8x9p

HURP (428-534)-alpha-tubulin-beta-tubulin complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 106.4 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tubulin alpha chain

Bos taurus

UniProt A0A0M3KKT1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–439 未记录 Tubulin beta chain × 1 (P02554) Disks large-associated protein 5,Green fluorescent protein × 1 (Q15398,P42212) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.54 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A0M3KKT1_TETTH
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–439; UniProt 1–439

Tubulin beta chain

Bos taurus

UniProt P02554

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–427 未记录 Tubulin alpha chain × 1 (A0A0M3KKT1) Disks large-associated protein 5,Green fluorescent protein × 1 (Q15398,P42212) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.54 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 137 个其他 PDB 条目、159 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TBB_PIG
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–427; UniProt 1–427

Disks large-associated protein 5,Green fluorescent protein

Homo sapiens

UniProt P42212

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 2–217 未记录 Tubulin alpha chain × 1 (A0A0M3KKT1) Tubulin beta chain × 1 (P02554) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.54 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 568 个其他 PDB 条目、744 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GFP_AEQVI
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 460–675; UniProt 2–217

Disks large-associated protein 5,Green fluorescent protein

Homo sapiens

UniProt Q15398

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 199–619 未记录 Tubulin alpha chain × 1 (A0A0M3KKT1) Tubulin beta chain × 1 (P02554) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.54 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 3 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DLGP5_HUMAN
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 34–454; UniProt 199–619

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8x9p

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8x9p
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8x9p
沉积日期 deposition_date2023-11-30
结构标题 titleHURP (428-534)-alpha-tubulin-beta-tubulin complex
关键词 keywordsHURP, tubulin, drug resistance, mitosis, CELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier32.78
回转半径 Rg (电子) rg_electron32.34
零角强度 I(0) i0192084000.00
分子量 molecular_weight109150.0 kDa
排除体积 excluded_volume135620 ų
包络体积 envelope_volume166100 ų
水化壳体积 shell_volume43338 ų
包络直径 envelope_diameter116.2
壳层 Rg shell_rg38.84
包络 Rg envelope_rg32.38
形状 Rg shape_rg32.34
总 Rg total_rg32.81
总原子数 total_atoms7669
残基数 n_residues973
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax106.4
Rg (实空间) rg_real32.89
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.82
I(0) (实空间) i0_real1.9210e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.8200e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal32.85
I(0) (倒空间) i0_reciprocal192100000.0000
解质量估计 total_estimate0.8683
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary35.5
偏度 Skewness skewness0.463
峰度 Kurtosis kurtosis-0.259
角度范围 angular_range— – 0.2400 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha44420000.0000
实空间数据点数 n_real_points49
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.861; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.987; Smooth: 0.716

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)