未记录 | 80I [(3~{S})-3-[[(2~{S})-2-[(4-methoxy-1~{H}-indol-2-yl)carbonylamino]-4-methyl-pentanoyl]amino]-2-oxidanylidene-4-[(3~{R})-2-oxidanylidene-3,4-dihydropyrrol-3-yl]butyl] dihydrogen phosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M HEPES 7.5, 20% PEG 10000
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.242 |
| 7WHC Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro catalytic domain 提交 2021-12-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3459（196 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；296 K；10% PEG 20000, 0.1M HEPES pH 7.0, 0.2M Calcium Chloride
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.264 |
| 7WHC Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro catalytic domain 提交 2021-12-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3459（196 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；296 K；10% PEG 20000, 0.1M HEPES pH 7.0, 0.2M Calcium Chloride
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.264 |
| 7WHC Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro catalytic domain 提交 2021-12-30 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3459（196 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；296 K；10% PEG 20000, 0.1M HEPES pH 7.0, 0.2M Calcium Chloride
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.264 |
| 7WHC Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro catalytic domain 提交 2021-12-30 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
3264–3459（196 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；296 K；10% PEG 20000, 0.1M HEPES pH 7.0, 0.2M Calcium Chloride
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.264 |
| 7WOH SARS-CoV-2 3CLpro 提交 2022-01-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3566（303 aa）
链 B
3264–3566（303 aa）
|
未记录 | 5IW (2S)-4-methyl-N-[(2S)-1-oxidanylidene-3-[(3S)-2-oxidanylidenepiperidin-3-yl]propan-2-yl]-2-[[(2S)-3-phenyl-2-[[(E)-3-phenylprop-2-enoyl]amino]propanoyl]amino]pentanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；290 K；100 mM MES (pH 6.0), 3% DMSO, 1 mM DTT, 6% polyethylene glycol (PEG) 6000
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.216 |
| 7WQ8 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z-DEVD-FMK 提交 2022-01-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% w/v PEG3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.222 |
| 7WQ9 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z-IETD-FMK 提交 2022-01-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.246 |
| 7WQA SARS-CoV-2 main protease in complex with Z-VAD-FMK 提交 2022-01-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Bis Tris propane 8.5, 0.2 M sodium fluoride, 20 % w/v PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.208 |
| 7WQK wild-type SARS-CoV-2 main protease in complex with MG-132 提交 2022-01-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M sodium chloride, 25% w/v PEG3,350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.289 |
| 7Z2K Crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease in orthorhombic space group p212121 提交 2022-02-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 1500 25%, MIB pH 7.5 0.1 M, 5% DMSO
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分辨率 1.65 Å R-free 0.214 |
| 7Z3U Crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease after incubation with Sulfo-Calpeptin 提交 2022-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
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分辨率 1.72 Å R-free 0.235 |
| 7Z59 SARS-CoV-2 main protease (Mpro) covalently modified with a penicillin derivative 提交 2022-03-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | IFO (3S)-4-[[2,4-bis(fluoranyl)phenyl]methoxy]-2-methyl-4-oxidanylidene-3-[[(Z)-3-oxidanylidene-2-(2-phenoxyethanoylamino)prop-1-enyl]amino]butane-2-sulfinic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；SARS-CoV-2 Mpro was thawed and diluted to 6 mg/mL (using 20 mM HEPES, pH 7.5, 50 mM NaCl). Beta-Lactam 20e was added to the protein solution to a final concentration of 10 mM; the mixture was incubated for 2 h at ambient temperature prior to dispensing plates. The drop composition was 0.15 uL protein ligand solution, 0.3 uL 11 percent v/v PEG 4000, 0.1 M MES, pH 6.5, and 0.05 ,microL Mpro crystal seed stock. The Mpro crystal seed stock was prepared by crushing Mpro crystals with a pipette tip, suspending them in 30% PEG 4000, 5%v/v DMSO, 0.1 M MES pH 6.5, and vortexing for 60 s with approximately 10 glass beads (1.0 mm diameter, BioSpec products). As reservoir solution was used: 11%v/v PEG 4K, 5%v/v DMSO, 0.1 M MES, pH 6.5. Crystals were grown using the sitting drop vapor diffusion method at 20 degree C and appeared within 24 h, reaching full size within 36 h. Crystals were looped after one week.
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分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 7ZB6 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) variant C44S at 2.12 A resolution 提交 2022-03-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
3264–3569（306 aa）
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突变：C44S 突变：C44S | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, DMSO, Sodium citrate, MES
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分辨率 2.12 Å R-free 0.298 |
| 7ZB7 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) variant Y54F at 1.63 A resolution 提交 2022-03-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
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突变：Y54F | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, DMSO, Sodium citrate, MES
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分辨率 1.63 Å R-free 0.213 |
| 7ZB8 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) variant K61A at 2.48 A resolution 提交 2022-03-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
3264–3569（306 aa）
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突变：K61A 突变：K61A | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, DMSO, Sodium citrate, MES
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分辨率 2.48 Å R-free 0.332 |
| 7ZQV Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with AG7404 提交 2022-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XNV ethyl (4R)-4-({(2S)-2-[3-{[(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)carbonyl]amino}-2-oxopyridin-1(2H)-yl]pent-4-ynoyl}amino)-5-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentanoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Sodium chloride, HEPES pH 7 and PEG 3350
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分辨率 2.26 Å R-free 0.241 |
| 7ZV5 Crystal structure of SARS Cov-2 main protease in complex with an inhibitor 4 提交 2022-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium nitrate, 0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5 20 % (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 7ZV7 Crystal structure of SARS Cov-2 main protease in complex with an inhibitor 57 提交 2022-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium Citrate, 15 % (w/v) PEG8000
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.220 |
| 7ZV8 Crystal structure of SARS Cov-2 main protease in complex with an inhibitor 58 提交 2022-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 OCA OCTANOIC ACID (CAPRYLIC ACID) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES pH 6.5, 12 %(w/v) PEG 20000
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.231 |
| 8A23 Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp10/nsp16 methyltransferase in complex with TO383 提交 2022-06-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4263–4384（122 aa）
|
未记录 | KW6 (2R,3R,4S,5R)-2-[4-azanyl-5-(2-quinolin-3-ylethynyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol × 1 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M ammonium sulfate,
0.1 M sodium acetate pH 5.5,
10 % w/v PEG 2000 MME
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.256 |
| 8A4Q crystal structures of diastereomer (R,S,S)-13b (13b-H) in complex with the SARS-CoV-2 Mpro. 提交 2022-06-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | V9R ~{tert}-butyl ~{N}-[1-[(2~{R})-3-cyclopropyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S},3~{S})-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]-4-[(phenylmethyl)amino]butan-2-yl]amino]propan-2-yl]-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；PEG8000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.219 |
| 8A4T crystal structures of diastereomer (S,S,S)-13b (13b-K) in complex with the SARS-CoV-2 Mpro 提交 2022-06-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | O6K ~{tert}-butyl ~{N}-[1-[(2~{S})-3-cyclopropyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S},3~{R})-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]-4-[(phenylmethyl)amino]butan-2-yl]amino]propan-2-yl]-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；PEG8000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.289 |
| 8A4T crystal structures of diastereomer (S,S,S)-13b (13b-K) in complex with the SARS-CoV-2 Mpro 提交 2022-06-13 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | O6K ~{tert}-butyl ~{N}-[1-[(2~{S})-3-cyclopropyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S},3~{R})-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]-4-[(phenylmethyl)amino]butan-2-yl]amino]propan-2-yl]-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；PEG8000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.289 |
| 8A4Y SARS-CoV-2 non-structural protein-1 (nsp1) in complex with N-(2,3-dihydro-1H-inden-5-yl)acetamide 提交 2022-06-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–126（117 aa）
|
未记录 | QO6 N-(2,3-dihydro-1H-inden-5-yl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；Commercial screen Index 44 (0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v PEG3350) was chosen for SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) crystallisation in large quantities using hanging drop method. Frozen stocks of SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) were thawed on ice and centrifuged in a Thermo Scientific Pico 17 Microcentrifuge, 24-Pl Rotor at 4 degrees, 20000 rpm for 10 min to remove aggregates before the determination of the protein concentration. Subsequently, the protein stock was diluted to 20 mg/mL with precrystallisation buffer (10 mM HEPES and 300 mM NaCl). 400 uL of Index condition 44 was added into each reservoir well. Five protein drops were set on each cover slip by mixing 1 uL of protein solution with 1 uL of the reservoir. The 24-well Linbro plates were incubated at 18 degrees.
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.166 |
| 8A55 Structure of N-terminal SARS-CoV-2 nonstructural protein 1 (nsp1) at atomic resolution 提交 2022-06-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–126（117 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；Commercial screen Index 44 (0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v PEG3350) was chosen for SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) crystallisation in large quantities using hanging drop method. Frozen stocks of SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) were thawed on ice and centrifuged in a Thermo Scientific Pico 17 Microcentrifuge, 24-Pl Rotor at 4 degrees, 20000 rpm for 10 min to remove aggregates before the determination of the protein concentration. Subsequently, the protein stock was diluted to 20 mg/mL with precrystallisation buffer (10 mM HEPES and 300 mM NaCl). 400 uL of Index condition 44 was added into each reservoir well. Five protein drops were set on each cover slip by mixing 1 uL of protein solution with 1 uL of the reservoir. The 24-well Linbro plates were incubated at 18 degrees.
|
分辨率 0.99 Å R-free 0.173 |
| 8ACD Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the non-covalent inhibitor GA-17S 提交 2022-07-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | LQ6 (2~{S})-4-[[2,4-bis(oxidanylidene)-1~{H}-pyrimidin-6-yl]carbonyl]-1-(3,4-dichlorophenyl)-~{N}-(thiophen-2-ylmethyl)piperazine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.15 K；0.1 M PCTP buffer pH 6.0 (PCTP represents a mixture of sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, and bis-Tris propane) and 25% PEG1500
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.184 |
| 8ACL Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the non-covalent inhibitor GC-14 提交 2022-07-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | LQL (2~{S})-1-(3,4-dichlorophenyl)-4-pyridin-3-ylcarbonyl-~{N}-(thiophen-2-ylmethyl)piperazine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.15 K；0.1 M PCTP buffer pH 6.0 (PCTP represents a mixture of sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, and bis-Tris propane) and 25% PEG1500
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.172 |
| 8AEB SARS-CoV-2 Main Protease complexed with N-(pyridin-3-ylmethyl)thioformamide 提交 2022-07-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 35J N-(pyridin-3-ylmethyl)thioformamide × 2 NA SODIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M NaFormate, 21% PEG 3350, 10% Glycerol, 8% DMSO
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.234 |
| 8AIU Mpro of SARS COV-2 in complex with the MG-97 inhibitor 提交 2022-07-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
3264–3568（305 aa）
链 BBB
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | M9X tert-butyl N-[1-[(2S)-3-cyclopropyl-1-[[(2S,3R)-4-(cyclopropylamino)-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis Tris Propane pH 6.50, 2M Sodium formate, 20% w/vPEG 3350, 10% v/vEthylene glycol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.206 |
| 8AIV Mpro of SARS COV-2 in complex with the MG-100 inhibitor 提交 2022-07-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
3264–3569（306 aa）
链 BBB
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | MFL tert-butyl N-[1-[(2S)-3-cyclopropyl-1-[[(2S,3R)-4-(methylamino)-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.02 M sodium/potassium phosphate, 0.1 M Bis Tris propane pH6.5, 20 % w/v PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.252 |
| 8AIZ Mpro of SARS-CoV-2 in complex with the RK-68 inhibitor 提交 2022-07-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | MIJ (2~{R},3~{S})-3-[[(2~{S})-3-cyclopropyl-2-[2-oxidanylidene-3-(2-phenylethanoylamino)pyridin-1-yl]propanoyl]amino]-~{N}-methyl-2-oxidanyl-4-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butanamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.002 M zinc chloride, 0.1 M Tris 8.0, 20 % w/v PEG 6000
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.224 |
| 8AJ0 Mpro of SARS COV-2 in complex with the RK-90 inhibitor 提交 2022-07-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
3264–3565（302 aa）
链 BBB
3264–3565（302 aa）
|
未记录 | MJ0 (2R,3S)-3-[[(2S)-3-cyclopropyl-2-[2-oxidanylidene-3-(3-phenylpropanoylamino)pyridin-1-yl]propanoyl]amino]-N-methyl-2-oxidanyl-4-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butanamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1MMES pH 6, 0.2MSodium chloride, 20% w/vPEG 6000, 10% v/vEthylene glycol
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.266 |
| 8AOU Solution NMR structure of full-length Nsp1 from SARS-CoV-2. 提交 2022-08-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–180（180 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）560；压力 1
NMR样品组成
600 uM [U-13C; U-15N] Nsp1, 50 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 2 mM EDTA, 0.01 % w/v sodium azide, 10 % v/v [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
500 uM [U-10% 13C; U-100% 15N] Nsp1, 50 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 2 mM EDTA, 0.01 % w/v sodium azide, 10 % v/v [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
500 uM [U-10% 13C; U-100% 15N] Nsp1, 50 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 2 mM EDTA, 0.01 % w/w sodium azide, 10 % v/v [U-2H] D2O, 12 mg/mL Pf1 phage, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8AYS SARS-CoV-2 non-structural protein-1 (nsp1) in complex with 4-(2-aminothiazol-4-yl)phenol 提交 2022-09-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
10–126（117 aa）
|
未记录 | 92G 4-(2-amino-1,3-thiazol-4-yl)phenol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；Commercial screen Index 44 (0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v PEG3350) was chosen for SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) crystallisation in large quantities using hanging drop method. Frozen stocks of SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) were thawed on ice and centrifuged in a Thermo Scientific Pico 17 Microcentrifuge, 24-Pl Rotor at 4 degrees, 20000 rpm for 10 min to remove aggregates before the determination of the protein concentration. Subsequently, the protein stock was diluted to 20 mg/mL with precrystallisation buffer (10 mM HEPES and 300 mM NaCl). 400 uL of Index condition 44 was added into each reservoir well. Five protein drops were set on each cover slip by mixing 1 uL of protein solution with 1 uL of the reservoir. The 24-well Linbro plates were incubated at 18 degrees.
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.150 |
| 8AZ8 SARS-CoV-2 non-structural protein-1 (nsp1) in complex with 2-(benzylamino)ethan-1-ol 提交 2022-09-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
10–126（117 aa）
|
未记录 | OEI 2-[(phenylmethyl)amino]ethanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；Commercial screen Index 44 (0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v PEG3350) was chosen for SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) crystallisation in large quantities using hanging drop method. Frozen stocks of SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) were thawed on ice and centrifuged in a Thermo Scientific Pico 17 Microcentrifuge, 24-Pl Rotor at 4 degrees, 20000 rpm for 10 min to remove aggregates before the determination of the protein concentration. Subsequently, the protein stock was diluted to 20 mg/mL with precrystallisation buffer (10 mM HEPES and 300 mM NaCl). 400 uL of Index condition 44 was added into each reservoir well. Five protein drops were set on each cover slip by mixing 1 uL of protein solution with 1 uL of the reservoir. The 24-well Linbro plates were incubated at 18 degrees.
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.207 |
| 8B2T SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in complex with nirmatrelvir alkyne 提交 2022-09-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | OW1 Nirmatrelvir (reacted form) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；11% (v/v) PEG 4K, 5% (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.223 |
| 8B56 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the inhibitor GD-9 提交 2022-09-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | OZI (2~{S})-4-(2-chloranylethanoyl)-1-(3,4-dichlorophenyl)-~{N}-(thiophen-2-ylmethyl)piperazine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；0.1 M PCTP BUFFER PH 6.0 (PCTP REPRESENTS A MIXTURE OF SODIUM PROPIONATE, SODIUM CACODYLATE TRIHYDRATE, AND BIS-TRIS PROPANE) AND 25% PEG1500
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分辨率 1.82 Å R-free 0.231 |
| 8B56 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the inhibitor GD-9 提交 2022-09-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | OZI (2~{S})-4-(2-chloranylethanoyl)-1-(3,4-dichlorophenyl)-~{N}-(thiophen-2-ylmethyl)piperazine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2 BR BROMIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；0.1 M PCTP BUFFER PH 6.0 (PCTP REPRESENTS A MIXTURE OF SODIUM PROPIONATE, SODIUM CACODYLATE TRIHYDRATE, AND BIS-TRIS PROPANE) AND 25% PEG1500
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.231 |
| 8BFO Structure of the apo form of Mpro from SARS-CoV-2 提交 2022-10-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.1 M sodium HEPES at pH 7.0 containing 22% PEG 4000 and 3% DMSO
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.286 |
| 8BFQ Structure of the apo form of Mpro from SARS-CoV-2 提交 2022-10-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.1 M sodium HEPES at pH 7.0 containing 22% PEG 4000 and 3% DMSO
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.253 |
| 8BGA Structure of Mpro in complex with FGA146 提交 2022-10-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | QQL 4-methoxy-~{N}-[(2~{S})-4-methyl-1-[[(2~{S})-4-nitro-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；0.1 M Bis-TRIS at pH 6.5 containing 18% PEG 3350
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.237 |
| 8BGD Structure of Mpro from SARS-CoV-2 in complex with FGA147 提交 2022-10-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | QH0 (phenylmethyl) N-[(2S)-4-methyl-1-[[(2S)-4-nitro-1-[(3R)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；0.1 M TRIS-HCl at pH 8.5 containing 20% PEG 2000 MME and 10 mM NiCl2
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.244 |
| 8BS1 Room-temperature structure of SARS-CoV-2 Main protease at atmospheric pressure 提交 2022-11-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl was equilibrated against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.199 |
| 8BS2 Room-temperature structure of SARS-CoV-2 Main protease at 104 MPa helium gas pressure in a sapphire capillary 提交 2022-11-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl was equilibrated against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.219 |
| 8BSD SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with tubercidin 提交 2022-11-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 31 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 TBN '2-(4-AMINO-PYRROLO[2,3-D]PYRIMIDIN-7-YL)-5-HYDROXYMETHYL-TETRAHYDRO-FURAN-3,4-DIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.207 |
| 8BWU Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp14 methyltransferase domain in complex with the SS148 inhibitor 提交 2022-12-07 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
6225–6452（228 aa）
|
未记录 | 6NR (2~{S})-2-azanyl-4-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanyl-5-cyano-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanyl]butanoic acid × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM bicine/Trizma pH 8.5;
10% w/v PEG 20.000, 20% v/v PEG MME 550;
20 mM D-glucose, 20 mM D-mannose, 20 mM D-galactose, 20 mM L-fucose, 20 mM D-xylose, 20 mM N-acetyl-D-glucosamine
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.264 |
| 8BZN SARS-CoV-2 non-structural protein 10 (nsp10) variant T102I 提交 2022-12-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4262–4384（123 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M Bis-Tris, pH 5.5 - 6.5, 1.8 - 2.4 M NaCl
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.235 |
| 8BZV SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with adenosine 提交 2022-12-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | ADN ADENOSINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 39 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；800 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.200 |
| 8C19 SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with 1-methyl-4-[5-(morpholin-4-ylcarbonyl)-2-furyl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine 提交 2022-12-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 T6B [5-(1-methylpyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)furan-2-yl]-morpholin-4-yl-methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 30% PEG3000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.226 |
| 8C19 SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with 1-methyl-4-[5-(morpholin-4-ylcarbonyl)-2-furyl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine 提交 2022-12-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 30% PEG3000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.226 |
| 8C1A SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with aztreonam 提交 2022-12-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | T6O aztreonam × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 30% PEG3000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.214 |
| 8C1A SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with aztreonam 提交 2022-12-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM CHES pH 9.5, 30% PEG3000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.214 |
| 8C5M SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with MTA 提交 2023-01-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 33 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 MTA 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；900 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.211 |
| 8CDC Native 3CLpro from SARS-CoV-2 at 1.54 A 提交 2023-01-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；20-60 mM ammonium acetate buffer at pH 7.0 and 20-30 % PEG4000 as a precipitant
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.239 |
| 8CMF Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 nsp3 epitope (orf1ab)1350-1364 提交 2023-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1350–1364（15 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SIN SUCCINIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；0.1 M SPG pH 4.6, 25 % PEG1500
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.240 |
| 8CMF Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 nsp3 epitope (orf1ab)1350-1364 提交 2023-02-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
1350–1364（15 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SIN SUCCINIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；0.1 M SPG pH 4.6, 25 % PEG1500
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.240 |
| 8CMG Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 nsp14 peptide (orf1ab)6420-6434 提交 2023-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
6420–6434（15 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 25 % PEG8000, 0.2 M ammonium sulphate
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.227 |
| 8CRF Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 5E11 refined against anomalous diffraction data 提交 2023-03-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–126（117 aa）
|
未记录 | NT9 ~{N}-methyl-1-(4-thiophen-2-ylphenyl)methanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.245 |
| 8CRK Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 7H2 refined against anomalous diffraction data 提交 2023-03-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
10–126（117 aa）
|
未记录 | OG3 (1~{R})-1-(4-chlorophenyl)ethanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25%w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.192 |
| 8CRM Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 11C6 refined against anomalous diffraction data 提交 2023-03-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–126（117 aa）
|
未记录 | OF6 1-[2-(3-chlorophenyl)-1,3-thiazol-4-yl]-~{N}-methyl-methanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.203 |
| 8CYU Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C5 提交 2022-05-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | P5X N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-N-[4-(dimethylamino)phenyl]-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.245 |
| 8CYU Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C5 提交 2022-05-24 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | P5X N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-N-[4-(dimethylamino)phenyl]-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.245 |
| 8CYZ Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C4 提交 2022-05-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | P6I N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-2-(isoquinolin-4-yl)-N-[4-(methylsulfanyl)phenyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.278 |
| 8CYZ Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C4 提交 2022-05-24 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | P6I N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-2-(isoquinolin-4-yl)-N-[4-(methylsulfanyl)phenyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.278 |
| 8CZ4 Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C3 提交 2022-05-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | P6R N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.244 |
| 8CZ4 Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C3 提交 2022-05-24 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | P6R N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.244 |
| 8CZ7 Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C2 提交 2022-05-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 C
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | P7L N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-2-(isoquinolin-4-yl)-N-(4-methoxyphenyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.271 |
| 8CZ7 Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C2 提交 2022-05-24 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | P7L N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-2-(isoquinolin-4-yl)-N-(4-methoxyphenyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.271 |
| 8CZW Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with the cyclopropane based inhibitor 15d 提交 2022-05-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | P8U [(1~{S},2~{R})-2-cyclohexylcyclopropyl]methyl ~{N}-[(2~{S})-1-[[(1~{S},2~{S})-1-[bis(oxidanyl)-oxidanylidene-$l^{5}-sulfanyl]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2 P8L [(1~{S},2~{R})-2-cyclohexylcyclopropyl]methyl ~{N}-[(2~{S})-1-[[(1~{R},2~{S})-1-[bis(oxidanyl)-oxidanylidene-$l^{5}-sulfanyl]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；25% (w/v) PEG 1500, 100 MIB
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.216 |
| 8CZX Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with the cyclopropane based inhibitor 17d 提交 2022-05-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | PJR [(1~{S},2~{R})-2-[4,4-bis(fluoranyl)cyclohexyl]cyclopropyl]methyl ~{N}-[(2~{S})-1-[[(1~{S},2~{S})-1-[bis(oxidanyl)-oxidanylidene-$l^{5}-sulfanyl]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2 P8C [(1~{S},2~{R})-2-[4,4-bis(fluoranyl)cyclohexyl]cyclopropyl]methyl ~{N}-[(2~{S})-1-[[(1~{R},2~{S})-1-[bis(oxidanyl)-oxidanylidene-$l^{5}-sulfanyl]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；25% (w/v) PEG 1500, 100 MIB
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.220 |
| 8D34 Crystal Structure of SARS CoV-2 NSP15 Endroribonuclease H250A 提交 2022-05-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
|
突变：H250A 突变：H250A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Calcium Acetate, 0.1 M Imidazole pH 8, 10% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.263 |
| 8D4J Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) H172Y Mutant 提交 2022-06-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：H172Y 突变：H172Y | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.209 |
| 8D4K Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) H172Y Mutant in Complex with Inhibitor GC376 提交 2022-06-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：H172Y | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.224 |
| 8D4L Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) S144A Mutant 提交 2022-06-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：S144A 突变：S144A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.213 |
| 8D4M Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) S144A Mutant in Complex with Inhibitor GC376 提交 2022-06-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：S144A | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.229 |
| 8D4N Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) E166Q Mutant 提交 2022-06-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：E166Q 突变：E166Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.258 |
| 8D4P Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor Jun10-90-3-C1 提交 2022-06-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | QAO 2-chloro-N-[(1R)-2-{[2-(3-fluorophenyl)ethyl]amino}-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-[4-(pentafluoro-lambda~6~-sulfanyl)phenyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG 3350, 0.1M KNa Tartrate, 0.005 M MgCl2
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.257 |
| 8DCZ Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) M165Y Mutant in Complex with Nirmatrelvir 提交 2022-06-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：M165Y 突变：M165Y | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.2M Sodium Chloride, 10% 1-6HexD, 20% PEG MME 2000
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.251 |
| 8DD1 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) H164N Mutant in Complex with Inhibitor GC376 提交 2022-06-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：H164N | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25 % PEG 3350 , 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.0005 M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.250 |
| 8DD9 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) S144L Mutant in Complex with Inhibitor GC376 提交 2022-06-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：S144L | B1S (1R,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.228 |
| 8DDI Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) E166N Mutant 提交 2022-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：E166N | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M Magnesium Chloride, 20% PEG 3350, 10% 1-6HexD, 0.1M HEPES pH 7.5, 0.1M Lithium Sulfate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.247 |
| 8DDM Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) E166R Mutant in Complex with Inhibitor GC376 提交 2022-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：E166R | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M Magnesium Chloride, 20% PEG 3350, 10% 1-6HexD, 0.1M HEPES pH 7.5, 0.1M Lithium Sulfate
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.245 |
| 8DFE Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) S144L Mutant 提交 2022-06-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：S144L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.268 |
| 8DFN Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) H164N Mutant 提交 2022-06-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：H164N 突变：H164N | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25 % PEG 3350 , 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.0005 M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.251 |
| 8DGB Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) Q192T Mutant in Complex with Inhibitor GC376 提交 2022-06-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：Q192T 突变：Q192T | B1S (1R,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.87 Å R-free 0.272 |
| 8DIB Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors 提交 2022-06-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | TKX 5-bromo-3-[(4-chloro-3-nitrophenyl)methoxy]pyridine-2-carbaldehyde × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.276 |
| 8DIC Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors 提交 2022-06-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | TNI 5-bromo-3-[(3-bromo-4-chlorophenyl)methoxy]pyridine-2-carbaldehyde × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.282 |
| 8DID Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors 提交 2022-06-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | U0R 5-bromo-3-[(5-bromo-2-chlorophenyl)methoxy]pyridine-2-carbaldehyde × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.294 |
| 8DIE Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors 提交 2022-06-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | U1J 5-bromo-3-[(4-methyl-3-nitrophenyl)methoxy]pyridine-2-carbaldehyde × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.303 |
| 8DIF Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors 提交 2022-06-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | U1R 5-bromo-3-[(naphthalen-2-yl)methoxy]pyridine-2-carbaldehyde × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.294 |
| 8DIG Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors 提交 2022-06-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | U26 (3P)-1-[(4-fluorophenyl)methyl]-3-(isoquinolin-4-yl)imidazolidine-2,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.271 |
| 8DIH Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors 提交 2022-06-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | U2B (1P,1'R)-1-(isoquinolin-4-yl)-2',3'-dihydrospiro[imidazolidine-4,1'-indene]-2,5-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.276 |
| 8DII Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors 提交 2022-06-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | U2I (2S)-N-(isoquinolin-4-yl)-2-methyl-2,3-dihydro-1,4-benzoxazepine-4(5H)-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.271 |
| 8DJJ Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates 提交 2022-06-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M Ammonium Phosphate, 0.1 M Tris, 50 % MPD
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.280 |
| 8DK8 Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates 提交 2022-07-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M Ammonium Phosphate, 0.1 M Tris, 50 % MPD
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.284 |
| 8DKH Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates 提交 2022-07-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：A260V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20% PEG 6000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.288 |
| 8DKK Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates 提交 2022-07-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.250 |
| 8DKL Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates 提交 2022-07-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：L89F 突变：L89F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Formate, 0.1 M Bis-Tris Propane pH 6.5, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.241 |
| 8DKZ Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates 提交 2022-07-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M Ammonium Phosphate, 0.1 M Tris, 50 % MPD
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.318 |
| 8DL9 Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound Z199538122 提交 2022-07-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | T4V 1-{4-[(naphthalen-1-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；17-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, microseeding
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.220 |
| 8DLB Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound Z2799209083 提交 2022-07-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | SRU 1-[(5S)-5-(3,4-dimethoxyphenyl)-3-phenyl-4,5-dihydro-1H-pyrazol-1-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；17-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, microseeding
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.206 |
| 8DMD Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound ZZ4461624291 提交 2022-07-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | SVL 1-[(3R)-4-[(3-chlorophenyl)methyl]-3-(2-methylpropyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；17-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, microseeding
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 8DMN Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates 提交 2022-07-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.272 |
| 8DOX Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with an inhibitor TKB-245 提交 2022-07-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3565（302 aa）
片段：UNP residues 3264-3565
|
未记录 | T2L (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(4-fluoro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M MES, pH 5.8, 15% PEG6000, 3% DMSO
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.229 |
| 8DOY Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with an inhibitor TKB-198 提交 2022-07-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3564（301 aa）
片段：UNP residues 3264-3564
链 B
3264–3564（301 aa）
片段：UNP residues 3264-3564
|
未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 T1X 7-fluoro-N-[(2S)-1-({(1S,2S)-1-(4-fluoro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M MES pH 6.0, 15% polyethyene glycol (PEG) 6000 and 3% DMSO
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.246 |
| 8DPR Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor TKB-248 提交 2022-07-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3565（302 aa）
片段：UNP residues 3264-3565
|
未记录 | T43 2,2,2-trifluoro-N-{(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-(4-fluoro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamothioyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexan-3-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M MES, pH 5.8, 15% PEG6000, 3% DMSO
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.247 |
| 8DQU Nanobody bound SARS-CoV-2 Nsp9 提交 2022-07-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 C
4141–4253（113 aa）
链 F
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1.8M ammonium sulfate, 0.1M MES pH 6.0
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.229 |
| 8DRR Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp4-nsp5 (C4) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3563（300 aa）
片段：UNP residues 3264-3563
链 B
3264–3563（300 aa）
片段：UNP residues 3264-3563
|
突变：C145A 突变：C145A | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.1 M Tris, 20% PEG6000, 0.3 M sodium chloride
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.237 |
| 8DRR Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp4-nsp5 (C4) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3563（300 aa）
片段：UNP residues 3264-3563
|
突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.1 M Tris, 20% PEG6000, 0.3 M sodium chloride
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.237 |
| 8DRS Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp6-nsp7 (C6) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3563（300 aa）
片段：UNP residues 3264-3563
链 B
3264–3563（300 aa）
片段：UNP residues 3264-3563
|
突变：C145A 突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.1 M HEPES, 20% PEG6000, 0.2 M ammonium chloride
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.218 |
| 8DRS Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp6-nsp7 (C6) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3563（300 aa）
片段：UNP residues 3264-3563
|
突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.1 M HEPES, 20% PEG6000, 0.2 M ammonium chloride
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.218 |
| 8DRT Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp6-nsp7 (C6) cut site sequence (form 2) 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3563（300 aa）
片段：UNP residues 3264-3563
链 B
3264–3563（300 aa）
片段：UNP residues 3264-3563
|
突变：C145A 突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；293 K；20% PEG3350, 0.2 M ammonium chloride
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.183 |
| 8DRU Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp7-nsp8 (C7) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3563（300 aa）
链 A
3937–3942（6 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | PO4 PHOSPHATE ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.1M HEPES
10% PEG 6K
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.237 |
| 8DRU Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp7-nsp8 (C7) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3563（300 aa）
链 B
3937–3942（6 aa）
链 E
3264–3563（300 aa）
链 E
3937–3942（6 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A 突变：C145A 突变：C145A | PO4 PHOSPHATE ION × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.1M HEPES
10% PEG 6K
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.237 |
| 8DRU Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp7-nsp8 (C7) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3563（300 aa）
链 C
3937–3942（6 aa）
链 F
3264–3563（300 aa）
链 F
3937–3942（6 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A 突变：C145A 突变：C145A | PO4 PHOSPHATE ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.1M HEPES
10% PEG 6K
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.237 |
| 8DRU Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp7-nsp8 (C7) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
3264–3563（300 aa）
链 D
3937–3942（6 aa）
链 G
3264–3563（300 aa）
链 G
3937–3942（6 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A 突变：C145A 突变：C145A | PO4 PHOSPHATE ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.1M HEPES
10% PEG 6K
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.237 |
| 8DRV Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp8-nsp9 (C8) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3563（300 aa）
链 A
4135–4140（6 aa）
链 C
3264–3563（300 aa）
链 C
4135–4140（6 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Tris pH 8.5, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.240 |
| 8DRV Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp8-nsp9 (C8) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3563（300 aa）
链 B
4135–4140（6 aa）
链 D
3264–3563（300 aa）
链 D
4135–4140（6 aa）
|
未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Tris pH 8.5, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.240 |
| 8DRW Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp9-nsp10 (C9) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3563（300 aa）
链 A
4248–4253（6 aa）
链 B
3264–3563（300 aa）
链 B
4248–4253（6 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9 PO4 PHOSPHATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Na/K phosphate (pH 6.2), 50% PEG200
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.239 |
| 8DRW Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp9-nsp10 (C9) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3563（300 aa）
链 C
4248–4253（6 aa）
链 D
3264–3563（300 aa）
链 D
4248–4253（6 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Na/K phosphate (pH 6.2), 50% PEG200
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.239 |
| 8DRW Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp9-nsp10 (C9) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
3264–3563（300 aa）
链 E
4248–4253（6 aa）
链 F
3264–3563（300 aa）
链 F
4248–4253（6 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Na/K phosphate (pH 6.2), 50% PEG200
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.239 |
| 8DRW Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp9-nsp10 (C9) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
3264–3563（300 aa）
链 G
4248–4253（6 aa）
链 H
3264–3563（300 aa）
链 H
4248–4253（6 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Na/K phosphate (pH 6.2), 50% PEG200
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.239 |
| 8DRW Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp9-nsp10 (C9) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
3264–3563（300 aa）
链 I
4248–4253（6 aa）
链 J
3264–3563（300 aa）
链 J
4248–4253（6 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Na/K phosphate (pH 6.2), 50% PEG200
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.239 |
| 8DRW Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp9-nsp10 (C9) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
3264–3563（300 aa）
链 K
4248–4253（6 aa）
链 L
3264–3563（300 aa）
链 L
4248–4253（6 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Na/K phosphate (pH 6.2), 50% PEG200
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.239 |
| 8DRW Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp9-nsp10 (C9) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 7 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 M
3264–3563（300 aa）
链 M
4248–4253（6 aa）
链 N
3264–3563（300 aa）
链 N
4248–4253（6 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Na/K phosphate (pH 6.2), 50% PEG200
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.239 |
| 8DRX Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp10-nsp11 (C10) cut site sequence (form 2) 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3563（300 aa）
链 A
4387–4392（6 aa）
链 B
3264–3563（300 aa）
链 B
4387–4392（6 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M tri-Na Citrate (pH 5.6), 35% t-Butanol
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.192 |
| 8DRY Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3563（300 aa）
链 A
5319–5324（6 aa）
链 B
3264–3563（300 aa）
链 B
5319–5324（6 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.9M CHES (pH 9.5), 20% PEG 8K
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.264 |
| 8DRY Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3563（300 aa）
链 C
5319–5324（6 aa）
链 D
3264–3563（300 aa）
链 D
5319–5324（6 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.9M CHES (pH 9.5), 20% PEG 8K
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.264 |
| 8DRY Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
3264–3563（300 aa）
链 E
5319–5324（6 aa）
链 F
3264–3563（300 aa）
链 F
5319–5324（6 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.9M CHES (pH 9.5), 20% PEG 8K
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.264 |
| 8DRY Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
3264–3563（300 aa）
链 G
5319–5324（6 aa）
链 H
3264–3563（300 aa）
链 H
5319–5324（6 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.9M CHES (pH 9.5), 20% PEG 8K
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.264 |
| 8DRY Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
3264–3563（300 aa）
链 I
5319–5324（6 aa）
链 J
3264–3563（300 aa）
链 J
5319–5324（6 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.9M CHES (pH 9.5), 20% PEG 8K
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.264 |
| 8DRY Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
3264–3563（300 aa）
链 K
5319–5324（6 aa）
链 L
3264–3563（300 aa）
链 L
5319–5324（6 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.9M CHES (pH 9.5), 20% PEG 8K
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.264 |
| 8DRZ Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp13-nsp14 (C13) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3563（300 aa）
链 B
3264–3563（300 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 5 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Na citrate (pH 5.6), 16% PEG 2K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.223 |
| 8DRZ Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp13-nsp14 (C13) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3563（300 aa）
链 D
3264–3563（300 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Na citrate (pH 5.6), 16% PEG 2K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.223 |
| 8DRZ Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp13-nsp14 (C13) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
3264–3563（300 aa）
|
突变：C145A | TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Na citrate (pH 5.6), 16% PEG 2K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.223 |
| 8DRZ Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp13-nsp14 (C13) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
3264–3563（300 aa）
链 G
3264–3563（300 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Na citrate (pH 5.6), 16% PEG 2K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.223 |
| 8DS0 Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp14-nsp15 (C14) cut site sequence (form 2) 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3563（300 aa）
链 B
3264–3563（300 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M MIB buffer (pH 6.0), 25% PEG 1500
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.246 |
| 8DS1 Structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3563（300 aa）
链 B
3264–3563（300 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15M DL-Malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.248 |
| 8DS1 Structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3563（300 aa）
链 D
3264–3563（300 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15M DL-Malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.248 |
| 8DS1 Structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
3264–3563（300 aa）
链 F
3264–3563（300 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15M DL-Malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.248 |
| 8DS1 Structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
3264–3563（300 aa）
链 H
3264–3563（300 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15M DL-Malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.248 |
| 8DS1 Structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
3264–3563（300 aa）
链 J
3264–3563（300 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15M DL-Malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.248 |
| 8DS1 Structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence 提交 2022-07-21 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
3264–3563（300 aa）
链 L
3264–3563（300 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15M DL-Malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.248 |
| 8DS2 Structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with the nsp13-nsp14 (C13) cut site sequence (form 2) 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3563（300 aa）
链 B
3264–3563（300 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 11 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.8M Succinic Acid (pH 7.0)
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.187 |
| 8DSU Crystal Structure of SARS CoV-2 Mpro with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231 提交 2022-07-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.254 |
| 8DT9 Crystal Structure of SARS CoV-2 Mpro mutant L141R with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231 提交 2022-07-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：L141R 突变：L141R | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 NA SODIUM ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.243 |
| 8DZ0 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease in complex with Ensitrelvir 提交 2022-08-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.275 |
| 8DZ1 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease mutant M49I in complex with Ensitrelvir 提交 2022-08-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：M49I 突变：M49I | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.256 |
| 8DZ2 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease in complex with Nirmatrelvir 提交 2022-08-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.230 |
| 8DZ6 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease mutant Q189K in complex with Nirmatrelvir 提交 2022-08-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：Q189K 突变：Q189K | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.296 |
| 8DZ9 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease G143S mutant in complex with Nirmatrelvir 提交 2022-08-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：G143S 突变：G143S | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.251 |
| 8DZ9 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease G143S mutant in complex with Nirmatrelvir 提交 2022-08-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
突变：G143S 突变：G143S | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.251 |
| 8DZA Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease A193T mutant in complex with Nirmatrelvir 提交 2022-08-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：A193T 突变：A193T | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.242 |
| 8DZB Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor 11 提交 2022-08-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 U6Y benzyl {(3S)-1-[(2S)-1-({(2S,3R)-4-(cyclopropylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-5-oxopyrrolidin-3-yl}carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M HEPES 7.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.210 |
| 8DZC Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor 17 提交 2022-08-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | U76 (3,5-difluorophenyl)methyl {(3S)-1-[(2S)-1-({(2S,3R)-4-(cyclopropylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-6-oxopiperidin-3-yl}carbamate × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25 % 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M HEPES 7.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.245 |
| 8E1Y Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease A193S mutant in complex with Nirmatrelvir 提交 2022-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：A193S 突变：A193S | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG 4000 Cryo protected with 40% PEG 400
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.272 |
| 8E25 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease M49I mutant in complex with Nirmatrelvir 提交 2022-08-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：M49I 突变：M49I | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG 4000 Cryo protected with 40% PEG 400
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.240 |
| 8E26 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease N142S mutant in complex with Nirmatrelvir 提交 2022-08-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：N142S 突变：N142S | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.265 |
| 8E4J Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease H41A miniprecursor mutant 提交 2022-08-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3258–3569（312 aa）
链 B
3258–3569（312 aa）
|
突变：Q0E, H41A 突变：Q0E, H41A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.207 |
| 8E4R Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease H41A miniprecursor mutant in complex with GC373 提交 2022-08-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3258–3569（312 aa）
链 B
3258–3569（312 aa）
|
突变：Q0E, H41A 突变：Q0E, H41A | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.195 |
| 8E4W Crystal Structure of SARS CoV-2 Mpro mutant N142P with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231 提交 2022-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：N142P 突变：N142P | V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；10-20% (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.241 |
| 8E5C Crystal Structure of SARS CoV-2 Mpro mutant L50F with Nirmatrelvir captured in two conformational states 提交 2022-08-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：L50F | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 NA SODIUM ION × 12 CL CHLORIDE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.254 |
| 8E5X Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a dimethyl sulfinyl benzene inhibitor 提交 2022-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
链 B
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | UO9 (2~{S})-2-[[(2~{S})-4-methyl-2-[[2-methyl-2-[oxidanyl(phenyl)-$l^{3}-sulfanyl]propoxy]carbonylamino]pentanoyl]amino]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 URR N~2~-(ethoxycarbonyl)-N-{(1S,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-1-sulfanylpropan-2-yl}-L-leucinamide × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；20% (w/v) PEG 3350, 100 mM Bis-Trs Propane, 200 mM KSCN
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.215 |
| 8E5Z Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a dimethyl sulfonyl benzene inhibitor 提交 2022-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | WJB (1R,2S)-2-[(N-{[2-(benzenesulfonyl)-2-methylpropoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 UQO (1S,2S)-2-[(N-{[2-(benzenesulfonyl)-2-methylpropoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；25 % (w/v) PEG 1500, 100 mM MIB
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.253 |
| 8E61 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a m-chlorophenyl dimethyl sulfane inhibitor 提交 2022-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 VLU (1R,2S)-2-{[N-({2-[(3-chlorophenyl)sulfanyl]-2-methylpropoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 VM0 (1S,2S)-2-{[N-({2-[(3-chlorophenyl)sulfanyl]-2-methylpropoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；30% (w/v) PEG 550 MME, 100 mM Bis-Tris, 50 mM calcium chloride
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.217 |
| 8E63 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a phenyl sulfane inhibitor 提交 2022-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
链 B
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | UV2 (1R,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-2-[(N-{[2-(phenylsulfanyl)ethoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]propane-1-sulfonic acid × 2 UUR 2-phenylsulfanylethyl ~{N}-[(2~{S})-1-[[(1~{S},2~{S})-1-[bis(oxidanyl)-oxidanylidene-$l^{5}-sulfanyl]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；25% (w/v) PEG 1500, 100 mM MIB
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.217 |
| 8E64 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a benzimidazole dimethyl sulfane inhibitor 提交 2022-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | WEL (1S,2S)-2-{[N-({2-[(1H-benzimidazol-2-yl)sulfanyl]-2-methylpropoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 WEQ (1~{R},2~{S})-2-[[(2~{S})-2-[[2-(1~{H}-benzimidazol-2-ylsulfanyl)-2-methyl-propoxy]carbonylamino]-4-methyl-pentanoyl]amino]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid;molecular oxygen × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；20% (w/v) PEG 3350, 100 mM Bis-Trs Propane, 200 mM KSCN
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.212 |
| 8E65 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a p-chlorodimethyl oxybenzene inhibitor 提交 2022-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | WF5 (1S,2S)-2-[(N-{[2-(4-chlorophenoxy)-2-methylpropoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；15% (w/v) PEG 20000, 100 mM Hepes
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.235 |
| 8E68 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a p-fluorodimethyl oxybenzene inhibitor 提交 2022-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | WGO N~2~-{[2-(4-fluorophenoxy)-2-methylpropoxy]carbonyl}-N-{(1R,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-1-sulfanylpropan-2-yl}-L-leucinamide × 2 WGU (1S,2S)-2-[(N-{[2-(4-fluorophenoxy)-2-methylpropoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；20 % (w/v) PEG 3350, 100 mM Bis-Tris propane, 20 mM sodium/potassium phosphate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.217 |
| 8E69 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a m-fluorodimethyl oxybenzene inhibitor 提交 2022-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | WIO (1R,2S)-2-[(N-{[2-(3-fluorophenoxy)-2-methylpropoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；20 % (w/v) PEG 3350, 100 mM Bis-Tris propane, 20 mM sodium/potassium phosphate
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.265 |
| 8E6A Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a p-chlorophenylethanol based inhibitor 提交 2022-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 WIX (1S,2S)-2-[(N-{[(2R)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxypropoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 WJ0 (1R,2S)-2-[(N-{[(2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxypropoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；20% (w/v) PEG 6000, 100 mM MES, 200 mM NaCl
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.277 |
| 8EHJ Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) H172Q Mutant 提交 2022-09-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：H172Q 突变：H172Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.250 |
| 8EHK Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) T135I Mutant 提交 2022-09-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：T135I | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.233 |
| 8EHL Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) S144M Mutant 提交 2022-09-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：S144M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.254 |
| 8EHM Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) S144F Mutant 提交 2022-09-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：S144F 突变：S144F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.243 |
| 8EIR SARS-CoV-2 polyprotein substrate regulates the stepwise Mpro cleavage reaction 提交 2022-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.49 Å |
| 8EJ7 Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates 提交 2022-09-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：E47K 突变：E47K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Potassium Thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris Propane pH 7.5, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.270 |
| 8EJ9 Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates 提交 2022-09-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：E47N | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Fluoride, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.329 |
| 8EKE Cryo-EM structure of SARS CoV-2 Mpro WT protease 提交 2022-09-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
| 8EOY Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI37 提交 2022-10-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | WOH benzyl {(2S)-1-[2-(3-amino-3-oxopropyl)-2-(chloroacetyl)hydrazinyl]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl}carbamate (non-preferred name) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.299 |
| 8ERS PanDDA analysis -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398507 - (R,S) isomer 提交 2022-10-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | WQO (1R,2S)-1-[(4-amino-2-hydroxybenzoyl)oxy]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.162 |
| 8ERS PanDDA analysis -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398507 - (R,S) isomer 提交 2022-10-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.162 |
| 8EUA Structure of SARS-CoV2 PLpro bound to a covalent inhibitor 提交 2022-10-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1563–1879（317 aa）
|
未记录 | WUK methyl 4-{2-[3-(2-{[(1R)-1-(naphthalen-1-yl)ethyl]carbamoyl}phenyl)propanoyl]hydrazinyl}-4-oxobutanoate × 1 ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；PEG 3350, CaCl2, CdCl2 and CoCl3
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.253 |
| 8EY2 Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Main protease C145S in complex with N-terminal peptide 提交 2022-10-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3259–3569（311 aa）
片段：UNP residues 3259-3569
链 B
3259–3569（311 aa）
片段：UNP residues 3259-3569
链 C
3259–3569（311 aa）
片段：UNP residues 3259-3569
链 D
3259–3569（311 aa）
片段：UNP residues 3259-3569
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8；20 mM Tris pH 7.8, 150 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8EYJ Crystal Structure of uncleaved SARS-CoV-2 Main Protease C145S mutant in complex with Nirmatrelvir 提交 2022-10-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3263–3569（307 aa）
链 B
3263–3569（307 aa）
|
未记录 | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG 4000
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.234 |
| 8EZV SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML2006a 提交 2022-11-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | X6O (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-(azetidin-1-yl)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；Sitting drops consisted of 0.23 uL A:0.23 uL B:
A) 5.3 mg/mL Mpro + 0.9 mM ML2006a in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO
B) 20% v/v 2-Propanol, 0.1 M Tris pH 8.0, 5% w/v PEG 8000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.220 |
| 8EZZ SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML2006a2 提交 2022-11-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | X70 (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-(3,3-difluoroazetidin-1-yl)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；Sitting drops consisted of 0.23 uL A:0.23 uL B:
A) 5.3 mg/mL Mpro + 0.9 mM ML2006a2 in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO
B) 0.1 M HEPES pH 7.5 4% w/v PEG 8000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.254 |
| 8F02 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML2006a4 提交 2022-11-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | X6T (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-(3,3-dimethylazetidin-1-yl)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；Sitting drops consisted of 0.23 uL A:0.23 uL B:
A) 5.3 mg/mL Mpro + 0.9 mM ML2006a4 in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO
B) 0.1 M BICINE pH 8.5, 8% w/v mPEG 5000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.255 |
| 8F2C SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML3006a 提交 2022-11-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | X9Z (1R,2S,5S)-N-[(2S,3R)-4-(azetidin-1-yl)-3-hydroxy-4-oxo-1-(2-oxopyrrolidin-1-yl)butan-2-yl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289.15 K；Sitting drops consisted of 0.23 uL A:0.23 uL B:
A) 5.3 mg/mL Mpro + 0.9 mM ML3006a in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO
B) 0.1 M MES pH 6.5, 4% PEG 35000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.267 |
| 8F2D SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML4006a 提交 2022-11-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XA8 (1R,2S,5S)-N-[(2S,3R)-4-(azetidin-1-yl)-3-hydroxy-4-oxo-1-(2-oxopiperidin-1-yl)butan-2-yl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289.15 K；Sitting drops consisted of 0.23 uL A:0.23 uL B:
A) 5.3 mg/mL Mpro + 0.9 mM ML4006a in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO
B) 0.1 M HEPES pH 7.5, 6% PEG 20000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.252 |
| 8F2E Crystal Structure of the CoV-Y domain of SARS-CoV-2 Nonstructural Protein 3 提交 2022-11-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2478–2763（286 aa）
片段：CoV-Y domain
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；20%(w/v) PEG 3350,
0.18M Tri-Ammonium Citrate
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.232 |
| 8F44 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a dimethyl phenyl sulfane inhibitor 提交 2022-11-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
链 B
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | XFF (2-methyl-2-phenylsulfanyl-propyl) ~{N}-[(2~{S})-1-[[(1~{S},2~{S})-1-[bis(oxidanyl)-oxidanylidene-$l^{5}-sulfanyl]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2 XFR (1R,2S)-1-hydroxy-2-[(N-{[2-methyl-2-(phenylsulfanyl)propoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；20% (w/v) PEG 2,000 MME, 100 mM Tris, 200 mM Trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.219 |
| 8F45 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a phenyl dimethyl sulfane inhibitor (cyclopropyl ketoamide warhead) 提交 2022-11-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | XF8 (2-methyl-2-phenylsulfanyl-propyl) ~{N}-[(2~{S})-1-[[(2~{S},3~{S})-3-[bis(oxidanyl)-oxidanylidene-$l^{5}-sulfanyl]-4-(cyclopropylamino)-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；28% (w/v) PEG 2000 MME, 100 mM Bis-Tris
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.204 |
| 8F46 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a dimethyl phenyl sulfane inhibitor (cyano warhead) 提交 2022-11-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | XCK N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-N~2~-{[2-methyl-2-(phenylsulfanyl)propoxy]carbonyl}-L-leucinamide × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；25% (w/v) PEG 1500, 100 mM PCTP
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.221 |
| 8F4S Crystal Structure of the SARS-CoV-2 2'-O-Methyltransferase with Compound 5a bound to the Cryptic Pocket of nsp16 提交 2022-11-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 XDU 4-[(E)-2-(2,4-dichlorophenyl)ethenyl]-6-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-ol × 1 FMT FORMIC ACID × 5 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；Protein: 4 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 5% Glycerol;
Screen: Anions (B2), 0.1M HEPES pH 7.5, 1.25M Sodium acetate;
Soaks: Compound 5a, 24 hours;
Cryo: 4M Sodium formate
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.191 |
| 8F4Y Crystal Structure of SARS-CoV-2 2'-O-Methyltransferase in Complex with Compound 5a covalently bound to nsp16 and nsp10 提交 2022-11-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 XDU 4-[(E)-2-(2,4-dichlorophenyl)ethenyl]-6-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-ol × 1 XE0 4-[2-(2,4-dichlorophenyl)ethyl]-6-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-ol × 3 FMT FORMIC ACID × 10 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；Protein: 3.83 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 5% Glycerol;
Screen: Anions (B2), 0.1M HEPES pH 7.5, 1.25M Sodium acetate;
Soaks: Compound 5a, 24 hours;
Cryo: 4M Sodium formate
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.180 |
| 8FIV Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor Jun10541R 提交 2022-12-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Y0I (3Z)-N-([1,1'-biphenyl]-4-yl)-3-imino-N-[(1R)-2-oxo-2-{[(1S)-1-phenylethyl]amino}-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25 % 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M HEPES 7.5
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.277 |
| 8FIW Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor Jun10221 提交 2022-12-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Y0E N-([1,1'-biphenyl]-4-yl)-N-[(1R)-2-oxo-2-{[(1S)-1-phenylethyl]amino}-1-(pyridin-3-yl)ethyl]prop-2-enamide × 2 Y1E N-([1,1'-biphenyl]-4-yl)-N-[(1S)-2-oxo-2-{[(1S)-1-phenylethyl]amino}-1-(pyridin-3-yl)ethyl]prop-2-enamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M HEPES 7.5
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.263 |
| 8FRJ Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SGC0946 提交 2023-01-07 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
6225–6433（209 aa）
|
突变：A4R, E67V, A77K | ZN ZINC ION × 1 AW2 5-bromo-7-{5-[(3-{[(4-tert-butylphenyl)carbamoyl]amino}propyl)(propan-2-yl)amino]-5-deoxy-beta-D-ribofuranosyl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.204 |
| 8FRK Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SGC8158 提交 2023-01-07 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
6225–6433（209 aa）
|
突变：A4R,E67V,A77K | ZN ZINC ION × 1 EOH ETHANOL × 1 MJ7 5'-S-(4-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}butyl)-5'-thioadenosine × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.251 |
| 8FTC Crystal structure of main protease of SARS-CoV-2 complexed with inhibitor 提交 2023-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | Y8O (1R,2S,5S)-3-[N-(difluoroacetyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；0.2M CH2(CO2Na)2; 20% PEG3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.206 |
| 8FTL Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease (Mpro) in complex with inhibitor Jun89-3-C1 提交 2023-01-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 5ZF N-([1,1'-biphenyl]-4-yl)-2-chloro-N-[(1R)-2-oxo-2-{[(1S)-1-phenylethyl]amino}-1-(pyridin-3-yl)ethyl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.259 |
| 8FWN Crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease C111S mutant 提交 2023-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
突变：C111S | PO4 PHOSPHATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 4 ACT ACETATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；277 K；100 mM Sodium acetate, 0.8 M Monosodium phosphate, 1.2 M Dipotassium hydrogen phosphate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.198 |
| 8FWO Crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease 提交 2023-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；277 K；100 mM Sodium acetate, 0.8 M Monosodium phosphate, 1.2 M Dipotassium hydrogen phosphate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.217 |
| 8FY6 SARS-CoV-2 main protease in complex with covalent inhibitor 提交 2023-01-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YVZ (1R,2S,5S)-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-N-{(2R)-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.1M MIB pH 6.5, 13%(w/v) PEG 1500, 10% (v/v) MPD
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.222 |
| 8FY7 SARS-CoV-2 main protease in complex with covalent inhibitor 提交 2023-01-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YFK 4-methoxy-N-[(2S)-4-methyl-1-oxo-1-({(2S)-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]but-3-en-2-yl}amino)pentan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291.15 K；29%(w/v) PEG 1500, 0.1M MIB pH 5.5
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.213 |
| 8GFK Room temperature X-ray structure of truncated SARS-CoV-2 main protease C145A mutant, residues 1-304 提交 2023-03-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
|
突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；15-18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.206 |
| 8GFN Room temperature X-ray structure of truncated SARS-CoV-2 main protease C145A mutant, residues 1-304, in complex with BBH1 提交 2023-03-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
链 B
3264–3567（304 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | ZGI (1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；15-18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.206 |
| 8GFO Room temperature X-ray structure of truncated SARS-CoV-2 main protease C145A mutant, residues 1-304, in complex with GC373 提交 2023-03-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
|
突变：C145A | ZH0 N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；15-18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.202 |
| 8GFR Room temperature X-ray structure of truncated SARS-CoV-2 main protease C145A mutant, residues 1-304, in complex with NBH2 提交 2023-03-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
|
突变：C145A | ZGO (1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-cyano-2-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]ethyl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-({1-[(2-methylpropane-2-sulfonyl)methyl]cyclohexyl}carbamoyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；15-18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.202 |
| 8GFU Room temperature X-ray structure of truncated SARS-CoV-2 main protease C145A mutant, residues 1-304, in complex with nirmatrelvir (NMV) 提交 2023-03-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
|
突变：C145A | ZGW Nirmatrelvir × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；15-18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.193 |
| 8GIA Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) Nsp3 macrodomain in complex with TFMU-ADPr 提交 2023-03-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | ZJ3 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-{[2-oxo-4-(trifluoromethyl)-2H-1-benzopyran-7-yl]oxy}oxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris-HCl, pH 8, 200 mM sodium acetate, 30% PEG4000
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.258 |
| 8GIA Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) Nsp3 macrodomain in complex with TFMU-ADPr 提交 2023-03-13 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | ZJ3 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-{[2-oxo-4-(trifluoromethyl)-2H-1-benzopyran-7-yl]oxy}oxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris-HCl, pH 8, 200 mM sodium acetate, 30% PEG4000
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.258 |
| 8GW1 A mechanism for SARS-CoV-2 RNA capping and its inhibition by nucleotide analogue inhibitors 提交 2022-09-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253（113 aa）
片段：UNP residues 4141-4253
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 8GW4 SARS-CoV-2 Mpro 1-302/C145A in complex with peptide 8-1 提交 2022-09-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3565（302 aa）
片段：UNP residues 3264-3565
链 B
3264–3565（302 aa）
片段：UNP residues 3264-3565
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M ammonium chloride, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.244 |
| 8GWB SARS-CoV-2 E-RTC complex with RNA-nsp9 提交 2022-09-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253（113 aa）
片段：UNP residues 4141-4253
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 8GWE SARS-CoV-2 E-RTC complex with RNA-nsp9 and GMPPNP 提交 2022-09-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5917（593 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5917（593 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253（113 aa）
片段：UNP residues 4141-4253
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.66 Å |
| 8GWF A mechanism for SARS-CoV-2 RNA capping and its inhibition by nucleotide analogue inhibitors 提交 2022-09-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253（113 aa）
片段：UNP residues 4141-4253
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 8GWG SARS-CoV-2 E-RTC complex with SMP-nsp9 and GMPPNP 提交 2022-09-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253（113 aa）
片段：UNP residues 4141-4253
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 6GS 2'-deoxy-2'-fluoro-2'-methyluridine 5'-(trihydrogen diphosphate) × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 8GWI SARS-CoV-2 E-RTC complex with SMP-nsp9 and GTP 提交 2022-09-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 6GS 2'-deoxy-2'-fluoro-2'-methyluridine 5'-(trihydrogen diphosphate) × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 8GWJ SARS CoV-2 Mpro 1-302 C145A in complex with peptide 7 提交 2022-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3565（302 aa）
片段：UNP residues 3264-3565
链 B
3264–3565（302 aa）
片段：UNP residues 3264-3565
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M ammonium chloride, 20%
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.271 |
| 8GWK SARS-CoV-2 RNA E-RTC complex with RMP-nsp9 and GMPPNP 提交 2022-09-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253（113 aa）
片段：UNP residues 4141-4253
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 F86 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-cyano-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.72 Å |
| 8GWM SARS-CoV-2 E-RTC bound with MMP-nsp9 and GMPPNP 提交 2022-09-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253（113 aa）
片段：UNP residues 4141-4253
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 6GS 2'-deoxy-2'-fluoro-2'-methyluridine 5'-(trihydrogen diphosphate) × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.64 Å |
| 8GWN A mechanism for SARS-CoV-2 RNA capping and its inhibitor of AT-527 提交 2022-09-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å |
| 8GWO A mechanism for SARS-CoV-2 RNA capping and its inhibition by nucleotide analogue inhibitors 提交 2022-09-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253（113 aa）
片段：UNP residues 4141-4253
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8GWS SARS-CoV-2 Mpro 1-302 c145a in complex with peptide 4 提交 2022-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3565（302 aa）
片段：UNP residues 3264-3565
链 B
3264–3565（302 aa）
片段：UNP residues 3264-3565
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M magnesium formate dihydrate, 20% PEG3350
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.253 |
| 8GY6 Structure of SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase with gossypol binding 提交 2022-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | GO3 Gossypol × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率未提供 |
| 8HDA Crystal structure of Ubl1 (residues 18-111) of SARS-CoV-2 提交 2022-11-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
836–929（94 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；15% w/v PEG 1500
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.229 |
| 8HDA Crystal structure of Ubl1 (residues 18-111) of SARS-CoV-2 提交 2022-11-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
836–929（94 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；15% w/v PEG 1500
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.229 |
| 8HEF The Crystal structure of deuterated S-217622 (Ensitrelvir) bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 提交 2022-11-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3564（301 aa）
链 B
3264–3564（301 aa）
|
未记录 | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；0.2 M Ammonium acetate, 15% (w/v) PEG3350
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.170 |
| 8HQF Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease G15S mutant in complex with inhibitor YH-53 提交 2022-12-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3564（299 aa）
链 B
3266–3564（299 aa）
|
突变：G15S 突变：G15S | HUR N-[(2S)-1-[[(2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-oxidanylidene-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES 7.5, 20% PEG 10000
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.230 |
| 8INQ Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) G15S Mutant 提交 2023-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：G15S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；1%(2% w/v Cytidine, 2% w/v Inosine, 2% w/v Ribavirin, 2% w/v Thymidine, 2% w/v Uridine), 0.1M(Sodium HEPES; MOPS (acid))PH7.5, 30%(40% v/v PEG 500* MME; 20 % w/v PEG 20000)
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.221 |
| 8INT Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) K90R Mutant 提交 2023-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：K90R | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.6%(1% w/v Ampicillin sodium salt, 1% w/v Apramycin sulfate salt, 1% w/v Bacitracin, 1% w/v Dihydrostreptomycin sesquisulfate, 1% w/v Gentamicin sulfate, 1% w/v Spectinomycin dihydrochloride pentahydrate), 0.1M(Tris (base); BICINE)PH8,5, 30%(40% v/v PEG 500* MME; 20 % w/v PEG 20000)
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.224 |
| 8INU Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) G15S Mutant in Complex with Inhibitor nirmatrelvir 提交 2023-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.8%(2% w/v Lidocaine hydrochloride monohydrate, 2% w/v Procaine hydrochloride, 2% w/v Proparacaine hydrochloride, 2% w/v tetracaine hydrochloride), 0.1M(Tris (base); BICINE)PH8.5, 30%(40% v/v Glycerol; 20% w/v PEG 4000)
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.214 |
| 8INW Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) K90R Mutant in Complex with Inhibitor nirmatrelvir 提交 2023-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；1%(2% w/v Cytidine, 2% w/v Inosine, 2% w/v Ribavirin, 2% w/v Thymidine, 2% w/v Uridine), 0.1M(Tris (base); BICINE)PH8.5. 30%(40% v/v Glycerol; 20% w/v PEG 4000)
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.244 |
| 8INX Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) G15S Mutant in Complex with Inhibitor ensitrelvir 提交 2023-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；4% v/v TacsimateTM pH 4.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.221 |
| 8INY Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) K90R Mutant in Complex with Inhibitor ensitrelvir 提交 2023-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；1.2%(3% w/v CHAPS, 3% w/v CHAPSO, 3% w/v Sodium glycocholate hydrate, 3% w/v Taurocholic acid sodium salt hydrate), 0.1M(Imidazole; MES monohydrate (acid))PH6.5, 30%(40% v/v PEG 500* MME; 20 % w/v PEG 20000)
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.215 |
| 8J32 Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease in complex with PF00835231 提交 2023-04-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3564（299 aa）
链 B
3266–3564（299 aa）
|
未记录 | V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M HEPES 7.5, 20% PEG 10000
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.254 |
| 8J38 Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease P132H mutant in complex with PF00835231 提交 2023-04-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3564（299 aa）
链 B
3266–3564（299 aa）
|
突变：P132H 突变：P132H | V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BICINE pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol 10,000
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.241 |
| 8J39 Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease V186F mutant in complex with PF00835231 提交 2023-04-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3265–3563（299 aa）
链 B
3265–3563（299 aa）
|
突变：V186F 突变：V186F | V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Na2SO4, 20%PEG3350
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.251 |
| 8JPQ SARS-CoV-2 Mpro in complex with D-5-96 提交 2023-06-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3565（302 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.15 M DL - Malic acid
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 8JUX Crystal structure of SARS-CoV-2 Papain-like protease complexed with noncovalent inhibitor SR-01 提交 2023-06-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1880（317 aa）
|
突变：C111S | MG MAGNESIUM ION × 1 V00 ~{N}-[(3-fluorophenyl)methyl]-1-[(1~{R})-1-(3-methoxynaphthalen-1-yl)ethyl]piperidine-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；283 K；0.05 M sodium cacodylate, pH5.5 , 0.1 M Magnesium acetate, 16% PEG6k
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.233 |
| 8JUX Crystal structure of SARS-CoV-2 Papain-like protease complexed with noncovalent inhibitor SR-01 提交 2023-06-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1564–1880（317 aa）
|
突变：C111S | V00 ~{N}-[(3-fluorophenyl)methyl]-1-[(1~{R})-1-(3-methoxynaphthalen-1-yl)ethyl]piperidine-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；283 K；0.05 M sodium cacodylate, pH5.5 , 0.1 M Magnesium acetate, 16% PEG6k
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.233 |
| 8K67 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro M165V mutant 提交 2023-07-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：M165V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.1；293 K；0.2 M BICINE, pH 8.1, 20% polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.251 |
| 8K68 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro M49K mutant 提交 2023-07-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：M49K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；0.2 M BIS-TRIS, pH 6.0, 20% w/v polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.205 |
| 8K6A Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro S301P mutant 提交 2023-07-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：S301P | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；293 K；0.2 M BIS-TRIS, pH 6.6, 20% polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.235 |
| 8K6B Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro M49K/M165V mutant 提交 2023-07-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：M49K,M165V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；0.2 M BIS-TRIS propane, pH 7.3, 20% polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.208 |
| 8K6C Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro M49K/S301P mutant 提交 2023-07-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：M49K,S301P 突变：M49K,S301P | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；0.2 M LiSO4, 0.1 M BIS-TRIS, pH 6.6, 17.5% polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.280 |
| 8K6D Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro M49K/S301P mutant in complex with WU-04 提交 2023-07-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：M49K,S301P | J7R ~{N}-[(1~{S},2~{R})-2-[[4-bromanyl-2-(methylcarbamoyl)-6-nitro-phenyl]amino]cyclohexyl]isoquinoline-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium formate, 12% polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.181 |
| 8OKB SARS-CoV2 NSP5 in complex with a peptidomimetic ligand 提交 2023-03-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | VQR methyl (4~{S})-4-[[(2~{S})-4-methyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoyl]amino]-5-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pentanoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M Ammonium acetate, 20% PEG6000
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.267 |
| 8OKC SARS-CoV2 NSP5 in complex with a GC-376 based peptidomimetic PROTAC 提交 2023-03-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | VQN (phenylmethyl) ~{N}-[(2~{R})-1-[[(~{Z},2~{S})-5-[4-[[1-[2-[(3~{R})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-6-fluoranyl-1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-5-yl]piperidin-4-yl]methyl]piperazin-1-yl]-5-oxidanylidene-1-[(3~{R})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pent-3-en-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2M Ammonium Acetate, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.249 |
| 8OKK Crystal structure of F2F-2020184-00X bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2. 提交 2023-03-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 83F tert-butyl-N-[(2S)-3-methyl-1-[(2S,4S)-4-methyl-2-[[(2S)-1-oxidanyl-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 2 ACT ACETATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 FMT FORMIC ACID × 5 NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Sodium formate 0.1M Ammonium
acetate 0.1M Sodium citrate tribasic
dihydrate 0.1M Potassium sodium tartrate
tetrahydrate 0.1M Sodium oxamate, 0.1 M Hepes/Mops pH 7.5, 12.5% v/v MPD; 12.5% PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.178 |
| 8OKL Crystal structure of F2F-2020185-01X bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2. 提交 2023-03-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 83N tert-butyl-N-[(2S)-1-[(2S,4S)-4-methoxy-2-[[(2S)-1-oxidanyl-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-3-methyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 FMT FORMIC ACID × 2 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Sodium formate 0.1M Ammonium
acetate 0.1M Sodium citrate tribasic
dihydrate 0.1M Potassium sodium tartrate
tetrahydrate 0.1M Sodium oxamate, 0.1 M Hepes/Mops pH 7.5, 12.5% v/v MPD; 12.5% PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.189 |
| 8OKM Crystal structure of F2F-2020197-00X bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2. 提交 2023-03-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 84C tert-butyl-N-[(2S)-1-[(3S,3aS,6aR)-3-[[(2S)-1-oxidanyl-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]carbamoyl]-3,3a,4,5,6,6a-hexahydro-1H-cyclopenta[c]pyrrol-2-yl]-3-methyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 2 CL CHLORIDE ION × 4 BR BROMIDE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.09M Sodium fluoride 0.09M Sodium
bromide 0.09M Sodium iodide, 0.1M Hepes/MOPS pH 7.5, 0.1 M Hepes/Mops pH 7.5, 12.5% v/v MPD; 12.5% PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.187 |
| 8OKN Crystal structure of F2F-2020198-00X bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2. 提交 2023-03-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 83W tert-butyl-N-[(2S,3R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-1-oxidanylidene-1-[(2S)-2-[[(2S)-1-oxidanyl-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]butan-2-yl]carbamate × 2 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 3 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.12M 1,6-Hexanediol 0.12M 1-Butanol 0.12M 1,2-Propanediol 0.12M 2-Propanol
0.12M 1,4-Butanediol 0.12M 1,3-Propanediol, 0.1M Tris/BICINE pH 8.5, 12.5% v/v MPD; 12.5% PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.174 |
| 8OSX SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with ATP 提交 2023-04-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 30 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 CL CHLORIDE ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；900 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.223 |
| 8OT0 SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with MTA and glycine 提交 2023-04-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 25 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 MTA 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE × 1 GLY GLYCINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；900 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.210 |
| 8OTO SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with AMP 提交 2023-04-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 28 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；900 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.186 |
| 8OTR SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with SAM analog BDH 33959089 提交 2023-04-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 28 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 W08 (2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-N-(1-methylpiperidin-4-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolane-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；900 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.209 |
| 8OV1 SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with ADP 提交 2023-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 31 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；900 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.188 |
| 8OV2 SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with Sangivamycin 提交 2023-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 22 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 SGV SANGIVAMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.198 |
| 8OV3 SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with 5-Iodotubercidin 提交 2023-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 21 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 5ID (2R,3R,4S,5R)-2-(4-AMINO-5-IODO-7H-PYRROLO[2,3-D]PYRIMIDIN-7-YL)-5-(HYDROXYMETHYL)TETRAHYDROFURAN-3,4-DIOL × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.211 |
| 8OV4 SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with Toyocamycin 提交 2023-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 22 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 TO1 4-amino-7-(beta-D-ribofuranosyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carbonitrile × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.207 |
| 8P54 Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 150 micromolar MG-132. 提交 2023-05-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.12M 1,6-Hexanediol 0.12M 1-Butanol
0.12M 1,2-Propanediol 0.12M 2-Propanol
0.12M 1,4-Butanediol 0.12M 1,3-Propanediol, 0.1 M imidazole/MES pH 6.5, 20% v/v PEG 500 MME 10 % w/v PEG 20000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.186 |
| 8P55 Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 75 micromolar MG-132. 提交 2023-05-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.12 M Diethylene glycol 0.12M Triethylene
glycol 0.12M Tetraethylene glycol 0.12M
Pentaethylene glycol, 0.1M imidazole/MES pH 6.5, 20% v/v Ethylene glycol 10
% w/v PEG 8000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.201 |
| 8P56 Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 150 micromolar X77. 提交 2023-05-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 CL CHLORIDE ION × 2 X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.12M 1,6-Hexanediol 0.12M 1-Butanol
0.12M 1,2-Propanediol 0.12M 2-Propanol
0.12M 1,4-Butanediol 0.12M 1,3-Propanediol, 0.1M Hepes/MOPS pH 7.5, 20% v/v Ethylene glycol 10 % w/v PEG 8000
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.184 |
| 8P57 Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 75 micromolar X77. 提交 2023-05-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M DL-Glutamic acid monohydrate, 0.1M
DL-Alanine 0.1M Glycine 0.1M DL-Lysine
monohydrochloride 0.1M DL-Serine, 0.1M Hepes/MOPS pH 7.5, 20% v/v Ethylene glycol 10 % w/v PEG 8000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.183 |
| 8P58 Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 500 micromolar X77 enantiomer R. 提交 2023-05-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 CL CHLORIDE ION × 2 X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.12M 1,6-Hexanediol 0.12M 1-Butanol
0.12M 1,2-Propanediol 0.12M 2-Propanol
0.12M 1,4-Butanediol 0.12M 1,3-Propanediol, 0.1 M Tris/Bicine pH 8.5, 20% v/v Ethylene glycol 10% w/v PEG 8000
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.179 |
| 8P5A Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 5 millimolar X77 enantiomer R. 提交 2023-05-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 CL CHLORIDE ION × 2 X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.12 M Diethylene glycol 0.12M Triethylene
glycol 0.12M Tetraethylene glycol 0.12M
Pentaethylene glycol, 0.1 M Tris/bicine pH 8.5, 20% v/v Ethylene glycol, 10% w/v PEG 8000
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.189 |
| 8P5B Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 500 micromolar X77 enantiomer S. 提交 2023-05-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium formate 0.1M Ammonium
acetate 0.1M Sodium citrate tribasic
dihydrate 0.1M Potassium sodium tartrate
tetrahydrate 0.1M Sodium oxamate, 0.1M imidazole/MES pH 6.5, 12.5% v/v MPD 12.5% PEG 1000 12.5% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.178 |
| 8P5C Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 5 millimolar X77 enantiomer S. 提交 2023-05-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 9M5 ~{N}-(4-~{tert}-butylphenyl)-~{N}-[(1~{S})-2-(cyclohexylamino)-2-oxidanylidene-1-pyridin-3-yl-ethyl]-1~{H}-imidazole-4-carboxamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium formate 0.1M Ammonium
acetate 0.1M Sodium citrate tribasic
dihydrate 0.1M Potassium sodium tartrate
tetrahydrate 0.1M Sodium oxamate, 0.1M imidazole/MES pH 6.5, 12.5% v/v MPD 12.5% PEG 1000 12.5% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.178 |
| 8P86 Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 5 mM MG-132, from an "old" crystal. 提交 2023-05-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.06 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.06 M Calcium chloride dihydrate, 0.1 M Hepes/MOPS pH 7.5, 20% v/v PEG 500 MME, 10% w/v PEG 20000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.197 |
| 8P87 Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 5 mM X77, from an "old" crystal. 提交 2023-05-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium formate, 0.1M Ammonium acetate, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M Sodium oxamate, 0.1 M Hepes/MOPS pH 7.5, 20% v/v Ethylene glycol, 10 % w/v PEG 8000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.191 |
| 8PH4 Co-Crystal structure of the SARS-CoV2 main protease Nsp5 with an Uracil-carrying X77-like inhibitor 提交 2023-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | MLI MALONATE ION × 1 YQN ~{N}-(4-~{tert}-butylphenyl)-~{N}-[(1~{S})-2-(cyclohexylamino)-2-oxidanylidene-1-pyridin-3-yl-ethyl]-2,6-bis(oxidanylidene)-5~{H}-pyrimidine-5-carboxamide × 4 NA SODIUM ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；295.15 K；23.5 % PEG 1.500, 0.2 M MIB pH 7.4, 5 % DMSO, 0.025 mM EDTA pH 7.0
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.248 |
| 8Q71 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the inhibitor GC-67 提交 2023-08-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | KKO (2~{S})-1-(3,4-dichlorophenyl)-4-(4-methoxypyridin-3-yl)carbonyl-~{N}-(thiophen-2-ylmethyl)piperazine-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；289 K；0.1M MES pH6.0, 20% PEG6000, 0.2M Ammonium chloride, 0.4 M GC67
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.290 |
| 8Q71 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the inhibitor GC-67 提交 2023-08-15 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | KKO (2~{S})-1-(3,4-dichlorophenyl)-4-(4-methoxypyridin-3-yl)carbonyl-~{N}-(thiophen-2-ylmethyl)piperazine-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；289 K；0.1M MES pH6.0, 20% PEG6000, 0.2M Ammonium chloride, 0.4 M GC67
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.290 |
| 8QDC Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the covalent inhibitor GUE-3642 (compound 1 in publication) 提交 2023-08-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XV9 (phenylmethyl) ~{N}-[(2~{S})-1-[[(2~{S})-1-[[(2~{S})-1-[[iminomethyl-(phenylmethyl)amino]-methyl-amino]-1-oxidanylidene-3-phenyl-propan-2-yl]amino]-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.03 M sodium fluoride, 0.03 M sodium bromide, 0.03 M sodium iodide, 0.1 M HEPES and MOPS, 12 % PEG500MME, 6% PEG20000, 200 microM inhibitor, condition MORPHEUS B5
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.239 |
| 8R7B SARS-CoV-2 NSP14 in complex with SAH and TDI-015051 提交 2023-11-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5926–6452（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 IMD IMIDAZOLE × 1 YDT N-[(5-fluoranyl-1-benzofuran-4-yl)methyl]-1,5-dimethyl-4-(1,4,6,7-tetrahydropyrazolo[4,3-c]pyridin-5-ylsulfonyl)pyrrole-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；11% (v/v) isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.0 with SAH and TDI-014988
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.244 |
| 8R7B SARS-CoV-2 NSP14 in complex with SAH and TDI-015051 提交 2023-11-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6452（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 IMD IMIDAZOLE × 4 YDT N-[(5-fluoranyl-1-benzofuran-4-yl)methyl]-1,5-dimethyl-4-(1,4,6,7-tetrahydropyrazolo[4,3-c]pyridin-5-ylsulfonyl)pyrrole-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；11% (v/v) isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.0 with SAH and TDI-014988
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.244 |
| 8RF2 Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 1E7 refined against the anomalous diffraction data 提交 2023-12-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–126（117 aa）
|
未记录 | A1H0G 1-benzothiophen-5-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.225 |
| 8RF3 Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 7G3 refined against the anomalous diffraction data 提交 2023-12-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–126（117 aa）
|
未记录 | A1H0L 2-(1-benzothiophen-3-yl)ethanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.220 |
| 8RF4 Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 9D4 refined against the anomalous diffraction data 提交 2023-12-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–126（117 aa）
|
未记录 | EQT 4-chloranyl-1~{H}-indazol-3-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.212 |
| 8RF5 Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 11A7 refined against the anomalous diffraction data 提交 2023-12-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–126（117 aa）
|
未记录 | FBB 6-fluoro-1,3-benzothiazol-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.202 |
| 8RF6 Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 11A7_AL5 refined against the anomalous diffraction data 提交 2023-12-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–126（117 aa）
|
未记录 | A1H0K 6-iodanyl-2,3-dihydro-1,3-benzothiazol-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.217 |
| 8RF8 Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 11A7_AL6 refined against the anomalous diffraction data 提交 2023-12-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–126（117 aa）
|
未记录 | A1H0M 6-bromanyl-1,3-benzothiazol-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.248 |
| 8RFC Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 7H2_AL1 refined against the anomalous diffraction data 提交 2023-12-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–126（117 aa）
|
未记录 | A1H0N (1~{R})-1-(4-bromophenyl)ethanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.206 |
| 8RFD Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 7H2_AL2 refined against the anomalous diffraction data 提交 2023-12-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–126（117 aa）
|
未记录 | A1H0J (1~{R})-1-(4-iodophenyl)ethanamine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.201 |
| 8RFF Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 6A6 refined against the anomalous diffraction data 提交 2023-12-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–126（117 aa）
|
未记录 | ABV 1,3-benzothiazol-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.5 K；The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.219 |
| 8RI4 Crystal structure of the SARS-CoV-2 Main Protease inhibited by (2-methylsulfanyl-6,7-dihydro-[1,4]dioxino[2,3-f]benzimidazol-3-yl)-(p-tolyl)methanone 提交 2023-12-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4MA 4-METHYLBENZOIC ACID × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 GOL GLYCEROL × 4 FMT FORMIC ACID × 4 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% PEG3350, 0.2 M Sodium Formate, 2.5 mM DMSO
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.234 |
| 8RJV Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the covalent inhibitor GUE-3778 (compound 12 in publication) 提交 2023-12-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1H1J (phenylmethyl) ~{N}-[(2~{S})-1-[[(3-chloranyl-2-fluoranyl-phenyl)methyl-(iminomethyl)amino]-methyl-amino]-1-oxidanylidene-3-phenyl-propan-2-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 6000, 0.2 M ammonium chloride, 0.4 mM inhibitor
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.275 |
| 8RJY Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the covalent inhibitor GUE-3899 (compound 58 in publication) 提交 2023-12-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1H1K ~{N}-[(2~{S})-1-[[(2~{S})-1-[[(4-chlorophenyl)methyl-(iminomethyl)amino]-methyl-amino]-1-oxidanylidene-3-phenyl-propan-2-yl]amino]-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]thiophene-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M potassium sodium tartrate
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.287 |
| 8RJZ Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the non-covalent inhibitor GUE-3801 (compound 80 in publication) 提交 2023-12-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1H1I (7~{S})-6-[2-[2,4-bis(chloranyl)phenoxy]ethanoyl]-14-fluoranyl-10-(iminomethyl)-9-methyl-7-(phenylmethyl)-2-oxa-6,9,10-triazabicyclo[10.4.0]hexadeca-1(12),13,15-trien-8-one × 2 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2 M sodium nitrate, 0.1 M Bis-Tris propane pH 6.5, 20% PEG 3350, 0.4 mM inhibitor
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.234 |
| 8RNE HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Nsp13 peptide, VMPLSAPTL 提交 2024-01-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
5556–5564（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.15 M potassium bromide, 20% w/v of PEG 2000 MME
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.243 |
| 8RNE HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Nsp13 peptide, VMPLSAPTL 提交 2024-01-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
5556–5564（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.15 M potassium bromide, 20% w/v of PEG 2000 MME
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.243 |
| 8RNE HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Nsp13 peptide, VMPLSAPTL 提交 2024-01-09 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
5556–5564（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.15 M potassium bromide, 20% w/v of PEG 2000 MME
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.243 |
| 8RNF HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Omicron Nsp13 peptide, VIPLSAPTL 提交 2024-01-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
5556–5564（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.15 M DL malic acid and 20% w/v of PEG3350
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.220 |
| 8RNF HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Omicron Nsp13 peptide, VIPLSAPTL 提交 2024-01-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
5556–5564（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.15 M DL malic acid and 20% w/v of PEG3350
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.220 |
| 8RNF HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Omicron Nsp13 peptide, VIPLSAPTL 提交 2024-01-09 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
5556–5564（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.15 M DL malic acid and 20% w/v of PEG3350
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.220 |
| 8RV4 SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 2 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1H3C 5-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]-2-phenyl-benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M MES (pH 5.6), 5% PEG 3350, 0.24 M magnesium chloride
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.233 |
| 8RV5 SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 1 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 MTA 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M MES (pH 5.6), 12% PEG 3350, 0.18 M magnesium chloride
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.214 |
| 8RV6 SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 2 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1H3B 3-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]-5-(4-hydroxyphenyl)benzoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M MES (pH 5.6), 12% PEG 3350, 0.1 M magnesium chloride
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.225 |
| 8RV7 SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 4 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1H3E 3-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]-5-(3-oxidanylprop-1-ynyl)benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M MES (pH 5.6), 9% PEG 3350, 0.06 M magnesium chloride
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.197 |
| 8RV8 SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 5 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1H28 5-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanyl]-2-chloranyl-benzoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M MES (pH 5.6), 11% PEG 3350, 0.24 M magnesium chloride
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.196 |
| 8RV9 SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 6 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1H3A 5-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]-2-chloranyl-benzoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M MES (pH 5.6), 5% PEG 3350, 0.24 M magnesium chloride
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.208 |
| 8RVA SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 7 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1H3D 3-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M MES (pH 5.6), 7% PEG 3350, 0.12 M magnesium chloride
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.204 |
| 8RVB SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 8 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1H29 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[2-(1~{H}-1,2,3-triazol-4-yl)ethylsulfanylmethyl]oxolane-3,4-diol × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M MES (pH 5.6), 5% PEG 3350, 0.22 M magnesium chloride
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.203 |
| 8RZC SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 11 提交 2024-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1H4D 3-[[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]-5-imidazol-1-yl-benzoic acid × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M MES (pH 5.6), 7% PEG 3350, 0.14 M magnesium chloride
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.210 |
| 8RZD SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 9 提交 2024-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
|
未记录 | A1H4C 3-[[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]-5-(3-hydroxyphenyl)benzoic acid × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M MES (pH 5.6), 9% PEG 3350, 0.14 M magnesium chloride
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.242 |
| 8RZE SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 10 提交 2024-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
|
未记录 | A1H4B 3-[[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]-5-pyridin-3-yl-benzoic acid × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M MES (pH 5.6), 12% PEG 3350, 0.12 M magnesium chloride
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.231 |
| 8S8W SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with Sangivamycin and m7GpppA-RNA (Cap0-RNA) 提交 2024-03-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 SGV SANGIVAMYCIN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ZN ZINC ION × 2 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.224 |
| 8S8X SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with Toyocamycin and m7GpppA-RNA (Cap0-RNA) 提交 2024-03-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 TO1 4-amino-7-(beta-D-ribofuranosyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.223 |
| 8S9Z Mpro inhibitors of SARS-CoV-2 提交 2023-03-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.258 |
| 8SG6 SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) H163A Mutant Reduced with 20mM TCEP 提交 2023-04-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：H163A 突变：H163A | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1M Tris, pH 8.5 and 26% (v/v) PEG Smear Broad (BCS B11); soaked with an additional 20mM TCEP for two hours
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.240 |
| 8SH6 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain Asn40Asp mutant (P43 crystal form) 提交 2023-04-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES pH 9.5, 29% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.126 |
| 8SH6 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain Asn40Asp mutant (P43 crystal form) 提交 2023-04-13 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES pH 9.5, 29% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.126 |
| 8SH8 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain Asn40Asp mutant in complex with ADP-ribose (P43 crystal form) 提交 2023-04-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.123 |
| 8SH8 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain Asn40Asp mutant in complex with ADP-ribose (P43 crystal form) 提交 2023-04-13 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.123 |
| 8SK4 Co-structure of SARS-CoV-2 (COVID-19 with covalent pyrazoline based inhibitors) 提交 2023-04-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | I3R 2-chloro-1-[(5R)-3-phenyl-5-(quinoxalin-5-yl)-4,5-dihydro-1H-pyrazol-1-yl]ethan-1-one × 2 IMD IMIDAZOLE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；10mg/ml
Covid-19Mpro (25 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM EDTA) was inhibited at 10X molar excess and
incubated on ice for 1hr, solution was spun down for 10min at 10,000 rpm. Crystals were grown by
hanging-drop vapor diffusion method at 18C. by mixing 1:1, 1:2 and 2:1 ratio of protein to well solution. Crystal grew out of well solution composed of 25% w/v Peg 1500, 100 mM MIB buffer pH 7.0, from PACT
screen (Nextal Biotechnologies).
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.236 |
| 8SKH Co-structure of SARS-CoV-2 (COVID-19 with covalent pyrazoline based inhibitors 提交 2023-04-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1W 2-chloro-1-[(4R,5R)-3,4,5-triphenyl-4,5-dihydro-1H-pyrazol-1-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10mg/ml Covid-19Mpro (25 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM EDTA) was inhibited at 10X molar excess and incubated on ice for 1hr, solution was spun down for 10min at 10,000 rpm. Crystals were grown by hanging-drop vapor diffusion method at 18C. by mixing 1:1, 1:2 and 2:1 ratio of protein to well solution. Crystal grew out of well solution composed of 25% w/v Peg 1500, 100 mM MIB buffer pH 7.0, from PACT screen (Nextal Biotechnologies).
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.231 |
| 8SQ9 SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp9 and UMPCPP, as a pre-catalytic NMPylation intermediate 提交 2023-05-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
链 G
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 WSB 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]uridine × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8SQJ SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to RNA-nsp9, as a noncatalytic RNA-nsp9 binding mode 提交 2023-05-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
链 G
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | VSN 5'-O-[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]guanosine × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.06 Å |
| 8SQK SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to RNA-nsp9 and GDP-betaS, as a pre-catalytic deRNAylation/mRNA capping intermediate 提交 2023-05-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5321（929 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
链 G
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | VSN 5'-O-[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]guanosine × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 8STY Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI60 提交 2023-05-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | WGE benzyl (3S)-3-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-2-azaspiro[4.4]nonane-2-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 8STZ Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI37 提交 2023-05-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | WGI benzyl (3S)-3-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-2-azaspiro[4.5]decane-2-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.229 |
| 8SXR Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with C5a 提交 2023-05-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | WZK N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-N-[4-(dimethylamino)phenyl]-2-(5-hydroxyisoquinolin-4-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.252 |
| 8T7Y Structure of SARS CoV-2 main protease in complex with Chymostatin. 提交 2023-06-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；1.8M Ammonium sulfate, 0.1% Bis-Tris ph 6.5, 2%v/v PEG monomethyl ether 550
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.244 |
| 8TBE Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with Pomotrelvir 提交 2023-06-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | ZQB Pomotrelvir bound form × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；24.1% PEG 3350, 100 mM MES pH 7.5
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.299 |
| 8TPB Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease 提交 2023-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | JVX N-[(1R)-2-(tert-butylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-(4-tert-butylphenyl)-2-chloroacetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Hepes PH 7.5
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.248 |
| 8TPC Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease 提交 2023-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | JJC N-[(1R)-2-(benzylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-[4-(2-chloroacetamido)phenyl]furan-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295.15 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium thiocyanate
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.223 |
| 8TPD Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease 提交 2023-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | JJO N-[(1R)-2-(benzylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-[3-(2-chloroacetamido)phenyl]furan-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295.15 K；PEG 3350, 0.2M Sodium thiocyanate
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.226 |
| 8TPE Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease 提交 2023-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | JK0 N-[(1R)-2-(benzylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-(4-tert-butylphenyl)-3-hydroxypropanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295.15 K；20% PEG 6000, 200mM NaCl, 100mM Hepes/NaOH pH 7
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.241 |
| 8TPF Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease 提交 2023-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | JWI N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-3-hydroxypropanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295.15 K；25% PEG 1500, 100mM PCB buffer pH 7.0
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.247 |
| 8TPG Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease 提交 2023-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | JKL (3R)-N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-3-hydroxybutanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295.15 K；25% PEG 1500, 100mM MMT buffer pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.214 |
| 8TPH Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease 提交 2023-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | JKL (3R)-N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-3-hydroxybutanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295.15 K；25% PEG 1500. 100mM MMT buffer, pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.206 |
| 8TPI Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease 提交 2023-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | JWO N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-2-hydroxy-2-methylpropanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295.15 K；25% PEG 1500, 100mM PCB buffer pH 7.0
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.234 |
| 8TQH MPI68 bound to Mpro of SARS-CoV-2 提交 2023-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | JX6 N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.230 |
| 8TQJ MPI57 bound to Mpro of SARS-CoV-2 提交 2023-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YHI benzyl (1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-3-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.237 |
| 8TQL MPI54 bound to Mpro of SARS-CoV-2 提交 2023-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | JY0 benzyl [(2S,3S)-3-tert-butoxy-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxobutan-2-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.268 |
| 8TQT MPI52 bound to Mpro of SARS-CoV-2 提交 2023-08-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | K2X (3-chlorophenyl)methyl [(2S)-3-cyclohexyl-1-({(1S,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-1-sulfanylpropan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.239 |
| 8TQU MPI51 bound to Mpro of SARS-CoV-2 提交 2023-08-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.269 |
| 8TV6 SARS-CoV-2 Mac1 in complex with MDOLL-0169 提交 2023-08-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain 1
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；0.1 M CHES pH 9.5, 32% PEG (v/v) 3000
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.225 |
| 8TV6 SARS-CoV-2 Mac1 in complex with MDOLL-0169 提交 2023-08-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain 1
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 V83 (1R,6R)-6-{[3-(methoxycarbonyl)-5,6,7,8-tetrahydro-4H-cyclohepta[b]thiophen-2-yl]carbamoyl}cyclohex-3-ene-1-carboxylic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；0.1 M CHES pH 9.5, 32% PEG (v/v) 3000
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.225 |
| 8TV7 SARS-CoV-2 Mac1 in complex with MDOLL-0229 提交 2023-08-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain 1
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 VI1 (1R,2R)-2-{[3-(methoxycarbonyl)-4,5,6,7,8,9-hexahydrocycloocta[b]thiophen-2-yl]carbamoyl}cyclohexane-1-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；0.1 M CHES pH 9.5, 32% PEG (v/v) 3000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.187 |
| 8TY3 MI-31 ligand bound to SARS-CoV-2 Mpro 提交 2023-08-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | SJF (1S,3aR,6aS)-2-[(3,4-dichlorophenoxy)acetyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.224 |
| 8TY4 MI-30 bound to Mpro of SARS-CoV-2 提交 2023-08-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | SO0 (1S,3aR,6aS)-2-[(2,4-dichlorophenoxy)acetyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.237 |
| 8TY5 MI-14 bound to Mpro of SARS-CoV-2 提交 2023-08-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | SQ3 (1R,2S,5S)-3-[(2,4-dichlorophenoxy)acetyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.253 |
| 8TYJ Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp10/nsp16 complex with bound SAH 提交 2023-08-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% (v/v) isopropyl alcohol, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M NaCl
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 8U2X Crystal Structure of NendoU (Uridylate-specific endoribonuclease, nsp15) from Betacoronavirus SARS-CoV-2 (H235A mutant) 提交 2023-09-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
|
突变：H235A | TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 CL CHLORIDE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；Morpheus Fusion G4: 0.2M Sodium formate; 0.2M Ammonium acetate; 0.2M Sodium citrate tribsic dihydrate; 0.2M Potassium sodium tartrate tetrahydrate; 0.2M Sodium oxamate, 3% w/v NDSB 195, 3% w/v NDSB 201, 3% w/v NDSB 211,3% w/v NDSB 221, 3% w/v NDSB 256, 0.5M Tris (base); 0.5M BICINE pH 8.5, 40% v/v PEG 500 MME; 20 % w/v PEG 20000, BewuA.18928.a.MX152.PW39137 at 18 mg/mL. Plate 13311 well G4 drop2, Puck: PSL-0109, Cryo: Direct
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.213 |
| 8U2X Crystal Structure of NendoU (Uridylate-specific endoribonuclease, nsp15) from Betacoronavirus SARS-CoV-2 (H235A mutant) 提交 2023-09-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
6453–6798（346 aa）
|
突变：H235A | TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；Morpheus Fusion G4: 0.2M Sodium formate; 0.2M Ammonium acetate; 0.2M Sodium citrate tribsic dihydrate; 0.2M Potassium sodium tartrate tetrahydrate; 0.2M Sodium oxamate, 3% w/v NDSB 195, 3% w/v NDSB 201, 3% w/v NDSB 211,3% w/v NDSB 221, 3% w/v NDSB 256, 0.5M Tris (base); 0.5M BICINE pH 8.5, 40% v/v PEG 500 MME; 20 % w/v PEG 20000, BewuA.18928.a.MX152.PW39137 at 18 mg/mL. Plate 13311 well G4 drop2, Puck: PSL-0109, Cryo: Direct
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.213 |
| 8U40 Crystal structure of main protease of SARS-CoV-2 complexed with inhibitor 提交 2023-09-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | V8X N-[(2S)-3-cyclopropyl-1-({(1E,2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxo-2,3-dihydropyridin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]-5,7-difluoro-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.2 M Potassium Thiocynate, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.274 |
| 8U4Y Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) L50F Mutant 提交 2023-09-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：L50F 突变：L50F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.239 |
| 8U9H Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI64 提交 2023-09-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | VZB (1R,2S,5R)-3-[(cyclohexyloxy)acetyl]-N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.227 |
| 8U9K Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI94 提交 2023-09-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | W0B diphenylmethyl (1R,2S,5R)-2-({(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-3-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.302 |
| 8U9M Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI95 提交 2023-09-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | VZT bis(4-fluorophenyl)methyl (1R,2S,5R)-2-({(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-3-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.240 |
| 8U9N Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI64 提交 2023-09-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | W0L (1R,2S,5S)-3-[bis(4-chlorophenyl)acetyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.242 |
| 8U9T Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI97 提交 2023-09-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | W1L (1R,2S,5S)-N~3~,N~3~-bis(4-chlorophenyl)-N~2~-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2,3-dicarboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.236 |
| 8U9U Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI98 提交 2023-09-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | W0W (1R,2S,5S)-3-[bis(4-chlorophenoxy)acetyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.287 |
| 8U9V Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI101 提交 2023-09-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | W1C N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-N~2~-{[(pyridin-3-yl)methoxy]carbonyl}-L-leucinamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.249 |
| 8U9W Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI105 提交 2023-09-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | W1U N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-N~2~-[(2R)-2-phenylazetidine-1-carbonyl]-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.233 |
| 8UAB SARS-CoV-2 main protease (Mpro) complex with AC1115 提交 2023-09-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | W28 N-[(2S)-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；0.1 M imidazole pH 8, 0.1 M LiSO4, 1 mM DTT, 12% PEG 3000
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.228 |
| 8UD2 SARS-CoV-2 Nsp15, apo-form 提交 2023-09-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
链 D
6453–6798（346 aa）
链 E
6453–6798（346 aa）
链 F
6453–6798（346 aa）
|
突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.33 Å |
| 8UD3 SARS-CoV-2 Nsp15 bound to poly(A/U) RNA, consensus form 提交 2023-09-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
链 D
6453–6798（346 aa）
链 E
6453–6798（346 aa）
链 F
6453–6798（346 aa）
|
突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.67 Å |
| 8UD4 SARS-CoV-2 Nsp15 bound to poly(A/U) RNA, state 1 提交 2023-09-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
链 D
6453–6798（346 aa）
链 E
6453–6798（346 aa）
链 F
6453–6798（346 aa）
|
突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 8UD5 SARS-CoV-2 Nsp15 bound to poly(A/U) RNA, state 2 提交 2023-09-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
链 D
6453–6798（346 aa）
链 E
6453–6798（346 aa）
链 F
6453–6798（346 aa）
|
突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A 突变：H234A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |
| 8UDF Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor DEL_7 提交 2023-09-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | WB0 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-(methylamino)-4-oxobutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2 CL CHLORIDE ION × 4 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6；293 K；100 mM MES, 20% w/v PEG4000, 100 mM sodium phosphate monobasic
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.194 |
| 8UDJ Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor DEL_2 提交 2023-09-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | WB5 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-4-(methylamino)-4-oxo-1-phenylbutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6；277 K；100 mM MES, 20% w/v PEG4000, 100 mM sodium phosphate monobasic
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.203 |
| 8UDM Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 16 提交 2023-09-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | WBE 2-cyano-D-phenylalanyl-N-[(2S)-4-({3-[(5-amino-4H-1,2,4-triazol-3-yl)amino]propyl}amino)-1-(4-fluorophenyl)-4-oxobutan-2-yl]-2,4-dichloro-D-phenylalaninamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6；277 K；100 mM MES, 20% w/v PEG4000, 100 mM sodium phosphate monobasic
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.179 |
| 8UDO Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 15 提交 2023-09-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | WBK 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-4-{[5-(dimethylamino)pentyl]amino}-1-(4-fluorophenyl)-4-oxobutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5；277 K；100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.203 |
| 8UDP Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 14 提交 2023-09-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | WBO 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-4-{[4-(dimethylamino)butyl]amino}-1-(4-fluorophenyl)-4-oxobutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5；277 K；100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.204 |
| 8UDQ Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 1 提交 2023-09-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | WC0 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-4-{[2-(dimethylamino)ethyl]amino}-1-(4-fluorophenyl)-4-oxobutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5；277 K；100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.217 |
| 8UDW Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 2 提交 2023-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | WDK 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-4-{[3-(dimethylamino)propyl]amino}-1-(4-fluorophenyl)-4-oxobutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5；277 K；100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.222 |
| 8UDX Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with C145 sulfinic acid in complex with inhibitor 17 提交 2023-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | WCZ 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-{[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propyl]amino}-4-oxobutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5；277 K；100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.212 |
| 8UDY Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 25 提交 2023-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | WD6 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-{(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-oxo-4-[(prop-2-yn-1-yl)amino]butan-2-yl}-D-phenylalaninamide × 2 NA SODIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5；277 K；100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.216 |
| 8UE0 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 47 提交 2023-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | WDF 2,4-dichloro-Nalpha-[(2R)-2-chloro-3-(2-cyanophenyl)propanoyl]-N-[(2S)-4-{[4-(dimethylamino)butyl]amino}-1-(4-fluorophenyl)-4-oxobutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2 NA SODIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5；277 K；100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.213 |
| 8UEA Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 29 提交 2023-09-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | WDQ 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-oxo-4-{[3-(pyridin-3-yl)propyl]amino}butan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2 CL CHLORIDE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6；277 K；100 mM MES, 20% w/v PEG4000, 100 mM sodium phosphate monobasic
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.204 |
| 8UEB Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 30 提交 2023-09-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | WE8 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-oxo-4-{[3-(pyridin-4-yl)propyl]amino}butan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6；277 K；100 mM MES, 20% w/v PEG4000, 100 mM sodium phosphate monobasic
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.199 |
| 8UEF Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 32 提交 2023-10-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | WEK 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-{(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-[(4-methoxybutyl)amino]-4-oxobutan-2-yl}-D-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5；277 K；100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.204 |
| 8UEG Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 27 提交 2023-10-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | WEO 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-{(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-oxo-4-[(pent-4-yn-1-yl)amino]butan-2-yl}-D-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5；277 K；100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.207 |
| 8UEH Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 31 提交 2023-10-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | WEX 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-{(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-oxo-4-[(2-phenylethyl)amino]butan-2-yl}-D-phenylalaninamide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 5；277 K；100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.199 |
| 8UEI Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 28 提交 2023-10-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | WF2 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-oxo-4-{[4-(pyrrolidin-1-yl)butyl]amino}butan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6；277 K；100 mM MES, 20% w/v PEG4000, 100 mM sodium phosphate monobasic
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.192 |
| 8UH5 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with an inhibitor TKB-272 提交 2023-10-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | WOK (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(5-fluoro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M MES, pH 5.8, 15% PEG6000, 3% DMSO
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.233 |
| 8UH9 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease E166V mutant in complex with an inhibitor TKB-272 提交 2023-10-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | WOK (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(5-fluoro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.4 M Sodium acetate trihydrate, pH 5.8, 30% PEG 400, 3% DMSO
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.240 |
| 8UIF Crystal structure of SARS CoV-2 3CL protease in complex with GSK4365096A 提交 2023-10-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | A1ADS N-[(benzyloxy)carbonyl]-4-fluoro-L-phenylalanyl-N-{(2R)-1-[(2S)-oxolan-2-yl]-3-[(3S)-2-oxooxolan-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；295 K；0.1M HEPES, pH 7.5, 16% PEG8000, 0.1M KH2PO4
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.220 |
| 8UPS Structure of SARS-Cov2 3CLPro in complex with Compound 5 提交 2023-10-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | I70 (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；0.1 M CHES pH 9.5, 10% w/v PEG3K, 20% glycerol for cryoprotection
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.268 |
| 8UPV Structure of SARS-Cov2 3CLPro in complex with Compound 33 提交 2023-10-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | X83 methyl {(2S)-1-[(1S,3aR,6aS)-1-{[(2R,3S,6R)-6-fluoro-2-hydroxy-1-(methylamino)-1-oxoheptan-3-yl]carbamoyl}hexahydrocyclopenta[c]pyrrol-2(1H)-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Tris pH 9-9.5, 14-18% PEG 8K, also in a 1:1 ratio of protein to precipitant solution and cryoprotected with 20% glycerol
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.199 |
| 8UPW Structure of SARS-Cov2 3CLPro in complex with Compound 34 提交 2023-10-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | X8F methyl {(2S)-1-[(1S,3aR,6aS)-1-{[(2R,3S,6S)-6-fluoro-2-hydroxy-1-(methylamino)-1-oxoheptan-3-yl]carbamoyl}hexahydrocyclopenta[c]pyrrol-2(1H)-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Tris pH 9-9.5, 14-18% PEG 8K in a 1:1 ratio of protein to precipitant solution, and cryoprotected with 20% glycerol
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.201 |
| 8UR9 Crystal Structure of the SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Compound 61 提交 2023-10-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XEK (5P)-5-[(1P,3M,3'P)-3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]-1-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；10% v/v 2-Propanol
0.1 M BICINE pH 8.5
30% w/v Polyethylene glycol 1500
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.236 |
| 8UTE Structure of SARS-Cov2 3CLPro in complex with Compound 27 提交 2023-10-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XKQ methyl {(2S)-1-[(1S,3aR,6aS)-1-{[(2R,3S)-6,6-difluoro-2-hydroxy-1-(methylamino)-1-oxoheptan-3-yl]carbamoyl}hexahydrocyclopenta[c]pyrrol-2(1H)-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 6, 40% v/v MPD, 5% w/v PEG 3350 in a 1:1 ratio of protein to precipitant solution
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.225 |
| 8UUG SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) with inhibitor Jun12303 提交 2023-11-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | XXW N-[(1R)-1-{(3M,5M)-3-[1-(difluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]-5-[1-(methoxymethyl)-1H-pyrazol-4-yl]phenyl}ethyl]-5-[2-(dimethylamino)ethoxy]-2-methylbenzamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 1 ZN ZINC ION × 5 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；277 K；0.2M Zinc Acetate, 0.1M BisTris pH 6.3, 8% PEG 8000
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.233 |
| 8UVM SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) complex with covalent inhibitor Jun11313 提交 2023-11-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | Y3R ethyl 4-oxo-4-(2-{3-[2-({(1S)-1-[(3P)-3-(thiophen-3-yl)phenyl]ethyl}carbamoyl)phenyl]propanoyl}hydrazinyl)butanoate × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；2.5M Ammonium Sulfate, 0.1M Sodium citrate dibasic trihydrate pH 6.7
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.204 |
| 8UVM SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) complex with covalent inhibitor Jun11313 提交 2023-11-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | Y3R ethyl 4-oxo-4-(2-{3-[2-({(1S)-1-[(3P)-3-(thiophen-3-yl)phenyl]ethyl}carbamoyl)phenyl]propanoyl}hydrazinyl)butanoate × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；2.5M Ammonium Sulfate, 0.1M Sodium citrate dibasic trihydrate pH 6.7
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.204 |
| 8UVM SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) complex with covalent inhibitor Jun11313 提交 2023-11-03 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | Y3R ethyl 4-oxo-4-(2-{3-[2-({(1S)-1-[(3P)-3-(thiophen-3-yl)phenyl]ethyl}carbamoyl)phenyl]propanoyl}hydrazinyl)butanoate × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；2.5M Ammonium Sulfate, 0.1M Sodium citrate dibasic trihydrate pH 6.7
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.204 |
| 8UVM SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) complex with covalent inhibitor Jun11313 提交 2023-11-03 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | Y3R ethyl 4-oxo-4-(2-{3-[2-({(1S)-1-[(3P)-3-(thiophen-3-yl)phenyl]ethyl}carbamoyl)phenyl]propanoyl}hydrazinyl)butanoate × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；2.5M Ammonium Sulfate, 0.1M Sodium citrate dibasic trihydrate pH 6.7
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.204 |
| 8V4U Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with a covalent inhibitor 提交 2023-11-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YDL N-(methoxycarbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-(trifluoromethyl)-L-prolinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；20.0% w/v PEG 3350 and 0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.264 |
| 8V7T Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease catalytic domain (residues 1-199) 提交 2023-12-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3462（199 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；20-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.178 |
| 8V7T Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease catalytic domain (residues 1-199) 提交 2023-12-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3462（199 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；20-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.178 |
| 8V7W Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease catalytic domain C145A precursor, residues nsp4(-6)-1-199-6H 提交 2023-12-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3258–3462（205 aa）
片段：catalytic domain
链 B
3258–3462（205 aa）
片段：catalytic domain
|
突变：C145A 突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；20-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.229 |
| 8V8E Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease catalytic domain (residues 1-199-6H) in complex with ensitrelvir (ESV) 提交 2023-12-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3462（199 aa）
片段：catalytic domain
|
未记录 | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；20-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.193 |
| 8V8E Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease catalytic domain (residues 1-199-6H) in complex with ensitrelvir (ESV) 提交 2023-12-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3462（199 aa）
片段：catalytic domain
|
未记录 | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；20-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.193 |
| 8V8G Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease catalytic domain (residues 1-196) in complex with ensitrelvir (ESV) 提交 2023-12-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3459（196 aa）
片段：catalytic domain (MPro1-196)
|
未记录 | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；20-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 8V8G Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease catalytic domain (residues 1-196) in complex with ensitrelvir (ESV) 提交 2023-12-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3459（196 aa）
片段：catalytic domain (MPro1-196)
|
未记录 | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；20-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 8VD7 MicroED structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro/3CLPro) with missing cone eliminated by suspended drop 提交 2023-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 | ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.5；0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 3350, 5% DMSO.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.248 |
| 8VDJ Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease (3CLpro) as a covalent complex with EDP-235 提交 2023-12-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AA0 4,6,7-trifluoro-N-{(2S)-1-[(3R,5'R)-5'-(iminomethyl)-2-oxo-1,2-dihydrospiro[indole-3,3'-pyrrolidin]-1'-yl]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl}-N-methyl-1H-indole-2-carboxamide × 2 SCN THIOCYANATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；The protein solution was incubated with DTT (0.22 mM) for 10 min on ice. Compound EDP-235 in DMSO (2.88 mM) was then added and incubated for 3 hrs on ice, then for 20 min at 18 C. Crystals appeared in drop with reservoir conditions: 0.2 M sodium thiocyanate, 20 % w/v PEG3350.
The sample was harvested after 10 days growth and transferred to drop of neat reservoir condition. Cryoprotection was achieved by supplementing this drop with additional PEG400 to a final concentration of 5 % w/v PEG400 in reservoir condition.
The sample was cryocooled by plunging into liquid nitrogen.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.271 |
| 8VEC Deep Mutational Scanning of SARS-CoV-2 PLpro 提交 2023-12-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1563–1878（316 aa）
|
突变：M208W | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；0.1M trisodium citrate pH 5.5, 20% w/v PEG3000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.217 |
| 8VQX Structure of SARS-CoV-2 main protease with potent peptide aldehyde inhibitor 提交 2024-01-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3259–3569（311 aa）
|
未记录 | A1ADM N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-1-(1H-indole-2-carbonyl)-4,4-dimethyl-L-prolinamide × 2 NA SODIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；32% PEG 2K MME,
0.1M bis-tris
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.204 |
| 8VSG SARS-CoV-2 main protease with covalent inhibitor 提交 2024-01-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 A1AD0 (1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-(1-phenylcyclopropane-1-carbonyl)-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.50, 32 % (w/v) PEG 2000 MME
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.233 |
| 8VUO Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp16/nsp10 in complex with Cap-1 RNA 提交 2024-01-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 C
6799–7096（298 aa）
链 D
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 ZN ZINC ION × 4 M7G 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25% (v/v) Ethylene glycol
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.219 |
| 8W1U SARS-CoV-2 Main protease bound to non-covalent lead molecule NZ-804 提交 2024-02-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
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未记录 | A1AFE 11-[1-(1H-pyrrolo[3,2-c]pyridine-7-carbonyl)piperidin-4-ylidene]-6,11-dihydro-5H-5lambda~6~-dibenzo[b,e]thiepine-5,5-dione × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；290 K；0.1 M MES pH 6.8, 0.2 M lithium sulfate, 24% PEG3350
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.288 |
| 8WKE Sulfate-bound SARS-CoV-2 Nsp9 提交 2023-09-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4141–4253（113 aa）
片段：UNP residues 4141-4253
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；2.4M Ammonium sulfate, 80mM, tri-sodium citrate, pH6
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.274 |
| 8WSH Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease, pH=4.0 提交 2023-10-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3563（298 aa）
链 B
3266–3563（298 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1M Sodium acetate trihydrate pH4.0,10%PEG4000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.236 |
| 8WTS SARS-CoV-2 3CLpro bound to covalent inhibitor 提交 2023-10-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | XDQ (2~{R})-2-[[4-[chloranyl-bis(fluoranyl)methoxy]phenyl]-(2-chloranyl-2-fluoranyl-ethanoyl)amino]-~{N}-(oxan-4-yl)-2-pyrimidin-5-yl-propanamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CL CHLORIDE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 8 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.207 |
| 8WZQ Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease V186F mutant in complex with CCF0058981 提交 2023-11-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3568（303 aa）
链 B
3266–3568（303 aa）
|
突变：V186F 突变：V186F | XIU 2-(benzotriazol-1-yl)-~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-~{N}-[4-(1~{H}-imidazol-5-yl)phenyl]ethanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；298 K；0.2M Na2SO4, 20%PEG3350
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.217 |
| 8X1X SARS-CoV-2 Papain like protease (PLpro) in complex with inhibitor Lithocholic acid 提交 2023-11-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
突变：C1674S | 4OA (3beta,5beta,14beta,17alpha)-3-hydroxycholan-24-oic acid × 3 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris-HCl (pH 7.5-9.0), 1.4 M NaH2PO4, 2-15% Glycerol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.284 |
| 8XAB Crystal structure of Ubl1 domain of nonstructural protein 3 of SARS-CoV-2 提交 2023-12-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
836–925（90 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M HEPES sodium, pH 7.5, 1.4 M Sodium citrate tribasic dihydrate
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.234 |
| 8XCH SARS-CoV-2 Replication-Transcription Complex has a dimer-of-dimeric architecture (ddRTC) in pre-capping initiation. 提交 2023-12-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 I
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 J
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 L
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 M
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 N
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 Q
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 R
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 T
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 U
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 V
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 Y
4393–5324（932 aa）
片段：UNP residues 4393-5324
链 Z
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 b
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 c
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
链 d
5325–5925（601 aa）
片段：UNP residues 5325-5925
|
未记录 | ZN ZINC ION × 32 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8XKO CryoEM structure of compound HNC-1664 bound with RdRP-RNA complex of SARS-CoV-2 提交 2023-12-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4139（197 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4139（197 aa）
|
未记录 | A1LVZ [[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-4-fluoranyl-5-(5-iodanyl-4-methyl-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 8XTD SARS-CoV-2 papain-like-protease (PLpro) in complex with inhibitor Linagliptin 提交 2024-01-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
片段：papain-like protease (PLPro)
|
突变：C1674S | 356 8-[(3R)-3-Aminopiperidin-1-yl]-7-but-2-yn-1-yl-3-methyl-1-[(4-methylquinazolin-2-yl)methyl]-3,7-dihydro-1H-purine-2,6-d ione × 1 GOL GLYCEROL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris-HCl (pH 7.5-9.0), 1.4 M NaH2PO4, 2-15% Glycerol
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.288 |
| 8XWR Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro-T21I/L50F double mutant with its peptidyl substrate 提交 2024-01-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：T21I, L50F, C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1 M Na3 citrate pH = 5.0, 18% w/v PEG 20K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.197 |
| 8XWT Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro-L50F mutant with its peptidyl substrate 提交 2024-01-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：L50F, C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.05 M HEPES, pH = 7.0, 1% w/v Tryptone, 1 mM NaN3, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.250 |
| 8Y4D Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease in complex with Bofutrelvir 提交 2024-01-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3561（296 aa）
链 B
3266–3561（296 aa）
|
未记录 | FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES 7.5, 20% PEG 10000
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.260 |
| 8Y4G Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease G15S mutant in complex with Bofutrelvir 提交 2024-01-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3561（296 aa）
链 B
3266–3561（296 aa）
|
突变：G15S 突变：G15S | FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20~24%PEG3350,0.12~0.21M sodium sulfate
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.250 |
| 8Y4H Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease K90R mutant in complex with Bofutrelvir 提交 2024-01-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3566（301 aa）
链 B
3266–3566（301 aa）
|
未记录 | FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.12~0.21M PEG3350,20%~24%Na2SO4
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.218 |
| 8YAX SARS-CoV-2 DMV nsp3-4 pore complex (full-pore) 提交 2024-02-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
819–2763（1945 aa）
链 B
819–2763（1945 aa）
链 C
2764–3263（500 aa）
链 D
2764–3263（500 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；150mM NaCl, 10mM Tris-HCl, 1mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.90 Å |
| 8YB5 SARS-CoV-2 DMV nsp3-4 pore complex (consensus-pore, C6 symmetry) 提交 2024-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
819–2763（1945 aa）
链 B
819–2763（1945 aa）
链 C
2764–3263（500 aa）
链 D
2764–3263（500 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；150mM NaCl, 10mM Tris-HCl, 1mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8YB7 SARS-CoV-2 DMV nsp3-4 pore complex (consensus-pore, C3 symmetry) 提交 2024-02-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 A
819–2763（1945 aa）
链 B
819–2763（1945 aa）
链 C
2764–3263（500 aa）
链 D
2764–3263（500 aa）
链 E
819–2763（1945 aa）
链 F
819–2763（1945 aa）
链 G
2764–3263（500 aa）
链 H
2764–3263（500 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；150mM NaCl, 10mM Tris-HCl, 1mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 8YKO Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease P132H mutant in complex withX77 提交 2024-03-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3563（298 aa）
链 B
3266–3563（298 aa）
|
突变：M132H 突变：M132H | X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BICINE pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol 10,000
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.279 |
| 8YRH Complex of SARS-CoV-2 main protease and Rosmarinic acid 提交 2024-03-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3563（298 aa）
链 B
3266–3563（298 aa）
|
未记录 | ROA (2R)-3-(3,4-dihydroxyphenyl)-2-{[(2E)-3-(3,4-dihydroxyphenyl)prop-2-enoyl]oxy}propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.15 M HEPES sodium (pH 7.5), 10% v/v 2-Propanol, and 20% w/v Polyethylene glycol 4,000.
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.246 |
| 8YWZ Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease H163A mutant in complex with Bofutrelvir 提交 2024-04-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3561（296 aa）
链 B
3266–3561（296 aa）
|
突变：H163A 突变：H163A | FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Na2SO4,24% PEG3350
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.233 |
| 8YX2 Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-P4 提交 2024-04-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1564–1878（315 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 2 A1LZ5 ~{N}-[1-(1,2-dihydroacenaphthylen-5-yl)cyclopropyl]-2-methyl-5-(4-methylpiperazin-1-yl)benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1M HEPES pH7.5, 25% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.256 |
| 8YX2 Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-P4 提交 2024-04-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 2 A1LZ5 ~{N}-[1-(1,2-dihydroacenaphthylen-5-yl)cyclopropyl]-2-methyl-5-(4-methylpiperazin-1-yl)benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1M HEPES pH7.5, 25% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.256 |
| 8YX3 Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-P28 提交 2024-04-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | A1LZ7 ~{N}-[1-(1,2-dihydroacenaphthylen-5-yl)cyclopropyl]-5-[(3~{S})-4-ethyl-3-methyl-piperazin-1-yl]-2-methyl-benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；298 K；0.03 M Citric acid, 0.07 M BIS-TRIS propane)/pH 7.6, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 8YX3 Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-P28 提交 2024-04-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | A1LZ7 ~{N}-[1-(1,2-dihydroacenaphthylen-5-yl)cyclopropyl]-5-[(3~{S})-4-ethyl-3-methyl-piperazin-1-yl]-2-methyl-benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；298 K；0.03 M Citric acid, 0.07 M BIS-TRIS propane)/pH 7.6, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.275 |
| 8YX4 Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-P31 提交 2024-04-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | A1LZ6 2-methyl-~{N}-[1-(1-methyl-2-oxidanylidene-benzo[cd]indol-6-yl)cyclopropyl]-5-[3-(4-methyl-4-oxidanyl-piperidin-1-yl)azetidin-1-yl]benzamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 3 CD CADMIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；5 mM CoCl2.6H2O, 5 mM NiCl2.6H2O, 5 mM CdCl2.H2O, 5 mM MgCl2.6H2O, 0.1 M HEPES pH 7.5, 12% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.233 |
| 8YX5 Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-P35 提交 2024-04-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | A1LZ8 5-[(1~{R},5~{S})-3,6-diazabicyclo[3.1.1]heptan-3-yl]-2-methyl-~{N}-[1-(1-methyl-2-oxidanylidene-benzo[cd]indol-6-yl)cyclopropyl]benzamide × 1 ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；298 K；0.03 M Citric acid, 0.07 M BIS-TRIS propane)/pH 7.6, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.195 |
| 8YX5 Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-P35 提交 2024-04-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | A1LZ8 5-[(1~{R},5~{S})-3,6-diazabicyclo[3.1.1]heptan-3-yl]-2-methyl-~{N}-[1-(1-methyl-2-oxidanylidene-benzo[cd]indol-6-yl)cyclopropyl]benzamide × 1 ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；298 K；0.03 M Citric acid, 0.07 M BIS-TRIS propane)/pH 7.6, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.195 |
| 8ZQ8 SARS-Cov-2 3CL protease in complex with macrocyclic inhibitor CG-1039 提交 2024-06-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1D8T CG-1039 × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M LiCl, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 13%(w/v) polyethylene glycol 8000
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.223 |
| 8ZSE Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-2002 提交 2024-06-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 4 A1L2A 2-methyl-5-(4-methylpiperazin-1-yl)-~{N}-(1-quinolin-4-ylcyclopropyl)benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.05 M Zinc acetate dihydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.257 |
| 8ZSE Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-2002 提交 2024-06-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1564–1878（315 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 4 A1L2A 2-methyl-5-(4-methylpiperazin-1-yl)-~{N}-(1-quinolin-4-ylcyclopropyl)benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.05 M Zinc acetate dihydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.257 |
| 8ZT9 The Crystal structure of mol066 bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 提交 2024-06-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3565（302 aa）
链 B
3264–3565（302 aa）
|
未记录 | A1D87 6-[(6-chloranyl-2-propan-2-yl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]pyrimidine-2,4-dione × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium acetate, 15% (w/v) PEG3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.186 |
| 8ZUB The Crystal structure of mol075 bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 提交 2024-06-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3564（301 aa）
链 B
3264–3564（301 aa）
|
未记录 | A1D80 6-[(6-chloranyl-2-pentyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]pyrimidine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium acetate, 15% (w/v) PEG3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.188 |
| 8ZUC The Crystal structure of mol080 bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 提交 2024-06-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3564（301 aa）
链 B
3264–3564（301 aa）
|
未记录 | A1D81 6-[[6-chloranyl-2-(3-methylbutyl)indazol-5-yl]amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]pyrimidine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium acetate, 15% (w/v) PEG3350
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.193 |
| 9ARQ Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (authentic protein) in complex with an inhibitor TKB-245 提交 2024-02-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | T2L (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(4-fluoro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；28% v/v 2-Propanol, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 3% v/v Polyethylene glycol 200
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.235 |
| 9ARS Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease E166V mutant in complex with an inhibitor TKB-245 提交 2024-02-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：E166V 突变：E166V | T2L (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(4-fluoro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 14 % w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.222 |
| 9ART Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease A191T mutant in complex with an inhibitor 5h 提交 2024-02-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 D
3264–3568（305 aa）
|
突变：A191T 突变：A191T | V7G N-[(2S)-1-({(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 12 % w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.231 |
| 9ASV Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a benzyl 2-pyrrolidone inhibitor 提交 2024-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
|
未记录 | A1AGE (1R,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-benzyl-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 A1AGF (1S,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-benzyl-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.5, 200 mM sodium fluoride
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.223 |
| 9ASW Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a m-fluorobenzyl 2-pyrrolidone inhibitor 提交 2024-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
|
未记录 | A1AGB (1R,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(3-fluorophenyl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 A1AGA (1S,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(3-fluorophenyl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；12% w/v PEG8000, 100 mM sodium cacodylate, pH 5.5, 100 mM calcium acetate
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.215 |
| 9ASY Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a m-chlorobenzyl 2-pyrrolidone inhibitor 提交 2024-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
|
未记录 | A1AGI (1R,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(3-chlorophenyl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 A1AGJ (1S,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(3-chlorophenyl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；15% v/v PEG400, 100 mM MES, pH 6.0, 100 mM calcium acetate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.219 |
| 9ASZ Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a phenylethyl 2-pyrrolidone inhibitor 提交 2024-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
|
未记录 | A1AGG (1S,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[(2S)-5-oxo-1-(2-phenylethyl)pyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；25% w/v PEG1500, 100 mM MMT, pH 7.0
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.239 |
| 9AT0 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a methylcyclohexyl 2-pyrrolidone inhibitor (S-enantiomer) 提交 2024-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
|
未记录 | A1AGX (1S,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-(cyclohexylmethyl)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 A1AGW (1R,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-(cyclohexylmethyl)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 MLT D-MALATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；25% w/v PEG1500, 100 mM MMT, pH 7.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.229 |
| 9AT1 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a methylcyclohexyl 2-pyrrolidone inhibitor (R-enantiomer) 提交 2024-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
|
未记录 | A1AGZ (1S,2S)-2-{[N-({[(2R)-1-(cyclohexylmethyl)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.0, 200 mM sodium formate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.221 |
| 9AT3 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with an ethylcyclohexyl 2-pyrrolidone inhibitor 提交 2024-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
|
未记录 | A1AGK (1R,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-(2-cyclohexylethyl)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 A1AGL (1S,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-(2-cyclohexylethyl)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；30% w/v PEG550 MME, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, 50 mM calcium chloride
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.212 |
| 9AT4 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a methylbicyclo[2.2.1]heptane 2-pyrrolidone inhibitor 提交 2024-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
|
未记录 | A1AGN (1S,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-{[(1S,2S,4R)-bicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]methyl}-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 A1AGM (1R,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-{[(1S,2S,4R)-bicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]methyl}-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.0, 200 mM sodium formate
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.172 |
| 9AT5 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a 1-methyl-4,4-difluorocyclohexyl 2-pyrrolidone inhibitor 提交 2024-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
|
未记录 | A1AGO (1R,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(4,4-difluorocyclohexyl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 A1AGP (1S,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(4,4-difluorocyclohexyl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.5, 200 mM sodium fluoride
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.183 |
| 9AT6 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a methylbicyclo[2.2.1]heptene 2-pyrrolidone inhibitor 提交 2024-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
|
未记录 | A1AGQ (1R,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-{[(1R,2S,4R)-bicyclo[2.2.1]hept-5-en-2-yl]methyl}-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 A1AGR (1S,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-{[(1R,2S,4R)-bicyclo[2.2.1]hept-5-en-2-yl]methyl}-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.0, 20 mM sodium potassium phosphate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.170 |
| 9AT7 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a 2,2-difluoro-5-methylbenzo[1,3]dioxole 2-pyrrolidone inhibitor 提交 2024-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567（304 aa）
片段：UNP residues 3264-3567
|
未记录 | A1AGS (1R,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(2,2-difluoro-2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 A1AGT (1S,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(2,2-difluoro-2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；25% w/v PEG1500, 100 mM SPG, pH 6.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.224 |
| 9AUJ Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant (S144A) in complex with Nirmatrelvir (PF-07321332) 提交 2024-02-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：S144A | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；294 K；0.1 M imidazole (pH 7.0), 20 % PEG 6000
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.219 |
| 9AUK Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant (A173V) in complex with Nirmatrelvir (PF-07321332) 提交 2024-02-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：A173V 突变：A173V | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；294 K；0.2 M NaCl, 0.1 M HEPES, pH 7, 20 % PEG 6000
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.253 |
| 9AUL Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant (A173V,T304I)) in complex with Nirmatrelvir (PF-07321332) 提交 2024-02-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：A173V,T304I | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；294 K；5 % MPD, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 10 % PEG 10000
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.277 |
| 9AUM Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant (T21I,S144A,T304I) in complex with Nirmatrelvir (PF-07321332) 提交 2024-02-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：T21I,S144A,T304I | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；294 K；0.1 M Tris, pH 8, 20 % 2-propanol, 5 % PEG8000
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.229 |
| 9AUN Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant (T21I,T304I) 提交 2024-02-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：T21I,T304I 突变：T21I,T304I | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；294 K；0.1 M MES, pH 6, 13.2 % PEG 4000
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.291 |
| 9AUO Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant (L50F,T304I) 提交 2024-02-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：L50F,T304I 突变：L50F,T304I | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；294 K；0.1 M MES, pH 5.6, 13 % PEG 4000
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.315 |
| 9AVQ Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease A191T mutant in complex with an inhibitor Nirmatrelvir 提交 2024-03-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：A191T | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；3% DMSO or 0.1 M MES pH 6.8, 15% PEG 6000
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.244 |
| 9AZX Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) Nsp3 macrodomain in complex with NDPr 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain (UNP residues 1024-1192)
|
未记录 | A1AH3 {(2R,3S,4R,5R)-5-[(8S)-4-aminopyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl]-5-cyano-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl}methyl [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-trihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris-HCl, pH 8, 200 mM sodium acetate, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.184 |
| 9AZX Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) Nsp3 macrodomain in complex with NDPr 提交 2024-03-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain (UNP residues 1024-1192)
|
未记录 | A1AH3 {(2R,3S,4R,5R)-5-[(8S)-4-aminopyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl]-5-cyano-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl}methyl [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-trihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris-HCl, pH 8, 200 mM sodium acetate, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.184 |
| 9AZX Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) Nsp3 macrodomain in complex with NDPr 提交 2024-03-11 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain (UNP residues 1024-1192)
|
未记录 | A1AH3 {(2R,3S,4R,5R)-5-[(8S)-4-aminopyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl]-5-cyano-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl}methyl [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-trihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris-HCl, pH 8, 200 mM sodium acetate, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.184 |
| 9BBQ SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6c inhibitor 提交 2024-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
未记录 | A1ALF N-[(2R)-1-({(2S)-1-amino-3-[(2S,3R)-2-hydroxypyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4'-ethoxy[1,1'-biphenyl]-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291.15 K；0.2 M Potassium chloride, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.232 |
| 9BBR SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6b inhibitor 提交 2024-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ALL 4'-fluoro-N-[(2S)-1-({(2R)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl][1,1'-biphenyl]-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291.15 K；1% w/v Tryptone, 0.001 M Sodium azide, 0.05 M HEPES sodium pH 7.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.209 |
| 9BBS SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6d inhibitor 提交 2024-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ALG N-[(2S)-1-({(2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4'-methoxy[1,1'-biphenyl]-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291.15 K；0.1 M MOPSO/bis-tris, 15%(w/v) PEG 3K, 20%(v/v) 1,2,4-butanetriol, 1%(w/v) NDSB 256 0.5 mM of each Oxometalate
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.224 |
| 9BBT SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6f inhibitor 提交 2024-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ALH N-[(2S)-1-({(2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-3',4'-dimethoxy[1,1'-biphenyl]-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291.15 K；5%(w/v) PEG 20K, 25%(w/v) 1,1,1-tris(hydroxymethyl)propane, 1%(w/v) NDSB 195 0.01 M of each Polyamine 0.1 M GlyGly/AMPD
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.234 |
| 9BBU SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6h inhibitor 提交 2024-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ALK N~2~-[4-(5-chloropyridin-3-yl)benzoyl]-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291.15 K；15%(w/v) PEG 3K, 20%(v/v) 1,2,4-butanetriol, 1%(w/v) NDSB 256 0.02 M of each Monosaccharide II 0.1 M MOPSO/bis-tris
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 9BBV SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6j inhibitor 提交 2024-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ALD N-{(1E,2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-N~2~-[4-(2-methyl-2H-indazol-4-yl)benzoyl]-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291.15 K；12.5%(w/v) PEG 4K, 20%(v/v) 1,2,6-hexanetriol 0.01 M of each Polyamine 0.1 M BES/TEA
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.258 |
| 9BBW SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6k inhibitor 提交 2024-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ALM N-{(2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-N~2~-[4-(6-methoxypyridin-3-yl)benzoyl]-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291.15 K；0.2 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.231 |
| 9BBX SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6l inhibitor 提交 2024-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ALN N-{(2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-N~2~-[4-(1-methyl-1H-indazol-5-yl)benzoyl]-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291.15 K；0.05 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M HEPES, 30% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.194 |
| 9BBY SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 18b inhibitor 提交 2024-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ALU 3-fluoro-N-[(2S)-1-({(2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4'-methoxy[1,1'-biphenyl]-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；15%(w/v) PEG 3K, 20%(v/v) 1,2,4-butanetriol, 1%(w/v) NDSB 256, 0.5 mM of each Oxometalate, 0.1 M BES/TEA
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.255 |
| 9BBZ SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 18d inhibitor 提交 2024-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ALV N~2~-[(4M)-2-fluoro-4-(1-methyl-1H-indazol-5-yl)benzene-1-carbonyl]-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；15%(w/v) PEG 3K, 20%(v/v) 1,2,4-butanetriol, 1%(w/v) NDSB 256, 0.5 mM of each Divalent cation II
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.218 |
| 9BC0 SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 18r inhibitor 提交 2024-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ALX 3-chloro-N-[(2R)-1-({(1Z,2S)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4'-methoxy[1,1'-biphenyl]-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291.15 K；12.5%(w/v) PEG 4K, 20%(v/v) 1,2,6-hexanetriol, 0.5 mM of each Oxometalate, 0.1 M GlyGly/AMPD
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.271 |
| 9BC1 SARS-CoV-2 Mpro in complex with peptide mimetic inhibitor 提交 2024-04-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291.15 K；15%(w/v) PEG 3K, 20%(v/v) 1,2,4-butanetriol, 1%(w/v) NDSB 256, 0.5 mM of each Divalent cation II, 0.1 M MOPSO/bis-tris
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.200 |
| 9BF7 SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) C111S Untagged Crystal Structure 提交 2024-04-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 4 ACT ACETATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277.15 K；Monosodium phosphate, dipotassium phosphate, tris-HCl, sucrose
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.196 |
| 9BIH SARS-CoV-2 endoribonuclease Nsp15 bound to dsRNA with 1 nucleotide bulge 提交 2024-04-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
链 D
6453–6798（346 aa）
链 E
6453–6798（346 aa）
链 F
6453–6798（346 aa）
|
突变：H235A 突变：H235A 突变：H235A 突变：H235A 突变：H235A 突变：H235A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.24 Å |
| 9BLF SARS-CoV-2 core polymerase complex inhibited by araCTP 提交 2024-04-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4391–5324（934 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 HF4 4-amino-1-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-arabinofuranosyl}pyrimidin-2(1H)-one × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 9BNU Crystal Structure of T190I SARS-CoV-2 Main Protease 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；0.1 M BIS-TRIS, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 5,000
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.231 |
| 9BNV Crystal Structure of A173V SARS-CoV-2 Main Protease 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294 K；0.1 M Imidazole, 20% w/v Polyethylene glycol 6,000
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.255 |
| 9BNW Crystal Structure of A173V/L50F SARS-CoV-2 Main Protease 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：A173V,L50F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；0.1 M HEPES, 30% w/v Polyethylene glycol 1,000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.201 |
| 9BNX Crystal Structure of L50F SARS-CoV-2 Main Protease 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；294 K；0.1 M MES monohydrate, 14% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.290 |
| 9BNY Crystal Structure of E166V/L50F SARS-CoV-2 Main Protease 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：E166V,L50F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；0.1 M BIS-TRIS, 20% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.270 |
| 9BNZ Crystal Structure of E166V SARS-CoV-2 Main Protease 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；294 K；4% v/v 2-Propanol, 0.1 M BIS-TRIS propane, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 5,000
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.252 |
| 9BO1 Crystal Structure of T190I SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Compound Mpro61 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XEK (5P)-5-[(1P,3M,3'P)-3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]-1-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；0.1 M BIS-TRIS, 20% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.247 |
| 9BO2 Crystal Structure of A173V/L50F SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Compound Mpro61 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XEK (5P)-5-[(1P,3M,3'P)-3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]-1-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；0.2 M L-Proline, 0.1 M HEPES, 24% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.244 |
| 9BO3 Crystal Structure of E166V SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Compound Mpro61 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | XEK (5P)-5-[(1P,3M,3'P)-3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]-1-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；10% v/v 2-Propanol, 0.1 M BICINE, 30% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.287 |
| 9BO5 Crystal Structure of T190I SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Nirmatrelvir 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；294 K；10% v/v Polyethylene glycol 200, 0.1 M BIS-TRIS propane, 18% w/v Polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.222 |
| 9BO6 Crystal Structure of A173V/L50F SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Nirmatrelvir 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：A173V,L50F | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；294 K；0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.0, 10% v/v Jeffamine M-600 pH 7.0
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.223 |
| 9BO7 Crystal Structure of L50F SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Nirmatrelvir 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；294 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 20% v/v Jeffamine M-600 pH 7.0
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.224 |
| 9BO9 Crystal Structure of T190I SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with GC376 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294 K；0.1 M Imidazole, 12% w/v Polyethylene glycol 20,000
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.239 |
| 9BOA Crystal Structure of A173V SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with GC376 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；294 K；10% v/v Polyethylene glycol 200, 0.1 M BIS-TRIS propane, 18% w/v Polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.240 |
| 9BOB Crystal Structure of A173V/L50F SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with GC376 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；294 K；4% v/v (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol, 0.1 M Citric acid, 20% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.239 |
| 9BOC Crystal Structure of L50F SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with GC376 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；0.1 M BICINE, 15% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.208 |
| 9BOD Crystal Structure of E166V/L50F SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with GC376 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；0.1 M BICINE, 15% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.241 |
| 9BOE Crystal Structure of E166V SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with GC376 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；294 K；10% v/v 2-Propanol, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate, 26% v/v Polyethylene glycol 400
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.230 |
| 9BPF Crystal structure of main protease of SARS-CoV-2 complexed with inhibitor 提交 2024-05-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | YDL N-(methoxycarbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-(trifluoromethyl)-L-prolinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.22 M NH4Cl, 0.1 M HEPES, 22% PEG6,000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.278 |
| 9BQF Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor 78 提交 2024-05-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | NOL N-[(BENZYLOXY)CARBONYL]-O-(TERT-BUTYL)-L-THREONYL-3-CYCLOHEXYL-N-[(1S)-2-HYDROXY-1-{[(3S)-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL]METHYL}ETHYL]-L-ALANINAMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.273 |
| 9BQG Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor k68 提交 2024-05-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AQ3 benzyl (2S,4S)-4-tert-butoxy-2-({(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)pyrrolidine-1-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.275 |
| 9BQL Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-A-32 提交 2024-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ARG O-tert-butyl-N-[(cyclopropylmethoxy)carbonyl]-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.274 |
| 9BQM Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-A-26 提交 2024-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ARI O-tert-butyl-N-{[(propan-2-yl)oxy]carbonyl}-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.258 |
| 9BQN Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-A-28 提交 2024-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ARK O-tert-butyl-N-[(2,2,2-trifluoroethoxy)carbonyl]-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.292 |
| 9BQO Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor k88 提交 2024-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ARM N-[(benzyloxy)carbonyl]-O-tert-butyl-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.297 |
| 9BQP Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor R79 提交 2024-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ARN propan-2-yl {(2R)-1-[(1R,2S,5R)-2-({(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexan-3-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.263 |
| 9BQQ Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor R81 提交 2024-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ARH N-[(benzyloxy)carbonyl]-O-tert-butyl-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2R)-3-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.254 |
| 9BQT Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor R80 提交 2024-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ARS N-[(benzyloxy)carbonyl]-O-tert-butyl-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2R)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.231 |
| 9BQY Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor R70 提交 2024-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ART (1R,2S,5R)-3-[N-(3,3-dimethylbutanoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(1E,2R)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.306 |
| 9BQZ Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor x11 提交 2024-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ARV (1H-indol-4-yl)methanol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.263 |
| 9BR0 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor YR-B-84 提交 2024-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ARU O-tert-butyl-N-(trifluoroacetyl)-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2R)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.278 |
| 9BR1 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-A-70 提交 2024-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ARR N-[(benzyloxy)carbonyl]-O-tert-butyl-L-threonyl-N-{(1S,2R)-1-(1,3-benzoxazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-3-cyclohexyl-L-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.257 |
| 9BRV SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) with Fragment 5 提交 2024-05-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1563–1879（317 aa）
|
突变：C270S | A1ASK N-[2-(dimethylamino)ethyl]-N'-(3-methylphenyl)thiourea × 2 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2M magnesium formate, 15-25%PEG3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.226 |
| 9BRV SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) with Fragment 5 提交 2024-05-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1563–1879（317 aa）
|
突变：C270S | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2M magnesium formate, 15-25%PEG3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.226 |
| 9BS7 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor Vinylpyridine 提交 2024-05-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AR3 3-ethenylpyridine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.285 |
| 9BS8 Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor YR-B-107 提交 2024-05-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AR4 benzyl (7S)-7-({(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-6-azaspiro[3.4]octane-6-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.225 |
| 9BSA Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-B-112 提交 2024-05-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AR5 2,2-dichloro-N-(5-chloropyridin-3-yl)-N-phenylacetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.251 |
| 9BSE Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor YR-B-165 提交 2024-05-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AR6 (3S)-N-{(2S)-1-amino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[(2R)-3,3-dimethyl-2-(2,2,2-trifluoroacetamido)butanoyl]-2-azaspiro[4.5]decane-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.239 |
| 9BSF Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor SR-A-171 提交 2024-05-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AR7 N-(4-tert-butylphenyl)-2,2-dichloro-N-(5-chloropyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.238 |
| 9BSG Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-C-20 提交 2024-05-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AR8 methyl 4-[(5-chloropyridin-3-yl)(phenyl)amino]-4-oxobutanoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.254 |
| 9BSI Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor SR-B-7 提交 2024-05-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AR9 N-[(1M)-3'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl]-N-(5-chloropyridin-3-yl)-2-fluoroacetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.248 |
| 9BSO Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor SR-B-13 提交 2024-05-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ARW N-[(1M)-3'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl]-N-(5-chloropyridin-3-yl)-3-sulfanylpropanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.270 |
| 9BSP Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-C-68 提交 2024-05-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ARX methyl 4-{[(1M)-3'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl](5-chloropyridin-3-yl)amino}-4-oxobutanoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.235 |
| 9BSQ Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-C-70 提交 2024-05-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ARY (2R)-N-[(1M)-3'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl]-N-(5-chloropyridin-3-yl)-2-hydroxy-2-sulfanylacetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.248 |
| 9BSR Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor YR-B-136B 提交 2024-05-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ASA (1R,2S,5R)-N-[(1R)-1-(7-fluoroisoquinolin-4-yl)-2-iminoethyl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.252 |
| 9BST Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor CID8009_5647 提交 2024-05-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A5Z [3-[2,6-bis(chloranyl)phenyl]-5-methyl-1,2-oxazol-4-yl]methanol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.297 |
| 9BTE Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor CID5573_0017 提交 2024-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ASF 4-[5-[4-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-1,2,5-oxadiazol-3-yl]-1~{H}-1,2,4-triazol-3-yl]-1,2,5-oxadiazole-3-thiol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.265 |
| 9BTF Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor SR-B-77 提交 2024-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ASH (1R,2S,5S)-N-[(1R)-1-(5-fluoropyridin-3-yl)-2-iminoethyl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.224 |
| 9BTK Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor YR-C-108T 提交 2024-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ASG (1R,2S,5R)-N-[(1R)-2-imino-1-(isoquinolin-4-yl)ethyl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-D-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.249 |
| 9BTR Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor YR-C-163 提交 2024-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ASI 2-chloro-N-[(3P)-3-(5-chloro-2-methyl-2H-indazol-7-yl)phenyl]-N-(5-chloropyridin-3-yl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.247 |
| 9BTT Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor SR-B-51T 提交 2024-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ASJ (1R,2S,5S)-N-[(1R)-1-(5-chloropyridin-3-yl)-2-iminoethyl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.234 |
| 9BVW SARS-CoV-2 main protease bound to inhibitor SR-B-103 提交 2024-05-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AS2 (1R,2S,5R)-N-[(1R)-1-(8-fluoroisoquinolin-4-yl)-2-iminoethyl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-D-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.260 |
| 9BVX SARS-CoV-2 main protease bound to inhibitor YR-C-155 提交 2024-05-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AS3 (1R,2S,5R)-N-[(1R)-1-(5-fluoroisoquinolin-4-yl)-2-iminoethyl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.208 |
| 9BVZ SARS-CoV-2 main protease bound to inhibitor AR-A-135 提交 2024-05-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AS4 [2-(iminomethyl)pyridin-3-yl]boronic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.321 |
| 9C80 Co-structure of SARS-CoV-2 (COVID-19 with covalent inhibitor 提交 2024-06-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AUX (5R,7S,8R)-7-(2-fluorophenyl)-3-[(2-fluorophenyl)carbamoyl]-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；25% Peg 1500, 0.1M MIB pH 7.0
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.265 |
| 9C8Q Co-structure of Main Protease of SARS-CoV-2 (COVID-19) with covalent inhibitor 提交 2024-06-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AU4 (7P,8S)-3-cyclohexyl-7-(3-methylpyridin-2-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；25% Peg 1500, 0.1M MIB pH 7.0
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.230 |
| 9CDK SARS-CoV-2 Mpro A173V mutant in complex with small molecule inhibitor Mpro61 提交 2024-06-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：A173V | XEK (5P)-5-[(1P,3M,3'P)-3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]-1-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；290 K；1% w/v Tryptone, 0.001 M Sodium azide, 0.05 M HEPES sodium pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.224 |
| 9CDL SARS-CoV-2 Mpro E166V/L50F double mutant in complex with small molecule inhibitor Mpro61 提交 2024-06-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：E166V, L50F | XEK (5P)-5-[(1P,3M,3'P)-3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]-1-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；290 K；0.1 M MES pH 6.0-6.5, 10% 2-propanol, 15-20% PEG3350
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.211 |
| 9CDM SARS-CoV-2 Mpro L50F mutant in complex with small molecule inhibitor Mpro61 提交 2024-06-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：L50F | XEK (5P)-5-[(1P,3M,3'P)-3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]-1-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；290 K；0.2 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1 M Imidazole pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.237 |
| 9CEC SARS-CoV-2 3CL Protease complexed with covalent inhibitor BC671 提交 2024-06-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AV3 N-[(2S)-1-{[(2S)-1-hydroxy-3-(2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)propan-2-yl]amino}-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100mM sodium potassium tartrate, 10% PEG 3350
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.258 |
| 9CED SARS-CoV-2 3CL Protease complexed with covalent inhibitor VK13 提交 2024-06-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AV7 N-[(2S)-1-{[(2S)-1-hydroxy-3-(2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)propan-2-yl]amino}-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100mM sodium potassium tartrate, 10% PEG 3350
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.277 |
| 9CEK SARS-CoV-2 3CL Protease complexed with covalent inhibitor VK20 提交 2024-06-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 NA SODIUM ION × 1 A1AV5 N-[(2S)-1-{[(2S)-1-hydroxy-3-(1,3-oxazol-4-yl)propan-2-yl]amino}-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 A1AV6 N-[(2S)-1-amino-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM sodium potassium tartrate, 10% PEG 3350
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.178 |
| 9CF9 SARS-CoV-2 3CL Protease complexed with covalent inhibitor BC787 提交 2024-06-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AWA N-[(2S)-1-{[(2S)-1-hydroxy-3-(pyridin-3-yl)propan-2-yl]amino}-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM sodium potassium tartrate, 10% PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.266 |
| 9CFB SARS-CoV-2 3CL Protease complexed with covalent inhibitor BC674 提交 2024-06-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1AWB N-[(2S)-3-cyclohexyl-1-{[(2S)-1-hydroxy-3-(2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)propan-2-yl]amino}-1-oxopropan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM sodium potassium tartrate, 10% PEG 3350
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.203 |
| 9CGV SARS-CoV-2 nsp12 NiRAN domain bound to a covalent inhibitor SW090466-1 提交 2024-07-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4392–5324（933 aa）
片段：UNP residues 4392-5324, fused to 6xHis-TEV
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942（83 aa）
片段：UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP residues 3943-4140
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1AWQ methyl (8S)-7-hydroxy-5-methylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxylate × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 9CJO X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease quadruple mutants 提交 2024-07-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：T21I, L50F, S144A, E166V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；J313: 0.1 M succinic acid, pH 7.0, 15% w/v PEG3350
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.273 |
| 9CJP X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease quadruple mutants in complex with Nirmatrelvir 提交 2024-07-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：T21I, L50F, S144A, E166V 突变：T21I, L50F, S144A, E166V | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 BR BROMIDE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；J309: 0.1 M Buffer System 3, pH 8.5, 0.09M NPS, 50% v/v Precipitant Mix 4, MD Morpheus MD1-47
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.226 |
| 9CJQ X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease quadruple mutants in complex with Ensitrelvir 提交 2024-07-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3570（307 aa）
片段：UNP residues 3264-3570
链 B
3264–3570（307 aa）
片段：UNP residues 3264-3570
|
突变：T21I, L50F, S144A, E166V 突变：T21I, L50F, S144A, E166V | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Data were collected for crystals of robot tray J000317: 0.05 M HEPES sodium, pH 7.0, 1% w/v Tryptone, 12% w/v PEG
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.258 |
| 9CJQ X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease quadruple mutants in complex with Ensitrelvir 提交 2024-07-07 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3570（307 aa）
片段：UNP residues 3264-3570
链 D
3264–3570（307 aa）
片段：UNP residues 3264-3570
|
突变：T21I, L50F, S144A, E166V 突变：T21I, L50F, S144A, E166V | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Data were collected for crystals of robot tray J000317: 0.05 M HEPES sodium, pH 7.0, 1% w/v Tryptone, 12% w/v PEG
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.258 |
| 9CJR X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease double mutants in complex with Ensitrelvir 提交 2024-07-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
链 B
3264–3567（304 aa）
|
突变：L50F, E166V 突变：L50F, E166V | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；Crystal data were collected from crystals from robot tray J000572, B8_10 (MD Morpheus MD1-47): 0.1 M Buffer System 2, pH 7.5, 0.09 M halogens, 50% v/v Precipitant Mix 4
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.215 |
| 9CJS X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease triple mutants in complex with Bofutrelvir 提交 2024-07-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
|
突变：T21I, L50F, E166V | FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；J000582,D04_00, MD ECO PACT premiet HT96 Eco: 0.1 M MMT, pH 7.0, 25% w/v PEG1500
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.278 |
| 9CJT X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease quadruple mutants in complex with Bofutrelvir 提交 2024-07-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：T21I, L50F, S144A, E166V | FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；J582,D03_10: 0.1 M MMT, pH 6.0, 25% w/v PEG1500
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.278 |
| 9CJU Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Bofutrelvir in orthorhombic form 提交 2024-07-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；J000854 E10_10: 0.12 M ethylene glycols, 0.1 M Buffer System 3, pH 8.5, 30% v/v Precipitant Mix 2
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.210 |
| 9CJV X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease complex with Bofutrelvir 提交 2024-07-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3566（303 aa）
|
未记录 | FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；J852 F07_10: 0.1 M Bis-Tris propane, pH 9.0, 25% w/v PEG1500, 0.1 M sodium chloride
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.247 |
| 9CMJ Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease drug resistant mutant (L50F, E166V) 提交 2024-07-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；16-18 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0 with microseeding
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.236 |
| 9CMN Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease drug resistant mutant (E166A, L167F) 提交 2024-07-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；16-18 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0 with microseeding
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.242 |
| 9CMS Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease drug resistant mutant (E166V) in complex with ensitrelvir (ESV) 提交 2024-07-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；16-18 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0 with microseeding
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.195 |
| 9CMU Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease drug resistant mutant (L50F, E166V) in complex with ensitrelvir (ESV) 提交 2024-07-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；287 K；16-18 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0 with microseeding
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.202 |
| 9CXY Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-1500 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | A1A5Z N-ethyl-N'-{4-[(2-oxopyrrolidin-1-yl)amino]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-8-yl}urea × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.161 |
| 9CXY Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-1500 提交 2024-08-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.161 |
| 9CXZ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-1501 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | A1A54 N-{4-[(2-oxopyrrolidin-1-yl)amino]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-8-yl}acetamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.160 |
| 9CXZ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-1501 提交 2024-08-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.160 |
| 9CY0 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-4206 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | A1A55 N-{4-[(2,2-dimethyl-5-oxopyrrolidin-1-yl)amino]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-8-yl}-N'-ethylurea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；200 mM lithium acetate, 20% PEG 3350
|
分辨率 0.80 Å R-free 0.185 |
| 9CY0 Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-4206 提交 2024-08-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | A1A55 N-{4-[(2,2-dimethyl-5-oxopyrrolidin-1-yl)amino]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-8-yl}-N'-ethylurea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；200 mM lithium acetate, 20% PEG 3350
|
分辨率 0.80 Å R-free 0.185 |
| 9D08 Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with covalent dipeptidyl inhibitor CIP-1 提交 2024-08-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | A1A09 N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；19% PEG Smear Medium, 0.1 M MES; pH 6.5, 0.1 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.216 |
| 9D2K SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) complex with covalent inhibitor Jun13567 提交 2024-08-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | A1A6J 2-(3-{2-[4-(3,3-dimethylazetidin-1-yl)-4-oxobutanoyl]hydrazin-1-yl}-3-oxopropyl)-N-{(1R)-1-[(3P,5P)-3-(1-ethyl-1H-pyrazol-3-yl)-5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)phenyl]ethyl}benzamide × 1 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 ZN ZINC ION × 5 CL CHLORIDE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, 10% PEG 8000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 9D2K SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) complex with covalent inhibitor Jun13567 提交 2024-08-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | A1A6J 2-(3-{2-[4-(3,3-dimethylazetidin-1-yl)-4-oxobutanoyl]hydrazin-1-yl}-3-oxopropyl)-N-{(1R)-1-[(3P,5P)-3-(1-ethyl-1H-pyrazol-3-yl)-5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)phenyl]ethyl}benzamide × 1 ZN ZINC ION × 5 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, 10% PEG 8000
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 9D6B Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-607 提交 2024-08-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | A1A17 2-[(2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]propan-2-ol × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.167 |
| 9D6B Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-607 提交 2024-08-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.167 |
| 9D6G Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-3716 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1A2F [(2R,3S)-3-methyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.142 |
| 9D6G Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-3716 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.142 |
| 9D6H Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-1504 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | A1AJW (2R)-3-methyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.150 |
| 9D6H Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-1504 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.150 |
| 9D6I Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-4317 提交 2024-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | A1A2G (3R)-3-hydroxy-3-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}-1lambda~6~-thiane-1,1-dione × 1 CL CHLORIDE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.138 |
| 9D6I Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-4317 提交 2024-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1025–1191（167 aa）
片段：macrodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；292 K；100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.138 |
| 9DDF SARS-CoV-2 main protease with inhibitor 提交 2024-08-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1A3N N-{(3S,4S)-1-[(4S)-imidazo[1,5-a]pyridine-8-carbonyl]-4-phenylpiperidin-3-yl}-1H-pyrrole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M bis-tris pH 6.5, 32% (w/v) polyethylene glycol 2000 monomethyl ether
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.251 |
| 9DDG SARS-CoV-2 main protease with inhibitor 提交 2024-08-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1A3O [(4R)-imidazo[1,5-a]pyridin-8-yl]{4-[(1M)-3'-nitro[1,1'-biphenyl]-2-yl]piperazin-1-yl}methanone × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M bis-tris pH 6.5, 32% (w/v) polyethylene glycol 2000 monomethyl ether
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.220 |
| 9DIW Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with covalent tripeptidyl inhibitor NIP-22c 提交 2024-09-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；19% PEG 4000, 0.1 M MES pH 6.5, 0.3 M dimethylethylammoniumpropane sulfonate (NDSB-195)
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.278 |
| 9DJ8 RNA-nsp9 bound to the NiRAN domain of the E-RTC with an empty G-pocket 提交 2024-09-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 G
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.58 Å |
| 9DNU SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) with inhibitor Jun13296 提交 2024-09-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | A1BEG 2-methyl-5-[(1R,5S)-8-methyl-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-N-{(1R)-1-[(2P)-2-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)quinolin-4-yl]ethyl}benzamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 ZN ZINC ION × 8 CL CHLORIDE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, and 6-20% PEG 8000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.212 |
| 9DNV SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) with inhibitor Jun13308 提交 2024-09-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | A1BEH 2-methyl-5-[(1R,4S)-5-methyl-2,5-diazabicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]-N-{(1R)-1-[(2P)-2-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)quinolin-4-yl]ethyl}benzamide × 1 ACY ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, and 6-20% PEG 8000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.227 |
| 9DO1 SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) with inhibitor Jun13307 提交 2024-09-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | A1BF2 2-methyl-N-{(1R)-1-[(2M)-2-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)quinolin-4-yl]ethyl}-5-{[(2R)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}benzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ZN ZINC ION × 6 CL CHLORIDE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；277 K；200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, and 6-20% PEG 8000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.238 |
| 9DO3 SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) with inhibitor Jun13317 提交 2024-09-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | A1BEF 5-[(3S)-3,4-dimethylpiperazin-1-yl]-2-methyl-N-{(1R)-1-[(2M)-2-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)quinolin-4-yl]ethyl}benzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZN ZINC ION × 7 CL CHLORIDE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；277 K；200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, and 6-20% PEG 8000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.233 |
| 9DO5 SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) with inhibitor Jun12665 提交 2024-09-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | A1BEE 5-[2-(dimethylamino)ethoxy]-N-{(1R)-1-[(2P)-2-{1-[2-(dimethylamino)-2-oxoethyl]-1H-pyrazol-4-yl}quinolin-4-yl]ethyl}-2-methylbenzamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 ZN ZINC ION × 8 CL CHLORIDE ION × 6 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；277 K；200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, and 6-20% PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.271 |
| 9DOI SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) with inhibitor Jun13306 提交 2024-09-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | A1BEL 2-methyl-N-{(1S)-1-[(2P)-2-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)quinolin-4-yl]ethyl}-5-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}benzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ACT ACETATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；277 K；200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, and 6-20% PEG 8000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.244 |
| 9DTZ SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 5 提交 2024-10-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1BCZ N-[(2S)-3-cyclopropyl-1-({(2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；20% PEG 6000, 0.1M MES pH 6.0, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.235 |
| 9DU2 SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 7 提交 2024-10-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1BCY N-[(2S)-3-cyclopropyl-1-{[(1Z,2S)-1-imino-4-(methanesulfonyl)butan-2-yl]amino}-1-oxopropan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；20% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris Propane pH 6.5, 0.2M Sodium Acetate
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.206 |
| 9DU3 SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 1 提交 2024-10-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1BCX N-[(2S)-3-cyclopropyl-1-({(2R)-1-hydroxy-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；20% PEG 3350, 0.2M Ammonium Tartrate Dibasic
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.244 |
| 9DU4 SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 3 提交 2024-10-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1BCW N-[(2S)-3-cyclopropyl-1-{[(2R)-1-hydroxy-4-(methanesulfonyl)butan-2-yl]amino}-1-oxopropan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；20% PEG 3350, 0.2M Lithium Nitrate
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.242 |
| 9DW6 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) C145A mutant in complex with peptide from human tRNA methyltransferase TRMT1 提交 2024-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；20-21.5% PEG3350, 100 mM sodium chloride, diffraction-quality crystals obtained from seeding
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.218 |
| 9E7B X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease V186G covalently bound to compound GRL-051-22 at 1.3 A 提交 2024-11-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：V186G | A1BFE (3S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.164 |
| 9E7S X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease covalently bound to compound GRL-051-22 at 1.75 A. 提交 2024-11-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1BFE (3S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.219 |
| 9E8R X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease T190I covalently bound to compound GRL-051-22 at 1.5 A 提交 2024-11-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：T190I | A1BFE (3S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.165 |
| 9E9P Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with covalent inhibitor A02 提交 2024-11-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1BGG 1-[(1M)-1-(3-methoxyphenyl)-2,5-dimethyl-1H-pyrrol-3-yl]ethan-1-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；26% PEG 6000, 0.1 M HEPES pH 7.5, 1 mM inhibitor
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.211 |
| 9E9W Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease M49I mutant in complex with S217622 提交 2024-11-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3564（299 aa）
链 B
3266–3564（299 aa）
|
突变：M49I 突变：M49I | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20~24%PEG3350, 0.12~0.21M sodium sulfate
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.220 |
| 9EEI Crystal structure of the SARS-CoV-2 Omicron nsp5 main protease (Mpro) E166V mutant in complex with inhibitor GC376 提交 2024-11-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
突变：P132H, E166V | UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG3350, sodium formate
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.258 |
| 9EET Crystal structure of the SARS-CoV-2 nsp5 main protease (Mpro) E166V mutant in complex with inhibitor GC376 提交 2024-11-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
突变：E166V | UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG3350, ammonium formate
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.229 |
| 9EEV Crystal structure of the SARS-CoV-2 Omicron nsp5 main protease (Mpro) E166V mutant in complex with inhibitor Nirmatrelvir (PF-07321332) 提交 2024-11-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：UNP residues 3264-3569
|
突变：P132H, E166V | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG3350, ammonium formate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.259 |
| 9EL4 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant E166A with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231 提交 2024-12-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：E166A 突变：E166A | GOL GLYCEROL × 3 V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.203 |
| 9ELV Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant E166V with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231 提交 2024-12-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：E166V 突变：E166V | GOL GLYCEROL × 3 V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.203 |
| 9EMJ SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with Toyocamycin and m7GpppA (Cap0-analog) 提交 2024-03-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | TO1 4-amino-7-(beta-D-ribofuranosyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carbonitrile × 1 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.207 |
| 9EML SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and m7GpppA (Cap0-analog)/m7GpppAm (Cap1-analog) 提交 2024-03-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 EDT {[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID × 1 V9G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-ADENOSINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.240 |
| 9EMV SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with Sangivamycin and m7GpppA (Cap0-analog)/m7GpppAm (Cap1-analog) 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | SGV SANGIVAMYCIN × 1 GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 V9G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-ADENOSINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.256 |
| 9EO6 SARS-CoV2 major protease in complex with a covalent inhibitor SLL11. 提交 2024-03-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：none 突变：none | K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；18% w/v PEG3350
0.2M KSCN
0.1M Bis-Tris Propanol pH 8.5
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.257 |
| 9EO6 SARS-CoV2 major protease in complex with a covalent inhibitor SLL11. 提交 2024-03-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
突变：none 突变：none | K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；18% w/v PEG3350
0.2M KSCN
0.1M Bis-Tris Propanol pH 8.5
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.257 |
| 9EO6 SARS-CoV2 major protease in complex with a covalent inhibitor SLL11. 提交 2024-03-14 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
3264–3569（306 aa）
链 F
3264–3569（306 aa）
|
突变：none 突变：none | K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；18% w/v PEG3350
0.2M KSCN
0.1M Bis-Tris Propanol pH 8.5
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.257 |
| 9EOR SARS-CoV2 major protease in complex with a covalent inhibitor SLL12. 提交 2024-03-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% w/v PEG3350
0.2M potassium-thiocyanate
0.1M bis-tris propane pH 8.5
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.289 |
| 9EOR SARS-CoV2 major protease in complex with a covalent inhibitor SLL12. 提交 2024-03-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% w/v PEG3350
0.2M potassium-thiocyanate
0.1M bis-tris propane pH 8.5
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.289 |
| 9EOR SARS-CoV2 major protease in complex with a covalent inhibitor SLL12. 提交 2024-03-15 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
3264–3569（306 aa）
链 F
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% w/v PEG3350
0.2M potassium-thiocyanate
0.1M bis-tris propane pH 8.5
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.289 |
| 9EOX SARS-CoV2 major protease in covalent complex with a soluble inhibitor. 提交 2024-03-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；18% w/v PEG3350
0.2M potassium-thiocyanate
0.1M bis-tris propane pH 8.7
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.231 |
| 9EOX SARS-CoV2 major protease in covalent complex with a soluble inhibitor. 提交 2024-03-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；18% w/v PEG3350
0.2M potassium-thiocyanate
0.1M bis-tris propane pH 8.7
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.231 |
| 9EOX SARS-CoV2 major protease in covalent complex with a soluble inhibitor. 提交 2024-03-15 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
3264–3569（306 aa）
链 F
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；18% w/v PEG3350
0.2M potassium-thiocyanate
0.1M bis-tris propane pH 8.7
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.231 |
| 9EUN SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with SAM and m7GTP 提交 2024-03-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.234 |
| 9EX8 Free form of a mutant of SARS-CoV-2 main protease Mpro. 提交 2024-04-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M MMT (DL-malic acid, MES, and Tris base in molar ratio 1:2:2), pH 7.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.211 |
| 9EXU Complex of a mutant of the SARS-CoV-2 main protease Mpro with the nsp4/5 substrate peptide (cocrystallization). 提交 2024-04-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M MMT (DL-malic acid, MES, and Tris base in molar ratio 1:2:2), pH 7.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.204 |
| 9EYA Complex of a mutant of the SARS-CoV-2 main protease Mpro with the nsp4/5 substrate peptide (soaking). 提交 2024-04-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M MMT (DL-malic acid, MES, and Tris base in molar ratio 1:2:2), pH 7.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.185 |
| 9EZ4 Complex of a mutant of the SARS-CoV-2 main protease Mpro with the nsp5/6 substrate peptide. 提交 2024-04-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 GLN GLUTAMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M MMT (DL-malic acid, MES, and Tris base in molar ratio 1:2:2), pH 7.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.215 |
| 9F2V Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with RHTCR02 提交 2024-04-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1H9E ~{tert}-butyl ~{N}-[1-[(2~{S})-1-[[(2~{R},3~{S})-4-azanyl-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-3-cyclopropyl-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Bis Tris Propane pH 7.50, 2M Sodium nitrate, 20% w/vPEG 3350 and 10% v/vEthylene glycol
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.209 |
| 9F2X Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with RHTCR03 提交 2024-04-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1H9D ~{tert}-butyl ~{N}-[4-[(2~{S})-1-[[(2~{S},3~{R})-4-azanyl-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-3-cyclopropyl-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-3-oxidanylidene-pyrazin-2-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1M HEPES pH 7.0, 2M Sodium chloride, 20% w/v PEG 6000, 10% v/v Ethylene glycol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.226 |
| 9F39 Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with RK-54 提交 2024-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | A1H9Y (2R,3R)-3-[[(2S)-3-cyclopropyl-2-[3-(2-methylpropanoylamino)-2-oxidanylidene-pyridin-1-yl]propanoyl]amino]-N-methyl-2-oxidanyl-4-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MMT pH 9.0, 25% w/v PEG 1500
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.305 |
| 9F3A Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with RK-325 提交 2024-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | A1H9Z tert-butyl N-[1-[(2S)-3-cyclopropyl-1-[[(2S,3R)-4-(methylamino)-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium bromide, 0.1 M Bis-Tris propane pH8.5, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.278 |
| 9F7P SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) C112S mutant 提交 2024-05-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1881（318 aa）
|
突变：C112S | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；288 K；1.8 M sodium malonate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.179 |
| 9F7Q SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) C112S mutant 提交 2024-05-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1881（318 aa）
|
突变：C112S | ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；288 K；2.5 M ammonium sulfate,0.1M MES
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.232 |
| 9F7R SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) C112S mutant 提交 2024-05-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1881（318 aa）
|
突变：C112S | ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；288 K；1.2M K2HPO4, 0.8M NaH2PO4, 0.1M sodium acetate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.163 |
| 9F7S SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) C112S-K191D-K229R mutant 提交 2024-05-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1881（318 aa）
|
突变：C112S; K191D; K229R | ZN ZINC ION × 1 MLI MALONATE ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；288 K；1.4 M sodium malonate, 5% PEG300
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.184 |
| 9F7T SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) C112S-K191D-K229R mutant: dimer 提交 2024-05-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1881（318 aa）
|
突变：C112S;K191D;K229R | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CL CHLORIDE ION × 4 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；288 K；4M sodium chloride, 0.1M TRIS
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.233 |
| 9F7U SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) C112S-K191D-Q222D-K229R-Q230R-C271S mutant 提交 2024-05-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1881（318 aa）
|
突变：C112S,K191D,Q222D,K229R,Q230R,C271S | MLA MALONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；288 K；1.6 M sodium malonate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.176 |
| 9F7Y SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) C112S-K191D-Q222D-K229R-Q230R-C271S mutant 提交 2024-05-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1881（318 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MLA MALONIC ACID × 2 NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；1.4 M sodium malonate, 0.1 M sodium succinate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.183 |
| 9FEH Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp14 methyltransferase domain in complex with the STM957 inhibitor 提交 2024-05-20 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
6225–6452（228 aa）
|
未记录 | A1IB6 ~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[4-azanyl-5-(2-pyridin-3-ylethynyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]-3-cyano-~{N}-ethyl-4-methoxy-benzenesulfonamide × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；12.5% w/v PEG 4000, 20% w/v 1,2,6-hexanetriol;
100mM Gly-Gly/AMPD pH 8.5;
10mM spermine, 10mM spermidine, 10mM 1,4-diaminobutane, 10mM DL-ornithine
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.230 |
| 9FHQ Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with RHTCR04 提交 2024-05-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ICP ~{tert}-butyl ~{N}-[1-[(2~{S})-1-[[(2~{S})-4-azanyl-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-3-cyclopropyl-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-6-oxidanylidene-pyrimidin-5-yl]carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1M HEPES pH7, 0.1M Calcium chloride dihydrate, 20% w/vPEG 6000, 10% v/vEthylene glycol
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.201 |
| 9FW2 SARS CoV-2 nsp10 in complex with the ExoN domain from nsp14 提交 2024-06-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.04-0.24 M Amino acids, 0.1 M buffer system 2 (pH 7.5), 16-38% v/v precipitant mix 2.
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.183 |
| 9FWH Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-ExoN in complex with VT00019 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 A1IGQ (4R)-4-phenyl-1,2-thiazolidine 1,1-dioxide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 24.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.09M
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.247 |
| 9FWI Ensemble model of ligand-free SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) and in complex with partially bound VT00025 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | A1IGP (3-oxidanylazetidin-1-yl)-phenyl-methanone × 1 ZN ZINC ION × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 36.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.09M
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.199 |
| 9FWJ Ensemble model of ligand-free SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) and in complex with partially bound VT00079 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 UYY 2-methoxybenzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 27.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.20M
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.254 |
| 9FWK Ensemble model of ligand-free SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) and in complex with partially bound VT00123 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 A1IGT (4S)-4-pyridin-4-ylpyrrolidin-2-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1IGS (4R)-4-pyridin-4-ylpyrrolidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 36.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.11M
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.199 |
| 9FWL Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00167 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 ZN ZINC ION × 4 A1IGO 3-phenylthiophene-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 36.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.09M
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.229 |
| 9FWM Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00180 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1IGR 1H-indole-3-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 36.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.14M
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.213 |
| 9FWN Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00219 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 A1IGN 1-methyl-1-(phenylmethyl)urea × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 30.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.20M
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.231 |
| 9FWO Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00216 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 A1IGM 1-methylpyrrole-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 27.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.17M
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.249 |
| 9FWP Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00198 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 A1IGK N-methylbenzamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 21.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.06M
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.246 |
| 9FWQ Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00218 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 A1IGJ 5,6,7,8-tetrahydro-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridine × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 29.00%w/v Morpheus Amino acids: 0.20M
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.260 |
| 9FWR Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00249 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 A1IGL (4R)-4-phenyl-1,3-oxazolidin-2-one × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 23.00%w/v Morpheus Amino acids: 0.09M
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.251 |
| 9FWS Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00258 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | MI7 7-METHOXY-1H-INDAZOLE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 21.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.11M
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.213 |
| 9FWT Ensemble model of ligand-free SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) and in complex with partially bound VT00259 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | VSL methyl 4,5,6,7-tetrahydro-2H-indazole-3-carboxylate × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 32.00%w/v Morpheus Amino acids: 0.11M
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.214 |
| 9FWU Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00421 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | A1IGI N,N-dimethyl-3-oxidanyl-benzamide × 1 ZN ZINC ION × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 32.00%w/v Morpheus Amino acids: 0.11M
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.201 |
| 9FX7 Crystal structure of Cryo2RT SARS-CoV-2 main protease at 294K 提交 2024-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.244 |
| 9FZ4 SARS CoV-2 nsp10 in complex with theExoN domain from nsp14 提交 2024-07-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.04-0.24 M Amino acids, 0.1 M buffer system 2 (pH 7.5), 16-38% v/v precipitant mix 2.
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.229 |
| 9FZK SARS CoV-2 nsp10 in complex with theExoN domain from nsp14 提交 2024-07-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6214（289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.04-0.24 M Amino acids, 0.1 M buffer system 2 (pH 7.5), 16-38% v/v precipitant mix 2
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.185 |
| 9GNY SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and Caffeine 提交 2024-09-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 CFF CAFFEINE × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.212 |
| 9GRP SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and beta-chloroethyl theophylline 提交 2024-09-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 21 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1IOQ 7-(2-chloroethyl)-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1 ZN ZINC ION × 2 IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.204 |
| 9GRQ SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline 提交 2024-09-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | TEP THEOPHYLLINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 28 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 NA SODIUM ION × 2 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.191 |
| 9GS4 SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative LAS 54571130 提交 2024-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4271–4385（115 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 32 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 NA SODIUM ION × 4 A1IOL ~{N}-[(5~{S})-5-azanyl-6-[(3~{S},4~{S},6~{R})-3-[1,3-dimethyl-2,6-bis(oxidanylidene)purin-7-yl]-4-methyl-4,6-bis(oxidanyl)azepan-1-yl]-6-oxidanylidene-hexyl]ethanamide × 2 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2 ZN ZINC ION × 4 IMD IMIDAZOLE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.222 |
| 9GTF SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative LAS 57256190 提交 2024-09-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 A1IOV 7-[(3~{R},4~{R},6~{S})-1-[(2~{S})-2-azanyl-4-methyl-pentanoyl]-4-methyl-4,6-bis(oxidanyl)azepan-3-yl]-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.222 |
| 9GUB SARS-CoV-2 Mac1 in complex with MCD-628 提交 2024-09-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1IO2 (2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-2-(7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-ylamino)propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；0.1 M CHES pH 9.5, 32% PEG (w/v) 3000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.175 |
| 9GUB SARS-CoV-2 Mac1 in complex with MCD-628 提交 2024-09-19 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1024–1192（169 aa）
|
未记录 | A1IO2 (2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-2-(7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-ylamino)propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；0.1 M CHES pH 9.5, 32% PEG (w/v) 3000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.175 |
| 9GUD SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative LAS 54570922 提交 2024-09-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 22 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1IO1 (3~{S})-3-azanyl-4-[(3~{R},4~{R},6~{S})-3-[1,3-dimethyl-2,6-bis(oxidanylidene)purin-7-yl]-4-methyl-4,6-bis(oxidanyl)azepan-1-yl]-4-oxidanylidene-butanoic acid × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 CL CHLORIDE ION × 3 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.200 |
| 9GUE SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative LAS 57256189 提交 2024-09-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1IO0 7-[(3~{S},4~{S},6~{R})-1-[(2~{S})-2-azanyl-4-methyl-pentanoyl]-4-methyl-4,6-bis(oxidanyl)azepan-3-yl]-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.190 |
| 9GUF SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative LAS 54571106 提交 2024-09-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 25 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1IOZ 7-[(3~{S},4~{S},6~{R})-1-[3-(aminomethyl)phenyl]carbonyl-4-methyl-4,6-bis(oxidanyl)azepan-3-yl]-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 CL CHLORIDE ION × 3 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.211 |
| 9GUY SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative LAS 54571098 提交 2024-09-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
6799–7096（298 aa）
链 C
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 23 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 A1IOL ~{N}-[(5~{S})-5-azanyl-6-[(3~{S},4~{S},6~{R})-3-[1,3-dimethyl-2,6-bis(oxidanylidene)purin-7-yl]-4-methyl-4,6-bis(oxidanyl)azepan-1-yl]-6-oxidanylidene-hexyl]ethanamide × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 CL CHLORIDE ION × 3 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.213 |
| 9GV2 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the covalently bound inhibitor FP237 (compound 8p in publication) 提交 2024-09-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1IPK (2S)-2-[2-(3-methoxyphenoxy)ethanoylamino]-4-methyl-N-[(2S)-3-oxidanylidene-1-phenyl-pentan-2-yl]pentanamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1M MMT (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3), pH 5.0, 25% w/v polyethylene glycol (PEG)1500
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.281 |
| 9GWO SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative LAS 54571126 提交 2024-09-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 NA SODIUM ION × 2 A1IQS 7-[(3~{S},4~{S},6~{R})-1-[(2~{S})-2-azanyl-3-(1~{H}-indol-3-yl)propanoyl]-4-methyl-4,6-bis(oxidanyl)azepan-3-yl]-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 2 IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.203 |
| 9H4B Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with GK-730 提交 2024-10-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ISK methyl 2-[(1S,2S)-2-[[(2S)-4-methyl-2-[[(2S)-3-methyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoyl]amino]pentanoyl]amino]-1-oxidanyl-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propyl]-1,3-thiazole-4-carboxylate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；0.02M Sodium potassium phosphate pH7.5, 20% w/v PEG 3350, 10% v/v Ethylene glycol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 9HBQ SARS-CoV-2 Main Protease complexed with (1R)-N-(3-chlorophenyl)-3-oxo-indane-1-carboxamide 提交 2024-11-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 A1ITO (1~{R})-~{N}-(3-chlorophenyl)-3-oxidanylidene-1,2-dihydroindene-1-carboxamide × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M NaFORMATE, 20% PEG 3350
then soaking with inhibitor (in DSMO) and cryoprotected with 10% glycerol
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.211 |
| 9HC1 SARS-CoV-2 Main Protease complexed with (1R)-N-(3-chlorophenyl)-3-oxo-N-[4-(2-oxopyrrolidin-1-yl)phenyl]indane-1-carboxamide 提交 2024-11-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ITP (1~{R})-~{N}-(3-chlorophenyl)-3-oxidanylidene-~{N}-[4-(2-oxidanylidenepyrrolidin-1-yl)phenyl]-1,2-dihydroindene-1-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M NaFORMATE pH7.5, 20% PEG 3350 then soaking with inhibitor (DMSO) and cryo-protected with 10% Glycerol
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.220 |
| 9HD8 SARS-CoV-2 Main Protease in complex with with (1R)-N-(3-chlorophenyl)-N-[4-(2,4-dioxo-1H-pyrimidin-5-yl)phenyl]-3-oxo-indane-1-carboxamide 提交 2024-11-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1ITV (1~{R})-~{N}-[4-[2,4-bis(oxidanylidene)-1~{H}-pyrimidin-5-yl]phenyl]-~{N}-(3-chlorophenyl)-3-oxidanylidene-1,2-dihydroindene-1-carboxamide × 2 NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2 M Potassium chloride 20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.221 |
| 9HDC SARS-CoV-2 Main Protease in complex with (3S)-3-[(3R)-3-phenylpiperidine-1-carbonyl]indan-1-one 提交 2024-11-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 A1ITW (3~{S})-3-[(3~{R})-3-phenylpiperidin-1-yl]carbonyl-2,3-dihydroinden-1-one × 2 FMT FORMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.2 M sodium formate, 20% PEG 3350. Then soaking with inhibitor (DMSO) and cryo-protection with glycerol (10%).
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.229 |
| 9HDJ SARS-CoV-2 Main Protease in complex with (3R)-3-[(3R)-4-benzyl-3-phenyl-piperidine-1-carbonyl]indan-1-one 提交 2024-11-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1IT1 (3~{R})-3-[(3~{R})-3-phenyl-4-(phenylmethyl)piperazin-1-yl]carbonyl-2,3-dihydroinden-1-one × 2 FMT FORMIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2 M sodium formate, 20% PEG 3350 then soaked with the inhibitor (DMSO) and cryo-protection with glycerol (10%)
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.281 |
| 9HDN SARS-CoV-2 Main Protease in complex with (1R)-3-oxo-N-[2-oxo-2-(N-phenylanilino)ethyl]indane-1-carboxamide 提交 2024-11-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1IT2 (1~{R})-~{N}-[2-(diphenylamino)-2-oxidanylidene-ethyl]-3-oxidanylidene-1,2-dihydroindene-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.2M Calcium Chloride, 0.1 Hepes pH7.5, 30% (w/v) PEG4000
Cryo-protection with glycerol (10%)
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.214 |
| 9HDN SARS-CoV-2 Main Protease in complex with (1R)-3-oxo-N-[2-oxo-2-(N-phenylanilino)ethyl]indane-1-carboxamide 提交 2024-11-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1IT2 (1~{R})-~{N}-[2-(diphenylamino)-2-oxidanylidene-ethyl]-3-oxidanylidene-1,2-dihydroindene-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.2M Calcium Chloride, 0.1 Hepes pH7.5, 30% (w/v) PEG4000
Cryo-protection with glycerol (10%)
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.214 |
| 9HFX Crystal structure of SARS CoV-2 3CLpro (Mpro) with ALG-097558 提交 2024-11-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：NONE
|
未记录 | A1IUN (1~{S},2~{S},3~{S},6~{R},7~{R})-~{N}-[(2~{S})-1-azanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]-4-[(2~{S})-2-[[2-chloranyl-2,2-bis(fluoranyl)ethanoyl]amino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-azatricyclo[5.2.1.0^{2,6}]decane-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；PCB, PEG 1500
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.243 |
| 9HFY Crystal structure of SARS CoV-2 3CLpro (Mpro) with ALG-097078 提交 2024-11-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：NONE
链 B
3264–3569（306 aa）
片段：NONE
|
未记录 | A1IUM (3~{S},3~{a}~{S},6~{a}~{R})-2-[(4-methoxy-1~{H}-indol-2-yl)carbonyl]-~{N}-[(2~{S},3~{R})-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]-4-[(phenylmethyl)amino]butan-2-yl]-3,3~{a},4,5,6,6~{a}-hexahydro-1~{H}-cyclopenta[c]pyrrole-3-carboxamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.25；293 K；PEG 2000 MME, Bis-Tris
|
分辨率 1.28 Å R-free 0.190 |
| 9I1S Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13 in complex with myricetin 提交 2025-01-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5326–5925（600 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.241 |
| 9I1S Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13 in complex with myricetin 提交 2025-01-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5326–5925（600 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1 MYC 3,5,7-TRIHYDROXY-2-(3,4,5-TRIHYDROXYPHENYL)-4H-CHROMEN-4-ONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.241 |
| 9I4V Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13 提交 2025-01-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.254 |
| 9I4V Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13 提交 2025-01-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.254 |
| 9I51 Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13 in complex with ADP 提交 2025-01-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.202 |
| 9I51 Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13 in complex with ADP 提交 2025-01-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.202 |
| 9I53 Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13 in complex with ATP 提交 2025-01-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.229 |
| 9I53 Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13 in complex with ATP 提交 2025-01-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5325–5925（601 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.229 |
| 9I81 SARS-CoV-2 RdRp bound to a stack of three HeE1-2Tyr molecules 提交 2025-02-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3940（81 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | 6CJ N-[8-(cyclohexyloxy)-1-oxo-2-phenyl-1H-pyrido[2,1-b][1,3]benzothiazole-4-carbonyl]-L-tyrosine × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 9IKZ SARS-CoV-2 E-RTC bound to pRNA-nsp9 and GDP-BeF3- 提交 2024-06-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5323（931 aa）
链 B
3948–4134（187 aa）
链 D
3948–4134（187 aa）
链 E
5325–5917（593 aa）
链 F
5325–5917（593 aa）
链 G
4141–4253（113 aa）
片段：UNP RESIDUES 4141-4253
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 9IMK SARS-CoV-2 Replication-Transcription Complex has a dimer architecture (dRTC) in post-capping state 提交 2024-07-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：octadecameric（18） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
链 E
5325–5925（601 aa）
链 F
5325–5925（601 aa）
链 G
4141–4253（113 aa）
链 H
4393–5324（932 aa）
链 I
3943–4140（198 aa）
链 K
3943–4140（198 aa）
链 L
5325–5925（601 aa）
链 M
5325–5925（601 aa）
链 N
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 16 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.01 Å |
| 9IMM SARS-CoV-2 Replication-Transcription Complex has a dimer architecture (local dRTC) in post-capping state 提交 2024-07-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
链 E
5325–5925（601 aa）
链 F
5325–5925（601 aa）
链 G
4141–4253（113 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 9J19 The crystal structure of COVID-19 main protease in complex with an inhibitor minocycline 提交 2024-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3268–3562（295 aa）
链 B
3268–3562（295 aa）
|
未记录 | MIY (4S,4AS,5AR,12AS)-4,7-BIS(DIMETHYLAMINO)-3,10,12,12A-TETRAHYDROXY-1,11-DIOXO-1,4,4A,5,5A,6,11,12A-OCTAHYDROTETRACENE-2- CARBOXAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；24% PEG 4000, 100 mM HEPES, PH 7.5, 3% DMSO
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.314 |
| 9JGX Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease E166N mutant in complex with Ibuzatrelvir 提交 2024-09-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3567（302 aa）
|
突变：E166N | YDL N-(methoxycarbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-(trifluoromethyl)-L-prolinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.12~0.21M PEG3350,20%~24%Na2SO4
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.272 |
| 9JGY Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease E166R mutant in complex with Ibuzatrelvir 提交 2024-09-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3567（302 aa）
|
突变：E166R | YDL N-(methoxycarbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-(trifluoromethyl)-L-prolinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.12~0.21M PEG3350,20%~24%Na2SO4
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.245 |
| 9JJ7 The crystal structure of SARS-CoV-2 NSP5 in complex with eIF4G2 提交 2024-09-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1 M MES pH 5.6, 7% PEG 6000, and 6% dimethyl sulfoxide (DMSO)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.212 |
| 9KGJ Discovery of an orally bioavailable reversible covalent SARS-CoV-2 Mpro inhibitor with pan-coronavirus activity 提交 2024-11-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1L7M cyclopropylcarbamic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；4% v/v TacsimateTM pH 5.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.248 |
| 9KGN Discovery of an orally bioavailable reversible covalent SARS-CoV-2 Mpro inhibitor with pan-coronavirus activity 提交 2024-11-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.02 M Citric acid, 0.08 M BIS-TRIS propane pH 8.8, 16% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.226 |
| 9KGQ Discovery of an orally bioavailable reversible covalent SARS-CoV-2 Mpro inhibitor with pan-coronavirus activity 提交 2024-11-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；4% v/v TacsimateTM pH 6.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.233 |
| 9KGR Discovery of an orally bioavailable reversible covalent SARS-CoV-2 Mpro inhibitor with pan-coronavirus activity 提交 2024-11-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1L7M cyclopropylcarbamic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M Magnesium sulfate heptahydrate,
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.208 |
| 9KGS Discovery of an orally bioavailable reversible covalent SARS-CoV-2 Mpro inhibitor with pan-coronavirus activity 提交 2024-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1L7M cyclopropylcarbamic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M Sodium malonate pH 6.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.236 |
| 9KH0 Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease S46F mutant in complex with S217622 提交 2024-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3265–3564（300 aa）
链 B
3265–3564（300 aa）
|
突变：S46F 突变：S46F | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20~24%PEG3350,0.12~0.21M sodium sulfate;
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.241 |
| 9KH1 Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease V186F mutant in complex with S217622 提交 2024-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3564（299 aa）
链 B
3266–3564（299 aa）
|
突变：V186F 突变：V186F | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20~24%PEG3350,0.12~0.21M sodium sulfate;
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.225 |
| 9KH3 Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease Y54C mutant in complex with S217622 提交 2024-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3564（299 aa）
链 B
3266–3564（299 aa）
|
突变：Y54C 突变：Y54C | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20~24%PEG3350,0.12~0.21M sodium sulfate;
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.221 |
| 9KR5 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound 3 提交 2024-11-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3565（302 aa）
|
突变：P3395H | A1EGN (6~{E})-6-(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)imino-3-[5-[(3~{S})-oxolan-3-yl]oxypyridin-3-yl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazinane-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 MES (pH 5.0-5.6) with polyethylene glycol (PEG) 6,000 (9-11% w/v)
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.230 |
| 9KSH Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound 1 提交 2024-11-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3565（302 aa）
|
突变：P132H | A1EGQ 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-pyridin-3-yl-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 MES (pH 5.0-5.6) with polyethylene glycol (PEG) 6,000 (9-11% w/v)
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.232 |
| 9KSI Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound 5 提交 2024-11-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | A1EGP (6E)-1-[[5-chloranyl-4-fluoranyl-2-(4-fluoranylphenoxy)phenyl]methyl]-6-(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)imino-3-(5-methoxypyridin-3-yl)-1,3,5-triazinane-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 MES (pH 5.0-5.6) with polyethylene glycol (PEG) 6,000 (9-11% w/v)
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.243 |
| 9KSJ Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound 8 提交 2024-11-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3564（301 aa）
|
突变：P132H | A1EGR 3-[[(6E)-6-(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)imino-3-[5-(2-methoxyethoxy)pyridin-3-yl]-2,4-bis(oxidanylidene)-1,3,5-triazinan-1-yl]methyl]-4-methyl-benzenecarbonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 MES (pH 5.0-5.6) with polyethylene glycol (PEG) 6,000 (9-11% w/v)
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.189 |
| 9KSK Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound 10 提交 2024-11-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3564（301 aa）
链 B
3264–3564（301 aa）
|
未记录 | A1EGS 4-[4-chloranyl-2-[[(6E)-6-(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)imino-3-(5-methylpyridin-3-yl)-2,4-bis(oxidanylidene)-1,3,5-triazinan-1-yl]methyl]-5-fluoranyl-phenoxy]-2-fluoranyl-benzenecarbonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 MES (pH 5.0-5.6) with polyethylene glycol (PEG) 6,000 (9-11% w/v)
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.307 |
| 9L09 SARS-CoV-2 C-RTC with 13-TP 提交 2024-12-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9L13 The crystal structure of SARS-CoV-2 Main protease in complex with an iso-quinoline-derived inhibitor FD6-31 提交 2024-12-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3564（301 aa）
|
未记录 | A1EH0 (5-chloranylspiro[1~{H}-2-benzofuran-3,4'-piperidine]-1'-yl)-isoquinolin-4-yl-methanone × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.1 M Bis-Tris 6.5, 20% PEG5000MME
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.233 |
| 9LGQ The crystal structure of SARS-CoV-2 NSP5 in complex with PTBP1 提交 2025-01-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1 M MES pH 5.6, 7% PEG 6000, and 6% dimethyl sulfoxide (DMSO)
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.218 |
| 9LLL compound 25 and SARS-CoV-2 Mpro 提交 2025-01-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1EK4 1-[[2-[5-(aminomethyl)thiophen-2-yl]oxy-5-chloranyl-4-fluoranyl-phenyl]methylidene]-6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(2-oxidanylidene-1~{H}-pyridin-3-yl)methyl]-1$l^{4},3,5-triazinane-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；289.15 K；PEG 6000, MES
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.282 |
| 9LVR Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with compound 1 提交 2025-02-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1L7P 6-(1,3-dihydroisoindol-2-yl)-3-(5-methylpyridin-3-yl)-1-[[3,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.02 M Sodium/potassium phosphate 0.1 M Bis-Tris propane 7.5 20 % w/v PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.268 |
| 9LZM Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease in complex with Pomotrelvir 提交 2025-02-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3566（301 aa）
链 B
3266–3566（301 aa）
|
未记录 | ZQB Pomotrelvir bound form × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES 7.5, 20% PEG 10000
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.240 |
| 9LZP Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease P132H mutant in complex with Pomotrelvir 提交 2025-02-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3561（296 aa）
链 B
3266–3561（296 aa）
|
突变：P132H 突变：P132H | ZQB Pomotrelvir bound form × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M BICINE pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol 10,000
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.265 |
| 9M29 Crystal Structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease with inhibitor AD05 提交 2025-02-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 18% (v/v) PEG 3350
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.216 |
| 9M2U Crystal Structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease with inhibitor AD06 提交 2025-02-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.1M Bis-Tris pH6.5, 18% (v/v) PEG 3350
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.316 |
| 9M2V Crystal Structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease with inhibitor MC12 提交 2025-02-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1L8G [2-[methyl(phenyl)amino]-1,3-thiazol-4-yl]methanol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.1M Bis-Tris pH6.5, 18% (v/v) PEG 3350
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.250 |
| 9M48 Cryo-EM structure of 6:1 nsp15/dsRNA complex 提交 2025-03-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
链 D
6453–6798（346 aa）
链 E
6453–6798（346 aa）
链 F
6453–6798（346 aa）
|
突变：H6686A 突变：H6686A 突变：H6686A 突变：H6686A 突变：H6686A 突变：H6686A | CO COBALT (II) ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9M49 Cryo-EM structure of 6:2 nsp15/dsRNA complex 提交 2025-03-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 A
6453–6798（346 aa）
链 B
6453–6798（346 aa）
链 C
6453–6798（346 aa）
链 D
6453–6798（346 aa）
链 E
6453–6798（346 aa）
链 F
6453–6798（346 aa）
|
突变：H6686A 突变：H6686A 突变：H6686A 突变：H6686A 突变：H6686A 突变：H6686A | CO COBALT (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.78 Å |
| 9M6R Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease E166N mutant in complex with Pomotrelvir 提交 2025-03-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3564（299 aa）
链 B
3266–3564（299 aa）
|
突变：E166N 突变：E166N | ZQB Pomotrelvir bound form × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.12~0.21M PEG3350,20%~24%Na2SO4
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.223 |
| 9M6S Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease E166R mutant in complex with Pomotrelvir 提交 2025-03-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3265–3564（300 aa）
链 B
3265–3564（300 aa）
|
突变：E166R 突变：E166R | ZQB Pomotrelvir bound form × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.12~0.21M PEG3350,20%~24%Na2SO4
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.271 |
| 9M6T Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease H163A mutant in complex with Pomotrelvir 提交 2025-03-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3267–3563（297 aa）
链 B
3267–3563（297 aa）
|
突变：H163A 突变：H163A | ZQB Pomotrelvir bound form × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Na2SO4,24% PEG3350
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.230 |
| 9M6U Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease M49I mutant in complex with Pomotrelvir 提交 2025-03-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3564（299 aa）
链 B
3266–3564（299 aa）
|
突变：M49I 突变：M49I | ZQB Pomotrelvir bound form × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.12M-0.21M Na2SO4, 20%-24% PEG3350
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.227 |
| 9M6V Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease V186F mutant in complex with Pomotrelvir 提交 2025-03-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3266–3564（299 aa）
链 B
3266–3564（299 aa）
|
未记录 | ZQB Pomotrelvir bound form × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2M Na2SO4, 20%PEG3350
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.259 |
| 9M8Z The complex structure of Plpro and Frag7 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1EM6 4-phenylpiperidin-4-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.243 |
| 9M90 The complex structure of Plpro and Frag13 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 A1EM7 2,4-dimethyl-1,3-thiazole-5-carboxylic acid × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.243 |
| 9M91 The complex structure of Plpro and Frag29 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 BZX 1,3-benzodioxol-5-ol × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.225 |
| 9M92 The complex structure of Plpro and Frag33 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 YRL 4-(2-hydroxyethyl)phenol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.209 |
| 9M93 The complex structure of Plpro and Frag44 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 FB2 benzenesulfonamide × 2 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.283 |
| 9M94 The complex structure of Plpro and Frag102 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1EM8 1,3-thiazol-5-ylmethanamine × 2 MLI MALONATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.222 |
| 9M95 The complex structure of Plpro and Frag124 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1EM9 [4-(4-methyl-1,4-diazepan-1-yl)phenyl]methanamine × 2 MLI MALONATE ION × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.209 |
| 9M96 The complex structure of Plpro and Frag164 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 A1ENA 6-morpholin-4-ylpyridazin-3-amine × 4 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.216 |
| 9M97 The complex structure of Plpro and Frag170 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1ENB 4-(pyrazol-1-ylmethyl)aniline × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.263 |
| 9M99 The complex structure of Plpro and Frag200 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | A1EE6 N-[(4-fluorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-butanamide × 4 MLI MALONATE ION × 2 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.235 |
| 9M9A The complex structure of Plpro and Frag209 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 9VQ [4-(pyrazol-1-ylmethyl)phenyl]methanol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.237 |
| 9M9B The complex structure of Plpro and Frag299 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1ENC 1-[6-(furan-2-yl)pyridin-3-yl]-~{N}-methyl-methanamine × 2 MLI MALONATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.271 |
| 9M9C The complex structure of Plpro and Frag368 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 A1END 5-fluoranyl-4-sulfanylidene-1~{H}-pyrimidin-2-one × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.193 |
| 9M9J The complex structure of Plpro and Frag443 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1ENE 4,5-bis(chloranyl)-2-methyl-pyridazin-3-one × 2 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.237 |
| 9M9K The complex structure of Plpro and Frag464 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1ENF 5-azanyl-1-methyl-3~{H}-indol-2-one × 2 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.226 |
| 9M9L The complex structure of Plpro and Frag712 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 A1ENG 3-(trifluoromethyl)-1,4-dihydropyrazol-5-one × 2 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.210 |
| 9MA9 The complex structure of Plpro and Frag762 提交 2025-03-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 A1ENJ 3-azanyl-4-methyl-benzoic acid × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate pH 6.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.220 |
| 9MAA The complex structure of Plpro and Frag794 提交 2025-03-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1ENK methyl 3-chloranyl-6-oxidanylidene-1~{H}-pyridazine-5-carboxylate × 2 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.233 |
| 9MAB The complex structure of Plpro and Frag747 提交 2025-03-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1EHF 4-methylthiophene-2-carboxamide × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate pH 6.0
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.228 |
| 9MAC The complex structure of Plpro and Frag746 提交 2025-03-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1AYY [6-(pyrrolidin-1-yl)pyridin-2-yl]methanol × 2 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
pH=6.0
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.204 |
| 9MAF The crystal structure of Plpro and Frag 550 提交 2025-03-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 MLI MALONATE ION × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 DJP 5-fluoropyrimidin-2-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate pH 6.0
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.216 |
| 9MAJ The complex structure of Plpro and Frag642 提交 2025-03-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 E5X 4-(hydroxymethyl)benzoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate pH 6.0
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.279 |
| 9MAL The complex structure of Plpro and Frag642 提交 2025-03-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 8K2 5-chloranylthiophene-2-sulfonamide × 2 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
pH 6.0
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.221 |
| 9MAM The complex structure of Plpro and Frag676 提交 2025-03-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1565–1879（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1ENH (2-pyrrolidin-1-ylpyridin-4-yl)methanol × 2 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；277 K；1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.204 |
| 9MCO Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease E166N mutant in complex with Leritrelvir 提交 2025-03-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
突变：E3429N 突变：E3429N | A1EN0 (3~{S},3~{a}~{S},6~{a}~{R})-2-[(2~{S})-2-cyclohexyl-2-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethanoylamino]ethanoyl]-~{N}-[(2~{S})-4-(cyclopentylamino)-3,4-bis(oxidanylidene)-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]-3,3~{a},4,5,6,6~{a}-hexahydro-1~{H}-cyclopenta[c]pyrrole-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M BICINE pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol 10,000
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.259 |
| 9MEI Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant L50F E166V with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231 提交 2024-12-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：L50F E166V 突变：L50F E166V | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.219 |
| 9MLJ X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease covalently bound to compound GRL-050-23 at 1.6 A 提交 2024-12-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1BMU (3S)-N-{(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]propan-2-yl}-7-fluoro-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/ml
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.179 |
| 9MRU Structural Asymmetry in SARS-CoV-2 Nsp15 Hexamer Important for Catalytic Activity 提交 2025-01-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6797（345 aa）
链 B
6453–6797（345 aa）
链 C
6453–6797（345 aa）
链 D
6453–6797（345 aa）
链 E
6453–6797（345 aa）
链 F
6453–6797（345 aa）
|
突变：E267Q 突变：E267Q 突变：E267Q 突变：E267Q 突变：E267Q 突变：E267Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；277 K；100 mM HEPES-NaOH, pH 7.5, 200 mM calcium acetate, 8% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.211 |
| 9MRW Functional Implications of Hexameric Dynamics in SARS-CoV-2 Nsp15 提交 2025-01-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6797（345 aa）
链 B
6453–6797（345 aa）
|
突变：E267Q 突变：E267Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；298 K；100 mM HEPES-NaOH, pH 7.5, 200 mM calcium acetate, 8% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.193 |
| 9MRY Functional Implications of HexamericDynamics in SARS-CoV-2 Nsp15 提交 2025-01-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
6453–6797（345 aa）
链 B
6453–6797（345 aa）
链 C
6453–6797（345 aa）
链 D
6453–6797（345 aa）
链 E
6453–6797（345 aa）
链 F
6453–6797（345 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 5.5；295 K；NendoU protein 75 mg/ml (20 mM HEPES pH 7.5, 150mM NaCl, 1mM TCEP) is added to the precipitant solution (100mM Na Citrate pH 5.5, 20% PEG 1000, 20% 2-Methyl-2,4-pentanediol (MPD)) in a 1:7 protein:precipitant ratio with agitation at 295K overnight.
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.228 |
| 9MVM Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro)in Complex with Inhibitor AVI-3318 提交 2025-01-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3259–3569（311 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BTM 1-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-3-[(2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)methyl]-1,3-diazinane-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% w/v polyethylene glycol 8000, 100mM Tris pH 7.4
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.244 |
| 9MVO Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Inhibitor AVI-4692 提交 2025-01-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BVT (3M,5P,6M)-5-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-yl)-6-(3-chlorophenyl)-3-(isoquinolin-4-yl)-1-(prop-2-en-1-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 A1BTO (3M,5P,6M)-5-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-yl)-6-(3-chlorophenyl)-3-(isoquinolin-4-yl)-1-(prop-2-yn-1-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% w/v polyethylene glycol 8000, 100 mM Tris pH 7.4
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.216 |
| 9MVP Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro)in Complex with Inhibitor AVI-4516 提交 2025-01-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1BTP (3M,5P)-5-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-yl)-3-(isoquinolin-4-yl)-6-methyl-1-(prop-2-en-1-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；24% w/v polyethylene glycol 8000, 100 mM Tris pH 7.4
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.253 |
| 9MVQ Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) variant Q192T in Complex with Inhibitor AVI-4303 提交 2025-01-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1BTN (3M,5P,6M)-5-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-yl)-6-(3-chlorophenyl)-3-(isoquinolin-4-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；24% w/v polyethylene glycol 8000, 100 mM Tris pH 7.4
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.199 |
| 9N5Q X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease M49I covalently bound to inhibitor GRL-051-22 at 1.50 A 提交 2025-02-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：M49I | A1BFE (3S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.164 |
| 9N6F X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease M165I covalently bound to inhibitor GRL-051-22 at 1.90 A 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：M165I | A1BFE (3S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2 NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；16% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.16 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.216 |
| 9N6J Room Temperature X-Ray Structure of SARS-CoV-2 Main Protease Mutant D48Y, P168 Deletion 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：D48Y | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；15-17 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.221 |
| 9N6L Room Temperature X-Ray Structure of SARS-CoV-2 Main Protease Mutant D48Y, P168 Deletion in Complex with GC373 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：D48Y | K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；15-17 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.224 |
| 9N6M Room Temperature X-Ray Structure of SARS-CoV-2 Main Protease Mutant D48Y, P168 Deletion in Complex with Nirmatrelvir 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：D48Y | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；15-17 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.221 |
| 9N6N Room Temperature X-Ray Structure of SARS-CoV-2 Main Protease Mutant D48Y, P168 Deletion in Complex with Pomotrelvir 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：D48Y | ZQB Pomotrelvir bound form × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；15-17 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.218 |
| 9N6P Room Temperature X-Ray Structure of SARS-CoV-2 Main Protease Mutant D48Y, P168 Deletion in Complex with Ensitrelvir 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：D48Y | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；15-17 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.199 |
| 9N6R Room Temperature X-Ray Structure of SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Ensitrelvir 提交 2025-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；287 K；15-17 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.202 |
| 9N99 SARS-CoV-2 Main protease in complex with AVI-8122 提交 2025-02-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1BWH N-[(2S)-3-cyclopropyl-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]-7-fluoro-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 20% PEG6000, 0.2 M NH4Cl
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.230 |
| 9N9B X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease V186F covalently bound to inhibitor GRL-051-22 at 1.60 A 提交 2025-02-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：V186F | A1BFE (3S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.185 |
| 9NAZ Structure of SARS-CoV-2 NSP14 bound to N-((4-vinylthiazol-2-yl)methyl)-1H-pyrazole-3-carboxamide 提交 2025-02-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 A1BX0 N-[(4-ethenyl-1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1H-pyrazole-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；Crystals appeared after two weeks when mixed 1:1 ratio with mother liquor containing sodium phosphate monobasic (1.26M to 1.61M) and potassium phosphate dibasic (0.14M to 0.24M). Ligand was soaked for at least 1 hour at a final concentration between 10-50 mM (10% DMSO).
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.240 |
| 9NFP Structure of SARS-CoV-2 NSP14 bound to N-((4-cyclopropylthiazol-2-yl)methyl)-1H-pyrazole-3-carboxamide 提交 2025-02-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 A1BXZ N-[(4-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1H-pyrazole-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Crystals appeared after two weeks when mixed 1:1 ratio with mother liquor containing sodium phosphate monobasic (1.26M to 1.61M) and potassium phosphate dibasic (0.14M to 0.24M). Ligand was soaked for at least 1 hour at a final concentration between 10-50 mM (10% DMSO).
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.231 |
| 9NHA Structure of SARS-CoV-2 NSP14 bound to N-((4-isopropylthiazol-2-yl)methyl)-1H-pyrazole-3-carboxamide 提交 2025-02-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 A1BX5 N-{[4-(propan-2-yl)-1,3-thiazol-2-yl]methyl}-1H-pyrazole-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Crystals appeared after two weeks when mixed 1:1 ratio with mother liquor containing sodium phosphate monobasic (1.26M to 1.61M) and potassium phosphate dibasic (0.14M to 0.24M). Ligand was soaked for at least 1 hour at a final concentration between 10-50 mM (10% DMSO)
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.268 |
| 9NHU Structure of SARS-CoV-2 NSP14 bound to 5-(((cyclopropylmethyl)amino)methyl)-N-((4-cyclopropylthiazol-2-yl)methyl)-1H-pyrazole-3-carboxamide 提交 2025-02-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 A1BYF 5-{[(cyclopropylmethyl)amino]methyl}-N-[(4-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1H-pyrazole-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Crystals appeared after two weeks when mixed 1:1 ratio with mother liquor containing sodium phosphate monobasic (1.26M to 1.61M) and potassium phosphate dibasic (0.14M to 0.24M). Ligand was soaked for at least 1 hour at a final concentration between 10-50 mM (10% DMSO).
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.272 |
| 9NIO SARS-CoV-2 NSP14 bound to N-((2-ethynylthiazol-4-yl)methyl)-1H-pyrazole-3-carboxamide 提交 2025-02-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 A1BYG N-[(2-ethynyl-1,3-thiazol-4-yl)methyl]-1H-pyrazole-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Crystals appeared after two weeks when mixed 1:1 ratio with mother liquor containing sodium phosphate monobasic (1.26M to 1.61M) and potassium phosphate dibasic (0.14M to 0.24M). Ligand was soaked for at least 1 hour at a final concentration between 10-50 mM (10% DMSO).
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.230 |
| 9NJG Structure of SARS-CoV-2 NSP14 bound to N-((4-cyclopropylthiazol-2-yl)methyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-3-carboxamide 提交 2025-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 A1BYT N-[(4-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-3-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Crystals appeared after two weeks when mixed 1:1 ratio with mother liquor containing sodium phosphate monobasic (1.26M to 1.61M) and potassium phosphate dibasic (0.14M to 0.24M). Ligand was soaked for at least 1 hour at a final concentration between 10-50 mM (10% DMSO).
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.274 |
| 9NMC SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 3-(6-bromo-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-4-oxoquinolin-1(4H)-yl)propanenitrile 提交 2025-03-04 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3259–3569（311 aa）
|
未记录 | A1BY2 (3P)-6-bromo-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)quinolin-4(1H)-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M NaCl, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.285 |
| 9NMD SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 3-(6-bromo-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-4-oxoquinolin-1(4H)-yl)propanenitrile 提交 2025-03-04 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3259–3569（311 aa）
|
未记录 | A1BY1 3-[(3P)-6-bromo-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-4-oxoquinolin-1(4H)-yl]propanenitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M Bis-TRIS pH 5.5-7.5, 25 % PEG 33500
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.268 |
| 9NME SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 2-[2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-4-oxo-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-8-yl]benzonitrile 提交 2025-03-04 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3259–3569（311 aa）
|
未记录 | A1BY3 (2M)-2-[(3P)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-4-oxo-6-(trifluoromethyl)-1,4-dihydroquinolin-8-yl]benzonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.228 |
| 9NMF SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 8-(6-amino-3-pyridyl)-2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-4-one 提交 2025-03-04 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3259–3569（311 aa）
链 B
3259–3569（311 aa）
|
未记录 | A1BY4 (3P,8M)-8-(6-aminopyridin-3-yl)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinolin-4(1H)-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Lithium Sulfate monohydrate, 0.1M BIS-TRIS pH 5.5-7.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.225 |
| 9NMG SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 8-(2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)-2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-4-one 提交 2025-03-04 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3259–3569（311 aa）
链 B
3259–3569（311 aa）
|
未记录 | A1BY5 (3P,8P)-8-(2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinolin-4(1H)-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5-7.5, 25 % PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.245 |
| 9NMH SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-8-(1,2,3,6-tetrahydropyridin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-4-one 提交 2025-03-04 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3259–3569（311 aa）
|
未记录 | A1BY6 (3P,8P)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-8-(1,2,3,6-tetrahydropyridin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinolin-4(1H)-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M NaCl, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5-7.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.274 |
| 9NNG X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease V186I covalently bound to inhibitor GRL-051-22 at 1.90 A 提交 2025-03-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：V186I | A1BFE (3S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2 K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 9NNW X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease V186F covalently bound to inhibitor GRL-050-23 at 1.55 A 提交 2025-03-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：V186F | A1BMU (3S)-N-{(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]propan-2-yl}-7-fluoro-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.191 |
| 9NPX SARS-CoV-2 nsp1 bound to the Rhinolophus lepidus 40S ribosomal subunit (local refinement of the 40S body) 提交 2025-03-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 j
1–180（180 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 57 K POTASSIUM ION × 13 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.10 Å |
| 9NSK Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor BBH-3 提交 2025-03-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1B20 N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl-3,4-dichloro-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 9NSL Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with with inhibitor BBH-4 提交 2025-03-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1B21 N-[(1S)-1-[(3R,5R,7R)-adamantan-1-yl]-2-({(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-2-oxoethyl]-N~2~-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.200 |
| 9NU6 SARS-CoV-2 main protease with inhibitor 提交 2025-03-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1B3B N-[(3S,4S)-4-(3-chloro-5-fluorophenyl)-1-(1,6-naphthyridine-8-carbonyl)piperidin-3-yl]-N~2~-(trifluoroacetyl)-D-valinamide × 2 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M bis-tris pH 6.5, 32 % (w/v) polyethylene glycol 2000 monomethyl ether
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.217 |
| 9NWA Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with an inhibitor TKB-277-5Cl 提交 2025-03-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1B7C (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(5-chloro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 16 % w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.200 |
| 9NWC Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with an inhibitor TKB-276-5Br 提交 2025-03-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1B7B (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(5-bromo-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-D-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 16% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.227 |
| 9O6D Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro S10A in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231 提交 2025-04-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：S10A 突变：S10A | V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；18-22% (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 9O6E Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro S10C in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231 提交 2025-04-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：S10C 突变：S10C | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；18-22% (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.225 |
| 9O6F Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro S113A in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231 提交 2025-04-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：S113A 突变：S113A | V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；18-22% (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.247 |
| 9O6P Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro S113C in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231 提交 2025-04-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：S113C 突变：S113C | V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；18-22% (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.268 |
| 9O6Q Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro L115A in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231 提交 2025-04-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：L115A 突变：L115A | V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；18-22% (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.237 |
| 9O74 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro L115M in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231 提交 2025-04-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：L115M 突变：L115M | V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；18-22 % (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.240 |
| 9OBH Co-Structure of SARS-CoV-2 3C-like proteinase nsp5 with Compound 34 提交 2025-04-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1CAR (4S)-4-(iminomethyl)-3-(isoquinolin-4-yl)-1-[(1s,3R)-3-(trifluoromethyl)cyclobutyl]imidazolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；25% Peg 1500, 0.1M MIB pH 7.0
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.231 |
| 9OCK Co-Structure of Main Protease of SARS-CoV-2 with Compound 1 提交 2025-04-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1CAS 2-fluoro-N-(isoquinolin-4-yl)-5-(trifluoromethyl)benzamide × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；25 %w/v PEG 1500
0.1 M MIB pH 7
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.211 |
| 9OIX Co-Structure of Main Protease of SARS-CoV-2 with NVP-EGT710 提交 2025-05-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1CBU (4S)-4-(iminomethyl)-3-(isoquinolin-4-yl)-1-[6-(trifluoromethyl)pyridin-3-yl]imidazolidin-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；25 %w/v PEG 1500
0.1 M MIB pH 7
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.231 |
| 9OIZ Co-Structure of Main Protease of SARS-CoV-2 with Compound 11 提交 2025-05-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1CBN (3M)-1-[(2E)-2-iminoethyl]-3-(isoquinolin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinazoline-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；25 %w/v PEG 1500
0.1 M MIB pH 7
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.260 |
| 9OJG Co-Structure of Main Protease of SARS-CoV-2 with Compound 2 提交 2025-05-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1CBY (3M)-3-(isoquinolin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinazoline-2,4(3H,8H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；25 %w/v PEG 1500
0.1 M MIB pH 7
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.244 |
| 9OJT Co-Structure of Main Protease of SARS-CoV-2 with Compound 10 提交 2025-05-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1CB2 (3M)-3-(3-ethylisoquinolin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinazoline-2,4(1H,3H)-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；25 %w/v PEG 1500
0.1 M MIB pH 7
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.248 |
| 9OPM Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro S147A in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231 提交 2025-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：S147A 突变：S147A | V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；18-22% (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.220 |
| 9OPN Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro S147N in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231 提交 2025-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
突变：S147N 突变：S147N | V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；18-22% (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.213 |
| 9P6F Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor SR-B-78 提交 2025-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1CG8 (1R,2S,5S)-N-[(1S,2Z)-2-imino-1-(5-methoxypyridin-3-yl)ethyl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.303 |
| 9P6P Crystal Structure of the SARS-CoV-2 2'-O-Methyltransferase with (m7GpppA)pUpU (Cap-0) and S-Adenosyl-L-homocysteine (SAH). 提交 2025-06-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 CL CHLORIDE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 10 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；Protein: 3.8 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: Classics II (B3), 0.5M Magnesium formate, 0.1M HEPES pH 7.5;
Soak: 0.5 hours, 0.2mM m7GpppAUU, 5mM SAH, in 2M Lithium sulfate.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.193 |
| 9P6P Crystal Structure of the SARS-CoV-2 2'-O-Methyltransferase with (m7GpppA)pUpU (Cap-0) and S-Adenosyl-L-homocysteine (SAH). 提交 2025-06-19 | Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
6799–7096（298 aa）
链 D
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 CL CHLORIDE ION × 7 SO4 SULFATE ION × 9 ZN ZINC ION × 2 MGT 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；Protein: 3.8 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: Classics II (B3), 0.5M Magnesium formate, 0.1M HEPES pH 7.5;
Soak: 0.5 hours, 0.2mM m7GpppAUU, 5mM SAH, in 2M Lithium sulfate.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.193 |
| 9PA9 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro with ALG-097608 (Inhibitor 1) 提交 2025-06-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3564（301 aa）
|
未记录 | A1CHF (1R,2R,3S,6S,7S)-4-[(2S)-3,3-dimethyl-2-(2,2,2-trifluoroacetamido)butanoyl]-10,10-difluoro-N-{(1E,2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl]propan-2-yl}-4-azatricyclo[5.2.1.0~2,6~]decane-3-carboxamide (non-preferred name) × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM Sodium Phosphate monobasic and 0.1 M MES pH 6.0 and 20% PEG 4000
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.221 |
| 9PAH Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro with ALG-097655 (Inhibitor 2) 提交 2025-06-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1CHJ (1R,2S,3S,6R,7S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-[(2S)-4,4,4-trifluoro-3,3-dimethyl-2-(2,2,2-trifluoroacetamido)butanoyl]-4-azatricyclo[5.2.1.0~2,6~]dec-8-ene-3-carboxamide (non-preferred name) × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 mM Sodium Phosphate monobasic and 0.1 M MES pH 6.0 and 20% PEG 4000
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.244 |
| 9PBC Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) L50F/E166V Double Mutant 提交 2025-06-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
突变：L50F, E166V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.259 |
| 9PJG SARS-CoV2 Mpro bound to compound 1 提交 2025-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；Morpheus condition F5
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.187 |
| 9PKR SARS-CoV2 main protease bound to compound 26 提交 2025-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
链 B
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；22% w/v PEG 3350, 0.2 M Na2SO4
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.201 |
| 9PUH SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 11 提交 2025-07-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1564–1877（314 aa）
|
突变：C111S | A1CLE 1'-methylspiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/mL protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.244 |
| 9PUH SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 11 提交 2025-07-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1877（314 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/mL protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.244 |
| 9PUH SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 11 提交 2025-07-31 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1564–1877（314 aa）
|
突变：C111S | A1CLE 1'-methylspiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/mL protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.244 |
| 9PUJ SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 17 提交 2025-07-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1877（314 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CLF 1'-methylspiro[naphtho[1,2-b]pyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/mL protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 9PUY SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 27 提交 2025-07-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1563–1879（317 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CLD 7,8-dimethyl-1'-[(pyridin-2-yl)methyl]spiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/ml protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.205 |
| 9PUY SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 27 提交 2025-07-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1563–1879（317 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CLD 7,8-dimethyl-1'-[(pyridin-2-yl)methyl]spiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/ml protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.205 |
| 9PUY SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 27 提交 2025-07-31 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1563–1879（317 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CLD 7,8-dimethyl-1'-[(pyridin-2-yl)methyl]spiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/ml protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.205 |
| 9PUY SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 27 提交 2025-07-31 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1563–1879（317 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CLD 7,8-dimethyl-1'-[(pyridin-2-yl)methyl]spiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/ml protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.205 |
| 9PV6 SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 37 提交 2025-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1563–1879（317 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 A1CLN (7M)-8-methyl-7-(2-methylpyridin-4-yl)-1'-[(pyridin-2-yl)methyl]spiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；50 mM HEPES pH = 7.0, Tryptone 2-4 % w/v and 10-16 % PEG-3350
12 mg/mL protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.202 |
| 9PV9 SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 46 提交 2025-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1563–1879（317 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CLP (7M)-8-methyl-1'-{[6-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-2-yl]methyl}-7-(2-methylpyridin-4-yl)-3,4-dihydrospiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidine] × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；50 mM HEPES pH = 7.0, Tryptone 2-4 % w/v and 10-16 % PEG-3350
12 mg/ mL portein
1:1 drop ratio
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.237 |
| 9PVI SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 47 提交 2025-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1563–1879（317 aa）
|
突变：C111S | ZN ZINC ION × 1 A1CLO (7M)-8-methyl-7-(2-methylpyridin-4-yl)-1'-{[(6P)-6-(1H-pyrazol-5-yl)pyridin-2-yl]methyl}-3,4-dihydrospiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidine] × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；50 mM HEPES pH = 7.0, Tryptone 2-4 % w/v and 10-16 % PEG-3350
12 mg/mL protein
1:1 drop ratio
crystallization with weak affinity ligand then back soak with desired ligand for 2 days prior to freezing
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.257 |
| 9PVK SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 53 提交 2025-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1563–1879（317 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 A1CLL (7M)-8-methyl-1'-{[5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-2-yl]methyl}-7-(2-methylpyridin-4-yl)-3,4-dihydrospiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidine] × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；50 mM HEPES pH = 7.0, Tryptone 2-4 % w/v and 10-16 % PEG-3350
12 mg/mL protein
1:1 drop ratio
cocrystalised with weak affinity ligand then back soaked with ligand of interest
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.248 |
| 9PYS NMR RDC refinement of the helical domain of the SARS-CoV-2 monomeric Main Protease (MPROH41Q,10-306) 提交 2025-08-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：H41Q | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.9；288 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR测量条件
pH 6.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成
20 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 25 mM HEPES, 1 mM TCEP, 500 uM [U-13C; U-15N; U-2H] MPro(10-306,H41Q), 97% H2O / 3% D2O | 97% H2O / 3% D2O
NMR样品组成
20 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 25 mM HEPES, 1 mM TCEP, 500 uM [U-13C; U-15N; U-2H] MPro(10-306,H41Q), 13 mg/mL Pf1 phage, 97% H2O / 3% D2O | 97% H2O / 3% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9PYT NMR RDC refinement of the catalytic domain of the SARS-CoV-2 monomeric Main Protease (MPROH41Q,10-306) 提交 2025-08-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：H41Q | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.9；288 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR测量条件
pH 6.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成
20 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 25 mM HEPES, 1 mM TCEP, 500 uM [U-13C; U-15N; U-2H] MPro(10,306,H41Q), 97% H2O / 3% D2O | 97% H2O / 3% D2O
NMR样品组成
20 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 25 mM HEPES, 1 mM TCEP, 430 uM [U-13C; U-15N; U-2H] MPro(10,306,H41Q), 13 mg/mL Pf1 phage, 97% H2O / 3% D2O | 97% H2O / 3% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9PYW SARS-CoV-2 nsp7, nsp8 and nsp12 bound to a primer-template pair with incorporated ara-UMP 提交 2025-08-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9PYZ SARS-CoV-2 core polymerase complex bound to RNA, araUMP, and UTP 提交 2025-08-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9PZ0 SARS-CoV-2 core polymerase complex with two UTP incorporation 提交 2025-08-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
链 D
3943–4140（198 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9Q1J Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 E191A mutant-T20P14-R complex 提交 2025-08-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 A
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 B
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
链 C
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 D
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
链 G
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 H
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
链 I
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 J
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
|
突变：E191A 突变：E191A 突变：E191A 突变：E191A | ZN ZINC ION × 20 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å |
| 9Q7S Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in complex with Jun13735 提交 2025-08-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1CR4 methyl {(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-{[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-5-(methylsulfanyl)-1-oxopentan-3-yl]carbamoyl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexan-3-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate (non-preferred name) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.07 M Bis-Tris (pH 8.0), 25% PEG 335
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.235 |
| 9Q8H SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative BDH 34019023 提交 2025-02-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6799–7096（298 aa）
链 B
4254–4392（139 aa）
|
未记录 | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 NA SODIUM ION × 2 A1I4H 9-[(3~{R},4~{R})-1-(3-azanylpropanoyl)-4-oxidanyl-pyrrolidin-3-yl]-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293.15 K；400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.219 |
| 9QD5 Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RS222C 提交 2025-03-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
片段：NONE
链 B
3264–3569（306 aa）
片段：NONE
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 NA SODIUM ION × 2 A1I6A 2-chloranyl-~{N}-[(~{R})-[1-(phenylmethyl)-1,2,3,4-tetrazol-5-yl]-pyridin-3-yl-methyl]-~{N}-(4-phenylphenyl)ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；100 mM MES pH 6.7, 11% PEG 4000 and 5% DMSO
150 nL Protein (5 mg/mL), 150 nL Crystallisation condition, 50 nL seed stock (1:250)
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.232 |
| 9QRA SARS-CoV-2 nsp14 with 1-(4-methylphenyl)-2-(2-methylsulfanyl-4,5-dihydroimidazol-1-yl)ethanone 提交 2025-04-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | A1I9H 1-(4-methylphenyl)-2-(2-methylsulfanylimidazol-1-yl)ethanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.249 |
| 9QRB SARS-CoV-2 nsp14 with 2,5-dichlorothiophene-3-sulfonamide 提交 2025-04-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | A1AYN 2,5-dichlorothiophene-3-sulfonamide × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.233 |
| 9QRB SARS-CoV-2 nsp14 with 2,5-dichlorothiophene-3-sulfonamide 提交 2025-04-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | A1AYN 2,5-dichlorothiophene-3-sulfonamide × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.233 |
| 9QRC SARS-CoV-2 nsp14 with 6-methyl-2-[(4-methylphenyl)methyl]pyridazin-3-one 提交 2025-04-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | A1I9I 6-methyl-2-[(4-methylphenyl)methyl]pyridazin-3-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 9QRD SARS-CoV-2 nsp14 with ethyl 2-(1H-indol-3-yl)acetate 提交 2025-04-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | A1I9J ethyl 2-(1~{H}-indol-3-yl)ethanoate × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.228 |
| 9QRE SARS-CoV-2 nsp14 with 2,5-dimethylpyrazol-3-amine 提交 2025-04-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | A1I9K 2,5-dimethylpyrazol-3-amine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.250 |
| 9QS5 SARS-CoV-2 nsp14 with 5-(thiophen-2-ylmethylamino)-3H-1,3,4-thiadiazole-2-thione 提交 2025-04-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1I9Y 5-(thiophen-2-ylmethylamino)-3~{H}-1,3,4-thiadiazole-2-thione × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.249 |
| 9QS5 SARS-CoV-2 nsp14 with 5-(thiophen-2-ylmethylamino)-3H-1,3,4-thiadiazole-2-thione 提交 2025-04-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1I9Y 5-(thiophen-2-ylmethylamino)-3~{H}-1,3,4-thiadiazole-2-thione × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.249 |
| 9QXB SARS-CoV-2 nsp14 with N-methyl-1-(2-methyl-5-phenylpyrazol-3-yl)methanamine 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | X6W methyl-3-methyl-5-phenyl-2H-pyrazol-4-methyl amine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.252 |
| 9QXC SARS-CoV-2 nsp14 with 1-benzofuran-3-carboxylic acid 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | A1JA8 1-benzofuran-3-carboxylic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.241 |
| 9QXD SARS-CoV-2 nsp14 with 2-(1H-indol-3-yl)ethanol 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | ZCW 2-(1H-indol-3-yl)ethanol × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.245 |
| 9QXE SARS-CoV-2 nsp14 with benzenesulfonamide 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | FB2 benzenesulfonamide × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.232 |
| 9QXF SARS-CoV-2 nsp14 with 5-chlorothiophene-2-sulfonamide 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 8K2 5-chloranylthiophene-2-sulfonamide × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.250 |
| 9QXG SARS-CoV-2 nsp14 with 3,4-dichlorobenzenesulfonamide 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | A1JBC 3,4-dichlorobenzenesulfonamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.257 |
| 9QXH SARS-CoV-2 nsp14 with 2,5-dichloro-4-methylthiophene-3-sulfonamide 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | A1JBA 2,5-dichloro-4-methylthiophene-3-sulfonamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.257 |
| 9QXI SARS-CoV-2 nsp14 with 2,5-dichlorothiophene-3-sulfonic acid 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | A1JA9 2,5-dichlorothiophene-3-sulfonic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.247 |
| 9QXK SARS-CoV-2 nsp14 with thiophene-3-sulfonamide 提交 2025-04-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5932–6452（521 aa）
|
未记录 | A1JBB thiophene-3-sulfonamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.233 |
| 9R5T NSP14 IN COMPLEX WITH LIGAND TDI-016037-NX-1 提交 2025-05-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5926–6452（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 A1JDF ~{N}-[(1-cyclopropyl-6-fluoranyl-indazol-7-yl)methyl]-1,5-dimethyl-4-[(7-methyl-2~{H}-indazol-5-yl)sulfonyl]pyrrole-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；isopropanol, imidazole
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.227 |
| 9R5T NSP14 IN COMPLEX WITH LIGAND TDI-016037-NX-1 提交 2025-05-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6452（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 A1JDF ~{N}-[(1-cyclopropyl-6-fluoranyl-indazol-7-yl)methyl]-1,5-dimethyl-4-[(7-methyl-2~{H}-indazol-5-yl)sulfonyl]pyrrole-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 IMD IMIDAZOLE × 4 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；isopropanol, imidazole
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.227 |
| 9S0M Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 1 提交 2025-07-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5926–6450（525 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 IMD IMIDAZOLE × 1 A1JKS (2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)oxolane-3,4-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.283 |
| 9S0M Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 1 提交 2025-07-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6450（525 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 IMD IMIDAZOLE × 1 A1JKS (2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)oxolane-3,4-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.283 |
| 9S2V NSP14 IN COMPLEX WITH LIGAND TDI-014925-CL-2 (compound 58) 提交 2025-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5926–6452（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 A1JLH ~{N}-[(6-fluoranyl-1-methyl-indazol-7-yl)methyl]-1,5-dimethyl-4-(1,4,6,7-tetrahydropyrazolo[4,3-c]pyridin-5-ylsulfonyl)pyrrole-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 3 IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；isopropanol and imidazole, pH 7.0
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.245 |
| 9S2V NSP14 IN COMPLEX WITH LIGAND TDI-014925-CL-2 (compound 58) 提交 2025-07-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6452（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 A1JLH ~{N}-[(6-fluoranyl-1-methyl-indazol-7-yl)methyl]-1,5-dimethyl-4-(1,4,6,7-tetrahydropyrazolo[4,3-c]pyridin-5-ylsulfonyl)pyrrole-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2 IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；isopropanol and imidazole, pH 7.0
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.245 |
| 9SAJ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 5 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5926–6450（525 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 IMD IMIDAZOLE × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 A1JMY 1-[2-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanyl]ethyl]-3-ethyl-urea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.239 |
| 9SAJ Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 5 提交 2025-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6450（525 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 IMD IMIDAZOLE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 CL CHLORIDE ION × 1 A1JMY 1-[2-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanyl]ethyl]-3-ethyl-urea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.239 |
| 9SAK Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 6 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5926–6450（525 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1JMZ (2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-(naphthalen-2-ylsulfanylmethyl)oxolane-3,4-diol × 1 IMD IMIDAZOLE × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.249 |
| 9SAK Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 6 提交 2025-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6450（525 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1JMZ (2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-(naphthalen-2-ylsulfanylmethyl)oxolane-3,4-diol × 1 IMD IMIDAZOLE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.249 |
| 9SAL Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 18 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5926–6450（525 aa）
|
未记录 | A1JM0 (2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-2-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)-5-[6-(methylamino)purin-9-yl]oxolane-3,4-diol × 1 IMD IMIDAZOLE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.226 |
| 9SAL Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 18 提交 2025-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6450（525 aa）
|
未记录 | A1JM0 (2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-2-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)-5-[6-(methylamino)purin-9-yl]oxolane-3,4-diol × 1 IMD IMIDAZOLE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.226 |
| 9SAM Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 26 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5926–6450（525 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 IMD IMIDAZOLE × 1 A1JM1 (1~{R},2~{S},3~{R},5~{S})-3-(6-aminopurin-9-yl)-5-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)cyclopentane-1,2-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.229 |
| 9SAM Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 26 提交 2025-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6450（525 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 IMD IMIDAZOLE × 3 A1JM1 (1~{R},2~{S},3~{R},5~{S})-3-(6-aminopurin-9-yl)-5-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)cyclopentane-1,2-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.229 |
| 9SAN Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 27 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5926–6450（525 aa）
|
未记录 | A1JM2 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-2-(4-azanylpyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)oxolane-3,4-diol × 1 IMD IMIDAZOLE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.264 |
| 9SAN Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 27 提交 2025-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5926–6450（525 aa）
|
未记录 | A1JM2 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-2-(4-azanylpyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)oxolane-3,4-diol × 1 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.264 |
| 9SAO Cryo-EM structure of SARS CoV-2 RdRp S759A mutant in complex with 20-40mer RNA incorporating remdesivir 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
4397–5324（928 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 75 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9SAP Cryo-EM structure of SARS CoV-2 RdRp wild-type in complex with 20-40mer RNA incorporating Remdesivir 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
4397–5324（928 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 75 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9SAQ Cryo-EM structure of SARS CoV-2 RdRp S759A mutant in complex with 20-40mer RNA incorporating ATP 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
4397–5324（928 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 75 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9SAR Cryo-EM structure of SARS CoV-2 RdRp wild-type in complex with 20-40mer RNA incorporating ATP 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
4397–5324（928 aa）
链 B
3943–4140（198 aa）
链 C
3860–3942（83 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 75 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9TH6 nsp14 of SARS-CoV-2 in complex with a camelid nanobody 提交 2025-12-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
5926–6452（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；22,5-26,25% w/v PEG 3350, 0.1 M Bis Tris propane, 0.2 M sodium fluoride
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.290 |
| 9U7D Crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease (Cys111Ser) in complex with YL1004 提交 2025-03-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1875（312 aa）
|
突变：C111S | A1EOE (4~{a}~{S})-8-azanyl-3-methyl-~{N}-[1-[4-(oxan-4-ylamino)naphthalen-1-yl]cyclopropyl]-2,4,4~{a},5-tetrahydro-1~{H}-pyrazino[2,1-c][1,4]benzoxazine-9-carboxamide × 2 ZN ZINC ION × 16 CL CHLORIDE ION × 12 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；6% (w/v) PEG8000, 100 mM MES/Sodium hydroxide pH 6.0, 200 mM zinc acetate and 20% PEG400
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.231 |
| 9U96 SARS-CoV2 Main protease(Mpro) complexed with TAB1 peptide 提交 2025-03-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3567（304 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG3350, Magnesium formate dihydrate
|
分辨率 3.43 Å R-free 0.245 |
| 9U96 SARS-CoV2 Main protease(Mpro) complexed with TAB1 peptide 提交 2025-03-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3264–3567（304 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG3350, Magnesium formate dihydrate
|
分辨率 3.43 Å R-free 0.245 |
| 9UHT SARS-CoV-2 E-RTC in complex with RNA-nsp9 and GMPPNP 提交 2025-04-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 A
4393–5324（932 aa）
片段：UNP RESIDUES 4393-5324
链 B
3943–4140（198 aa）
片段：UNP RESIDUES 3943-4140
链 C
3860–3937（78 aa）
片段：UNP RESIDUES 3860-3942
链 D
3943–4140（198 aa）
片段：UNP RESIDUES 3943-4140
链 E
5325–5917（593 aa）
片段：UNP RESIDUES 5325-5925
链 F
5325–5917（593 aa）
片段：UNP RESIDUES 5325-5925
链 G
4141–4253（113 aa）
片段：UNP RESIDUES 4141-4253
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å |
| 9UX6 SARS-CoV2 Main protease(Mpro) complexed with RIP1 peptide 提交 2025-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
链 B
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG3350, Magnesium formate dihydrate
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.228 |
| 9UX6 SARS-CoV2 Main protease(Mpro) complexed with RIP1 peptide 提交 2025-05-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
3264–3569（306 aa）
链 D
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG3350, Magnesium formate dihydrate
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.228 |
| 9VAO Crystal structure of Papain-like protease (PLpro) from SARS-CoV-2 提交 2025-06-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1877（314 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；Tris buffer pH 8.0, Sodium dihydrogen phosphate/Potassium hydrogen phosphate
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.224 |
| 9VCK Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10/nsp14:RNA:SMP complex 提交 2025-06-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
4254–4384（131 aa）
链 B
5927–6448（522 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 K5X [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-4-fluoranyl-4-methyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.22 Å |
| 9VCL Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10/nsp14:RNA:ATMP complex 提交 2025-06-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
4254–4392（139 aa）
链 B
5926–6452（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 EIF [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-fluoranyl-4-methyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 9VUW Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease with a deletion of Asn51 提交 2025-07-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.12 M Alcohols, 0.1 M Buffer System 2 pH 7.5, 37.5% v/v Precipitant Mix 4
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.211 |
| 9VWY Crystal structure of C270S mutant of Papain-like protease (PLpro) from SARS-CoV-2 提交 2025-07-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1877（314 aa）
|
突变：C270S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；Tris buffer pH 8.0, Sodium dihydrogen phosphate/Potassium hydrogen phosphate
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.195 |
| 9WHE A novel, covalent and highly synthetically accessible SARS-CoV-2 Mpro chloroacetamide inhibitor 提交 2025-08-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | A1MBL (2~{R})-~{N}-[4,4-bis(fluoranyl)cyclohexyl]-2-[ethanoyl-[4-(1,2-thiazol-5-yl)phenyl]amino]-2-pyrazin-2-yl-ethanamide × 2 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 26 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；291 K；0.2 M LiSO4, pH 7.9, 12% PEG3350
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.276 |
| 9XFR The crystal structure of SARS-CoV-2 Main protease in complex with inhibitor FD2-12 提交 2025-10-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | A1EZ6 2-(2-chlorophenyl)-7-(5-methylpyridin-3-yl)-5,7-diazaspiro[3.4]octane-6,8-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；289.15 K；0.10% w/v n-Octyl-b-D-glucoside, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 22% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.251 |
| 9XG2 The crystal structure of SARS-CoV-2 Main protease in complex with inhibitor FD2-21 提交 2025-10-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
未记录 | A1EZ7 7-(5-azanylpyridin-3-yl)-2-(2-chlorophenyl)-5,7-diazaspiro[3.4]octane-6,8-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.237 |
| 9XYM Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in complex with Jun13698 提交 2025-08-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1CR5 (1R,2S,5S)-6,6-dimethyl-N-[(2S)-4-(methylsulfanyl)-1-oxobutan-2-yl]-3-[N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.07 M Bis-Tris (pH 8.0), 25% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.87 Å R-free 0.253 |
| 9XYX Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) T169S Mutant 提交 2025-08-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：T169S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.260 |
| 9XYZ Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) E166V Mutant 提交 2025-08-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
|
突变：E166V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.277 |
| 9XZ6 Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in complex with Jun13699 提交 2025-08-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1CR3 methyl {(2S)-1-[(1R,2S,5S)-6,6-dimethyl-2-{[(2S)-4-(methylsulfanyl)-1-oxobutan-2-yl]carbamoyl}-3-azabicyclo[3.1.0]hexan-3-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.07 M Bis-Tris (pH 8.0), 25% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.47 Å R-free 0.262 |
| 9YRK Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 (E191A) in complex with T20P14-B complex, dimeric form 提交 2025-10-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 B
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
链 C
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 D
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2 EIF [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-fluoranyl-4-methyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9YRL Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 (E191A) in complex with T20P14-B complex, protomer A focused refinement 提交 2025-10-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
4254–4392（139 aa）
片段：UNP residues 4254-4392
链 B
5926–6452（527 aa）
片段：UNP residues 5926-6452
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 EIF [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-fluoranyl-4-methyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9YRN Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 (E191A) in complex with T20P14-S complex, tetrameric form 提交 2025-10-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：12-meric（12） 与全部聚合物一致 |
链 A
4254–4392（139 aa）
链 B
5926–6452（527 aa）
链 C
4254–4392（139 aa）
链 D
5926–6452（527 aa）
链 G
4254–4392（139 aa）
链 H
5926–6452（527 aa）
链 I
4254–4392（139 aa）
链 J
5926–6452（527 aa）
|
突变：E191A 突变：E191A 突变：E191A 突变：E191A | ZN ZINC ION × 20 MG MAGNESIUM ION × 6 K5X [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-4-fluoranyl-4-methyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 9YRO Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 (E191A) in complex with T20P14-S complex, monomeric form 提交 2025-10-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
4254–4392（139 aa）
链 B
5926–6452（527 aa）
|
突变：E191A | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 K5X [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-4-fluoranyl-4-methyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.55 Å |
| 9Z0C SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 7 提交 2025-10-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1563–1879（317 aa）
|
未记录 | A1CZV (7M)-1',8-dimethyl-7-(2-methylpyridin-4-yl)spiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；10-16 % PEG-3350, 2-4% Tryptone, 50 mM HEPES pH = 7.0
1:1 drop ratio
corcrystal:14 mg/mL protein incubated with 10 mM ligand 1 h before drop set up
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.252 |
| 9Z0D SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 41 提交 2025-10-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 A1CZW N'-[3-(2-{[(7M)-8-methyl-7-(2-methylpyridin-4-yl)-3,4-dihydrospiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-1'-yl]methyl}pyridin-3-yl)propanoyl]-4-(2-oxa-6-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)-4-oxobutanehydrazide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20-24 % PEG-3350, 150-300 mM Magnesium formate
1:1 drop ratio
crocrystalisation. 16 mg/mL protein incubated in 10 mM ligand 1 hour before tray set up
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.238 |
| 9Z0D SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 41 提交 2025-10-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 A1CZW N'-[3-(2-{[(7M)-8-methyl-7-(2-methylpyridin-4-yl)-3,4-dihydrospiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-1'-yl]methyl}pyridin-3-yl)propanoyl]-4-(2-oxa-6-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)-4-oxobutanehydrazide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20-24 % PEG-3350, 150-300 mM Magnesium formate
1:1 drop ratio
crocrystalisation. 16 mg/mL protein incubated in 10 mM ligand 1 hour before tray set up
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.238 |
| 9Z0D SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 41 提交 2025-10-31 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 A1CZW N'-[3-(2-{[(7M)-8-methyl-7-(2-methylpyridin-4-yl)-3,4-dihydrospiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-1'-yl]methyl}pyridin-3-yl)propanoyl]-4-(2-oxa-6-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)-4-oxobutanehydrazide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20-24 % PEG-3350, 150-300 mM Magnesium formate
1:1 drop ratio
crocrystalisation. 16 mg/mL protein incubated in 10 mM ligand 1 hour before tray set up
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.238 |
| 9Z0D SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 41 提交 2025-10-31 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1564–1878（315 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 A1CZW N'-[3-(2-{[(7M)-8-methyl-7-(2-methylpyridin-4-yl)-3,4-dihydrospiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-1'-yl]methyl}pyridin-3-yl)propanoyl]-4-(2-oxa-6-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)-4-oxobutanehydrazide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20-24 % PEG-3350, 150-300 mM Magnesium formate
1:1 drop ratio
crocrystalisation. 16 mg/mL protein incubated in 10 mM ligand 1 hour before tray set up
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.238 |
| 9Z6B Crystal structure of SARS-CoV-2 PLpro in complex with compound 10 提交 2025-11-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1881（318 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 A1C09 methyl 4-{[(2E)-2-{[(2S)-3-amino-2-{1-[(1R)-1-(naphthalen-1-yl)ethyl]piperidin-4-yl}propanoyl]imino}acetyl]amino}butanoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.8 M sodium/potassium phosphate pH 8.2
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.261 |
| 9Z6C Crystal structure of SARS-CoV-2 PLpro in complex with compound 14 提交 2025-11-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1564–1881（318 aa）
|
未记录 | A1C1A methyl 4-{[(2E)-2-{[(2S)-3-amino-2-(1-{(1R)-1-[7-(propan-2-yl)naphthalen-1-yl]ethyl}piperidin-4-yl)propanoyl]imino}acetyl]amino}butanoate × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290.15 K；3.5 M Sodium formate
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.247 |
| 9Z6C Crystal structure of SARS-CoV-2 PLpro in complex with compound 14 提交 2025-11-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1564–1881（318 aa）
|
未记录 | A1C1A methyl 4-{[(2E)-2-{[(2S)-3-amino-2-(1-{(1R)-1-[7-(propan-2-yl)naphthalen-1-yl]ethyl}piperidin-4-yl)propanoyl]imino}acetyl]amino}butanoate × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290.15 K；3.5 M Sodium formate
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.247 |
| 9Z74 X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease V186G covalently bound to inhibitor Nirmatrelvir at 1.81 A 提交 2025-11-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
突变：V186G | 4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.206 |
| 9ZJ1 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor NN-IV-169 提交 2025-12-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
链 B
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.50 Å R-free 0.192 |
| 9ZJ2 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor AMJ-II-122 提交 2025-12-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
链 B
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.50 Å R-free 0.188 |
| 9ZJ3 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor AMJ-II-72 提交 2025-12-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
链 B
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å R-free 0.231 |
| 9ZJ4 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor IKR-I-45 提交 2025-12-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.44 Å R-free 0.266 |
| 9ZJ5 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor IKR-I-52 提交 2025-12-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.76 Å R-free 0.218 |
| 9ZJ6 Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor PSR-I-162 提交 2025-12-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
链 B
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.52 Å R-free 0.181 |
| 9ZNL X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease covalently bound to inhibitor GRL-050-22 at 1.16 A 提交 2025-12-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1C3L (3S)-N-[(1S,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-1-(4-phenyl-1,3-thiazol-2-yl)propan-2-yl]-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.159 |
| 9ZO3 X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease covalently bound to inhibitor GRL-062-22 at 1.65 A 提交 2025-12-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3569（306 aa）
|
未记录 | A1C3M (3S)-N-{(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.196 |
| 9ZZH Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor CSD-V-169 提交 2026-01-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
链 B
3264–3568（305 aa）
片段：Full Length
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.87 Å R-free 0.212 |