Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 3)

Histone H3.1

Homo sapiens

UniProt P68431

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 10 DNA 2 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 1–136 链 E； UniProt 1–136	未记录	Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2B type 1-C/E/F/G/I × 2 （P62807） DNA (147-MER) × 1 DNA (147-MER) × 1 E3 ubiquitin-protein ligase RNF168 × 1 （Q8IYW5） Polyubiquitin-B × 1 （P0CG47） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8TXX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2B2T Tandem chromodomains of human CHD1 complexed with Histone H3 Tail containing trimethyllysine 4 and phosphothreonine 3 提交 2005-09-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–19（19 aa） 片段：residues 1-19	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；283 K；4% PEG3350, 0.05M HEPES, pH 8.0, 10mM BTP, 12.5mM NaCl, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K, pH 8.00	分辨率 2.45 Å R-free 0.266
2B2U Tandem chromodomains of human CHD1 complexed with Histone H3 Tail containing trimethyllysine 4 and dimethylarginine 2 提交 2005-09-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–15（15 aa） 片段：residues 1-15	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；283 K；4% PEG3350, 0.05M HEPES, pH 8.0, 10mM BTP, 12.5mM NaCl, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K, pH 8.00	分辨率 2.95 Å R-free 0.290
2B2V Crystal structure analysis of human CHD1 chromodomains 1 and 2 bound to histone H3 resi 1-15 MeK4 提交 2005-09-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–15（15 aa） 片段：residues 1-15	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；283 K；4% PEG3350, 0.05M HEPES, pH 8.0, 10mM BTP, 12.5mM NaCl, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K, pH 8.00	分辨率 2.65 Å R-free 0.266
2B2W Tandem chromodomains of human CHD1 complexed with Histone H3 Tail containing trimethyllysine 4 提交 2005-09-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–19（19 aa） 片段：residues 1-19	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；283 K；4% PEG3350, 0.05M HEPES pH 8.0, 10mM BTP, 12.5mM NaCl, 5mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K, pH 8.00	分辨率 2.40 Å R-free 0.273
2CV5 Crystal structure of human nucleosome core particle 提交 2005-05-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 0–135（136 aa） 链 E 0–135（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 9 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.277
2L75 Solution structure of CHD4-PHD2 in complex with H3K9me3 提交 2010-12-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–14（13 aa） 片段：UNP residues 2-14	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）15；压力 ambient NMR样品组成 1 mM CHD4-PHD2-1; 1 mM H3K9me3-2, 20 uM DSS-3; 1 mM DTT-4; 5 mM sodium chloride-5; 10 mM sodium phosphate-6; 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CHD4-PHD2-7; 1.1 mM H3K9me3-8; 20 uM DSS-9; 1 mM DTT-10; 5 mM sodium chloride-11; 10 mM sodium phosphate-12; 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CHD4-PHD2-13; 1.1 mM H3K9me3-14; 20 uM DSS-15; 1 mM DTT-16; 5 mM sodium chloride-17; 10 mM sodium phosphate-18; 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
2RI7 Crystal structure of PHD finger-linker-bromodomain Y17E mutant from human BPTF in the H3(1-9)K4ME2 bound state 提交 2007-10-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 2–10（9 aa） 片段：N-terminal tail residues 2-10	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；BPTF Y17E PHD finger-linker-bromodomain (16.5 mg/ml, 20 mM Tris-HCl pH 7.5, 50 mM KCl) was pre-incubated with three-fold molar excess of H3(1-9)K4me2 peptide in the presence of 5 mM MgCl2 for about 30 min on ice. Drops were made by mixing 2 l each of the complex with the reservoir solution: 8.5% isopropanol, 0.085 M Hepes-Na, pH 7.5, 17% PEG 4000, 15% Glycerol. A 0.3 l of 1 M KCl was then added to the drops as additive., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.45 Å R-free 0.192
2UXN Structural Basis of Histone Demethylation by LSD1 Revealed by Suicide Inactivation 提交 2007-03-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 2–22（21 aa） 片段：HISTONE H3-DERIVED SUICIDE INHIBITOR, RESIDUES 2-22	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FDA DIHYDROFLAVINE-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；PROTEIN: 25 MM HEPES, PH 7.4, 200 MM SODIUM CHLORIDE, 1 MM PMSF, AND 5 MM DTT RESERVOIR: 0.8 M LITHIUM SULFATE, 0.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.4 M SODIUM CHLORIDE, 0.1 M SODIUM CITRATE, PH 5.6, AND 10 MM DTT	分辨率 2.72 Å R-free 0.272
3A1B Crystal structure of the DNMT3A ADD domain in complex with histone H3 提交 2009-03-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–21（20 aa） 片段：ADD(ATRX-DNMT3-DNMT3L) domain(residues 476-614), UNP residues 2-21(Histone H3.1)	未记录	ZN ZINC ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；10% PEG 2000 monomethyl ether, 0.1M Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.29 Å R-free 0.224
3AFA The human nucleosome structure 提交 2010-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
3AYW Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K56Q mutation 提交 2011-05-19	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：K56Q 突变：K56Q	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.90 Å R-free 0.273
3AZE Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K64Q mutation 提交 2011-05-25	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：K64Q 突变：K64Q	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.302
3AZF Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K79Q mutation 提交 2011-05-25	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：K79Q 突变：K79Q	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.70 Å R-free 0.263
3AZG Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K115Q mutation 提交 2011-05-25	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：K115Q 突变：K115Q	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.40 Å R-free 0.269
3AZH Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K122Q mutation 提交 2011-05-25	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：K122Q 突变：K122Q	CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.49 Å R-free 0.266
3AZI Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K31Q mutation 提交 2011-05-25	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.70 Å R-free 0.289
3AZJ Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K44Q mutation 提交 2011-05-25	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.89 Å R-free 0.268
3AZK Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K59Q mutation 提交 2011-05-25	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3AZL Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K77Q mutation 提交 2011-05-25	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.70 Å R-free 0.259
3AZM Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K79Q mutation 提交 2011-05-25	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.89 Å R-free 0.296
3AZN Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K91Q mutation 提交 2011-05-25	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.254
3KMT Crystal structure of vSET/SAH/H3 ternary complex 提交 2009-11-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 26–33（8 aa） 片段：residues 26-33	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；26% PEG 4000, 0.1 M sodium citrate pH 6.3, 5% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.78 Å R-free 0.224
3KMT Crystal structure of vSET/SAH/H3 ternary complex 提交 2009-11-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 26–33（8 aa） 片段：residues 26-33	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；26% PEG 4000, 0.1 M sodium citrate pH 6.3, 5% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.78 Å R-free 0.224
3KMT Crystal structure of vSET/SAH/H3 ternary complex 提交 2009-11-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 26–33（8 aa） 片段：residues 26-33	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；26% PEG 4000, 0.1 M sodium citrate pH 6.3, 5% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.78 Å R-free 0.224
3KMT Crystal structure of vSET/SAH/H3 ternary complex 提交 2009-11-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 26–33（8 aa） 片段：residues 26-33 链 H 26–33（8 aa） 片段：residues 26-33	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；26% PEG 4000, 0.1 M sodium citrate pH 6.3, 5% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.78 Å R-free 0.224
3KMT Crystal structure of vSET/SAH/H3 ternary complex 提交 2009-11-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 26–33（8 aa） 片段：residues 26-33	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；26% PEG 4000, 0.1 M sodium citrate pH 6.3, 5% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.78 Å R-free 0.224
3KQI crystal structure of PHF2 PHD domain complexed with H3K4Me3 peptide 提交 2009-11-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–12（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；2.0 M ammonium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.78 Å R-free 0.218
3KQI crystal structure of PHF2 PHD domain complexed with H3K4Me3 peptide 提交 2009-11-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–12（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；2.0 M ammonium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.78 Å R-free 0.218
3LQI Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me2 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 R 2–10（9 aa） 片段：Histone H3 N-terminal tail	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M ammonium acetate, 25% PEG3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.92 Å R-free 0.241
3LQI Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me2 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 S 2–10（9 aa） 片段：Histone H3 N-terminal tail	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M ammonium acetate, 25% PEG3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.92 Å R-free 0.241
3LQI Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me2 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 2–10（9 aa） 片段：Histone H3 N-terminal tail	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M ammonium acetate, 25% PEG3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.92 Å R-free 0.241
3LQJ Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me3 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Q 2–10（9 aa） 片段：Histone H3 N-terminal tail	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 0.2 M Li2SO4, 15% PEG3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.274
3LQJ Crystal structure of MLL1 PHD3-Bromo complexed with H3(1-9)K4me3 peptide 提交 2010-02-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 2–10（9 aa） 片段：Histone H3 N-terminal tail	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；293 K；0.1 M Tris, 0.2 M Li2SO4, 15% PEG3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.274
3O34 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H3(13-32)K23ac peptide 提交 2010-07-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 14–33（20 aa） 片段：UNP residues 14-35	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2 BTN BIOTIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；100 mM Na-citrate (pH 5.6), 200 mM K/Na-tartrate tetrahydrate and 1.6 M ammonium sulfate , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.241
3O35 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H3(23-31)K27ac peptide 提交 2010-07-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 24–32（9 aa） 片段：UNP residues 14 -22	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；200 mM Na-acetate, 30% Polyethylene glycol 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.76 Å R-free 0.225
3O35 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H3(23-31)K27ac peptide 提交 2010-07-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 24–32（9 aa） 片段：UNP residues 14 -22	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；200 mM Na-acetate, 30% Polyethylene glycol 4000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.76 Å R-free 0.225
3O37 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H3(1-10)K4 peptide 提交 2010-07-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 2–11（10 aa） 片段：UNP residues 2-11	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM Tris (pH 7.5), 30% Polyethylene glycol monomethyl ether 5000 and 100 mM NaCl , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.254
3O37 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H3(1-10)K4 peptide 提交 2010-07-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 2–11（10 aa） 片段：UNP residues 2-11	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM Tris (pH 7.5), 30% Polyethylene glycol monomethyl ether 5000 and 100 mM NaCl , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.254
3O37 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H3(1-10)K4 peptide 提交 2010-07-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 2–11（10 aa） 片段：UNP residues 2-11	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM Tris (pH 7.5), 30% Polyethylene glycol monomethyl ether 5000 and 100 mM NaCl , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.254
3O37 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H3(1-10)K4 peptide 提交 2010-07-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 2–11（10 aa） 片段：UNP residues 2-11	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；50 mM Tris (pH 7.5), 30% Polyethylene glycol monomethyl ether 5000 and 100 mM NaCl , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.254
3U4S Histone Lysine demethylase JMJD2A in complex with T11C peptide substrate crosslinked to N-oxalyl-D-cysteine 提交 2011-10-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 8–15（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NI NICKEL (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 08P N-(carboxycarbonyl)-D-cysteine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG 3350, 0.1M citrate, 2 mM NiCl2, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.15 Å R-free 0.222
3U4S Histone Lysine demethylase JMJD2A in complex with T11C peptide substrate crosslinked to N-oxalyl-D-cysteine 提交 2011-10-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 8–15（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NI NICKEL (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 08P N-(carboxycarbonyl)-D-cysteine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG 3350, 0.1M citrate, 2 mM NiCl2, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.15 Å R-free 0.222
3U5N Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-20)K9me3K14ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–21（20 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9 and acetylated K14, UNP residues 2-21	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M ammonium tartrate and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.95 Å R-free 0.256
3U5N Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-20)K9me3K14ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–21（20 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9 and acetylated K14, UNP residues 2-21	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M ammonium tartrate and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.95 Å R-free 0.256
3U5O Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-22)K9me3K14acK18ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 2–23（22 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14 and K18, UNP residues 2-23	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium citrate and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.280
3U5O Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-22)K9me3K14acK18ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2–23（22 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14 and K18, UNP residues 2-23	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium citrate and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.280
3U5O Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-22)K9me3K14acK18ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 2–23（22 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14 and K18, UNP residues 2-23	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium citrate and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.280
3U5O Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-22)K9me3K14acK18ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 2–23（22 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14 and K18, UNP residues 2-23	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium citrate and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.280
3U5O Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-22)K9me3K14acK18ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 2–23（22 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14 and K18, UNP residues 2-23	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium citrate and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.280
3U5O Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-22)K9me3K14acK18ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 2–23（22 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14 and K18, UNP residues 2-23	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium citrate and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.280
3U5O Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-22)K9me3K14acK18ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 2–23（22 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14 and K18, UNP residues 2-23	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium citrate and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.280
3U5O Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-22)K9me3K14acK18ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 2–23（22 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14 and K18, UNP residues 2-23	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium citrate and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.280
3U5P Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-28)K9me3K14acK18acK23ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 2–29（28 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14, K18 and K23, UNP residues 2-29	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M lithium sulfate, 0.1 mM Tris pH 8.0 and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.265
3U5P Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-28)K9me3K14acK18acK23ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 2–29（28 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14, K18 and K23, UNP residues 2-29	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M lithium sulfate, 0.1 mM Tris pH 8.0 and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.265
3U5P Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-28)K9me3K14acK18acK23ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 2–29（28 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14, K18 and K23, UNP residues 2-29	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M lithium sulfate, 0.1 mM Tris pH 8.0 and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.265
3U5P Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-28)K9me3K14acK18acK23ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 2–29（28 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14, K18 and K23, UNP residues 2-29	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M lithium sulfate, 0.1 mM Tris pH 8.0 and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.265
3U5P Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-28)K9me3K14acK18acK23ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 2–29（28 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14, K18 and K23, UNP residues 2-29	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M lithium sulfate, 0.1 mM Tris pH 8.0 and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.265
3U5P Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-28)K9me3K14acK18acK23ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 2–29（28 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14, K18 and K23, UNP residues 2-29	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M lithium sulfate, 0.1 mM Tris pH 8.0 and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.265
3U5P Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-28)K9me3K14acK18acK23ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 2–29（28 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14, K18 and K23, UNP residues 2-29	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M lithium sulfate, 0.1 mM Tris pH 8.0 and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.265
3U5P Crystal structure of the complex of TRIM33 PHD-Bromo and H3(1-28)K9me3K14acK18acK23ac histone peptide 提交 2011-10-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 2–29（28 aa） 片段：N-terminal histone H3 peptide containing trimethylated K9, acetylated K14, K18 and K23, UNP residues 2-29	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M lithium sulfate, 0.1 mM Tris pH 8.0 and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.265
3V43 Crystal structure of MOZ 提交 2011-12-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Q 2–19（18 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-19	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 4 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M tri-sodium citrate, 30% w/v PEG 4000, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K	分辨率 1.47 Å R-free 0.176
3W96 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H2A N-terminal region 提交 2013-04-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.296
3W97 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H2B N-terminal region 提交 2013-04-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.20 Å R-free 0.321
3W98 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H3.1 N-terminal region 提交 2013-04-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 29–136（108 aa） 片段：UNP residues 29-136 链 E 29–136（108 aa） 片段：UNP residues 29-136	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.42 Å R-free 0.303
3W99 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H4 N-terminal region 提交 2013-04-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.312
3WA9 The nucleosome containing human H2A.Z.1 提交 2013-04-30	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.07 Å R-free 0.271
3WAA The nucleosome containing human H2A.Z.2 提交 2013-04-30	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.271
3WKJ The nucleosome containing human TSH2B 提交 2013-10-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.291
3X1S Crystal structure of the nucleosome core particle 提交 2014-11-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70mM KCL, 70-90mM MnCl2, 24% MPD, 20mM Na-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.81 Å R-free 0.270
3X1T Crystal structure of nucleosome core particle consisting of mouse testis specific histone variants H2aa and H2ba 提交 2014-11-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 22 CL CHLORIDE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70mM Kcl, 70-90mM MnCl2, 24% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.81 Å R-free 0.266
3X1U Crystal structure of nucleosome core particle in the presence of histone variants involved in reprogramming 提交 2014-11-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CL CHLORIDE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70 mM KCl, 70-90 mM MnCl2, 24% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.25 Å R-free 0.270
3X1V Crystal structure of nucleosome core particle in the presence of histone variant involved in reprogramming 提交 2014-11-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 19 CL CHLORIDE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70 mM KCl, 70-90 mM MnCl2, Na-cocodylate, 24% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.92 Å R-free 0.259
3ZVY PHD finger of human UHRF1 in complex with unmodified histone H3 N- terminal tail 提交 2011-07-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–9（8 aa） 片段：RESIDUES 2-9	未记录	ZN ZINC ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；290 K；CRYSTALS WERE OBTAINED AT 17 DEGREES USING THE VAPOR DIFFUSION METHOD BY MIXING A PROTEIN SOLUTION AT A CONCENTRATION OF 606 MICROM (IN 20 MM TRIS PH 7, 150 MM NACL, 0.5 MM TCEP, 25 MICROM ZNCL2 AND 0.1 MM PMSF) AND 10-FOLD EXCESS OF PEPTIDE WITH AN EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION (0.1 M TRIS PH 8.5, 0.2 M MGCL2, 30 % PEG 4000). CRYSTALS WERE CRYOPROTECTED WITH 15 % MPD AND FLASH FROZEN IN LIQUID NITROGEN.	分辨率 1.95 Å R-free 0.227
3ZVY PHD finger of human UHRF1 in complex with unmodified histone H3 N- terminal tail 提交 2011-07-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–9（8 aa） 片段：RESIDUES 2-9	未记录	ZN ZINC ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；290 K；CRYSTALS WERE OBTAINED AT 17 DEGREES USING THE VAPOR DIFFUSION METHOD BY MIXING A PROTEIN SOLUTION AT A CONCENTRATION OF 606 MICROM (IN 20 MM TRIS PH 7, 150 MM NACL, 0.5 MM TCEP, 25 MICROM ZNCL2 AND 0.1 MM PMSF) AND 10-FOLD EXCESS OF PEPTIDE WITH AN EQUAL VOLUME OF RESERVOIR SOLUTION (0.1 M TRIS PH 8.5, 0.2 M MGCL2, 30 % PEG 4000). CRYSTALS WERE CRYOPROTECTED WITH 15 % MPD AND FLASH FROZEN IN LIQUID NITROGEN.	分辨率 1.95 Å R-free 0.227
4BD3 Phf19 links methylated lysine 36 of histone H3 to regulation of Polycomb activity 提交 2012-10-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 32–42（11 aa） 片段：H3(31-41)K36ME3, RESIDUES 32-42	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 1.0 NMR样品组成 90% WATER/10% D2O	分辨率未提供
4C1Q Crystal structure of the PRDM9 SET domain in complex with H3K4me2 and AdoHcy. 提交 2013-08-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–11（10 aa） 片段：N-TERMINUS, RESIDUES 2-11	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；278 K；0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5 AND 25% W/V PEG3350	分辨率 2.30 Å R-free 0.252
4F4U The bicyclic intermediate structure provides insights into the desuccinylation mechanism of SIRT5 提交 2012-05-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 5–16（12 aa） 片段：UNP residue 5-16	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；16% PEG 4000, 6% Glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.261
4F4U The bicyclic intermediate structure provides insights into the desuccinylation mechanism of SIRT5 提交 2012-05-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 5–16（12 aa） 片段：UNP residue 5-16	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；16% PEG 4000, 6% Glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.261
4F56 The bicyclic intermediate structure provides insights into the desuccinylation mechanism of SIRT5 提交 2012-05-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 5–16（12 aa） 片段：UNP residue 5-16	未记录	ZN ZINC ION × 1 CGK 3-[(2R,3aR,5R,6R,6aR)-5-({[(S)-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}methyl)-2,6-dihydroxytetrahydrofuro[2,3-d][1,3]oxathiol-2-yl]propanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；30% PEG 10000, 0.1M Tris, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.233
4F56 The bicyclic intermediate structure provides insights into the desuccinylation mechanism of SIRT5 提交 2012-05-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 5–16（12 aa） 片段：UNP residue 5-16	未记录	ZN ZINC ION × 1 CGK 3-[(2R,3aR,5R,6R,6aR)-5-({[(S)-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}methyl)-2,6-dihydroxytetrahydrofuro[2,3-d][1,3]oxathiol-2-yl]propanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；30% PEG 10000, 0.1M Tris, pH 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.233
4FT2 crystal structure of Zea mays ZMET2 in complex H3(1-15)K9me2 peptide and SAH 提交 2012-06-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 16–30（15 aa） 片段：histone H3 peptide, UNP residues 16-30	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.2 M calcium acetate, 0.1 M imidazole pH 8.0, and 10% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.20 Å R-free 0.277
4FT4 crystal structure of Zea mays ZMET2 in complex H3(1-32)K9me2 peptide and SAH 提交 2012-06-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Q 33–64（32 aa） 片段：histone H3 peptide, UNP residues 33-64	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M sodium citrate, 0.1 M bis-tris propane, pH 6.5 and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.70 Å R-free 0.248
4FT4 crystal structure of Zea mays ZMET2 in complex H3(1-32)K9me2 peptide and SAH 提交 2012-06-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 33–64（32 aa） 片段：histone H3 peptide, UNP residues 33-64	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M sodium citrate, 0.1 M bis-tris propane, pH 6.5 and 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.70 Å R-free 0.248
4FWF Complex structure of LSD2/AOF1/KDM1b with H3K4 mimic 提交 2012-07-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 2–21（20 aa） 片段：UNP residues 2-21	突变：K4M	ZN ZINC ION × 3 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；21% PEG3350, 200mM diammonium citrate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.70 Å R-free 0.237
4LK9 Crystal Structure of MOZ double PHD finger histone H3 tail complex 提交 2013-07-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–22（21 aa） 片段：unp residues 2-22	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；283 K；100 mM Na-Hepes, 1.4 M sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 283K	分辨率 1.60 Å R-free 0.186
4LKA Crystal Structure of MOZ double PHD finger histone H3K9ac complex 提交 2013-07-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–22（21 aa） 片段：unp residues 2-22	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；283 K；100 mM Na-Hepes, 1.4 M sodium citrate, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 283K	分辨率 1.61 Å R-free 0.185
4LLB Crystal Structure of MOZ double PHD finger histone H3K14ac complex 提交 2013-07-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–22（21 aa） 片段：unp residues 2-22	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；283 K；100 mM Tris-Cl, 200 mM Li2SO4, 30% PEG 4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 283K	分辨率 2.50 Å R-free 0.266
4LLB Crystal Structure of MOZ double PHD finger histone H3K14ac complex 提交 2013-07-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–22（21 aa） 片段：unp residues 2-22	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；283 K；100 mM Tris-Cl, 200 mM Li2SO4, 30% PEG 4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 283K	分辨率 2.50 Å R-free 0.266
4N4H Crystal structure of the Bromo-PWWP of the mouse zinc finger MYND-type containing 11 isoform alpha in complex with histone H3.1K36me3 提交 2013-10-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 22–43（22 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；289 K；25% (w/v) polyethylene glycol 4000, 0.1M Tris-HCl, pH 8.3, 0.2M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.30 Å R-free 0.263
4UP0 Ternary crystal structure of the Pygo2 PHD finger in complex with the B9L HD1 domain and a H3K4me2 peptide 提交 2014-06-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 2–16（15 aa） 片段：RESIDUES 2-16	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1 M SODIUM CITRATE, 0.1 M TRIS PH 7, 0.2 M NACL	分辨率 1.28 Å R-free 0.166
4YM5 Crystal structure of the human nucleosome containing 6-4PP (inside) 提交 2015-03-06	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 4.00 Å R-free 0.289
4YM6 Crystal structure of the human nucleosome containing 6-4PP (outside) 提交 2015-03-06	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 3.51 Å R-free 0.287
4Z0R Crystal Structure of the CW domain of ZCWPW2 mutant F78R in complex with histone H3 peptide 提交 2015-03-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–16（15 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-16)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；2 M ammonium sulfate, 2% PEG400, 0.1 M HEPES sodium	分辨率 1.75 Å R-free 0.192
4Z2M Crystal structure of human SPT16 Mid-AID/H3-H4 tetramer FACT Histone complex 提交 2015-03-30	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 35–136（102 aa） 片段：UNP residues 35-136 链 I 35–136（102 aa） 片段：UNP residues 35-136	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；10% PEG400, 0.9-1.1 M Imidazole, 100-150 mM L-histidine	分辨率 2.98 Å R-free 0.246
5AV5 human nucleosome core particle 提交 2015-06-11	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.233
5AV6 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.20 Å R-free 0.229
5AV8 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.20 Å R-free 0.233
5AV9 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.20 Å R-free 0.239
5AVB human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.236
5AVC human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.238
5B24 The crystal structure of the nucleosome containing cyclobutane pyrimidine dimer 提交 2015-12-31	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 3.60 Å R-free 0.249
5B2I Human nucleosome containing CpG unmethylated DNA 提交 2016-01-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 3.00 Å R-free 0.257
5B2J Human nucleosome containing CpG methylated DNA 提交 2016-01-18	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.60 Å R-free 0.252
5B31 The crystal structure of the heterotypic H2AZ/H2A nucleosome with H3.1. 提交 2016-02-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.20 Å R-free 0.271
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0	分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0	分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0	分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 N 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0	分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0	分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 V 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0	分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5CPI Nucleosome containing unmethylated Sat2R DNA 提交 2015-07-21	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.90 Å R-free 0.295
5CPJ Nucleosome containing methylated Sat2R DNA 提交 2015-07-21	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 3.15 Å R-free 0.295
5CPK Nucleosome containing methylated Sat2L DNA 提交 2015-07-21	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.63 Å R-free 0.284
5GSE Crystal structure of unusual nucleosome 提交 2016-08-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；potassium bromide, potassium thiocyanate, Tris-HCl, PGA-LM, PEG 400	分辨率 3.14 Å R-free 0.255
5GSU Crystal structure of nucleosome core particle consisting of human testis-specific histone variants, Th2A and Th2B 提交 2016-08-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；20mM Pottasium Cacodylate pH 6.0, 60-70mM KCl, 70-90mM MnCl2	分辨率 3.10 Å R-free 0.257
5GT0 Crystal structure of nucleosome complex with human testis-specific histone variants, Th2a 提交 2016-08-18	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14 CL CHLORIDE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；60-70mM KCl, 70-90mM MnCl2, 24% MPD	分辨率 2.82 Å R-free 0.280
5GT3 Crystal structure of nucleosome particle in the presence of human testis-specific histone variant, hTh2b 提交 2016-08-18	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 12 CL CHLORIDE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；60-70mM KCl, 70-90mM MnCl2, 24% MPD	分辨率 2.91 Å R-free 0.258
5GTC Crystal structure of complex between DMAP-SH conjugated with a Kaposi's sarcoma herpesvirus LANA peptide (5-15) and nucleosome core particle 提交 2016-08-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.70 Å R-free 0.267
5HJB AF9 YEATS in complex with histone H3 Crotonylation at K9 提交 2016-01-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 4–11（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；20% (w/v) polyethylene glycol 4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 3% MPD	分辨率 2.70 Å R-free 0.253
5HJC BRD3 second bromodomain in complex with histone H3 acetylation at K18 提交 2016-01-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 16–24（9 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；30%(w/v) polyethylene glycol methyl ether 5000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES, 0.1 M guanidine hydrochloride	分辨率 2.60 Å R-free 0.269
5HJD AF9 YEATS in complex with histone H3 Crotonylation at K18 提交 2016-01-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 15–21（7 aa） 链 D 15–21（7 aa） 链 F 15–21（7 aa） 链 L 15–21（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CU COPPER (II) ION × 3 SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；20%(w/v) polyethylene glycol 4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M copper chloride dihydrate	分辨率 2.81 Å R-free 0.273
5HJD AF9 YEATS in complex with histone H3 Crotonylation at K18 提交 2016-01-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 H 15–21（7 aa） 链 I 15–21（7 aa） 链 J 15–21（7 aa） 链 M 15–21（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；20%(w/v) polyethylene glycol 4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M copper chloride dihydrate	分辨率 2.81 Å R-free 0.273
5IQL Crystal structure of YEATS2 YEATS bound to H3K27cr peptide 提交 2016-03-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 25–32（8 aa） 片段：H3 peptide (UNP RESIDUES 25-32)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris propane, 4.0 M NH4Ac, pH 7.0	分辨率 2.10 Å R-free 0.253
5J9S ENL YEATS in complex with histone H3 acetylation at K27 提交 2016-04-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 16–40（25 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M K/Na Tartrate, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, 2M (NH4)2SO4	分辨率 2.70 Å R-free 0.210
5JRG Crystal structure of the nucleosome containing the DNA with tetrahydrofuran (THF) 提交 2016-05-06	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.50 Å R-free 0.245
5KKL Structure of ctPRC2 in complex with H3K27me3 and H3K27M 提交 2016-06-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 23–31（9 aa）	突变：K2027M	ZN ZINC ION × 8 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15% PEG4000, 175mM ammonium citrate, pH 7.0	分辨率 2.94 Å R-free 0.234
5T1G chromo shadow domain of CBX1 in complex with a histone peptide 提交 2016-08-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 39–53（15 aa） 片段：unp residues 39-53	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UNX UNKNOWN LIGAND × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；1.5 M sodium citrate, 0.1 M HEPES	分辨率 1.90 Å R-free 0.243
5T1I CBX3 chromo shadow domain in complex with histone H3 peptide 提交 2016-08-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 39–53（15 aa） 片段：unp residues 39-53	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UNX UNKNOWN LIGAND × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 3350, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M Hepes, 5% Ethylene Glycol	分辨率 1.60 Å R-free 0.239
5T8R Crystal structure of human BAZ2A PHD zinc finger in complex with unmodified H3 10-mer 提交 2016-09-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 2–11（10 aa） 片段：UNP residues 2-11	未记录	ZN ZINC ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；2.2 M Na/K phosphate	分辨率 2.40 Å R-free 0.235
5T8R Crystal structure of human BAZ2A PHD zinc finger in complex with unmodified H3 10-mer 提交 2016-09-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 2–11（10 aa） 片段：UNP residues 2-11	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；2.2 M Na/K phosphate	分辨率 2.40 Å R-free 0.235
5T8R Crystal structure of human BAZ2A PHD zinc finger in complex with unmodified H3 10-mer 提交 2016-09-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 2–11（10 aa） 片段：UNP residues 2-11	未记录	ZN ZINC ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；2.2 M Na/K phosphate	分辨率 2.40 Å R-free 0.235
5T8R Crystal structure of human BAZ2A PHD zinc finger in complex with unmodified H3 10-mer 提交 2016-09-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 2–11（10 aa） 片段：UNP residues 2-11	未记录	ZN ZINC ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；2.2 M Na/K phosphate	分辨率 2.40 Å R-free 0.235
5TBN Solution NMR structure of PHF20 PHD domain in complex with a histone H3K4me2 peptide 提交 2016-09-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–12（11 aa） 片段：residues 2-12	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM sodium phosphate；压力 101325 NMR样品组成 1.5 mM [U-15N] PHF20 PHD domain, 6.0 mM H3K4me2 peptide, 25 mM sodium phosphate, 0.3 mM DSS, 1.5 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.5 mM [U-13C; U-15N] PHF20 PHD domain, 6.0 mM H3K4me2 peptide, 25 mM sodium phosphate, 0.3 mM DSS, 1.5 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 2 mM H3K4me2 peptide, 25 mM sodium phosphate, 0.3 mM DSS, 1.5 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5VA6 CRYSTAL STRUCTURE OF ATXR5 IN COMPLEX WITH HISTONE H3.1 MONO-METHYLATED ON R26 提交 2017-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 20–37（18 aa） 片段：residues 20-37	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50% polypropylene glycol 400, 5% DMSO, 0.1 M HEPES-NaOH (pH 6.0)	分辨率 2.40 Å R-free 0.297
5VA6 CRYSTAL STRUCTURE OF ATXR5 IN COMPLEX WITH HISTONE H3.1 MONO-METHYLATED ON R26 提交 2017-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 20–37（18 aa） 片段：residues 20-37	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50% polypropylene glycol 400, 5% DMSO, 0.1 M HEPES-NaOH (pH 6.0)	分辨率 2.40 Å R-free 0.297
5WFC Humanized mutant of the Chaetomium thermophilum Polycomb Repressive Complex 2 bound to the inhibitor GSK343 提交 2017-07-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 23–33（11 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8 A97 N-[(6-methyl-2-oxo-4-propyl-1,2-dihydropyridin-3-yl)methyl]-6-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-4-yl]-1-(propan-2-yl)-1H-indazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；100 mM sodium malonate pH 7.0, 16% PEG 3350, 43 mM 3-cyclohexyl-1-propylphosphocholine	分辨率 2.28 Å R-free 0.203
5WVO Crystal structure of DNMT1 RFTS domain in complex with K18/K23 mono-ubiquitylated histone H3 提交 2016-12-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 2–37（36 aa） 片段：UNP residues 2-37	突变：K18C,K23C	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；100mM Bis-Tris (pH 6.0), 200mM lithium sulfate monohydrate, 20% PEG 10000	分辨率 2.00 Å R-free 0.239
5XF3 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (R,R-configuration) 提交 2017-04-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 RRK (1R,2R)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55 mM MnCl2, 25-49 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.270
5XF4 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (S,S-configuration) 提交 2017-04-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 SSK (1S,2S)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55 mM MnCl2, 25-49 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0	分辨率 2.87 Å R-free 0.266
5XF5 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (R,S-configuration) 提交 2017-04-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 RSK (1S,2R)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55mM MnCl2, 25-49mM KCl, 20mM K-Cacodylate pH 6.0	分辨率 2.82 Å R-free 0.264
5XFR Ternary complex of MTF2, DNA and histone 提交 2017-04-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 C 34–41（8 aa） 链 D 34–41（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M MES monohydrate-pH 6.5, 0.2M ammonium sulfate, 25% PEG monomethyl ether 5000, 10% glycerol	分辨率 2.25 Å R-free 0.231
5Y0C Crystal Structure of the human nucleosome at 2.09 angstrom resolution 提交 2017-07-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 10 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.09 Å R-free 0.249
5Y0D Crystal Structure of the human nucleosome containing the H2B E76K mutant 提交 2017-07-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 1.99 Å R-free 0.252
5Z23 Crystal structure of the nucleosome containing a chimeric histone H3/CENP-A CATD 提交 2017-12-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–75（75 aa） 链 A 114–136（23 aa） 链 E 1–75（75 aa） 链 E 114–136（23 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.73 Å R-free 0.261
5Z30 The crystal structure of the nucleosome containing a cancer-associated histone H2A.Z R80C mutant 提交 2018-01-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.45 Å R-free 0.243
5ZBX The crystal structure of the nucleosome containing histone H3.1 CATD(V76Q, K77D) 提交 2018-02-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–75（75 aa） 链 A 114–136（23 aa） 链 E 1–75（75 aa） 链 E 114–136（23 aa）	突变：V76Q, K77D 突变：V76Q, K77D 突变：V76Q, K77D 突变：V76Q, K77D	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.58 Å R-free 0.249
6BHD Crystal structure of SETDB1 with a modified H3 peptide 提交 2017-10-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 5–20（16 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UNX UNKNOWN LIGAND × 35 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；25% PEG3350, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M HEPES, 5% glycerol	分辨率 1.25 Å R-free 0.183
6BHE Crystal structure of SETDB1 with a modified H3 peptide 提交 2017-10-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 5–20（16 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UNX UNKNOWN LIGAND × 36	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；25% PEG3350, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M HEPES, 5% glycerol	分辨率 1.35 Å R-free 0.172
6BHG Crystal structure of SETDB1 with a modified H3 peptide 提交 2017-10-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 5–20（16 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UNX UNKNOWN LIGAND × 40	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；20% PEG5000 MME, 0.1 M Bis-Tris	分辨率 1.45 Å R-free 0.176
6BHH Crystal structure of SETDB1 with a modified H3 peptide 提交 2017-10-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 5–20（16 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 26	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；25% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES	分辨率 1.85 Å R-free 0.237
6BHI Crystal structure of SETDB1 with a modified H3 peptide 提交 2017-10-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 5–20（16 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UNX UNKNOWN LIGAND × 35	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；25% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES	分辨率 1.40 Å R-free 0.187
6D07 Crystal structure of the complex between human chromobox homolog 1 (CBX1) and H3K9me3 peptide 提交 2018-04-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–16（15 aa） 片段：H3K9(me)3 peptide (UNP residues 2-16)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M Tris, pH 8.0, 30% w/v PEG3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.257
6D07 Crystal structure of the complex between human chromobox homolog 1 (CBX1) and H3K9me3 peptide 提交 2018-04-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–16（15 aa） 片段：H3K9(me)3 peptide (UNP residues 2-16)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M Tris, pH 8.0, 30% w/v PEG3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.257
6D08 Crystal structure of an engineered bump-hole complex of mutant human chromobox homolog 1 (CBX1) with H3K9bn peptide 提交 2018-04-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–16（15 aa） 片段：H3K9bn peptide (UNP residues 2-16)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M citrate, pH 5.0, 3 M ammonium sulfate	分辨率 2.10 Å R-free 0.252
6D08 Crystal structure of an engineered bump-hole complex of mutant human chromobox homolog 1 (CBX1) with H3K9bn peptide 提交 2018-04-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–16（15 aa） 片段：H3K9bn peptide (UNP residues 2-16)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M citrate, pH 5.0, 3 M ammonium sulfate	分辨率 2.10 Å R-free 0.252
6HKT Structure of an H1-bound 6-nucleosome array 提交 2018-09-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：50-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa） 链 U 1–136（136 aa） 链 Y 1–136（136 aa） 链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa） 链 k 1–136（136 aa） 链 o 1–136（136 aa） 链 u 1–136（136 aa） 链 y 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293.15 K；15% MPD, 0.1 M NaCl and 0.1 M Tris pH 8.8	分辨率 9.70 Å R-free 0.286
6HTS Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to nucleosome 提交 2018-10-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 I 1–136（136 aa） 链 M 1–136（136 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
6IPU Human nucleosome core particle containing 145 bp of DNA 提交 2018-11-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 39–136（98 aa） 链 E 39–136（98 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate	分辨率 1.99 Å R-free 0.263
6IQ4 Nucleosome core particle cross-linked with a hetero-binuclear molecule possessing RAPTA and gold(I) 4-(diphenylphosphino)benzoic acid groups. 提交 2018-11-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 39–136（98 aa） 链 E 39–136（98 aa）	未记录	AU GOLD ION × 1 XIS 4-diphenylphosphanylbenzoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 D0X [Ru(eta(6)-p-cymene)Cl-2(pta) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate	分辨率 2.25 Å R-free 0.257
6JOU Crystal structure of the human nucleosome containing H2A.Z.1 S42R 提交 2019-03-23	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.17 Å R-free 0.250
6JR0 Crystal structure of the human nucleosome phased with 12 selenium atoms 提交 2019-04-02	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.50 Å R-free 0.253
6JR1 Crystal structure of the human nucleosome phased with 16 selenium atoms 提交 2019-04-02	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.243
6JXD Human nucleosome core particle with cohesive end DNA termini 提交 2019-04-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 39–136（98 aa） 链 E 39–135（97 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 17	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate	分辨率 2.25 Å R-free 0.292
6K1I Human nucleosome core particle with gammaH2A.X variant 提交 2019-05-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 23 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；potassium chloride, manganese chloride, potassium cacodylate	分辨率 2.75 Å R-free 0.277
6K1J Human nucleosome core particle with H2A.X variant 提交 2019-05-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；Potassium Chloride, Manganese Chloride, Potassium Cacodylate	分辨率 2.85 Å R-free 0.319
6K1K Human nucleosome core particle with H2A.X S139E variant 提交 2019-05-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 33 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；potassium chloride, manganese chloride, potassium cacodylate	分辨率 2.20 Å R-free 0.275
6KE9 The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-07-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 41–136（96 aa） 链 E 41–136（96 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose	分辨率 2.22 Å R-free 0.230
6KVD Crystal structure of human nucleosome containing H2A.J 提交 2019-09-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 13 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.21 Å R-free 0.257
6L49 H3-CA-H3 tri-nucleosome with the 22 base-pair linker DNA 提交 2019-10-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa） 链 S 1–136（136 aa） 链 W 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 18.90 Å
6L4A H3-H3-H3 tri-nucleosome with the 22 base-pair linker DNA 提交 2019-10-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa） 链 S 1–136（136 aa） 链 W 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 12.30 Å
6L9H The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-11-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 41–136（96 aa） 链 E 41–136（96 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose	分辨率 2.60 Å R-free 0.278
6L9Z 338 bp di-nucleosome assembled with linker histone H1.X 提交 2019-11-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 8 CA CALCIUM ION × 65 K POTASSIUM ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate	分辨率 2.50 Å R-free 0.256
6LA2 343 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：38-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa） 链 U 1–136（136 aa） 链 Y 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa） 链 i 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Sodium acetate	分辨率 3.89 Å R-free 0.267
6LA8 349 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 23 K POTASSIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate (cryo-25% MPD)	分辨率 3.40 Å R-free 0.265
6LA9 349 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 (high cryoprotectant) 提交 2019-11-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 40 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate	分辨率 3.70 Å R-free 0.266
6LAB 169 bp nucleosome, harboring cohesive DNA termini, assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 20 K POTASSIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate	分辨率 3.20 Å R-free 0.262
6LE9 The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-11-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 41–136（96 aa） 链 E 41–136（96 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose	分辨率 2.60 Å R-free 0.281
6LER 169 bp nucleosome harboring non-identical cohesive DNA termini. 提交 2019-11-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate	分辨率 3.00 Å R-free 0.261
6LER 169 bp nucleosome harboring non-identical cohesive DNA termini. 提交 2019-11-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 8 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate	分辨率 3.00 Å R-free 0.261
6M3V 355 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini 提交 2020-03-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate, Poly glutamic acid	分辨率 4.60 Å R-free 0.261
6M44 355 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini (high cryoprotectant) 提交 2020-03-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate, Poly glutamic acid	分辨率 3.81 Å R-free 0.286
6M4D Structural mechanism of nucleosome dynamics governed by human histone variants H2A.B and H2A.Z.2.2 提交 2020-03-06	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6M4G Structural mechanism of nucleosome dynamics governed by human histone variants H2A.B and H2A.Z.2.2 提交 2020-03-06	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
6M4H Structural mechanism of nucleosome dynamics governed by human histone variants H2A.B and H2A.Z.2.2 提交 2020-03-07	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6R8Y Cryo-EM structure of NCP-6-4PP(-1)-UV-DDB 提交 2019-04-02	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
6R8Z Cryo-EM structure of NCP_THF2(-1)-UV-DDB 提交 2019-04-02	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6R90 Cryo-EM structure of NCP-THF2(+1)-UV-DDB class A 提交 2019-04-02	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6R91 Cryo-EM structure of NCP_THF2(-3)-UV-DDB 提交 2019-04-02	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6R92 Cryo-EM structure of NCP-THF2(+1)-UV-DDB class B 提交 2019-04-02	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
6R93 Cryo-EM structure of NCP-6-4PP 提交 2019-04-02	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6R94 Cryo-EM structure of NCP_THF2(-3) 提交 2019-04-02	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
6T90 OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2019-10-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–134（134 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
6T93 Nucleosome with OCT4-SOX2 motif at SHL-6 提交 2019-10-25	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.49 Å
6UPK Structure of FACT_subnucleosome complex 1 提交 2019-10-17	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
6UPL Structure of FACT_subnucleosome complex 2 提交 2019-10-17	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
6USJ Structure of two nucleosomes bridged by human PARP2 提交 2019-10-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Buffer was pH-adjusted and filtered through a 0.22 um filter. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 2s, blot force 0	分辨率 10.50 Å
6V2K The nucleosome structure after H2A-H2B exchange 提交 2019-11-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.60 Å R-free 0.248
6V41 crystal structure of CDY1 chromodomain bound to H3K9me3 提交 2019-11-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 QQQ 2–16（15 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UNX UNKNOWN LIGAND × 20	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；1.4 M sodium citrate, 0.1 M HEPES	分辨率 1.60 Å R-free 0.215
6V92 RSC-NCP 提交 2019-12-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric	链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 20.00 Å
6WAV Crystal structure of PHF1 in complex with H3K36me3 substitution 提交 2020-03-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 32–43（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 17	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；1.2 M ammonium sulfate and 0.1 M sodium acetate 4.6	分辨率 1.70 Å R-free 0.241
6WAV Crystal structure of PHF1 in complex with H3K36me3 substitution 提交 2020-03-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 32–43（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UNX UNKNOWN LIGAND × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；1.2 M ammonium sulfate and 0.1 M sodium acetate 4.6	分辨率 1.70 Å R-free 0.241
6WAV Crystal structure of PHF1 in complex with H3K36me3 substitution 提交 2020-03-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 32–43（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UNX UNKNOWN LIGAND × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；1.2 M ammonium sulfate and 0.1 M sodium acetate 4.6	分辨率 1.70 Å R-free 0.241
6WAV Crystal structure of PHF1 in complex with H3K36me3 substitution 提交 2020-03-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 32–43（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	UNX UNKNOWN LIGAND × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；291 K；1.2 M ammonium sulfate and 0.1 M sodium acetate 4.6	分辨率 1.70 Å R-free 0.241
6WW4 Crystal structure of HERC2 ZZ domain in complex with histone H3 tail 提交 2020-05-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–7（6 aa） 片段：fusion protein	未记录	ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, and 17% PEG 10000	分辨率 2.25 Å R-free 0.243
6WW4 Crystal structure of HERC2 ZZ domain in complex with histone H3 tail 提交 2020-05-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–7（6 aa） 片段：fusion protein	未记录	ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, and 17% PEG 10000	分辨率 2.25 Å R-free 0.243
6YIH Structure of Chromosomal Passenger Complex (CPC) bound to phosphorylated Histone 3 peptide at 2.6 A. 提交 2020-04-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 2–13（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；291 K；20 % (w/v) PEG 4,000, 100 mM HEPES pH 7.0, 150 mM ammonium sulphate	分辨率 2.55 Å R-free 0.259
6YOV OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 提交 2020-04-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–134（134 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
7BWD Structure of Dot1L-H2BK34ub Nucleosome Complex 提交 2020-04-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.32 Å
7C0M Human cGAS-nucleosome complex 提交 2020-05-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa） 链 a 2–136（135 aa） 链 e 2–136（135 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7CCQ Structure of the 1:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-06-17	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 39–136（98 aa） 链 E 39–136（98 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7CCR Structure of the 2:2 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 A 39–136（98 aa） 链 E 39–136（98 aa） 链 L 39–136（98 aa） 链 P 39–136（98 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
7COW 353 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini with linker histone H1.0 提交 2020-08-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 K POTASSIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；potassium acetate, calcium chloride, potassium chloride	分辨率 2.86 Å R-free 0.297
7D1Z Cryo-EM structure of SET8-nucleosome complex 提交 2020-09-15	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
7DBP Linker histone defines structure and self-association behaviour of the 177 bp human chromosome 提交 2020-10-21	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7E8D NSD2 E1099K mutant bound to nucleosome 提交 2021-03-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 SFG SINEFUNGIN × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7K5X Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.0 提交 2020-09-17	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.93 Å
7K5Y Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.4 提交 2020-09-17	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
7K60 Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.10 提交 2020-09-17	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
7K61 Cryo-EM structure of 197bp nucleosome aided by scFv 提交 2020-09-17	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
7K63 Cryo-EM structure of a chromatosome containing chimeric linker histone gH1.10-ncH1.4 提交 2020-09-18	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.03 Å
7KLR Solution structure of the PHD1 domain of histone demethylase KDM5A in complex with a histone H3(1-10) peptide 提交 2020-10-31	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–11（10 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1 NMR样品组成 900 uM [U-13C; U-15N] Histone lysine demethylase 5A, KDM5A, 4000 uM Histone H3.1, 50 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 5 mM beta-mercaptoethanol, 0.1 mM ZnCl2, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 550 uM [U-13C; U-15N] Histone lysine demethylase 5A, KDM5A, 800 uM Histone H3.1, 50 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 5 mM beta-mercaptoethanol, 0.1 mM ZnCl2, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1250 uM [U-13C; U-15N] Histone lysine demethylase 5A, KDM5A, 400 uM Histone H3.1, 50 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 5 mM beta-mercaptoethanol, 0.1 mM ZnCl2, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
7LBK Crystal structure of human Survivin bound to histone H3 T3phK4me3 peptide 提交 2021-01-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 2–13（12 aa） 链 D 2–13（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；The crystal was obtained by mixing 1 uL of protein at 10 mg/mL with 1 uL of mother liquor composed of 0.16 M potassium/sodium tartrate, 14% PEG 3350.	分辨率 2.70 Å R-free 0.253
7LBO Crystal structure of human Survivin bound to histone H3 T3phK4me1 peptide 提交 2021-01-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 2–13（12 aa） 链 F 2–13（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；1 uL of protein at 10 mg/mL was mixed with 1 uL of buffer composed of 0.16 M potassium/sodium tartrate, 12% PEG 3350	分辨率 2.50 Å R-free 0.261
7LBP Crystal structure of human Survivin bound to histone H3T3phK4ac peptide 提交 2021-01-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–13（12 aa） 链 D 2–13（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；1 uL of protein at 10mg/mL was mixed with 1 uL of buffer composed of 0.16 M potassium/sodium tartrate, 12% PEG 3350	分辨率 2.60 Å R-free 0.247
7LBQ Crystal structure of human Survivin bound to histone H3 T3phK4me2 peptide 提交 2021-01-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 2–13（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；1 uL of protein was mixed with 1uL of buffer composed of 2.25 mM spermine, 9 mM MgCl2, 0.9 mM spermidine, 1.8 mM cobalt (III)hexamine chloride, 0.05 sodium cacodylate pH 7.0, 5% PEG 400	分辨率 2.69 Å R-free 0.268
7LYA Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle with linked histone proteins H2A and H2B 提交 2021-03-06	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.91 Å
7LYB Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with BRCA1-BARD1-UbcH5c 提交 2021-03-06	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
7LYC Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A Lys13 and Lys15 in complex with BARD1 (residues 415-777) 提交 2021-03-06	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
7MJU Crystal structure of human AF10 PZP bound to histone H3 tail 提交 2021-04-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–14（13 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.09 M Tris, 22.5% PEG 3350, and 10 mM spermine tetrahydrochloride	分辨率 2.10 Å R-free 0.206
7NL0 Cryo-EM structure of the Lin28B nucleosome core particle 提交 2021-02-19	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7SCY Nuc147 bound to single BRCT 提交 2021-09-29	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7SCZ Nuc147 bound to multiple BRCTs 提交 2021-09-29	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7U0G structure of LIN28b nucleosome bound 3 OCT4 提交 2022-02-18	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7U0I Structure of LIN28b nucleosome bound 2 OCT4 提交 2022-02-18	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7U0J Structure of 162bp LIN28b nucleosome 提交 2022-02-18	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7V6Q Crystal structure of sNASP-ASF1A-H3.1-H4 complex 提交 2021-08-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–136（136 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；18% (v/v) Tacsimate, pH 5.0 11% (v/v) PEG2000MME	分辨率 3.00 Å R-free 0.203
7V6Q Crystal structure of sNASP-ASF1A-H3.1-H4 complex 提交 2021-08-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–136（136 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；18% (v/v) Tacsimate, pH 5.0 11% (v/v) PEG2000MME	分辨率 3.00 Å R-free 0.203
7V90 Telomeric mononucleosome 提交 2021-08-24	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7V96 Telomeric Dinucleosome 提交 2021-08-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.92 Å
7V9C Telomeric Dinucleosome in open state 提交 2021-08-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7V9J Telomeric trinucleosome 提交 2021-08-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa） 链 S 1–136（136 aa） 链 W 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.00 Å
7V9K Telomeric tetranucleosome 提交 2021-08-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa） 链 S 1–136（136 aa） 链 W 1–136（136 aa） 链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å
7V9S Telomeric trinucleosome in open state 提交 2021-08-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa） 链 S 1–136（136 aa） 链 W 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.00 Å
7VA4 Telomeric tetranucleosome in open state 提交 2021-08-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa） 链 S 1–136（136 aa） 链 W 1–136（136 aa） 链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 14.00 Å
7VZ4 Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601L DNA sequence 提交 2021-11-15	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 1.89 Å
7W9V Cryo-EM structure of nucleosome in complex with p300 acetyltransferase catalytic core (complex I) 提交 2021-12-10	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.95 Å
7X57 Cryo-EM structure of human subnucleosome (closed form) 提交 2022-03-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 C 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa） 链 G 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.63 Å
7X58 Cryo-EM structure of human subnucleosome (open form) 提交 2022-03-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 C 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa） 链 G 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.93 Å
7XVL Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169an DNA fragment) 提交 2022-05-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 U 1–136（136 aa） 链 Y 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.51 Å R-free 0.280
7XVL Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169an DNA fragment) 提交 2022-05-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric	链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa） 链 i 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.51 Å R-free 0.280
7XVM Crystal Structure of Nucleosome-H5 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 18 CL CHLORIDE ION × 3 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 2.84 Å R-free 0.259
7XX5 Crystal Structure of Nucleosome-H1.3 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.19 Å R-free 0.259
7XX6 Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 21 K POTASSIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.39 Å R-free 0.296
7XX6 Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 U 1–136（136 aa） 链 Y 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa） 链 i 1–136（136 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 26 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.39 Å R-free 0.296
7XZX Cryo-EM structure of the nucleosome in complex with p53 DNA-binding domain 提交 2022-06-03	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.53 Å
7XZY Cryo-EM structure of the nucleosome containing 193 base-pair DNA with a p53 target sequence 提交 2022-06-03	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.97 Å
7XZZ Cryo-EM structure of the nucleosome in complex with p53 提交 2022-06-03	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7Y00 Cryo-EM structure of the nucleosome containing 169 base-pair DNA with a p53 target sequence 提交 2022-06-03	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.96 Å
7Y5U Cryo-EM structure of the monomeric human CAF1LC-H3-H4 complex 提交 2022-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7Y5V Cryo-EM structure of the dimeric human CAF1LC-H3-H4 complex 提交 2022-06-17	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 D 1–136（136 aa） 链 I 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
7Y5W Cryo-EM structure of the left-handed Di-tetrasome 提交 2022-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 C 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 G 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7Y60 Cryo-EM structure of human CAF1LC bound right-handed Di-tetrasome 提交 2022-06-18	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 C 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 G 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7Y61 Cryo-EM structure of the two CAF1LCs bound right-handed Di-tetrasome 提交 2022-06-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 C 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 G 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
7Y7I chicken KNL2 in complex with the CENP-A nucleosome 提交 2022-06-22	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–64（64 aa） 链 E 1–64（64 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
7YOZ Cryo-EM structure of human subnucleosome (intermediate form) 提交 2022-08-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 C 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa） 链 G 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7YQK cryo-EM structure of gammaH2AXK15ub-H4K20me2 nucleosome bound to 53BP1 提交 2022-08-07	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 37–136（100 aa） 链 E 37–136（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
7ZI4 Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to a WT nucleosome 提交 2022-04-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 I 1–136（136 aa） 链 M 1–136（136 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4uL of sample applied to Quantifoil R2/2 Cu 300 mesh grids. blot parameters were wait time 30 sec, blot time 0.5 sec, blot force -8	分辨率 3.20 Å
8DK5 Structure of 187bp LIN28b nucleosome with site 0 mutation 提交 2022-07-02	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.71 Å
8EVG 162bp CX3CR1 nucleosome (further classified with better nucleosome end) 提交 2022-10-20	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8EVH CX3CR1 nucleosome and wild type PU.1 complex 提交 2022-10-20	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8EVI CX3CR1 nucleosome and PU.1 complex containing disulfide bond mutations 提交 2022-10-20	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.64 Å
8EVJ CX3CR1 nucleosome bound PU.1 and C/EBPa 提交 2022-10-20	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8GE0 Crystal structure of JADE1 PZP domain in complex with Histone H3 提交 2023-03-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–14（13 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000	分辨率 2.40 Å R-free 0.241
8GE0 Crystal structure of JADE1 PZP domain in complex with Histone H3 提交 2023-03-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–14（13 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000	分辨率 2.40 Å R-free 0.241
8GE0 Crystal structure of JADE1 PZP domain in complex with Histone H3 提交 2023-03-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 2–14（13 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000	分辨率 2.40 Å R-free 0.241
8GUI Bre1-nucleosome complex (Model I) 提交 2022-09-12	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.81 Å
8GUJ Bre1-nucleosome complex (Model II) 提交 2022-09-12	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8GUK Human nucleosome core particle (free form) 提交 2022-09-12	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.51 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 a 2–136（135 aa） 链 e 2–136（135 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 a 2–136（135 aa） 链 e 2–136（135 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
8H1T Cryo-EM structure of BAP1-ASXL1 bound to chromatosome 提交 2022-10-04	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8HAG Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (3.2 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8HAH Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (3.9 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8HAI Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (4.7 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
8HAJ Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (4.8 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
8HAK Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 4 (4.5 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
8HAL Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 提交 2022-10-26	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8HAM Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 提交 2022-10-26	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
8HAN Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 3 提交 2022-10-26	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8IEG Bre1(mRBD-RING)/Rad6-Ub/nucleosome complex 提交 2023-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 E 38–135（98 aa） 链 K 38–135（98 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å
8IEJ RNF20-RNF40/hRad6A-Ub/nucleosome complex 提交 2023-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 E 38–135（98 aa） 链 K 38–135（98 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
8IHL Overlapping tri-nucleosome 提交 2023-02-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa） 链 K 2–136（135 aa） 链 M 2–136（135 aa） 链 Q 2–136（135 aa） 链 U 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.64 Å
8IIY Crystal structure of MBP fused GAS41 YEATS domain in complex with H3K14ac peptide 提交 2023-02-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2–20（19 aa） 链 C 2–20（19 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris buffer (pH 8.5) containing 20% (w/v) PEG monomethyl ether 2000, 200 mM trimethylamine N-oxide	分辨率 2.15 Å R-free 0.247
8IIZ Crystal structure of MBP fused GAS41 YEATS domain in complex with H3K27ac peptide 提交 2023-02-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2–33（32 aa） 链 C 2–33（32 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris buffer (pH 8.5) containing 20% (w/v) PEG monomethyl ether 2000, 200 mM trimethylamine N-oxide	分辨率 2.10 Å R-free 0.301
8IJ0 Crystal structure of GAS41 YEATS domain in complex with H3K9ac peptide 提交 2023-02-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–12（11 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Na-HEPES buffer (pH 7.5) containing 5% (w/v) PEG 400 and 2 M ammonium sulfate	分辨率 1.52 Å R-free 0.189
8IJ0 Crystal structure of GAS41 YEATS domain in complex with H3K9ac peptide 提交 2023-02-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–12（11 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 4 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Na-HEPES buffer (pH 7.5) containing 5% (w/v) PEG 400 and 2 M ammonium sulfate	分辨率 1.52 Å R-free 0.189
8IQF Cryo-EM structure of the dimeric human CAF1-H3-H4 complex 提交 2023-03-16	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 D 1–136（136 aa） 链 I 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
8IQG Cryo-EM structure of the monomeric human CAF1-H3-H4 complex 提交 2023-03-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8J6S Cryo-EM structure of the single CAF-1 bound right-handed Di-tetrasome 提交 2023-04-26	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 C 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 G 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8J6T Cryo-EM structure of the double CAF-1 bound right-handed Di-tetrasome 提交 2023-04-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 C 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 G 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8JBX Human canonical 601 DNA nucleosome 提交 2023-05-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
8JCC Human histone H2B variant H2BFWT Cryo-EM structure with 601 DNA sequence 提交 2023-05-10	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
8JCD Human H2BFWTH100R nucleosome with 601 DNA 提交 2023-05-11	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.14 Å
8JHF Native SUV420H1 bound to 167-bp nucleosome 提交 2023-05-23	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane	分辨率 3.68 Å
8JHG Native SUV420H1 bound to 167-bp nucleosome 提交 2023-05-23	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane	分辨率 3.58 Å
8JL9 Cryo-EM structure of the human nucleosome with scFv 提交 2023-06-02	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.65 Å
8JLA Cryo-EM structure of the human nucleosome lacking N-terminal region of H2A, H2B, H3, and H4 提交 2023-06-02	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 29–136（108 aa） 链 E 29–136（108 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å
8JND The cryo-EM structure of the nonameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-06-06	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.66 Å
8JNE The cryo-EM structure of the decameric RAD51 ring bound to the nucleosome without the linker DNA binding 提交 2023-06-06	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.68 Å
8JNF The cryo-EM structure of the RAD51 filament bound to the nucleosome 提交 2023-06-06	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.91 Å
8KCY Structure of nucleosome complexed with two DEK molecules 提交 2023-08-08	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8KD1 Structure of nucleosome complexed with one DEK molecule 提交 2023-08-08	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8KE0 Structure of H1.2 bound to the nucleosome 提交 2023-08-11	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8OFF Structure of BARD1 ARD-BRCTs in complex with H2AKc15ub nucleosomes (Map1) 提交 2023-03-15	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 Ca 1–135（135 aa） 链 Cb 1–135（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force = 0 N blot time = 8 s	分辨率 3.40 Å
8OO7 CryoEM Structure INO80core Hexasome complex composite model state1 提交 2023-04-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 M 2–136（135 aa） 链 Q 2–136（135 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)	分辨率 2.80 Å
8OOA CryoEM Structure INO80core Hexasome complex Hexasome refinement state1 提交 2023-04-04	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 M 2–136（135 aa） 链 Q 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)	分辨率 3.18 Å
8OOP CryoEM Structure INO80core Hexasome complex composite model state2 提交 2023-04-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 M 2–136（135 aa） 链 Q 2–136（135 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)	分辨率 2.70 Å
8OOS CryoEM Structure INO80core Hexasome complex ATPase-hexasome refinement state 2 提交 2023-04-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 M 2–136（135 aa） 链 Q 2–136（135 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)	分辨率 3.29 Å
8OSJ Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to a nucleosomal E-box at position SHL-6.2 (DNA conformation 1) 提交 2023-04-19	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
8OSK Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to a nucleosomal E-box at position SHL+5.8 (composite map) 提交 2023-04-19	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8OSL Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to the native Por enhancer nucleosome (map 2, additional 3D classification and flexible refinement) 提交 2023-04-19	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
8OTS OCT4 and MYC-MAX co-bound to a nucleosome 提交 2023-04-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8OTT MYC-MAX bound to a nucleosome at SHL+5.8 提交 2023-04-21	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 40–134（95 aa） 链 E 40–134（95 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8OX0 Structure of apo telomeric nucleosome 提交 2023-04-28	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM HEPES-KOH pH 8.0, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1% glycerol, 0.01% Igepal CA-630,1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot Force: -15 Blot Time: 2.5 s	分辨率 2.52 Å
8OX1 Structure of TRF1core in complex with telomeric nucleosome 提交 2023-04-28	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM HEPES-KOH pH 8.0, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1% glycerol, 0.01% Igepal CA-630, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot Force: -15 Blot Time: 2.5 s	分辨率 2.70 Å
8Q36 Structure of Nucleosome Core with a Bound Metallopeptide Conjugate (Foamy Virus GAG Peptide-Au[I] Compound) 提交 2023-08-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 AAA 39–136（98 aa） 链 EEE 39–136（98 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0].	分辨率 2.60 Å R-free 0.262
8Q3E High Resolution Structure of Nucleosome Core with Bound Foamy Virus GAG Peptide 提交 2023-08-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 AAA 39–136（98 aa） 链 EEE 39–136（98 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]	分辨率 2.17 Å R-free 0.270
8Q3M Structure of Nucleosome Core with a Bound Kaposi Sarcoma Associated Herpesvirus LANA Peptide Having a Methionine to Ornithine Substitution 提交 2023-08-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 AAA 39–136（98 aa） 链 EEE 39–136（98 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]	分辨率 2.50 Å R-free 0.268
8Q3X Structure of Nucleosome Core with a Bound Metallopeptide Conjugate (Kaposi Sarcoma Associated Herpesvirus LANA Peptide-Au[I] Compound) 提交 2023-08-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 AAA 39–136（98 aa） 链 EEE 39–136（98 aa）	未记录	AU GOLD ION × 1 XIS 4-diphenylphosphanylbenzoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]	分辨率 2.30 Å R-free 0.262
8QKT Structure of a nucleosome composed of a palindromic 167-base pair blunt-ended DNA fragment 提交 2023-09-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 AAA 39–136（98 aa） 链 EEE 39–136（98 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 19	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；MnCl2-containing buffers	分辨率 3.26 Å R-free 0.321
8QKT Structure of a nucleosome composed of a palindromic 167-base pair blunt-ended DNA fragment 提交 2023-09-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 KKK 39–136（98 aa） 链 OOO 39–136（98 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；MnCl2-containing buffers	分辨率 3.26 Å R-free 0.321
8RGM Cryo-EM structure of nucleosome containing Widom603 DNA 提交 2023-12-14	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8SMW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 1) 提交 2023-04-26	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8SMX Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 2) 提交 2023-04-26	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SMY Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 3) 提交 2023-04-26	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SMZ Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (Class 4) 提交 2023-04-26	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SN0 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 5) 提交 2023-04-26	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SN1 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 6) 提交 2023-04-26	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8SN2 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) 提交 2023-04-26	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8SN3 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8SN4 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN5 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 3) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8SN6 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 4) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN7 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 5) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN8 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 6) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN9 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8SNA Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8SPS High resolution structure of ESRRB nucleosome bound OCT4 at site a and site b 提交 2023-05-03	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8SPU Structure of ESRRB nucleosome bound OCT4 at site c 提交 2023-05-03	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8SWI Crystal structure of legAS4 from Legionella pneumophila subsp. pneumophila with histone H3 (1-12)peptide 提交 2023-05-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–13（12 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M Bis-Tris 6.5 and 38% PPG P400	分辨率 3.00 Å R-free 0.310
8SYP Genomic CX3CR1 nucleosome 提交 2023-05-25	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8TXV Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 1) 提交 2023-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8TXW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 2) 提交 2023-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8U13 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A lysine 15 in complex with RNF168-UbcH5c (class 1) 提交 2023-08-30	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8U14 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A lysine 15 in complex with RNF168-UbcH5c (class 2) 提交 2023-08-30	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8U9S Cryo-EM structure of NRCAM nucleosome aided by scFv 提交 2023-09-20	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8UBJ Cryo-EM structure of NRCAM nucleosome aided by scFv (3D Flex map) 提交 2023-09-23	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8UBK Cryo-EM structure of Ascl1/E12a in complex with NRCAM nucleosome 提交 2023-09-23	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8UBL Cryo-EM structure of Ascl1/E12a in complex with NRCAM nucleosome (3D Flex map) 提交 2023-09-23	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8UPF Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168-UbcH5c 提交 2023-10-22	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8VFX Cryo-EM structure of 186bp ALBN1 nucleosome aided by scFv 提交 2023-12-22	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.65 Å
8VFY Cryo-EM structure of FoxA1 in complex with ALBN1 nucleosome (class 1) 提交 2023-12-22	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.89 Å
8VFZ Cryo-EM structure of FoxA1 in complex with ALBN1 nucleosome (class 2) 提交 2023-12-22	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8VG0 Cryo-EM structure of GATA4 in complex with ALBN1 nucleosome 提交 2023-12-22	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
8VG1 Cryo-EM structure of FoxA1 and GATA4 in complex with ALBN1 nucleosome 提交 2023-12-22	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.48 Å
8VG2 Cryo-EM structure of FoxA1 and GATA4 in complex with H14 chromatosome 提交 2023-12-22	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
8VLR Cryo-EM structure of native H2AK119bu nucleosome at 2.6 提交 2024-01-12	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 39–136（98 aa） 链 E 39–136（98 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl, pH 7.5, 50 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8VMI PRC2_AJ119-450 bound to H3K4me3 提交 2024-01-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 B 2–7（6 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8VML PRC2_AJ1-450 bound to H3K4me3 提交 2024-01-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 I 20–41（22 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8VNV PRC2_AJ1-450 bound to H3K36me3 with histone H3 tail engaged 提交 2024-01-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 I 20–41（22 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8W9D Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 1 提交 2023-09-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 K POTASSIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8W9E Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 2 提交 2023-09-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8W9F Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 3 提交 2023-09-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8WG5 Cryo-EM structure of USP16 bound to H2AK119Ub nucleosome 提交 2023-09-20	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 38–135（98 aa） 链 E 38–135（98 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 C 1–136（136 aa） 链 G 1–136（136 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 C 1–136（136 aa） 链 G 1–136（136 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 C 1–136（136 aa） 链 G 1–136（136 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8XBT The cryo-EM structure of the octameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-12-07	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.12 Å
8XBU The cryo-EM structure of the decameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-12-07	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.24 Å
8XBW The cryo-EM structure of the RAD51 N-terminal lobe domain bound to the histone H4 tail of the nucleosome 提交 2023-12-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.89 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 a 2–136（135 aa） 链 e 2–136（135 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 a 2–136（135 aa） 链 e 2–136（135 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8Y3C Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (closed form) 提交 2024-01-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.21 Å
8Y3D Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (intermediate form2) 提交 2024-01-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
8Y3E Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (open form) 提交 2024-01-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.32 Å
8Y3F Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (intermediate form1) 提交 2024-01-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.54 Å
8YBJ Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601 DNA sequence 提交 2024-02-14	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.38 Å
8YBK Cryo-EM structure of the human nucleosome containing the H3.1 E97K mutant 提交 2024-02-14	突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	突变：E97K 突变：E97K	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.69 Å
8YJF Structure of human SPT16 MD-CTD and MCM2 HBD chaperoning a histone H3-H4 tetramer and an H2A-H2B dimer 提交 2024-03-01	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 57–136（80 aa） 链 E 57–136（80 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M calcium acetate, 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5, 12% (w/v) PEG 8000	分辨率 4.40 Å R-free 0.312
8YJM Structure of human SPT16 MD-CTD and MCM2 HBD chaperoning a histone H3-H4 tetramer and a single chain H2B-H2A chimera 提交 2024-03-02	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 C 57–136（80 aa） 链 E 57–136（80 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M sodium citrate pH 5.5, 5%(w/v) PEG 4000	分辨率 4.15 Å R-free 0.286
8YNY Structure of Cas9-sgRNA ribonucleoprotein bound to nucleosome 提交 2024-03-12	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：13-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.52 Å
8YTI Crystal Structure of Nucleosome-H1x Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2024-03-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 8 CA CALCIUM ION × 52 K POTASSIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45 mM CaCl2, 25 mM KCl, 10 mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 2.70 Å R-free 0.267
8YV8 Cryo-EM structure of CDCA7 bound to nucleosome including hemimethylated CpG site in Widom601 positioning sequence. 提交 2024-03-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9ECP Structure of the native human NCP purified from HEK293 cells 提交 2024-11-14	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 39–134（96 aa） 链 E 39–134（96 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.91 Å
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Q 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 a 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 b 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 13 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 c 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 14 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 d 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 15 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 e 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 16 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 f 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 R 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 S 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 U 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 V 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 W 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 X 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9EHI Crystal structure of ENL YEATS in complex with histone H3 methacrylated at K18 提交 2024-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Y 16–22（7 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES monohydrate, pH 6.0, 20% (v/v) Jeffamine M600, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.267
9FGQ Structure of human APC3loop 375-381 bound to the NCP 提交 2024-05-24	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPEs pH8.0, 50 mM NaCl, 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9FH9 Structure of CyclinB1 N-terminus bound to the NCP 提交 2024-05-27	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9GCG CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 M 1–136（136 aa） 链 Q 1–136（136 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.43 Å
9GE4 CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-07	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 M 1–136（136 aa） 链 Q 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.52 Å
9GE5 CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 M 43–136（94 aa） 链 Q 43–136（94 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
9GEL CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 M 1–136（136 aa） 链 Q 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.86 Å
9GEV CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 M 1–136（136 aa） 链 Q 1–136（136 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
9GF6 CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-08	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 M 1–136（136 aa） 链 Q 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9GFB CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 M 1–136（136 aa） 链 Q 1–136（136 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
9GFM CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 M 44–136（93 aa） 链 Q 37–136（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9IGW Ku70/80 bound to 147 bp nucleosome 提交 2025-02-20	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.32 Å
9IGX Ku70/80 bound to 153 bp nucleosome 提交 2025-02-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 A 39–135（97 aa） 链 E 39–135（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.56 Å
9J8M Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (High mobility complex) 提交 2024-08-21	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.82 Å
9J8N Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (Low mobility complex) 提交 2024-08-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：32-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.14 Å
9J8O Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-H1-nucleosome complex 提交 2024-08-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.05 Å
9J8W Cryo-EM structure of NCP-UV-DDB complex containing CPD 提交 2024-08-21	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
9JC6 Human H2BW2 nucleosome 提交 2024-08-28	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
9MLL GammaH2AX containing nucleosomes, Parallel stack 提交 2024-12-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 L 1–136（136 aa） 链 P 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9MLN GammaH2AX containing nucleosome, Canonical (Class 1) 提交 2024-12-19	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9MLR GammaH2AX containing nucleosome, Half-wrapped (Class 2) 提交 2024-12-19	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9MLS GammaH2AX containing nucleosome, Extended (Class 3) 提交 2024-12-19	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9MMK H2AX containing nucleosome, Canonical (Class 1) 提交 2024-12-20	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9MMM H2AX containing nucleosomes, Parallel stack 提交 2024-12-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 L 1–136（136 aa） 链 P 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
9MMN H2AX containing nucleosomes, Left offset stack 提交 2024-12-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 L 1–136（136 aa） 链 P 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9MMO H2AX containing nucleosomes, Right offset stack 提交 2024-12-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 L 1–136（136 aa） 链 P 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9MMT H2AX containing nucleosome, Unwrapped (Class 2) 提交 2024-12-20	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9Q80 Ku70/80 with Ku70 linker and SAP domain bound to a 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-02-21	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.39 Å
9Q8X Ku70/80 bound to a 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-02-25	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9Q9F DNA-PK bound to a 153 bp H2AX nucleosome model 1 提交 2025-02-26	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.54 Å
9QCR DNA-PK bound to 153 bp H2AX nucleosome model 2 提交 2025-03-05	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.37 Å
9QCS Ku80 mediated DNA-PK dimer bound to 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-03-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：26-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.38 Å
9QLM Solution structure of the TAF3-PHD bound to a H3K4me3Q5ser histone tail peptide with a serotonylated glutamine 提交 2025-03-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–13（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2 SRO SEROTONIN × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）44；压力 1 NMR样品组成 0.88 mM [U-13C; U-15N] TAF3-PHD, 0.88 mM H3K4me3Q5ser, 20 mM potassium phosphate, 4 mM potassium chloride, 10 uM zinc chloride, 0.01 % w/v sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9QMS DNA-PK bound to 153 bp H2AX nucleosome with ATPyS 提交 2025-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：30-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 a 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.00 Å
9R04 p53 bound to the nucleosome at position SHL-5.7 (crosslinked sample) 提交 2025-04-24	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9R2M p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (non-crosslinked sample, composite map) 提交 2025-04-30	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9R2P p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (crosslinked sample) 提交 2025-04-30	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
9R2Q p53 bound to nucleosome at position SHL-5.7 (non-crosslinked sample) 提交 2025-04-30	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.90 Å
9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 a 1–136（136 aa） 链 c 1–136（136 aa） 链 e 1–136（136 aa） 链 g 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 e 1–136（136 aa） 链 g 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.54 Å
9UZ7 Cryo-EM structure of the nucleosome core particle with site-specific DNA-histone crosslinking 提交 2025-05-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 B 2–136（135 aa）	突变：C96S/C110S/K115C 突变：C96S/C110S/K115C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6；10 mM HEPES, pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率未提供
9V6Q Cryo-EM structure of two cPRC1 complexes bound to opposite faces of an endogenous 147-bp mono-nucleosome 提交 2025-05-27	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.60 Å
9V6S Cryo-EM structure of a single cPRC1 complex engaged on one face of an endogenous 147-bp mononucleosome 提交 2025-05-27	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
9V6X Cryo-EM structure of the cPRC1 complex bound to an endogenous 184-bp mono-nucleosome 提交 2025-05-27	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.00 Å
9V8L Cryo-EM structure of the cPRC1-di-nucleosome (loose) complex 提交 2025-05-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 O 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 6.60 Å
9V9H Cryo-EM structure of the cPRC1-di-nucleosome (tight) complex 提交 2025-05-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 M 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.50 Å
9V9P Cryo-EM structure of the cPRC1-di-nucleosome (CBX7) complex 提交 2025-06-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 A 1–136（136 aa） 链 E 1–136（136 aa） 链 K 1–136（136 aa） 链 M 1–136（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.40 Å
9VEM SIRT2 structure in complex with H3K18myr peptide and native NAD: pre-catalysis state 1 提交 2025-06-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 17–22（6 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Tris 8.0, 25% PEG 2000MME	分辨率 2.57 Å R-free 0.264
9VEW SIRT2 structure in complex with H3K18myr peptide and native NAD: pre-catalysis state 2 提交 2025-06-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 16–22（7 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Tris 8.0, 25% PEG 2000MME	分辨率 2.68 Å R-free 0.251
9VG0 SIRT2 structure in complex with H3K18myr peptide 提交 2025-06-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 16–22（7 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 ZN ZINC ION × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Tris 8.0, 25% PEG 2000MME	分辨率 1.61 Å R-free 0.231
9VG3 SIRT2 structure in complex with H3K18myr peptide: pre NAD binding state 提交 2025-06-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 17–22（6 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZN ZINC ION × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；Tris 8.0, 25% PEG2000MME	分辨率 2.15 Å R-free 0.251
9VGE SIRT2 demyristoylation intermediate I structure 提交 2025-06-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 16–22（7 aa）	未记录	NCA NICOTINAMIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1 YDD [[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2R,3S,4R,5S)-3,4-bis(oxidanyl)-5-tetradecoxy-oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；Tris 8.0, 25% PEG 2000MME	分辨率 2.56 Å R-free 0.282
9VGZ SIRT2-F96A structure in complex with H3K18myr peptide and native NAD 提交 2025-06-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 16–22（7 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ZN ZINC ION × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；Tris 8.0, 25% PEG 2000MME	分辨率 2.34 Å R-free 0.236
9VH0 SIRT2-H187A structure in complex with H3K18myr peptide and native NAD 提交 2025-06-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 16–21（6 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M MES 5.5, 9.2% PEG10000	分辨率 2.41 Å R-free 0.273
9VH0 SIRT2-H187A structure in complex with H3K18myr peptide and native NAD 提交 2025-06-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 16–21（6 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289 K；0.1 M MES 5.5, 9.2% PEG10000	分辨率 2.41 Å R-free 0.273
9XSF Cryo-EM structure of H4S47GlcNAc nucleosome at 3.39 angstrom 提交 2025-11-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.39 Å
9YL3 State 1 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.50 Å
9YLE State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.63 Å
9YLY MLL4FC bound to a nucleosome with p53 RE 提交 2025-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.77 Å
9YM8 State 2 focused on PHD FYR of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.43 Å
9YMF State 2 focused on H3 N terminal tail of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 A 2–136（135 aa） 链 E 2–136（135 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.45 Å
9ZEO Competition for different elements of the nucleosome acidic patch yields distinct functional outcomes. VHH 1G1 提交 2025-11-30	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 A 39–136（98 aa） 链 E 39–136（98 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES pH7.6, 50 mM NaCl, 0.5 mM MgCl2, 1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

共 402 个其他 PDB 条目、475 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H31_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–140； UniProt 1–136 作者链 E； PDB构建体 5–140； UniProt 1–136

Histone H4

Homo sapiens

UniProt P62805

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 10 DNA 2 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物数一致	链 B； UniProt 1–103 链 F； UniProt 1–103	未记录	Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H2B type 1-C/E/F/G/I × 2 （P62807） DNA (147-MER) × 1 DNA (147-MER) × 1 E3 ubiquitin-protein ligase RNF168 × 1 （Q8IYW5） Polyubiquitin-B × 1 （P0CG47） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8TXX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
10XZ Non-damaged nucleosome 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
10YA Nucleosome containing a nick at SHL-4 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
10YB Nucleosome containing a nick at SHL-2 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
10YC Nucleosome containing a nick at SHL-4 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
10YD Nucleosome containing a nick at SHL-6 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
10YE DNA Ligase IIIa bound to nucleosome containing a nick at SHL0 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric	链 B 23–102（80 aa） 链 F 23–102（80 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
10YF DNA Ligase IIIa bound to nucleosome containing a nick at SHL-2 (composite) 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric	链 B 23–102（80 aa） 链 F 23–102（80 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率未提供
10YG DNA Ligase IIIa bound to a nucleosome containing a nick at SHL-4 (composite) 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric	链 B 23–102（80 aa） 链 F 23–102（80 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率未提供
10YH DNA Ligase IIIa bound to a nucleosome containing a nick at SHL-6 (composite) 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric	链 B 23–102（80 aa） 链 F 23–102（80 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
10YI XRCC1-DNA Ligase IIIa complex bound to a nucleosome containing a nick at SHL-6 (composite) 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric	链 B 23–102（80 aa） 链 F 23–102（80 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
2BQZ Crystal structure of a ternary complex of the human histone methyltransferase Pr-SET7 (also known as SET8) 提交 2005-04-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 17–25（9 aa） 片段：RESIDUES 17-25	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.00	分辨率 1.50 Å R-free 0.206
2BQZ Crystal structure of a ternary complex of the human histone methyltransferase Pr-SET7 (also known as SET8) 提交 2005-04-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 17–25（9 aa） 片段：RESIDUES 17-25	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.00	分辨率 1.50 Å R-free 0.206
2CV5 Crystal structure of human nucleosome core particle 提交 2005-05-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 0–102（103 aa） 链 F 0–102（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 9 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.277
2LVM Solution structure of human 53BP1 tandem Tudor domains in complex with a histone H4K20me2 peptide 提交 2012-07-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 15–28（14 aa） 片段：UNP residues 15-28	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 1.7 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 8.5 mM protein_2, 25 mM sodium phosphate, 0.001 % DSS, 0.001 % NaN3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.7 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 8.5 mM protein_2, 25 mM sodium phosphate, 0.001 % DSS, 0.001 % NaN3, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 5 mM protein_1, 4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_2, 25 mM sodium phosphate, 0.001 % DSS, 0.001 % NaN3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mM protein_1, 4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_2, 25 mM sodium phosphate, 0.001 % DSS, 0.001 % NaN3, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
2RNY Complex Structures of CBP Bromodomain with H4 ack20 Peptide 提交 2008-02-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 14–28（15 aa） 片段：UNP residues 14-28	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient NMR样品组成 0.5mM [U-100% 13C; U-100% 15N] sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
2RS9 Solution structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with histone H4K5ac peptide 提交 2011-12-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–11（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient NMR样品组成 1.5 mM H4K5ac-1, 0.54 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Bromodomain-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3A6N The nucleosome containing a testis-specific histone variant, human H3T 提交 2009-09-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.264
3AFA The human nucleosome structure 提交 2010-02-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
3AV1 The human nucleosome structure containing the histone variant H3.2 提交 2011-02-18	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.290
3AV2 The human nucleosome structure containing the histone variant H3.3 提交 2011-02-18	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.272
3AYW Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K56Q mutation 提交 2011-05-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.90 Å R-free 0.273
3AZE Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K64Q mutation 提交 2011-05-25	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.302
3AZF Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K79Q mutation 提交 2011-05-25	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.70 Å R-free 0.263
3AZG Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K115Q mutation 提交 2011-05-25	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.40 Å R-free 0.269
3AZH Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K122Q mutation 提交 2011-05-25	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.49 Å R-free 0.266
3AZI Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K31Q mutation 提交 2011-05-25	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	突变：K31Q 突变：K31Q	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.70 Å R-free 0.289
3AZJ Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K44Q mutation 提交 2011-05-25	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	突变：K44Q 突变：K44Q	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.89 Å R-free 0.268
3AZK Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K59Q mutation 提交 2011-05-25	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	突变：K59Q 突变：K59Q	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3AZL Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K77Q mutation 提交 2011-05-25	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	突变：K77Q 突变：K77Q	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.70 Å R-free 0.259
3AZM Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K79Q mutation 提交 2011-05-25	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	突变：K79Q 突变：K79Q	CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.89 Å R-free 0.296
3AZN Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K91Q mutation 提交 2011-05-25	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	突变：K91Q 突变：K91Q	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.254
3CFS Structural basis of the interaction of RbAp46/RbAp48 with histone H4 提交 2008-03-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 28–42（15 aa） 片段：UNP residues 28 to 42	未记录	ARS ARSENIC × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；18% PEG8000, 0.2M Ca acetate, 0.1M Na Cacodylate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.40 Å R-free 0.249
3CFV Structural basis of the interaction of RbAp46/RbAp48 with histone H4 提交 2008-03-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 25–42（18 aa） 片段：UNP residues 25 to 42	未记录	ARS ARSENIC × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；13% PEG 2000, 0.2M Ca acetate, 0.1M Na Cacodylate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.257
3CFV Structural basis of the interaction of RbAp46/RbAp48 with histone H4 提交 2008-03-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 25–42（18 aa） 片段：UNP residues 25 to 42	未记录	ARS ARSENIC × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；13% PEG 2000, 0.2M Ca acetate, 0.1M Na Cacodylate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.257
3F9W Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.206
3F9W Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.206
3F9W Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.206
3F9W Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.206
3F9X Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20me2 / AdoHcy 提交 2008-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.25 Å R-free 0.207
3F9X Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20me2 / AdoHcy 提交 2008-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.25 Å R-free 0.207
3F9X Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20me2 / AdoHcy 提交 2008-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.25 Å R-free 0.207
3F9X Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20me2 / AdoHcy 提交 2008-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.25 Å R-free 0.207
3F9Y Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20me1 / AdoHcy 提交 2008-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.220
3F9Y Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20me1 / AdoHcy 提交 2008-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.220
3F9Z Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y245F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.257
3F9Z Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y245F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.257
3F9Z Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y245F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.257
3F9Z Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y245F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.257
3NQJ Crystal structure of (CENP-A/H4)2 heterotetramer 提交 2010-06-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 21–103（83 aa） 片段：UNP residues 21-103	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；0.17 M ammonium sulfate, 0.085 M sodium cacodylate (pH 6.5), 25.5% PEG-8000, 15% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.10 Å R-free 0.241
3NQU Crystal structure of partially trypsinized (CENP-A/H4)2 heterotetramer 提交 2010-06-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–103（103 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；295 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES (pH 7.9), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3O36 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H4(14-19)K16ac peptide 提交 2010-07-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 15–20（6 aa） 片段：UNP residues 15-20	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Bis-Tris (pH 6.5), 30% Polyethylene glycol 3350, 100 mM ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.216
3O36 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H4(14-19)K16ac peptide 提交 2010-07-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 15–20（6 aa） 片段：UNP residues 15-20	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Bis-Tris (pH 6.5), 30% Polyethylene glycol 3350, 100 mM ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.216
3QZS Crystal Structure of BPTF bromo in complex with histone H4K16ac - Form I 提交 2011-03-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 13–22（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；100 mM Tris-HCl pH 8.0, 20% Glycerol, vapor diffusion, hanging drop	分辨率 1.80 Å R-free 0.230
3QZS Crystal Structure of BPTF bromo in complex with histone H4K16ac - Form I 提交 2011-03-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 13–22（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；100 mM Tris-HCl pH 8.0, 20% Glycerol, vapor diffusion, hanging drop	分辨率 1.80 Å R-free 0.230
3QZT Crystal Structure of BPTF bromo in complex with histone H4K16ac - Form II 提交 2011-03-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 13–22（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；20% (W/V) PEGMME 2K, 20% Glycerol and 0.2 M KCl, 0.1 M Tris-HCL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.50 Å R-free 0.198
3QZV Crystal Structure of BPTF PHD-linker-bromo in complex with histone H4K12ac peptide 提交 2011-03-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 8–18（11 aa） 片段：Histone H4 7-17	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% (W/V) PEG3000, 0.3 M NaAcetate, 0.1 M Na-Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.234
3R45 Structure of a CENP-A-Histone H4 Heterodimer in complex with chaperone HJURP 提交 2011-03-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–103（103 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 13 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；2M ammonium sulfate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.60 Å R-free 0.245
3UVW Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H4K5acK8ac) 提交 2011-11-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–12（11 aa） 片段：unp residues 2-12	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；278 K；0.1M Tris, 20% MPD, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K, pH 8.0	分辨率 1.37 Å R-free 0.171
3UVY Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H4K16acK20ac) 提交 2011-11-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 16–26（11 aa） 片段：UNP RESIDUES 16-26	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；278 K；0.2M NaI, 0.1M BTProp, 20% PEG 3350, 10% EtGly, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 2.02 Å R-free 0.258
3UW9 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H4K8acK12ac) 提交 2011-12-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 8–18（11 aa） 片段：unp residues 8-18	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1M Tris, 0.3M LiCl 15% PEG6000, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K, pH 8.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.257
3UW9 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H4K8acK12ac) 提交 2011-12-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 8–18（11 aa） 片段：unp residues 8-18	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1M Tris, 0.3M LiCl 15% PEG6000, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K, pH 8.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.257
3W96 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H2A N-terminal region 提交 2013-04-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.296
3W97 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H2B N-terminal region 提交 2013-04-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.20 Å R-free 0.321
3W98 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H3.1 N-terminal region 提交 2013-04-01	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.42 Å R-free 0.303
3W99 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H4 N-terminal region 提交 2013-04-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 17–103（87 aa） 片段：UNP residues 17-103 链 F 17–103（87 aa） 片段：UNP residues 17-103	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.312
3WA9 The nucleosome containing human H2A.Z.1 提交 2013-04-30	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.07 Å R-free 0.271
3WAA The nucleosome containing human H2A.Z.2 提交 2013-04-30	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.271
3WKJ The nucleosome containing human TSH2B 提交 2013-10-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.291
3WTP Crystal Structure of the heterotypic nucleosome containing human CENP-A and H3.3 提交 2014-04-14	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K	分辨率 2.67 Å R-free 0.270
3X1S Crystal structure of the nucleosome core particle 提交 2014-11-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70mM KCL, 70-90mM MnCl2, 24% MPD, 20mM Na-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.81 Å R-free 0.270
3X1T Crystal structure of nucleosome core particle consisting of mouse testis specific histone variants H2aa and H2ba 提交 2014-11-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 22 CL CHLORIDE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70mM Kcl, 70-90mM MnCl2, 24% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.81 Å R-free 0.266
3X1U Crystal structure of nucleosome core particle in the presence of histone variants involved in reprogramming 提交 2014-11-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CL CHLORIDE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70 mM KCl, 70-90 mM MnCl2, 24% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.25 Å R-free 0.270
3X1V Crystal structure of nucleosome core particle in the presence of histone variant involved in reprogramming 提交 2014-11-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 19 CL CHLORIDE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70 mM KCl, 70-90 mM MnCl2, Na-cocodylate, 24% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.92 Å R-free 0.259
4GQB Crystal Structure of the human PRMT5:MEP50 Complex 提交 2012-08-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 C 2–22（21 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	0XU (2S,5S,6E)-2,5-diamino-6-[(3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxydihydrofuran-2(3H)-ylidene]hexanoic acid × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20-30% PEG3350, 100-250 mM ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.06 Å R-free 0.222
4H9N Complex structure 1 of DAXX/H3.3(sub5)/H4 提交 2012-09-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.95 Å R-free 0.209
4H9O Complex structure 2 of DAXX/H3.3(sub5,G90M)/H4 提交 2012-09-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.05 Å R-free 0.225
4H9P Complex structure 3 of DAXX/H3.3(sub5,G90A)/H4 提交 2012-09-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.242
4H9P Complex structure 3 of DAXX/H3.3(sub5,G90A)/H4 提交 2012-09-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.242
4H9Q Complex structure 4 of DAXX(E225A)/H3.3(sub5)/H4 提交 2012-09-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.95 Å R-free 0.221
4H9Q Complex structure 4 of DAXX(E225A)/H3.3(sub5)/H4 提交 2012-09-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.95 Å R-free 0.221
4H9R Complex structure 5 of DAXX(E225A)/H3.3(sub5,G90A)/H4 提交 2012-09-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；1.6 M Na/K-phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.230
4H9R Complex structure 5 of DAXX(E225A)/H3.3(sub5,G90A)/H4 提交 2012-09-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；1.6 M Na/K-phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.230
4H9S Complex structure 6 of DAXX/H3.3(sub7)/H4 提交 2012-09-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 21–103（83 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；0.1 M Na/K-phosphate, 2.5M NaCl, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.250
4H9S Complex structure 6 of DAXX/H3.3(sub7)/H4 提交 2012-09-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 21–103（83 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；0.1 M Na/K-phosphate, 2.5M NaCl, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.250
4H9S Complex structure 6 of DAXX/H3.3(sub7)/H4 提交 2012-09-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 21–103（83 aa） 链 D 21–103（83 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；0.1 M Na/K-phosphate, 2.5M NaCl, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.250
4HGA Structure of the variant histone H3.3-H4 heterodimer in complex with its chaperone DAXX 提交 2012-10-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–103（103 aa）	未记录	PC4 TETRACHLOROPLATINATE(II) × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；298 K；0.1M HEPES-Na, pH 7.6, 23% (v/v) PEG 3350, 0.25M Ammonium acetate, 1% Tacsimate pH 7.0, 6% ethanol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
4M38 Crystal structure of Trypanosoma brucei protein arginine methyltransferase 7 complex with AdoHcy and histone H4 peptide 提交 2013-08-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 2–22（21 aa） 片段：UNP residues 2-22 链 F 2–22（21 aa） 片段：UNP residues 2-22	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；100mM MES, 20% PEG 1000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.230
4QUT Structure of the bromodomain of human ATPase family AAA domain-containing protein 2 (ATAD2) complexed with Histone H4-K(ac)12 提交 2014-07-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 7–13（7 aa） 片段：histone H4 tail	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；apo crystals grew in 1.8-2.2 M ammonium sulphate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5-6.5. Soaking performed in 28-32% PEG 3350, 50 mM bis-tris pH 5.5, 50 mM ammonium phosphate and 20% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K	分辨率 1.70 Å R-free 0.180
4QUU Structure of the bromodomain of human ATPase family AAA domain-containing protein 2 (ATAD2) complexed with Histone H4-K(ac)5 提交 2014-07-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–13（13 aa） 片段：histone H4 tail	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；apo crystals grew in 1.8-2.2 M ammonium sulphate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5-6.5. Soaking performed in 28-32% PEG 3350, 50 mM bis-tris pH 5.5, 50 mM ammonium phosphate and 20% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K	分辨率 1.80 Å R-free 0.200
4QYD Crystal Structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with a histone H4K12ac peptide 提交 2014-07-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 5–18（14 aa） 片段：histone H4K12ac peptide (UNP residues 5-18)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 10% w/v polyethylene glycol (PEG) 6,000, 5% v/v (+/-)-2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.94 Å R-free 0.213
4YM5 Crystal structure of the human nucleosome containing 6-4PP (inside) 提交 2015-03-06	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 4.00 Å R-free 0.289
4YM6 Crystal structure of the human nucleosome containing 6-4PP (outside) 提交 2015-03-06	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 3.51 Å R-free 0.287
4YY6 Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a butyryllysine peptide 提交 2015-03-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；277 K；0.2 M sodium malonate, pH 4.0, 20% w/v PEG3350	分辨率 1.45 Å R-free 0.208
4YYD Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a crotonyllysine peptide 提交 2015-03-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.2 M sodium malonate, pH 7.0, 20% w/v PEG3350	分辨率 1.52 Å R-free 0.226
4YYG Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a butyryllysine peptide 提交 2015-03-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.05 M calcium chloride dihydrate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 30% v/v PEG550 MME	分辨率 2.10 Å R-free 0.311
4YYH Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a crotonyllysine peptide 提交 2015-03-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.5, 0.2 M sodium chloride, 20% w/v PEG3350	分辨率 1.74 Å R-free 0.260
4YYH Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a crotonyllysine peptide 提交 2015-03-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Y 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.5, 0.2 M sodium chloride, 20% w/v PEG3350	分辨率 1.74 Å R-free 0.260
4YYI Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to an acetylated peptide 提交 2015-03-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 25% w/v PEG3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.242
4YYI Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to an acetylated peptide 提交 2015-03-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 25% w/v PEG3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.242
4YYJ Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a butyryllysine peptide 提交 2015-03-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M ammonium chloride, 20% w/v PEG3350	分辨率 1.85 Å R-free 0.244
4YYJ Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a butyryllysine peptide 提交 2015-03-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M ammonium chloride, 20% w/v PEG3350	分辨率 1.85 Å R-free 0.244
4YYK Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a crotonyllysine peptide 提交 2015-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES, pH 6.5, 15% w/v PEG550 MME	分辨率 1.79 Å R-free 0.261
4YYK Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a crotonyllysine peptide 提交 2015-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES, pH 6.5, 15% w/v PEG550 MME	分辨率 1.79 Å R-free 0.261
4YYM Crystal structure of TAF1 BD2 Bromodomain bound to a butyryllysine peptide 提交 2015-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 Z 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M calcium chloride, 20 w/v PEG3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.261
4YYN Crystal structure of TAF1 BD2 Bromodomain bound to a crotonyllysine peptide 提交 2015-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 Z 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M calcium acetate, 20% w/v PEG3350	分辨率 1.85 Å R-free 0.243
4Z2M Crystal structure of human SPT16 Mid-AID/H3-H4 tetramer FACT Histone complex 提交 2015-03-30	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 1–103（103 aa） 链 J 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；10% PEG400, 0.9-1.1 M Imidazole, 100-150 mM L-histidine	分辨率 2.98 Å R-free 0.246
4Z5T The nucleosome containing human H3.5 提交 2015-04-03	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.269
5AV5 human nucleosome core particle 提交 2015-06-11	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.233
5AV6 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.20 Å R-free 0.229
5AV8 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.20 Å R-free 0.233
5AV9 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.20 Å R-free 0.239
5AVB human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.236
5AVC human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.238
5AY8 Crystal structure of human nucleosome containing H3.Y 提交 2015-08-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；sodium acetate, manganese chloride, 2-propanol, trimethylamine N-oxide	分辨率 2.80 Å R-free 0.249
5B0Y Crystal structure of the nucleosome containing histone H3 with the crotonylated lysine 122 提交 2015-11-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.56 Å R-free 0.249
5B0Z The crystal structure of the nucleosome containing H3.2, at 1.98 A resolution 提交 2015-11-14	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 1.99 Å R-free 0.254
5B24 The crystal structure of the nucleosome containing cyclobutane pyrimidine dimer 提交 2015-12-31	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 3.60 Å R-free 0.249
5B2I Human nucleosome containing CpG unmethylated DNA 提交 2016-01-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 3.00 Å R-free 0.257
5B2J Human nucleosome containing CpG methylated DNA 提交 2016-01-18	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.60 Å R-free 0.252
5B31 The crystal structure of the heterotypic H2AZ/H2A nucleosome with H3.1. 提交 2016-02-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.20 Å R-free 0.271
5B32 The crystal structure of the heterotypic H2AZ/H2A nucleosome with H3.3. 提交 2016-02-08	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.35 Å R-free 0.259
5B33 The crystal structure of the H2AZ nucleosome with H3.3. 提交 2016-02-08	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.92 Å R-free 0.252
5B40 The nucleosome structure containing H2B-K120 and H4-K31 monoubiquitinations 提交 2016-03-22	突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	突变：K31C 突变：K31C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；90mM Tris-HCl (pH 7.8), 3.6% PGA-LM, 25.2% PEG 400, 2-6% Pentaerythritol ethoxylate (3/4 EO/OH)	分辨率 3.33 Å R-free 0.263
5BNV Crystal structure of Human MCM2 HBD chaperoning a histone H3-H4 tetramer 提交 2015-05-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 2–103（102 aa） 链 E 2–103（102 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；1.5 M sodium/potassium phosphate, pH 8.0	分辨率 2.79 Å R-free 0.220
5BNX Crystal structure of Human MCM2 HBD and ASF1b chaperoning a histone H3.3-H4 dimer 提交 2015-05-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；3.2 M sodium formate, 0.1 M Tris, pH 8.5	分辨率 2.31 Å R-free 0.213
5BO0 Crystal structure of Human MCM2 HBD and ASF1b chaperoning a histone H3.2-H4 dimer 提交 2015-05-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；3.2 M sodium formate, 0.1 M Tris, pH 8.5	分辨率 2.91 Å R-free 0.238
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 K 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0	分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0	分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0	分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 O 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0	分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 S 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0	分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 W 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0	分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5CPI Nucleosome containing unmethylated Sat2R DNA 提交 2015-07-21	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.90 Å R-free 0.295
5CPJ Nucleosome containing methylated Sat2R DNA 提交 2015-07-21	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 3.15 Å R-free 0.295
5CPK Nucleosome containing methylated Sat2L DNA 提交 2015-07-21	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.63 Å R-free 0.284
5FA5 Crystal Structure of PRMT5:MEP50 in complex with MTA and H4 peptide 提交 2015-12-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 C 2–21（20 aa） 片段：DNA binding residues 2-21	未记录	MTA 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；200 mM ammonium sulfate, 20-28% PEG 3350, 2 mM 5-deoxy-5-(methylthio)adenosine, 1 mM H4 peptide (1-20)	分辨率 2.34 Å R-free 0.221
5FA5 Crystal Structure of PRMT5:MEP50 in complex with MTA and H4 peptide 提交 2015-12-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 2–21（20 aa） 片段：DNA binding residues 2-21	未记录	MTA 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；200 mM ammonium sulfate, 20-28% PEG 3350, 2 mM 5-deoxy-5-(methylthio)adenosine, 1 mM H4 peptide (1-20)	分辨率 2.34 Å R-free 0.221
5FA5 Crystal Structure of PRMT5:MEP50 in complex with MTA and H4 peptide 提交 2015-12-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 2–21（20 aa） 片段：DNA binding residues 2-21	未记录	MTA 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；200 mM ammonium sulfate, 20-28% PEG 3350, 2 mM 5-deoxy-5-(methylthio)adenosine, 1 mM H4 peptide (1-20)	分辨率 2.34 Å R-free 0.221
5FA5 Crystal Structure of PRMT5:MEP50 in complex with MTA and H4 peptide 提交 2015-12-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2–21（20 aa） 片段：DNA binding residues 2-21	未记录	MTA 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；200 mM ammonium sulfate, 20-28% PEG 3350, 2 mM 5-deoxy-5-(methylthio)adenosine, 1 mM H4 peptide (1-20)	分辨率 2.34 Å R-free 0.221
5FWE JMJD2A COMPLEXED WITH NI(II), NOG AND HISTONE H4(1-15)R3me2s PEPTIDE 提交 2016-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–16（15 aa） 片段：HISTONE H4(1-15)R3ME2S PEPTIDE, UNP RESIDUES 2-16	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NI NICKEL (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；SITTING DROPS, 277 K, 0.15 M POTASSIUM BROMIDE, 30 % W/V PEG 2000 MME, pH 7.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.255
5FWE JMJD2A COMPLEXED WITH NI(II), NOG AND HISTONE H4(1-15)R3me2s PEPTIDE 提交 2016-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–16（15 aa） 片段：HISTONE H4(1-15)R3ME2S PEPTIDE, UNP RESIDUES 2-16	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NI NICKEL (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；SITTING DROPS, 277 K, 0.15 M POTASSIUM BROMIDE, 30 % W/V PEG 2000 MME, pH 7.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.255
5GSE Crystal structure of unusual nucleosome 提交 2016-08-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；potassium bromide, potassium thiocyanate, Tris-HCl, PGA-LM, PEG 400	分辨率 3.14 Å R-free 0.255
5GSU Crystal structure of nucleosome core particle consisting of human testis-specific histone variants, Th2A and Th2B 提交 2016-08-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；20mM Pottasium Cacodylate pH 6.0, 60-70mM KCl, 70-90mM MnCl2	分辨率 3.10 Å R-free 0.257
5GT0 Crystal structure of nucleosome complex with human testis-specific histone variants, Th2a 提交 2016-08-18	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14 CL CHLORIDE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；60-70mM KCl, 70-90mM MnCl2, 24% MPD	分辨率 2.82 Å R-free 0.280
5GT3 Crystal structure of nucleosome particle in the presence of human testis-specific histone variant, hTh2b 提交 2016-08-18	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 12 CL CHLORIDE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；60-70mM KCl, 70-90mM MnCl2, 24% MPD	分辨率 2.91 Å R-free 0.258
5GTC Crystal structure of complex between DMAP-SH conjugated with a Kaposi's sarcoma herpesvirus LANA peptide (5-15) and nucleosome core particle 提交 2016-08-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.70 Å R-free 0.267
5GXQ The crystal structure of the nucleosome containing H3.6 提交 2016-09-19	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.85 Å R-free 0.262
5JA4 Crystal structure of human TONSL and MCM2 HBDs binding to a histone H3-H4 tetramer 提交 2016-04-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；0.1M MES pH 5.6, 7% isopropanol	分辨率 2.42 Å R-free 0.246
5JRG Crystal structure of the nucleosome containing the DNA with tetrahydrofuran (THF) 提交 2016-05-06	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.50 Å R-free 0.245
5KDM Crystal structure of EBV tegument protein BNRF1 in complex with histone chaperone DAXX and histones H3.3-H4 提交 2016-06-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；0.1M MES pH 6.0, 0.8 M ammonium sulfate	分辨率 3.50 Å R-free 0.280
5X7X The crystal structure of the nucleosome containing H3.3 at 2.18 angstrom resolution 提交 2017-02-27	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.18 Å R-free 0.256
5XF3 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (R,R-configuration) 提交 2017-04-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 RRK (1R,2R)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55 mM MnCl2, 25-49 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.270
5XF4 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (S,S-configuration) 提交 2017-04-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 SSK (1S,2S)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55 mM MnCl2, 25-49 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0	分辨率 2.87 Å R-free 0.266
5XF5 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (R,S-configuration) 提交 2017-04-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 RSK (1S,2R)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55mM MnCl2, 25-49mM KCl, 20mM K-Cacodylate pH 6.0	分辨率 2.82 Å R-free 0.264
5Y0C Crystal Structure of the human nucleosome at 2.09 angstrom resolution 提交 2017-07-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 10 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.09 Å R-free 0.249
5Y0D Crystal Structure of the human nucleosome containing the H2B E76K mutant 提交 2017-07-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 1.99 Å R-free 0.252
5Z23 Crystal structure of the nucleosome containing a chimeric histone H3/CENP-A CATD 提交 2017-12-28	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.73 Å R-free 0.261
5Z30 The crystal structure of the nucleosome containing a cancer-associated histone H2A.Z R80C mutant 提交 2018-01-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.45 Å R-free 0.243
5ZBX The crystal structure of the nucleosome containing histone H3.1 CATD(V76Q, K77D) 提交 2018-02-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.58 Å R-free 0.249
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.60 Å
6BUZ Cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with kinetochore protein CENP-N 提交 2017-12-11	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.92 Å
6C0W Cryo-EM structure of human kinetochore protein CENP-N with the centromeric nucleosome containing CENP-A 提交 2018-01-02	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6E0C Cryo-EM structure of the CENP-A nucleosome (W601) in complex with a single chain antibody fragment 提交 2018-07-06	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.63 Å
6E0P Cryo-EM structure of the centromeric nucleosome (Native alpha satellite DNA) in complex with a single chain antibody fragment 提交 2018-07-06	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 sec before plunging	分辨率 2.60 Å
6FML CryoEM Structure INO80core Nucleosome complex 提交 2018-01-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 N 2–103（102 aa） 链 R 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8, 60 mM KCl, 0.5% glycerol, 0.25 mM CaCl2, 20 uM ZnCl2, 0.25 mM DTT, 0.05% Octyl-beta-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.34 Å
6HKT Structure of an H1-bound 6-nucleosome array 提交 2018-09-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：50-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa） 链 V 1–103（103 aa） 链 Z 1–103（103 aa） 链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa） 链 l 1–103（103 aa） 链 p 1–103（103 aa） 链 v 1–103（103 aa） 链 z 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293.15 K；15% MPD, 0.1 M NaCl and 0.1 M Tris pH 8.8	分辨率 9.70 Å R-free 0.286
6HTS Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to nucleosome 提交 2018-10-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 J 1–103（103 aa） 链 N 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
6IPU Human nucleosome core particle containing 145 bp of DNA 提交 2018-11-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 22–103（82 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate	分辨率 1.99 Å R-free 0.263
6IQ4 Nucleosome core particle cross-linked with a hetero-binuclear molecule possessing RAPTA and gold(I) 4-(diphenylphosphino)benzoic acid groups. 提交 2018-11-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 22–103（82 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	AU GOLD ION × 1 XIS 4-diphenylphosphanylbenzoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 D0X [Ru(eta(6)-p-cymene)Cl-2(pta) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate	分辨率 2.25 Å R-free 0.257
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6JOU Crystal structure of the human nucleosome containing H2A.Z.1 S42R 提交 2019-03-23	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.17 Å R-free 0.250
6JR0 Crystal structure of the human nucleosome phased with 12 selenium atoms 提交 2019-04-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.50 Å R-free 0.253
6JR1 Crystal structure of the human nucleosome phased with 16 selenium atoms 提交 2019-04-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.243
6JXD Human nucleosome core particle with cohesive end DNA termini 提交 2019-04-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 22–103（82 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 17	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate	分辨率 2.25 Å R-free 0.292
6K1I Human nucleosome core particle with gammaH2A.X variant 提交 2019-05-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 23 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；potassium chloride, manganese chloride, potassium cacodylate	分辨率 2.75 Å R-free 0.277
6K1J Human nucleosome core particle with H2A.X variant 提交 2019-05-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；Potassium Chloride, Manganese Chloride, Potassium Cacodylate	分辨率 2.85 Å R-free 0.319
6K1K Human nucleosome core particle with H2A.X S139E variant 提交 2019-05-10	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 33 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；potassium chloride, manganese chloride, potassium cacodylate	分辨率 2.20 Å R-free 0.275
6KE9 The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-07-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 17–103（87 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose	分辨率 2.22 Å R-free 0.230
6KVD Crystal structure of human nucleosome containing H2A.J 提交 2019-09-04	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 13 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.21 Å R-free 0.257
6KXV Crystal structure of a nucleosome containing Leishmania histone H3 提交 2019-09-13	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium acetate, isopropanol, manganese chloride, trimethylamine N-oxide	分辨率 3.63 Å R-free 0.264
6L49 H3-CA-H3 tri-nucleosome with the 22 base-pair linker DNA 提交 2019-10-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa） 链 T 1–103（103 aa） 链 X 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 18.90 Å
6L4A H3-H3-H3 tri-nucleosome with the 22 base-pair linker DNA 提交 2019-10-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa） 链 T 1–103（103 aa） 链 X 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 12.30 Å
6L9H The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-11-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 17–103（87 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose	分辨率 2.60 Å R-free 0.278
6L9Z 338 bp di-nucleosome assembled with linker histone H1.X 提交 2019-11-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 8 CA CALCIUM ION × 65 K POTASSIUM ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate	分辨率 2.50 Å R-free 0.256
6LA2 343 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：38-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa） 链 V 1–103（103 aa） 链 Z 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa） 链 j 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Sodium acetate	分辨率 3.89 Å R-free 0.267
6LA8 349 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 23 K POTASSIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate (cryo-25% MPD)	分辨率 3.40 Å R-free 0.265
6LA9 349 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 (high cryoprotectant) 提交 2019-11-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 40 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate	分辨率 3.70 Å R-free 0.266
6LAB 169 bp nucleosome, harboring cohesive DNA termini, assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 20 K POTASSIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate	分辨率 3.20 Å R-free 0.262
6LE9 The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-11-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 17–103（87 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose	分辨率 2.60 Å R-free 0.281
6LER 169 bp nucleosome harboring non-identical cohesive DNA termini. 提交 2019-11-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate	分辨率 3.00 Å R-free 0.261
6LER 169 bp nucleosome harboring non-identical cohesive DNA termini. 提交 2019-11-26	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 8 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate	分辨率 3.00 Å R-free 0.261
6M3V 355 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini 提交 2020-03-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate, Poly glutamic acid	分辨率 4.60 Å R-free 0.261
6M44 355 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini (high cryoprotectant) 提交 2020-03-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate, Poly glutamic acid	分辨率 3.81 Å R-free 0.286
6M4D Structural mechanism of nucleosome dynamics governed by human histone variants H2A.B and H2A.Z.2.2 提交 2020-03-06	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
6M4G Structural mechanism of nucleosome dynamics governed by human histone variants H2A.B and H2A.Z.2.2 提交 2020-03-06	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
6M4H Structural mechanism of nucleosome dynamics governed by human histone variants H2A.B and H2A.Z.2.2 提交 2020-03-07	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6MLC PHD6 domain of MLL3 in complex with histone H4 提交 2018-09-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 E 2–21（20 aa） 片段：residues 2-21	未记录	ZN ZINC ION × 42 GOL GLYCEROL × 6 UNX UNKNOWN LIGAND × 30	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；2 M Na-Form, 0.1 M Tris, pH 8.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.216
6MLC PHD6 domain of MLL3 in complex with histone H4 提交 2018-09-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 F 2–21（20 aa） 片段：residues 2-21	未记录	ZN ZINC ION × 42 GOL GLYCEROL × 24 UNX UNKNOWN LIGAND × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；2 M Na-Form, 0.1 M Tris, pH 8.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.216
6MUO CENP-A nucleosome bound by two copies of CENP-C(CD) and one copy CENP-N(NT) 提交 2018-10-23	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 9–102（94 aa） 链 F 9–102（94 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10 mM HEPES, 50 mN NaCl, 1 mM EDTA, 1mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 8 seconds before plunging	分辨率 3.60 Å
6MUP CENP-A nucleosome bound by two copies of CENP-C(CD) and two copies CENP-N(NT) 提交 2018-10-23	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 9–102（94 aa） 链 F 9–102（94 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10 mM HEPES, 50 mN NaCl, 1 mM EDTA, 1mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 8 seconds before plunging	分辨率 3.50 Å
6O1D Cryo-EM structure of the centromeric nucleosome with native alpha satellite DNA 提交 2019-02-19	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 sec before plunging	分辨率 3.40 Å
6R0C Human-D02 Nucleosome Core Particle with biotin-streptavidin label 提交 2019-03-12	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6R8Y Cryo-EM structure of NCP-6-4PP(-1)-UV-DDB 提交 2019-04-02	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
6R8Z Cryo-EM structure of NCP_THF2(-1)-UV-DDB 提交 2019-04-02	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6R90 Cryo-EM structure of NCP-THF2(+1)-UV-DDB class A 提交 2019-04-02	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6R91 Cryo-EM structure of NCP_THF2(-3)-UV-DDB 提交 2019-04-02	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6R92 Cryo-EM structure of NCP-THF2(+1)-UV-DDB class B 提交 2019-04-02	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
6R93 Cryo-EM structure of NCP-6-4PP 提交 2019-04-02	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6R94 Cryo-EM structure of NCP_THF2(-3) 提交 2019-04-02	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
6RNY PFV intasome - nucleosome strand transfer complex 提交 2019-05-09	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：octadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；1 min incubation 3.5s blot	分辨率 3.90 Å
6RXS Crystal structure of CobB Ac3(A76G,Y92A, I131L, V187Y) in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 13–23（11 aa） 片段：H4K16Ac	突变：K16ALY 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.03 M HCl, 23% PEG3350	分辨率 1.60 Å R-free 0.205
6SE0 Class 1 : CENP-A nucleosome 提交 2019-07-29	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6SE6 Class2 : CENP-A nucleosome in complex with CENP-C central region 提交 2019-07-29	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
6SEE Class2A : CENP-A nucleosome in complex with CENP-C central region 提交 2019-07-29	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6SEF Class2C : CENP-A nucleosome in complex with CENP-C central region 提交 2019-07-29	聚集状态不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6SEG Class1: CENP-A nucleosome in complex with CENP-C central region 提交 2019-07-30	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
6T79 Structure of a human nucleosome at 3.2 A resolution 提交 2019-10-21	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.	分辨率 3.20 Å
6T7A Structure of human Sox11 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21	聚集状态不同 实验环境不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.	分辨率 3.70 Å
6T7B Structure of human Sox2 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.	分辨率 5.10 Å
6T7C Structure of two copies of human Sox11 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.	分辨率 4.00 Å
6T7D Structure of human Sox11 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.	分辨率 4.40 Å
6T90 OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2019-10-25	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
6T93 Nucleosome with OCT4-SOX2 motif at SHL-6 提交 2019-10-25	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.49 Å
6UPK Structure of FACT_subnucleosome complex 1 提交 2019-10-17	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
6UPL Structure of FACT_subnucleosome complex 2 提交 2019-10-17	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
6USJ Structure of two nucleosomes bridged by human PARP2 提交 2019-10-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Buffer was pH-adjusted and filtered through a 0.22 um filter. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 2s, blot force 0	分辨率 10.50 Å
6V2K The nucleosome structure after H2A-H2B exchange 提交 2019-11-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.60 Å R-free 0.248
6V92 RSC-NCP 提交 2019-12-13	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 20.00 Å
6VO5 Crystal structure of Human histone acetytransferas 1 (HAT1) in complex with isobutryl-COA and K12A mutant variant of histone H4 提交 2020-01-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–21（20 aa）	未记录	ACT ACETATE ION × 1 CO6 ISOBUTYRYL-COENZYME A × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 20K and 0.1M MES pH6.5	分辨率 1.60 Å R-free 0.198
6VO5 Crystal structure of Human histone acetytransferas 1 (HAT1) in complex with isobutryl-COA and K12A mutant variant of histone H4 提交 2020-01-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–21（20 aa）	未记录	CO6 ISOBUTYRYL-COENZYME A × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 20K and 0.1M MES pH6.5	分辨率 1.60 Å R-free 0.198
6X59 The mouse cGAS catalytic domain binding to human assembled nucleosome 提交 2020-05-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
6X5A The mouse cGAS catalytic domain binding to human nucleosome that purified from HEK293T cells 提交 2020-05-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.36 Å
6XJD Two mouse cGAS catalytic domain binding to human assembled nucleosome 提交 2020-06-23	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.80 Å
6Y5D Structure of human cGAS (K394E) bound to the nucleosome 提交 2020-02-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 N 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 9 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6Y5E Structure of human cGAS (K394E) bound to the nucleosome (focused refinement of cGAS-NCP subcomplex) 提交 2020-02-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 23–103（81 aa） 链 F 21–103（83 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 8 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
6YOV OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 提交 2020-04-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
7A08 CryoEM Structure of cGAS Nucleosome complex 提交 2020-08-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 e 2–103（102 aa） 链 i 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.11 Å
7BWD Structure of Dot1L-H2BK34ub Nucleosome Complex 提交 2020-04-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.32 Å
7BXT The cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with CENP-C peptide and CENP-N N-terminal domain 提交 2020-04-20	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
7BY0 The cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with the phosphorylated CENP-C 提交 2020-04-21	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–102（102 aa） 链 F 1–102（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7C0M Human cGAS-nucleosome complex 提交 2020-05-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa） 链 b 2–103（102 aa） 链 f 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7CIZ Crystal structure of DNAJC9 HBD helix2 in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–103（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05 M Lithium sulfate, 0.05 M Sodium sulfate; 0.05 M Tris, pH 8.5, 30% (v/v) PEG400.	分辨率 1.80 Å R-free 0.214
7CIZ Crystal structure of DNAJC9 HBD helix2 in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05 M Lithium sulfate, 0.05 M Sodium sulfate; 0.05 M Tris, pH 8.5, 30% (v/v) PEG400.	分辨率 1.80 Å R-free 0.214
7CIZ Crystal structure of DNAJC9 HBD helix2 in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05 M Lithium sulfate, 0.05 M Sodium sulfate; 0.05 M Tris, pH 8.5, 30% (v/v) PEG400.	分辨率 1.80 Å R-free 0.214
7CJ0 Crystal structure of DNAJC9 HBD in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 2–103（102 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.17 M Sodium acetate, 0.1 M Tris, pH8.5, 25% (v/v) PEG 4000, 20% (v/v) Glycerol	分辨率 2.50 Å R-free 0.295
7CJ0 Crystal structure of DNAJC9 HBD in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.17 M Sodium acetate, 0.1 M Tris, pH8.5, 25% (v/v) PEG 4000, 20% (v/v) Glycerol	分辨率 2.50 Å R-free 0.295
7COW 353 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini with linker histone H1.0 提交 2020-08-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 K POTASSIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；potassium acetate, calcium chloride, potassium chloride	分辨率 2.86 Å R-free 0.297
7D1Z Cryo-EM structure of SET8-nucleosome complex 提交 2020-09-15	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
7D20 Cryo-EM structure of SET8-CENP-A-nucleosome complex 提交 2020-09-15	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7DBP Linker histone defines structure and self-association behaviour of the 177 bp human chromosome 提交 2020-10-21	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7E8D NSD2 E1099K mutant bound to nucleosome 提交 2021-03-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 SFG SINEFUNGIN × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7EIC Crystal structure of AF9 YEATS domain in complex with H4K5acK8ac peptide 提交 2021-03-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–13（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-Tris buffer (pH 6.5) containing 100 mM ammonium acetate and 25% PEG3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.205
7JO9 1:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-08-06	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7JOA 2:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-08-06	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7JZV Cryo-EM structure of the BRCA1-UbcH5c/BARD1 E3-E2 module bound to a nucleosome 提交 2020-09-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 Q 2–103（102 aa） 链 q 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7K5X Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.0 提交 2020-09-17	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.93 Å
7K5Y Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.4 提交 2020-09-17	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
7K60 Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.10 提交 2020-09-17	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
7K61 Cryo-EM structure of 197bp nucleosome aided by scFv 提交 2020-09-17	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
7K63 Cryo-EM structure of a chromatosome containing chimeric linker histone gH1.10-ncH1.4 提交 2020-09-18	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.03 Å
7LMK Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me3 提交 2021-02-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 15–27（13 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline, 0.1 M HEPES (pH 7.5)	分辨率 2.65 Å R-free 0.258
7LMK Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me3 提交 2021-02-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 15–27（13 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline, 0.1 M HEPES (pH 7.5)	分辨率 2.65 Å R-free 0.258
7LMK Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me3 提交 2021-02-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 15–27（13 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline, 0.1 M HEPES (pH 7.5)	分辨率 2.65 Å R-free 0.258
7LMK Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me3 提交 2021-02-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 15–27（13 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline, 0.1 M HEPES (pH 7.5)	分辨率 2.65 Å R-free 0.258
7LMM Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me2 提交 2021-02-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 15–27（13 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES (pH 6.5) ,13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline	分辨率 2.80 Å R-free 0.267
7LMM Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me2 提交 2021-02-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 15–27（13 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES (pH 6.5) ,13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline	分辨率 2.80 Å R-free 0.267
7LMM Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me2 提交 2021-02-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 15–27（13 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES (pH 6.5) ,13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline	分辨率 2.80 Å R-free 0.267
7LMM Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me2 提交 2021-02-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 15–27（13 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES (pH 6.5) ,13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline	分辨率 2.80 Å R-free 0.267
7LYA Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle with linked histone proteins H2A and H2B 提交 2021-03-06	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.91 Å
7LYB Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with BRCA1-BARD1-UbcH5c 提交 2021-03-06	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
7LYC Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A Lys13 and Lys15 in complex with BARD1 (residues 415-777) 提交 2021-03-06	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
7M98 ATAD2 bromodomain complexed with histone H4K5ac (res 1-10) ligand 提交 2021-03-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–16（15 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；2.0 M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, pH 6.6	分辨率 1.60 Å R-free 0.219
7NL0 Cryo-EM structure of the Lin28B nucleosome core particle 提交 2021-02-19	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7PET The 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa） 链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa） 链 l 1–103（103 aa） 链 p 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.50 Å
7PEU Trinucleosome of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa） 链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7PEV Nucleosome stack of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.00 Å
7PEW Nucleosome 1 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
7PEX Nucleosome 2 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
7PEY Nucleosome 3 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7PEZ Nucleosome 4 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 l 1–103（103 aa） 链 p 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.90 Å
7PF0 Trinucleosome of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa） 链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.00 Å
7PF2 Nucleosome stack of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
7PF3 Nucleosome 4 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 l 1–103（103 aa） 链 p 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7PF4 Nucleosome 3 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7PF5 Nucleosome 2 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7PF6 Nucleosome 1 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7PFA Trinucleosome of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa） 链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.70 Å
7PFC Nucleosome stack of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
7PFD Nucleosome 1 of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7PFE Nucleosome 2 of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7PFF Nucleosome 3 of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7PFT Trinucleosome of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa） 链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.80 Å
7PFU Nucleosome stack of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.00 Å
7PFV Nucleosome 1 of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7PFW Nucleosome 2 of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.20 Å
7PFX Nucleosome 3 of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7PII Structure of the human CCAN CENP-A alpha-satellite complex 提交 2021-08-19	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.68 Å
7R5R Structure of the human CCAN CENP-A alpha-satellite complex 提交 2022-02-11	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.44 Å
7SCY Nuc147 bound to single BRCT 提交 2021-09-29	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7SCZ Nuc147 bound to multiple BRCTs 提交 2021-09-29	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7TAN Structure of VRK1 C-terminal tail bound to nucleosome core particle 提交 2021-12-21	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
7U0G structure of LIN28b nucleosome bound 3 OCT4 提交 2022-02-18	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7U0I Structure of LIN28b nucleosome bound 2 OCT4 提交 2022-02-18	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7U0J Structure of 162bp LIN28b nucleosome 提交 2022-02-18	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7U46 Cryo-EM structure of CENP-A nucleosome (palindromic alpha satellite DNA) in complex with CENP-N 提交 2022-02-28	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.68 Å
7U47 CryoEM structure of CENP-N promoted nucleosome stacks with CENP-A and palindromic alpha satellite DNA sequence 提交 2022-02-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 M 1–103（103 aa） 链 Q 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.50 Å
7U4D CryoEM structure of CENP-N promoted nucleosome stacks with CENP-A and 601 DNA sequence 提交 2022-02-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 M 1–103（103 aa） 链 Q 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å
7U50 APE1 bound to a nucleosome core particle with AP-site at SHL-6 提交 2022-03-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7U51 Nucleosome core particle with AP-site at SHL-6 提交 2022-03-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7U52 nucleosome core particle with AP-site at SHL-6.5 提交 2022-03-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7U53 Nucleosome core particle with AP-site at SHL0 提交 2022-03-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7UV9 KDM2A-nucleosome structure stabilized by H3K36C-UNC8015 covalent conjugate 提交 2022-04-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	OH0 N-heptanoyl-N-hydroxy-beta-alanine × 1 FE FE (III) ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.20 Å
7V1M Structural basis for the co-chaperone relationship of sNASP and ASF1b 提交 2021-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；8% v/v Tacsimate, pH 6.0, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.83 Å R-free 0.240
7V1M Structural basis for the co-chaperone relationship of sNASP and ASF1b 提交 2021-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；8% v/v Tacsimate, pH 6.0, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.83 Å R-free 0.240
7V6Q Crystal structure of sNASP-ASF1A-H3.1-H4 complex 提交 2021-08-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 3–103（101 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；18% (v/v) Tacsimate, pH 5.0 11% (v/v) PEG2000MME	分辨率 3.00 Å R-free 0.203
7V6Q Crystal structure of sNASP-ASF1A-H3.1-H4 complex 提交 2021-08-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 3–103（101 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；18% (v/v) Tacsimate, pH 5.0 11% (v/v) PEG2000MME	分辨率 3.00 Å R-free 0.203
7V90 Telomeric mononucleosome 提交 2021-08-24	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7V96 Telomeric Dinucleosome 提交 2021-08-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.92 Å
7V9C Telomeric Dinucleosome in open state 提交 2021-08-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7V9J Telomeric trinucleosome 提交 2021-08-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa） 链 T 1–103（103 aa） 链 X 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.00 Å
7V9K Telomeric tetranucleosome 提交 2021-08-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa） 链 T 1–103（103 aa） 链 X 1–103（103 aa） 链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å
7V9S Telomeric trinucleosome in open state 提交 2021-08-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa） 链 T 1–103（103 aa） 链 X 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.00 Å
7VA4 Telomeric tetranucleosome in open state 提交 2021-08-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa） 链 T 1–103（103 aa） 链 X 1–103（103 aa） 链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 14.00 Å
7VCQ structure of viral protein BKRF4 in complex with H3.3-H4-ASF1 提交 2021-09-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2% Tacsimate pH 7.0; o.1M HEPES pH 7.5; 20% PEG3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.283
7VCQ structure of viral protein BKRF4 in complex with H3.3-H4-ASF1 提交 2021-09-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2% Tacsimate pH 7.0; o.1M HEPES pH 7.5; 20% PEG3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.283
7VCQ structure of viral protein BKRF4 in complex with H3.3-H4-ASF1 提交 2021-09-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2% Tacsimate pH 7.0; o.1M HEPES pH 7.5; 20% PEG3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.283
7VZ4 Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601L DNA sequence 提交 2021-11-15	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 1.89 Å
7W9V Cryo-EM structure of nucleosome in complex with p300 acetyltransferase catalytic core (complex I) 提交 2021-12-10	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.95 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 b 2–103（102 aa） 链 f 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 b 2–103（102 aa） 链 f 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 b 2–103（102 aa） 链 f 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7X57 Cryo-EM structure of human subnucleosome (closed form) 提交 2022-03-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 D 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 H 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.63 Å
7X58 Cryo-EM structure of human subnucleosome (open form) 提交 2022-03-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 D 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa） 链 H 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.93 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7XTI RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58hex) 提交 2022-05-17	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7XVL Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169an DNA fragment) 提交 2022-05-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 V 1–103（103 aa） 链 Z 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.51 Å R-free 0.280
7XVL Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169an DNA fragment) 提交 2022-05-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric	链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa） 链 j 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.51 Å R-free 0.280
7XVM Crystal Structure of Nucleosome-H5 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 18 CL CHLORIDE ION × 3 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 2.84 Å R-free 0.259
7XX5 Crystal Structure of Nucleosome-H1.3 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.19 Å R-free 0.259
7XX6 Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 21 K POTASSIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.39 Å R-free 0.296
7XX6 Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 V 1–103（103 aa） 链 Z 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa） 链 j 1–103（103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 26 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.39 Å R-free 0.296
7XZX Cryo-EM structure of the nucleosome in complex with p53 DNA-binding domain 提交 2022-06-03	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.53 Å
7XZY Cryo-EM structure of the nucleosome containing 193 base-pair DNA with a p53 target sequence 提交 2022-06-03	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.97 Å
7XZZ Cryo-EM structure of the nucleosome in complex with p53 提交 2022-06-03	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7Y00 Cryo-EM structure of the nucleosome containing 169 base-pair DNA with a p53 target sequence 提交 2022-06-03	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.96 Å
7Y5U Cryo-EM structure of the monomeric human CAF1LC-H3-H4 complex 提交 2022-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7Y5V Cryo-EM structure of the dimeric human CAF1LC-H3-H4 complex 提交 2022-06-17	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 E 1–103（103 aa） 链 J 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
7Y5W Cryo-EM structure of the left-handed Di-tetrasome 提交 2022-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 D 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 H 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7Y60 Cryo-EM structure of human CAF1LC bound right-handed Di-tetrasome 提交 2022-06-18	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 D 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 H 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7Y61 Cryo-EM structure of the two CAF1LCs bound right-handed Di-tetrasome 提交 2022-06-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 D 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 H 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
7Y7I chicken KNL2 in complex with the CENP-A nucleosome 提交 2022-06-22	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
7YOZ Cryo-EM structure of human subnucleosome (intermediate form) 提交 2022-08-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 D 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 H 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7YWX Structure of the human CCAN CENP-A alpha-satellite complex 提交 2022-02-14	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 12.00 Å
7YYH Structure of the human CCANdeltaT CENP-A alpha-satellite complex 提交 2022-02-17	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.90 Å
7ZI4 Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to a WT nucleosome 提交 2022-04-07	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 J 1–103（103 aa） 链 N 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4uL of sample applied to Quantifoil R2/2 Cu 300 mesh grids. blot parameters were wait time 30 sec, blot time 0.5 sec, blot force -8	分辨率 3.20 Å
8AAG H1-bound palindromic nucleosome, state 1 提交 2022-07-01	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
8ATF Nucleosome-bound Ino80 ATPase 提交 2022-08-23	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 N 2–103（102 aa） 链 R 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å
8AV6 CryoEM structure of INO80 core nucleosome complex in closed grappler conformation 提交 2022-08-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 N 2–103（102 aa） 链 R 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.68 Å
8DK5 Structure of 187bp LIN28b nucleosome with site 0 mutation 提交 2022-07-02	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.71 Å
8EVG 162bp CX3CR1 nucleosome (further classified with better nucleosome end) 提交 2022-10-20	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
8EVH CX3CR1 nucleosome and wild type PU.1 complex 提交 2022-10-20	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8EVI CX3CR1 nucleosome and PU.1 complex containing disulfide bond mutations 提交 2022-10-20	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.64 Å
8EVJ CX3CR1 nucleosome bound PU.1 and C/EBPa 提交 2022-10-20	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8GUI Bre1-nucleosome complex (Model I) 提交 2022-09-12	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.81 Å
8GUJ Bre1-nucleosome complex (Model II) 提交 2022-09-12	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8GUK Human nucleosome core particle (free form) 提交 2022-09-12	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.51 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
8H1T Cryo-EM structure of BAP1-ASXL1 bound to chromatosome 提交 2022-10-04	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.95 Å
8HLW Crystal structure of SIRT3 in complex with H4K16la peptide 提交 2022-12-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 14–21（8 aa） 片段：residues 20-27, with lactylated No.23 lysine	未记录	ZN ZINC ION × 1 2OP (2S)-2-HYDROXYPROPANOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；0.1 M Tris pH 8.5, 25% (w/v) Polyethylene glycol 3350	分辨率 2.50 Å R-free 0.243
8IEG Bre1(mRBD-RING)/Rad6-Ub/nucleosome complex 提交 2023-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 F 23–102（80 aa） 链 L 23–102（80 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å
8IEJ RNF20-RNF40/hRad6A-Ub/nucleosome complex 提交 2023-02-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 F 23–102（80 aa） 链 L 23–102（80 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
8IHL Overlapping tri-nucleosome 提交 2023-02-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 N 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa） 链 V 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.64 Å
8IQF Cryo-EM structure of the dimeric human CAF1-H3-H4 complex 提交 2023-03-16	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 E 1–103（103 aa） 链 J 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
8IQG Cryo-EM structure of the monomeric human CAF1-H3-H4 complex 提交 2023-03-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8J6S Cryo-EM structure of the single CAF-1 bound right-handed Di-tetrasome 提交 2023-04-26	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 D 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 H 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8J6T Cryo-EM structure of the double CAF-1 bound right-handed Di-tetrasome 提交 2023-04-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 D 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 H 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.60 Å
8JBX Human canonical 601 DNA nucleosome 提交 2023-05-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
8JCC Human histone H2B variant H2BFWT Cryo-EM structure with 601 DNA sequence 提交 2023-05-10	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
8JCD Human H2BFWTH100R nucleosome with 601 DNA 提交 2023-05-11	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.14 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8JHF Native SUV420H1 bound to 167-bp nucleosome 提交 2023-05-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 18–103（86 aa） 链 F 18–103（86 aa）	突变：K20M 突变：K20M	ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane	分辨率 3.68 Å
8JHG Native SUV420H1 bound to 167-bp nucleosome 提交 2023-05-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 18–103（86 aa） 链 F 18–103（86 aa）	突变：K20M 突变：K20M	ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane	分辨率 3.58 Å
8JL9 Cryo-EM structure of the human nucleosome with scFv 提交 2023-06-02	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.65 Å
8JLA Cryo-EM structure of the human nucleosome lacking N-terminal region of H2A, H2B, H3, and H4 提交 2023-06-02	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 17–103（87 aa） 链 F 17–103（87 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å
8JLB Cryo-EM structure of the 145 bp human nucleosome containing H3.2 C110A mutant 提交 2023-06-02	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.36 Å
8JLD Cryo-EM structure of the 145 bp human nucleosome containing acetylated H3 tail 提交 2023-06-02	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.48 Å
8JND The cryo-EM structure of the nonameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-06-06	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.66 Å
8JNE The cryo-EM structure of the decameric RAD51 ring bound to the nucleosome without the linker DNA binding 提交 2023-06-06	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.68 Å
8JNF The cryo-EM structure of the RAD51 filament bound to the nucleosome 提交 2023-06-06	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.91 Å
8KB5 Cryo-EM structure of the human nucleosome containing H3.8 提交 2023-08-03	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.26 Å
8KCY Structure of nucleosome complexed with two DEK molecules 提交 2023-08-08	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8KD1 Structure of nucleosome complexed with one DEK molecule 提交 2023-08-08	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8KE0 Structure of H1.2 bound to the nucleosome 提交 2023-08-11	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8OFF Structure of BARD1 ARD-BRCTs in complex with H2AKc15ub nucleosomes (Map1) 提交 2023-03-15	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 Da 1–103（103 aa） 链 Db 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force = 0 N blot time = 8 s	分辨率 3.40 Å
8OL1 cGAS-Nucleosome in complex with SPSB3-ELOBC (composite structure) 提交 2023-03-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 23–103（81 aa） 链 F 23–103（81 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8OO7 CryoEM Structure INO80core Hexasome complex composite model state1 提交 2023-04-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 N 2–103（102 aa） 链 R 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)	分辨率 2.80 Å
8OOA CryoEM Structure INO80core Hexasome complex Hexasome refinement state1 提交 2023-04-04	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 N 2–103（102 aa） 链 R 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)	分辨率 3.18 Å
8OOP CryoEM Structure INO80core Hexasome complex composite model state2 提交 2023-04-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 N 2–103（102 aa） 链 R 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)	分辨率 2.70 Å
8OOS CryoEM Structure INO80core Hexasome complex ATPase-hexasome refinement state 2 提交 2023-04-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 N 2–103（102 aa） 链 R 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)	分辨率 3.29 Å
8OSJ Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to a nucleosomal E-box at position SHL-6.2 (DNA conformation 1) 提交 2023-04-19	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
8OSK Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to a nucleosomal E-box at position SHL+5.8 (composite map) 提交 2023-04-19	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8OSL Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to the native Por enhancer nucleosome (map 2, additional 3D classification and flexible refinement) 提交 2023-04-19	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
8OTS OCT4 and MYC-MAX co-bound to a nucleosome 提交 2023-04-21	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8OTT MYC-MAX bound to a nucleosome at SHL+5.8 提交 2023-04-21	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 22–103（82 aa） 链 F 22–103（82 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8OX0 Structure of apo telomeric nucleosome 提交 2023-04-28	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM HEPES-KOH pH 8.0, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1% glycerol, 0.01% Igepal CA-630,1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot Force: -15 Blot Time: 2.5 s	分辨率 2.52 Å
8OX1 Structure of TRF1core in complex with telomeric nucleosome 提交 2023-04-28	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM HEPES-KOH pH 8.0, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1% glycerol, 0.01% Igepal CA-630, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot Force: -15 Blot Time: 2.5 s	分辨率 2.70 Å
8PEF Crystal structure of SLF1 Ankyrin repeat domain in complex with H4 tail (K20me0) 提交 2023-06-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 10–26（17 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Sodium malonate dibasic monohydrate 0.1M Hepes pH 7 30% (w/v) Poly(acrylic acid sodium salt) 2100	分辨率 1.28 Å R-free 0.225
8Q36 Structure of Nucleosome Core with a Bound Metallopeptide Conjugate (Foamy Virus GAG Peptide-Au[I] Compound) 提交 2023-08-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 BBB 17–103（87 aa） 链 FFF 17–103（87 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0].	分辨率 2.60 Å R-free 0.262
8Q3E High Resolution Structure of Nucleosome Core with Bound Foamy Virus GAG Peptide 提交 2023-08-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 BBB 17–103（87 aa） 链 FFF 17–103（87 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]	分辨率 2.17 Å R-free 0.270
8Q3M Structure of Nucleosome Core with a Bound Kaposi Sarcoma Associated Herpesvirus LANA Peptide Having a Methionine to Ornithine Substitution 提交 2023-08-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 BBB 17–103（87 aa） 链 FFF 17–103（87 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]	分辨率 2.50 Å R-free 0.268
8Q3X Structure of Nucleosome Core with a Bound Metallopeptide Conjugate (Kaposi Sarcoma Associated Herpesvirus LANA Peptide-Au[I] Compound) 提交 2023-08-04	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 BBB 17–103（87 aa） 链 FFF 17–103（87 aa）	未记录	AU GOLD ION × 1 XIS 4-diphenylphosphanylbenzoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]	分辨率 2.30 Å R-free 0.262
8QZM Structure of DNMT3A1 UDR region bound to H2AK119ub nucleosome 提交 2023-10-27	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5, 65 mM NaCl, 1 mM DTT, 0.1 mM S-Adenosyl methionine cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric	链 O 1–103（103 aa） 链 U 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8RGM Cryo-EM structure of nucleosome containing Widom603 DNA 提交 2023-12-14	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8SB6 Structure of human BRD2-BD1 bound to a histone H4 acetyl-methyllysine peptide 提交 2023-04-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–16（15 aa） 片段：N-terminal peptide (UNP residues 2-16)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 20-25% PEG5000 MME, 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 1.80 Å R-free 0.204
8SB6 Structure of human BRD2-BD1 bound to a histone H4 acetyl-methyllysine peptide 提交 2023-04-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 2–16（15 aa） 片段：N-terminal peptide (UNP residues 2-16)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 20-25% PEG5000 MME, 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 1.80 Å R-free 0.204
8SMW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 1) 提交 2023-04-26	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8SMX Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 2) 提交 2023-04-26	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SMY Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 3) 提交 2023-04-26	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SMZ Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (Class 4) 提交 2023-04-26	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SN0 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 5) 提交 2023-04-26	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SN1 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 6) 提交 2023-04-26	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8SN2 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) 提交 2023-04-26	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8SN3 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8SN4 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN5 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 3) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8SN6 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 4) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN7 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 5) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN8 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 6) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN9 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8SNA Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8SPS High resolution structure of ESRRB nucleosome bound OCT4 at site a and site b 提交 2023-05-03	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8SPU Structure of ESRRB nucleosome bound OCT4 at site c 提交 2023-05-03	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8SYP Genomic CX3CR1 nucleosome 提交 2023-05-25	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8TGP Crystal structure of SIRT2 with FAM-PEG4-H4K16(myristoyl) peptide 提交 2023-07-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 9–21（13 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M MES monohydrate pH 6.5 (NaOH), 20% w/v PEG 4,000	分辨率 1.76 Å R-free 0.230
8TXV Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 1) 提交 2023-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8TXW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 2) 提交 2023-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8U13 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A lysine 15 in complex with RNF168-UbcH5c (class 1) 提交 2023-08-30	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8U14 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A lysine 15 in complex with RNF168-UbcH5c (class 2) 提交 2023-08-30	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8U9S Cryo-EM structure of NRCAM nucleosome aided by scFv 提交 2023-09-20	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8UBJ Cryo-EM structure of NRCAM nucleosome aided by scFv (3D Flex map) 提交 2023-09-23	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8UBK Cryo-EM structure of Ascl1/E12a in complex with NRCAM nucleosome 提交 2023-09-23	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8UBL Cryo-EM structure of Ascl1/E12a in complex with NRCAM nucleosome (3D Flex map) 提交 2023-09-23	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8UPF Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168-UbcH5c 提交 2023-10-22	配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8VFX Cryo-EM structure of 186bp ALBN1 nucleosome aided by scFv 提交 2023-12-22	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.65 Å
8VFY Cryo-EM structure of FoxA1 in complex with ALBN1 nucleosome (class 1) 提交 2023-12-22	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.89 Å
8VFZ Cryo-EM structure of FoxA1 in complex with ALBN1 nucleosome (class 2) 提交 2023-12-22	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8VG0 Cryo-EM structure of GATA4 in complex with ALBN1 nucleosome 提交 2023-12-22	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
8VG1 Cryo-EM structure of FoxA1 and GATA4 in complex with ALBN1 nucleosome 提交 2023-12-22	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.48 Å
8VG2 Cryo-EM structure of FoxA1 and GATA4 in complex with H14 chromatosome 提交 2023-12-22	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
8VLR Cryo-EM structure of native H2AK119bu nucleosome at 2.6 提交 2024-01-12	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 20–103（84 aa） 链 F 20–103（84 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl, pH 7.5, 50 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8VMJ H3K4me3 nucleosome bound to PRC2_AJ119-450 提交 2024-01-13	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 J 1–103（103 aa） 链 Q 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8VMN H3K4me3 nucleosome bound to PRC2_AJ1-450 提交 2024-01-13	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 J 1–103（103 aa） 链 Q 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8VO0 H3K36me3-modified nucleosome bound to PRC2_AJ1-450 with histone H3 tail disengaged 提交 2024-01-14	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 J 26–103（78 aa） 链 Q 25–103（79 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8VOB H3K36me3-modified nucleosome bound to PRC2_AJ1-450 提交 2024-01-14	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 J 1–103（103 aa） 链 Q 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8VWS Nucleosome containing 8oxoG at SHL-6 提交 2024-02-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；50 mM HEPES (pH-7.1), 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, and 1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8VWT OGG1 bound to a nucleosome containing 8oxoG at SHL-6 (composite map) 提交 2024-02-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；50 mM HEPES (pH-7.1), 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, and 1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8VWU Nucleosome containing 8oxoG at SHL4 提交 2024-02-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；50 mM HEPES (pH-7.1), 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, and 1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8VWV OGG1 bound to a nucleosome containing 8oxoG at SHL4 (composite map) 提交 2024-02-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；50 mM HEPES (pH-7.1), 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, and 1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8W9D Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 1 提交 2023-09-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 K POTASSIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8W9E Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 2 提交 2023-09-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8W9F Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 3 提交 2023-09-05	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8WG5 Cryo-EM structure of USP16 bound to H2AK119Ub nucleosome 提交 2023-09-20	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 24–102（79 aa） 链 F 24–102（79 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 D 1–103（103 aa） 链 H 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 D 1–103（103 aa） 链 H 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 D 1–103（103 aa） 链 H 1–103（103 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8X7I Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub in complex with H2AK13Ub nucleosomes determined by intein-based E2-Ub-NCP conjugation strategy 提交 2023-11-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 20–102（83 aa） 链 F 20–102（83 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
8X7J Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub/nucleosomes complex determined by activity-based chemical trapping strategy 提交 2023-11-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 21–102（82 aa） 链 F 21–102（82 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.39 Å
8X7K Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub in complex with H2AK13Ub nucleosomes determined by activity-based chemical trapping strategy (adjacent H2AK13/15 dual-monoubiquitination) 提交 2023-11-24	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 21–102（82 aa） 链 F 21–102（82 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
8XBT The cryo-EM structure of the octameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-12-07	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.12 Å
8XBU The cryo-EM structure of the decameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-12-07	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.24 Å
8XBW The cryo-EM structure of the RAD51 N-terminal lobe domain bound to the histone H4 tail of the nucleosome 提交 2023-12-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.89 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 b 2–103（102 aa） 链 f 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 b 2–103（102 aa） 链 f 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8Y3C Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (closed form) 提交 2024-01-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.21 Å
8Y3D Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (intermediate form2) 提交 2024-01-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
8Y3E Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (open form) 提交 2024-01-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.32 Å
8Y3F Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (intermediate form1) 提交 2024-01-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.54 Å
8YBJ Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601 DNA sequence 提交 2024-02-14	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.38 Å
8YBK Cryo-EM structure of the human nucleosome containing the H3.1 E97K mutant 提交 2024-02-14	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.69 Å
8YE8 Crystal structure of mouse BAHCC1 TTD domain in complex with H4K20me1 peptide 提交 2024-02-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 15–26（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES, pH 6.5, 10 mM Li2SO4, 8% PEG20000 and 3 mM H4K20me	分辨率 1.90 Å R-free 0.238
8YJF Structure of human SPT16 MD-CTD and MCM2 HBD chaperoning a histone H3-H4 tetramer and an H2A-H2B dimer 提交 2024-03-01	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 D 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M calcium acetate, 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5, 12% (w/v) PEG 8000	分辨率 4.40 Å R-free 0.312
8YJM Structure of human SPT16 MD-CTD and MCM2 HBD chaperoning a histone H3-H4 tetramer and a single chain H2B-H2A chimera 提交 2024-03-02	聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 D 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M sodium citrate pH 5.5, 5%(w/v) PEG 4000	分辨率 4.15 Å R-free 0.286
8YNY Structure of Cas9-sgRNA ribonucleoprotein bound to nucleosome 提交 2024-03-12	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：13-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.52 Å
8YTI Crystal Structure of Nucleosome-H1x Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2024-03-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 L 1–103（103 aa） 链 P 1–103（103 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 8 CA CALCIUM ION × 52 K POTASSIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45 mM CaCl2, 25 mM KCl, 10 mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 2.70 Å R-free 0.267
8YV8 Cryo-EM structure of CDCA7 bound to nucleosome including hemimethylated CpG site in Widom601 positioning sequence. 提交 2024-03-28	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8Z50 Crystal structure of the ASF1-H3T-H4 complex 提交 2024-04-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M MES pH 6.0, 10% PEG 6000	分辨率 2.80 Å R-free 0.255
8ZJR Structure of nucleosome-bound RFX5 complex 提交 2024-05-15	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8ZJT Structure of free nucleosome 提交 2024-05-15	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9BE6 Cryo-EM structure of Human Nucleosome collected by Leginon on Krios at 3.0 Angstrom resolution 提交 2024-04-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 F 26–103（78 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9D3K Two Dsup molecules in complex with the nucleosome open from both sides 提交 2024-08-11	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 24–102（79 aa） 链 F 24–102（79 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9D3L Two Dsup molecules in complex with the nucleosome open from the left side 提交 2024-08-11	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 24–102（79 aa） 链 F 24–102（79 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9D3M Two HMGN2s in complex with the nucleosome 提交 2024-08-11	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 22–103（82 aa） 链 F 22–103（82 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9D3N 167-bp 5S rDNA nucleosome cross-linked with glutaraldehyde 提交 2024-08-11	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 25–103（79 aa） 链 F 25–103（79 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9D3O 167-bp 5S rDNA nucleosome - closed 提交 2024-08-11	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 22–103（82 aa） 链 F 22–103（82 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9D3P 167-bp 5S rDNA nucleosome - open I (open only on the downstream side) 提交 2024-08-11	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 22–103（82 aa） 链 F 22–103（82 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9D3Q 167-bp 5S rDNA nucleosome - open II 提交 2024-08-11	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 23–103（81 aa） 链 F 23–103（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9D3R 147-bp 5S rDNA nucleosome - closed 提交 2024-08-11	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 22–103（82 aa） 链 F 22–103（82 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9D3S 147-bp 5S rDNA nucleosome - open I (open on the downstream side) 提交 2024-08-11	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 22–103（82 aa） 链 F 22–103（82 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9D3T 147-bp 5S rDNA nucleosome cross-linked with glutaraldehyde 提交 2024-08-11	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 25–102（78 aa） 链 F 25–102（78 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9DWF Nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-4.5 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9DWG DNA Polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-4.5 (State 1, composite) 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9DWH DNA Polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-4.5 (State 2, composite) 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9DWI DNA Polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-4.5 (State 3, composite) 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9DWJ Nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-3.5 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9DWK DNA Polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-3.5 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9DWL Nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-5.5 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9DWM DNA polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-5.5 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9E00 Cryo-EM structure of human DNMT3A2-DNMT3B3 complex bound to di-nucleosome 提交 2024-10-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 N 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.75 Å
9E05 The consensus model of the cryo-EM structure of human DNMT3A2-DNMT3B3 complex bound to di-nucleosome 提交 2024-10-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 N 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 18 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.00 Å
9E09 Cryo-EM structure a single nucleosome (2) focus of human DNMT3A2-DNMT3B3 complex bound to di-nucleosome 提交 2024-10-17	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 N 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.72 Å
9E0R Cryo-EM structure of a single nucleosome (1) focus of human DNMT3A2-DNMT3B3 complex bound to di-nucleosome 提交 2024-10-18	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9E2D Cryo-EM structure of human DNMT3A2-DNMT3B3 complex bound to a di-nucleosome with a five base pair linker 提交 2024-10-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 N 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 18 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.08 Å
9E2F Cryo-EM structure of a di-nucleosome with a five base pair linker 提交 2024-10-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 N 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.90 Å
9E2Q Cryo-EM structure of DNMT 3A2/3B3 tetramer in complex with a di-nucleosome with a six base pair linker 提交 2024-10-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 N 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 18 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.14 Å
9E2R Cryo-EM structure of human DNMT3A2-DNMT3B3 complex bound to a di-nucleosome and an histone-3 peptide 提交 2024-10-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 N 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 18 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.71 Å
9E3D Cryo-EM structure of DNMT 3A2/3B3 tetramer in complex with a di-nucleosome with K120R mutant H2B 提交 2024-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 N 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9E3R Cryo-EM structure of PWWP domain deleted DNMT 3A2/3B3 in complex with a di-nucleosome 提交 2024-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 N 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 18 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
9E3U Cryo-EM structure of DNMT 3A2/3B3 tetramer bound to a di-nucleosome with a 25 base-pair linker 提交 2024-10-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
9E49 Cryo-EM structure of a di-nucleosome with an eight base-pair linker 提交 2024-10-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 N 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.93 Å
9ECP Structure of the native human NCP purified from HEK293 cells 提交 2024-11-14	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 22–103（82 aa） 链 F 22–103（82 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 1.91 Å
9EOZ Human OGG1 bound to a nucleosome core particle with 8-oxodGuo lesion at SHL6.0 提交 2024-03-16	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9FGQ Structure of human APC3loop 375-381 bound to the NCP 提交 2024-05-24	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPEs pH8.0, 50 mM NaCl, 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9FH9 Structure of CyclinB1 N-terminus bound to the NCP 提交 2024-05-27	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9GCG CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 N 2–103（102 aa） 链 R 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.43 Å
9GE4 CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-07	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 N 2–103（102 aa） 链 R 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.52 Å
9GE5 CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 N 23–103（81 aa） 链 R 26–103（78 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
9GEL CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 N 2–103（102 aa） 链 R 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.86 Å
9GEV CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 N 2–103（102 aa） 链 R 2–103（102 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
9GF6 CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-08	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 N 2–103（102 aa） 链 R 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9GFB CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 N 2–103（102 aa） 链 R 2–103（102 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
9GFM CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 N 22–103（82 aa） 链 R 25–103（79 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9GMK SIRT7:H3K18DTU nucleosome complex 提交 2024-08-29	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9GMR SIRT7-H3K36MTUnucleosome complex 提交 2024-08-29	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	A1IY0 [[(2~{R},3~{a}~{R},5~{R},6~{R},6~{a}~{R})-2-(methylamino)-6-oxidanyl-2-(propylamino)-3~{a},5,6,6~{a}-tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]oxathiol-5-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9GW2 State 2 MAP 1 SETD2 bound to proximal H3 of upstream nucleosome 提交 2024-09-26	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.84 Å
9GXA CENP-A/H4 di-tetrasome assembled on alpha-satellite DNA. 提交 2024-09-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 D 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa） 链 H 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.01 Å
9IGW Ku70/80 bound to 147 bp nucleosome 提交 2025-02-20	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.32 Å
9IGX Ku70/80 bound to 153 bp nucleosome 提交 2025-02-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 18–101（84 aa） 链 F 18–101（84 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.56 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9IPU cryo-EM structure of the RNF168(1-193)/UbcH5c-Ub ubiquitylation module bound to H1.0-K63-Ub3 modified chromatosome 提交 2024-07-11	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J8M Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (High mobility complex) 提交 2024-08-21	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.82 Å
9J8N Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (Low mobility complex) 提交 2024-08-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：32-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.14 Å
9J8O Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-H1-nucleosome complex 提交 2024-08-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.05 Å
9J8W Cryo-EM structure of NCP-UV-DDB complex containing CPD 提交 2024-08-21	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
9JC6 Human H2BW2 nucleosome 提交 2024-08-28	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
9K9L Cryo-EM structure of the human CENP-A-H4 octasome. 提交 2024-10-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 D 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 H 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.66 Å
9KQO cryo-EM structure of RNF20/RNF40-RAD6A-Ub in complex with H2BS112GlcNAc nucleosome 提交 2024-11-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 F 2–103（102 aa） 链 L 2–103（102 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.48 Å
9L1X hDEK-nucleosome complex (conformation 1) 提交 2024-12-16	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.69 Å
9L22 hDEK-nucleosome complex (conformation 2) 提交 2024-12-16	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9MLL GammaH2AX containing nucleosomes, Parallel stack 提交 2024-12-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 M 1–103（103 aa） 链 Q 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9MLN GammaH2AX containing nucleosome, Canonical (Class 1) 提交 2024-12-19	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9MLR GammaH2AX containing nucleosome, Half-wrapped (Class 2) 提交 2024-12-19	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9MLS GammaH2AX containing nucleosome, Extended (Class 3) 提交 2024-12-19	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9MMK H2AX containing nucleosome, Canonical (Class 1) 提交 2024-12-20	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9MMM H2AX containing nucleosomes, Parallel stack 提交 2024-12-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 M 1–103（103 aa） 链 Q 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
9MMN H2AX containing nucleosomes, Left offset stack 提交 2024-12-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 M 1–103（103 aa） 链 Q 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9MMO H2AX containing nucleosomes, Right offset stack 提交 2024-12-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 M 1–103（103 aa） 链 Q 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9MMT H2AX containing nucleosome, Unwrapped (Class 2) 提交 2024-12-20	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9NQU KDM6B-nucleosome structure stabilized by H3K27C-UNC8015 covalent conjugate 提交 2025-03-13	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 OH0 N-heptanoyl-N-hydroxy-beta-alanine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.16 Å
9OGR Cryo-EM analysis of human H2A.Z on methylated Sat2R-P DNA (v1) 提交 2025-05-01	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
9OGS Cryo-EM analysis of human H2A.Z on Sat2R-P DNA (v1) 提交 2025-05-01	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
9OGZ Cryo-EM analysis of human H2A.Z on Sat2R-P DNA (v2) 提交 2025-05-02	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
9OH0 Cryo-EM analysis of human H2A.Z on methylated Sat2R-P DNA (v2) 提交 2025-05-02	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
9OH1 Cryo-EM analysis of human H2A.Z on 601L DNA 提交 2025-05-02	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.09 Å
9OH2 Cryo-EM analysis of human H2A.Z on methylated 601L DNA 提交 2025-05-02	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.14 Å
9Q80 Ku70/80 with Ku70 linker and SAP domain bound to a 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-02-21	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.39 Å
9Q8X Ku70/80 bound to a 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-02-25	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9Q9F DNA-PK bound to a 153 bp H2AX nucleosome model 1 提交 2025-02-26	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.54 Å
9QCR DNA-PK bound to 153 bp H2AX nucleosome model 2 提交 2025-03-05	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.37 Å
9QCS Ku80 mediated DNA-PK dimer bound to 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-03-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：26-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.38 Å
9QMS DNA-PK bound to 153 bp H2AX nucleosome with ATPyS 提交 2025-03-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：30-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.00 Å
9R04 p53 bound to the nucleosome at position SHL-5.7 (crosslinked sample) 提交 2025-04-24	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9R2M p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (non-crosslinked sample, composite map) 提交 2025-04-30	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9R2P p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (crosslinked sample) 提交 2025-04-30	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
9R2Q p53 bound to nucleosome at position SHL-5.7 (non-crosslinked sample) 提交 2025-04-30	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.90 Å
9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9RZC State 3 MAP 1 SETD2 bound to distal H3 of upstream nucleosome 提交 2025-07-15	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.66 Å
9RZE State 2 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to proximal upstream H3 提交 2025-07-15	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.53 Å
9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.72 Å
9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24	聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
9TAX Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a mono-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric	链 d 1–103（103 aa） 链 h 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
9TAY Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a di-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 d 1–103（103 aa） 链 h 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 15.50 Å
9U5U The 1:1 cryo-EM structure of BAP1/ASXL1-K351Ub in complex with H2AK119Ub nucleosome 提交 2025-03-21	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 d 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa） 链 h 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17	聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric	链 f 1–103（103 aa） 链 h 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.54 Å
9UZ7 Cryo-EM structure of the nucleosome core particle with site-specific DNA-histone crosslinking 提交 2025-05-16	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–103（102 aa） 链 D 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6；10 mM HEPES, pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率未提供
9V6Q Cryo-EM structure of two cPRC1 complexes bound to opposite faces of an endogenous 147-bp mono-nucleosome 提交 2025-05-27	聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.60 Å
9V6S Cryo-EM structure of a single cPRC1 complex engaged on one face of an endogenous 147-bp mononucleosome 提交 2025-05-27	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
9V6X Cryo-EM structure of the cPRC1 complex bound to an endogenous 184-bp mono-nucleosome 提交 2025-05-27	实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.00 Å
9V8L Cryo-EM structure of the cPRC1-di-nucleosome (loose) complex 提交 2025-05-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 S 1–103（103 aa） 链 T 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 6.60 Å
9V9H Cryo-EM structure of the cPRC1-di-nucleosome (tight) complex 提交 2025-05-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 Q 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.50 Å
9V9P Cryo-EM structure of the cPRC1-di-nucleosome (CBX7) complex 提交 2025-06-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 B 1–103（103 aa） 链 F 1–103（103 aa） 链 Q 1–103（103 aa） 链 R 1–103（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.40 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 b 1–103（103 aa） 链 f 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.62 Å
9XSF Cryo-EM structure of H4S47GlcNAc nucleosome at 3.39 angstrom 提交 2025-11-20	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.39 Å
9Y46 Human nucleosome structure on Nickel-NTA lipid affinity grid (C2 refinement) 提交 2025-09-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.59 Å
9Y47 Human nucleosome structure on Nickel-NTA lipid affinity grid (C1 refinement) 提交 2025-09-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.74 Å
9YL3 State 1 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.50 Å
9YLE State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.63 Å
9YLY MLL4FC bound to a nucleosome with p53 RE 提交 2025-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.77 Å
9YM8 State 2 focused on PHD FYR of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.43 Å
9YMF State 2 focused on H3 N terminal tail of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 B 2–103（102 aa） 链 F 2–103（102 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.45 Å
9ZEN Competition for different elements of the nucleosome acidic patch yields distinct functional outcomes. VHH 1B2 提交 2025-11-30	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 B 25–103（79 aa） 链 F 25–103（79 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES pH7.6, 50 mM NaCl, 0.5 mM MgCl2, 1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.17 Å
9ZEO Competition for different elements of the nucleosome acidic patch yields distinct functional outcomes. VHH 1G1 提交 2025-11-30	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 B 21–103（83 aa） 链 F 21–103（83 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES pH7.6, 50 mM NaCl, 0.5 mM MgCl2, 1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

共 581 个其他 PDB 条目、633 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 5–107； UniProt 1–103 作者链 F； PDB构建体 5–107； UniProt 1–103

Histone H2B type 1-C/E/F/G/I

Homo sapiens

UniProt P62807

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 10 DNA 2 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物数一致	链 D； UniProt 1–124 链 H； UniProt 1–124	未记录	Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H4 × 2 （P62805） DNA (147-MER) × 1 DNA (147-MER) × 1 E3 ubiquitin-protein ligase RNF168 × 1 （Q8IYW5） Polyubiquitin-B × 1 （P0CG47） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8TXX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
10XZ Non-damaged nucleosome 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
10YA Nucleosome containing a nick at SHL-4 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
10YB Nucleosome containing a nick at SHL-2 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
10YC Nucleosome containing a nick at SHL-4 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
10YD Nucleosome containing a nick at SHL-6 提交 2026-02-12	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
5GT0 Crystal structure of nucleosome complex with human testis-specific histone variants, Th2a 提交 2016-08-18	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14 CL CHLORIDE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；60-70mM KCl, 70-90mM MnCl2, 24% MPD	分辨率 2.82 Å R-free 0.280
5KGF Structural model of 53BP1 bound to a ubiquitylated and methylated nucleosome, at 4.5 A resolution 提交 2016-06-13	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；High concentration NCP-ubme/GST-53BP1 complex at 200 mM salt was diluted just prior to grid freezing. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Plunged into liquid ethane-propane (FEI VITROBOT MARK III)	分辨率 4.54 Å
6C0W Cryo-EM structure of human kinetochore protein CENP-N with the centromeric nucleosome containing CENP-A 提交 2018-01-02	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6FML CryoEM Structure INO80core Nucleosome complex 提交 2018-01-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 P 2–126（125 aa） 链 T 2–126（125 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8, 60 mM KCl, 0.5% glycerol, 0.25 mM CaCl2, 20 uM ZnCl2, 0.25 mM DTT, 0.05% Octyl-beta-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.34 Å
6R0C Human-D02 Nucleosome Core Particle with biotin-streptavidin label 提交 2019-03-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6RNY PFV intasome - nucleosome strand transfer complex 提交 2019-05-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：octadecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；1 min incubation 3.5s blot	分辨率 3.90 Å
6SE0 Class 1 : CENP-A nucleosome 提交 2019-07-29	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6SE6 Class2 : CENP-A nucleosome in complex with CENP-C central region 提交 2019-07-29	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
6SEE Class2A : CENP-A nucleosome in complex with CENP-C central region 提交 2019-07-29	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6SEF Class2C : CENP-A nucleosome in complex with CENP-C central region 提交 2019-07-29	构建体不同 聚集状态不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6SEG Class1: CENP-A nucleosome in complex with CENP-C central region 提交 2019-07-30	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
6UPK Structure of FACT_subnucleosome complex 1 提交 2019-10-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
6UPL Structure of FACT_subnucleosome complex 2 提交 2019-10-17	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 L 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.40 Å
6X59 The mouse cGAS catalytic domain binding to human assembled nucleosome 提交 2020-05-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 3–126（124 aa） 链 H 3–126（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
6X5A The mouse cGAS catalytic domain binding to human nucleosome that purified from HEK293T cells 提交 2020-05-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 3–126（124 aa） 链 H 3–126（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.36 Å
6XJD Two mouse cGAS catalytic domain binding to human assembled nucleosome 提交 2020-06-23	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 3–126（124 aa） 链 H 3–126（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.80 Å
7A08 CryoEM Structure of cGAS Nucleosome complex 提交 2020-08-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 c 2–126（125 aa） 链 g 2–126（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.11 Å
7JO9 1:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-08-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7JOA 2:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-08-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7PII Structure of the human CCAN CENP-A alpha-satellite complex 提交 2021-08-19	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.68 Å
7R5R Structure of the human CCAN CENP-A alpha-satellite complex 提交 2022-02-11	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.44 Å
7TAN Structure of VRK1 C-terminal tail bound to nucleosome core particle 提交 2021-12-21	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.00 Å
7TRF Human telomerase catalytic core RNP with H2A/H2B 提交 2022-01-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 F 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7U46 Cryo-EM structure of CENP-A nucleosome (palindromic alpha satellite DNA) in complex with CENP-N 提交 2022-02-28	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.68 Å
7U47 CryoEM structure of CENP-N promoted nucleosome stacks with CENP-A and palindromic alpha satellite DNA sequence 提交 2022-02-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa） 链 O 1–126（126 aa） 链 S 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.50 Å
7U4D CryoEM structure of CENP-N promoted nucleosome stacks with CENP-A and 601 DNA sequence 提交 2022-02-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa） 链 O 1–126（126 aa） 链 S 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å
7U50 APE1 bound to a nucleosome core particle with AP-site at SHL-6 提交 2022-03-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7U51 Nucleosome core particle with AP-site at SHL-6 提交 2022-03-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7U52 nucleosome core particle with AP-site at SHL-6.5 提交 2022-03-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7U53 Nucleosome core particle with AP-site at SHL0 提交 2022-03-01	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7UV9 KDM2A-nucleosome structure stabilized by H3K36C-UNC8015 covalent conjugate 提交 2022-04-29	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	OH0 N-heptanoyl-N-hydroxy-beta-alanine × 1 FE FE (III) ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.20 Å
7YWX Structure of the human CCAN CENP-A alpha-satellite complex 提交 2022-02-14	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 V 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 12.00 Å
7YYH Structure of the human CCANdeltaT CENP-A alpha-satellite complex 提交 2022-02-17	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 h 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.90 Å
8ATF Nucleosome-bound Ino80 ATPase 提交 2022-08-23	构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 P 2–126（125 aa） 链 T 2–126（125 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å
8AV6 CryoEM structure of INO80 core nucleosome complex in closed grappler conformation 提交 2022-08-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 P 2–126（125 aa） 链 T 2–126（125 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.68 Å
8JBX Human canonical 601 DNA nucleosome 提交 2023-05-09	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
8OFF Structure of BARD1 ARD-BRCTs in complex with H2AKc15ub nucleosomes (Map1) 提交 2023-03-15	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric	链 Ba 1–126（126 aa） 链 Bb 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force = 0 N blot time = 8 s	分辨率 3.40 Å
8OO7 CryoEM Structure INO80core Hexasome complex composite model state1 提交 2023-04-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 P 2–126（125 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)	分辨率 2.80 Å
8OOA CryoEM Structure INO80core Hexasome complex Hexasome refinement state1 提交 2023-04-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 P 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)	分辨率 3.18 Å
8OOP CryoEM Structure INO80core Hexasome complex composite model state2 提交 2023-04-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 P 2–126（125 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)	分辨率 2.70 Å
8OOS CryoEM Structure INO80core Hexasome complex ATPase-hexasome refinement state 2 提交 2023-04-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 P 2–126（125 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)	分辨率 3.29 Å
8OX0 Structure of apo telomeric nucleosome 提交 2023-04-28	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM HEPES-KOH pH 8.0, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1% glycerol, 0.01% Igepal CA-630,1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot Force: -15 Blot Time: 2.5 s	分辨率 2.52 Å
8OX1 Structure of TRF1core in complex with telomeric nucleosome 提交 2023-04-28	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM HEPES-KOH pH 8.0, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1% glycerol, 0.01% Igepal CA-630, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot Force: -15 Blot Time: 2.5 s	分辨率 2.70 Å
8QZM Structure of DNMT3A1 UDR region bound to H2AK119ub nucleosome 提交 2023-10-27	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5, 65 mM NaCl, 1 mM DTT, 0.1 mM S-Adenosyl methionine cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8TXV Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 1) 提交 2023-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–124（124 aa） 链 H 1–124（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8TXW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 2) 提交 2023-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–124（124 aa） 链 H 1–124（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8U13 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A lysine 15 in complex with RNF168-UbcH5c (class 1) 提交 2023-08-30	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–124（124 aa） 链 H 1–124（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8VWS Nucleosome containing 8oxoG at SHL-6 提交 2024-02-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；50 mM HEPES (pH-7.1), 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, and 1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8VWT OGG1 bound to a nucleosome containing 8oxoG at SHL-6 (composite map) 提交 2024-02-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；50 mM HEPES (pH-7.1), 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, and 1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8VWU Nucleosome containing 8oxoG at SHL4 提交 2024-02-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；50 mM HEPES (pH-7.1), 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, and 1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8VWV OGG1 bound to a nucleosome containing 8oxoG at SHL4 (composite map) 提交 2024-02-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；50 mM HEPES (pH-7.1), 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, and 1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 B 1–126（126 aa） 链 F 1–126（126 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 B 1–126（126 aa） 链 F 1–126（126 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 B 1–126（126 aa） 链 F 1–126（126 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9DWF Nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-4.5 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9DWG DNA Polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-4.5 (State 1, composite) 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9DWH DNA Polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-4.5 (State 2, composite) 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9DWI DNA Polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-4.5 (State 3, composite) 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9DWJ Nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-3.5 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9DWK DNA Polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-3.5 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：dodecameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9DWL Nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-5.5 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9DWM DNA polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-5.5 提交 2024-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：dodecameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9EOZ Human OGG1 bound to a nucleosome core particle with 8-oxodGuo lesion at SHL6.0 提交 2024-03-16	构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 H 2–126（125 aa） 链 M 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9NQU KDM6B-nucleosome structure stabilized by H3K27C-UNC8015 covalent conjugate 提交 2025-03-13	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 OH0 N-heptanoyl-N-hydroxy-beta-alanine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.16 Å
9TAX Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a mono-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric	链 f 1–126（126 aa） 链 j 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
9TAY Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a di-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 J 1–126（126 aa） 链 f 1–126（126 aa） 链 j 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 15.50 Å
9V6Q Cryo-EM structure of two cPRC1 complexes bound to opposite faces of an endogenous 147-bp mono-nucleosome 提交 2025-05-27	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.60 Å
9V6S Cryo-EM structure of a single cPRC1 complex engaged on one face of an endogenous 147-bp mononucleosome 提交 2025-05-27	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
9V6X Cryo-EM structure of the cPRC1 complex bound to an endogenous 184-bp mono-nucleosome 提交 2025-05-27	构建体不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.00 Å
9V8L Cryo-EM structure of the cPRC1-di-nucleosome (loose) complex 提交 2025-05-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa） 链 P 1–126（126 aa） 链 R 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 6.60 Å
9V9H Cryo-EM structure of the cPRC1-di-nucleosome (tight) complex 提交 2025-05-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa） 链 N 1–126（126 aa） 链 P 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.50 Å
9V9P Cryo-EM structure of the cPRC1-di-nucleosome (CBX7) complex 提交 2025-06-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 D 1–126（126 aa） 链 H 1–126（126 aa） 链 N 1–126（126 aa） 链 P 1–126（126 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.40 Å
9Y46 Human nucleosome structure on Nickel-NTA lipid affinity grid (C2 refinement) 提交 2025-09-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.59 Å
9Y47 Human nucleosome structure on Nickel-NTA lipid affinity grid (C1 refinement) 提交 2025-09-02	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 D 2–126（125 aa） 链 H 2–126（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.74 Å

共 79 个其他 PDB 条目、79 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H2B1C_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 5–128； UniProt 1–124 作者链 H； PDB构建体 5–128； UniProt 1–124

E3 ubiquitin-protein ligase RNF168

Homo sapiens

UniProt Q8IYW5

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 10 DNA 2 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物数一致	链 K； UniProt 1–571	未记录	Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2B type 1-C/E/F/G/I × 2 （P62807） DNA (147-MER) × 1 DNA (147-MER) × 1 Polyubiquitin-B × 1 （P0CG47） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8TXX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3L11 Crystal Structure of the Ring Domain of RNF168 提交 2009-12-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–113（113 aa） 片段：ring domain (UNP residues 1-113)	未记录	ZN ZINC ION × 2 MLI MALONATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；291 K；1.5 M NaMalonate, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.12 Å R-free 0.215
4GB0 Crystal Structure of the RING domain of RNF168 提交 2012-07-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–111（111 aa） 片段：UNP residues 1-111	未记录	MLI MALONATE ION × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1.6M sodium malonate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
5XIS Crystal structure of RNF168 UDM1 in complex with Lys63-linked diubiquitin, form I 提交 2017-04-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 110–188（79 aa） 片段：UNP residues 110-188	未记录	XYZ beta-D-xylofuranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；15% PEG3350, 0.1 M Tris-HCl (pH 8.5), 100 mM MgCl2	分辨率 1.78 Å R-free 0.245
5XIS Crystal structure of RNF168 UDM1 in complex with Lys63-linked diubiquitin, form I 提交 2017-04-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 110–188（79 aa） 片段：UNP residues 110-188	未记录	XYZ beta-D-xylofuranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；15% PEG3350, 0.1 M Tris-HCl (pH 8.5), 100 mM MgCl2	分辨率 1.78 Å R-free 0.245
5XIT Crystal structure of RNF168 UDM1 in complex with Lys63-linked diubiquitin, form II 提交 2017-04-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 113–188（76 aa） 片段：UNP residues 113-188	未记录	GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；23% PEG MME 2000, 0.1 M Bis-Tris (pH 6.5), 10 mM Pr acetate	分辨率 2.25 Å R-free 0.239
5XIT Crystal structure of RNF168 UDM1 in complex with Lys63-linked diubiquitin, form II 提交 2017-04-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 113–188（76 aa） 片段：UNP residues 113-188	未记录	GOL GLYCEROL × 1 PR PRASEODYMIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；23% PEG MME 2000, 0.1 M Bis-Tris (pH 6.5), 10 mM Pr acetate	分辨率 2.25 Å R-free 0.239
5XIU Crystal structure of RNF168 UDM2 in complex with Lys63-linked diubiquitin 提交 2017-04-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 419–462（44 aa） 片段：UNP residues 419-462	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；25% PEG3350, 0.1 M Tris-HCl (pH8.5), 0.2 M Ammonium Acetate	分辨率 1.80 Å R-free 0.207
5YDK Crystal structure of RNF168 UDM1 in complex with Lys63-linked diubiquitin, tetrameric form 提交 2017-09-13	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 113–194（82 aa） 片段：UNP residues 113-194	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 7.6 21% PEG3350	分辨率 2.50 Å R-free 0.260
5YDK Crystal structure of RNF168 UDM1 in complex with Lys63-linked diubiquitin, tetrameric form 提交 2017-09-13	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 113–194（82 aa） 片段：UNP residues 113-194	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 7.6 21% PEG3350	分辨率 2.50 Å R-free 0.260
5YDK Crystal structure of RNF168 UDM1 in complex with Lys63-linked diubiquitin, tetrameric form 提交 2017-09-13	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 113–194（82 aa） 片段：UNP residues 113-194	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 7.6 21% PEG3350	分辨率 2.50 Å R-free 0.260
5YDK Crystal structure of RNF168 UDM1 in complex with Lys63-linked diubiquitin, tetrameric form 提交 2017-09-13	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 113–194（82 aa） 片段：UNP residues 113-194	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 7.6 21% PEG3350	分辨率 2.50 Å R-free 0.260
8SMW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 1) 提交 2023-04-26	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8SMX Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 2) 提交 2023-04-26	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SMY Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 3) 提交 2023-04-26	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SMZ Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (Class 4) 提交 2023-04-26	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SN0 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 5) 提交 2023-04-26	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SN1 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 6) 提交 2023-04-26	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8SN2 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) 提交 2023-04-26	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8SN3 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8SN4 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN5 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 3) 提交 2023-04-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8SN6 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 4) 提交 2023-04-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN7 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 5) 提交 2023-04-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN8 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 6) 提交 2023-04-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN9 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8SNA Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 K 1–93（93 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8TXV Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 1) 提交 2023-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–571（571 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8TXW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 2) 提交 2023-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–571（571 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8U13 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A lysine 15 in complex with RNF168-UbcH5c (class 1) 提交 2023-08-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1–94（94 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8U14 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A lysine 15 in complex with RNF168-UbcH5c (class 2) 提交 2023-08-30	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–94（94 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8UPF Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168-UbcH5c 提交 2023-10-22	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–94（94 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8UQ8 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 2-residue linker 提交 2023-10-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–94（94 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 7 GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (9.5 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl	分辨率 2.34 Å R-free 0.236
8UQ8 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 2-residue linker 提交 2023-10-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 a 1–94（94 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 14 GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (9.5 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl	分辨率 2.34 Å R-free 0.236
8UQ9 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 4-residue linker 提交 2023-10-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–94（94 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 17 GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (8.8 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl	分辨率 2.30 Å R-free 0.206
8UQ9 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 4-residue linker 提交 2023-10-23	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 a 1–94（94 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 19 GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (8.8 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl	分辨率 2.30 Å R-free 0.206
8UQA Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 12-residue linker 提交 2023-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 1–94（94 aa）	突变：C85K in UbcH5c	NA SODIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (8.0 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl	分辨率 2.05 Å R-free 0.231
8UQB Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 20-residue linker (crystallization condition 1) 提交 2023-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–94（94 aa）	突变：C85K in UbcH5c	ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (12 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 50 mM BIS-TRIS propane, pH 7.0, 1 M NaCl	分辨率 2.48 Å R-free 0.260
8UQC Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 20-residue linker (crystallization condition 2) 提交 2023-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–94（94 aa）	突变：C85K in UbcH5c	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (12 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 4% tacsimate, pH 6, 13.5% PEG3350	分辨率 2.61 Å R-free 0.252
8UQD Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 20-residue linker (condition 2. RING not modeled in density) 提交 2023-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–94（94 aa）	突变：C85K in UbcH5c	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (12 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 4% tacsimate, pH 6, 13.5% PEG3350	分辨率 3.89 Å R-free 0.322
8UQE Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 26-residue linker (RING not modeled in density) 提交 2023-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–94（94 aa）	突变：S22R,C85K in UbcH5c	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (10 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.0 M sodium acetate	分辨率 3.56 Å R-free 0.268
8X7I Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub in complex with H2AK13Ub nucleosomes determined by intein-based E2-Ub-NCP conjugation strategy 提交 2023-11-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 L 1–113（113 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
8X7J Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub/nucleosomes complex determined by activity-based chemical trapping strategy 提交 2023-11-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 L 1–113（113 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.39 Å
8X7K Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub in complex with H2AK13Ub nucleosomes determined by activity-based chemical trapping strategy (adjacent H2AK13/15 dual-monoubiquitination) 提交 2023-11-24	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–113（113 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
9IPU cryo-EM structure of the RNF168(1-193)/UbcH5c-Ub ubiquitylation module bound to H1.0-K63-Ub3 modified chromatosome 提交 2024-07-11	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 L 1–193（193 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9KQ2 Cryo-EM structure of RNF168'-RNF168-UbcH5c complex bound to nucleosome 提交 2024-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1–103（103 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å

共 38 个其他 PDB 条目、45 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RN168_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 4–574； UniProt 1–571

Polyubiquitin-B

Homo sapiens

UniProt P0CG47

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 10 DNA 2 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物数一致	链 M； UniProt 18–76	未记录	Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2B type 1-C/E/F/G/I × 2 （P62807） DNA (147-MER) × 1 DNA (147-MER) × 1 E3 ubiquitin-protein ligase RNF168 × 1 （Q8IYW5） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8TXX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2MBB Solution Structure of the human Polymerase iota UBM1-Ubiquitin Complex 提交 2013-07-29	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa） 片段：UNP P0CG47 residues 1-76	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient NMR样品组成 3 mM [U-100% 15N] GB1-UBM1, 3 mM [U-100% 15N] ubiquitin, 100 mM potassium chloride, 25 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] GB1-UBM1, 3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ubiquitin, 100 mM potassium chloride, 25 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] GB1-UBM1, 3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ubiquitin, 100 mM potassium chloride, 25 mM sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] GB1-UBM1, 3 mM ubiquitin, 100 mM potassium chloride, 25 mM sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 3 mM GB1-UBM1, 3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] ubiquitin, 100 mM potassium chloride, 25 mM sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
2MRO Structure of the complex of ubiquitin and the UBA domain from DNA-damage-inducible 1 protein (Ddi1) 提交 2014-07-14	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa） 片段：Human Ubiquitin	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；298.2 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] Ub-1, 20 mM sodium phosphate-2, 7 % [U-99% 2H] D2O-3, 93 % H2O-4, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] UBA-5, 20 mM sodium phosphate-6, 7 % [U-99% 2H] D2O-7, 93 % H2O-8, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
2MSG Solid-state NMR structure of ubiquitin 提交 2014-08-04	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–78（72 aa） 片段：UNP residuse 1-72	未记录	未记录非水小分子	SOLID-STATE NMR NMR测量条件 273 K；压力 ambient NMR样品组成 20 mg [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 30 mg [1-glucose 13C,U-100% 15N] Ubiquitin, 40 mg [2-glucose 13C,U-100% 15N] Ubiquitin, 40 % v/v MPD, 0.2 M CdCl2, 1 mg DSS, 100% H20 | 100% H20	分辨率未提供
2N13 Complex structure of MyUb (1080-1122) of human Myosin VI with K63-diUb 提交 2015-03-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–76（76 aa） 链 C 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2Y5B Structure of USP21 in complex with linear diubiquitin-aldehyde 提交 2011-01-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–152（152 aa） 片段：LINEAR DIUBIQUITIN ALDEHYDE, RESIDUES 1-152	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；15% PEG8000, 0.2 M NH4SO4, pH 7.4	分辨率 2.70 Å R-free 0.279
2Y5B Structure of USP21 in complex with linear diubiquitin-aldehyde 提交 2011-01-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–152（152 aa） 片段：LINEAR DIUBIQUITIN ALDEHYDE, RESIDUES 1-152	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；15% PEG8000, 0.2 M NH4SO4, pH 7.4	分辨率 2.70 Å R-free 0.279
3O65 Crystal structure of a Josephin-ubiquitin complex: Evolutionary restraints on ataxin-3 deubiquitinating activity 提交 2010-07-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；291 K；The protein complex was at 8 mg/ml in 10 mM Tris pH 7,5mm DTT. 2 microlitres drops were set up under paraffin oil. To 1.1 microlitres of precipitant (1.6 M sodium citrate pH 6.5, pH adjusted with HCl) 0.9 microlitres of protein was added, the final concentration of precipitant was therefore 0.88 M sodium citrate. For cryo crystals were passed through the 1.6 M sodium citrate pH 6.5 preciptant solution and then flash frozen in liquid nitrogen, microbatch under paraffin oil, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.224
3O65 Crystal structure of a Josephin-ubiquitin complex: Evolutionary restraints on ataxin-3 deubiquitinating activity 提交 2010-07-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；291 K；The protein complex was at 8 mg/ml in 10 mM Tris pH 7,5mm DTT. 2 microlitres drops were set up under paraffin oil. To 1.1 microlitres of precipitant (1.6 M sodium citrate pH 6.5, pH adjusted with HCl) 0.9 microlitres of protein was added, the final concentration of precipitant was therefore 0.88 M sodium citrate. For cryo crystals were passed through the 1.6 M sodium citrate pH 6.5 preciptant solution and then flash frozen in liquid nitrogen, microbatch under paraffin oil, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.224
3O65 Crystal structure of a Josephin-ubiquitin complex: Evolutionary restraints on ataxin-3 deubiquitinating activity 提交 2010-07-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；291 K；The protein complex was at 8 mg/ml in 10 mM Tris pH 7,5mm DTT. 2 microlitres drops were set up under paraffin oil. To 1.1 microlitres of precipitant (1.6 M sodium citrate pH 6.5, pH adjusted with HCl) 0.9 microlitres of protein was added, the final concentration of precipitant was therefore 0.88 M sodium citrate. For cryo crystals were passed through the 1.6 M sodium citrate pH 6.5 preciptant solution and then flash frozen in liquid nitrogen, microbatch under paraffin oil, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.224
3O65 Crystal structure of a Josephin-ubiquitin complex: Evolutionary restraints on ataxin-3 deubiquitinating activity 提交 2010-07-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；291 K；The protein complex was at 8 mg/ml in 10 mM Tris pH 7,5mm DTT. 2 microlitres drops were set up under paraffin oil. To 1.1 microlitres of precipitant (1.6 M sodium citrate pH 6.5, pH adjusted with HCl) 0.9 microlitres of protein was added, the final concentration of precipitant was therefore 0.88 M sodium citrate. For cryo crystals were passed through the 1.6 M sodium citrate pH 6.5 preciptant solution and then flash frozen in liquid nitrogen, microbatch under paraffin oil, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.224
3O65 Crystal structure of a Josephin-ubiquitin complex: Evolutionary restraints on ataxin-3 deubiquitinating activity 提交 2010-07-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 B 1–76（76 aa） 链 D 1–76（76 aa） 链 F 1–76（76 aa） 链 H 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；291 K；The protein complex was at 8 mg/ml in 10 mM Tris pH 7,5mm DTT. 2 microlitres drops were set up under paraffin oil. To 1.1 microlitres of precipitant (1.6 M sodium citrate pH 6.5, pH adjusted with HCl) 0.9 microlitres of protein was added, the final concentration of precipitant was therefore 0.88 M sodium citrate. For cryo crystals were passed through the 1.6 M sodium citrate pH 6.5 preciptant solution and then flash frozen in liquid nitrogen, microbatch under paraffin oil, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.224
3O65 Crystal structure of a Josephin-ubiquitin complex: Evolutionary restraints on ataxin-3 deubiquitinating activity 提交 2010-07-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 1–76（76 aa） 链 D 1–76（76 aa） 链 F 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；291 K；The protein complex was at 8 mg/ml in 10 mM Tris pH 7,5mm DTT. 2 microlitres drops were set up under paraffin oil. To 1.1 microlitres of precipitant (1.6 M sodium citrate pH 6.5, pH adjusted with HCl) 0.9 microlitres of protein was added, the final concentration of precipitant was therefore 0.88 M sodium citrate. For cryo crystals were passed through the 1.6 M sodium citrate pH 6.5 preciptant solution and then flash frozen in liquid nitrogen, microbatch under paraffin oil, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.224
3OJ3 Crystal structure of the A20 ZnF4 and ubiquitin complex 提交 2010-08-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；292 K；0.1 M MES pH 6.5 and 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K	分辨率 2.50 Å R-free 0.226
3OJ3 Crystal structure of the A20 ZnF4 and ubiquitin complex 提交 2010-08-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；292 K；0.1 M MES pH 6.5 and 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K	分辨率 2.50 Å R-free 0.226
3OJ3 Crystal structure of the A20 ZnF4 and ubiquitin complex 提交 2010-08-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；292 K；0.1 M MES pH 6.5 and 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K	分辨率 2.50 Å R-free 0.226
3OJ3 Crystal structure of the A20 ZnF4 and ubiquitin complex 提交 2010-08-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；292 K；0.1 M MES pH 6.5 and 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K	分辨率 2.50 Å R-free 0.226
3OJ3 Crystal structure of the A20 ZnF4 and ubiquitin complex 提交 2010-08-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；292 K；0.1 M MES pH 6.5 and 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K	分辨率 2.50 Å R-free 0.226
3OJ3 Crystal structure of the A20 ZnF4 and ubiquitin complex 提交 2010-08-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；292 K；0.1 M MES pH 6.5 and 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K	分辨率 2.50 Å R-free 0.226
3OJ3 Crystal structure of the A20 ZnF4 and ubiquitin complex 提交 2010-08-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；292 K；0.1 M MES pH 6.5 and 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K	分辨率 2.50 Å R-free 0.226
3OJ3 Crystal structure of the A20 ZnF4 and ubiquitin complex 提交 2010-08-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；292 K；0.1 M MES pH 6.5 and 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K	分辨率 2.50 Å R-free 0.226
3OJ3 Crystal structure of the A20 ZnF4 and ubiquitin complex 提交 2010-08-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 1-76 链 C 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 1-76 链 D 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；292 K；0.1 M MES pH 6.5 and 30% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K	分辨率 2.50 Å R-free 0.226
3OJ4 Crystal structure of the A20 ZnF4, ubiquitin and UbcH5A complex 提交 2010-08-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.1；292 K；0.1 M HEPES pH 7.1 and 1.85 M Na Malonate pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K	分辨率 3.40 Å R-free 0.319
3OJ4 Crystal structure of the A20 ZnF4, ubiquitin and UbcH5A complex 提交 2010-08-20	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.1；292 K；0.1 M HEPES pH 7.1 and 1.85 M Na Malonate pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K	分辨率 3.40 Å R-free 0.319
3ONS Crystal structure of Human Ubiquitin in a new crystal form 提交 2010-08-30	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–72（72 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；2 ul of a 10 mg/ml protein solution was mixed with 2 ul of the reservoir solution (50-56 % MPD and 8-18 % (v/v) glycerol solution in 27mM sodium citrate (pH 4.0-4.2) buffer), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.211
3PTF X-ray structure of the non-covalent complex between UbcH5A and Ubiquitin 提交 2010-12-02	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；Crystals of the complex were grown by hanging-drop vapor diffusion at 19 C by combining 1.5 ul of protein solution (20 mM MES pH 6.0, 150 mM NaCl and 0.5 mM TCEP) at 20 mg/ml with 1.5 ul of reservoir solution (0.1 M Tris pH 8.5 and 24% PEG 10,000), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.70 Å R-free 0.275
3PTF X-ray structure of the non-covalent complex between UbcH5A and Ubiquitin 提交 2010-12-02	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa） 片段：Ubiquitin	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；Crystals of the complex were grown by hanging-drop vapor diffusion at 19 C by combining 1.5 ul of protein solution (20 mM MES pH 6.0, 150 mM NaCl and 0.5 mM TCEP) at 20 mg/ml with 1.5 ul of reservoir solution (0.1 M Tris pH 8.5 and 24% PEG 10,000), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.70 Å R-free 0.275
3ZLZ Lys6-linked tri-ubiquitin 提交 2013-02-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–76（76 aa） 链 B 1–76（76 aa）	突变：YES 突变：YES	ZN ZINC ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；20% (V/V) PEG3350 AND 0.2 M ZINC ACETATE, pH 7.4	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
3ZLZ Lys6-linked tri-ubiquitin 提交 2013-02-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–76（76 aa）	突变：YES	ZN ZINC ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；20% (V/V) PEG3350 AND 0.2 M ZINC ACETATE, pH 7.4	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
3ZLZ Lys6-linked tri-ubiquitin 提交 2013-02-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa）	突变：YES	ZN ZINC ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；20% (V/V) PEG3350 AND 0.2 M ZINC ACETATE, pH 7.4	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
3ZNH Crimean Congo Hemorrhagic Fever Virus OTU domain in complex with ubiquitin-propargyl. 提交 2013-02-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；20-30% PEG 8000, 100 MM NA CACODYLATE PH 6.5, 100 MM MG ACETATE, AND 2% N-OCTYL-BETA-D-GLUCOSIDE.	分辨率 2.30 Å R-free 0.275
4UEL UCH-L5 in complex with ubiquitin-propargyl bound to the RPN13 DEUBAD domain 提交 2014-12-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa）	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 277 K；100 MM BIS-TRIS-PROPANE PH 5.8, 300 MM NABR, 21% PEG3350. 4 DEGREES CELSIUS	分辨率 2.30 Å R-free 0.234
4UF6 UCH-L5 in complex with ubiquitin-propargyl bound to an activating fragment of INO80G 提交 2014-12-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 277 K；100 MM MIB PH 5.0, 250 MM AMMONIUM ACETATE, 25% PEG 3350. 4 DEGREES CELSIUS	分辨率 3.69 Å R-free 0.269
4UF6 UCH-L5 in complex with ubiquitin-propargyl bound to an activating fragment of INO80G 提交 2014-12-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 277 K；100 MM MIB PH 5.0, 250 MM AMMONIUM ACETATE, 25% PEG 3350. 4 DEGREES CELSIUS	分辨率 3.69 Å R-free 0.269
4UF6 UCH-L5 in complex with ubiquitin-propargyl bound to an activating fragment of INO80G 提交 2014-12-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 277 K；100 MM MIB PH 5.0, 250 MM AMMONIUM ACETATE, 25% PEG 3350. 4 DEGREES CELSIUS	分辨率 3.69 Å R-free 0.269
4UF6 UCH-L5 in complex with ubiquitin-propargyl bound to an activating fragment of INO80G 提交 2014-12-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 277 K；100 MM MIB PH 5.0, 250 MM AMMONIUM ACETATE, 25% PEG 3350. 4 DEGREES CELSIUS	分辨率 3.69 Å R-free 0.269
4WHV E3 ubiquitin-protein ligase RNF8 in complex with Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N and Polyubiquitin-B 提交 2014-09-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–76（76 aa） 片段：unp residues 1-76 链 F 1–76（76 aa） 片段：unp residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；1.04 M (NH4)2HPO4	分辨率 8.30 Å R-free 0.337
4WHV E3 ubiquitin-protein ligase RNF8 in complex with Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N and Polyubiquitin-B 提交 2014-09-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 1–76（76 aa） 片段：unp residues 1-76 链 L 1–76（76 aa） 片段：unp residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；1.04 M (NH4)2HPO4	分辨率 8.30 Å R-free 0.337
4WLR Crystal Structure of mUCH37-hRPN13 CTD-hUb complex 提交 2014-10-07	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；277 K；25% PEG 3350, 220 mM MgCl2,100 mM Bis-Tris	分辨率 2.00 Å R-free 0.227
4WUR The crystal structure of the MERS-CoV papain-like protease (C111S) with human ubiquitin 提交 2014-11-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；291 K；22% w/v PEG 4000, 15% v/v 2-propanol, 0.1M tri-sodium citrate pH 4.8 and 10% glycerol	分辨率 3.16 Å R-free 0.252
4WZP Ser65 phosphorylated ubiquitin, major conformation 提交 2014-11-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；30% (w/v) PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.237
4WZP Ser65 phosphorylated ubiquitin, major conformation 提交 2014-11-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；30% (w/v) PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.237
4WZP Ser65 phosphorylated ubiquitin, major conformation 提交 2014-11-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；30% (w/v) PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.237
4WZP Ser65 phosphorylated ubiquitin, major conformation 提交 2014-11-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；30% (w/v) PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.237
4WZP Ser65 phosphorylated ubiquitin, major conformation 提交 2014-11-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；30% (w/v) PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.237
4WZP Ser65 phosphorylated ubiquitin, major conformation 提交 2014-11-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；30% (w/v) PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.237
4WZP Ser65 phosphorylated ubiquitin, major conformation 提交 2014-11-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；30% (w/v) PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.237
4WZP Ser65 phosphorylated ubiquitin, major conformation 提交 2014-11-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 H 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；30% (w/v) PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.237
4XOF Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal - Orthorhombic Ubiquitin crystals without Zinc. 提交 2015-01-16	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% (w/v) PEG 1450, 50mM HEPES pH 7.0	分辨率 1.15 Å R-free 0.171
4ZFR Catalytic domain of Sst2 F403A mutant bound to ubiquitin 提交 2015-04-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 77–152（76 aa） 片段：unp residues 77-152	未记录	ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M sodium citrate tribasic diehydrate, 0.1M HEPES sodium, 20% v/v 2-propanol	分辨率 1.72 Å R-free 0.237
4ZFT Catalytic domain of Sst2 F403W mutant bound to ubiquitin 提交 2015-04-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 77–152（76 aa） 片段：unp residues 77-152	未记录	ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；(0.04 M Citric acid, 0.06 M BIS-TRIS propane), 20% w/v PEG 3,350	分辨率 2.30 Å R-free 0.235
4ZFT Catalytic domain of Sst2 F403W mutant bound to ubiquitin 提交 2015-04-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 77–152（76 aa） 片段：unp residues 77-152	未记录	ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；(0.04 M Citric acid, 0.06 M BIS-TRIS propane), 20% w/v PEG 3,350	分辨率 2.30 Å R-free 0.235
4ZPZ Crystal Structure of Semi-synthetic Ubiquitin with Phospho-Ser65 and Ala46Cys 提交 2015-05-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–73（73 aa） 片段：ubiquitin, UNP residues 1-73 链 B 1–73（73 aa） 片段：ubiquitin, UNP residues 1-73	突变：A46C, Phospho-Ser65 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：A46C, Phospho-Ser65 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；50 mM sodium cacodylate, 25% PEG 4000	分辨率 1.54 Å R-free 0.173
4ZUX SAGA DUB module Ubp8/Sgf11/Sus1/Sgf73 bound to ubiqitinated nucleosome 提交 2015-05-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 X 1–76（76 aa） 链 c 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Tris-acetate pH 7.4, 50 mM sodium acetate, 5 mM Mg-acetate, 5% sucrose and 5% 2-propanol	分辨率 3.82 Å R-free 0.256
4ZUX SAGA DUB module Ubp8/Sgf11/Sus1/Sgf73 bound to ubiqitinated nucleosome 提交 2015-05-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 h 1–76（76 aa） 链 m 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Tris-acetate pH 7.4, 50 mM sodium acetate, 5 mM Mg-acetate, 5% sucrose and 5% 2-propanol	分辨率 3.82 Å R-free 0.256
5BNB Crystal structure of a Ube2S-ubiquitin conjugate 提交 2015-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–76（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris, 20% PEG 4000	分辨率 2.49 Å R-free 0.304
5BNB Crystal structure of a Ube2S-ubiquitin conjugate 提交 2015-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 1–76（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris, 20% PEG 4000	分辨率 2.49 Å R-free 0.304
5BNB Crystal structure of a Ube2S-ubiquitin conjugate 提交 2015-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–76（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris, 20% PEG 4000	分辨率 2.49 Å R-free 0.304
5BNB Crystal structure of a Ube2S-ubiquitin conjugate 提交 2015-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–76（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris, 20% PEG 4000	分辨率 2.49 Å R-free 0.304
5CAW Structure of Pediculus humanus Parkin bound to phospho-ubiquitin 提交 2015-06-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	突变：G76 exchanged to chemical probe 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；2% (v/v) PEG400, 2 M NH4SO4, 0.1 M HEPES pH 7.5	分辨率 2.62 Å R-free 0.260
5CAW Structure of Pediculus humanus Parkin bound to phospho-ubiquitin 提交 2015-06-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa）	突变：G76 exchanged to chemical probe 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；2% (v/v) PEG400, 2 M NH4SO4, 0.1 M HEPES pH 7.5	分辨率 2.62 Å R-free 0.260
5CRA Structure of the SdeA DUB Domain 提交 2015-07-22	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–75（75 aa） 片段：UNP residues 1-75	未记录	SO4 SULFATE ION × 6 GVE METHYL 4-AMINOBUTANOATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M Tris:HCl, 3.0 M Sodium Chloride	分辨率 2.64 Å R-free 0.236
5CRA Structure of the SdeA DUB Domain 提交 2015-07-22	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–75（75 aa） 片段：UNP residues 1-75	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 GVE METHYL 4-AMINOBUTANOATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M Tris:HCl, 3.0 M Sodium Chloride	分辨率 2.64 Å R-free 0.236
5CVM USP46~ubiquitin BEA covalent complex 提交 2015-07-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–59（59 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；3.6 M sodium formate	分辨率 1.90 Å R-free 0.197
5CVN WDR48 (2-580):USP46~ubiquitin ternary complex 提交 2015-07-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；292 K；0.1 M sodium chloride, 5% ethanol, 15% MPD, 0.1 M Tris pH 8.8	分辨率 3.36 Å R-free 0.222
5CVO WDR48:USP46~ubiquitin ternary complex 提交 2015-07-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；15% MPD, 0.1 M NaCl, 0.1 M HEPES, pH 7.0	分辨率 3.88 Å R-free 0.275
5CVO WDR48:USP46~ubiquitin ternary complex 提交 2015-07-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；15% MPD, 0.1 M NaCl, 0.1 M HEPES, pH 7.0	分辨率 3.88 Å R-free 0.275
5D0K Structure of UbE2D2:RNF165:Ub complex 提交 2015-08-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；MES, sodium chloride, PEG 6000	分辨率 2.65 Å R-free 0.238
5D0K Structure of UbE2D2:RNF165:Ub complex 提交 2015-08-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；MES, sodium chloride, PEG 6000	分辨率 2.65 Å R-free 0.238
5D0K Structure of UbE2D2:RNF165:Ub complex 提交 2015-08-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；MES, sodium chloride, PEG 6000	分辨率 2.65 Å R-free 0.238
5D0K Structure of UbE2D2:RNF165:Ub complex 提交 2015-08-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；MES, sodium chloride, PEG 6000	分辨率 2.65 Å R-free 0.238
5D0M Structure of UbE2D2:RNF165:Ub complex 提交 2015-08-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 1.91 Å R-free 0.213
5DFL Crystal structure of Ube2K~Ubiquitin conjugate 提交 2015-08-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M di-ammonium citrate pH 5.0, 20% PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
5DK8 Human ubiquitin in the P1 space group 提交 2015-09-03	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–75（74 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 2-75	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；288 K；0.2M magnesium chloride hexahydrate, 30% w/v PEG 4000, 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 1.32 Å R-free 0.201
5DK8 Human ubiquitin in the P1 space group 提交 2015-09-03	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–75（74 aa） 片段：Ubiquitin, UNP residues 2-75	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；288 K；0.2M magnesium chloride hexahydrate, 30% w/v PEG 4000, 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 1.32 Å R-free 0.201
5E6J Structure of SARS PLpro bound to a Lys48-linked di-ubiquitin activity based probe 提交 2015-10-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–75（75 aa）	未记录	ACT ACETATE ION × 1 NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；285 K；0.1 M MES, 0.1 M lithium acetate, 17% PEG 6000	分辨率 2.85 Å R-free 0.264
5E6J Structure of SARS PLpro bound to a Lys48-linked di-ubiquitin activity based probe 提交 2015-10-09	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–75（75 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；285 K；0.1 M MES, 0.1 M lithium acetate, 17% PEG 6000	分辨率 2.85 Å R-free 0.264
5EDV Structure of the HOIP-RBR/UbcH5B~ubiquitin transfer complex 提交 2015-10-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76 链 G 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；285 K；0.06M Tris, 0.04M Bicine, 0.02 M 1,6-Hexanediol, 0.02 M 1-Butanol, 0.02 M 1,2- Propanediol (racemic), 0.02 M 2-Propanol, 0.02 M 1,4-Butanediol, 0.02 M 1,3-Propanediol, 20% PEG550MME, 10% PEG20K, 8% glycerol	分辨率 3.48 Å R-free 0.303
5EDV Structure of the HOIP-RBR/UbcH5B~ubiquitin transfer complex 提交 2015-10-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76 链 F 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76 链 G 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76 链 H 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；285 K；0.06M Tris, 0.04M Bicine, 0.02 M 1,6-Hexanediol, 0.02 M 1-Butanol, 0.02 M 1,2- Propanediol (racemic), 0.02 M 2-Propanol, 0.02 M 1,4-Butanediol, 0.02 M 1,3-Propanediol, 20% PEG550MME, 10% PEG20K, 8% glycerol	分辨率 3.48 Å R-free 0.303
5EDV Structure of the HOIP-RBR/UbcH5B~ubiquitin transfer complex 提交 2015-10-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76 链 H 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；285 K；0.06M Tris, 0.04M Bicine, 0.02 M 1,6-Hexanediol, 0.02 M 1-Butanol, 0.02 M 1,2- Propanediol (racemic), 0.02 M 2-Propanol, 0.02 M 1,4-Butanediol, 0.02 M 1,3-Propanediol, 20% PEG550MME, 10% PEG20K, 8% glycerol	分辨率 3.48 Å R-free 0.303
5EMZ Crystal structure of K48-linked diubiquitin with F45W mutation in the proximal unit 提交 2015-11-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa） 链 B 1–76（76 aa）	突变：F45W	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；LiSO Tris PEG-3350	分辨率 1.66 Å R-free 0.209
5EMZ Crystal structure of K48-linked diubiquitin with F45W mutation in the proximal unit 提交 2015-11-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa） 链 D 1–76（76 aa）	突变：F45W	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；LiSO Tris PEG-3350	分辨率 1.66 Å R-free 0.209
5EMZ Crystal structure of K48-linked diubiquitin with F45W mutation in the proximal unit 提交 2015-11-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–76（76 aa） 链 F 1–76（76 aa）	突变：F45W	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；LiSO Tris PEG-3350	分辨率 1.66 Å R-free 0.209
5EYA TRIM25 RING domain in complex with Ubc13-Ub conjugate 提交 2015-11-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76 链 D 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Li citrate, 20% PEG 3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.228
5GJQ Structure of the human 26S proteasome bound to USP14-UbAl 提交 2016-07-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 y 1–76（76 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-76	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2 seconds before plunging	分辨率 4.35 Å
5GO7 Linear tri-ubiquitin 提交 2016-07-26	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；289 K；0.2M sodium dihydrogen phosphate, 20% PEG 3350, PH 6.0	分辨率 1.80 Å R-free 0.310
5GO8 Linear tetra-ubiquitin 提交 2016-07-26	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；0.2M Sodium acetate trihydrate, 20% PEG 3350, PH8.0	分辨率 2.21 Å R-free 0.322
5GOB Lys6-linked di-ubiquitin 提交 2016-07-26	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；289 K；0.2M Magnesium chloride hexahydrate, 20% PEG 3350, PH5.9	分辨率 1.15 Å R-free 0.229
5GOC Lys11-linked diubiquitin 提交 2016-07-26	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2M Li2SO4, 0.1M tris 8.5, 30% PEG 4000	分辨率 1.73 Å R-free 0.235
5GOD Lys27-linked di-ubiquitin 提交 2016-07-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa） 链 B 1–76（76 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate, 0.1M Sodium cacodylate trihydrate PH6.5, 20% PEG 8000	分辨率 1.15 Å R-free 0.222
5GOG Lys29-linked di-ubiquitin 提交 2016-07-27	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2M Potassium sulfate, 20% PEG 3350	分辨率 1.98 Å R-free 0.330
5GOH Lys33-linked di-ubiquitin 提交 2016-07-27	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2M Magnesium sulfate heptahydrate, 20% peg 3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.271
5GOI Lys48-linked di-ubiquitin 提交 2016-07-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa） 链 B 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1M Sodium citrate tribasic dehydrate PH5.6, 20% 2-Propanol, 20%PEG 4000	分辨率 1.59 Å R-free 0.311
5GOJ Lys63-linked di-ubiquitin 提交 2016-07-27	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1M TRIS hydrochloride PH8.5, 2.0M Ammonium phosphate monobasic	分辨率 1.55 Å R-free 0.253
5GOK K11/K63-branched tri-Ubiquitin 提交 2016-07-27	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；289 K；0.2M MgSO4, 20% PEG 3350, 4mM CdCl2, PH6.0	分辨率 1.84 Å R-free 0.245
5H7S Structural basis of the flanking zinc-finger motifs crucial for the E3 ligase activity of the LNX1 RING domain 提交 2016-11-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–76（76 aa） 链 F 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；0.04 M Citric acid, 0.06 M BIS-TRIS propane, pH 6.4, 20% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 3.49 Å R-free 0.286
5IBK Skp1-F-box in complex with a ubiquitin variant 提交 2016-02-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 75–150（76 aa） 片段：UNP residues 75-150	突变：L8G, T9A, G10R, K11T, T12A, R42I, A46S, G47R, Q49L, Q62H, K63R, H68R, R72I, L73F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；100 mM Acetate pH 4.5, 12% PEG 4000, 15% glyerol	分辨率 2.50 Å R-free 0.240
5IBK Skp1-F-box in complex with a ubiquitin variant 提交 2016-02-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 75–150（76 aa） 片段：UNP residues 75-150	突变：L8G, T9A, G10R, K11T, T12A, R42I, A46S, G47R, Q49L, Q62H, K63R, H68R, R72I, L73F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；100 mM Acetate pH 4.5, 12% PEG 4000, 15% glyerol	分辨率 2.50 Å R-free 0.240
5IFR Structure of the stable UBE2D3-UbDha conjugate 提交 2016-02-26	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；200mM tripotassium citrate, 20% PEG 3350	分辨率 2.20 Å R-free 0.243
5J8P Lys27-linked diubiquitin 提交 2016-04-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.2M magnesium acetate tetrahydrate, 0.1M sodium cacodylate trihydrate, pH 6.5, 20% PEG 8000	分辨率 1.55 Å R-free 0.295
5JBV Lys27-linked triubiquitin 提交 2016-04-13	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；291 K；20% (w/v) PEG 3350, 4mM CdCl2, pH 5.9, 200mM Mg(NO3)2	分辨率 2.10 Å R-free 0.306
5JBY Lys27-linked triubiquitin 提交 2016-04-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–76（76 aa） 链 C 1–76（76 aa） 链 E 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% (w/v) PEG 3350, 4mM CdCl2, pH 5.9, 200mM Mg(NO3)2	分辨率 1.99 Å R-free 0.308
5JG6 APC11-Ubv shows role of noncovalent RING-Ubiquitin interactions in processive multiubiquitination and Ubiquitin chain elongation by APC/C 提交 2016-04-19	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 76–154（79 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 33% PEG4000	分辨率 2.00 Å R-free 0.220
5JG6 APC11-Ubv shows role of noncovalent RING-Ubiquitin interactions in processive multiubiquitination and Ubiquitin chain elongation by APC/C 提交 2016-04-19	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 76–154（79 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 33% PEG4000	分辨率 2.00 Å R-free 0.220
5JP3 Structure of Xanthomonas campestris effector protein XopD bound to ubiquitin 提交 2016-05-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M CHES (pH 9.5) 1.0M sodium citrate	分辨率 2.90 Å R-free 0.285
5JP3 Structure of Xanthomonas campestris effector protein XopD bound to ubiquitin 提交 2016-05-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–75（75 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M CHES (pH 9.5) 1.0M sodium citrate	分辨率 2.90 Å R-free 0.285
5JP3 Structure of Xanthomonas campestris effector protein XopD bound to ubiquitin 提交 2016-05-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–75（75 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M CHES (pH 9.5) 1.0M sodium citrate	分辨率 2.90 Å R-free 0.285
5JP3 Structure of Xanthomonas campestris effector protein XopD bound to ubiquitin 提交 2016-05-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–75（75 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M CHES (pH 9.5) 1.0M sodium citrate	分辨率 2.90 Å R-free 0.285
5JTJ USP7CD-CTP in complex with Ubiquitin 提交 2016-05-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；0.05 M Calcium chloride, 0.1 M MES pH 6.0 and 45% PEG 200	分辨率 3.32 Å R-free 0.209
5JTJ USP7CD-CTP in complex with Ubiquitin 提交 2016-05-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–76（76 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；0.05 M Calcium chloride, 0.1 M MES pH 6.0 and 45% PEG 200	分辨率 3.32 Å R-free 0.209
5JTV USP7CD-UBL45 in complex with Ubiquitin 提交 2016-05-09	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M K chloride, 0.05 M HEPES pH 7.5 and 35% v/v Pentaerythritol propoxylate	分辨率 3.31 Å R-free 0.269
5JTV USP7CD-UBL45 in complex with Ubiquitin 提交 2016-05-09	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M K chloride, 0.05 M HEPES pH 7.5 and 35% v/v Pentaerythritol propoxylate	分辨率 3.31 Å R-free 0.269
5JTV USP7CD-UBL45 in complex with Ubiquitin 提交 2016-05-09	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M K chloride, 0.05 M HEPES pH 7.5 and 35% v/v Pentaerythritol propoxylate	分辨率 3.31 Å R-free 0.269
5JTV USP7CD-UBL45 in complex with Ubiquitin 提交 2016-05-09	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M K chloride, 0.05 M HEPES pH 7.5 and 35% v/v Pentaerythritol propoxylate	分辨率 3.31 Å R-free 0.269
5JTV USP7CD-UBL45 in complex with Ubiquitin 提交 2016-05-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–76（76 aa） 链 F 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M K chloride, 0.05 M HEPES pH 7.5 and 35% v/v Pentaerythritol propoxylate	分辨率 3.31 Å R-free 0.269
5JTV USP7CD-UBL45 in complex with Ubiquitin 提交 2016-05-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–76（76 aa） 链 D 1–76（76 aa） 链 F 1–76（76 aa） 链 H 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M K chloride, 0.05 M HEPES pH 7.5 and 35% v/v Pentaerythritol propoxylate	分辨率 3.31 Å R-free 0.269
5JTV USP7CD-UBL45 in complex with Ubiquitin 提交 2016-05-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–76（76 aa） 链 H 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M K chloride, 0.05 M HEPES pH 7.5 and 35% v/v Pentaerythritol propoxylate	分辨率 3.31 Å R-free 0.269
5K9P Ser20 phosphorylated ubiquitin 提交 2016-06-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；45% (w/v) PEG 400, 100 mM tris-HCl	分辨率 1.55 Å R-free 0.219
5KGF Structural model of 53BP1 bound to a ubiquitylated and methylated nucleosome, at 4.5 A resolution 提交 2016-06-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 M 1–76（76 aa） 链 O 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；High concentration NCP-ubme/GST-53BP1 complex at 200 mM salt was diluted just prior to grid freezing. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Plunged into liquid ethane-propane (FEI VITROBOT MARK III)	分辨率 4.54 Å
5KHY Crystal structure of oxime-linked K6 diubiquitin 提交 2016-06-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–73（73 aa） 链 B 1–75（75 aa）	突变：Unnatural aminoxylysine amino acid at position 6 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：unnatural residue 76 oxime linked to chain A	ZN ZINC ION × 10 ETA ETHANOLAMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG 3350, Zinc acetate	分辨率 3.50 Å R-free 0.331
5KYC Crystal structure of USP7 catalytic domain [V302K] mutant in complex with ubiquitin (malonate bound) 提交 2016-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	MLA MALONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；8% tacsimate pH 4.0, 20% PEG3350	分辨率 1.43 Å R-free 0.192
5KYD Crystal structure of USP7 catalytic domain [V302K] mutant in complex with ubiquitin 提交 2016-07-21	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；0.2M Ammonium fluoride, 20% PEG3350	分辨率 1.62 Å R-free 0.213
5KYE Crystal structure of USP7 catalytic domain [H294E] mutant in complex with ubiquitin 提交 2016-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；0.1M HEPES pH 7.5, 25% PEG3350, 0.2M Ammonium acetate	分辨率 1.97 Å R-free 0.223
5KYE Crystal structure of USP7 catalytic domain [H294E] mutant in complex with ubiquitin 提交 2016-07-21	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；0.1M HEPES pH 7.5, 25% PEG3350, 0.2M Ammonium acetate	分辨率 1.97 Å R-free 0.223
5KYF Crystal structure of USP7 catalytic domain [L299A] mutant in complex with ubiquitin 提交 2016-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；0.1M HEPES pH 7.5, 25% PEG3350	分辨率 1.45 Å R-free 0.185
5L8H Structure of USP46-UbVME 提交 2016-06-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.96M Sodium Citrate pH7.5 and 0.1mM zinc chloride Cryo - 20% Glycerol	分辨率 1.85 Å R-free 0.194
5L8W Structure of USP12-UB-PRG/UAF1 提交 2016-06-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；3.2% PEG4000, 0.1mM MMT pH6.5, 0.1 mM TCEP. Cryo- 30% Glycerol	分辨率 2.79 Å R-free 0.259
5L9T Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC/C-CDH1) with E2 UBE2S poised for polyubiquitination where UBE2S, APC2, and APC11 are modeled into low resolution density 提交 2016-06-11	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 S 77–153（77 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
5LN1 STRUCTURE OF UBIQUITYLATED-RPN10 FROM YEAST; 提交 2016-08-02	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 U 77–152（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION, RECRYSTALLIZATION；pH 6.5；292 K；12% (W/V) PEG 20000, 0.1M MES PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 292K	分辨率 3.14 Å R-free 0.248
5LRV Structure of Cezanne/OTUD7B OTU domain bound to Lys11-linked diubiquitin 提交 2016-08-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa） 链 C 1–75（75 aa）	突变：K11X 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：G76X 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M phosphate citrate (pH 4.2), 20% (w/v) PEG 8K, 0.2 M sodium chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
5LRW Structure of Cezanne/OTUD7B OTU domain bound to ubiquitin 提交 2016-08-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	突变：G76X 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M sodium acetate (pH 4.8), 6% (w/v) PEG 6K	分辨率 2.00 Å R-free 0.217
5LRW Structure of Cezanne/OTUD7B OTU domain bound to ubiquitin 提交 2016-08-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–75（75 aa）	突变：G76X 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M sodium acetate (pH 4.8), 6% (w/v) PEG 6K	分辨率 2.00 Å R-free 0.217
5LRX Structure of A20 OTU domain bound to ubiquitin 提交 2016-08-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	突变：G76X 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.1 M MES/imidazole (pH 6.5), 7% (w/v) PEG 8K, 20% ethylene glycol	分辨率 2.85 Å R-free 0.246
5LRX Structure of A20 OTU domain bound to ubiquitin 提交 2016-08-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa）	突变：G76X 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.1 M MES/imidazole (pH 6.5), 7% (w/v) PEG 8K, 20% ethylene glycol	分辨率 2.85 Å R-free 0.246
5M93 Crystal structure of SdeA-modified ubiquitin. 提交 2016-10-31	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 76–152（77 aa）	突变：M1S	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M sodium acetate pH 4 - 5.5, 0.2M lithium sulfate and 30% PEG 8000	分辨率 1.79 Å R-free 0.231
5M93 Crystal structure of SdeA-modified ubiquitin. 提交 2016-10-31	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 76–152（77 aa）	突变：M1S	SO4 SULFATE ION × 1 RIB alpha-D-ribofuranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M sodium acetate pH 4 - 5.5, 0.2M lithium sulfate and 30% PEG 8000	分辨率 1.79 Å R-free 0.231
5M93 Crystal structure of SdeA-modified ubiquitin. 提交 2016-10-31	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 76–152（77 aa）	突变：M1S	RIB alpha-D-ribofuranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M sodium acetate pH 4 - 5.5, 0.2M lithium sulfate and 30% PEG 8000	分辨率 1.79 Å R-free 0.231
5MNJ Structure of MDM2-MDMX-UbcH5B-ubiquitin complex 提交 2016-12-13	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 77–152（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, 0.175 M Li2SO4 and 16-20 %(v/v) PEG 3350	分辨率 2.16 Å R-free 0.231
5MNJ Structure of MDM2-MDMX-UbcH5B-ubiquitin complex 提交 2016-12-13	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 77–152（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, 0.175 M Li2SO4 and 16-20 %(v/v) PEG 3350	分辨率 2.16 Å R-free 0.231
5N2W WT-Parkin and pUB complex 提交 2017-02-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 8 CL CHLORIDE ION × 1 TMO trimethylamine oxide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris pH 8.5, 200mM TMAO, PEG MME 2000	分辨率 2.68 Å R-free 0.243
5N38 S65DParkin and pUB complex 提交 2017-02-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris pH 8.5, 200mM TMAO, PEG MME 2000	分辨率 2.60 Å R-free 0.236
5NL5 Crystal structure of Zn1.7-E16V human ubiquitin (hUb) mutant adduct, from a solution 70 mM zinc acetate/1.3 mM E16V hUb 提交 2017-04-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–76（76 aa）	突变：E16V	ZN ZINC ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22-30% (w/v) PEG 1450, 50 mM HEPES pH 6.5-7.0, 70 mM Zn(CH3COO)2	分辨率 1.96 Å R-free 0.237
5NL5 Crystal structure of Zn1.7-E16V human ubiquitin (hUb) mutant adduct, from a solution 70 mM zinc acetate/1.3 mM E16V hUb 提交 2017-04-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–76（76 aa）	突变：E16V	ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22-30% (w/v) PEG 1450, 50 mM HEPES pH 6.5-7.0, 70 mM Zn(CH3COO)2	分辨率 1.96 Å R-free 0.237
5NL5 Crystal structure of Zn1.7-E16V human ubiquitin (hUb) mutant adduct, from a solution 70 mM zinc acetate/1.3 mM E16V hUb 提交 2017-04-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–76（76 aa）	突变：E16V	ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22-30% (w/v) PEG 1450, 50 mM HEPES pH 6.5-7.0, 70 mM Zn(CH3COO)2	分辨率 1.96 Å R-free 0.237
5NLJ Crystal structure of Zn3-E16V human ubiquitin (hUb) mutant adduct, from a solution 70 mM zinc acetate/20% v/v TFE/1.3 mM E16V hUb 提交 2017-04-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–76（76 aa）	突变：E16V	ACT ACETATE ION × 4 ZN ZINC ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22-30% (w/v) PEG 1450, 50 mM HEPES, 70 mM Zn(CH3COO)2 and 20% v/v TFE.	分辨率 1.53 Å R-free 0.240
5NLJ Crystal structure of Zn3-E16V human ubiquitin (hUb) mutant adduct, from a solution 70 mM zinc acetate/20% v/v TFE/1.3 mM E16V hUb 提交 2017-04-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–76（76 aa）	突变：E16V	ACT ACETATE ION × 1 ZN ZINC ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ETF TRIFLUOROETHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22-30% (w/v) PEG 1450, 50 mM HEPES, 70 mM Zn(CH3COO)2 and 20% v/v TFE.	分辨率 1.53 Å R-free 0.240
5NLJ Crystal structure of Zn3-E16V human ubiquitin (hUb) mutant adduct, from a solution 70 mM zinc acetate/20% v/v TFE/1.3 mM E16V hUb 提交 2017-04-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–76（76 aa）	突变：E16V	ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22-30% (w/v) PEG 1450, 50 mM HEPES, 70 mM Zn(CH3COO)2 and 20% v/v TFE.	分辨率 1.53 Å R-free 0.240
5NVG Thr12 Phosphorylated Ubiquitin 提交 2017-05-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；291.15 K；20% (v/v) ethanol, 20% (w/v) PEG-1000, 0.1M Phosphate-citrate pH 4.2	分辨率 1.07 Å R-free 0.167
5O44 Crystal structure of unbranched mixed tri-Ubiquitin chain containing K48 and K63 linkages. 提交 2017-05-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 B 1–74（74 aa） 链 C 1–74（74 aa） 链 D 1–76（76 aa） 链 F 1–76（76 aa）	突变：Deleted for Gly 75 and Gly 76 突变：Deleted for Gly 75 and Gly 76 突变：K48R 突变：K48R	SO4 SULFATE ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.3M MgSo4 and 100mM MES monohydrate pH 6.5	分辨率 3.14 Å R-free 0.254
5O6T BIRC4 RING in complex with dimeric ubiquitin variant 提交 2017-06-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 75–150（76 aa） 链 D 75–150（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；291 K；0.1 M NaHEPES pH 7.5, 1.4 M tri-Na citrate	分辨率 1.57 Å R-free 0.183
5OHK Crystal structure of USP30 in covalent complex with ubiquitin propargylamide (high resolution) 提交 2017-07-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；291 K；10% (w/v) PEG 20000, 0.1 M sodium citrate pH 5.4, 0.2 M lithium sulfate	分辨率 2.34 Å R-free 0.261
5OHL K6-specific affimer bound to K6 diUb 提交 2017-07-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 1–76（76 aa） 链 K 1–76（76 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；32.5%PEG 2K MME 200mM Ammonium Acetate 0.1M Tris pH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.227
5OHL K6-specific affimer bound to K6 diUb 提交 2017-07-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 1–76（76 aa） 链 K 1–76（76 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；32.5%PEG 2K MME 200mM Ammonium Acetate 0.1M Tris pH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.227
5OHL K6-specific affimer bound to K6 diUb 提交 2017-07-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 L 1–76（76 aa） 链 N 1–76（76 aa）	未记录	15P POLYETHYLENE GLYCOL (N=34) × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；32.5%PEG 2K MME 200mM Ammonium Acetate 0.1M Tris pH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.227
5OHL K6-specific affimer bound to K6 diUb 提交 2017-07-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 L 1–76（76 aa） 链 N 1–76（76 aa）	未记录	15P POLYETHYLENE GLYCOL (N=34) × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；32.5%PEG 2K MME 200mM Ammonium Acetate 0.1M Tris pH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.227
5OHL K6-specific affimer bound to K6 diUb 提交 2017-07-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 1–76（76 aa） 链 M 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；32.5%PEG 2K MME 200mM Ammonium Acetate 0.1M Tris pH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.227
5OHL K6-specific affimer bound to K6 diUb 提交 2017-07-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 1–76（76 aa） 链 M 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；32.5%PEG 2K MME 200mM Ammonium Acetate 0.1M Tris pH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.227
5OHL K6-specific affimer bound to K6 diUb 提交 2017-07-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 O 1–76（76 aa） 链 P 1–76（76 aa）	未记录	15P POLYETHYLENE GLYCOL (N=34) × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；32.5%PEG 2K MME 200mM Ammonium Acetate 0.1M Tris pH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.227
5OHN Crystal structure of USP30 in covalent complex with ubiquitin propargylamide (low resolution) 提交 2017-07-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；20% (w/v) PAA 5100 Na, 100 mM Hepes pH 8.0, 2.5% (v/v) glycerol	分辨率 3.60 Å R-free 0.253
5OHN Crystal structure of USP30 in covalent complex with ubiquitin propargylamide (low resolution) 提交 2017-07-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；20% (w/v) PAA 5100 Na, 100 mM Hepes pH 8.0, 2.5% (v/v) glycerol	分辨率 3.60 Å R-free 0.253
5OHP Crystal structure of USP30 (C77A) in complex with Lys6-linked diubiquitin 提交 2017-07-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa） 链 C 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.73 M sodium citrate, 0.1 M Hepes pH 7.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.249
5TOF Room temperature structure of ubiquitin variant u7ub25 提交 2016-10-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 75–152（78 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；1ul protein solution at 20 mg/ml (20 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl), 1ul crystallization solution (0.1 M citric acid pH 4.6, 2.6 M ammonium sulfate)	分辨率 1.12 Å R-free 0.175
5TOG Room temperature structure of ubiquitin variant u7ub25.2540 提交 2016-10-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 75–152（78 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1ul protein solution at 10 mg/ml (20 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl), 1ul crystallization solution (0.1 M citric acid pH 4.2, 2.2 M ammonium sulfate)	分辨率 1.08 Å R-free 0.121
5TOG Room temperature structure of ubiquitin variant u7ub25.2540 提交 2016-10-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 75–152（78 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1ul protein solution at 10 mg/ml (20 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl), 1ul crystallization solution (0.1 M citric acid pH 4.2, 2.2 M ammonium sulfate)	分辨率 1.08 Å R-free 0.121
5TUT UbcH5a-Ub isopeptide conjugate 提交 2016-11-07	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；Hampton PEG/Ion F10	分辨率 2.60 Å R-free 0.243
5UJL Representative 1-conformer ensembles of K27-linked Ub2 from RDC data 提交 2017-01-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa） 片段：residues 1-76 链 B 1–76（76 aa） 片段：residues 1-76	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；296 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1 NMR测量条件 pH 6.8；296 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1 NMR样品组成 150 uM [U-99% 15N] K27-diubiquitin, Distal Ub is 15N-labelled Proximal Ub is not enriched, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 150 uM [U-99% 15N] K27-diubiquitin, Distal Ub is not enriched Proximal Ub is 15N-labelled, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
5UJN Representative 2-conformer ensembles of K27-linked Ub2 from RDC data 提交 2017-01-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa） 链 B 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；296 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1 NMR样品组成 150 uM [U-99% 15N] distal K27-Ub2, 20 mM NaPhosphate, 0.02 % NaN3, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 150 uM [U-99% 15N] proximal K27-Ub2, 20 mM NaPhosphate, 0.02 % NaN3, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
5ULF Crystal Structure of a UbcH5b~Ub conjugate 提交 2017-01-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；100 mM bis-Tris pH 5.5, 150 mM ammonium sulfate, 20% PEG 3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.261
5ULF Crystal Structure of a UbcH5b~Ub conjugate 提交 2017-01-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；100 mM bis-Tris pH 5.5, 150 mM ammonium sulfate, 20% PEG 3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.261
5ULH Structure of RNF165 in complex with a UbcH5b~Ub conjugate 提交 2017-01-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 SCN THIOCYANATE ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；200 mM potassium thiocyanate, 20% PEG 3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.217
5ULK Crystal Structure of RNF165 in complex with a UbcH5b~Ub conjugate 提交 2017-01-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；200 mM ammonium nitrate, 20% PEG 3350	分辨率 2.38 Å R-free 0.267
5V1Y Crystal structure of the ternary RPN13 PRU-RPN2 (940-953)-ubiquitin complex 提交 2017-03-02	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；277 K；0.1 M citric acid, pH 4.6, 20% PEG6000	分辨率 1.42 Å R-free 0.175
5V1Y Crystal structure of the ternary RPN13 PRU-RPN2 (940-953)-ubiquitin complex 提交 2017-03-02	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；277 K；0.1 M citric acid, pH 4.6, 20% PEG6000	分辨率 1.42 Å R-free 0.175
5V1Z Crystal structure of the RPN13 PRU-RPN2 (932-953)-ubiquitin complex 提交 2017-03-02	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.6, 22.5% PEG3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.182
5V1Z Crystal structure of the RPN13 PRU-RPN2 (932-953)-ubiquitin complex 提交 2017-03-02	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.1 M sodium acetate, pH 4.6, 22.5% PEG3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.182
5VEY Solution NMR structure of histone H2A-H2B mono-ubiquitylated at H2A Lys15 in complex with RNF169 (653-708) 提交 2017-04-06	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM KCl；压力 1 NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM KCl；压力 1 NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5VF0 Solution NMR structure of human RAD18 (198-240) in complex with ubiquitin 提交 2017-04-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM KCl；压力 1 NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RAD18, 3 mM Ubiquitin, 25 mM MES-Bis-TRIS, 50 mM KCl, 10 uM ZnCl2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 3 mM RAD18, 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 25 mM MES-Bis-TRIS, 50 mM KCl, 10 uM ZnCl2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.9 mM [U-15N] RAD18, 25 mM MES-Bis-TRIS, 50 mM KCl, 10 uM ZnCl2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RAD18, 25 mM MES-Bis-TRIS, 50 mM KCl, 10 uM ZnCl2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.2 mM [U-100% 15N] RAD18, 1.0 mM Ubiquitin, 25 mM MES-Bis-TRIS, 50 mM KCl, 10 uM ZnCl2, 5 % Alkyl-polyethylene glycol (C12E5)/n-hexanol mixture, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM RAD18, 0.2 mM [U-100% 15N] Ubiquitin, 25 mM MES-Bis-TRIS, 50 mM KCl, 10 uM ZnCl2, 5 % Alkyl-polyethylene glycol (C12E5)/n-hexanol mixture, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5VNZ Structure of a TRAF6-Ubc13~Ub complex 提交 2017-05-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；289 K；0.05-0.3 mM sodium citrate, 100 mM bBis-Tris propane, and 17-23% PEG 3350	分辨率 3.41 Å R-free 0.294
5VNZ Structure of a TRAF6-Ubc13~Ub complex 提交 2017-05-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 F 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；289 K；0.05-0.3 mM sodium citrate, 100 mM bBis-Tris propane, and 17-23% PEG 3350	分辨率 3.41 Å R-free 0.294
5VO0 Structure of a TRAF6-Ubc13~Ub complex 提交 2017-05-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–76（76 aa） 链 F 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；100-200 mM Na/K tartrate, 11-15% PEG 3350 and 100 mM bis-Tris propane pH 7.5	分辨率 3.90 Å R-free 0.299
5VZM Solution NMR structure of human Rev1 (932-1039) in complex with ubiquitin 提交 2017-05-29	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM sodium phosphate；压力 1 NMR测量条件 pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM sodium phosphate；压力 1 NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 20 mM Sodium phosphate buffer, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Rev1, 3 mM Ubiquitin, 50 mM Sodium phosphate buffer, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 3 mM Rev1, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 50 mM Sodium phosphate buffer, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5VZW TRIM23 RING domain in complex with UbcH5-Ub 提交 2017-05-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–76（76 aa） 链 D 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 0.2 M calcium chloride, 17% w/v PEG3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.237
5W46 Structure of S65D Phosphomimetic Ubiquitin Refined at 1.2 Angstroms Resolution 提交 2017-06-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–76（76 aa）	突变：S65D	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；295 K；Tris pH 8.0, magnesium chloride, PEG 3350, Hepes	分辨率 1.18 Å R-free 0.190
5W46 Structure of S65D Phosphomimetic Ubiquitin Refined at 1.2 Angstroms Resolution 提交 2017-06-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–76（76 aa）	突变：S65D	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；295 K；Tris pH 8.0, magnesium chloride, PEG 3350, Hepes	分辨率 1.18 Å R-free 0.190
5WFI X-ray structure of MHV PLP2 (Cys1716Ser) catalytic mutant in complex with free ubiquitin 提交 2017-07-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 5 FMT FORMIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；50 mM Tris, pH 7.5, 100 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 0.2 M potassium formate, 20% PEG3350	分辨率 1.85 Å R-free 0.197
5WFI X-ray structure of MHV PLP2 (Cys1716Ser) catalytic mutant in complex with free ubiquitin 提交 2017-07-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 5 FMT FORMIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；50 mM Tris, pH 7.5, 100 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 0.2 M potassium formate, 20% PEG3350	分辨率 1.85 Å R-free 0.197
5X3M crystal structure of p-Ub-S65-NH2 提交 2017-02-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2M Lithium Sulfate monohydrate, 0.1M HEPES pH 7.5, 25%(w/v) Polyethylene Glycol 3350	分辨率 1.82 Å R-free 0.271
5X3N Crystal structure of DiUb-K6 提交 2017-02-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2M Magnesium formate dihydrate, 20%(w/v) Polyethylene glycol 3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.276
5X3O Crystal structure of p-DiUb-S65-COOH 提交 2017-02-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2M Ammonium phosphate monobasic, 20%(w/v) Polyethylene glycol 3350	分辨率 2.19 Å R-free 0.315
5XBO Lanthanoid tagging via an unnatural amino acid for protein structure characterization 提交 2017-03-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	未记录	TB TERBIUM(III) ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 760 NMR样品组成 20mM HEPES, 100mM sodium chloride, 10% D2O, 0.2mM [U-99% 15N] ubiquitin, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 20mM HEPES, 100mM sodium chloride, 0.1mM [U-99% 15N] HHR23A UBA1 Domain, 0.1 mM ubiquitin, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5XDP K11/48-branched teraubiquitin 提交 2017-03-28	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；289 K；0.2M Potassium nitrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3350	分辨率 2.38 Å R-free 0.271
5XK4 Retracted state of S65-phosphorylated ubiquitin 提交 2017-05-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 760 NMR样品组成 0.8 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] phosphorylated ubiquitin, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5XK5 Relaxed state of S65-phosphorylated ubiquitin 提交 2017-05-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 760 NMR样品组成 0.8 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] relaxed pUb, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5XPK Crystal structure of ubiquitin-k6mimic 提交 2017-06-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Ammonium formate, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.27 Å R-free 0.310
5YIJ Structure of a Legionella effector with substrates 提交 2017-10-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–76（76 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-76 链 D 1–76（76 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-76 链 G 1–76（76 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-76	未记录	NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PEG 1000, Tris	分辨率 3.18 Å R-free 0.275
5YIK Structure of a Legionella effector with its substrate 提交 2017-10-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–76（76 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-76 链 D 1–76（76 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-76 链 F 1–76（76 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-76	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；PEG 1000, Tris	分辨率 3.10 Å R-free 0.279
5YMY The structure of the complex between Rpn13 and K48-diUb 提交 2017-10-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–76（76 aa） 链 B 1–76（76 aa）	突变：K48R	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 760 NMR样品组成 0.58 mM [U-13C; U-15N; U-2H] Rpn13, 20 mM MES, 0.15 M sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5YT6 Crystal structure of TAX1BP1 UBZ2 in complex with mono-ubiquitin 提交 2017-11-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 77–152（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Ammonium sulfate, BIS TRIS propane	分辨率 1.50 Å R-free 0.225
5YT6 Crystal structure of TAX1BP1 UBZ2 in complex with mono-ubiquitin 提交 2017-11-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 77–152（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Ammonium sulfate, BIS TRIS propane	分辨率 1.50 Å R-free 0.225
5YT6 Crystal structure of TAX1BP1 UBZ2 in complex with mono-ubiquitin 提交 2017-11-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 77–152（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Ammonium sulfate, BIS TRIS propane	分辨率 1.50 Å R-free 0.225
5YT6 Crystal structure of TAX1BP1 UBZ2 in complex with mono-ubiquitin 提交 2017-11-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 77–152（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Ammonium sulfate, BIS TRIS propane	分辨率 1.50 Å R-free 0.225
5ZBU Crystal Structure of PA-TM-RING E3 ligase RNF13 RING domain in complex with E2~Ub 提交 2018-02-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；0.1M MES monohydrate, 14% PEG 4000	分辨率 3.20 Å R-free 0.262
5ZD0 Solution structure of human ubiquitin with three alanine mutations in living eukaryotic cells by in-cell NMR spectroscopy 提交 2018-02-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–76（76 aa）	突变：L8A,I44A,V70A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 0；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 AMBIENT NMR测量条件 pH 0；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 AMBIENT NMR样品组成 50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] human ubiquitin with three alanine mutations 1, 50 uM [U-100% 15N] human ubiquitin with three alanine mutations 2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6A6I Crystal structure of the winged-helix domain of Cockayne syndrome group B protein in complex with ubiquitin 提交 2018-06-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	突变：K48R	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；28% PEG1000, 10% glycerol, 0.1 M tricine (pH 8.0), and 350 mM MgCl2.	分辨率 2.60 Å R-free 0.236
6A6I Crystal structure of the winged-helix domain of Cockayne syndrome group B protein in complex with ubiquitin 提交 2018-06-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa） 片段：UNP residues 1-76	突变：K48R	GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；28% PEG1000, 10% glycerol, 0.1 M tricine (pH 8.0), and 350 mM MgCl2.	分辨率 2.60 Å R-free 0.236
6A6I Crystal structure of the winged-helix domain of Cockayne syndrome group B protein in complex with ubiquitin 提交 2018-06-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–77（77 aa） 片段：UNP residues 1-77	突变：M77D	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；28% PEG1000, 10% glycerol, 0.1 M tricine (pH 8.0), and 350 mM MgCl2.	分辨率 2.60 Å R-free 0.236
6A6I Crystal structure of the winged-helix domain of Cockayne syndrome group B protein in complex with ubiquitin 提交 2018-06-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–77（77 aa） 片段：UNP residues 1-77	突变：M77D	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；28% PEG1000, 10% glycerol, 0.1 M tricine (pH 8.0), and 350 mM MgCl2.	分辨率 2.60 Å R-free 0.236
6ASR REV1 UBM2 domain complex with ubiquitin 提交 2017-08-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa） 片段：residues 1-76	未记录	NI NICKEL (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.1 M MES pH 6.0, 10 % PEG 8000	分辨率 2.36 Å R-free 0.229
6ASR REV1 UBM2 domain complex with ubiquitin 提交 2017-08-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa） 片段：residues 1-76	未记录	NI NICKEL (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；0.1 M MES pH 6.0, 10 % PEG 8000	分辨率 2.36 Å R-free 0.229
6BVA Ubiquitin Variant (UbV.Fl10.1) bound to a human Skp1-Fbl10 fragment complex. 提交 2017-12-12	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 76–152（77 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 0.2 M calcium chloride, 18% (w/v) PEG 6000	分辨率 2.66 Å R-free 0.263
6BVA Ubiquitin Variant (UbV.Fl10.1) bound to a human Skp1-Fbl10 fragment complex. 提交 2017-12-12	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 76–152（77 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 0.2 M calcium chloride, 18% (w/v) PEG 6000	分辨率 2.66 Å R-free 0.263
6BYH Ubiquitin Variant (UbV.Fl11.1) bound to a human Skp1-Fbl11 fragment complex. 提交 2017-12-20	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 76–152（77 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M PCTP buffer pH6, 25% (w/v) PEG 1500	分辨率 2.61 Å R-free 0.294
6BYH Ubiquitin Variant (UbV.Fl11.1) bound to a human Skp1-Fbl11 fragment complex. 提交 2017-12-20	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 76–152（77 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M PCTP buffer pH6, 25% (w/v) PEG 1500	分辨率 2.61 Å R-free 0.294
6BYH Ubiquitin Variant (UbV.Fl11.1) bound to a human Skp1-Fbl11 fragment complex. 提交 2017-12-20	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 76–152（77 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M PCTP buffer pH6, 25% (w/v) PEG 1500	分辨率 2.61 Å R-free 0.294
6C16 Ubiquitin variant (UbV.Fbl10.1) bound to a human Skp1-Fbl11 fragment complex. 提交 2018-01-04	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 77–152（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；0.1 M malic acid pH 4.5, 0.15 M sodium chloride, 27% (w/v) PEG3350	分辨率 3.27 Å R-free 0.317
6C16 Ubiquitin variant (UbV.Fbl10.1) bound to a human Skp1-Fbl11 fragment complex. 提交 2018-01-04	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 77–152（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；0.1 M malic acid pH 4.5, 0.15 M sodium chloride, 27% (w/v) PEG3350	分辨率 3.27 Å R-free 0.317
6CP2 SidC in complex with UbcH7~Ub 提交 2018-03-13	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 75–152（78 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；298 K；16% PEG 3000, 0.1 M Tris pH 9.0	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
6DGF Ubiquitin Variant bound to USP2 提交 2018-05-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 153–226（74 aa）	突变：Q2C, K6C, K11R, T12C	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES buffer pH 6, 12% (w/v) PEG3350, 0.2M sodium sulfate	分辨率 2.34 Å R-free 0.224
6EI1 Crystal structure of the covalent complex between deubiquitinase ZUFSP (ZUP1) and Ubiquitin-PA 提交 2017-09-16	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1 GOL GLYCEROL × 1 MLI MALONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；277 K；0.2 M sodium malonate pH 5, 20 % PEG 3350	分辨率 1.73 Å R-free 0.203
6FDK Structure of Chlamydia trachomatis effector protein Cdu1 bound to ubiquitin 提交 2017-12-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M MES pH 6.5, 12% PEG 20000	分辨率 1.60 Å R-free 0.203
6FGE Crystal structure of human ZUFSP/ZUP1 in complex with ubiquitin 提交 2018-01-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MLI MALONATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GOL GLYCEROL × 2 FMT FORMIC ACID × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NH4 AMMONIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；4% v/v Tacsimate pH 5.0 and 12% w/v Polyethylene glycol 3,350.	分辨率 1.74 Å R-free 0.209
6FTX Structure of the chromatin remodelling enzyme Chd1 bound to a ubiquitinylated nucleosome 提交 2018-02-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 N 1–76（76 aa） 链 O 1–76（76 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6FX4 Disulfide between E3 HECT ligase Smurf2 and Ubiquitin G76C 提交 2018-03-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	突变：G76C	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1.36M tri-Sodium citrat pH6.5, 15% (v/v) Glycerol	分辨率 2.50 Å R-free 0.239
6FX4 Disulfide between E3 HECT ligase Smurf2 and Ubiquitin G76C 提交 2018-03-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa）	突变：G76C	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1.36M tri-Sodium citrat pH6.5, 15% (v/v) Glycerol	分辨率 2.50 Å R-free 0.239
6FYH Disulfide between ubiquitin G76C and the E3 HECT ligase Huwe1 提交 2018-03-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	突变：G76C	SO4 SULFATE ION × 2 ZN ZINC ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.8M Zn SO4 0.1M Na Acetat pH 4.0	分辨率 2.91 Å R-free 0.266
6GLC Structure of phospho-Parkin bound to phospho-ubiquitin 提交 2018-05-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 6 GOL GLYCEROL × 3 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5% (w/v) PEG 1000, 12.5% (w/v) PEG 3350, 12.5% (v/v) MPD, 0.03 M of each sodium nitrate, disodium hydrogen phosphate, ammonium sulphate, 0.1 M MOPS/HEPES-Na (pH 7.5)	分辨率 1.80 Å R-free 0.205
6GZS Structure of Chlamydia trachomatis effector protein ChlaDUB1 bound to ubiquitin 提交 2018-07-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES (pH 6.0), 20% PEG 6000	分辨率 1.90 Å R-free 0.213
6H4H Usp28 catalytic domain variant E593D in complex with UbPA 提交 2018-07-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–75（75 aa） 链 D 1–75（75 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 AYE prop-2-en-1-amine × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；273 K；0.1 M Citrate pH 5.0 0.8 M Ammonium Sulfate	分辨率 3.50 Å R-free 0.280
6HEI Structure of the catalytic domain of USP28 (insertion deleted) bound to Ubiquitin-PA 提交 2018-08-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 77–151（75 aa）	突变：residue 76 replaced with PA warhead 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；22% (w/v) PEG 3350, 300 mM potassium sodium tartrate	分辨率 1.64 Å R-free 0.214
6HEK Structure of human USP28 bound to Ubiquitin-PA 提交 2018-08-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 77–152（76 aa） 链 D 77–152（76 aa）	突变：residue 76 replaced with PA warhead 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：residue 76 replaced with PA warhead 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；291 K；8% (w/v) PEG 3350, 200 mM ammonium acetate and 100 mM sodium citrate pH 5.4	分辨率 3.03 Å R-free 0.237
6HPR Crystal structure of cIAP1 RING domain bound to UbcH5B-Ub and a non-covalent Ub 提交 2018-09-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 75–152（78 aa） 链 D 75–152（78 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M ammonium fluoride and 15% (w/v) PEG 3350	分辨率 1.70 Å R-free 0.197
6IF1 Crystal structure of Ube2K and K48-linked di-ubiquitin complex 提交 2018-09-18	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；293 K；Tris-HCl, polyethylene glycol 3350, ammonium acetate.	分辨率 2.47 Å R-free 0.236
6IF1 Crystal structure of Ube2K and K48-linked di-ubiquitin complex 提交 2018-09-18	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；293 K；Tris-HCl, polyethylene glycol 3350, ammonium acetate.	分辨率 2.47 Å R-free 0.236
6ISU Crystal structure of Lys27-linked di-ubiquitin in complex with its selective interacting protein UCHL3 提交 2018-11-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa） 链 C 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；18% PEG 3350 (w/v), 400 mM Ca(AC)2	分辨率 1.87 Å R-free 0.264
6JB6 Crystal structure of Ub-conjugated Ube2K C92K&K97A mutant (isopeptide linkage), 2.7 A resolution 提交 2019-01-25	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；HEPES, PEG 400, magnesium chloride	分辨率 2.70 Å R-free 0.284
6JB7 Crystal structure of Ub-conjugated Ube2K C92K&K97A mutant (isopeptide linkage), 2.1 A resolution 提交 2019-01-25	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；HEPES, PEG 400, magnesium chloride	分辨率 2.10 Å R-free 0.250
6JMA cryo-EM structure of DOT1L bound to H2B ubiquitinated nucleosome 提交 2019-03-07	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 Y 1–76（76 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.80 Å
6K9P Structure of Deubiquitinase 提交 2019-06-17	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；291 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.05 Å R-free 0.210
6LP2 Structure of Lpg2148/UBE2N-Ub complex 提交 2020-01-08	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, potassium citrate	分辨率 2.48 Å R-free 0.233
6MSB Cryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S proteasome 提交 2018-10-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 u 1–76（76 aa） 链 w 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6MSD Cryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S proteasome 提交 2018-10-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 u 1–76（76 aa） 链 w 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6MSE Cryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S proteasome 提交 2018-10-16	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 u 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
6MSG Cryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S proteasome 提交 2018-10-16	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 u 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
6N13 UbcH7-Ub Complex with R0RBR Parkin and phosphoubiquitin 提交 2018-11-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 0.11 mM [U-13C; U-15N; U-2H] UbcH7, 0.11 mM [U-13C; U-15N; U-2H] ubiquitin, 0.11 mM [U-2H] Parkin -residues 144-465 comprising the RING0-RING1-IBR and RING2(Rcat) domains, 0.11 mM [U-2H] phosphorylated ubiquitin, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6NJ9 Active state Dot1L bound to the H2B-Ubiquitinated nucleosome, 2-to-1 complex 提交 2019-01-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 L 1–76（76 aa） 链 N 1–76（76 aa）	突变：G76C 突变：G76C	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions were prepared on the day of freezing and filtered though a 0.2 um filter prior to use. cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot once for 3.5 seconds before freezing.	分辨率 2.96 Å
6OQ1 Crystal Structure of Branched K11/K48-Linked Tri-Ubiquitin 提交 2019-04-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–76（76 aa） 链 C 1–76（76 aa） 链 F 1–77（77 aa）	突变：K11R, K48C, K63R 突变：K48R 突变：M77D	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；bis-tris, sodium chloride, PEG 3350	分辨率 2.20 Å R-free 0.230
6OQ1 Crystal Structure of Branched K11/K48-Linked Tri-Ubiquitin 提交 2019-04-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa） 链 D 1–76（76 aa） 链 E 1–77（77 aa）	突变：K11R, K48C, K63R 突变：K48R 突变：M77D	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；bis-tris, sodium chloride, PEG 3350	分辨率 2.20 Å R-free 0.230
6OQ2 NMR Structure of Branched K11/K48-Linked Tri-Ubiquitin 提交 2019-04-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa） 链 D 1–76（76 aa） 链 E 1–77（77 aa）	突变：K11R, K48R, K63R 突变：K48R 突变：M77D	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1 NMR样品组成 120 uM [U-15N-distal11] Branched K11/K48-Linked Tri-Ubiquitin, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 100 uM [U-15N-distal48] Branched K11/K48-Linked Tri-Ubiquitin, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 60 uM [U-15N-distal11] Branched K11/K48-Linked Tri-Ubiquitin, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 110 uM [U-15N-distal48] Branched K11/K48-Linked Tri-Ubiquitin, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
6PGV Human Josephin-2 in complex with ubiquitin 提交 2019-06-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	未记录	NEH ETHANAMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 4.6；293 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 0.2 M CaCl2, 22.5% (w/v) PEG 6000; microbatch under Al's Oil	分辨率 2.30 Å R-free 0.224
6QK9 A dimeric ubiquitin formed by a single amino acid substitution 提交 2019-01-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 77–150（74 aa） 链 B 77–150（74 aa）	突变：G10V 突变：G10V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.06 M Divalents (0.3M Magnesium chloride hexahydrate, 0.3M Calcium chloride dihydrate), 50% Precipitation mix 1 (40% v/v PEG 500 MME, 20 % w/v PEG 20000), 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 2.23 Å R-free 0.281
6QK9 A dimeric ubiquitin formed by a single amino acid substitution 提交 2019-01-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 77–150（74 aa） 链 D 77–150（74 aa）	突变：G10V 突变：G10V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.06 M Divalents (0.3M Magnesium chloride hexahydrate, 0.3M Calcium chloride dihydrate), 50% Precipitation mix 1 (40% v/v PEG 500 MME, 20 % w/v PEG 20000), 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 2.23 Å R-free 0.281
6QK9 A dimeric ubiquitin formed by a single amino acid substitution 提交 2019-01-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 77–150（74 aa） 链 F 77–150（74 aa）	突变：G10V 突变：G10V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.06 M Divalents (0.3M Magnesium chloride hexahydrate, 0.3M Calcium chloride dihydrate), 50% Precipitation mix 1 (40% v/v PEG 500 MME, 20 % w/v PEG 20000), 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 2.23 Å R-free 0.281
6QK9 A dimeric ubiquitin formed by a single amino acid substitution 提交 2019-01-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 77–150（74 aa） 链 H 77–150（74 aa）	突变：G10V 突变：G10V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.06 M Divalents (0.3M Magnesium chloride hexahydrate, 0.3M Calcium chloride dihydrate), 50% Precipitation mix 1 (40% v/v PEG 500 MME, 20 % w/v PEG 20000), 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 2.23 Å R-free 0.281
6QK9 A dimeric ubiquitin formed by a single amino acid substitution 提交 2019-01-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 77–150（74 aa） 链 J 77–150（74 aa）	突变：G10V 突变：G10V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.06 M Divalents (0.3M Magnesium chloride hexahydrate, 0.3M Calcium chloride dihydrate), 50% Precipitation mix 1 (40% v/v PEG 500 MME, 20 % w/v PEG 20000), 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 2.23 Å R-free 0.281
6QK9 A dimeric ubiquitin formed by a single amino acid substitution 提交 2019-01-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 77–150（74 aa） 链 L 77–150（74 aa）	突变：G10V 突变：G10V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.06 M Divalents (0.3M Magnesium chloride hexahydrate, 0.3M Calcium chloride dihydrate), 50% Precipitation mix 1 (40% v/v PEG 500 MME, 20 % w/v PEG 20000), 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 2.23 Å R-free 0.281
6QML UCHL3 in complex with synthetic, K27-linked diubiquitin 提交 2019-02-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–76（76 aa）	突变：M1(NLE) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 2 BR BROMIDE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Drops set up in MRC 2 well, 96 well plate using a Mosquito crystallization robot. 100+100 nl drops. Best crystals: 21% PEG 3350 0.15M KBr 0.1M Bis-Tris pH 5.5 Crystals grow also in KCl and AmSO4 (0.2 M), or with PEG 200 MME. Crystals can be obtained at 4C as well.	分辨率 2.10 Å R-free 0.233
6QML UCHL3 in complex with synthetic, K27-linked diubiquitin 提交 2019-02-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–76（76 aa）	突变：M1(NLE) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 3 BR BROMIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298.15 K；Drops set up in MRC 2 well, 96 well plate using a Mosquito crystallization robot. 100+100 nl drops. Best crystals: 21% PEG 3350 0.15M KBr 0.1M Bis-Tris pH 5.5 Crystals grow also in KCl and AmSO4 (0.2 M), or with PEG 200 MME. Crystals can be obtained at 4C as well.	分辨率 2.10 Å R-free 0.233
6UD0 Solution-state NMR structural ensemble of human Tsg101 UEV in complex with K63-linked diubiquitin 提交 2019-09-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–76（76 aa） 链 B 1–77（77 aa）	突变：K63R 突变：+D77	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.8；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 1 NMR样品组成 200 uM [U-98% 15N] Tsg101 UEV domain, 200 uM K63-linked diubiquitin, distal domain, 200 uM K63-linked diubiquitin, proximal domain, 20 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 200 uM K63-linked diubiquitin, distal domain, 200 uM [U-98% 15N] K63-linked diubiquitin, proximal domain, 20 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 200 uM Tsg101 UEV domain, 200 uM [U-98% 15N] K63-linked diubiquitin, distal domain, 200 uM K63-linked diubiquitin, proximal domain, 20 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 200 uM Tsg101 UEV domain, 200 uM K63-linked diubiquitin, distal domain, 200 uM [U-98% 15N] K63-linked diubiquitin, proximal domain, 20 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 125 uM [U-98% 15N] Tsg101 UEV domain, 125 uM K63-linked diubiquitin, distal domain, 125 uM K63-linked diubiquitin, proximal domain, 20 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 125 uM [U-98% 15N] Tsg101 UEV domain, 125 uM K63-linked diubiquitin, distal domain, 125 uM K63-linked diubiquitin, proximal domain, 20 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 125 uM [U-98% 15N] Tsg101 UEV domain, 125 uM K63-linked diubiquitin, distal domain, 125 uM K63-linked diubiquitin, proximal domain, 20 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 125 uM [U-98% 15N] Tsg101 UEV domain, 125 uM K63-linked diubiquitin, distal domain, 125 uM K63-linked diubiquitin, proximal domain, 20 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 200 uM [U-98% 15N] Tsg101 UEV domain, 20 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 200 uM [U-98% 15N] K63-linked diubiquitin, distal domain, 200 uM K63-linked diubiquitin, proximal domain, 20 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
6UYI hRpn13:hRpn2:K48-diubiquitin 提交 2019-11-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–77（77 aa） 链 D 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298.15 K；离子强度（mmCIF原始值）0.11；压力 ambient NMR样品组成 0.6 mM [U-13C] Rpn13, 0.6 mM Rpn2, 0.72 mM [U-13C] proximal ubiquitin, 0.72 mM distal ubiquitin, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-13C] Rpn13, 0.6 mM Rpn2, 0.72 mM proximal ubiquitin, 0.72 mM [U-13C] distal ubiquitin, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
6UYJ hRpn13:hRpn2:K48-diubiquitin 提交 2019-11-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–77（77 aa） 链 D 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298.15 K；离子强度（mmCIF原始值）0.11；压力 ambient NMR样品组成 0.6 mM [U-13C] Rpn13, 0.6 mM Rpn2, 0.72 mM [U-13C] proximal ubiquitin, 0.72 mM distal ubiquitin, 100% D2O | 100% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-13C] Rpn13, 0.6 mM Rpn2, 0.72 mM [U-13C] proximal ubiquitin, 0.72 mM distal ubiquitin, 100% D2O | 100% D2O	分辨率未提供
6XZ1 Conjugate of the HECT domain of HUWE1 with ubiquitin 提交 2020-01-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–75（75 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 2 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.65 M Sodium phosphate monobasic, potassium phosphate dibasic, 0.1 M HEPES pH 7.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.255
6XZ1 Conjugate of the HECT domain of HUWE1 with ubiquitin 提交 2020-01-31	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–75（75 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 3 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.65 M Sodium phosphate monobasic, potassium phosphate dibasic, 0.1 M HEPES pH 7.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.255
7AHZ Crystal structure of Western clawed frog MDM2 RING domain homodimer bound to UbcH5B-Ub 提交 2020-09-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 CCC 75–152（78 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；0.1 M HEPES, 10 % w/v PEG 20000	分辨率 1.82 Å R-free 0.231
7AHZ Crystal structure of Western clawed frog MDM2 RING domain homodimer bound to UbcH5B-Ub 提交 2020-09-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 FFF 75–152（78 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；0.1 M HEPES, 10 % w/v PEG 20000	分辨率 1.82 Å R-free 0.231
7AHZ Crystal structure of Western clawed frog MDM2 RING domain homodimer bound to UbcH5B-Ub 提交 2020-09-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 III 75–152（78 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；0.1 M HEPES, 10 % w/v PEG 20000	分辨率 1.82 Å R-free 0.231
7AHZ Crystal structure of Western clawed frog MDM2 RING domain homodimer bound to UbcH5B-Ub 提交 2020-09-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 LLL 75–152（78 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；0.1 M HEPES, 10 % w/v PEG 20000	分辨率 1.82 Å R-free 0.231
7AI0 Crystal structure of human MDM2-G443T RING domain homodimer bound to UbcH5B-Ub (Crystal form 1) 提交 2020-09-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 CCC 75–152（78 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；292 K；0.1 M Tris, 0.075 M NaOAc, 0.1 M NaCl, 15 % w/v PEG Smear Medium	分辨率 1.56 Å R-free 0.185
7AI0 Crystal structure of human MDM2-G443T RING domain homodimer bound to UbcH5B-Ub (Crystal form 1) 提交 2020-09-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 FFF 75–152（78 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；292 K；0.1 M Tris, 0.075 M NaOAc, 0.1 M NaCl, 15 % w/v PEG Smear Medium	分辨率 1.56 Å R-free 0.185
7AI1 Crystal structure of human MDM2-G443T RING domain homodimer bound to UbcH5B-Ub (Crystal form 2) 提交 2020-09-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 CCC 75–152（78 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；0.1 M HEPES, 0.2 M NH4NO3, 20 % w/v PEG Smear Broad	分辨率 2.07 Å R-free 0.266
7AI1 Crystal structure of human MDM2-G443T RING domain homodimer bound to UbcH5B-Ub (Crystal form 2) 提交 2020-09-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 FFF 75–152（78 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；0.1 M HEPES, 0.2 M NH4NO3, 20 % w/v PEG Smear Broad	分辨率 2.07 Å R-free 0.266
7AY2 Crystal structure of truncated USP1-UAF1 reacted with ubiquitin-prg 提交 2020-11-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；8-13% w/v PEG3350, 0.1 M citric acid/Bis-Tris propane pH 4.1	分辨率 3.20 Å R-free 0.234
7AY2 Crystal structure of truncated USP1-UAF1 reacted with ubiquitin-prg 提交 2020-11-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；8-13% w/v PEG3350, 0.1 M citric acid/Bis-Tris propane pH 4.1	分辨率 3.20 Å R-free 0.234
7CAP Cyclic Lys48-linked triubiquitin 提交 2020-06-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–76（76 aa） 链 B 1–76（76 aa） 链 C 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；20% PEG 3350, 200 mM zinc acetate	分辨率 1.33 Å R-free 0.174
7DNI MDA5 CARDs-MAVS CARD polyUb complex 提交 2020-12-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 E 1–76（76 aa） 链 F 1–76（76 aa） 链 G 1–76（76 aa） 链 H 1–76（76 aa） 链 I 1–76（76 aa） 链 J 1–76（76 aa） 链 K 1–76（76 aa） 链 L 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5	分辨率 3.20 Å
7DNJ K63-polyUb MDA5CARDs complex 提交 2020-12-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 E 1–76（76 aa） 链 F 1–76（76 aa） 链 G 1–76（76 aa） 链 H 1–76（76 aa） 链 I 1–76（76 aa） 链 J 1–76（76 aa） 链 K 1–76（76 aa） 链 L 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER	分辨率 3.30 Å
7F7X Protein complex between phosphorylated ubiquitin and Ubqln2 UBA 提交 2021-06-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1 NMR样品组成 20 mM HEPES, 0.15 M sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
7JMS Structure of the Hazara virus OTU bound to ubiquitin 提交 2020-08-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 AYE prop-2-en-1-amine × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.3 M calcium chloride, 20% PEG 4000	分辨率 2.78 Å R-free 0.273
7JMS Structure of the Hazara virus OTU bound to ubiquitin 提交 2020-08-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–75（75 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 AYE prop-2-en-1-amine × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.3 M calcium chloride, 20% PEG 4000	分辨率 2.78 Å R-free 0.273
7JMS Structure of the Hazara virus OTU bound to ubiquitin 提交 2020-08-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–75（75 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.3 M calcium chloride, 20% PEG 4000	分辨率 2.78 Å R-free 0.273
7JMS Structure of the Hazara virus OTU bound to ubiquitin 提交 2020-08-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–75（75 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.3 M calcium chloride, 20% PEG 4000	分辨率 2.78 Å R-free 0.273
7LYC Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A Lys13 and Lys15 in complex with BARD1 (residues 415-777) 提交 2021-03-06	构建体不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
7M2K CDC34A-Ubiquitin-2ab inhibitor complex 提交 2021-03-16	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	未记录	GZM 4-[(3',5'-dichloro[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]-N-ethyl-1-(methoxyacetyl)piperidine-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES pH 7.0 29% PEG3350 40 mM DL-Malic acid 5 mM DTT	分辨率 2.47 Å R-free 0.276
7M2K CDC34A-Ubiquitin-2ab inhibitor complex 提交 2021-03-16	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa）	未记录	GZM 4-[(3',5'-dichloro[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]-N-ethyl-1-(methoxyacetyl)piperidine-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES pH 7.0 29% PEG3350 40 mM DL-Malic acid 5 mM DTT	分辨率 2.47 Å R-free 0.276
7M2K CDC34A-Ubiquitin-2ab inhibitor complex 提交 2021-03-16	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–76（76 aa）	未记录	GZM 4-[(3',5'-dichloro[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]-N-ethyl-1-(methoxyacetyl)piperidine-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES pH 7.0 29% PEG3350 40 mM DL-Malic acid 5 mM DTT	分辨率 2.47 Å R-free 0.276
7M2K CDC34A-Ubiquitin-2ab inhibitor complex 提交 2021-03-16	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–76（76 aa）	未记录	GZM 4-[(3',5'-dichloro[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]-N-ethyl-1-(methoxyacetyl)piperidine-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES pH 7.0 29% PEG3350 40 mM DL-Malic acid 5 mM DTT	分辨率 2.47 Å R-free 0.276
7MC9 X-RAY STRUCTURE OF PEDV PAPAIN-LIKE PROTEASE 2 bound to UB-PA 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.30M MgCl2, 0.1M Tris, and 16% PEG 4k	分辨率 3.10 Å R-free 0.257
7MC9 X-RAY STRUCTURE OF PEDV PAPAIN-LIKE PROTEASE 2 bound to UB-PA 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.30M MgCl2, 0.1M Tris, and 16% PEG 4k	分辨率 3.10 Å R-free 0.257
7MC9 X-RAY STRUCTURE OF PEDV PAPAIN-LIKE PROTEASE 2 bound to UB-PA 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.30M MgCl2, 0.1M Tris, and 16% PEG 4k	分辨率 3.10 Å R-free 0.257
7MC9 X-RAY STRUCTURE OF PEDV PAPAIN-LIKE PROTEASE 2 bound to UB-PA 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.30M MgCl2, 0.1M Tris, and 16% PEG 4k	分辨率 3.10 Å R-free 0.257
7MC9 X-RAY STRUCTURE OF PEDV PAPAIN-LIKE PROTEASE 2 bound to UB-PA 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.30M MgCl2, 0.1M Tris, and 16% PEG 4k	分辨率 3.10 Å R-free 0.257
7MC9 X-RAY STRUCTURE OF PEDV PAPAIN-LIKE PROTEASE 2 bound to UB-PA 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.30M MgCl2, 0.1M Tris, and 16% PEG 4k	分辨率 3.10 Å R-free 0.257
7MC9 X-RAY STRUCTURE OF PEDV PAPAIN-LIKE PROTEASE 2 bound to UB-PA 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.30M MgCl2, 0.1M Tris, and 16% PEG 4k	分辨率 3.10 Å R-free 0.257
7MC9 X-RAY STRUCTURE OF PEDV PAPAIN-LIKE PROTEASE 2 bound to UB-PA 提交 2021-04-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.30M MgCl2, 0.1M Tris, and 16% PEG 4k	分辨率 3.10 Å R-free 0.257
7MEY Structure of yeast Ubr1 in complex with Ubc2 and monoubiquitinated N-degron 提交 2021-04-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–75（75 aa） 片段：K48C 链 D 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 Z3V 2-(ethylamino)ethane-1-thiol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.67 Å
7MYF Ubiquitin variant UbV.k.1 in complex with Ube2k 提交 2021-05-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	突变：Q31F, G21R, T23Y, A57S, K59Q, K74E, E75F, T77F, V81I, L82S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2-0.3 M ammonium citrate dibasic, 20-25% PEG3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.293
7MYH Ubiquitin variant UbV.k.2 in complex with Ube2k 提交 2021-05-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	突变：K6S, L8F, T9V, K11L, T14M, K63N, E64D, T66I, H68R, L71I, G76L	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；0.2 M sodium citrate tribasic trihydrate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 7.5, 20% PEG3350	分辨率 2.39 Å R-free 0.249
7OJE Crystal structure of the covalent complex between Tribolium castaneum deubiquitinase ZUP and Ubiquitin-PA 提交 2021-05-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CIT CITRIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；8 % (v/v) Tacsimate pH 7; 22 %PEG3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.219
7OJE Crystal structure of the covalent complex between Tribolium castaneum deubiquitinase ZUP and Ubiquitin-PA 提交 2021-05-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CIT CITRIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；8 % (v/v) Tacsimate pH 7; 22 %PEG3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.219
7OJX E2 UBE2K covalently linked to donor Ub, acceptor di-Ub, and RING E3 primed for K48-linked Ub chain synthesis 提交 2021-05-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–76（76 aa） 链 D 1–76（76 aa） 链 E 1–76（76 aa）	突变：K48C	ZN ZINC ION × 2 ME7 1,1'-ethane-1,2-diylbis(1H-pyrrole-2,5-dione) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；Crystals were grown in: 0.2 M sodium citrate, 0.1 M Bis Tris propane 7.5 and 20 % (w/v) PEG 3350. The crystallization drops were set as a 1:1 mixture of the protein complex solution and the precipitant solution.	分辨率 2.40 Å R-free 0.236
7QO5 26S proteasome Rpt1-RK -Ubp6-UbVS complex in the si state 提交 2021-12-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric	链 9 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.00 Å
7RBR The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2, C111S mutant, in complex with a Lys48-linked di-ubiquitin 提交 2021-07-06	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–77（77 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；280 K；0.2 M di-sodium tartrate, 20% PEG-3350,	分辨率 1.88 Å R-free 0.228
7RMA Structure of the fourth UIM (Ubiquitin Interacting Motif) of ANKRD13D in complex with a high affinity UbV (Ubiquitin Variant) 提交 2021-07-27	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–79（79 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；0.1M Li2SO4, 0.1M sodium acetate pH 4.5 and 50% PEG 400. Crystals were cryoprotected in this buffer plus 20% ethylene glycol	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
7S6O The crystal structure of Lys48-linked di-ubiquitin 提交 2021-09-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa） 链 B 1–76（76 aa）	突变：K48R 突变：Aspartic acid residue added to C terminus (D77)	ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；289 K；50 mM acetate, 8.6% PEG2000 MME, 17.1% PEG400	分辨率 1.25 Å R-free 0.175
7UV5 The crystal structure of Papain-Like Protease of SARS CoV-2, C111S/D286N mutant, in complex with a Lys48-linked di-ubiquitin 提交 2022-04-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–76（76 aa）	突变：K48R	ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.2 M sodium tartrate, 15% PEG3350	分辨率 1.45 Å R-free 0.179
7W38 Structure of USP14-bound human 26S proteasome in state EA2.0_UBL 提交 2021-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 u 1–76（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7W39 Structure of USP14-bound human 26S proteasome in state EA2.1_UBL 提交 2021-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric	链 u 1–76（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7W3A Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-engaged state ED4_USP14 提交 2021-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric	链 y 1–76（76 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7W3B Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-engaged state ED5_USP14 提交 2021-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric	链 y 1–76（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7W3C Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-engaged state ED0_USP14 提交 2021-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric	链 y 1–76（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7W3F Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-engaged state ED1_USP14 提交 2021-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric	链 y 1–76（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7W3G Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-engaged state ED2.0_USP14 提交 2021-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric	链 y 1–76（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7W3H Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-engaged state ED2.1_USP14 提交 2021-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：49-meric	链 y 1–76（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7W3I Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-inhibited state SB_USP14 提交 2021-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 y 1–76（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7W3J Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-inhibited state SC_USP14 提交 2021-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 y 1–76（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7W3K Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-inhibited state SD4_USP14 提交 2021-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 y 1–76（76 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7W3M Structure of USP14-bound human 26S proteasome in substrate-inhibited state SD5_USP14 提交 2021-11-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 y 1–76（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7XCR Cryo-EM structure of Dot1L and H2BK34ub-H3K79Nle nucleosome 1:1 complex 提交 2022-03-25	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–76（76 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.57 Å
7XCT Cryo-EM structure of Dot1L and H2BK34ub-H3K79Nle nucleosome 2:1 complex 提交 2022-03-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 L 1–76（76 aa） 链 N 1–76（76 aa）	未记录	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8BS9 Structure of USP36 in complex with Ubiquitin-PA 提交 2022-11-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 AYE prop-2-en-1-amine × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；0.3 M potassium formate, 14% (w/v) PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.209
8BS9 Structure of USP36 in complex with Ubiquitin-PA 提交 2022-11-24	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 AYE prop-2-en-1-amine × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；0.3 M potassium formate, 14% (w/v) PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.209
8C07 Structure of HECT E3 UBR5 forming K48 linked Ubiquitin chains 提交 2022-12-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 1–76（76 aa） 链 K 1–76（76 aa）	未记录	SY8 5-azanylpentan-2-one × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8C61 Structure of USP54 in complex with Lys63-linked diUbiquitin-PA 提交 2023-01-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 1–75（75 aa） 链 C 1–76（76 aa） 链 E 1–75（75 aa） 链 F 1–76（76 aa）	突变：K63R 突变：K63R	ZN ZINC ION × 6 AYE prop-2-en-1-amine × 2 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；27.2 % (v/v) PEG 400, 0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride	分辨率 2.50 Å R-free 0.243
8C61 Structure of USP54 in complex with Lys63-linked diUbiquitin-PA 提交 2023-01-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 H 1–75（75 aa） 链 I 1–76（76 aa） 链 K 1–75（75 aa） 链 L 1–76（76 aa）	突变：K63R 突变：K63R	ZN ZINC ION × 6 AYE prop-2-en-1-amine × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；27.2 % (v/v) PEG 400, 0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride	分辨率 2.50 Å R-free 0.243
8DMQ Crystal structure of Legionella pneumophila macrodomain MavL in complex with ubiquitin vinyl methyl ester 提交 2022-07-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–75（75 aa）	未记录	FLC CITRATE ANION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GVE METHYL 4-AMINOBUTANOATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium citrate, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.19 Å R-free 0.209
8DMQ Crystal structure of Legionella pneumophila macrodomain MavL in complex with ubiquitin vinyl methyl ester 提交 2022-07-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–75（75 aa）	未记录	FLC CITRATE ANION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GVE METHYL 4-AMINOBUTANOATE × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium citrate, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.19 Å R-free 0.209
8DMS Crystal structure of Legionella pneumophila macrodomain MavL in complex with ubiquitin vinyl methyl ester soaked with ADP-ribose 提交 2022-07-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–75（75 aa）	未记录	1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 GVE METHYL 4-AMINOBUTANOATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium citrate, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.15 Å R-free 0.207
8DMS Crystal structure of Legionella pneumophila macrodomain MavL in complex with ubiquitin vinyl methyl ester soaked with ADP-ribose 提交 2022-07-08	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–75（75 aa）	未记录	AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 GVE METHYL 4-AMINOBUTANOATE × 1 FLC CITRATE ANION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium citrate, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.15 Å R-free 0.207
8EFW Structure of SdeA DUB Domain disulfide crosslinked with Ubiquitin 提交 2022-09-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；2.8M sodium acetate: HCl pH7	分辨率 2.81 Å
8EFX Structure of OtDUB DUB Domain disulfide crosslinked with Ubiquitin 提交 2022-09-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.16M Magnesium chloride, 0.08M Tris at pH 8.5, 24% PEG 8000 and 20% glycerol	分辨率 1.85 Å R-free 0.229
8EHO PRRSV-1 PLP2 domain bound to ubiquitin 提交 2022-09-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 3CN 3-AMINOPROPANE × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.2M Mg(NO3)2	分辨率 2.85 Å R-free 0.247
8EHO PRRSV-1 PLP2 domain bound to ubiquitin 提交 2022-09-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 3CN 3-AMINOPROPANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.2M Mg(NO3)2	分辨率 2.85 Å R-free 0.247
8EHO PRRSV-1 PLP2 domain bound to ubiquitin 提交 2022-09-14	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 3CN 3-AMINOPROPANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.2M Mg(NO3)2	分辨率 2.85 Å R-free 0.247
8F1F Structure of K48-linked tri-ubiquitin in complex with cyclic peptide 提交 2022-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–76（76 aa） 链 B 1–76（76 aa） 链 C 1–76（76 aa）	突变：D77 added to the C-terminus 突变：K48R	GOL GLYCEROL × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；Droplets were formed by mixing equal volumes of Ub3:Ub4a complex (8 mg/ml) and the crystallization solution containing 0.15 M NaCl, 23% (w/v) PEG 3350 and 0.1 M HEPES (pH 7.5)	分辨率 1.85 Å R-free 0.298
8F1F Structure of K48-linked tri-ubiquitin in complex with cyclic peptide 提交 2022-11-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 a 1–76（76 aa） 链 b 1–76（76 aa） 链 c 1–76（76 aa）	突变：D77 added to the C-terminus 突变：K48R	EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；Droplets were formed by mixing equal volumes of Ub3:Ub4a complex (8 mg/ml) and the crystallization solution containing 0.15 M NaCl, 23% (w/v) PEG 3350 and 0.1 M HEPES (pH 7.5)	分辨率 1.85 Å R-free 0.298
8G6G H2BK120ub+H3K79me2-modified nucleosome ubiquitin position 5 提交 2023-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 K 1–76（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.93 Å
8G6H H2BK120ub+H3K79me2-modified nucleosome ubiquitin position 6 提交 2023-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 K 1–76（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.06 Å
8G6Q H2AK119ub-modified nucleosome ubiquitin position 1 提交 2023-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 K 1–76（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.41 Å
8G6S H2AK119ub-modified nucleosome ubiquitin position 2 提交 2023-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 K 1–76（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
8GRM Cryo-EM structure of PRC1 bound to H2AK119-UbcH5b-Ub nucleosome 提交 2022-09-02	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 O 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
8H1T Cryo-EM structure of BAP1-ASXL1 bound to chromatosome 提交 2022-10-04	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 M 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8IC9 Lys48-linked K48C-diubiquitin 提交 2023-02-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa） 链 B 1–76（76 aa）	突变：K48C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；38% 2-methyl-2,4-pentanediol and 50 mM sodium citrate (pH 4.0)	分辨率 1.25 Å R-free 0.219
8IC9 Lys48-linked K48C-diubiquitin 提交 2023-02-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa） 链 D 1–76（76 aa）	突变：K48C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；38% 2-methyl-2,4-pentanediol and 50 mM sodium citrate (pH 4.0)	分辨率 1.25 Å R-free 0.219
8ITP Crystal structure of USP47 catalytic domain complex with ubiquitin 提交 2023-03-22	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM bis-Tris (pH 5.5), 25% PEG 3350, 50 mM MgCl2	分辨率 3.00 Å R-free 0.284
8ITP Crystal structure of USP47 catalytic domain complex with ubiquitin 提交 2023-03-22	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–76（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM bis-Tris (pH 5.5), 25% PEG 3350, 50 mM MgCl2	分辨率 3.00 Å R-free 0.284
8J1P Cryo-EM structure of Ufd4 in complex with K29/48 triUb 提交 2023-04-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–76（76 aa） 链 D 1–76（76 aa） 链 E 1–76（76 aa）	突变：K29C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.31 Å
8JRT Cryo-EM structure of human 26S proteasomal RP subcomplex (Ea state) bound to K11/K48-branched ubiquitin (Ub) chain composed of three Ub. 提交 2023-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 u 77–152（76 aa） 链 v 77–152（76 aa） 链 w 77–152（76 aa）	突变：K63R 突变：K63R 突变：K63R	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；incubation time= 3 s blotting time= 2.5 s	分辨率 3.60 Å
8JTI Cryo-EM structure of human 26S RP (Eb state) bound to K11/K48-branched ubiquitin (Ub) chain composed of four Ub. 提交 2023-06-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 u 77–152（76 aa） 链 v 77–152（76 aa） 链 w 77–152（76 aa） 链 x 77–152（76 aa）	突变：K63R 突变：K63R 突变：K63R 突变：K63R	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；incubation time= 3 s blotting time= 2.5 s	分辨率 3.80 Å
8K0G Cryo-EM structure of human 26S RP (Ed state) bound to K11/K48-branched ubiquitin (Ub) chain composed of four Ub. 提交 2023-07-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 u 77–152（76 aa） 链 v 77–152（76 aa） 链 w 77–152（76 aa） 链 x 77–152（76 aa）	突变：K63R 突变：K63R 突变：K63R 突变：K63R	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；incubation time= 3 s blotting time= 2.5 s	分辨率 3.80 Å
8K6F LnaB-Actin-PRUb ternary complex 提交 2023-07-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–76（76 aa） 链 F 1–76（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；PEG8000, Sodium Choride, Sodium HEPES	分辨率 3.41 Å R-free 0.243
8K6R LnaB-Actin-PRUb ternary complex in the presence of AMPPNP 提交 2023-07-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；Sodium Chloride, Sodium HEPES, PEG8000	分辨率 2.76 Å R-free 0.261
8K6V LnaB-Actin-PRUb ternary complex 提交 2023-07-25	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；Magnesium acetate, MOPS, PEG8000	分辨率 2.60 Å R-free 0.307
8OYP Crystal structure of Ubiquitin specific protease 11 (USP11) in complex with a substrate mimetic 提交 2023-05-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NO3 NITRATE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；100 mM Tris/Bicine pH 8.5, 30 mM sodium nitrate, 30 mM sodium phosphate dibasic, 30 mM ammonium sulphate, 11.25% v/v MPD; 11.25% PEG 1000; 11.25% w/v PEG 3350 with 5 mM CdCl2	分辨率 2.44 Å R-free 0.235
8OYP Crystal structure of Ubiquitin specific protease 11 (USP11) in complex with a substrate mimetic 提交 2023-05-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NO3 NITRATE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；100 mM Tris/Bicine pH 8.5, 30 mM sodium nitrate, 30 mM sodium phosphate dibasic, 30 mM ammonium sulphate, 11.25% v/v MPD; 11.25% PEG 1000; 11.25% w/v PEG 3350 with 5 mM CdCl2	分辨率 2.44 Å R-free 0.235
8Q00 TssM-Ub-PA complex - A USP-like DUB from B. pseudomallei (193-430) reacted with Ub-PA 提交 2023-07-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FLC CITRATE ANION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M ammonium citrate dibasic and 22 % w/v PEG 3350; 1:2, 1:1, 2:1 protein:reservoir ration; cryoprotected with reservoir + 25% ethylene glycol	分辨率 1.62 Å R-free 0.198
8Q00 TssM-Ub-PA complex - A USP-like DUB from B. pseudomallei (193-430) reacted with Ub-PA 提交 2023-07-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M ammonium citrate dibasic and 22 % w/v PEG 3350; 1:2, 1:1, 2:1 protein:reservoir ration; cryoprotected with reservoir + 25% ethylene glycol	分辨率 1.62 Å R-free 0.198
8RQI Structure of Rhizobium NopD with ubiquitin 提交 2024-01-18	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M imidazole 8.0 and 10% PEG8000	分辨率 1.94 Å R-free 0.199
8RX0 (NEDD8)-CRL2VHL-MZ1-Brd4BD2-Ub(G76S, K48C)-UBE2R1(C93K, S138C, C191S, C223S)-Ub 提交 2024-02-05	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 U 1–76（76 aa）	未记录	759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN3 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 M 18–76（59 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8SN4 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 M 18–76（59 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN5 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 3) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 M 18–76（59 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8SN6 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 4) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 M 18–76（59 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN7 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 5) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 M 18–76（59 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN8 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 6) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 M 18–76（59 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN9 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 M 18–76（59 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8SNA Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26	聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 M 18–76（59 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8TXV Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 1) 提交 2023-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 M 18–76（59 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8TXW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 2) 提交 2023-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 M 18–76（59 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8V25 H2BK120ub-modified nucleosome ubiquitin position 1 提交 2023-11-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1–76（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.32 Å
8V26 H2BK120ub-modified nucleosome ubiquitin position 2 提交 2023-11-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1–76（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8V27 H2BK120ub-modified nucleosome ubiquitin position 3 提交 2023-11-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1–76（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
8V28 H2BK120ub-modified nucleosome ubiquitin position 4 提交 2023-11-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1–76（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.36 Å
8W31 Crystal structure of parkin (R0RB):2pUb with activator compound 提交 2024-02-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–75（75 aa） 片段：residues 1-75 链 C 1–75（75 aa） 片段：residues 1-75	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 6 A1AE9 (S)-1-(6-benzyl-3-(4-(1,2,3,4-tetrahydroquinoline-1-carbonyl)phenyl)-6,7-dihydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-5(4H)-yl)ethan-1-one × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.2 M Sodium Chloride, 0.1M HEPES pH 7.5, 25% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.50 Å R-free 0.294
8XEP Crystal structure of a Legionella pneumophila type IV effector in complex with ubiquitin 提交 2023-12-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–76（76 aa） 链 C 1–76（76 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；100 mM sodium acetate, pH 6.0, 160 mM ammonium sulfate, 21% PEG 4000, 20% glycerol	分辨率 2.95 Å R-free 0.228
9AVT Structure of TAB2 NZF domain bound to K6 / Lys6-linked diubiquitin 提交 2024-03-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–76（76 aa） 链 B 1–76（76 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.2 M ammonium sulphate	分辨率 1.50 Å R-free 0.203
9AVW Structure of TAB2 NZF domain bound to K6 / Lys6-linked diubiquitin 提交 2024-03-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–152（152 aa） 链 B 1–152（152 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 6 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；2.2 M ammonium sulphate, 20% glycerol	分辨率 1.75 Å R-free 0.222
9AZJ Structure of ubiquitinated NEMO UBAN K285C-Ub G76C bound to HOIP NZF1 提交 2024-03-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 F 1–76（76 aa） 链 S 1–76（76 aa） 链 Z 1–76（76 aa）	突变：G76C 突变：G76C 突变：G76C	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.6；293 K；150nl protein + 50 nl mother liquor: 0.1 M Tris/Bicine pH 8.6, 24.2% PEG 500 MME, 8% PEG 20K, 0.03 M each of NaI, NaBr, and NaF. Cryoprotected in mother liquor containing 20% glycerol	分辨率 3.32 Å R-free 0.285
9B0Z Structure of Optineurin bound to HOIP NZF1 domain and M1-linked diubiquitin, crystal form 2 提交 2024-03-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 C 1–152（152 aa） 链 D 1–152（152 aa） 链 G 1–152（152 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；20% PEG 2K MME, 0.2 M TAO and 0.1 M Tris pH 8.5. Cryoprotected in mother liquor containing 20% glycerol	分辨率 2.41 Å R-free 0.270
9B12 Structure of Optineurin bound to HOIP NZF1 domain and M1-linked diubiquitin, crystal form 1 提交 2024-03-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；3:1 with reservoir solution containing 50% PEG 200 and 0.1 M HEPES pH 7.5	分辨率 1.81 Å R-free 0.269
9B12 Structure of Optineurin bound to HOIP NZF1 domain and M1-linked diubiquitin, crystal form 1 提交 2024-03-12	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–152（152 aa）	未记录	PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 3 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；3:1 with reservoir solution containing 50% PEG 200 and 0.1 M HEPES pH 7.5	分辨率 1.81 Å R-free 0.269
9C5E Covalent Complex Between Parkin Catalytic (Rcat) Domain and Ubiquitin 提交 2024-06-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1 NMR样品组成 300 uM [U-13C; U-15N] Rcat domain from Parkin, 300 uM Ubiquitin G75-C3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 800 uM [U-13C; U-15N] Rcat domain from Parkin, 800 uM Ubiquitin G75-C3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 uM [U-13C; U-15N] Ubiquitin G75-C3, 300 uM Rcat domain from Parkin, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 uM [U-13C; U-15N] Rcat domain from Parkin, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 500 uM [U-13C; U-15N] Ubiquitin G75-C3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9D1I Structure of Ubiquitin bound to KLHDC3-EloB/C 提交 2024-08-07	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–76（76 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%PEG5KMME, 0.1M HEPES pH=7.0, 5% Tascsimate pH=7.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.189
9DBY ncPRC1RYBP bound to singly modified H2AK119Ub nucleosome 提交 2024-08-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 N 1–76（76 aa）	突变：G76C	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9DDE ncPRC1RYBP bound to H2AK119Ub/H1.4 chromatosome 提交 2024-08-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 N 1–76（76 aa）	突变：G76C	ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9DG3 ncPRC1RYBP Delta-linker mutant bound to singly modified H2AK119Ub nucleosome 提交 2024-09-01	构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 N 1–76（76 aa）	突变：G76C	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.46 Å
9EBS Cryo-EM structure of USP1-UAF1-Ubiquitin in complex with TNG348 提交 2024-11-13	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–75（75 aa）	未记录	A1A4Y 3-(methanesulfonyl)propan-1-amine × 1 ZN ZINC ION × 1 A1BHF 2-(4-cyclopropyl-6-methoxypyrimidin-5-yl)-9-({4-[1-methyl-4-(trifluoromethyl)-1H-imidazol-2-yl]phenyl}methyl)-7-(2,2,2-trifluoroethyl)-7,9-dihydro-8H-purin-8-imine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9EMK DupA from legionella covalently bound to ubiquitin-based probe 提交 2024-03-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1H50 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{S})-5-[(1-ethyl-1,2,3-triazol-4-yl)methoxy]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl ethanesulfonate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 6000 0.1 M HEPES pH7 0.2 M MgCl2	分辨率 2.17 Å R-free 0.239
9EMK DupA from legionella covalently bound to ubiquitin-based probe 提交 2024-03-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1H50 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{S})-5-[(1-ethyl-1,2,3-triazol-4-yl)methoxy]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl ethanesulfonate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 6000 0.1 M HEPES pH7 0.2 M MgCl2	分辨率 2.17 Å R-free 0.239
9EMK DupA from legionella covalently bound to ubiquitin-based probe 提交 2024-03-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1H50 [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{S})-5-[(1-ethyl-1,2,3-triazol-4-yl)methoxy]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl ethanesulfonate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 6000 0.1 M HEPES pH7 0.2 M MgCl2	分辨率 2.17 Å R-free 0.239
9F5T Ubiquitin C-terminal clippase BpJOS 提交 2024-04-30	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；0.1 M CHES pH 9.5; 22 % PEG 8000; 1:2 protein reservoir drop ration; cryoprotected with reservoir + 20% Glycerol	分辨率 2.56 Å R-free 0.253
9F5T Ubiquitin C-terminal clippase BpJOS 提交 2024-04-30	构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–152（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；0.1 M CHES pH 9.5; 22 % PEG 8000; 1:2 protein reservoir drop ration; cryoprotected with reservoir + 20% Glycerol	分辨率 2.56 Å R-free 0.253
9F6G Human USP30 chimera bound to Ubiquitin-PA 提交 2024-05-01	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.56 M sodium citrate pH 7.0	分辨率 1.50 Å R-free 0.211
9FN4 DUBS Parachlamydia sp. PcJOS 提交 2024-06-09	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Molecular Dimensions Morpheus B7, 298 K.	分辨率 2.15 Å R-free 0.201
9FPA DUBS Parachlamydia sp. PcJOS orthorhombic crystal form 提交 2024-06-13	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–152（152 aa）	未记录	CIT CITRIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Midas G6. 35 % v/v glycerol ethoxylate, 0.2 M lithium citrate	分辨率 2.18 Å R-free 0.212
9G7G Structure of the clippase PaJOS from Pigmentiphaga aceris 提交 2024-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M TRIS pH 8.5, 30 % w/v PEG4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.231
9G7G Structure of the clippase PaJOS from Pigmentiphaga aceris 提交 2024-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M TRIS pH 8.5, 30 % w/v PEG4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.231
9G7G Structure of the clippase PaJOS from Pigmentiphaga aceris 提交 2024-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 V 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M TRIS pH 8.5, 30 % w/v PEG4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.231
9G7G Structure of the clippase PaJOS from Pigmentiphaga aceris 提交 2024-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 X 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M TRIS pH 8.5, 30 % w/v PEG4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.231
9G7G Structure of the clippase PaJOS from Pigmentiphaga aceris 提交 2024-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M TRIS pH 8.5, 30 % w/v PEG4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.231
9G7G Structure of the clippase PaJOS from Pigmentiphaga aceris 提交 2024-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M TRIS pH 8.5, 30 % w/v PEG4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.231
9G7G Structure of the clippase PaJOS from Pigmentiphaga aceris 提交 2024-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M TRIS pH 8.5, 30 % w/v PEG4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.231
9G7G Structure of the clippase PaJOS from Pigmentiphaga aceris 提交 2024-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M TRIS pH 8.5, 30 % w/v PEG4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.231
9G7G Structure of the clippase PaJOS from Pigmentiphaga aceris 提交 2024-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M TRIS pH 8.5, 30 % w/v PEG4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.231
9G7G Structure of the clippase PaJOS from Pigmentiphaga aceris 提交 2024-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M TRIS pH 8.5, 30 % w/v PEG4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.231
9G7G Structure of the clippase PaJOS from Pigmentiphaga aceris 提交 2024-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M TRIS pH 8.5, 30 % w/v PEG4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.231
9G7G Structure of the clippase PaJOS from Pigmentiphaga aceris 提交 2024-07-21	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 R 1–75（75 aa）	未记录	AYE prop-2-en-1-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M magnesium chloride, 0.1 M TRIS pH 8.5, 30 % w/v PEG4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.231
9GKM Structure of HECT E3 TRIP12 forming K29/K48-branched Ubiquitin chains 提交 2024-08-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–76（76 aa）	突变：K48R	SY8 5-azanylpentan-2-one × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.69 Å
9HNW USP1-UAF1 bound to Lys63-linked diubiquitin 提交 2024-12-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–75（75 aa） 链 D 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：K63(DAB) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
9ISZ Structure of Clr4 catalyzing K14-ubiquitinated histone H3 K9 methylation 提交 2024-07-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 153–228（76 aa） 链 D 153–228（76 aa）	突变：G76C 突变：G76C	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2 ZN ZINC ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；18-20% PEG1000, 100 mM Imidazole, 200 mM CaAc2, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.274
9ISZ Structure of Clr4 catalyzing K14-ubiquitinated histone H3 K9 methylation 提交 2024-07-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 153–228（76 aa）	突变：G76C	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；18-20% PEG1000, 100 mM Imidazole, 200 mM CaAc2, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.274
9ISZ Structure of Clr4 catalyzing K14-ubiquitinated histone H3 K9 methylation 提交 2024-07-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 153–228（76 aa）	突变：G76C	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；18-20% PEG1000, 100 mM Imidazole, 200 mM CaAc2, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.274
9MC6 Cryo-EM structure of Human UBA1-UBE2O-Ub -Transthiolation state 2 提交 2025-03-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.32 Å
9MC7 Cryo-EM structure of Human UBA1-UBE2O-Ub -Recruitment state 4 提交 2025-03-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
9MC9 Cryo-EM structure of Human UBA1-UBE2O-Ub -Transthiolation state 1 提交 2025-03-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å
9MCB Cryo-EM structure of Human UBA1-UBE2O-Ub -Recruitment state 1 提交 2025-03-17	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
9QHI Structure of UBA6-UbDha-BIRC6 trapped ternary complex (cluster 0) 提交 2025-03-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–76（76 aa） 链 E 1–76（76 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.27 Å
9QUG Structure of a UBC-Ubiquitin conjugate 提交 2025-04-10	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–76（76 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4 P4K polyethylene glycol × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M Trimethylamine N-oxide dihydrate, 0.1 M Tris pH 8.5, 20% (w/v) Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000	分辨率 1.80 Å R-free 0.192
9V33 Calypso/Asx/NCP-ub complex 提交 2025-05-21	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 M 77–151（75 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN	分辨率 5.90 Å
9V9Q Cryo-EM structure of the cPRC1-UbcH5c E3-E2 complex bound to the H2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 O 153–228（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å
9V9R Cryo-EM structure of the ncPRC1.1-UbcH5c E3-E2 complex bound to the H2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 O 153–228（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.20 Å
9V9S Cryo-EM structure of the ncPRC1.1 complex bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 K 153–228（76 aa） 链 O 153–228（76 aa）	突变：G76C 突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.80 Å
9V9T Cryo-EM structure of the ncPRC1.6 complex bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 K 153–228（76 aa） 链 O 153–228（76 aa）	突变：G76C 突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å
9V9U Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing two RNF2-BMI1 bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 O 153–228（76 aa） 链 P 153–228（76 aa）	突变：G76C 突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.70 Å
9V9V Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RNF2-BMI1 and one RYBP bound to the H2AK119ubH2BK120ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 K 153–228（76 aa） 链 O 153–228（76 aa）	突变：G76C 突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.80 Å
9V9W Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing two RYBP bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 K 153–228（76 aa） 链 O 153–228（76 aa）	突变：G76C 突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
9V9Y Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RNF2-BMI1 and one RYBP bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 K 153–228（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.20 Å
9V9Z Cryo-EM structure of the ncPRC1.4 complex containing one RYBP bound to the H2AK119ub-modified nucleosome 提交 2025-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 O 153–228（76 aa）	突变：G76C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å
9YL3 State 1 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 O 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.50 Å
9YLE State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08	构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 O 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.63 Å
9YM8 State 2 focused on PHD FYR of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 O 1–76（76 aa） 链 U 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.43 Å
9YMF State 2 focused on H3 N terminal tail of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 O 1–76（76 aa） 链 U 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.45 Å

共 278 个其他 PDB 条目、429 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	UBB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 23–81； UniProt 18–76

Histone H2A type 1-B/E

Homo sapiens

UniProt P04908

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 10 DNA 2 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物数一致	链 C； UniProt 12–130 链 G； UniProt 12–130	突变：K13S	Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2B type 1-C/E/F/G/I × 2 （P62807） DNA (147-MER) × 1 DNA (147-MER) × 1 E3 ubiquitin-protein ligase RNF168 × 1 （Q8IYW5） Polyubiquitin-B × 1 （P0CG47）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8TXX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2RVQ Solution structure of the isolated histone H2A-H2B heterodimer 提交 2016-03-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；293 K；离子强度（mmCIF原始值）400；压力 ambient NMR样品组成 0.1-0.3 mM [U-13C; U-15N; U-2H] entity_1-1, 0.1-0.3 mM [U-13C; U-15N; U-2H] entity_2-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3A6N The nucleosome containing a testis-specific histone variant, human H3T 提交 2009-09-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.264
3AFA The human nucleosome structure 提交 2010-02-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
3AN2 The structure of the centromeric nucleosome containing CENP-A 提交 2010-08-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.60 Å R-free 0.325
3AV1 The human nucleosome structure containing the histone variant H3.2 提交 2011-02-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.290
3AV2 The human nucleosome structure containing the histone variant H3.3 提交 2011-02-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.272
3AYW Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K56Q mutation 提交 2011-05-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.90 Å R-free 0.273
3AZE Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K64Q mutation 提交 2011-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.302
3AZF Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K79Q mutation 提交 2011-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.70 Å R-free 0.263
3AZG Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K115Q mutation 提交 2011-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.40 Å R-free 0.269
3AZH Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K122Q mutation 提交 2011-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.49 Å R-free 0.266
3AZI Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K31Q mutation 提交 2011-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.70 Å R-free 0.289
3AZJ Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K44Q mutation 提交 2011-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.89 Å R-free 0.268
3AZK Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K59Q mutation 提交 2011-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3AZL Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K77Q mutation 提交 2011-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.70 Å R-free 0.259
3AZM Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K79Q mutation 提交 2011-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.89 Å R-free 0.296
3AZN Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K91Q mutation 提交 2011-05-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.254
3W96 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H2A N-terminal region 提交 2013-04-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 11–130（120 aa） 片段：UNP residues 11-130 链 G 11–130（120 aa） 片段：UNP residues 11-130	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.296
3W97 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H2B N-terminal region 提交 2013-04-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.20 Å R-free 0.321
3W98 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H3.1 N-terminal region 提交 2013-04-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.42 Å R-free 0.303
3W99 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H4 N-terminal region 提交 2013-04-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.312
3WKJ The nucleosome containing human TSH2B 提交 2013-10-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.291
3WTP Crystal Structure of the heterotypic nucleosome containing human CENP-A and H3.3 提交 2014-04-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K	分辨率 2.67 Å R-free 0.270
3X1S Crystal structure of the nucleosome core particle 提交 2014-11-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70mM KCL, 70-90mM MnCl2, 24% MPD, 20mM Na-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.81 Å R-free 0.270
3X1V Crystal structure of nucleosome core particle in the presence of histone variant involved in reprogramming 提交 2014-11-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 19 CL CHLORIDE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70 mM KCl, 70-90 mM MnCl2, Na-cocodylate, 24% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.92 Å R-free 0.259
4YM5 Crystal structure of the human nucleosome containing 6-4PP (inside) 提交 2015-03-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 4.00 Å R-free 0.289
4YM6 Crystal structure of the human nucleosome containing 6-4PP (outside) 提交 2015-03-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 3.51 Å R-free 0.287
4Z5T The nucleosome containing human H3.5 提交 2015-04-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.269
5AV5 human nucleosome core particle 提交 2015-06-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.233
5AV6 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.20 Å R-free 0.229
5AV8 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.20 Å R-free 0.233
5AV9 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.20 Å R-free 0.239
5AVB human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.236
5AVC human nucleosome core particle 提交 2015-06-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.238
5AY8 Crystal structure of human nucleosome containing H3.Y 提交 2015-08-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；sodium acetate, manganese chloride, 2-propanol, trimethylamine N-oxide	分辨率 2.80 Å R-free 0.249
5B0Y Crystal structure of the nucleosome containing histone H3 with the crotonylated lysine 122 提交 2015-11-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.56 Å R-free 0.249
5B0Z The crystal structure of the nucleosome containing H3.2, at 1.98 A resolution 提交 2015-11-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 1.99 Å R-free 0.254
5B24 The crystal structure of the nucleosome containing cyclobutane pyrimidine dimer 提交 2015-12-31	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 3.60 Å R-free 0.249
5B2I Human nucleosome containing CpG unmethylated DNA 提交 2016-01-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 3.00 Å R-free 0.257
5B2J Human nucleosome containing CpG methylated DNA 提交 2016-01-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride	分辨率 2.60 Å R-free 0.252
5B31 The crystal structure of the heterotypic H2AZ/H2A nucleosome with H3.1. 提交 2016-02-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.20 Å R-free 0.271
5B32 The crystal structure of the heterotypic H2AZ/H2A nucleosome with H3.3. 提交 2016-02-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.35 Å R-free 0.259
5B40 The nucleosome structure containing H2B-K120 and H4-K31 monoubiquitinations 提交 2016-03-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；90mM Tris-HCl (pH 7.8), 3.6% PGA-LM, 25.2% PEG 400, 2-6% Pentaerythritol ethoxylate (3/4 EO/OH)	分辨率 3.33 Å R-free 0.263
5CPI Nucleosome containing unmethylated Sat2R DNA 提交 2015-07-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.90 Å R-free 0.295
5CPJ Nucleosome containing methylated Sat2R DNA 提交 2015-07-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 3.15 Å R-free 0.295
5CPK Nucleosome containing methylated Sat2L DNA 提交 2015-07-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.63 Å R-free 0.284
5GSE Crystal structure of unusual nucleosome 提交 2016-08-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；potassium bromide, potassium thiocyanate, Tris-HCl, PGA-LM, PEG 400	分辨率 3.14 Å R-free 0.255
5GTC Crystal structure of complex between DMAP-SH conjugated with a Kaposi's sarcoma herpesvirus LANA peptide (5-15) and nucleosome core particle 提交 2016-08-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.70 Å R-free 0.267
5GXQ The crystal structure of the nucleosome containing H3.6 提交 2016-09-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.85 Å R-free 0.262
5JRG Crystal structure of the nucleosome containing the DNA with tetrahydrofuran (THF) 提交 2016-05-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.50 Å R-free 0.245
5VEY Solution NMR structure of histone H2A-H2B mono-ubiquitylated at H2A Lys15 in complex with RNF169 (653-708) 提交 2017-04-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 13–106（94 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM KCl；压力 1 NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM KCl；压力 1 NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5X7X The crystal structure of the nucleosome containing H3.3 at 2.18 angstrom resolution 提交 2017-02-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.18 Å R-free 0.256
5XF3 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (R,R-configuration) 提交 2017-04-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 RRK (1R,2R)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55 mM MnCl2, 25-49 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.270
5XF4 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (S,S-configuration) 提交 2017-04-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 SSK (1S,2S)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55 mM MnCl2, 25-49 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0	分辨率 2.87 Å R-free 0.266
5XF5 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (R,S-configuration) 提交 2017-04-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 RSK (1S,2R)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55mM MnCl2, 25-49mM KCl, 20mM K-Cacodylate pH 6.0	分辨率 2.82 Å R-free 0.264
5Y0C Crystal Structure of the human nucleosome at 2.09 angstrom resolution 提交 2017-07-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 10 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.09 Å R-free 0.249
5Y0D Crystal Structure of the human nucleosome containing the H2B E76K mutant 提交 2017-07-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 1.99 Å R-free 0.252
5Z23 Crystal structure of the nucleosome containing a chimeric histone H3/CENP-A CATD 提交 2017-12-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：L51M,L58M,L93M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：L51M,L58M,L93M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.73 Å R-free 0.261
5ZBX The crystal structure of the nucleosome containing histone H3.1 CATD(V76Q, K77D) 提交 2018-02-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.58 Å R-free 0.249
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.60 Å
6BUZ Cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with kinetochore protein CENP-N 提交 2017-12-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.92 Å
6E0C Cryo-EM structure of the CENP-A nucleosome (W601) in complex with a single chain antibody fragment 提交 2018-07-06	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.63 Å
6E0P Cryo-EM structure of the centromeric nucleosome (Native alpha satellite DNA) in complex with a single chain antibody fragment 提交 2018-07-06	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 sec before plunging	分辨率 2.60 Å
6HKT Structure of an H1-bound 6-nucleosome array 提交 2018-09-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：50-meric	链 0 1–130（130 aa） 链 2 1–130（130 aa） 链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa） 链 W 1–130（130 aa） 链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa） 链 m 1–130（130 aa） 链 q 1–130（130 aa） 链 w 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293.15 K；15% MPD, 0.1 M NaCl and 0.1 M Tris pH 8.8	分辨率 9.70 Å R-free 0.286
6HTS Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to nucleosome 提交 2018-10-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 K 1–130（130 aa） 链 O 1–130（130 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.90 Å
6IPU Human nucleosome core particle containing 145 bp of DNA 提交 2018-11-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 14–120（107 aa） 链 G 14–120（107 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate	分辨率 1.99 Å R-free 0.263
6IQ4 Nucleosome core particle cross-linked with a hetero-binuclear molecule possessing RAPTA and gold(I) 4-(diphenylphosphino)benzoic acid groups. 提交 2018-11-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 15–120（106 aa） 链 G 15–120（106 aa）	未记录	AU GOLD ION × 1 XIS 4-diphenylphosphanylbenzoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 D0X [Ru(eta(6)-p-cymene)Cl-2(pta) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate	分辨率 2.25 Å R-free 0.257
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6JR0 Crystal structure of the human nucleosome phased with 12 selenium atoms 提交 2019-04-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：L65M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：L65M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.50 Å R-free 0.253
6JR1 Crystal structure of the human nucleosome phased with 16 selenium atoms 提交 2019-04-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：L65M, L85M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：L65M, L85M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.40 Å R-free 0.243
6JXD Human nucleosome core particle with cohesive end DNA termini 提交 2019-04-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 14–119（106 aa） 链 G 14–119（106 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 17	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate	分辨率 2.25 Å R-free 0.292
6KE9 The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-07-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 15–119（105 aa） 链 G 15–119（105 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose	分辨率 2.22 Å R-free 0.230
6KXV Crystal structure of a nucleosome containing Leishmania histone H3 提交 2019-09-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium acetate, isopropanol, manganese chloride, trimethylamine N-oxide	分辨率 3.63 Å R-free 0.264
6L49 H3-CA-H3 tri-nucleosome with the 22 base-pair linker DNA 提交 2019-10-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa） 链 U 1–130（130 aa） 链 Y 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 18.90 Å
6L4A H3-H3-H3 tri-nucleosome with the 22 base-pair linker DNA 提交 2019-10-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa） 链 U 1–130（130 aa） 链 Y 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 12.30 Å
6L9H The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-11-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 15–119（105 aa） 链 G 15–119（105 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose	分辨率 2.60 Å R-free 0.278
6L9Z 338 bp di-nucleosome assembled with linker histone H1.X 提交 2019-11-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 8 CA CALCIUM ION × 65 K POTASSIUM ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate	分辨率 2.50 Å R-free 0.256
6LA2 343 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：38-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa） 链 W 1–130（130 aa） 链 a 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa） 链 k 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Sodium acetate	分辨率 3.89 Å R-free 0.267
6LA8 349 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 23 K POTASSIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate (cryo-25% MPD)	分辨率 3.40 Å R-free 0.265
6LA9 349 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 (high cryoprotectant) 提交 2019-11-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 40 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate	分辨率 3.70 Å R-free 0.266
6LAB 169 bp nucleosome, harboring cohesive DNA termini, assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 20 K POTASSIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate	分辨率 3.20 Å R-free 0.262
6LE9 The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-11-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 15–119（105 aa） 链 G 15–119（105 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose	分辨率 2.60 Å R-free 0.281
6LER 169 bp nucleosome harboring non-identical cohesive DNA termini. 提交 2019-11-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate	分辨率 3.00 Å R-free 0.261
6LER 169 bp nucleosome harboring non-identical cohesive DNA termini. 提交 2019-11-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 8 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate	分辨率 3.00 Å R-free 0.261
6M3V 355 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini 提交 2020-03-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate, Poly glutamic acid	分辨率 4.60 Å R-free 0.261
6M44 355 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini (high cryoprotectant) 提交 2020-03-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate, Poly glutamic acid	分辨率 3.81 Å R-free 0.286
6O1D Cryo-EM structure of the centromeric nucleosome with native alpha satellite DNA 提交 2019-02-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 sec before plunging	分辨率 3.40 Å
6R8Y Cryo-EM structure of NCP-6-4PP(-1)-UV-DDB 提交 2019-04-02	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
6R8Z Cryo-EM structure of NCP_THF2(-1)-UV-DDB 提交 2019-04-02	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6R90 Cryo-EM structure of NCP-THF2(+1)-UV-DDB class A 提交 2019-04-02	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6R91 Cryo-EM structure of NCP_THF2(-3)-UV-DDB 提交 2019-04-02	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6R92 Cryo-EM structure of NCP-THF2(+1)-UV-DDB class B 提交 2019-04-02	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
6R93 Cryo-EM structure of NCP-6-4PP 提交 2019-04-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6R94 Cryo-EM structure of NCP_THF2(-3) 提交 2019-04-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
6T79 Structure of a human nucleosome at 3.2 A resolution 提交 2019-10-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.	分辨率 3.20 Å
6T7A Structure of human Sox11 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.	分辨率 3.70 Å
6T7B Structure of human Sox2 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.	分辨率 5.10 Å
6T7C Structure of two copies of human Sox11 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.	分辨率 4.00 Å
6T7D Structure of human Sox11 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.	分辨率 4.40 Å
6T90 OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2019-10-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
6T93 Nucleosome with OCT4-SOX2 motif at SHL-6 提交 2019-10-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.49 Å
6V92 RSC-NCP 提交 2019-12-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 20.00 Å
6YOV OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 提交 2020-04-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
7BWD Structure of Dot1L-H2BK34ub Nucleosome Complex 提交 2020-04-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.32 Å
7BXT The cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with CENP-C peptide and CENP-N N-terminal domain 提交 2020-04-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
7BY0 The cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with the phosphorylated CENP-C 提交 2020-04-21	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7C0M Human cGAS-nucleosome complex 提交 2020-05-01	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa） 链 c 2–130（129 aa） 链 g 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7CCQ Structure of the 1:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 16–118（103 aa） 链 G 16–118（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7CCR Structure of the 2:2 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-06-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 C 16–118（103 aa） 链 G 16–118（103 aa） 链 N 16–118（103 aa） 链 R 16–118（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
7COW 353 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini with linker histone H1.0 提交 2020-08-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 K POTASSIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；potassium acetate, calcium chloride, potassium chloride	分辨率 2.86 Å R-free 0.297
7D1Z Cryo-EM structure of SET8-nucleosome complex 提交 2020-09-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
7D20 Cryo-EM structure of SET8-CENP-A-nucleosome complex 提交 2020-09-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7DBP Linker histone defines structure and self-association behaviour of the 177 bp human chromosome 提交 2020-10-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7K5X Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.0 提交 2020-09-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.93 Å
7K5Y Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.4 提交 2020-09-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.76 Å
7K60 Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.10 提交 2020-09-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
7K61 Cryo-EM structure of 197bp nucleosome aided by scFv 提交 2020-09-17	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
7K63 Cryo-EM structure of a chromatosome containing chimeric linker histone gH1.10-ncH1.4 提交 2020-09-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.03 Å
7LYA Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle with linked histone proteins H2A and H2B 提交 2021-03-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 13–130（118 aa） 链 G 13–130（118 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.91 Å
7LYB Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with BRCA1-BARD1-UbcH5c 提交 2021-03-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 13–130（118 aa） 链 G 13–130（118 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
7LYC Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A Lys13 and Lys15 in complex with BARD1 (residues 415-777) 提交 2021-03-06	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 13–130（118 aa） 链 G 13–130（118 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
7NL0 Cryo-EM structure of the Lin28B nucleosome core particle 提交 2021-02-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7PET The 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa） 链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa） 链 m 1–130（130 aa） 链 q 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.50 Å
7PEU Trinucleosome of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa） 链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
7PEV Nucleosome stack of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.00 Å
7PEW Nucleosome 1 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
7PEX Nucleosome 2 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
7PEY Nucleosome 3 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7PEZ Nucleosome 4 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 m 1–130（130 aa） 链 q 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.90 Å
7PF0 Trinucleosome of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa） 链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.00 Å
7PF2 Nucleosome stack of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
7PF3 Nucleosome 4 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 m 1–130（130 aa） 链 q 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7PF4 Nucleosome 3 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7PF5 Nucleosome 2 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7PF6 Nucleosome 1 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7PFA Trinucleosome of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa） 链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.70 Å
7PFC Nucleosome stack of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
7PFD Nucleosome 1 of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7PFE Nucleosome 2 of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7PFF Nucleosome 3 of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7PFT Trinucleosome of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa） 链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.80 Å
7PFU Nucleosome stack of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.00 Å
7PFV Nucleosome 1 of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7PFW Nucleosome 2 of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.20 Å
7PFX Nucleosome 3 of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7V90 Telomeric mononucleosome 提交 2021-08-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7V96 Telomeric Dinucleosome 提交 2021-08-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.92 Å
7V99 catalytic core of human telomerase holoenzyme 提交 2021-08-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 K 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.54 Å
7V9C Telomeric Dinucleosome in open state 提交 2021-08-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7V9J Telomeric trinucleosome 提交 2021-08-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa） 链 U 1–130（130 aa） 链 Y 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.00 Å
7V9K Telomeric tetranucleosome 提交 2021-08-25	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa） 链 U 1–130（130 aa） 链 Y 1–130（130 aa） 链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å
7V9S Telomeric trinucleosome in open state 提交 2021-08-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa） 链 U 1–130（130 aa） 链 Y 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.00 Å
7VA4 Telomeric tetranucleosome in open state 提交 2021-08-27	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa） 链 U 1–130（130 aa） 链 Y 1–130（130 aa） 链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 14.00 Å
7VZ4 Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601L DNA sequence 提交 2021-11-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 1.89 Å
7W9V Cryo-EM structure of nucleosome in complex with p300 acetyltransferase catalytic core (complex I) 提交 2021-12-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.95 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 c 2–130（129 aa） 链 g 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 c 2–130（129 aa） 链 g 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 c 2–130（129 aa） 链 g 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7XD1 cryo-EM structure of unmodified nucleosome 提交 2022-03-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 11–119（109 aa） 链 G 11–119（109 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7XTI RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58hex) 提交 2022-05-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7XVL Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169an DNA fragment) 提交 2022-05-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 W 1–130（130 aa） 链 a 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.51 Å R-free 0.280
7XVL Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169an DNA fragment) 提交 2022-05-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric	链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa） 链 k 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.51 Å R-free 0.280
7XVM Crystal Structure of Nucleosome-H5 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 18 CL CHLORIDE ION × 3 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 2.84 Å R-free 0.259
7XX5 Crystal Structure of Nucleosome-H1.3 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.19 Å R-free 0.259
7XX6 Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 21 K POTASSIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.39 Å R-free 0.296
7XX6 Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric	链 W 1–130（130 aa） 链 a 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa） 链 k 1–130（130 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 26 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 3.39 Å R-free 0.296
7XZX Cryo-EM structure of the nucleosome in complex with p53 DNA-binding domain 提交 2022-06-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.53 Å
7XZY Cryo-EM structure of the nucleosome containing 193 base-pair DNA with a p53 target sequence 提交 2022-06-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.97 Å
7XZZ Cryo-EM structure of the nucleosome in complex with p53 提交 2022-06-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
7Y00 Cryo-EM structure of the nucleosome containing 169 base-pair DNA with a p53 target sequence 提交 2022-06-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.96 Å
7Y7I chicken KNL2 in complex with the CENP-A nucleosome 提交 2022-06-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	突变：L51M, L58M, L93M 突变：L51M, L58M, L93M	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
7ZI4 Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to a WT nucleosome 提交 2022-04-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 K 1–130（130 aa） 链 O 1–130（130 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4uL of sample applied to Quantifoil R2/2 Cu 300 mesh grids. blot parameters were wait time 30 sec, blot time 0.5 sec, blot force -8	分辨率 3.20 Å
8G57 Structure of nucleosome-bound Sirtuin 6 deacetylase 提交 2023-02-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；12.5 mM HEPES pH 7.5, 60 mM KCl, 1.5% glycerol, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
8GRM Cryo-EM structure of PRC1 bound to H2AK119-UbcH5b-Ub nucleosome 提交 2022-09-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 12–120（109 aa） 链 G 12–120（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
8HAG Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (3.2 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8HAH Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (3.9 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8HAI Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (4.7 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
8HAJ Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (4.8 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
8HAK Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 4 (4.5 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
8HAL Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 提交 2022-10-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8HAM Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 提交 2022-10-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
8HAN Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 3 提交 2022-10-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.95 Å
8HQY Cryo-EM structure of SSX1 bound to the H2AK119Ub nucleosome at a resolution of 3.05 angstrom 提交 2022-12-14	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 14–119（106 aa） 链 G 14–119（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
8HR1 Cryo-EM structure of SSX1 bound to the unmodified nucleosome at a resolution of 3.02 angstrom 提交 2022-12-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 14–119（106 aa） 链 G 14–119（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.02 Å
8I17 Structural basis for H2A-H2B recognitions by human Spt16 提交 2023-01-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 14–113（100 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4,000	分辨率 1.98 Å R-free 0.211
8I17 Structural basis for H2A-H2B recognitions by human Spt16 提交 2023-01-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 14–113（100 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4,000	分辨率 1.98 Å R-free 0.211
8I17 Structural basis for H2A-H2B recognitions by human Spt16 提交 2023-01-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 14–113（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4,000	分辨率 1.98 Å R-free 0.211
8IEG Bre1(mRBD-RING)/Rad6-Ub/nucleosome complex 提交 2023-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 11–119（109 aa） 链 G 11–119（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å
8IEJ RNF20-RNF40/hRad6A-Ub/nucleosome complex 提交 2023-02-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 11–119（109 aa） 链 G 11–119（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
8IHL Overlapping tri-nucleosome 提交 2023-02-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 O 1–130（130 aa） 链 S 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.64 Å
8JBX Human canonical 601 DNA nucleosome 提交 2023-05-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
8JCC Human histone H2B variant H2BFWT Cryo-EM structure with 601 DNA sequence 提交 2023-05-10	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
8JCD Human H2BFWTH100R nucleosome with 601 DNA 提交 2023-05-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.14 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8JHG Native SUV420H1 bound to 167-bp nucleosome 提交 2023-05-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 16–130（115 aa） 链 G 16–130（115 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane	分辨率 3.58 Å
8JL9 Cryo-EM structure of the human nucleosome with scFv 提交 2023-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.65 Å
8JLA Cryo-EM structure of the human nucleosome lacking N-terminal region of H2A, H2B, H3, and H4 提交 2023-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 11–130（120 aa） 链 G 11–130（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å
8JLB Cryo-EM structure of the 145 bp human nucleosome containing H3.2 C110A mutant 提交 2023-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.36 Å
8JLD Cryo-EM structure of the 145 bp human nucleosome containing acetylated H3 tail 提交 2023-06-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.48 Å
8JND The cryo-EM structure of the nonameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-06-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.66 Å
8JNE The cryo-EM structure of the decameric RAD51 ring bound to the nucleosome without the linker DNA binding 提交 2023-06-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.68 Å
8JNF The cryo-EM structure of the RAD51 filament bound to the nucleosome 提交 2023-06-06	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.91 Å
8KB5 Cryo-EM structure of the human nucleosome containing H3.8 提交 2023-08-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.26 Å
8KCY Structure of nucleosome complexed with two DEK molecules 提交 2023-08-08	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8KD1 Structure of nucleosome complexed with one DEK molecule 提交 2023-08-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8KE0 Structure of H1.2 bound to the nucleosome 提交 2023-08-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8OSJ Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to a nucleosomal E-box at position SHL-6.2 (DNA conformation 1) 提交 2023-04-19	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
8OSK Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to a nucleosomal E-box at position SHL+5.8 (composite map) 提交 2023-04-19	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8OSL Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to the native Por enhancer nucleosome (map 2, additional 3D classification and flexible refinement) 提交 2023-04-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
8OTS OCT4 and MYC-MAX co-bound to a nucleosome 提交 2023-04-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8OTT MYC-MAX bound to a nucleosome at SHL+5.8 提交 2023-04-21	构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 9–117（109 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8Q36 Structure of Nucleosome Core with a Bound Metallopeptide Conjugate (Foamy Virus GAG Peptide-Au[I] Compound) 提交 2023-08-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 CCC 14–120（107 aa） 链 GGG 14–120（107 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0].	分辨率 2.60 Å R-free 0.262
8Q3E High Resolution Structure of Nucleosome Core with Bound Foamy Virus GAG Peptide 提交 2023-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 CCC 14–120（107 aa） 链 GGG 14–120（107 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]	分辨率 2.17 Å R-free 0.270
8Q3M Structure of Nucleosome Core with a Bound Kaposi Sarcoma Associated Herpesvirus LANA Peptide Having a Methionine to Ornithine Substitution 提交 2023-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 CCC 14–120（107 aa） 链 GGG 14–120（107 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]	分辨率 2.50 Å R-free 0.268
8Q3X Structure of Nucleosome Core with a Bound Metallopeptide Conjugate (Kaposi Sarcoma Associated Herpesvirus LANA Peptide-Au[I] Compound) 提交 2023-08-04	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 CCC 14–120（107 aa） 链 GGG 14–120（107 aa）	未记录	AU GOLD ION × 1 XIS 4-diphenylphosphanylbenzoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]	分辨率 2.30 Å R-free 0.262
8RGM Cryo-EM structure of nucleosome containing Widom603 DNA 提交 2023-12-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8SMW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 1) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8SMX Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 2) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SMY Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 3) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SMZ Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (Class 4) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SN0 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 5) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8SN1 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 6) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8SN2 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8SN3 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8SN4 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN5 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 3) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8SN6 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 4) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN7 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 5) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN8 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 6) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8SN9 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8SNA Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26	突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8TXV Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 1) 提交 2023-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：K13S 突变：K13S	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8TXW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 2) 提交 2023-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 12–130（119 aa） 链 G 12–130（119 aa）	突变：K13S 突变：K13S	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8U13 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A lysine 15 in complex with RNF168-UbcH5c (class 1) 提交 2023-08-30	构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 13–130（118 aa） 链 G 13–130（118 aa）	突变：K13S 突变：K13S	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8U14 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A lysine 15 in complex with RNF168-UbcH5c (class 2) 提交 2023-08-30	构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 13–130（118 aa） 链 G 13–130（118 aa）	突变：K13S 突变：K13S	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8U9S Cryo-EM structure of NRCAM nucleosome aided by scFv 提交 2023-09-20	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8UBJ Cryo-EM structure of NRCAM nucleosome aided by scFv (3D Flex map) 提交 2023-09-23	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8UBK Cryo-EM structure of Ascl1/E12a in complex with NRCAM nucleosome 提交 2023-09-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8UBL Cryo-EM structure of Ascl1/E12a in complex with NRCAM nucleosome (3D Flex map) 提交 2023-09-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8UPF Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168-UbcH5c 提交 2023-10-22	构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 13–130（118 aa） 链 G 13–130（118 aa）	突变：R11S 突变：R11S	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8UQ8 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 2-residue linker 提交 2023-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 13–106（94 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 7 GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (9.5 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl	分辨率 2.34 Å R-free 0.236
8UQ8 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 2-residue linker 提交 2023-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 a 13–106（94 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 14 GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (9.5 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl	分辨率 2.34 Å R-free 0.236
8UQ9 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 4-residue linker 提交 2023-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 13–106（94 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 17 GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (8.8 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl	分辨率 2.30 Å R-free 0.206
8UQ9 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 4-residue linker 提交 2023-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 a 13–106（94 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 19 GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (8.8 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl	分辨率 2.30 Å R-free 0.206
8UQA Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 12-residue linker 提交 2023-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 13–106（94 aa）	突变：C85K in UbcH5c	NA SODIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (8.0 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl	分辨率 2.05 Å R-free 0.231
8UQB Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 20-residue linker (crystallization condition 1) 提交 2023-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 13–106（94 aa）	突变：C85K in UbcH5c	ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (12 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 50 mM BIS-TRIS propane, pH 7.0, 1 M NaCl	分辨率 2.48 Å R-free 0.260
8UQC Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 20-residue linker (crystallization condition 2) 提交 2023-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 13–106（94 aa）	突变：C85K in UbcH5c	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (12 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 4% tacsimate, pH 6, 13.5% PEG3350	分辨率 2.61 Å R-free 0.252
8UQD Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 20-residue linker (condition 2. RING not modeled in density) 提交 2023-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 13–106（94 aa）	突变：C85K in UbcH5c	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (12 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 4% tacsimate, pH 6, 13.5% PEG3350	分辨率 3.89 Å R-free 0.322
8UQE Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 26-residue linker (RING not modeled in density) 提交 2023-10-23	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 13–106（94 aa）	突变：S22R,C85K in UbcH5c	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (10 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.0 M sodium acetate	分辨率 3.56 Å R-free 0.268
8VFX Cryo-EM structure of 186bp ALBN1 nucleosome aided by scFv 提交 2023-12-22	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.65 Å
8VFY Cryo-EM structure of FoxA1 in complex with ALBN1 nucleosome (class 1) 提交 2023-12-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.89 Å
8VFZ Cryo-EM structure of FoxA1 in complex with ALBN1 nucleosome (class 2) 提交 2023-12-22	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8VG0 Cryo-EM structure of GATA4 in complex with ALBN1 nucleosome 提交 2023-12-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
8VG1 Cryo-EM structure of FoxA1 and GATA4 in complex with ALBN1 nucleosome 提交 2023-12-22	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.48 Å
8VG2 Cryo-EM structure of FoxA1 and GATA4 in complex with H14 chromatosome 提交 2023-12-22	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
8VLR Cryo-EM structure of native H2AK119bu nucleosome at 2.6 提交 2024-01-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 12–119（108 aa） 链 G 12–119（108 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl, pH 7.5, 50 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8W9D Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 1 提交 2023-09-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 K POTASSIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8W9E Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 2 提交 2023-09-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8W9F Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 3 提交 2023-09-05	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8WG5 Cryo-EM structure of USP16 bound to H2AK119Ub nucleosome 提交 2023-09-20	构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 11–119（109 aa） 链 G 11–119（109 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
8X7I Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub in complex with H2AK13Ub nucleosomes determined by intein-based E2-Ub-NCP conjugation strategy 提交 2023-11-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 11–121（111 aa） 链 G 11–119（109 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
8X7J Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub/nucleosomes complex determined by activity-based chemical trapping strategy 提交 2023-11-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 12–119（108 aa） 链 G 11–118（108 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.39 Å
8X7K Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub in complex with H2AK13Ub nucleosomes determined by activity-based chemical trapping strategy (adjacent H2AK13/15 dual-monoubiquitination) 提交 2023-11-24	构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 15–119（105 aa） 链 G 11–118（108 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
8XBT The cryo-EM structure of the octameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-12-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.12 Å
8XBU The cryo-EM structure of the decameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-12-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.24 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 c 2–130（129 aa） 链 g 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric	链 c 2–130（129 aa） 链 g 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8Y3C Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (closed form) 提交 2024-01-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.21 Å
8Y3D Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (intermediate form2) 提交 2024-01-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
8Y3E Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (open form) 提交 2024-01-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.32 Å
8Y3F Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (intermediate form1) 提交 2024-01-29	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.54 Å
8YBJ Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601 DNA sequence 提交 2024-02-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.38 Å
8YBK Cryo-EM structure of the human nucleosome containing the H3.1 E97K mutant 提交 2024-02-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.69 Å
8YNY Structure of Cas9-sgRNA ribonucleoprotein bound to nucleosome 提交 2024-03-12	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：13-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.52 Å
8YTI Crystal Structure of Nucleosome-H1x Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2024-03-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 M 1–130（130 aa） 链 Q 1–130（130 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 8 CA CALCIUM ION × 52 K POTASSIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45 mM CaCl2, 25 mM KCl, 10 mM Na-acetate (pH 4.5)	分辨率 2.70 Å R-free 0.267
8YV8 Cryo-EM structure of CDCA7 bound to nucleosome including hemimethylated CpG site in Widom601 positioning sequence. 提交 2024-03-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8ZJR Structure of nucleosome-bound RFX5 complex 提交 2024-05-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8ZJT Structure of free nucleosome 提交 2024-05-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9BE5 Cryo-EM structure of Human Nucleosome collected by EPU on Glacios at 3.3 Angstrom resolution 提交 2024-04-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 G 15–119（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9BE6 Cryo-EM structure of Human Nucleosome collected by Leginon on Krios at 3.0 Angstrom resolution 提交 2024-04-14	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 G 15–119（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9GE5 CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 S 12–119（108 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
9GEL CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 S 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.86 Å
9GEV CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-07	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 O 2–130（129 aa） 链 S 2–130（129 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
9GF6 CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 O 2–130（129 aa） 链 S 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9GFB CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric	链 O 2–130（129 aa） 链 S 2–130（129 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.55 Å
9GFM CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 O 14–119（106 aa） 链 S 9–119（111 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9GW2 State 2 MAP 1 SETD2 bound to proximal H3 of upstream nucleosome 提交 2024-09-26	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.84 Å
9IGW Ku70/80 bound to 147 bp nucleosome 提交 2025-02-20	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.32 Å
9IGX Ku70/80 bound to 153 bp nucleosome 提交 2025-02-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 C 12–121（110 aa） 链 G 12–121（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.56 Å
9IPU cryo-EM structure of the RNF168(1-193)/UbcH5c-Ub ubiquitylation module bound to H1.0-K63-Ub3 modified chromatosome 提交 2024-07-11	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9J8M Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (High mobility complex) 提交 2024-08-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.82 Å
9J8N Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (Low mobility complex) 提交 2024-08-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：32-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.14 Å
9J8O Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-H1-nucleosome complex 提交 2024-08-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa） 链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.05 Å
9J8W Cryo-EM structure of NCP-UV-DDB complex containing CPD 提交 2024-08-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
9JC6 Human H2BW2 nucleosome 提交 2024-08-28	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
9KQO cryo-EM structure of RNF20/RNF40-RAD6A-Ub in complex with H2BS112GlcNAc nucleosome 提交 2024-11-26	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.48 Å
9L1X hDEK-nucleosome complex (conformation 1) 提交 2024-12-16	构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 2–120（119 aa） 链 G 2–120（119 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.69 Å
9L22 hDEK-nucleosome complex (conformation 2) 提交 2024-12-16	构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9R04 p53 bound to the nucleosome at position SHL-5.7 (crosslinked sample) 提交 2025-04-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9R2M p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (non-crosslinked sample, composite map) 提交 2025-04-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9R2P p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (crosslinked sample) 提交 2025-04-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.18 Å
9R2Q p53 bound to nucleosome at position SHL-5.7 (non-crosslinked sample) 提交 2025-04-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.90 Å
9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 C 1–130（130 aa） 链 G 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9RZC State 3 MAP 1 SETD2 bound to distal H3 of upstream nucleosome 提交 2025-07-15	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.66 Å
9RZE State 2 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to proximal upstream H3 提交 2025-07-15	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.53 Å
9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.72 Å
9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å
9U5U The 1:1 cryo-EM structure of BAP1/ASXL1-K351Ub in complex with H2AK119Ub nucleosome 提交 2025-03-21	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
9UZ7 Cryo-EM structure of the nucleosome core particle with site-specific DNA-histone crosslinking 提交 2025-05-16	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 E 2–130（129 aa） 链 F 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6；10 mM HEPES, pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率未提供
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 c 1–130（130 aa） 链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同	Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 g 1–130（130 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.62 Å
9XSF Cryo-EM structure of H4S47GlcNAc nucleosome at 3.39 angstrom 提交 2025-11-20	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.39 Å
9YL3 State 1 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.50 Å
9YLE State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.63 Å
9YLY MLL4FC bound to a nucleosome with p53 RE 提交 2025-10-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.77 Å
9YM8 State 2 focused on PHD FYR of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.43 Å
9YMF State 2 focused on H3 N terminal tail of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric	链 C 2–130（129 aa） 链 G 2–130（129 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.45 Å
9ZEN Competition for different elements of the nucleosome acidic patch yields distinct functional outcomes. VHH 1B2 提交 2025-11-30	构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric	链 C 11–121（111 aa） 链 G 11–121（111 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES pH7.6, 50 mM NaCl, 0.5 mM MgCl2, 1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.17 Å
9ZEO Competition for different elements of the nucleosome acidic patch yields distinct functional outcomes. VHH 1G1 提交 2025-11-30	构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric	链 C 11–121（111 aa） 链 G 11–121（111 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES pH7.6, 50 mM NaCl, 0.5 mM MgCl2, 1 mM EDTA cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

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UniProt名称	H2A1B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–119； UniProt 12–130 作者链 G； PDB构建体 1–119； UniProt 12–130

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