8f7d

LRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 104.6 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A,Soluble cytochrome b562

Mus musculus

UniProt P0ABE7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 23–127 突变:T48D Volume-regulated anion channel subunit LRRC8C × 1 (Q8R502) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 714 个其他 PDB 条目、822 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C562_ECOLX
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 77–181; UniProt 23–127

Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A,Soluble cytochrome b562

Mus musculus

UniProt Q80WG5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–76 链 A; UniProt 90–810 突变:T48D Volume-regulated anion channel subunit LRRC8C × 1 (Q8R502) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 35 个其他 PDB 条目、35 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LRC8A_MOUSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 A; PDB构建体 182–902; UniProt 90–810

Volume-regulated anion channel subunit LRRC8C

Mus musculus

UniProt Q8R502

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 F; UniProt 1–803 未记录 Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A,Soluble cytochrome b562 × 1 (Q80WG5,P0ABE7) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 17 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LRC8C_MOUSE
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–803; UniProt 1–803

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8f7d

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8f7d
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8f7d
沉积日期 deposition_date2022-11-18
结构标题 titleLRRC8A(T48D):C conformation 2 top focus
关键词 keywordsion channel, volume-regulation, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier32.91
回转半径 Rg (电子) rg_electron32.48
零角强度 I(0) i0123469000.00
分子量 molecular_weight93446.0 kDa
排除体积 excluded_volume119380 ų
包络体积 envelope_volume152220 ų
水化壳体积 shell_volume39531 ų
包络直径 envelope_diameter104.6
壳层 Rg shell_rg39.00
包络 Rg envelope_rg31.86
形状 Rg shape_rg32.48
总 Rg total_rg33.03
总原子数 total_atoms6578
残基数 n_residues811
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax104.6
Rg (实空间) rg_real32.87
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.83
I(0) (实空间) i0_real1.2350e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.0330e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal32.89
I(0) (倒空间) i0_reciprocal123500000.0000
解质量估计 total_estimate0.9004
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary41.4
偏度 Skewness skewness0.270
峰度 Kurtosis kurtosis-0.508
角度范围 angular_range— – 0.2400 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha44690000.0000
实空间数据点数 n_real_points49
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.937; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.896

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)