8vdq

Cryogenic electron microscopy model of full-length talin

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 143.3 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Green fluorescent protein,Talin-1

Mus musculus

UniProt P26039

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–2541 未记录 无其他共同聚合物 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 5.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 50 个其他 PDB 条目、70 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TLN1_MOUSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 264–2804; UniProt 1–2541

Green fluorescent protein,Talin-1

Mus musculus

UniProt P42212

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 2–238 未记录 无其他共同聚合物 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 5.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 568 个其他 PDB 条目、744 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GFP_AEQVI
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 14–250; UniProt 2–238

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8vdq

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8vdq
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8vdq
沉积日期 deposition_date2023-12-17
结构标题 titleCryogenic electron microscopy model of full-length talin
关键词 keywordsTalin, focal adhesion, f-actin binding, CELL ADHESION; CELL ADHESION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier44.83
回转半径 Rg (电子) rg_electron44.44
零角强度 I(0) i0829396000.00
分子量 molecular_weight229660.0 kDa
排除体积 excluded_volume284990 ų
包络体积 envelope_volume402840 ų
水化壳体积 shell_volume75405 ų
包络直径 envelope_diameter139.7
壳层 Rg shell_rg49.96
包络 Rg envelope_rg43.01
形状 Rg shape_rg44.46
总 Rg total_rg44.64
总原子数 total_atoms16077
残基数 n_residues2192
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax143.3
Rg (实空间) rg_real44.64
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.22
I(0) (实空间) i0_real8.2940e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.6200e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal44.83
I(0) (倒空间) i0_reciprocal829600000.0000
解质量估计 total_estimate0.9012
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary53.2
偏度 Skewness skewness0.149
峰度 Kurtosis kurtosis-0.563
角度范围 angular_range— – 0.1750 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha62330000.0000
实空间数据点数 n_real_points36
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.930; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.928

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)