8v8c

Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor time resolved bound to epibatidine and PNU-120596 asymmetric state 1

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 138.8 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7,Soluble cytochrome b562

Homo sapiens

UniProt P0ABE7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 × 5 其他聚合物 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 23–128 链 B; UniProt 23–128 链 C; UniProt 23–128 链 D; UniProt 23–128 链 E; UniProt 23–128 未记录 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 EPJ EPIBATIDINE × 5 I34 N-(5-Chloro-2,4-dimethoxyphenyl)-N'-(5-methyl-3-isoxazolyl)-urea × 5 CA CALCIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.29 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 714 个其他 PDB 条目、822 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C562_ECOLX
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 355–460; UniProt 23–128 作者链 B; PDB构建体 355–460; UniProt 23–128 作者链 C; PDB构建体 355–460; UniProt 23–128 作者链 D; PDB构建体 355–460; UniProt 23–128 作者链 E; PDB构建体 355–460; UniProt 23–128

Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7,Soluble cytochrome b562

Homo sapiens

UniProt P36544

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 × 5 其他聚合物 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 24–412 链 A; UniProt 413–502 链 B; UniProt 24–412 链 B; UniProt 413–502 链 C; UniProt 24–412 链 C; UniProt 413–502 链 D; UniProt 24–412 链 D; UniProt 413–502 链 E; UniProt 24–412 链 E; UniProt 413–502 未记录 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 EPJ EPIBATIDINE × 5 I34 N-(5-Chloro-2,4-dimethoxyphenyl)-N'-(5-methyl-3-isoxazolyl)-urea × 5 CA CALCIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.29 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 44 个其他 PDB 条目、44 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACHA7_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–350; UniProt 24–412 作者链 A; PDB构建体 461–550; UniProt 413–502 作者链 B; PDB构建体 1–350; UniProt 24–412 作者链 B; PDB构建体 461–550; UniProt 413–502 作者链 C; PDB构建体 1–350; UniProt 24–412 作者链 C; PDB构建体 461–550; UniProt 413–502 作者链 D; PDB构建体 1–350; UniProt 24–412 作者链 D; PDB构建体 461–550; UniProt 413–502 作者链 E; PDB构建体 1–350; UniProt 24–412 作者链 E; PDB构建体 461–550; UniProt 413–502

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8v8c

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8v8c
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8v8c
沉积日期 deposition_date2023-12-05
结构标题 titleAlpha7-nicotinic acetylcholine receptor time resolved bound to epibatidine and PNU-120596 asymmetric state 1
关键词 keywordsION CHANNEL, MEMBRANE PROTEIN, NICOTINIC RECEPTOR; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier41.57
回转半径 Rg (电子) rg_electron40.82
零角强度 I(0) i0655034000.00
分子量 molecular_weight221640.0 kDa
排除体积 excluded_volume281550 ų
包络体积 envelope_volume368290 ų
水化壳体积 shell_volume73488 ų
包络直径 envelope_diameter143.1
壳层 Rg shell_rg47.19
包络 Rg envelope_rg41.22
形状 Rg shape_rg40.84
总 Rg total_rg41.11
总原子数 total_atoms30959
残基数 n_residues1879
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax138.8
Rg (实空间) rg_real41.62
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.17
I(0) (实空间) i0_real6.5500e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.0900e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal41.57
I(0) (倒空间) i0_reciprocal655000000.0000
解质量估计 total_estimate0.6261
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary47.5
偏度 Skewness skewness0.449
峰度 Kurtosis kurtosis-0.245
角度范围 angular_range— – 0.1900 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha117500000.0000
实空间数据点数 n_real_points39
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.759; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.008; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.834

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)