Cysteinyl leukotriene receptor 1,Soluble cytochrome b562,Cysteinyl leukotriene receptor 1
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 23–127 | 未记录 | KNT pranlukast × 1 NA SODIUM ION × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 9 OLA OLEIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；100 mM sodium citrate pH 6 200-600 mM lithium nitrate 30-38% v/v PEG400 | 分辨率 2.70 Å R-free 0.254 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 6RZ4 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10KT Crystal structure of A2A adenosine receptor A2AR-bRIL in complex with Compound50 提交 2026-01-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 A1C5S (4%{S})-2-[(3%{R},6%{S})-1-(1-ethyl-1%{H}-pyrazol-4-yl)-6-methylpiperidin-3-yl]-7-methoxy[1,2,4]triazolo[1,5-%{c}]quinazolin-5-amine × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 17 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 6 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；0.1 M sodium citrate buffer pH 5.0, 0.02-0.04 M Na thiocyanate, 27-30% PEG400, and 2% (v/v) 2, 5-Hexanediol
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.243 |
| 11TD Structure of human CCR4 in apo state 提交 2026-03-12 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 11TF Structure of human CCR4 in complex with PRT193 提交 2026-03-12 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1DAO (1R,3r)-3-{(3R)-3-[1-(5-chloro-4-{[(1R)-1-(2,4-dichlorophenyl)ethyl]amino}-6-methylpyrimidin-2-yl)azetidin-3-yl]piperidin-1-yl}-1-methylcyclobutane-1-carboxylic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 11TH Structure of human CCR4 in complex with FLX475 提交 2026-03-12 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1DAP 2-[(3R)-3-(1-{1-[(1R)-1-(2,4-dichlorophenyl)ethyl]-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl}azetidin-3-yl)piperidin-1-yl]ethan-1-ol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 11TK Structure of human CCR4 in complex with AZD2098 提交 2026-03-12 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1DAN 2,3-dichloro-N-(3-methoxypyrazin-2-yl)benzene-1-sulfonamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 11TL Structure of human CCR4 in complex with GSK2239633A 提交 2026-03-12 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1DAM N-[(3-{[3-(5-chlorothiophene-2-sulfonamido)-4-methoxy-1H-indazol-1-yl]methyl}phenyl)methyl]-2-hydroxy-2-methylpropanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 1APC SOLUTION STRUCTURE OF APOCYTOCHROME B562 提交 1993-10-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1LM3 A Multi-generation Analysis of Cytochrome b562 Redox Variants: Evolutionary Strategies for Modulating Redox Potential Revealed Using a Library Approach 提交 2002-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：F61I, F65Y, R106L 突变：F61I, F65Y, R106L | MG MAGNESIUM ION × 3 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；302 K；30% polyethylene glycol 4000, 0.1M MgCl2, 0.1M Tris HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 302K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.333 |
| 1M6T CRYSTAL STRUCTURE OF B562RIL, A REDESIGNED FOUR HELIX BUNDLE 提交 2002-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M7W,H102I,R106L | SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；298 K；3.2 M NH4(SO4), 2.44 mM N-octanoylsucrose, 0.1 M Bicine, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.248 |
| 1QPU SOLUTION STRUCTURE OF OXIDIZED ESCHERICHIA COLI CYTOCHROME B562 提交 1999-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）500 mM PHOSPHATE；压力 AMBIENT
NMR测量条件
pH 4.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）500 mM PHOSPHATE；压力 AMBIENT
NMR测量条件
pH 4.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）500 mM PHOSPHATE；压力 AMBIENT
NMR样品组成
3 MM CYTOCHROME B562, 500 MM PHOSPHATE BUFFER, PH 4.8
NMR样品组成
3 MM CYTOCHROME B562 U-15N, 500 MM PHOSPHATE BUFFER, PH 4.8
NMR样品组成
3 MM CYTOCHROME B562, 500 MM PHOSPHATE BUFFER, PH 4.8
|
分辨率未提供 |
| 1QQ3 THE SOLUTION STRUCTURE OF THE HEME BINDING VARIANT ARG98CYS OF OXIDIZED ESCHERICHIA COLI CYTOCHROME B562 提交 1999-06-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：R98C | HEB HEME B/C × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）500mM PHOSPHATE；压力 AMBIENT
NMR测量条件
pH 4.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）500mM PHOSPHATE；压力 AMBIENT
NMR样品组成
3MM R98C CYTOCHROME B562; 500MM PHOSPHATE BUFFER; 90% H2O, 10% D2O
NMR样品组成
2.5MM R98C CYTOCHROME B562; 500MM PHOSPHATE BUFFER; 90% H2O, 10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 22EM Gi bound kappa-opioid receptor in complex with beta01 提交 2026-01-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 F
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |
| 24XY P2Y13R-Gq complex bound to ADP 提交 2026-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：mutation | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 24XZ P2Y14R-Gi complex bound to UDP 提交 2026-03-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：mutation | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.93 Å |
| 256B IMPROVEMENT OF THE 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION MODEL OF CYTOCHROME B562 BY REDETERMINING THE PRIMARY STRUCTURE AND USING MOLECULAR GRAPHICS 提交 1990-01-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.40 Å |
| 256B IMPROVEMENT OF THE 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION MODEL OF CYTOCHROME B562 BY REDETERMINING THE PRIMARY STRUCTURE AND USING MOLECULAR GRAPHICS 提交 1990-01-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.40 Å |
| 25IK Cryo-EM structure of MasR(FL)-Gq 提交 2026-04-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
25–127（103 aa）
|
突变：M29W/H124I | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 25IL Cryo-EM structure of MasR(del2-25)-Gq 提交 2026-04-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
25–127（103 aa）
|
突变：M29W,H124I | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 28VJ NorA bound to miniprotein I-23 提交 2026-02-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
22–128（107 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 2BC5 Crystal structure of E. coli cytochrome b562 with engineered c-type heme linkages 提交 2005-10-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, R98C, Y101C | SO4 SULFATE ION × 1 HEC HEME C × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；70% ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.277 |
| 2BC5 Crystal structure of E. coli cytochrome b562 with engineered c-type heme linkages 提交 2005-10-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 10 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, R98C, Y101C 突变：K59W, R98C, Y101C | SO4 SULFATE ION × 4 HEC HEME C × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；70% ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.277 |
| 2BC5 Crystal structure of E. coli cytochrome b562 with engineered c-type heme linkages 提交 2005-10-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, R98C, Y101C | SO4 SULFATE ION × 3 HEC HEME C × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；70% ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.277 |
| 2BC5 Crystal structure of E. coli cytochrome b562 with engineered c-type heme linkages 提交 2005-10-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, R98C, Y101C | SO4 SULFATE ION × 4 HEC HEME C × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；70% ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.277 |
| 2BC5 Crystal structure of E. coli cytochrome b562 with engineered c-type heme linkages 提交 2005-10-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, R98C, Y101C | SO4 SULFATE ION × 1 HEC HEME C × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；70% ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.277 |
| 2BC5 Crystal structure of E. coli cytochrome b562 with engineered c-type heme linkages 提交 2005-10-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, R98C, Y101C 突变：K59W, R98C, Y101C 突变：K59W, R98C, Y101C 突变：K59W, R98C, Y101C | SO4 SULFATE ION × 9 HEC HEME C × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；70% ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.277 |
| 2BC5 Crystal structure of E. coli cytochrome b562 with engineered c-type heme linkages 提交 2005-10-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, R98C, Y101C 突变：K59W, R98C, Y101C 突变：K59W, R98C, Y101C 突变：K59W, R98C, Y101C | SO4 SULFATE ION × 9 HEC HEME C × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；70% ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.277 |
| 2BC5 Crystal structure of E. coli cytochrome b562 with engineered c-type heme linkages 提交 2005-10-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, R98C, Y101C 突变：K59W, R98C, Y101C 突变：K59W, R98C, Y101C 突变：K59W, R98C, Y101C | SO4 SULFATE ION × 9 HEC HEME C × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；70% ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.277 |
| 2BC5 Crystal structure of E. coli cytochrome b562 with engineered c-type heme linkages 提交 2005-10-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, R98C, Y101C 突变：K59W, R98C, Y101C 突变：K59W, R98C, Y101C 突变：K59W, R98C, Y101C | SO4 SULFATE ION × 9 HEC HEME C × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；70% ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.277 |
| 2BC5 Crystal structure of E. coli cytochrome b562 with engineered c-type heme linkages 提交 2005-10-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 9 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, R98C, Y101C 突变：K59W, R98C, Y101C | SO4 SULFATE ION × 5 HEC HEME C × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；70% ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.277 |
| 2QLA Crystal Structure of a 16-Helix Bundle Architecture Produced by the Zinc-Mediated Self Assembly of Four Cytochrome cb562 Molecules 提交 2007-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：K59H, D73H, K77H, R98C, Y101C 突变：K59H, D73H, K77H, R98C, Y101C 突变：K59H, D73H, K77H, R98C, Y101C 突变：K59H, D73H, K77H, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；100mM Tris, 1.25 mM ZnCl2, 25% PEG 3350, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.295 |
| 3C62 Tetrameric Cytochrome cb562 (H59/D62/H63/H73/A74/H77) Assembly Stabilized by Interprotein Zinc Coordination 提交 2008-02-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：K59H, R62D, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C 突变：K59H, R62D, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C 突变：K59H, R62D, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C 突变：K59H, R62D, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 5 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；11% PEG 400, 100 mM CaCl2, 100 mM TRIS, 2 mM ZnCl2,
pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.273 |
| 3C63 Tetrameric Cytochrome cb562 (K34/H59/D62/H63/H73/A74/H77) Assembly Stabilized by Interprotein Zinc Coordination 提交 2008-02-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：R34K, K59H, R62D, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C 突变：R34K, K59H, R62D, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C 突变：R34K, K59H, R62D, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C 突变：R34K, K59H, R62D, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 5 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；12% PEG 400, 200 mM CaCl2, 100 mM TRIS, 1.25 mM ZnCl2,
pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.247 |
| 3DE8 Crystal Structure of a Dimeric Cytochrome cb562 Assembly Induced by Copper Coordination 提交 2008-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：K59H, D73H, K77H, R98C, Y101C 突变：K59H, D73H, K77H, R98C, Y101C 突变：K59H, D73H, K77H, R98C, Y101C 突变：K59H, D73H, K77H, R98C, Y101C | CU COPPER (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM Hepes, 25% PEG 3350, 200 mM CaCl2, 17.8 mM CuSO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.244 |
| 3DE8 Crystal Structure of a Dimeric Cytochrome cb562 Assembly Induced by Copper Coordination 提交 2008-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：K59H, D73H, K77H, R98C, Y101C 突变：K59H, D73H, K77H, R98C, Y101C | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM Hepes, 25% PEG 3350, 200 mM CaCl2, 17.8 mM CuSO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.244 |
| 3DE8 Crystal Structure of a Dimeric Cytochrome cb562 Assembly Induced by Copper Coordination 提交 2008-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：K59H, D73H, K77H, R98C, Y101C 突变：K59H, D73H, K77H, R98C, Y101C | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM Hepes, 25% PEG 3350, 200 mM CaCl2, 17.8 mM CuSO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.244 |
| 3DE9 Crystal Structure of a Trimeric Cytochrome cb562 Assembly Induced by Nickel Coordination 提交 2008-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：K59H, D73H, K77H, R98C, Y101C | NI NICKEL (II) ION × 9 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 23% PEG 4000, 4.16 mM NiSO4, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.278 |
| 3FOO A Triangular Cytochrome b562 Superstructure Mediated by Ni Coordination - Monoclinic Form 提交 2008-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C 突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C 突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 3 NI NICKEL (II) ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；25% PEG2000, 0.2 M NaCl, 0.1 M TRIS, 3.3 mM NiCl2, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.268 |
| 3FOO A Triangular Cytochrome b562 Superstructure Mediated by Ni Coordination - Monoclinic Form 提交 2008-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
链 F
23–128（106 aa）
|
突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C 突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C 突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 3 NI NICKEL (II) ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；25% PEG2000, 0.2 M NaCl, 0.1 M TRIS, 3.3 mM NiCl2, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.268 |
| 3FOO A Triangular Cytochrome b562 Superstructure Mediated by Ni Coordination - Monoclinic Form 提交 2008-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 G
23–128（106 aa）
链 H
23–128（106 aa）
链 I
23–128（106 aa）
|
突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C 突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C 突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 3 NI NICKEL (II) ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；25% PEG2000, 0.2 M NaCl, 0.1 M TRIS, 3.3 mM NiCl2, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.268 |
| 3FOO A Triangular Cytochrome b562 Superstructure Mediated by Ni Coordination - Monoclinic Form 提交 2008-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 J
23–128（106 aa）
链 K
23–128（106 aa）
链 L
23–128（106 aa）
|
突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C 突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C 突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 3 NI NICKEL (II) ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；25% PEG2000, 0.2 M NaCl, 0.1 M TRIS, 3.3 mM NiCl2, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.268 |
| 3FOP A Triangular Cytochrome b562 Superstructure Mediated by Ni Coordination - Hexagonal Form 提交 2008-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 NI NICKEL (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；25% PEG2000, 0.2 M MgCl2, 0.1 M TRIS, 3.3 mM NiCl2, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.277 |
| 3FOP A Triangular Cytochrome b562 Superstructure Mediated by Ni Coordination - Hexagonal Form 提交 2008-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 NI NICKEL (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；25% PEG2000, 0.2 M MgCl2, 0.1 M TRIS, 3.3 mM NiCl2, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.277 |
| 3FOP A Triangular Cytochrome b562 Superstructure Mediated by Ni Coordination - Hexagonal Form 提交 2008-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C 突变：K59C, R62A, H63A, K77H, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 3 NI NICKEL (II) ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；25% PEG2000, 0.2 M MgCl2, 0.1 M TRIS, 3.3 mM NiCl2, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.277 |
| 3HNI Crystal structure of the Zn-induced tetramer of the engineered cyt cb562 variant RIDC-1 提交 2009-05-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；100 mM HEPES, 30% Jeffamine ED-2001, 1.5 mM zinc chloride, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.278 |
| 3HNI Crystal structure of the Zn-induced tetramer of the engineered cyt cb562 variant RIDC-1 提交 2009-05-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 E
23–128（106 aa）
链 F
23–128（106 aa）
链 G
23–128（106 aa）
链 H
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；100 mM HEPES, 30% Jeffamine ED-2001, 1.5 mM zinc chloride, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.278 |
| 3HNJ Crystal structure of the Zn-induced tetramer of the engineered cyt cb562 variant RIDC-2 提交 2009-05-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, I67L, V69I, Q71A, A89K, Q93L, T96A, T97I 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, I67L, V69I, Q71A, A89K, Q93L, T96A, T97I 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, I67L, V69I, Q71A, A89K, Q93L, T96A, T97I 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, I67L, V69I, Q71A, A89K, Q93L, T96A, T97I | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 ZN ZINC ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；100 mM BIS-TRIS, 25% PEG 3350, 3.4 mM zinc chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.272 |
| 3HNK Crystal structure of the dimeric assembly of the cyt cb562 variant RIDC-1 提交 2009-05-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；26% PEG 2000, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.271 |
| 3HNK Crystal structure of the dimeric assembly of the cyt cb562 variant RIDC-1 提交 2009-05-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；26% PEG 2000, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.271 |
| 3HNK Crystal structure of the dimeric assembly of the cyt cb562 variant RIDC-1 提交 2009-05-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；26% PEG 2000, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.271 |
| 3HNL Crystal structure of the Cu-induced dimer of the engineered cyt cb562 variant RIDC-1 提交 2009-05-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CU COPPER (II) ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM HEPES, 200 mM sodium chloride, 25% PEG 3350, 10.7 mM copper sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.270 |
| 3HNL Crystal structure of the Cu-induced dimer of the engineered cyt cb562 variant RIDC-1 提交 2009-05-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, D66W, V69I | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 CU COPPER (II) ION × 4 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM HEPES, 200 mM sodium chloride, 25% PEG 3350, 10.7 mM copper sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.270 |
| 3IQ5 Crystal structure of an engineered metal-free tetrameric cytochrome cb562 complex templated by Zn-coordination 提交 2009-08-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% PEG 400, 0.1M Bis-Tris, 0.15M Sodium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.277 |
| 3IQ5 Crystal structure of an engineered metal-free tetrameric cytochrome cb562 complex templated by Zn-coordination 提交 2009-08-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% PEG 400, 0.1M Bis-Tris, 0.15M Sodium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.277 |
| 3IQ6 Crystal structure of a tetrameric Zn-bound cytochrome cb562 complex with covalently and non-covalently stabilized interfaces 提交 2009-08-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 2000, 0.1M HEPES, 0.15 M Sodium chloride, 1.15 mM Zinc chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.296 |
| 3IQ6 Crystal structure of a tetrameric Zn-bound cytochrome cb562 complex with covalently and non-covalently stabilized interfaces 提交 2009-08-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 E
23–128（106 aa）
链 F
23–128（106 aa）
链 G
23–128（106 aa）
链 H
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 2000, 0.1M HEPES, 0.15 M Sodium chloride, 1.15 mM Zinc chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.296 |
| 3L1M Crystal Structure of a Ni-directed Dimer of Cytochrome cb562 with a Quinolate-Histidine Hybrid Coordination Motif 提交 2009-12-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：residues 23-128
|
突变：K59W, G70C, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 HQI N-(8-hydroxyquinolin-5-yl)acetamide × 2 NI NICKEL (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 25% PEG 1500, 1.05 mM nickel(II) sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.314 |
| 3L1M Crystal Structure of a Ni-directed Dimer of Cytochrome cb562 with a Quinolate-Histidine Hybrid Coordination Motif 提交 2009-12-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：residues 23-128
|
突变：K59W, G70C, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 HQI N-(8-hydroxyquinolin-5-yl)acetamide × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 25% PEG 1500, 1.05 mM nickel(II) sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.314 |
| 3M15 A Zn-mediated asymmetric trimer of a cytochrome cb562 variant (D74A-RIDC1) 提交 2010-03-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 3 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å R-free 0.313 |
| 3M4B A Zn-mediated tetrahedral protein lattice cage 提交 2010-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, I67C, V69I, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, I67C, V69I, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, I67C, V69I, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, I67C, V69I, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 12 ACT ACETATE ION × 12 ZN ZINC ION × 36 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 1500, 0.1 M Bis-Tris, 0.2 M CaCl2 and 5 mM ZnCl2., pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.256 |
| 3M4C A Zn-mediated tetrahedral protein lattice cage encapsulating a microperoxidase 提交 2010-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, I67C, V69I, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, I67C, V69I, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, I67C, V69I, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, I67C, V69I, D73H, D74A, K77H, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 15 ACT ACETATE ION × 12 ZN ZINC ION × 30 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；12% PEG 1900 MME , 0.1 M HEPES pH 7.5 , 0.2 M NaCl, 2 mM ZnCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.223 |
| 3M79 A tetrameric Zn-bound cytochrome cb562 complex with covalently and non-covalently stabilized interfaces crystallized in the presence of Cu(II) and Zn(II) 提交 2010-03-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å R-free 0.271 |
| 3M79 A tetrameric Zn-bound cytochrome cb562 complex with covalently and non-covalently stabilized interfaces crystallized in the presence of Cu(II) and Zn(II) 提交 2010-03-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 E
23–128（106 aa）
链 F
23–128（106 aa）
链 G
23–128（106 aa）
链 H
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å R-free 0.271 |
| 3NMI Crystal structure of the phenanthroline-modified cytochrome cb562 variant, MBP-Phen2 提交 2010-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：W59C, R62A, H63A, D66A, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；2.8 M sodium acetate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.235 |
| 3NMI Crystal structure of the phenanthroline-modified cytochrome cb562 variant, MBP-Phen2 提交 2010-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：W59C, R62A, H63A, D66A, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；2.8 M sodium acetate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.235 |
| 3NMI Crystal structure of the phenanthroline-modified cytochrome cb562 variant, MBP-Phen2 提交 2010-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：W59C, R62A, H63A, D66A, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；2.8 M sodium acetate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.235 |
| 3NMI Crystal structure of the phenanthroline-modified cytochrome cb562 variant, MBP-Phen2 提交 2010-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：W59C, R62A, H63A, D66A, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；2.8 M sodium acetate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.235 |
| 3NMI Crystal structure of the phenanthroline-modified cytochrome cb562 variant, MBP-Phen2 提交 2010-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
23–128（106 aa）
|
突变：W59C, R62A, H63A, D66A, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；2.8 M sodium acetate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.235 |
| 3NMI Crystal structure of the phenanthroline-modified cytochrome cb562 variant, MBP-Phen2 提交 2010-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 F
23–128（106 aa）
|
突变：W59C, R62A, H63A, D66A, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；2.8 M sodium acetate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.235 |
| 3NMJ Crystal structure of a nickel mediated dimer for the phenanthroline-modified cytochrome cb562 variant, MBP-Phen2 提交 2010-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：W59C, R62A, H63A, D66A, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；30% PEG 400, 0.1 M Tris, 0.2 ammonium sulfate, 6.2 mM nickel sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.238 |
| 3NMJ Crystal structure of a nickel mediated dimer for the phenanthroline-modified cytochrome cb562 variant, MBP-Phen2 提交 2010-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：W59C, R62A, H63A, D66A, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；30% PEG 400, 0.1 M Tris, 0.2 ammonium sulfate, 6.2 mM nickel sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.238 |
| 3NMJ Crystal structure of a nickel mediated dimer for the phenanthroline-modified cytochrome cb562 variant, MBP-Phen2 提交 2010-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：W59C, R62A, H63A, D66A, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；30% PEG 400, 0.1 M Tris, 0.2 ammonium sulfate, 6.2 mM nickel sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.238 |
| 3NMJ Crystal structure of a nickel mediated dimer for the phenanthroline-modified cytochrome cb562 variant, MBP-Phen2 提交 2010-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：W59C, R62A, H63A, D66A, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；30% PEG 400, 0.1 M Tris, 0.2 ammonium sulfate, 6.2 mM nickel sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.238 |
| 3NMK Crystal structure of a zinc mediated dimer for the phenanthroline-modified cytochrome cb562 variant, MBP-Phen2 提交 2010-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：W59C, R62A, H63A, D66A, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris, 0.2 M ammonium sulfate, 30% PEG 400, 12.4 mM zinc chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.233 |
| 3NMK Crystal structure of a zinc mediated dimer for the phenanthroline-modified cytochrome cb562 variant, MBP-Phen2 提交 2010-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：W59C, R62A, H63A, D66A, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris, 0.2 M ammonium sulfate, 30% PEG 400, 12.4 mM zinc chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.233 |
| 3NMK Crystal structure of a zinc mediated dimer for the phenanthroline-modified cytochrome cb562 variant, MBP-Phen2 提交 2010-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：W59C, R62A, H63A, D66A, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris, 0.2 M ammonium sulfate, 30% PEG 400, 12.4 mM zinc chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.233 |
| 3NMK Crystal structure of a zinc mediated dimer for the phenanthroline-modified cytochrome cb562 variant, MBP-Phen2 提交 2010-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：W59C, R62A, H63A, D66A, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PXX N-1,10-phenanthrolin-5-ylacetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris, 0.2 M ammonium sulfate, 30% PEG 400, 12.4 mM zinc chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.233 |
| 3TOL Crystal structure of an engineered cytochrome cb562 that forms 1D, Zn-mediated coordination polymers 提交 2011-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：Soluble cytochrome b562
链 B
23–128（106 aa）
片段：Soluble cytochrome b562
|
突变：D73H, K77H, R98C, Y101C, K27E, D28K, T31E, R34L, L38A, Q41L, H59R, D66A, V69M, L76A 突变：D73H, K77H, R98C, Y101C, K27E, D28K, T31E, R34L, L38A, Q41L, H59R, D66A, V69M, L76A | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；20% PEG 3350, 2.1 mM ZnCl2, 20mM CaCl2 and 100 mM BISTRIS, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.245 |
| 3TOL Crystal structure of an engineered cytochrome cb562 that forms 1D, Zn-mediated coordination polymers 提交 2011-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
23–128（106 aa）
片段：Soluble cytochrome b562
链 D
23–128（106 aa）
片段：Soluble cytochrome b562
|
突变：D73H, K77H, R98C, Y101C, K27E, D28K, T31E, R34L, L38A, Q41L, H59R, D66A, V69M, L76A 突变：D73H, K77H, R98C, Y101C, K27E, D28K, T31E, R34L, L38A, Q41L, H59R, D66A, V69M, L76A | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；20% PEG 3350, 2.1 mM ZnCl2, 20mM CaCl2 and 100 mM BISTRIS, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.245 |
| 3TOM Crystal structure of an engineered cytochrome cb562 that forms 2D, Zn-mediated sheets 提交 2011-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
23–128（106 aa）
片段：Soluble cytochrome b562
链 D
23–128（106 aa）
片段：Soluble cytochrome b562
|
突变：D73H, K77H, R98C, Y101C, K27E, D28K, T31E, R34L, L38A, Q41L, H59R, D66A, V69M, L76A 突变：D73H, K77H, R98C, Y101C, K27E, D28K, T31E, R34L, L38A, Q41L, H59R, D66A, V69M, L76A | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 ZN ZINC ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；298 K；8 mM ZnCl2 and 200 mM BISTRIS, pH 6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.286 |
| 3TOM Crystal structure of an engineered cytochrome cb562 that forms 2D, Zn-mediated sheets 提交 2011-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：Soluble cytochrome b562
链 B
23–128（106 aa）
片段：Soluble cytochrome b562
|
突变：D73H, K77H, R98C, Y101C, K27E, D28K, T31E, R34L, L38A, Q41L, H59R, D66A, V69M, L76A 突变：D73H, K77H, R98C, Y101C, K27E, D28K, T31E, R34L, L38A, Q41L, H59R, D66A, V69M, L76A | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 ZN ZINC ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；298 K；8 mM ZnCl2 and 200 mM BISTRIS, pH 6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.286 |
| 3TOM Crystal structure of an engineered cytochrome cb562 that forms 2D, Zn-mediated sheets 提交 2011-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：Soluble cytochrome b562
链 B
23–128（106 aa）
片段：Soluble cytochrome b562
链 C
23–128（106 aa）
片段：Soluble cytochrome b562
链 D
23–128（106 aa）
片段：Soluble cytochrome b562
|
突变：D73H, K77H, R98C, Y101C, K27E, D28K, T31E, R34L, L38A, Q41L, H59R, D66A, V69M, L76A 突变：D73H, K77H, R98C, Y101C, K27E, D28K, T31E, R34L, L38A, Q41L, H59R, D66A, V69M, L76A 突变：D73H, K77H, R98C, Y101C, K27E, D28K, T31E, R34L, L38A, Q41L, H59R, D66A, V69M, L76A 突变：D73H, K77H, R98C, Y101C, K27E, D28K, T31E, R34L, L38A, Q41L, H59R, D66A, V69M, L76A | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 ZN ZINC ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；298 K；8 mM ZnCl2 and 200 mM BISTRIS, pH 6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.286 |
| 3U8P Cytochrome b562 integral fusion with EGFP 提交 2011-10-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：F64L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.4；0.1 M MES/NAOH, PH 6.4, 200 MM magnesium acetate and 20% (W/V) PEG 8000; for cryoprotection 16% glycerol was added to the reservoir buffer, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.242 |
| 3U8P Cytochrome b562 integral fusion with EGFP 提交 2011-10-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：F64L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.4；0.1 M MES/NAOH, PH 6.4, 200 MM magnesium acetate and 20% (W/V) PEG 8000; for cryoprotection 16% glycerol was added to the reservoir buffer, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.242 |
| 3U8P Cytochrome b562 integral fusion with EGFP 提交 2011-10-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：F64L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.4；0.1 M MES/NAOH, PH 6.4, 200 MM magnesium acetate and 20% (W/V) PEG 8000; for cryoprotection 16% glycerol was added to the reservoir buffer, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.242 |
| 4EA3 Structure of the N/OFQ Opioid Receptor in Complex with a Peptide Mimetic 提交 2012-03-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M29W, H124I, K128L 突变：M29W, H124I, K128L | 0NN 1-benzyl-N-[3-(1'H,3H-spiro[2-benzofuran-1,4'-piperidin]-1'-yl)propyl]-D-prolinamide × 2 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 OLA OLEIC ACID × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Lipidic Cubic Phase (LCP)；pH 6.4；293 K；25-30% (v/v) PEG 400,
100 to 200 mM potassium sodium tartrate tetrahydrate,
100 mM BIS-TRIS propane pH 6.4 , Lipidic Cubic Phase (LCP), temperature 293K
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.288 |
| 4EA3 Structure of the N/OFQ Opioid Receptor in Complex with a Peptide Mimetic 提交 2012-03-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M29W, H124I, K128L 突变：M29W, H124I, K128L | 0NN 1-benzyl-N-[3-(1'H,3H-spiro[2-benzofuran-1,4'-piperidin]-1'-yl)propyl]-D-prolinamide × 2 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 OLA OLEIC ACID × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Lipidic Cubic Phase (LCP)；pH 6.4；293 K；25-30% (v/v) PEG 400,
100 to 200 mM potassium sodium tartrate tetrahydrate,
100 mM BIS-TRIS propane pH 6.4 , Lipidic Cubic Phase (LCP), temperature 293K
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.288 |
| 4EA3 Structure of the N/OFQ Opioid Receptor in Complex with a Peptide Mimetic 提交 2012-03-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M29W, H124I, K128L 突变：M29W, H124I, K128L | 0NN 1-benzyl-N-[3-(1'H,3H-spiro[2-benzofuran-1,4'-piperidin]-1'-yl)propyl]-D-prolinamide × 2 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 OLA OLEIC ACID × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Lipidic Cubic Phase (LCP)；pH 6.4；293 K；25-30% (v/v) PEG 400,
100 to 200 mM potassium sodium tartrate tetrahydrate,
100 mM BIS-TRIS propane pH 6.4 , Lipidic Cubic Phase (LCP), temperature 293K
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.288 |
| 4EIY Crystal structure of the chimeric protein of A2aAR-BRIL in complex with ZM241385 at 1.8A resolution 提交 2012-04-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M215W, H310I, R314L | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 16 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 6 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5；293 K；25-28% (v/v) PEG 400, 0.04-0.06M sodium thiocyanate, 2% (v/v) 2,5-hexanediol, 100mM sodium citrate, pH 5.0, Lipid Cubic Phase (LCP), temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.213 |
| 4IAQ Crystal structure of the chimeric protein of 5-HT1B-BRIL in complex with dihydroergotamine (PSI Community Target) 提交 2012-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：L138W, M29W, H124I, R128L | 2GM Dihydroergotamine × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Lipid Cubic Phase (LCP)；pH 8.7；293 K；100 mM Tris pH 8.7, 32-36% (v/v) PEG400, 90 mM sodium citrate tribasic dihydrate, 120 mM ammonium sulfate
, Lipid Cubic Phase (LCP), temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.257 |
| 4IAR Crystal structure of the chimeric protein of 5-HT1B-BRIL in complex with ergotamine (PSI Community Target) 提交 2012-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：L138W, M29W, H124I, R128L | ERM Ergotamine × 1 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Lipid Cubic Phase (LCP)；pH 7.5；293 K；100 mM Tris pH 7.5, 30% (v/v) PEG400, 400 mM lithium chloride
, Lipid Cubic Phase (LCP), temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.261 |
| 4IB4 Crystal structure of the chimeric protein of 5-HT2B-BRIL in complex with ergotamine 提交 2012-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M144W, M29W, H124I, R128L | ERM Ergotamine × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 OLA OLEIC ACID × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Lipid Cubic Phase (LCP)；pH 8；293 K；100 mM Tris/HCl pH 8.0, 100 mM magnesium sulfate and 30% (v/v) PEG400, Lipid Cubic Phase (LCP) , temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.266 |
| 4JE9 Crystal structure of an engineered metal-free RIDC1 construct with four interfacial disulfide bonds 提交 2013-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 B
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, E81C, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, E81C, T96C, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5；293 K；30% methyl-pentanediol, 0.1M Tris pH 8.5, 0.2M sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.302 |
| 4JEA Crystal structure of an engineered Zn-RIDC1 construct with four interfacial disulfide bonds 提交 2013-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 B
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 C
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 D
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, E81C, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, E81C, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, E81C, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, E81C, T96C, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5；293 K；35% methyl-pentanediol, 0.1M Tris pH 8.5, 0.2M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.179 |
| 4JEB Crystal structure of an engineered RIDC1 tetramer with four interfacial disulfide bonds and four three-coordinate Zn(II) sites 提交 2013-02-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 B
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59A, D66W, V69I, D73H, D74A, K77H, E81C, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59A, D66W, V69I, D73H, D74A, K77H, E81C, T96C, R98C, Y101C | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 ZN ZINC ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；35% methyl-pentandiol, 0.1M HEPES pH 7.5, 0.2M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.309 |
| 4JKV Structure of the human smoothened 7TM receptor in complex with an antitumor agent 提交 2013-03-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
片段：BRIL
链 B
23–127（105 aa）
片段：BRIL
|
突变：M7W, H101I, R107L 突变：M7W, H101I, R107L | 1KS 4-fluoro-N-methyl-N-{1-[4-(1-methyl-1H-pyrazol-5-yl)phthalazin-1-yl]piperidin-4-yl}-2-(trifluoromethyl)benzamide × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 5 OLA OLEIC ACID × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Lipidic Cubic Phase (LCP)；pH 7.8；293 K；100 mM HEPES, pH 7.8, 70 mM ammonium fluoride, 32% (v/v) PEG400, 4% 8% (v/v) P400, Lipidic Cubic Phase (LCP), temperature 293K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.231 |
| 4L6R Structure of the class B human glucagon G protein coupled receptor 提交 2013-06-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128 and 123-434
|
突变：M7W, H102I, R106L | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6；293 K；100 mM MES pH 6.0, 140-200 mM NaK tartrate tetrahydrate, 9-17% (v/v) PEG 400, 0.35-0.55% (v/v) Jeffamine M-600 pH 7.0, 200 uM NNC0640, Lipidic Cubic Phase (LCP), temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.339 |
| 4N6H 1.8 A Structure of the human delta opioid 7TM receptor (PSI Community Target) 提交 2013-10-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP P0ABE7 residues 23-128, UNP P41143 residues 36-338
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L, P37S | OLA OLEIC ACID × 12 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 5 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 3 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 EJ4 (4bS,8R,8aS,14bR)-7-(cyclopropylmethyl)-5,6,7,8,14,14b-hexahydro-4,8-methano[1]benzofuro[2,3-a]pyrido[4,3-b]carbazole-1,8a(9H)-diol × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LCP；293 K；31-34% (v/v) PEG 400, 0.095 to 0.12 M K/Na tartrate, 5% (v/v) ethylene glycol, 100 mM MES buffer at pH 6.1-6.2, LCP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.190 |
| 4NC3 Crystal structure of the 5-HT2B receptor solved using serial femtosecond crystallography in lipidic cubic phase. 提交 2013-10-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：BRIL
|
突变：M7W | PLM PALMITIC ACID × 1 ERM Ergotamine × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 OLA OLEIC ACID × 3 DGA DIACYL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Lipidic Cubic Phase (LCP)；pH 8；293 K；100mM Tris/HCl pH8.0, 20-80mM MgCl2 and 30% (v/v) PEG400 , Lipidic Cubic Phase (LCP), temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.270 |
| 4NTJ Structure of the human P2Y12 receptor in complex with an antithrombotic drug 提交 2013-12-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：D294N, M1007W, H1102I, R1106L | AZJ ethyl 6-{4-[(benzylsulfonyl)carbamoyl]piperidin-1-yl}-5-cyano-2-methylpyridine-3-carboxylate × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.05-0.15M ammonium formate, 0.1M sodium cacodylate, pH 6.0-6.5, 25-35% PEG 400, 200M AZD1283, Lipidic Cubic Phase, temperature 293K
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.246 |
| 4O9R Human Smoothened Receptor structure in complex with cyclopamine 提交 2014-01-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP Q99835 residues 190-433, P0ABE7 residues 23-128, Q99835 residues 441-555
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L | CY8 Cyclopamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Lipidic Cubic Phase (LCP)；pH 7；293 K；100 mM Hepes, 30 % (v/v) PEG 400, 100 mM NaCl , pH 7.0, Lipidic Cubic Phase (LCP), temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.278 |
| 4OR2 Human class C G protein-coupled metabotropic glutamate receptor 1 in complex with a negative allosteric modulator 提交 2014-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102I, R106L 突变：M7W, H102I, R106L | FM9 4-fluoro-N-methyl-N-{4-[6-(propan-2-ylamino)pyrimidin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}benzamide × 2 CLR CHOLESTEROL × 6 OLA OLEIC ACID × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Lipidic Cubic Phase (LCP)；pH 7；293 K；100mM HEPES (pH 7.0), 27-30% (v/v) PEG 400, 80-120mM (NH4)2HPO4, 4-8mM TCEP, Lipidic Cubic Phase (LCP), temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.268 |
| 4PXZ Crystal structure of P2Y12 receptor in complex with 2MeSADP 提交 2014-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W/H1102I/R1106L/D294N | 6AD 2-(methylsulfanyl)adenosine 5'-(trihydrogen diphosphate) × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Lipidic cubic phase (LCP)；pH 5；293 K；30-40% PEG 400, 0.30-0.45M ammonium acetate, citrate, 3% v/v 1-Propanol, 0.1 M sodium citrate, pH 5.0, Lipidic cubic phase (LCP), temperature 293.0K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.230 |
| 4PY0 Crystal structure of P2Y12 receptor in complex with 2MeSATP 提交 2014-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：D294N, M1007W, H1102I, R1106L | 6AT 2-(methylsulfanyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Lipidic cubic phase (LCP)；pH 6；293 K；35-40% PEG 400, 0.15-0.20M ammonium tartrate, 4% v/v MPD, 0.1M sodium citrate, pH 6.0, Lipidic cubic phase (LCP), temperature 293.0K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.265 |
| 4QIM Structure of the human smoothened receptor in complex with ANTA XV 提交 2014-05-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP Q99835 residues 190-433, P0ABE7 residues 23-128, Q99835 residues 441-555
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L | A8T 2-{6-[4-(4-benzylphthalazin-1-yl)piperazin-1-yl]pyridin-3-yl}propan-2-ol × 1 ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Lipidic Cubic Phase (LCP)；pH 7.2；293 K；100-115mM NH4Cl, 100mM HEPES pH7.2, 36% PEG400, Lipidic Cubic Phase (LCP), temperature 293K
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.263 |
| 4QIN Structure of the human smoothened receptor in complex with SAG1.5 提交 2014-05-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP Q99835 residues 190-433, P0ABE7 residues 23-128, Q99835 residues 441-555
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L | SG8 3-chloro-4,7-difluoro-N-[trans-4-(methylamino)cyclohexyl]-N-[3-(pyridin-4-yl)benzyl]-1-benzothiophene-2-carboxamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Lipidic Cubic Phase (LCP)；pH 6；293 K；100mM MgSO4, 100mM MES pH6.0, 30% PEG400, 2-3% Polypropylene glycol P 400, Lipidic Cubic Phase (LCP), temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.260 |
| 4RWA Synchrotron structure of the human delta opioid receptor in complex with a bifunctional peptide (PSI community target) 提交 2014-12-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M29W, H124I, R138L,M29W, H124I, R138L | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；25-28% (v/v) PEG 400, 0.12 to 0.2 M NaCl, 100 mM MES buffer at pH 6.0, 1 mM DIPP-NH2 and 5% (v/v) of either one of the following additives: 30% glycerol, 1.0 M glycine or 0.01M L-glutathione reduced/0.01M L-glutathione oxidized, Lipidic cubic phase, temperature 293K
|
分辨率 3.28 Å R-free 0.273 |
| 4RWA Synchrotron structure of the human delta opioid receptor in complex with a bifunctional peptide (PSI community target) 提交 2014-12-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M29W, H124I, R138L,M29W, H124I, R138L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；25-28% (v/v) PEG 400, 0.12 to 0.2 M NaCl, 100 mM MES buffer at pH 6.0, 1 mM DIPP-NH2 and 5% (v/v) of either one of the following additives: 30% glycerol, 1.0 M glycine or 0.01M L-glutathione reduced/0.01M L-glutathione oxidized, Lipidic cubic phase, temperature 293K
|
分辨率 3.28 Å R-free 0.273 |
| 4RWD XFEL structure of the human delta opioid receptor in complex with a bifunctional peptide 提交 2014-12-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M29W, H124I, R138L,M29W, H124I, R138L | OLA OLEIC ACID × 3 NA SODIUM ION × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；0.1M MES pH 6.0, 10-180mM Lithium citrate, 30-32% (v/v) PEG400, Lipidic cubic phase, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.238 |
| 4RWD XFEL structure of the human delta opioid receptor in complex with a bifunctional peptide 提交 2014-12-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M29W, H124I, R138L,M29W, H124I, R138L | OLA OLEIC ACID × 4 NA SODIUM ION × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；0.1M MES pH 6.0, 10-180mM Lithium citrate, 30-32% (v/v) PEG400, Lipidic cubic phase, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.238 |
| 4U9D Crystal Structure of the Zn-directed tetramer of the engineered cyt cb562 variant, AB3 提交 2014-08-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 B
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 C
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 D
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, A89H, T96C, R98C, A100H, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, A89H, T96C, R98C, A100H, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, A89H, T96C, R98C, A100H, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, A89H, T96C, R98C, A100H, Y101C | HEC HEME C × 4 ZN ZINC ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；18% PEG 400 in 20 mM Tris (pH 8.5) and 0.2 M MgCl2
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.296 |
| 4U9E Crystal structure of the Zn-directed tetramer of the engineered cyt cb562 variant, A104/57G AB3 提交 2014-08-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, E57G, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, A89H, T96C, R98C, A100H, Y101C, K104A, | HEC HEME C × 4 CA CALCIUM ION × 20 ZN ZINC ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；27% (+/-)-2-methyl-2,4-pentanediol 400 in 100 mM Bis-Tris (pH 6.5) with 0.2M CaCl2 and 20 mM ampicillin
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.285 |
| 4YAY XFEL structure of human Angiotensin Receptor 提交 2015-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L | ZD7 5,7-diethyl-1-{[2'-(1H-tetrazol-5-yl)biphenyl-4-yl]methyl}-3,4-dihydro-1,6-naphthyridin-2(1H)-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；294 K；100 mM sodium citrate, pH 5.0, 450 mM NH4H2PO4, 28% (v/v) PEG400 and 4% (v/v) DMSO
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.274 |
| 4Z34 Crystal Structure of Human Lysophosphatidic Acid Receptor 1 in complex with ONO9780307 提交 2015-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–64（42 aa）
片段：unp residues 2-232; unp residues 23-64; unp residues 73-127; unp residues 248-326
链 A
73–127（55 aa）
片段：unp residues 2-232; unp residues 23-64; unp residues 73-127; unp residues 248-326
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L 突变：M1007W, H1102I, R1106L | ON7 {1-[(2S,3S)-2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-ylmethyl)-3-(3,5-dimethoxy-4-methylphenyl)-3-hydroxypropyl]-4-(methoxycarbonyl)-1 H-pyrrol-3-yl}acetic acid × 1 1WV (2S)-2,3-dihydroxypropyl (7Z)-tetradec-7-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.5),
34 - 38% (v/v) PEG400 and
200 mM ammonium acetate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.281 |
| 4Z35 Crystal Structure of Human Lysophosphatidic Acid Receptor 1 in complex with ONO-9910539 提交 2015-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–64（42 aa）
链 A
73–127（55 aa）
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L 突变：M1007W, H1102I, R1106L | ON9 3-{1-[(2S,3S)-3-(4-acetyl-3,5-dimethoxyphenyl)-2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-ylmethyl)-3-hydroxypropyl]-4-(methoxycarbonyl)-1H-pyrrol-3-yl}propanoic acid × 1 1WV (2S)-2,3-dihydroxypropyl (7Z)-tetradec-7-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1 M sodium citrate
(pH 5.5), 34 - 38% (v/v) PEG400 and 200 mM ammonium acetate
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.279 |
| 4Z36 Crystal Structure of Human Lysophosphatidic Acid Receptor 1 in complex with ONO-3080573 提交 2015-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–64（42 aa）
片段：unp residues 2-232; unp residues 23-64; unp residues 78-127; unp residues 249-327
链 A
78–127（50 aa）
片段：unp residues 2-232; unp residues 23-64; unp residues 78-127; unp residues 249-327
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L 突变：M1007W, H1102I, R1106L | ON3 1-(4-{[(2S,3R)-2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-yloxy)-3-(3,5-dimethoxy-4-methylphenyl)-3-hydroxypropyl]oxy}phenyl)cyclopropan ecarboxylic acid × 1 1WV (2S)-2,3-dihydroxypropyl (7Z)-tetradec-7-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1 M sodium citrate
(pH 5.5), 34 - 38% (v/v) PEG400 and 200 mM ammonium acetate
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.292 |
| 4ZUD Crystal Structure of Human Angiotensin Receptor in Complex with Inverse Agonist Olmesartan at 2.8A resolution. 提交 2015-05-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L | OLM Olmesartan × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；100 mM sodium citrate, pH 5.0, 400 mM KH2PO4, 25% (v/v) PEG400, and 6% (v/v) DMSO
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.234 |
| 5AWI Domain-swapped cytochrome cb562 dimer 提交 2015-07-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 B
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
|
突变：R98C, Y101C 突变：R98C, Y101C | HEC HEME C × 2 ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；25% PEG MME 350, 6 mM ZnSO4, 750 mM MES buffer
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.205 |
| 5BU7 Crystal structure of an engineered protein that forms nanotubes with tunable diameters 提交 2015-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：T96C, D73H, K77H, R98C, Y101C, K27E, D28K, T31E, R34L, L38A, Q41L, H59R, D66A, V69M, L76A 突变：T96C, D73H, K77H, R98C, Y101C, K27E, D28K, T31E, R34L, L38A, Q41L, H59R, D66A, V69M, L76A | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 ZN ZINC ION × 14 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；298 K；50-fold excess of zinc chloride
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.292 |
| 5DHG The crystal structure of nociceptin/orphanin FQ peptide receptor (NOP) in complex with C-35 (PSI Community Target) 提交 2015-08-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L | DGV 1-benzyl-N-{3-[4-(2,6-dichlorophenyl)piperidin-1-yl]propyl}-D-prolinamide × 1 OLA OLEIC ACID × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.5；293 K；25-35% (V/V) PEG400, 130-200 MM POTASSIM SODIUM TARTRATE TETRAHYDRATE, 100 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 6.4, LIPIDIC CUBIC PHASE, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.275 |
| 5DHG The crystal structure of nociceptin/orphanin FQ peptide receptor (NOP) in complex with C-35 (PSI Community Target) 提交 2015-08-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L | DGV 1-benzyl-N-{3-[4-(2,6-dichlorophenyl)piperidin-1-yl]propyl}-D-prolinamide × 1 OLA OLEIC ACID × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.5；293 K；25-35% (V/V) PEG400, 130-200 MM POTASSIM SODIUM TARTRATE TETRAHYDRATE, 100 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 6.4, LIPIDIC CUBIC PHASE, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.275 |
| 5DHG The crystal structure of nociceptin/orphanin FQ peptide receptor (NOP) in complex with C-35 (PSI Community Target) 提交 2015-08-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L 突变：M1007W, H1102I, R1106L | DGV 1-benzyl-N-{3-[4-(2,6-dichlorophenyl)piperidin-1-yl]propyl}-D-prolinamide × 2 OLA OLEIC ACID × 5 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.5；293 K；25-35% (V/V) PEG400, 130-200 MM POTASSIM SODIUM TARTRATE TETRAHYDRATE, 100 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 6.4, LIPIDIC CUBIC PHASE, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.275 |
| 5DHH The crystal structure of nociceptin/orphanin FQ peptide receptor (NOP) in complex with SB-612111 (PSI Community Target) 提交 2015-08-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L | OLA OLEIC ACID × 5 DGW (5S,7S)-7-{[4-(2,6-dichlorophenyl)piperidin-1-yl]methyl}-1-methyl-6,7,8,9-tetrahydro-5H-benzo[7]annulen-5-ol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.4；293 K；25-35% (V/V) PEG400, 130-200 MM POTASSIM SODIUM TARTRATE TETRAHYDRATE, 100 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 6.4, LIPIDIC CUBIC PHASE, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.279 |
| 5DHH The crystal structure of nociceptin/orphanin FQ peptide receptor (NOP) in complex with SB-612111 (PSI Community Target) 提交 2015-08-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L | OLA OLEIC ACID × 2 DGW (5S,7S)-7-{[4-(2,6-dichlorophenyl)piperidin-1-yl]methyl}-1-methyl-6,7,8,9-tetrahydro-5H-benzo[7]annulen-5-ol × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.4；293 K；25-35% (V/V) PEG400, 130-200 MM POTASSIM SODIUM TARTRATE TETRAHYDRATE, 100 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 6.4, LIPIDIC CUBIC PHASE, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.279 |
| 5DHH The crystal structure of nociceptin/orphanin FQ peptide receptor (NOP) in complex with SB-612111 (PSI Community Target) 提交 2015-08-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L 突变：M1007W, H1102I, R1106L | OLA OLEIC ACID × 7 DGW (5S,7S)-7-{[4-(2,6-dichlorophenyl)piperidin-1-yl]methyl}-1-methyl-6,7,8,9-tetrahydro-5H-benzo[7]annulen-5-ol × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.4；293 K；25-35% (V/V) PEG400, 130-200 MM POTASSIM SODIUM TARTRATE TETRAHYDRATE, 100 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 6.4, LIPIDIC CUBIC PHASE, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.279 |
| 5IU4 Crystal structure of stabilized A2A adenosine receptor A2AR-StaR2-bRIL in complex with ZM241385 at 1.7A resolution 提交 2016-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：;A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, L235A, V239A, S277A ; | NA SODIUM ION × 1 ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 OLA OLEIC ACID × 20 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES pH 5.5, 0.2M K/Na tartrate, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (v/v) (+/-)-2-methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.200 |
| 5IU7 Crystal structure of stabilized A2A adenosine receptor A2AR-StaR2-bRIL in complex with compound 12c at 1.9A resolution 提交 2016-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：;A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A ; | NA SODIUM ION × 1 6DY 2-(furan-2-yl)-N~5~-[2-(4-phenylpiperidin-1-yl)ethyl][1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazine-5,7-diamine × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 OLA OLEIC ACID × 18 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.lM tri-sodium citrate pH 5.3-5.4, 0.05M sodium thiocyanate, 29-32% PEG400, 2% (v/v) 2,5-hexanediol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.198 |
| 5IU8 Crystal structure of stabilized A2A adenosine receptor A2AR-StaR2-bRIL in complex with compound 12f at 2.0A resolution 提交 2016-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：;A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A ; | NA SODIUM ION × 1 6DZ 2-(furan-2-yl)-N~5~-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)ethyl][1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazine-5,7-diamine × 1 HTO HEPTANE-1,2,3-TRIOL × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 OLA OLEIC ACID × 19 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES pH 5.5, 0.2M K/Na tartrate, 33.5% PEG400, 0.5% (v/v) 1,2,3-heptanetriol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.200 |
| 5IUA Crystal structure of stabilized A2A adenosine receptor A2AR-StaR2-bRIL in complex with compound 12b at 2.2A resolution 提交 2016-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：;A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A ; | NA SODIUM ION × 1 6DX 2-(furan-2-yl)-N~5~-[3-(4-phenylpiperazin-1-yl)propyl][1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazine-5,7-diamine × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 OLA OLEIC ACID × 17 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.lM tri-sodium citrate pH 5.3-5.4, 0.05M sodium thiocyanate, 29-32% PEG400, 2% (v/v) 2,5-hexanediol
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.233 |
| 5IUB Crystal structure of stabilized A2A adenosine receptor A2AR-StaR2-bRIL in complex with compound 12x at 2.1A resolution 提交 2016-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：;A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, L202A, L235A, V239A, S277A ; | NA SODIUM ION × 1 6DV N~5~-{2-[4-(2,4-difluorophenyl)piperazin-1-yl]ethyl}-2-(furan-2-yl)[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazine-5,7-diamine × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 16 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES pH 5.5, 0.2M K/Na tartrate, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (v/v) (+/-)-2-methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.218 |
| 5JTB Crystal structure of the chimeric protein of A2aAR-BRIL with bound iodide ions 提交 2016-05-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
片段：;UNP Residues 2-208,UNP Residues 23-217,UNP Residues 219-316,UNP Residues 2-208,UNP Residues 23-217,UNP Residues 219-316,UNP Residues 2-208,UNP Residues 23-217,UNP Residues 219-316
;
|
未记录 | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 IOD IODIDE ION × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 OLA OLEIC ACID × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 6 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；in meso lipidic cubic phase crystallization
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.294 |
| 5K2A 2.5 angstrom A2a adenosine receptor structure with sulfur SAD phasing using XFEL data 提交 2016-05-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 10 OLA OLEIC ACID × 10 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；28 % (v/v) PEG 400, 40 mM sodium thiocyanate and 100 mM sodium citrate buffer pH 5.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.228 |
| 5K2B 2.5 angstrom A2a adenosine receptor structure with MR phasing using XFEL data 提交 2016-05-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 9 OLA OLEIC ACID × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；28 % (v/v) PEG 400, 40 mM sodium thiocyanate and 100 mM sodium citrate buffer pH 5.0
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.219 |
| 5K2C 1.9 angstrom A2a adenosine receptor structure with sulfur SAD phasing and phase extension using XFEL data 提交 2016-05-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 10 OLA OLEIC ACID × 11 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；28 % (v/v) PEG 400, 40 mM sodium thiocyanate and 100 mM sodium citrate buffer pH 5.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.208 |
| 5K2D 1.9A angstrom A2a adenosine receptor structure with MR phasing using XFEL data 提交 2016-05-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 OLA OLEIC ACID × 11 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；28 % (v/v) PEG 400, 40 mM sodium thiocyanate and 100 mM sodium citrate buffer pH 5.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.207 |
| 5L31 Crystal structure of an engineered metal-free RIDC1 variant containing five disulfide bonds. 提交 2016-08-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 B
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 C
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 D
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEC HEME C × 4 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 45% MPD, and 0.1 M Bis Tris (pH 6.5) mixed with 1.5 uL of 2.8 mM protein
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.267 |
| 5L32 Crystal structure of the Zn-RIDC1 complex bearing six interfacial disulfide bonds 提交 2016-08-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 B
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 C
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
链 D
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 23-128
|
未记录 | HEC HEME C × 4 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；294 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Bis-Tris (pH 6.5), 35% PEG 400
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.250 |
| 5L7D Structure of human Smoothened in complex with cholesterol 提交 2016-06-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
片段：UNP residues 32-428,UNP residues 23-127,UNP residues 443-555
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；0.1 M MES pH 6, 30% (v/v) PEG500 DME, 0.1 M sodium acetate, 0.5 mM zinc chloride, 0.1 M ammonium fluoride
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.264 |
| 5L7D Structure of human Smoothened in complex with cholesterol 提交 2016-06-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–127（105 aa）
片段：UNP residues 32-428,UNP residues 23-127,UNP residues 443-555
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；0.1 M MES pH 6, 30% (v/v) PEG500 DME, 0.1 M sodium acetate, 0.5 mM zinc chloride, 0.1 M ammonium fluoride
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.264 |
| 5L7I Structure of human Smoothened in complex with Vismodegib 提交 2016-06-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 VIS 2-chloranyl-~{N}-(4-chloranyl-3-pyridin-2-yl-phenyl)-4-methylsulfonyl-benzamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 4；293 K；0.09 M sodium acetate pH4, 0.09 M sodium malonate, 27% (v/v) PEG500 DME, 0.1 M sodium acetate, 0.5 mM zinc chloride, 0.1 M ammonium fluoride.
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.257 |
| 5L7I Structure of human Smoothened in complex with Vismodegib 提交 2016-06-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | VIS 2-chloranyl-~{N}-(4-chloranyl-3-pyridin-2-yl-phenyl)-4-methylsulfonyl-benzamide × 1 NA SODIUM ION × 1 MPG [(Z)-octadec-9-enyl] (2R)-2,3-bis(oxidanyl)propanoate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 4；293 K；0.09 M sodium acetate pH4, 0.09 M sodium malonate, 27% (v/v) PEG500 DME, 0.1 M sodium acetate, 0.5 mM zinc chloride, 0.1 M ammonium fluoride.
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.257 |
| 5MZJ Crystal structure of stabilized A2A adenosine receptor A2AR-StaR2-bRIL in complex with theophylline at 2.0A resolution 提交 2017-01-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A,M1007W,L235A, V239A, S277A, G318A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE,
27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.204 |
| 5MZP Crystal structure of stabilized A2A adenosine receptor A2AR-StaR2-bRIL in complex with caffeine at 2.1A resolution 提交 2017-02-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：;A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, M1007W, L235A, V239A, S277A, G318A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, M1007W, L235A, V239A, S277A, G318A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, M1007W, L235A, V239A, S277A, G318A ; | NA SODIUM ION × 1 CFF CAFFEINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 OLA OLEIC ACID × 18 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 TAR D(-)-TARTARIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE,
27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.220 |
| 5N2R Crystal structure of stabilized A2A adenosine receptor A2AR-StaR2-bRIL in complex with PSB36 at 2.8A resolution 提交 2017-02-08 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：;A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, M1007W, L235A, V239A, S277A, G318A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, M1007W, L235A, V239A, S277A, G318A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, M1007W, L235A, V239A, S277A, G318A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, M1007W, L235A, V239A, S277A, G318A ; | NA SODIUM ION × 1 8JN 1-butyl-3-[(~{E})-3-oxidanylprop-1-enyl]-8-[(1~{R},5~{S})-3-tricyclo[3.3.1.0^{3,7}]nonanyl]-7~{H}-purine-2,6-dione × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 21 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 5 TAR D(-)-TARTARIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.229 |
| 5N2S Crystal structure of stabilized A1 receptor in complex with PSB36 at 3.3A resolution 提交 2017-02-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
22–127（106 aa）
|
突变：A57L, T91A, N159A, Y205A, L236A, L240A, T277A, C309S,A57L, T91A, N159A, Y205A, L236A, L240A, T277A, C309S | 8K8 1-butyl-3-(3-oxidanylpropyl)-8-[(1~{R},5~{S})-3-tricyclo[3.3.1.0^{3,7}]nonanyl]-7~{H}-purine-2,6-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.5；293 K；0.1M SODIUM / POTASSIUM PHOSPHATE PH 7.5, 0.2M LITHIUM SULPHATE, 37.5% (W/V) PEG400
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.278 |
| 5NDD Crystal structure of a thermostabilised human protease-activated receptor-2 (PAR2) in complex with AZ8838 at 2.8 angstrom resolution 提交 2017-03-08 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：G89A, H108A, G157A, M166L, Y174A, V176E, N222Q, M268A,I289A, L293A | 8TZ (~{S})-(4-fluoranyl-2-propyl-phenyl)-(1~{H}-imidazol-2-yl)methanol × 1 NA SODIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.8；293 K；0.1 M sodium citrate/citrate acid pH 5.5-6.2, 0.2 M ammonium phosphate dibasic, 38-43 % (w/v) PEG400 and 1 mM AZ8838
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.264 |
| 5NDZ Crystal structure of a thermostabilised human protease-activated receptor-2 (PAR2) in complex with AZ3451 at 3.6 angstrom resolution 提交 2017-03-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：;G89A, H108A, G157A, M166L, Y174A, V176E, N222Q, M268A, I289A, L293A,G89A, H108A, G157A, M166L, Y174A, V176E, N222Q, M268A, I289A, L293A,G89A, H108A, G157A, M166L, Y174A, V176E, N222Q, M268A, I289A, L293A,G89A, H108A, G157A, M166L, Y174A, V176E, N222Q, M268A, I289A, L293A ; | 8UN 2-(6-bromanyl-1,3-benzodioxol-5-yl)-~{N}-(4-cyanophenyl)-1-[(1~{S})-1-cyclohexylethyl]benzimidazole-5-carboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.8；293 K；0.1 M sodium citrate/citrate acid pH 5.5-6.2, 0.2 M ammonium phosphate dibasic, 38-43 % (w/v) PEG400
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.291 |
| 5NJ6 Crystal structure of a thermostabilised human protease-activated receptor-2 (PAR2) in ternary complex with Fab3949 and AZ7188 at 4.0 angstrom resolution 提交 2017-03-28 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：;G89A, H108A, G157A, M166L, Y174A, V176E, N222Q, M268A, I289A, L293A,G89A, H108A, G157A, M166L, Y174A, V176E, N222Q, M268A, I289A, L293A,G89A, H108A, G157A, M166L, Y174A, V176E, N222Q, M268A, I289A, L293A ; | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.7；293 K；0.1M MES pH 5.5-6.2, 0.2M POTASSIUM / SODIUM TARTRATE, 30-35% (W/V) PEG400, 2% (W/V) 2,5-HEXANEDIOL
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.319 |
| 5NLX A2A Adenosine receptor room-temperature structure determined by serial millisecond crystallography 提交 2017-04-05 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | OLA OLEIC ACID × 3 NA SODIUM ION × 1 ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；291 K；0.1M sodium citrate pH 5.0, 0.05M sodium thiocyanate, 28-34% PEG400, 5 mM ZM241385, 2% (v/v) 1,6-hexanediol
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.229 |
| 5NM2 A2A Adenosine receptor cryo structure 提交 2017-04-05 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 OLA OLEIC ACID × 15 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 CLR CHOLESTEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；291 K；0.1M sodium citrate pH 5.0, 0.05M sodium thiocyanate, 28-34% PEG400, 5 mM ZM241385, 2% (v/v) 1,6-hexanedio
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.212 |
| 5NM4 A2A Adenosine receptor room-temperature structure determined by serial femtosecond crystallography 提交 2017-04-05 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | OLA OLEIC ACID × 5 NA SODIUM ION × 1 ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；291 K；0.1M sodium citrate pH 5.0, 0.05M sodium thiocyanate, 28-34% PEG400, 5 mM ZM241385, 2% (v/v) 1,6-hexanediol
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.235 |
| 5OLG Structure of the A2A-StaR2-bRIL562-ZM241385 complex at 1.86A obtained from in meso soaking experiments. 提交 2017-07-27 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：;A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A ; | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 OLA OLEIC ACID × 17 SCN THIOCYANATE ION × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 CIT CITRIC ACID × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293.15 K；Crystal growth: 0.l M tri-sodium citrate pH 5.3-5.4, 0.05 M sodium thiocyanate, 29-32% PEG400, 2% (v/v) 2,5-hexanediol, 0.5 mM theophylline.
ZM241385 was subsequently added to motherliquor for the soaking experiment at a final concentration of 0.005 mM.
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.224 |
| 5OLH Structure of the A2A-StaR2-bRIL562-Vipadenant complex at 2.6A obtained from in meso soaking experiments. 提交 2017-07-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：;A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A ; | 9XT 3-[(4-azanyl-3-methyl-phenyl)methyl]-7-(furan-2-yl)-[1,2,3]triazolo[4,5-d]pyrimidin-5-amine × 1 OLA OLEIC ACID × 15 NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293.15 K；Crystal growth: 0.l M tri-sodium citrate pH 5.3-5.4, 0.05 M sodium thiocyanate, 29-32% PEG400, 2% (v/v) 2,5-hexanediol and 0.5 mM theophylline
Vipadenant was added to the mother liquor to a concentration of 0.005 mM for the soaking experiments.
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.249 |
| 5OLO Structure of the A2A-StaR2-bRIL562-Tozadenant complex at 3.1A obtained from in meso soaking experiments. 提交 2017-07-28 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A | 9XW ~{N}-(4-methoxy-7-morpholin-4-yl-1,3-benzothiazol-2-yl)-4-methyl-4-oxidanyl-piperidine-1-carboxamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 10 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293.15 K；Crystal growth: 0.l M tri-sodium citrate pH 5.3-5.4, 0.05 M sodium thiocyanate, 29-32% PEG400, 2% (v/v) 2,5-hexanediol and 0.5 mM theophylline
Tozadenant was added to the mother liquor to a concentration of 0.005 mM for the soaking experiments.
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.245 |
| 5OLV Structure of the A2A-StaR2-bRIL562-LUAA47070 complex at 2.0A obtained from in meso soaking experiments. 提交 2017-07-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：;A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A ; | 9Y2 4-(3,3-dimethylbutanoylamino)-3,5-bis(fluoranyl)-~{N}-(1,3-thiazol-2-yl)benzamide × 1 NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 OLA OLEIC ACID × 13 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293.15 K；Crystal growth: 0.l M tri-sodium citrate pH 5.3-5.4, 0.05 M sodium thiocyanate, 29-32% PEG400, 2% (v/v) 2,5-hexanediol and 0.5 mM theophylline
LUAA47070 was added to the mother liquor to a concentration of 0.005 mM for the soaking experiments.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 5OLZ Structure of the A2A-StaR2-bRIL562-Compound 4e complex at 1.9A obtained from bespoke co-crystallisation experiments. 提交 2017-07-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：;A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A ; | T4E 4-(3-amino-5-phenyl-1,2,4-triazin-6-yl)-2-chlorophenol × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 OLA OLEIC ACID × 15 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 11 TAR D(-)-TARTARIC ACID × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293.15 K；0.l M tri-sodium citrate pH 5.3-5.4, 0.05 M sodium thiocyanate, 29-32% PEG400, 2% (v/v) 2,5-hexanediol and 0.005 mM Compound 4e.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.196 |
| 5OM1 Structure of the A2A-StaR2-bRIL562-Compound 4e complex at 2.1A obtained from in meso soaking experiments (1 hour soak). 提交 2017-07-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：;A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A ; | T4E 4-(3-amino-5-phenyl-1,2,4-triazin-6-yl)-2-chlorophenol × 1 NA SODIUM ION × 1 OLA OLEIC ACID × 14 CLR CHOLESTEROL × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 12 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293.15 K；Crystal growth: 0.l M tri-sodium citrate pH 5.3-5.4, 0.05 M sodium thiocyanate, 29-32% PEG400, 2% (v/v) 2,5-hexanediol and 0.5 mM theophylline
Compound 4e was added to the mother liquor to a concentration of 0.005 mM for the soaking experiments.
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.210 |
| 5OM4 Structure of the A2A-StaR2-bRIL562-Compound 4e complex at 1.86A obtained from in meso soaking experiments (24 hour soak). 提交 2017-07-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：;A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A,A54L; T88A; R107A; K122A; L202A; L235A; V239A; S277A; N154A ; | T4E 4-(3-amino-5-phenyl-1,2,4-triazin-6-yl)-2-chlorophenol × 1 NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 OLA OLEIC ACID × 16 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 11 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293.15 K；Crystal growth: 0.l M tri-sodium citrate pH 5.3-5.4, 0.05 M sodium thiocyanate, 29-32% PEG400, 2% (v/v) 2,5-hexanediol and 0.5 mM theophylline
Compound 4e was added to the mother liquor to a concentration of 0.005 mM for the soaking experiments.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.205 |
| 5TUD Structural Insights into the Extracellular Recognition of the Human Serotonin 2B Receptor by an Antibody 提交 2016-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP P41595 residues 36-248 and 314-405 linked by UNP P0ABE7 residues 23-128
|
突变：M144W, M1007W, H1102I, R1106L | ERM Ergotamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.7；293 K；Tris/HCL pH 7.7, 60 mM Sodium/Potassium Tartrate, 25% PEG400.
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.247 |
| 5TUD Structural Insights into the Extracellular Recognition of the Human Serotonin 2B Receptor by an Antibody 提交 2016-11-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 D
23–128（106 aa）
片段：UNP P41595 residues 36-248 and 314-405 linked by UNP P0ABE7 residues 23-128
|
突变：M144W, M1007W, H1102I, R1106L | ERM Ergotamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.7；293 K；Tris/HCL pH 7.7, 60 mM Sodium/Potassium Tartrate, 25% PEG400.
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.247 |
| 5TVN Crystal structure of the LSD-bound 5-HT2B receptor 提交 2016-11-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M144W, M1007W, H1102I, R1106L | 7LD (8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM Tris/HCl pH 7.5-8.0, 90-130 mM potassium phosphate monobasic, 28-30% PEG400
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.263 |
| 5UEN Crystal structure of the human adenosine A1 receptor A1AR-bRIL in complex with the covalent antagonist DU172 at 3.2A resolution 提交 2017-01-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
片段：;UNP P30542 reisues 2-210, UNP P0ABE7 residues 23-127, UNP P30542 residues 228-31,UNP P30542 reisues 2-210, UNP P0ABE7 residues 23-127, UNP P30542 residues 228-31,UNP P30542 reisues 2-210, UNP P0ABE7 residues 23-127, UNP P30542 residues 228-31
;
链 B
23–127（105 aa）
片段：;UNP P30542 reisues 2-210, UNP P0ABE7 residues 23-127, UNP P30542 residues 228-31,UNP P30542 reisues 2-210, UNP P0ABE7 residues 23-127, UNP P30542 residues 228-31,UNP P30542 reisues 2-210, UNP P0ABE7 residues 23-127, UNP P30542 residues 228-31
;
|
未记录 | DU1 4-{[3-(8-cyclohexyl-2,6-dioxo-1-propyl-1,2,6,7-tetrahydro-3H-purin-3-yl)propyl]carbamoyl}benzene-1-sulfonyl fluoride × 2 OLA OLEIC ACID × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM Hepes pH 7.0-8.0, 28-38% PEG 300 and 500-700 mM NH4F
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.316 |
| 5UIG Crystal structure of adenosine A2A receptor bound to a novel triazole-carboximidamide antagonist 提交 2017-01-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L,M1007W, H1102I, R1106L,M1007W, H1102I, R1106L | EDT {[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 8D1 5-amino-N-[(2-methoxyphenyl)methyl]-2-(3-methylphenyl)-2H-1,2,3-triazole-4-carboximidamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.045 M MES, 0.045 M MgCl2, 28% PEG400, 5% Jeffamine M-600 (pH 7.0)
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.299 |
| 5UIG Crystal structure of adenosine A2A receptor bound to a novel triazole-carboximidamide antagonist 提交 2017-01-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L,M1007W, H1102I, R1106L,M1007W, H1102I, R1106L | EDT {[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 8D1 5-amino-N-[(2-methoxyphenyl)methyl]-2-(3-methylphenyl)-2H-1,2,3-triazole-4-carboximidamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.045 M MES, 0.045 M MgCl2, 28% PEG400, 5% Jeffamine M-600 (pH 7.0)
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.299 |
| 5UNF XFEL structure of human angiotensin II type 2 receptor (Monoclinic form) in complex with compound 1 (N-benzyl-N-(2-ethyl-4-oxo-3-{[2'-(2H-tetrazol-5-yl)[1,1'-biphenyl]-4-yl]) 提交 2017-01-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP P0ABE7 residues 23-128 and UNP P50052 35-335 linked via LINKER resdiues GSGS
链 B
23–128（106 aa）
片段：UNP P0ABE7 residues 23-128 and UNP P50052 35-335 linked via LINKER resdiues GSGS
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L 突变：M1007W, H1102I, R1106L | 8ES N-benzyl-N-(2-ethyl-4-oxo-3-{[2'-(2H-tetrazol-5-yl)[1,1'-biphenyl]-4-yl]methyl}-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)thiophene-2-carboxamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 8；293 K；100 mM Tris-HCl, pH 8.0, 25 mM potassium formate, 25% (v/v) PEG400, and 0.3% (v/v) (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.256 |
| 5UNG XFEL structure of human angiotensin II type 2 receptor (Orthorhombic form) in complex with compound 1 (N-benzyl-N-(2-ethyl-4-oxo-3-{[2'-(2H-tetrazol-5-yl)[1,1'-biphenyl]-4-yl] methyl}-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)thiophene-2-carboxamide) 提交 2017-01-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
片段：UNP P0ABE7 residues 23-128 and UNP P50052 35-335 linked via LINKER resdiues GSGS
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L | 8ES N-benzyl-N-(2-ethyl-4-oxo-3-{[2'-(2H-tetrazol-5-yl)[1,1'-biphenyl]-4-yl]methyl}-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)thiophene-2-carboxamide × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 OLA OLEIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 8；293 K；100 mM Tris-HCl, pH 8.0, 25 mM potassium formate, 25% (v/v) PEG400, and 0.3% (v/v) (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.262 |
| 5UNH Synchrotron structure of human angiotensin II type 2 receptor in complex with compound 2 (N-[(furan-2-yl)methyl]-N-(4-oxo-2-propyl-3-{[2'-(2H-tetrazol-5-yl)[1,1'- biphenyl]-4-yl]methyl}-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)benzamide) 提交 2017-01-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：;UNP P0ABE7 residues 23-128 and UNP P50052 35-335 linked via LINKER resdiues GSGS,UNP P0ABE7 residues 23-128 and UNP P50052 35-335 linked via LINKER resdiues GSGS
;
链 B
23–128（106 aa）
片段：;UNP P0ABE7 residues 23-128 and UNP P50052 35-335 linked via LINKER resdiues GSGS,UNP P0ABE7 residues 23-128 and UNP P50052 35-335 linked via LINKER resdiues GSGS
;
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L,M1007W, H1102I, R1106L 突变：M1007W, H1102I, R1106L,M1007W, H1102I, R1106L | 8EM N-[(furan-2-yl)methyl]-N-(4-oxo-2-propyl-3-{[2'-(2H-tetrazol-5-yl)[1,1'-biphenyl]-4-yl]methyl}-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)benzamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 8；293 K；100 mM Tris-HCl, pH 8.0, 25 mM potassium formate, 25% (v/v) PEG400, and 0.3% (v/v) (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.259 |
| 5UVI Serial Millisecond Crystallography of Membrane and Soluble Protein Micro-crystals using Synchrotron Radiation 提交 2017-02-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 OLA OLEIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；0.1 M sodium citrate pH 5.0, 32 % PEG 400, 75 mM sodium thocyanate
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.287 |
| 5VRA 2.35-Angstrom In situ Mylar structure of human A2A adenosine receptor at 100 K 提交 2017-05-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP P29274 residues 2-208 and 219-316 linked by UNP P0ABE7 residues 23-128
|
未记录 | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 6 OLA OLEIC ACID × 10 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；25-28% PEG400, 0.04-0.06 M sodium thiocyanate, 2% 2,5-hexanediol, and 100 mM sodium citrate pH 5.0
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.223 |
| 5WIU Structure of the human D4 Dopamine receptor in complex with Nemonapride 提交 2017-07-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
24–128（105 aa）
|
未记录 | AQD Nemonapride × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 OLA OLEIC ACID × 9 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；298 K；100 mM Tris-HCl, pH 5.8-6.2, 160-200 mM ammonium phosphate dibasic, 34% PEG400
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.236 |
| 5WIV Structure of the sodium-bound human D4 Dopamine receptor in complex with Nemonapride 提交 2017-07-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
24–128（105 aa）
|
未记录 | AQD Nemonapride × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 5 OLA OLEIC ACID × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM Tris-HCl, pH 5.9-6.2, 100-140 mM ammonium phosphate dibasic, 180-200 mM sodium chloride, 34% PEG400
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.227 |
| 5XJM Complex structure of angiotensin II type 2 receptor with Fab 提交 2017-05-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：UNP residues 35-242,UNP residues 246-346
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293 K；34%(v/v) PEG 300, 0.1 M HEPES pH 7.0, 0.5%(v/v) Tacsimate (pH7.0)
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.275 |
| 5XZI Crystal structure of the Zn-directed tetramer of the engineered cyt cb562 variant, AB5 提交 2017-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, E86D, A89E, Q93H, T96C, R98C, A100H, Y101C | HEC HEME C × 4 ZN ZINC ION × 8 CL CHLORIDE ION × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；31.5% 2-methyl-2,4-pentanediol 400, 0.1M HEPES, pH 7.5, 0.2M MgCl2
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.263 |
| 5XZJ Crystal structure of the Zn-directed tetramer of the engineered cyt cb562 variant, C96T/AB5 提交 2017-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, E86D, A89E, Q93H, R98C, A100H, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, E86D, A89E, Q93H, R98C, A100H, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, E86D, A89E, Q93H, R98C, A100H, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, E86D, A89E, Q93H, R98C, A100H, Y101C | HEC HEME C × 4 ZN ZINC ION × 14 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；45% 2-methyl-2,4-pentanediol 400,
0.1M HEPES, pH 6.5
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.217 |
| 5YM7 Crystal Structure of B562RIL without disulfide bond 提交 2017-10-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102I, R106L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；NH4(SO4), Bicine , N-octanoylsucrose
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.238 |
| 5YM7 Crystal Structure of B562RIL without disulfide bond 提交 2017-10-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102I, R106L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；NH4(SO4), Bicine , N-octanoylsucrose
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.238 |
| 5YO3 Crystal Structure of B562RIL with engineered disulfide bond V16C-A29C 提交 2017-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, V16C, A29C, H102I, R106L | SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；NH4(SO4), Bicine, N-octanoylsucrose
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.188 |
| 5YO3 Crystal Structure of B562RIL with engineered disulfide bond V16C-A29C 提交 2017-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, V16C, A29C, H102I, R106L | SO4 SULFATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；292 K；NH4(SO4), Bicine, N-octanoylsucrose
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.188 |
| 5YO4 Crystal Structure of B562RIL with engineered disulfide bond K27C-A79C 提交 2017-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102I, R106L, K27C, A79C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；3.2M NH4(SO4),
0.1M Bicine
2.44mM N-octanoylsucrose
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.212 |
| 5YO5 Crystal Structure of B562RIL with engineered disulfide bond A20C-Q25C 提交 2017-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102I, R106L, A20C, Q25C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；3.2M NH4(SO4),
0.1M Bicine
2.44mM N-octanoylsucrose
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.267 |
| 5YO5 Crystal Structure of B562RIL with engineered disulfide bond A20C-Q25C 提交 2017-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102I, R106L, A20C, Q25C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；3.2M NH4(SO4),
0.1M Bicine
2.44mM N-octanoylsucrose
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.267 |
| 5YO5 Crystal Structure of B562RIL with engineered disulfide bond A20C-Q25C 提交 2017-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102I, R106L, A20C, Q25C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；3.2M NH4(SO4),
0.1M Bicine
2.44mM N-octanoylsucrose
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.267 |
| 5YO5 Crystal Structure of B562RIL with engineered disulfide bond A20C-Q25C 提交 2017-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102I, R106L, A20C, Q25C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；3.2M NH4(SO4),
0.1M Bicine
2.44mM N-octanoylsucrose
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.267 |
| 5YO5 Crystal Structure of B562RIL with engineered disulfide bond A20C-Q25C 提交 2017-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102I, R106L, A20C, Q25C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；3.2M NH4(SO4),
0.1M Bicine
2.44mM N-octanoylsucrose
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.267 |
| 5YO5 Crystal Structure of B562RIL with engineered disulfide bond A20C-Q25C 提交 2017-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 F
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102I, R106L, A20C, Q25C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；3.2M NH4(SO4),
0.1M Bicine
2.44mM N-octanoylsucrose
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.267 |
| 5YO5 Crystal Structure of B562RIL with engineered disulfide bond A20C-Q25C 提交 2017-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 G
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102I, R106L, A20C, Q25C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；3.2M NH4(SO4),
0.1M Bicine
2.44mM N-octanoylsucrose
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.267 |
| 5YO5 Crystal Structure of B562RIL with engineered disulfide bond A20C-Q25C 提交 2017-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 H
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102I, R106L, A20C, Q25C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；3.2M NH4(SO4),
0.1M Bicine
2.44mM N-octanoylsucrose
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.267 |
| 5YO6 Crystal Structure of B562RIL with engineered disulfide bond T9C-A36C 提交 2017-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102L. R106L, T9C, A36C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；3.2M NH4(SO4),
0.1M Bicine
2.44mM N-octanoylsucrose
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.237 |
| 6A93 Crystal structure of 5-HT2AR in complex with risperidone 提交 2018-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–62（40 aa）
链 A
88–128（41 aa）
|
突变：S162K, M164W, R120I, H124I, R128G, M29W 突变：S162K, M164W, R120I, H124I, R128G, M29W | 8NU 3-[2-[4-(6-fluoranyl-1,2-benzoxazol-3-yl)piperidin-1-yl]ethyl]-2-methyl-6,7,8,9-tetrahydropyrido[1,2-a]pyrimidin-4-one × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 ZN ZINC ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM MES, pH 6.0-6.5, 28-31% (v/v) PEG 400, 120-200 mM Am-formate, 1-2% (v/v) DMSO
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.275 |
| 6A93 Crystal structure of 5-HT2AR in complex with risperidone 提交 2018-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–62（40 aa）
链 B
88–128（41 aa）
|
突变：S162K, M164W, R120I, H124I, R128G, M29W 突变：S162K, M164W, R120I, H124I, R128G, M29W | 8NU 3-[2-[4-(6-fluoranyl-1,2-benzoxazol-3-yl)piperidin-1-yl]ethyl]-2-methyl-6,7,8,9-tetrahydropyrido[1,2-a]pyrimidin-4-one × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM MES, pH 6.0-6.5, 28-31% (v/v) PEG 400, 120-200 mM Am-formate, 1-2% (v/v) DMSO
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.275 |
| 6A94 Crystal structure of 5-HT2AR in complex with zotepine 提交 2018-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–62（40 aa）
链 A
88–128（41 aa）
|
突变：S162K, M164W,R120I, H124I, R128G, M29W 突变：S162K, M164W,R120I, H124I, R128G, M29W | ZOT 2-(3-chloranylbenzo[b][1]benzothiepin-5-yl)oxy-N,N-dimethyl-ethanamine × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM MES, pH 6.0, or HEPES, pH 7.0, 30% (v/v) PEG400, 100 mM Li-chloride, Na-acetate, or 14 other various salts from StockOptions Salt (Hampton Research)
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.269 |
| 6A94 Crystal structure of 5-HT2AR in complex with zotepine 提交 2018-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–62（40 aa）
链 B
88–128（41 aa）
|
突变：S162K, M164W,R120I, H124I, R128G, M29W 突变：S162K, M164W,R120I, H124I, R128G, M29W | ZOT 2-(3-chloranylbenzo[b][1]benzothiepin-5-yl)oxy-N,N-dimethyl-ethanamine × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 A6L 2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM MES, pH 6.0, or HEPES, pH 7.0, 30% (v/v) PEG400, 100 mM Li-chloride, Na-acetate, or 14 other various salts from StockOptions Salt (Hampton Research)
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.269 |
| 6AI5 Disulfide-free, Zn-directed tetramer of the engineered cyt cb562 variant, C96T/A104AB3 提交 2018-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
链 G
23–128（106 aa）
|
突变：C96T/A104AB3 突变：C96T/A104AB3 突变：C96T/A104AB3 突变：C96T/A104AB3 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 ZN ZINC ION × 8 CL CHLORIDE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；12.5% PEG 3350, pH 7.5, 0.2 M MgCl2
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.209 |
| 6AK3 Crystal structure of the human prostaglandin E receptor EP3 bound to prostaglandin E2 提交 2018-08-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–62（40 aa）
链 A
85–127（43 aa）
链 B
23–62（40 aa）
链 B
85–127（43 aa）
|
突变：A173I,V185S,N217Q,S258D,C289L,N308Q,M1007W,R1098I,H1102I 突变：A173I,V185S,N217Q,S258D,C289L,N308Q,M1007W,R1098I,H1102I 突变：A173I,V185S,N217Q,S258D,C289L,N308Q,M1007W,R1098I,H1102I 突变：A173I,V185S,N217Q,S258D,C289L,N308Q,M1007W,R1098I,H1102I | P2E (Z)-7-[(1R,2R,3R)-3-hydroxy-2-[(E,3S)-3-hydroxyoct-1-enyl]-5-oxo-cyclopentyl]hept-5-enoic acid × 2 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；buffer A (0.1 M MES-NaOH (pH 6.0), 35 % PEG300, 400 mM Na2SO4, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.2 mM ONO-AE3-240),
buffer B (0.1 M MES-NaOH (pH 5.5-6.0), 30-40 % PEG300, 100 mM NaCl, 100 mM Li2SO4, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.2 mM ONO-AE3-240),
buffer C (0.1 M MES-NaOH (pH 6.1) or 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5-8.0), 30 % PEG500MME, 200 mM (NH4)2SO4, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.2 mM ONO-AE3-240), buffer D (0.1 M MES-NaOH (pH 5.8-6.1), 30 % PEG300, 100 mM MgSO4, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.2 mM ONO-AE3-240), buffer E (0.1 M MES-NaOH (pH 5.5), 30 % PEG300, 100 mM K2SO4, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.2 mM ONO-AE3-240)
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.295 |
| 6AQF Crystal structure of A2AAR-BRIL in complex with the antagonist ZM241385 produced from Pichia pastoris 提交 2017-08-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：;UNP P29274 residues 2-208 and 219-316 linked via UNP P0ABE7 residues 23-128,UNP P29274 residues 2-208 and 219-316 linked via UNP P0ABE7 residues 23-128,UNP P29274 residues 2-208 and 219-316 linked via UNP P0ABE7 residues 23-128
;
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L,M1007W, H1102I, R1106L,M1007W, H1102I, R1106L | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 OLA OLEIC ACID × 7 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；26-28 % (v/v) PEG400
40-60 mM sodium thiocyanate
2% (v/v) 2,5-hexanediol
100mM sodium citrate pH 5.0
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.256 |
| 6B73 Crystal Structure of a nanobody-stabilized active state of the kappa-opioid receptor 提交 2017-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：unp residues 23-128; unp residues 54-358
|
突变：M29W, H124I, L51R, I135L | CVV N-[(5alpha,6beta)-17-(cyclopropylmethyl)-3-hydroxy-7,8-didehydro-4,5-epoxymorphinan-6-yl]-3-iodobenzamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 OLA OLEIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5-7.0, 140-200 mM magnesium sulfate hydrate, 100 mM sodium citrate tribasic dehydrate, 10 mM Manganese(II) chloride tetrahydrate, 28-30% PEG400
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.275 |
| 6B73 Crystal Structure of a nanobody-stabilized active state of the kappa-opioid receptor 提交 2017-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
23–128（106 aa）
片段：unp residues 23-128; unp residues 54-358
|
突变：M29W, H124I, L51R, I135L | CVV N-[(5alpha,6beta)-17-(cyclopropylmethyl)-3-hydroxy-7,8-didehydro-4,5-epoxymorphinan-6-yl]-3-iodobenzamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM Bis-tris pH 6.5-7.0, 140-200 mM magnesium sulfate hydrate, 100 mM sodium citrate tribasic dehydrate, 10 mM Manganese(II) chloride tetrahydrate, 28-30% PEG400
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.275 |
| 6BQG Crystal structure of 5-HT2C in complex with ergotamine 提交 2017-11-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M29W, H124I, R128L, C360N | ERM Ergotamine × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.1 M sodium citrate pH 6.0, 100mM (NH4)2SO4, 30% PEG400
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.291 |
| 6BQH Crystal structure of 5-HT2C in complex with ritanserin 提交 2017-11-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | E2J 6-(2-{4-[bis(4-fluorophenyl)methylidene]piperidin-1-yl}ethyl)-7-methyl-5H-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidin-5-one × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 OLA OLEIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.1 M sodium citrate pH 6.0, 100mM (NH4)2SO4, 30% PEG400
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.275 |
| 6C1Q Crystal structure of human C5a receptor in complex with an orthosteric antagonist PMX53 and an allosteric antagonist NDT9513727 提交 2018-01-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
23–128（106 aa）
片段：cytochrome (UNP residues 23-127) + C5a receptor (UNP residues 30-331)
|
突变：M29W, H124I, R128L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 9P2 1-(1,3-benzodioxol-5-yl)-~{N}-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-~{N}-[(3-butyl-2,5-diphenyl-imidazol-4-yl)methyl]methanamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；283 K；25-35% PEG300, 100 mM MES, pH 6.5, 80-150 mM sodium malonate, 0.5% P400, 5 uM NDT, 5 uM PMX53
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.286 |
| 6C1R Crystal structure of human C5a receptor in complex with an orthosteric antagonist PMX53 and an allosteric antagonist avacopan 提交 2018-01-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
23–128（106 aa）
片段：cytochrome (UNP residues 23-127) + C5a receptor (UNP residues 30-331)
|
突变：M29W, H124I, R128L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EFD avacopan × 1 MLI MALONATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 OLA OLEIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；283 K；25-32% PEG300, 100 mM MES, pH6.5, 90-120 mM sodium malonate, 1% P400, 5 uM avacopan, 5 uM PMX53
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.224 |
| 6CBV Crystal structure of BRIL bound to an affinity matured synthetic antibody. 提交 2018-02-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102I, R106L | GOL GLYCEROL × 2 FMT FORMIC ACID × 2 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M Sodium formate, 20 % w/v PEG 3350
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.225 |
| 6CC4 Structure of MurJ from Escherichia coli 提交 2018-02-05 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；100 mM MES, pH 6.0, 100 mM potassium phosphate dibasic, 28% PEG300, 1% 1,2,3-heptanetriol, lipid stock used for reconstitution was 10:1 w/w monoolein:cholesterol
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.301 |
| 6CMO Rhodopsin-Gi complex 提交 2018-03-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6D32 Crystal structure of Xenopus Smoothened in complex with cyclopamine 提交 2018-04-14 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | CY8 Cyclopamine × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；Reconstituted in 10:1 monoolein:cholesterol mix. Precipitant solution: 35-45% PEG 300, 300-500 mM LiSO4, 0.1 M MES pH 6-6.5
|
分辨率 3.75 Å R-free 0.260 |
| 6D35 Crystal structure of Xenopus Smoothened in complex with cholesterol 提交 2018-04-14 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；Reconstituted in 10:1 monoolein:cholesterol mix. Precipitant solution: 35-45% PEG 300, 300-500 mM LiSO4, 0.1 M MES pH 6-6.5
|
分辨率 3.90 Å R-free 0.304 |
| 6DHY Crystallogrpahic tetramer of Zn-bound RIDC1 variant bearing two disulfide bonded cysteines 提交 2018-05-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, A38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, A38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, A38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, A38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C | HEC HEME C × 4 CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；8% PEG 1900 MME (w/v), 40 mM CaCl2, 33.3 mM Tris (pH 7.5)
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.258 |
| 6DHZ Crystallographic octamer of a metal-free RIDC1 variant bearing two disulfide bonded cysteines 提交 2018-05-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, A38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, A38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, A38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, A38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, K77H, T96C, R98C, Y101C | HEC HEME C × 8 CA CALCIUM ION × 14 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；15% 2-methyl-2,4-pentane diol (v/v), 33.3 mM Bis-Tris (pH 6.5), 66.7 mM CaCl2
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.277 |
| 6DO1 Structure of nanobody-stabilized angiotensin II type 1 receptor bound to S1I8 提交 2018-06-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
24–122（99 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 3 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 8；293.15 K；Protein was reconstituted with a 10:1 (w:w) mix of monoolein and cholesterol. Crystals were grown in cubic phase sandwich plates with using 100 mM Tris pH 8.0, 15-25 mM MgCl2, and 28-29% PEG 300
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.359 |
| 6DO1 Structure of nanobody-stabilized angiotensin II type 1 receptor bound to S1I8 提交 2018-06-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
24–122（99 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 8；293.15 K；Protein was reconstituted with a 10:1 (w:w) mix of monoolein and cholesterol. Crystals were grown in cubic phase sandwich plates with using 100 mM Tris pH 8.0, 15-25 mM MgCl2, and 28-29% PEG 300
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.359 |
| 6DRX Structural Determinants of Activation and Biased Agonism at the 5-HT2B Receptor 提交 2018-06-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
未记录 | H8G N,N-diethyl-N'-[(8alpha)-6-methyl-9,10-didehydroergolin-8-yl]urea × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM Tris/HCl pH 7.4-7.7, 30-50 mM
Ammonium tartrate dibasic, 30% v/v PEG400
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.286 |
| 6DRY Structural Determinants of Activation and Biased Agonism at the 5-HT2B Receptor 提交 2018-06-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
未记录 | H8D (8beta)-N-[(2S)-1-hydroxybutan-2-yl]-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 OLA OLEIC ACID × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM Tris/HCl pH 7.2-8.0, 170-190 mM Potassium phosphate monobasic, 30% v/v PEG400
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.272 |
| 6DRZ Structural Determinants of Activation and Biased Agonism at the 5-HT2B Receptor 提交 2018-06-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 OLA OLEIC ACID × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 H8J (8alpha)-N-[(2S)-1-hydroxybutan-2-yl]-1,6-dimethyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM Tris/HCl pH 7.3-7.5, 40-100 mM MgCl2, 30% v/v PEG400
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.263 |
| 6DS0 Structural Determinants of Activation and Biased Agonism at the 5-HT2B Receptor 提交 2018-06-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 H8M (1S)-1-[(2-chloro-3,4-dimethoxyphenyl)methyl]-6-methyl-2,3,4,9-tetrahydro-1H-beta-carboline × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM Tris/HCl pH 8.0, 100 mM Sodium Formate, 30% v/v PEG400
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.264 |
| 6DY4 Fe(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH2E 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97E, R98C, Y101C | FE FE (III) ION × 1 HEC HEME C × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEG 1500, and 0.1 M Tris (pH 8.5) mixed with 2 uL of 4 mM protein and 2.5 mM Iron(II) Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.254 |
| 6DY4 Fe(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH2E 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97E, R98C, Y101C | FE FE (III) ION × 1 HEC HEME C × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEG 1500, and 0.1 M Tris (pH 8.5) mixed with 2 uL of 4 mM protein and 2.5 mM Iron(II) Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.254 |
| 6DY6 Mn(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH2E 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97E, R98C, Y101C | MN MANGANESE (II) ION × 2 HEC HEME C × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 30% PEG 400, 200 mM Ammonium Acetate and 0.1 M Tris (pH 8.5) mixed with 1 uL of 2.5 mM protein and 2 mM Manganese(II) Chloride
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.260 |
| 6DY6 Mn(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH2E 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97E, R98C, Y101C | HEC HEME C × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 30% PEG 400, 200 mM Ammonium Acetate and 0.1 M Tris (pH 8.5) mixed with 1 uL of 2.5 mM protein and 2 mM Manganese(II) Chloride
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.260 |
| 6DY8 Mn(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH2EY 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97E, R98C, Y101C | HEC HEME C × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 25% PEG 1500, 200 mM Calcium Chloride, and 0.1 M Tris (pH 8.5) mixed with 1 uL of 3.5 mM protein and 3.5 mM Manganese(II)Chloride
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.278 |
| 6DY8 Mn(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH2EY 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97E, R98C, Y101C | HEC HEME C × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 25% PEG 1500, 200 mM Calcium Chloride, and 0.1 M Tris (pH 8.5) mixed with 1 uL of 3.5 mM protein and 3.5 mM Manganese(II)Chloride
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.278 |
| 6DY8 Mn(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH2EY 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97E, R98C, Y101C | HEC HEME C × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 25% PEG 1500, 200 mM Calcium Chloride, and 0.1 M Tris (pH 8.5) mixed with 1 uL of 3.5 mM protein and 3.5 mM Manganese(II)Chloride
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.278 |
| 6DY8 Mn(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH2EY 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97E, R98C, Y101C | HEC HEME C × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 25% PEG 1500, 200 mM Calcium Chloride, and 0.1 M Tris (pH 8.5) mixed with 1 uL of 3.5 mM protein and 3.5 mM Manganese(II)Chloride
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.278 |
| 6DYB Metal-free structure of the engineered cyt cb562 variant, CH3 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C | HEC HEME C × 1 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 30% PEG 400, 200 mM calcium chloride and 0.1 M Hepes (pH 7.5) mixed with 1 uL of 2.5 mM protein
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.309 |
| 6DYB Metal-free structure of the engineered cyt cb562 variant, CH3 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C | HEC HEME C × 1 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 30% PEG 400, 200 mM calcium chloride and 0.1 M Hepes (pH 7.5) mixed with 1 uL of 2.5 mM protein
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.309 |
| 6DYC Co(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH3 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C | CO COBALT (II) ION × 1 HEC HEME C × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEG 3350, 200 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 5.5) mixed with 2 uL of 3 mM protein and 3 mM Cobalt(II) Chloride
|
分辨率 1.33 Å R-free 0.192 |
| 6DYC Co(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH3 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C | HEC HEME C × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEG 3350, 200 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 5.5) mixed with 2 uL of 3 mM protein and 3 mM Cobalt(II) Chloride
|
分辨率 1.33 Å R-free 0.192 |
| 6DYD Cu(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH3 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C | CA CALCIUM ION × 2 HEC HEME C × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Drop consists of 2 uL of 45% MPD, 200 mM calcium chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 5.5) mixed with 2 uL of 2 mM protein and 2 mM Copper(II) sulfate
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.247 |
| 6DYD Cu(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH3 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C | CA CALCIUM ION × 3 HEC HEME C × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Drop consists of 2 uL of 45% MPD, 200 mM calcium chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 5.5) mixed with 2 uL of 2 mM protein and 2 mM Copper(II) sulfate
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.247 |
| 6DYE Fe(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH3 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C | FE FE (III) ION × 1 HEC HEME C × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEG 1500, 200 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.5) mixed with 2 uL of 3 mM protein and 2 mM Iron(II) Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.270 |
| 6DYE Fe(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH3 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C | HEC HEME C × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEG 1500, 200 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.5) mixed with 2 uL of 3 mM protein and 2 mM Iron(II) Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.270 |
| 6DYF Cu(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH3Y 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C | HEC HEME C × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Drop consists of 2 uL of 30% PEG 400, 200 mM Magnesium Choride and 0.1 M Bis-Tris (pH 5.5) mixed with 1 uL of 2.7 mM protein and 1.5 mM Copper(II) Sulfate
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.165 |
| 6DYF Cu(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH3Y 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C | HEC HEME C × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Drop consists of 2 uL of 30% PEG 400, 200 mM Magnesium Choride and 0.1 M Bis-Tris (pH 5.5) mixed with 1 uL of 2.7 mM protein and 1.5 mM Copper(II) Sulfate
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.165 |
| 6DYG Fe(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH3Y 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C | HEC HEME C × 1 FE FE (III) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEG 1500, 200 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.5) mixed with 1 uL of 2.7 mM protein and 1.5 mM Iron(II) Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.217 |
| 6DYG Fe(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH3Y 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C | HEC HEME C × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEG 1500, 200 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.5) mixed with 1 uL of 2.7 mM protein and 1.5 mM Iron(II) Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.217 |
| 6DYH Vanadyl-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH3Y 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C | V VANADIUM ION × 1 HEC HEME C × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 40% PPG, 200 mM calcium chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 5.5) mixed with 1 uL of 3.5 mM protein and 2 mM Vanadyl Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.234 |
| 6DYH Vanadyl-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, CH3Y 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C | HEC HEME C × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 40% PPG, 200 mM calcium chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 5.5) mixed with 1 uL of 3.5 mM protein and 2 mM Vanadyl Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.234 |
| 6DYI Co(II)-bound structure of the engineered cyt cb562 variant, H3 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, I67H, Q71H, T97H, R98C, Y101C | CO COBALT (II) ION × 1 HEC HEME C × 1 CL CHLORIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 25% PEG 5000 MME, 200 mM Calcium Chloride and 0.1 M Tris (pH 8.5) mixed with 1 uL of 5 mM protein and 10 mM Cobalt(II) Chloride
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.255 |
| 6DYJ Iron-bound structure of the engineered cyt b562 variant, CH3Y* 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, Y101A, H102I, R106L | FE FE (III) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEP 426, 100 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.0) mixed with 1 uL of 2 mM protein and 1.1 mM Iron(II) Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.252 |
| 6DYJ Iron-bound structure of the engineered cyt b562 variant, CH3Y* 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, Y101A, H102I, R106L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEP 426, 100 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.0) mixed with 1 uL of 2 mM protein and 1.1 mM Iron(II) Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.252 |
| 6DYJ Iron-bound structure of the engineered cyt b562 variant, CH3Y* 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, Y101A, H102I, R106L | MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEP 426, 100 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.0) mixed with 1 uL of 2 mM protein and 1.1 mM Iron(II) Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.252 |
| 6DYJ Iron-bound structure of the engineered cyt b562 variant, CH3Y* 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 G
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, Y101A, H102I, R106L | FE FE (III) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEP 426, 100 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.0) mixed with 1 uL of 2 mM protein and 1.1 mM Iron(II) Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.252 |
| 6DYK Iron- and Nitric Oxide-bound structure of the engineered cyt b562 variant, CH3Y* 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, Y101A, H102I, R106L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEP 426, 50 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.0) mixed with 1 uL of 4 mM protein and 2.2 mM Iron(II) Sulfate (Anaerobic crystal growth). Diethylamine NONOate (5 mM) was added to mother liquor prior to crystal harvest
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.249 |
| 6DYK Iron- and Nitric Oxide-bound structure of the engineered cyt b562 variant, CH3Y* 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, Y101A, H102I, R106L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEP 426, 50 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.0) mixed with 1 uL of 4 mM protein and 2.2 mM Iron(II) Sulfate (Anaerobic crystal growth). Diethylamine NONOate (5 mM) was added to mother liquor prior to crystal harvest
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.249 |
| 6DYK Iron- and Nitric Oxide-bound structure of the engineered cyt b562 variant, CH3Y* 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, Y101A, H102I, R106L | FE FE (III) ION × 1 NO NITRIC OXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEP 426, 50 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.0) mixed with 1 uL of 4 mM protein and 2.2 mM Iron(II) Sulfate (Anaerobic crystal growth). Diethylamine NONOate (5 mM) was added to mother liquor prior to crystal harvest
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.249 |
| 6DYK Iron- and Nitric Oxide-bound structure of the engineered cyt b562 variant, CH3Y* 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 G
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, Y101A, H102I, R106L | FE FE (III) ION × 1 NO NITRIC OXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；Drop consists of 2 uL of 25% PEP 426, 50 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 6.0) mixed with 1 uL of 4 mM protein and 2.2 mM Iron(II) Sulfate (Anaerobic crystal growth). Diethylamine NONOate (5 mM) was added to mother liquor prior to crystal harvest
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.249 |
| 6DYL Vanadyl-bound structure of the engineered cyt b562 variant, CH3Y* 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, Y101A, H102I, R106L | V VANADIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 35% PEP 426, 50 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 5.5) mixed with 1 uL of 4 mM protein and 2.2 mM Vanadyl Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.226 |
| 6DYL Vanadyl-bound structure of the engineered cyt b562 variant, CH3Y* 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, Y101A, H102I, R106L | V VANADIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 35% PEP 426, 50 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 5.5) mixed with 1 uL of 4 mM protein and 2.2 mM Vanadyl Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.226 |
| 6DYL Vanadyl-bound structure of the engineered cyt b562 variant, CH3Y* 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, Y101A, H102I, R106L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 35% PEP 426, 50 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 5.5) mixed with 1 uL of 4 mM protein and 2.2 mM Vanadyl Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.226 |
| 6DYL Vanadyl-bound structure of the engineered cyt b562 variant, CH3Y* 提交 2018-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 G
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, K59W, I67H, G70Y, Q71H, T96C, T97H, Y101A, H102I, R106L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Drop consists of 1 uL of 35% PEP 426, 50 mM Magnesium Chloride and 0.1 M Bis-Tris (pH 5.5) mixed with 1 uL of 4 mM protein and 2.2 mM Vanadyl Sulfate (Anaerobic crystal growth)
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.226 |
| 6G7O Crystal structure of human alkaline ceramidase 3 (ACER3) at 2.7 Angstrom resolution 提交 2018-04-06 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 6 NA SODIUM ION × 3 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.5；293.15 K；75mM MgSO4, 34-40% PEG400, 5% DMSO
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.270 |
| 6GT3 Crystal Structure of the A2A-StaR2-bRIL562 in complex with AZD4635 at 2.0A resolution 提交 2018-06-15 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：;A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, M1007W, H1102I, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, M1007W, H1102I, L235A, V239A, S277A,A54L, T88A, R107A, K122A, N154A, L202A, M1007W, H1102I, L235A, V239A, S277A ; | NA SODIUM ION × 1 F9Q 6-(2-chloranyl-6-methyl-pyridin-4-yl)-5-(4-fluorophenyl)-1,2,4-triazin-3-amine × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 15 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.3；293.15 K；0.1 M TRI-SODIUM CITRATE PH 5.3-5.4, 0.05 M SODIUM THIOCYANATE, 29-32% PEG400, 2%(V/V) 2,5-HEXANEDIOL
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.201 |
| 6IIU Crystal structure of the human thromboxane A2 receptor bound to ramatroban 提交 2018-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W/H1102I/R1106L/L247A | A8X 3-[(3R)-3-[(4-fluorophenyl)sulfonylamino]-1,2,3,4-tetrahydrocarbazol-9-yl]propanoic acid × 1 ZN ZINC ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；Magnesium acetate, PEG 500 DME
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.218 |
| 6IIV Crystal structure of the human thromboxane A2 receptor bound to daltroban 提交 2018-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W/H1102I/R1106L/L247A | A90 2-[4-[2-[(4-chlorophenyl)sulfonylamino]ethyl]phenyl]ethanoic acid × 1 ZN ZINC ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；Magnesium acetate, PEG 400
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.237 |
| 6IQL Crystal structure of dopamine receptor D4 bound to the subtype-selective ligand, L745870 提交 2018-11-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
|
突变：F121W,C181R,P201I,M1007W,H1106L,P317A,G307A 突变：F121W,C181R,P201I,M1007W,H1106L,P317A,G307A | L74 3-{[4-(4-chlorophenyl)piperazin-1-yl]methyl}-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；100 mM MES (pH 6.0), 50 mM ammonium citrate, 30% PEG 400
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.336 |
| 6JOD Angiotensin II type 2 receptor with ligand 提交 2019-03-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 C
23–62（40 aa）
链 C
89–128（40 aa）
|
突变：M1007W,R1098I,H1102I,R1106G 突变：M1007W,R1098I,H1102I,R1106G | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；30% (v/v) PEG 300
0.1 M HEPES (pH 7.0)
100 mM Sodium phosphate dibasic dihydrate
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.287 |
| 6JZH Structure of human A2A adenosine receptor in complex with ZM241385 obtained from SFX experiments under atmospheric pressure 提交 2019-05-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：N154Q,M29W,H124I,R128L | NA SODIUM ION × 1 ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 OLA OLEIC ACID × 19 CLR CHOLESTEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；27% (v/v) PEG400, 50-mM sodium thiocyanate, 2% (v/v) 2,5-hexanediol, 100-mM sodium citrate (pH 5.0)
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.218 |
| 6KO5 Complex structure of Ghrelin receptor with Fab 提交 2019-08-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | 8QX 6-(4-bromanyl-2-fluoranyl-phenoxy)-2-methyl-3-[[(3~{S})-1-propan-2-ylpiperidin-3-yl]methyl]pyrido[3,2-d]pyrimidin-4-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM MES (pH6.6-7.0), 400 mM potassium acetate and 36-40% polyethylene glycol (PEG) 300.
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.258 |
| 6LPJ A2AR crystallized in EROCOC17+4, LCP-SFX at 277 K 提交 2020-01-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M29W, H124I, R128L | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 D12 DODECANE × 1 MYS PENTADECANE × 6 HEX HEXANE × 1 8K6 Octadecane × 3 D10 DECANE × 1 OCT N-OCTANE × 3 UND UNDECANE × 1 ER0 [(2~{R},3~{S})-2,3,4-tris(oxidanyl)butyl] (5~{R},9~{R},13~{R})-5,9,13,17-tetramethyloctadecanoate × 2 TRD TRIDECANE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM sodium citrate pH5.5, 37% PEG300, 50 mM NaSCN, and 2% 2,5-hexanediol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.207 |
| 6LPK A2AR crystallized in EROCOC17+4, LCP-SFX at 293 K 提交 2020-01-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M29W, H124I, R128L | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 D12 DODECANE × 1 MYS PENTADECANE × 6 HEX HEXANE × 1 8K6 Octadecane × 3 D10 DECANE × 1 OCT N-OCTANE × 3 UND UNDECANE × 1 ER0 [(2~{R},3~{S})-2,3,4-tris(oxidanyl)butyl] (5~{R},9~{R},13~{R})-5,9,13,17-tetramethyloctadecanoate × 2 TRD TRIDECANE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM sodium citrate pH5.5, 37% PEG300, 50 mM NaSCN, and 2% 2,5-hexanediol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.209 |
| 6LPL A2AR crystallized in EROCOC17+4, SS-ROX at 100 K 提交 2020-01-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 D12 DODECANE × 1 MYS PENTADECANE × 6 HEX HEXANE × 1 8K6 Octadecane × 3 D10 DECANE × 1 OCT N-OCTANE × 3 UND UNDECANE × 1 ER0 [(2~{R},3~{S})-2,3,4-tris(oxidanyl)butyl] (5~{R},9~{R},13~{R})-5,9,13,17-tetramethyloctadecanoate × 2 TRD TRIDECANE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100 mM sodium citrate pH5.5, 35-40% PEG400, 50 mM NaSCN, and 2% 2,5-hexanediol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 6LW5 Crystal structure of the human formyl peptide receptor 2 in complex with WKYMVm 提交 2020-02-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L, S211L | CLR CHOLESTEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.1 M Tris, pH 7.5, 35% PEG500 DME, 3% PPG400, 100 mM CH3COOLi
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.289 |
| 6M97 Crystal structure of the high-affinity copper transporter Ctr1 提交 2018-08-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | TBR HEXATANTALUM DODECABROMIDE × 6 ZN ZINC ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM zinc acetate, 50 mM sodium cacodylate pH 5.9, and 26% PEG 400.
|
分辨率 3.03 Å R-free 0.332 |
| 6M98 Crystal structure of the high-affinity copper transporter Ctr1 in complex with Cu(I) 提交 2018-08-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 6 ZN ZINC ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM zinc acetate, 50 mM sodium cacodylate pH 5.9, and 28% PEG 400.
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.340 |
| 6ME6 XFEL crystal structure of human melatonin receptor MT2 in complex with 2-phenylmelatonin 提交 2018-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M2007W, H2102I, R2106L, P37S, D86N, L108F, F129W, N137D, C140L, W246F, A305P 突变：M2007W, H2102I, R2106L, P37S, D86N, L108F, F129W, N137D, C140L, W246F, A305P | JEY N-[2-(5-methoxy-2-phenyl-1H-indol-3-yl)ethyl]acetamide × 2 ZN ZINC ION × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；N-(2-Acetamido)iminodiacetic acid, PEG 400, ammonium acetate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.249 |
| 6ME7 XFEL crystal structure of human melatonin receptor MT2 (H208A) in complex with 2-phenylmelatonin 提交 2018-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M2007W, H2102I, R2106L, P37S, D86N, L108F, F129W, N137D, C140L, W246F, A305P | JEY N-[2-(5-methoxy-2-phenyl-1H-indol-3-yl)ethyl]acetamide × 1 ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；N-(2-Acetamido)iminodiacetic acid, PEG 400, ammonium acetate
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.250 |
| 6ME7 XFEL crystal structure of human melatonin receptor MT2 (H208A) in complex with 2-phenylmelatonin 提交 2018-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M2007W, H2102I, R2106L, P37S, D86N, L108F, F129W, N137D, C140L, W246F, A305P | JEY N-[2-(5-methoxy-2-phenyl-1H-indol-3-yl)ethyl]acetamide × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；N-(2-Acetamido)iminodiacetic acid, PEG 400, ammonium acetate
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.250 |
| 6ME8 XFEL crystal structure of human melatonin receptor MT2 (N86D) in complex with 2-phenylmelatonin 提交 2018-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M2007W, H2102I, R2106L, P37S, D86N, L108F, F129W, N137D, C140L, W246F, A305P | JEY N-[2-(5-methoxy-2-phenyl-1H-indol-3-yl)ethyl]acetamide × 1 ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；N-(2-Acetamido)iminodiacetic acid, PEG 400, ammonium acetate
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.262 |
| 6ME8 XFEL crystal structure of human melatonin receptor MT2 (N86D) in complex with 2-phenylmelatonin 提交 2018-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M2007W, H2102I, R2106L, P37S, D86N, L108F, F129W, N137D, C140L, W246F, A305P | JEY N-[2-(5-methoxy-2-phenyl-1H-indol-3-yl)ethyl]acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；N-(2-Acetamido)iminodiacetic acid, PEG 400, ammonium acetate
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.262 |
| 6ME9 XFEL crystal structure of human melatonin receptor MT2 in complex with ramelteon 提交 2018-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M2007W, H2102I, R2106L, P37S, D86N, L108F, F129W, N137D, C140L, W246F, A305P | JEV N-{2-[(8S)-1,6,7,8-tetrahydro-2H-indeno[5,4-b]furan-8-yl]ethyl}propanamide × 1 ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；N-(2-Acetamido)iminodiacetic acid, PEG 400, ammonium acetate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.270 |
| 6ME9 XFEL crystal structure of human melatonin receptor MT2 in complex with ramelteon 提交 2018-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M2007W, H2102I, R2106L, P37S, D86N, L108F, F129W, N137D, C140L, W246F, A305P | JEV N-{2-[(8S)-1,6,7,8-tetrahydro-2H-indeno[5,4-b]furan-8-yl]ethyl}propanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；N-(2-Acetamido)iminodiacetic acid, PEG 400, ammonium acetate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.270 |
| 6MH8 High-viscosity injector-based Pink Beam Serial Crystallography of Micro-crystals at a Synchrotron Radiation Source 提交 2018-09-17 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；298 K；sodium citrate pH 5.0, PEG 400, sodium thiocyanate
|
分辨率 4.20 Å R-free 0.288 |
| 6OS0 Structure of synthetic nanobody-stabilized angiotensin II type 1 receptor bound to angiotensin II 提交 2019-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
24–122（99 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.6；293 K；Protein complex was reconstituted with a 10:1 (w/w) mixture of monoolein and cholesterol. Crystals were grown in 100 mM Tris pH 7.6, 10 mM MgCl2, 25-26% PEG 300
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.318 |
| 6OS1 Structure of synthetic nanobody-stabilized angiotensin II type 1 receptor bound to TRV023 提交 2019-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
24–122（99 aa）
|
未记录 | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 6 CLR CHOLESTEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 8；293 K；Protein complex was reconstituted with a 10:1 (w/w) mixture of monoolein and cholesterol. Crystals were grown in 100 mM Tris pH 8, 50-70 mM MgCl2, 30% PEG 300, 2-4% 1,3-butanediol
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.282 |
| 6OS2 Structure of synthetic nanobody-stabilized angiotensin II type 1 receptor bound to TRV026 提交 2019-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
24–122（99 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 6 CLR CHOLESTEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 8；293 K；Protein complex was reconstituted with a 10:1 (w/w) mixture of monoolein and cholesterol. Crystals were grown in 100 mM Tris pH 8, 65 mM MgCl2, 26-28% PEG 300, 4.5% 1,3-butanediol
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.285 |
| 6OT4 Bimetallic dodecameric cage design 2 (BMC2) from cytochrome cb562 提交 2019-05-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：E8H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：E8H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：E8H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：E8H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C | HEC HEME C × 12 HAE ACETOHYDROXAMIC ACID × 24 FE FE (III) ION × 12 ZN ZINC ION × 18 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；Protein solution:
2.2 mM protein with 1.65 mM Fe and 2 mM Zn added 1 hour before crystallisation.
1 ul to 1 ul drops with following mother liquor:
30% PEG400, 0.1 M TrisHCl pH 8.5, 0.2 M NaCl
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.191 |
| 6OT7 Bimetallic dodecameric cage design 3 (BMC3) from cytochrome cb562 提交 2019-05-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C | HEC HEME C × 12 ZN ZINC ION × 21 FE FE (III) ION × 12 HAE ACETOHYDROXAMIC ACID × 24 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；Protein solution of:
2.2 mM protein with 1.65 mM Fe and 3 mM Zn premixed briefly prior to crystallisation.
Drops were 1ul + 1 ul of protein solution and the following mother liquor:
30% PEG400, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M (NH4)2SO4
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.211 |
| 6OT8 Bimetallic hexameric cage design 4 (BMC4) from cytochrome cb562 提交 2019-05-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：D2E,D5E,E8H,V16H,Q25E,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63S,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C | HEC HEME C × 6 ZN ZINC ION × 18 FE FE (III) ION × 6 HAE ACETOHYDROXAMIC ACID × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；Protein solution of:
2.2 mM protein with 1.05 mM Fe and 3 mM Zn premixed 1 hour prior to crystallisation.
Drops were 1ul + 1 ul of protein solution and the following mother liquor:
30% PEG400, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.218 |
| 6OT9 Bimetallic dodecameric cage design 1 (BMC1) from cytochrome cb562 提交 2019-05-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：E8H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,R98C,Y101C 突变：E8H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,R98C,Y101C 突变：E8H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,R98C,Y101C 突变：E8H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,R98C,Y101C | ZN ZINC ION × 18 HAE ACETOHYDROXAMIC ACID × 12 HEC HEME C × 12 FE FE (III) ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；Protein solution:
2.1 mM protein, 1.05 mM Fe, 2 mM Zn added 1 hour prior to crystallisation.
1 ul + 1ul drops from protein solution and following mother liquor;
22.5% PEG400, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M NaCl
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.272 |
| 6OVH Cryo-EM structure of Bimetallic dodecameric cage design 3 (BMC3) from cytochrome cb562 提交 2019-05-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
链 F
23–128（106 aa）
链 G
23–128（106 aa）
链 H
23–128（106 aa）
链 I
23–128（106 aa）
链 J
23–128（106 aa）
链 K
23–128（106 aa）
链 L
23–128（106 aa）
|
突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C 突变：D5H,E8H,V16H,A24T,Q25T,R34Q,L38Q,Q41W,K42S,K59S,H63C,D66W,I67E,V69I,D73N,D74A,K77H,N80K,E81Q,G82C,R98C,Y101C | HEC HEME C × 12 HAE ACETOHYDROXAMIC ACID × 24 ZN ZINC ION × 24 FE FE (III) ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 6PS7 XFEL A2aR structure by ligand exchange from LUF5843 to ZM241385. 提交 2019-07-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 9 CLR CHOLESTEROL × 3 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 OLA OLEIC ACID × 13 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；50mM sodium thiocyanate, 100 mM sodium citrate pH 4.8, and 28% PEG 400, 2 mM of target ligand ZM241385
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.201 |
| 6RZ5 XFEL crystal structure of the human cysteinyl leukotriene receptor 1 in complex with zafirlukast 提交 2019-06-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | ZLK zafirlukast × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 OLA OLEIC ACID × 11 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293 K；75-175 mM sodium phosphate
24-34% v/v PEG400
100 mM HEPES pH 7.0
1 uM zafirlukast
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.223 |
| 6RZ5 XFEL crystal structure of the human cysteinyl leukotriene receptor 1 in complex with zafirlukast 提交 2019-06-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | ZLK zafirlukast × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 9 OLA OLEIC ACID × 8 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293 K；75-175 mM sodium phosphate
24-34% v/v PEG400
100 mM HEPES pH 7.0
1 uM zafirlukast
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.223 |
| 6RZ6 Crystal structure of the human cysteinyl leukotriene receptor 2 in complex with ONO-2570366 (C2221 space group) 提交 2019-06-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | KNW (2~{S})-8-[[4-[4-(2-chloranyl-5-fluoranyl-phenyl)butoxy]phenyl]carbonylamino]-4-(4-oxidanyl-4-oxidanylidene-butyl)-2,3- dihydro-1,4-benzoxazine-2-carboxylic acid × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 16 OLA OLEIC ACID × 10 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 8；293 K；100-200 mM NH4 Tartrate dibasic
28-32% v/v PEG400
100 mM HEPES pH 8.0
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.232 |
| 6RZ7 Crystal structure of the human cysteinyl leukotriene receptor 2 in complex with ONO-2570366 (F222 space group) 提交 2019-06-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | KNW (2~{S})-8-[[4-[4-(2-chloranyl-5-fluoranyl-phenyl)butoxy]phenyl]carbonylamino]-4-(4-oxidanyl-4-oxidanylidene-butyl)-2,3- dihydro-1,4-benzoxazine-2-carboxylic acid × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 OLA OLEIC ACID × 21 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293 K；30 mM NH4 tartrate dibasic
24% PEG400
100 mM HEPES 7.0
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.259 |
| 6RZ8 Crystal structure of the human cysteinyl leukotriene receptor 2 in complex with ONO-2080365 提交 2019-06-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | KNZ (2~{S})-8-[[4-[4-[2,3-bis(fluoranyl)phenoxy]butoxy]-2-fluoranyl-phenyl]carbonylamino]-4-(4-oxidanyl-4-oxidanylidene-but yl)-2,3-dihydro-1,4-benzoxazine-2-carboxylic acid × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 10 OLA OLEIC ACID × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 8；293 K；100 mM K Formate
30% v/v PEG400
100 mM TRIS-HCl pH 8.0
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.246 |
| 6RZ9 Crystal structure of the human cysteinyl leukotriene receptor 2 in complex with ONO-2770372 提交 2019-06-12 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | KO5 (2~{S})-8-[[4-[4-(5-fluoranyl-2-methyl-phenyl)butoxy]phenyl]carbonylamino]-4-(4-oxidanyl-4-oxidanylidene-butyl)-2,3-dih ydro-1,4-benzoxazine-2-carboxylic acid × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 13 OLA OLEIC ACID × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293 K；210mM NH4 tartrate dibasic
29% PEG400
HEPES 7.0
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.254 |
| 6S0Q Structure of the A2A adenosine receptor determined at SwissFEL using native-SAD at 4.57 keV from 50,000 diffraction patterns 提交 2019-06-18 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：ADORA2A,ADORA2A,ADORA2A | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 OLA OLEIC ACID × 7 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 CLR CHOLESTEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；297 K；0.1M sodium citrate pH 5.0, 0.05M sodium thiocyanate, 28-34% PEG400, 5 mM ZM241385, 2% (v/v) 1,6-hexanedio
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.221 |
| 6UR8 CryoEM structure of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor in complex with varenicline 提交 2019-10-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–123（101 aa）
链 D
23–123（101 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 QMR VARENICLINE × 2 BMA beta-D-mannopyranose × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.71 Å |
| 6USF CryoEM structure of human alpha4beta2 nicotinic acetylcholine receptor with varenicline in complex with anti-BRIL synthetic antibody BAK5 提交 2019-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric |
链 A
23–123（101 aa）
链 D
23–123（101 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 QMR VARENICLINE × 2 BMA beta-D-mannopyranose × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.87 Å |
| 6WGT Crystal structure of HTR2A with hallucinogenic agonist 提交 2020-04-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | 7LD (8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 OLA OLEIC ACID × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293.15 K；100 mM Tris (pH7.0)
370-410 mM KPO4-mono
90-120 mM GuHCl
28-34% PEG 400
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.305 |
| 6WGT Crystal structure of HTR2A with hallucinogenic agonist 提交 2020-04-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
未记录 | 7LD (8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 OLA OLEIC ACID × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293.15 K；100 mM Tris (pH7.0)
370-410 mM KPO4-mono
90-120 mM GuHCl
28-34% PEG 400
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.305 |
| 6WGT Crystal structure of HTR2A with hallucinogenic agonist 提交 2020-04-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
|
未记录 | 7LD (8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293.15 K；100 mM Tris (pH7.0)
370-410 mM KPO4-mono
90-120 mM GuHCl
28-34% PEG 400
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.305 |
| 6WH4 Crystal structure of HTR2A with inverse agonist 提交 2020-04-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | 89F 1-methyl-4-[(5~{S})-3-methylsulfanyl-5,6-dihydrobenzo[b][1]benzothiepin-5-yl]piperazine × 1 OLA OLEIC ACID × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293.15 K；100 mM Tris (pH7.0)
380 mM potassium phosphate-monobasic
33% PEG 400
100 mM Guanidine HCL
300 mM NDSB-195
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.304 |
| 6WH4 Crystal structure of HTR2A with inverse agonist 提交 2020-04-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
未记录 | 89F 1-methyl-4-[(5~{S})-3-methylsulfanyl-5,6-dihydrobenzo[b][1]benzothiepin-5-yl]piperazine × 1 OLA OLEIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293.15 K；100 mM Tris (pH7.0)
380 mM potassium phosphate-monobasic
33% PEG 400
100 mM Guanidine HCL
300 mM NDSB-195
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.304 |
| 6WH4 Crystal structure of HTR2A with inverse agonist 提交 2020-04-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
|
未记录 | 89F 1-methyl-4-[(5~{S})-3-methylsulfanyl-5,6-dihydrobenzo[b][1]benzothiepin-5-yl]piperazine × 1 OLA OLEIC ACID × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 NDS ETHYL DIMETHYL AMMONIO PROPANE SULFONATE × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293.15 K；100 mM Tris (pH7.0)
380 mM potassium phosphate-monobasic
33% PEG 400
100 mM Guanidine HCL
300 mM NDSB-195
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.304 |
| 6WHA HTR2A bound to 25-CN-NBOH in complex with a mini-Galpha-q protein, beta/gamma subunits and an active-state stabilizing single-chain variable fragment (scFv16) obtained by cryo-electron microscopy (cryoEM) 提交 2020-04-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–127（105 aa）
片段：cybC (UNP residues 23-127) + linker + HTR2A (UNP residues 66-404)
|
未记录 | U0G 4-(2-{[(2-hydroxyphenyl)methyl]amino}ethyl)-2,5-dimethoxybenzonitrile × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
| 6WQA 2.0A angstrom A2a adenosine receptor structure using XFEL data collected in helium atmosphere. 提交 2020-04-28 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 15 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 5 GOL GLYCEROL × 1 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；PEG400, sodium thiocyanate, sodium citrate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.216 |
| 6WW2 Structure of human Frizzled5 by fiducial-assisted cryo-EM 提交 2020-05-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；5s blotting
|
分辨率 3.70 Å |
| 6WYU Crystallographic trimer of metal-free TriCyt2 提交 2020-05-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：Q41K, D54A, K59I, H63V, V69L, G70W, D73H, K77H, R98C, Y101C 突变：Q41K, D54A, K59I, H63V, V69L, G70W, D73H, K77H, R98C, Y101C 突变：Q41K, D54A, K59I, H63V, V69L, G70W, D73H, K77H, R98C, Y101C | HEC HEME C × 3 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；43% MPD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris (pH 8.5)
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.191 |
| 6WZ0 Fe-bound structure of an engineered metal-dependent protein trimer, TriCyt2 提交 2020-05-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：Q41K, D54A, K59I, H63V, V69L, G70W, D73H, K77H, R98C, Y101C 突变：Q41K, D54A, K59I, H63V, V69L, G70W, D73H, K77H, R98C, Y101C 突变：Q41K, D54A, K59I, H63V, V69L, G70W, D73H, K77H, R98C, Y101C | HEC HEME C × 3 FE2 FE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；25% PEG400, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS (pH 8.5)
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.212 |
| 6WZ1 Mn-bound structure of an engineered protein trimer, TriCyt3 提交 2020-05-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80K, R98C, Y101C 突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80K, R98C, Y101C 突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80K, R98C, Y101C | HEC HEME C × 3 MN MANGANESE (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；30% PEG 400, 0.2 M CaCl2, 0.1 M BIS-TRIS (pH 6.5)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 6WZ2 Co-bound structure of an engineered protein trimer, TriCyt3 提交 2020-05-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80K, R98C, Y101C 突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80K, R98C, Y101C 突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80K, R98C, Y101C | HEC HEME C × 3 CO COBALT (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；25% PEG1500, 0.2 M MgCl2, 0.1 M HEPES (pH 7.5)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.218 |
| 6WZ3 Cu-bound structure of the engineered protein trimer, TriCyt3 提交 2020-05-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80K, R98C, Y101C 突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80K, R98C, Y101C 突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80K, R98C, Y101C | HEC HEME C × 3 CL CHLORIDE ION × 7 CU COPPER (II) ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG1500, 0.2 M MgCl2, 0.1 M BIS-TRIS (pH 5.5)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.236 |
| 6WZ7 Mn-bound structure of a TriCyt3 variant 提交 2020-05-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80E, E81K, R98C, Y101C 突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80E, E81K, R98C, Y101C 突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80E, E81K, R98C, Y101C | HEC HEME C × 3 MN MANGANESE (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 5 CA CALCIUM ION × 9 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；45% MPD, 0.2 M calcium chloride, 0.1 M HEPES (pH 7.5)
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.219 |
| 6WZA Ni-bound structure of an engineered metal-dependent protein trimer, TriCyt1 提交 2020-05-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：K59H, D66N, G70W, D73H, K77H, R98C, Y101C 突变：K59H, D66N, G70W, D73H, K77H, R98C, Y101C 突变：K59H, D66N, G70W, D73H, K77H, R98C, Y101C | HEC HEME C × 3 NI NICKEL (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 6 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；22.5% PEG 400, 0.2 M NaCl, 0.1 M HEPES (pH 7.5)
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.306 |
| 6WZC Ni-bound structure of an engineered protein trimer, TriCyt3 提交 2020-05-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80K, R98C, Y101C | HEC HEME C × 3 NI NICKEL (II) ION × 6 CA CALCIUM ION × 12 CL CHLORIDE ION × 9 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；25% PEG2000, 0.2 M CaCl2, 0.1 M Bis-Tris (pH 6.5)
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.219 |
| 6X7E Co-bound structure of an engineered protein trimer, TriCyt3, with delta isomerism at the hexahistidine coordination site 提交 2020-05-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80K, R98C, Y101C 突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80K, R98C, Y101C 突变：T31K, A35K, Q41K, D54A, K59I, H63V, I67E, V69A, G70W, Q71E, D73H, L76A, K77H, N80K, R98C, Y101C | HEC HEME C × 3 CO COBALT (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；25% PEG1500, 200 mM MgCl2, 100 mM TRIS (8.5)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.213 |
| 6X8X Cu-bound structure of an engineered metal-dependent protein trimer, TriCyt1 提交 2020-06-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：K59H, D66N, G70W, D73H, K77H, R98C, Y101C | HEC HEME C × 3 CU COPPER (II) ION × 3 CA CALCIUM ION × 15 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；25% PEG2000, 200 mM CaCl2, 100 mM TRIS (pH 8.5)
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.342 |
| 6ZDR Crystal structure of stabilized A2A adenosine receptor A2AR-StaR2-bRIL in complex with Chromone 4d 提交 2020-06-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | QGE [3-(4-methyl-1,3-thiazol-2-yl)-4-oxidanylidene-6-propyl-chromen-7-yl] ethanoate × 1 NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 11 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；PEG 400; Sodium Citrate; Sodium Thiocyanate; 2,5 Hexanediol
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.218 |
| 6ZDV Crystal structure of stabilized A2A adenosine receptor A2AR-StaR2-bRIL in complex with Chromone 5d 提交 2020-06-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | QGW [2-methyl-3-(4-methyl-1,3-thiazol-2-yl)-4-oxidanylidene-6-propyl-chromen-7-yl] ethanoate × 1 NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 OLA OLEIC ACID × 14 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；PEG 400, Sodium Citrate, Sodium Thiocyanate, 2,5 Hexanediol
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.224 |
| 7ARO Crystal structure of the non-ribose partial agonist LUF5833 bound to the adenosine A2A receptor 提交 2020-10-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | RVZ 2-azanyl-6-(1~{H}-imidazol-2-ylmethylsulfanyl)-4-phenyl-pyridine-3,5-dicarbonitrile × 2 OLA OLEIC ACID × 8 CLR CHOLESTEROL × 2 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；300 K；29-32% PEG 400, 0.1M tri-sodium Citrate pH = 5.3-5.4, 0.05M Sodium Thiocyanate, 2.5 % 2,5-hexanediol
|
分辨率 3.12 Å R-free 0.255 |
| 7BW0 Active human TGR5 complex with a synthetic agonist 23H 提交 2020-04-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7C61 Crystal structure of 5-HT1B-BRIL and SRP2070_Fab complex 提交 2020-05-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：L138W,M1007W,H1102I,R1106L | ERM Ergotamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；30% PEG400, 0.4M SODIUM THIOCYANATE, 0.1M SODIUM ACETATE PH 5.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.290 |
| 7C6A Crystal structure of AT2R-BRIL and SRP2070_Fab complex 提交 2020-05-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：L93V, F133W, M1007W, H1102I, R1106L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.05M POTASSIUM ACETATE, 0.1M MES PH6.5, 26-36% PEG300
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.285 |
| 7CMU Dopamine Receptor D3R-Gi-Pramipexole complex 提交 2020-07-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M35W,H130I,R134L | G6L (6S)-N6-propyl-4,5,6,7-tetrahydro-1,3-benzothiazole-2,6-diamine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7CMV Dopamine Receptor D3R-Gi-PD128907 complex 提交 2020-07-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M35W,H130I,R134L | G6O (4aR,10bR)-4-propyl-3,4a,5,10b-tetrahydro-2H-chromeno[4,3-b][1,4]oxazin-9-ol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 7DFP Human dopamine D2 receptor in complex with spiperone 提交 2020-11-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–62（40 aa）
链 A
88–128（41 aa）
|
突变：S121K,L123W,M1007W,R1098I, H1102I, R1106G 突变：S121K,L123W,M1007W,R1098I, H1102I, R1106G | SIP 8-[4-(4-fluorophenyl)-4-oxidanylidene-butyl]-1-phenyl-1,3,8-triazaspiro[4.5]decan-4-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 8；293 K；0.1M Tris-HCl pH 8.0, 0.1M Lithium acetate dihydrate, 30% (V/V) polyethylene glycol 400, 5% (v/v) dimethyl sulfoxide, 0.01M Adenosine triphosphate, 1mM spiperone
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.216 |
| 7E2X Apo serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Gi protein complex 提交 2021-02-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M7W,H102I,R106L,L125W | J40 [(2R)-1-[oxidanyl-[(2R,3R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrakis(oxidanyl)-4-phosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-3-tetradecanoyloxy-propan-2-yl] (5E,8E)-hexadeca-5,8,11,14-tetraenoate × 1 CLR CHOLESTEROL × 10 PLM PALMITIC ACID × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7E2Y Serotonin-bound Serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Gi protein complex 提交 2021-02-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M7W,H102I,R106L,L125W | SRO SEROTONIN × 1 J40 [(2R)-1-[oxidanyl-[(2R,3R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrakis(oxidanyl)-4-phosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-3-tetradecanoyloxy-propan-2-yl] (5E,8E)-hexadeca-5,8,11,14-tetraenoate × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7E2Z Aripiprazole-bound serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Gi protein complex 提交 2021-02-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M7W,H102I,R106L,L125W | 9SC 7-[4-[4-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]piperazin-1-yl]butoxy]-3,4-dihydro-1H-quinolin-2-one × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 J40 [(2R)-1-[oxidanyl-[(2R,3R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrakis(oxidanyl)-4-phosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-3-tetradecanoyloxy-propan-2-yl] (5E,8E)-hexadeca-5,8,11,14-tetraenoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7E32 Serotonin 1D (5-HT1D) receptor-Gi protein complex 提交 2021-02-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M7W,H102I,R106L,L127W | SRO SEROTONIN × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7E33 Serotonin 1E (5-HT1E) receptor-Gi protein complex 提交 2021-02-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M7W,H102I,R106L,L111W | HVU 3-(1-methylpiperidin-4-yl)-1H-indol-5-ol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7EXD Lasmiditan-bound serotonin 1F (5-HT1F) receptor-Gi protein complex 提交 2021-05-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 05X 2,4,6-tris(fluoranyl)-N-[6-(1-methylpiperidin-4-yl)carbonylpyridin-2-yl]benzamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7EZC Adenosine A2a receptor mutant-I92N 提交 2021-06-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–123（101 aa）
链 B
23–123（101 aa）
|
突变：I92N,M1007W 突变：I92N,M1007W | UKA 6-(2,2-diphenylethylamino)-9-[(2R,3R,4S,5S)-5-(ethylcarbamoyl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]-N-[2-[(1-pyridin-2-ylpiperidin-4-yl)carbamoylamino]ethyl]purine-2-carboxamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 8.2；291 K；100 mM Tris pH 8.2, 30% PEG400 and 0.4 M (NH4)2SO4.
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.313 |
| 7F61 Crystal structure of human histamine receptor H3R in complex with antagonist PF03654746 提交 2021-06-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M7W, H102I, R106L | 1IB N-ethyl-3-fluoranyl-3-[3-fluoranyl-4-(pyrrolidin-1-ylmethyl)phenyl]cyclobutane-1-carboxamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；294 K；100mM sodium cacodylate trihydrate, pH6.4, 90mM sodium citrate, 34% PEG400, 2% Dichloromethane
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.285 |
| 7F83 Crystal Structure of a receptor in Complex with inverse agonist 提交 2021-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：T130K,N188Q,M1012W,H1107I,R1111L 突变：T130K,N188Q,M1012W,H1107I,R1111L | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 6 1KQ 2-(2-methylimidazo[2,1-b][1,3]thiazol-6-yl)-1-[2-[(1R)-5-(6-methylpyrimidin-4-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]-2,7-diazaspiro[3.5]nonan-7-yl]ethanone × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293.15 K；100mM HEPES, pH 7.0, 25%-36% PEG300, 80mM - 150mM NH4F
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.265 |
| 7IN1 Crystal structure of A2A in complex with TEP for 21h 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.279 |
| 7IN2 Crystal structure of A2A in complex with 1 mM ZM241385 for 21h 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.267 |
| 7IN3 Crystal structure of A2A in complex with 5 mM ZM241385 for 21h 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.262 |
| 7IN4 Crystal structure of A2A in complex with 10 mM ZM241385 for 21h 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.308 |
| 7IN5 Crystal structure of A2A in complex with TEP for 3h 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.257 |
| 7IN6 Crystal structure of A2A in complex with 1 mM ZM241385 for 3h 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.333 |
| 7IN7 Crystal structure of A2A in complex with 5 mM ZM241385 for 3h 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.271 |
| 7IN8 Crystal structure of A2A in complex with 10 mM ZM241385 for 3h 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.300 |
| 7IN9 Crystal structure of A2A in complex with Fi16 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1COM (3M)-3-(2-methyl-1,3-thiazol-4-yl)pyridine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.227 |
| 7INA Crystal structure of A2A in complex with F2 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CON 2-{[5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]sulfanyl}acetamide × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.284 |
| 7INB Crystal structure of A2A in complex with F4 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 8ZX 4-methoxybenzamide × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.266 |
| 7INC Crystal structure of A2A in complex with F7 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1COP (1R)-1-(1H-1,3-benzimidazol-2-yl)ethan-1-ol × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.245 |
| 7IND Crystal structure of A2A in complex with F12 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1COO 4-fluorobenzene-1-carbothioamide × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.258 |
| 7INE Crystal structure of A2A in complex with F35 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 VN9 3,4-dihydro-1~{H}-quinolin-2-one × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.257 |
| 7INF Crystal structure of A2A in complex with F44 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1COQ 2,4-difluorobenzene-1-carbothioamide × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.247 |
| 7ING Crystal structure of A2A in complex with F99 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 ES2 6-chloro-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.238 |
| 7INH Crystal structure of A2A in complex with F132 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1COR 6-bromo-2-methyl-4H-3,1-benzoxazin-4-one × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.282 |
| 7INI Crystal structure of A2A in complex with F135 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1COV 5~{H}-pyrido[2,1-b]quinazolin-11-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.259 |
| 7INJ Crystal structure of A2A in complex with F148 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1COW (4-chlorophenyl)[2-(methylsulfanyl)-1H-imidazol-1-yl]methanone × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.271 |
| 7INK Crystal structure of A2A in complex with F163 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1COX methyl 1H-indole-6-carboxylate × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.248 |
| 7INL Crystal structure of A2A in complex with F173 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1COY 5-methyl-1,2-oxazole-3-carbothioamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.250 |
| 7INM Crystal structure of A2A in complex with F178 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 U4D 5-(trifluoromethyl)pyridin-2-one × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.241 |
| 7INN Crystal structure of A2A in complex with F210 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1COZ N-(4-chlorophenyl)thiourea × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.234 |
| 7INO Crystal structure of A2A in complex with F223 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CO0 N-[2-amino-4-(trifluoromethyl)phenyl]acetamide × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.228 |
| 7INP Crystal structure of A2A in complex with F235 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 YPN 2-[(5-CHLORO-2-PYRIDYL)SULFANYL]ETHANOL × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.242 |
| 7INQ Crystal structure of A2A in complex with F242 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 2O8 4-[(trifluoromethyl)sulfanyl]benzamide × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.242 |
| 7INR Crystal structure of A2A in complex with F273 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 LR5 4-(trifluoromethyl)benzamide × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.234 |
| 7INT Crystal structure of A2A in complex with F293 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CO1 2-(methylsulfanyl)-1H-1,3-benzimidazole × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.253 |
| 7INU Crystal structure of A2A in complex with F336 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CO2 (2S)-2-methyl-6-(trifluoromethyl)-2H-1,4-benzothiazin-3(4H)-one × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.279 |
| 7INV Crystal structure of A2A in complex with F379 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 Y25 5-chloropyridin-3-ol × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.246 |
| 7INW Crystal structure of A2A in complex with F428 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1BL1 N-[4-(trifluoromethyl)phenyl]acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.244 |
| 7INX Crystal structure of A2A in complex with FU2-57 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CO3 (2S)-3-{methyl[5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]amino}propane-1,2-diol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.246 |
| 7INY Crystal structure of A2A in complex with FU2-59 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CS6 1-[(2S)-2-(hydroxymethyl)pyrrolidin-1-yl]-2-{[5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]oxy}ethan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.229 |
| 7INZ Crystal structure of A2A in complex with FU4-40 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CO5 4-(4-methoxyphenyl)-2H-1lambda~4~,3-thiazol-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.239 |
| 7IO0 Crystal structure of A2A in complex with FU4-54 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CO6 6-(4-methoxyphenyl)pyrimidine-2,4(3H,5H)-dione × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.240 |
| 7IO1 Crystal structure of A2A in complex with FU7-1 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CO7 6-methoxy-1H-indole-2-carboxylic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.243 |
| 7IO2 Crystal structure of A2A in complex with FU7-15 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CO8 2-(1H-1,3-benzimidazol-2-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.242 |
| 7IO3 Crystal structure of A2A in complex with FU7-29 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CO9 (6-bromo-1H-indol-2-yl)methanol × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.246 |
| 7IO4 Crystal structure of A2A in complex with FU12-19 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1IGL (4R)-4-phenyl-1,3-oxazolidin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.244 |
| 7IO5 Crystal structure of A2A in complex with FU12-45 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPA 4-chloro-N-hydroxybenzamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.237 |
| 7IO6 Crystal structure of A2A in complex with FU12-86 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPB 2-phenyl-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.236 |
| 7IO7 Crystal structure of A2A in complex with FU18-60 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPC 3-(3-hydroxypropyl)-3,5-dihydro-4H-pyrimido[5,4-b]indol-4-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.243 |
| 7IO8 Crystal structure of A2A in complex with FU18-82 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPD 2-{[(R)-methanesulfinyl]methyl}-1H-1,3-benzimidazole × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.247 |
| 7IO9 Crystal structure of A2A in complex with FU35-2 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPE (2R)-2-methyl-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazine-2-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.256 |
| 7IOA Crystal structure of A2A in complex with FU35-5 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPF N-phenyl-1H-tetrazol-5-amine × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.236 |
| 7IOB Crystal structure of A2A in complex with FU35-42 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPH N~5~-phenyl-1,2,4-thiadiazole-3,5-diamine × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.237 |
| 7IOC Crystal structure of A2A in complex with FU18-82 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPI N-phenyl-1,3,4-thiadiazol-2-amine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.256 |
| 7IOD Crystal structure of A2A in complex with FU35-78 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPJ (3-anilino-1,2,4-oxadiazol-5-yl)methanol × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.241 |
| 7IOE Crystal structure of A2A in complex with FU44-18 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPK 4-chloro-N-(2-hydroxyethoxy)benzamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.225 |
| 7IOF Crystal structure of A2A in complex with FU99-31 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPL 5-chloro-2-{[3-(3-methyl-1,2,4-oxadiazol-5-yl)propyl]sulfanyl}-1H-1,3-benzimidazole × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.244 |
| 7IOG Crystal structure of A2A in complex with FU99-89 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPM 2-[(5-chloro-1H-1,3-benzimidazol-2-yl)sulfanyl]acetamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.236 |
| 7IOH Crystal structure of A2A in complex with FU99-91 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPN 4-[(1H-1,3-benzimidazol-2-yl)sulfanyl]butanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.238 |
| 7IOI Crystal structure of A2A in complex with FU101-88 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPO N-(3-fluoro-4-methoxyphenyl)-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.235 |
| 7IOJ Crystal structure of A2A in complex with FU113-13 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPP N-[(furan-2-yl)methyl]thiophene-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.238 |
| 7IOK Crystal structure of A2A in complex with FU113-99 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPQ 5-fluoro-N-[(1H-pyrazol-3-yl)methyl]thiophene-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.242 |
| 7IOL Crystal structure of A2A in complex with FU132-3 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPR N-(4-bromophenyl)-1H-imidazole-4-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.241 |
| 7IOM Crystal structure of A2A in complex with FU18-82 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPS 2-(4-bromophenyl)-1lambda~6~,2-thiazinane-1,1-dione × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.281 |
| 7ION Crystal structure of A2A in complex with FU132-90 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPT ({2-oxo-2-[4-(trifluoromethyl)anilino]ethyl}sulfanyl)acetic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.244 |
| 7IOO Crystal structure of A2A in complex with FU132,428-27 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPU 5-bromo-2-carbamamidobenzoic acid × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.236 |
| 7IOP Crystal structure of A2A in complex with FU163-33 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPV methyl 6-bromo-1H-indole-2-carboxylate × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.230 |
| 7IOQ Crystal structure of A2A in complex with FU163-51 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPW N-[2-(1H-imidazol-2-yl)ethyl]-6-(trifluoromethyl)-1H-indole-2-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.233 |
| 7IOR Crystal structure of A2A in complex with FU163-53 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPX 3-hydroxypropyl 6-(trifluoromethyl)-1H-indole-2-carboxylate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.233 |
| 7IOS Crystal structure of A2A in complex with FU163-58 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPY 3-[2-(1H-imidazol-4-yl)ethyl]-7-methoxy-3,5-dihydro-4H-pyrimido[5,4-b]indol-4-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.240 |
| 7IOT Crystal structure of A2A in complex with FU163-67 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CPZ 6-bromo-1H-indole-2-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.245 |
| 7IOU Crystal structure of A2A in complex with FU163-75 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CP0 N-(2-amino-2-oxoethyl)-6-chloro-1H-indole-2-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
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X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.234 |
| 7IOV Crystal structure of A2A in complex with FU163-104 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CP1 7-bromo-3-methyl-3,5-dihydro-4H-pyridazino[4,5-b]indol-4-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.236 |
| 7IOW Crystal structure of A2A in complex with FU163-106 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CP2 N-{2-[(furan-2-carbonyl)amino]ethyl}-6-(propan-2-yl)-1H-indole-2-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
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分辨率 2.17 Å R-free 0.225 |
| 7IOX Crystal structure of A2A in complex with FU163-109 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CP3 [(3S)-3-(1H-1,3-benzimidazol-1-yl)pyrrolidin-1-yl](6-methoxy-1H-indol-2-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.250 |
| 7IOY Crystal structure of A2A in complex with FU210-12 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CP4 N-(4-fluorophenyl)-N'-{2-[3-(pyridin-2-yl)-1H-pyrazol-1-yl]ethyl}urea × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.244 |
| 7IOZ Crystal structure of A2A in complex with FU223-7 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CP5 5-chloro-1,3-benzothiazol-2(3H)-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.242 |
| 7IP0 Crystal structure of A2A in complex with FU223-43 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CP6 methyl (3-methylphenyl)carbamate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.259 |
| 7IP1 Crystal structure of A2A in complex with FU235-66 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CP7 (2S)-3-[(5-chloropyridin-2-yl)sulfanyl]propane-1,2-diol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.243 |
| 7IP2 Crystal structure of A2A in complex with FU242-98 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CP8 N-[4-(trifluoromethoxy)phenyl]urea × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.232 |
| 7IP3 Crystal structure of A2A in complex with FU273-23 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CP9 N-[2-(methanesulfonamido)ethyl]-4-(trifluoromethyl)benzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.238 |
| 7IP4 Crystal structure of A2A in complex with FU273-77 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CQA 3-[(4-bromophenyl)methanesulfonyl]propan-1-ol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.222 |
| 7IP5 Crystal structure of A2A in complex with FU293-69 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CQB N-(2-hydroxyethyl)-1H-indole-2-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.239 |
| 7IP6 Crystal structure of A2A in complex with FU293-80 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 6N4 2-(1H-BENZIMIDAZOL-2-YLSULFANYL)ETHANOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.223 |
| 7IP7 Crystal structure of A2A in complex with FU293-87 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CQC 1-(1H-1,3-benzimidazol-2-yl)ethan-1-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.238 |
| 7IP8 Crystal structure of A2A in complex with FU300-24 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CQD 3-hydroxy-N-[(1H-pyrrol-2-yl)methyl]-4-(trifluoromethyl)benzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.252 |
| 7IP9 Crystal structure of A2A in complex with FU336-22 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CQE N-{[(2S)-3-oxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydro-2H-1,4-benzothiazin-2-yl]acetyl}glycine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.238 |
| 7IPA Crystal structure of A2A in complex with FU336-32 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CQF 1-{[(2S)-6-chloro-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzothiazin-2-yl]acetyl}azetidine-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.250 |
| 7IPB Crystal structure of A2A in complex with FU336-34 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CQG (2S)-3-{2-[(2S)-6-chloro-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzothiazin-2-yl]acetamido}-2-hydroxy-2-methylpropanoic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.250 |
| 7IPC Crystal structure of A2A in complex with FU336-61 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CQH 2-[(2S)-6-chloro-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzothiazin-2-yl]-N-[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]acetamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.226 |
| 7IPD Crystal structure of A2A in complex with FU379-101 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CQI 7-chloroquinolin-2(1H)-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.240 |
| 7IPE Crystal structure of A2A in complex with FU428-8 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CQJ (3R)-3-(4-bromophenyl)-4-[(5S)-2-oxo-2,5-dihydro-1,3-oxazole-5-carbonyl]piperazin-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.245 |
| 7IPF Crystal structure of A2A in complex with FU428-16 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CQK N-(4-ethylphenyl)-2-[(6-methyl-2-oxo-2,5-dihydropyrimidin-4-yl)sulfanyl]acetamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.240 |
| 7IPG Crystal structure of A2A in complex with FU428-36 提交 2025-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,N154A,L202A,L235A,V239A | NA SODIUM ION × 1 TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 A1CS8 (3S)-4-[(2R)-2-hydroxybutanoyl]-3-[4-(trifluoromethyl)phenyl]piperazin-2-one × 1 A1CQL (3R)-4-[(2R)-2-hydroxybutanoyl]-3-[4-(trifluoromethyl)phenyl]piperazin-2-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1M MES PH 5.5, 0.2M K/NA TARTRATE, 27.5-40% PEG400, 0.5-1% (V/V) (+/-)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.249 |
| 7JNI Crystal structure of the angiotensin II type 2 receptoror (AT2R) in complex with EMA401 提交 2020-08-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L in cyt b562 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VFD Olodanrigan × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 OLA OLEIC ACID × 3 FMT FORMIC ACID × 1 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；Tris-HCl pH 8.0,
Potassium Formate,
PEG400, and 1,6-hexanediol
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.273 |
| 7JNI Crystal structure of the angiotensin II type 2 receptoror (AT2R) in complex with EMA401 提交 2020-08-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L in cyt b562 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | VFD Olodanrigan × 1 OLA OLEIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；Tris-HCl pH 8.0,
Potassium Formate,
PEG400, and 1,6-hexanediol
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.273 |
| 7JVR Cryo-EM structure of Bromocriptine-bound dopamine receptor 2 in complex with Gi protein 提交 2020-08-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 08Y bromoergocryptine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7KOO Alpha-7 nicotinic acetylcholine receptor bound to alpha-bungarotoxin in a resting state 提交 2020-11-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CA CALCIUM ION × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7KOQ Alpha-7 nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine in a desensitized state 提交 2020-11-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 EPJ EPIBATIDINE × 5 CA CALCIUM ION × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7KOX Alpha-7 nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine and PNU-120596 in the activated state 提交 2020-11-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 EPJ EPIBATIDINE × 5 CA CALCIUM ION × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 7LR5 Ni-bound crystal structure of the engineered cyt cb562 variant, DiCyt2, crystallized in the presence of Ni(II) (M1) and Cu(II) (M2) 提交 2021-02-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：D60H, I67H, Q71H, T97H, A100H, K104H 突变：D60H, I67H, Q71H, T97H, A100H, K104H | HEC HEME C × 2 NI NICKEL (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG1500 25%, pH 8 EPPS 100 mM, No salt,
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.230 |
| 7LRA Ni-bound crystal structure of the engineered cyt cb562 variant, DiCyt2, crystallized in the presence of Cu(II) (M1) and Ni(II) (M2) 提交 2021-02-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：D60H, I67H, Q71H, T97H, A100H, K104H 突变：D60H, I67H, Q71H, T97H, A100H, K104H | HEC HEME C × 2 NI NICKEL (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；293 K；PEG1500 25%, Ammonium acetate 200 mM, pH 8.4 EPPS 100 mM
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.214 |
| 7LRB Ni-bound crystal structure of the engineered cyt cb562 variant, DiCyt2, crystallized in the presence of Ni(II) (M1) and Cu(II) (M2) 提交 2021-02-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：D60H, I67H, Q71H, T97H, A100H, K104H 突变：D60H, I67H, Q71H, T97H, A100H, K104H | HEC HEME C × 2 CO COBALT (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG1500 25%, Ammonium acetate 160 mM, pH 8.4 EPPS 100 mM
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.211 |
| 7LRR Co-bound crystal structure of the engineered cyt cb562 variant, DiCyt2, crystallized in the presence of Cu(II) (M1) and Co(II) (M2) 提交 2021-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：D60H, I67H, Q71H, T96C, T97H, A100H, K104H 突变：D60H, I67H, Q71H, T96C, T97H, A100H, K104H | HEC HEME C × 2 CO COBALT (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG1500 25%, NaCl 200 mM, pH 8 EPPS 100 mM
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.229 |
| 7LRV Ni-bound crystal structure of the engineered cyt cb562 variant, DiCyt2, crystallized in the presence of Ni(II) 提交 2021-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：D60H, I67H, Q71H, T96C, T97H, A100H, K104H 突变：D60H, I67H, Q71H, T96C, T97H, A100H, K104H | HEC HEME C × 2 NI NICKEL (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG1500 25%, pH 8 EPPS 100 mM
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.216 |
| 7LSJ Cu-bound crystal structure of the engineered cyt cb562 variant, DiCyt2 - H63A, crystallized in the presence of Cu(II) 提交 2021-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：D60H, H63A, I67H, Q71H, T96C, T97H, A100H, K104H 突变：D60H, H63A, I67H, Q71H, T96C, T97H, A100H, K104H | HEC HEME C × 2 CA CALCIUM ION × 5 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG1500 24%, CaCl2 200 mM, pH 8 EPPS 100 mM
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.192 |
| 7LSL Cu-bound crystal structure of the engineered cyt cb562 variant, DiCyt2 - H63A, crystallized in the presence of Ni(II) 提交 2021-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：D60H, H63A, I67H, Q71H, T96C, T97H, A100H, K104H 突变：D60H, H63A, I67H, Q71H, T96C, T97H, A100H, K104H | HEC HEME C × 2 NI NICKEL (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；PEG1500 25%, NH4Ac 200 mM, pH 7 MOPS 100 mM
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.244 |
| 7LSN Ni-bound crystal structure of the engineered cyt cb562 variant, DiCyt2 - H63A, crystallized in the presence of Ni(II) 提交 2021-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：D60H, H63A, I67H, Q71H, T96C, T97H, A100H, K104H 突变：D60H, H63A, I67H, Q71H, T96C, T97H, A100H, K104H | HEC HEME C × 2 NI NICKEL (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG1500 25%, (NH4)2SO4 120 mM, pH 8 EPPS 100 mM
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.236 |
| 7LV1 Cu-bound crystal structure of the engineered cyt cb562 variant, DiCyt2, crystallized in the presence of Cu(II) 提交 2021-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：D60H, I67H, Q71H, T96C, T97H, A100H, K104H 突变：D60H, I67H, Q71H, T96C, T97H, A100H, K104H | HEC HEME C × 2 CA CALCIUM ION × 4 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；PEG1500 25%, CaCl2 200 mM, pH 6 MES 100 mM
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.237 |
| 7LV4 Cu-bound crystal structure of the engineered cyt cb562 variant, DiCyt2 - H97A, crystallized in the presence of Cu(II) 提交 2021-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：D60H, I67H, Q71H, T96C, T97A, A100H, K104H 突变：D60H, I67H, Q71H, T96C, T97A, A100H, K104H | HEC HEME C × 2 CA CALCIUM ION × 3 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；PEG1500 25%, CaCl2 200 mM, pH 7 MOPS 100 mM
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.306 |
| 7MK4 Co-bound crystal structure of the engineered cyt cb562 variant, DiCyt2 提交 2021-04-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
未记录 | HEC HEME C × 2 CO COBALT (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；298 K；PEG1500 25%, NaCl 140 mM, pH 6.6 MES 100 mM
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.213 |
| 7MYZ Structure of the full length 5-TM receptor CD47 bound to Fab B6H12 提交 2021-05-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 C
23–127（105 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；100mM sodium citrate pH 6.0, 450mM ammonium acetate, 32% PEG400
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.277 |
| 7MYZ Structure of the full length 5-TM receptor CD47 bound to Fab B6H12 提交 2021-05-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 D
23–127（105 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；100mM sodium citrate pH 6.0, 450mM ammonium acetate, 32% PEG400
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.277 |
| 7N4F Ni-bound crystal structure of the engineered cyt cb562 variant, AB2-H100A, crystallized in the presence of Ni(II) 提交 2021-06-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, D60H, I67H, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C, K104H 突变：K59W, D60H, I67H, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C, K104H | HEC HEME C × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；PEG1500 25%, MgCl2 200 mM, pH 7 MOPS 100 mM
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.254 |
| 7N4G Co-bound crystal structure of the engineered cyt cb562 variant, AB2-H100A, crystallized in the presence of Co(II) 提交 2021-06-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：K59W, D60H, I67H, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C, K104H 突变：K59W, D60H, I67H, Q71H, T96C, T97H, R98C, Y101C, K104H | HEC HEME C × 2 CO COBALT (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；PEG1500 25%, MgCl2 200 mM, pH 8 EPPS 100 mM
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.325 |
| 7PP1 Crystal structure of the P2Y12 receptor in complex with the inverse agonist selatogrel. 提交 2021-09-13 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 AAA
23–128（106 aa）
|
未记录 | 7Y5 Selatogrel × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；298 K；0.1 M ammonium formate, 0.1 M sodium cacdylate, pH 6.0-6.5, 25-35% PEG400
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.286 |
| 7PX4 Crystal structure of the adenosine A2A receptor (A2A-PSB1-bRIL) in complex with preladenant conjugate PSB-2113 提交 2021-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：S91K | CLR CHOLESTEROL × 3 8E2 Preladenant conjugate PSB-2113 × 1 OLA OLEIC ACID × 26 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；24% (v/v) PEG-400 (polyethylene glycol 400, average molecular weight 400), 10-30 mM sodium thiocyanate, 100 mM sodium citrate pH 5.2, and 2% (v/v) 2,5-hexanediol
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.240 |
| 7PYR Crystal structure of the adenosine A2A receptor (A2A-PSB1-bRIL) in complex with preladenant conjugate PSB-2115 提交 2021-10-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：S91K | CLR CHOLESTEROL × 3 8IM 2-[2-[2-[2-[2-[2-[4-[4-[2-[7-azanyl-4-(furan-2-yl)-3,5,6,8,10,11-hexazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1(9),2,4,7,11-pentaen-10-yl]ethyl]piperazin-1-yl]phenoxy]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-~{N}-[5-[2,2-bis(fluoranyl)-4,6,10,12-tetramethyl-1,3-diaza-2$l^{4}-boratricyclo[7.3.0.0^{3,7}]dodeca-4,6,9,11-tetraen-8-yl]pentyl]ethanamide × 1 OLA OLEIC ACID × 25 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；24% (v/v) PEG-400 (polyethylene glycol 400, average molecular weight 400), 10-30 mM sodium thiocyanate, 100 mM sodium citrate pH 5.2, and 2% (v/v) 2,5-hexanediol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.252 |
| 7RM5 MicroED structure of the human adenosine receptor at 2.8A 提交 2021-07-26 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 NA SODIUM ION × 1 |
ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液
pH 5；25-28% (v/v) PEG 400, 0.04-0.06M sodium thiocyanate, 2% (v/v) 2,5-hexanediol, 100mM sodium citrate, pH 5.0, Lipid Cubic Phase (LCP), temperature 293K
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.288 |
| 7RWU Crystal structure of Ni-bound RIDC1 variant in the presence of reductant 提交 2021-08-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C | NI NICKEL (II) ION × 9 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 HEC HEME C × 3 CL CHLORIDE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；45% MPD, 0.1 M Tris, 0.2 M MgCl2
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.189 |
| 7RWV Crystal structure of a metal-free RIDC1 variant 提交 2021-08-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C 突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C 突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C 突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C | HEC HEME C × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；30% PEG400, 0.1 M HEPES, 0.2 M MgCl2
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.252 |
| 7RWW Crystal structure of a Zn-bound RIDC1 variant 提交 2021-08-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C 突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C 突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C 突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C | ZN ZINC ION × 5 HEC HEME C × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；45% MPD, 0.1 M HEPES, 0.2 M MgCl2
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.208 |
| 7RWX Crystal structure of a Zn-bound RIDC1 variant in the presence of reductant 提交 2021-08-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C 突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 HEC HEME C × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；30% PEG400, 0.1 M HEPES, 0.2 M CaCl2
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.290 |
| 7RWY Crystal structure of a Fe-bound RIDC1 variant in the presence of reductant 提交 2021-08-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C 突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C 突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C | HEC HEME C × 3 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 FE FE (III) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；40% PPG, 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.259 |
| 7RWY Crystal structure of a Fe-bound RIDC1 variant in the presence of reductant 提交 2021-08-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 F
23–128（106 aa）
|
突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C 突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C 突变：R56A, L60A, Q63W, K64S, K81H, D88W, V91I, D95H, D96A, K99H, T118C, R120C, Y123C | HEC HEME C × 3 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 FE FE (III) ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；40% PPG, 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.259 |
| 7S8M CryoEM structure of Gi-coupled MRGPRX2 with peptide agonist Cortistatin-14 提交 2021-09-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.54 Å |
| 7S8O CryoEM structure of Gi-coupled MRGPRX2 with small molecule agonist (R)-Zinc-3573 提交 2021-09-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | 8IU (3R)-N,N-dimethyl-1-[(8S)-5-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl]pyrrolidin-3-amine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.58 Å |
| 7S8P CryoEM structure of Gq-coupled MRGPRX4 with small molecule agonist MS47134 提交 2021-09-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | 8IX N-[(1r,3R,5S,7R)-3,5-dimethyltricyclo[3.3.1.1~3,7~]decane-1-carbonyl]-D-phenylalanine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7SBF PZM21 bound Mu Opioid Receptor-Gi Protein Complex 提交 2021-09-24 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 8QY N-[(2S)-2-(dimethylamino)-3-(4-hydroxyphenyl)propyl]-N'-[(2S)-1-(thiophen-3-yl)propan-2-yl]urea × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7SU2 Crystal structure of a Co-bound RIDC1 variant 提交 2021-11-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 G
23–128（106 aa）
|
突变：A56, A60, W63, S64, H81, W88, I91, H95, A96, H99, C118, C120, C123 突变：A56, A60, W63, S64, H81, W88, I91, H95, A96, H99, C118, C120, C123 突变：A56, A60, W63, S64, H81, W88, I91, H95, A96, H99, C118, C120, C123 突变：A56, A60, W63, S64, H81, W88, I91, H95, A96, H99, C118, C120, C123 | HEC HEME C × 4 CO COBALT (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG400, 200 mM NaCl, 100 mM HEPES (7.5)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.232 |
| 7T2G CryoEM structure of mu-opioid receptor - Gi protein complex bound to mitragynine pseudoindoxyl (MP) 提交 2021-12-04 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | EIG Mitragynine pseudoindoxyl × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 7T32 CryoEM structure of the adenosine 2A receptor-BRIL/Anti BRIL Fab complex with ZM241385 提交 2021-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：YES | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 OTHER
|
分辨率 3.40 Å |
| 7TEP Crystal structure of a Cu-bound cytochrome cb562 variant in the presence of reductant 提交 2022-01-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, D74A, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, D74A, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, D74A, K77H, T96C, R98C, Y101C 突变：R34A, L38A, Q41W, K42S, K59H, D66W, V69I, D73H, D74A, K77H, T96C, R98C, Y101C | HEC HEME C × 4 CU COPPER (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；25% PEG1500, 0.1 M Bis-Tris, 0.2 M ammonium acetate
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.339 |
| 7TX6 Cryo-EM structure of the human reduced folate carrier in complex with methotrexate 提交 2022-02-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
25–127（103 aa）
|
突变：UNP residues 215-241 replaced with engineered epitope | MTX METHOTREXATE × 1 AJP Digitonin × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7TX7 Cryo-EM structure of the human reduced folate carrier 提交 2022-02-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
25–127（103 aa）
|
突变：UNP residues 215-241 replaced with engineered epitope | AJP Digitonin × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7VOD Crystal structure of 5-HT2AR in complex with cariprazine 提交 2021-10-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–62（40 aa）
链 A
88–128（41 aa）
|
突变：S162K,N164W,M1007W,R1098I,H1102I,R1106G,S372N 突变：S162K,N164W,M1007W,R1098I,H1102I,R1106G,S372N | MG MAGNESIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 7RU 3-[4-[2-[4-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]piperazin-1-yl]ethyl]cyclohexyl]-1,1-dimethyl-urea × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293.15 K；100 mM Tris/HCl, 100 mM Potassium formate, 30% PEG
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.239 |
| 7VOE Crystal structure of 5-HT2AR in complex with aripiprazole 提交 2021-10-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–62（40 aa）
链 A
88–128（41 aa）
|
突变：S162K,N164W,M1007W,R1098I,H1102I,R1106G,S372N 突变：S162K,N164W,M1007W,R1098I,H1102I,R1106G,S372N | CLR CHOLESTEROL × 3 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 9SC 7-[4-[4-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]piperazin-1-yl]butoxy]-3,4-dihydro-1H-quinolin-2-one × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293.15 K；100 mM Tris/HCl, 50 mM ammonium floride, 28%-30% PEG400,
300 mM NDSB-195 or 3% w/v trimethylamine N-oxide dihydrate
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.244 |
| 7W0L Cryo-EM structure of a dimeric GPCR-Gi complex with small molecule 提交 2021-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 Q
23–127（105 aa）
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 8EH (1R,2S)-N-[4-(2,6-dimethoxyphenyl)-5-(6-methylpyridin-2-yl)-1,2,4-triazol-3-yl]-1-(5-methylpyrimidin-2-yl)-1-oxidanyl-propane-2-sulfonamide × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.57 Å |
| 7W0M Cryo-EM structure of a monomeric GPCR-Gi complex with small molecule 提交 2021-11-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 8EH (1R,2S)-N-[4-(2,6-dimethoxyphenyl)-5-(6-methylpyridin-2-yl)-1,2,4-triazol-3-yl]-1-(5-methylpyrimidin-2-yl)-1-oxidanyl-propane-2-sulfonamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.71 Å |
| 7W0N Cryo-EM structure of a dimeric GPCR-Gi complex with peptide 提交 2021-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 Q
23–127（105 aa）
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.21 Å |
| 7W0O Cryo-EM structure of a monomeric GPCR-Gi complex with peptide 提交 2021-11-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 7W0P Cryo-EM structure of a GPCR-Gi complex with peptide 提交 2021-11-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 7WJ5 Cryo-EM structure of human somatostatin receptor 2 complex with its agonist somatostatin delineates the ligand binding specificity 提交 2022-01-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.72 Å |
| 7WVV Cryo-EM structure of the human formyl peptide receptor 2 in complex with fMLFII and Gi2 提交 2022-02-11 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
突变：S211L | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7WVW Cryo-EM structure of the human formyl peptide receptor 2 in complex with fMYFINILTL and Gi2 提交 2022-02-11 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
突变：S211L | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7WVX Cryo-EM structure of the human formyl peptide receptor 2 in complex with fhumanin and Gi2 提交 2022-02-11 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
突变：S211L | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7WVY Cryo-EM structure of the human formyl peptide receptor 2 in complex with Abeta42 and Gi2 提交 2022-02-11 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
突变：S211L | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7X5H Serotonin 5A (5-HT5A) receptor-Gi protein complex 提交 2022-03-04 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 8K3 3-(2-azanylethyl)-1H-indole-5-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7XAY Crystal structure of Hat1-Hat2-Asf1-H3-H4 提交 2022-03-19 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | COA COENZYME A × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；100 mM Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% PEG-3350, and 200 mM sodium nitrate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.256 |
| 7XKI Human Cx36/GJD2 (N-terminal deletion BRIL-fused mutant) gap junction channel in soybean lipids (D6 symmetry) 提交 2022-04-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
链 F
23–128（106 aa）
链 G
23–128（106 aa）
链 H
23–128（106 aa）
链 I
23–128（106 aa）
链 J
23–128（106 aa）
链 K
23–128（106 aa）
链 L
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L | MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 48 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7XKT Human Cx36/GJD2 (BRIL-fused mutant) gap junction channel in detergents at 2.2 Angstroms resolution 提交 2022-04-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
链 F
23–128（106 aa）
链 G
23–128（106 aa）
链 H
23–128（106 aa）
链 I
23–128（106 aa）
链 J
23–128（106 aa）
链 K
23–128（106 aa）
链 L
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L | MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 72 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 24 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å |
| 7XRZ Crystal structure of BRIL and SRP2070_Fab complex 提交 2022-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 X
24–128（105 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；PEG 6000, Tris-HCl
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.268 |
| 7XRZ Crystal structure of BRIL and SRP2070_Fab complex 提交 2022-05-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 Y
24–128（105 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；PEG 6000, Tris-HCl
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.268 |
| 7XT8 Serotonin 4 (5-HT4) receptor-Gs-Nb35 complex 提交 2022-05-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 5 PLM PALMITIC ACID × 2 SRO SEROTONIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7XT9 Serotonin 4 (5-HT4) receptor-Gs complex 提交 2022-05-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 4 PLM PALMITIC ACID × 2 SRO SEROTONIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7XTA Serotonin 4 (5-HT4) receptor-Gi-scFv16 complex 提交 2022-05-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | SRO SEROTONIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7XTB Serotonin 6 (5-HT6) receptor-Gs-Nb35 complex 提交 2022-05-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | SRO SEROTONIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7XTC Serotonin 7 (5-HT7) receptor-Gs-Nb35 complex 提交 2022-05-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 8K3 3-(2-azanylethyl)-1H-indole-5-carboxamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7XWO Neurokinin A bound to active human neurokinin 2 receptor in complex with G324 提交 2022-05-26 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 7XY6 Adenosine receptor bound to an agonist in complex with G protein obtained by cryo-EM 提交 2022-05-31 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
突变：M29W, H124I | I5D 2-[6-azanyl-3,5-dicyano-4-[4-(cyclopropylmethoxy)phenyl]pyridin-2-yl]sulfanylethanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.99 Å |
| 7XY7 Adenosine receptor bound to a non-selective agonist in complex with a G protein obtained by cryo-EM 提交 2022-05-31 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
突变：M29W, H124I | NEC N-ETHYL-5'-CARBOXAMIDO ADENOSINE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 7XZ5 GPR119-Gs-LPC complex 提交 2022-06-02 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | LSC (4R,7R,18E)-4,7-dihydroxy-N,N,N-trimethyl-10-oxo-3,5,9-trioxa-4-phosphaheptacos-18-en-1-aminium 4-oxide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7XZ6 GPR119-Gs-APD668 complex 提交 2022-06-02 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | I7J propan-2-yl 4-[1-(2-fluoranyl-4-methylsulfonyl-phenyl)pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-yl]oxypiperidine-1-carboxylate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7Y12 Cryo-EM structure of MrgD-Gi complex with beta-alanine 提交 2022-06-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
片段：Chimera protein of Cytochrome b-562 (UNP residues 23-127) and MrgD (UNP residues 5-321)
|
突变：M29W, H124I | BAL BETA-ALANINE × 1 PLM PALMITIC ACID × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot time 3 seconds
blot force 5
|
分辨率 3.10 Å |
| 7Y13 Cryo-EM structure of apo-state MrgD-Gi complex (local) 提交 2022-06-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 R
23–127（105 aa）
片段：Chimera protein of Cytochrome b-562 (UNP residues 23-127) and MrgD (UNP residues 5-321)
|
突变：M29W, H124I | PLM PALMITIC ACID × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot time 3 seconds
blot force 5
|
分辨率 3.10 Å |
| 7Y14 Cryo-EM structure of MrgD-Gi complex with beta-alanine (local) 提交 2022-06-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 R
23–127（105 aa）
片段：Chimera protein of Cytochrome b-562 (UNP residues 23-127) and MrgD (UNP residues 5-321)
|
突变：M29W ,H124I | BAL BETA-ALANINE × 1 PLM PALMITIC ACID × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot time 3 seconds
blot force 5
|
分辨率 3.20 Å |
| 7Y15 Cryo-EM structure of apo-state MrgD-Gi complex 提交 2022-06-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
片段：Chimera protein of Cytochrome b-562 (UNP residues 23-127) and MrgD (UNP residues 5-321)
|
突变：M29W, H124I | PLM PALMITIC ACID × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot time 3 seconds
blot force 5
|
分辨率 2.90 Å |
| 7YIT Molecular mechanism of biased signaling at the kappa opioid receptor 提交 2022-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 E
23–128（106 aa）
|
突变：M1007W,V1084E,H1102I | IVB nalfurafine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.7；293 K；40-200 mM magnesium sulfate hydrate, 100 mM sodium citrate tribasic dehydrate, 10 mM Manganese (II) chloride tetrahydrate
28-30% PEG400
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.335 |
| 7YXA XFEL crystal structure of the human sphingosine 1 phosphate receptor 5 in complex with ONO-5430608 提交 2022-02-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 B2O 4-[6-(2-naphthalen-1-ylethoxy)-2,3,4,5-tetrahydro-1H-3-benzazepin-3-ium-3-yl]butanoic acid × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；295 K；crystallization in syringes in precipitant conditions containing 100-300 mM KH2PO4 monobasic, 28-32% v/v PEG400, and 100 mM HEPES pH 7
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.329 |
| 7YXA XFEL crystal structure of the human sphingosine 1 phosphate receptor 5 in complex with ONO-5430608 提交 2022-02-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–128（106 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 B2O 4-[6-(2-naphthalen-1-ylethoxy)-2,3,4,5-tetrahydro-1H-3-benzazepin-3-ium-3-yl]butanoic acid × 1 OLA OLEIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；295 K；crystallization in syringes in precipitant conditions containing 100-300 mM KH2PO4 monobasic, 28-32% v/v PEG400, and 100 mM HEPES pH 7
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.329 |
| 7ZI0 Structure of human Smoothened in complex with cholesterol and SAG 提交 2022-04-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | V0S 3-chloro-N-[trans-4-(methylamino)cyclohexyl]-N-{[3-(pyridin-4-yl)phenyl]methyl}-1-benzothiophene-2-carboxamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 2 MPG [(Z)-octadec-9-enyl] (2R)-2,3-bis(oxidanyl)propanoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；0.1 M MES pH6.0,
0.09-0.12 M potassium formate,
24-27% (v/v) PEG500 DME,
0.5 mM zinc chloride,
0.1 M ammonium fluoride
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.275 |
| 7ZI0 Structure of human Smoothened in complex with cholesterol and SAG 提交 2022-04-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | V0S 3-chloro-N-[trans-4-(methylamino)cyclohexyl]-N-{[3-(pyridin-4-yl)phenyl]methyl}-1-benzothiophene-2-carboxamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；0.1 M MES pH6.0,
0.09-0.12 M potassium formate,
24-27% (v/v) PEG500 DME,
0.5 mM zinc chloride,
0.1 M ammonium fluoride
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.275 |
| 7ZL9 Crystal structure of human GPCR Niacin receptor (HCA2) 提交 2022-04-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | OLA OLEIC ACID × 5 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100mM pH5.4 sodium citrate, 60mM ammonium citrate, 36% PEG400, and 3% Additive 80 (40% PPG)
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.248 |
| 7ZLY Crystal structure of human GPCR Niacin receptor (HCA2) expressed from Spodoptera frugiperda 提交 2022-04-17 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | OLA OLEIC ACID × 6 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100mM pH5.4 sodium citrate, 60mM ammonium citrate, 36% PEG400, and 3% Additive 80 (40% PPG)
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.280 |
| 8A2O Room-temperature structure of the stabilised A2A-Theophylline complex determined by synchrotron serial crystallography 提交 2022-06-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,L202A,L235A,V239A6,S277A,N154A | TEP THEOPHYLLINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 3 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 4.5；293 K；0.1 M tri-sodium citrate pH 4.5, 0.05 M sodium thiocyanate, 29% (v/v) polyethylene glycol 400, 2% (v/v) 2,5-hexanediol
|
分辨率 3.45 Å R-free 0.241 |
| 8A2P Room-temperature structure of the stabilised A2A-LUAA47070 complex determined by synchrotron serial crystallography 提交 2022-06-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：A54L,T88A,R107A,K122A,L202A,L235A,V239A6,S277A,N154A | 9Y2 4-(3,3-dimethylbutanoylamino)-3,5-bis(fluoranyl)-~{N}-(1,3-thiazol-2-yl)benzamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 4 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 4.5；293 K；0.1 M tri-sodium citrate pH 4.5, 0.05 M sodium thiocyanate, 29% (v/v) polyethylene glycol 400, 2% (v/v) 2,5-hexanediol
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.247 |
| 8C9W Crystal structure of the adenosine A2A receptor (construct A2A-PSB2-bRIL) complexed with Etrumadenant at the orthosteric pocket 提交 2023-01-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | U30 3-[2-azanyl-6-[1-[[6-(2-oxidanylpropan-2-yl)pyridin-2-yl]methyl]-1,2,3-triazol-4-yl]pyrimidin-4-yl]-2-methyl-benzenecarbonitrile × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 5 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；293 K；30 % (w/v) PEG400, 7 % (w/v) Tacsimate pH 7.0,100 mM HEPES-Na pH 7.4, 1.8 % (w/v) 2,5-hexandiol, 25 microM Etrumadenant
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.267 |
| 8CIC Crystal structure of stabilized A2A adenosine receptor A2AR-StaR2-bRIL in complex with clinical candidate Etrumadenant 提交 2023-02-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：A54L,T88A,K122A,V239A,R107A,L202A,L235A | NA SODIUM ION × 1 U30 3-[2-azanyl-6-[1-[[6-(2-oxidanylpropan-2-yl)pyridin-2-yl]methyl]-1,2,3-triazol-4-yl]pyrimidin-4-yl]-2-methyl-benzenecarbonitrile × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 OLA OLEIC ACID × 15 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；294 K；0.1 M sodium citrate pH 5.0, 50 mM sodium thiocyanate, 3 % (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 21-32 % (w/v) PEG400, and 2 mM theophylline
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.214 |
| 8CU6 Crystal structure of A2AAR-StaR2-S277-bRIL in complex with a novel A2a antagonist, LJ-4517 提交 2022-05-16 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：yes | OLA OLEIC ACID × 16 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 LJX (2R,3R,4R)-2-[(8P)-6-amino-2-(hex-1-yn-1-yl)-8-(thiophen-2-yl)-9H-purin-9-yl]oxolane-3,4-diol × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.1 M HEPES, pH 5.3, 0.05 M sodium thiocyanate, 30% PEG400, 2% 2,2,2-trifluoroethanol
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.247 |
| 8CU7 Crystal structure of A2AAR-StaR2-bRIL in complex with a novel A2a antagonist, LJ-4517 提交 2022-05-16 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：S277A | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 LJX (2R,3R,4R)-2-[(8P)-6-amino-2-(hex-1-yn-1-yl)-8-(thiophen-2-yl)-9H-purin-9-yl]oxolane-3,4-diol × 1 NA SODIUM ION × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 OLA OLEIC ACID × 23 CLR CHOLESTEROL × 3 ETF TRIFLUOROETHANOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.1 M HEPES, pH 5.3, 0.05 M sodium thiocyanate, 30% PEG400, 2% 2,2,2-trifluoroethanol
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.211 |
| 8DEN Heme-Free Cytochrome Variant ApoCyt 提交 2022-06-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；22% PEG 2000, 200 mM MgCl2, 100 mM Tris pH 8.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.217 |
| 8DEN Heme-Free Cytochrome Variant ApoCyt 提交 2022-06-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；22% PEG 2000, 200 mM MgCl2, 100 mM Tris pH 8.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.217 |
| 8DEP Cryo-EM structure of the human reduced folate carrier, apo condition 提交 2022-06-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
25–127（103 aa）
|
未记录 | AJP Digitonin × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8DJK HMGCR-UBIAD1 Complex State 2 提交 2022-06-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 C
25–127（103 aa）
|
未记录 | Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 6 AJP Digitonin × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.33 Å |
| 8DJM HMGCR-UBIAD1 Complex State 1 提交 2022-07-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 C
25–127（103 aa）
|
未记录 | Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 6 AJP Digitonin × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 8DR8 LRRC8A:C conformation 2 (oblong) top mask 提交 2022-07-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 20 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 8DRA LRRC8A:C conformation 2 (oblong) LRR mask 提交 2022-07-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å |
| 8DRD Ni(II)-bound B2 dimer (H60/H100/H104) 提交 2022-07-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
未记录 | HEC HEME C × 2 NI NICKEL (II) ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；MPD 45%, NaCl 200 mM, TRIS-HCl 100 mM
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.215 |
| 8DRE LRRC8A:C conformation 2 (oblong) 提交 2022-07-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 20 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 8DRF Zn(II)-bound B2 dimer (H60/H100/H104) 提交 2022-07-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：D60H, A100H, K104H | HEC HEME C × 2 ZN ZINC ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；PEG3350 7%, (NH4)2SO4 200 mM, MES 100 mM
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.242 |
| 8DRJ Apo B2 dimer (H60/H100/H104) formed in the presence of Cu(II) 提交 2022-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：D60H, A100H, K104H 突变：D60H, A100H, K104H | HEC HEME C × 2 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；PEG3350 25%, (NH4)2SO4 200 mM, Tris 100 mM, CuCl2 4 mM
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 8DRK LRRC8A:C conformation 1 (round) top focus 提交 2022-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 21 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 8DRL Zn(II)-bound B2 dimer (H60/H100/H104) formed in Cu(II)//Zn(II) (M1 // M2) condition 提交 2022-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：D60H, A100H, K104H | HEC HEME C × 2 ZN ZINC ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；298 K；PEG3350 24%, CHES 100 mM
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.202 |
| 8DRM Zn(II)-bound B2 dimer (H60/H100/H104) formed in Zn(II)//Cu(II) (M1 // M2) condition 提交 2022-07-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | HEC HEME C × 2 ZN ZINC ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；298 K；PEG3350 25%, CHES 100 mM
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.229 |
| 8DRN LRRC8A:C conformation 1 (round) LRR focus 1 提交 2022-07-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.12 Å |
| 8DRO LRRC8A:C conformation 1 (round) LRR focus 2 提交 2022-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.06 Å |
| 8DRQ LRRC8A:C conformation 1 (round) LRR focus 3 提交 2022-07-21 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.16 Å |
| 8DS3 LRRC8A:C conformation 1 (round) 提交 2022-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 21 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
| 8DS9 LRRC8A:C in MSPE3D1 nanodisc top focus 提交 2022-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 8DSA LRRC8A:C in MSP1E3D1 nanodisc 提交 2022-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.48 Å |
| 8DU3 Crystal structure of A2AAR-StaR2-bRIL in complex with compound 21a 提交 2022-07-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：A79L, T113A, R132A, K147A, N179A, L227A, M240W, H335I, R339L, L356A, V360A, S398A | TKO (4M)-6-bromo-4-(furan-2-yl)quinazolin-2-amine × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 OLA OLEIC ACID × 17 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 4.5；293 K；Sodium Citrate pH 4.5, sodium thiocyanate, PEG 400, 2,4-hexanediol
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.232 |
| 8F74 LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 15 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8F77 LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D | PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 15 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 8F79 LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D | PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 17 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 8F7B LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D 突变：T48D | PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 17 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 8F7C Cryo-EM structure of human pannexin 2 提交 2022-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
链 F
23–127（105 aa）
链 G
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8；20mM Tris-HCL, 150mM NaCl, 40uM GDN, 1mM Fluorinated Fos-Choline-8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.92 Å |
| 8F7D LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：T48D | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8F7E LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
|
突变：T48D 突变：T48D | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.13 Å |
| 8F7J LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus 提交 2022-11-18 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
23–127（105 aa）
|
突变：T48D | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.32 Å |
| 8FYN MicroED structure of A2A from plasma milled lamellae 提交 2023-01-26 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 15 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 5 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 NA SODIUM ION × 1 |
ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液
pH 4.7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.279 |
| 8GNE Crystal structure of human adenosine A2A receptor in complex with an insurmountable inverse agonist, KW-6356. 提交 2022-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：N154Q,M1007W,H1102I,R1106L | JQR ~{N}-[4-(furan-2-yl)-5-(oxan-4-ylcarbonyl)-1,3-thiazol-2-yl]-6-methyl-pyridine-3-carboxamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 18 PE4 2-{2-[2-(2-{2-[2-(2-ETHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293.15 K；PEG 400, sodium thiocyanate, 2,5-hexanediol, sodium citrate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.235 |
| 8GY7 Cryo-EM structure of ACTH-bound melanocortin-2 receptor in complex with MRAP1 and Gs protein 提交 2022-09-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8HII The BRIL-SLC19A1/Fab/Nb ternary complex 提交 2022-11-20 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.57 Å |
| 8HIJ The 5-MTHF-bound BRIL-SLC19A1/Fab/Nb ternary complex 提交 2022-11-20 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | THH N-[4-({[(6S)-2-AMINO-4-HYDROXY-5-METHYL-5,6,7,8-TETRAHYDROPTERIDIN-6-YL]METHYL}AMINO)BENZOYL]-L-GLUTAMIC ACID × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 8HIK The TPP-bound BRIL-SLC19A1/Fab/Nb ternary complex 提交 2022-11-20 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | TPP THIAMINE DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.72 Å |
| 8HJ5 Cryo-EM structure of Gq-coupled MRGPRX1 bound with Compound-16 提交 2022-11-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 F
24–128（105 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L | U2U N-{2-[(1-aminoisoquinolin-6-yl)oxy]-4-methylphenyl}-2-methoxybenzene-1-sulfonamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8HN8 Cryo-EM structure of ligand histamine-bound Histamine H4 receptor Gi complex 提交 2022-12-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | HSM HISTAMINE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8HNK CXCR3-DNGi complex activated by CXCL11 提交 2022-12-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 8HNL CXCR3-DNGi complex activated by PS372424 提交 2022-12-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 4AI (3S)-N-[(2S)-5-carbamimidamido-1-(cyclohexylmethylamino)-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-2-(4-oxidanylidene-4-phenyl-butanoyl)-3,4-dihydro-1H-isoquinoline-3-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 8HNM CXCR3-DNGi complex activated by VUF11222 提交 2022-12-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 4IE [4-(2-bromophenyl)phenyl]methyl-[[(1R,5S)-6,6-dimethyl-2-bicyclo[3.1.1]hept-2-enyl]methyl]-dimethyl-azanium × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 8HNN Structure of CXCR3 complexed with antagonist SCH546738 提交 2022-12-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 43I 3-azanyl-6-chloranyl-5-[(3S)-4-[1-[(4-chlorophenyl)methyl]piperidin-4-yl]-3-ethyl-piperazin-1-yl]pyrazine-2-carboxamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8HOC Cryo-EM structure of ligand histamine-bound Histamine H4 receptor Gi complex 提交 2022-12-09 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | ITF 2-(1~{H}-imidazol-5-yl)ethyl carbamimidothioate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8HQE Cryo-EM structure of the apo-GPR132-Gi 提交 2022-12-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 8HQM Activation mechanism of GPR132 by NPGLY 提交 2022-12-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | 140 N-PALMITOYLGLYCINE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 8HQN Activation mechanism of GPR132 by 9(S)-HODE 提交 2022-12-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | 9HO (9S,10E,12Z)-9-hydroxyoctadeca-10,12-dienoic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8HS2 Orphan GPR20 in complex with Fab046 提交 2022-12-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 R
30–127（98 aa）
|
突变：L139W,D293N | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 8HS3 Gi bound orphan GPR20 in ligand-free state 提交 2022-12-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
22–127（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 8HSC Gi bound Orphan GPR20 complex with Fab046 in ligand-free state 提交 2022-12-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 R
30–127（98 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 8HVI Activation mechanism of GPR132 by compound NOX-6-7 提交 2022-12-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
30–123（94 aa）
|
未记录 | NFI 3-methyl-5-[(4-oxidanylidene-4-phenyl-butanoyl)amino]-1-benzofuran-2-carboxylic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 8IBU Cryo-EM structure of the erythromycin-bound motilin receptor-Gq protein complex 提交 2023-02-10 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | ERY ERYTHROMYCIN A × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å |
| 8IBV Cryo-EM structure of the motilin-bound motilin receptor-Gq protein complex 提交 2023-02-10 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.19 Å |
| 8IHB Cryo-EM structure of HCA2-Gi complex with GSK256073 提交 2023-02-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
突变：M29W,H124I | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 OKL 8-chloranyl-3-pentyl-7H-purine-2,6-dione × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.85 Å |
| 8IHF Cryo-EM structure of HCA2-Gi complex with MK6892 提交 2023-02-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
突变：M29W,H124I | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 FI7 2-[[2,2-dimethyl-3-[3-(5-oxidanylpyridin-2-yl)-1,2,4-oxadiazol-5-yl]propanoyl]amino]cyclohexene-1-carboxylic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 8IHH Cryo-EM structure of HCA2-Gi complex with LUF6283 提交 2023-02-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
突变：M29W,H124I | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 P8A 5-butyl-1~{H}-pyrazole-3-carboxylic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.06 Å |
| 8IHI Cryo-EM structure of HCA2-Gi complex with acifran 提交 2023-02-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
突变：M29W,H124I | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 P9X (5~{S})-5-methyl-4-oxidanylidene-5-phenyl-furan-2-carboxylic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 8IHJ Cryo-EM structure of HCA3-Gi complex with acifran 提交 2023-02-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
突变：M29W,H124I | P9X (5~{S})-5-methyl-4-oxidanylidene-5-phenyl-furan-2-carboxylic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
| 8IHK Cryo-EM structure of HCA3-Gi complex with acifran (local) 提交 2023-02-22 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
突变：M29W,H124I | P9X (5~{S})-5-methyl-4-oxidanylidene-5-phenyl-furan-2-carboxylic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.21 Å |
| 8IKJ Cryo-EM structure of the inactive CD97 提交 2023-02-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 R
21–127（107 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8IRS Dopamine Receptor D2R-Gi-Rotigotine complex 提交 2023-03-19 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | R5F Rotigotine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8IRT Dopamine Receptor D3R-Gi-Rotigotine complex 提交 2023-03-19 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | R5F Rotigotine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8IRV Dopamine Receptor D5R-Gs-Rotigotine complex 提交 2023-03-19 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | R5F Rotigotine × 1 CLR CHOLESTEROL × 10 PLM PALMITIC ACID × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8J46 Human Consensus Olfactory Receptor OR52c in apo state, OR52c-bRIL 提交 2023-04-19 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot time 3 seconds
|
分辨率 3.66 Å |
| 8J7E Crystal structure of BRIL in complex with 1b3 Fab 提交 2023-04-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 F
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIQUID DIFFUSION；295.15 K；0.1 M sodium acetate pH 5.0, 15% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.251 |
| 8J7E Crystal structure of BRIL in complex with 1b3 Fab 提交 2023-04-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIQUID DIFFUSION；295.15 K；0.1 M sodium acetate pH 5.0, 15% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.251 |
| 8J9O Cryo-EM structure of inactive FZD1 提交 2023-05-04 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8JH7 FZD6 in inactive state 提交 2023-05-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 D
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8JHC FZD3 in inactive state 提交 2023-05-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8JJ8 Cryo-EM structure of the beta2AR-mBRIL/1b3 Fab/Glue complex with a partial agonist 提交 2023-05-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 F
23–128（106 aa）
|
未记录 | H98 ~{N}-[5-[(1~{R})-2-[[(2~{R})-1-(4-methoxyphenyl)propan-2-yl]amino]-1-oxidanyl-ethyl]-2-oxidanyl-phenyl]methanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.20 Å |
| 8JJL cryo-EM structure of the beta2-AR-mBRIL/1b3 Fab/Glue complex with a full agonist 提交 2023-05-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | DZQ Olodaterol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.20 Å |
| 8JLJ T1AM-bound mTAAR1-Gs protein complex 提交 2023-06-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M15W,H110I,R114L | UJF 4-[4-(2-azanylethyl)-2-iodanyl-phenoxy]phenol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8JLK Ulotaront(SEP-363856)-bound mTAAR1-Gs protein complex 提交 2023-06-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M15W,H110I,R114L | UJL 1-[(7~{S})-5,7-dihydro-4~{H}-thieno[2,3-c]pyran-7-yl]-~{N}-methyl-methanamine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 8JLN T1AM-bound hTAAR1-Gs protein complex 提交 2023-06-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L | UJF 4-[4-(2-azanylethyl)-2-iodanyl-phenoxy]phenol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.24 Å |
| 8JLO Ulotaront(SEP-363856)-bound hTAAR1-Gs protein complex 提交 2023-06-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L | UJL 1-[(7~{S})-5,7-dihydro-4~{H}-thieno[2,3-c]pyran-7-yl]-~{N}-methyl-methanamine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.52 Å |
| 8JLP Ralmitaront(RO-6889450)-bound hTAAR1-Gs protein complex 提交 2023-06-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L | UJU 5-ethyl-4-methyl-~{N}-[4-[(2~{S})-morpholin-2-yl]phenyl]-1~{H}-pyrazole-3-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 8JLQ Fenoldopam-bound hTAAR1-Gs protein complex 提交 2023-06-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L | G3C (1R)-6-chloranyl-1-(4-hydroxyphenyl)-2,3,4,5-tetrahydro-1H-3-benzazepine-7,8-diol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å |
| 8JLR A77636-bound hTAAR1-Gs protein complex 提交 2023-06-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L | VRK (1~{S},3~{R})-3-(1-adamantyl)-1-(aminomethyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isochromene-5,6-diol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8JMT Structure of the adhesion GPCR ADGRL3 in the apo state 提交 2023-06-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
24–65（42 aa）
链 A
77–128（52 aa）
|
突变：T364A/M566W/H654I 突变：T364A/M566W/H654I | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.36 Å |
| 8JPN Cryo-EM structure of succinate receptor bound to cis-epoxysuccinic acid coupling to Gi 提交 2023-06-12 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | U9S (2R,3S)-oxirane-2,3-dicarboxylic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8JPP Cryo-EM structure of succinate receptor bound to succinate acid coupling MiniGsq 提交 2023-06-12 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | SIN SUCCINIC ACID × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8JSO AMPH-bound hTAAR1-Gs protein complex 提交 2023-06-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L | 1WE (2S)-1-phenylpropan-2-amine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8JT6 5-HT1A-Gi in complex with compound (R)-IHCH-7179 提交 2023-06-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 5 PLM PALMITIC ACID × 2 J40 [(2R)-1-[oxidanyl-[(2R,3R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrakis(oxidanyl)-4-phosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-3-tetradecanoyloxy-propan-2-yl] (5E,8E)-hexadeca-5,8,11,14-tetraenoate × 1 EZX 1-(4-fluorophenyl)-4-[(7R)-2,5,11-triazatetracyclo[7.6.1.0^2,7.0^12,16]hexadeca-1(15),9,12(16),13-tetraen-5-yl]butan-1-one × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8JT8 Crystal structure of 5-HT2AR in complex with (R)-IHCH-7179 提交 2023-06-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–62（40 aa）
链 A
88–128（41 aa）
|
突变：S162K,M164W,M1007W,R1098I,H1102I,R1106G,S372N 突变：S162K,M164W,M1007W,R1098I,H1102I,R1106G,S372N | MG MAGNESIUM ION × 1 EZX 1-(4-fluorophenyl)-4-[(7R)-2,5,11-triazatetracyclo[7.6.1.0^2,7.0^12,16]hexadeca-1(15),9,12(16),13-tetraen-5-yl]butan-1-one × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 CLR CHOLESTEROL × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 8；293.15 K；100 mM Tris/HCl, 160 mM Potassium fluoride, 30% PEG400
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.270 |
| 8K2W Structure of CXCR3 complexed with antagonist AMG487 提交 2023-07-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 1 LPC [1-MYRISTOYL-GLYCEROL-3-YL]PHOSPHONYLCHOLINE × 1 FI6 N-[(1R)-1-[3-(4-ethoxyphenyl)-4-oxidanylidene-pyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl]ethyl]-N-(pyridin-3-ylmethyl)-2-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]ethanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8K2X CXCR3-DNGi complex activated by CXCL10 提交 2023-07-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8K4S CryoEM structure of Gq coupled MRGPRX4 with agonist DCA-3P 提交 2023-07-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | JW0 (4~{R})-4-[(3~{R},5~{R},8~{R},9~{S},10~{S},12~{S},13~{R},14~{S},17~{R})-10,13-dimethyl-12-oxidanyl-3-phosphonooxy-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1~{H}-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanoic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8K8J Cannabinoid Receptor 1 bound to Fenofibrate coupling MiniGsq and Nb35 Complex 提交 2023-07-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | J3O Fenofibrate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.88 Å |
| 8K9K Full agonist-bound mu-type opioid receptor-G protein complex 提交 2023-08-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
突变：M7W,H102I,R106L | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 8KEX CryoEM structure of Gq coupled MRGPRX4 with agonist DCA-3P, local 提交 2023-08-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | JW0 (4~{R})-4-[(3~{R},5~{R},8~{R},9~{S},10~{S},12~{S},13~{R},14~{S},17~{R})-10,13-dimethyl-12-oxidanyl-3-phosphonooxy-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1~{H}-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanoic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8KIG Cryo-EM structure of MC3R in complex with SHU9119 提交 2023-08-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8PWN Structure of A2A adenosine receptor A2AR-StaR2-bRIL, solved at wavelength 2.75 A 提交 2023-07-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–123（101 aa）
|
未记录 | TEP THEOPHYLLINE × 1 OLA OLEIC ACID × 12 CLR CHOLESTEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.1 M TRI-SODIUM CITRATE PH 5.3-5.4, 0.05 M SODIUM THIOCYANATE, 29-32% PEG400, 2%(V/V) 2,5-HEXANEDIOL
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.261 |
| 8QJ2 Structure of active state MC4R in complex with a potent ligand mimicking nanobody 提交 2023-09-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
22–127（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8RLN Crystal structure of human adenosine A2A receptor (construct A2A-PSB2-bRIL) complexed with the partial antagonist LUF5834 at the orthosteric pocket 提交 2024-01-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 A1H1S 2-azanyl-4-(4-hydroxyphenyl)-6-(1~{H}-imidazol-2-ylmethylsulfanyl)pyridine-3,5-dicarbonitrile × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.2；293 K；23% (w/v) PEG400, 90 mM sodium thiocyanate, 100 mM sodium citrate pH 5.2, and 2% (w/v) 2,5 hexandiol
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.281 |
| 8RQQ In meso structure of the adenosine A2a G protein-coupled receptor, A2aR, in 7.10 monoacylglycerol 提交 2024-01-19 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 A1H2K 7.10 monoacylglycerol (S-form) × 8 A1H52 7.10 monoacylglycerol (R-form) × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；30-35.5 %(v/v) PEG400, 50 mM sodium thiocyanate, 100 mM sodium citrate at pH 5, 0.2 %(v/v) 2,5-hexanediol, and 0.025 mM ZM241385
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.274 |
| 8RW0 Crystal structure of the adenosine A2A receptor in complex with Istradefylline 提交 2024-02-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | JQ9 8-[(~{E})-2-(3,4-dimethoxyphenyl)ethenyl]-1,3-diethyl-7-methyl-purine-2,6-dione × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 23 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；0.1 M Sodium citrate pH 5, 0.05 M Sodium thiocyanate, 3% (v/v)
2-methyl-2,4-pentanediol, 32% (v/v) PEG 400, 1 mM Theophylline
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.217 |
| 8RW4 Crystal structure of the adenosine A2A receptor in complex with the synthetic photoswitch 'AzoSwitch2 提交 2024-02-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1H3L 8-[(~{E})-(3,4-dimethoxyphenyl)diazenyl]-1,3-diethyl-7~{H}-purine-2,6-dione × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 19 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；0.1 M Sodium citrate pH 5, 0.05 M Sodium thiocyanate, 3% (v/v)
2-methyl-2,4-pentanediol, 32% (v/v) PEG 400, 1 mM Theophylline
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.235 |
| 8RW7 Crystal structure of the adenosine A2A receptor in complex with the synthetic photoswitch 'StilSwitch1 提交 2024-02-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1H3J 8-[(~{E})-2-(3,4-dimethoxyphenyl)ethenyl]-1,3-diethyl-7~{H}-purine-2,6-dione × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；0.1 M Sodium citrate pH 5, 0.05 M Sodium thiocyanate, 3% (v/v)
2-methyl-2,4-pentanediol, 32% (v/v) PEG 400, 1 mM Theophylline
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.214 |
| 8RWC Crystal structure of the adenosine A2A receptor in complex with the synthetic photoswitch 'StilSwitch2 提交 2024-02-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1H3I 8-[(~{E})-2-[3,4-bis(oxidanyl)phenyl]ethenyl]-1,3-diethyl-7-methyl-purine-2,6-dione × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 6 OLA OLEIC ACID × 19 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；0.1 M Sodium citrate pH 5, 0.05 M Sodium thiocyanate, 3% (v/v)
2-methyl-2,4-pentanediol, 32% (v/v) PEG 400, 1 mM Theophylline
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.241 |
| 8RWD Crystal structure of the adenosine A2A receptor in complex with the synthetic photoswitch 'StilSwitch3 提交 2024-02-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1H3H 1,3-diethyl-8-[(~{E})-2-(4-methoxy-3-oxidanyl-phenyl)ethenyl]-7-methyl-purine-2,6-dione × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 26 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；0.1 M Sodium citrate pH 5, 0.05 M Sodium thiocyanate, 3% (v/v)
2-methyl-2,4-pentanediol, 32% (v/v) PEG 400, 1 mM Theophylline
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.209 |
| 8RWE Crystal structure of the adenosine A2A receptor in complex with the synthetic photoswitch 'StilSwitch4 提交 2024-02-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1H3K 1,3-diethyl-8-[(~{E})-2-(3-methoxy-4-oxidanyl-phenyl)ethenyl]-7-methyl-purine-2,6-dione × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 23 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；0.1 M Sodium citrate pH 5, 0.05 M Sodium thiocyanate, 3% (v/v)
2-methyl-2,4-pentanediol, 32% (v/v) PEG 400, 1 mM Theophylline
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.227 |
| 8RWH Dark structure of the human adenosine A2A receptor bound to synthetic photoswitch 'StilSwitch2' determined by serial synchrotron crystallography 提交 2024-02-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1H3I 8-[(~{E})-2-[3,4-bis(oxidanyl)phenyl]ethenyl]-1,3-diethyl-7-methyl-purine-2,6-dione × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 22 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.85；293 K；0.1 M sodium potassium phosphate pH 5.85, 27-30% PEG 500 MME, 0.2 M sodium thiocyanate, 0.4 mM StilSwitch2
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.241 |
| 8RWI Steady state structure of the human adenosine A2A receptor bound to synthetic photoswitch 'StilSwitch2' determined by serial synchrotron crystallography 提交 2024-02-05 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1H3I 8-[(~{E})-2-[3,4-bis(oxidanyl)phenyl]ethenyl]-1,3-diethyl-7-methyl-purine-2,6-dione × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 17 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.85；293 K；0.1 M sodium potassium phosphate pH 5.85, 27-30% PEG 500 MME, 0.2 M sodium thiocyanate, 0.4 mM StilSwitch2
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.317 |
| 8RWX Steady state structure of the human adenosine A2A receptor bound to synthetic photoswitch 'StilSwitch3' determined by serial synchrotron crystallography 提交 2024-02-05 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1H3H 1,3-diethyl-8-[(~{E})-2-(4-methoxy-3-oxidanyl-phenyl)ethenyl]-7-methyl-purine-2,6-dione × 1 OLA OLEIC ACID × 16 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.85；293 K；0.1 M sodium potassium phosphate pH 5.85, 27-30% PEG 500 MME, 0.2 M sodium thiocyanate, 0.4 mM StilSwitch3
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.347 |
| 8T1V Crystal structure of orphan G protein-coupled receptor 6 with bound inverse agonist 3h 提交 2023-06-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | XY8 3-{4-[(2,4-difluorophenyl)methyl]piperazin-1-yl}-7-methyl-N-(propan-2-yl)pyrido[3,4-b]pyrazin-2-amine × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；NaCH3COO, PEG 400, NaCl, PPG P40
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.258 |
| 8T1W Crystal structure of orphan G protein-coupled receptor 6 with bound CVN424 提交 2023-06-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | X7T 1-{2-[4-(2,4-difluorophenoxy)piperidin-1-yl]-3-{[(3R)-oxolan-3-yl]amino}-7,8-dihydropyrido[3,4-b]pyrazin-6(5H)-yl}ethan-1-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；NaCH3COO, PEG 400, NaCl, PPG P40
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.322 |
| 8TB7 Cryo-EM Structure of GPR61- 提交 2023-06-28 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | ZOB 6-{[(3,5-difluoropyridin-4-yl)methyl]amino}-N-(4-ethoxy-6-methylpyrimidin-2-yl)-2-methoxy-N-(2-methoxyethyl)pyridine-3-sulfonamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 8TF5 Crystal structure of orphan G protein-coupled receptor 6, pseudoapo form 提交 2023-07-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：C92L,A142P,M232W,H327I,R331L,G342R,S354C,Y383L,C408D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 5 P15 2,5,8,11,14,17-HEXAOXANONADECAN-19-OL × 2 OLA OLEIC ACID × 12 CLR CHOLESTEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；NaCH3COO, PEG 400, NaCl, PPG P40
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.214 |
| 8TH3 Structure of AT118-H Nanobody Antagonist in Complex with the Angiotensin II Type I Receptor 提交 2023-07-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
24–127（104 aa）
链 B
24–127（104 aa）
|
未记录 | Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM HEPES, pH 7.4, 100 mM NaCl, 0.05% GDN, 0.005% CHS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8TH4 Structure of AT118-L Nanobody Antagonist in Complex with the Angiotensin II Type I Receptor and Losartan 提交 2023-07-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
24–127（104 aa）
|
未记录 | LSN [2-butyl-5-chloranyl-3-[[4-[2-(2H-1,2,3,4-tetrazol-5-yl)phenyl]phenyl]methyl]imidazol-4-yl]methanol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM HEPES, pH 7.4, 100 mM NaCl, 0.05% GDN, 0.005% CHS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8TS1 Cryo-EM structure of human MRS2 with Mg2+ 提交 2023-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl, 40 mM MgCl2 and 0.04 mM GDN
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.92 Å |
| 8TS2 Cryo-EM structure of human MRS2 with EDTA 提交 2023-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–123（101 aa）
链 B
23–123（101 aa）
链 C
23–123（101 aa）
链 D
23–123（101 aa）
链 E
23–123（101 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl, 10 mM EDTA and 0.04 mM GDN
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 8TS3 Cryo-EM structure of human MRS2 with Ca2+ 提交 2023-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl, 10 mM Ca2+ and 0.04 mM GDN
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 8UHB Cryo-EM Structure of the Ro5256390-bound hTA1-Gs heterotrimer signaling complex 提交 2023-10-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–123（101 aa）
|
突变：M(-129)W, R(-14)G, Q(-3)E, F112W | WV8 (2R,4S)-4-[(2S)-2-phenylbutyl]-1,3-oxazolidin-2-amine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 8UT1 Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine 提交 2023-10-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 15 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 EPJ EPIBATIDINE × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 8UTB Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine and NS-1738 提交 2023-10-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | XG3 N-(5-chloro-2-hydroxyphenyl)-N'-[2-chloro-5-(trifluoromethyl)phenyl]urea × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 EPJ EPIBATIDINE × 5 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 8UZJ Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine and ivermectin 提交 2023-11-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 EPJ EPIBATIDINE × 5 IVM (2aE,4E,5'S,6S,6'R,7S,8E,11R,13R,15S,17aR,20R,20aR,20bS)-6'-[(2S)-butan-2-yl]-20,20b-dihydroxy-5',6,8,19-tetramethyl-17 -oxo-3',4',5',6,6',10,11,14,15,17,17a,20,20a,20b-tetradecahydro-2H,7H-spiro[11,15-methanofuro[4,3,2-pq][2,6]benzodioxacy clooctadecine-13,2'-pyran]-7-yl 2,6-dideoxy-4-O-(2,6-dideoxy-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranosyl)-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranoside × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 8V80 Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine and (-)-TQS 提交 2023-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 10 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 EPJ EPIBATIDINE × 5 YLR (3aR,4S,9bS)-4-(naphthalen-1-yl)-3a,4,5,9b-tetrahydro-3H-cyclopenta[c]quinoline-8-sulfonamide × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.34 Å |
| 8V82 Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine and PNU-120596 提交 2023-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 15 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 EPJ EPIBATIDINE × 5 I34 N-(5-Chloro-2,4-dimethoxyphenyl)-N'-(5-methyl-3-isoxazolyl)-urea × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.61 Å |
| 8V86 Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to GAT107 提交 2023-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 10 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 YLI (3aR,4S,9bS)-4-(4-bromophenyl)-3a,4,5,9b-tetrahydro-3H-cyclopenta[c]quinoline-8-sulfonamide × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.47 Å |
| 8V88 Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine and GAT107 提交 2023-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 10 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 EPJ EPIBATIDINE × 5 YLI (3aR,4S,9bS)-4-(4-bromophenyl)-3a,4,5,9b-tetrahydro-3H-cyclopenta[c]quinoline-8-sulfonamide × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 8V89 Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor time resolved resting state 提交 2023-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 R16 HEXADECANE × 5 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.53 Å |
| 8V8A Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor time resolved bound to epibatidine and PNU-120596 desensitized intermediate state 提交 2023-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 15 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 EPJ EPIBATIDINE × 5 I34 N-(5-Chloro-2,4-dimethoxyphenyl)-N'-(5-methyl-3-isoxazolyl)-urea × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.19 Å |
| 8V8C Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor time resolved bound to epibatidine and PNU-120596 asymmetric state 1 提交 2023-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 EPJ EPIBATIDINE × 5 I34 N-(5-Chloro-2,4-dimethoxyphenyl)-N'-(5-methyl-3-isoxazolyl)-urea × 5 CA CALCIUM ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 8V8D Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor time resolved bound to epibatidine and PNU-120596 asymmetric state 2 提交 2023-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 EPJ EPIBATIDINE × 5 I34 N-(5-Chloro-2,4-dimethoxyphenyl)-N'-(5-methyl-3-isoxazolyl)-urea × 5 CA CALCIUM ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 8VHF Cryo-EM structure of GPR119-Gs-Nb35 complex with small molecule agonist MBX-2982 提交 2024-01-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | 8VP 2-[1-(5-ethylpyrimidin-2-yl)piperidin-4-yl]-4-[[4-(1,2,3,4-tetrazol-1-yl)phenoxy]methyl]-1,3-thiazole × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å |
| 8W77 Human Consensus Olfactory Receptor OR52c in apo state, OR52c only 提交 2023-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot time 3 seconds
|
分辨率 3.61 Å |
| 8W8B Cryo-EM structure of SEP-363856 bounded serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Gi protein complex 提交 2023-09-01 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 5 PLM PALMITIC ACID × 1 UJL 1-[(7~{S})-5,7-dihydro-4~{H}-thieno[2,3-c]pyran-7-yl]-~{N}-methyl-methanamine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8W8Q Cryo-EM structure of the GPR101-Gs complex 提交 2023-09-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 C
23–128（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å |
| 8W8W Cryo-EM structure of alpha-MSH-MC3R-Gs_Nb35 complex 提交 2023-09-04 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8W8X Cryo-EM structure of beta-MSH-MC3R-Gs_Nb35 complex 提交 2023-09-04 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8W8Y Cryo-EM structure of gamma-MSH-MC3R-Gs_Nb35 complex 提交 2023-09-04 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8WJX ADP-bound purinergic receptor 1 in complex with miniGs/q 提交 2023-09-26 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8WRZ Cry-EM structure of cannabinoid receptor-beta-arrestin-1 complex 提交 2023-10-16 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
突变：M29W, H124I, T210I, E273K, T283V, R340E | 8D0 (6~{a}~{R},9~{R},10~{a}~{R})-9-(hydroxymethyl)-3-(8-isothiocyanato-2-methyl-octan-2-yl)-6,6-dimethyl-6~{a},7,8,9,10,10~{a}-hexahydrobenzo[c]chromen-1-ol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8X2K OEA bound GPR3-Gs complex structure 提交 2023-11-09 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | 5YM (Z)-N-(2-hydroxyethyl)octadec-9-enamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
| 8X3K Cryo-EM structure of human VMAT2 in complex with serotonin. 提交 2023-11-13 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：M8W,H103I | SRO SEROTONIN × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 8X5X CryoEM structure of the histamine H1 receptor in apo-form 提交 2023-11-20 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–127（105 aa）
|
突变：M217W,H313I | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.50 Å |
| 8X5Y CryoEM structure of the histamine H1 receptor-BRIL/Anti BRIL Fab complex with astemizole 提交 2023-11-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–65（43 aa）
链 B
77–127（51 aa）
|
未记录 | XB7 1-[(4-fluorophenyl)methyl]-N-{1-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]piperidin-4-yl}-1H-benzimidazol-2-amine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.00 Å |
| 8X63 CryoEM structure of the histamine H1 receptor-BRIL/Anti BRIL Fab complex with mepyramine 提交 2023-11-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–65（43 aa）
链 B
77–127（51 aa）
|
未记录 | Y5E mepyramine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.20 Å |
| 8X64 CryoEM structure of the histamine H1 receptor-BRIL/Anti BRIL Fab complex with desloratadine 提交 2023-11-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–65（43 aa）
链 B
77–127（51 aa）
|
未记录 | Y5R desloratadine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.40 Å |
| 8XML Cryo-EM structure of the Apo CCR8-Gi complex 提交 2023-12-27 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.58 Å |
| 8XQE Cryo-EM structure of human dimeric APJR-Gi complex with apelin-13. 提交 2024-01-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 Q
23–127（105 aa）
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.48 Å |
| 8XQF Cryo-EM structure of human monomeric APJR-Gi complex with apelin-13. 提交 2024-01-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |
| 8XQI Cryo-EM structure of human dimeric Apelin receptor. 提交 2024-01-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 8XQJ Cryo-EM structure of human dimeric APJR complex with antagonistic antibody 提交 2024-01-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 8XV2 Thiamine-bound human SLC19A3 提交 2024-01-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | VIB 3-(4-AMINO-2-METHYL-PYRIMIDIN-5-YLMETHYL)-5-(2-HYDROXY-ETHYL)-4-METHYL-THIAZOL-3-IUM × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8XV5 Pyridoxamine-bound human SLC19A3 提交 2024-01-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | PXM 4-(AMINOMETHYL)-5-(HYDROXYMETHYL)-2-METHYLPYRIDIN-3-OL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8XV9 Fedratinib-bound human SLC19A3 提交 2024-01-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | 2TA N-tert-butyl-3-{[5-methyl-2-({4-[2-(pyrrolidin-1-yl)ethoxy]phenyl}amino)pyrimidin-4-yl]amino}benzenesulfonamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8XVJ Cryo-EM structure of ETAR bound with Macitentan 提交 2024-01-15 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1D5I Macitentan × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 8XVK Cryo-EM structure of ETAR bound with Ambrisentan 提交 2024-01-15 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1D5J Ambrisentan × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.21 Å |
| 8XVL Cryo-EM structure of ETAR bound with Zibotentan 提交 2024-01-15 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1D5L Zibotentan × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 8Y6J The structure of Oryza sativa HKT1;1 提交 2024-02-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.46 Å |
| 8Y6L Oryza sativa HKT1;5 salt sensitive variant 提交 2024-02-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8Y6M The structure of Oryza sativa HKT2;1 提交 2024-02-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.91 Å |
| 8Y6N The structure of Oryza sativa HKT1;5 salt tolerant variant 提交 2024-02-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8Y6Y GLPG0974-bound human FFA2 提交 2024-02-03 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1LYD GLPG-0974 × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
| 8YNS Cryo-EM structure of SNAP-94847-bound MCHR1, S1 state 提交 2024-03-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–65（43 aa）
|
未记录 | A1D6T ~{N}-[3-[1-[[4-[3,4-bis(fluoranyl)phenoxy]phenyl]methyl]piperidin-4-yl]-4-methyl-phenyl]-2-methyl-propanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.33 Å |
| 8YNT Cryo-EM structure of SNAP-94847-bound MCHR1, S2 state 提交 2024-03-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–65（43 aa）
|
未记录 | A1D6T ~{N}-[3-[1-[[4-[3,4-bis(fluoranyl)phenoxy]phenyl]methyl]piperidin-4-yl]-4-methyl-phenyl]-2-methyl-propanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 8YRG CryoEM structure of fospropofol-bound MRGPRX4-Gq complex 提交 2024-03-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1LZU [2,6-di(propan-2-yl)phenoxy]methyl dihydrogen phosphate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 8YZK Orphan receptor GPRC5D in complex with scFv150-18 提交 2024-04-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
22–128（107 aa）
链 B
22–128（107 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8Z74 Cryo-EM structure of APJR complex with agonistic antibody 提交 2024-04-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 8Z7J Cryo-EM structure of APJR-Gi complex with agonistic antibody 提交 2024-04-20 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.12 Å |
| 8ZBB Cryo-EM structure of outward state Anhydromuropeptide permease (AmpG) G50W/L269W 提交 2024-04-26 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：G50W/L269W | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 8ZBI Cryo-EM structure of Somatostatin receptor 3 (SSTR3) with Gi1 complex 提交 2024-04-26 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 D
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 8ZBJ Cryo-EM structure of Somatostatin receptor 5 (SSTR5) with Gi1 complex 提交 2024-04-26 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 8ZFK Caenorhabditis elegans ACR-23 in betaine and monepantel bound state 提交 2024-05-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 A1D8E ~{N}-[(2~{S})-2-cyano-1-[5-cyano-2-(trifluoromethyl)phenoxy]propan-2-yl]-4-(trifluoromethylsulfanyl)benzamide × 5 BET TRIMETHYL GLYCINE × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.64 Å |
| 8ZFL Caenorhabditis elegans ACR-23 in apo state 提交 2024-05-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.61 Å |
| 8ZFM Caenorhabditis elegans ACR-23 in betaine bound state 提交 2024-05-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
链 C
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 BET TRIMETHYL GLYCINE × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.96 Å |
| 8ZFZ cryo-EM structure of Gs-coupled zebrafish GPR4 at pH 6.5 提交 2024-05-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
22–128（107 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8ZMF Crystal structure of an inverse agonist antipsychotic drug derivative-bound 5-HT2C 提交 2024-05-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L,C360N | A1L10 1-[(4-fluorophenyl)methyl]-1-[(8~{S})-5-methyl-5-azaspiro[2.5]octan-8-yl]-3-[[4-(2-methylpropoxy)phenyl]methyl]urea × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；18-24% PEG300, 40-60 mM ammonium phosphate dibasic
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.285 |
| 8ZMG Crystal structure of an inverse agonist antipsychotic drug pimavanserin-bound 5-HT2A 提交 2024-05-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–62（40 aa）
链 A
88–128（41 aa）
|
突变：S162K,M164W,M29W,H124I,R128L,R315G 突变：S162K,M164W,M29W,H124I,R128L,R315G | A1L11 Pimavanserin × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；32-38%PEG300, 40-60mM lithium chloride
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.328 |
| 8ZMG Crystal structure of an inverse agonist antipsychotic drug pimavanserin-bound 5-HT2A 提交 2024-05-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–62（40 aa）
链 B
88–128（41 aa）
|
突变：S162K,M164W,M29W,H124I,R128L,R315G 突变：S162K,M164W,M29W,H124I,R128L,R315G | A1L11 Pimavanserin × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；32-38%PEG300, 40-60mM lithium chloride
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.328 |
| 8ZPL Cryo-EM strucutre of CXCR4 complexed with antagonist HF51116 提交 2024-05-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 A1D8K (2S)-N-[[4-[[3-(cyclohexylamino)propylamino]methyl]phenyl]methyl]-5-(diaminomethylideneamino)-2-(pyridin-2-ylmethylamino)pentanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 8ZPM Cryo-EM strucutre of CXCR4 complexed with antagonist AMD070 提交 2024-05-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1D8L Mavorixafor × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8ZPN Cryo-EM strucutre of CXCR4 complexed with antagonist AMD3100 提交 2024-05-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 VH6 Plerixafor × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 8ZRN Structure of abt 提交 2024-06-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1D8V 5-[[(2~{S})-azetidin-2-yl]methoxy]-2-chloranyl-pyridine × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 8ZRP Structure of nico 提交 2024-06-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 B
23–127（105 aa）
链 D
23–127（105 aa）
链 E
23–127（105 aa）
|
未记录 | NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.32 Å |
| 8ZSJ Cryo-EM structure of the apo hTAAR1-Gs complex 提交 2024-06-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8ZSP Cryo-EM structure of the LSD-bound hTAAR1-Gs complex 提交 2024-06-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 7LD (8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 8ZSS Cryo-EM structure of the RO5263397-bound hTAAR1-Gs complex 提交 2024-06-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1D8X (4~{S})-4-(3-fluoranyl-2-methyl-phenyl)-1,3-oxazolidin-2-amine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
| 8ZSV Cryo-EM structure of the RO5263397-bound mTAAR1-Gs complex 提交 2024-06-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1D8X (4~{S})-4-(3-fluoranyl-2-methyl-phenyl)-1,3-oxazolidin-2-amine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.96 Å |
| 8ZVZ Cryo-EM strcuture of Prostaglandin D2 Receptor DP1 activated by BW245C 提交 2024-06-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 D
21–127（107 aa）
|
未记录 | A1AF8 7-{(4S)-3-[(3R)-3-cyclohexyl-3-hydroxypropyl]-2,5-dioxoimidazolidin-4-yl}heptanoic acid × 1 CLR CHOLESTEROL × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.35 Å |
| 8ZW0 Cryo-EM strcuture of Prostaglandin D2 Receptor DP1 activated by PGD2 提交 2024-06-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 D
21–127（107 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 PG2 PROSTAGLANDIN D2 × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.72 Å |
| 8ZWF cryoEM structure of JR14a bound C3aR-BRIL-BAG2 complex 提交 2024-06-13 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：E27Q,M29W,H124I | A1D9A (2~{S})-5-[bis(azanyl)methylideneamino]-2-[[5-[bis(4-chlorophenyl)methyl]-3-methyl-thiophen-2-yl]carbonylamino]pentanoic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8ZYT Cryo-EM structure of neurotensin receptor 1 in complex with beta-arrestin1 and SBI-553 (complex 3) 提交 2024-06-18 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 1 SRW 2-[{2-(1-fluorocyclopropyl)-4-[4-(2-methoxyphenyl)piperidin-1-yl]quinazolin-6-yl}(methyl)amino]ethan-1-ol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å |
| 8ZYU Cryo-EM structure of neurotensin receptor 1 in complex with beta-arrestin1 and SBI-553 (complex 1) 提交 2024-06-18 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SRW 2-[{2-(1-fluorocyclopropyl)-4-[4-(2-methoxyphenyl)piperidin-1-yl]quinazolin-6-yl}(methyl)amino]ethan-1-ol × 1 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å |
| 8ZYY Cryo-EM structure of neurotensin receptor 1 in complex with beta-arrestin1 and SBI-553 (complex 2) 提交 2024-06-18 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 1 SRW 2-[{2-(1-fluorocyclopropyl)-4-[4-(2-methoxyphenyl)piperidin-1-yl]quinazolin-6-yl}(methyl)amino]ethan-1-ol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 9BS9 Local refinement of DRD2 bound to LSD in complex with a mini-GoA and scFv16 obtained by cryo-electron microscopy (cryoEM) 提交 2024-05-13 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 7LD (8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.28 Å |
| 9BSB Global reconstruction of DRD2 bound to LSD in complex with a mini-GoA and scFv16 obtained by cryo-electron microscopy (cryoEM) 提交 2024-05-13 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 7LD (8alpha)-N,N-diethyl-6-methyl-9,10-didehydroergoline-8-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.32 Å |
| 9C3F Cryo-EM structure of E. coli AmpG 提交 2024-05-31 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 9CAX Structure of human SLC2A9 transporter 提交 2024-06-18 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；4 degree cold buffer pH7.5 (300mM NaCl, 50mM Tris and 0.02% GDN)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 9CBB Structure of urate bound human SLC2A9 transporter 提交 2024-06-18 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | URC URIC ACID × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；4 degree cold buffer pH7.5 (300mM NaCl, 50mM Tris and 0.02% GDN)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.15 Å |
| 9DNG Structure of rat beta-arrestin 1 by fiducial-assisted cryo-EM 提交 2024-09-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M29W, H124I, R128L | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.52 Å |
| 9DNM Structure of rat beta-arrestin 1 bound to allosteric inhibitor 提交 2024-09-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M29W, H124I, R128L | ODN (1beta,6beta,7beta,8alpha,9beta,10alpha,13alpha,14R,16beta)-1,6,7,14-tetrahydroxy-7,20-epoxykauran-15-one × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 9DVB Thermus thermophilus MreC-MreD complex with an internal MreD BRIL fusion and an anti-BRIL Fab 提交 2024-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 B
30–119（90 aa）
片段：BRIL domain, residues 30-119
链 N
30–119（90 aa）
片段：BRIL domain, residues 30-119
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9DVC Thermus thermophilus MreC-MreD complex with a C-terminal MreD BRIL fusion and an anti-BRIL Fab 提交 2024-10-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 B
30–119（90 aa）
片段：BRIL domain, residues 30-119
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.40 Å |
| 9DYD Asenapine-bound serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Goa protein complex 提交 2024-10-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–128（106 aa）
片段：residues 1-25 of the 5-HT receptor deleted
|
突变：L125W | A1BIR (3aS,12bR)-asenapine × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 J40 [(2R)-1-[oxidanyl-[(2R,3R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrakis(oxidanyl)-4-phosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-3-tetradecanoyloxy-propan-2-yl] (5E,8E)-hexadeca-5,8,11,14-tetraenoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot force 3 for 3-5 seconds was used and subsequent grids were screened for ice thickness prior to data collection.
|
分辨率 2.96 Å |
| 9DYE Buspirone-bound serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Goa protein complex 提交 2024-10-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–128（106 aa）
片段：residues 1-25 of the 5-HT receptor deleted
|
突变：L125W | YLX Buspirone × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 J40 [(2R)-1-[oxidanyl-[(2R,3R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrakis(oxidanyl)-4-phosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-3-tetradecanoyloxy-propan-2-yl] (5E,8E)-hexadeca-5,8,11,14-tetraenoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot force 3 for 3-5 seconds was used and subsequent grids were screened for ice thickness prior to data collection.
|
分辨率 2.90 Å |
| 9DYF Asenapine-bound serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Gi1 protein complex 提交 2024-10-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–128（106 aa）
片段：residues 1-25 of the 5-HT receptor deleted
|
突变：L125W | A1BIR (3aS,12bR)-asenapine × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 J40 [(2R)-1-[oxidanyl-[(2R,3R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrakis(oxidanyl)-4-phosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-3-tetradecanoyloxy-propan-2-yl] (5E,8E)-hexadeca-5,8,11,14-tetraenoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot force 3 for 3-5 seconds was used and subsequent grids were screened for ice thickness prior to data collection.
|
分辨率 2.74 Å |
| 9EAH Structure of nanobody AT209 in complex with the olmesartan-bound angiotensin II type I receptor (AT1R) 提交 2024-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
24–128（105 aa）
链 B
24–128（105 aa）
|
突变：M232W, H327I, R331L 突变：M232W, H327I, R331L | OLM Olmesartan × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9EAI Structure of nanobody AT206 in complex with the losartan-bound angiotensin II type I receptor (AT1R) 提交 2024-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
24–128（105 aa）
链 B
24–128（105 aa）
|
突变：M232W, H327I, R331L 突变：M232W, H327I, R331L | LSN [2-butyl-5-chloranyl-3-[[4-[2-(2H-1,2,3,4-tetrazol-5-yl)phenyl]phenyl]methyl]imidazol-4-yl]methanol × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9EAJ Structure of nanobody AT206 in complex with the angiotensin II type I receptor (AT1R) 提交 2024-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
24–128（105 aa）
链 B
24–128（105 aa）
|
突变：M232W, H327I, R331L 突变：M232W, H327I, R331L | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9EE5 Cryo-EM structure of the ONO2550289-bound prostaglandin D2 receptor (DP1)-bRIL-Fab complex 提交 2024-11-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | A1BIL [2-chloro-5-(2,6-dimethyl-4-{[(2S)-4-methyl-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl]methoxy}benzamido)phenyl]acetic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å |
| 9EI5 Cryo-EM structure of Apo form of prostaglandin D2 receptor (DP1)-bRIL-Fab complex 提交 2024-11-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å |
| 9EKH Cryo-EM structure ONO3030297-bound prostaglandin D2 receptor (DP1)-bRIL-Fab complex 提交 2024-12-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 A1BI8 1-[2-chloro-5-(2,6-dimethyl-4-{[(2S)-4-methyl-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl]methoxy}benzamido)phenyl]cyclopropane-1-carboxylic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å |
| 9FUP Serial microseconds crystallography at ID29 using fixed-target (small foils): A2a adenosine receptor co-crystallised with Istradefylline 提交 2024-06-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 11 OLB (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 JQ9 8-[(~{E})-2-(3,4-dimethoxyphenyl)ethenyl]-1,3-diethyl-7-methyl-purine-2,6-dione × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；0.1 M tri-sodium citrate pH 5.0, 50 mM sodium thiocyanate, 29-30% (v/v) PEG 400, 1% (v/v) 1,6-hexanediol
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.288 |
| 9GYO CryoEM structure of Gs-coupled GPBAR with small molecule agonist P395 提交 2024-10-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | FWX 2-(ethylamino)-6-[3-(4-propan-2-ylphenyl)propanoyl]-7,8-dihydro-5H-pyrido[4,3-d]pyrimidine-4-carboxamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
|
分辨率 2.50 Å |
| 9H2X Crystal structure of stabilized A2A adenosine receptor A2AR-StaR2-bRIL in complex with compound 7, a novel nanomolar A2A receptor antagonist from modern hit-finding with structure-guided de novo design 提交 2024-10-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 21 A1IR1 4-(furan-2-yl)-6-(6-imidazol-1-ylpyridin-2-yl)-1,3,5-triazin-2-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.l M tri-sodium citrate pH 5.3-5.4, 0.05 M sodium thiocyanate, 29-32% PEG400, 2% (v/v) 2,5-hexanediol and 0.5 mM theophylline.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.226 |
| 9H37 Crystal structure of stabilized A2A adenosine receptor A2AR-StaR2-bRIL in complex with compound 9, a novel nanomolar A2A receptor antagonist from modern hit-finding with structure-guided de novo design 提交 2024-10-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 OLA OLEIC ACID × 21 A1IR0 2-(furan-2-yl)-7-pyridin-4-yl-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.1 M tri-sodium citrate pH 5.3-5.4, 0.05 M sodium thiocyanate, 29-32% PEG400, 2% (v/v) 2,5-hexanediol and 0.5 mM theophylline
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.220 |
| 9HAP Cryo-EM structure of inactive human arginine-vasopressin (AVP) V2 receptor (V2R) with tolvaptan 提交 2024-11-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–123（101 aa）
|
未记录 | A1IT8 (R)-Tolvaptan × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 9IP5 Hemichannel sub-structure of Cx36/GJD2 gap junction intercellular channel (FN conformation) in brain polar lipid nanodiscs, treated with a 14-fold molar excess of carbenoxolone 提交 2024-07-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
链 F
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L | C14 TETRADECANE × 18 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20mM HEPES(pH 7.5), 150mM KCl, 2mM beta-mercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.52 Å |
| 9IPM Hemichannel sub-structure of Cx36/GJD2 gap junction intercellular channel (FN conformation) in soybean polar lipid nanodiscs, treated with a 20-fold molar excess of carbenoxolone 提交 2024-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
链 F
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L | MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 12 C14 TETRADECANE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20mM HEPES(pH 7.5), 150mM KCl, 2mM beta-mercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 9IPN Hemichannel sub-structure of Cx36/GJD2 gap junction intercellular channel (FN conformation) in soybean polar lipid nanodiscs, treated with a 10-fold molar excess of carbenoxolone and incubated shortly 提交 2024-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
链 F
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L | MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 6 C14 TETRADECANE × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20mM HEPES(pH 7.5), 150mM KCl, 2mM beta-mercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.46 Å |
| 9IPO Hemichannel sub-structure of Cx36/GJD2 gap junction intercellular channel (FN conformation) in soybean polar lipid nanodiscs, treated with a 10-fold molar excess of carbenoxolone 提交 2024-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
链 F
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L | MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 12 C14 TETRADECANE × 18 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20mM HEPES(pH 7.5), 150mM KCl, 2mM beta-mercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.41 Å |
| 9IPY Structure of JR14a-bound human C3aR 提交 2024-07-12 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
突变：M1012W/H1107I | A1D9A (2~{S})-5-[bis(azanyl)methylideneamino]-2-[[5-[bis(4-chlorophenyl)methyl]-3-methyl-thiophen-2-yl]carbonylamino]pentanoic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9ISI Structure of human C3aR in apo state 提交 2024-07-17 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–127（105 aa）
|
突变：M1012W/H1107I | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 9IYA Cryo-EM structure of GPR55-Fab-Nb-ONO-9710531 complex 提交 2024-07-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1L3E 4-(3-bromanyl-5-ethoxy-4-oxidanyl-phenyl)-~{N}-(2-methoxyphenyl)-2-methyl-5-oxidanylidene-4,6,7,8-tetrahydro-1~{H}-quinoline-3-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 9IZF Cryo-EM structure of LPA1-Gi complex with LPA 提交 2024-08-01 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 9IZG Cryo-EM structure of LPA1-Gq complex with LPA 提交 2024-08-01 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 9IZH Cryo-EM structure of LPA1-G13 complex with LPA 提交 2024-08-01 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 9J05 Apo state purinergic receptor P2Y14-BRIL/PPTN/1B3 Fab-4/9Glue 提交 2024-08-02 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9J0B UDP-Glucose bound purinergic receptor P2Y14 in complex with Gi 提交 2024-08-02 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | UPG URIDINE-5'-DIPHOSPHATE-GLUCOSE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
|
分辨率 2.88 Å |
| 9J0F NADH bound purinergic receptor P2Y14 in complex with Gi 提交 2024-08-02 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
|
分辨率 2.76 Å |
| 9J0I UDP-Glucuronic acid bound purinergic receptor P2Y14 complex with Gi 提交 2024-08-02 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | UGA URIDINE-5'-DIPHOSPHATE-GLUCURONIC ACID × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
|
分辨率 2.76 Å |
| 9J31 cryo-EM structure of zebrafish GPR4-Gs complex at pH 8.5 提交 2024-08-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
22–128（107 aa）
|
突变：M29W, H124I, R128L | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8.5；20 mM MES (pH 6.5), 100 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.0025% (w/v) LMNG, and 0.0005% (w/v) CHS.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å |
| 9J9Z Cryo-EM structure of Outward state Anhydromuropeptide permease (AmpG) complex with GlcNAc-1,6-anhMurNAc 提交 2024-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
27–127（101 aa）
|
突变：G50W/L269W | 2YP (2R)-2-[[(1R,2S,3R,4R,5R)-4-acetamido-2-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-6,8-dioxabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]oxy]propanoic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 9JFU Cryo-EM structure of inactive GPR4 with NE52-QQ57 提交 2024-09-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1L1E NE52-QQ57 × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 9JG0 Cryo-EM structure of neuropeptide FF receptor 2 in the ligand-free state with BRIL fusion, anti-BRIL Fab, and nanobody 提交 2024-09-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.91 Å |
| 9JG1 Cryo-EM structure of Adriforant-bound Histamine receptor 4 H4R at inactive state 提交 2024-09-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1EBW Adriforant × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 9JGK cryo-EM structure of 5-Hydroxytryptamine 2B Receptor in complex with balovaptan 提交 2024-09-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
22–127（106 aa）
|
未记录 | A1EB7 Balovaptan × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9JKQ Cryo-EM structure of the METH-bound hTAAR1-Gs complex 提交 2024-09-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | B40 (2S)-N-methyl-1-phenylpropan-2-amine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.66 Å |
| 9JOZ outward-open hSLC19A1 提交 2024-09-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 9JRI outward-open hSLC19A1 + 5-MTHF 提交 2024-09-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | C2F 5-METHYL-5,6,7,8-TETRAHYDROFOLIC ACID × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 9JRK outward-open hSLC19A1 + MTX 提交 2024-09-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | MTX METHOTREXATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.44 Å |
| 9JRL outward-open hSLC19A1 + PT523 提交 2024-09-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | COP N-(4-CARBOXY-4-{4-[(2,4-DIAMINO-PTERIDIN-6-YLMETHYL)-AMINO]-BENZOYLAMINO}-BUTYL)-PHTHALAMIC ACID × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 9JRM outward-open hSLC19A1 + 2'3'-CDAS 提交 2024-09-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | GJF (1~{R},3~{S},6~{R},8~{R},9~{R},10~{S},12~{S},15~{R},17~{R},18~{R})-8,17-bis(6-aminopurin-9-yl)-3,12-bis(oxidanylidene)-3,12-bis(sulfanyl)-2,4,7,11,13,16-hexaoxa-3$l^{5},12$l^{5}-diphosphatricyclo[13.2.1.0^{6,10}]octadecane-9,18-diol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.34 Å |
| 9JRN outward-open hSLC19A1 + TPP 提交 2024-09-29 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | TPP THIAMINE DIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.74 Å |
| 9JRO Structural Insights into Selective Antagonism of PF04418948 and EP2 Prostaglandin Receptor 提交 2024-09-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1ECS PF-04418948 × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9JRT Structural Insights into Selective Antagonism of TG6-129 and EP2 Prostaglandin Receptor 提交 2024-09-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1EC5 ~{N}-[[4-[(5-ethyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)sulfamoyl]phenyl]carbamothioyl]-3-(4-fluorophenyl)propanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.28 Å |
| 9KC9 Cryo-EM structure of docked mouse bestrophin-1 in a partial open state 提交 2024-11-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：BRIL-3X
链 B
23–128（106 aa）
片段：BRIL-3X
链 C
23–128（106 aa）
片段：BRIL-3X
链 D
23–128（106 aa）
片段：BRIL-3X
链 E
23–128（106 aa）
片段：BRIL-3X
|
突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L | CA CALCIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9KCA Cryo-EM structure of docked mouse bestrophin-1 in a closed state 提交 2024-11-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
片段：BRIL-3X
链 B
23–128（106 aa）
片段：BRIL-3X
链 C
23–128（106 aa）
片段：BRIL-3X
链 D
23–128（106 aa）
片段：BRIL-3X
链 E
23–128（106 aa）
片段：BRIL-3X
|
突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L | CA CALCIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 9KFI Cryo-EM structure of the human relaxin family peptide receptor 3 in complex with relaxin-3 and G protein 提交 2024-11-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：M29W, H124I, R128L | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.91 Å |
| 9KFJ Cryo-EM structure of the compound 4-bound human relaxin family peptide receptor 3 (RXFP3)-Gi complex 提交 2024-11-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 C
23–128（106 aa）
|
突变：M29W, H124I, R128L | IYF 1-[2-(4-chlorophenyl)ethyl]-3-[(7-ethyl-5-oxidanyl-1H-indol-3-yl)methylideneamino]guanidine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9KFK Cryo-EM structure of the relaxin-3-bound human relaxin family peptide receptor 4 (RXFP4)-Gi complex 提交 2024-11-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 9KKN Cryo-EM structure of human VAChT in complex with ACh 提交 2024-11-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M8W,H103I,R107L | ACH ACETYLCHOLINE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.72 Å |
| 9KKO Cryo-EM structure of human VAChT in apo state 提交 2024-11-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M8W,H103I,R107L | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 9KP6 Cryo-EM structure of mouse bestrophin-1 in a closed state 提交 2024-11-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 D
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 9KQ5 Cryo-EM structure of human VAChT at protonated state 提交 2024-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M8W,H103I,R107L | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.21 Å |
| 9KQ8 Cryo-EM structure of human VMAT2 in complex with valbenazine 提交 2024-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M8W,H103I,R107L | XW7 valbenazine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å |
| 9KQA Cryo-EM structure of human VMAT2 in complex with Tetrabenazine 提交 2024-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M8W,H103I,R107L | EBZ (3S,5R,11bS)-9,10-dimethoxy-3-(2-methylpropyl)-1,3,4,6,7,11b-hexahydro-2H-pyrido[2,1-a]isoquinolin-2-one × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.28 Å |
| 9KQE Cryo-EM structure of human VMAT2 in complex with dopamine. 提交 2024-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M8W,H103I,R107L | LDP L-DOPAMINE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9KQM Cryo-EM structure of human VAChT in complex with VSM 提交 2024-11-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M8W,H103I,R107L | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.50 Å |
| 9L3Z Cryo-EM structure of the inactive chemokine-like receptor 1 (CMKLR1) 提交 2024-12-19 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–127（105 aa）
|
突变：F259D | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9L9O Cryo-EM structure of apo GPR50 with BRIL fusion, anti-BRIL Fab, and anti-Fab Nb complex 提交 2024-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M29W,H124I,R128L | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 9LLG Cryo-EM structure of D1R in complex with de novo designed negative allosteric GEM targeting TM5/6/7 提交 2025-01-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 R
30–120（91 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 A1EKL Flupentixol × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.77 Å |
| 9LMO Cryo-EM structure of human apo inactive GPR4 提交 2025-01-19 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9LMP Cryo-EM structure of antagonist-bounded inactive human GPR4 提交 2025-01-19 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1L1E NE52-QQ57 × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å |
| 9LRS The structure of MRGPRX4 with PSB-18061 提交 2025-02-01 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1L7J 4-[7-methyl-2,6-bis(oxidanylidene)-1-prop-2-ynyl-8-[2-[3-(trifluoromethyl)phenyl]ethyl]purin-3-yl]butylphosphonic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 9LVB IAA-free AUX1 提交 2025-02-12 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.97 Å |
| 9M0D Cryo-EM structure of neurotensin receptor 1 in complex with beta-arrestin 1 提交 2025-02-24 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.41 Å |
| 9M8P GPR3 dimer with antagonist AF64394 提交 2025-03-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
|
未记录 | 5YM (Z)-N-(2-hydroxyethyl)octadec-9-enamide × 2 1DO 1-DODECANOL × 4 A1AJD (4Z)-oct-4-en-1-ol × 4 A1EM2 N-[(4-chloranyl-2-propan-2-yloxy-phenyl)methyl]-5-phenyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20mM NaCl, 100mM Hepes, 0.003% LMNG, 0.001% GDN
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.42 Å |
| 9M8V dimer-GPR3-Gs complex 提交 2025-03-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
|
未记录 | A1EM2 N-[(4-chloranyl-2-propan-2-yloxy-phenyl)methyl]-5-phenyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine × 2 1DO 1-DODECANOL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20mM NaCl, 100mM Hepes, 0.003% LMNG, 0.001% GDN
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.83 Å |
| 9MD1 Buspirone-bound serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Gz protein complex 提交 2024-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–128（106 aa）
片段：residues 1-25 of the 5-HT receptor deleted
|
突变：L125W | YLX Buspirone × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 J40 [(2R)-1-[oxidanyl-[(2R,3R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrakis(oxidanyl)-4-phosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-3-tetradecanoyloxy-propan-2-yl] (5E,8E)-hexadeca-5,8,11,14-tetraenoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot force 3 for 3-5 seconds was used and subsequent grids were screened for ice thickness prior to data collection.
|
分辨率 3.03 Å |
| 9MD1 Buspirone-bound serotonin 1A (5-HT1A) receptor-Gz protein complex 提交 2024-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
23–128（106 aa）
片段：residues 1-25 of the 5-HT receptor deleted
|
突变：L125W | YLX Buspirone × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 J40 [(2R)-1-[oxidanyl-[(2R,3R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrakis(oxidanyl)-4-phosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-3-tetradecanoyloxy-propan-2-yl] (5E,8E)-hexadeca-5,8,11,14-tetraenoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot force 3 for 3-5 seconds was used and subsequent grids were screened for ice thickness prior to data collection.
|
分辨率 3.03 Å |
| 9OXA CryoEM structure of Gi-coupled TAS2R43 with aristolochic acid I 提交 2025-06-03 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | GOQ 8-methoxy-6-nitro-naphtho[1,2-e][1,3]benzodioxole-5-carboxylic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9P1S A2AR-BRIL in complex with ZM241385 and PGD2 提交 2025-06-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | LMN Lauryl Maltose Neopentyl Glycol × 1 ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.34 Å |
| 9P1T A2AR-BRIL in complex with ZM241385 提交 2025-06-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
未记录 | LMN Lauryl Maltose Neopentyl Glycol × 1 ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 9PNG Co-bound structure of the H77C variant of TriCyt2 提交 2025-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 6 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；21% PEG 1500, 200 mM CaCl2, 100 mM MES (pH 5.5)
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.223 |
| 9PNH Ni-bound structure of the H77C variant of TriCyt2 提交 2025-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；25% PEG 1500, 200 mM CaCl2,
100 mM HEPES (pH 8.5)
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.227 |
| 9PPM Mn-bound structure of the H77C variant of TriCyt2 提交 2025-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
链 H
23–128（106 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；25% PEG 1500, 200 mM NH4OAc, 100 mM HEPES (pH 8.5)
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.291 |
| 9PPM Mn-bound structure of the H77C variant of TriCyt2 提交 2025-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
23–128（106 aa）
链 E
23–128（106 aa）
链 G
23–128（106 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；25% PEG 1500, 200 mM NH4OAc, 100 mM HEPES (pH 8.5)
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.291 |
| 9PPM Mn-bound structure of the H77C variant of TriCyt2 提交 2025-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 D
23–128（106 aa）
链 F
23–128（106 aa）
链 K
23–128（106 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；25% PEG 1500, 200 mM NH4OAc, 100 mM HEPES (pH 8.5)
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.291 |
| 9PPM Mn-bound structure of the H77C variant of TriCyt2 提交 2025-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 I
23–128（106 aa）
链 J
23–128（106 aa）
链 L
23–128（106 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；25% PEG 1500, 200 mM NH4OAc, 100 mM HEPES (pH 8.5)
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.291 |
| 9PPN Cu-bound structure of the H77C variant of TriCyt2 提交 2025-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；21% PEG 1500, 200 mM CaCl2, 100 mM MES (pH 5.5)
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.220 |
| 9PPO Zn-bound structure of the H77C variant of TriCyt2 提交 2025-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；25% PEG 1500, 200 mM CaCl2,
100 mM HEPES (pH 8.5)
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.223 |
| 9PPR Zn- and Bi-bound structure of the H77C variant of TriCyt2 提交 2025-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 5 BS3 Bismuth(III) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；18% PEG 1500, 200 mM CaCl2,
100 mM HEPES (pH 8.5)
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.225 |
| 9PPS Co- and Bi-bound structure of the H77C variant of TriCyt2 提交 2025-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
未记录 | BS3 Bismuth(III) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 CO COBALT (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；25% PEG 1500, 200 mM CaCl2,
100 mM HEPES (pH 6.5)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.257 |
| 9PPT Ni- and Bi-bound structure of the H77C variant of TriCyt2 提交 2025-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
未记录 | BS3 Bismuth(III) ION × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG 1500, 200 mM CaCl2, 100 mM MES (pH 5.5)
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.267 |
| 9PQ4 Bi-bound structure of the H77C variant of TriCyt2 提交 2025-07-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
链 B
23–128（106 aa）
链 C
23–128（106 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 BS3 Bismuth(III) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG 1500, 200 mM CaCl2, 100 mM MES (pH 5.5)
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.218 |
| 9PXU Inactive-state naloxone-mu opioid receptor nanobody6 complex 提交 2025-08-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–123（101 aa）
|
未记录 | A1APV Naloxone × 1 NA SODIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9PXV Nucleotide-free naloxone-mu opioid receptor Gi1 complex 提交 2025-08-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–123（101 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 A1APV Naloxone × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.02 Å |
| 9PXW Latent-state naloxone-mu opioid receptor-Gi GDPbS complex (rebound) 提交 2025-08-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–123（101 aa）
|
未记录 | VSN 5'-O-[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]guanosine × 1 A1APV Naloxone × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9PXX Unlatched-state naloxone-mu opioid receptor-Gi GDPbS complex (rebound) 提交 2025-08-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–123（101 aa）
|
未记录 | VSN 5'-O-[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]guanosine × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 A1APV Naloxone × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9PXY Primed-state naloxone-mu opioid receptor-Gi GDPbS complex (rebound) 提交 2025-08-06 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 A1APV Naloxone × 1 VSN 5'-O-[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]guanosine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9PY2 Engaged-state loperamide-mu opioid receptor-Gi GDPbS complex (rebound) 提交 2025-08-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–123（101 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 A1CMV 4-[4-(4-chlorophenyl)-4-hydroxypiperidin-1-yl]-N,N-dimethyl-2,2-diphenylbutanamide × 1 VSN 5'-O-[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]guanosine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 9PY3 Unlatched-state loperamide-mu opioid receptor-Gi GDPbS complex (rebound) 提交 2025-08-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–123（101 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 A1CMV 4-[4-(4-chlorophenyl)-4-hydroxypiperidin-1-yl]-N,N-dimethyl-2,2-diphenylbutanamide × 1 VSN 5'-O-[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]guanosine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9PY4 Primed-state loperamide-mu opioid receptor-Gi GDPbS complex (rebound) 提交 2025-08-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | VSN 5'-O-[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]guanosine × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 A1CMV 4-[4-(4-chlorophenyl)-4-hydroxypiperidin-1-yl]-N,N-dimethyl-2,2-diphenylbutanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.78 Å |
| 9R42 Quinpirole-bound Dopamine D3 Receptor - Gi Protein Complex 提交 2025-05-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1JDS (4aR,8aR)-5-propyl-1,4,4a,6,7,8,8a,9-octahydropyrazolo[3,4-g]quinoline × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.24 Å |
| 9TMP Crystal Structure of Native Cytochrome b562 in complex with the synthetic anti-BRIL antibody BAG2. 提交 2025-12-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–128（128 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M MOPS/HEPES-Na pH 7.5, 0.03M bromide, 0.03M fluoride, 0.03M imidazole, 12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.237 |
| 9U80 Cryo-EM structure of conivaptan-bound human vasopressin V2 receptor complex with Fab 提交 2025-03-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1ECE Conivaptan × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 9U81 Cryo-EM structure of tolvaptan-bound human vasopressin V2 receptor complex with Fab 提交 2025-03-25 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1ECF Tolvaptan × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 9UPU Cryo-EM strucutre of CXCR4 complexed with agonist SDV1a 提交 2025-04-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9UPV Cryo-EM structure of CXCR4 complexed with agonist SDVX1 提交 2025-04-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 9UVT Cryo-EM structure of bradykinin B2 receptor (B2R)-BRIL/anti BRIL SRP2070 Fab antibody complex with icatibant 提交 2025-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M258W/H353I/R357L | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
|
分辨率 3.29 Å |
| 9UVU Cryo-EM structure of bradykinin B2 receptor (B2R)-BRIL/anti BRIL SRP2070 Fab antibody complex with icatibant, focused on receptor 提交 2025-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M258W/H353I/R357L | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
|
分辨率 3.69 Å |
| 9UVV Cryo-EM structure of Vasopressin receptor 2 (V2R)-BRIL/anti BRIL SRP2070 Fab antibody complex with tolvaptan 提交 2025-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M243W/H338I/R342L | A1IT8 (R)-Tolvaptan × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
|
分辨率 3.02 Å |
| 9UVW Cryo-EM structure of Vasopressin receptor 2 (V2R)-BRIL/anti BRIL SRP2070 Fab antibody complex with tolvaptan, focused on receptor 提交 2025-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M243W/H338I/R342L | A1IT8 (R)-Tolvaptan × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
|
分辨率 2.89 Å |
| 9UVX Cryo-EM structure of Vasopressin receptor 2 (V2R)-BRIL/anti BRIL SRP2070 Fab antibody complex with OPC51803, focused on receptor 提交 2025-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–128（106 aa）
|
突变：M243W/H338I/R342L | A1L9O 2-[(5~{R})-1-(2-chloranyl-4-pyrrolidin-1-yl-phenyl)carbonyl-2,3,4,5-tetrahydro-1-benzazepin-5-yl]-~{N}-propan-2-yl-ethanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
|
分辨率 3.31 Å |
| 9UWD Cryo-EM structure of inactive-DP1 提交 2025-05-12 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.41 Å |
| 9UY3 Anamorelin bound growth hormone secretagogue receptor in complex with Gq 提交 2025-05-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 A1ESD 2-azanyl-N-[(2R)-1-[(3S)-3-[dimethylamino(methyl)carbamoyl]-3-(phenylmethyl)piperidin-1-yl]-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-2-methyl-propanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.52 Å |
| 9V2N Macimorelin bound growth hormone secretagogue receptor in complex with Gq 提交 2025-05-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | A1EQV Macimorelin × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.63 Å |
| 9V81 cryoEM structure of HEP-50768-bound MRGPRX4-Gq complex 提交 2025-05-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1L9Y 5-[2-fluoranyl-3-[(2S)-5-(trifluoromethyl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-2-yl]phenyl]-1H-1,2,3,4-tetrazole × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.63 Å |
| 9V82 Local refine map of HEP-50768-bound MRGPRX4 提交 2025-05-29 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1L9Y 5-[2-fluoranyl-3-[(2S)-5-(trifluoromethyl)-2,3-dihydro-1-benzofuran-2-yl]phenyl]-1H-1,2,3,4-tetrazole × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.56 Å |
| 9VJ5 Cryo-EM structure of 5-HT1AR-GoA in complex with gepirone 提交 2025-06-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
30–127（98 aa）
|
未记录 | A1ESA Gepirone × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 T7M (2R)-1-(heptadecanoyloxy)-3-{[(R)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrahydroxy-4-(phosphonooxy)cyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propan-2-yl (5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.69 Å |
| 9VJ6 Cryo-EM structure of 5-HT1AR-Gi3 in complex with F-15599 提交 2025-06-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
30–127（98 aa）
|
未记录 | A1ESC (3-chloranyl-4-fluoranyl-phenyl)-[4-fluoranyl-4-[[(5-methylpyrimidin-2-yl)methylamino]methyl]piperidin-1-yl]methanone × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 T7M (2R)-1-(heptadecanoyloxy)-3-{[(R)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrahydroxy-4-(phosphonooxy)cyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propan-2-yl (5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.62 Å |
| 9VJE Cryo-EM structure of 5-HT1AR-GoA in complex with buspirone 提交 2025-06-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
30–127（98 aa）
|
未记录 | YLX Buspirone × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 T7M (2R)-1-(heptadecanoyloxy)-3-{[(R)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrahydroxy-4-(phosphonooxy)cyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propan-2-yl (5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.47 Å |
| 9VJF Cryo-EM structure of 5-HT1AR-Gi3 in complex with buspirone 提交 2025-06-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
30–127（98 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 T7M (2R)-1-(heptadecanoyloxy)-3-{[(R)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrahydroxy-4-(phosphonooxy)cyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propan-2-yl (5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 YLX Buspirone × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 9VJG Cryo-EM structure of 5-HT1AR-Gz in complex with (R)-8-OH-DPAT 提交 2025-06-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
30–127（98 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 T7M (2R)-1-(heptadecanoyloxy)-3-{[(R)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrahydroxy-4-(phosphonooxy)cyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propan-2-yl (5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 A1ESE (7~{R})-7-(dipropylamino)-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-1-ol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.67 Å |
| 9VMY Cryo-EM structure of 5-HT1AR-GoA in complex with TMU4142 提交 2025-06-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
30–127（98 aa）
|
未记录 | A1ES2 8-[3-[[(2~{S})-3-(1~{H}-indol-4-yloxy)-2-oxidanyl-propyl]amino]propyl]-8-azaspiro[4.5]decane-7,9-dione × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 T7M (2R)-1-(heptadecanoyloxy)-3-{[(R)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrahydroxy-4-(phosphonooxy)cyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propan-2-yl (5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |
| 9VNF Cryo-EM structure of 5-HT1AR-GoA in complex with (S)-pindolol 提交 2025-06-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
30–127（98 aa）
|
未记录 | A1ES4 (2~{S})-1-(1~{H}-indol-4-yloxy)-3-(propan-2-ylamino)propan-2-ol × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 T7M (2R)-1-(heptadecanoyloxy)-3-{[(R)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5S,6R)-2,3,5,6-tetrahydroxy-4-(phosphonooxy)cyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propan-2-yl (5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.74 Å |
| 9VNY Cryo-EM structure of Gi coupled Sphingosine 1-phosphate receptor bound with CYM5442 提交 2025-07-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 F
23–128（106 aa）
|
未记录 | A1L3G 2-[[(1~{R})-4-[5-(3,4-diethoxyphenyl)-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-2,3-dihydro-1~{H}-inden-1-yl]amino]ethanol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å |
| 9VNZ Cryo-EM structure of Gi coupled Sphingosine 1-phosphate receptor bound with HY-X-1011 提交 2025-07-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 F
23–128（106 aa）
|
未记录 | A1ESY [(2~{S})-2-azanyl-2-[[4-[5-[4-cyclohexyl-3-(trifluoromethyl)phenyl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-2-fluoranyl-phenyl]methyl]-3-oxidanyl-propyl] dihydrogen phosphate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 9VO0 Cryo-EM structure of Gi coupled Sphingosine 1-phosphate receptor bound with Ponesimod 提交 2025-07-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 F
23–128（106 aa）
|
未记录 | A1ESZ (2~{Z},5~{Z})-5-[[4-[(2~{R})-2,3-bis(oxidanyl)propoxy]-3-chloranyl-phenyl]methylidene]-3-(2-methylphenyl)-2-propylimino-1,3-thiazolidin-4-one × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 9VO1 Cryo-EM structure of Gi coupled Sphingosine 1-phosphate receptor bound with SAR247799 提交 2025-07-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 F
23–128（106 aa）
|
未记录 | A1LYQ SAR247799 × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 9W0P CryoEM structure of T2R14 in complex with chlorhexidine and heterotrimeric G protein complex 提交 2025-07-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | XC9 1-[6-[azanylidene-[[azanylidene-[[(4-chlorophenyl)amino]methyl]-$l^{4}-azanyl]methyl]-$l^{4}-azanyl]hexyl]-3-[~{N}-(4-chlorophenyl)carbamimidoyl]guanidine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 1s
|
分辨率 3.60 Å |
| 9W0Q Cryo-EM structure of T2R14 in complex with tangeretin and heterotrimeric G protein 提交 2025-07-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–128（106 aa）
|
未记录 | A1EUI 5,6,7,8-tetramethoxy-2-(4-methoxyphenyl)chromen-4-one × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 1s
|
分辨率 3.20 Å |
| 9W1P G6P-bound human SLC37A4 lateral dimer 提交 2025-07-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | G6P 6-O-phosphono-alpha-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9W1Q Human SLC37A4 lateral dimer 提交 2025-07-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9W1R S-4048-bound human SLC37A4 monomer 提交 2025-07-26 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1EUP (1~{S},3~{R},4~{R},5~{R})-1-[[(1~{R},2~{S})-2-(4-chlorophenyl)cyclopropyl]methoxy]-3-[(~{Z})-3-imidazo[4,5-b]pyridin-1-yl-3-phenyl-prop-2-enoyl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)cyclohexane-1-carboxylic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9W32 antagonist 1-bound inactive SSTR5 structure 提交 2025-07-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1EVP 1-[2-[[3,5-diethoxy-4-(4-fluorophenyl)phenyl]methyl]-5-oxa-2,6-diazaspiro[3.4]oct-6-en-7-yl]piperidine-4-carboxylic acid × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.59 Å |
| 9W33 S5A1-bound inactive SSTR5 structure 提交 2025-07-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1EVQ 4-[8-[(2-cyclopropyl-5-ethoxy-4-methyl-phenyl)methyl]-2-oxidanylidene-1,3,8-triazaspiro[4.5]decan-3-yl]benzoic acid × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.69 Å |
| 9W6W 5-CT-bound serotonin 5A (5-HT5A) receptor-Gi protein complex 提交 2025-08-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 R
22–127（106 aa）
|
未记录 | 8K3 3-(2-azanylethyl)-1H-indole-5-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |
| 9WYL CryoEM structure of quinol dependent Nitric Oxide Reductase with BRIL 提交 2025-09-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
23–127（105 aa）
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 FE FE (III) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9XZN Teichoic acid flippase TacF from Streptococcus pneumoniae 提交 2025-08-27 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
23–127（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.63 Å |
| 9YFU Structure of GPR61 bound to inverse agonist compound 15 提交 2025-09-26 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 R
23–127（105 aa）
|
未记录 | A1CWB N-(5-chloro-4,6-dimethylpyrimidin-2-yl)-6-{[(3,5-difluoropyridin-4-yl)methyl]amino}-2-methylpyridine-3-sulfonamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 9ZR7 Cryo-EM structure of NRAS(Q61K)-BRIL fusion in complex with Fab(BAG2) and Monobody(Mb24) 提交 2025-12-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
29–125（97 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.28 Å |
共 714 个其他 PDB 条目、822 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
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| UniProt名称 | C562_ECOLX |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 227–331； UniProt 23–127 |
