9yle

State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquitin

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	[histone H3]-lysine(4) N-methyltransferase,Histone-lysine N-methyltransferase 2D × 1 （A0A6P6IDI8,O14686） Retinoblastoma-binding protein 5 × 1 （Q15291） Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 × 1 （Q9UBL3） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 2-E × 2 （Q16778） DNA (145-MER) × 1 WD repeat-containing protein 5 × 1 （P61964） DNA (145-MER) × 1 Protein dpy-30 homolog × 2 （Q9C005） water × 11	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	UBB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76

[histone H3]-lysine(4) N-methyltransferase,Histone-lysine N-methyltransferase 2D

Homo sapiens

UniProt A0A6P6IDI8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Ubiquitin × 1 （P0CG47） Retinoblastoma-binding protein 5 × 1 （Q15291） Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 × 1 （Q9UBL3） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 2-E × 2 （Q16778） DNA (145-MER) × 1 WD repeat-containing protein 5 × 1 （P61964） DNA (145-MER) × 1 Protein dpy-30 homolog × 2 （Q9C005） water × 11	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A6P6IDI8_PUMCO
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 11–225； UniProt 1102–1316

[histone H3]-lysine(4) N-methyltransferase,Histone-lysine N-methyltransferase 2D

Homo sapiens

UniProt O14686

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Ubiquitin × 1 （P0CG47） Retinoblastoma-binding protein 5 × 1 （Q15291） Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 × 1 （Q9UBL3） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 2-E × 2 （Q16778） DNA (145-MER) × 1 WD repeat-containing protein 5 × 1 （P61964） DNA (145-MER) × 1 Protein dpy-30 homolog × 2 （Q9C005） water × 11	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KMT2D_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 226–1256； UniProt 4507–5537

Retinoblastoma-binding protein 5

Homo sapiens

UniProt Q15291

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Ubiquitin × 1 （P0CG47） [histone H3]-lysine(4) N-methyltransferase,Histone-lysine N-methyltransferase 2D × 1 （A0A6P6IDI8,O14686） Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 × 1 （Q9UBL3） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 2-E × 2 （Q16778） DNA (145-MER) × 1 WD repeat-containing protein 5 × 1 （P61964） DNA (145-MER) × 1 Protein dpy-30 homolog × 2 （Q9C005） water × 11	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RBBP5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–538； UniProt 1–538

Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2

Homo sapiens

UniProt Q9UBL3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Ubiquitin × 1 （P0CG47） [histone H3]-lysine(4) N-methyltransferase,Histone-lysine N-methyltransferase 2D × 1 （A0A6P6IDI8,O14686） Retinoblastoma-binding protein 5 × 1 （Q15291） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 2-E × 2 （Q16778） DNA (145-MER) × 1 WD repeat-containing protein 5 × 1 （P61964） DNA (145-MER) × 1 Protein dpy-30 homolog × 2 （Q9C005） water × 11	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ASH2L_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–628； UniProt 1–628

Histone H3.1

Homo sapiens

UniProt P68431

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Ubiquitin × 1 （P0CG47） [histone H3]-lysine(4) N-methyltransferase,Histone-lysine N-methyltransferase 2D × 1 （A0A6P6IDI8,O14686） Retinoblastoma-binding protein 5 × 1 （Q15291） Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 × 1 （Q9UBL3） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 2-E × 2 （Q16778） DNA (145-MER) × 1 WD repeat-containing protein 5 × 1 （P61964） DNA (145-MER) × 1 Protein dpy-30 homolog × 2 （Q9C005） water × 11	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H31_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–135； UniProt 2–136 作者链 E； PDB构建体 1–135； UniProt 2–136

Histone H4

Homo sapiens

UniProt P62805

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Ubiquitin × 1 （P0CG47） [histone H3]-lysine(4) N-methyltransferase,Histone-lysine N-methyltransferase 2D × 1 （A0A6P6IDI8,O14686） Retinoblastoma-binding protein 5 × 1 （Q15291） Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 × 1 （Q9UBL3） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 2-E × 2 （Q16778） DNA (145-MER) × 1 WD repeat-containing protein 5 × 1 （P61964） DNA (145-MER) × 1 Protein dpy-30 homolog × 2 （Q9C005） water × 11	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–102； UniProt 2–103 作者链 F； PDB构建体 1–102； UniProt 2–103

Histone H2A type 1-B/E

Homo sapiens

UniProt P04908

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Ubiquitin × 1 （P0CG47） [histone H3]-lysine(4) N-methyltransferase,Histone-lysine N-methyltransferase 2D × 1 （A0A6P6IDI8,O14686） Retinoblastoma-binding protein 5 × 1 （Q15291） Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 × 1 （Q9UBL3） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2B type 2-E × 2 （Q16778） DNA (145-MER) × 1 WD repeat-containing protein 5 × 1 （P61964） DNA (145-MER) × 1 Protein dpy-30 homolog × 2 （Q9C005） water × 11	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H2A1B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–129； UniProt 2–130 作者链 G； PDB构建体 1–129； UniProt 2–130

Histone H2B type 2-E

Homo sapiens

UniProt Q16778

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Ubiquitin × 1 （P0CG47） [histone H3]-lysine(4) N-methyltransferase,Histone-lysine N-methyltransferase 2D × 1 （A0A6P6IDI8,O14686） Retinoblastoma-binding protein 5 × 1 （Q15291） Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 × 1 （Q9UBL3） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） DNA (145-MER) × 1 WD repeat-containing protein 5 × 1 （P61964） DNA (145-MER) × 1 Protein dpy-30 homolog × 2 （Q9C005） water × 11	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H2B2E_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–125； UniProt 2–126 作者链 H； PDB构建体 1–125； UniProt 2–126

WD repeat-containing protein 5

Homo sapiens

UniProt P61964

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Ubiquitin × 1 （P0CG47） [histone H3]-lysine(4) N-methyltransferase,Histone-lysine N-methyltransferase 2D × 1 （A0A6P6IDI8,O14686） Retinoblastoma-binding protein 5 × 1 （Q15291） Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 × 1 （Q9UBL3） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 2-E × 2 （Q16778） DNA (145-MER) × 1 DNA (145-MER) × 1 Protein dpy-30 homolog × 2 （Q9C005） water × 11	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	WDR5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–334； UniProt 1–334

Protein dpy-30 homolog

Homo sapiens

UniProt Q9C005

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Ubiquitin × 1 （P0CG47） [histone H3]-lysine(4) N-methyltransferase,Histone-lysine N-methyltransferase 2D × 1 （A0A6P6IDI8,O14686） Retinoblastoma-binding protein 5 × 1 （Q15291） Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 × 1 （Q9UBL3） Histone H3.1 × 2 （P68431） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 2-E × 2 （Q16778） DNA (145-MER) × 1 WD repeat-containing protein 5 × 1 （P61964） DNA (145-MER) × 1 water × 11	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	DPY30_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 Q； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9yle
沉积日期 deposition_date	2025-10-08
结构标题 title	State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac
关键词 keywords	MLL4 complex, histone modification, nucleosome recognition, transcription coactivation, TRANSCRIPTION, TRANSCRIPTION-DNA complex; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9yle__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9yle__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9yle__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	57.66 Å
Rg（电子密度）	57.85 Å
总 Rg	57.95 Å
原子数	26696
残基数	2908
排除体积	456500 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9yle__assembly_1__model_1`	17-meric （17）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Ubiquitin
分子量 formula_weight	8622.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O
原子数 atom_count	26853

MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	[histone H3]-lysine(4) N-methyltransferase,Histone-lysine N-methyltransferase 2D
分子量 formula_weight	140004.7 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.364
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MDYKDDDDKSDTMQNTVVLFSNTDKFVLMQDMCVVCGSFGRGAEGHLLACSQCSQCYHPYCVNSKITKVMLLKGWRCVECIVCEVCGQASDPSRLLLCDDCDISYHTYCLDPPLLTVPKGGWKCKWCVSCMQCGAASPGFHCEWQNSYTHCGPCASLVTCPICHAPYVEEDLLIQCRHCERWMHAGCESLFTEDDVEQAADEGFDCVSCQPYVVKPAAPVAPPELSNKEDAAARKPLTPKPKRVQKASDRLVSSRKKLRKEDGVRASEALLKQLKQELSLLPLTEPAITANFSLFAPFGSGCPVNGQSQLRGAFGSGALPTGPDYYSQLLTKNNLSNPPTPPSSLPPTPPPSVQQKMVNGVTPSEELGEHPKDAASARDSERALRDTSEVKSLDLLAALPTPPHNQTEDVRMESDEDSDSPDSIVPASSPESILGEEAPRFPHLGSGRWEQEDRALSPVIPLIPRASIPVFPDTKPYGALGLEVPGKLPVTTWEKGKGSEVSVMLTVSAAAAKNLNGVMVAVAELLSMKIPNSYEVLFPESPARAGTEPKKGEAEGPGGKEKGLEGKSPDTGPDWLKQFDAVLPGYTLKSQLDILSLLKQESPAPEPPTQHSYTYNVSNLDVRQLSAPPPEEPSPPPSPLAPSPASPPTEPLVELPTEPLAEPPVPSPLPLASSPESARPKPRARPPEEGEDSRPPRLKKWKGVRWKRLRLLLTIQKGSGRQEDEREVAEFMEQLGTALRPDKVPRDMRRCCFCHEEGDGATDGPARLLNLDLDLWVHLNCALWSTEVYETQGGALMNVEVALHRGLLTKCSLCQRTGATSSCNRMRCPNVYHFACAIRAKCMFFKDKTMLCPMHKIKGPCEQELSSFAVFRRVYIERDEVKQIASIIQRGERLHMFRVGGLVFHAIGQLLPHQMADFHSATALYPVGYEATRIYWSLRTNNRRCCYRCSIGENNGRPEFVIKVIEQGLEDLVFTDASPQAVWNRIIEPVAAMRKEADMLRLFPEYLKGEELFGLTVHAVLRIAESLPGVESCQNYLFRYGRHPLMELPLMINPTGCARSEPKILTHYKRPHTLNSTSMSKAYQSTFTGETNTPYSKQFVHSKSSQYRRLRTEWKNNVYLARSRIQGLGLYAAKDLEKHTMVIEYIGTIIRNEVANRREKIYEEQNRGIYMFRINNEHVIDATLTGGPARYINHSCAPNCVAEVVTFDKEDKIIIISSRRIPKGEELTYDYQFDFEDDQHKIPCHCGAWNCRKWMN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Retinoblastoma-binding protein 5
分子量 formula_weight	59223.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MNLELLESFGQNYPEEADGTLDCISMALTCTFNRWGTLLAVGCNDGRIVIWDFLTRGIAKIISAHIHPVCSLCWSRDGHKLVSASTDNIVSQWDVLSGDCDQRFRFPSPILKVQYHPRDQNKVLVCPMKSAPVMLTLSDSKHVVLPVDDDSDLNVVASFDRRGEYIYTGNAKGKILVLKTDSQDLVASFRVTTGTSNTTAIKSIEFARKGSCFLINTADRIIRVYDGREILTCGRDGEPEPMQKLQDLVNRTPWKKCCFSGDGEYIVAGSARQHALYIWEKSIGNLVKILHGTRGELLLDVAWHPVRPIIASISSGVVSIWAQNQVENWSAFAPDFKELDENVEYEERESEFDIEDEDKSEPEQTGADAAEDEEVDVTSVDPIAAFCSSDEELEDSKALLYLPIAPEVEDPEENPYGPPPDAVQTSLMDEGASSEKKRQSSADGSQPPKKKPKTTNIELQGVPNDEVHPLLGVKGDGKSKKKQAGRPKGSKGKEKDSPFKPKLYKGDRGLPLEGSAKGKVQAELSQPLTAGGAISELL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2
分子量 formula_weight	68805.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

MAAAGAGPGQEAGAGPGPGAVANATGAEEGEMKPVAAGAAAPPGEGISAAPTVEPSSGEAEGGEANLVDVSGGLETESSNGKDTLEGAGDTSEVMDTQAGSVDEENGRQLGEVELQCGICTKWFTADTFGIDTSSCLPFMTNYSFHCNVCHHSGNTYFLRKQANLKEMCLSALANLTWQSRTQDEHPKTMFSKDKDIIPFIDKYWECMTTRQRPGKMTWPNNIVKTMSKERDVFLVKEHPDPGSKDPEEDYPKFGLLDQDLSNIGPAYDNQKQSSAVSTSGNLNGGIAAGSSGKGRGAKRKQQDGGTTGTTKKARSDPLFSAQRLPPHGYPLEHPFNKDGYRYILAEPDPHAPDPEKLELDCWAGKPIPGDLYRACLYERVLLALHDRAPQLKISDDRLTVVGEKGYSMVRASHGVRKGAWYFEITVDEMPPDTAARLGWSQPLGNLQAPLGYDKFSYSWRSKKGTKFHQSIGKHYSSGYGQGDVLGFYINLPEDTETAKSLPDTYKDKALIKFKSYLYFEEKDFVDKAEKSLKQTPHSEIIFYKNGVNQGVAYKDIFEGVYFPAISLYKSCTVSINFGPCFKYPPKDLTYRPMSDMGWGAVVEHTLADVLYHVETEVDGRRSPPWEP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Histone H3.1
分子量 formula_weight	15306.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,E

ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	11263.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,F

SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Histone H2A type 1-B/E
分子量 formula_weight	14034.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,G

SGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Histone H2B type 2-E
分子量 formula_weight	13820.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,H

PEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DNA (145-MER)
分子量 formula_weight	45604.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	J

ACAGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAG

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	WD repeat-containing protein 5
分子量 formula_weight	36635.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MATEEKKPETEAARAQPTPSSSATQSKPTPVKPNYALKFTLAGHTKAVSSVKFSPNGEWLASSSADKLIKIWGAYDGKFEKTISGHKLGISDVAWSSDSNLLVSASDDKTLKIWDVSSGKCLKTLKGHSNYVFCCNFNPQSNLIVSGSFDESVRIWDVKTGKCLKTLPAHSDPVSAVHFNRDGSLIVSSSYDGLCRIWDTASGQCLKTLIDDDNPPVSFVKFSPNGKYILAATLDNTLKLWDYSKGKCLKTYTGHKNEKYCIFANFSVTGGKWIVSGSEDNLVYIWNLQTKEIVQKLQGHTDVVISTACHPTENIIASAALENDKTIKLWKSDC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	DNA (145-MER)
分子量 formula_weight	45145.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	I

CTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCTGT

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Protein dpy-30 homolog
分子量 formula_weight	11261.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,Q

MEPEQMLEGQTQVAENPHSEYGLTDNVERIVENEKINAEKSSKQKVDLQSLPTRAYLDQTVVPILLQGLAVLAKERPPNPIEFLASYLLKNKAQFEDRN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 13 Entity 13 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	157

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.630 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	3.63 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	25255

State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ubiquitin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

[histone H3]-lysine(4) N-methyltransferase,Histone-lysine N-methyltransferase 2D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

[histone H3]-lysine(4) N-methyltransferase,Histone-lysine N-methyltransferase 2D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Retinoblastoma-binding protein 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H3.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2A type 1-B/E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2B type 2-E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

WD repeat-containing protein 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体