当前蛋白身份：P42212
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B9C Green Fluorescent Protein Mutant F99S, M153T and V163A 提交 1999-02-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
链 C
1–238（238 aa）
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.3；22% PEG 4000, 50 MM HEPES PH 8.5, 50 MM MGCL2, 10 MM 2-MERCAPTOETHANOL, 23% MG/ ML PROTEINA, pH 8.3
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.280 |
| 1BFP BLUE VARIANT OF GREEN FLUORESCENT PROTEIN 提交 1997-04-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65, H66, AND G67 ARE REPLACED WITH IIC 66, Y145F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；277 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED AT 4 DEGC FROM 100MM SODIUM ACETATE PH 4.5 AND 10-12% PEG3400., temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å |
| 1C4F GREEN FLUORESCENT PROTEIN S65T AT PH 4.6 提交 1999-08-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：65 - 67 REPLACED BY CRO, S65T SUBSTITUTION, Q80R SUBSTITUTION 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；10-13% PEG 3400, 100MM SODIUM ACETATE AND 100 MM AMMONIUM ACETATE, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.25 Å |
| 1CV7 Crystal structure of enhanced cyan-emission variant of GFP 提交 1999-08-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–228（228 aa）
|
突变：K26R,F64L,S65T,Y66W,N146I,M153T,V163A,N164H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；12% PEG-1550, 50mM calcium acetate and 100 mM acetaete buffer, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.50 Å |
| 1EMA GREEN FLUORESCENT PROTEIN FROM AEQUOREA VICTORIA 提交 1996-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–239（237 aa）
|
突变：65 - 67 REPLACED BY CRO, Q80R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.2；22-26% PEG 4000, 50 MM HEPES PH 8.0-8.4, 50 MM MGCL2, 10 MM 2-MERCAPTOETHANOL, 5-7 MG PROTEIN, pH 8.2
|
分辨率 1.90 Å |
| 1EMB GREEN FLUORESCENT PROTEIN (GFP) FROM AEQUOREA VICTORIA, GLN 80 REPLACED WITH ARG 提交 1997-01-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Q80R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 3.8；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 50 MM KH2PO4 AND 20 % (W/V) PEG 8000, PH 3.8.
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.250 |
| 1EMC GREEN FLUORESCENT PROTEIN FROM AEQUOREA VICTORIA, MUTANT 提交 1997-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–237（236 aa）
链 B
2–237（236 aa）
链 C
2–237（236 aa）
链 D
2–237（236 aa）
|
突变：INS(A1[B]), F64L, I167T, K238N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：INS(A1[B]), F64L, I167T, K238N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：INS(A1[B]), F64L, I167T, K238N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：INS(A1[B]), F64L, I167T, K238N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED BY HANGING DROP METHOD. PROTEIN SOLUTION: 14 MG/ML IN 20 MM KPO4, PH 7.0 WELL SOLUTION: 60% MPD, 50MM TRISCL, PH 8.0 PROTEIN:WELL 1:1, vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.288 |
| 1EME GREEN FLUORESCENT PROTEIN FROM AEQUOREA VICTORIA, MUTANT 提交 1997-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–237（236 aa）
|
突变：INS(A1[B]), F64L, I167T, K238N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED BY HANGING DROP METHOD. PROTEIN SOLUTION: 13 MG/ML IN 20 MM TRIS/HCL WELL SOLUTION: 1.8 M AS, 100 MM TRIS/HCL, PH 8.5 PROTEIN:WELL 1:1, vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.285 |
| 1EMF GREEN FLUORESCENT PROTEIN FROM AEQUOREA VICTORIA, MUTANT 提交 1997-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：INS(A1[B]), F64L, Y66H, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED BY HANGING DROP METHOD. PROTEIN SOLUTION: 21 MG/ML IN 20 MM TRIS/HCL WELL SOLUTION: 2.1 M AS, 100 MM TRIS/HCL, PH 8.5 PROTEIN:WELL 1:1, vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.262 |
| 1EMG GREEN FLUORESCENT PROTEIN (65-67 REPLACED BY CRO, S65T SUBSTITUTION, Q80R) 提交 1998-11-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–229（228 aa）
|
突变：65 - 67 REPLACED BY CRO, S65T SUBSTITUTION, Q80R SUBSTITUTION 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；CRYSTALLIZATION CONDITIONS:
22-26% PEG 4000, 50 MM HEPES PH 8.0, 50 MM MGCL2,
12 MG PROTEIN
|
分辨率 2.00 Å |
| 1EMK GREEN FLUORESCENT PROTEIN FROM AEQUOREA VICTORIA, MUTANT 提交 1997-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–237（236 aa）
|
突变：INS(A1[B]), F64L, S65C, I167T, K238N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED BY HANGING DROP METHOD. PROTEIN SOLUTION: 17 MG/ML IN 20 MM TRISCL WELL SOLUTION: 1.95 M AS, 100MM TRISCL, PH 8.5 PROTEIN:WELL 1:1, vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.282 |
| 1EML GREEN FLUORESCENT PROTEIN FROM AEQUOREA VICTORIA, MUTANT 提交 1997-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–237（236 aa）
|
突变：INS(A1[B]), F64L, K238N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED BY HANGING DROP METHOD. PROTEIN SOLUTION: 17 MG/ML IN 20 MM TRISCL WELL SOLUTION: 2.0 M AS, 100 MM TRISCL, PH 8.5 (HAMPTON SCREEN I, SOLUTION 4) PROTEIN:WELL 1:1, vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.285 |
| 1EMM GREEN FLUORESCENT PROTEIN FROM AEQUOREA VICTORIA, MUTANT 提交 1997-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：INS(A1[B]), F64L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED BY HANGING DROP METHOD. PROTEIN SOLUTION: 13 MG/ML IN 20 MM K-PO4, PH 7.0 WELL SOLUTION: 1.95 M AS, 100 MM TRIS/HCL, PH 8.5 PROTEIN:WELL 1:1, vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.275 |
| 1F09 CRYSTAL STRUCTURE OF THE GREEN FLUORESCENT PROTEIN (GFP) VARIANT YFP-H148Q WITH TWO BOUND IODIDES 提交 2000-05-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65G, V68L, S72A, Q80R, T203Y, H148Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IOD IODIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 1550, sodium acetate, magnesium chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 2.14 Å |
| 1F0B CRYSTAL STRUCTURE OF THE GREEN FLUORESCENT PROTEIN (GFP) VARIANT YFP-H148Q 提交 2000-05-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65G, V68L, S72A, Q80R, T203Y, H148Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 1550, sodium acetate, magnesium chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 2.10 Å |
| 1GFL STRUCTURE OF GREEN FLUORESCENT PROTEIN 提交 1996-08-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–239（238 aa）
|
突变：Q80R | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；FREE TEXT GOES HERE., pH 7.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.262 |
| 1GFL STRUCTURE OF GREEN FLUORESCENT PROTEIN 提交 1996-08-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–239（238 aa）
|
突变：Q80R | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；FREE TEXT GOES HERE., pH 7.0
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.262 |
| 1H6R The oxidized state of a redox sensitive variant of green fluorescent protein 提交 2001-06-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；100 MM HEPES, PH 8.0, 100 MM MGCL2, AND 14% PEG4000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.212 |
| 1H6R The oxidized state of a redox sensitive variant of green fluorescent protein 提交 2001-06-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；100 MM HEPES, PH 8.0, 100 MM MGCL2, AND 14% PEG4000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.212 |
| 1H6R The oxidized state of a redox sensitive variant of green fluorescent protein 提交 2001-06-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；100 MM HEPES, PH 8.0, 100 MM MGCL2, AND 14% PEG4000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.212 |
| 1HCJ Photoproduct of the wild-type Aequorea victoria Green Fluorescent Protein 提交 2001-05-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 D
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；277 K；CRYSTALS WERE GROWN AT 4C FROM 50 MM MGCL2, 14-17 % PEG3350 AND 50-100 MM TRIS/CL PH 7.8 - 8.6.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.267 |
| 1HCJ Photoproduct of the wild-type Aequorea victoria Green Fluorescent Protein 提交 2001-05-04 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
链 C
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；277 K；CRYSTALS WERE GROWN AT 4C FROM 50 MM MGCL2, 14-17 % PEG3350 AND 50-100 MM TRIS/CL PH 7.8 - 8.6.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.267 |
| 1HUY CRYSTAL STRUCTURE OF CITRINE, AN IMPROVED YELLOW VARIANT OF GREEN FLUORESCENT PROTEIN 提交 2001-01-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；50 mM NH4OAc, 50 mM NaOAc, 8% PEG 3400, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.208 |
| 1JBY CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A DUAL-WAVELENGTH EMISSION GREEN FLUORESCENT PROTEIN VARIANT AT LOW PH 提交 2001-06-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65T,Q80R,H148G,T203C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；PEG 1550, citrate, ammonium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.80 Å |
| 1JBZ CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A DUAL-WAVELENGTH EMISSION GREEN FLUORESCENT PROTEIN VARIANT AT HIGH PH 提交 2001-06-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65T,Q80R,H148G,T203C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；PEG 4000, Tris, Magnesium chloride, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å |
| 1JC0 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A REDOX-SENSITIVE GREEN FLUORESCENT PROTEIN VARIANT IN A REDUCED FORM 提交 2001-06-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：C48S,F64L,S65T,Q80R,S147C,Q204C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；PEG 4000, Lithium Sulfate, Tris, DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å |
| 1JC0 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A REDOX-SENSITIVE GREEN FLUORESCENT PROTEIN VARIANT IN A REDUCED FORM 提交 2001-06-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：C48S,F64L,S65T,Q80R,S147C,Q204C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；PEG 4000, Lithium Sulfate, Tris, DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å |
| 1JC0 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A REDOX-SENSITIVE GREEN FLUORESCENT PROTEIN VARIANT IN A REDUCED FORM 提交 2001-06-07 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：C48S,F64L,S65T,Q80R,S147C,Q204C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；PEG 4000, Lithium Sulfate, Tris, DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å |
| 1JC1 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A REDOX-SENSITIVE GREEN FLUORESCENT PROTEIN VARIANT IN A OXIDIZED FORM 提交 2001-06-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：C48S,F64L,S65T,Q80R,S147C,Q204C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；PEG 4000, Lithium Sulfate, Tris, Copper (II) Chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.90 Å |
| 1JC1 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A REDOX-SENSITIVE GREEN FLUORESCENT PROTEIN VARIANT IN A OXIDIZED FORM 提交 2001-06-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：C48S,F64L,S65T,Q80R,S147C,Q204C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；PEG 4000, Lithium Sulfate, Tris, Copper (II) Chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.90 Å |
| 1JC1 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A REDOX-SENSITIVE GREEN FLUORESCENT PROTEIN VARIANT IN A OXIDIZED FORM 提交 2001-06-07 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：C48S,F64L,S65T,Q80R,S147C,Q204C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；PEG 4000, Lithium Sulfate, Tris, Copper (II) Chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.90 Å |
| 1KP5 Cyclic Green Fluorescent Protein 提交 2001-12-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：M1S,S2R,Q25H,Q80R,F99S,Y100F,M141L,M153T,P157Q,V163A,K172E,I219V,I229L,T230V,H231P,G232R,M233G,D234T,E235G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；285 K；ammonium sulfate, glycine, pH 10, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 1KP5 Cyclic Green Fluorescent Protein 提交 2001-12-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：M1S,S2R,Q25H,Q80R,F99S,Y100F,M141L,M153T,P157Q,V163A,K172E,I219V,I229L,T230V,H231P,G232R,M233G,D234T,E235G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；285 K；ammonium sulfate, glycine, pH 10, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 1KP5 Cyclic Green Fluorescent Protein 提交 2001-12-28 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：M1S,S2R,Q25H,Q80R,F99S,Y100F,M141L,M153T,P157Q,V163A,K172E,I219V,I229L,T230V,H231P,G232R,M233G,D234T,E235G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M1S,S2R,Q25H,Q80R,F99S,Y100F,M141L,M153T,P157Q,V163A,K172E,I219V,I229L,T230V,H231P,G232R,M233G,D234T,E235G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；285 K；ammonium sulfate, glycine, pH 10, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 1KP5 Cyclic Green Fluorescent Protein 提交 2001-12-28 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：M1S,S2R,Q25H,Q80R,F99S,Y100F,M141L,M153T,P157Q,V163A,K172E,I219V,I229L,T230V,H231P,G232R,M233G,D234T,E235G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M1S,S2R,Q25H,Q80R,F99S,Y100F,M141L,M153T,P157Q,V163A,K172E,I219V,I229L,T230V,H231P,G232R,M233G,D234T,E235G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；285 K；ammonium sulfate, glycine, pH 10, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 1KP5 Cyclic Green Fluorescent Protein 提交 2001-12-28 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：M1S,S2R,Q25H,Q80R,F99S,Y100F,M141L,M153T,P157Q,V163A,K172E,I219V,I229L,T230V,H231P,G232R,M233G,D234T,E235G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M1S,S2R,Q25H,Q80R,F99S,Y100F,M141L,M153T,P157Q,V163A,K172E,I219V,I229L,T230V,H231P,G232R,M233G,D234T,E235G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；285 K；ammonium sulfate, glycine, pH 10, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 1KP5 Cyclic Green Fluorescent Protein 提交 2001-12-28 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：M1S,S2R,Q25H,Q80R,F99S,Y100F,M141L,M153T,P157Q,V163A,K172E,I219V,I229L,T230V,H231P,G232R,M233G,D234T,E235G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M1S,S2R,Q25H,Q80R,F99S,Y100F,M141L,M153T,P157Q,V163A,K172E,I219V,I229L,T230V,H231P,G232R,M233G,D234T,E235G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；285 K；ammonium sulfate, glycine, pH 10, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 1KP5 Cyclic Green Fluorescent Protein 提交 2001-12-28 | Assembly 7 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：M1S,S2R,Q25H,Q80R,F99S,Y100F,M141L,M153T,P157Q,V163A,K172E,I219V,I229L,T230V,H231P,G232R,M233G,D234T,E235G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；285 K；ammonium sulfate, glycine, pH 10, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 1MYW CRYSTAL STRUCTURE OF A YELLOW FLUORESCENT PROTEIN WITH IMPROVED MATURATION AND REDUCED ENVIRONMENTAL SENSITIVITY 提交 2002-10-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
片段：residues 2-230
|
突变：F46L, F64L, S65G, V68L, S72A, M153T, V163A, S175G, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；298 K；Tris, ammonium sulfate, PEG400, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.248 |
| 1Q4A S65T Q80R Green Fluorescent Protein (GFP) pH 8.5 提交 2003-08-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Q80R, S65T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 4000, MgCl2, BME, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.201 |
| 1Q4B S65T Q80R Green Fluorescent Protein (GFP) pH 5.5 提交 2003-08-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Q80R, S65T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；PEG 4000, MgCl2, BME, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.231 |
| 1Q4C S65T Q80R T203C Green Fluorescent Protein (GFP) pH 8.5 提交 2003-08-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Q80R, S65T, T203C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 4000, MgCl2, BME, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.214 |
| 1Q4D S65T Q80R T203C Green Fluorescent Protein (GFP) pH 5.5 提交 2003-08-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Q80R, S65T, T203C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；PEG 4000, MgCl2, BME, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.233 |
| 1Q4E S65T Q80R Y145C Green Fluorescent Protein (GFP) pH 8.5 提交 2003-08-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Q80R, S65T, Y145C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 4000, MgCl2, BME, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.202 |
| 1Q73 S65T Q80R Y145C T203C Green Fluorescent Protein (GFP) pH 8.5 提交 2003-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Q80R, S65T, Y145C, T203C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 4000, MgCl2, BME, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.210 |
| 1QXT Crystal structure of precyclized intermediate for the green fluorescent protein R96A variant (A) 提交 2003-09-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–229（229 aa）
片段：residues 1-229
|
突变：R96A F99S M153T V163A F64L S65T | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 4000, MAGNESIUM CHLORIDE, HEPES, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.257 |
| 1QY3 Crystal structure of precyclized intermediate for the green fluorescent protein R96A variant (B) 提交 2003-09-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–229（229 aa）
片段：residues 1-229
|
突变：R96A F99S M153T V163A F64L S65T | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 4000, Magnesium Chloride, Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.242 |
| 1QYF Crystal structure of matured green fluorescent protein R96A variant 提交 2003-09-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–229（229 aa）
片段：residues 1-229
|
突变：R96A, F99S, M153T, V163A, F64L, S65CRO, Y66CRO, G67CRO 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 4000, Magnesium Chloride, Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.214 |
| 1QYO Anaerobic precylization intermediate crystal structure for S65G Y66G GFP variant 提交 2003-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F99S, M153T, V163A, F64L, S65G, Y66G | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 4000, Magnesium Chloride, Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.222 |
| 1RM9 Probing the Role of Tryptophans in Aequorea Victoria Green Fluorescent Proteins with an Expanded Genetic Code 提交 2003-11-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
371–608（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；22% PEG 10000, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.268 |
| 1RMM Probing the Role of Tryptophans in Aequorea Victoria Green Fluorescent Proteins with an Expanded Genetic Code 提交 2003-11-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
290–517（228 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；14% PEG 1000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.233 |
| 1RMO Probing the Role of Tryptophans in Aequorea Victoria Green Fluorescent Proteins with an Expanded Genetic Code 提交 2003-11-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
314–551（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；14% PEG 1000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.221 |
| 1RMP Probing the Role of Tryptophans in Aequorea Victoria Green Fluorescent Proteins with an Expanded Genetic Code 提交 2003-11-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
290–517（228 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；14% PEG 1000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.233 |
| 1RRX Crystallographic Evidence for Isomeric Chromophores in 3-Fluorotyrosyl-Green Fluorescent Protein 提交 2003-12-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
290–517（228 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；PEG 4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.272 |
| 1W7S Wild-Type Aequorea victoria Green Fluorescent Protein 提交 2004-09-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
链 C
1–238（238 aa）
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；277 K；CRYSTALS WERE GROWN AT 4C FROM 50 MM MGCL2, 14-17 % PEG3350 AND 50-100 MM TRIS/CL PH 7.8 - 8.6.
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.216 |
| 1W7T Photoproduct of the Wild-Type Aequorea victoria Green Fluorescent Protein at 100 K 提交 2004-09-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
链 C
1–238（238 aa）
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；277 K；CRYSTALS WERE GROWN AT 4C FROM 50 MM MGCL2, 14-17 % PEG3350 AND 50-100 MM TRIS/CL PH 7.8 - 8.6.
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.220 |
| 1W7U Photoproduct of the Wild-Type Aequorea victoria Green Fluorescent Protein after structural annealing at 170K 提交 2004-09-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
链 C
1–238（238 aa）
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；277 K；CRYSTALS WERE GROWN AT 4C FROM 50 MM MGCL2, 14-17 % PEG3350 AND 50-100 MM TRIS/CL PH 7.8 - 8.6.
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.226 |
| 1YFP STRUCTURE OF YELLOW-EMISSION VARIANT OF GFP 提交 1998-08-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–229（227 aa）
|
突变：S65G, V68L, S72A, Q80R, H148G, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；YFP WAS CONCENTRATED TO 10 MG/ML IN 50 MM HEPES PH 7.5. ROD-SHAPED CRYSTALS WITH APPROXIMATE DIMENSIONS OF 0.8 X 0.12 X 0.03 MM WERE GROWN IN HANGING DROPS CONTAINING 5 MICROLITERS PROTEIN AND 5 MICROLITERS MOTHER LIQUOR AT 15 DEGREES C AFTER 2 WEEKS. THE MOTHER LIQUOR CONTAINED 2.2 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE PH 6.9., vapor diffusion - hanging drop, temperature 288K
|
分辨率 2.50 Å |
| 1YFP STRUCTURE OF YELLOW-EMISSION VARIANT OF GFP 提交 1998-08-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–229（227 aa）
|
突变：S65G, V68L, S72A, Q80R, H148G, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；YFP WAS CONCENTRATED TO 10 MG/ML IN 50 MM HEPES PH 7.5. ROD-SHAPED CRYSTALS WITH APPROXIMATE DIMENSIONS OF 0.8 X 0.12 X 0.03 MM WERE GROWN IN HANGING DROPS CONTAINING 5 MICROLITERS PROTEIN AND 5 MICROLITERS MOTHER LIQUOR AT 15 DEGREES C AFTER 2 WEEKS. THE MOTHER LIQUOR CONTAINED 2.2 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE PH 6.9., vapor diffusion - hanging drop, temperature 288K
|
分辨率 2.50 Å |
| 1YHG Uncyclized precursor structure of S65G Y66S V68G GFP variant 提交 2005-01-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65G, Y66S, V68G, F99S, M153T, V163A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 4000, 50 mM MgCl2, 50 mM Hepes 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.280 |
| 1YHG Uncyclized precursor structure of S65G Y66S V68G GFP variant 提交 2005-01-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65G, Y66S, V68G, F99S, M153T, V163A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 4000, 50 mM MgCl2, 50 mM Hepes 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.280 |
| 1YHH Uncyclized precursor structure of S65A Y66S G67A GFP variant 提交 2005-01-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65A, Y66S, G67A, F99S, M153T, V163A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG4000, 50 mM MgCl2, 50 mM Hepes , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.228 |
| 1YHI Uncyclized precursor structure of S65A Y66S R96A GFP variant 提交 2005-01-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65A, Y66S, R96A, F99S, M153T, V163A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG4000, 50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.257 |
| 2AH8 roGFP1-R7. Cystal structure analysis of a rate-enhanced variant of redox-sensitive green fluorescent protein in the oxidized form. 提交 2005-07-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
片段：GFP
|
突变：Q80R,C48S,S147C,Q204C,S202K,F223R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；295 K；sodium citrate, imidazole, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.280 |
| 2AH8 roGFP1-R7. Cystal structure analysis of a rate-enhanced variant of redox-sensitive green fluorescent protein in the oxidized form. 提交 2005-07-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
片段：GFP
|
突变：Q80R,C48S,S147C,Q204C,S202K,F223R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；295 K；sodium citrate, imidazole, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.280 |
| 2AH8 roGFP1-R7. Cystal structure analysis of a rate-enhanced variant of redox-sensitive green fluorescent protein in the oxidized form. 提交 2005-07-27 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
片段：GFP
链 B
1–238（238 aa）
片段：GFP
|
突变：Q80R,C48S,S147C,Q204C,S202K,F223R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q80R,C48S,S147C,Q204C,S202K,F223R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IMD IMIDAZOLE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；295 K；sodium citrate, imidazole, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.280 |
| 2AHA Crystal structure analysis of a rate-enhanced variant of redox-sensitive green fluorescent protein in the reduced form, roGFP1-R8. 提交 2005-07-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
片段：GFP
|
突变：Q80R,C48S,S147C,Q204C,K41D,F223R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295 K；sodium phosphate/citrate, ammonium sulfate, DTT, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.275 |
| 2AHA Crystal structure analysis of a rate-enhanced variant of redox-sensitive green fluorescent protein in the reduced form, roGFP1-R8. 提交 2005-07-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
片段：GFP
|
突变：Q80R,C48S,S147C,Q204C,K41D,F223R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；295 K；sodium phosphate/citrate, ammonium sulfate, DTT, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.275 |
| 2AWJ GFP R96M pre-cyclized intermediate in chromophore formation 提交 2005-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–229（228 aa）
片段：residues 1-229
|
突变：F64L, S65T, R96M, F99S, M153T, V163A | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；295 K；PEG4000, magnesium chloride, Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K, pH 8.00
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.241 |
| 2AWK GFP R96M mature chromophore 提交 2005-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–229（229 aa）
片段：residues 1-229
|
突变：F64L, S65T, R96M, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；PEG4000, Magnesium chloride, HEPES, pH 8.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.188 |
| 2AWL Mature R96K GFP mutant 提交 2005-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–229（229 aa）
片段：RESIDUES 1-229
|
突变：F64L, S65T, R96K, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；PEG4000, Magnesium chloride, HEPES, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.270 |
| 2AWM GFP R96A chromophore maturation recovery mutant R96A Q183R 提交 2005-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–229（229 aa）
|
突变：F64L, S65T, R96A, F99S, M153T, V163A, Q183R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；PEG4000, Magnesium chloride, HEPES, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.223 |
| 2B3P Crystal structure of a superfolder green fluorescent protein 提交 2005-09-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S30R, Y39N, F64L, S65T, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CD CADMIUM ION × 9 ACY ACETIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；Hepes-NaOH, sodium acetate, cadmium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.218 |
| 2B3Q Crystal structure of a well-folded variant of green fluorescent protein 提交 2005-09-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：F64L, S65T, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F64L, S65T, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 3000, Ca(OAc)2, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.259 |
| 2B3Q Crystal structure of a well-folded variant of green fluorescent protein 提交 2005-09-20 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：F64L, S65T, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F64L, S65T, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 3000, Ca(OAc)2, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.259 |
| 2DUE crystal structure of a green fluorescent protein variant S65T/H148D at pH 10 提交 2006-07-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65T, H148D, Q80R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；298 K；100mM MgCl2, 100mM CHES pH 10, 26% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.204 |
| 2DUF crystal structure of a green fluorescent protein variant S65T/H148D at pH 5.6 提交 2006-07-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65T, H148D, Q80R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；100mM MgCl2, 100mM NaOAc pH 5.6, 26% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.244 |
| 2DUG crystal structure of a green fluorescent protein S65T/H148N at pH 5 提交 2006-07-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65T, H148N, Q80R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；50mM Li2SO4, 100mM Acetate pH 9.5, 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.241 |
| 2DUH crystal structure of a green fluorescent protein variant S65T/H148N at pH 9.5 提交 2006-07-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65T, H148N, Q80R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；50mM Li2SO4, 100mM TRIS pH 9.5, 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.209 |
| 2DUI crystal structure of a green fluorescent protein variant H148D at pH 9 提交 2006-07-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：H148D, Q80R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；298 K；100mM MgCl2, 100mM Tris pH 8.5, 30% PEG 1550, pH 9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.216 |
| 2EMD GREEN FLUORESCENT PROTEIN FROM AEQUOREA VICTORIA, MUTANT 提交 1997-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：INS(A1[B]), F64L, Y66H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED BY HANGING DROP METHOD. PROTEIN SOLUTION: 21 MG/ML IN 20 MM TRIS/HCL WELL SOLUTION: 2.1 M AS, 100 MM TRIS/HCL, PH 8.5 PROTEIN:WELL 1:1, vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.236 |
| 2EMN GREEN FLUORESCENT PROTEIN FROM AEQUOREA VICTORIA, MUTANT 提交 1997-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：INS(A1[B]), F64L, Y66H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED BY HANGING DROP METHOD. PROTEIN SOLUTION: 21 MG/ML IN 20 MM TRIS/HCL, PH 8.0. WELL SOLUTION: 2.1 M AS, 100 MM TRIS/HCL, PH 8.5. PROTEIN:WELL 1:1., vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.299 |
| 2EMO GREEN FLUORESCENT PROTEIN FROM AEQUOREA VICTORIA, MUTANT 提交 1997-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：INS(A1[B]), F64L, Y66H, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED BY HANGING DROP METHOD. PROTEIN SOLUTION: 21 MG/ML IN 20 MM TRIS/HCL, PH 8.0 WELL SOLUTION: 1.95 M AS, 100 MM TRIS HCL, PH 8.5 PROTEIN:WELL 1:1, vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.343 |
| 2FWQ Reduced enolate chromophore intermediate for Y66H GFP variant 提交 2006-02-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65T, Y66H, F99S, H148G, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；298 K；50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, 20% PEG 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 8.00
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.198 |
| 2FZU Reduced enolate chromophore intermediate for GFP variant 提交 2006-02-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65T, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, 20% PEG 4K, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.199 |
| 2G16 Structure of S65A Y66S GFP variant after backbone fragmentation 提交 2006-02-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–64（63 aa）
片段：residues 2-64
链 B
65–238（174 aa）
片段：residues 65-238
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S65A, Y66S, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, 20% PEG 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.241 |
| 2G2S Structure of S65G Y66S GFP variant after spontaneous peptide hydrolysis 提交 2006-02-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–65（64 aa）
链 B
66–238（173 aa）
|
突变：F64L, S65G 突变：Y66S, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；298 K；50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, 20% PEG 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 8.00
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.174 |
| 2G3D Structure of S65G Y66A GFP variant after spontaneous peptide hydrolysis 提交 2006-02-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–65（64 aa）
链 B
66–238（173 aa）
|
突变：F64L, S65G 突变：Y66A, F99S, M153T, V163A | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, 20% PEG 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.215 |
| 2G5Z Structure of S65G Y66S GFP variant after spontaneous peptide hydrolysis and decarboxylation 提交 2006-02-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–65（64 aa）
链 B
66–238（173 aa）
|
突变：S65G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Y66S, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, 20% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 8.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.232 |
| 2G6E Structure of cyclized F64L S65A Y66S GFP variant 提交 2006-02-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65A, Y66S, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, 20% PEG 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.187 |
| 2H6V Spectroscopic and structural study of the heterotropic linkage between halide and proton ion binding to GFP proteins- E2(GFP) APO FORM 提交 2006-06-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；14% (w/v) PEG3350, 100 mM NH4 acetate pH 5.0, 0.2 M NH4F, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.187 |
| 2H9W Green fluorescent protein ground states: the influence of a second protonation site near the chromophore 提交 2006-06-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–237（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；298 K；AS, Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.186 |
| 2HCG Structure of S65T Y66F GFP variant after cyclization, carbon-carbon bond cleavage, and oxygen incorporation reactions 提交 2006-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65T, Y66F, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；19% PEG 4K, 50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.188 |
| 2HFC Structure of S65T Y66F R96A GFP variant in precursor state 提交 2006-06-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65T, Y66F, R96A, F99S, M153T, V163A | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；19% PEG 4K, 50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.203 |
| 2HGD Structure of S65A Y66F GFP variant with an oxidized chromophore 提交 2006-06-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65A, Y66F, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；19% PEG 4K, 50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.239 |
| 2HGY Structure of S65A Y66F E222A GFP variant after cyclization and carbon-carbon bond cleavage 提交 2006-06-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65A, Y66F, F99S, M153T, V163A, E222A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；19% PEG 4K, 50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.260 |
| 2HJO Crystal structure of V224H design intermediate for GFP metal ion reporter 提交 2006-06-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L S65T V224H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；19% PEG 4K, 50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.165 |
| 2HQZ Crystal structure of L42H design intermediate for GFP metal ion reporter 提交 2006-07-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L, S65T, L42H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；19% PEG 4K, 50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.179 |
| 2HRS Crystal structure of L42H V224H design intermediate for GFP metal ion reporter 提交 2006-07-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L S65T F99S M153T V163A L42H V224H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；19% PEG 4K, 50 mM MgCl2, 50 mM Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.192 |
| 2JAD Yellow fluorescent protein - glutaredoxin fusion protein 提交 2006-11-27 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 10；50MM BICARBONATE PH 10 1.5-1.75M MGSO4
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.247 |
| 2O24 Spectroscopic and Structural Study of the Heterotropic Linkage between Halide and Proton Ion Binding to Gfp Proteins: E2(GFP)-Cl Complex 提交 2006-11-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；14% (W/V) PEG 3350, 100 MM NH4 ACETATE, 0.2 M NH4CL, PH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.192 |
| 2O29 Spectroscopic and Structural Study of the Heterotropic Linkage between Halide and Proton Ion Binding to Gfp Proteins: E2(GFP)-BR Complex 提交 2006-11-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BR BROMIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；14% (W/V) PEG 3350, 100 MM NH4 ACETATE, 0.2 M NH4Br, PH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 100K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.208 |
| 2O2B Spectroscopic and Structural Study of the Heterotropic Linkage between Halide and Proton Ion Binding to Gfp Proteins: E2(GFP)-I Complex 提交 2006-11-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IOD IODIDE ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；14% (W/V) PEG 3350, 100 MM NH4 ACETATE, 0.2 M NH4I, PH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 100K
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.234 |
| 2OKW A non-invasive GFP-based biosensor for mercury ions 提交 2007-01-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65T, R80Q, S205C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；100mM Pipes, 30% PEG 8000, 200mM Na-acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.268 |
| 2OKW A non-invasive GFP-based biosensor for mercury ions 提交 2007-01-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：S65T, R80Q, S205C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；100mM Pipes, 30% PEG 8000, 200mM Na-acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.268 |
| 2OKW A non-invasive GFP-based biosensor for mercury ions 提交 2007-01-17 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：S65T, R80Q, S205C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；100mM Pipes, 30% PEG 8000, 200mM Na-acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.268 |
| 2OKW A non-invasive GFP-based biosensor for mercury ions 提交 2007-01-17 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：S65T, R80Q, S205C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；100mM Pipes, 30% PEG 8000, 200mM Na-acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.268 |
| 2OKW A non-invasive GFP-based biosensor for mercury ions 提交 2007-01-17 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1–238（238 aa）
|
突变：S65T, R80Q, S205C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；100mM Pipes, 30% PEG 8000, 200mM Na-acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.268 |
| 2OKW A non-invasive GFP-based biosensor for mercury ions 提交 2007-01-17 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1–238（238 aa）
|
突变：S65T, R80Q, S205C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；100mM Pipes, 30% PEG 8000, 200mM Na-acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.268 |
| 2OKY A non-invasive GFP-based biosensor for mercury ions 提交 2007-01-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65T, R80Q, S205C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；32% PEG 8000, 100mM PIPES, 200mM ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.302 |
| 2OKY A non-invasive GFP-based biosensor for mercury ions 提交 2007-01-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：S65T, R80Q, S205C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；32% PEG 8000, 100mM PIPES, 200mM ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.302 |
| 2Q57 X-ray structure of Cerulean GFP: A tryptophan-based chromophore useful for fluorescence lifetime imaging 提交 2007-05-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L, S72A, Q80R, Y145A, N146I, H148D, M153T, V163A, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；100mM sodium acetate, 19% PEG 4000, 1mM EDTA, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.262 |
| 2QLE GFP/S205V mutant 提交 2007-07-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Q80R, S205V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；298 K；100mM Imidazol pH 8.0, 1.1M Na Citrate at room temperature for 6-7 months., temperature 298K
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.256 |
| 2QLE GFP/S205V mutant 提交 2007-07-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：Q80R, S205V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；298 K；100mM Imidazol pH 8.0, 1.1M Na Citrate at room temperature for 6-7 months., temperature 298K
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.256 |
| 2QLE GFP/S205V mutant 提交 2007-07-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：Q80R, S205V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；298 K；100mM Imidazol pH 8.0, 1.1M Na Citrate at room temperature for 6-7 months., temperature 298K
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.256 |
| 2QLE GFP/S205V mutant 提交 2007-07-12 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：Q80R, S205V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；298 K；100mM Imidazol pH 8.0, 1.1M Na Citrate at room temperature for 6-7 months., temperature 298K
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.256 |
| 2QRF Green Fluorescent Protein: Cyclized-only Intermediate of Chromophore Maturation in the Q183E variant 提交 2007-07-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–230（230 aa）
|
突变：F64L, F99S, M153T, V163A, Q183E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；8-12% Peg 4000, 50 mM Magnesium Chloride, 50 mM Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.229 |
| 2QT2 Cyclized-Dehydrated Intermediate of GFP Variant Q183E in Chromophore Maturation 提交 2007-07-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L, F99S, M153T, V163A, Q183E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；Peg4000, Magnesium chloride, Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.189 |
| 2QU1 Crystal Structure of a Cyclized GFP Variant 提交 2007-08-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；Protein solution (4.95 mg/ml Protein, 0.050 M Sodium chloride, 0.0003 M TCEP, 0.005 M Bis-Tris pH 7.0) mixed in a 1:1 ratio with the Well solution (0.080 M Calcium chloride, 15% PEG 4000, 0.1 M HEPPS pH 8.5) and cryoprotected with well solution supplemented with 20% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.220 |
| 2QZ0 Mature Q183E variant of Green Fluorescent Protein Chromophore 提交 2007-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–229（228 aa）
|
突变：F64L, F99S, M153T, V163A, Q183E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；Peg4000, Magnesium chloride, Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.170 |
| 2WSN Structure of Enhanced Cyan Fluorescent Protein at physiological pH 提交 2009-09-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
片段：RESIDUES 2-238
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；19.5% PEG8000, 4% GLYCEROL, 1M HEPES PH 7.5
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.185 |
| 2WSO Structure of Cerulean Fluorescent Protein at physiological pH 提交 2009-09-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
片段：RESIDUES 2-238
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；15% PEG 8000, 0.1M MGCL2, 0.1 M HEPES PH 7.0
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.177 |
| 2WUR Atomic resolution structure of GFP measured on a rotating anode 提交 2009-10-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 EOH ETHANOL × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION: 2 UL PROTEIN (10 MG/ML IN 20 MM TRIS, PH 8.0) PLUS 2 UL RESERVOIR (40% ETHANOL, 10 % DIOXANE)
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.174 |
| 2Y0G X-ray structure of Enhanced Green Fluorescent Protein (EGFP) 提交 2010-12-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.2；50 MM HEPES PH 8.2, 24% PEG 4000, 50 MM MGCL2, 10 MM BETA-MERCAPTOEPTHANOL
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.188 |
| 2YDZ X-ray structure of the cyan fluorescent protein SCFP3A (K206A mutant) 提交 2011-03-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.75；16 MG/ML PROTEIN, 13% PEG8000, 100 MM MGCL2, 100 MM HEPES PH 6.75
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.193 |
| 2YE0 X-ray structure of the cyan fluorescent protein mTurquoise (K206A mutant) 提交 2011-03-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.75；16 MG/ML PROTEIN, 14% PEG8000, 100 MM MGCL2, 100 MM HEPES PH 6.75
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.185 |
| 2YE1 X-ray structure of the cyan fluorescent proteinmTurquoise-GL (K206A mutant) 提交 2011-03-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；35 MG/ML PROTEIN, 14% PEG8000, 100 MM MGCL2, 100 MM HEPES PH 7.00
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.194 |
| 3CB9 Development of a family of redox-sensitive green fluorescent protein indicators for use in relatively oxidizing subcellular environments 提交 2008-02-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：C48S,F64L,F99S,S147CR,H148S,M153T,V163A,I167T,Q204C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1M tris, 22% PEG 1550, 0.02M magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.169 |
| 3CBE Development of a family of redox-sensitive green fluorescent protein indicators for use in relatively oxidizing subcellular environments 提交 2008-02-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：C48S,F64L,F99S,S147CR,H148S,M153T,V163A,I167T,Q204C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1M tris, 22% PEG 1550, 0.02M magnesium chloride. After crystal formation TCEP added to 20mM., pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.188 |
| 3CD1 Development of a family of redox-sensitive green fluorescent protein indicators for use in relatively oxidizing subcellular environments 提交 2008-02-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：C48S,F64L,F99S,S147CR,H148S,M153T,V163A,I167T,Q204C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1M tris, 24% PEG 1550, 0.04M sodium acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.184 |
| 3CD9 Development of a family of redox-sensitive green fluorescent protein indicators for use in relatively oxidizing subcellular environments 提交 2008-02-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：C48S,F64L,F99S,S147CR,H148S,M153T,V163A,I167T,Q204C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1M tris, 24% PEG 1550, 0.04M sodium acetate. TCEP added to 20mM after crystal formation., pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.193 |
| 3DPW Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1 Atmosphere Number 1: Structure 1 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.284 |
| 3DPX Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 5000 Atmospheres: Structure 26 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.240 |
| 3DPZ Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 4000 Atmospheres Number 3: Structure 25 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.294 |
| 3DQ1 Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 4000 Atmospheres Number 2: Structure 24 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.296 |
| 3DQ2 Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 4000 Atmospheres Number 1: Structure 23 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.282 |
| 3DQ3 Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 2500 Atmospheres: Structure 22 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.253 |
| 3DQ4 Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 2000 Atmospheres Number 2: Structure 20 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.240 |
| 3DQ5 Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1960 Atmospheres: Structure 19 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.255 |
| 3DQ6 Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1920 Atmospheres Number 2: Structure 18 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.255 |
| 3DQ7 Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1920 Atmospheres Number 1: Structure 17 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.250 |
| 3DQ8 Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1500 Atmospheres Number 2: Structure 16 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.283 |
| 3DQ9 Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1500 Atmospheres Number 1: Structure 15 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.271 |
| 3DQA Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1250 Atmospheres Number 4: Structure 14 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.245 |
| 3DQC Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1250 Atmospheres Number 3: Structure 13 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.279 |
| 3DQD Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1250 Atmospheres Number 2: Structure 12 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.280 |
| 3DQE Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1250 Atmospheres Number 1: Structure 11 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.263 |
| 3DQF Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1000 Atmospheres Number 6: Structure 10 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.244 |
| 3DQH Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1000 Atmospheres Number 5: Structure 9 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.237 |
| 3DQI Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1000 Atmospheres Number 4: Structure 8 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.266 |
| 3DQJ Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1000 Atmospheres Number 3: Structure 7 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.298 |
| 3DQK Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1000 Atmospheres Number 2: Structure 6 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.265 |
| 3DQL Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1000 Atmospheres Number 1: Structure 5 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.271 |
| 3DQM Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 750 Atmospheres: Structure 4 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.260 |
| 3DQN Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 500 Atmospheres: Structure 3 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.257 |
| 3DQO Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 1 Atmosphere Number 2: Structure 2 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.259 |
| 3DQU Structure of the Yellow Fluorescent Protein Citrine Frozen at 2000 Atmospheres Number 1: Structure 20 in a Series of 26 High Pressure Structures 提交 2008-07-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, Q69M, S72A, T203Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；Crystals grown by seeding using a Seed Bead (HR2-320, Hampton Research) in 5% PEG 3350, 50 mM Na Acetate, 50 mM NH4 Acetate, pH 5.0. Crystals were grown at 4 deg C and at ambient pressure, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.257 |
| 3EK4 Calcium-saturated GCaMP2 Monomer 提交 2008-09-18 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1 M Magnesium formate dihydrate, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.280 |
| 3EK7 Calcium-saturated GCaMP2 dimer 提交 2008-09-18 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 30%(w/v) polyethylene glycol 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.241 |
| 3EK8 Calcium-saturated GCaMP2 T116V/G87R mutant monomer 提交 2008-09-19 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
突变：T116V, G87R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：T116V, G87R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1 M Magnesium formate dihydrate, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.266 |
| 3EKH Calcium-saturated GCaMP2 T116V/K378W mutant monomer 提交 2008-09-19 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
突变：T116V, K378W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：T116V, K378W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1 M Magnesium formate dihydrate, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.224 |
| 3EKJ Calcium-free GCaMP2 (calcium binding deficient mutant) 提交 2008-09-19 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
突变：T329G, E334Q, D359G, E370Q, D396G, E407Q, D432G, E443Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：T329G, E334Q, D359G, E370Q, D396G, E407Q, D432G, E443Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.280 |
| 3EVP crystal structure of circular-permutated EGFP 提交 2008-10-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.45 Å R-free 0.174 |
| 3EVR Crystal structure of Calcium bound monomeric GCAMP2 提交 2008-10-13 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
片段：UNP P42212 residues 2-238, UNP P0DP29 residues 148-305
链 A
2–144（143 aa）
片段：UNP P42212 residues 2-238, UNP P0DP29 residues 148-305
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.190 |
| 3EVU Crystal structure of Calcium bound dimeric GCAMP2 提交 2008-10-13 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
147–238（92 aa）
片段：UNP P11799 residues 1731-1749, UNP P42212 residues 2-144/147-238, UNP P0DP29 residues 3-238
链 A
2–144（143 aa）
片段：UNP P11799 residues 1731-1749, UNP P42212 residues 2-144/147-238, UNP P0DP29 residues 3-238
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.75 Å R-free 0.197 |
| 3EVV Crystal Structure of Calcium bound dimeric GCAMP2 (#2) 提交 2008-10-13 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å R-free 0.270 |
| 3G9A Green fluorescent protein bound to minimizer nanobody 提交 2009-02-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S2G, Q80R, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；100mM Mes pH 6.5, 30% PEG 8000, 15% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.194 |
| 3GEX 1.6 angstrom crystal structure of fluorescent protein Cypet 提交 2009-02-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：T10G, V12I, D20E, A88V, I168A, E173T, L195I 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；30% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 0.2M Lithium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.229 |
| 3GJ1 Non photoactivated state of PA-GFP 提交 2009-03-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–230（230 aa）
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, T203H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.7 M Ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M Lithium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.252 |
| 3GJ1 Non photoactivated state of PA-GFP 提交 2009-03-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–230（230 aa）
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, T203H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.7 M Ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M Lithium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.252 |
| 3GJ1 Non photoactivated state of PA-GFP 提交 2009-03-07 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–230（230 aa）
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, T203H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.7 M Ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M Lithium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.252 |
| 3GJ1 Non photoactivated state of PA-GFP 提交 2009-03-07 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–230（230 aa）
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, T203H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.7 M Ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M Lithium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.252 |
| 3GJ2 Photoactivated state of PA-GFP 提交 2009-03-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–230（230 aa）
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, T203H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；18% PEG 3550, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M Calcium acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.248 |
| 3GJ2 Photoactivated state of PA-GFP 提交 2009-03-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–230（230 aa）
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, T203H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；18% PEG 3550, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M Calcium acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.248 |
| 3GJ2 Photoactivated state of PA-GFP 提交 2009-03-07 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–230（230 aa）
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, T203H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；18% PEG 3550, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M Calcium acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.248 |
| 3GJ2 Photoactivated state of PA-GFP 提交 2009-03-07 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–230（230 aa）
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, T203H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；18% PEG 3550, 0.1 M Tris-HCl, 0.2 M Calcium acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.248 |
| 3I19 1.4 Angstrom Crystal Structure of Fluorescent Protein Cypet 提交 2009-06-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：T9G, V11I, D19E, A87V, I167A, E172T, L194I 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；30% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 0.2M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.197 |
| 3K1K Green fluorescent protein bound to enhancer nanobody 提交 2009-09-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S2G, Q80R, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；60% MPD, 100MM NAAC PH 4.6, 10MM CACL2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.255 |
| 3K1K Green fluorescent protein bound to enhancer nanobody 提交 2009-09-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：S2G, Q80R, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；60% MPD, 100MM NAAC PH 4.6, 10MM CACL2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.255 |
| 3LA1 High resolution crystal structure of CyPet mutant A167I 提交 2010-01-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：T9G, V11I, D19E, A87V, A167I, E172T, L194I 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；30% PEG 4000, 0.1M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2M LI2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.159 |
| 3O77 The structure of Ca2+ Sensor (Case-16) 提交 2010-07-30 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
147–238（92 aa）
链 A
2–146（145 aa）
|
突变：POINT MUTATIONS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：POINT MUTATIONS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；Reservoir: 50mM Imidazol, 1.9M Na2malonate pH 6.4; Protein stock solution: 50mM Tris HCl (pH 7.4), 150mM NaCl, 10mM dithiothreitol, protein 4.1mg/ml; Drop ratio reservoir/protein = 1/3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.274 |
| 3O78 The structure of Ca2+ Sensor (Case-12) 提交 2010-07-30 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
147–238（92 aa）
链 A
2–146（145 aa）
|
突变：POINT MUTATIONS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：POINT MUTATIONS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；Reservoir: 100mM Tris HCL (pH 5.5), 100mM (NH4)2SO4, 21% PEG 3350; Protein stock: 7.6 mg/ml Protein, 50mM Tris HCl (pH 7.4), 150mM NaCl; Seed stock solution: 20mM CaCl2, 20% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.316 |
| 3O78 The structure of Ca2+ Sensor (Case-12) 提交 2010-07-30 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
147–238（92 aa）
链 B
2–146（145 aa）
|
突变：POINT MUTATIONS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：POINT MUTATIONS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；Reservoir: 100mM Tris HCL (pH 5.5), 100mM (NH4)2SO4, 21% PEG 3350; Protein stock: 7.6 mg/ml Protein, 50mM Tris HCl (pH 7.4), 150mM NaCl; Seed stock solution: 20mM CaCl2, 20% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.316 |
| 3O78 The structure of Ca2+ Sensor (Case-12) 提交 2010-07-30 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
147–238（92 aa）
链 A
2–146（145 aa）
链 B
147–238（92 aa）
链 B
2–146（145 aa）
|
突变：POINT MUTATIONS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：POINT MUTATIONS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：POINT MUTATIONS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：POINT MUTATIONS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；Reservoir: 100mM Tris HCL (pH 5.5), 100mM (NH4)2SO4, 21% PEG 3350; Protein stock: 7.6 mg/ml Protein, 50mM Tris HCl (pH 7.4), 150mM NaCl; Seed stock solution: 20mM CaCl2, 20% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.316 |
| 3OGO Structure of the GFP:GFP-nanobody complex at 2.8 A resolution in spacegroup P21212 提交 2010-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；20% PEG 4000, 20% isopropanol, 0.1M trisodium citrate dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.253 |
| 3OGO Structure of the GFP:GFP-nanobody complex at 2.8 A resolution in spacegroup P21212 提交 2010-08-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；20% PEG 4000, 20% isopropanol, 0.1M trisodium citrate dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.253 |
| 3OGO Structure of the GFP:GFP-nanobody complex at 2.8 A resolution in spacegroup P21212 提交 2010-08-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；20% PEG 4000, 20% isopropanol, 0.1M trisodium citrate dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.253 |
| 3OGO Structure of the GFP:GFP-nanobody complex at 2.8 A resolution in spacegroup P21212 提交 2010-08-17 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；20% PEG 4000, 20% isopropanol, 0.1M trisodium citrate dihydrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.253 |
| 3OSQ Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into E. coli maltose binding protein at position 175 提交 2010-09-09 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
147–238（92 aa）
片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396
链 A
2–146（145 aa）
片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；296 K；0.5 M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 1.0 M Lithium sulfate monohydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.199 |
| 3OSR Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into E. coli maltose binding protein at position 311 提交 2010-09-09 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
147–238（92 aa）
片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396
链 A
2–146（145 aa）
片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；296 K；0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 8% w/v polyethylene glycol 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 296K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.226 |
| 3OSR Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into E. coli maltose binding protein at position 311 提交 2010-09-09 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
147–238（92 aa）
片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396
链 B
2–146（145 aa）
片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；296 K；0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 8% w/v polyethylene glycol 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 296K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.226 |
| 3P28 Structure of a Circular Permutant of Green Fluorescent Protein 提交 2010-10-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
50–229（180 aa）
片段：UNP P42212 residues 50-229, 2-49
链 A
3–49（47 aa）
片段：UNP P42212 residues 50-229, 2-49
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；279 K；0.07 M Na-acetate trihydrate pH 4.6, 5.6% PEG 4000, and 30 % Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.237 |
| 3SG2 Crystal Structure of GCaMP2-T116V,D381Y 提交 2011-06-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 A
2–144（143 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：T116V,D381Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：T116V,D381Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.207 |
| 3SG3 Crystal Structure of GCaMP3-D380Y 提交 2011-06-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 A
2–144（143 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：D380Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D380Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M Tris, pH 8.5, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.199 |
| 3SG4 Crystal Structure of GCaMP3-D380Y, LP(linker 2) 提交 2011-06-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 A
2–144（143 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：D380Y, LP(linker 2) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D380Y, LP(linker 2) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M Tris, pH 8.5, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.213 |
| 3SG5 Crystal Structure of Dimeric GCaMP3-D380Y, QP(linker 1), LP(linker 2) 提交 2011-06-14 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 A
2–144（143 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：D380Y, QP(linker 1), LP(linker 2) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D380Y, QP(linker 1), LP(linker 2) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 SO4 SULFATE ION × 8 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.226 |
| 3SG6 Crystal Structure of Dimeric GCaMP2-LIA(linker 1) 提交 2011-06-14 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 A
2–144（143 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：LIA(linker 1) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：LIA(linker 1) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 30% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.249 |
| 3SG7 Crystal Structure of GCaMP3-KF(linker 1) 提交 2011-06-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 A
2–144（143 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：KF(linker 1) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：KF(linker 1) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.230 |
| 3SRY Engineered high-affinity halide-binding protein derived from YFP: halide-free 提交 2011-07-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S72A, K79R, Q183A, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；17% PEG3000, 150 mM sodium acetate, 90 mM magnesium chloride, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.157 |
| 3SS0 Engineered high-affinity halide-binding protein derived from YFP: fluoride complex 提交 2011-07-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S72A, K79R, Q183A, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；17% PEG3000, 100 mM sodium acetate, 90 mM magnesium chloride, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.192 |
| 3SSH Engineered high-affinity halide-binding protein derived from YFP: chloride complex 提交 2011-07-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S72A, K79R, Q183A, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；17% PEG3000, 100 mM sodium acetate, 90 mM magnesium chloride, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.28 Å R-free 0.160 |
| 3SSK Engineered high-affinity halide-binding protein derived from YFP: bromide complex 提交 2011-07-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S72A, K79R, Q183A, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BR BROMIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；17% PEG2000, 150 mM sodium acetate, 90 mM magnesium chloride, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.172 |
| 3SSL Engineered high-affinity halide-binding protein derived from YFP: iodide complex 提交 2011-07-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S72A, K79R, Q183A, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IOD IODIDE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；17% PEG2000, 150 mM sodium acetate, 90 mM magnesium chloride, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.176 |
| 3SSP Engineered low-affinity halide-binding protein derived from YFP: halide-free 提交 2011-07-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S72A, K79R, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；14% PEG4000, 50 mM sodium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.174 |
| 3SST Engineered low-affinity halide-binding protein derived from YFP: chloride complex 提交 2011-07-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S72A, K79R, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；14% PEG4000, 50 mM sodium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.182 |
| 3SSV Engineered low-affinity halide-binding protein derived from YFP: fluoride complex 提交 2011-07-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S72A, K79R, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | F FLUORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；18% PEG2000, 50 mM sodium acetate, 90 mM magnesium chloride, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.213 |
| 3SSY Engineered low-affinity halide-binding protein derived from YFP: iodide complex 提交 2011-07-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S72A, K79R, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IOD IODIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；22% PEG2000, 50 mM sodium acetate, 90 mM magnesium chloride, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.194 |
| 3ST0 Engineered medium-affinity halide-binding protein derived from YFP: halide-free 提交 2011-07-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Q69T, S72A, K79R, V163A, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 FMT FORMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；290 K；10% PEG3000, 150 mM ammonium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.166 |
| 3SV5 Engineered medium-affinity halide-binding protein derived from YFP: iodide complex 提交 2011-07-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Q69T, S72A, K79R, V163A, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 IOD IODIDE ION × 4 FMT FORMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；21% PEG2000, 50 mM sodium acetate, 90 mM magnesium chloride, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.182 |
| 3SVB Engineered medium-affinity halide-binding protein derived from YFP: fluoride complex 提交 2011-07-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Q69T, S72A, K79R, V163A, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；290 K；10% PEG3000, 150 mM ammonium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.164 |
| 3SVC Engineered medium-affinity halide-binding protein derived from YFP: chloride complex 提交 2011-07-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Q69T, S72A, K79R, V163A, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；20% PEG2000, 50 mM sodium acetate, 90 mM magnesium chloride, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.164 |
| 3SVD Engineered medium-affinity halide-binding protein derived from YFP: bromide complex 提交 2011-07-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Q69T, S72A, K79R, V163A, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 BR BROMIDE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；21% PEG2000, 50 mM sodium acetate, 90 mM magnesium chloride, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.196 |
| 3SVE Engineered low-affinity halide-binding protein derived from YFP: bromide complex 提交 2011-07-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S72A, K79R, T203Y, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BR BROMIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；18% PEG2000, 50 mM sodium acetate, 90 mM magnesium chloride, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.179 |
| 3U8P Cytochrome b562 integral fusion with EGFP 提交 2011-10-17 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–38（37 aa）
链 A
40–238（199 aa）
|
突变：F64L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F64L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.4；0.1 M MES/NAOH, PH 6.4, 200 MM magnesium acetate and 20% (W/V) PEG 8000; for cryoprotection 16% glycerol was added to the reservoir buffer, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.242 |
| 3U8P Cytochrome b562 integral fusion with EGFP 提交 2011-10-17 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–38（37 aa）
链 B
40–238（199 aa）
|
突变：F64L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F64L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.4；0.1 M MES/NAOH, PH 6.4, 200 MM magnesium acetate and 20% (W/V) PEG 8000; for cryoprotection 16% glycerol was added to the reservoir buffer, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.242 |
| 3U8P Cytochrome b562 integral fusion with EGFP 提交 2011-10-17 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2–38（37 aa）
链 C
40–238（199 aa）
|
突变：F64L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F64L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.4；0.1 M MES/NAOH, PH 6.4, 200 MM magnesium acetate and 20% (W/V) PEG 8000; for cryoprotection 16% glycerol was added to the reservoir buffer, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.242 |
| 3UFZ Crystal structure of a Trp-less green fluorescent protein translated by the universal genetic code 提交 2011-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–229（228 aa）
片段：UNP RESIDUES 2-229
|
突变：T9A, W57F, Q80R, F99S, M153T, V163A, T200C, S205T, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；15% PEG 6000, 5% Glycerol, pH 8.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.228 |
| 3UG0 Crystal structure of a Trp-less green fluorescent protein translated by the simplified genetic code 提交 2011-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–229（228 aa）
片段：UNP RESIDUES 2-229
|
突变：T9A, W57F, Q80R, F99S, M153T, V163A, T200C, S205T, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；17% PEG 20000, 100mM MES (pH6.5), vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.241 |
| 3V3D Crystal Structure of an eYFP single mutant 提交 2011-12-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：V68L, S72A, Y203F, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；2M (NH4)2SO4, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.229 |
| 3W1C Structure of a pressure sensitive YFP variant YFP-G1 提交 2012-11-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, S72A, T204Y, H232L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；13-15% PEG 8000, 0.1M Bis-Tris buffer, 350-400mM calcium acetate , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.211 |
| 3W1D Structure of a pressure sensitive YFP variant YFP-G3 提交 2012-11-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S65G, V68L, S72A, T206Y, H234L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；13-17% PEG 8000, 0.1M Bis-Tris buffer, 200-400mM calcium acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.208 |
| 3WLC Crystal structure of dimeric GCaMP6m 提交 2013-11-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
片段：UNP RESIDUES 37-55, 149-238, 2-144, 3-149
链 A
2–144（143 aa）
片段：UNP RESIDUES 37-55, 149-238, 2-144, 3-149
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, N61D, D79Y, M77G, K78S, T80R, S82T, R91G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, N61D, D79Y, M77G, K78S, T80R, S82T, R91G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M HEPES, 20% w/v PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.225 |
| 3WLD Crystal structure of monomeric GCaMP6m 提交 2013-11-08 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
片段：UNP RESIDUES 37-55, 149-238, 2-144, 3-149
链 A
2–144（143 aa）
片段：UNP RESIDUES 37-55, 149-238, 2-144, 3-149
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, N61D, D79Y, M77G, K78S, T80R, S82T, R91G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, N61D, D79Y, M77G, K78S, T80R, S82T, R91G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.1M HEPES, 18% w/v PEG 3350, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.212 |
| 3ZTF X-ray Structure of the Cyan Fluorescent Protein mTurquoise2 (K206A mutant) 提交 2011-07-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
片段：RESIDUES 2-238
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.25；30 MG/ML PROTEIN, 19% PEG 8000, 100 MM MGCL2, 100 MM HEPES PH 7.25 .
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.177 |
| 4ANJ MYOSIN VI (MDinsert2-GFP fusion) PRE-POWERSTROKE STATE (MG.ADP.AlF4) 提交 2012-03-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
片段：MYOSIN-6 RESIDUES 1-817, GFP RESIDUES 2-238
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
5% PEG 8000, 50 MM MES PH 5.5, 100 MM NH4SO4, 20 MM MGCL2, 20 MM NACL AND 3 % PROPAN-2-OL
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.288 |
| 4AR7 X-ray structure of the cyan fluorescent protein mTurquoise 提交 2012-04-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；6 MG/ML PROTEIN, 15% PEG8000, 100 MM MGCL2, 100 MM HEPES PH 6.50
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.166 |
| 4AS8 X-ray structure of the cyan fluorescent protein Cerulean cryoprotected with ethylene glycol 提交 2012-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.25；13 MG/ML PROTEIN, 14% PEG8000, 100 MM MGCL2, 100 MM HEPES PH 7.25
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.132 |
| 4B5Y X-ray structure of the cyan fluorescent protein mTurquoise-GL (K206A mutant) in space group C222(1) 提交 2012-08-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；35 MG/ML PROTEIN, 14% PEG8000, 100 MM MGCL2, 100 MM HEPES PH 6.50
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.179 |
| 4BDU Bax BH3-in-Groove dimer (GFP) 提交 2012-10-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–230（230 aa）
片段：BAX RESIDUES 53-128
链 B
1–230（230 aa）
片段：BAX RESIDUES 53-128
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
10% PEG3350, 20% MPD, 0.5% CHAPS, 0.1 M TRIS PH 8.0
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.246 |
| 4BDU Bax BH3-in-Groove dimer (GFP) 提交 2012-10-08 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–230（230 aa）
片段：BAX RESIDUES 53-128
链 D
1–230（230 aa）
片段：BAX RESIDUES 53-128
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
10% PEG3350, 20% MPD, 0.5% CHAPS, 0.1 M TRIS PH 8.0
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.246 |
| 4EN1 The 1.62A structure of a FRET-optimized Cerulean Fluorescent Protein 提交 2012-04-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.7；298 K；mother liquor consisting of 0.08 M sodium acetate trihydrate, 0.16 M ammonium sulfate, 9% (w/v) PEG4000, and 19% (v/v) glycerol. Hanging drops contained 2 uL protein solution and 1 uL mother liquor, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.205 |
| 4EN1 The 1.62A structure of a FRET-optimized Cerulean Fluorescent Protein 提交 2012-04-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.7；298 K；mother liquor consisting of 0.08 M sodium acetate trihydrate, 0.16 M ammonium sulfate, 9% (w/v) PEG4000, and 19% (v/v) glycerol. Hanging drops contained 2 uL protein solution and 1 uL mother liquor, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.205 |
| 4EUL Crystal structure of enhanced Green Fluorescent Protein to 1.35A resolution reveals alternative conformations for Glu222 提交 2012-04-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES pH 6.5, 200 mM calcium acetate, 20% (w/v) PEG8000, 13% PEG200 for cryoprotection, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.169 |
| 4GES crystal structure of GFP-TYR151PYZ with an unnatural amino acid incorporation 提交 2012-08-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：P99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.9；289 K；60~100mg/ml protein sample in 50 mM Hepes, pH 7.5, reservior solution:16~19% PEG 3000, 100mM Tris pH 8.9,0.2M calcium acetate, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.188 |
| 4GF6 crystal structure of GFP with cuprum bound at the Incorporated metal Chelating Amino Acid PYZ151 提交 2012-08-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
4–238（235 aa）
|
突变：P99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.9；289 K；60~100mg/ml protein sample in 50 mM Hepes, pH 7.5, reservior solution:17~19% PEG 3000, 100mM Tris pH 8.9,0.2M calcium acetate , VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.179 |
| 4H47 1.9 angstrom CyPet structure at pH5.2 提交 2012-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：T9G, V11I, D19E, A87V, I167A, E172T, L194I 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；293 K；30% PEG 4000, 0.1M Sodium Acetate, 0.2M Lithium sulfate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.243 |
| 4H48 1.45 angstrom CyPet Structure at pH7.0 提交 2012-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：T9G, V11I, D19E, A87V, I167A, E172T, L194I 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；30% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl, 0.2M Lithium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.211 |
| 4IK1 High resolution structure of GCaMPJ at pH 8.5 提交 2012-12-25 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T, D362Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T, D362Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；Tris pH 8.5, (NH4)2SO4, 25% PEG 3350, 0.5% DDAO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.205 |
| 4IK3 High resolution structure of GCaMP3 at pH 8.5 提交 2012-12-25 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；Tris pH 8.5, (NH4)2SO4, 23% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.214 |
| 4IK4 High resolution structure of GCaMP3 at pH 5.0 提交 2012-12-25 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；289 K；Bis-Tris pH 5.0, (NH4)2SO4 and 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.212 |
| 4IK5 High resolution structure of Delta-REST-GCaMP3 提交 2012-12-25 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；Tris pH 8.5, NH4OAc, 23% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.228 |
| 4IK8 High resolution structure of GCaMP3 dimer form 1 at pH 7.5 提交 2012-12-25 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；HEPES pH 7.5, (NH4)2SO4, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.209 |
| 4IK9 High resolution structure of GCaMP3 dimer form 2 at pH 7.5 提交 2012-12-25 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；HEPES pH 7.5, (NH4)2SO4, 21% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.195 |
| 4J88 Dark-state structure of sfGFP containing the unnatural amino acid p-azido-phenylalanine at residue 66 提交 2013-02-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, Q80R, F99S, N105T, F145Y, M153T, V163A, A171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；278 K；10 mg/mL protein and 100 mM Tris-HCl, pH 8.3, 2.8 M (NH4)2SO4 (200+200 nanoL drop against 60 microL reservoir), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.228 |
| 4J88 Dark-state structure of sfGFP containing the unnatural amino acid p-azido-phenylalanine at residue 66 提交 2013-02-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, Q80R, F99S, N105T, F145Y, M153T, V163A, A171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；278 K；10 mg/mL protein and 100 mM Tris-HCl, pH 8.3, 2.8 M (NH4)2SO4 (200+200 nanoL drop against 60 microL reservoir), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.228 |
| 4J89 Different photochemical events of a genetically encoded aryl azide define and modulate GFP fluorescence 提交 2013-02-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, Q80R, F99S, N105T, F145Y, M153T, V163A, A171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；283 K；20 mg/mL protein and 100 mM Tris-HCl, 2.4 M (NH4)2SO4, 1+1 microL drop against 85 microL reservoir, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.242 |
| 4J89 Different photochemical events of a genetically encoded aryl azide define and modulate GFP fluorescence 提交 2013-02-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, Q80R, F99S, N105T, F145Y, M153T, V163A, A171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；283 K；20 mg/mL protein and 100 mM Tris-HCl, 2.4 M (NH4)2SO4, 1+1 microL drop against 85 microL reservoir, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.242 |
| 4J8A Irradiated-state structure of sfGFP containing the unnatural amino acid p-azido-phenylalanine at residue 145 提交 2013-02-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, Q80R, F99S, N105T, F145(HOX), M153T, V163A, A171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 30 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；278 K；10 mg/mL protein and 100 mM Tris-HCl, pH 8.3, 2 M (NH4)2SO4, 200+200 nanoL drop against 60 microL reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.165 |
| 4JFG Crystal structure of sfGFP-66-HqAla 提交 2013-02-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：S30R, Y39N, Q80R, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S30R, Y39N, Q80R, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HQY quinolin-8-ol × 2 CS CESIUM ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；15-20% polyethylene glycol (PEG) 3350, 0.13-0.18M CsCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.312 |
| 4JFG Crystal structure of sfGFP-66-HqAla 提交 2013-02-28 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：S30R, Y39N, Q80R, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S30R, Y39N, Q80R, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HQY quinolin-8-ol × 2 CS CESIUM ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；15-20% polyethylene glycol (PEG) 3350, 0.13-0.18M CsCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.312 |
| 4JFG Crystal structure of sfGFP-66-HqAla 提交 2013-02-28 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–238（238 aa）
链 G
1–238（238 aa）
|
突变：S30R, Y39N, Q80R, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S30R, Y39N, Q80R, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HQY quinolin-8-ol × 2 CS CESIUM ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；15-20% polyethylene glycol (PEG) 3350, 0.13-0.18M CsCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.312 |
| 4JFG Crystal structure of sfGFP-66-HqAla 提交 2013-02-28 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
1–238（238 aa）
链 H
1–238（238 aa）
|
突变：S30R, Y39N, Q80R, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S30R, Y39N, Q80R, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HQY quinolin-8-ol × 2 CS CESIUM ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；15-20% polyethylene glycol (PEG) 3350, 0.13-0.18M CsCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.312 |
| 4JRB Structure of Cockroach Allergen Bla g 1 Tandem Repeat as a EGFP fusion 提交 2013-03-21 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–229（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 PGT (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 1 D12 DODECANE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；100mM Tris, 10% propanol, 20% PEG4K, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.246 |
| 4KA9 Crystal structure analysis of single amino acid deletion mutations in EGFP 提交 2013-04-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L, S65T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NA SODIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；291 K；0.1 M HEPES, 0.01 M ZnCl2, 20% (w/v) PEG 6000, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 291K
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.210 |
| 4KAG Crystal structure analysis of a single amino acid deletion mutation in EGFP 提交 2013-04-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L, S65T, D190delta 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 SO4 SULFATE ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.1 M Na cacodylate, 0.2 M NaCl, 1M Na citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.161 |
| 4KEX Crystal structure analysis of a single amino acid deletion mutation in EGFP 提交 2013-04-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L, S65T, A227delta 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4；291 K；0.1 M MMT Buffer (Malic acid, MES and Tris), 25% (w/v) PEG 1500, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.209 |
| 4KW4 Crystal Structure of Green Fluorescent Protein 提交 2013-05-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S147H, S202H, Q204H, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 8.2；294 K；50 mM HEPES pH 8.2, 50 mM MgCl2, 22% PEG4000, hanging drop, temperature 294K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.204 |
| 4KW8 Crystal Structure of Green Fluorescent Protein 提交 2013-05-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S147H, S202H, Q204H, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 8.2；294 K；50 mM HEPES pH 8.2, 50 mM MgCl2, 22% PEG4000, hanging drop, temperature 294K
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.225 |
| 4KW9 Crystal Structure of Green Fluorescent Protein 提交 2013-05-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S147H, S202H, Q204H, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 5 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 8.2；294 K；50 mM HEPES pH 8.2, 50 mM MgCl2, 22% PEG4000, hanging drop, temperature 294K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.210 |
| 4L12 Crystal structure of EGFP-based Calcium Sensor CatchER complexed with Gd 提交 2013-06-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–230（229 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：F64L, S65T, S147E, M153T, V163A, S202D, Q204E, F223E, T225E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GD GADOLINIUM ATOM × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；51 mM HEPES, pH 7.0, 1 mM beta-mercaptoethanol, 50 mM sodium acetate, 17% PEG4000, 2 mM gadolinium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.220 |
| 4L13 Crystal structure of Ligand Free EGFP-based Calcium Sensor CatchER 提交 2013-06-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–230（229 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：F64L, S65T, S147E, M153T, V163A, S202D, Q204E, F223E, T225E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ACY ACETIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；51 mM HEPES, pH 7.0, 1 mM beta-mercaptoethanol, 50 mM sodium acetate, 17% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.203 |
| 4L1I Crystal structure of EGFP-based Calcium Sensor CatchER complexed with Ca 提交 2013-06-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–230（229 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：F64L, S65T, S147E, M153T, V163A, S202D, Q204E, F223E, T225E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.9 mM protein, 53 mM HEPES, pH 7.0, 1 mM beta-mercaptoethanol, 50 mM sodium acetate, 16% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.191 |
| 4LQT 1.10A resolution crystal structure of a superfolder green fluorescent protein (W57A) mutant 提交 2013-07-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, W57A, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；40% (v/v) Isopropanol, 0.1 M Imidazole acid, 15% (w/v) PEG 8000, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.146 |
| 4LQU 1.60A resolution crystal structure of a superfolder green fluorescent protein (W57G) mutant 提交 2013-07-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, W57G, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；25% (v/v) PEG 3350, 0.1 M bis-tris, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.182 |
| 4LQU 1.60A resolution crystal structure of a superfolder green fluorescent protein (W57G) mutant 提交 2013-07-19 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, W57G, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；25% (v/v) PEG 3350, 0.1 M bis-tris, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.182 |
| 4LQU 1.60A resolution crystal structure of a superfolder green fluorescent protein (W57G) mutant 提交 2013-07-19 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, W57G, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；25% (v/v) PEG 3350, 0.1 M bis-tris, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.182 |
| 4LQU 1.60A resolution crystal structure of a superfolder green fluorescent protein (W57G) mutant 提交 2013-07-19 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, W57G, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；25% (v/v) PEG 3350, 0.1 M bis-tris, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.182 |
| 4LW5 Crystal structure of all-trans green fluorescent protein 提交 2013-07-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：yes 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 20% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.281 |
| 4LW5 Crystal structure of all-trans green fluorescent protein 提交 2013-07-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：yes 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 20% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.281 |
| 4LW5 Crystal structure of all-trans green fluorescent protein 提交 2013-07-26 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2–238（237 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：yes 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 20% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.281 |
| 4LW5 Crystal structure of all-trans green fluorescent protein 提交 2013-07-26 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
2–238（237 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：yes 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 20% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.281 |
| 4LW5 Crystal structure of all-trans green fluorescent protein 提交 2013-07-26 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
2–238（237 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：yes 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 20% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.281 |
| 4N3D Crystal structure of the dimeric variant EGFP-K162Q in P61 space group 提交 2013-10-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–232（232 aa）
|
突变：K162Q, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PO4 PHOSPHATE ION × 2 K POTASSIUM ION × 3 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Two microliters of protein 10mg/ml in buffer 20 Tris 8.0 100 NaCl mixed with equal amount of resevoir solution - 0.056 NaH2PO4, 1.344 M K2HPO4 pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.194 |
| 4N3D Crystal structure of the dimeric variant EGFP-K162Q in P61 space group 提交 2013-10-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–232（232 aa）
|
突变：K162Q, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Two microliters of protein 10mg/ml in buffer 20 Tris 8.0 100 NaCl mixed with equal amount of resevoir solution - 0.056 NaH2PO4, 1.344 M K2HPO4 pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.194 |
| 4OGS Crystal structure of GFP S205A/T203V at 2.2 A resolution 提交 2014-01-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S205A, T203V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；298 K；Crystals were produced using 1 uL protein (26 mg/ml in 0.1 M imidazole, pH 7.8) mixed with 1 uL well solution, Crystallization screens varied from 22% to 32% (w:v) polyethylene glycol monomethyl ether (PEG) 2000 and 0.05M to 0.2M KBr at room temperature, for a range of pH values near neutrality, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.306 |
| 4OGS Crystal structure of GFP S205A/T203V at 2.2 A resolution 提交 2014-01-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：S205A, T203V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；298 K；Crystals were produced using 1 uL protein (26 mg/ml in 0.1 M imidazole, pH 7.8) mixed with 1 uL well solution, Crystallization screens varied from 22% to 32% (w:v) polyethylene glycol monomethyl ether (PEG) 2000 and 0.05M to 0.2M KBr at room temperature, for a range of pH values near neutrality, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.306 |
| 4ORN Blue Fluorescent Protein mKalama1 提交 2014-02-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：several 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.01 M cobalt chloride, 0.1 M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.183 |
| 4ORN Blue Fluorescent Protein mKalama1 提交 2014-02-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
突变：several 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；1.8 M ammonium sulfate, 0.01 M cobalt chloride, 0.1 M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.183 |
| 4P1Q GREEN FLUORESCENT PROTEIN E222H VARIANT 提交 2014-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–231（229 aa）
|
突变：E222H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Na-acetate, PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.172 |
| 4P7H Structure of Human beta-Cardiac Myosin Motor Domain::GFP chimera 提交 2014-03-27 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5–238（234 aa）
片段：UNP P12883 residues 1-787,UNP P42212 residues 5-238
|
突变：Q80R, K101N, V163A, I167T, S175G, D190N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；10% Tacsimate, pH 6.0, 10% glycerol, 14-15% PEG 3350, 0.2 mM MgCL2, and 5 mM TCEP
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 4P7H Structure of Human beta-Cardiac Myosin Motor Domain::GFP chimera 提交 2014-03-27 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5–238（234 aa）
片段：UNP P12883 residues 1-787,UNP P42212 residues 5-238
|
突变：Q80R, K101N, V163A, I167T, S175G, D190N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；10% Tacsimate, pH 6.0, 10% glycerol, 14-15% PEG 3350, 0.2 mM MgCL2, and 5 mM TCEP
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.284 |
| 4PA0 Omecamtiv Mercarbil binding site on the Human Beta-Cardiac Myosin Motor Domain 提交 2014-04-06 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5–234（230 aa）
片段：UNP P12883 residues 1-787, UNP P42212 residues 5-234
|
突变：Q80R, V163A, I167T, S175G, D190N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 2OW methyl 4-(2-fluoro-3-{[(6-methylpyridin-3-yl)carbamoyl]amino}benzyl)piperazine-1-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；Tacsimate, pH 6.0, PEG 3350, glycerol, MgCL2, TCEP and ligand, omecamptiv mercarbil
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.246 |
| 4PA0 Omecamtiv Mercarbil binding site on the Human Beta-Cardiac Myosin Motor Domain 提交 2014-04-06 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5–234（230 aa）
片段：UNP P12883 residues 1-787, UNP P42212 residues 5-234
|
突变：Q80R, V163A, I167T, S175G, D190N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 2OW methyl 4-(2-fluoro-3-{[(6-methylpyridin-3-yl)carbamoyl]amino}benzyl)piperazine-1-carboxylate × 1 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；Tacsimate, pH 6.0, PEG 3350, glycerol, MgCL2, TCEP and ligand, omecamptiv mercarbil
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.246 |
| 4PFE Crystal structure of vsfGFP-0 提交 2014-04-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–229（228 aa）
链 B
2–229（228 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1M Sodium acetate pH 4.6 30 %(v/v) PEG 400, 20mM Hepes pH 7.5, 150mM NaCl
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.255 |
| 4U2V Bak BH3-in-Groove dimer (GFP) 提交 2014-07-18 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–230（230 aa）
片段：UNP P42212 residues 1-230, UNP Q16611 residues 68-148
链 C
1–230（230 aa）
片段：UNP P42212 residues 1-230, UNP Q16611 residues 68-148
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CAC CACODYLATE ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；4.5% PEG 8000, 40% MPD, 100 mM tri-sodium citrate, 90 mM cacodylate acid pH 6.5 and 1% Octyl glucoside
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.250 |
| 4U2V Bak BH3-in-Groove dimer (GFP) 提交 2014-07-18 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–230（230 aa）
片段：UNP P42212 residues 1-230, UNP Q16611 residues 68-148
链 D
1–230（230 aa）
片段：UNP P42212 residues 1-230, UNP Q16611 residues 68-148
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CAC CACODYLATE ION × 5 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；4.5% PEG 8000, 40% MPD, 100 mM tri-sodium citrate, 90 mM cacodylate acid pH 6.5 and 1% Octyl glucoside
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.250 |
| 4XBI Structure Of A Malarial Protein Involved in Proteostasis 提交 2014-12-17 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–230（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；2 M ammonium sulphate
100 mM Hepes pH=7
protein at 13-15 mg/ml
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.202 |
| 4XBI Structure Of A Malarial Protein Involved in Proteostasis 提交 2014-12-17 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–230（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；2 M ammonium sulphate
100 mM Hepes pH=7
protein at 13-15 mg/ml
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.202 |
| 4XGY GFP based antibody (fluorobody) 提交 2015-01-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–173（172 aa）
链 A
174–238（65 aa）
|
突变：R30S,N39Y,L64F,R80Q,S99F,T105N,F145Y,T153M,A163V,V219A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R30S,N39Y,L64F,R80Q,S99F,T105N,F145Y,T153M,A163V,V219A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PE5 3,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；40% PEG400, 0.1M Hepes, pH 7.0
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.167 |
| 4XL5 X-ray structure of bGFP-A / EGFP complex 提交 2015-01-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05M MgAc, 0.1M NaAc, 5%-15% PEG 8K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.268 |
| 4XOV Structure of rsGreen0.7 in the green-off-state 提交 2015-01-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；289 K；0.15 M NaBr, 30% PEG 2000 MME
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.168 |
| 4XOW Structure of rsGreen0.7 in the green-on-state 提交 2015-01-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；289 K；0.1 M Tris pH 8.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.165 |
| 4XVP X-ray structure of bGFP-C / EGFP complex 提交 2015-01-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65T, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；293 K；50 mM tricine pH 6.9, 25% PEG4K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.292 |
| 4XVP X-ray structure of bGFP-C / EGFP complex 提交 2015-01-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65T, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；293 K；50 mM tricine pH 6.9, 25% PEG4K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.292 |
| 4XVP X-ray structure of bGFP-C / EGFP complex 提交 2015-01-27 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65T, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；293 K；50 mM tricine pH 6.9, 25% PEG4K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.292 |
| 4Z4K Crystal structure of GFP-TAX1BP1 UBZ1+2 domain fusion protein 提交 2015-04-02 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–230（230 aa）
片段：UBZ1 and UBZ2
链 B
1–230（230 aa）
片段：UBZ1 and UBZ2
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v PEG 3350.
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.280 |
| 4Z4M Crystal structure of GFP-TAX1BP1 UBZ2 domain fusion protein 提交 2015-04-02 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–230（230 aa）
片段：UBZ2
链 B
1–230（230 aa）
片段：UBZ2
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；293 K；0.2 M Ammonium fluoride, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.298 |
| 4ZF3 Crystal structure of Green Fluorescent Protein (GFP); S65T, H148D; circular permutant ( 50-51) 提交 2015-04-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
51–237（187 aa）
链 A
4–50（47 aa）
|
突变：S30R, Y39I, C48S, F64L, S65T, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128Y, Y145F, H148D, M153T, K156N, V163A, K166T, I167V, I171V, S205T, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S30R, Y39I, C48S, F64L, S65T, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128Y, Y145F, H148D, M153T, K156N, V163A, K166T, I167V, I171V, S205T, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；50 mM sodium acetate, 100 mM NaCl, 5% (wt/vol) PEG 3550
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.261 |
| 4ZF3 Crystal structure of Green Fluorescent Protein (GFP); S65T, H148D; circular permutant ( 50-51) 提交 2015-04-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
51–237（187 aa）
链 B
4–50（47 aa）
|
突变：S30R, Y39I, C48S, F64L, S65T, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128Y, Y145F, H148D, M153T, K156N, V163A, K166T, I167V, I171V, S205T, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S30R, Y39I, C48S, F64L, S65T, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128Y, Y145F, H148D, M153T, K156N, V163A, K166T, I167V, I171V, S205T, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；50 mM sodium acetate, 100 mM NaCl, 5% (wt/vol) PEG 3550
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.261 |
| 4ZF4 Crystal structure of Green Fluorescent Protein (GFP); S65T, Y66(Cl1Y), H148D; circular permutant (50-51) 提交 2015-04-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
51–237（187 aa）
链 A
4–50（47 aa）
|
突变：S30R, Y39I, C48S, F64L, S65T, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, H148D, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, S205T, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S30R, Y39I, C48S, F64L, S65T, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, H148D, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, S205T, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；50 mM sodium acetate, 100 mM NaCl, 15% (wt/vol) PEG 3550
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.246 |
| 4ZF4 Crystal structure of Green Fluorescent Protein (GFP); S65T, Y66(Cl1Y), H148D; circular permutant (50-51) 提交 2015-04-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
51–237（187 aa）
链 B
4–50（47 aa）
|
突变：S30R, Y39I, C48S, F64L, S65T, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, H148D, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, S205T, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S30R, Y39I, C48S, F64L, S65T, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, H148D, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, S205T, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；50 mM sodium acetate, 100 mM NaCl, 15% (wt/vol) PEG 3550
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.246 |
| 4ZF5 Crystal structure of Green Fluorescent Protein (GFP); S65T, Y66(Cl2Y), H148D; circular permutant ( 50-51) 提交 2015-04-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
51–237（187 aa）
链 A
4–50（47 aa）
|
突变：S30R, Y39I, C48S, F64L, S65T, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, H148D, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, S205T, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S30R, Y39I, C48S, F64L, S65T, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, H148D, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, S205T, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；50 mM sodium acetate, 100 mM NaCl, 5% (wt/vol) PEG 3550
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.232 |
| 4ZF5 Crystal structure of Green Fluorescent Protein (GFP); S65T, Y66(Cl2Y), H148D; circular permutant ( 50-51) 提交 2015-04-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
51–237（187 aa）
链 B
4–50（47 aa）
|
突变：S30R, Y39I, C48S, F64L, S65T, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, H148D, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, S205T, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S30R, Y39I, C48S, F64L, S65T, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, H148D, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, S205T, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；50 mM sodium acetate, 100 mM NaCl, 5% (wt/vol) PEG 3550
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.232 |
| 5AQB DARPin-based Crystallization Chaperones exploit Molecular Geometry as a Screening Dimension in Protein Crystallography 提交 2015-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–231（230 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；PEG3350 20.0% W/V, SODIUM FORMATE 0.2 M, BIS TRIS PROPANE 0.1 M, PH 8
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.177 |
| 5BKF Cyro-EM structure of human Glycine Receptor alpha2-beta heteromer, Glycine bound, desensitized state 提交 2021-03-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
2–238（237 aa）
|
突变：four substitutions in the GFP portion | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 GLY GLYCINE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 5BKG Cyro-EM structure of human Glycine Receptor alpha2-beta heteromer, glycine bound, (semi)open state 提交 2021-03-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
2–238（237 aa）
|
突变：four substitutions in the GFP | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 GLY GLYCINE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 5DTX Crystal structure of rsEGFP2 in the fluorescent on-state 提交 2015-09-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；293 K；0.1 M HEPES, 1.7 M ammonium sulphate
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.206 |
| 5DTY Crystal structure of rsEGFP2 in the non-fluorescent off-state 提交 2015-09-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；293 K；0.1 M HEPES, 1.7 M ammonium sulphate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.224 |
| 5DTZ Crystal structure of rsFolder in the fluorescent on-state 提交 2015-09-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 20% PEG3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.202 |
| 5DTZ Crystal structure of rsFolder in the fluorescent on-state 提交 2015-09-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 20% PEG3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.202 |
| 5DTZ Crystal structure of rsFolder in the fluorescent on-state 提交 2015-09-18 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 20% PEG3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.202 |
| 5DTZ Crystal structure of rsFolder in the fluorescent on-state 提交 2015-09-18 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 20% PEG3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.202 |
| 5DU0 Crystal structure of rsFolder in the non-fluorescent off-state 提交 2015-09-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 20% PEG3350
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.257 |
| 5DU0 Crystal structure of rsFolder in the non-fluorescent off-state 提交 2015-09-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 20% PEG3350
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.257 |
| 5DU0 Crystal structure of rsFolder in the non-fluorescent off-state 提交 2015-09-18 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 20% PEG3350
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.257 |
| 5DU0 Crystal structure of rsFolder in the non-fluorescent off-state 提交 2015-09-18 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 20% PEG3350
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.257 |
| 5F9G pnGFP1.5-Y.Cro: circularly permuted green fluorescent protein (with a tyrosine-derived chromophore) 提交 2015-12-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
145–238（94 aa）
片段：UNP residues 145-238, UNP residues 2-144
链 A
2–144（143 aa）
片段：UNP residues 145-238, UNP residues 2-144
|
突变：circular permutation,circular permutation 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：circular permutation,circular permutation 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；pnGFP1.5-Y.Cro in buffer 50mM Hepes pH 7.5, 0.3M NaCl, 1mM beta-mercaptoethanol, A280=52; Crystals were grown in drops of 1ul protein solution: 1ul well solution containing 20-22% PEG 3350, 0.25M potassium thiocyanate, 0.1M Tris pH 8.0
|
分辨率 2.77 Å R-free 0.295 |
| 5FGU Structure of Sda1 nuclease apoprotein as an EGFP fixed-arm fusion 提交 2015-12-21 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–229（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 ACT ACETATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；Crystals were grown by mixing 0.25uL of protein (13.3mg/mL) with 0.25uL mother liquor (45mM Na cacodylate pH 6, 13.5mM magnesium sulfate, 1.53M ammonium sulfate), using sitting drop vapor diffusion
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 5FGU Structure of Sda1 nuclease apoprotein as an EGFP fixed-arm fusion 提交 2015-12-21 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–229（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 12 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 ACT ACETATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；Crystals were grown by mixing 0.25uL of protein (13.3mg/mL) with 0.25uL mother liquor (45mM Na cacodylate pH 6, 13.5mM magnesium sulfate, 1.53M ammonium sulfate), using sitting drop vapor diffusion
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 5FJI Three-dimensional structures of two heavily N-glycosylated Aspergillus sp. Family GH3 beta-D-glucosidases 提交 2015-10-09 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
20–863（844 aa）
片段：MATURE PEPTIDE COMPRISING RESIDUES 20-863
链 B
20–863（844 aa）
片段：MATURE PEPTIDE COMPRISING RESIDUES 20-863
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 39 IMD IMIDAZOLE × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.1M MIB (PACT SCREEN BUFFER)PH 5.0, 21 % PEG 1500, 25 % ETHYLENE GLYCOL
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.174 |
| 5HBD Filamentous Assembly of Green Fluorescent Protein Supported by a C-terminal fusion of 18-residues, viewed in space group C2 提交 2015-12-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65A, V68L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1M sodium citrate, 10% MPD, 0.1M HEPES, pH 7.5
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.205 |
| 5HGE Filamentous Assembly of Green Fluorescent Protein Supported by a C-terminal fusion of 18-residues, viewed in space group P212121 提交 2016-01-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：The biological unit is a filament with 2 sub 1 screw symmetry. One filament is composed of chain A and the following symmetry operators 1/2+X,1/2-Y,-Z; -1+X,Y,Z; -1/2+X,1/2-Y,-Z; 1+X,Y,Z; 3/2+X,1/2-Y,-Z; 2+X,Y,Z; etc.（100） 待复核 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65A, V68L and S72A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；30% MPD, 20% ethanol, 20 mM HEPES, pH 7.5, 10 mM NaCl
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.211 |
| 5HW9 Filamentous Assembly of Green Fluorescent Protein Supported by a C-terminal fusion of 18-residues, viewed in space group P21 提交 2016-01-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65A, V68L, S72A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；10% 1,6-hexanediol, sodium cacodylate pH 6.5, 5 mM magnesium chloride, 200 mM KCl
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.232 |
| 5HZO GFP mutant S205G 提交 2016-02-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–235（235 aa）
片段：UNP residues 1-235
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MLT D-MALATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；295 K；1.0 M malate, pH 8.0, Tris, 0.3 M NaCl, 1% n-nonyl-beta-D maltoside
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.276 |
| 5HZO GFP mutant S205G 提交 2016-02-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–235（235 aa）
片段：UNP residues 1-235
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MLT D-MALATE × 1 UMQ UNDECYL-MALTOSIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；295 K；1.0 M malate, pH 8.0, Tris, 0.3 M NaCl, 1% n-nonyl-beta-D maltoside
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.276 |
| 5J2O Crystal structure of the cyan fluorescence protein Cerulean S175G mutant 提交 2016-03-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F65L/Y145A/N146I/H148D/M153T/V163A/S175G/H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；16% PEG 8000, 0.1M MGCL2, 0.1M HEPES PH 7.5
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.188 |
| 5J3N C-terminal domain of EcoR124I HsdR subunit fused with the pH-sensitive GFP variant ratiometric pHluorin 提交 2016-03-31 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
片段：UNP Residues 2-238, 887-1038
链 B
2–238（237 aa）
片段：UNP Residues 2-238, 887-1038
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2 M KH2PO4, 4% v/v acetone
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.254 |
| 5J3N C-terminal domain of EcoR124I HsdR subunit fused with the pH-sensitive GFP variant ratiometric pHluorin 提交 2016-03-31 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
片段：UNP Residues 2-238, 887-1038
链 B
2–238（237 aa）
片段：UNP Residues 2-238, 887-1038
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2 M KH2PO4, 4% v/v acetone
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.254 |
| 5KTG Crystal structure of mouse Bak BH3-in-groove homodimer (GFP) 提交 2016-07-11 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–230（230 aa）
片段：GFP, GS linker, BAK (UNP residues 66-144)
链 B
1–230（230 aa）
片段：GFP, GS linker, BAK (UNP residues 66-144)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；7-12% PEG3350, 20% MPD, 100 mM Tris, pH 7.0-8.5, 0.5% CHAPS
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.275 |
| 5KTG Crystal structure of mouse Bak BH3-in-groove homodimer (GFP) 提交 2016-07-11 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–230（230 aa）
片段：GFP, GS linker, BAK (UNP residues 66-144)
链 B
1–230（230 aa）
片段：GFP, GS linker, BAK (UNP residues 66-144)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；7-12% PEG3350, 20% MPD, 100 mM Tris, pH 7.0-8.5, 0.5% CHAPS
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.275 |
| 5LEL Crystal structure of DARPin-DARPin rigid fusion, variant DD_Off7_10_3G124 in complex with Maltose-binding Protein and Green Fluorescent Protein 提交 2016-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350 23.2% w/v, Sodium acetate 0.2 M, Bis-Tris propane 0.1 M, pH 8.0
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.306 |
| 5LEL Crystal structure of DARPin-DARPin rigid fusion, variant DD_Off7_10_3G124 in complex with Maltose-binding Protein and Green Fluorescent Protein 提交 2016-06-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350 23.2% w/v, Sodium acetate 0.2 M, Bis-Tris propane 0.1 M, pH 8.0
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.306 |
| 5LEL Crystal structure of DARPin-DARPin rigid fusion, variant DD_Off7_10_3G124 in complex with Maltose-binding Protein and Green Fluorescent Protein 提交 2016-06-30 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350 23.2% w/v, Sodium acetate 0.2 M, Bis-Tris propane 0.1 M, pH 8.0
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.306 |
| 5LEM Crystal structure of DARPin-DARPin rigid fusion, variant DD_Off7_11_3G124 in complex with Maltose-binding Protein and Green Fluorescent Protein 提交 2016-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；PEG6000 20% w/v, TAPS 0.02 M, pH 9.0
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.295 |
| 5MA3 GFP-binding DARPin fusion gc_R11 提交 2016-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Sodium Acetate, 0.1 M Sodium Cacodylate pH 6.5, 30% w/v PEG 8000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.192 |
| 5MA4 GFP-binding DARPin fusion gc_K7 提交 2016-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M Sodium Acetate trihydrate, 0.1M TRIS HCl pH 8.5, 30%w/v PEG 4000
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.170 |
| 5MA5 GFP-binding DARPin fusion gc_K11 提交 2016-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CIT CITRIC ACID × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M tri Sodium citrate pH 5.6, 20% v/v 2-Propanol, 20%w/v PEG 4000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.184 |
| 5MA5 GFP-binding DARPin fusion gc_K11 提交 2016-11-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CIT CITRIC ACID × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M tri Sodium citrate pH 5.6, 20% v/v 2-Propanol, 20%w/v PEG 4000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.184 |
| 5MA6 GFP-binding DARPin 3G124nc 提交 2016-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PO4 PHOSPHATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M Na-Acetate pH 5.5, 0.5M KH2PO4
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.241 |
| 5MA8 GFP-binding DARPin 3G124nc 提交 2016-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M Sodium Acetate. 0.1M TRIS (HOAc) pH 7.5, 25% PEG 2K MME
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.236 |
| 5MA8 GFP-binding DARPin 3G124nc 提交 2016-11-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.3 M Sodium Acetate. 0.1M TRIS (HOAc) pH 7.5, 25% PEG 2K MME
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.236 |
| 5MA9 GFP-binding DARPin fusion gc_R11 提交 2016-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M TRIS pH 8.5, 30% w/v PEG 4000, 0.2 M LiSO4
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.203 |
| 5MA9 GFP-binding DARPin fusion gc_R11 提交 2016-11-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M TRIS pH 8.5, 30% w/v PEG 4000, 0.2 M LiSO4
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.203 |
| 5MA9 GFP-binding DARPin fusion gc_R11 提交 2016-11-03 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M TRIS pH 8.5, 30% w/v PEG 4000, 0.2 M LiSO4
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.203 |
| 5MA9 GFP-binding DARPin fusion gc_R11 提交 2016-11-03 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M TRIS pH 8.5, 30% w/v PEG 4000, 0.2 M LiSO4
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.203 |
| 5MAD GFP-binding DARPin 3G61 提交 2016-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Sodium citrate tribasic, pH 5.5, 30% PEG 4000, 0.2 M Ammonium acetate
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.199 |
| 5MAD GFP-binding DARPin 3G61 提交 2016-11-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Sodium citrate tribasic, pH 5.5, 30% PEG 4000, 0.2 M Ammonium acetate
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.199 |
| 5MAD GFP-binding DARPin 3G61 提交 2016-11-03 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Sodium citrate tribasic, pH 5.5, 30% PEG 4000, 0.2 M Ammonium acetate
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.199 |
| 5MAD GFP-binding DARPin 3G61 提交 2016-11-03 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Sodium citrate tribasic, pH 5.5, 30% PEG 4000, 0.2 M Ammonium acetate
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.199 |
| 5MAK GFP-binding DARPin fusion gc_R7 提交 2016-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CIT CITRIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M Tri Sodium Citrate pH 5.6, 20% v/v 2-Propanol, 20%w/v PEG 4000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.304 |
| 5MAK GFP-binding DARPin fusion gc_R7 提交 2016-11-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CIT CITRIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M Tri Sodium Citrate pH 5.6, 20% v/v 2-Propanol, 20%w/v PEG 4000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.304 |
| 5MSE GFP nuclear transport receptor mimic 3B8 提交 2017-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 8 IMD IMIDAZOLE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；293 K；5-9% PEG8000, 28% glycerol, 100?mM Imidazole (pH 7.1)
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.206 |
| 5N9O EGFP(enhanced green fluorescent protein) mutant - L232H 提交 2017-02-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：L232H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | AE4 3,6,9,12,15-PENTAOXAHEPTADECAN-1-OL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；288 K；2-propanol ,
MES monohydrate,
PEG 2000
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.211 |
| 5O89 Crystal Structure of rsEGFP2 in the fluorescent on-state determined by SFX 提交 2017-06-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8；293 K；2 M ammonium sulphate, 20 mM NaCl, 120 mM HEPES
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.195 |
| 5O8A Crystal Structure of rsEGFP2 in the non-fluorescent off-state determined by SFX 提交 2017-06-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8；293 K；2 M ammonium sulphate, 20 mM NaCl, 120 mM HEPES
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.184 |
| 5O8B Difference-refined excited-state structure of rsEGFP2 1ps following 400nm-laser irradiation of the off-state. 提交 2017-06-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8；293 K；2 M ammonium sulphate, 20 mM NaCl, 120 mM HEPES
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.311 |
| 5O8C Composite structure of rsEGFP2 1ps following 400nm-laser irradiation of the off-state. 提交 2017-06-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8；293 K；2 M ammonium sulphate, 20 mM NaCl, 120 mM HEPES
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.176 |
| 5OX8 Structure of Enhanced Cyan Fluorescent Protein at pH 5.0 提交 2017-09-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65T, Y66W, N146I, M153T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；100mM citric acid pH 5.0, 12% PEG8000, 100mM MgCl2
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.166 |
| 5OX9 Structure of the Cyan Fluorescent Protein SCFP3A at pH 4.5 提交 2017-09-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65T, Y66W, S72A, N146I, H148D, M153T, V163A, S175G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；100mM citric acid pH4.5, 16% PEG8000, 100mM MgCl2
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.172 |
| 5OXA Structure of the S205A mutant of the Cyan Fluorescent Protein Cerulean at pH 7.0 提交 2017-09-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65T, Y66W, N146I, H148D, M153T, S205A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100mM HEPES buffer pH 7.0, 12% PEG8000, 100mM MgCl2
|
分辨率 1.16 Å R-free 0.139 |
| 5OXB Structure of blue-light irradiated Cerulean 提交 2017-09-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65T, Y66W, N146I, H148D, M153T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100mM HEPES pH 7.0, 12% PEG8000, 100mM MgCl2
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.157 |
| 5OXC Structure of Cerulean Fluorescent Protein at 1.02 Angstrom resolution 提交 2017-09-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L, S65T, Y66W, N146I, H148D, M153T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100mM HEPES 7.0, 12% PEG8000, 100mM MgCl2
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.115 |
| 5T3I cyan fluorescence protein soaked with selenourea for 5 min 提交 2016-08-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SEY selenourea × 13 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；16% (w/v) PEG 3350, 50 mM citric acid, and 50 mM bis-tris propane buffer pH 5.0.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.177 |
| 5WJ2 Crystal structure of the green fluorescent protein Clover 提交 2017-07-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, S66X, Y66X, G66X, Q69A, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V, and T203H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；100mM Tris, pH 8.5, 50mM MgCl2, 25% PEG3350
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.217 |
| 5WJ2 Crystal structure of the green fluorescent protein Clover 提交 2017-07-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, S66X, Y66X, G66X, Q69A, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V, and T203H 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；100mM Tris, pH 8.5, 50mM MgCl2, 25% PEG3350
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.217 |
| 5WJ3 Crystal structure of green fluorescent protein Clover mutant S147C/Q204C 提交 2017-07-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
突变：S30R, Y39N, Q69A, F99S, N105T, Y145F, S147C, M153T, V163A, T203H, Q204C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；100mM Tris, pH 8.5, 50mM MgCl2, 25% PEG3350
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.162 |
| 5WJ3 Crystal structure of green fluorescent protein Clover mutant S147C/Q204C 提交 2017-07-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
|
突变：S30R, Y39N, Q69A, F99S, N105T, Y145F, S147C, M153T, V163A, T203H, Q204C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；100mM Tris, pH 8.5, 50mM MgCl2, 25% PEG3350
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.162 |
| 5WJ4 Crystal structure of redox-sensitive green fluorescent protein Clover mutant roClover1 提交 2017-07-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, S65X, Y65X, G65X, Q69A, F99S, N105T, Y145F, S147C, H148D, M153T, V163A, I171V, T203V, Q204C, E222Q. 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；100mM Tris, pH 8.5, 50mM MgCl2, 25% PEG3350
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.193 |
| 5WJ4 Crystal structure of redox-sensitive green fluorescent protein Clover mutant roClover1 提交 2017-07-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, S65X, Y65X, G65X, Q69A, F99S, N105T, Y145F, S147C, H148D, M153T, V163A, I171V, T203V, Q204C, E222Q. 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；100mM Tris, pH 8.5, 50mM MgCl2, 25% PEG3350
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.193 |
| 6AA2 X-ray structure of ReQy1 (oxidized form) 提交 2018-07-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：K26R, F46L, T65G, S72A, R80Q, S99F, Y145G, N146W, S147CA, V150I, T167I, T203Y, Q204C, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50mM Tris-HCl(pH 7.5), 150mM NaCl, 250mM Trilithium Citrate, 14%(w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.229 |
| 6AA2 X-ray structure of ReQy1 (oxidized form) 提交 2018-07-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
突变：K26R, F46L, T65G, S72A, R80Q, S99F, Y145G, N146W, S147CA, V150I, T167I, T203Y, Q204C, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50mM Tris-HCl(pH 7.5), 150mM NaCl, 250mM Trilithium Citrate, 14%(w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.229 |
| 6AA2 X-ray structure of ReQy1 (oxidized form) 提交 2018-07-17 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2–238（237 aa）
|
突变：K26R, F46L, T65G, S72A, R80Q, S99F, Y145G, N146W, S147CA, V150I, T167I, T203Y, Q204C, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50mM Tris-HCl(pH 7.5), 150mM NaCl, 250mM Trilithium Citrate, 14%(w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.229 |
| 6AA6 X-ray structure of ReQy1 (reduced form) 提交 2018-07-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：K26R, F46L, T65G, S72A, R80Q, S99F, Y145G, N146W, S147SA, V150I, T167I, T203Y, Q204C, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50mM Tris-HCl(pH7.0), 150mM NaCl, 20%(w/v) PEG3350
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.247 |
| 6AA6 X-ray structure of ReQy1 (reduced form) 提交 2018-07-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
突变：K26R, F46L, T65G, S72A, R80Q, S99F, Y145G, N146W, S147SA, V150I, T167I, T203Y, Q204C, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50mM Tris-HCl(pH7.0), 150mM NaCl, 20%(w/v) PEG3350
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.247 |
| 6AS9 Filamentous Assembly of Green Fluorescent Protein Supported by a C-terminal fusion of 18-residues, viewed in space group P212121 form 2 提交 2017-08-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ACT ACETATE ION × 10 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；0.1 M sodium acetate, pH 5.0 and 65% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.183 |
| 6B7R Truncated strand 11-less green fluorescent protein 提交 2017-10-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–214（213 aa）
|
突变：S30R, Y39I, C48S, F64L, S66X, Y66X, G66X, C70A, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M CHES pH 9.5, 1.0M trisodium citrate
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.184 |
| 6B7R Truncated strand 11-less green fluorescent protein 提交 2017-10-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–214（213 aa）
|
突变：S30R, Y39I, C48S, F64L, S66X, Y66X, G66X, C70A, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M CHES pH 9.5, 1.0M trisodium citrate
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.184 |
| 6B7T Truncated strand 10-less green fluorescent protein 提交 2017-10-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
214–237（24 aa）
链 A
3–194（192 aa）
|
突变：;K3Q, S30R, Y39I, C48S, F64L, S66X, Y66X, G66X, C70A, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, L221H, F223Y, T225N,K3Q, S30R, Y39I, C48S, F64L, S66X, Y66X, G66X, C70A, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, L221H, F223Y, T225N ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：;K3Q, S30R, Y39I, C48S, F64L, S66X, Y66X, G66X, C70A, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, L221H, F223Y, T225N,K3Q, S30R, Y39I, C48S, F64L, S66X, Y66X, G66X, C70A, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, L221H, F223Y, T225N ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES pH 7.0, 0.2M ammonium chloride, 22.5 v/v% PEG 6000
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.209 |
| 6B7T Truncated strand 10-less green fluorescent protein 提交 2017-10-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
214–237（24 aa）
链 B
3–194（192 aa）
|
突变：;K3Q, S30R, Y39I, C48S, F64L, S66X, Y66X, G66X, C70A, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, L221H, F223Y, T225N,K3Q, S30R, Y39I, C48S, F64L, S66X, Y66X, G66X, C70A, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, L221H, F223Y, T225N ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：;K3Q, S30R, Y39I, C48S, F64L, S66X, Y66X, G66X, C70A, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, L221H, F223Y, T225N,K3Q, S30R, Y39I, C48S, F64L, S66X, Y66X, G66X, C70A, Q80R, F99S, N105K, E111V, I128T, Y145F, M153T, V163A, K166T, I167V, I171V, L221H, F223Y, T225N ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES pH 7.0, 0.2M ammonium chloride, 22.5 v/v% PEG 6000
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.209 |
| 6EFR Crystal Structure of iNicSnFR 1.0 提交 2018-08-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–145（145 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；6mM nicotine, 50mM MgCl2, 10mM HEPES, 30% PEG 550
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.250 |
| 6FLL SPECTROSCOPIC AND STRUCTURAL STUDY OF QW, A EGFP MUTANT SHOWING PHOTOSWITCHING PROPERTIES 提交 2018-01-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；PEG 3350, 0.1 M AMMONIUM ACETATE, 0.2 M NH4F, PH 5.0
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.232 |
| 6FWW GFP/KKK. A redesigned GFP with improved solubility 提交 2018-03-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：V11K, Y39K, F64L, F99S, M153T, V163A, L221K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；291 K；0.1 M MMT buffer, 25 % PEG 1500, pH 4.0
|
分辨率 1.13 Å R-free 0.203 |
| 6GEL The structure of TWITCH-2B 提交 2018-04-26 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–227（227 aa）
链 A
174–238（65 aa）
链 A
1–173（173 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 FMT FORMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.2 M sodium formiate, 5 mM calcium chloride, 18 % PEG 3350
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.240 |
| 6GEL The structure of TWITCH-2B 提交 2018-04-26 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–227（227 aa）
链 B
174–238（65 aa）
链 B
1–173（173 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 FMT FORMIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.2 M sodium formiate, 5 mM calcium chloride, 18 % PEG 3350
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.240 |
| 6GEZ THE STRUCTURE OF TWITCH-2B N532F 提交 2018-04-27 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–227（227 aa）
链 A
174–238（65 aa）
链 A
1–173（173 aa）
|
突变：N532F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N532F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N532F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 FMT FORMIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.2 M SODIUM FORMIATE, PH 7.0, 5 MM CALCIUM CHLORIDE, 20 % PEG3350
|
分辨率 2.47 Å R-free 0.234 |
| 6GEZ THE STRUCTURE OF TWITCH-2B N532F 提交 2018-04-27 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–227（227 aa）
链 B
174–238（65 aa）
链 B
1–173（173 aa）
|
突变：N532F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N532F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N532F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 FMT FORMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.2 M SODIUM FORMIATE, PH 7.0, 5 MM CALCIUM CHLORIDE, 20 % PEG3350
|
分辨率 2.47 Å R-free 0.234 |
| 6GO8 Structure of GFPmut2 crystallized at pH 6 提交 2018-06-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65A, V68L, S72A: First six residues GSHIGP derive from the expression tag 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；277 K；45% MPD
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.174 |
| 6GO9 Structure of GFPmut2 crystallized at pH 6 and transferred to pH 7 提交 2018-06-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65A, V68L, S72A: First six residues GSHIGP derive from the expression tag 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；277 K；45% MPD
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.193 |
| 6GQG Structure of GFPmut2 crystallized at pH 8.5 提交 2018-06-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65A, V68L, S72A; First six residues GSHIGP derive from the expression tag 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；0.2 M CaCl2, 19% PEG 4000
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.223 |
| 6GQH Structure of GFPmut2 crystallized at pH 8.5 and transferred to pH 6 提交 2018-06-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65A, V68L, S72A; First six residues GSHIGP derive from the expression tag 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；0.2 M CaCl2, 19% PEG 4000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.236 |
| 6GRM Structure of GFPmut2 crystallized at pH 6 and transferred to pH 9 提交 2018-06-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：S65A, V68L, S72A: First six residues GSHIGP derive from the expression tag 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；277 K；MPD 45%
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.275 |
| 6HR1 Crystal structure of the YFPnano fusion protein 提交 2018-09-26 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；293 K；24% w/v PEG 3350
0.2 M di-Ammonium tartrate
10% v/v Glycerol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.214 |
| 6HR1 Crystal structure of the YFPnano fusion protein 提交 2018-09-26 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.8；293 K；24% w/v PEG 3350
0.2 M di-Ammonium tartrate
10% v/v Glycerol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.214 |
| 6IR6 Green fluorescent protein variant GFPuv with the native lysine residue at the C-terminus 提交 2018-11-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30%(w/v) PEG 1500, 3%(v/v) MPD, 0.2M Magnesium sulfate, 0.1M Sodium acetate/Acetic acid pH 5.5
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.216 |
| 6IR7 Green fluorescent protein variant GFPuv with the modification to 6-hydroxynorleucine at the C-terminus 提交 2018-11-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–237（236 aa）
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LDO 6-HYDROXY-L-NORLEUCINE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M MES pH 6.5, 30% PEGMME5000
|
分辨率 1.28 Å R-free 0.195 |
| 6ITC Structure of a substrate engaged SecA-SecY protein translocation machine 提交 2018-11-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 G
1–238（238 aa）
|
突变：Q80R,F99S,M153T,V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.45 Å |
| 6JGH Crystal structure of the F99S/M153T/V163A/T203I variant of GFP at 0.94 A 提交 2019-02-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–231（230 aa）
|
突变：T203I, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；308 K；PEG 4000, MgCl2, Tris-HCl buffer
|
分辨率 0.94 Å R-free 0.129 |
| 6JGI Crystal structure of the S65T/F99S/M153T/V163A variant of GFP at 0.85 A 提交 2019-02-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–231（230 aa）
|
突变：S65T, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；308 K；PEG 4000, MgCl2, Tris-HCl buffer
|
分辨率 0.85 Å R-free 0.112 |
| 6JGJ Crystal structure of the F99S/M153T/V163A/E222Q variant of GFP at 0.78 A 提交 2019-02-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–231（230 aa）
|
突变：E222Q, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；308 K；PEG 4000, MgCl2, Tris-HCl buffer
|
分辨率 0.78 Å R-free 0.125 |
| 6KKZ Crystal structure of the S65T/F99S/M153T/V163A variant of perdeuterated GFP at pD 8.5 提交 2019-07-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–231（230 aa）
|
突变：S65T, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.1；308 K；PEG 4000, MgCl2, Tris-DCl buffer
|
分辨率 0.90 Å R-free 0.123 |
| 6KL0 Crystal structure of the S65T/F99S/M153T/V163A variant of perdeuterated GFP at pD 7.0 提交 2019-07-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–231（230 aa）
|
突变：S65T, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.6；308 K；PEG 4000, MgCl2, Tris-DCl buffer
|
分辨率 0.80 Å R-free 0.120 |
| 6KL1 Crystal structure of the S65T/F99S/M153T/V163A variant of non-deuterated GFP at pD 8.5 提交 2019-07-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–232（231 aa）
|
突变：S65T, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.1；308 K；PEG 4000, MgCl2, Tris-DCl buffer
|
分辨率 0.85 Å R-free 0.118 |
| 6L27 X-ray crystal structure of the mutant green fluorescent protein 提交 2019-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–231（228 aa）
|
突变：SYG was converted to GYS of chromophore by post translational reaction. 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES-NaOD (pD 7.0), 5.0 % w/v PEG 2000 and 50 mM NDSB
|
分辨率 0.77 Å R-free 0.124 |
| 6LR7 Crystal structure of GFPuv complexed with the nanobody LaG16 at 1.67 Angstron resolution 提交 2020-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.3M Sodium Chloride, 0.01M Tris 8.0, 27.5% w/v PEG
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.226 |
| 6MB2 Cryo-EM structure of the PYD filament of AIM2 提交 2018-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 a
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
链 b
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
链 c
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
链 d
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
链 e
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
链 f
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
链 g
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
链 h
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
链 i
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
链 j
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
链 k
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
链 l
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
链 m
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
链 n
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
链 o
2–229（228 aa）
片段：UNP residues 2-229
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.00 Å R-free 0.423 |
| 6MDR Cryo-EM structure of the Ceru+32/GFP-17 protomer 提交 2018-09-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 a
3–232（230 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 b
2–232（231 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 c
3–232（230 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 d
2–232（231 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 e
3–232（230 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 f
2–232（231 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 g
3–232（230 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 h
2–232（231 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 i
3–232（230 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 j
2–232（231 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 k
3–232（230 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 l
2–232（231 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 m
3–232（230 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 n
2–232（231 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 o
3–232（230 aa）
片段：UNP residues 3-232
链 p
2–232（231 aa）
片段：UNP residues 3-232
|
突变：;E7R, T10R, V12K, D20K, E33K, E35K, Y67W, S73A, D77K, E91K, D103K, D118R, E125K, I129R, D134K, E143R, F146G, N147I, H149D, N150K, Q158R, N165K, E173K, D191R, D198R, Q205R, N213K, T231K ; 突变：T39D, T44D, R81E, N150E, K157D, Q158E, N165E, V194D, N199E, A228D, H232E 突变：;E7R, T10R, V12K, D20K, E33K, E35K, Y67W, S73A, D77K, E91K, D103K, D118R, E125K, I129R, D134K, E143R, F146G, N147I, H149D, N150K, Q158R, N165K, E173K, D191R, D198R, Q205R, N213K, T231K ; 突变：T39D, T44D, R81E, N150E, K157D, Q158E, N165E, V194D, N199E, A228D, H232E 突变：;E7R, T10R, V12K, D20K, E33K, E35K, Y67W, S73A, D77K, E91K, D103K, D118R, E125K, I129R, D134K, E143R, F146G, N147I, H149D, N150K, Q158R, N165K, E173K, D191R, D198R, Q205R, N213K, T231K ; 突变：T39D, T44D, R81E, N150E, K157D, Q158E, N165E, V194D, N199E, A228D, H232E 突变：;E7R, T10R, V12K, D20K, E33K, E35K, Y67W, S73A, D77K, E91K, D103K, D118R, E125K, I129R, D134K, E143R, F146G, N147I, H149D, N150K, Q158R, N165K, E173K, D191R, D198R, Q205R, N213K, T231K ; 突变：T39D, T44D, R81E, N150E, K157D, Q158E, N165E, V194D, N199E, A228D, H232E 突变：;E7R, T10R, V12K, D20K, E33K, E35K, Y67W, S73A, D77K, E91K, D103K, D118R, E125K, I129R, D134K, E143R, F146G, N147I, H149D, N150K, Q158R, N165K, E173K, D191R, D198R, Q205R, N213K, T231K ; 突变：T39D, T44D, R81E, N150E, K157D, Q158E, N165E, V194D, N199E, A228D, H232E 突变：;E7R, T10R, V12K, D20K, E33K, E35K, Y67W, S73A, D77K, E91K, D103K, D118R, E125K, I129R, D134K, E143R, F146G, N147I, H149D, N150K, Q158R, N165K, E173K, D191R, D198R, Q205R, N213K, T231K ; 突变：T39D, T44D, R81E, N150E, K157D, Q158E, N165E, V194D, N199E, A228D, H232E 突变：;E7R, T10R, V12K, D20K, E33K, E35K, Y67W, S73A, D77K, E91K, D103K, D118R, E125K, I129R, D134K, E143R, F146G, N147I, H149D, N150K, Q158R, N165K, E173K, D191R, D198R, Q205R, N213K, T231K ; 突变：T39D, T44D, R81E, N150E, K157D, Q158E, N165E, V194D, N199E, A228D, H232E 突变：;E7R, T10R, V12K, D20K, E33K, E35K, Y67W, S73A, D77K, E91K, D103K, D118R, E125K, I129R, D134K, E143R, F146G, N147I, H149D, N150K, Q158R, N165K, E173K, D191R, D198R, Q205R, N213K, T231K ; 突变：T39D, T44D, R81E, N150E, K157D, Q158E, N165E, V194D, N199E, A228D, H232E | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 6MWQ Single particle cryoEM structure of a DARPin-aldolase platform in complex with GFP 提交 2018-10-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
2–230（229 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were frozen on a manual plunger at the Scripps Research Institute Core Microscopy Facility in a 4 degrees C cold room humidified to >95%.
|
分辨率 3.00 Å |
| 6MWQ Single particle cryoEM structure of a DARPin-aldolase platform in complex with GFP 提交 2018-10-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
2–230（229 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were frozen on a manual plunger at the Scripps Research Institute Core Microscopy Facility in a 4 degrees C cold room humidified to >95%.
|
分辨率 3.00 Å |
| 6MWQ Single particle cryoEM structure of a DARPin-aldolase platform in complex with GFP 提交 2018-10-30 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
2–230（229 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were frozen on a manual plunger at the Scripps Research Institute Core Microscopy Facility in a 4 degrees C cold room humidified to >95%.
|
分辨率 3.00 Å |
| 6MWQ Single particle cryoEM structure of a DARPin-aldolase platform in complex with GFP 提交 2018-10-30 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
2–230（229 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were frozen on a manual plunger at the Scripps Research Institute Core Microscopy Facility in a 4 degrees C cold room humidified to >95%.
|
分辨率 3.00 Å |
| 6QQ8 Cryogenic temperature structure of the fluorescent protein Cerulean recorded after an accumulated dose of 290 kGy 提交 2019-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100mM HEPES pH 7.0, 12% PEG8000, 100mM MgCl2
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.197 |
| 6QQ9 Cryogenic temperature structure of the fluorescent protein Cerulean recorded after an accumulated dose of 5.8 MGy 提交 2019-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CO2 CARBON DIOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100mM HEPES 7.0, 12% PEG8000, 100mM MgCl2
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.195 |
| 6QQA Room temperature structure of the fluorescent protein Cerulean recorded after an accumulated dose of 21 kGy 提交 2019-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；15% PEG 8000, 0.1M MGCL2, 0.1 M HEPES PH 7.0
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.167 |
| 6QQB Room temperature structure of the fluorescent protein Cerulean recorded after an accumulated dose of 147 kGy 提交 2019-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；15% PEG 8000, 0.1M MGCL2, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.266 |
| 6QUH GHK tagged GFP variant crystal form II at 1.34A wavelength 提交 2019-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–230（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Sosium Acetate pH 5.4, 30%MPD, 0.1M Cacl2
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.188 |
| 6QUH GHK tagged GFP variant crystal form II at 1.34A wavelength 提交 2019-02-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
2–230（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Sosium Acetate pH 5.4, 30%MPD, 0.1M Cacl2
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.188 |
| 6QUI GHK tagged GFP variant at 17Kev 提交 2019-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–230（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Mes pH 6.5, 1.2M Ammonium sulphate, 8% glycerol
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.224 |
| 6QUI GHK tagged GFP variant at 17Kev 提交 2019-02-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
2–230（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Mes pH 6.5, 1.2M Ammonium sulphate, 8% glycerol
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.224 |
| 6QUJ GHK tagged GFP variant 提交 2019-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–230（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Mes pH 6.5, 1.2M Ammonium Sulphate, 8% Glycerol
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.221 |
| 6QUJ GHK tagged GFP variant 提交 2019-02-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
2–230（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Mes pH 6.5, 1.2M Ammonium Sulphate, 8% Glycerol
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.221 |
| 6SM0 Venus 66 p-Azido-L-Phenylalanin (azF) variant, dark grown 提交 2019-08-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–230（229 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OXY OXYGEN MOLECULE × 1 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；10mM Zn Cl2, 100 mM Na acetate,
20% PEG 6000
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.243 |
| 6T39 Crystal structure of rsEGFP2 in its off-state determined by SFX 提交 2019-10-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 8；293 K；100 mM HEPES pH 8.0, 2.5 M ammonium sulphate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.202 |
| 6T3A Difference-refined structure of rsEGFP2 10 ns following 400-nm laser irradiation of the off-state determined by SFX 提交 2019-10-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 8；293 K；100 mM HEPES pH 8.0, 2.5 M ammonium sulphate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.287 |
| 6T90 OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2019-10-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–238（238 aa）
|
未记录 | PTD PENTANEDIAL × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å |
| 6UN4 Crystal structure of rsEGFP2, Y67(3-ClY), Y107(3-ClY) 提交 2019-10-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L,Q69L,V163S,A206K,H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；293 K；80 mM HEPES, pH 8.1, 1.84 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.198 |
| 6UN5 Crystal structure of green fluorescent protein (GFP); S65T, Y66(2,3,5-F3Y); ih circular permutant (50-51) 提交 2019-10-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4–50（47 aa）
链 B
4–50（47 aa）
|
突变：;A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S,A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：;A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S,A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M ammonium acetate, 31% PEG 3350
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.205 |
| 6UN6 Crystal structure of green fluorescent protein (GFP); S65T, Y66(3-NO2Y); ih circular permutant (50-51) 提交 2019-10-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4–50（47 aa）
链 B
4–50（47 aa）
|
突变：A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M ammonium acetate, 34% PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.181 |
| 6UN7 Crystal structure of green fluorescent protein (GFP); S65T, Y66(3-OMeY); ih circular permutant (50-51) 提交 2019-10-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4–50（47 aa）
链 B
4–50（47 aa）
|
突变：A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15 M ammonium acetate, 34% PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.191 |
| 6UZ0 Cardiac sodium channel with flecainide 提交 2019-11-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 6OU [(2~{R})-1-[2-azanylethoxy(oxidanyl)phosphoryl]oxy-3-hexadecanoyloxy-propan-2-yl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 11 K4D Flecainide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；waiting for 20s, blot for 2.5-3.5s before plunging
|
分辨率 3.24 Å |
| 6UZ3 Cardiac sodium channel 提交 2019-11-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 6OU [(2~{R})-1-[2-azanylethoxy(oxidanyl)phosphoryl]oxy-3-hexadecanoyloxy-propan-2-yl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 11 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；waiting for 20s, blot for 2.5-3.5s before plunging
|
分辨率 3.50 Å |
| 6VAL Cryo-EM structure of an undecameric chicken CALHM1 and human CALHM2 chimera 提交 2019-12-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
片段：GFP + CALHM1 (UNP residues 2-204) + CALMH2 (UNP residues 207-323)
链 B
1–238（238 aa）
片段：GFP + CALHM1 (UNP residues 2-204) + CALMH2 (UNP residues 207-323)
链 C
1–238（238 aa）
片段：GFP + CALHM1 (UNP residues 2-204) + CALMH2 (UNP residues 207-323)
链 D
1–238（238 aa）
片段：GFP + CALHM1 (UNP residues 2-204) + CALMH2 (UNP residues 207-323)
链 E
1–238（238 aa）
片段：GFP + CALHM1 (UNP residues 2-204) + CALMH2 (UNP residues 207-323)
链 F
1–238（238 aa）
片段：GFP + CALHM1 (UNP residues 2-204) + CALMH2 (UNP residues 207-323)
链 G
1–238（238 aa）
片段：GFP + CALHM1 (UNP residues 2-204) + CALMH2 (UNP residues 207-323)
链 H
1–238（238 aa）
片段：GFP + CALHM1 (UNP residues 2-204) + CALMH2 (UNP residues 207-323)
链 I
1–238（238 aa）
片段：GFP + CALHM1 (UNP residues 2-204) + CALMH2 (UNP residues 207-323)
链 J
1–238（238 aa）
片段：GFP + CALHM1 (UNP residues 2-204) + CALMH2 (UNP residues 207-323)
链 K
1–238（238 aa）
片段：GFP + CALHM1 (UNP residues 2-204) + CALMH2 (UNP residues 207-323)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 sec before plunging
|
分辨率 3.87 Å |
| 6VAM Cryo-EM structure of octameric chicken CALHM1 提交 2019-12-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
片段：GFP (UNP residues 2-238) + CALHM1 (UNP residues 3-329)
链 B
2–238（237 aa）
片段：GFP (UNP residues 2-238) + CALHM1 (UNP residues 3-329)
链 C
2–238（237 aa）
片段：GFP (UNP residues 2-238) + CALHM1 (UNP residues 3-329)
链 D
2–238（237 aa）
片段：GFP (UNP residues 2-238) + CALHM1 (UNP residues 3-329)
链 E
2–238（237 aa）
片段：GFP (UNP residues 2-238) + CALHM1 (UNP residues 3-329)
链 F
2–238（237 aa）
片段：GFP (UNP residues 2-238) + CALHM1 (UNP residues 3-329)
链 G
2–238（237 aa）
片段：GFP (UNP residues 2-238) + CALHM1 (UNP residues 3-329)
链 H
2–238（237 aa）
片段：GFP (UNP residues 2-238) + CALHM1 (UNP residues 3-329)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 sec before plunging
|
分辨率 3.63 Å |
| 6WRF ClpX-ClpP complex bound to GFP-ssrA, recognition complex 提交 2020-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 S
3–229（227 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 6WSG ClpX-ClpP complex bound to ssrA-tagged GFP, intermediate complex 提交 2020-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 S
3–229（227 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 6WV9 Takifugu rubripes VKOR-like with vitamin K1 in noncatalytic state 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–144（144 aa）
链 A
146–238（93 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.5；295 K；42% PEG 400, 50 mM ammonium formate, 0.1 M HEPES pH 7.5.
protein-ligand co-crystallization
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.282 |
| 6WVA Takifugu rubripes VKOR-like with vitamin K1 epoxide at non-catalytic state 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–144（144 aa）
链 A
146–238（93 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.5；295 K；42% PEG 400, 50 mM ammonium formate, 0.1 M HEPES pH 7.5
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.278 |
| 6WVD Human JAGN1 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–144（144 aa）
链 A
146–231（86 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；295 K；30% PEG400, 0.1 M Li2SO4, 0.1M NaCl, 0.1 M Tris pH 8.0
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.227 |
| 6WVE Chicken SPCS1 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–144（144 aa）
链 A
146–231（86 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；295 K；25% PEG 400, 100 mM ammonium acetate, 0.1 M MES pH 6.0
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.232 |
| 6WVF E.coli DsbB C104S with ubiquinone 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–144（144 aa）
链 A
146–231（86 aa）
|
突变：C8A,C49V,C104S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C8A,C49V,C104S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UQ1 UBIQUINONE-1 × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；295 K；34% PEG 400, 60 mM NaCl, 0.1 M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.286 |
| 6WVG human CD53 提交 2020-05-06 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–144（144 aa）
链 A
145–230（86 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；295 K；30% PEG 400, 0.1 M KH2PO4, 0.1 M MES pH 6.0
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.269 |
| 6WVG human CD53 提交 2020-05-06 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–144（144 aa）
链 B
145–230（86 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；295 K；30% PEG 400, 0.1 M KH2PO4, 0.1 M MES pH 6.0
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.269 |
| 6WVI VKOR-like from Takifugu rubripes 提交 2020-05-06 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–144（144 aa）
链 A
146–238（93 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.5；295 K；42% PEG 400, 50 mM ammonium formate, 0.1 M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.235 |
| 6YOV OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 提交 2020-04-15 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 K
1–238（238 aa）
|
未记录 | PTD PENTANEDIAL × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.42 Å |
| 6ZSM Crystal structure of rsGCaMP double mutant Ile80His/Val116Ile in the ON state (non-illuminated) 提交 2020-07-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 5 FMT FORMIC ACID × 14 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；292 K；0.20 M sodium formate, 0.1 M Bis-Tris-Propane buffer pH 8.5, 19% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.198 |
| 6ZSN Crystal structure of rsGCaMP double mutant Ile80His/Val116Ile in the OFF state (illuminated) 提交 2020-07-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–238（90 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FMT FORMIC ACID × 6 CA CALCIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.20 M sodium formate, 0.1 M Bis-Tris-Propane buffer pH 8.5, 19% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.259 |
| 6ZUI Crystal structure of the Cys-Ser mutant of the cpYFP-based biosensor for hypochlorous acid 提交 2020-07-23 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
145–237（93 aa）
链 A
2–144（143 aa）
|
突变：C353S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C353S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；283.15 K；Tris (0.1 M, pH 8), CaCl2 (0.1 M), MgCl2 (0.1 M) and PE15/4 (15%)
Protein concentration:7 mg/mL
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.273 |
| 7A7K rsEGFP in the green-on state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM (NH4)SO4
100 mM Bis-trip pH 5.5
25 % PEG 3350
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.211 |
| 7A7L rsEGFP in the green-off state 提交 2020-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.0 M (NH4)2SO4
200 mM K/Na-tartrate
100 mM citrate pH 5.0
100 mM b-Nicotinamide adenine dinucleotide
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.179 |
| 7AA5 Human TRPV4 structure in presence of 4a-PDD 提交 2020-09-03 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
链 B
3–238（236 aa）
链 C
3–238（236 aa）
链 D
3–238（236 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging
|
分辨率 4.18 Å |
| 7AMB Crystal structure of rsFolder2 in its fluorescent on-state 提交 2020-10-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–232（231 aa）
|
突变：S30R, Y39N, F64L, S65A, Q69L, Q80R, F99S, N105T, M153T, V163S, I171V, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG 3350, 100 mM Tris pH 8.5, 20 mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.190 |
| 7AMB Crystal structure of rsFolder2 in its fluorescent on-state 提交 2020-10-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–232（231 aa）
|
突变：S30R, Y39N, F64L, S65A, Q69L, Q80R, F99S, N105T, M153T, V163S, I171V, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG 3350, 100 mM Tris pH 8.5, 20 mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.190 |
| 7AMB Crystal structure of rsFolder2 in its fluorescent on-state 提交 2020-10-08 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2–232（231 aa）
|
突变：S30R, Y39N, F64L, S65A, Q69L, Q80R, F99S, N105T, M153T, V163S, I171V, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG 3350, 100 mM Tris pH 8.5, 20 mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.190 |
| 7AMB Crystal structure of rsFolder2 in its fluorescent on-state 提交 2020-10-08 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
2–232（231 aa）
|
突变：S30R, Y39N, F64L, S65A, Q69L, Q80R, F99S, N105T, M153T, V163S, I171V, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG 3350, 100 mM Tris pH 8.5, 20 mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.190 |
| 7AMF Crystal structure of rsFolder2 in its non-fluorescent off-state 提交 2020-10-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–232（231 aa）
|
突变：S30R, Y39N, F64L, S65A, Q69L, Q80R, F99S, N105T, M153T, V163S, I171V, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG 3350, 100 mM Tris pH 8.5, 20 mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.193 |
| 7AMF Crystal structure of rsFolder2 in its non-fluorescent off-state 提交 2020-10-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–232（231 aa）
|
突变：S30R, Y39N, F64L, S65A, Q69L, Q80R, F99S, N105T, M153T, V163S, I171V, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG 3350, 100 mM Tris pH 8.5, 20 mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.193 |
| 7AMF Crystal structure of rsFolder2 in its non-fluorescent off-state 提交 2020-10-08 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2–232（231 aa）
|
突变：S30R, Y39N, F64L, S65A, Q69L, Q80R, F99S, N105T, M153T, V163S, I171V, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG 3350, 100 mM Tris pH 8.5, 20 mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.193 |
| 7AMF Crystal structure of rsFolder2 in its non-fluorescent off-state 提交 2020-10-08 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
2–232（231 aa）
|
突变：S30R, Y39N, F64L, S65A, Q69L, Q80R, F99S, N105T, M153T, V163S, I171V, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG 3350, 100 mM Tris pH 8.5, 20 mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.193 |
| 7AMU Crystal structure of rsEGFP2 T204A in its fluorescent on-state 提交 2020-10-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65A, Q69L, V163S, A206K, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 11；293 K；Ammonium sulphate
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.226 |
| 7BYL Cryo-EM structure of human KCNQ4 提交 2020-04-23 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 E
2–238（237 aa）
链 G
2–238（237 aa）
|
突变：F64L/S65T/K107T/A206K 突变：F64L/S65T/K107T/A206K 突变：F64L/S65T/K107T/A206K 突变：F64L/S65T/K107T/A206K | PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 K POTASSIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 7BYM Cryo-EM structure of human KCNQ4 with retigabine 提交 2020-04-23 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 E
2–238（237 aa）
链 G
2–238（237 aa）
|
突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L 突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L 突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L 突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L | PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 FBX ethyl N-[2-azanyl-4-[(4-fluorophenyl)methylamino]phenyl]carbamate × 4 K POTASSIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7BYN Cryo-EM structure of human KCNQ4 with linopirdine 提交 2020-04-23 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 E
2–238（237 aa）
链 G
2–238（237 aa）
|
突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L 突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L 突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L 突变：F64L/S65T/K107T/A206K/H231L | PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 K POTASSIUM ION × 3 FCC 1-phenyl-3,3-bis(pyridin-4-ylmethyl)indol-2-one × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7CD7 GFP-40/GFPuv complex, Form I 提交 2020-06-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
片段：UNP residues 3-238
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；15% (w/v) PEG 4000, 200 mM MgCl2, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.226 |
| 7CD7 GFP-40/GFPuv complex, Form I 提交 2020-06-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
3–238（236 aa）
片段：UNP residues 3-238
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；15% (w/v) PEG 4000, 200 mM MgCl2, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.226 |
| 7CD8 GFP-40/GFPuv complex, Form II 提交 2020-06-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
片段：UNP residues 3-238
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A, A206K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；5.5% (w/v) PEG 8000, 5% (v/v) ethylene glycol, 50 mM [Co(NH3)6]Cl3, 0.1 M HEPES-Na, pH 7.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 7K18 Cardiac Sodium channel with toxin bound 提交 2020-09-07 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 6OU [(2~{R})-1-[2-azanylethoxy(oxidanyl)phosphoryl]oxy-3-hexadecanoyloxy-propan-2-yl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 11 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7KM4 Crystal Structure of Oxidized Version of Redox-Sensitive Superfolder Green Fluorescent Protein 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；200, Potassium Chloride, 20% PEG-3350
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.321 |
| 7KS0 GluK2/K5 with 6-Cyano-7-nitroquinoxaline-2,3-dione (CNQX) 提交 2020-11-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.30 Å |
| 7KS3 GluK2/K5 with L-Glu 提交 2020-11-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.80 Å |
| 7KUY Cyro-EM structure of human Glycine Receptor alpha2-beta heteromer, strychnine bound state 提交 2020-11-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
2–238（237 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 SY9 STRYCHNINE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7L31 Cyro-EM structure of human Glycine Receptor alpha2-beta heteromer, strychnine bound state, 3.8 Angstrom 提交 2020-12-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
2–238（237 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 SY9 STRYCHNINE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7O7C Crystal structure of rsEGFP2 mutant V151A in the non-fluorescent off-state determined by synchrotron radiation at 100K 提交 2021-04-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：M1_S2insV, F64L, S65T, H231L, A206K, Q69L, V163S, T65A, V150A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；100 mM HEPES pH 7.8 - 8.4 and 1.7 - 2.4 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.196 |
| 7O7D Crystal structure of rsEGFP2 mutant V151A in the fluorescent on-state determined by synchrotron radiation at 100K 提交 2021-04-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：M1_S2insV, F64L, S65T, H231L, A206K, Q69L, V163S, T65A, V150A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM HEPES pH 7.8 - 8.4 and 1.7 - 2.4 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.179 |
| 7O7E Crystal structure of rsEGFP2 mutant V151L in the fluorescent on-state determined by synchrotron radiation at 100K 提交 2021-04-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：M1_S2insV, F64L, S65T, H231L, A206K, Q69L, V163S, T65A, V150L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；1.7 M ammonium sulfate, 100 mM HEPES pH 7.8
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.208 |
| 7O7H Crystal structure of rsEGFP2 mutant V151L in the non-fluorescent off-state determined by synchrotron radiation at 100K 提交 2021-04-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：M1_S2insV, F64L, S65T, H231L, A206K, Q69L, V163S, T65A, V150L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；1.8 M ammonium sulfate, 100 mM HEPES pH 8.2
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.197 |
| 7O7U Crystal structure of rsEGFP2 in the non-fluorescent off-state determined by serial femtosecond crystallography at room temperature 提交 2021-04-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：M1_S2insV, F64L, S65T, H231L, A206K, Q69L, V163S, T65A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8；293 K；100 mM HEPES pH 8.0, 2 M ammonium sulphate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.215 |
| 7O7V Crystal structure of rsEGFP2 mutant V151A in the fluorescent on-state determined by serial femtosecond crystallography at room temperature 提交 2021-04-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：M1_S2insV, F64L, S65T, H231L, A206K, Q69L, V163S, T65A, V150A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8；293 K；100 mM HEPES pH 8.0, 2 M ammonium sulphate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.192 |
| 7O7W Crystal structure of rsEGFP2 mutant V151L in the non-fluorescent off-state the determined by serial femtosecond crystallography at room temperature 提交 2021-04-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：M1_S2insV, F64L, S65T, H231L, A206K, Q69L, V163S, T65A, V150L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8；293 K；100 mM HEPES pH 8.0, 2 M ammonium sulphate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.213 |
| 7O7X Crystal structure of rsEGFP2 mutant V151A in the non-fluorescent off-state determined by serial femtosecond crystallography at room temperature 提交 2021-04-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：M1_S2insV, F64L, S65T, H231L, A206K, Q69L, V163S, T65A, V150A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8；293 K；100 mM HEPES pH 8.0, 2 M ammonium sulphate
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.201 |
| 7PCA Functional and structural characterization of redox sensitive superfolder green fluorescent protein and variants 提交 2021-08-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 2 EOH ETHANOL × 2 ARF FORMAMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；46% ETOH, 0.25% v/v Dichloromethane
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.163 |
| 7PCZ Functional and structural characterization of redox sensitive superfolder green fluorescent protein and variants 提交 2021-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EOH ETHANOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；10% polyethylenglycol (PEG) 6000, 30% ethanol and 100 mM natriumacetate
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.197 |
| 7PCZ Functional and structural characterization of redox sensitive superfolder green fluorescent protein and variants 提交 2021-08-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EOH ETHANOL × 5 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；10% polyethylenglycol (PEG) 6000, 30% ethanol and 100 mM natriumacetate
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.197 |
| 7PD0 Functional and structural characterization of redox sensitive superfolder green fluorescent protein and variants 提交 2021-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；30% PEG 4000.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.298 |
| 7PD0 Functional and structural characterization of redox sensitive superfolder green fluorescent protein and variants 提交 2021-08-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；30% PEG 4000.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.298 |
| 7PD0 Functional and structural characterization of redox sensitive superfolder green fluorescent protein and variants 提交 2021-08-04 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；30% PEG 4000.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.298 |
| 7PD0 Functional and structural characterization of redox sensitive superfolder green fluorescent protein and variants 提交 2021-08-04 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；30% PEG 4000.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.298 |
| 7PHR Structure of a fully assembled T-cell receptor engaging a tumor-associated peptide-MHC I 提交 2021-08-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 7PNN mVenus released from fusion protein. 提交 2021-09-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；200 mM KCl, 20% (w/v) PEG3350
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.169 |
| 7SAH Crystal Structure of LaG16 Nanobody bound to eGFP 提交 2021-09-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；295 K；100mM BICINE with 2% (w/v) 1,4-Dioxane and 10% (w/v) PEG20000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.177 |
| 7SAI Crystal Structure of Lag30 Nanobody bound to eGFP 提交 2021-09-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 5 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；800 mM KH2PO4/NaH2PO4, 100 mM HEPES
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.197 |
| 7SQY CSDaV GFP mutant 提交 2021-11-07 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric（180） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 8 seconds before plunging with -2mm off set
|
分辨率 3.40 Å |
| 7SQY CSDaV GFP mutant 提交 2021-11-07 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 8 seconds before plunging with -2mm off set
|
分辨率 3.40 Å |
| 7SQY CSDaV GFP mutant 提交 2021-11-07 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 8 seconds before plunging with -2mm off set
|
分辨率 3.40 Å |
| 7SQY CSDaV GFP mutant 提交 2021-11-07 | Assembly 4 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 8 seconds before plunging with -2mm off set
|
分辨率 3.40 Å |
| 7SQY CSDaV GFP mutant 提交 2021-11-07 | Assembly 5 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 8 seconds before plunging with -2mm off set
|
分辨率 3.40 Å |
| 7SSV Structure of human Kv1.3 with Fab-ShK fusion 提交 2021-11-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 7SSX Structure of human Kv1.3 提交 2021-11-11 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å |
| 7SSY Structure of human Kv1.3 (alternate conformation) 提交 2021-11-11 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å |
| 7SSZ Structure of human Kv1.3 with A0194009G09 nanobodies 提交 2021-11-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 7VCM crystal structure of GINKO1 提交 2021-09-03 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–144（143 aa）
链 A
149–238（90 aa）
|
突变：F65L,V94I,M304K,V313A,S325G,D330Y,T353V,A356K,H381L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F65L,V94I,M304K,V313A,S325G,D330Y,T353V,A356K,H381L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M MES pH 6.0, 20% PEG6000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.225 |
| 7VCM crystal structure of GINKO1 提交 2021-09-03 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–144（143 aa）
链 B
149–238（90 aa）
|
突变：F65L,V94I,M304K,V313A,S325G,D330Y,T353V,A356K,H381L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：F65L,V94I,M304K,V313A,S325G,D330Y,T353V,A356K,H381L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M MES pH 6.0, 20% PEG6000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.225 |
| 7Y96 Crystal structure of the carboxy-terminal domain of a coronavirus M protein fused with a split GFP 提交 2022-06-24 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–144（144 aa）
片段：carboxy-terminal domain
链 A
146–230（85 aa）
片段：carboxy-terminal domain
链 B
1–144（144 aa）
片段：carboxy-terminal domain
链 B
146–230（85 aa）
片段：carboxy-terminal domain
|
突变：R30S,Y39N,M153T,V163A,I171A,A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R30S,Y39N,M153T,V163A,I171A,A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R30S,Y39N,M153T,V163A,I171A,A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R30S,Y39N,M153T,V163A,I171A,A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；293 K；0.4 M ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.3, PEG 3350 27%, 0.5% ethyl acetate
|
分辨率 3.42 Å R-free 0.265 |
| 7YDQ Structure of PfNT1(Y190A)-GFP in complex with GSK4 提交 2022-07-04 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：Y190A | IRX 5-methyl-N-[2-(2-oxidanylideneazepan-1-yl)ethyl]-2-phenyl-1,3-oxazole-4-carboxamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.04 Å |
| 8A6G Room temperature rsEGFP2 with a chlorinated chromophore in the non-fluorescent OFF-state 提交 2022-06-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；293 K；1.3M ammonium sulfate, 100mM Hepes pH 8.1, 20mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.195 |
| 8A6N Room temperature rsEGFP2 with a chlorinated chromophore 300 fs after Photoexcitation 提交 2022-06-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；293 K；1.3M ammonium sulfate, 100mM Hepes pH 8.1, 20mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.213 |
| 8A6O Room temperature rsEGFP2 with a chlorinated chromophore 600 fs after Photoexcitation 提交 2022-06-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；293 K；1.3M ammonium sulfate, 100mM Hepes pH 8.1, 20mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.206 |
| 8A6P Room temperature rsEGFP2 with a chlorinated chromophore 900 fs after photoexcitation 提交 2022-06-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；293 K；1.3M ammonium sulfate, 100mM Hepes pH 8.1, 20mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.204 |
| 8A6Q Room temperature rsEGFP2 with a chlorinated chromophore 5 ps after photoexcitation 提交 2022-06-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；293 K；1.3M ammonium sulfate, 100mM Hepes pH 8.1, 20mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.207 |
| 8A6R Room temperature rsEGFP2 with a chlorinated chromophore 100 ps after Photoexcitation 提交 2022-06-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；293 K；1.3M ammonium sulfate, 100mM Hepes pH 8.1, 20mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.205 |
| 8A6S Room temperature rsEGFP2 with a chlorinated chromophore 1 microsecond after Photoexcitation 提交 2022-06-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；293 K；1.3M ammonium sulfate, 100mM Hepes pH 8.1, 20mM NaCl
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.203 |
| 8A7V Room temperature rsEGFP2 in its OFF-state obtained with SFX 提交 2022-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；293 K；120 mM HEPES pH 8.0, 1.5 M ammonium sulphate, 20 mM NaCl
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.195 |
| 8A83 rsEGFP2 with a chlorinated chromophore in the fluorescent ON-state in a crystal dehydrated after illumination 提交 2022-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1.76 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES; Cryoprotectant 1.6 M sucrose, 2.72 M ammonium sulfate, 0.16 M HEPES
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.229 |
| 8AHA rsEGFP2 photoswitched to its off-state at 100K 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；293 K；100 mM HEPES buffer, pH 8.1
1.9 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.223 |
| 8AHB rsEGFP2 photoswitched to its off-state at room temperature and back-switched to its on-state at 100K 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；293 K；100 mM HEPES buffer, pH 8.1
1.9 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.220 |
| 8AM4 Cl-rsEGFP2 Long Wavelength Structure 提交 2022-08-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Hepes pH 8.0, 1.80 M ammonium sulphate, 20 mM NaCl
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.257 |
| 8B6S X-ray structure of the haloalkane dehalogenase HaloTag7 fusion to the green fluorescent protein GFP (ChemoG1) labeled with a chloroalkane tetramethylrhodamine fluorophore substrate 提交 2022-09-27 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OEH [9-[2-carboxy-5-[2-[2-(6-chloranylhexoxy)ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-6-(dimethylamino)xanthen-3-ylidene]-dimethyl-azanium × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.085 M Tris-HCl pH 8.5, 0.17 M sodium acetate, 15% (v/v) glycerol, 27% (m/v) PEG 4000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.201 |
| 8B6S X-ray structure of the haloalkane dehalogenase HaloTag7 fusion to the green fluorescent protein GFP (ChemoG1) labeled with a chloroalkane tetramethylrhodamine fluorophore substrate 提交 2022-09-27 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OEH [9-[2-carboxy-5-[2-[2-(6-chloranylhexoxy)ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-6-(dimethylamino)xanthen-3-ylidene]-dimethyl-azanium × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.085 M Tris-HCl pH 8.5, 0.17 M sodium acetate, 15% (v/v) glycerol, 27% (m/v) PEG 4000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.201 |
| 8B6T X-ray structure of the interface optimized haloalkane dehalogenase HaloTag7 fusion to the green fluorescent protein GFP (ChemoG5-TMR) labeled with a chloroalkane tetramethylrhodamine fluorophore substrate 提交 2022-09-27 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OEH [9-[2-carboxy-5-[2-[2-(6-chloranylhexoxy)ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-6-(dimethylamino)xanthen-3-ylidene]-dimethyl-azanium × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2M magnesium chloride, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 30% (m/v) PEG 4000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.245 |
| 8B6T X-ray structure of the interface optimized haloalkane dehalogenase HaloTag7 fusion to the green fluorescent protein GFP (ChemoG5-TMR) labeled with a chloroalkane tetramethylrhodamine fluorophore substrate 提交 2022-09-27 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3–238（236 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OEH [9-[2-carboxy-5-[2-[2-(6-chloranylhexoxy)ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-6-(dimethylamino)xanthen-3-ylidene]-dimethyl-azanium × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2M magnesium chloride, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 30% (m/v) PEG 4000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.245 |
| 8BAN Secretagogin (mouse) in complex with its target peptide from SNAP-25 提交 2022-10-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–228（227 aa）
|
突变：F64L,Q80R,I167T MUTATIONS IN ENHANCED GFP (HIGHER FLUORESCENCE INTENSITY) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；PEG 3350 (20%), 2 mM CaCl2, 0.1 M Bis-Tris-Propane pH 6.5, 25 mM Tris-HCl pH 8.0, 0.2 M NaI
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.248 |
| 8BAN Secretagogin (mouse) in complex with its target peptide from SNAP-25 提交 2022-10-11 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–228（227 aa）
|
突变：F64L,Q80R,I167T MUTATIONS IN ENHANCED GFP (HIGHER FLUORESCENCE INTENSITY) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；PEG 3350 (20%), 2 mM CaCl2, 0.1 M Bis-Tris-Propane pH 6.5, 25 mM Tris-HCl pH 8.0, 0.2 M NaI
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.248 |
| 8BAV Secretagogin (human) in complex with its target peptide from SNAP-25 提交 2022-10-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–228（227 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.2 M Na-acetate
20% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.262 |
| 8BAV Secretagogin (human) in complex with its target peptide from SNAP-25 提交 2022-10-12 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–228（227 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.2 M Na-acetate
20% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.262 |
| 8BBJ Secretagogin (mouse) in complex with its target peptide from Syntaxin-4 提交 2022-10-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–228（227 aa）
|
突变：F64L,Q80R,I167T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 CAC CACODYLATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；277 K；0.1 M Na cacodylate pH 5.5, 0.2 M NH4SO4, 25% v/v PEGSM (PEG-smear)
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.269 |
| 8BBJ Secretagogin (mouse) in complex with its target peptide from Syntaxin-4 提交 2022-10-13 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–228（227 aa）
|
突变：F64L,Q80R,I167T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；277 K；0.1 M Na cacodylate pH 5.5, 0.2 M NH4SO4, 25% v/v PEGSM (PEG-smear)
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.269 |
| 8BVG Bright fluorescent protein BrUSLEE with subnanosecond fluorescence lifetime 提交 2022-12-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；6.4% Tacsimate pH 5.0, 16% PEG 3350
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.271 |
| 8BVG Bright fluorescent protein BrUSLEE with subnanosecond fluorescence lifetime 提交 2022-12-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；6.4% Tacsimate pH 5.0, 16% PEG 3350
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.271 |
| 8BVG Bright fluorescent protein BrUSLEE with subnanosecond fluorescence lifetime 提交 2022-12-03 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
2–238（237 aa）
链 F
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；6.4% Tacsimate pH 5.0, 16% PEG 3350
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.271 |
| 8BXP SfGFP C148 F206 mutant 提交 2022-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–233（233 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Bis-tris propane, pH 7.5, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.234 |
| 8BXP SfGFP C148 F206 mutant 提交 2022-12-09 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–233（233 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Bis-tris propane, pH 7.5, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.234 |
| 8C1X sfGFP C148 F206 mutant 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–233（233 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 7.5, 20 % w/v PEG 3350
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.247 |
| 8C1X sfGFP C148 F206 mutant 提交 2022-12-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–233（233 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 7.5, 20 % w/v PEG 3350
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.247 |
| 8C1X sfGFP C148 F206 mutant 提交 2022-12-21 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–233（233 aa）
链 D
1–233（233 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 7.5, 20 % w/v PEG 3350
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.247 |
| 8C7I Crystal structure of the PS2 assembly factor Psb32 from the cyanobactium Thermosyncechococcus vestitus (formerly elongatus) 提交 2023-01-16 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；291 K；1 M sodium citrate, 0.1 M CHES pH 9.5
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.258 |
| 8DFL Structure of human Kv1.3 with A0194009G09 nanobodies (alternate conformation) 提交 2022-06-22 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 8DHR An ester mutant of SfGFP 提交 2022-06-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：R30S, N39Y, L64F, R80Q, S99F, T105N, F145Y, T153M, A163V, V171I, V206A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；50 mM Hepes, pH 7.5 and 25% Peg4000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.188 |
| 8DHR An ester mutant of SfGFP 提交 2022-06-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：R30S, N39Y, L64F, R80Q, S99F, T105N, F145Y, T153M, A163V, V171I, V206A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；50 mM Hepes, pH 7.5 and 25% Peg4000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.188 |
| 8DN2 Cryo-EM structure of human Glycine Receptor alpha1-beta heteromer, glycine-bound state 2(expanded open) 提交 2022-07-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–238（238 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 HEX HEXANE × 10 HP6 HEPTANE × 9 UND UNDECANE × 3 OCT N-OCTANE × 7 GLY GLYCINE × 3 DD9 nonane × 2 NBU N-BUTANE × 3 D10 DECANE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8DN3 Cryo-EM structure of human Glycine Receptor alpha1-beta heteromer, apo state 提交 2022-07-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–238（238 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 HEX HEXANE × 15 UND UNDECANE × 12 DD9 nonane × 13 NBU N-BUTANE × 5 HP6 HEPTANE × 8 D10 DECANE × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.55 Å |
| 8DN4 Cryo-EM structure of human Glycine Receptor alpha-1 beta heteromer, glycine-bound state3(desensitized state) 提交 2022-07-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–238（238 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 LNK PENTANE × 1 HEX HEXANE × 9 NBU N-BUTANE × 3 OCT N-OCTANE × 1 DD9 nonane × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8DN5 Cryo-EM structure of human Glycine Receptor alpha1-beta heteromer, glycine-bound state1(open state) 提交 2022-07-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–238（238 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 DD9 nonane × 4 HP6 HEPTANE × 6 HEX HEXANE × 13 UND UNDECANE × 6 NBU N-BUTANE × 8 D10 DECANE × 3 OCT N-OCTANE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.63 Å |
| 8DPD superfolder GFP Tyr74pCNPhe mutant 提交 2022-07-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：S30R, Y39N, F64L, Q80R, F99S, N105T, Y145F, M153T, V163A, I171V, A206V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CO2 CARBON DIOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M Magnesium chloride, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.252 |
| 8DTA Metal sensitive GFP (mseGFP) complexed with phenylarsine oxide. 提交 2022-07-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：C48S,F64L,S147C,S202C,H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PA0 Phenylarsine oxide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.1M Tris, pH 8
0.2M Lithium sulfate
32% PEG3350
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.183 |
| 8ET3 Cryo-EM structure of a delivery complex containing the SspB adaptor, an ssrA-tagged substrate, and the AAA+ ClpXP protease 提交 2022-10-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 S
3–238（236 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8F6P Rat Cardiac Sodium Channel with Ranolazine Bound 提交 2022-11-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 BMA beta-D-mannopyranose × 3 XHO (R)-ranolazine × 1 6OU [(2~{R})-1-[2-azanylethoxy(oxidanyl)phosphoryl]oxy-3-hexadecanoyloxy-propan-2-yl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 6 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 13 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8FCK Structure of the vertebrate augmin complex 提交 2022-12-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 E
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.88 Å |
| 8FED Structure of Mce1-LucB complex from Mycobacterium smegmatis (Map1) 提交 2022-12-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 G
33–238（206 aa）
链 H
33–238（206 aa）
|
未记录 | UNL UNKNOWN LIGAND × 31 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM Tris-HCl pH 7.5, 5 mM MgSO4, 150 mM NaCl, 1 mM DDM, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |
| 8FEE Structure of Mce1 transporter from Mycobacterium smegmatis in the absence of LucB (Map2) 提交 2022-12-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 G
33–238（206 aa）
链 H
33–238（206 aa）
|
未记录 | UNL UNKNOWN LIGAND × 31 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM Tris-HCl pH 7.5, 5 mM MgSO4, 150 mM NaCl, 1 mM DDM, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8FEF Structure of Mce1 transporter from Mycobacterium smegmatis (Map0) 提交 2022-12-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 G
33–238（206 aa）
链 H
33–238（206 aa）
|
未记录 | UNL UNKNOWN LIGAND × 31 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM Tris-HCl pH 7.5, 5 mM MgSO4, 150 mM NaCl, 1 mM DDM, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.71 Å |
| 8G0I High Affinity nanobodies against GFP 提交 2023-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.2 M potassium chloride, 20% (w/v) PEG3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.241 |
| 8IYY Single excitation and two emissions pH sensor protein(SITE-pHorin)_pH7.0 提交 2023-04-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：C48S, F64L, S65T, S72A, N146F, H148G, M153T, V163A, S175G, T203C, A206K, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；14% PEG 8000, 100 mm MgCl2, 100 mm HEPES PH 7.0
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.227 |
| 8IYZ mTurquoise2 S65T 提交 2023-04-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L, S65T, Y66W, S72A, N146F, H148D, M153T, V163A, S175G, A206K, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；20% PEG 8000, 100 mM MgCl2, 100 mM HEPES PH 6.5
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.221 |
| 8IZ0 mTurquoise2 W66Y 提交 2023-04-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L,S72A,N146F,H148D,M153T,V163A,S175G,A206K,H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 8000, 100 mm MgCl2, 100 mm HEPES PH 6.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.199 |
| 8IZ1 Single excitation and two emissions pH sensor protein (SITE-pHorin)_C203E_pH5.0 提交 2023-04-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：C48S, F64L, S65T, S72A, N146F, H148G, M153T, V163A, S175G, T203E, A206K, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；20% PEG 6000, 100 mm MgCl2, 100 mm Citrate Acid pH 5.0
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.220 |
| 8IZ2 Single excitation and two emissions pH sensor protein (SITE-pHorin)_C203E_pH8.0 提交 2023-04-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：C48S, F64L, S65T, S72A, N146F, H148G, M153T, V163A, S175G, T203E, A206K, H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；PEG 8000, MgCl2, Tris-HCl
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.180 |
| 8IZ3 Single excitation and two emissions pH sensor protein(SITE-pHorin)_pH5.5 提交 2023-04-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：C48S,F64L,S72A,S65T,N146F,H148G,M153T,V163A,S175G,T203C,A206K,H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；0.1M Bis-tris pH5.5, 25%(w/v) PEG3350
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.247 |
| 8J0J AtSLAC1 8D mutant in closed state 提交 2023-04-11 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：S59D,T62D,S65D,S86D,S107D,S124D,S146D,S152D,S595R,Y604N,F629L,S630T,Q645R,F664S,N670T,Y710F,M718T,V728A,I736V,A771V 突变：S59D,T62D,S65D,S86D,S107D,S124D,S146D,S152D,S595R,Y604N,F629L,S630T,Q645R,F664S,N670T,Y710F,M718T,V728A,I736V,A771V 突变：S59D,T62D,S65D,S86D,S107D,S124D,S146D,S152D,S595R,Y604N,F629L,S630T,Q645R,F664S,N670T,Y710F,M718T,V728A,I736V,A771V | CL CHLORIDE ION × 3 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8J1E AtSLAC1 in open state 提交 2023-04-12 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：S595R,Y604N,F629L,S630T,Q645R,F664S,N670T,Y710F,M718T,V728A,I736V,A771V 突变：S595R,Y604N,F629L,S630T,Q645R,F664S,N670T,Y710F,M718T,V728A,I736V,A771V 突变：S595R,Y604N,F629L,S630T,Q645R,F664S,N670T,Y710F,M718T,V728A,I736V,A771V | Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 CL CHLORIDE ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å |
| 8JKC Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 4.5 提交 2023-06-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 2.2M Sodium Chloride
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.246 |
| 8JKC Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 4.5 提交 2023-06-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 2.2M Sodium Chloride
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.246 |
| 8JKC Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 4.5 提交 2023-06-01 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 2.2M Sodium Chloride
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.246 |
| 8JKC Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 4.5 提交 2023-06-01 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；0.1M sodium acetate pH 4.5, 2.2M Sodium Chloride
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.246 |
| 8JKG Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 5.5 提交 2023-06-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M sodium acetate pH 5.5), 2.2M Sodium Chloride
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.230 |
| 8JKG Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 5.5 提交 2023-06-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M sodium acetate pH 5.5), 2.2M Sodium Chloride
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.230 |
| 8JKG Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 5.5 提交 2023-06-01 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M sodium acetate pH 5.5), 2.2M Sodium Chloride
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.230 |
| 8JKG Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 5.5 提交 2023-06-01 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M sodium acetate pH 5.5), 2.2M Sodium Chloride
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.230 |
| 8JKI Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 7.5 提交 2023-06-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES pH 7.5, 2.5M sodium chloride, 12% PEG 1500, 2.2M sodium chloride
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.265 |
| 8JKI Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 7.5 提交 2023-06-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES pH 7.5, 2.5M sodium chloride, 12% PEG 1500, 2.2M sodium chloride
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.265 |
| 8JKI Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 7.5 提交 2023-06-01 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES pH 7.5, 2.5M sodium chloride, 12% PEG 1500, 2.2M sodium chloride
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.265 |
| 8JKI Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 7.5 提交 2023-06-01 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES pH 7.5, 2.5M sodium chloride, 12% PEG 1500, 2.2M sodium chloride
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.265 |
| 8JL2 Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 9.5 提交 2023-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M sodium Tris pH 9.5, 0.8M sodium dihydrogen phosphate
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.218 |
| 8JL2 Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 9.5 提交 2023-06-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M sodium Tris pH 9.5, 0.8M sodium dihydrogen phosphate
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.218 |
| 8JL2 Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 9.5 提交 2023-06-02 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M sodium Tris pH 9.5, 0.8M sodium dihydrogen phosphate
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.218 |
| 8JL2 Crystal structure of the Green fluorescent protein SE_A277 variant at pH 9.5 提交 2023-06-02 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M sodium Tris pH 9.5, 0.8M sodium dihydrogen phosphate
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.218 |
| 8JL5 Crystal structure of the Green fluorescent protein SEA227D variant at pH 4.5 提交 2023-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T,A227D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Citric acid pH 4.5, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.222 |
| 8JL5 Crystal structure of the Green fluorescent protein SEA227D variant at pH 4.5 提交 2023-06-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T,A227D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Citric acid pH 4.5, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.222 |
| 8JL5 Crystal structure of the Green fluorescent protein SEA227D variant at pH 4.5 提交 2023-06-02 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T,A227D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Citric acid pH 4.5, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.222 |
| 8JL5 Crystal structure of the Green fluorescent protein SEA227D variant at pH 4.5 提交 2023-06-02 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T,A227D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Citric acid pH 4.5, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.222 |
| 8JL6 Crystal structure of the Green fluorescent protein SEA227D variant at pH 5.5 提交 2023-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T,A227D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Citric acid pH 5.5-6.0, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.275 |
| 8JL6 Crystal structure of the Green fluorescent protein SEA227D variant at pH 5.5 提交 2023-06-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T,A227D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Citric acid pH 5.5-6.0, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.275 |
| 8JL6 Crystal structure of the Green fluorescent protein SEA227D variant at pH 5.5 提交 2023-06-02 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T,A227D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Citric acid pH 5.5-6.0, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.275 |
| 8JL6 Crystal structure of the Green fluorescent protein SEA227D variant at pH 5.5 提交 2023-06-02 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T,A227D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Citric acid pH 5.5-6.0, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.275 |
| 8JL7 Crystal structure of the Green fluorescent protein SEA227D variant at pH 8.0 提交 2023-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T,A227D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Tris pH 8.0, 0.2M lithium chloride, 20% PEG 6000
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.249 |
| 8JL7 Crystal structure of the Green fluorescent protein SEA227D variant at pH 8.0 提交 2023-06-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T,A227D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Tris pH 8.0, 0.2M lithium chloride, 20% PEG 6000
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.249 |
| 8JLL Crystal structure of the Green fluorescent protein SEA227D variant at pH 9.5 提交 2023-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T,A227D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M CHES pH 9.5, 0.2M sodium chloride, 1.26M ammonium sulfate
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.282 |
| 8JLL Crystal structure of the Green fluorescent protein SEA227D variant at pH 9.5 提交 2023-06-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T,A227D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M CHES pH 9.5, 0.2M sodium chloride, 1.26M ammonium sulfate
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.282 |
| 8JLL Crystal structure of the Green fluorescent protein SEA227D variant at pH 9.5 提交 2023-06-02 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T,A227D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M CHES pH 9.5, 0.2M sodium chloride, 1.26M ammonium sulfate
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.282 |
| 8JLL Crystal structure of the Green fluorescent protein SEA227D variant at pH 9.5 提交 2023-06-02 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204T,A206T,A227D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M CHES pH 9.5, 0.2M sodium chloride, 1.26M ammonium sulfate
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.282 |
| 8JLM Crystal structure of the Green fluorescent protein SET203EF223DA227 variant at pH 4.5 提交 2023-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204E,A206T,F223D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M acetate pH 4.5, 25% (w/v) PEG 1500, 30% (w/v) MPD
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.241 |
| 8JLS Crystal structure of the Green fluorescent protein SET203EF223DA227 variant at pH 6.0 提交 2023-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204E,A206T,F223D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M acetate pH 6.0, 25% (w/v) PEG 1500, 30% (w/v) MPD
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.203 |
| 8JLT Crystal structure of the Green fluorescent protein SET203EF223DA227 variant at pH 7.0 提交 2023-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204E,A206T,F223D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Imidazole pH 7.0, 40% (w/v) Isopropanol, 15% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.229 |
| 8JLT Crystal structure of the Green fluorescent protein SET203EF223DA227 variant at pH 7.0 提交 2023-06-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204E,A206T,F223D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Imidazole pH 7.0, 40% (w/v) Isopropanol, 15% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.229 |
| 8JLU Crystal structure of the Green fluorescent protein SET203EF223DA227 variant at pH 8.5 提交 2023-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204E,A206T,F223D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Tris pH 8.5, 0.1M Magnesium chloride, 25% (w/v) PEG 33
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.245 |
| 8JLU Crystal structure of the Green fluorescent protein SET203EF223DA227 variant at pH 8.5 提交 2023-06-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204E,A206T,F223D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Tris pH 8.5, 0.1M Magnesium chloride, 25% (w/v) PEG 33
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.245 |
| 8JLU Crystal structure of the Green fluorescent protein SET203EF223DA227 variant at pH 8.5 提交 2023-06-02 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204E,A206T,F223D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Tris pH 8.5, 0.1M Magnesium chloride, 25% (w/v) PEG 33
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.245 |
| 8JLU Crystal structure of the Green fluorescent protein SET203EF223DA227 variant at pH 8.5 提交 2023-06-02 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
突变：F64L,Q80R,S147D,N149Q,V163A,S175G,S202F,Q204E,A206T,F223D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Tris pH 8.5, 0.1M Magnesium chloride, 25% (w/v) PEG 33
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.245 |
| 8JZU SLC15A4_TASL complex 提交 2023-07-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
突变：M21V,F64L,S65T,A206K,H231L | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å |
| 8K4S CryoEM structure of Gq coupled MRGPRX4 with agonist DCA-3P 提交 2023-07-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
2–235（234 aa）
|
未记录 | JW0 (4~{R})-4-[(3~{R},5~{R},8~{R},9~{S},10~{S},12~{S},13~{R},14~{S},17~{R})-10,13-dimethyl-12-oxidanyl-3-phosphonooxy-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1~{H}-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanoic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8KEX CryoEM structure of Gq coupled MRGPRX4 with agonist DCA-3P, local 提交 2023-08-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
2–235（234 aa）
|
未记录 | JW0 (4~{R})-4-[(3~{R},5~{R},8~{R},9~{S},10~{S},12~{S},13~{R},14~{S},17~{R})-10,13-dimethyl-12-oxidanyl-3-phosphonooxy-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1~{H}-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanoic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8OTS OCT4 and MYC-MAX co-bound to a nucleosome 提交 2023-04-21 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric（13） 与全部聚合物一致 |
链 K
2–238（237 aa）
|
未记录 | PTD PENTANEDIAL × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8OVN X-ray structure of the SF-iGluSnFR-S72A 提交 2023-04-26 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
147–238（92 aa）
链 A
1–148（148 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CIT CITRIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；1.5 M tri-sodium citrate pH 6.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.253 |
| 8OVO X-ray structure of the SF-iGluSnFR-S72A in complex with L-aspartate 提交 2023-04-26 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
147–238（92 aa）
链 A
1–148（148 aa）
链 B
147–238（92 aa）
链 B
1–148（148 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ASP ASPARTIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2 M lithium acetate, 21% (m/v) PEG 3350, 20 mM L-aspartate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.220 |
| 8OVP X-ray structure of the iAspSnFR in complex with L-aspartate 提交 2023-04-26 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
147–238（92 aa）
链 A
1–148（148 aa）
链 B
147–238（92 aa）
链 B
1–148（148 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ASP ASPARTIC ACID × 2 ACT ACETATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2 M magnesium acetate, 18% (m/v) PEG 3350, 40 mM L-aspartate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.202 |
| 8OVY Structure of analogue of superfolded GFP 提交 2023-04-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PEG 3350/PEG 1K/MPD (1:1:1) 37.5%, Bicine/Trizma 0.1 M pH 8.5, Morpheus III Alkaloids 0.8% w/v, Morpheus Alcohols 0.12 M
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.214 |
| 8OVY Structure of analogue of superfolded GFP 提交 2023-04-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PEG 3350/PEG 1K/MPD (1:1:1) 37.5%, Bicine/Trizma 0.1 M pH 8.5, Morpheus III Alkaloids 0.8% w/v, Morpheus Alcohols 0.12 M
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.214 |
| 8PKO The ERAD misfolded glycoprotein checkpoint complex from Chaetomium thermophilum (EDEM:PDI heterodimer). 提交 2023-06-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6–238（233 aa）
|
突变：N-term truncation and GFP fusion | CA CALCIUM ION × 1 THJ THIOSULFATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7；Micro SEC buffer: 150 mM NaCl, 20 mM MES pH 7.0, 1 mM CaCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotting time 3 s, waiting time 30 s
Sample volume 3 uL, blot force 10
|
分辨率 2.60 Å |
| 8QWJ Structure of GFP variant 提交 2023-10-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Fusion screen from Molecular Dimension, condition E10
30% PEG 20K/PEG 500 MME (1:2), 0.1 M Bicine/Trizma pH 8.5, 1.5% Morpheus III Vitamins , 1.2% (w/v) Morpheus III Cholic acids
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.278 |
| 8SFS High Affinity nanobodies against GFP 提交 2023-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NH4 AMMONIUM ION × 6 GOL GLYCEROL × 6 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 1.26 M ammonium sulphate
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.218 |
| 8SFS High Affinity nanobodies against GFP 提交 2023-04-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NH4 AMMONIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 4 NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 1.26 M ammonium sulphate
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.218 |
| 8SFV High affinity nanobodies to GFP 提交 2023-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 5 NA SODIUM ION × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.2 M lithium sulphate, 0.1 M tris pH 7.0, 1 M potassium sodium tartrate
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.206 |
| 8SFX High Affinity nanobodies against GFP 提交 2023-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 3 MLT D-MALATE × 1 NA SODIUM ION × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1 M bis-tris propane pH 7.0, 1.2 M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.228 |
| 8SFX High Affinity nanobodies against GFP 提交 2023-04-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 2 MLT D-MALATE × 1 NA SODIUM ION × 12 PO4 PHOSPHATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1 M bis-tris propane pH 7.0, 1.2 M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.228 |
| 8SFZ High Affinity nanobodies against GFP 提交 2023-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M potassium formate pH 7.3, 20% (w/v) PEG335
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 8SFZ High Affinity nanobodies against GFP 提交 2023-04-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M potassium formate pH 7.3, 20% (w/v) PEG335
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 8SFZ High Affinity nanobodies against GFP 提交 2023-04-11 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M potassium formate pH 7.3, 20% (w/v) PEG335
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 8SG3 High Affinity nanobodies against GFP 提交 2023-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.2 M sodium potassium phosphate pH 6.2, 2.5 M sodium chloride
|
分辨率 3.11 Å R-free 0.303 |
| 8SLC High Affinity nanobodies against GFP 提交 2023-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 2 M sodium formate
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.241 |
| 8SLC High Affinity nanobodies against GFP 提交 2023-04-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 2 M sodium formate
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.241 |
| 8SMU Integral fusion of the HtaA CR2 domain from Corynebacterium diphtheriae within EGFP 提交 2023-04-26 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–39（39 aa）
链 A
40–238（199 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 GOL GLYCEROL × 7 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；1.9 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate, 0.2 M sodium chloride
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.233 |
| 8SMU Integral fusion of the HtaA CR2 domain from Corynebacterium diphtheriae within EGFP 提交 2023-04-26 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–39（39 aa）
链 B
40–238（199 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 GOL GLYCEROL × 4 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；1.9 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate, 0.2 M sodium chloride
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.233 |
| 8SMU Integral fusion of the HtaA CR2 domain from Corynebacterium diphtheriae within EGFP 提交 2023-04-26 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–39（39 aa）
链 C
40–238（199 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 GOL GLYCEROL × 7 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；1.9 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate, 0.2 M sodium chloride
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.233 |
| 8SMU Integral fusion of the HtaA CR2 domain from Corynebacterium diphtheriae within EGFP 提交 2023-04-26 | Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–39（39 aa）
链 D
40–238（199 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 GOL GLYCEROL × 5 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；1.9 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate, 0.2 M sodium chloride
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.233 |
| 8SYG Cryo-EM structure of tetradecameric hub domain of CaMKII alpha 提交 2023-05-25 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
链 E
2–238（237 aa）
链 F
2–238（237 aa）
链 G
2–238（237 aa）
链 H
2–238（237 aa）
链 I
2–238（237 aa）
链 J
2–238（237 aa）
链 K
2–238（237 aa）
链 L
2–238（237 aa）
链 M
2–238（237 aa）
链 N
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8T15 Cryo-EM structure of dodecameric hub domain of CaMKII alpha 提交 2023-06-01 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
链 E
2–238（237 aa）
链 F
2–238（237 aa）
链 G
2–238（237 aa）
链 H
2–238（237 aa）
链 I
2–238（237 aa）
链 J
2–238（237 aa）
链 K
2–238（237 aa）
链 L
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8T17 Cryo-EM structure of tetradecameric hub domain of CaMKII beta 提交 2023-06-02 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
链 E
2–238（237 aa）
链 F
2–238（237 aa）
链 G
2–238（237 aa）
链 H
2–238（237 aa）
链 I
2–238（237 aa）
链 J
2–238（237 aa）
链 K
2–238（237 aa）
链 L
2–238（237 aa）
链 M
2–238（237 aa）
链 N
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8T18 Cryo-EM structure of dodecameric hub domain of CaMKII beta 提交 2023-06-02 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
链 E
2–238（237 aa）
链 F
2–238（237 aa）
链 G
2–238（237 aa）
链 H
2–238（237 aa）
链 I
2–238（237 aa）
链 J
2–238（237 aa）
链 K
2–238（237 aa）
链 L
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8T6K Cryo-EM structure of tetradecameric CaMKII beta holoenzyme T287A T306A T307A 提交 2023-06-16 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
链 E
2–238（237 aa）
链 F
2–238（237 aa）
链 G
2–238（237 aa）
链 H
2–238（237 aa）
链 I
2–238（237 aa）
链 J
2–238（237 aa）
链 K
2–238（237 aa）
链 L
2–238（237 aa）
链 M
2–238（237 aa）
链 N
2–238（237 aa）
|
突变：T287A T306A T307A 突变：T287A T306A T307A 突变：T287A T306A T307A 突变：T287A T306A T307A 突变：T287A T306A T307A 突变：T287A T306A T307A 突变：T287A T306A T307A 突变：T287A T306A T307A 突变：T287A T306A T307A 突变：T287A T306A T307A 突变：T287A T306A T307A 突变：T287A T306A T307A 突变：T287A T306A T307A 突变：T287A T306A T307A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8T6L Cryo-EM structure of rat cardiac sodium channel NaV1.5 with batrachotoxin analog BTX-B 提交 2023-06-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：A33T,G214D | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 LBN 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine × 10 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 11 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 2 YIJ (1R)-1-[(5aR,7aR,9R,11aS,11bS,12R,13aR)-9,12-dihydroxy-2,11a-dimethyl-1,2,3,4,7a,8,9,10,11,11a,12,13-dodecahydro-7H-9,11b-epoxy-13a,5a-prop[1]enophenanthro[2,1-f][1,4]oxazepin-14-yl]ethyl benzoate × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8T6Q Cryo-EM structure of dodecameric CaMKII beta holoenzyme T287A T306A T307A 提交 2023-06-16 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
链 F
2–238（237 aa）
链 G
2–238（237 aa）
链 H
2–238（237 aa）
链 I
2–238（237 aa）
链 J
2–238（237 aa）
链 K
2–238（237 aa）
链 L
2–238（237 aa）
链 N
2–238（237 aa）
|
突变：T287A,T306A,T307A 突变：T287A,T306A,T307A 突变：T287A,T306A,T307A 突变：T287A,T306A,T307A 突变：T287A,T306A,T307A 突变：T287A,T306A,T307A 突变：T287A,T306A,T307A 突变：T287A,T306A,T307A 突变：T287A,T306A,T307A 突变：T287A,T306A,T307A 突变：T287A,T306A,T307A 突变：T287A,T306A,T307A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8TLM Structure of a class A GPCR/Fab complex 提交 2023-07-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8VDP Cryogenic electron microscopy model of full-length talin without FABD 提交 2023-12-17 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8VDQ Cryogenic electron microscopy model of full-length talin 提交 2023-12-17 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å |
| 8W2L TRPM7 structure in complex with anticancer agent CCT128930 in closed state 提交 2024-02-20 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
片段：residues 3-1280 of the TRPM7 channel
链 B
2–238（237 aa）
片段：residues 3-1280 of the TRPM7 channel
链 C
2–238（237 aa）
片段：residues 3-1280 of the TRPM7 channel
链 D
2–238（237 aa）
片段：residues 3-1280 of the TRPM7 channel
|
未记录 | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 52 CLR CHOLESTEROL × 4 M05 4-(4-chlorobenzyl)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)piperidin-4-aminium × 4 DU0 2-[2-[(1~{S},2~{S},4~{S},5'~{R},6~{R},7~{S},8~{R},9~{S},12~{S},13~{R},16~{S})-5',7,9,13-tetramethylspiro[5-oxapentacyclo[10.8.0.0^{2,9}.0^{4,8}.0^{13,18}]icos-18-ene-6,2'-oxane]-16-yl]oxyethyl]propane-1,3-diol × 4 CA CALCIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.45 Å |
| 8WG3 mouse TMEM63b in LMNG-CHS micelle 提交 2023-09-20 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L,S65T,A206K,H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 LBN 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8WG4 mouse TMEM63b in DDM-CHS micelle with YN9303-24 Fab 提交 2023-09-20 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F64L,S65T,A206K,H231L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LBN 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8X9P HURP (428-534)-alpha-tubulin-beta-tubulin complex 提交 2023-11-30 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
2–217（216 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 8XTW Structure of human VAChT in complex with acetylcholine 提交 2024-01-12 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–229（228 aa）
|
突变：S30R,Y39N,F64L,S65T,Q80R,F99S,N105T,Y145F,M153T,V163A,I171V,A206V | ACH ACETYLCHOLINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8XTX Structure of human VAChT in an apo conformation 提交 2024-01-12 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–229（228 aa）
|
突变：S30R,Y39N,F64L,S65T,Q80R,F99S,N105T,Y145F,M153T,V163A,I171V,A206V | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8XTY Structure of human VAChT in complex with vesamicol 提交 2024-01-12 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–229（228 aa）
|
突变：S30R,Y39N,F64L,S65T,Q80R,F99S,N105T,Y145F,M153T,V163A,I171V,A206V | A1LWL vesamicol × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8Y8V Cryo-EM structure of AQP7 in POPC nanodisc 提交 2024-02-06 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
未记录 | P5S O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.49 Å |
| 8Y8V Cryo-EM structure of AQP7 in POPC nanodisc 提交 2024-02-06 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
未记录 | P5S O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.49 Å |
| 8Y8V Cryo-EM structure of AQP7 in POPC nanodisc 提交 2024-02-06 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
未记录 | P5S O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.49 Å |
| 8YA0 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+7C) 提交 2024-02-07 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 G
3–229（227 aa）
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 8YA2 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+20C) 提交 2024-02-07 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 G
3–229（227 aa）
|
突变：Q80R, F99S, M153T, V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å |
| 8ZUP Crystal structure of the F99S/M153T/V163A/T203V/E222Q variant of GFP at pH 8.5 提交 2024-06-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–231（230 aa）
|
突变：F99S,M153T,V163A,T203V,E222Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；308 K；PEG 4000, magnesium chloride, MES-NaOH buffer (pH 5.0)
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.173 |
| 8ZUQ Crystal structure of the F99S/M153T/V163A/T203I/E222Q variant of GFP at pH 8.5 提交 2024-06-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–231（230 aa）
|
突变：F99S,M153T,V163A,T203I,E222Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；308 K；PEG 4000, magnesium chloride, MES-NaOH buffer (pH 5.0)
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.193 |
| 8ZUR Crystal structure of the F99S/M153T/V163A/T203V/E222Q variant of GFP at pH 5.0 提交 2024-06-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–231（230 aa）
|
突变：F99S,M153T,V163A,T203V,E222Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；308 K；PEG 4000, magnesium chloride, MES-NaOH buffer (pH 5.0)
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.166 |
| 8ZUS Crystal structure of the F99S/M153T/V163A/T203V variant of GFP at pH 7.5 提交 2024-06-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–231（230 aa）
|
突变：F99S,M153T,V163A,T203V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；308 K；PEG 4000, magnesium chloride, MES-NaOH buffer (pH 5.0)
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.165 |
| 8ZUT Crystal structure of the F99S/M153T/V163A variant of GFP at pH 8.5 提交 2024-06-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–231（230 aa）
|
突变：F99S,M153T,V163A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；308 K；PEG 4000, magnesium chloride, Tris-HCl buffer (pH 8.5)
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.197 |
| 9BOI Cryo-EM structure of human Spns1 in complex with LPC (18:1) 提交 2024-05-03 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
未记录 | 42H (4R,7R,18Z)-4,7-dihydroxy-N,N,N-trimethyl-10-oxo-3,5,9-trioxa-4-phosphaheptacos-18-en-1-aminium 4-oxide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 9C7C Diheteromeric GluN1/GluN2A (delM653) in nanodisc complexed with glycine, glutamate, and GNE-4123, open conformation 提交 2024-06-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
5–238（234 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
5–238（234 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | A1AUV 4-cyclohexyl-N-[(8R)-2-cyclopropyl-7-hydroxy-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-6-yl]benzene-1-sulfonamide × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 HP6 HEPTANE × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 8 GLY GLYCINE × 2 D12 DODECANE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 D10 DECANE × 2 HEX HEXANE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9C7E Diheteromeric GluN1/GluN2A (delM653) in nanodisc complex with glycine, glutamate, and GNE-4123, open conformation, C2 symmetry 提交 2024-06-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
5–238（234 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
5–238（234 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | A1AUV 4-cyclohexyl-N-[(8R)-2-cyclopropyl-7-hydroxy-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-6-yl]benzene-1-sulfonamide × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 6 D12 DODECANE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 9C7P Diheteromeric GluN1/GluN2A (delM653) in digitonin complexed with glycine, glutamate, and GNE-4123 提交 2024-06-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.61 Å |
| 9C7Q Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A, in complex with glycine and glutamate 提交 2024-06-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.05 Å |
| 9C7R Diheteromeric GluN1/GluN2A (M817V) in digitonin complexed with glycine, glutamate, and GNE-4123 提交 2024-06-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.99 Å |
| 9CLA Human Kv1.3 mutant-H451V 提交 2024-07-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 9CLV Human Kv1.3 mutant-P424G 提交 2024-07-12 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 9CON Human Kv1.3-H451V with A0194009G09 nanobodies conformation 1 提交 2024-07-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.06 Å |
| 9CTY Human Kv1.3-H451V with A0194009G09 nanobodies conformation 2 提交 2024-07-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
| 9CXT Hemagglutinin A/Hong Kong/1/68 produced in GnTI- cells 提交 2024-07-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–233（233 aa）
链 D
1–233（233 aa）
链 F
1–233（233 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；TBS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9CXU Endo H-treated hemagglutinin A/Hong Kong/1/68 提交 2024-07-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–233（233 aa）
链 D
1–233（233 aa）
链 F
1–233（233 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；TBS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 9D0Y Map of endoH-treated hemagglutinin A/Sing/INFIMH/16 提交 2024-08-07 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
1–233（233 aa）
链 E
1–233（233 aa）
链 F
1–233（233 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；TBS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9EBW Chimeric fluorescence biosensor formed from a lactate-binding protein and GFP, bound to lactate 提交 2024-11-13 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–146（145 aa）
链 A
149–238（90 aa）
链 B
2–146（145 aa）
链 B
149–238（90 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 2 LAC LACTIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；citric acid, PEG 6000, 1,3-propanediol
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.285 |
| 9EBW Chimeric fluorescence biosensor formed from a lactate-binding protein and GFP, bound to lactate 提交 2024-11-13 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–146（145 aa）
链 C
149–238（90 aa）
链 D
2–146（145 aa）
链 D
149–238（90 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | LAC LACTIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；citric acid, PEG 6000, 1,3-propanediol
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.285 |
| 9EBX Chimeric fluorescence biosensor formed from a lactate-binding protein and GFP 提交 2024-11-13 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–146（145 aa）
链 A
149–238（90 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；magnesium chloride hexahydrate, HEPES, PEG 3350
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.280 |
| 9EEF Human Kv1.3 mutant - G427H 提交 2024-11-19 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
突变：G427H 突变：G427H 突变：G427H 突变：G427H | K POTASSIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 9EI0 Human Kv1.3 mutant - G427H with A0194009G09 nanobodies 提交 2024-11-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.91 Å |
| 9F22 DARPin eGFP complex DP1 (3G190.24) 提交 2024-04-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 BR BROMIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Na acetate pH 5.5, 10% e/v PEG 8K, 10% PEG 1K, 0.2 M KBr
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.223 |
| 9F23 DARPin eGFP complex DP2 (2G156) 提交 2024-04-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1H87 2-[[(2S)-2-oxidanylpropoxy]methyl]-2-[[(2S)-2-[(2S)-2-oxidanylpropoxy]propoxy]methyl]propane-1,3-diol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 NA SODIUM ION × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50%pentaerythriol propoxylate
0.1 M Tris, pH 8.0
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.212 |
| 9F23 DARPin eGFP complex DP2 (2G156) 提交 2024-04-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | A1H87 2-[[(2S)-2-oxidanylpropoxy]methyl]-2-[[(2S)-2-[(2S)-2-oxidanylpropoxy]propoxy]methyl]propane-1,3-diol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 NA SODIUM ION × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 PXN (2S)-1-[3-{[(2R)-2-hydroxypropyl]oxy}-2,2-bis({[(2R)-2-hydroxypropyl]oxy}methyl)propoxy]propan-2-ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50%pentaerythriol propoxylate
0.1 M Tris, pH 8.0
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.212 |
| 9F24 DARPin eGFP complex DP4 (2G71) 提交 2024-04-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 8% PEG 20000, 8% PEG 550 MME, 0.2 M KBr
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.222 |
| 9F33 Cryo-EM structure of Dopamine 3 Receptor:Go complex bound to bitopic FOB02-04A - Conformation A 提交 2024-04-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
2–238（237 aa）
|
突变：L119W | A1H9N N-[2-[(1R,2S)-2-[[(2S,5S)-2-(6-azanylpyridin-3-yl)-5-methyl-morpholin-4-yl]methyl]cyclopropyl]ethyl]-1H-indole-2-carboxamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å |
| 9F34 Cryo-EM structure of Dopamine 3 receptor:Go complex bound to bitopic FOB02-04A - Conformation B 提交 2024-04-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
2–238（237 aa）
|
突变：L119W | A1H9N N-[2-[(1R,2S)-2-[[(2S,5S)-2-(6-azanylpyridin-3-yl)-5-methyl-morpholin-4-yl]methyl]cyclopropyl]ethyl]-1H-indole-2-carboxamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 9F6Y CryoEM structure of Human Mediator subunit MED23 complexed with phosphorylated Elk-1 transcription factor 提交 2024-05-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 9FBU X-ray structure of the iGluSnFR3 in complex with L-glutamate 提交 2024-05-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
147–238（92 aa）
链 A
1–148（148 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；26% (m/v) PEG 1500
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.211 |
| 9FQT Cryo-EM structure of MmCAT1 bound with FrMLV-RBD in the apo inward-open state 提交 2024-06-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9FQU Cryo-EM structure of MmCAT1 bound with FrMLV-RBD in the arginine-bound inward-occluded state 提交 2024-06-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 2 ARG ARGININE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 9FQV Cryo-EM structure of MmCAT1 bound with FrMLV-RBD in the lysine-bound inward-occluded state 提交 2024-06-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
未记录 | LYS LYSINE × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 9FQW Cryo-EM structure of MmCAT1 bound with FrMLV-RBD in the ornithine-bound inward-occluded state 提交 2024-06-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
未记录 | Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 2 ORN L-ornithine × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9GU0 Human adult muscle nAChR in resting state in detergent with alpha-bungarotoxin 提交 2024-09-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric（11） 与蛋白数一致 |
链 E
2–238（237 aa）
|
突变：EGFP insertion between residues R344 and A345 in the M3-M4 intracellular loop | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.013% DDM, 0.0013% CHS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot time 2s, blot force -10
|
分辨率 2.96 Å |
| 9GU1 Human adult muscle nAChR in resting state in nanodisc with alpha-bungarotoxin 提交 2024-09-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric（11） 与蛋白数一致 |
链 E
2–238（237 aa）
|
突变：EGFP insertion between residues R344 and A345 in the M3-M4 intracellular loop | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CU COPPER (II) ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；2.5 uL of sample was frozen; blot time 4.5 s, blot force -10
|
分辨率 2.48 Å |
| 9GU2 Human adult muscle nAChR in desensitised state in nanodisc with 100 uM acetylcholine 提交 2024-09-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 E
2–238（237 aa）
|
突变：EGFP insertion between residues R344 and A345 in the M3-M4 intracellular loop | ACH ACETYLCHOLINE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CU COPPER (II) ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；2.5 ul sample, blot time=6 s, blot force=-10
|
分辨率 2.73 Å |
| 9GU3 Human adult muscle nAChR in desensitised state in nanodisc with 1 mM acetylcholine 提交 2024-09-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 E
2–238（237 aa）
|
突变：EGFP insertion between residues R344 and A345 in the M3-M4 intracellular loop | ACH ACETYLCHOLINE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；2.5 ul sample, blot time=4 s, blot force=-10
|
分辨率 2.64 Å |
| 9HAA a5b3 GABAA Receptor resting state 提交 2024-11-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
1–238（238 aa）
链 E
2–238（237 aa）
|
未记录 | BUA butanoic acid × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 2 mM Fluorinated Fos-choline 8, 0.005% LMNG, 0.0005% CHS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 9HNQ a5b3 GABAA Receptor bound to GABA and Mb25 in desensitized state in detergent micelles 提交 2024-12-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
链 C
1–238（238 aa）
链 D
1–238（238 aa）
链 E
1–238（238 aa）
|
未记录 | ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 0.005% LMNG, 0.0005% CHS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.81 Å |
| 9HNR a5b3 GABAA Receptor in 1 a5 to 4 b3 stoichiometry in desensitized state 提交 2024-12-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
链 C
1–238（238 aa）
链 D
1–238（238 aa）
链 E
1–238（238 aa）
|
未记录 | ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 9HNS a5b3 GABAAR bound to GABA and Mb25 in a desensitized state in saposin nanodiscs after long GABA treatment 提交 2024-12-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
1–238（238 aa）
链 E
2–238（237 aa）
|
未记录 | ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9HNT a5b3 GABAAR bound to Etomidate, GABA, and Mb25 in a desensitized state in saposin nanodiscs 提交 2024-12-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 D
1–238（238 aa）
|
未记录 | V8D Etomidate × 2 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.32 Å |
| 9HUM a5b3 GABAAR bound to GABA and Mb25 in a desensitized state in saposin nanodiscs after short GABA treatment 提交 2024-12-23 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
1–238（238 aa）
链 E
2–238（237 aa）
|
未记录 | ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 9J97 Closed structure of human XPR1 提交 2024-08-22 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
|
未记录 | 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CLR CHOLESTEROL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9J98 Open structure of human XPR1 提交 2024-08-22 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
|
未记录 | 8PE (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.33 Å |
| 9LK2 monomeric ZYG11B-EloB-EloC + substrate peptide GYIND 提交 2025-01-15 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
突变：F821L/S822T/Q837R/F856S/M910T/V920A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 9LK6 dimeric ZYG11B-EloB-EloC + substrate peptide GYIND 提交 2025-01-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
突变：F821L/S822T/Q837R/F856S/M910T/V920A 突变：F821L/S822T/Q837R/F856S/M910T/V920A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.27 Å |
| 9NA8 Augmin1345 Extended-body 提交 2025-02-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50mM HEPES,150mM KCl,1mM EGTA,1mM MgCl2,10mM betamercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9NA9 Augmin1345-Extended-Tripod 提交 2025-02-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.90 Å |
| 9O58 Zymogen ADAM17-iRhom2 complex bound by the MEDI3622 Fab 提交 2025-04-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å |
| 9OO6 Human PORCN bound to inhibitor C59 提交 2025-05-15 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
未记录 | A1CC5 2-[4-(2-methylpyridin-4-yl)phenyl]-N-[4-(pyridin-3-yl)phenyl]acetamide × 1 AV0 Lauryl Maltose Neopentyl Glycol × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.39 Å |
| 9OO7 Human PORCN bound to inhibitor ETC159 提交 2025-05-15 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 A1CC6 2-(1,3-dimethyl-2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydro-7H-purin-7-yl)-N-(6-phenylpyridazin-3-yl)acetamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.61 Å |
| 9OO8 Apo Human PORCN 提交 2025-05-15 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.32 Å |
| 9OSF The intact LBD state of GluK2/K5 with 5-iodowillardiine and kynurenic acid sodium salt 提交 2025-05-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM Tris, 300 mM NaCl, 0.35 mM DDM, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.83 Å |
| 9OSI The intact LBD state of GluK2/K5 with alpha-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) 提交 2025-05-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM Tris, 300 mM NaCl, 0.35 mM DDM, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.95 Å |
| 9P3N The open state of zebrafish TRPM5 with 1mM EDTA and 0.5mM CBTA 提交 2025-06-14 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 YUY (2R)-2-(hydroxymethyl)-4-{[(25R)-10alpha,14beta,17beta-spirost-5-en-3beta-yl]oxy}butyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-beta-D-glucopyranoside × 4 YUV (25R)-14beta,17beta-spirost-5-en-3beta-ol × 4 A1CGW 5-chloro-N-[(5-chloro-1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1,2-benzothiazol-6-amine × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9P3O Zebrafish TRPM5 with 5mM calcium and 0.5mM CBTA 提交 2025-06-14 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 8 YUV (25R)-14beta,17beta-spirost-5-en-3beta-ol × 4 A1CGW 5-chloro-N-[(5-chloro-1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1,2-benzothiazol-6-amine × 4 YUY (2R)-2-(hydroxymethyl)-4-{[(25R)-10alpha,14beta,17beta-spirost-5-en-3beta-yl]oxy}butyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-beta-D-glucopyranoside × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.92 Å |
| 9P3P Zebrafish TRPM5 with 5mM EGTA and 0.5mM CBTA 提交 2025-06-14 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 YUY (2R)-2-(hydroxymethyl)-4-{[(25R)-10alpha,14beta,17beta-spirost-5-en-3beta-yl]oxy}butyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-beta-D-glucopyranoside × 4 YUV (25R)-14beta,17beta-spirost-5-en-3beta-ol × 4 A1CGW 5-chloro-N-[(5-chloro-1,3-thiazol-2-yl)methyl]-1,2-benzothiazol-6-amine × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9P3T Zebrafish TRPM5 with 5mM calcium and 0.5mM TPPO 提交 2025-06-14 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 8 YUY (2R)-2-(hydroxymethyl)-4-{[(25R)-10alpha,14beta,17beta-spirost-5-en-3beta-yl]oxy}butyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-beta-D-glucopyranoside × 4 YUV (25R)-14beta,17beta-spirost-5-en-3beta-ol × 4 A1CG5 oxotri(phenyl)-lambda~5~-phosphane × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9QBF HER2/ErbB2 extracellular domain (ECD) in compact conformation in complex with trastuzumab (TZB) antibody 提交 2025-03-02 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Del1-22,Del1030-1255,C789S,C805S,C965S. | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9QBG HER2/ErbB2 extracellular domain (ECD) in extended conformation in complex with trastuzumab (TZB) antibody 提交 2025-03-02 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Del1-22,Del1030-1255,C789S,C805S,C965S. | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9QBH HER2/ErbB2 extracellular domain (ECD) from a near full-length construct solubilized in amphipols. 提交 2025-03-02 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：Del1-22,Del1030-1255,C789S,C805S,C965S. | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.77 Å |
| 9QKS B subtilis Type VIIb Core Unit (T7bCU) + DUF 提交 2025-03-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 G
7–230（224 aa）
链 H
7–230（224 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9QNF Connexin-32 (Cx32) in MSP2N2 nanodiscs with POPC 提交 2025-03-25 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
链 E
2–238（237 aa）
链 F
2–238（237 aa）
链 G
2–238（237 aa）
链 H
2–238（237 aa）
链 I
2–238（237 aa）
链 J
2–238（237 aa）
链 K
2–238（237 aa）
链 L
2–238（237 aa）
|
未记录 | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 12 CLR CHOLESTEROL × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 9QNT Connexin-32 (Cx32) in MSP2N2 nanodiscs with liver polar lipids 提交 2025-03-25 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
2–238（237 aa）
链 E
2–238（237 aa）
链 F
2–238（237 aa）
链 G
2–238（237 aa）
链 H
2–238（237 aa）
链 I
2–238（237 aa）
链 J
2–238（237 aa）
链 K
2–238（237 aa）
链 L
2–238（237 aa）
|
未记录 | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 12 CLR CHOLESTEROL × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 9QXL The structure of ADGRL4 in the active-state 提交 2025-04-15 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 9RGB M.tuberculosis MmpS5L5-acpM complex 提交 2025-06-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 D
2–238（237 aa）
链 E
2–238（237 aa）
链 F
2–238（237 aa）
|
未记录 | L9Q (1S)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(octadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM HEPES pH 8.0, 150 mM NaCl, 0.004% LMNG
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 V
2–238（237 aa）
|
未记录 | PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9RL5 a5b3 GABAAR bound to Topiramate, GABA, and Mb25 in a desensitized state in saposin nanodiscs 提交 2025-06-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 E
2–238（237 aa）
|
未记录 | ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 TOR [(3aS,5aR,8aR,8bS)-2,2,7,7-tetramethyltetrahydro-3aH-bis[1,3]dioxolo[4,5-b:4',5'-d]pyran-3a-yl]methyl sulfamate × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 V
2–238（237 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 V
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.90 Å |
| 9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 V
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 9RPB a5b3 GABAAR bound to GABA, and Mb25 in a desensitized state in saposin nanodiscs, topiramate-free 提交 2025-06-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 D
1–238（238 aa）
链 E
2–238（237 aa）
|
未记录 | ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9RPD D. melanogaster Augmin TII N-clamp (GST-fusion) bound to a microtubule, well-defined subset of particles 提交 2025-06-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 K
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.90 Å |
| 9S0T Superfolder green fluorescent protein (sfGFP) exhibiting p-(phenylazo)-L-phenylalanine (Pap) at position 39 in complex with alpha-cyclodextrin 提交 2025-07-17 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；3 M sodium chloride, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.228 |
| 9S0T Superfolder green fluorescent protein (sfGFP) exhibiting p-(phenylazo)-L-phenylalanine (Pap) at position 39 in complex with alpha-cyclodextrin 提交 2025-07-17 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；3 M sodium chloride, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.228 |
| 9S2U 1:1 complex of M.tuberculosis MmpL5 and M.smegmatis AcpM 提交 2025-07-22 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM HEPES pH8.0, 150 mM NaCl, 0.004% LMNG, 50 uM Bedaquiline
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9SDL Cryo-EM structure of PfHT1 bound to 2,5-anhydro-D-mannitol 提交 2025-08-14 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
|
未记录 | A1IVP 2.5-anhydro-D-mannitol × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.42 Å |
| 9SYR Human quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatD 提交 2025-10-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致 |
链 LN
2–230（229 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 COA COENZYME A × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.55 Å |
| 9T9P Adenosine receptor A2a (A2AR)-beta-lactamase fusion bound to beta-lactamase inhibitory protein II (BLIPII) and ZM241385 提交 2025-11-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–238（237 aa）
|
未记录 | ZMA 4-{2-[(7-amino-2-furan-2-yl[1,2,4]triazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-5-yl)amino]ethyl}phenol × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9U9D Bipartite Genetically Encoded Biosensor sG-GECO1 提交 2025-03-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
149–172（24 aa）
链 B
170–238（69 aa）
链 B
2–146（145 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2m sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1M Bis-Tris propane pH 8.5, 20% w/v PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.227 |
| 9VED The cryo-EM structure of mouse Piezo1-MDFI complex 提交 2025-06-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.63 Å |
| 9VEE The cryo-EM structure of human Piezo2-MDFIC2 complex (composite map) 提交 2025-06-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 B
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
| 9VEF The cryo-EM structure of human Piezo2-MDFIC complex (composite map) 提交 2025-06-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
2–238（237 aa）
链 C
2–238（237 aa）
链 E
2–238（237 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.75 Å |
| 9VUI Cryo-EM structure of the human measles virus RNA-dependent RNA polymerase complex bound to viral protein C 提交 2025-07-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 X
1–238（238 aa）
链 Y
1–238（238 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；300mM NaCl, 25mM HEPES, 1mM TCEP, 6mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.72 Å |
| 9W1Y DENV2 non-structural protein 1 (NS1) with C-terminal mVenus Conformation 2 提交 2025-07-26 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
链 a
1–238（238 aa）
链 b
1–238（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å |
| 9W24 DENV2 non-structural protein 1 (NS1) with C-terminal mVenus fusion 提交 2025-07-26 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
链 a
1–238（238 aa）
链 b
1–238（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9W25 DENV2 non-structural protein 1 (NS1) with C-terminal mVenus Conformation 1 提交 2025-07-26 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
链 a
1–238（238 aa）
链 b
1–238（238 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.30 Å |
| 9W62 Cryo-EM structure of human ABCD3 in inward-facing conformation in the presence of phytanoyl-CoA 提交 2025-08-03 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–238（238 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 4 LBN 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.28 Å |
| 9W63 Cryo-EM structure of C20:5-CoA bound state human ABCD3 in inward-facing conformation 提交 2025-08-03 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
未记录 | 3IX S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-3-phosphonooxy-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenethioate × 2 CLR CHOLESTEROL × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 9W64 Cryo-EM structure of CHS bound state human ABCD3 in inward-facing conformation 提交 2025-08-03 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
未记录 | Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.81 Å |
| 9W65 Cryo-EM structure of ATP bound state human ABCD3 in inward-facing conformation 提交 2025-08-03 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：E596Q | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 CLR CHOLESTEROL × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 9W66 Cryo-EM structure of ATP bound state human ABCD3 in outward-facing conformation 提交 2025-08-03 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
|
突变：E596Q | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9YOP Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin in the interacting-heads motif and S2-FH docked state 提交 2025-10-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9YP4 Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin bound to omecamtiv mecarbil in the interacting-heads motif and S2-FH docked state 提交 2025-10-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
|
未记录 | 2OW methyl 4-(2-fluoro-3-{[(6-methylpyridin-3-yl)carbamoyl]amino}benzyl)piperazine-1-carboxylate × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 9YP9 Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin bound to mavacamten in the interacting-heads motif and S2-FH docked state 提交 2025-10-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 XB2 Mavacamten × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9YR7 Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin bound to mavacamten in the interacting-heads motif and S2-FH undocked state 提交 2025-10-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
|
未记录 | XB2 Mavacamten × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9YRG Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin in the interacting-heads motif and S2-FH undocked state 提交 2025-10-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9YRH Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin bound to omecamtiv mecarbil in the interacting-heads motif and S2-FH undocked state 提交 2025-10-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–238（238 aa）
链 B
1–238（238 aa）
|
未记录 | 2OW methyl 4-(2-fluoro-3-{[(6-methylpyridin-3-yl)carbamoyl]amino}benzyl)piperazine-1-carboxylate × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9YZQ Isoreticular co-crystal 1 with asymmetrical expanded duplex (31mer) containing insert sequence TGATGAGCAG and loaded with Engrailed homeodomain enhanced Green fluorescent protein fusion 提交 2025-10-30 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–238（238 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；40mM Magnesium acetate, 1.4M Lithium sulfate, 50mM MES pH 6.5. The crystal was crosslinked with 45mg/mL EDC overnight, and then looped into a solution of 50mM potassium chloride, 4mM calcium chloride, 10% glycerol, and 10mM Tris hydrochloride for 1 hour. The drop was then supplemented with 22 micromolar engrailed homeodomain-enhanced Green fluorescent protein fusion
|
分辨率 3.75 Å R-free 0.338 |