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10DV
Room Temperature X-Ray Structure of SARS CoV-2 Main Protease Intermediate Precursor with Ensitrelvir (ESV)
提交 2026-01-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3572(309 aa)
链 B
3264–3572(309 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5 or 7.0
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.234
|
|
11RO
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro with UM-005
提交 2026-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1DAK N-(trifluoroacetyl)-D-phenylalanyl-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.71 Å
R-free 0.239
|
|
12AF
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro with UM-067
提交 2026-03-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
A1DA8 N-(trifluoroacetyl)-D-phenylalanyl-3-cyclopropyl-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.266
|
|
13MI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12860
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1AY5 (furan-2-yl)(thiomorpholin-4-yl)methanone × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.194
|
|
13MJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13647
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CT0 2-fluorobenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.202
|
|
13MK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12961
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1AYD N-(2,4-difluorophenyl)-N'-methylthiourea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.26 Å
R-free 0.196
|
|
13ML
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13431
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CT1 N-[(pyridin-3-yl)methyl]benzenecarbothioamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.213
|
|
13MM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13408
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
6OT 3,5-dichlorobenzene-1-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.14 Å
R-free 0.193
|
|
13MN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12338
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CT2 4-(piperazin-1-yl)phenol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.229
|
|
13MO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with TD1471
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CUB 4-acetylbenzene-1-sulfonamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.205
|
|
13MP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with TD1452
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CUC 3-chlorobenzene-1-sulfonamide × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.42 Å
R-free 0.245
|
|
13MQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13639
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
VN9 3,4-dihydro-1~{H}-quinolin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.196
|
|
13MR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13275
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CUD N-(2-fluorophenyl)pyridine-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.204
|
|
13MS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13952
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CUE 3-oxo-3-(piperidin-1-yl)propanenitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.18 Å
R-free 0.198
|
|
13MT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14022
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
X4P 2-chloropyridine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.190
|
|
13MU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with FL0184
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1AY2 2-methoxy-7,7-dimethyl-6,7-dihydro-5H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-5-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.190
|
|
13MV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12895
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CUK 1,3-dihydro-2-benzofuran-5-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.47 Å
R-free 0.222
|
|
13MW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PDK0219
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CUL (7S)-6-(5-chloropyridin-2-yl)-7-hydroxy-6,7-dihydro-5H-pyrrolo[3,4-b]pyrazin-5-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.194
|
|
13MX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13509
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CUM N-(2-methylphenyl)morpholine-4-carbothioamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.190
|
|
13MY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12362
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CUO 2,2-dimethyl-N-(pyridin-4-yl)propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.195
|
|
13MZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14473
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CUP N-(2,4-dimethylphenyl)-N'-[(pyridin-4-yl)methyl]thiourea × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.204
|
|
13NA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12973
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CUQ 3-(1H-pyrrol-1-yl)benzene-1-carbothioamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.37 Å
R-free 0.209
|
|
13NB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14425
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CUR N-(2-{[(furan-2-yl)methyl]sulfanyl}ethyl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.81 Å
R-free 0.230
|
|
13NC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12597
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CUS 6-methyl-2-phenyl-4,5-dihydropyridazin-3(2H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.174
|
|
13ND
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13652
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CUU 5-tert-butyl-2,4-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.188
|
|
13NE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PDK0362
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
0OL phenyl(piperidin-1-yl)methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.189
|
|
13NF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14399
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CUV (4S)-4-(prop-2-en-1-yl)-5-propyl-2,4-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.208
|
|
13NG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12572
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
60Q 2-pyrrol-1-ylbenzoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.200
|
|
13NH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13189
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1EE6 N-[(4-fluorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-butanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.67 Å
R-free 0.222
|
|
13NI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12139
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
F2L ~{N}-[2,6-bis(fluoranyl)phenyl]ethanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.181
|
|
13NJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13190
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
XZT 1-(2,4-difluorophenyl)pyrrolidine-2,5-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.199
|
|
13NK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13409
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1JBC 3,4-dichlorobenzenesulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.238
|
|
13NL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14367
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CUW 2-(2-fluorophenyl)-N-[(1R,3s,5S)-8-methyl-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.13 Å
R-free 0.212
|
|
13NM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12910
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CUX 3-(phenoxymethyl)aniline × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.211
|
|
13NN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with T0407
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
W1P 5-methyl-2-phenyl-2,4-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.59 Å
R-free 0.223
|
|
13NO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13239
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CUY [2-(phenoxymethyl)phenyl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.61 Å
R-free 0.214
|
|
13NP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13464
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1AYN 2,5-dichlorothiophene-3-sulfonamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.18 Å
R-free 0.214
|
|
13NQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13430
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1AY4 3-methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1,3-benzoxazole-6-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.220
|
|
13NR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr16749
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CU2 N-methyl-N-phenylthiourea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.207
|
|
13NS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14426
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CU4 N-(2,6-dimethylphenyl)-N'-[(pyridin-3-yl)methyl]thiourea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.207
|
|
13NT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12169
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CU5 1-[2-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl]methanamine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.203
|
|
13NU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13806
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CU6 1,1'-(piperidine-1,4-diyl)di(ethan-1-one) × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.188
|
|
13NV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12938
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1AY6 {3-[(pyridin-2-yl)oxy]phenyl}methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.86 Å
R-free 0.226
|
|
13NW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13256
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CU9 4-(4-methyl-1,4-diazepan-1-yl)benzonitrile × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.37 Å
R-free 0.215
|
|
13NX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13501
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CVA N-[3-(trifluoromethyl)phenyl]hydrazinecarbothioamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.24 Å
R-free 0.225
|
|
13NY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13835
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1AA8 2-(methylsulfanyl)pyridine-3-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.197
|
|
13NZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14215
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
W77 2,4-dichloro-N-(pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.185
|
|
13OA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13232
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1AYG 6-(2,3-dimethylphenoxy)pyridin-3-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.12 Å
R-free 0.194
|
|
13OB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12754
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CVB 1-[2-(morpholin-4-yl)phenyl]methanamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.213
|
|
13OC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13508
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
SNJ 2,5-diphenyl-4~{H}-pyrazol-3-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.186
|
|
13OD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12214
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
9TW 3-chloranyl-4-fluoranyl-benzamide × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.207
|
|
13OE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12542
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CVC 1-[4-(1H-imidazol-1-yl)phenyl]ethan-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.183
|
|
13OF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13009
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CVD 6-(2-fluorophenoxy)pyridin-3-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.42 Å
R-free 0.215
|
|
13OG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12109
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
V4X 3-oxo-3-(thiomorpholin-4-yl)propanenitrile × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.212
|
|
13OH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12970
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CVE N-cyclohexyl-N'-(2-hydroxyethyl)thiourea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.209
|
|
13OI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13020
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
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突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CVH N-methyl-1-[3-(piperidin-1-yl)phenyl]methanamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.86 Å
R-free 0.224
|
|
13OJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13319
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1EM9 [4-(4-methyl-1,4-diazepan-1-yl)phenyl]methanamine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.41 Å
R-free 0.209
|
|
13OK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13487
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CVF N-methyl-1-[4-(4-methyl-1,4-diazepan-1-yl)phenyl]methanamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.190
|
|
13OL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14108
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CVI thiophene-2-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.190
|
|
13OM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13521
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CVJ (4S)-4-methyl-N-(propan-2-yl)-6,7-dihydrothieno[3,2-c]pyridine-5(4H)-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.190
|
|
13ON
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12648
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CVK 2,4-dichlorobenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.18 Å
R-free 0.217
|
|
13OO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12829
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CVP N-(2-cyano-4,6-difluorophenyl)acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.197
|
|
13OP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14494
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CVL N-(1-benzylpiperidin-4-yl)cyclobutanecarboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.99 Å
R-free 0.229
|
|
13OQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13577
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
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突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CVM 2-chloro-N-[(pyridin-2-yl)methyl]benzamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.227
|
|
13OR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13474
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CVN N'-(2,3-dichlorophenyl)-N,N-dimethylurea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.54 Å
R-free 0.233
|
|
13OS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13576
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CVO (2S)-N-(2,6-dimethylphenyl)-2-(pyrrolidin-1-yl)propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.207
|
|
13OT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12204
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1EHY 2-(2-methylimidazol-1-yl)aniline × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.22 Å
R-free 0.230
|
|
13OU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13389
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CVV N-(2,6-dimethylphenyl)-N'-(2-hydroxyethyl)thiourea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.225
|
|
13OV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12354
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CVX 3-(morpholin-4-yl)aniline × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.237
|
|
13OW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12808
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CVW (5R)-5-methyl-6-(thiophen-2-yl)-4,5-dihydropyridazin-3(2H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.98 Å
R-free 0.255
|
|
13OX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13347
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1AXZ 3-(2-phenylethyl)-2-sulfanylideneimidazolidin-4-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.76 Å
R-free 0.239
|
|
13OY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13146
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1AXA {4-[(oxan-4-yl)oxy]phenyl}methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.68 Å
R-free 0.233
|
|
13OZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12541
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
HX8 4-phenoxyphenol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.76 Å
R-free 0.218
|
|
13PA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-4461
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CVZ 1-(7-amino-1H-indol-1-yl)ethan-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.76 Å
R-free 0.246
|
|
13PB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13944
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1AX0 5-fluoro-2-methylbenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.214
|
|
13PC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12861
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CV0 (oxan-4-yl)(piperidin-1-yl)methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.217
|
|
13PD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr16677
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
SNU 4-(1H-pyrrol-1-yl)aniline × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.62 Å
R-free 0.253
|
|
13PE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with FS-3319
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CV1 5-(morpholin-4-yl)-1H-indole × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.37 Å
R-free 0.221
|
|
13PF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12776
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CV2 [4-(morpholin-4-yl)phenyl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.41 Å
R-free 0.226
|
|
13PG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr16736
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CV3 cyclobutyl(morpholin-4-yl)methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.29 Å
R-free 0.218
|
|
13PH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12864
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
8K2 5-chloranylthiophene-2-sulfonamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.84 Å
R-free 0.242
|
|
13PI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12314
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
SLS 3,4-dihydro-2~{H}-chromene-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.223
|
|
13PJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13351
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
2O8 4-[(trifluoromethyl)sulfanyl]benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.225
|
|
13PL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12992
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CV4 N-(2,4-difluorophenyl)hydrazinecarbothioamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.55 Å
R-free 0.228
|
|
13PM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12188
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CV5 [3-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.44 Å
R-free 0.234
|
|
13PN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr16619
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CV6 1,3-diazepane-2-thione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.11 Å
R-free 0.222
|
|
13PO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 5T-0834
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CV7 1-[5-(4-methylpiperazin-1-yl)thiophen-2-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.216
|
|
13PP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-5144
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
3C5 N-methyl-1-[3-(pyridin-3-yl)phenyl]methanamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.98 Å
R-free 0.223
|
|
13PQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12920
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
RZN (4-phenoxyphenyl)methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.212
|
|
13PR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12546
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
54F 3-(pyridin-2-yloxy)aniline × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.37 Å
R-free 0.229
|
|
13PS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14256
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1AX8 3-amino-4-methylbenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.41 Å
R-free 0.232
|
|
13PT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13240
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CWC [3-(phenoxymethyl)phenyl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.64 Å
R-free 0.214
|
|
13PU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14262
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CWD N-(2-methylphenyl)-N'-[2-(pyridin-2-yl)ethyl]thiourea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.18 Å
R-free 0.202
|
|
13PV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14220
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
UTG N-(2-chlorophenyl)-N'-[(furan-2-yl)methyl]thiourea × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.17 Å
R-free 0.202
|
|
13PW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13277
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CWE N'-(2,4-difluorophenyl)-N,N-dimethylthiourea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.216
|
|
13PX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13634
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CWF 4-aminobenzamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.47 Å
R-free 0.230
|
|
13PY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr14240
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1AW1 2-chloro-4-(trifluoromethyl)benzene-1-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.211
|
|
13PZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12779
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CWG [3-(morpholin-4-yl)phenyl]methanol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.56 Å
R-free 0.235
|
|
13QA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12206
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CWH 4-(2-methyl-1H-imidazol-1-yl)aniline × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.201
|
|
13QB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13881
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1ENG 3-(trifluoromethyl)-1,4-dihydropyrazol-5-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.42 Å
R-free 0.228
|
|
13QC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with FS-2015
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CWI 4-methyl-N-[(pyridin-3-yl)methyl]pyridin-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.22 Å
R-free 0.231
|
|
13QD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13673
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1EHF 4-methylthiophene-2-carboxamide × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.183
|
|
13QE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with DH-0718
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1AW5 6-bromo-1-methyl-3,4-dihydroquinolin-2(1H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.192
|
|
13QF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-5947
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1AW7 4-bromo-3-[(dimethylamino)methyl]phenol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.207
|
|
13QG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12321
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CWJ (2S)-2-methyl-2,3-dihydro-1,5-benzoxazepin-4(5H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.43 Å
R-free 0.232
|
|
13QH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr13551
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1AW9 N-[(1R,2S,4R)-bicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]-N'-[(2S)-1-hydroxybutan-2-yl]thiourea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.84 Å
R-free 0.224
|
|
13QI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12593
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CWN N-[(thiophen-2-yl)methyl]hydrazinecarbothioamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.82 Å
R-free 0.220
|
|
13QJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 7T-0223
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CWO N-ethyl-1H-1,3-benzimidazol-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.58 Å
R-free 0.225
|
|
13QK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-3475
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CWP 5-bromo-N-methylpyridine-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.227
|
|
13QL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PDK0169
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CWT 4-phenylmorpholin-3-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.24 Å
R-free 0.208
|
|
13QM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12588
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CWU 4-(piperazin-1-yl)benzonitrile × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.12 Å
R-free 0.205
|
|
13QN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-6504
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
Y1H (6-fluoro-2H,4H-1,3-benzodioxin-8-yl)methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.237
|
|
13QO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-3142
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CWV 1,3-diazaspiro[4.5]decane-2,4-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.04 Å
R-free 0.198
|
|
13QP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with Fr12207
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1EE3 4-prop-2-ynyl-1,4-thiazinane 1,1-dioxide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.219
|
|
13QQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 10W-0336
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CWW (6aS,10R)-6a,7,8,9-tetrahydropyrido[3,2-e]pyrrolo[1,2-a]pyrazin-6(5H)-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.41 Å
R-free 0.264
|
|
13QR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 5D-043
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CWZ 3-(4-methoxyphenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.04 Å
R-free 0.202
|
|
13QS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-5351
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CW0 2-bromo-5-chloropyridin-4(1H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.12 Å
R-free 0.229
|
|
13QT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 7J-015
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CW1 (4R)-8-chloro-6-(trifluoromethyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.189
|
|
13QU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with PS-4774
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1AY3 3-bromo-1H-pyrazolo[3,4-c]pyridine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.216
|
|
13QV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 6R-0620
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CW2 (3R)-1-[(2-chloro-1,3-thiazol-5-yl)methyl]-3-methylpiperidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.193
|
|
13QW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 8B-017
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CW3 (2P)-2-(1H-imidazol-1-yl)-5-(trifluoromethyl)pyridine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.205
|
|
13QX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 1X-0873
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CW5 1-[(6-chloropyridin-3-yl)methyl]piperidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.205
|
|
13QY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 2T-1515
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CW6 4-acetyl-2-(1H-pyrrol-1-yl)benzonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.36 Å
R-free 0.214
|
|
13QZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 3R-1315
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CW7 5,6,7,8-tetrahydro-4H-furo[3,2-c]azepin-4-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.186
|
|
13RA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 5X-0942
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CW8 (2E)-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-2(3H)-imine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.196
|
|
13RB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 9R-0337
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
A1CW9 N-{[(2R)-oxolan-2-yl]methyl}-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.194
|
|
13RC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 12P-613
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CXA 4-(cyclopentylmethyl)-1lambda~6~-thiomorpholine-1,1-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.217
|
|
13RD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 3T-0366
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CXB 4-(4-methoxyphenyl)-1H-imidazole × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.198
|
|
13RE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with AS-5711
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CXC methyl [(1S)-3-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-1-yl]acetate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.198
|
|
13RF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 11G-454S
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CXD N-[2-(morpholin-4-yl)phenyl]acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.83 Å
R-free 0.268
|
|
13RG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with 6D-023
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CXE (1R)-3-(3,4-dichlorophenyl)-1lambda~4~,3-thiazolidine-1,4-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.199
|
|
13RH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of PLpro-C111S in complex with FS-2990
提交 2025-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1561–1880(320 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 1
A1CXG 1-phenyl-1H-imidazole-4-carboxylic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;1.4 M Sodium Maleate pH 6.0
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.201
|
|
13RI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004094
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CXR (2R)-3-methyl-2-{[(6P)-6-(thiophen-2-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}butan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.155
|
|
13RI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004094
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.155
|
|
13RJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004097
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CXS (2R)-3-methyl-2-{[(6M)-6-(1H-pyrrol-2-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}butan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.169
|
|
13RJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004097
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.169
|
|
13RK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004052
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CXT (4M)-4-{4-[(2,2-dimethyl-5-oxopyrrolidin-1-yl)amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl}-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.186
|
|
13RK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004052
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.186
|
|
13RL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004054
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CXU (4P)-4-(4-{[(2R)-1-hydroxy-3-methylbutan-2-yl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.161
|
|
13RL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004054
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.161
|
|
13RM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004100
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CXV (2R)-3-methyl-2-{[(6P)-6-(1,2-thiazol-5-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}butan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.149
|
|
13RM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004100
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.149
|
|
13RN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004214
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CXW (2R)-3-methyl-2-{[(6P)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}butan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.155
|
|
13RN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004214
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.155
|
|
13RO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004268
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CXX (2R)-3-methyl-2-{[(6P)-6-(1H-pyrazol-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}butan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.95 Å
R-free 0.162
|
|
13RO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004268
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.95 Å
R-free 0.162
|
|
13RP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004272
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CXY (2R)-3-methyl-2-{[6-(pyrimidin-5-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}butan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.95 Å
R-free 0.155
|
|
13RP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004272
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.95 Å
R-free 0.155
|
|
13RQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004683
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CXZ (3P)-3-(4-{[(2R)-1-hydroxy-3-methylbutan-2-yl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)thiophene-2-carbonitrile × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.161
|
|
13RQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004683
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.161
|
|
13RR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004678
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CX0 (2R)-2-{[(6P)-6-(2-fluorophenyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-3-methylbutan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.165
|
|
13RR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004678
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.165
|
|
13RS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005707
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CX1 (4P)-4-(4-{[(2R)-1-hydroxy-3-methylbutan-2-yl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1-methyl-1H-pyrazole-3-carbonitrile × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.94 Å
R-free 0.159
|
|
13RS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005707
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.94 Å
R-free 0.159
|
|
13RT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006249
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CX2 N-{4-[(4,4-dimethyl-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl)amino]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-8-yl}-2,2-difluoroacetamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.174
|
|
13RT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006249
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.174
|
|
13RU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006318
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CX3 (4M)-4-{4-[(4,4-dimethyl-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl)amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl}-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.201
|
|
13RU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006318
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.201
|
|
13RV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006319
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CX4 (4M)-1-methyl-4-{4-[(2-oxo-3,8-dioxa-1-azaspiro[4.5]decan-1-yl)amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl}-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.172
|
|
13RV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006319
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.172
|
|
13RW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006354
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CX5 1-[(8-cyclopropyl-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-5,5-dimethylpyrrolidin-2-one × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.182
|
|
13RW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006354
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.182
|
|
13RX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006344
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CX6 (4M)-4-(4-{[8-(methanesulfonyl)-2-oxo-3-oxa-1,8-diazaspiro[4.5]decan-1-yl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.182
|
|
13RX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006344
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.182
|
|
13RY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006372
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CX7 4,4-dimethyl-3-{[8-(trifluoromethyl)-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl]amino}-1,3-oxazolidin-2-one × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.178
|
|
13RY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006372
提交 2025-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.178
|
|
23LW
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease A173V mutant in complex with leritrelvir
提交 2026-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:A173V
突变:A173V
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.238
|
|
23LX
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease P168 deletion mutant in complex with leritrelvir
提交 2026-02-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.231
|
|
23LZ
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease G143S mutant in complex with leritrelvir
提交 2026-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
3264–3569(306 aa)
|
突变:G143S
突变:G143S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.247
|
|
23LZ
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease G143S mutant in complex with leritrelvir
提交 2026-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
突变:G143S
突变:G143S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.247
|
|
23MA
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease H172Y mutant in complex with leritrelvir
提交 2026-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:H172Y
突变:H172Y
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.240
|
|
23MC
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease M49I mutant in complex with leritrelvir
提交 2026-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:M49I
突变:M49I
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.215
|
|
23MD
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease M49I/M165I mutant in complex with leritrelvir
提交 2026-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:M49I/M165I
突变:M49I/M165I
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.219
|
|
23ME
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease M49I/M165T mutant in complex with leritrelvir
提交 2026-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:M49I/M165T
突变:M49I/M165T
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.220
|
|
23MF
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease M165T mutant in complex with leritrelvir
提交 2026-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:M165T
突变:M165T
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.205
|
|
23MG
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease S144A mutant in complex with leritrelvir
提交 2026-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:S144A
突变:S144A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.239
|
|
23MI
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease M49T mutant in complex with leritrelvir
提交 2026-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:M49T
突变:M49T
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.216
|
|
23MJ
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease Q192L mutant in complex with leritrelvir
提交 2026-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:Q192L
突变:Q192L
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.200
|
|
23MK
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease P168 deletion and A173V mutant in complex with leritrelvir
提交 2026-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:A173V
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.238
|
|
23ML
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease Q189K mutant in complex with leritrelvir
提交 2026-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:Q189K
突变:Q189K
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.253
|
|
24EW
SARS-CoV-2 polymerase with incorporated and pre-incorporated AT-9052-Sp
提交 2026-03-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.39 Å
|
|
28WF
SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative ligand AD1
提交 2026-02-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
|
未记录
|
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1J0V [(2~{S},6~{R})-6-(6-aminopurin-9-yl)morpholin-2-yl]methanol × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;0.1 M MES (pH 5.6), 12% PEG 3350, 60 mM magnesium chloride
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.278
|
|
5R7Y
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of COVID-19 main protease in complex with Z45617795
提交 2020-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
JFM N-(2-phenylethyl)methanesulfonamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.237
|
|
5R7Z
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1220452176
提交 2020-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
HWH ~{N}-[2-(5-fluoranyl-1~{H}-indol-3-yl)ethyl]ethanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.233
|
|
5R80
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z18197050
提交 2020-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
RZG methyl 4-sulfamoylbenzoate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.235
|
|
5R81
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of COVID-19 main protease in complex with Z1367324110
提交 2020-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
RZJ 1-methyl-3,4-dihydro-2~{H}-quinoline-7-sulfonamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.249
|
|
5R82
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of COVID-19 main protease in complex with Z219104216
提交 2020-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
RZS 6-(ethylamino)pyridine-3-carbonitrile × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.31 Å
R-free 0.212
|
|
5R83
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z44592329
提交 2020-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
K0G N-phenyl-N'-pyridin-3-ylurea × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.215
|
|
5R84
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of COVID-19 main protease in complex with Z31792168
提交 2020-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
GWS 2-cyclohexyl-~{N}-pyridin-3-yl-ethanamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.293
|
|
5R8T
PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 main protease screened against DSI poised (Enamine), Fraglites and Peplites (Newcastle university), Mini Frags (Astex), York 3D (York university), electrophile cysteine covalent (Weizman institute) fragment libraries
提交 2020-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO
|
分辨率 1.27 Å
R-free 0.208
|
|
5RE4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1129283193
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
SZY N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.266
|
|
5RE5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z33545544
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T0J N~1~-phenylpiperidine-1,4-dicarboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.265
|
|
5RE6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z54571979
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O0S N-{4-[(pyrimidin-2-yl)oxy]phenyl}acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.251
|
|
5RE7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z30932204
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T0S N-[(4-sulfamoylphenyl)methyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.225
|
|
5RE8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2737076969
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T0V 1-(3-fluorophenyl)-N-[(furan-2-yl)methyl]methanamine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.248
|
|
5RE9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2856434836
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
LPZ 2-(4-methylphenoxy)-1-(4-methylpiperazin-4-ium-1-yl)ethanone × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.225
|
|
5REA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z31432226
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
JGP (azepan-1-yl)(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methanone × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.228
|
|
5REB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2856434899
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T0Y 1-[(thiophen-3-yl)methyl]piperidin-4-ol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.224
|
|
5REC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1587220559
提交 2020-03-15
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T1J 2-{[(1H-benzimidazol-2-yl)amino]methyl}phenol × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.237
|
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5RED
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2856434865
提交 2020-03-15
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
JJG 4-[2-(phenylsulfanyl)ethyl]morpholine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.47 Å
R-free 0.211
|
|
5REE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2217052426
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T1M (2R,3R)-1-benzyl-2-methylpiperidin-3-ol × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.242
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5REF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z24758179
提交 2020-03-15
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
6SU methyl 3-(methylsulfonylamino)benzoate × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.246
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5REG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1545313172
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
LWA (2~{S})-~{N}-(4-aminocarbonylphenyl)oxolane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.227
|
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5REH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z111507846
提交 2020-03-15
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
AWP 1-cyclohexyl-3-(2-pyridin-4-ylethyl)urea × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.257
|
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5REI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2856434856
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T1S 4-[(3-chlorophenyl)methyl]morpholine × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.240
|
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5REJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102241
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T1V 1-{4-[(thiophen-2-yl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
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分辨率 1.72 Å
R-free 0.240
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5REK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102327
提交 2020-03-15
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T1Y 1-{4-[(3-fluorophenyl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
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分辨率 1.74 Å
R-free 0.230
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5REL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102340
提交 2020-03-15
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T2G 1-{4-[(3-methylphenyl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.220
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5REM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0103016
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T2J 1 1-(4-(2-nitrophenyl)piperazin-1-yl)ethan-1-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.246
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5REN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102425
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T2V 1-[(3R)-3-(1,3-benzothiazol-2-yl)piperidin-1-yl]ethan-1-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.278
|
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5REO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102578
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T2Y N-[(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl]acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.227
|
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5REP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102201
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T3G 1-{4-[(2,6-difluorophenyl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.231
|
|
5RER
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102615
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T3J 1-[(2R)-2-(4-fluorophenyl)morpholin-4-yl]ethan-1-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.253
|
|
5RES
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102281
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T3V 1-{4-[(2-fluorophenyl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.226
|
|
5RET
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102269
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T47 1-{4-[(3-chlorophenyl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.222
|
|
5REU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102395
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T4D 2-[(4-acetylpiperazin-1-yl)sulfonyl]benzonitrile × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.232
|
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5REV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0103072
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T4J N-[3-(thiomorpholine-4-carbonyl)phenyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.222
|
|
5REW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102275
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T4M N-[(1R)-1-(naphthalen-1-yl)ethyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.224
|
|
5REX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102287
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T4V 1-{4-[(naphthalen-1-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.251
|
|
5REY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102911
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T4Y 1-{4-[(2-methylphenyl)methyl]-1,4-diazepan-1-yl}ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.274
|
|
5REZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with POB0129
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T54 (1R,2S)-2-(thiophen-3-yl)cyclopentane-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.272
|
|
5RF0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with POB0073
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T5D [1-(pyridin-2-yl)cyclopentyl]methanol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.226
|
|
5RF1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NCL-00023830
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T5G 4-bromobenzene-1-sulfonamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.236
|
|
5RF2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1741969146
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
HVB 1-azanylpropylideneazanium × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.222
|
|
5RF3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1741970824
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T5V pyrimidin-5-amine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.221
|
|
5RF4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1741982125
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T5Y pyridin-2-ol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.225
|
|
5RF5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z3241250482
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
HV2 1,1-bis(oxidanylidene)thietan-3-ol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.231
|
|
5RF6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1348371854
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
NTG 5-(1,4-oxazepan-4-yl)pyridine-2-carbonitrile × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.217
|
|
5RF7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z316425948_minor
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T67 1-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.217
|
|
5RF8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z271004858
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
SFY 4-amino-N-(pyridin-2-yl)benzenesulfonamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.44 Å
R-free 0.213
|
|
5RF9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z217038356
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
S7D 1-[(2~{S})-2-methylmorpholin-4-yl]-2-pyrazol-1-yl-ethanone × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.215
|
|
5RFA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2643472210
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
JGY 1-methyl-N-{[(2S)-oxolan-2-yl]methyl}-1H-pyrazole-3-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.215
|
|
5RFB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1271660837
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
K3S N-[(1-methyl-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methyl]ethanamine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.224
|
|
5RFC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z979145504
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
K1Y methyl (2-methyl-4-phenyl-1,3-thiazol-5-yl)carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.213
|
|
5RFD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z126932614
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T6J 2-[(methylsulfonyl)methyl]-1H-benzimidazole × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.41 Å
R-free 0.211
|
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5RFE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z509756472
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
JGG N-[(4-cyanophenyl)methyl]morpholine-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.46 Å
R-free 0.214
|
|
5RFF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102704
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T6M 1-{4-[(4-chlorophenyl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.247
|
|
5RFG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102372
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T6V N-[(3S)-1,1-dioxo-2,3-dihydro-1H-1lambda~6~-thiophen-3-yl]-N-phenylacetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.306
|
|
5RFH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102277
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T6Y 1-{4-[(5-chlorothiophen-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.237
|
|
5RFI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102353
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T71 1-{4-[(2,5-dimethylphenyl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.242
|
|
5RFJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0103067
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T7A N-(4-methoxy-1,3-benzothiazol-2-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.241
|
|
5RFK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102575
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T7D N-(1-acetylpiperidin-4-yl)benzamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.235
|
|
5RFL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102389
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T7G 1-acetyl-N-(2-hydroxyphenyl)piperidine-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.225
|
|
5RFM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102539
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T7J N-[(3R)-1,1-dioxo-2,3-dihydro-1H-1lambda~6~-thiophen-3-yl]-N-(4-methylphenyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.257
|
|
5RFN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102868
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T7P N-[(3R)-1,1-dioxo-2,3-dihydro-1H-1lambda~6~-thiophen-3-yl]-N-(4-fluorophenyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.239
|
|
5RFO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102972
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T7S 1-[4-(piperidine-1-carbonyl)piperidin-1-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.278
|
|
5RFP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102190
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T7V N-[(1S)-1-(3-chlorophenyl)ethyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.297
|
|
5RFQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102179
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T7Y N-[3-(2-oxopyrrolidin-1-yl)phenyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.76 Å
R-free 0.227
|
|
5RFR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102169
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T81 1-{4-[(5-bromothiophen-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.71 Å
R-free 0.238
|
|
5RFS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102739
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T84 1-{4-[(thiophen-3-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.233
|
|
5RFT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102432
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T8A 1-[(4S)-4-phenyl-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.237
|
|
5RFU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102121
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T8D 1-{4-[(5-chlorothiophen-2-yl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.210
|
|
5RFV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102306
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T8J 1-[4-(thiophene-2-carbonyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.224
|
|
5RFW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102243
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T8M 1-{4-[(thiophen-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.223
|
|
5RFX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102254
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T8P 1-[4-(4-methoxyphenyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.216
|
|
5RFY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102974
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T8S 1-acetyl-N-methyl-N-(propan-2-yl)piperidine-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.277
|
|
5RFZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102274
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
T8V N-(2-chloropyridin-3-yl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.227
|
|
5RG0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102535
提交 2020-03-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T8Y 1,1'-(piperazine-1,4-diyl)di(ethan-1-one) × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.236
|
|
5RG1
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NCL-00024905
提交 2020-03-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
T9J Nalpha-acetyl-N-(3-bromoprop-2-yn-1-yl)-L-tyrosinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.215
|
|
5RG2
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NCL-00025058
提交 2020-03-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
T9M N~2~-acetyl-N-prop-2-en-1-yl-D-allothreoninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.228
|
|
5RG3
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NCL-00025412
提交 2020-03-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
T9P N~2~-acetyl-N~1~-prop-2-en-1-yl-L-aspartamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.215
|
|
5RGG
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2856434890 (Mpro-x0165)
提交 2020-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NZD 4-methyl-N-phenylpiperazine-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.26 Å
R-free 0.216
|
|
5RGH
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1619978933 (Mpro-x0395)
提交 2020-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
U0M 5-fluoro-1-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)methyl]-1,2,3,6-tetrahydropyridine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.208
|
|
5RGI
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z369936976 (Mpro-x0397)
提交 2020-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
U0P N'-cyclopropyl-N-methyl-N-[(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)methyl]urea × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.212
|
|
5RGJ
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1401276297 (Mpro-x0425)
提交 2020-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
U0S (5S)-7-(pyrazin-2-yl)-2-oxa-7-azaspiro[4.4]nonane × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.34 Å
R-free 0.206
|
|
5RGK
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1310876699 (Mpro-x0426)
提交 2020-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
U0V 2-fluoro-N-[2-(pyridin-4-yl)ethyl]benzamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.210
|
|
5RGL
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102962 (Mpro-x0705)
提交 2020-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
U0Y 1-[4-(4-methylbenzene-1-carbonyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.76 Å
R-free 0.229
|
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5RGM
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102142 (Mpro-x0708)
提交 2020-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
U1D N'-acetyl-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophene-2-carbohydrazide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.04 Å
R-free 0.224
|
|
5RGN
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102759 (Mpro-x0731)
提交 2020-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
U1A 1-{4-[(4-methylphenyl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.233
|
|
5RGO
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102248 (Mpro-x0736)
提交 2020-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
U1G 1-[4-(furan-2-carbonyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.217
|
|
5RGP
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PCM-0102628 (Mpro-x0771)
提交 2020-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
U1M 1-{4-[(2,4-dimethylphenyl)sulfonyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.202
|
|
5RGQ
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1849009686 (Mpro-x1086)
提交 2020-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
U1V 1-(4-fluoro-2-methylphenyl)methanesulfonamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.225
|
|
5RGR
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z328695024 (Mpro-x1101)
提交 2020-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
K1G N,1-dimethyl-N-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.41 Å
R-free 0.200
|
|
5RGS
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1259086950 (Mpro-x1163)
提交 2020-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
S7V [(2~{R})-4-(phenylmethyl)morpholin-2-yl]methanol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.231
|
|
5RGT
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4439011607 (Mpro-x2540)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
UHS N-[(1R)-2-(tert-butylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-(5-tert-butyl-1,2-oxazol-3-yl)propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.22 Å
R-free 0.271
|
|
5RGU
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4444622180 (Mpro-x2562)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UGD N-(3-{[(2R)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)-2-(pyrimidin-5-yl)acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.11 Å
R-free 0.238
|
|
5RGV
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4444622066 (Mpro-x2563)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UGG 2-(isoquinolin-4-yl)-N-phenylacetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.232
|
|
5RGW
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4444621910 (Mpro-x2569)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UGM 2-(5-cyanopyridin-3-yl)-N-(pyridin-3-yl)acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.203
|
|
5RGX
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1344037997 (Mpro-x2572)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UGP 2-(3-cyanophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.218
|
|
5RGY
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1535580916 (Mpro-x2581)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UGS N-(4-methoxypyridin-2-yl)-2-(naphthalen-2-yl)acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.246
|
|
5RGZ
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1343543528 (Mpro-x2600)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UH1 2-(3-cyanophenyl)-N-(pyridin-3-yl)acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.209
|
|
5RH0
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1286870272 (Mpro-x2608)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UH4 N-(5-methylthiophen-2-yl)-N'-pyridin-3-ylurea × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.240
|
|
5RH1
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z2010253653 (Mpro-x2643)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UGV 2-(5-chlorothiophen-2-yl)-N-(pyridin-3-yl)acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.243
|
|
5RH2
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1129289650 (Mpro-x2646)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UH7 2-(3-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.230
|
|
5RH3
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1264525706 (Mpro-x2649)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UHA (2R)-2-(3-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.232
|
|
5RH4
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1530425063 (Mpro-x2659)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UHG (2R)-2-(6-chloro-9H-carbazol-2-yl)propanoic acid × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.34 Å
R-free 0.205
|
|
5RH5
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4439011520 (Mpro-x2694)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UHV N-(5-tert-butyl-1,2-oxazol-3-yl)-N-[(1R)-2-[(4-methoxy-2-methylphenyl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.223
|
|
5RH6
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4439011588 (Mpro-x2703)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
UHY N-[(1R)-2-[(2-ethyl-6-methylphenyl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-[6-(propan-2-yl)pyridin-3-yl]propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.217
|
|
5RH7
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4439011584 (Mpro-x2705)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
UJ1 N-(5-tert-butyl-1H-pyrazol-3-yl)-N-[(1R)-2-[(2-ethyl-6-methylphenyl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.71 Å
R-free 0.220
|
|
5RH8
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4444621965 (Mpro-x2764)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
UHM 2-(cyanomethoxy)-N-[(1,2-thiazol-4-yl)methyl]benzamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.221
|
|
5RH9
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z4438424255 (Mpro-x2776)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
UJ4 N-{4-[(1S)-1-methoxyethyl]phenyl}-N-[(1R)-2-[(4-methoxy-2-methylphenyl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.225
|
|
5RHA
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z147647874 (Mpro-x2779)
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
T8M 1-{4-[(thiophen-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.209
|
|
5RHB
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Cov_HetLib030 (Mpro-x2097)
提交 2020-05-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
USD (E)-1-(pyrimidin-2-yl)methanimine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.207
|
|
5RHC
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Cov_HetLib053 (Mpro-x2119)
提交 2020-05-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
USA (E)-1-(1H-imidazol-2-yl)methanimine × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.217
|
|
5RHD
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with SF013 (Mpro-x2193)
提交 2020-05-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14
US7 1-[4-(methylsulfonyl)phenyl]piperazine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.206
|
|
5RHE
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PG-COV-42 (Mpro-x2052)
提交 2020-05-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UPD 1-acetyl-N-(6-methoxypyridin-3-yl)piperidine-4-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.216
|
|
5RHF
PanDDA analysis group deposition SARS-CoV-2 main protease fragment screen -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PG-COV-34 (Mpro-x2754)
提交 2020-05-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
UPJ 1-acetyl-N-methyl-N-phenylpiperidine-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.76 Å
R-free 0.228
|
|
5RL0
PanDDA analysis group deposition of computational designs of SARS-CoV-2 main protease covalent inhibitors -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-adc59df6-2 (Mpro-x3110)
提交 2020-08-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
VEG ethyl N-[(2R)-2-[(4-tert-butylphenyl)(propanoyl)amino]-2-(pyridin-3-yl)acetyl]-beta-alaninate × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.214
|
|
5RL1
PanDDA analysis group deposition of computational designs of SARS-CoV-2 main protease covalent inhibitors -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-adc59df6-27 (Mpro-x3113)
提交 2020-08-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
VEJ N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-[(3-methoxypropyl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.210
|
|
5RL2
PanDDA analysis group deposition of computational designs of SARS-CoV-2 main protease covalent inhibitors -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-adc59df6-26 (Mpro-x3115)
提交 2020-08-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
VEM N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-[(2-methoxyethyl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.200
|
|
5RL3
PanDDA analysis group deposition of computational designs of SARS-CoV-2 main protease covalent inhibitors -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-adc59df6-39 (Mpro-x3117)
提交 2020-08-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
VEP N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-[(oxan-4-yl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.205
|
|
5RL4
PanDDA analysis group deposition of computational designs of SARS-CoV-2 main protease covalent inhibitors -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-adc59df6-3 (Mpro-x3124)
提交 2020-08-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
VEV N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(methylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.205
|
|
5RL5
PanDDA analysis group deposition of computational designs of SARS-CoV-2 main protease covalent inhibitors -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-adc59df6-30 (Mpro-x3359)
提交 2020-08-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
VEY N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(ethylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.217
|
|
5RL6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z198195770
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.249
|
|
5RL6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z198195770
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LJA N-[3-(carbamoylamino)phenyl]acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.249
|
|
5RL7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z364321922
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
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VVD 5-(acetylamino)-2-fluorobenzoic acid × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.269
|
|
5RL7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z364321922
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
VVD 5-(acetylamino)-2-fluorobenzoic acid × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.269
|
|
5RL8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z53825177
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
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VVG N-(2-fluorophenyl)ethanesulfonamide × 2
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.270
|
|
5RL8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z53825177
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.270
|
|
5RL9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1703168683
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.231
|
|
5RL9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1703168683
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
UR7 1-(3-fluoro-4-methylphenyl)methanesulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.231
|
|
5RLB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z216450634
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
VVJ N-cycloheptyl-N-methylmethanesulfonamide × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.262
|
|
5RLB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z216450634
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.262
|
|
5RLC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z56923284
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.252
|
|
5RLC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z56923284
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
VVM 4-amino-N-phenylbenzene-1-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.252
|
|
5RLD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z19735981
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.270
|
|
5RLD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z19735981
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
VVY 2-phenoxy-1-(pyrrolidin-1-yl)ethan-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.270
|
|
5RLE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1429867185
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.262
|
|
5RLE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1429867185
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
VVP 4-methoxy-1H-indole × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.262
|
|
5RLF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z235341991
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
NY7 N-(2-methoxy-5-methylphenyl)glycinamide × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.254
|
|
5RLF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z235341991
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.254
|
|
5RLG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z19739650
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
VW1 (2S)-2-(4-cyanophenoxy)propanamide × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.286
|
|
5RLG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z19739650
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.286
|
|
5RLH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2856434778
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.38 Å
R-free 0.251
|
|
5RLH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2856434778
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
K2P 2-(trifluoromethoxy)benzoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.38 Å
R-free 0.251
|
|
5RLI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z45617795
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
JFM N-(2-phenylethyl)methanesulfonamide × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.26 Å
R-free 0.268
|
|
5RLI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z45617795
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
JFM N-(2-phenylethyl)methanesulfonamide × 2
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.26 Å
R-free 0.268
|
|
5RLJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1407673036
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.228
|
|
5RLJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1407673036
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
VW4 (2S)-2-phenylpropane-1-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.228
|
|
5RLK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1509882419
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.240
|
|
5RLK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1509882419
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
NYV 1-(propan-2-yl)-1H-imidazole-4-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.240
|
|
5RLL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z425387594
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.267
|
|
5RLL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z425387594
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
H04 1-(2-ethoxyphenyl)piperazine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.267
|
|
5RLM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1650168321
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.237
|
|
5RLM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1650168321
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
VW7 N-(8-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinolin-5-yl)acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.237
|
|
5RLN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z364328788
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
NZG 3-(acetylamino)-4-fluorobenzoic acid × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.258
|
|
5RLN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z364328788
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.258
|
|
5RLO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1454310449
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.243
|
|
5RLO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1454310449
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
UQS N-[(2-fluorophenyl)methyl]-1H-pyrazol-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.243
|
|
5RLP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z166605480
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.56 Å
R-free 0.253
|
|
5RLP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z166605480
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
VWA (1S)-1-(4-fluorophenyl)-N-methylethan-1-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.56 Å
R-free 0.253
|
|
5RLQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z285782452
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
UVA N-methyl-2-(methylsulfonyl)aniline × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.254
|
|
5RLQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z285782452
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.254
|
|
5RLR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z822382694
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.283
|
|
5RLR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z822382694
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
VWD (1R)-2-(methylsulfonyl)-1-phenylethan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.283
|
|
5RLS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z59181945
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
VWG N-hydroxyquinoline-2-carboxamide × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.254
|
|
5RLS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z59181945
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.254
|
|
5RLT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z53116498
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.43 Å
R-free 0.264
|
|
5RLT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z53116498
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
UVJ 3-(2-methyl-1H-benzimidazol-1-yl)propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.43 Å
R-free 0.264
|
|
5RLU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z744754722
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
JG4 2-(thiophen-2-yl)-1H-imidazole × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.273
|
|
5RLU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z744754722
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
JG4 2-(thiophen-2-yl)-1H-imidazole × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.273
|
|
5RLV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2467208649
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
VWJ N-(propan-2-yl)-1H-benzimidazol-2-amine × 2
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.260
|
|
5RLV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2467208649
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
VWJ N-(propan-2-yl)-1H-benzimidazol-2-amine × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.260
|
|
5RLW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z45705015
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
S9S ~{N}-[2-(4-fluorophenyl)ethyl]methanesulfonamide × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.237
|
|
5RLW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z45705015
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
S9S ~{N}-[2-(4-fluorophenyl)ethyl]methanesulfonamide × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.237
|
|
5RLY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2027049478
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
K34 5-(1,3-thiazol-2-yl)-1H-1,2,4-triazole × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.43 Å
R-free 0.261
|
|
5RLY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2027049478
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
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K34 5-(1,3-thiazol-2-yl)-1H-1,2,4-triazole × 2
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.43 Å
R-free 0.261
|
|
5RLZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2293643386
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
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VWM (3R)-1-acetyl-3-hydroxypiperidine-3-carboxylic acid × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.273
|
|
5RLZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2293643386
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.273
|
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5RM0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1492796719
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.238
|
|
5RM0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1492796719
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
S7G ~{N}-[(3~{R})-1,2,3,4-tetrahydroquinolin-3-yl]ethanamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.238
|
|
5RM1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z426041412
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.234
|
|
5RM1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z426041412
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
RY4 N-[4-(aminomethyl)phenyl]methanesulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.234
|
|
5RM2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1741964527
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.273
|
|
5RM2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1741964527
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
UXG 1-(diphenylmethyl)azetidin-3-ol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.273
|
|
5RM3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1745658474
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
S7J 2-(trifluoromethyl)pyrimidine-5-carboxamide × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.274
|
|
5RM3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1745658474
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.274
|
|
5RM4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1639162606
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.96 Å
R-free 0.253
|
|
5RM4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1639162606
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
PK4 2-fluoro-N,3-dimethylbenzene-1-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.96 Å
R-free 0.253
|
|
5RM5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z373768900
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.262
|
|
5RM5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z373768900
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
NUA N-(1-ethyl-1H-pyrazol-4-yl)cyclobutanecarboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.262
|
|
5RM6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z396380540
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.13 Å
R-free 0.251
|
|
5RM6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z396380540
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
HR5 ~{N}-(cyclobutylmethyl)-1,5-dimethyl-pyrazole-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.13 Å
R-free 0.251
|
|
5RM7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z69118333
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.269
|
|
5RM7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z69118333
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
N0E ~{N}-(4-hydroxyphenyl)-3-phenyl-propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.269
|
|
5RM8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1614545742
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
GQJ methyl (2~{S},4~{R})-1-(furan-2-ylcarbonyl)-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxylate × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.14 Å
R-free 0.248
|
|
5RM8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1614545742
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.14 Å
R-free 0.248
|
|
5RM9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2856434942
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.254
|
|
5RM9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2856434942
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
EJQ ~{N}-(4-fluorophenyl)-2-pyrrolidin-1-yl-ethanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.254
|
|
5RMA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z321318226
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.236
|
|
5RMA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z321318226
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
JHJ N-(4-methoxyphenyl)-N'-pyridin-4-ylurea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.236
|
|
5RMB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2856434920
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
VWV ethyl (1,1-dioxo-1lambda~6~,4-thiazinan-4-yl)acetate × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.249
|
|
5RMB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2856434920
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.249
|
|
5RMC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z24758179
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.258
|
|
5RMC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z24758179
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
6SU methyl 3-(methylsulfonylamino)benzoate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.258
|
|
5RMD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z57614330
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
VWY N-ethyl-4-[(methylsulfonyl)amino]benzamide × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.261
|
|
5RMD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z57614330
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
VWY N-ethyl-4-[(methylsulfonyl)amino]benzamide × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.261
|
|
5RME
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z26333434
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
RYM 4-(benzimidazol-1-ylmethyl)benzenecarbonitrile × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.284
|
|
5RME
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z26333434
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.284
|
|
5RMF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z54226006
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
NX7 (2,6-difluorophenyl)(pyrrolidin-1-yl)methanone × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.270
|
|
5RMF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z54226006
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.270
|
|
5RMG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z285675722
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.12 Å
R-free 0.256
|
|
5RMG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z285675722
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
MUK 4,6-dimethyl-~{N}-phenyl-pyrimidin-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.12 Å
R-free 0.256
|
|
5RMH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1101755952
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
VX4 [(4S)-4-methylazepan-1-yl](1,3-thiazol-4-yl)methanone × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.243
|
|
5RMH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1101755952
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.243
|
|
5RMI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z53860899
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
STV ~{N}-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)ethanesulfonamide × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.12 Å
R-free 0.251
|
|
5RMI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z53860899
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.12 Å
R-free 0.251
|
|
5RMJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z68299550
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
JOV 3-chloro-N-(1-hydroxy-2-methylpropan-2-yl)benzamide × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.296
|
|
5RMJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z68299550
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.296
|
|
5RMK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1273312153
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.274
|
|
5RMK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z1273312153
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
O2A N-methyl-1H-indole-7-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.274
|
|
5RML
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z85956652
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.43 Å
R-free 0.288
|
|
5RML
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with Z85956652
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
VXD N-(3-chloro-2-methylphenyl)glycinamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.43 Å
R-free 0.288
|
|
5RMM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with POB0066
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.281
|
|
5RMM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 helicase in complex with POB0066
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
VXG (3S,4R)-1-acetyl-4-phenylpyrrolidine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.281
|
|
5ROB
PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 helicase
提交 2020-09-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.254
|
|
5ROB
PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 helicase
提交 2020-09-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.254
|
|
5RS7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000034618676
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W4Y 1-{2-[(propan-2-yl)oxy]ethyl}-2-sulfanylidene-1,2,3,5-tetrahydro-4H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-4-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.190
|
|
5RS7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000034618676
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.190
|
|
5RS8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000001601
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
H35 N-(FURAN-2-YLMETHYL)-7H-PURIN-6-AMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.179
|
|
5RS8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000001601
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.179
|
|
5RS9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000007636250
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W4V 6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d][1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-8-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.178
|
|
5RS9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000007636250
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.178
|
|
5RSB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001674697
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W4S 7-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.184
|
|
5RSB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001674697
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.184
|
|
5RSC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000003888754
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W5S 7-[(furan-2-yl)methyl]-5,6-dimethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.201
|
|
5RSC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000003888754
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.201
|
|
5RSD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000331945
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
1LQ quinazolin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.189
|
|
5RSD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000331945
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.189
|
|
5RSE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000336438345
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W5P 4-[(3R)-3-fluoropiperidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.208
|
|
5RSE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000336438345
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.208
|
|
5RSF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000026180281
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W5M 9-methyl-9H-purine-2,6-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.173
|
|
5RSF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000026180281
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.173
|
|
5RSG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000263392672
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W5J N-methyl-N-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl-beta-alanine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.183
|
|
5RSG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000263392672
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.183
|
|
5RSH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000274438208
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W5G 4-(5-azaspiro[2.5]octan-5-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.179
|
|
5RSH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000274438208
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.179
|
|
5RSI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000374420934
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W5D 4-(1,4-oxazonan-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.217
|
|
5RSI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000374420934
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.217
|
|
5RSJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000089254160_N3
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W5A 3-[(2-methyl-1,3-thiazol-4-yl)methyl]-3H-purin-6-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.193
|
|
5RSJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000089254160_N3
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.193
|
|
5RSK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000901381520_N3
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W57 3-[(3-methoxy-1,2-oxazol-5-yl)methyl]-3H-purin-6-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.164
|
|
5RSK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000901381520_N3
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.164
|
|
5RSL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000365052868
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W51 6-[(1s,4s)-2-azabicyclo[2.2.2]octan-2-yl]-5-chloropyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.189
|
|
5RSL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000365052868
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.189
|
|
5RSM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000001099
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
4SO 4-sulfamoylbenzoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.185
|
|
5RSM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000001099
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.185
|
|
5RSN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000064576
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
51X (1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.181
|
|
5RSN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000064576
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.181
|
|
5RSO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000000226
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TYZ PARA ACETAMIDO BENZOIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.187
|
|
5RSO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000000226
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.187
|
|
5RSP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002560357
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
LSA 1,2-BENZISOTHIAZOL-3(2H)-ONE 1,1-DIOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.172
|
|
5RSP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002560357
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.172
|
|
5RSQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000158490
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
MOK 5-methyl-3-phenyl-1,2-oxazole-4-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.170
|
|
5RSQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000158490
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.170
|
|
5RSR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000158650
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
XIY 2-HYDROXYMETHYL-BENZOIMIDAZOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.191
|
|
5RSR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000158650
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.191
|
|
5RSS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000006691828
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
NC3 N-[(CYCLOHEXYLAMINO)CARBONYL]GLYCINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.167
|
|
5RSS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000006691828
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.167
|
|
5RST
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332673
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
5HN 5-hydroxypyridine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.169
|
|
5RST
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332673
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.169
|
|
5RSU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000002055
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
OHB salicylamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
5RSU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000002055
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
5RSV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000340465
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
4MB 4-[(METHYLSULFONYL)AMINO]BENZOIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.179
|
|
5RSV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000340465
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.179
|
|
5RSW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000337835
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
6FZ 2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.177
|
|
5RSW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000337835
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.177
|
|
5RSX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388262
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
YTX 2-(3-methoxy-4-oxidanyl-phenyl)ethanoic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.176
|
|
5RSX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388262
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.176
|
|
5RSY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004787230
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
3R6 2-hydroxy-5-(methylsulfanyl)benzoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.192
|
|
5RSY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004787230
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.192
|
|
5RSZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004218283
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
ZZA 1-PHENYL-1H-PYRAZOLE-4-CARBOXYLIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.182
|
|
5RSZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004218283
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.182
|
|
5RT0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002582714
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
4BL 6-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.157
|
|
5RT0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002582714
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.157
|
|
5RT1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039810
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
3A9 2,3-dihydro-1-benzofuran-5-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
5RT1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039810
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
5RT2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008652361
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
5OF 2-(4-oxidanylidene-3~{H}-phthalazin-1-yl)ethanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.174
|
|
5RT2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008652361
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.174
|
|
5RT3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000039281982
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
2FX 1-benzothiophen-2-ylacetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.219
|
|
5RT3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000039281982
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.219
|
|
5RT4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000051581
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
4BX 3-(1H-benzimidazol-2-yl)propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.175
|
|
5RT4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000051581
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.175
|
|
5RT5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000058111
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
07L 7-hydroxy-2H-chromen-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.172
|
|
5RT5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000058111
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.172
|
|
5RT6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000156509
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
05R 2-(3,4-dichlorophenyl)ethanoic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.182
|
|
5RT6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000156509
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.182
|
|
5RT7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000015442276
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
GVH 1H-PYRROLO[2,3-B]PYRIDINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.173
|
|
5RT7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000015442276
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.173
|
|
5RT8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161908
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
HLR 1,2-benzoxazol-3-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.160
|
|
5RT8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161908
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.160
|
|
5RT9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388280
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
54G 2-hydroxy-5-methylbenzoic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.185
|
|
5RT9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388280
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.185
|
|
5RTA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332540
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
Q6T 1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
5RTA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332540
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
5RTB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000006534965
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
3XH 3-Hydroxyhippuric acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.186
|
|
5RTB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000006534965
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.186
|
|
5RTC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000006490906
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
EVE 1H-benzimidazole-2-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.201
|
|
5RTC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000006490906
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.201
|
|
5RTD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000157108
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
MHW 3-HYDROXYPICOLINIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.178
|
|
5RTD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000157108
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.178
|
|
5RTE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000013283576
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
4FL 4-(1H-imidazol-2-yl)pyridine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.193
|
|
5RTE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000013283576
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.193
|
|
5RTF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002047514
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.166
|
|
5RTF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002047514
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
ISN ISATIN × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.166
|
|
5RTG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000395673
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
3HP 3-HYDROXYPHENYLACETATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.180
|
|
5RTG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000395673
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.180
|
|
5RTH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000156863
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
3BZ 3-chlorobenzoate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.172
|
|
5RTH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000156863
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.172
|
|
5RTI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004219237
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
6U6 3-(5-chloranyl-1,3-benzothiazol-2-yl)propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.185
|
|
5RTI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004219237
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.185
|
|
5RTJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332752
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
PHB P-HYDROXYBENZOIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.176
|
|
5RTJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332752
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.176
|
|
5RTK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000164504
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
BZX 1,3-benzodioxol-5-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.164
|
|
5RTK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000164504
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.164
|
|
5RTL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388056
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
4J8 4-methylbenzenesulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
5RTL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388056
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
5RTM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000002005
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
PZA PYRAZINE-2-CARBOXAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.168
|
|
5RTM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000002005
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.168
|
|
5RTN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000013514509
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
AQO 2-AMINOQUINAZOLIN-4(3H)-ONE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.174
|
|
5RTN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000013514509
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.174
|
|
5RTO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388302
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
5RTO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388302
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
4PN 4-PIPERIDINO-PIPERIDINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
5RTP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001679336
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
AOT 2-oxidanylidene-2-phenylazanyl-ethanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.168
|
|
5RTP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001679336
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.168
|
|
5RTQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000019015078
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
4JO 5-bromo-6-methylpyridin-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.172
|
|
5RTQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000019015078
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.172
|
|
5RTR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000018169763
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
SHA SALICYLHYDROXAMIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.168
|
|
5RTR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000018169763
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.168
|
|
5RTS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000159004
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
0LO 5-phenylpyridine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
5RTS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000159004
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
5RTT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000873830
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
NMI 3-(1-methyl-1H-indol-3-yl)propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.182
|
|
5RTT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000873830
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.182
|
|
5RTU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000159056
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
1FF 1-methyl-5-phenyl-1H-pyrazole-4-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
5RTU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000159056
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
5RTV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001698894
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
PF0 3-hydroxy-2-methylbenzoic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.172
|
|
5RTV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001698894
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.172
|
|
5RTW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000164777
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
OHP (2-HYDROXYPHENYL)ACETIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.175
|
|
5RTW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000164777
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.175
|
|
5RTX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000090873
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
6OT 3,5-dichlorobenzene-1-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.161
|
|
5RTX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000090873
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.161
|
|
5RTY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000157088
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
HBD 4-HYDROXYBENZAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.181
|
|
5RTY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000157088
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.181
|
|
5RTZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000404062
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
FHB 3-FLUORO-4-HYDROXYBENZOIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.178
|
|
5RTZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000404062
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.178
|
|
5RU0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388514
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
2CL (2,6-DICHLOROPHENYL)ACETIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.166
|
|
5RU0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388514
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
2CL (2,6-DICHLOROPHENYL)ACETIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.166
|
|
5RU1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000034687
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DFA DIPHENYLACETIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.180
|
|
5RU1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000034687
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.180
|
|
5RU2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000331715
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
06Y 2-phenoxyethanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.194
|
|
5RU2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000331715
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.194
|
|
5RU3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161696
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.160
|
|
5RU3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161696
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
8H8 2-fluoro-4-hydroxybenzonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.160
|
|
5RU4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001688638
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
6V9 2-methyl-1,3-thiazole-5-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.168
|
|
5RU4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001688638
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.168
|
|
5RU5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000098208711
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
BXW 3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzothiazine-7-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
5RU5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000098208711
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
5RU6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001442764
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
5RU6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001442764
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
2UP naphthalene-2-carboximidamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
5RU7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000003591110
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
PYD 2,5-DIMETHYL-PYRIMIDIN-4-YLAMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.162
|
|
5RU7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000003591110
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.162
|
|
5RU8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000154817
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
1SQ ISOQUINOLIN-1-AMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.156
|
|
5RU8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000154817
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.156
|
|
5RU9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000165882
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
4SV 3-AMINOPYRIDINE-4-CARBOXYLIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.189
|
|
5RU9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000165882
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.189
|
|
5RUA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000033986325
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
3EU (3,5-dichlorophenyl)acetic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.174
|
|
5RUA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000033986325
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.174
|
|
5RUC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000005878
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
NCA NICOTINAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.170
|
|
5RUC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000005878
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.170
|
|
5RUD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008615114
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
2D0 4-chloro-1,3-benzothiazol-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.171
|
|
5RUD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008615114
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.171
|
|
5RUE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000000922
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
BHA 2-HYDROXY-4-AMINOBENZOIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.183
|
|
5RUE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000000922
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.183
|
|
5RUF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000016989831
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
54T 6-chloro-1,3-benzothiazol-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.167
|
|
5RUF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000016989831
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.167
|
|
5RUG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000038389
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
NOA NAPHTHYLOXYACETIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.189
|
|
5RUG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000038389
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.189
|
|
5RUH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000123600
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
KNL (2,6-dichlorophenoxy)acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.172
|
|
5RUH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000123600
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.172
|
|
5RUI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332651
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
4YS isoquinolin-1(2H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.166
|
|
5RUI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332651
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.166
|
|
5RUJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000404314
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
2SX (5-bromo-1H-indol-3-yl)acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.185
|
|
5RUJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000404314
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.185
|
|
5RUK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161692
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
NVU 2-(1,2-benzoxazol-3-yl)ethanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.183
|
|
5RUK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161692
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.183
|
|
5RUL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000163774
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
5ZE 4,6-dimethylpyrimidin-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.172
|
|
5RUL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000163774
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.172
|
|
5RUM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008861082
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
52F 3-(3-oxo-3,4-dihydroquinoxalin-2-yl)propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.176
|
|
5RUM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008861082
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.176
|
|
5RUN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000194295
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
EXB 3-(1H-benzimidazol-1-yl)propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.171
|
|
5RUN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000194295
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.171
|
|
5RUO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001683100
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W6A 4-chloro-1H-indole-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.179
|
|
5RUO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001683100
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.179
|
|
5RUP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004976927
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
04R [3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-indazol-1-yl]acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.174
|
|
5RUP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000004976927
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.174
|
|
5RUQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000032199226
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W6D 1H-indole-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
5RUQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000032199226
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
5RUR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000017744334
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
FBB 6-fluoro-1,3-benzothiazol-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.168
|
|
5RUR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000017744334
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.168
|
|
5RUS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388081
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
HSM HISTAMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.161
|
|
5RUS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388081
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.161
|
|
5RUT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161958
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
APG ATROLACTIC ACID (2-PHENYL-LACTIC ACID) × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.178
|
|
5RUT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000161958
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.178
|
|
5RUU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000438614
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W6G N-(1,3,4-thiadiazol-2-yl)benzenesulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.191
|
|
5RUU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000438614
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.191
|
|
5RUV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000019015194
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
5RUV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000019015194
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W6J 1-(pyridin-2-yl)-1,4-diazepane × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
5RUW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000045014941
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W6M 3-{[(3-methyl-1,2,4-oxadiazol-5-yl)methyl]carbamoyl}benzoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.171
|
|
5RUW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000045014941
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.171
|
|
5RUX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002020050
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W6P 1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
5RUX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002020050
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
5RUY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000013517187
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
XAN XANTHINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.189
|
|
5RUY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000013517187
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.189
|
|
5RUZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000019685960
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W6S 4-(1H-pyrazol-3-yl)piperidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.167
|
|
5RUZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000019685960
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.167
|
|
5RV0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039994
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W6V N-(1,3-thiazol-2-yl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
5RV0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039994
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
5RV1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000251609
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.180
|
|
5RV1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000251609
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.180
|
|
5RV2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000311783
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W7S N-benzylpyrazine-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.197
|
|
5RV2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000311783
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.197
|
|
5RV3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000057162
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
MYI (5-methoxy-1H-indol-3-yl)acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.190
|
|
5RV3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000057162
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.190
|
|
5RV4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039224
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
4FS quinolin-3-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.176
|
|
5RV4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039224
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.176
|
|
5RV5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008578948
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
JG8 BENZOFURO[3,2-D]PYRIMIDIN-4(3H)-ONE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.182
|
|
5RV5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000008578948
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.182
|
|
5RV6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000158540
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
0HN 1,3-benzodioxole-5-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.160
|
|
5RV6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000158540
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.160
|
|
5RV7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000003954002
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
JNZ 1H-indazol-3-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.160
|
|
5RV7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000003954002
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.160
|
|
5RV8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039575
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
8EJ 6-methylpyridine-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.177
|
|
5RV8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000039575
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.177
|
|
5RV9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388150
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
EKZ 4-tert-butylbenzene-1,2-diol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.182
|
|
5RV9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000388150
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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EKZ 4-tert-butylbenzene-1,2-diol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.182
|
|
5RVA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000016343276
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
HQD 3-HYDROXY-2-METHYLQUINOLIN-4(1H)-ONE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
5RVA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000016343276
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
5RVB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000014419577
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
7PD 2-aminopteridine-4,7(3H,8H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.164
|
|
5RVB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000014419577
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.164
|
|
5RVC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000933940912
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W7V (1R,5R)-N-methyl-N-(1H-pyrazol-4-yl)bicyclo[3.1.0]hexane-1-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.156
|
|
5RVC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000933940912
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.156
|
|
5RVD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000263980802
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W7Y 4-[(2R)-2-cyclobutylpyrrolidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.198
|
|
5RVD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000263980802
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.198
|
|
5RVE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000736709772
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W8A {[(2S)-1-oxo-1-(2-oxoimidazolidin-1-yl)propan-2-yl]sulfanyl}acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.170
|
|
5RVE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000736709772
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.170
|
|
5RVF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000082473428_N3
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W8D 3-{[(2R)-oxolan-2-yl]methyl}-3H-purin-6-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.173
|
|
5RVF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000082473428_N3
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.173
|
|
5RVG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000400552187_N3
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
W8J 3-{3-[(3S)-oxolan-3-yl]propyl}-3H-purin-6-amine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.179
|
|
5RVG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000400552187_N3
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.179
|
|
5RVH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000265642
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
Q3C quinoline-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.184
|
|
5RVH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000265642
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.184
|
|
5RVI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000084843283
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
CLW CHLORZOXAZONE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.94 Å
R-free 0.181
|
|
5RVI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000084843283
提交 2020-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
CLW CHLORZOXAZONE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.94 Å
R-free 0.181
|
|
5RVJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000001612349
提交 2020-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
4JQ 6-amino-2H-chromen-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.20 Å
R-free 0.158
|
|
5RVK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002977810
提交 2020-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
2AK 7-bromo-5-methyl-1H-indole-2,3-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.46 Å
R-free 0.195
|
|
5RVL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000149580
提交 2020-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
BVF 4-METHYLPYRIDIN-2-AMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.36 Å
R-free 0.195
|
|
5RVM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000157088
提交 2020-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
HBD 4-HYDROXYBENZAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.155
|
|
5RVN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000332748
提交 2020-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
ANN 4-METHOXYBENZOIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.26 Å
R-free 0.187
|
|
5RVO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000013514509
提交 2020-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
AQO 2-AMINOQUINAZOLIN-4(3H)-ONE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.212
|
|
5RVP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000154817
提交 2020-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
1SQ ISOQUINOLIN-1-AMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.142
|
|
5RVQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002508153
提交 2020-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
4BY 5-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.183
|
|
5RVR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000016052862
提交 2020-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
LZ1 1H-indazole × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.157
|
|
5RVS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000000159004
提交 2020-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
0LO 5-phenylpyridine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.223
|
|
5RVT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002582714
提交 2020-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
4BL 6-methyl-1H-indole-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.26 Å
R-free 0.170
|
|
5RVU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000002506130
提交 2020-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
6P3 6-phenylpyridine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.20 Å
R-free 0.188
|
|
5RVV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000020269197
提交 2020-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
WB1 6-methyl-1H-indole-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM TRIS, 50 mM sodium acetate, 28% PEG 4000
|
分辨率 1.42 Å
R-free 0.215
|
|
5S18
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-321461
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
WOY 6,7-dihydro-5H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.211
|
|
5S18
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-321461
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.211
|
|
5S1A
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-43406
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WPS 5-amino-3-methyl-1H-pyrazole-4-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.211
|
|
5S1A
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-43406
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WPS 5-amino-3-methyl-1H-pyrazole-4-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.211
|
|
5S1C
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z3034471507
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WPV 1-(5-bromopyridin-3-yl)methanamine × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.202
|
|
5S1C
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z3034471507
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.202
|
|
5S1E
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with AB-601_30915014
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WPY N-(1,3-thiazol-2-yl)acetamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.215
|
|
5S1E
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with AB-601_30915014
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.215
|
|
5S1G
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-108952
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WQ1 (4-methylpyridin-3-yl)methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.197
|
|
5S1G
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-108952
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.197
|
|
5S1I
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-301084
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WQ4 5-amino-2-methyl-1,3-oxazole-4-carbonitrile × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.194
|
|
5S1I
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-301084
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.194
|
|
5S1K
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-105873
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WQ7 1-(2-aminoethyl)pyridin-2(1H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.205
|
|
5S1K
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-105873
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.205
|
|
5S1M
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with STK497968
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DE5 2-azanyl-~{N}-(1,3-thiazol-2-yl)ethanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.204
|
|
5S1M
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with STK497968
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.204
|
|
5S1O
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with STL414928
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WQA 2H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-amine × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.209
|
|
5S1O
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with STL414928
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.209
|
|
5S1Q
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-17035
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WQG quinazolin-4(3H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.210
|
|
5S1Q
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-17035
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.210
|
|
5S1S
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1613477500
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WQJ 7,8-dihydro-5H-pyrano[4,3-b]pyridin-3-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.202
|
|
5S1S
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1613477500
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.202
|
|
5S1U
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-52144
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WQM (3S)-N-methyl-6-oxo-3,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.197
|
|
5S1U
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-52144
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.197
|
|
5S1W
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z838838708
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WQV N-(5-bromo-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.204
|
|
5S1W
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z838838708
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.204
|
|
5S1Y
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with STK346965
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WQY 1-(quinolin-3-yl)methanamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.200
|
|
5S1Y
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with STK346965
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.200
|
|
5S20
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with PB1827975385
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WRD (5R)-5-amino-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.196
|
|
5S20
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with PB1827975385
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.196
|
|
5S22
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z145120524
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WRJ 2H-1-benzopyran-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.218
|
|
5S22
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z145120524
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.218
|
|
5S24
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-697611
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WRM 2-(1H-benzimidazol-1-yl)-N-methylacetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.222
|
|
5S24
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with EN300-697611
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.222
|
|
5S26
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z605596346
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
L46 4-acetyl-3-ethyl-N,5-dimethyl-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.208
|
|
5S26
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z605596346
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.208
|
|
5S27
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1262398530
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.217
|
|
5S27
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1262398530
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WSM 4-(3-aminopropyl)-2H-1,4-benzoxazin-3(4H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.217
|
|
5S28
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z409974522
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WRV N-(3-fluoro-4-methylphenyl)-N'-[(2S)-1-hydroxypropan-2-yl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.215
|
|
5S28
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z409974522
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.215
|
|
5S29
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z199959602
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WRY 7-fluoro-N,2-dimethylquinoline-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.222
|
|
5S29
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z199959602
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.222
|
|
5S2A
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1263529624
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WS4 N-(4-hydroxyphenyl)-1-methyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.211
|
|
5S2A
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1263529624
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.211
|
|
5S2B
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z373769142
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WSG N-(1-ethyl-1H-pyrazol-4-yl)-4-fluorobenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.208
|
|
5S2B
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z373769142
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.208
|
|
5S2C
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z45612755
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WSJ N-(1,5-dimethyl-3-oxo-2-phenyl-2,3-dihydro-1H-pyrazol-4-yl)methanesulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.207
|
|
5S2C
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z45612755
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.207
|
|
5S2D
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z369936976
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.193
|
|
5S2D
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z369936976
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
U0P N'-cyclopropyl-N-methyl-N-[(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)methyl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.193
|
|
5S2E
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1152242726
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
VZM N-(6-methoxypyridin-3-yl)-N'-thiophen-2-ylurea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.209
|
|
5S2E
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1152242726
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.209
|
|
5S2F
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z44592329
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
K0G N-phenyl-N'-pyridin-3-ylurea × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.215
|
|
5S2F
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z44592329
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.215
|
|
5S2G
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z321318226
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
JHJ N-(4-methoxyphenyl)-N'-pyridin-4-ylurea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.212
|
|
5S2G
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z321318226
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.212
|
|
5S2H
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434920
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.206
|
|
5S2H
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434920
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
VWV ethyl (1,1-dioxo-1lambda~6~,4-thiazinan-4-yl)acetate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.206
|
|
5S2I
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57299529
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.208
|
|
5S2I
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57299529
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
LUY ~{N}-(2-phenylethyl)-1~{H}-benzimidazol-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.208
|
|
5S2J
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z509756472
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.205
|
|
5S2J
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z509756472
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
JGG N-[(4-cyanophenyl)methyl]morpholine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.205
|
|
5S2K
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z445856640
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
VZP N-[(3R)-1,1-dioxo-1lambda~6~-thiolan-3-yl]-N-methyl-N'-propan-2-ylurea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.193
|
|
5S2K
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z445856640
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.193
|
|
5S2L
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2234920345
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
VZS N-(2-methoxy-5-methylphenyl)-N'-4H-1,2,4-triazol-4-ylurea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.198
|
|
5S2L
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2234920345
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
VZS N-(2-methoxy-5-methylphenyl)-N'-4H-1,2,4-triazol-4-ylurea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.198
|
|
5S2M
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z56827661
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
VZY N-(3-methylbenzene-1-carbonyl)glycine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.197
|
|
5S2M
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z56827661
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.197
|
|
5S2N
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1787627869
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
GWY 5-chloranyl-~{N}-methyl-~{N}-[[(3~{S})-oxolan-3-yl]methyl]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.204
|
|
5S2N
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1787627869
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.204
|
|
5S2O
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z645232558
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
NXS [1-(pyrimidin-2-yl)piperidin-4-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.195
|
|
5S2O
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z645232558
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.195
|
|
5S2P
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z927746322
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W04 N~2~-methyl-N-(4-methylpyridin-2-yl)glycinamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.192
|
|
5S2P
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z927746322
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.192
|
|
5S2Q
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z26781952
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W0A N-[(1H-benzimidazol-2-yl)methyl]butanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.28 Å
R-free 0.195
|
|
5S2Q
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z26781952
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.28 Å
R-free 0.195
|
|
5S2R
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57292369
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
K41 2-methyl-N-(2-methyl-2H-tetrazol-5-yl)propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.202
|
|
5S2R
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57292369
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.202
|
|
5S2S
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434894
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
GWV ~{N},~{N}-dimethyl-4-[(propan-2-ylamino)methyl]aniline × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.194
|
|
5S2S
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434894
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.194
|
|
5S2T
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z26781964
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W0D N-[(1H-benzimidazol-2-yl)methyl]furan-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.213
|
|
5S2T
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z26781964
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.213
|
|
5S2U
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z85956652
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.193
|
|
5S2U
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z85956652
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
VXD N-(3-chloro-2-methylphenyl)glycinamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.193
|
|
5S2V
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1186029914
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.196
|
|
5S2V
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1186029914
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W0G (3R)-1-(2-fluorophenyl)-3-(methylamino)pyrrolidin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.196
|
|
5S2W
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1407672867
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
GWP 2-cyclopropyl-1~{H}-imidazole-4-carboxamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.201
|
|
5S2W
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1407672867
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.201
|
|
5S2X
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1139246057
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.193
|
|
5S2X
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1139246057
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W0J (3R)-N-methyl-1-(pyridazin-3-yl)piperidin-3-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.193
|
|
5S2Y
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z19727416
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.203
|
|
5S2Y
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z19727416
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W0M (2R)-2-(4-chlorophenoxy)propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.203
|
|
5S2Z
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z126932614
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
T6J 2-[(methylsulfonyl)methyl]-1H-benzimidazole × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.201
|
|
5S2Z
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z126932614
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.201
|
|
5S30
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z65532537
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W0P (2R)-2-(2-fluorophenoxy)propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.207
|
|
5S30
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z65532537
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.207
|
|
5S31
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741959530
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.222
|
|
5S31
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741959530
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W0S 1-(3,4,5-trimethoxyphenyl)methanamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.222
|
|
5S32
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z26781943
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W0V N-[(1H-benzimidazol-2-yl)methyl]-2-methylpropanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.236
|
|
5S32
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z26781943
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.236
|
|
5S33
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z906021418
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
K2G 5-chloro-2-(propan-2-yl)pyrimidine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.206
|
|
5S33
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z906021418
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.206
|
|
5S34
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434941
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
GOV (2S)-1-{[(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl]amino}propan-2-ol × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.194
|
|
5S34
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434941
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.194
|
|
5S35
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z68404778
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
B1A ~{N}-(4-phenylazanylphenyl)ethanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.213
|
|
5S35
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z68404778
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.213
|
|
5S36
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434938
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
7ZC 1-(5-methoxy-1H-indol-3-yl)-N,N-dimethyl-methanamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.209
|
|
5S36
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434938
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
7ZC 1-(5-methoxy-1H-indol-3-yl)-N,N-dimethyl-methanamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.209
|
|
5S37
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1954800564
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
NZ1 5-methoxy-1,3-benzothiazol-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.22 Å
R-free 0.205
|
|
5S37
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1954800564
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.22 Å
R-free 0.205
|
|
5S38
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1745658474
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
S7J 2-(trifluoromethyl)pyrimidine-5-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.203
|
|
5S38
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1745658474
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.203
|
|
5S39
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z165170770
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W0Y N-methyl-4-sulfamoylbenzamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.206
|
|
5S39
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z165170770
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.206
|
|
5S3A
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1562205518
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W17 1-(2-hydroxyethyl)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.209
|
|
5S3A
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1562205518
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.209
|
|
5S3B
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741966151
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W1A N-[(piperidin-4-yl)methyl]methanesulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.193
|
|
5S3B
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741966151
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.193
|
|
5S3C
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434937
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W1D (4-acetylphenoxy)acetic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.227
|
|
5S3C
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434937
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.227
|
|
5S3D
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z30820160
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
JFP N-(4-methyl-1,3-thiazol-2-yl)propanamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.213
|
|
5S3D
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z30820160
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.213
|
|
5S3E
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z274553586
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
WSY 3-(3,5-dimethyl-1H-1,2,4-triazol-1-yl)propanoic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.207
|
|
5S3E
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z274553586
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.207
|
|
5S3F
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57446103
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W1J N-(2-propyl-2H-tetrazol-5-yl)furan-2-carboxamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.194
|
|
5S3F
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57446103
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.194
|
|
5S3G
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z384468096
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
JHS N-[(4-phenyloxan-4-yl)methyl]acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.197
|
|
5S3G
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z384468096
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.197
|
|
5S3H
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434892
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W1M 3-[(1-methyl-1H-pyrazole-3-carbonyl)amino]benzoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.210
|
|
5S3H
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2856434892
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.210
|
|
5S3I
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z50145861
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.201
|
|
5S3I
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z50145861
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W1P 5-methyl-2-phenyl-2,4-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.201
|
|
5S3J
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1324853681
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W1S (8S)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridine-8-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.197
|
|
5S3J
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1324853681
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.197
|
|
5S3K
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z219104216
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
RZS 6-(ethylamino)pyridine-3-carbonitrile × 1
NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.196
|
|
5S3K
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z219104216
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.196
|
|
5S3L
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z54628578
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
JH4 N-methylpyrimidin-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.196
|
|
5S3L
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z54628578
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.196
|
|
5S3M
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z45656995
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
S2S 4-(methylsulfonylamino)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.26 Å
R-free 0.207
|
|
5S3M
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z45656995
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.26 Å
R-free 0.207
|
|
5S3N
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z287484230
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W1V 2-(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.200
|
|
5S3N
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z287484230
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.200
|
|
5S3O
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z102768020
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W1Y N-methyl-1-(1-phenyl-1H-pyrazol-4-yl)methanamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.196
|
|
5S3O
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z102768020
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.196
|
|
5S3P
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1238477790
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W21 N-(cyclopentanecarbonyl)-L-alanine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.194
|
|
5S3P
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1238477790
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.194
|
|
5S3Q
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0013
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W2A (2R,3R)-2-methyl-1-(methylsulfonyl)piperidine-3-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.196
|
|
5S3Q
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0013
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W2A (2R,3R)-2-methyl-1-(methylsulfonyl)piperidine-3-carbonitrile × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.196
|
|
5S3R
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0014
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.201
|
|
5S3R
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0014
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W24 (2S,3S)-N,2-dimethyl-1-(methylsulfonyl)piperidine-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.201
|
|
5S3S
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0103
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W27 1-[(5S,8R)-6,7,8,9-tetrahydro-5H-5,8-epiminocyclohepta[b]pyridin-10-yl]ethan-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.209
|
|
5S3S
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0103
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.209
|
|
5S3T
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0128
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W2G (1R,2S)-2-(thiophen-3-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.188
|
|
5S3T
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0128
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W2G (1R,2S)-2-(thiophen-3-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.188
|
|
5S3U
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0041
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W2J [(3R,5R)-5-methylpiperidin-3-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.193
|
|
5S3U
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0041
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.193
|
|
5S3V
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0120
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.195
|
|
5S3V
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0120
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W2M (2R)-1',4'-dihydro-2'H-spiro[pyrrolidine-2,3'-quinolin]-2'-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.195
|
|
5S3W
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0135
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.186
|
|
5S3W
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0135
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W2S (3R,4R)-4-(2-methylphenyl)oxolane-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.186
|
|
5S3X
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0136
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W2V (3S,4S)-4-(3-methoxyphenyl)oxane-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.197
|
|
5S3X
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0136
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.197
|
|
5S3Y
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0012
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.198
|
|
5S3Y
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0012
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W2Y (2S,3S)-2-methyl-1-(methylsulfonyl)piperidine-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.198
|
|
5S3Z
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0140
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W34 (3R,4S)-4-(3-methoxyphenyl)oxan-3-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.31 Å
R-free 0.186
|
|
5S3Z
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with POB0140
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.31 Å
R-free 0.186
|
|
5S40
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00023824
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
HHQ 4-iodanyl-3~{H}-pyridin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.204
|
|
5S40
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00023824
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.204
|
|
5S41
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00023825
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
HGQ 4-bromanyl-1~{H}-pyridin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.213
|
|
5S41
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00023825
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.213
|
|
5S42
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00023833
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.195
|
|
5S42
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00023833
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
HH8 4-bromanyl-1,8-naphthyridine × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.195
|
|
5S43
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00024661
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.201
|
|
5S43
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00024661
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
UUJ 5-bromo-2-hydroxybenzonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.201
|
|
5S44
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00024890
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W3A (4-bromo-1H-pyrazol-1-yl)acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.201
|
|
5S44
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00024890
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.201
|
|
5S45
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00024773
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W3D (4-bromo-2-oxopyridin-1(2H)-yl)acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.208
|
|
5S45
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with NCL-00024773
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.208
|
|
5S46
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57131035
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
HYN imidazolidine-2,4-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.205
|
|
5S46
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z57131035
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.205
|
|
5S47
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z940713508
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
BAQ pyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.197
|
|
5S47
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z940713508
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.197
|
|
5S48
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741982125
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
HRZ 1~{H}-pyridin-2-one × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.199
|
|
5S48
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741982125
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
HRZ 1~{H}-pyridin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.199
|
|
5S49
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z56866006
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
3TR 3-AMINO-1,2,4-TRIAZOLE × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.197
|
|
5S49
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z56866006
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
3TR 3-AMINO-1,2,4-TRIAZOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.197
|
|
5S4A
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z955123498
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
4AP 4-AMINOPYRIDINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.192
|
|
5S4A
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z955123498
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
4AP 4-AMINOPYRIDINE × 3
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.192
|
|
5S4B
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z3219959731
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W3G pyridazin-3(2H)-one × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.208
|
|
5S4B
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z3219959731
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.208
|
|
5S4C
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1954800348
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W3J 1,4,5,6-tetrahydropyrimidin-2-amine × 3
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.183
|
|
5S4C
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1954800348
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W3J 1,4,5,6-tetrahydropyrimidin-2-amine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.183
|
|
5S4D
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741982441
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
2OP (2S)-2-HYDROXYPROPANOIC ACID × 1
LAC LACTIC ACID × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.22 Å
R-free 0.206
|
|
5S4D
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z1741982441
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.22 Å
R-free 0.206
|
|
5S4E
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2301685688
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
W3M 1H-imidazole-5-carbonitrile × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.196
|
|
5S4E
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with Z2301685688
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W3M 1H-imidazole-5-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.196
|
|
5S4F
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF003
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W3P 1,8-naphthyridine × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.213
|
|
5S4F
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF003
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.213
|
|
5S4G
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF005
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W3S [1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-3-amine × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.224
|
|
5S4G
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF005
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.224
|
|
5S4H
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF048
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W3V 1-carbamoylpiperidine-4-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.223
|
|
5S4H
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF048
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.223
|
|
5S4I
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF051
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W3Y (5S)-1-(4-chlorophenyl)-5-methylimidazolidine-2,4-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.204
|
|
5S4I
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF051
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.204
|
|
5S4J
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF054
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W41 6-chlorotetrazolo[1,5-b]pyridazine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.202
|
|
5S4J
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with SF054
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.202
|
|
5S4K
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with FMOOA000509a
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.209
|
|
5S4K
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain in complex with FMOOA000509a
提交 2020-11-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
W44 (2S,5R,6R)-7-methyl-2,3,4,5,6,7-hexahydro-1H-2,6-methanoazocino[5,4-b]indol-5-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.209
|
|
5S6X
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z2889976755
提交 2020-11-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
WUG 1-(2,4-dimethyl-1H-imidazol-5-yl)methanamine × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.222
|
|
5S6Y
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z56900771
提交 2020-11-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
WUJ N-[(furan-2-yl)methyl]urea × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.254
|
|
5S6Z
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with PB2255187532
提交 2020-11-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
WUM 4-[(dimethylamino)methyl]-1,3-thiazol-2-amine × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.222
|
|
5S70
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with EN300-181428
提交 2020-11-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
WUS (5R)-2-methyl-4,5,6,7-tetrahydro-1H-benzimidazol-5-amine × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.33 Å
R-free 0.228
|
|
5S71
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with FUZS-5
提交 2020-11-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
WUV 5'-thiothymidine × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.215
|
|
5S72
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with BBL029427
提交 2020-11-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
WUY N-(2-aminoethyl)-N'-phenylurea × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.51 Å
R-free 0.277
|
|
5S73
PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain
提交 2020-11-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.223
|
|
5S73
PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain
提交 2020-11-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.223
|
|
5S74
PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain
提交 2020-11-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 0.96 Å
R-free 0.185
|
|
5S74
PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 Nsp3 macrodomain
提交 2020-11-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 0.1;293.15 K;30% PEG 3K
|
分辨率 0.96 Å
R-free 0.185
|
|
5SA4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z239136710
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
K3A N-(5-methyl-1H-pyrazol-3-yl)acetamide × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.225
|
|
5SA5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z1530301542
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
ZQA 4-ethyl-2-(1H-imidazol-5-yl)-1,3-thiazole × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.219
|
|
5SA6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z2856434783
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
O3G N-benzyl-1-(4-fluorophenyl)methanamine × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.52 Å
R-free 0.222
|
|
5SA7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z1673618163
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
WL7 4-amino-N-(2-hydroxyethyl)-N-methylbenzene-1-sulfonamide × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.22 Å
R-free 0.225
|
|
5SA8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z68299550
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
JOV 3-chloro-N-(1-hydroxy-2-methylpropan-2-yl)benzamide × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.222
|
|
5SA9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z2697514548
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
GWG 1-methylindazole-3-carboxamide × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.223
|
|
5SAA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z319891284
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
ZQD 3-[(2S)-1-(methanesulfonyl)pyrrolidin-2-yl]-5-methyl-1,2-oxazole × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.24 Å
R-free 0.227
|
|
5SAB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z31504642
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
WJD 2-methoxy-N-phenylacetamide × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.231
|
|
5SAC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z59181945
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
VWG N-hydroxyquinoline-2-carboxamide × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.217
|
|
5SAD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z425449682
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
EJW (3-phenyl-1,2-oxazol-5-yl)methylazanium × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.223
|
|
5SAE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z3219959731
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
W3G pyridazin-3(2H)-one × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.12 Å
R-free 0.223
|
|
5SAF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with EN300-321461
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
WOY 6,7-dihydro-5H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.11 Å
R-free 0.222
|
|
5SAG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with EN300-1605072
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
ZQG 3-(1H-imidazol-2-yl)propan-1-amine × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.230
|
|
5SAH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with EN300-100112
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
ZQJ 2-methyl-5,6,7,8-tetrahydropyrido[4,3-c]pyridazin-3(2H)-one × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.256
|
|
5SAI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z1424343998
提交 2021-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
ZQM N-{2-[(propan-2-yl)sulfanyl]phenyl}urea × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.222
|
|
5SBF
PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 NendoU
提交 2021-07-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;277 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.211
|
|
5SKW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1272494722
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
LF6 {(1R,2R)-2-[(Z)-(3-methyl-1,2,4-thiadiazol-5(2H)-ylidene)amino]cyclopentyl}methanol × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 2
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.267
|
|
5SKX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z126932614
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
T6J 2-[(methylsulfonyl)methyl]-1H-benzimidazole × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 2
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.34 Å
R-free 0.275
|
|
5SKY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z466628048
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
O2M N-[(4-methyl-1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1H-pyrazole-5-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.248
|
|
5SKZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z57258487
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
NVD N-{[4-(dimethylamino)phenyl]methyl}-4H-1,2,4-triazol-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.244
|
|
5SL0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z57260516
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
B0V 2-methoxy-~{N}-(2,4,6-trimethylphenyl)ethanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.260
|
|
5SL1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1273312153
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
O2A N-methyl-1H-indole-7-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.38 Å
R-free 0.267
|
|
5SL2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z100643660
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LFO N,1-dimethyl-1H-indole-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.256
|
|
5SL3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z223688272
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LGR 2-[acetyl(methyl)amino]benzoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.269
|
|
5SL4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z383202616
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LHR N-(1H-indazol-6-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.281
|
|
5SL5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z32014663
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
WNV N,N,2,3-tetramethylbenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.36 Å
R-free 0.281
|
|
5SL6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z256709556
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
60P 3-methylthiophene-2-carboxylic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.29 Å
R-free 0.293
|
|
5SL7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1186029914
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
W0G (3R)-1-(2-fluorophenyl)-3-(methylamino)pyrrolidin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.251
|
|
5SL8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2856434762
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
JGD N,N-dimethylpyridin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.261
|
|
5SL9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z54571979
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
O0S N-{4-[(pyrimidin-2-yl)oxy]phenyl}acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.295
|
|
5SLA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1003207278
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LJR 1-cyclohexyl-N-methylmethanesulfonamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.271
|
|
5SLB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z744930860
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LJK 3-methyl-N-(2-methylbutan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.242
|
|
5SLC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1849009686
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
U1V 1-(4-fluoro-2-methylphenyl)methanesulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.260
|
|
5SLD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1246465616
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LJ6 (2R)-3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-N,N,2-trimethylpropanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.258
|
|
5SLE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z56880342
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
JGA N-ethyl-N'-(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)urea × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.261
|
|
5SLF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z198195770
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LJA N-[3-(carbamoylamino)phenyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.245
|
|
5SLG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z32400357
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
NZJ 1-(3-methylbenzene-1-carbonyl)piperidine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.323
|
|
5SLH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z65532537
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LLU (2S)-2-(2-fluorophenoxy)propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.264
|
|
5SLI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1003146540
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LL0 2-(difluoromethoxy)benzene-1-sulfonamide × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.271
|
|
5SLJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1430613393
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LKU 3-fluoro-N-(3-hydroxy-4-methylphenyl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.31 Å
R-free 0.247
|
|
5SLK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1354370680
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LKL 2-[(5-chloro-3-fluoropyridin-2-yl)(methyl)amino]ethan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.285
|
|
5SLL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z54615640
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LK6 N-[(3R)-3-methyl-1,1-dioxo-1lambda~6~-thiolan-3-yl]cyclopropanecarboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.251
|
|
5SLM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z28290384
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
WN1 N-(2-fluorophenyl)-3-methoxybenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.307
|
|
5SLN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z57299529
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LUY ~{N}-(2-phenylethyl)-1~{H}-benzimidazol-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.298
|
|
5SLO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z56983806
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
JJM 1-methyl-N-(3-methylphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.281
|
|
5SLP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z373768898
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
UWY N-(1-ethyl-1H-pyrazol-4-yl)cyclopentanecarboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.260
|
|
5SLQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2856434829
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
ELQ [3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-(4-methylpiperazin-1-yl)methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.11 Å
R-free 0.274
|
|
5SLR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2073741691
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LO6 2-(difluoromethoxy)-1-[(2R,6S)-2,6-dimethylmorpholin-4-yl]ethan-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.267
|
|
5SLS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1373445602
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
SZE 4-(3-fluoranylpyridin-2-yl)-1-methyl-piperazin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.29 Å
R-free 0.292
|
|
5SLT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1816233707
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LNS 6-(methylcarbamoyl)pyridine-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.257
|
|
5SLU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1796014543
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
UX1 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-N-methylcyclopropane-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.283
|
|
5SLV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2856434942
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
EJQ ~{N}-(4-fluorophenyl)-2-pyrrolidin-1-yl-ethanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.280
|
|
5SLW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1310876699
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
U0V 2-fluoro-N-[2-(pyridin-4-yl)ethyl]benzamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.273
|
|
5SLX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z752989138
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LMW 2-[(4-aminophenyl)(ethyl)amino]ethan-1-ol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.76 Å
R-free 0.259
|
|
5SLY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1526504764
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LM6 1-(1-ethyl-1H-pyrazol-5-yl)-N-methylmethanamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.292
|
|
5SLZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2072621991
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LQP 2-(difluoromethoxy)-1-[(3aR,6aS)-hexahydrocyclopenta[c]pyrrol-2(1H)-yl]ethan-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.54 Å
R-free 0.294
|
|
5SM0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z32665176
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LQI (1-benzofuran-2-yl)(4-methylpiperidin-1-yl)methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.273
|
|
5SM1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z68277692
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
WH1 N-methyl-N-[2-(pyridin-2-yl)ethyl]benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.260
|
|
5SM2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z3006151474
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LQ3 (5S)-5-(difluoromethoxy)pyridin-2(5H)-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.270
|
|
5SM3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z943693514
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
GT4 ~{N}-(4-hydroxyphenyl)-2-methoxy-ethanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.306
|
|
5SM4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2856434944
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
AWD ~{N}-(4-fluorophenyl)-4-methyl-piperazine-1-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.271
|
|
5SM5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2856434807
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
S5J 2-[4-(2-methoxyphenyl)piperazin-1-yl]ethanenitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.249
|
|
5SM6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1899842917
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
K1A 3-[(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)methyl]-5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2(3H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.29 Å
R-free 0.278
|
|
5SM7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z1247413608
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LPU 1-(methanesulfonyl)piperidin-4-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.268
|
|
5SM8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2027158783
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
WKA N-(2,1,3-benzoxadiazol-4-yl)acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.267
|
|
5SM9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2234920345
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
VZS N-(2-methoxy-5-methylphenyl)-N'-4H-1,2,4-triazol-4-ylurea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.271
|
|
5SMA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2856434890
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
NZD 4-methyl-N-phenylpiperazine-1-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.259
|
|
5SMB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z419995480
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LRR 1-(morpholin-4-yl)-4-phenylbutan-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.18 Å
R-free 0.280
|
|
5SMC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2033637875
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LRF N~2~-(4-cyano-3-methyl-1,2-thiazol-5-yl)-N~2~-methylglycinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.263
|
|
5SMD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z274575916
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
WKS 2,4-dimethyl-6-(piperazin-1-yl)pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.263
|
|
5SME
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z437584380
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
I8D (4-chlorophenyl)(thiomorpholin-4-yl)methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.255
|
|
5SMF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z56791867
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
K1S N,N-diethyl-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.319
|
|
5SMG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2092370954
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LR9 3-amino-N-ethyl-N-methylbenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.253
|
|
5SMH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z2856434938
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
7ZC 1-(5-methoxy-1H-indol-3-yl)-N,N-dimethyl-methanamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.64 Å
R-free 0.280
|
|
5SMI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with Z71580604
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
LQV (2S)-N-(5-methylpyridin-2-yl)oxolane-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.329
|
|
5SMK
PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 NSP14
提交 2022-03-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;278 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.217
|
|
5SML
PanDDA analysis group deposition of SARS-CoV-2 main protease ligands identified from single sequence-guideddeep generative framework -- Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z68337194 (Mpro-IBM0045)
提交 2022-04-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O3R 6-{[(3,4-dichlorophenyl)methyl](methyl)amino}pyridine-3-sulfonamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.227
|
|
5SMM
PanDDA analysis group deposition of SARS-CoV-2 main protease ligands identified from single sequence-guideddeep generative framework -- Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1633315555 (Mpro-IBM0058)
提交 2022-04-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
O46 N-[4-(3-fluorophenyl)oxan-4-yl]-2-(3-hydroxyphenyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.231
|
|
5SMN
PanDDA analysis group deposition of SARS-CoV-2 main protease ligands identified from single sequence-guideddeep generative framework -- Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z1365651030 (Mpro-IBM0078)
提交 2022-04-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O4F N-(1-cyanocyclopropyl)-1-(3-methylpyridin-4-yl)piperidine-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.36 Å
R-free 0.212
|
|
5SOI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000078036511 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WVG 3-[(3R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]propanoic acid × 1
WYY 3-[(3S)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SOI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000078036511 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SOJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000642067873 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RWQ [(3R)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)piperidin-3-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.150
|
|
5SOJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000642067873 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.150
|
|
5SOK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000302059710 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RVO 5-chloro-6-{(3R)-3-[(pyridin-4-yl)oxy]pyrrolidin-1-yl}pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.159
|
|
5SOK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000302059710 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.159
|
|
5SOL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000910475722 - (S,R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WVM (8S)-8-fluoro-6-(6-{[(2R)-2-hydroxypropyl]amino}pyrimidin-4-yl)-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.163
|
|
5SOL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000910475722 - (S,R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.163
|
|
5SOM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000835985505 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WVY [(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]methyl [4-(1H-pyrazol-1-yl)phenyl]acetate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SOM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000835985505 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SON
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000920153280 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WW1 3-{[(2R)-2-phenylpropyl]sulfanyl}-7H-[1,2,4]triazolo[4,3-b][1,2,4]triazole × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.178
|
|
5SON
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000920153280 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.178
|
|
5SOO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000897286891 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WW4 4-{(3R)-3-[(1,3-thiazol-2-yl)methyl]pyrrolidin-1-yl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.157
|
|
5SOO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000897286891 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.157
|
|
5SOP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001364194305 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RYI (5R)-7-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2lambda~6~-thia-7-azaspiro[4.5]decane-2,2-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.174
|
|
5SOP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001364194305 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.174
|
|
5SOQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000896845531 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WWJ 5-ethyl-4-{(3R)-3-[(3-methyl-1,2,4-oxadiazol-5-yl)methyl]piperidin-1-yl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SOQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000896845531 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SOR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000110510893
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WWP 3-{[3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-3H-purin-6-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SOR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000110510893
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SOS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000559260078
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WWS 3-[(5-chloropyridin-2-yl)methyl]-3H-purin-6-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.151
|
|
5SOS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000559260078
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.151
|
|
5SOT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000292637864 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WX4 {1-[(3R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]-1H-1,2,3-triazol-4-yl}methanol × 1
S1O {1-[(3S)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]-1H-1,2,3-triazol-4-yl}methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.154
|
|
5SOT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000292637864 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.154
|
|
5SOU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000285507655 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WX7 5-[(3R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]-1,3,4-oxadiazol-2(3H)-one × 1
RZ9 5-[(3S)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]-1,3,4-oxadiazol-2(3H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.152
|
|
5SOU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000285507655 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.152
|
|
5SOV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000893191027 - (S) and (R) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WXD 5-ethyl-4-[(3S)-3-(methylsulfonyl)piperidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
WXA 5-ethyl-4-[(3R)-3-(methylsulfonyl)piperidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.157
|
|
5SOV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000893191027 - (S) and (R) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.157
|
|
5SOW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000118179920
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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WXG 1-{2-[(9H-purin-6-yl)sulfanyl]ethyl}pyrrolidin-2-one × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.177
|
|
5SOW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000118179920
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.177
|
|
5SOX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000043461211
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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WXJ 4-[2-(6-amino-3H-purin-3-yl)ethoxy]benzonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.136
|
|
5SOX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000043461211
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.136
|
|
5SOY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000222377450
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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WXS 4-methyl-5-{[(9H-purin-6-yl)sulfanyl]methyl}-2H-1,3-dioxol-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.183
|
|
5SOY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000222377450
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.183
|
|
5SOZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000827900828
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WXY (1-azaspiro[4.5]decan-1-yl)(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.162
|
|
5SOZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000827900828
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.162
|
|
5SP0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000681764827
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WY7 3-{[5-(furan-2-yl)-1,2-oxazol-3-yl]methyl}-3H-purin-6-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.146
|
|
5SP0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000681764827
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.146
|
|
5SP1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001472868186
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WYA 3-{[methyl(pyrido[2,3-b]pyrazin-6-yl)amino]methyl}[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazin-8(7H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.173
|
|
5SP1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001472868186
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.173
|
|
5SP2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000579359572 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WYG [(2R)-4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)morpholin-2-yl]acetic acid × 1
S3E [(2S)-4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)morpholin-2-yl]acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.154
|
|
5SP2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000579359572 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.154
|
|
5SP3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000450476923 - (S,R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WYJ [(2S,6R)-6-methyl-4-(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholin-2-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.160
|
|
5SP3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000450476923 - (S,R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.160
|
|
5SP4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398572
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RWL 9-[(2-chloro-1,3-thiazol-4-yl)methyl]-9H-purine-2,6-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.178
|
|
5SP4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398572
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.178
|
|
5SP6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398580
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RXX 9-{[(2P)-2-(5-methylfuran-2-yl)-1,3-thiazol-4-yl]methyl}-9H-purine-2,6-diamine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.204
|
|
5SP6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398580
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.204
|
|
5SP7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010903509 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RVS (1S,2S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-1,2,3,4-tetrahydronaphthalene-2-carboxylic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.152
|
|
5SP7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010903509 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.152
|
|
5SP8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894415 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RXI (6~{S})-7-[4-(cyclopropylcarbamoylamino)phenyl]carbonyl-3-methyl-6,8-dihydro-5~{H}-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazine-6-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.162
|
|
5SP8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894415 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.162
|
|
5SP9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3508769536 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.146
|
|
5SP9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3508769536 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RWC (3S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzoyl]-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.146
|
|
5SPA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894417 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RY6 (1S,2S)-1-(4-carbamamidobenzamido)-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 2
RYC (1R,2R)-1-(4-carbamamidobenzamido)-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.155
|
|
5SPA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894417 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.155
|
|
5SPB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894404 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S09 (1R,2R)-4-hydroxy-1-[4-(phenylcarbamamido)benzamido]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
S0T (1S,2S)-4-hydroxy-1-[4-(phenylcarbamamido)benzamido]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.165
|
|
5SPB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894404 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.165
|
|
5SPC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894387 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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QLF (1S,2S)-4-hydroxy-1-[(5,6,7,8-tetrahydro-1,8-naphthyridine-3-carbonyl)amino]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
QLU (1R,2R)-4-hydroxy-1-[(5,6,7,8-tetrahydro-1,8-naphthyridine-3-carbonyl)amino]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.153
|
|
5SPC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894387 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.153
|
|
5SPD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398539 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QYJ (1S,2S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 2
QRU (1R,2R)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.162
|
|
5SPD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398539 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.162
|
|
5SPE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398531 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S1F (1S,2S)-1-{4-[(methoxycarbonyl)amino]benzamido}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.144
|
|
5SPE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398531 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.144
|
|
5SPF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398569
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RYQ 9-[(2-methyl-1,3-thiazol-4-yl)methyl]-9H-purine-2,6-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.160
|
|
5SPF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398569
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.160
|
|
5SPG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398585
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RZI 9-[(2-cyclopropyl-1,3-thiazol-4-yl)methyl]-9H-purine-2,6-diamine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.158
|
|
5SPG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398585
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.158
|
|
5SPH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398515 - (R,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RZR (1R,2S)-1-[4-(methylcarbamamido)benzamido]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.151
|
|
5SPH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398515 - (R,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.151
|
|
5SPI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4574659604 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S1X (1S,2S)-1-{4-[(cyclopropanecarbonyl)amino]benzamido}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
S2R (1R,2R)-1-{4-[(cyclopropanecarbonyl)amino]benzamido}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.145
|
|
5SPI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4574659604 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.145
|
|
5SPJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000893101964
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S3R 5-chloro-N~3~-[(4-cyclopropyl-5-methyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]pyrazine-2,3-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.146
|
|
5SPJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000893101964
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.146
|
|
5SPK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250003296134 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S4F 3-[(3R)-1-(6-amino-5-chloropyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.160
|
|
5SPK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250003296134 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.160
|
|
5SPL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000611664196 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RW5 [(2S,4S)-4-methyl-2-(5-methylfuran-2-yl)piperidin-1-yl](7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.144
|
|
5SPL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000611664196 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.144
|
|
5SPM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00002410346
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S4O 4-hydroxy-6-(3-hydroxy-1-methyl-1,4,5,7-tetrahydro-6H-pyrazolo[3,4-c]pyridine-6-carbonyl)-2H-pyran-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.146
|
|
5SPM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00002410346
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.146
|
|
5SPN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00010608284
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S50 1-cyclopentyl-3-methyl-N-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)-1H-pyrazole-5-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.155
|
|
5SPN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00010608284
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.155
|
|
5SPO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00020289192 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.152
|
|
5SPO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00020289192 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S5F 6-chloro-4-{(8S)-8-[(4H-1,2,4-triazol-4-yl)methyl]-6-azaspiro[3.4]octan-6-yl}pyrimidin-2(1H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.152
|
|
5SPP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250002155324
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S5U 4-[methyl(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]butanoic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SPP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250002155324
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SPQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00014134848 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S63 (3R)-1-[(4-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)acetyl]-3-methylpyrrolidine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.164
|
|
5SPQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00014134848 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.164
|
|
5SPR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250002852032 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S6C [(3S)-1-(7H-purin-6-yl)piperidin-3-yl]acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.159
|
|
5SPR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250002852032 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.159
|
|
5SPS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00012962804 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S6N (3S)-6,6-dimethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)piperidine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.167
|
|
5SPS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00012962804 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.167
|
|
5SPT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000850008207
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
S6U 2-(2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl)ethyl 7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carboxylate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.161
|
|
5SPT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000850008207
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.161
|
|
5SPU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001364774273 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S7F (3S)-1-(6-amino-5-methylpyridine-3-sulfonyl)piperidine-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.155
|
|
5SPU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001364774273 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.155
|
|
5SPV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250003774401
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S7O 2-[methyl-[(9-oxidanylidene-1$l^{4},7,8-triazabicyclo[4.3.0]nona-1(6),2,4-trien-3-yl)carbonyl]amino]ethanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.167
|
|
5SPV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250003774401
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.167
|
|
5SPW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00004674769 - (R,S,R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
S5O (1R,5S,6R)-3-(7H-purin-6-yl)-3-azabicyclo[3.2.2]nonane-6-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.152
|
|
5SPW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00004674769 - (R,S,R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.152
|
|
5SPX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250003958539
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QIW (5M)-5-(3-ethyl-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)-1,3-dimethyl-1H-pyrazole-4-carboxylic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.159
|
|
5SPX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250003958539
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.159
|
|
5SPY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL300019621104
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QJ0 1-(5-bromo-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)-2-[(1H-tetrazol-5-yl)sulfanyl]ethan-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.169
|
|
5SPY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL300019621104
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.169
|
|
5SPZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250001448407 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QJC (3S)-3-(fluoromethyl)-1-(6-oxo-1,6-dihydropyridazine-4-carbonyl)pyrrolidine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.160
|
|
5SPZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250001448407 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.160
|
|
5SQ0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL300007260658 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QJG (2S,4S)-1-(6-fluoro-2-hydroxyquinoline-4-carbonyl)-4-methylazetidine-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SQ0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL300007260658 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SQ1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001601221314 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QJO 1-(2-aminopyrimidine-5-sulfonyl)-4,4-difluoro-L-proline × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.165
|
|
5SQ1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001601221314 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.165
|
|
5SQ2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2976440814 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QJU 7-fluoro-4-{(3R)-3-[(3-methyl-1,2,4-oxadiazol-5-yl)methyl]piperidin-1-yl}-9H-pyrimido[4,5-b]indole × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.158
|
|
5SQ2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2976440814 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.158
|
|
5SQ3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5028367848 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QK6 [(2R)-4-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholin-2-yl]acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.152
|
|
5SQ3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5028367848 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.152
|
|
5SQ4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2364980062 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QKC 7-fluoro-4-[(3R)-3-(methanesulfonyl)piperidin-1-yl]-9H-pyrimido[4,5-b]indole × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.147
|
|
5SQ4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2364980062 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.147
|
|
5SQ5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894407 - (R,S) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QKL (1R,2S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
QKX (1S,2S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.155
|
|
5SQ5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894407 - (R,S) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.155
|
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5SQ6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894406
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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QL6 3-{[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]methyl}-1H-indole-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.170
|
|
5SQ6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894406
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.170
|
|
5SQ7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1445235880
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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QM6 3-{[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]methyl}-1-benzofuran-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.199
|
|
5SQ7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1445235880
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.199
|
|
5SQ8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1445261766
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QMF 3-{[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]methyl}-1-benzothiophene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.184
|
|
5SQ8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1445261766
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.184
|
|
5SQ9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894420 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QMO (1R,2R)-4-hydroxy-1-{4-[(propan-2-yl)carbamamido]benzamido}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
QN0 (1S,2S)-4-hydroxy-1-{4-[(propan-2-yl)carbamamido]benzamido}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.161
|
|
5SQ9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894420 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.161
|
|
5SQA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894395 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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QNF (1R,2R)-4-hydroxy-1-[(3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazine-7-carbonyl)amino]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
QNV (1S,2S)-4-hydroxy-1-[(3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazine-7-carbonyl)amino]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.158
|
|
5SQA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894395 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.158
|
|
5SQB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894390 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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QO3 (1R,2R)-1-({6-[(cyclopropylmethyl)amino]pyridine-3-carbonyl}amino)-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
QOF (1S,2S)-1-({6-[(cyclopropylmethyl)amino]pyridine-3-carbonyl}amino)-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.138
|
|
5SQB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894390 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.138
|
|
5SQC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894388 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QOR (1R,2R)-4-hydroxy-1-({5-[(oxan-4-yl)amino]pyrazine-2-carbonyl}amino)-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
QP9 (1S,2S)-4-hydroxy-1-({5-[(oxan-4-yl)amino]pyrazine-2-carbonyl}amino)-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.152
|
|
5SQC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894388 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.152
|
|
5SQD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894382 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QPL (1R,2R)-4-hydroxy-1-{[2-(hydroxymethyl)-1H-benzimidazole-5-carbonyl]amino}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
QPX (1S,2S)-4-hydroxy-1-{[2-(hydroxymethyl)-1H-benzimidazole-5-carbonyl]amino}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SQD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894382 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SQE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894392- (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QR0 (1S,2S)-4-hydroxy-1-{4-[(1H-imidazol-1-yl)amino]benzamido}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.153
|
|
5SQE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894392- (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.153
|
|
5SQF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250000548538 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QQ9 (3R)-1-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-4-carbonyl)piperidine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.153
|
|
5SQF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250000548538 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.153
|
|
5SQG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894430 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QQI (1R,2R)-1-{[6-(cyclopropylcarbamamido)pyridine-3-carbonyl]amino}-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
QQR (1S,2S)-1-{[6-(cyclopropylcarbamamido)pyridine-3-carbonyl]amino}-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.159
|
|
5SQG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894430 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.159
|
|
5SQH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894431- (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QR6 (1S,2S)-1-[2-chloro-4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.151
|
|
5SQH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894431- (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.151
|
|
5SQI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5016127255 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QRC (1S,2S)-4-hydroxy-1-[4-(methylcarbamamido)benzamido]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 2
QRI (1R,2R)-4-hydroxy-1-[4-(methylcarbamamido)benzamido]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.158
|
|
5SQI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5016127255 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.158
|
|
5SQJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5021668601
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
QRU (1R,2R)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.153
|
|
5SQJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5021668601
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.153
|
|
5SQK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2479782408 - (R,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QS6 (1R,3S)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclopentan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SQK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2479782408 - (R,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SQL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2689779890
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QSL 3-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}-1lambda~6~-thietane-1,1-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SQL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2689779890
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QSL 3-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}-1lambda~6~-thietane-1,1-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SQM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5028367849 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QT0 5-[(3R)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)piperidin-3-yl]-1,3,4-oxadiazol-2(3H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.157
|
|
5SQM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5028367849 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.157
|
|
5SQN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4914649780 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QT6 3-[(3S)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)piperidin-3-yl]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.161
|
|
5SQN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4914649780 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.161
|
|
5SQO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5030903496 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QTF (8R)-8-fluoro-6-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.162
|
|
5SQO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5030903496 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.162
|
|
5SQP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5028367859 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QTO (8S)-6-(6-anilinopyrimidin-4-yl)-8-fluoro-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.159
|
|
5SQP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5028367859 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.159
|
|
5SQQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00014649046
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QU3 4-(2-amino-7,8-dihydropyrido[4,3-d]pyrimidine-6(5H)-carbonyl)-N-methylfuran-2-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.146
|
|
5SQQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with FRESH00014649046
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.146
|
|
5SQR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL300016493575 - (R,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QUC (2R,3S)-1-(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-3-sulfonyl)-2-methylpiperidine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SQR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL300016493575 - (R,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SQS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001240411747
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QVC (4P)-4-[(4M)-4-(3-methyl-1,2,4-oxadiazol-5-yl)pyridin-2-yl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.150
|
|
5SQS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC001240411747
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.150
|
|
5SQT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000833624464 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QUR (3R,4R)-4-methyl-1-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-benzoxazole-7-carbonyl)pyrrolidine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.157
|
|
5SQT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINC000833624464 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QV1 (3S,4S)-4-methyl-1-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-benzoxazole-7-carbonyl)pyrrolidine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.157
|
|
5SQU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250004627335
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
QVL N,3-dimethyl-N-(1H-tetrazol-5-yl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SQU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with REAL250004627335
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SQV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894399 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QVX (1S,2S)-4-hydroxy-1-{4-[(pyridin-3-yl)amino]benzamido}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.161
|
|
5SQV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894399 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.161
|
|
5SQW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5014193706 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QW3 (1R,2R)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)-2-hydroxybenzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
QWC (1S,2S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)-2-hydroxybenzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SQW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5014193706 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 B
1025–1191(167 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SQX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5183357278 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1025–1191(167 aa)
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未记录
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QWX (1R,2R)-1-[2-amino-4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
QX5 (1S,2S)-1-[2-amino-4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.174
|
|
5SQX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5183357278 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.174
|
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5SQY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5211314110 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1025–1191(167 aa)
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未记录
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QWO (1S,2S)-1-{[4-(cyclopropylcarbamamido)-1,3-benzothiazole-7-carbonyl]amino}-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.158
|
|
5SQY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5211314110 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.158
|
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5SQZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1039058598
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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QXC N-[(pyridin-2-yl)methyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.154
|
|
5SQZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1039058598
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.154
|
|
5SR0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3649721459 - (R,S) and (S,R) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QXS (1S,2R)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclohexan-1-ol × 1
QY0 (1R,2S)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclohexan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.160
|
|
5SR0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3649721459 - (R,S) and (S,R) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.160
|
|
5SR1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1272415642 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QXL (3R)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-1lambda~6~-thiane-1,1-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SR1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1272415642 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QXL (3R)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-1lambda~6~-thiane-1,1-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SR2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with EN300-36602160
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QYC (1R,2S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.155
|
|
5SR2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with EN300-36602160
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.155
|
|
5SR3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5021669050 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QYJ (1S,2S)-1-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.154
|
|
5SR3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5021669050 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.154
|
|
5SR4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2479779298 - (R,S) and (S,R) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QYO (1S,3R)-3-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]cyclopentan-1-ol × 1
QYU (1R,3S)-3-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]cyclopentan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SR4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2479779298 - (R,S) and (S,R) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SR5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265454473 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QZ6 (2R)-2-{[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]methyl}-1lambda~6~-thietane-1,1-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.147
|
|
5SR5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265454473 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.147
|
|
5SR6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3011799020 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QZF (8R)-8-fluoro-6-(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.153
|
|
5SR6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3011799020 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.153
|
|
5SR7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4914649782 - (R,R,S) and (S,S,R) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QZO (1S,6R,7S)-3-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-3-azabicyclo[4.1.0]heptane-7-carboxylic acid × 1
QZX (1R,6S,7R)-3-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-3-azabicyclo[4.1.0]heptane-7-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.174
|
|
5SR7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4914649782 - (R,R,S) and (S,S,R) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.174
|
|
5SR8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4914650235 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
R0A [(6S)-8-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-5-oxa-8-azaspiro[3.5]nonan-6-yl]acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.171
|
|
5SR8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4914650235 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.171
|
|
5SR9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3562259556 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
R0H methyl (3R)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-3-(hydroxymethyl)pyrrolidine-3-carboxylate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.153
|
|
5SR9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3562259556 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.153
|
|
5SRA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5372052920 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
R0L (2R)-4-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholine-2-carboxylic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.157
|
|
5SRA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5372052920 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.157
|
|
5SRB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562532 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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R0R (8R)-8-fluoro-6-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-2-oxa-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1
R0W (8S)-8-fluoro-6-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-2-oxa-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.158
|
|
5SRB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562532 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.158
|
|
5SRC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562500 - (R,R) and (R,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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QIO (2R)-[(3R)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)piperidin-3-yl](hydroxy)acetic acid × 1
QIR (2S)-[(3R)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)piperidin-3-yl](hydroxy)acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.175
|
|
5SRC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562500 - (R,R) and (R,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.175
|
|
5SRD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5373433723 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
R8K (8S)-8-fluoro-6-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-N-(methanesulfonyl)-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.165
|
|
5SRD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5373433723 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.165
|
|
5SRE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562530 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
R8R (5R)-7-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-7-azaspiro[3.5]nonane-5-carboxylic acid × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.152
|
|
5SRE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562530 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.152
|
|
5SRF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4175156780 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
R8Z (3R)-3-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)(methyl)amino]-1lambda~6~-thiane-1,1-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SRF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4175156780 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.156
|
|
5SRG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265428403
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
R98 7-fluoro-N-methyl-N-[(pyridin-2-yl)methyl]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-amine × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.151
|
|
5SRG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265428403
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.151
|
|
5SRH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265470867 - pyrimido-indole core only
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
R9F 7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.161
|
|
5SRH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265470867 - pyrimido-indole core only
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.161
|
|
5SRI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5278734565 - pyrimido-indole core only
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
R9F 7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.158
|
|
5SRI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5278734565 - pyrimido-indole core only
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.158
|
|
5SRJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265428226
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
R9L 3-{[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]methyl}-1lambda~6~-thietane-1,1-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SRJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265428226
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SRK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5373433775 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
R9U (2R)-4-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-N-(methanesulfonyl)morpholine-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.146
|
|
5SRK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5373433775 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.146
|
|
5SRL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5352447655 - (R,R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RA3 [(2R,6R)-4-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-6-(hydroxymethyl)morpholin-2-yl]acetic acid × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.148
|
|
5SRL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5352447655 - (R,R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.148
|
|
5SRM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3860662215 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RBB [(2R)-6,6-dimethyl-4-(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholin-2-yl]acetic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.151
|
|
5SRM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3860662215 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.151
|
|
5SRN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2466029596 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RBO [(2R)-4-(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholin-2-yl]acetic acid × 1
RC3 [(2S)-4-(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholin-2-yl]acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SRN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2466029596 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SRO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562509 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RCR (8R)-6-(7-bromo-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-8-fluoro-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1
RD6 (8S)-6-(7-bromo-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-8-fluoro-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.153
|
|
5SRO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562509 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.153
|
|
5SRP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5340019182 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RDN (8R)-6-(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1
TFA trifluoroacetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.150
|
|
5SRP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5340019182 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.150
|
|
5SRQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3831836449 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RDU [(6R)-8-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-5-oxa-8-azaspiro[3.5]nonan-6-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.147
|
|
5SRQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z3831836449 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.147
|
|
5SRR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4158218973 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RF0 [(2S,6S)-4-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-6-methoxymorpholin-2-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SRR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4158218973 - (S,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.149
|
|
5SRS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2614735107 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RFI 3-[(3S)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)pyrrolidin-3-yl]-1,3-oxazolidin-2-one × 1
RFU 3-[(3R)-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)pyrrolidin-3-yl]-1,3-oxazolidin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.143
|
|
5SRS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2614735107 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.143
|
|
5SRT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562791 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RG5 7-fluoro-4-[(2R)-2-(1H-tetrazol-5-yl)morpholin-4-yl]-9H-pyrimido[4,5-b]indole × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.167
|
|
5SRT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562791 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.167
|
|
5SRU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562523 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RGF (8S)-6-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.168
|
|
5SRU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562523 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.168
|
|
5SRV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562533 - (R,R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RI3 (3R,4R)-4-cyclopropyl-3-fluoro-1-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)pyrrolidine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.165
|
|
5SRV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562533 - (R,R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.165
|
|
5SRW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2364914118 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RI7 methyl [(2S)-4-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholin-2-yl]acetate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.146
|
|
5SRW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2364914118 - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.146
|
|
5SRX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562503 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RIK 3-[(2R)-4-(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)morpholin-2-yl]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.151
|
|
5SRX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562503 - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.151
|
|
5SRY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265428218
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RIW 1-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]pyrrolidin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.150
|
|
5SRY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5265428218
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.150
|
|
5SRZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5281440906 - (R,S) and (S,R) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RIZ (1R,2S)-2-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]cyclohexane-1-carboxylic acid × 1
RJ9 (1S,2R)-2-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]cyclohexane-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.161
|
|
5SRZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5281440906 - (R,S) and (S,R) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.161
|
|
5SS0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCn9000000uj1v
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RJL 3-hydroxy-N-{2-[(5-methoxypyridine-3-carbonyl)amino]ethyl}pyridine-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.151
|
|
5SS0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCn9000000uj1v
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.151
|
|
5SS1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCou000000a2Hm
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RJS (8S)-N-[(4-bromo-3-fluorophenyl)methanesulfonyl]pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.187
|
|
5SS1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCou000000a2Hm
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.187
|
|
5SS2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCnt000006kx7L
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RK0 N-{5-[(3-cyano-4-methylphenyl)sulfamoyl]-4-methyl-1,3-thiazol-2-yl}acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.160
|
|
5SS2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCnt000006kx7L
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.160
|
|
5SS3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCnu000001eLaQ
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RK9 N-{5-[(3-cyanophenyl)sulfamoyl]-4-methyl-1,3-thiazol-2-yl}propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.180
|
|
5SS3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCnu000001eLaQ
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.180
|
|
5SS4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCns000000RJoU
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RKI (3-{[(thieno[3,2-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]methyl}phenyl)acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.159
|
|
5SS4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCns000000RJoU
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.159
|
|
5SS5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCpE000000mAwk - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RKU (3S)-3-(4-bromophenyl)-3-[(6-fluoro-1H-benzimidazole-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.161
|
|
5SS5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCpE000000mAwk - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.161
|
|
5SS6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINClf00000cdzal
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RL5 1-(2-{[2-(ethylamino)-1,3-thiazole-5-carbonyl]amino}ethyl)-1H-imidazole-4-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.158
|
|
5SS6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINClf00000cdzal
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.158
|
|
5SS7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCnz000004Qo8S
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.146
|
|
5SS7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCnz000004Qo8S
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RL9 4-fluoro-3-{[(1H-indole-5-carbonyl)amino]methyl}benzoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.146
|
|
5SS8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCny000002NPIr
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RLN (4-{[(thieno[3,2-b]pyridine-7-carbonyl)amino]methyl}phenyl)acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.150
|
|
5SS8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCny000002NPIr
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.150
|
|
5SS9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCow000000AiWv - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RLU (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.167
|
|
5SS9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCow000000AiWv - (R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.167
|
|
5SSA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINClv000001jcNa - (r,r) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RM6 [(1r,3r)-3-{[(thieno[2,3-c]pyridine-5-carbonyl)amino]methyl}cyclobutyl]acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.172
|
|
5SSA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINClv000001jcNa - (r,r) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.172
|
|
5SSB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCmk000007RhkC
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RMU 4-[(6-chloro-5-cyanopyridin-3-yl)sulfamoyl]-5-methylfuran-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.157
|
|
5SSB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCmk000007RhkC
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.157
|
|
5SSC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCk500000doQ8X
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RNC [3-(5-hydroxy-1,2,4-oxadiazol-3-yl)azetidin-1-yl][5-(methylamino)pyrazin-2-yl]methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.167
|
|
5SSC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCk500000doQ8X
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.167
|
|
5SSD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCm4000007vvRA - (R,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RNL (1R,2S)-2-({2-[(4S)-7-methyl-8-oxo-7,8-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazin-3-yl]ethyl}carbamoyl)cyclopropane-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.158
|
|
5SSD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCm4000007vvRA - (R,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.158
|
|
5SSE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCoD000001aHBe
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
ROO 2-methyl-5-{[(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]methyl}furan-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.149
|
|
5SSE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCoD000001aHBe
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.149
|
|
5SSF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCmr000000sTGN
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RP0 4-[(4-bromo-3-cyanophenyl)sulfamoyl]-5-methylfuran-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.165
|
|
5SSF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCmr000000sTGN
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.165
|
|
5SSG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCpv000006Li5M - (R,R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RPU (3R)-3-(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)-3-[(2R)-3-(furan-2-yl)-2-methylpropanamido]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.163
|
|
5SSG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCpv000006Li5M - (R,R) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.163
|
|
5SSH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCpx000006Mh4L - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RQ8 3-(5-bromopyridin-3-yl)-N-[5-(1,1-difluoroethyl)pyridine-3-carbonyl]-L-alanine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.149
|
|
5SSH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCpx000006Mh4L - (S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.149
|
|
5SSI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCn500000bifGU
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RQC (3R)-1-[3-(1-methyl-4-oxo-4,5-dihydro-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-yl)propanoyl]pyrrolidine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.152
|
|
5SSI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCn500000bifGU
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.152
|
|
5SSJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCno00000broQT
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RQI 2-{2-[(6-fluoro-1H-benzimidazole-5-carbonyl)amino]ethyl}-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.146
|
|
5SSJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCno00000broQT
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.146
|
|
5SSK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCkk00000cjQyM - (R,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RQR (1S,4R)-4-[(thieno[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]cyclopent-2-ene-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.145
|
|
5SSK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCkk00000cjQyM - (R,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.145
|
|
5SSL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCoj00000doMWF
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RR3 1-[4-(cyanomethyl)phenyl]-N-(1-methyl-1H-pyrazolo[4,3-d]pyrimidin-7-yl)methanesulfonamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.163
|
|
5SSL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ZINCoj00000doMWF
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.163
|
|
5SSM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166256 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RRF (1R,2R)-1-[(1H-benzimidazole-5-carbonyl)amino]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
RS0 (1S,2S)-1-[(1H-benzimidazole-5-carbonyl)amino]-4-hydroxy-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.156
|
|
5SSM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166256 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.156
|
|
5SSN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894382 - (R,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RS9 (1R,2S)-4-hydroxy-1-{[2-(hydroxymethyl)-1H-benzimidazole-5-carbonyl]amino}-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.152
|
|
5SSN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5010894382 - (R,S) isomer
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.152
|
|
5SSO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562519 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RSR (8R)-6-(2-amino-7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-8-fluoro-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1
RT5 (8S)-6-(2-amino-7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)-8-fluoro-6-azaspiro[3.4]octane-8-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.157
|
|
5SSO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5198562519 - (R) and (S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.157
|
|
5SSP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166285 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RTI (1S,2S)-4-hydroxy-1-[(1H-indole-5-carbonyl)amino]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
RTU (1R,2R)-4-hydroxy-1-[(1H-indole-5-carbonyl)amino]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.149
|
|
5SSP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166285 - (R,R) and (S,S) isomers
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.149
|
|
5SSQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166291
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RV3 3-{[(1H-benzimidazole-5-carbonyl)amino]methyl}-1H-indole-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.150
|
|
5SSQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166291
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.150
|
|
5SSR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166300
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RVF 3-{[(2-hydroxy-1H-benzimidazole-5-carbonyl)amino]methyl}-1H-indole-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.147
|
|
5SSR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5459166300
提交 2022-06-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.147
|
|
6LU7
The crystal structure of COVID-19 main protease in complex with an inhibitor N3
提交 2020-01-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:3C-like proteinase
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;293 K;2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.235
|
|
6LZE
The crystal structure of COVID-19 main protease in complex with an inhibitor 11a
提交 2020-02-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3566(303 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;293 K;2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.199
|
|
6M03
The crystal structure of COVID-19 main protease in apo form
提交 2020-02-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 8.1;293 K;10% polyethylene glycol (PEG) 3000, 0.2M LiSO4, 1mM DTT, 0.1M imidazole buffer (pH 8.1), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.246
|
|
6M0K
The crystal structure of COVID-19 main protease in complex with an inhibitor 11b
提交 2020-02-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
FJC ~{N}-[(2~{S})-3-(3-fluorophenyl)-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;293 K;2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.193
|
|
6M2N
SARS-CoV-2 3CL protease (3CL pro) in complex with a novel inhibitor
提交 2020-02-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
3WL 5,6,7-trihydroxy-2-phenyl-4H-chromen-4-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;100 mM MES, pH5.8, 2% PEG6000, 3% DMSO, 1mM DTT
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.254
|
|
6M2N
SARS-CoV-2 3CL protease (3CL pro) in complex with a novel inhibitor
提交 2020-02-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
3WL 5,6,7-trihydroxy-2-phenyl-4H-chromen-4-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;100 mM MES, pH5.8, 2% PEG6000, 3% DMSO, 1mM DTT
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.254
|
|
6M2Q
SARS-CoV-2 3CL protease (3CL pro) apo structure (space group C21)
提交 2020-02-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;100mM MES, pH5.8, 10% PEG6000, 3% DMSO, 1mM DTT
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.204
|
|
6M71
SARS-Cov-2 RNA-dependent RNA polymerase in complex with cofactors
提交 2020-03-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Solutions were made fresh from concentrated to avoid microbial contamination.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot for 3 seconds before plunging.
|
分辨率 2.90 Å
|
|
6VWW
Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2.
提交 2020-02-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 27
MG MAGNESIUM ION × 3
ACY ACETIC ACID × 9
CL CHLORIDE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;289 K;0.2 M Calcium Acetate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 10 %(w/v) PEG8000
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.178
|
|
6VXS
Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS CoV-2
提交 2020-02-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 2
NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;289 K;0.1 M CHES pH 9.5, 30 %(w/v) PEG3000
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.234
|
|
6VXS
Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS CoV-2
提交 2020-02-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 2
NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;289 K;0.1 M CHES pH 9.5, 30 %(w/v) PEG3000
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.234
|
|
6W01
The 1.9 A Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 in the Complex with a Citrate
提交 2020-02-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 66
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9
CIT CITRIC ACID × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;289 K;0.1 M sodium citrate pH 5.6, 10 %(w/v) PEG4000
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.185
|
|
6W02
Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS CoV-2 in the complex with ADP ribose
提交 2020-02-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;289 K;0.01 M sodium citrate, 33 %(w/v) PEG6000
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.173
|
|
6W02
Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS CoV-2 in the complex with ADP ribose
提交 2020-02-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;289 K;0.01 M sodium citrate, 33 %(w/v) PEG6000
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.173
|
|
6W4B
The crystal structure of Nsp9 RNA binding protein of SARS CoV-2
提交 2020-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
4141–4253(113 aa)
链 B
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;289 K;1.8 M di-Ammonium hydrogen citrate,
0.1 M Sodium acetate
|
分辨率 2.95 Å
R-free 0.276
|
|
6W4H
1.80 Angstrom Resolution Crystal Structure of NSP16 - NSP10 Complex from SARS-CoV-2
提交 2020-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
片段:UNP residues 6799-7096
链 B
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
|
未记录
|
SO3 SULFITE ION × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
ACT ACETATE ION × 2
BDF beta-D-fructopyranose × 2
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;5.3 mg/mL 1:1 nsp16/nsp10 in 0.15 M sodium chloride, 0.01 M Tris, pH 7.5, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% glycerol against ComPAS screen A7 (0.2 M calcium acetate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 18% w/v PEG 8000), cryoprotectant: 1:1 screen + 50% sucrose
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.163
|
|
6W61
Crystal Structure of the methyltransferase-stimulatory factor complex of NSP16 and NSP10 from SARS CoV-2.
提交 2020-03-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CL CHLORIDE ION × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;289 K;0.1 M sodium citrate, pH 5.6, 10 5(w/v) PEG4000, 10 %(w/v) isopropanol
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.193
|
|
6W63
Structure of COVID-19 main protease bound to potent broad-spectrum non-covalent inhibitor X77
提交 2020-03-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;294 K;3 mM DTT, 1% MPD, 80mM KCl, 50 mM MES pH 6.0, 16% PEG 10k
2uL protein ( 125 uM 3CLpro, 25 mM HEPES pH 7.5, 2.5 mM DTT, 1% DMSO, 400 uM 077) + 1 uL reservoir
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.221
|
|
6W6Y
Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS CoV-2 in complex with AMP
提交 2020-03-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:ADP ribose phosphatase (ADRP) domain (UNP residues 1024-1192)
|
未记录
|
AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289 K;0.1 M MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.189
|
|
6W6Y
Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS CoV-2 in complex with AMP
提交 2020-03-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
片段:ADP ribose phosphatase (ADRP) domain (UNP residues 1024-1192)
|
未记录
|
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289 K;0.1 M MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.189
|
|
6W75
1.95 Angstrom Resolution Crystal Structure of NSP10 - NSP16 Complex from SARS-CoV-2
提交 2020-03-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
片段:UNP residues 6799-7096
链 B
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 2
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
FMT FORMIC ACID × 9
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.3;292 K;9.7 mg/mL 1:1 nsp10/nsp16 in 0.5 M sodium chloride, 0.01 M Tris, pH 7.5, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% glycerol against ComPAS screen F10 (0.4 M potassium/sodium tartrate), cryoprotectant: 4 M sodium formate
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.174
|
|
6W75
1.95 Angstrom Resolution Crystal Structure of NSP10 - NSP16 Complex from SARS-CoV-2
提交 2020-03-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
6799–7096(298 aa)
片段:UNP residues 6799-7096
链 D
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 5
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
FMT FORMIC ACID × 11
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.3;292 K;9.7 mg/mL 1:1 nsp10/nsp16 in 0.5 M sodium chloride, 0.01 M Tris, pH 7.5, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% glycerol against ComPAS screen F10 (0.4 M potassium/sodium tartrate), cryoprotectant: 4 M sodium formate
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.174
|
|
6W9Q
Peptide-bound SARS-CoV-2 Nsp9 RNA-replicase
提交 2020-03-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;298 K;2.2M AmSO4, 0.1M Citrate-phosphate pH4
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.246
|
|
6WCF
Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS-CoV-2 in complex with MES
提交 2020-03-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289 K;0.1 M MES, PH 6.5, 30% W/V PEG4000
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.154
|
|
6WEN
Crystal Structure of ADP ribose phosphatase of NSP3 from SARS-CoV-2 in the apo form
提交 2020-04-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;289 K;34.3% PEG 5000 MME, 150 mM AMPD/Tris, pH 9.0, 30 mM K/NA tartrate
|
分辨率 1.35 Å
R-free 0.144
|
|
6WEY
High-resolution structure of the SARS-CoV-2 NSP3 Macro X domain
提交 2020-04-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1195(171 aa)
片段:Macro X domain (residues 207-377)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;298 K;Morpheus Screen D9 (0.12M Alcohols, 0.1M buffer system 3, pH 8.5, 30% PPT mix 1 [40% PEG 500 MME/20% PEG 20K])
|
分辨率 0.95 Å
R-free 0.136
|
|
6WIQ
Crystal structure of the co-factor complex of NSP7 and the C-terminal domain of NSP8 from SARS CoV-2
提交 2020-04-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 B
4019–4140(122 aa)
片段:C-terminal domain (UNP residues 4019-4140)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;289 K;0.1 M Tris, pH 8.5, 1.5 M ammonium phosphate dibasic
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.252
|
|
6WJT
2.0 Angstrom Resolution Crystal Structure of Nsp16-Nsp10 Heterodimer from SARS-CoV-2 in Complex with S-Adenosyl-L-Homocysteine
提交 2020-04-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 1
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
FMT FORMIC ACID × 8
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: ComPAS (F10), 0.4M Potassium/Sodium tartrate;
Soak and Cryo: 5mM SAH, 4M Sodium formate, 3 hrs.
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.191
|
|
6WJT
2.0 Angstrom Resolution Crystal Structure of Nsp16-Nsp10 Heterodimer from SARS-CoV-2 in Complex with S-Adenosyl-L-Homocysteine
提交 2020-04-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
6799–7096(298 aa)
链 D
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 1
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
FMT FORMIC ACID × 5
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: ComPAS (F10), 0.4M Potassium/Sodium tartrate;
Soak and Cryo: 5mM SAH, 4M Sodium formate, 3 hrs.
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.191
|
|
6WKQ
1.98 Angstrom Resolution Crystal Structure of NSP16-NSP10 Heterodimer from SARS-CoV-2 in Complex with Sinefungin
提交 2020-04-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
片段:UNP residues 6799-7096
链 B
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 2
SFG SINEFUNGIN × 1
FMT FORMIC ACID × 6
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;5.3 mg/mL 1:1 nsp10/nsp16 in 0.15 M sodium chloride, 0.01 M Tris, pH 7.5, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% glycerol against ComPAS screen F10 (0.4 M potassium/sodium tartrate), soak and cryoprotection: 5 mM SFG, 4 M sodium formate, 3 hrs
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.180
|
|
6WKQ
1.98 Angstrom Resolution Crystal Structure of NSP16-NSP10 Heterodimer from SARS-CoV-2 in Complex with Sinefungin
提交 2020-04-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
6799–7096(298 aa)
片段:UNP residues 6799-7096
链 D
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 2
SFG SINEFUNGIN × 1
FMT FORMIC ACID × 9
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;5.3 mg/mL 1:1 nsp10/nsp16 in 0.15 M sodium chloride, 0.01 M Tris, pH 7.5, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% glycerol against ComPAS screen F10 (0.4 M potassium/sodium tartrate), soak and cryoprotection: 5 mM SFG, 4 M sodium formate, 3 hrs
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.180
|
|
6WKS
Structure of SARS-CoV-2 nsp16/nsp10 in complex with RNA cap analogue (m7GpppA) and S-adenosylmethionine
提交 2020-04-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 AAA
6799–7096(298 aa)
链 BBB
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
ADN ADENOSINE × 1
GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;10% (v/v) MPD, 0.1M HEPES pH 7.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.188
|
|
6WLC
Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 in the Complex with Uridine-5'-Monophosphate
提交 2020-04-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 6
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 6
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 30
ACT ACETATE ION × 12
SO4 SULFATE ION × 3
FMT FORMIC ACID × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;289 K;16 %(w/v) PEG400, 100 mM Tris pH 8.5, 200 mM sodium acetate
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.195
|
|
6WNP
X-ray Structure of SARS-CoV-2 main protease bound to Boceprevir at 1.45 A
提交 2020-04-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
U5G boceprevir (bound form) × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;278 K;2.67 mM DTT, 0.33% MPD, 16.7 mM MES pH 6.0, 26.7 mM KCl, 5% PEG-10,000, 16.7 mM HEPES pH 7.5, 0.67% DMSO and 200 uM Boceprevir
|
分辨率 1.44 Å
R-free 0.196
|
|
6WOJ
Structure of the SARS-CoV-2 macrodomain (NSP3) in complex with ADP-ribose
提交 2020-04-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1023–1197(175 aa)
片段:UNP Residues 1023-1197
|
未记录
|
APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.2;291 K;1.8 M NaH2PO4/K2HPO4, 0.1 M NDSB-256
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.252
|
|
6WOJ
Structure of the SARS-CoV-2 macrodomain (NSP3) in complex with ADP-ribose
提交 2020-04-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1023–1197(175 aa)
片段:UNP Residues 1023-1197
|
未记录
|
APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.2;291 K;1.8 M NaH2PO4/K2HPO4, 0.1 M NDSB-256
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.252
|
|
6WOJ
Structure of the SARS-CoV-2 macrodomain (NSP3) in complex with ADP-ribose
提交 2020-04-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1023–1197(175 aa)
片段:UNP Residues 1023-1197
|
未记录
|
APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.2;291 K;1.8 M NaH2PO4/K2HPO4, 0.1 M NDSB-256
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.252
|
|
6WOJ
Structure of the SARS-CoV-2 macrodomain (NSP3) in complex with ADP-ribose
提交 2020-04-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1023–1197(175 aa)
片段:UNP Residues 1023-1197
|
未记录
|
APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.2;291 K;1.8 M NaH2PO4/K2HPO4, 0.1 M NDSB-256
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.252
|
|
6WQ3
Crystal Structure of Nsp16-Nsp10 Heterodimer from SARS-CoV-2 in Complex with 7-methyl-GpppA and S-adenosyl-L-homocysteine.
提交 2020-04-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1
M7G 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
SO4 SULFATE ION × 8
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;292 K;Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: Anions (A10), 0.1M MES pH 6.5, 0.6M tri-Sodium citrate;
Soak and Cryo: 1mM SAH, 0.5mM GpppA, 2M Lithium sulfate.
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.186
|
|
6WQD
The 1.95 A Crystal Structure of the Co-factor Complex of NSP7 and the C-terminal Domain of NSP8 from SARS-CoV-2
提交 2020-04-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 B
4019–4140(122 aa)
片段:C-terminal domain (UNP residues 4019-4140)
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
4019–4140(122 aa)
片段:C-terminal domain (UNP residues 4019-4140)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;289 K;0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Tris, pH 8.5, 20% w/v PEG8000
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.229
|
|
6WQF
Structural Plasticity of the SARS-CoV-2 3CL Mpro Active Site Cavity Revealed by Room Temperature X-ray Crystallography
提交 2020-04-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;BIS-TRIS pH=6.5, 20% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.230
|
|
6WRH
The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2 , C111S mutant
提交 2020-04-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 3
CL CHLORIDE ION × 2
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;277 K;0.1 M Acetate buffer, 0.8 M NaH2PO4 / 1.2 M K2HPO4
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.164
|
|
6WRZ
Crystal Structure of Nsp16-Nsp10 Heterodimer from SARS-CoV-2 with 7-methyl-GpppA and S-adenosyl-L-homocysteine in the Active Site and Sulfates in the mRNA Binding Groove.
提交 2020-04-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1
MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
SO4 SULFATE ION × 10
CL CHLORIDE ION × 4
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: Anions (F3), 0.1M HEPES pH 7.5, 0.9M Sodium phosphate, 0.9M Potassium phosphate;
Soak and Cryo: 1mM SAH, 0.5mM GpppA, 2M Lithium sulfate.
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.190
|
|
6WTC
Crystal Structure of the Second Form of the Co-factor Complex of NSP7 and the C-terminal Domain of NSP8 from SARS CoV-2
提交 2020-05-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 B
4019–4140(122 aa)
片段:C-terminal domain (UNP residues 4019-4140)
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
4019–4140(122 aa)
片段:C-terminal domain (UNP residues 4019-4140)
|
未记录
|
ACY ACETIC ACID × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;289 K;0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 25% w/v PEG3350
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.214
|
|
6WTJ
Feline coronavirus drug inhibits the main protease of SARS-CoV-2 and blocks virus replication
提交 2020-05-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;295 K;0.2 M Sodium chloride 0.1 M HEPES pH 7.0 20 % w/v PEG 6000.
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.235
|
|
6WTK
Feline coronavirus drug inhibits the main protease of SARS-CoV-2 and blocks virus replication
提交 2020-05-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;0.2 M Sodium chloride 0.1 M HEPES pH 7.0 20 % w/v PEG 6000.
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.255
|
|
6WTM
Feline coronavirus drug inhibits the main protease of SARS-CoV-2 and blocks virus replication
提交 2020-05-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;295 K;0.2 M Sodium sulfate, 0.1 M Bis-Tris propane pH 6.5, 20 % w/v PEG 3350.
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.252
|
|
6WTT
Crystals Structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease with inhibitor GC-376
提交 2020-05-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
|
未记录
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
GOL GLYCEROL × 2
CL CHLORIDE ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;15 % PEG 2k, 10 % 1,6-HexD, 0.2 M NaCl
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.300
|
|
6WTT
Crystals Structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease with inhibitor GC-376
提交 2020-05-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
3264–3567(304 aa)
链 C
3264–3567(304 aa)
|
未记录
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 1
CL CHLORIDE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
B1S (1R,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;15 % PEG 2k, 10 % 1,6-HexD, 0.2 M NaCl
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.300
|
|
6WUU
Crystal structure of the SARS CoV-2 Papain-like protease in complex with peptide inhibitor VIR250
提交 2020-05-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1563–1879(317 aa)
片段:UNP Residues 1563-1879
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.79 Å
R-free 0.230
|
|
6WUU
Crystal structure of the SARS CoV-2 Papain-like protease in complex with peptide inhibitor VIR250
提交 2020-05-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1563–1879(317 aa)
片段:UNP Residues 1563-1879
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.79 Å
R-free 0.230
|
|
6WUU
Crystal structure of the SARS CoV-2 Papain-like protease in complex with peptide inhibitor VIR250
提交 2020-05-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
1563–1879(317 aa)
片段:UNP Residues 1563-1879
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.79 Å
R-free 0.230
|
|
6WUU
Crystal structure of the SARS CoV-2 Papain-like protease in complex with peptide inhibitor VIR250
提交 2020-05-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1563–1879(317 aa)
片段:UNP Residues 1563-1879
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.79 Å
R-free 0.230
|
|
6WVN
Crystal Structure of Nsp16-Nsp10 from SARS-CoV-2 in Complex with 7-methyl-GpppA and S-Adenosylmethionine.
提交 2020-05-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 14
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1
MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ADE ADENINE × 2
SO4 SULFATE ION × 10
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: Anions (F3), 0.1M HEPES pH 7.5, 0.9M Sodium phosphate, 0.9M Potassium phosphate;
Soak and Cryo: 5mM SAM, 0.5mM GpppA, 2M Lithium sulfate.
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.178
|
|
6WX4
Crystal structure of the SARS CoV-2 Papain-like protease in complex with peptide inhibitor VIR251
提交 2020-05-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1563–1879(317 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.8 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Tris HCl pH 8.5 and 0.5% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 5,000
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.196
|
|
6WXC
Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 in the Complex with potential repurposing drug Tipiracil
提交 2020-05-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CMU 5-CHLORO-6-(1-(2-IMINOPYRROLIDINYL) METHYL) URACIL × 6
PO4 PHOSPHATE ION × 6
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 27
FMT FORMIC ACID × 12
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;289 K;0.2 M sodium chloride, 0.1 M sodium/potassium phosphate pH 6.2 10 %(w/v) PEG8000
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.194
|
|
6WXD
SARS-CoV-2 Nsp9 RNA-replicase
提交 2020-05-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
4141–4253(113 aa)
链 B
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;293 K;2.2M Ammonium Sulfate, 0.1M phosphate-citrate buffer pH 4
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.253
|
|
6WZU
The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2 , P3221 space group
提交 2020-05-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 1
GOL GLYCEROL × 2
PO4 PHOSPHATE ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;277 K;0.1 M acetate buffer, 0.8 NaH2PO4/1.2 M K2HPO4, seeds from PLprotease C111S mutant crystals
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.174
|
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6X1B
Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 in the Complex with the Product Nucleotide GpU.
提交 2020-05-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
PO4 PHOSPHATE ION × 6
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;289 K;0.2 M sodium chloride, 0.1 M sodium/potassium phosphate pH 6.2 10 %(w/v) PEG8000
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.185
|
|
6X4I
Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 in the Complex with 3'-uridinemonophosphate
提交 2020-05-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
U3P 3'-URIDINEMONOPHOSPHATE × 6
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 60
NA SODIUM ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;289 K;0.2M Sodium Chloride, 0.1M Sodium Potassium phosphate, 10% PEG8000
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.189
|
|
6XA4
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with UAW241
提交 2020-06-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.239
|
|
6XA9
SARS CoV-2 PLpro in complex with ISG15 C-terminal domain propargylamide
提交 2020-06-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1563–1878(316 aa)
片段:UNP residues 1563-1878
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 3
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.2 M lithium sulfate, 25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.5
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.231
|
|
6XA9
SARS CoV-2 PLpro in complex with ISG15 C-terminal domain propargylamide
提交 2020-06-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
1563–1878(316 aa)
片段:UNP residues 1563-1878
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 3
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.2 M lithium sulfate, 25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.5
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.231
|
|
6XA9
SARS CoV-2 PLpro in complex with ISG15 C-terminal domain propargylamide
提交 2020-06-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
1563–1878(316 aa)
片段:UNP residues 1563-1878
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.2 M lithium sulfate, 25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.5
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.231
|
|
6XAA
SARS CoV-2 PLpro in complex with ubiquitin propargylamide
提交 2020-06-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1563–1878(316 aa)
片段:UNP residues 1563-1878
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;30% PEG4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris chloride, pH 8.5
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.260
|
|
6XB0
Room temperature X-ray crystallography reveals catalytic cysteine in the SARS-CoV-2 3CL Mpro is highly reactive: Insights for enzyme mechanism and drug design
提交 2020-06-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;BIS-TRIS pH=6.5, 20% PEG3350
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.201
|
|
6XB1
Room temperature X-ray crystallography reveals catalytic cysteine in the SARS-CoV-2 3CL Mpro is highly reactive: Insights for enzyme mechanism and drug design
提交 2020-06-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
NEN 1-ETHYL-PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;BIS-TRIS pH=6.5, 20% PEG3350
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.202
|
|
6XB2
Room temperature X-ray crystallography reveals catalytic cysteine in the SARS-CoV-2 3CL Mpro is highly reactive: Insights for enzyme mechanism and drug design
提交 2020-06-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
NEN 1-ETHYL-PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 4
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;BIS-TRIS pH=6.5, 20% PEG3350
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.257
|
|
6XBG
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor UAW246
提交 2020-06-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 3
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.206
|
|
6XBH
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor UAW247
提交 2020-06-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.221
|
|
6XBI
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor UAW248
提交 2020-06-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
NA SODIUM ION × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.217
|
|
6XCH
Room-temperature X-ray Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Leupeptin
提交 2020-06-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;BIS-TRIS pH=6.5, 20% PEG3350
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.237
|
|
6XDH
Crystal Structure of NendoU (Uridylate-specific endoribonuclease, nsp15) from Betacoronavirus SARS-CoV-2
提交 2020-06-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
片段:BewuA.18928.a.MX151
|
未记录
|
ACT ACETATE ION × 3
CIT CITRIC ACID × 3
FMT FORMIC ACID × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;BewuA.18928.a.MX151.PW38806 at 36 mg/ml mixed 1:1 with Morpheus(G3): 10% (w/v) PEG 4000, 20% (v/v) glycerol, 0.1 M MES/imidazole, pH=6.5, 0.02 M of each sodium formate, ammonium acetate, trisodium citrate, sodium potassium l-tartrate, sodium oxamate. Tray: 315968g8, puck: teq6-3.
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.182
|
|
6XDH
Crystal Structure of NendoU (Uridylate-specific endoribonuclease, nsp15) from Betacoronavirus SARS-CoV-2
提交 2020-06-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
6453–6798(346 aa)
片段:BewuA.18928.a.MX151
|
未记录
|
ACT ACETATE ION × 6
CIT CITRIC ACID × 3
FMT FORMIC ACID × 9
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;BewuA.18928.a.MX151.PW38806 at 36 mg/ml mixed 1:1 with Morpheus(G3): 10% (w/v) PEG 4000, 20% (v/v) glycerol, 0.1 M MES/imidazole, pH=6.5, 0.02 M of each sodium formate, ammonium acetate, trisodium citrate, sodium potassium l-tartrate, sodium oxamate. Tray: 315968g8, puck: teq6-3.
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.182
|
|
6XEZ
Structure of SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-RTC
提交 2020-06-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:octameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
1N7 CHAPSO × 3
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
6XFN
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with UAW243
提交 2020-06-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.228
|
|
6XG3
The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2 , C111S mutant, at room temperature
提交 2020-06-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;277 K;0.1 M acetate buffer, 0.8 NaH2PO4/1.2 M K2HPO4
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.193
|
|
6XG3
The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2 , C111S mutant, at room temperature
提交 2020-06-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 2
PO4 PHOSPHATE ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;277 K;0.1 M acetate buffer, 0.8 NaH2PO4/1.2 M K2HPO4
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.193
|
|
6XHM
Covalent complex of SARS-CoV-2 main protease with N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide
提交 2020-06-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;294 K;Precipitant: 25.0 %w/v (25.0 uL of stock 50.0 %w/v) PEG 1500, Buffer: 0.1 M (5.0 uL of stock 1.0 M) MMT (pH 4.00)
|
分辨率 1.41 Å
R-free 0.210
|
|
6XHU
Room temperature X-ray crystallography reveals oxidation and reactivity of cysteine residues in SARS-CoV-2 3CL Mpro: Insights for enzyme mechanism and drug design
提交 2020-06-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;18% PEG 3350, 0.1 M BisTris pH 6.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.246
|
|
6XIP
The 1.5 A Crystal Structure of the Co-factor Complex of NSP7 and the C-terminal Domain of NSP8 from SARS CoV-2
提交 2020-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3860–3942(83 aa)
链 B
4019–4140(122 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
4019–4140(122 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;289 K;0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.199
|
|
6XKF
The crystal structure of 3CL MainPro of SARS-CoV-2 with oxidized Cys145 (Sulfenic acid cysteine).
提交 2020-06-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;289 K;0.15M ammonium sulfate,0.1M Tris,15% PEG4000
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.239
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6XKH
THE 1.28A CRYSTAL STRUCTURE OF 3CL MAINPRO OF SARS-COV-2 WITH OXIDIZED C145 (sulfinic acid cysteine)
提交 2020-06-26
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
FMT FORMIC ACID × 8
ACT ACETATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;289 K;0.1 M Tris,
15% (w/v) PEG6000
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分辨率 1.28 Å
R-free 0.175
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6XKM
Room Temperature Structure of SARS-CoV-2 NSP10/NSP16 Methyltransferase in a Complex with SAM Determined by Fixed-Target Serial Crystallography
提交 2020-06-26
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
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未记录
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CL CHLORIDE ION × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;pH 6.5;295 K;Protein: 4.0 mg/ml (NSP10/NSP16 1:1), 0.15 M NaCl, 0.01 M Tris-HCl, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, pH 7.5.
Precipitation buffer: 0.1 M MES pH 6.5, 0.9 M NaF. Batch crystallization: 100 ul of protein mixed with 100 ul of precipitation buffer in 500 ul polypropylene tube.
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分辨率 2.25 Å
R-free 0.213
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6XMK
1.70 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 7j
提交 2020-06-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
链 B
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
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未记录
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QYS (1S,2S)-2-[(N-{[(4,4-difluorocyclohexyl)methoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8;293 K;20% (w/v) PEG 6000, 100 mM Tris, 200 mM NaCl
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分辨率 1.70 Å
R-free 0.212
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6XOA
The crystal structure of 3CL MainPro of SARS-CoV-2 with C145S mutation
提交 2020-07-06
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:C145S
突变:C145S
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.02 M sodium/potassium phosphate,
20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.251
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6XOA
The crystal structure of 3CL MainPro of SARS-CoV-2 with C145S mutation
提交 2020-07-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
突变:C145S
突变:C145S
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.02 M sodium/potassium phosphate,
20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.251
|
|
6XQB
SARS-CoV-2 RdRp/RNA complex
提交 2020-07-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.40 Å
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6XQS
Room-temperature X-ray Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Telaprevir
提交 2020-07-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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SV6 (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;287.15 K;18-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.204
|
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6XQT
Room-temperature X-ray Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Narlaprevir
提交 2020-07-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
NNA (1R,2S,5S)-3-[N-({1-[(tert-butylsulfonyl)methyl]cyclohexyl}carbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(1S)-1-[(1R)-2-(cyclopropylamino)-1-hydroxy-2-oxoethyl]pentyl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287.15 K;18-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.277
|
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6XQU
Room-temperature X-ray Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Boceprevir
提交 2020-07-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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U5G boceprevir (bound form) × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287.15 K;18-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.234
|
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6XR3
X-ray Structure of SARS-CoV-2 main protease bound to GRL-024-20 at 1.45 A
提交 2020-07-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
V7G N-[(2S)-1-({(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;2.7 mM DTT, 0.7% MPD, 33 mM MES pH 6.0, 80 mM KCl, 15% PEG 10,000, 17 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.187
|
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6Y2E
Crystal structure of the free enzyme of the SARS-CoV-2 (2019-nCoV) main protease
提交 2020-02-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.1 M MMT (DL-malic acid, MES and Tris base in the molar ratios 1:2:2), pH 7.0, 25% PEG 1,500
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.222
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6Y2F
Crystal structure (monoclinic form) of the complex resulting from the reaction between SARS-CoV-2 (2019-nCoV) main protease and tert-butyl (1-((S)-1-(((S)-4-(benzylamino)-3,4-dioxo-1-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)butan-2-yl)amino)-3-cyclopropyl-1-oxopropan-2-yl)-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)carbamate (alpha-ketoamide 13b)
提交 2020-02-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
O6K ~{tert}-butyl ~{N}-[1-[(2~{S})-3-cyclopropyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S},3~{R})-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]-4-[(phenylmethyl)amino]butan-2-yl]amino]propan-2-yl]-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;293 K;10% PEG 200, 0.1 M bis-tris propane, pH 9.0, 18% PEG 8,000
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.219
|
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6Y84
SARS-CoV-2 main protease with unliganded active site (2019-nCoV, coronavirus disease 2019, COVID-19)
提交 2020-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;15% PEG 4000, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5.
0.15 microlitre protein + 0.3 microlitre reservoir + 0.05 microlitre seed stock
|
分辨率 1.39 Å
R-free 0.200
|
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6YB7
SARS-CoV-2 main protease with unliganded active site (2019-nCoV, coronavirus disease 2019, COVID-19).
提交 2020-03-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;5% PEG 4000, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5. 0.15 microlitre protein + 0.3 microlitre reservoir + 0.05 microlitre seed stock
|
分辨率 1.25 Å
R-free 0.180
|
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6YNQ
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to 2-Methyl-1-tetralone.
提交 2020-04-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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P6N (2~{S})-2-methyl-3,4-dihydro-2~{H}-naphthalen-1-one × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.226
|
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6YVF
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to AZD6482.
提交 2020-04-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A82 2-[[(1R)-1-(7-methyl-2-morpholin-4-yl-4-oxidanylidene-pyrido[1,2-a]pyrimidin-9-yl)ethyl]amino]benzoic acid × 2
CL CHLORIDE ION × 4
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6
CA CALCIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION;291 K;Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.208
|
|
6YWK
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with HEPES
提交 2020-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;33% BMW PgSmear, 0.1M MgCl2 and 0.1M HEPES 7.0
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.214
|
|
6YWK
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with HEPES
提交 2020-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;33% BMW PgSmear, 0.1M MgCl2 and 0.1M HEPES 7.0
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.214
|
|
6YWK
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with HEPES
提交 2020-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6
MG MAGNESIUM ION × 1
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;33% BMW PgSmear, 0.1M MgCl2 and 0.1M HEPES 7.0
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.214
|
|
6YWK
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with HEPES
提交 2020-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;33% BMW PgSmear, 0.1M MgCl2 and 0.1M HEPES 7.0
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.214
|
|
6YWK
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with HEPES
提交 2020-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 E
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;33% BMW PgSmear, 0.1M MgCl2 and 0.1M HEPES 7.0
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.214
|
|
6YWL
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose
提交 2020-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293.15 K;27% PEG 4000, 0.2M sodium acetate pH 7, 0.1M tris 8.0
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.223
|
|
6YWL
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose
提交 2020-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293.15 K;27% PEG 4000, 0.2M sodium acetate pH 7, 0.1M tris 8.0
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.223
|
|
6YWL
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose
提交 2020-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293.15 K;27% PEG 4000, 0.2M sodium acetate pH 7, 0.1M tris 8.0
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.223
|
|
6YWL
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose
提交 2020-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293.15 K;27% PEG 4000, 0.2M sodium acetate pH 7, 0.1M tris 8.0
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.223
|
|
6YWL
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose
提交 2020-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 E
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293.15 K;27% PEG 4000, 0.2M sodium acetate pH 7, 0.1M tris 8.0
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.223
|
|
6YWM
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with MES
提交 2020-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293.15 K;23% PEG 6000, 0.1M MgCl2, 5% Ethylene Glycol, 0.1M MES 6.0
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.229
|
|
6YWM
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with MES
提交 2020-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293.15 K;23% PEG 6000, 0.1M MgCl2, 5% Ethylene Glycol, 0.1M MES 6.0
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.229
|
|
6YWM
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) NSP3 macrodomain in complex with MES
提交 2020-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293.15 K;23% PEG 6000, 0.1M MgCl2, 5% Ethylene Glycol, 0.1M MES 6.0
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.229
|
|
6YYT
Structure of replicating SARS-CoV-2 polymerase
提交 2020-05-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:octameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
6YZ1
The crystal structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp16 methyltransferase complex with Sinefungin
提交 2020-05-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4263–4384(122 aa)
|
未记录
|
SFG SINEFUNGIN × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;300 nl protein: 150 nl well solution
100 mM MES pH 6.5,
200 mM NaCl,
10% w/v PEG 4000
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.226
|
|
6Z2E
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with the activity-based probe, biotin-PEG(4)-Abu-Tle-Leu-Gln-vinylsulfone
提交 2020-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 AAA
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q5T (4~{S})-4-[[(2~{S})-2-[[(2~{S})-2-[[(2~{S})-2-[3-[2-[2-[2-[2-[5-[(3~{a}~{S},4~{R},6~{a}~{R})-2-oxidanylidene-3,3~{a},4,6~{a}-tetrahydro-1~{H}-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]butanoyl]amino]-3,3-dimethyl-butanoyl]amino]-4-methyl-pentanoyl]amino]-6-methylsulfonyl-hexanamide × 2
CL CHLORIDE ION × 4
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293.15 K;0.12 M Ethylene glycols (0.3 M Diethylene glycol, 0.3 M Triethylene glycol, 0.3 M Tetraethylene glycol, 0.3 M Pentaethylene glycol), 0.1 M buffer system 2 (1.0 M Sodium HEPES, MOPS (acid), pH 7.5), pH 7.5, 30% Precipitant mix 3 (20% glycerol, 10% PEG 4000)
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.243
|
|
6Z5T
SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-ribose
提交 2020-05-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1197(174 aa)
|
突变:0
|
APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.775 M DL-Malic Acid pH 7.0
10 mM TCEP
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.249
|
|
6Z5T
SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-ribose
提交 2020-05-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1197(174 aa)
|
突变:0
|
APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.775 M DL-Malic Acid pH 7.0
10 mM TCEP
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.249
|
|
6Z6I
SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPD
提交 2020-05-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1197(174 aa)
|
未记录
|
A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
GOL GLYCEROL × 1
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.9 M DL-Malic Acid
5% (v/v) glycerol
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.279
|
|
6Z6I
SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPD
提交 2020-05-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1197(174 aa)
|
未记录
|
A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
GOL GLYCEROL × 1
NA SODIUM ION × 1
MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.9 M DL-Malic Acid
5% (v/v) glycerol
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.279
|
|
6Z6I
SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPD
提交 2020-05-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1024–1197(174 aa)
|
未记录
|
A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
GOL GLYCEROL × 2
NA SODIUM ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.9 M DL-Malic Acid
5% (v/v) glycerol
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.279
|
|
6Z6I
SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPD
提交 2020-05-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1024–1197(174 aa)
|
未记录
|
A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6
GOL GLYCEROL × 1
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.9 M DL-Malic Acid
5% (v/v) glycerol
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.279
|
|
6Z72
SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPM
提交 2020-05-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1197(174 aa)
|
未记录
|
A3R Adenosine Diphosphate (Hydroxymethyl)pyrrolidine monoalcohol × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.775 M DL-Malic Acid pH 7.0
4.5% (v/v) ethylene glycol
200 mM potassium cyanate
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.263
|
|
6Z72
SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPM
提交 2020-05-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1197(174 aa)
|
未记录
|
A3R Adenosine Diphosphate (Hydroxymethyl)pyrrolidine monoalcohol × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.775 M DL-Malic Acid pH 7.0
4.5% (v/v) ethylene glycol
200 mM potassium cyanate
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.263
|
|
6Z72
SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPM
提交 2020-05-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1024–1197(174 aa)
|
未记录
|
A3R Adenosine Diphosphate (Hydroxymethyl)pyrrolidine monoalcohol × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.775 M DL-Malic Acid pH 7.0
4.5% (v/v) ethylene glycol
200 mM potassium cyanate
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.263
|
|
6Z72
SARS-CoV-2 Macrodomain in complex with ADP-HPM
提交 2020-05-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1024–1197(174 aa)
|
未记录
|
A3R Adenosine Diphosphate (Hydroxymethyl)pyrrolidine monoalcohol × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
NA SODIUM ION × 1
MLT D-MALATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.775 M DL-Malic Acid pH 7.0
4.5% (v/v) ethylene glycol
200 mM potassium cyanate
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.263
|
|
6ZLW
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human 40S ribosomal subunit
提交 2020-07-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 i
1–180(180 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
|
6ZM7
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human CCDC124-80S-EBP1 ribosome complex
提交 2020-07-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 CF
1–180(180 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
6ZME
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human CCDC124-80S-eERF1 ribosome complex
提交 2020-07-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 83
PDB 声明:88-meric
|
链 CF
1–180(180 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
6ZMI
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human LYAR-80S ribosome complex
提交 2020-07-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 i
1–180(180 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
|
6ZMO
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human LYAR-80S-eEF1a ribosome complex
提交 2020-07-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 i
1–180(180 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6ZMT
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a pre-40S-like ribosome complex
提交 2020-07-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 34
PDB 声明:35-meric
|
链 i
1–180(180 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
6ZN5
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a pre-40S-like ribosome complex - state 2
提交 2020-07-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 i
1–180(180 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
6ZOJ
SARS-CoV-2-Nsp1-40S complex, composite map
提交 2020-07-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 j
1–180(180 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 166
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
6ZOK
SARS-CoV-2-Nsp1-40S complex, focused on body
提交 2020-07-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 21
PDB 声明:22-meric
|
链 j
1–180(180 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 109
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
6ZON
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a human 43S preinitiation ribosome complex - state 1
提交 2020-07-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:48-meric
|
链 J
1–180(180 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
6ZP4
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a human 43S preinitiation ribosome complex - state 2
提交 2020-07-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 52
PDB 声明:54-meric
|
链 J
1–180(180 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
6ZPE
Nonstructural protein 10 (nsp10) from SARS CoV-2
提交 2020-07-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
4263–4384(122 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
CL CHLORIDE ION × 3
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 2.17 M NaCl
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.160
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6ZRT
Crystal structure of SARS CoV2 main protease in complex with inhibitor Telaprevir
提交 2020-07-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
SV6 (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.75;291 K;100 mM MES pH 6.75
5% DMSO (V/V)
18% PEG 6000 (W/V)
300 uM Telaprevir
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分辨率 2.10 Å
R-free 0.237
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6ZRU
Crystal structure of SARS CoV2 main protease in complex with inhibitor Boceprevir
提交 2020-07-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
U5G boceprevir (bound form) × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.75;291 K;100 mM MES pH 6.75
5% DMSO (V/V)
16% PEG 6000 (W/V)
300 uM Boceprevir
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.215
|
|
6ZSL
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase at 1.94 Angstrom resolution
提交 2020-07-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.03M Sodium nitrate, 0.03 Sodium phosphate
dibasic, 0.03M Ammonium sulfate, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.253
|
|
6ZSL
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase at 1.94 Angstrom resolution
提交 2020-07-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.03M Sodium nitrate, 0.03 Sodium phosphate
dibasic, 0.03M Ammonium sulfate, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.253
|
|
7A1U
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Fusidic Acid.
提交 2020-08-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
FUA FUSIDIC ACID × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
IMD IMIDAZOLE × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.204
|
|
7AAP
Nsp7-Nsp8-Nsp12 SARS-CoV2 RNA-dependent RNA polymerase in complex with template:primer dsRNA and favipiravir-RTP
提交 2020-09-04
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
POP PYROPHOSPHATE 2- × 1
GE6 [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(3-aminocarbonyl-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyrazin-1-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.50 Å
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7ABU
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to RS102895
提交 2020-09-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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R6Q 1'-[2-[4-(trifluoromethyl)phenyl]ethyl]spiro[1~{H}-3,1-benzoxazine-4,4'-piperidine]-2-one × 2
IMD IMIDAZOLE × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;0.1 M MIB
25% PEG 1500
5% DMSO
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.215
|
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7ADW
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to 2,4'-Dimethylpropiophenone.
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
R7Q 2-methyl-1-(4-methylphenyl)propan-1-one × 2
IMD IMIDAZOLE × 2
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.229
|
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7AEG
SARS-CoV-2 main protease in a covalent complex with SDZ 224015 derivative, compound 5
提交 2020-09-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;Mpro was thawed and diluted to 6 mg/ml using 20 mM Hepes pH 7.5, 50 mM NaCl. The ligand of interest was dissolved in DMSO to 10 mM and then diluted into the protein solution to a final concentration of 1 mM. The ligand was then allowed to incubate with the protein for two hours at room temperature prior to dispensing plates. The drop composition was 0.15 ul protein ligand solution, 0.3 ul 11% (v/v) PEG 4K, 0.1 M MES pH 6.5, and 0.05 ul Mpro crystal seed stock. The Mpro crystal seed stock was prepared by crushing Mpro crystals with a pipette tip, suspending them in 30% PEG 4K, 5% (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5, and vortexing for 60 s with approximately 10 glass beads (1.0 mm diameter, BioSpec products). Reservoir solution was 11pc (v/v) PEG 4K, 5pc (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5. Crystals were grown using the sitting drop vapor diffusion method at 20 degrees C and appeared within 24 hours, reaching full size within 36 hours.
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分辨率 1.70 Å
R-free 0.202
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7AEH
SARS-CoV-2 main protease in a covalent complex with a pyridine derivative of ABT-957, compound 1
提交 2020-09-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
R8H (2~{R})-5-oxidanylidene-~{N}-[(2~{R},3~{S})-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-phenyl-4-(pyridin-2-ylmethylamino)butan-2-yl]-1-(phenylmethyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;Mpro was thawed and diluted to 6 mg/ml using 20 mM Hepes pH 7.5, 50 mM NaCl. The ligand of interest was dissolved in DMSO to 10 mM and then diluted into the protein solution to a final concentration of 1 mM. The ligand was then allowed to incubate with the protein for two hours at room temperature prior to dispensing plates. The drop composition was 0.15 ul protein ligand solution, 0.3 ul 11% (v/v) PEG 4K, 0.1 M MES pH 6.5, and 0.05 ul Mpro crystal seed stock. The Mpro crystal seed stock was prepared by crushing Mpro crystals with a pipette tip, suspending them in 30% PEG 4K, 5% (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5, and vortexing for 60 s with approximately 10 glass beads (1.0 mm diameter, BioSpec products). Reservoir solution was 11pc (v/v) PEG 4K, 5pc (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5. Crystals were grown using the sitting drop vapor diffusion method at 20 degrees C and appeared within 24 hours, reaching full size within 36 hours.
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分辨率 1.30 Å
R-free 0.173
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7AF0
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Ipidacrine.
提交 2020-09-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
CL CHLORIDE ION × 2
R9W 2,3,5,6,7,8-hexahydro-1~{H}-cyclopenta[b]quinolin-9-amine × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION;291 K;Co-crystallization with the compounds was achieved by equilibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1 mMEDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB, pH 7.5, containing 25% w/w PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To obtain well-diffracting crystals in a reproducible way seeding was applied for crystal growth. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 - 3 days. Crystals were manually harvested and flash-frozen in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
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分辨率 1.70 Å
R-free 0.225
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7AGA
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to AT7519
提交 2020-09-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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LZE 4-{[(2,6-dichlorophenyl)carbonyl]amino}-N-piperidin-4-yl-1H-pyrazole-3-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 4
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
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分辨率 1.68 Å
R-free 0.223
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7AHA
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Maleate.
提交 2020-09-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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CL CHLORIDE ION × 4
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
SIN SUCCINIC ACID × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
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分辨率 1.68 Å
R-free 0.201
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7AK4
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Tretazicar.
提交 2020-09-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 AA
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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CB1 5-(AZIRIDIN-1-YL)-2,4-DINITROBENZAMIDE × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;pH 7.5;282 K;25% PEG 1.500, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO
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分辨率 1.63 Å
R-free 0.221
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7AKU
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Calpeptin.
提交 2020-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION;291 K;Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.235
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7ALH
Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 at 1.65A resolution (spacegroup C2).
提交 2020-10-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M Na Acetate, 20% PEG 3350
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分辨率 1.65 Å
R-free 0.189
|
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7ALI
Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 at 1.65A resolution (spacegroup P2(1)).
提交 2020-10-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M Na Acetate, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.217
|
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7AMJ
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to PD 168568.
提交 2020-10-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14
RMZ (3~{S})-3-[2-[4-(3,4-dimethylphenyl)piperazin-1-yl]ethyl]-2,3-dihydroisoindol-1-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.210
|
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7ANS
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Adrafinil.
提交 2020-10-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
RNW 2-[(diphenylmethyl)-oxidanyl-$l^{3}-sulfanyl]-~{N}-oxidanyl-ethanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.211
|
|
7AOL
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Climbazole
提交 2020-10-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
IMD IMIDAZOLE × 2
RQH (1~{S})-1-(4-chloranylphenoxy)-1-imidazol-1-yl-3,3-dimethyl-butan-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;291 K;25% PEG 1500
5% DMSO
0.1 M MIB pH 7.5
|
分辨率 1.47 Å
R-free 0.192
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|
7AP6
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to MUT056399.
提交 2020-10-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
RQN 4-(4-ethyl-5-fluoranyl-2-oxidanyl-phenoxy)-3-fluoranyl-benzamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
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分辨率 1.78 Å
R-free 0.237
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7APH
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Tofogliflozin.
提交 2020-10-16
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 AA
3264–3569(306 aa)
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未记录
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RT2 Tofogliflozin × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;pH 7.5;282 K;25% PEG 1500, 0.1M MIB, 5% DMSO
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分辨率 1.65 Å
R-free 0.266
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7AQE
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to UNC-2327
提交 2020-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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CL CHLORIDE ION × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
RV5 N-1,2,3-Benzothiadiazol-6-yl-N'-[2-oxo-2-(1-piperidinyl)ethyl]urea also called unc-2327 × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;25% PEG1500, 5% DMSO, 0.1 M MIB Buffer
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分辨率 1.39 Å
R-free 0.223
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7AQI
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Ifenprodil
提交 2020-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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QEL 4-[(1R,2S)-2-(4-benzylpiperidin-1-yl)-1-hydroxypropyl]phenol × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
IMD IMIDAZOLE × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
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分辨率 1.70 Å
R-free 0.266
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7AQJ
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Triglycidyl isocyanurate.
提交 2020-10-22
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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S7H 1-[(2~{R})-2-oxidanylpropyl]-3-[[(2~{R})-oxiran-2-yl]methyl]-5-[[(2~{S})-oxiran-2-yl]methyl]-1,3,5-triazinane-2,4,6-trione × 2
RV8 Triglycidyl isocyanurate × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
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分辨率 2.59 Å
R-free 0.260
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7AR5
Structure of apo SARS-CoV-2 Main Protease with small beta angle, space group C2.
提交 2020-10-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MMT buffer (1:2:2 molar ratio of malic acid, MES, and Tris), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
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分辨率 1.40 Å
R-free 0.214
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7AR6
Structure of apo SARS-CoV-2 Main Protease with large beta angle, space group C2.
提交 2020-10-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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CL CHLORIDE ION × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
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分辨率 1.40 Å
R-free 0.190
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7ARF
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to thioglucose.
提交 2020-10-24
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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RVW (2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{S})-2-(hydroxymethyl)-6-sulfanyl-oxane-3,4,5-triol × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.253
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7AU4
Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 3
提交 2020-11-02
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
RY5 (3~{S})-6-chloranyl-3'-(1,2-oxazol-3-ylmethyl)spiro[1,2-dihydroindene-3,5'-imidazolidine]-2',4'-dione × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.25;293 K;100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (100 mM Tris pH 8.25, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 100 mM Tris pH 8.25, 10 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
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分辨率 1.82 Å
R-free 0.214
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7AVD
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to SEN1269 ligand
提交 2020-11-05
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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CL CHLORIDE ION × 2
S1W 3-[[5-[3-(dimethylamino)phenoxy]pyrimidin-2-yl]amino]phenol × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.239
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7AWR
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Tegafur
提交 2020-11-09
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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S7W TEGAFUR × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;PEG 1500 25%, 0.1 M MIB Buffer pH 7.5, 5% DMSO
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分辨率 1.34 Å
R-free 0.192
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7AWS
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to TH-302.
提交 2020-11-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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S8E (1-methyl-2-nitro-1H-imidazol-5-yl)methyl (R)-N-(2-bromoethyl)-N'-ethylphosphorodiamidate × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
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分辨率 1.81 Å
R-free 0.238
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7AWU
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to LSN2463359.
提交 2020-11-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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S8B ~{N}-propan-2-yl-5-(2-pyridin-4-ylethynyl)pyridine-2-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
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分辨率 2.07 Å
R-free 0.258
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7AWW
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Clonidine
提交 2020-11-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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CLU 2,6-DICHLORO-N-IMIDAZOLIDIN-2-YLIDENEANILINE × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;PEG 1500 25%, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.220
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7AX6
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Glutathione isopropyl ester
提交 2020-11-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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S8H (2~{S})-2-azanyl-5-oxidanylidene-5-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-1-[(2-oxidanylidene-2-propan-2-yloxy-ethyl)amino]-3-sulfanyl-propan-2-yl]amino]pentanoic acid × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
IMD IMIDAZOLE × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;291 K;25% peg 1500, 5% dmso, 0.1 M MIB
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.248
|
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7AXM
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Pelitinib
提交 2020-11-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
93J (2E)-N-{4-[(3-chloro-4-fluorophenyl)amino]-3-cyano-7-ethoxyquinolin-6-yl}-4-(dimethylamino)but-2-enamide × 2
IMD IMIDAZOLE × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;291 K;0.1 M MIB pH 7.5, 25% PEG1500, 5% DMSO
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.209
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7AXO
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to AR-42.
提交 2020-11-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
QCP AR-42 × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compounds was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.201
|
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7AY7
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to Isofloxythepin
提交 2020-11-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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S8T 9-fluoranyl-3-propan-2-yl-5,6-dihydrobenzo[b][1]benzothiepine × 4
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
IMD IMIDAZOLE × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;291 K;25% PEG1500, 5% DMSO, 0.1 M MIB pH 7.5
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.195
|
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7B2J
Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 5
提交 2020-11-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimer
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
SQ2 2-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-yl)-1-(4-methylpiperidin-1-yl)ethan-1-one × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.75;293 K;100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 15 mM compound, 7.5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.203
|
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7B2U
Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 1
提交 2020-11-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimer
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
SQ5 (5S)-5-(cyclohexylmethyl)-3-(5-fluoropyridin-3-yl)imidazolidine-2,4-dione × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.75;293 K;100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 10 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.246
|
|
7B3B
Structure of elongating SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase with Remdesivir at position -3 (structure 1)
提交 2020-11-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:pentameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
7B3C
Structure of elongating SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase with Remdesivir at position -4 (structure 2)
提交 2020-11-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:pentameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
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7B3D
Structure of elongating SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase with AMP at position -4 (structure 3)
提交 2020-11-30
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:pentameric
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链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.80 Å
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7B3E
Crystal structure of myricetin covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2
提交 2020-11-30
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimer
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10
CL CHLORIDE ION × 1
MYC 3,5,7-TRIHYDROXY-2-(3,4,5-TRIHYDROXYPHENYL)-4H-CHROMEN-4-ONE × 2
NA SODIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M DL-Glutamic acid monohydrate, 0.1M DL-Alanine, 0.1M Glycine, 0.1M DL-Lysine monohydrochloride, 0.1M DL-Serine, 0.1M HEPES/MOPS pH 7.5, 20% v/v Ethylene glycol; 10 % w/v PEG 8000
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分辨率 1.77 Å
R-free 0.204
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7B5Z
Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 6
提交 2020-12-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
SYH 2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-yl)-1-(4-methylenepiperidin-1-yl)ethan-1-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.75;293 K;100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 12.5 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
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分辨率 1.65 Å
R-free 0.196
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7B77
Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 8
提交 2020-12-09
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
T0W 2-(benzotriazol-1-yl)-~{N}-ethyl-~{N}-(furan-3-ylmethyl)ethanamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.75;293 K;100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 12.5 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.214
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7B83
Structure of SARS-CoV-2 Main Protease bound to pyrithione zinc
提交 2020-12-12
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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PK8 9-oxa-7-thia-1-azonia-8$l^{2}-zincabicyclo[4.3.0]nona-1,3,5-triene × 2
IMD IMIDAZOLE × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
COUNTER-DIFFUSION;291 K;Co-crystallization with the compounds was achieved mixing 0.23 uL of protein solution (6.25 mg/mL) in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT/TCEP (respectively), 1 mM EDTA, and 150 mM NaCl with 0.22 uL of reservoir solution consisting of 100 mM MIB, pH 7.5, containing 25% w/w PEG 1500 and 5% (v/v) DMSO, and 0.05 uL of a micro-seed crystal suspension. This growth solution was equilibrated by sitting drop vapor diffusion against 40 uL reservoir solution.
Prior to crystallization 125 nL droplets of 10 mM compound solutions from the two libraries in DMSO were applied to the wells of SwissCI 96-well plates (2-well or 3-well low profile, respectively) and subsequently dried in vacuum. Taking the crystallization drop volume into account this resulted in a final compound concentration of 2.5 mM and a molar ratio of 13.6 of compound to protein. To obtain well-diffracting crystals in a reproducible way micro-seeding was applied for crystal growth. Crystals appeared within a few hours and reached their final size (200x100x10 um3) after 2 - 3 days. Crystals were manually harvested and flash-frozen in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.207
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7BAJ
Crystal structure of ligand-free SARS-CoV-2 main protease
提交 2020-12-15
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;200mM ammonium chloride, 5%glycerol and 18% polyethylene glycol mw. 3350
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分辨率 1.65 Å
R-free 0.207
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7BAK
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease treated with ebselen
提交 2020-12-15
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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SE SELENIUM ATOM × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;200mM ammonium chloride, 5%glycerol and 16% polyethylene glycol mw.3350
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分辨率 2.05 Å
R-free 0.219
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7BAL
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease treated with ebselen derivative of MR6-31-2
提交 2020-12-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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SE SELENIUM ATOM × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;292 K;200mM ammonium chloride, 5%glycerol and 20% polyethylene glycol mw. 3350
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分辨率 1.85 Å
R-free 0.249
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7BB2
Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 at 1.6A resolution (spacegroup P2(1)2(1)2(1))
提交 2020-12-16
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14
CL CHLORIDE ION × 1
NA SODIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M D-Glucose, 0.1M D-Mannose, 0.1M D-Galactose, 0.1M L-Fucose, 0.1M D-Xylose, 0.1M N-Acetyl-D-Glucosamine, 0.1 M Imidazole/MES monohydrate (acid) pH 6.5, 20% v/v Ethylene glycol, 10 % w/v PEG 8000
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分辨率 1.60 Å
R-free 0.189
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7BE7
Crystal structure of MG-132 covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2.
提交 2020-12-22
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
NA SODIUM ION × 1
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.12M Ethylene glycols (Diethylene glycol; Triethylene glycol; Tetraethylene glycol; Pentaethylene glycol) 0.1M Tris/BICINE pH 8.5, 20% v/v PEG 500 MME; 10 % w/v PEG 20000
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分辨率 1.68 Å
R-free 0.201
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7BF3
Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with adenosine
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1194(170 aa)
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未记录
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
ADN ADENOSINE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;33% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.217
|
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7BF3
Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with adenosine
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1194(170 aa)
|
未记录
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
ADN ADENOSINE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;33% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.217
|
|
7BF3
Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with adenosine
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;33% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.217
|
|
7BF3
Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with adenosine
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;33% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.217
|
|
7BF3
Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with adenosine
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 E
1025–1194(170 aa)
|
未记录
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;33% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.217
|
|
7BF4
Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with GMP
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1194(170 aa)
|
未记录
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5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.3;293.15 K;30% PEG 4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 MgCl2, 0.1 M tris, pH 8.3
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.174
|
|
7BF5
Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with ADP-ribose-phosphate (ADP-ribose-2'-phosphate, ADPRP)
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1194(170 aa)
|
未记录
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MG MAGNESIUM ION × 1
A2R [(2R,3R,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-3-HYDROXY-4-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-TRIHYDROXYTETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;30% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.217
|
|
7BF5
Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with ADP-ribose-phosphate (ADP-ribose-2'-phosphate, ADPRP)
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
A2R [(2R,3R,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-3-HYDROXY-4-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-TRIHYDROXYTETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;30% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.217
|
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7BF5
Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with ADP-ribose-phosphate (ADP-ribose-2'-phosphate, ADPRP)
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
A2R [(2R,3R,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-3-HYDROXY-4-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-TRIHYDROXYTETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;30% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.217
|
|
7BF5
Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with ADP-ribose-phosphate (ADP-ribose-2'-phosphate, ADPRP)
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;30% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.217
|
|
7BF5
Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with ADP-ribose-phosphate (ADP-ribose-2'-phosphate, ADPRP)
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 E
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
A2R [(2R,3R,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-3-HYDROXY-4-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-TRIHYDROXYTETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;30% broad-molecular-weight PEG smears, 0.1 M MgCl2, 0.1 M tris, pH 7.0
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.217
|
|
7BF6
Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with remdesivir metabolite GS-441524
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1194(170 aa)
|
未记录
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U08 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolane-2-carbonitrile × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.3;293.15 K;30% PEG 4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M tris, pH 8.3
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.226
|
|
7BF6
Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with remdesivir metabolite GS-441524
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
U08 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolane-2-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.3;293.15 K;30% PEG 4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M tris, pH 8.3
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.226
|
|
7BF6
Crystal structure of SARS-CoV-2 macrodomain in complex with remdesivir metabolite GS-441524
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1025–1194(170 aa)
|
未记录
|
U08 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolane-2-carbonitrile × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.3;293.15 K;30% PEG 4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M tris, pH 8.3
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.226
|
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7BFB
Crystal structure of ebselen covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2.
提交 2021-01-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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9JT N-phenyl-2-selanylbenzamide × 5
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7
NA SODIUM ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.12M alcohols (1,6-Hexanediol; 1-Butanol; 1,2-Propanediol; 2-Propanol; 1,4-Butanediol; 1,3-Propanediol), 0.1M Hepes/MOPS pH 7.5, 20% v/v PEG 500 MME, 10 % w/v PEG 20000
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.199
|
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7BGP
Crystal structure of MG-132 covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 in absence of DTT.
提交 2021-01-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10
ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.12M Ethylene glycols (Diethylene glycol; Triethylene glycol; Tetraethylene glycol; Pentaethylene glycol) 0.1M Tris/BICINE pH 8.5, 20% v/v PEG 500 MME; 10 % w/v PEG 20000
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.201
|
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7BIJ
Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 13
提交 2021-01-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 AAA
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
TU8 (3~{S})-3'-(5-fluoranylpyridin-3-yl)spiro[1,2-dihydroindene-3,5'-imidazolidine]-2',4'-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.75;293 K;100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 12.5 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 1.47 Å
R-free 0.212
|
|
7BQ7
Crystal structure of 2019-nCoV nsp16-nsp10 complex
提交 2020-03-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.4 M Magnesium formate dihydrate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 2.37 Å
R-free 0.208
|
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7BQY
THE CRYSTAL STRUCTURE OF COVID-19 MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH AN INHIBITOR N3 at 1.7 angstrom
提交 2020-03-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;293 K;2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.226
|
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7BTF
SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase in complex with cofactors in reduced condition
提交 2020-04-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å
|
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7BUY
The crystal structure of COVID-19 main protease in complex with carmofur
提交 2020-04-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
JRY hexylcarbamic acid × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;293.15 K;5% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.201
|
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7BV1
Cryo-EM structure of the apo nsp12-nsp7-nsp8 complex
提交 2020-04-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
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7BV2
The nsp12-nsp7-nsp8 complex bound to the template-primer RNA and triphosphate form of Remdesivir(RTP)
提交 2020-04-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:pentameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
POP PYROPHOSPHATE 2- × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
F86 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-cyano-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å
|
|
7BW4
Structure of the RNA-dependent RNA polymerase from SARS-CoV-2
提交 2020-04-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
4402–5324(923 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
7BZF
COVID-19 RNA-dependent RNA polymerase post-translocated catalytic complex
提交 2020-04-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å
|
|
7C2I
Crystal structure of nsp16-nsp10 heterodimer from SARS-CoV-2 in complex with SAM (with additional SAM during crystallization)
提交 2020-05-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
片段:nsp16
链 B
4254–4392(139 aa)
片段:nsp10
|
未记录
|
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;0.4 M Sodium malonate, 0.1 M MES, and 0.5% w/v PEG 10000.
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.209
|
|
7C2J
Crystal structure of nsp16-nsp10 heterodimer from SARS-CoV-2 in complex with SAM (without additional SAM during crystallization)
提交 2020-05-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
片段:nsp16
链 B
4254–4392(139 aa)
片段:nsp10
|
未记录
|
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;0.1 M MES and 12 % w/v PEG 20000.
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.235
|
|
7C2K
COVID-19 RNA-dependent RNA polymerase pre-translocated catalytic complex
提交 2020-05-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.93 Å
|
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7C2Q
The crystal structure of COVID-19 main protease in the apo state
提交 2020-05-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3561(296 aa)
链 B
3266–3561(296 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 7.5;293 K;0.1M HEPES pH 7.5, 4% PEG 8000
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.265
|
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7C2Y
The crystal structure of COVID-2019 main protease in the apo state
提交 2020-05-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3561(298 aa)
链 B
3264–3561(298 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 7.5;293 K;0.1M HEPES sodium pH 7.5, 10% Propanol ,20% PEG 4000
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.262
|
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7C6S
Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease complexed with Boceprevir
提交 2020-05-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
U5G boceprevir (bound form) × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;20% PEG5000,0.1 M BIS-TRIS
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.222
|
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7C6U
Crystal structure of SARS-CoV-2 complexed with GC376
提交 2020-05-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4000
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.251
|
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7C7P
Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with Telaprevir
提交 2020-05-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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SV6 (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;13% PEG4000, 0.1 M MES pH6.0
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.216
|
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7C8B
Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with Z-VAD(OMe)-FMK
提交 2020-05-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;11% PEG 4000, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.230
|
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7C8R
Complex Structure of SARS-CoV-2 3CL Protease with TG-0203770
提交 2020-06-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
TG3 ethyl (4R)-4-[[(2S)-4-methyl-2-[[(2S,3R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoyl]amino]pentanoyl]amino]-5-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pentanoate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4;293 K;10% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate trihydrate, pH 4.0.
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.248
|
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7C8T
Complex Structure of SARS-CoV-2 3CL Protease with TG-0205221
提交 2020-06-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
NOL N-[(BENZYLOXY)CARBONYL]-O-(TERT-BUTYL)-L-THREONYL-3-CYCLOHEXYL-N-[(1S)-2-HYDROXY-1-{[(3S)-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL]METHYL}ETHYL]-L-ALANINAMIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 3.5;293 K;14% PEG 1,000, 0.1 M citric acid, pH 3.5.
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.233
|
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7C8U
The crystal structure of COVID-19 main protease in complex with GC376
提交 2020-06-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.2M Lithium chloride, 0.1M Hepes pH 7, 20% w/v PEG 6000
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.273
|
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7CA8
The crystal structure of COVID-19 main protease in complex with an inhibitor Shikonin
提交 2020-06-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3561(298 aa)
链 B
3264–3561(298 aa)
|
未记录
|
FNO 2-[(1R)-4-methyl-1-oxidanyl-pent-3-enyl]-5,8-bis(oxidanyl)naphthalene-1,4-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1M HEPES 7.5, 20% PEG 10000
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.279
|
|
7CAM
SARS-CoV-2 main protease (Mpro) apo structure (space group P212121)
提交 2020-06-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1 M BICINE, 20% w/v Polyethylene glycol 10,000
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.309
|
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7CB7
1.7A resolution structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with broad-spectrum coronavirus protease inhibitor GC376
提交 2020-06-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 1
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
B1S (1R,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M Bis-Tris propane, 0.02 M sodium/potassium phosphate, 20% (w/v) PEG3350
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.192
|
|
7CBT
The crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with GC376
提交 2020-06-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1M Sodium malonate pH 6.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.292
|
|
7CJD
Crystal structure of the SARS-CoV-2 PLpro C111S mutant
提交 2020-07-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1564–1881(318 aa)
链 B
1564–1881(318 aa)
链 C
1564–1881(318 aa)
链 D
1564–1881(318 aa)
|
突变:C111S
突变:C111S
突变:C111S
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 4
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.1;296 K;3%dextran sulfate sodium salt,0.1m Bicine ph8.5,15%PEG20000
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.282
|
|
7CJM
SARS CoV-2 PLpro in complex with GRL0617
提交 2020-07-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1564–1878(315 aa)
|
突变:C1674S
|
TTT 5-amino-2-methyl-N-[(1R)-1-naphthalen-1-ylethyl]benzamide × 1
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;283 K;12% PEG 3350, 0.1M Tris pH 7.5, 0.005M Cobalt(II) chloride hexahydrate, 0.005M Cadmium chloride hemi(pentahydrate), 0.005M Magnesium chloride hexahydrate, 0.005M Nickel(II) chloride hexahydrate
|
分辨率 3.20 Å
R-free 0.286
|
|
7CMD
Crystal structure of the SARS-CoV-2 PLpro with GRL0617
提交 2020-07-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1881(318 aa)
|
未记录
|
TTT 5-amino-2-methyl-N-[(1R)-1-naphthalen-1-ylethyl]benzamide × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;296 K;0.24M ammonium acetate,0.1M sodium citrate pH5.6,24% PEG4000
|
分辨率 2.59 Å
R-free 0.298
|
|
7CMD
Crystal structure of the SARS-CoV-2 PLpro with GRL0617
提交 2020-07-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1564–1881(318 aa)
|
未记录
|
TTT 5-amino-2-methyl-N-[(1R)-1-naphthalen-1-ylethyl]benzamide × 1
ZN ZINC ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;296 K;0.24M ammonium acetate,0.1M sodium citrate pH5.6,24% PEG4000
|
分辨率 2.59 Å
R-free 0.298
|
|
7CMD
Crystal structure of the SARS-CoV-2 PLpro with GRL0617
提交 2020-07-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1564–1881(318 aa)
|
未记录
|
TTT 5-amino-2-methyl-N-[(1R)-1-naphthalen-1-ylethyl]benzamide × 1
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;296 K;0.24M ammonium acetate,0.1M sodium citrate pH5.6,24% PEG4000
|
分辨率 2.59 Å
R-free 0.298
|
|
7CMD
Crystal structure of the SARS-CoV-2 PLpro with GRL0617
提交 2020-07-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1564–1881(318 aa)
|
未记录
|
TTT 5-amino-2-methyl-N-[(1R)-1-naphthalen-1-ylethyl]benzamide × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;296 K;0.24M ammonium acetate,0.1M sodium citrate pH5.6,24% PEG4000
|
分辨率 2.59 Å
R-free 0.298
|
|
7COM
Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with Boceprevir (space group P212121)
提交 2020-08-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
U5G boceprevir (bound form) × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;21% (v/v) PEG 4000; 20% (v/v) PEG400; 0.1 M MES pH6.5;
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.246
|
|
7CTT
Cryo-EM structure of Favipiravir bound to replicating polymerase complex of SARS-CoV-2 in the pre-catalytic state.
提交 2020-08-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
GE6 [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(3-aminocarbonyl-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyrazin-1-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
7CUT
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with Z-VAD-FMK
提交 2020-08-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
GOL GLYCEROL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 10% w/v PEG6000, 5% v/v MPD
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.223
|
|
7CUU
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with MG132
提交 2020-08-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 2
GOL GLYCEROL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 10% w/v PEG4000, 5% v/v Isopropanol
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.196
|
|
7CWB
Ambient-Temperature Serial Femtosecond X-ray Crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease at 1.9 A Resolution (C121)
提交 2020-08-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;294 K;0.1 M MMT 6.0, 25% w/v PEG 1500
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.257
|
|
7CWC
Ambient-Temperature Serial Femtosecond X-ray Crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease at 2.1 A Resolution (P212121)
提交 2020-08-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;294 K;0.2 M Sodium acetate trihydrate,
0.1 M Tris 8.5,
30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.259
|
|
7CX9
Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with INZ-1
提交 2020-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
GKF 3-iodanyl-1~{H}-indazole-7-carbaldehyde × 2
GOL GLYCEROL × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.1M MES pH5.0; 11% PEG 4000.
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.209
|
|
7CXM
Architecture of a SARS-CoV-2 mini replication and transcription complex
提交 2020-09-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:nonameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
|
突变:D910N
|
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 2.90 Å
|
|
7CXN
Architecture of a SARS-CoV-2 mini replication and transcription complex
提交 2020-09-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:nonameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
|
突变:D910N
|
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å
|
|
7CYQ
Cryo-EM structure of an extended SARS-CoV-2 replication and transcription complex reveals an intermediate state in cap synthesis
提交 2020-09-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 7
PDB 声明:nonameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253(113 aa)
片段:UNP residues 4141-4253
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å
|
|
7D1M
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-CoV-2 MAIN PROTEASE COMPLEXED WITH GC376
提交 2020-09-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.8;291 K;10mM Tris, 1mM EDTA, 1mM DTT
|
分辨率 1.35 Å
R-free 0.157
|
|
7D4F
Structure of COVID-19 RNA-dependent RNA polymerase bound to suramin
提交 2020-09-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 G
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
H3U 8-(3-(3-aminobenzamido)-4-methylbenzamido)naphthalene-1,3,5-trisulfonic acid × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å
|
|
7D7K
The crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease in apo form
提交 2020-10-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1567–1878(312 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
CFF CAFFEINE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7
SO4 SULFATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 8;293 K;0.1M Tris pH 8.0, 2.0M Ammonium sulfate, 0.033% w/v Caffeine, 0.033% w/v Dithioerythritol, 0.033% w/v L-Methionine
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.207
|
|
7D7K
The crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease in apo form
提交 2020-10-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1567–1878(312 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
CFF CAFFEINE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 8;293 K;0.1M Tris pH 8.0, 2.0M Ammonium sulfate, 0.033% w/v Caffeine, 0.033% w/v Dithioerythritol, 0.033% w/v L-Methionine
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.207
|
|
7D7L
The crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease in complex with YM155
提交 2020-10-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1567–1878(312 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
CFF CAFFEINE × 1
GXU 1-(2-methoxyethyl)-2-methyl-3-(pyrazin-2-ylmethyl)benzo[f]benzimidazol-3-ium-4,9-dione × 2
SO4 SULFATE ION × 5
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 8;293 K;0.1M Tris pH 8.0, 2.0M Ammonium sulfate, 0.033% w/v Caffeine, 0.033% w/v Dithioerythritol, 0.033% w/v L-Methionine
|
分辨率 2.11 Å
R-free 0.218
|
|
7D7L
The crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease in complex with YM155
提交 2020-10-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1567–1878(312 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
CFF CAFFEINE × 1
GXU 1-(2-methoxyethyl)-2-methyl-3-(pyrazin-2-ylmethyl)benzo[f]benzimidazol-3-ium-4,9-dione × 3
SO4 SULFATE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 8;293 K;0.1M Tris pH 8.0, 2.0M Ammonium sulfate, 0.033% w/v Caffeine, 0.033% w/v Dithioerythritol, 0.033% w/v L-Methionine
|
分辨率 2.11 Å
R-free 0.218
|
|
7DDC
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Tafenoquine
提交 2020-10-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
H3F Tafenoquine × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M Ammonium acetate,0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 17% w/v Polyethylene glycol 10000
|
分辨率 2.17 Å
R-free 0.234
|
|
7DFG
Structure of COVID-19 RNA-dependent RNA polymerase bound to favipiravir
提交 2020-11-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 G
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
1RP 6-fluoro-3-oxo-4-(5-O-phosphono-beta-D-ribofuranosyl)-3,4-dihydropyrazine-2-carboxamide × 1
ZN ZINC ION × 2
POP PYROPHOSPHATE 2- × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
7DFH
Structure of COVID-19 RNA-dependent RNA polymerase bound to ribavirin
提交 2020-11-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 G
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
POP PYROPHOSPHATE 2- × 2
RVP RIBAVIRIN MONOPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å
|
|
7DG6
Structure of SARS-Cov2-Mpro-1-302
提交 2020-11-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3264–3565(302 aa)
片段:UNP residues 3264-3565
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M bicine, pH=9.0, 10% PEG20000, 2% 1,4-dioxane
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.233
|
|
7DIY
Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp10 bound to nsp14-exoribonuclease domain
提交 2020-11-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 B
5926–6214(289 aa)
片段:UNP residues 5926-6214
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;0.1 M MOPS, 0.1 M Magnesium acetate tetrahydrate and 12 % w/v PEG 8000
|
分辨率 2.69 Å
R-free 0.264
|
|
7DOI
Structure of COVID-19 RNA-dependent RNA polymerase bound to penciclovir.
提交 2020-12-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 G
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
POP PYROPHOSPHATE 2- × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
HCU [(2R)-4-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3H-purin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)butyl] dihydrogen phosphate × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
|
7DOK
Structure of COVID-19 RNA-dependent RNA polymerase (extended conformation) bound to penciclovir
提交 2020-12-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 G
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
HCU [(2R)-4-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3H-purin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)butyl] dihydrogen phosphate × 1
MG MAGNESIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 2
POP PYROPHOSPHATE 2- × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.73 Å
|
|
7DTE
SARS-CoV-2 RdRP catalytic complex with T33-1 RNA
提交 2021-01-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
7DVP
SARS-CoV-2 Mpro mutant (H41A) in complex with nsp4|5 peptidyl substrate
提交 2021-01-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
3254–3273(20 aa)
|
突变:H41A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;293 K;2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.219
|
|
7DVW
SARS-CoV-2 Mpro mutant (H41A) in complex with nsp5|6 peptidyl substrate
提交 2021-01-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
3560–3579(20 aa)
|
突变:H41A
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;293 K;2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.173
|
|
7DVX
SARS-CoV-2 Mpro mutant (H41A) in complex with nsp6|7 peptidyl substrate
提交 2021-01-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
3850–3869(20 aa)
|
突变:H41A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;293 K;2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.247
|
|
7DVY
SARS-CoV-2 Mpro mutant (H41A) in complex with nsp9|10 peptidyl substrate
提交 2021-01-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
4244–4263(20 aa)
|
突变:H41A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;293 K;2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.216
|
|
7DW0
SARS-CoV-2 Mpro mutant (H41A) in complex with nsp14|15 peptidyl substrate
提交 2021-01-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
6443–6462(20 aa)
|
突变:H41A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;293 K;2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.208
|
|
7DW6
SARS-CoV-2 Mpro mutant (H41A) in complex with nsp15|16 peptidyl substrate
提交 2021-01-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
6789–6808(20 aa)
|
突变:H41A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;293 K;2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.221
|
|
7E18
Crystal structure of SAR-CoV-2 3CL protease complex with inhibitor YH-53
提交 2021-02-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
HUR N-[(2S)-1-[[(2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-oxidanylidene-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;30%(w/v) PEG4000, 0.1 M sodium acetate pH 4.6, 0.2 M ammonium acetate
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.199
|
|
7E19
Crystal structure of SAR-CoV-2 3CL protease complex with inhibitor SH-5
提交 2021-02-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
HUO (phenylmethyl) N-[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-oxidanylidene-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;17.5% PEG4000
0.1M sodium acetate pH 4.6
0.2 M ammonium acetate
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.235
|
|
7E35
Crystal structure of the SARS-CoV-2 papain-like protease (PLPro) C112S mutant bound to compound S43
提交 2021-02-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
片段:papain-like protease (PLPro)
链 B
1564–1878(315 aa)
片段:papain-like protease (PLPro)
|
突变:C112S
突变:C112S
|
ZN ZINC ION × 2
GYX N-[(3-acetamidophenyl)methyl]-1-[(1R)-1-naphthalen-1-ylethyl]piperidine-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;289 K;0.1M sodium citrate tribasic dihydrate at pH 5.5, 16%(v/v) PEG 8000
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.317
|
|
7E5X
THE CRYSTAL STRUCTURE OF COVID-19 MAIN PROTEASE apo form at 2.2 angstrom
提交 2021-02-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;293 K;2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.266
|
|
7E6K
Viral protease
提交 2021-02-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
HYR N-(2-phenoxyethyl)methanethioamide × 6
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
SO4 SULFATE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 7.5;293 K;0.03M Sodium nitrate, 0.03M Sodium phosphate dibasic, 0.03M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium HEPES (PH7.5), 0.1M MOPS (PH7.5), 20% PEG 500MME, 10% PEG 20000, protein concentration 5mg/ml, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.202
|
|
7ED5
A dual mechanism of action of AT-527 against SARS-CoV-2 polymerase
提交 2021-03-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
AT9 [[(2R,3R,4R,5R)-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1H-purin-9-yl)-4-fluoranyl-4-methyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å
|
|
7EGQ
Co-transcriptional capping machineries in SARS-CoV-2 RTC: Coupling of N7-methyltransferase and 3'-5' exoribonuclease with polymerase reveals mechanisms for capping and proofreading
提交 2021-03-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 18
PDB 声明:22-meric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253(113 aa)
片段:UNP residues 4141-4253
链 H
4254–4392(139 aa)
链 K
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
链 N
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 O
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 P
3860–3942(83 aa)
链 Q
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 R
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 S
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 T
4141–4253(113 aa)
片段:UNP residues 4141-4253
链 U
4254–4392(139 aa)
链 X
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 26
MG MAGNESIUM ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å
|
|
7EIZ
Coupling of N7-methyltransferase and 3'-5' exoribonuclease with SARS-CoV-2 polymerase reveals mechanisms for capping and proofreading
提交 2021-04-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 9
PDB 声明:undecameric
|
链 A
4393–5321(929 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253(113 aa)
链 H
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 K
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 13
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å
|
|
7EQ4
Crystal Structure of the N-terminus of Nonstructural protein 1 from SARS-CoV-2
提交 2021-04-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
11–125(115 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;298 K;0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Glycine pH 9.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.25 Å
R-free 0.197
|
|
7FR0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890182452
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WW0 2-hydroxy-N-(pentan-3-yl)-3H-imidazo[4,5-b]pyridine-7-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.145
|
|
7FR0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890182452
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.145
|
|
7FR1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1423250928
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WWC 1-methyl-N'-(7H-purin-6-yl)cyclopropane-1-carbohydrazide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.152
|
|
7FR1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1423250928
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.152
|
|
7FR2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5551425673 - (S) isomer
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WWH 3-cyclohexyl-N-{(2S)-1-[(9H-purin-6-yl)amino]butan-2-yl}propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.153
|
|
7FR2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5551425673 - (S) isomer
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.153
|
|
7FR3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A01A - (S) isomer
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WWH 3-cyclohexyl-N-{(2S)-1-[(9H-purin-6-yl)amino]butan-2-yl}propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.166
|
|
7FR3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A01A - (S) isomer
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.166
|
|
7FR4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A26A - (S) isomer
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
WWN 2-cyclohexyl-N-{(2S)-1-[(7H-purin-6-yl)amino]butan-2-yl}acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7FR4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A26A - (S) isomer
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7FR5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890189003
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WWT 2-hydroxy-N-propyl-3H-imidazo[4,5-b]pyridine-7-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.156
|
|
7FR5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890189003
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.156
|
|
7FR6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890147894
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
7FR6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890147894
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WX6 (azepan-1-yl)(2-hydroxy-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-7-yl)methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
7FR7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z431872694
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WXB 6-(azepane-1-carbonyl)pyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.173
|
|
7FR7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z431872694
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.173
|
|
7FR8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890408258 - (R) isomer
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.156
|
|
7FR8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z2890408258 - (R) isomer
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WXF (2-hydroxy-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-7-yl)[(2R)-2-methylmorpholin-4-yl]methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.156
|
|
7FR9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1367095370
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WXK N-(1-methylcyclopropyl)-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrido[2,3-d]pyrimidine-6-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.166
|
|
7FR9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1367095370
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.166
|
|
7FRA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1343520564
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WXO 6-(azepane-1-sulfonyl)pyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7FRA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z1343520564
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7FRB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5551426009 - (S) isomer
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WXT 1-methyl-N-{(2S)-3-methyl-2-[(9H-purin-6-yl)amino]butyl}cyclobutane-1-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7FRB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5551426009 - (S) isomer
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7FRC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A05 - (R) isomer
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WXX 3-cyclohexyl-N-{(2R)-2-[(1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-yl)amino]butyl}propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7FRC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A05 - (R) isomer
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7FRD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A25A - (S) isomer
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
WY6 3-phenyl-N-{(2S)-1-[(7H-purin-6-yl)amino]butan-2-yl}propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.162
|
|
7FRD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with PTERA_A25A - (S) isomer
提交 2022-10-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.162
|
|
7GAV
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-f7918075-2 (SARS2_MproA-x0854)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13
CL CHLORIDE ION × 2
KFU (3S)-5-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-3-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.236
|
|
7GAW
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e194df51-1 (SARS2_MproA-x0862)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
KG9 (4S)-6-chloro-2-[(1-cyanocyclopropyl)methanesulfonyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.252
|
|
7GAX
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with GAB-REV-70cc3ca5-4 (Mpro-x10019)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
KJI N-(4-methylpyridin-3-yl)-N~2~-(quinolin-4-yl)glycinamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.71 Å
R-free 0.220
|
|
7GAY
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-031a96cc-8 (Mpro-x10022)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
KJO N-phenyl-2-(pyridin-3-yl)prop-2-enamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.197
|
|
7GAZ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DUN-NEW-f8ce3686-14 (Mpro-x10049)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
KL6 1-{2-[(methanesulfonyl)amino]ethyl}-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-7-sulfonamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.214
|
|
7GB0
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-c0143b99-1 (Mpro-x10082)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
KLR (2S)-N-tert-butyl-2-[4-(2-cyanoethyl)anilino]-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.42 Å
R-free 0.199
|
|
7GB1
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with STE-KUL-2e0d2e88-2 (Mpro-x10150)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
KMF N-[2-(4-acetylpiperazin-1-yl)ethyl]naphthalene-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.29 Å
R-free 0.197
|
|
7GB2
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MED-COV-4280ac29-25 (Mpro-x10155)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
KMX 1-{4-[(2-benzyl-1,3-thiazol-5-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.203
|
|
7GB3
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAV-CRI-3edb475e-6 (Mpro-x10172)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
KNU N-[(1S)-1-(3-chloro-5-fluorophenyl)ethyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.38 Å
R-free 0.206
|
|
7GB4
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAR-DIA-23aa0b97-6 (Mpro-x10178)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
KO9 N-(5-cyanopyridin-3-yl)-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.230
|
|
7GB5
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-2 (Mpro-x10201)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
KOI 2-(3-chlorophenyl)-N-(pyridin-3-yl)acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.26 Å
R-free 0.195
|
|
7GB6
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JOR-UNI-2fc98d0b-12 (Mpro-x10236)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
KP0 N-(3-chlorophenyl)-N-(2-cyclohexylethyl)-N'-(pyridin-3-yl)urea × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.217
|
|
7GB7
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JOR-UNI-2fc98d0b-6 (Mpro-x10237)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
KQ3 N-(3-chlorophenyl)-N-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-N'-(pyridin-3-yl)urea × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.205
|
|
7GB8
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-14 (Mpro-x10247)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
KQL N-(4-methylpyridin-3-yl)-2-[3-(trifluoromethyl)phenyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.233
|
|
7GB9
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-11 (Mpro-x10248)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
KQX 2-(4-methylphenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.210
|
|
7GBA
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ANT-OPE-d972fbad-1 (Mpro-x10296)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
KS0 1-{4-[(4-fluorophenyl)methyl]piperazin-1-yl}propan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.255
|
|
7GBB
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAN-LON-a5fc619e-3 (Mpro-x10306)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
KSI 1-[(3S)-4-[(3-chlorophenyl)methyl]-3-(2-methylpropyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.234
|
|
7GBC
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-2eddb1ff-1 (Mpro-x10314)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
KSX 2-(5-cyanopyridin-3-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.225
|
|
7GBD
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-MED-2de63afb-2 (Mpro-x10322)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
KT9 N-(3-methyl-5-{[(2S)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)-2-(pyrimidin-5-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.222
|
|
7GBE
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-a3ef7265-20 (Mpro-x10324)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
KU6 (4R)-6-chloro-N-(4-cyclopropyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.22 Å
R-free 0.221
|
|
7GBF
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-9 (Mpro-x10327)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
KUU (2R)-2-(3-chlorophenyl)-3-methyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)butanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.213
|
|
7GBG
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-1 (Mpro-x10329)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
KVF (2S)-2-(3-chlorophenyl)-N-(5-methylpyridazin-4-yl)butanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.46 Å
R-free 0.212
|
|
7GBH
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-49816e9b-2 (Mpro-x10334)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
KVO 2-(3-chlorophenyl)-N-(2,4-dimethylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.209
|
|
7GBI
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-a3ef7265-3 (Mpro-x10338)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
KVX (3S)-5-chloro-N-[4-(hydroxymethyl)pyridin-3-yl]-2,3-dihydro-1-benzofuran-3-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.29 Å
R-free 0.192
|
|
7GBJ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-32 (Mpro-x10355)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
KW9 7-fluoro-N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.229
|
|
7GBK
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-95b75b4d-2 (Mpro-x10359)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
KXF 2-(3-hydroxyphenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.216
|
|
7GBL
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-MED-2de63afb-1 (Mpro-x10371)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
KWR N-(3-{[(2S)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.245
|
|
7GBM
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-3 (Mpro-x10377)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
KX9 (2R)-2-(3-chlorophenyl)-N-[(4M)-4-(1H-pyrazol-1-yl)pyridin-3-yl]propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.215
|
|
7GBN
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-MED-2de63afb-14 (Mpro-x10387)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
KXR N-(3-fluoro-5-{[(2S)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)-2-(pyrimidin-5-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.235
|
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7GBO
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-20 (Mpro-x10392)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
KY0 1-(3-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)cyclopropane-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.217
|
|
7GBP
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-10 (Mpro-x10395)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
KYC (2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-(dimethylamino)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.223
|
|
7GBQ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-23 (Mpro-x10396)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
KYU 2-(3-chlorophenyl)-2,2-difluoro-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.226
|
|
7GBR
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-7e92b6ca-4 (Mpro-x10403)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
KZC N-(2-anilinoethyl)-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.259
|
|
7GBS
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-95b75b4d-1 (Mpro-x10417)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
KZX 2-(3-fluorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.211
|
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7GBT
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-7e92b6ca-2 (Mpro-x10419)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
L1F N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]-N-methyl-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.25 Å
R-free 0.195
|
|
7GBU
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ADA-UNI-f8e79267-5 (Mpro-x10421)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
L2I (2S)-4-(methylamino)-2-phenyl-N-(pyridin-3-yl)butanamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.230
|
|
7GBV
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-22 (Mpro-x10422)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
L3I 2-(3-chlorophenyl)-2-methyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.225
|
|
7GBW
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-8 (Mpro-x10423)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
L6R (2R)-2-(3-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)pentanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.240
|
|
7GBX
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-5a013bed-2 (Mpro-x10466)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
L6D N-(1H-benzimidazol-1-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.228
|
|
7GBY
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-5 (Mpro-x10473)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
L5I (2R)-3-cyclopropyl-2-methyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.222
|
|
7GBZ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-11 (Mpro-x10474)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
L4U (3S)-3,4-dimethyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)pentanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.227
|
|
7GC0
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-21 (Mpro-x10476)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
L4N (5R)-N-(4-methylpyridin-3-yl)spiro[2.4]heptane-5-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.215
|
|
7GC1
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-25 (Mpro-x10478)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
L7F 2-[(1S,5R)-bicyclo[3.1.0]hexan-1-yl]-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.239
|
|
7GC2
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-93268d01-13 (Mpro-x10484)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
L7Q 3-methyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)-3-phenylbutanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.231
|
|
7GC3
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-cedd89ab-4 (Mpro-x10488)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
L7V 1-[(2S)-2-(5-cyclopropyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)pyrrolidin-1-yl]-2-(pyridin-3-yl)ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.214
|
|
7GC4
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-18 (Mpro-x10494)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
L83 N-(2-amino-4-methylpyridin-3-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.219
|
|
7GC5
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DUN-NEW-f8ce3686-24 (Mpro-x10506)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
L8F N-(2-{7-[(4-acetylpiperazin-1-yl)methyl]-1H-indol-3-yl}ethyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.227
|
|
7GC6
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-THE-c331be7a-6 (Mpro-x10513)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
L8O 1-[(4R)-4-(3-methylphenyl)-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.216
|
|
7GC7
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-39 (Mpro-x10525)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
L93 6-fluoro-N-[(2R)-2-(2-methoxyphenoxy)propyl]-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.211
|
|
7GC8
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-18 (Mpro-x10535)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
L9F (3P,5R)-3-(3-chlorophenyl)-5-(pyridin-3-yl)imidazolidine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.228
|
|
7GC9
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-22 (Mpro-x10555)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
L9O (1S)-N-(4-methylpyridin-3-yl)spiro[3.3]heptane-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.230
|
|
7GCA
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-18 (Mpro-x10559)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
LB0 (1r,3r)-3-cyclopropyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)cyclobutane-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.215
|
|
7GCB
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-13 (Mpro-x10565)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
LBC 2-(3-iodophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.222
|
|
7GCC
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-95b75b4d-4 (Mpro-x10566)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
LBO 2-(3-cyclopropylphenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.227
|
|
7GCD
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-23 (Mpro-x10575)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
LCU 2-[(1R,3s,5S)-bicyclo[3.1.0]hexan-3-yl]-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.215
|
|
7GCE
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-93268d01-7 (Mpro-x10598)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
LDX 3-(2-fluorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.39 Å
R-free 0.204
|
|
7GCF
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-5a013bed-4 (Mpro-x10604)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
LKX 2-(3-chlorophenyl)-N-(5-oxo-1,5-dihydro-4H-1,2,4-triazol-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.42 Å
R-free 0.212
|
|
7GCG
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-21 (Mpro-x10606)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
LKI 3-chloro-N-(4-methylpyridin-3-yl)benzene-1-sulfonamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.246
|
|
7GCI
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-27 (Mpro-x10610)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
LJO (3R)-3-cyano-N-(4-methylpyridin-3-yl)oxolane-3-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.216
|
|
7GCJ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-19 (Mpro-x10626)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
LJ0 (1R,6S,7r)-N-(4-methylpyridin-3-yl)bicyclo[4.1.0]heptane-7-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.34 Å
R-free 0.204
|
|
7GCK
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-48 (Mpro-x10638)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
LF3 2-(6-chloro-3-oxo-2,3-dihydro-4H-1,4-benzoxazin-4-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.217
|
|
7GCL
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-59 (Mpro-x10645)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
LR0 (7R)-N-(4-acetamidopyridin-3-yl)-4-fluorobicyclo[4.2.0]octa-1,3,5-triene-7-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.229
|
|
7GCM
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-THE-c331be7a-2 (Mpro-x10678)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
LQU 3-[(4R)-2-acetyl-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-4-yl]benzonitrile × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.227
|
|
7GCN
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-41 (Mpro-x10679)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
LQ0 2-(6-chloro-1H-indol-1-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.216
|
|
7GCO
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-7e92b6ca-1 (Mpro-x10700)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
LO0 N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]-2-oxo-2,3-dihydropyridine-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.217
|
|
7GCP
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NAU-LAT-64f4b287-5 (Mpro-x10710)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
LM0 (3S)-N',2-diacetyl-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carbohydrazide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.214
|
|
7GCQ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-2eddb1ff-2 (Mpro-x10723)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
LRC 2-(5-chloropyridin-3-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.239
|
|
7GCR
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with WAR-XCH-72a8c209-5 (Mpro-x10728)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
LRN 1-[(3R)-3-{(cyclohexylmethyl)[(1r,4R)-4-hydroxycyclohexyl]amino}piperidin-1-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.224
|
|
7GCS
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-18 (Mpro-x10733)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
LS0 2-(6-fluoro-1H-indol-1-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.223
|
|
7GCT
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BRU-LEF-c49414a7-1 (Mpro-x10756)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
LSF N-(4-methylpyridin-3-yl)-2-(3-{[(2R)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.235
|
|
7GCU
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-25 (Mpro-x10787)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
LT9 1-(3-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)-3-oxocyclobutane-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.208
|
|
7GCV
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-2eddb1ff-7 (Mpro-x10789)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
LUC 2-(3-chloro-5-{[(2R)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.229
|
|
7GCW
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NAU-LAT-445f63e5-6 (Mpro-x10800)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
LV9 N-(4-benzyloxan-4-yl)-N'-(pyridin-3-yl)urea × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.211
|
|
7GCX
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-24 (Mpro-x10801)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
LVM N-(4-methylpyridin-3-yl)-2-(spiro[2.3]hexan-5-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.225
|
|
7GCY
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-c59291d4-5 (Mpro-x10812)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
LW6 1H-indole-4-carbaldehyde × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.217
|
|
7GCZ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-c59291d4-4 (Mpro-x10820)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
LWO 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[4-(methylamino)phenyl]-N-[(thiophen-3-yl)methyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.228
|
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7GD0
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-23 (Mpro-x10834)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
M4L (2S)-2-(3-bromophenyl)-2-hydroxy-N-(4-methoxypyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.230
|
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7GD1
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-58 (Mpro-x10856)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
M2X (2R)-2-amino-2-(5-bromo-2-methoxyphenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.208
|
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7GD2
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-3 (Mpro-x10862)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
M26 N-[(1R)-1-(3-bromophenyl)-2-methoxyethyl]-2-[(3S)-5-fluoro-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-3-yl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.212
|
|
7GD3
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-c59291d4-3 (Mpro-x10870)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
Y6J ~{N}-[4-[2-(benzotriazol-1-yl)ethanoyl-(thiophen-3-ylmethyl)amino]phenyl]cyclopropanecarboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.222
|
|
7GD4
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-c59291d4-2 (Mpro-x10871)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
R30 N-{4-[(1H-benzotriazol-1-ylacetyl)(thiophen-3-ylmethyl)amino]phenyl}propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.222
|
|
7GD5
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-d2866bdf-1 (Mpro-x10876)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
M0X 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[4-(dimethylamino)phenyl]-N-[(thiophen-3-yl)methyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.220
|
|
7GD6
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-0f94fc3d-38 (Mpro-x10888)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
M0G (2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxy-N-(4-methylpyridin-3-yl)butanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.210
|
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7GD7
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ADA-UNI-f8e79267-2 (Mpro-x10889)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
LZX (2R)-4-[(methanesulfonyl)amino]-2-phenyl-N-(pyridin-3-yl)butanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.211
|
|
7GD8
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-119787ef-1 (Mpro-x10898)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
KU6 (4R)-6-chloro-N-(4-cyclopropyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.218
|
|
7GD9
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DUN-NEW-f8ce3686-23 (Mpro-x10899)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
LXF N-{4-[(2-phenylethyl)sulfamoyl]-1,3-benzothiazol-2-yl}acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.212
|
|
7GDA
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-2eddb1ff-3 (Mpro-x10900)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
MF0 (2R)-2-(5-chloropyridin-3-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.71 Å
R-free 0.215
|
|
7GDB
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-968e8d9c-1 (Mpro-x10906)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
M9U (4S)-6-chloro-N-(4-cyclopropyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.216
|
|
7GDC
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-0a73fcb8-7 (Mpro-x10942)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
M93 (4R)-6-chloro-N-[4-(hydroxymethyl)pyridin-3-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.217
|
|
7GDD
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ADA-UCB-6c2cb422-1 (Mpro-x10959)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
860 2-(3-chlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.34 Å
R-free 0.201
|
|
7GDE
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-12 (Mpro-x10976)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
M7X 2-(3-chlorophenyl)-N-(5-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.224
|
|
7GDF
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-a3ef7265-23 (Mpro-x10995)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
M6U N-(4-ethylpyridin-3-yl)-2-[6-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.231
|
|
7GDG
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAR-DIA-23aa0b97-14 (Mpro-x10996)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
M6I N-(3-chlorophenyl)-N'-(pyridin-3-yl)urea × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.226
|
|
7GDH
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LOR-NEU-c8f11034-6 (Mpro-x11001)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
M5X (3S)-3-hydroxy-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indole-5-sulfonamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.238
|
|
7GDI
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-49816e9b-1 (Mpro-x11011)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
M5I N-(3-chlorophenyl)-2-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.242
|
|
7GDJ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-16 (Mpro-x11013)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
M50 2-(3-chlorophenyl)-N-(5-methylpyridazin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.268
|
|
7GDK
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-21 (Mpro-x11025)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
MJR 2-(3-chlorophenyl)-N-(3-methyl-1H-pyrazol-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.232
|
|
7GDL
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-15 (Mpro-x11041)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
MKI 2-(3-chlorophenyl)-N-methyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.231
|
|
7GDM
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-714a760b-16 (Mpro-x11044)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
MQ3 (2R)-2-cyclohexyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.216
|
|
7GDN
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-0e996074-1 (Mpro-x11159)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
MU3 (4R)-N-(4-cyclopropyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.35 Å
R-free 0.197
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7GDO
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-c0c213c9-14 (Mpro-x11164)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
MVR N-[(1-methyl-1H-pyrazol-3-yl)methyl]-2-(pyridin-3-yl)-N-[4-(pyridin-2-yl)phenyl]acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.76 Å
R-free 0.267
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7GDP
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NAU-LAT-8502cac5-2 (Mpro-x11186)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
MVX (3S)-5-chloro-N-(4-cyclopropyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-3-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.82 Å
R-free 0.239
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7GDQ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LOR-NOR-30067bb9-15 (Mpro-x11204)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
MWN methyl (3R)-5-bromo-3-hydroxy-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indole-7-carboxylate × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.72 Å
R-free 0.212
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7GDR
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LOR-NOR-30067bb9-2 (Mpro-x11208)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
MX9 (3-methylphenyl)methyl (3R)-3-hydroxy-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indole-7-carboxylate × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.233
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7GDS
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LOR-NOR-30067bb9-18 (Mpro-x11212)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
MZF (3R)-5-bromo-3-hydroxy-1-[(1,2,4-oxadiazol-3-yl)methyl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.46 Å
R-free 0.204
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7GDT
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAK-UNK-0d6072ac-20 (Mpro-x11223)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
N00 (2R)-2-(6-chloro-1-methyl-9H-carbazol-2-yl)propanoic acid × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.51 Å
R-free 0.216
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7GDU
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-SGC-a8a902d9-1 (Mpro-x11225)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
N0F (3R)-3-(4-hydroxypiperidin-1-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)-3-(thiophen-3-yl)propanamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.63 Å
R-free 0.214
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7GDV
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NAU-LAT-8502cac5-6 (Mpro-x11231)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
N0O (3S)-5-chloro-N-(4-phenyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-3-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.91 Å
R-free 0.241
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7GDW
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BRU-THA-a358fbdd-2 (Mpro-x11233)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
N0X (4R)-N-(4-cyclopropyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)-4-methyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.67 Å
R-free 0.221
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7GDX
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LOR-NOR-30067bb9-7 (Mpro-x11254)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
N1U (3S)-5-bromo-1-[(3,4-dimethoxyphenyl)methyl]-3-hydroxy-7-methyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.229
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7GDY
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LOR-NOR-30067bb9-6 (Mpro-x11258)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
N2X (3S)-5-bromo-1-[(2-ethoxyphenyl)methyl]-3-hydroxy-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.259
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7GDZ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-c9973a83-1 (Mpro-x11271)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
N3I 2-(3-chloro-5-methoxyphenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.246
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7GE0
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-6af13d92-2 (Mpro-x11276)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
N3R 5-fluoro-N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.248
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7GE1
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-6af13d92-3 (Mpro-x11294)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
N43 5-methoxy-N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.252
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7GE2
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-6af13d92-1 (Mpro-x11313)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
N4L N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]-5-methyl-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.240
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7GE3
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-714a760b-3 (Mpro-x11317)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
N5L N-(5-amino-4-methylpyridin-3-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.27 Å
R-free 0.192
|
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7GE4
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-714a760b-19 (Mpro-x11318)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
N6X N-(5-amino-4-methylpyridin-3-yl)-2-(3-cyanophenyl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.200
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7GE5
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-5b47150d-6 (Mpro-x11339)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
N7L (1R,2R)-2-(fluoromethyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)cyclopropane-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.225
|
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7GE6
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-a3ef7265-18 (Mpro-x11346)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
N8X 2-(3,5-dimethylphenyl)-N-(4-methyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.218
|
|
7GE7
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ADA-UCB-6c2cb422-3 (Mpro-x11354)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
N9I 2-(4-methylpyridin-3-yl)-N-(1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-8-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.207
|
|
7GE8
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-7e92b6ca-16 (Mpro-x11366)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NB0 4-[4-(2-fluorophenyl)piperazine-1-carbonyl]quinolin-2(1H)-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.225
|
|
7GE9
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-12 (Mpro-x11368)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NB6 2-(3-bromophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.206
|
|
7GEA
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-83b26c96-2 (Mpro-x11372)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
N6F (2S)-N-(4-acetamidopyridin-3-yl)-2-(3-chlorophenyl)propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.229
|
|
7GEB
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-93268d01-8 (Mpro-x11417)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NDI 2-(4-acetylpiperazin-1-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.39 Å
R-free 0.219
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7GEC
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UCB-00f2c2b3-7 (Mpro-x11424)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NEL 2-(3-chlorophenyl)-N-(1H-indazol-4-yl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.25 Å
R-free 0.197
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7GED
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-cedd89ab-2 (Mpro-x11426)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NGX (2S)-1-(3-chlorophenyl)-3-(1H-1,2,4-triazol-1-yl)propan-2-ol × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.48 Å
R-free 0.223
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7GEE
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-93268d01-5 (Mpro-x11427)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NIJ 3-(3-fluorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.29 Å
R-free 0.198
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7GEF
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-93268d01-11 (Mpro-x11428)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
NJE N-(4-methylpyridin-3-yl)-2-(piperidin-1-yl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.186
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7GEG
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-a364e151-1 (Mpro-x11431)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NJU 2-(3-chlorophenyl)-N-(5,6,7,8-tetrahydroisoquinolin-4-yl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.73 Å
R-free 0.222
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7GEH
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-06d94977-2 (Mpro-x11432)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NKU 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[(3-chlorophenyl)methyl]-N-methylacetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.23 Å
R-free 0.197
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7GEI
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-8df914d1-2 (Mpro-x11454)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NM0 2-(3-chlorophenyl)-N-[(4R)-imidazo[1,2-a]pyridin-3-yl]acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.69 Å
R-free 0.232
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7GEJ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-c9c1e0d8-2 (Mpro-x11458)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NO0 2-(3-ethynylphenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.74 Å
R-free 0.251
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7GEK
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-8df914d1-4 (Mpro-x11473)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NOI 2-(3-chlorophenyl)-N-(1-methyl-1H-imidazol-5-yl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.41 Å
R-free 0.214
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7GEL
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-cedd89ab-1 (Mpro-x11475)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NQ3 (1M,3P)-1-(3-chlorophenyl)-3-(4-methylpyridin-3-yl)-1,3-dihydro-2H-imidazol-2-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.217
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7GEM
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-15 (Mpro-x11485)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
NQO 2-(3-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridazin-3-yl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.32 Å
R-free 0.206
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7GEN
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-1e5f28a7-1 (Mpro-x11488)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NRC methyl (2R)-2-(3-chlorophenyl)-3-[(4-methylpyridin-3-yl)amino]-3-oxopropanoate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.210
|
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7GEO
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-50fe53e8-3 (Mpro-x11493)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NRX 2-(3-chlorophenyl)-N-[(4S)-imidazo[1,5-a]pyridin-1-yl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.224
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7GEQ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UCB-1dbca3b4-15 (Mpro-x11498)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
NSR (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 2.06 Å
R-free 0.257
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7GER
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-f7918075-5 (Mpro-x11499)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NU0 2-(3-chlorophenyl)-N-(2,6-naphthyridin-4-yl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.71 Å
R-free 0.280
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7GES
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-bb423b95-7 (Mpro-x11501)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NUR 2-(3-chlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-N-methylacetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 1.47 Å
R-free 0.213
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7GET
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-0c2c77e1-1 (Mpro-x11507)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NV9 2-(3-chlorophenyl)-N-(4-phenylpyridin-3-yl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.254
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7GEU
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-50fe53e8-1 (Mpro-x11508)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NVO 2-(3-chlorophenyl)-N-(phthalazin-1-yl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.211
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7GEV
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-f13221e1-4 (Mpro-x11513)
提交 2023-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NW0 3-(3-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.215
|
|
7GEW
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-bb423b95-2 (Mpro-x11530)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NWI 2-(3-chlorophenyl)-N-(1,6-naphthyridin-8-yl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.46 Å
R-free 0.219
|
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7GEX
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIC-UNK-66895286-1 (Mpro-x11532)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NX9 2-(3-chlorophenyl)-N-(1H-pyrazol-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.216
|
|
7GEY
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIC-UNK-66895286-3 (Mpro-x11540)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NYR N-(3-chlorophenyl)-2-(3-methyl-1H-pyrazol-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.34 Å
R-free 0.216
|
|
7GEZ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-6747fa38-1 (Mpro-x11541)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
NZK 2-(4-acetylpiperazin-1-yl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.34 Å
R-free 0.204
|
|
7GF0
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-bb423b95-1 (Mpro-x11542)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O0C 2-(3-chlorophenyl)-N-(2,7-naphthyridin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.242
|
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7GF1
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-95b75b4d-5 (Mpro-x11543)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O0R 2-(3-chlorophenyl)-N-(4-cyclopropylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.255
|
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7GF2
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIC-UNK-08cd9c58-1 (Mpro-x11548)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O0X 2-(3-chlorophenyl)-N-(1,7-naphthyridin-5-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.38 Å
R-free 0.219
|
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7GF3
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-5 (Mpro-x11557)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O1I (2S)-2-(3-chlorophenyl)-3-hydroxy-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.260
|
|
7GF4
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-590ac91e-17 (Mpro-x11560)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O1X (2S)-2-(difluoromethoxy)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.230
|
|
7GF5
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0da5ad92-7 (Mpro-x11562)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O2R 2-(2-butoxy-5-chlorophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.37 Å
R-free 0.213
|
|
7GF6
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-f42f3716-6 (Mpro-x11564)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O3I 2-[(1M)-5-chloro-2',3'-difluoro-4'-methyl[1,1'-biphenyl]-3-yl]-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.219
|
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7GF7
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TAT-ENA-80bfd3e5-7 (Mpro-x11579)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O3U N-[(1R)-1,5-dicyano-4-(methylsulfanyl)-3-azaspiro[5.5]undeca-2,4-dien-2-yl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.241
|
|
7GF8
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TAT-ENA-80bfd3e5-37 (Mpro-x11587)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O4L N-(3-acetyl-2,5-dimethyl-1H-pyrrol-1-yl)-4-oxo-3,4-dihydrophthalazine-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.210
|
|
7GF9
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TAT-ENA-80bfd3e5-4 (Mpro-x11590)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O5C 1-[(4S)-3-(4-fluorobenzoyl)-2-methylindolizin-1-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.240
|
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7GFA
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-3b92565d-1 (Mpro-x11609)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
Z26 2-(5-chloro-2-methoxyphenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.263
|
|
7GFB
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-b3e365b9-1 (Mpro-x11612)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NSR (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.224
|
|
7GFC
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-a0b0dbcb-4 (Mpro-x11616)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O87 4-{4-[3-(trifluoromethyl)phenyl]piperazine-1-carbonyl}quinolin-2(1H)-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.253
|
|
7GFD
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-2eddb1ff-8 (Mpro-x11641)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O8L (2S)-2-(3-chloro-5-{[(2R)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.236
|
|
7GFE
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-6344a35d-1 (Mpro-x11642)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
O9O N-{3-chloro-5-[(6-methoxypyridin-2-yl)oxy]phenyl}-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.218
|
|
7GFF
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5d20d11c-1 (Mpro-x11708)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
O9X (2R)-2-(difluoromethoxy)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.223
|
|
7GFG
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with CHO-MSK-6e55470f-5 (Mpro-x11723)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OAO 2-{3-chloro-5-[(3-methyl-1,2,4-oxadiazol-5-yl)methoxy]phenyl}-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.250
|
|
7GFH
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-f7918075-8 (Mpro-x11742)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OBO 2-(3-chlorophenyl)-N-(1H-imidazo[4,5-c]pyridin-7-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.46 Å
R-free 0.223
|
|
7GFI
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with WIL-MOD-03b86a88-6 (Mpro-x11743)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OCI 2-(3-chloro-5-sulfamamidophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.233
|
|
7GFJ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-c0c213c9-1 (Mpro-x11757)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OD7 2-(6-methoxy-1H-benzotriazol-1-yl)-N-[4-(piperidin-4-yl)phenyl]-N-[(pyridin-2-yl)methyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.222
|
|
7GFK
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-044491d2-1 (Mpro-x11764)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
ODX 2-(3-chloro-5-{[(1S,2S)-2-hydroxycyclopentyl]amino}phenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.217
|
|
7GFL
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-bfb445d4-2 (Mpro-x11789)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OE6 N-(1H-benzotriazol-1-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.244
|
|
7GFM
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-1901c25b-1 (Mpro-x11790)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OEO N-[4-(dimethylamino)phenyl]-2-(isoquinolin-4-yl)-N-[(thiophen-3-yl)methyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.251
|
|
7GFN
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-7374c256-2 (Mpro-x11797)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OFX 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[4-(dimethylamino)phenyl]-N-[(1H-pyrazol-5-yl)methyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.236
|
|
7GFO
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ROB-IMP-e811baff-1 (Mpro-x11798)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OGF 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[4-(methylcarbamamido)phenyl]-N-[(thiophen-3-yl)methyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.223
|
|
7GFP
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-6b94ceba-5 (Mpro-x11801)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OHC 2-[3-(acetamidomethyl)-5-chlorophenyl]-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.243
|
|
7GFQ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-b3e365b9-3 (Mpro-x11809)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OI4 (4R)-6-chloro-N-(4-methylpyridin-3-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.228
|
|
7GFR
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-3c72d439-1 (Mpro-x11810)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OIE 2-(4-chloropyridin-2-yl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.46 Å
R-free 0.221
|
|
7GFS
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAR-UCB-f313ec4d-6 (Mpro-x11812)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OIK (isoquinolin-4-yl)(4-phenylpiperazin-1-yl)methanone × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.234
|
|
7GFT
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAR-UCB-f313ec4d-2 (Mpro-x11813)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OIX N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]isoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.236
|
|
7GFU
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-bbbbc21a-3 (Mpro-x11831)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OJ9 2-(5-chloro-1-benzofuran-7-yl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.228
|
|
7GFV
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-2db6411e-2 (Mpro-x11852)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OJO 1-{4-[(3-chloro-5-hydroxyphenyl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.235
|
|
7GFW
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-fa06b69f-6 (Mpro-x11894)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OK9 N-{(1Z)-1-[5-(morpholin-4-yl)thiophen-2-yl]-3-oxoprop-1-en-2-yl}thiophene-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.214
|
|
7GFX
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-199e2e7c-1 (Mpro-x12000)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OKW 2-(3-chlorophenyl)-N-(6,7-dihydro-5H-cyclopenta[c]pyridin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.258
|
|
7GFY
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LOR-NOR-c954e7ad-4 (Mpro-x12010)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14
OLX [(3R)-5-ethyl-3-hydroxy-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-1-yl]acetic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.214
|
|
7GFZ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-a0b0dbcb-8 (Mpro-x12025)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
ONU 4-[3-(2-methoxyanilino)azetidine-1-carbonyl]quinolin-2(1H)-one × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.215
|
|
7GG0
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-e44ffd04-1 (Mpro-x12026)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OGV 2-(3-chlorophenyl)-N-[(4S)-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-3-yl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.228
|
|
7GG1
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-a0b0dbcb-9 (Mpro-x12064)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OGO 4-[3-(2-methoxyphenoxy)azetidine-1-carbonyl]quinolin-2(1H)-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.209
|
|
7GG2
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-8a69d52e-7 (Mpro-x12073)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OO6 (3S,4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3-methyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.275
|
|
7GG3
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with AAR-RCN-748c104b-1 (Mpro-x12080)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
OOL (E)-1-(4,6-dimethoxypyrimidin-2-yl)methanimine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.42 Å
R-free 0.215
|
|
7GG4
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAG-UCB-52b62a6f-11 (Mpro-x12136)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OPU (4R)-6-chloro-N-[(4S)-7-methyl[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-8-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.259
|
|
7GG5
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-87c86d55-1 (Mpro-x12143)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OQF 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[4-(dimethylamino)phenyl]-N-[(1,3-thiazol-4-yl)methyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.214
|
|
7GG6
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-477dc5b7-2 (Mpro-x12171)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OQL (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.245
|
|
7GG7
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with CHO-MSK-00c5269a-2 (Mpro-x12177)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OQX 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[(3-chlorophenyl)methyl]-N-(4-methoxyphenyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.207
|
|
7GG8
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-cd485364-2 (Mpro-x12202)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
ORR 1-(5-amino-3,4-dihydro-1,7-naphthyridin-1(2H)-yl)-2-(3-chlorophenyl)ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.218
|
|
7GG9
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ANT-DIA-62e4526e-1 (Mpro-x12204)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
SQ2 2-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-yl)-1-(4-methylpiperidin-1-yl)ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.230
|
|
7GGA
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-e4b030d8-13 (Mpro-x12207)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
OSI (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.204
|
|
7GGB
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-044491d2-7 (Mpro-x12300)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OT6 2-{3-chloro-5-[(2-cyano-2-methylpropyl)amino]phenyl}-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.38 Å
R-free 0.199
|
|
7GGC
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-044491d2-3 (Mpro-x12321)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OTV 2-(3-chloro-5-{[(1S,2R)-2-(trifluoromethyl)cyclopropyl]amino}phenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.286
|
|
7GGD
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-b5746674-38 (Mpro-x12350)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OUF N-[(furan-2-yl)methyl]-N'-(2-methyl-1-oxo-1,2-dihydroisoquinolin-4-yl)-N-{3-[(propan-2-yl)oxy]propyl}urea × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.204
|
|
7GGE
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-6d04362c-1 (Mpro-x12419)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
OV4 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-benzyl-N-[4-(dimethylamino)phenyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.248
|
|
7GGF
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-6d04362c-2 (Mpro-x12423)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
OVF 2-(1H-benzotriazol-1-yl)-N-[(3-chlorophenyl)methyl]-N-[4-(dimethylamino)phenyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.282
|
|
7GGG
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-d6de1f3c-2 (Mpro-x12582)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OVX 1-(3-chlorophenyl)-4-(isoquinoline-4-carbonyl)piperazin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.228
|
|
7GGH
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-c9c1e0d8-3 (Mpro-x12587)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
OWC (3S)-3-(3-chlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)piperidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.246
|
|
7GGI
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-14ad9fe9-1 (Mpro-x12640)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OWX 2-(3-chlorophenyl)-N-(1,2,3,4-tetrahydro-1,7-naphthyridin-5-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.210
|
|
7GGJ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-4f474d93-1 (Mpro-x12659)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OYF (4R)-6-chloro-N-(2,7-naphthyridin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.234
|
|
7GGK
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-64a710fa-1 (Mpro-x12661)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OYX N-(2-cyclohexylethyl)-2-(isoquinolin-4-yl)-N-[(thiophen-2-yl)methyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.225
|
|
7GGL
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-ce760d3f-8 (Mpro-x12674)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OZC (3S)-3-(4-chlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)piperidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.22 Å
R-free 0.272
|
|
7GGM
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-afd4d4fd-2 (Mpro-x12677)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
OZX 2-(6-chloropyridin-2-yl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.235
|
|
7GGN
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-d6de1f3c-1 (Mpro-x12679)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
P0X 4-[4-(3-chlorophenyl)-3-oxopiperazine-1-carbonyl]quinolin-2(1H)-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.239
|
|
7GGO
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-8b8a49e1-4 (Mpro-x12682)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
P3L (4R)-6-chloro-N-[(4R)-2-oxopiperidin-4-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.229
|
|
7GGP
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UCB-29506327-1 (Mpro-x12686)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
P4R (1'M,4S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,4'-imidazolidine]-2',5'-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.218
|
|
7GGQ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-92e193ae-1 (Mpro-x12692)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
OQL (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.227
|
|
7GGR
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-c7771779-1 (Mpro-x12695)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
P6O (4S)-6-chloro-4-hydroxy-N-(isoquinolin-4-yl)-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.228
|
|
7GGS
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0e5afe9d-1 (Mpro-x12696)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
P7R (4R)-6-chloro-N-(1-methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-7-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.220
|
|
7GGT
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-c852c98b-10 (Mpro-x12698)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
P9O (4R)-6-chloro-N-(5,6,7,8-tetrahydro-2,6-naphthyridin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.225
|
|
7GGU
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0e5afe9d-3 (Mpro-x12699)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
PJ6 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.29 Å
R-free 0.237
|
|
7GGV
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIC-UNK-91acba05-6 (Mpro-x12710)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
PJX (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.235
|
|
7GGW
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-2bb0cf2b-2 (Mpro-x12715)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
PKW (4R)-6-chloro-N-(1-methyl-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-7-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.240
|
|
7GGX
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-971238d3-5 (Mpro-x12716)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
PQ6 (4R)-4-(aminomethyl)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.228
|
|
7GGY
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-966f8da6-2 (Mpro-x12717)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
PUU (4R)-1-acetyl-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.17 Å
R-free 0.278
|
|
7GGZ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-3c65e9ce-2 (Mpro-x12719)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
PVR 2-(4-acetylpiperazin-1-yl)-N-(4-cyclopropylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.46 Å
R-free 0.209
|
|
7GH0
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-ce760d3f-4 (Mpro-x12723)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
PWR (4R)-6-chloro-N-(2-oxo-2lambda~5~-isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.220
|
|
7GH1
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-2bb0cf2b-1 (Mpro-x12731)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
PZ6 (4S)-4-(aminomethyl)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.214
|
|
7GH2
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-090737b9-1 (Mpro-x12735)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
Q0I (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-N-propanoyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.218
|
|
7GH3
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-3c65e9ce-4 (Mpro-x12740)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
Q1C 2-(4-methylpiperidin-1-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.237
|
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7GH4
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-00c1612e-1 (Mpro-x12777)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
Q1U 2-(3-chlorophenyl)-N-(6-methoxyisoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.248
|
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7GH5
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-714-12 (Mpro-x2908)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q2G N-(3-chlorophenyl)-N'-(4-methylpyridin-3-yl)urea × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.213
|
|
7GH6
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-916-2 (Mpro-x2910)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q2U N-[2-(2-methoxyphenoxy)ethyl]-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.216
|
|
7GH7
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-714-22 (Mpro-x2912)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q36 (2R)-2-(3-cyanophenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)propanamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.204
|
|
7GH8
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAR-DIA-23aa0b97-13 (Mpro-x2964)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q3U N-(5-aminopyridin-3-yl)-N'-(3-chlorophenyl)urea × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.207
|
|
7GH9
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-362d364a-10 (Mpro-x2971)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q45 2-[(2S)-2-{2-[(methanesulfonyl)amino]ethyl}piperidin-1-yl]-N-(pyridin-3-yl)acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.211
|
|
7GHA
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAN-LON-a5fc619e-8 (Mpro-x3077)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q4F 1-{(1S,4S)-5-[(3-chlorophenyl)methyl]-2,5-diazabicyclo[2.2.1]heptan-2-yl}ethan-1-one × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.225
|
|
7GHB
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with GAB-REV-70cc3ca5-8 (Mpro-x3080)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q4R N~2~-methyl-N-(4-methylpyridin-3-yl)-N~2~-(quinoline-8-sulfonyl)glycinamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.225
|
|
7GHC
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with GAB-REV-70cc3ca5-13 (Mpro-x3108)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q5C N-(4-methylpyridin-3-yl)-N~2~-[(pyridin-3-yl)acetyl]glycinamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.210
|
|
7GHD
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-4e090d3a-57 (Mpro-x3298)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q5K (2S)-N-{2-[(4-fluorobenzene-1-sulfonyl)amino]phenyl}-2-hydroxy-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.234
|
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7GHE
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-916a2c5a-4 (Mpro-x3303)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q5R 4-(4-phenylpiperazine-1-carbonyl)quinolin-2(1H)-one × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.17 Å
R-free 0.256
|
|
7GHF
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BAR-COM-4e090d3a-47 (Mpro-x3305)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q60 N'-[(1-methyl-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methyl]-N-(2-phenylethyl)-N-[(pyridin-3-yl)methyl]urea × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.223
|
|
7GHG
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAV-CRI-3edb475e-4 (Mpro-x3324)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q69 N-[(1R)-1-(3-chlorophenyl)-2-hydroxyethyl]acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.209
|
|
7GHH
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TOB-UNK-c2aba166-1 (Mpro-x3325)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q6U 1-[4-(prop-2-yn-1-yl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.223
|
|
7GHI
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAN-PUR-6788a628-2 (Mpro-x3333)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
Q7C N~3~-acetyl-N~3~-[(3S)-1,1-dioxo-1lambda~6~-thiolan-3-yl]-beta-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.219
|
|
7GHJ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with SIM-SYN-f15aaa3a-1 (Mpro-x3348)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
Q7R 1-[4-(diphenylmethyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.209
|
|
7GHK
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with DAR-DIA-eace69ff-36 (Mpro-x3351)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q8I 1-(5-fluoro-1H-indol-3-yl)-N-methylmethanamine × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.208
|
|
7GHL
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with GAB-REV-70cc3ca5-18 (Mpro-x3366)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Q8O 2-(1H-benzimidazol-6-yl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.41 Å
R-free 0.205
|
|
7GHM
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-ce40166b-17 (Mpro-P0008)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13
Q99 N-[2-(3-chloro-5-{[(2S)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenoxy)ethyl]-2-oxo-1,2-dihydroquinoline-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.234
|
|
7GHN
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-f2460aef-1 (Mpro-P0009)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13
QBR N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-{[2-(3-fluorophenyl)ethyl]amino}-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]furan-2-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.252
|
|
7GHO
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-c9c1e0d8-4 (Mpro-P0010)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
QC3 (3S)-3-(3-chlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)pyrrolidin-2-one × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.279
|
|
7GHP
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-4f474d93-1 (Mpro-P0012)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13
OYF (4R)-6-chloro-N-(2,7-naphthyridin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.247
|
|
7GHQ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-64a710fa-1 (Mpro-P0016)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14
OYX N-(2-cyclohexylethyl)-2-(isoquinolin-4-yl)-N-[(thiophen-2-yl)methyl]acetamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.251
|
|
7GHR
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-ce760d3f-8 (Mpro-P0017)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
OZC (3S)-3-(4-chlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)piperidin-2-one × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.260
|
|
7GHS
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ERI-UCB-d6de1f3c-2 (Mpro-P0018)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14
OVX 1-(3-chlorophenyl)-4-(isoquinoline-4-carbonyl)piperazin-2-one × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.248
|
|
7GHT
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-c9c1e0d8-3 (Mpro-P0019)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
OWC (3S)-3-(3-chlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)piperidin-2-one × 2
CL CHLORIDE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.257
|
|
7GHU
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UCB-29506327-1 (Mpro-P0022)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
P4R (1'M,4S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,4'-imidazolidine]-2',5'-dione × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.256
|
|
7GHV
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-afd4d4fd-2 (Mpro-P0025)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
OZX 2-(6-chloropyridin-2-yl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.255
|
|
7GHW
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-8b8a49e1-4 (Mpro-P0026)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 19
P3L (4R)-6-chloro-N-[(4R)-2-oxopiperidin-4-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.246
|
|
7GHX
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0e5afe9d-1 (Mpro-P0030)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14
P7R (4R)-6-chloro-N-(1-methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-7-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.241
|
|
7GHY
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-c852c98b-10 (Mpro-P0031)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16
P9O (4R)-6-chloro-N-(5,6,7,8-tetrahydro-2,6-naphthyridin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.244
|
|
7GHZ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIC-UNK-91acba05-6 (Mpro-P0033)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 20
PJX (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.254
|
|
7GI0
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-92e193ae-1 (Mpro-P0034)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 20
OQL (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.251
|
|
7GI1
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-0e5afe9d-3 (Mpro-P0038)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
PJ6 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.257
|
|
7GI2
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-971238d3-5 (Mpro-P0039)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16
PQ6 (4R)-4-(aminomethyl)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.243
|
|
7GI3
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-090737b9-1 (Mpro-P0041)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 18
Q0I (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-N-propanoyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 5
CA CALCIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.262
|
|
7GI4
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with TRY-UNI-2eddb1ff-7 (Mpro-P0045)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
QCC 2-(3-chloro-5-{[(2S)-4-oxoazetidin-2-yl]oxy}phenyl)-N-(4-methylpyridin-3-yl)acetamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.254
|
|
7GI5
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BRU-THA-92256091-17 (Mpro-P0053)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
QCO N-[(1R)-2-{[2-(3-fluorophenyl)ethyl]amino}-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-{4-[(propan-2-yl)oxy]phenyl}-1H-imidazole-4-carboxamide × 1
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.293
|
|
7GI6
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-4aa06b95-1 (Mpro-P0056)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
QD4 (4R)-6-chloro-N~4~-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydroquinoline-1,4(2H)-dicarboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.265
|
|
7GI7
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-6c284e65-1 (Mpro-P0057)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
QD9 N-[(3-chlorophenyl)methyl]-N-[5-(dimethylamino)pyridin-2-yl]-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.256
|
|
7GI8
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIC-UNK-45817b9b-1 (Mpro-P0060)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 17
QDF (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.256
|
|
7GI9
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-26 (Mpro-P0061)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
QDU 2-(2,5-difluorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.282
|
|
7GIA
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-33 (Mpro-P0063)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
QE3 2-(5-chloropyridin-2-yl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.04 Å
R-free 0.269
|
|
7GIB
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-10 (Mpro-P0064)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
QER 2-(3-fluorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.257
|
|
7GIC
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-13 (Mpro-P0065)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
QEX N-(isoquinolin-4-yl)-2-(3-methylphenyl)acetamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.329
|
|
7GID
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-1 (Mpro-P0066)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
QF5 N-(isoquinolin-4-yl)-2-phenylacetamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.266
|
|
7GIE
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-17 (Mpro-P0068)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
QF9 2-(3-chloro-5-cyanophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.17 Å
R-free 0.292
|
|
7GIF
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-7 (Mpro-P0069)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13
QFL 2-(4-fluorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.256
|
|
7GIG
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-12 (Mpro-P0074)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
QFU 2-(3-cyanophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.280
|
|
7GIH
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-16 (Mpro-P0075)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
QG3 2-(3,5-difluorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.253
|
|
7GII
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-8416115c-13 (Mpro-P0091)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
QGC (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1-[(4H-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.12 Å
R-free 0.282
|
|
7GIJ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5d65ec79-1 (Mpro-P0097)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
QGO (4S)-6-chloro-4-[2-(dimethylamino)-2-oxoethyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.281
|
|
7GIK
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-1f3f1a6f-1 (Mpro-P0098)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
QGX (2R)-2-amino-2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.286
|
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7GIL
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-6 (Mpro-P0108)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
QH6 2-(3-chloro-4-fluorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.287
|
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7GIM
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-UNI-3735e77e-2 (Mpro-P0111)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
QHI (4R)-6,8-dichloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.279
|
|
7GIN
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-869ac754-1 (Mpro-P0114)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
QHU (4R)-6,7-dichloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.254
|
|
7GIO
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-fce787c2-3 (Mpro-P0121)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
QI4 (2S)-2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)propanamide × 2
CL CHLORIDE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.04 Å
R-free 0.262
|
|
7GIP
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-8416115c-5 (Mpro-P0122)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
QI7 (4R)-6-chloro-1-[(1H-imidazol-2-yl)methyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.262
|
|
7GIQ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-c852c98b-5 (Mpro-P0124)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
QIM (4R)-6-chloro-N-[6-(methanesulfonyl)isoquinolin-4-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.260
|
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7GIR
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-971238d3-1 (Mpro-P0125)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
QIB (4S)-6-chloro-4-hydroxy-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.18 Å
R-free 0.267
|
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7GIS
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-2d450e86-30 (Mpro-P0126)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
QIQ 2-(5-chloropyridin-3-yl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.260
|
|
7GIT
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-fce787c2-5 (Mpro-P0129)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
QIT (2S)-2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-2-(methylamino)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.269
|
|
7GIU
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-05e671eb-10 (Mpro-P0130)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
QIZ (4R)-6-chloro-7-fluoro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.270
|
|
7GIV
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-de59a476-2 (Mpro-P0135)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
QJ6 (2R)-2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-2-methoxyacetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.299
|
|
7GIW
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-f9802937-7 (Mpro-P0141)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
QJF (4R)-6-chloro-N-(6-methoxyisoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.283
|
|
7GIX
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UNK-cf7facf1-1 (Mpro-P0143)
提交 2023-08-11
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
P4R (1'M,4S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,4'-imidazolidine]-2',5'-dione × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 2.07 Å
R-free 0.275
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7GIY
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BRU-CON-c4e3408a-1 (Mpro-P0145)
提交 2023-08-11
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
OI4 (4R)-6-chloro-N-(4-methylpyridin-3-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
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分辨率 2.04 Å
R-free 0.293
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7GIZ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-5d232de5-4 (Mpro-P0148)
提交 2023-08-11
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
PUU (4R)-1-acetyl-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.275
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7GJ0
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-70ae9412-2 (Mpro-P0151)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13
QJL (4R)-6-chloro-4-{[(N,N-dimethylglycyl)amino]methyl}-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.267
|
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7GJ1
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UNK-82501c2c-1 (Mpro-P0153)
提交 2023-08-11
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
QJR 2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(2,7-naphthyridin-4-yl)acetamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.271
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7GJ2
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-70ae9412-1 (Mpro-P0154)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
QK3 (4R)-6-chloro-4-{[2-(1H-imidazol-1-yl)acetamido]methyl}-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.264
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7GJ3
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-29afea89-2 (Mpro-P0157)
提交 2023-08-11
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13
PJ6 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.260
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7GJ4
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-5d232de5-1 (Mpro-P0160)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
QKB (4R)-6-chloro-N-(6-fluoroisoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.13 Å
R-free 0.283
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7GJ5
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-5d232de5-5 (Mpro-P0171)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
PJX (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.13 Å
R-free 0.275
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7GJ6
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-fce787c2-4 (Mpro-P0178)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
QKI (2S)-2-(3,4-dichlorophenyl)-2-hydroxy-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.267
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7GJ7
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UCB-50c39ae8-7 (Mpro-P0179)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13
Q0I (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-N-propanoyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.249
|
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7GJ8
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-fce787c2-6 (Mpro-P0185)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
QKR 2-(3,4-dichlorophenyl)-2,2-difluoro-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.267
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7GJ9
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-c3a96089-4 (Mpro-P0186)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
QL3 N-(6-acetamidopyridin-3-yl)-N-[(3-chlorophenyl)methyl]-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.299
|
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7GJA
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-de59a476-4 (Mpro-P0187)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
QLC (2R)-2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-2-(2-methoxyethoxy)acetamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.289
|
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7GJB
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5d65ec79-2 (Mpro-P0188)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
QLO (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.274
|
|
7GJC
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-BAS-c2bc0d80-6 (Mpro-P0207)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
QM3 (1'P,3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,3'-pyrrolidine]-2',5'-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.286
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7GJD
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-3b97339c-2 (Mpro-P0208)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
QM9 (4S)-4-amino-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.262
|
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7GJE
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e69ad64a-2 (Mpro-P0213)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
QML (3S)-5-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-N-propanoyl-2,3-dihydro-1-benzofuran-3-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.267
|
|
7GJF
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-8c98ee63-2 (Mpro-P0224)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
QMX (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-({[(1-methyl-1H-pyrazol-3-yl)methyl]amino}methyl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.274
|
|
7GJG
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-UNI-8e43a71e-8 (Mpro-P0238)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
QN9 (4S)-6-chloro-4-{2-[4-(3-hydroxypropyl)piperazin-1-yl]-2-oxoethyl}-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.280
|
|
7GJH
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-DND-f2e727cd-5 (Mpro-P0240)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
QNU (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.269
|
|
7GJI
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-d08626de-3 (Mpro-P0243)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
QO0 (4S)-6,7-dichloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.249
|
|
7GJJ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-9739a092-9 (Mpro-P0394)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
QOO 2-{3-chloro-5-[4-(ethanesulfonyl)piperazin-1-yl]phenyl}-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.267
|
|
7GJK
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RAL-THA-4aa06b95-7 (Mpro-P0578)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
QOU (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-(2-methoxyethyl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.290
|
|
7GJL
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-UNI-3735e77e-1 (Mpro-P0600)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
QOC (3R)-3-(3,4-dichlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)piperidin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.17 Å
R-free 0.281
|
|
7GJM
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-e4b030d8-11 (Mpro-P0601)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
QP0 (3R,4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3-methyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.276
|
|
7GJN
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-37aac4bd-4 (Mpro-P0602)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
QP6 (4S)-6,8-difluoro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.279
|
|
7GJO
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-a13804f0-3 (Mpro-P0607)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
QIZ (4R)-6-chloro-7-fluoro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.283
|
|
7GJP
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-fe871b40-11 (Mpro-P0626)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
QPQ (4S)-6-chloro-7-fluoro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.281
|
|
7GJQ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-78e1d523-1 (Mpro-P0627)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
QQ6 (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzothiopyran-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.271
|
|
7GJR
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e9e99895-11 (Mpro-P0630)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
QQF 2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-N~2~-(methoxyacetyl)-L-alaninamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.303
|
|
7GJS
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e9e99895-2 (Mpro-P0640)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
QQO (2R)-N-{(2R)-2-(3,4-dichlorophenyl)-1-[(isoquinolin-4-yl)amino]-1-oxopropan-2-yl}-4-(propan-2-yl)morpholine-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.279
|
|
7GJT
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-ba1ac7b9-11 (Mpro-P0642)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
QQU (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-{2-oxo-2-[(2R)-2-(1H-pyrazol-4-yl)piperidin-1-yl]ethyl}-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.12 Å
R-free 0.286
|
|
7GJU
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e9e99895-6 (Mpro-P0655)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
QR5 (2R)-2-[2-(3-cyclopropyl-2-oxoimidazolidin-1-yl)acetamido]-2-(3,4-dichlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.273
|
|
7GJV
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-932d1078-3 (Mpro-P0661)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
QP6 (4S)-6,8-difluoro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.275
|
|
7GJW
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with KAD-UNI-80f122c8-2 (Mpro-P0743)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
QR9 (4S)-4-{2-[(1R,4R)-5-acetyl-2,5-diazabicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]-2-oxoethyl}-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.46 Å
R-free 0.303
|
|
7GJX
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-3ccb8ef6-1 (Mpro-P0744)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
QNU (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.291
|
|
7GJY
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e9e99895-13 (Mpro-P0747)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
QRS (3S)-N-{(2R)-2-(3,4-dichlorophenyl)-1-[(isoquinolin-4-yl)amino]-1-oxopropan-2-yl}-1-methylpyrrolidine-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.18 Å
R-free 0.284
|
|
7GJZ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with LON-WEI-9739a092-6 (Mpro-P0764)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13
CL CHLORIDE ION × 1
QRF 2-{3-chloro-5-[4-(furan-2-carbonyl)piperazin-1-yl]phenyl}-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.259
|
|
7GK0
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with BEN-BAS-c2bc0d80-7 (Mpro-P0765)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
QS3 (1'M,4S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-3'-methyl-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,4'-imidazolidine]-2',5'-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.287
|
|
7GK1
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-9e38fd34-1 (Mpro-P0766)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
QSF (3S)-5-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3-methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indole-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.269
|
|
7GK2
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-ba1ac7b9-13 (Mpro-P0772)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
QSX (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-{2-[(1S,4S)-5-methyl-2,5-diazabicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]-2-oxoethyl}-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.287
|
|
7GK3
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-fb82b63d-3 (Mpro-P0776)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
QT3 (1R)-7-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-methyl-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-1-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.283
|
|
7GK4
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-bb7ffe78-1 (Mpro-P0777)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
QTC 2-(3-chloro-5-ethylphenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.284
|
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7GK5
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-5d232de5-7 (Mpro-P0793)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
CL CHLORIDE ION × 1
QC3 (3S)-3-(3-chlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)pyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.268
|
|
7GK6
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-fb82b63d-1 (Mpro-P0800)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
QTL (1R)-7-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-1-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.288
|
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7GK7
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-ba1ac7b9-21 (Mpro-P0805)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
QU9 (4S)-6-chloro-4-(2-{(2R)-2-[(1H-imidazol-1-yl)methyl]pyrrolidin-1-yl}-2-oxoethyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.18 Å
R-free 0.292
|
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7GK8
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-dd3ad2b5-2 (Mpro-P0808)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
CL CHLORIDE ION × 1
QUQ (4S)-2-acetyl-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.289
|
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7GK9
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-477dc5b7-5 (Mpro-P0811)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 2
QV0 (3'R)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,3'-piperidin]-2'-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.278
|
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7GKA
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-5d232de5-8 (Mpro-P0816)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
QV9 (3R)-3-(3-chlorophenyl)-1-(isoquinolin-4-yl)pyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.283
|
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7GKB
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-96f51285-5 (Mpro-P0831)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 1
QVG (4R)-6-chloro-7-fluoro-N-(6-fluoroisoquinolin-4-yl)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.284
|
|
7GKC
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-9c80c481-1 (Mpro-P0845)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
QVJ (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-{[2-(methylamino)-2-oxoethoxy]methyl}-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.268
|
|
7GKD
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-UNI-8d415491-3 (Mpro-P0850)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
QVU (4R)-6,7-dichloro-N-(2,7-naphthyridin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.24 Å
R-free 0.299
|
|
7GKE
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-dd3ad2b5-3 (Mpro-P0851)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
QW1 (4S)-6-chloro-N~4~-(isoquinolin-4-yl)-3,4-dihydroisoquinoline-2,4(1H)-dicarboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.281
|
|
7GKF
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-UNI-8d415491-6 (Mpro-P0872)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
QWL (4R)-6,7-dichloro-N-(6-fluoroisoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.263
|
|
7GKG
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-2f867453-1 (Mpro-P0878)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 2
QWU (3S)-5-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-3-methyl-2,3-dihydro-1H-indole-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.279
|
|
7GKH
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-UNI-8d415491-1 (Mpro-P0884)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
QX3 (4R)-6,7-dichloro-N-(4-cyclopropylpyridin-3-yl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.282
|
|
7GKI
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RUB-POS-1325a9ea-4 (Mpro-P0887)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
QX9 2-(3-chlorophenyl)-N-(6-methylisoquinolin-4-yl)acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.291
|
|
7GKJ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-ba1ac7b9-19 (Mpro-P0904)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 1
QXI (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-{2-[(4R,8S)-8-methyl-5,6-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazin-7(8H)-yl]-2-oxoethyl}-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.76 Å
R-free 0.274
|
|
7GKK
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JIN-POS-6dc588a4-6 (Mpro-P0906)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
CL CHLORIDE ION × 1
QXR N-(4-tert-butoxypyridin-3-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.277
|
|
7GKL
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with SAM-UNK-2684b532-12 (Mpro-P0925)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
QXX 2-(3-chlorophenyl)-N-[4-(trifluoromethyl)pyridin-3-yl]acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.277
|
|
7GKM
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-e0fe77e5-13 (Mpro-P0950)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 1
QY6 (3R)-6'-chloro-1-(isoquinolin-4-yl)-2',3'-dihydro-1'H-spiro[piperidine-3,4'-quinolin]-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.280
|
|
7GKN
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-611d11e7-4 (Mpro-P0978)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16
CL CHLORIDE ION × 1
QYI (4S)-6-chloro-N-(6-fluoroisoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.274
|
|
7GKO
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-30 (Mpro-P0996)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 1
QYN (4S)-6-chloro-2-(1H-imidazole-2-sulfonyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.274
|
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7GKP
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-3 (Mpro-P1007)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
QYR (4S)-6-chloro-2-(cyclopropanesulfonyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.263
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7GKQ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-18 (Mpro-P1010)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
QZ0 (4S)-6-chloro-N~4~-(isoquinolin-4-yl)-N~2~,N~2~-dimethyl-3,4-dihydroisoquinoline-2,4(1H)-dicarboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.272
|
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7GKR
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-2 (Mpro-P1015)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
CL CHLORIDE ION × 1
QZC (4S)-6-chloro-2-(dimethylsulfamoyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.265
|
|
7GKS
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-11 (Mpro-P1062)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
QZL (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(3R)-3-methylpyrrolidine-1-sulfonyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.250
|
|
7GKT
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e6dd326d-8 (Mpro-P1073)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
QZU (4R)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-[(prop-2-enamido)methyl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.260
|
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7GKU
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-40 (Mpro-P1079)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
CL CHLORIDE ION × 1
R08 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-(1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.258
|
|
7GKV
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-23 (Mpro-P1090)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
R0F (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.264
|
|
7GKW
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e6dd326d-6 (Mpro-P1200)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
R0Q methyl ({(4R)-6-chloro-4-[(isoquinolin-4-yl)carbamoyl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-yl}methyl)carbamate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.258
|
|
7GKX
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-28 (Mpro-P1202)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
CL CHLORIDE ION × 1
R1I (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-(2-methoxyethyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.282
|
|
7GKY
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RUB-POS-1325a9ea-14 (Mpro-P1470)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
R1U 2-(3-chlorophenyl)-N-(1-methyl-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-7-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.263
|
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7GKZ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-afb6844f-1 (Mpro-P1474)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
R2L (4R)-6-chloro-N-[4-methyl-5-(methylamino)pyridin-3-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.258
|
|
7GL0
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-a13804f0-4 (Mpro-P1477)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
R2X (2S,5R)-N-{(1R)-1-(3-chlorophenyl)-2-[(isoquinolin-4-yl)amino]-2-oxoethyl}-5-(pyrrolidine-1-carbonyl)oxolane-2-carboxamide (non-preferred name) × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.257
|
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7GL1
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-8293a91a-8 (Mpro-P1507)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 1
R3I (3S)-5-chloro-1'-(6-fluoroisoquinolin-4-yl)-2H-spiro[[1]benzofuran-3,3'-pyrrolidin]-2'-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.71 Å
R-free 0.239
|
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7GL2
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-1981ceba-4 (Mpro-P1623)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 2
R43 (4S)-6-chloro-2-(3-cyanoazetidine-1-sulfonyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.259
|
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7GL3
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-1981ceba-2 (Mpro-P1624)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 2
R4X (4S)-2-(azetidine-1-sulfonyl)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.242
|
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7GL4
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-1981ceba-3 (Mpro-P1638)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
R5H (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-(3-methoxyazetidine-1-sulfonyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.254
|
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7GL5
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-10fcb19e-1 (Mpro-P1661)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 2
R5O (4S)-6-chloro-N-{6-[(methanesulfonyl)amino]isoquinolin-4-yl}-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.257
|
|
7GL6
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-8695a11f-1 (Mpro-P1701)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
CL CHLORIDE ION × 3
R66 (3R)-3-(3-chlorophenyl)-3-hydroxy-1-(isoquinolin-4-yl)pyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.242
|
|
7GL7
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-6bf93aa8-1 (Mpro-P1783)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13
CL CHLORIDE ION × 1
R6L (4S)-6-chloro-4-methoxy-N-[7-(methylsulfamoyl)isoquinolin-4-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.248
|
|
7GL8
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-dc2604c4-1 (Mpro-P1788)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
KG9 (4S)-6-chloro-2-[(1-cyanocyclopropyl)methanesulfonyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.242
|
|
7GL9
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with VLA-UCB-50c39ae8-2 (Mpro-P1800)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
QM3 (1'P,3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,3'-pyrrolidine]-2',5'-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.289
|
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7GLA
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-86c60949-2 (Mpro-P1812)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
R7F (4R)-6-chloro-N-[6-(2-hydroxypropan-2-yl)isoquinolin-4-yl]-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.245
|
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7GLB
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-015fb6b4-2 (Mpro-P1835)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 2
R76 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.249
|
|
7GLC
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-6f6ae286-3 (Mpro-P1858)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
R87 (4S)-6-chloro-N-(7-fluoroisoquinolin-4-yl)-4-methoxy-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.271
|
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7GLD
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-15 (Mpro-P1879)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
CL CHLORIDE ION × 1
R8I (4S)-6-chloro-2-{2-[(cyanomethyl)amino]-2-oxoethyl}-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.248
|
|
7GLE
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-13 (Mpro-P1889)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
R8O (4S)-6-chloro-2-[2-(cyclopropylamino)-2-oxoethyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.259
|
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7GLF
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-22 (Mpro-P1978)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
R8X (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(2-methoxyethyl)(methyl)sulfamoyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.240
|
|
7GLG
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-18 (Mpro-P1980)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
CL CHLORIDE ION × 1
R95 (4S)-6-chloro-2-[(cyanomethyl)(methyl)sulfamoyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.238
|
|
7GLH
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-b38839dc-1 (Mpro-P1981)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
R9E 2-(3-chlorophenyl)-N-(7-fluoro-6-methoxyisoquinolin-4-yl)acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.257
|
|
7GLI
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-af1eef35-2 (Mpro-P1982)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
CL CHLORIDE ION × 1
R9I methyl N-[(4S)-6-chloro-4-[(isoquinolin-4-yl)carbamoyl]-3,4-dihydroisoquinoline-2(1H)-sulfonyl]-N-methylglycinate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.256
|
|
7GLJ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-4fff0a85-3 (Mpro-P1983)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
R9R (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(3-methyl-1,1-dioxo-1lambda~6~-thietan-3-yl)methanesulfonyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.247
|
|
7GLK
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-76744c27-4 (Mpro-P1986)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
CL CHLORIDE ION × 1
R9Z (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(1-methoxycyclopropyl)methanesulfonyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.240
|
|
7GLL
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-4fff0a85-1 (Mpro-P1988)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
RAQ (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(oxan-4-yl)methanesulfonyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.245
|
|
7GLM
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-21 (Mpro-P1990)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RBM (4S)-6-chloro-2-[(2-cyanoethyl)(methyl)sulfamoyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.260
|
|
7GLN
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-16 (Mpro-P1991)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RBX (4S)-6-chloro-2-[ethyl(methyl)sulfamoyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.240
|
|
7GLO
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with JAN-GHE-5a013bed-2 (Mpro-P2001)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
L6D N-(1H-benzimidazol-1-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.246
|
|
7GLP
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ADA-UCB-6c2cb422-1 (Mpro-P2005)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
860 2-(3-chlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.250
|
|
7GLQ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-8df914d1-2 (Mpro-P2007)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
NM0 2-(3-chlorophenyl)-N-[(4R)-imidazo[1,2-a]pyridin-3-yl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.244
|
|
7GLR
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIC-UNK-08cd9c58-1 (Mpro-P2010)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
O0X 2-(3-chlorophenyl)-N-(1,7-naphthyridin-5-yl)acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.245
|
|
7GLS
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-bfb445d4-2 (Mpro-P2011)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
OE6 N-(1H-benzotriazol-1-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.261
|
|
7GLT
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-4223bc15-12 (Mpro-P2017)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RC9 (4S)-6-chloro-2-[(1-cyanocyclobutyl)methanesulfonyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.241
|
|
7GLU
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-6479a3a9-2 (Mpro-P2028)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 1
RD5 2-(5-chloro-2-{[(methanesulfonyl)amino]methyl}phenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.245
|
|
7GLV
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-a54ce14d-2 (Mpro-P2031)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
R76 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.248
|
|
7GLW
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-1cbc2fae-1 (Mpro-P2036)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
CL CHLORIDE ION × 1
RDK (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methyl-1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.237
|
|
7GLX
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-2e8b2191-11 (Mpro-P2039)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RDQ (4S)-6-chloro-N-{6-[(methanesulfonyl)amino]isoquinolin-4-yl}-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.241
|
|
7GLY
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-23 (Mpro-P2057)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RDX (4S)-6-chloro-2-[(2-hydroxyethyl)(methyl)sulfamoyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.243
|
|
7GLZ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-14 (Mpro-P2067)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
REU (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(2S)-1-(methylamino)-1-oxopropan-2-yl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.254
|
|
7GM0
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-bfd29aac-1 (Mpro-P2070)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RFF (4S)-6-chloro-2-[(1-cyanocyclopropyl)methanesulfonyl]-N-(1-methyl-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-7-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.76 Å
R-free 0.251
|
|
7GM1
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-2e8b2191-10 (Mpro-P2072)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RFR (4S)-6-chloro-N-{6-[(methanesulfonyl)amino]isoquinolin-4-yl}-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.261
|
|
7GM2
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-2e8b2191-12 (Mpro-P2074)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RG3 (4S)-6-chloro-N-[7-(methanesulfonyl)isoquinolin-4-yl]-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.244
|
|
7GM3
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-c20a539d-4 (Mpro-P2075)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RG9 2-(3-chlorophenyl)-N-[7-(2-hydroxypropan-2-yl)isoquinolin-4-yl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.254
|
|
7GM4
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-6f6ae286-5 (Mpro-P2080)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RGQ (4S)-6-chloro-N-(7-fluoroisoquinolin-4-yl)-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.264
|
|
7GM5
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-2 (Mpro-P2089)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
RGX (4S)-6-chloro-2-(cyclopropylsulfamoyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.71 Å
R-free 0.247
|
|
7GM6
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-7889e8da-5 (Mpro-P2090)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RHI (4S)-6-chloro-N-[7-(methanesulfonyl)isoquinolin-4-yl]-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.255
|
|
7GM7
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-a577c8a2-1 (Mpro-P2099)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RI1 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.256
|
|
7GM8
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-7889e8da-3 (Mpro-P2101)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RI6 (4S)-6-chloro-N-(7-chloroisoquinolin-4-yl)-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.244
|
|
7GM9
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-1bed62cf-3 (Mpro-P2113)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RIJ 2-[(1'P,3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2',5'-dioxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylacetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.251
|
|
7GMA
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-7174c657-5 (Mpro-P2141)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
R2X (2S,5R)-N-{(1R)-1-(3-chlorophenyl)-2-[(isoquinolin-4-yl)amino]-2-oxoethyl}-5-(pyrrolidine-1-carbonyl)oxolane-2-carboxamide (non-preferred name) × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.248
|
|
7GMB
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-31 (Mpro-P2144)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RIU 2-(3-chlorophenyl)-N-{6-[2-(dimethylamino)ethoxy]isoquinolin-4-yl}acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.246
|
|
7GMC
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-5cd9ea36-17 (Mpro-P2147)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
RIY (4S)-6-chloro-2-(ethylsulfamoyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.238
|
|
7GMD
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-7174c657-6 (Mpro-P2176)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
R2X (2S,5R)-N-{(1R)-1-(3-chlorophenyl)-2-[(isoquinolin-4-yl)amino]-2-oxoethyl}-5-(pyrrolidine-1-carbonyl)oxolane-2-carboxamide (non-preferred name) × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.243
|
|
7GME
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-38 (Mpro-P2177)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RJ3 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]isoquinoline-7-carboxylic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.244
|
|
7GMF
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e119ab4f-3 (Mpro-P2178)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RJF (4S)-6-chloro-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-N-(5-methylisoquinolin-4-yl)-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.237
|
|
7GMG
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e119ab4f-2 (Mpro-P2182)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
RJO (4S)-6-chloro-N-(6-fluoroisoquinolin-4-yl)-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.238
|
|
7GMH
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-37 (Mpro-P2183)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RJX 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]isoquinoline-6-carboxylic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.236
|
|
7GMI
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-2 (Mpro-P2185)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RK6 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]-N-methylisoquinoline-7-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.245
|
|
7GMJ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-477dc5b7-4 (Mpro-P2197)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RKC (3'R)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2,3-dihydrospiro[[1]benzopyran-4,3'-pyrrolidin]-2'-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.237
|
|
7GMK
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-d899bab6-1 (Mpro-P2201)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RKR 2-(3-chlorophenyl)-N-[6-(dimethylamino)isoquinolin-4-yl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.240
|
|
7GML
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-28 (Mpro-P2203)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RL0 2-(3-chlorophenyl)-N-{6-[(methanesulfonyl)(methyl)amino]isoquinolin-4-yl}acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.244
|
|
7GMM
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-20 (Mpro-P2204)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RL8 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]-N-methylisoquinoline-6-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.238
|
|
7GMN
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-14 (Mpro-P2205)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RLH 2-(3-chlorophenyl)-N-{7-[2-(pyrrolidin-1-yl)ethoxy]isoquinolin-4-yl}acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.268
|
|
7GMO
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-12c4873b-5 (Mpro-P2206)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RLR (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.245
|
|
7GMP
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-7 (Mpro-P2207)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RM3 2-(3-chlorophenyl)-N-[7-(dimethylamino)isoquinolin-4-yl]acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.259
|
|
7GMQ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-13 (Mpro-P2210)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RMI 2-(3-chlorophenyl)-N-{7-[2-(dimethylamino)ethoxy]isoquinolin-4-yl}acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.244
|
|
7GMR
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-7fb4f80a-2 (Mpro-P2214)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RN0 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]isoquinolin-6-yl methanesulfonate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.249
|
|
7GMS
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-be9e6f63-3 (Mpro-P2215)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
RNI (4S)-6-chloro-2-[(1-cyanocyclopropyl)methanesulfonyl]-N-{7-[(methanesulfonyl)amino]isoquinolin-4-yl}-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.257
|
|
7GMT
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-19 (Mpro-P2218)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
ROZ 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]isoquinoline-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.247
|
|
7GMU
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-22 (Mpro-P2219)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
RPK N-(6-acetamidoisoquinolin-4-yl)-2-(3-chlorophenyl)acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.259
|
|
7GMV
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-8bb691af-4 (Mpro-P2222)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 1
RPZ 2-[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylacetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.252
|
|
7GMW
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e119ab4f-1 (Mpro-P2224)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RQ6 (4S)-6-chloro-N-(7-fluoroisoquinolin-4-yl)-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.256
|
|
7GMX
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-90fd5f68-21 (Mpro-P2229)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RQO 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]-N,N-dimethylisoquinoline-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.268
|
|
7GMY
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-e69ed63d-13 (Mpro-P2242)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RQF (4S)-6-chloro-N-(7-fluoroisoquinolin-4-yl)-1-oxo-2-[2-oxo-2-(propylamino)ethyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.255
|
|
7GMZ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-c3ea9889-6 (Mpro-P2243)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
RR0 (2r,4r)-6-chloro-N-(7-fluoroisoquinolin-4-yl)-2,3-dihydro-4H-2,4-methano-1-benzopyran-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.248
|
|
7GN0
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-43f8f7d6-6 (Mpro-P2256)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
RRD (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-{2-[(oxetan-3-yl)amino]-2-oxoethyl}-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.247
|
|
7GN1
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-8bb691af-6 (Mpro-P2263)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RRU 1-{[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidine]-2(3H)-sulfonyl]methyl}cyclopropane-1-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.261
|
|
7GN2
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-e69ed63d-1 (Mpro-P2273)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RS6 (4S)-6-chloro-N-(7-fluoroisoquinolin-4-yl)-1-oxo-2-{2-oxo-2-[(propan-2-yl)amino]ethyl}-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.242
|
|
7GN3
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with PET-UNK-7fb4f80a-1 (Mpro-P2284)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RSL 4-[2-(3-chlorophenyl)acetamido]isoquinolin-7-yl methanesulfonate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.261
|
|
7GN4
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-43f8f7d6-4 (Mpro-P2291)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 1
RT4 (4S)-6-chloro-2-[2-(cyclopropylamino)-2-oxoethyl]-N-(isoquinolin-4-yl)-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.241
|
|
7GN5
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-968bafd9-1 (Mpro-P2295)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RT9 (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[(1-methoxycyclopropyl)methanesulfonyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.254
|
|
7GN6
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e119ab4f-5 (Mpro-P2358)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RTS (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-4-methyl-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.44 Å
R-free 0.274
|
|
7GN7
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-1cbc2fae-2 (Mpro-P2381)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RV0 (4S)-6-chloro-4-ethyl-N-(isoquinolin-4-yl)-1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.264
|
|
7GN8
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-c7726e07-5 (Mpro-P2385)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 1
RPZ 2-[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylacetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.250
|
|
7GN9
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-12c4873b-2 (Mpro-P2402)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RVL (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-[1-(methylcarbamoyl)cyclopropyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.253
|
|
7GNA
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-4483ae88-4 (Mpro-P2415)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
RVR (4S)-6-chloro-1,1-dioxo-N-(5,6,7,8-tetrahydroisoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.266
|
|
7GNB
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-ee636701-1 (Mpro-P2468)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 1
RW0 (3R,4S)-6-chloro-N-[7-(methanesulfonyl)isoquinolin-4-yl]-3-methyl-2-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.239
|
|
7GNC
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-8bb691af-8 (Mpro-P2487)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
CL CHLORIDE ION × 1
RW9 2-[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-1,2'-dioxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylacetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.238
|
|
7GND
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIK-UNK-78dbf1b8-1 (Mpro-P2601)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RVR (4S)-6-chloro-1,1-dioxo-N-(5,6,7,8-tetrahydroisoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.238
|
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7GNE
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIK-ENA-5d9157e9-6 (Mpro-P2605)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
CL CHLORIDE ION × 1
RWO (4R)-6-chloro-4-methyl-1,1-dioxo-N-(5,6,7,8-tetrahydroisoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.251
|
|
7GNF
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MIK-ENA-5d9157e9-5 (Mpro-P2606)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13
CL CHLORIDE ION × 1
RWT (4S)-6-chloro-4-methyl-1,1-dioxo-N-(5,6,7,8-tetrahydroisoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.251
|
|
7GNG
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-705e09b8-1 (Mpro-P2607)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13
CL CHLORIDE ION × 1
RXU 2-[(3'S)-6-chloro-2'-oxo-1'-(5,6,7,8-tetrahydroisoquinolin-4-yl)-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylacetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.250
|
|
7GNH
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-853c0ffa-9 (Mpro-P2649)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
RYB 1-{[(3'S)-6-chloro-1'-{6-[2-(dimethylamino)ethoxy]isoquinolin-4-yl}-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidine]-2(3H)-sulfonyl]methyl}cyclopropane-1-carbonitrile × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.242
|
|
7GNI
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDG-MED-b1ef7fe3-1 (Mpro-P2660)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 1
RZF 2-[(3'S)-6-chloro-1'-(6-chloroisoquinolin-4-yl)-1,2'-dioxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylacetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.241
|
|
7GNJ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with EDJ-MED-976a33d5-1 (Mpro-P2724)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16
CL CHLORIDE ION × 1
RZU 1-[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-1,2'-dioxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylcyclopropane-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.229
|
|
7GNK
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-ecbed2ba-12 (Mpro-P2730)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 18
CL CHLORIDE ION × 1
S0X 2-[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-(cyclopropylmethyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.253
|
|
7GNL
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-WEI-dcc3321b-1 (Mpro-P2757)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 1
S1U (4S)-6-chloro-2-{2-[4-(4-ethylpiperazin-1-yl)anilino]-2-oxoethyl}-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.239
|
|
7GNM
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-WEI-dcc3321b-2 (Mpro-P2761)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 15
CL CHLORIDE ION × 1
S1L (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-{2-[3-(morpholin-4-yl)anilino]-2-oxoethyl}-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.254
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7GNN
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-WEI-dcc3321b-3 (Mpro-P2775)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
S39 (4S)-2-{2-[(1,3-benzothiazol-5-yl)amino]-2-oxoethyl}-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.252
|
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7GNO
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-WEI-dcc3321b-4 (Mpro-P2838)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14
CL CHLORIDE ION × 1
S3X (4S)-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-2-(2-{[(1S)-1-(4-nitrophenyl)ethyl]amino}-2-oxoethyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.232
|
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7GNP
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-WEI-dcc3321b-5 (Mpro-P2889)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 19
CL CHLORIDE ION × 2
S4X (4S)-6-chloro-2-(2-{[(1r,3R,5R,7S)-3-hydroxyadamantan-1-yl]amino}-2-oxoethyl)-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.260
|
|
7GNQ
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with NIR-WEI-dcc3321b-6 (Mpro-P2916)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 18
CL CHLORIDE ION × 3
S5L (4S)-2-[2-(4-acetamidoanilino)-2-oxoethyl]-6-chloro-N-(isoquinolin-4-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.224
|
|
7GNR
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-e48723dc-2 (Mpro-P3038)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 17
CL CHLORIDE ION × 1
RZU 1-[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-1,2'-dioxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidin]-2(3H)-yl]-N-methylcyclopropane-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.257
|
|
7GNS
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-50a80394-1 (Mpro-P3050)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 1
S6K 1-{[(3'S,4'R)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-4'-methyl-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidine]-2(3H)-sulfonyl]methyl}cyclopropane-1-carbonitrile × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.265
|
|
7GNT
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MAT-POS-50a80394-2 (Mpro-P3054)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11
CL CHLORIDE ION × 1
S7C 1-{[(3'S,4'R)-6-chloro-4'-ethyl-1'-(isoquinolin-4-yl)-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-pyrrolidine]-2(3H)-sulfonyl]methyl}cyclopropane-1-carbonitrile × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.251
|
|
7GNU
Group deposition SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitors from the COVID Moonshot -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with ALP-POS-133e7cd9-2 (Mpro-P3074)
提交 2023-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
CL CHLORIDE ION × 1
S7U 1-{[(3'S)-6-chloro-1'-(isoquinolin-4-yl)-2'-oxo-1H-spiro[isoquinoline-4,3'-piperidine]-2(3H)-sulfonyl]methyl}cyclopropane-1-carbonitrile × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;15% PEG 4K, 5% DMSO, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.245
|
|
7GRE
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-1
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XWH 4-[3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-5-yl]pyridine × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
NA SODIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.249
|
|
7GRF
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-2
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XWZ 5-bromopyridin-3-amine × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.239
|
|
7GRG
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-3
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Y2C 3,5-dichloropyridin-4-amine × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
NA SODIUM ION × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.236
|
|
7GRH
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-4
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 18
Y25 5-chloropyridin-3-ol × 2
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.253
|
|
7GRI
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-5
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
Y1R (1S)-1-(1H-pyrazol-5-yl)ethan-1-ol × 2
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.258
|
|
7GRJ
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-6
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
Y1L (5-chloro-1-benzothiophen-3-yl)methanol × 2
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.268
|
|
7GRK
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-7
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
Y1H (6-fluoro-2H,4H-1,3-benzodioxin-8-yl)methanol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.236
|
|
7GRL
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-8
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Y1C 4-(4,5-dibromo-2H-1,2,3-triazol-2-yl)butan-2-one × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.229
|
|
7GRM
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-9
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
NA SODIUM ION × 2
ZHA ~{N}-(5-oxidanylidene-7,8-dihydro-6~{H}-naphthalen-2-yl)ethanamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.231
|
|
7GRN
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-10
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
Y0W 2-[(3S)-pyrrolidin-3-yl]-5-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazole × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.301
|
|
7GRO
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-11
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Y3N N-[4-cyano-2-(trifluoromethyl)phenyl]acetamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14
NA SODIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.232
|
|
7GRP
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-12
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
VXQ 1-(2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl)methanamine × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
NA SODIUM ION × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.230
|
|
7GRQ
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-13
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
Y0S N-[(3-methylthiophen-2-yl)methyl]benzamide × 1
NA SODIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.234
|
|
7GRR
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-14
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
Y0O 5-(3-cyclohexylprop-1-yn-1-yl)pyridine-3-carboxylic acid × 1
SO4 SULFATE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.248
|
|
7GRS
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-15
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 25
NT9 ~{N}-methyl-1-(4-thiophen-2-ylphenyl)methanamine × 2
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.47 Å
R-free 0.224
|
|
7GRT
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-16
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Y0L N-[(2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl)methyl]benzamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.71 Å
R-free 0.257
|
|
7GRU
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-17
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 1
Y0H 3-(4-chlorophenyl)-1-methyl-1H-pyrazol-5-amine × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.241
|
|
7GRV
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-18
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Y0C (2S)-2-(2-fluorophenyl)-1,3-thiazolidin-4-one × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
NA SODIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.236
|
|
7GRW
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-19
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
XZX (2S)-N-(3,5-dichlorophenyl)-2-hydroxypropanamide × 2
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.239
|
|
7GRX
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-20
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12
NA SODIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
XZT 1-(2,4-difluorophenyl)pyrrolidine-2,5-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.219
|
|
7GRY
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-21
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
CL CHLORIDE ION × 2
XZO 1-(3,5-dichlorophenyl)pyrrolidine-2,5-dione × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.217
|
|
7GRZ
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-22
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
NA SODIUM ION × 1
XZI N,N-dimethyl-2-[(naphthalen-2-yl)oxy]acetamide × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.254
|
|
7GS0
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-23
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
XZE (pyridin-2-yl)(quinolin-2-yl)methanone × 1
NA SODIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.221
|
|
7GS1
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-24
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
GT7 2-cyano-~{N}-cyclohexyl-ethanamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.245
|
|
7GS2
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-25
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
5F8 3-(pyridin-3-yl)benzoic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.240
|
|
7GS3
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-26
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
JAH (6-phenylpyridin-3-yl)methanamine × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.279
|
|
7GS4
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-27
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
XZ6 7-(hydroxymethyl)-3-methyl-6~{H}-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidin-5-one × 1
CL CHLORIDE ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.278
|
|
7GS5
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-28
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
0TI (3R)-5-fluoro-3-hydroxy-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 3
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9
SO4 SULFATE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.247
|
|
7GS6
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with cpd-29
提交 2023-11-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
XXN (3S)-4,7-dichloro-3-hydroxy-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 3
SO4 SULFATE ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.228
|
|
7GYY
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000006-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AJF 4-[(3S)-3-(1H-1,2,4-triazol-1-yl)pyrrolidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.20 Å
R-free 0.252
|
|
7GYY
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000006-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.20 Å
R-free 0.252
|
|
7GYZ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000035-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AI6 N-(4-methyl-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-5-yl)-N'-(1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-yl)urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.235
|
|
7GYZ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000035-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.235
|
|
7GZ0
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000051-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AI7 (3S)-3-{[(1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}-1lambda~6~-thiane-1,1-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.235
|
|
7GZ0
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000051-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.235
|
|
7GZ1
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000061-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AJG 3-chloro-N-(1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-yl)pyridine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.208
|
|
7GZ1
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000061-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.208
|
|
7GZ2
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000072-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AJH (2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)azepane-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.231
|
|
7GZ2
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000072-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.231
|
|
7GZ3
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000090-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AJI (2S,3S)-N-(5,6-dimethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2-methyloxolane-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.197
|
|
7GZ3
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000090-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.197
|
|
7GZ4
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000018-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AJJ 5-[(2-fluorophenyl)sulfamoyl]-2-methyl-N-(1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-yl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.240
|
|
7GZ4
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000018-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.240
|
|
7GZ5
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000050-002
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AJK 4-[4-(4-methylpyrimidin-2-yl)piperidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.180
|
|
7GZ5
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000050-002
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.180
|
|
7GZ6
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000243-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AJL (3R)-3-methoxy-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)pyrrolidine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.198
|
|
7GZ6
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000243-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.198
|
|
7GZ7
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000131-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
QL6 3-{[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]methyl}-1H-indole-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.29 Å
R-free 0.202
|
|
7GZ7
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000131-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.29 Å
R-free 0.202
|
|
7GZ8
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000453-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AJW (2R)-3-methyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.183
|
|
7GZ8
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000453-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.183
|
|
7GZ9
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000462-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AJX N~2~-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-D-valinamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.180
|
|
7GZ9
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000462-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.180
|
|
7GZA
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000479-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKD (3R)-3-(propan-2-yl)-4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperazin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.194
|
|
7GZA
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000479-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.194
|
|
7GZB
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000495-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKE (2R)-(2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl)[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.193
|
|
7GZB
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000495-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.193
|
|
7GZC
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000588-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKF (3R)-3-(4-fluorophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.212
|
|
7GZC
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000588-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.212
|
|
7GZD
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000593-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKG (3R)-3-(pyridin-4-yl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.190
|
|
7GZD
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000593-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.190
|
|
7GZE
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000601-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKH (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-{[5-(dimethylamino)pyridine-2-carbonyl]amino}propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.200
|
|
7GZE
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000601-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.200
|
|
7GZF
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000605-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKI (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(1-methyl-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.204
|
|
7GZF
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000605-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.204
|
|
7GZG
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000620-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKP (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine-5-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.25 Å
R-free 0.203
|
|
7GZG
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000620-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.25 Å
R-free 0.203
|
|
7GZH
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000670-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKQ (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.25 Å
R-free 0.255
|
|
7GZH
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000670-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.25 Å
R-free 0.255
|
|
7GZI
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000753-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKR 3-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-1-methyl-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.233
|
|
7GZI
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000753-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.233
|
|
7GZJ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000789-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKS (2R)-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.277
|
|
7GZJ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000789-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.277
|
|
7GZK
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000877-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AI8 N-{(1R)-1-[(3R)-oxolan-3-yl]ethyl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.221
|
|
7GZK
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000877-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.221
|
|
7GZL
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008304-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AI9 (3R)-3-[4-(cyclopropylcarbamamido)benzamido]-3-[3-(difluoromethyl)phenyl]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.214
|
|
7GZL
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008304-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.214
|
|
7GZM
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008324-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKT N-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-D-valine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.210
|
|
7GZM
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008324-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.210
|
|
7GZN
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008351-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKU (4S)-4-hydroxy-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-D-proline × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.26 Å
R-free 0.213
|
|
7GZN
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008351-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.26 Å
R-free 0.213
|
|
7GZO
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008338-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKV 3-cyclopropyl-N-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-L-alanine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.20 Å
R-free 0.195
|
|
7GZO
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008338-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.20 Å
R-free 0.195
|
|
7GZQ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008379-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKV 3-cyclopropyl-N-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-L-alanine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.242
|
|
7GZQ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008379-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.242
|
|
7GZR
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008273-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AKZ (3S)-3-[3-(methanesulfonamido)phenyl]-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.46 Å
R-free 0.237
|
|
7GZR
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008273-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.46 Å
R-free 0.237
|
|
7GZS
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008340-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AK0 N-[(1R)-1-(4-methoxyphenyl)-2-(1H-tetrazol-5-yl)ethyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.246
|
|
7GZS
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008340-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.246
|
|
7GZT
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008348-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AK1 4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.268
|
|
7GZT
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008348-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.268
|
|
7GZU
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008674-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1AK2 7-{(1S)-2-methyl-1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propyl}-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.210
|
|
7GZU
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008674-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES (pH 9.5) and 30% PEG-3000
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.210
|
|
7GZV
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012336-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AK3 4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-[(3R)-1-methylpyrrolidin-3-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.229
|
|
7GZW
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012338-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AK4 (3M)-3-(4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-N-methylbenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.147
|
|
7GZX
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011176-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
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A1AK5 7-[(1S)-2-methyl-1-{[(6M)-6-{5-[(methylamino)methyl]furan-3-yl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}propyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.194
|
|
7GZY
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011144-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AK6 (4M)-4-(4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.157
|
|
7GZZ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011184-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AK7 2-[(4M)-4-(4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazol-1-yl]-N-methylacetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.192
|
|
7H00
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011221-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1ALQ (4M)-4-(4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro[1,4]dioxino[2,3-b]pyridin-6-yl)-2,2-dimethylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.171
|
|
7H01
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011192-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1ALR 7-[(1S)-2-methyl-1-{[(6M)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}propyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~,2-benzothiazine-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.38 Å
R-free 0.202
|
|
7H02
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000455-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1ALS N-[(1S)-1-(3,4-dihydro-2H-1lambda~4~-thiophen-5-yl)-2-methylpropyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.188
|
|
7H03
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000452-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1ALY N-[(2R)-1,1-difluoro-3-methylbutan-2-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.22 Å
R-free 0.236
|
|
7H04
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0000453-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AJW (2R)-3-methyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.195
|
|
7H05
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008287-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AL0 N-[(1S)-2-methyl-1-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)propyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.192
|
|
7H06
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0010739-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AL1 7-{(1S)-1-[(6-amino-5-chloropyrimidin-4-yl)amino]-2-methylpropyl}-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.24 Å
R-free 0.186
|
|
7H07
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0010744-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AL4 N-[(1S,2S)-1-(4-methoxyphenyl)-2-(1H-tetrazol-5-yl)propyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.236
|
|
7H08
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012346-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AL5 4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.220
|
|
7H09
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011177-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AL6 (4M)-1-methyl-4-(4-{[(1R)-2-methyl-1-(3-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrido[3,2-b][1,4]oxazin-6-yl)propyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.39 Å
R-free 0.253
|
|
7H09
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011177-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AL6 (4M)-1-methyl-4-(4-{[(1R)-2-methyl-1-(3-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrido[3,2-b][1,4]oxazin-6-yl)propyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.39 Å
R-free 0.253
|
|
7H0A
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008485-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AL7 2-[(4P)-4-(4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazol-1-yl]-N,N-dimethylacetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.204
|
|
7H0A
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008485-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AL7 2-[(4P)-4-(4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazol-1-yl]-N,N-dimethylacetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.204
|
|
7H0B
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0010716-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMD (4M)-4-(4-{[(1R)-1-(2,3-dihydro[1,4]dioxino[2,3-b]pyridin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.227
|
|
7H0B
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0010716-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMD (4M)-4-(4-{[(1R)-1-(2,3-dihydro[1,4]dioxino[2,3-b]pyridin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1-methyl-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.227
|
|
7H0C
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012349-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AME 4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.212
|
|
7H0C
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012349-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AME 4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.212
|
|
7H0D
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011446-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AIP 7-[(1S)-1-{[(6P)-6-(1,3-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.255
|
|
7H0E
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011153-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMF 4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.37 Å
R-free 0.223
|
|
7H0E
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011153-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMF 4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.37 Å
R-free 0.223
|
|
7H0F
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011207-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMG N-cyclopropyl-4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.26 Å
R-free 0.226
|
|
7H0F
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011207-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMG N-cyclopropyl-4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.26 Å
R-free 0.226
|
|
7H0G
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011210-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMI (4S)-6-{(1S)-1-[(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-2-methylpropyl}-2,3-dihydro-4H-1,4lambda~4~-benzoxathiin-4-one × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.185
|
|
7H0G
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011210-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMI (4S)-6-{(1S)-1-[(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-2-methylpropyl}-2,3-dihydro-4H-1,4lambda~4~-benzoxathiin-4-one × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.185
|
|
7H0H
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011204-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMJ N-ethyl-4-{[(1S)-2-methyl-1-(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)propyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.31 Å
R-free 0.213
|
|
7H0H
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011204-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMJ N-ethyl-4-{[(1S)-2-methyl-1-(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)propyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.31 Å
R-free 0.213
|
|
7H0I
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012317-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMK 4-{[(1R)-1-(4,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-1,4lambda~6~-benzoxathiin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.186
|
|
7H0J
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012318-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AML 6-{(1S)-2-methyl-1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propyl}-2,3-dihydro-4H-1,4lambda~6~-benzoxathiine-4,4-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.230
|
|
7H0J
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012318-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AML 6-{(1S)-2-methyl-1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propyl}-2,3-dihydro-4H-1,4lambda~6~-benzoxathiine-4,4-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.230
|
|
7H0K
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011076-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMP 4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~,2-benzothiazin-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.282
|
|
7H0L
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011436-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMQ 4-{[(S)-cyclopropyl(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)methyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.245
|
|
7H0L
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011436-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMQ 4-{[(S)-cyclopropyl(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)methyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.245
|
|
7H0M
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011428-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMR 2-[(4P)-4-(4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazol-1-yl]acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.46 Å
R-free 0.317
|
|
7H0M
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011428-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMR 2-[(4P)-4-(4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazol-1-yl]acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.46 Å
R-free 0.317
|
|
7H0N
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011215-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMS 7-[(1R)-1-({(6M)-6-[(4R)-imidazo[1,5-a]pyridin-6-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}amino)-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.41 Å
R-free 0.199
|
|
7H0N
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011215-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMS 7-[(1R)-1-({(6M)-6-[(4R)-imidazo[1,5-a]pyridin-6-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}amino)-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.41 Å
R-free 0.199
|
|
7H0O
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012310-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMT 7-{(1S)-2-methyl-1-[(9H-purin-6-yl)amino]propyl}-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.198
|
|
7H0P
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008445-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMU (2S,3S)-3-(4-bromophenyl)-2-methyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.31 Å
R-free 0.240
|
|
7H0Q
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013821-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMV 4-{[(1S)-1-(2-aminopyridin-4-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.199
|
|
7H0Q
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013821-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMV 4-{[(1S)-1-(2-aminopyridin-4-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.199
|
|
7H0R
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013730-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AMW 7-[(1R)-2-methyl-1-{[(6M)-6-(1-methyl-2-oxo-1,2-dihydropyridin-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}propyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.21 Å
R-free 0.216
|
|
7H0S
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013769-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1ANI 4-{[(1S)-1-(2-acetamido-1,3-benzothiazol-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.29 Å
R-free 0.196
|
|
7H0S
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013769-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1ANI 4-{[(1S)-1-(2-acetamido-1,3-benzothiazol-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.29 Å
R-free 0.196
|
|
7H0T
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013772-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1ANJ 7-[(1S)-1-{[(6M)-6-{3-[(4-acetylpiperazin-1-yl)methyl]phenyl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.293
|
|
7H0U
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013775-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1ANK 7-[(1S)-2-methyl-1-({(6M)-6-[(4R)-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-7-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}amino)propyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.47 Å
R-free 0.247
|
|
7H0V
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013318-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1ANL 4-(4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-N-(2-hydroxyethyl)benzene-1-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.28 Å
R-free 0.218
|
|
7H0W
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013738-001
提交 2024-01-23
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1024–1192(169 aa)
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未记录
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A1ANP 7-{(1R)-2-methyl-1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propyl}-3,4-dihydro-1lambda~6~-thiopyrano[2,3-b]pyridine-1,1(2H)-dione × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.204
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7H0X
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013255-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
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未记录
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A1ANQ (4M)-1-methyl-4-(4-{[(1S)-2-methyl-1-(3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-6-yl)propyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.218
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7H0X
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013255-001
提交 2024-01-23
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
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A1ANQ (4M)-1-methyl-4-(4-{[(1S)-2-methyl-1-(3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-6-yl)propyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazole-5-carbonitrile × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
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分辨率 1.30 Å
R-free 0.218
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7H0Y
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013258-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
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A1ANR 4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-(1-methylazetidin-3-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.283
|
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7H0Y
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013258-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
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A1ANR 4-{[(1S)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-(1-methylazetidin-3-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.283
|
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7H0Z
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013269-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
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未记录
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A1ANS 4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.23 Å
R-free 0.193
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7H10
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013259-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
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A1ANV 7-[(1R)-1-{[6-(methanesulfonyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.206
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7H11
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013392-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
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A1ANW 7-[(1R)-1-{[(6M)-6-(2,5-dihydrofuran-3-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.233
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7H12
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013388-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
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A1ANX 7-[(1R)-2-methyl-1-{[(6M)-6-(1H-pyrazol-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}propyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.192
|
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7H13
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013385-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
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A1ANU 7-[(1R)-1-{[(6M)-6-(3,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-5-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.22 Å
R-free 0.213
|
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7H14
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013383-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
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A1ANY 7-[(1R)-2-methyl-1-{[(6M)-6-(1-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyridin-3-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}propyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.189
|
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7H15
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013387-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1ANZ 7-[(1R)-1-{[(6M)-6-{2-[2-(dimethylamino)ethoxy]pyridin-4-yl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.185
|
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7H16
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0015776-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
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A1AN0 7-{(1R)-1-[(6-bromo-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-2-methylpropyl}-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.201
|
|
7H17
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013389-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AN2 7-[(1R)-1-{[6-(2-aminopyrimidin-5-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.184
|
|
7H18
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013390-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
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A1AN3 7-[(1R)-1-({6-[2-(3-hydroxyazetidin-1-yl)pyrimidin-5-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}amino)-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.182
|
|
7H19
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013827-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
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A1AN4 4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.173
|
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7H19
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013827-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AN4 4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.173
|
|
7H1A
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013833-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AL7 2-[(4P)-4-(4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazol-1-yl]-N,N-dimethylacetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.179
|
|
7H1A
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013833-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AL7 2-[(4P)-4-(4-{[(1S)-1-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-2-methylpropyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl)-1H-pyrazol-1-yl]-N,N-dimethylacetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.179
|
|
7H1B
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0013839-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AN5 7-{(1S)-1-[(6,7-dihydro[1,4]dioxino[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-2-methylpropyl}-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.47 Å
R-free 0.247
|
|
7H1C
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0014597-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AOA 7-[(1S)-1-{[(5R,8S)-10-acetyl-6,7,8,9-tetrahydro-5H-5,8-epiminocyclohepta[d]pyrimidin-4-yl]amino}-2-methylpropyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.44 Å
R-free 0.254
|
|
7H1D
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0011198-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AOB 4-{[(1R)-1-(1,1-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-1lambda~6~-benzothiopyran-7-yl)-2-methylpropyl]amino}-N-[(3R)-1-methylpyrrolidin-3-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.186
|
|
7H1E
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0008674-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AK2 7-{(1S)-2-methyl-1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propyl}-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.14 Å
R-free 0.192
|
|
7H1F
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0015381-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AK0 N-[(1R)-1-(4-methoxyphenyl)-2-(1H-tetrazol-5-yl)ethyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.205
|
|
7H1G
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with ASAP-0012329-001
提交 2024-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1AOC 7-[(1S)-2-methyl-1-{[(6M)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}propyl]-3,4-dihydro-1lambda~6~-benzothiopyran-1,1(2H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES (pH 6.50) and 30 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.24 Å
R-free 0.203
|
|
7HC4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3367
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A03 ethyl {4-[(2-oxopyrrolidin-1-yl)amino]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-8-yl}carbamate × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7HC4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3367
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7HC5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3765
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A02 (5R)-1-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-5-methylpyrrolidin-2-one × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.159
|
|
7HC5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3765
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.159
|
|
7HC6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3764
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A01 (5S)-1-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-5-methylpyrrolidin-2-one × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.160
|
|
7HC6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3764
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.160
|
|
7HC7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-4051
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A00 N-cyclopropyl-N'-{4-[(2-oxopyrrolidin-1-yl)amino]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-8-yl}urea × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.158
|
|
7HC7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-4051
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.158
|
|
7HC8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3763
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A0Z (5S)-1-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-5-phenylpyrrolidin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.169
|
|
7HC8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3763
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.169
|
|
7HC9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3762
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A0R (5R)-1-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-5-phenylpyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.177
|
|
7HC9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-3762
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.177
|
|
7HCA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-4636
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A0Q 1-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-5,5-dimethylpyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.173
|
|
7HCA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-4636
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.173
|
|
7HCB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000286
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7HCB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000286
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A2H N-cyclopropyl-5-{[(1-phenyl-1H-tetrazol-5-yl)methyl]sulfanyl}-1,3,4-thiadiazol-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7HCC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000296
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A41 3-{2-[(5-amino-1,3,4-thiadiazol-2-yl)sulfanyl]ethyl}-1,3-benzoxazol-2(3H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.150
|
|
7HCC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000296
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.150
|
|
7HCD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000303
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A42 (3R,6S)-6-methyl-1-(3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazine-7-carbonyl)piperidine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7HCD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000303
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7HCE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000002
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1A47 1-[(1R,6S,8R)-8lambda~4~-thia-7,9-diazatetracyclo[4.3.0.0~1,8~.0~6,8~]nona-2,4-diene-2-sulfonyl]-L-proline × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.148
|
|
7HCE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000002
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.148
|
|
7HCF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000313
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A49 (2S)-3-phenyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
A1A5A (2R)-3-phenyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.150
|
|
7HCF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000313
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.150
|
|
7HCG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000316
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A5B 3-[(2H-1,3-benzodioxole-5-carbonyl)amino]thiophene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.149
|
|
7HCG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000316
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.149
|
|
7HCH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000317
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A5C 2-[(5,6-dimethylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)sulfanyl]benzoic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.159
|
|
7HCH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000317
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.159
|
|
7HCI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000321
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A19 7-benzyl-5,6-dimethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.149
|
|
7HCI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000321
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.149
|
|
7HCJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000328
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A5D (2R)-2-methyl-3-[(2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-6-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
A1A5E (2S)-2-methyl-3-[(2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-6-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.153
|
|
7HCJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000328
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.153
|
|
7HCK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000329
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A5F (2S)-6-methyl-N-[(4S)-5,6,7,8-tetrahydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-3-yl]-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.156
|
|
7HCK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000329
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.156
|
|
7HCL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000341
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A5J 2-[2-(6-methyl-4-oxothieno[2,3-d][1,2,3]triazin-3(4H)-yl)ethyl]-1H-1lambda~6~,2-benzothiazole-1,1,3(2H)-trione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.155
|
|
7HCL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000341
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.155
|
|
7HCM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000348
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A5K (3R,4R)-1-[2-(hydroxymethyl)-1-methyl-1H-1,3-benzimidazole-5-carbonyl]-4-methylpiperidine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.156
|
|
7HCM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000348
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.156
|
|
7HCN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000288
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A5W (2S)-(3-oxo-1,2-benzothiazol-2(3H)-yl)(phenyl)acetic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.173
|
|
7HCN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000288
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.173
|
|
7HCO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000291
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
A1A5X 4-fluoro-3-({[1-(propan-2-yl)-1H-tetrazol-5-yl]sulfanyl}methyl)-1-benzothiophene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.87 Å
R-free 0.153
|
|
7HCO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000291
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.87 Å
R-free 0.153
|
|
7HCP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000338
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A5Y (8R)-6-(7-fluoro-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-6-carbonyl)-6-azaspiro[4.5]decane-8-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.96 Å
R-free 0.166
|
|
7HCP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000338
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.96 Å
R-free 0.166
|
|
7HCQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000345
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A50 7-methyl-N-[6-(methylamino)pyridin-3-yl]-1-benzothiophene-2-sulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.169
|
|
7HCQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000345
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.169
|
|
7HCR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000611
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1A56 (3S)-3-hydroxy-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidine-3-carboxamide × 1
A1A57 (3R)-3-hydroxy-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidine-3-carboxamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
7HCR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000611
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
7HCS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000609
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1A58 [(2S,4S)-4-fluoro-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]methanol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.165
|
|
7HCS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000609
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.165
|
|
7HCT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000612
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A6N (3R)-3-ethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-3-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.175
|
|
7HCT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000612
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.175
|
|
7HCU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000616
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A6O (3R,4R)-4-fluoro-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-3-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.170
|
|
7HCU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000616
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.170
|
|
7HCV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000610
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
A1A6P (3R,5R)-5-(hydroxymethyl)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-3-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.161
|
|
7HCV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000610
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.161
|
|
7HCW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0001444
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A6Q (3R,4S)-4-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]oxolan-3-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7HCW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0001444
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7HCX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003571
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A6V 1-{[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclobutan-1-ol × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.164
|
|
7HCX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003571
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.164
|
|
7HCY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003701
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A6U (1R)-1-[(2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]ethane-1,2-diol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.171
|
|
7HCY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003701
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.171
|
|
7HCZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003702
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A6X [(8R)-7-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-1,4-dioxa-7-azaspiro[4.4]nonan-8-yl]methanol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.155
|
|
7HCZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003702
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.155
|
|
7HD0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003703
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A6Y (2S)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-3-(1,3-thiazol-5-yl)propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.158
|
|
7HD0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003703
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.158
|
|
7HD1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003704
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A6Z [(2S)-4,4-dimethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.159
|
|
7HD1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003704
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.159
|
|
7HD2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003705
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1A60 (2S)-3-(furan-3-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.167
|
|
7HD2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003705
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.167
|
|
7HD3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003707
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A61 [(3S)-2-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-8-oxa-2-azaspiro[4.5]decan-3-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.169
|
|
7HD3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003707
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.169
|
|
7HD4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003708
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A62 [(3S)-2-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2-azaspiro[4.4]nonan-3-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.162
|
|
7HD4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003708
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.162
|
|
7HD5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003709
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A63 (2S)-3-(benzyloxy)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
A1A64 (2R)-3-(benzyloxy)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.168
|
|
7HD5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003709
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.168
|
|
7HD6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0001445
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A65 2-[(2S)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]propan-2-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.164
|
|
7HD6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0001445
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.164
|
|
7HD7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003710
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A66 [(6S)-5-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-5-azaspiro[2.4]heptan-6-yl]methanol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.157
|
|
7HD7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003710
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.157
|
|
7HD8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003711
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A68 (2S)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-3-(thiophen-2-yl)propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.163
|
|
7HD8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003711
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.163
|
|
7HD9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003713
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A7W [(1S,3S,4R)-2-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2-azabicyclo[2.2.1]heptan-3-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.163
|
|
7HD9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003713
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.163
|
|
7HDA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003715
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A7Z (2S)-2-phenyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.161
|
|
7HDA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003715
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.161
|
|
7HDB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003717
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1A70 [(3R)-4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)morpholin-3-yl]methanol × 1
A1A71 [(3S)-4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)morpholin-3-yl]methanol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.160
|
|
7HDB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003717
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.160
|
|
7HDC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003718
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A72 (1R,2R)-1-(4-chlorophenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propane-1,3-diol × 2
A1A73 (1R,2S)-1-(4-chlorophenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propane-1,3-diol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7HDC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003718
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7HDD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003719
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A75 [(2R,5S)-5-tert-butyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.160
|
|
7HDD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003719
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.160
|
|
7HDE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003720
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A76 [(2S,3aS,6aS)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)octahydrocyclopenta[b]pyrrol-2-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.153
|
|
7HDE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003720
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.153
|
|
7HDF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003721
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1A77 [(2R)-4-methyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperazin-2-yl]methanol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7HDF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003721
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7HDG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003722
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A78 [(2S,4R)-4-tert-butyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.160
|
|
7HDG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003722
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.160
|
|
7HDH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003726
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A8F [(2R)-5,5-dimethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 2
A1A8E [(2S)-5,5-dimethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7HDH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003726
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7HDI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003727
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A8G [(3S)-2-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2-azaspiro[4.5]decan-3-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.166
|
|
7HDI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003727
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.166
|
|
7HDJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003728
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A8H [(7S)-6-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-6-azaspiro[3.4]octan-7-yl]methanol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.176
|
|
7HDJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003728
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.06 Å
R-free 0.176
|
|
7HDK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003730
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A8D (2S,3R)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butane-1,3-diol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7HDK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003730
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7HDL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003731
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A8J 2-[(2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]-2,3-dihydro-1H-inden-2-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.169
|
|
7HDL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003731
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.169
|
|
7HDM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003732
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A8K (4S)-4-hydroxy-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-D-proline × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.164
|
|
7HDM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003732
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.164
|
|
7HDN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003734
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1A8L (2R)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butane-1,4-diol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.172
|
|
7HDN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003734
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.172
|
|
7HDO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003637
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A8M (2S)-4,4,4-trifluoro-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.181
|
|
7HDO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003637
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.181
|
|
7HDP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003638
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A8W (2S)-2-cyclobutyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7HDP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003638
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7HDQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003639
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1A8X (1S,2S)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclopentan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.158
|
|
7HDQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003639
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.158
|
|
7HDR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003640
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A80 (2S)-3-(4-fluorophenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
A1A8Z (2R)-3-(4-fluorophenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7HDR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003640
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7HDS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003641
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A81 (2S)-3-cyclobutyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.162
|
|
7HDS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003641
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.162
|
|
7HDT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003642
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A82 (1S,3S)-1-phenyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butane-1,4-diol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.154
|
|
7HDT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003642
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.154
|
|
7HDU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003643
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A83 (2R)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.167
|
|
7HDU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003643
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.167
|
|
7HDV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003644
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A84 (2S)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]pent-4-yn-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.158
|
|
7HDV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003644
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.158
|
|
7HDW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003646
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A85 (3S)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.171
|
|
7HDW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003646
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.171
|
|
7HDX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003648
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A86 (2S)-4,4-dimethyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]pentan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.175
|
|
7HDX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003648
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.175
|
|
7HDY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003650
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A87 (2R)-3-(1H-indol-3-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
A1A88 (2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.159
|
|
7HDY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003650
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.159
|
|
7HDZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003651
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A89 (2S)-2-cyclopropyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.170
|
|
7HDZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003651
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.170
|
|
7HE0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003652
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9A (R)-phenyl[(2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]methanol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.160
|
|
7HE0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003652
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.160
|
|
7HE1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003655
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9D [(2S,3S)-3-methyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.171
|
|
7HE1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003655
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.171
|
|
7HE2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003656
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
A1A9E [(2R,4R)-4-methoxy-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.160
|
|
7HE2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003656
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.160
|
|
7HE3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003657
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9F (2S)-3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.162
|
|
7HE3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003657
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.162
|
|
7HE4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003658
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A9G (2S)-3-(1,3-dioxolan-2-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.155
|
|
7HE4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003658
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.155
|
|
7HE5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003659
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9H (2R)-2-(furan-2-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.161
|
|
7HE5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003659
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.161
|
|
7HE6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003660
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9I (2S)-3-[(2R)-oxolan-2-yl]-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.181
|
|
7HE6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003660
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.07 Å
R-free 0.181
|
|
7HE7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003662
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9J (2S)-3-cyclopropyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
7HE7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003662
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
7HE8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003664
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9K (3aR,6S,6aS)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)octahydrocyclopenta[b]pyrrol-6-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.167
|
|
7HE8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003664
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.167
|
|
7HE9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003665
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 2
A1A9L (2S)-3-[(3S)-oxolan-3-yl]-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.161
|
|
7HE9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003665
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.161
|
|
7HEA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003666
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A9M (1R)-1-[(2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.155
|
|
7HEA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003666
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.155
|
|
7HEB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003667
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9N (3R)-2-methyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]pentan-2-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.161
|
|
7HEB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003667
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.161
|
|
7HEC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003669
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9O (2S,3R)-3-phenyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7HEC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003669
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7HED
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003670
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9T {1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclobutyl}methanol × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.159
|
|
7HED
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003670
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.159
|
|
7HEE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003671
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9Q (2S)-3-(dimethylamino)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.161
|
|
7HEE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003671
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.161
|
|
7HEF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003673
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9R (2S)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-3-(1,3-thiazol-2-yl)propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.153
|
|
7HEF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003673
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.153
|
|
7HEG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003674
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9S (2R)-3-(2-methylphenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.158
|
|
7HEG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003674
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.158
|
|
7HEH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003675
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1A9U (2R)-3-(3-methylphenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.154
|
|
7HEH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003675
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.154
|
|
7HEI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003677
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9V (2S)-3-(piperidin-1-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.155
|
|
7HEI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003677
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.155
|
|
7HEJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003679
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9W (2S)-2-[(3R)-oxolan-3-yl]-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.155
|
|
7HEJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003679
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.155
|
|
7HEK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003681
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A9X [(1s,4s)-2-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2-azabicyclo[2.1.1]hexan-1-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.160
|
|
7HEK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003681
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.160
|
|
7HEL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003683
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A9Z (2S)-3-(4-methylphenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
A1A9Y (2R)-3-(4-methylphenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.158
|
|
7HEL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003683
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.158
|
|
7HEM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003684
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A91 (2R)-3-(3,4-dimethylphenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
A1A90 (2S)-3-(3,4-dimethylphenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7HEM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003684
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7HEN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003685
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A92 [(2S)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]methanol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.155
|
|
7HEN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003685
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.155
|
|
7HEO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003686
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A94 (2S)-3-(4-iodophenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
A1A93 (2R)-3-(4-iodophenyl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.153
|
|
7HEO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003686
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.153
|
|
7HEP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003688
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A95 {1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclopropyl}methanol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.152
|
|
7HEP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003688
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.152
|
|
7HEQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003690
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A96 (2R)-3-cyclohexyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
7HEQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003690
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
7HER
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003691
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 2
A1A97 (2S)-3-cyclopentyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.160
|
|
7HER
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003691
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.160
|
|
7HES
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003692
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1A98 {1-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclopentyl}methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.170
|
|
7HES
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003692
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.170
|
|
7HET
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003693
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BAB (2R)-2-[(1R)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1
A1BAC (2S)-2-[(1R)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.155
|
|
7HET
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003693
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.155
|
|
7HEU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003695
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BAA 2-ethyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7HEU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003695
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7HEV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003696
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BAD (2R)-3-(pyridin-2-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
A1BAE (2S)-3-(pyridin-2-yl)-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.156
|
|
7HEV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003696
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.156
|
|
7HEW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003697
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A99 (2R)-2-methyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.157
|
|
7HEW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003697
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.157
|
|
7HEX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003733
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1BAG [(2S,5R)-5-(1,3-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.160
|
|
7HEX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003733
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.160
|
|
7HEY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003635
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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TFA trifluoroacetic acid × 1
A1BAI (2S,3R)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]pentan-2-ol × 1
A1BAJ (2R,3S)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]pentan-2-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.158
|
|
7HEY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003635
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.158
|
|
7HEZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003649
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1BAH (2S)-2-cyclopentyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7HEZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003649
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7HF0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003661
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
A1BAK (3R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-3-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
7HF0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003661
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
7HF1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003761
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BAM 1-{[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.162
|
|
7HF1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003761
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.162
|
|
7HF2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004062
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BAN (1R)-1-[(2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]ethan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.160
|
|
7HF2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004062
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.160
|
|
7HF3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004064
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BAP [(2S,4R)-4-methyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1
A1BAQ [(2R,4S)-4-methyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.165
|
|
7HF3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004064
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.165
|
|
7HF4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004066
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
TFA trifluoroacetic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
A1BAO 4-{(2S)-3-hydroxy-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propyl}phenol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.154
|
|
7HF4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004066
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.154
|
|
7HF5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003758
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BAS 2-methyl-1-[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-2-ol × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.166
|
|
7HF5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003758
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.166
|
|
7HF6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003760
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
A1BAT 1-{[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclopentan-1-ol × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.165
|
|
7HF6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0003760
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.165
|
|
7HF7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004063
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1BAR [(2R,5S)-5-methyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.151
|
|
7HF7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004063
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.151
|
|
7HF8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004329
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BAU (1r,4r)-1-{[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexane-1,4-diol × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.167
|
|
7HF8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004329
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.167
|
|
7HF9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004194
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BAV 4-{[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}oxan-4-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.162
|
|
7HF9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004194
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.162
|
|
7HFA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004195
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BAW 4-{[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}thian-4-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.161
|
|
7HFA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004195
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.161
|
|
7HFB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004331
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BAX (1r,4r)-4-methyl-1-{[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexan-1-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.179
|
|
7HFB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004331
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.179
|
|
7HFC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004126
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BAY 2-[(2R)-3,3-dimethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]propan-2-ol × 1
A1BAZ 2-[(2S)-3,3-dimethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]propan-2-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.165
|
|
7HFC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004126
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.165
|
|
7HFD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004127
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BA8 2-[(1S,3aR,7aS)-2-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)octahydro-1H-isoindol-1-yl]propan-2-ol × 1
A1BA9 2-[(1S,3aS,7aR)-2-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)octahydro-1H-isoindol-1-yl]propan-2-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.171
|
|
7HFD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004127
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.171
|
|
7HFE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004128
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BA5 2-[(1S,2R,5R)-3-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-3-azabicyclo[3.2.0]heptan-2-yl]propan-2-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.167
|
|
7HFE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004128
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.167
|
|
7HFF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004307
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BA6 (1S,3R)-3-methyl-1-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.166
|
|
7HFF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004307
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.166
|
|
7HFG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004308
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BA7 4,4-difluoro-1-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.166
|
|
7HFG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004308
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.166
|
|
7HFH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004311
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1BBI (3R)-3-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}oxan-3-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.160
|
|
7HFH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004311
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.160
|
|
7HFI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004312
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
A1BBJ (1r,4r)-4-methyl-1-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.163
|
|
7HFI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004312
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.163
|
|
7HFJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004313
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BBK (1R,4S,5R)-4-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}-2-oxabicyclo[3.1.1]heptan-4-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.160
|
|
7HFJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004313
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.160
|
|
7HFK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004314
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BBL 4-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}oxan-4-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.170
|
|
7HFK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004314
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.170
|
|
7HFL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004319
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BBM 4-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}thian-4-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7HFL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004319
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7HFM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004320
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BBN (1R,2R,4S)-2-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}bicyclo[2.2.2]octan-2-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.163
|
|
7HFM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004320
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.163
|
|
7HFN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004322
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BBO (3R)-3-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}thian-3-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.158
|
|
7HFN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004322
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.158
|
|
7HFO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004309
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BBP (1S,3R)-1-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}-3-(trifluoromethyl)cyclohexan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.160
|
|
7HFO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004309
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.160
|
|
7HFP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004318
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1BBQ 4-{[methyl(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}oxan-4-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.156
|
|
7HFP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004318
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.156
|
|
7HFQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005994
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BBR [(2S)-4,4-dimethyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.168
|
|
7HFQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005994
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.168
|
|
7HFR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005997
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1BBS (3aS,6S,6aR)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)octahydrocyclopenta[b]pyrrol-6-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.157
|
|
7HFR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005997
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.157
|
|
7HFS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005998
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BBT [(2S)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-1,2,5,6-tetrahydropyridin-2-yl]methanol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.152
|
|
7HFS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005998
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.152
|
|
7HFT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006000
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BBU 4-[(2R)-2-tert-butylpyrrolidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.169
|
|
7HFT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006000
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.169
|
|
7HFU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006002
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BBX [(2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7HFU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006002
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7HFV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005158
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BBY (2S,3R)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-2-ol × 1
A1BBZ (2R,3R)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-2-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.189
|
|
7HFV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005158
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.189
|
|
7HFW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005216
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BB0 4-[(2R)-2-(propan-2-yl)pyrrolidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.161
|
|
7HFW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005216
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.161
|
|
7HFX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005266
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BCC 2-methyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.151
|
|
7HFX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0005266
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.151
|
|
7HFY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006217
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BCD 1-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7HFY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006217
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.154
|
|
7HFZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006220
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BCE (1r,4r)-1-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}cyclohexane-1,4-diol × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.164
|
|
7HFZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0006220
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.164
|
|
7HHS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000411
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A7O 1-({6-[(1H-indazol-5-yl)amino]pyrimidin-4-yl}amino)pyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.148
|
|
7HHS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000411
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.148
|
|
7HHT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000372
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
A1A7P 1-{[(5P)-5-(3-fluoropyridin-2-yl)pyrimidin-4-yl]amino}pyrrolidin-2-one × 2
BR BROMIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.157
|
|
7HHT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000372
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.157
|
|
7HHU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000528
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A7M (3R)-3-(2,4-difluorophenyl)-3-[(6,7-dihydro-5H-cyclopenta[c]pyridine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.179
|
|
7HHU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000528
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.179
|
|
7HHV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000527
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
A1A7L (3R)-3-(2,4-difluorophenyl)-3-{[(4R)-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyridine-5-carbonyl]amino}propanoic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.166
|
|
7HHV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000527
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.166
|
|
7HHW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000724
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A7K (5S)-1-[(5-iodo-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-(thiophen-2-yl)pyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.168
|
|
7HHW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000724
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.168
|
|
7HHX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000729
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1A7J 4-{[(5S)-2-oxo-5-(thiophen-2-yl)pyrrolidin-1-yl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.182
|
|
7HHX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000729
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.182
|
|
7HHY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000700
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A7I (5S)-1-[(5-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-phenylpyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.172
|
|
7HHY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000700
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.172
|
|
7HHZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000703
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A7H (5S)-1-[(5-bromo-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-phenylpyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.170
|
|
7HHZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000703
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.170
|
|
7HI0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000708
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A7G (5S)-1-[(5-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-methylpyrrolidin-2-one × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.162
|
|
7HI0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000708
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.162
|
|
7HI1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000712
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A7F (5S)-1-[(6-bromo-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-phenylpyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.168
|
|
7HI1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000712
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.168
|
|
7HI2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000682
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A7E (5S)-1-[(6-chloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-phenylpyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.171
|
|
7HI2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000682
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.171
|
|
7HI3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000688
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A7D (5S)-1-[(6-chloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-(thiophen-2-yl)pyrrolidin-2-one × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.162
|
|
7HI3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000688
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.162
|
|
7HI4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000689
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A7C (5S)-1-[(5-chloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-5-phenylpyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.178
|
|
7HI4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000689
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.178
|
|
7HI5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000737
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A7B (5S)-1-[(9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-5-(thiophen-2-yl)pyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.174
|
|
7HI5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0000737
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.174
|
|
7HI6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004099
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A69 (2R)-3-methyl-2-{[(6P)-6-(1H-pyrazol-3-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino}butan-1-ol × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.162
|
|
7HI6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004099
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.162
|
|
7HI7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004197
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1A7A (2R)-2-[(8-amino-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-3-methylbutan-1-ol × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.173
|
|
7HI7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-0004197
提交 2024-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.09 Å
R-free 0.173
|
|
7HPI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_6
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJ2 6-{[(3-fluorophenyl)methyl]sulfanyl}-9H-purine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.166
|
|
7HPI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_6
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.166
|
|
7HPJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_28
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJ3 (1R,2S)-2-[(thieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)amino]cyclohexane-1-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.168
|
|
7HPJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_28
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.168
|
|
7HPK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_79
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJ4 (6-bromo-1H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-yl)methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.183
|
|
7HPK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_79
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.183
|
|
7HPL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_8
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJI 4-[3-(1H-pyrazol-1-yl)azetidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.162
|
|
7HPL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_8
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.162
|
|
7HPM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_42
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1BJ5 (2S)-1-[(5-ethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-2,3-dimethylbutan-2-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.181
|
|
7HPM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_42
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.181
|
|
7HPN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_87
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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A1BJ6 [(3R)-3-(propan-2-yl)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-3-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.159
|
|
7HPN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1708_87
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.159
|
|
7HPO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1695_15
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJ7 (3R)-1-(5-cyanopyridin-2-yl)-N-(1,3-thiazol-2-yl)piperidine-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.162
|
|
7HPO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1695_15
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.162
|
|
7HPP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1695_54
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BKE (1S,2S)-N-[3,5-difluoro-4-(methanesulfonyl)phenyl]-2-(pyridin-3-yl)cyclopropane-1-carboxamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.157
|
|
7HPP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1695_54
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.157
|
|
7HPQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_25
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BKD 4-[(2,4,6-trifluorophenyl)sulfanyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carbonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.188
|
|
7HPQ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_25
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.188
|
|
7HPR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_50
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BKC (1S,6R)-10-(6-chloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-4-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.170
|
|
7HPR
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_50
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.170
|
|
7HPS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_83
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BKB 1-{[(7-bromo-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]methyl}cyclopropane-1-carboxamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.154
|
|
7HPS
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_83
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.154
|
|
7HPT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_72
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1BKA 9-fluoro-4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2,3,4,5-tetrahydro-1,4-benzoxazepine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.168
|
|
7HPT
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_72
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.168
|
|
7HPU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1718_59
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJO (3S)-3-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]piperidine-2,6-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.161
|
|
7HPU
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1718_59
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.161
|
|
7HPV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1879_22
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJN N-(2-acetamido-1,3-thiazole-5-sulfonyl)-1-(3,4-dichlorophenyl)cyclobutane-1-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.142
|
|
7HPV
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1879_22
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.142
|
|
7HPW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1706_56
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BKQ 4-{[(1S)-2-bromocyclohex-2-en-1-yl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 1
A1CM4 4-{[(1R)-2-bromocyclohex-2-en-1-yl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.165
|
|
7HPW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1706_56
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.165
|
|
7HPX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_92
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BKP 7-fluoro-N-[(1R)-1-(1,3-thiazol-2-yl)propyl]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.157
|
|
7HPX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_92
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.157
|
|
7HPY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_91
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BKO (1s,3s)-3-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-3-methylcyclobutan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.166
|
|
7HPY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_91
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.166
|
|
7HPZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1705_34
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BKN 6-cyclopropyl-N-{[(3S)-3-hydroxy-1-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5-carbonyl)pyrrolidin-3-yl]methyl}pyridine-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.164
|
|
7HPZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1705_34
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.164
|
|
7HQ0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1706_49
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJM 2-(5-bromo-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-3-carbonyl)-6-cyclopropyl-1lambda~6~,2,6-thiadiazinane-1,1-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.163
|
|
7HQ0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1706_49
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.163
|
|
7HQ1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_67
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BKM 4-bromo-N-(5,6-dimethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pent-4-enamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.166
|
|
7HQ1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_67
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.166
|
|
7HQ2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_92
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BKL N-(5,6-dimethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-3,3-dimethylbutanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.171
|
|
7HQ2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_92
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.171
|
|
7HQ3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1709_75
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1BKK 2-bromo-3-fluoro-4-[(propan-2-yl)oxy]-N-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.159
|
|
7HQ3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1709_75
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.159
|
|
7HQ4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_78
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1BKI 3-{(3R)-3-[(5-bromo-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butyl}-1,3-oxazolidin-2-one × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
7HQ4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_78
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
7HQ5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_85
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BKH (1R,2S)-2-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-N-methylcyclohexane-1-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.187
|
|
7HQ5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_85
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.187
|
|
7HQ6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1702_11
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJJ (4R)-N-[(1s,4S)-4-(3-hydroxy-2-methylbenzamido)cyclohexyl]imidazo[1,2-a]pyrimidine-7-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.170
|
|
7HQ6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1702_11
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.170
|
|
7HQ7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_26
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BKF 6-{[(3-ethylphenyl)methyl]sulfanyl}-9H-purine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.151
|
|
7HQ7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_26
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.151
|
|
7HQ8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_95
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BKG (3R)-1-(2-fluoroethyl)-3-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]pyrrolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.152
|
|
7HQ8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_95
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.152
|
|
7HQ9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_45
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJ8 (5S)-5-{[(5,6-dimethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}-4,4-dimethylpyrrolidin-2-one × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.183
|
|
7HQ9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_45
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.183
|
|
7HQA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1716_34
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1BJ9 4-{[(2-fluoro-5-hydroxyphenyl)methyl]amino}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.171
|
|
7HQA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1716_34
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.171
|
|
7HQB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1705_4
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJL [(5S)-7-(2-amino-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-7-azaspiro[3.5]nonan-5-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.170
|
|
7HQB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1705_4
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.170
|
|
7HQC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_6
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1BJQ 5-ethyl-N-(4,4,4-trifluoro-2,2-dimethylbutyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.153
|
|
7HQC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1696_6
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.153
|
|
7HQD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_48
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJK phenyl(4-{[(9H-purin-6-yl)sulfanyl]methyl}phenyl)methanone × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.164
|
|
7HQD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_48
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.164
|
|
7HQE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_79
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJR 7-fluoro-N-[(3R)-oxolan-3-yl]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-amine × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
7HQE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_79
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.163
|
|
7HQF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_16
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJS 6-({[3-(difluoromethyl)phenyl]methyl}sulfanyl)-9H-purine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.159
|
|
7HQF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_16
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.159
|
|
7HQG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_97
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJ1 6-{[(3-chloro-4-fluorophenyl)methyl]sulfanyl}-9H-purine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7HQG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1717_97
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7HQH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_71
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJ0 (3R)-3-[(7-bromo-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]-N-methylbutanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.157
|
|
7HQH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_71
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.157
|
|
7HQI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_88
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJZ 3-(6-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)but-3-en-1-ol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7HQI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_88
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.158
|
|
7HQJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_48
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJY N-[(1R)-2,2-dimethylcyclopentyl]-5,6-dimethyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.165
|
|
7HQJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1690_48
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.165
|
|
7HQK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1702_58
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJX N'-(3,5-dichloro-4-methylbenzene-1-sulfonyl)-2-hydroxybenzohydrazide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.166
|
|
7HQK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1702_58
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.166
|
|
7HQL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_78
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJW 3-{2-[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]ethyl}-1,3-oxazolidin-2-one × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.160
|
|
7HQL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_78
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.160
|
|
7HQM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_76
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJV (4R)-4-{[(7-fluoro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]methyl}-1-propylpyrrolidin-2-one × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.147
|
|
7HQM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_76
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.147
|
|
7HQN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1706_32
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1BJU 1-(3-bromo-4-chlorophenyl)cyclopropane-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.156
|
|
7HQN
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1706_32
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.156
|
|
7HQO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_89
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJT (1R)-1-{1-[(7-bromo-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)amino]cyclopropyl}-2-methoxyethan-1-ol × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.169
|
|
7HQO
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_89
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.169
|
|
7HQP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_9
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1BJP 4-[(3R)-3-(2-fluorophenyl)pyrrolidin-1-yl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.156
|
|
7HQP
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with CACHE3HI_1715_9
提交 2024-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.156
|
|
7HUC
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment B07 from the F2X-Entry Screen in monoclinic space group
提交 2025-01-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UIS N-[3-(diethylamino)phenyl]ethanamide × 4
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.235
|
|
7HUD
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment B08 from the F2X-Entry Screen in monoclinic space group
提交 2025-01-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
T9S ethyl 1,3-dihydro-2H-pyrrolo[3,4-c]pyridine-2-carboxylate × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.229
|
|
7HUE
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment D08 from the F2X-Entry Screen in monoclinic space group
提交 2025-01-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1BNP N-[(3R)-1,1-dioxo-1lambda~6~-thiolan-3-yl]-N,N',N'-trimethylurea × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.233
|
|
7I13
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment B05 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 1
NA SODIUM ION × 1
A1BVZ 2-acetylbenzoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.262
|
|
7I14
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment B08 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
T9S ethyl 1,3-dihydro-2H-pyrrolo[3,4-c]pyridine-2-carboxylate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.269
|
|
7I15
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment C02 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 2
SYA 2,4,5-tris(fluoranyl)-3-methoxy-benzoic acid × 2
NA SODIUM ION × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.282
|
|
7I16
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment C07 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CL CHLORIDE ION × 1
VN9 3,4-dihydro-1~{H}-quinolin-2-one × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 2.13 Å
R-free 0.273
|
|
7I17
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment C10 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 1
TJV 1,3-benzodioxole-5-carbothioamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.260
|
|
7I18
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment D04 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
R9D methyl 4-fluoro-D-phenylalaninate × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.255
|
|
7I19
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment D08 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 1
A1BVW N-[(3S)-1,1-dioxo-1lambda~6~-thiolan-3-yl]-N,N',N'-trimethylurea × 2
NA SODIUM ION × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.268
|
|
7I1A
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment D11 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 1
R9M 3-(1,3-thiazol-2-yl)propanoic acid × 3
NA SODIUM ION × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.243
|
|
7I1C
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment E11 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 2
RA7 [2-(morpholin-4-yl)-1,3-thiazol-5-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.254
|
|
7I1D
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment F04 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 1
RB7 N-[(4-bromo-3-methylphenyl)methyl]-2-(methylsulfonyl)ethan-1-amine × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.268
|
|
7I1E
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment G03 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 2
RD4 3-ethoxybenzene-1-carboximidamide × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.246
|
|
7I1F
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment G04 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
NA SODIUM ION × 1
T9V N-(4-methoxyphenyl)acetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.260
|
|
7I1G
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment G09 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 2
RDM (2R)-2-(acetylamino)-4-phenylbutanoic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.242
|
|
7I1H
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment G10 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
A1BVY 1-phenyl-1H-tetrazole × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.256
|
|
7I1I
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment H03 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
RDY N-[(benzyloxy)carbonyl]-N-methyl-L-alanine × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.255
|
|
7I1J
PanDDA analysis group deposition -- Main Protease (SARS-CoV-2) in complex with fragment H11 from the F2X-Entry Screen in orthorhombic space group
提交 2025-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 1
TBJ N-cyclopentyl-N'-{[(2R)-oxolan-2-yl]methyl}urea × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.7;291 K;0.2 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3) pH 7.7, 23.5 % PEG 1500, 5 % DMSO, 1 mM DTT. Crystal seeds were used to ensure reproducible crystal growth.
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.248
|
|
7IB8
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X10590 (well A03) from the KIT library
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
A1CEI 5-(4-bromophenyl)-1H-tetrazole × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.231
|
|
7IB9
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X11415 (well A09) from the KIT library
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
A1CEJ 3-methylnaphthalen-2-ol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.222
|
|
7IBA
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X13162 (well B06) from the KIT library
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
A1CRA 4-(2-aminoethyl)-2-iodophenol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.242
|
|
7IBB
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X13458 (well B08) from the KIT library
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
A1CS0 (2-bromo-1,4-phenylene)dimethanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.236
|
|
7IBC
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X15604 (well C08) from the KIT library
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
A1CS2 2-[(1-methylcyclobutyl)sulfanyl]benzoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.13 Å
R-free 0.295
|
|
7IBD
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X2317 (well E01) from the KIT library
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
RMN (R)-MANDELIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.223
|
|
7IBE
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X4071 (well F06) from the KIT library
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
A1CRB 2,2,2-trifluoro-1-(1-methyl-1H-imidazol-2-yl)ethan-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.226
|
|
7IBF
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X4161 (well F07) from the KIT library
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
A1CS1 (3S)-3-(4-hydroxyphenyl)piperazin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.251
|
|
7IBG
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X5449 (well G01) from the KIT library
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
A1CS3 methyl (1S)-2-oxocyclopentane-1-carboxylate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.231
|
|
7IBH
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X6553 (well G10) from the KIT library
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
A1CS4 (4-bromanyl-5-methyl-thiophen-2-yl)-oxidanyl-oxidanylidene-boron × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.294
|
|
7IBI
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment X7214 (well H02) from the KIT library
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
A1CS5 N,N'-(pyridine-2,6-diyl)diacetamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.254
|
|
7IBJ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A01 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.227
|
|
7IBK
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.231
|
|
7IBL
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A04 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.240
|
|
7IBM
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.41 Å
R-free 0.225
|
|
7IBN
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A06 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.241
|
|
7IBO
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.233
|
|
7IBP
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A08 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.227
|
|
7IBQ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A10 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.230
|
|
7IBR
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A11 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.225
|
|
7IBS
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.233
|
|
7IBT
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo01 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.239
|
|
7IBU
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.240
|
|
7IBV
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo03 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.249
|
|
7IBW
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo04 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.244
|
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7IBX
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.235
|
|
7IBY
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo06 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.244
|
|
7IBZ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.240
|
|
7IC0
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo08 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.239
|
|
7IC1
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.245
|
|
7IC2
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.244
|
|
7IC3
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo13 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.250
|
|
7IC4
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B01 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.242
|
|
7IC5
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.229
|
|
7IC6
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B03 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.235
|
|
7IC7
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B04 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.254
|
|
7IC8
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.232
|
|
7IC9
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.242
|
|
7ICA
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B07 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.238
|
|
7ICB
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.237
|
|
7ICC
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B10 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.231
|
|
7ICW
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B11 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.238
|
|
7ICX
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.232
|
|
7ICY
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C01 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.79 Å
R-free 0.242
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7ICZ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.79 Å
R-free 0.242
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7ID0
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C02 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.68 Å
R-free 0.245
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7ID1
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C03 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.95 Å
R-free 0.241
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7ID2
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C04 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.83 Å
R-free 0.237
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7ID3
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.73 Å
R-free 0.240
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7ID4
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C06 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.57 Å
R-free 0.240
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7ID5
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.83 Å
R-free 0.238
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7ID6
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.245
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7ID7
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C10 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.89 Å
R-free 0.260
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7ID8
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C11 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.84 Å
R-free 0.247
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7ID9
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.82 Å
R-free 0.246
|
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7IDA
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.73 Å
R-free 0.242
|
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7IDB
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D03 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.68 Å
R-free 0.242
|
|
7IDC
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D04 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.68 Å
R-free 0.242
|
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7IDD
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D04 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.248
|
|
7IDE
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.79 Å
R-free 0.238
|
|
7IDF
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D06 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.235
|
|
7IDG
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.241
|
|
7IDH
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D08 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.239
|
|
7IDI
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.238
|
|
7IDJ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D10 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.238
|
|
7IDK
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D11 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.242
|
|
7IDL
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.381
|
|
7IDM
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D01 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.258
|
|
7IDN
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.242
|
|
7IDO
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E03 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.240
|
|
7IDP
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E04 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.251
|
|
7IDQ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.237
|
|
7IDR
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E06 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.70 Å
R-free 0.245
|
|
7IDS
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.249
|
|
7IDT
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E08 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.258
|
|
7IDU
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.245
|
|
7IDV
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E10 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.234
|
|
7IDW
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E11 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
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分辨率 1.79 Å
R-free 0.236
|
|
7IDX
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.279
|
|
7IDY
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F01 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.248
|
|
7IDZ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.89 Å
R-free 0.413
|
|
7IE0
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F03 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.241
|
|
7IE1
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F04 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.245
|
|
7IE2
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.265
|
|
7IE3
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F08 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.252
|
|
7IE4
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.242
|
|
7IE5
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F10 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.242
|
|
7IE6
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.337
|
|
7IE7
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F12 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.237
|
|
7IE8
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G02 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.239
|
|
7IE9
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G03 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.248
|
|
7IEA
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G04 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.242
|
|
7IEB
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.235
|
|
7IEC
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G06 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.235
|
|
7IED
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G08 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.241
|
|
7IEE
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.247
|
|
7IEF
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.249
|
|
7IEG
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H01 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.249
|
|
7IEH
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H03 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.246
|
|
7IEI
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H05 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.251
|
|
7IEJ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H06 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.254
|
|
7IEK
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H08 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.252
|
|
7IEL
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H09 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.253
|
|
7IEM
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H10 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.227
|
|
7IEN
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H11 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.248
|
|
7IEO
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H12 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-05-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.252
|
|
7IIW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5398393122
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
RLU (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
A1CJB (3S)-3-(4-bromophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.167
|
|
7IIW
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z5398393122
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.167
|
|
7IIX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7691912366
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CJC (3S)-3-(4-bromophenyl)-3-[(2-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
A1CJD (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(2-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.177
|
|
7IIX
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7691912366
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.177
|
|
7IIY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075283
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CJE (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
A1CJF (3S)-3-(4-bromophenyl)-3-[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.170
|
|
7IIY
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075283
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.170
|
|
7IIZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075280
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CJR (3S)-3-(4-bromophenyl)-3-[(9H-purine-6-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
A1CJS (3R)-3-(4-bromophenyl)-3-[(9H-purine-6-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.158
|
|
7IIZ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075280
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.158
|
|
7IJ0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075284
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CJT (3R)-3-(4-bromo-2-methylphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.178
|
|
7IJ0
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075284
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.178
|
|
7IJ1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075302
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CJV (3R)-3-(4-hydroxyphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
A1CJW (3S)-3-(4-hydroxyphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.165
|
|
7IJ1
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8598075302
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.165
|
|
7IJ2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8727396638
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1CJX (2R,3S)-2-methyl-3-phenyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
A1CJY (2S,3R)-2-methyl-3-phenyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.164
|
|
7IJ2
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8727396638
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.164
|
|
7IJ3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8727396582
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CJZ (3R)-3-(3-methylphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.166
|
|
7IJ3
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8727396582
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.166
|
|
7IJ4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7692046343
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1CJ0 (3S)-3-(4-chlorophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.176
|
|
7IJ4
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7692046343
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.176
|
|
7IJ5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7692056627
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CJ1 (3S)-3-(pyridin-2-yl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.166
|
|
7IJ5
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7692056627
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.99 Å
R-free 0.166
|
|
7IJ6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7140729870
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CJ3 (3S)-3-(4-methylphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.177
|
|
7IJ6
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7140729870
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.177
|
|
7IJ7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7691912473
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1AKG (3R)-3-(pyridin-4-yl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.162
|
|
7IJ7
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7691912473
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.162
|
|
7IJ8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8928826043
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CJ4 (3R)-3-phenyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]butanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.173
|
|
7IJ8
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8928826043
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.173
|
|
7IJ9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8928826033
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1CJ5 (3R)-3-(3-fluorophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.173
|
|
7IJ9
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8928826033
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.173
|
|
7IJA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8929429249
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CJ6 (3S)-3-(2-methylphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7IJA
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8929429249
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.159
|
|
7IJB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8768700676
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1CJ7 (3S)-3-(2-chlorophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.157
|
|
7IJB
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8768700676
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.157
|
|
7IJC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8929428675
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1CJ8 (3S)-3-(pyridin-3-yl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.182
|
|
7IJC
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8929428675
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.182
|
|
7IJD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7692056404
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1CKA (3S)-3-(4-fluorophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
7IJD
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7692056404
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
7IJE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523169
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1CKB (3S)-3-phenyl-3-[(9H-purine-6-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
7IJE
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523169
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.165
|
|
7IJF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8727401304
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1CKC (3S)-3-(3-chlorophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.177
|
|
7IJF
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8727401304
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.177
|
|
7IJG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990527720
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1CKD (3R)-3-(2-fluorophenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.153
|
|
7IJG
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990527720
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.153
|
|
7IJH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523176
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CKE (3S)-3-[(5-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]-3-phenylpropanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.164
|
|
7IJH
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523176
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.164
|
|
7IJI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523172
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CKF (3S)-3-[(2-methyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]-3-phenylpropanoic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.182
|
|
7IJI
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523172
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.182
|
|
7IJJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990919037
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1CKH (3R)-3-(3-hydroxyphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
A1CKI (3S)-3-(3-hydroxyphenyl)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.172
|
|
7IJJ
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990919037
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.172
|
|
7IJK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990919048
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CKJ (2R,3S)-2-hydroxy-3-phenyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.153
|
|
7IJK
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990919048
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.153
|
|
7IJL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523194
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CKK (3S)-3-[(2-chloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]-3-phenylpropanoic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.184
|
|
7IJL
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z8990523194
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.184
|
|
7IJM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7534253453
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1CKL (3S)-3-phenyl-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-4-carbonyl)amino]propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.179
|
|
7IJM
PanDDA analysis group deposition -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z7534253453
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.01 Å
R-free 0.179
|
|
7IJN
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB175 (Mac1-x10181)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CLR (1R,2S)-2-(1H-indazol-4-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.22 Å
R-free 0.169
|
|
7IJN
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB175 (Mac1-x10181)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CLR (1R,2S)-2-(1H-indazol-4-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.22 Å
R-free 0.169
|
|
7IJO
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB177 (Mac1-x10183)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CLS (1R,2S)-2-(isoquinolin-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.169
|
|
7IJO
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB177 (Mac1-x10183)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.18 Å
R-free 0.169
|
|
7IJP
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB179 (Mac1-x10184)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CLT (1R,2S)-2-(1-methyl-1H-1,3-benzimidazol-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.22 Å
R-free 0.206
|
|
7IJP
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB179 (Mac1-x10184)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.22 Å
R-free 0.206
|
|
7IJQ
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with POB176 (Mac1-x10199)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CLU (1R,2S)-2-(1,3-benzoxazol-5-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.21 Å
R-free 0.174
|
|
7IJQ
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with POB176 (Mac1-x10199)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.21 Å
R-free 0.174
|
|
7IJR
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0208 (Mac1-x10313)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CLV (1R,2R)-2-(isoquinolin-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.21 Å
R-free 0.219
|
|
7IJR
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0208 (Mac1-x10313)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.21 Å
R-free 0.219
|
|
7IJS
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0209 (Mac1-x10314)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CLW (1R,2R)-2-(1,3-benzothiazol-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.164
|
|
7IJS
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0209 (Mac1-x10314)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.164
|
|
7IJT
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0185 (Mac1-x10331)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
A1CLX (2P)-2-(1,3-benzothiazol-6-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.172
|
|
7IJT
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0185 (Mac1-x10331)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;100 mM CHES, pH 9.5, 30% w/v PEG3000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.172
|
|
7IJU
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0206 (Mac1-x10390)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1CLZ (2P)-2-(isoquinolin-6-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.29 Å
R-free 0.259
|
|
7IJV
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0207 (Mac1-x10395)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1CL0 (2M)-2-(quinoxalin-6-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.27 Å
R-free 0.251
|
|
7IJW
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0208 (Mac1-x10399)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1CLV (1R,2R)-2-(isoquinolin-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.285
|
|
7IJX
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0209 (Mac1-x10400)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1CLW (1R,2R)-2-(1,3-benzothiazol-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.38 Å
R-free 0.268
|
|
7IJY
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0185 (Mac1-x10407)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1CLX (2P)-2-(1,3-benzothiazol-6-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.251
|
|
7IJZ
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0221 (Mac1-x10516)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1CL4 (2P)-2-(quinolin-6-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.32 Å
R-free 0.235
|
|
7IK0
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0211 (Mac1-x10525)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1CL5 (1R,2R)-2-(quinoxalin-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.37 Å
R-free 0.244
|
|
7IK1
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0215 (Mac1-x10529)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1CL7 (1R,2R)-2-(2-amino-1,3-benzothiazol-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.34 Å
R-free 0.235
|
|
7IK2
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0228 (Mac1-x10558)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1CL8 (2P)-2-(2-carbamamido-1,3-benzothiazol-6-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.206
|
|
7IK3
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0212 (Mac1-x10580)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1CL9 (1R,2R)-2-(quinolin-6-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.254
|
|
7IK4
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0213 (Mac1-x10581)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1CMA (1R,2R)-2-(quinolin-7-yl)cyclopentane-1-carboxylic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.210
|
|
7IK5
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0216 (Mac1-x10584)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1CMB (2P)-2-(2-amino-1,3-benzothiazol-6-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.20 Å
R-free 0.224
|
|
7IK6
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0217 (Mac1-x10585)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1CMC (2P)-2-[2-(methylamino)-1,3-benzothiazol-6-yl]cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.251
|
|
7IK7
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0218 (Mac1-x10586)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1CMD (2P)-2-[2-(ethylamino)-1,3-benzothiazol-6-yl]cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.23 Å
R-free 0.233
|
|
7IK8
Group deposition of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with inhibitors from the O'Brien group -- Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP3 Macrodomain in complex with POB0222 (Mac1-x10590)
提交 2025-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1CME (2P)-2-(quinolin-7-yl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, pH 6.5, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.192
|
|
7IPH
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo11 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-08-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.285
|
|
7IPI
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-08-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.256
|
|
7IPJ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G11 (dataset 2) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-08-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.268
|
|
7IPK
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H07 (dataset 1) from the KIT library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-08-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.269
|
|
7IPL
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment B03 from the F2X-Entry library
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
SYG 2-[(1~{S})-1-azanylpropyl]phenol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.33 Å
R-free 0.228
|
|
7IPM
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment B08 from the F2X-Entry library
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
T9S ethyl 1,3-dihydro-2H-pyrrolo[3,4-c]pyridine-2-carboxylate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.229
|
|
7IPN
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment C02 from the F2X-Entry library
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
SYA 2,4,5-tris(fluoranyl)-3-methoxy-benzoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.255
|
|
7IPO
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment C06 from the F2X-Entry library
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
A1I4V ~{N}-(3-chloranyl-4-methyl-phenyl)ethanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.242
|
|
7IPP
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment D10 from the F2X-Entry library
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
R9J 2-methyl-N-(4-methylphenyl)-L-alanine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.38 Å
R-free 0.227
|
|
7IPQ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment E01 from the F2X-Entry library
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
A1CSC methyl 3-amino-2-hydroxybenzoate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.227
|
|
7IPR
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment E04 from the F2X-Entry library
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
VNV 3-phenyl-1,2-oxazol-5-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.37 Å
R-free 0.215
|
|
7IPS
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment E12 from the F2X-Entry library
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
SYV 6-azanyl-3-methyl-1,3-benzoxazol-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.231
|
|
7IPT
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment F02 from the F2X-Entry library
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
T9Y ethyl 5-(trifluoromethyl)-1H-pyrazole-4-carboxylate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.235
|
|
7IPU
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 in complex with fragment F09 from the F2X-Entry library
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
UI4 4-pyridin-2-ylphenol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.239
|
|
7IPV
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A01a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.240
|
|
7IPW
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A02a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.236
|
|
7IPX
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A03a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.254
|
|
7IPY
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A04a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.243
|
|
7IPZ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A05a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.243
|
|
7IQ0
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A06a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.312
|
|
7IQ1
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A07a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.46 Å
R-free 0.243
|
|
7IQ2
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A08a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.254
|
|
7IQ3
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A09a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.252
|
|
7IQ4
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A10a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.249
|
|
7IQ5
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A11b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.23 Å
R-free 0.250
|
|
7IQ6
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal A12a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.47 Å
R-free 0.239
|
|
7IQ7
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo01 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.245
|
|
7IQ8
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo02 (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.245
|
|
7IQ9
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo03 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.254
|
|
7IQA
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo04 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.246
|
|
7IQB
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo05 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.246
|
|
7IQC
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo06 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.256
|
|
7IQD
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo07 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.251
|
|
7IQE
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo08 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.375
|
|
7IQF
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo09 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.247
|
|
7IQG
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo11 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.338
|
|
7IQH
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo12 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.288
|
|
7IQI
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo13 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.47 Å
R-free 0.244
|
|
7IQJ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo14 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.263
|
|
7IQK
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo15 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.256
|
|
7IQL
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo15 (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.257
|
|
7IQM
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo16 (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.257
|
|
7IQN
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo17 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.246
|
|
7IQO
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo18 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.241
|
|
7IQP
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo19 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.39 Å
R-free 0.238
|
|
7IQQ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo20 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.250
|
|
7IQR
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo21 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.273
|
|
7IQS
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo22 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.247
|
|
7IQT
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo23 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.246
|
|
7IQU
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo25 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.248
|
|
7IQV
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo26 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.243
|
|
7IQW
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo27 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.247
|
|
7IQX
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo28 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.245
|
|
7IQY
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo29 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.244
|
|
7IQZ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo30 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.253
|
|
7IR0
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo31 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.250
|
|
7IR1
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo32 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.252
|
|
7IR2
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo33 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.246
|
|
7IR3
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo34 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.254
|
|
7IR4
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo35 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.250
|
|
7IR5
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal Apo36 (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.254
|
|
7IR6
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B01a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.247
|
|
7IR7
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B02a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.239
|
|
7IR8
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B03b (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.44 Å
R-free 0.280
|
|
7IR9
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B04a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.234
|
|
7IRA
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B05a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.267
|
|
7IRB
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B05b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.27 Å
R-free 0.292
|
|
7IRC
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B06a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.261
|
|
7IRD
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B07a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.249
|
|
7IRE
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B08b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.21 Å
R-free 0.248
|
|
7IRF
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B09b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.13 Å
R-free 0.289
|
|
7IRG
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B10a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.263
|
|
7IRH
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B11a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.252
|
|
7IRI
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal B12a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.252
|
|
7IRJ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C01a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.247
|
|
7IRK
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C02b (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.19 Å
R-free 0.265
|
|
7IRL
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C03a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.252
|
|
7IRM
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C04a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.298
|
|
7IRN
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C05a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.257
|
|
7IRO
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C06b (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.263
|
|
7IRP
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C07a (dataset 4) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.247
|
|
7IRQ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C08a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.259
|
|
7IRR
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C09a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.250
|
|
7IRS
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C10a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.249
|
|
7IRT
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C11a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.37 Å
R-free 0.234
|
|
7IRU
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal C12a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.250
|
|
7IRV
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D01a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.39 Å
R-free 0.236
|
|
7IRW
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D02a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.258
|
|
7IRX
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D03a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.244
|
|
7IRY
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D04a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.242
|
|
7IRZ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D05a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.244
|
|
7IS0
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D06a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.247
|
|
7IS1
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D07a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.285
|
|
7IS2
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D08a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.245
|
|
7IS3
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D09a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.254
|
|
7IS4
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D10b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.244
|
|
7IS5
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D11a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.265
|
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7IS6
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D11b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.264
|
|
7IS7
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal D12a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.246
|
|
7IS8
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E01a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.291
|
|
7IS9
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E01a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.246
|
|
7ISA
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E01b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.251
|
|
7ISB
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E02a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.246
|
|
7ISC
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E03a (dataset 3) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.235
|
|
7ISD
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E03b (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.21 Å
R-free 0.271
|
|
7ISE
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E04b (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.24 Å
R-free 0.260
|
|
7ISF
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E05a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.251
|
|
7ISG
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E06a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.244
|
|
7ISH
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E07a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.240
|
|
7ISI
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E08a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.260
|
|
7ISJ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E09a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.251
|
|
7ISK
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E10a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.259
|
|
7ISL
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal E11a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.255
|
|
7ISM
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F01a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.263
|
|
7ISN
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F03a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.242
|
|
7ISO
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F04a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.247
|
|
7ISP
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F05a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.241
|
|
7ISQ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F06a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.262
|
|
7ISR
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F07a (dataset 3) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.254
|
|
7ISS
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F08a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.245
|
|
7IST
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F10a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.257
|
|
7ISU
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F11a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.246
|
|
7ISV
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal F12a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.257
|
|
7ISW
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G01a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.269
|
|
7ISX
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G02a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.252
|
|
7ISY
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G03a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.352
|
|
7ISZ
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G04a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.244
|
|
7IT0
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G05a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.245
|
|
7IT1
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G07a (dataset 4) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.245
|
|
7IT2
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G08a (dataset 3) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.255
|
|
7IT3
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G09a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.76 Å
R-free 0.253
|
|
7IT4
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G10a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.252
|
|
7IT5
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G11a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.251
|
|
7IT6
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal G12a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.256
|
|
7IT7
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H01a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.236
|
|
7IT8
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H02a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.265
|
|
7IT9
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H03a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.230
|
|
7ITA
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H04a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.71 Å
R-free 0.260
|
|
7ITB
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H05a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.270
|
|
7ITC
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H06a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.250
|
|
7ITD
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H07a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.255
|
|
7ITE
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H08a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.261
|
|
7ITF
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H09a (dataset 2) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.251
|
|
7ITG
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H10a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.246
|
|
7ITH
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H11a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.259
|
|
7ITI
PanDDA analysis group deposition -- SARS-CoV-2 Nsp1 crystal H12a (dataset 1) from the F2X-Entry library screening campaign, data used for ground state calculation
提交 2025-09-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–125(116 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% (w/v) PEG 3350. Reproducibility was improved by seeding.
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.253
|
|
7JFQ
The crystal structure of 3CL MainPro of SARS-CoV-2 with de-oxidized C145
提交 2020-07-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
FMT FORMIC ACID × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;0.1 M TRIS pH 8.5 and 15% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.198
|
|
7JHE
Room Temperature Structure of SARS-CoV-2 Nsp10/Nsp16 Methyltransferase in a Complex with 2'-O-methylated m7GpppA Cap-1 and SAH Determined by Fixed-Target Serial Crystallography
提交 2020-07-20
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
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未记录
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CL CHLORIDE ION × 1
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
V9G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-ADENOSINE × 1
MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;pH 6.5;295 K;Protein: 4.0 mg/ml (NSP10/NSP16 1:1), 0.15 M NaCl, 0.01 M Tris-HCl, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, pH 7.5. Precipitation buffer: 0.1 M MES pH 6.5, 0.9 M NaF. Batch crystallization: 100 ul of protein mixed with 100 ul of precipitation buffer in 500 ul polypropylene tube. Crystals were soaked with m7GpppA (0.5 mM) for 10 minutes before data collection.
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分辨率 2.25 Å
R-free 0.248
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7JIB
Room Temperature Crystal Structure of Nsp10/Nsp16 from SARS-CoV-2 with Substrates and Products of 2'-O-methylation of the Cap-1
提交 2020-07-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
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未记录
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CL CHLORIDE ION × 2
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1
V9G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-ADENOSINE × 1
MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;295 K;Protein: 4.0 mg/ml (Nsp10/Nsp16 1:1), 0.15 M NaCl, 0.01 M Tris-HCl, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, pH 7.5. Precipitation buffer: 0.1 M MES pH 6.5, 0.9 M NaF. Sitting drops made using 0.4 ul of protein mixed with 0.4 ul of precipitation buffer.
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分辨率 2.65 Å
R-free 0.181
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7JKV
Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with an inhibitor GRL-2420
提交 2020-07-29
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
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未记录
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V7G N-[(2S)-1-({(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M MES pH 5.8, 15% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO
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分辨率 1.25 Å
R-free 0.177
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7JLT
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP7-NSP8 complex.
提交 2020-07-30
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
3860–3942(83 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;0.2 M Magnesium Chloride Hexahydrate, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 25% w/v PEG 3350
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分辨率 2.70 Å
R-free 0.283
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7JME
Structure of the SARS-CoV-2 NSP3 Macro X domain in complex with cyclic AMP
提交 2020-07-31
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1025–1195(171 aa)
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未记录
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CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;289.15 K;30% PEG 4K, 0.1M MES pH 6.5, crystals then soaked in 35% PEG 4K, 20mM cAMP
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分辨率 1.55 Å
R-free 0.182
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7JOY
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with its C-terminal autoprocessing sequence.
提交 2020-08-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;0.1 M MES pH 6, 16-22% PEG 3350, 5% MPD
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.252
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7JP0
Crystal structure of Mpro with inhibitor r1
提交 2020-08-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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VJA N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 20% w/v PEG3350, pH 8.0
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分辨率 1.65 Å
R-free 0.226
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7JP1
Structure of wild-type substrate free SARS-CoV-2 Mpro.
提交 2020-08-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES pH 6.5, 15-20% PEG 3350
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.233
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7JPE
Room Temperature Structure of SARS-CoV-2 Nsp10/Nsp16 Methyltransferase in a Complex with m7GpppA Cap-0 and SAM Determined by Fixed-Target Serial Crystallography
提交 2020-08-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
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GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
M7G 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;pH 6.5;297 K;Protein: 4.0 mg/ml (NSP10/NSP16 1:1), 0.15 M CaCl, 0.01 M Tris-HCl, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% Glycerol, pH 7.5.
Precipitation buffer: 0.1M MES pH 6.5, 0.9 M NaF. Batch crystallization: 100 ul of protein mixed with 100 ul of precipitation buffer in 500 ul polypropylane tube. Two days before data collection 1 mM EDTA was added to batch crystallization. Crystal were soaked with m7GpppA (0.5 mM) for 10 minutes before data collection.
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分辨率 2.18 Å
R-free 0.237
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7JPY
Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in its apo-form
提交 2020-08-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
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分辨率 1.60 Å
R-free 0.205
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7JPZ
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI1
提交 2020-08-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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GHX (phenylmethyl) N-[(2S)-1-oxidanylidene-1-[[(2S)-1-oxidanyl-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-3-phenyl-propan-2-yl]carbamate × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
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分辨率 1.60 Å
R-free 0.241
|
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7JQ0
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI3
提交 2020-08-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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VHV N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.227
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7JQ1
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI4
提交 2020-08-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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VHJ N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl]propan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
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分辨率 1.65 Å
R-free 0.298
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7JQ2
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI5
提交 2020-08-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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VHM N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-3-cyclohexyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.214
|
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7JQ3
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI6
提交 2020-08-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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VHP N-[(benzyloxy)carbonyl]-O-tert-butyl-L-threonyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.254
|
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7JQ4
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI7
提交 2020-08-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
XM2 N-[(benzyloxy)carbonyl]-O-tert-butyl-L-threonyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.238
|
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7JQ5
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI8
提交 2020-08-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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NOL N-[(BENZYLOXY)CARBONYL]-O-(TERT-BUTYL)-L-THREONYL-3-CYCLOHEXYL-N-[(1S)-2-HYDROXY-1-{[(3S)-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL]METHYL}ETHYL]-L-ALANINAMIDE × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0, with a protein concentration of 14 mg/ml
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.329
|
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7JQB
SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex
提交 2020-08-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 33
PDB 声明:34-meric
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链 F
145–180(36 aa)
片段:UNP residues 145-180
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.70 Å
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7JQC
SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex
提交 2020-08-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 33
PDB 声明:35-meric
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链 F
145–180(36 aa)
片段:UNP residues 145-180
|
未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.30 Å
|
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7JR3
SARS-CoV-2 3CL protease crystallized under reducing conditions
提交 2020-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;0.1 M MES, 15% PEG4000, 1 mM TCEP
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.183
|
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7JR4
SARS-CoV-2 3CL protease with alternative conformation of the active site promoted by methylene-bridged cysteine and lysine residues
提交 2020-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;0.1 M MES, 15% PEG4000, 5% DMSO
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.180
|
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7JST
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL in apo form
提交 2020-08-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 6;277 K;0.1 M sodium phosphate-monobasic, 0.1 MES, and 20% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.196
|
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7JSU
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with GC376
提交 2020-08-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
PO4 PHOSPHATE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 6;277 K;0.1 M sodium phosphate-monobasic, 0.1 M MES (pH 6), and 20% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.203
|
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7JT0
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with MAC5576
提交 2020-08-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
LW1 thiophene-2-carbaldehyde × 2
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 6;277 K;0.1 M sodium phosphate-monobasic, 0.1 M MES (pH 6), and 20% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.192
|
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7JT7
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with compound 4
提交 2020-08-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
TG3 ethyl (4R)-4-[[(2S)-4-methyl-2-[[(2S,3R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoyl]amino]pentanoyl]amino]-5-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pentanoate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 5;277 K;0.1 M potassium nitrate, 0.1 M sodium acetate, and 20% (w/v) PEG 1000
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.225
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7JU7
The crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease in complex with masitinib
提交 2020-08-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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G65 Masitinib × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
GOL GLYCEROL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;296 K;0.2 M NaCl,
0.1 M MES,
20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.192
|
|
7JUN
Joint neutron/X-ray structure of SARS-CoV-2 3CL Mpro at room temperature
提交 2020-08-20
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;287 K;18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.6, 3% DMSO
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分辨率未提供
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7JVZ
SARS CoV-2 MAIN PROTEASE 3CLpro, ROOM TEMPERATURE, DAMAGE FREE XFEL MONOCLINIC STRUCTURE
提交 2020-08-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;pH 6.5;293 K;12.5 % PEG 3350, 100 mmol/L bistris
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.217
|
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7JW8
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with compound 4 in space group P1
提交 2020-08-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
TG3 ethyl (4R)-4-[[(2S)-4-methyl-2-[[(2S,3R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoyl]amino]pentanoyl]amino]-5-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pentanoate × 2
BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 6.5;277 K;0.1 M BIS-TRIS and 20% (w/v) PEG MME 5000
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.227
|
|
7JW8
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with compound 4 in space group P1
提交 2020-08-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
TG3 ethyl (4R)-4-[[(2S)-4-methyl-2-[[(2S,3R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoyl]amino]pentanoyl]amino]-5-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pentanoate × 2
BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 6.5;277 K;0.1 M BIS-TRIS and 20% (w/v) PEG MME 5000
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.227
|
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7JYC
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (3CLpro/Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor Narlaprevir
提交 2020-08-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
NNA (1R,2S,5S)-3-[N-({1-[(tert-butylsulfonyl)methyl]cyclohexyl}carbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(1S)-1-[(1R)-2-(cyclopropylamino)-1-hydroxy-2-oxoethyl]pentyl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3% DMSO
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.212
|
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7JYY
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer in Complex with (m7GpppA)pUpUpApApA (Cap-0) and S-Adenosylmethionine (SAM).
提交 2020-09-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
NA SODIUM ION × 1
CL CHLORIDE ION × 1
FMT FORMIC ACID × 4
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;292 K;Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: ComPAS (G5), 0.1M Sodium citrate pH 5.6, 1.0M Ammonium dihydrogen phosphate;
Soak: 1.5 hours, 0.2mM [M7Gppp]rArUrUrArArA, 5mM SAM, 5mM Manganese chloride;
Cryo: 4M Sodium formate.
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.185
|
|
7JYY
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer in Complex with (m7GpppA)pUpUpApApA (Cap-0) and S-Adenosylmethionine (SAM).
提交 2020-09-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
|
链 C
6799–7096(298 aa)
链 D
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
NA SODIUM ION × 2
FMT FORMIC ACID × 3
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;292 K;Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: ComPAS (G5), 0.1M Sodium citrate pH 5.6, 1.0M Ammonium dihydrogen phosphate;
Soak: 1.5 hours, 0.2mM [M7Gppp]rArUrUrArArA, 5mM SAM, 5mM Manganese chloride;
Cryo: 4M Sodium formate.
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.185
|
|
7JZ0
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer in Complex with (m7GpppA2m)pUpUpApApA (Cap-1) and S-Adenosyl-L-homocysteine (SAH).
提交 2020-09-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
NA SODIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
FMT FORMIC ACID × 6
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;292 K;Protein: 4.7mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: Anions (E6), 0.1M Sodium acetate pH 4.6, 0.5M Sodium succinate;
Soak: 17 hours, 0.2mM [M7Gppp]rArUrUrArArA, 5mM SAM, 5mM Manganese chloride,
Cryo: 4M Sodium formate.
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.198
|
|
7JZ0
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer in Complex with (m7GpppA2m)pUpUpApApA (Cap-1) and S-Adenosyl-L-homocysteine (SAH).
提交 2020-09-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
|
链 C
6799–7096(298 aa)
链 D
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
NA SODIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 5
FMT FORMIC ACID × 2
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;292 K;Protein: 4.7mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: Anions (E6), 0.1M Sodium acetate pH 4.6, 0.5M Sodium succinate;
Soak: 17 hours, 0.2mM [M7Gppp]rArUrUrArArA, 5mM SAM, 5mM Manganese chloride,
Cryo: 4M Sodium formate.
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.198
|
|
7K0E
1.90 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with deuterated GC376
提交 2020-09-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
链 B
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;25% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Hepes, 0.2 M ammonium acetate
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.230
|
|
7K0F
1.65 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a deuterated GC376 alpha-ketoamide analog (compound 5)
提交 2020-09-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
VR4 N-{(2S,3R)-4-(benzylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucinamide × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;28% PEG 2000 MME, 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.225
|
|
7K0R
Nucleotide bound SARS-CoV-2 Nsp15
提交 2020-09-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
链 D
6453–6798(346 aa)
链 E
6453–6798(346 aa)
链 F
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 6
PO4 PHOSPHATE ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
7K1L
Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 in the Complex with Uridine-2',3'-Vanadate
提交 2020-09-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
UVC URIDINE-2',3'-VANADATE × 6
ACT ACETATE ION × 6
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
SO4 SULFATE ION × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;289 K;16 % w/v Polyethylene glycol 4,000, 100 mM TRIS; pH 8.5, 200 mM Sodium acetate
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.192
|
|
7K1O
Crystal Structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 in the Complex with Uridine-3',5'-Diphosphate
提交 2020-09-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
VQV 1-(3,5-di-O-phosphono-alpha-L-xylofuranosyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 6
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;289 K;8 % w/v Polyethylene glycol 4,000, 100 mM Sodium acetate; pH 4.6
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.242
|
|
7K3N
Crystal Structure of NSP1 from SARS-CoV-2
提交 2020-09-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–180(180 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;292.15 K;0.2 M sodium formate, 20% PEG3350
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.248
|
|
7K3T
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (3CLpro/Mpro) at 1.2 A Resolution and a Possible Capture of Zinc Binding Intermediate
提交 2020-09-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 22
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;20% PEG 3350, 0.1 M MES pH 6.5, 5% DMSO
|
分辨率 1.20 Å
R-free 0.167
|
|
7K40
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (3CLpro/Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor Boceprevir at 1.35 A Resolution
提交 2020-09-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
U5G boceprevir (bound form) × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.2;298 K;20% PEG4000, 0.1 M HEPES, pH 7.2, 0.1 M sodium chloride, 4% DMSO
|
分辨率 1.35 Å
R-free 0.192
|
|
7K5I
SARS-COV-2 nsp1 in complex with human 40S ribosome
提交 2020-09-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 1
1–180(180 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
7K6D
SARS-CoV-2 Main Protease Co-Crystal Structure with Telaprevir Determined from Crystals Grown with 40 nL Acoustically Ejected Mpro Droplets at 1.48 A Resolution (Cryo-protected)
提交 2020-09-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
SV6 (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3% DMSO, 1 mM telaprevir
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.215
|
|
7K6E
SARS-CoV-2 Main Protease Co-Crystal Structure with Telaprevir Determined from Crystals Grown with 40 nL Acoustically Ejected Mpro Droplets at 1.63 A Resolution (Direct Vitrification)
提交 2020-09-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
SV6 (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3% DMSO
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.245
|
|
7K7P
Structure of SARS-CoV-2 nonstuctural protein 1
提交 2020-09-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
10–127(118 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5, 30 % w/v Polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.216
|
|
7K9P
Room temperature structure of NSP15 Endoribonuclease from SARS CoV-2 solved using SFX.
提交 2020-09-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;pH 5.5;295 K;NendoU protein 75 mg/ml (20 mM HEPES pH 7.5, 150mM NaCl, 1mM TCEP) is added to the precipitant solution (100mM Na Citrate pH 5.5, 20% PEG 1000, 20% 2-Methyl-2,4-pentanediol (MPD)) in a 1:7 protein:precipitant ratio with agitation at 295K overnight.
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.209
|
|
7KAG
Crystal structure of the ubiquitin-like domain 1 (Ubl1) of Nsp3 from SARS-CoV-2
提交 2020-09-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
819–929(111 aa)
片段:ubiquitin-like domain
链 B
819–929(111 aa)
片段:ubiquitin-like domain
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M Hepes pH 7.5, 2% hexanediol
|
分辨率 3.21 Å
R-free 0.248
|
|
7KEG
Crystal structure from SARS-COV2 NendoU NSP15
提交 2020-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
PO4 PHOSPHATE ION × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.2;293 K;15% PEG 8000, 0.1 M Sodium/Potassium Phosphate pH 6.2.
Cryo-condition by adding 20% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.218
|
|
7KEH
Crystal structure from SARS-CoV-2 NendoU NSP15
提交 2020-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 6
SO4 SULFATE ION × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;20 % w/v Polyethylene glycol 3350, 100 mM BIS-TRIS propane, pH 6.5, 200 mM Sodium sulfate
|
分辨率 2.59 Å
R-free 0.220
|
|
7KF4
Crystal structure from SARS-CoV-2 NendoU NSP15
提交 2020-10-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
链 D
6453–6798(346 aa)
链 E
6453–6798(346 aa)
链 F
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5;293 K;0.1 M trisodium citrate pH 5, 14 % w/v PEG6000
|
分辨率 2.61 Å
R-free 0.246
|
|
7KFI
SARS-CoV-2 Main protease immature form - apo structure
提交 2020-10-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG4000
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.218
|
|
7KG3
Crystal structure of CoV-2 Nsp3 Macrodomain
提交 2020-10-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
MLI MALONATE ION × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
GOL GLYCEROL × 1
SO4 SULFATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;308 K;70% saturated ammonium sulfate, 0.4% BME, 200 mM Imidazole / Malate pH 7.4,
50 mM MES pH 6.0
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.177
|
|
7KHP
Acyl-enzyme intermediate structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with its C-terminal autoprocessing sequence.
提交 2020-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;0.1M MES pH 6, 16-22% PEG 3350, 5% MPD
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.248
|
|
7KOA
Room Temperature Structure of SARS-CoV-2 Nsp10/16 Methyltransferase in a Complex with Cap-0 and SAM Determined by Pink-Beam Serial Crystallography
提交 2020-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 2
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;pH 6.5;298 K;Protein: 4.0 mg/ml (NSP10/NSP16 1:1), 0.15 M NaCl, 0.01 M Tris-HCl, 2 mM SAM, 1 mM TCEP, 5% glycerol, pH 7.5.; Precipitation buffer: 0.1 M MES pH 6.5, 0.9 M NaF. Batch crystallization: 100 ul of protein mixed with 100 ul of precipitation buffer in 500 ul polypropylane tube. Crystals were soaked with m7GpppA (0.5 mM) for 10 minutes before data collection.
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.277
|
|
7KPH
SARS-CoV-2 Main Protease in mature form
提交 2020-11-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M Bis-Tris, 25% PEG 3350
cryo 30% PEG 400
|
分辨率 1.46 Å
R-free 0.181
|
|
7KQO
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain (P43 crystal form)
提交 2020-11-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.85 Å
R-free 0.138
|
|
7KQO
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain (P43 crystal form)
提交 2020-11-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.85 Å
R-free 0.138
|
|
7KQP
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose (P43 crystal form)
提交 2020-11-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.88 Å
R-free 0.123
|
|
7KQP
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose (P43 crystal form)
提交 2020-11-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.88 Å
R-free 0.123
|
|
7KQW
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain (C2 crystal form, methylated)
提交 2020-11-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain (UNP residues 1024-1192)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, pH 8.5, 100 mM sodium acetate, 28% PEG4000
|
分辨率 0.93 Å
R-free 0.147
|
|
7KR0
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain (C2 crystal form, 100 K)
提交 2020-11-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain (UNP residues 1024-1192)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, pH 8.5, 100 mM sodium acetate, 28% PEG4000
|
分辨率 0.77 Å
R-free 0.117
|
|
7KR1
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain (C2 crystal form, 310 K)
提交 2020-11-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain (UNP residues 1024-1192)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris, pH 8.5, 100 mM sodium acetate, 28% PEG4000
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.221
|
|
7KRI
FR6-bound SARS-CoV-2 Nsp9 RNA-replicase
提交 2020-11-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4141–4253(113 aa)
链 B
4141–4253(113 aa)
链 C
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 6
X0Y 1,3-dimethyl-1H-pyrrolo[3,4-d]pyrimidine-2,4(3H,6H)-dione × 12
MLI MALONATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 4;293 K;0.1M Sodium Citrate pH 4.0
2.2-2.4M Sodium Malonate
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.195
|
|
7KRN
Structure of SARS-CoV-2 backtracked complex bound to nsp13 helicase - nsp13(1)-BTC
提交 2020-11-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 5
PDB 声明:heptameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 5
MG MAGNESIUM ION × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
1N7 CHAPSO × 3
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
7KRO
Structure of SARS-CoV-2 backtracked complex complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-BTC
提交 2020-11-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:octameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
1N7 CHAPSO × 3
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
7KRP
Structure of SARS-CoV-2 backtracked complex complex bound to nsp13 helicase - BTC (local refinement)
提交 2020-11-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
1N7 CHAPSO × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
7KVL
SARS-CoV-2 Main protease immature form - FMAX Library E01 fragment
提交 2020-11-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 11
X4P 2-chloropyridine-4-carboxamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
SER SERINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG4000
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.227
|
|
7KVR
SARS-CoV-2 Main protease immature form - FMAX Library E09 fragment
提交 2020-11-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5
X4V N~4~,N~4~-dimethylpyridine-2,4-diamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG4000
|
分辨率 2.12 Å
R-free 0.225
|
|
7KX5
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with noncovalent inhibitor Jun8-76-3A
提交 2020-12-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
X7V N-([1,1'-biphenyl]-4-yl)-N-[(1R)-2-oxo-2-{[(1S)-1-phenylethyl]amino}-1-(pyridin-3-yl)ethyl]furan-2-carboxamide × 2
GOL GLYCEROL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;20% PEG 3000, 0.2 M NaF
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.279
|
|
7KXB
Crystal structure of SARS-CoV-2 Nsp3 Macrodomain complex with PARG329
提交 2020-12-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
XB1 N-{3-[(1,3-dimethyl-2,6-dioxo-2,3,6,9-tetrahydro-1H-purin-8-yl)sulfanyl]propyl}-N'-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]thiourea × 1
BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1
SO4 SULFATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;60% ASO4
0.4% BME
50 mM MES pH 6.0
200 mM Imidazole /Malate pH 8.6
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.188
|
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7KYU
The crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease with the formation of Cys145-1H-indole-5-carboxylate
提交 2020-12-08
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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XC4 1-[(1H-indole-5-carbonyl)oxy]-1H-benzotriazole × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;289 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1M MES, 20% (w/v) PEG6000
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.187
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7L0D
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML188
提交 2020-12-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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0EN N-[(1R)-2-(tert-butylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-(4-tert-butylphenyl)furan-2-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;23% (w/v) PEG 3350, Potassium Sodium Tartrate Tetrahydrate
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分辨率 2.39 Å
R-free 0.261
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7L10
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2 (2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 4
提交 2020-12-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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XEY 2-[3-(3,5-dichlorophenyl)-2-oxo[2H-[1,3'-bipyridine]]-5-yl]benzonitrile × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 6,000
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分辨率 1.63 Å
R-free 0.251
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7L11
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 5
提交 2020-12-14
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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XF1 2-[3-(3-chloro-5-propoxyphenyl)-2-oxo[2H-[1,3'-bipyridine]]-5-yl]benzonitrile × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 22% v/v Polyethylene glycol 400
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.232
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7L12
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 14
提交 2020-12-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XF4 (5S)-5-{3-[3-(benzyloxy)-5-chlorophenyl]-2-oxo[2H-[1,3'-bipyridine]]-5-yl}pyrimidine-2,4(3H,5H)-dione × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.10% w/v n-Octyl-b-D-glucoside, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 22% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.249
|
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7L13
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 21
提交 2020-12-14
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XF7 (5S)-5-(3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]phenyl}-2-oxo[2H-[1,3'-bipyridine]]-5-yl)pyrimidine-2,4(3H,5H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M BIS-TRIS propane pH 9.0, 20% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.17 Å
R-free 0.248
|
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7L14
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 26
提交 2020-12-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XFD 2-{3-[3-chloro-5-(cyclopropylmethoxy)phenyl]-2-oxo[2H-[1,3'-bipyridine]]-5-yl}benzonitrile × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M BIS-TRIS propane pH 9.0, 8% w/v Polyethylene glycol 20,000
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.204
|
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7L1F
SARS-CoV-2 RdRp in complex with 4 Remdesivir monophosphate
提交 2020-12-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:pentameric
|
链 A
4424–5321(898 aa)
链 C
4020–4133(114 aa)
链 D
3861–3923(63 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.89 Å
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7L5D
The crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease in complex with demethylated analog of masitinib
提交 2020-12-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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XNJ N-(4-methyl-3-{[4-(pyridin-3-yl)-1,3-thiazol-2-yl]amino}phenyl)-4-[(piperazin-1-yl)methyl]benzamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
GOL GLYCEROL × 8
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.2M NACL, 0.1M MES, 20% (W/V) PEG6000
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分辨率 1.58 Å
R-free 0.201
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7L6R
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer in Complex with (m7GpppA2m)pUpUpApApA (Cap-1), S-Adenosyl-L-homocysteine (SAH) and Manganese (Mn).
提交 2020-12-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
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链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
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MN MANGANESE (II) ION × 1
CL CHLORIDE ION × 2
SO4 SULFATE ION × 1
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
GLC alpha-D-glucopyranose × 4
ZN ZINC ION × 1
BDF beta-D-fructopyranose × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;292 K;Protein: 3.0 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol; Screen: Ammonium sulfate (E2), 0.1M Citric acid pH 5.0, 0.8M Ammonium sulfate; Soak: 6hours, 0.2mM m7GpppAUUAAA, 5mM SAM, 20mM Manganese chloride in screen solution; Cryo: 25% Sucrose in screen solution.
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分辨率 1.98 Å
R-free 0.166
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7L6T
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer in Complex with (m7GpppA2m)pUpUpApApA (Cap-1), S-Adenosyl-L-homocysteine (SAH) and two Magnesium (Mg) ions.
提交 2020-12-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
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MG MAGNESIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
FMT FORMIC ACID × 1
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
GLC alpha-D-glucopyranose × 2
ZN ZINC ION × 2
BDF beta-D-fructopyranose × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;Protein: 3.8 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;Screen: Classics II (B3), 0.5M Magnesium formate, 0.1M HEPES pH 7.5;Soak: 6hours, 0.2mM m7GpppAUUAAA, 5mM SAM, in screen solution;Cryo: 25% Sucrose in screen solution.
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分辨率 1.78 Å
R-free 0.162
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7L8I
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Rupintrivir (P21)
提交 2020-12-31
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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AG7 4-{2-(4-FLUORO-BENZYL)-6-METHYL-5-[(5-METHYL-ISOXAZOLE-3-CARBONYL)-AMINO]-4-OXO-HEPTANOYLAMINO}-5-(2-OXO-PYRROLIDIN-3-YL)-PENTANOIC ACID ETHYL ESTER × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;22% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris-Methane pH 5.5 and 0.2 M NaCl
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分辨率 2.10 Å
R-free 0.263
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7L8J
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Rupintrivir (P21212)
提交 2020-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
AG7 4-{2-(4-FLUORO-BENZYL)-6-METHYL-5-[(5-METHYL-ISOXAZOLE-3-CARBONYL)-AMINO]-4-OXO-HEPTANOYLAMINO}-5-(2-OXO-PYRROLIDIN-3-YL)-PENTANOIC ACID ETHYL ESTER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;19% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris-Methane pH 5.5 and 0.2 M NaCl
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分辨率 2.45 Å
R-free 0.281
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7LB7
Joint X-ray/neutron structure of SARS-CoV-2 main protease (3CL Mpro) in complex with Telaprevir
提交 2021-01-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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SV6 (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2
|
实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;287 K;18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.6
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分辨率未提供
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7LBN
X-ray crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease with Calpain I Inhibitor
提交 2021-01-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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SO4 SULFATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.2M sodium citrate, 15% PEG3350, 20mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 1.76 Å
R-free 0.185
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7LCO
Improved Feline Drugs as SARS-CoV-2 Mpro Inhibitors: Structure-Activity Studies & Micellar Solubilization for Enhanced Bioavailability
提交 2021-01-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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XTJ (3-fluorophenyl)methyl [(2S)-3-cyclopropyl-1-oxo-1-({(2S)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)propan-2-yl]carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.249
|
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7LCR
Improved Feline Drugs as SARS-CoV-2 Mpro Inhibitors: Structure-Activity Studies & Micellar Solubilization for Enhanced Bioavailability
提交 2021-01-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XTM N~2~-{[(3-fluorophenyl)methoxy]carbonyl}-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.277
|
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7LCS
Improved Feline Drugs as SARS-CoV-2 Mpro Inhibitors: Structure-Activity Studies & Micellar Solubilization for Enhanced Bioavailability
提交 2021-01-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XTP benzyl [(2S)-3-cyclopropyl-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;0.2 M Lithium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.255
|
|
7LCT
Improved Feline Drugs as SARS-CoV-2 Mpro Inhibitors: Structure-Activity Studies & Micellar Solubilization for Enhanced Bioavailability
提交 2021-01-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XU4 N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-N~2~-{[(1S)-1-phenylethoxy]carbonyl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;295 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.233
|
|
7LDL
Improved Feline Drugs as SARS-CoV-2 Mpro Inhibitors: Structure-Activity Studies & Micellar Solubilization for Enhanced Bioavailability
提交 2021-01-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XV4 N-[(2S)-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.261
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|
7LDX
SARS-CoV-2 Main protease immature form - F2X Entry Library E06 fragment
提交 2021-01-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
R9V (3-endo)-8-benzyl-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-ol × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG4000
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.273
|
|
7LFE
SARS-CoV-2 Main protease immature form - F2X Entry Library E03 fragment
提交 2021-01-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
XWS (2R,4R)-1-phenylhexahydropyrimidine-2,4-diol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG4000
|
分辨率 2.79 Å
R-free 0.253
|
|
7LFP
SARS-CoV-2 Main protease immature form - F2X Entry Library G05 fragment
提交 2021-01-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
XY4 N-phenyl-N'-propan-2-ylurea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG4000
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.261
|
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7LFZ
Human leukocyte antigen B*07:02 in complex with SARS-CoV2 epitope IPRRNVATL
提交 2021-01-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
5916–5924(9 aa)
片段:UNP residues 5916-5924
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;290 K;0.1 M sodium citrate, pH 8.0, 20% PEG4000, 20% isopropanol
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.224
|
|
7LG2
Human leukocyte antigen A*0201 in complex with SARS-CoV2 epitope ALWEIQQVV
提交 2021-01-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
4094–4102(9 aa)
片段:UNP residues 4094-4102
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 3
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;290 K;25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.2 M magnesium chloride
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.254
|
|
7LG3
Human leukocyte antigen A*0201 in complex with SARS-CoV2 epitope KLWAQCVQL
提交 2021-01-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
3886–3894(9 aa)
片段:UNP residues 3896-3894
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;290 K;20% PEG4000, 0.1 M sodium acetate, pH 5.6, 20% isopropanol
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.248
|
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7LG7
Crystal structure of CoV-2 Nsp3 Macrodomain complex with PARG345
提交 2021-01-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:Macrodomain
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未记录
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XYJ 3-[(1,3-dimethyl-2,6-dioxo-2,3,6,9-tetrahydro-1H-purin-8-yl)sulfanyl]-N-{[2-(morpholin-4-yl)ethyl]sulfonyl}propanamide × 1
SO4 SULFATE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;60% ASO4,0.4% BME,50 mM MES 6.0,200 mM Imidazole /Malate 8.2
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.206
|
|
7LGO
Crystal structure of the nucleic acid binding domain (NAB) of Nsp3 from SARS-CoV-2
提交 2021-01-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1907–2021(115 aa)
片段:nucleic acid binding domain (NAB)
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未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;2 M ammonium sulfate, 2% hexanediol. Cryoprotectant paratone.
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.318
|
|
7LGO
Crystal structure of the nucleic acid binding domain (NAB) of Nsp3 from SARS-CoV-2
提交 2021-01-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1907–2021(115 aa)
片段:nucleic acid binding domain (NAB)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;2 M ammonium sulfate, 2% hexanediol. Cryoprotectant paratone.
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.318
|
|
7LHQ
Solution structure of SARS-CoV-2 nonstructural protein 7 at pH 7.0
提交 2021-01-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3860–3942(83 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)150;压力 1
NMR样品组成
1.7 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] SARS-CoV-2 nsp7, 10 mM MOPS, 150 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 0.025 % sodium azide, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
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分辨率未提供
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7LKD
X-ray crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in space group P21.
提交 2021-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.2 M sodium sulphate, 10% PEG 3350, 20 mM HEPES pH 7.5, 15% glycerol
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.226
|
|
7LKE
X-ray crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in space group C2
提交 2021-02-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.2 M sodium sulphate, 10% PEG 3350, 20 mM HEPES pH 7.5, 15% glycerol
|
分辨率 2.69 Å
R-free 0.294
|
|
7LKR
1.65 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 2a
提交 2021-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
Y4D (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3s,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1
Y5S (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3s,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1
Y8Y (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3r,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1
Y91 (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3r,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris, 100 mM ammonium phosphate dibasic, 5% v/v 2-propanol
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.219
|
|
7LKS
1.70 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 2f
提交 2021-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
Y7G (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,2S,4S)-bicyclo[2.2.1]heptan-2-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
Y4P (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,2S,4S)-bicyclo[2.2.1]heptan-2-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% w/v PEG3350, 200 mM sodium formate
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.221
|
|
7LKT
1.50 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 2k
提交 2021-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
Y7M (1S,2S)-2-((S)-2-(((adamantan-1-ylmethoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
Y4V (1R,2S)-2-((S)-2-(((adamantan-1-ylmethoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
FLC CITRATE ANION × 1
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;15% w/v PEG6000, 100 mM sodium citrate
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.205
|
|
7LKU
1.65 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 3b (deuterated analog of inhibitor 2a)
提交 2021-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
Y4D (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3s,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1
Y5S (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3s,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1
Y8Y (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3r,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1
Y91 (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3r,5S)-bicyclo[3.3.1]nonan-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;20% w/v PEG4000, 100 mM Tris
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.211
|
|
7LKV
1.55 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 3c
提交 2021-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
Y4J (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3R,5S)-bicyclo[3.3.1]non-6-en-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
Y64 (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3R,5S)-bicyclo[3.3.1]non-6-en-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris, 100 mM ammonium phosphate dibasic, 5% v/v 2-propanol
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.208
|
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7LKW
1.65 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 3d (deuterated analog of inhibitor 3c)
提交 2021-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
Y8S (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3S,5S)-bicyclo[3.3.1]non-6-en-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
Y8V (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3S,5S)-bicyclo[3.3.1]non-6-en-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
CL CHLORIDE ION × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris, 100 mM ammonium phosphate dibasic, 5% v/v 2-propanol
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.227
|
|
7LKX
1.60 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 3e
提交 2021-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
Y51 (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1S,2S,4S)-bicyclo[2.2.1]hept-5-en-2-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
Y71 (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1S,2S,4S)-bicyclo[2.2.1]hept-5-en-2-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;15% w/v PEG3350, 100 mM succinic acid
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.212
|
|
7LMC
Structure of SARS CoV-2 main protease shows simultaneous processing of its N- and C-terminii
提交 2021-02-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
链 E
3258–3263(6 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;286 K;0.1 M MES, pH 6, 20 % PEG 6000, 0.2 M ammonium chloride
|
分辨率 2.98 Å
R-free 0.288
|
|
7LMC
Structure of SARS CoV-2 main protease shows simultaneous processing of its N- and C-terminii
提交 2021-02-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
链 F
3258–3263(6 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;286 K;0.1 M MES, pH 6, 20 % PEG 6000, 0.2 M ammonium chloride
|
分辨率 2.98 Å
R-free 0.288
|
|
7LMD
SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 2-(benzotriazol-1-yl)-N-[4-(1H-pyrazol-4-yl)phenyl]-N-(3-thienylmethyl)acetamide
提交 2021-02-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Y6A 2-(benzotriazol-1-yl)-~{N}-[4-(1~{H}-pyrazol-4-yl)phenyl]-~{N}-(thiophen-3-ylmethyl)ethanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;289.15 K;0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.234
|
|
7LME
SARS-CoV-2 3CLPro in complex with N-[4-[[2-(benzotriazol-1-yl)acetyl]-(3-thienylmethyl)amino]phenyl]cyclopropanecarboxamide
提交 2021-02-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Y6J ~{N}-[4-[2-(benzotriazol-1-yl)ethanoyl-(thiophen-3-ylmethyl)amino]phenyl]cyclopropanecarboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;289.15 K;0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.240
|
|
7LMF
SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 2-(benzotriazol-1-yl)-N-[4-(1H-imidazol-4-yl)phenyl]-N-(3-thienylmethyl)acetamide
提交 2021-02-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Y6G 2-(benzotriazol-1-yl)-~{N}-[4-(1~{H}-imidazol-4-yl)phenyl]-~{N}-(thiophen-3-ylmethyl)ethanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;289.15 K;0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.254
|
|
7LTJ
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (3CL Mpro) in complex with a non-covalent inhibitor Mcule-5948770040
提交 2021-02-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YD1 6-[4-(3,4-dichlorophenyl)piperazin-1-yl]carbonyl-1~{H}-pyrimidine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0 with 0.2 microL of 1 to 200 dilution microseeds and incubated at 14degC
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.192
|
|
7LTN
Crystal structure of Mpro in complex with inhibitor CDD-1713
提交 2021-02-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YCV 2-[4-(1~{H}-indazol-4-yl)-2-methanoyl-6-methoxy-phenoxy]-~{N},~{N}-dimethyl-ethanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;20% PEG3350, 0.2 M sodium acetate
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分辨率 1.79 Å
R-free 0.245
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7LW3
Structure of SARS-CoV-2 nsp16/nsp10 complex in presence of Cap-1 analog (m7GpppAmU) and SAH
提交 2021-02-27
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
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MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
YG4 [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(6-azanyl-7,8-dihydropurin-9-yl)-2-[[[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-7-methyl-6-oxidanylidene-1,8-dihydropurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxymethyl]-4-methoxy-oxolan-3-yl] [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{S})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;10% (v/v) propanol, 0.01 M MES/NaOH pH 6.0, 0.2 M calcium acetate
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分辨率 2.30 Å
R-free 0.251
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7LW4
Structure of SARS-CoV-2 nsp16/nsp10 complex in presence of S-adenosyl-L-homocysteine (SAH)
提交 2021-02-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
ACT ACETATE ION × 9
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;10% (v/v) propanol-2, 0.1 M MES/NaOH pH 6.0, 0.2 M Calccium acetate
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.240
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7LYH
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor UAWJ9-36-1
提交 2021-03-07
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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YHJ benzyl (1S,3aR,6aS)-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)hexahydrocyclopenta[c]pyrrole-2(1H)-carboxylate × 2
GOL GLYCEROL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;20% PEG 3350, 0.2 M NaF
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.222
|
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7LYI
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor UAWJ9-36-3
提交 2021-03-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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GOL GLYCEROL × 2
NA SODIUM ION × 2
YHI benzyl (1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-3-carboxylate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;20% PEG 3350, 0.2 M NaF
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.217
|
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7LZT
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 8b
提交 2021-03-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3568(305 aa)
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未记录
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SO4 SULFATE ION × 2
YMY (1R,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-(((((1s,4S)-4-propylcyclohexyl)methoxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
YN1 (1S,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-(((((1s,4S)-4-propylcyclohexyl)methoxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.5 M ammonium sulfate, 100 mM MES
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.197
|
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7LZU
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 12b
提交 2021-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
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YKM (1R,2S)-2-((S)-2-((((S)-1-(4,4-difluorocyclohexyl)ethoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
YKP (1S,2S)-2-((S)-2-((((S)-1-(4,4-difluorocyclohexyl)ethoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;20% w/v PEG5000 MME, 100 mM Bis-Tris
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.201
|
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7LZV
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 19b
提交 2021-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
YLM (1R,2S)-2-((S)-2-((((4-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
YLS (1S,2S)-2-((S)-2-((((4-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;20% w/v PEG4000, 100 mM Tris
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.212
|
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7LZW
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 20b (deuterated analog of 19b)
提交 2021-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
YLM (1R,2S)-2-((S)-2-((((4-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
YLS (1S,2S)-2-((S)-2-((((4-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;20% w/v PEG4000, 100 mM Tris
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.258
|
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7LZX
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 1c
提交 2021-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
YMG (1S,2S)-2-((S)-2-((((4,4-dimethylcyclohexyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
YMD (1R,2S)-2-((S)-2-((((4,4-dimethylcyclohexyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;20% w/v PEG2000 MME, 100 mM Tris, 200 mM Trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.214
|
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7LZY
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 3c
提交 2021-03-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
YMJ (1R,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-(((((1s,4S)-4-propylcyclohexyl)oxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
YMM (1S,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-(((((1s,4S)-4-propylcyclohexyl)oxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;17% w/v PEG10000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM ammonium acetate
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.223
|
|
7LZZ
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 5c
提交 2021-03-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
YMS (1R,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-(((((1r,4S)-4-phenylcyclohexyl)oxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
YMV (1S,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-(((((1r,4S)-4-phenylcyclohexyl)oxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;10% w/v PEG3350, 100 mM HEPES, 200 L-proline
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.229
|
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7M00
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 13c
提交 2021-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
YKA (1R,2S)-2-((S)-2-((((2-(4,4-difluorocyclohexyl)propan-2-yl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
YKD (1S,2S)-2-((S)-2-((((2-(4,4-difluorocyclohexyl)propan-2-yl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;20% w/v PEG5000 MME, 100 mM Bis-Tris
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.265
|
|
7M01
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 14c
提交 2021-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
YKV (1S,2S)-2-((S)-2-((((S)-1-(4,4-difluorocyclohexyl)-2-phenylethoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
YKS (1R,2S)-2-((S)-2-((((S)-1-(4,4-difluorocyclohexyl)-2-phenylethoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;20% w/v PEG5000 MME, 100 mM Bis-Tris
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.224
|
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7M02
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 17c
提交 2021-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
YL7 (1S,2S)-2-((S)-2-((((2-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
YKY (1R,2S)-2-((S)-2-((((2-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;30% w/v PEG2000 MME, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.241
|
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7M03
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 18c
提交 2021-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
YLD (1R,2S)-2-((S)-2-((((3-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
YLJ (1S,2S)-2-((S)-2-((((3-fluorobenzyl)oxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;30% w/v PEG2000 MME, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.249
|
|
7M04
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 21c
提交 2021-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
YLV (1R,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-((((perfluorophenyl)methoxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((R)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
YM1 (1S,2S)-1-hydroxy-2-((S)-4-methyl-2-((((perfluorophenyl)methoxy)carbonyl)amino)pentanamido)-3-((R)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;20% w/v PEG5000 MME, 100 mM Bis-Tris
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.223
|
|
7M2P
Structure of the SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 18
提交 2021-03-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0.
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.206
|
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7M8M
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 11
提交 2021-03-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YSG 5-[3-(3-chloro-5-propoxyphenyl)-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M Sodium malonate pH 8.0, 0.1 M Tris pH 8.0, 30% w/v Polyethylene glycol 1,000
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.234
|
|
7M8N
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 16
提交 2021-03-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YSP 5-(3-{3-chloro-5-[(2-methylphenyl)methoxy]phenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 25% v/v Polyethylene glycol 300
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.229
|
|
7M8O
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 19
提交 2021-03-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YSM 5-(3-{3-chloro-5-[(3-fluorophenyl)methoxy]phenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 22% v/v Polyethylene glycol 400
|
分辨率 2.44 Å
R-free 0.288
|
|
7M8P
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 23
提交 2021-03-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YSJ 5-(3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M Succinic acid pH 7.0, 0.1 M BICINE pH 8.5, 30% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.231
|
|
7M8X
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 6
提交 2021-03-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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YTJ 2-{3-[3-chloro-5-(2-methoxyethoxy)phenyl]-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl}benzonitrile × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 6,000
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.273
|
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7M8Y
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 15
提交 2021-03-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YTM 5-{3-[3-chloro-5-(2-phenylethoxy)phenyl]-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl}pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M Imidazole pH 7.0, 20% v/v Jeffamine ED-2001 pH 7.0
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.228
|
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7M8Z
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 29
提交 2021-03-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YTV 5-{3-[3-chloro-5-(3-hydroxy-3-methylbutoxy)phenyl]-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl}pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 6,000
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.240
|
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7M90
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 50
提交 2021-03-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YTS 5-(3-{3-chloro-5-[2-(3-oxopiperazin-1-yl)ethoxy]phenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 20% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.273
|
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7M91
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SARS-COV-2(2019-NCOV) MAIN PROTEASE IN COMPLEX WITH COMPOUND 25
提交 2021-03-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YU4 5-{3-[3-chloro-5-(3,3,3-trifluoropropoxy)phenyl]-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl}pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 6,000
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.233
|
|
7MAT
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor dFFR
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
H37 D-phenylalanyl-N-[(3S)-6-carbamimidamido-1-chloro-2-oxohexan-3-yl]-L-phenylalaninamide × 2
SO4 SULFATE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1.8M AmSO4 + 0.1M MES pH 6.5 + 3% Dioxane
|
分辨率 2.74 Å
R-free 0.260
|
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7MAU
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor dFFR-yne
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 3
YVP N-{3-[(prop-2-yn-1-yl)oxy]propanoyl}-D-phenylalanyl-N-[(3S)-6-carbamimidamido-2-oxohexan-3-yl]-L-phenylalaninamide × 2
DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1.7M AmSO4 + 0.1M MES pH 6.5 + 3% Dioxane
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.214
|
|
7MAV
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor dFFCit-yne
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YVY N-{3-[(prop-2-yn-1-yl)oxy]propanoyl}-D-phenylalanyl-N-[(3S)-6-(carbamoylamino)-2-oxohexan-3-yl]-L-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1.6M AmSO4 + 0.1M MES pH 6.5 + 3% Dioxane
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.244
|
|
7MAW
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM129
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YVA ethyl (4R)-4-({3-cyclopropyl-N-[(2E)-3-(4-ethynylphenyl)prop-2-enoyl]-L-alanyl}amino)-5-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentanoate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;19% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.229
|
|
7MAX
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM137
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YV7 D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-4-fluoro-L-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;14% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.243
|
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7MAZ
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM139
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YVD 4-fluoro-D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-4-fluoro-L-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;19% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.207
|
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7MB0
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM141
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YVG D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;20% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.199
|
|
7MB1
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM143
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YVJ 4-fluoro-D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;12% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.214
|
|
7MB2
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM144
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YVM 4-fluoro-N-{3-[(prop-2-yn-1-yl)oxy]propanoyl}-D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;20% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.210
|
|
7MB3
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM145
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YVV N-{3-[(prop-2-yn-1-yl)oxy]propanoyl}-D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.233
|
|
7MB3
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM145
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YVV N-{3-[(prop-2-yn-1-yl)oxy]propanoyl}-D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.233
|
|
7MB3
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor SM145
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
3264–3569(306 aa)
链 F
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YVV N-{3-[(prop-2-yn-1-yl)oxy]propanoyl}-D-phenylalanyl-N-{(2R)-5-ethoxy-5-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15% PEG 3350 + 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5 + 0.2M NaCl
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.233
|
|
7MB4
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp4/5 (P6-P1)
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
链 E
3258–3263(6 aa)
链 F
3258–3263(6 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;14% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.220
|
|
7MB4
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp4/5 (P6-P1)
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
链 G
3258–3263(6 aa)
链 H
3258–3263(6 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;14% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.220
|
|
7MB5
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp5/6 (P6-P1)
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
链 C
3564–3569(6 aa)
链 D
3564–3569(6 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;20% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.184
|
|
7MB6
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp6/7 (P6-P1)
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
链 C
3854–3859(6 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;10% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.272
|
|
7MB7
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp7/8 (P6-P1)
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3937–3942(6 aa)
|
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;18% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.224
|
|
7MB8
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp8/9 (P6-P1)
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
链 E
4135–4140(6 aa)
链 F
4135–4140(6 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.195
|
|
7MB8
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp8/9 (P6-P1)
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
链 G
4135–4140(6 aa)
链 H
4135–4140(6 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.195
|
|
7MB9
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) C145A in Complex with Cleavage Site Nsp10/11 (P6-P1)
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
链 C
4387–4392(6 aa)
链 D
4387–4392(6 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;13% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris-Methane:HCl pH 5.5, 0.2M NaCl
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.228
|
|
7MBG
SARS-CoV-2 Main protease in orthorhombic space group
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.222
|
|
7MBI
Structure of SARS-CoV2 3CL protease covalently bound to peptidomimetic inhibitor
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YWJ 4-methoxy-N-[(2S)-4-methyl-1-oxo-1-({(2S)-3-oxo-1-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]butan-2-yl}amino)pentan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;295 K;2 M Sodium citrate tribasic dihydrate 0.1 M Bis-Tris propane 8.5 20 % w/v PEG 3350
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.261
|
|
7MBI
Structure of SARS-CoV2 3CL protease covalently bound to peptidomimetic inhibitor
提交 2021-03-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
3264–3569(306 aa)
链 C
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YWJ 4-methoxy-N-[(2S)-4-methyl-1-oxo-1-({(2S)-3-oxo-1-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]butan-2-yl}amino)pentan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide × 2
FN7 2,4,6-trimethylpyridine-3-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;295 K;2 M Sodium citrate tribasic dihydrate 0.1 M Bis-Tris propane 8.5 20 % w/v PEG 3350
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.261
|
|
7MC5
Crystal structure of the SARS-CoV-2 ExoN-nsp10 complex
提交 2021-04-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
5928–6214(287 aa)
片段:UNP residues 5926-6214
链 M
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 23
TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;di-ammonium tartrate, pH 7.0, PEG 3350
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.197
|
|
7MC6
Crystal structure of the SARS-CoV-2 ExoN-nsp10 complex containing Mg2+ ion
提交 2021-04-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
5926–6214(289 aa)
片段:UNP residues 5926-6214
链 M
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9
CL CHLORIDE ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;MgCl2 , Tris-HCl pH 8.5, PEG 4000
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.219
|
|
7ME0
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 NSP15 NendoU at pH 6.0
提交 2021-04-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
链 D
6453–6798(346 aa)
链 E
6453–6798(346 aa)
链 F
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.48 Å
|
|
7MGR
SARS-CoV-2 main protease in complex with nsp8/9 substrate peptide
提交 2021-04-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277.15 K;5% PEG 4000; 0.1 M Tris, pH 8; 5% Dimethyl Sulfoxide (DMSO)
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.229
|
|
7MGS
SARS-CoV-2 main protease in complex with N-terminal autoprocessing substrate
提交 2021-04-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:C145A
|
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291.15 K;9% Polyethylene Glycol (PEG) 6000; 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.227
|
|
7MHF
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) at 100 K
提交 2021-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;22% PEG4000, 100 mM HEPES, pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.224
|
|
7MHG
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) at 240 K
提交 2021-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;22% PEG4000, 100 mM HEPES, pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.205
|
|
7MHH
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) at 277 K
提交 2021-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.253
|
|
7MHI
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) at 298 K
提交 2021-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.228
|
|
7MHJ
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) at 298 K and High Humidity
提交 2021-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.240
|
|
7MHK
Crystal Structure of Apo/Unliganded SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) at 310 K
提交 2021-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.247
|
|
7MHL
Ensemble refinement structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) at 100 K
提交 2021-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;22% PEG4000, 100 mM HEPES, pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.227
|
|
7MHM
Ensemble refinement structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) at 240 K
提交 2021-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;22% PEG4000, 100 mM HEPES, pH 7.0, 3-5% DMSO
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.197
|
|
7MHN
Ensemble refinement structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) at 277 K
提交 2021-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3--5% DMSO
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.215
|
|
7MHO
Ensemble refinement structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) at 298 K
提交 2021-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3--5% DMSO
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.208
|
|
7MHP
Ensemble refinement structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) at 298 K at high humidity
提交 2021-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3--5% DMSO
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.221
|
|
7MHQ
Ensemble refinement structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) at 310 K
提交 2021-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;22% PEG 4000, 100 mM HEPES pH 7.0, 3--5% DMSO
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.235
|
|
7MLF
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (3CLpro/Mpro) Covalently Bound to Compound C7
提交 2021-04-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
|
未记录
|
C7A N-(4-tert-butylphenyl)-2-chloro-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;30% PEG2000 MME, 0.1 M potassium thiocyanate
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.279
|
|
7MLG
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (3CLpro/Mpro) Covalently Bound to Compound C63
提交 2021-04-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
ZJ1 (2R)-2-[(4-tert-butylphenyl)(ethanesulfonyl)amino]-N-cyclohexyl-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;295 K;0.1 M BTP, pH 6.5, 20% PEG3350, 0.2 M potassium thiocyanate
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.268
|
|
7MNG
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (3CLpro/Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor VBY-825 (Partial Occupancy)
提交 2021-04-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
ZL7 (2R,3S)-N-cyclopropyl-3-{[(2R)-3-(cyclopropylmethanesulfonyl)-2-{[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-(4-fluorophenyl)ethyl]amino}propanoyl]amino}-2-hydroxypentanamide (non-preferred name) × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;PEG 4000, HEPES pH 7.0, 1 mM VBY-825 (in final drop), 4% DMSO (in final drop)
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.218
|
|
7MPB
SARS Coronavirus-2 Main Protease 3CL-pro binding Ascorbate
提交 2021-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
ASC ASCORBIC ACID × 2
ETF TRIFLUOROETHANOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;300 K;15 % PEG 3350, 5 mmol/L ascorbate, and trifluoroethanol (4 %)
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.244
|
|
7MRR
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (3CLpro/Mpro) in Complex with Covalent Inhibitor Leupeptin
提交 2021-05-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;PEG 4000, HEPES pH 7.0, 3% DMSO
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.245
|
|
7MSW
Full length SARS-CoV-2 Nsp2
提交 2021-05-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
181–818(638 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;Filtered and degassed before running FPLC
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 5 seconds before plunging into liquid ethane
|
分辨率 3.76 Å
|
|
7MSX
SARS-CoV-2 Nsp2
提交 2021-05-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
181–818(638 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;Filtered and degassed before running FPLC
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane
|
分辨率 3.15 Å
|
|
7N06
SARS-CoV-2 Nsp15 endoribonuclease post-cleavage state
提交 2021-05-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
6453–6797(345 aa)
链 B
6453–6797(345 aa)
链 C
6453–6797(345 aa)
链 D
6453–6797(345 aa)
链 E
6453–6797(345 aa)
链 F
6453–6797(345 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å
|
|
7N0B
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 (WT)-RNA complex
提交 2021-05-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 B
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 5
CA CALCIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
7N0C
Cryo-EM structure of the monomeric form of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 (E191A)-RNA complex
提交 2021-05-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 B
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
|
突变:E191A
|
ZN ZINC ION × 5
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
7N0D
Cryo-EM structure of the tetrameric form of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 (E191A)-RNA complex
提交 2021-05-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 8
PDB 声明:tetradecameric
|
链 A
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 B
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
链 C
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 D
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
链 E
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 F
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
链 G
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 H
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
|
突变:E191A
突变:E191A
突变:E191A
突变:E191A
|
ZN ZINC ION × 20
MG MAGNESIUM ION × 6
1N7 CHAPSO × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å
|
|
7N33
SARS-CoV-2 Nsp15 endoribonuclease pre-cleavage state
提交 2021-05-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
6453–6796(344 aa)
链 B
6453–6796(344 aa)
链 C
6453–6796(344 aa)
链 D
6453–6796(344 aa)
链 E
6453–6796(344 aa)
链 F
6453–6796(344 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å
|
|
7N3K
Oridonin-bound SARS-CoV-2 Nsp9
提交 2021-06-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
4141–4253(113 aa)
链 B
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
ODN (1beta,6beta,7beta,8alpha,9beta,10alpha,13alpha,14R,16beta)-1,6,7,14-tetrahydroxy-7,20-epoxykauran-15-one × 2
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;295 K;20% PEG 4000, 0.17M NH4SO4, 0.1M NaCitrate Phosphate pH 4.0
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.285
|
|
7N3K
Oridonin-bound SARS-CoV-2 Nsp9
提交 2021-06-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
4141–4253(113 aa)
链 D
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
ODN (1beta,6beta,7beta,8alpha,9beta,10alpha,13alpha,14R,16beta)-1,6,7,14-tetrahydroxy-7,20-epoxykauran-15-one × 2
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;295 K;20% PEG 4000, 0.17M NH4SO4, 0.1M NaCitrate Phosphate pH 4.0
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.285
|
|
7N3K
Oridonin-bound SARS-CoV-2 Nsp9
提交 2021-06-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
4141–4253(113 aa)
链 F
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
ODN (1beta,6beta,7beta,8alpha,9beta,10alpha,13alpha,14R,16beta)-1,6,7,14-tetrahydroxy-7,20-epoxykauran-15-one × 2
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;295 K;20% PEG 4000, 0.17M NH4SO4, 0.1M NaCitrate Phosphate pH 4.0
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.285
|
|
7N3K
Oridonin-bound SARS-CoV-2 Nsp9
提交 2021-06-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 G
4141–4253(113 aa)
链 H
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
ODN (1beta,6beta,7beta,8alpha,9beta,10alpha,13alpha,14R,16beta)-1,6,7,14-tetrahydroxy-7,20-epoxykauran-15-one × 2
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;295 K;20% PEG 4000, 0.17M NH4SO4, 0.1M NaCitrate Phosphate pH 4.0
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.285
|
|
7N44
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (2019-NCoV) main protease in complex with 5-(3-{3-chloro-5-[(5-methyl-1,3-thiazol-4-yl)methoxy]phenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione (compound 13)
提交 2021-06-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
06I 5-(3-{3-chloro-5-[(5-methyl-1,3-thiazol-4-yl)methoxy]phenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.15 M DL-malic acid, pH 7.0, 0.1 M imidazole, pH 7.0, 22% v/v PEG550 MME
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.218
|
|
7N5Z
SARS-CoV-2 Main protease C145S mutant
提交 2021-06-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 25% w/v PEG3350
|
分辨率 1.76 Å
R-free 0.197
|
|
7N6N
SARS-CoV-2 Main protease C145S mutant in complex with N and C-terminal residues
提交 2021-06-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
3259–3569(311 aa)
片段:UNP residues 3259-3569
链 B
3259–3569(311 aa)
片段:UNP residues 3259-3569
链 C
3259–3263(5 aa)
片段:N-terminal domain (UNP residues 3259-3263)
|
突变:C145S
突变:C145S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M phosphate/citrate, pH 5.5, 20% v/v PEG Smear High (BCS Screen A08)
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.255
|
|
7N7R
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z2472938267
提交 2021-06-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
S6V 1-[2-(2-oxidanylidenepyrrolidin-1-yl)ethyl]-3-phenyl-urea × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.240
|
|
7N7U
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with LIZA-7
提交 2021-06-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
0MI 1-[(2~{R},4~{S},5~{R})-5-[[(azanylidene-$l^{4}-azanylidene)amino]methyl]-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]-5-methyl-pyrimidine-2,4-dione × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;'0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.254
|
|
7N7W
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with CSC000178569
提交 2021-06-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
0OI N-(2-fluorophenyl)-N'-methylurea × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.42 Å
R-free 0.228
|
|
7N7Y
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z18197050
提交 2021-06-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
RZG methyl 4-sulfamoylbenzoate × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.241
|
|
7N83
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NendoU in complex with Z2443429438
提交 2021-06-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 6
WNM (3S)-1-(phenylsulfonyl)pyrrolidin-3-amine × 21
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M Na3 Citrate pH 5,14% w/v PEG6000
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.232
|
|
7N89
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease C145A mutant in complex with substrate Ac-SAVLQSGF-CONH2
提交 2021-06-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.218
|
|
7N8C
Joint X-ray/neutron structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with Mcule5948770040
提交 2021-06-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YD1 6-[4-(3,4-dichlorophenyl)piperazin-1-yl]carbonyl-1~{H}-pyrimidine-2,4-dione × 2
|
实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0 reservoir solution and 0.2 microL microseeds at 1:200 dilution
|
分辨率未提供
|
|
7NBR
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with the HCV NS3/4A inhibitor boceprevir
提交 2021-01-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 AAA
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
U5G boceprevir (bound form) × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293.15 K;0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 30% PEG 8000
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.269
|
|
7NBS
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with the HCV NS3/4A inhibitor telaprevir
提交 2021-01-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 AAA
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 2
SV6 (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293.15 K;0.2 M Sodium bromide, 0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5, 20% PEG3350
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.256
|
|
7NBT
Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 21
提交 2021-01-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 AAA
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
U7W 2-(benzotriazol-1-yl)-1-[(4~{S})-4-methyl-6,7-dihydro-4~{H}-thieno[3,2-c]pyridin-5-yl]ethanone × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.75;293 K;100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 12.5 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.230
|
|
7NBY
Crystal structure of SU3327 (halicin) covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2.
提交 2021-01-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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U88 5-nitro-1,3-thiazole × 8
NO3 NITRATE ION × 3
CL CHLORIDE ION × 2
SO4 SULFATE ION × 1
NA SODIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.09M NPS (Sodium nitrate, Sodium phosphate dibasic, Ammonium sulfate), 0.1M Hepes/Mops pH 7.5, 20% v/v PEG 500 MME, 10 % w/v PEG 20000
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.198
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7NEO
Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 15
提交 2021-02-04
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 AAA
3264–3569(306 aa)
链 BBB
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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U9H 2-cyclobutyl-7-(5-fluoropyridin-3-yl)-5,7-diazaspiro[3.4]octane-6,8-dione × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.75;293 K;100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 12 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
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分辨率 1.64 Å
R-free 0.239
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7NEV
Structure of the hemiacetal complex between the SARS-CoV-2 Main Protease and Leupeptin
提交 2021-02-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
IMD IMIDAZOLE × 2
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;Co-crystallization with the compounds was achieved by equilibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1 mMEDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB, pH 7.5, containing 25% w/w PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To obtain well-diffracting crystals in a reproducible way seeding was applied for crystal growth. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 - 3 days. Crystals were manually harvested and flash-frozen in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
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分辨率 1.70 Å
R-free 0.234
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7NF5
Crystal structure of MG-132 covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 in spacegroup C2.
提交 2021-02-05
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8
IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 6
CL CHLORIDE ION × 4
NA SODIUM ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.05M Magnesium chloride hexahydrate , 0.1M MES pH 6.5, 5 % w/vPEG 4000, 10% v/v 2-Propanol
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.225
|
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7NG3
Crystal structure of MG-132 covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 in spacegroup P1.
提交 2021-02-08
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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CL CHLORIDE ION × 1
ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.05M Magnesium chloride hexahydrate , 0.1M MES pH 6.5, 5 % w/vPEG 4000, 10% v/v 2-Propanol
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.215
|
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7NG6
Crystal structure of MG-132 covalently bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 in spacegroup P1 in absence of DTT.
提交 2021-02-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 2
ACT ACETATE ION × 1
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Magnesium acetate tetrahydrate, 0.1M MES pH 6.5, 10% w/vPEG 10,000
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.208
|
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7NIJ
SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in a novel conformational state.
提交 2021-02-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.1 M MMT (DL-malic acid, MES, and Tris base in molar ratio 1:2:2), pH 7.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.58 Å
R-free 0.203
|
|
7NIO
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase APO form
提交 2021-02-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
链 E
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;containing 20 % Ethylene Glycol, 10 % PEG 8K, 0.05 M MES pH 6.5, 0.05 M Imidazole pH 6.5, 10% v/v Ethylene glycols mix
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.286
|
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7NN0
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase in complex with AMP-PNP
提交 2021-02-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
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ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
ZN ZINC ION × 3
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20 % Ethylene Glycol, 10 % PEG 8K, 0.05 M MES pH 6.5, 0.05 M Imidazole pH 6.5, 10% v/v Alcohols mix
|
分辨率 3.04 Å
R-free 0.284
|
|
7NN0
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase in complex with AMP-PNP
提交 2021-02-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20 % Ethylene Glycol, 10 % PEG 8K, 0.05 M MES pH 6.5, 0.05 M Imidazole pH 6.5, 10% v/v Alcohols mix
|
分辨率 3.04 Å
R-free 0.284
|
|
7NN0
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase in complex with AMP-PNP
提交 2021-02-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20 % Ethylene Glycol, 10 % PEG 8K, 0.05 M MES pH 6.5, 0.05 M Imidazole pH 6.5, 10% v/v Alcohols mix
|
分辨率 3.04 Å
R-free 0.284
|
|
7NN0
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase in complex with AMP-PNP
提交 2021-02-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20 % Ethylene Glycol, 10 % PEG 8K, 0.05 M MES pH 6.5, 0.05 M Imidazole pH 6.5, 10% v/v Alcohols mix
|
分辨率 3.04 Å
R-free 0.284
|
|
7NNG
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2327226104
提交 2021-02-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
UJK 1-(2-methylphenyl)-1,2,3-triazole-4-carboxylic acid × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.38 Å
R-free 0.295
|
|
7NNG
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase in complex with Z2327226104
提交 2021-02-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
UJK 1-(2-methylphenyl)-1,2,3-triazole-4-carboxylic acid × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8K, 0.05 M HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium Nitrate, 0,03 M Sodium Phosphate, 0.03 M Ammonium Sulphate
|
分辨率 2.38 Å
R-free 0.295
|
|
7NT4
X-ray structure of SCoV2-PLpro in complex with small molecule inhibitor
提交 2021-03-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
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PRL PROFLAVIN × 3
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.05 M Sodium cacodylate pH 6.5
0.2 M Potassium chloride,
0.1 M Magnesium acetate
10 %(w/v) PEG 8000
|
分辨率 2.68 Å
R-free 0.264
|
|
7NT4
X-ray structure of SCoV2-PLpro in complex with small molecule inhibitor
提交 2021-03-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
PRL PROFLAVIN × 3
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.05 M Sodium cacodylate pH 6.5
0.2 M Potassium chloride,
0.1 M Magnesium acetate
10 %(w/v) PEG 8000
|
分辨率 2.68 Å
R-free 0.264
|
|
7NTS
Crystal structure of the SARS-CoV-2 Main Protease with oxidized C145
提交 2021-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10
GOL GLYCEROL × 2
FMT FORMIC ACID × 18
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2M NaFormate, 20% PEG 3350, 10% DMSO, 10% Glycerol
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.207
|
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7O46
Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 17
提交 2021-04-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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V18 2-cyclobutyl-7-isoquinolin-4-yl-5,7-diazaspiro[3.4]octane-6,8-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.75;293 K;100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 6.25 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG3K, RT, 2 h.
|
分辨率 2.23 Å
R-free 0.249
|
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7O7Y
Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution)
提交 2021-04-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 BK
4254–5324(1071 aa)
|
未记录
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SPD SPERMIDINE × 30
SPM SPERMINE × 3
MG MAGNESIUM ION × 420
UNX UNKNOWN LIGAND × 330
ZN ZINC ION × 8
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.20 Å
|
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7O7Z
Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot)
提交 2021-04-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 BK
4254–5324(1071 aa)
|
未记录
|
SPD SPERMIDINE × 30
SPM SPERMINE × 3
MG MAGNESIUM ION × 420
UNX UNKNOWN LIGAND × 329
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.40 Å
|
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7O80
Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site
提交 2021-04-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:88-meric
|
链 BK
4254–5324(1071 aa)
|
未记录
|
SPD SPERMIDINE × 1
MG MAGNESIUM ION × 355
UNX UNKNOWN LIGAND × 374
ZN ZINC ION × 8
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å
|
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7O81
Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot
提交 2021-04-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 80
PDB 声明:87-meric
|
链 BK
4254–5324(1071 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 349
UNX UNKNOWN LIGAND × 266
ZN ZINC ION × 8
SPD SPERMIDINE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.10 Å
|
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7ORR
Non-structural protein 10 (nsp10) from SARS CoV-2 in complex with fragment VT00022
提交 2021-06-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
4263–4384(122 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
PIM 4-PHENYL-1H-IMIDAZOLE × 2
GOL GLYCEROL × 2
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;Protein - 63 mg/mL in 50 mM Tris/HCl pH 8.0, 150 mM NaCl; precipitant (reservoir) - 0.1 M Bis-Tris/HCl pH 6.7, 2.4 M NaCl; 1:1, 1:2, 2:1 protein-to-precipitant ratios, 300 nL total drop volume. Soaking: reservoir solution, supplemented to 50 mM ligand, 5% (v/v) DMSO, 15% (v/v) glycerol; 2 h, 293K.
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.184
|
|
7ORU
Non-structural protein 10 (nsp10) from SARS CoV-2 in complex with fragment VT00221
提交 2021-06-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
4263–4384(122 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
2AQ QUINOLIN-2-AMINE × 1
GOL GLYCEROL × 1
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;Protein - 63 mg/mL in 50 mM Tris/HCl pH 8.0, 150 mM NaCl; precipitant (reservoir) - 0.1 M Bis-Tris/HCl pH 6.7, 2.4 M NaCl; 1:1, 1:2, 2:1 protein-to-precipitant ratios, 300 nL total drop volume. Soaking: reservoir solution, supplemented to 50 mM ligand, 5% (v/v) DMSO, 15% (v/v) glycerol; 2 h, 293K.
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.172
|
|
7ORV
Non-structural protein 10 (nsp10) from SARS CoV-2 in complex with fragment VT00239
提交 2021-06-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
4263–4384(122 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
X4V N~4~,N~4~-dimethylpyridine-2,4-diamine × 1
GOL GLYCEROL × 1
CL CHLORIDE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;Protein - 63 mg/mL in 50 mM Tris/HCl pH 8.0, 150 mM NaCl; precipitant (reservoir) - 0.1 M Bis-Tris/HCl pH 6.7, 2.4 M NaCl; 1:1, 1:2, 2:1 protein-to-precipitant ratios, 300 nL total drop volume. Soaking: reservoir solution, supplemented to 50 mM ligand, 5% (v/v) DMSO, 15% (v/v) glycerol; 2 h, 293K.
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分辨率 1.95 Å
R-free 0.202
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7ORW
Non-structural protein 10 (nsp10) from SARS CoV-2 in complex with fragment VT00265
提交 2021-06-06
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
4263–4384(122 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 2
7WA 1H-benzimidazol-4-amine × 1
GOL GLYCEROL × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;Protein - 63 mg/mL in 50 mM Tris/HCl pH 8.0, 150 mM NaCl; precipitant (reservoir) - 0.1 M Bis-Tris/HCl pH 6.7, 2.4 M NaCl; 1:1, 1:2, 2:1 protein-to-precipitant ratios, 300 nL total drop volume. Soaking: reservoir solution, supplemented to 50 mM ligand, 5% (v/v) DMSO, 15% (v/v) glycerol; 2 h, 293K.
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分辨率 1.95 Å
R-free 0.209
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7OYG
Dimeric form of SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase
提交 2021-06-24
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:decameric
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链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
4393–5324(932 aa)
链 E
3943–4140(198 aa)
链 F
3860–3942(83 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 4
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 5.50 Å
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7OZU
SARS-CoV-2 RdRp with Molnupiravir/ NHC in the template strand base-paired with A
提交 2021-06-28
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:pentameric
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链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3940(81 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.30 Å
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7OZV
SARS-CoV-2 RdRp with Molnupiravir/ NHC in the template strand base-paired with G
提交 2021-06-28
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:pentameric
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链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3940(81 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å
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7P2O
NMR solution structure of SUD-C domain of SARS-CoV-2
提交 2021-07-06
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1498–1561(64 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.2;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 1
NMR样品组成
0.7 mM [U-99% 15N] SUD-C domain of SARS-CoV-2, 50 mM no sodium phosphate, 50 mM no sodium chloride, 2 mM no DTT, 2 mM no EDTA, 0.25 mM no DSS, 10 % no D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.7 mM [U-99% 15N] SUD-C domain of SARS-CoV-2, 50 mM no sodium phosphate, 50 mM no sodium chloride, 2 mM no DTT, 2 mM no EDTA, 0.25 mM no DSS, 10 % no D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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7PFL
The SARS-CoV2 major protease (Mpro) apo structure to 1.8 A resolution
提交 2021-08-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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NA SODIUM ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% w/v PEG 6000
100 mM HEPES pH 7
200 mM ammonium-sulfate
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.219
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7PFM
A SARS-CoV2 major protease non-covalent ligand structure determined to 2.0 A resolution
提交 2021-08-11
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
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未记录
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7IL N-[(1R)-2-(tert-butylamino)-2-oxidanylidene-1-pyridin-3-yl-ethyl]-N-(4-tert-butylphenyl)-1H-imidazole-5-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% w/v PEG 3350
200 mM Potassiumthiocyanate
100 mM Bis-Tris Propane pH 8.5
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.220
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7PHZ
Crystal structure of X77 bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 in spacegroup P2(1)2(1)2(1).
提交 2021-08-19
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
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未记录
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X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5
CL CHLORIDE ION × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
NA SODIUM ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1 M Tris/BICINE pH 8.5; 0.12M D-Glucose; 0.12M D-Mannose; 0.12M D-Galactose; 0.12M L-Fucose; 0.12M D-Xylose; 0.12M N-Acetyl-D-Glucosamine; 20% v/v Ethylene glycol; 10 % w/v PEG 8000
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分辨率 1.66 Å
R-free 0.181
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7PXZ
Reduced form of SARS-CoV-2 Main Protease determined by XFEL radiation
提交 2021-10-08
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;pH 7.5;291 K;Vapor diffusion was set up with 2 uL MPro (35 mg/mL) and 2 uL 25% PEG1500, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO. Seedstock was prepared by 100 uL 25% PEG1500, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO and 4 uL seeds from plate, vortex 5 times for 5 seconds, add 12.5 uL of MPro (35 mg/mL) and incubate at 18 deg overnight. Final sample was prepared in batch mode by adding 900 uL 25% PEG1500, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO and 100 uL seedstock and 100 uL MPro (35 mg per mL). Add seedbeads (250 uL volume in 1.5 mL Eppi) and incubate overnight at 900 rpm and 18 deg.
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分辨率 1.75 Å
R-free 0.212
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7PZQ
Oxidized form of SARS-CoV-2 Main Protease determined by XFEL radiation
提交 2021-10-13
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;pH 7.5;291 K;Vapor diffusion was set up with 2 uL MPro (35 mg/mL) and 2 uL 25% PEG1500, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO. Seedstock was prepared by 100 uL 25% PEG1500, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO and 4 uL seeds from plate, vortex 5 times for 5 seconds, add 12.5 uL of MPro (35 mg/mL) and incubate at 18 deg overnight. Final sample was prepared in batch mode by adding 900 uL 25% PEG1500, 0.1 M MIB pH 7.5, 5% DMSO and 100 uL seedstock and 100 uL MPro (35 mg per mL). Add seedbeads (250 uL volume in 1.5 mL Eppi) and incubate overnight at 900 rpm and 18 deg. Crystals were soaked with crystallization buffer containing containing 4 mM Calpeptin.
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分辨率 2.25 Å
R-free 0.243
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7Q5E
Crystal structure of F2F-2020209-00X bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2.
提交 2021-11-03
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
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未记录
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90I benzyl (S)-2-(((S)-3,4-dioxo-1-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)-4-(phenethylamino)butan-2-yl)carbamoyl)pyrrolidine-1-carboxylate × 2
CL CHLORIDE ION × 2
NA SODIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.12M 1,6-Hexanediol 0.12M 1-Butanol
0.12M 1,2-Propanediol 0.12M 2-Propanol
0.12M 1,4-Butanediol 0.12M 1,3-Propanediol, 0.1M Tris/bicine pH 8.5, 20% v/v PEG 500 MME 10 % w/v PEG 20000
0.1 M Buffer System 3 8.5 30 % v/v Precipitant Mix 1
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分辨率 1.67 Å
R-free 0.194
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7Q5F
Crystal structure of F2F-2020216-01X bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2.
提交 2021-11-03
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
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未记录
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90X (S)-1-(2-(2,4-dichlorophenoxy)acetyl)-N-((S)-3,4-dioxo-1-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)-4-(phenethylamino)butan-2-yl)pyrrolidine-2-carboxamide × 2
SO4 SULFATE ION × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
CL CHLORIDE ION × 2
NO3 NITRATE ION × 2
NA SODIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.09M Sodium nitrate 0.09 Sodium phosphate dibasic 0.09M Ammonium sulfate, 0.1M Hepes/MOPS pH 7.5, 20% v/v PEG 500 MME 10 % w/v PEG 20000
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分辨率 1.72 Å
R-free 0.196
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7QBB
Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease (Nsp5) in complex with compound 18
提交 2021-11-18
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
V1B 7-isoquinolin-4-yl-2-phenyl-5,7-diazaspiro[3.4]octane-6,8-dione × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.75;293 K;100 nL protein (8.3 mg/mL, 50 mM Tris pH 8.0, 300 mM NaCl), 50 nL seeds, 450 nL reservoir (200 mM HEPES pH 7.75, 5% DMSO, 12.5% PEG4K).
Soaking: 200 mM HEPES pH 7.75, 6.25 mM compound, 5% DMSO, 10% PEG300, 20% PEG4K, RT, 2 h.
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.258
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7QG7
SARS-CoV-2 macrodomain Nsp3b bound to the remdesivir nucleoside GS-441524
提交 2021-12-07
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1025–1194(170 aa)
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未记录
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U08 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolane-2-carbonitrile × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;289.15 K;0.1 M Bis-Tris Propane/HCl pH 7.0, 2.2 M DL-Malic Acid pH 7.0, EG as cryoprotectant
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分辨率 1.72 Å
R-free 0.226
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7QG7
SARS-CoV-2 macrodomain Nsp3b bound to the remdesivir nucleoside GS-441524
提交 2021-12-07
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1194(170 aa)
|
未记录
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U08 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolane-2-carbonitrile × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;289.15 K;0.1 M Bis-Tris Propane/HCl pH 7.0, 2.2 M DL-Malic Acid pH 7.0, EG as cryoprotectant
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.226
|
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7QGI
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in the absence of NSP10
提交 2021-12-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
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分辨率 1.65 Å
R-free 0.221
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7QIF
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with 7MeGpppG.
提交 2021-12-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
5932–6452(521 aa)
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未记录
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GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277.15 K;1.26M sodium phosphate monobasic, 0.14M potassium phosphate dibasic
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分辨率 2.53 Å
R-free 0.246
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7QKA
Crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease in complex with covalently bound GC376
提交 2021-12-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6
UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;291 K;Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.207
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7QT5
Room temperature In-situ SARS-CoV-2 MPRO with bound Z31792168
提交 2022-01-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
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未记录
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GWS 2-cyclohexyl-~{N}-pyridin-3-yl-ethanamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;11% (v/v) PEG 4K, 5% (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5
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分辨率 2.26 Å
R-free 0.231
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7QT6
Room temperature In-situ SARS-CoV-2 MPRO with bound Z1367324110
提交 2022-01-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
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RZJ 1-methyl-3,4-dihydro-2~{H}-quinoline-7-sulfonamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;298 K;11% (v/v) PEG 4K, 5% (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 2.11 Å
R-free 0.222
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7QT7
Room temperature In-situ SARS-CoV-2 MPRO with bound Z4439011520
提交 2022-01-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
UHV N-(5-tert-butyl-1,2-oxazol-3-yl)-N-[(1R)-2-[(4-methoxy-2-methylphenyl)amino]-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;298 K;11% (v/v) PEG 4K, 5% (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.216
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7QT8
Room temperature In-situ SARS-CoV-2 MPRO with bound ABT-957
提交 2022-01-14
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
R8H (2~{R})-5-oxidanylidene-~{N}-[(2~{R},3~{S})-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-phenyl-4-(pyridin-2-ylmethylamino)butan-2-yl]-1-(phenylmethyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;11% (v/v) PEG 4K, 5% (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.236
|
|
7R1T
Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp10/nsp16 in complex with the SS148 inhibitor
提交 2022-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4263–4384(122 aa)
|
未记录
|
6NR (2~{S})-2-azanyl-4-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanyl-5-cyano-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanyl]butanoic acid × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;10% w/v PEG 20,000, 20% v/v PEG MME 550;
0.03 M sodium nitrate, 0.03 M disodium hydrogen phosphate, 0.03 M ammonium sulfate;
0.1 M MES/imidazole pH 6.5
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.247
|
|
7R1U
Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp10/nsp16 in complex with the WZ16 inhibitor
提交 2022-02-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4263–4384(122 aa)
|
未记录
|
4IK (2S,5S)-2,6-diamino-5-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl}hexanoic acid × 1
GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;8% w/v PEG 8,000;
0.2 M NaCl;
0.1 M MES pH 6
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.252
|
|
7R2V
Structure of nsp14 from SARS-CoV-2 in complex with SAH
提交 2022-02-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5926–6449(524 aa)
|
突变:D90A, E92A
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SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1
ZN ZINC ION × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;278 K;PEG/Imidazole
|
分辨率 2.53 Å
R-free 0.254
|
|
7R2V
Structure of nsp14 from SARS-CoV-2 in complex with SAH
提交 2022-02-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5926–6449(524 aa)
|
突变:D90A, E92A
|
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3
ZN ZINC ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;278 K;PEG/Imidazole
|
分辨率 2.53 Å
R-free 0.254
|
|
7R7H
Peptidomimetic nitrile warheads as SARS-CoV-2 3CL protease inhibitors
提交 2021-06-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
4IT N-[(2S)-1-({(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;0.2 M Ammonium chloride 0.1 M HEPES 7.0 20 % w/v PEG 6000
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.259
|
|
7RB0
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 NSP15 NendoU at pH 7.5
提交 2021-07-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
链 D
6453–6798(346 aa)
链 E
6453–6798(346 aa)
链 F
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Hepes pH 7.5, 200 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å
|
|
7RB2
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 NSP15 NendoU in BIS-Tris pH 6.0
提交 2021-07-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
链 D
6453–6798(346 aa)
链 E
6453–6798(346 aa)
链 F
6453–6798(346 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6;100 mM BIS-Tris 6.0, 200 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.27 Å
|
|
7RBZ
X-ray Structure of SARS-CoV-2 main protease covalently modified by compound GRL-017-20
提交 2021-07-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
4IJ 5-chloropyridin-3-yl 2,3-dihydro-1H-indole-4-carboxylate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;278 K;2.67 mM DTT, 0.33% MPD, 16.7 mM MES pH 6.0, 26.7 mM KCl, 5% PEG-10,000, 16.7 mM HEPES pH 7.5, 0.67% DMSO and 200 uM inhibitor
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.189
|
|
7RC0
X-ray Structure of SARS-CoV-2 main protease covalently modified by compound GRL-091-20
提交 2021-07-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
4I9 5-chloro-4-methylpyridin-3-yl 1H-indole-4-carboxylate × 2
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;278 K;2.67 mM DTT, 0.33% MPD, 16.7 mM MES pH 6.0, 26.7 mM KCl, 5% PEG-10,000, 16.7 mM HEPES pH 7.5, 0.67% DMSO and 200 uM inhibitor
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.174
|
|
7RDX
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-RTC - open class
提交 2021-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:octameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
1N7 CHAPSO × 3
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
7RDY
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-RTC - engaged class
提交 2021-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:octameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
链 F
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
1N7 CHAPSO × 3
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
7RDZ
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-RTC - apo class
提交 2021-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:octameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
7RE0
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-RTC - swiveled class
提交 2021-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:octameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
7RE1
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-RTC (composite)
提交 2021-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:octameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
链 F
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3
1N7 CHAPSO × 3
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.91 Å
|
|
7RE2
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(1)-RTC
提交 2021-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 5
PDB 声明:heptameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 5
MG MAGNESIUM ION × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
1N7 CHAPSO × 3
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å
|
|
7RE3
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp13 helicase - nsp13(2)-RTC dimer
提交 2021-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 12
PDB 声明:hexadecameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 G
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 H
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 I
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 J
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 K
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 L
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 16
MG MAGNESIUM ION × 6
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 4
1N7 CHAPSO × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.33 Å
|
|
7RFR
Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with a covalent inhibitor
提交 2021-07-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
4W8 (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-3-(4-methoxy-1H-indole-2-carbonyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;294 K;0.1 M MES, pH 6.0, 20.0% w/v PEG6000, 0.2 M sodium chloride
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.228
|
|
7RFS
Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with a covalent inhibitor
提交 2021-07-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;25.0% w/v PEG1500, 0.1 M MIB, pH 6.0
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.260
|
|
7RFU
Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with a covalent inhibitor
提交 2021-07-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
4YG (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-3-[N-(methanesulfonyl)-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;25.0% w/v PEG1500, 0.1 M MMT, pH 8.0
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.276
|
|
7RFW
Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with a covalent inhibitor
提交 2021-07-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;25.0% w/v PEG1500, 0.1 M MMT, pH 6.0
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.227
|
|
7RLS
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-68
提交 2021-07-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
5YN 6-[4-(3,4,5-trichlorophenyl)piperazine-1-carbonyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.201
|
|
7RM2
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with Mcule-CSR-494190-S1
提交 2021-07-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
5YJ 6-[4-(3,5-dichloro-4-methylphenyl)piperazine-1-carbonyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.190
|
|
7RMB
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-78
提交 2021-07-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
5Z7 6-[4-(4-bromo-3-chlorophenyl)piperazine-1-carbonyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.194
|
|
7RME
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-52
提交 2021-07-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
5Z3 6-{4-[4-chloro-3-(trifluoromethyl)phenyl]piperazine-1-carbonyl}pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.203
|
|
7RMT
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-70
提交 2021-07-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
5ZN 2-chloro-4-[4-(2,6-dioxo-1,2,5,6-tetrahydropyrimidine-4-carbonyl)piperazin-1-yl]benzaldehyde × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.196
|
|
7RMZ
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-63
提交 2021-07-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
5ZJ 6-{4-[3-chloro-4-(trifluoromethyl)phenyl]piperazine-1-carbonyl}pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.189
|
|
7RN0
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor Jun9-57-3R
提交 2021-07-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 4
5ZB (2R)-2-{acetyl[4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl]amino}-N-[(1S)-1-phenylethyl]-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;25 % 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M HEPES 7.5
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.241
|
|
7RN1
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor Jun9-62-2R
提交 2021-07-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 4
SO4 SULFATE ION × 2
5ZF N-([1,1'-biphenyl]-4-yl)-2-chloro-N-[(1R)-2-oxo-2-{[(1S)-1-phenylethyl]amino}-1-(pyridin-3-yl)ethyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;25% PEG 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M HEPES 7.5
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.223
|
|
7RN4
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-69
提交 2021-07-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
H69 6-[4-(3,4-dichlorophenyl)piperidine-1-carbonyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.190
|
|
7RNH
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-45
提交 2021-07-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
5ZW 6-[4-(4-chlorophenyl)piperazine-1-carbonyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.201
|
|
7RNK
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with HL-3-71
提交 2021-07-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
5ZT 6-{4-[3-chloro-4-(hydroxymethyl)phenyl]piperazine-1-carbonyl}pyrimidine-2,4(3H,5H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.206
|
|
7RNW
SARS-CoV-2 Main Protease in complex with a cyclic peptide inhibitor
提交 2021-07-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;22% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris pH 6.0, 0.3M NaCl
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.231
|
|
7RNW
SARS-CoV-2 Main Protease in complex with a cyclic peptide inhibitor
提交 2021-07-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;22% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris pH 6.0, 0.3M NaCl
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.231
|
|
7RQG
Crystal structure of the Nsp3 Y3 domain from SARS-CoV-2
提交 2021-08-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2662–2763(102 aa)
片段:Y3 domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;1.1 sodium citrate, M, 0.1 M Hepes pH 7.5; Cryoprotectant paratone
|
分辨率 2.17 Å
R-free 0.242
|
|
7RQG
Crystal structure of the Nsp3 Y3 domain from SARS-CoV-2
提交 2021-08-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2662–2763(102 aa)
片段:Y3 domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;1.1 sodium citrate, M, 0.1 M Hepes pH 7.5; Cryoprotectant paratone
|
分辨率 2.17 Å
R-free 0.242
|
|
7RQG
Crystal structure of the Nsp3 Y3 domain from SARS-CoV-2
提交 2021-08-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
2662–2763(102 aa)
片段:Y3 domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;1.1 sodium citrate, M, 0.1 M Hepes pH 7.5; Cryoprotectant paratone
|
分辨率 2.17 Å
R-free 0.242
|
|
7RQG
Crystal structure of the Nsp3 Y3 domain from SARS-CoV-2
提交 2021-08-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
2662–2763(102 aa)
片段:Y3 domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;1.1 sodium citrate, M, 0.1 M Hepes pH 7.5; Cryoprotectant paratone
|
分辨率 2.17 Å
R-free 0.242
|
|
7RVM
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI11
提交 2021-08-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7V2 N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.238
|
|
7RVN
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI12
提交 2021-08-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
7VB N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methylidene-L-norvalinamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.212
|
|
7RVO
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI13
提交 2021-08-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7VI N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-3-cyclopropyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.275
|
|
7RVP
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI14
提交 2021-08-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7VQ N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-3-furan-2-yl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.274
|
|
7RVQ
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI16
提交 2021-08-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
7VW N-[(benzyloxy)carbonyl]-O-tert-butyl-L-threonyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.322
|
|
7RVR
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI18
提交 2021-08-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7W5 N-[(benzyloxy)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.46 Å
R-free 0.323
|
|
7RVS
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI19
提交 2021-08-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
81L N-[(benzyloxy)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-3-cyclopropyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.227
|
|
7RVT
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI20
提交 2021-08-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7XK N~2~-[(2S)-2-{[(benzyloxy)carbonyl]amino}-2-cyclopropylacetyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.308
|
|
7RVU
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI21
提交 2021-08-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7XT N-[(benzyloxy)carbonyl]-3-methyl-L-isovalyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.329
|
|
7RVV
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI22
提交 2021-08-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7Y2 N-[(benzyloxy)carbonyl]-2-methyl-L-alanyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.428
|
|
7RVW
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI23
提交 2021-08-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7YB benzyl (1-{[(2S)-3-cyclohexyl-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]carbamoyl}cyclopropyl)carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.217
|
|
7RVX
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI24
提交 2021-08-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
7YI benzyl [(1S)-1-cyclopropyl-2-{[(2S)-3-cyclopropyl-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]amino}-2-oxoethyl]carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.265
|
|
7RVY
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI25
提交 2021-08-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7YQ O-tert-butyl-N-{[(3-chlorophenyl)methoxy]carbonyl}-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.268
|
|
7RVZ
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI26
提交 2021-08-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7YW O-tert-butyl-N-{[(3-chlorophenyl)methoxy]carbonyl}-L-threonyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.220
|
|
7RW0
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI27
提交 2021-08-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7YZ N-{[(3-chlorophenyl)methoxy]carbonyl}-L-valyl-3-cyclohexyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.253
|
|
7RW1
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI28
提交 2021-08-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
800 N-(1H-indole-2-carbonyl)-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.316
|
|
7S3K
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound Z1530718726
提交 2021-09-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Z26 2-(5-chloro-2-methoxyphenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;18-20% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.204
|
|
7S3S
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound Z1530724813
提交 2021-09-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
860 2-(3-chlorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;18-20% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.222
|
|
7S4B
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound Z1530724963
提交 2021-09-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
87H (2R)-2-(3-fluorophenyl)-N-(isoquinolin-4-yl)propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;18-20% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.210
|
|
7S6W
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI29
提交 2021-09-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
8G9 (1R,2S,5S)-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.29 Å
R-free 0.242
|
|
7S6X
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI30
提交 2021-09-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
I70 (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.207
|
|
7S6Y
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI32
提交 2021-09-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
8GW (1R,2S,5S)-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(2S,3R)-4-[(cyclopropylmethyl)amino]-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.258
|
|
7S6Z
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI33
提交 2021-09-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
I71 (1R,2S,5S)-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(2S,3R)-4-(ethylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.222
|
|
7S70
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI34
提交 2021-09-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
8H3 (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-(butylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.322
|
|
7S71
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI35
提交 2021-09-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
8H9 (1R,2S,5S)-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(2S,3R)-4-(hexylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.219
|
|
7S72
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI36
提交 2021-09-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
8I0 (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-(benzylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.296
|
|
7S73
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI37
提交 2021-09-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
I69 (6S)-5-{(2S)-2-[(tert-butylcarbamoyl)amino]-3,3-dimethylbutanoyl}-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-5-azaspiro[2.4]heptane-6-carboxamide (non-preferred name) × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.238
|
|
7S74
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI38
提交 2021-09-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
I68 N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.272
|
|
7S75
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI42
提交 2021-09-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
8I7 (1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(3-methylbutanoyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.309
|
|
7S82
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Main protease C145S in complex with N-terminal peptide
提交 2021-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3259–3569(311 aa)
片段:UNP residues 3259-3569
链 B
3259–3569(311 aa)
片段:UNP residues 3259-3569
链 C
3259–3569(311 aa)
片段:UNP residues 3259-3569
链 D
3259–3569(311 aa)
片段:UNP residues 3259-3569
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.8;20 mM Tris pH 7.8, 150 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
7SD9
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI48
提交 2021-09-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
8T6 N-[(2S)-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4,4-dimethyl-1-oxopentan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.249
|
|
7SDA
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI49
提交 2021-09-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
8UI N-[(2S)-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4,4-dimethyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.244
|
|
7SDC
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MI-09
提交 2021-09-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
I80 (1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-{[4-(trifluoromethoxy)phenoxy]acetyl}-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.300
|
|
7SET
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML1000
提交 2021-10-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
I70 (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;Sitting drops consisted of 0.25 uL A:0.25 uL B:
A) 9 mg/mL Mpro + 0.5 mM ML1000 in 50 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 5 % DMSO
B) 0.1 M MES pH 6.5 + 15 % w/v PEG 6000 + 5% v/v 2-methyl-2,4-petanediol
cryoprotectant was 25% glycerol
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分辨率 1.70 Å
R-free 0.206
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7SF1
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML1001
提交 2021-10-02
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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8ZI (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-[N-(3,3-dimethylbutanoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;Sitting drops consisted of 0.16 uL A:0.16 uL B:
A) 5 mg/mL Mpro + 1.5 mM ML1001 in in 20 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 5 % DMSO
B) 0.1 M HEPES pH 7.5 + 0.2 M L-Proline + 24 % w/v PEG 1500
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.208
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7SF3
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML1006m
提交 2021-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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90H (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-3-hydroxy-4-(methylamino)-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;Sitting drops consisted of 0.18 uL A:0.18 uL B:
A) 7 mg/mL Mpro + 1 mM ML1006m in in 20 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 3 % DMSO
B) 0.1 M HEPES pH 7.5 + 10% w/v PEG8000
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.195
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7SFB
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML101
提交 2021-10-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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90U benzyl (1R,2S,5S)-2-({(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}carbamoyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-3-carboxylate × 2
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;Sitting drops consisted of 0.19 uL A:0.19 uL B:
A) 5.5 mg/mL Mpro + 0.5 mM ML101 in in 20 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 5 % DMSO
B) 0.1 M di-sodium malonate + 12 % w/v PEG 3350
The cryoprotectant was 30% v/v PEG200
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.232
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7SFH
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML102
提交 2021-10-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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91I (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-(3-phenylpropanoyl)-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
CA CALCIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;Sitting drops consisted of 0.19 uL A:0.19 uL B:
A) 5.5 mg/mL Mpro + 0.5 mM ML102 in in 20 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 5 % DMSO
B) 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 +16 % w/v PEG 10000
Cryoprotectant was 30% v/v glycerol
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.193
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7SFI
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML104
提交 2021-10-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
91Z (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[N-(2,4,6-trifluorophenyl)glycyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
CA CALCIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;Sitting drops consisted of 0.19 uL A:0.19 uL B:
A) 5.5 mg/mL Mpro + 0.5 mM ML104 in in 20 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 5 % DMSO
B) 0.1 M MES pH 6 + 14 % w/v PEG 4000
Cryoprotectant was 30% v/v glycerol.
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.239
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7SGH
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML124N
提交 2021-10-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
99W (S)-N-((S)-1-imino-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propan-2-yl)-4-methyl-2-(2-((2,4,6-trifluorophenyl)amino)acetamido)pentanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;Sitting drops consisted of 0.16 uL A:0.16 uL B:
A) 7 mg/mL Mpro + 1 mM ML124N in 20 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 3 % DMSO
B) Morpheus HT-96 well D1: 0.1 M MES pH 6.5 + 0.12 M Alcohols + 30 % v/v Precipitant Mix 1
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.232
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7SGH
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML124N
提交 2021-10-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
99W (S)-N-((S)-1-imino-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propan-2-yl)-4-methyl-2-(2-((2,4,6-trifluorophenyl)amino)acetamido)pentanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;Sitting drops consisted of 0.16 uL A:0.16 uL B:
A) 7 mg/mL Mpro + 1 mM ML124N in 20 mM Tris pH 7.3 + 2 mM DTT + 3 % DMSO
B) Morpheus HT-96 well D1: 0.1 M MES pH 6.5 + 0.12 M Alcohols + 30 % v/v Precipitant Mix 1
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.232
|
|
7SH7
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI87
提交 2021-10-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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9GI benzyl [(2S,3R)-3-tert-butoxy-1-{[(2S)-3-cyclohexyl-1-oxo-1-(2-{[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]methyl}-2-propanoylhydrazinyl)propan-2-yl]amino}-1-oxobutan-2-yl]carbamate (non-preferred name) × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.297
|
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7SH8
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI88
提交 2021-10-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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GJ3 benzyl [(2S,3R)-1-{[(2S)-1-(2-acetyl-2-{[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]methyl}hydrazinyl)-3-cyclohexyl-1-oxopropan-2-yl]amino}-3-tert-butoxy-1-oxobutan-2-yl]carbamate (non-preferred name) × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.272
|
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7SH9
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI86
提交 2021-10-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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9HA benzyl [(2S,3R)-1-({(2S)-1-[2-acetyl-2-(3-amino-3-oxopropyl)hydrazinyl]-3-cyclohexyl-1-oxopropan-2-yl}amino)-3-tert-butoxy-1-oxobutan-2-yl]carbamate (non-preferred name) × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.263
|
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7SHB
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI79
提交 2021-10-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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I64 benzyl [(2S)-1-({(2S)-1-[2-(3-amino-3-oxopropyl)-2-propanoylhydrazinyl]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl}amino)-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate (non-preferred name) × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.309
|
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7SI9
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with PF-07321332
提交 2021-10-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, compound soaked into apo-protease crystals
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.207
|
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7T2T
SARS-CoV2 Mpro native form
提交 2021-12-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;30% PEG 3350, 0.1 M Bis-tris propane pH 7.0
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.200
|
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7T2U
SARS-CoV2 3C-Like protease complexed with Nemo peptide
提交 2021-12-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
3263–3569(307 aa)
链 B
3263–3569(307 aa)
|
突变:C145S
突变:C145S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295 K;20% PEG3350, 0.1M Bis-Tris (pH 6.5)
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.300
|
|
7T2U
SARS-CoV2 3C-Like protease complexed with Nemo peptide
提交 2021-12-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
3263–3569(307 aa)
链 D
3263–3569(307 aa)
|
突变:C145S
突变:C145S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295 K;20% PEG3350, 0.1M Bis-Tris (pH 6.5)
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.300
|
|
7T2V
SARS CoV2 Mpro C145S mutant
提交 2021-12-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3263–3569(307 aa)
链 B
3263–3569(307 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295 K;0.1MMESpH6.5,20%v/vPEGSmear High
|
分辨率 2.47 Å
R-free 0.237
|
|
7T2V
SARS CoV2 Mpro C145S mutant
提交 2021-12-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3263–3569(307 aa)
链 D
3263–3569(307 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295 K;0.1MMESpH6.5,20%v/vPEGSmear High
|
分辨率 2.47 Å
R-free 0.237
|
|
7T42
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 2c
提交 2021-12-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
FIK (1S,2S)-2-[(N-{[(2-acetyl-2-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)oxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
FIW (1R,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[2-(2-methylpropanoyl)-2-azaspiro[3.3]heptan-6-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;25% (w/v) PEG 1500, 100 mM PCTP
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.212
|
|
7T43
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 3c
提交 2021-12-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
FN2 (1S,2S)-1-hydroxy-2-[(N-{[(2-methyl-2-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)oxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
FP8 (1R,2S)-1-hydroxy-2-[(N-{[(2-methyl-2-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)oxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4;293 K;25% (w/v) PEG 1500, 100 mM PCTP
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.213
|
|
7T44
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 4c
提交 2021-12-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
ESS (1R,2S)-2-[(N-{[(2-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)oxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
ET6 (1S,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[2-(methanesulfonyl)-2-azaspiro[3.3]heptan-6-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;17% (w/v) PEG 10000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM ammonium acetate
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.226
|
|
7T45
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 7c
提交 2021-12-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
EW9 (1S,2S)-2-{[N-({[7-(tert-butoxycarbonyl)-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% (w/v) PEG 3350, 200 mM sodium fluoride
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.221
|
|
7T46
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 8c
提交 2021-12-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
链 B
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
F8C (1S,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[7-(2-methylpropanoyl)-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
F5L (1R,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[7-(2-methylpropanoyl)-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;25 % (w/v) PEG 3350, 100 mM Bis-Tris, 200 mM NaCl
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.193
|
|
7T48
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 9c
提交 2021-12-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 2
FHS (1S,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-2-{[N-({[7-(phenylacetyl)-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}propane-1-sulfonic acid × 2
FEY (1R,2S)-2-{[N-({[(2r,4R)-7-acetyl-7-azaspiro[3.5]non-5-en-2-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM Hepes, 200 mM lithium sulfate
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.242
|
|
7T49
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 10c
提交 2021-12-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
链 B
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
FV5 (1R,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[7-(methanesulfonyl)-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
FVE (1S,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[7-(methanesulfonyl)-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl]oxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;25 % (w/v) PEG 1500, 100 MMT
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.241
|
|
7T4A
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 11c
提交 2021-12-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
EQS (1S,2S)-2-[(N-{[(7-cyano-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl)oxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
EO6 (1R,2S)-2-[(N-{[(7-cyano-7-azaspiro[3.5]nonan-2-yl)oxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PO4 PHOSPHATE ION × 1
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20 % (w/v) PEG 3350, 20 mM sodium/postassium phosphate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.225
|
|
7T4B
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 14c
提交 2021-12-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
链 B
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
FWI (1R,2S)-2-{[N-({[1-(tert-butoxycarbonyl)azetidin-3-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3R)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-pyrrol-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
FZI (1S,2S)-2-{[N-({[1-(tert-butoxycarbonyl)azetidin-3-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3R)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-pyrrol-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;25% (w/v) PEG 3350, 100 mM Bis-Tris, 200 mM sodium chloride
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.216
|
|
7T70
Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 4/5
提交 2021-12-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 18
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 14
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.220
|
|
7T8M
Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 5/6
提交 2021-12-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
GOL GLYCEROL × 9
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.197
|
|
7T8R
Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 7/8
提交 2021-12-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:C145A
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.228
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 10
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 J
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 11
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 K
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 12
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 L
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 13
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 M
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 14
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 N
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 15
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 O
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 16
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 P
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 E
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 6
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 F
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 7
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 G
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 8
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 H
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9W
Crystal structure of the Nsp3 bSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain from SARS-CoV-2
提交 2021-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 9
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 I
2048–2152(105 aa)
片段:BSM (Betacoronavirus-Specific Marker) domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;40% tacsimate, 0.5 M MES pH 6
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.316
|
|
7T9Y
Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 8/9
提交 2021-12-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.18 Å
R-free 0.236
|
|
7TA4
Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 9/10
提交 2021-12-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.216
|
|
7TA7
Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 10/11
提交 2021-12-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.255
|
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7TB2
Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 12/13
提交 2021-12-21
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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突变:C145A
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.218
|
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7TBT
Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 13/14
提交 2021-12-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
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突变:C145A
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.266
|
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7TC4
Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A with substrate peptide 15/16
提交 2021-12-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
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GOL GLYCEROL × 3
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.227
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7TDU
Joint X-ray/neutron structure of SARS-CoV-2 main protease (3CL Mpro) in complex with BBH-1
提交 2022-01-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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I1W (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxo(1-~2~H)pyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-3-{N-[tert-butyl(~2~H)carbamoyl]-3-methyl-L-(N-~2~H)valyl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-(~2~H)carboxamide × 2
|
实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;287 K;20% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率未提供
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7TE0
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor PF-07321332
提交 2022-01-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.248
|
|
7TEH
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (3CL Mpro) in complex with BBH-2
提交 2022-01-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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I1Z (1R,2S,5S)-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;293 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.186
|
|
7TEK
SARS-CoV-2 3CLPro in complex with N-(4-(1H-pyrazol-4-yl)phenyl)-N-(3-chlorobenzyl)-2-(pyridin-3-yl)acetamide
提交 2022-01-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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I2D N-[(3-chlorophenyl)methyl]-N-[4-(1H-pyrazol-4-yl)phenyl]-2-(pyridin-3-yl)acetamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289.15 K;0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.274
|
|
7TEL
SARS-CoV-2 3CLPro in complex with N-(4-(1H-imidazol-4-yl)phenyl)-N-(3-chloro-5-fluorobenzyl)-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide
提交 2022-01-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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I2N N-[(3-chloro-5-fluorophenyl)methyl]-N-[4-(1H-imidazol-4-yl)phenyl]-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289.15 K;0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.260
|
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7TFR
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease (3CL Mpro) in complex with NBH-2
提交 2022-01-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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NB2 (1R,2S,5S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-({1-[(2-methylpropane-2-sulfonyl)methyl]cyclohexyl}carbamoyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.181
|
|
7TGR
Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with GC376
提交 2022-01-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
|
未记录
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
B1S (1R,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
CL CHLORIDE ION × 4
K POTASSIUM ION × 2
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M potassium thiocyanate, 20 % PEG 3350, and 0.1 M Bis-Tris propane buffer pH 6.5
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.225
|
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7THH
SUD-C and Ubl2 domains of SARS CoV-2 Nsp3 protein
提交 2022-01-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1496–1623(128 aa)
片段:SUD-C and Ubl2 domains, residues 1496-1623
|
未记录
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CL CHLORIDE ION × 2
P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;289 K;0.2 M ammonium iodide, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.32 Å
R-free 0.191
|
|
7THH
SUD-C and Ubl2 domains of SARS CoV-2 Nsp3 protein
提交 2022-01-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1496–1623(128 aa)
片段:SUD-C and Ubl2 domains, residues 1496-1623
|
未记录
|
P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1
IOD IODIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;289 K;0.2 M ammonium iodide, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.32 Å
R-free 0.191
|
|
7THH
SUD-C and Ubl2 domains of SARS CoV-2 Nsp3 protein
提交 2022-01-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1496–1623(128 aa)
片段:SUD-C and Ubl2 domains, residues 1496-1623
|
未记录
|
P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1
IOD IODIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;289 K;0.2 M ammonium iodide, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.32 Å
R-free 0.191
|
|
7THH
SUD-C and Ubl2 domains of SARS CoV-2 Nsp3 protein
提交 2022-01-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1496–1623(128 aa)
片段:SUD-C and Ubl2 domains, residues 1496-1623
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;289 K;0.2 M ammonium iodide, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.32 Å
R-free 0.191
|
|
7THH
SUD-C and Ubl2 domains of SARS CoV-2 Nsp3 protein
提交 2022-01-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 E
1496–1623(128 aa)
片段:SUD-C and Ubl2 domains, residues 1496-1623
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;289 K;0.2 M ammonium iodide, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.32 Å
R-free 0.191
|
|
7THH
SUD-C and Ubl2 domains of SARS CoV-2 Nsp3 protein
提交 2022-01-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 6
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 F
1496–1623(128 aa)
片段:SUD-C and Ubl2 domains, residues 1496-1623
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;289 K;0.2 M ammonium iodide, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.32 Å
R-free 0.191
|
|
7THM
SARS-CoV-2 nsp12/7/8 complex with a native N-terminus nsp9
提交 2022-01-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
链 G
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MN MANGANESE (II) ION × 1
POP PYROPHOSPHATE 2- × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å
|
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7TI9
Crystal structure of the ubiquitin-like domain 1 (Ubl1) of Nsp3 from SARS-CoV-2, form 2
提交 2022-01-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
818–929(112 aa)
片段:ubiquitin-like domain 1 (Ubl1)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 4
CL CHLORIDE ION × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;1.6 M ammonium sulfate, 2% hexanediol, 0.1M Hepes pH 7.5, 1.25% 1-Butyl-3-methylimidazolium dicyanamide
|
分辨率 2.73 Å
R-free 0.249
|
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7TJ2
SARS-CoV-2 endoribonuclease Nsp15 bound to dsRNA
提交 2022-01-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:octameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
链 D
6453–6798(346 aa)
链 E
6453–6798(346 aa)
链 F
6453–6798(346 aa)
|
突变:H235A
突变:H235A
突变:H235A
突变:H235A
突变:H235A
突变:H235A
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
7TQ2
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with the cyclopropane based inhibitor 1c
提交 2022-01-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
ISG N-{(2S)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-N~2~-({[(1R,2R)-2-phenylcyclopropyl]methoxy}carbonyl)-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;8% (w/v) PEG 8000, 100 mM sodium citrate
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.263
|
|
7TQ3
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with the cyclopropane based inhibitor 5c
提交 2022-01-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
IS5 N~2~-({[(1R,2R)-2-(3-fluorophenyl)cyclopropyl]methoxy}carbonyl)-N-{(2S)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;20% (w/v) PEG 6000, 100 mM Hepes, 200 mM lithium chloride
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.247
|
|
7TQ4
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with the cyclopropane based inhibitor 6c
提交 2022-01-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
IRZ N~2~-({[(1R,2R)-2-(3-chlorophenyl)cyclopropyl]methoxy}carbonyl)-N-{(2S)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;293 K;25 % (w/v) PEG 1500, 100 MMT
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.296
|
|
7TQ5
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with the cyclopropane based inhibitor 10d
提交 2022-01-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
IRW (1S,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[(1R,2R)-2-(4-methoxyphenyl)cyclopropyl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
ITX (1R,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[(1R,2R)-2-(4-methoxyphenyl)cyclopropyl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
CL CHLORIDE ION × 1
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;20 % (w/v) PEG 3350, 100 Bis-Tris propane, 200 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.217
|
|
7TQ6
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with the cyclopropane based inhibitor 13d
提交 2022-01-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
链 B
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
IT3 (1S,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-2-{[N-({[(1R,2R)-2-propylcyclopropyl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}propane-1-sulfonic acid × 2
ITG (1R,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-2-{[N-({[(1R,2R)-2-propylcyclopropyl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;20 % (w/v) PEG 5000 MME, 100 Bis-Tris
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.216
|
|
7TQV
SARS-CoV-2 endoribonuclease Nsp15 bound to dsRNA
提交 2022-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:octameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
链 D
6453–6798(346 aa)
链 E
6453–6798(346 aa)
链 F
6453–6798(346 aa)
|
突变:H235A
突变:H235A
突变:H235A
突变:H235A
突变:H235A
突变:H235A
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å
|
|
7TW7
Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SAM
提交 2022-02-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
6225–6452(228 aa)
|
突变:A4R, E67V, A77K
|
ZN ZINC ION × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293.15 K;11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate, and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.218
|
|
7TW8
Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SAH
提交 2022-02-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
6225–6452(228 aa)
|
突变:A4R, E67V, A77K
|
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293.15 K;11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.206
|
|
7TW9
Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to Sinefungin
提交 2022-02-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
6225–6452(228 aa)
|
突变:A4R, E67V, A77K
|
SFG SINEFUNGIN × 1
ZN ZINC ION × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
EOH ETHANOL × 1
MOH METHANOL × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293.15 K;11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate, and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5
|
分辨率 1.41 Å
R-free 0.232
|
|
7TWF
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 73 kGy)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG3000
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.135
|
|
7TWF
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 73 kGy)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG3000
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.135
|
|
7TWG
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 153 kGy)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG 3000
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.126
|
|
7TWG
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 153 kGy)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG 3000
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.126
|
|
7TWH
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 290 kGy)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG3000
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.115
|
|
7TWH
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 290 kGy)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG3000
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.115
|
|
7TWI
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 539 kGy)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG3000
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.113
|
|
7TWI
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form, 539 kGy)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain (UNP residues 1025-1191)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, pH 9.5, 32% PEG3000
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.113
|
|
7TWJ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 4 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.109
|
|
7TWJ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 4 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.109
|
|
7TWN
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 5 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 1
NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.114
|
|
7TWN
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 5 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.114
|
|
7TWO
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 6 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 1
NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.119
|
|
7TWO
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 6 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.119
|
|
7TWP
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 7 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
ACT ACETATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.124
|
|
7TWP
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 7 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.124
|
|
7TWQ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 9 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.126
|
|
7TWQ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 9 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.126
|
|
7TWR
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 8 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
ACT ACETATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.121
|
|
7TWR
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 8 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.121
|
|
7TWS
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 10 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 32% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.127
|
|
7TWS
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at pH 10 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 32% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.127
|
|
7TWT
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 4 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.120
|
|
7TWT
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 4 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.120
|
|
7TWV
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 5 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1
CIT CITRIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.107
|
|
7TWV
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 5 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.107
|
|
7TWW
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 6 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1
CIT CITRIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.107
|
|
7TWW
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 6 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.107
|
|
7TWX
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 7 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.109
|
|
7TWX
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 7 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.109
|
|
7TWY
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 8 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.107
|
|
7TWY
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 8 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.107
|
|
7TX0
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 9 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.84 Å
R-free 0.111
|
|
7TX0
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 9 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.84 Å
R-free 0.111
|
|
7TX1
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 10 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.108
|
|
7TX1
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at pH 10 (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.108
|
|
7TX3
Neutron crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1
|
实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 34% PEG 3000
|
分辨率未提供
|
|
7TX3
Neutron crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P43 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 34% PEG 3000
|
分辨率未提供
|
|
7TX4
Neutron crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain at 293 K (P21 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289 K;100 mM MES pH 6.5, 28% PEG 4000
|
分辨率未提供
|
|
7TX5
Neutron crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with ADP-ribose at 293 K (C2 crystal form)
提交 2022-02-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1
|
实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289 K;100 mM MES pH 6.5, 25% PEG 4000
|
分辨率未提供
|
|
7U92
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML1006a
提交 2022-03-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
M0C (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-(azetidin-1-yl)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289.15 K;Sitting drops consisted of 0.2 uL A:0.2 uL B: A) 5.2 mg/mL + 0.9 mM ML1006a in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO, B) MES pH 6.5, 8 % PEG20000
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.207
|
|
7UKK
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with GC-376
提交 2022-04-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.181
|
|
7ULT
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer Apo-Form.
提交 2022-04-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 4
FMT FORMIC ACID × 7
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 5% Glycerol; Screen: ComPAS (F10), 0.4M Potassium/Sodium tartrate.
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.188
|
|
7ULT
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Nsp16/10 Heterodimer Apo-Form.
提交 2022-04-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
6799–7096(298 aa)
链 D
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 4
FMT FORMIC ACID × 10
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;Protein: 5.3 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 5% Glycerol; Screen: ComPAS (F10), 0.4M Potassium/Sodium tartrate.
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.188
|
|
7UO4
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to Remdesivir triphosphate, in a pre-catalytic state
提交 2022-04-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
NWX [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-cyano-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å
|
|
7UO7
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to ATP, in a pre-catalytic state
提交 2022-04-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å
|
|
7UO9
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to UTP, in a pre-catalytic state
提交 2022-04-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å
|
|
7UOB
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to GTP, in a pre-catalytic state
提交 2022-04-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
L2B 3'-DEOXYURIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.68 Å
|
|
7UOE
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to CTP, in a pre-catalytic state
提交 2022-04-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
L2B 3'-DEOXYURIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.67 Å
|
|
7UR9
SARS-Cov2 Main protease in complex with inhibitor CDD-1845
提交 2022-04-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
O5F (2P)-2-(isoquinolin-4-yl)-1-[4-(methylamino)-4-oxobutyl]-N-[(1S)-1-(naphthalen-2-yl)ethyl]-1H-benzimidazole-7-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.2 M Sodium chloride, 20%(w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.200
|
|
7URB
Sars-Cov2 Main Protease in complex with CDD-1733
提交 2022-04-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
O5O (2P)-2-(isoquinolin-4-yl)-1-[(1s,3R)-3-(methylcarbamoyl)cyclobutyl]-N-{(1S)-1-[4-(trifluoromethyl)phenyl]butyl}-1H-benzimidazole-7-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1 M Sodium HEPES pH 7.5, 15% (w/v) PEG 20000
|
分辨率 2.14 Å
R-free 0.254
|
|
7US4
Sars-Cov2 Main Protease in complex with CDD-1819
提交 2022-04-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
O69 (2P)-2-(isoquinolin-4-yl)-1-[(1s,3R)-3-(methylcarbamoyl)cyclobutyl]-N-[(1S)-1-(naphthalen-2-yl)ethyl]-1H-benzimidazole-7-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1 M MES pH 6.5, 15% (w/v) PEG 20000
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.235
|
|
7UU6
Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in its apo-form
提交 2022-04-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.252
|
|
7UU7
Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in its apo-form
提交 2022-04-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.245
|
|
7UU8
Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in its apo-form
提交 2022-04-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.257
|
|
7UU9
Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in its apo-form
提交 2022-04-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 2.47 Å
R-free 0.253
|
|
7UUA
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI8
提交 2022-04-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
NOL N-[(BENZYLOXY)CARBONYL]-O-(TERT-BUTYL)-L-THREONYL-3-CYCLOHEXYL-N-[(1S)-2-HYDROXY-1-{[(3S)-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL]METHYL}ETHYL]-L-ALANINAMIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.273
|
|
7UUB
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI12
提交 2022-04-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
7VB N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-valyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methylidene-L-norvalinamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.230
|
|
7UUC
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI19
提交 2022-04-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
81L N-[(benzyloxy)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-3-cyclopropyl-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.229
|
|
7UUD
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI33
提交 2022-04-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
I71 (1R,2S,5S)-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(2S,3R)-4-(ethylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.237
|
|
7UUE
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI85
提交 2022-04-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
I65 benzyl [(2S,3R)-1-({(2S)-1-[2-(3-amino-3-oxopropyl)-2-propanoylhydrazinyl]-3-cyclohexyl-1-oxopropan-2-yl}amino)-3-tert-butoxy-1-oxobutan-2-yl]carbamate (non-preferred name) × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.1 M Bis-tris, pH6.5, 16% w/v PEG10k
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.232
|
|
7UUG
SARS-CoV-2 Main Protease S144A (Mpro S144A) in Complex with ML1006a
提交 2022-04-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:S144A
|
M0C (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-(azetidin-1-yl)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289.15 K;Sitting drops consisted of 0.19 uL A:0.19 uL B:
A) 5.1 mg/mL Mpro S144A + 0.9 mM ML1006a in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO
B) 0.1 M MES pH 6.5, 10% PEG20000
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.240
|
|
7UUP
SARS-CoV-2 Main Protease S144A (Mpro S144A) in Complex with Nirmatrelvir (PF-07321332)
提交 2022-04-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:S144A
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289.15 K;Sitting drops consisted of 0.19 uL A:0.19 uL B:
A) 5.1 mg/mL Mpro S144A + 0.9 mM ML1001 in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO
B) 0.1 M MES pH 6.5, 10% PEG20000
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.237
|
|
7VAH
The crystal structure of COVID-19 main protease in H41A mutation
提交 2021-08-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:H41A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;293 K;2% polyethylene glycol (PEG) 6000, 3% DMSO, 1mM DTT, 0.1M MES buffer (pH 6.0), protein concentration 5mg/ml
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.217
|
|
7VVP
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease in complex with PF07304814
提交 2021-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3561(296 aa)
链 B
3266–3561(296 aa)
|
未记录
|
80I [(3~{S})-3-[[(2~{S})-2-[(4-methoxy-1~{H}-indol-2-yl)carbonylamino]-4-methyl-pentanoyl]amino]-2-oxidanylidene-4-[(3~{R})-2-oxidanylidene-3,4-dihydropyrrol-3-yl]butyl] dihydrogen phosphate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M HEPES 7.5, 20% PEG 10000
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.242
|
|
7WHC
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro catalytic domain
提交 2021-12-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3264–3459(196 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;296 K;10% PEG 20000, 0.1M HEPES pH 7.0, 0.2M Calcium Chloride
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.264
|
|
7WHC
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro catalytic domain
提交 2021-12-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
3264–3459(196 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;296 K;10% PEG 20000, 0.1M HEPES pH 7.0, 0.2M Calcium Chloride
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.264
|
|
7WHC
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro catalytic domain
提交 2021-12-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
3264–3459(196 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;296 K;10% PEG 20000, 0.1M HEPES pH 7.0, 0.2M Calcium Chloride
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.264
|
|
7WHC
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro catalytic domain
提交 2021-12-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
3264–3459(196 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;296 K;10% PEG 20000, 0.1M HEPES pH 7.0, 0.2M Calcium Chloride
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.264
|
|
7WOH
SARS-CoV-2 3CLpro
提交 2022-01-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3566(303 aa)
链 B
3264–3566(303 aa)
|
未记录
|
5IW (2S)-4-methyl-N-[(2S)-1-oxidanylidene-3-[(3S)-2-oxidanylidenepiperidin-3-yl]propan-2-yl]-2-[[(2S)-3-phenyl-2-[[(E)-3-phenylprop-2-enoyl]amino]propanoyl]amino]pentanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;290 K;100 mM MES (pH 6.0), 3% DMSO, 1 mM DTT, 6% polyethylene glycol (PEG) 6000
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.216
|
|
7WQ8
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z-DEVD-FMK
提交 2022-01-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, 20% w/v PEG3350
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.222
|
|
7WQ9
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Z-IETD-FMK
提交 2022-01-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.246
|
|
7WQA
SARS-CoV-2 main protease in complex with Z-VAD-FMK
提交 2022-01-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M Bis Tris propane 8.5, 0.2 M sodium fluoride, 20 % w/v PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.208
|
|
7WQK
wild-type SARS-CoV-2 main protease in complex with MG-132
提交 2022-01-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M sodium chloride, 25% w/v PEG3,350
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.289
|
|
7Z2K
Crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease in orthorhombic space group p212121
提交 2022-02-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
MLI MALONATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;PEG 1500 25%, MIB pH 7.5 0.1 M, 5% DMSO
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.214
|
|
7Z3U
Crystal structure of SARS-CoV-2 Main Protease after incubation with Sulfo-Calpeptin
提交 2022-03-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
NA SODIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;291 K;Co-crystallization with the compound was achieved by equlibrating a 6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. Prior to crystallization compound solutions in DMSO were dried onto the wells of SwissCI 96-well plates. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days. Crystals were manually harvested and flash cooled in liquid nitrogen for subsequent X-ray diffraction data collection.
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.235
|
|
7Z59
SARS-CoV-2 main protease (Mpro) covalently modified with a penicillin derivative
提交 2022-03-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
IFO (3S)-4-[[2,4-bis(fluoranyl)phenyl]methoxy]-2-methyl-4-oxidanylidene-3-[[(Z)-3-oxidanylidene-2-(2-phenoxyethanoylamino)prop-1-enyl]amino]butane-2-sulfinic acid × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;SARS-CoV-2 Mpro was thawed and diluted to 6 mg/mL (using 20 mM HEPES, pH 7.5, 50 mM NaCl). Beta-Lactam 20e was added to the protein solution to a final concentration of 10 mM; the mixture was incubated for 2 h at ambient temperature prior to dispensing plates. The drop composition was 0.15 uL protein ligand solution, 0.3 uL 11 percent v/v PEG 4000, 0.1 M MES, pH 6.5, and 0.05 ,microL Mpro crystal seed stock. The Mpro crystal seed stock was prepared by crushing Mpro crystals with a pipette tip, suspending them in 30% PEG 4000, 5%v/v DMSO, 0.1 M MES pH 6.5, and vortexing for 60 s with approximately 10 glass beads (1.0 mm diameter, BioSpec products). As reservoir solution was used: 11%v/v PEG 4K, 5%v/v DMSO, 0.1 M MES, pH 6.5. Crystals were grown using the sitting drop vapor diffusion method at 20 degree C and appeared within 24 h, reaching full size within 36 h. Crystals were looped after one week.
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.252
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7ZB6
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) variant C44S at 2.12 A resolution
提交 2022-03-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
3264–3569(306 aa)
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突变:C44S
突变:C44S
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;PEG3350, DMSO, Sodium citrate, MES
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分辨率 2.12 Å
R-free 0.298
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7ZB7
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) variant Y54F at 1.63 A resolution
提交 2022-03-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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突变:Y54F
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
GOL GLYCEROL × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;PEG3350, DMSO, Sodium citrate, MES
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分辨率 1.63 Å
R-free 0.213
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7ZB8
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) variant K61A at 2.48 A resolution
提交 2022-03-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
3264–3569(306 aa)
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突变:K61A
突变:K61A
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;PEG3350, DMSO, Sodium citrate, MES
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分辨率 2.48 Å
R-free 0.332
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7ZQV
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with AG7404
提交 2022-05-03
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
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未记录
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XNV ethyl (4R)-4-({(2S)-2-[3-{[(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)carbonyl]amino}-2-oxopyridin-1(2H)-yl]pent-4-ynoyl}amino)-5-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]pentanoate × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;Sodium chloride, HEPES pH 7 and PEG 3350
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分辨率 2.26 Å
R-free 0.241
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7ZV5
Crystal structure of SARS Cov-2 main protease in complex with an inhibitor 4
提交 2022-05-13
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.2 M Sodium nitrate, 0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5 20 % (w/v) PEG 3350
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.240
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7ZV7
Crystal structure of SARS Cov-2 main protease in complex with an inhibitor 57
提交 2022-05-13
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.05 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium Citrate, 15 % (w/v) PEG8000
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分辨率 1.34 Å
R-free 0.220
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7ZV8
Crystal structure of SARS Cov-2 main protease in complex with an inhibitor 58
提交 2022-05-13
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
OCA OCTANOIC ACID (CAPRYLIC ACID) × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.1 M MES pH 6.5, 12 %(w/v) PEG 20000
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分辨率 1.94 Å
R-free 0.231
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8A23
Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp10/nsp16 methyltransferase in complex with TO383
提交 2022-06-02
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4263–4384(122 aa)
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未记录
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KW6 (2R,3R,4S,5R)-2-[4-azanyl-5-(2-quinolin-3-ylethynyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol × 1
GOL GLYCEROL × 1
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.2 M ammonium sulfate,
0.1 M sodium acetate pH 5.5,
10 % w/v PEG 2000 MME
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分辨率 2.80 Å
R-free 0.256
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8A4Q
crystal structures of diastereomer (R,S,S)-13b (13b-H) in complex with the SARS-CoV-2 Mpro.
提交 2022-06-13
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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V9R ~{tert}-butyl ~{N}-[1-[(2~{R})-3-cyclopropyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S},3~{S})-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]-4-[(phenylmethyl)amino]butan-2-yl]amino]propan-2-yl]-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;PEG8000
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分辨率 1.75 Å
R-free 0.219
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8A4T
crystal structures of diastereomer (S,S,S)-13b (13b-K) in complex with the SARS-CoV-2 Mpro
提交 2022-06-13
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
3264–3568(305 aa)
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未记录
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O6K ~{tert}-butyl ~{N}-[1-[(2~{S})-3-cyclopropyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S},3~{R})-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]-4-[(phenylmethyl)amino]butan-2-yl]amino]propan-2-yl]-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 1
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;PEG8000
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分辨率 2.50 Å
R-free 0.289
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8A4T
crystal structures of diastereomer (S,S,S)-13b (13b-K) in complex with the SARS-CoV-2 Mpro
提交 2022-06-13
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 B
3264–3568(305 aa)
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未记录
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O6K ~{tert}-butyl ~{N}-[1-[(2~{S})-3-cyclopropyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S},3~{R})-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]-4-[(phenylmethyl)amino]butan-2-yl]amino]propan-2-yl]-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;PEG8000
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分辨率 2.50 Å
R-free 0.289
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8A4Y
SARS-CoV-2 non-structural protein-1 (nsp1) in complex with N-(2,3-dihydro-1H-inden-5-yl)acetamide
提交 2022-06-13
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–126(117 aa)
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未记录
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QO6 N-(2,3-dihydro-1H-inden-5-yl)acetamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;Commercial screen Index 44 (0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v PEG3350) was chosen for SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) crystallisation in large quantities using hanging drop method. Frozen stocks of SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) were thawed on ice and centrifuged in a Thermo Scientific Pico 17 Microcentrifuge, 24-Pl Rotor at 4 degrees, 20000 rpm for 10 min to remove aggregates before the determination of the protein concentration. Subsequently, the protein stock was diluted to 20 mg/mL with precrystallisation buffer (10 mM HEPES and 300 mM NaCl). 400 uL of Index condition 44 was added into each reservoir well. Five protein drops were set on each cover slip by mixing 1 uL of protein solution with 1 uL of the reservoir. The 24-well Linbro plates were incubated at 18 degrees.
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分辨率 1.10 Å
R-free 0.166
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8A55
Structure of N-terminal SARS-CoV-2 nonstructural protein 1 (nsp1) at atomic resolution
提交 2022-06-14
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–126(117 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;Commercial screen Index 44 (0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v PEG3350) was chosen for SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) crystallisation in large quantities using hanging drop method. Frozen stocks of SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) were thawed on ice and centrifuged in a Thermo Scientific Pico 17 Microcentrifuge, 24-Pl Rotor at 4 degrees, 20000 rpm for 10 min to remove aggregates before the determination of the protein concentration. Subsequently, the protein stock was diluted to 20 mg/mL with precrystallisation buffer (10 mM HEPES and 300 mM NaCl). 400 uL of Index condition 44 was added into each reservoir well. Five protein drops were set on each cover slip by mixing 1 uL of protein solution with 1 uL of the reservoir. The 24-well Linbro plates were incubated at 18 degrees.
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分辨率 0.99 Å
R-free 0.173
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8ACD
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the non-covalent inhibitor GA-17S
提交 2022-07-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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LQ6 (2~{S})-4-[[2,4-bis(oxidanylidene)-1~{H}-pyrimidin-6-yl]carbonyl]-1-(3,4-dichlorophenyl)-~{N}-(thiophen-2-ylmethyl)piperazine-2-carboxamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293.15 K;0.1 M PCTP buffer pH 6.0 (PCTP represents a mixture of sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, and bis-Tris propane) and 25% PEG1500
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分辨率 1.39 Å
R-free 0.184
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8ACL
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the non-covalent inhibitor GC-14
提交 2022-07-05
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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LQL (2~{S})-1-(3,4-dichlorophenyl)-4-pyridin-3-ylcarbonyl-~{N}-(thiophen-2-ylmethyl)piperazine-2-carboxamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293.15 K;0.1 M PCTP buffer pH 6.0 (PCTP represents a mixture of sodium propionate, sodium cacodylate trihydrate, and bis-Tris propane) and 25% PEG1500
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分辨率 1.40 Å
R-free 0.172
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8AEB
SARS-CoV-2 Main Protease complexed with N-(pyridin-3-ylmethyl)thioformamide
提交 2022-07-12
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
35J N-(pyridin-3-ylmethyl)thioformamide × 2
NA SODIUM ION × 8
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2M NaFormate, 21% PEG 3350, 10% Glycerol, 8% DMSO
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分辨率 1.83 Å
R-free 0.234
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8AIU
Mpro of SARS COV-2 in complex with the MG-97 inhibitor
提交 2022-07-27
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 AAA
3264–3568(305 aa)
链 BBB
3264–3568(305 aa)
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未记录
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M9X tert-butyl N-[1-[(2S)-3-cyclopropyl-1-[[(2S,3R)-4-(cyclopropylamino)-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 2
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1M Bis Tris Propane pH 6.50, 2M Sodium formate, 20% w/vPEG 3350, 10% v/vEthylene glycol
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.206
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8AIV
Mpro of SARS COV-2 in complex with the MG-100 inhibitor
提交 2022-07-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 AAA
3264–3569(306 aa)
链 BBB
3264–3569(306 aa)
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未记录
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MFL tert-butyl N-[1-[(2S)-3-cyclopropyl-1-[[(2S,3R)-4-(methylamino)-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 2
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.02 M sodium/potassium phosphate, 0.1 M Bis Tris propane pH6.5, 20 % w/v PEG 3350
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分辨率 2.60 Å
R-free 0.252
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8AIZ
Mpro of SARS-CoV-2 in complex with the RK-68 inhibitor
提交 2022-07-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 AAA
3264–3569(306 aa)
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未记录
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MIJ (2~{R},3~{S})-3-[[(2~{S})-3-cyclopropyl-2-[2-oxidanylidene-3-(2-phenylethanoylamino)pyridin-1-yl]propanoyl]amino]-~{N}-methyl-2-oxidanyl-4-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butanamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;0.002 M zinc chloride, 0.1 M Tris 8.0, 20 % w/v PEG 6000
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分辨率 1.99 Å
R-free 0.224
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8AJ0
Mpro of SARS COV-2 in complex with the RK-90 inhibitor
提交 2022-07-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 AAA
3264–3565(302 aa)
链 BBB
3264–3565(302 aa)
|
未记录
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MJ0 (2R,3S)-3-[[(2S)-3-cyclopropyl-2-[2-oxidanylidene-3-(3-phenylpropanoylamino)pyridin-1-yl]propanoyl]amino]-N-methyl-2-oxidanyl-4-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butanamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
NA SODIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;0.1MMES pH 6, 0.2MSodium chloride, 20% w/vPEG 6000, 10% v/vEthylene glycol
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分辨率 2.52 Å
R-free 0.266
|
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8AOU
Solution NMR structure of full-length Nsp1 from SARS-CoV-2.
提交 2022-08-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–180(180 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)560;压力 1
NMR样品组成
600 uM [U-13C; U-15N] Nsp1, 50 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 2 mM EDTA, 0.01 % w/v sodium azide, 10 % v/v [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
500 uM [U-10% 13C; U-100% 15N] Nsp1, 50 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 2 mM EDTA, 0.01 % w/v sodium azide, 10 % v/v [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
500 uM [U-10% 13C; U-100% 15N] Nsp1, 50 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 2 mM EDTA, 0.01 % w/w sodium azide, 10 % v/v [U-2H] D2O, 12 mg/mL Pf1 phage, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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8AYS
SARS-CoV-2 non-structural protein-1 (nsp1) in complex with 4-(2-aminothiazol-4-yl)phenol
提交 2022-09-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
10–126(117 aa)
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未记录
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92G 4-(2-amino-1,3-thiazol-4-yl)phenol × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;Commercial screen Index 44 (0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v PEG3350) was chosen for SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) crystallisation in large quantities using hanging drop method. Frozen stocks of SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) were thawed on ice and centrifuged in a Thermo Scientific Pico 17 Microcentrifuge, 24-Pl Rotor at 4 degrees, 20000 rpm for 10 min to remove aggregates before the determination of the protein concentration. Subsequently, the protein stock was diluted to 20 mg/mL with precrystallisation buffer (10 mM HEPES and 300 mM NaCl). 400 uL of Index condition 44 was added into each reservoir well. Five protein drops were set on each cover slip by mixing 1 uL of protein solution with 1 uL of the reservoir. The 24-well Linbro plates were incubated at 18 degrees.
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分辨率 1.37 Å
R-free 0.150
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8AZ8
SARS-CoV-2 non-structural protein-1 (nsp1) in complex with 2-(benzylamino)ethan-1-ol
提交 2022-09-05
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 B
10–126(117 aa)
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未记录
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OEI 2-[(phenylmethyl)amino]ethanol × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;Commercial screen Index 44 (0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v PEG3350) was chosen for SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) crystallisation in large quantities using hanging drop method. Frozen stocks of SARS-CoV-2 nsp1 (residues 10 to 126) were thawed on ice and centrifuged in a Thermo Scientific Pico 17 Microcentrifuge, 24-Pl Rotor at 4 degrees, 20000 rpm for 10 min to remove aggregates before the determination of the protein concentration. Subsequently, the protein stock was diluted to 20 mg/mL with precrystallisation buffer (10 mM HEPES and 300 mM NaCl). 400 uL of Index condition 44 was added into each reservoir well. Five protein drops were set on each cover slip by mixing 1 uL of protein solution with 1 uL of the reservoir. The 24-well Linbro plates were incubated at 18 degrees.
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分辨率 1.18 Å
R-free 0.207
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8B2T
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in complex with nirmatrelvir alkyne
提交 2022-09-14
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3568(305 aa)
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未记录
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OW1 Nirmatrelvir (reacted form) × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;11% (v/v) PEG 4K, 5% (v/v) DMSO, 0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.223
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8B56
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the inhibitor GD-9
提交 2022-09-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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OZI (2~{S})-4-(2-chloranylethanoyl)-1-(3,4-dichlorophenyl)-~{N}-(thiophen-2-ylmethyl)piperazine-2-carboxamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293.15 K;0.1 M PCTP BUFFER PH 6.0 (PCTP REPRESENTS A MIXTURE OF SODIUM PROPIONATE, SODIUM CACODYLATE TRIHYDRATE, AND BIS-TRIS PROPANE) AND 25% PEG1500
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分辨率 1.82 Å
R-free 0.231
|
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8B56
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the inhibitor GD-9
提交 2022-09-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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OZI (2~{S})-4-(2-chloranylethanoyl)-1-(3,4-dichlorophenyl)-~{N}-(thiophen-2-ylmethyl)piperazine-2-carboxamide × 1
CL CHLORIDE ION × 2
BR BROMIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293.15 K;0.1 M PCTP BUFFER PH 6.0 (PCTP REPRESENTS A MIXTURE OF SODIUM PROPIONATE, SODIUM CACODYLATE TRIHYDRATE, AND BIS-TRIS PROPANE) AND 25% PEG1500
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.231
|
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8BFO
Structure of the apo form of Mpro from SARS-CoV-2
提交 2022-10-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;0.1 M sodium HEPES at pH 7.0 containing 22% PEG 4000 and 3% DMSO
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.286
|
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8BFQ
Structure of the apo form of Mpro from SARS-CoV-2
提交 2022-10-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;0.1 M sodium HEPES at pH 7.0 containing 22% PEG 4000 and 3% DMSO
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.253
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8BGA
Structure of Mpro in complex with FGA146
提交 2022-10-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
QQL 4-methoxy-~{N}-[(2~{S})-4-methyl-1-[[(2~{S})-4-nitro-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;295 K;0.1 M Bis-TRIS at pH 6.5 containing 18% PEG 3350
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.237
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8BGD
Structure of Mpro from SARS-CoV-2 in complex with FGA147
提交 2022-10-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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QH0 (phenylmethyl) N-[(2S)-4-methyl-1-[[(2S)-4-nitro-1-[(3R)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;295 K;0.1 M TRIS-HCl at pH 8.5 containing 20% PEG 2000 MME and 10 mM NiCl2
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分辨率 1.62 Å
R-free 0.244
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8BS1
Room-temperature structure of SARS-CoV-2 Main protease at atmospheric pressure
提交 2022-11-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl was equilibrated against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.199
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|
8BS2
Room-temperature structure of SARS-CoV-2 Main protease at 104 MPa helium gas pressure in a sapphire capillary
提交 2022-11-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;6.25 mg/ml protein solution in 20 mM HEPES buffer (pH 7.8) containing 1 mM DTT, 1mM EDTA, and 150 mM NaCl was equilibrated against a reservoir solution of 100 mM MIB buffer (2:3:3 molar ratio of malonic acid, imidazole, and boric acid), pH 7.5, containing 25% v/v PEG 1500 and 5% v/v DMSO. To achieve reproducible crystal growth seeding was used. Crystals appeared within a few hours and reached their final size after 2 -3 days.
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.219
|
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8BSD
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with tubercidin
提交 2022-11-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 31
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
TBN '2-(4-AMINO-PYRROLO[2,3-D]PYRIMIDIN-7-YL)-5-HYDROXYMETHYL-TETRAHYDRO-FURAN-3,4-DIOL × 1
CL CHLORIDE ION × 2
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
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分辨率 1.95 Å
R-free 0.207
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8BWU
Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp14 methyltransferase domain in complex with the SS148 inhibitor
提交 2022-12-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
6225–6452(228 aa)
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未记录
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6NR (2~{S})-2-azanyl-4-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanyl-5-cyano-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanyl]butanoic acid × 1
ZN ZINC ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;100 mM bicine/Trizma pH 8.5;
10% w/v PEG 20.000, 20% v/v PEG MME 550;
20 mM D-glucose, 20 mM D-mannose, 20 mM D-galactose, 20 mM L-fucose, 20 mM D-xylose, 20 mM N-acetyl-D-glucosamine
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分辨率 2.36 Å
R-free 0.264
|
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8BZN
SARS-CoV-2 non-structural protein 10 (nsp10) variant T102I
提交 2022-12-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
4262–4384(123 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 3
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;0.1 M Bis-Tris, pH 5.5 - 6.5, 1.8 - 2.4 M NaCl
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分辨率 2.19 Å
R-free 0.235
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8BZV
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with adenosine
提交 2022-12-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
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ADN ADENOSINE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 39
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293.15 K;800 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.200
|
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8C19
SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with 1-methyl-4-[5-(morpholin-4-ylcarbonyl)-2-furyl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine
提交 2022-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
T6B [5-(1-methylpyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)furan-2-yl]-morpholin-4-yl-methanone × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 30% PEG3000
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.226
|
|
8C19
SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with 1-methyl-4-[5-(morpholin-4-ylcarbonyl)-2-furyl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine
提交 2022-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 30% PEG3000
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.226
|
|
8C1A
SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with aztreonam
提交 2022-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
T6O aztreonam × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 30% PEG3000
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.214
|
|
8C1A
SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with aztreonam
提交 2022-12-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM CHES pH 9.5, 30% PEG3000
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.214
|
|
8C5M
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with MTA
提交 2023-01-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 33
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
MTA 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;900 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.211
|
|
8CDC
Native 3CLpro from SARS-CoV-2 at 1.54 A
提交 2023-01-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;20-60 mM ammonium acetate buffer at pH 7.0 and 20-30 % PEG4000 as a precipitant
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.239
|
|
8CMF
Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 nsp3 epitope (orf1ab)1350-1364
提交 2023-02-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
1350–1364(15 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
SIN SUCCINIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;291 K;0.1 M SPG pH 4.6, 25 % PEG1500
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.240
|
|
8CMF
Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 nsp3 epitope (orf1ab)1350-1364
提交 2023-02-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 F
1350–1364(15 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
SIN SUCCINIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;291 K;0.1 M SPG pH 4.6, 25 % PEG1500
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.240
|
|
8CMG
Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 nsp14 peptide (orf1ab)6420-6434
提交 2023-02-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
6420–6434(15 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16
SO4 SULFATE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 25 % PEG8000, 0.2 M ammonium sulphate
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.227
|
|
8CRF
Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 5E11 refined against anomalous diffraction data
提交 2023-03-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–126(117 aa)
|
未记录
|
NT9 ~{N}-methyl-1-(4-thiophen-2-ylphenyl)methanamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.245
|
|
8CRK
Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 7H2 refined against anomalous diffraction data
提交 2023-03-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
10–126(117 aa)
|
未记录
|
OG3 (1~{R})-1-(4-chlorophenyl)ethanamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25%w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.192
|
|
8CRM
Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 11C6 refined against anomalous diffraction data
提交 2023-03-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–126(117 aa)
|
未记录
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OF6 1-[2-(3-chlorophenyl)-1,3-thiazol-4-yl]-~{N}-methyl-methanamine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.42 Å
R-free 0.203
|
|
8CYU
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C5
提交 2022-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
P5X N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-N-[4-(dimethylamino)phenyl]-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.245
|
|
8CYU
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C5
提交 2022-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
P5X N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-N-[4-(dimethylamino)phenyl]-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.245
|
|
8CYZ
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C4
提交 2022-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
P6I N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-2-(isoquinolin-4-yl)-N-[4-(methylsulfanyl)phenyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.278
|
|
8CYZ
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C4
提交 2022-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
P6I N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-2-(isoquinolin-4-yl)-N-[4-(methylsulfanyl)phenyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.278
|
|
8CZ4
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C3
提交 2022-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
P6R N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.244
|
|
8CZ4
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C3
提交 2022-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
P6R N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-2-(isoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.244
|
|
8CZ7
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C2
提交 2022-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 C
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
P7L N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-2-(isoquinolin-4-yl)-N-(4-methoxyphenyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.271
|
|
8CZ7
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with compound C2
提交 2022-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
P7L N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-2-(isoquinolin-4-yl)-N-(4-methoxyphenyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.271
|
|
8CZW
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with the cyclopropane based inhibitor 15d
提交 2022-05-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
P8U [(1~{S},2~{R})-2-cyclohexylcyclopropyl]methyl ~{N}-[(2~{S})-1-[[(1~{S},2~{S})-1-[bis(oxidanyl)-oxidanylidene-$l^{5}-sulfanyl]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2
P8L [(1~{S},2~{R})-2-cyclohexylcyclopropyl]methyl ~{N}-[(2~{S})-1-[[(1~{R},2~{S})-1-[bis(oxidanyl)-oxidanylidene-$l^{5}-sulfanyl]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;293 K;25% (w/v) PEG 1500, 100 MIB
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.216
|
|
8CZX
Structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with the cyclopropane based inhibitor 17d
提交 2022-05-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
PJR [(1~{S},2~{R})-2-[4,4-bis(fluoranyl)cyclohexyl]cyclopropyl]methyl ~{N}-[(2~{S})-1-[[(1~{S},2~{S})-1-[bis(oxidanyl)-oxidanylidene-$l^{5}-sulfanyl]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2
P8C [(1~{S},2~{R})-2-[4,4-bis(fluoranyl)cyclohexyl]cyclopropyl]methyl ~{N}-[(2~{S})-1-[[(1~{R},2~{S})-1-[bis(oxidanyl)-oxidanylidene-$l^{5}-sulfanyl]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;293 K;25% (w/v) PEG 1500, 100 MIB
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.220
|
|
8D34
Crystal Structure of SARS CoV-2 NSP15 Endroribonuclease H250A
提交 2022-05-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
|
突变:H250A
突变:H250A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Calcium Acetate, 0.1 M Imidazole pH 8, 10% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 2.91 Å
R-free 0.263
|
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8D4J
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) H172Y Mutant
提交 2022-06-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:H172Y
突变:H172Y
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.209
|
|
8D4K
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) H172Y Mutant in Complex with Inhibitor GC376
提交 2022-06-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:H172Y
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.224
|
|
8D4L
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) S144A Mutant
提交 2022-06-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:S144A
突变:S144A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.213
|
|
8D4M
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) S144A Mutant in Complex with Inhibitor GC376
提交 2022-06-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:S144A
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.229
|
|
8D4N
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) E166Q Mutant
提交 2022-06-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:E166Q
突变:E166Q
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.258
|
|
8D4P
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor Jun10-90-3-C1
提交 2022-06-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
QAO 2-chloro-N-[(1R)-2-{[2-(3-fluorophenyl)ethyl]amino}-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-[4-(pentafluoro-lambda~6~-sulfanyl)phenyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;25% PEG 3350, 0.1M KNa Tartrate, 0.005 M MgCl2
|
分辨率 2.04 Å
R-free 0.257
|
|
8DCZ
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) M165Y Mutant in Complex with Nirmatrelvir
提交 2022-06-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:M165Y
突变:M165Y
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;0.2M Sodium Chloride, 10% 1-6HexD, 20% PEG MME 2000
|
分辨率 2.38 Å
R-free 0.251
|
|
8DD1
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) H164N Mutant in Complex with Inhibitor GC376
提交 2022-06-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:H164N
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25 % PEG 3350 , 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.0005 M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.250
|
|
8DD9
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) S144L Mutant in Complex with Inhibitor GC376
提交 2022-06-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:S144L
|
B1S (1R,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.04 Å
R-free 0.228
|
|
8DDI
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) E166N Mutant
提交 2022-06-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:E166N
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;0.1M Magnesium Chloride, 20% PEG 3350, 10% 1-6HexD, 0.1M HEPES pH 7.5, 0.1M Lithium Sulfate
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.247
|
|
8DDM
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) E166R Mutant in Complex with Inhibitor GC376
提交 2022-06-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:E166R
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;0.1M Magnesium Chloride, 20% PEG 3350, 10% 1-6HexD, 0.1M HEPES pH 7.5, 0.1M Lithium Sulfate
|
分辨率 2.78 Å
R-free 0.245
|
|
8DFE
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) S144L Mutant
提交 2022-06-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:S144L
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.268
|
|
8DFN
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) H164N Mutant
提交 2022-06-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:H164N
突变:H164N
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25 % PEG 3350 , 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.0005 M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.04 Å
R-free 0.251
|
|
8DGB
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) Q192T Mutant in Complex with Inhibitor GC376
提交 2022-06-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:Q192T
突变:Q192T
|
B1S (1R,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.87 Å
R-free 0.272
|
|
8DIB
Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors
提交 2022-06-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
TKX 5-bromo-3-[(4-chloro-3-nitrophenyl)methoxy]pyridine-2-carbaldehyde × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;294 K;0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.17 Å
R-free 0.276
|
|
8DIC
Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors
提交 2022-06-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
TNI 5-bromo-3-[(3-bromo-4-chlorophenyl)methoxy]pyridine-2-carbaldehyde × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;294 K;0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.282
|
|
8DID
Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors
提交 2022-06-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
U0R 5-bromo-3-[(5-bromo-2-chlorophenyl)methoxy]pyridine-2-carbaldehyde × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;294 K;0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.294
|
|
8DIE
Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors
提交 2022-06-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
U1J 5-bromo-3-[(4-methyl-3-nitrophenyl)methoxy]pyridine-2-carbaldehyde × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;294 K;0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.303
|
|
8DIF
Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors
提交 2022-06-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
U1R 5-bromo-3-[(naphthalen-2-yl)methoxy]pyridine-2-carbaldehyde × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;294 K;0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.294
|
|
8DIG
Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors
提交 2022-06-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
U26 (3P)-1-[(4-fluorophenyl)methyl]-3-(isoquinolin-4-yl)imidazolidine-2,4-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;294 K;0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.271
|
|
8DIH
Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors
提交 2022-06-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
U2B (1P,1'R)-1-(isoquinolin-4-yl)-2',3'-dihydrospiro[imidazolidine-4,1'-indene]-2,5-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;294 K;0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.12 Å
R-free 0.276
|
|
8DII
Virtual screening for novel SARS-CoV-2 main protease non-covalent and covalent inhibitors
提交 2022-06-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
U2I (2S)-N-(isoquinolin-4-yl)-2-methyl-2,3-dihydro-1,4-benzoxazepine-4(5H)-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;294 K;0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.59 Å
R-free 0.271
|
|
8DJJ
Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates
提交 2022-06-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2 M Ammonium Phosphate, 0.1 M Tris, 50 % MPD
|
分辨率 2.51 Å
R-free 0.280
|
|
8DK8
Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates
提交 2022-07-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2 M Ammonium Phosphate, 0.1 M Tris, 50 % MPD
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.284
|
|
8DKH
Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates
提交 2022-07-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:A260V
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M NaCl, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20% PEG 6000
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.288
|
|
8DKK
Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates
提交 2022-07-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M NaCl, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.250
|
|
8DKL
Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates
提交 2022-07-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:L89F
突变:L89F
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Sodium Formate, 0.1 M Bis-Tris Propane pH 6.5, 20% PEG 3350
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.241
|
|
8DKZ
Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates
提交 2022-07-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2 M Ammonium Phosphate, 0.1 M Tris, 50 % MPD
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.318
|
|
8DL9
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound Z199538122
提交 2022-07-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
T4V 1-{4-[(naphthalen-1-yl)methyl]piperazin-1-yl}ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;17-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, microseeding
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.220
|
|
8DLB
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound Z2799209083
提交 2022-07-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
SRU 1-[(5S)-5-(3,4-dimethoxyphenyl)-3-phenyl-4,5-dihydro-1H-pyrazol-1-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;17-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, microseeding
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.206
|
|
8DMD
Room temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound ZZ4461624291
提交 2022-07-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
SVL 1-[(3R)-4-[(3-chlorophenyl)methyl]-3-(2-methylpropyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;17-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, microseeding
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.240
|
|
8DMN
Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates
提交 2022-07-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2 M NaCl, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20% PEG 6000
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.272
|
|
8DOX
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with an inhibitor TKB-245
提交 2022-07-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3565(302 aa)
片段:UNP residues 3264-3565
|
未记录
|
T2L (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(4-fluoro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1 M MES, pH 5.8, 15% PEG6000, 3% DMSO
|
分辨率 1.46 Å
R-free 0.229
|
|
8DOY
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with an inhibitor TKB-198
提交 2022-07-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3564(301 aa)
片段:UNP residues 3264-3564
链 B
3264–3564(301 aa)
片段:UNP residues 3264-3564
|
未记录
|
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1
T1X 7-fluoro-N-[(2S)-1-({(1S,2S)-1-(4-fluoro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1 M MES pH 6.0, 15% polyethyene glycol (PEG) 6000 and 3% DMSO
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.246
|
|
8DPR
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor TKB-248
提交 2022-07-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3565(302 aa)
片段:UNP residues 3264-3565
|
未记录
|
T43 2,2,2-trifluoro-N-{(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-(4-fluoro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamothioyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexan-3-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}acetamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M MES, pH 5.8, 15% PEG6000, 3% DMSO
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.247
|
|
8DQU
Nanobody bound SARS-CoV-2 Nsp9
提交 2022-07-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 24
PDB 声明:24-meric
|
链 C
4141–4253(113 aa)
链 F
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;1.8M ammonium sulfate, 0.1M MES pH 6.0
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.229
|
|
8DRR
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp4-nsp5 (C4) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3563(300 aa)
片段:UNP residues 3264-3563
链 B
3264–3563(300 aa)
片段:UNP residues 3264-3563
|
突变:C145A
突变:C145A
|
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8;293 K;0.1 M Tris, 20% PEG6000, 0.3 M sodium chloride
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.237
|
|
8DRR
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp4-nsp5 (C4) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3264–3563(300 aa)
片段:UNP residues 3264-3563
|
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8;293 K;0.1 M Tris, 20% PEG6000, 0.3 M sodium chloride
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.237
|
|
8DRS
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp6-nsp7 (C6) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3563(300 aa)
片段:UNP residues 3264-3563
链 B
3264–3563(300 aa)
片段:UNP residues 3264-3563
|
突变:C145A
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;0.1 M HEPES, 20% PEG6000, 0.2 M ammonium chloride
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.218
|
|
8DRS
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp6-nsp7 (C6) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3264–3563(300 aa)
片段:UNP residues 3264-3563
|
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;0.1 M HEPES, 20% PEG6000, 0.2 M ammonium chloride
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.218
|
|
8DRT
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp6-nsp7 (C6) cut site sequence (form 2)
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3563(300 aa)
片段:UNP residues 3264-3563
链 B
3264–3563(300 aa)
片段:UNP residues 3264-3563
|
突变:C145A
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.3;293 K;20% PEG3350, 0.2 M ammonium chloride
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.183
|
|
8DRU
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp7-nsp8 (C7) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3563(300 aa)
链 A
3937–3942(6 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
PO4 PHOSPHATE ION × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;0.1M HEPES
10% PEG 6K
|
分辨率 2.31 Å
R-free 0.237
|
|
8DRU
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp7-nsp8 (C7) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
3264–3563(300 aa)
链 B
3937–3942(6 aa)
链 E
3264–3563(300 aa)
链 E
3937–3942(6 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
突变:C145A
突变:C145A
|
PO4 PHOSPHATE ION × 3
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;0.1M HEPES
10% PEG 6K
|
分辨率 2.31 Å
R-free 0.237
|
|
8DRU
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp7-nsp8 (C7) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3264–3563(300 aa)
链 C
3937–3942(6 aa)
链 F
3264–3563(300 aa)
链 F
3937–3942(6 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
突变:C145A
突变:C145A
|
PO4 PHOSPHATE ION × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;0.1M HEPES
10% PEG 6K
|
分辨率 2.31 Å
R-free 0.237
|
|
8DRU
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp7-nsp8 (C7) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
3264–3563(300 aa)
链 D
3937–3942(6 aa)
链 G
3264–3563(300 aa)
链 G
3937–3942(6 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
突变:C145A
突变:C145A
|
PO4 PHOSPHATE ION × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;0.1M HEPES
10% PEG 6K
|
分辨率 2.31 Å
R-free 0.237
|
|
8DRV
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp8-nsp9 (C8) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3563(300 aa)
链 A
4135–4140(6 aa)
链 C
3264–3563(300 aa)
链 C
4135–4140(6 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Tris pH 8.5, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.240
|
|
8DRV
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp8-nsp9 (C8) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
3264–3563(300 aa)
链 B
4135–4140(6 aa)
链 D
3264–3563(300 aa)
链 D
4135–4140(6 aa)
|
未记录
|
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Tris pH 8.5, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.240
|
|
8DRW
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp9-nsp10 (C9) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3563(300 aa)
链 A
4248–4253(6 aa)
链 B
3264–3563(300 aa)
链 B
4248–4253(6 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 2
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 3
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9
PO4 PHOSPHATE ION × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Na/K phosphate (pH 6.2), 50% PEG200
|
分辨率 2.67 Å
R-free 0.239
|
|
8DRW
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp9-nsp10 (C9) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3264–3563(300 aa)
链 C
4248–4253(6 aa)
链 D
3264–3563(300 aa)
链 D
4248–4253(6 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 2
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 5
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
PO4 PHOSPHATE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Na/K phosphate (pH 6.2), 50% PEG200
|
分辨率 2.67 Å
R-free 0.239
|
|
8DRW
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp9-nsp10 (C9) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
3264–3563(300 aa)
链 E
4248–4253(6 aa)
链 F
3264–3563(300 aa)
链 F
4248–4253(6 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 2
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 3
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
PO4 PHOSPHATE ION × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Na/K phosphate (pH 6.2), 50% PEG200
|
分辨率 2.67 Å
R-free 0.239
|
|
8DRW
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp9-nsp10 (C9) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 G
3264–3563(300 aa)
链 G
4248–4253(6 aa)
链 H
3264–3563(300 aa)
链 H
4248–4253(6 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 1
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 4
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Na/K phosphate (pH 6.2), 50% PEG200
|
分辨率 2.67 Å
R-free 0.239
|
|
8DRW
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp9-nsp10 (C9) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 I
3264–3563(300 aa)
链 I
4248–4253(6 aa)
链 J
3264–3563(300 aa)
链 J
4248–4253(6 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 2
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 3
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6
PO4 PHOSPHATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Na/K phosphate (pH 6.2), 50% PEG200
|
分辨率 2.67 Å
R-free 0.239
|
|
8DRW
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp9-nsp10 (C9) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 6
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 K
3264–3563(300 aa)
链 K
4248–4253(6 aa)
链 L
3264–3563(300 aa)
链 L
4248–4253(6 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 1
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Na/K phosphate (pH 6.2), 50% PEG200
|
分辨率 2.67 Å
R-free 0.239
|
|
8DRW
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp9-nsp10 (C9) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 7
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 M
3264–3563(300 aa)
链 M
4248–4253(6 aa)
链 N
3264–3563(300 aa)
链 N
4248–4253(6 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 2
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
PO4 PHOSPHATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Na/K phosphate (pH 6.2), 50% PEG200
|
分辨率 2.67 Å
R-free 0.239
|
|
8DRX
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp10-nsp11 (C10) cut site sequence (form 2)
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3563(300 aa)
链 A
4387–4392(6 aa)
链 B
3264–3563(300 aa)
链 B
4387–4392(6 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M tri-Na Citrate (pH 5.6), 35% t-Butanol
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.192
|
|
8DRY
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3563(300 aa)
链 A
5319–5324(6 aa)
链 B
3264–3563(300 aa)
链 B
5319–5324(6 aa)
|
未记录
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.9M CHES (pH 9.5), 20% PEG 8K
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.264
|
|
8DRY
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3264–3563(300 aa)
链 C
5319–5324(6 aa)
链 D
3264–3563(300 aa)
链 D
5319–5324(6 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.9M CHES (pH 9.5), 20% PEG 8K
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.264
|
|
8DRY
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
3264–3563(300 aa)
链 E
5319–5324(6 aa)
链 F
3264–3563(300 aa)
链 F
5319–5324(6 aa)
|
未记录
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.9M CHES (pH 9.5), 20% PEG 8K
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.264
|
|
8DRY
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 G
3264–3563(300 aa)
链 G
5319–5324(6 aa)
链 H
3264–3563(300 aa)
链 H
5319–5324(6 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.9M CHES (pH 9.5), 20% PEG 8K
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.264
|
|
8DRY
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 I
3264–3563(300 aa)
链 I
5319–5324(6 aa)
链 J
3264–3563(300 aa)
链 J
5319–5324(6 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.9M CHES (pH 9.5), 20% PEG 8K
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.264
|
|
8DRY
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 6
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 K
3264–3563(300 aa)
链 K
5319–5324(6 aa)
链 L
3264–3563(300 aa)
链 L
5319–5324(6 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.9M CHES (pH 9.5), 20% PEG 8K
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.264
|
|
8DRZ
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp13-nsp14 (C13) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3563(300 aa)
链 B
3264–3563(300 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 5
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Na citrate (pH 5.6), 16% PEG 2K
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.223
|
|
8DRZ
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp13-nsp14 (C13) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3264–3563(300 aa)
链 D
3264–3563(300 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
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PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2
1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1
NA SODIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Na citrate (pH 5.6), 16% PEG 2K
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.223
|
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8DRZ
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp13-nsp14 (C13) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
3264–3563(300 aa)
|
突变:C145A
|
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Na citrate (pH 5.6), 16% PEG 2K
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.223
|
|
8DRZ
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp13-nsp14 (C13) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 F
3264–3563(300 aa)
链 G
3264–3563(300 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Na citrate (pH 5.6), 16% PEG 2K
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.223
|
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8DS0
Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with nsp14-nsp15 (C14) cut site sequence (form 2)
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3563(300 aa)
链 B
3264–3563(300 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M MIB buffer (pH 6.0), 25% PEG 1500
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.246
|
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8DS1
Structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3563(300 aa)
链 B
3264–3563(300 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.15M DL-Malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.248
|
|
8DS1
Structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3264–3563(300 aa)
链 D
3264–3563(300 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.15M DL-Malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.248
|
|
8DS1
Structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
3264–3563(300 aa)
链 F
3264–3563(300 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.15M DL-Malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.248
|
|
8DS1
Structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 G
3264–3563(300 aa)
链 H
3264–3563(300 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.15M DL-Malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.248
|
|
8DS1
Structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 I
3264–3563(300 aa)
链 J
3264–3563(300 aa)
|
未记录
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.15M DL-Malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.248
|
|
8DS1
Structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with nsp12-nsp13 (C12) cut site sequence
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 6
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 K
3264–3563(300 aa)
链 L
3264–3563(300 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.15M DL-Malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.248
|
|
8DS2
Structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with the nsp13-nsp14 (C13) cut site sequence (form 2)
提交 2022-07-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3563(300 aa)
链 B
3264–3563(300 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
GOL GLYCEROL × 11
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.8M Succinic Acid (pH 7.0)
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.187
|
|
8DSU
Crystal Structure of SARS CoV-2 Mpro with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231
提交 2022-07-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.254
|
|
8DT9
Crystal Structure of SARS CoV-2 Mpro mutant L141R with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231
提交 2022-07-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:L141R
突变:L141R
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
NA SODIUM ION × 9
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.243
|
|
8DZ0
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease in complex with Ensitrelvir
提交 2022-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 2.29 Å
R-free 0.275
|
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8DZ1
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease mutant M49I in complex with Ensitrelvir
提交 2022-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:M49I
突变:M49I
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.256
|
|
8DZ2
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease in complex with Nirmatrelvir
提交 2022-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 2.13 Å
R-free 0.230
|
|
8DZ6
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease mutant Q189K in complex with Nirmatrelvir
提交 2022-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:Q189K
突变:Q189K
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 2.37 Å
R-free 0.296
|
|
8DZ9
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease G143S mutant in complex with Nirmatrelvir
提交 2022-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:G143S
突变:G143S
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.251
|
|
8DZ9
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease G143S mutant in complex with Nirmatrelvir
提交 2022-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
突变:G143S
突变:G143S
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.251
|
|
8DZA
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease A193T mutant in complex with Nirmatrelvir
提交 2022-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:A193T
突变:A193T
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.242
|
|
8DZB
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor 11
提交 2022-08-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
U6Y benzyl {(3S)-1-[(2S)-1-({(2S,3R)-4-(cyclopropylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-5-oxopyrrolidin-3-yl}carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;25% PEG 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M HEPES 7.5
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.210
|
|
8DZC
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor 17
提交 2022-08-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
U76 (3,5-difluorophenyl)methyl {(3S)-1-[(2S)-1-({(2S,3R)-4-(cyclopropylamino)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-6-oxopiperidin-3-yl}carbamate × 2
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;25 % 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M HEPES 7.5
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.245
|
|
8E1Y
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main protease A193S mutant in complex with Nirmatrelvir
提交 2022-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:A193S
突变:A193S
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG 4000 Cryo protected with 40% PEG 400
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.272
|
|
8E25
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease M49I mutant in complex with Nirmatrelvir
提交 2022-08-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:M49I
突变:M49I
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M MES pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG 4000 Cryo protected with 40% PEG 400
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.240
|
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8E26
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease N142S mutant in complex with Nirmatrelvir
提交 2022-08-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:N142S
突变:N142S
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M MES, pH 6.7, 5% v/v DMSO, 8% w/v PEG4000, 30% w/v PEG400
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.265
|
|
8E4J
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease H41A miniprecursor mutant
提交 2022-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3258–3569(312 aa)
链 B
3258–3569(312 aa)
|
突变:Q0E, H41A
突变:Q0E, H41A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.207
|
|
8E4R
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease H41A miniprecursor mutant in complex with GC373
提交 2022-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3258–3569(312 aa)
链 B
3258–3569(312 aa)
|
突变:Q0E, H41A
突变:Q0E, H41A
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.195
|
|
8E4W
Crystal Structure of SARS CoV-2 Mpro mutant N142P with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231
提交 2022-08-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:N142P
突变:N142P
|
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;293 K;10-20% (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.75 Å
R-free 0.241
|
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8E5C
Crystal Structure of SARS CoV-2 Mpro mutant L50F with Nirmatrelvir captured in two conformational states
提交 2022-08-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:L50F
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
NA SODIUM ION × 12
CL CHLORIDE ION × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.254
|
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8E5X
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a dimethyl sulfinyl benzene inhibitor
提交 2022-08-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
链 B
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
UO9 (2~{S})-2-[[(2~{S})-4-methyl-2-[[2-methyl-2-[oxidanyl(phenyl)-$l^{3}-sulfanyl]propoxy]carbonylamino]pentanoyl]amino]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
URR N~2~-(ethoxycarbonyl)-N-{(1S,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-1-sulfanylpropan-2-yl}-L-leucinamide × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM Bis-Trs Propane, 200 mM KSCN
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.215
|
|
8E5Z
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a dimethyl sulfonyl benzene inhibitor
提交 2022-08-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
WJB (1R,2S)-2-[(N-{[2-(benzenesulfonyl)-2-methylpropoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
UQO (1S,2S)-2-[(N-{[2-(benzenesulfonyl)-2-methylpropoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;25 % (w/v) PEG 1500, 100 mM MIB
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.253
|
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8E61
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a m-chlorophenyl dimethyl sulfane inhibitor
提交 2022-08-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 1
VLU (1R,2S)-2-{[N-({2-[(3-chlorophenyl)sulfanyl]-2-methylpropoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
VM0 (1S,2S)-2-{[N-({2-[(3-chlorophenyl)sulfanyl]-2-methylpropoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;30% (w/v) PEG 550 MME, 100 mM Bis-Tris, 50 mM calcium chloride
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.217
|
|
8E63
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a phenyl sulfane inhibitor
提交 2022-08-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
链 B
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
UV2 (1R,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-2-[(N-{[2-(phenylsulfanyl)ethoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]propane-1-sulfonic acid × 2
UUR 2-phenylsulfanylethyl ~{N}-[(2~{S})-1-[[(1~{S},2~{S})-1-[bis(oxidanyl)-oxidanylidene-$l^{5}-sulfanyl]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;25% (w/v) PEG 1500, 100 mM MIB
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.217
|
|
8E64
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a benzimidazole dimethyl sulfane inhibitor
提交 2022-08-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
WEL (1S,2S)-2-{[N-({2-[(1H-benzimidazol-2-yl)sulfanyl]-2-methylpropoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
WEQ (1~{R},2~{S})-2-[[(2~{S})-2-[[2-(1~{H}-benzimidazol-2-ylsulfanyl)-2-methyl-propoxy]carbonylamino]-4-methyl-pentanoyl]amino]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid;molecular oxygen × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM Bis-Trs Propane, 200 mM KSCN
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.212
|
|
8E65
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a p-chlorodimethyl oxybenzene inhibitor
提交 2022-08-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
WF5 (1S,2S)-2-[(N-{[2-(4-chlorophenoxy)-2-methylpropoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;15% (w/v) PEG 20000, 100 mM Hepes
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.235
|
|
8E68
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a p-fluorodimethyl oxybenzene inhibitor
提交 2022-08-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
WGO N~2~-{[2-(4-fluorophenoxy)-2-methylpropoxy]carbonyl}-N-{(1R,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-1-sulfanylpropan-2-yl}-L-leucinamide × 2
WGU (1S,2S)-2-[(N-{[2-(4-fluorophenoxy)-2-methylpropoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;20 % (w/v) PEG 3350, 100 mM Bis-Tris propane, 20 mM sodium/potassium phosphate
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.217
|
|
8E69
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a m-fluorodimethyl oxybenzene inhibitor
提交 2022-08-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
WIO (1R,2S)-2-[(N-{[2-(3-fluorophenoxy)-2-methylpropoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;20 % (w/v) PEG 3350, 100 mM Bis-Tris propane, 20 mM sodium/potassium phosphate
|
分辨率 2.26 Å
R-free 0.265
|
|
8E6A
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a p-chlorophenylethanol based inhibitor
提交 2022-08-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 1
WIX (1S,2S)-2-[(N-{[(2R)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxypropoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
WJ0 (1R,2S)-2-[(N-{[(2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxypropoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-1-hydroxy-3-[(3R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;20% (w/v) PEG 6000, 100 mM MES, 200 mM NaCl
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.277
|
|
8EHJ
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) H172Q Mutant
提交 2022-09-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:H172Q
突变:H172Q
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.250
|
|
8EHK
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) T135I Mutant
提交 2022-09-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:T135I
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.18 Å
R-free 0.233
|
|
8EHL
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) S144M Mutant
提交 2022-09-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:S144M
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.254
|
|
8EHM
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) S144F Mutant
提交 2022-09-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:S144F
突变:S144F
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.243
|
|
8EIR
SARS-CoV-2 polyprotein substrate regulates the stepwise Mpro cleavage reaction
提交 2022-09-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.49 Å
|
|
8EJ7
Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates
提交 2022-09-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:E47K
突变:E47K
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Potassium Thiocyanate, 0.1 M Bis-Tris Propane pH 7.5, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.270
|
|
8EJ9
Polymorphism in SARS-CoV-2 Nsp5 main protease reveals differences in cleavage of viral and host substrates
提交 2022-09-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:E47N
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Sodium Fluoride, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.329
|
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8EKE
Cryo-EM structure of SARS CoV-2 Mpro WT protease
提交 2022-09-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.36 Å
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8EOY
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI37
提交 2022-10-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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WOH benzyl {(2S)-1-[2-(3-amino-3-oxopropyl)-2-(chloroacetyl)hydrazinyl]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl}carbamate (non-preferred name) × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.299
|
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8ERS
PanDDA analysis -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398507 - (R,S) isomer
提交 2022-10-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
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未记录
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WQO (1R,2S)-1-[(4-amino-2-hydroxybenzoyl)oxy]-2,3-dihydro-1H-indene-2-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.162
|
|
8ERS
PanDDA analysis -- Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with Z4718398507 - (R,S) isomer
提交 2022-10-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;293 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.162
|
|
8EUA
Structure of SARS-CoV2 PLpro bound to a covalent inhibitor
提交 2022-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1563–1879(317 aa)
|
未记录
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WUK methyl 4-{2-[3-(2-{[(1R)-1-(naphthalen-1-yl)ethyl]carbamoyl}phenyl)propanoyl]hydrazinyl}-4-oxobutanoate × 1
ZN ZINC ION × 3
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;PEG 3350, CaCl2, CdCl2 and CoCl3
|
分辨率 3.10 Å
R-free 0.253
|
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8EY2
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Main protease C145S in complex with N-terminal peptide
提交 2022-10-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3259–3569(311 aa)
片段:UNP residues 3259-3569
链 B
3259–3569(311 aa)
片段:UNP residues 3259-3569
链 C
3259–3569(311 aa)
片段:UNP residues 3259-3569
链 D
3259–3569(311 aa)
片段:UNP residues 3259-3569
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.8;20 mM Tris pH 7.8, 150 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
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8EYJ
Crystal Structure of uncleaved SARS-CoV-2 Main Protease C145S mutant in complex with Nirmatrelvir
提交 2022-10-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3263–3569(307 aa)
链 B
3263–3569(307 aa)
|
未记录
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES pH 6.7, 5% DMSO, 8% PEG 4000
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.234
|
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8EZV
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML2006a
提交 2022-11-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
X6O (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-(azetidin-1-yl)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;289 K;Sitting drops consisted of 0.23 uL A:0.23 uL B:
A) 5.3 mg/mL Mpro + 0.9 mM ML2006a in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO
B) 20% v/v 2-Propanol, 0.1 M Tris pH 8.0, 5% w/v PEG 8000
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.220
|
|
8EZZ
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML2006a2
提交 2022-11-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
X70 (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-(3,3-difluoroazetidin-1-yl)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;289 K;Sitting drops consisted of 0.23 uL A:0.23 uL B:
A) 5.3 mg/mL Mpro + 0.9 mM ML2006a2 in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO
B) 0.1 M HEPES pH 7.5 4% w/v PEG 8000
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.254
|
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8F02
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML2006a4
提交 2022-11-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
X6T (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-(3,3-dimethylazetidin-1-yl)-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]butan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;289 K;Sitting drops consisted of 0.23 uL A:0.23 uL B:
A) 5.3 mg/mL Mpro + 0.9 mM ML2006a4 in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO
B) 0.1 M BICINE pH 8.5, 8% w/v mPEG 5000
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.255
|
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8F2C
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML3006a
提交 2022-11-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
X9Z (1R,2S,5S)-N-[(2S,3R)-4-(azetidin-1-yl)-3-hydroxy-4-oxo-1-(2-oxopyrrolidin-1-yl)butan-2-yl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;289.15 K;Sitting drops consisted of 0.23 uL A:0.23 uL B:
A) 5.3 mg/mL Mpro + 0.9 mM ML3006a in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO
B) 0.1 M MES pH 6.5, 4% PEG 35000
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.267
|
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8F2D
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with ML4006a
提交 2022-11-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XA8 (1R,2S,5S)-N-[(2S,3R)-4-(azetidin-1-yl)-3-hydroxy-4-oxo-1-(2-oxopiperidin-1-yl)butan-2-yl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;289.15 K;Sitting drops consisted of 0.23 uL A:0.23 uL B:
A) 5.3 mg/mL Mpro + 0.9 mM ML4006a in in 20 mM Tris pH 7.3 + 3 mM TCEP + 3 % DMSO
B) 0.1 M HEPES pH 7.5, 6% PEG 20000
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.252
|
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8F2E
Crystal Structure of the CoV-Y domain of SARS-CoV-2 Nonstructural Protein 3
提交 2022-11-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2478–2763(286 aa)
片段:CoV-Y domain
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;20%(w/v) PEG 3350,
0.18M Tri-Ammonium Citrate
|
分辨率 2.43 Å
R-free 0.232
|
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8F44
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a dimethyl phenyl sulfane inhibitor
提交 2022-11-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
链 B
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
XFF (2-methyl-2-phenylsulfanyl-propyl) ~{N}-[(2~{S})-1-[[(1~{S},2~{S})-1-[bis(oxidanyl)-oxidanylidene-$l^{5}-sulfanyl]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2
XFR (1R,2S)-1-hydroxy-2-[(N-{[2-methyl-2-(phenylsulfanyl)propoxy]carbonyl}-L-leucyl)amino]-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;291 K;20% (w/v) PEG 2,000 MME, 100 mM Tris, 200 mM Trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.219
|
|
8F45
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a phenyl dimethyl sulfane inhibitor (cyclopropyl ketoamide warhead)
提交 2022-11-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
XF8 (2-methyl-2-phenylsulfanyl-propyl) ~{N}-[(2~{S})-1-[[(2~{S},3~{S})-3-[bis(oxidanyl)-oxidanylidene-$l^{5}-sulfanyl]-4-(cyclopropylamino)-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;28% (w/v) PEG 2000 MME, 100 mM Bis-Tris
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.204
|
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8F46
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a dimethyl phenyl sulfane inhibitor (cyano warhead)
提交 2022-11-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
XCK N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-N~2~-{[2-methyl-2-(phenylsulfanyl)propoxy]carbonyl}-L-leucinamide × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;25% (w/v) PEG 1500, 100 mM PCTP
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.221
|
|
8F4S
Crystal Structure of the SARS-CoV-2 2'-O-Methyltransferase with Compound 5a bound to the Cryptic Pocket of nsp16
提交 2022-11-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 1
XDU 4-[(E)-2-(2,4-dichlorophenyl)ethenyl]-6-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-ol × 1
FMT FORMIC ACID × 5
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;Protein: 4 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 5% Glycerol;
Screen: Anions (B2), 0.1M HEPES pH 7.5, 1.25M Sodium acetate;
Soaks: Compound 5a, 24 hours;
Cryo: 4M Sodium formate
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.191
|
|
8F4Y
Crystal Structure of SARS-CoV-2 2'-O-Methyltransferase in Complex with Compound 5a covalently bound to nsp16 and nsp10
提交 2022-11-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 2
XDU 4-[(E)-2-(2,4-dichlorophenyl)ethenyl]-6-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-ol × 1
XE0 4-[2-(2,4-dichlorophenyl)ethyl]-6-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-ol × 3
FMT FORMIC ACID × 10
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;Protein: 3.83 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 5% Glycerol;
Screen: Anions (B2), 0.1M HEPES pH 7.5, 1.25M Sodium acetate;
Soaks: Compound 5a, 24 hours;
Cryo: 4M Sodium formate
|
分辨率 2.13 Å
R-free 0.180
|
|
8FIV
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor Jun10541R
提交 2022-12-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Y0I (3Z)-N-([1,1'-biphenyl]-4-yl)-3-imino-N-[(1R)-2-oxo-2-{[(1S)-1-phenylethyl]amino}-1-(pyridin-3-yl)ethyl]propanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;25 % 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M HEPES 7.5
|
分辨率 2.51 Å
R-free 0.277
|
|
8FIW
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease in complex with inhibitor Jun10221
提交 2022-12-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Y0E N-([1,1'-biphenyl]-4-yl)-N-[(1R)-2-oxo-2-{[(1S)-1-phenylethyl]amino}-1-(pyridin-3-yl)ethyl]prop-2-enamide × 2
Y1E N-([1,1'-biphenyl]-4-yl)-N-[(1S)-2-oxo-2-{[(1S)-1-phenylethyl]amino}-1-(pyridin-3-yl)ethyl]prop-2-enamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;25% PEG 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M HEPES 7.5
|
分辨率 2.54 Å
R-free 0.263
|
|
8FRJ
Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SGC0946
提交 2023-01-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
6225–6433(209 aa)
|
突变:A4R, E67V, A77K
|
ZN ZINC ION × 1
AW2 5-bromo-7-{5-[(3-{[(4-tert-butylphenyl)carbamoyl]amino}propyl)(propan-2-yl)amino]-5-deoxy-beta-D-ribofuranosyl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293.15 K;11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.204
|
|
8FRK
Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SGC8158
提交 2023-01-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
6225–6433(209 aa)
|
突变:A4R,E67V,A77K
|
ZN ZINC ION × 1
EOH ETHANOL × 1
MJ7 5'-S-(4-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}butyl)-5'-thioadenosine × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293.15 K;11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.251
|
|
8FTC
Crystal structure of main protease of SARS-CoV-2 complexed with inhibitor
提交 2023-01-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
Y8O (1R,2S,5S)-3-[N-(difluoroacetyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;0.2M CH2(CO2Na)2; 20% PEG3350
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.206
|
|
8FTL
Crystal structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease (Mpro) in complex with inhibitor Jun89-3-C1
提交 2023-01-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
5ZF N-([1,1'-biphenyl]-4-yl)-2-chloro-N-[(1R)-2-oxo-2-{[(1S)-1-phenylethyl]amino}-1-(pyridin-3-yl)ethyl]acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.259
|
|
8FWN
Crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease C111S mutant
提交 2023-01-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
突变:C111S
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PO4 PHOSPHATE ION × 3
GOL GLYCEROL × 4
ACT ACETATE ION × 1
ZN ZINC ION × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;277 K;100 mM Sodium acetate, 0.8 M Monosodium phosphate, 1.2 M Dipotassium hydrogen phosphate
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.198
|
|
8FWO
Crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease
提交 2023-01-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
PO4 PHOSPHATE ION × 1
ZN ZINC ION × 1
CL CHLORIDE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;277 K;100 mM Sodium acetate, 0.8 M Monosodium phosphate, 1.2 M Dipotassium hydrogen phosphate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.217
|
|
8FY6
SARS-CoV-2 main protease in complex with covalent inhibitor
提交 2023-01-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YVZ (1R,2S,5S)-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-N-{(2R)-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277.15 K;0.1M MIB pH 6.5, 13%(w/v) PEG 1500, 10% (v/v) MPD
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.222
|
|
8FY7
SARS-CoV-2 main protease in complex with covalent inhibitor
提交 2023-01-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YFK 4-methoxy-N-[(2S)-4-methyl-1-oxo-1-({(2S)-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]but-3-en-2-yl}amino)pentan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;291.15 K;29%(w/v) PEG 1500, 0.1M MIB pH 5.5
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.213
|
|
8GFK
Room temperature X-ray structure of truncated SARS-CoV-2 main protease C145A mutant, residues 1-304
提交 2023-03-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
|
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;15-18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.206
|
|
8GFN
Room temperature X-ray structure of truncated SARS-CoV-2 main protease C145A mutant, residues 1-304, in complex with BBH1
提交 2023-03-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
链 B
3264–3567(304 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
ZGI (1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;15-18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.206
|
|
8GFO
Room temperature X-ray structure of truncated SARS-CoV-2 main protease C145A mutant, residues 1-304, in complex with GC373
提交 2023-03-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
|
突变:C145A
|
ZH0 N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;15-18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.202
|
|
8GFR
Room temperature X-ray structure of truncated SARS-CoV-2 main protease C145A mutant, residues 1-304, in complex with NBH2
提交 2023-03-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
|
突变:C145A
|
ZGO (1R,2S,5S)-N-{(1S)-1-cyano-2-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]ethyl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-({1-[(2-methylpropane-2-sulfonyl)methyl]cyclohexyl}carbamoyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;15-18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.202
|
|
8GFU
Room temperature X-ray structure of truncated SARS-CoV-2 main protease C145A mutant, residues 1-304, in complex with nirmatrelvir (NMV)
提交 2023-03-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
|
突变:C145A
|
ZGW Nirmatrelvir × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;15-18% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.193
|
|
8GIA
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) Nsp3 macrodomain in complex with TFMU-ADPr
提交 2023-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
ZJ3 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-{[2-oxo-4-(trifluoromethyl)-2H-1-benzopyran-7-yl]oxy}oxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100 mM Tris-HCl, pH 8, 200 mM sodium acetate, 30% PEG4000
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.258
|
|
8GIA
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) Nsp3 macrodomain in complex with TFMU-ADPr
提交 2023-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
ZJ3 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-{[2-oxo-4-(trifluoromethyl)-2H-1-benzopyran-7-yl]oxy}oxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100 mM Tris-HCl, pH 8, 200 mM sodium acetate, 30% PEG4000
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.258
|
|
8GW1
A mechanism for SARS-CoV-2 RNA capping and its inhibition by nucleotide analogue inhibitors
提交 2022-09-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:nonameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253(113 aa)
片段:UNP residues 4141-4253
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MN MANGANESE (II) ION × 2
U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å
|
|
8GW4
SARS-CoV-2 Mpro 1-302/C145A in complex with peptide 8-1
提交 2022-09-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3565(302 aa)
片段:UNP residues 3264-3565
链 B
3264–3565(302 aa)
片段:UNP residues 3264-3565
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M ammonium chloride, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.244
|
|
8GWB
SARS-CoV-2 E-RTC complex with RNA-nsp9
提交 2022-09-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:decameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253(113 aa)
片段:UNP residues 4141-4253
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MN MANGANESE (II) ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å
|
|
8GWE
SARS-CoV-2 E-RTC complex with RNA-nsp9 and GMPPNP
提交 2022-09-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:decameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5917(593 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5917(593 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253(113 aa)
片段:UNP residues 4141-4253
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.66 Å
|
|
8GWF
A mechanism for SARS-CoV-2 RNA capping and its inhibition by nucleotide analogue inhibitors
提交 2022-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:nonameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253(113 aa)
片段:UNP residues 4141-4253
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å
|
|
8GWG
SARS-CoV-2 E-RTC complex with SMP-nsp9 and GMPPNP
提交 2022-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:nonameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253(113 aa)
片段:UNP residues 4141-4253
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
6GS 2'-deoxy-2'-fluoro-2'-methyluridine 5'-(trihydrogen diphosphate) × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å
|
|
8GWI
SARS-CoV-2 E-RTC complex with SMP-nsp9 and GTP
提交 2022-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:nonameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
6GS 2'-deoxy-2'-fluoro-2'-methyluridine 5'-(trihydrogen diphosphate) × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å
|
|
8GWJ
SARS CoV-2 Mpro 1-302 C145A in complex with peptide 7
提交 2022-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3565(302 aa)
片段:UNP residues 3264-3565
链 B
3264–3565(302 aa)
片段:UNP residues 3264-3565
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M ammonium chloride, 20%
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.271
|
|
8GWK
SARS-CoV-2 RNA E-RTC complex with RMP-nsp9 and GMPPNP
提交 2022-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:nonameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253(113 aa)
片段:UNP residues 4141-4253
|
未记录
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ZN ZINC ION × 8
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
F86 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanylpyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-cyano-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.72 Å
|
|
8GWM
SARS-CoV-2 E-RTC bound with MMP-nsp9 and GMPPNP
提交 2022-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:nonameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253(113 aa)
片段:UNP residues 4141-4253
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
6GS 2'-deoxy-2'-fluoro-2'-methyluridine 5'-(trihydrogen diphosphate) × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.64 Å
|
|
8GWN
A mechanism for SARS-CoV-2 RNA capping and its inhibitor of AT-527
提交 2022-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:nonameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å
|
|
8GWO
A mechanism for SARS-CoV-2 RNA capping and its inhibition by nucleotide analogue inhibitors
提交 2022-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:nonameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 G
4141–4253(113 aa)
片段:UNP residues 4141-4253
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
8GWS
SARS-CoV-2 Mpro 1-302 c145a in complex with peptide 4
提交 2022-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3565(302 aa)
片段:UNP residues 3264-3565
链 B
3264–3565(302 aa)
片段:UNP residues 3264-3565
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M magnesium formate dihydrate, 20% PEG3350
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.253
|
|
8GY6
Structure of SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase with gossypol binding
提交 2022-09-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
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GO3 Gossypol × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率未提供
|
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8HDA
Crystal structure of Ubl1 (residues 18-111) of SARS-CoV-2
提交 2022-11-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
836–929(94 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;15% w/v PEG 1500
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.229
|
|
8HDA
Crystal structure of Ubl1 (residues 18-111) of SARS-CoV-2
提交 2022-11-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
836–929(94 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;15% w/v PEG 1500
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.229
|
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8HEF
The Crystal structure of deuterated S-217622 (Ensitrelvir) bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2
提交 2022-11-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3564(301 aa)
链 B
3264–3564(301 aa)
|
未记录
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;289 K;0.2 M Ammonium acetate, 15% (w/v) PEG3350
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.170
|
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8HQF
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease G15S mutant in complex with inhibitor YH-53
提交 2022-12-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3564(299 aa)
链 B
3266–3564(299 aa)
|
突变:G15S
突变:G15S
|
HUR N-[(2S)-1-[[(2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-oxidanylidene-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1M HEPES 7.5, 20% PEG 10000
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.230
|
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8INQ
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) G15S Mutant
提交 2023-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:G15S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;293 K;1%(2% w/v Cytidine, 2% w/v Inosine, 2% w/v Ribavirin, 2% w/v Thymidine, 2% w/v Uridine), 0.1M(Sodium HEPES; MOPS (acid))PH7.5, 30%(40% v/v PEG 500* MME; 20 % w/v PEG 20000)
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.221
|
|
8INT
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) K90R Mutant
提交 2023-03-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:K90R
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;293 K;0.6%(1% w/v Ampicillin sodium salt, 1% w/v Apramycin sulfate salt, 1% w/v Bacitracin, 1% w/v Dihydrostreptomycin sesquisulfate, 1% w/v Gentamicin sulfate, 1% w/v Spectinomycin dihydrochloride pentahydrate), 0.1M(Tris (base); BICINE)PH8,5, 30%(40% v/v PEG 500* MME; 20 % w/v PEG 20000)
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.224
|
|
8INU
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) G15S Mutant in Complex with Inhibitor nirmatrelvir
提交 2023-03-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;293 K;0.8%(2% w/v Lidocaine hydrochloride monohydrate, 2% w/v Procaine hydrochloride, 2% w/v Proparacaine hydrochloride, 2% w/v tetracaine hydrochloride), 0.1M(Tris (base); BICINE)PH8.5, 30%(40% v/v Glycerol; 20% w/v PEG 4000)
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.214
|
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8INW
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) K90R Mutant in Complex with Inhibitor nirmatrelvir
提交 2023-03-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;293 K;1%(2% w/v Cytidine, 2% w/v Inosine, 2% w/v Ribavirin, 2% w/v Thymidine, 2% w/v Uridine), 0.1M(Tris (base); BICINE)PH8.5. 30%(40% v/v Glycerol; 20% w/v PEG 4000)
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.244
|
|
8INX
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) G15S Mutant in Complex with Inhibitor ensitrelvir
提交 2023-03-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;293 K;4% v/v TacsimateTM pH 4.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.221
|
|
8INY
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) K90R Mutant in Complex with Inhibitor ensitrelvir
提交 2023-03-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;293 K;1.2%(3% w/v CHAPS, 3% w/v CHAPSO, 3% w/v Sodium glycocholate hydrate, 3% w/v Taurocholic acid sodium salt hydrate), 0.1M(Imidazole; MES monohydrate (acid))PH6.5, 30%(40% v/v PEG 500* MME; 20 % w/v PEG 20000)
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.215
|
|
8J32
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease in complex with PF00835231
提交 2023-04-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3564(299 aa)
链 B
3266–3564(299 aa)
|
未记录
|
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M HEPES 7.5, 20% PEG 10000
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.254
|
|
8J38
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease P132H mutant in complex with PF00835231
提交 2023-04-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3564(299 aa)
链 B
3266–3564(299 aa)
|
突变:P132H
突变:P132H
|
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M BICINE pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol 10,000
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.241
|
|
8J39
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease V186F mutant in complex with PF00835231
提交 2023-04-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3265–3563(299 aa)
链 B
3265–3563(299 aa)
|
突变:V186F
突变:V186F
|
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2M Na2SO4, 20%PEG3350
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.251
|
|
8JPQ
SARS-CoV-2 Mpro in complex with D-5-96
提交 2023-06-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3565(302 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.15 M DL - Malic acid
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.250
|
|
8JUX
Crystal structure of SARS-CoV-2 Papain-like protease complexed with noncovalent inhibitor SR-01
提交 2023-06-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1880(317 aa)
|
突变:C111S
|
MG MAGNESIUM ION × 1
V00 ~{N}-[(3-fluorophenyl)methyl]-1-[(1~{R})-1-(3-methoxynaphthalen-1-yl)ethyl]piperidine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;283 K;0.05 M sodium cacodylate, pH5.5 , 0.1 M Magnesium acetate, 16% PEG6k
|
分辨率 3.20 Å
R-free 0.233
|
|
8JUX
Crystal structure of SARS-CoV-2 Papain-like protease complexed with noncovalent inhibitor SR-01
提交 2023-06-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1564–1880(317 aa)
|
突变:C111S
|
V00 ~{N}-[(3-fluorophenyl)methyl]-1-[(1~{R})-1-(3-methoxynaphthalen-1-yl)ethyl]piperidine-4-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;283 K;0.05 M sodium cacodylate, pH5.5 , 0.1 M Magnesium acetate, 16% PEG6k
|
分辨率 3.20 Å
R-free 0.233
|
|
8K67
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro M165V mutant
提交 2023-07-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:M165V
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.1;293 K;0.2 M BICINE, pH 8.1, 20% polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.251
|
|
8K68
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro M49K mutant
提交 2023-07-25
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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突变:M49K
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;0.2 M BIS-TRIS, pH 6.0, 20% w/v polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.205
|
|
8K6A
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro S301P mutant
提交 2023-07-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:S301P
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;293 K;0.2 M BIS-TRIS, pH 6.6, 20% polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.235
|
|
8K6B
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro M49K/M165V mutant
提交 2023-07-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:M49K,M165V
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;293 K;0.2 M BIS-TRIS propane, pH 7.3, 20% polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.208
|
|
8K6C
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro M49K/S301P mutant
提交 2023-07-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:M49K,S301P
突变:M49K,S301P
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.6;293 K;0.2 M LiSO4, 0.1 M BIS-TRIS, pH 6.6, 17.5% polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.280
|
|
8K6D
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro M49K/S301P mutant in complex with WU-04
提交 2023-07-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:M49K,S301P
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J7R ~{N}-[(1~{S},2~{R})-2-[[4-bromanyl-2-(methylcarbamoyl)-6-nitro-phenyl]amino]cyclohexyl]isoquinoline-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M sodium formate, 12% polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.181
|
|
8OKB
SARS-CoV2 NSP5 in complex with a peptidomimetic ligand
提交 2023-03-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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VQR methyl (4~{S})-4-[[(2~{S})-4-methyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoyl]amino]-5-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pentanoate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.2M Ammonium acetate, 20% PEG6000
|
分辨率 2.31 Å
R-free 0.267
|
|
8OKC
SARS-CoV2 NSP5 in complex with a GC-376 based peptidomimetic PROTAC
提交 2023-03-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
VQN (phenylmethyl) ~{N}-[(2~{R})-1-[[(~{Z},2~{S})-5-[4-[[1-[2-[(3~{R})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-6-fluoranyl-1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-5-yl]piperidin-4-yl]methyl]piperazin-1-yl]-5-oxidanylidene-1-[(3~{R})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]pent-3-en-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.2M Ammonium Acetate, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.249
|
|
8OKK
Crystal structure of F2F-2020184-00X bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2.
提交 2023-03-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
83F tert-butyl-N-[(2S)-3-methyl-1-[(2S,4S)-4-methyl-2-[[(2S)-1-oxidanyl-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 2
ACT ACETATE ION × 4
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5
FMT FORMIC ACID × 5
NA SODIUM ION × 3
CL CHLORIDE ION × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M Sodium formate 0.1M Ammonium
acetate 0.1M Sodium citrate tribasic
dihydrate 0.1M Potassium sodium tartrate
tetrahydrate 0.1M Sodium oxamate, 0.1 M Hepes/Mops pH 7.5, 12.5% v/v MPD; 12.5% PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.178
|
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8OKL
Crystal structure of F2F-2020185-01X bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2.
提交 2023-03-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
83N tert-butyl-N-[(2S)-1-[(2S,4S)-4-methoxy-2-[[(2S)-1-oxidanyl-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-3-methyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
FMT FORMIC ACID × 2
NA SODIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Sodium formate 0.1M Ammonium
acetate 0.1M Sodium citrate tribasic
dihydrate 0.1M Potassium sodium tartrate
tetrahydrate 0.1M Sodium oxamate, 0.1 M Hepes/Mops pH 7.5, 12.5% v/v MPD; 12.5% PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.189
|
|
8OKM
Crystal structure of F2F-2020197-00X bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2.
提交 2023-03-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
84C tert-butyl-N-[(2S)-1-[(3S,3aS,6aR)-3-[[(2S)-1-oxidanyl-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]carbamoyl]-3,3a,4,5,6,6a-hexahydro-1H-cyclopenta[c]pyrrol-2-yl]-3-methyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 2
CL CHLORIDE ION × 4
BR BROMIDE ION × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.09M Sodium fluoride 0.09M Sodium
bromide 0.09M Sodium iodide, 0.1M Hepes/MOPS pH 7.5, 0.1 M Hepes/Mops pH 7.5, 12.5% v/v MPD; 12.5% PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.187
|
|
8OKN
Crystal structure of F2F-2020198-00X bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2.
提交 2023-03-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
83W tert-butyl-N-[(2S,3R)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-1-oxidanylidene-1-[(2S)-2-[[(2S)-1-oxidanyl-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]butan-2-yl]carbamate × 2
CL CHLORIDE ION × 2
NA SODIUM ION × 3
MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.12M 1,6-Hexanediol 0.12M 1-Butanol 0.12M 1,2-Propanediol 0.12M 2-Propanol
0.12M 1,4-Butanediol 0.12M 1,3-Propanediol, 0.1M Tris/BICINE pH 8.5, 12.5% v/v MPD; 12.5% PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.35 Å
R-free 0.174
|
|
8OSX
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with ATP
提交 2023-04-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 30
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
CL CHLORIDE ION × 2
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;900 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.223
|
|
8OT0
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with MTA and glycine
提交 2023-04-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 25
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
MTA 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE × 1
GLY GLYCINE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;900 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.210
|
|
8OTO
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with AMP
提交 2023-04-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 28
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;900 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.186
|
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8OTR
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with SAM analog BDH 33959089
提交 2023-04-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 28
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
W08 (2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-N-(1-methylpiperidin-4-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolane-2-carboxamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;900 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.209
|
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8OV1
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with ADP
提交 2023-04-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 31
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293.15 K;900 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.188
|
|
8OV2
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with Sangivamycin
提交 2023-04-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 22
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
SGV SANGIVAMYCIN × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.198
|
|
8OV3
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with 5-Iodotubercidin
提交 2023-04-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 21
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
5ID (2R,3R,4S,5R)-2-(4-AMINO-5-IODO-7H-PYRROLO[2,3-D]PYRIMIDIN-7-YL)-5-(HYDROXYMETHYL)TETRAHYDROFURAN-3,4-DIOL × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.211
|
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8OV4
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with Toyocamycin
提交 2023-04-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 22
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
TO1 4-amino-7-(beta-D-ribofuranosyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carbonitrile × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.207
|
|
8P54
Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 150 micromolar MG-132.
提交 2023-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
NA SODIUM ION × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.12M 1,6-Hexanediol 0.12M 1-Butanol
0.12M 1,2-Propanediol 0.12M 2-Propanol
0.12M 1,4-Butanediol 0.12M 1,3-Propanediol, 0.1 M imidazole/MES pH 6.5, 20% v/v PEG 500 MME 10 % w/v PEG 20000
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.186
|
|
8P55
Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 75 micromolar MG-132.
提交 2023-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
NA SODIUM ION × 2
ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.12 M Diethylene glycol 0.12M Triethylene
glycol 0.12M Tetraethylene glycol 0.12M
Pentaethylene glycol, 0.1M imidazole/MES pH 6.5, 20% v/v Ethylene glycol 10
% w/v PEG 8000
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.201
|
|
8P56
Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 150 micromolar X77.
提交 2023-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8
CL CHLORIDE ION × 2
X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.12M 1,6-Hexanediol 0.12M 1-Butanol
0.12M 1,2-Propanediol 0.12M 2-Propanol
0.12M 1,4-Butanediol 0.12M 1,3-Propanediol, 0.1M Hepes/MOPS pH 7.5, 20% v/v Ethylene glycol 10 % w/v PEG 8000
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.184
|
|
8P57
Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 75 micromolar X77.
提交 2023-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 1
X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M DL-Glutamic acid monohydrate, 0.1M
DL-Alanine 0.1M Glycine 0.1M DL-Lysine
monohydrochloride 0.1M DL-Serine, 0.1M Hepes/MOPS pH 7.5, 20% v/v Ethylene glycol 10 % w/v PEG 8000
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.183
|
|
8P58
Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 500 micromolar X77 enantiomer R.
提交 2023-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7
CL CHLORIDE ION × 2
X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.12M 1,6-Hexanediol 0.12M 1-Butanol
0.12M 1,2-Propanediol 0.12M 2-Propanol
0.12M 1,4-Butanediol 0.12M 1,3-Propanediol, 0.1 M Tris/Bicine pH 8.5, 20% v/v Ethylene glycol 10% w/v PEG 8000
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.179
|
|
8P5A
Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 5 millimolar X77 enantiomer R.
提交 2023-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10
CL CHLORIDE ION × 2
X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.12 M Diethylene glycol 0.12M Triethylene
glycol 0.12M Tetraethylene glycol 0.12M
Pentaethylene glycol, 0.1 M Tris/bicine pH 8.5, 20% v/v Ethylene glycol, 10% w/v PEG 8000
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.189
|
|
8P5B
Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 500 micromolar X77 enantiomer S.
提交 2023-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
CL CHLORIDE ION × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M Sodium formate 0.1M Ammonium
acetate 0.1M Sodium citrate tribasic
dihydrate 0.1M Potassium sodium tartrate
tetrahydrate 0.1M Sodium oxamate, 0.1M imidazole/MES pH 6.5, 12.5% v/v MPD 12.5% PEG 1000 12.5% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.47 Å
R-free 0.178
|
|
8P5C
Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 5 millimolar X77 enantiomer S.
提交 2023-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
9M5 ~{N}-(4-~{tert}-butylphenyl)-~{N}-[(1~{S})-2-(cyclohexylamino)-2-oxidanylidene-1-pyridin-3-yl-ethyl]-1~{H}-imidazole-4-carboxamide × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
ACT ACETATE ION × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
CL CHLORIDE ION × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M Sodium formate 0.1M Ammonium
acetate 0.1M Sodium citrate tribasic
dihydrate 0.1M Potassium sodium tartrate
tetrahydrate 0.1M Sodium oxamate, 0.1M imidazole/MES pH 6.5, 12.5% v/v MPD 12.5% PEG 1000 12.5% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.178
|
|
8P86
Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 5 mM MG-132, from an "old" crystal.
提交 2023-05-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
ALD N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl-N-[(2S)-1-hydroxy-4-methylpentan-2-yl]-L-leucinamide × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3
NA SODIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.06 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.06 M Calcium chloride dihydrate, 0.1 M Hepes/MOPS pH 7.5, 20% v/v PEG 500 MME, 10% w/v PEG 20000
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.197
|
|
8P87
Crystal structure of the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2 obtained in presence of 5 mM X77, from an "old" crystal.
提交 2023-05-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
ACT ACETATE ION × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
CL CHLORIDE ION × 2
X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M Sodium formate, 0.1M Ammonium acetate, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M Sodium oxamate, 0.1 M Hepes/MOPS pH 7.5, 20% v/v Ethylene glycol, 10 % w/v PEG 8000
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.191
|
|
8PH4
Co-Crystal structure of the SARS-CoV2 main protease Nsp5 with an Uracil-carrying X77-like inhibitor
提交 2023-06-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
MLI MALONATE ION × 1
YQN ~{N}-(4-~{tert}-butylphenyl)-~{N}-[(1~{S})-2-(cyclohexylamino)-2-oxidanylidene-1-pyridin-3-yl-ethyl]-2,6-bis(oxidanylidene)-5~{H}-pyrimidine-5-carboxamide × 4
NA SODIUM ION × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.4;295.15 K;23.5 % PEG 1.500, 0.2 M MIB pH 7.4, 5 % DMSO, 0.025 mM EDTA pH 7.0
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.248
|
|
8Q71
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the inhibitor GC-67
提交 2023-08-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
KKO (2~{S})-1-(3,4-dichlorophenyl)-4-(4-methoxypyridin-3-yl)carbonyl-~{N}-(thiophen-2-ylmethyl)piperazine-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;289 K;0.1M MES pH6.0, 20% PEG6000, 0.2M Ammonium chloride, 0.4 M GC67
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.290
|
|
8Q71
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the inhibitor GC-67
提交 2023-08-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
KKO (2~{S})-1-(3,4-dichlorophenyl)-4-(4-methoxypyridin-3-yl)carbonyl-~{N}-(thiophen-2-ylmethyl)piperazine-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;289 K;0.1M MES pH6.0, 20% PEG6000, 0.2M Ammonium chloride, 0.4 M GC67
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.290
|
|
8QDC
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the covalent inhibitor GUE-3642 (compound 1 in publication)
提交 2023-08-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XV9 (phenylmethyl) ~{N}-[(2~{S})-1-[[(2~{S})-1-[[(2~{S})-1-[[iminomethyl-(phenylmethyl)amino]-methyl-amino]-1-oxidanylidene-3-phenyl-propan-2-yl]amino]-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;0.03 M sodium fluoride, 0.03 M sodium bromide, 0.03 M sodium iodide, 0.1 M HEPES and MOPS, 12 % PEG500MME, 6% PEG20000, 200 microM inhibitor, condition MORPHEUS B5
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.239
|
|
8R7B
SARS-CoV-2 NSP14 in complex with SAH and TDI-015051
提交 2023-11-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5926–6452(527 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
IMD IMIDAZOLE × 1
YDT N-[(5-fluoranyl-1-benzofuran-4-yl)methyl]-1,5-dimethyl-4-(1,4,6,7-tetrahydropyrazolo[4,3-c]pyridin-5-ylsulfonyl)pyrrole-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;11% (v/v) isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.0 with SAH and TDI-014988
|
分辨率 2.18 Å
R-free 0.244
|
|
8R7B
SARS-CoV-2 NSP14 in complex with SAH and TDI-015051
提交 2023-11-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5926–6452(527 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
IMD IMIDAZOLE × 4
YDT N-[(5-fluoranyl-1-benzofuran-4-yl)methyl]-1,5-dimethyl-4-(1,4,6,7-tetrahydropyrazolo[4,3-c]pyridin-5-ylsulfonyl)pyrrole-2-carboxamide × 1
CL CHLORIDE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;11% (v/v) isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.0 with SAH and TDI-014988
|
分辨率 2.18 Å
R-free 0.244
|
|
8RF2
Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 1E7 refined against the anomalous diffraction data
提交 2023-12-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–126(117 aa)
|
未记录
|
A1H0G 1-benzothiophen-5-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291.15 K;The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
|
分辨率 1.44 Å
R-free 0.225
|
|
8RF3
Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 7G3 refined against the anomalous diffraction data
提交 2023-12-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–126(117 aa)
|
未记录
|
A1H0L 2-(1-benzothiophen-3-yl)ethanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291.15 K;The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
|
分辨率 1.23 Å
R-free 0.220
|
|
8RF4
Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 9D4 refined against the anomalous diffraction data
提交 2023-12-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–126(117 aa)
|
未记录
|
EQT 4-chloranyl-1~{H}-indazol-3-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291.15 K;The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
|
分辨率 1.11 Å
R-free 0.212
|
|
8RF5
Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 11A7 refined against the anomalous diffraction data
提交 2023-12-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–126(117 aa)
|
未记录
|
FBB 6-fluoro-1,3-benzothiazol-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291.15 K;The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.202
|
|
8RF6
Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 11A7_AL5 refined against the anomalous diffraction data
提交 2023-12-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–126(117 aa)
|
未记录
|
A1H0K 6-iodanyl-2,3-dihydro-1,3-benzothiazol-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291.15 K;The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
|
分辨率 1.08 Å
R-free 0.217
|
|
8RF8
Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 11A7_AL6 refined against the anomalous diffraction data
提交 2023-12-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–126(117 aa)
|
未记录
|
A1H0M 6-bromanyl-1,3-benzothiazol-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291.15 K;The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
|
分辨率 1.12 Å
R-free 0.248
|
|
8RFC
Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 7H2_AL1 refined against the anomalous diffraction data
提交 2023-12-12
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–126(117 aa)
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未记录
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A1H0N (1~{R})-1-(4-bromophenyl)ethanamine × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291.15 K;The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
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分辨率 1.10 Å
R-free 0.206
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8RFD
Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 7H2_AL2 refined against the anomalous diffraction data
提交 2023-12-12
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–126(117 aa)
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未记录
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A1H0J (1~{R})-1-(4-iodophenyl)ethanamine × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291.15 K;The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
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分辨率 1.13 Å
R-free 0.201
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8RFF
Crystal structure of N-terminal SARS-CoV-2 nsp1 in complex with fragment hit 6A6 refined against the anomalous diffraction data
提交 2023-12-12
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
10–126(117 aa)
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未记录
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ABV 1,3-benzothiazol-2-amine × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291.5 K;The crystallisation condition used is Index 71 (Cat. No.: HR2-944-71; Hampton Research, Aliso Viejo, CA, USA) containing 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 0.2 M NaCl and 25% w/v Polyethylene glycol 3350
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分辨率 1.31 Å
R-free 0.219
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8RI4
Crystal structure of the SARS-CoV-2 Main Protease inhibited by (2-methylsulfanyl-6,7-dihydro-[1,4]dioxino[2,3-f]benzimidazol-3-yl)-(p-tolyl)methanone
提交 2023-12-18
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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4MA 4-METHYLBENZOIC ACID × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
GOL GLYCEROL × 4
FMT FORMIC ACID × 4
NA SODIUM ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;20% PEG3350, 0.2 M Sodium Formate, 2.5 mM DMSO
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分辨率 1.70 Å
R-free 0.234
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8RJV
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the covalent inhibitor GUE-3778 (compound 12 in publication)
提交 2023-12-21
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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A1H1J (phenylmethyl) ~{N}-[(2~{S})-1-[[(3-chloranyl-2-fluoranyl-phenyl)methyl-(iminomethyl)amino]-methyl-amino]-1-oxidanylidene-3-phenyl-propan-2-yl]carbamate × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M MES pH 6.0, 20% PEG 6000, 0.2 M ammonium chloride, 0.4 mM inhibitor
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分辨率 1.91 Å
R-free 0.275
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8RJY
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the covalent inhibitor GUE-3899 (compound 58 in publication)
提交 2023-12-22
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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A1H1K ~{N}-[(2~{S})-1-[[(2~{S})-1-[[(4-chlorophenyl)methyl-(iminomethyl)amino]-methyl-amino]-1-oxidanylidene-3-phenyl-propan-2-yl]amino]-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]thiophene-2-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;20% PEG 3350, 0.2 M potassium sodium tartrate
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分辨率 1.97 Å
R-free 0.287
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8RJZ
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the non-covalent inhibitor GUE-3801 (compound 80 in publication)
提交 2023-12-22
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
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未记录
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A1H1I (7~{S})-6-[2-[2,4-bis(chloranyl)phenoxy]ethanoyl]-14-fluoranyl-10-(iminomethyl)-9-methyl-7-(phenylmethyl)-2-oxa-6,9,10-triazabicyclo[10.4.0]hexadeca-1(12),13,15-trien-8-one × 2
B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.2 M sodium nitrate, 0.1 M Bis-Tris propane pH 6.5, 20% PEG 3350, 0.4 mM inhibitor
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分辨率 1.70 Å
R-free 0.234
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8RNE
HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Nsp13 peptide, VMPLSAPTL
提交 2024-01-09
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 P
5556–5564(9 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.15 M potassium bromide, 20% w/v of PEG 2000 MME
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分辨率 1.71 Å
R-free 0.243
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8RNE
HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Nsp13 peptide, VMPLSAPTL
提交 2024-01-09
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 E
5556–5564(9 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.15 M potassium bromide, 20% w/v of PEG 2000 MME
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分辨率 1.71 Å
R-free 0.243
|
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8RNE
HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Nsp13 peptide, VMPLSAPTL
提交 2024-01-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 H
5556–5564(9 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.15 M potassium bromide, 20% w/v of PEG 2000 MME
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分辨率 1.71 Å
R-free 0.243
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8RNF
HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Omicron Nsp13 peptide, VIPLSAPTL
提交 2024-01-09
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 P
5556–5564(9 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.15 M DL malic acid and 20% w/v of PEG3350
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分辨率 1.87 Å
R-free 0.220
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8RNF
HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Omicron Nsp13 peptide, VIPLSAPTL
提交 2024-01-09
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 E
5556–5564(9 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.15 M DL malic acid and 20% w/v of PEG3350
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分辨率 1.87 Å
R-free 0.220
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8RNF
HLA-E*01:03 in complex with SARS-CoV-2 Omicron Nsp13 peptide, VIPLSAPTL
提交 2024-01-09
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 H
5556–5564(9 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.15 M DL malic acid and 20% w/v of PEG3350
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分辨率 1.87 Å
R-free 0.220
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8RV4
SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 2
提交 2024-01-31
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
6799–7096(298 aa)
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未记录
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MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1H3C 5-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]-2-phenyl-benzoic acid × 1
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;0.1 M MES (pH 5.6), 5% PEG 3350, 0.24 M magnesium chloride
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分辨率 2.35 Å
R-free 0.233
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8RV5
SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 1
提交 2024-01-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
6799–7096(298 aa)
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未记录
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MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
MTA 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE × 1
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;0.1 M MES (pH 5.6), 12% PEG 3350, 0.18 M magnesium chloride
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分辨率 2.05 Å
R-free 0.214
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8RV6
SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 2
提交 2024-01-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
6799–7096(298 aa)
|
未记录
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MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1H3B 3-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]-5-(4-hydroxyphenyl)benzoic acid × 1
GOL GLYCEROL × 3
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;0.1 M MES (pH 5.6), 12% PEG 3350, 0.1 M magnesium chloride
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分辨率 2.25 Å
R-free 0.225
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8RV7
SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 4
提交 2024-01-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
|
未记录
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MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1H3E 3-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]-5-(3-oxidanylprop-1-ynyl)benzoic acid × 1
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;0.1 M MES (pH 5.6), 9% PEG 3350, 0.06 M magnesium chloride
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分辨率 1.90 Å
R-free 0.197
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8RV8
SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 5
提交 2024-01-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
6799–7096(298 aa)
|
未记录
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MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1H28 5-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanyl]-2-chloranyl-benzoic acid × 1
GOL GLYCEROL × 2
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;0.1 M MES (pH 5.6), 11% PEG 3350, 0.24 M magnesium chloride
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分辨率 1.70 Å
R-free 0.196
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8RV9
SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 6
提交 2024-01-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
6799–7096(298 aa)
|
未记录
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MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1H3A 5-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]-2-chloranyl-benzoic acid × 1
GOL GLYCEROL × 2
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;0.1 M MES (pH 5.6), 5% PEG 3350, 0.24 M magnesium chloride
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分辨率 1.90 Å
R-free 0.208
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8RVA
SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 7
提交 2024-01-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
6799–7096(298 aa)
|
未记录
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MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1H3D 3-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]benzoic acid × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;0.1 M MES (pH 5.6), 7% PEG 3350, 0.12 M magnesium chloride
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.204
|
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8RVB
SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 8
提交 2024-01-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
|
未记录
|
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1H29 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[2-(1~{H}-1,2,3-triazol-4-yl)ethylsulfanylmethyl]oxolane-3,4-diol × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;0.1 M MES (pH 5.6), 5% PEG 3350, 0.22 M magnesium chloride
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.203
|
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8RZC
SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 11
提交 2024-02-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
|
未记录
|
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1H4D 3-[[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]-5-imidazol-1-yl-benzoic acid × 1
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;0.1 M MES (pH 5.6), 7% PEG 3350, 0.14 M magnesium chloride
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.210
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8RZD
SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 9
提交 2024-02-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
|
未记录
|
A1H4C 3-[[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]-5-(3-hydroxyphenyl)benzoic acid × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;0.1 M MES (pH 5.6), 9% PEG 3350, 0.14 M magnesium chloride
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.242
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8RZE
SARS-CoV-2 nsp16-nsp10 in complex with SAM derivative inhibitor 10
提交 2024-02-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
|
未记录
|
A1H4B 3-[[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanylmethyl]-5-pyridin-3-yl-benzoic acid × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;0.1 M MES (pH 5.6), 12% PEG 3350, 0.12 M magnesium chloride
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.231
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8S8W
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with Sangivamycin and m7GpppA-RNA (Cap0-RNA)
提交 2024-03-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
SGV SANGIVAMYCIN × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
ZN ZINC ION × 2
GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.224
|
|
8S8X
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with Toyocamycin and m7GpppA-RNA (Cap0-RNA)
提交 2024-03-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
TO1 4-amino-7-(beta-D-ribofuranosyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carbonitrile × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 2
GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.223
|
|
8S9Z
Mpro inhibitors of SARS-CoV-2
提交 2023-03-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.258
|
|
8SG6
SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) H163A Mutant Reduced with 20mM TCEP
提交 2023-04-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:H163A
突变:H163A
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;298 K;0.1M Tris, pH 8.5 and 26% (v/v) PEG Smear Broad (BCS B11); soaked with an additional 20mM TCEP for two hours
|
分辨率 2.49 Å
R-free 0.240
|
|
8SH6
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain Asn40Asp mutant (P43 crystal form)
提交 2023-04-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES pH 9.5, 29% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.126
|
|
8SH6
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain Asn40Asp mutant (P43 crystal form)
提交 2023-04-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES pH 9.5, 29% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.126
|
|
8SH8
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain Asn40Asp mutant in complex with ADP-ribose (P43 crystal form)
提交 2023-04-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.123
|
|
8SH8
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain Asn40Asp mutant in complex with ADP-ribose (P43 crystal form)
提交 2023-04-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES pH 9.5, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.123
|
|
8SK4
Co-structure of SARS-CoV-2 (COVID-19 with covalent pyrazoline based inhibitors)
提交 2023-04-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
I3R 2-chloro-1-[(5R)-3-phenyl-5-(quinoxalin-5-yl)-4,5-dihydro-1H-pyrazol-1-yl]ethan-1-one × 2
IMD IMIDAZOLE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;10mg/ml
Covid-19Mpro (25 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM EDTA) was inhibited at 10X molar excess and
incubated on ice for 1hr, solution was spun down for 10min at 10,000 rpm. Crystals were grown by
hanging-drop vapor diffusion method at 18C. by mixing 1:1, 1:2 and 2:1 ratio of protein to well solution. Crystal grew out of well solution composed of 25% w/v Peg 1500, 100 mM MIB buffer pH 7.0, from PACT
screen (Nextal Biotechnologies).
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.236
|
|
8SKH
Co-structure of SARS-CoV-2 (COVID-19 with covalent pyrazoline based inhibitors
提交 2023-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1W 2-chloro-1-[(4R,5R)-3,4,5-triphenyl-4,5-dihydro-1H-pyrazol-1-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;10mg/ml Covid-19Mpro (25 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM EDTA) was inhibited at 10X molar excess and incubated on ice for 1hr, solution was spun down for 10min at 10,000 rpm. Crystals were grown by hanging-drop vapor diffusion method at 18C. by mixing 1:1, 1:2 and 2:1 ratio of protein to well solution. Crystal grew out of well solution composed of 25% w/v Peg 1500, 100 mM MIB buffer pH 7.0, from PACT screen (Nextal Biotechnologies).
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.231
|
|
8SQ9
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to nsp9 and UMPCPP, as a pre-catalytic NMPylation intermediate
提交 2023-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 5
PDB 声明:heptameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
链 G
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
WSB 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]uridine × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
8SQJ
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to RNA-nsp9, as a noncatalytic RNA-nsp9 binding mode
提交 2023-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 5
PDB 声明:octameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
链 G
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
VSN 5'-O-[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]guanosine × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.06 Å
|
|
8SQK
SARS-CoV-2 replication-transcription complex bound to RNA-nsp9 and GDP-betaS, as a pre-catalytic deRNAylation/mRNA capping intermediate
提交 2023-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 5
PDB 声明:octameric
|
链 A
4393–5321(929 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
链 G
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
VSN 5'-O-[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]guanosine × 2
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å
|
|
8STY
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI60
提交 2023-05-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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WGE benzyl (3S)-3-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-2-azaspiro[4.4]nonane-2-carboxylate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.250
|
|
8STZ
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI37
提交 2023-05-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
WGI benzyl (3S)-3-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-2-azaspiro[4.5]decane-2-carboxylate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.229
|
|
8SXR
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with C5a
提交 2023-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
WZK N-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-N-[4-(dimethylamino)phenyl]-2-(5-hydroxyisoquinolin-4-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M Tris pH 8, 15 % PEG 8000, 10 % ethylene glycol
|
分辨率 2.11 Å
R-free 0.252
|
|
8T7Y
Structure of SARS CoV-2 main protease in complex with Chymostatin.
提交 2023-06-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295 K;1.8M Ammonium sulfate, 0.1% Bis-Tris ph 6.5, 2%v/v PEG monomethyl ether 550
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.244
|
|
8TBE
Co-crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro with Pomotrelvir
提交 2023-06-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
ZQB Pomotrelvir bound form × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;24.1% PEG 3350, 100 mM MES pH 7.5
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.299
|
|
8TPB
Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease
提交 2023-08-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
JVX N-[(1R)-2-(tert-butylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-(4-tert-butylphenyl)-2-chloroacetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Hepes PH 7.5
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.248
|
|
8TPC
Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease
提交 2023-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
JJC N-[(1R)-2-(benzylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-[4-(2-chloroacetamido)phenyl]furan-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295.15 K;20% PEG 3350, 0.2M Sodium thiocyanate
|
分辨率 1.73 Å
R-free 0.223
|
|
8TPD
Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease
提交 2023-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
JJO N-[(1R)-2-(benzylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-[3-(2-chloroacetamido)phenyl]furan-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295.15 K;PEG 3350, 0.2M Sodium thiocyanate
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.226
|
|
8TPE
Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease
提交 2023-08-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
JK0 N-[(1R)-2-(benzylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-N-(4-tert-butylphenyl)-3-hydroxypropanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295.15 K;20% PEG 6000, 200mM NaCl, 100mM Hepes/NaOH pH 7
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.241
|
|
8TPF
Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease
提交 2023-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
JWI N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-3-hydroxypropanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295.15 K;25% PEG 1500, 100mM PCB buffer pH 7.0
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.247
|
|
8TPG
Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease
提交 2023-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
JKL (3R)-N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-3-hydroxybutanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295.15 K;25% PEG 1500, 100mM MMT buffer pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.214
|
|
8TPH
Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease
提交 2023-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
JKL (3R)-N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-3-hydroxybutanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295.15 K;25% PEG 1500. 100mM MMT buffer, pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.206
|
|
8TPI
Synthesis, X-Ray Crystallographic and Biological Activities of Covalent, Non-Peptidic Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease
提交 2023-08-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
JWO N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-2-hydroxy-2-methylpropanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295.15 K;25% PEG 1500, 100mM PCB buffer pH 7.0
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.234
|
|
8TQH
MPI68 bound to Mpro of SARS-CoV-2
提交 2023-08-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
JX6 N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.230
|
|
8TQJ
MPI57 bound to Mpro of SARS-CoV-2
提交 2023-08-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YHI benzyl (1R,2S,5S)-2-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-3-carboxylate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.237
|
|
8TQL
MPI54 bound to Mpro of SARS-CoV-2
提交 2023-08-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
JY0 benzyl [(2S,3S)-3-tert-butoxy-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxobutan-2-yl]carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.268
|
|
8TQT
MPI52 bound to Mpro of SARS-CoV-2
提交 2023-08-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
K2X (3-chlorophenyl)methyl [(2S)-3-cyclohexyl-1-({(1S,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-1-sulfanylpropan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.239
|
|
8TQU
MPI51 bound to Mpro of SARS-CoV-2
提交 2023-08-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.269
|
|
8TV6
SARS-CoV-2 Mac1 in complex with MDOLL-0169
提交 2023-08-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain 1
|
未记录
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;0.1 M CHES pH 9.5, 32% PEG (v/v) 3000
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.225
|
|
8TV6
SARS-CoV-2 Mac1 in complex with MDOLL-0169
提交 2023-08-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain 1
|
未记录
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
V83 (1R,6R)-6-{[3-(methoxycarbonyl)-5,6,7,8-tetrahydro-4H-cyclohepta[b]thiophen-2-yl]carbamoyl}cyclohex-3-ene-1-carboxylic acid × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;0.1 M CHES pH 9.5, 32% PEG (v/v) 3000
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.225
|
|
8TV7
SARS-CoV-2 Mac1 in complex with MDOLL-0229
提交 2023-08-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain 1
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
VI1 (1R,2R)-2-{[3-(methoxycarbonyl)-4,5,6,7,8,9-hexahydrocycloocta[b]thiophen-2-yl]carbamoyl}cyclohexane-1-carboxylic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;0.1 M CHES pH 9.5, 32% PEG (v/v) 3000
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.187
|
|
8TY3
MI-31 ligand bound to SARS-CoV-2 Mpro
提交 2023-08-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
SJF (1S,3aR,6aS)-2-[(3,4-dichlorophenoxy)acetyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.224
|
|
8TY4
MI-30 bound to Mpro of SARS-CoV-2
提交 2023-08-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
SO0 (1S,3aR,6aS)-2-[(2,4-dichlorophenoxy)acetyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.237
|
|
8TY5
MI-14 bound to Mpro of SARS-CoV-2
提交 2023-08-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
SQ3 (1R,2S,5S)-3-[(2,4-dichlorophenoxy)acetyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% w/v PEG3350, pH 8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.253
|
|
8TYJ
Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp10/nsp16 complex with bound SAH
提交 2023-08-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;10% (v/v) isopropyl alcohol, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M NaCl
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.201
|
|
8U2X
Crystal Structure of NendoU (Uridylate-specific endoribonuclease, nsp15) from Betacoronavirus SARS-CoV-2 (H235A mutant)
提交 2023-09-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
|
突变:H235A
|
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3
CL CHLORIDE ION × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;291 K;Morpheus Fusion G4: 0.2M Sodium formate; 0.2M Ammonium acetate; 0.2M Sodium citrate tribsic dihydrate; 0.2M Potassium sodium tartrate tetrahydrate; 0.2M Sodium oxamate, 3% w/v NDSB 195, 3% w/v NDSB 201, 3% w/v NDSB 211,3% w/v NDSB 221, 3% w/v NDSB 256, 0.5M Tris (base); 0.5M BICINE pH 8.5, 40% v/v PEG 500 MME; 20 % w/v PEG 20000, BewuA.18928.a.MX152.PW39137 at 18 mg/mL. Plate 13311 well G4 drop2, Puck: PSL-0109, Cryo: Direct
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.213
|
|
8U2X
Crystal Structure of NendoU (Uridylate-specific endoribonuclease, nsp15) from Betacoronavirus SARS-CoV-2 (H235A mutant)
提交 2023-09-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
6453–6798(346 aa)
|
突变:H235A
|
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;291 K;Morpheus Fusion G4: 0.2M Sodium formate; 0.2M Ammonium acetate; 0.2M Sodium citrate tribsic dihydrate; 0.2M Potassium sodium tartrate tetrahydrate; 0.2M Sodium oxamate, 3% w/v NDSB 195, 3% w/v NDSB 201, 3% w/v NDSB 211,3% w/v NDSB 221, 3% w/v NDSB 256, 0.5M Tris (base); 0.5M BICINE pH 8.5, 40% v/v PEG 500 MME; 20 % w/v PEG 20000, BewuA.18928.a.MX152.PW39137 at 18 mg/mL. Plate 13311 well G4 drop2, Puck: PSL-0109, Cryo: Direct
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.213
|
|
8U40
Crystal structure of main protease of SARS-CoV-2 complexed with inhibitor
提交 2023-09-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
V8X N-[(2S)-3-cyclopropyl-1-({(1E,2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxo-2,3-dihydropyridin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]-5,7-difluoro-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;0.2 M Potassium Thiocynate, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.274
|
|
8U4Y
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) L50F Mutant
提交 2023-09-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:L50F
突变:L50F
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.239
|
|
8U9H
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI64
提交 2023-09-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
VZB (1R,2S,5R)-3-[(cyclohexyloxy)acetyl]-N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.227
|
|
8U9K
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI94
提交 2023-09-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
W0B diphenylmethyl (1R,2S,5R)-2-({(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-3-carboxylate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.302
|
|
8U9M
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI95
提交 2023-09-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
VZT bis(4-fluorophenyl)methyl (1R,2S,5R)-2-({(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-3-carboxylate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.240
|
|
8U9N
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI64
提交 2023-09-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
W0L (1R,2S,5S)-3-[bis(4-chlorophenyl)acetyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.242
|
|
8U9T
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI97
提交 2023-09-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
W1L (1R,2S,5S)-N~3~,N~3~-bis(4-chlorophenyl)-N~2~-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2,3-dicarboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.236
|
|
8U9U
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI98
提交 2023-09-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
W0W (1R,2S,5S)-3-[bis(4-chlorophenoxy)acetyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.287
|
|
8U9V
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI101
提交 2023-09-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
W1C N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-N~2~-{[(pyridin-3-yl)methoxy]carbonyl}-L-leucinamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.249
|
|
8U9W
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor MPI105
提交 2023-09-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
W1U N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-methyl-N~2~-[(2R)-2-phenylazetidine-1-carbonyl]-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.233
|
|
8UAB
SARS-CoV-2 main protease (Mpro) complex with AC1115
提交 2023-09-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
W28 N-[(2S)-1-({(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;295 K;0.1 M imidazole pH 8, 0.1 M LiSO4, 1 mM DTT, 12% PEG 3000
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.228
|
|
8UD2
SARS-CoV-2 Nsp15, apo-form
提交 2023-09-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
链 D
6453–6798(346 aa)
链 E
6453–6798(346 aa)
链 F
6453–6798(346 aa)
|
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.33 Å
|
|
8UD3
SARS-CoV-2 Nsp15 bound to poly(A/U) RNA, consensus form
提交 2023-09-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:octameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
链 D
6453–6798(346 aa)
链 E
6453–6798(346 aa)
链 F
6453–6798(346 aa)
|
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.67 Å
|
|
8UD4
SARS-CoV-2 Nsp15 bound to poly(A/U) RNA, state 1
提交 2023-09-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:octameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
链 D
6453–6798(346 aa)
链 E
6453–6798(346 aa)
链 F
6453–6798(346 aa)
|
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å
|
|
8UD5
SARS-CoV-2 Nsp15 bound to poly(A/U) RNA, state 2
提交 2023-09-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:octameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
链 D
6453–6798(346 aa)
链 E
6453–6798(346 aa)
链 F
6453–6798(346 aa)
|
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
突变:H234A
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å
|
|
8UDF
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor DEL_7
提交 2023-09-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
WB0 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-(methylamino)-4-oxobutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2
CL CHLORIDE ION × 4
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 6;293 K;100 mM MES, 20% w/v PEG4000, 100 mM sodium phosphate monobasic
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.194
|
|
8UDJ
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor DEL_2
提交 2023-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
WB5 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-4-(methylamino)-4-oxo-1-phenylbutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 6;277 K;100 mM MES, 20% w/v PEG4000, 100 mM sodium phosphate monobasic
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.203
|
|
8UDM
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 16
提交 2023-09-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
WBE 2-cyano-D-phenylalanyl-N-[(2S)-4-({3-[(5-amino-4H-1,2,4-triazol-3-yl)amino]propyl}amino)-1-(4-fluorophenyl)-4-oxobutan-2-yl]-2,4-dichloro-D-phenylalaninamide × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 6;277 K;100 mM MES, 20% w/v PEG4000, 100 mM sodium phosphate monobasic
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.179
|
|
8UDO
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 15
提交 2023-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
WBK 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-4-{[5-(dimethylamino)pentyl]amino}-1-(4-fluorophenyl)-4-oxobutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 5;277 K;100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.203
|
|
8UDP
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 14
提交 2023-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
WBO 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-4-{[4-(dimethylamino)butyl]amino}-1-(4-fluorophenyl)-4-oxobutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 5;277 K;100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.204
|
|
8UDQ
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 1
提交 2023-09-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
WC0 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-4-{[2-(dimethylamino)ethyl]amino}-1-(4-fluorophenyl)-4-oxobutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 5;277 K;100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 2.12 Å
R-free 0.217
|
|
8UDW
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 2
提交 2023-09-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
WDK 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-4-{[3-(dimethylamino)propyl]amino}-1-(4-fluorophenyl)-4-oxobutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 5;277 K;100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.222
|
|
8UDX
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with C145 sulfinic acid in complex with inhibitor 17
提交 2023-09-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
WCZ 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-{[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propyl]amino}-4-oxobutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 5;277 K;100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.212
|
|
8UDY
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 25
提交 2023-09-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
WD6 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-{(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-oxo-4-[(prop-2-yn-1-yl)amino]butan-2-yl}-D-phenylalaninamide × 2
NA SODIUM ION × 2
CA CALCIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 5;277 K;100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.216
|
|
8UE0
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 47
提交 2023-09-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
WDF 2,4-dichloro-Nalpha-[(2R)-2-chloro-3-(2-cyanophenyl)propanoyl]-N-[(2S)-4-{[4-(dimethylamino)butyl]amino}-1-(4-fluorophenyl)-4-oxobutan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2
NA SODIUM ION × 4
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 5;277 K;100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.213
|
|
8UEA
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 29
提交 2023-09-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
WDQ 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-oxo-4-{[3-(pyridin-3-yl)propyl]amino}butan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2
CL CHLORIDE ION × 4
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 6;277 K;100 mM MES, 20% w/v PEG4000, 100 mM sodium phosphate monobasic
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.204
|
|
8UEB
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 30
提交 2023-09-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
WE8 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-oxo-4-{[3-(pyridin-4-yl)propyl]amino}butan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 6;277 K;100 mM MES, 20% w/v PEG4000, 100 mM sodium phosphate monobasic
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.199
|
|
8UEF
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 32
提交 2023-10-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
WEK 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-{(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-[(4-methoxybutyl)amino]-4-oxobutan-2-yl}-D-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 5;277 K;100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.204
|
|
8UEG
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 27
提交 2023-10-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
WEO 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-{(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-oxo-4-[(pent-4-yn-1-yl)amino]butan-2-yl}-D-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 5;277 K;100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.207
|
|
8UEH
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 31
提交 2023-10-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
WEX 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-{(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-oxo-4-[(2-phenylethyl)amino]butan-2-yl}-D-phenylalaninamide × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 5;277 K;100 mM sodium acetate, 20% w/v PEG8000, 100 mM potassium thiocyanate
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.199
|
|
8UEI
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease with inhibitor 28
提交 2023-10-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
WF2 2-cyano-D-phenylalanyl-2,4-dichloro-N-[(2S)-1-(4-fluorophenyl)-4-oxo-4-{[4-(pyrrolidin-1-yl)butyl]amino}butan-2-yl]-D-phenylalaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 6;277 K;100 mM MES, 20% w/v PEG4000, 100 mM sodium phosphate monobasic
|
分辨率 1.71 Å
R-free 0.192
|
|
8UH5
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with an inhibitor TKB-272
提交 2023-10-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
WOK (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(5-fluoro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1 M MES, pH 5.8, 15% PEG6000, 3% DMSO
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.233
|
|
8UH9
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease E166V mutant in complex with an inhibitor TKB-272
提交 2023-10-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
WOK (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(5-fluoro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.4 M Sodium acetate trihydrate, pH 5.8, 30% PEG 400, 3% DMSO
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.240
|
|
8UIF
Crystal structure of SARS CoV-2 3CL protease in complex with GSK4365096A
提交 2023-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
A1ADS N-[(benzyloxy)carbonyl]-4-fluoro-L-phenylalanyl-N-{(2R)-1-[(2S)-oxolan-2-yl]-3-[(3S)-2-oxooxolan-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;295 K;0.1M HEPES, pH 7.5, 16% PEG8000, 0.1M KH2PO4
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.220
|
|
8UPS
Structure of SARS-Cov2 3CLPro in complex with Compound 5
提交 2023-10-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
I70 (1R,2S,5S)-N-{(2S,3R)-4-amino-3-hydroxy-4-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-3-[N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;0.1 M CHES pH 9.5, 10% w/v PEG3K, 20% glycerol for cryoprotection
|
分辨率 2.44 Å
R-free 0.268
|
|
8UPV
Structure of SARS-Cov2 3CLPro in complex with Compound 33
提交 2023-10-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
X83 methyl {(2S)-1-[(1S,3aR,6aS)-1-{[(2R,3S,6R)-6-fluoro-2-hydroxy-1-(methylamino)-1-oxoheptan-3-yl]carbamoyl}hexahydrocyclopenta[c]pyrrol-2(1H)-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;0.1 M Tris pH 9-9.5, 14-18% PEG 8K, also in a 1:1 ratio of protein to precipitant solution and cryoprotected with 20% glycerol
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.199
|
|
8UPW
Structure of SARS-Cov2 3CLPro in complex with Compound 34
提交 2023-10-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
X8F methyl {(2S)-1-[(1S,3aR,6aS)-1-{[(2R,3S,6S)-6-fluoro-2-hydroxy-1-(methylamino)-1-oxoheptan-3-yl]carbamoyl}hexahydrocyclopenta[c]pyrrol-2(1H)-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;0.1 M Tris pH 9-9.5, 14-18% PEG 8K in a 1:1 ratio of protein to precipitant solution, and cryoprotected with 20% glycerol
|
分辨率 1.44 Å
R-free 0.201
|
|
8UR9
Crystal Structure of the SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Compound 61
提交 2023-10-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XEK (5P)-5-[(1P,3M,3'P)-3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]-1-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;294 K;10% v/v 2-Propanol
0.1 M BICINE pH 8.5
30% w/v Polyethylene glycol 1500
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.236
|
|
8UTE
Structure of SARS-Cov2 3CLPro in complex with Compound 27
提交 2023-10-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XKQ methyl {(2S)-1-[(1S,3aR,6aS)-1-{[(2R,3S)-6,6-difluoro-2-hydroxy-1-(methylamino)-1-oxoheptan-3-yl]carbamoyl}hexahydrocyclopenta[c]pyrrol-2(1H)-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;0.1 M sodium cacodylate pH 6, 40% v/v MPD, 5% w/v PEG 3350 in a 1:1 ratio of protein to precipitant solution
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.225
|
|
8UUG
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) with inhibitor Jun12303
提交 2023-11-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
XXW N-[(1R)-1-{(3M,5M)-3-[1-(difluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]-5-[1-(methoxymethyl)-1H-pyrazol-4-yl]phenyl}ethyl]-5-[2-(dimethylamino)ethoxy]-2-methylbenzamide × 1
GOL GLYCEROL × 1
ACT ACETATE ION × 1
ZN ZINC ION × 5
CL CHLORIDE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.3;277 K;0.2M Zinc Acetate, 0.1M BisTris pH 6.3, 8% PEG 8000
|
分辨率 2.74 Å
R-free 0.233
|
|
8UVM
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) complex with covalent inhibitor Jun11313
提交 2023-11-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
Y3R ethyl 4-oxo-4-(2-{3-[2-({(1S)-1-[(3P)-3-(thiophen-3-yl)phenyl]ethyl}carbamoyl)phenyl]propanoyl}hydrazinyl)butanoate × 1
SO4 SULFATE ION × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;277 K;2.5M Ammonium Sulfate, 0.1M Sodium citrate dibasic trihydrate pH 6.7
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.204
|
|
8UVM
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) complex with covalent inhibitor Jun11313
提交 2023-11-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
Y3R ethyl 4-oxo-4-(2-{3-[2-({(1S)-1-[(3P)-3-(thiophen-3-yl)phenyl]ethyl}carbamoyl)phenyl]propanoyl}hydrazinyl)butanoate × 1
SO4 SULFATE ION × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;277 K;2.5M Ammonium Sulfate, 0.1M Sodium citrate dibasic trihydrate pH 6.7
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.204
|
|
8UVM
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) complex with covalent inhibitor Jun11313
提交 2023-11-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
Y3R ethyl 4-oxo-4-(2-{3-[2-({(1S)-1-[(3P)-3-(thiophen-3-yl)phenyl]ethyl}carbamoyl)phenyl]propanoyl}hydrazinyl)butanoate × 1
SO4 SULFATE ION × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;277 K;2.5M Ammonium Sulfate, 0.1M Sodium citrate dibasic trihydrate pH 6.7
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.204
|
|
8UVM
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) complex with covalent inhibitor Jun11313
提交 2023-11-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
Y3R ethyl 4-oxo-4-(2-{3-[2-({(1S)-1-[(3P)-3-(thiophen-3-yl)phenyl]ethyl}carbamoyl)phenyl]propanoyl}hydrazinyl)butanoate × 1
SO4 SULFATE ION × 1
CL CHLORIDE ION × 2
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;277 K;2.5M Ammonium Sulfate, 0.1M Sodium citrate dibasic trihydrate pH 6.7
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.204
|
|
8V4U
Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with a covalent inhibitor
提交 2023-11-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YDL N-(methoxycarbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-(trifluoromethyl)-L-prolinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294 K;20.0% w/v PEG 3350 and 0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.264
|
|
8V7T
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease catalytic domain (residues 1-199)
提交 2023-12-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3264–3462(199 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;20-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.178
|
|
8V7T
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease catalytic domain (residues 1-199)
提交 2023-12-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
3264–3462(199 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;20-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.178
|
|
8V7W
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease catalytic domain C145A precursor, residues nsp4(-6)-1-199-6H
提交 2023-12-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3258–3462(205 aa)
片段:catalytic domain
链 B
3258–3462(205 aa)
片段:catalytic domain
|
突变:C145A
突变:C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;20-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.229
|
|
8V8E
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease catalytic domain (residues 1-199-6H) in complex with ensitrelvir (ESV)
提交 2023-12-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3462(199 aa)
片段:catalytic domain
|
未记录
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;20-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.193
|
|
8V8E
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease catalytic domain (residues 1-199-6H) in complex with ensitrelvir (ESV)
提交 2023-12-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
3264–3462(199 aa)
片段:catalytic domain
|
未记录
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;20-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.193
|
|
8V8G
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease catalytic domain (residues 1-196) in complex with ensitrelvir (ESV)
提交 2023-12-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3264–3459(196 aa)
片段:catalytic domain (MPro1-196)
|
未记录
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;20-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.201
|
|
8V8G
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease catalytic domain (residues 1-196) in complex with ensitrelvir (ESV)
提交 2023-12-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
3264–3459(196 aa)
片段:catalytic domain (MPro1-196)
|
未记录
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;20-22% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.201
|
|
8VD7
MicroED structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro/3CLPro) with missing cone eliminated by suspended drop
提交 2023-12-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
CL CHLORIDE ION × 2
|
ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5;0.1 M MES pH 6.5, 20% PEG 3350, 5% DMSO.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.248
|
|
8VDJ
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease (3CLpro) as a covalent complex with EDP-235
提交 2023-12-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AA0 4,6,7-trifluoro-N-{(2S)-1-[(3R,5'R)-5'-(iminomethyl)-2-oxo-1,2-dihydrospiro[indole-3,3'-pyrrolidin]-1'-yl]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl}-N-methyl-1H-indole-2-carboxamide × 2
SCN THIOCYANATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;The protein solution was incubated with DTT (0.22 mM) for 10 min on ice. Compound EDP-235 in DMSO (2.88 mM) was then added and incubated for 3 hrs on ice, then for 20 min at 18 C. Crystals appeared in drop with reservoir conditions: 0.2 M sodium thiocyanate, 20 % w/v PEG3350.
The sample was harvested after 10 days growth and transferred to drop of neat reservoir condition. Cryoprotection was achieved by supplementing this drop with additional PEG400 to a final concentration of 5 % w/v PEG400 in reservoir condition.
The sample was cryocooled by plunging into liquid nitrogen.
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.271
|
|
8VEC
Deep Mutational Scanning of SARS-CoV-2 PLpro
提交 2023-12-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1563–1878(316 aa)
|
突变:M208W
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;277.15 K;0.1M trisodium citrate pH 5.5, 20% w/v PEG3000
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.217
|
|
8VQX
Structure of SARS-CoV-2 main protease with potent peptide aldehyde inhibitor
提交 2024-01-19
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3259–3569(311 aa)
|
未记录
|
A1ADM N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-1-(1H-indole-2-carbonyl)-4,4-dimethyl-L-prolinamide × 2
NA SODIUM ION × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;32% PEG 2K MME,
0.1M bis-tris
|
分辨率 1.35 Å
R-free 0.204
|
|
8VSG
SARS-CoV-2 main protease with covalent inhibitor
提交 2024-01-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1
A1AD0 (1R,2S,5S)-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-(1-phenylcyclopropane-1-carbonyl)-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 13
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M BIS-TRIS pH 6.50, 32 % (w/v) PEG 2000 MME
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.233
|
|
8VUO
Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp16/nsp10 in complex with Cap-1 RNA
提交 2024-01-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 C
6799–7096(298 aa)
链 D
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16
ZN ZINC ION × 4
M7G 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;25% (v/v) Ethylene glycol
|
分辨率 2.39 Å
R-free 0.219
|
|
8W1U
SARS-CoV-2 Main protease bound to non-covalent lead molecule NZ-804
提交 2024-02-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
链 B
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
A1AFE 11-[1-(1H-pyrrolo[3,2-c]pyridine-7-carbonyl)piperidin-4-ylidene]-6,11-dihydro-5H-5lambda~6~-dibenzo[b,e]thiepine-5,5-dione × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;290 K;0.1 M MES pH 6.8, 0.2 M lithium sulfate, 24% PEG3350
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.288
|
|
8WKE
Sulfate-bound SARS-CoV-2 Nsp9
提交 2023-09-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
4141–4253(113 aa)
片段:UNP residues 4141-4253
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;2.4M Ammonium sulfate, 80mM, tri-sodium citrate, pH6
|
分辨率 2.12 Å
R-free 0.274
|
|
8WSH
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease, pH=4.0
提交 2023-10-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3563(298 aa)
链 B
3266–3563(298 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1M Sodium acetate trihydrate pH4.0,10%PEG4000
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.236
|
|
8WTS
SARS-CoV-2 3CLpro bound to covalent inhibitor
提交 2023-10-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
XDQ (2~{R})-2-[[4-[chloranyl-bis(fluoranyl)methoxy]phenyl]-(2-chloranyl-2-fluoranyl-ethanoyl)amino]-~{N}-(oxan-4-yl)-2-pyrimidin-5-yl-propanamide × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
CL CHLORIDE ION × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 8 % w/v PEG 4000
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.207
|
|
8WZQ
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease V186F mutant in complex with CCF0058981
提交 2023-11-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3568(303 aa)
链 B
3266–3568(303 aa)
|
突变:V186F
突变:V186F
|
XIU 2-(benzotriazol-1-yl)-~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-~{N}-[4-(1~{H}-imidazol-5-yl)phenyl]ethanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;298 K;0.2M Na2SO4, 20%PEG3350
|
分辨率 1.66 Å
R-free 0.217
|
|
8X1X
SARS-CoV-2 Papain like protease (PLpro) in complex with inhibitor Lithocholic acid
提交 2023-11-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
突变:C1674S
|
4OA (3beta,5beta,14beta,17alpha)-3-hydroxycholan-24-oic acid × 3
GOL GLYCEROL × 3
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277.15 K;0.1 M Tris-HCl (pH 7.5-9.0), 1.4 M NaH2PO4, 2-15% Glycerol
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.284
|
|
8XAB
Crystal structure of Ubl1 domain of nonstructural protein 3 of SARS-CoV-2
提交 2023-12-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
836–925(90 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;0.1 M HEPES sodium, pH 7.5, 1.4 M Sodium citrate tribasic dihydrate
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.234
|
|
8XCH
SARS-CoV-2 Replication-Transcription Complex has a dimer-of-dimeric architecture (ddRTC) in pre-capping initiation.
提交 2023-12-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 24
PDB 声明:32-meric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 E
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 F
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 I
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 J
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 L
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 M
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 N
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 Q
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 R
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 T
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 U
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 V
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 Y
4393–5324(932 aa)
片段:UNP residues 4393-5324
链 Z
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 b
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 c
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
链 d
5325–5925(601 aa)
片段:UNP residues 5325-5925
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 32
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
PO4 PHOSPHATE ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
8XKO
CryoEM structure of compound HNC-1664 bound with RdRP-RNA complex of SARS-CoV-2
提交 2023-12-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4139(197 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4139(197 aa)
|
未记录
|
A1LVZ [[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-4-fluoranyl-5-(5-iodanyl-4-methyl-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å
|
|
8XTD
SARS-CoV-2 papain-like-protease (PLpro) in complex with inhibitor Linagliptin
提交 2024-01-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
片段:papain-like protease (PLPro)
|
突变:C1674S
|
356 8-[(3R)-3-Aminopiperidin-1-yl]-7-but-2-yn-1-yl-3-methyl-1-[(4-methylquinazolin-2-yl)methyl]-3,7-dihydro-1H-purine-2,6-d ione × 1
GOL GLYCEROL × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277.15 K;0.1 M Tris-HCl (pH 7.5-9.0), 1.4 M NaH2PO4, 2-15% Glycerol
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.288
|
|
8XWR
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro-T21I/L50F double mutant with its peptidyl substrate
提交 2024-01-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:T21I, L50F, C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Na3 citrate pH = 5.0, 18% w/v PEG 20K
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.197
|
|
8XWT
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro-L50F mutant with its peptidyl substrate
提交 2024-01-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:L50F, C145A
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.05 M HEPES, pH = 7.0, 1% w/v Tryptone, 1 mM NaN3, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.250
|
|
8Y4D
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease in complex with Bofutrelvir
提交 2024-01-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3561(296 aa)
链 B
3266–3561(296 aa)
|
未记录
|
FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1M HEPES 7.5, 20% PEG 10000
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.260
|
|
8Y4G
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease G15S mutant in complex with Bofutrelvir
提交 2024-01-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3561(296 aa)
链 B
3266–3561(296 aa)
|
突变:G15S
突变:G15S
|
FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;20~24%PEG3350,0.12~0.21M sodium sulfate
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.250
|
|
8Y4H
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease K90R mutant in complex with Bofutrelvir
提交 2024-01-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3566(301 aa)
链 B
3266–3566(301 aa)
|
未记录
|
FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.12~0.21M PEG3350,20%~24%Na2SO4
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.218
|
|
8YAX
SARS-CoV-2 DMV nsp3-4 pore complex (full-pore)
提交 2024-02-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 24
PDB 声明:24-meric
|
链 A
819–2763(1945 aa)
链 B
819–2763(1945 aa)
链 C
2764–3263(500 aa)
链 D
2764–3263(500 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;150mM NaCl, 10mM Tris-HCl, 1mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.90 Å
|
|
8YB5
SARS-CoV-2 DMV nsp3-4 pore complex (consensus-pore, C6 symmetry)
提交 2024-02-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 24
PDB 声明:24-meric
|
链 A
819–2763(1945 aa)
链 B
819–2763(1945 aa)
链 C
2764–3263(500 aa)
链 D
2764–3263(500 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;150mM NaCl, 10mM Tris-HCl, 1mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å
|
|
8YB7
SARS-CoV-2 DMV nsp3-4 pore complex (consensus-pore, C3 symmetry)
提交 2024-02-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 24
PDB 声明:24-meric
|
链 A
819–2763(1945 aa)
链 B
819–2763(1945 aa)
链 C
2764–3263(500 aa)
链 D
2764–3263(500 aa)
链 E
819–2763(1945 aa)
链 F
819–2763(1945 aa)
链 G
2764–3263(500 aa)
链 H
2764–3263(500 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;150mM NaCl, 10mM Tris-HCl, 1mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å
|
|
8YKO
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease P132H mutant in complex withX77
提交 2024-03-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3563(298 aa)
链 B
3266–3563(298 aa)
|
突变:M132H
突变:M132H
|
X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M BICINE pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol 10,000
|
分辨率 2.11 Å
R-free 0.279
|
|
8YRH
Complex of SARS-CoV-2 main protease and Rosmarinic acid
提交 2024-03-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3563(298 aa)
链 B
3266–3563(298 aa)
|
未记录
|
ROA (2R)-3-(3,4-dihydroxyphenyl)-2-{[(2E)-3-(3,4-dihydroxyphenyl)prop-2-enoyl]oxy}propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.15 M HEPES sodium (pH 7.5), 10% v/v 2-Propanol, and 20% w/v Polyethylene glycol 4,000.
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.246
|
|
8YWZ
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease H163A mutant in complex with Bofutrelvir
提交 2024-04-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3561(296 aa)
链 B
3266–3561(296 aa)
|
突变:H163A
突变:H163A
|
FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1M Na2SO4,24% PEG3350
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.233
|
|
8YX2
Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-P4
提交 2024-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1564–1878(315 aa)
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突变:C111S
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ZN ZINC ION × 2
A1LZ5 ~{N}-[1-(1,2-dihydroacenaphthylen-5-yl)cyclopropyl]-2-methyl-5-(4-methylpiperazin-1-yl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1M HEPES pH7.5, 25% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.31 Å
R-free 0.256
|
|
8YX2
Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-P4
提交 2024-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 2
A1LZ5 ~{N}-[1-(1,2-dihydroacenaphthylen-5-yl)cyclopropyl]-2-methyl-5-(4-methylpiperazin-1-yl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1M HEPES pH7.5, 25% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.31 Å
R-free 0.256
|
|
8YX3
Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-P28
提交 2024-04-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
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A1LZ7 ~{N}-[1-(1,2-dihydroacenaphthylen-5-yl)cyclopropyl]-5-[(3~{S})-4-ethyl-3-methyl-piperazin-1-yl]-2-methyl-benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;298 K;0.03 M Citric acid, 0.07 M BIS-TRIS propane)/pH 7.6, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.275
|
|
8YX3
Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-P28
提交 2024-04-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
A1LZ7 ~{N}-[1-(1,2-dihydroacenaphthylen-5-yl)cyclopropyl]-5-[(3~{S})-4-ethyl-3-methyl-piperazin-1-yl]-2-methyl-benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;298 K;0.03 M Citric acid, 0.07 M BIS-TRIS propane)/pH 7.6, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.275
|
|
8YX4
Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-P31
提交 2024-04-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
A1LZ6 2-methyl-~{N}-[1-(1-methyl-2-oxidanylidene-benzo[cd]indol-6-yl)cyclopropyl]-5-[3-(4-methyl-4-oxidanyl-piperidin-1-yl)azetidin-1-yl]benzamide × 1
GOL GLYCEROL × 1
ZN ZINC ION × 3
CD CADMIUM ION × 6
CL CHLORIDE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;5 mM CoCl2.6H2O, 5 mM NiCl2.6H2O, 5 mM CdCl2.H2O, 5 mM MgCl2.6H2O, 0.1 M HEPES pH 7.5, 12% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.233
|
|
8YX5
Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-P35
提交 2024-04-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
A1LZ8 5-[(1~{R},5~{S})-3,6-diazabicyclo[3.1.1]heptan-3-yl]-2-methyl-~{N}-[1-(1-methyl-2-oxidanylidene-benzo[cd]indol-6-yl)cyclopropyl]benzamide × 1
ZN ZINC ION × 2
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;298 K;0.03 M Citric acid, 0.07 M BIS-TRIS propane)/pH 7.6, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.195
|
|
8YX5
Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-P35
提交 2024-04-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
A1LZ8 5-[(1~{R},5~{S})-3,6-diazabicyclo[3.1.1]heptan-3-yl]-2-methyl-~{N}-[1-(1-methyl-2-oxidanylidene-benzo[cd]indol-6-yl)cyclopropyl]benzamide × 1
ZN ZINC ION × 2
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.6;298 K;0.03 M Citric acid, 0.07 M BIS-TRIS propane)/pH 7.6, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.195
|
|
8ZQ8
SARS-Cov-2 3CL protease in complex with macrocyclic inhibitor CG-1039
提交 2024-06-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1D8T CG-1039 × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 M LiCl, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 13%(w/v) polyethylene glycol 8000
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.223
|
|
8ZSE
Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-2002
提交 2024-06-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 4
A1L2A 2-methyl-5-(4-methylpiperazin-1-yl)-~{N}-(1-quinolin-4-ylcyclopropyl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;0.05 M Zinc acetate dihydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.257
|
|
8ZSE
Crystal Structure of SARS CoV-2 Papain-like Protease PLpro-C111S in Complex with GZNL-2002
提交 2024-06-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1564–1878(315 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 4
A1L2A 2-methyl-5-(4-methylpiperazin-1-yl)-~{N}-(1-quinolin-4-ylcyclopropyl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;0.05 M Zinc acetate dihydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.257
|
|
8ZT9
The Crystal structure of mol066 bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2
提交 2024-06-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3565(302 aa)
链 B
3264–3565(302 aa)
|
未记录
|
A1D87 6-[(6-chloranyl-2-propan-2-yl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]pyrimidine-2,4-dione × 2
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium acetate, 15% (w/v) PEG3350
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.186
|
|
8ZUB
The Crystal structure of mol075 bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2
提交 2024-06-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3564(301 aa)
链 B
3264–3564(301 aa)
|
未记录
|
A1D80 6-[(6-chloranyl-2-pentyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]pyrimidine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium acetate, 15% (w/v) PEG3350
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.188
|
|
8ZUC
The Crystal structure of mol080 bound to the main protease (3CLpro/Mpro) of SARS-CoV-2
提交 2024-06-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3564(301 aa)
链 B
3264–3564(301 aa)
|
未记录
|
A1D81 6-[[6-chloranyl-2-(3-methylbutyl)indazol-5-yl]amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]pyrimidine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium acetate, 15% (w/v) PEG3350
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.193
|
|
9ARQ
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (authentic protein) in complex with an inhibitor TKB-245
提交 2024-02-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
T2L (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(4-fluoro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;28% v/v 2-Propanol, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 3% v/v Polyethylene glycol 200
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.235
|
|
9ARS
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease E166V mutant in complex with an inhibitor TKB-245
提交 2024-02-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:E166V
突变:E166V
|
T2L (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(4-fluoro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 14 % w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.222
|
|
9ART
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease A191T mutant in complex with an inhibitor 5h
提交 2024-02-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 D
3264–3568(305 aa)
|
突变:A191T
突变:A191T
|
V7G N-[(2S)-1-({(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 12 % w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.231
|
|
9ASV
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a benzyl 2-pyrrolidone inhibitor
提交 2024-02-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
|
未记录
|
A1AGE (1R,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-benzyl-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
A1AGF (1S,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-benzyl-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.5, 200 mM sodium fluoride
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.223
|
|
9ASW
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a m-fluorobenzyl 2-pyrrolidone inhibitor
提交 2024-02-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
|
未记录
|
A1AGB (1R,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(3-fluorophenyl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
A1AGA (1S,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(3-fluorophenyl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;291 K;12% w/v PEG8000, 100 mM sodium cacodylate, pH 5.5, 100 mM calcium acetate
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.215
|
|
9ASY
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a m-chlorobenzyl 2-pyrrolidone inhibitor
提交 2024-02-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
|
未记录
|
A1AGI (1R,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(3-chlorophenyl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
A1AGJ (1S,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(3-chlorophenyl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;15% v/v PEG400, 100 mM MES, pH 6.0, 100 mM calcium acetate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.219
|
|
9ASZ
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a phenylethyl 2-pyrrolidone inhibitor
提交 2024-02-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
|
未记录
|
A1AGG (1S,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[(2S)-5-oxo-1-(2-phenylethyl)pyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;25% w/v PEG1500, 100 mM MMT, pH 7.0
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.239
|
|
9AT0
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a methylcyclohexyl 2-pyrrolidone inhibitor (S-enantiomer)
提交 2024-02-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
|
未记录
|
A1AGX (1S,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-(cyclohexylmethyl)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
A1AGW (1R,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-(cyclohexylmethyl)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
MLT D-MALATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;25% w/v PEG1500, 100 mM MMT, pH 7.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.229
|
|
9AT1
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a methylcyclohexyl 2-pyrrolidone inhibitor (R-enantiomer)
提交 2024-02-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
|
未记录
|
A1AGZ (1S,2S)-2-{[N-({[(2R)-1-(cyclohexylmethyl)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.0, 200 mM sodium formate
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.221
|
|
9AT3
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with an ethylcyclohexyl 2-pyrrolidone inhibitor
提交 2024-02-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
|
未记录
|
A1AGK (1R,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-(2-cyclohexylethyl)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
A1AGL (1S,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-(2-cyclohexylethyl)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
CA CALCIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;30% w/v PEG550 MME, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, 50 mM calcium chloride
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.212
|
|
9AT4
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a methylbicyclo[2.2.1]heptane 2-pyrrolidone inhibitor
提交 2024-02-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
|
未记录
|
A1AGN (1S,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-{[(1S,2S,4R)-bicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]methyl}-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
A1AGM (1R,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-{[(1S,2S,4R)-bicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]methyl}-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.0, 200 mM sodium formate
|
分辨率 1.35 Å
R-free 0.172
|
|
9AT5
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a 1-methyl-4,4-difluorocyclohexyl 2-pyrrolidone inhibitor
提交 2024-02-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
|
未记录
|
A1AGO (1R,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(4,4-difluorocyclohexyl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
A1AGP (1S,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(4,4-difluorocyclohexyl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.5, 200 mM sodium fluoride
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.183
|
|
9AT6
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a methylbicyclo[2.2.1]heptene 2-pyrrolidone inhibitor
提交 2024-02-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
|
未记录
|
A1AGQ (1R,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-{[(1R,2S,4R)-bicyclo[2.2.1]hept-5-en-2-yl]methyl}-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
A1AGR (1S,2S)-2-{[N-({[(2S)-1-{[(1R,2S,4R)-bicyclo[2.2.1]hept-5-en-2-yl]methyl}-5-oxopyrrolidin-2-yl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;20% w/v PEG3350, 100 mM Bis-Tris propane, pH 7.0, 20 mM sodium potassium phosphate
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.170
|
|
9AT7
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with a 2,2-difluoro-5-methylbenzo[1,3]dioxole 2-pyrrolidone inhibitor
提交 2024-02-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
链 B
3264–3567(304 aa)
片段:UNP residues 3264-3567
|
未记录
|
A1AGS (1R,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(2,2-difluoro-2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
A1AGT (1S,2S)-2-({N-[({(2S)-1-[(2,2-difluoro-2H-1,3-benzodioxol-5-yl)methyl]-5-oxopyrrolidin-2-yl}methoxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;25% w/v PEG1500, 100 mM SPG, pH 6.0
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.224
|
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9AUJ
Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant (S144A) in complex with Nirmatrelvir (PF-07321332)
提交 2024-02-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:S144A
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;294 K;0.1 M imidazole (pH 7.0), 20 % PEG 6000
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.219
|
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9AUK
Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant (A173V) in complex with Nirmatrelvir (PF-07321332)
提交 2024-02-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:A173V
突变:A173V
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;294 K;0.2 M NaCl, 0.1 M HEPES, pH 7, 20 % PEG 6000
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.253
|
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9AUL
Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant (A173V,T304I)) in complex with Nirmatrelvir (PF-07321332)
提交 2024-02-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:A173V,T304I
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;294 K;5 % MPD, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 10 % PEG 10000
|
分辨率 2.42 Å
R-free 0.277
|
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9AUM
Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant (T21I,S144A,T304I) in complex with Nirmatrelvir (PF-07321332)
提交 2024-02-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:T21I,S144A,T304I
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;294 K;0.1 M Tris, pH 8, 20 % 2-propanol, 5 % PEG8000
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.229
|
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9AUN
Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant (T21I,T304I)
提交 2024-02-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:T21I,T304I
突变:T21I,T304I
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;294 K;0.1 M MES, pH 6, 13.2 % PEG 4000
|
分辨率 2.29 Å
R-free 0.291
|
|
9AUO
Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant (L50F,T304I)
提交 2024-02-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:L50F,T304I
突变:L50F,T304I
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;294 K;0.1 M MES, pH 5.6, 13 % PEG 4000
|
分辨率 2.42 Å
R-free 0.315
|
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9AVQ
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease A191T mutant in complex with an inhibitor Nirmatrelvir
提交 2024-03-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:A191T
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;3% DMSO or 0.1 M MES pH 6.8, 15% PEG 6000
|
分辨率 2.58 Å
R-free 0.244
|
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9AZX
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) Nsp3 macrodomain in complex with NDPr
提交 2024-03-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain (UNP residues 1024-1192)
|
未记录
|
A1AH3 {(2R,3S,4R,5R)-5-[(8S)-4-aminopyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl]-5-cyano-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl}methyl [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-trihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100 mM Tris-HCl, pH 8, 200 mM sodium acetate, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.184
|
|
9AZX
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) Nsp3 macrodomain in complex with NDPr
提交 2024-03-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain (UNP residues 1024-1192)
|
未记录
|
A1AH3 {(2R,3S,4R,5R)-5-[(8S)-4-aminopyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl]-5-cyano-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl}methyl [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-trihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100 mM Tris-HCl, pH 8, 200 mM sodium acetate, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.184
|
|
9AZX
Crystal structure of SARS-CoV-2 (Covid-19) Nsp3 macrodomain in complex with NDPr
提交 2024-03-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain (UNP residues 1024-1192)
|
未记录
|
A1AH3 {(2R,3S,4R,5R)-5-[(8S)-4-aminopyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl]-5-cyano-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl}methyl [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-trihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;100 mM Tris-HCl, pH 8, 200 mM sodium acetate, 30% w/v PEG4000
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.184
|
|
9BBQ
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6c inhibitor
提交 2024-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
未记录
|
A1ALF N-[(2R)-1-({(2S)-1-amino-3-[(2S,3R)-2-hydroxypyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4'-ethoxy[1,1'-biphenyl]-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291.15 K;0.2 M Potassium chloride, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.232
|
|
9BBR
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6b inhibitor
提交 2024-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ALL 4'-fluoro-N-[(2S)-1-({(2R)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl][1,1'-biphenyl]-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291.15 K;1% w/v Tryptone, 0.001 M Sodium azide, 0.05 M HEPES sodium pH 7.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.209
|
|
9BBS
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6d inhibitor
提交 2024-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ALG N-[(2S)-1-({(2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4'-methoxy[1,1'-biphenyl]-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291.15 K;0.1 M MOPSO/bis-tris, 15%(w/v) PEG 3K, 20%(v/v) 1,2,4-butanetriol, 1%(w/v) NDSB 256 0.5 mM of each Oxometalate
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.224
|
|
9BBT
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6f inhibitor
提交 2024-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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A1ALH N-[(2S)-1-({(2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-3',4'-dimethoxy[1,1'-biphenyl]-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;291.15 K;5%(w/v) PEG 20K, 25%(w/v) 1,1,1-tris(hydroxymethyl)propane, 1%(w/v) NDSB 195 0.01 M of each Polyamine 0.1 M GlyGly/AMPD
|
分辨率 2.57 Å
R-free 0.234
|
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9BBU
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6h inhibitor
提交 2024-04-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ALK N~2~-[4-(5-chloropyridin-3-yl)benzoyl]-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291.15 K;15%(w/v) PEG 3K, 20%(v/v) 1,2,4-butanetriol, 1%(w/v) NDSB 256 0.02 M of each Monosaccharide II 0.1 M MOPSO/bis-tris
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.220
|
|
9BBV
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6j inhibitor
提交 2024-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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A1ALD N-{(1E,2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-N~2~-[4-(2-methyl-2H-indazol-4-yl)benzoyl]-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291.15 K;12.5%(w/v) PEG 4K, 20%(v/v) 1,2,6-hexanetriol 0.01 M of each Polyamine 0.1 M BES/TEA
|
分辨率 2.46 Å
R-free 0.258
|
|
9BBW
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6k inhibitor
提交 2024-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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A1ALM N-{(2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-N~2~-[4-(6-methoxypyridin-3-yl)benzoyl]-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291.15 K;0.2 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.31 Å
R-free 0.231
|
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9BBX
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 6l inhibitor
提交 2024-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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A1ALN N-{(2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-N~2~-[4-(1-methyl-1H-indazol-5-yl)benzoyl]-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291.15 K;0.05 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M HEPES, 30% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.194
|
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9BBY
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 18b inhibitor
提交 2024-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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A1ALU 3-fluoro-N-[(2S)-1-({(2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4'-methoxy[1,1'-biphenyl]-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291.15 K;15%(w/v) PEG 3K, 20%(v/v) 1,2,4-butanetriol, 1%(w/v) NDSB 256, 0.5 mM of each Oxometalate, 0.1 M BES/TEA
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.255
|
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9BBZ
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 18d inhibitor
提交 2024-04-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ALV N~2~-[(4M)-2-fluoro-4-(1-methyl-1H-indazol-5-yl)benzene-1-carbonyl]-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291.15 K;15%(w/v) PEG 3K, 20%(v/v) 1,2,4-butanetriol, 1%(w/v) NDSB 256, 0.5 mM of each Divalent cation II
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.218
|
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9BC0
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 18r inhibitor
提交 2024-04-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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A1ALX 3-chloro-N-[(2R)-1-({(1Z,2S)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4'-methoxy[1,1'-biphenyl]-4-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;291.15 K;12.5%(w/v) PEG 4K, 20%(v/v) 1,2,6-hexanetriol, 0.5 mM of each Oxometalate, 0.1 M GlyGly/AMPD
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.271
|
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9BC1
SARS-CoV-2 Mpro in complex with peptide mimetic inhibitor
提交 2024-04-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291.15 K;15%(w/v) PEG 3K, 20%(v/v) 1,2,4-butanetriol, 1%(w/v) NDSB 256, 0.5 mM of each Divalent cation II, 0.1 M MOPSO/bis-tris
|
分辨率 1.72 Å
R-free 0.200
|
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9BF7
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) C111S Untagged Crystal Structure
提交 2024-04-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1564–1878(315 aa)
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未记录
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PO4 PHOSPHATE ION × 3
GOL GLYCEROL × 4
ACT ACETATE ION × 1
ZN ZINC ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277.15 K;Monosodium phosphate, dipotassium phosphate, tris-HCl, sucrose
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.196
|
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9BIH
SARS-CoV-2 endoribonuclease Nsp15 bound to dsRNA with 1 nucleotide bulge
提交 2024-04-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:octameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
链 D
6453–6798(346 aa)
链 E
6453–6798(346 aa)
链 F
6453–6798(346 aa)
|
突变:H235A
突变:H235A
突变:H235A
突变:H235A
突变:H235A
突变:H235A
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.24 Å
|
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9BLF
SARS-CoV-2 core polymerase complex inhibited by araCTP
提交 2024-04-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4391–5324(934 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
HF4 4-amino-1-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-arabinofuranosyl}pyrimidin-2(1H)-one × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å
|
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9BNU
Crystal Structure of T190I SARS-CoV-2 Main Protease
提交 2024-05-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;294 K;0.1 M BIS-TRIS, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 5,000
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.231
|
|
9BNV
Crystal Structure of A173V SARS-CoV-2 Main Protease
提交 2024-05-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;294 K;0.1 M Imidazole, 20% w/v Polyethylene glycol 6,000
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.255
|
|
9BNW
Crystal Structure of A173V/L50F SARS-CoV-2 Main Protease
提交 2024-05-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:A173V,L50F
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;294 K;0.1 M HEPES, 30% w/v Polyethylene glycol 1,000
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.201
|
|
9BNX
Crystal Structure of L50F SARS-CoV-2 Main Protease
提交 2024-05-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;294 K;0.1 M MES monohydrate, 14% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.290
|
|
9BNY
Crystal Structure of E166V/L50F SARS-CoV-2 Main Protease
提交 2024-05-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:E166V,L50F
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;294 K;0.1 M BIS-TRIS, 20% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.270
|
|
9BNZ
Crystal Structure of E166V SARS-CoV-2 Main Protease
提交 2024-05-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;294 K;4% v/v 2-Propanol, 0.1 M BIS-TRIS propane, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 5,000
|
分辨率 2.08 Å
R-free 0.252
|
|
9BO1
Crystal Structure of T190I SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Compound Mpro61
提交 2024-05-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XEK (5P)-5-[(1P,3M,3'P)-3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]-1-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;294 K;0.1 M BIS-TRIS, 20% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.247
|
|
9BO2
Crystal Structure of A173V/L50F SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Compound Mpro61
提交 2024-05-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XEK (5P)-5-[(1P,3M,3'P)-3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]-1-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;294 K;0.2 M L-Proline, 0.1 M HEPES, 24% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.244
|
|
9BO3
Crystal Structure of E166V SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Compound Mpro61
提交 2024-05-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
XEK (5P)-5-[(1P,3M,3'P)-3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]-1-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;294 K;10% v/v 2-Propanol, 0.1 M BICINE, 30% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 2.78 Å
R-free 0.287
|
|
9BO5
Crystal Structure of T190I SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Nirmatrelvir
提交 2024-05-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;294 K;10% v/v Polyethylene glycol 200, 0.1 M BIS-TRIS propane, 18% w/v Polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.222
|
|
9BO6
Crystal Structure of A173V/L50F SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Nirmatrelvir
提交 2024-05-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:A173V,L50F
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4;294 K;0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.0, 10% v/v Jeffamine M-600 pH 7.0
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.223
|
|
9BO7
Crystal Structure of L50F SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Nirmatrelvir
提交 2024-05-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;294 K;0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 20% v/v Jeffamine M-600 pH 7.0
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.224
|
|
9BO9
Crystal Structure of T190I SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with GC376
提交 2024-05-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;294 K;0.1 M Imidazole, 12% w/v Polyethylene glycol 20,000
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.239
|
|
9BOA
Crystal Structure of A173V SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with GC376
提交 2024-05-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;294 K;10% v/v Polyethylene glycol 200, 0.1 M BIS-TRIS propane, 18% w/v Polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.240
|
|
9BOB
Crystal Structure of A173V/L50F SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with GC376
提交 2024-05-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 3.5;294 K;4% v/v (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol, 0.1 M Citric acid, 20% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.239
|
|
9BOC
Crystal Structure of L50F SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with GC376
提交 2024-05-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;294 K;0.1 M BICINE, 15% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 1.68 Å
R-free 0.208
|
|
9BOD
Crystal Structure of E166V/L50F SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with GC376
提交 2024-05-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;294 K;0.1 M BICINE, 15% w/v Polyethylene glycol 1,500
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.241
|
|
9BOE
Crystal Structure of E166V SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with GC376
提交 2024-05-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;294 K;10% v/v 2-Propanol, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate, 26% v/v Polyethylene glycol 400
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.230
|
|
9BPF
Crystal structure of main protease of SARS-CoV-2 complexed with inhibitor
提交 2024-05-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
YDL N-(methoxycarbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-(trifluoromethyl)-L-prolinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.22 M NH4Cl, 0.1 M HEPES, 22% PEG6,000
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.278
|
|
9BQF
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor 78
提交 2024-05-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
NOL N-[(BENZYLOXY)CARBONYL]-O-(TERT-BUTYL)-L-THREONYL-3-CYCLOHEXYL-N-[(1S)-2-HYDROXY-1-{[(3S)-2-OXOPYRROLIDIN-3-YL]METHYL}ETHYL]-L-ALANINAMIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.273
|
|
9BQG
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor k68
提交 2024-05-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AQ3 benzyl (2S,4S)-4-tert-butoxy-2-({(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)pyrrolidine-1-carboxylate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.275
|
|
9BQL
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-A-32
提交 2024-05-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ARG O-tert-butyl-N-[(cyclopropylmethoxy)carbonyl]-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.274
|
|
9BQM
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-A-26
提交 2024-05-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ARI O-tert-butyl-N-{[(propan-2-yl)oxy]carbonyl}-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.258
|
|
9BQN
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-A-28
提交 2024-05-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ARK O-tert-butyl-N-[(2,2,2-trifluoroethoxy)carbonyl]-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.292
|
|
9BQO
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor k88
提交 2024-05-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ARM N-[(benzyloxy)carbonyl]-O-tert-butyl-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.297
|
|
9BQP
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor R79
提交 2024-05-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ARN propan-2-yl {(2R)-1-[(1R,2S,5R)-2-({(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexan-3-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.263
|
|
9BQQ
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor R81
提交 2024-05-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ARH N-[(benzyloxy)carbonyl]-O-tert-butyl-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2R)-3-oxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}-L-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.254
|
|
9BQT
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor R80
提交 2024-05-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ARS N-[(benzyloxy)carbonyl]-O-tert-butyl-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2R)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.231
|
|
9BQY
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor R70
提交 2024-05-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ART (1R,2S,5R)-3-[N-(3,3-dimethylbutanoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(1E,2R)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.306
|
|
9BQZ
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor x11
提交 2024-05-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ARV (1H-indol-4-yl)methanol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.263
|
|
9BR0
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor YR-B-84
提交 2024-05-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ARU O-tert-butyl-N-(trifluoroacetyl)-L-threonyl-3-cyclohexyl-N-{(2R)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.278
|
|
9BR1
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-A-70
提交 2024-05-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ARR N-[(benzyloxy)carbonyl]-O-tert-butyl-L-threonyl-N-{(1S,2R)-1-(1,3-benzoxazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-3-cyclohexyl-L-alaninamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.257
|
|
9BRV
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) with Fragment 5
提交 2024-05-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1563–1879(317 aa)
|
突变:C270S
|
A1ASK N-[2-(dimethylamino)ethyl]-N'-(3-methylphenyl)thiourea × 2
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2M magnesium formate, 15-25%PEG3350
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.226
|
|
9BRV
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) with Fragment 5
提交 2024-05-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1563–1879(317 aa)
|
突变:C270S
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2M magnesium formate, 15-25%PEG3350
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.226
|
|
9BS7
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor Vinylpyridine
提交 2024-05-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AR3 3-ethenylpyridine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.285
|
|
9BS8
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor YR-B-107
提交 2024-05-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AR4 benzyl (7S)-7-({(2R)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}carbamoyl)-6-azaspiro[3.4]octane-6-carboxylate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.225
|
|
9BSA
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-B-112
提交 2024-05-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AR5 2,2-dichloro-N-(5-chloropyridin-3-yl)-N-phenylacetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.251
|
|
9BSE
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor YR-B-165
提交 2024-05-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AR6 (3S)-N-{(2S)-1-amino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[(2R)-3,3-dimethyl-2-(2,2,2-trifluoroacetamido)butanoyl]-2-azaspiro[4.5]decane-3-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.239
|
|
9BSF
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor SR-A-171
提交 2024-05-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AR7 N-(4-tert-butylphenyl)-2,2-dichloro-N-(5-chloropyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.238
|
|
9BSG
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-C-20
提交 2024-05-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AR8 methyl 4-[(5-chloropyridin-3-yl)(phenyl)amino]-4-oxobutanoate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.254
|
|
9BSI
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor SR-B-7
提交 2024-05-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AR9 N-[(1M)-3'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl]-N-(5-chloropyridin-3-yl)-2-fluoroacetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.248
|
|
9BSO
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor SR-B-13
提交 2024-05-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ARW N-[(1M)-3'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl]-N-(5-chloropyridin-3-yl)-3-sulfanylpropanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.270
|
|
9BSP
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-C-68
提交 2024-05-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ARX methyl 4-{[(1M)-3'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl](5-chloropyridin-3-yl)amino}-4-oxobutanoate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.235
|
|
9BSQ
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor VB-C-70
提交 2024-05-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ARY (2R)-N-[(1M)-3'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl]-N-(5-chloropyridin-3-yl)-2-hydroxy-2-sulfanylacetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.248
|
|
9BSR
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor YR-B-136B
提交 2024-05-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ASA (1R,2S,5R)-N-[(1R)-1-(7-fluoroisoquinolin-4-yl)-2-iminoethyl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.252
|
|
9BST
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor CID8009_5647
提交 2024-05-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A5Z [3-[2,6-bis(chloranyl)phenyl]-5-methyl-1,2-oxazol-4-yl]methanol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.297
|
|
9BTE
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor CID5573_0017
提交 2024-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ASF 4-[5-[4-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-1,2,5-oxadiazol-3-yl]-1~{H}-1,2,4-triazol-3-yl]-1,2,5-oxadiazole-3-thiol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.265
|
|
9BTF
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor SR-B-77
提交 2024-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ASH (1R,2S,5S)-N-[(1R)-1-(5-fluoropyridin-3-yl)-2-iminoethyl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.224
|
|
9BTK
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor YR-C-108T
提交 2024-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ASG (1R,2S,5R)-N-[(1R)-2-imino-1-(isoquinolin-4-yl)ethyl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-D-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.249
|
|
9BTR
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor YR-C-163
提交 2024-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ASI 2-chloro-N-[(3P)-3-(5-chloro-2-methyl-2H-indazol-7-yl)phenyl]-N-(5-chloropyridin-3-yl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.247
|
|
9BTT
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor SR-B-51T
提交 2024-05-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ASJ (1R,2S,5S)-N-[(1R)-1-(5-chloropyridin-3-yl)-2-iminoethyl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.234
|
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9BVW
SARS-CoV-2 main protease bound to inhibitor SR-B-103
提交 2024-05-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AS2 (1R,2S,5R)-N-[(1R)-1-(8-fluoroisoquinolin-4-yl)-2-iminoethyl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-D-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.260
|
|
9BVX
SARS-CoV-2 main protease bound to inhibitor YR-C-155
提交 2024-05-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AS3 (1R,2S,5R)-N-[(1R)-1-(5-fluoroisoquinolin-4-yl)-2-iminoethyl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.208
|
|
9BVZ
SARS-CoV-2 main protease bound to inhibitor AR-A-135
提交 2024-05-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AS4 [2-(iminomethyl)pyridin-3-yl]boronic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17%
W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.321
|
|
9C80
Co-structure of SARS-CoV-2 (COVID-19 with covalent inhibitor
提交 2024-06-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AUX (5R,7S,8R)-7-(2-fluorophenyl)-3-[(2-fluorophenyl)carbamoyl]-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5-carboxylic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;25% Peg 1500, 0.1M MIB pH 7.0
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.265
|
|
9C8Q
Co-structure of Main Protease of SARS-CoV-2 (COVID-19) with covalent inhibitor
提交 2024-06-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AU4 (7P,8S)-3-cyclohexyl-7-(3-methylpyridin-2-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;25% Peg 1500, 0.1M MIB pH 7.0
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.230
|
|
9CDK
SARS-CoV-2 Mpro A173V mutant in complex with small molecule inhibitor Mpro61
提交 2024-06-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:A173V
|
XEK (5P)-5-[(1P,3M,3'P)-3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]-1-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;290 K;1% w/v Tryptone, 0.001 M Sodium azide, 0.05 M HEPES sodium pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.61 Å
R-free 0.224
|
|
9CDL
SARS-CoV-2 Mpro E166V/L50F double mutant in complex with small molecule inhibitor Mpro61
提交 2024-06-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:E166V, L50F
|
XEK (5P)-5-[(1P,3M,3'P)-3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]-1-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;290 K;0.1 M MES pH 6.0-6.5, 10% 2-propanol, 15-20% PEG3350
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.211
|
|
9CDM
SARS-CoV-2 Mpro L50F mutant in complex with small molecule inhibitor Mpro61
提交 2024-06-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:L50F
|
XEK (5P)-5-[(1P,3M,3'P)-3-{3-chloro-5-[(2-chlorophenyl)methoxy]-4-fluorophenyl}-2-oxo-2H-[1,3'-bipyridin]-5-yl]-1-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;290 K;0.2 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 0.1 M Imidazole pH 7.0, 20% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.237
|
|
9CEC
SARS-CoV-2 3CL Protease complexed with covalent inhibitor BC671
提交 2024-06-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AV3 N-[(2S)-1-{[(2S)-1-hydroxy-3-(2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)propan-2-yl]amino}-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;100mM sodium potassium tartrate, 10% PEG 3350
|
分辨率 2.36 Å
R-free 0.258
|
|
9CED
SARS-CoV-2 3CL Protease complexed with covalent inhibitor VK13
提交 2024-06-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AV7 N-[(2S)-1-{[(2S)-1-hydroxy-3-(2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)propan-2-yl]amino}-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;100mM sodium potassium tartrate, 10% PEG 3350
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.277
|
|
9CEK
SARS-CoV-2 3CL Protease complexed with covalent inhibitor VK20
提交 2024-06-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1
NA SODIUM ION × 1
A1AV5 N-[(2S)-1-{[(2S)-1-hydroxy-3-(1,3-oxazol-4-yl)propan-2-yl]amino}-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
A1AV6 N-[(2S)-1-amino-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;100 mM sodium potassium tartrate, 10% PEG 3350
|
分辨率 1.38 Å
R-free 0.178
|
|
9CF9
SARS-CoV-2 3CL Protease complexed with covalent inhibitor BC787
提交 2024-06-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AWA N-[(2S)-1-{[(2S)-1-hydroxy-3-(pyridin-3-yl)propan-2-yl]amino}-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;100 mM sodium potassium tartrate, 10% PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.266
|
|
9CFB
SARS-CoV-2 3CL Protease complexed with covalent inhibitor BC674
提交 2024-06-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1AWB N-[(2S)-3-cyclohexyl-1-{[(2S)-1-hydroxy-3-(2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)propan-2-yl]amino}-1-oxopropan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide × 2
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;100 mM sodium potassium tartrate, 10% PEG 3350
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.203
|
|
9CGV
SARS-CoV-2 nsp12 NiRAN domain bound to a covalent inhibitor SW090466-1
提交 2024-07-01
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
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链 A
4392–5324(933 aa)
片段:UNP residues 4392-5324, fused to 6xHis-TEV
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
链 C
3860–3942(83 aa)
片段:UNP residues 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP residues 3943-4140
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未记录
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ZN ZINC ION × 2
A1AWQ methyl (8S)-7-hydroxy-5-methylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxylate × 1
MN MANGANESE (II) ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.70 Å
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9CJO
X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease quadruple mutants
提交 2024-07-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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突变:T21I, L50F, S144A, E166V
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;J313: 0.1 M succinic acid, pH 7.0, 15% w/v PEG3350
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分辨率 2.33 Å
R-free 0.273
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9CJP
X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease quadruple mutants in complex with Nirmatrelvir
提交 2024-07-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
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突变:T21I, L50F, S144A, E166V
突变:T21I, L50F, S144A, E166V
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4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
BR BROMIDE ION × 3
SO4 SULFATE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;J309: 0.1 M Buffer System 3, pH 8.5, 0.09M NPS, 50% v/v Precipitant Mix 4, MD Morpheus MD1-47
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分辨率 1.71 Å
R-free 0.226
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9CJQ
X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease quadruple mutants in complex with Ensitrelvir
提交 2024-07-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3570(307 aa)
片段:UNP residues 3264-3570
链 B
3264–3570(307 aa)
片段:UNP residues 3264-3570
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突变:T21I, L50F, S144A, E166V
突变:T21I, L50F, S144A, E166V
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7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Data were collected for crystals of robot tray J000317: 0.05 M HEPES sodium, pH 7.0, 1% w/v Tryptone, 12% w/v PEG
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分辨率 2.24 Å
R-free 0.258
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9CJQ
X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease quadruple mutants in complex with Ensitrelvir
提交 2024-07-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 C
3264–3570(307 aa)
片段:UNP residues 3264-3570
链 D
3264–3570(307 aa)
片段:UNP residues 3264-3570
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突变:T21I, L50F, S144A, E166V
突变:T21I, L50F, S144A, E166V
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7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Data were collected for crystals of robot tray J000317: 0.05 M HEPES sodium, pH 7.0, 1% w/v Tryptone, 12% w/v PEG
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分辨率 2.24 Å
R-free 0.258
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9CJR
X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease double mutants in complex with Ensitrelvir
提交 2024-07-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3567(304 aa)
链 B
3264–3567(304 aa)
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突变:L50F, E166V
突变:L50F, E166V
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7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;Crystal data were collected from crystals from robot tray J000572, B8_10 (MD Morpheus MD1-47): 0.1 M Buffer System 2, pH 7.5, 0.09 M halogens, 50% v/v Precipitant Mix 4
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分辨率 1.65 Å
R-free 0.215
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9CJS
X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease triple mutants in complex with Bofutrelvir
提交 2024-07-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3567(304 aa)
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突变:T21I, L50F, E166V
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FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;J000582,D04_00, MD ECO PACT premiet HT96 Eco: 0.1 M MMT, pH 7.0, 25% w/v PEG1500
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分辨率 2.09 Å
R-free 0.278
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9CJT
X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease quadruple mutants in complex with Bofutrelvir
提交 2024-07-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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突变:T21I, L50F, S144A, E166V
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FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;J582,D03_10: 0.1 M MMT, pH 6.0, 25% w/v PEG1500
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分辨率 1.92 Å
R-free 0.278
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9CJU
Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with Bofutrelvir in orthorhombic form
提交 2024-07-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
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未记录
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FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;J000854 E10_10: 0.12 M ethylene glycols, 0.1 M Buffer System 3, pH 8.5, 30% v/v Precipitant Mix 2
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分辨率 1.68 Å
R-free 0.210
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9CJV
X-ray crystal structure of SARS-CoV-2 main protease complex with Bofutrelvir
提交 2024-07-07
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3566(303 aa)
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未记录
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FHR ~{N}-[(2~{S})-3-cyclohexyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]propan-2-yl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;J852 F07_10: 0.1 M Bis-Tris propane, pH 9.0, 25% w/v PEG1500, 0.1 M sodium chloride
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分辨率 1.91 Å
R-free 0.247
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9CMJ
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease drug resistant mutant (L50F, E166V)
提交 2024-07-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;16-18 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0 with microseeding
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分辨率 2.10 Å
R-free 0.236
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9CMN
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease drug resistant mutant (E166A, L167F)
提交 2024-07-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;16-18 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0 with microseeding
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.242
|
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9CMS
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease drug resistant mutant (E166V) in complex with ensitrelvir (ESV)
提交 2024-07-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
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未记录
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7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;16-18 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0 with microseeding
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.195
|
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9CMU
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease drug resistant mutant (L50F, E166V) in complex with ensitrelvir (ESV)
提交 2024-07-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;287 K;16-18 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 7.0 with microseeding
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.202
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|
9CXY
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-1500
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
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A1A5Z N-ethyl-N'-{4-[(2-oxopyrrolidin-1-yl)amino]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-8-yl}urea × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.161
|
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9CXY
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-1500
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.03 Å
R-free 0.161
|
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9CXZ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-1501
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
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A1A54 N-{4-[(2-oxopyrrolidin-1-yl)amino]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-8-yl}acetamide × 1
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.160
|
|
9CXZ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-1501
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.160
|
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9CY0
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-4206
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
A1A55 N-{4-[(2,2-dimethyl-5-oxopyrrolidin-1-yl)amino]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-8-yl}-N'-ethylurea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;292 K;200 mM lithium acetate, 20% PEG 3350
|
分辨率 0.80 Å
R-free 0.185
|
|
9CY0
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-4206
提交 2024-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
A1A55 N-{4-[(2,2-dimethyl-5-oxopyrrolidin-1-yl)amino]-9H-pyrimido[4,5-b]indol-8-yl}-N'-ethylurea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;292 K;200 mM lithium acetate, 20% PEG 3350
|
分辨率 0.80 Å
R-free 0.185
|
|
9D08
Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with covalent dipeptidyl inhibitor CIP-1
提交 2024-08-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
A1A09 N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;19% PEG Smear Medium, 0.1 M MES; pH 6.5, 0.1 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.216
|
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9D2K
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) complex with covalent inhibitor Jun13567
提交 2024-08-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
A1A6J 2-(3-{2-[4-(3,3-dimethylazetidin-1-yl)-4-oxobutanoyl]hydrazin-1-yl}-3-oxopropyl)-N-{(1R)-1-[(3P,5P)-3-(1-ethyl-1H-pyrazol-3-yl)-5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)phenyl]ethyl}benzamide × 1
DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1
ZN ZINC ION × 5
CL CHLORIDE ION × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;277 K;200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, 10% PEG 8000
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.232
|
|
9D2K
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) complex with covalent inhibitor Jun13567
提交 2024-08-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
A1A6J 2-(3-{2-[4-(3,3-dimethylazetidin-1-yl)-4-oxobutanoyl]hydrazin-1-yl}-3-oxopropyl)-N-{(1R)-1-[(3P,5P)-3-(1-ethyl-1H-pyrazol-3-yl)-5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)phenyl]ethyl}benzamide × 1
ZN ZINC ION × 5
CL CHLORIDE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;277 K;200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, 10% PEG 8000
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.232
|
|
9D6B
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-607
提交 2024-08-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
A1A17 2-[(2R)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)pyrrolidin-2-yl]propan-2-ol × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.167
|
|
9D6B
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodmain in complex with AVI-607
提交 2024-08-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.167
|
|
9D6G
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-3716
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
A1A2F [(2R,3S)-3-methyl-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-2-yl]methanol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.142
|
|
9D6G
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-3716
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.00 Å
R-free 0.142
|
|
9D6H
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-1504
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
A1AJW (2R)-3-methyl-2-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]butan-1-ol × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.150
|
|
9D6H
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-1504
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 1.02 Å
R-free 0.150
|
|
9D6I
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-4317
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
A1A2G (3R)-3-hydroxy-3-{[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}-1lambda~6~-thiane-1,1-dione × 1
CL CHLORIDE ION × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.138
|
|
9D6I
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with AVI-4317
提交 2024-08-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1025–1191(167 aa)
片段:macrodomain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;292 K;100 mM CHES, 28% PEG 3000
|
分辨率 0.97 Å
R-free 0.138
|
|
9DDF
SARS-CoV-2 main protease with inhibitor
提交 2024-08-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1A3N N-{(3S,4S)-1-[(4S)-imidazo[1,5-a]pyridine-8-carbonyl]-4-phenylpiperidin-3-yl}-1H-pyrrole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M bis-tris pH 6.5, 32% (w/v) polyethylene glycol 2000 monomethyl ether
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.251
|
|
9DDG
SARS-CoV-2 main protease with inhibitor
提交 2024-08-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1A3O [(4R)-imidazo[1,5-a]pyridin-8-yl]{4-[(1M)-3'-nitro[1,1'-biphenyl]-2-yl]piperazin-1-yl}methanone × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M bis-tris pH 6.5, 32% (w/v) polyethylene glycol 2000 monomethyl ether
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.220
|
|
9DIW
Crystal structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with covalent tripeptidyl inhibitor NIP-22c
提交 2024-09-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;19% PEG 4000, 0.1 M MES pH 6.5, 0.3 M dimethylethylammoniumpropane sulfonate (NDSB-195)
|
分辨率 2.43 Å
R-free 0.278
|
|
9DJ8
RNA-nsp9 bound to the NiRAN domain of the E-RTC with an empty G-pocket
提交 2024-09-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 G
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.58 Å
|
|
9DNU
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) with inhibitor Jun13296
提交 2024-09-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
A1BEG 2-methyl-5-[(1R,5S)-8-methyl-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-N-{(1R)-1-[(2P)-2-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)quinolin-4-yl]ethyl}benzamide × 1
ACT ACETATE ION × 1
ZN ZINC ION × 8
CL CHLORIDE ION × 4
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;277 K;200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, and 6-20% PEG 8000
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.212
|
|
9DNV
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) with inhibitor Jun13308
提交 2024-09-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
A1BEH 2-methyl-5-[(1R,4S)-5-methyl-2,5-diazabicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]-N-{(1R)-1-[(2P)-2-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)quinolin-4-yl]ethyl}benzamide × 1
ACY ACETIC ACID × 1
ZN ZINC ION × 6
CL CHLORIDE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.7;277 K;200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, and 6-20% PEG 8000
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.227
|
|
9DO1
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) with inhibitor Jun13307
提交 2024-09-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
A1BF2 2-methyl-N-{(1R)-1-[(2M)-2-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)quinolin-4-yl]ethyl}-5-{[(2R)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}benzamide × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
ZN ZINC ION × 6
CL CHLORIDE ION × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.8;277 K;200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, and 6-20% PEG 8000
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.238
|
|
9DO3
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) with inhibitor Jun13317
提交 2024-09-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
A1BEF 5-[(3S)-3,4-dimethylpiperazin-1-yl]-2-methyl-N-{(1R)-1-[(2M)-2-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)quinolin-4-yl]ethyl}benzamide × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
ACT ACETATE ION × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
ZN ZINC ION × 7
CL CHLORIDE ION × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.8;277 K;200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, and 6-20% PEG 8000
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.233
|
|
9DO5
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) with inhibitor Jun12665
提交 2024-09-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
A1BEE 5-[2-(dimethylamino)ethoxy]-N-{(1R)-1-[(2P)-2-{1-[2-(dimethylamino)-2-oxoethyl]-1H-pyrazol-4-yl}quinolin-4-yl]ethyl}-2-methylbenzamide × 1
ACT ACETATE ION × 1
ZN ZINC ION × 8
CL CHLORIDE ION × 6
GOL GLYCEROL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.9;277 K;200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, and 6-20% PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.271
|
|
9DOI
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) with inhibitor Jun13306
提交 2024-09-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
A1BEL 2-methyl-N-{(1S)-1-[(2P)-2-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)quinolin-4-yl]ethyl}-5-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}benzamide × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
ACT ACETATE ION × 1
CL CHLORIDE ION × 5
ZN ZINC ION × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.8;277 K;200 mM zinc acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5-6.6, and 6-20% PEG 8000
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.244
|
|
9DTZ
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 5
提交 2024-10-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1BCZ N-[(2S)-3-cyclopropyl-1-({(2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;296 K;20% PEG 6000, 0.1M MES pH 6.0, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.235
|
|
9DU2
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 7
提交 2024-10-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1BCY N-[(2S)-3-cyclopropyl-1-{[(1Z,2S)-1-imino-4-(methanesulfonyl)butan-2-yl]amino}-1-oxopropan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;20% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris Propane pH 6.5, 0.2M Sodium Acetate
|
分辨率 1.86 Å
R-free 0.206
|
|
9DU3
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 1
提交 2024-10-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1BCX N-[(2S)-3-cyclopropyl-1-({(2R)-1-hydroxy-3-[(3R)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;20% PEG 3350, 0.2M Ammonium Tartrate Dibasic
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.244
|
|
9DU4
SARS-CoV-2 Mpro in complex with compound 3
提交 2024-10-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1BCW N-[(2S)-3-cyclopropyl-1-{[(2R)-1-hydroxy-4-(methanesulfonyl)butan-2-yl]amino}-1-oxopropan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;296 K;20% PEG 3350, 0.2M Lithium Nitrate
|
分辨率 2.42 Å
R-free 0.242
|
|
9DW6
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) C145A mutant in complex with peptide from human tRNA methyltransferase TRMT1
提交 2024-10-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:C145A
突变:C145A
|
CL CHLORIDE ION × 1
NA SODIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;20-21.5% PEG3350, 100 mM sodium chloride, diffraction-quality crystals obtained from seeding
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.218
|
|
9E7B
X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease V186G covalently bound to compound GRL-051-22 at 1.3 A
提交 2024-11-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:V186G
|
A1BFE (3S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.164
|
|
9E7S
X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease covalently bound to compound GRL-051-22 at 1.75 A.
提交 2024-11-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1BFE (3S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.219
|
|
9E8R
X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease T190I covalently bound to compound GRL-051-22 at 1.5 A
提交 2024-11-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:T190I
|
A1BFE (3S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.165
|
|
9E9P
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in complex with covalent inhibitor A02
提交 2024-11-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1BGG 1-[(1M)-1-(3-methoxyphenyl)-2,5-dimethyl-1H-pyrrol-3-yl]ethan-1-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;26% PEG 6000, 0.1 M HEPES pH 7.5, 1 mM inhibitor
|
分辨率 1.76 Å
R-free 0.211
|
|
9E9W
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease M49I mutant in complex with S217622
提交 2024-11-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3564(299 aa)
链 B
3266–3564(299 aa)
|
突变:M49I
突变:M49I
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;20~24%PEG3350, 0.12~0.21M sodium sulfate
|
分辨率 1.48 Å
R-free 0.220
|
|
9EEI
Crystal structure of the SARS-CoV-2 Omicron nsp5 main protease (Mpro) E166V mutant in complex with inhibitor GC376
提交 2024-11-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
突变:P132H, E166V
|
UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;PEG3350, sodium formate
|
分辨率 2.76 Å
R-free 0.258
|
|
9EET
Crystal structure of the SARS-CoV-2 nsp5 main protease (Mpro) E166V mutant in complex with inhibitor GC376
提交 2024-11-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
突变:E166V
|
UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;PEG3350, ammonium formate
|
分辨率 2.39 Å
R-free 0.229
|
|
9EEV
Crystal structure of the SARS-CoV-2 Omicron nsp5 main protease (Mpro) E166V mutant in complex with inhibitor Nirmatrelvir (PF-07321332)
提交 2024-11-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:UNP residues 3264-3569
|
突变:P132H, E166V
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;PEG3350, ammonium formate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.259
|
|
9EL4
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant E166A with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231
提交 2024-12-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:E166A
突变:E166A
|
GOL GLYCEROL × 3
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.88 Å
R-free 0.203
|
|
9ELV
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant E166V with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231
提交 2024-12-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:E166V
突变:E166V
|
GOL GLYCEROL × 3
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.203
|
|
9EMJ
SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with Toyocamycin and m7GpppA (Cap0-analog)
提交 2024-03-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
TO1 4-amino-7-(beta-D-ribofuranosyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carbonitrile × 1
GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1
MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.207
|
|
9EML
SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and m7GpppA (Cap0-analog)/m7GpppAm (Cap1-analog)
提交 2024-03-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
EDT {[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID × 1
V9G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-ADENOSINE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.240
|
|
9EMV
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with Sangivamycin and m7GpppA (Cap0-analog)/m7GpppAm (Cap1-analog)
提交 2024-03-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
SGV SANGIVAMYCIN × 1
GTA P1-7-METHYLGUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8
V9G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-ADENOSINE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.34 Å
R-free 0.256
|
|
9EO6
SARS-CoV2 major protease in complex with a covalent inhibitor SLL11.
提交 2024-03-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:none
突变:none
|
K POTASSIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;18% w/v PEG3350
0.2M KSCN
0.1M Bis-Tris Propanol pH 8.5
|
分辨率 2.11 Å
R-free 0.257
|
|
9EO6
SARS-CoV2 major protease in complex with a covalent inhibitor SLL11.
提交 2024-03-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
突变:none
突变:none
|
K POTASSIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;18% w/v PEG3350
0.2M KSCN
0.1M Bis-Tris Propanol pH 8.5
|
分辨率 2.11 Å
R-free 0.257
|
|
9EO6
SARS-CoV2 major protease in complex with a covalent inhibitor SLL11.
提交 2024-03-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 E
3264–3569(306 aa)
链 F
3264–3569(306 aa)
|
突变:none
突变:none
|
K POTASSIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;18% w/v PEG3350
0.2M KSCN
0.1M Bis-Tris Propanol pH 8.5
|
分辨率 2.11 Å
R-free 0.257
|
|
9EOR
SARS-CoV2 major protease in complex with a covalent inhibitor SLL12.
提交 2024-03-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% w/v PEG3350
0.2M potassium-thiocyanate
0.1M bis-tris propane pH 8.5
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.289
|
|
9EOR
SARS-CoV2 major protease in complex with a covalent inhibitor SLL12.
提交 2024-03-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% w/v PEG3350
0.2M potassium-thiocyanate
0.1M bis-tris propane pH 8.5
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.289
|
|
9EOR
SARS-CoV2 major protease in complex with a covalent inhibitor SLL12.
提交 2024-03-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 E
3264–3569(306 aa)
链 F
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% w/v PEG3350
0.2M potassium-thiocyanate
0.1M bis-tris propane pH 8.5
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.289
|
|
9EOX
SARS-CoV2 major protease in covalent complex with a soluble inhibitor.
提交 2024-03-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;18% w/v PEG3350
0.2M potassium-thiocyanate
0.1M bis-tris propane pH 8.7
|
分辨率 2.54 Å
R-free 0.231
|
|
9EOX
SARS-CoV2 major protease in covalent complex with a soluble inhibitor.
提交 2024-03-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;18% w/v PEG3350
0.2M potassium-thiocyanate
0.1M bis-tris propane pH 8.7
|
分辨率 2.54 Å
R-free 0.231
|
|
9EOX
SARS-CoV2 major protease in covalent complex with a soluble inhibitor.
提交 2024-03-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 E
3264–3569(306 aa)
链 F
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;18% w/v PEG3350
0.2M potassium-thiocyanate
0.1M bis-tris propane pH 8.7
|
分辨率 2.54 Å
R-free 0.231
|
|
9EUN
SARS-CoV-2 nsp10-16 methyltransferase in complex with SAM and m7GTP
提交 2024-03-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.33 Å
R-free 0.234
|
|
9EX8
Free form of a mutant of SARS-CoV-2 main protease Mpro.
提交 2024-04-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;0.1 M MMT (DL-malic acid, MES, and Tris base in molar ratio 1:2:2), pH 7.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.211
|
|
9EXU
Complex of a mutant of the SARS-CoV-2 main protease Mpro with the nsp4/5 substrate peptide (cocrystallization).
提交 2024-04-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;0.1 M MMT (DL-malic acid, MES, and Tris base in molar ratio 1:2:2), pH 7.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.204
|
|
9EYA
Complex of a mutant of the SARS-CoV-2 main protease Mpro with the nsp4/5 substrate peptide (soaking).
提交 2024-04-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;0.1 M MMT (DL-malic acid, MES, and Tris base in molar ratio 1:2:2), pH 7.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.185
|
|
9EZ4
Complex of a mutant of the SARS-CoV-2 main protease Mpro with the nsp5/6 substrate peptide.
提交 2024-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
GLN GLUTAMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;0.1 M MMT (DL-malic acid, MES, and Tris base in molar ratio 1:2:2), pH 7.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.215
|
|
9F2V
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with RHTCR02
提交 2024-04-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1H9E ~{tert}-butyl ~{N}-[1-[(2~{S})-1-[[(2~{R},3~{S})-4-azanyl-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-3-cyclopropyl-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M Bis Tris Propane pH 7.50, 2M Sodium nitrate, 20% w/vPEG 3350 and 10% v/vEthylene glycol
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.209
|
|
9F2X
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with RHTCR03
提交 2024-04-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1H9D ~{tert}-butyl ~{N}-[4-[(2~{S})-1-[[(2~{S},3~{R})-4-azanyl-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-3-cyclopropyl-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-3-oxidanylidene-pyrazin-2-yl]carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.1M HEPES pH 7.0, 2M Sodium chloride, 20% w/v PEG 6000, 10% v/v Ethylene glycol
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.226
|
|
9F39
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with RK-54
提交 2024-04-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
A1H9Y (2R,3R)-3-[[(2S)-3-cyclopropyl-2-[3-(2-methylpropanoylamino)-2-oxidanylidene-pyridin-1-yl]propanoyl]amino]-N-methyl-2-oxidanyl-4-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butanamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M MMT pH 9.0, 25% w/v PEG 1500
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.305
|
|
9F3A
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with RK-325
提交 2024-04-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
A1H9Z tert-butyl N-[1-[(2S)-3-cyclopropyl-1-[[(2S,3R)-4-(methylamino)-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyridin-3-yl]carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Sodium bromide, 0.1 M Bis-Tris propane pH8.5, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.278
|
|
9F7P
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) C112S mutant
提交 2024-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1881(318 aa)
|
突变:C112S
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
NA SODIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;288 K;1.8 M sodium malonate
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.179
|
|
9F7Q
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) C112S mutant
提交 2024-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1881(318 aa)
|
突变:C112S
|
ZN ZINC ION × 1
GOL GLYCEROL × 1
SO4 SULFATE ION × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;288 K;2.5 M ammonium sulfate,0.1M MES
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.232
|
|
9F7R
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) C112S mutant
提交 2024-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1881(318 aa)
|
突变:C112S
|
ZN ZINC ION × 1
GOL GLYCEROL × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;288 K;1.2M K2HPO4, 0.8M NaH2PO4, 0.1M sodium acetate
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.163
|
|
9F7S
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) C112S-K191D-K229R mutant
提交 2024-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1881(318 aa)
|
突变:C112S; K191D; K229R
|
ZN ZINC ION × 1
MLI MALONATE ION × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
NA SODIUM ION × 3
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;288 K;1.4 M sodium malonate, 5% PEG300
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.184
|
|
9F7T
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) C112S-K191D-K229R mutant: dimer
提交 2024-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1564–1881(318 aa)
|
突变:C112S;K191D;K229R
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
CL CHLORIDE ION × 4
ZN ZINC ION × 2
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;288 K;4M sodium chloride, 0.1M TRIS
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.233
|
|
9F7U
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) C112S-K191D-Q222D-K229R-Q230R-C271S mutant
提交 2024-05-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1881(318 aa)
|
突变:C112S,K191D,Q222D,K229R,Q230R,C271S
|
MLA MALONIC ACID × 1
GOL GLYCEROL × 1
NA SODIUM ION × 3
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;288 K;1.6 M sodium malonate
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.176
|
|
9F7Y
SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) C112S-K191D-Q222D-K229R-Q230R-C271S mutant
提交 2024-05-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1881(318 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
MLA MALONIC ACID × 2
NA SODIUM ION × 3
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;288 K;1.4 M sodium malonate, 0.1 M sodium succinate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.183
|
|
9FEH
Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp14 methyltransferase domain in complex with the STM957 inhibitor
提交 2024-05-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
6225–6452(228 aa)
|
未记录
|
A1IB6 ~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[4-azanyl-5-(2-pyridin-3-ylethynyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]-3-cyano-~{N}-ethyl-4-methoxy-benzenesulfonamide × 1
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;12.5% w/v PEG 4000, 20% w/v 1,2,6-hexanetriol;
100mM Gly-Gly/AMPD pH 8.5;
10mM spermine, 10mM spermidine, 10mM 1,4-diaminobutane, 10mM DL-ornithine
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.230
|
|
9FHQ
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with RHTCR04
提交 2024-05-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ICP ~{tert}-butyl ~{N}-[1-[(2~{S})-1-[[(2~{S})-4-azanyl-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]amino]-3-cyclopropyl-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-6-oxidanylidene-pyrimidin-5-yl]carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.1M HEPES pH7, 0.1M Calcium chloride dihydrate, 20% w/vPEG 6000, 10% v/vEthylene glycol
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.201
|
|
9FW2
SARS CoV-2 nsp10 in complex with the ExoN domain from nsp14
提交 2024-06-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
GOL GLYCEROL × 2
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.04-0.24 M Amino acids, 0.1 M buffer system 2 (pH 7.5), 16-38% v/v precipitant mix 2.
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.183
|
|
9FWH
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-ExoN in complex with VT00019
提交 2024-06-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
A1IGQ (4R)-4-phenyl-1,2-thiazolidine 1,1-dioxide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 24.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.09M
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.247
|
|
9FWI
Ensemble model of ligand-free SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) and in complex with partially bound VT00025
提交 2024-06-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
A1IGP (3-oxidanylazetidin-1-yl)-phenyl-methanone × 1
ZN ZINC ION × 4
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 36.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.09M
|
分辨率 1.53 Å
R-free 0.199
|
|
9FWJ
Ensemble model of ligand-free SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) and in complex with partially bound VT00079
提交 2024-06-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
MG MAGNESIUM ION × 1
UYY 2-methoxybenzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 27.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.20M
|
分辨率 2.42 Å
R-free 0.254
|
|
9FWK
Ensemble model of ligand-free SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) and in complex with partially bound VT00123
提交 2024-06-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
A1IGT (4S)-4-pyridin-4-ylpyrrolidin-2-one × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1IGS (4R)-4-pyridin-4-ylpyrrolidin-2-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 36.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.11M
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.199
|
|
9FWL
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00167
提交 2024-06-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
ZN ZINC ION × 4
A1IGO 3-phenylthiophene-2-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 36.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.09M
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.229
|
|
9FWM
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00180
提交 2024-06-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
A1IGR 1H-indole-3-carboxamide × 1
ZN ZINC ION × 4
MG MAGNESIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 36.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.14M
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.213
|
|
9FWN
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00219
提交 2024-06-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
MG MAGNESIUM ION × 2
A1IGN 1-methyl-1-(phenylmethyl)urea × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 30.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.20M
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.231
|
|
9FWO
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00216
提交 2024-06-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
A1IGM 1-methylpyrrole-2-carboxamide × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 27.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.17M
|
分辨率 2.18 Å
R-free 0.249
|
|
9FWP
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00198
提交 2024-06-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
A1IGK N-methylbenzamide × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 21.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.06M
|
分辨率 2.38 Å
R-free 0.246
|
|
9FWQ
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00218
提交 2024-06-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
A1IGJ 5,6,7,8-tetrahydro-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridine × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 29.00%w/v Morpheus Amino acids: 0.20M
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.260
|
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9FWR
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00249
提交 2024-06-30
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 4
A1IGL (4R)-4-phenyl-1,3-oxazolidin-2-one × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 23.00%w/v Morpheus Amino acids: 0.09M
|
分辨率 2.29 Å
R-free 0.251
|
|
9FWS
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00258
提交 2024-06-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
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MI7 7-METHOXY-1H-INDAZOLE × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
ZN ZINC ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 21.50%w/v Morpheus Amino acids: 0.11M
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.213
|
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9FWT
Ensemble model of ligand-free SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) and in complex with partially bound VT00259
提交 2024-06-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
VSL methyl 4,5,6,7-tetrahydro-2H-indazole-3-carboxylate × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
ZN ZINC ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 32.00%w/v Morpheus Amino acids: 0.11M
|
分辨率 1.64 Å
R-free 0.214
|
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9FWU
Crystal Structure of SARS-CoV-2 NSP10-NSP14 (ExoN) in complex with VT00421
提交 2024-06-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
A1IGI N,N-dimethyl-3-oxidanyl-benzamide × 1
ZN ZINC ION × 4
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Morpheus buffer 2 (pH: 7.5): 0.10M - Morpheus Ethylene glycols: 32.00%w/v Morpheus Amino acids: 0.11M
|
分辨率 1.43 Å
R-free 0.201
|
|
9FX7
Crystal structure of Cryo2RT SARS-CoV-2 main protease at 294K
提交 2024-07-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
SO4 SULFATE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;300 mM sodium nitrate, 300 mM disodium hydrogen phosphate, 300 mM ammonium sulphate, 100 mM MES/imidazole pH 6.5, 10% (w/v) PEG550 MME and 20% (w/v) PEG 20K
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.244
|
|
9FZ4
SARS CoV-2 nsp10 in complex with theExoN domain from nsp14
提交 2024-07-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
MG MAGNESIUM ION × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.04-0.24 M Amino acids, 0.1 M buffer system 2 (pH 7.5), 16-38% v/v precipitant mix 2.
|
分辨率 2.44 Å
R-free 0.229
|
|
9FZK
SARS CoV-2 nsp10 in complex with theExoN domain from nsp14
提交 2024-07-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
5926–6214(289 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.04-0.24 M Amino acids, 0.1 M buffer system 2 (pH 7.5), 16-38% v/v precipitant mix 2
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.185
|
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9GNY
SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and Caffeine
提交 2024-09-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
CFF CAFFEINE × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ZN ZINC ION × 2
IMD IMIDAZOLE × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.212
|
|
9GRP
SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and beta-chloroethyl theophylline
提交 2024-09-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 21
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1IOQ 7-(2-chloroethyl)-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 2
IMD IMIDAZOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.204
|
|
9GRQ
SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline
提交 2024-09-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
TEP THEOPHYLLINE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 28
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
NA SODIUM ION × 2
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.191
|
|
9GS4
SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative LAS 54571130
提交 2024-09-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4271–4385(115 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 32
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
NA SODIUM ION × 4
A1IOL ~{N}-[(5~{S})-5-azanyl-6-[(3~{S},4~{S},6~{R})-3-[1,3-dimethyl-2,6-bis(oxidanylidene)purin-7-yl]-4-methyl-4,6-bis(oxidanyl)azepan-1-yl]-6-oxidanylidene-hexyl]ethanamide × 2
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2
ZN ZINC ION × 4
IMD IMIDAZOLE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.222
|
|
9GTF
SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative LAS 57256190
提交 2024-09-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
A1IOV 7-[(3~{R},4~{R},6~{S})-1-[(2~{S})-2-azanyl-4-methyl-pentanoyl]-4-methyl-4,6-bis(oxidanyl)azepan-3-yl]-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.222
|
|
9GUB
SARS-CoV-2 Mac1 in complex with MCD-628
提交 2024-09-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1IO2 (2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-2-(7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-ylamino)propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;0.1 M CHES pH 9.5, 32% PEG (w/v) 3000
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.175
|
|
9GUB
SARS-CoV-2 Mac1 in complex with MCD-628
提交 2024-09-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1024–1192(169 aa)
|
未记录
|
A1IO2 (2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-2-(7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-ylamino)propanoic acid × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;0.1 M CHES pH 9.5, 32% PEG (w/v) 3000
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.175
|
|
9GUD
SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative LAS 54570922
提交 2024-09-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 22
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1IO1 (3~{S})-3-azanyl-4-[(3~{R},4~{R},6~{S})-3-[1,3-dimethyl-2,6-bis(oxidanylidene)purin-7-yl]-4-methyl-4,6-bis(oxidanyl)azepan-1-yl]-4-oxidanylidene-butanoic acid × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
CL CHLORIDE ION × 3
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.200
|
|
9GUE
SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative LAS 57256189
提交 2024-09-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1IO0 7-[(3~{S},4~{S},6~{R})-1-[(2~{S})-2-azanyl-4-methyl-pentanoyl]-4-methyl-4,6-bis(oxidanyl)azepan-3-yl]-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ZN ZINC ION × 2
IMD IMIDAZOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.190
|
|
9GUF
SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative LAS 54571106
提交 2024-09-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 25
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1IOZ 7-[(3~{S},4~{S},6~{R})-1-[3-(aminomethyl)phenyl]carbonyl-4-methyl-4,6-bis(oxidanyl)azepan-3-yl]-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
CL CHLORIDE ION × 3
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.211
|
|
9GUY
SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative LAS 54571098
提交 2024-09-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
6799–7096(298 aa)
链 C
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 23
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1IOL ~{N}-[(5~{S})-5-azanyl-6-[(3~{S},4~{S},6~{R})-3-[1,3-dimethyl-2,6-bis(oxidanylidene)purin-7-yl]-4-methyl-4,6-bis(oxidanyl)azepan-1-yl]-6-oxidanylidene-hexyl]ethanamide × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
CL CHLORIDE ION × 3
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.213
|
|
9GV2
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease (MPro) in complex with the covalently bound inhibitor FP237 (compound 8p in publication)
提交 2024-09-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1IPK (2S)-2-[2-(3-methoxyphenoxy)ethanoylamino]-4-methyl-N-[(2S)-3-oxidanylidene-1-phenyl-pentan-2-yl]pentanamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
NA SODIUM ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;298 K;0.1M MMT (sodium malonate, imidazole, and boric acid in the molar ratios 2:3:3), pH 5.0, 25% w/v polyethylene glycol (PEG)1500
|
分辨率 2.56 Å
R-free 0.281
|
|
9GWO
SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative LAS 54571126
提交 2024-09-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14
NA SODIUM ION × 2
A1IQS 7-[(3~{S},4~{S},6~{R})-1-[(2~{S})-2-azanyl-3-(1~{H}-indol-3-yl)propanoyl]-4-methyl-4,6-bis(oxidanyl)azepan-3-yl]-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
ZN ZINC ION × 2
IMD IMIDAZOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.203
|
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9H4B
Crystal structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with GK-730
提交 2024-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ISK methyl 2-[(1S,2S)-2-[[(2S)-4-methyl-2-[[(2S)-3-methyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoyl]amino]pentanoyl]amino]-1-oxidanyl-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propyl]-1,3-thiazole-4-carboxylate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;294 K;0.02M Sodium potassium phosphate pH7.5, 20% w/v PEG 3350, 10% v/v Ethylene glycol
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分辨率 1.90 Å
R-free 0.231
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9HBQ
SARS-CoV-2 Main Protease complexed with (1R)-N-(3-chlorophenyl)-3-oxo-indane-1-carboxamide
提交 2024-11-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
A1ITO (1~{R})-~{N}-(3-chlorophenyl)-3-oxidanylidene-1,2-dihydroindene-1-carboxamide × 2
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.2M NaFORMATE, 20% PEG 3350
then soaking with inhibitor (in DSMO) and cryoprotected with 10% glycerol
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.211
|
|
9HC1
SARS-CoV-2 Main Protease complexed with (1R)-N-(3-chlorophenyl)-3-oxo-N-[4-(2-oxopyrrolidin-1-yl)phenyl]indane-1-carboxamide
提交 2024-11-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ITP (1~{R})-~{N}-(3-chlorophenyl)-3-oxidanylidene-~{N}-[4-(2-oxidanylidenepyrrolidin-1-yl)phenyl]-1,2-dihydroindene-1-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
GOL GLYCEROL × 1
NA SODIUM ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.2M NaFORMATE pH7.5, 20% PEG 3350 then soaking with inhibitor (DMSO) and cryo-protected with 10% Glycerol
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.220
|
|
9HD8
SARS-CoV-2 Main Protease in complex with with (1R)-N-(3-chlorophenyl)-N-[4-(2,4-dioxo-1H-pyrimidin-5-yl)phenyl]-3-oxo-indane-1-carboxamide
提交 2024-11-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1ITV (1~{R})-~{N}-[4-[2,4-bis(oxidanylidene)-1~{H}-pyrimidin-5-yl]phenyl]-~{N}-(3-chlorophenyl)-3-oxidanylidene-1,2-dihydroindene-1-carboxamide × 2
NA SODIUM ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.2 M Potassium chloride 20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.221
|
|
9HDC
SARS-CoV-2 Main Protease in complex with (3S)-3-[(3R)-3-phenylpiperidine-1-carbonyl]indan-1-one
提交 2024-11-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
A1ITW (3~{S})-3-[(3~{R})-3-phenylpiperidin-1-yl]carbonyl-2,3-dihydroinden-1-one × 2
FMT FORMIC ACID × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;293 K;0.2 M sodium formate, 20% PEG 3350. Then soaking with inhibitor (DMSO) and cryo-protection with glycerol (10%).
|
分辨率 1.79 Å
R-free 0.229
|
|
9HDJ
SARS-CoV-2 Main Protease in complex with (3R)-3-[(3R)-4-benzyl-3-phenyl-piperidine-1-carbonyl]indan-1-one
提交 2024-11-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1IT1 (3~{R})-3-[(3~{R})-3-phenyl-4-(phenylmethyl)piperazin-1-yl]carbonyl-2,3-dihydroinden-1-one × 2
FMT FORMIC ACID × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.2 M sodium formate, 20% PEG 3350 then soaked with the inhibitor (DMSO) and cryo-protection with glycerol (10%)
|
分辨率 2.05 Å
R-free 0.281
|
|
9HDN
SARS-CoV-2 Main Protease in complex with (1R)-3-oxo-N-[2-oxo-2-(N-phenylanilino)ethyl]indane-1-carboxamide
提交 2024-11-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1IT2 (1~{R})-~{N}-[2-(diphenylamino)-2-oxidanylidene-ethyl]-3-oxidanylidene-1,2-dihydroindene-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;293 K;0.2M Calcium Chloride, 0.1 Hepes pH7.5, 30% (w/v) PEG4000
Cryo-protection with glycerol (10%)
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.214
|
|
9HDN
SARS-CoV-2 Main Protease in complex with (1R)-3-oxo-N-[2-oxo-2-(N-phenylanilino)ethyl]indane-1-carboxamide
提交 2024-11-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1IT2 (1~{R})-~{N}-[2-(diphenylamino)-2-oxidanylidene-ethyl]-3-oxidanylidene-1,2-dihydroindene-1-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;293 K;0.2M Calcium Chloride, 0.1 Hepes pH7.5, 30% (w/v) PEG4000
Cryo-protection with glycerol (10%)
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.214
|
|
9HFX
Crystal structure of SARS CoV-2 3CLpro (Mpro) with ALG-097558
提交 2024-11-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:NONE
|
未记录
|
A1IUN (1~{S},2~{S},3~{S},6~{R},7~{R})-~{N}-[(2~{S})-1-azanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]-4-[(2~{S})-2-[[2-chloranyl-2,2-bis(fluoranyl)ethanoyl]amino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-azatricyclo[5.2.1.0^{2,6}]decane-3-carboxamide × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;PCB, PEG 1500
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.243
|
|
9HFY
Crystal structure of SARS CoV-2 3CLpro (Mpro) with ALG-097078
提交 2024-11-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:NONE
链 B
3264–3569(306 aa)
片段:NONE
|
未记录
|
A1IUM (3~{S},3~{a}~{S},6~{a}~{R})-2-[(4-methoxy-1~{H}-indol-2-yl)carbonyl]-~{N}-[(2~{S},3~{R})-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]-4-[(phenylmethyl)amino]butan-2-yl]-3,3~{a},4,5,6,6~{a}-hexahydro-1~{H}-cyclopenta[c]pyrrole-3-carboxamide × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.25;293 K;PEG 2000 MME, Bis-Tris
|
分辨率 1.28 Å
R-free 0.190
|
|
9I1S
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13 in complex with myricetin
提交 2025-01-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5326–5925(600 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.241
|
|
9I1S
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13 in complex with myricetin
提交 2025-01-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5326–5925(600 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1
MYC 3,5,7-TRIHYDROXY-2-(3,4,5-TRIHYDROXYPHENYL)-4H-CHROMEN-4-ONE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.241
|
|
9I4V
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13
提交 2025-01-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 2.33 Å
R-free 0.254
|
|
9I4V
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13
提交 2025-01-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 2.33 Å
R-free 0.254
|
|
9I51
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13 in complex with ADP
提交 2025-01-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
PO4 PHOSPHATE ION × 1
MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.202
|
|
9I51
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13 in complex with ADP
提交 2025-01-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 2
MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.202
|
|
9I53
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13 in complex with ATP
提交 2025-01-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
PO4 PHOSPHATE ION × 1
MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.229
|
|
9I53
Crystal structure of the SARS-CoV-2 helicase NSP13 in complex with ATP
提交 2025-01-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5325–5925(601 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 2
MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;16 % Ethylene Glycol, 8 % PEG 8000, 0.05 M Na HEPES, 0.05 M MOPS, 0.03 M Sodium nitrate, 0.03 M Sodium phosphate dibasic, 0.03 M Ammonium sulfate, 9 % MPD
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.229
|
|
9I81
SARS-CoV-2 RdRp bound to a stack of three HeE1-2Tyr molecules
提交 2025-02-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3940(81 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
6CJ N-[8-(cyclohexyloxy)-1-oxo-2-phenyl-1H-pyrido[2,1-b][1,3]benzothiazole-4-carbonyl]-L-tyrosine × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å
|
|
9IKZ
SARS-CoV-2 E-RTC bound to pRNA-nsp9 and GDP-BeF3-
提交 2024-06-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:nonameric
|
链 A
4393–5323(931 aa)
链 B
3948–4134(187 aa)
链 D
3948–4134(187 aa)
链 E
5325–5917(593 aa)
链 F
5325–5917(593 aa)
链 G
4141–4253(113 aa)
片段:UNP RESIDUES 4141-4253
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å
|
|
9IMK
SARS-CoV-2 Replication-Transcription Complex has a dimer architecture (dRTC) in post-capping state
提交 2024-07-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:octadecameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
链 E
5325–5925(601 aa)
链 F
5325–5925(601 aa)
链 G
4141–4253(113 aa)
链 H
4393–5324(932 aa)
链 I
3943–4140(198 aa)
链 K
3943–4140(198 aa)
链 L
5325–5925(601 aa)
链 M
5325–5925(601 aa)
链 N
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 16
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.01 Å
|
|
9IMM
SARS-CoV-2 Replication-Transcription Complex has a dimer architecture (local dRTC) in post-capping state
提交 2024-07-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:undecameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
链 E
5325–5925(601 aa)
链 F
5325–5925(601 aa)
链 G
4141–4253(113 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å
|
|
9J19
The crystal structure of COVID-19 main protease in complex with an inhibitor minocycline
提交 2024-08-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3268–3562(295 aa)
链 B
3268–3562(295 aa)
|
未记录
|
MIY (4S,4AS,5AR,12AS)-4,7-BIS(DIMETHYLAMINO)-3,10,12,12A-TETRAHYDROXY-1,11-DIOXO-1,4,4A,5,5A,6,11,12A-OCTAHYDROTETRACENE-2- CARBOXAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;24% PEG 4000, 100 mM HEPES, PH 7.5, 3% DMSO
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.314
|
|
9JGX
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease E166N mutant in complex with Ibuzatrelvir
提交 2024-09-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3567(302 aa)
|
突变:E166N
|
YDL N-(methoxycarbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-(trifluoromethyl)-L-prolinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.12~0.21M PEG3350,20%~24%Na2SO4
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.272
|
|
9JGY
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease E166R mutant in complex with Ibuzatrelvir
提交 2024-09-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3567(302 aa)
|
突变:E166R
|
YDL N-(methoxycarbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-(trifluoromethyl)-L-prolinamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.12~0.21M PEG3350,20%~24%Na2SO4
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.245
|
|
9JJ7
The crystal structure of SARS-CoV-2 NSP5 in complex with eIF4G2
提交 2024-09-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;0.1 M MES pH 5.6, 7% PEG 6000, and 6% dimethyl sulfoxide (DMSO)
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.212
|
|
9KGJ
Discovery of an orally bioavailable reversible covalent SARS-CoV-2 Mpro inhibitor with pan-coronavirus activity
提交 2024-11-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1L7M cyclopropylcarbamic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;4% v/v TacsimateTM pH 5.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.37 Å
R-free 0.248
|
|
9KGN
Discovery of an orally bioavailable reversible covalent SARS-CoV-2 Mpro inhibitor with pan-coronavirus activity
提交 2024-11-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.02 M Citric acid, 0.08 M BIS-TRIS propane pH 8.8, 16% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.226
|
|
9KGQ
Discovery of an orally bioavailable reversible covalent SARS-CoV-2 Mpro inhibitor with pan-coronavirus activity
提交 2024-11-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;4% v/v TacsimateTM pH 6.0, 12% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.233
|
|
9KGR
Discovery of an orally bioavailable reversible covalent SARS-CoV-2 Mpro inhibitor with pan-coronavirus activity
提交 2024-11-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1L7M cyclopropylcarbamic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2 M Magnesium sulfate heptahydrate,
|
分辨率 1.47 Å
R-free 0.208
|
|
9KGS
Discovery of an orally bioavailable reversible covalent SARS-CoV-2 Mpro inhibitor with pan-coronavirus activity
提交 2024-11-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1L7M cyclopropylcarbamic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2 M Sodium malonate pH 6.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.236
|
|
9KH0
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease S46F mutant in complex with S217622
提交 2024-11-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3265–3564(300 aa)
链 B
3265–3564(300 aa)
|
突变:S46F
突变:S46F
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;20~24%PEG3350,0.12~0.21M sodium sulfate;
|
分辨率 1.76 Å
R-free 0.241
|
|
9KH1
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease V186F mutant in complex with S217622
提交 2024-11-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3564(299 aa)
链 B
3266–3564(299 aa)
|
突变:V186F
突变:V186F
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;20~24%PEG3350,0.12~0.21M sodium sulfate;
|
分辨率 1.51 Å
R-free 0.225
|
|
9KH3
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease Y54C mutant in complex with S217622
提交 2024-11-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3564(299 aa)
链 B
3266–3564(299 aa)
|
突变:Y54C
突变:Y54C
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;20~24%PEG3350,0.12~0.21M sodium sulfate;
|
分辨率 1.49 Å
R-free 0.221
|
|
9KR5
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound 3
提交 2024-11-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3565(302 aa)
|
突变:P3395H
|
A1EGN (6~{E})-6-(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)imino-3-[5-[(3~{S})-oxolan-3-yl]oxypyridin-3-yl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazinane-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;300 K;0.1 MES (pH 5.0-5.6) with polyethylene glycol (PEG) 6,000 (9-11% w/v)
|
分辨率 1.92 Å
R-free 0.230
|
|
9KSH
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound 1
提交 2024-11-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3565(302 aa)
|
突变:P132H
|
A1EGQ 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-pyridin-3-yl-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;300 K;0.1 MES (pH 5.0-5.6) with polyethylene glycol (PEG) 6,000 (9-11% w/v)
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.232
|
|
9KSI
Crystal Structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound 5
提交 2024-11-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
A1EGP (6E)-1-[[5-chloranyl-4-fluoranyl-2-(4-fluoranylphenoxy)phenyl]methyl]-6-(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)imino-3-(5-methoxypyridin-3-yl)-1,3,5-triazinane-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;300 K;0.1 MES (pH 5.0-5.6) with polyethylene glycol (PEG) 6,000 (9-11% w/v)
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.243
|
|
9KSJ
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound 8
提交 2024-11-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3564(301 aa)
|
突变:P132H
|
A1EGR 3-[[(6E)-6-(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)imino-3-[5-(2-methoxyethoxy)pyridin-3-yl]-2,4-bis(oxidanylidene)-1,3,5-triazinan-1-yl]methyl]-4-methyl-benzenecarbonitrile × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;300 K;0.1 MES (pH 5.0-5.6) with polyethylene glycol (PEG) 6,000 (9-11% w/v)
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.189
|
|
9KSK
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with compound 10
提交 2024-11-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3564(301 aa)
链 B
3264–3564(301 aa)
|
未记录
|
A1EGS 4-[4-chloranyl-2-[[(6E)-6-(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)imino-3-(5-methylpyridin-3-yl)-2,4-bis(oxidanylidene)-1,3,5-triazinan-1-yl]methyl]-5-fluoranyl-phenoxy]-2-fluoranyl-benzenecarbonitrile × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;300 K;0.1 MES (pH 5.0-5.6) with polyethylene glycol (PEG) 6,000 (9-11% w/v)
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.307
|
|
9L09
SARS-CoV-2 C-RTC with 13-TP
提交 2024-12-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
9L13
The crystal structure of SARS-CoV-2 Main protease in complex with an iso-quinoline-derived inhibitor FD6-31
提交 2024-12-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3564(301 aa)
|
未记录
|
A1EH0 (5-chloranylspiro[1~{H}-2-benzofuran-3,4'-piperidine]-1'-yl)-isoquinolin-4-yl-methanone × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.1 M Bis-Tris 6.5, 20% PEG5000MME
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.233
|
|
9LGQ
The crystal structure of SARS-CoV-2 NSP5 in complex with PTBP1
提交 2025-01-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;0.1 M MES pH 5.6, 7% PEG 6000, and 6% dimethyl sulfoxide (DMSO)
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.218
|
|
9LLL
compound 25 and SARS-CoV-2 Mpro
提交 2025-01-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1EK4 1-[[2-[5-(aminomethyl)thiophen-2-yl]oxy-5-chloranyl-4-fluoranyl-phenyl]methylidene]-6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(2-oxidanylidene-1~{H}-pyridin-3-yl)methyl]-1$l^{4},3,5-triazinane-2,4-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;289.15 K;PEG 6000, MES
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.282
|
|
9LVR
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with compound 1
提交 2025-02-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1L7P 6-(1,3-dihydroisoindol-2-yl)-3-(5-methylpyridin-3-yl)-1-[[3,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.02 M Sodium/potassium phosphate 0.1 M Bis-Tris propane 7.5 20 % w/v PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.268
|
|
9LZM
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease in complex with Pomotrelvir
提交 2025-02-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3566(301 aa)
链 B
3266–3566(301 aa)
|
未记录
|
ZQB Pomotrelvir bound form × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1M HEPES 7.5, 20% PEG 10000
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.240
|
|
9LZP
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease P132H mutant in complex with Pomotrelvir
提交 2025-02-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3561(296 aa)
链 B
3266–3561(296 aa)
|
突变:P132H
突变:P132H
|
ZQB Pomotrelvir bound form × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1 M BICINE pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol 10,000
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.265
|
|
9M29
Crystal Structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease with inhibitor AD05
提交 2025-02-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289.15 K;0.1M Bis-Tris pH 6.5, 18% (v/v) PEG 3350
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.216
|
|
9M2U
Crystal Structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease with inhibitor AD06
提交 2025-02-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289.15 K;0.1M Bis-Tris pH6.5, 18% (v/v) PEG 3350
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.316
|
|
9M2V
Crystal Structure of the SARS-CoV-2 (COVID-19) main protease with inhibitor MC12
提交 2025-02-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1L8G [2-[methyl(phenyl)amino]-1,3-thiazol-4-yl]methanol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289.15 K;0.1M Bis-Tris pH6.5, 18% (v/v) PEG 3350
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.250
|
|
9M48
Cryo-EM structure of 6:1 nsp15/dsRNA complex
提交 2025-03-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:octameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
链 D
6453–6798(346 aa)
链 E
6453–6798(346 aa)
链 F
6453–6798(346 aa)
|
突变:H6686A
突变:H6686A
突变:H6686A
突变:H6686A
突变:H6686A
突变:H6686A
|
CO COBALT (II) ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
|
9M49
Cryo-EM structure of 6:2 nsp15/dsRNA complex
提交 2025-03-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:decameric
|
链 A
6453–6798(346 aa)
链 B
6453–6798(346 aa)
链 C
6453–6798(346 aa)
链 D
6453–6798(346 aa)
链 E
6453–6798(346 aa)
链 F
6453–6798(346 aa)
|
突变:H6686A
突变:H6686A
突变:H6686A
突变:H6686A
突变:H6686A
突变:H6686A
|
CO COBALT (II) ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.78 Å
|
|
9M6R
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease E166N mutant in complex with Pomotrelvir
提交 2025-03-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3564(299 aa)
链 B
3266–3564(299 aa)
|
突变:E166N
突变:E166N
|
ZQB Pomotrelvir bound form × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.12~0.21M PEG3350,20%~24%Na2SO4
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.223
|
|
9M6S
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease E166R mutant in complex with Pomotrelvir
提交 2025-03-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3265–3564(300 aa)
链 B
3265–3564(300 aa)
|
突变:E166R
突变:E166R
|
ZQB Pomotrelvir bound form × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.12~0.21M PEG3350,20%~24%Na2SO4
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.271
|
|
9M6T
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease H163A mutant in complex with Pomotrelvir
提交 2025-03-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3267–3563(297 aa)
链 B
3267–3563(297 aa)
|
突变:H163A
突变:H163A
|
ZQB Pomotrelvir bound form × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1M Na2SO4,24% PEG3350
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.230
|
|
9M6U
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease M49I mutant in complex with Pomotrelvir
提交 2025-03-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3564(299 aa)
链 B
3266–3564(299 aa)
|
突变:M49I
突变:M49I
|
ZQB Pomotrelvir bound form × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.12M-0.21M Na2SO4, 20%-24% PEG3350
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.227
|
|
9M6V
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease V186F mutant in complex with Pomotrelvir
提交 2025-03-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3266–3564(299 aa)
链 B
3266–3564(299 aa)
|
未记录
|
ZQB Pomotrelvir bound form × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2M Na2SO4, 20%PEG3350
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.259
|
|
9M8Z
The complex structure of Plpro and Frag7
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
A1EM6 4-phenylpiperidin-4-ol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.243
|
|
9M90
The complex structure of Plpro and Frag13
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
A1EM7 2,4-dimethyl-1,3-thiazole-5-carboxylic acid × 2
DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2
MLI MALONATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.03 Å
R-free 0.243
|
|
9M91
The complex structure of Plpro and Frag29
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
BZX 1,3-benzodioxol-5-ol × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.225
|
|
9M92
The complex structure of Plpro and Frag33
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
YRL 4-(2-hydroxyethyl)phenol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.209
|
|
9M93
The complex structure of Plpro and Frag44
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
FB2 benzenesulfonamide × 2
MLI MALONATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.283
|
|
9M94
The complex structure of Plpro and Frag102
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
A1EM8 1,3-thiazol-5-ylmethanamine × 2
MLI MALONATE ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.222
|
|
9M95
The complex structure of Plpro and Frag124
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
A1EM9 [4-(4-methyl-1,4-diazepan-1-yl)phenyl]methanamine × 2
MLI MALONATE ION × 2
DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.209
|
|
9M96
The complex structure of Plpro and Frag164
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 4
A1ENA 6-morpholin-4-ylpyridazin-3-amine × 4
MLI MALONATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.78 Å
R-free 0.216
|
|
9M97
The complex structure of Plpro and Frag170
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
A1ENB 4-(pyrazol-1-ylmethyl)aniline × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.43 Å
R-free 0.263
|
|
9M99
The complex structure of Plpro and Frag200
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
A1EE6 N-[(4-fluorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-butanamide × 4
MLI MALONATE ION × 2
ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.235
|
|
9M9A
The complex structure of Plpro and Frag209
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
9VQ [4-(pyrazol-1-ylmethyl)phenyl]methanol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.36 Å
R-free 0.237
|
|
9M9B
The complex structure of Plpro and Frag299
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
A1ENC 1-[6-(furan-2-yl)pyridin-3-yl]-~{N}-methyl-methanamine × 2
MLI MALONATE ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.71 Å
R-free 0.271
|
|
9M9C
The complex structure of Plpro and Frag368
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
A1END 5-fluoranyl-4-sulfanylidene-1~{H}-pyrimidin-2-one × 2
DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2
MLI MALONATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.193
|
|
9M9J
The complex structure of Plpro and Frag443
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
A1ENE 4,5-bis(chloranyl)-2-methyl-pyridazin-3-one × 2
MLI MALONATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.237
|
|
9M9K
The complex structure of Plpro and Frag464
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
A1ENF 5-azanyl-1-methyl-3~{H}-indol-2-one × 2
MLI MALONATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.226
|
|
9M9L
The complex structure of Plpro and Frag712
提交 2025-03-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 4
A1ENG 3-(trifluoromethyl)-1,4-dihydropyrazol-5-one × 2
MLI MALONATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.210
|
|
9MA9
The complex structure of Plpro and Frag762
提交 2025-03-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 4
A1ENJ 3-azanyl-4-methyl-benzoic acid × 2
DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2
MLI MALONATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate pH 6.0
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.220
|
|
9MAA
The complex structure of Plpro and Frag794
提交 2025-03-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
A1ENK methyl 3-chloranyl-6-oxidanylidene-1~{H}-pyridazine-5-carboxylate × 2
MLI MALONATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
|
分辨率 2.38 Å
R-free 0.233
|
|
9MAB
The complex structure of Plpro and Frag747
提交 2025-03-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
A1EHF 4-methylthiophene-2-carboxamide × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate pH 6.0
|
分辨率 2.18 Å
R-free 0.228
|
|
9MAC
The complex structure of Plpro and Frag746
提交 2025-03-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
A1AYY [6-(pyrrolidin-1-yl)pyridin-2-yl]methanol × 2
MLI MALONATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
pH=6.0
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.204
|
|
9MAF
The crystal structure of Plpro and Frag 550
提交 2025-03-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 4
MLI MALONATE ION × 2
DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2
DJP 5-fluoropyrimidin-2-ol × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate pH 6.0
|
分辨率 2.04 Å
R-free 0.216
|
|
9MAJ
The complex structure of Plpro and Frag642
提交 2025-03-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
E5X 4-(hydroxymethyl)benzoic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate pH 6.0
|
分辨率 2.65 Å
R-free 0.279
|
|
9MAL
The complex structure of Plpro and Frag642
提交 2025-03-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 4
8K2 5-chloranylthiophene-2-sulfonamide × 2
MLI MALONATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
pH 6.0
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.221
|
|
9MAM
The complex structure of Plpro and Frag676
提交 2025-03-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1565–1879(315 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 2
A1ENH (2-pyrrolidin-1-ylpyridin-4-yl)methanol × 2
MLI MALONATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6;277 K;1.6 M Sodium Malonate Dibasic Monohydrate
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分辨率 1.81 Å
R-free 0.204
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9MCO
Crystal structure of SARS-Cov-2 main protease E166N mutant in complex with Leritrelvir
提交 2025-03-17
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
突变:E3429N
突变:E3429N
|
A1EN0 (3~{S},3~{a}~{S},6~{a}~{R})-2-[(2~{S})-2-cyclohexyl-2-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethanoylamino]ethanoyl]-~{N}-[(2~{S})-4-(cyclopentylamino)-3,4-bis(oxidanylidene)-1-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]-3,3~{a},4,5,6,6~{a}-hexahydro-1~{H}-cyclopenta[c]pyrrole-3-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M BICINE pH 8.5, 20% w/v Polyethylene glycol 10,000
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分辨率 1.81 Å
R-free 0.259
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9MEI
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro mutant L50F E166V with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231
提交 2024-12-06
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:L50F E166V
突变:L50F E166V
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;10-20 % (w/v) PEG 3350, 0.20-0.30 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
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分辨率 1.84 Å
R-free 0.219
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9MLJ
X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease covalently bound to compound GRL-050-23 at 1.6 A
提交 2024-12-19
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
A1BMU (3S)-N-{(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]propan-2-yl}-7-fluoro-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2
NA SODIUM ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;20% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/ml
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.179
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9MRU
Structural Asymmetry in SARS-CoV-2 Nsp15 Hexamer Important for Catalytic Activity
提交 2025-01-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6797(345 aa)
链 B
6453–6797(345 aa)
链 C
6453–6797(345 aa)
链 D
6453–6797(345 aa)
链 E
6453–6797(345 aa)
链 F
6453–6797(345 aa)
|
突变:E267Q
突变:E267Q
突变:E267Q
突变:E267Q
突变:E267Q
突变:E267Q
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;pH 7.5;277 K;100 mM HEPES-NaOH, pH 7.5, 200 mM calcium acetate, 8% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.211
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9MRW
Functional Implications of Hexameric Dynamics in SARS-CoV-2 Nsp15
提交 2025-01-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6453–6797(345 aa)
链 B
6453–6797(345 aa)
|
突变:E267Q
突变:E267Q
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;pH 7.5;298 K;100 mM HEPES-NaOH, pH 7.5, 200 mM calcium acetate, 8% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.193
|
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9MRY
Functional Implications of HexamericDynamics in SARS-CoV-2 Nsp15
提交 2025-01-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 A
6453–6797(345 aa)
链 B
6453–6797(345 aa)
链 C
6453–6797(345 aa)
链 D
6453–6797(345 aa)
链 E
6453–6797(345 aa)
链 F
6453–6797(345 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE;pH 5.5;295 K;NendoU protein 75 mg/ml (20 mM HEPES pH 7.5, 150mM NaCl, 1mM TCEP) is added to the precipitant solution (100mM Na Citrate pH 5.5, 20% PEG 1000, 20% 2-Methyl-2,4-pentanediol (MPD)) in a 1:7 protein:precipitant ratio with agitation at 295K overnight.
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.228
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9MVM
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro)in Complex with Inhibitor AVI-3318
提交 2025-01-15
|
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3259–3569(311 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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A1BTM 1-[(4-chlorothiophen-2-yl)methyl]-3-[(2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)methyl]-1,3-diazinane-2,4-dione × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;20% w/v polyethylene glycol 8000, 100mM Tris pH 7.4
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分辨率 1.96 Å
R-free 0.244
|
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9MVO
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in Complex with Inhibitor AVI-4692
提交 2025-01-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3568(305 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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A1BVT (3M,5P,6M)-5-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-yl)-6-(3-chlorophenyl)-3-(isoquinolin-4-yl)-1-(prop-2-en-1-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
A1BTO (3M,5P,6M)-5-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-yl)-6-(3-chlorophenyl)-3-(isoquinolin-4-yl)-1-(prop-2-yn-1-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;20% w/v polyethylene glycol 8000, 100 mM Tris pH 7.4
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.216
|
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9MVP
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro)in Complex with Inhibitor AVI-4516
提交 2025-01-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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A1BTP (3M,5P)-5-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-yl)-3-(isoquinolin-4-yl)-6-methyl-1-(prop-2-en-1-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;24% w/v polyethylene glycol 8000, 100 mM Tris pH 7.4
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.253
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9MVQ
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) variant Q192T in Complex with Inhibitor AVI-4303
提交 2025-01-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
A1BTN (3M,5P,6M)-5-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-yl)-6-(3-chlorophenyl)-3-(isoquinolin-4-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;24% w/v polyethylene glycol 8000, 100 mM Tris pH 7.4
|
分辨率 1.57 Å
R-free 0.199
|
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9N5Q
X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease M49I covalently bound to inhibitor GRL-051-22 at 1.50 A
提交 2025-02-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:M49I
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A1BFE (3S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.164
|
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9N6F
X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease M165I covalently bound to inhibitor GRL-051-22 at 1.90 A
提交 2025-02-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:M165I
|
A1BFE (3S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2
NA SODIUM ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;16% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.16 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.216
|
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9N6J
Room Temperature X-Ray Structure of SARS-CoV-2 Main Protease Mutant D48Y, P168 Deletion
提交 2025-02-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:D48Y
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;15-17 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.221
|
|
9N6L
Room Temperature X-Ray Structure of SARS-CoV-2 Main Protease Mutant D48Y, P168 Deletion in Complex with GC373
提交 2025-02-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:D48Y
|
K36 (1S,2S)-2-({N-[(benzyloxy)carbonyl]-L-leucyl}amino)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;15-17 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.224
|
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9N6M
Room Temperature X-Ray Structure of SARS-CoV-2 Main Protease Mutant D48Y, P168 Deletion in Complex with Nirmatrelvir
提交 2025-02-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:D48Y
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;15-17 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.221
|
|
9N6N
Room Temperature X-Ray Structure of SARS-CoV-2 Main Protease Mutant D48Y, P168 Deletion in Complex with Pomotrelvir
提交 2025-02-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:D48Y
|
ZQB Pomotrelvir bound form × 2
NA SODIUM ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;15-17 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.218
|
|
9N6P
Room Temperature X-Ray Structure of SARS-CoV-2 Main Protease Mutant D48Y, P168 Deletion in Complex with Ensitrelvir
提交 2025-02-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:D48Y
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;15-17 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.199
|
|
9N6R
Room Temperature X-Ray Structure of SARS-CoV-2 Main Protease in Complex with Ensitrelvir
提交 2025-02-05
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
7YY 6-[(6-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)amino]-3-[(1-methyl-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-1-[[2,4,5-tris(fluoranyl)phenyl]methyl]-1,3,5-triazine-2,4-dione × 2
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;287 K;15-17 % PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.202
|
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9N99
SARS-CoV-2 Main protease in complex with AVI-8122
提交 2025-02-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1BWH N-[(2S)-3-cyclopropyl-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-1-oxopropan-2-yl]-7-fluoro-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291.15 K;0.1 M HEPES pH 7.0, 20% PEG6000, 0.2 M NH4Cl
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.230
|
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9N9B
X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease V186F covalently bound to inhibitor GRL-051-22 at 1.60 A
提交 2025-02-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:V186F
|
A1BFE (3S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.185
|
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9NAZ
Structure of SARS-CoV-2 NSP14 bound to N-((4-vinylthiazol-2-yl)methyl)-1H-pyrazole-3-carboxamide
提交 2025-02-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
5932–6452(521 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
A1BX0 N-[(4-ethenyl-1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1H-pyrazole-3-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277.15 K;Crystals appeared after two weeks when mixed 1:1 ratio with mother liquor containing sodium phosphate monobasic (1.26M to 1.61M) and potassium phosphate dibasic (0.14M to 0.24M). Ligand was soaked for at least 1 hour at a final concentration between 10-50 mM (10% DMSO).
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.240
|
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9NFP
Structure of SARS-CoV-2 NSP14 bound to N-((4-cyclopropylthiazol-2-yl)methyl)-1H-pyrazole-3-carboxamide
提交 2025-02-21
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
5932–6452(521 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
A1BXZ N-[(4-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1H-pyrazole-3-carboxamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;Crystals appeared after two weeks when mixed 1:1 ratio with mother liquor containing sodium phosphate monobasic (1.26M to 1.61M) and potassium phosphate dibasic (0.14M to 0.24M). Ligand was soaked for at least 1 hour at a final concentration between 10-50 mM (10% DMSO).
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分辨率 2.30 Å
R-free 0.231
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9NHA
Structure of SARS-CoV-2 NSP14 bound to N-((4-isopropylthiazol-2-yl)methyl)-1H-pyrazole-3-carboxamide
提交 2025-02-24
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
5932–6452(521 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
A1BX5 N-{[4-(propan-2-yl)-1,3-thiazol-2-yl]methyl}-1H-pyrazole-3-carboxamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;Crystals appeared after two weeks when mixed 1:1 ratio with mother liquor containing sodium phosphate monobasic (1.26M to 1.61M) and potassium phosphate dibasic (0.14M to 0.24M). Ligand was soaked for at least 1 hour at a final concentration between 10-50 mM (10% DMSO)
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.268
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9NHU
Structure of SARS-CoV-2 NSP14 bound to 5-(((cyclopropylmethyl)amino)methyl)-N-((4-cyclopropylthiazol-2-yl)methyl)-1H-pyrazole-3-carboxamide
提交 2025-02-25
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
5932–6452(521 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
A1BYF 5-{[(cyclopropylmethyl)amino]methyl}-N-[(4-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1H-pyrazole-3-carboxamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;Crystals appeared after two weeks when mixed 1:1 ratio with mother liquor containing sodium phosphate monobasic (1.26M to 1.61M) and potassium phosphate dibasic (0.14M to 0.24M). Ligand was soaked for at least 1 hour at a final concentration between 10-50 mM (10% DMSO).
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分辨率 2.10 Å
R-free 0.272
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9NIO
SARS-CoV-2 NSP14 bound to N-((2-ethynylthiazol-4-yl)methyl)-1H-pyrazole-3-carboxamide
提交 2025-02-26
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
5932–6452(521 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
A1BYG N-[(2-ethynyl-1,3-thiazol-4-yl)methyl]-1H-pyrazole-3-carboxamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;Crystals appeared after two weeks when mixed 1:1 ratio with mother liquor containing sodium phosphate monobasic (1.26M to 1.61M) and potassium phosphate dibasic (0.14M to 0.24M). Ligand was soaked for at least 1 hour at a final concentration between 10-50 mM (10% DMSO).
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.230
|
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9NJG
Structure of SARS-CoV-2 NSP14 bound to N-((4-cyclopropylthiazol-2-yl)methyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-3-carboxamide
提交 2025-02-27
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
5932–6452(521 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
A1BYT N-[(4-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-3-carboxamide × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;Crystals appeared after two weeks when mixed 1:1 ratio with mother liquor containing sodium phosphate monobasic (1.26M to 1.61M) and potassium phosphate dibasic (0.14M to 0.24M). Ligand was soaked for at least 1 hour at a final concentration between 10-50 mM (10% DMSO).
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.274
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9NMC
SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 3-(6-bromo-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-4-oxoquinolin-1(4H)-yl)propanenitrile
提交 2025-03-04
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配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
信息不足
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3259–3569(311 aa)
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未记录
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A1BY2 (3P)-6-bromo-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)quinolin-4(1H)-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1 M NaCl, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350
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分辨率 2.20 Å
R-free 0.285
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9NME
SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 2-[2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-4-oxo-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-8-yl]benzonitrile
提交 2025-03-04
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配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
信息不足
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3259–3569(311 aa)
|
未记录
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A1BY3 (2M)-2-[(3P)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-4-oxo-6-(trifluoromethyl)-1,4-dihydroquinolin-8-yl]benzonitrile × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350
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分辨率 1.60 Å
R-free 0.228
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9NMF
SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 8-(6-amino-3-pyridyl)-2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-4-one
提交 2025-03-04
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
信息不足
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3259–3569(311 aa)
链 B
3259–3569(311 aa)
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未记录
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A1BY4 (3P,8M)-8-(6-aminopyridin-3-yl)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinolin-4(1H)-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Lithium Sulfate monohydrate, 0.1M BIS-TRIS pH 5.5-7.5, 25% PEG 3350
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.225
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9NMG
SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 8-(2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)-2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-4-one
提交 2025-03-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3259–3569(311 aa)
链 B
3259–3569(311 aa)
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未记录
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A1BY5 (3P,8P)-8-(2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinolin-4(1H)-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5-7.5, 25 % PEG 3350
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.245
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9NMH
SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-8-(1,2,3,6-tetrahydropyridin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-4-one
提交 2025-03-04
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配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
信息不足
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3259–3569(311 aa)
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未记录
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A1BY6 (3P,8P)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-8-(1,2,3,6-tetrahydropyridin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinolin-4(1H)-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1 M NaCl, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5-7.5, 25% PEG 3350
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分辨率 2.50 Å
R-free 0.274
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9NNG
X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease V186I covalently bound to inhibitor GRL-051-22 at 1.90 A
提交 2025-03-05
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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突变:V186I
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A1BFE (3S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2
K POTASSIUM ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
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分辨率 1.90 Å
R-free 0.224
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9NNW
X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease V186F covalently bound to inhibitor GRL-050-23 at 1.55 A
提交 2025-03-06
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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突变:V186F
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A1BMU (3S)-N-{(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]propan-2-yl}-7-fluoro-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
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分辨率 1.55 Å
R-free 0.191
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9NPX
SARS-CoV-2 nsp1 bound to the Rhinolophus lepidus 40S ribosomal subunit (local refinement of the 40S body)
提交 2025-03-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 23
PDB 声明:24-meric
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链 j
1–180(180 aa)
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未记录
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MG MAGNESIUM ION × 57
K POTASSIUM ION × 13
ZN ZINC ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.10 Å
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9NSK
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor BBH-3
提交 2025-03-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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A1B20 N-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valyl-3,4-dichloro-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-phenylalaninamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
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分辨率 1.90 Å
R-free 0.201
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9NSL
Room-temperature X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with with inhibitor BBH-4
提交 2025-03-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
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未记录
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A1B21 N-[(1S)-1-[(3R,5R,7R)-adamantan-1-yl]-2-({(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}amino)-2-oxoethyl]-N~2~-(tert-butylcarbamoyl)-3-methyl-L-valinamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;287 K;18-21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5 or pH 7.0
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.200
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9NU6
SARS-CoV-2 main protease with inhibitor
提交 2025-03-19
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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A1B3B N-[(3S,4S)-4-(3-chloro-5-fluorophenyl)-1-(1,6-naphthyridine-8-carbonyl)piperidin-3-yl]-N~2~-(trifluoroacetyl)-D-valinamide × 2
BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M bis-tris pH 6.5, 32 % (w/v) polyethylene glycol 2000 monomethyl ether
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.217
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9NWA
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with an inhibitor TKB-277-5Cl
提交 2025-03-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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A1B7C (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(5-chloro-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 16 % w/v Polyethylene glycol 3,350
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.200
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9NWC
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with an inhibitor TKB-276-5Br
提交 2025-03-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1B7B (1R,2S,5S)-N-{(1S,2S)-1-(5-bromo-1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-D-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 16% w/v Polyethylene glycol 3,350
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分辨率 1.79 Å
R-free 0.227
|
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9O6D
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro S10A in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231
提交 2025-04-12
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:S10A
突变:S10A
|
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;18-22% (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.239
|
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9O6E
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro S10C in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231
提交 2025-04-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:S10C
突变:S10C
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DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;18-22% (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.99 Å
R-free 0.225
|
|
9O6F
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro S113A in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231
提交 2025-04-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:S113A
突变:S113A
|
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;18-22% (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.97 Å
R-free 0.247
|
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9O6P
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro S113C in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231
提交 2025-04-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:S113C
突变:S113C
|
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;18-22% (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.268
|
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9O6Q
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro L115A in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231
提交 2025-04-14
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:L115A
突变:L115A
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V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;18-22% (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.237
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9O74
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro L115M in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231
提交 2025-04-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:L115M
突变:L115M
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V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;18-22 % (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.240
|
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9OBH
Co-Structure of SARS-CoV-2 3C-like proteinase nsp5 with Compound 34
提交 2025-04-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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A1CAR (4S)-4-(iminomethyl)-3-(isoquinolin-4-yl)-1-[(1s,3R)-3-(trifluoromethyl)cyclobutyl]imidazolidin-2-one × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;25% Peg 1500, 0.1M MIB pH 7.0
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.231
|
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9OCK
Co-Structure of Main Protease of SARS-CoV-2 with Compound 1
提交 2025-04-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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A1CAS 2-fluoro-N-(isoquinolin-4-yl)-5-(trifluoromethyl)benzamide × 2
NA SODIUM ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;25 %w/v PEG 1500
0.1 M MIB pH 7
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.211
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9OIX
Co-Structure of Main Protease of SARS-CoV-2 with NVP-EGT710
提交 2025-05-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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A1CBU (4S)-4-(iminomethyl)-3-(isoquinolin-4-yl)-1-[6-(trifluoromethyl)pyridin-3-yl]imidazolidin-2-one × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;25 %w/v PEG 1500
0.1 M MIB pH 7
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.231
|
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9OIZ
Co-Structure of Main Protease of SARS-CoV-2 with Compound 11
提交 2025-05-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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A1CBN (3M)-1-[(2E)-2-iminoethyl]-3-(isoquinolin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinazoline-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;25 %w/v PEG 1500
0.1 M MIB pH 7
|
分辨率 2.46 Å
R-free 0.260
|
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9OJG
Co-Structure of Main Protease of SARS-CoV-2 with Compound 2
提交 2025-05-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1CBY (3M)-3-(isoquinolin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinazoline-2,4(3H,8H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;25 %w/v PEG 1500
0.1 M MIB pH 7
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.244
|
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9OJT
Co-Structure of Main Protease of SARS-CoV-2 with Compound 10
提交 2025-05-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
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A1CB2 (3M)-3-(3-ethylisoquinolin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinazoline-2,4(1H,3H)-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;25 %w/v PEG 1500
0.1 M MIB pH 7
|
分辨率 1.71 Å
R-free 0.248
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9OPM
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro S147A in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231
提交 2025-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:S147A
突变:S147A
|
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;18-22% (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 2.13 Å
R-free 0.220
|
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9OPN
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Mpro S147N in complex with Pfizer Intravenous Inhibitor PF-00835231
提交 2025-05-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
突变:S147N
突变:S147N
|
V2M N-[(2S)-1-({(2S,3S)-3,4-dihydroxy-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl}amino)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;18-22% (w/v) PEG 3350, 0.15-0.22 M NaCl, and 0.1 M Bis-Tris methane pH 5.5
|
分辨率 1.77 Å
R-free 0.213
|
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9P6F
Structure of the SARS-CoV-2 main protease in complex with inhibitor SR-B-78
提交 2025-06-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1CG8 (1R,2S,5S)-N-[(1S,2Z)-2-imino-1-(5-methoxypyridin-3-yl)ethyl]-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;0.2 M Ammonium phosphate dibasic, 17% W/v PEG3350, pH8.0
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.303
|
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9P6P
Crystal Structure of the SARS-CoV-2 2'-O-Methyltransferase with (m7GpppA)pUpU (Cap-0) and S-Adenosyl-L-homocysteine (SAH).
提交 2025-06-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
CL CHLORIDE ION × 4
SO4 SULFATE ION × 10
ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;Protein: 3.8 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: Classics II (B3), 0.5M Magnesium formate, 0.1M HEPES pH 7.5;
Soak: 0.5 hours, 0.2mM m7GpppAUU, 5mM SAH, in 2M Lithium sulfate.
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分辨率 1.95 Å
R-free 0.193
|
|
9P6P
Crystal Structure of the SARS-CoV-2 2'-O-Methyltransferase with (m7GpppA)pUpU (Cap-0) and S-Adenosyl-L-homocysteine (SAH).
提交 2025-06-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
|
链 C
6799–7096(298 aa)
链 D
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
CL CHLORIDE ION × 7
SO4 SULFATE ION × 9
ZN ZINC ION × 2
MGT 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;292 K;Protein: 3.8 mg/ml (nsp10/nsp16 1:1), 0.15M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 7.5 , 2mM SAM, 1mM TCEP, 5% Glycerol;
Screen: Classics II (B3), 0.5M Magnesium formate, 0.1M HEPES pH 7.5;
Soak: 0.5 hours, 0.2mM m7GpppAUU, 5mM SAH, in 2M Lithium sulfate.
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.193
|
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9PA9
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro with ALG-097608 (Inhibitor 1)
提交 2025-06-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3564(301 aa)
|
未记录
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A1CHF (1R,2R,3S,6S,7S)-4-[(2S)-3,3-dimethyl-2-(2,2,2-trifluoroacetamido)butanoyl]-10,10-difluoro-N-{(1E,2R)-1-imino-3-[(3R)-2-oxo-3,4-dihydro-2H-pyrrol-3-yl]propan-2-yl}-4-azatricyclo[5.2.1.0~2,6~]decane-3-carboxamide (non-preferred name) × 2
PO4 PHOSPHATE ION × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;0.1 mM Sodium Phosphate monobasic and 0.1 M MES pH 6.0 and 20% PEG 4000
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.221
|
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9PAH
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CLpro with ALG-097655 (Inhibitor 2)
提交 2025-06-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1CHJ (1R,2S,3S,6R,7S)-N-{(1Z,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-4-[(2S)-4,4,4-trifluoro-3,3-dimethyl-2-(2,2,2-trifluoroacetamido)butanoyl]-4-azatricyclo[5.2.1.0~2,6~]dec-8-ene-3-carboxamide (non-preferred name) × 2
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277.15 K;0.1 mM Sodium Phosphate monobasic and 0.1 M MES pH 6.0 and 20% PEG 4000
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.244
|
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9PBC
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) L50F/E166V Double Mutant
提交 2025-06-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
突变:L50F, E166V
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.259
|
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9PJG
SARS-CoV2 Mpro bound to compound 1
提交 2025-07-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;Morpheus condition F5
|
分辨率 1.74 Å
R-free 0.187
|
|
9PKR
SARS-CoV2 main protease bound to compound 26
提交 2025-07-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
链 B
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 4
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290 K;22% w/v PEG 3350, 0.2 M Na2SO4
|
分辨率 1.54 Å
R-free 0.201
|
|
9PUH
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 11
提交 2025-07-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1564–1877(314 aa)
|
突变:C111S
|
A1CLE 1'-methylspiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/mL protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 2.39 Å
R-free 0.244
|
|
9PUH
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 11
提交 2025-07-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1877(314 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/mL protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 2.39 Å
R-free 0.244
|
|
9PUH
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 11
提交 2025-07-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1564–1877(314 aa)
|
突变:C111S
|
A1CLE 1'-methylspiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/mL protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 2.39 Å
R-free 0.244
|
|
9PUJ
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 17
提交 2025-07-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1877(314 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CLF 1'-methylspiro[naphtho[1,2-b]pyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/mL protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.234
|
|
9PUY
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 27
提交 2025-07-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1563–1879(317 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CLD 7,8-dimethyl-1'-[(pyridin-2-yl)methyl]spiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/ml protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.205
|
|
9PUY
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 27
提交 2025-07-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1563–1879(317 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CLD 7,8-dimethyl-1'-[(pyridin-2-yl)methyl]spiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 2
K POTASSIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/ml protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.205
|
|
9PUY
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 27
提交 2025-07-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1563–1879(317 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CLD 7,8-dimethyl-1'-[(pyridin-2-yl)methyl]spiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1
K POTASSIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/ml protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.205
|
|
9PUY
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 27
提交 2025-07-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1563–1879(317 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CLD 7,8-dimethyl-1'-[(pyridin-2-yl)methyl]spiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 2
K POTASSIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 mM sodium citrate and 15-25 % PEG-3350
27.7 mg/ml protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.205
|
|
9PV6
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 37
提交 2025-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1563–1879(317 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
A1CLN (7M)-8-methyl-7-(2-methylpyridin-4-yl)-1'-[(pyridin-2-yl)methyl]spiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;50 mM HEPES pH = 7.0, Tryptone 2-4 % w/v and 10-16 % PEG-3350
12 mg/mL protein
1:1 drop ratio
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.202
|
|
9PV9
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 46
提交 2025-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1563–1879(317 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CLP (7M)-8-methyl-1'-{[6-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-2-yl]methyl}-7-(2-methylpyridin-4-yl)-3,4-dihydrospiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidine] × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;50 mM HEPES pH = 7.0, Tryptone 2-4 % w/v and 10-16 % PEG-3350
12 mg/ mL portein
1:1 drop ratio
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.237
|
|
9PVI
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 47
提交 2025-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1563–1879(317 aa)
|
突变:C111S
|
ZN ZINC ION × 1
A1CLO (7M)-8-methyl-7-(2-methylpyridin-4-yl)-1'-{[(6P)-6-(1H-pyrazol-5-yl)pyridin-2-yl]methyl}-3,4-dihydrospiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidine] × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;50 mM HEPES pH = 7.0, Tryptone 2-4 % w/v and 10-16 % PEG-3350
12 mg/mL protein
1:1 drop ratio
crystallization with weak affinity ligand then back soak with desired ligand for 2 days prior to freezing
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.257
|
|
9PVK
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 53
提交 2025-08-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1563–1879(317 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
A1CLL (7M)-8-methyl-1'-{[5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-2-yl]methyl}-7-(2-methylpyridin-4-yl)-3,4-dihydrospiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidine] × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;50 mM HEPES pH = 7.0, Tryptone 2-4 % w/v and 10-16 % PEG-3350
12 mg/mL protein
1:1 drop ratio
cocrystalised with weak affinity ligand then back soaked with ligand of interest
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.248
|
|
9PYS
NMR RDC refinement of the helical domain of the SARS-CoV-2 monomeric Main Protease (MPROH41Q,10-306)
提交 2025-08-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:H41Q
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.9;288 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 1
NMR测量条件
pH 6.9;298 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 1
NMR样品组成
20 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 25 mM HEPES, 1 mM TCEP, 500 uM [U-13C; U-15N; U-2H] MPro(10-306,H41Q), 97% H2O / 3% D2O | 97% H2O / 3% D2O
NMR样品组成
20 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 25 mM HEPES, 1 mM TCEP, 500 uM [U-13C; U-15N; U-2H] MPro(10-306,H41Q), 13 mg/mL Pf1 phage, 97% H2O / 3% D2O | 97% H2O / 3% D2O
|
分辨率未提供
|
|
9PYT
NMR RDC refinement of the catalytic domain of the SARS-CoV-2 monomeric Main Protease (MPROH41Q,10-306)
提交 2025-08-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:H41Q
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.9;288 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 1
NMR测量条件
pH 6.9;298 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 1
NMR样品组成
20 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 25 mM HEPES, 1 mM TCEP, 500 uM [U-13C; U-15N; U-2H] MPro(10,306,H41Q), 97% H2O / 3% D2O | 97% H2O / 3% D2O
NMR样品组成
20 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 25 mM HEPES, 1 mM TCEP, 430 uM [U-13C; U-15N; U-2H] MPro(10,306,H41Q), 13 mg/mL Pf1 phage, 97% H2O / 3% D2O | 97% H2O / 3% D2O
|
分辨率未提供
|
|
9PYW
SARS-CoV-2 nsp7, nsp8 and nsp12 bound to a primer-template pair with incorporated ara-UMP
提交 2025-08-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9PYZ
SARS-CoV-2 core polymerase complex bound to RNA, araUMP, and UTP
提交 2025-08-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ZN ZINC ION × 2
UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9PZ0
SARS-CoV-2 core polymerase complex with two UTP incorporation
提交 2025-08-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
链 D
3943–4140(198 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
9Q1J
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 E191A mutant-T20P14-R complex
提交 2025-08-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 8
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 B
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
链 C
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 D
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
链 G
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 H
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
链 I
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 J
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
|
突变:E191A
突变:E191A
突变:E191A
突变:E191A
|
ZN ZINC ION × 20
MG MAGNESIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å
|
|
9Q7S
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in complex with Jun13735
提交 2025-08-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1CR4 methyl {(2S)-1-[(1R,2S,5S)-2-{[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-5-(methylsulfanyl)-1-oxopentan-3-yl]carbamoyl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexan-3-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate (non-preferred name) × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;0.07 M Bis-Tris (pH 8.0), 25% PEG 335
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.235
|
|
9Q8H
SARS-CoV-2 methyltransferase nsp10-16 in complex with SAM and theophylline derivative BDH 34019023
提交 2025-02-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
6799–7096(298 aa)
链 B
4254–4392(139 aa)
|
未记录
|
SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
NA SODIUM ION × 2
A1I4H 9-[(3~{R},4~{R})-1-(3-azanylpropanoyl)-4-oxidanyl-pyrrolidin-3-yl]-1,3-dimethyl-purine-2,6-dione × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ZN ZINC ION × 2
IMD IMIDAZOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.15 K;400 mM sodium fluoride, 100 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.219
|
|
9QD5
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with RS222C
提交 2025-03-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
片段:NONE
链 B
3264–3569(306 aa)
片段:NONE
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
NA SODIUM ION × 2
A1I6A 2-chloranyl-~{N}-[(~{R})-[1-(phenylmethyl)-1,2,3,4-tetrazol-5-yl]-pyridin-3-yl-methyl]-~{N}-(4-phenylphenyl)ethanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.7;293 K;100 mM MES pH 6.7, 11% PEG 4000 and 5% DMSO
150 nL Protein (5 mg/mL), 150 nL Crystallisation condition, 50 nL seed stock (1:250)
|
分辨率 2.04 Å
R-free 0.232
|
|
9QRA
SARS-CoV-2 nsp14 with 1-(4-methylphenyl)-2-(2-methylsulfanyl-4,5-dihydroimidazol-1-yl)ethanone
提交 2025-04-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
A1I9H 1-(4-methylphenyl)-2-(2-methylsulfanylimidazol-1-yl)ethanone × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.29 Å
R-free 0.249
|
|
9QRB
SARS-CoV-2 nsp14 with 2,5-dichlorothiophene-3-sulfonamide
提交 2025-04-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
A1AYN 2,5-dichlorothiophene-3-sulfonamide × 4
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.233
|
|
9QRB
SARS-CoV-2 nsp14 with 2,5-dichlorothiophene-3-sulfonamide
提交 2025-04-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
A1AYN 2,5-dichlorothiophene-3-sulfonamide × 4
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.94 Å
R-free 0.233
|
|
9QRC
SARS-CoV-2 nsp14 with 6-methyl-2-[(4-methylphenyl)methyl]pyridazin-3-one
提交 2025-04-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
A1I9I 6-methyl-2-[(4-methylphenyl)methyl]pyridazin-3-one × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4
PO4 PHOSPHATE ION × 1
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.239
|
|
9QRD
SARS-CoV-2 nsp14 with ethyl 2-(1H-indol-3-yl)acetate
提交 2025-04-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
A1I9J ethyl 2-(1~{H}-indol-3-yl)ethanoate × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.228
|
|
9QRE
SARS-CoV-2 nsp14 with 2,5-dimethylpyrazol-3-amine
提交 2025-04-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
A1I9K 2,5-dimethylpyrazol-3-amine × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.250
|
|
9QS5
SARS-CoV-2 nsp14 with 5-(thiophen-2-ylmethylamino)-3H-1,3,4-thiadiazole-2-thione
提交 2025-04-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1I9Y 5-(thiophen-2-ylmethylamino)-3~{H}-1,3,4-thiadiazole-2-thione × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 7
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.249
|
|
9QS5
SARS-CoV-2 nsp14 with 5-(thiophen-2-ylmethylamino)-3H-1,3,4-thiadiazole-2-thione
提交 2025-04-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
A1I9Y 5-(thiophen-2-ylmethylamino)-3~{H}-1,3,4-thiadiazole-2-thione × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.249
|
|
9QXB
SARS-CoV-2 nsp14 with N-methyl-1-(2-methyl-5-phenylpyrazol-3-yl)methanamine
提交 2025-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
X6W methyl-3-methyl-5-phenyl-2H-pyrazol-4-methyl amine × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.252
|
|
9QXC
SARS-CoV-2 nsp14 with 1-benzofuran-3-carboxylic acid
提交 2025-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
A1JA8 1-benzofuran-3-carboxylic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.98 Å
R-free 0.241
|
|
9QXD
SARS-CoV-2 nsp14 with 2-(1H-indol-3-yl)ethanol
提交 2025-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
ZCW 2-(1H-indol-3-yl)ethanol × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5
PO4 PHOSPHATE ION × 2
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.245
|
|
9QXE
SARS-CoV-2 nsp14 with benzenesulfonamide
提交 2025-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
FB2 benzenesulfonamide × 3
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.93 Å
R-free 0.232
|
|
9QXF
SARS-CoV-2 nsp14 with 5-chlorothiophene-2-sulfonamide
提交 2025-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 1
8K2 5-chloranylthiophene-2-sulfonamide × 2
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.25 Å
R-free 0.250
|
|
9QXG
SARS-CoV-2 nsp14 with 3,4-dichlorobenzenesulfonamide
提交 2025-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
A1JBC 3,4-dichlorobenzenesulfonamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.257
|
|
9QXH
SARS-CoV-2 nsp14 with 2,5-dichloro-4-methylthiophene-3-sulfonamide
提交 2025-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
A1JBA 2,5-dichloro-4-methylthiophene-3-sulfonamide × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.257
|
|
9QXI
SARS-CoV-2 nsp14 with 2,5-dichlorothiophene-3-sulfonic acid
提交 2025-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
A1JA9 2,5-dichlorothiophene-3-sulfonic acid × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.14 Å
R-free 0.247
|
|
9QXK
SARS-CoV-2 nsp14 with thiophene-3-sulfonamide
提交 2025-04-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5932–6452(521 aa)
|
未记录
|
A1JBB thiophene-3-sulfonamide × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291.15 K;1.26 M sodium phosphate monobasic, 0.14 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.233
|
|
9R5T
NSP14 IN COMPLEX WITH LIGAND TDI-016037-NX-1
提交 2025-05-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5926–6452(527 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
A1JDF ~{N}-[(1-cyclopropyl-6-fluoranyl-indazol-7-yl)methyl]-1,5-dimethyl-4-[(7-methyl-2~{H}-indazol-5-yl)sulfonyl]pyrrole-2-carboxamide × 1
CL CHLORIDE ION × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7
IMD IMIDAZOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;isopropanol, imidazole
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.227
|
|
9R5T
NSP14 IN COMPLEX WITH LIGAND TDI-016037-NX-1
提交 2025-05-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5926–6452(527 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
A1JDF ~{N}-[(1-cyclopropyl-6-fluoranyl-indazol-7-yl)methyl]-1,5-dimethyl-4-[(7-methyl-2~{H}-indazol-5-yl)sulfonyl]pyrrole-2-carboxamide × 1
CL CHLORIDE ION × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6
IMD IMIDAZOLE × 4
IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;isopropanol, imidazole
|
分辨率 1.89 Å
R-free 0.227
|
|
9S0M
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 1
提交 2025-07-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5926–6450(525 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
IMD IMIDAZOLE × 1
A1JKS (2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)oxolane-3,4-diol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.283
|
|
9S0M
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 1
提交 2025-07-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5926–6450(525 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
IMD IMIDAZOLE × 1
A1JKS (2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)oxolane-3,4-diol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.283
|
|
9S2V
NSP14 IN COMPLEX WITH LIGAND TDI-014925-CL-2 (compound 58)
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5926–6452(527 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
A1JLH ~{N}-[(6-fluoranyl-1-methyl-indazol-7-yl)methyl]-1,5-dimethyl-4-(1,4,6,7-tetrahydropyrazolo[4,3-c]pyridin-5-ylsulfonyl)pyrrole-2-carboxamide × 1
CL CHLORIDE ION × 3
IMD IMIDAZOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;isopropanol and imidazole, pH 7.0
|
分辨率 2.38 Å
R-free 0.245
|
|
9S2V
NSP14 IN COMPLEX WITH LIGAND TDI-014925-CL-2 (compound 58)
提交 2025-07-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5926–6452(527 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
A1JLH ~{N}-[(6-fluoranyl-1-methyl-indazol-7-yl)methyl]-1,5-dimethyl-4-(1,4,6,7-tetrahydropyrazolo[4,3-c]pyridin-5-ylsulfonyl)pyrrole-2-carboxamide × 1
CL CHLORIDE ION × 2
IMD IMIDAZOLE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;isopropanol and imidazole, pH 7.0
|
分辨率 2.38 Å
R-free 0.245
|
|
9SAJ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 5
提交 2025-08-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5926–6450(525 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
IMD IMIDAZOLE × 3
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
CL CHLORIDE ION × 1
A1JMY 1-[2-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanyl]ethyl]-3-ethyl-urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.239
|
|
9SAJ
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 5
提交 2025-08-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5926–6450(525 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
IMD IMIDAZOLE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6
CL CHLORIDE ION × 1
A1JMY 1-[2-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanyl]ethyl]-3-ethyl-urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.239
|
|
9SAK
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 6
提交 2025-08-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5926–6450(525 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
A1JMZ (2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-(naphthalen-2-ylsulfanylmethyl)oxolane-3,4-diol × 1
IMD IMIDAZOLE × 3
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
CL CHLORIDE ION × 5
ZN ZINC ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.249
|
|
9SAK
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 6
提交 2025-08-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5926–6450(525 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
A1JMZ (2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-(naphthalen-2-ylsulfanylmethyl)oxolane-3,4-diol × 1
IMD IMIDAZOLE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
CL CHLORIDE ION × 1
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.249
|
|
9SAL
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 18
提交 2025-08-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5926–6450(525 aa)
|
未记录
|
A1JM0 (2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-2-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)-5-[6-(methylamino)purin-9-yl]oxolane-3,4-diol × 1
IMD IMIDAZOLE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.29 Å
R-free 0.226
|
|
9SAL
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 18
提交 2025-08-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5926–6450(525 aa)
|
未记录
|
A1JM0 (2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-2-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)-5-[6-(methylamino)purin-9-yl]oxolane-3,4-diol × 1
IMD IMIDAZOLE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
ZN ZINC ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.29 Å
R-free 0.226
|
|
9SAM
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 26
提交 2025-08-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5926–6450(525 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
IMD IMIDAZOLE × 1
A1JM1 (1~{R},2~{S},3~{R},5~{S})-3-(6-aminopurin-9-yl)-5-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)cyclopentane-1,2-diol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.54 Å
R-free 0.229
|
|
9SAM
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 26
提交 2025-08-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5926–6450(525 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
IMD IMIDAZOLE × 3
A1JM1 (1~{R},2~{S},3~{R},5~{S})-3-(6-aminopurin-9-yl)-5-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)cyclopentane-1,2-diol × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.54 Å
R-free 0.229
|
|
9SAN
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 27
提交 2025-08-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
5926–6450(525 aa)
|
未记录
|
A1JM2 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-2-(4-azanylpyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)oxolane-3,4-diol × 1
IMD IMIDAZOLE × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
ZN ZINC ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.73 Å
R-free 0.264
|
|
9SAN
Crystal structure of SARS-CoV-2 NSP14 in complex with compound 27
提交 2025-08-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
5926–6450(525 aa)
|
未记录
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A1JM2 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-2-(4-azanylpyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-(1,3-benzothiazol-2-ylsulfanylmethyl)oxolane-3,4-diol × 1
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;7% isopropanol and 0.1 M imidazole, pH 7.75
|
分辨率 2.73 Å
R-free 0.264
|
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9SAO
Cryo-EM structure of SARS CoV-2 RdRp S759A mutant in complex with 20-40mer RNA incorporating remdesivir
提交 2025-08-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:pentameric
|
链 A
4397–5324(928 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 75 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
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9SAP
Cryo-EM structure of SARS CoV-2 RdRp wild-type in complex with 20-40mer RNA incorporating Remdesivir
提交 2025-08-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:pentameric
|
链 A
4397–5324(928 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 75 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
9SAQ
Cryo-EM structure of SARS CoV-2 RdRp S759A mutant in complex with 20-40mer RNA incorporating ATP
提交 2025-08-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:pentameric
|
链 A
4397–5324(928 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 75 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9SAR
Cryo-EM structure of SARS CoV-2 RdRp wild-type in complex with 20-40mer RNA incorporating ATP
提交 2025-08-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:pentameric
|
链 A
4397–5324(928 aa)
链 B
3943–4140(198 aa)
链 C
3860–3942(83 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 75 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9TH6
nsp14 of SARS-CoV-2 in complex with a camelid nanobody
提交 2025-12-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
5926–6452(527 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293.15 K;22,5-26,25% w/v PEG 3350, 0.1 M Bis Tris propane, 0.2 M sodium fluoride
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.290
|
|
9U7D
Crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease (Cys111Ser) in complex with YL1004
提交 2025-03-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1564–1875(312 aa)
|
突变:C111S
|
A1EOE (4~{a}~{S})-8-azanyl-3-methyl-~{N}-[1-[4-(oxan-4-ylamino)naphthalen-1-yl]cyclopropyl]-2,4,4~{a},5-tetrahydro-1~{H}-pyrazino[2,1-c][1,4]benzoxazine-9-carboxamide × 2
ZN ZINC ION × 16
CL CHLORIDE ION × 12
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;6% (w/v) PEG8000, 100 mM MES/Sodium hydroxide pH 6.0, 200 mM zinc acetate and 20% PEG400
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.231
|
|
9U96
SARS-CoV2 Main protease(Mpro) complexed with TAB1 peptide
提交 2025-03-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3567(304 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;PEG3350, Magnesium formate dihydrate
|
分辨率 3.43 Å
R-free 0.245
|
|
9U96
SARS-CoV2 Main protease(Mpro) complexed with TAB1 peptide
提交 2025-03-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
3264–3567(304 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;PEG3350, Magnesium formate dihydrate
|
分辨率 3.43 Å
R-free 0.245
|
|
9UHT
SARS-CoV-2 E-RTC in complex with RNA-nsp9 and GMPPNP
提交 2025-04-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 7
PDB 声明:decameric
|
链 A
4393–5324(932 aa)
片段:UNP RESIDUES 4393-5324
链 B
3943–4140(198 aa)
片段:UNP RESIDUES 3943-4140
链 C
3860–3937(78 aa)
片段:UNP RESIDUES 3860-3942
链 D
3943–4140(198 aa)
片段:UNP RESIDUES 3943-4140
链 E
5325–5917(593 aa)
片段:UNP RESIDUES 5325-5925
链 F
5325–5917(593 aa)
片段:UNP RESIDUES 5325-5925
链 G
4141–4253(113 aa)
片段:UNP RESIDUES 4141-4253
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å
|
|
9UX6
SARS-CoV2 Main protease(Mpro) complexed with RIP1 peptide
提交 2025-05-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
链 B
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;PEG3350, Magnesium formate dihydrate
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.228
|
|
9UX6
SARS-CoV2 Main protease(Mpro) complexed with RIP1 peptide
提交 2025-05-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
3264–3569(306 aa)
链 D
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;PEG3350, Magnesium formate dihydrate
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.228
|
|
9VAO
Crystal structure of Papain-like protease (PLpro) from SARS-CoV-2
提交 2025-06-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1877(314 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 2
GOL GLYCEROL × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;Tris buffer pH 8.0, Sodium dihydrogen phosphate/Potassium hydrogen phosphate
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.224
|
|
9VCK
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10/nsp14:RNA:SMP complex
提交 2025-06-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
4254–4384(131 aa)
链 B
5927–6448(522 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 5
CA CALCIUM ION × 2
K5X [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-4-fluoranyl-4-methyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.22 Å
|
|
9VCL
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10/nsp14:RNA:ATMP complex
提交 2025-06-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
4254–4392(139 aa)
链 B
5926–6452(527 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 5
CA CALCIUM ION × 2
EIF [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-fluoranyl-4-methyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å
|
|
9VUW
Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease with a deletion of Asn51
提交 2025-07-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;0.12 M Alcohols, 0.1 M Buffer System 2 pH 7.5, 37.5% v/v Precipitant Mix 4
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.211
|
|
9VWY
Crystal structure of C270S mutant of Papain-like protease (PLpro) from SARS-CoV-2
提交 2025-07-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1877(314 aa)
|
突变:C270S
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
ZN ZINC ION × 1
PO4 PHOSPHATE ION × 3
GOL GLYCEROL × 4
CL CHLORIDE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;Tris buffer pH 8.0, Sodium dihydrogen phosphate/Potassium hydrogen phosphate
|
分辨率 1.83 Å
R-free 0.195
|
|
9WHE
A novel, covalent and highly synthetically accessible SARS-CoV-2 Mpro chloroacetamide inhibitor
提交 2025-08-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
A1MBL (2~{R})-~{N}-[4,4-bis(fluoranyl)cyclohexyl]-2-[ethanoyl-[4-(1,2-thiazol-5-yl)phenyl]amino]-2-pyrazin-2-yl-ethanamide × 2
ACT ACETATE ION × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 26
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.9;291 K;0.2 M LiSO4, pH 7.9, 12% PEG3350
|
分辨率 1.82 Å
R-free 0.276
|
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9XFR
The crystal structure of SARS-CoV-2 Main protease in complex with inhibitor FD2-12
提交 2025-10-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
A1EZ6 2-(2-chlorophenyl)-7-(5-methylpyridin-3-yl)-5,7-diazaspiro[3.4]octane-6,8-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;289.15 K;0.10% w/v n-Octyl-b-D-glucoside, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 22% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.251
|
|
9XG2
The crystal structure of SARS-CoV-2 Main protease in complex with inhibitor FD2-21
提交 2025-10-29
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
未记录
|
A1EZ7 7-(5-azanylpyridin-3-yl)-2-(2-chlorophenyl)-5,7-diazaspiro[3.4]octane-6,8-dione × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289.15 K;0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
|
分辨率 2.04 Å
R-free 0.237
|
|
9XYM
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in complex with Jun13698
提交 2025-08-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1CR5 (1R,2S,5S)-6,6-dimethyl-N-[(2S)-4-(methylsulfanyl)-1-oxobutan-2-yl]-3-[N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;0.07 M Bis-Tris (pH 8.0), 25% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.87 Å
R-free 0.253
|
|
9XYX
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) T169S Mutant
提交 2025-08-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:T169S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.67 Å
R-free 0.260
|
|
9XYZ
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) E166V Mutant
提交 2025-08-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
|
突变:E166V
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;25% PEG 3350, 0.1M Potassium/Sodium Tartrate, 0.005M Magnesium Chloride
|
分辨率 2.42 Å
R-free 0.277
|
|
9XZ6
Crystal Structure of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) in complex with Jun13699
提交 2025-08-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1CR3 methyl {(2S)-1-[(1R,2S,5S)-6,6-dimethyl-2-{[(2S)-4-(methylsulfanyl)-1-oxobutan-2-yl]carbamoyl}-3-azabicyclo[3.1.0]hexan-3-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;0.07 M Bis-Tris (pH 8.0), 25% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.47 Å
R-free 0.262
|
|
9YRK
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 (E191A) in complex with T20P14-B complex, dimeric form
提交 2025-10-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:hexameric
|
链 A
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 B
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
链 C
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 D
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 10
MG MAGNESIUM ION × 2
EIF [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-fluoranyl-4-methyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9YRL
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 (E191A) in complex with T20P14-B complex, protomer A focused refinement
提交 2025-10-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
4254–4392(139 aa)
片段:UNP residues 4254-4392
链 B
5926–6452(527 aa)
片段:UNP residues 5926-6452
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 5
MG MAGNESIUM ION × 1
EIF [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-fluoranyl-4-methyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.90 Å
|
|
9YRN
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 (E191A) in complex with T20P14-S complex, tetrameric form
提交 2025-10-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 8
PDB 声明:12-meric
|
链 A
4254–4392(139 aa)
链 B
5926–6452(527 aa)
链 C
4254–4392(139 aa)
链 D
5926–6452(527 aa)
链 G
4254–4392(139 aa)
链 H
5926–6452(527 aa)
链 I
4254–4392(139 aa)
链 J
5926–6452(527 aa)
|
突变:E191A
突变:E191A
突变:E191A
突变:E191A
|
ZN ZINC ION × 20
MG MAGNESIUM ION × 6
K5X [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-4-fluoranyl-4-methyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å
|
|
9YRO
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp14 (E191A) in complex with T20P14-S complex, monomeric form
提交 2025-10-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:trimeric
|
链 A
4254–4392(139 aa)
链 B
5926–6452(527 aa)
|
突变:E191A
|
ZN ZINC ION × 5
MG MAGNESIUM ION × 1
K5X [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-4-fluoranyl-4-methyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.55 Å
|
|
9Z0C
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 7
提交 2025-10-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1563–1879(317 aa)
|
未记录
|
A1CZV (7M)-1',8-dimethyl-7-(2-methylpyridin-4-yl)spiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-4(3H)-one × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;10-16 % PEG-3350, 2-4% Tryptone, 50 mM HEPES pH = 7.0
1:1 drop ratio
corcrystal:14 mg/mL protein incubated with 10 mM ligand 1 h before drop set up
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.252
|
|
9Z0D
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 41
提交 2025-10-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
A1CZW N'-[3-(2-{[(7M)-8-methyl-7-(2-methylpyridin-4-yl)-3,4-dihydrospiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-1'-yl]methyl}pyridin-3-yl)propanoyl]-4-(2-oxa-6-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)-4-oxobutanehydrazide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;20-24 % PEG-3350, 150-300 mM Magnesium formate
1:1 drop ratio
crocrystalisation. 16 mg/mL protein incubated in 10 mM ligand 1 hour before tray set up
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.238
|
|
9Z0D
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 41
提交 2025-10-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
A1CZW N'-[3-(2-{[(7M)-8-methyl-7-(2-methylpyridin-4-yl)-3,4-dihydrospiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-1'-yl]methyl}pyridin-3-yl)propanoyl]-4-(2-oxa-6-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)-4-oxobutanehydrazide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;20-24 % PEG-3350, 150-300 mM Magnesium formate
1:1 drop ratio
crocrystalisation. 16 mg/mL protein incubated in 10 mM ligand 1 hour before tray set up
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.238
|
|
9Z0D
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 41
提交 2025-10-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
A1CZW N'-[3-(2-{[(7M)-8-methyl-7-(2-methylpyridin-4-yl)-3,4-dihydrospiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-1'-yl]methyl}pyridin-3-yl)propanoyl]-4-(2-oxa-6-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)-4-oxobutanehydrazide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;20-24 % PEG-3350, 150-300 mM Magnesium formate
1:1 drop ratio
crocrystalisation. 16 mg/mL protein incubated in 10 mM ligand 1 hour before tray set up
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.238
|
|
9Z0D
SARS-CoV-2 Papain-like Protease (PLpro) in complex with Fragment 41
提交 2025-10-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1564–1878(315 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
A1CZW N'-[3-(2-{[(7M)-8-methyl-7-(2-methylpyridin-4-yl)-3,4-dihydrospiro[[1]benzopyran-2,4'-piperidin]-1'-yl]methyl}pyridin-3-yl)propanoyl]-4-(2-oxa-6-azaspiro[3.3]heptan-6-yl)-4-oxobutanehydrazide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;20-24 % PEG-3350, 150-300 mM Magnesium formate
1:1 drop ratio
crocrystalisation. 16 mg/mL protein incubated in 10 mM ligand 1 hour before tray set up
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.238
|
|
9Z6B
Crystal structure of SARS-CoV-2 PLpro in complex with compound 10
提交 2025-11-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1881(318 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
A1C09 methyl 4-{[(2E)-2-{[(2S)-3-amino-2-{1-[(1R)-1-(naphthalen-1-yl)ethyl]piperidin-4-yl}propanoyl]imino}acetyl]amino}butanoate × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277.15 K;1.8 M sodium/potassium phosphate pH 8.2
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.261
|
|
9Z6C
Crystal structure of SARS-CoV-2 PLpro in complex with compound 14
提交 2025-11-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1564–1881(318 aa)
|
未记录
|
A1C1A methyl 4-{[(2E)-2-{[(2S)-3-amino-2-(1-{(1R)-1-[7-(propan-2-yl)naphthalen-1-yl]ethyl}piperidin-4-yl)propanoyl]imino}acetyl]amino}butanoate × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290.15 K;3.5 M Sodium formate
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.247
|
|
9Z6C
Crystal structure of SARS-CoV-2 PLpro in complex with compound 14
提交 2025-11-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1564–1881(318 aa)
|
未记录
|
A1C1A methyl 4-{[(2E)-2-{[(2S)-3-amino-2-(1-{(1R)-1-[7-(propan-2-yl)naphthalen-1-yl]ethyl}piperidin-4-yl)propanoyl]imino}acetyl]amino}butanoate × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;290.15 K;3.5 M Sodium formate
|
分辨率 2.06 Å
R-free 0.247
|
|
9Z74
X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease V186G covalently bound to inhibitor Nirmatrelvir at 1.81 A
提交 2025-11-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
突变:V186G
|
4WI (1R,2S,5S)-N-{(1E,2S)-1-imino-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-6,6-dimethyl-3-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.81 Å
R-free 0.206
|
|
9ZJ1
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor NN-IV-169
提交 2025-12-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
链 B
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.192
|
|
9ZJ2
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor AMJ-II-122
提交 2025-12-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
链 B
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.188
|
|
9ZJ3
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor AMJ-II-72
提交 2025-12-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
链 B
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.231
|
|
9ZJ4
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor IKR-I-45
提交 2025-12-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.44 Å
R-free 0.266
|
|
9ZJ5
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor IKR-I-52
提交 2025-12-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.76 Å
R-free 0.218
|
|
9ZJ6
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor PSR-I-162
提交 2025-12-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
链 B
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.181
|
|
9ZNL
X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease covalently bound to inhibitor GRL-050-22 at 1.16 A
提交 2025-12-13
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1C3L (3S)-N-[(1S,2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]-1-(4-phenyl-1,3-thiazol-2-yl)propan-2-yl]-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.159
|
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9ZO3
X-ray structure of SARS-CoV-2 main protease covalently bound to inhibitor GRL-062-22 at 1.65 A
提交 2025-12-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3569(306 aa)
|
未记录
|
A1C3M (3S)-N-{(1S,2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopiperidin-3-yl]propan-2-yl}-2-[3-methyl-N-(trifluoroacetyl)-L-valyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxamide × 2
NA SODIUM ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;12% PEG 10K, 0.003 M DTT, 1% MPD, 0.05 M MES (pH 6.0), 0.12 M KCl, 2.5% DMSO, 25 mM HEPES, protein concentration 5.5 mg/mL
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.196
|
|
9ZZH
Crystal structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor CSD-V-169
提交 2026-01-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
链 B
3264–3568(305 aa)
片段:Full Length
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 1.87 Å
R-free 0.212
|