8uqo

PLCb3-Gbg-Gaq complex on membranes

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 134.6 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1

Homo sapiens

UniProt P62873

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–340 链 C; UniProt 1–340 未记录 Guanine nucleotide-binding protein subunit gamma × 2 (G3V2N0) Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha × 1 (P50148) 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3 × 1 (Q01970) GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.37 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 1260 个其他 PDB 条目、1263 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GBB1_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–340; UniProt 1–340 作者链 C; PDB构建体 1–340; UniProt 1–340

Guanine nucleotide-binding protein subunit gamma

Homo sapiens

UniProt G3V2N0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 39–110 链 G; UniProt 39–110 未记录 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 2 (P62873) Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha × 1 (P50148) 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3 × 1 (Q01970) GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.37 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G3V2N0_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 2–73; UniProt 39–110 作者链 G; PDB构建体 2–73; UniProt 39–110

Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha

Homo sapiens

UniProt P50148

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 7–359 未记录 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 2 (P62873) Guanine nucleotide-binding protein subunit gamma × 2 (G3V2N0) 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3 × 1 (Q01970) GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.37 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GNAQ_HUMAN
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–355; UniProt 7–359

1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3

Homo sapiens

UniProt Q01970

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白拷贝数一致 链 Q; UniProt 10–1234 未记录 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 2 (P62873) Guanine nucleotide-binding protein subunit gamma × 2 (G3V2N0) Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha × 1 (P50148) GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.37 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 12 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PLCB3_HUMAN
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 10–1234; UniProt 10–1234

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8uqo

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8uqo
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8uqo
沉积日期 deposition_date2023-10-24
最后修订 last_revision2023-12-06
结构标题 titlePLCb3-Gbg-Gaq complex on membranes
关键词 keywordsPLCb3, Gbg, Gaq, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier43.07
回转半径 Rg (电子) rg_electron42.48
零角强度 I(0) i0589408000.00
分子量 molecular_weight198580.0 kDa
排除体积 excluded_volume247810 ų
包络体积 envelope_volume344530 ų
水化壳体积 shell_volume66807 ų
包络直径 envelope_diameter138.4
壳层 Rg shell_rg48.50
包络 Rg envelope_rg41.78
形状 Rg shape_rg42.48
总 Rg total_rg42.75
总原子数 total_atoms13958
残基数 n_residues1823
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax134.6
Rg (实空间) rg_real42.90
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.91
I(0) (实空间) i0_real5.8940e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error9.9870e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal43.07
I(0) (倒空间) i0_reciprocal589500000.0000
解质量估计 total_estimate0.8972
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary61.8
偏度 Skewness skewness0.079
峰度 Kurtosis kurtosis-0.662
角度范围 angular_range— – 0.1850 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha156900000.0000
实空间数据点数 n_real_points38
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.942; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.835

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)