2.54 A S.cerevisiae Chd1[L886G/L889G/L891G]-nucleosome 1:1 complex

Histone H4

Xenopus laevis

UniProt P62799

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 9 DNA 2 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物数一致	链 B； UniProt 16–103 链 F； UniProt 16–103	未记录	DNA Tracking Strand × 1 DNA Lagging Strand × 1 Histone H2A × 2 （Q6AZJ8） Histone H2B 1.1 × 2 （P02281） Chromo domain-containing protein 1 × 1 （P32657） Histone H3 × 2 （A0A310TTQ1）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.54 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9N6H	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AOI COMPLEX BETWEEN NUCLEOSOME CORE PARTICLE (H3,H4,H2A,H2B) AND 146 BP LONG DNA FRAGMENT 提交 1997-07-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 17–103（87 aa） 片段：HISTONE H4 链 F 17–103（87 aa） 片段：HISTONE H4	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 6	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å R-free 0.302
1KX3 X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP146, at 2.0 A Resolution 提交 2002-01-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.275
1P34 Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.70 Å R-free 0.270
1P3A Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 3.00 Å R-free 0.260
1P3B Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 3.00 Å R-free 0.286
1P3F Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
1P3G Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.70 Å R-free 0.265
1P3I Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.30 Å R-free 0.275
1P3K Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.90 Å R-free 0.291
1P3L Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.40 Å R-free 0.265
1P3M Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
1P3O Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.75 Å R-free 0.276
1P3P Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.70 Å R-free 0.268
1ZBB Structure of the 4_601_167 Tetranucleosome 提交 2005-04-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：36-meric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa） 链 b 1–102（102 aa） 链 f 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.75；294 K；magnesium chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, trisCl, pH 6.75, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 9.00 Å
1ZLA X-ray Structure of a Kaposi's sarcoma herpesvirus LANA peptide bound to the nucleosomal core 提交 2005-05-05	构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；Manganese chloride, Potassium chloride, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.90 Å R-free 0.277
21VV Cryo-EM structure of ncBAF bound to the nucleosome 提交 2025-12-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8.0, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.5 mM ADP, 8 mM NaF, 1 mM BeSO4. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
21WA Cryo-EM structure of the ATPase domain of SMARCA4 bound to a nucleosome 提交 2025-12-31	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8.0, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.5 mM ADP, 8 mM NaF, 1 mM BeSO4. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
21WC Cryo-EM structure of the ATPase domain of SMARCA4 and the finger helix of BCL7A bound to a nucleosome 提交 2025-12-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8.0, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.5 mM ADP, 8 mM NaF, 1 mM BeSO4. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
2F8N 2.9 Angstrom X-ray structure of hybrid macroH2A nucleosomes 提交 2005-12-02	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；34 to 37.5mM KCl and 40-45mM MnCl2, 5mM Potassium Cacodylate, Sample concentration: 8-12 mg/ml, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.90 Å R-free 0.269
2FJ7 Crystal structure of Nucleosome Core Particle Containing a Poly (dA.dT) Sequence Element 提交 2005-12-31	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；20 to 35 mM KCl, 34 to 48 mM MnCl2, and 5mM K-cacodylate pH 6.0 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 3.20 Å R-free 0.350
2HUE Structure of the H3-H4 chaperone Asf1 bound to histones H3 and H4 提交 2006-07-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 20–102（83 aa） 片段：residues 20-102	未记录	ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；0.1M potassium sulfate, 0.1M Tris-HCl, 14.5% PEG 4K, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.70 Å R-free 0.239
2HUE Structure of the H3-H4 chaperone Asf1 bound to histones H3 and H4 提交 2006-07-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 20–102（83 aa） 片段：residues 20-102	未记录	ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；0.1M potassium sulfate, 0.1M Tris-HCl, 14.5% PEG 4K, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.70 Å R-free 0.239
2HUE Structure of the H3-H4 chaperone Asf1 bound to histones H3 and H4 提交 2006-07-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 20–102（83 aa） 片段：residues 20-102	未记录	ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；0.1M potassium sulfate, 0.1M Tris-HCl, 14.5% PEG 4K, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.70 Å R-free 0.239
2HUE Structure of the H3-H4 chaperone Asf1 bound to histones H3 and H4 提交 2006-07-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 20–102（83 aa） 片段：residues 20-102	未记录	ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；0.1M potassium sulfate, 0.1M Tris-HCl, 14.5% PEG 4K, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.70 Å R-free 0.239
2IO5 Crystal structure of the CIA- histone H3-H4 complex 提交 2006-10-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 0.05M cadmium sulfate hydrate, 1.0M sodium acetate tryhydrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.70 Å R-free 0.293
2NZD Nucleosome core particle containing 145 bp of DNA 提交 2006-11-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；85 mM MnCl2, 60 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate, 4 mg/ml NCP over well with 1/2 conc., pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.65 Å R-free 0.283
3B6F Nucleosome core particle treated with cisplatin 提交 2007-10-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；MnCl2, KCl, K-Cacodylate, pH 6.0, vapor diffusion, temperature 291K	分辨率 3.45 Å R-free 0.402
3B6G Nucleosome core particle treated with oxaliplatin 提交 2007-10-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；MnCl2, KCl, K-Cacodylate, pH 6.0, vapor diffusion, temperature 291K	分辨率 3.45 Å R-free 0.435
3C1B The effect of H3 K79 dimethylation and H4 K20 trimethylation on nucleosome and chromatin structure 提交 2008-01-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；Manganese chloride, Potassium chloride, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.20 Å R-free 0.270
3C1C The effect of H3 K79 dimethylation and H4 K20 trimethylation on nucleosome and chromatin structure 提交 2008-01-22	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；Manganese chloride, Potassium chloride, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 3.15 Å R-free 0.290
3KUY DNA Stretching in the Nucleosome Facilitates Alkylation by an Intercalating Antitumor Agent 提交 2009-11-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1 ATV 2-[(2R)-oxiran-2-ylmethyl]-1H-benzo[de]isoquinoline-1,3(2H)-dione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6；291 K；85 mM MnCl2, 60 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate, 4 mg/ml NCP over well with 1/2 conc., pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, EVAPORATION	分辨率 2.90 Å R-free 0.286
3KWQ Structural characterization of H3K56Q nucleosomes and nucleosomal arrays 提交 2009-12-01	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 21–103（83 aa） 片段：UNP residues 21-103 链 F 21–103（83 aa） 片段：UNP residues 21-103	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.50 Å R-free 0.315
3KXB Structural characterization of H3K56Q nucleosomes and nucleosomal arrays 提交 2009-12-02	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；Crystals were grown by vapor diffusion in 8 20 days at 20 C using a droplet containing 4.0 mg ml−1 core particle 50 mM KCl, 70 75 mM MnCl , and 20 mM potassium cacodylate, pH 6.0, surrounded by silicon oil DC200 (110mPa s; Fluka) and equilibrated against 40 46 mM MnCl2, 35 40 mM KCl and 20 mM potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.292
3LEL Structural Insight into the Sequence-Dependence of Nucleosome Positioning 提交 2010-01-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 20mM K-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.95 Å R-free 0.300
3LEL Structural Insight into the Sequence-Dependence of Nucleosome Positioning 提交 2010-01-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 L 2–103（102 aa） 链 P 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 19	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 20mM K-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.95 Å R-free 0.300
3LJA Using Soft X-Rays for a Detailed Picture of Divalent Metal Binding in the Nucleosome 提交 2010-01-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 45	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；85 mM MnCl2, 60 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate, 4 mg/ml NCP over well with 1/2 conc., pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, EVAPORATION	分辨率 2.75 Å R-free 0.259
3LZ0 Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Composed of the Widom 601 DNA Sequence (orientation 1) 提交 2010-03-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；K cacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.318
3LZ1 Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Composed of the Widom 601 DNA Sequence (orientation 2) 提交 2010-03-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；Kcacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.319
3MGP Binding of Cobalt ions to the Nucleosome Core Particle 提交 2010-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 CO COBALT (II) ION × 43	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 40mM K-cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.44 Å R-free 0.282
3MGQ Binding of Nickel ions to the Nucleosome Core Particle 提交 2010-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 47 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 40mM K-cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.65 Å R-free 0.276
3MGR Binding of Rubidium ions to the Nucleosome Core Particle 提交 2010-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 RB RUBIDIUM ION × 5 MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 40mM K-cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.30 Å R-free 0.267
3MGS Binding of Cesium ions to the Nucleosome Core particle 提交 2010-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 CS CESIUM ION × 12 MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 40mM K-cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 3.15 Å R-free 0.238
3MNN A Ruthenium Antitumour Agent Forms Specific Histone Protein Adducts in the Nucleosome Core 提交 2010-04-22	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 RU RUTHENIUM ION × 3 MML 1-methyl-4-(1-methylethyl)benzene × 3 PTW 1,3,5-triaza-7-phosphatricyclo[3.3.1.1~3,7~]decane × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；55mM KCl, 85mM MnCl2, 20mM K-Cacodylate, pH 6, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.277
3MVD Crystal structure of the chromatin factor RCC1 in complex with the nucleosome core particle 提交 2010-05-04	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；294 K；25 mM sodium acetate buffer, 25 mM sodium citrate, 1 mM DTT, 6 % PEG2000-MME, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 2.90 Å R-free 0.215
3O62 Nucleosome core particle modified with a cisplatin 1,3-cis-{Pt(NH3)2}2+-d(GpTpG) intrastrand cross-link 提交 2010-07-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	CPT Cisplatin × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；40-46 mM MnCl2, 30-45 mM KCl, and 20 mM potassium cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.22 Å R-free 0.306
3REH 2.5 Angstrom Crystal Structure of the Nucleosome Core Particle Assembled with a 145 bp Alpha-Satellite DNA (NCP145) 提交 2011-04-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；KCl, MnCl2, K-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
3REI 2.65 Angstrom Crystal Structure of the Nucleosome Core Particle Assembled with a 145 bp Alpha-Satellite DNA (NCP145) Derivatized with Triamminechloroplatinum(II) Chloride 提交 2011-04-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	PT PLATINUM (II) ION × 49 SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.65 Å R-free 0.276
3REJ 2.55 Angstrom Crystal Structure of the Nucleosome Core Particle Assembled with a 146 bp Alpha-Satellite DNA (NCP146b) 提交 2011-04-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 13 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.55 Å R-free 0.262
3REK 2.6 Angstrom Crystal Structure of the Nucleosome Core Particle Assembled with a 146 bp Alpha-Satellite DNA (NCP146b) Derivatized with Oxaliplatin 提交 2011-04-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 PT PLATINUM (II) ION × 40 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.281
3REL 2.7 Angstrom Crystal Structure of the Nucleosome Core Particle Assembled with a 146 bp Alpha-Satellite DNA (NCP146b) Derivatized with Triamminechloroplatinum(II) Chloride 提交 2011-04-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 PT PLATINUM (II) ION × 48 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å R-free 0.302
3TU4 Crystal structure of the Sir3 BAH domain in complex with a nucleosome core particle. 提交 2011-09-15	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.241
3TU4 Crystal structure of the Sir3 BAH domain in complex with a nucleosome core particle. 提交 2011-09-15	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.241
3UT9 Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Assembled with a Palindromic Widom '601' Derivative (NCP-601L) 提交 2011-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 29 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；K-cacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, temperature 291K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.20 Å R-free 0.289
3UTA Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Assembled with an Alpha-Satellite Sequence Containing Two TTAAA elements (NCP-TA2) 提交 2011-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 17	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；K-cacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, temperature 291K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.07 Å R-free 0.266
3UTB Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Assembled with the 146b Alpha-Satellite Sequence (NCP146b) 提交 2011-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 21 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；K-cacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, temperature 291K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.20 Å R-free 0.275
4EO5 Yeast Asf1 bound to H3/H4G94P mutant 提交 2012-04-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 21–103（83 aa） 片段：residues 20-102	突变：G94P	ACT ACETATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；298 K；7.14% PEG 3350, 0.2 M Magnesium Acetate, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.240
4J8U X-ray structure of NCP145 with chlorido(eta-6-p-cymene)(N-phenyl-2-pyridinecarbothioamide)osmium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 ELJ chlorido(eta-6-p-cymene)(N-phenyl-2-pyridinecarbothioamide)osmium(II) × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.38 Å R-free 0.280
4J8V X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-phenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.58 Å R-free 0.273
4J8V X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-phenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 F 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.58 Å R-free 0.273
4J8V X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-phenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.58 Å R-free 0.273
4J8W X-ray structure of NCP145 with chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)osmium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 1MK chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)osmium(II) × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.41 Å R-free 0.275
4J8X X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.280
4J8X X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 F 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.280
4J8X X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.280
4KGC Nucleosome Core Particle Containing (ETA6-P-CYMENE)-(1, 2-ETHYLENEDIAMINE)-RUTHENIUM 提交 2013-04-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	HRU (ethane-1,2-diamine-kappa~2~N,N')[(1,2,3,4,5,6-eta)-1-methyl-4-(propan-2-yl)cyclohexane-1,2,3,4,5,6-hexayl]ruthenium × 4 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.69 Å R-free 0.282
4LD9 Crystal structure of the N-terminally acetylated BAH domain of Sir3 bound to the nucleosome core particle 提交 2013-06-24	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293.15 K；50 mM MES pH 6.5, 12% PEG 400, 12 mM MnCl2, 100 mM NaCl, 10 mM EDTA, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.15K	分辨率 3.31 Å R-free 0.295
4R8P Crystal structure of the Ring1B/Bmi1/UbcH5c PRC1 ubiquitylation module bound to the nucleosome core particle 提交 2014-09-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Modified micro batch under oil；pH 7.5；294 K；25 mM HEPES pH 7.5, 80 mM NH4NO3, 3 % PEG2000-MME, Modified micro batch under oil, temperature 294K	分辨率 3.28 Å R-free 0.245
4WU8 Structure of trPtNAP-NCP145 提交 2014-10-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	CX3 [2-(3-{bis[2-(amino-kappaN)ethyl]amino-kappaN}propyl)-1H-benzo[de]isoquinoline-1,3(2H)-dionato(2-)]platinum(1+) × 2 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；Manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate	分辨率 2.45 Å R-free 0.263
4WU9 Structure of cisPtNAP-NCP145 提交 2014-10-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 CX8 [2-{3-[(2-{[2-(amino-kappaN)ethyl]amino-kappaN}ethyl)amino-kappaN]propyl}-1H-benzo[de]isoquinoline-1,3(2H)-dionato(3-)]platinum × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；Manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate	分辨率 2.60 Å R-free 0.273
4XUJ Nucleosome core particle containing adducts from treatment with a thiomorpholine-substituted [(eta-6-p-cymene)Ru(3-hydroxy-2-pyridone)Cl] compound 提交 2015-01-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 片段：UNP residues 2-103 链 F 2–103（102 aa） 片段：UNP residues 2-103	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 4A6 [(1,2,3,4,5,6-eta)-1-methyl-4-(propan-2-yl)benzene]ruthenium × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40mM MnCl2, 30mM KCl, 20mM K-Cacodylate	分辨率 3.18 Å R-free 0.299
4XZQ Nucleosome disassembly by RSC and SWI/SNF is enhanced by H3 acetylation near the nucleosome dyad axis 提交 2015-02-04	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 25–103（79 aa） 片段：residues 25-103 链 F 25–103（79 aa） 片段：residues 25-103	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292.15 K；potassium chloride, potassium cacodylate, manganese chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.299
4YS3 Nucleosome disassembly by RSC and SWI/SNF is enhanced by H3 acetylation near the nucleosome dyad axis 提交 2015-03-16	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 25–103（79 aa） 片段：residues 25-103 链 F 25–103（79 aa） 片段：residues 25-103	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；292.15 K；postassium chloride, manganese chloride, cacodylate	分辨率 3.00 Å R-free 0.279
4Z66 Nucleosome disassembly by RSC and SWI/SNF is enhanced by H3 acetylation near the nucleosome dyad axis 提交 2015-04-03	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 22–103（82 aa） 链 F 22–103（82 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292.15 K；potassium chloride, potassium cacodylate, manganese chloride	分辨率 2.50 Å R-free 0.296
4ZBJ UBN1 peptide bound to H3.3/H4/Asf1 提交 2015-04-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 21–103（83 aa） 片段：UNP residues 21-103	未记录	CL CHLORIDE ION × 8 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 6.0, 8% PEG 8K, 0.2 M NaCl	分辨率 2.25 Å R-free 0.235
4ZUX SAGA DUB module Ubp8/Sgf11/Sus1/Sgf73 bound to ubiqitinated nucleosome 提交 2015-05-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Tris-acetate pH 7.4, 50 mM sodium acetate, 5 mM Mg-acetate, 5% sucrose and 5% 2-propanol	分辨率 3.82 Å R-free 0.256
4ZUX SAGA DUB module Ubp8/Sgf11/Sus1/Sgf73 bound to ubiqitinated nucleosome 提交 2015-05-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Tris-acetate pH 7.4, 50 mM sodium acetate, 5 mM Mg-acetate, 5% sucrose and 5% 2-propanol	分辨率 3.82 Å R-free 0.256
5BS7 Structure of histone H3/H4 in complex with Spt2 提交 2015-06-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 2–103（102 aa） 链 D 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.02 M NaCl, 0.2 M HEPES 7.5, 1.5 M ammonium sulfate	分辨率 3.30 Å R-free 0.290
5BSA Structure of histone H3/H4 in complex with Spt2 提交 2015-06-01	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 2–103（102 aa） 链 D 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.02 M NaCl, 0.2 M HEPES 7.5, 1.6 M ammonium sulfate	分辨率 4.61 Å R-free 0.329
5CP6 Nucleosome Core Particle with Adducts from the Anticancer Compound, [(eta6-5,8,9,10-tetrahydroanthracene)Ru(ethylenediamine)Cl][PF6] 提交 2015-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	RUH (ethane6-5,8,9,10-tetrahydroanthracene)Ru(II)(ethylene-diamine)Cl × 3 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.60 Å R-free 0.251
5DNM Nucleosome core particle containing adducts of ruthenium(II)-toluene PTA complex 提交 2015-09-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 RAX dichloro[(1,2,3,4,5,6-eta)-6-methylbenzene]1,3,5-triaza-7lambda~5~-phosphatricyclo[3.3.1.1~3,7~]dec-7-ylruthenium × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate	分辨率 2.81 Å R-free 0.241
5DNN Nucleosome core particle containing adducts of gold(I)-triethylphosphane and ruthenium(II)-toluene PTA complexes 提交 2015-09-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	AUF triethylphosphanuidylgold(1+) × 2 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 RAX dichloro[(1,2,3,4,5,6-eta)-6-methylbenzene]1,3,5-triaza-7lambda~5~-phosphatricyclo[3.3.1.1~3,7~]dec-7-ylruthenium × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate	分辨率 2.80 Å R-free 0.236
5E5A Crystal structure of the chromatin-tethering domain of Human cytomegalovirus IE1 protein bound to the nucleosome core particle 提交 2015-10-08	构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；289 K；sodium cacodylate, magnesium acetate, 2-methyl-2,4-pentanediol	分辨率 2.81 Å R-free 0.242
5F99 X-ray Structure of the MMTV-A Nucleosome Core Particle 提交 2015-12-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	突变：H18R 突变：H18R	CL CHLORIDE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；sample was mixed 1:1 with 10 mM K-cacodylate, pH 6.0, 180 mM MgCl2, 50 mM KCl and equilibrated against a 1:4 dilution of the same solution	分辨率 2.63 Å R-free 0.252
5HQ2 Structural model of Set8 histone H4 Lys20 methyltransferase bound to nucleosome core particle 提交 2016-01-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 5.5；277 K；25 mM sodium acetate pH 5.5, 40 mM sodium citrate,1 mM DTT, 6% PEG2000-MME	分辨率 4.50 Å R-free 0.397
5KGF Structural model of 53BP1 bound to a ubiquitylated and methylated nucleosome, at 4.5 A resolution 提交 2016-06-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	突变：K20C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：K20C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；High concentration NCP-ubme/GST-53BP1 complex at 200 mM salt was diluted just prior to grid freezing. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Plunged into liquid ethane-propane (FEI VITROBOT MARK III)	分辨率 4.54 Å
5MLU Crystal structure of the PFV GAG CBS bound to a mononucleosome 提交 2016-12-07	构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 20–103（84 aa） 链 F 20–103（84 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；0.05M MnCl2, 0.04M KCl, 0.1M potassium cacodylate pH 6.0, 5% trehalose, 24% MPD	分辨率 2.80 Å R-free 0.252
5NL0 Crystal structure of a 197-bp palindromic 601L nucleosome in complex with linker histone H1 提交 2017-04-03	构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293.15 K；Mix of equal volumes of the nucleosome/H1 complex (25-30 microM) and a crystallization solution composed of MPD (6% v/v), 50 mM NaCl, and 50 mM sodium potassium phosphate pH 6.4.	分辨率 5.40 Å R-free 0.265
5NL0 Crystal structure of a 197-bp palindromic 601L nucleosome in complex with linker histone H1 提交 2017-04-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 L 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293.15 K；Mix of equal volumes of the nucleosome/H1 complex (25-30 microM) and a crystallization solution composed of MPD (6% v/v), 50 mM NaCl, and 50 mM sodium potassium phosphate pH 6.4.	分辨率 5.40 Å R-free 0.265
5O9G Structure of nucleosome-Chd1 complex 提交 2017-06-19	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
5OMX X-ray Structure of the H2A-N38C Nucleosome Core Particle 提交 2017-08-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 33 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；8 mg/ml sample was mixed 1:1 with 10 mM K-Cacodylate (pH 6.0), 140-150 mM MnCl2, 100 KCl. and equilibrated against a 1:4 dilution of the same solution	分辨率 2.32 Å R-free 0.259
5ONG X-Ray crystal structure of a nucleosome core particle with its DNA site-specifically crosslinked to the histone octamer 提交 2017-08-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 20 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；Sample was mixed in a 1:1 ratio with 10 mM Na-cacodylate, pH 6.0, 130-180 mM MnCl2, 100-160 mM KCl and equilibrated against a 1:4 dilution of the same solution	分辨率 2.80 Å R-free 0.247
5ONW X-Ray crystal structure of a nucleosome core particle with its DNA site-specifically crosslinked to the histone octamer and the two H2A/H2B dimers crosslinked via H2A N38C 提交 2017-08-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 20 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；Sample was mixed in a 1:1 ratio with 10 mM Na-cacodylate, pH 6.0, 160-210 mM MnCl2, 140-200 mM KCl and equilibrated against a 1:4 dilution of the same solution	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5OXV Structure of the 4_601_157 tetranucleosome (C2 form) 提交 2017-09-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa） 链 L 2–103（102 aa） 链 P 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；30-60 mM KCl, 90-110 mM MgCl2 and 5 mM Na-cacodylate, pH 6	分辨率 6.72 Å R-free 0.352
5OY7 Structure of the 4_601_157 tetranucleosome (P1 form) 提交 2017-09-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa） 链 J 2–103（102 aa） 链 N 2–103（102 aa） 链 R 2–103（102 aa） 链 V 2–103（102 aa） 链 Z 2–103（102 aa） 链 d 2–103（102 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；30-60 mM KCl, 90-110 mM MgCl2 and 5 mM Na-cacodyalte, pH 6.0	分辨率 5.77 Å R-free 0.238
5X0X Complex of Snf2-Nucleosome complex with Snf2 bound to position +6 of the nucleosome 提交 2017-01-23	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.97 Å
5X0Y Complex of Snf2-Nucleosome complex with Snf2 bound to SHL2 of the nucleosome 提交 2017-01-23	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.69 Å
5XF6 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having an ethylenediamine linker 提交 2017-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 EDN ETHANE-1,2-DIAMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate , pH 6.0	分辨率 2.63 Å R-free 0.254
5Z3L Structure of Snf2-nucleosome complex in apo state 提交 2018-01-08	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.31 Å
5Z3O Structure of Snf2-nucleosome complex in ADP state 提交 2018-01-08	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.62 Å
5Z3U Structure of Snf2-nucleosome complex at shl2 in ADP BeFx state 提交 2018-01-08	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.31 Å
5Z3V Structure of Snf2-nucleosome complex at shl-2 in ADP BeFx state 提交 2018-01-08	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.22 Å
6ESF Nucleosome : Class 1 提交 2017-10-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6ESG Nucleosome breathing : Class 2 提交 2017-10-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.40 Å
6ESH Nucleosome breathing : Class 3 提交 2017-10-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
6ESI Nucleosome breathing : Class 4 提交 2017-10-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.30 Å
6FQ5 Class 1 : canonical nucleosome 提交 2018-02-13	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 19–102（84 aa） 链 F 19–103（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6FQ6 Class 2 : distorted nucleosome 提交 2018-02-13	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 19–103（85 aa） 链 F 19–103（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6FQ8 Class 3 : translocated nucleosome 提交 2018-02-13	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 18–103（86 aa） 链 F 18–103（86 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
6FTX Structure of the chromatin remodelling enzyme Chd1 bound to a ubiquitinylated nucleosome 提交 2018-02-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6G0L Structure of two molecules of the chromatin remodelling enzyme Chd1 bound to a nucleosome 提交 2018-03-19	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
6I84 Structure of transcribing RNA polymerase II-nucleosome complex 提交 2018-11-19	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 O 1–103（103 aa） 链 U 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6IRO the crosslinked complex of ISWI-nucleosome in the ADP-bound state 提交 2018-11-13	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
6IY2 Structure of Snf2-MMTV-A nucleosome complex at shl2 in ADP state 提交 2018-12-12	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 16–103（88 aa） 链 F 16–103（88 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
6IY3 Structure of Snf2-MMTV-A nucleosome complex at shl-2 in ADP state 提交 2018-12-12	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 16–103（88 aa） 链 F 16–103（88 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.67 Å
6J99 Cryo-EM structure of human DOT1L in complex with an H2B-monoubiquitinated nucleosome 提交 2019-01-22	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6JM9 cryo-EM structure of DOT1L bound to unmodified nucleosome 提交 2019-03-07	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 17–103（87 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
6JMA cryo-EM structure of DOT1L bound to H2B ubiquitinated nucleosome 提交 2019-03-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 17–103（87 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.80 Å
6JYL The crosslinked complex of ISWI-nucleosome in the ADP.BeF-bound state 提交 2019-04-26	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot 1.5s	分辨率 3.37 Å
6K1P The complex of ISWI-nucleosome in the ADP.BeF-bound state 提交 2019-05-10	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5；10 mM Tris, 50 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5s	分辨率 3.87 Å
6KIU Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (3.2 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6KIV Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6KIW Cryo-EM structure of human MLL3-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6KIX Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode1 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6KIZ Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode2 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6KW3 The ClassA RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.13 Å
6KW4 The ClassB RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.55 Å
6KW5 The ClassC RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 S 1–103（103 aa） 链 W 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.13 Å
6LTJ Structure of nucleosome-bound human BAF complex 提交 2020-01-22	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6NE3 Cryo-EM structure of singly-bound SNF2h-nucleosome complex with SNF2h bound at SHL-2 提交 2018-12-16	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；2.5 ul of nucleosome-443 SNF2h complexes were applied to a glow discharged Quantifoil holey carbon grid (1.2 um hole size, 400 mesh), blotted in a Vitrobot Mark I (FEI Company) using 6 seconds blotting at 100% humidity, and then plunge-frozen in liquid ethane cooled by liquid nitrogen.	分辨率 3.90 Å
6NJ9 Active state Dot1L bound to the H2B-Ubiquitinated nucleosome, 2-to-1 complex 提交 2019-01-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions were prepared on the day of freezing and filtered though a 0.2 um filter prior to use. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot once for 3.5 seconds before freezing.	分辨率 2.96 Å
6NN6 Structure of Dot1L-H2BK120ub nucleosome complex 提交 2019-01-14	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6NOG Poised-state Dot1L bound to the H2B-Ubiquitinated nucleosome 提交 2019-01-16	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions were prepared on the day of freezing and filtered though a 0.2 um filter prior to use. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot once for 3.5 seconds before freezing	分辨率 3.90 Å
6NQA Active state Dot1L bound to the H2B-Ubiquitinated nucleosome, 1-to-1 complex 提交 2019-01-19	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions were prepared on the day of freezing and filtered though a 0.2 um filter prior to use. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot once for 3.5 seconds before freezing.	分辨率 3.54 Å
6NZO Set2 bound to nucleosome 提交 2019-02-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6O22 Structure of Asf1-H3:H4-Rtt109-Vps75 histone chaperone-lysine acetyltransferase complex with the histone substrate. 提交 2019-02-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	实验方法未声明 NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1 NMR样品组成 70 uM ILV methyl labelled, perdeuterated Vps75 (dimer), 70 uM Rtt109, 70 uM Asf1, 70 uM H3, 70 uM H4, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 70 uM ILV methyl labelled, perdeuterated Vps75 (dimer), 70 uM Rtt109, 70 uM Asf1, 70 uM H3(110A,63C) mutant with a cysteine coupled to a paramagnetic tag, 70 uM H4, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 90 uM ILV methyl labelled, perdeuterated Vps75 (dimer), 90 uM Rtt109, 90 uM Asf1, 90 uM H3(110A,76C) mutant with a cysteine coupled to a paramagnetic tag, 90 uM H4, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 30 uM ILV methyl labelled, perdeuterated Vps75 (dimer), 30 uM Rtt109, 30 uM Asf1, 30 uM H3, 30 uM H4(30C) mutant with a cysteine coupled to a paramagnetic tag, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 70 uM ILV methyl labelled, perdeuterated Vps75 (dimer), 70 uM Rtt109, 70 uM Asf1, 70 uM H3, 70 uM H4(82C) mutant with a cysteine coupled to a paramagnetic tag, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 80 uM ILV methyl labelled, perdeuterated Vps75 (dimer), 80 uM Rtt109, 80 uM Asf1, 80 uM H3, 80 uM H4(45C) mutant with a cysteine coupled to a paramagnetic tag, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 30 uM ILV methyl labelled, perdeuterated Vps75 (dimer), 30 uM Rtt109, 30 uM Asf1, 30 uM H3, 30 uM H4(93C) mutant with a cysteine coupled to a paramagnetic tag, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
6O96 Dot1L bound to the H2BK120 Ubiquitinated nucleosome 提交 2019-03-13	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 PROPANE；blotted for 3s before plunging	分辨率 3.50 Å
6OM3 Crystal structure of the Orc1 BAH domain in complex with a nucleosome core particle 提交 2019-04-18	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277.15 K；6 mM Na-Cacodylate pH 6.0, 0.4 mM Spermine-HCl, 2 mM MgCl2 and 1.75% v/v PEG 400	分辨率 3.30 Å R-free 0.250
6OM3 Crystal structure of the Orc1 BAH domain in complex with a nucleosome core particle 提交 2019-04-18	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 N 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277.15 K；6 mM Na-Cacodylate pH 6.0, 0.4 mM Spermine-HCl, 2 mM MgCl2 and 1.75% v/v PEG 400	分辨率 3.30 Å R-free 0.250
6PA7 The cryo-EM structure of the human DNMT3A2-DNMT3B3 complex bound to nucleosome. 提交 2019-06-11	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 3 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
6PWV Cryo-EM structure of MLL1 core complex bound to the nucleosome 提交 2019-07-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 H 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
6PWW Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5 and WDR5 bound to the nucleosome 提交 2019-07-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 H 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6PWX Cryo-EM structure of RbBP5 bound to the nucleosome 提交 2019-07-23	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 H 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6PX1 Set2 bound to nucleosome 提交 2019-07-24	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
6PX3 Set2 bound to nucleosome 提交 2019-07-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6R1U Structure of LSD2/NPAC-linker/nucleosome core particle complex: Class 2 提交 2019-03-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.36 Å
6RYR Nucleosome-CHD4 complex structure (single CHD4 copy) 提交 2019-06-11	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
6RYU Nucleosome-CHD4 complex structure (two CHD4 copies) 提交 2019-06-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6S01 Structure of LEDGF PWWP domain bound H3K36 methylated nucleosome 提交 2019-06-13	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solution were made from stock solution cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds before plunging	分辨率 3.20 Å
6T9L SAGA DUB module bound to a ubiqitinated nucleosome 提交 2019-10-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solution were made from stock solution cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds before plunging	分辨率 3.60 Å
6TDA Structure of SWI/SNF chromatin remodeler RSC bound to a nucleosome 提交 2019-11-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 15.00 Å
6TEM CENP-A nucleosome core particle with 145 base pairs of the Widom 601 sequence by cryo-EM 提交 2019-11-12	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6UGM Structural basis of COMPASS eCM recognition of an unmodified nucleosome 提交 2019-09-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6UH5 Structural basis of COMPASS eCM recognition of the H2Bub nucleosome 提交 2019-09-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
6UXW SWI/SNF nucleosome complex with ADP-BeFx 提交 2019-11-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 S 2–103（102 aa） 链 W 2–103（102 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 12 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；10 mM HEPES, pH 7.9, 10 mM MgCl2, 50 mM KCl, 1 mM DTT, 5% glycerol, 0.05% NP-40 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.96 Å
6VEN Yeast COMPASS in complex with a ubiquitinated nucleosome 提交 2020-01-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 5 3.5 sec blot time	分辨率 3.37 Å
6VYP Crystal structure of the LSD1/CoREST histone demethylase bound to its nucleosome substrate 提交 2020-02-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；277 K；25 mM HEPES pH7.5, 75 mM triammonium citrate, 10% PEG2000-MME, Modified Microbatch under oil	分辨率 4.99 Å R-free 0.277
6VYP Crystal structure of the LSD1/CoREST histone demethylase bound to its nucleosome substrate 提交 2020-02-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 b 2–103（102 aa） 链 f 2–103（102 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；277 K；25 mM HEPES pH7.5, 75 mM triammonium citrate, 10% PEG2000-MME, Modified Microbatch under oil	分辨率 4.99 Å R-free 0.277
6VZ4 Cryo-EM structure of Sth1-Arp7-Arp9-Rtt102 bound to the nucleosome in ADP Beryllium Fluoride state 提交 2020-02-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4 second blot time, blot force 20	分辨率 3.90 Å
6W5I Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class01) 提交 2020-03-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 H 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
6W5M Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class02) 提交 2020-03-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 H 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
6W5N Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class05) 提交 2020-03-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 H 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.00 Å
6WKR PRC2-AEBP2-JARID2 bound to H2AK119ub1 nucleosome 提交 2020-04-16	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：octadecameric	链 J 1–103（103 aa） 链 Q 1–103（103 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
6WZ5 Bridging of double-strand DNA break activates PARP2/HPF1 to modify chromatin 提交 2020-05-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.20 Å
6WZ9 Bridging of double-strand DNA break activates PARP2/HPF1 to modify chromatin 提交 2020-05-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
6X0N Bridging of double-strand DNA break activates PARP2/HPF1 to modify chromatin 提交 2020-05-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：23-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa） 链 b 2–103（102 aa） 链 f 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
6YN1 Crystal structure of histone chaperone APLF acidic domain bound to the histone H2A-H2B-H3-H4 octamer 提交 2020-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 D 21–103（83 aa） 链 I 21–103（83 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH6.5, 1.0 M tri-sodium citrate	分辨率 2.35 Å R-free 0.233
6YN1 Crystal structure of histone chaperone APLF acidic domain bound to the histone H2A-H2B-H3-H4 octamer 提交 2020-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 N 21–103（83 aa） 链 S 21–103（83 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH6.5, 1.0 M tri-sodium citrate	分辨率 2.35 Å R-free 0.233
6YN1 Crystal structure of histone chaperone APLF acidic domain bound to the histone H2A-H2B-H3-H4 octamer 提交 2020-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 X 21–103（83 aa） 链 c 21–103（83 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH6.5, 1.0 M tri-sodium citrate	分辨率 2.35 Å R-free 0.233
6YN1 Crystal structure of histone chaperone APLF acidic domain bound to the histone H2A-H2B-H3-H4 octamer 提交 2020-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 h 21–103（83 aa） 链 m 21–103（83 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH6.5, 1.0 M tri-sodium citrate	分辨率 2.35 Å R-free 0.233
6Z6P HDAC-PC-Nuc 提交 2020-05-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 21–103（83 aa） 链 F 26–103（78 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.43 Å
6ZHX Cryo-EM structure of the regulatory linker of ALC1 bound to the nucleosome's acidic patch: nucleosome class. 提交 2020-06-24	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 2.5 s, blot force 0. Two sample applications and blots were performed before vitrification.	分辨率 2.50 Å
6ZHY Cryo-EM structure of the regulatory linker of ALC1 bound to the nucleosome's acidic patch: hexasome class. 提交 2020-06-24	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 2.5 s, blot force 0. Two sample applications and blots were performed before vitrification.	分辨率 3.00 Å
7AT8 Histone H3 recognition by nucleosome-bound PRC2 subunit EZH2. 提交 2020-10-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 E 2–103（102 aa） 链 I 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.40 Å
7CRO NSD2 bearing E1099K/T1150A dual mutation in complex with 187-bp NCP 提交 2020-08-14	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane	分辨率 3.75 Å
7CRP NSD3 bearing E1181K/T1232A dual mutation in complex with 187-bp NCP (1:1 binding mode) 提交 2020-08-14	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7CRQ NSD3 bearing E1181K/T1232A dual mutation in complex with 187-bp NCP (2:1 binding mode) 提交 2020-08-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane	分辨率 3.15 Å
7CRR Native NSD3 bound to 187-bp nucleosome 提交 2020-08-14	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane	分辨率 3.48 Å
7E8I Structural insight into BRCA1-BARD1 complex recruitment to damaged chromatin 提交 2021-03-01	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7EG6 Snf5 Finger Helix bound to the nucleosome 提交 2021-03-24	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7EGP The structure of SWI/SNF-nucleosome complex 提交 2021-03-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 P 2–103（102 aa） 链 T 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
7ENN The structure of ALC1 bound to the nucleosome 提交 2021-04-18	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 F 2–103（102 aa） 链 L 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7K6P Active state Dot1 bound to the unacetylated H4 nucleosome 提交 2020-09-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 14–103（90 aa） 链 F 14–103（90 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7K6Q Active state Dot1 bound to the H4K16ac nucleosome 提交 2020-09-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 12–103（92 aa） 链 F 12–103（92 aa）	突变：K17X 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：K17X 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7KBD Nucleosome in interphase chromosome formed in Xenopus egg extract (oligo fraction) 提交 2020-10-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
7KBE Nucleosome isolated from metaphase chromosome formed in Xenopus egg extract (oligo fraction) 提交 2020-10-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7KBF H1.8 bound nucleosome isolated from metaphase chromosome in Xenopus egg extract (oligo fraction) 提交 2020-10-02	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.42 Å
7KTQ Nucleosome from a dimeric PRC2 bound to a nucleosome 提交 2020-11-24	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 25–103（79 aa） 链 F 25–103（79 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7M1X Cryo-EM Structure of Nucleosome containing mouse histone variant H2A.Z 提交 2021-03-15	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4.5 seconds before plunging	分辨率 3.70 Å
7MBM Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode01 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 H 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.76 Å
7MBN Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode02 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 H 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.02 Å
7NKX RNA polymerase II-Spt4/5-nucleosome-Chd1 structure 提交 2021-02-19	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NKY RNA Polymerase II-Spt4/5-nucleosome-FACT structure 提交 2021-02-19	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7OH9 Nucleosome with TBP and TFIIA bound at SHL -6 提交 2021-05-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7OHA nucleosome with TBP and TFIIA bound at SHL +2 提交 2021-05-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7OHB TBP-nucleosome complex 提交 2021-05-10	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7OHC Cryo-EM structure of nucleosome core particle composed of the Widom 601 DNA sequence 提交 2021-05-10	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7OTQ Cryo-EM structure of ALC1/CHD1L bound to a PARylated nucleosome 提交 2021-06-10	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL were applied on grid and immediately blotted for 2.5 s at blot force 0.	分辨率 4.80 Å
7SSA Cryo-EM structure of pioneer factor Cbf1 bound to the nucleosome 提交 2021-11-10	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7SWY 2.6 A structure of a 40-601[TA-rich+1]-40 nucleosome 提交 2021-11-21	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；20 mM HEPES, pH 7.0, 60 mM KCl, 1.5 mM DTT, 1 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7TN2 Composite model of a Chd1-nucleosome complex in the nucleotide-free state derived from 2.3A and 2.7A Cryo-EM maps 提交 2022-01-20	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；20 mM HEPES, pH 7.0, 60 mM KCl, 1.5 mM DTT, 1 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
7UD5 Complex between MLL1-WRAD and an H2B-ubiquitinated nucleosome 提交 2022-03-18	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
7UNC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS complex with rewrapped nucleosome 提交 2022-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7UND Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-nucleosome complex (stalled at +38) 提交 2022-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7UNK Structure of Importin-4 bound to the H3-H4-ASF1 histone-histone chaperone complex 提交 2022-04-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å
7UX9 Arabidopsis DDM1 bound to nucleosome (H2A.W, H2B, H3.3, H4, with 147 bp DNA) 提交 2022-05-05	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 G 1–103（103 aa） 链 H 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 2.5 seconds before plunging.	分辨率 3.20 Å
7VDT The motor-nucleosome module of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7VDV The overall structure of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7X3T Cryo-EM structure of ISW1a-dinucleosome 提交 2022-03-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.40 Å
7X3V Cryo-EM structure of IOC3-N2 nucleosome 提交 2022-03-01	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.09 Å
7X3W Cryo-EM structure of ISW1-N1 nucleosome 提交 2022-03-01	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7X3X Cryo-EM structure of N1 nucleosome-RA 提交 2022-03-01	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7XFC Structure of nucleosome-DI complex (-30I, Apo state) 提交 2022-04-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.90 Å
7XFH Structure of nucleosome-AAG complex (A-30I, post-catalytic state) 提交 2022-04-01	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.90 Å
7XFI Structure of nucleosome-DI complex (-50I, Apo state) 提交 2022-04-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.90 Å
7XFJ Structure of nucleosome-AAG complex (T-50I, post-catalytic state) 提交 2022-04-01	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.00 Å
7XFL Structure of nucleosome-AAG complex (A-53I, free state) 提交 2022-04-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.80 Å
7XFM Structure of nucleosome-AAG complex (A-53I, post-catalytic state) 提交 2022-04-01	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.10 Å
7XFN Structure of nucleosome-DI complex (-55I, Apo state) 提交 2022-04-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.80 Å
7XNP Structure of nucleosome-AAG complex (A-55I, post-catalytic state) 提交 2022-04-29	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.90 Å
7YI1 Cryo-EM structure of Eaf3 CHD bound to H3K36me3 nucleosome 提交 2022-07-14	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7YI4 Cryo-EM structure of Rpd3S complex bound to H3K36me3 nucleosome in close state 提交 2022-07-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 H 2–103（102 aa） 链 L 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.96 Å
7YI5 Cryo-EM structure of Rpd3S complex bound to H3K36me3 nucleosome in loose state 提交 2022-07-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 H 2–103（102 aa） 链 L 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.96 Å
7YRD histone methyltransferase 提交 2022-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7YRG histone methyltransferase 提交 2022-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
7ZS9 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome (complex A) 提交 2022-05-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric	链 b 2–103（102 aa） 链 f 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7ZSA Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP (complex B) 提交 2022-05-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric	链 b 2–103（102 aa） 链 f 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7ZSB Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP, complex C 提交 2022-05-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric	链 b 2–103（102 aa） 链 f 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8A3Y Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex 提交 2022-06-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8B0A Cryo-EM structure of ALC1 bound to an asymmetric, site-specifically PARylated nucleosome 提交 2022-09-07	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	突变：0 突变：0	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8CBN structure of LEDGF/p75 PWWP domain bound to the H3K36 trimethylated dinucleosome 提交 2023-01-25	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
8CBQ structure of LEDGF/p75 PWWP domain bound to the H3K36 trimethylated dinucleosome 提交 2023-01-25	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8CEO Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator and the +1 nucleosome 提交 2023-02-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：54-meric	链 s 2–103（102 aa） 链 w 2–103（102 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8DU4 Complex between RbBP5-WDR5 and an H2B-ubiquitinated nucleosome 提交 2022-07-26	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
8ETT Class1 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 6.68 Å
8ETV Class2 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 3.16 Å
8EU2 Class3 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-18	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 2.93 Å
8F86 SIRT6 bound to an H3K9Ac nucleosome 提交 2022-11-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZSL [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(3aR,5R,6R,6aR)-6-hydroxytetrahydro-2H-furo[2,3-d][1,3]oxathiol-5-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8G57 Structure of nucleosome-bound Sirtuin 6 deacetylase 提交 2023-02-11	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 19–103（85 aa） 链 F 19–103（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；12.5 mM HEPES pH 7.5, 60 mM KCl, 1.5% glycerol, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
8G6G H2BK120ub+H3K79me2-modified nucleosome ubiquitin position 5 提交 2023-02-15	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.93 Å
8G6H H2BK120ub+H3K79me2-modified nucleosome ubiquitin position 6 提交 2023-02-15	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.06 Å
8G6Q H2AK119ub-modified nucleosome ubiquitin position 1 提交 2023-02-15	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.41 Å
8G6S H2AK119ub-modified nucleosome ubiquitin position 2 提交 2023-02-15	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
8G86 Human Oct4 bound to nucleosome with human nMatn1 sequence (focused refinement of nucleosome) 提交 2023-02-17	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
8G88 Human Oct4 bound to nucleosome with human nMatn1 sequence 提交 2023-02-17	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
8G8B Nucleosome with human nMatn1 sequence in complex with Human Oct4 提交 2023-02-17	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8G8G Interaction of H3 tail in LIN28B nucleosome with Oct4 提交 2023-02-17	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8GPN Human menin in complex with H3K79Me2 nucleosome 提交 2022-08-26	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 NB 1–103（103 aa） 链 NF 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 NB 1–103（103 aa） 链 NF 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8KD2 Rpd3S in complex with 187bp nucleosome 提交 2023-08-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 P 2–103（102 aa） 链 T 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8KD3 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification, H3K9Q mutation and 187bp DNA 提交 2023-08-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 P 2–103（102 aa） 链 T 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8KD4 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 187bp DNA, class1 提交 2023-08-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 P 2–103（102 aa） 链 T 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.93 Å
8KD5 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 187bp DNA, class2 提交 2023-08-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 P 2–103（102 aa） 链 T 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8KD6 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 187bp DNA, class3 提交 2023-08-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 P 2–103（102 aa） 链 T 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
8KD7 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 167bp DNA 提交 2023-08-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 P 2–103（102 aa） 链 T 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.09 Å
8OF4 Nucleosome Bound human SIRT6 (Composite) 提交 2023-03-13	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
8PC5 H3K36me3 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex 提交 2023-06-09	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8PC6 H3K36me3 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex - pose 2 提交 2023-06-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
8PEO H3K36me2 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex 提交 2023-06-14	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.69 Å
8PEP H3K36me2 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex - pose 2 提交 2023-06-14	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8RUP Chromosome Passenger Complex (CPC) localization module in complex with H3.T3p-nucleosome 提交 2024-01-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10 mM TRIS-HCl, pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.3% n-octyl-beta-D-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blotting time, -10 force, no wait time.	分辨率 2.42 Å
8RUQ Borealin N-terminus in complex with H3.T3p-nucleosome 提交 2024-01-31	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10 mM TRIS-HCl, pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.3% n-octyl-beta-D-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blotting time, -10 force, no wait time.	分辨率 2.29 Å
8SVF BAP1/ASXL1 bound to the H2AK119Ub Nucleosome 提交 2023-05-16	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8T3T Structure of Bre1-nucleosome complex - state3 提交 2023-06-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.21 Å
8T3W Structure of Bre1-nucleosome complex - state2 提交 2023-06-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8T3Y Structure of Bre1-nucleosome complex - state1 提交 2023-06-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES, pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
8T9G Automethylated PRC2 dimer bound to nucleosome 提交 2023-06-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 J 1–103（103 aa） 链 X 1–103（103 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
8TAS PRC2 monomer bound to nucleosome 提交 2023-06-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 J 1–103（103 aa） 链 X 1–103（103 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8TB9 PRC2-J119-450 monomer bound to H1-nucleosome 提交 2023-06-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 J 1–103（103 aa） 链 X 1–103（103 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8UXQ Structure of Heterochromatin Protein 1 (HP1) alpha in complex with an H2A.Z nucleosome 提交 2023-11-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 F 2–103（102 aa） 链 L 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.30 Å
8V4Y Cryo-EM structure of singly-bound SNF2h-nucleosome complex with SNF2h at inactive SHL2 (conformation 1) 提交 2023-11-29	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；12.5 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 60 mM KCl, 5 mM MgCl2, 2 mM ADP, 2 mM BeSO4, 10 mM NaF, 1.5% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8V6V Cryo-EM structure of doubly-bound SNF2h-nucleosome complex 提交 2023-12-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；12.5 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 60 mM KCl, 5 mM MgCl2, 2 mM ADP, 2 mM BeSO4, 10 mM NaF, 1.5% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8V7L Cryo-EM structure of singly-bound SNF2h-nucleosome complex with SNF2h at inactive SHL2 (conformation 2) 提交 2023-12-04	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；12.5 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 60 mM KCl, 5 mM MgCl2, 2 mM ADP, 2 mM BeSO4, 10 mM NaF, 1.5% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8VX5 Nucleosome core particle containing an 8-oxoG damage site 提交 2024-02-03	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8VX6 Human OGG1 bound at the nucleosomal DNA entry site 提交 2024-02-03	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8XJV Structural basis for the linker histone H5-nucleosome binding and chromatin compaction 提交 2023-12-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 108 PDB 声明：110-meric	链 0 1–103（103 aa） 链 1 1–103（103 aa） 链 2 1–103（103 aa） 链 3 1–103（103 aa） 链 4 1–103（103 aa） 链 5 1–103（103 aa） 链 6 1–103（103 aa） 链 7 1–103（103 aa） 链 8 1–103（103 aa） 链 9 1–103（103 aa） 链 CD 1–103（103 aa） 链 a2 1–103（103 aa） 链 a3 1–103（103 aa） 链 a4 1–103（103 aa） 链 a5 1–103（103 aa） 链 a6 1–103（103 aa） 链 a7 1–103（103 aa） 链 a8 1–103（103 aa） 链 a9 1–103（103 aa） 链 v 1–103（103 aa） 链 w 1–103（103 aa） 链 x 1–103（103 aa） 链 y 1–103（103 aa） 链 z 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.60 Å
9B2S Haspin bound to nucleosome in position 1 提交 2024-03-16	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.01 Å
9B2T Haspin bound to nucleosome in position 2 提交 2024-03-16	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.99 Å
9B3P The cryo-EM structure of the H2A.Z-H3.3 double-variant nucleosome 提交 2024-03-19	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Tris-HCl, 5mM NaCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Freezing condition: blot force 0, blot time 4.5 second	分辨率 3.00 Å
9C9G S.c INO80 in complex with S.c 0/80 nucleosome 提交 2024-06-13	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 2.91 Å
9C9S S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 1 提交 2024-06-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 3.09 Å
9C9T S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 2 提交 2024-06-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 3.16 Å
9C9X S.c INO80 in complex with Xenopus 0/80 nucleosome, Nucleosome 提交 2024-06-16	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 2.83 Å
9CA7 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the fully-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 V 2–103（102 aa） 链 X 2–103（102 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
9CA8 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the partially-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 V 2–103（102 aa） 链 X 2–103（102 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.92 Å
9CAA Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the pre-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 V 2–103（102 aa） 链 X 2–103（102 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.04 Å
9CAB Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the encounter state (composite structure) 提交 2024-06-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 V 2–103（102 aa） 链 X 2–103（102 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.94 Å
9CAU DeltaArp8 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Nucleosome 提交 2024-06-17	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 4.18 Å
9CB7 DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Ino80-Nucleosome 提交 2024-06-18	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 4.04 Å
9CG9 Cryo-EM structure of an HMGB1 box bound to nucleosome at SHL-2 提交 2024-06-28	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample was applied to grid.	分辨率 2.94 Å
9DBY ncPRC1RYBP bound to singly modified H2AK119Ub nucleosome 提交 2024-08-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9DDE ncPRC1RYBP bound to H2AK119Ub/H1.4 chromatosome 提交 2024-08-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9DG3 ncPRC1RYBP Delta-linker mutant bound to singly modified H2AK119Ub nucleosome 提交 2024-09-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.46 Å
9DGG ncPRC1RYBP bound to unmodified nucleosome 提交 2024-09-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
9E1L Snf2h bound nucleosome complex - ClassA1 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
9E1M Snf2h bound nucleosome complex - ClassA2 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
9E1N Snf2h bound nucleosome complex-ClassA3 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9E1O Snf2h bound nucleosome complex - ClassB1 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9E1P Snf2h bound nucleosome complex - ClassB2 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
9E1Q Snf2h bound nucleosome complex - ClassB3 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9E1R Snf2h bound nucleosome complex - ClassB4 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9E1U Snf2h bound nucleosome complex - ClassC1 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9E1V Snf2h bound nucleosome complex - ClassC2 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9E1W Snf2h bound nucleosome complex - ClassC3 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9E1X Snf2h bound nucleosome complex - ClassD1 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9E1Y Empty Nucleosome with 601 widom sequence 提交 2024-10-21	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9EAR CHD1-nucleosome complex (closed state) 提交 2024-11-11	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 18–103（86 aa） 链 F 18–103（86 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9EGX RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-hexasome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGY RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGZ RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EH0 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 30 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9EH1 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 20 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 b 25–102（78 aa） 链 f 25–102（78 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9EH2 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-FACT nucleosome upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9EIL SIRT6 bound to an H3K27Ac nucleosome 提交 2024-11-26	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZSL [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(3aR,5R,6R,6aR)-6-hydroxytetrahydro-2H-furo[2,3-d][1,3]oxathiol-5-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9F0O The molecular basis and modulation of lamin-specific chromatin interaction 提交 2024-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 21–103（83 aa） 链 F 21–103（83 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
9GD0 Structure of a hexasome-nucleosome complex with a dyad-to-dyad distance of 103 bp. 提交 2024-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9GD1 Structure of Chd1 bound to a hexasome-nucleosome complex with a dyad-to-dyad distance of 103 bp. 提交 2024-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
9GD2 Structure of Chd1 bound to a dinucleosome with a dyad-to-dyad distance of 103 bp. 提交 2024-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9GD3 Structure of a mononucleosome bound by one copy of Chd1 with the DBD on the exit-side DNA. 提交 2024-08-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9GEN Recombinant Myeloperoxidase bound to nucleosome core particle 提交 2024-08-07	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 17–103（87 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.76 Å
9GEO Nucleosome core particle 提交 2024-08-07	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 17–103（87 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.79 Å
9GEP Native monomeric Myeloperoxidase bound to nucleosome core particle 提交 2024-08-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 17–103（87 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.89 Å
9GEQ Native dimeric Myeloperoxidase bound to nucleosome core particle; composite map 提交 2024-08-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 17–103（87 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
9GER Native dimeric Myeloperoxidase bound to nucleosome core particle, intermediate state; composite map 提交 2024-08-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 17–103（87 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.58 Å
9IGJ structure of two human ELF2 transcription factors in complex with a nucleosome 提交 2025-02-19	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；1 mM EDTA, 30 mM NaCl, 2 mM DTT in 20 mM HEPES, pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9IHD Nucleosome core particle bound by one molecule of DTT-reduced native monomeric myeloperoxidase 提交 2025-02-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 17–103（87 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å
9IHE Nucleosome core particle bound by two molecules of DTT-reduced native monomeric myeloperoxidase 提交 2025-02-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 17–103（87 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
9IHF Nucleosome core particle bound by one monomer and one dimer of of DTT-reduced native myeloperoxidase 提交 2025-02-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 B 17–103（87 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
9JAO The structure of SMARCAD1 bound to the hexasome in the presence of ADP-BeFx 提交 2024-08-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9LJ2 Structure of isw1-nucleosome double-bound complex in ADP-ADP+ state 提交 2025-01-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 16–103（88 aa） 链 F 16–103（88 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
9M76 UHRF1 bound to a mononucleosome in its pre-active state, with the RING domain bound to the SRA domain. 提交 2025-03-09	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9M77 The activated state of human UHRF1 bound to a mononucleosome, with the finger loop ordered and linker 4 disordered. 提交 2025-03-09	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9MPP The cryo-EM structure of nucleosome-bound DNA methyltransferases DNMT3A2 and DNMT3L 提交 2024-12-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9N6I 2.61 A S.cerevisiae Chd1[L886G/L889G/L891G]-nucleosome 2:1 complex 提交 2025-02-05	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 16–103（88 aa） 链 F 16–103（88 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.61 Å
9N6K 2.88 A S.cerevisiae Chd1[L886G/L889G/L891G]-nucleosome 2:1 complex with DNA-binding domain 提交 2025-02-05	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 16–103（88 aa） 链 F 16–103（88 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9NH8 CHD1-nucleosome complex (anchored state) 提交 2025-02-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ARG ARGININE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9NY4 USP21 bound to H2AK119ub nucleosome 提交 2025-03-26	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
9Q7U Composite map for Cryo-EM structure of DNMT3A2-DNMT3B3 tetramer bound to 167H3K36me2-nucleosome 提交 2025-08-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9QAJ Structure of the nucleosome-bound human BCL7A 提交 2025-02-28	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
9R5K Structural characterisation of chromatin remodelling intermediates supports linker DNA dependent product inhibition as a mechanism for nucleosome spacing. 提交 2025-05-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Hepes, 120mM Nacl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrified carried out in climate chamber with 100% humidity	分辨率 4.20 Å
9R5S Structural characterisation of chromatin remodelling intermediates supports linker DNA dependent product inhibition as a mechanism for nucleosome spacing. 提交 2025-05-09	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Hepes, 120mM Nacl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrified carried out in climate chamber with 100% humidity	分辨率 3.80 Å
9R5W Structural characterisation of chromatin remodelling intermediates supports linker DNA dependent product inhibition as a mechanism for nucleosome spacing. 提交 2025-05-10	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Hepes, 120mM Nacl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrified carried out in climate chamber with 100% humidity	分辨率 3.80 Å
9SI3 Chromosomal Passenger Complex in complex with H3T3ph Nucleosome 提交 2025-08-28	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.83 Å
9SI9 Chromosomal Passenger Complex in complex with H3T3ph Nucleosome (Class0) 提交 2025-08-28	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.86 Å
9SJ5 Chromosomal Passenger Complex in complex with H3T3ph Nucleosome (Class1) 提交 2025-08-29	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
9SLJ Chromosomal Passenger Complex in complex with H3T3ph Nucleosome (Double Occupancy) 提交 2025-09-04	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9T4V ALC1/CHD1L in an intermediate conformation, bound to a PARylated nucleosome 提交 2025-11-02	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL were applied on grid and immediately blotted for 2.5 s at blot force 0.	分辨率 6.60 Å
9UX9 local ATPase-NCP structure of the ncBAF-nucleosome complex in the ADP-BeFx-bound state 提交 2025-05-13	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
9UXA local ARP-NCP structure of the ncBAF-nucleosome complex in the apo state 提交 2025-05-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
9V2V Cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3L in complex with mono-nucleosome 提交 2025-05-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 R 23–101（79 aa） 链 V 23–101（79 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9V2W Cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3L in complex with di-nucleosome 提交 2025-05-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 L 23–101（79 aa） 链 R 23–101（79 aa） 链 V 23–101（79 aa） 链 Z 23–101（79 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9V33 Calypso/Asx/NCP-ub complex 提交 2025-05-21	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 5.90 Å
9V9Q Cryo-EM structure of the cPRC1-UbcH5c E3-E2 complex bound to the H2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å
9V9R Cryo-EM structure of the ncPRC1.1-UbcH5c E3-E2 complex bound to the H2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.20 Å
9V9S Cryo-EM structure of the ncPRC1.1 complex bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.80 Å
9V9T Cryo-EM structure of the ncPRC1.6 complex bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å
9V9U Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing two RNF2-BMI1 bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.70 Å
9V9V Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RNF2-BMI1 and one RYBP bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.80 Å
9V9W Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing two RYBP bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
9V9X Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RNF2-BMI1 bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.30 Å
9V9Y Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RNF2-BMI1 and one RYBP bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.20 Å
9V9Z Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RYBP bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
9W74 Cryo-EM structure of the close-packed di-hexasome (CPDH) 提交 2025-08-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.94 Å
9WBZ The structure of NCP-motor-ARP module of ncBAF-nucleosome complex 提交 2025-08-15	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9WC0 The structure of NCP-RA module of ncBAF-nucleosome complex 提交 2025-08-15	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9XYC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-ELOF1-LEDGF-nucleosome LEDGF+nucleosome map Q 提交 2025-08-25	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9Y4P Cryo-EM structure of DNMT3A2/3B3 in complex with H3K36me2 di-nucleosome with eight base pair linker 提交 2025-09-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa） 链 X 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 18 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.84 Å

共 354 个其他 PDB 条目、370 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H4_XENLA
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–88； UniProt 16–103 作者链 F； PDB构建体 1–88； UniProt 16–103

Histone H2A

Xenopus laevis

UniProt Q6AZJ8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 9 DNA 2 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物数一致	链 C； UniProt 11–120 链 G； UniProt 11–120	未记录	DNA Tracking Strand × 1 DNA Lagging Strand × 1 Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2B 1.1 × 2 （P02281） Chromo domain-containing protein 1 × 1 （P32657） Histone H3 × 2 （A0A310TTQ1）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.54 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9N6H	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1S32 Molecular Recognition of the Nucleosomal 'Supergroove' 提交 2004-01-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–120（119 aa） 链 G 2–120（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14 IMT 4-AMINO-(1-METHYLIMIDAZOLE)-2-CARBOXYLIC ACID × 4 PYB 4-AMINO-(1-METHYLPYRROLE)-2-CARBOXYLIC ACID × 12 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 BAL BETA-ALANINE × 2 DIB 3-AMINO-(DIMETHYLPROPYLAMINE) × 2 OGG 2-(2-CARBAMOYLMETHOXY-ETHOXY)-ACETAMIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；Manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.05 Å R-free 0.243
21VV Cryo-EM structure of ncBAF bound to the nucleosome 提交 2025-12-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8.0, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.5 mM ADP, 8 mM NaF, 1 mM BeSO4. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
21WA Cryo-EM structure of the ATPase domain of SMARCA4 bound to a nucleosome 提交 2025-12-31	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8.0, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.5 mM ADP, 8 mM NaF, 1 mM BeSO4. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
21WC Cryo-EM structure of the ATPase domain of SMARCA4 and the finger helix of BCL7A bound to a nucleosome 提交 2025-12-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8.0, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.5 mM ADP, 8 mM NaF, 1 mM BeSO4. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
2NZD Nucleosome core particle containing 145 bp of DNA 提交 2006-11-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–120（119 aa） 链 G 2–120（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；85 mM MnCl2, 60 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate, 4 mg/ml NCP over well with 1/2 conc., pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.65 Å R-free 0.283
3B6F Nucleosome core particle treated with cisplatin 提交 2007-10-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；MnCl2, KCl, K-Cacodylate, pH 6.0, vapor diffusion, temperature 291K	分辨率 3.45 Å R-free 0.402
3B6G Nucleosome core particle treated with oxaliplatin 提交 2007-10-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；MnCl2, KCl, K-Cacodylate, pH 6.0, vapor diffusion, temperature 291K	分辨率 3.45 Å R-free 0.435
3KUY DNA Stretching in the Nucleosome Facilitates Alkylation by an Intercalating Antitumor Agent 提交 2009-11-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–120（119 aa） 链 G 2–120（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1 ATV 2-[(2R)-oxiran-2-ylmethyl]-1H-benzo[de]isoquinoline-1,3(2H)-dione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6；291 K；85 mM MnCl2, 60 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate, 4 mg/ml NCP over well with 1/2 conc., pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, EVAPORATION	分辨率 2.90 Å R-free 0.286
3KWQ Structural characterization of H3K56Q nucleosomes and nucleosomal arrays 提交 2009-12-01	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 15–121（107 aa） 片段：UNP residues 15-121 链 G 15–121（107 aa） 片段：UNP residues 15-121	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.50 Å R-free 0.315
3KXB Structural characterization of H3K56Q nucleosomes and nucleosomal arrays 提交 2009-12-02	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；Crystals were grown by vapor diffusion in 8 20 days at 20 C using a droplet containing 4.0 mg ml−1 core particle 50 mM KCl, 70 75 mM MnCl , and 20 mM potassium cacodylate, pH 6.0, surrounded by silicon oil DC200 (110mPa s; Fluka) and equilibrated against 40 46 mM MnCl2, 35 40 mM KCl and 20 mM potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.292
3LEL Structural Insight into the Sequence-Dependence of Nucleosome Positioning 提交 2010-01-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 20mM K-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.95 Å R-free 0.300
3LEL Structural Insight into the Sequence-Dependence of Nucleosome Positioning 提交 2010-01-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 M 2–130（129 aa） 链 Q 2–130（129 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 19	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 20mM K-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.95 Å R-free 0.300
3LJA Using Soft X-Rays for a Detailed Picture of Divalent Metal Binding in the Nucleosome 提交 2010-01-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 45	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；85 mM MnCl2, 60 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate, 4 mg/ml NCP over well with 1/2 conc., pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, EVAPORATION	分辨率 2.75 Å R-free 0.259
3LZ0 Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Composed of the Widom 601 DNA Sequence (orientation 1) 提交 2010-03-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–120（119 aa） 片段：residues 2-120 链 G 2–120（119 aa） 片段：residues 2-120	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；K cacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.318
3LZ1 Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Composed of the Widom 601 DNA Sequence (orientation 2) 提交 2010-03-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–120（119 aa） 片段：residues 2-120 链 G 2–120（119 aa） 片段：residues 2-120	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；Kcacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.319
3MGP Binding of Cobalt ions to the Nucleosome Core Particle 提交 2010-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–120（119 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-120 链 G 2–120（119 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-120	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 CO COBALT (II) ION × 43	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 40mM K-cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.44 Å R-free 0.282
3MGQ Binding of Nickel ions to the Nucleosome Core Particle 提交 2010-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–120（119 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-120 链 G 2–120（119 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-120	未记录	NI NICKEL (II) ION × 47 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 40mM K-cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.65 Å R-free 0.276
3MGR Binding of Rubidium ions to the Nucleosome Core Particle 提交 2010-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–120（119 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-120 链 G 2–120（119 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-120	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 RB RUBIDIUM ION × 5 MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 40mM K-cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.30 Å R-free 0.267
3MGS Binding of Cesium ions to the Nucleosome Core particle 提交 2010-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–120（119 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-120 链 G 2–120（119 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-120	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 CS CESIUM ION × 12 MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 40mM K-cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 3.15 Å R-free 0.238
3MNN A Ruthenium Antitumour Agent Forms Specific Histone Protein Adducts in the Nucleosome Core 提交 2010-04-22	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–120（119 aa） 链 G 2–120（119 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 RU RUTHENIUM ION × 3 MML 1-methyl-4-(1-methylethyl)benzene × 3 PTW 1,3,5-triaza-7-phosphatricyclo[3.3.1.1~3,7~]decane × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；55mM KCl, 85mM MnCl2, 20mM K-Cacodylate, pH 6, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.277
3MVD Crystal structure of the chromatin factor RCC1 in complex with the nucleosome core particle 提交 2010-05-04	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；294 K；25 mM sodium acetate buffer, 25 mM sodium citrate, 1 mM DTT, 6 % PEG2000-MME, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 2.90 Å R-free 0.215
3TU4 Crystal structure of the Sir3 BAH domain in complex with a nucleosome core particle. 提交 2011-09-15	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.241
3TU4 Crystal structure of the Sir3 BAH domain in complex with a nucleosome core particle. 提交 2011-09-15	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.241
3UT9 Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Assembled with a Palindromic Widom '601' Derivative (NCP-601L) 提交 2011-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 29 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；K-cacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, temperature 291K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.20 Å R-free 0.289
3UTA Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Assembled with an Alpha-Satellite Sequence Containing Two TTAAA elements (NCP-TA2) 提交 2011-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 17	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；K-cacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, temperature 291K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.07 Å R-free 0.266
3UTB Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Assembled with the 146b Alpha-Satellite Sequence (NCP146b) 提交 2011-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 21 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；K-cacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, temperature 291K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.20 Å R-free 0.275
4J8V X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-phenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 C 2–130（129 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.58 Å R-free 0.273
4J8V X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-phenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 G 2–130（129 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.58 Å R-free 0.273
4J8V X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-phenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.58 Å R-free 0.273
4J8W X-ray structure of NCP145 with chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)osmium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 1MK chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)osmium(II) × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.41 Å R-free 0.275
4J8X X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 C 2–130（129 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.280
4J8X X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 G 2–130（129 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.280
4J8X X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.280
4KGC Nucleosome Core Particle Containing (ETA6-P-CYMENE)-(1, 2-ETHYLENEDIAMINE)-RUTHENIUM 提交 2013-04-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	HRU (ethane-1,2-diamine-kappa~2~N,N')[(1,2,3,4,5,6-eta)-1-methyl-4-(propan-2-yl)cyclohexane-1,2,3,4,5,6-hexayl]ruthenium × 4 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.69 Å R-free 0.282
4KHA Structural basis of histone H2A-H2B recognition by the essential chaperone FACT 提交 2013-04-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 15–103（89 aa） 片段：UNP residues 15-103	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；manual setup 1ul protein (15 mg / ml) plus 1 ul crystallization buffer (7.25% [vol/vol] PEG8000, 0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris pH 7.8), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.35 Å R-free 0.229
4LD9 Crystal structure of the N-terminally acetylated BAH domain of Sir3 bound to the nucleosome core particle 提交 2013-06-24	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293.15 K；50 mM MES pH 6.5, 12% PEG 400, 12 mM MnCl2, 100 mM NaCl, 10 mM EDTA, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.15K	分辨率 3.31 Å R-free 0.295
4R8P Crystal structure of the Ring1B/Bmi1/UbcH5c PRC1 ubiquitylation module bound to the nucleosome core particle 提交 2014-09-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Modified micro batch under oil；pH 7.5；294 K；25 mM HEPES pH 7.5, 80 mM NH4NO3, 3 % PEG2000-MME, Modified micro batch under oil, temperature 294K	分辨率 3.28 Å R-free 0.245
4XUJ Nucleosome core particle containing adducts from treatment with a thiomorpholine-substituted [(eta-6-p-cymene)Ru(3-hydroxy-2-pyridone)Cl] compound 提交 2015-01-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 片段：UNP residues 2-126 链 G 2–130（129 aa） 片段：UNP residues 2-126	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 4A6 [(1,2,3,4,5,6-eta)-1-methyl-4-(propan-2-yl)benzene]ruthenium × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40mM MnCl2, 30mM KCl, 20mM K-Cacodylate	分辨率 3.18 Å R-free 0.299
4XZQ Nucleosome disassembly by RSC and SWI/SNF is enhanced by H3 acetylation near the nucleosome dyad axis 提交 2015-02-04	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 15–121（107 aa） 片段：residues 15-121 链 G 15–121（107 aa） 片段：residues 15-121	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292.15 K；potassium chloride, potassium cacodylate, manganese chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.299
4YS3 Nucleosome disassembly by RSC and SWI/SNF is enhanced by H3 acetylation near the nucleosome dyad axis 提交 2015-03-16	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 15–121（107 aa） 片段：residues 15-121 链 G 15–121（107 aa） 片段：residues 15-121	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；292.15 K；postassium chloride, manganese chloride, cacodylate	分辨率 3.00 Å R-free 0.279
4Z66 Nucleosome disassembly by RSC and SWI/SNF is enhanced by H3 acetylation near the nucleosome dyad axis 提交 2015-04-03	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 15–121（107 aa） 链 G 15–121（107 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292.15 K；potassium chloride, potassium cacodylate, manganese chloride	分辨率 2.50 Å R-free 0.296
5CP6 Nucleosome Core Particle with Adducts from the Anticancer Compound, [(eta6-5,8,9,10-tetrahydroanthracene)Ru(ethylenediamine)Cl][PF6] 提交 2015-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	RUH (ethane6-5,8,9,10-tetrahydroanthracene)Ru(II)(ethylene-diamine)Cl × 3 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.60 Å R-free 0.251
5DNM Nucleosome core particle containing adducts of ruthenium(II)-toluene PTA complex 提交 2015-09-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 RAX dichloro[(1,2,3,4,5,6-eta)-6-methylbenzene]1,3,5-triaza-7lambda~5~-phosphatricyclo[3.3.1.1~3,7~]dec-7-ylruthenium × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate	分辨率 2.81 Å R-free 0.241
5DNN Nucleosome core particle containing adducts of gold(I)-triethylphosphane and ruthenium(II)-toluene PTA complexes 提交 2015-09-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	AUF triethylphosphanuidylgold(1+) × 2 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 RAX dichloro[(1,2,3,4,5,6-eta)-6-methylbenzene]1,3,5-triaza-7lambda~5~-phosphatricyclo[3.3.1.1~3,7~]dec-7-ylruthenium × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate	分辨率 2.80 Å R-free 0.236
5E5A Crystal structure of the chromatin-tethering domain of Human cytomegalovirus IE1 protein bound to the nucleosome core particle 提交 2015-10-08	构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；289 K；sodium cacodylate, magnesium acetate, 2-methyl-2,4-pentanediol	分辨率 2.81 Å R-free 0.242
5HQ2 Structural model of Set8 histone H4 Lys20 methyltransferase bound to nucleosome core particle 提交 2016-01-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric	链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 5.5；277 K；25 mM sodium acetate pH 5.5, 40 mM sodium citrate,1 mM DTT, 6% PEG2000-MME	分辨率 4.50 Å R-free 0.397
5O9G Structure of nucleosome-Chd1 complex 提交 2017-06-19	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
5OMX X-ray Structure of the H2A-N38C Nucleosome Core Particle 提交 2017-08-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	突变：N38C 突变：N38C	MN MANGANESE (II) ION × 33 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；8 mg/ml sample was mixed 1:1 with 10 mM K-Cacodylate (pH 6.0), 140-150 mM MnCl2, 100 KCl. and equilibrated against a 1:4 dilution of the same solution	分辨率 2.32 Å R-free 0.259
5ONG X-Ray crystal structure of a nucleosome core particle with its DNA site-specifically crosslinked to the histone octamer 提交 2017-08-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 20 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；Sample was mixed in a 1:1 ratio with 10 mM Na-cacodylate, pH 6.0, 130-180 mM MnCl2, 100-160 mM KCl and equilibrated against a 1:4 dilution of the same solution	分辨率 2.80 Å R-free 0.247
5ONW X-Ray crystal structure of a nucleosome core particle with its DNA site-specifically crosslinked to the histone octamer and the two H2A/H2B dimers crosslinked via H2A N38C 提交 2017-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	突变：N38C 突变：N38C	MN MANGANESE (II) ION × 20 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；Sample was mixed in a 1:1 ratio with 10 mM Na-cacodylate, pH 6.0, 160-210 mM MnCl2, 140-200 mM KCl and equilibrated against a 1:4 dilution of the same solution	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5OXV Structure of the 4_601_157 tetranucleosome (C2 form) 提交 2017-09-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；30-60 mM KCl, 90-110 mM MgCl2 and 5 mM Na-cacodylate, pH 6	分辨率 6.72 Å R-free 0.352
5OY7 Structure of the 4_601_157 tetranucleosome (P1 form) 提交 2017-09-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 K 1–130（130 aa） 链 O 1–130（130 aa） 链 S 1–130（130 aa） 链 W 1–130（130 aa） 链 a 1–130（130 aa） 链 e 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；30-60 mM KCl, 90-110 mM MgCl2 and 5 mM Na-cacodyalte, pH 6.0	分辨率 5.77 Å R-free 0.238
5X0X Complex of Snf2-Nucleosome complex with Snf2 bound to position +6 of the nucleosome 提交 2017-01-23	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.97 Å
5X0Y Complex of Snf2-Nucleosome complex with Snf2 bound to SHL2 of the nucleosome 提交 2017-01-23	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.69 Å
5XF6 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having an ethylenediamine linker 提交 2017-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 EDN ETHANE-1,2-DIAMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate , pH 6.0	分辨率 2.63 Å R-free 0.254
5Z3L Structure of Snf2-nucleosome complex in apo state 提交 2018-01-08	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.31 Å
5Z3O Structure of Snf2-nucleosome complex in ADP state 提交 2018-01-08	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.62 Å
5Z3U Structure of Snf2-nucleosome complex at shl2 in ADP BeFx state 提交 2018-01-08	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.31 Å
5Z3V Structure of Snf2-nucleosome complex at shl-2 in ADP BeFx state 提交 2018-01-08	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.22 Å
6ESF Nucleosome : Class 1 提交 2017-10-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6ESG Nucleosome breathing : Class 2 提交 2017-10-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.40 Å
6ESH Nucleosome breathing : Class 3 提交 2017-10-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
6ESI Nucleosome breathing : Class 4 提交 2017-10-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.30 Å
6FQ5 Class 1 : canonical nucleosome 提交 2018-02-13	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 10–119（110 aa） 链 G 10–119（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6FQ6 Class 2 : distorted nucleosome 提交 2018-02-13	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 10–119（110 aa） 链 G 10–119（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6FQ8 Class 3 : translocated nucleosome 提交 2018-02-13	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 10–119（110 aa） 链 G 10–119（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
6IRO the crosslinked complex of ISWI-nucleosome in the ADP-bound state 提交 2018-11-13	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
6IY2 Structure of Snf2-MMTV-A nucleosome complex at shl2 in ADP state 提交 2018-12-12	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 10–122（113 aa） 链 G 10–122（113 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
6IY3 Structure of Snf2-MMTV-A nucleosome complex at shl-2 in ADP state 提交 2018-12-12	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 10–122（113 aa） 链 G 10–122（113 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.67 Å
6J99 Cryo-EM structure of human DOT1L in complex with an H2B-monoubiquitinated nucleosome 提交 2019-01-22	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6JM9 cryo-EM structure of DOT1L bound to unmodified nucleosome 提交 2019-03-07	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 15–121（107 aa） 链 G 15–121（107 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
6JMA cryo-EM structure of DOT1L bound to H2B ubiquitinated nucleosome 提交 2019-03-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 15–130（116 aa） 链 G 15–130（116 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.80 Å
6JYL The crosslinked complex of ISWI-nucleosome in the ADP.BeF-bound state 提交 2019-04-26	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot 1.5s	分辨率 3.37 Å
6K01 Crystal structure of xH2A-H2B 提交 2019-05-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 15–106（92 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M HEPES pH=7.5, 25% PEG 3350	分辨率 2.84 Å R-free 0.278
6K1P The complex of ISWI-nucleosome in the ADP.BeF-bound state 提交 2019-05-10	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5；10 mM Tris, 50 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5s	分辨率 3.87 Å
6KIU Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (3.2 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6KIV Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6KIW Cryo-EM structure of human MLL3-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6KIX Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode1 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6KIZ Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode2 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6KW3 The ClassA RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 O 1–130（130 aa） 链 S 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.13 Å
6KW4 The ClassB RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 O 1–130（130 aa） 链 S 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.55 Å
6KW5 The ClassC RSC-Nucleosome Complex 提交 2019-09-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 O 1–130（130 aa） 链 T 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.13 Å
6N1Z Importin-9 bound to H2A-H2B 提交 2018-11-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–130（130 aa） 片段：HISTONE H2A	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.04 M MES, 0.11 M potassium acetate, 2 mM magnesium acetate, 2 mM DTT, 3.0 M potassium formate, 25% glycerol	分辨率 2.70 Å R-free 0.238
6N1Z Importin-9 bound to H2A-H2B 提交 2018-11-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–130（130 aa） 片段：HISTONE H2A	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.04 M MES, 0.11 M potassium acetate, 2 mM magnesium acetate, 2 mM DTT, 3.0 M potassium formate, 25% glycerol	分辨率 2.70 Å R-free 0.238
6NZO Set2 bound to nucleosome 提交 2019-02-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 18–130（113 aa） 链 G 18–130（113 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6O96 Dot1L bound to the H2BK120 Ubiquitinated nucleosome 提交 2019-03-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：G99R, A123S 突变：G99R, A123S	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 PROPANE；blotted for 3s before plunging	分辨率 3.50 Å
6OM3 Crystal structure of the Orc1 BAH domain in complex with a nucleosome core particle 提交 2019-04-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：G99R, S123A 突变：G99R, S123A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277.15 K；6 mM Na-Cacodylate pH 6.0, 0.4 mM Spermine-HCl, 2 mM MgCl2 and 1.75% v/v PEG 400	分辨率 3.30 Å R-free 0.250
6OM3 Crystal structure of the Orc1 BAH domain in complex with a nucleosome core particle 提交 2019-04-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 O 1–130（130 aa） 链 S 1–130（130 aa）	突变：G99R, S123A 突变：G99R, S123A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277.15 K；6 mM Na-Cacodylate pH 6.0, 0.4 mM Spermine-HCl, 2 mM MgCl2 and 1.75% v/v PEG 400	分辨率 3.30 Å R-free 0.250
6PX1 Set2 bound to nucleosome 提交 2019-07-24	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 18–130（113 aa） 链 G 18–130（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
6PX3 Set2 bound to nucleosome 提交 2019-07-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 18–130（113 aa） 链 G 18–130（113 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6R1T Structure of LSD2/NPAC-linker/nucleosome core particle complex: Class 1, free nuclesome 提交 2019-03-15	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 11–121（111 aa） 链 G 11–121（111 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.02 Å
6R1U Structure of LSD2/NPAC-linker/nucleosome core particle complex: Class 2 提交 2019-03-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.36 Å
6R25 Structure of LSD2/NPAC-linker/nucleosome core particle complex: Class 3 提交 2019-03-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.61 Å
6S01 Structure of LEDGF PWWP domain bound H3K36 methylated nucleosome 提交 2019-06-13	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solution were made from stock solution cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds before plunging	分辨率 3.20 Å
6T9L SAGA DUB module bound to a ubiqitinated nucleosome 提交 2019-10-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solution were made from stock solution cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds before plunging	分辨率 3.60 Å
6TDA Structure of SWI/SNF chromatin remodeler RSC bound to a nucleosome 提交 2019-11-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 15.00 Å
6TEM CENP-A nucleosome core particle with 145 base pairs of the Widom 601 sequence by cryo-EM 提交 2019-11-12	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6UGM Structural basis of COMPASS eCM recognition of an unmodified nucleosome 提交 2019-09-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 C 13–119（107 aa） 链 G 13–119（107 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6UH5 Structural basis of COMPASS eCM recognition of the H2Bub nucleosome 提交 2019-09-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 C 13–119（107 aa） 链 G 13–119（107 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
6VZ4 Cryo-EM structure of Sth1-Arp7-Arp9-Rtt102 bound to the nucleosome in ADP Beryllium Fluoride state 提交 2020-02-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4 second blot time, blot force 20	分辨率 3.90 Å
6W5I Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class01) 提交 2020-03-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 I 2–130（129 aa） 链 M 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
6WZ5 Bridging of double-strand DNA break activates PARP2/HPF1 to modify chromatin 提交 2020-05-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.20 Å
6WZ9 Bridging of double-strand DNA break activates PARP2/HPF1 to modify chromatin 提交 2020-05-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
6X0N Bridging of double-strand DNA break activates PARP2/HPF1 to modify chromatin 提交 2020-05-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：23-meric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa） 链 c 2–130（129 aa） 链 g 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
6YN1 Crystal structure of histone chaperone APLF acidic domain bound to the histone H2A-H2B-H3-H4 octamer 提交 2020-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 14–119（106 aa） 链 F 14–119（106 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH6.5, 1.0 M tri-sodium citrate	分辨率 2.35 Å R-free 0.233
6YN1 Crystal structure of histone chaperone APLF acidic domain bound to the histone H2A-H2B-H3-H4 octamer 提交 2020-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 K 14–119（106 aa） 链 P 14–119（106 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH6.5, 1.0 M tri-sodium citrate	分辨率 2.35 Å R-free 0.233
6YN1 Crystal structure of histone chaperone APLF acidic domain bound to the histone H2A-H2B-H3-H4 octamer 提交 2020-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 U 14–119（106 aa） 链 Z 14–119（106 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH6.5, 1.0 M tri-sodium citrate	分辨率 2.35 Å R-free 0.233
6YN1 Crystal structure of histone chaperone APLF acidic domain bound to the histone H2A-H2B-H3-H4 octamer 提交 2020-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 e 14–119（106 aa） 链 j 14–119（106 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH6.5, 1.0 M tri-sodium citrate	分辨率 2.35 Å R-free 0.233
6Z6P HDAC-PC-Nuc 提交 2020-05-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 17–119（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.43 Å
7AT8 Histone H3 recognition by nucleosome-bound PRC2 subunit EZH2. 提交 2020-10-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 F 2–130（129 aa） 链 J 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.40 Å
7CRO NSD2 bearing E1099K/T1150A dual mutation in complex with 187-bp NCP 提交 2020-08-14	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane	分辨率 3.75 Å
7CRP NSD3 bearing E1181K/T1232A dual mutation in complex with 187-bp NCP (1:1 binding mode) 提交 2020-08-14	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7CRQ NSD3 bearing E1181K/T1232A dual mutation in complex with 187-bp NCP (2:1 binding mode) 提交 2020-08-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane	分辨率 3.15 Å
7CRR Native NSD3 bound to 187-bp nucleosome 提交 2020-08-14	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane	分辨率 3.48 Å
7E8I Structural insight into BRCA1-BARD1 complex recruitment to damaged chromatin 提交 2021-03-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	突变：K16C 突变：K16C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7EA5 Yeast Set2 bound to a nucleosome containing oncohistone mutations 提交 2021-03-06	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 14–118（105 aa） 链 G 14–118（105 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7EGP The structure of SWI/SNF-nucleosome complex 提交 2021-03-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 Q 2–130（129 aa） 链 U 2–130（129 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
7KTQ Nucleosome from a dimeric PRC2 bound to a nucleosome 提交 2020-11-24	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 14–118（105 aa） 链 G 14–118（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7MBM Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode01 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 I 2–130（129 aa） 链 M 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.76 Å
7MBN Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode02 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 I 2–130（129 aa） 链 M 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.02 Å
7OH9 Nucleosome with TBP and TFIIA bound at SHL -6 提交 2021-05-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7OHA nucleosome with TBP and TFIIA bound at SHL +2 提交 2021-05-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7OHB TBP-nucleosome complex 提交 2021-05-10	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7OHC Cryo-EM structure of nucleosome core particle composed of the Widom 601 DNA sequence 提交 2021-05-10	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7UD5 Complex between MLL1-WRAD and an H2B-ubiquitinated nucleosome 提交 2022-03-18	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
7UNC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS complex with rewrapped nucleosome 提交 2022-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7UND Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-nucleosome complex (stalled at +38) 提交 2022-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7VDT The motor-nucleosome module of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7VDV The overall structure of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7VVU NuA4 HAT module bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 N 1–130（130 aa） 链 S 1–130（130 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.40 Å
7VVZ NuA4 bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 N 1–130（130 aa） 链 S 1–130（130 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 8.80 Å
7X3T Cryo-EM structure of ISW1a-dinucleosome 提交 2022-03-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.40 Å
7X3V Cryo-EM structure of IOC3-N2 nucleosome 提交 2022-03-01	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.09 Å
7X3W Cryo-EM structure of ISW1-N1 nucleosome 提交 2022-03-01	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7X3X Cryo-EM structure of N1 nucleosome-RA 提交 2022-03-01	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7XPX Cryo-EM structure of the histone methyltransferase SET8 bound to H4K20Ecx-nucleosome 提交 2022-05-06	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7YI1 Cryo-EM structure of Eaf3 CHD bound to H3K36me3 nucleosome 提交 2022-07-14	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7YI4 Cryo-EM structure of Rpd3S complex bound to H3K36me3 nucleosome in close state 提交 2022-07-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 I 2–130（129 aa） 链 M 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.96 Å
7YI5 Cryo-EM structure of Rpd3S complex bound to H3K36me3 nucleosome in loose state 提交 2022-07-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 I 2–130（129 aa） 链 M 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.96 Å
7ZS9 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome (complex A) 提交 2022-05-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric	链 c 2–130（129 aa） 链 g 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7ZSA Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP (complex B) 提交 2022-05-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric	链 c 2–130（129 aa） 链 g 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7ZSB Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP, complex C 提交 2022-05-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric	链 c 2–130（129 aa） 链 g 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8A3Y Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex 提交 2022-06-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 c 17–119（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8CBN structure of LEDGF/p75 PWWP domain bound to the H3K36 trimethylated dinucleosome 提交 2023-01-25	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
8CBQ structure of LEDGF/p75 PWWP domain bound to the H3K36 trimethylated dinucleosome 提交 2023-01-25	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8CEO Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator and the +1 nucleosome 提交 2023-02-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：54-meric	链 t 2–130（129 aa） 链 x 2–130（129 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8DU4 Complex between RbBP5-WDR5 and an H2B-ubiquitinated nucleosome 提交 2022-07-26	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
8ETT Class1 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 C 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 6.68 Å
8ETV Class2 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 C 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 3.16 Å
8EU2 Class3 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 C 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 2.93 Å
8EUE Class1 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 3.48 Å
8EUJ Class2 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 3.36 Å
8G6G H2BK120ub+H3K79me2-modified nucleosome ubiquitin position 5 提交 2023-02-15	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.93 Å
8G6H H2BK120ub+H3K79me2-modified nucleosome ubiquitin position 6 提交 2023-02-15	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.06 Å
8G6Q H2AK119ub-modified nucleosome ubiquitin position 1 提交 2023-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：K119C 突变：K119C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.41 Å
8G6S H2AK119ub-modified nucleosome ubiquitin position 2 提交 2023-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：K119C 突变：K119C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
8G86 Human Oct4 bound to nucleosome with human nMatn1 sequence (focused refinement of nucleosome) 提交 2023-02-17	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
8G88 Human Oct4 bound to nucleosome with human nMatn1 sequence 提交 2023-02-17	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
8G8B Nucleosome with human nMatn1 sequence in complex with Human Oct4 提交 2023-02-17	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8G8G Interaction of H3 tail in LIN28B nucleosome with Oct4 提交 2023-02-17	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8HXY Cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3S in complex with nucleosome 提交 2023-01-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-Na pH 7.5, 40 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8HXZ Cryo-EM structure of Eaf3 CHD in complex with nucleosome 提交 2023-01-05	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-Na pH 7.5, 40 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8HY0 Composite cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3S in complex with nucleosome 提交 2023-01-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-Na pH 7.5, 40 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8IHM Eaf3 CHD domain bound to the nucleosome 提交 2023-02-23	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.58 Å
8IHT Rpd3S bound to the nucleosome 提交 2023-02-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.72 Å
8JHO Cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3S in complex with di-nucleosome 提交 2023-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa） 链 c 2–130（129 aa） 链 g 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-Na pH 7.5, 40 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.60 Å
8KD2 Rpd3S in complex with 187bp nucleosome 提交 2023-08-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 Q 2–130（129 aa） 链 U 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8KD3 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification, H3K9Q mutation and 187bp DNA 提交 2023-08-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 Q 2–130（129 aa） 链 U 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8KD4 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 187bp DNA, class1 提交 2023-08-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 Q 2–130（129 aa） 链 U 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.93 Å
8KD5 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 187bp DNA, class2 提交 2023-08-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 Q 2–130（129 aa） 链 U 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8KD6 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 187bp DNA, class3 提交 2023-08-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 Q 2–130（129 aa） 链 U 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
8KD7 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 167bp DNA 提交 2023-08-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 Q 2–130（129 aa） 链 U 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.09 Å
8PC5 H3K36me3 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex 提交 2023-06-09	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8PC6 H3K36me3 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex - pose 2 提交 2023-06-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
8PEO H3K36me2 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex 提交 2023-06-14	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.69 Å
8PEP H3K36me2 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex - pose 2 提交 2023-06-14	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8RUQ Borealin N-terminus in complex with H3.T3p-nucleosome 提交 2024-01-31	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10 mM TRIS-HCl, pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.3% n-octyl-beta-D-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blotting time, -10 force, no wait time.	分辨率 2.29 Å
8SKZ Cryo-EM structure of DDM1-HELLS chimera bound to the nucleosome 提交 2023-04-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8T9H Catalytic and non-catalytic mechanisms of histone H4 lysine 20 methyltransferase SUV420H1 提交 2023-06-24	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；50 mM HEPES pH 7.9, 100 mM NaCl, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å
8TAS PRC2 monomer bound to nucleosome 提交 2023-06-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 R 1–130（130 aa） 链 U 1–130（130 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8TOF Rpd3S bound to an H3K36Cme3 modified nucleosome 提交 2023-08-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8U5H Cryo-EM structure of human DNMT3A UDR bound to H2AK119ub1-modified nucleosome 提交 2023-09-12	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 K 1–130（130 aa） 链 R 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
8UW1 Cryo-EM structure of DNMT3A1 UDR in complex with H2AK119Ub-nucleosome 提交 2023-11-05	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；50 mM HEPES pH 7.9, 100 mM NaCl, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.88 Å
8V25 H2BK120ub-modified nucleosome ubiquitin position 1 提交 2023-11-21	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.32 Å
8V26 H2BK120ub-modified nucleosome ubiquitin position 2 提交 2023-11-21	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8V27 H2BK120ub-modified nucleosome ubiquitin position 3 提交 2023-11-21	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
8V28 H2BK120ub-modified nucleosome ubiquitin position 4 提交 2023-11-22	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.36 Å
8VMJ H3K4me3 nucleosome bound to PRC2_AJ119-450 提交 2024-01-13	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 K 13–119（107 aa） 链 R 13–119（107 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8VMN H3K4me3 nucleosome bound to PRC2_AJ1-450 提交 2024-01-13	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 K 13–119（107 aa） 链 R 13–119（107 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8VO0 H3K36me3-modified nucleosome bound to PRC2_AJ1-450 with histone H3 tail disengaged 提交 2024-01-14	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 K 13–119（107 aa） 链 R 13–119（107 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8VX5 Nucleosome core particle containing an 8-oxoG damage site 提交 2024-02-03	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8VX6 Human OGG1 bound at the nucleosomal DNA entry site 提交 2024-02-03	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8XAA Structure of NAP1 in complex with H2A-H2B 提交 2023-12-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 I 15–106（92 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Tris, pH 8.0, 25 % v/v PEG 400	分辨率 3.35 Å R-free 0.261
8XAA Structure of NAP1 in complex with H2A-H2B 提交 2023-12-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 K 15–106（92 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Tris, pH 8.0, 25 % v/v PEG 400	分辨率 3.35 Å R-free 0.261
8XJV Structural basis for the linker histone H5-nucleosome binding and chromatin compaction 提交 2023-12-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 108 PDB 声明：110-meric	链 A 1–130（130 aa） 链 Ae 1–130（130 aa） 链 B 1–130（130 aa） 链 C 1–130（130 aa） 链 D 1–130（130 aa） 链 E 1–130（130 aa） 链 F 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 H 1–130（130 aa） 链 I 1–130（130 aa） 链 K 1–130（130 aa） 链 L 1–130（130 aa） 链 aj 1–130（130 aa） 链 ak 1–130（130 aa） 链 al 1–130（130 aa） 链 am 1–130（130 aa） 链 an 1–130（130 aa） 链 ao 1–130（130 aa） 链 ap 1–130（130 aa） 链 aq 1–130（130 aa） 链 ar 1–130（130 aa） 链 as 1–130（130 aa） 链 at 1–130（130 aa） 链 au 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.60 Å
9B2S Haspin bound to nucleosome in position 1 提交 2024-03-16	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.01 Å
9B2T Haspin bound to nucleosome in position 2 提交 2024-03-16	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.99 Å
9C9X S.c INO80 in complex with Xenopus 0/80 nucleosome, Nucleosome 提交 2024-06-16	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 2.83 Å
9CAN S.c INO80 in complex with Xenopus 0/40 nucleosome 提交 2024-06-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 3.30 Å
9E1X Snf2h bound nucleosome complex - ClassD1 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9EAR CHD1-nucleosome complex (closed state) 提交 2024-11-11	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 15–119（105 aa） 链 G 15–119（105 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9JAO The structure of SMARCAD1 bound to the hexasome in the presence of ADP-BeFx 提交 2024-08-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 G 1–130（130 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9JNP Structure of isw1-nucleosome complex in ATP state 提交 2024-09-23	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
9JNT Structure of isw1-nucleosome complex in ADP* state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9JNU Structure of isw1-nucleosome complex in ADP state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9JNV Structure of isw1-nucleosome complex in ADP(S) state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9JNW Structure of isw1-nucleosome complex in ADP+ state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9JNX Structure of isw1-nucleosome complex in ADP*+ state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9JNZ Structure of isw1-nucleosome complex in Apo state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9JO2 Structure of isw1-nucleosome complex in Apo* state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9JO5 Structure of isw1-nucleosome complex in ADP-B state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9KQ2 Cryo-EM structure of RNF168'-RNF168-UbcH5c complex bound to nucleosome 提交 2024-11-25	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9LIU Structure of isw1-nucleosome double-bound complex in ATP-ATP state 提交 2025-01-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9LJ2 Structure of isw1-nucleosome double-bound complex in ADP-ADP+ state 提交 2025-01-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 13–119（107 aa） 链 G 13–119（107 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
9M76 UHRF1 bound to a mononucleosome in its pre-active state, with the RING domain bound to the SRA domain. 提交 2025-03-09	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9M77 The activated state of human UHRF1 bound to a mononucleosome, with the finger loop ordered and linker 4 disordered. 提交 2025-03-09	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9N6I 2.61 A S.cerevisiae Chd1[L886G/L889G/L891G]-nucleosome 2:1 complex 提交 2025-02-05	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 11–120（110 aa） 链 G 11–120（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.61 Å
9N6K 2.88 A S.cerevisiae Chd1[L886G/L889G/L891G]-nucleosome 2:1 complex with DNA-binding domain 提交 2025-02-05	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 11–120（110 aa） 链 G 11–120（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9NH8 CHD1-nucleosome complex (anchored state) 提交 2025-02-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	ARG ARGININE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9QAJ Structure of the nucleosome-bound human BCL7A 提交 2025-02-28	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 C 2–120（119 aa） 链 G 2–120（119 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
9UX9 local ATPase-NCP structure of the ncBAF-nucleosome complex in the ADP-BeFx-bound state 提交 2025-05-13	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
9UXA local ARP-NCP structure of the ncBAF-nucleosome complex in the apo state 提交 2025-05-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
9V2V Cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3L in complex with mono-nucleosome 提交 2025-05-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 O 12–118（107 aa） 链 S 12–118（107 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9V2W Cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3L in complex with di-nucleosome 提交 2025-05-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 B 12–118（107 aa） 链 M 12–118（107 aa） 链 O 12–118（107 aa） 链 S 12–118（107 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9V33 Calypso/Asx/NCP-ub complex 提交 2025-05-21	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 5.90 Å
9V9Q Cryo-EM structure of the cPRC1-UbcH5c E3-E2 complex bound to the H2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å
9V9R Cryo-EM structure of the ncPRC1.1-UbcH5c E3-E2 complex bound to the H2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.20 Å
9V9S Cryo-EM structure of the ncPRC1.1 complex bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：K119C 突变：K119C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.80 Å
9V9T Cryo-EM structure of the ncPRC1.6 complex bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：K119C 突变：K119C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å
9V9U Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing two RNF2-BMI1 bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：K119C 突变：K119C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.70 Å
9V9V Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RNF2-BMI1 and one RYBP bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：K119C 突变：K119C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.80 Å
9V9W Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing two RYBP bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：K119C 突变：K119C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
9V9X Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RNF2-BMI1 bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：K119C 突变：K119C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.30 Å
9V9Y Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RNF2-BMI1 and one RYBP bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：K119C 突变：K119C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.20 Å
9V9Z Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RYBP bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：K119C 突变：K119C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
9WBZ The structure of NCP-motor-ARP module of ncBAF-nucleosome complex 提交 2025-08-15	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9WC0 The structure of NCP-RA module of ncBAF-nucleosome complex 提交 2025-08-15	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å

共 226 个其他 PDB 条目、238 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q6AZJ8_XENLA
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–110； UniProt 11–120 作者链 G； PDB构建体 1–110； UniProt 11–120

Histone H2B 1.1

Xenopus laevis

UniProt P02281

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 9 DNA 2 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物数一致	链 D； UniProt 33–126 链 H； UniProt 33–126	未记录	DNA Tracking Strand × 1 DNA Lagging Strand × 1 Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 2 （Q6AZJ8） Chromo domain-containing protein 1 × 1 （P32657） Histone H3 × 2 （A0A310TTQ1）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.54 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9N6H	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AOI COMPLEX BETWEEN NUCLEOSOME CORE PARTICLE (H3,H4,H2A,H2B) AND 146 BP LONG DNA FRAGMENT 提交 1997-07-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 27–125（99 aa） 片段：HISTONE H2B 链 H 27–125（99 aa） 片段：HISTONE H2B	突变：A7P 突变：A7P	MN MANGANESE (II) ION × 6	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å R-free 0.302
1F66 2.6 A CRYSTAL STRUCTURE OF A NUCLEOSOME CORE PARTICLE CONTAINING THE VARIANT HISTONE H2A.Z 提交 2000-06-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.60 Å R-free 0.249
1KX3 X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP146, at 2.0 A Resolution 提交 2002-01-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.275
1KX4 X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP146b, at 2.6 A Resolution 提交 2002-01-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.300
1KX5 X-Ray Structure of the Nucleosome Core Particle, NCP147, at 1.9 A Resolution 提交 2002-01-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.94 Å R-free 0.275
1M18 LIGAND BINDING ALTERS THE STRUCTURE AND DYNAMICS OF NUCLEOSOMAL DNA 提交 2002-06-18	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 11 1SZ N-[5-[[4-[[5-[[5-[[5-[[5-[[3-[3-(dimethylamino)propylamino]-3-oxidanylidene-propyl]carbamoyl]-1-methyl-pyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methyl-pyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methyl-pyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methyl-pyrrol-3-yl]amino]-4-oxidanylidene-butyl]carbamoyl]-1-methyl-pyrrol-3-yl]-1-methyl-4-[[1-methyl-4-[(1-methylimidazol-2-yl)carbonylamino]pyrrol-2-yl]carbonylamino]imidazole-2-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；Manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.45 Å R-free 0.257
1P34 Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.70 Å R-free 0.270
1P3A Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 3.00 Å R-free 0.260
1P3B Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 3.00 Å R-free 0.286
1P3F Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
1P3G Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.70 Å R-free 0.265
1P3I Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.30 Å R-free 0.275
1P3K Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.90 Å R-free 0.291
1P3L Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.40 Å R-free 0.265
1P3M Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.90 Å R-free 0.270
1P3O Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.75 Å R-free 0.276
1P3P Crystallographic Studies of Nucleosome Core Particles containing Histone 'Sin' Mutants 提交 2003-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；MnCl2, KCl, Potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.70 Å R-free 0.268
1ZBB Structure of the 4_601_167 Tetranucleosome 提交 2005-04-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：36-meric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa） 链 d 1–125（125 aa） 链 h 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.75；294 K；magnesium chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, trisCl, pH 6.75, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 9.00 Å
2F8N 2.9 Angstrom X-ray structure of hybrid macroH2A nucleosomes 提交 2005-12-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 H 4–125（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；34 to 37.5mM KCl and 40-45mM MnCl2, 5mM Potassium Cacodylate, Sample concentration: 8-12 mg/ml, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.90 Å R-free 0.269
2FJ7 Crystal structure of Nucleosome Core Particle Containing a Poly (dA.dT) Sequence Element 提交 2005-12-31	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；20 to 35 mM KCl, 34 to 48 mM MnCl2, and 5mM K-cacodylate pH 6.0 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 3.20 Å R-free 0.350
2NZD Nucleosome core particle containing 145 bp of DNA 提交 2006-11-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–125（125 aa） 链 H 1–125（125 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；85 mM MnCl2, 60 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate, 4 mg/ml NCP over well with 1/2 conc., pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.65 Å R-free 0.283
3B6F Nucleosome core particle treated with cisplatin 提交 2007-10-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；MnCl2, KCl, K-Cacodylate, pH 6.0, vapor diffusion, temperature 291K	分辨率 3.45 Å R-free 0.402
3B6G Nucleosome core particle treated with oxaliplatin 提交 2007-10-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；MnCl2, KCl, K-Cacodylate, pH 6.0, vapor diffusion, temperature 291K	分辨率 3.45 Å R-free 0.435
3KWQ Structural characterization of H3K56Q nucleosomes and nucleosomal arrays 提交 2009-12-01	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 34–126（93 aa） 片段：UNP residues 34-126 链 H 34–126（93 aa） 片段：UNP residues 34-126	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.50 Å R-free 0.315
3KXB Structural characterization of H3K56Q nucleosomes and nucleosomal arrays 提交 2009-12-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S33T 突变：S33T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；Crystals were grown by vapor diffusion in 8 20 days at 20 C using a droplet containing 4.0 mg ml−1 core particle 50 mM KCl, 70 75 mM MnCl , and 20 mM potassium cacodylate, pH 6.0, surrounded by silicon oil DC200 (110mPa s; Fluka) and equilibrated against 40 46 mM MnCl2, 35 40 mM KCl and 20 mM potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.292
3LEL Structural Insight into the Sequence-Dependence of Nucleosome Positioning 提交 2010-01-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 20mM K-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.95 Å R-free 0.300
3LEL Structural Insight into the Sequence-Dependence of Nucleosome Positioning 提交 2010-01-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 N 2–126（125 aa） 链 R 2–126（125 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 19	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 20mM K-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.95 Å R-free 0.300
3LJA Using Soft X-Rays for a Detailed Picture of Divalent Metal Binding in the Nucleosome 提交 2010-01-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 45	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；85 mM MnCl2, 60 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate, 4 mg/ml NCP over well with 1/2 conc., pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, EVAPORATION	分辨率 2.75 Å R-free 0.259
3LZ0 Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Composed of the Widom 601 DNA Sequence (orientation 1) 提交 2010-03-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；K cacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.318
3LZ1 Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Composed of the Widom 601 DNA Sequence (orientation 2) 提交 2010-03-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；Kcacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.319
3MGP Binding of Cobalt ions to the Nucleosome Core Particle 提交 2010-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 CO COBALT (II) ION × 43	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 40mM K-cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.44 Å R-free 0.282
3MGQ Binding of Nickel ions to the Nucleosome Core Particle 提交 2010-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 47 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 40mM K-cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.65 Å R-free 0.276
3MGR Binding of Rubidium ions to the Nucleosome Core Particle 提交 2010-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 RB RUBIDIUM ION × 5 MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 40mM K-cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.30 Å R-free 0.267
3MGS Binding of Cesium ions to the Nucleosome Core particle 提交 2010-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 CS CESIUM ION × 12 MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；85mM MnCl2, 60mM KCl, 40mM K-cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 3.15 Å R-free 0.238
3MNN A Ruthenium Antitumour Agent Forms Specific Histone Protein Adducts in the Nucleosome Core 提交 2010-04-22	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 RU RUTHENIUM ION × 3 MML 1-methyl-4-(1-methylethyl)benzene × 3 PTW 1,3,5-triaza-7-phosphatricyclo[3.3.1.1~3,7~]decane × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；55mM KCl, 85mM MnCl2, 20mM K-Cacodylate, pH 6, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.277
3MVD Crystal structure of the chromatin factor RCC1 in complex with the nucleosome core particle 提交 2010-05-04	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；294 K；25 mM sodium acetate buffer, 25 mM sodium citrate, 1 mM DTT, 6 % PEG2000-MME, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 2.90 Å R-free 0.215
3O62 Nucleosome core particle modified with a cisplatin 1,3-cis-{Pt(NH3)2}2+-d(GpTpG) intrastrand cross-link 提交 2010-07-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	CPT Cisplatin × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；40-46 mM MnCl2, 30-45 mM KCl, and 20 mM potassium cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.22 Å R-free 0.306
3REH 2.5 Angstrom Crystal Structure of the Nucleosome Core Particle Assembled with a 145 bp Alpha-Satellite DNA (NCP145) 提交 2011-04-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；KCl, MnCl2, K-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
3REI 2.65 Angstrom Crystal Structure of the Nucleosome Core Particle Assembled with a 145 bp Alpha-Satellite DNA (NCP145) Derivatized with Triamminechloroplatinum(II) Chloride 提交 2011-04-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	PT PLATINUM (II) ION × 49 SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.65 Å R-free 0.276
3REJ 2.55 Angstrom Crystal Structure of the Nucleosome Core Particle Assembled with a 146 bp Alpha-Satellite DNA (NCP146b) 提交 2011-04-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 13 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.55 Å R-free 0.262
3REK 2.6 Angstrom Crystal Structure of the Nucleosome Core Particle Assembled with a 146 bp Alpha-Satellite DNA (NCP146b) Derivatized with Oxaliplatin 提交 2011-04-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 PT PLATINUM (II) ION × 40 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.281
3REL 2.7 Angstrom Crystal Structure of the Nucleosome Core Particle Assembled with a 146 bp Alpha-Satellite DNA (NCP146b) Derivatized with Triamminechloroplatinum(II) Chloride 提交 2011-04-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 PT PLATINUM (II) ION × 48 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å R-free 0.302
3TU4 Crystal structure of the Sir3 BAH domain in complex with a nucleosome core particle. 提交 2011-09-15	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.241
3TU4 Crystal structure of the Sir3 BAH domain in complex with a nucleosome core particle. 提交 2011-09-15	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.241
3UT9 Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Assembled with a Palindromic Widom '601' Derivative (NCP-601L) 提交 2011-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 29 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；K-cacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, temperature 291K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.20 Å R-free 0.289
3UTA Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Assembled with an Alpha-Satellite Sequence Containing Two TTAAA elements (NCP-TA2) 提交 2011-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 17	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；K-cacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, temperature 291K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.07 Å R-free 0.266
3UTB Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Assembled with the 146b Alpha-Satellite Sequence (NCP146b) 提交 2011-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 21 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；K-cacodylate, KCl, MnCl2, pH 6.0, temperature 291K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.20 Å R-free 0.275
4J8U X-ray structure of NCP145 with chlorido(eta-6-p-cymene)(N-phenyl-2-pyridinecarbothioamide)osmium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 ELJ chlorido(eta-6-p-cymene)(N-phenyl-2-pyridinecarbothioamide)osmium(II) × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.38 Å R-free 0.280
4J8V X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-phenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 D 2–126（125 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.58 Å R-free 0.273
4J8V X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-phenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 H 2–126（125 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.58 Å R-free 0.273
4J8V X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-phenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.58 Å R-free 0.273
4J8W X-ray structure of NCP145 with chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)osmium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 1MK chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)osmium(II) × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.41 Å R-free 0.275
4J8X X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 D 2–126（125 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.280
4J8X X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 H 2–126（125 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.280
4J8X X-ray structure of NCP145 with bound chlorido(eta-6-p-cymene)(N-fluorophenyl-2-pyridinecarbothioamide)ruthenium(II) 提交 2013-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 RU7 PARA-CYMENE RUTHENIUM CHLORIDE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.280
4KGC Nucleosome Core Particle Containing (ETA6-P-CYMENE)-(1, 2-ETHYLENEDIAMINE)-RUTHENIUM 提交 2013-04-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	HRU (ethane-1,2-diamine-kappa~2~N,N')[(1,2,3,4,5,6-eta)-1-methyl-4-(propan-2-yl)cyclohexane-1,2,3,4,5,6-hexayl]ruthenium × 4 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.69 Å R-free 0.282
4KHA Structural basis of histone H2A-H2B recognition by the essential chaperone FACT 提交 2013-04-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 34–126（93 aa） 片段：UNP residues 652-945 and 34-126	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；manual setup 1ul protein (15 mg / ml) plus 1 ul crystallization buffer (7.25% [vol/vol] PEG8000, 0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris pH 7.8), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.35 Å R-free 0.229
4LD9 Crystal structure of the N-terminally acetylated BAH domain of Sir3 bound to the nucleosome core particle 提交 2013-06-24	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293.15 K；50 mM MES pH 6.5, 12% PEG 400, 12 mM MnCl2, 100 mM NaCl, 10 mM EDTA, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.15K	分辨率 3.31 Å R-free 0.295
4R8P Crystal structure of the Ring1B/Bmi1/UbcH5c PRC1 ubiquitylation module bound to the nucleosome core particle 提交 2014-09-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Modified micro batch under oil；pH 7.5；294 K；25 mM HEPES pH 7.5, 80 mM NH4NO3, 3 % PEG2000-MME, Modified micro batch under oil, temperature 294K	分辨率 3.28 Å R-free 0.245
4WU8 Structure of trPtNAP-NCP145 提交 2014-10-31	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	突变：S29T 突变：S29T	CX3 [2-(3-{bis[2-(amino-kappaN)ethyl]amino-kappaN}propyl)-1H-benzo[de]isoquinoline-1,3(2H)-dionato(2-)]platinum(1+) × 2 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；Manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate	分辨率 2.45 Å R-free 0.263
4WU9 Structure of cisPtNAP-NCP145 提交 2014-10-31	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	突变：S29T 突变：S29T	SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 CX8 [2-{3-[(2-{[2-(amino-kappaN)ethyl]amino-kappaN}ethyl)amino-kappaN]propyl}-1H-benzo[de]isoquinoline-1,3(2H)-dionato(3-)]platinum × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；Manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate	分辨率 2.60 Å R-free 0.273
4XUJ Nucleosome core particle containing adducts from treatment with a thiomorpholine-substituted [(eta-6-p-cymene)Ru(3-hydroxy-2-pyridone)Cl] compound 提交 2015-01-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 片段：UNP residues 2-126 链 H 2–126（125 aa） 片段：UNP residues 2-126	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 4A6 [(1,2,3,4,5,6-eta)-1-methyl-4-(propan-2-yl)benzene]ruthenium × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40mM MnCl2, 30mM KCl, 20mM K-Cacodylate	分辨率 3.18 Å R-free 0.299
4XZQ Nucleosome disassembly by RSC and SWI/SNF is enhanced by H3 acetylation near the nucleosome dyad axis 提交 2015-02-04	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 34–126（93 aa） 片段：residues 34-126 链 H 34–126（93 aa） 片段：residues 34-126	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292.15 K；potassium chloride, potassium cacodylate, manganese chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.299
4YS3 Nucleosome disassembly by RSC and SWI/SNF is enhanced by H3 acetylation near the nucleosome dyad axis 提交 2015-03-16	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 34–126（93 aa） 片段：residues 34-126 链 H 34–126（93 aa） 片段：residues 34-126	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；292.15 K；postassium chloride, manganese chloride, cacodylate	分辨率 3.00 Å R-free 0.279
4Z66 Nucleosome disassembly by RSC and SWI/SNF is enhanced by H3 acetylation near the nucleosome dyad axis 提交 2015-04-03	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 33–126（94 aa） 链 H 33–126（94 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292.15 K；potassium chloride, potassium cacodylate, manganese chloride	分辨率 2.50 Å R-free 0.296
4ZUX SAGA DUB module Ubp8/Sgf11/Sus1/Sgf73 bound to ubiqitinated nucleosome 提交 2015-05-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Tris-acetate pH 7.4, 50 mM sodium acetate, 5 mM Mg-acetate, 5% sucrose and 5% 2-propanol	分辨率 3.82 Å R-free 0.256
4ZUX SAGA DUB module Ubp8/Sgf11/Sus1/Sgf73 bound to ubiqitinated nucleosome 提交 2015-05-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 N 5–126（122 aa） 链 R 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Tris-acetate pH 7.4, 50 mM sodium acetate, 5 mM Mg-acetate, 5% sucrose and 5% 2-propanol	分辨率 3.82 Å R-free 0.256
5CP6 Nucleosome Core Particle with Adducts from the Anticancer Compound, [(eta6-5,8,9,10-tetrahydroanthracene)Ru(ethylenediamine)Cl][PF6] 提交 2015-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	RUH (ethane6-5,8,9,10-tetrahydroanthracene)Ru(II)(ethylene-diamine)Cl × 3 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.60 Å R-free 0.251
5DNM Nucleosome core particle containing adducts of ruthenium(II)-toluene PTA complex 提交 2015-09-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 RAX dichloro[(1,2,3,4,5,6-eta)-6-methylbenzene]1,3,5-triaza-7lambda~5~-phosphatricyclo[3.3.1.1~3,7~]dec-7-ylruthenium × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate	分辨率 2.81 Å R-free 0.241
5DNN Nucleosome core particle containing adducts of gold(I)-triethylphosphane and ruthenium(II)-toluene PTA complexes 提交 2015-09-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	AUF triethylphosphanuidylgold(1+) × 2 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 RAX dichloro[(1,2,3,4,5,6-eta)-6-methylbenzene]1,3,5-triaza-7lambda~5~-phosphatricyclo[3.3.1.1~3,7~]dec-7-ylruthenium × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate	分辨率 2.80 Å R-free 0.236
5E5A Crystal structure of the chromatin-tethering domain of Human cytomegalovirus IE1 protein bound to the nucleosome core particle 提交 2015-10-08	构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；289 K；sodium cacodylate, magnesium acetate, 2-methyl-2,4-pentanediol	分辨率 2.81 Å R-free 0.242
5F99 X-ray Structure of the MMTV-A Nucleosome Core Particle 提交 2015-12-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；sample was mixed 1:1 with 10 mM K-cacodylate, pH 6.0, 180 mM MgCl2, 50 mM KCl and equilibrated against a 1:4 dilution of the same solution	分辨率 2.63 Å R-free 0.252
5G2E Structure of the Nap1 H2A H2B complex 提交 2016-04-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 L 28–126（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 10-15% W/V PEG3350; 200 MM LICL	分辨率 6.70 Å R-free 0.310
5G2E Structure of the Nap1 H2A H2B complex 提交 2016-04-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 28–126（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 10-15% W/V PEG3350; 200 MM LICL	分辨率 6.70 Å R-free 0.310
5G2E Structure of the Nap1 H2A H2B complex 提交 2016-04-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 28–126（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 10-15% W/V PEG3350; 200 MM LICL	分辨率 6.70 Å R-free 0.310
5G2E Structure of the Nap1 H2A H2B complex 提交 2016-04-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 T 28–126（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 10-15% W/V PEG3350; 200 MM LICL	分辨率 6.70 Å R-free 0.310
5G2E Structure of the Nap1 H2A H2B complex 提交 2016-04-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 X 28–126（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 10-15% W/V PEG3350; 200 MM LICL	分辨率 6.70 Å R-free 0.310
5G2E Structure of the Nap1 H2A H2B complex 提交 2016-04-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 28–126（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 10-15% W/V PEG3350; 200 MM LICL	分辨率 6.70 Å R-free 0.310
5HQ2 Structural model of Set8 histone H4 Lys20 methyltransferase bound to nucleosome core particle 提交 2016-01-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：hexadecameric	链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 5.5；277 K；25 mM sodium acetate pH 5.5, 40 mM sodium citrate,1 mM DTT, 6% PEG2000-MME	分辨率 4.50 Å R-free 0.397
5NL0 Crystal structure of a 197-bp palindromic 601L nucleosome in complex with linker histone H1 提交 2017-04-03	构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293.15 K；Mix of equal volumes of the nucleosome/H1 complex (25-30 microM) and a crystallization solution composed of MPD (6% v/v), 50 mM NaCl, and 50 mM sodium potassium phosphate pH 6.4.	分辨率 5.40 Å R-free 0.265
5NL0 Crystal structure of a 197-bp palindromic 601L nucleosome in complex with linker histone H1 提交 2017-04-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 N 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293.15 K；Mix of equal volumes of the nucleosome/H1 complex (25-30 microM) and a crystallization solution composed of MPD (6% v/v), 50 mM NaCl, and 50 mM sodium potassium phosphate pH 6.4.	分辨率 5.40 Å R-free 0.265
5O9G Structure of nucleosome-Chd1 complex 提交 2017-06-19	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–125（121 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
5OMX X-ray Structure of the H2A-N38C Nucleosome Core Particle 提交 2017-08-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 33 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；8 mg/ml sample was mixed 1:1 with 10 mM K-Cacodylate (pH 6.0), 140-150 mM MnCl2, 100 KCl. and equilibrated against a 1:4 dilution of the same solution	分辨率 2.32 Å R-free 0.259
5ONG X-Ray crystal structure of a nucleosome core particle with its DNA site-specifically crosslinked to the histone octamer 提交 2017-08-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 20 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；Sample was mixed in a 1:1 ratio with 10 mM Na-cacodylate, pH 6.0, 130-180 mM MnCl2, 100-160 mM KCl and equilibrated against a 1:4 dilution of the same solution	分辨率 2.80 Å R-free 0.247
5ONW X-Ray crystal structure of a nucleosome core particle with its DNA site-specifically crosslinked to the histone octamer and the two H2A/H2B dimers crosslinked via H2A N38C 提交 2017-08-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 20 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；Sample was mixed in a 1:1 ratio with 10 mM Na-cacodylate, pH 6.0, 160-210 mM MnCl2, 140-200 mM KCl and equilibrated against a 1:4 dilution of the same solution	分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5OXV Structure of the 4_601_157 tetranucleosome (C2 form) 提交 2017-09-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa） 链 N 1–126（126 aa） 链 R 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；30-60 mM KCl, 90-110 mM MgCl2 and 5 mM Na-cacodylate, pH 6	分辨率 6.72 Å R-free 0.352
5OY7 Structure of the 4_601_157 tetranucleosome (P1 form) 提交 2017-09-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa） 链 L 1–126（126 aa） 链 P 1–126（126 aa） 链 T 1–126（126 aa） 链 X 1–126（126 aa） 链 b 1–126（126 aa） 链 f 1–126（126 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；30-60 mM KCl, 90-110 mM MgCl2 and 5 mM Na-cacodyalte, pH 6.0	分辨率 5.77 Å R-free 0.238
5X0X Complex of Snf2-Nucleosome complex with Snf2 bound to position +6 of the nucleosome 提交 2017-01-23	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.97 Å
5X0Y Complex of Snf2-Nucleosome complex with Snf2 bound to SHL2 of the nucleosome 提交 2017-01-23	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.69 Å
5XF6 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having an ethylenediamine linker 提交 2017-04-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 EDN ETHANE-1,2-DIAMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40 mM MnCl2, 30 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate , pH 6.0	分辨率 2.63 Å R-free 0.254
5Z3L Structure of Snf2-nucleosome complex in apo state 提交 2018-01-08	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.31 Å
5Z3O Structure of Snf2-nucleosome complex in ADP state 提交 2018-01-08	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.62 Å
5Z3U Structure of Snf2-nucleosome complex at shl2 in ADP BeFx state 提交 2018-01-08	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.31 Å
5Z3V Structure of Snf2-nucleosome complex at shl-2 in ADP BeFx state 提交 2018-01-08	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.22 Å
6ESF Nucleosome : Class 1 提交 2017-10-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6ESG Nucleosome breathing : Class 2 提交 2017-10-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.40 Å
6ESH Nucleosome breathing : Class 3 提交 2017-10-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
6ESI Nucleosome breathing : Class 4 提交 2017-10-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.30 Å
6I84 Structure of transcribing RNA polymerase II-nucleosome complex 提交 2018-11-19	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 R 5–126（122 aa） 链 W 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6IRO the crosslinked complex of ISWI-nucleosome in the ADP-bound state 提交 2018-11-13	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
6J99 Cryo-EM structure of human DOT1L in complex with an H2B-monoubiquitinated nucleosome 提交 2019-01-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T, K117C 突变：S29T, K117C	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6JM9 cryo-EM structure of DOT1L bound to unmodified nucleosome 提交 2019-03-07	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 34–126（93 aa） 链 H 34–126（93 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.30 Å
6JMA cryo-EM structure of DOT1L bound to H2B ubiquitinated nucleosome 提交 2019-03-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 34–126（93 aa） 链 H 34–126（93 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.80 Å
6JYL The crosslinked complex of ISWI-nucleosome in the ADP.BeF-bound state 提交 2019-04-26	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot 1.5s	分辨率 3.37 Å
6K01 Crystal structure of xH2A-H2B 提交 2019-05-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 28–126（99 aa）	突变：S30T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M HEPES pH=7.5, 25% PEG 3350	分辨率 2.84 Å R-free 0.278
6K1P The complex of ISWI-nucleosome in the ADP.BeF-bound state 提交 2019-05-10	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5；10 mM Tris, 50 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5s	分辨率 3.87 Å
6KIU Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (3.2 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T/K117T 突变：S29T/K117T	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6KIV Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T/K117C 突变：S29T/K117C	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6KIW Cryo-EM structure of human MLL3-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T/K117C 突变：S29T/K117C	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6KIX Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode1 提交 2019-07-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T/K117C 突变：S29T/K117C	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6KIZ Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode2 提交 2019-07-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T/K117C 突变：S29T/K117C	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6N1Z Importin-9 bound to H2A-H2B 提交 2018-11-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 5–126（122 aa） 片段：HISTONE H2B 1.1	突变：S33T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.04 M MES, 0.11 M potassium acetate, 2 mM magnesium acetate, 2 mM DTT, 3.0 M potassium formate, 25% glycerol	分辨率 2.70 Å R-free 0.238
6N1Z Importin-9 bound to H2A-H2B 提交 2018-11-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 5–126（122 aa） 片段：HISTONE H2B 1.1	突变：S33T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.04 M MES, 0.11 M potassium acetate, 2 mM magnesium acetate, 2 mM DTT, 3.0 M potassium formate, 25% glycerol	分辨率 2.70 Å R-free 0.238
6NJ9 Active state Dot1L bound to the H2B-Ubiquitinated nucleosome, 2-to-1 complex 提交 2019-01-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S32T, K120C 突变：S32T, K120C	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions were prepared on the day of freezing and filtered though a 0.2 um filter prior to use. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot once for 3.5 seconds before freezing.	分辨率 2.96 Å
6NN6 Structure of Dot1L-H2BK120ub nucleosome complex 提交 2019-01-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S33T, K121C 突变：S33T, K121C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6NOG Poised-state Dot1L bound to the H2B-Ubiquitinated nucleosome 提交 2019-01-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S32T, K120C 突变：S32T, K120C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions were prepared on the day of freezing and filtered though a 0.2 um filter prior to use. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot once for 3.5 seconds before freezing	分辨率 3.90 Å
6NQA Active state Dot1L bound to the H2B-Ubiquitinated nucleosome, 1-to-1 complex 提交 2019-01-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S32T, K120C 突变：S32T, K120C	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions were prepared on the day of freezing and filtered though a 0.2 um filter prior to use. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot once for 3.5 seconds before freezing.	分辨率 3.54 Å
6NZO Set2 bound to nucleosome 提交 2019-02-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6O96 Dot1L bound to the H2BK120 Ubiquitinated nucleosome 提交 2019-03-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：K120C, S32T 突变：K120C, S32T	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 PROPANE；blotted for 3s before plunging	分辨率 3.50 Å
6OM3 Crystal structure of the Orc1 BAH domain in complex with a nucleosome core particle 提交 2019-04-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	突变：S32T 突变：S32T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277.15 K；6 mM Na-Cacodylate pH 6.0, 0.4 mM Spermine-HCl, 2 mM MgCl2 and 1.75% v/v PEG 400	分辨率 3.30 Å R-free 0.250
6OM3 Crystal structure of the Orc1 BAH domain in complex with a nucleosome core particle 提交 2019-04-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 P 1–126（126 aa） 链 T 1–126（126 aa）	突变：S32T 突变：S32T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277.15 K；6 mM Na-Cacodylate pH 6.0, 0.4 mM Spermine-HCl, 2 mM MgCl2 and 1.75% v/v PEG 400	分辨率 3.30 Å R-free 0.250
6PA7 The cryo-EM structure of the human DNMT3A2-DNMT3B3 complex bound to nucleosome. 提交 2019-06-11	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 3 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
6PWV Cryo-EM structure of MLL1 core complex bound to the nucleosome 提交 2019-07-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 J 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
6PWW Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5 and WDR5 bound to the nucleosome 提交 2019-07-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 J 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6PWX Cryo-EM structure of RbBP5 bound to the nucleosome 提交 2019-07-23	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 J 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6PX1 Set2 bound to nucleosome 提交 2019-07-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
6PX3 Set2 bound to nucleosome 提交 2019-07-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6R1U Structure of LSD2/NPAC-linker/nucleosome core particle complex: Class 2 提交 2019-03-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.36 Å
6RYR Nucleosome-CHD4 complex structure (single CHD4 copy) 提交 2019-06-11	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
6RYU Nucleosome-CHD4 complex structure (two CHD4 copies) 提交 2019-06-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6S01 Structure of LEDGF PWWP domain bound H3K36 methylated nucleosome 提交 2019-06-13	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solution were made from stock solution cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds before plunging	分辨率 3.20 Å
6T9L SAGA DUB module bound to a ubiqitinated nucleosome 提交 2019-10-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 D 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solution were made from stock solution cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds before plunging	分辨率 3.60 Å
6TDA Structure of SWI/SNF chromatin remodeler RSC bound to a nucleosome 提交 2019-11-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 15.00 Å
6TEM CENP-A nucleosome core particle with 145 base pairs of the Widom 601 sequence by cryo-EM 提交 2019-11-12	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6UGM Structural basis of COMPASS eCM recognition of an unmodified nucleosome 提交 2019-09-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 H 2–126（125 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6UXW SWI/SNF nucleosome complex with ADP-BeFx 提交 2019-11-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 U 5–126（122 aa） 链 Y 5–126（122 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 12 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；10 mM HEPES, pH 7.9, 10 mM MgCl2, 50 mM KCl, 1 mM DTT, 5% glycerol, 0.05% NP-40 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.96 Å
6VEN Yeast COMPASS in complex with a ubiquitinated nucleosome 提交 2020-01-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：K120C, S30T 突变：K120C, S30T	ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 5 3.5 sec blot time	分辨率 3.37 Å
6VYP Crystal structure of the LSD1/CoREST histone demethylase bound to its nucleosome substrate 提交 2020-02-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S32T 突变：S32T	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；277 K；25 mM HEPES pH7.5, 75 mM triammonium citrate, 10% PEG2000-MME, Modified Microbatch under oil	分辨率 4.99 Å R-free 0.277
6VYP Crystal structure of the LSD1/CoREST histone demethylase bound to its nucleosome substrate 提交 2020-02-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 d 5–126（122 aa） 链 h 5–126（122 aa）	突变：S32T 突变：S32T	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；277 K；25 mM HEPES pH7.5, 75 mM triammonium citrate, 10% PEG2000-MME, Modified Microbatch under oil	分辨率 4.99 Å R-free 0.277
6W4L The crystal structure of a single chain H2B-H2A histone chimera from Xenopus laevis 提交 2020-03-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 34–126（93 aa）	未记录	PPV PYROPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.9；291 K；0.2M sodium thiocyanate, 20% PEG3350	分辨率 1.31 Å R-free 0.206
6W5I Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class01) 提交 2020-03-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 J 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
6W5M Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class02) 提交 2020-03-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 J 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
6W5N Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class05) 提交 2020-03-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 J 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.00 Å
6WKR PRC2-AEBP2-JARID2 bound to H2AK119ub1 nucleosome 提交 2020-04-16	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：octadecameric	链 M 1–126（126 aa） 链 S 1–126（126 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
6WZ5 Bridging of double-strand DNA break activates PARP2/HPF1 to modify chromatin 提交 2020-05-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.20 Å
6WZ9 Bridging of double-strand DNA break activates PARP2/HPF1 to modify chromatin 提交 2020-05-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
6X0N Bridging of double-strand DNA break activates PARP2/HPF1 to modify chromatin 提交 2020-05-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：23-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa） 链 d 5–126（122 aa） 链 h 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
6ZHX Cryo-EM structure of the regulatory linker of ALC1 bound to the nucleosome's acidic patch: nucleosome class. 提交 2020-06-24	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 2.5 s, blot force 0. Two sample applications and blots were performed before vitrification.	分辨率 2.50 Å
6ZHY Cryo-EM structure of the regulatory linker of ALC1 bound to the nucleosome's acidic patch: hexasome class. 提交 2020-06-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 D 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 2.5 s, blot force 0. Two sample applications and blots were performed before vitrification.	分辨率 3.00 Å
7AT8 Histone H3 recognition by nucleosome-bound PRC2 subunit EZH2. 提交 2020-10-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 G 5–126（122 aa） 链 K 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.40 Å
7E8I Structural insight into BRCA1-BARD1 complex recruitment to damaged chromatin 提交 2021-03-01	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7EG6 Snf5 Finger Helix bound to the nucleosome 提交 2021-03-24	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7EGP The structure of SWI/SNF-nucleosome complex 提交 2021-03-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 R 5–126（122 aa） 链 V 5–126（122 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
7ENN The structure of ALC1 bound to the nucleosome 提交 2021-04-18	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7K6P Active state Dot1 bound to the unacetylated H4 nucleosome 提交 2020-09-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 33–125（93 aa） 链 H 33–125（93 aa）	突变：K120C,S32T 突变：K120C,S32T	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7K6Q Active state Dot1 bound to the H4K16ac nucleosome 提交 2020-09-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 33–125（93 aa） 链 H 33–125（93 aa）	突变：K120C, S32T 突变：K120C, S32T	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7KBD Nucleosome in interphase chromosome formed in Xenopus egg extract (oligo fraction) 提交 2020-10-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
7KBE Nucleosome isolated from metaphase chromosome formed in Xenopus egg extract (oligo fraction) 提交 2020-10-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7KBF H1.8 bound nucleosome isolated from metaphase chromosome in Xenopus egg extract (oligo fraction) 提交 2020-10-02	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.42 Å
7M1X Cryo-EM Structure of Nucleosome containing mouse histone variant H2A.Z 提交 2021-03-15	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4.5 seconds before plunging	分辨率 3.70 Å
7MBM Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode01 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 J 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.76 Å
7MBN Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode02 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 J 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.02 Å
7NKX RNA polymerase II-Spt4/5-nucleosome-Chd1 structure 提交 2021-02-19	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 d 5–126（122 aa） 链 h 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7NKY RNA Polymerase II-Spt4/5-nucleosome-FACT structure 提交 2021-02-19	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric	链 d 5–126（122 aa） 链 h 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7OH9 Nucleosome with TBP and TFIIA bound at SHL -6 提交 2021-05-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7OHA nucleosome with TBP and TFIIA bound at SHL +2 提交 2021-05-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7OHB TBP-nucleosome complex 提交 2021-05-10	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7OHC Cryo-EM structure of nucleosome core particle composed of the Widom 601 DNA sequence 提交 2021-05-10	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7OTQ Cryo-EM structure of ALC1/CHD1L bound to a PARylated nucleosome 提交 2021-06-10	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL were applied on grid and immediately blotted for 2.5 s at blot force 0.	分辨率 4.80 Å
7UD5 Complex between MLL1-WRAD and an H2B-ubiquitinated nucleosome 提交 2022-03-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S32T, K120C 突变：S32T, K120C	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
7UNC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS complex with rewrapped nucleosome 提交 2022-04-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 d 5–126（122 aa） 链 h 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7UND Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-nucleosome complex (stalled at +38) 提交 2022-04-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 d 5–126（122 aa） 链 h 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7VDT The motor-nucleosome module of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7VDV The overall structure of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7VVU NuA4 HAT module bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 U 1–126（126 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.40 Å
7VVZ NuA4 bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 U 1–126（126 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 8.80 Å
7X3T Cryo-EM structure of ISW1a-dinucleosome 提交 2022-03-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa） 链 N 1–126（126 aa） 链 R 1–126（126 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.40 Å
7X3V Cryo-EM structure of IOC3-N2 nucleosome 提交 2022-03-01	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.09 Å
7X3W Cryo-EM structure of ISW1-N1 nucleosome 提交 2022-03-01	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7X3X Cryo-EM structure of N1 nucleosome-RA 提交 2022-03-01	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7XFC Structure of nucleosome-DI complex (-30I, Apo state) 提交 2022-04-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.90 Å
7XFH Structure of nucleosome-AAG complex (A-30I, post-catalytic state) 提交 2022-04-01	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.90 Å
7XFI Structure of nucleosome-DI complex (-50I, Apo state) 提交 2022-04-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.90 Å
7XFJ Structure of nucleosome-AAG complex (T-50I, post-catalytic state) 提交 2022-04-01	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.00 Å
7XFL Structure of nucleosome-AAG complex (A-53I, free state) 提交 2022-04-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.80 Å
7XFM Structure of nucleosome-AAG complex (A-53I, post-catalytic state) 提交 2022-04-01	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.10 Å
7XFN Structure of nucleosome-DI complex (-55I, Apo state) 提交 2022-04-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.80 Å
7XNP Structure of nucleosome-AAG complex (A-55I, post-catalytic state) 提交 2022-04-29	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.90 Å
7XPX Cryo-EM structure of the histone methyltransferase SET8 bound to H4K20Ecx-nucleosome 提交 2022-05-06	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7YI1 Cryo-EM structure of Eaf3 CHD bound to H3K36me3 nucleosome 提交 2022-07-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7YI4 Cryo-EM structure of Rpd3S complex bound to H3K36me3 nucleosome in close state 提交 2022-07-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 J 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.96 Å
7YI5 Cryo-EM structure of Rpd3S complex bound to H3K36me3 nucleosome in loose state 提交 2022-07-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 J 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.96 Å
7YRD histone methyltransferase 提交 2022-08-09	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 32–126（95 aa） 链 H 32–126（95 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7YRG histone methyltransferase 提交 2022-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 32–126（95 aa） 链 H 32–126（95 aa）	突变：S33T 突变：S33T	ZN ZINC ION × 2 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
7ZS9 Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome (complex A) 提交 2022-05-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric	链 d 2–126（125 aa） 链 h 2–126（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7ZSA Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP (complex B) 提交 2022-05-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric	链 d 2–126（125 aa） 链 h 2–126（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7ZSB Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with the +1 nucleosome and NTP, complex C 提交 2022-05-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric	链 d 2–126（125 aa） 链 h 2–126（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8B0A Cryo-EM structure of ALC1 bound to an asymmetric, site-specifically PARylated nucleosome 提交 2022-09-07	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric	链 d 1–126（126 aa） 链 h 1–126（126 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 d 1–126（126 aa） 链 h 1–126（126 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 d 1–126（126 aa） 链 h 1–126（126 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8CBN structure of LEDGF/p75 PWWP domain bound to the H3K36 trimethylated dinucleosome 提交 2023-01-25	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
8CBQ structure of LEDGF/p75 PWWP domain bound to the H3K36 trimethylated dinucleosome 提交 2023-01-25	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8DU4 Complex between RbBP5-WDR5 and an H2B-ubiquitinated nucleosome 提交 2022-07-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S32T, K120C 突变：S32T, K120C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
8ETT Class1 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 D 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 6.68 Å
8ETV Class2 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 D 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 3.16 Å
8EU2 Class3 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 D 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 2.93 Å
8F86 SIRT6 bound to an H3K9Ac nucleosome 提交 2022-11-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ZSL [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(3aR,5R,6R,6aR)-6-hydroxytetrahydro-2H-furo[2,3-d][1,3]oxathiol-5-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8G6G H2BK120ub+H3K79me2-modified nucleosome ubiquitin position 5 提交 2023-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S33T, K120C 突变：S33T, K120C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.93 Å
8G6H H2BK120ub+H3K79me2-modified nucleosome ubiquitin position 6 提交 2023-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S33T, K120C 突变：S33T, K120C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.06 Å
8G6Q H2AK119ub-modified nucleosome ubiquitin position 1 提交 2023-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S33T 突变：S33T	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.41 Å
8G6S H2AK119ub-modified nucleosome ubiquitin position 2 提交 2023-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S33T 突变：S33T	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
8G86 Human Oct4 bound to nucleosome with human nMatn1 sequence (focused refinement of nucleosome) 提交 2023-02-17	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
8G88 Human Oct4 bound to nucleosome with human nMatn1 sequence 提交 2023-02-17	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
8G8B Nucleosome with human nMatn1 sequence in complex with Human Oct4 提交 2023-02-17	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8G8G Interaction of H3 tail in LIN28B nucleosome with Oct4 提交 2023-02-17	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES pH 7.5, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8GPN Human menin in complex with H3K79Me2 nucleosome 提交 2022-08-26	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8KD2 Rpd3S in complex with 187bp nucleosome 提交 2023-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 R 5–126（122 aa） 链 V 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8KD3 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification, H3K9Q mutation and 187bp DNA 提交 2023-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 R 5–126（122 aa） 链 V 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8KD4 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 187bp DNA, class1 提交 2023-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 R 5–126（122 aa） 链 V 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.93 Å
8KD5 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 187bp DNA, class2 提交 2023-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 R 5–126（122 aa） 链 V 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8KD6 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 187bp DNA, class3 提交 2023-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 R 5–126（122 aa） 链 V 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
8KD7 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 167bp DNA 提交 2023-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 R 5–126（122 aa） 链 V 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.09 Å
8PC5 H3K36me3 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex 提交 2023-06-09	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8PC6 H3K36me3 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex - pose 2 提交 2023-06-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
8PEO H3K36me2 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex 提交 2023-06-14	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.69 Å
8PEP H3K36me2 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex - pose 2 提交 2023-06-14	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8RUP Chromosome Passenger Complex (CPC) localization module in complex with H3.T3p-nucleosome 提交 2024-01-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10 mM TRIS-HCl, pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.3% n-octyl-beta-D-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blotting time, -10 force, no wait time.	分辨率 2.42 Å
8RUQ Borealin N-terminus in complex with H3.T3p-nucleosome 提交 2024-01-31	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10 mM TRIS-HCl, pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.3% n-octyl-beta-D-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blotting time, -10 force, no wait time.	分辨率 2.29 Å
8SIY Origin Recognition Complex Associated (ORCA) protein bound to H4K20me3-nucleosome 提交 2023-04-17	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 F 5–126（122 aa） 链 J 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8SKZ Cryo-EM structure of DDM1-HELLS chimera bound to the nucleosome 提交 2023-04-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8SVF BAP1/ASXL1 bound to the H2AK119Ub Nucleosome 提交 2023-05-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	突变：S33T 突变：S33T	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8T3T Structure of Bre1-nucleosome complex - state3 提交 2023-06-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.21 Å
8T3W Structure of Bre1-nucleosome complex - state2 提交 2023-06-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
8T3Y Structure of Bre1-nucleosome complex - state1 提交 2023-06-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES, pH 7.5, 50 mM NaCl, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
8T9F Catalytic and non-catalytic mechanisms of histone H4 lysine 20 methyltransferase SUV420H1 提交 2023-06-23	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；50 mM HEPES pH 7.9, 100 mM NaCl, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8T9G Automethylated PRC2 dimer bound to nucleosome 提交 2023-06-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 S 5–126（122 aa） 链 V 5–126（122 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
8T9H Catalytic and non-catalytic mechanisms of histone H4 lysine 20 methyltransferase SUV420H1 提交 2023-06-24	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；50 mM HEPES pH 7.9, 100 mM NaCl, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å
8TAS PRC2 monomer bound to nucleosome 提交 2023-06-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 S 5–126（122 aa） 链 V 5–126（122 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8TB9 PRC2-J119-450 monomer bound to H1-nucleosome 提交 2023-06-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 S 5–126（122 aa） 链 V 5–126（122 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8THU Catalytic and non-catalytic mechanisms of histone H4 lysine 20 methyltransferase SUV420H1 提交 2023-07-18	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；50 mM HEPES pH 7.9, 100 mM NaCl, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8TOF Rpd3S bound to an H3K36Cme3 modified nucleosome 提交 2023-08-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 d 5–126（122 aa） 链 h 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8U5H Cryo-EM structure of human DNMT3A UDR bound to H2AK119ub1-modified nucleosome 提交 2023-09-12	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 M 5–126（122 aa） 链 S 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
8UW1 Cryo-EM structure of DNMT3A1 UDR in complex with H2AK119Ub-nucleosome 提交 2023-11-05	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；50 mM HEPES pH 7.9, 100 mM NaCl, 2 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.88 Å
8UXQ Structure of Heterochromatin Protein 1 (HP1) alpha in complex with an H2A.Z nucleosome 提交 2023-11-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 H 2–126（125 aa） 链 N 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.30 Å
8V25 H2BK120ub-modified nucleosome ubiquitin position 1 提交 2023-11-21	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T, K117C 突变：S29T, K117C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.32 Å
8V26 H2BK120ub-modified nucleosome ubiquitin position 2 提交 2023-11-21	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T, K117C 突变：S29T, K117C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8V27 H2BK120ub-modified nucleosome ubiquitin position 3 提交 2023-11-21	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T, K117C 突变：S29T, K117C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
8V28 H2BK120ub-modified nucleosome ubiquitin position 4 提交 2023-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T, K117C 突变：S29T, K117C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.36 Å
8V4Y Cryo-EM structure of singly-bound SNF2h-nucleosome complex with SNF2h at inactive SHL2 (conformation 1) 提交 2023-11-29	构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；12.5 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 60 mM KCl, 5 mM MgCl2, 2 mM ADP, 2 mM BeSO4, 10 mM NaF, 1.5% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8V6V Cryo-EM structure of doubly-bound SNF2h-nucleosome complex 提交 2023-12-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；12.5 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 60 mM KCl, 5 mM MgCl2, 2 mM ADP, 2 mM BeSO4, 10 mM NaF, 1.5% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8V7L Cryo-EM structure of singly-bound SNF2h-nucleosome complex with SNF2h at inactive SHL2 (conformation 2) 提交 2023-12-04	构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；12.5 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 60 mM KCl, 5 mM MgCl2, 2 mM ADP, 2 mM BeSO4, 10 mM NaF, 1.5% glycerol cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8VO0 H3K36me3-modified nucleosome bound to PRC2_AJ1-450 with histone H3 tail disengaged 提交 2024-01-14	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 M 40–126（87 aa） 链 S 38–126（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8VOB H3K36me3-modified nucleosome bound to PRC2_AJ1-450 提交 2024-01-14	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 M 31–126（96 aa） 链 S 31–126（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8VX5 Nucleosome core particle containing an 8-oxoG damage site 提交 2024-02-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8VX6 Human OGG1 bound at the nucleosomal DNA entry site 提交 2024-02-03	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S29T 突变：S29T	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8XAA Structure of NAP1 in complex with H2A-H2B 提交 2023-12-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 J 28–126（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Tris, pH 8.0, 25 % v/v PEG 400	分辨率 3.35 Å R-free 0.261
8XAA Structure of NAP1 in complex with H2A-H2B 提交 2023-12-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 L 28–126（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Tris, pH 8.0, 25 % v/v PEG 400	分辨率 3.35 Å R-free 0.261
8XJV Structural basis for the linker histone H5-nucleosome binding and chromatin compaction 提交 2023-12-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 108 PDB 声明：110-meric	链 Aa 5–126（122 aa） 链 Ab 5–126（122 aa） 链 Ac 5–126（122 aa） 链 Ad 5–126（122 aa） 链 Af 5–126（122 aa） 链 Ag 5–126（122 aa） 链 At 5–126（122 aa） 链 J 5–126（122 aa） 链 M 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa） 链 O 5–126（122 aa） 链 P 5–126（122 aa） 链 Q 5–126（122 aa） 链 R 5–126（122 aa） 链 S 5–126（122 aa） 链 T 5–126（122 aa） 链 U 5–126（122 aa） 链 V 5–126（122 aa） 链 W 5–126（122 aa） 链 av 5–126（122 aa） 链 aw 5–126（122 aa） 链 ax 5–126（122 aa） 链 ay 5–126（122 aa） 链 az 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.60 Å
8ZVY Alpha-Synuclein with H2a-H2b dimer complex structure. 提交 2024-06-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 34–126（93 aa） 链 B 34–126（93 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；100 mM Tris pH 8.0 and 10% PEG 8000.	分辨率 1.72 Å R-free 0.220
9B2S Haspin bound to nucleosome in position 1 提交 2024-03-16	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S33T 突变：S33T	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.01 Å
9B2T Haspin bound to nucleosome in position 2 提交 2024-03-16	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S33T 突变：S33T	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.99 Å
9B3P The cryo-EM structure of the H2A.Z-H3.3 double-variant nucleosome 提交 2024-03-19	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Tris-HCl, 5mM NaCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Freezing condition: blot force 0, blot time 4.5 second	分辨率 3.00 Å
9C9X S.c INO80 in complex with Xenopus 0/80 nucleosome, Nucleosome 提交 2024-06-16	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 2.83 Å
9CA7 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the fully-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 R 2–126（125 aa） 链 T 2–126（125 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
9CA8 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the partially-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 R 2–126（125 aa） 链 T 2–126（125 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.92 Å
9CAA Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the pre-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 R 2–126（125 aa） 链 T 2–126（125 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.04 Å
9CAB Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the encounter state (composite structure) 提交 2024-06-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 R 2–126（125 aa） 链 T 2–126（125 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.94 Å
9CAN S.c INO80 in complex with Xenopus 0/40 nucleosome 提交 2024-06-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 3.30 Å
9CG9 Cryo-EM structure of an HMGB1 box bound to nucleosome at SHL-2 提交 2024-06-28	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	突变：S32T 突变：S32T	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample was applied to grid.	分辨率 2.94 Å
9DBY ncPRC1RYBP bound to singly modified H2AK119Ub nucleosome 提交 2024-08-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	突变：S33T 突变：S33T	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9DDE ncPRC1RYBP bound to H2AK119Ub/H1.4 chromatosome 提交 2024-08-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	突变：S33T 突变：S33T	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9DG3 ncPRC1RYBP Delta-linker mutant bound to singly modified H2AK119Ub nucleosome 提交 2024-09-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	突变：S33T 突变：S33T	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.46 Å
9DGG ncPRC1RYBP bound to unmodified nucleosome 提交 2024-09-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	突变：S33T 突变：S33T	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
9E1L Snf2h bound nucleosome complex - ClassA1 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
9E1M Snf2h bound nucleosome complex - ClassA2 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
9E1N Snf2h bound nucleosome complex-ClassA3 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9E1O Snf2h bound nucleosome complex - ClassB1 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9E1P Snf2h bound nucleosome complex - ClassB2 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.25 Å
9E1Q Snf2h bound nucleosome complex - ClassB3 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9E1R Snf2h bound nucleosome complex - ClassB4 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9E1U Snf2h bound nucleosome complex - ClassC1 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9E1V Snf2h bound nucleosome complex - ClassC2 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9E1W Snf2h bound nucleosome complex - ClassC3 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9E1X Snf2h bound nucleosome complex - ClassD1 提交 2024-10-21	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9E1Y Empty Nucleosome with 601 widom sequence 提交 2024-10-21	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9EGX RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-hexasome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 d 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGY RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 d 5–126（122 aa） 链 h 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGZ RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 d 5–126（122 aa） 链 h 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EH0 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 30 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 d 5–126（122 aa） 链 h 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9EH1 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 20 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 d 5–126（122 aa） 链 h 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9EH2 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-FACT nucleosome upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 h 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9EIL SIRT6 bound to an H3K27Ac nucleosome 提交 2024-11-26	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ZSL [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(3aR,5R,6R,6aR)-6-hydroxytetrahydro-2H-furo[2,3-d][1,3]oxathiol-5-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9F0O The molecular basis and modulation of lamin-specific chromatin interaction 提交 2024-04-17	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 30–126（97 aa） 链 H 30–126（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
9FH9 Structure of CyclinB1 N-terminus bound to the NCP 提交 2024-05-27	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9GD0 Structure of a hexasome-nucleosome complex with a dyad-to-dyad distance of 103 bp. 提交 2024-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9GD1 Structure of Chd1 bound to a hexasome-nucleosome complex with a dyad-to-dyad distance of 103 bp. 提交 2024-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
9GD2 Structure of Chd1 bound to a dinucleosome with a dyad-to-dyad distance of 103 bp. 提交 2024-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa） 链 Q 5–126（122 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9GD3 Structure of a mononucleosome bound by one copy of Chd1 with the DBD on the exit-side DNA. 提交 2024-08-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9GEN Recombinant Myeloperoxidase bound to nucleosome core particle 提交 2024-08-07	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 30–125（96 aa） 链 H 30–125（96 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.76 Å
9GEO Nucleosome core particle 提交 2024-08-07	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 30–125（96 aa） 链 H 30–125（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.79 Å
9GEP Native monomeric Myeloperoxidase bound to nucleosome core particle 提交 2024-08-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 D 30–125（96 aa） 链 H 30–125（96 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.89 Å
9GEQ Native dimeric Myeloperoxidase bound to nucleosome core particle; composite map 提交 2024-08-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 D 30–125（96 aa） 链 H 30–125（96 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
9GER Native dimeric Myeloperoxidase bound to nucleosome core particle, intermediate state; composite map 提交 2024-08-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 D 30–125（96 aa） 链 H 30–125（96 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.58 Å
9IGJ structure of two human ELF2 transcription factors in complex with a nucleosome 提交 2025-02-19	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；1 mM EDTA, 30 mM NaCl, 2 mM DTT in 20 mM HEPES, pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9IHD Nucleosome core particle bound by one molecule of DTT-reduced native monomeric myeloperoxidase 提交 2025-02-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 D 30–125（96 aa） 链 H 30–125（96 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å
9IHE Nucleosome core particle bound by two molecules of DTT-reduced native monomeric myeloperoxidase 提交 2025-02-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 D 30–125（96 aa） 链 H 30–125（96 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
9IHF Nucleosome core particle bound by one monomer and one dimer of of DTT-reduced native myeloperoxidase 提交 2025-02-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 D 30–125（96 aa） 链 H 30–125（96 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
9JAO The structure of SMARCAD1 bound to the hexasome in the presence of ADP-BeFx 提交 2024-08-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 H 5–126（122 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9M76 UHRF1 bound to a mononucleosome in its pre-active state, with the RING domain bound to the SRA domain. 提交 2025-03-09	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9M77 The activated state of human UHRF1 bound to a mononucleosome, with the finger loop ordered and linker 4 disordered. 提交 2025-03-09	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9MPP The cryo-EM structure of nucleosome-bound DNA methyltransferases DNMT3A2 and DNMT3L 提交 2024-12-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9N6I 2.61 A S.cerevisiae Chd1[L886G/L889G/L891G]-nucleosome 2:1 complex 提交 2025-02-05	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 33–126（94 aa） 链 H 33–126（94 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.61 Å
9NH8 CHD1-nucleosome complex (anchored state) 提交 2025-02-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ARG ARGININE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9NY4 USP21 bound to H2AK119ub nucleosome 提交 2025-03-26	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
9Q7U Composite map for Cryo-EM structure of DNMT3A2-DNMT3B3 tetramer bound to 167H3K36me2-nucleosome 提交 2025-08-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9QAJ Structure of the nucleosome-bound human BCL7A 提交 2025-02-28	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
9QIK M2 nucleosome 提交 2025-03-17	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–126（126 aa） 链 D 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.03 Å
9R5K Structural characterisation of chromatin remodelling intermediates supports linker DNA dependent product inhibition as a mechanism for nucleosome spacing. 提交 2025-05-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Hepes, 120mM Nacl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrified carried out in climate chamber with 100% humidity	分辨率 4.20 Å
9R5S Structural characterisation of chromatin remodelling intermediates supports linker DNA dependent product inhibition as a mechanism for nucleosome spacing. 提交 2025-05-09	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Hepes, 120mM Nacl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrified carried out in climate chamber with 100% humidity	分辨率 3.80 Å
9R5W Structural characterisation of chromatin remodelling intermediates supports linker DNA dependent product inhibition as a mechanism for nucleosome spacing. 提交 2025-05-10	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Hepes, 120mM Nacl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrified carried out in climate chamber with 100% humidity	分辨率 3.80 Å
9T4V ALC1/CHD1L in an intermediate conformation, bound to a PARylated nucleosome 提交 2025-11-02	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL were applied on grid and immediately blotted for 2.5 s at blot force 0.	分辨率 6.60 Å
9W74 Cryo-EM structure of the close-packed di-hexasome (CPDH) 提交 2025-08-05	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 5–126（122 aa） 链 N 5–126（122 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.94 Å
9WBZ The structure of NCP-motor-ARP module of ncBAF-nucleosome complex 提交 2025-08-15	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9WC0 The structure of NCP-RA module of ncBAF-nucleosome complex 提交 2025-08-15	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9XYC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-ELOF1-LEDGF-nucleosome LEDGF+nucleosome map Q 提交 2025-08-25	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 d 1–126（126 aa） 链 h 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9Y4P Cryo-EM structure of DNMT3A2/3B3 in complex with H3K36me2 di-nucleosome with eight base pair linker 提交 2025-09-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 D 5–126（122 aa） 链 H 5–126（122 aa） 链 P 5–126（122 aa） 链 T 5–126（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 18 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.84 Å

共 310 个其他 PDB 条目、327 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H2B11_XENLA
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–94； UniProt 33–126 作者链 H； PDB构建体 1–94； UniProt 33–126

Chromo domain-containing protein 1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32657

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 9 DNA 2 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物数一致	链 K； UniProt 122–956	片段：residues 122-956 突变：L886G, L889G, L891G	DNA Tracking Strand × 1 DNA Lagging Strand × 1 Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 2 （Q6AZJ8） Histone H2B 1.1 × 2 （P02281） Histone H3 × 2 （A0A310TTQ1）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.54 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9N6H	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2DY7 Solution structure of the first chromodomain of yeast Chd1 提交 2006-09-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 172–252（81 aa） 片段：chromodomain 1	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain; 20mM potassium phosphate buffer; 30mM d-DTT; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain; 20mM potassium phosphate buffer; 30mM d-DTT; 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain U-15N; 20mM potassium phosphate buffer; 30mM d-DTT; 90% H2O, 10% D2O | 290% H2O, 10% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain U-13C,15N; 20mM potassium phosphate buffer; 30mM d-DTT; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain U-13C,15N; 20mM potassium phosphate buffer; 30mM d-DTT; 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
2DY8 Solution structure of the second chromodomain of yeast Chd1 提交 2006-09-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 279–347（69 aa） 片段：chromodomain 2	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；293 K；离子强度（mmCIF原始值）300mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain; 20mM potassium phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain; 20mM potassium phosphate buffer; 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain U-15N; 20mM potassium phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain U-13C,15N; 20mM potassium phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3-0.5mM chromodomain U-13C,15N; 20mM potassium phosphate buffer; 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
2H1E Tandem chromodomains of budding yeast CHD1 提交 2006-05-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 174–339（166 aa） 片段：chromodomain, residues 174-339 链 B 174–339（166 aa） 片段：chromodomain, residues 174-339	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；283 K；10mM BTP, 12mM NaCl, 5mM TCEP, 0.9M ammonium sulfate, 3.75% isopropanol, 4.5mg/ml yeast CHD1 tandem chromodomains, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K, pH 8.00	分辨率 2.20 Å R-free 0.246
2H1E Tandem chromodomains of budding yeast CHD1 提交 2006-05-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 174–339（166 aa） 片段：chromodomain, residues 174-339 链 B 174–339（166 aa） 片段：chromodomain, residues 174-339	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；283 K；10mM BTP, 12mM NaCl, 5mM TCEP, 0.9M ammonium sulfate, 3.75% isopropanol, 4.5mg/ml yeast CHD1 tandem chromodomains, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K, pH 8.00	分辨率 2.20 Å R-free 0.246
2XB0 DNA-binding domain from Saccharomyces cerevisiae chromatin- remodelling protein Chd1 提交 2010-04-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 X 1009–1274（266 aa） 片段：DNA BINDING DOMAIN, RESIDUES 1009-1274	未记录	GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1 M TRIS, PH 8.5, 28% PEG 4K, 0.35 M MGCL2	分辨率 2.00 Å R-free 0.248
3MWY Crystal structure of the chromodomain-ATPase portion of the yeast Chd1 chromatin remodeler 提交 2010-05-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 W 142–939（798 aa） 片段：double chromodomains and ATPase motor (UNP residues 142-939)	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；18% PEG 3350; 400 mM K+/Na+ tartrate; 5% xylitol; 10 mM MgCl2; 1 mM ATPgammaS, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.70 Å R-free 0.318
3MWY Crystal structure of the chromodomain-ATPase portion of the yeast Chd1 chromatin remodeler 提交 2010-05-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 W 142–939（798 aa） 片段：double chromodomains and ATPase motor (UNP residues 142-939)	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；18% PEG 3350; 400 mM K+/Na+ tartrate; 5% xylitol; 10 mM MgCl2; 1 mM ATPgammaS, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.70 Å R-free 0.318
3TED Crystal structure of the Chd1 DNA-binding domain in complex with a DNA duplex 提交 2011-08-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1006–1274（269 aa） 片段：SANT/SLIDE DNA-binding domain, UNP residues 1006-1274	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；14-18% PEG 400 0.1 M BisTris, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.249
5J70 The Chd1 DNA-binding domain in complex with 17mer DNA duplex 提交 2016-04-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1006–1274（269 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；277 K；14% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.01M CaCl2, 0.05 M Na cacodylate, pH 5.5	分辨率 2.96 Å R-free 0.252
5J70 The Chd1 DNA-binding domain in complex with 17mer DNA duplex 提交 2016-04-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 B 1006–1274（269 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；277 K；14% PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.01M CaCl2, 0.05 M Na cacodylate, pH 5.5	分辨率 2.96 Å R-free 0.252
5O9G Structure of nucleosome-Chd1 complex 提交 2017-06-19	构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 W 1–1468（1468 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
6G0L Structure of two molecules of the chromatin remodelling enzyme Chd1 bound to a nucleosome 提交 2018-03-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 M 1–1468（1468 aa） 链 W 1–1468（1468 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
7NKX RNA polymerase II-Spt4/5-nucleosome-Chd1 structure 提交 2021-02-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 W 1–1468（1468 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7TN2 Composite model of a Chd1-nucleosome complex in the nucleotide-free state derived from 2.3A and 2.7A Cryo-EM maps 提交 2022-01-20	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 W 118–1274（1157 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；20 mM HEPES, pH 7.0, 60 mM KCl, 1.5 mM DTT, 1 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
9GD1 Structure of Chd1 bound to a hexasome-nucleosome complex with a dyad-to-dyad distance of 103 bp. 提交 2024-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 W 1–1468（1468 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
9GD2 Structure of Chd1 bound to a dinucleosome with a dyad-to-dyad distance of 103 bp. 提交 2024-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 S 1–1468（1468 aa） 链 T 1–1468（1468 aa） 链 W 1–1468（1468 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9GD3 Structure of a mononucleosome bound by one copy of Chd1 with the DBD on the exit-side DNA. 提交 2024-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 T 1–1468（1468 aa） 链 W 1–1468（1468 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9N6I 2.61 A S.cerevisiae Chd1[L886G/L889G/L891G]-nucleosome 2:1 complex 提交 2025-02-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 122–956（835 aa） 链 L 122–956（835 aa）	突变：L886G, L889G, L891G 突变：L886G, L889G, L891G	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.61 Å
9N6K 2.88 A S.cerevisiae Chd1[L886G/L889G/L891G]-nucleosome 2:1 complex with DNA-binding domain 提交 2025-02-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 122–1265（1144 aa） 链 L 122–1265（1144 aa）	突变：L886G, L889G, L891G 突变：L886G, L889G, L891G	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9R5S Structural characterisation of chromatin remodelling intermediates supports linker DNA dependent product inhibition as a mechanism for nucleosome spacing. 提交 2025-05-09	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 W 2–1468（1467 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Hepes, 120mM Nacl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrified carried out in climate chamber with 100% humidity	分辨率 3.80 Å

共 17 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CHD1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–835； UniProt 122–956

Histone H3

Xenopus laevis

UniProt A0A310TTQ1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 9 DNA 2 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 39–136 链 E； UniProt 39–136	未记录	DNA Tracking Strand × 1 DNA Lagging Strand × 1 Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A × 2 （Q6AZJ8） Histone H2B 1.1 × 2 （P02281） Chromo domain-containing protein 1 × 1 （P32657）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.54 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9N6H	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1S32 Molecular Recognition of the Nucleosomal 'Supergroove' 提交 2004-01-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14 IMT 4-AMINO-(1-METHYLIMIDAZOLE)-2-CARBOXYLIC ACID × 4 PYB 4-AMINO-(1-METHYLPYRROLE)-2-CARBOXYLIC ACID × 12 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 BAL BETA-ALANINE × 2 DIB 3-AMINO-(DIMETHYLPROPYLAMINE) × 2 OGG 2-(2-CARBAMOYLMETHOXY-ETHOXY)-ACETAMIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；Manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K	分辨率 2.05 Å R-free 0.243
21VV Cryo-EM structure of ncBAF bound to the nucleosome 提交 2025-12-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8.0, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.5 mM ADP, 8 mM NaF, 1 mM BeSO4. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
21WA Cryo-EM structure of the ATPase domain of SMARCA4 bound to a nucleosome 提交 2025-12-31	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8.0, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.5 mM ADP, 8 mM NaF, 1 mM BeSO4. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
21WC Cryo-EM structure of the ATPase domain of SMARCA4 and the finger helix of BCL7A bound to a nucleosome 提交 2025-12-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8.0, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.5 mM ADP, 8 mM NaF, 1 mM BeSO4. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6IRO the crosslinked complex of ISWI-nucleosome in the ADP-bound state 提交 2018-11-13	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
6IY2 Structure of Snf2-MMTV-A nucleosome complex at shl2 in ADP state 提交 2018-12-12	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 37–136（100 aa） 链 E 37–136（100 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
6IY3 Structure of Snf2-MMTV-A nucleosome complex at shl-2 in ADP state 提交 2018-12-12	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 37–136（100 aa） 链 E 37–136（100 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.67 Å
6J99 Cryo-EM structure of human DOT1L in complex with an H2B-monoubiquitinated nucleosome 提交 2019-01-22	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6JYL The crosslinked complex of ISWI-nucleosome in the ADP.BeF-bound state 提交 2019-04-26	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot 1.5s	分辨率 3.37 Å
6K1P The complex of ISWI-nucleosome in the ADP.BeF-bound state 提交 2019-05-10	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5；10 mM Tris, 50 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5s	分辨率 3.87 Å
6KIU Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (3.2 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6KIV Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6KIW Cryo-EM structure of human MLL3-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6KIX Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode1 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6KIZ Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode2 提交 2019-07-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6NZO Set2 bound to nucleosome 提交 2019-02-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：K36M 突变：K36M	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6PX1 Set2 bound to nucleosome 提交 2019-07-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：K36M 突变：K36M	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
6PX3 Set2 bound to nucleosome 提交 2019-07-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：K36M 突变：K36M	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6R1T Structure of LSD2/NPAC-linker/nucleosome core particle complex: Class 1, free nuclesome 提交 2019-03-15	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 38–136（99 aa） 链 E 38–136（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.02 Å
6R1U Structure of LSD2/NPAC-linker/nucleosome core particle complex: Class 2 提交 2019-03-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 M 2–136（135 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.36 Å
6R25 Structure of LSD2/NPAC-linker/nucleosome core particle complex: Class 3 提交 2019-03-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa） 链 M 2–136（135 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.61 Å
6S01 Structure of LEDGF PWWP domain bound H3K36 methylated nucleosome 提交 2019-06-13	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solution were made from stock solution cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds before plunging	分辨率 3.20 Å
6VYP Crystal structure of the LSD1/CoREST histone demethylase bound to its nucleosome substrate 提交 2020-02-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	突变：K4M 突变：K4M	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；277 K；25 mM HEPES pH7.5, 75 mM triammonium citrate, 10% PEG2000-MME, Modified Microbatch under oil	分辨率 4.99 Å R-free 0.277
6VYP Crystal structure of the LSD1/CoREST histone demethylase bound to its nucleosome substrate 提交 2020-02-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 a 2–136（135 aa） 链 e 2–136（135 aa）	突变：K4M 突变：K4M	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；277 K；25 mM HEPES pH7.5, 75 mM triammonium citrate, 10% PEG2000-MME, Modified Microbatch under oil	分辨率 4.99 Å R-free 0.277
6YN1 Crystal structure of histone chaperone APLF acidic domain bound to the histone H2A-H2B-H3-H4 octamer 提交 2020-04-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 C 39–136（98 aa） 链 H 39–136（98 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH6.5, 1.0 M tri-sodium citrate	分辨率 2.35 Å R-free 0.233
6YN1 Crystal structure of histone chaperone APLF acidic domain bound to the histone H2A-H2B-H3-H4 octamer 提交 2020-04-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 M 39–136（98 aa） 链 R 39–136（98 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH6.5, 1.0 M tri-sodium citrate	分辨率 2.35 Å R-free 0.233
6YN1 Crystal structure of histone chaperone APLF acidic domain bound to the histone H2A-H2B-H3-H4 octamer 提交 2020-04-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 W 39–136（98 aa） 链 b 39–136（98 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH6.5, 1.0 M tri-sodium citrate	分辨率 2.35 Å R-free 0.233
6YN1 Crystal structure of histone chaperone APLF acidic domain bound to the histone H2A-H2B-H3-H4 octamer 提交 2020-04-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 g 39–136（98 aa） 链 l 39–136（98 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH6.5, 1.0 M tri-sodium citrate	分辨率 2.35 Å R-free 0.233
6Z6P HDAC-PC-Nuc 提交 2020-05-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 39–135（97 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.43 Å
6ZHX Cryo-EM structure of the regulatory linker of ALC1 bound to the nucleosome's acidic patch: nucleosome class. 提交 2020-06-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：C110A 突变：C110A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 2.5 s, blot force 0. Two sample applications and blots were performed before vitrification.	分辨率 2.50 Å
6ZHY Cryo-EM structure of the regulatory linker of ALC1 bound to the nucleosome's acidic patch: hexasome class. 提交 2020-06-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：C110A 突变：C110A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 2.5 s, blot force 0. Two sample applications and blots were performed before vitrification.	分辨率 3.00 Å
7E8I Structural insight into BRCA1-BARD1 complex recruitment to damaged chromatin 提交 2021-03-01	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7EA5 Yeast Set2 bound to a nucleosome containing oncohistone mutations 提交 2021-03-06	构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 35–135（101 aa） 链 E 35–135（101 aa）	突变：K37M 突变：K37M	ZN ZINC ION × 3 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7KTQ Nucleosome from a dimeric PRC2 bound to a nucleosome 提交 2020-11-24	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 38–136（99 aa） 链 E 38–136（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7M1X Cryo-EM Structure of Nucleosome containing mouse histone variant H2A.Z 提交 2021-03-15	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4.5 seconds before plunging	分辨率 3.70 Å
7MBM Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode01 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 G 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.76 Å
7MBN Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode02 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 G 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.02 Å
7SWY 2.6 A structure of a 40-601[TA-rich+1]-40 nucleosome 提交 2021-11-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	突变：C110A 突变：C110A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；20 mM HEPES, pH 7.0, 60 mM KCl, 1.5 mM DTT, 1 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7TN2 Composite model of a Chd1-nucleosome complex in the nucleotide-free state derived from 2.3A and 2.7A Cryo-EM maps 提交 2022-01-20	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	突变：C110A 突变：C110A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；20 mM HEPES, pH 7.0, 60 mM KCl, 1.5 mM DTT, 1 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
7UD5 Complex between MLL1-WRAD and an H2B-ubiquitinated nucleosome 提交 2022-03-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：K4Nle, M90Nle, M120Nle 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：K4Nle, M90Nle, M120Nle 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.25 Å
7VDT The motor-nucleosome module of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7VDV The overall structure of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7VVU NuA4 HAT module bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.40 Å
7VVZ NuA4 bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 8.80 Å
7X3T Cryo-EM structure of ISW1a-dinucleosome 提交 2022-03-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.40 Å
7X3V Cryo-EM structure of IOC3-N2 nucleosome 提交 2022-03-01	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.09 Å
7X3W Cryo-EM structure of ISW1-N1 nucleosome 提交 2022-03-01	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7X3X Cryo-EM structure of N1 nucleosome-RA 提交 2022-03-01	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7XPX Cryo-EM structure of the histone methyltransferase SET8 bound to H4K20Ecx-nucleosome 提交 2022-05-06	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7YI1 Cryo-EM structure of Eaf3 CHD bound to H3K36me3 nucleosome 提交 2022-07-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7YI4 Cryo-EM structure of Rpd3S complex bound to H3K36me3 nucleosome in close state 提交 2022-07-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 G 2–136（135 aa） 链 K 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.96 Å
7YI5 Cryo-EM structure of Rpd3S complex bound to H3K36me3 nucleosome in loose state 提交 2022-07-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 G 2–136（135 aa） 链 K 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.96 Å
8B0A Cryo-EM structure of ALC1 bound to an asymmetric, site-specifically PARylated nucleosome 提交 2022-09-07	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8CBN structure of LEDGF/p75 PWWP domain bound to the H3K36 trimethylated dinucleosome 提交 2023-01-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
8CBQ structure of LEDGF/p75 PWWP domain bound to the H3K36 trimethylated dinucleosome 提交 2023-01-25	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8DU4 Complex between RbBP5-WDR5 and an H2B-ubiquitinated nucleosome 提交 2022-07-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：K4Nle, M90Nle, M120Nle 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：K4Nle, M90Nle, M120Nle 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
8ETT Class1 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 6.68 Å
8ETV Class2 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 3.16 Å
8EU2 Class3 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-18	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 2.93 Å
8EUE Class1 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 3.48 Å
8EUJ Class2 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 3.36 Å
8G57 Structure of nucleosome-bound Sirtuin 6 deacetylase 提交 2023-02-11	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 4–135（132 aa） 链 E 4–135（132 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；12.5 mM HEPES pH 7.5, 60 mM KCl, 1.5% glycerol, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
8G6G H2BK120ub+H3K79me2-modified nucleosome ubiquitin position 5 提交 2023-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：K79(MLY), C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：K79(MLY), C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.93 Å
8G6H H2BK120ub+H3K79me2-modified nucleosome ubiquitin position 6 提交 2023-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：K79(MLY), C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：K79(MLY), C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.06 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 NA 1–136（136 aa） 链 NE 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric	链 NA 1–136（136 aa） 链 NE 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
8HXX Cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3S 提交 2023-01-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 E 2–136（135 aa）	突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-Na pH 7.5, 40 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8HXY Cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3S in complex with nucleosome 提交 2023-01-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-Na pH 7.5, 40 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8HXZ Cryo-EM structure of Eaf3 CHD in complex with nucleosome 提交 2023-01-05	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-Na pH 7.5, 40 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8HY0 Composite cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3S in complex with nucleosome 提交 2023-01-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-Na pH 7.5, 40 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8IHM Eaf3 CHD domain bound to the nucleosome 提交 2023-02-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.58 Å
8IHN Cryo-EM structure of the Rpd3S core complex 提交 2023-02-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 2–25（24 aa） 片段：N-ter	未记录	ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å
8IHT Rpd3S bound to the nucleosome 提交 2023-02-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.72 Å
8JHO Cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3S in complex with di-nucleosome 提交 2023-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa） 链 a 2–136（135 aa） 链 e 2–136（135 aa）	突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-Na pH 7.5, 40 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.60 Å
8KD2 Rpd3S in complex with 187bp nucleosome 提交 2023-08-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 O 2–136（135 aa） 链 S 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8KD3 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification, H3K9Q mutation and 187bp DNA 提交 2023-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 O 2–136（135 aa） 链 S 2–136（135 aa）	突变：C110A, K9Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C110A, K9Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8KD4 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 187bp DNA, class1 提交 2023-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 O 2–136（135 aa） 链 S 2–136（135 aa）	突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.93 Å
8KD5 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 187bp DNA, class2 提交 2023-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 O 2–136（135 aa） 链 S 2–136（135 aa）	突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8KD6 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 187bp DNA, class3 提交 2023-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 O 2–136（135 aa） 链 S 2–136（135 aa）	突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
8KD7 Rpd3S in complex with nucleosome with H3K36MLA modification and 167bp DNA 提交 2023-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 O 2–136（135 aa） 链 S 2–136（135 aa）	突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.09 Å
8PC5 H3K36me3 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex 提交 2023-06-09	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8PC6 H3K36me3 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex - pose 2 提交 2023-06-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
8PEO H3K36me2 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex 提交 2023-06-14	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.69 Å
8PEP H3K36me2 nucleosome-LEDGF/p75 PWWP domain complex - pose 2 提交 2023-06-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 39–136（98 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8RUP Chromosome Passenger Complex (CPC) localization module in complex with H3.T3p-nucleosome 提交 2024-01-31	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 E 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10 mM TRIS-HCl, pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.3% n-octyl-beta-D-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blotting time, -10 force, no wait time.	分辨率 2.42 Å
8RUQ Borealin N-terminus in complex with H3.T3p-nucleosome 提交 2024-01-31	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 E 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10 mM TRIS-HCl, pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.3% n-octyl-beta-D-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 s blotting time, -10 force, no wait time.	分辨率 2.29 Å
8TOF Rpd3S bound to an H3K36Cme3 modified nucleosome 提交 2023-08-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8XJV Structural basis for the linker histone H5-nucleosome binding and chromatin compaction 提交 2023-12-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 108 PDB 声明：110-meric	链 X 1–136（136 aa） 链 Y 1–136（136 aa） 链 Z 1–136（136 aa） 链 a 1–136（136 aa） 链 b 1–136（136 aa） 链 c 1–136（136 aa） 链 d 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa） 链 f 1–136（136 aa） 链 g 1–136（136 aa） 链 h 1–136（136 aa） 链 i 1–136（136 aa） 链 j 1–136（136 aa） 链 k 1–136（136 aa） 链 l 1–136（136 aa） 链 m 1–136（136 aa） 链 n 1–136（136 aa） 链 o 1–136（136 aa） 链 p 1–136（136 aa） 链 q 1–136（136 aa） 链 r 1–136（136 aa） 链 s 1–136（136 aa） 链 t 1–136（136 aa） 链 u 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.60 Å
9C9X S.c INO80 in complex with Xenopus 0/80 nucleosome, Nucleosome 提交 2024-06-16	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 2.83 Å
9CAN S.c INO80 in complex with Xenopus 0/40 nucleosome 提交 2024-06-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 3.30 Å
9EAR CHD1-nucleosome complex (closed state) 提交 2024-11-11	构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：K4C C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：K4C C110A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9EGX RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-hexasome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGY RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGZ RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EH0 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 30 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9EH1 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 20 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9EH2 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-FACT nucleosome upstream 提交 2024-11-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9JAO The structure of SMARCAD1 bound to the hexasome in the presence of ADP-BeFx 提交 2024-08-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9JNP Structure of isw1-nucleosome complex in ATP state 提交 2024-09-23	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
9JNT Structure of isw1-nucleosome complex in ADP* state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9JNU Structure of isw1-nucleosome complex in ADP state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9JNV Structure of isw1-nucleosome complex in ADP(S) state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9JNW Structure of isw1-nucleosome complex in ADP+ state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9JNX Structure of isw1-nucleosome complex in ADP*+ state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9JNZ Structure of isw1-nucleosome complex in Apo state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9JO2 Structure of isw1-nucleosome complex in Apo* state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9JO5 Structure of isw1-nucleosome complex in ADP-B state 提交 2024-09-24	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9KQ2 Cryo-EM structure of RNF168'-RNF168-UbcH5c complex bound to nucleosome 提交 2024-11-25	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9LIU Structure of isw1-nucleosome double-bound complex in ATP-ATP state 提交 2025-01-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9LJ2 Structure of isw1-nucleosome double-bound complex in ADP-ADP+ state 提交 2025-01-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 38–135（98 aa） 链 E 38–135（98 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
9M76 UHRF1 bound to a mononucleosome in its pre-active state, with the RING domain bound to the SRA domain. 提交 2025-03-09	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9M77 The activated state of human UHRF1 bound to a mononucleosome, with the finger loop ordered and linker 4 disordered. 提交 2025-03-09	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9N6I 2.61 A S.cerevisiae Chd1[L886G/L889G/L891G]-nucleosome 2:1 complex 提交 2025-02-05	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 37–136（100 aa） 链 E 37–136（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.61 Å
9Q7U Composite map for Cryo-EM structure of DNMT3A2-DNMT3B3 tetramer bound to 167H3K36me2-nucleosome 提交 2025-08-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 9 SAO 5'-S-[(3S)-3-azaniumyl-3-carboxypropyl]-5'-thioadenosine × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9UX9 local ATPase-NCP structure of the ncBAF-nucleosome complex in the ADP-BeFx-bound state 提交 2025-05-13	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
9UXA local ARP-NCP structure of the ncBAF-nucleosome complex in the apo state 提交 2025-05-13	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
9V2V Cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3L in complex with mono-nucleosome 提交 2025-05-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 Q 38–135（98 aa） 链 U 38–135（98 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9V2W Cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3L in complex with di-nucleosome 提交 2025-05-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 H 38–135（98 aa） 链 Q 38–135（98 aa） 链 U 38–135（98 aa） 链 W 38–135（98 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9V33 Calypso/Asx/NCP-ub complex 提交 2025-05-21	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 5.90 Å
9V9Q Cryo-EM structure of the cPRC1-UbcH5c E3-E2 complex bound to the H2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å
9V9R Cryo-EM structure of the ncPRC1.1-UbcH5c E3-E2 complex bound to the H2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.20 Å
9V9S Cryo-EM structure of the ncPRC1.1 complex bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.80 Å
9V9T Cryo-EM structure of the ncPRC1.6 complex bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å
9V9U Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing two RNF2-BMI1 bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.70 Å
9V9V Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RNF2-BMI1 and one RYBP bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.80 Å
9V9W Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing two RYBP bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
9V9X Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RNF2-BMI1 bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.30 Å
9V9Y Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RNF2-BMI1 and one RYBP bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.20 Å
9V9Z Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RYBP bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
9Y4P Cryo-EM structure of DNMT3A2/3B3 in complex with H3K36me2 di-nucleosome with eight base pair linker 提交 2025-09-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 A 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 18 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.84 Å

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UniProt名称	A0A310TTQ1_XENLA
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–98； UniProt 39–136 作者链 E； PDB构建体 1–98； UniProt 39–136

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